KR20160074848A - Novel Biomarker Indicative of Colorectal Cancer and Their Uses - Google Patents

Novel Biomarker Indicative of Colorectal Cancer and Their Uses Download PDF

Info

Publication number
KR20160074848A
KR20160074848A KR1020140183439A KR20140183439A KR20160074848A KR 20160074848 A KR20160074848 A KR 20160074848A KR 1020140183439 A KR1020140183439 A KR 1020140183439A KR 20140183439 A KR20140183439 A KR 20140183439A KR 20160074848 A KR20160074848 A KR 20160074848A
Authority
KR
South Korea
Prior art keywords
epitope
antibody
present
colon cancer
pro
Prior art date
Application number
KR1020140183439A
Other languages
Korean (ko)
Other versions
KR101652894B1 (en
Inventor
안성수
김세진
Original Assignee
가천대학교 산학협력단
(의료)길의료재단
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by 가천대학교 산학협력단, (의료)길의료재단 filed Critical 가천대학교 산학협력단
Priority to KR1020140183439A priority Critical patent/KR101652894B1/en
Publication of KR20160074848A publication Critical patent/KR20160074848A/en
Application granted granted Critical
Publication of KR101652894B1 publication Critical patent/KR101652894B1/en

Links

Images

Classifications

    • GPHYSICS
    • G01MEASURING; TESTING
    • G01NINVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
    • G01N33/00Investigating or analysing materials by specific methods not covered by groups G01N1/00 - G01N31/00
    • G01N33/48Biological material, e.g. blood, urine; Haemocytometers
    • G01N33/50Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing
    • G01N33/53Immunoassay; Biospecific binding assay; Materials therefor
    • G01N33/574Immunoassay; Biospecific binding assay; Materials therefor for cancer
    • G01N33/57407Specifically defined cancers
    • G01N33/57446Specifically defined cancers of stomach or intestine
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12QMEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q1/00Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
    • C12Q1/68Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
    • C12Q1/6876Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes
    • C12Q1/6883Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes for diseases caused by alterations of genetic material
    • C12Q1/6886Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes for diseases caused by alterations of genetic material for cancer
    • GPHYSICS
    • G01MEASURING; TESTING
    • G01NINVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
    • G01N33/00Investigating or analysing materials by specific methods not covered by groups G01N1/00 - G01N31/00
    • G01N33/48Biological material, e.g. blood, urine; Haemocytometers
    • G01N33/50Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing
    • G01N33/53Immunoassay; Biospecific binding assay; Materials therefor
    • G01N33/543Immunoassay; Biospecific binding assay; Materials therefor with an insoluble carrier for immobilising immunochemicals

Abstract

Provided in the present invention is all-multimer type p53, as a novel molecular marker with respect to colorectal cancer. The marker of the present invention can be used for diagnosing colorectal cancer in a convenient, rapid, and accurate manner. A kit for diagnosing colorectal cancer comprises: a capture formulation for capturing monomer-type or multimer-type p53; and a detection formulation coupled to a p53 epitope and an overlapped epitope.

Description

대장암에 대한 신규 바이오마커 및 그의 용도{Novel Biomarker Indicative of Colorectal Cancer and Their Uses}Novel Biomarker Indicative of Colorectal Cancer and Their Uses < RTI ID = 0.0 >

본 발명은 대장암에 대한 신규 바이오마커(전체 멀티머 형의 p53) 및 그의 용도에 관한 것이다.
The present invention relates to novel biomarkers for colon cancer (whole multimeric p53) and uses thereof.

대장은 입으로 섭취된 음식물의 소화, 흡수가 이루어지는 곳이며, 잉여 음식물이 머무르는 곳이기도 하다. 또한, 이곳에서 수분을 흡수하여 대변이 만들어 지고, 이와 더불어 여러 종류의 많은 세균이 서식하는 곳이기도 하다. 사람의 경우, 대장의 길이는 약 2 m 정도이고, 결장과 직장, 항문으로 구성되어 있다. 대장점막이 있는 곳이면 어디서나 암이 생기지만, 암이 생기기 쉬운 부위는 에스결장과 직장이다.The colon is the place where digestion and absorption of the food ingested by the mouth occurs, and where the surplus food remains. In addition, it absorbs water to create feces, and it is also home to many different bacteria. In the case of a human, the length of the large intestine is about 2 m and consists of the colon, rectum and anus. Cancer occurs anywhere in the large intestine mucosa, but the area where cancer is likely to occur is the colon and rectum.

현재 우리나라에서 대장암 발생률은 매우 현저하게 증가하고 있고, 대장암에 의한 사망은, 남성의 경우 위암, 폐암, 간암에 이어 네 번째를 차지하고 있으며, 여성의 경우 또한 유사하다. 대장암 발생에 영향을 미치는 것으로는 유전인자보다도 환경인자의 비중이 크다고 여겨지고 있는데, 식생활의 급격한 서구화, 특히 동물성 지방이나 단백질의 과다섭취가 원인이라고 인식되고 있다. 그러나, 5% 전후의 대장암은 유전적 소인에 의해 발생한다고 알려져 있다.Currently, the incidence of colorectal cancer in Korea is remarkably increased, and death from colorectal cancer is the fourth after menstruation, lung cancer and liver cancer. It is considered that environmental factor is more important than genetic factor to affect colon cancer development. It is recognized that it is caused by rapid westernization of food, especially animal fat or protein. However, about 5% of colon cancer is known to be caused by genetic predisposition.

대장암은 조기 발견 시 내시경적 절제나 외과적 치료에 의해 완전히 치유될 수 있으며, 진행되어 간이나 폐로 전이(원격전이) 되었더라도 수술이 가능한 시기라면 외과적 치료에 의한 완치를 기대할 수 있다. 그러나, 발견이 늦어지면 폐, 간, 림프 절이나 복막 등 절제하기 어려운 곳으로의 전이가 일어나기 때문에 상기의 경우처럼 외과적 치료를 사용할 수 없다.Colorectal cancer can be completely cured by endoscopic resection or surgical treatment at the time of early detection, and even if it progresses to liver or lung metastasis (distant metastasis), surgery can be cured by surgical treatment if surgery is possible. However, when the discovery is delayed, surgical treatment can not be used as in the above case, since metastasis to the lung, liver, lymph node or peritoneum is difficult.

이와 같이, 대장암은 조기인 경우라면 거의 100% 가까이 완치되지만, 일반적으로 자각증상이 없기 때문에 무증상인 시기에 발견하는 것이 매우 어렵고, 이에 따라 주기적인 검사가 선행되어야 한다. 대장암의 진단은 대장과 관련된 증세를 보이는 환자에게 직장 수지검사(rectal digital examination), 분변 잠혈검사(fecal occult blood test) 및 대장조영술에 의해 수행되고 있으며, 필요에 따라 결장경 검사를 통한 조직검사가 행해진다.Thus, colorectal cancer is nearly 100% cured in early cases, but it is very difficult to detect in asymptomatic periods because there is usually no subjective symptoms, and periodic examination should precede it. Diagnosis of colorectal cancer is performed by rectal digital examination, fecal occult blood test, and colonoscopy in patients with symptoms related to the large bowel, and if necessary, biopsy through colonoscopy Is done.

현재 이용 가능한 가장 조기의 검출방법은 분변혈에 대한 시험 또는 내시경 과정을 수반한다. 그러나, 분변혈이 검출되면 일반적으로 종양 크기가 상당하다. 잠혈 기준(guaiac-based)의 분변 검사의 감수성 역시 26%로, 이는 악성 병변이 있는 74%의 환자가 검출되지 않음을 의미한다(Ahlquist et al., Gastroenterol. Clin. North Am. 26: 41-55, 1997). 전암성 및 암성 병변의 시각화는 조기 검출에 대한 최선의 접근법이지만, 결장 내시경은 상당한 비용뿐만 아니라, 환자에게 고통과 위험을 초래할 수 있다는 문제점이 있다(Anderson et al., J. Natl. Cancer Institute 94: 1126-1133, 2002).The earliest method of detection currently available involves testing or endoscopic procedures for the hematopoiesis. However, when tumorigenesis is detected, tumor size is generally significant. The susceptibility of guaiac-based fecal specimens was also 26%, meaning that 74% of patients with malignant lesions were not detected (Ahlquist et al., Gastroenterol. Clin. North Am . 55, 1997). Visualization of pre-cancerous and cancerous lesions is the best approach for early detection, but the problem is that colonoscopy is not only costly, but can also cause pain and danger to the patient (Anderson et al., J. Natl. Cancer Institute 94 : 1126-1133, 2002).

상기와 같은 종래의 방법들은 진단의 정확도가 낮을 뿐만 아니라, 대장암이 발병하기 이전의 환자들에 대한 조기 진단이 불가능하며, 피검체들에게 불편을 주는 문제점이 있다. 이러한 기존 진단방법의 단점을 보완하기 위한 방법으로, 대장암을 조기에 정확하게 진단할 수 있는 바이오마커에 대한 개발이 요구되고 있으며, 이에 따라 환자의 혈장에서 종양 표지자의 농도를 측정하여 대장암을 진단하려는 시도가 이루어지고 있다.
Such conventional methods have a problem that not only the diagnosis accuracy is low but also early diagnosis of the patients before the onset of colorectal cancer is impossible and inconvenience is given to the subjects. In order to overcome the disadvantages of the existing diagnostic methods, development of a biomarker capable of accurately diagnosing colon cancer early is required. Accordingly, the concentration of the tumor marker in the plasma of the patient is measured, There is an attempt to do so.

본 명세서 전체에 걸쳐 다수의 논문 및 특허문헌이 참조되고 그 인용이 표시되어 있다. 인용된 논문 및 특허문헌의 개시 내용은 그 전체로서 본 명세서에 참조로 삽입되어 본 발명이 속하는 기술 분야의 수준 및 본 발명의 내용이 보다 명확하게 설명된다.
Numerous papers and patent documents are referenced and cited throughout this specification. The disclosures of the cited papers and patent documents are incorporated herein by reference in their entirety to better understand the state of the art to which the present invention pertains and the content of the present invention.

대한민국 등록특허공보 제10-1311718호Korean Patent Registration No. 10-1311718 대한민국 등록특허공보 제10-1212024호Korean Registered Patent No. 10-1212024

본 발명자들은 대장암을 신속하고 정확하게 분자진단 할 수 있는 신규한 바이오마커를 발굴하고자 예의 연구 노력하였다. 그 결과, 바이오마커로서 혈액 내 전체 멀티머 형의 p53을 검출하는 것으로, 대장암을 조기 진단할 수 있음을 확인함으로써, 본 발명을 완성하였다.The present inventors have tried to find a novel biomarker capable of rapidly and accurately molecular diagnosis of colon cancer. As a result, it has been confirmed that colon cancer can be diagnosed early by detecting all multimeric p53 in the blood as a biomarker, thereby completing the present invention.

따라서, 본 발명의 목적은 대장암 진단용 키트를 제공하는 데 있다.Accordingly, an object of the present invention is to provide a kit for colon cancer diagnosis.

본 발명의 다른 목적은 대장암 진단에 필요한 정보를 제공하기 위하여 대장암 마커를 검출하는 방법을 제공하는 데 있다.
It is another object of the present invention to provide a method for detecting colon cancer markers in order to provide information necessary for colon cancer diagnosis.

본 발명의 다른 목적 및 이점은 하기의 발명의 상세한 설명, 청구범위 및 도면에 의해 보다 명확하게 된다.
Other objects and advantages of the present invention will become more apparent from the following detailed description of the invention, claims and drawings.

본 발명의 일 양태에 따르면, 본 발명은 p53 상의 에피토프에 결합하여 인간의 생물학적 시료 내에 존재하는 모노머 형 또는 멀티머 형의 p53을 포획하는 포획 제제; 및 상기 포획 제제가 결합하는 p53 상의 에피토프와 오버래핑 된 에피토프에 결합하는 검출 제제를 포함하고, 상기 포획 및 검출 제제는 항체 또는 앱타머인 것을 특징으로 하는 대장암 진단용 키트를 제공한다.
According to one aspect of the present invention, the present invention provides a capture agent which binds to an epitope on p53 and captures monomeric or multimeric forms of p53 present in a biological sample of a human; And a detection agent that binds to an epitope overlapped with an epitope on p53 to which the capture agent binds, wherein the capture and detection agent is an antibody or an aptamer.

본 발명자들은 대장암을 신속하고 정확하게 분자진단 할 수 있는 신규한 바이오마커를 발굴하고자 예의 연구 노력하였다. 그 결과, 바이오마커로서 혈액 내 전체 멀티머 형의 p53을 검출하는 것으로, 대장암을 조기 진단할 수 있음을 확인하였다.The present inventors have tried to find a novel biomarker capable of rapidly and accurately molecular diagnosis of colon cancer. As a result, it was confirmed that colon cancer can be diagnosed early by detecting whole multimeric p53 in the blood as a biomarker.

본 명세서에서 사용된 표현, "대장암 진단용 키트"는 대장암 진단용 조성물이 포함된 키트를 의미한다. 따라서, 상기 표현 "대장암 진단용 키트"는 "대장암 진단용 조성물"과 서로 교차 또는 혼용하여 사용 가능하다.As used herein, the expression "colorectal cancer diagnostic kit" means a kit containing a colorectal cancer diagnostic composition. Therefore, the above expression "colorectal cancer diagnostic kit" can be used in a cross or mixed manner with "composition for diagnosing colorectal cancer ".

본 명세서에서 사용된 용어, "진단"은 특정 질병 또는 질환에 대한 한 객체의 감수성(susceptibility)을 판정하는 것, 한 객체가 특정 질병 또는 질환을 현재 가지고 있는지 여부를 판정하는 것, 특정 질병 또는 질환에 걸린 한 객체의 예후(prognosis)(예컨대, 대장암의 단계 결정 또는 치료에 대한 반응성 예측)를 판정하는 것, 또는 테라메트릭스(therametrics)(예컨대, 치료 효능에 대한 정보를 제공하기 위하여 객체의 상태를 모니터링 하는 것)를 포함한다.As used herein, the term "diagnosing" is intended to include determining the susceptibility of an object to a particular disease or disorder, determining whether an object currently has a particular disease or disorder, Determining the prognosis of an object (e.g., predicting the stage of colorectal cancer or predicting its responsiveness to treatment), or determining the state of an object (e.g., ). ≪ / RTI >

대장암은 대장에 생긴 암세포로 이루어진 각종 악성종양을 의미하는데, 본 발명자들은 본 발명의 마커를 사용하면, 개체로부터 채취한 시료로부터 대장암의 발병 여부를 신속하고 정확하게 진단할 수 있음을 확인하였다(실시예 2 참조).The colon cancer refers to various malignant tumors composed of cancer cells formed in the large intestine. The present inventors confirmed that the marker of the present invention can rapidly and accurately diagnose the incidence of colon cancer from the sample collected from an individual See Example 2).

본 명세서에서 사용된 용어, "대장암 진단 마커 혹은 대장암 마커"란 대장암을 진단할 수 있는 물질로, 정상인에 비하여 대장암이 발병한 개체에서 감소 양상을 보이는 생체 분자를 의미한다. 본 발명의 목적상, 상기 대장암 진단 마커는 전체 멀티머 형의 p53이다.As used herein, the term "colorectal cancer marker or colon cancer marker" refers to a biomolecule capable of diagnosing colorectal cancer and showing a decrease pattern in individuals suffering from colon cancer as compared with normal individuals. For the purposes of the present invention, the colon cancer diagnostic marker is an entire multimeric p53.

본 명세서에서 사용된 용어, "모노머 형(monomer form)의 p53"은 일반적인 단일 분자로서의 p53을 의미하고, 용어 "멀티머 형(multimer form)의 p53"은 모노머 형의 p53이 둘 이상 포함된 p53 복합체를 의미한다. p53은 세포의 이상증식이나 돌연변이가 일어나지 않도록 막아주는 대표적인 암 억제 단백질인데(이의 아미노산 서열은 서열목록 제5서열에 나타내었다), 돌연변이가 발생하면 경우에 따라 모노머 형의 p53이 서로 뭉쳐 다이머(dimer), 테트라머(tetramer) 또는 피브릴(fibril) 등을 형성할 수 있고, 나아가 프리온과 유사한 아밀로이드 올리고머(amyloid oligomer)를 형성할 수 있다.As used herein, the term "monomer form p53" refers to p53 as a general single molecule, and the term "multimeric form of p53" refers to p53 with two or more monomeric forms of p53 ≪ / RTI > p53 is a typical cancer-suppressing protein that prevents abnormal proliferation or mutation of a cell (its amino acid sequence is shown in Sequence Listing 5). When a mutation occurs, a monomeric p53 mutates to form a dimer ), Tetramer or fibril, and furthermore amyloid oligomers similar to prions can be formed.

본 발명의 일구현예에 따르면, 본 발명의 키트는 면역분석 방식, 즉 항원-항체 반응 방식으로 대장암 마커(전체 멀티머 형의 p53)를 검출하는데 사용될 수 있다.According to one embodiment of the present invention, the kit of the present invention can be used for detecting colon cancer markers (all multimeric p53) by an immunoassay method, that is, an antigen-antibody reaction method.

이 경우, 대장암 마커의 검출은, p53 상의 에피토프에 결합하여 모노머 형 또는 멀티머 형의 p53을 포획하는 포획 제제(항체 또는 앱타머), 및 상기 포획 제제가 결합하는 에피토프와 오버래핑 된 에피토프에 결합하는 검출 제제(항체 또는 앱타머)를 이용하여 실시할 수 있다. 이 경우 생물학적 시료 내에 존재하는 전체 멀티머 형의 p53을 검출할 수 있다.In this case, the detection of colon cancer markers is carried out by using a capture agent (antibody or aptamer) which binds to an epitope on p53 and captures a monomeric or multimeric p53, and an epitope bound to an epitope to which the capture agent binds (An antibody or an aptamer). In this case, the entire multimeric p53 present in the biological sample can be detected.

본 명세서에서 사용된 용어, "항체"란 항원성 부위에 대해서 지시되는 특이적인 단백질 분자를 의미한다. 본 발명의 목적상, 상기 항체는 본 발명의 마커 또는 상기 마커의 구성 단백질에 대해 특이적으로 결합하는 항체를 의미하며, 다클론 항체, 단클론 항체 및 재조합 항체를 모두 포함한다.As used herein, the term "antibody" refers to a specific protein molecule directed against an antigenic site. For purposes of the present invention, the antibody refers to an antibody that specifically binds to the marker of the present invention or the constituent protein of the marker, and includes both polyclonal antibodies, monoclonal antibodies, and recombinant antibodies.

상기한 바와 같이 새로운 대장암 진단 마커가 규명되었으므로, 모노머 형 또는 멀티머 형의 p53(마커 단백질 항원)을 이용하여 항체를 생성하는 것은 당업계에 널리 공지된 기술을 이용하여 용이하게 제조할 수 있다.Since new colon cancer diagnostic markers have been identified as described above, the production of antibodies using monomeric or multimeric p53 (marker protein antigens) can be easily performed using techniques well known in the art .

상기 다클론 항체는 상기한 마커 단백질 항원을 동물에 주사하고 동물로부터 채혈하여 항체를 포함하는 혈청을 수득하는 당업계에 널리 공지된 방법에 의해 생산할 수 있다. 이러한 다클론 항체는 염소, 토끼, 양, 원숭이, 말, 돼지,소 개 등의 임의의 동물 종 숙주로부터 제조 가능하다.The polyclonal antibody can be produced by a method well known in the art for obtaining serum containing the antibody by injecting the marker protein antigen into the animal and collecting it from the animal. Such polyclonal antibodies can be prepared from any animal species host, such as goats, rabbits, sheep, monkeys, horses, pigs, small dogs, and the like.

상기 단클론 항체는 당업계에 널리 공지된 하이브리도마 방법(hybridoma method)(Kohler 및 Milstein, European Jounral of Immunology 6:511-519, 1976 참조) 또는 파지 항체 라이브러리(Clackson et al. Nature, 352:624-628, 1991; Marks et al. J. Mol. Biol., 222:58, 1-597, 1991) 기술을 이용하여 제조될 수 있다.The monoclonal antibody may be prepared by a hybridoma method (see Kohler and Milstein, European Jounal of Immunology 6: 511-519, 1976) or a phage antibody library (Clackson et al. Nature , 352: 624 -628, 1991; Marks et al., J. Mol. Biol. , 222: 58, 1-597, 1991).

상기 방법으로 제조된 항체는 겔 전지영동, 투석, 염 침전, 이온교환 크로마토그래피, 친화성 크로마토그래피 등의 방법을 이용하여 분리, 정제할 수 있다. 또한, 본 발명의 항체는 2개의 전체 길이의 경쇄 및 2개의 전체 길이의 중쇄를 가지는 완전한 형태뿐만 아니라, 항체 분자의 기능적인 단편을 포함한다. 항체 분자의 기능적인 단편이란 적어도 항원 결합 기능을 보유하고 있는 단편을 뜻하며, Fab, F(ab'), F(ab') 2 및 Fv 등이 있다.The antibody prepared by the above method can be isolated and purified by gel electrophoresis, dialysis, salt precipitation, ion exchange chromatography, affinity chromatography, and the like. In addition, the antibodies of the present invention include functional fragments of antibody molecules as well as complete forms with two full-length light chains and two full-length heavy chains. A functional fragment of an antibody molecule refers to a fragment having at least an antigen binding function, and includes Fab, F (ab ') 2, F (ab') 2 and Fv.

본 발명의 키트는 통상적인 면역분석 방법에 적용되어 대장암을 진단하는데 이용될 수 있다. 이러한 면역분석 방법은 종래에 개발된 다양한 정량적 또는 정성적 면역분석 방법으로서, 면역분석 포맷은 웨스턴 블랏, 엘라이자(enzyme linked immunosorbent assay, ELISA), 샌드위치 엘라이자, 방사선면역분석(RIA: Radioimmunoassay), 방사 면역확산법(radioimmunodiffusion), 오우크테로니(Ouchterlony) 면역 확산법, 로케트(rocket) 면역전기영동, 조직면역염색, 면역침전 분석법(Immunoprecipitation Assay), 보체 고정 분석법(Complement Fixation Assay), 유세포분석(Fluorescence Activated Cell Sorter, FACS), 단백질 칩(protein chip) 등이 있다.The kit of the present invention can be applied to a conventional immunoassay to diagnose colon cancer. Such immunoassay methods are various quantitative or qualitative immunoassay methods conventionally developed. Immunoassay formats include enzyme linked immunosorbent assay (ELISA), sandwich ELISA, radioimmunoassay (RIA) Immunoprecipitation Assay, Complement Fixation Assay, Fluorescence Immunoassay, Immunoprecipitation Assay, Immunoprecipitation Assay, Immunoprecipitation Assay, Immunoprecipitation Assay, Immunoprecipitation Assay, Immunoprecipitation Assay, Immunoprecipitation Assay, Fluorescence Immunodiffusion, Ouchterlony Immunodiffusion, Rocket Immunoelectrophoresis, Activated Cell Sorter (FACS), and protein chip.

상기 면역분석 또는 면역염색의 방법은 Enzyme Immunoassay, E. T. Maggio, ed., CRC Press, Boca Raton, Florida, 1980; Gaastra, W., Enzymelinked immunosorbent assay(ELISA), in Methods in Molecular Biology, Vol. 1, Walker, J.M. ed., Humana Press, NJ, 1984; 및 Ed Harlow and David Lane, Using Antibodies:A Laboratory Manual, Cold Spring Harbor Laboratory Press, 1999에 기재되어 있으며, 상기 문헌은 본 명세서에 참조로서 삽입된다.Methods of immunoassay or immunostaining are described in Enzyme Immunoassay, ET Maggio, ed., CRC Press, Boca Raton, Florida, 1980; Gaastra, W., Enzymelinked immunosorbent assay (ELISA), in Methods in Molecular Biology, Vol. 1, Walker, JM ed., Humana Press, NJ, 1984; And Ed Harlow and David Lane, Using Antibodies: A Laboratory Manual , Cold Spring Harbor Laboratory Press, 1999, which is incorporated herein by reference.

예를 들어, 본 발명의 키트가 방사능면역분석 방법에 적용되는 경우, 키트 내의 검출 제제는 방사능동위원소(예컨대, C14, I125, P32 및 S35)로 레이블링된다.For example, when the kit of the present invention is applied to a radioactive immunoassay, the detection agent in the kit is labeled with radioactive isotopes (e.g., C 14 , I 125 , P 32, and S 35 ).

본 발명의 일구현예에 따르면, 본 발명의 키트는 멀티머 검출 시스템(Multimer Detection System, MDS로 약칭)에 적용되어 대장암 마커를 검출하는데 활용될 수 있다. 상기 MDS의 상세한 내용은 대한민국 등록특허 제10-0987639호에 나타나 있으며, 상기 문헌은 참조로서 본 명세서에 삽입된다.According to one embodiment of the present invention, the kit of the present invention may be applied to a Multimer Detection System (abbreviated as MDS) to detect colon cancer markers. The details of the MDS are disclosed in Korean Patent No. 10-0987639, which is incorporated herein by reference.

본 발명의 키트가 MDS에 적용되는 경우, 본 발명의 키트에는 p53 상의 에피토프에 결합하여 인간의 생물학적 시료 내에 존재하는 모노머 형 또는 멀티머 형의 p53을 포획하는 포획 제제 외에, 검출 제제로서 상기 포획 제제가 결합하는 p53 상의 에피토프와 오버래핑 된 에피토프에 결합하는 항체 또는 앱타머가 포함된다.When the kit of the present invention is applied to an MDS, the kit of the present invention may further comprise, in addition to the capture agent capturing a monomeric or multimeric p53 existing in a human biological sample by binding to an epitope on p53, Lt; RTI ID = 0.0 > p53 < / RTI >

상기 용어 "오버래핑(overlapped with)"은 검출 제제와 포획 제제가 인식하는 에피토프 서열이 완전히 또는 부분적으로 겹쳐진 것을 의미한다. 이와 같이, MDS에서는 에피토프가 서로 오래래핑 된 포획 제제와 검출 제제를 사용하기 때문에, 검출 제제는 포획 제제에 결합된 모노머 형의 p53에는 결합하지 못하지만 멀티머 형의 p53에는 결합이 가능하므로 MDS를 통하여 생물학적 시료 내에 존재하는 모노머 형의 p53 이외의 모든 멀티머 형의 p53을 검출할 수 있다.The term " overlapped with "means that the detection agent and the epitope sequence recognized by the capture agent are completely or partially overlapped. As described above, since the MDS employs capturing agents and detection agents long-lived with epitopes, the detection agent can not bind to the monomer-type p53 bound to the capture agent but can bind to the multimeric p53. Therefore, All multimeric forms of p53 other than the monomeric p53 present in the biological sample can be detected.

상기 검출 항체는 검출 가능한 시그널을 발생시키는 레이블을 가지고 있다. 상기 레이블은 화학물질(예컨대, 바이오틴), 효소(알칼린 포스파타아제, β-갈락토시다아제, 호스 래디쉬 퍼옥시다아제 및 사이토크롬 P450), 방사능물질, 형광물질(예컨대, 플루오레신), 발광물질, 화학발광물질(chemiluminescent) 및 FRET(fluorescence resonance energy transfer)을 포함하나, 이에 한정되는 것은 아니다. 다양한 레이블 및 레이블링 방법은 Ed Harlow and David Lane, Using Antibodies:A Laboratory Manual, Cold Spring Harbor Laboratory Press, 1999에 기재되어 있다.The detection antibody has a label that generates a detectable signal. The label may be labeled with a chemical (e. G., Biotin), an enzyme (alkaline phosphatase,? -Galactosidase, horseradish peroxidase and cytochrome P450), a radioactive material, But are not limited to, luminescent materials, chemiluminescent materials, and fluorescence resonance energy transfer (FRET). Various labels and labeling methods are described in Ed Harlow and David Lane, Using Antibodies: A Laboratory Manual , Cold Spring Harbor Laboratory Press,

상기 MDS 및 ELISA에서 최종적인 효소의 활성 측정 또는 시그널의 측정은 당업계에 공지된 다양한 방법에 따라 실시될 수 있다. 이러한 시그널이 검출은 본 발명의 마커의 정성적 또는 정량적 분석을 가능하게 한다. 만일, 레이블로서 바이오틴이 이용된 경우에는 스트렙타비딘으로, 루시퍼라아제가 이용된 경우에는 루시페린으로 시그널을 용이하게 검출할 수 있다.Measurement of the activity of the final enzyme or measurement of the signal in the MDS and ELISA can be performed according to various methods known in the art. This detection of the signal enables a qualitative or quantitative analysis of the marker of the present invention. If biotin is used as a label, it can be easily detected by streptavidin. When luciferase is used, luciferin can easily detect a signal.

본 발명의 일구현예에 따르면, 상기 포획 제제가 결합하는 에피토프는 서열목록 제1서열 내지 제4서열로 구성된 군으로부터 선택된다.According to one embodiment of the invention, the epitope to which the capture agent binds is selected from the group consisting of SEQ ID NOS: 1 to 4.

본 발명의 다른 변형예에 따르면, 항체 대신에 앱타머를 이용할 수 있다. 앱타머는 올리고핵산 또는 펩타이드 분자, 바람직하게는 펩타이드 분자이며, 앱타머의 일반적인 내용은 Bock LC et al. Nature 355(6360):5646(1992); Hoppe-Seyler F, Butz K "Peptide aptamers: powerful new tools for molecular medicine". J Mol Med. 78(8):42630(2000); Cohen BA, Colas P, Brent R . "An artificial cellcycle inhibitor isolated from a combinatorial library". Proc Natl Acad Sci USA. 95(24):142727(1998)에 상세하게 개시되어 있다.According to another variant of the invention, an aptamer can be used instead of an antibody. The aptamer is an oligonucleic acid or peptide molecule, preferably a peptide molecule, and the general contents of aptamers are described in Bock LC et al. Nature 355 (6360): 5646 (1992); Hoppe-Seyler F, Butz K "Peptide aptamers: powerful new tools for molecular medicine". J Mol Med . 78 (8): 42630 (2000); Cohen BA, Colas P, Brent R. "An artificial cell cycle inhibitor isolated from a combinatorial library". Proc Natl Acad Sci USA . 95 (24): 142727 (1998).

상술한 면역분석 과정에 의한 최종적인 시그널의 세기를 분석함으로써, 대장암을 진단할 수 있다. 구체적으로, 시료에서 본 발명의 마커에 대한 시그널이 정상 시료 보다 약하게 나오는 경우에는 대장암으로 진단할 수 있다(실시예 2 참조).By analyzing the intensity of the final signal by the above-described immunoassay, colon cancer can be diagnosed. Specifically, when a signal for a marker of the present invention in a sample is weaker than a normal sample, it can be diagnosed as a colon cancer (see Example 2).

상술한 바와 같이, 본 발명의 키트는 면역분석(immunoassay)용 키트이며, 예를 들어 본 발명의 키트는 MDS 또는 ELISA 키트이다. 이 경우, 본 발명의 키트는 MDS 또는 ELISA를 수행하기 위해 필요한 필수 성분을 추가적으로 포함할 수 있다.As described above, the kit of the present invention is a kit for immunoassay. For example, the kit of the present invention is an MDS or ELISA kit. In this case, the kit of the present invention may additionally include essential components necessary for performing MDS or ELISA.

본 발명의 키트는 상기한 성분을 포함하는 다수의 별도 패키징 또는 컴파트먼트로 제작될 수 있다.The kits of the present invention may be made from a number of separate packaging or compartments including the components described above.

본 발명의 일구현예에 따르면, 본 발명의 생물학적 시료는 혈액, 혈장 또는 혈청이다.
According to one embodiment of the present invention, the biological sample of the present invention is blood, plasma or serum.

본 발명의 다른 양태에 따르면, 본 발명은 대장암 진단에 필요한 정보를 제공하기 위하여 인간의 생물학적 시료에 있는 멀티머 형의 p53의 존재여부 또는 양을 측정하는 단계를 통하여 대장암 마커를 검출하는 방법을 제공한다.According to another aspect of the present invention, there is provided a method for detecting a colon cancer marker through the step of measuring the presence or amount of a multimeric p53 in a human biological sample to provide information necessary for diagnosis of colon cancer .

상기 대장암 마커를 검출하는 방법과 상기 대장암 진단용 키트는 동일한 마커를 사용하기 때문에, 이 둘 사이에 공통된 내용은 본 명세서의 과도한 복잡성을 회피하기 위하여 그 기재를 생략한다.Since the method for detecting colon cancer markers and the colon cancer diagnostic kit use the same marker, the description common to both is omitted in order to avoid the excessive complexity of the present specification.

본 발명은 대장암을 의사의 소견에 의한 판단이 아니라, 분자 진단 방법으로 판단한다. 본 발명의 마커는 대장암에서 저농도로 존재하는 생체 분자이다.The present invention judges colon cancer by a molecular diagnostic method, not by doctor's findings. The marker of the present invention is a biomolecule present in a low concentration in colon cancer.

본 발명의 일구현예에 따르면, 본 발명의 방법은 항원-항체 반응 방식으로 실시할 수 있다.According to one embodiment of the present invention, the method of the present invention can be carried out by an antigen-antibody reaction method.

특정예에 따르면, 본 발명의 방법은 (a) p53에 대해 결합능이 있고 고상의 매트릭스에 고정화된 포획 항체에 인간으로부터 분리된 생물학적 시료를 접촉시키는 단계; (b) 단계 (a)의 결과물에 상기 포획 항체가 결합하는 에피토프와 오버래핑 된 에피토프에 결합하는 검출 항체를 접촉시키는 단계; 및 (c) 단계 (b)에서 형성된 항원-항체 복합체를 검출하는 단계를 포함한다.According to a specific example, the method comprises the steps of: (a) contacting a biological sample isolated from a human with a capture antibody immobilized on a solid phase matrix that is capable of binding to p53; (b) contacting the resultant product of step (a) with a detection antibody that binds to an epitope to which the capture antibody binds and an overlapped epitope; And (c) detecting the antigen-antibody complex formed in step (b).

상기 항원-항체 복합체 형성의 검출은 검출 가능한 시그널을 발생시키는 레이블을 이용하여 실시할 수 있다.Detection of the antigen-antibody complex formation can be carried out using a label that generates a detectable signal.

본 발명에 따르면, 간편하면서도 신속하게 대장암의 발병 여부를 용이하게 결정할 수 있다. 또한, 본 발명의 방법에 의해 나온 데이터를 근거로 하여 대장암 치료제를 환자에게 처리할 수 있다.
INDUSTRIAL APPLICABILITY According to the present invention, it is possible to easily and easily determine whether or not a colon cancer develops. In addition, the colon cancer therapeutic agent can be treated on the basis of the data obtained by the method of the present invention.

본 발명의 특징 및 이점을 요약하면 다음과 같다:The features and advantages of the present invention are summarized as follows:

(ⅰ) 본 발명은 대장암에 대한 신규한 분자 마커로서 전체 멀티머 형의 p53을 제안한다.(I) The present invention proposes a whole multimeric p53 as a novel molecular marker for colon cancer.

(ⅱ) 본 발명의 마커는 혈액 마커로서 대장암을 편리하고, 신속 및 정확하게 진단하는데 이용될 수 있다.
(Ii) The marker of the present invention can be used to conveniently, promptly and accurately diagnose colon cancer as a blood marker.

도 1a 및 1b는 항-p53 항체의 에피토프 매핑 결과를 보여준다.
도 2는 MDS(Multimer Detection System)를 이용하여 혈장 내 전체 멀티머 형의 p53을 검출한 결과를 보여준다.
Figures 1a and 1b show the epitope mapping results of the anti-p53 antibody.
FIG. 2 shows the results of detection of whole multimeric p53 in plasma by using MDS (Multimer Detection System).

이하, 실시예를 통하여 본 발명을 더욱 상세히 설명하고자 한다. 이들 실시예는 오로지 본 발명을 보다 구체적으로 설명하기 위한 것으로, 본 발명의 요지에 따라 본 발명의 범위가 이들 실시예에 의해 제한되지 않는다는 것은 당업계에서 통상의 지식을 가진 자에 있어서 자명할 것이다.
Hereinafter, the present invention will be described in more detail with reference to Examples. It is to be understood by those skilled in the art that these embodiments are only for describing the present invention in more detail and that the scope of the present invention is not limited by these embodiments in accordance with the gist of the present invention .

실시예Example

실시예 1. 항-p53 항체의 에피토프 매핑(mapping)Example 1. Epitope mapping of anti-p53 antibody [

1-1. 실험재료1-1. Experimental material

0.1M 인산나트륨, 0.15M 염화나트륨, 10 mM EDTA(pH 7.2): 결합 버퍼(Binding Buffer)0.1 M sodium phosphate, 0.15 M sodium chloride, 10 mM EDTA (pH 7.2): Binding Buffer

PBS(0.01M, pH 7.4) + 0.05% Tween: 세척 버퍼PBS (0.01 M, pH 7.4) + 0.05% Tween: Wash buffer

PBS(pH 4.5): 펩타이드-SH 그룹 유지PBS (pH 4.5): Peptide-SH group maintenance

PBS(0.01M, pH 7.4): 스트렙트아비딘-폴리 HRP 희석용PBS (0.01 M, pH 7.4): for dilution of streptavidin-poly HRP

PBS(pH7.4)에 용해된 1% BSA: 분석 희석액(Assay diluent)1% BSA: Assay diluent dissolved in PBS (pH 7.4)

PBS(pH 7.4)에 용해된 시스테인 용액: 블록킹 버퍼(Blocking buffer), 50 mg/ml PBS(pH4.5) 시스테인 스톡 용액을 만들고, PBS(pH 7.4)로 희석해서 사용.Cysteine solution dissolved in PBS (pH 7.4): Blocking buffer, 50 mg / ml PBS (pH 4.5) Cysteine stock solution was prepared and diluted with PBS (pH 7.4).

DMSO(Dimethyl sulfoxide): 동결방지, 유기용매DMSO (Dimethyl sulfoxide): freezing, organic solvents

2N H2SO4: 종결 용액(stop solution)
2N H 2 SO 4 : stop solution

1-2. 펩타이드 스톡 준비1-2. Peptide stock preparation

표 1에 나타낸 각각의 p53의 여러 펩타이드 단편((주)루젠에스씨아이, 순도>98%) 1 mg을 100 ㎕ DMSO에 녹이고, PBS(pH 4.5) 100 ㎕를 첨가한 다음 얼음에 꽃아 두었다(5 mg/㎖). 이후, -70℃로 냉동 보관하였다.1 mg of each peptide fragment of each of the p53 shown in Table 1 (Lucent's seed, purity> 98%) was dissolved in 100 μl of DMSO, 100 μl of PBS (pH 4.5) was added, and the mixture was allowed to stand on ice mg / ml). Then, it was stored frozen at -70 ° C.

펩타이드 단편Peptide fragment p53 내 위치Location within p53 펩타이드 단편Peptide fragment p53 내 위치Location within p53 1One 1-201-20 1717 166-185166-185 22 4-234-23 1818 169-188169-188 33 7-267-26 1919 172-191172-191 44 10-2910-29 2020 175-194175-194 55 13-3213-32 2121 178-197178-197 66 16-3516-35 2222 181-200181-200 77 19-3819-38 2323 184-203184-203 88 22-4122-41 2424 187-207187-207 99 33-5033-50 2525 355-373355-373 1010 36-5336-53 2626 358-376358-376 1111 39-5639-56 2727 361-379361-379 1212 42-5942-59 2828 364-382364-382 1313 45-6245-62 2929 367-385367-385 1414 48-6548-65 3030 370-388370-388 1515 51-6851-68 3131 373-391373-391 1616 54-7154-71

1-3. 항-p53 항체의 에피토프 매핑1-3. Epitope mapping of anti-p53 antibody

Pierce 말레이미드 활성화 96-웰 플레이트(Pierce Maleimide Activated 96-Well Plates; Thermo, 15152)를 사용하였다. 플레이트 활성화를 위하여 준비해둔 세척 버퍼로 3번 세척하고(300 ㎕), 펩타이드 스톡 용액을 준비해둔 결합 버퍼로 희석한 다음 5 ㎍/㎖의 농도(working concentration)로 4℃에서 하룻밤 동안 인큐베이션 하여 플레이트를 코팅하였다(100 ㎕). 이후, 세척 버퍼로 3번 세척하였다(300 ㎕). 블록킹 버퍼를 25 ㎍/㎖(200 ㎕)의 농도로 처리하고 1시간 동안 인큐베이션 한 다음, 세척 버퍼로 3번 세척하였다(300 ㎕).Pierce maleimide activated 96-well plates (Pierce Maleimide Activated 96-Well Plates; Thermo, 15152) were used. The plate stock solution was diluted with the prepared binding buffer and incubated overnight at 4 째 C with a working concentration of 5 / / ml to wash the plate (3 ㎕) with wash buffer prepared for plate activation (100 l). It was then washed three times with wash buffer (300 l). Blocking buffer was treated at a concentration of 25 [mu] g / ml (200 [mu] l), incubated for 1 hour and then washed 3 times with wash buffer (300 [mu] l).

검출 항체(Anti-p53 PAb1801, Abcam, ab28; Anti-p53 BP53-12, Abcam, ab7757; Anti-p53 DO-11, GeneTex, GTX75258; Anti-p53 PAb122, Abcam, ab90363)를 분석 희석액으로 작용 농도(working concentration) 200 ng/㎖로 희석한 후 플레이트에 처리한 다음(100 ㎕), 상온에서 1시간 동안 흔들어 주면서(400 rpm) 인큐베이션 하였다. 이후, 세척 버퍼로 3번 세척하였다(300 ㎕). 스트렙트아비딘-폴리 HRP(Pierce, 21140)를 PBS(0.01M, pH 7.4)로 X20,000배 희석한 다음 플레이트에 처리한 후(100 ㎕), 상온에서 3분 동안 흔들어 주면서(400 rpm) 인큐베이션 하였다. 이후, 세척 버퍼로 3번 세척하였다(300 ㎕). TMB (3,3',5,5'-tetramethyl benzidine) 100 ㎕를 처리한 후 20분 동안 37℃에서 인큐베이션 한 후, 종결 용액 50 ㎕를 처리하여 반응을 종결시켰다. 광학 밀도 값은 마이크로플레이트 리더를 사용하여 450 nm에서 0.1초 간격으로 측정하였다. 실험 결과는 도 1a 및 1b에 나타내었다.(Anti-p53 PAb1801, Abcam, ab28; Anti-p53 BP53-12, Abcam, ab7757; Anti-p53 DO-11, GeneTex, GTX75258; Anti-p53 PAb122, Abcam, ab90363) working concentration 200 ng / ml, treated with plates (100 l), and incubated at room temperature for 1 hour with shaking (400 rpm). It was then washed three times with wash buffer (300 l). Streptavidin-poly HRP (Pierce, 21140) was diluted X20,000 times with PBS (0.01 M, pH 7.4) and then treated with plates (100 μl), shaking at room temperature for 3 minutes (400 rpm) Respectively. It was then washed three times with wash buffer (300 l). 100 [mu] l of TMB (3,3 ', 5,5'-tetramethyl benzidine) was incubated for 20 minutes at 37 [deg.] C, and the reaction was terminated by treating 50 [mu] l of the final solution. Optical density values were measured at 450 nm using a microplate reader at 0.1 second intervals. The experimental results are shown in Figs. 1A and 1B.

상기 도 1의 결과를 통하여, Anti-p53 PAb1801 항체의 p53 결합 부위(에피토프)가 서열목록 제1서열의 아미노산 서열이며, Anti-p53 BP53-12 항체의 에피토프가 서열목록 제2서열의 아미노산 서열이고, Anti-p53 DO-11 항체의 에피토프가 서열목록 제3서열의 아미노산 서열이며, Anti-p53 PAb122 항체의 에피토프가 서열목록 제4서열의 아미노산 서열임을 확인하였다(도 1a 및 1b).
1, the p53 binding site (epitope) of the anti-p53 PAb1801 antibody is the amino acid sequence of the first sequence of the sequence listing, and the epitope of the anti-p53 BP53-12 antibody is the amino acid sequence of the second sequence of the sequence listing , The epitope of the anti-p53 DO-11 antibody was the amino acid sequence of the third sequence of the sequence listing, and the epitope of the anti-p53 PAb122 antibody was the amino acid sequence of the fourth sequence of the sequence listing (FIGS.

실시예 2. MDS(Multimer Detection System)를 이용한 혈장 내 전체 멀티머 형의 p53 검출Example 2 Detection of Whole Multimeric P53 in Plasma Using MDS (Multimer Detection System)

2-1. 실험재료2-1. Experimental material

PBS(0.01M, pH 7.4): 포획 항체와 스트렙트아비딘-폴리 HRP 희석용PBS (0.01 M, pH 7.4): for capture antibody and dilution of streptavidin-poly HRP

PBS(0.01M, pH 7.4) + 0.05% Tween: 세척 버퍼PBS (0.01 M, pH 7.4) + 0.05% Tween: Wash buffer

PBS(pH 7.4)에 용해된 1% BSA: 분석 희석액(Assay diluent)1% BSA: Assay diluent dissolved in PBS (pH 7.4)

25% BlockAce: 블록킹 버퍼(Blocking Buffer)25% BlockAce: Blocking Buffer

2N H2SO4: 종결 용액(Stop solution)
2N H 2 SO 4 : Stop solution

2-2. 플레이트 준비2-2. Plate preparation

포획 항체(Anti-p53 PAb1801; Abcam, ab28)를 PBS(0.01M, pH 7.4)로 희석한 후, 4℃에서 하룻밤 동안 인큐베이션 하여 100 ㎕(1 ㎍/㎖)를 코팅한 다음 세척 버퍼로 3번 세척하였다(300 ㎕). 300 ㎕의 블록킹 용액을 처리한 후 37℃에서 90분 동안 인큐베이션 한 다음 세척 버퍼로 3번 세척하였다(300 ㎕).
After incubation at 4 ° C overnight, 100 μl (1 μg / ml) of anti-p53 PAb1801 (Abcam, ab28) was diluted with PBS (0.01M, pH 7.4) Washed (300 l). 300 [mu] l of blocking solution was treated and incubated at 37 [deg.] C for 90 minutes and then washed three times with wash buffer (300 [mu] l).

2-3. MDS를 이용한 혈장 내 전체 멀티머 형의 p53 검출2-3. Detection of all multimeric p53 in plasma using MDS

표 2에 기재된 80명의 대장암 환자와, 대조군으로 사용하기 위한 15명의 정상인으로부터 혈액을 채취하였다. 구체적으로, 대장암 환자 80명과 정상인 15명으로부터 혈액 10 ㎖을 항응고제(EDTA tube)를 이용하여 채취하였다. 채혈 후 곧바로 항응고제가 충분히 섞이도록 천천히 혼합하였다. 이후 튜브는 상온에서 보관하고 채혈 후 1시간 이내에 850xg에서 30분간 원심분리 후 혈구와 섞이지 않게 혈장을 분리 하고, 1.5 ㎖ 튜브에 분주 후 -80℃ 냉동 보관하였다.Blood was collected from the 80 colorectal cancer patients listed in Table 2 and 15 healthy persons for use as a control group. Specifically, 10 ml of blood was collected from 80 colon cancer patients and 15 normal patients using an anticoagulant (EDTA tube). Immediately after the blood collection, the anticoagulant was slowly mixed so that the mixture was sufficiently mixed. The tubes were then stored at room temperature and centrifuged at 850 xg for 30 minutes within 1 hour after collection. Plasma was separated from the blood without mixing with blood cells, and the tubes were placed in 1.5 ml tubes and stored at -80 ° C.

Figure pat00001
Figure pat00001

혈장 샘플을 분석 희석액으로 10배 희석한 후 100 ㎕를 포획 항체가 고정되어 있는 플레이트에 처리하였다. 처리 후, 1시간 동안 상온에서 흔들어주면서(400 rpm) 인큐베이션 하였다. 이후, 세척 버퍼로 3번 세척하였다(300 ㎕). 검출 항체(Anti-p53 PAb1801; Abcam, ab28)를 분석 희석액으로 희석한 후 100 ㎕를 플레이트에 처리하고(100 ng/㎖), 1시간 동안 상온에서 흔들어주면서(400 rpm) 인큐베이션 하였다. 이후, 세척 버퍼로 3번 세척하였다(300 ㎕). 스트렙트아비딘-폴리 HRP(Pierce, 21140)를 PBS(0.01M, pH 7.4)로 X20,000배 희석한 다음 플레이트에 처리하고(100 ㎕), 상온에서 30분간 흔들어주면서(400 rpm) 인큐베이션 하였다. 이후, 세척 버퍼로 3번 세척하였다(300 ㎕). TMB(3,3',5,5'-tetramethyl benzidine) 100 ㎕를 플레이트에 처리한 후, 20분 동안 37℃에서 인큐베이션 한 다음 종결 용액 50 ㎕로 반응을 종결시켰다. 광학 밀도 값은 마이크로플레이트 리더를 사용하여 450 nm에서 0.1초 간격으로 측정하였다. 모든 통계 분석은 MiniTab 버전14(Minitab Inc.,State College, PA, USA)를 이용하여 통계치를 산출하였다. 결과는 평균(mean)과 표준편차(standard deviation, SD)로 표시하였고, 모든 결과 비교는 paired t-test를 이용하여 p<0.05 수준에서 유의성을 검증하였다.Plasma samples were diluted 10-fold with the analytical diluent and 100 [mu] l were treated on plates with capture antibodies. After the treatment, the cells were incubated for 1 hour at room temperature (400 rpm) while shaking. It was then washed three times with wash buffer (300 l). 100 [mu] l of the detection antibody (Anti-p53 PAb1801; Abcam, ab28) was diluted with the analytical dilution, and the plate was treated with the plate (100 ng / ml) and incubated for 1 hour at room temperature with shaking (400 rpm). It was then washed three times with wash buffer (300 l). Streptavidin-poly HRP (Pierce, 21140) was diluted X20,000 times with PBS (0.01 M, pH 7.4) and then treated with plates (100 L) and incubated at room temperature for 30 minutes (400 rpm). It was then washed three times with wash buffer (300 l). 100 μl of TMB (3,3 ', 5,5'-tetramethyl benzidine) was treated on the plate, incubated for 20 minutes at 37 ° C, and the reaction was terminated with 50 μl of termination solution. Optical density values were measured at 450 nm using a microplate reader at 0.1 second intervals. All statistical analyzes were performed using MiniTab version 14 (Minitab Inc., State College, PA, USA). Results were expressed as mean and standard deviation (SD), and all results were compared using paired t-test at p <0.05.

이와 같이 정상인과 대장암 환자의 혈액을 이용하여 혈장 내에 존재하는 전체 멀티머 형의 p53의 양을 MDS 법으로 측정하였으며, 실험결과는 도 2에 나타내었다.The total amount of multimeric p53 present in plasma was measured by the MDS method using the blood of normal and colorectal cancer patients. The results of the experiment are shown in FIG.

도 2에 나타난 바와 같이, 대장암 환자의 혈액에서는 정상인에 비하여 현저히 적은 양의 전체 멀티머 형의 p53이 검출되었다(도 2). 이러한 결과는, 혈액 내에 존재하는 전체 멀티머 형의 p53의 양을 측정하여 대장암을 신속하고 정확하게 진단할 수 있음을 의미한다.
As shown in Fig. 2, a significantly smaller amount of whole multimeric p53 was detected in the blood of patients with colorectal cancer (Fig. 2). These results indicate that the total amount of multimeric p53 present in the blood can be measured to quickly and accurately diagnose colon cancer.

이상으로 본 발명의 특정한 부분을 상세히 기술하였는바, 당업계의 통상의 지식을 가진 자에게 있어서 이러한 구체적인 기술은 단지 바람직한 구현 예일 뿐이며, 이에 본 발명의 범위가 제한되는 것이 아닌 점은 명백하다. 따라서, 본 발명의 실질적인 범위는 첨부된 청구항과 그의 등가물에 의하여 정의된다고 할 것이다.While the present invention has been particularly shown and described with reference to exemplary embodiments thereof, it is to be understood that the same is by way of illustration and example only and is not to be construed as limiting the scope of the present invention. Accordingly, the actual scope of the present invention will be defined by the appended claims and their equivalents.

<110> Gachon University of Medicne and Science Industry-Academic Cooperation Foundation <120> Novel Biomarker Indicative of Colorectal Cancer and Their Uses <130> PN140310 <160> 5 <170> KopatentIn 2.0 <210> 1 <211> 10 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> epitope of PAb1801 antibody <400> 1 Ser Pro Asp Asp Ile Glu Gln Trp Phe Thr 1 5 10 <210> 2 <211> 10 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> epitope of BP53-12 antibody <400> 2 Gln Glu Thr Phe Ser Asp Leu Trp Lys Leu 1 5 10 <210> 3 <211> 10 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> epitope of DO-11 antibody <400> 3 Arg Cys Ser Asp Ser Asp Gly Leu Ala Pro 1 5 10 <210> 4 <211> 9 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> epitope of PAb122 antibody <400> 4 Lys Ser Lys Lys Gly Gln Ser Thr Ser 1 5 <210> 5 <211> 393 <212> PRT <213> homo sapiens <400> 5 Met Glu Glu Pro Gln Ser Asp Pro Ser Val Glu Pro Pro Leu Ser Gln 1 5 10 15 Glu Thr Phe Ser Asp Leu Trp Lys Leu Leu Pro Glu Asn Asn Val Leu 20 25 30 Ser Pro Leu Pro Ser Gln Ala Met Asp Asp Leu Met Leu Ser Pro Asp 35 40 45 Asp Ile Glu Gln Trp Phe Thr Glu Asp Pro Gly Pro Asp Asp Glu Ala 50 55 60 Pro Arg Met Pro Glu Ala Ala Pro Arg Val Ala Pro Ala Pro Ala Ala 65 70 75 80 Pro Thr Pro Ala Ala Pro Ala Pro Ala Pro Ser Trp Pro Leu Ser Ser 85 90 95 Ser Val Pro Ser Gln Lys Thr Tyr Gln Gly Ser Tyr Gly Phe Arg Leu 100 105 110 Gly Phe Leu His Ser Gly Thr Ala Lys Ser Val Thr Cys Thr Tyr Ser 115 120 125 Pro Ala Leu Asn Lys Met Phe Cys Gln Leu Ala Lys Thr Cys Pro Val 130 135 140 Gln Leu Trp Val Asp Ser Thr Pro Pro Pro Gly Thr Arg Val Arg Ala 145 150 155 160 Met Ala Ile Tyr Lys Gln Ser Gln His Met Thr Glu Val Val Arg Arg 165 170 175 Cys Pro His His Glu Arg Cys Ser Asp Ser Asp Gly Leu Ala Pro Pro 180 185 190 Gln His Leu Ile Arg Val Glu Gly Asn Leu Arg Val Glu Tyr Leu Asp 195 200 205 Asp Arg Asn Thr Phe Arg His Ser Val Val Val Pro Tyr Glu Pro Pro 210 215 220 Glu Val Gly Ser Asp Cys Thr Thr Ile His Tyr Asn Tyr Met Cys Asn 225 230 235 240 Ser Ser Cys Met Gly Gly Met Asn Arg Arg Pro Ile Leu Thr Ile Ile 245 250 255 Thr Leu Glu Asp Ser Ser Gly Asn Leu Leu Gly Arg Asn Ser Phe Glu 260 265 270 Val Arg Val Cys Ala Cys Pro Gly Arg Arg Arg Thr Glu Lys Glu Asn 275 280 285 Leu Arg Lys Lys Gly Glu Pro His His Glu Leu Pro Pro Gly Ser Thr 290 295 300 Lys Arg Ala Leu Pro Asn Asn Thr Ser Ser Ser Pro Gln Pro Lys Lys 305 310 315 320 Lys Pro Leu Asp Gly Glu Tyr Phe Thr Leu Gln Ile Arg Gly Arg Glu 325 330 335 Arg Phe Glu Met Phe Arg Glu Leu Asn Glu Ala Leu Glu Leu Lys Asp 340 345 350 Ala Gln Ala Gly Lys Glu Pro Gly Gly Ser Arg Ala His Ser Ser His 355 360 365 Leu Lys Ser Lys Lys Gly Gln Ser Thr Ser Arg His Lys Lys Leu Met 370 375 380 Phe Lys Thr Glu Gly Pro Asp Ser Asp 385 390 <110> Gachon University of Medicine and Science Industry-Academic Cooperation Foundation <120> Novel Biomarker Indicative of Colorectal Cancer and Their Uses <130> PN140310 <160> 5 <170> Kopatentin 2.0 <210> 1 <211> 10 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> epitope of PAb1801 antibody <400> 1 Ser Pro Asp Asp Ile Glu Gln Trp Phe Thr   1 5 10 <210> 2 <211> 10 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> epitope of BP53-12 antibody <400> 2 Gln Glu Thr Phe Ser Asp Leu Trp Lys Leu   1 5 10 <210> 3 <211> 10 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> epitope of DO-11 antibody <400> 3 Arg Cys Ser Asp Ser Asp Gly Leu Ala Pro   1 5 10 <210> 4 <211> 9 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> epitope of PAb122 antibody <400> 4 Lys Ser Lys Lys Gly Gln Ser Thr Ser   1 5 <210> 5 <211> 393 <212> PRT <213> homo sapiens <400> 5 Met Glu Glu Pro Gln Ser Asp Pro Ser Val Glu Pro Pro Leu Ser Gln   1 5 10 15 Glu Thr Phe Ser Asp Leu Trp Lys Leu Leu Pro Glu Asn Asn Val Leu              20 25 30 Ser Pro Leu Pro Ser Gln Ala Met Asp Asp Leu Met Leu Ser Pro Asp          35 40 45 Asp Ile Glu Gln Trp Phe Thr Glu Asp Pro Gly Pro Asp Asp Glu Ala      50 55 60 Pro Arg Met Pro Glu Ala Ala Pro Arg Val Ala Pro Ala Pro Ala Ala  65 70 75 80 Pro Thr Pro Ala Ala Pro Ala Pro Ala Pro Ser Trp Pro Leu Ser Ser                  85 90 95 Ser Val Pro Ser Gln Lys Thr Tyr Gln Gly Ser Tyr Gly Phe Arg Leu             100 105 110 Gly Phe Leu His Ser Gly Thr Ala Lys Ser Val Thr Cys Thr Tyr Ser         115 120 125 Pro Ala Leu Asn Lys Met Phe Cys Gln Leu Ala Lys Thr Cys Pro Val     130 135 140 Gln Leu Trp Val Asp Ser Thr Pro Pro Pro Gly Thr Arg Val Arg Ala 145 150 155 160 Met Ala Ile Tyr Lys Gln Ser Gln His Met Thr Glu Val Val Arg Arg                 165 170 175 Cys Pro His His Glu Arg Cys Ser Asp Ser Asp Gly Leu Ala Pro Pro             180 185 190 Gln His Leu Ile Arg Val Glu Gly Asn Leu Arg Val Glu Tyr Leu Asp         195 200 205 Asp Arg Asn Thr Phe Arg His Ser Val Val Val Pro Tyr Glu Pro Pro     210 215 220 Glu Val Gly Ser Asp Cys Thr Thr Ile His Tyr Asn Tyr Met Cys Asn 225 230 235 240 Ser Ser Cys Met Gly Gly Met Asn Arg Arg Pro Ile Leu Thr Ile Ile                 245 250 255 Thr Leu Glu Asp Ser Ser Gly Asn Leu Leu Gly Arg Asn Ser Phe Glu             260 265 270 Val Arg Val Cys Ala Cys Pro Gly Arg Arg Arg Thr Glu Lys Glu Asn         275 280 285 Leu Arg Lys Lys Gly Glu Pro His His Glu Leu Pro Pro Gly Ser Thr     290 295 300 Lys Arg Ala Leu Pro Asn Asn Thr Ser Ser Ser Pro Gln Pro Lys Lys 305 310 315 320 Lys Pro Leu Asp Gly Glu Tyr Phe Thr Leu Gln Ile Arg Gly Arg Glu                 325 330 335 Arg Phe Glu Met Phe Arg Glu Leu Asn Glu Ala Leu Glu Leu Lys Asp             340 345 350 Ala Gln Ala Gly Lys Glu Pro Gly Gly Ser Ser Ala His Ser Ser His         355 360 365 Leu Lys Ser Lys Lys Gly Gln Ser Thr Ser Arg His Lys Lys Leu Met     370 375 380 Phe Lys Thr Glu Gly Pro Asp Ser Asp 385 390

Claims (5)

p53 상의 에피토프에 결합하여 인간의 생물학적 시료 내에 존재하는 모노머 형 또는 멀티머 형의 p53을 포획하는 포획 제제; 및 상기 포획 제제가 결합하는 p53 상의 에피토프와 오버래핑 된 에피토프에 결합하는 검출 제제를 포함하고, 상기 포획 및 검출 제제는 항체 또는 앱타머인 것을 특징으로 하는 대장암 진단용 키트.
a capture agent that binds to an epitope on p53 and captures monomeric or multimeric forms of p53 present in a human biological sample; And a detection agent that binds to an epitope overlapped with an epitope on p53 to which said capture agent binds, wherein said capture and detection agent is an antibody or an aptamer.
제 1 항에 있어서, 상기 에피토프는 서열목록 제1서열 내지 제4서열로 구성된 군으로부터 선택된 아미노산 서열인 것을 특징으로 하는 키트.
2. The kit according to claim 1, wherein the epitope is an amino acid sequence selected from the group consisting of SEQ ID NOS: 1 to 4.
제 1 항에 있어서, 상기 생물학적 시료는 혈액, 혈장 또는 혈청인 것을 특징으로 하는 키트.
The kit according to claim 1, wherein the biological sample is blood, plasma or serum.
대장암 진단에 필요한 정보를 제공하기 위하여 인간의 생물학적 시료에 있는 멀티머 형의 p53의 존재여부 또는 양을 측정하는 단계를 통하여 대장암 마커를 검출하는 방법.
A method of detecting a colon cancer marker by measuring the presence or amount of a multimeric p53 in a human biological sample to provide information necessary for colon cancer diagnosis.
제 4 항에 있어서, 상기 방법은 (a) p53에 대해 결합능이 있고 고상의 매트릭스에 고정화된 포획 항체에 인간으로부터 분리된 생물학적 시료를 접촉시키는 단계; (b) 단계 (a)의 결과물에 상기 포획 항체가 결합하는 p53 상의 에피토프와 오버래핑 된 에피토프에 결합하는 검출 항체를 접촉시키는 단계; 및 (c) 단계 (b)에서 형성된 항원-항체 복합체를 검출하는 단계를 포함하는 것을 특징으로 하는 방법.5. The method of claim 4, wherein the method comprises the steps of: (a) contacting a biological sample isolated from a human with a capture antibody immobilized on a solid phase matrix capable of binding to p53; (b) contacting a resultant product of step (a) with an epitope on p53 to which said capture antibody binds, with a detection antibody that binds to the overlapped epitope; And (c) detecting an antigen-antibody complex formed in step (b).
KR1020140183439A 2014-12-18 2014-12-18 Novel Biomarker Indicative of Colorectal Cancer and Their Uses KR101652894B1 (en)

Priority Applications (1)

Application Number Priority Date Filing Date Title
KR1020140183439A KR101652894B1 (en) 2014-12-18 2014-12-18 Novel Biomarker Indicative of Colorectal Cancer and Their Uses

Applications Claiming Priority (1)

Application Number Priority Date Filing Date Title
KR1020140183439A KR101652894B1 (en) 2014-12-18 2014-12-18 Novel Biomarker Indicative of Colorectal Cancer and Their Uses

Publications (2)

Publication Number Publication Date
KR20160074848A true KR20160074848A (en) 2016-06-29
KR101652894B1 KR101652894B1 (en) 2016-09-02

Family

ID=56365440

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
KR1020140183439A KR101652894B1 (en) 2014-12-18 2014-12-18 Novel Biomarker Indicative of Colorectal Cancer and Their Uses

Country Status (1)

Country Link
KR (1) KR101652894B1 (en)

Citations (3)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
JP2007222170A (en) * 1994-07-20 2007-09-06 Univ Of Dundee Interruption of binding of mdm2 and p53 protein and therapeutic application thereof
KR101212024B1 (en) 2011-08-08 2012-12-13 한국생명공학연구원 Biomarkers Indicative of Colon Cancer and Metastasis and Diagnosis and Screening Therapeutics Using the Same
KR101311718B1 (en) 2011-07-05 2013-09-25 한국과학기술연구원 Protein marker RPE-spondin for colon cancer diagnosis and diagnosis kit for colon cancer using antibodies against the same

Patent Citations (3)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
JP2007222170A (en) * 1994-07-20 2007-09-06 Univ Of Dundee Interruption of binding of mdm2 and p53 protein and therapeutic application thereof
KR101311718B1 (en) 2011-07-05 2013-09-25 한국과학기술연구원 Protein marker RPE-spondin for colon cancer diagnosis and diagnosis kit for colon cancer using antibodies against the same
KR101212024B1 (en) 2011-08-08 2012-12-13 한국생명공학연구원 Biomarkers Indicative of Colon Cancer and Metastasis and Diagnosis and Screening Therapeutics Using the Same

Non-Patent Citations (1)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Title
Rodrigues, N. R. 외, "p53 mutation in colorectal cancer"(1990년)* *

Also Published As

Publication number Publication date
KR101652894B1 (en) 2016-09-02

Similar Documents

Publication Publication Date Title
Chen et al. Elevated level of anterior gradient-2 in pancreatic juice from patients with pre-malignant pancreatic neoplasia
CN105755112B (en) The diagnosis of colorectal cancer
JP2009527735A (en) Free NGAL as a biomarker for cancer
WO2022083673A1 (en) Biomarker for esophageal cancer, and use thereof
US9562906B2 (en) Methods for detection of gastric cancer
JP6925328B2 (en) Methods for detecting nucleosomes containing histone modifications and variants
JP2017133831A (en) Detecting method for colorectal cancer metastasis
CN103038642B (en) Method, array and use thereof
KR20190013707A (en) Use of the nucleosome-transcription factor complex for cancer detection
WO2016195051A1 (en) Plasma biomarker panel for diagnosing pancreatic cancer
KR101589285B1 (en) Paralemmin as a marker of cardiovascular disorders and cardiovascular disorders diagnostic kit using thereof
JP6639408B2 (en) Method for detecting arteriosclerosis and cancer using deoxyhypusine synthase gene as an index
KR101652894B1 (en) Novel Biomarker Indicative of Colorectal Cancer and Their Uses
ES2939143T3 (en) Biomarkers for a Combination Therapy Comprising Lenvatinib and Everolimus
KR101702115B1 (en) Novel Biomarker Indicative of Colorectal Cancer and Their Uses
US8697368B2 (en) Diagnostic marker for lung cancer comprising HPαR as active ingredient
KR20130005087A (en) Protein marker melanotransferrin for colon cancer diagnosis and diagnosis kit for colon cancer using antibodies against the same
KR100883530B1 (en) Protein marker adenosylhomocysteinase for colon cancer diagnosis and diagnosis kit for colon cancer using antibodies against the same
ES2539723T3 (en) Method to determine the risk of developing brain metastases and a kit to carry out said method
KR102131860B1 (en) Biomarker Composition for Diagnosing Colorectal Cancer Specifically Binding to Arginine-methylated Gamma-glutamyl Transferase 1
KR102128251B1 (en) Biomarker Composition for Diagnosing Colorectal Cancer Specifically Binding to Arginine-methylated Dopamine Receptor D2
KR101893244B1 (en) Novel Biomarker Indicative of Diabetes and Their Uses
WO2008095110A2 (en) Compositions and methods for detecting cancers in a subject
JP4795353B2 (en) Use of carbamoyl phosphate synthase 1 (CPS1) as a humoral biomarker for the diagnosis of tumor diseases and chronic inflammatory bowel disease
KR101977410B1 (en) Novel Biomarker Indicative of Diabetes and Their Uses

Legal Events

Date Code Title Description
A201 Request for examination
E902 Notification of reason for refusal
E701 Decision to grant or registration of patent right
GRNT Written decision to grant
FPAY Annual fee payment

Payment date: 20190826

Year of fee payment: 4