KR20190033394A - EXPB3-Mab-3-1-H3-C11-E4(EXPB3-C11-E4) as a Mono clonal Antibody for Detecting PWN Infection, Method for Preparing Mono clonal Antibody for Detecting PWN Infection, Method for Detecting PWN infection using the Same, and Method of Extract Solution for Detecting PWN Infection - Google Patents

EXPB3-Mab-3-1-H3-C11-E4(EXPB3-C11-E4) as a Mono clonal Antibody for Detecting PWN Infection, Method for Preparing Mono clonal Antibody for Detecting PWN Infection, Method for Detecting PWN infection using the Same, and Method of Extract Solution for Detecting PWN Infection Download PDF

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Abstract

The present invention provides EXPB3-Mab-3-1-H3-C11-E4 (EXPB3-C11-E4) as a monoclonal antibody for detecting PWN infection, a method for preparing a monoclonal antibody for detecting PWN infection, a method for detecting PWN infection using EXPB3-Mab-3-1-H3-C11-E4 (EXPB3-C11-E4), and a method for extracting a solution for detecting PWN infection used in the detection.

Description

PWN-감염 검사용 단일클론항체 EXPB3-Mab-3-1-H3-C11-E4(EXPB3-C11-E4), PWN-감염 검출용 단일클론항체의 제조방법, 상기 EXPB3-Mab-3-1-H3-C11-E4(EXPB3-C11-E4)를 사용하는 PWN-감염 검사방법, 및 상기 검사에 사용되는 PWN-감염 검사용 추출액의 제조방법{EXPB3-Mab-3-1-H3-C11-E4(EXPB3-C11-E4) as a Mono clonal Antibody for Detecting PWN Infection, Method for Preparing Mono clonal Antibody for Detecting PWN Infection, Method for Detecting PWN infection using the Same, and Method of Extract Solution for Detecting PWN Infection} Mab-3-1-H3-C11-E4 (EXPB3-C11-E4), a method for producing a monoclonal antibody for PWN infection detection, a method for producing the above EXPB3-Mab- H3-C11-E4 (EXPB3-C11-E4), and a method for producing PWN-infectious test extract used in said test {EXPB3-Mab-3-1-H3-C11-E4 (EXPB3-C11-E4) as a Monoclonal Antibody for Detecting PWN Infection, Method for Preparing Mono Clonal Antibody for Detecting PWN Infection, Method for Detecting PWN Infection Using the Same,

본 발명은 PWN-감염 검사용 단일클론항체인 EXPB3-Mab-3-1-H3-C11-E4(EXPB3-C11-E4), PWN-감염 검사용 단일클론항체의 제조방법, 상기 EXPB3-Mab-3-1-H3-C11-E4(EXPB3-C11-E4)를 사용하는 PWN-감염 검사방법, 및 상기 검사에 사용되는 PWN-감염 검사용 추출액의 제조방법에 관한 것이다. (EXPB3-C11-E4) which is a monoclonal antibody for PWN-infection test, a method for producing a monoclonal antibody for PWN-infection test, a method for producing the EXPB3-Mab- 3-1-H3-C11-E4 (EXPB3-C11-E4), and a method for producing an extract for PWN-infectivity test used in the test.

Pine wilt disease(PWD)는 현재 세계에서 가장 파괴적인 침엽수림 병이며 소나무 선충(PWN), Bursaphelenchus xylophilus(Steiner & Buhner, 1934) Nickle(Futai, 2013) 감염으로 인한 것으로 판명되었다. 이 질병은 1905년 일본 나가사키에서 처음 보고 된 이래 1982년 중국, 1985년 대만, 1988년 한국 등 다른 동아시아 국가로 확산되었다(Futai, 2013; Suzuki, 2002). 또한, PWN에 감염된 소나무는 1999년 포르투갈의 이베리아 반도에서 관찰되었으며 (Futai, 2013; Mota et al., 1999), 2008년 포르투갈 근처 스페인의 카세레스 지역에서 관찰되었다(Abelleira et al., 2011 ). 지역 내 PWN의 확산은 Monochamus spp. 속의 여러 소나무 톱밥 딱정벌레 종에 의해 매개된다. 그러나 외딴 지역이나 다른 대륙에서 PWD의 발생은 PWN과 그 감염된 나무의 인공적인 운송으로 인해 발생한다는 것이 알려져 있다(Futai, 2013). Pine wilt disease (PWD) is currently the most destructive coniferous forest disease in the world and has been found to be due to infection with pine nematode (PWN), Bursaphelenchus xylophilus (Steiner & Buhner, 1934) and Nickle (Futai, 2013). The disease was first reported in Nagasaki, Japan in 1905, and spread to other East Asian countries, including China in 1982, Taiwan in 1985, and Korea in 1988 (Futai, 2013; Suzuki, 2002). In addition, pine trees infected with PWN have been observed in the Iberian Peninsula of Portugal in 1999 (Futai, 2013; Mota et al., 1999) and were observed in 2008 in the Caceres region of Spain near Portugal (Abelleira et al., 2011). The proliferation of PWN in the area is due to Monochamus spp. It is mediated by several pine sawdust beetles species. However, it is known that outbreaks of PWD occur in remote areas or on other continents due to the artificial transport of PWN and its infected trees (Futai, 2013).

그러므로 현재 PWD가 광범위하게 확산되지 않도록 하는 가장 좋은 방법은 PWN-감염 지역에서 다른 감염되지 않은 지역으로 소나무를 옮기는 것을 방지하는 것이다. 동시에 감염된 나무의 제거가 그 매개체의 밀도를 감소시키기 때문에 PWN-감염된 나무를 찾아서 태우는 것이 PWD의 확산을 막는 가장 효과적인 방법 중 하나이다(Futai, 2013).Therefore, the best way to prevent current widespread spread of PWD is to prevent the transfer of pine trees from PWN-infected areas to other uninfected areas. Finding and burning PWN-infected trees is one of the most effective ways to prevent the spread of PWD (Futai, 2013), because removal of infected trees simultaneously reduces the density of the medium.

PWN과 감염된 소나무를 확인하고 발견하기 위해 다양한 연구 노력이 수행되었다. 소나무의 PWN-감염의 확인은 소나무에서 추출된 선충의 현미경 관찰을 기반으로 하였다(Futai, 2013; Yik and Birchfield, 1981). A variety of research efforts have been conducted to identify and detect PWNs and infected pines. Identification of PWN-infection in pine trees was based on microscopic observation of nematodes from pine trees (Futai, 2013; Yik and Birchfield, 1981).

미토콘드리아 유전자(Cheng et al., 2008; Kanzaki and Futai, 2002)를 포함한 다양한 분자 표지, internal transcribed regions(Cheng et al., 2008; Kanzaki and Futai, 2002) 및 다양한 마이크로 위성(Jung et al. 2010; Mallez et al., 2013)이 확인되고 기술개발에 사용되었다. (Cheng et al., 2008; Kanzaki and Futai, 2002) and various microsatellites (Jung et al., 2010), including mitochondrial genes (Cheng et al., 2008; Mallez et al., 2013) was identified and used for technology development.

그러나 분자 도구의 대부분은 정교한 기계를 필요로 하고 때로는 진단을 완료하기 위해 아가로오스겔에서 PCR을 분리해야 한다. 이러한 한계를 극복하기 위해 고리매개등온증폭(LAMP)을 사용하는 몇 가지 방법이 개발되었다(Kang et al., 2015; Kikuchi et al., 2009). 그러나 LAMP 반응 혼합물은 약 60℃에서 적어도 1 시간 동안 배양해야 하며 목재 형광체에서 게놈 DNA를 추출하기 위해 강한 형광 신호를 UV 투광으로 확인해야 한다.However, most of the molecular tools require a sophisticated machine and sometimes the PCR should be separated from the agarose gel to complete the diagnosis. To overcome these limitations, several methods of using ring-mediated isothermal amplification (LAMP) have been developed (Kang et al., 2015; Kikuchi et al., 2009). However, the LAMP reaction mixture should be incubated at about 60 ° C for at least 1 hour and a strong fluorescence signal should be identified by UV light to extract the genomic DNA from the wood phosphors.

이러한 한계를 극복하기 위해서는 현장에서 빠른 진단을 위해 항원 - 항체 상호 작용을 이용하여 신속한 검사를 진행할 수 있는 키트를 개발하는 것이 요구된다. To overcome these limitations, it is required to develop kits that can perform rapid tests using antigen-antibody interactions for rapid diagnosis in the field.

대한민국 공개특허 제10-2010-0045817호Korean Patent Publication No. 10-2010-0045817

본 발명은 상기와 같은 종래기술의 문제를 해결하기 위하여 안출된 것으로서, SUMMARY OF THE INVENTION The present invention has been made to solve the above-mentioned problems of the prior art,

항원-항체 상호 작용에 의하여 신속하고 정확하게 PWN-감염 검사를 수행하는 것을 가능하게 하는 PWN-감염 검사용 단일클론항체인 EXPB3-Mab-3-1-H3-C11-E4(EXPB3-C11-E4), PWN-감염 검사용 단일클론항체의 제조방법, 상기 EXPB3-Mab-3-1-H3-C11-E4(EXPB3-C11-E4)를 사용하는 PWN-감염 검사방법, 및 상기 검사에 사용되어 PWN-감염 검사의 정확성을 향상시킬 수 있는 PWN-감염 검사용 추출액의 제조방법을 제공하는 것을 목적으로 한다.EXPB3-Mab-3-1-H3-C11-E4 (EXPB3-C11-E4) which is a monoclonal antibody for PWN-infection test which makes it possible to perform PWN-infection test quickly and accurately by antigen- , A method for producing a monoclonal antibody for PWN infection test, a method for testing PWN infection using EXPB3-Mab-3-1-H3-C11-E4 (EXPB3-C11-E4) It is another object of the present invention to provide a method for producing an extract for PWN-infection test which can improve the accuracy of the infection test.

본 발명은 The present invention

(a) EXPB3의 아미노산 서열을 Bursaphelenchus xylophilus 유전자 데이터베이스를 사용하여 blast하여, PWN 및 다른 선충종의 EXP 동족체에 대한 아미노산 서열 불일치를 나타내는 펩타이드를 설계하는 단계;(a) blending the amino acid sequence of EXPB3 with the Bursaphelenchus xylophilus gene database to design a peptide that exhibits amino acid sequence mismatch for PWN and EXP homologues of other nematode species;

(b) 상기(a)단계에서 설계된 펩타이드를 keyhole limpet hemocyanin(KLH)과 접합시킨 다음, 항원으로 사용하여 Balb / C 쥐들을 면역시켜서 융합 하이브리도마를 얻는 단계;(b) binding the peptide designed in step (a) with keyhole limpet hemocyanin (KLH) and then immunizing Balb / C rats using the peptide as an antigen to obtain a fusion hybridoma;

(c) 상기(b)단계에서 얻은 융합 하이브리도마의 상층액을 상기(b)단계에서 제조된 항원을 사용하여 ELISA로 1차 스크리닝 하는 단계;(c) primary screening the supernatant of the fusion hybridomas obtained in step (b) by ELISA using the antigen prepared in step (b);

(d) PWN-감염 소나무(PWNIPTs)로부터 목재 펠릿을 수집하고, PBS 추출액으로 추출하는 단계;(d) collecting wood pellets from PWN-infected pine trees (PWNIPTs) and extracting with PBS extract;

(e) 상기(c)단계에서 1차 스크리닝된 하이브리도마 계통을 상기(d)단계에서 얻어진 PBS 추출액을 항원으로 사용하여 ELISA로 2차 스크리닝 하고, 단일 세포 복제를 위해 OD(optical density)를 기준으로 클론을 선택하는 단계; 및(e) Hybridoma strain first screened in step (c) is secondly screened by ELISA using the PBS extract obtained in step (d) as an antigen, and OD (optical density) Selecting a clone by reference; And

(f)(e)단계에서 선택된 클론에 대하여 제한된 희석을 수행한 후, 상기(d)단계에서 얻어진 PBS 추출액을 항원으로 사용하여 ELISA로 3차 스크리닝 하여 단일클론항체를 선별하는 단계;(f) performing a limited dilution on the clone selected in step (e), and then screening the monoclonal antibody by ELISA using the PBS extract obtained in step (d) as an antigen;

를 포함하는 PWN-감염 소나무 검출용 단일클론항체의 제조방법을 제공한다.A method for producing a monoclonal antibody for detecting PWN-infected pines comprising the steps of:

본 발명은 또한,The present invention also relates to

(1) PWN-감염 의심 소나무로부터 목재 펠릿을 수집하는 단계; 및(1) collecting wood pellets from PWN-suspect pine trees; And

(2) 상기(1)단계에서 수집된 목재 펠릿을 PBS 추출액으로 추출하는 단계;(2) extracting the wood pellets collected in the step (1) with PBS extract;

를 포함하는 PWN-감염 검사용 추출액의 제조방법을 제공한다. A method for preparing an extract for PWN-infectivity test.

본 발명은 또한,The present invention also relates to

PWN-감염 검사용 단일클론항체인 EXPB3-Mab-3-1-H3-C11-E4(EXPB3-C11-E4)를 제공한다. EXPB3-Mab-3-1-H3-C11-E4 (EXPB3-C11-E4) which is a monoclonal antibody for PWN-infection test.

본 발명은 또한,The present invention also relates to

(A) PWN-감염 의심 소나무로부터 목재 펠릿을 수집하는 단계; 및(A) collecting wood pellets from PWN-suspect pine trees; And

(B) 상기(A)단계에서 수집된 목재 펠릿을 PBS 추출액으로 추출하는 단계; 및(B) extracting the wood pellets collected in the step (A) with a PBS extract; And

(C) 상기 PWN-감염 검사용 단일클론항체인 EXPB3-Mab-3-1-H3-C11-E4(EXPB3-C11-E4)와 상기(B)단계의 PBS 추출액을 사용하여 ELISA를 실시하는 단계;(C) Performing ELISA using EXPB3-Mab-3-1-H3-C11-E4 (EXPB3-C11-E4) which is a monoclonal antibody for PWN-infection test and PBS extract in step (B) ;

를 포함하는 PWN-감염 검사방법을 제공한다.The method comprising the steps of:

본 발명의 PWN-감염 검사용 단일클론항체인 EXPB3-Mab-3-1-H3-C11-E4(EXPB3-C11-E4)를 사용하면 항원-항체 상호 작용에 의하여 신속하고 정확하게 PWN-감염 검사를 수행할 수 있다.EXPB3-Mab-3-1-H3-C11-E4 (EXPB3-C11-E4), a monoclonal antibody for the PWN-infection test of the present invention, can be used to rapidly and accurately test for PWN infection by antigen- Can be performed.

또한, 상기와 같은 PWN-감염 검사를 수행할 수 있는 진단 키트의 제조에 매우 유용하게 사용될 수 있다. In addition, it can be very usefully used in the production of a diagnostic kit capable of conducting the PWN-infection test as described above.

또한, 본 발명의 PWN-감염 검사용 추출액의 제조방법에 의해 제조되는 추출액은 신속하고 정확한 PWN-감염 검사를 가능하게 한다. In addition, the extract prepared by the method of the present invention for producing an extract for PWN-infectious test enables rapid and accurate testing of PWN-infection.

도 1은 EXPB3-Mabs의 각 추출물에 대한 면역 반응성을 나타내는 그래프이다.
도 2는 PWNIPT의 PBS 추출물에 대한 96 개의 선택된 하이브리도마의 면역 반응을 나타낸 그래프이다.
도 3은 두 EXPB3 하이브리도마 클론의 제한된 희석 결과를 나타낸다.
도 4는 EXPB3-Mab-3-1-H3-C11-E4(EXPB3-C11-E4)를 사용하여 9 개의 서로 다른 위치에서 수집 된 74 개의 PWNIPT 각각에 존재하는 항원의 양을 측정한 결과를 나타낸다.
도 5는 2개의 EXPB3 펩타이드에 대한 융합 하이브리도마 셀 라인의 상층액을 사용한 1차 스크리닝 결과를 나타낸 그래프이다.
도 6내지 도 8은 낮은 normalized specificity를 나타낸 9개의 EXPB3 하이브리도마 클론의 제한 희석 결과를 나타낸 그래프이다.
Figure 1 is a graph showing the immunoreactivity of each extract of EXPB3-Mabs.
Figure 2 is a graph showing the immunological response of 96 selected hybridomas to the PBS extract of PWNIPT.
Figure 3 shows the results of limited dilution of two EXPB3 hybridomas clones.
Figure 4 shows the results of measuring the amount of antigen present in each of 74 PWNIPTs collected at 9 different sites using EXPB3-Mab-3-1-H3-C11-E4 (EXPB3-C11-E4) .
5 is a graph showing the results of primary screening using the supernatant of a fusion hybridoma cell line for two EXPB3 peptides.
FIGS. 6 to 8 are graphs showing limiting dilution results of nine EXPB3 hybridomas clones showing low normalized specificity. FIG.

본 발명은 The present invention

(a) EXPB3의 아미노산 서열을 Bursaphelenchus xylophilus 유전자 데이터베이스를 사용하여 blast하여, PWN 및 다른 선충종의 EXP 동족체에 대한 아미노산 서열 불일치를 나타내는 펩타이드를 설계하는 단계;(a) blending the amino acid sequence of EXPB3 with the Bursaphelenchus xylophilus gene database to design a peptide that exhibits amino acid sequence mismatch for PWN and EXP homologues of other nematode species;

(b) 상기(a)단계에서 설계된 펩타이드를 keyhole limpet hemocyanin(KLH)과 접합시킨 다음, 항원으로 사용하여 Balb / C 쥐들을 면역시켜서 융합 하이브리도마를 얻는 단계;(b) binding the peptide designed in step (a) with keyhole limpet hemocyanin (KLH) and then immunizing Balb / C rats using the peptide as an antigen to obtain a fusion hybridoma;

(c) 상기(b)단계에서 얻은 융합 하이브리도마의 상층액을 상기(b)단계에서 제조된 항원을 사용하여 ELISA로 1차 스크리닝 하는 단계;(c) primary screening the supernatant of the fusion hybridomas obtained in step (b) by ELISA using the antigen prepared in step (b);

(d) PWN-감염 소나무(PWNIPTs)로부터 목재 펠릿을 수집하고, PBS 추출액으로 추출하는 단계;(d) collecting wood pellets from PWN-infected pine trees (PWNIPTs) and extracting with PBS extract;

(e) 상기(c)단계에서 1차 스크리닝된 하이브리도마 계통을 상기(d)단계에서 얻어진 PBS 추출액을 항원으로 사용하여 ELISA로 2차 스크리닝 하고, 단일 세포 복제를 위해 OD(optical density)를 기준으로 클론을 선택하는 단계; 및(e) Hybridoma strain first screened in step (c) is secondly screened by ELISA using the PBS extract obtained in step (d) as an antigen, and OD (optical density) Selecting a clone by reference; And

(f)(e)단계에서 선택된 클론에 대하여 제한된 희석을 수행한 후, 상기(d)단계에서 얻어진 PBS 추출액을 항원으로 사용하여 ELISA로 3차 스크리닝 하여 단일클론항체를 선별하는 단계;(f) performing a limited dilution on the clone selected in step (e), and then screening the monoclonal antibody by ELISA using the PBS extract obtained in step (d) as an antigen;

를 포함하는 PWN-감염 소나무 검출용 단일클론항체의 제조방법에 관한 것이다.To a method for producing a monoclonal antibody for detecting PWN-infected pines.

본 연구에서는 EXPB3에 대한 융합 하이브리도마 라이브러리를 분비하는 단일 클론 항체(Mab)를 구축하여 PWN-감염 소나무(PWNIPTs)를 선택적으로 인식하는 Mab를 선별 하였다. 또한 한국의 9 개 지역에서 수집 된 다양한 PWNIPT를 사용하여 Mab의 특이성과 민감성을 확인하였다In this study, Mabs selectively recognizing PWN-infected pine (PWNIPTs) were constructed by constructing a monoclonal antibody (Mab) that secretes a fusion hybrid library for EXPB3. In addition, the specificity and sensitivity of Mab were confirmed using various PWNIPTs collected in 9 Korean regions

상기 단일클론항체의 제조방법에 있어서, 상기(a)단계에서 펩타이드 설계에 의해 얻어진 펩타이드의 서열은 42-CGLDIANLSAGVSSKLFD-59 및 141-KPATITYLKCSDTTPTTNC-150일 수 있다.In the method for producing the monoclonal antibody, the sequence of the peptide obtained by the peptide design in the step (a) may be 42-CGLDIANLSAGVSSKLFD-59 and 141-KPATITYLKCSDTTPTTNC-150.

상기(d)단계에서 PWN-감염 소나무(PWNIPTs)로부터 목재 펠릿의 수집은 2개 이상 지역의 소나무에서 수행되는 것이 바람직하다. 구체적으로 본 발명에서는, 하기 표 1 내지 3에 나타낸 바와 같이, 한국의 9 개 지역 목재 펠릿 수집기(FJ Technology Co., LTD, Seoul., Korea)를 이용하여 PWNIPT 74 개와 healthy pine trees(HPT) 22 개로부터 목재 펠릿를 수집하여 사용하였다. Collection of wood pellets from PWN-infected pine trees (PWNIPTs) in step (d) is preferably carried out in two or more pine trees. Specifically, in the present invention, as shown in Tables 1 to 3, 74 PWNIPTs and healthy pine trees (HPT) 22 using a 9-region wood pellet collector (FJ Technology Co., Ltd., Seoul, Korea) Wood pellets were collected from dogs and used.

Figure pat00001
Figure pat00001

Figure pat00002
Figure pat00002

Figure pat00003
Figure pat00003

본 발명의 단일클론항체의 제조방법에 있어서, In the method for producing a monoclonal antibody of the present invention,

상기(d)단계에서 추출은 PBS 용액을 목재 펠렛과 혼합하고 실온에서 인큐베이션하는 방법으로 수행될 수 있으며, 상기 PBS 용액과 목재 펠렛은 1:0.5~0.5:1의 중량비로 혼합되며, 인규베이션 시간은 3~20분인 것이 바람직하다. The extraction in step (d) may be performed by mixing the PBS solution with the wood pellet and incubating at room temperature. The PBS solution and the wood pellet are mixed at a weight ratio of 1: 0.5 to 0.5: 1, and the incubation time Is preferably 3 to 20 minutes.

본 발명은 또한, The present invention also relates to

(1) PWN-감염 의심 소나무로부터 목재 펠릿을 수집하는 단계; 및(1) collecting wood pellets from PWN-suspect pine trees; And

(2) 상기(1)단계에서 수집된 목재 펠릿을 PBS 추출액으로 추출하는 단계;(2) extracting the wood pellets collected in the step (1) with PBS extract;

를 포함하는 PWN-감염 검사용 추출액의 제조방법에 관한 것이다. And a method for producing the extract for PWN-infection test.

상기(2)단계에서 추출은 PBS 용액을 목재 펠렛과 혼합하고 실온에서 인큐베이션하는 방법으로 수행되는 것이 바람직하다. The extraction in the step (2) is preferably carried out by mixing the PBS solution with the wood pellet and incubating at room temperature.

상기 PBS 용액과 목재 펠렛은 1:0.5~0.5:1의 중량비로 혼합되며, 인규베이션 시간은 3~20분인 것이 바람직하다. The PBS solution and the wood pellets are mixed at a weight ratio of 1: 0.5 to 0.5: 1, and the incubation time is preferably 3 to 20 minutes.

본 발명은 또한, The present invention also relates to

PWN-감염 검사용 단일클론항체인 EXPB3-Mab-3-1-H3-C11-E4(EXPB3-C11-E4)를 제공한다. EXPB3-Mab-3-1-H3-C11-E4 (EXPB3-C11-E4) which is a monoclonal antibody for PWN-infection test.

상기 EXPB3-Mab-3-1-H3-C11-E4(EXPB3-C11-E4)는 상기 본 발명의 방법으로 제조될 수 있다. EXPB3-Mab-3-1-H3-C11-E4 (EXPB3-C11-E4) can be prepared by the method of the present invention.

본 발명은 또한,The present invention also relates to

(A) PWN-감염 의심 소나무로부터 목재 펠릿을 수집하는 단계; 및(A) collecting wood pellets from PWN-suspect pine trees; And

(B) 상기(A)단계에서 수집된 목재 펠릿을 PBS 추출액으로 추출하는 단계; 및(B) extracting the wood pellets collected in the step (A) with a PBS extract; And

(C) 제9항의 PWN-감염 검사용 단일클론항체인 EXPB3-Mab-3-1-H3-C11-E4(EXPB3-C11-E4)와 상기(B)단계의 PBS 추출액을 사용하여 ELISA를 실시하는 단계;(C) An ELISA was carried out using the EXPB3-Mab-3-1-H3-C11-E4 (EXPB3-C11-E4) as the monoclonal antibody for PWN-infection test of paragraph 9 and the PBS extract of step (B) ;

를 포함하는 PWN-감염 검사방법에 관한 것이다.And a method for testing PWN infection.

이하에서, 실시예를 통하여 본 발명을 보다 상세히 설명한다. 그러나, 하기의 실시예는 본 발명을 더욱 구체적으로 설명하기 위한 것으로서, 본 발명의 범위가 하기의 실시예에 의하여 한정되는 것은 아니다. 하기의 실시예는 본 발명의 범위 내에서 당업자에 의해 적절히 수정, 변경될 수 있다. Hereinafter, the present invention will be described in more detail by way of examples. However, the following examples are intended to further illustrate the present invention, and the scope of the present invention is not limited by the following examples. The following examples can be appropriately modified and changed by those skilled in the art within the scope of the present invention.

1. 실시예1. Example

(1)(One) 항원에 대한 펩타이드의 표적 단백질 식별 및 합성Identification and synthesis of target proteins of peptides against antigens

이전 연구에서 본 발명자들은 ExpansinB3(EXPB3)이 PWN의 전파 및 분산 단계에서 고도로 발현되었다고 보고했다(Lee et al., 2012). EXPB3의 아미노산 서열은, GeneDB(http://www.genedb.org/Homepage/Bxylophilus) 및 NCBI Blast(https://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi)의 B. xylophilus 데이터베이스를 사용하여 blast하는데 사용되었다. Blast 결과에 기초하여, PWN 및 다른 선충종의 다양한 EXP 동족체에 대한 아미노산 서열 불일치를 나타내는 2 개의 펩타이드가 설계되었다. 합성된 2 개의 펩타이드의 서열은 42-CGLDIANLSAGVSSKLFD-59 및 141-KPATITYLKCSDTTPTTNC-150이었다. 두 펩타이드는 keyhole limpet hemocyanin(KLH)과 접합시킨 다음, 4 개의 Balb / C 쥐들을 면역시키기 위한 항원으로 사용되었다.In a previous study, the present inventors reported that ExpansinB3 (EXPB3) was highly expressed in the propagation and dispersion steps of PWN (Lee et al., 2012). The amino acid sequence of EXPB3 can be found in the B. xylophilus database of GeneDB (http://www.genedb.org/Homepage/Bxylophilus) and NCBI Blast (https://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi) Used to blast. Based on the Blast results, two peptides were designed that exhibit amino acid sequence mismatches for various EXP homologues of PWN and other nematode species. The sequences of the two peptides synthesized were 42-CGLDIANLSAGVSSKLFD-59 and 141-KPATITYLKCSDTTPTTNC-150. Two peptides were conjugated with keyhole limpet hemocyanin (KLH) and then used as an antigen to immunize four Balb / C mice.

(2) EXPB3 특이 단일 클론 항체 면역 및 1 차 스크리닝(2) EXPB3-specific monoclonal antibody immunization and primary screening

실험을 구성하는 융합 하이브리도마 세포주는 한림 대학교의 실험 동물 윤리위원회에 의해 승인되었다(No. HMC2016-00622-7). 본 발명자들은 Lee et al.에서 사용 된 표준 단일 클론 항체 생성 프로토콜을 따랐다(Lee et al., 2011). 2 개의 펩타이드 항원을 인식하는 융합 하이브리도마의 상층액을 ELISA(enzyme linked immunosorbent assay)를 사용하여 스크리닝 하였다. 항원 펩타이드(0.1 ㎍ / ㎖)를 사용하여 96-well plate를 코팅 한 다음, PBS에 5.0 % 비 지방 건조 우유로 실온(RT)에서 1 시간 동안 흔들어 블로킹시켰다. PBS(PBST)의 0.1 % Triton X-100으로 3 회 세척 한 후, 1920 융합 하이브리도마 세포주의 상층액을 첨가하고 밤새 4 ℃에서 배양 하였다. PBST로 3 회 세척 한 후, Peroxidase 접합 anti-mouse IgG, A 및 M 항체(ThermoFisher Scientific, Waltham, MA, USA)를 적용하고 실온에서 2 시간 동안 배양하였다. 1단계 - Ultra TMB 용액(ThermoFisher Scientific)을 사용하여 Peroxidase 활성을 검출하였고, Epoch ELISA plate reader(Biotek, Winooski, VT, USA)를 사용하여 측정했다.Fusion hybrid hybridoma cell lines constituting the experiment were approved by the Laboratory Animal Ethics Committee of Hallym University (No. HMC2016-00622-7). The present inventors followed the standard monoclonal antibody production protocol used in Lee et al. (Lee et al., 2011). The supernatants of the fusion hybridomas recognizing the two peptide antigens were screened using an enzyme linked immunosorbent assay (ELISA). The 96-well plate was coated with the antigen peptide (0.1 μg / ml) and then blocked by shaking for 1 hour at room temperature (RT) with 5.0% nonfat dry milk in PBS. After washing three times with 0.1% Triton X-100 in PBS (PBST), the supernatant of the 1920 fusion hybridoma cell line was added and incubated overnight at 4 ° C. After washing three times with PBST, peroxidase conjugated anti-mouse IgG, A and M antibodies (ThermoFisher Scientific, Waltham, MA, USA) were applied and incubated at room temperature for 2 hours. Step 1 - Peroxidase activity was detected using Ultra TMB solution (ThermoFisher Scientific) and measured using Epoch ELISA plate reader (Biotek, Winooski, VT, USA).

(3) 목재 펠릿 수집 및 추출물 제조(3) Manufacture of wood pellets and extracts

한국의 9 개 지역 또는 3 개 지역에서 목재 펠릿 수집기(FJ Technology Co., LTD, Seoul., Korea)를 이용하여 PWNIPT 74 개와 healthy pine trees(HPT) 22 개로부터 목재 펠릿을 수집하였다(표1). 수집 된 목재 펠릿을 즉시 실험실로 옮긴 다음 사용하기 전까지 4℃에서 냉장 보관했다.Wood pellets were collected from 74 PWNIPT and 22 healthy pine trees (HPT) using a wood pellet collector (FJ Technology Co., LTD, Seoul, Korea) in 9 regions or 3 regions of Korea (Table 1) . The collected wood pellets were immediately transferred to the laboratory and refrigerated at 4 ° C until use.

최적의 추출 용액을 결정하기 위해 본 발명자들은 dH2O를 단독으로 사용하거나 0.1 % Triton X-100(H2OT)과 함께 사용했다. 그리고 인산염 완충 식염수(PBS, 0.01M 인산 나트륨, 0.154 M NaCl, pH 7.2)를 단독으로 사용하거나 0.1 % Triton X-100(PBST)과 함께 사용했다. 4 가지 추출 용액 총 5ml를 목재 펠렛 0.5g과 혼합하고 실온에서 5 분 동안 인큐베이션 한 다음, 찌꺼기를 피하기 위해 용액을 조심스럽게 부었다. 용액 중에서 PBS 추출물은 선택된 다른 상층액에 보다 높은 면역 반응을 나타냈다(도 1). 따라서, 본 연구에서는 PBS를 추출액으로 사용하여 다른 모든 실험을 수행하였다.To determine the optimal extraction solution, we used dH 2 O alone or in combination with 0.1% Triton X-100 (H 2 OT). And either phosphate buffered saline (PBS, 0.01 M sodium phosphate, 0.154 M NaCl, pH 7.2) was used alone or in combination with 0.1% Triton X-100 (PBST). A total of 5 ml of the four extraction solutions was mixed with 0.5 g of wood pellets and incubated at room temperature for 5 minutes and then the solution was poured carefully to avoid debris. The PBS extract in solution showed a higher immune response to other selected supernatants (Figure 1). Therefore, in this study, all other experiments were performed using PBS as an extract.

도 1에 나타낸 바와 같이, EXPB3-Mabs는 PBS 추출물에 상대적으로 높은 면역 반응성을 나타냈다. H2O, 1.0 % Triton X-100(H2OT)을 함유 한 H2O 또는 1.0 % Triton X-100(PBST) 추출물을 갖는 PBS와 비교하여, PBS 추출물은 높은 광학 밀도(OD)를 나타내었다. 제주도, 변산과 전라북도 익산에서 얻은 두 PWNIPT의 PBS 추출물은 다른 추출물보다 높은 OD 값을 보였다. 그러나 경남 의령의 PWNIPT에서 추출한 H2O 추출물의 OD 값은 더 높았다.As shown in Fig. 1, EXPB3-Mabs showed relatively high immunoreactivity with PBS extract. Compared to PBS with H 2 O or 1.0% Triton X-100 (PBST) extracts containing H 2 O, 1.0% Triton X-100 (H 2 OT), PBS extracts showed high optical density . The extracts of the two PWNIPT extracts from Jeju Island, Songsan and Iksan, Jeollabukdo showed higher OD values than the other extracts. However, the OD value of H 2 O extracts extracted from PWNIPT of Gyeongnam Province was higher.

(4) 74 PWN에 감염된 소나무의 PBS 추출물을 이용한 2 차 스크리닝(4) Second screening of 74 PWN-infected pines with PBS extract

상기(1)에서 선택된 96 개의 하이브리도마 계통을 면역원으로서 74 PWNIPT의 PBS 추출물을 사용하는 것을 제외하고는 동일한 방법으로 2차 스크리닝을 하였다. 이 스크리닝은 세 번의 반복으로 수행되었다. 단일 세포 복제를 위해 높은 OD를 가진 12 개의 클론을 선택했다.The 96 hybrid hybrid lines selected in (1) above were subjected to secondary screening in the same manner, except that 74 PWNIPT PBS extract was used as an immunogen. This screening was performed in three replicates. Twelve clones with high OD were selected for single cell replication.

(5) 제한 희석에 의한 단일 세포 복제(5) Single cell replication by limiting dilution

앞서 언급한 바와 같이 혼합 PWNIPT 에서 더 높은 OD를 나타내는 12개의 하이브리도마 계통 중 단일 세포 클론을 수득하기 위해 제한된 희석이 수행되었다(Lee et al., 2011). 제한된 희석 클론으로부터의 상등액을 74 PWNIPT 중 혼합 PBS 추출물을 사용하여 스크리닝 하였다. 한국의 3 개 지역에서 생산된 22 개의 건강한 소나무(HPT)의 PBS 추출물을 모아 대조군으로 사용하였다. 74 개의 PWNIPT의 혼합 PBS 추출물에 대한 각각의 Mab의 OD를 동일한 Mab의 OD에 의해 22 개의 HPT의 혼합 PBS 추출물에 대해 표준화시켰다. 방정식은 다음과 같다: As mentioned earlier, a limited dilution was performed to obtain a single cell clone out of 12 hybridoma strains showing higher OD in the mixed PWNIPT (Lee et al., 2011). The supernatant from the limited dilution clones was screened using mixed PBS extracts of 74 PWNIPT. Twenty - two healthy pine tree (HPT) PBS extracts from three Korean regions were collected and used as a control. The OD of each Mab for the mixed PBS extract of 74 PWNIPTs was normalized to the mixed PBS extract of 22 HPTs by the OD of the same Mab. The equation is as follows:

정규화 된 특이성 =(74 PWNIPT의 혼합 PBS 추출물의 OD - 22 HPT의 혼합 PBS 추출물의 OD) / 22 HPT의 혼합 PBS 추출물의 ODNormalized specificity = (OD of OD-22 HPT mixed PBS extract of 74 PWNIPT OD of PBS extract / 22 OD of mixed PBS extract of HPT)

(6) EXPB3-Mab-3-1-H3-C11 ~ 74 PWNIPT의 표준화 된 특이성 측정(6) EXPB3-Mab-3-1-H3-C11-74 Standardized specificity measurement of PWNIPT

EXPB3-Mab-3-1-H3-C11은 희석이 제한적이었으며, EXPB3-Mab-3-1-H3-C11-E4(EXPB3-C11-E4)가 PWNIPT의 혼합 PBS 추출물에 대해 가장 강한 반응성을 가짐을 발견했다(도 3). 지역 및 감염 단계에 따라 PWNIPT 사이에 알려지지 않은 변이가 있을 수 있기 때문에 한국의 9 개 지역에서 나온 74 개의 PWNIPT의 PBS 추출물을 사용했다. 하이브리도마 세포 배양 배지를 대조군 및 백그라운드 신호로 사용 하였다. 74 개의 PWNIPT를 사용하여 선택된 하이브리도마 계통을 추가로 스크리닝하였다. 이 연구에서는 붉은 소나무 42 그루와 검은 소나무 32 그루의 목재 펠릿을 사용했다(표 1~3). 연구에 사용 된 소나무에서 PWD의 진행 범위는 육안 검사와 PWN의 존재에 의해 정상(0)에서 완전소멸(6)까지 분포되어 있다. 또한, 감염된 나무의 둘레는 지상 1.2m에서 측정되었으며 상관 분석을 위해 사용되었다(표 1~3).EXPB3-Mab-3-1-H3-C11 had limited dilution and EXPB3-Mab-3-1-H3-C11-E4 (EXPB3-C11-E4) had the strongest reactivity to mixed PBS extract of PWNIPT (Fig. 3). Because there may be unknown variations between PWNIPTs depending on area and stage of infection, we used 74 PWNIPT PBS extracts from nine Korean regions. Hybridoma cell culture media were used as control and background signals. The selected hybridoma lines were further screened using 74 PWNIPTs. In this study, 42 red pine trees and 32 black pine wood pellets were used (Tables 1-3). The range of progression of PWD in the pine trees used in the study is distributed from normal (0) to complete disappearance (6) by visual inspection and presence of PWN. In addition, the perimeter of infected trees was measured at 1.2 m above the ground and used for correlation analysis (Tables 1-3).

(7) 통계 분석(7) Statistical analysis

그룹 간의 차이점은 Excel 프로그램(Microsoft, Redmond, WA, USA) 분산 분석(ANOVA)을 사용하여 분석되었다. Tukey-Kramer 사후 분석은 Excel 프로그램(Microsoft)을 사용하여 그룹 간의 차이를 확인하기 위해 수행되었다. 광학 밀도, 질병 진행도 및 지상 1.2m에서의 나무 둘레의 피어슨 상관 계수는 Excel 프로그램(Microsoft)을 사용하여 계산되었다.Differences between groups were analyzed using an Excel program (Microsoft, Redmond, WA, USA) ANOVA. Tukey-Kramer post-mortem analysis was performed using an Excel program (Microsoft) to identify differences between groups. Optical density, disease progression and tree perimeter Pearson correlation coefficients at 1.2 m above ground were calculated using the Excel program (Microsoft).

2. 실험결과2. Experimental results

(1) 항원 펩타이드를 이용한 1 차 스크리닝에 의해 EXPB3 항체를 분비하는 96 개의 하이브리도마 계통을 확인하였다.(1) 96 hybrid hybridomas secreting EXPB3 antibody were identified by primary screening using antigenic peptides.

1,920 융합 하이브리도마 계통을 포함하는 EXPB3 단일 클론 항체(Mab) 라이브러리는 PWNIPT를 인식하는 Mab 스크리닝을 위해 생성되었다. 1 차 스크리닝은 ELISA에 의해 항원으로 사용 된 Mab를 인식하는 EXPB3 펩타이드를 분비하는 융합 하이브리도마 계통을 찾기 위해 수행되었다. 플레이트 사이에 약간의 차이가 있기 때문에 각 플레이트에서 가장 높은 OD를 사용하여 각 96 플레이트의 OD를 표준화 했다. ELISA에서 얻은 정규화 된 OD의 컷오프 값은 각 플레이트의 최고 OD의 40 % 이상이었다. 1 차 스크리닝 후, 96 개의 융합 세포를 추가 연구를 위해 선택 하였다(도 1).The EXPB3 monoclonal antibody (Mab) library containing 1,920 fused hybridoma lines was generated for Mab screening to recognize PWNIPT. The primary screening was performed by ELISA to find a fusion hybridoma line that secretes the EXPB3 peptide recognizing the Mab used as an antigen. Because there is a slight difference between the plates, the OD of each 96 plate was standardized using the highest OD on each plate. The cut-off value of the normalized OD obtained in the ELISA was at least 40% of the highest OD of each plate. After primary screening, 96 fusion cells were selected for further study (Figure 1).

(2) PBS는 EXPB3-Mabs 항원을 추출하기에 적합한 용액이었다(2) PBS was a solution suitable for extracting EXPB3-Mabs antigen

항원을 가장 효율적으로 추출 할 수 있는 용액을 선택하는 것은 진단 기술 개발의 중요한 단계 중 하나이다. 특히 건강 또는 환경 유해 화학 물질이 포함되지 않은 추출 용액을 선택하는 것이 중요하다. 왜냐하면 용액에 사람이나 환경에 유해한 물질이 포함되어있는 경우 현장에서 사용되는 진단 방법이 문제가 될 수 있기 때문이다. 그러므로 0.1 % Triton X-100을 포함하거나 포함하지 않은 dH2O와 PBS를 선택했다. Triton X-100의 LD50은 쥐에게 경구 투여시 1,800 mg / kg이다(MSDS, 2013). 따라서 용액에 0.1 % Triton X-100을 첨가해도 사람과 다른 야생 동물에 심각한 독성을 일으키지 않는다.Choosing a solution that can extract the most efficient antigen is one of the important steps in the development of diagnostic technology. It is especially important to select extraction solutions that do not contain health or environmentally hazardous chemicals. This is because diagnostic methods used in the field can be a problem if the solution contains substances harmful to humans or the environment. Therefore, we selected dH 2 O and PBS with or without 0.1% Triton X-100. LD50 of Triton X-100 is 1,800 mg / kg orally for rats (MSDS, 2013). Therefore, the addition of 0.1% Triton X-100 to the solution does not cause serious toxicity to humans and other wildlife.

네 가지 EXPB3-Mab3-1-H3-C11 서브 클론을 사용하여 4 가지 추출물로 ELISA를 수행하여 4 가지 용매의 추출 효율을 비교했다(도 1). 4 개의 EXPB3-Mab 중 EXPB3-Mab-3-1-H3-C11-E3 및 -E4는 2개의 다른 Mab과 비교했을 때 OD가 높았다. OD는 4개의 Mab간에 차이가 있었지만 4 가지 추출 용액 및 3 가지 PWNIPT와 비슷한 OD 경향을 보였다. 제주도, 변산(Pyeoson) 및 전라북도 익산의 PWNIPT에서 추출한 PBS 추출물은 H2O, H2OT, PBST 추출물과 비교했을 때 상대적으로 높은 OD를 보였다. 그러나 경남 의령의 PWNIPT에서 추출한 dH2O는 다른 추출물보다 높은 OD를 보였다(도 1). 이 결과는 PBS가 PWNIPT로부터 항원을 추출하는데 적합하다는 것을 시사한다.Four extracts were subjected to ELISA using four EXPB3-Mab3-1-H3-C11 subclones to compare extraction efficiencies of four solvents (Fig. 1). EXPB3-Mab-3-1-H3-C11-E3 and -E4 of the four EXPB3-Mabs had a higher OD compared to the two other Mabs. The OD showed a similar OD trend to the four extract solutions and the three PWNIPTs, although there was a difference between the four Mabs. Compared with H 2 O, H 2 OT and PBST extracts, PBS extracts from PWNIPT of Jeju, Pyeoson and Iksan, Jeollabukdo showed relatively high OD. However, dH 2 O extracted from PWNIPT of Gyeongnam Nuclear Plant showed OD higher than other extracts (Fig. 1). These results suggest that PBS is suitable for extracting antigen from PWNIPT.

(3) 9 개의 하이브리도마 계통은 PWN-감염 소나무의 PBS 추출물에 특이성을 보였다.(3) Nine hybridoma strains showed specificity for PBS extract of PWN-infected pine.

PWNIPT의 PBS 추출물을 사용하여 96 개의 선택된 하이브리도마 계통 중 PWNIPT를 인식 할 수 있는 Mab를 분비하는 하이브리도마 계통을 확인하기 위해 ELISA에 의해 각 하이브리도마의 특이성을 분석 하였다. PWN 9 개 지역(표 1~3 및 도 4)에서 42 개의 붉은 소나무와 32 개의 검은 소나무를 포함하는 74 개의 PWNIPT를 얻었다. 74 개의 PWNIT에서 PBS 추출물을 모아 2 차 스크리닝에 사용했다. 96 개의 하이브리도마 계통의 OD는 OD가 가장 높은 EXPB3-Mab-3-3-D9를 사용하여 표준화 하였다. 9 개의 하이브리도마 계통은 0.2보다 큰 정규화 된 OD 값을 나타냈다(도 2).The specificity of each hybridoma was analyzed by ELISA to identify the hybridoma lines that secrete PWNIPT - recognizable Mabs among 96 selected hybridoma lines using PWNIPT 's PBS extract. 74 PWNIPTs, including 42 red pines and 32 black pines, were obtained in 9 PWN regions (Tables 1-3 and 4). PBS extracts were collected from 74 PWNITs and used for secondary screening. ODs of 96 hybridoma lines were standardized using EXPB3-Mab-3-3-D9, which has the highest OD. Nine hybridoma lines showed normalized OD values of greater than 0.2 (Figure 2).

(4) EXPB3-Mab-3-3-D9 및 -3-3-H3의 단일 클론은 PWNIPT에 대한 높은 표준화 특이성을 가진다.(4) The single clones of EXPB3-Mab-3-3-D9 and -3-3-H3 have a high standardization specificity for PWNIPT.

단일 세포 클론을 확립하기 위해, OD 값이 0.2 이상인 9 개 라인을 포함한 13 개 라인의 세포가 96 웰 플레이트에서 제한된 희석 정도를 보였다. 96 개 웰의 상등액을 표준화 된 특이성을 계산하기 위해 74 개의 PWNIPT와 22 개의 HPT의 합성 PBS 추출물을 사용하여 스크리닝 하였다. 조사한 13 개의 계통 중 EXPB3-Mab-3-1-C9 및 -3-2-G11 계통의 2 계통 분열이 실패하여 ELISA를 수행 할 수 없었다. EXPB3-Mab-3-2-E1, EXPB3-Mab3-2-G9, EXPB3-Mab-3-2-F1, EXPB3-Mab-3-2-E1 및 EXPB3-Mab를 포함하는 5 개의 하이브리도마 계통의 단일 세포 클론 -3-1-G4는 매우 낮은 표준화 특이성(<1.0)을 보였다(도7, E). EXPB3-Mab-3-1-C3, EXPB3-Mab-3-1-F4, EXPB3-Mab-3-1-A5 및 EXPB3-Mab-3-2-E9로부터 단일 세포 클론은 1.04 ~ 2.46 범위의 표준화된 특이성을 보였다(도 6 및 7의A-D). EXPB3-Mab-3-3-D9(EXPB3-D9)와 EXPB3-Mab-3-1-H3(EXPB1-H3) 두 줄의 단일 클론은 다른 줄의 단일 클론보다 더 높은 표준화 특이성을 보였다(도 3). EXPB3-D9 및 EXPB1-H3의 단일 세포 클론 중 3 개는 3.4 이상의 정규화 된 특이성을 가졌다. 그 클론은 이후 연구에 사용되었다.To establish a single cell clone, 13 lines of cells, including 9 lines with an OD value of 0.2 or greater, showed limited dilution in 96 well plates. 96 wells of supernatant were screened using 74 PWNIPT and 22 HPT synthetic PBS extracts to calculate standardized specificity. Of the thirteen strains examined, two strains of EXPB3-Mab-3-1-C9 and -3-2-G11 strains failed and ELISA could not be performed. Five hybridoma lines containing EXPB3-Mab-3-2-E1, EXPB3-Mab3-2-G9, EXPB3-Mab-3-2-F1, EXPB3-Mab-3-2-E1 and EXPB3- Of the single cell clone -3-1-G4 showed very low standardization specificity (< 1.0) (Fig. 7, E). Single cell clones from EXPB3-Mab-3-1-C3, EXPB3-Mab-3-1-F4, EXPB3-Mab-3-1-A5 and EXPB3- (AD of Figures 6 and 7). A single clone of two lines of EXPB3-Mab-3-3-D9 (EXPB3-D9) and EXPB3-Mab-3-1-H3 (EXPB1-H3) showed a higher standardization specificity than the other line of single clone ). Three of the single cell clones of EXPB3-D9 and EXPB1-H3 had a normalized specificity of 3.4 or greater. The clone was used in subsequent studies.

도 3은 두 EXPB3 하이브리도마 클론의 제한된 희석 결과를 나타낸다. 즉, 13 개의 EXPB3 하이브리도마 계통으로부터 단일 클론을 선택하기 위해, 제한된 희석이 수행되었다(A). EXPB3 - Mab - 3-1 - D9에서 제한 희석 세포에서 60개, 상등액의 정규화된 특이성(B) EXPB3 - Mab - 3-1 - H3에서 제한 희석 세포에서 48개, 상등액의 정규화된 특이성. 추가 분석을 위해 각 계통의 세 클론을 선택했다.Figure 3 shows the results of limited dilution of two EXPB3 hybridomas clones. That is, to select a single clone from 13 EXPB3 hybridoma lines, a limited dilution was performed (A). EXPB3 - Mab - 3-1 - normalized specificity of supernatant in limiting dilution cells in D9, (B) normalized specificity of 48 supernatants in limiting dilution cells in EXPB3 - Mab - 3-1 - H3. Two clones of each strain were selected for further analysis.

(5) EXPB3 항체에 의해 밝혀진 PWNIPT의 변이(5) Variations of PWNIPT revealed by EXPB3 antibody

이 발명의 연구에서 사용 된 PWNIPT의 질병 진행 정도는 펠렛 수확 시 나무의 외부 특성에 의해서만 결정되었다. 따라서 각 소나무의 상세한 감염 기간이나 생리적 변화에 관한 정보는 없다. 본 발명자들은 개발 된 EXPB3-Mab-3-1-H3-C11-E4(EXPB3-C11-E4)를 사용하여 9 개의 서로 다른 위치에서 수집 된 74 개의 PWNIPT 각각에 존재하는 항원의 양을 측정했다(도 4A).The degree of disease progression of PWNIPT used in the study of the present invention was determined only by the external properties of the tree upon pellet harvesting. Therefore, there is no information about the detailed infection period or physiological change of each pine tree. We measured the amount of antigen present in each of the 74 PWNIPTs collected at 9 different sites using the developed EXPB3-Mab-3-1-H3-C11-E4 (EXPB3-C11-E4) 4A).

붉은 소나무의 EXPB3-C11-E4의 OD 값을 검은 소나무의 OD 값과 비교하여 검은 소나무의 OD 값이 붉은 소나무 값보다 통계적으로 유의하게 높다는 것을 발견했다(도 4B). 제주도의 3 개 지역에서 수집 된 검은 소나무는 한국의 5 개 지역에서 수집 된 32 개의 검은 소나무를 비교할 때 본토 지역보다 높은 OD를 갖는 경향이 있었다(도 4C). 그러나 한국의 7 개 지역에서 수집 된 42 개의 붉은 소나무는 통계적으로 유의 한 차이가 없었다(도 4D).The OD value of EXPB3-C11-E4 of red pine was compared with the OD value of black pine, and the OD value of black pine was found to be statistically higher than that of red pine (Fig. 4B). Black pines collected from three regions of Cheju Island tended to have OD higher than those of the mainland when comparing 32 black pines collected in five regions of Korea (Fig. 4C). However, there were no statistically significant differences in the 42 red pines collected from seven regions of Korea (Fig. 4D).

붉은 소나무의 OD와 질병 진행 정도 사이에는 상관 관계가 없었다(Pearson correlation coefficient = -0.174). 그러나 지상 1.2 미터 위의 나무 둘레와 OD 사이뿐만 아니라 지면 1.2 미터의 나무 둘레와 질병 진행 정도에는 낮은 상관 관계가 있었다(피어슨 상관 계수: - 0.21529 및 0.34562). 대조적으로 지면 1.2m 높이에서 나무의 외경과 OD는 물론 OD와 질병 진행 정도 사이에 높은 상관 관계가 있었다(피어슨 상관 계수: 0.49583과 0.43023). 그러나 검은 소나무에 대한 지표의 1.2m(Pearson 상관 계수: -0.21069)에서의 질병 진행 정도와 나무 둘레의 상관 관계는 낮았다. 이 분석의 결과는 개별 검은 소나무의 종, 분포 지역 및 발달 단계에 따라 EXBP3-Mab 반응성에 차이가 있음을 시사했다.There was no correlation between the OD of the red pines and disease progression (Pearson correlation coefficient = -0.174). However, there was a low correlation between tree circumference (1.2 m above the ground) and OD (1.2 m above the ground) and disease progression (Pearson correlation coefficients: - 0.21529 and 0.34562). In contrast, there was a high correlation between OD and OD and disease progression at 1.2 m above ground (Pearson correlation coefficient: 0.49583 and 0.43023). However, the correlation between the degree of disease progression and the tree circumference at 1.2 m (Pearson correlation coefficient: -0.21069) on the black pines was low. The results of this analysis suggest that there is a difference in EXBP3-Mab reactivity depending on species, distribution area and stage of development of individual black pine trees.

3. 결과 토의3. Results Discussion

이 연구의 주요 목표는 현장에서 PWNIPT의 신속한 진단에 사용될 수 있는 EXPB3-Mab의 어레이를 생성하고 정확한 진단을 완료하기 위해 목재 펠릿을 수집하는 방법을 확립하는 것이다. 이 목표를 달성하기 위해 먼저 PWNIPT의 펠릿에서 항원을 가장 효율적으로 추출 할 수 는 적합한 용액을 확인했다. 가장 구체적인 MAB를 확인하기 위해 PWNIPT의 PBS 추출물을 사용했다. EXPB3-Mabs는 PWNIPT의 PBS 추출물에 대한 높은 반응성뿐만 아니라 HPBs의 PBS 추출물에 대한 낮은 반응성을 사용하여 EXPB3-Mabs의 정확도와 민감도를 증가시키기 위해 스크리닝되었다. 따라서 EXPB3-Mabs는 PWNIPT에 대한 높은 특이성 및 민감도를 가지는 방법론으로 계산된 정규화된 민감도를 기반으로 선택되었다. PWNIPT에서 PWN을 검출하는 방법에 대한 다른 연구 보고서가 발표된 이래 PWNIPT는 육상 1.3m 높이의 트렁크 나무 판이나 쥐똥 나무에서 수집되었다(Magnusson et al., 2007; Schroder et al., 2009). 본 발명자들은 한국 성인의 신체적 특성을 고려하여 샘플링 위치가 지상 1.2 m에 위치하도록 하였다. 이 방법론은 현장에서의 적용 가능성을 높이기 위해 모든 샘플에 유사하게 적용되었다.The main goal of this study is to establish a method for collecting wood pellets to generate an array of EXPB3-Mabs that can be used for rapid diagnosis of PWNIPT in situ and to complete an accurate diagnosis. To achieve this goal, we first identified a suitable solution to extract the antigen most efficiently from the PWNIPT pellet. A PBS extract of PWNIPT was used to identify the most specific MAB. EXPB3-Mabs were screened to increase the accuracy and sensitivity of EXPB3-Mabs using high reactivity to PBS extracts of PWNIPT as well as low reactivity to PBS extracts of HPBs. Thus, EXPB3-Mabs was selected based on the normalized sensitivity calculated by a methodology with high specificity and sensitivity to PWNIPT. PWNIPT has been collected from trunk wood pellets or pellets of 1.3 m in height since the publication of another research report on PWN detection in PWNIPT (Magnusson et al., 2007; Schroder et al., 2009). The present inventors have set the sampling position to be 1.2 m above the ground in consideration of the physical characteristics of Korean adults. This methodology has been applied similarly to all samples to increase applicability in the field.

본 발명의 연구에 따르면, 조사한 PWNIPT 중 검은 소나무가 붉은 소나무보다 EXPB3-Mabs에 대해 통계적으로 유의하게 더 높은 반응성을 보였다(도 4B). 또한, 검은 소나무에 대한 반응성은 질병의 진행 정도와 나무의 둘레와 중요한 상관 관계를 보였다. 이 결과는 붉은 소나무와 달리 EXPB3-C11-E4 항체에 대한 반응성에 의해 검은 소나무에서의 PWD 진행이 예측 될 수 있음을 시사한다.According to the study of the present invention, black pine trees showed significantly higher reactivity to EXPB3-Mabs than red pine trees (Fig. 4B). In addition, the reactivity to black pine trees showed a significant correlation with the degree of disease progression and the perimeter of trees. This result suggests that PWD progression in black pine can be predicted by reactivity to EXPB3-C11-E4 antibody, unlike red pine.

EXP는 식물체에 존재하는 효소이며 세포벽 이완을 매개하는데 중요한 역할을 하며 인접한 세포벽 다당류 사이의 접착을 감소시켜 정상적인 발달을 가능하게 한다(Marowa et al., 2016). 또한, 식물 기생 선충류의 EXPs는 식물의 EXPs와 유사한 기능을 가지고 있으며, 따라서 숙주 식물에 선충의 침입을 도울 수 있다(Qin et al., 2004). 이 연구에서 개발 된 EXP3-Mabs는 신속한 탐지 도구의 개발뿐만 아니라 소나무에서의 PWN의 침입과 번식 메커니즘을 연구하는 데 매우 귀중한 자료가 될 것으로 기대된다.EXP is an enzyme present in plants and plays an important role in mediating cell wall relaxation and allows for normal development by reducing adhesion between adjacent cell wall polysaccharides (Marowa et al., 2016). In addition, EXPs of plant parasitic nematodes have similar functions to those of plant EXPs and thus can help to invade nematodes in host plants (Qin et al., 2004). The EXP3-Mabs developed in this study are expected to be very valuable data for studying the invasion and breeding mechanism of PWN in pine trees as well as the development of rapid detection tools.

Claims (11)

(a) EXPB3의 아미노산 서열을 Bursaphelenchus xylophilus 유전자 데이터베이스를 사용하여 blast하여, PWN 및 다른 선충종의 EXP 동족체에 대한 아미노산 서열 불일치를 나타내는 펩타이드를 설계하는 단계;
(b) 상기(a)단계에서 설계된 펩타이드를 keyhole limpet hemocyanin(KLH)과 접합시킨 다음, 항원으로 사용하여 Balb / C 쥐들을 면역시켜서 융합 하이브리도마를 얻는 단계;
(c) 상기(b)단계에서 얻은 융합 하이브리도마의 상층액을 상기(b)단계에서 제조된 항원을 사용하여 ELISA로 1차 스크리닝 하는 단계;
(d) PWN-감염 소나무(PWNIPTs)로부터 목재 펠릿을 수집하고, PBS 추출액으로 추출하는 단계;
(e) 상기(c)단계에서 1차 스크리닝된 하이브리도마 계통을 상기(d)단계에서 얻어진 PBS 추출액을 항원으로 사용하여 ELISA로 2차 스크리닝 하고, 단일 세포 복제를 위해 OD(optical density)를 기준으로 클론을 선택하는 단계; 및
(f)(e)단계에서 선택된 클론에 대하여 제한된 희석을 수행한 후, 상기(d)단계에서 얻어진 PBS 추출액을 항원으로 사용하여 ELISA로 3차 스크리닝 하여 단일클론항체를 선별하는 단계;
를 포함하는 PWN-감염 소나무 검출용 단일클론항체의 제조방법.
(a) blending the amino acid sequence of EXPB3 with the Bursaphelenchus xylophilus gene database to design a peptide that exhibits amino acid sequence mismatch for PWN and EXP homologues of other nematode species;
(b) binding the peptide designed in step (a) with keyhole limpet hemocyanin (KLH) and then immunizing Balb / C rats using the peptide as an antigen to obtain a fusion hybridoma;
(c) primary screening the supernatant of the fusion hybridomas obtained in step (b) by ELISA using the antigen prepared in step (b);
(d) collecting wood pellets from PWN-infected pine trees (PWNIPTs) and extracting with PBS extract;
(e) Hybridoma strain first screened in step (c) is secondly screened by ELISA using the PBS extract obtained in step (d) as an antigen, and OD (optical density) Selecting a clone by reference; And
(f) performing a limited dilution on the clone selected in step (e), and then screening the monoclonal antibody by ELISA using the PBS extract obtained in step (d) as an antigen;
Lt; RTI ID = 0.0 &gt; PWN-infected pine &lt; / RTI &gt; detection.
제 1항에 있어서,
상기(a)단계에서 펩타이드 설계에 의해 얻어진 펩타이드의 서열이 42-CGLDIANLSAGVSSKLFD-59 및 141-KPATITYLKCSDTTPTTNC-150인 것을 특징으로 하는 단일클론항체의 제조방법.
The method according to claim 1,
Wherein the sequence of the peptide obtained by the peptide design in step (a) is 42-CGLDIANLSAGVSSKLFD-59 and 141-KPATITYLKCSDTTPTTNC-150.
제 1항에 있어서,
상기(d)단계에서 PWN-감염 소나무(PWNIPTs)로부터 목재 펠릿의 수집은 2개 이상 지역의 소나무에서 수행되는 것을 특징으로 하는 단일클론항체의 제조방법.
The method according to claim 1,
Wherein the collection of wood pellets from PWN-infected pine trees (PWNIPTs) in step (d) is performed in two or more pines of the area.
제 1항에 있어서,
상기(d)단계에서 추출은 PBS 용액을 목재 펠렛과 혼합하고 실온에서 인큐베이션하는 방법으로 수행되는 것을 특징으로 하는 단일클론항체의 제조방법.
The method according to claim 1,
Wherein the extraction in step (d) is carried out by mixing the PBS solution with wood pellets and incubating at room temperature.
제 4항에 있어서,
상기 PBS 용액과 목재 펠렛은 1:0.5~0.5:1의 중량비로 혼합되며, 인규베이션 시간은 3~20분인 것을 특징으로 하는 단일클론항체의 제조방법.
5. The method of claim 4,
Wherein the PBS solution and the wood pellet are mixed at a weight ratio of 1: 0.5 to 0.5: 1, and the incubation time is 3 to 20 minutes.
(1) PWN-감염 의심 소나무로부터 목재 펠릿을 수집하는 단계; 및
(2) 상기(1)단계에서 수집된 목재 펠릿을 PBS 추출액으로 추출하는 단계;
를 포함하는 PWN-감염 검사용 추출액의 제조방법.
(1) collecting wood pellets from PWN-suspect pine trees; And
(2) extracting the wood pellets collected in the step (1) with PBS extract;
&Lt; RTI ID = 0.0 &gt; PWN-infection &lt; / RTI &gt;
제 6항에 있어서,
상기(2)단계에서 추출은 PBS 용액을 목재 펠렛과 혼합하고 실온에서 인큐베이션하는 방법으로 수행되는 것을 특징으로 하는 PWN-감염 검사용 추출액의 제조방법.
The method according to claim 6,
Wherein the extraction in step (2) is performed by mixing the PBS solution with the wood pellet and incubating at room temperature.
제 7항에 있어서,
상기 PBS 용액과 목재 펠렛은 1:0.5~0.5:1의 중량비로 혼합되며, 인규베이션 시간은 3~20분인 것을 특징으로 하는 PWN-감염 검사용 추출액의 제조방법.
8. The method of claim 7,
Wherein the PBS solution and the wood pellets are mixed at a weight ratio of 1: 0.5 to 0.5: 1, and the incubation time is 3 to 20 minutes.
PWN-감염 검사용 단일클론항체인 EXPB3-Mab-3-1-H3-C11-E4(EXPB3-C11-E4).EXPB3-Mab-3-1-H3-C11-E4 (EXPB3-C11-E4) which is a monoclonal antibody for PWN-infection test. 제9항에 있어서,
상기 EXPB3-Mab-3-1-H3-C11-E4(EXPB3-C11-E4)는 상기 청구항 1항의 방법으로 제조되는 것을 특징으로 하는 EXPB3-Mab-3-1-H3-C11-E4(EXPB3-C11-E4).
10. The method of claim 9,
EXPB3-Mab-3-1-H3-C11-E4 (EXPB3-C11-E4) is prepared by the method of claim 1. EXPB3-Mab-3-1-H3- C11-E4).
(A) PWN-감염 의심 소나무로부터 목재 펠릿을 수집하는 단계; 및
(B) 상기(A)단계에서 수집된 목재 펠릿을 PBS 추출액으로 추출하는 단계; 및
(C) 제9항의 PWN-감염 검사용 단일클론항체인 EXPB3-Mab-3-1-H3-C11-E4(EXPB3-C11-E4)와 상기(B)단계의 PBS 추출액을 사용하여 ELISA를 실시하는 단계;
를 포함하는 PWN-감염 검사방법.
(A) collecting wood pellets from PWN-suspect pine trees; And
(B) extracting the wood pellets collected in the step (A) with a PBS extract; And
(C) An ELISA was carried out using the EXPB3-Mab-3-1-H3-C11-E4 (EXPB3-C11-E4) as the monoclonal antibody for PWN-infection test of paragraph 9 and the PBS extract of step (B) ;
Lt; / RTI &gt;
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