KR20240072312A - 한우 암소의 번식 관련 형질 예측용 snp 마커 조성물 및 이의 용도 - Google Patents
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Abstract
본 발명은 한우 암소의 번식 관련 형질 예측용 SNP 마커 조성물 및 이의 용도에 관한 것으로, 본 발명의 SNP 마커 조성물을 이용하면 한우 암소의 번식과 관련된 다양한 형질을 동시에 분석할 수 있으므로, 우수한 번식우 선별, 번식효율 증대 및 종의 개량에 유용하게 활용될 수 있다.
Description
본 발명은 한우 암소의 번식 관련 형질 예측용 SNP 마커 조성물 및 이의 용도에 관한 것이다.
한우는 우리나라 고유 품종으로, 우수한 육질을 보유하고 있어 일본의 화우와 더불어 고품질의 소고기로 자리매김하고 있다. 한우는 성질이 온순하고 질병에 강한 저항성을 가지고 있어 농경 시작과 함께 일소로 사용되었고, 급격한 경제 발전과 함께 한우의 역할은 육용으로 대체되었다. 현재 한우는 우리나라에서 사용되고 있는 육우 중 대부분을 차지하고 있으며, 소고기의 소비가 급증함에 따라 한우의 육종 개량을 추진할 필요가 있다.
가축개량은 전통적으로 개량목표 달성에 적합한 가축을 종축으로 선발하고, 선발한 가축을 적절한 교배체계를 통하여 능력이 우수한 후대를 생산하는 방식으로 이루어져 왔다. 우수한 개체를 선발하는 기술은 단순히 선발하고자 하는 개체의 표현형에 근거하여 선발하던 방식에서 개체 자신의 능력과 혈연관계가 있는 개체의 능력을 모두 이용하여 개체별 유전능력을 추정하고 이를 바탕으로 선발하는 방법으로 발전해 왔다. 한우의 개량은 주로 산육 또는 도체 형질 등의 생산 형질에 초점을 맞추어 이루어져 왔으나, 송아지 생산에 직접적으로 영향을 미치는 번식 형질 및 생산비 절감을 위한 사료 효율 형질에 관한 관심은 미비한 실정이다. 이러한 이유는 번식 형질 개량을 위해서 기록이 우선시 되어야 하는데, 번식 형질에 대해 기록을 하기 위해서는 오랜 시간이 필요하며, 번식 형질에 대한 정의와 체계가 없다면 번식 형질의 수집은 더 어렵기 때문이다.
한우의 번식 형질은 암소의 번식 형질과 수소의 번식 형질로 구분할 수 있으며, 암소의 번식 형질은 크게 생식 형질과 분만 형질로 나눌 수 있다. 생식 형질은 암소가 태어나서 도태되기 전까지의 번식기록을 통해 얻을 수 있는 것으로, 생애 첫 분만까지의 일령, 첫 수정에 의한 수태율, 분만일, 분만간격(calving interval) 및 분만 후 첫 수정까지의 일령 등이 있으며, 분만 형질에는 송아지 크기, 분만 난이도 등이 있다.
최근 DNA 분석기술의 발달로 인해 유전체 수준에서 변이를 분석하고, 이를 이용하여 개체 선발 및 집단 내 유전적 특성에 관한 연구가 가능해졌다. 체계적인 데이터 축적을 통한 연구가 이루어짐으로써 좀 더 정확하게 유전능력을 계산하고, 이를 농가에 제공하게 된다면 농가소득 증대에 도움이 되고, 국가단위로는 한우산업의 경쟁력 강화를 통한 자급률 향상에 기여할 수 있을 것이다.
한편, 한국공개특허 제2009-0065412호에는 '돼지의 성장, 육질 및 번식 형질과 관련된 유전자를 조기에 진단할 수 있는 cDNA chip과 그 개발방법 및 상기 칩을 이용한 성장, 육질 및 번식 형질이 우수한 종돈선별방법'이 개시되어 있으나, 본 발명의 한우 암소의 번식 관련 형질 예측용 SNP 마커 조성물 및 이의 용도에 대해서는 기재된 바가 없다.
본 발명은 상기와 같은 요구에 의해 도출된 것으로서, 본 발명자들은 한우 암소 시료의 게놈 DNA를 추출하고 고밀도 Illumina bovine 50K SNPs 어레이를 이용하여 SNP(single nucleotide polymorphism)를 분석하였다. 각각의 SNP에 대하여 번식 관련 형질(초산일령, 송아지 생시체중, 임신기간, 수태당 인공수정횟수, 분만간격)과의 연관분석을 위해 전장유전체연관분석(GWAS)을 수행한 결과, 번식 관련 형질에 대해 통계적 유의성을 가지는 97개의 SNPs 마커를 발굴함으로써, 본 발명을 완성하였다.
상기 과제를 해결하기 위해, 본 발명은 서열번호 1 내지 97의 염기서열로 이루어진 폴리뉴클레오티드에 있어서, 각각의 염기서열 중 36번째에 위치한 SNP(single nucleotide polymorphism) 염기를 포함하는 8개 이상의 연속된 뉴클레오티드로 구성된 폴리뉴클레오티드 또는 이의 상보적 폴리뉴클레오티드를 포함하는, 한우 암소의 번식 관련 형질 예측용 SNP 마커 조성물을 제공한다.
또한, 본 발명은 상기 SNP 염기를 포함하는 폴리뉴클레오티드를 증폭하기 위한, 한우 암소의 번식 관련 형질 예측용 프라이머 세트를 제공한다.
또한, 본 발명은 상기 프라이머 세트 및 증폭 반응을 수행하기 위한 시약을 포함하는, 한우 암소의 번식 관련 형질 예측용 키트를 제공한다.
또한, 본 발명은 한우 암소 개체로부터 게놈 DNA를 분리하는 단계; 및 상기 분리된 게놈 DNA를 주형으로, 서열번호 1 내지 97의 염기서열로 이루어진 폴리뉴클레오티드의 각 36번째의 SNP 위치 염기의 유전자형을 결정하는 단계;를 포함하는, 한우 암소의 번식 관련 형질을 예측하는 방법을 제공한다.
또한, 본 발명은 상기 SNP 염기를 포함하는 폴리뉴클레오티드 또는 이의 cDNA를 포함하는, 한우 암소의 번식 관련 형질 예측용 마이크로어레이를 제공한다.
본 발명의 SNP 마커 조성물을 이용하면 한우 암소의 번식과 관련된 다양한 형질을 동시에 분석할 수 있으므로, 우수한 번식우 선별, 번식효율 증대 및 종의 개량에 유용하게 활용될 수 있다.
도 1은 한우 암소 집단의 1산차 초산일령(A) 및 송아지 생시체중(B) 형질에 따른 GWAS 결과를 토대로 작성한 manhattan plot(위) 및 QQ-plot(아래)이다. manhattan plot에서 보라색 점선은 본페로니 기준선을, 회색 점선은 FDR(false discovery rate) 기준선을, 빨간점은 각 형질에 유의적인 SNP를 나타낸 것이다.
도 2는 한우 암소 집단의 1산차 임신기간(A) 및 수태당 인공수정횟수(B) 형질에 따른 GWAS 결과를 토대로 작성한 manhattan plot(위) 및 QQ-plot(아래)이다. manhattan plot에서 보라색 점선은 본페로니 기준선을, 회색 점선은 FDR 기준선을, 빨간점은 각 형질에 유의적인 SNP를 나타낸 것이다.
도 3은 한우 암소 집단의 2산차 분만간격 형질에 따른 GWAS 결과를 토대로 작성한 manhattan plot(위) 및 QQ-plot(아래)이다. manhattan plot에서 보라색 점선은 본페로니 기준선을, 회색 점선은 FDR 기준선을, 빨간점은 각 형질에 유의적인 SNP를 나타낸 것이다.
도 2는 한우 암소 집단의 1산차 임신기간(A) 및 수태당 인공수정횟수(B) 형질에 따른 GWAS 결과를 토대로 작성한 manhattan plot(위) 및 QQ-plot(아래)이다. manhattan plot에서 보라색 점선은 본페로니 기준선을, 회색 점선은 FDR 기준선을, 빨간점은 각 형질에 유의적인 SNP를 나타낸 것이다.
도 3은 한우 암소 집단의 2산차 분만간격 형질에 따른 GWAS 결과를 토대로 작성한 manhattan plot(위) 및 QQ-plot(아래)이다. manhattan plot에서 보라색 점선은 본페로니 기준선을, 회색 점선은 FDR 기준선을, 빨간점은 각 형질에 유의적인 SNP를 나타낸 것이다.
본 발명의 목적을 달성하기 위하여, 본 발명은 서열번호 1 내지 97의 염기서열로 이루어진 폴리뉴클레오티드에 있어서, 각각의 염기서열 중 36번째에 위치한 SNP(single nucleotide polymorphism) 염기를 포함하는 8개 이상의 연속된 뉴클레오티드로 구성된 폴리뉴클레오티드 또는 이의 상보적 폴리뉴클레오티드를 포함하는, 한우 암소의 번식 관련 형질 예측용 SNP 마커 조성물을 제공한다.
본 발명의 SNP 마커 조성물에 있어서, 상기 번식 관련 형질은 초산일령, 생시체중, 임신기간, 인공수정횟수 및 분만간격으로 이루어진 군으로부터 선택되는 1개 이상의 형질일 수 있으나, 이에 제한되지 않는다.
본 발명의 일 구현 예에 있어서, 상기 연속된 뉴클레오티드는 8 내지 100개의 연속된 뉴클레오티드일 수 있으나, 이에 제한되지 않는다.
본 발명에서, 용어 "뉴클레오티드"는 단일 가닥 또는 이중 가닥 형태로 존재하는 디옥시리보뉴클레오티드 또는 리보뉴클레오티드이며, 특별하게 다르게 언급되어 있지 않은 한 자연의 뉴클레오티드의 유사체를 포함한다.
본 발명의 일 구현 예에 따른 SNP 마커 조성물에 있어서, 상기 SNP 위치 염기는 서열번호 1 내지 97의 염기서열 모두 36번째로, 다형성 염기 정보는 표 7 내지 11의 SNP 염기서열 정보에서 [/]로 표시하였으며, 본 발명의 서열번호 1 내지 97의 염기서열은 표 7 내지 11의 사선(/) 앞에 위치한 염기를 포함하는 서열을 의미한다.
본 발명은 상기 서열번호 1 내지 97의 염기서열에서 SNP 위치의 염기 변이체에 관한 것이나, 이러한 SNP 염기 변이가 이중 가닥의 gDNA(게놈 DNA)에서 발견되는 경우, 상기 뉴클레오티드 서열에 대해 상보적인 폴리뉴클레오티드 서열도 포함하는 것으로 해석된다. 따라서 상보적인 폴리뉴클레오티드 서열에서 SNP 위치의 염기도 상보적인 염기가 된다. 이러한 측면에서, 본 명세서에 제시된 모든 서열은, 특별한 언급이 없는 한, 게놈 DNA의 센스 가닥에 있는 서열을 기준으로 한 것이다.
본 발명은 또한, 상기 SNP 염기를 포함하는 폴리뉴클레오티드를 증폭하기 위한, 한우 암소의 번식 관련 형질 예측용 프라이머 세트를 제공한다.
본 발명에 있어서, "프라이머"는 카피하려는 핵산 가닥에 상보적인 단일 가닥 올리고뉴클레오티드 서열을 말하며, 프라이머 연장 산물의 합성을 위한 개시점으로서 작용할 수 있다. 상기 프라이머의 길이 및 서열은 연장 산물의 합성을 시작하도록 허용해야 한다. 프라이머의 구체적인 길이 및 서열은 요구되는 DNA 또는 RNA 표적의 복합도(complexity)뿐만 아니라 온도 및 이온 강도와 같은 프라이머 이용 조건에 의존할 것이다.
본 발명에 있어서, 프라이머로서 이용된 올리고뉴클레오티드는 또한 뉴클레오티드 유사체(analogue), 예를 들면, 포스포로티오에이트(phosphorothioate), 알킬포스포로티오에이트 또는 펩티드 핵산(peptide nucleic acid)을 포함할 수 있거나, 또는 삽입 물질(intercalating agent)를 포함할 수 있다.
본 발명은 또한, 상기 프라이머 세트 및 증폭 반응을 수행하기 위한 시약을 포함하는, 한우 암소의 번식 관련 형질 예측용 키트를 제공한다.
본 발명의 키트에 있어서, 상기 증폭 반응을 수행하기 위한 시약은 DNA 폴리머라제, dNTPs 및 버퍼를 포함할 수 있으나, 이에 제한되지 않는다.
본 발명의 키트는 또한 최적의 반응 수행 조건을 기재한 사용자 안내서를 추가로 포함할 수 있다. 안내서는 키트 사용법, 예를 들면, PCR 완충액 제조 방법, 제시되는 반응 조건 등을 설명하는 인쇄물이다. 안내서는 팜플렛 또는 전단지 형태의 안내 책자, 키트에 부착된 라벨, 및 키트를 포함하는 패키지의 표면상에 설명을 포함한다. 또한, 안내서는 인터넷과 같이 전기 매체를 통해 공개되거나 제공되는 정보를 포함한다.
본 발명은 또한,
한우 암소 개체로부터 게놈 DNA를 분리하는 단계; 및
상기 분리된 게놈 DNA를 주형으로, 서열번호 1 내지 97의 염기서열로 이루어진 폴리뉴클레오티드의 각 36번째의 SNP 위치 염기의 유전자형을 결정하는 단계;를 포함하는, 한우 암소의 번식 관련 형질을 예측하는 방법을 제공한다.
본 발명의 일 구현 예에 따른 방법에 있어서, 상기 폴리뉴클레오티드는 전술한 것과 같으며, 각 폴리뉴클레오티드의 SNP 위치 염기의 유전자형 정보는 표 7 내지 11에 개시된 것과 같다.
본 발명의 일 구현 예에 따른 방법에 있어서, 상기 번식 관련 형질은 초산일령, 생시체중, 임신기간, 인공수정횟수 및 분만간격으로 이루어진 군으로부터 선택되는 1개 이상의 형질일 수 있으나, 이에 제한되지 않는다.
상기 초산일령은 생시부터 초산시까지의 기간을 의미하는 것으로, 초산일령이 단축될수록 우수한 형질로 판단할 수 있으나, 너무 빠른 초산은 이후의 번식성에 영향을 미칠 가능성이 있다. 또한, 생시체중은 암소에서 태어난 송아지의 체중을 의미하는 것으로, 암소가 송아지의 성장능력을 높일 수 있는 임신말기에 충분한 영양을 공급받지 못하면 생시체중이 적게 나가고 이로 인해 육성률이 저하되기 때문에 생시체중이 높을수록 우수한 형질로 판단할 수 있다. 임신기간은 암소가 임신을 하여 분만하기까지의 기간을 의미하는 것으로, 임신기간이 짧으면 송아지 생산을 증가시킬 수 있으므로, 임신기간이 짧을수록 우수한 형질로 판단할 수 있다. 인공수정횟수는 임신이 될 때까지의 인공수정 횟수를 의미하는 것으로, 수차례 인공수정을 실시하여도 임신이 되지 않는 암소는 농가 경제에 손실을 초래하는 주된 원인이므로 인공수정횟수가 적을수록 우수한 형질로 판단할 수 있다. 분만간격은 이전 산차 분만일로부터 금회 분만일까지의 기간을 의미하는 것으로, 분만간격이 길어지면 후보축의 원활한 공급이 어렵기 때문에 분만간격이 짧을수록 우수한 형질로 판단할 수 있다.
본 발명의 표 2 내지 6의 SNP에서 사선(/) 앞에 위치하는 SNP는 빈도가 낮은 minor allele를 의미하고, 사선(/) 뒤에 위치하는 SNP는 빈도가 높은 major allele를 의미한다. 표 2 내지 6의 Estimate는 해당 형질에 대한 SNP의 Regression cofficient(SNP 효과)로 상가적 효과를 의미하며, 첫번째 alllele(minor allele)이 두번째 allele(major allele)로 대체될 때 기대치를 의미한다.
표 2의 초산일령에 있어서, 유전자형이 minor allele 기준으로 Estimate 값이 음수(-)일 경우 초산일령이 빠른 것으로, Estimate 값이 양수(+)일 경우 초산일령이 느린 것으로 예측할 수 있다. 또한 표 3의 생시체중에 있어서, 유전자형이 minor allele 기준으로 Estimate 값이 음수(-)일 경우 생시체중이 적게 나가는 것으로, Estimate 값이 양수(+)일 경우 생시체중이 많이 나가는 것으로 예측할 수 있다. 또한 표 4의 임신기간에 있어서, 유전자형이 minor allele 기준으로 Estimate 값이 음수(-)일 경우 임신기간이 짧은 것으로, Estimate 값이 양수(+)일 경우 생시체중이 긴 것으로 예측할 수 있다. 또한 표 5의 인공수정횟수에 있어서, 유전자형이 minor allele 기준으로 Estimate 값이 음수(-)일 경우 인공수정횟수가 적은 것으로, Estimate 값이 양수(+)일 경우 인공수정횟수가 많은 것으로 예측할 수 있다. 또한 표 6의 분만간격에 있어서, 유전자형이 minor allele 기준으로 Estimate 값이 음수(-)일 경우 분만간격이 짧은 것으로, Estimate 값이 양수(+)일 경우 분만간격이 긴 것으로 예측할 수 있다.
본 발명의 판별방법에 있어서, 피검체(한우 암소 개체)로부터 게놈 DNA를 분리하는 방법은 당업계에 알려진 통상적인 방법을 통하여 이루어질 수 있다. 예를 들면, 조직 또는 세포로부터 DNA를 직접적으로 정제하거나 PCR과 같은 증폭 방법을 사용하여 특정한 영역을 특이적으로 증폭하고 이를 분리함으로써 이루어질 수 있다. 본 발명에 있어서, DNA란 DNA 뿐만 아니라 mRNA로부터 합성되는 cDNA도 포함한다. 피검체로부터 핵산을 얻는 단계는 예를 들면, PCR 증폭법, 리가제 연쇄 반응(ligase chain reaction), 전사증폭(transcription amplification), 자가유지 서열복제(self-sustained sequence replication system; Guatelli 등, Proc. Natl. Acad. Sci. USA (1990) 87:1874-1878) 및 핵산 서열 기재 증폭(nucleic acid sequence-based amplification)이 사용될 수 있으나, 이에 제한되지는 않는다.
분리된 DNA의 유전자형 결정 즉, 염기서열의 분석은 당업계에 알려진 다양한 방법에 의하여 이루어질 수 있다. 예를 들면, 디데옥시법에 의한 직접적인 핵산의 뉴클레오티드 서열의 결정을 통하여 이루어지거나, SNP 부위의 서열을 포함하는 프로브 또는 그에 상보적인 프로브를 상기 DNA와 혼성화시키고 그로부터 얻어지는 혼성화 정도를 측정함으로써 다형성 부위의 뉴클레오티드 서열을 결정/분석하는 방법 등이 이용될 수 있으나, 이에 제한되지는 않는다. 상기 혼성화의 정도는 예를 들면, 검출가능한 표지를 표적 DNA에 표지하여, 혼성화된 표적 DNA만을 특이적으로 검출함으로써 이루어질 수 있으며, 그외 전기적 신호 검출방법 등이 사용될 수 있으나, 이에 제한되지는 않는다.
본 발명은 또한, 본 발명에 따른 SNP 염기를 포함하는 폴리뉴클레오티드 또는 이의 cDNA를 포함하는, 한우 암소의 번식 관련 형질 예측용 마이크로어레이를 제공한다.
바람직하게는, 상기 폴리뉴클레오티드는 아미노-실란, 폴리 L-라이신 또는 알데히드의 활성기가 코팅된 기판에 고정될 수 있으나, 이에 제한되지는 않는다. 바람직하게는, 상기 기판은 실리콘 웨이퍼, 유리, 석영, 금속 또는 플라스틱일 수 있으나, 이에 제한되지는 않는다. 상기 폴리뉴클레오티드를 기판에 고정화시키는 방법으로는 피에조일렉트릭(piezoelectric) 방식을 이용한 마이크로피펫팅(micropipetting)법, 핀(pin) 형태의 스폿터(spotter)를 이용한 방법 등을 사용할 수 있다.
본 발명의 마이크로어레이는 본 발명에 따른 폴리뉴클레오티드 또는 그의 상보적 폴리뉴클레오티드, 그에 의해 코딩되는 폴리펩티드 또는 그의 cDNA를 이용하여 본 분야의 당업자에게 알려져 있는 통상적인 방법에 의해 제조될 수 있다.
이하, 본 발명을 실시예에 의해 상세히 설명한다. 단, 하기 실시예는 본 발명을 예시하는 것일 뿐, 본 발명의 내용이 하기 실시예에 한정되는 것은 아니다.
실시예 1. 한우 암소 시료의 수집 및 Illumina bovine 50K SNPs 어레이 분석
2018년 8월부터 2020년까지 봉화(경상북도 봉화, 경주, 상주, 영주) 축협에서 국내산 암소 5,635두의 시료(혈액 또는 모근)를 수집하여 게노믹 DNA를 추출하고, 고밀도 Illumina Bovine SNP50K Bead Chip(Illumina, 미국)을 이용하여 제조사의 지침에 따라 SNP 분석을 실시하였다. 또한, 번식 관련 형질로서 초산일령, 송아지 생시체중, 임신기간, 수태당 인공수정횟수 및 분만간격 형질을 수집하였다(표 1).
Trait | N | Mean | S.D | Min | Max |
초산일령 | 4,618 | 771.4 | 129.96 | 499 | 1,984 |
생시체중 | 3,443 | 25.55 | 1.97 | 19 | 50 |
임신기간 | 4,618 | 286.34 | 7.78 | 206 | 340 |
인공수정횟수 | 4,618 | 1.38 | 0.76 | 1 | 5 |
분만간격 | 3,120 | 369.24 | 40.51 | 243 | 499 |
실시예 2. 전장유전체연관분석(genome-wide association study, GWAS)
고밀도 Illumina bovine 50K SNPs 어레이 분석을 통해 얻어진 각각의 SNP에 대하여, 번식 관련 형질인 초산일령, 송아지 생시체중, 임신기간, 수태당 인공수정횟수 및 분만간격 형질과의 연관분석을 위해 전장유전체연관분석을 수행하였다.
Animal model에서 SNP 정보를 활용한 개체들간의 G matrix(GCTA software)를 사용하였고, 아래와 같은 일반 선형 모델(animal model)을 적용하였다.
Y=XB+Za+e
[Y: 표현형 벡터, b: 고정효과로 y 절편, 비유단계(12), 월령그룹(3), e: 잔차벡터, a: 임의 효과로 개체효과, 농가-분만연도-분만계절, 농가]
분석은 상용 animal model을 수행하는 ASREML 4.0 프로그램(https://www.animalgenome.org/bioinfo/resources/manuals/ASReml3/asreml_release_notes.htm)을 구동하여, 분석형질에 대해 single trait model를 사용하여 표현형 잔차(공변이)를 수집하였고, 각 표현형 잔차로 PLINK 프로그램을 이용하여 single marker simple regressin 분석을 실행하였다.
Yresidual=β0+βaddX+e
[Y: 표현형의 잔차, β0: y 절편, e: 잔차벡터, βi: SNP 효과 크기값(add=상가적), X: 효과 계수 matrix로 additive AA, AB, BB 유전자형에 대하여 1, 0, -1 값을 부여함]
상기와 같은 연관분석을 통해, 각 형질마다 유의수준 α=0.05에 대하여 FDR(false discovery rate) 값을 임계값으로 설정하여 -log10 P 값이 임계값 보다 큰 SNP를 해당 형질과 통계적 유의도를 가진 연관성을 보인다고 판단하여 이를 선별하였다.
그 결과, 하기 표 2 내지 6에 나타난 바와 같이 초산일령에서 16개(도 1A), 송아지 생시체중에서 27개(도 1B), 임신기간에서 23개(도 2A), 수태당 인공수정횟수에서 17개(도 2B), 분만간격에서 14개(도 3)의 유의적인 SNP를 확인할 수 있었다.
또한, 상기 총 97개의 SNP 마커에 대한 염기서열 정보는 하기 표 7 내지 11에 나타내었다.
서열목록 전자파일 첨부
Claims (7)
- 서열번호 1 내지 97의 염기서열로 이루어진 폴리뉴클레오티드에 있어서, 각각의 염기서열 중 36번째에 위치한 SNP(single nucleotide polymorphism) 염기를 포함하는 8개 이상의 연속된 뉴클레오티드로 구성된 폴리뉴클레오티드 또는 이의 상보적 폴리뉴클레오티드를 포함하는, 한우 암소의 번식 관련 형질 예측용 SNP 마커 조성물.
- 제1항에 있어서, 상기 연속된 뉴클레오티드는 8 내지 100개의 연속된 뉴클레오티드인 것을 특징으로 하는, 한우 암소의 번식 관련 형질 예측용 SNP 마커 조성물.
- 제1항에 있어서, 상기 번식 관련 형질은 초산일령, 생시체중, 임신기간, 인공수정횟수 및 분만간격으로 이루어진 군으로부터 선택되는 1개 이상의 형질인 것을 특징으로 하는, 한우 암소의 번식 관련 형질 예측용 SNP 마커 조성물.
- 제1항에 기재된 SNP(single nucleotide polymorphism) 염기를 포함하는 폴리뉴클레오티드를 증폭하기 위한, 한우 암소의 번식 관련 형질 예측용 프라이머 세트.
- 제4항의 프라이머 세트 및 증폭 반응을 수행하기 위한 시약을 포함하는, 한우 암소의 번식 관련 형질 예측용 키트.
- 한우 암소 개체로부터 게놈 DNA를 분리하는 단계; 및
상기 분리된 게놈 DNA를 주형으로, 서열번호 1 내지 97의 염기서열로 이루어진 폴리뉴클레오티드의 각 36번째의 SNP(single nucleotide polymorphism) 위치 염기의 유전자형을 결정하는 단계;를 포함하는, 한우 암소의 번식 관련 형질을 예측하는 방법. - 제1항에 기재된 SNP(single nucleotide polymorphism) 염기를 포함하는 폴리뉴클레오티드 또는 이의 cDNA를 포함하는, 한우 암소의 번식 관련 형질 예측용 마이크로어레이.
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