KR20210069417A - 호메오단백질의 세포외 분비능 조절방법 및 이를 이용하여 세포외 분비능이 조절된 호메오단백질 변이체 - Google Patents

Abstract

본 발명은 호메오단백질의 세포외 분비능 조절방법 및 이를 이용하여 세포외 분비능이 조절된 호메오단백질 변이체에 관한 것으로서, 보다 구체적으로 호메오도메인 외부 아미노산 서열 중 아미노산 서열의 소수성 증감을 통하여 세포외 분비능을 증감시키는 방법 또는 호메오도메인 외부 아미노산 서열의 소수성 증감을 통하여 세포외 분비능을 증감시키는 호메오단백질에 관한 것이다.
본 발명자들은 호메오단백질의 세포외 분비능에 영향을 주는 요인으로 호메오도메인 자체뿐만 아니라 호메오도메인 외부의 소수성의 아미노산 서열 존재여부가 관련 있음을 최초로 규명하여, 상기 소수성 아미노산의 서열을 치환함으로써 배양세포와 생체 내 조직에서 세포외 분비능이 증감된 호메오단백질을 유도할 수 있음을 확인하였는바, 호메오단백질들의 분비 기전에 대한 연구를 통해 분비 표식을 포함하지 않는 다양한 세포 내 단백질들이 분비되는 분비 경로에 대한 이해를 높이는 데에 유용하게 쓰일 것으로 기대된다.

Description

호메오단백질의 세포외 분비능 조절방법 및 이를 이용하여 세포외 분비능이 조절된 호메오단백질 변이체 {Method of regulating for Extracellular Secretion of Homeoprotein and homeoprotein variants having regulated extracellular secretion ability using the same}

본 발명은 호메오단백질의 세포외 분비능 조절방법 및 이를 이용하여 세포외 분비능이 조절된 호메오단백질 변이체에 관한 것으로서, 보다 구체적으로 호메오도메인 외부 아미노산 서열의 소수성 증감을 통하여 세포외 분비능을 증감시키는 방법 또는 호메오도메인 외부 아미노산 서열의 소수성 증감을 통하여 세포외 분비능이 증감된 호메오단백질에 관한 것이다.

세포는 소수성인 세포막으로 둘러싸여 있기 때문에 세포 내부에서 생성된 단백질이나 핵산 등 친수성 생체 고분자들은 세포막을 통과하지 못하고 세포 내부에서만 머무르며 작용할 수 있다. 그러나 성장호르몬처럼 세포 외부로 분비되어 작용하는 단백질들은 소포체와 골지체를 포함한 세포 내 단백질 분비 소기관을 거쳐 세포 외부로 분비된다. 상기 분비 경로로 이동할 수 있는 단백질들은 특이한 분비 표식을 가지고 있는데, 대부분 단백질들은 이 표식을 가지고 있지 않아 세포 내부에서 생성되어 기능을 완료한 후 소멸한다.

전사인자 (transcription factor)는 DNA 서열에 포함된 유전정보를 해독해 RNA를 생성하는 전사과정 (transcription)을 유도하는 본연의 기능을 수행하기 위해 표적 DNA가 위치한 세포의 핵으로 이동하여 존재하며, 전사를 통해 생성된 RNA는 번역과정을 통해 세포 내 다양한 반응을 담당하는 단백질의 형성을 유도하기 때문에 특정 RNA의 전사를 유발하는 전사인자 유무는 해당 세포의 특징을 규정하는데 중요한 의미를 가진다. 따라서 전사인자는 특정 세포에서 생성-작용-소멸되어야 해당 세포의 특징을 온전히 결정할 수 있다.

전사인자들 중 발달 과정의 세포 운명을 결정하는데 특히 중요한 것으로 알려진 호메오단백질들은 전형적인 전사 조절 기능 외에 다양한 세포 내 기능이 있음이 알려져 있다. 특히 세포질에서 RNA의 단백질로의 번역 과정을 조절하는 특징은 초파리 초기 배아의 머리와 몸통을 결정하는데 중요한 것으로 밝혀졌다.

한편, 외래 호메오단백질은 세포막을 통과해서 도입이 되는데, 이러한 세포막 투과 기능은 1991년 프랑스 연구자들에 의해 최초로 알려졌다. 지금까지 10여개에 이르는 호메오단백질이 세포 간 이동이 가능한 것으로 확인되었으며, 인간 호메오단백질의 호메오도메인을 이용하여 단백질을 도입하는 것에 관한 연구는 진행되었으나 (한국등록특허공보 제10-1106262호), 호메오단백질의 외부 분비와 관련하여 호메오도메인의 외부의 아미노산 서열이 미치는 영향에 대해서는 연구가 미진한 실정이다.

본 발명자들은 호메오단백질의 세포외 분비능에 영향을 주는 요인으로 호메오도메인 자체뿐만 아니라 호메오도메인 외부의 소수성 아미노산 서열 존재 여부가 관련되어 있음을 최초로 규명하여, 상기 소수성 아미노산의 서열을 친수성 아미노산 서열로 치환함으로써 배양세포와 생체 내 조직에서 세포외 분비능이 감소하였고 반대로 해당 위치의 친수성 아미노산 서열을 소수성 아미노산 서열로 치환함으로써 배양세포와 생체 내 조직에서 세포외 분비능이 증가된 호메오단백질을 유도할 수 있음을 확인하였는바, 이에 기초하여 본 발명을 완성하였다.

이에, 본 발명은 하기 그룹으로 이루어진 군으로부터 선택되는, 세포외 분비능이 증감된 호메오단백질 변이체를 제공하는 것을 목적으로 한다.

1) 서열번호 1로 표시되는 아미노산 서열로 이루어진, HOXD4 단백질의 233번째 아미노산이 치환된 변이체;

2) 서열번호 2로 표시되는 아미노산 서열로 이루어진, SHOX2 단백질의 305번째 아미노산이 치환된 변이체;

3) 서열번호 3으로 표시되는 아미노산 서열로 이루어진, EN2 단백질의 143번째 및 191번째 아미노산이 치환된 변이체;

4) 서열번호 4로 표시되는 아미노산 서열로 이루어진, OTX2 단백질의 220번째 또는 258번째 아미노산이 치환된 변이체;

5) 서열번호 5로 표시되는 아미노산 서열로 이루어진, PAX6 단백질의 130번째 아미노산이 치환된 변이체; 및

6) 서열번호 6으로 표시되는 아미노산 서열로 이루어진, VAX1 단백질의 305번째 아미노산이 치환된 변이체.

또한 하기 그룹으로 이루어진 군으로부터 선택되는 어느 하나의 아미노산을 치환하는 단계를 포함하는, 호메오단백질의 세포외 분비능 증감방법 또는 세포외 분비능이 증감된 호메오단백질의 제조방법을 제공하는 것을 다른 목적으로 한다.

또한 하기 그룹으로 이루어진 군으로부터 선택되는 어느 하나의 아미노산을 확인하는 단계를 포함하는, 호메오단백질의 세포외 분비능 예측방법을 제공하는 것을 또 다른 목적으로 한다.

1) 서열번호 1로 표시되는 아미노산 서열로 이루어진, HOXD4 단백질의 233번째 아미노산;

2) 서열번호 2로 표시되는 아미노산 서열로 이루어진, SHOX2 단백질의 305번째 아미노산;

3) 서열번호 3으로 표시되는 아미노산 서열로 이루어진, EN2 단백질의 143번째 및 191번째 아미노산;

4) 서열번호 4로 표시되는 아미노산 서열로 이루어진, OTX2 단백질의 220번째 또는 258번째 아미노산;

5) 서열번호 5로 표시되는 아미노산 서열로 이루어진, PAX6 단백질의 130번째 아미노산; 및

6) 서열번호 6으로 표시되는 아미노산 서열로 이루어진, VAX1 단백질의 305번째 아미노산.

그러나, 본 발명이 이루고자 하는 기술적 과제는 이상에서 언급한 과제에 제한되지 않으며, 언급되지 않은 또 다른 과제들은 아래의 기재로부터 당업자에게 명확하게 이해될 수 있을 것이다.

상기와 같은 본 발명의 목적을 달성하기 위하여, 본 발명은,

하기 그룹으로 이루어진 군으로부터 선택되는, 세포외 분비능이 증감된 호메오단백질 변이체를 제공한다.

1) 서열번호 1로 표시되는 아미노산 서열로 이루어진, HOXD4 단백질의 233번째 아미노산이 치환된 변이체;

2) 서열번호 2로 표시되는 아미노산 서열로 이루어진, SHOX2 단백질의 305번째 아미노산이 치환된 변이체;

3) 서열번호 3으로 표시되는 아미노산 서열로 이루어진, EN2 단백질의 143번째 및 191번째 아미노산이 치환된 변이체;

4) 서열번호 4로 표시되는 아미노산 서열로 이루어진, OTX2 단백질의 220번째 또는 258번째 아미노산이 치환된 변이체;

5) 서열번호 5로 표시되는 아미노산 서열로 이루어진, PAX6 단백질의 130번째 아미노산이 치환된 변이체; 및

6) 서열번호 6으로 표시되는 아미노산 서열로 이루어진, VAX1 단백질의 305번째 아미노산이 치환된 변이체.

본 발명의 일 구현예로, 상기 아미노산은 호메오도메인의 외부 모티프 내 아미노산인 것일 수 있다.

발명의 다른 구현예로, 상기 아미노산이 소수성 아미노산 (hydrophobic amino acid)으로 치환되는 경우 세포외 분비능이 증진되는 것일 수 있다.

본 발명의 또 다른 구현예로, 상기 소수성 아미노산은 류신 (Leu, L)인 것일 수 있다.

본 발명의 또 다른 구현예로, 상기 아미노산이 친수성 아미노산 (hydrophilic amino acid)으로 치환되는 경우 세포외 분비능이 감소되는 것일 수 있다.

본 발명의 또 다른 구현예로, 상기 친수성 아미노산은 글루타메이트 (Glu, E)인 것일 수 있다.

또한 본 발명은, 하기 그룹으로 이루어진 군으로부터 선택되는 어느 하나의 아미노산을 치환하는 단계를 포함하는, 호메오단백질의 세포외 분비능 증감방법 또는 세포외 분비능이 증감된 호메오단백질의 제조방법을 제공한다.

또한 본 발명은, 하기 그룹으로 이루어진 군으로부터 선택되는 어느 하나의 아미노산을 확인하는 단계를 포함하는, 호메오단백질의 세포외 분비능 예측방법을 제공한다.

1) 서열번호 1로 표시되는 아미노산 서열로 이루어진, HOXD4 단백질의 233번째 아미노산;

2) 서열번호 2로 표시되는 아미노산 서열로 이루어진, SHOX2 단백질의 305번째 아미노산;

3) 서열번호 3으로 표시되는 아미노산 서열로 이루어진, EN2 단백질의 143번째 및 191번째 아미노산;

4) 서열번호 4로 표시되는 아미노산 서열로 이루어진, OTX2 단백질의 220번째 또는 258번째 아미노산;

5) 서열번호 5로 표시되는 아미노산 서열로 이루어진, PAX6 단백질의 130번째 아미노산; 및

6) 서열번호 6으로 표시되는 아미노산 서열로 이루어진, VAX1 단백질의 305번째 아미노산.

본 발명자들은 호메오단백질의 세포외 분비능에 영향을 주는 요인으로 호메오도메인 자체뿐만 아니라 호메오도메인 외부의 소수성의 아미노산 서열 존재여부가 관련 있음을 최초로 규명하여, 상기 아미노산 서열의 소수성 증감을 통하여 세포외 분비능이 증감된 호메오단백질을 유도할 수 있음을 확인하였는바, 호메오단백질들의 분비 기전에 대한 연구를 통해 분비 표식을 포함하지 않는 다양한 세포 내 단백질들이 분비되는 분비 경로에 대한 이해를 높이는 데에 유용하게 쓰일 것으로 기대된다.

도 1은 배지에서의 293T, GT1-7 및 MDCK 세포의 V5-HP 분비와 관련된 이미지를 나타낸 것이다 (점의 색깔은 해당 세포주에서 관찰되는 분비를 나타냄).
도 2는 호메오단백질에서 호메오도메인을 분리하여, 293T 세포에서 발현을 관찰한 상기 호메오도메인과 분비의 관련성을 확인한 것을 나타낸 것이다.
도 3은 호메오도메인을 삭제한 호메오단백질의 돌연변이와 분비의 관련성을 확인한 결과를 나타낸 것이다.
도 4는 STAR 방법에 기술된 다중 서열 정렬을 이용하여, sHP에서 공유 모티프를 확인한 결과를 나타낸 것이다.
도 5는 도 4에서 화살표로 표시된 지점에서의 sHP와 nsHP의 아미노산 서열을 나타낸 것이다.
도 6은 sHP와 nsHP에서 각각 공유될 것으로 예상되는 아미노산의 위치를 표시하여 나타낸 것이다 (호메오도메인은 빨강색으로 표시함).
도 7은 돌연변이 호메오단백질의 세포외 분비능을 비교하여 나타낸 것이다 (이미지 아래의 점수는 야생형 호메오단백질의 분비 지수와 비교한 평균 RSI (Relative Secretion Index) 값을 나타냄).
도 8은 야생형 호메오단백질 및 돌연변이 호메오단백질의 HeLa 세포 간 전달능을 비교한 이미지와 RTI (relative transfer index) 값을 나타낸 것이다 (* p <0.01; ** p <0.005; ANOVA., 스케일 바 25 μm).
도 9는 야생형 호메오단백질 및 돌연변이 호메오단백질의 마우스 배아 뇌 세포 간 전달능을 비교한 이미지와 RTI 값을 나타낸 것이다 (* p <0.01; ** p <0.005; ANOVA., 스케일 바, 25 μm).
도 10은 분비-결함 OTX2 (F258E)의 전사활성을 형질 감염된 세포에서 OTX2 표적 CRX 프로모터에 의해 유도되는 루시페라제의 활성을 측정하여 나타낸 것이다 (*p < 0.01; **p < 0.005; ***p < 0.001; ANOVA.).
도 11은 PAX6 변이체의 전사활성을 tandem PAX6 표적 DNA 서열에 의해 유도되는 루시페라제의 활성을 측정하여 나타낸 것이다 (*p < 0.01; **p < 0.005; ***p < 0.001; ANOVA.).
도 12는 VAX1 변이체의 전사활성을 TCF7L2 프로모터에 의해 유도되는 루시페라제의 활성을 측정하여 나타낸 것이다 (*p < 0.01; **p < 0.005; ***p < 0.001; ANOVA.).
도 13은 V5-VAX1, V5-VAX1 (L305E) 또는 V5-VAX1 (WF/SR)을 과발현하는 293T 세포를 48시간 동안 E13.5 마우스 망막 외식 편과 공동 배양한 결과를 나타낸 것이다 (*p < 0.01; **p < 0.005; ***p < 0.001; ANOVA.).
도 14는 망막 외식 편을 재조합 V5-태그된 야생형 및 돌연변이체 VAX1 단백질로 48시간 동안 처리하여 면역 염색한 결과를 나타낸 것이다 (*p < 0.01; **p < 0.005; ***p < 0.001; ANOVA.).

이하, 본 발명을 상세히 설명한다.

본 발명자들은 호메오단백질의 세포외 분비능에 영향을 주는 요인으로 호메오도메인 자체뿐만 아니라 호메오도메인 외부의 소수성 아미노산 서열의 존재 여부가 관련되어 있음을 최초로 규명하여, 상기 아미노산 서열의 소수성 증감을 통하여 세포외 분비능이 증감된 호메오단백질을 유도할 수 있음을 확인하였는바, 이에 기초하여 본 발명을 완성하였다.

본 발명에 있어서, “호메오도메인 (homeodomain)”은 60여개의 아미노산으로 이루어진 유전자 결합활성을 나타내는 구조의 단백질을 말한다. 호메오도메인은　호메오상자라고 알려진 180bp 크기의 유전자로부터 발현된다. 표적 유전자 프로모터 부위에 염기서열 특이적으로 결합하여 유전자 발현을 촉진하거나 저해하는 기능을 하는 것으로 알려져 있고, 호메오도메인은 초기 초파리 발생을 조절하는 단백질 군에서 주로 확인되어 초파리 발생 관련 호메오도메인으로 명칭되었으며, 초파리의 체절결정유전자, 일 군의　분절유전자,　척추동물의　Hox 유전자 등의 형태형성을 제어하는 유전자, 효모의 접합형 결정유전자　MAT, 조직에 특유한　유전자발현을 제어하는 전사인자군 등을 발견할 수 있다. 이런 그룹들의 호메오도메인은 각각 특징적인 아미노산 배열을 갖고 동물계에서 진화적인 보존성을 나타낸다. 호메오도메인을 갖는 단백질을 “호메오단백질”이라고 총칭하며, 본 발명에서 상기 호메오단백질은 HOXD4, SHOX2, EN2, OTX2, PAX6 및 VAX1로 이루어진 군에서 선택된 어느 하나인 것일 수 있으나 이에 제한되는 것은 아니다.

본 발명에 있어서, “호메오도메인의 외부 모티프”는 호메오도메인의 내부가 아닌, 호메오도메인의 영역을 벗어난 특정 영역의 아미노산 서열 단편을 말하고, 상기 특정 영역의 아미노산 서열 단편은 호메오도메인의 업스트림 또는 다운 스트림에 위치할 수 있다.

본 발명자들은 호메오단백질의 세포외 분비능과 호메오도메인의 외부 모티프의 소수성 아미노산과의 관련성을 구체적으로 확인하였는데, 보다 구체적으로 본 발명의 일 실시예에서는 호메오단백질의 세포외 분비에 있어서, 호메오도메인의 외부 모티프 내 소수성 잔기의 중요성을 확인하기 위해 sHP (secretory homeodomain-containing proteins)의 각 상응하는 위치의 소수성 아미노산을 친수성 아미노산인 글루타메이트 (Glu, E)로 대체하는 실험을 수행하여, EN2의 143 번째 및 191 번째 위치에서 류신을 글루타메이트로 치환하면 생장배지에서 측정되는 돌연변이된 EN2의 양이 감소함을 확인하였고, OTX2의 220 번째 위치의 류신, OTX2의 258 번째 위치의 페닐알라닌, PAX6의 130 번째 위치의 류신 또는 VAX1의 305 번째 위치의 류신을 글루타메이트로 변경한 돌연변이체들의 세포외 분비능이 감소함을 확인하였다. (실시예 3 참조).

또한 본 발명의 다른 실시예에서는 호메오도메인의 외부 모티프 내 친수성 또는 소수성 아미노산 서열을 소수성 아미노산 또는 다른 소수성 아미노산으로 치환하였는데 보다 구체적으로는 HOXD4의 233 번째에 위치한 세린을 류신으로 치환하거나 SHOX2의 305 번째에 위치한 프롤린을 류신으로 치환한 돌연변이체의 세포외 분비능이 증진됨을 확인하였다 (실시예 3 참조).

또한 본 발명의 또 다른 실시예를 통해 OTX2 (F258E) 및 PAX6 (L130E)는 전사활성을 여전히 나타내며, OTX2 표적 CRX 프로모터 및 tandem PAX6 결합 서열의 다운 스트림에서 야생형의 OTX2 및 PAX6 정도로 강한 루시페라제 리포터 발현을 유도함을 확인하였고, VAX1 (L305E)는 또한 루시페라제의 발현을 활성화시키며, 이의 전사는 VAX1 target transcription factor 7-like 2 (TCF7L2) 유전자 업스트림 서열에 의해 야생형의 VAX1만큼 유의하게 조절됨을 확인하여, 소수성 잔기가 sHP의 전사활성에 영향을 미치지 않으면서 호메오단백질의 세포 외부로의 분비에 관여함을 확인하였다 (실시예 5 참고).

상기 실시예의 실험결과를 통해 본 발명자들은 본 발명에 따라 호메오단백질의 호메오도메인의 외부 모티프의 특정 소수성 아미노산을 친수성 아미노산으로 치환하면 상기 호메오단백질의 전사활성은 전혀 감소시키지 않으면서, 호메오단백질의 세포외 분비능만을 감소시킬 수 있음을 제안한다.

이에, 본 발명은 하기 그룹으로 이루어진 군으로부터 선택되는, 세포외 분비능이 증감된 호메오단백질 변이체를 제공한다:

1) 서열번호 1로 표시되는 아미노산 서열로 이루어진 HOXD4 단백질의 233번째 아미노산이 치환된 변이체;

2) 서열번호 2로 표시되는 아미노산 서열로 이루어진 SHOX2 단백질의 305번째 아미노산이 치환된 변이체;

3) 서열번호 3으로 표시되는 아미노산 서열로 이루어진 EN2 단백질의 143번째 및 191번째 아미노산이 치환된 변이체;

4) 서열번호 4로 표시되는 아미노산 서열로 이루어진 OTX2 단백질의 220번째 또는 258번째 아미노산이 치환된 변이체;

5) 서열번호 5로 표시되는 아미노산 서열로 이루어진 PAX6 단백질의 130번째 아미노산이 치환된 변이체; 및

6) 서열번호 6으로 표시되는 아미노산 서열로 이루어진 VAX1 단백질의 305번째 아미노산이 치환된 변이체.

본 발명에 따른 상기 아미노산은 호메오도메인의 외부 모티프 내 아미노산인 것일 수 있으며, 본 발명에 따른 상기 아미노산이 소수성 아미노산으로 치환되는 경우 세포외 분비능이 증진되는 것일 수 있으며, 상기 소수성 아미노산은 류신 (Leu, L)인 것일 수 있으나 이에 제한되는 것은 아니다.

본 발명에 있어서, “소수성 아미노산 (hydrophobic amino acid)”은 수용액에서 단백질 내부에 존재하는 경향이 강한　아미노산의 총칭하는 것으로서, 보다 구체적으로 소수성 아미노산에는　페닐알라닌,　트립토판, 이소류신, 류신, 프롤린, 메티오닌, 발린, 글라이신, 알라닌, 시스테인 등이 있다. 소수성 잔기 사이의　소수성 상호작용에 의해 단백질의　입체구조가 지탱된다. 또한 효소　활성중심　부위에서　기질결합부위　일부를 형성하고 있는 것도 있다. 프롤린 이외의 소수성 아미노산은 β 구조 형성능도 크다. 단백질 표면의 소수영역은 다른 단백질, 생체막의 지질부분이나 소수성 리간드와 결합하는 장소라고 여겨진다.

본 발명에 따른 상기 아미노산은 호메오도메인의 외부 모티프 내 아미노산인 것일 수 있으며, 본 발명에 따른 상기 아미노산이 친수성 아미노산으로 치환되는 경우 세포외 분비능이 감소되는 것일 수 있으며, 상기 친수성 아미노산은 글루타메이트 (Glu, E)인 것일 수 있으나 이에 제한되는 것은 아니다.

또한 본 발명의 다른 양태로서, 본 발명은 하기 그룹으로 이루어진 군으로부터 선택되는 어느 하나의 아미노산을 치환하는 단계를 포함하는, 호메오단백질의 세포외 분비능 증감방법 또는 세포외 분비능이 증감된 호메오단백질의 제조방법을 제공한다:

1) 서열번호 1로 표시되는 아미노산 서열로 이루어진 HOXD4 단백질의 233번째 아미노산;

2) 서열번호 2로 표시되는 아미노산 서열로 이루어진 SHOX2 단백질의 305번째 아미노산;

3) 서열번호 3으로 표시되는 아미노산 서열로 이루어진 EN2 단백질의 143번째 및 191번째 아미노산;

4) 서열번호 4로 표시되는 아미노산 서열로 이루어진 OTX2 단백질의 220번째 또는 258번째 아미노산;

5) 서열번호 5로 표시되는 아미노산 서열로 이루어진 PAX6 단백질의 130번째 아미노산; 및

6) 서열번호 6으로 표시되는 아미노산 서열로 이루어진 VAX1 단백질의 305번째 아미노산.

또한 본 발명의 또 다른 양태로서, 본 발명은 하기 그룹으로 이루어진 군으로부터 선택되는 어느 하나의 아미노산을 확인하는 단계를 포함하는, 호메오단백질의 세포외 분비능 예측방법을 제공한다:

1) 서열번호 1로 표시되는 아미노산 서열로 이루어진 HOXD4 단백질의 233번째 아미노산;

2) 서열번호 2로 표시되는 아미노산 서열로 이루어진 SHOX2 단백질의 305번째 아미노산;

3) 서열번호 3으로 표시되는 아미노산 서열로 이루어진 EN2 단백질의 143번째 및 191번째 아미노산;

4) 서열번호 4로 표시되는 아미노산 서열로 이루어진 OTX2 단백질의 220번째 또는 258번째 아미노산;

5) 서열번호 5로 표시되는 아미노산 서열로 이루어진 PAX6 단백질의 130번째 아미노산; 및

6) 서열번호 6으로 표시되는 아미노산 서열로 이루어진 VAX1 단백질의 305번째 아미노산.

이하, 본 발명의 이해를 돕기 위하여 바람직한 실시예를 제시한다. 그러나 하기의 실시예는 본 발명을 보다 쉽게 이해하기 위하여 제공되는 것일 뿐, 하기 실시예에 의해 본 발명의 내용이 한정되는 것은 아니다.

[실시예]

실시예 1. 실험 준비 및 실험 방법

1-1. 동물

마우스로 수행된 모든 실험은 한국과학기술원 (KAIST)의 승인된 기관동물관리 및 사용위원회 (IACUC) 프로토콜 (KAIST IACUC 13-130)에 따라 수행하였다.

1-2. Gateway cloning of human HP ORFs

Dana-Farber Cancer Research Institute (DFCRI)에 의해 개발된 human ORFeome v7.0과 Johns Hopkins University에 의해 개발된 human ORFeome으로부터 170개의 인간 HP cDNA를 얻었으며, 배양된 세포주 및 마우스 배아 뇌에서의 발현을 위해 게이트웨이 클로닝 기술 (Invitrogen)을 사용하여 HP ORF를 pCAGIG-V5 벡터로 클로닝 하였다.

1-3. 세포배양, 형질감염 및 dot blot analysis

293T, HeLa, GT1-7 및 MDCK 세포를 10 % 소 태아 혈청 (FBS)을 함유하는 Dulbecco's modified Eagle medium (DMEM)에서 유지시켰다. 이어서, 293T 세포를 폴리에틸렌 이민 (PEI)과 함께 형질 감염시켰으며, HeLa, GT1-7, MDCK 세포를 제조사의 매뉴얼에 따라 Genjet (Signagen) 및 DNA 시험관 내 형질 감염 시약으로 형질 감염시켰다. 형질 감염된 세포의 생장배지를 형질 감염 6 시간 후 FreeStyle serum-free media (GIBCO BRL)로 교체하고, 수집하였다.　0.5 mL의 배지를 GE Whatman Dot-Blot 96 웰 플레이트 시스템의 각 웰에 첨가하고, 진공으로 도포하여 PVDF 막을 가로 질러 배지를 흡인시켰다. 이어서, 성장 배지에서 단백질 및 핵산을 포획한 막을 항-V5 및 항-GFP 항체로 블롯팅하였으며, 동시에, 형질 감염된 세포를 RIPA 완충액 (0.1 % SDS를 갖는 PBS)에 용해시키고, 웨스턴 블롯 분석을 위해 상청액을 수집하였다.

1-4. 면역 염색

마우스 배아 뇌 및 눈을 1시간 동안 4 % 파라포름알데히드 (PFA)를 함유하는 PBS에서 후속 고정을 위해 단리하였다. 이어서, 샘플을 티슈텍 O.C.T.에서 냉동 보존하기 전에 16 시간 동안 4 ℃에서 후속 배양을 위해 20 % 수크로스/PBS 용액으로 이동시켰다.

그 다음으로, 동결된 샘플을 12 μm 내지 20 μm의 두께로 슬라이드 유리 상에 동결 절단 하였다. 대안적으로, 커버 슬립상에서 배양된 HeLa 세포를 20분 동안 4 % PFA/PBS에 고정시켰다. 이어서, 슬라이드 상의 조직 및 커버 슬립 상의 HeLa 세포를 실온에서 1시간 동안 차단 용액 (10 % 정상 당나귀 혈청 및 0.1 % Triton X-100을 포함하는 PBS)에서 배양하였다. 그 다음으로, 세포를 16시간 동안 4 ℃에서 Triton X-100이 없는 1차 항체를 포함하는 차단 용액에서 추가로 배양한 후, 1차 항체를 인식하는 형광단-컨쥬게이트된, 2차 항체와 함께 배양하였다. 이어서, IHC 신호의 형광 이미지를 Olympus FV1000 공초점 현미경을 이용하여 획득하였다.

1-5. 재조합 V5-HP 친화성 정제

V5-태깅된 호메오단백질을 발현하는 293T 세포를 20 mM Tris-HCl (pH 7.9), 500 mM NaCl, 20 % 글리세롤, 4 mM MgCl₂, 0.4 mM EDTA 및 프로테아제 억제제 칵테일 (Millipore)로 구성된 완충액에 용해시켰다. 13,200 rpm에서 10분 동안 원심 분리한 후 수득된 세포의 상청액 분획을 16시간 동안 4 ℃에서 항-V5 항체와 함께, 이어서 2시간 동안 단백질-G 세파로스 (GE Healthcare) 비드와 함께 배양하였다. 단백질-G 세파로스 면역 복합체를 V5 태그 HP 전에 세척 완충제 (20 mM Tris-HCl (pH 7.9), 150 mM NaCl, 2 mM MgCl₂, 0.2 mM EDTA, 0.1 % NP40 및 프로테아제 억제제)로 5회 세척하였다. 0.25 mg/ml V5 펩티드를 함유하는 세척 완충액에서 단백질-G 세파로스 비드로부터 용출시켰다. 이어서 V5 펩티드를 Amicon Ultra 원심 분리 필터 장치 (Millipore)로 제거하였다.

1-6. 망막 외식 편 및 축색 성장 분석

망막 외식 편은 이전 보고서에 설명된 대로 준비되었다 (Kim et al., 2014). 간략히, 망막을 E13.5 마우스 배아로부터 단리하고 외식 편을 콜라겐 혼합물에 첨가하고 폴리-L- 라이신 (10 μg/ml) 및 라미닌 (10 μg/ml)으로 코팅된 플레이트에 위치시켰다. 이어서, 외식 편을 37 ℃에서 1시간 동안 배양하여 겔화 시킨 후 B27 보충제 (인비트로젠)를 함유하는 Neurobasal medium을 첨가하였다. 외식 편을 단백질로 처리하기 전에 48시간 동안 배양하거나 48시간 동안 293T 세포 응집체와 공동 배양하였다.

1-7. Quantification & Statistical Analysis

다중 시퀀스 정렬은 가장 정확한 갭 정렬을 제공하도록 설계된 기본 옵션과 함께 MUSCLE (로그 예측에 의한 다중 시퀀스 비교) 소프트웨어를 사용하여 구축되었다 (Edgar, 2004). 서로 다른 RSI 컷 오프가 있는 sHP 및 nsHP 서열에 대해 MSA (다중 서열 정렬) 결과를 두 개의 하위 MSA로 분할하고 각 MSA 열에서 아미노산 빈도를 나타내는 서열 프로파일을 계산하였다. sHP 및 nsHP 서열을 구별하는 독특한 MSA 컬럼을 식별하기 위해, MSA 컬럼 i에서 2개의 하위 MSA 사이의 차이는 다음과 같이 정의된 JS-분산을 사용하여 계산되었다.

여기서 p_i (k) 및 q_i (k)는 sHP 및 nsHP 서열에 대한 하위 MSA에서 MSA 컬럼 i의 아미노산 k의 빈도를 나타내고, λ는 0.5이고, r_i (k)는 (p_i (k) + q_i (k)) = 2로 정의된다.

1-8. 통계 분석

통계 분석은 Prism Software (GraphPad; v5.0) 측정 도구를 사용하여 수행되었다. 통계 분석의 모든 데이터는 평균 ±STE로 표시된다. 두 그룹 간의 비교는 짝을 이루지 않은 Student's t test에 의해 이루어졌으며, 여러 그룹 간의 차이는 여러 그룹 간의 유의 한 차이를 결정하기 위해 Tukey의 사후 테스트를 사용하여 분산 분석 (ANOVA)으로 결정되었다. P 값 < 0.01은 통계적으로 유의미한 결과로 간주되었다.

실시예 2. 호메오단백질의 세포외 분비에 영향을 주는 도메인의 확인

EN2의 분비에 있어서, 호메오도메인의 두 번째와 세 번째 헬릭스 사이의 링커 영역인 Sec 모티프가 관여한다는 것이 제안되었으며, 도 1에 나타낸 바와 같이 Sec 모티프가 모든 호메오도메인에 의해 공유되는 것을 감안할 때, 다른 기능 영역이 없는 PRD 클래스 호메오도메인만 가지는 HPX / HOPX의 분비 가능성이 없거나 매우 낮다는 것을 확인하였다 (RSI (293T): 0.00, RSI (GT1-7): 3.97, RSI (MDCK): 0.96).

또한 도 2에 나타낸 바와 같이 분리된 다양한 호메오도메인의 분비성을 추가로 조사한 결과, 3개의 세포주 중 어느 것에서도 분비의 증거가 발견되지 않았다.

반면, 상기 도 1에 나타낸 바와 같이 호메오도메인이 결여된 BARX1, EVX1, PAX3 및 ZFHX3의 이소형의 경우에는 특정 세포 상황에서 호메오도메인이 없더라도 세포외 분비능을 가짐을 확인하였다.

이에, 호메오도메인이 삭제된 sHP (secretory homeodomain-containing proteins)의 분비를 테스트한 결과, 도 3에 나타낸 바와 같이 OTX2, PAX6이 호메오도메인이 없이도 여전히 분비되는 반면, VAX1은 분비를 위해 호메오도메인을 필요로 함을 확인하였다.

상기 결과를 종합하면, 호메오단백질의 분비에 있어 호메오도메인의 존재여부가 중요한 요건이기는 하나 호메오단백질의 세포외 분비에 있어 충분 요건은 아님을 확인할 수 있다. 또한 호메오단백질의 세포외 분비에 있어서는 호메오도메인 외부의 다른 도메인 모티프가 필요한 것으로 추측할 수 있었다.

실시예 3. 호메오단백질의 세포외 분비에 영향을 주는 소수성 아미노산 서열의 확인

실시예 2의 실험 결과를 참조하여, 도 4에 나타낸 바와 같이 다중 시퀀스 정렬을 통해 호메오도메인의 외부에 위치하며, 다양한 sHP (secretory homeodomain-containing proteins)가 공유하는 모티프를 식별하고자 하였다.

그 결과 도 5에 나타낸 바와 같이, 페닐알라닌 (Phe, F), 류신 (Leu, L) 및 메티오닌 (Met, M)을 포함한 소수성 아미노산이 sHP (secretory homeodomain-containing proteins)의 호메오도메인 외부에서 동일한 위치에서 검출됨을 확인하였다.

호메오단백질의 세포외 분비에 있어서, 상기 잔기의 중요성을 확인하기 위해 sHP (secretory homeodomain-containing proteins)의 각 상응하는 위치의 소수성 아미노산을 친수성 아미노산인 글루타메이트 (Glu, E)로 대체하는 실험을 수행하였다.

그 결과, 도 6 및 도 7에 나타낸 바와 같이 EN2의 143 번째 및 191 번째 위치에서 류신 (Leu, L) 잔기를 글루타메이트 (Glu, E)로 변경하면 생장배지에서 측정되는 분비된 돌연변이체 EN2의 양이 감소함을 확인하였다.

상기의 결과와 더불어 도 6 및 도 7에 나타낸 바와 같이 OTX2의 220 번째 위치의 류신, OTX2의 258 번째 위치의 페닐알라닌, PAX6의 130 번째 위치의 류신, VAX1의 305 번째 위치의 류신 등 다른 sHP (secretory homeodomain-containing proteins)의 류신 (또는 페닐알라닌)이 글루타메이트로 치환한 돌연변이체의 세포외 분비능 감소를 확인하였는바, 류신 (또는 페닐알라닌)이 글루타메이트로 치환된 호메오단백질의 세포외 분비능은 감소되는 것이 일반적인 규칙임을 알 수 있었다. 여기서, 각각의 돌연변이체는 EN2 (L143E), EN2 (L191E), OTX2 (L220E), OTX2(F258E), PAX6 (L130E) 및 VAX1 (L305E)로 나타낸다.

반대로, 도 6 및 도 7에 나타낸 바와 같이 293T 세포에서 HOXD4의 233 번째에 위치한 세린을 류신으로 치환하거나 SHOX2의 305 번째에 위치한 프롤린을 류신으로 치환한 돌연변이체의 세포외 분비능이 증진됨을 확인하였다. 여기서, 각각의 돌연변이체는 HOXD4 (S233L) 및 SHOX2 (P305L)로 나타낸다. 하기 표 1은 각 돌연변이체의 서열번호를 나타낸 것이다.

서열번호	돌연변이체
7	HOXD4 (S233L)
8	SHOX2 (P305L)
9	EN2 (L143E) EN2 (L191E)
10	OTX2 (L220E)
11	OTX2 (F258E)
12	PAX6 (L130E)
13	VAX1 (L305E)

실시예 4. 호메오단백질의 세포외 분비능과 이웃한 세포에 대한 전달능의 관련성 확인

EN2의 143 번째 및 191 번째 위치에서 류신 (Leu, L) 잔기를 글루타메이트 (Glu, E)로 변경된 돌연변이체, OTX2의 220 번째 위치의 류신, OTX2의 258 번째 위치의 페닐알라닌, PAX6의 130 번째 위치의 류신, VAX1의 305 번째 위치의 류신이 글루타메이트로 치환된 돌연변이체 또는 세포외 분비능에 있어 결함이 있는 sHP (secretory homeodomain-containing proteins)는 도 8에 나타낸 바와 같이 야생형의 호메오단백질에 비해 세포 간 전달의 효율이 떨어짐을 확인하였다.

반대로, 도 8에 나타낸 바와 같이 HOXD4의 233 번째에 위치한 세린을 류신으로 치환하거나 SHOX2의 305 번째에 위치한 프롤린을 류신으로 치환한 돌연변이체의 HeLa 세포 사이의 전달능은 증가한 것을 확인하였다.

또한 상기 배양된 세포에서의 실험 결과와 유사하게, 도 9에 나타낸 바와 같이 호메오도메인 외부의 소수성 잔기들은 마우스 뇌 세포 간 호메오단백질의 전달에서도 중요한 역할을 함을 확인하였다.

상기 결과들을 종합할 때, 호메오단백질의 분비는 호메오도메인에만 의존한다기 보다는 호메오단백질의 분비가 각 단백질의 3차원 구조에 의해 결정되며, 상기의 3차원 구조는 호메오도메인 외부의 소수성 아미노산과 같은 호메오도메인 외부의 잔기에 의해 결정된다는 것을 확인한 것이다.

또한 상기 부위의 돌연변이 또는 번역 후 변형은 호메오단백질의 세포외 분비능을 변화시킬 수 있음을 예측할 수 있다.

실시예 5. 호메오단백질의 세포외 분비능과 전사활성의 관련성 확인

전술한 실시예를 통해 호메오도메인 외부의 소수성 아미노산 잔기의 돌연변이가 호메오단백질의 분비에 대해 중대한 영향을 미친다는 것을 확인하였다. 이에, 상기의 돌연변이가 호메오단백질의 전사활성에 어떠한 영향을 미치는지 여부를 확인하고자 하기의 실험을 수행하였다.

그 결과 도 8 및 도 9에 나타낸 바와 같이 호메오도메인 외부의 아미노산 잔기 중 류신 또는 페닐알라닌을 글루타메이트로 치환한 돌연변이는 sHP의 세포 내 분포를 변화시키지 않았으며 모든 상기 돌연변이체 호메오단백질들은 핵에서 검출됨을 확인하였다.

또한 도 10 및 도 11에 나타낸 바와 같이 OTX2 (F258E) 및 PAX6 (L130E)는 전사활성을 여전히 나타내며, OTX2 표적 CRX 프로모터 및 tandem PAX6 결합 서열의 다운 스트림에서 야생형의 OTX2 및 PAX6 정도로 강한 루시페라제 리포터 발현을 유도함을 확인하였다.

또한 도 12에 나타낸 바와 같이 VAX1 (L305E)는 또한 루시페라제의 발현을 활성화시키며, 이의 전사는 VAX1 target transcription factor 7-like 2 (TCF7L2) 유전자 업 스트림 서열 (Vacik et al., 2011)에 의해 야생형의 VAX1만큼 유의하게 조절됨을 확인하였다.

상기 결과는 소수성 잔기가 sHP의 전사활성에 영향을 미치지 않으면서 세포외 분비능을 향상시킴을 시사한다.

다음으로, VAX1의 세포 간 전달에 의존하는, 망막 축색 성장에 미치는 VAX1 (L305E)와 야생형 VAX1의 능력을 비교하였다.

293T 세포에서 과발현된 V5-VAX1은 도 13에 나타낸 바와 같이 공동 배양된 마우스 망막 외식 편으로부터 돌출된 축색 돌기에서 검출 가능하였으나, 293T 세포에서 발현된 V5-VAX1 (L305E) 단백질은 망막 축색에서 검출 가능한 양이 되지 않거나 축색 성장을 촉진하지 않았다. 그러나 도 14에 나타낸 바와 같이 망막 외식 편의 생장배지에 첨가된 재조합 V5-VAX1 (L305E)은 망막 축색에서 검출 가능하고, 야생형 VAX1만큼 효율적으로 축색 성장을 유도하였다. 반대로, 분비될 수는 있지만 세포막을 통과할 수 없는 재조합 V5-VAX1 (WF/SR)은 망막 축색에서 검출되지 않았으며, 축색 성장을 유도하지는 못함을 확인하였다.

종합적으로, 상기 결과는 VAX1 (L305E)가 핵에서 정상적인 전사 인자로서의 기능을 수행하지만, 세포 외부로의 분비는 불가능하다는 것을 시사한다.

전술한 본 발명의 설명은 예시를 위한 것이며, 본 발명이 속하는 기술분야의 통상의 지식을 가진 자는 본 발명의 기술적 사상이나 필수적인 특징을 변경하지 않고서 다른 구체적인 형태로 쉽게 변형이 가능하다는 것을 이해할 수 있을 것이다. 그러므로 이상에서 기술한 실시예들은 모든 면에서 예시적인 것이며 한정적이 아닌 것으로 이해되어야 한다.

<110> Korea Advanced Institute of Science and Technlogy (KAIST) <120> Method of regulating for Extracellular Secretion of Homeoprotein and homeoprotein variants having regulated extracellular secretion ability using the same <130> PD19-191 <160> 13 <170> KoPatentIn 3.0 <210> 1 <211> 255 <212> PRT <213> Homo sapiens <400> 1 Met Val Met Ser Ser Tyr Met Val Asn Ser Lys Tyr Val Asp Pro Lys 1 5 10 15 Phe Pro Pro Cys Glu Glu Tyr Leu Gln Gly Gly Tyr Leu Gly Glu Gln 20 25 30 Gly Ala Asp Tyr Tyr Gly Gly Gly Ala Gln Gly Ala Asp Phe Gln Pro 35 40 45 Pro Gly Leu Tyr Pro Arg Pro Asp Phe Gly Glu Gln Pro Phe Gly Gly 50 55 60 Ser Gly Pro Gly Pro Gly Ser Ala Leu Pro Ala Arg Gly His Gly Gln 65 70 75 80 Glu Pro Gly Gly Pro Gly Gly His Tyr Ala Ala Pro Gly Glu Pro Cys 85 90 95 Pro Ala Pro Pro Ala Pro Pro Pro Ala Pro Leu Pro Gly Ala Arg Ala 100 105 110 Tyr Ser Gln Ser Asp Pro Lys Gln Pro Pro Ser Gly Thr Ala Leu Lys 115 120 125 Gln Pro Ala Val Val Tyr Pro Trp Met Lys Lys Val His Val Asn Ser 130 135 140 Val Asn Pro Asn Tyr Thr Gly Gly Glu Pro Lys Arg Ser Arg Thr Ala 145 150 155 160 Tyr Thr Arg Gln Gln Val Leu Glu Leu Glu Lys Glu Phe His Phe Asn 165 170 175 Arg Tyr Leu Thr Arg Arg Arg Arg Ile Glu Ile Ala His Thr Leu Cys 180 185 190 Leu Ser Glu Arg Gln Ile Lys Ile Trp Phe Gln Asn Arg Arg Met Lys 195 200 205 Trp Lys Lys Asp His Lys Leu Pro Asn Thr Lys Gly Arg Ser Ser Ser 210 215 220 Ser Ser Ser Ser Ser Ser Cys Ser Ser Ser Val Ala Pro Ser Gln His 225 230 235 240 Leu Gln Pro Met Ala Lys Asp His His Thr Asp Leu Thr Thr Leu 245 250 255 <210> 2 <211> 355 <212> PRT <213> Homo sapiens <400> 2 Met Glu Glu Leu Thr Ala Phe Val Ser Lys Ser Phe Asp Gln Lys Val 1 5 10 15 Lys Glu Lys Lys Glu Ala Ile Thr Tyr Arg Glu Val Leu Glu Ser Gly 20 25 30 Pro Leu Arg Gly Ala Lys Glu Pro Thr Gly Cys Thr Glu Ala Gly Arg 35 40 45 Asp Asp Arg Ser Ser Pro Ala Val Arg Ala Ala Gly Gly Gly Gly Gly 50 55 60 Gly Gly Gly Gly Gly Gly Gly Gly Gly Gly Gly Gly Gly Val Gly Gly 65 70 75 80 Gly Gly Ala Gly Gly Gly Ala Gly Gly Gly Arg Ser Pro Val Arg Glu 85 90 95 Leu Asp Met Gly Ala Ala Glu Arg Ser Arg Glu Pro Gly Ser Pro Arg 100 105 110 Leu Thr Glu Gly Arg Arg Lys Pro Thr Lys Ala Glu Val Gln Ala Thr 115 120 125 Leu Leu Leu Pro Gly Glu Ala Phe Arg Phe Leu Val Ser Pro Glu Leu 130 135 140 Lys Asp Arg Lys Glu Asp Ala Lys Gly Met Glu Asp Glu Gly Gln Thr 145 150 155 160 Lys Ile Lys Gln Arg Arg Ser Arg Thr Asn Phe Thr Leu Glu Gln Leu 165 170 175 Asn Glu Leu Glu Arg Leu Phe Asp Glu Thr His Tyr Pro Asp Ala Phe 180 185 190 Met Arg Glu Glu Leu Ser Gln Arg Leu Gly Leu Ser Glu Ala Arg Val 195 200 205 Gln Val Trp Phe Gln Asn Arg Arg Ala Lys Cys Arg Lys Gln Glu Asn 210 215 220 Gln Leu His Lys Gly Val Leu Ile Gly Ala Ala Ser Gln Phe Glu Ala 225 230 235 240 Cys Arg Val Ala Pro Tyr Val Asn Val Gly Ala Leu Arg Met Pro Phe 245 250 255 Gln Gln Asp Ser His Cys Asn Val Thr Pro Leu Ser Phe Gln Val Gln 260 265 270 Ala Gln Leu Gln Leu Asp Ser Ala Val Ala His Ala His His His Leu 275 280 285 His Pro His Leu Ala Ala His Ala Pro Tyr Met Met Phe Pro Ala Pro 290 295 300 Pro Phe Gly Leu Pro Leu Ala Thr Leu Ala Ala Asp Ser Ala Ser Ala 305 310 315 320 Ala Ser Val Val Ala Ala Ala Ala Ala Ala Lys Thr Thr Ser Lys Asn 325 330 335 Ser Ser Ile Ala Asp Leu Arg Leu Lys Ala Lys Lys His Ala Ala Ala 340 345 350 Leu Gly Leu 355 <210> 3 <211> 333 <212> PRT <213> Homo sapiens <400> 3 Met Glu Glu Asn Asp Pro Lys Pro Gly Glu Ala Ala Ala Ala Val Glu 1 5 10 15 Gly Gln Arg Gln Pro Glu Ser Ser Pro Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly 20 25 30 Gly Gly Ser Ser Pro Gly Glu Ala Asp Thr Gly Arg Arg Arg Ala Leu 35 40 45 Met Leu Pro Ala Val Leu Gln Ala Pro Gly Asn His Gln His Pro His 50 55 60 Arg Ile Thr Asn Phe Phe Ile Asp Asn Ile Leu Arg Pro Glu Phe Gly 65 70 75 80 Arg Arg Lys Asp Ala Gly Thr Cys Cys Ala Gly Ala Gly Gly Gly Arg 85 90 95 Gly Gly Gly Ala Gly Gly Glu Gly Gly Ala Ser Gly Ala Glu Gly Gly 100 105 110 Gly Gly Ala Gly Gly Ser Glu Gln Leu Leu Gly Ser Gly Ser Arg Glu 115 120 125 Pro Arg Gln Asn Pro Pro Cys Ala Pro Gly Ala Gly Gly Pro Leu Pro 130 135 140 Ala Ala Gly Ser Asp Ser Pro Gly Asp Gly Glu Gly Gly Ser Lys Thr 145 150 155 160 Leu Ser Leu His Gly Gly Ala Lys Lys Gly Gly Asp Pro Gly Gly Pro 165 170 175 Leu Asp Gly Ser Leu Lys Ala Arg Gly Leu Gly Gly Gly Asp Leu Ser 180 185 190 Val Ser Ser Asp Ser Asp Ser Ser Gln Ala Gly Ala Asn Leu Gly Ala 195 200 205 Gln Pro Met Leu Trp Pro Ala Trp Val Tyr Cys Thr Arg Tyr Ser Asp 210 215 220 Arg Pro Ser Ser Gly Pro Arg Ser Arg Lys Pro Lys Lys Lys Asn Pro 225 230 235 240 Asn Lys Glu Asp Lys Arg Pro Arg Thr Ala Phe Thr Ala Glu Gln Leu 245 250 255 Gln Arg Leu Lys Ala Glu Phe Gln Thr Asn Arg Tyr Leu Thr Glu Gln 260 265 270 Arg Arg Gln Ser Leu Ala Gln Glu Leu Ser Leu Asn Glu Ser Gln Ile 275 280 285 Lys Ile Trp Phe Gln Asn Lys Arg Ala Lys Ile Lys Lys Ala Thr Gly 290 295 300 Asn Lys Asn Thr Leu Ala Val His Leu Met Ala Gln Gly Leu Tyr Asn 305 310 315 320 His Ser Thr Thr Ala Lys Glu Gly Lys Ser Asp Ser Glu 325 330 <210> 4 <211> 297 <212> PRT <213> Homo sapiens <400> 4 Met Met Ser Tyr Leu Lys Gln Pro Pro Tyr Ala Val Asn Gly Leu Ser 1 5 10 15 Leu Thr Thr Ser Gly Met Asp Leu Leu His Pro Ser Val Gly Tyr Pro 20 25 30 Gly Pro Trp Ala Ser Cys Pro Ala Ala Thr Pro Arg Lys Gln Arg Arg 35 40 45 Glu Arg Thr Thr Phe Thr Arg Ala Gln Leu Asp Val Leu Glu Ala Leu 50 55 60 Phe Ala Lys Thr Arg Tyr Pro Asp Ile Phe Met Arg Glu Glu Val Ala 65 70 75 80 Leu Lys Ile Asn Leu Pro Glu Ser Arg Val Gln Val Trp Phe Lys Asn 85 90 95 Arg Arg Ala Lys Cys Arg Gln Gln Gln Gln Gln Gln Gln Asn Gly Gly 100 105 110 Gln Asn Lys Val Arg Pro Ala Lys Lys Lys Thr Ser Pro Ala Arg Glu 115 120 125 Val Ser Ser Glu Ser Gly Thr Ser Gly Gln Phe Thr Pro Pro Ser Ser 130 135 140 Thr Ser Val Pro Thr Ile Ala Ser Ser Ser Ala Pro Val Ser Ile Trp 145 150 155 160 Ser Pro Ala Ser Ile Ser Pro Leu Ser Asp Pro Leu Ser Thr Ser Ser 165 170 175 Ser Cys Met Gln Arg Ser Tyr Pro Met Thr Tyr Thr Gln Ala Ser Gly 180 185 190 Tyr Ser Gln Gly Tyr Ala Gly Ser Thr Ser Tyr Phe Gly Gly Met Asp 195 200 205 Cys Gly Ser Tyr Leu Thr Pro Met His His Gln Leu Pro Gly Pro Gly 210 215 220 Ala Thr Leu Ser Pro Met Gly Thr Asn Ala Val Thr Ser His Leu Asn 225 230 235 240 Gln Ser Pro Ala Ser Leu Ser Thr Gln Gly Tyr Gly Ala Ser Ser Leu 245 250 255 Gly Phe Asn Ser Thr Thr Asp Cys Leu Asp Tyr Lys Asp Gln Thr Ala 260 265 270 Ser Trp Lys Leu Asn Phe Asn Ala Asp Cys Leu Asp Tyr Lys Asp Gln 275 280 285 Thr Ser Ser Trp Lys Phe Gln Val Leu 290 295 <210> 5 <211> 422 <212> PRT <213> Homo sapiens <400> 5 Met Gln Asn Ser His Ser Gly Val Asn Gln Leu Gly Gly Val Phe Val 1 5 10 15 Asn Gly Arg Pro Leu Pro Asp Ser Thr Arg Gln Lys Ile Val Glu Leu 20 25 30 Ala His Ser Gly Ala Arg Pro Cys Asp Ile Ser Arg Ile Leu Gln Val 35 40 45 Ser Asn Gly Cys Val Ser Lys Ile Leu Gly Arg Tyr Tyr Glu Thr Gly 50 55 60 Ser Ile Arg Pro Arg Ala Ile Gly Gly Ser Lys Pro Arg Val Ala Thr 65 70 75 80 Pro Glu Val Val Ser Lys Ile Ala Gln Tyr Lys Arg Glu Cys Pro Ser 85 90 95 Ile Phe Ala Trp Glu Ile Arg Asp Arg Leu Leu Ser Glu Gly Val Cys 100 105 110 Thr Asn Asp Asn Ile Pro Ser Val Ser Ser Ile Asn Arg Val Leu Arg 115 120 125 Asn Leu Ala Ser Glu Lys Gln Gln Met Gly Ala Asp Gly Met Tyr Asp 130 135 140 Lys Leu Arg Met Leu Asn Gly Gln Thr Gly Ser Trp Gly Thr Arg Pro 145 150 155 160 Gly Trp Tyr Pro Gly Thr Ser Val Pro Gly Gln Pro Thr Gln Asp Gly 165 170 175 Cys Gln Gln Gln Glu Gly Gly Gly Glu Asn Thr Asn Ser Ile Ser Ser 180 185 190 Asn Gly Glu Asp Ser Asp Glu Ala Gln Met Arg Leu Gln Leu Lys Arg 195 200 205 Lys Leu Gln Arg Asn Arg Thr Ser Phe Thr Gln Glu Gln Ile Glu Ala 210 215 220 Leu Glu Lys Glu Phe Glu Arg Thr His Tyr Pro Asp Val Phe Ala Arg 225 230 235 240 Glu Arg Leu Ala Ala Lys Ile Asp Leu Pro Glu Ala Arg Ile Gln Val 245 250 255 Trp Phe Ser Asn Arg Arg Ala Lys Trp Arg Arg Glu Glu Lys Leu Arg 260 265 270 Asn Gln Arg Arg Gln Ala Ser Asn Thr Pro Ser His Ile Pro Ile Ser 275 280 285 Ser Ser Phe Ser Thr Ser Val Tyr Gln Pro Ile Pro Gln Pro Thr Thr 290 295 300 Pro Val Ser Ser Phe Thr Ser Gly Ser Met Leu Gly Arg Thr Asp Thr 305 310 315 320 Ala Leu Thr Asn Thr Tyr Ser Ala Leu Pro Pro Met Pro Ser Phe Thr 325 330 335 Met Ala Asn Asn Leu Pro Met Gln Pro Pro Val Pro Ser Gln Thr Ser 340 345 350 Ser Tyr Ser Cys Met Leu Pro Thr Ser Pro Ser Val Asn Gly Arg Ser 355 360 365 Tyr Asp Thr Tyr Thr Pro Pro His Met Gln Thr His Met Asn Ser Gln 370 375 380 Pro Met Gly Thr Ser Gly Thr Thr Ser Thr Gly Leu Ile Ser Pro Gly 385 390 395 400 Val Ser Val Pro Val Gln Val Pro Gly Ser Glu Pro Asp Met Ser Gln 405 410 415 Tyr Trp Pro Arg Leu Gln 420 <210> 6 <211> 336 <212> PRT <213> Homo sapiens <400> 6 Met Phe Gly Lys Thr Asp Lys Met Asp Val Arg Cys His Ser Asp Thr 1 5 10 15 Glu Ala Ala Arg Val Ser Lys Asn Ala His Lys Glu Ser Arg Glu Ile 20 25 30 Lys Gly Ala Glu Gly Ser Leu Pro Ala Ala Phe Leu Lys Glu Pro Gln 35 40 45 Gly Ala Phe Ser Ala Ser Gly Ala Ser Glu Asp Cys Asn Lys Ser Lys 50 55 60 Ser Asn Ser Ser Ala Asp Pro Asp Tyr Cys Arg Arg Ile Leu Val Arg 65 70 75 80 Asp Ala Lys Gly Ser Ile Arg Glu Ile Ile Leu Pro Lys Gly Leu Asp 85 90 95 Leu Asp Arg Pro Lys Arg Thr Arg Thr Ser Phe Thr Ala Glu Gln Leu 100 105 110 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Leu Thr Arg Arg Arg Arg Ile Glu Ile Ala His Thr Leu Cys 180 185 190 Leu Ser Glu Arg Gln Ile Lys Ile Trp Phe Gln Asn Arg Arg Met Lys 195 200 205 Trp Lys Lys Asp His Lys Leu Pro Asn Thr Lys Gly Arg Ser Ser Ser 210 215 220 Ser Ser Ser Ser Ser Ser Cys Ser Leu Ser Val Ala Pro Ser Gln His 225 230 235 240 Leu Gln Pro Met Ala Lys Asp His His Thr Asp Leu Thr Thr Leu 245 250 255 <210> 8 <211> 355 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> SHOX2 (P305L) <400> 8 Met Glu Glu Leu Thr Ala Phe Val Ser Lys Ser Phe Asp Gln Lys Val 1 5 10 15 Lys Glu Lys Lys Glu Ala Ile Thr Tyr Arg Glu Val Leu Glu Ser Gly 20 25 30 Pro Leu Arg Gly Ala Lys Glu Pro Thr Gly Cys Thr Glu Ala Gly Arg 35 40 45 Asp Asp Arg Ser Ser Pro Ala Val Arg Ala Ala Gly Gly Gly Gly Gly 50 55 60 Gly Gly Gly Gly Gly Gly Gly Gly Gly Gly Gly Gly Gly Val Gly Gly 65 70 75 80 Gly Gly Ala Gly Gly Gly Ala Gly Gly Gly Arg Ser Pro Val Arg Glu 85 90 95 Leu Asp Met Gly Ala Ala Glu Arg Ser Arg Glu Pro Gly Ser Pro Arg 100 105 110 Leu Thr Glu Gly Arg 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Ala Ala Ala Ala Ala Lys Thr Thr Ser Lys Asn 325 330 335 Ser Ser Ile Ala Asp Leu Arg Leu Lys Ala Lys Lys His Ala Ala Ala 340 345 350 Leu Gly Leu 355 <210> 9 <211> 333 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> EN2 (L143E) EN2 (L191E) <400> 9 Met Glu Glu Asn Asp Pro Lys Pro Gly Glu Ala Ala Ala Ala Val Glu 1 5 10 15 Gly Gln Arg Gln Pro Glu Ser Ser Pro Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly 20 25 30 Gly Gly Ser Ser Pro Gly Glu Ala Asp Thr Gly Arg Arg Arg Ala Leu 35 40 45 Met Leu Pro Ala Val Leu Gln Ala Pro Gly Asn His Gln His Pro His 50 55 60 Arg Ile Thr Asn Phe Phe Ile Asp Asn Ile Leu Arg Pro Glu Phe Gly 65 70 75 80 Arg Arg Lys Asp Ala Gly Thr Cys Cys Ala Gly Ala Gly Gly Gly Arg 85 90 95 Gly Gly Gly Ala Gly Gly Glu Gly Gly Ala Ser Gly Ala Glu Gly Gly 100 105 110 Gly Gly Ala Gly Gly Ser Glu Gln Leu Leu Gly Ser Gly Ser Arg Glu 115 120 125 Pro Arg Gln Asn Pro Pro Cys Ala Pro Gly Ala Gly Gly Pro Glu Pro 130 135 140 Ala Ala Gly Ser Asp Ser Pro Gly Asp Gly Glu Gly Gly Ser Lys Thr 145 150 155 160 Leu Ser Leu His Gly Gly Ala Lys Lys Gly Gly Asp Pro Gly Gly Pro 165 170 175 Leu Asp Gly Ser Leu Lys Ala Arg Gly Leu Gly Gly Gly Asp Glu Ser 180 185 190 Val Ser Ser Asp Ser Asp Ser Ser Gln Ala Gly Ala Asn Leu Gly Ala 195 200 205 Gln Pro Met Leu Trp Pro Ala Trp Val Tyr Cys Thr Arg Tyr Ser Asp 210 215 220 Arg Pro Ser Ser Gly Pro Arg Ser Arg Lys Pro Lys Lys Lys Asn Pro 225 230 235 240 Asn Lys Glu Asp Lys Arg Pro Arg Thr Ala Phe Thr Ala Glu Gln Leu 245 250 255 Gln Arg Leu Lys Ala Glu Phe Gln Thr Asn Arg Tyr Leu Thr Glu Gln 260 265 270 Arg Arg Gln Ser Leu Ala Gln Glu Leu Ser Leu Asn Glu Ser Gln Ile 275 280 285 Lys Ile Trp Phe Gln Asn Lys Arg Ala Lys Ile Lys Lys Ala Thr Gly 290 295 300 Asn Lys Asn Thr Leu Ala Val His Leu Met Ala Gln Gly Leu Tyr Asn 305 310 315 320 His Ser Thr Thr Ala Lys Glu Gly Lys Ser Asp Ser Glu 325 330 <210> 10 <211> 297 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> OTX2 (L220E) <400> 10 Met Met Ser Tyr Leu Lys Gln Pro Pro Tyr Ala Val Asn Gly Leu Ser 1 5 10 15 Leu Thr Thr 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Asn Ala Val Thr Ser His Leu Asn 225 230 235 240 Gln Ser Pro Ala Ser Leu Ser Thr Gln Gly Tyr Gly Ala Ser Ser Leu 245 250 255 Gly Phe Asn Ser Thr Thr Asp Cys Leu Asp Tyr Lys Asp Gln Thr Ala 260 265 270 Ser Trp Lys Leu Asn Phe Asn Ala Asp Cys Leu Asp Tyr Lys Asp Gln 275 280 285 Thr Ser Ser Trp Lys Phe Gln Val Leu 290 295 <210> 11 <211> 297 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> OTX2 (F258E) <400> 11 Met Met Ser Tyr Leu Lys Gln Pro Pro Tyr Ala Val Asn Gly Leu Ser 1 5 10 15 Leu Thr Thr Ser Gly Met Asp Leu Leu His Pro Ser Val Gly Tyr Pro 20 25 30 Gly Pro Trp Ala Ser Cys Pro Ala Ala Thr Pro Arg Lys Gln Arg Arg 35 40 45 Glu Arg Thr Thr Phe Thr Arg Ala Gln Leu Asp Val Leu Glu Ala Leu 50 55 60 Phe Ala Lys Thr Arg Tyr Pro Asp Ile Phe Met Arg Glu Glu Val Ala 65 70 75 80 Leu Lys Ile Asn Leu Pro Glu Ser Arg Val Gln Val Trp Phe Lys Asn 85 90 95 Arg Arg Ala Lys Cys Arg Gln Gln Gln Gln Gln Gln Gln Asn Gly Gly 100 105 110 Gln Asn Lys Val Arg Pro Ala Lys Lys Lys Thr Ser Pro Ala Arg Glu 115 120 125 Val Ser Ser Glu Ser Gly Thr Ser Gly Gln Phe Thr Pro Pro Ser Ser 130 135 140 Thr Ser Val Pro Thr Ile Ala Ser Ser Ser Ala Pro Val Ser Ile Trp 145 150 155 160 Ser Pro Ala Ser Ile Ser Pro Leu Ser Asp Pro Leu Ser Thr Ser Ser 165 170 175 Ser Cys Met Gln Arg Ser Tyr Pro Met Thr Tyr Thr Gln Ala Ser Gly 180 185 190 Tyr Ser Gln Gly Tyr Ala Gly Ser Thr Ser Tyr Phe Gly Gly Met Asp 195 200 205 Cys Gly Ser Tyr Leu Thr Pro Met His His Gln Leu Pro Gly Pro Gly 210 215 220 Ala Thr Leu Ser Pro Met Gly Thr Asn Ala Val Thr Ser His Leu Asn 225 230 235 240 Gln Ser Pro Ala Ser Leu Ser Thr Gln Gly Tyr Gly Ala Ser Ser Leu 245 250 255 Gly Glu Asn Ser Thr Thr Asp Cys Leu Asp Tyr Lys Asp Gln Thr Ala 260 265 270 Ser Trp Lys Leu Asn Phe Asn Ala Asp Cys Leu Asp Tyr Lys Asp Gln 275 280 285 Thr Ser Ser Trp Lys Phe Gln Val Leu 290 295 <210> 12 <211> 422 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> PAX6 (L130E) <400> 12 Met Gln Asn Ser His Ser Gly Val Asn Gln Leu Gly Gly Val Phe Val 1 5 10 15 Asn Gly Arg Pro Leu 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Met Phe Gly Lys Thr Asp Lys Met Asp Val Arg Cys His Ser Asp Thr 1 5 10 15 Glu Ala Ala Arg Val Ser Lys Asn Ala His Lys Glu Ser Arg Glu Ile 20 25 30 Lys Gly Ala Glu Gly Ser Leu Pro Ala Ala Phe Leu Lys Glu Pro Gln 35 40 45 Gly Ala Phe Ser Ala Ser Gly Ala Ser Glu Asp Cys Asn Lys Ser Lys 50 55 60 Ser Asn Ser Ser Ala Asp Pro Asp Tyr Cys Arg Arg Ile Leu Val Arg 65 70 75 80 Asp Ala Lys Gly Ser Ile Arg Glu Ile Ile Leu Pro Lys Gly Leu Asp 85 90 95 Leu Asp Arg Pro Lys Arg Thr Arg Thr Ser Phe Thr Ala Glu Gln Leu 100 105 110 Tyr Arg Leu Glu Met Glu Phe Gln Arg Cys Gln Tyr Val Val Gly Arg 115 120 125 Glu Arg Thr Glu Leu Ala Arg Gln Leu Asn Leu Ser Glu Thr Gln Val 130 135 140 Lys Val Trp Phe Gln Asn Arg Arg Thr Lys Gln Lys Lys Asp Gln Gly 145 150 155 160 Lys Asp Ser Glu Leu Arg Ser Val Val Ser Glu Thr Ala Ala Thr Cys 165 170 175 Ser Val Leu Arg Leu Leu Glu Gln Gly Arg Leu Leu Ser Pro Pro Gly 180 185 190 Leu Pro Ala Leu Leu Pro Pro Cys Ala Thr Gly Ala Leu Gly Ser Ala 195 200 205 Leu Arg Gly Pro Ser Leu Pro Ala Leu Gly Ala Gly Ala Ala Ala Gly 210 215 220 Ser Ala Ala Ala Ala Ala Ala Ala Ala Thr Ala Pro Gly Pro Ala Gly 225 230 235 240 Ala Ala Ser Gln His Pro Pro Ala Val Gly Gly Ala Pro Gly Pro Gly 245 250 255 Pro Ala Gly Pro Gly Gly Leu His Ala Gly Ala Pro Thr Ala Ser His 260 265 270 Gly Leu Phe Ser Leu Pro Val Pro Ser Leu Leu Gly Ser Val Ala Ser 275 280 285 Arg Leu Ser Ser Ala Pro Leu Thr Met Ala Gly Ser Leu Ala Gly Asn 290 295 300 Glu Gln Glu Leu Ser Ala Arg Tyr Leu Ser Ser Ser Ala Phe Glu Pro 305 310 315 320 Tyr Ser Arg Thr Asn Asn Lys Glu Gly Ala Glu Lys Lys Ala Leu Asp 325 330 335

Claims (8)

1. 하기 그룹으로 이루어진 군으로부터 선택되는, 세포외 분비능이 증감된 호메오단백질 변이체.
   1) 서열번호 1로 표시되는 아미노산 서열로 이루어진, HOXD4 단백질 (NCBI Reference Sequence:　NP_055436.2)의 233번째 아미노산이 치환된 변이체;
   2) 서열번호 2로 표시되는 아미노산 서열로 이루어진, SHOX2 단백질 (NCBI Reference Sequence:　NP_003021.3)의 305번째 아미노산이 치환된 변이체;
   3) 서열번호 3으로 표시되는 아미노산 서열로 이루어진, EN2 단백질 (NCBI Reference Sequence:　NP_001418.2)의 143번째 및 191번째 아미노산이 치환된 변이체;
   4) 서열번호 4로 표시되는 아미노산 서열로 이루어진, OTX2 단백질 (NCBI Reference Sequence:　NP_001257454.1)의 220번째 또는 258번째 아미노산이 치환된 변이체;
   5) 서열번호 5로 표시되는 아미노산 서열로 이루어진, PAX6 단백질 (NCBI Reference Sequence:　NP_000271.1)의 130번째 아미노산이 치환된 변이체; 및
   6) 서열번호 6으로 표시되는 아미노산 서열로 이루어진, VAX1 단백질 (NCBI Reference Sequence:　NP_072158.1)의 305번째 아미노산이 치환된 변이체.
   
2. 제1항에 있어서,
   상기 아미노산은 호메오도메인의 외부 모티프 내 아미노산인 것을 특징으로 하는, 호메오단백질 변이체.
   
3. 제1항에 있어서,
   상기 아미노산이 소수성 아미노산 (hydrophobic amino acid)으로 치환되는 경우 세포외 분비능이 증진되는 것을 특징으로 하는, 호메오단백질 변이체.
   
4. 제1항에 있어서,
   상기 아미노산이 친수성 아미노산 (hydrophilic amino acid)으로 치환되는 경우 세포외 분비능이 감소되는 것을 특징으로 하는, 호메오단백질 변이체.
   
5. 제3항에 있어서,
   상기 소수성 아미노산은 류신 (Leu, L)인 것을 특징으로 하는, 호메오단백질 변이체.
   
6. 제4항에 있어서,
   상기 친수성 아미노산은 글루타메이트 (Glu, E)인 것을 특징으로 하는, 호메오단백질 변이체.
   
7. 하기 그룹으로 이루어진 군으로부터 선택되는 어느 하나의 아미노산을 치환하는 단계를 포함하는, 호메오단백질의 세포외 분비능 증감방법.
   1) 서열번호 1로 표시되는 아미노산 서열로 이루어진, HOXD4 단백질 (NCBI Reference Sequence:　NP_055436.2)의 233번째 아미노산;
   2) 서열번호 2로 표시되는 아미노산 서열로 이루어진, SHOX2 단백질 (NCBI Reference Sequence:　NP_003021.3)의 305번째 아미노산;
   3) 서열번호 3으로 표시되는 아미노산 서열로 이루어진, EN2 단백질 (NCBI Reference Sequence:　NP_001418.2)의 143번째 및 191번째 아미노산;
   4) 서열번호 4로 표시되는 아미노산 서열로 이루어진, OTX2 단백질 (NCBI Reference Sequence:　NP_001257454.1)의 220번째 또는 258번째 아미노산;
   5) 서열번호 5로 표시되는 아미노산 서열로 이루어진, PAX6 단백질 (NCBI Reference Sequence:　NP_000271.1)의 130번째 아미노산; 및
   6) 서열번호 6으로 표시되는 아미노산 서열로 이루어진, VAX1 단백질 (NCBI Reference Sequence:　NP_072158.1)의 305번째 아미노산.
   
8. 하기 그룹으로 이루어진 군으로부터 선택되는 어느 하나의 아미노산을 확인하는 단계를 포함하는, 호메오단백질의 세포외 분비능 예측방법.
   1) 서열번호 1로 표시되는 아미노산 서열로 이루어진, HOXD4 단백질 (NCBI Reference Sequence:　NP_055436.2)의 233번째 아미노산;
   2) 서열번호 2로 표시되는 아미노산 서열로 이루어진, SHOX2 단백질 (NCBI Reference Sequence:　NP_003021.3)의 305번째 아미노산;
   3) 서열번호 3으로 표시되는 아미노산 서열로 이루어진, EN2 단백질 (NCBI Reference Sequence:　NP_001418.2)의 143번째 및 191번째 아미노산;
   4) 서열번호 4로 표시되는 아미노산 서열로 이루어진, OTX2 단백질 (NCBI Reference Sequence:　NP_001257454.1)의 220번째 또는 258번째 아미노산;
   5) 서열번호 5로 표시되는 아미노산 서열로 이루어진, PAX6 단백질 (NCBI Reference Sequence:　NP_000271.1)의 130번째 아미노산; 및
   6) 서열번호 6으로 표시되는 아미노산 서열로 이루어진, VAX1 단백질 (NCBI Reference Sequence:　NP_072158.1)의 305번째 아미노산.
   

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