KR20220101919A - Method for diagnosing tumor prognosis in companion dogs using the measurement of cell-free DNA - Google Patents

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Abstract

The present invention relates to a method for diagnosing tumor prognosis in a companion dog by using measurement of a cell-free nucleic acid and, more specifically, to a method for predicting tumor prognosis in a companion dog, which comprises: a step (a) of measuring a level of cell-free DNA (cfDNA) in a biological sample from a subject; and a step (b) of comparing the measured level of the cfDNA with a cut-off value set by analysis of an ROC curve. In addition, the present invention relates to a method for diagnosing a tumor of a companion dog, which comprises: a step (a) of measuring a level of cell-free DNA (cfDNA) in a biological sample from the subject; and a step (b) of comparing the measured level with a level of cfDNA of a normal control. The method for diagnosing a tumor of a companion dog and predicting tumor prognosis according to the present invention is a method for simply measuring a concentration of cfDNA present in blood of a companion dog, thereby allowing a user to rapidly and precisely diagnose tumor prognosis including determining whether a tumor develops or not and predicting a survival rate of the companion dog with a tumor.

Description

세포 유리 핵산의 측정을 통한 반려견의 종양 예후를 진단하는 방법{Method for diagnosing tumor prognosis in companion dogs using the measurement of cell-free DNA}Method for diagnosing tumor prognosis in companion dogs through measurement of cell-free nucleic acid {Method for diagnosing tumor prognosis in companion dogs using the measurement of cell-free DNA}

본 발명은 세포 유리 핵산의 측정을 통한 반려견의 종양 예후를 예측 또는 진단하는 방법에 관한 것이다.The present invention relates to a method for predicting or diagnosing a tumor prognosis in a dog through measurement of cell-free nucleic acid.

현재 우리나라는 핵가족화를 넘어선 1-2인 가구화가 이루어지고 있고 반려동물을 키우고 있는 인구가 증가하고 있다. 반려동물 중에서 가장 큰 부분을 차지하고 있는 것이 반려견으로, 반려견은 평균적으로 11~13년 정도 사는 것으로 알려져 있으나, 최근에는 공중보건 향상 및 의료 향상으로 15~20년 정도까지 그 수명이 연장되었다. 또한, 국민 의식 수준 향상으로 반려동물도 이제 사람과 비슷한 수준의 인격체로 여겨지는 경우가 많다.Currently, in Korea, one-to-one households are moving beyond nuclear families, and the number of people raising companion animals is increasing. Dogs account for the largest portion of companion animals, and dogs are known to live on average 11 to 13 years, but recently, their lifespan has been extended to 15 to 20 years due to improvements in public health and medical care. In addition, as the level of public awareness has improved, companion animals are often regarded as human beings on a level similar to that of humans.

하지만, 많은 반려견을 포함하는 반려동물이 대부분 주택 내에서 생활하기 때문에 운동이 부족하고 스트레스를 많이 받게 되어 손쉽게 질환에 노출되는 경향이 있다. 특히 반려동물에서 종양질환은 인간과 달리 정기검진 등 종양에 대한 적절한 바이오마커 등과 같은 진단 수단이 없고, 동물병원에서 조형검사, 조직검사 등 정밀검사를 일상적으로 수행할 수 없는 한계가 있다.However, since most companion animals, including many dogs, live in houses, they tend to be easily exposed to diseases due to lack of exercise and a lot of stress. In particular, in companion animals, tumor diseases, unlike humans, do not have diagnostic means such as appropriate biomarkers for tumors, such as regular checkups, and there is a limitation in that detailed examinations such as plastic examinations and biopsies cannot be routinely performed at veterinary hospitals.

따라서 반려동물에서 종양질환을 신속하고 정확하게 진단할 수 있는 기술의 개발이 필요한 시점이다.Therefore, it is necessary to develop a technology that can quickly and accurately diagnose tumor diseases in companion animals.

한편, 세포 유리 핵산(cell-free DNA; cfDNA)은 세포 안에 존재하지 않고 혈액에 떠돌아다니는 DNA 조각을 의미한다. 특히 사람과 동물에서 암에 걸린 개체의 혈액에는 cfDNA가 증가됨이 보고된 바 있으며 이는 종양 세포의 사멸 및 괴사, 활성 세포로부터의 분비, 용해되어 순환하는 세포로부터 종양의 DNA가 파생되기 때문이다. 또한 최근에는 액체 생검(liquid biopsy) 분야에서 체액에 존재하는 암세포 유래의 핵산을 비침습적으로 분석하여 암의 조기 진단, 단계 및 예후 평가, 항암 요법에 대한 반응 모니터링 등 혈장 바이오마커로 주목을 받고 있다.On the other hand, cell-free nucleic acid (cell-free DNA; cfDNA) refers to a piece of DNA that does not exist in a cell and is floating in the blood. In particular, it has been reported that cfDNA is increased in the blood of cancer-stricken individuals in humans and animals, because tumor DNA is derived from tumor cell death and necrosis, secretion from active cells, and lysis and circulating cells. In addition, recently, in the field of liquid biopsy, non-invasive analysis of cancer cell-derived nucleic acids present in body fluids is drawing attention as a plasma biomarker for early diagnosis of cancer, evaluation of stages and prognosis, and monitoring of response to anticancer therapy. .

그러나 아직까지 종양 바이오마커로서 cfDNA에 대한 수의학적 연구는 거의 진행되지 못하고 있는 실정이다.However, veterinary research on cfDNA as a tumor biomarker has not yet been progressed.

대한민국 공개특허 10-2020-0049647Republic of Korea Patent Publication 10-2020-0049647

이에 본 발명자들은 건강한 개, 비종양성 질환을 가진 개 및 종양에 걸린 개의 혈액으로부터 cfDNA를 각각 추출하고, 각 실험군에 대한 혈액 내 cfDNA의 농도를 측정하여 반려견에서 종양과 cfDNA와의 상관관계를 분석하였고, 나아가 종양에 걸린 개의 경우, 종양 치료에 따른 반응과 cfDNA 농도 변화에 대한 상관관계를 분석하여 반려견의 종양 예후에 대한 진단을 정량적으로 판단할 수 있는 새로운 진단 방법을 확립함으로써 본 발명을 완성하였다.Accordingly, the present inventors extracted cfDNA from the blood of healthy dogs, dogs with non-neoplastic diseases and dogs with tumors, respectively, and measured the concentration of cfDNA in the blood for each experimental group to analyze the correlation between tumor and cfDNA in dogs, Furthermore, in the case of a dog with a tumor, the present invention was completed by establishing a new diagnostic method that can quantitatively determine the diagnosis of the dog's tumor prognosis by analyzing the correlation between the response to tumor treatment and the change in cfDNA concentration.

따라서 본 발명의 목적은, (a) 피검체 유래의 생물학적 시료에서 cfDNA (Cell-free DNA) 수준을 측정하는 단계; 및 (b) 측정된 cfDNA 수준을 ROC 곡선 분석에 의해 설정된 컷-오프(cut-off) 값과 비교하는 단계를 포함하는, 반려견의 종양 예후 예측방법을 제공하는 것이다.Therefore, an object of the present invention, (a) measuring the level of cfDNA (Cell-free DNA) in a biological sample derived from a subject; and (b) comparing the measured cfDNA level with a cut-off value set by ROC curve analysis, to provide a method for predicting tumor prognosis in dogs.

본 발명의 다른 목적은, (a) 피검체 유래의 생물학적 시료에서 cfDNA(Cell-free DNA) 수준을 측정하는 단계; 및 (b) 정상 대조군의 cfDNA 수준과 비교하는 단계를 포함하는, 반려견의 종양 진단방법을 제공하는 것이다.Another object of the present invention, (a) measuring the level of cfDNA (Cell-free DNA) in a biological sample derived from a subject; And (b) to provide a method for diagnosing a canine tumor, including the step of comparing it with the cfDNA level of a normal control.

상기 본 발명의 목적을 달성하기 위해, 본 발명은 (a) 피검체 유래의 생물학적 시료에서 cfDNA (Cell-free DNA) 수준을 측정하는 단계; 및 (b) 측정된 cfDNA 수준을 ROC 곡선 분석에 의해 설정된 컷-오프(cut-off) 값과 비교하는 단계를 포함하는, 반려견의 종양 예후 예측방법을 제공한다.In order to achieve the above object of the present invention, the present invention (a) measuring the level of cfDNA (Cell-free DNA) in a biological sample derived from a subject; and (b) comparing the measured cfDNA level with a cut-off value set by ROC curve analysis.

본 발명의 일실시예에 있어서, 상기 생물학적 시료는 전혈, 혈장 또는 혈청일 수 있다.In one embodiment of the present invention, the biological sample may be whole blood, plasma or serum.

본 발명의 일실시예에 있어서, 상기 측정된 cfDNA 수준이 컷-오프(cut-off) 값보다 낮은 경우 상기 반려견의 생존 확률이 높을 것으로 판단하고, 상기 측정된 cfDNA 수준이 컷-오프(cut-off) 값보다 높은 경우 상기 반려견의 생존 확률이 낮을 것으로 판단하는 단계를 더 포함할 수 있다.In one embodiment of the present invention, if the measured cfDNA level is lower than the cut-off value, it is determined that the survival probability of the dog is high, and the measured cfDNA level is cut-off (cut-off) off) may further include the step of determining that the survival probability of the dog is low when it is higher than the value.

본 발명의 일실시예에 있어서, 상기 설정된 컷-오프(cut-off) 값은 1,247.5 ug/L일 수 있다.In an embodiment of the present invention, the set cut-off value may be 1,247.5 ug/L.

본 발명의 일실시예에 있어서, 상기 측정된 cfDNA 수준이 컷-오프(cut-off) 값인 1,247.5 ug/L 보다 낮은 경우, 상기 반려견의 생존 확률은 80% 이상일 것으로 예측할 수 있다.In one embodiment of the present invention, when the measured cfDNA level is lower than the cut-off value of 1,247.5 ug/L, the survival probability of the dog can be predicted to be 80% or more.

본 발명의 일실시예에 있어서, 상기 측정된 cfDNA 수준이 컷-오프(cut-off) 값인 1,247.5 ug/L 보다 높은 경우, 상기 반려견의 상기 생존 확률은 30% 미만일 것으로 예측할 수 있다.In one embodiment of the present invention, when the measured cfDNA level is higher than the cut-off value of 1,247.5 ug/L, the survival probability of the dog can be predicted to be less than 30%.

본 발명의 일실시예에 있어서, 상기 종양은 간세포암, 이소성 갑상선암, 폐선암, 유선암, 세포 갑상선암, 편평세포암, 신장세포암, 이행상피암, 장 선암, 림프종, 백혈병, 혈관육종, 간질육종, 구강평활근 육종, 위장기질종양(GIST), 다엽성 뼈종양, 비만세포종양, 갈색 세포종 및 말초 신경초 종양으로 이루어진 군 중에서 선택되는 것일 수 있다.In one embodiment of the present invention, the tumor is hepatocellular carcinoma, ectopic thyroid cancer, lung adenocarcinoma, mammary gland cancer, cell thyroid cancer, squamous cell carcinoma, renal cell carcinoma, transitional epithelial cancer, intestinal adenocarcinoma, lymphoma, leukemia, angiosarcoma, stromal sarcoma, It may be selected from the group consisting of oral leiomyosarcoma, gastrointestinal stromal tumor (GIST), multilobed bone tumor, mast cell tumor, pheochromocytoma, and peripheral nerve sheath tumor.

또한 본 발명은, (a) 피검체 유래의 생물학적 시료에서 cfDNA(Cell-free DNA) 수준을 측정하는 단계; 및 (b) 정상 대조군의 cfDNA 수준과 비교하는 단계를 포함하는, 반려견의 종양 진단방법을 제공한다.In addition, the present invention, (a) measuring the level of cfDNA (Cell-free DNA) in a biological sample derived from the subject; And (b) provides a method for diagnosing a canine tumor, including the step of comparing it with the cfDNA level of a normal control.

본 발명의 일실시예에 있어서, 상기 생물학적 시료는 전혈, 혈장 또는 혈청일 수 있다.In one embodiment of the present invention, the biological sample may be whole blood, plasma or serum.

본 발명의 일실시예에 있어서, 상기 피검체 유래의 cfDNA 수준이 정상 대조군의 cfDNA 수준에 비해 높은 경우, 종양이 발생한 것으로 판단하는 단계를 더 포함하는 것일 수 있다.In one embodiment of the present invention, when the cfDNA level derived from the subject is higher than the cfDNA level of the normal control, the step of determining that a tumor has occurred may be further included.

본 발명의 일실시예에 있어서, 상기 피검체 유래의 cfDNA 수준이 1,553.9 ug/L 농도보다 높은 경우, 종양이 발생한 것으로 판단할 수 있다.In one embodiment of the present invention, when the cfDNA level derived from the subject is higher than the concentration of 1,553.9 ug/L, it can be determined that a tumor has occurred.

본 발명의 일실시예에 있어서, 상기 종양은 간세포암, 이소성 갑상선암, 폐선암, 유선암, 세포 갑상선암, 편평세포암, 신장세포암, 이행상피암, 장 선암, 림프종, 백혈병, 혈관육종, 간질육종, 구강평활근 육종, 위장기질종양(GIST), 다엽성 뼈종양, 비만세포종양, 갈색 세포종 및 말초 신경초 종양으로 이루어진 군 중에서 선택되는 것일 수 있다.In one embodiment of the present invention, the tumor is hepatocellular carcinoma, ectopic thyroid cancer, lung adenocarcinoma, mammary gland cancer, cell thyroid cancer, squamous cell carcinoma, renal cell carcinoma, transitional epithelial cancer, intestinal adenocarcinoma, lymphoma, leukemia, angiosarcoma, stromal sarcoma, It may be selected from the group consisting of oral leiomyosarcoma, gastrointestinal stromal tumor (GIST), multilobed bone tumor, mast cell tumor, pheochromocytoma, and peripheral nerve sheath tumor.

본 발명은 건강한 개에 비해 종양이 유발된 개의 혈액 내에 cfDNA(Cell-free DNA)의 농도가 증가되어 있음을 확인하였고, 특히 비종양성 질환을 가진 군에 비해 종양 질환을 가진 군에서 cfDNA의 농도가 유의적으로 높은 것을 확인함에 따라 cfDNA의 농도 측정을 통해 반려견의 종양 발병 여부를 진단할 수 있는 효과가 있다. 나아가 본 발명은 종양 치료 기간 중에 치료에 대한 반응과 cfDNA간의 변화 경향성을 분석하여 종양의 예후 및 생존율을 예측할 수 있는 컷-오프(cut off) 값을 규명하였는데, 검출된 cfDNA 농도 측정값을 컷-오프 값인 1,247.5 ug/L 값과 비교하여 종양 치료에 대한 예후 및 생존율을 객관적이고 정확하게 예측 및 진단할 수 있다.The present invention confirmed that the concentration of cfDNA (cell-free DNA) in the blood of tumor-inducing dogs was increased compared to healthy dogs. As it is confirmed that it is significantly higher, it has the effect of diagnosing whether a dog develops a tumor by measuring the concentration of cfDNA. Furthermore, the present invention identified a cut-off value that can predict the prognosis and survival rate of a tumor by analyzing the change tendency between the response to treatment and cfDNA during the tumor treatment period. Compared with the off value of 1,247.5 ug/L, it is possible to objectively and accurately predict and diagnose the prognosis and survival rate for tumor treatment.

도 1은 본 발명의 일실시예에서 건강한 군, 비종양성 질환군 및 종양 질환군에 대한 임상데이터의 평균 변수를 측정한 결과로서, (A)는 백혈구(WBC), 호중구(NEU), C- 반응성 단백질(CRP) 및 알부민의 평균 농도를 측정한 결과이고, (B)는 적혈구(RBC), 헤모글로빈(Hgb) 및 헤마토크릿(Hct)의 평균 농도를 측정한 결과이며, (C)는 알라닌 아미노트랜스퍼라제(ALT), 알칼리성 포스파타제(ALKP) 및 감마-글루타밀 트랜스 펩티다제(GGT)의 평균 간 효소활성을 측정한 결과를 나타낸 것이다. 모든 데이터는 평균 ± SD로 표시하였다.
도 2는 건강한 군과 임상학적으로 질병군 간의 cfDNA의 평균 농도를 측정한 결과를 나타낸 것으로, (A)는 건강한 군과 질병군(비종양성 기저 질환군 및 종양 질환군으로 구성)의 평균 cfDNA 농도를 비교한 것이고, (B)는 건강한 군, 비종양성 질환군 및 종양 질환군에 대한 평균 cfDNA 농도를 비교한 것이다.
도 3은 건강한 군, 비종양성 기저 질환군 및 다양한 종류의 종양 질환군에 대한 cfDNA 농도를 측정한 결과를 나타낸 것이다.
도 4는 종양질환이 있는 개의 예후 마커로서 cfDNA에 대한 진단 민감도 및 1- 특이성을 식별하는 ROC(receiver operating characteristic) 분석 곡선을 나타낸 것이며, AUC에 대한 95% 신뢰 구간은 cfDNA의 경우 0.701(0.523-0.880)이었고 통계적으로 유의했다(P <0.05).
도 5는 종양질환이 있는 개에서 cfDNA 대 생존율의 상관 관계를 분석한 결과로, cfDNA 농도 1,247.5 μg/L을 컷-오프로 사용한 Kaplan-Meier 플롯은 통계적으로 유의한 차이를 보여주었다(n = 38, P <0.05).
도 6은 치료반응에 따른 cfDNA 농도를 비교한 결과로서, cfDNA 농도는 실선으로 표기되어있고, 다양한 시점에서의 LD 합계는 점선으로 표시되어 있다. (A)~(C)에서 각 그래프의 왼쪽의 세로축은 cfDNA 농도를, 오른쪽의 세로축은 LD의 합을 나타낸 것이다. 또한, 모든 그래프 각각에서 가로축 레이블은 혈장 샘플링 날짜 및 종양 반응상태를 나타낸 것이며, (A)~(J)는 각각 개 no.1 ~ no.10에 해당하는 종양을 갖는 개에 대한 분석 결과이다.
도 7은 다중심성 림프종(multicentric lymphoma)이 있는 개를 대상으로 LD의 합 및 cfDNA 농도 사이의 상관관계를 분석한 결과이다.
1 is a result of measuring the average parameters of clinical data for a healthy group, a non-neoplastic disease group and a tumor disease group in an embodiment of the present invention, (A) is a white blood cell (WBC), neutrophil (NEU), C- It is the result of measuring the average concentration of reactive protein (CRP) and albumin, (B) is the result of measuring the average concentration of red blood cells (RBC), hemoglobin (Hgb) and hematocrit (Hct), (C) is alanine aminotransfer The results of measuring the average liver enzyme activity of rase (ALT), alkaline phosphatase (ALKP) and gamma-glutamyl transpeptidase (GGT) are shown. All data are expressed as mean±SD.
Figure 2 shows the results of measuring the average concentration of cfDNA between the healthy group and the clinically diseased group, (A) is a comparison of the average cfDNA concentration of the healthy group and the disease group (composed of a non-neoplastic underlying disease group and a tumor disease group) and (B) compares the mean cfDNA concentrations for the healthy group, non-neoplastic disease group, and tumor disease group.
3 shows the results of measuring cfDNA concentrations in the healthy group, non-neoplastic underlying disease group, and various types of tumor disease group.
Figure 4 shows the ROC (receiver operating characteristic) analysis curve that identifies the diagnostic sensitivity and 1-specificity for cfDNA as a prognostic marker for dogs with tumor disease, and the 95% confidence interval for AUC is 0.701 (0.523-) for cfDNA. 0.880) and was statistically significant (P <0.05).
5 is a result of analyzing the correlation between cfDNA and survival rate in dogs with oncology. The Kaplan-Meier plot using a cfDNA concentration of 1,247.5 μg/L as a cut-off showed a statistically significant difference (n = 38). , P < 0.05).
6 is a result of comparing the cfDNA concentration according to the treatment response. The cfDNA concentration is indicated by a solid line, and the sum of LDs at various time points is indicated by a dotted line. In (A)-(C), the left vertical axis of each graph represents the cfDNA concentration, and the right vertical axis represents the sum of LDs. In addition, in each of all graphs, the horizontal axis labels indicate the plasma sampling date and tumor response status, and (A) to (J) are analysis results for dogs having tumors corresponding to dogs no.1 to no.10, respectively.
7 is a result of analyzing the correlation between the sum of LD and cfDNA concentration in dogs with multicentric lymphoma.

본 발명은 반려견의 종양을 진단하고 또한 종양의 예후를 예측할 수 있는 새로운 방법을 제공하는 기술로서, 구체적으로 본 발명은 반려견의 생물학적 시료에서 cfDNA(Cell-free DNA) 수준을 측정하고, 반려견의 종양을 진단 또는 예후를 예측할 수 있는 객관적 지표로서 cfDNA 수준에 대한 컷-오프(cut-off) 값을 규명한 점에 특징이 있다.The present invention is a technology that provides a new method for diagnosing a dog's tumor and predicting the prognosis of the tumor. Specifically, the present invention measures the level of cfDNA (Cell-free DNA) in a dog's biological sample, and the dog's tumor It is characterized in that it identified the cut-off value for the cfDNA level as an objective indicator that can predict the diagnosis or prognosis.

앞서 종래기술에서도 언급했던 바와 같이, 아직까지 반려동물의 종양을 객관적이고 정확하게 진단할 수 있는 방법이 부재한 실정이었다.As mentioned in the prior art, there is still no method for objectively and accurately diagnosing a tumor in a companion animal.

이에 본 발명자들은 반려견을 대상으로 건강한 군, 비종양성 질환군 및 종양 질환군으로 분류된 실험군을 대상으로 혈액으로부터 cfDNA(Cell-free DNA)를 분리하고, 이의 농도를 정량적으로 측정하여, 종양 발생 또는 종양의 예후를 예측할 수 있는 판단 기준이 되는 정량적인 기준값, 즉 컷-오프(cut-off) 값을 규명하였다.Accordingly, the present inventors isolated cfDNA (Cell-free DNA) from blood from the experimental group classified into a healthy group, a non-neoplastic disease group, and a tumor disease group for dogs, and quantitatively measures the concentration thereof, A quantitative reference value, that is, a cut-off value, which is a criterion for predicting the prognosis of a tumor was identified.

특히 본 발명에서는 반려견 종양 진단을 위한 수단으로 cfDNA를 이용하였는데, 상기 “cfDNA(Cell-free DNA)”는 혈장에 존재하는 세포에서 유래한 DNA를 의미하며, 혈액 안에는 작은 무세포 DNA 혹은 세포 유리 DNA가 섞여 있다. 이러한 세포 유리 DNA는 태아의 성별, 유전자 변이나 염색체 수 이상을 검사하기 위한 비침습적 검사에 사용되고 있다. 그러나 아직까지 반려견의 종양을 진단하거나 종양의 예후를 예측하기 위한 용도로는 사용되지 않고 있었다.In particular, in the present invention, cfDNA was used as a means for diagnosing canine tumors. The term “cfDNA (Cell-free DNA)” refers to DNA derived from cells present in plasma, and small cell-free DNA or cell-free DNA in blood. is mixed Such cell-free DNA is being used in a non-invasive test to check for abnormalities in fetal sex, genetic variation, or chromosome number. However, it has not yet been used for diagnosing tumors in dogs or predicting the prognosis of tumors.

한편, 본 발명의 일실시예에 따르면, cfDNA의 수준(농도) 분석을 통해 반려견의 종양 발생을 진단할 수 있는지를 확인하였는데, 이를 위해 반려견들을 대상으로 임상학적 분석을 통해 건강한 군, 비종양성 질환군 및 종양 질환군으로 구분하고, 각 반려견으로부터 혈액 내 cfDNA의 농도를 측정한 다음, 평균 농도를 분석한 결과, 건강한 군은 877.8 ± 181.7 μg/, 비종양성 질환군은 1,154.4 ± 326.5 μg/L, 종양 질환군에서는 1,553.9 ± 544.3 μg/L의 평균 cfDNA 농도가 측정되었다.On the other hand, according to an embodiment of the present invention, it was confirmed whether it was possible to diagnose tumor occurrence in dogs through analysis of the level (concentration) of cfDNA. After dividing into group and tumor disease group, and measuring the concentration of cfDNA in the blood from each dog, and analyzing the average concentration, the healthy group showed 877.8 ± 181.7 μg/L, the non-neoplastic disease group was 1,154.4 ± 326.5 μg/L, In the tumor disease group, an average cfDNA concentration of 1,553.9 ± 544.3 μg/L was measured.

이를 통해 본 발명자들은 혈액 내 cfDNA의 수준 측정을 통해 반려견의 종양 발생 여부를 확인할 수 있음을 알 수 있었으며, 나아가 비종양성 질환과 종양 질환도 구분하여 진단할 수 있음을 알 수 있었다. Through this, the present inventors were able to confirm whether or not tumors occurred in dogs by measuring the level of cfDNA in the blood, and furthermore, it was found that non-neoplastic diseases and tumor diseases can be differentiated and diagnosed.

본 발명의 다른 일실시예에서는, 다양한 종양 유형의 질환군에 대하여 cfDNA 농도를 비교 분석하였는데, 이를 위해 각각 림프종양(n = 13), 암종 (n = 15), 육종 (n = 5), 기타 종양 (n = 5)에서의 cfDNA 농도를 분석하였다.In another embodiment of the present invention, cfDNA concentrations were compared and analyzed for disease groups of various tumor types. For this purpose, lymphoma (n = 13), carcinoma (n = 15), sarcoma (n = 5), etc. cfDNA concentrations in tumors (n = 5) were analyzed.

그 결과, 건강한 군에 비해 종양 질환군에서의 cfDNA 농도가 유의하게 높은 것으로 나타났고, 다양한 종양 유형의 질환군 중에서 림프종에서 cfDNA 농도가 가장 높은 수준으로 증가해 있는 것으로 나타났다.As a result, the cfDNA concentration in the tumor disease group was significantly higher than in the healthy group, and the cfDNA concentration in the lymphoma was increased to the highest level among the disease groups of various tumor types.

그러므로 본 발명은, (a) 피검체 유래의 생물학적 시료에서 cfDNA(Cell-free DNA) 수준을 측정하는 단계; 및 (b) 정상 대조군의 cfDNA 수준과 비교하는 단계를 포함하는 반려견의 종양 진단방법을 제공할 수 있다.Therefore, the present invention, (a) measuring the level of cfDNA (Cell-free DNA) in a biological sample derived from a subject; And (b) it may provide a method for diagnosing a canine tumor comprising the step of comparing it with the cfDNA level of a normal control.

본 발명에서 상기 피검체 유래의 생물학적 시료는 전혈(혈액), 혈장 또는 혈청일 수 있다.In the present invention, the biological sample derived from the subject may be whole blood (blood), plasma or serum.

상기 피검체 유래의 생물학적 시료에서 cfDNA(Cell-free DNA) 수준을 측정하는 것은, 상기 생물학적 시료로부터 cfDNA를 분리하고 농도를 측정하는 과정을 통해 수행되어지는데, cfDNA의 분리는 해당 시료로부터 핵산을 추출, 분리 및 정제하는 당업계에 공지된 방법을 통해 수행할 수 있다. 본 발명의 일실시예에서는 혈장 또는 혈청 샘플을 16,000×g 및 4°C에서 10분 동안 원심분리하여 무세포(cell-free) 혈장 또는 혈청을 수득하였고, 원심분리 후 정제된 cfDNA를 포함하는 상층액을 수득한 후, 이를 정량분석에 사용하였다. Measuring the level of cfDNA (Cell-free DNA) in the biological sample derived from the subject is performed by isolating cfDNA from the biological sample and measuring the concentration. Separation of cfDNA involves extracting nucleic acids from the sample , separation and purification can be carried out through methods known in the art. In an embodiment of the present invention, a plasma or serum sample was centrifuged at 16,000 × g and 4 °C for 10 minutes to obtain cell-free plasma or serum, and the upper layer containing purified cfDNA after centrifugation After obtaining a liquid, it was used for quantitative analysis.

또한 본 발명에서 진단할 수 있는 상기 반려견의 종양으로는, 이에 제한되지는 않으나, 간세포암, 이소성 갑상선암, 폐선암, 유선암, 세포 갑상선암, 편평세포암, 신장세포암, 이행상피암, 장 선암, 림프종, 백혈병, 혈관육종, 간질육종, 구강평활근 육종, 위장기질종양(GIST), 다엽성 뼈종양, 비만세포종양, 갈색 세포종 및 말초 신경초 종양으로 이루어진 군 중에서 선택된 것일 수 있다. 바람직하게는 림프종일 수 있다.In addition, the canine tumors that can be diagnosed in the present invention include, but are not limited to, hepatocellular carcinoma, ectopic thyroid cancer, lung adenocarcinoma, mammary gland cancer, cell thyroid cancer, squamous cell carcinoma, renal cell carcinoma, transitional epithelial carcinoma, intestinal adenocarcinoma, lymphoma , leukemia, angiosarcoma, stromal sarcoma, oral leiomyosarcoma, gastrointestinal stromal tumor (GIST), multilobed bone tumor, mast cell tumor, pheochromocytoma, and peripheral nerve sheath tumor. Preferably it may be a lymphoma.

본 발명에서 상기 “진단(diagnosis)”이란 넓은 의미로는 질환에 걸린 개채의 병의 실태를 모든 면에 걸쳐서 판단하는 것을 의미한다. 판단의 내용은 병명, 병인, 병형, 경중, 병상의 상세한 양태, 및 합병증의 유무 등을 포함한다.In the present invention, the term “diagnosis” in a broad sense means judging the actual condition of a diseased individual in all aspects. The content of the judgment includes the disease name, etiology, disease type, severity, detailed mode of the disease, and the presence or absence of complications.

나아가 본 발명자들은 반려견의 혈액 내 cfDNA의 수준 측정을 통해 반려견의 종양 예후를 예측할 수 있는지를 확인하기 위한 실험을 수행하였는데, 본 발명의 일실시예에 따르면 38 마리의 종양 질환군에 대한 혈장 cfDNA를 관찰기간(최대 60주) 동안 분석하였다. Furthermore, the present inventors conducted an experiment to determine whether the dog's tumor prognosis can be predicted by measuring the level of cfDNA in the dog's blood. According to an embodiment of the present invention, plasma cfDNA for 38 tumor disease groups was obtained. Analysis was conducted during the observation period (up to 60 weeks).

그 결과, 각 실험군 반려견의 cfDNA 수준을 기반으로 ROC 곡선을 생성하였고, cfDNA 농도에 대한 컷-오프 값을 분석한 결과, 컷-오프 값이 1,247.5 μg/L인 것으로 측정되었다. 컷-오프 값을 이용하여 종양으로 진단받은 반려견들에 대한 생존 곡선을 분석한 결과, cfDNA 농도가 컷-오프 값인 1,247.5 μg/L 보다 낮은 수치를 보인 군들은 생존 확률이 82.1%로 비교적 높은 생존율을 보이는 것으로 나타난 반면, cfDNA 농도가 1,247.5 μg/L 보다 높은 수치를 보인 군들은 생존 확률이 26.5%로 낮은 생존율을 보이는 것으로 나타났다.As a result, an ROC curve was generated based on the cfDNA level of dogs in each experimental group, and as a result of analyzing the cut-off value for the cfDNA concentration, the cut-off value was measured to be 1,247.5 μg/L. As a result of analyzing the survival curve for dogs diagnosed with tumors using the cut-off value, the group with a cfDNA concentration lower than the cut-off value of 1,247.5 μg/L had a survival probability of 82.1%, indicating a relatively high survival rate. On the other hand, the group with a cfDNA concentration higher than 1,247.5 μg/L showed a low survival rate with a survival probability of 26.5%.

그러므로 본 발명자들은 종양이 발병된 반려견에 대해서도 혈액 내 cfDNA 농도를 측정하여 상기 반려견의 종양 예후의 예측이 가능함을 알 수 있었다.Therefore, the present inventors found that it is possible to predict the tumor prognosis of the dog by measuring the cfDNA concentration in the blood even for a dog with a tumor.

이에 본 발명은 (a) 피검체 유래의 생물학적 시료에서 cfDNA(Cell-free DNA) 수준을 측정하는 단계; 및 (b) 측정된 cfDNA 수준을 ROC(Receiver Operation Characteristic) 곡선 분석에 의해 설정된 컷-오프(cut-off) 값과 비교하는 단계를 포함하는 반려견의 종양 예후 예측방법을 제공할 수 있다.Accordingly, the present invention comprises the steps of: (a) measuring the level of cfDNA (Cell-free DNA) in a biological sample derived from a subject; and (b) comparing the measured cfDNA level with a cut-off value set by Receiver Operation Characteristic (ROC) curve analysis.

본 발명에서 상기 “예후”는 특정 질병 또는 질환에 대한 한 객체 즉, 검사 개체가 질환을 차후에 가지게 될지의 여부를 판정하는 것, 치료에 대한 검사 개체의 반응성을 판정하는 것, 또는 치료 효능에 대한 정보를 제공하기 위하여 개체의 상태를 모니터링하는 것을 모두 포함한다. In the present invention, the “prognosis” refers to an object for a specific disease or condition, that is, determining whether a test subject will have a disease in the future, determining the responsiveness of a test subject to treatment, or determining the efficacy of a treatment It includes both monitoring the condition of an entity to provide information.

또한, 상기 “종양 예후”는 종양의 치료 후에 해당 개체의 개발, 전이, 약물 반응성, 내성, 생존율 등과 같은 여부를 판단하는 것을 의미한다.In addition, the “tumor prognosis” refers to determining whether the subject develops, metastases, drug reactivity, resistance, survival rate, etc. after treatment of the tumor.

또한 상기 방법은 상기 측정된 cfDNA 수준이 컷-오프(cut-off) 값보다 낮은 경우 상기 반려견의 생존 확률이 높을 것으로 판단하고, 상기 측정된 cfDNA 수준이 컷-오프(cut-off) 값보다 높은 경우 상기 반려견의 생존 확률이 낮을 것으로 판단하는 단계를 더 포함할 수 있다.In addition, the method determines that the survival probability of the dog is high when the measured cfDNA level is lower than the cut-off value, and the measured cfDNA level is higher than the cut-off value In this case, the method may further include determining that the survival probability of the dog is low.

이때 상기 설정된 컷-오프(cut-off) 값은 1,247.5 ug/L일 수 있다.In this case, the set cut-off value may be 1,247.5 ug/L.

보다 구체적으로, 상기 측정된 cfDNA 수준이 컷-오프(cut-off) 값인 1,247.5 ug/L 보다 낮은 경우, 상기 반려견의 상기 생존 확률은 80% 이상일 것으로 예측할 수 있고, 상기 측정된 cfDNA 수준이 컷-오프(cut-off) 값인 1,247.5 ug/L 보다 높은 경우, 상기 반려견의 상기 생존 확률은 30% 미만일 것으로 예측할 수 있다.More specifically, when the measured cfDNA level is lower than the cut-off value of 1,247.5 ug/L, the survival probability of the dog can be predicted to be 80% or more, and the measured cfDNA level is cut- If it is higher than the cut-off value of 1,247.5 ug/L, the survival probability of the dog can be predicted to be less than 30%.

또한 cfDNA 수준 측정을 통해 예후를 예측할 수 있는 상기 종양 질환은, 이에 제한되지는 않으나, 간세포암, 이소성 갑상선암, 폐선암, 유선암, 세포 갑상선암, 편평세포암, 신장세포암, 이행상피암, 장 선암, 림프종, 백혈병, 혈관육종, 간질육종, 구강평활근 육종, 위장기질종양(GIST), 다엽성 뼈종양, 비만세포종양, 갈색 세포종 및 말초 신경초 종양으로 이루어진 군 중에서 선택된 것일 수 있다.In addition, the above tumor diseases whose prognosis can be predicted by measuring cfDNA levels include, but are not limited to, hepatocellular carcinoma, ectopic thyroid cancer, lung adenocarcinoma, mammary gland cancer, cell thyroid cancer, squamous cell cancer, renal cell cancer, transitional epithelial cancer, intestinal adenocarcinoma, It may be selected from the group consisting of lymphoma, leukemia, angiosarcoma, stromal sarcoma, oral leiomyosarcoma, gastrointestinal stromal tumor (GIST), multilobed bone tumor, mast cell tumor, pheochromocytoma, and peripheral nerve sheath tumor.

이하, 본 발명의 구성요소와 기술적 특징을 다음의 실시예들을 통하여 보다 상세하게 설명하고자 한다. 그러나 하기 실시예들은 본 발명의 내용을 예시하는 것일 뿐 발명의 범위가 실시예에 의해 한정되는 것은 아니다.Hereinafter, the components and technical features of the present invention will be described in more detail through the following examples. However, the following examples are merely illustrative of the content of the present invention, and the scope of the present invention is not limited by the examples.

<실험재료 및 방법><Test materials and methods>

1. 실험설계1. Experimental design

하기 실시예의 실험은 경상 동물 의료원을 방문한 개를 대상으로 무작위 시험관 내 실험을 수행한 것으로, 모든 개의 혈장 cfDNA 농도를 측정하고 질병 분류에 따라 임상 데이터를 분석하였으며, 경상대학교(GNU)의 기관동물 관리위원회 (IACUC)의 승인 하에 실험을 수행하였다.The experiment in the following example was a randomized in vitro experiment performed on dogs who visited Gyeongsang Animal Medical Center, and the plasma cfDNA concentrations of all dogs were measured and clinical data were analyzed according to disease classification. Institutional Animal Management of Gyeongsang National University (GNU) Experiments were performed with the approval of the Committee (IACUC).

<1> 케이스 선택<1> Select case

본 실험은 2019년부터 2020년까지 경상 동물 의료원을 방문한 120 마리의 동물을 무작위로 선별하여 채취한 혈액 샘플을 사용하여 분석하였고, 대조군 샘플은 전주와 광주에 있는 지역 병원에서 수득한 것을 사용하였다. 반려견의 품종, 성별 및 나이는 모두 다양했고, 진단서에 종양 질환군, 비종양성 질환군 및 정상군(건강한 반려견 군)으로 분류하였다. 또한 모든 개의 임상데이터와 의료기록을 수집하고 이를 함께 평가하였다. 샘플에 대한 데이터에는 개의 연령, 성별, 품종, 전혈검사 (CBC; complete blood count), 혈청 생화학, 정맥혈 가스 분석 및 진단 영상 결과, 기저 질환진행 및 임상결과가 포함되어 있으며, 이러한 데이터는 생존 퇴원 vs 죽거나 안락사된 것으로 정의하였다.This experiment was analyzed using blood samples collected from random selection of 120 animals who visited Gyeongsang Animal Medical Center from 2019 to 2020, and control samples obtained from local hospitals in Jeonju and Gwangju were used. Dog breeds, sex, and age were all diverse, and the diagnosis was classified into a tumor disease group, a non-neoplastic disease group, and a normal group (healthy dog group). In addition, clinical data and medical records of all dogs were collected and evaluated together. Data on samples include age, sex, breed, complete blood count (CBC), serum biochemistry, venous blood gas analysis and diagnostic imaging results, underlying disease progression and clinical results. It was defined as dead or euthanized.

<1-1> 건강한 군<1-1> healthy group

건강한 견주 소유의 개는 기저 질병에 걸린 개와의 비교를 위한 대조군으로 사용하였다. 혈액 샘플은 전주와 광주 지역의 동물병원에 전달된 임상적으로 정상적인 고객 소유의 개 35 마리로부터 채취하여 수득하였다. 또한 현재 질병의 이력, 정기 임상검사에서 발견된 이상소견 또는 전혈(CBC), 혈청 생화학 또는 소변 분석에서 이상증상이 있는 반려견들은 제외시켰다.Dogs from healthy owners were used as controls for comparison with dogs with underlying disease. Blood samples were obtained from 35 clinically normal customer-owned dogs delivered to veterinary hospitals in Jeonju and Gwangju. In addition, dogs with a history of current disease, abnormal findings found in regular clinical examinations, or abnormal symptoms in whole blood (CBC), serum biochemistry, or urine analysis were excluded.

<1-2> 비종양성 질환군(기저 질환이 있는 군)<1-2> Non-neoplastic disease group (group with underlying disease)

비종양군에는 임상 증상을 보이며 종양 이외의 기저 질환으로 진단된 모든 반려견을 포함하도록 하였다. 모든 비종양성 군은 물리적 테스트, 실험실 테스트 및 진단영상 분석을 수행하였다. 비종양성군의 의료 기록은 진료 기록, 병력, 신체 검사, 임상 징후, 일상적인 혈액 분석, 완전 소변검사 및 진단영상을 포함하도록 하였다.In the non-tumor group, all dogs who showed clinical symptoms and were diagnosed with an underlying disease other than tumor were included. All non-neoplastic groups underwent physical tests, laboratory tests, and diagnostic imaging analyses. Medical records of the non-neoplastic group included medical records, medical history, physical examination, clinical signs, routine blood analysis, complete urinalysis, and diagnostic images.

이러한 선별 검사를 바탕으로 정확한 진단을 위해 추가 검사를 통한 여러 사례를 평가하였다. 심내막염(Endocarditis)은 1시간 간격으로 정맥 천자를 통해 최소 3개의 다른 부위에서 동일한 원인균을 배양했을 때, 심초음파 및 혈액 배양을 통해 추가로 진단하였다. Mycoplasma haemocanis 및 Babesia canis와 같은 혈액 기생충은 중합효소연쇄반응(PCR)의 분석을 통해 진단하였다. 면역 매개 용혈성 빈혈 (IMHA; immune-mediated hemolytic anemia)이 있는 모든 개는 식염수 응집 검사와 혈액 필름 검사를 통해 용혈을 기반으로 확인하였다. 개의 부신피질 과다증 (HAC; Hyperadrenocorticism)은 저용량 덱사메타손 억제 검사(LDDST)에 근거하여 뇌하수체 의존성 부신피질 과다증(PDH) 또는 부신종양(AT)으로 진단하였다. 외인성 스테로이드 치료 이력이 있는 개는 치료 중단 후 최소 2주 후에 검사를 받았다. 췌장염은 SNAP 키트를 이용한 개 췌장리파제 (cPL) 검사(Canine SNAP® cPLTM; IDEXX Laboratories Inc., Westbrook, ME, USA)를 사용한 검사, 혈액 검사 및 약물 또는 음식 이력을 포함하여 복통, 구토, 설사, 발열, 복부 초음파와 같은 임상 징후를 기반으로 종합적으로 진단하였다. 급성 췌장염의 경우, 개 췌장 특이적 리파아제(Spec cPL; 개 사양 cPL® 테스트, IDEXX Laboratories Inc., Westbrook, ME, USA)를 통해 치료에 대한 반응을 모니터링하였다. 림프관 확장증(Lymphangiectasia)과 혈관 확장증(vascular ectasia)은 생검 샘플의 육안 병변과 조직 병리에 근거하여 위장 내시경을 통해 확인하였다. 피부 석회증(calcinosis cutis)이 있는 개는 포피 주위에 병변이 있는 것으로 확인하였고, 확실한 진단은 병변의 피부 생검을 기반으로 확인하였다. 마지막으로 컴퓨터 단층 촬영(CT) 스캔(Canon Aquilion Lightning 160; Canon Medical Systems Corporation, Otawara, Japan)을 기반으로 기관지 연화증과 죽상 동맥 경화증을 진단하였다.Based on these screening tests, several cases were evaluated through additional tests for an accurate diagnosis. Endocarditis was further diagnosed through echocardiography and blood culture when the same causative bacteria were cultured in at least three different sites through venipuncture at 1 hour intervals. Blood parasites such as Mycoplasma haemocanis and Babesia canis were diagnosed by polymerase chain reaction (PCR) analysis. All dogs with immune-mediated hemolytic anemia (IMHA) were identified on the basis of hemolysis by saline agglutination test and blood film test. Canine hyperadrenocorticism (HAC) was diagnosed as pituitary-dependent hyperadrenocorticism (PDH) or adrenal tumor (AT) based on the low-dose dexamethasone inhibition test (LDDST). Dogs with a history of exogenous steroid treatment were examined at least 2 weeks after discontinuation of treatment. Pancreatitis can be diagnosed with abdominal pain, vomiting, diarrhea, A comprehensive diagnosis was made based on clinical signs such as fever and abdominal ultrasound. For acute pancreatitis, response to treatment was monitored via canine pancreatic specific lipase (Spec cPL; canine spec cPL® test, IDEXX Laboratories Inc., Westbrook, ME, USA). Lymphangiectasia and vascular ectasia were confirmed by gastrointestinal endoscopy based on gross lesions and histopathology of biopsy samples. Dogs with calcinosis cutis were confirmed to have a lesion around the foreskin, and a definitive diagnosis was confirmed based on a skin biopsy of the lesion. Finally, bronchomalacia and atherosclerosis were diagnosed based on computed tomography (CT) scans (Canon Aquilion Lightning 160; Canon Medical Systems Corporation, Otawara, Japan).

<1-3> 종양 질환군<1-3> tumor disease group

종양 질환군의 종양 유형은 다양했지만 악성 종양이 발병한 개 38 마리로 구성된 단일 종양군에 대한 분석을 진행하였는데, 모든 진단은 병력, 임상 징후, 혈액 검사, 진단 영상 및 미세바늘흡인(FNA;fine needle aspiration)을 통한 세포 검사를 기반으로 수행하였다. 조직병리학적으로 생검 또는 수술적 절제를 통해 확실한 진단을 내렸다. 반려견의 종양이 수술적 절제 또는 생검이 어려운 부위에 있는 경우에는 이전 진단 방법을 종합적으로 평가하여 진단을 내렸다. 전산화 단층 촬영, 복부 초음파 및 혈액 검사를 포함하여 세계보건기구 병기 결정 시스템 (OwenLN. 1980)에 따라 종양 유형에 따른 악성 종양의 병기를 진단하였다. 개 림프종의 임상적 병기 결정(OwenLN.1980)은 표면 림프절, 간 및 비장 침범에 대한 임상 검사 및 미세바늘흡인 분석을 기반으로 하였다. 골수 흡인을 사용하여 말기 침윤을 평가하였다. 모든 말초 마디 및 기타 종양 덩어리는 2차원으로, 가능하면 3차원으로 측정하였다. 관찰 시간은 진단 직후 계산하였다. cfDNA 수준이 질병 진행과 관련이 있는지 확인하기 위해 시간이 지남에 따라 악성 종양이 있는 10 마리의 개로부터 혈액을 반복적으로 채취하였다. 내과 기록, 품고, 성별, 병력, 신체 검사, 임상 징후, 일상적인 혈액 분석 및 진단 영상을 포함한 종양 집단의 의료 기록을 검토하였다. 방사선 치료는 양산의 S 동물병원에서 시행하였고 Elekta Synergy® (Elekta, Stockholm, Sweden)를 사용하였다. 모든 방사선 치료 프로토콜은 각 반려견에 대해 개별적으로 적용되도록 하였다.Although the types of tumors in the tumor group were diverse, we analyzed a single tumor group consisting of 38 dogs with malignant tumors. It was performed based on cytology through needle aspiration). Histopathologically, a definitive diagnosis was made by biopsy or surgical excision. If the dog's tumor was in an area where surgical resection or biopsy was difficult, the diagnosis was made by comprehensively evaluating previous diagnostic methods. Malignant tumors were staged according to tumor type according to the World Health Organization staging system (OwenLN. 1980), including computed tomography, abdominal ultrasound, and blood tests. Clinical staging of canine lymphoma (OwenLN.1980) was based on clinical examination and microneedle aspiration analysis of superficial lymph node, liver and spleen involvement. Bone marrow aspiration was used to evaluate terminal infiltration. All peripheral nodes and other tumor masses were measured in two dimensions, possibly in three dimensions. Observation time was calculated immediately after diagnosis. Blood was repeatedly drawn from 10 dogs with malignant tumors over time to determine if cfDNA levels were associated with disease progression. Medical records of the tumor population were reviewed, including medical records, fertility, sex, medical history, physical examination, clinical signs, routine blood analysis, and diagnostic imaging. Radiation therapy was performed at S Animal Hospital in Yangsan, and Elekta Synergy® (Elekta, Stockholm, Sweden) was used. All radiotherapy protocols were to be applied individually for each dog.

<2> 혈액 샘플 수집 및 처리<2> Blood sample collection and processing

임상적으로 정상인 개와 병에 걸린 개의 모든 샘플들은 경정맥 천자를 통해 수집하였고 EDTA 튜브 또는 리튬 헤파린 튜브 또는 혈청 분리 튜브에 보관하였다. EDTA 혈액 샘플은 자동 혈액 분석기를 사용하여 분석하였다. 헤파린화 된 혈장 또는 혈청은 샘플 수집 후 30 분 이내에 2,000×g에서 5 분 동안 원심 분리하여 말초 혈액에서 분리하였다. 혈장 또는 혈청의 상등액을 플라스틱 저온 튜브로 옮겼다. 지역 동물병원의 샘플은 드라이아이스로 보관하여 GNU로 이송되었다. 모든 샘플은 DNA 분석 전에 초저온 냉동고에서 -80°C의 온도로 냉동된 상태로 보관하였다. 헤파린 화된 혈장 또는 혈청 샘플을 실온(RT)에서 해동하고 분석 직전에 원심 분리를 수행하였다. 종양질환 개에서 여러 차례 채취한 혈액 샘플은 화학 요법이 투여되기 전에 샘플링하였다.All samples from clinically normal dogs and diseased dogs were collected by jugular venipuncture and stored in EDTA tubes or lithium heparin tubes or serum separation tubes. EDTA blood samples were analyzed using an automated hematology analyzer. Heparinized plasma or serum was separated from peripheral blood by centrifugation at 2,000 × g for 5 minutes within 30 minutes of sample collection. The supernatant of plasma or serum was transferred to a plastic cryo tube. Samples from the local veterinary hospital were stored on dry ice and transported to GNU. All samples were stored frozen at a temperature of -80 °C in a cryogenic freezer prior to DNA analysis. Heparinized plasma or serum samples were thawed at room temperature (RT) and centrifuged immediately prior to analysis. Blood samples from multiple oncological dogs were sampled before chemotherapy was administered.

2. 임상데이터의 비교분석2. Comparative analysis of clinical data

의료 기록에서 수집된 데이터에는 품종, 나이, 성별, 체중, 이력, 임상 징후, 신체 검사 결과, 전체 혈구수 및 혈청 생화학을 포함한 모든 임상 병리학적 데이터의 평가 자료가 포함되도록 하였다.Data collected from medical records included evaluation of all clinical pathologic data including breed, age, sex, weight, history, clinical signs, physical examination results, complete blood count, and serum biochemistry.

<2-1> 임상병리학적 매개변수<2-1> Clinicopathological parameters

120 마리 개의 임상 상태는 혈액학적 분석, 산-염기 균형, 전해질 농도, 혈청 생화학적 분석 및 소변 분석을 ProCyteDx 완전 혈구수 카운트(IDEXX, Westbrook, ME, USA), 혈액 가스 분석기(Nova pHOX analyzer, Nova Biomedical, Waltham, MA, USA)를 이용하여 수행하였고, 혈액요소질소(BUN), 크레아티닌, 인, 포도당, 총 단백질, 알부민, 글로불린, 총 빌리루빈, ALKP, 알라닌 아미노전이효소(ALT), GGT, 콜레스테롤, 아밀라아제, 리파아제의 분석을 위해 Catalyst Dx 화학분석기(IDEXX, Westbrook, ME, USA) 및 소변 분석기(IDEXX, Westbrook, ME, USA)로 분석하였다.The clinical condition of 120 dogs was performed using a ProCyteDx complete blood count (IDEXX, Westbrook, ME, USA), a blood gas analyzer (Nova pHOX analyzer, Nova Biomedical, Waltham, MA, USA), blood urea nitrogen (BUN), creatinine, phosphorus, glucose, total protein, albumin, globulin, total bilirubin, ALKP, alanine aminotransferase (ALT), GGT, cholesterol , amylase, and lipase were analyzed with a Catalyst Dx chemical analyzer (IDEXX, Westbrook, ME, USA) and a urine analyzer (IDEXX, Westbrook, ME, USA).

<2-2> 결절 림프종(nodal lymphoma)에 대한 평가 기준<2-2> Evaluation criteria for nodal lymphoma

다중심성 림프종(Multicentric lymphoma) 견에서 표재성 림프절의 길이는 기존 합의 기준(Vail et al., 2010)에 근거하여 림프절의 가장 긴 지름에 비해 지름이 20mm 이상인 림프절의 총합으로 평가하였다. 다중심성 림프종이 있는 개의 림프절 직경은 화학요법 직전에 각 신체 검사 중에 측정되었다. 평가자는 두 명의 수의사를 포함하도록 하였다. 결과는 기존 합의 기준에 따라 각 평가자의 림프절 직경(LD) 값의 합의 차이가 20% 미만일 때 기록하도록 하였다.The length of superficial lymph nodes in dogs with multicentric lymphoma was evaluated as the total number of lymph nodes with a diameter greater than 20 mm compared to the longest diameter of the lymph nodes based on the existing consensus criteria (Vail et al., 2010). Lymph node diameters in dogs with multicentral lymphoma were measured during each physical examination immediately prior to chemotherapy. The raters included two veterinarians. Results were recorded when the difference in the sum of the lymph node diameter (LD) values of each rater was less than 20% according to the existing consensus criteria.

<2-3> 화학요법 반응평가 기준<2-3> Criteria for chemotherapy response evaluation

치료 및 재발 기준에 대한 반응은 신체 검사 및 추가 검사를 기반으로 당업계에 알려진 림프종((Vail et al., 2010) 및 기타 고형 종양((Nguyen et al., 2015)에 따른 기준 설명에 따라 정의하였다. 병변 반응은 모든 내방 시 평가하였다.Response to treatment and recurrence criteria is defined according to the criteria description according to art-known lymphomas ((Vail et al., 2010) and other solid tumors ((Nguyen et al., 2015)) based on physical examination and further examination. The lesion response was evaluated at all visits.

결절 림프종의 치료 반응 평가에서 표적 병변은 기준선에서 LD가 20mm 이상인 말초 림프절(PLN)을 측정하도록 하였다. 표적 병변은 크기(LD가 있는 PLN) 및 정확한 반복 측정에 대한 적합성(즉, 영상기술 없이 임상적으로)을 기준으로 선택하였다. LD는 각 표적 병변에 대해 측정하였다. 모든 표적 병변에 대한 LD의 합계를 계산하고 기준선 합계 LD로 기록하였다. 다른 모든 병변은 비표적 병변으로 정의하여 병변의 길이를 기록하였다.In the evaluation of treatment response for nodular lymphoma, the target lesion was a peripheral lymph node (PLN) with an LD greater than or equal to 20 mm at baseline. Target lesions were selected based on size (PLN with LD) and suitability for accurate repeat measurements (ie, clinically without imaging techniques). LD was measured for each target lesion. The sum of the LDs for all target lesions was calculated and reported as the baseline sum LD. All other lesions were defined as non-target lesions and the length of the lesion was recorded.

고형 종양의 치료 반응 평가에서 표적 병변의 최소 크기는 다음과 같이 정의하였다.The minimum size of the target lesion in the evaluation of the treatment response of solid tumors was defined as follows.

i) 임상 검사: 캘리퍼 측정에 기반하고 디지털 사진을 근거로 한 10mm,i) Clinical examination: 10 mm based on caliper measurements and digital photos;

ii) CT 스캔, 자기공명영상(MRI): 10mm; 최대 슬라이스 두께 5mm,ii) CT scan, magnetic resonance imaging (MRI): 10 mm; Maximum slice thickness 5mm,

iii) 흉부 방사선 사진: 20 mm, 및iii) chest radiograph: 20 mm, and

iv) LN : 짧은 중심축이 > 15mmiv) LN: short central axis > 15mm

다른 모든 병변은 측정 불가능한 것으로 간주하였다. 예컨대, 캘리퍼 측정에 기초한 병변이 <10 mm; 병리학적 LN <15 mm 단축; 복수, 흉막 및 심낭 삼출; 신체 검사에 의해 발견된 기관 비대와 같은 조건일 시 측정 불가능한 병변으로 정의하였다(Nguyen et al., 2015).All other lesions were considered non-measurable. For example, lesions based on caliper measurements are <10 mm; pathological LN <15 mm shortening; ascites, pleural and pericardial effusions; It was defined as an unmeasurable lesion under conditions such as organ hypertrophy found by physical examination (Nguyen et al., 2015).

3. cfDNA 분리 및 정량분석3. cfDNA Isolation and Quantitation

혈장 또는 혈청 샘플을 실온에서 10분 동안 해동한 다음, 모든 샘플을 16,000 × g 및 4 °C에서 10 분 동안 원심분리하여 무세포(cell-free) 혈장을 수득하였다. 원심분리 후 정제된 상층액만을 cfDNA 분석에 사용하였다. cfDNA는 제조업체의 사양에 따라 Qubit dsDNA HS Assay Kit 및 Qubit 1.0 형광계(Life Sciences, Carlsbad, CA, USA)로 정량화하였다. Qubit 분석은 dsDNA에 결합할 때 높은 강도를 갖는 형광염료를 사용하여 분석하는 것이며, 측정된 형광염료의 양은 시료 내에 있는 dsDNA의 양에 비례한다. 1회 분석 당 사용되는 반응 부피는 10 μL의 혈장 또는 혈청시료를 포함하여 200 μL로 하였다. Qubit 1.0 (Life Science, Carlsbad, CA, USA) 내에서 제조업체가 제공하는 희석 알고리즘을 사용하여 cfDNA의 농도를 계산하였다. Qubit 1.0은 각 분석 전에 지정된 표준물질로 보정하였고, 모든 샘플은 2번씩 분석하였다.Plasma or serum samples were thawed at room temperature for 10 min, and then all samples were centrifuged at 16,000 × g and 4 °C for 10 min to obtain cell-free plasma. Only the supernatant purified after centrifugation was used for cfDNA analysis. cfDNA was quantified with a Qubit dsDNA HS Assay Kit and a Qubit 1.0 fluorometer (Life Sciences, Carlsbad, CA, USA) according to the manufacturer's specifications. Qubit analysis uses a fluorescent dye having high intensity when binding to dsDNA, and the amount of the measured fluorescent dye is proportional to the amount of dsDNA in the sample. The reaction volume used per analysis was 200 µL including 10 µL of plasma or serum samples. The concentration of cfDNA was calculated using the dilution algorithm provided by the manufacturer in Qubit 1.0 (Life Science, Carlsbad, CA, USA). Qubit 1.0 was calibrated with a designated standard before each analysis, and all samples were analyzed twice.

4. 통계처리4. Statistical processing

평균, 표준 편차 및 유의한 차이를 계산하였는데, cfDNA 데이터의 농도는 Shapiro-Wilk 테스트에서 정상적으로 분포되지 않았으므로 데이터는 정규화를 위해 역변환시켰다. 범주형 변수(예컨대: 질병 상태, 종양의 존재) 간의 비교는 Mann-Whitney U 테스트를 사용하여 수행하였고 종양 유형 간의 비교는 Kruskal-Wallis 테스트와 Dunnett T3 테스트를 통해 수행하였다. 생존 시간 예측을위한 cfDNA의 진단 값은 ROC(receiver operating characteristic) 곡선을 사용하여 평가하였다. Kaplan-Meier 곡선 분석은 ROC에서 얻은 컷-오프 값으로 종양 그룹의 생존 시간을 결정하기 위해 생존 곡선을 분석하는데 사용하였다. Spearman의 상관 관계 테스트는 표재성 림프절의 합과 다중심성 림프종의 DNA 농도에 대한 상관성을 분석하는데 사용하였다. 연속적으로 모니터링되는 질병 진행이 있는 개체의 cfDNA 값과 혈액학적 매개변수 간의 상관관계는 선형 혼합 모델을 사용하여 분석하였다. cfDNA 농도와 모든 임상 병리학적 변수 사이의 연관성은 단계적 배제가 있는 다중 선형 회귀 모델을 개량하여 분석하였다.Mean, standard deviation, and significant difference were calculated. The concentrations of cfDNA data were not normally distributed in the Shapiro-Wilk test, so the data were inversely transformed for normalization. Comparisons between categorical variables (eg, disease status, presence of tumors) were performed using the Mann-Whitney U test and comparisons between tumor types were performed using the Kruskal-Wallis test and Dunnett T3 test. The diagnostic value of cfDNA for survival time prediction was evaluated using a receiver operating characteristic (ROC) curve. Kaplan-Meier curve analysis was used to analyze survival curves to determine survival time of tumor groups with cut-off values obtained from ROC. Spearman's correlation test was used to analyze the correlation between the sum of superficial lymph nodes and the DNA concentration of polycentric lymphoma. Correlations between cfDNA values and hematological parameters in subjects with continuously monitored disease progression were analyzed using a linear mixed model. The association between cfDNA concentration and all clinical pathologic variables was analyzed by modifying a multiple linear regression model with stepwise exclusion.

통계적 유의성은 P <0.05 및 P <0.01로 설정하였고, 통계 소프트웨어 패키지 SPSS(SPSS 25.0, SPSS Inc, Chicago, IL, USA)를 사용하여 모든 통계 평가를 수행하였다. 모든 그래프는 GraphPad Prism 7.0 (GraphPad Software, La Jolla, CA, USA)을 사용하여 플롯하였고, 모든 결과는 평균 ± 표준 편차(SD)로 표시하였다.Statistical significance was set at P < 0.05 and P < 0.01, and all statistical evaluations were performed using the statistical software package SPSS (SPSS 25.0, SPSS Inc, Chicago, IL, USA). All graphs were plotted using GraphPad Prism 7.0 (GraphPad Software, La Jolla, CA, USA), and all results were expressed as mean ± standard deviation (SD).

<실시예 1><Example 1>

개들의 분류와 특성Classification and Characteristics of Dogs

다양한 품종, 체중 및 연령의 총 120 마리의 개를 연구에 사용하였다. 이 동물들은 기저 질환의 유무에 따라 85 마리의 질병군 및 35 마리의 건강한 대조군으로 분류하였다. 질병군은 종양성 질환의 유무에 따라 다시 38 마리는 종양 질환군으로 47 마리는 비종양 질환군으로 분류하였다.A total of 120 dogs of various breeds, weights and ages were used in the study. These animals were divided into 85 diseased animals and 35 healthy controls according to the presence or absence of underlying disease. According to the presence or absence of oncological disease, 38 animals were classified into oncological disease group and 47 animals into non-tumor disease group.

총 85 마리에 대하여 전혈구 수, 혈액가스 분석, 생화학 분석 및 진단 영상을 포함한 임상 데이터를 분석하였고, 35 마리의 건강한 대조군에 대해서는 임상 기록, 전혈구 수 및 생화학 방법에 따라 분석하였다. 혈액 가스 및 전해질 분석은 동물의 운송 및 운송 중에 혈액 가스 및 전해질 변화가 발생할 수 있기 때문에 부분적으로 분석을 수행하였다.Clinical data including total blood cell count, blood gas analysis, biochemical analysis, and diagnostic images were analyzed for a total of 85 animals. For 35 healthy controls, clinical records, complete blood cell count and biochemical methods were analyzed. Blood gas and electrolyte analysis was performed in part because blood gas and electrolyte changes may occur during transport and transport of animals.

구체적으로 본 실험에 사용된 반려견들의 분류와 특징을 설명하면 다음과 같다.Specifically, the classification and characteristics of the dogs used in this experiment will be described as follows.

건강한 개 35 마리는 수컷 21 마리(중성화 하지 않은 수컷 4 마리)와 암컷 14 마리(중성화 하지 않은 암컷 4 마리)가 포함되며, 평균 연령은 5.4세(범위 : 1-19 세)이다. 비종양성 질환이 있는 47 마리의 개는 수컷 26 마리(온전한 4 마리)와 암컷 21 마리(온전한 9 마리)이며, 평균 연령은 9.5세(범위 : 1-17 세)이다. 38마리의 종양성 질환이 있는 개는 평균 연령 11 세(범위 : 3-20 세)이며, 11 마리의 수컷과 27 마리의 암컷(온전한 4마리)을 포함한다. 종양성 질환 및 비종양성 질환의 개의 연령은 건강한 대조군보다 유의하게 높았다(종양성 질환군은 평균 11세, 비종양성 질환군 9.5세, 건강한 군은 5.4세, 각각 P <0.01 및 P <0.05). 종양의 기원에 따른 가장 흔한 악성 종양 유형은 암종(n=15; 간세포암 3 마리, 이소성 갑상선암 3 마리, 폐선암 2 마리, 유선암 2 마리, C-세포 갑상선암 1 마리, 편평세포암 1 마리, 신장세포암 1 마리, 이행상피암 1 마리, 장 선암 1 마리)인 것으로 나타났고, 그 다음으로 림프종 또는 백혈병(n = 13), 육종 (n = 5, 혈관육종 1 마리, , 간질육종 1 마리, 구강평활근 육종 1 마리, 위장기질종양(GIST) 1마리 및 다엽성 뼈종양 1 마리), 비만세포종양(n = 2), 및 갈색 세포종 및 말초 신경초 종양 각각 1 마리의 순으로 나타났다. 상기와 같이 분류된 각 실험군에 대한 특성 확인은 하기 표 1(본 발명의 실험에 사용된 건강한 군, 비종양성 기저질환군 및 종양질환 군에 대한 특성 확인)에 정리하여 나타내었다.The 35 healthy dogs included 21 males (4 unneutered males) and 14 females (4 unneutered females), with an average age of 5.4 years (range: 1-19 years). The 47 dogs with non-neoplastic disease were 26 males (4 intact) and 21 females (9 intact), with a mean age of 9.5 years (range: 1-17 years). 38 dogs with neoplastic disease had an average age of 11 years (range: 3-20 years), including 11 males and 27 females (4 intact). The age of dogs with neoplastic disease and non-neoplastic disease was significantly higher than that of the healthy control group (mean 11 years for the oncological disease group, 9.5 years for the non-neoplastic disease group, and 5.4 years for the healthy group, respectively, Po0.01 and Po0.05). The most common malignant tumor types according to tumor origin were carcinoma (n=15; 3 hepatocellular carcinomas, 3 ectopic thyroid carcinomas, 2 lung adenocarcinomas, 2 mammary carcinomas, 1 C-cell thyroid carcinoma, 1 squamous cell carcinoma, and renal 1 cell carcinoma, 1 transitional cell carcinoma, 1 intestinal adenocarcinoma), followed by lymphoma or leukemia (n = 13), sarcoma (n = 5, hemangiosarcoma 1 patient, , stromal sarcoma 1 patient, oral 1 leiomyosarcoma, 1 gastrointestinal stromal tumor (GIST) and 1 multilobed bone tumor), mast cell tumor (n = 2), and pheochromocytoma and peripheral nerve sheath tumor in 1 patient, respectively. Characteristic confirmation for each experimental group classified as described above is summarized in Table 1 below (characteristic confirmation for the healthy group, non-neoplastic underlying disease group, and tumor disease group used in the experiment of the present invention).

[표 1][Table 1]

Figure pat00001
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Figure pat00002
Figure pat00002

Figure pat00003
Figure pat00003

Figure pat00004
Figure pat00004

Figure pat00005
Figure pat00005

F, female; FS, female spayed; M, male; NM, neutered maleF, female; FS, female spayed; M, male; NM, neutral male

<실시예 2><Example 2>

임상데이터의 비교결과Comparison of clinical data

혈액학, 생화학 및 전해질 매개변수를 포함하여 상기 실시예 1의 각 실험군에 대한 임상 데이터를 분석하였다. 임상 병리학적 데이터의 비교를 위해 종양 유무에 따라 실험동물군을 세분화 하였고, 종양질환 군 및 건강한 군 간에는 유의한 차이가 확인되었고, 120 마리 모두의 혈액학적 데이터를 분석하였다.Clinical data for each experimental group of Example 1 were analyzed, including hematology, biochemistry and electrolyte parameters. For comparison of clinical pathological data, experimental animal groups were subdivided according to the presence or absence of tumors, significant differences were confirmed between the tumor disease group and the healthy group, and hematological data of all 120 animals were analyzed.

Figure pat00006
Figure pat00006

건강한 군, 비종양성 질환군 및 종양 질환군의 임상 데이터에 대한 평균 변수Mean variables for clinical data in the healthy group, non-neoplastic disease group, and tumor disease group

데이터는 평균 ± SD로 표시하였고, Kruskal-Wallis 테스트, P <0.05; Mann-Whitney U 테스트, *는 P <0.05를 나타내고 **는 P <0.01을 나타낸 것이다.Data are expressed as mean ± SD, Kruskal-Wallis test, P <0.05; Mann-Whitney U test, * indicates P <0.05 and ** indicates P < 0.01.

BUN: 혈액 요소 질소, iCa: 이온화 칼슘, iMg: 이온화된 마그네슘, HCO3: 중탄산염을 나타낸 것이다.BUN: blood urea nitrogen, iCa: ionized calcium, iMg: ionized magnesium, HCO 3: bicarbonate.

혈액학적 분석 결과는 상기 표 2에 나타내었는데, 분석결과에 의하면 종양질환 군 및 비종양성 질환군 모두 평균 호중구 수(종양 질환군, 12.50 ± 8.95 × 109/L, 비종양성 군, 11.54 ± 8.29 × 109/L)가 유의하게 높은 것으로 나타났고(P <0.01), 적혈구, 적혈구 용적율 및 헤모글로빈 농도의 수준은 건강한 군에 비해 유의적으로 낮은 것(종양 질환군: 5.72 ± 1.46 × 1012/L, 36.45 ± 9.68 %, 12.50 ± 3.33 g/dL 각각, 비종양성 질환군: 5.84 ± 1.62 × 1012/L, 38.36 ± 11.19 %, 13.18 ± 3.73 g/dL 각각) 으로 나타났다(도 1A 및 1B). 또한, 종양 질환군(63.58 ± 6.05 fL)은 건강한 군(66.31 ± 2.45 fL)에 비해 감소된 MCV를 나타내었고, 반면 비종양성 질환군(73.07 ± 74.80 × 103/L, 0.30 ± 0.34 × 109/L, 각각)은 건강한 군(80.60 ± 31.45 × 103/L 및 0.41 ± 0.24 x 109/L, 각각)에 비해 망상 적혈구 및 호산구 수가 감소된 것으로 나타났다(P <0.05).The results of hematological analysis are shown in Table 2, and according to the analysis results, the average number of neutrophils in both the tumor disease group and the non-neoplastic disease group (tumor disease group, 12.50 ± 8.95 × 10 9 /L, non-neoplastic group, 11.54 ± 8.29 × 10 9 /L) was significantly higher (P < 0.01), and the levels of red blood cells, hematocrit and hemoglobin concentration were significantly lower than in the healthy group (tumor disease group: 5.72 ± 1.46 × 10 12 /L). , 36.45 ± 9.68%, 12.50 ± 3.33 g/dL, respectively, non-neoplastic disease group: 5.84 ± 1.62 × 10 12 /L, 38.36 ± 11.19%, and 13.18 ± 3.73 g/dL, respectively) ( FIGS. 1A and 1B ). In addition, the tumor disease group (63.58 ± 6.05 fL) showed reduced MCV compared to the healthy group (66.31 ± 2.45 fL), whereas the non-neoplastic disease group (73.07 ± 74.80 × 10 3 /L, 0.30 ± 0.34 × 10 9 ) /L, respectively) showed reduced reticulocyte and eosinophil counts (P <0.05) compared to the healthy group (80.60 ± 31.45 × 10 3 /L and 0.41 ± 0.24 × 10 9 /L, respectively).

또한, ALKP, GGT 및 아밀라아제 수치는 종양 질환군 및 비종양성 질환군(종양 질환군: 555.15 ± 798.71 U/L, 10.65 ± 15.64 U/L 및 888.96 ± 446.48 U/L, 각각, 비종양성 질환군: 738.70 ± 1370.21 U/L, 33.97 ± 72.35 U/L 및 770.44 ± 300.54 U/L, 각각) 모두에서 건강한 군(92.34 ± 119.31 U/L, 1.13 ± 3.24 U/L, 606.40 ± 187.96 U/L, 각각) 에 비해 유의하게 증가한 것으로 나타났다(도 1A 및 1C). 또한, 비종양성 질환군(0.88 ± 0.99 mg/dL)의 크레아티닌 수치는 건강한 군(0.82 ± 0.18 mg/dL)에 비해 유의하게 증가한 것으로 나타났다(P <0.05). 그러나 알부민 수치는 건강한 군(3.40 ± 0.32g)에 비해 종양 질환군 및 비종양성 질환군(2.94 ± 0.51 g/dL 및 3.01 ± 0.48 g/dL, 각각)에서 유의하게 감소한 것으로 나타났다(P <0.01).(도 1A).In addition, ALKP, GGT and amylase levels were measured in the tumor group and non-neoplastic group (tumor group: 555.15 ± 798.71 U/L, 10.65 ± 15.64 U/L and 888.96 ± 446.48 U/L, respectively, in the non-neoplastic disease group: 738.70 ± 1370.21 U/L, 33.97 ± 72.35 U/L and 770.44 ± 300.54 U/L, respectively) in the healthy group (92.34 ± 119.31 U/L, 1.13 ± 3.24 U/L, 606.40 ± 187.96 U/L, respectively) ) was significantly increased compared to ( FIGS. 1A and 1C ). Also, the creatinine level of the non-neoplastic disease group (0.88 ± 0.99 mg/dL) was significantly increased compared to that of the healthy group (0.82 ± 0.18 mg/dL) (P <0.05). However, albumin levels were significantly decreased in the tumor group and non-neoplastic group (2.94 ± 0.51 g/dL and 3.01 ± 0.48 g/dL, respectively) compared to the healthy group (3.40 ± 0.32 g) (P < 0.01). . (Fig. 1A).

또한, 전해질 및 혈액 가스 분석 결과, 종양 질환군과 비종양성 질환군 모두 나트륨, 칼륨 및 중탄산염 농도가 건강한 군에 비해 감소한 것으로 나타났다(종양 질환군: 146.14 ± 3.50 mmol/L, 4.18 ± 0.50 mmol/L 및 22.07 ± 4.01 mmol/L, 각각, 비종양성 질환군: 144.99 ± 5.69 mmol/L, 4.21 ± 0.62 mmol/L, 21.17 ± 4.04 mmol/L, 각각, 건강한 군: 148.30 ± 2.65 mmol/L, 4.71 ± 0.49 mmol/L 및 24.03 ± 2.59 mmol/L, 각각)(P <0.05). 그러나 이온화된 칼슘 농도는 건강한 군(1.21 ± 0.07 mmol/L)보다 종양 및 비종양성 질환군(1.27 ± 0.06 mmol/L 및 1.26 ± 0.09 mmol/L, 각각)에서 유의하게 증가한 것으로 나타났다(P <0.05). 종양 질환군에서 젖산 농도가 낮다는 점을 제외하고는 종양 질환군 및 비종양성 질환군 간의 다른 전해질의 차이는 관찰되지 않았다.In addition, as a result of electrolyte and blood gas analysis, both the tumor disease group and the non-neoplastic disease group showed decreased sodium, potassium and bicarbonate concentrations compared to the healthy group (tumor disease group: 146.14 ± 3.50 mmol/L, 4.18 ± 0.50 mmol/L) and 22.07 ± 4.01 mmol/L, respectively, non-neoplastic disease group: 144.99 ± 5.69 mmol/L, 4.21 ± 0.62 mmol/L, 21.17 ± 4.04 mmol/L, respectively, healthy group: 148.30 ± 2.65 mmol/L, 4.71 ± 0.49 mmol/L and 24.03 ± 2.59 mmol/L, respectively) (P <0.05). However, the ionized calcium concentration was significantly increased in the tumor and non-neoplastic disease groups (1.27 ± 0.06 mmol/L and 1.26 ± 0.09 mmol/L, respectively) than in the healthy group (1.21 ± 0.07 mmol/L) (P <0.05). ). No other electrolyte differences were observed between the tumor disease group and the non-neoplastic disease group, except for the low lactate concentration in the tumor disease group.

<실시예 3><Example 3>

cfDNA 농도 비교결과cfDNA concentration comparison result

<3-1> 건강한 군 및 질병군에서의 cfDNA 분석<3-1> cfDNA analysis in healthy and diseased groups

건강한 개(건강한 군) 및 임상적으로 질환이 있는 개(질병군)에 대한 cfDNA 농도 분석 결과를 도 2A에 나타내었다. 구체적으로, 건강한 군에서의 cfDNA 평균 농도는 877.8 ± 181.7 μg/L인 것으로 확인되었다. 클리닉에서 진단 또는 치료를 받은 총 85 마리의 개를 임상학적으로 질환이 있는 군으로 분류하였다. 질환군에서의 cfDNA 평균 농도는 1,333 ± 478.3 μg/L인 것으로 나타났고, 이러한 결과는 건강한 군에서보다 그 농도가 유의하게 높은 것으로 확인되었다(P <0.001).The results of cfDNA concentration analysis for healthy dogs (healthy group) and clinically diseased dogs (disease group) are shown in FIG. 2A . Specifically, it was confirmed that the average concentration of cfDNA in the healthy group was 877.8 ± 181.7 μg/L. A total of 85 dogs diagnosed or treated at the clinic were classified as clinically diseased. The average concentration of cfDNA in the disease group was found to be 1,333 ± 478.3 μg/L, and this result was confirmed to be significantly higher than that in the healthy group (P <0.001).

다음으로 임상적으로 질병이 있는 개들에 대해서는, 종양이 있는 군 및 종양이 없는 군으로 분류하였다. 종양 질환을 앓고 있는 개의 수는 38 마리였고, 47 마리는 다른 질병으로 진단받았다. 건강한 군, 비종양성 질환군 및 종양 질환군에서의 평균 cfDNA 농도는 각각 877.8 ± 181.7 μg/L, 1,154.4 ± 326.5 μg/L 및 1,553.9 ± 544.3 μg/L인 것으로 나타났다. 종양 질환군과 비종양성 질환군 간에는 cfDNA 농도에 상당한 차이가 있는 것으로 나타났고(P <0.001), 종양 질환군 및 건강한 군 간에도 유의한 차이가 있는 것으로 나타났다(P <0.001) (도 2B).Next, for the clinically diseased dogs, a group with a tumor and a group without a tumor were classified. The number of dogs with tumor disease was 38, and 47 dogs were diagnosed with other diseases. The mean cfDNA concentrations in the healthy group, non-neoplastic disease group and tumor disease group were 877.8 ± 181.7 µg/L, 1,154.4 ± 326.5 µg/L and 1,553.9 ± 544.3 µg/L, respectively. There was a significant difference in cfDNA concentration between the tumor disease group and the non-neoplastic disease group (P < 0.001), and there was also a significant difference between the tumor disease group and the healthy group (P < 0.001) ( FIG. 2B ).

<3-2> 다양한 종양 유형에서의 cfDNA 농도 비교<3-2> Comparison of cfDNA concentration in various tumor types

나아가 본 발명자들은 종양의 원인에 따른 다양한 종양 유형에서의 cfDNA 농도를 비교 분석하였다. 이를 위해 각각 림프종양(n = 13), 암종 (n = 15), 육종 (n = 5), 기타 종양 (n = 5)에서의 cfDNA 농도를 분석하였고, 또한 건강한 군과도 비교하였다.Furthermore, the present inventors compared and analyzed the cfDNA concentration in various tumor types according to the cause of the tumor. To this end, cfDNA concentrations in lymphoma (n = 13), carcinoma (n = 15), sarcoma (n = 5), and other tumors (n = 5) were analyzed, respectively, and compared with the healthy group.

그 결과, 도 3에 나타낸 바와 같이, 종양 질환군에서의 혈장 DNA가 건강한 군에 비해 유의하게 높은 것으로 나타났다(P <0.001). 한편, cfDNA의 농도를 종양 기원에 따라 비교했을 때 림프종양이 가장 높은 농도로 존재하는 것으로 나타났다.As a result, as shown in FIG. 3 , plasma DNA in the tumor disease group was significantly higher than in the healthy group (P <0.001). On the other hand, when the concentration of cfDNA was compared according to tumor origin, it was found that lymphoma was present at the highest concentration.

이러한 결과를 통해 본 발명자들은 반려견에서 종양이 발생한 경우, 종양이 발생하지 않은 경우에 비해 혈액 내 cfDNA의 농도가 증가한다는 사실을 토대로, cfDNA의 농도 분석을 통해 반려견의 종양 발생 여부를 예측 또는 진단할 수 있음을 알 수 있었다.Based on the fact that the concentration of cfDNA in the blood increases when a tumor develops in a dog compared to a case in which no tumor occurs, the present inventors can predict or diagnose whether a dog develops a tumor by analyzing the concentration of cfDNA. knew that it could be

<실시예 4><Example 4>

cfDNA 분석을 통한 종양이 있는 개의 예후 평가Evaluation of the prognosis of tumor-bearing dogs by cfDNA analysis

cfDNA의 농도 변화가 질환에 대한 예후 평가에 있어서 중요한 지표로 사용될 수 있는지를 분석하기 위해, 38 마리의 종양 질환군에 대한 혈장 cfDNA를 관찰 기간 동안 분석하였다.To analyze whether the change in the concentration of cfDNA can be used as an important indicator in the prognostic evaluation of disease, plasma cfDNA for 38 tumor disease groups was analyzed during the observation period.

그 결과, cfDNA 수준을 기반으로 ROC 곡선을 생성하였고 cfDNA 농도에 대한 컷-오프 값을 분석한 결과, 컷-오프 값이 1,247.5 μg/L인 것으로 나타났으며, 곡선아래면적(AUC)은 0.701 (95 % 신뢰 구간, 0.523-0.880; P <0.05), 86.7 % 민감도 및 52.2 % 특이도인 것으로 나타났다(도 4).As a result, an ROC curve was generated based on the cfDNA level, and as a result of analyzing the cut-off value for the cfDNA concentration, the cut-off value was found to be 1,247.5 μg/L, and the area under the curve (AUC) was 0.701 ( 95% confidence interval, 0.523-0.880; Po0.05), 86.7% sensitivity and 52.2% specificity (Fig. 4).

대부분의 개는 cfDNA가 1,247.5 μg/L 이하인 군(14 마리)과 cfDNA가 1,247.5 μg/L 이상인 군(24 마리)의 두 그룹으로 나뉘었고, 컷-오프 값을 이용하여 생존 곡선을 분석한 결과, 컷-오프 값보다 낮은 개는 생존 확률이 82.1 %인 것으로 나타난 반면, 컷-오프 값보다 높은 개는 생존 확률이 26.5 %인 것으로 나타났다(도 5). 따라서 60주 동안 종양 질환군의 개에 대한 cfDNA의 농도를 모니터링한 결과, cfDNA의 농도 분석을 통해 종양 질환군에 대한 예후, 구체적으로는 생존 확률을 예측할 수 있음을 알 수 있었으며, cfDNA의 농도가 컷-오프 값 1,247.5 μg/L 보다 낮은 경우, 생존 확률이 높을 것으로 예측 또는 진단할 수 있으며, 반면 cfDNA의 농도가 컷-오프 값 1,247.5 μg/L 보다 높은 경우에는 생존 확률이 낮을 것으로 예측 또는 진단할 수 있음을 알 수 있었다.Most of the dogs were divided into two groups: a group with cfDNA of 1,247.5 μg/L or less (14 dogs) and a group with cfDNA of 1,247.5 μg/L or more (24 dogs). As a result of analyzing survival curves using cut-off values, Dogs lower than the cut-off value showed a survival probability of 82.1%, whereas dogs higher than the cut-off value showed a survival probability of 26.5% (Fig. 5). Therefore, as a result of monitoring the concentration of cfDNA in dogs of the tumor disease group for 60 weeks, it was found that the prognosis for the tumor disease group, specifically the survival probability, could be predicted through the concentration analysis of cfDNA. If the cut-off value is lower than 1,247.5 μg/L, a high probability of survival can be predicted or diagnosed, whereas when the concentration of cfDNA is higher than the cut-off value of 1,247.5 μg/L, the survival probability is predicted or diagnosed as low. knew that it could be

<실시예 5><Example 5>

cfDNA 분석을 통한 종양의 치료반응 모니터링Monitoring of tumor treatment response through cfDNA analysis

<5-1> 케이스 설명<5-1> Case Description

총 10 마리의 종양 진단을 받은 개를 대상으로 화학 요법 또는 방사선 요법 동안 지속적으로 cfDNA 농도를 모니터링하였다. 10 마리의 종양 진단을 받은 동물 중, 6 마리의 개는 림프종(lymphoma), 2 마리는 이소성 갑상선암(ectopic thyroid carcinoma), 1 마리는 장 선암(intestinal adenocarcinoma) 및 다른 1 마리는 혈관 육종(hemangiosarcoma)으로 진단되었다. 또한 10 마리 중, 6 마리는 화학 요법을 처치하였고, 1 마리는 외과적 절제술을, 다른 1 마리는 완화 요법 처치를 받았다. 나머지 2 마리는 방사선 요법 치료를 받았다. 다중심성 B 세포 림프종 진단을 받은 4 마리의 개 모두 CHOP (UW-Madison-19) 프로토콜에 기반한 화학요법 치료를 받았다. L-asparaginase는 이들 4마리 모두에 대해 유도 시 사용하였다. 10 마리 중 3 마리는 완전완화(complete remission)로 평가되었고, 1 마리는 안정(stable disease)으로 평가되었으며, 2 마리는 진행성 질환 반응으로, 나머지 4 마리는 질병 진행으로 인한 사망으로 평가되었다. 이들 각 개에 대한 특성은 하기 표 3에 나타내었고, 각 실험 동물에 대한 모니터링 절차는 아래에 기술되어 있으며, 도 6에 나타나 있다.A total of 10 tumor-diagnosed dogs were continuously monitored for cfDNA concentrations during chemotherapy or radiation therapy. Of the 10 animals diagnosed with tumors, 6 dogs had lymphoma, 2 dogs had ectopic thyroid carcinoma, 1 animal had intestinal adenocarcinoma, and 1 dog had hemangiosarcoma. was diagnosed with Also out of 10 animals, 6 received chemotherapy, 1 underwent surgical resection, and 1 underwent palliative care. The remaining two animals were treated with radiation therapy. All four dogs diagnosed with multicentric B-cell lymphoma received chemotherapy treatment based on the CHOP (UW-Madison-19) protocol. L-asparaginase was used for induction in all four animals. 3 out of 10 animals were evaluated for complete remission, 1 for stable disease, 2 for progressive disease response, and 4 for death due to disease progression. The characteristics for each of these dogs are shown in Table 3 below, and the monitoring procedure for each experimental animal is described below and is shown in FIG. 6 .

Figure pat00007
Figure pat00007

후속연구 동안 평가된 종양질환 군에 대한 10 마리 개의 임상적 특징10 Clinical Characteristics of Oncology Groups Evaluated During Follow-up Study

CR: complete remission, SD: stable disease, PD: progressive disease, NA: not available. * According to the WHO staging system(Liptak et al., 2004; Valli et al., 2011).CR: complete remission, SD: stable disease, PD: progressive disease, NA: not available. * According to the WHO staging system (Liptak et al., 2004; Valli et al., 2011).

개 no. 1: 단계 Ⅳb의 다중심성 B 세포 림프종이며, L-CHOP 화학요법(UW-Madison-19)을 2차로(cyclophosphamide) 받기 직전 cfDNA 농도는 1,070 μg/L였다. 개는 화학요법을 받기 위해 매주 병원을 방문하였고, 진단 당시 LD의 합은 268mm 였으나 점차 감소하여 화학요법 2 개월 후 LD의 합은 0mm였다. 복부 림프절 크기, 간 및 비장도 2개월마다 모니터링하였다. 그 결과 항암 화학요법 후, 2 개월마다 림프절 크기가 점차 감소하고 마지막 평가에서 간과 비장으로의 종양 세포 침윤이 관찰되지 않았다. 동시에, cfDNA의 농도는 860 μg/L로 가장 낮은 것으로 나타났다(도 6A). 질병이 진행되는 동안 cfDNA 양은 림프절 크기와 유의하게 상관 관계가 있는 것으로 나타났다(P <0.01) (도 7).dog no. 1: It is a stage IVb multicentric B-cell lymphoma, and the cfDNA concentration was 1,070 μg/L just before receiving the second dose (cyclophosphamide) of L-CHOP chemotherapy (UW-Madison-19). The dog visited the hospital every week for chemotherapy. At the time of diagnosis, the sum of LD was 268 mm, but it gradually decreased to 0 mm after 2 months of chemotherapy. Abdominal lymph node size, liver and spleen were also monitored every 2 months. As a result, after chemotherapy, lymph node size gradually decreased every 2 months, and tumor cell infiltration into the liver and spleen was not observed at the last evaluation. At the same time, the concentration of cfDNA was found to be the lowest at 860 μg/L (Fig. 6A). During disease progression, the amount of cfDNA was significantly correlated with lymph node size (P < 0.01) (Fig. 7).

개 no. 2: 단계 Ⅴb 다중심성 B 세포 림프종 질환이 있고, L-CHOP 화학 요법 전에 처음 측정된 cfDNA 농도는 1,585 μg/L 이었고 LD의 합은 205 mm였다. 2가지 변수는 화학요법 시작 2 주 후에 감소한 것으로 나타났다(도 6B). 다음 2 개월 동안 약 2 주 간격으로 cfDNA와 LD의 합을 측정했을 때, LD와 cfDNA의 합을 기준으로 부분 완화(PR; partial remission)로 평가되었다. 부분 완화 상태로 166일 후 혈장의 cfDNA는 이전 농도 보다 2배인 것으로 나타났고, LD의 합도 화학요법 시작 6 개월 후 증가한 것으로 나타났다. 동시에 신체검사에서 발열과 저혈압이 확인되었고 혈액 검사에서 호중구 좌방 이동(band cell, 10,809 cells/μl)를 동반한 백혈구 증가(60.59 × 109/L)와 심한 혈소판 감소증(27 × 103/μl)이 확인되었다. 일주일 후, 임상 징후는 기준선과 유사했으며 혈액 검사에서 범혈구 감소증이 확인되었다. LD 및 혈장 DNA 수준은 모두 이전보다 낮았다. 개는 5일 후에 사망하였다. 질병이 진행되는 동안 cfDNA와 림프절 크기는 유의한 상관 관계가 있는 것으로 나타났다(P <0.01) (도 7).dog no. 2: With stage Vb multicentric B-cell lymphoma disease, the cfDNA concentration first measured before L-CHOP chemotherapy was 1,585 μg/L and the sum of LDs was 205 mm. Both variables appeared to decrease 2 weeks after initiation of chemotherapy ( FIG. 6B ). When the sum of cfDNA and LD was measured at approximately 2-week intervals for the next 2 months, partial remission (PR) was evaluated based on the sum of LD and cfDNA. After 166 days in partial remission, plasma cfDNA was found to be twice the previous concentration, and the sum of LD was also increased 6 months after initiation of chemotherapy. At the same time, a physical examination revealed fever and hypotension, and a blood test showed an increase in leukocytes (60.59 × 10 9 /L) with left neutrophils (band cell, 10,809 cells/μl) and severe thrombocytopenia (27 × 10 3 /μl). This was confirmed. After one week, clinical signs were similar to baseline and blood tests confirmed pancytopenia. Both LD and plasma DNA levels were lower than before. The dog died 5 days later. There was a significant correlation between cfDNA and lymph node size during disease progression (P < 0.01) (Fig. 7).

개 no. 3: 화학요법 시작 전 혈장 cfDNA 수준이 930 μg/L인 단계 Ⅳb 다중심성 B 세포 림프종이 있다. L-CHOP 화학요법 (UW-Madison-19) 처치를 시작한 지 한달 후 LD의 합은 감소했지만 cfDNA는 유사한 농도를 보였다(도 6C). 그러나 no. 3의 개는 호중구 감소증으로 인해 일주일 동안 실험이 일시 중단되었다. 1주일 후 34 일에 cfDNA 농도가 1,705 μg/L이고 LD의 합이 137.5 mm으로 확인되어 2가지 변수의 급격한 증가가 관찰되었다. 이들 변수는 독소루비신 (L-CHOP 프로토콜 4주기) 주사 후 1 주일 후에 감소하였다. 그러나 개는 화학요법 시작 후 3 개월 만에 사망했으며, 식욕 부진, 우울증, 질병 진행 및 약물 내성에 따른 발열과 같은 심각한 임상 징후가 있었다. LD와 cfDNA 농도의 합은 유의한 상관 관계가 있는 것으로 나타났다(P <0.01) (도 7).dog no. 3: I have stage IVb multicentric B-cell lymphoma with a plasma cfDNA level of 930 μg/L prior to initiation of chemotherapy. One month after initiation of L-CHOP chemotherapy (UW-Madison-19) treatment, the sum of LDs decreased, but cfDNA showed a similar concentration ( FIG. 6C ). but no. In 3 dogs, the experiment was suspended for a week due to neutropenia. One week later, on day 34, the cfDNA concentration was 1,705 μg/L and the sum of LDs was 137.5 mm, and a sharp increase in two variables was observed. These variables decreased one week after doxorubicin (4 cycles of L-CHOP protocol) injection. However, the dog died 3 months after initiation of chemotherapy and had severe clinical signs such as anorexia, depression, disease progression and fever with drug resistance. The sum of LD and cfDNA concentrations showed a significant correlation (P < 0.01) (Fig. 7).

개 no. 4: 단계 Ⅴb의 다중심성 T 세포 림프종 질환이 있으며, 화학요법 전 첫 방문에서 cfDNA 농도는 1,860 μg/L이었고 LD의 합은 59 mm였다. 4 일째에는 L- 아스파라기나제 주사로 로무스틴 기반 화학요법(구조 프로토콜)을 시작했다. 마지막으로, 개가 3 주 후 두 번째로 치료를 받았을 때, 2 일에 표면 림프절이 거의 만져지지 않았고 혈장 DNA 수준이 866.5 μg/L로 떨어진 것으로 나타났다(도 6D). 그 이후로 cfDNA는 3주마다 분석하였는데 cfDNA의 농도는 도 6D와 같이 전반적으로 비슷한 수치를 보였다. 정확한 수치는 기록되지 않았지만 2번째 화학요법 처치 이후 표면 림프절이 발전하지 않은 것으로 나타났다. 마지막 5 주기 이후 개는 완전 완화 (CR; complete remission)를 보였고 지금까지 CR 상태를 계속 유지하고 있다.dog no. 4: With stage Vb multicentral T-cell lymphoma disease, the cfDNA concentration at the first visit before chemotherapy was 1,860 μg/L and the sum of LDs was 59 mm. On day 4, lomustine-based chemotherapy (rescue protocol) was initiated with L-asparaginase injection. Finally, when the dog was treated for the second time after 3 weeks, it was found that on day 2 the superficial lymph nodes were barely palpable and the plasma DNA level dropped to 866.5 μg/L ( FIG. 6D ). After that, cfDNA was analyzed every 3 weeks, and the concentration of cfDNA was generally similar as shown in FIG. 6D. Exact numbers were not recorded, but it did not appear that the superficial lymph nodes developed after the second chemotherapy treatment. After the last 5 cycles, the dog showed complete remission (CR) and has maintained CR status until now.

개 no. 5: 개는 소장을 외과적으로 절제한 후 장의 선암을 진단 받았다. 수술 후 전이 평가를 위해 동물병원으로 이송했고, 당시 측정된 최초의 cfDNA 농도는 1,555 μg/L였다. 이후 2개월 마다 전이 평가를 위해 임상 징후, 혈액 매개 변수 및 CT 스캔을 모니터링하고 치료에 대한 반응을 CR로 평가하였으며, cfDNA 농도는 2 개월마다 측정하였는데, 점진적으로 농도가 감소하는 것으로 나타났다(도 6E).dog no. 5: The dog was diagnosed with adenocarcinoma of the intestine after surgical resection of the small intestine. After surgery, he was transferred to a veterinary hospital for metastasis evaluation, and the initial cfDNA concentration measured at that time was 1,555 μg/L. Thereafter, clinical signs, blood parameters and CT scans were monitored for metastasis evaluation every 2 months, and response to treatment was evaluated by CR, and cfDNA concentrations were measured every 2 months, showing a gradual decrease in concentrations (Fig. 6E). ).

개 no. 6: 단계 Ⅳ의 후복강 혈관육종 질환이 있으며, 복부 종괴는 처음 방문했을 때 주된 문제였으며 당시 cfDNA의 농도는 1,400 μg/L였다. 종괴를 수술적으로 절제한 다음, piroxicam(Piroxicam; GL Pharma, Chungbuk, Korea) 0.3 mg/kg, cyclophosphamide(Alkyloxan; Ildong Pharm, Seoul, Korea) 15 mg/m2, doxycycline (Doxycycline Hyclate; Kukje Pharm, Seongnam, Korea) 5 mg/kg을 생검 결과까지 24시간 마다 경구 투여하는 화학요법 처치를 진행하였다. 3주 후 cfDNA 수치는 1,120 μg/L로 감소했다(도 6F). VAC 프로토콜(Alvarez et al., 2013)을 시작하기 전에 cfDNA 수준은 989.5 μg/L로 더 떨어졌다. 그러나 개 DNA 농도는 VAC 화학요법 2회차 이후 점차 증가했다. 마지막으로 마지막 cfDNA 농도가 가장 높은 날에 SDMA가 증가하고 혈액 검사에서 질소혈증(azotemia)이 확인되었다. 개 주인은 마지막 cfDNA 측정일인 74일째에 화학요법을 중단하기로 결정했다.dog no. 6: We have stage IV retroperitoneal hemangiosarcoma disease. Abdominal mass was the main problem at the first visit, and the concentration of cfDNA was 1,400 μg/L. After surgical resection of the mass, piroxicam (Piroxicam; GL Pharma, Chungbuk, Korea) 0.3 mg/kg, cyclophosphamide (Alkyloxan; Ildong Pharm, Seoul, Korea) 15 mg/m 2 , doxycycline (Doxycycline Hyclate; Kukje Pharm, Seongnam, Korea) was administered chemotherapy in which 5 mg/kg was orally administered every 24 hours until the biopsy result. After 3 weeks, the cfDNA level decreased to 1,120 μg/L ( FIG. 6F ). Before starting the VAC protocol (Alvarez et al., 2013), cfDNA levels further dropped to 989.5 μg/L. However, the dog DNA concentration gradually increased after the second round of VAC chemotherapy. Finally, on the last day of the highest cfDNA concentration, SDMA increased and blood tests confirmed azotemia. The dog owner decided to stop chemotherapy on day 74, the last cfDNA measurement.

개 no. 7: 개는 비상피성 피부 T세포 림프종으로 진단 받았다. 최초 방문시 혈장 DNA 농도는 985.5 μg/L였다. 그러나 식욕 부진, 우울증, 흑색변과 같은 임상 징후가 악화되어 화학요법을 시행하지 않았다. 대신 완화요법을 처치하였다. 주인은 40 일째에 개를 안락사시키기로 결정했고, 개의 마지막날의 cfDNA 농도는 1,435 μg / L로 이전보다 약간 높은 수치를 나타내었다(도 6G).dog no. 7: The dog was diagnosed with non-epithelial cutaneous T-cell lymphoma. The plasma DNA concentration at the first visit was 985.5 μg/L. However, chemotherapy was not performed because clinical signs such as anorexia, depression, and melanoma worsened. Instead, palliative care was administered. The owner decided to euthanize the dog on day 40, and the cfDNA concentration on the last day of the dog was 1,435 μg / L, which was slightly higher than before (Fig. 6G).

개 no. 8: 단계 Ⅳb의 다중심성 T 세포 림프종으로 진단받았다. L-CHOP 프로토콜을 이용한 화학요법이 시작되었고 다음날 cfDNA 농도가 증가한 것으로 나타났다(도 6H). 마지막으로 개는 화학요법 4일 후 종양 용해 증후군으로 사망했다.dog no. 8: Diagnosed with stage IVb multicentric T-cell lymphoma. Chemotherapy using the L-CHOP protocol was initiated and the cfDNA concentration appeared to increase the next day (Fig. 6H). Finally, the dog died of oncolytic syndrome 4 days after chemotherapy.

개 no. 9: 개는 조직 병리학상 심장의 이소성 갑상선암으로 진단 받았다. 첫 방문 시 cfDNA는 1,490 μg/L로 측정되었다. 이후 3 주마다 cfDNA 수준을 분석하고 췌장염 치료와 치료를 병행하여 복강 천자를 통한 복막 삼출을 제거했다. 개는 51 일에 심낭 절제술을 받고 한 달 후 3일 동안 방사선 요법을 받았다(도 6I). cfDNA는 1개월과 3개월 간격으로 분석되었고 수치는 점차 증가하는 것으로 나타났다. 그러나 개의 임상징후 중 하나였던 복막 삼출은 첫 방문부터 현재까지 지속적으로 관찰되었으며, CT를 통해 주기적으로 모니터링했을 때 종양 크기는 일정하게 유지되는 것으로 나타났다.dog no. 9: The dog was histopathologically diagnosed with ectopic thyroid cancer of the heart. At the first visit, cfDNA was measured at 1,490 μg/L. Thereafter, cfDNA levels were analyzed every 3 weeks and peritoneal effusion was removed by peritoneal puncture in combination with pancreatitis treatment. Dogs underwent pericardiocystectomy on day 51 and radiation therapy for 3 days one month later ( FIG. 6I ). cfDNA was analyzed at 1-month and 3-month intervals, and the level was found to gradually increase. However, peritoneal effusion, which was one of the clinical signs of dogs, was continuously observed from the first visit to the present, and the tumor size was maintained constant when periodically monitored by CT.

개 no. 10: 상기 9번 개와 같은 부위에서 이소성 갑상선 암종을 진단 받았으며 심낭 절제술과 방사선 요법을 통해 치료 받았다. 초기 진단 전에 측정된 DNA 농도는 1,200 μg/L였다. 2 주 후, 개는 심낭 절제술을 받고 총 12 번의 방사선 치료를 받았다. 마지막 방사선 치료 후 약 한 달 후에 측정된 두 번째 cfDNA 농도는 1,860 μg/L로 2 개월 전 수준보다 증가한 것으로 나타났다(도 6J). 또한 개를 치료했지만 심장 기저부에 위치한 종괴의 크기가 증가하여 기관 이탈을 일으켜 기침을 유발했다.dog no. 10: He was diagnosed with ectopic thyroid carcinoma in the same area as dog 9 above, and was treated with pericardiotomy and radiation therapy. The DNA concentration measured before the initial diagnosis was 1,200 μg/L. Two weeks later, the dog underwent pericardectomy and a total of 12 radiation treatments. The second cfDNA concentration measured about one month after the last radiation treatment was 1,860 μg/L, which was higher than the level two months before (Fig. 6J). They also treated the dog, but the mass at the base of the heart increased in size, causing organ dislocation and coughing.

<5-2> 화학요법에 대한 반응에서 혈장 cfDNA의 역학 분석<5-2> Epidemiologic analysis of plasma cfDNA in response to chemotherapy

cfDNA 농도의 변화 추세는 종양 질환군 8 마리의 치료 기간 동안 분석하였다(도 6). 다중심성 B 세포 림프종으로 진단된 1번, 2번 및 3번 개에서, cfDNA는 치료 기간 동안 한 사람에 의해 지속적으로 모니터링하였다. 각 개의 표재성 림프절 LD의 합은 cfDNA 농도와 유의하게 관련이 있는 것으로 나타났다(P <0.01) (도 7). 또한 cfDNA와 LD의 합에 대한 그래픽 분석은 시간이 지남에 따라 증가 및 감소하는 경향을 보여주었다. 또한 일반적으로 화학요법에 반응하는 CR(완전완화) 또는 PR(부분완화)은 두 곡선에서 모두 감소하는 경향을 보였고 PD(부분질환)에서 증가하는 경향을 나타내었다(도 6). 한편, 2번과 3번 개는 진행성 질환으로 사망했으나, cfDNA와 LD의 합은 사망 5 ~ 7 일 전 1주일 전에 비해 감소한 것으로 나타났다. 또한 범혈구 감소증(호중구 감소증 (0.889 × 103/μl, 기준 범위, 2.95-11.64 × 103/μl), 혈소판 감소증 (12 × 103/μl, 기준 범위, 200-500 × 103/μl), 비재생성 경증 빈혈( PCV, 33 %; 기준 범위, 37.3 ~ 61.7 %)은 2가지의 변수 감소와 동시에 2번 개의 혈액 검사에서 확인되었으며, 3번 개도 만료 1 주일 전에 범혈구 감소증이 있는 것으로 확인되었다. 그리고 cfDNA와 LD의 합이 동시에 감소한 것으로 나타났다(도 6B 및 6C).The trend of change in cfDNA concentration was analyzed during the treatment period of 8 mice in the tumor disease group (FIG. 6). In dogs #1, #2 and #3 diagnosed with multicentric B-cell lymphoma, cfDNA was continuously monitored by one person during the treatment period. The sum of superficial lymph node LDs in each dog was found to be significantly related to cfDNA concentration (P < 0.01) (Fig. 7). In addition, graphical analysis of the sum of cfDNA and LD showed an increasing and decreasing trend over time. Also, in general, CR (complete remission) or PR (partial remission) responding to chemotherapy showed a tendency to decrease in both curves, and showed a tendency to increase in PD (partial disease) ( FIG. 6 ). On the other hand, dogs 2 and 3 died from progressive disease, but the sum of cfDNA and LD decreased compared to 5-7 days before 1 week before death. Also, pancytopenia (neutropenia (0.889 × 10 3 /μl, baseline range, 2.95-11.64 × 10 3 /μl), thrombocytopenia (12 × 10 3 /μl, baseline range, 200-500 × 10 3 /μl) , Non-regenerative mild anemia (PCV, 33 %; baseline range, 37.3 to 61.7 %) was confirmed in two blood tests concurrently with two variable reductions, and in dog three, pancytopenia was confirmed one week before expiration. And it was found that the sum of cfDNA and LD decreased at the same time ( FIGS. 6B and 6C ).

또한, 4번 및 5번 개는 모두 CR(완전완화)로 평가되었다. 4번 개에서는 화학요법이 진행됨에 따라 cfDNA 농도가 두드러지게 감소하는 것으로 나타났다. 그러나 6번, 7번 및 8번 개에서는 진행성 질환 또는 사망하는 것으로 나타났다. 6번 개의 경우, 화학요법 시작 시 DNA 농도가 감소하였으나 다시 증가하는 경향으로 확인되었다. 8번 개에서는 화학요법 시작 1일 후 증가하였으나, 결국 화학요법 4일 후 종양 용해 증후군으로 사망하였다.In addition, dogs 4 and 5 were both evaluated as CR (complete remission). Dog 4 showed a marked decrease in cfDNA concentration as chemotherapy progressed. However, dogs 6, 7 and 8 showed progressive disease or death. In case of dog 6, the DNA concentration decreased at the start of chemotherapy, but showed a tendency to increase again. In dog 8, the increase was increased 1 day after initiation of chemotherapy, but eventually died of tumor lysis syndrome 4 days after chemotherapy.

<5-3> 방사선요법에 대한 반응에서 혈장 cfDNA의 역학 분석<5-3> Epidemiologic analysis of plasma cfDNA in response to radiotherapy

나아가 종양 질환군의 2마리의 개에 대하여 방사선 치료를 받은 이후의 cfDNA 경향을 분석하였다(도 6I 및 6J). 9번 및 10번 개 모두 방사선 상태를 기초로 안정 질병(SD)으로 평가되었으나, cfDNA 농도는 2개월 후까지 증가하는 것으로 나타났다. 또한 종양 크기와 임상 징후는 치료 전과 유사한 것으로 나타났다. 10번 개는 방사선 치료 후, 한 달 동안 기침증상을 보였고, 초음파에서 종괴의 크기가 이전보다 커진 것으로 나타났다.Furthermore, cfDNA trends after radiation treatment were analyzed for two dogs in the tumor disease group ( FIGS. 6I and 6J ). Dogs 9 and 10 were both assessed as stable disease (SD) based on radiation status, but cfDNA concentrations were found to increase until 2 months later. In addition, tumor size and clinical signs were similar to those before treatment. Dog No. 10 showed coughing symptoms for one month after radiation treatment, and the size of the mass was larger than before on ultrasound.

이상과 같은 실험 결과들에 의하면, 반려견들을 대상으로 건강한 군, 비종양성 질환군 및 종양 질환군 사이의 cfDNA 농도의 차이가 있음을 확인함으로써, cfDNA를 반려견의 종양 진단용 바이오 마커로 사용할 수 있음을 알 수 있었다. 뿐만 아니라 본 발명자들은 종양 질환의 개에 대한 혈액 내 cfDNA 농도를 측정하여 종양에 따른 개의 생존율에 대한 정량적인 컷-오프 값을 최초로 제공하였고, 지속적인 cfDNA에 대한 모니터링을 통해 종양 치료에 따른 치료 반응과 질환의 진행을 예측 또는 진단하는데 유용하게 사용될 수 있음을 알 수 있었다.According to the above experimental results, it was confirmed that cfDNA can be used as a biomarker for diagnosing tumors in dogs by confirming that there is a difference in cfDNA concentration between the healthy group, non-neoplastic disease group, and tumor disease group in dogs. could In addition, the present inventors first provided a quantitative cut-off value for the survival rate of dogs according to tumors by measuring the concentration of cfDNA in the blood for dogs with oncological diseases. It was found that it can be usefully used for predicting or diagnosing disease progression.

이제까지 본 발명에 대하여 그 바람직한 실시예들을 중심으로 살펴보았다. 본 발명이 속하는 기술 분야에서 통상의 지식을 가진 자는 본 발명이 본 발명의 본질적인 특성에서 벗어나지 않는 범위에서 변형된 형태로 구현될 수 있음을 이해할 수 있을 것이다. 그러므로 개시된 실시예들은 한정적인 관점이 아니라 설명적인 관점에서 고려되어야 한다. 본 발명의 범위는 전술한 설명이 아니라 특허청구범위에 나타나 있으며, 그와 동등한 범위 내에 있는 모든 차이점은 본 발명에 포함된 것으로 해석되어야 할 것이다.So far, with respect to the present invention, the preferred embodiments have been looked at. Those of ordinary skill in the art to which the present invention pertains will understand that the present invention can be implemented in a modified form without departing from the essential characteristics of the present invention. Therefore, the disclosed embodiments are to be considered in an illustrative rather than a restrictive sense. The scope of the present invention is indicated in the claims rather than the foregoing description, and all differences within the scope equivalent thereto should be construed as being included in the present invention.

Claims (12)

(a) 피검체 유래의 생물학적 시료에서 cfDNA (Cell-free DNA) 수준을 측정하는 단계; 및
(b) 측정된 cfDNA 수준을 ROC(Receiver Operation Characteristic) 곡선 분석에 의해 설정된 컷-오프(cut-off) 값과 비교하는 단계를 포함하는,
반려견의 종양 예후 예측방법.
(a) measuring the level of cfDNA (Cell-free DNA) in a biological sample derived from a subject; and
(b) comparing the measured cfDNA level with a cut-off value established by Receiver Operation Characteristic (ROC) curve analysis,
A method for predicting tumor prognosis in dogs.
제1항에 있어서,
상기 생물학적 시료는 전혈, 혈장 또는 혈청인 것을 특징으로 하는, 반려견의 종양 예후 예측방법.
According to claim 1,
The biological sample is whole blood, plasma or serum, characterized in that the dog's tumor prognosis prediction method.
제1항에 있어서,
상기 측정된 cfDNA 수준이 컷-오프(cut-off) 값보다 낮은 경우 상기 반려견의 생존 확률이 높을 것으로 판단하고, 상기 측정된 cfDNA 수준이 컷-오프(cut-off) 값보다 높은 경우 상기 반려견의 생존 확률이 낮을 것으로 판단하는 단계를 더 포함하는 것을 특징으로 하는, 반려견의 종양 예후 예측방법.
According to claim 1,
When the measured cfDNA level is lower than the cut-off value, it is determined that the survival probability of the dog is high, and when the measured cfDNA level is higher than the cut-off value, the dog's A method for predicting tumor prognosis in dogs, characterized in that it further comprises the step of determining that the probability of survival is low.
제1항에 있어서,
상기 설정된 컷-오프(cut-off) 값은 1,247.5 ug/L인 것을 특징으로 하는, 반려견의 종양 예후 예측방법.
According to claim 1,
The set cut-off (cut-off) value is 1,247.5 ug / L, characterized in that, the dog's tumor prognosis prediction method.
제3항에 있어서,
상기 측정된 cfDNA 수준이 컷-오프(cut-off) 값인 1,247.5 ug/L 보다 낮은 경우, 상기 반려견의 상기 생존 확률은 80% 이상일 것으로 예측하는 것을 특징으로 하는, 반려견의 종양 예후 예측방법.
4. The method of claim 3,
If the measured cfDNA level is lower than the cut-off value of 1,247.5 ug/L, the survival probability of the dog is 80% or more, characterized in that it is predicted to be more than 80%.
제3항에 있어서,
상기 측정된 cfDNA 수준이 컷-오프(cut-off) 값인 1,247.5 ug/L 보다 높은 경우, 상기 반려견의 상기 생존 확률은 30% 미만일 것으로 예측하는 것을 특징으로 하는, 반려견의 종양 예후 예측방법.
4. The method of claim 3,
When the measured cfDNA level is higher than the cut-off value of 1,247.5 ug/L, the survival probability of the dog is predicted to be less than 30%, a method for predicting tumor prognosis in dogs.
제1항에 있어서,
상기 종양은 간세포암, 이소성 갑상선암, 폐선암, 유선암, 세포 갑상선암, 편평세포암, 신장세포암, 이행상피암, 장 선암, 림프종, 백혈병, 혈관육종, 간질육종, 구강평활근 육종, 위장기질종양(GIST), 다엽성 뼈종양, 비만세포종양, 갈색 세포종 및 말초 신경초 종양으로 이루어진 군 중에서 선택되는 것을 특징으로 하는, 반려견의 종양 예후 예측방법.
According to claim 1,
The tumor is hepatocellular carcinoma, ectopic thyroid cancer, lung adenocarcinoma, mammary gland cancer, cell thyroid cancer, squamous cell carcinoma, renal cell carcinoma, transitional epithelial carcinoma, intestinal adenocarcinoma, lymphoma, leukemia, angiosarcoma, stromal sarcoma, oral leiomyosarcoma, gastrointestinal stromal tumor (GIST) ), multilobed bone tumor, mast cell tumor, pheochromocytoma and peripheral nerve sheath tumor, characterized in that selected from the group consisting of, tumor prognosis prediction method in dogs.
(a) 피검체 유래의 생물학적 시료에서 cfDNA(Cell-free DNA) 수준을 측정하는 단계; 및
(b) 정상 대조군의 cfDNA 수준과 비교하는 단계를 포함하는,
반려견의 종양 진단방법.
(a) measuring the level of cfDNA (Cell-free DNA) in a biological sample derived from a subject; and
(b) comparing the cfDNA level of a normal control,
How to diagnose a canine tumor.
제8항에 있어서,
상기 생물학적 시료는 전혈, 혈장 또는 혈청인 것을 특징으로 하는, 반려견의 종양 진단방법.
9. The method of claim 8,
The biological sample is whole blood, plasma or serum, characterized in that the dog tumor diagnosis method.
제8항에 있어서,
상기 피검체 유래의 cfDNA 수준이 정상 대조군의 cfDNA 수준에 비해 높은 경우, 종양이 발생한 것으로 판단하는 단계를 더 포함하는 것을 특징으로 하는, 반려견의 종양 진단방법.
9. The method of claim 8,
When the cfDNA level derived from the subject is higher than the cfDNA level of the normal control group, the method for diagnosing tumors in dogs, characterized in that it further comprises the step of determining that a tumor has occurred.
제10항에 있어서,
상기 피검체 유래의 cfDNA 수준이 1,553.9 ug/L 농도보다 높은 경우, 종양이 발생한 것으로 판단하는 것을 특징으로 하는, 반려견의 종양 진단 방법.
11. The method of claim 10,
When the cfDNA level derived from the subject is higher than the concentration of 1,553.9 ug/L, it is characterized in that it is determined that a tumor has occurred, a method for diagnosing a dog's tumor.
제8항에 있어서,
상기 종양은 간세포암, 이소성 갑상선암, 폐선암, 유선암, 세포 갑상선암, 편평세포암, 신장세포암, 이행상피암, 장 선암, 림프종, 백혈병, 혈관육종, 간질육종, 구강평활근 육종, 위장기질종양(GIST), 다엽성 뼈종양, 비만세포종양, 갈색 세포종 및 말초 신경초 종양으로 이루어진 군 중에서 선택되는 것을 특징으로 하는, 반려견의 종양 진단 방법.
9. The method of claim 8,
The tumor is hepatocellular carcinoma, ectopic thyroid cancer, lung adenocarcinoma, mammary gland cancer, cell thyroid cancer, squamous cell carcinoma, renal cell carcinoma, transitional epithelial carcinoma, intestinal adenocarcinoma, lymphoma, leukemia, angiosarcoma, stromal sarcoma, oral leiomyosarcoma, gastrointestinal stromal tumor (GIST) ), multilobed bone tumor, mast cell tumor, pheochromocytoma and peripheral nerve sheath tumor, characterized in that selected from the group consisting of, a dog tumor diagnosis method.
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