KR20160104330A - Device for diagnosing ovarian cancer and Method for providing information on diagnosing ovarian cancer - Google Patents
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Abstract
Description
본 발명은 난소암 진단 장치와 난소암 진단 정보 제공 방법에 관한 것이다. The present invention relates to an ovarian cancer diagnostic apparatus and a method for providing diagnosis information of ovarian cancer.
암은 세포가 무한히 증식해 정상적인 세포의 기능을 방해하는 질병으로, 폐암, 위암(gastric cancer, GC), 유방암(breast cancer, BRC), 대장암(colorectal cancer, CRC) 및 난소암(ovarian cancer, OVC) 등이 대표적이나, 실질적으로는 어느 조직(tissue)에서나 발생할 수 있다. Cancer is a disease in which cells infiltrate infinitely and interfere with normal cell function. It is a disease of lung, gastric cancer, breast cancer (BRC), colorectal cancer (CRC) and ovarian cancer OVC), and the like, but they can occur in virtually any tissue.
초창기 암 진단은 암 세포의 성장에 따른 생체 조직의 외적 변화에 근거하였으나, 근래에 들어 혈액, 당쇄(glyco chain), 디엔에이(DNA) 등 생물의 조직 또는 세포에 존재하는 미량의 생체 분자를 이용한 진단 및 검출이 시도되고 있다. 그러나 가장 보편적으로 사용되는 암 진단 방법은 생체 조직 검사를 통해 얻어진 조직 샘플을 이용하거나, 영상을 이용한 진단이다.Early diagnosis of cancer was based on external changes of the biotissue due to the growth of cancer cells. Recently, however, diagnosis using biomolecules such as blood, glycocyte, DNA, And detection has been attempted. However, the most commonly used cancer diagnosis method is a tissue sample obtained through biopsy or an image diagnosis.
그 중 생체 조직 검사는 환자에게 큰 고통을 야기하며, 고비용이 들뿐만 아니라, 진단까지 긴 시간이 소요되는 단점이 있다. 또한, 환자가 실제 암에 걸린 경우, 생체 조직 검사 과정 중 암의 전이가 유발될 수 있는 위험이 있으며, 생체 조직 검사를 통해 조직 샘플을 얻을 수 없는 부위의 경우, 외과적인 수술을 통해 의심되는 조직의 적출이 이루어지기 전에는 질병의 진단이 불가능한 단점이 있다.Among them, biopsy results in great pain for the patient, which is not only costly but also takes a long time to diagnose. In addition, when the patient is actually cancerous, there is a risk that cancer metastasis may be induced during the biopsy, and in the case where a tissue sample can not be obtained through biopsy, It is impossible to diagnose the disease until the removal of the disease.
영상을 이용한 진단에서는 엑스레이(X-ray) 영상, 질병 표적 물질이 부착된 조영제를 사용하여 획득한 핵자기 공명(nuclear magnetic resonance, NMR) 영상 등을 기반으로 암을 판정한다. 그러나 이러한 영상 진단은 임상의 또는 판독의의 숙련도에 따라 오진의 가능성이 있으며, 영상을 얻는 기기의 정밀도에 크게 의존하는 단점이 있다. 더 나아가, 가장 정밀한 기기조차도 수 mm 이하의 종양은 검출이 불가능하여, 발병 초기 단계에서는 검출이 어려운 단점이 있다. 또한, 영상을 얻기 위해 환자 또는 질병 보유 가능자가 유전자의 돌연변이를 유발할 수 있는 고에너지의 전자기파에 노출되므로, 또 다른 질병을 야기할 수 있을 뿐만 아니라, 영상을 통한 진단 횟수에 제한이 있는 단점이 있다.In the diagnosis using imaging, cancer is judged based on X-ray image, nuclear magnetic resonance (NMR) image obtained using a contrast agent having a disease target substance, and the like. However, there is a possibility of misdiagnosis according to the skill of the clinician or the reader, and this image diagnosis has a disadvantage that it depends greatly on the precision of the device for obtaining the image. Furthermore, even the most precise apparatus can not detect tumors of a few mm or less, which is difficult to detect in the early stages of onset. In addition, in order to obtain an image, a patient or a disease-capable person is exposed to electromagnetic waves of high energy capable of causing mutation of a gene, so that it can not only cause another disease but also has a disadvantage in that the number of diagnosis through imaging is limited .
한편, 최근 생물학적 시료에서 추출한 저질량 이온에 대한 생물통계학적 분석을 통해 암을 진단하는 방법이 제시되고 있다.On the other hand, recent biostatistical analysis of low-mass ions extracted from biological samples suggests a method of diagnosing cancer.
본 발명의 목적은 생물학적 시료에서 추출한 저질량 이온에 대한 생물통계학적 분석을 통해 난소암을 진단하는 장치와 난소암 진단 정보를 제공하는 방법을 제시하는 것이다.The object of the present invention is to provide a device for diagnosing ovarian cancer and a method for providing diagnosis information of ovarian cancer through biostatistical analysis of low mass ions extracted from biological sample.
상기 본 발명의 목적은 난소암 진단 장치에 있어서, 생물학적 시료에서 검출한 저질량 이온의 질량스펙트럼 데이터를 입력하는 입력부; 제1 난소암 진단용 저질량 이온 그룹을 이용하여 상기 입력부에서 입력한 상기 질량스펙트럼 데이터에 대해 난소암 진단 정보를 판정하는 진단부를 포함하며, 상기 제1 난소암 진단용 저질량 이온 그룹은 21.1873, 37.0311, 37.5142, 37.7989, 38.6222, 84.8716, 147.1669, 171.4024, 175.1585, 188.8544, 190.7493, 230.0197 및 709.7879 m/z (단, 오차범위는 ±0.1%) 가운데 적어도 1개의 저질량 이온을 포함하는 것에 의해 달성된다.It is an object of the present invention to provide an ovarian cancer diagnosis apparatus comprising an input unit for inputting mass spectrum data of low mass ions detected in a biological sample; And a diagnostic unit for determining ovarian cancer diagnostic information on the mass spectral data input from the input unit using a low mass ion group for first ovarian cancer diagnosis, wherein the first low-mass ion group for ovarian cancer diagnosis is 21.1873, 37.0311, At least one low mass ion among the m / z (where the error range is ± 0.1%) is achieved by the use of a low-mass ion such as sodium hydroxide, sodium hydroxide, sodium hydroxide, potassium hydroxide,
상기 제1 난소암 진단용 저질량 이온 그룹은 21.1873, 37.0311, 37.5142, 37.7989, 38.6222, 84.8716, 147.1669, 171.4024, 175.1585, 188.8544, 190.7493, 230.0197 및 709.7879 m/z (단, 오차범위는 ±0.1%) 가운데 적어도 3개의 저질량 이온을 포함할 수 있다.The low mass ion group for diagnosis of the first ovarian cancer was found to be in the range of 21.1873, 37.0311, 37.5142, 37.7989, 38.6222, 84.8716, 147.1669, 171.4024, 175.1585, 188.8544, 190.7493, 230.0197 and 709.7879 m / z At least three low mass ions.
상기 제1 난소암 진단용 저질량 이온 그룹은 21.1873, 37.0311, 37.5142, 37.7989, 38.6222, 84.8716, 147.1669, 171.4024, 175.1585, 188.8544, 190.7493, 230.0197 및 709.7879 m/z (단, 오차범위는 ±0.1%) 가운데 적어도 5개의 저질량 이온을 포함할 수 있다.The low mass ion group for diagnosis of the first ovarian cancer was found to be in the range of 21.1873, 37.0311, 37.5142, 37.7989, 38.6222, 84.8716, 147.1669, 171.4024, 175.1585, 188.8544, 190.7493, 230.0197 and 709.7879 m / z At least five low mass ions.
상기 진단부는 제2 난소암 진단용 저질량 이온 그룹을 추가로 이용하여 상기 질량스펙트럼 데이터에 대해 난소암 진단 정보를 판정하며, 상기 제2 난소암 진단용 저질량 이온 그룹은 496.5220, 524.5837 및 1466.7073 m/z (단, 오차범위는 ±0.1%) 가운데 적어도 1개의 저질량 이온을 포함할 수 있다.Wherein the diagnostic unit further comprises a low mass ion group for the second ovarian cancer diagnosis to determine ovarian cancer diagnostic information for the mass spectral data and the low mass ion group for the second ovarian cancer diagnosis comprises 496.5220, 524.5837 and 1466.7073 m / z (With an error range of +/- 0.1%).
상기 제2 난소암 진단용 저질량 이온 그룹은 496.5220, 524.5837 및 1466.7073 m/z (단, 오차범위는 ±0.1%)을 포함할 수 있다.The second group of low mass ions for ovarian cancer diagnosis may include 496.5220, 524.5837 and 1466.7073 m / z (with an error range of +/- 0.1%).
상기 본 발명의 목적은 난소암 진단 장치에 있어서, 제1 난소암 진단용 저질량 이온 그룹을 이용하여 생물학적 시료에서 검출한 저질량 이온의 질량스펙트럼 데이터에 대해 난소암 진단 정보를 판정하는 진단부와; 상기 진단부의 진단결과를 출력하는 출력부를 포함하며, 상기 제1 난소암 진단용 저질량 이온 그룹은 21.1873, 37.0311, 37.5142, 37.7989, 38.6222, 84.8716, 147.1669, 171.4024, 175.1585, 188.8544, 190.7493, 230.0197 및 709.7879 m/z (단, 오차범위는 ±0.1%) 가운데 적어도 1개의 저질량 이온을 포함하는 것에 의해 달성된다.It is an object of the present invention to provide an ovarian cancer diagnostic apparatus comprising: a diagnostic unit for determining ovarian cancer diagnostic information on mass spectral data of low mass ions detected in a biological sample using a low mass ion group for first ovarian cancer diagnosis; And an output unit for outputting a diagnosis result of the diagnosis unit, wherein the first low-mass ion group for ovarian cancer diagnosis is 21.1873, 37.0311, 37.5142, 37.7989, 38.6222, 84.8716, 147.1669, 171.4024, 175.1585, 188.8544, 190.7493, 230.0197 and 709.7879 m / z (with an error range of +/- 0.1%).
상기 제1 난소암 진단용 저질량 이온 그룹은 21.1873, 37.0311, 37.5142, 37.7989, 38.6222, 84.8716, 147.1669, 171.4024, 175.1585, 188.8544, 190.7493, 230.0197 및 709.7879 m/z (단, 오차범위는 ±0.1%) 가운데 적어도 3개의 저질량 이온을 포함할 수 있다.The low mass ion group for diagnosis of the first ovarian cancer was found to be in the range of 21.1873, 37.0311, 37.5142, 37.7989, 38.6222, 84.8716, 147.1669, 171.4024, 175.1585, 188.8544, 190.7493, 230.0197 and 709.7879 m / z At least three low mass ions.
상기 제1 난소암 진단용 저질량 이온 그룹은 21.1873, 37.0311, 37.5142, 37.7989, 38.6222, 84.8716, 147.1669, 171.4024, 175.1585, 188.8544, 190.7493, 230.0197 및 709.7879 m/z (단, 오차범위는 ±0.1%) 가운데 적어도 5개의 저질량 이온을 포함할 수 있다.The low mass ion group for diagnosis of the first ovarian cancer was found to be in the range of 21.1873, 37.0311, 37.5142, 37.7989, 38.6222, 84.8716, 147.1669, 171.4024, 175.1585, 188.8544, 190.7493, 230.0197 and 709.7879 m / z At least five low mass ions.
상기 진단부는 제2 난소암 진단용 저질량 이온 그룹을 추가로 이용하여 상기 질량스펙트럼 데이터에 대해 난소암 진단 정보를 판정하며, 상기 제2 난소암 진단용 저질량 이온 그룹은 496.5220, 524.5837 및 1466.7073 m/z (단, 오차범위는 ±0.1%) 가운데 적어도 1개의 저질량 이온을 포함할 수 있다.Wherein the diagnostic unit further comprises a low mass ion group for the second ovarian cancer diagnosis to determine ovarian cancer diagnostic information for the mass spectral data and the low mass ion group for the second ovarian cancer diagnosis comprises 496.5220, 524.5837 and 1466.7073 m / z (With an error range of +/- 0.1%).
상기 제2 난소암 진단용 저질량 이온 그룹은 496.5220, 524.5837 및 1466.7073 m/z (단, 오차범위는 ±0.1%)을 포함할 수 있다.The second group of low mass ions for ovarian cancer diagnosis may include 496.5220, 524.5837 and 1466.7073 m / z (with an error range of +/- 0.1%).
상기 본 발명의 목적은 난소암 진단을 위한 정보를 제공하는 방법에 있어서, 생물학적 시료에서 저질량 이온의 질량스펙트럼 데이터를 얻는 단계; 제1 난소암 진단용 저질량 이온 그룹을 이용하여 상기 질량스펙트럼 데이터에 대한 난소암 진단 정보를 제공하는 난소암 진단 정보 제공단계를 포함하며, 상기 제1 난소암 진단용 저질량 이온 그룹은 21.1873, 37.0311, 37.5142, 37.7989, 38.6222, 84.8716, 147.1669, 171.4024, 175.1585, 188.8544, 190.7493, 230.0197 및 709.7879 m/z (단, 오차범위는 ±0.1%) 가운데 적어도 1개의 저질량 이온을 포함하는 것에 의해 달성된다.It is an object of the present invention to provide a method for diagnosing ovarian cancer, comprising: obtaining mass spectral data of a low mass ion in a biological sample; And providing ovarian cancer diagnosis information on the mass spectral data using the low mass ion group for the first ovarian cancer diagnosis, wherein the low mass ion group for the first ovarian cancer diagnosis is 21.1873, 37.0311, 37.5142, 37.7989, 38.6222, 84.8716, 147.1669, 171.4024, 175.1585, 188.8544, 190.7493, 230.0197 and 709.7879 m / z (with an error range of +/- 0.1%).
상기 제1 난소암 진단용 저질량 이온 그룹은 21.1873, 37.0311, 37.5142, 37.7989, 38.6222, 84.8716, 147.1669, 171.4024, 175.1585, 188.8544, 190.7493, 230.0197 및 709.7879 m/z (단, 오차범위는 ±0.1%) 가운데 적어도 3개의 저질량 이온을 포함할 수 있다.The low mass ion group for diagnosis of the first ovarian cancer was found to be in the range of 21.1873, 37.0311, 37.5142, 37.7989, 38.6222, 84.8716, 147.1669, 171.4024, 175.1585, 188.8544, 190.7493, 230.0197 and 709.7879 m / z At least three low mass ions.
상기 제1 난소암 진단용 저질량 이온 그룹은 21.1873, 37.0311, 37.5142, 37.7989, 38.6222, 84.8716, 147.1669, 171.4024, 175.1585, 188.8544, 190.7493, 230.0197 및 709.7879 m/z (단, 오차범위는 ±0.1%) 가운데 적어도 5개의 저질량 이온을 포함할 수 있다.The low mass ion group for diagnosis of the first ovarian cancer was found to be in the range of 21.1873, 37.0311, 37.5142, 37.7989, 38.6222, 84.8716, 147.1669, 171.4024, 175.1585, 188.8544, 190.7493, 230.0197 and 709.7879 m / z At least five low mass ions.
상기 난소암 진단 정보 제공단계는 제2 난소암 진단용 저질량 이온 그룹을 추가로 이용하여 상기 질량스펙트럼 데이터에 대해 난소암 진단 정보를 제공하며, 상기 제2 난소암 진단용 저질량 이온 그룹은 496.5220, 524.5837 및 1466.7073 m/z (단, 오차범위는 ±0.1%) 가운데 적어도 1개의 저질량 이온을 포함할 수 있다.The ovarian cancer diagnostic information providing step may further include a low mass ion group for diagnosing ovarian cancer to provide ovarian cancer diagnosis information to the mass spectral data, and the low mass ion group for the second ovarian cancer diagnosis is 496.5220, 524.5837 And 1466.7073 m / z (with an error range of +/- 0.1%).
상기 제2 난소암 진단용 저질량 이온 그룹은 496.5220, 524.5837 및 1466.7073 m/z (단, 오차범위는 ±0.1%)을 포함할 수 있다.The second group of low mass ions for ovarian cancer diagnosis may include 496.5220, 524.5837 and 1466.7073 m / z (with an error range of +/- 0.1%).
본 발명에 따르면 생물학적 시료에서 추출한 저질량 이온에 대한 생물통계학적 분석을 통해 난소암을 진단하는 장치와 난소암 진단 정보를 제공하는 방법이 제시된다.According to the present invention, a method for diagnosing ovarian cancer and a method for providing ovarian cancer diagnostic information by biostatistical analysis of low-mass ions extracted from a biological sample are presented.
도 1은 본 발명의 실시 예에 따른 난소암 진단 장치의 블록도이고,
도 2는 주성분 분석 기반의 선형 판별 분석(principal component analysis-based linear discriminant analysis, PCA-DA)에 따른 기준 질량스펙트럼의 판별점수 분포도이고,
도 3은 제1 그룹후보로 계산한 기준 질량스펙트럼의 판별점수 분포도이고,
도 4는 제1 그룹을 이용한 훈련집합 A1의 진단 결과를 나타낸 것이고,
도 5는 제1 그룹을 이용한 훈련집합 A2의 진단 결과를 나타낸 것이고,
도 6은 제1 그룹을 이용한 검증집합 B의 진단 결과를 나타낸 것이고,
도 7은 제1 그룹 및 제2 그룹을 이용한 훈련집합 A1의 진단 결과를 나타낸 것이고,
도 8은 제1 그룹 및 제2 그룹을 이용한 훈련집합 A2의 진단 결과를 나타낸 것이고,
도 9는 제1 그룹 및 제2 그룹을 이용한 검증집합 B의 진단 결과를 나타낸 것이다.1 is a block diagram of an ovarian cancer diagnosis apparatus according to an embodiment of the present invention,
FIG. 2 is a discriminant score distribution diagram of a reference mass spectrum according to principal component analysis-based linear discriminant analysis (PCA-DA)
3 is a discrimination score distribution diagram of the reference mass spectrum calculated by the first group candidate,
4 shows the diagnostic result of the training set A 1 using the first group,
FIG. 5 shows the diagnostic result of the training set A 2 using the first group,
6 shows the diagnostic result of the verification set B using the first group,
FIG. 7 shows the diagnostic result of the training set A 1 using the first group and the second group,
FIG. 8 shows the diagnostic result of the training set A 2 using the first group and the second group,
9 shows the diagnostic result of the verification set B using the first group and the second group.
본 발명에서, "생물학적 시료"는 전혈(whole blood), 혈청(serum), 혈장(plasma), 요(urine), 분변(stool), 객담(sputum), 타액(saliva), 조직, 세포, 세포 추출물, 체외 세포 배양물 등과 같은 시료들을 포함하나, 이에 제한되지 않는다. 아래에 기술되는 실시 예에서는 환자 또는 비환자의 혈청을 생물학적 시료로 사용하였다.In the present invention, the term "biological sample" refers to whole blood, serum, plasma, urine, stool, sputum, saliva, Extracts, in vitro cell cultures, and the like. In the examples described below, sera from patients or non-patients was used as a biological sample.
본 발명에서, MALDI-TOF(matrix assisted laser desorption/ionization -time of fight) 질량분석기에 의해 측정된 질량값(mass to charge ratio, m/z)은 "±0.1%"의 오차범위를 포함한다. 이는 실험 환경에 따라 질량값 측정치에 다소의 오차가 발생할 수 있으며 질량값이 커질수록 오차가 커지기 때문이다.In the present invention, the mass to charge ratio (m / z) measured by a MALDI-TOF (matrix assisted laser desorption / ionization-time of fight) mass spectrometer includes an error range of "± 0.1%". This is because some errors may occur in the mass value measurement depending on the experimental environment, and the larger the mass value, the larger the error becomes.
본 발명에서, "저질량 이온"은 MALDI-TOF 질량분석기 등을 이용하여 획득한 질량값이 1500 m/z보다 작은 이온을 의미한다. 경우에 따라 진단용 저질량 이온들 중 일부는 이 범위보다 더 높은 질량값을 가지기도 하나, 대부분이 이 범위 내에 들어오므로 이 경우에도 저질량 이온이라는 명칭을 그대로 사용하려고 한다. 즉, 1500 m/z이라는 한계는 확정적인 값이 아니라 대략적인 값의 의미로 사용된 것이다.In the present invention, "low mass ion" means an ion having a mass value obtained using a MALDI-TOF mass spectrometer or the like, which is smaller than 1500 m / z. In some cases, some of the diagnostic low-mass ions have a higher mass value than this range, but most of them fall within this range, so even in this case we try to use the name low-mass ion. That is, the limit of 1500 m / z is used as a rough value rather than a definite value.
본 발명에서, 각 저질량 이온은 MALDI-TOF 질량분석기에서 측정되는 해당 저질량 이온의 질량값으로 표현되었다. 본 발명에서 MALDI-TOF 질량분석기에 의해 측정된 질량값은 MALDI-TOF 질량분석기의 포지티브 모드(positive mode)에서 획득된 값이다. 본 발명에서 질량값은 MALDI-TOF 질량분석기에 의해 측정되는 각 저질량 이온의 H+ adduct 형태의 값으로, 실제 저질량 이온의 질량값은 이보다 1 m/z만큼 작다.In the present invention, each low-mass ion is expressed as a mass value of the corresponding low-mass ion measured in a MALDI-TOF mass spectrometer. In the present invention, the mass value measured by a MALDI-TOF mass spectrometer is a value obtained in a positive mode of a MALDI-TOF mass spectrometer. In the present invention, the mass value is the value of the H + adduct form of each low mass ion measured by a MALDI-TOF mass spectrometer, and the mass value of the actual low mass ion is as small as 1 m / z.
본 발명에서, "질량 강도"는 MALDI-TOF 질량분석기로 측정되는 값을 말하며, 저질량 이온의 양과 상관 관계를 가진다.In the present invention, "mass intensity" refers to a value measured by a MALDI-TOF mass spectrometer and has a correlation with the amount of low mass ions.
본 발명에서, "정규화"는 데이터(data)의 범위를 일치시키거나 분포를 유사하게 만들어 주는 것을 말하며, 평균값(mean), 중간값(median) 등을 이용하여 정규화할 수 있으나 이에 제한되지 않고, 경우에 따라 다양한 공지의 방법들이 적용될 수 있다. 본 실시 예에서는 각 시료별 질량 강도들의 소계를 구하고, 시료별 소계들의 평균을 구한 후, 각 시료별 질량 강도들의 소계가 이 평균과 일치하도록 각 질량 강도에 시료별 배율 인자를 곱하는 방식으로 정규화하였다. 즉, 이와 같이 정규화한 후에는 각 시료별 질량 강도들의 소계가 같아진다.In the present invention, "normalization" refers to matching the range of data or making the distribution similar, and may be normalized using mean, median, Various known methods may be applied in some cases. In this embodiment, the subtotal of the mass intensities of each sample is obtained, and the average of the subscales of each sample is obtained, and normalized by multiplying each mass intensity by the sample magnification factor so that the subtotal of the mass intensities of each sample coincides with this average . That is, after normalization as above, the subtotal of the mass intensities for each sample becomes equal.
본 발명에서, "파레토 스케일링"은 정규화한 각 질량 강도에서 질량 이온별 평균값을 뺀 후 표준편차의 제곱근으로 나누는 것을 말한다. 더 일반적인 스케일링 방법인 오토스케일링(autoscaling)에서는 표준편차로 나누는 것을 통해 데이터의 크기 정보를 완전히 상쇄시키는 것에 비해, 파레토 스케일링에서는 데이터의 크기 정보를 부분적으로 유지하는 것을 통해 노이즈(noise)의 증폭을 피할 수 있다는 장점이 있다.In the present invention, "Pareto scaling" refers to subtracting the mean value of each mass ion from each normalized mass intensity, and then dividing by the square root of the standard deviation. In a more general scaling method, autoscaling completely eliminates the size information of the data by dividing it by the standard deviation, whereas in Pareto scaling, avoiding the amplification of noise by partially preserving the size information of the data There is an advantage that it can be.
본 발명에서, "가중치(weighting factor)"는 가중치를 곱한 후의 데이터의 수치적 크기가 통계적 관점에서의 중요성에 비례하도록 조정하는 인자를 말하는데, PCA-DA 분석 결과로 획득되는 질량 이온별 인자적재값(factor loading)을 가중치의 일례라 할 수 있다.
In the present invention, a "weighting factor" refers to a factor that adjusts the numerical magnitude of data after multiplying the weight by proportional to the significance in terms of statistical significance. (factor loading) is an example of a weight.
본 발명에 있어서, 생물학적 시료의 원시 저질량 이온 그룹(이하 "원시 그룹"이라 함)에서 제1 난소암 진단용 저질량 이온 그룹 후보(이하 "제1 그룹후보"라 함)를 도출하는 과정과 최종 도출된 제1 난소암 진단용 저질량 이온 그룹(이하 "제1 그룹"이라 함) 및/또는 제2 난소암 진단용 저질량 이온 그룹(이하 "제2 그룹"이라 함)을 이용하여 난소암에 대한 양성/음성을 판단하는 과정은 본 출원인의 다른 출원, 예를 들어 한국특허공개 제2013-0079988호를 참조할 수 있다.
In the present invention, a process of deriving a candidate for a low mass ion group for diagnosis of a first ovarian cancer (hereinafter referred to as "first group candidate") from a raw low mass ion group of a biological sample (hereinafter referred to as a " (Hereinafter referred to as " first group ") and / or a low-mass ion group for diagnosis of second ovarian cancer (hereinafter referred to as" second group & The process of judging the positive / negative can be found in another application of the present applicant, for example, Korean Patent Publication No. 2013-0079988.
이하 도면을 참조하여 본 발명을 더욱 상세히 설명한다.BEST MODE FOR CARRYING OUT THE INVENTION The present invention will be described in more detail with reference to the drawings.
첨부된 도면은 본 발명의 기술적 사상을 더욱 구체적으로 설명하기 위하여 도시한 일례에 불과하므로 본 발명의 사상이 첨부된 도면에 한정되는 것은 아니다.
BRIEF DESCRIPTION OF THE DRAWINGS The accompanying drawings, which are included to provide a further understanding of the invention and are incorporated in and constitute a part of this application, illustrate embodiments of the invention and, together with the description, serve to explain the principles of the invention.
도 1은 본 발명의 실시 예에 따른 난소암 진단 장치를 나타낸 것이다.FIG. 1 shows an ovarian cancer diagnosis apparatus according to an embodiment of the present invention.
입력부(100)에서는 생물학적 시료에서 검출한 저질량 이온의 질량스펙트럼 데이터(이하 "진단대상 데이터"라 한다)를 입력한다. 입력부(100)에서 진단대상 데이터에 대해 정렬, 정규화 및/또는 스케일링과 같은 전처리 과정을 거치게 하거나, 미리 전처리 과정을 마친 진단대상 데이터를 입력부(100)에 입력할 수 있다. 또한 진단대상 데이터는 경우에 따라 제1 그룹에 해당하는 데이터나 제1 그룹 및 제2 그룹에 해당하는 데이터만을 포함할 수도 있다.The
환자 한 명에 대해서도 여러 개의 진단대상 데이터를 입력부(100)에 입력할 수 있다.It is possible to input a plurality of diagnostic object data to the
진단부(200)는 제1 그룹만을 이용하거나 제1 그룹과 제2 그룹을 모두 이용하여 입력한 진단대상 데이터에 대해 난소암 진단 정보를 생성한다. 즉, 진단부(200)에서는 진단대상 데이터에 대해 난소암 양성 또는 난소암 음성을 판정한다.The
진단부(200)는 입력한 진단대상 데이터에 포함되어 있는 제1 그룹 및 제2 그룹에 해당하는 데이터를 이용하여 난소암 양성/음성 여부를 판단한다. 예를 들어, 제1 그룹 및 제2 그룹에 해당하는 저질량 이온의 스케일링된 질량 강도와 가중치를 이용하여 판별점수를 도출하고, 판별점수에 대한 소정의 기준에 따라 난소암 양성/음성 여부를 판단할 수 있다.The
제1 그룹에 해당하는 저질량 이온은 21.1873, 37.0311, 37.5142, 37.7989, 38.6222, 84.8716, 147.1669, 171.4024, 175.1585, 188.8544, 190.7493, 230.0197 및 709.7879 m/z 가운데 선택할 수 있다. 이 13개 저질량 이온 가운데 적어도 1개, 적어도 2개, 적어도 3개, 적어도 4개, 적어도 5개, 적어도 6개, 적어도 7개, 적어도 8개, 적어도 9개, 적어도 10개, 적어도 11개 또는 적어도 12개를 사용할 수 있다. 13개 저질량 이온을 모두 사용하는 것도 가능하다.The low mass ions corresponding to the first group can be selected from among 21.1873, 37.0311, 37.5142, 37.7989, 38.6222, 84.8716, 147.1669, 171.4024, 175.1585, 188.8544, 190.7493, 230.0197 and 709.7879 m / z. At least one, at least two, at least three, at least four, at least five, at least six, at least seven, at least eight, at least nine, at least ten, and at least eleven of the thirteen low mass ions Or at least 12 can be used. It is also possible to use all 13 low mass ions.
제2 그룹에 해당하는 저질량 이온은 496.5220, 524.5837 및 1466.7073 m/z 가운데 선택할 수 있다. 이 3개 저질량 이온 가운데 적어도 1개 또는 적어도 2개를 사용하거나 3개를 모두 사용할 수 있다. 제2 그룹의 저질량 이온을 구체적으로 설명하면, 496.5220 m/z는 LPC(lysophosphatidylcholine) 16:0에 해당하며, 524.5837 m/z는 LPC(lysophosphatidylcholine) 18:0에 해당하며, 1466.7073 m/z는 피브리노겐 알파 체인에 해당한다.The low mass ions corresponding to the second group can be selected from 496.5220, 524.5837 and 1466.7073 m / z. At least one, or at least two, or all three of these three low mass ions can be used. Specifically, 496.5220 m / z corresponds to LPC (lysophosphatidylcholine) 16: 0, 524.5837 m / z corresponds to LPC (lysophosphatidylcholine) 18: 0, and 1466.7073 m / z corresponds to LPC Corresponds to the fibrinogen alpha chain.
제2 그룹의 저질량 이온들은 Triple-TOF 질량분석기를 이용하여 혈액 내의 물질을 분석했을 때 통계학적(P value)으로 매우 유의하며 정상대조군과 견주었을 때 양적 차이를 분명히 보인 저질량 이온들이다.
The second group of low-mass ions are very low in mass (P value) when analyzed in the blood using Triple-TOF mass spectrometry, and are low mass ions whose quantitative difference is clear when compared to the normal control group.
이하에서는 제1 그룹을 도출하는 방법에 대해 설명한다.Hereinafter, a method of deriving the first group will be described.
제1 그룹은 제1 그룹후보에서 선발하는데, 원시 그룹에서 제1 그룹후보를 도출하는 과정을 먼저 설명하면 다음과 같다.The first group is selected from the first group candidates. The process of deriving the first group candidates from the original group will be described first.
한 개 시료에 대해 질량스펙트럼을 되풀이하여 측정할 수 있다. 이후 예시되는 실시 예에서는 한 개 시료에 대해 여섯 번 되풀이하여 질량스펙트럼을 측정하였다. 훈련집합으로 선정한 시료들에 대해 여섯 번 되풀이하여 질량스펙트럼을 측정한 다음 PCA-DA 분석을 각각 적용하여 여섯 개 가운데 가장 우수한 판별 성능을 보인 질량스펙트럼을 기준 질량스펙트럼으로 선택했다. 이 기준 질량스펙트럼에 대한 PCA-DA 분석으로 얻게 되는 인자적재값이 각 저질량 이온의 가중치가 된다. The mass spectrum can be repeatedly measured for one sample. In the example illustrated hereafter, mass spectra were measured six times for one sample. The mass spectra were selected six times for the samples selected as the training set, and then the mass spectrum showing the best discrimination performance among the six was selected as the reference mass spectrum by applying the PCA-DA analysis. The factor load value obtained by the PCA-DA analysis for this reference mass spectrum is the weight of each low mass ion.
다음으로 기준 질량스펙트럼의 각 시료마다 파레토 스케일링한 질량강도에 가중치를 곱한 값의 절댓값이 0.1보다 큰 질량 이온들을 선정했다. 이렇게 시료마다 선택한 질량 이온들 가운데 기준 질량스펙트럼을 구성하는 전체 시료의 50 % 이상에서 공통으로 나타나는 P개 질량 이온들을 제1 그룹후보로 선택했다.Next, we selected mass ions whose absolute value of the value obtained by multiplying the Pareto-scaled mass intensity by each weight of each sample in the reference mass spectrum is greater than 0.1. We selected the P mass ions, which are common to more than 50% of the total samples constituting the reference mass spectrum among the mass ions selected for each sample, as the first group candidate.
다음으로 제1 그룹후보에서 제1 그룹을 도출하는 과정을 설명한다.Next, a process of deriving the first group from the first group candidate will be described.
본 과정에서는 개별 저질량 이온이 아니라 제1 그룹후보로 구성할 수 있는 저질량 이온 조합의 진단성능을 바탕으로 제1 그룹의 저질량 이온들을 선택한다. 이 때 진단성능은 제1 그룹후보를 선정하고 저질량 이온의 가중치를 계산할 때 쓴 훈련집합(집합 A1)에 새로운 훈련집합(집합 A2)을 더한 훈련집합에 대한 진단성능을 뜻한다. 과적합(overfitting) 현상을 완화하기 위해 이와 같이 훈련집합을 확장했다. 훈련집합 A1에 대해서는 여섯 번 되풀이하여 측정한 질량스펙트럼 가운데 기준 질량스펙트럼으로 선정되지 않은 나머지 다섯 개의 질량스펙트럼을 평균하여 판별점수를 계산하였고, 훈련집합 A2에 대해서는 여섯 번 되풀이하여 측정한 질량스펙트럼 가운데 임의로 선정한 다섯 개의 질량스펙트럼을 평균하여 판별점수를 계산하였다. 질량스펙트럼을 측정하는 실험에서 피할 수 없는 랜덤 오차(random error)를 줄이기 위해 이와 같이 평균 판별점수를 기준으로 진단성능을 평가했다. In this procedure, the first group of low mass ions are selected based on the diagnostic capability of low mass ion combinations that can be composed of the first group candidates rather than individual low mass ions. In this case, the diagnostic performance refers to the diagnostic performance of the training set with the new training set (group A 2 ) added to the training set (group A 1 ) used when selecting the first group candidate and calculating the weight of the low mass ion. We have thus extended the training set to mitigate the overfitting phenomenon. For the training set A 1 , the discriminant score was calculated by averaging the remaining five mass spectrums not selected as the reference mass spectrum among the mass spectra measured six times, and the mass spectrum measured six times for the training set A 2 And the discriminant score was calculated by averaging the five selected mass spectra. In order to reduce the inevitable random error in the experiment of measuring the mass spectrum, the diagnostic performance was evaluated based on the average discrimination score.
첫 번째 단계에서는 P개 제1 그룹후보 가운데 2개 또는 3개의 저질량 이온으로 구성할 수 있는 모든 조합(PC2와 PC3)의 진단성능을 비교하여 민감도와 특이도를 더한 값이 가장 큰 조합을 선정한다. 민감도와 특이도를 더한 값이 같은 조합이 하나 이상일 때는 그 조합들 가운데 가장 작은 개수의 저질량 이온을 가진 조합을 선택한다. 저질량 이온의 개수까지 같은 경우에는 피셔의 판별비(Fisher's discriminant ratio)가 가장 큰 조합을 선택한다.In the first step, the diagnostic performance of all combinations ( P C 2 and P C 3 ) that can consist of two or three low mass ions among the P first group candidates is compared and the sensitivity plus specificity value Select a large combination. When there is more than one combination of sensitivity plus specificity, the combination with the lowest number of low mass ions is selected. When the number of low-mass ions is the same, the Fisher's discriminant ratio is selected to be the largest.
도출된 2개 또는 3개 저질량 이온을 뺀 나머지 제1 그룹후보를 가지고 위 과정을 되풀이하며, 이 과정은 제1 그룹후보에서 저질량 이온이 하나만 남거나 하나도 남지 않을 때까지 반복한다.The process is repeated with the first group candidate remaining after subtracting the two or three low mass ions derived, and this process is repeated until only one low mass ion remains or none remains in the first group candidate.
두 번째 단계에서는 첫 번째 단계에서 구성한 2개 또는 3개 저질량 이온을 가지는 조합들을 마치 1개의 저질량 이온인 것처럼 생각하고 첫 번째 단계와 같은 과정을 되풀이한다.In the second step, the combinations with two or three low mass ions constituted in the first step are regarded as one low mass ion and the same process as the first step is repeated.
즉, 앞 단계에서 구성한 저질량 이온 조합을 다음 단계에서는 1개의 저질량 이온인 것처럼 간주하고 같은 과정을 되풀이하는 것이다. 씨앗집합은 저질량 이온 조합이 몇 번째 단계에서 구성되었는지에 상관없이 민감도와 특이도를 더한 값이 가장 큰 저질량 이온 조합으로 선정한다.In other words, the low mass ion combination formed in the previous step is regarded as one low mass ion in the next step and the same process is repeated. The seed set is chosen as the lowest mass ion combination with the highest sensitivity plus specificity, regardless of the stage of the low mass ion combination.
S개 저질량 이온이 씨앗집합으로 선정되었다고 하면 제1 그룹후보는 R(= P - S)개가 남게 된다. 남은 제1 그룹후보 가운데 1개, 2개, 3개의 저질량 이온으로 구성할 수 있는 모든 조합(RC1, RC2, RC3)을 씨앗집합에 더한 후 그 진단성능(민감도와 특이도를 더한 값)을 견주어 진단성능이 가장 좋은 조합이 원래 씨앗집합의 진단성능보다 낫다면 씨앗집합을 갱신한다. If the S low mass ions are selected as the seed set, the first group candidate will remain R (= P - S). ( R C 1 , R C 2 , and R C 3 ) that can consist of one, two, or three low-mass ions among the remaining Group 1 candidates are added to the seed set and their diagnostic performance The seed set is updated if the combination with the best diagnostic performance is better than the diagnostic performance of the original seed set.
씨앗집합을 갱신한 다음 남은 제1 그룹후보를 가지고 이 과정을 되풀이한다. 이러한 반복 과정을 거쳐 마지막으로 갱신한 씨앗집합을 난소암을 진단하기 위한 최종 그룹, 즉 제1 그룹으로 선정한다.
Update the seed set and repeat this process with the remaining first group candidates. The last set of seed sets that have undergone this repetition process is selected as the final group for diagnosing ovarian cancer, that is, the first group.
실시 예 - 제1 그룹 도출Example-Deriving Group 1
이하에서는 위에서 설명한 방법을 이용하여 제1 그룹을 도출한 과정을 설명한다. Hereinafter, a process of deriving the first group using the above-described method will be described.
총 1,184개의 여성 혈청 시료를 사용하였는데, 환자군에 따른 시료 개수와 나이 정보를 표 1에 나타내었다.A total of 1,184 female serum samples were used. The sample number and age information for each patient group are shown in Table 1.
표 1에서 Control은 정상대조군, BUT는 자궁 양성종양(benign uterine tumor), BOT는 난소 양성종양(benign ovarian tumor), PCL는 자궁경부암 전암병변(precancerous cervical lesion), BBT는 유방 양성종양(benign breast tumor), UCC는 자궁경부암(uterine cervical cancer), EMC는 자궁내막암(endometrial cancer)을 뜻한다.In Table 1, Control is the normal control, BUT is the benign uterine tumor, BOT is the benign ovarian tumor, PCL is the precancerous cervical lesion, BBT is the benign breast UCC refers to uterine cervical cancer, and EMC refers to endometrial cancer.
어느 병원에서 어떤 시료를 몇 개씩 모았는가 하는 정보는 표 2에 나타내었다.
Information on how many samples were collected at each hospital is shown in Table 2.
시료들을 대략 삼등분하여 표 3과 같이 훈련집합과 검증집합으로 나누었다. 표 3에 나타낸 것과 같이 자궁경부암과 자궁내막암 시료는 개수가 많지 않아 훈련집합으로 사용하지 않았고, 나머지 시료들로 구성한 저질량 이온 판별식을 적용하였을 때 난소암이 아닌 것으로 판정되는지 살펴보는 용도로만 사용하였다.
The samples were roughly divided into triplicate and training set and verification set as shown in Table 3. As shown in Table 3, when the low mass ion discrimination formula consisting of the remaining samples was not used as the training set because the number of cervical cancer and endometrial cancer samples was not so large, Respectively.
환자군에 따른 시료 정보를 표 4-14에 정리하였다.
Table 4-14 summarizes the sample information for each patient group.
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훈련집합 A1의 기준 질량스펙트럼에 대해 PCA-DA를 적용한 결과를 도 2에 나타내었다. 도 2에서 DS는 판별점수(discriminant score)를 뜻한다. 판별점수 0점(수평 점선)을 기준으로 하면 환자군에 따라 낮은 특이도를 얻게 되기도 하지만, 판별점수 문턱값을 도 2의 수평 실선과 같이 바꾸면 기준 질량스펙트럼에 대한 판별결과는 민감도와 특이도가 모두 매우 우수하다는 것을 알 수 있다.The results of applying PCA-DA to the reference mass spectrum of training set A 1 are shown in FIG. In FIG. 2, DS denotes a discriminant score. When the discrimination score 0 point (horizontal dotted line) is used as reference, low specificity is obtained depending on the patient group. However, when the discrimination score threshold is changed to the horizontal solid line of FIG. 2, the discrimination result on the reference mass spectrum shows that both the sensitivity and the specificity It can be seen that it is very excellent.
제1 그룹후보 도출 과정을 통해 176개의 제1 그룹후보가 선발되었다. 176개의 제1 그룹후보만으로 기준 질량스펙트럼을 판별한 결과를 도 3에 나타내었다. 10,000개의 저질량 이온으로 판별한 도 2에 견주었을 때 민감도와 특이도가 모두 그대로 유지되었을 뿐만 아니라 전체 저질량 이온의 2 %도 되지 않는 저질량 이온만을 사용했는데도 판별점수의 범위가 크게 달라지지 않았음을 확인할 수 있다.Through the process of deriving the first group candidates, 176 first group candidates were selected. FIG. 3 shows a result of discrimination of the reference mass spectrum with only 176 first group candidates. As shown in FIG. 2, which is discriminated by 10,000 low-mass ions, not only the sensitivity and specificity were maintained, but the range of the discrimination score did not change much even though only low-mass ions which were not 2% of the total low-mass ions were used You can see the sound.
위에서 설명한 방법을 이용하여 제1 그룹후보에서 13개의 제1 그룹을 도출하였다.
Using the method described above, thirteen first groups were derived from the first group candidates.
실시 예 - 난소암 판정 - 제1 그룹 이용Example - ovarian cancer determination - use of group 1
훈련집합 A1과 A2에 대하여 제1 그룹의 13개 저질량 이온을 이용하여 판정한 결과를 각각 도 4와 도 5에 나타내었다. The results of the determination using 13 low-mass ions of the first group for training sets A 1 and A 2 are shown in FIGS. 4 and 5, respectively.
훈련집합 A1과 A2에 대한 진단성능은 표 15와 같으며, 민감도와 특이도가 우수함을 확인할 수 있다.
The diagnostic performance of the training set A 1 and A 2 is shown in Table 15, and it can be confirmed that the sensitivity and the specificity are excellent.
검증집합 B에 대하여 제1 그룹의 13개 저질량 이온을 이용하여 검증한 결과를 도 6에 나타내었다.FIG. 6 shows the result of verifying the verification set B using 13 low-mass ions of the first group.
검증집합 B에 대한 진단성능은 표 16과 같으며, 검증집합에 대해서도 민감도와 특이도가 우수함을 확인할 수 있다.
Table 16 shows the diagnostic performance of the verification set B, and it can be confirmed that the sensitivity and specificity are also excellent for the verification set.
실시 예 - 난소암 판정 - 제1 그룹과 제2 그룹 이용Example - Ovarian cancer determination - use of first group and second group
훈련집합 A1과 A2에 대하여 제1 그룹의 13개 저질량 이온과 제2 그룹의 3개 저질량 이온을 이용하여 판정한 결과를 각각 도 7과 도 8에 나타내었다.The results of the determination using 13 low-mass ions of the first group and three low-mass ions of the second group for training sets A 1 and A 2 are shown in FIGS. 7 and 8, respectively.
훈련집합 A1과 A2에 대한 진단성능은 표 17과 같으며, 민감도와 특이도가 우수함을 확인할 수 있다. 제1 그룹만 이용한 경우 양수 판별점수를 갖는 시료는 난소암 양성으로, 음수 판별점수를 갖는 시료는 난소암 음성으로 판정했다. 즉, 난소암 양성/음성 여부를 판정하는 판별점수의 문턱값은 0점이었다. 제1 그룹과 제2 그룹을 이용한 경우에는 훈련집합에 대한 진단성능이 최대가 되도록 판별점수의 문턱값(도 7과 8의 수평 실선)을 결정했다. 이와 같이 선정한 판별점수의 문턱값을 이후 검증집합에 대한 판정에 그대로 적용하였다.
The diagnostic performance of the training set A 1 and A 2 is shown in Table 17, and it can be confirmed that the sensitivity and the specificity are excellent. When only the first group was used, the sample with a positive discrimination score was judged to be ovarian cancer positive, while the sample with negative discrimination score was judged negative to ovarian cancer. That is, the threshold value of the discrimination score for determining whether ovarian cancer was positive / negative was 0 point. When the first group and the second group are used, the threshold value of the discrimination score (the horizontal solid line in FIGS. 7 and 8) is determined so that the diagnostic performance for the training set is maximized. The threshold value of the discrimination score thus selected is applied to the judgment of the verification set as it is.
검증집합 B에 대하여 제1 그룹의 13개 저질량 이온과 제2 그룹의 3개 저질량 이온을 이용하여 검증한 결과를 도 9에 나타내었다.FIG. 9 shows the result of verifying the verification set B using thirteen low-mass ions of the first group and three low-mass ions of the second group.
검증집합 B에 대한 진단성능은 표 18과 같으며, 검증집합에 대해서도 민감도와 특이도가 우수함을 확인할 수 있다. 특히, 제1 그룹의 13개 저질량 이온만 이용한 경우와 견주었을 때 훈련집합에 포함되지 않았던 자궁경부암과 자궁내막암에 대해서도 높은 특이도를 나타내었다.
The diagnostic performance for the assertion set B is shown in Table 18, and it can be confirmed that the sensitivity and specificity are also excellent for the asserted set. Particularly, high specificity was also shown for 13 cervical cancer and endometrial cancer, which were not included in the training group when only 13 low - mass ions of group 1 were used and when compared.
전술한 실시 예들은 본 발명을 설명하기 위한 예시로서, 본 발명이 이에 한정되는 것은 아니다. 본 발명이 속하는 기술분야에서 통상의 지식을 가진 자라면 이로부터 다양하게 변형하여 본 발명을 실시하는 것이 가능할 것이므로, 본 발명의 기술적 보호범위는 첨부된 특허청구범위에 의해 정해져야 할 것이다.
The above-described embodiments are illustrative of the present invention, and the present invention is not limited thereto. It will be understood by those skilled in the art that various changes in form and details may be made therein without departing from the spirit and scope of the present invention as defined by the appended claims.
Claims (15)
생물학적 시료에서 검출한 저질량 이온의 질량스펙트럼 데이터를 입력하는 입력부;
제1 난소암 진단용 저질량 이온 그룹을 이용하여 상기 입력부에서 입력한 상기 질량스펙트럼 데이터에 대해 난소암 진단 정보를 판정하는 진단부를 포함하며,
상기 제1 난소암 진단용 저질량 이온 그룹은 21.1873, 37.0311, 37.5142, 37.7989, 38.6222, 84.8716, 147.1669, 171.4024, 175.1585, 188.8544, 190.7493, 230.0197 및 709.7879 m/z (단, 오차범위는 ±0.1%) 가운데 적어도 1개의 저질량 이온을 포함하는 것을 특징으로 하는 난소암 진단 장치.In an ovarian cancer diagnosis apparatus,
An input unit for inputting mass spectral data of low mass ions detected in the biological sample;
And a diagnosis unit for determining ovarian cancer diagnosis information on the mass spectral data input from the input unit using a low mass ion group for first ovarian cancer diagnosis,
The low mass ion group for diagnosis of the first ovarian cancer was found to be in the range of 21.1873, 37.0311, 37.5142, 37.7989, 38.6222, 84.8716, 147.1669, 171.4024, 175.1585, 188.8544, 190.7493, 230.0197 and 709.7879 m / z And at least one low-mass ion.
상기 제1 난소암 진단용 저질량 이온 그룹은 21.1873, 37.0311, 37.5142, 37.7989, 38.6222, 84.8716, 147.1669, 171.4024, 175.1585, 188.8544, 190.7493, 230.0197 및 709.7879 m/z (단, 오차범위는 ±0.1%) 가운데 적어도 3개의 저질량 이온을 포함하는 것을 특징으로 하는 난소암 진단 장치.The method according to claim 1,
The low mass ion group for diagnosis of the first ovarian cancer was found to be in the range of 21.1873, 37.0311, 37.5142, 37.7989, 38.6222, 84.8716, 147.1669, 171.4024, 175.1585, 188.8544, 190.7493, 230.0197 and 709.7879 m / z And at least three low-mass ions.
상기 제1 난소암 진단용 저질량 이온 그룹은 21.1873, 37.0311, 37.5142, 37.7989, 38.6222, 84.8716, 147.1669, 171.4024, 175.1585, 188.8544, 190.7493, 230.0197 및 709.7879 m/z (단, 오차범위는 ±0.1%) 가운데 적어도 5개의 저질량 이온을 포함하는 것을 특징으로 하는 난소암 진단 장치.The method according to claim 1,
The low mass ion group for diagnosis of the first ovarian cancer was found to be in the range of 21.1873, 37.0311, 37.5142, 37.7989, 38.6222, 84.8716, 147.1669, 171.4024, 175.1585, 188.8544, 190.7493, 230.0197 and 709.7879 m / z And at least five low-mass ions.
상기 진단부는 제2 난소암 진단용 저질량 이온 그룹을 추가로 이용하여 상기 질량스펙트럼 데이터에 대해 난소암 진단 정보를 판정하며,
상기 제2 난소암 진단용 저질량 이온 그룹은 496.5220, 524.5837 및 1466.7073 m/z (단, 오차범위는 ±0.1%) 가운데 적어도 1개의 저질량 이온을 포함하는 것을 특징으로 하는 난소암 진단 장치.4. The method according to any one of claims 1 to 3,
Wherein the diagnostic unit further uses a low mass ion group for diagnosing a second ovarian cancer to determine ovarian cancer diagnostic information for the mass spectral data,
Wherein the second ovarian cancer diagnostic low mass ion group comprises at least one low mass ion among 496.5220, 524.5837, and 1466.7073 m / z (with an error range of +/- 0.1%).
상기 제2 난소암 진단용 저질량 이온 그룹은 496.5220, 524.5837 및 1466.7073 m/z (단, 오차범위는 ±0.1%)을 포함하는 것을 특징으로 하는 난소암 진단 장치.5. The method of claim 4,
Wherein the second low-mass ion group for diagnosing ovarian cancer comprises 496.5220, 524.5837, and 1466.7073 m / z (with an error range of +/- 0.1%).
제1 난소암 진단용 저질량 이온 그룹을 이용하여 생물학적 시료에서 검출한 저질량 이온의 질량스펙트럼 데이터에 대해 난소암 진단 정보를 판정하는 진단부와;
상기 진단부의 진단결과를 출력하는 출력부를 포함하며,
상기 제1 난소암 진단용 저질량 이온 그룹은 21.1873, 37.0311, 37.5142, 37.7989, 38.6222, 84.8716, 147.1669, 171.4024, 175.1585, 188.8544, 190.7493, 230.0197 및 709.7879 m/z (단, 오차범위는 ±0.1%) 가운데 적어도 1개의 저질량 이온을 포함하는 것을 특징으로 하는 난소암 진단 장치.In an ovarian cancer diagnosis apparatus,
A diagnostic unit for diagnosing ovarian cancer diagnosis information on mass spectral data of low mass ions detected in the biological sample using a low mass ion group for first ovarian cancer diagnosis;
And an output unit for outputting a diagnosis result of the diagnosis unit,
The low mass ion group for diagnosis of the first ovarian cancer was found to be in the range of 21.1873, 37.0311, 37.5142, 37.7989, 38.6222, 84.8716, 147.1669, 171.4024, 175.1585, 188.8544, 190.7493, 230.0197 and 709.7879 m / z And at least one low-mass ion.
상기 제1 난소암 진단용 저질량 이온 그룹은 21.1873, 37.0311, 37.5142, 37.7989, 38.6222, 84.8716, 147.1669, 171.4024, 175.1585, 188.8544, 190.7493, 230.0197 및 709.7879 m/z (단, 오차범위는 ±0.1%) 가운데 적어도 3개의 저질량 이온을 포함하는 것을 특징으로 하는 난소암 진단 장치.The method according to claim 6,
The low mass ion group for diagnosis of the first ovarian cancer was found to be in the range of 21.1873, 37.0311, 37.5142, 37.7989, 38.6222, 84.8716, 147.1669, 171.4024, 175.1585, 188.8544, 190.7493, 230.0197 and 709.7879 m / z And at least three low-mass ions.
상기 제1 난소암 진단용 저질량 이온 그룹은 21.1873, 37.0311, 37.5142, 37.7989, 38.6222, 84.8716, 147.1669, 171.4024, 175.1585, 188.8544, 190.7493, 230.0197 및 709.7879 m/z (단, 오차범위는 ±0.1%) 가운데 적어도 5개의 저질량 이온을 포함하는 것을 특징으로 하는 난소암 진단 장치.The method according to claim 6,
The low mass ion group for diagnosis of the first ovarian cancer was found to be in the range of 21.1873, 37.0311, 37.5142, 37.7989, 38.6222, 84.8716, 147.1669, 171.4024, 175.1585, 188.8544, 190.7493, 230.0197 and 709.7879 m / z And at least five low-mass ions.
상기 진단부는 제2 난소암 진단용 저질량 이온 그룹을 추가로 이용하여 상기 질량스펙트럼 데이터에 대해 난소암 진단 정보를 판정하며,
상기 제2 난소암 진단용 저질량 이온 그룹은 496.5220, 524.5837 및 1466.7073 m/z (단, 오차범위는 ±0.1%) 가운데 적어도 1개의 저질량 이온을 포함하는 것을 특징으로 하는 난소암 진단 장치.9. The method according to any one of claims 6 to 8,
Wherein the diagnostic unit further uses a low mass ion group for diagnosing a second ovarian cancer to determine ovarian cancer diagnostic information for the mass spectral data,
Wherein the second ovarian cancer diagnostic low mass ion group comprises at least one low mass ion among 496.5220, 524.5837, and 1466.7073 m / z (with an error range of +/- 0.1%).
상기 제2 난소암 진단용 저질량 이온 그룹은 496.5220, 524.5837 및 1466.7073 m/z (단, 오차범위는 ±0.1%)을 포함하는 것을 특징으로 하는 난소암 진단 장치.10. The method of claim 9,
Wherein the second low-mass ion group for diagnosing ovarian cancer comprises 496.5220, 524.5837, and 1466.7073 m / z (with an error range of +/- 0.1%).
생물학적 시료에서 저질량 이온의 질량스펙트럼 데이터를 얻는 단계;
제1 난소암 진단용 저질량 이온 그룹을 이용하여 상기 질량스펙트럼 데이터에 대한 난소암 진단 정보를 제공하는 난소암 진단 정보 제공단계를 포함하며,
상기 제1 난소암 진단용 저질량 이온 그룹은 21.1873, 37.0311, 37.5142, 37.7989, 38.6222, 84.8716, 147.1669, 171.4024, 175.1585, 188.8544, 190.7493, 230.0197 및 709.7879 m/z (단, 오차범위는 ±0.1%) 가운데 적어도 1개의 저질량 이온을 포함하는 것을 특징으로 하는 난소암 진단 정보 제공 방법.A method for providing information for ovarian cancer diagnosis,
Obtaining mass spectral data of low mass ions in a biological sample;
And providing ovarian cancer diagnostic information on the mass spectral data using a low mass ion group for first ovarian cancer diagnosis,
The low mass ion group for diagnosis of the first ovarian cancer was found to be in the range of 21.1873, 37.0311, 37.5142, 37.7989, 38.6222, 84.8716, 147.1669, 171.4024, 175.1585, 188.8544, 190.7493, 230.0197 and 709.7879 m / z And at least one low-mass ion.
상기 제1 난소암 진단용 저질량 이온 그룹은 21.1873, 37.0311, 37.5142, 37.7989, 38.6222, 84.8716, 147.1669, 171.4024, 175.1585, 188.8544, 190.7493, 230.0197 및 709.7879 m/z (단, 오차범위는 ±0.1%) 가운데 적어도 3개의 저질량 이온을 포함하는 것을 특징으로 하는 난소암 진단 정보 제공 방법.12. The method of claim 11,
The low mass ion group for diagnosis of the first ovarian cancer was found to be in the range of 21.1873, 37.0311, 37.5142, 37.7989, 38.6222, 84.8716, 147.1669, 171.4024, 175.1585, 188.8544, 190.7493, 230.0197 and 709.7879 m / z Wherein the diagnostic information comprises at least three low-mass ions.
상기 제1 난소암 진단용 저질량 이온 그룹은 21.1873, 37.0311, 37.5142, 37.7989, 38.6222, 84.8716, 147.1669, 171.4024, 175.1585, 188.8544, 190.7493, 230.0197 및 709.7879 m/z (단, 오차범위는 ±0.1%) 가운데 적어도 5개의 저질량 이온을 포함하는 것을 특징으로 하는 난소암 진단 정보 제공 방법.12. The method of claim 11,
The low mass ion group for diagnosis of the first ovarian cancer was found to be in the range of 21.1873, 37.0311, 37.5142, 37.7989, 38.6222, 84.8716, 147.1669, 171.4024, 175.1585, 188.8544, 190.7493, 230.0197 and 709.7879 m / z Wherein the diagnostic information comprises at least five low-mass ions.
상기 난소암 진단 정보 제공단계는 제2 난소암 진단용 저질량 이온 그룹을 추가로 이용하여 상기 질량스펙트럼 데이터에 대해 난소암 진단 정보를 제공하며,
상기 제2 난소암 진단용 저질량 이온 그룹은 496.5220, 524.5837 및 1466.7073 m/z (단, 오차범위는 ±0.1%) 가운데 적어도 1개의 저질량 이온을 포함하는 것을 특징으로 하는 난소암 진단 정보 제공 방법.14. The method according to any one of claims 11 to 13,
The ovarian cancer diagnosis information providing step may further include a low mass ion group for the second ovarian cancer diagnosis to provide ovarian cancer diagnosis information on the mass spectral data,
Wherein the second low-mass ion group for ovarian cancer diagnosis comprises at least one low mass ion among 496.5220, 524.5837 and 1466.7073 m / z (with an error range of +/- 0.1%).
상기 제2 난소암 진단용 저질량 이온 그룹은 496.5220, 524.5837 및 1466.7073 m/z (단, 오차범위는 ±0.1%)을 포함하는 것을 특징으로 하는 난소암 진단 정보 제공 방법.
15. The method of claim 14,
Wherein the second low-mass ion group for diagnosing ovarian cancer comprises 496.5220, 524.5837, and 1466.7073 m / z (with an error range of +/- 0.1%).
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