KR20240100026A - 병렬 또는 다중반응검지법-질량분석 기반 표적 당 펩타이드 정량화 방법 - Google Patents
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Abstract
분석장치가 샘플에 대한 질량 스펙트럼 데이터를 입력받는 단계; 분석장치가 상기 질량스펙트럼의 정보로부터 MS스펙트럼(Q1) 및 MS/MS스펙트럼(Q3)의 정보를 추출하는 단계; 분석장치가 상기 Q1 및 Q3 정보를 이용해서 제1값(=Q1/Q3)을 계산하는 단계; 분석장치가 별도의 데이터베이스로부터 목표 당 펩타이드의 MS스펙트럼(Q'1)와 MS/MS스펙트럼 정보(Q'3)를 입력받는 단계; 분석장치가 상기 Q'1 및 Q'3 정보를 이용하여 제2값(=Q'1/Q'3)을 계산하는 단계; 및 분석장치가 상기 제1값과 제2값을 비교하여 상기 샘플내에 당 펩타이드를 분석하는 단계; 를 포함하는 질량분석기를 이용한 당 펩타이드 정량화 방법.
Description
이하 설명하는 기술은 질량분석기를 이용한 스펙트럼 결과로부터 당 펩타이드를 자동으로 정성, 정량 분석하는 방법에 대한 것이다.
우리 몸의 세포형질을 결정하는 중요 요소는 유전자와 단백질이다. 인간의 혈액시료는 수많은 단백질들의 혼합체이며, 이중에서 50%는 당단백질이라고 알려져 있다.
암은 세포분열을 통한 증식과정에서 고유의 단백질 및 당단백질을 만들어 낸다. 최근혈액에서 암세포가 분비하는 고유의 단백질/당단백질을 종양표지자로 하여 암을 진단하는 방법을 이용하는 바이오마커가 활용되고 있다.
유전자 분석은 NGS(Next Generation Sequencing)기술로 비교적 쉽게 얻을 수 있지만, 펩타이드의 정량[특정 단백질 양(농도) 측정] 분석은 속도 및 규모에서 제한적으로 이뤄지고 있다.
현재 종양표지자 검사는 암세포가 분비한 당 펩타이드(항원)과 항체의 반응으로 농도를 측정한다. 이때 당 펩타이드의 다양성 때문에 종양표지자 마다 새로운 항체 분석법을 개발하여야 하므로 많은 시간과 비용을 든다. 또한 같은 검사를 해도 각 분석실험실마다 편차가 있어 동일한 실험값을 얻기도 어려워 한계가 있다.
이하 설명하는 발명은 위 과제를 해결하기 위하여, 분석장치가 샘플에 대한 질량 스펙트럼 데이터를 입력받는 단계; 분석장치가 상기 질량스펙트럼의 정보로부터 MS스펙트럼(Q1) 및 MS/MS스펙트럼(Q3)의 정보를 추출하는 단계;분석장치가 상기 Q1 및 Q3 정보를 이용해서 제1값(=Q1/Q3)을 계산하는 단계; 분석장치가 별도의 데이터베이스로부터 목표 당 펩타이드의 MS스펙트럼(Q'1)와 MS/MS스펙트럼 정보(Q'3)를 입력받는 단계; 분석장치가 상기 Q'1 및 Q'3 정보를 이용하여 제2값(=Q'1/Q'3)을 계산하는 단계; 분석장치가 상기 제1값과 제2값을 비교하여 상기 샘플내에 당 펩타이드를 분석하는 단계를 포함하는 질량분석기를 이용한 당 펩타이드 정량화 방법을 제공한다.
이하 설명하는 발명은 위 과제를 해결하기 위하여, 샘플내의 질량 스펙트럼 데이터를 입력받는 입력장치; 목표 당 펩타이드의 스펙트럼 데이터를 저장해 놓은 저장장치; 상기 샘플내의 질량 스펙트럼 데이터와 상기 목표 당 펩타이드의 스펙트럼 데이터에서 MS스펙트럼(Q1) 및 MS/MS 스펙트럼(Q3)의 정보를 추출하여 Q1/Q3값을 각각 계산하고 양자를 비교하여 샘플내의 당 펩타이드를 정량화 하는 연산장치를 포함하는 당 펩타이드 분석장치를 제공한다.
이하 설명하는 발명에 따르면 인간의 혈액샘플로부터 당 펩타이드가 무엇이 있는지 파악할 수 있다. 즉 병렬 또는 다중 반응 검지법을 하면 극미량의 1ug의 시료를 한번의 검사로 100~300여개의 당 펩타이드를 한번에 정량화 할 수 있으며, 이때 (당)펩타이드가 암표지자인지 밝혀지면 수십여가지의 암도 밝혀낼 수 있다. 특히 단백질에 비해 상대적으로 농도가 낮은 당단백질을 정량(Quantitation) 분석할 수 있는 생물정보처리 기술이 가능하다.
도1은 샘플로부터 당 펩타이드를 분석하는 시스템의 대한 예이다.
도2은 탄뎀 스펙트럼의 구조를 나타낸 예이다.
도3은 분석장치가 당 펩타이드를 정량화 하는 과정을 도시한 예이다.
도4은 당 펩타이드를 정량화하는 구체적인 과정을 도시한 예이다.
도5은 샘플로부터 당 펩타이드를 분석하는 장치에 대한 예이다.
도2은 탄뎀 스펙트럼의 구조를 나타낸 예이다.
도3은 분석장치가 당 펩타이드를 정량화 하는 과정을 도시한 예이다.
도4은 당 펩타이드를 정량화하는 구체적인 과정을 도시한 예이다.
도5은 샘플로부터 당 펩타이드를 분석하는 장치에 대한 예이다.
이하 설명하는 기술은 다양한 변경을 가할 수 있고 여러 가지 실시예를 가질 수 있는 바, 특정 실시예들을 도면에 예시하고 상세하게 설명하고자 한다. 그러나, 이는 이하 설명하는 기술을 특정한 실시 형태에 대해 한정하려는 것이 아니며, 이하 설명하는 기술의 사상 및 기술 범위에 포함되는 모든 변경, 균등물 내지 대체물을 포함하는 것으로 이해되어야 한다.
제1, 제2, A, B 등의 용어는 다양한 구성요소들을 설명하는데 사용될 수 있지만, 해당 구성요소들은 상기 용어들에 의해 한정되지는 않으며, 단지 하나의 구성요소를 다른 구성요소로부터 구별하는 목적으로만 사용된다. 예를 들어, 이하 설명하는 기술의 권리 범위를 벗어나지 않으면서 제1 구성요소는 제2 구성요소로 명명될 수 있고, 유사하게 제2 구성요소도 제1 구성요소로 명명될 수 있다.
및/또는 이라는 용어는 복수의 관련된 기재된 항목들의 조합 또는 복수의 관련된 기재된 항목들 중의 어느 항목을 포함한다. 본 명세서에서 사용되는 용어에서 단수의 표현은 문맥상 명백하게 다르게 해석되지 않는 한 복수의 표현을 포함하는 것으로 이해되어야 하고, "포함한다" 등의 용어는 설명된 특징, 개수, 단계, 동작, 구성요소, 부분품 또는 이들을 조합한 것이 존재함을 의미하는 것이지, 하나 또는 그 이상의 다른 특징들이나 개수, 단계 동작 구성요소, 부분품 또는 이들을 조합한 것들의 존재 또는 부가 가능성을 배제하지 않는 것으로 이해되어야 한다.
도면에 대한 상세한 설명을 하기에 앞서, 본 명세서에서의 구성부들에 대한 구분은 각 구성부가 담당하는 주기능 별로 구분한 것에 불과함을 명확히 하고자 한다. 즉, 이하에서 설명할 2개 이상의 구성부가 하나의 구성부로 합쳐지거나 또는 하나의 구성부가 보다 세분화된 기능별로 2개 이상으로 분화되어 구비될 수도 있다. 그리고 이하에서 설명할 구성부 각각은 자신이 담당하는 주기능 이외에도 다른 구성부가 담당하는 기능 중 일부 또는 전부의 기능을 추가적으로 수행할 수도 있으며, 구성부 각각이 담당하는 주기능 중 일부 기능이 다른 구성부에 의해 전담되어 수행될 수도 있음은 물론이다. 또, 방법 또는 동작 방법을 수행함에 있어서, 상기 방법을 이루는 각 과정들은 문맥상 명백하게 특정 순서를 기재하지 않은 이상 명기된 순서와 다르게 일어날 수 있다. 즉, 각 과정들은 명기된 순서와 동일하게 일어날 수도 있고 실질적으로 동시에 수행될 수도 있으며 반대의 순서대로 수행될 수도 있다.
이하 설명하는 기술은 샘플에서 당 펩타이드를 분석하기 위한 방법이다.
이하 설명에서 사용하는 용어에 대하여 설명한다. 용어에 대한 별다른 정의가 없는 경우 해당 용어는 해당 분야에서 널리 이해되는 사전적 의미로 해석될 수 있다.
"샘플"은 일반적으로 당 펩타이드를 분석하고자 하는 대상이다. 일반적으로 혈액(혈청)이 될 수 있다. 나아가, 샘플은 당 펩타이드를 분석하고자 하는 다른 형태의 시료일 수도 있다.
이하 설명에서 분석 대상은 기본적으로 인간을 의미한다. 나아가 분석 대상은 동물, 식물, 곤충, 효모 등이 될 수도 있다.
"가수분해"는 당단백질을 당 펩타이드로 분해하는 과정을 말한다. 상기 가수분해 통상의 기술분야에 잘 알려진 방법이라면 어떠한 방법을 사용하여 수행될 수 있다. 특히, 상기 가수분해는 가수분해 효소를 사용하여 수행될 수 있고, 이는 구체적으로, 트립신(trypsin), 아르기닌 C(Arg-C), 아스파르트산 N(Asp-N), 글루탐산 C(Glu-C), 라이신 C(Lys-C), 키모트립신(chymotrypsin) 및 프로테나아제 K(proteinase K)로 구성된 군으로부터 선택된 효소로 수행될 수 있다.
“액체크로마토그래피(liquid chromatography, LC)”는 크로마토그래피의 한 종류로써, 이동상(mobile phase)을 액체를 이용하는 것을 말한다.
“추출된 이온 크로마토그램(extracted ion chromatograms, XIC or EIC)”는 전체 크로마토그램 중에서 하나 또는 그 이상의 분석물질을 대표하는 m/z값들을 기준으로 특정 이온을 추출하여 보여주는 크로마토그램을 말한다.
“질량 분석기”는 물질의 질량을 질량 대 전하의 비로 측정하는 기기를 말한다. 질량분석기는 분석하고자 하는 물질을 이온화하여 전하를 갖게 만들어 준 뒤 질량 대 전하비에 따라 물질을 분리하여 어떤 신호가 있는지 보여준다.
"탄뎀 스펙트럼(MS/MS)"은 전체 질량 스펙트럼(MS) 중에서 관심있는 이온 또는 상대적으로 감도가 높은 이온들을 선택하여 분석한 스펙트럼을 의미한다. 탄뎀 스펙트럼은 CID(collision-induced dissociation) 또는 HCD(Higher-energy Ctrapdissociation)-MS/MS 스펙트럼일 수 있다.
“b 이온”, “y 이온”은 펩타이드의 아마이드결합(-CONH-) 쪼개질?? 나오는 조각에 이름을 붙인 것을 말한다. 즉 하나의 펩타이드의 아마이드 결합이 쪼개지면 b이온과 y이온이 생성된다. “b 이온” 이란 아마이드 결합(-CONH-)이 분해될 때 CO결합을 포함하는 조각을 말한다. “y 이온”이란 아마이드 결합(-COHN-)이 분해될 때 NH결합을 포함하는 조각을 말한다.
이하 분석장치가 스펙트럼 데이터를 분석하여 당 펩타이드를 분석한다고 설명한다. 분석장치는 일정한 데이터 처리가 가능한 다양한 장치로 구현될 수 있다. 예컨대, 분석장치는 PC, 네트워크상의 서버, 스마트 기기, 전용 프로그램이 임베딩된 칩셋 등으로 구현될 수 있다.
도1은 당 펩타이드 정량화를 위한 분석 시스템에 대한 예이다.
도1의 샘플은 사용자가 당 펩타이드가 어느정도 있는지 분석하기 위한 것을 말한다. 이는 인간의 혈액이나 암세포에서 추출한 용액이 될 수도 있다.
분석하고자 하는 대상 샘플에 전처리 과정을 거칠 수 있다(100). 이 전처리 과정에 가수분해 과정이 포함될 수 있다. 가수분해 과정을 거치면 샘플의 펩타이드가 당 펩타이드로 분해될 수 있다.
질량분석기(200)는 시료에 대한 질량분석을 수행한다. 여기서 질량 분석기는 액체크로마토그래피(liquid chromatography)와 결합된 LC-MS/MS일 수 있다. 질량분석기(200)는 질량분석 결과로 디지털 형태의 질량 스펙트럼을 생성할 수 있다. 질량분석기(200)는 생성한 질량 스펙트럼 데이터를 별도의 데이터 베이스에 저장할 수도 있다.
데이터베이스(300)은 기존의 당 펩타이드의 관련된 정보를 저장한다. 상기 정보에는 당 펩타이드의 질량분석결과가 포함될 수 있다.
분석장치(400)는 질량분석기로부터 온 스펙트럼 데이터를 분석한다. 분석장치는 데이터베이스(300)로 부터 저장된 정보를 전송받거나, 내부 저장장치에 데이터베이스(300)을 별도로 저장해 둘 수 있다. 분석장치(400) 질량분석기(200)부터온 샘플의 스펙트럼 데이터와 데이터베이스(300)으로부터 온 정보를 비교분석 할 수 있다. 비교한 데이터를 통하여 당 펩타이드가 무엇이고 그 양이 어느정도 인지 파악할 수 있다.
도1에서 사용자(A)는 분석장치(400)를 이용하여 스펙트럼 데이터를 분석하여 당 펩타이드를 분석할 수 있다. 분석장치(400)는 유선 또는 무선 네트워크를 통해 고분해능 질량분석기(200)과 데이터베이스(300)으로 부터 스펙트럼 데이터를 입력받을 수 있다. 경우에 따라서는 분석장치(400)는 고 분해능 질량분석기(200)와 물리적으로 연결된 장치일 수도 있다.
도2는 탄뎀 질량분석기(MS/MS) (200)을 대략적으로 도시한 예이다.
이하 설명하는 기술의 일 구현예에서는 표적화 된 MS기술인 Multiple reaction monitoring이 사용될 수 있다. 예를 들어 3개의 Quadrupole(Q1, Q2, Q3)에 이온이 유도되어 질량/전하비율에 따라 분석하는 방식이 이용될 수 있다. 샘플은 먼저 Q1으로 들어간다. Q1은 m/z의 값에 따라 특정한 값만을 통과시키는 필터의 역할을 한다. 이에 특정한 m/z값을 가진 펩타이드 이온만이 Q1을 통과하고, 나머지는 통과하지 못하게 된다. 이렇게 통과된 펩타이드는 Q2로 전달된다. Q2는 충돌관의 역할을 하는데 여기에 도달한 전구체이온(precursor ion)은 내부충돌 기체와 충돌하여 쪼개져 다양한 길이를 가지는 펩타이드 이온이 된다(product ion). 이 펩타이드 이온은 Q3로 보내진다. Q3는 Q1과 마찬가지로 m/z에 값에 따라 특정한 값만 통과시키는 필터의 역할을 하고, 나머지는 통과하지 못하게 한다. Q3을 통과함에 따라 특정한 m/z값을 가진 펩타이드 단편이 선별되고, 이는 검출기에서 디지털 신호로 전환된다.
탄뎀 질량분석기(MS/MS)을 이용하면 첫번째 Quadrupole와 세번째 Quadrupole을 통하여 2개의 스펙트럼 데이터를 얻을 수 있다.
도3은 분석장치가(400)가 당 펩타이드를 정량하는 과정을 도시한 예이다.
분석장치(400)는 초기 질량 스펙트럼 데이터를 입력받는다. 초기 질량 스펙트럼 데이터는 질량 분석기가 샘플을 분석하여 생성한 데이터를 말한다. 분석장치는 초기 질량 스펙트럼 데이터에서 MS(질량 스펙트럼) 데이터(Q1)와 탄뎀 스펙트럼에서 MS/MS 데이터(Q3)를 추출할 수 있다. 예컨대, 분석장치는 RAWConverterv1.1 (The Scripps Research Institute, 미국)을 이용하여 초기 질량 스펙트럼데이터에서 ms1(MS) 및 ms2(MS/MS) 파일을 추출할 수 있다.
이때 추출된 Q1값과 Q3값으로부터 Q1/Q3값을 계산할 수 있다. 각 당 펩타이드는 지문과 같은 고유의 Q1/Q3을 값을 가지고 있다. 따라서 당 펩타이드의 종류마다 고유의 Q1/Q3을 가지고 있으며 이는 겹치지 아니한다. 이를 통하여 당 펩타이드를 분석하는데 이용될 수 있다.
분석장치(400)는 데이터베이스로부터(300)으로부터 기존의 실험등의 결과로 축척 된 각 당 펩타이드의 정보를 전송받는다. 이 정보에는 각 당 펩타이드마다 질량분석기를 통하여 분석된 MS스펙트럼(Q'1), MS/MS스펙트럼(Q'3)이 포함되어 있을 수 있다. 분석장치는 Q'1 및 Q'3 값을 통하여 Q'1/Q'3값을 계산할 수 있다.
분석장치(400)는 상기 샘플로부터 추출되어 계산된 Q1/Q3값과 데이터베이스(300)으로부터 계산된 Q'1/Q'3값을 비교하여 샘플내에 들어있는 펩타이드가 무엇인지 분석할 수 있다. 펩타이드를 분석하는 때에는 아래와 같은 수학식1을 이용하여 펩타이드를 분석할 수 있다. 사용자는 수학식1에 의하여 계산된 스펙트럼 유사도를 이용하여 참조패턴과 가장 유사한 표적 당 펩타이드의 탄뎀스펙트럼을 선택하고, 선택된 스펙트럼으로부터 Q1/Q3의 XIC(Extracted Ion Chromatograms)을 계산하여 당 펩타이드를 정량 분석할 수 있다. 이때 당 펩타이드의 양에 대한 정보, 당 사슬의 종류, 당 사슬에 부가되는 변형등에 대한 정보도 함께 파악할 수 있다.
(S: 탄뎀질량분석 스펙트럼의 질량(x)와 상대적인 피크강도(y))
(Si: (x,y) 매트릭스이며, x는 n번째의 상대적인 피크 강도, y는 n번?? 피크의 질량)
(S'i: (x',y') 매트릭스이며, x'는 n번째의 상대적인 피크 강도, y'은 n번째 피크의 질량)
도4는 당 펩타이드를 정량하는 과정을 구체적으로 나타난 예이다.
먼저 사용자는 미리 각 당백질마다 실험을 수행하여 데이터베이스를 구축한다(610). 이 실험에 MS/MS 분석이 포함될 수 있다. 상기 MS/MS의 수행결과 나오는 실험결과를 전하(charge), 펩타이드 서열(sequence)을 등을 기준으로 하여 당 펩타이드를 미리 분류해 둘 수 있다. 상기 MS/MS의 수행결과 나오는 실험결과을 통하여 각 당 펩타이드마다 MS/MS 분석을 할때 검출되는 Oxnonium ion, B ion, Y ion의 정보를 미리 저장해 둘 수도 있다. 데이터베이스에는 당 펩타이드마다의 머무름 시간(Retention Times)의 정보가 저장될 수 도 있다.
사용자는 보고자하는 샘플에서 질량분석기를 통하여 MS데이터와(MS1) MS/MS데이터(MS2)을 얻는다(620).
MS/MS의 분석결과(MS2 spectra)에서 나오는 결과와 상기 데이터베이스 나오는 결과를 비교분석 한다(630). 비교하는 과정에서 수학식1이 이용될 수 있다. 비교분석 결과 참조패턴과 유사도가 0.98이상이 된다고 판단되면 해당 MS/MS데이터를 선택할 수 있다(640). 선택된 MS/MS 스펙트럼으로부터 Oxonium이온, B이온, Y이온의 XICs(Extracted ion chromatogram)을 파악할 수 있다(650).
데이터베이스에 저장된 결과는 XML파일로 변환하여 기존의 데이터베이스(SkyLine, Spectronaut 등)에서 당 펩타이드가 무엇인지 확인할 수 있다(660).
상기 선택된 스펙트럼으로부터 파악된 Oxonium이온, B이온, Y이온의 XICs의 값과, 상기 수동적으로 확인한 데이터와 함께 분석하여 상기 샘플내에서의 당 단백질을 정량할 수 있다(670)
도5은 당 펩타이드를 분석하는 분석장치에 대한 예이다.
분석장치는 전술한 분석장치(도1의 400)에 해당한다.
분석장치(400)는 물리적으로 다양한 형태로 구현될 수 있다. 예컨대, 분석장치(400)는 PC와 같은 컴퓨터 장치, 네트워크의 서버, 데이터 처리 전용 칩셋 등의 형태를 가질 수 있다.
분석장치(400)는 저장장치(410), 메모리(420), 연산장치(430), 인터페이스 장치(440), 통신장치(450) 및 출력장치(460)를 포함할 수 있다.
저장장치(410)는 초기 질량 스펙트럼 데이터에서 당 펩타이드를 분석하는 프로그램을 저장할 수 있다.
저장장치(410)는 당 펩타이드를 동정하기 위한 이론적인 MS1데이터 및 MS/MS 데이터의 값을 저장할 수 있다.
저장장치(410)는 질량분석기부터 온 분석 결과를 저장할 수 있다.
메모리(420)는 분석장치(400)가 질량 스펙트럼 데이터를 분석하는 과정에서 생성되는 데이터 및 정보 등을 저장할 수 있다.
연산 장치(430)는 질량 스펙트럼 데이터에서 MS데이터 및/또는 MS/MS데이터)를 추출할 수 있다.
연산 장치(430)는 추출된 MS데이터(Q1)과 MS/MS데이터(Q3)을 통하여 Q1/Q3값을 계산할 수 있다.
연산 장치(430)은 계산된 Q1/Q3값을 비교하여 샘플속의 당 펩타이드가 무엇인지 정량화 할 수 있다.
인터페이스 장치(440)는 외부로부터 일정한 명령 및 데이터를 입력 받는 장치이다.
인터페이스 장치(440)는 물리적으로 연결된 입력 장치 또는 외부 저장장치로부터 초기 스펙트럼 데이터를 입력받을 수 있다.
인터페이스 장치(440)는 사용자로부터 별도의 실험적 데이터를 입력받을 수도 있다.
인터페이스 장치(440)는 분석 결과를 외부 객체에 전달할 수도 있다.
통신장치(450)는 유선 또는 무선 네트워크를 통해 일정한 정보를 수신하고 전송하는 구성을 의미한다.
통신장치(450)는 외부 객체로부터 초기 스펙트럼 데이터를 수신할 수 있다. 통신장치(450)는 분석에 필요한 별도의 실험적 데이터를 수신할 수도 있다. 또는 통신장치(450)는 분석 결과를 사용자 단말과 같은 외부객체에 송신할 수도 있다.
인터페이스 장치(440) 및 통신장치(450)는 사용자 또는 다른 물리적 객체로부터 일정한 데이터를 주고받는 구성이므로, 포괄적으로 입출력장치라고도 명명할 수 있다. 정보 내지 데이터 입력 기능에 한정하면 인터페이스 장치(440) 및 통신장치(450)는 입력장치라고 할 수도 있다.
출력장치(460)는 일정한 정보를 출력하는 장치이다.
출력장치(460)는 데이터 처리 과정에 필요한 인터페이스, 분석 결과, 분석 내용에 대한 시각 자료 등을 출력할 수 있다.
비일시적 판독 가능 매체란 레지스터, 캐쉬, 메모리 등과 같이 짧은 순간 동안 데이터를 저장하는 매체가 아니라 반영구적으로 데이터를 저장하며, 기기에 의해 판독(reading)이 가능한 매체를 의미한다.
구체적으로는, 상술한 다양한 어플리케이션 또는 프로그램들은 CD, DVD, 하드 디스크, 블루레이 디스크, USB, 메모리카드, ROM (read-only memory), PROM (programmable read only memory), EPROM(Erasable PROM, EPROM) 또는 EEPROM(Electrically EPROM) 또는 플래시 메모리 등과 같은 비일시적 판독 가능 매체에 저장되어 제공될 수 있다.
일시적 판독 가능 매체는 스태틱 램(Static RAM，SRAM), 다이내믹 램(Dynamic RAM，DRAM), 싱크로너스 디램 (Synchronous DRAM，SDRAM), 2배속 SDRAM(Double Data Rate SDRAM，DDR SDRAM), 증강형 SDRAM(Enhanced SDRAM，ESDRAM), 동기화 DRAM(Synclink DRAM，SLDRAM) 및 직접 램버스 램(Direct Rambus RAM，DRRAM) 과 같은 다양한 RAM을 의미한다.
본 실시예 및 본 명세서에 첨부된 도면은 전술한 기술에 포함되는 기술적 사상의 일부를 명확하게 나타내고 있는 것에 불과하며, 전술한 기술의 명세서 및 도면에 포함된 기술적 사상의 범위 내에서 당업자가 용이하게 유추할 수 있는 변형예와 구체적인 실시례는 모두 전술한 기술의 권리범위에 포함되는 것이 자명하다고 할 것이다.
Claims (6)
- 분석장치가 샘플에 대한 질량 스펙트럼 데이터를 입력받는 단계;
분석장치가 상기 질량스펙트럼의 정보로부터 MS스펙트럼(Q1) 및 MS/MS스펙트럼(Q3)의 정보를 추출하는 단계;
분석장치가 상기 Q1 및 Q3 정보를 이용해서 제1값(=Q1/Q3)을 계산하는 단계;
분석장치가 별도의 데이터베이스로부터 목표 당 펩타이드의 MS스펙트럼(Q'1)와 MS/MS스펙트럼 정보(Q'3)를 입력받는 단계;
분석장치가 상기 Q'1 및 Q'3 정보를 이용하여 제2값(=Q'1/Q'3)을 계산하는 단계; 및
분석장치가 상기 제1값과 제2값을 비교하여 상기 샘플내에 당 펩타이드를 분석하는 단계; 를 포함하는
질량분석기를 이용한 당 펩타이드 정량화 방법. - 청구항 1항에서
분석장치가 상기 샘플과 상기 데이터 베이스에서 당 펩타이드의 머무름시간(retention time), Oxonium 이온, B 이온, Y 이온에 대한 정보를 더 추출하고 이를 더 고려하여 샘플내의 당 펩타이드를 분석하는 것을 특징으로 하는
질량분석기를 이용한 당 펩타이드 정량화 방법. - 청구항1항에서
상기 샘플내에 당 펩타이드를 비교하는 단계는 아래의 식을 이용하여 비교하는 것을 특징으로 하는 질량분석기를 이용한 당 펩타이드 정량화 방법
(S: 탄뎀질량분석 스펙트럼의 질량(x)와 상대적인 피크강도(y)
(Si: (x,y) 매트릭스이며, x는 n번째의 상대적인 피크 강도, y는 n번?? 피크의 질량)
(S'i: (x',y') 매트릭스이며, x'는 n번째의 상대적인 피크 강도, y'은 n번째 피크의 질량)
- 청구항 3항에서,
상기 식으로부터 계산된 값을 이용하여 참조 패턴과 표적 당 펩타이드의 탄뎀 스펙트럼을 선택하고, 선택된 스펙트럼으로부터 XIC(Extracted Ion chromatograms)을 자동으로 계산하여 정량분석하는 것을 특징으로 하는
질량분석기를 이용한 당 펩타이드 정량화 방법. - 청구항 1항에서,
상기 샘플은 가수분해하여 수득 된 당 펩타이드인 것을 특징으로 하는 질량분석기를 이용한 당 펩타이드 정량화 방법.
- 샘플내의 질량 스펙트럼 데이터를 입력받는 입력장치;
목표 당 펩타이드의 스펙트럼 데이터를 저장해 놓은 저장장치; 및
상기 샘플내의 질량 스펙트럼을 통하여 MS스펙트럼(Q1), MS/MS스펙트럼(Q3)데이터를 추출하여 제1값(=Q1/Q3)을 계산하고, 상기 목표 당 펩타이드의 스펙트럼 데이터를 통하여 MS스펙트럼(Q'1), MS/MS 스펙트럼(Q'3) 데이터를 추출하여 제2값(=Q'1/Q'3)을 계산한 후 제1값과 제2값을 비교하여 샘플내의 당 펩타이드를 정량화 하는 연산장치; 를 포함하는 당 펩타이드 분석장치.
Publications (1)
| Publication Number | Publication Date |
|---|---|
| KR20240100026A true KR20240100026A (ko) | 2024-07-01 |
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