KR20210066634A - A composition, kit and method for diagnosing PARP1 inhibitor resistant cancer - Google Patents

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Abstract

According to a composition, kit and method for diagnosing PARP1 inhibitor resistance, it is possible to efficiently diagnose PARP1 inhibitor-resistant cancer, maximize the therapeutic effect using the PARP1 inhibitor, and efficiently select candidate substances capable of treating PARP1 inhibitor-resistant cancer.

Description

PARP1 저해제 내성 암의 진단를 위한 조성물, 키트 및 방법{A composition, kit and method for diagnosing PARP1 inhibitor resistant cancer}Composition, kit and method for diagnosing PARP1 inhibitor resistant cancer {A composition, kit and method for diagnosing PARP1 inhibitor resistant cancer}

PARP1 저해제 내성 암의 진단을 위한 조성물, 키트 및 방법에 관한 것이다.Compositions, kits and methods for the diagnosis of PARP1 inhibitor-resistant cancer.

PARP 효소는 항암제로 손상된 종양세포의 DNA 회복을 도와 항암 효과를 낮추는 역할을 한다. 암세포 내에서 PARP 활성이 증가되기 때문에 암세포의 생존 메커니즘과도 관련이 깊다. 이로 인해 PARP 저해제는 암세포의 DNA 회복을 억제하고 방사선 등과 같은 암치료의 효과를 증진시킨다. PARP 계열 치료제는 이미 시장에 신약으로 출시됐지만 적응증 확장을 위한 후속 연구가 활발하다. 현재까지는 아스트라제네카의 올라파립(성분명 olaparib)을 비롯해 테사로의 니라파립(niraparib), 클로비스 온콜로지의 루카파립(rucaparib) 등이 난소암 치료제로 활용되고 있는데 올라파립은 올해 FDA로부터 BRCA 변이의 HER2-음성 전이 유방암 적응증을 추가로 승인 받았다.The PARP enzyme plays a role in reducing the anticancer effect by helping the DNA recovery of tumor cells damaged by anticancer drugs. Since PARP activity is increased in cancer cells, it is also closely related to the survival mechanism of cancer cells. For this reason, PARP inhibitors inhibit DNA repair of cancer cells and enhance the effects of cancer treatment such as radiation. Although PARP-based therapeutics have already been launched as new drugs on the market, follow-up studies to expand indications are active. So far, AstraZeneca's olaparib (ingredient name olaparib), Tesaro's niraparib, and Clovis Oncology's rucaparib are being used as ovarian cancer treatments. -Additionally approved for an indication for negative metastatic breast cancer.

이처럼 PARP1 저해제는 BRCA 돌연변이 난소암, 유방암 등에서 항암 효과를 입증하여 실제 임상에서 사용되고 있으나, 대부분의 경우 획득 내성이 발생하는 문제가 있다. 이와 관련하여, 53BP1(p53-binding protein) 기능의 소실이 실험적으로 PARP1 저해제 내성을 유발할 수 있음을 확인한 연구 결과(Cell 2010; Nat Struct Mol Biol 2010; Cell Cycle 2012); PARP 저해제 내성 세포에서 상동 재조합 DNA 복구 경로의 유전자인 Rad51의 발현이 증가하였음을 확인한 연구 결과(Mol Cancer Res 2009); PARP 저해제 내성 세포에서 mTOR pathway의 하위 유전자인 리보솜 단백질 S6의 인산화가 증가되고, mTOR 억제제인 rapamycin에 의해서 PARP 억제제의 내성이 극복됨을 확인한 연구 결과(Oncotarget 2014)가 있다. As such, PARP1 inhibitors have proven their anticancer effects in BRCA mutant ovarian cancer and breast cancer and are being used in actual clinical trials, but there is a problem in that acquired resistance occurs in most cases. In this regard, the results of studies confirming that loss of 53BP1 (p53-binding protein) function can experimentally induce PARP1 inhibitor resistance (Cell 2010; Nat Struct Mol Biol 2010; Cell Cycle 2012); Results of a study confirming that the expression of Rad51, a gene of the homologous recombination DNA repair pathway, was increased in PARP inhibitor-resistant cells (Mol Cancer Res 2009); In PARP inhibitor-resistant cells, phosphorylation of ribosomal protein S6, a subgene of mTOR pathway, is increased, and there is a study result (Oncotarget 2014) confirming that PARP inhibitor resistance is overcome by rapamycin, an mTOR inhibitor.

그러나, 이러한 연구 결과들은 대부분 시스플라틴의 획득 내성 기전 연구에서 비롯된 결과로서, PARP1 저해제의 획득 내성도 이와 비슷할 것으로 간접적으로 유추된 결과들이다. 즉, 아직까지 암 치료에 이용될 수준의 합의를 이룬 PARP1 저해제의 획득 내성 기전은 알려진 바 없다.However, most of these study results are results from studies on the mechanism of acquired resistance to cisplatin, and are indirectly inferred that the acquired resistance of PARP1 inhibitors will be similar to this. That is, the mechanism of acquired resistance of PARP1 inhibitors that have reached agreement to be used for cancer treatment is not known.

일 양상은 S100A7 (S100 calcium-binding protein), PROM1 (Prominin-1), MT1G (Metallothionein 1G), 및 CCL2 (Chemokine (C-C motif) ligand 2)로 이루어진 군으로부터 선택된 하나 이상의 유전자의 발현 수준을 측정하기 위한 제제를 포함하는 PARP1 저해제 내성 진단용 조성물을 제공하는 것이다.One aspect is to measure the expression level of one or more genes selected from the group consisting of S100A7 (S100 calcium-binding protein), PROM1 (Prominin-1), MT1G (Metallothionein 1G), and CCL2 (Chemokine (CC motif) ligand 2) To provide a composition for diagnosis of PARP1 inhibitor resistance comprising a formulation for

다른 양상은 S100A7, PROM1, MT1G, 및 CCL2로 이루어진 군으로부터 선택된 하나 이상의 유전자의 발현 수준을 측정하기 위한 제제를 포함하는 PARP1 저해제 내성 진단용 키트를 제공하는 것이다. Another aspect is to provide a kit for diagnosing PARP1 inhibitor resistance, comprising an agent for measuring the expression level of one or more genes selected from the group consisting of S100A7, PROM1, MT1G, and CCL2.

또 다른 양상은 개체의 시료로부터 S100A7, PROM1, MT1G, 및 CCL2로 이루어진 군으로부터 선택된 하나 이상의 유전자의 발현 수준을 측정하는 단계를 포함하는 PARP1 저해제 내성 진단을 위한 정보제공방법을 제공하는 것이다.Another aspect is to provide an information providing method for diagnosing PARP1 inhibitor resistance, comprising measuring the expression level of one or more genes selected from the group consisting of S100A7, PROM1, MT1G, and CCL2 from a sample of an individual.

또 다른 양상은 PARP1 저해제 내성 암의 치료를 위한 후보 물질이 투여된 개체의 시료로부터 S100A7, PROM1, MT1G, 및 CCL2로 이루어진 군으로부터 선택된 하나 이상의 유전자의 발현 수준을 측정하는 단계를 포함하는 PARP1 저해제 내성 암 치료제를 스크리닝하는 방법을 제공하는 것이다.Another aspect is PARP1 inhibitor resistance comprising the step of measuring the expression level of one or more genes selected from the group consisting of S100A7, PROM1, MT1G, and CCL2 from a sample of an individual administered with a candidate substance for the treatment of PARP1 inhibitor-resistant cancer To provide a method for screening a cancer therapeutic agent.

일 양상은 S100A7 (S100 calcium-binding protein), PROM1 (Prominin-1), MT1G (Metallothionein 1G), 및 CCL2 (Chemokine (C-C motif) ligand 2)로 이루어진 군으로부터 선택된 하나 이상의 유전자의 발현 수준을 측정하기 위한 제제를 포함하는 PARP1 저해제 내성 진단용 조성물을 제공한다. One aspect is to measure the expression level of one or more genes selected from the group consisting of S100A7 (S100 calcium-binding protein), PROM1 (Prominin-1), MT1G (Metallothionein 1G), and CCL2 (Chemokine (CC motif) ligand 2) It provides a composition for diagnosis of PARP1 inhibitor resistance comprising a formulation for

본 명세서에서 용어, "S100A7 (S100 calcium-binding protein)"은 2개의 EF-hand 칼슘-결합 모티프를 함유하는 단백질로서, S100 family에 속한다. S100 단백질을은 세포의 핵 및/또는 세포질과 같이 세포에 광범위하게 존재하고, 세포 주기 진행, 분화와 같은 많은 세포 과정의 조절에 관여하는 것으로 알려져 있다. 특히, S100A7은 구조가 알려진 다른 S100 단백질과 다르게, 칼슘결합 능력이 부족하고, 주로 대장균(E.coli)에 대한 우수한 항균 펩티드로 기능하는 것으로 알려져 있다. 상기 S100A7은 종양 조직이 발생할 수 있는 각종 동물 유래의 S100A7일 수 있으며, 특히 인간 유래의 S100A7일 수 있으며, 공지의 데이터베이스인 NCBI GeneBank에서 그 서열 정보를 알 수 있다. 예를 들어, NM_002963.4을 포함하는 mRNA로부터 발현되는 단백질, NP_002954.2의 아미노산 서열을 포함하는 펩티드 또는 단백질로 번역될 수 있다. 상기 mRNA 또는 상기 단백질과 일부 뉴클레오티드 서열 또는 아미노산 서열이 일치하지 않더라도, 생물학적으로 동등한 활성을 갖는 뉴클레오티드 서열 또는 아미노산 서열은 S100A7의 mRNA 또는 S100A7 단백질로 간주될 수 있다.As used herein, the term "S100A7 (S100 calcium-binding protein)" is a protein containing two EF-hand calcium-binding motifs, and belongs to the S100 family. S100 protein is widely present in cells such as the nucleus and/or cytoplasm of cells and is known to be involved in the regulation of many cellular processes such as cell cycle progression and differentiation. In particular, S100A7, unlike other S100 proteins whose structure is known, lacks calcium binding ability, and is known to mainly function as an excellent antibacterial peptide against E. coli. The S100A7 may be S100A7 derived from various animals capable of generating tumor tissue, in particular S100A7 derived from a human, and the sequence information can be found in NCBI GeneBank, a known database. For example, it can be translated into a protein expressed from mRNA containing NM_002963.4, a peptide or protein containing the amino acid sequence of NP_002954.2. Even if the mRNA or the protein and some nucleotide sequence or amino acid sequence do not match, a nucleotide sequence or amino acid sequence having biologically equivalent activity may be regarded as S100A7 mRNA or S100A7 protein.

본 명세서에서 용어, "PROM1 (Prominin-1)"은 CD133 항원으로도 알려져 있고, 특히 세포 돌출부에 위치하는 펜타스팬(pentaspan) 막 관통 당단백질이다. PROM1의 정확한 기능은 알려진 바 없고, 세포막 위상(topology)을 조직하는 역할을 수행할 것이라고 제안된 바 있다. 상기 PROM1은 종양 조직이 발생할 수 있는 각종 동물 유래의 PROM1일 수 있으며, 특히 인간 유래의 PROM1일 수 있으며, 공지의 데이터베이스인 NCBI GeneBank에서 그 서열 정보를 알 수 있다. 예를 들어, NM_001145847.2, NM_001145848.2, NM_001145849.2, NM_001145850.2, NM_001145851.2, NM_001163577.1, NM_001163578.1, NM_001163581.1, NM_001163582.1, 또는 NM_001163583.1을 포함하는 mRNA로부터 발현되는 단백질, NP_001139319.1, NP_001139320.1, NP_001139321.1, NP_001139322.1, NP_001139323.1, NP_001157049.1, NP_001157050.1, NP_001157053.1, NP_001157054.1, 또는 NP_001157055.1의 아미노산 서열을 포함하는 펩티드 또는 단백질로 번역될 수 있다. 상기 mRNA 또는 상기 단백질과 일부 뉴클레오티드 서열 또는 아미노산 서열이 일치하지 않더라도, 생물학적으로 동등한 활성을 갖는 뉴클레오티드 서열 또는 아미노산 서열은 PROM1의 mRNA 또는 PROM1 단백질로 간주될 수 있다.As used herein, the term "PROM1 (Prominin-1)" is also known as the CD133 antigen, and in particular, is a pentaspan transmembrane glycoprotein located in the cell protrusion. The exact function of PROM1 is unknown, and it has been suggested that it may play a role in organizing the cell membrane topology. The PROM1 may be PROM1 derived from various animals capable of generating tumor tissues, particularly PROM1 derived from humans, and its sequence information can be found in NCBI GeneBank, a known database. For example, expression from an mRNA comprising NM_001145847.2, NM_001145848.2, NM_001145849.2, NM_001145850.2, NM_001145851.2, NM_001163577.1, NM_001163578.1, NM_001163581.1, NM_001163582.1, or NM_001163583.1 a peptide comprising the amino acid sequence of NP_001139319.1, NP_001139320.1, NP_001139321.1, NP_001139322.1, NP_001139323.1, NP_001157049.1, NP_001157050.1, NP_001157053.1, NP_001157054.1, or NP_001157055.1 Or it can be translated into a protein. Even if the mRNA or the protein and some nucleotide sequence or amino acid sequence do not match, a nucleotide sequence or amino acid sequence having a biologically equivalent activity may be regarded as an mRNA of PROM1 or a PROM1 protein.

본 명세서에서 용어, "MT1G (Metallothionein 1G)"는 금속에 의해 유도되는 단백질의 일종으로서, 구성 아미노산 중 시스테인이 풍부한 저분자량의 단백질이다. 카드뮴, 납, 아연, 수은, 구리, 비소, 은 등과 같은 넓은 범위의 금속에 결합하는 것으로 알려져 있다. 또한, 메탈로티오넨인의 시스테인 잔기가 유해한 산화 라디칼을 포획할 수 있으므로, 산화적 스트레스를 조절하는데 역할을 하는 것으로 알려져 있다. 상기 MT1G는 종양 조직이 발생할 수 있는 각종 동물 유래의 MT1G일 수 있으며, 특히 인간 유래의 MT1G일 수 있으며, 공지의 데이터베이스인 NCBI GeneBank에서 그 서열 정보를 알 수 있다. 예를 들어, NM_005950.3, 또는 NM_001301267.2을 포함하는 mRNA로부터 발현되는 단백질, NP_001288196.1 또는 NP_005941.1의 아미노산 서열을 포함하는 펩티드 또는 단백질로 번역될 수 있다. 상기 mRNA 또는 상기 단백질과 일부 뉴클레오티드 서열 또는 아미노산 서열이 일치하지 않더라도, 생물학적으로 동등한 활성을 갖는 뉴클레오티드 서열 또는 아미노산 서열은 MT1G의 mRNA 또는 MT1G 단백질로 간주될 수 있다.As used herein, the term “MT1G (Metallothionein 1G)” is a type of metal-induced protein, and is a low-molecular-weight protein rich in cysteine among constituent amino acids. It is known to bind to a wide range of metals such as cadmium, lead, zinc, mercury, copper, arsenic, silver, and the like. It is also known to play a role in regulating oxidative stress, as the cysteine residue of metallothionene can trap harmful oxidative radicals. The MT1G may be MT1G derived from various animals capable of generating tumor tissues, particularly MT1G derived from humans, and its sequence information can be found in NCBI GeneBank, a known database. For example, it can be translated into a protein expressed from an mRNA comprising NM_005950.3, or NM_001301267.2, a peptide or protein comprising the amino acid sequence of NP_001288196.1 or NP_005941.1. Even if the mRNA or the protein and some nucleotide sequence or amino acid sequence do not match, a nucleotide sequence or amino acid sequence having a biologically equivalent activity may be regarded as an MT1G mRNA or MT1G protein.

본 명세서에서 용어, "CCL2 (Chemokine (C-C motif) ligand 2)"은 단핵세포 화학유인물질 단백질 1(monocyte chemoattractant protein 1 (MCP1)) 또는 작은 유도성 사이토카인 A2(small inducible cytokine A2)로도 불리며, 조직 손상 또는 감염에 의해 생산된 염증 부위에 단핵구, 기억 T 세포, 수지상 세포를 모으는 역할을 하는 것으로 알려져 있다. 상기 CCL2는 종양 조직이 발생할 수 있는 각종 동물 유래의 CCL2일 수 있으며, 특히 인간 유래의 CCL2일 수 있으며, 공지의 데이터베이스인 NCBI GeneBank에서 그 서열 정보를 알 수 있다. 예를 들어, NM_002982.4 또는 NM_011331.3을 포함하는 mRNA로부터 발현되는 단백질, NP_002973.1 또는 NP_035461.2의 아미노산 서열을 포함하는 펩티드 또는 단백질로 번역될 수 있다. 상기 mRNA 또는 상기 단백질과 일부 뉴클레오티드 서열 또는 아미노산 서열이 일치하지 않더라도, 생물학적으로 동등한 활성을 갖는 뉴클레오티드 서열 또는 아미노산 서열은 CCL2의 mRNA 또는 CCL2 단백질로 간주될 수 있다.As used herein, the term "CCL2 (Chemokine (CC motif) ligand 2)" is also called monocyte chemoattractant protein 1 (MCP1)) or small inducible cytokine A2 (small inducible cytokine A2), It is known to play a role in recruiting monocytes, memory T cells, and dendritic cells to sites of inflammation produced by tissue damage or infection. The CCL2 may be CCL2 derived from various animals capable of generating tumor tissues, in particular CCL2 derived from humans, and its sequence information can be found in NCBI GeneBank, a known database. For example, it can be translated into a protein expressed from mRNA containing NM_002982.4 or NM_011331.3, a peptide or protein containing the amino acid sequence of NP_002973.1 or NP_035461.2. Even if the mRNA or the protein and some nucleotide sequence or amino acid sequence do not match, a nucleotide sequence or amino acid sequence having a biologically equivalent activity may be regarded as an mRNA of CCL2 or a CCL2 protein.

본 명세서에서 용어, "PARP1(Poly [ADP-ribose] polymerase 1)"은 DNA 복구, 괴사 및 세포 기능장애로 완결되는 세포 에너지 풀의 균형, 및 전-염증성 유전자의 발현에 관여하는 분자로서, 산화적 스트레스 및 DNA 손상에 의해 촉진되는 염증성 손상과 같은 다양한 생리학적 조건에서 발견되는 것으로 알려져 있다. 상기 PARP1은 공지의 데이터베이스인 NCBI GeneBank에서 그 서열 정보를 알 수 있다. 예를 들어, NM_001618.4 또는 NM_007415.3을 포함하는 mRNA로부터 발현되는 단백질, NP_001609.2의 아미노산 서열을 포함하는 펩티드 또는 단백질로 번역될 수 있다. 상기 mRNA 또는 상기 단백질과 일부 뉴클레오티드 서열 또는 아미노산 서열이 일치하지 않더라도, 생물학적으로 동등한 활성을 갖는 뉴클레오티드 서열 또는 아미노산 서열은 PARP1의 mRNA 또는 PARP1 단백질로 간주될 수 있다.As used herein, the term "PARP1 (Poly [ADP-ribose] polymerase 1)" is a molecule involved in DNA repair, balance of the cellular energy pool, which results in necrosis and cellular dysfunction, and expression of pro-inflammatory genes, oxidized It is known to be found in a variety of physiological conditions, such as inflammatory damage promoted by inflammatory stress and DNA damage. The sequence information of the PARP1 can be known from NCBI GeneBank, a known database. For example, it can be translated into a protein expressed from mRNA comprising NM_001618.4 or NM_007415.3, a peptide or protein comprising the amino acid sequence of NP_001609.2. Even if the mRNA or the protein and some nucleotide sequence or amino acid sequence do not match, a nucleotide sequence or amino acid sequence having biologically equivalent activity may be regarded as an mRNA of PARP1 or a PARP1 protein.

본 명세서에서 용어, "PARP1 저해제"는 세포 내에서 PARP1의 발현 또는 활성을 감소시키는 제제를 의미하는 것으로, 예를 들어, PARP1에 직접적으로 작용하거나 또는 PARP1의 상위 조절자에 간접적으로 작용하여 PARP1의 발현을 전사 수준에서 감소시키거나, 발현된 PARP1의 분해를 증가시키거나, 그 활성을 방해함으로써 PARP1의 발현 수준 또는 그 활성을 감소시키는 제제를 의미할 수 있으며, 세포 내 PARP1의 발현 또는 활성을 감소시켜 세포의 방사선 민감도를 증진시킬 수 있는 제제라면 제한 없이 포함될 수 있다. 일 구체예에서, 켈로이드 섬유아세포에서 PARP1을 저해한 결과, 상기 세포의 성장 및 이동성, 섬유화 마커의 발현이 유의적으로 억제되고, 켈로이드 조직의 크기 및 경도가 유의적으로 감소함을 확인하였다.As used herein, the term "PARP1 inhibitor" refers to an agent that reduces the expression or activity of PARP1 in a cell, for example, acts directly on PARP1 or indirectly acts on an up-regulator of PARP1 to inhibit PARP1. It may refer to an agent that reduces the expression level or activity of PARP1 by decreasing the expression at the transcriptional level, increasing the degradation of the expressed PARP1, or interfering with the activity thereof, and reducing the expression or activity of PARP1 in the cell Any agent capable of enhancing the radiation sensitivity of cells may be included without limitation. In one embodiment, as a result of inhibiting PARP1 in keloid fibroblasts, it was confirmed that the growth and mobility of the cells, the expression of fibrosis markers were significantly inhibited, and the size and hardness of the keloid tissue were significantly reduced.

상기 PARP1 저해제는 PARP1 저해 활성을 가진 물질이라면, 특별히 제한되지 않으나, 당업계에 공지된 표준 기법을 통해 세포에 처리될 수 있는 핵산 또는 폴리펩티드 같은 생물학적 분자, 화합물, 세균이나 식물 또는 동물로부터 분리된 추출물일 수 있다. The PARP1 inhibitor is not particularly limited as long as it is a substance having PARP1 inhibitory activity, but biological molecules such as nucleic acids or polypeptides that can be processed into cells through standard techniques known in the art, compounds, extracts isolated from bacteria, plants, or animals can be

상기 PARP1 활성 저해제는 PARP1 단백질 또는 이의 단편에 특이적으로 결합하는 항체, 이의 항원 결합 단편, 펩티드, 단백질 또는 이들의 조합일 수 있다.The PARP1 activity inhibitor may be an antibody that specifically binds to the PARP1 protein or fragment thereof, an antigen-binding fragment thereof, a peptide, a protein, or a combination thereof.

상기 PARP1 발현 저해제는 PARP1에 특이적인 siRNA, RNA 앱타머, 리보자임, PARP1를 코딩하는 뉴클레오티드 서열에 상보적으로 결합하는 안티센스 핵산 분자 또는 이들의 조합일 수 있다.The PARP1 expression inhibitor may be an siRNA specific for PARP1, an RNA aptamer, a ribozyme, an antisense nucleic acid molecule that complementarily binds to a nucleotide sequence encoding PARP1, or a combination thereof.

상기 PARP1 저해제는 올라파립(olaparib), 탈라조파립(Talazoparib), 니라파립 (Niraparib), 루카파립(Rucaparib), 벨리파립(Veliparib), 파미파립(Pamiparib), 또는 이들의 조합일 수 있다. 일 구체예에서, 올라파립을 투여한 BRCA1 돌연변이 난소암 동물 모델을 이용하여 PARP1 저해제 내성과 관련된 유전자로서 S100A7, PROM1, MT1G, CCL2를 발견하였다.The PARP1 inhibitor may be olaparib, Talazoparib, Niraparib, Rucaparib, Veliparib, Pamiparib, or a combination thereof. In one embodiment, S100A7, PROM1, MT1G, and CCL2 were found as genes related to PARP1 inhibitor resistance using a BRCA1 mutant ovarian cancer animal model to which olaparib was administered.

본 명세서에서 용어, "진단"은 병리 상태의 존재 또는 특징을 확인하는 것을 의미하며, PARP1 저해제 내성의 존재 여부, PARP1 저해제 내성 암의 발병 여부 또는 발병 가능성 여부를 확인하는 것을 포함하는 의미일 수 있다.As used herein, the term "diagnosis" refers to confirming the presence or characteristics of a pathological condition, and may mean including determining whether PARP1 inhibitor resistance exists, whether or not PARP1 inhibitor-resistant cancer develops or is likely to develop. .

본 명세서에서 용어, "PARP1 저해제 내성"은 PARP1 저해제를 이용하여 암 환자를 치료할 때, 치료 초기부터 치료 효과가 없거나 초기에는 암 치료 효과가 있으나 계속적인 치료 과정에서 암 치료 효과가 상실되는 것을 의미한다. 항암제 치료에 있어서 일반적인 치료 효과 판정은 고형 종양 그룹의 반응 평가 기준(RECIST v1.1: New response evaluation criteria in solid tumours: Revised RECIST guideline (version 1.1))에 기초하여 결정할 수 있다 (EUROPEAN JOURNAL OF CANCER 45, (2009) 228-247). 상기 기준에 따라 암 치료의 효과는 종양의 크기 변화 등으로부터 완전 반응(Complete Response: CR), 부분 반응(Partial Response: PR), 진행(Progressive Disease: PD) 또는 안정(Stable Disease: SD) 그룹으로 분류할 수 있다. 예를 들어, RECIST v1.1에 따라 대상 병변(TL: target lesion)으로 결정된 경우, 상기 완전 반응 그룹(CR)은 모든 대상 병변이 소멸되고, 모든 대상 및 비-대상 병변에서 병리학적 림프절이 감소된(short axis <10 mm) 그룹을 의미할 수 있다. 상기 부분 반응 그룹(PR)은 베이스라인의 총 직경을 기준으로 하여 대상 병변의 직경의 합이 적어도 30% 감소된 그룹을 의미할 수 있다. 상기 진행 그룹(PD)은 연구에 따른 가장 작은 합계를 기준으로 하여 대상 병변의 직경의 합이 적어도 20% 증가되고, 이와 같은 직경의 합이 상대적으로 20% 증가할 뿐만 아니라, 절대적으로 적어도 5 mm가 증가된 그룹을 의미할 수 있다. 상기 안정 그룹(SD)은 연구에 따른 가장 작은 직경을 기준으로, 부분 반응 그룹으로 분류될 만큼 충분히 감소되지 않고, 진행 그룹으로 분류될 만큼 충분히 증가하지 않은 그룹을 의미할 수 있다.As used herein, the term "PARP1 inhibitor resistance" means that when a cancer patient is treated using a PARP1 inhibitor, there is no therapeutic effect from the initial stage of treatment, or there is an initial cancer treatment effect, but the cancer treatment effect is lost during the continuous treatment process. . The determination of the general therapeutic effect in anticancer drug treatment can be determined based on the response evaluation criteria in the solid tumor group (RECIST v1.1: New response evaluation criteria in solid tumours: Revised RECIST guideline (version 1.1)) (EUROPEAN JOURNAL OF CANCER 45) , (2009) 228-247). According to the above criteria, the effect of cancer treatment is a complete response (CR), partial response (PR), progressive disease (PD) or stable disease (SD) group from a change in the size of the tumor. can be classified. For example, if a target lesion (TL) is determined according to RECIST v1.1, the complete response group (CR) has all target lesions disappear, and pathological lymph nodes are reduced in all target and non-target lesions. It may mean a group with a short axis <10 mm. The partial response group (PR) may refer to a group in which the sum of the diameters of the target lesions is reduced by at least 30% based on the total diameter of the baseline. In the advanced group (PD), the sum of the diameters of the target lesions is increased by at least 20% based on the smallest sum according to the study, and the sum of these diameters is increased by 20% relatively, but also absolutely at least 5 mm may mean an increased group. The stable group (SD) may refer to a group that does not decrease sufficiently to be classified as a partial response group and does not increase sufficiently to be classified as an advanced group based on the smallest diameter according to the study.

상기 "발현 수준의 측정"은 S100A7, PROM1, MT1G, CCL2 또는 이들의 조합의 유전자 자체, 또는 상기 유전자가 발현된 수준, 즉, 상기 유전자에 의해 코딩 되는 단백질의 발현 수준을 확인함으로써 알 수 있다. 예를 들어, 상기 유전자와 특이적으로 결합하는 안티센스 올리고뉴클레오티드, 프라이머 쌍, 또는 프로브를 사용하여 상기 유전자의 발현 수준을 측정할 수 있다.The "measurement of the expression level" may be determined by checking the gene itself of S100A7, PROM1, MT1G, CCL2 or a combination thereof, or the level at which the gene is expressed, that is, the expression level of the protein encoded by the gene. For example, an antisense oligonucleotide that specifically binds to the gene, a primer pair, or a probe may be used to measure the expression level of the gene.

상기 "안티센스 올리고뉴클레오티드"는 안티센스 올리고머가 왓슨-크릭 염기쌍 형성에 의해 RNA 내의 표적 서열과 혼성화되어, 표적서열 내에서 miRNA와 RNA:올리고머 헤테로이중체의 형성을 허용하는, 뉴클레오티드염기의 서열 및 서브 유닛간 백본을 갖는 올리고머를 지칭하는 것일 수 있다. 올리고머는 표적 서열에 대한 정확한 서열 상보성 또는 근사 상보성을 가질 수 있다.The "antisense oligonucleotide" refers to an antisense oligomer that hybridizes with a target sequence in RNA by Watson-Crick base pairing, thereby allowing the formation of a miRNA and RNA:oligomeric heteroduplex within the target sequence. Sequences and subunits of nucleotide bases It may refer to an oligomer having a liver backbone. An oligomer may have exact sequence complementarity or approximate complementarity to a target sequence.

상기 "프라이머"는 자유 3-말단 수산화기 (free 3' hydroxyl group)를 가지는 핵산 서열로 특정 염기 서열에 대해 상보적인 주형 (template)과 염기쌍을 형성할 수 있고 주형 가닥 복사를 위한 시작 지점으로서 작용하는 핵산 서열을 말한다. 프라이머는 적절한 완충용액 및 온도에서 중합반응을 위한 시약 (즉, DNA 폴리머라제 또는 역전사효소) 및 상이한 4가지의 뉴클레오시드 트리포스페이트의 존재하에서 DNA 합성을 개시할 수 있다. 예를 들면 S100A7, PROM1, MT1G, 또는 CCL2에 대한 특이적인 프라이머로서 7개 내지 50개의 뉴클레오티드 서열을 가진 센스 및 안티센스 프라이머를 이용하여 PCR 증폭을 실시하여 원하는 생성물의 생성량의 측정을 통해 개체의 PARP1 저해제 내성을 진단할 수 있다. PCR 조건, 센스 및 안티센스 프라이머의 길이는 당업계에 공지된 기술에 따라 적절히 선택될 수 있다. 상기 프라이머는 10 내지 100, 15 내지 100, 10 내지 80, 10 내지 50, 10 내지 30, 10 내지 20, 15 내지 80, 15 내지 50, 15 내지 30, 15 내지 20, 20 내지 100, 20 내지 80, 20 내지 50, 또는 20 내지 30 nt를 갖는 것일 수 있다.The "primer" is a nucleic acid sequence having a free 3' hydroxyl group, capable of base pairing with a template complementary to a specific base sequence and serving as a starting point for template strand copying. nucleic acid sequence. The primer is capable of initiating DNA synthesis in the presence of a reagent for polymerization (ie, DNA polymerase or reverse transcriptase) and four different nucleoside triphosphates in an appropriate buffer and temperature. For example, PCR amplification is performed using sense and antisense primers having a sequence of 7 to 50 nucleotides as specific primers for S100A7, PROM1, MT1G, or CCL2. Through measurement of the amount of production of the desired product, the individual's PARP1 inhibitor resistance can be diagnosed. PCR conditions and lengths of sense and antisense primers may be appropriately selected according to techniques known in the art. The primers are 10 to 100, 15 to 100, 10 to 80, 10 to 50, 10 to 30, 10 to 20, 15 to 80, 15 to 50, 15 to 30, 15 to 20, 20 to 100, 20 to 80 , 20 to 50, or 20 to 30 nt.

상기 "프로브"는 표적 핵산 예를 들면, miRNA와 특이적으로 결합을 이룰 수 있는 RNA 또는 DNA 등의 핵산 단편을 의미하며, 특정 miRNA의 존재 유무, 함량 및 발현량을 확인할 수 있도록 라벨링(labeling)되어 있을 수 있다. 프로브는 올리고뉴클레오티드(oligonucleotide) 프로브, 단일가닥 DNA(single strand DNA) 프로브, 이중가닥 DNA(double strand DNA) 프로브, RNA 프로브 등의 형태로 제작될 수 있다. 예를 들면, S100A7, PROM1, MT1G, 또는 CCL2와 상보적인 핵산 서열을 갖는 프로브를 이용하여 혼성화를 실시하여, 혼성화 정도를 통해 발현량을 측정함으로써 개체의 PARP1 저해제 내성을 진단할 수 있다. 적절한 프로브의 선택 및 혼성화 조건은 당해 기술분야에 공지된 기술에 따라 적절히 선택할 수 있다. 상기 프로브는 10 내지 100, 15 내지 100, 10 내지 80, 10 내지 50, 10 내지 30, 10 내지 20, 15 내지 80, 15 내지 50, 15 내지 30, 15 내지 20, 20 내지 100, 20 내지 80, 20 내지 50, 또는 20 내지 30 nt를 갖는 것일 수 있다.The "probe" refers to a nucleic acid fragment such as RNA or DNA that can specifically bind to a target nucleic acid, for example, miRNA, and is labeled to check the presence, content, and expression level of a specific miRNA. may have been The probe may be manufactured in the form of an oligonucleotide probe, a single-stranded DNA probe, a double-stranded DNA probe, an RNA probe, or the like. For example, by performing hybridization using a probe having a nucleic acid sequence complementary to S100A7, PROM1, MT1G, or CCL2, and measuring the expression level through the degree of hybridization, the individual's PARP1 inhibitor resistance can be diagnosed. Suitable probe selection and hybridization conditions can be appropriately selected according to techniques known in the art. The probe is 10 to 100, 15 to 100, 10 to 80, 10 to 50, 10 to 30, 10 to 20, 15 to 80, 15 to 50, 15 to 30, 15 to 20, 20 to 100, 20 to 80 , 20 to 50, or 20 to 30 nt.

또한, 안티센스 올리고뉴클레오티드, 프라이머 또는 프로브는 포스포아미다이트(phosphoramidite) 고체 지지체 합성법이나 기타 널리 공지된 방법을 이용하여 화학적으로 합성될 수 있다. 또한, 이러한 핵산 서열은 당해 기술분야에 공지된 다양한 방법을 통해 변형시킬 수 있다. 이러한 변형의 예는 메틸화, 캡화, 천연 뉴클레오티드 하나 이상의 동족체로의 치환, 또는 뉴클레오티드 간의 변형, 예를 들면 하전되지 않은 연결체(예: 메틸 포스포네이트, 포스포트리에스테르, 포스포로아미데이트, 카바메이트 등) 또는 하전된 연결체(예: 포스포로티오에이트, 포스포로디티오에이트 등)로의 변형을 포함할 수 있다. 또한, 프라이머 또는 프로브는 검출 가능한 신호를 직접적으로 또는 간접적으로 제공할 수 있는 표지를 이용하여 변형될 수 있다. 상기 표지의 예는 방사성 동위원소, 형광성 분자, 또는 바이오틴을 포함할 수 있다.In addition, antisense oligonucleotides, primers or probes can be chemically synthesized using phosphoramidite solid support synthesis or other well-known methods. In addition, such nucleic acid sequences can be modified through various methods known in the art. Examples of such modifications include methylation, encapsulation, substitution of one or more homologues of natural nucleotides, or modifications between nucleotides, such as uncharged linkages such as methyl phosphonates, phosphotriesters, phosphoroamidates, carbamates. etc.) or charged linkages (eg, phosphorothioate, phosphorodithioate, etc.). In addition, the primer or probe may be modified with a label capable of providing a detectable signal, either directly or indirectly. Examples of such labels may include radioactive isotopes, fluorescent molecules, or biotin.

일 구체예에 따르면, 종양 세포 또는 조직 내 S100A7, PROM1 또는 CCL2의 발현 증가 및 MT1G의 발현 감소는 PARP1 저해제 내성과 연관성이 있는 것으로 밝혀졌다. 따라서, S100A7, PROM1, CCL2, 또는 MT1G의 발현 수준은 PARP1 저해제 내성을 진단하는데 사용될 수 있다.According to one embodiment, an increase in the expression of S100A7, PROM1 or CCL2 and a decrease in the expression of MT1G in a tumor cell or tissue were found to be associated with PARP1 inhibitor resistance. Thus, the expression level of S100A7, PROM1, CCL2, or MT1G can be used to diagnose PARP1 inhibitor resistance.

다른 양상은 S100A7, PROM1, MT1G, 및 CCL2로 이루어진 군으로부터 선택된 하나 이상의 유전자의 발현 수준을 측정하기 위한 제제를 포함하는 PARP1 저해제 내성 진단용 키트를 제공한다. Another aspect provides a kit for diagnosing PARP1 inhibitor resistance, comprising an agent for measuring the expression level of one or more genes selected from the group consisting of S100A7, PROM1, MT1G, and CCL2.

상기 키트에서 언급된 용어 또는 요소 중 상기 조성물에 대한 설명에서 언급된 것과 같은 것은, 앞에서 상기 조성물에 대한 설명에서 언급된 바와 같은 것으로 이해된다.Among the terms or elements mentioned in the kit, those mentioned in the description of the composition are understood as being referred to in the description of the composition above.

상기 키트는 S100A7, PROM1, CCL2, 또는 MT1G의 발현 수준을 측정함으로써, PARP1 저해제 내성을 진단할 수 있는 효과가 있다. 상기 키트에는 PARP1 저해제 내성의 진단을 위한 안티센스 올리고뉴클레오티드, 프라이머 쌍, 프로브, 등 뿐만 아니라 분석 방법에 적합한 한 종류 또는 그 이상의 다른 구성 성분 조성물, 용액, 또는 장치가 더 포함될 수 있으며, RT-PCR 키트, 마이크로어레이 칩 키트, DNA 칩 키트를 포함할 수 있다.The kit has the effect of diagnosing PARP1 inhibitor resistance by measuring the expression level of S100A7, PROM1, CCL2, or MT1G. The kit may further include antisense oligonucleotides, primer pairs, probes, etc. for the diagnosis of PARP1 inhibitor resistance, as well as one or more other component compositions, solutions, or devices suitable for the assay method, RT-PCR kit , a microarray chip kit, and a DNA chip kit.

상기 S100A7, PROM1, CCL2, 또는 MT1G의 발현 수준을 측정하기 위한 키트는 RT-PCR을 수행하기 위해 필요한 요소를 포함하는 키트일 수 있다. RT-PCR 키트는 마커 유전자에 대한 특이적인 각각의 프라이머 쌍 외에도 테스트 튜브 또는 다른 적절한 컨테이너, 반응 완충액, 데옥시뉴클레오티드(dNTPs), Taq-중합 효소 및 역전사효소와 같은 효소, DNase, RNase 억제제, DEPC-물(DEPC-water), 멸균수 등을 포함할 수 있다.The kit for measuring the expression level of S100A7, PROM1, CCL2, or MT1G may be a kit including elements necessary for performing RT-PCR. In addition to each primer pair specific for a marker gene, the RT-PCR kit includes a test tube or other suitable container, reaction buffer, deoxynucleotides (dNTPs), enzymes such as Taq-polymerase and reverse transcriptase, DNase, RNase inhibitors, DEPC -Water (DEPC-water), sterile water, etc. may be included.

또한, 상기 S100A7, PROM1, CCL2, 또는 MT1G의 발현 수준을 측정하기 위한 키트는 마이크로어레이를 수행하기 위해 필요한 필수 요소를 포함하는 키트일 수 있다. 마이크로어레이 키트는, 유전자 또는 그의 단편에 해당하는 cDNA가 프로브로 부착되어 있는 기판을 포함하고 기판은 정량 대조구 유전자 또는 그의 단편에 해당하는 cDNA를 포함할 수 있으며, 상기 유전자를 이용하여 당업계에서 통상적으로 사용되는 제조 방법에 의하여 용이하게 제조될 수 있다. 마이크로어레이를 제작하기 위해서, 상기 탐색된 마커를 탐침 DNA 분자로 이용하여 DNA 칩의 기판상에 고정화시키기 위해 파이조일렉트릭(piezoelectric) 방식을 이용한 마이크로피펫팅(micropipetting)법 또는 핀(pin) 형태의 스폿터(spotter)를 이용한 방법 등을 사용할 수 있다. 상기 마이크로어레이 칩의 기판은 아미노-실란(amino-silane), 폴리-L-라이신(poly-L-lysine) 및 알데히드 (aldehyde)로 이루어진 군에서 선택되는 활성기가 코팅된 것일 수 있다. 또한, 상기 기판은 슬라이드 글래스, 플라스틱, 금속, 실리콘, 나일론 막 및 니트로셀룰로스 막(nitrocellulose membrane)으로 이루어진 군에서 선택되는 것일 수 있다.In addition, the kit for measuring the expression level of S100A7, PROM1, CCL2, or MT1G may be a kit including essential elements necessary for performing a microarray. The microarray kit includes a substrate to which a cDNA corresponding to a gene or a fragment thereof is attached as a probe, and the substrate may include a cDNA corresponding to a quantitative control gene or a fragment thereof. It can be easily manufactured by the manufacturing method used as In order to fabricate a microarray, a micropipetting method using a piezoelectric method or a pin type to immobilize the detected marker on a substrate of a DNA chip using the probe DNA molecule A method using a spotter or the like can be used. The substrate of the microarray chip may be coated with an active group selected from the group consisting of amino-silane, poly-L-lysine, and aldehyde. In addition, the substrate may be selected from the group consisting of slide glass, plastic, metal, silicon, nylon membrane, and nitrocellulose membrane.

또한, 상기 S100A7, PROM1, CCL2, 또는 MT1G의 발현 수준을 측정하기 위한 키트는 DNA 칩을 수행하기 위해 필요한 필수 요소를 포함하는 키트일 수 있다. DNA 칩 키트는 유전자 또는 그의 단편에 해당하는 cDNA 또는 올리고뉴클레오티드(oligonucleotide)가 부착되어 있는 기판, 및 형광표식 프로브를 제작하기 위한 시약, 제제, 효소 등을 포함할 수 있다. 또한, 상기 기판은 대조군 유전자 또는 그의 단편에 해당하는 cDNA 또는 올리고뉴클레오티드를 포함할 수 있다.In addition, the kit for measuring the expression level of S100A7, PROM1, CCL2, or MT1G may be a kit including essential elements necessary for performing a DNA chip. The DNA chip kit may include a substrate to which cDNA or oligonucleotide corresponding to a gene or fragment thereof is attached, and reagents, agents, enzymes, etc. for preparing a fluorescent probe. In addition, the substrate may include cDNA or oligonucleotide corresponding to a control gene or a fragment thereof.

또 다른 양상은 개체의 시료로부터 S100A7, PROM1, MT1G, 및 CCL2로 이루어진 군으로부터 선택된 하나 이상의 유전자의 발현 수준을 측정하는 단계를 포함하는 PARP1 저해제 내성 진단을 위한 정보제공방법을 제공한다.Another aspect provides an information providing method for diagnosing PARP1 inhibitor resistance, comprising measuring the expression level of one or more genes selected from the group consisting of S100A7, PROM1, MT1G, and CCL2 from a sample of an individual.

상기 진단을 위한 정보제공방법에서 언급된 용어 또는 요소 중 상기 조성물 또는 키트에 대한 설명에서 언급된 것과 같은 것은, 앞에서 상기 조성물 또는 키트에 대한 설명에서 언급된 바와 같은 것으로 이해된다.Among the terms or elements mentioned in the information providing method for diagnosis, those mentioned in the description of the composition or kit are understood to be the same as those mentioned in the description of the composition or kit above.

본 명세서에서 용어, "개체"는 PARP1 저해제 내성의 존재 여부를 확인 또는 예측하고자 하는 개체를 의미한다. 상기 개체는 척추동물일 수 있고, 구체적으로 포유류, 양서류, 파충류, 조류 등일 수 있으며, 보다 구체적으로 포유동물, 예를 들면, 인간(Homo sapiens)일 수 있다.As used herein, the term "subject" refers to an individual who wants to confirm or predict the presence of PARP1 inhibitor resistance. The subject may be a vertebrate, specifically mammals, amphibians, reptiles, birds, etc., and more specifically mammals, for example, humans (Homo sapiens).

본 명세서에서 용어, "시료"는 개체로부터 분리된 전혈, 혈청, 혈장, 타액, 뇨, 객담, 림프액, 세포, 조직 등을 포함할 수 있고, 예를 들어, 종양 세포 또는 종양 조직일 수 있다.As used herein, the term "sample" may include whole blood, serum, plasma, saliva, urine, sputum, lymph, cells, tissues, etc. isolated from an individual, for example, it may be a tumor cell or tumor tissue.

상기 "발현 수준을 측정하는 방법"은 역전사 중합효소반응, 경쟁적 역전사 중합효소반응, 실시간 역전사 중합효소반응, RNase 보호 분석법, 노던 블랏팅, DNA 칩으로 이루어진 군으로부터 선택되는 하나 이상일 수 있다.The "method for measuring the expression level" may be one or more selected from the group consisting of a reverse transcription polymerase reaction, a competitive reverse transcription polymerase reaction, a real-time reverse transcription polymerase reaction, an RNase protection assay, Northern blotting, and a DNA chip.

상기 방법에서, 개체의 시료로부터 측정된 S100A7, PROM1, 또는 CCL2의 발현 수준이 정상 대조군에 비해 증가된 경우, 및 개체의 시료로부터 측정된 MT1G의 발현 수준이 정상 대조군에 비해 감소된 경우, PARP1 저해제 내성을 갖는 것으로 판단할 수 있다. 상기 발현 수준의 변화는 개체의 발현 수준이 정상 대조군 또는 양성 대조군에 비하여 유사한 수준 또는 1%, 2%, 3%, 4%, 5%, 10%, 20%, 30%, 40%, 50%, 60%, 70%, 80%, 90% 및 100% 이상 증가 또는 감소하는 것을 포함할 수 있다.In the method, when the expression level of S100A7, PROM1, or CCL2 measured from the subject's sample is increased compared to the normal control, and the expression level of MT1G measured from the subject's sample is decreased compared to the normal control, PARP1 inhibitor It can be judged to be resistant. The change in the expression level of the subject is a similar level or 1%, 2%, 3%, 4%, 5%, 10%, 20%, 30%, 40%, 50% compared to the normal control or positive control. , 60%, 70%, 80%, 90%, and 100% or more increasing or decreasing.

또 다른 양상은 PARP1 저해제 내성 암의 치료를 위한 후보 물질이 투여된 개체의 시료로부터 S100A7, PROM1, MT1G, 및 CCL2로 이루어진 군으로부터 선택된 하나 이상의 유전자의 발현 수준을 측정하는 단계를 포함하는 PARP1 저해제 내성 암 치료제를 스크리닝하는 방법을 제공한다. Another aspect is PARP1 inhibitor resistance comprising the step of measuring the expression level of one or more genes selected from the group consisting of S100A7, PROM1, MT1G, and CCL2 from a sample of an individual administered with a candidate substance for the treatment of PARP1 inhibitor-resistant cancer A method for screening a cancer therapeutic agent is provided.

상기 스크리닝하는 방법에서 언급된 용어 또는 요소 중 상기 진단용 조성물, 키트 또는 방법에 대한 설명에서 언급된 것과 같은 것은, 앞에서 상기 진단용 조성물, 키트 또는 방법에 대한 설명에서 언급된 바와 같은 것으로 이해된다.Among the terms or elements mentioned in the screening method, those mentioned in the description of the diagnostic composition, kit or method are understood to be the same as those mentioned in the description of the diagnostic composition, kit or method.

본 명세서에서 용어, "후보 물질"은 새롭게 합성된 또는 공지된 화합물로, PARP1 저해제 내성 암의 치료에 효과를 나타낼 것으로 기대되는 물질을 제한 없이 포함할 수 있다.As used herein, the term "candidate substance" is a newly synthesized or known compound, and may include, without limitation, substances expected to have an effect in the treatment of PARP1 inhibitor-resistant cancer.

상기 후보약물의 "투여"는 적절한 방법으로 개체에 소정의 물질을 도입하는 것을 의미한다. 상기 후보 물질의 투여 경로는 목적 조직에 도달할 수 있는 한, 어떠한 일반적인 경로를 통하여 투여될 수 있다. 복강내 투여, 정맥내, 투여, 근육내 투여, 피하 투여, 피내 투여, 경구 투여, 국소 투여, 비내 투여, 폐내 투여, 직장내 등으로 투여될 수 있다.The "administration" of the candidate drug means introducing a predetermined substance into a subject by an appropriate method. The administration route of the candidate substance may be administered through any general route as long as it can reach the target tissue. It can be administered by intraperitoneal administration, intravenous administration, administration, intramuscular administration, subcutaneous administration, intradermal administration, oral administration, topical administration, intranasal administration, intrapulmonary administration, rectal administration, and the like.

상기 방법에서, 개체의 시료로부터 측정된 S100A7, PROM1, 또는 CCL2의 발현 수준이 정상 대조군에 비해 증가된 경우, 및 개체의 시료로부터 측정된 MT1G의 발현 수준이 정상 대조군에 비해 감소된 경우, 후보물질을 PARP1 저해제 내성 암 치료제로 판단할 수 있다. 상기 발현 수준의 변화는 개체의 발현 수준이 정상 대조군 또는 양성 대조군에 비하여 유사한 수준 또는 1%, 2%, 3%, 4%, 5%, 10%, 20%, 30%, 40%, 50%, 60%, 70%, 80%, 90% 및 100% 이상 증가 또는 감소하는 것을 포함할 수 있다.In the method, when the expression level of S100A7, PROM1, or CCL2 measured from the subject's sample is increased compared to the normal control, and the expression level of MT1G measured from the subject's sample is decreased compared to the normal control, the candidate substance can be determined as a therapeutic agent for PARP1 inhibitor-resistant cancer. The change in the expression level of the subject is a similar level or 1%, 2%, 3%, 4%, 5%, 10%, 20%, 30%, 40%, 50% compared to the normal control or positive control. , 60%, 70%, 80%, 90%, and 100% or more increasing or decreasing.

일 양상에 따른 PARP1 저해제 내성 진단용 조성물, 키트 및 방법은 PARP1 저해제 내성 암을 효율적으로 진단하여 PARP1 저해제를 이용한 치료 효과를 극대화할 수 있고, PARP1 저해제 내성 암을 치료할 수 있는 후보 물질을 효율적으로 선별할 수 있다.The composition, kit and method for diagnosing PARP1 inhibitor resistance according to an aspect can efficiently diagnose PARP1 inhibitor-resistant cancer, maximize the therapeutic effect using the PARP1 inhibitor, and efficiently select candidate substances capable of treating PARP1 inhibitor-resistant cancer. can

도 1은 PARP1 저해제 내성 진단에 이용될 수 있는 유전자를 선별하기 위한 전체적인 실험 방법을 나타낸 도면이다.1 is a view showing an overall experimental method for selecting a gene that can be used for diagnosis of PARP1 inhibitor resistance.

이하 실시예를 통하여 보다 상세하게 설명한다. 그러나, 이들 실시예는 예시적으로 설명하기 위한 것으로 본 발명의 범위가 이들 실시예에 한정되는 것은 아니다.Hereinafter, it will be described in more detail through examples. However, these examples are for illustrative purposes only, and the scope of the present invention is not limited to these examples.

실시예 1. PARP1 저해제 내성과 S100A7, PROM1, MT1G, 및 CCL2 발현의 연관성 확인Example 1. Confirmation of association between PARP1 inhibitor resistance and S100A7, PROM1, MT1G, and CCL2 expression

PARP1 저해제 내성과 S100A7, PROM1, MT1G, 및 CCL2 발현의 연관성을 확인하기 위해, 생식계 BRCA1 돌연변이 난소암 환자-유래 종양 이종이식(PDTX: Patient-Derived Tumor Xenograft) 동물 모델에 난소암 항암제이자 PARP1 저해제인 올라파립을 표준 용량에서부터 점차 증량하여 투여한 후, 올라파립 내성 동물 모델을 구축하고, 이로부터 내성 종양 조직을 확보하여 마이크로어레이를 수행하였다. 전체적인 실험 과정은 도 1에 나타내었다.To confirm the association between PARP1 inhibitor resistance and S100A7, PROM1, MT1G, and CCL2 expression, a patient-derived tumor xenograft (PDTX: Patient-Derived Tumor Xenograft) animal model of germline BRCA1 mutant ovarian cancer was used as an ovarian cancer anticancer drug and PARP1 inhibitor. After administration of olaparib gradually increased from the standard dose, olaparib-resistant animal models were constructed, and microarrays were performed by securing the resistant tumor tissue therefrom. The overall experimental process is shown in FIG. 1 .

구체적으로, NSG 마우스 6마리에 각각 생식계 BRCA1 돌연변이 난소암 환자-유래 종양 이종이식으로 피하 이식하였다. 이 중 3마리는 대조군으로, 나머지 3마리는 PARP1 저해제인 올라파립을 투여하여 실험군으로 하였다. 상기 동물 모델에서 종양 크기가 약 100mm3가 되었을 때, 올라파립의 경구 투여를 시작하였다. 표준 용량인 50 mg/kg을 1일 1회 투여, 75 mg/kg을 1일 2회 투여, 100 mg/kg을 1일 2회 투여하는 점차 증량하는 방식으로 3~4개월간 투여하였다. 이후, 1주에 3회씩 종양 크기를 측정하였다. 종양 크기가 최대 감소치에서 다시 증가하여 25% 이상 증가하면 획득 내성인 것으로 판단하였다(Nat Genet. 2012 Jul 1;44(8):852-60). PARP1 저해제에 대한 획득 내성이 확인된 조직을 확보하였다. 상기 조직을 이용하여 mRNA 마이크로어레이를 수행하였다. 사용된 프로브 서열은 하기 표 1에 나타내었다.Specifically, each of 6 NSG mice was subcutaneously transplanted with germline BRCA1 mutant ovarian cancer patient-derived tumor xenografts. Among them, 3 mice were used as a control group, and the remaining 3 mice were treated as an experimental group by administering olaparib, a PARP1 inhibitor. When the tumor size in the animal model reached about 100 mm 3 , oral administration of olaparib was started. The standard dose, 50 mg/kg, was administered once a day, 75 mg/kg was administered twice a day, and 100 mg/kg was administered twice a day in a gradually increasing manner for 3-4 months. Thereafter, the tumor size was measured three times a week. When the tumor size increased again from the maximum decrease and increased by 25% or more, it was judged as acquired resistance (Nat Genet. 2012 Jul 1:44(8):852-60). Tissues with acquired resistance to PARP1 inhibitors were obtained. mRNA microarrays were performed using the tissue. The probe sequences used are shown in Table 1 below.

유전자명gene name 프로브 서열probe sequence 서열번호SEQ ID NO: S100A7S100A7 GAGAAGACATTTTATTGTTCCTGGGGAGAAGACATTTTATTGTTCCTGGG 1One TCTCAAAGACATCGGCGAGGTAATTTCTCAAAGACATCGGCGAGGTAATT 22 AAGACATCGGCGAGGTAATTTGTGCAAGACATCGGCGAGGTAATTTGTGC 33 ATCGGCGAGGTAATTTGTGCCCTTTATCGGCGAGGTAATTTGTGCCCTTT 44 ACATCGGCGAGGTAATTTGTGCCCTACATCGGCGAGGTAATTTGTGCCCT 55 GGAGAAGACATTTTATTGTTCCTGGGGAGAAGACATTTTATTGTTCCTGG 66 CATCGGCGAGGTAATTTGTGCCCTTCATCGGCGAGGTAATTTGTGCCCTT 77 GACATCGGCGAGGTAATTTGTGCCCGACATCGGCGAGGTAATTTGTGCCC 88 AGACATCGGCGAGGTAATTTGTGCCAGACATCGGCGAGGTAATTTTGGCC 99 AAAGACATCGGCGAGGTAATTTGTGAAAGACATCGGCGAGGTAATTTGTG 1010 CTTTCAGCCAGTAGTCAGTCTGGGCCTTTCAGCCAGTAGTCAGTCTGGGC 1111 TCTGGTGGGAGAAGACATTTTATTGTCTGGTGGGAGAAGACATTTTATTG 1212 PROM1PROM1 GAACTCGATCCACTGCAGATAATGTGAACTCGATCCACTGCAGATAATGT 1313 TGTGAACGCCTTGTCCTTGGTAGTGTGTGAACGCCTTGTCCTTGGTAGTG 1414 AAATCCAGAGAAGCTAGAATCCTAGAAATCCAGAGAAGCTAGAATCCTAG 1515 GAAGTCTTGGTCCTGCACATCAATGGAAGTCTTGGTCCTGCACATCAATG 1616 ATGATAAAAGATTCACTCCTGCGGGATGATAAAAGATTCACTCCTGCGGG 1717 GAGTTTCATTCAAGAGAGTTCGCAAGAGTTTCATTCAAGAGAGTTCGCAA 1818 CAGCAGTATCTAGAGCGGTGGCCACCAGCAGTATCTAGAGCGGTGGCCAC 1919 CGGAATAATTCCTTGCTCGTGTAAGCGGAATAATTCCTTGCTCGTGTAAG 2020 CGTGGTTTGGCGTTGTACTCTGTCACGTGGTTTGGCGTTGTACTCTGTCA 2121 TCACCAACAGGGAGATTGCAAAGCATCACCAACAGGGAGATTGCAAAGCA 2222 TCTATAGGAAGGACTCGTTGCTGGTTCTATAGGAAGGACTCGTTGCTGGT 2323 GGGTCTCAGTCGGTCAAGAATTCCGGGGTCTCAGTCGGTCAAGAATTCCG 2424 CATTCGACGATAGTACTTAGCCAGTCATTCGACGATAGTACTTAGCCAGT 2525 CCCGAGAGCGAGTCCGAAGTCTCTGCCCGAGAGCGAGTCCGAAGTCTCTG 2626 CAGTACAGTGGAAGGAGTGCGCTCACAGTACAGTGGAAGGAGTGCGCTCA 2727 GACCCTGGCTCGTGAATTATTTATGGACCCTGGCTCGTGAATTATTTATG 2828 TTAGACCTAAGATTACAGTTTCTGGTTAGACCTAAGATTACAGTTTCTGG 2929 TGCTGCACCCAACAGAAAGATATTATGCTGCACCCAACAGAAAGATATTA 3030 CAGGTGAAGAGTGCCGTAAGTGCCTCAGGTGAAGAGTGCCGTAAGTGCCT 3131 GCTTCCCAGAGAGATAGTATTCCCAGCTTCCCAGAGAGATAGTATTCCCA 3232 AAGGCAAGCGTGTTCCTGGGCAGAAAAGGCAAGCGTGTTCCTGGGCAGAA 3333 TAACACTGGGCATGGCACGTAGTCGTAACACTGGGCATGGCACGTAGTCG 3434 GTTGTCAAGTTCTGCATCCACGGGTGTTGTCAAGTTCTGCATCCACGGGT 3535 CATTGAGAGATGACCGCAGGCTAGTCATTGAGAGATGACCGCAGGCTAGT 3636 CTGAACAGAAGTGACCCAACTACTACTGAACAGAGAGTGACCCAACTACTA 3737 CGCGAGCTGCGGGACACAAAAGAATCGCGAGCTGCGGGACACAAAAGAAT 3838 TGTGTGCTGAGATAACCTCCCAGGCTGTGTGCTGAGATAACCTCCCAGGC 3939 TGAGCAGGCTTCTCCTATCTGGGCCTGAGCAGGCTTCTCCTATCTGGGCC 4040 GAAATCACGCGGCTGTACCACATAGGAAATCACGCGGCTGTACCACATAG 4141 GACGCACTCTGATTGGACCGGCTGAGACGCACTCTGATTGGACCGGCTGA 4242 CCTTGAATAGTGATGGACCATGGACCCTTGAATAGTGATGGACCATGGAC 4343 CATCTTGCTCCAAAATGTAGGTCCCCATCTTGCTCCAAAATGTAGGTCCC 4444 GGATACCCAACATCTGAGACCACGTGGATACCCAACATCTGAGACCACGT 4545 TGTGTAGCAGTGAGAGCCTTCCAGATGTGTAGCAGTGAGAGCCTTCCAGA 4646 TGTCATAACAGGATTGTGAATACCATGTCATAACAGGATTGTGAATAACCA 4747 CTGGCACGCAGCTGGAAGGCTATCTCTGGCACGCAGCTGGAAGGCTATCT 4848 TCTAAGTGGCTCTCTGGGTGAACCATCTAAGTGGCTCTCTGGGTGAACCA 4949 TGGAAAGTCCTTGTAGACCCAGAAATGGAAAGTCCTTGTAGACCCAGAAA 5050 TAAACTGAGCCTTGAGTTAAGGTCCTAAACTGAGCCTTGAGTTAAGGTCC 5151 GATCCTTGATCTGCCCGCTTAGTAGGATCCTTGATCTGCCCGCTTAGTAG 5252 TCCAGATCCACGAGAAAGGAGCCCATCCAGATCCACGAGAAAGGAGCCCA 5353 CCAGATCCACGAGAAAGGAGCCCACCCAGATCCACGAGAAAGGAGCCCAC 5454 CAGGCCTGGGTAATTCTTGTGGTCACAGGCCTGGGTAATTCTTGTGGTCA 5555 TTGTGACATGCTTGCTCTCCCTGCTTTGTGACATGCTTGCTCTCCCTGCT 5656 CATGTCTGCTGCTATCCACAACCTGCATGTCTGCTGCTATCCACAACCTG 5757 CAGATCCACGAGAAAGGAGCCCACACAGATCCACGAGAAAGGAGCCCACA 5858 TATTCCGGACGGTCGTGGTGCCATCTATTCCGGACGGTCGTGGTGCCATC 5959 TGCTGCTATCCACAACCTGTGTCTGTGCTGCTATCCACAACCTGTGTCTG 6060 TGCTATCCACAACCTGTGTCTGTGATGCTATCCACAACCTGTGTCTGTGA 6161 GTCTGCTGCTATCCACAACCTGTGTGTTCTGCTGCTATCCACAACCTGTGT 6262 TCTGCTGCTATCCACAACCTGTGTCTCTGCTGCTATCCACAACCTGTGTC 6363 GTCCAGATCCACGAGAAAGGAGCCCGTCCAGATCCACGAGAAAGGAGCCC 6464 GAGTATTCTTACAAGTGTCCCCAGGGAGTATTCTTACAAGTGTCCCCAGG 6565 GCTATCCACAACCTGTGTCTGTGAGGCTATCCACAACCTGTGTCTGTGAG 6666 GGTCCAGATCCACGAGAAAGGAGCCGGTCCAGATCCACGAGAAAGGAGCC 6767 CATCTTCTGGAGCTGTGATTCTGCACATCTTCTGGAGCTGTGATTCTGCA 6868 MT1GMT1G CAAGTAGGGAGACGTATGTAACAAACAAGTAGGGAGACGTATGTAACAAA 6969 CCTGTGAACTGGACTGAACGAGACACCTGTGAACTGGACTGAACGAGACA 7070 GACATCACAGCTCTGGTGATCCCAGGACATCACAGCTCTGGTGATCCCAG 7171 GTGGCCATCACAACACCTAGACGGGGTGGCCATCACAACACCTAGACGGG 7272 AAGTTCTCCCGCCAGGCGGCCTGGGAAGTTCTCCCGCCAGGCGGCCTGGG 7373 CCAGTTAAAACTGAACAGGTGCCTTCCAGTTAAAACTGAACAGGTGCCTT 7474 TGTAGGACTGCAAGACACTGGACCGTGTAGGACTGCAAGACACTGGACCG 7575 GCGGTGGCTTCTCCCAATCAGTTCAGCGGTGGCTTCTCCCAATCAGTTCA 7676 AGCGGTGGCTTCTCCCAATCAGTTCAGCGGTGGCTTCTCCCAATCAGTTC 7777 GGGACCCCAATGACCATGATACAGTGGGACCCCAATGACCATGATACAGT 7878 TAAGCAGGAGAACGACTCAAGATACTAAGCAGGAGAACGACTCAAGATAC 7979 CTTTCCTGAGGTGATCAGCCGCACGCTTTCCTGAGGTGATCAGCCGCACG 8080 TGAGAGCAGCTTTAACACACAGGCCTGAGAGCAGCTTTAACACACAGGCC 8181 TGCCCAGGCCGTAGTGCTGCACGTATGCCCAGGCCGTAGTGCTGCACGTA 8282 AGGTAGTCAGCCATGGTCTCCTCCCAGGTAGTCAGCCATGGTCTCCTCCC 8383 AGGCCTTCTCCTTCTAAGTGTTGCAAGGCCTTCTCCTTCTAAGTGTTGCA 8484 TGCTCCCAAGGAGAACACAAGGAAGTGCTCCCAAGGAGAACACAAGGAAG 8585 TCTTGACAGAGTGCTGGGCCTGGCCTCTTGACAGAGTGCTGGGCCTGGCC 8686 TGCTCTGTAAGATCCGCCAAGTCCATGCTCTGTAAGATCCGCCAAGTCCA 8787 TTTCCTGAGGTGATCAGCCGCACGCTTTCCTGAGGTGATCAGCCGCACGC 8888 CACGGCGGAAAGTCTGCAGGAAGTCCACGGCGGAAAGTCTGCAGGAAGTC 8989 AAATAAAAGCGTCAGGTCCCAACAGAAATAAAAGCGTCAGGTCCCAACAG 9090 CACACTTTCAATCCGAGGAGCCAGCCACACTTTCAATCCGAGGAGCCAGC 9191 CTGAAACAGAGGGTTGCGGCCTGAACTGAAACAGAGGGTTGCGGCCTGAA 9292 CCGGGCATCGTGGACCTCGATGATACCGGGCATCGTGGACCTCGATGATA 9393 GCTGCCGCAGGATAGTTAGGCTGAAGCTGCCGCAGGATAGTTAGGCTGAA 9494 AGCACGCGCTCTACGTTGTCACAGGAGCACGCGCTCTACGTTGTCACAGG 9595 CAGTACACGCGGAGCCGACGCAGGACAGTACACCGCGGAGCCGACGCAGGA 9696 TTTGGCGCAAAGACTATGACGACTGTTTGGCGCAAAGACTATGACGACTG 9797 CAAAGACACCGTGCCGTGAGGAAGACAAAGACACCGTGCCGTGAGGAAGA 9898 CAAAGACACTAACCAAGAGGACGGCCAAAGACACTAACCAAGAGGACGGC 9999 CCL2CCL2 AATAAGTTAGCTGCAGATTCTTGGGAATAAGTTAGCTGCAGATTCTTGGG 100100 GGTGGTCCATGGAATCCTGAACCCAGGTGGTCCATGGAATCCTGAACCCA 101101 GCAAAGACCCTCAAAACATCCCAGGGCAAAGACCCTCAAAACATCCCAGG 102102 TCTGCACTGAGATCTTCCTATTGGTTCTGCACTGAGATCTTCCTATTGGT 103103 TGATTCTTCTATAGCTCGCGAGCCTTGATTCTTCTATAGCTCGCGAGCCT 104104 GTGATTCTTCTATAGCTCGCGAGCCGTGATTCTTCTATAGCTCGCGAGCC 105105 GAGAGTGCGAGCTTCAGTTTGAGAAGAGAGTGCGAGCTTCAGTTTGAGAA 106106 CGAGAGTGCGAGCTTCAGTTTGAGACGAGAGTGCGAGCTTCAGTTTGAGA 107107 GATCTCCTTGGCCACAATGGTCTTGGATCTCCTTGGCCACAATGGTCTTG 108108 GGTGATTCTTCTATAGCTCGCGAGCGGTGATTCTTCTATAGCTCGCGAGC 109109 TGGTGATTCTTCTATAGCTCGCGAGTGGTGATTCTTCTATAGCTCGCGAG 110110

마이크로어레이 결과를 분석하여, PARP1 저해제 내성 조직에서 대조군 조직과 비교한 각 유전자 발현의 배수 변화를 표 2에 나타내었다. 하기 표 2에 나타낸 바와 같이, 대조군과 비교하여, 올라파립 내성 조직 2개 (OR_2, OR_3) 중 적어도 하나에서 유전자 발현이 3.5배 이상 증가하거나 감소하는 유전자를 선별하였다. Table 2 shows the fold change in expression of each gene in the PARP1 inhibitor-resistant tissue compared to the control tissue by analyzing the microarray results. As shown in Table 2 below, compared to the control group, the gene expression in at least one of the two olaparib-resistant tissues (OR_2, OR_3) was selected for a 3.5-fold increase or decrease in gene expression.

유전자gene OR2/C Fold ChangeOR2/C Fold Change OR3/C Fold ChangeOR3/C Fold Change S100A7S100A7 1313 PROM1PROM1 5.15.1 6.66.6 MT1GMT1G -12.9-12.9 -2.7-2.7 CCL2CCL2 4.24.2 1.71.7

마이크로 어레이 데이터로부터 최소 3.5배 변화를 나타낸 유전자를 선택하였다. 전체 선택된 유전자들은 KEGG 소프트웨어에 의해 분석되었다. KEGG 소프트웨어는 기전, 유전적 정보, 면역 시스템과 질병의 기반을 둔 유전자들을 다루는 데이터베이스의 모음이다. 이 데이터베이스 내에서 PARP1 저해제 내성 메커니즘에서 중요한 역할을 가진 것으로 생각되는 유전자들만이 선택되었다. 또한, 전체 유전자들은 DAVID 소프트웨어로 분석되었다. DAVID 소프트웨어는 기전과 질병에 관련된 생물정보에 기반을 둔 데이터베이스로 이를 이용하여 내성 메커니즘에서 주요한 역할을 하는 것으로 생각되는 유전자를 선택하였다. Genes exhibiting at least 3.5-fold change from microarray data were selected. All selected genes were analyzed by KEGG software. KEGG software is a collection of databases covering the genes underlying mechanisms, genetic information, immune system and disease. Only genes thought to have an important role in the mechanism of PARP1 inhibitor resistance within this database were selected. In addition, all genes were analyzed with DAVID software. The DAVID software is a database based on bioinformation related to mechanisms and diseases, and using it, genes that are thought to play a major role in the resistance mechanism were selected.

상기 분석들을 통해, 총 10개의 유전자를 선택하였고, Gene card를 이용하여 이들의 경로 분석, 발현 분석, 위치 분석, 및 기능 분석을 수행하여, 기존 문헌에 제시된 바 없는 신규한, PARP1 저해제 내성을 진단할 수 있는 총 4개의 유전자를 선별하였다.Through the above analysis, a total of 10 genes were selected, and their pathway analysis, expression analysis, location analysis, and function analysis were performed using a gene card to diagnose a novel, PARP1 inhibitor resistance not presented in the existing literature. A total of four possible genes were selected.

상기 결과로부터, 정상 대조군 조직 또는 PARP1 저해제가 투여된 양성 대조군 조직과 비교하여, PARP1 저해제 내성 조직에서 S100A7, PROM1, MT1G, 및 CCL2의 발현 수준이 현저한 차이를 나타냄을 확인할 수 있다. 즉, S100A7, PROM1, MT1G, 및 CCL2의 발현 수준 측정을 통해, PARP1 저해제 내성을 효율적으로 진단하여 PARP1 저해제를 이용한 치료 효과를 극대화할 수 있고, PARP1 저해제 내성 암을 치료할 수 있는 후보 물질을 효율적으로 선별할 수 있음을 확인하였다.From the above results, it can be confirmed that the expression levels of S100A7, PROM1, MT1G, and CCL2 are significantly different in the PARP1 inhibitor-resistant tissue compared to the normal control tissue or the positive control tissue administered with the PARP1 inhibitor. That is, by measuring the expression levels of S100A7, PROM1, MT1G, and CCL2, it is possible to efficiently diagnose PARP1 inhibitor resistance, maximize the therapeutic effect using the PARP1 inhibitor, and efficiently select candidate substances capable of treating PARP1 inhibitor-resistant cancer. It was confirmed that selection was possible.

<110> SUNGKWANG MEDICAL FOUNDATION <120> {A composition, kit and method for diagnosing PARP1 inhibitor resistant cancer <130> PN130402 <160> 110 <170> KoPatentIn 3.0 <210> 1 <211> 25 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> S100A7 probe 1 <400> 1 gagaagacat tttattgttc ctggg 25 <210> 2 <211> 25 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> S100A7 probe 2 <400> 2 tctcaaagac atcggcgagg taatt 25 <210> 3 <211> 25 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> S100A7 probe 3 <400> 3 aagacatcgg cgaggtaatt tgtgc 25 <210> 4 <211> 25 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> S100A7 probe 4 <400> 4 atcggcgagg taatttgtgc ccttt 25 <210> 5 <211> 25 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> S100A7 probe 5 <400> 5 acatcggcga ggtaatttgt gccct 25 <210> 6 <211> 25 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> S100A7 probe 6 <400> 6 ggagaagaca ttttattgtt cctgg 25 <210> 7 <211> 25 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> S100A7 probe 7 <400> 7 catcggcgag gtaatttgtg ccctt 25 <210> 8 <211> 25 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> S100A7 probe 8 <400> 8 gacatcggcg aggtaatttg tgccc 25 <210> 9 <211> 25 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> S100A7 probe 9 <400> 9 agacatcggc gaggtaattt gtgcc 25 <210> 10 <211> 25 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> S100A7 probe 10 <400> 10 aaagacatcg gcgaggtaat ttgtg 25 <210> 11 <211> 25 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> S100A7 probe 11 <400> 11 ctttcagcca gtagtcagtc tgggc 25 <210> 12 <211> 25 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> S100A7 probe 12 <400> 12 tctggtggga gaagacattt tattg 25 <210> 13 <211> 25 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> PROM1 probe 1 <400> 13 gaactcgatc cactgcagat aatgt 25 <210> 14 <211> 25 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> PROM1 probe 2 <400> 14 tgtgaacgcc ttgtccttgg tagtg 25 <210> 15 <211> 25 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> PROM1 probe 3 <400> 15 aaatccagag aagctagaat cctag 25 <210> 16 <211> 25 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> PROM1 probe 4 <400> 16 gaagtcttgg tcctgcacat caatg 25 <210> 17 <211> 25 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> PROM1 probe 5 <400> 17 atgataaaag attcactcct gcggg 25 <210> 18 <211> 25 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> PROM1 probe 6 <400> 18 gagtttcatt caagagagtt cgcaa 25 <210> 19 <211> 25 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> PROM1 probe 7 <400> 19 cagcagtatc tagagcggtg gccac 25 <210> 20 <211> 25 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> PROM1 probe 8 <400> 20 cggaataatt ccttgctcgt gtaag 25 <210> 21 <211> 25 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> PROM1 probe 9 <400> 21 cgtggtttgg cgttgtactc tgtca 25 <210> 22 <211> 25 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> PROM1 probe 10 <400> 22 tcaccaacag ggagattgca aagca 25 <210> 23 <211> 25 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> PROM1 probe 11 <400> 23 tctataggaa ggactcgttg ctggt 25 <210> 24 <211> 25 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> PROM1 probe 12 <400> 24 gggtctcagt cggtcaagaa ttccg 25 <210> 25 <211> 25 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> PROM1 probe 13 <400> 25 cattcgacga tagtacttag ccagt 25 <210> 26 <211> 25 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> PROM1 probe 14 <400> 26 cccgagagcg agtccgaagt ctctg 25 <210> 27 <211> 25 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> PROM1 probe 15 <400> 27 cagtacagtg gaaggagtgc gctca 25 <210> 28 <211> 25 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> PROM1 probe 16 <400> 28 gaccctggct cgtgaattat ttatg 25 <210> 29 <211> 25 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> PROM1 probe 17 <400> 29 ttagacctaa gattacagtt tctgg 25 <210> 30 <211> 25 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> PROM1 probe 18 <400> 30 tgctgcaccc aacagaaaga tatta 25 <210> 31 <211> 25 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> PROM1 probe 19 <400> 31 caggtgaaga gtgccgtaag tgcct 25 <210> 32 <211> 25 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> PROM1 probe 20 <400> 32 gcttcccaga gagatagtat tccca 25 <210> 33 <211> 25 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> PROM1 probe 21 <400> 33 aaggcaagcg tgttcctggg cagaa 25 <210> 34 <211> 25 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> PROM1 probe 22 <400> 34 taacactggg catggcacgt agtcg 25 <210> 35 <211> 25 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> PROM1 probe 23 <400> 35 gttgtcaagt tctgcatcca cgggt 25 <210> 36 <211> 25 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> PROM1 probe 24 <400> 36 cattgagaga tgaccgcagg ctagt 25 <210> 37 <211> 25 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> PROM1 probe 25 <400> 37 ctgaacagaa gtgacccaac tacta 25 <210> 38 <211> 25 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> PROM1 probe 26 <400> 38 cgcgagctgc gggacacaaa agaat 25 <210> 39 <211> 25 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> PROM1 probe 27 <400> 39 tgtgtgctga gataacctcc caggc 25 <210> 40 <211> 25 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> PROM1 probe 28 <400> 40 tgagcaggct tctcctatct gggcc 25 <210> 41 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S100A7 probe 12 <400> 12 tctggtggga gaagacattt tattg 25 <210> 13 <211> 25 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> PROM1 probe 1 <400> 13 gaactcgatc cactgcagat aatgt 25 <210> 14 <211> 25 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> PROM1 probe 2 <400> 14 tgtgaacgcc ttgtccttgg tagtg 25 <210> 15 <211> 25 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> PROM1 probe 3 <400> 15 aaatccagag aagctagaat cctag 25 <210> 16 <211> 25 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> PROM1 probe 4 <400> 16 gaagtcttgg tcctgcacat caatg 25 <210> 17 <211> 25 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> PROM1 probe 5 <400> 17 atgataaaag attcactcct gcggg 25 <210> 18 <211> 25 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> PROM1 probe 6 <400> 18 gagtttcatt caagagagtt cgcaa 25 <210> 19 <211> 25 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> PROM1 probe 7 <400> 19 cagcagtatc tagagcggtg gccac 25 <210> 20 <211> 25 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> PROM1 probe 8 <400> 20 cggaataatt ccttgctcgt gtaag 25 <210> 21 <211> 25 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> PROM1 probe 9 <400> 21 cgtggtttgg cgttgtactc tgtca 25 <210> 22 <211> 25 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> PROM1 probe 10 <400> 22 tcaccaacag ggagattgca aagca 25 <210> 23 <211> 25 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> PROM1 probe 11 <400> 23 tctataggaa ggactcgttg ctggt 25 <210> 24 <211> 25 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> PROM1 probe 12 <400> 24 gggtctcagt cggtcaagaa ttccg 25 <210> 25 <211> 25 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> PROM1 probe 13 <400> 25 cattcgacga tagtacttag ccagt 25 <210> 26 <211> 25 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> PROM1 probe 14 <400> 26 cccgagagcg agtccgaagt ctctg 25 <210> 27 <211> 25 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> PROM1 probe 15 <400> 27 cagtacagtg gaaggagtgc gctca 25 <210> 28 <211> 25 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> PROM1 probe 16 <400> 28 gaccctggct cgtgaattat ttatg 25 <210> 29 <211> 25 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> PROM1 probe 17 <400> 29 ttagacctaa gattacagtt tctgg 25 <210> 30 <211> 25 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> PROM1 probe 18 <400> 30 tgctgcaccc aacagaaaga tatta 25 <210> 31 <211> 25 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> PROM1 probe 19 <400> 31 caggtgaaga gtgccgtaag tgcct 25 <210> 32 <211> 25 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> PROM1 probe 20 <400> 32 gcttcccaga gagatagtat tccca 25 <210> 33 <211> 25 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> PROM1 probe 21 <400> 33 aaggcaagcg tgttcctggg cagaa 25 <210> 34 <211> 25 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> PROM1 probe 22 <400> 34 taacactggg catggcacgt agtcg 25 <210> 35 <211> 25 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> PROM1 probe 23 <400> 35 gttgtcaagt tctgcatcca cgggt 25 <210> 36 <211> 25 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> PROM1 probe 24 <400> 36 cattgagaga tgaccgcagg ctagt 25 <210> 37 <211> 25 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> PROM1 probe 25 <400> 37 ctgaacagaa gtgacccaac tacta 25 <210> 38 <211> 25 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> PROM1 probe 26 <400> 38 cgcgagctgc gggacacaaa agaat 25 <210> 39 <211> 25 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> PROM1 probe 27 <400> 39 tgtgtgctga gataacctcc caggc 25 <210> 40 <211> 25 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> PROM1 probe 28 <400> 40 tgagcaggct tctcctatct gggcc 25 <210> 41 <211> 25 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> PROM1 probe 29 <400> 41 gaaatcacgc ggctgtacca catag 25 <210> 42 <211> 25 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> PROM1 probe 30 <400> 42 gacgcactct gattggaccg gctga 25 <210> 43 <211> 25 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> PROM1 probe 31 <400> 43 ccttgaatag tgatggacca tggac 25 <210> 44 <211> 25 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> PROM1 probe 32 <400> 44 catcttgctc caaaatgtag gtccc 25 <210> 45 <211> 25 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> PROM1 probe 33 <400> 45 ggatacccaa catctgagac cacgt 25 <210> 46 <211> 25 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> PROM1 probe 34 <400> 46 tgtgtagcag tgagagcctt ccaga 25 <210> 47 <211> 25 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> PROM1 probe 35 <400> 47 tgtcataaca ggattgtgaa tacca 25 <210> 48 <211> 25 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> PROM1 probe 36 <400> 48 ctggcacgca gctggaaggc tatct 25 <210> 49 <211> 25 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> PROM1 probe 37 <400> 49 tctaagtggc tctctgggtg aacca 25 <210> 50 <211> 25 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> PROM1 probe 38 <400> 50 tggaaagtcc ttgtagaccc agaaa 25 <210> 51 <211> 25 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> PROM1 probe 39 <400> 51 taaactgagc cttgagttaa ggtcc 25 <210> 52 <211> 25 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> PROM1 probe 40 <400> 52 gatccttgat ctgcccgctt agtag 25 <210> 53 <211> 25 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> PROM1 probe 41 <400> 53 tccagatcca cgagaaagga gccca 25 <210> 54 <211> 25 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> PROM1 probe 42 <400> 54 ccagatccac gagaaaggag cccac 25 <210> 55 <211> 25 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> PROM1 probe 43 <400> 55 caggcctggg taattcttgt ggtca 25 <210> 56 <211> 25 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> PROM1 probe 44 <400> 56 ttgtgacatg cttgctctcc ctgct 25 <210> 57 <211> 25 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> PROM1 probe 45 <400> 57 catgtctgct gctatccaca acctg 25 <210> 58 <211> 25 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> PROM1 probe 46 <400> 58 cagatccacg agaaaggagc ccaca 25 <210> 59 <211> 25 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> PROM1 probe 47 <400> 59 tattccggac ggtcgtggtg ccatc 25 <210> 60 <211> 25 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> PROM1 probe 48 <400> 60 tgctgctatc cacaacctgt gtctg 25 <210> 61 <211> 25 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> PROM1 probe 49 <400> 61 tgctatccac aacctgtgtc tgtga 25 <210> 62 <211> 25 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> PROM1 probe 50 <400> 62 gtctgctgct atccacaacc tgtgt 25 <210> 63 <211> 25 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> PROM1 probe 51 <400> 63 tctgctgcta tccacaacct gtgtc 25 <210> 64 <211> 25 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> PROM1 probe 52 <400> 64 gtccagatcc acgagaaagg agccc 25 <210> 65 <211> 25 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> PROM1 probe 53 <400> 65 gagtattctt acaagtgtcc ccagg 25 <210> 66 <211> 25 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> PROM1 probe 54 <400> 66 gctatccaca acctgtgtct gtgag 25 <210> 67 <211> 25 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> PROM1 probe 55 <400> 67 ggtccagatc cacgagaaag gagcc 25 <210> 68 <211> 25 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> PROM1 probe 56 <400> 68 catcttctgg agctgtgatt ctgca 25 <210> 69 <211> 25 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> MT1G probe 1 <400> 69 caagtaggga gacgtatgta acaaa 25 <210> 70 <211> 25 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> MT1G probe 2 <400> 70 cctgtgaact ggactgaacg agaca 25 <210> 71 <211> 25 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> MT1G probe 3 <400> 71 gacatcacag ctctggtgat cccag 25 <210> 72 <211> 25 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> MT1G probe 4 <400> 72 gtggccatca caacacctag acggg 25 <210> 73 <211> 25 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> MT1G probe 5 <400> 73 aagttctccc gccaggcggc ctggg 25 <210> 74 <211> 25 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> MT1G probe 6 <400> 74 ccagttaaaa ctgaacaggt gcctt 25 <210> 75 <211> 25 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> MT1G probe 7 <400> 75 tgtaggactg caagacactg gaccg 25 <210> 76 <211> 25 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> MT1G probe 8 <400> 76 gcggtggctt ctcccaatca gttca 25 <210> 77 <211> 25 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> MT1G probe 9 <400> 77 agcggtggct tctcccaatc agttc 25 <210> 78 <211> 25 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> MT1G probe 10 <400> 78 gggaccccaa tgaccatgat acagt 25 <210> 79 <211> 25 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> MT1G probe 11 <400> 79 taagcaggag aacgactcaa gatac 25 <210> 80 <211> 25 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> MT1G probe 12 <400> 80 ctttcctgag gtgatcagcc gcacg 25 <210> 81 <211> 25 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> MT1G probe 13 <400> 81 tgagagcagc tttaacacac aggcc 25 <210> 82 <211> 25 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> MT1G probe 14 <400> 82 tgcccaggcc gtagtgctgc acgta 25 <210> 83 <211> 25 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> MT1G probe 15 <400> 83 aggtagtcag ccatggtctc ctccc 25 <210> 84 <211> 25 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> MT1G probe 16 <400> 84 aggccttctc cttctaagtg ttgca 25 <210> 85 <211> 25 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> MT1G probe 17 <400> 85 tgctcccaag gagaacacaa ggaag 25 <210> 86 <211> 25 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> MT1G probe 18 <400> 86 tcttgacaga gtgctgggcc tggcc 25 <210> 87 <211> 25 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> MT1G probe 19 <400> 87 tgctctgtaa gatccgccaa gtcca 25 <210> 88 <211> 25 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> MT1G probe 20 <400> 88 tttcctgagg tgatcagccg cacgc 25 <210> 89 <211> 25 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> MT1G probe 21 <400> 89 cacggcggaa agtctgcagg aagtc 25 <210> 90 <211> 25 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> MT1G probe 22 <400> 90 aaataaaagc gtcaggtccc aacag 25 <210> 91 <211> 25 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> MT1G probe 23 <400> 91 cacactttca atccgaggag ccagc 25 <210> 92 <211> 25 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> MT1G probe 24 <400> 92 ctgaaacaga gggttgcggc ctgaa 25 <210> 93 <211> 25 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> MT1G probe 25 <400> 93 ccgggcatcg tggacctcga tgata 25 <210> 94 <211> 25 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> MT1G probe 26 <400> 94 gctgccgcag gatagttagg ctgaa 25 <210> 95 <211> 25 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> MT1G probe 27 <400> 95 agcacgcgct ctacgttgtc acagg 25 <210> 96 <211> 25 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> MT1G probe 28 <400> 96 cagtacacgc ggagccgacg cagga 25 <210> 97 <211> 25 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> MT1G probe 29 <400> 97 tttggcgcaa agactatgac gactg 25 <210> 98 <211> 25 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> MT1G probe 30 <400> 98 caaagacacc gtgccgtgag gaaga 25 <210> 99 <211> 25 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> MT1G probe 31 <400> 99 caaagacact aaccaagagg acggc 25 <210> 100 <211> 25 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> CCL2 probe 1 <400> 100 aataagttag ctgcagattc ttggg 25 <210> 101 <211> 25 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> CCL2 probe 2 <400> 101 ggtggtccat ggaatcctga accca 25 <210> 102 <211> 25 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> CCL2 probe 3 <400> 102 gcaaagaccc tcaaaacatc ccagg 25 <210> 103 <211> 25 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> CCL2 probe 4 <400> 103 tctgcactga gatcttccta ttggt 25 <210> 104 <211> 25 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> CCL2 probe 5 <400> 104 tgattcttct atagctcgcg agcct 25 <210> 105 <211> 25 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> CCL2 probe 6 <400> 105 gtgattcttc tatagctcgc gagcc 25 <210> 106 <211> 25 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> CCL2 probe 7 <400> 106 gagagtgcga gcttcagttt gagaa 25 <210> 107 <211> 25 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> CCL2 probe 8 <400> 107 cgagagtgcg agcttcagtt tgaga 25 <210> 108 <211> 25 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> CCL2 probe 9 <400> 108 gatctccttg gccacaatgg tcttg 25 <210> 109 <211> 25 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> CCL2 probe 10 <400> 109 ggtgattctt ctatagctcg cgagc 25 <210> 110 <211> 25 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> CCL2 probe 11 <400> 110 tggtgattct tctatagctc gcgag 25

Claims (12)

S100A7 (S100 calcium-binding protein), PROM1 (Prominin-1), MT1G (Metallothionein 1G), 및 CCL2 (Chemokine (C-C motif) ligand 2)로 이루어진 군으로부터 선택된 하나 이상의 유전자의 발현 수준을 측정하기 위한 제제를 포함하는 PARP1 저해제 내성 진단용 조성물.An agent for measuring the expression level of one or more genes selected from the group consisting of S100A7 (S100 calcium-binding protein), PROM1 (Prominin-1), MT1G (Metallothionein 1G), and CCL2 (Chemokine (CC motif) ligand 2) A composition for diagnosis of PARP1 inhibitor resistance comprising. 청구항 1에 있어서, 상기 제제는 유전자에 특이적으로 결합하는 안티센스 올리고뉴클레오티드, 프라이머 쌍, 또는 프로브를 포함하는 것인 조성물.The composition of claim 1 , wherein the agent comprises an antisense oligonucleotide, a primer pair, or a probe that specifically binds to a gene. 청구항 1에 있어서, 상기 PARP1 저해제는 올라파립(olaparib), 탈라조파립(Talazoparib), 니라파립 (Niraparib), 루카파립(Rucaparib), 벨리파립(Veliparib), 파미파립(Pamiparib) 또는 이들의 조합인 것인 조성물.The method according to claim 1, wherein the PARP1 inhibitor is olaparib, talazoparib, niraparib, rucaparib, veliparib, pamiparib, or a combination thereof. composition. 청구항 1 내지 3 중 어느 한 항의 조성물을 포함하는 PARP1 저해제 내성 진단용 키트.A kit for diagnosing PARP1 inhibitor resistance, comprising the composition of any one of claims 1 to 3. 개체의 시료로부터 S100A7, PROM1, MT1G, 및 CCL2로 이루어진 군으로부터 선택된 하나 이상의 유전자의 발현 수준을 측정하는 단계; 및
상기 측정된 유전자의 발현 수준을 정상 대조군 시료의 발현 수준과 비교하는 단계를 포함하는 PARP1 저해제 내성을 예측하기 위한 정보제공방법.
Measuring the expression level of one or more genes selected from the group consisting of S100A7, PROM1, MT1G, and CCL2 from the subject's sample; and
Information providing method for predicting PARP1 inhibitor resistance comprising the step of comparing the expression level of the measured gene with the expression level of a normal control sample.
청구항 5에 있어서, 상기 유전자의 발현 수준을 측정하는 단계는 역전사 중합효소반응(RT-PCR), 경쟁적 역전사 중합효소반응(Competitive RT-PCR), 실시간 역전사 중합효소반응(Realtime RT-PCR), RNase 보호 분석법(RPA; RNase protection assay), 노던 블랏팅(Northern blotting), 또는 DNA 칩에 의하여 수행하는 것인 정보제공방법.The method according to claim 5, wherein the step of measuring the expression level of the gene is reverse transcription polymerase reaction (RT-PCR), competitive reverse transcription polymerase reaction (Competitive RT-PCR), real-time reverse transcription polymerase reaction (Realtime RT-PCR), RNase An information providing method that is performed by a protection assay (RPA; RNase protection assay), Northern blotting, or a DNA chip. 청구항 5에 있어서, 상기 시료는 종양 조직인 것인 정보제공방법.The method according to claim 5, wherein the sample is a tumor tissue. 청구항 5에 있어서, 상기 측정된 S100A7, PROM1 또는 CCL2 유전자의 발현 수준이 정상 대조군에 비해 높은 경우, 및 상기 측정된 MT1G 유전자의 발현 수준이 정상 대조군에 비해 낮은 경우, PARP1 저해제 내성으로 판단하는 단계를 더 포함하는 것인 정보제공방법.The method according to claim 5, when the measured expression level of the S100A7, PROM1 or CCL2 gene is higher than that of the normal control, and when the measured expression level of the MT1G gene is lower than that of the normal control, the step of determining PARP1 inhibitor resistance Information providing method that further includes. PARP1 저해제 내성 암의 치료를 위한 후보 물질이 투여된 개체의 시료로부터 S100A7, PROM1, MT1G, 및 CCL2로 이루어진 군으로부터 선택된 하나 이상의 유전자의 발현 수준을 측정하는 단계; 및
상기 측정된 유전자의 발현 수준을 정상 대조군 시료의 발현 수준과 비교하는 단계를 포함하는 PARP1 저해제 내성 암 치료제를 스크리닝하는 방법.
Measuring the expression level of one or more genes selected from the group consisting of S100A7, PROM1, MT1G, and CCL2 from a sample of an individual administered with a candidate substance for treatment of PARP1 inhibitor-resistant cancer; and
A method of screening a PARP1 inhibitor-resistant cancer therapeutic agent comprising the step of comparing the measured expression level of the gene with the expression level of a normal control sample.
청구항 9에 있어서, 상기 시료는 종양 조직인 것인 스크리닝 방법.The screening method according to claim 9, wherein the sample is a tumor tissue. 청구항 9에 있어서, 상기 유전자의 발현 수준을 측정하는 단계는 역전사 중합효소반응, 경쟁적 역전사 중합효소반응, 실시간 역전사 중합효소반응, RNase 보호 분석법, 노던 블랏팅, 또는 DNA 칩에 의하여 수행하는 것인 스크리닝 방법.The screening method according to claim 9, wherein the step of measuring the expression level of the gene is performed by a reverse transcription polymerase reaction, a competitive reverse transcription polymerase reaction, a real-time reverse transcription polymerase reaction, an RNase protection assay, Northern blotting, or a DNA chip. Way. 청구항 9에 있어서, 상기 측정된 S100A7, PROM1 또는 CCL2 유전자의 발현 수준이 정상 대조군에 비해 높은 경우, 및 상기 측정된 MT1G 유전자의 발현 수준이 정상 대조군에 비해 낮은 경우, 투여된 후보 물질을 PARP1 저해제 내성 암 치료제로 판단하는 단계를 더 포함하는 것인 스크리닝 방법.The method according to claim 9, when the measured expression level of the S100A7, PROM1 or CCL2 gene is higher than that of the normal control, and when the measured expression level of the MT1G gene is lower than that of the normal control, the administered candidate substance is PARP1 inhibitor resistance The screening method further comprising the step of determining a cancer therapeutic agent.
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Non-Patent Citations (3)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Title
American Association for Cancer Research (epub.2018.11.06) DOI: 10.1158/1541-7786.MCR-18-0594.* *
Oncol Rep. 2018 Sep;40(3):1574-1582. doi: 10.3892/or.2018.6527. *
Published online 2018 Feb 22. doi: 10.3389/fonc.2018.00031 *

Cited By (1)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
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