KR920008380B1 - Expression vector ptty2 and production of lipase - Google Patents

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Abstract

(a) preparing lipase producing recombinant plasmid pJH92 with use of lipase coding DNA sequence-contg. gener fragment dirived from Pseudomonas fluorescens; (b) separating the DNA fragment contg. lipse gene from pJH92; (c) inserting the DNA fragment into tac promotor-contg. high expression plasmid pTTQ19 to obtain the plasmid pTTY2; (d) transforming the pTTY2 into E. coli and culturing; and (e) extracting and separating the lipase inculusion body from the E. coli culture, and refolding. E. coli BL21 contg. high expression plasmid pTTY2 is prepd. and heat resistant lipase can be produced with high yield by industrialmass prodn..

Description

고수율 발현용 플라스미드 pTTY2의 제조 및 이를 사용한 내열성 리파제의 대량 생산 방법Preparation of high yield plasmid pTTY2 and mass production method of heat resistant lipase using same

제1도는 본 발명에 의해 형질전환된 새로운 균주에서 얻은 리파제의 활성의 확인도이다.1 is a diagram showing the activity of lipase obtained in a new strain transformed by the present invention.

제2도는 본 발명에 의해 유전자 조작된 재조합 플라스미드 pJH92의 제한효소 지도이다.2 is a restriction map of recombinant plasmid pJH92 genetically engineered by the present invention.

제3도는 본 발명에 의해 분리된 리파제 유전자를 함유하는 뉴클레오타이드 서열을 도시한 것이다.3 shows a nucleotide sequence containing a lipase gene isolated by the present invention.

제4도는 본 발명에 의해 분리된 고수율 발현용 재조합 플라스미드를 제조하는 공정도이다.4 is a process chart for preparing a recombinant plasmid for high yield expression isolated by the present invention.

제5도는 고수율 발현용 플라스미드 벡터 pTTYQ19를 사용하여 만든 플라스미드 pTTY2를 사용하여 형질전환시킨 대장균으로부터 생산된 리파제에 대한 전기영동(Sodium dodesyl Sulfate Polyacrylamide Gel Electrophoresis) 사진이다.FIG. 5 is a photograph of Sodium dodesyl Sulfate Polyacrylamide Gel Electrophoresis for lipase produced from E. coli transformed with plasmid pTTY2 made using high yield expression plasmid vector pTTYQ19.

제6도는 재조합 플라스미드 pTTY2로 형질전환시킨 대장균을 리파제 생산을 하도록 유도(Induction)한 후 전자현미경으로 관찰한 사진이다.Figure 6 is a photograph of the E. coli transformed with the recombinant plasmid pTTY2 to induce lipase production and observed by electron microscopy.

본 발명은 지방의 가수분해에 의해 글리세롤과 지방산을 만드는데 관여하는 미생물의 리파제(lipase) 생산에 관한 것이다. 즉, 열안정성이 높은 리파제를 생산한다고 보고된 슈도모나스 플루오레슨스(Pseudomonas fluorescens)SIK W1으로부터 리파제를 코딩하는 유전자를 분리하여 유전적 정보를 분석하고 발현 벡터(expression vector)의 제조 및 다른 숙주세포에서의 유전자 발현의 조절 및 생산을 목적으로 재조합 플라스미드를 제조하고 대장균에서 발현시켜 대량 생산하는 것에 관한 것이다.The present invention relates to lipase production of microorganisms involved in making glycerol and fatty acids by hydrolysis of fats. That is, the gene encoding the lipase is isolated from Pseudomonas fluorescens SIK W1, which is reported to produce lipase with high thermal stability, to analyze genetic information, to prepare expression vectors, and in other host cells. The present invention relates to the production of recombinant plasmids for the purpose of regulation and production of gene expression and expression in E. coli and mass production.

리파제(EC 3.1.1.3)는 긴 사슬을 갖는 지방을 가수분해하여 지방산과 글리세롤, 모노- 및 디-글리세리드를 만드는 반응을 촉매하는 효소로서 자연계의 동식물 및 여러 미생물들로부터 얻어진다. 특히 구강 리파제나 췌장, 간조직 리파제등은 오랫동안 연구되어 왔다. 그러나 상업적으로는 계절이나 장소에 구애받지 않고 생산이 가능하며 세포의 증식 기간이 짧아 적은 시간내에 대량 생산이 가능한 미생물 유래의 리파제가 적합한 촉매제로 사용되고 있다.Lipase (EC 3.1.1.3) is an enzyme that catalyzes the reaction of hydrolyzing fats with long chains to produce fatty acids and glycerol, mono- and diglycerides, obtained from natural plants and animals and from many microorganisms. In particular, oral lipase, pancreas and liver lipase have been studied for a long time. However, commercially available lipases derived from microorganisms that can be produced regardless of season or place and can be mass-produced within a short time due to the short growth period of cells are used as suitable catalysts.

리파제는 낙농 및 식품 제조에 긴요하게 사용되어 왔으며 특히 식품의 풍미를 증진시키는데 중요한 위치를 차지하고 있다. 우유 산업에서는 특수한 풍미를 제공하는데 리파제가 이용되며 혈청내 지방의 분석 및 세제산업등에서 사용되기도 한다. 최근에는 이러한 리파제의 산업적 가치를 높이기 위해 효소 특성의 개선, 가수분해 반응의 역반응을 이용한 지방질의 합성 및 고품질로의 변환, 고정화에 의한 리파제의 안정화등 여러 측면에서 연구를 시도하고 있다.Lipases have been used critically in dairy and food production, and are particularly important for enhancing the flavor of food. In the milk industry, lipases are used to provide a special flavor, and are also used in the analysis of serum fat and in the detergent industry. Recently, in order to increase the industrial value of these lipases, studies have been conducted in various aspects such as improvement of enzyme properties, synthesis of lipids using reverse reaction of hydrolysis reaction, conversion to high quality, and stabilization of lipase by immobilization.

그러나 이들 여러 가지 응용성에도 불구하고 리파제의 산업적 이용은 아직 활발하지 않다. 그 이유는 리파제의 기질인 트리글리세리드(Triglyceride)가 수용액 상에서 불용성이기 때문에 리파제 활성을 극대화시키기 위해서는 반응 공정의 개선이 필요하며, 리파제의 세포외 분비시의 불안정성의 개선, 대량 생산에 의한 저렴한 리파제 보급이 문제가 되고 있기 때문이다.However, despite their many applications, the industrial use of lipases is not yet active. The reason is that triglyceride, which is a substrate of lipase, is insoluble in aqueous solution, so it is necessary to improve the reaction process in order to maximize the lipase activity, improve the instability of extracellular secretion of lipase, and inexpensive lipase dissemination by mass production. This is a problem.

리파제는 자연계의 동식물, 그리고 여러 미생물들로부터 얻어진다. 리파제를 생산하는 미생물인 진균류와 세균류에 넓게 분포하고 있다. 진균류에는 라이조푸스 아리주스(Rhizopus arrhizus), 라이조푸스 델레마(Rhizopus delemar), 아스퍼질러스 나이거(Aspergillus niger), 뮤코 쟈바니쿠스(Mucor javanicus)등이 글리세리드의 1번과 3번 위치에 특이성이 있는 리파제를 많이 생성하며, 세균류에는 스타필로코커스 아우레우스(Staphylococcus aureus), 슈도모나스 플루오레슨스(Pseudomonas fluorescens), 슈도모나스 프라지(Pseudomonas fragi)등에서의 효소 생산이 많이 연구되어 왔다. 특히 저온균인 슈도모나스 플루오레슨스(Pseudemonas fluorescens)는 매우 열에 내성이 있는 리파제를 생산한다고 보고되었다. 드리센(Driessen et al., Food Science Abstract, 6(3), 130, 1973)등은 슈도모나스 플루오레슨스(Pseudomonas fluorescens) 22F 균주에서 생산된 리파제가 매우 높은 내열성을 가짐(150℃에서 활성이 90% 감소하는데 걸리는 시간인 D값이 4.8분임)을 보고하였으며, 이 보고 이후로 이와 같은 현상을 아담스등(Adams et al. J, Dairy Sci., 64,1951,1981), 앤더슨등(Andersson et al., J Dairy Sci. 62.361-367 1979)에 의해 확인되었으며, 이런 리파제의 성질을 규명하고 이용하려는 목적으로 집중적인 연구의 대상이 되어 왔다.Lipases are obtained from natural plants and animals and from many microorganisms. It is widely distributed in fungi and bacteria, microorganisms producing lipase. Fungi include Rhizopus arrhizus, Rhizopus delemar, Aspergillus niger, and Muco javanicus at specific positions 1 and 3 of glycerides. It produces a lot of lipases, and bacteria have been studied for the production of enzymes in Staphylococcus aureus, Pseudomonas fluorescens, Pseudomonas fragi, and the like. In particular, Pseudemonas fluorescens, a low-temperature bacterium, has been reported to produce very heat resistant lipases. Driessen et al., Food Science Abstract, 6 (3), 130, 1973) have shown that lipase produced in Pseudomonas fluorescens 22F strain has a very high heat resistance (activity of 90 at 150 ° C). The time taken to decrease% was 4.8 minutes), and since this report, this phenomenon has been reported by Adams et al. (Adams et al. J, Dairy Sci., 64,1951,1981), Anderson et al. (Andersson et al. , J Dairy Sci. 62.361-367 1979), and have been the subject of intensive research for the purpose of identifying and exploiting the properties of these lipases.

종래의 화학 공학적인 방법은 물에 녹지 않는 지방을 가수분해하여 글리세롤과 지방산을 만드는데 고온(250℃)과 고압(55 atm)을 요구하므로 많은 에너지를 소모하는 공정이다. 최근에는 유기 용매 상에서 유리된 리파제나 고정화된 리파제를 사용하여 효소 공학적으로 지방산과 모노-, 디-글리세리드를 생산하는 방법과 지방질의 개질등이 시도되고 있다.The conventional chemical engineering method consumes a lot of energy because it requires high temperature (250 ° C.) and high pressure (55 atm) to hydrolyze fat insoluble in water to form glycerol and fatty acids. Recently, methods for producing fatty acids and mono- and di-glycerides using lipases or immobilized lipases liberated in organic solvents, and modification of fats have been attempted.

이러한 효소공학적 지방질 분해 및 제조 방법은 실온에서 반응시키고 조작 및 공정이 간편하며 다른 부반응이 없어 높은 수율을 얻을 수 있으나, 리파제가 세포에 의해 다량으로 항상 만들어지는 단백질이 아니고, 생산을 위해서는 효소 생산 유도에 필요한 불용성 기질을 요구하기 때문에 대규모 생산이 어렵다. 또한 적은 양이 생산되어 정제에 복잡한 공정이 필요하므로 생산가가 높아 아직 실용성이 맞지 않다.These enzyme engineering lipolysis and preparation method can be reacted at room temperature, easy to operate and process and high yield because there are no other side reactions, but lipase is not a protein that is always made in large quantities by cells, and induction of enzyme production for production Large-scale production is difficult because it requires the insoluble substrate needed for the process. In addition, since a small amount is produced and a complicated process is required for purification, the production price is high and its practicality is not suitable yet.

본 발명은 이러한 문제점을 해결하기 위해 내열성이 있다고 보고된 슈도모나스 플루오레슨스(Pseudomonas fluorescens)의 리파제 유전자를 고수율 발현용 플라스미드 벡터인 pTTY2를 사용하여 대장균에서 대량 생산하기 위한 것이다. 저온균인 슈도모나스 플루오레슨스가 생산하는 이 리파제는 100℃에서 그 활성이 90% 감소하는데 약 50분이 소요되는 내열성 효소임을 앤더슨(Anderssom et al. J. Dairy Sci. 62,361,1979)등이 발표한 바 있다. 또한 이들은 슈도모나스 플루오레슨스(P. fluorescens)SIK W1으로부터 생산된 리파제가 도데실 설폰산 나트륨(Sodium dodecyl sulfate). 우레아(Urea)등 화학적 변성제들에도 매우 내성이 있음을 보고하였다.The present invention is to mass-produce the lipase gene of Pseudomonas fluorescens (Pseudomonas fluorescens) reported to be heat-resistant in E. coli using a high yield expression plasmid vector pTTY2. The lipase produced by Pseudomonas fluorescence, a low-temperature bacterium, has been reported by Anderson (Anderssom et al. J. Dairy Sci. 62,361,1979), which is a heat-resistant enzyme that takes about 50 minutes to reduce its activity by 90% at 100 ° C. have. They are also lipases produced from P. fluorescens SIK W1, which is sodium dodecyl sulfate. It has also been reported to be very resistant to chemical denaturants such as urea.

그러나, 이들은 생산되는 리파제가 소량이였기 때문에 그 특성을 규명하기가 어려웠을 뿐만 아니라 열안정성에 관여되는 요인들을 화학적 성분 및 구조적 특성을 기초로 하여 연구하기가 어려웠다. 이런 문제를 해결하기 위하여 본 발명자들은 슈도모나스 플루오레슨스(P. fluorescens)SKI W1으로부터 리파제를 코딩하는 유전자를 분리하여 대장균에서 발현시킴으로써 대량의 리파제를 생산하고자 하였다. 그 일환으로 앤더슨등으로부터 슈도모나스 플루오레슨스(P. fluorescens)SKI W1을 공여받아 그 균주로부터 리파제 유전자를 분리하여 대장균에 클로닝하였고, 이를 발표한 바 있다(한국 산업미생물 학회 춘계 학술 발표대회, 1988).However, they were difficult to characterize because of the small amount of lipase produced, and the factors involved in thermal stability were difficult to study based on chemical composition and structural properties. In order to solve this problem, the present inventors attempted to produce a large amount of lipase by separating genes encoding lipase from P. fluorescens SKI W1 and expressing them in E. coli. As part of this, Pseudomonas fluorescens SKI W1 was donated by Anderson et al., And the lipase gene was isolated from the strain and cloned into Escherichia coli, and it was announced (Korea Industrial Microbiological Society Spring Conference, 1988). .

그러나 이때 대장균에서 생산되는 리파제의 양은 매우 적어 이용에 많은 어려움이 있었고, 보다 효율적이면서 다량의 리파제를 생산하도록 하는 노력이 필요했다. 따라서 본 발명에서는 대장균에 클로닝된 유전자를 유전자 근원으로하여 유전자의 전체 염기 서열을 결정하고 이것을 근거로 하여 강력한 발현벡터(expression vector)에 연결시킴으로써 재조합 플라스미드를 만들고 이를 이용하여 대장균을 형질전환시키면, 형질전환된 균주는 IPTG에 의해 유도(Induction)된 발현을 통하여 다량으로 리파제를 생산할 수 있는 특성을 지니도록 하였다.However, at this time, the amount of lipase produced in E. coli was very small, which made it difficult to use, and efforts were required to produce more efficient and large amounts of lipase. Therefore, in the present invention, when the gene cloned in E. coli is used as a gene source, the entire nucleotide sequence of the gene is determined, and the recombinant plasmid is transformed by linking to a strong expression vector based on this. The transformed strain was designed to have the ability to produce large amounts of lipase through expression induced by IPTG.

본 발명에서 사용한 발현 벡터인 pTTQ19(Amersham International Plc. UK에서 구입)은 강력한 프로모터(Promoter)인 tac 프로모터와 rmB 전사 종료 서열을 가지며 IPTG에 의해 유도되는 pUC19 유래의 벡터이다. 또한 이 벡터는 lac Iq유전자를 지니고 있기 때문에 외부 유전자에 의해 대장균에서 생성되는 산물은 정확히 제어되는 상태에서 만들어지도록 고안되어 있다(M.J.R. Stark, Gene, 51, 255, 1987).PTTQ19 (purchased from Amersham International Plc.UK), the expression vector used in the present invention, is a vector derived from pUC19 derived from IPTG having a strong promoter, the tac promoter and the rmB transcription termination sequence. In addition, since the vector contains the lac I q gene, the product produced in Escherichia coli by an external gene is designed to be produced in a precisely controlled state (MJR Stark, Gene, 51, 255, 1987).

한편, 강력한 발현 벡터(expression vector)를 이용하여 대장균에서 외부 유전자의 발현에 의한 단백질 생산을 도모하는 경우 대부분 대장균내에서 이들이 생산되어서 봉입체(inclusion body)를 형성함이 보고되어 왔다. 이런 봉입체의 형성은 여러 가지 장점을 가지고 있는데, 그 중 하나는 초기 분리 공정이 매우 간단하다는 것이다. 즉, 대장균을 배양시킨 후 세포벽을 파괴하는 간단한 조작을 거쳐 낮은 속도에서 원심분리를 행하여 얻어진 봉입체로부터 비교적 높은(약 50%이상) 순도의 단백질을 얻을 수 있다. 이러한 간단한 초기 분리 단계 공정은 작업 용량의 감소, 정제 단계의 감소에 의한 시간과 시설 장치비의 절약, 정제 효율의 극대화등을 제공한다.On the other hand, when the production of protein by the expression of external genes in E. coli using a strong expression vector (expression) has been reported to form the inclusion body (inclusion body) is produced in most of them. The formation of such enclosures has several advantages, one of which is that the initial separation process is very simple. That is, a relatively high (about 50% or more) purity protein can be obtained from the inclusion body obtained by centrifugation at low speed through a simple operation of culturing E. coli and destroying the cell wall. This simple initial separation stage process provides a reduction in working capacity, saving time and equipment costs by reducing the purification stage, and maximizing purification efficiency.

또 다른 봉입체 형성의 장점은 봉입체 형성이 외래 유전자에 의한 대장균에서의 단백질 생산시에 생성 물질의 안정성 및 축적량을 높아지게 한다는 것이다. 이와 같은 현상은 대장균내에 존재하는 단백질 분해 효소들이 봉입체를 공격하지 않는다는 보고(Cheng et al. Gene, 14,121,1981)와 잘 일치한다. 이때 분리된 봉입체는 물에 잘 용해되어 생물학적으로 활성이 있는 형태로 전환이 될 수 있어야 한다.Another advantage of inclusion body formation is that inclusion body formation increases the stability and accumulation of product during the production of proteins in Escherichia coli by foreign genes. This is in good agreement with the report that proteolytic enzymes present in E. coli do not attack inclusion bodies (Cheng et al. Gene, 14,121,1981). In this case, the separated inclusion body should be able to be dissolved in water and converted into a biologically active form.

본 발명은 대장균내에서 발현 벡터에 의해 리파제가 생산되어 봉입체를 형성하게한 후 이를 분리하여 활성이 있는 리파제로 만드는 것을 특징으로 한다. 또한 슈도모나스 플루오레슨스(P, Pluorescens)에서의 리파제 생산은 8℃ 정도의 낮은 온도에서 좋은 생산성을 갖는데 반해 긴 세대 시간을 필요로 한다. 따라서 37℃에서 짧은 세대 시간을 갖는 형질전환된 대장균에 의한 리파제 생산은 매우 큰 장점을 갖는다.The present invention is characterized in that a lipase is produced by an expression vector in Escherichia coli to form an inclusion body, which is then separated into an active lipase. Lipase production in Pseudomonas Pluorescens (P) also requires long generation times while good productivity at temperatures as low as 8 ° C. Thus, lipase production by transformed Escherichia coli with a short generation time at 37 ° C. has a great advantage.

본 발명에서 이용한 대부분의 유전자 조작방법은 하기 문헌에 수록된 방법에 준하여 행하였다[참고 문헌 : Molecular cloning, A laboratory manual(Cold Spring Harbor Laboratory 출판, T. Maniatis 등, 1982)]. 본 발명의 구체적인 실시예는 다음과 같다.Most of the genetic manipulations used in the present invention were carried out in accordance with the methods listed in the literature (Molecular cloning, A laboratory manual (Cold Spring Harbor Laboratory publication, T. Maniatis et al., 1982)). Specific embodiments of the present invention are as follows.

[실시예 1]Example 1

리파제를 유전 암호화 하는 유전자를 슈도모나스 플루오레슨스(P. fluorescens)로부터 클로닝하는 방법.A method of cloning a gene that encodes a lipase from P. fluorescens.

본 발명은 대장균주 JM83과 플라스미드 DNA pUC19를 사용하여 다음과 같은 방법으로 수행되었다.The present invention was carried out by the following method using E. coli strain JM83 and plasmid DNA pUC19.

pUC19 플라스미드에 앰피실린 내성 유전자가 함유되어 있으므로 슈도모나스 플루오레슨스(P. fluorescens)의 DNA를 순수 분리하여 제한효소로 절단한 후 pUC19 플라스미드와 연결시켜 재조합 플라스미드를 만들고 대장균에 형질전환시킨 다음 앰피실린과 지방질이 도포된 고체 배지에서 앰피실린 내성과 리파제 활성을 있는 유전자 조작된 미생물을 선별할 수 있다.Since pUC19 plasmid contains ampicillin resistance gene, DNA of P. fluorescens is isolated purely, cleaved with restriction enzyme and linked with pUC19 plasmid to make recombinant plasmid, transformed into E. coli, and then transformed into ampicillin and Genetically engineered microorganisms with ampicillin resistance and lipase activity can be selected from a lipid-coated solid medium.

우선 플라스미드를 대량으로 취출하기 위해 대장균 균주 JM83/pUC19를 박토 펩톤(10g/ℓ), 박토이스트추출액(5g/ℓ), 염화나트륨(10g/ℓ), pH 7.5를 포함하는 액체 배지(LB 배지)에서 온도 37℃의 조건에서 진탕배양한 다음 원심분리하여 수확하고 라이소자임(Lysozyme)을 가한 다음 도데실 설폰산 나트륨(Sodium dodecyl sulfonate)으로 용해시키고 나서 CsCl-EtBr 초 원심분리를 이용하여 분리한다.First, E. coli strain JM83 / pUC19 was extracted in a liquid medium (LB medium) containing bactopeptone (10 g / l), bacto yeast extract (5 g / l), sodium chloride (10 g / l), and pH 7.5 in order to extract the plasmid in large quantities. After shaking incubation at a temperature of 37 ℃, harvested by centrifugation, lysozyme was added, dissolved in sodium dodecyl sulfonate and separated by CsCl-EtBr ultracentrifugation.

리파제 유전자의 공여 균주인 슈도모나스 플루오레슨스(P. fluorescens)로부터 염색체 DNA를 분리하는 방법은 개선된 Marmur 방법(J. Marmur, J. Mol Biol., 3, 208,1961)을 이용하였다. 먼저 슈도모나스 플루오레슨스(P. fluorescens)를 위에 기술한 액체 배지 100ml에서 5시간 배양후 원심분리기(Beckman Model J2-21 M/E)를 사용하여 수확하고 100mg/ml 정도의 라이소자임을 가한 후 25% SDS 용액을 소량씩 가하면서 현탁하여 세포를 파괴시켰다. 여기에 5몰 염화나트륨 1ml를 가한 다음 페놀/클로로포름 용액을 넣고 현탁시킨 후 원심분리하여 상등액을 취해 2배의 95% 에탄올을 첨가하여 생성되는 DNA의 침전물을 1mM EDTA가 함유된 10mM 트리스 완충용액 pH 8.0에 용해시켰다. 이것에 알엔아제(RNase)를 처리한 다음 최종 밀도가 1.55g/ml이 되도록 CaCl을 용해시키고 원심분리기(Beckman, Model TL-100)에서 분리한 다음 염색체 DNA 시료로 사용하였다. 재조합 플라스미드를 제조하기 위하여 위에서 제조한 플라스미드 pUC19를 BamH I 제한효소로 처리한 다음, 분리된 염색체 DNA를 Sau3A I 제한효소로 처리된 것과 혼합하여 T4 DNA 리가제를 사용하여 연결하였다. 이 연결된 재조합 플라스미드를 염화칼슘으로 전처리한 슈용 균주인 수장균 균주 JM83과 같이 혼합하고 0.5% 트리-뷰티린(tributyrin)과 최종 농도 50㎍/ml의 앰피실린을 포함하는 고체 배지에서 도포하여 37℃에서 24시간 배양후 앰피실린 내성 균주중에서 트리-뷰티린(tributyrin)을 가수분해하는 집락을 선별하였다.Separation of chromosomal DNA from P. fluorescens, a donor strain of the lipase gene, was performed using an improved Marmur method (J. Marmur, J. Mol Biol., 3, 208, 1961). First, P. fluorescens (P. fluorescens) was incubated for 5 hours in 100 ml of the liquid medium described above, harvested using a centrifuge (Beckman Model J2-21 M / E), and added to the 100 mg / ml lysozyme. Cells were destroyed by suspending small amounts of SDS solution. To this, 1 ml of 5 molar sodium chloride was added, suspended in a phenol / chloroform solution, followed by centrifugation to obtain a supernatant, and 2 times 95% ethanol was added to precipitate the resulting DNA. 10 mM Tris buffer solution containing 8.0 mM EDTA pH 8.0 Dissolved in. After treatment with Rnase (RNase), CaCl was dissolved to a final density of 1.55 g / ml, separated in a centrifuge (Beckman, Model TL-100), and used as a chromosome DNA sample. To prepare a recombinant plasmid, the plasmid pUC19 prepared above was treated with BamH I restriction enzyme, and then the isolated chromosomal DNA was mixed with that treated with Sau3A I restriction enzyme and linked using T4 DNA ligase. This linked recombinant plasmid was mixed with E. coli strain JM83, a strain for pretreatment with calcium chloride, and applied in a solid medium containing 0.5% tri-butyrin and ampicillin at a final concentration of 50 µg / ml at 37 ° C. Colonies that hydrolyze tri-butyrin were selected from ampicillin resistant strains after 24 h incubation.

이렇게 하여 8개의 에스테라제(esterase)혹은 리파제(lipase) 활성을 보이는 균주를 선별하였다. 이들 선별된 균주들을 에스테라제(esterase)와 리파제(lipase) 활성을 분별할 수 있는 스크리닝 배지인 ROM 고체 배지[올리브유(olive oil) 1%와 로다민 비(rhodamine B) 0.001%]에서 24시간 배양시켜 오렌지 형광을 보이는 것을 리파제 생산균으로 채택하였다(제1도).In this way, eight strains (esterase) or lipase (lipase) showing a strain showing the activity was selected. These selected strains were incubated for 24 hours in ROM solid medium (1% olive oil and 0.001% rhodamine B), a screening medium that can distinguish esterase and lipase activity. It was adopted as a lipase producing bacteria that shows orange fluorescence (Fig. 1).

[실시예 2]Example 2

리파제를 코딩하는 DNA의 제한효소 지도 작성Mapping Restriction Enzymes of DNA Encoding Lipases

유전자 조작된 균주로부터 리파제 유전자를 포함하고 있는 재조합 플라스미드를 분리하여 대장균 균주 JM83에 다시 형질전환시켜 트리-뷰티린(tributyrin), 올리브유(olive oil) 또는 앰피실린에 함유된 고체 LB 배지에서 리파제 활성을 조사하여 100% 재현성을 확인하였다. 이 확인된 균주로부터 플라스미드를 분리하여 분리된 플라스미드를 pJH9이라 명명하였다. 이 분리된 재조합 플라스미드 pJH9을 EcoR I과 Hind III로 절단한 다음 삽입된 염색체 DNA 절편을 전기 영동후 전기 용출(electroelution)시켰다. 이것을 Sau3 AI 제한효소로 부분 절단하고 아가로스 겔에서 전기 영동한 후 1-2kb 길이의 DNA 단편들을 다시 용출시켰다. 이 DNA 단편들을 BamH I으로 절단시킨 pUC 19 운반체에 결합시킨 후 형질전환시켜 리파제 활성이 있는 대장균 균주를 선별하였다. 이들의 플라스미드를 조사한 결과 2kb의 삽입된 DNA 절편을 가지고 있음을 알 수 있었고, 이것에서 350 염기의 Pst I 단편이 제거된 1.65kb의 염색체 DNA 절편을 갖는 최종적 플라스미드 pJH92를 얻었다. 플라스미드 pJH92를 여러 가지 제한효소들로 단일 혹은 이중 절단하여 아가로스 겔 상에서 전기 영동 양상을 비교하여 제한효소 지도를 작성하였다. 제2도에 플라스미드 pJH92의 제한효소 지도를 나타내었다. 재조합 플라스미드 pJH92은 슈도모나스 플루오레슨스(P. fluorescens) 리파제(lipase)의 유전자를 함유하고 있는 새로운 플라스미드이다.Recombinant plasmid containing the lipase gene was isolated from the genetically engineered strain and transformed back into E. coli strain JM83 for lipase activity in solid LB medium contained in tri- butyrin, olive oil or ampicillin. Investigation confirmed 100% reproducibility. Plasmids were isolated from this identified strain, and the separated plasmids were named pJH9. The isolated recombinant plasmid pJH9 was digested with EcoR I and Hind III, and the inserted chromosomal DNA fragments were subjected to electroelution after electrophoresis. This was partially digested with Sau3 AI restriction enzyme and electrophoresed on agarose gel, followed by elution of 1-2 kb length DNA fragments. These DNA fragments were bound to pUC 19 carriers digested with BamH I and transformed to select E. coli strains with lipase activity. Examination of these plasmids revealed that they had a 2 kb inserted DNA fragment, from which the final plasmid pJH92 was obtained having a 1.65 kb chromosomal DNA fragment from which 350 base Pst I fragments were removed. Restriction maps were prepared by comparing plasmid pJH92 single or double cleavage with various restriction enzymes and comparing the electrophoretic patterns on agarose gels. 2 shows a restriction map of plasmid pJH92. Recombinant plasmid pJH92 is a new plasmid containing the gene of P. fluorescens lipase.

[실시예 3]Example 3

리파제(lipase)를 코딩하는 DNA의 뉴클레오타이드의 서열의 측정Determination of the Sequence of Nucleotides of DNA Encoding Lipases

플라스미드 pJH91을 제한효소인 Pst I, EcoR I, HindIII, Sal I, Ava II Sau3A I, HaeIII등으로 분해시켜 길이가 수백 염기쌍인 DNA 단편들로 분리시켰다. 이 분리된 각각의 DAN 단편들을 M13 박테리아 파지 DAN의 폴리링커 부위에 삽입시킨 다음, 뉴클레오타이드 서열을 생거의 디데옥시쇄 종결방법(Sanger dideoxy chain termination method)에 따라 측정하였다. 이렇게 하여 측정한 뉴클레오타이드 서열의 결과를 제3도에 도시하였다.Plasmid pJH91 was digested with restriction enzymes Pst I, EcoR I, HindIII, Sal I, Ava II Sau3A I, HaeIII and the like to separate DNA fragments of several hundred bases in length. Each of these isolated DAN fragments was inserted into the polylinker site of the M13 bacterial phage DAN, and then the nucleotide sequence was measured according to Sanger dideoxy chain termination method. The result of the nucleotide sequence measured in this way is shown in FIG.

[실시예 4]Example 4

리파제 발현 플라스미드이 제조Lipase Expression Plasmids Prepared

대장균에서 리파제를 대량 생산하기 위하여 위에서 얻은 재조합 플라스미드 pJH92를 유전자 근원으로 사용하여 발현용 재조합 플라스미드를 제조하였다. 우선 제한효소인 EcoR I과 Pst I을 동시에 처리하여 플라스미드 pJH92를 분해시킨 후 1.65킬로베이스(kb)에 해당하는 DNA 단편 부분을 분리하였다. 이 DNA 단편 용액을 페놀(phenol) 및 클로로포름(chloroform)으로 불순물을 추출 제거한 후 에탄올로 침전시켜 DNA 단편들을 정제 회수하였다. 한편, 발현 벡터인 pTTQ19는 제한효소인 EcoR I과 Pst I으로 동시에 처리한 후 37℃에서 2시간 반응시켜 절단시킨 후, 페놀(phenol) 및 클로로포름(chloroform)으로 추출하여 불순물을 제거하고 에탄올로 침전시켜 후 정제 회수하였다. 이 플라스미드 단편에 위에 기술한 방법으로 정제한 리파제 유전자를 함유한 DNA 단편들을 첨가하고 16℃에서 3시간동안 T4 박테리아 파지의 DNA 리가제(ligase) 존재하에서 반응시켜 연결시켰다(제4도에 재조합 플라스미드를 제조하는 과정을 도시하였다)연결된 반응 용액을 대장균 균주 JM103(Escherichia coli JM103), 대장균 균주 HB101(E. coli 101), 및 대장균 균주 BL 21(E. coli BL21)에 형질전환시킨 후 선별용 배지(LB, 앰피실린 100㎍/ml, 트리-뷰티린 5mg/ml)에서 리파제 활성을 보이는 대장균을 선별하였다.In order to mass-produce lipase in Escherichia coli, a recombinant plasmid for expression was prepared using the recombinant plasmid pJH92 obtained above as a gene source. First, the restriction enzymes EcoR I and Pst I were simultaneously treated to decompose the plasmid pJH92, and then a DNA fragment corresponding to 1.65 kilobase (kb) was isolated. The DNA fragment solution was extracted by removing impurities with phenol and chloroform, and then precipitated with ethanol to recover the DNA fragments. Meanwhile, pTTQ19, an expression vector, was treated with EcoR I and Pst I as restriction enzymes at the same time, and then cleaved for 2 hours at 37 ° C., extracted with phenol and chloroform to remove impurities and precipitated with ethanol. After purification was recovered. To this plasmid fragment, DNA fragments containing the lipase gene purified by the method described above were added and reacted in the presence of a DNA ligase of T4 bacterial phage for 3 hours at 16 ° C (recombinant plasmid in FIG. 4). The connected reaction solution was transformed into Escherichia coli strain JM103 (Escherichia coli JM103), Escherichia coli strain HB101 (E. coli 101), and Escherichia coli strain BL 21 (E. coli BL21), and then the selection medium. E. coli showing lipase activity was selected from (LB, ampicillin 100 μg / ml, tri-butyrin 5 mg / ml).

형질전환은 하나한(Hanahan)에 의해 공지된 방법(DNA Cloning, 제1권 109, 1985)을 사용하였다. 또한 리파제 유전자가 벡터내에 원하는 위치에 삽입되었는지의 여부를 조사하기 위해, 리파제 활성이 있는 앰피실린 내성 균주들을 LB 배지에서 37℃, 8-10시간 배양한 후 공지의 방법에 따라 플라스미드를 분리 정제하고 제한효소인 EcoR I과 Pst I 등으로 처리하여 아가로스 겔 전기 영동 후 결과를 확인하였다. 이와 같은 방법으로 제조된 재조합 플라스미드를 pTTY2라 명명하였다.Transformation used a method known by Hanahan (DNA Cloning, Vol. 1, 109, 1985). In addition, to investigate whether the lipase gene was inserted into the desired position in the vector, lipase-activated ampicillin-resistant strains were cultured in LB medium at 37 ° C. for 8-10 hours, and the plasmid was isolated and purified according to a known method. Treatment with the restriction enzymes EcoR I and Pst I and the like confirmed the results after agarose gel electrophoresis. The recombinant plasmid prepared in this manner was named pTTY2.

[실시예 5]Example 5

발현용 플라스미드 pTTY2를 이용한 대장균내에서의 리파제 유전자의 발현Expression of Lipase Gene in Escherichia Coli Using Expression Plasmid pTTY2

만들어진 플라스미드 pTTY2는 tac 프로모터에 의해 리파제 유전자의 발현이 조절된다. 특히 lac Iq유전자를 플라스미드 상에 지니고 있어 정상적인 배양조건하에서는 제한자(repressor)를 생산하여 tac 프로모터의 작용을 제한하게 된다. 따라서 대장균에서 리파제를 대량 발현시키기 위해 다음과 같은 조작을 거쳤다.The resulting plasmid pTTY2 regulates the expression of the lipase gene by the tac promoter. In particular, the lac I q gene has a plasmid on the plasmid, thereby producing a repressor under normal culture conditions, thereby limiting the action of the tac promoter. Therefore, the following manipulations were carried out to mass-express lipase in Escherichia coli.

먼저 재조합 플라스미드 pTTY2를 함유하는 대장균을 100㎍/ml의 앰피실린이 포함된 LB 액체 배지에 접종하고 37℃에서 8-10시간 통기 배양 후 계대하여 600nm에서 탁도가 0.5가 될 때까지 배양한 다음 IPTG(isopropyl-thiogalactopyranoside)를 최종 농도가 1.0mM이 되도록 첨가하고, 2.5-3시간 동안 더 배양하였다.First, E. coli containing the recombinant plasmid pTTY2 was inoculated into LB liquid medium containing 100 µg / ml ampicillin, followed by aeration for 8-10 hours at 37 ° C, followed by subculture at 600 nm until the turbidity became 0.5. (isopropyl-thiogalactopyranoside) was added to a final concentration of 1.0 mM and further incubated for 2.5-3 hours.

리파제의 대장균에서의 발현 여부는 배양액 1ml을 채취하여 SDS-폴리아크릴아미드 전기 영동을 수행하여 조사하였다(제5도 참조). 시험된 E. coli HB101. JM103, BL21중에서 JM103에 의한 리파제 생산은 재현성이 없고 대장균내에서 재조합 플라스미드의 안정성이 문제가 된다. 따라서 본 발명에서는 E. coli BL21을 선별하는 조작을 거쳐 E. coli BL21을 리파제 대량 생산균으로 선택하였으며 이 균주는 가장 높은 리파제 생산균으로 밝혀졌다.(pTTY2 플라스미드를 함유하는 E. coli BL21은 1990년 11월 14일 한국 과학기술연구원 유전공학센터에 KTCC 8498 P호로 기탁되어 적법한 절차에 의해 분양될 수 있다). 또한 HB101은 BL21에 비해 효소 생산성이 낮음을 알수 있었다. 발현된 리파제의 양은 농도계(densitometer)로 조사하였는데 그 결과는 총 대장균 단백질 함량의 약 40%에 해당하는 것으로 나타났다. 또한 생산되는 리파제는 대장균 세포질내에 봉입체(inclusion body)의 형태로 존재함을 전자현미경 사진을 통하여 확인하였다)(제6도 참조).The expression of lipase in Escherichia coli was examined by 1 ml of the culture medium and SDS-polyacrylamide electrophoresis (see FIG. 5). E. coli HB101 tested. The lipase production by JM103 in JM103 and BL21 is not reproducible and the stability of recombinant plasmid in E. coli is a problem. Therefore, in the present invention, E. coli BL21 was selected as the lipase mass producing bacterium through the operation of screening E. coli BL21. This strain was found to be the highest lipase producing bacterium. (E. coli BL21 containing pTTY2 plasmid was 1990 On November 14, 2014, it was deposited with KTCC 8498 P to the Genetic Engineering Center of the Korea Institute of Science and Technology and can be distributed by lawful procedure). HB101 also showed lower enzyme productivity than BL21. The amount of lipase expressed was examined by densitometer and the results corresponded to about 40% of the total E. coli protein content. In addition, the produced lipase was confirmed in the form of inclusion bodies in the E. coli cytoplasm through electron micrographs (see FIG. 6).

[실시예 6]Example 6

봉입체(inclusion body)의 분리 및 리파제 활성의 회복Isolation of Inclusion Body and Restoration of Lipase Activity

봉입체 형태로 생성된 효소는 활성을 지니고 있지 않다. 따라서 생물학적 활성을 가지는 효소로 전환하는 것이 필요하다. 본 발명에서 봉입체의 형태로 생산된 리파제의 효소 활성 회복은 Marston F.A.O의 공지된 방법(DNA Cloning. vol 3. IRL press. 1985)에 준하여 수행하였다.Enzymes produced in inclusion body form are not active. Therefore, it is necessary to convert to enzymes having biological activity. Enzyme activity recovery of the lipase produced in the form of inclusion bodies in the present invention was carried out according to the known method of Marston F.A.O (DNA Cloning. Vol 3. IRL press. 1985).

배양된 대장균을 원심분리하여 수확한 후 초음파처리시킨 다음 4000×g에서 10분간 원심분리하여 세포파편(cell debris)을 제거하였다. 이렇게하여 얻어진 세포 응집물들을 8M Urea로 용해시키고 이 용액을 희석용 완충용액에서 투석시킨 다음 리파제 활성을 측정하였다. 리파제 활성의 조사는 다음과 같이 수행되었다. 효소 반응을 위한 기질 용액의 제조는 공지된 앤더슨의 방법(Andersson: J. Dairy Sci. 62,361, 1979)에 따랐다. 50mM 인산나트륨 완충용액(pH 7.0)에 최종 농도가 5%가 되도록 아라비아 고무를 용해시켰다. 이 용액 45ml에 기질인 올리브유 5ml을 가한 다음 초음파처리를 10분간 수행하여 에멀션(emulsion)을 만들었다. 여기에 30ml H2O, 30ml CaCl2(0.075M), 20ml NaCl(3M), 20ml 타우로콜산 나트륨(15mg/ml)을 첨가하였다. 이렇게 만들어진 기질용액 2ml을 원하는 온도로 맞추고 미리 준비된 효소 용액을 첨가하여 일정시간 반응시켰다. 효소반응 후 6N HCl을 0.5ml 가하여 반응을 정지시킨 다음 공지된 지방산 정량법(Kwon et al : JAOCS, 63,89,1986)에 따라 생산된 지방산의 양을 측정하였다. 그리고 효소의 열안정성의 조사는 다음과 같이 수행되었다. 즉 1.5ml에 에펜도르프(eppendorf) 튜브에 효소 용액(2.8mg/ml)을 100㎕씩 분주한 다음 원하는 특정 온도에서 열처리를 수행하였다. 열처리한 효소 용액을 4℃에서 10분간 방치한 후 34℃에서 15분간 반응시켜 효소의 잔류 활성도를 측정하였다. 이 결과 생산된 리파제는 80℃, 95℃에서 60분씩 열처리하였을 때 잔류 활성도가 각각 85%, 70%인 내열성 라파제임을 알 수 있었다.The cultured E. coli was harvested by centrifugation, sonicated and centrifuged at 4000 × g for 10 minutes to remove cell debris. The cell aggregates thus obtained were lysed with 8M Urea and the solution was dialyzed in dilution buffer and the lipase activity was measured. Investigation of the lipase activity was performed as follows. The preparation of the substrate solution for the enzymatic reaction was according to the known Anderson method (Andersson: J. Dairy Sci. 62,361, 1979). The gum arabic was dissolved in 50 mM sodium phosphate buffer (pH 7.0) to a final concentration of 5%. 45 ml of this solution was added with 5 ml of olive oil as a substrate, followed by sonication for 10 minutes to form an emulsion. To this was added 30 ml H 2 O, 30 ml CaCl 2 (0.075 M), 20 ml NaCl (3 M), 20 ml sodium taurocholate (15 mg / ml). 2 ml of the substrate solution thus prepared was adjusted to a desired temperature and reacted for a predetermined time by adding a pre-prepared enzyme solution. After the enzyme reaction, 0.5 ml of 6N HCl was added to stop the reaction, and the amount of fatty acid produced was measured according to a known fatty acid quantitative method (Kwon et al: JAOCS, 63,89,1986). And the investigation of the thermal stability of the enzyme was carried out as follows. That is, 1.5 μl of an enzyme solution (2.8 mg / ml) was dispensed into an Eppendorf tube in 1.5 ml, and then heat-treated at a specific desired temperature. The heat treated enzyme solution was left at 4 ° C. for 10 minutes and then reacted at 34 ° C. for 15 minutes to determine the residual activity of the enzyme. As a result, when the lipase produced was heat-treated at 80 ° C. and 95 ° C. for 60 minutes, the lipase was 85% and 70%, respectively.

Claims (5)

리파제를 대량으로 생산하고 이 리파제 생성이 탁프로모터(tac promoter)의 조절하에 있게되는 플라스미드 pTTY2.Plasmid pTTY2, which produces large amounts of lipase and the lipase production is under the control of a tac promoter. 내열성 리파제를 코딩하는 아래의 뉴클레오타이드 서열.The nucleotide sequence below, encoding a heat resistant lipase. (a) 슈도모나스플루오레슨스(P. fluorescens) 유래의 내열성 리파제(lipase)를 코딩(coding)하는 유전자 단편을 사용하여 리파제 생산특성을 지닌 재조합 플라스미드 pJH92을 제조하고, (b)이 pJH92중 리파제 함유 유전자 단편을 탁프로모터(tac promotor)를 함유한 고발현용 플라스미드 pTTQ19에 연결하여 플라스미드 pTTY2를 제조하고, (c)이 플라스미드 pTTY2에 의해 대장균을 형질전환시키고, (d) 이 형질전환된 대장균을 배양하고 발현시켜, 발현된 대장균들로부터 리파제 봉입체를 추출분리한 다음 활성이 있는 리파제로 재전환(refolding)시킴을 특징으로 하는, 내열성 리파제의 대량 생산 방법.(a) a recombinant plasmid pJH92 having lipase production characteristics was prepared using a gene fragment encoding a heat resistant lipase derived from P. fluorescens, and (b) contains a lipase in pJH92. The gene fragment was linked to a high expression plasmid pTTQ19 containing a tac promotor to prepare plasmid pTTY2, (c) transforming Escherichia coli with plasmid pTTY2, and (d) culturing the transformed Escherichia coli And expressing, extracting and separating the lipase inclusion body from the expressed E. coli, and then refolding the active lipase into the active lipase. 제3항에 있어서, (a)단계에서 리파제 유전자를 클로닝할 때 먼저 트리-뷰티린(tributyrin)을 함유하는 배지에서 에스테라제 활성을 보이는 균주를 선별한 다음 올리브유(olive oli)과 로다민 비(rhodamine B)색소가 함유된 배지에서 다시 선별하여 리파제 활성만을 갖는 균주를 채택하는 것을 포함하는 방법.The method according to claim 3, wherein when cloning the lipase gene in step (a), a strain showing esterase activity in a medium containing tri-butyrin is first selected, followed by olive oli and rhodamine ratios. (rhodamine B) Reselection in a medium containing the pigment to adopt a strain having only lipase activity. 제3항에 있어서, 슈도모나스플루오레슨스(P. fluorescens)의 내열성 리파제(lipase)를 코딩하는 유전자가 아래의 뉴클레오타이드 서열인 방법.4. The method according to claim 3, wherein the gene encoding the heat resistant lipase of P. fluorescens is the following nucleotide sequence.
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