KR20150111015A - Biochip for the detection and determination of the concentration of cardiac biomakers, and method for the detection and determination of cardiac biomakers using the same - Google Patents

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Abstract

The present invention relates to a protein analysis method for measuring a complex of an antibody-gene conjugate, an antigen and a labeling substance-secondary antibody conjugate by using a biochip of a 9G guanine DNA chip type; a method for quickly and simultaneously detecting various types of heart disease biomarker proteins (cTnI, NT proBNP and BNP) at a pictogram concentration level used to separate a normal state and an abnormal state of the heart disease biomarker proteins by using a standard concentration-sensitivity graph and for analyzing the concentration thereof; and a method for diagnosing heart diseases, monitoring heart disease progression and treatment processes of heart diseases, and determining whether the heart diseases are completedly cured or not.

Description

심질환 바이오마커의 표준농도-감도 테이블에 의한 심질환의 진행상태 및 치료상태를 모니터링하는 방법 및 이를 위한 바이오칩 {Biochip for the detection and determination of the concentration of cardiac biomakers, and method for the detection and determination of cardiac biomakers using the same}TECHNICAL FIELD [0001] The present invention relates to a method for monitoring progress and treatment status of cardiovascular diseases by a standard concentration-sensitivity table of cardiovascular biomarkers, and a biochip for such monitoring and determination of cardiac biomarkers using the same}

본 발명은 심질환 바이오마커를 함유하는 표준샘플의 농도-감도 그래프를 이용하여 심질환 바이오마커들의 농도를 신속하고 정량적으로 측청함으로써 심질환을 진단하는 방법 및 심질환의 진행 및 치료상태를 모니터링하는 방법에 관한 것이다. The present invention relates to a method for diagnosing cardiovascular disease by rapidly and quantitatively monitoring the concentration of cardiovascular biomarkers using a concentration-sensitivity graph of a standard sample containing a cardiovascular biomarker, and a method for monitoring progress and treatment status of cardiovascular diseases .

더욱 구체적으로는, 본 발명은 심질환 바이오마커의 농도에 따라 측정수단의 민감도가 비례하여 측정될 수 있는 바이오칩을 사용하여, 심질환 바이오마커를 함유하는 표준샘플의 농도-감도 그래프를 작성하고, 상기 동일한 유형의 바이오칩을 사용하여 피험자의 혈액샘플에서 심질환 바이오마커들를 검출하고, 상기 표준샘플 농도-감도 그래프와 비교하여 이들의 농도를 정량적으로 결정하고, 이에 의해 심질환을 진단하는 방법 및 심질환의 진행 및 치료상태를 모니터링하는 방법에 관한 것이다. More specifically, the present invention creates a concentration-sensitivity graph of a standard sample containing a heart disease biomarker using a biochip that can be measured in proportion to the sensitivity of the measurement means according to the concentration of the heart disease biomarker, Type biochip to detect heart disease biomarkers in a blood sample of a subject and to quantitatively determine their concentration by comparison with the standard sample concentration-sensitivity graph, thereby diagnosing heart disease, And more particularly to a method for monitoring status.

사람 주먹만한 크기의 심장은 그 기능이 저하되면 인체에 미치는 영향이 대단히 큰데, 혈액순환의 저하뿐만 아니라 심근경색, 고혈압, 심부전, 부정맥, 심근증 등 치사율이 높은 질병에 걸리기 쉽기 때문이다. 세계보건기구 (WHO)의 통계에 따르면 심혈관계질환은 전 세계적으로 사망률 29.2%로서 1위를 차지하고 있으며, 우리나라에서도 지난 30년간 심혈관계질환의 발병률 및 유병률이 매우 가파르게 높아지고 있으며 암, 뇌혈관질환에 이어 사망률이 높다 (참고, 통계청, 2006). The heart of a man-sized fist has a very large effect on the human body when its function is deteriorated because it is easy to suffer from diseases with high mortality such as myocardial infarction, hypertension, heart failure, arrhythmia and cardiomyopathy as well as deterioration of blood circulation. According to statistics of the World Health Organization (WHO), cardiovascular disease is the world's leading cause of death with a death rate of 29.2%. In Korea, the incidence and prevalence of cardiovascular disease has increased sharply in the last 30 years, The mortality rate is high (Reference, National Statistical Office, 2006).

심혈관 질환은 국내 혈관질환에 의한 사망자의 1/3 수준을 차지하고 있으며 40-50대의 급성사망 원인의 중요 원인으로 꼽히고 있다. 특히 평소 건강을 자부하는 중년이 돌연사하는 경우 80%가 급성 심근경색(AMI)이다. 또 연령 증가에 따라 조기발견 되지 않으면 사망률이 급증하는 것으로 알려져 있고 동시에 정기적인 검진이 필수적인 질병으로 알려져 있다. 이 질병은 주로 심혈관계의 막힘 현상에 의해 초래되기 때문에 초기에 증상을 판단하여 적절한 처치를 하지 못하면 대부분 사망에 이르게 된다. 또 이 질병에 의한 사망자의 대부분이 사회 경제적으로 중추적인 역할을 하는 40-50대이기 때문에 이 질병을 조기에 진단하고 적절한 조치를 할 수 있게 하는 진단기술 및 제품의 개발은 국가경제의 활력증진 및 국민보건향상에 필수적이라 할 수 있다. Cardiovascular disease accounts for one-third of deaths from domestic vascular disease and is considered to be a major cause of acute deaths in the 40-50 age group. Especially, in the case of a sudden middle-aged man who is very proud of his health, 80% is an acute myocardial infarction (AMI). In addition, it is known that if mortality is not detected early due to age increase, it is known that periodic screening is essential. Because this disease is mainly caused by clogging of cardiovascular system, if the symptoms are judged early and proper treatment is not done, it will mostly lead to death. Since most of the deaths due to this disease are socially and economically important in the 40s and 50s, the development of diagnostic technologies and products that can diagnose the disease early and take appropriate measures will enhance the vitality of the national economy, It can be said that it is necessary to improve the public health.

미국 심장학회(ACC/AHA) 가이드 라인을 보면 첫째, 20분 이상의 흉통, 둘째, 심전도의 변화, 셋째, 심질환 마커 (Cardiac marker) 농도의 증가 등과 같은 3가지 조건 중에서 최소 2개 이상이 해당 될 경우 급성심근경색(Acute Myocardial Infarction, AMI)로 진단하고 있다.The American College of Cardiology guidelines (ACC / AHA) suggest that at least two of the three conditions, first of all, chest pain over 20 minutes, second, changes in ECG, and increased cardiac marker concentrations Acute myocardial infarction (AMI) is diagnosed.

급성심근경색 (AMI)은 증상이 나타난 후 한 시간 이내에 사망하는 환자가 전체 사망자의 절반 이상이기 때문에 신속한 진단과 치료가 중요하다. 그러나, X-ray나 심전도 등의 기본검사, 심장초음파 등의 정밀검사들은 시간과 장비가 요구되고, AMI 환자의 약 20% 이상은 심전도의 변화를 나타내지 않아서 흉통과 심전도는 AMI 진단에 대한 기준으로써 다소 미흡하기 때문에, 급성심근경색의 주요 진단기준으로서 심질환 바이오마커 (Cardiac Bio-Markers)의 중요성이 더욱 강조되고 있으며, 때문에 신속한 혈액진단 방법의 개발이 요구되어 왔다. Acute myocardial infarction (AMI) is important because rapid diagnosis and treatment are important because more than half of all deaths occur within one hour of symptom onset. However, basic tests such as X-ray and electrocardiogram, and echocardiography require time and equipment. Approximately 20% of AMI patients do not show electrocardiographic changes. Chest pain and electrocardiogram are the criteria for AMI diagnosis The importance of cardiac bio-markers as a major diagnostic criterion for acute myocardial infarction has been emphasized more and more, and therefore rapid development of blood diagnostic methods has been required.

현재 상용화되어 널리 쓰이고 있는 심근경색 진단기기는 혈액 속의 바이오마커를 형광전이(fluorescence resonance transfer, FRET) 기술을 이용하여 진단하고 있는데, 각각의 마커당 15분이 소요되며, 한 번에 하나의 마커에 대해서만 검출할 수 밖에 없으며, 검출 한계도 대부분 1∼10ng/mL 수준이다.Myocardial infarction diagnostic devices, which are widely used and widely used nowadays, diagnose biomarkers in blood using fluorescence resonance transfer (FRET) technique, which takes 15 minutes for each marker and only for one marker at a time And most of the detection limit is 1 ~ 10 ng / mL.

심질환 마커의 급격한 농도변화를 신속히 그리고 적시에 진단 및 판단하는 것은 급성심근경색(AMI)에 대해서는 매우 필요하다. 특히 가슴에 가벼운 통증이 있는 경우에 자가진단, 병원방문, 신속처리 등에 필요할 뿐만 아니라, 진단 및 치료과정에서 심질환 마커의 농도를 완치수준까지 검출하여 치료과정이 완료되었음을 확인할 수 있는 방법으로서도 매우 유용하다. Rapid and timely diagnosis and determination of rapid changes in cardiac marker markers is highly needed for acute myocardial infarction (AMI). It is very useful not only for self-diagnosis, hospital visit, and rapid treatment when there is a slight pain in the chest but also as a method for confirming that the treatment process is completed by detecting the concentration of the heart disease marker in the diagnosis and treatment process to the cure level .

심질환 마커로서는 심혈관 질환을 반영하는 바이오마커인 Cardiac troponin I(cTnI)와 급성 호흡곤란의 감별 진단, 심부전의 진단 및 예후판정 등에 유용한 바이오마커로 B-type natriuretic peptide(BNP) 혹은 Nterminal proBNP(NT proBNP)가 많이 활용되고 있다. B-type natriuretic peptide (BNP) or nterminal proBNP (NT proBNP), which is a useful biomarker for differential diagnosis of cardiac troponin I (cTnI) and acute respiratory distress, and diagnosis of heart failure and prognosis, ) Is widely used.

cTnI은 정상치와 이상치를 구분하는 수치가 250pg/ml, NT proBNP는 80pg/ml, BNP는 100-400pg/ml 수준 (참고문헌: American Heart Association Circulation, 2002; 105: 2328-2331. Biosite Package Insert., en.wikipedia.org/wiki/Troponin) 으로 알려져 있어 수백 pg/ml부터 수십 pg/ml 수준까지 바이오마커를 정량적으로 분석하는 것이 매우 중요하다. The cTnI level was 250 pg / ml, NT proBNP was 80 pg / ml, and BNP was 100-400 pg / ml, which distinguishes between normal and abnormal values (Reference: American Heart Association Circulation, 2002; 105: 2328-2331. , en.wikipedia.org/wiki/Troponin), it is very important to quantitatively analyze biomarkers from several hundred pg / ml to several tens of pg / ml.

심질환 바이오마커 단백질의 분석에 지금까지 널리 사용되고 있는 ELISA plate 또는 NC membrane 등의 기술은 주로 고체기질 위에 항체 단백질을 화학결합 혹은 물리흡착으로 고정시킨 다음, 단백질 농도를 측정하는 검출방식을 사용하고 있다. 화학결합에 의한 고정기술에서는 고정화 후 시간이 경과함에 따라서 고정화된 단백질의 활성이 감소하므로 높은 민감도 확보가 어렵고, 물리흡착에 의한 고정기술에서는 고정화되는 단백질의 방향성 제어와 고정화 후 단백질 활성 유지가 어려워 민감도 및 재현성 확보가 어렵다. 또한 고체 기질 상에 고정화된 단백질은 시간이 경과할수록 고정화된 단백질의 변성, 비특이 결합들이 발생하게 되어 다종의 심질환 바이오마커를 이상상태 및 정상상태로 구분할 수 있게 해주는 수백 pg/ml부터 수십 pg/ml 의 농도수준에서의 정밀한 분석에는 매우 어려운 문제점들이 있다. Techniques such as ELISA plate or NC membrane, which have been widely used for analysis of cardiovascular biomarker proteins, mainly use a detection method in which an antibody protein is immobilized on a solid substrate by chemical bonding or physical adsorption, and then protein concentration is measured. In the fixing technique by chemical bonding, since the activity of the immobilized protein decreases with time after immobilization, it is difficult to secure high sensitivity. In the immobilization technique by physical adsorption, it is difficult to maintain the protein activity after immobilization of the immobilized protein, And it is difficult to ensure reproducibility. In addition, proteins immobilized on a solid substrate will be denatured and non-specific binding to immobilized proteins as time goes by, resulting in several hundred pg / ml to several tens of pg / ml, which allows discrimination of multiple heart disease biomarkers into an abnormal state and a normal state. lt; RTI ID = 0.0 > mg / ml. < / RTI >

때문에, 지금까지 알려진 심질환 마커 진단 기술 및 제품들은 대부분 심질환 표지마커들을 하나씩 진단하는 것들이며, 또한 1ng/ml 이상에서는 정량적인 농도분석이 가능하지만 그 이하의 농도변화를 확인하는 것은 어려웠다. For this reason, known diagnostic methods and products for cardiovascular markers are mostly diagnostic of cardiogenic marker markers, and quantitative concentration analysis is possible at more than 1 ng / ml, but it has been difficult to confirm the concentration change below this level.

급성심근경색(AMI)의 경우 빠른 진단과 치료가 필요한데, 심질환 바이오마커 단백질의 농도를 바이오칩을 사용하여 측정하고 측정된 농도수치를 근거로 심질환의 진행상황 및 치료상태를 판단하기 위해서는, 시료 내에 수십 pg 내지 수백 pg의 극미량으로 함유된 여러 가지 심질환 바이오마커 단백질들을 동시에 신속하고 정밀하게 검출할 수 있는 기술의 개발은 매우 중요한 의미를 갖는다. In the case of acute myocardial infarction (AMI), rapid diagnosis and treatment are required. In order to determine the progress of the heart disease and the treatment state based on the measurement of the concentration of the heart disease biomarker protein using the biochip, The development of a technique for simultaneously and rapidly detecting various coronary heart disease biomarker proteins contained in trace amounts of pg to several hundred pg is very important.

한편, 심질환 바이오마커 단백질의 검출 및 농도 측정을 위한 하나의 방법 또는 수단으로서 단백질칩과 같은 바이오칩의 사용이 많이 시도되고 있다. 하지만, 표지 단백질 분석을 위한 단백질 칩 기반기술은 주로 다양한 분자인식 기술을 이용해 좁은 공간에 다수의 단백질을 칩 표면에 고정하는 방식이 주류를 이뤘으며 대부분 연구용으로 사용돼왔다. 특히 대다수의 표지 단백질의 분석이 결합용 항체와 분석에 필요한 물질이 부착된 이차항체 사이에 항체-항원-항체의 샌드위치 형태로 결합된 상태에서 이루어져 재현성 있는 분석이 쉽지 않았다. On the other hand, many attempts have been made to use biochips such as protein chips as a method or means for the detection and concentration measurement of cardiovascular biomarker proteins. However, protein chip-based technology for analyzing the labeled protein has mainly used a method of fixing a large number of proteins on a chip surface in a narrow space by using various molecular recognition technologies, and has been mainly used for research. In particular, analysis of the majority of the labeled proteins was carried out in a sandwich form of the antibody-antigen-antibody between the binding antibody and the secondary antibody attached to the substance required for analysis, so that reproducible analysis was difficult.

본 발명의 발명자들은 대한민국 특허출원 10-2005-0096322호에서 아미노캘릭스아렌 유도체 및 연속된 구아닌-부착된 유전자를 사용하여 신속하고 고감도로 목적하는 유전자를 검출할 수 유전자칩을 개시하였으며, 대한민국 특허출원 10-2008-0093800호에서는 아미노캘릭스아민 유도체 및 연속된 구아닌-부착된 유전자를 사용하여 상온 교잡반응이 가능한 유전자칩을 개시하고 있다. The inventors of the present invention have disclosed a gene chip capable of detecting a desired gene with a rapid and high sensitivity by using an amino-calixarene derivative and a continuous guanine-attached gene in Korean Patent Application No. 10-2005-0096322, The application 10-2008-0093800 discloses a gene chip capable of hybridization at room temperature using an amino-calixamine derivative and a continuous guanine-attached gene.

본 발명의 발명자들에 의해 발표된 논문 (Chem. Commun., 2011, 47, 7716-7718)에는 상술한 문헌에서 개시된 유전차칩을 사용하여 피코그램 수준에서 바이오마커를 검출할 수 있는 기술을 개시하고 있다. 상기 기술은 다수의 결합용 항체와 이차항체 등을 각각의 표지 단백질과 용액 상에서 신속하게 결합한 뒤 각각의 단백질이 칩 안의 정해진 위치에 유전자-유전자 결합을 이용해 고정되는 것으로서, 기존의 단백질 칩 기반기술에서 나타나던 문제를 대부분 해결하고 있다. 하지만, 상기 논문은 심질환 바이오마커가 아니라 피코그램 수준으로 존재하는 일반적인 바이오마커들을 동시에 검출하는 것은 언급하고 있지만, 이러한 바이오마커 단백질들의 농도를 정량적으로 분석하지는 못하고 있다. In a paper published by the inventors of the present invention (Chem. Commun., 2011, 47 , 7716-7718), a technique for detecting a biomarker at a picogram level using a genetic chip disclosed in the above-mentioned document is disclosed have. The above technique is a method in which a plurality of binding antibodies and a secondary antibody are rapidly bound to each labeled protein in solution and then each protein is immobilized using gene-gene binding at a predetermined position in the chip. Most of the problems have been solved. However, although the above-mentioned article refers to detecting not only cardiovascular biomarkers but general biomarkers existing at the picogram level, it is not possible to quantitatively analyze the concentrations of these biomarker proteins.

따라서, 여러 가지 심질환 바이오마커들을 동시에 신속하게 검출하고 아울러 이들의 농도를 피코그램 수준에서 정량적으로 결정할 수 있는 방법을 개발함으로써, 심질환의 진행과정 및/또는 치료과정에서 바이오마커의 농도 변화를 확인하고, 이를 통해 심질환의 진행상황 및/또는 치료상태를 모니터링할 수 있는 효과적인 수단에 대해 많은 필요성이 있어 왔다. Therefore, by detecting a variety of heart disease biomarkers simultaneously and quantitatively determining their concentrations at the picogram level, changes in the concentration of biomarkers in the process and / , There has been a great need for effective means for monitoring progress and / or treatment status of heart disease.

한국특허출원 10-2008-0093800호Korean Patent Application No. 10-2008-0093800

Chem. Commun., 2011, 47, 7716-7718Chem. Commun., 2011, 47, 7716-7718

본 발명자들은 기질, 아미노캘력스아민 유도체 및 9G-유전자로 된 유전자칩 (이후 9G DNA Chip으로도 칭함)을 개발하고, 여기에 항체-유전자 결합체, 항원 및 표지물질-항체 결합체를 사용하여 신호의 감도를 증폭시키는 방법을 사용하여 항원으로서 CRP 등의 바이오마커 단백질을 피코그램 수준에서도 검출할 수 있음을 발표한 바 있으나, 심질환 바이오마커의 이상상태 및 정상상태로 구분할 수 있게 해주는 수백 pg/ml부터 수십 pg/ml의 수준에서 이들의 농도를 정량적으로 분석 또는 결정할 수 있는 방법은 아직 개발되지 못하였다. The present inventors have developed a gene chip (hereinafter also referred to as 9G DNA chip) composed of a substrate, an amino-calixamine derivative and a 9G-gene, and used an antibody-gene conjugate, an antigen and a labeling- It has been reported that biomarker proteins such as CRP as an antigen can be detected at the level of picogram using a method of amplifying the sensitivity. However, it is difficult to distinguish the abnormal state of the heart disease biomarker from the abnormal state and several hundred pg / ml Methods for quantitatively analyzing or determining their concentrations at the level of tens of pg / ml have not yet been developed.

본 발명자들은 상술한 유전자칩을 사용하여 항원 단백질의 검출 및 농도결정에 대해 더욱 연구한 결과, 항체-유전자 결합체, 항원 및 표지물질-항체 결합체들이 복합체를 형성하여 상기 유전자칩에 정량적으로 결합하는 것을 발견하였는데, 이러한 발견을 근거로 심질환 바이오마커를 함유하는 표준샘플의 농도-감도 그래프를 작성할 수 있었으며, 상기 동일한 유형의 바이오칩을 사용하여 피험자의 혈액샘플에서 심질환 바이오마커들를 검출하여 심질환을 신속하게 진단할 수 있을 뿐만 아니라, 상기 표준샘플 농도-감도 그래프와 비교하여 이들의 농도를 피코그램 수준에서도 정량적으로 결정함으로써 심질환의 진행 및 치료상태를 모니터링할 수 있음을 발견하고 본 발명을 완성하였다. The present inventors have further studied the detection and concentration determination of an antigen protein using the above-described gene chip. As a result, it has been found that an antibody-gene conjugate, an antigen and a labeling substance-antibody conjugate form a complex and quantitatively bind to the gene chip Based on these findings, a concentration-sensitivity graph of a standard sample containing a cardiovascular biomarker could be generated. Using the same type of biochip, the cardiovascular biomarkers were detected in a blood sample of a subject, The present invention has been accomplished based on the discovery that quantitative determination of these concentrations at the picogram level as well as the standard sample concentration-sensitivity graphs can be performed to monitor the progression and treatment status of heart diseases.

본 발명에 따르면, 심질환 바이오마커 단백질의 이상상태 및 정상상태를 구분할 수 있게 해주는 피코그램 농도수준에서 다종의 심질환 바이오마커 단백질들을 동시에 신속하게 검출하고 이들의 농도를 동시에 정량적으로 분석할 수 있으며, 이에 의해 심질환의 진단 뿐만 아니라 심질환의 진행과정 및 치료과정을 모니터링하고 완치 판단을 가능하게 해줄 수 있다. According to the present invention, it is possible to rapidly and simultaneously detect various kinds of cardiovascular biomarker proteins at a picogram concentration level that allows discrimination between an abnormal state and a normal state of a heart disease biomarker protein, and simultaneously quantitatively analyze their concentrations. It is possible to monitor the progress and treatment process of the heart disease as well as the diagnosis of heart disease and make a cure judgment.

도 1은 항체-유전자 및 항체-형광체 합성에 대한 모식도이다.
도 2는 항체-유전자 및 항체-형광체 합성에서 얻어진 물질에 대한 나노드롭(Nanodrop) 측정 값이다.
도 3은 단백질 검출용 바이오칩의 형태 및 제조방법 모식도이다.
도 4는 단백질 검출방법 및 실험과정을 나타내고 있다.
도 5는 표준샘플을 사용하여 측정한 결과 및 감도 대비 농도 그래프를 나타내고 있다.
도 6은 최적의 내부표준스팟 감도 결과 및 내부표준스팟 감도 대비 단백질 농도를 나타낸 그래프이다.
도 7은 내부표준스팟이 적용된 단백질 검출용 바이오 칩 및 내부표준스팟(IS : Internal Standard) 과 단백질 검출 스팟(PD : Protein Detection)의 위치가 나타나있다.
도 8은 내부표준스팟으로 게인(gain)을 조절하여 얻어진 3가지 심질환 바이오마커 단백질 (cTnI, NT proBNP, BNP)의 실제농도 및 측정 농도 결과이다.
도 9는 혈액샘플 내의 3가지 심질환 바이오마커 단백질 (cTnI, NT proBNP, BNP)을 1/2 에서 1/32 까지 희석한 농도에서 측정된 결과이다.
Figure 1 is a schematic diagram of antibody-gene and antibody-phosphor syntheses.
Figure 2 is a Nanodrop measurement for a material obtained from antibody-gene and antibody-phosphor syntheses.
Fig. 3 is a schematic view showing a form and a manufacturing method of a biochip for protein detection.
Fig. 4 shows a protein detection method and an experimental procedure.
FIG. 5 shows the results of measurement using a standard sample and a sensitivity contrast concentration graph.
FIG. 6 is a graph showing optimal internal standard spot sensitivity results and protein concentration versus internal standard spot sensitivity. FIG.
FIG. 7 shows the position of an internal standard spot (IS) and a protein detection spot (PD) with a biochip for protein detection using an internal standard spot.
Figure 8 is the actual concentration and measured concentration results of the three heart disease biomarker proteins (cTnI, NT proBNP, BNP) obtained by adjusting the gain to the internal standard spot.
Figure 9 shows the results measured at a dilution from one half to one-thirty of the three heart disease biomarker proteins (cTnI, NT proBNP, BNP) in a blood sample.

하기 단계 (1)~(3)를 포함하는, 심질환 바이오마커의 정량적 분석 방법을 제공하는 것이다:There is provided a method for quantitative analysis of cardiovascular biomarkers comprising the following steps (1) to (3):

(1) 바이오칩을 이용하여 항원(antigen)인 심질환 바이오마커 단백질들의 표준농도-감도 그래프를 작성하고, (1) A standard concentration-sensitivity graph of anticholinergic biomarker proteins, which are antigens, is prepared using a biochip,

(2) 피험자의 혈액샘플을 바이오칩으로 분석하여 혈액에 포함된 심질환 바이오마커 단백질들의 측정감도를 수득하고, (2) analyzing a subject's blood sample with a biochip to obtain a measurement sensitivity of heart disease biomarker proteins contained in blood,

(3) 전술한 측정감도를 전술한 표준농도-감도 그래프와 비교하여 심질환 바이오마커 단백질들의 환산 농도를 결정하고, (3) determining the converted concentration of heart disease biomarker proteins by comparing the measured sensitivities described above with the standard concentration-sensitivity graphs described above,

(4) 상기 수득된 심질환 바이오마커 단백질들의 환산 농도로부터 심질환 진행태 또는 치료상태를 결정함. (4) Determination of progression of heart disease or treatment state from the converted concentration of the obtained heart disease biomarker proteins.

본 발명의 하나의 구현예에 따르면, 전술한 바이오칩은 심질환 바이오마커들을 피코그램 수준에서 검출할 수 있을 뿐만 아니라 피코그램 수준에서 농도를 정량적으로 분석할 수 있는 바이오칩에서 선택될 수 있다. 이러한 유형의 바이오칩으로서, 예를들면, 하기 (a)~(d)를 포함하는 바이오칩을 언급할 수 있다:According to one embodiment of the present invention, the biochip described above can be selected from biochips capable of detecting heart disease biomarkers at the picogram level as well as quantitatively analyzing the concentration at the picogram level. As this type of biochip, for example, a biochip including the following (a) to (d) can be mentioned:

(a) 고체 기질, (a) a solid substrate,

(b) 고체기질에의 부착수단 및 연속된 구아닌 염기의 인식 부위를 갖는 아미노캘릭스아렌 유도체, (b) means of attachment to a solid substrate and an amino-calixarene derivative having a recognition site for a continuous guanine base,

(c) 연속된 구아닌 염기 및 목적 염기(서열)을 갖는 고정화 유전자, 및 (c) an immobilized gene having a continuous guanine base and a desired base (sequence), and

(d) 상기 고정화 유전자에 상보 결합가능한 유전자 및 항체를 결합시킨 항체-유전자 결합체를 포함하는 바이오칩. (d) an antibody-gene conjugate comprising a complementary binding gene and an antibody bound to the immobilized gene.

상기 바이오칩에 있어서, 측정하고자 하는 샘플은 (e) 심질환 바이오마커 단백질 항원에 더하여 (f) 표지물질-항체 결합체가 측정 전 또는 측정시에 첨가되며, 전술한 성분 (d)는 바이오칩에 포함되어 있거나, 샘플 첨가 전후에 별도로 첨가될 수 있다. In the biochip, the sample to be measured may be added to (e) a heart-healthy biomarker protein antigen, (f) a marker-antibody conjugate before or during measurement, and (d) , And may be separately added before or after the sample is added.

또, 상기 기재된 바이오칩에 있어서, 전술한 아미노캘릭스아렌 유도체는 전술한 부착수단과 고체기질 표면 사이의 화학적 또는 물리적 결합에 의해 고체기질에 부착되어 있고, 전술한 고정화 유전자는 연속된 구아닌 염기에 의해 전술한 고정화 유전자의 연속된 구아닌 염기의 인식부위에 부착되어 있다. In the above-described biochip, the above-mentioned aminocylian arene derivative is attached to the solid substrate by chemical or physical bonding between the above-mentioned attachment means and the surface of the solid substrate, and the immobilized gene described above is bound to the solid substrate by a continuous guanine base Is attached to the recognition site of the continuous guanine base of the aforementioned immobilized gene.

본 발명의 하나의 구현예에 따르면, 전술한 표준농도-감도 그래프를 작성하기 위한 단계 (1)은 하기를 포함할 수 있다:According to one embodiment of the present invention, step (1) for creating a standard concentration-sensitivity graph as described above may comprise:

(1a) 항원인 심질환 바이오마커 단백질 1종 이상을 각각 소정농도로 함유하는 용액 및 이를 정해진 비율로 희석한 용액(들)을 각각 제조함으로써 표준용액을 준비하고, A solution containing a predetermined concentration of at least one kind of heart disease biomarker protein (1a) antigen and a solution (s) obtained by diluting the same at a predetermined ratio are prepared,

(1b) 전술한 표준용액들을 바이오칩으로 분석하여 표준감도를 수득하고, (1b) The standard solutions described above were analyzed by biochip to obtain a standard sensitivity,

(1c) 전술한 표준농도 및 수득된 표준감도로부터 표준농도-감도 그래프를 작성함. (1c) A standard concentration-sensitivity graph is prepared from the above-mentioned standard concentration and the obtained standard sensitivity.

본 발명의 하나의 변법에 따르면, 전술한 표준농도-감도 그래프는 표준농도의 수치 및 표준감도의 수치를 결합한 그래프 형태로서, 이 대신에 표준농도의 수치 및 표준감도의 이미지를 결합한 테이블 형태 (표준농도-감도 스팟)를 작성하여 사용할 수 있다. According to one variation of the present invention, the above-described standard density-sensitivity graph is a graph form combining numerical values of standard concentration and numerical values of standard sensitivity, and instead of this, a table in which standard concentration values and standard sensitivity images are combined Density-sensitivity spot) can be created and used.

본 발명의 하나의 구현예에 따르면, 성분 (d)는 바이오칩의 제조 시에 미리 첨가될 수도 있지만, 성분 (e) 및 (f)를 포함하는 샘플과 함께 또는 별도로 첨가될 수 있다. According to one embodiment of the present invention, the component (d) may be added beforehand or separately with the sample containing the components (e) and (f), although it may be added in advance in the production of the biochip.

본 발명의 하나의 구현예에 따르면, 전술한 심질환 바이오마커 단백질 항원은 cTnI, NT proBNP 및 BNP 중의 1종 이상, 바람직하게는 3종 모두이고, 전술한 항체는 상기 항원의 항체에서 선택될 수 있다. According to one embodiment of the present invention, the aforementioned cardiovascular biomarker protein antigen is one or more, preferably all three, of cTnI, NT proBNP and BNP, and the above-mentioned antibodies may be selected from the antibodies of the antigens .

본 발명의 하나의 구현예에 따르면, 상기 연속된 구아닌 염기는 구아닌(G) 염기가 7개 이상, 바람직하게는 9개가 연속적으로 결합되어 형성될 수 있다. 또, 목적 염기(서열)은 길이가 특별히 한정되지 않으며, 필요에 따라 13mer 이하, 14~17mer, 18~21mer 또는 22mer 이상에서 선택될 수있다. According to one embodiment of the present invention, the continuous guanine base may be formed by continuously connecting seven or more, preferably nine, guanine (G) bases. The desired base (sequence) is not particularly limited in length, and may be selected from 13 mer or less, 14 to 17 mer, 18 to 21 mer, or 22 mer or more, as necessary.

상기 고체기질은 금, 은, 백금과 같은 금속, 유리, 유리섬유 쉬트, 실리콘웨이퍼, 및 수정결정으로 이루어진 군에서 선택될 수 있으며, 기질의 표면은 예를들면 아민기, 실록산기 등으로 개질될 수 있다. The solid substrate may be selected from the group consisting of metals such as gold, silver, and platinum, glass, glass fiber sheets, silicon wafers, and crystal crystals, and the surface of the substrate may be modified with an amine group, a siloxane group, .

본 발명의 하나의 구현예에 따르면, 상기 아미노 캘릭스아렌 유도체는 하기 화학식 1 또는 화학식 2로 표시되는 아미노캘릭스아렌 유도체에서 선택될 수 있다:According to one embodiment of the present invention, the aminocylian arene derivative may be selected from aminocarboxylarene derivatives represented by the following general formula (1) or (2)

[화학식 1][Chemical Formula 1]

Figure pat00001
Figure pat00001

[화학식 2](2)

Figure pat00002

Figure pat00002

[상기 식 중에서, R1, R2, R3, R4, R5, R6, R7, R8, R'1, R'2, R'3, R'4, R'5, R'6, R'7, R'8은 서로 독립적으로 -H, -CH3, -C2H5, -C3H7, -OCH3, -Cl, -C6H5 ,-OH, -OCH2CH3, -Br, -CF3, -OCH2C6H5, -OC6H5, -OC6H4CH3, -OC6H4C(CH3)3, -OC6H4CF3, -OC6H4Cl, -OCOCH3, -NHCOCH3, -CONHCH3, -CN, COOH, 및 -COOR 로 이루어진 군에서 선택되며, 상기 -COOR 에서 R 은 -CH3 또는 -C2H5 를 나타내며. Wherein R 1 , R 2 , R 3 , R 4 , R 5 , R 6 , R 7 , R 8 , R 1 , R 2 , R 3 , R 4 , R 5 , R '6, R' 7, R '8 are each independently -H, -CH 3, -C 2 H 5, -C 3 H 7, -OCH 3, -Cl, -C 6 H 5, -OH, - OCH 2 CH 3 , -Br, -CF 3 , -OCH 2 C 6 H 5 , -OC 6 H 5 , -OC 6 H 4 CH 3 , -OC 6 H 4 C (CH 3 ) 3 , -OC 6 H 4 CF 3, -OC 6 H 4 Cl, -OCOCH 3, -NHCOCH 3, -CONHCH 3, -CN, and selected from the group consisting of COOH, and -COOR, in the -COOR R is -CH 3 or -C 2 H 5 .

Y1, Y2, Y3 및 Y4 는 서로 독립적으로 -H, -(CH2)n-CH=O, -(CH2)n-SH, -(CH2CH2O)m-CH2CH2-CH=O, -(CH2CH2O)m-CH2CH2-SH, -(CH2)m-C6H4-(CH2)c-Z, 및-CO-(CH2)m-1-C6H4-(CH2)c-Z 로 이루어진 군에서 선택된다 (n= 2~15, m= 1~10, c= 0~10, Z 는 -SH, -CHO, -COOH 및 -NH2 로 이루어진 군으로부터 선택되는 기, 그리고 -C6H4- 와 C6H5 는 페닐기로 정의됨)].Y 1, Y 2, Y 3 and Y 4 are independently -H, each other - (CH 2) n-CH = O, - (CH 2) n-SH, - (CH 2 CH 2 O) m-CH 2 CH 2 -CH = O, - ( CH 2 CH 2 O) m-CH 2 CH 2 -SH, - (CH 2) mC 6 H 4 - (CH 2) cZ, and -CO- (CH 2) m- 1-c 6 H 4 - ( CH 2) is selected from the group consisting of cZ (n = 2 ~ 15, m = 1 ~ 10, c = 0 ~ 10, Z is -SH, -CHO, -COOH and -NH 2 , and -C 6 H 4 - and C 6 H 5 are defined as phenyl groups).

바람직하게는, 화학식 1에서 R1 = R2 = R3 = R4 = R5 = R6 = R7 = R8 및 R'1 = R'2 = R'3 = R'4 = R'5 = R'6 = R'7 = R'8 (단 R1≠R'1)이고, 화학식 2에서 R1 = R'1 = R3 = R'3 = R5 = R'5 = R7 = R'7 이고, R2 = R'2 = R4 = R'4 = R6 = R'6 = R8 = R'8 이며, R1≠R2 이다. Preferably, R 1 = R 2 = R 3 = R 4 = R 5 = R 6 = R 7 = R 8 and R '1 = R' 2 = R '3 = R' 4 = R '5 in the formula (1) = R ' 6 = R' 7 = R ' 8 where R 1 ≠ R' 1 and R 1 = R ' 1 = R 3 = R' 3 = R 5 = R ' 5 = R 7 = R ' 7 and R 2 = R' 2 = R 4 = R ' 4 = R 6 = R' 6 = R 8 = R ' 8 and R 1 ≠ R 2 .

상기 화학식 1 및 2에서 치환기 Y1, Y2, Y3 및 Y4 는 고체기질에의 부착수단으로서 고체기질의 표면과 또는 표면에 부착된 관능기와 이온결합, 공유결합, 배위결합 등을 통해 화학식 1 및 2의 화합물을 부착시키는 역할을 한다. The substituents Y 1 , Y 2 , Y 3 and Y 4 in the general formulas (1) and (2) may be bonded to the surface of a solid substrate or a functional group attached to the surface of the solid substrate by ionic bonding, covalent bonding, 1 and < RTI ID = 0.0 > 2 < / RTI >

본 발명의 하나의 구현예에 있어서, 고체기질이 금일 경우에는 화학식 1 또는 2에서 Y1, Y2, Y3 및 Y4 중의 하나 이상은 티올기에서 선택될 수 있다. 고체기질이 아민 작용기가 부착되어 있는 유리, 실리콘웨이퍼 및 수정결정으로 이루어진 군에서 선택되는 경우, Y1, Y2, Y3 및 Y4 중의 하나 이상이 알데히드기에서 선택될 수 있고, 이에 의해 전술한 기질과 화학식 1 또는 2의 화합물의 연결은 이민기 또는 이를 환원시킨 아민기를 통해 달성될 수 있다. In one embodiment of the present invention, when the solid substrate is gold, at least one of Y 1 , Y 2 , Y 3 and Y 4 in formula (1) or (2) may be selected from the thiol group. When the solid substrate is selected from the group consisting of glass having an amine functional group, a silicon wafer and crystal crystals, at least one of Y 1 , Y 2 , Y 3 and Y 4 may be selected from aldehyde groups, The linkage of the substrate with the compound of formula (I) or (II) can be achieved through an imine group or an amine group reduced therefrom.

본 발명에 따르면, 전술한 표지물질은 형광체, 효소, 방사능 물질, 미세입자 및 색소로 이루어진 군에서 선택될 수 있다. According to the present invention, the above-mentioned labeling substance can be selected from the group consisting of phosphors, enzymes, radioactive substances, fine particles and pigments.

본 발명의 또다른 목적은, 상술한 방법을 사용한 항원 단백질의 정량분석 방법으로서, 항원 단백질을 도 10에 기재된 마커단백질로 구성된 군에서 하나 이상, 바람직하게는 3~10종을 선택하여, 이들을 동시에 정량적으로 분석하는 항원 단백질의 정량분석 방법을 제공하는 것이다.Yet another object of the present invention is to provide a method for quantitatively analyzing an antigen protein using the above-described method, wherein at least one, preferably 3 to 10 species of antigen proteins are selected from the group consisting of the marker proteins shown in FIG. 10, And to provide a quantitative analysis method of an antigen protein to be quantitatively analyzed.

본 발명의 또다른 목적은 cTnI, NT proBNP, BNP 등을 포함하는 심질환 마커 단백질의 농도를 1,000pg/ml 에서 25 pg/ml 사이에서 동시에 정량적으로 분석하여 치료과정 모니터링 혹은 조기진단에 사용하거나, 이런 목적에 사용될 수 있는 바이오칩을 제공하는 것이다.It is another object of the present invention to simultaneously quantitatively analyze the concentration of cardiovascular marker protein including cTnI, NT proBNP, BNP, etc. from 1,000 pg / ml to 25 pg / ml for monitoring the treatment process or for early diagnosis, And to provide a biochip that can be used for the purpose.

본 발명의 더 이상의 목적은, 단백질 농도분석에 필수적인 내부표준으로서 표준농도-감도 그래프 또는 표준농도-감도 테이블을 제조하는 방법 및 이를 위한 혼합 유전자 고정화 신기술, 및 상기의 내부표준을 적용한 단백질 농도 분석방법을 제공하는 것이다.A further object of the present invention is to provide a method for preparing a standard concentration-sensitivity graph or a standard concentration-sensitivity table as an internal standard indispensable for the analysis of protein concentration, a novel gene immobilization technology for the same and a protein concentration analysis method using the internal standard .

본 발명에 따라서 내부표준으로서 표준농도-감도 그래프 또는 표준농도-감도 테이블을 작성하고, 이를 이용하여 상기 바이오칩을 사용하여 검출된 바이오마커의 측정감도로부터 농도를 정량적으로 결정하고, 이렇게 결정된 바이오마커의 실측 농도를 이용하여 해당 질환의 진행 및 치료상태를 모니터링하는 방법에 응용할 수 있다. According to the present invention, a standard concentration-sensitivity graph or a standard concentration-sensitivity table is prepared as an internal standard, the concentration is quantitatively determined from the measurement sensitivity of the biomarker detected using the bio-chip, The present invention can be applied to a method for monitoring the progress and treatment state of a disease using measured concentration.

이하 본 발명을 상세하게 설명한다.Hereinafter, the present invention will be described in detail.

구체적으로는, 본 발명의 바이오칩은 하기의 구성을 가질 수 있다: Specifically, the biochip of the present invention may have the following configuration:

(a) 금, 은, 백금과 같은 금속, 유리, 실리콘웨이퍼, 및 수정결정으로 이루어진 군에서 선택될 수 있는 고체 기질; (a) a solid substrate which can be selected from the group consisting of metals such as gold, silver, platinum, glass, silicon wafers, and crystal crystals;

(b) 상기 고체 기질에 부착되어 있고, 고체 기질에의 부착 부위 및 연속된 구아닌 염기의 인식 부위를 갖는 아미노캘릭스아렌 유도체, 여기서 전술한 연속된 구아닌 염기는 구체적으로는 5개 이상, 바람직하게는 7개 이상, 특별하게는 9개 이상 연속된 구아닌 염기를 의미함; (b) an aminocarixarene derivative attached to the solid substrate and having an attachment site to a solid substrate and a recognition site of a continuous guanine base, wherein the aforementioned continuous guanine base is specifically 5 or more, Means at least 7, in particular at least 9 consecutive guanine bases;

(c) 상기 아미노캘릭스아렌 유도체에 부착되어 있고, 연속된 구아닌 염기 및 목적 염기(서열)을 갖는 연결 유전자, 여기서 연결 유전자는 연속된 구아닌 염기의 를 통해 전술한 아미노캘릭스아렌 유도체에 부착되어 있음; 및(c) a linking gene attached to the aminocylian arene derivative and having a continuous guanine base and a target base (sequence), wherein the linking gene is attached to the above-mentioned aminocalixarene derivative through a continuous guanine base has exist; And

(d) 상기 연결 유전자에 상보 결합되어 있는 항체-유전자 결합체, 여기서 전술한 항체-유전자 결합체는 전술한 목적 염기(서열)과 상보적인 염기(서열) 및 전술한 항체 단백질(결합용 항체)가 결합되어 있음. (d) an antibody-gene conjugate complementary to the linking gene, wherein the antibody-gene conjugate described above comprises a base (sequence) complementary to the above-mentioned objective base (sequence) and the aforementioned antibody protein .

본 발명에 따른 바이오칩을 사용하면, (d) 항체-유전자 결합체, (e) 항원 및 (f) 표지물질-부착된 2차 항체들이 유전자-유전자 결합되어 형성된 결합체들을 검출할 수 있다. 구체적으로, 상기 (a)~(d)를 포함하는 바이오칩에, (e)항원 및 (f) 표지물질-부착된 2차 항체의 혼합물을 첨가하면, (d) 항체-유전자 결합체에 (e) 항원이 부착되고, 이 (e) 항체에 (f) 표지물질-부착된 2차 항체가 부착되어, 전술한 (d) 항체-유전자 결합체, (e) 항원 및 (f) 표지물질-부착된 2차 항체의 결합체가 형성될 수 있다. Using the biochip according to the present invention, it is possible to detect complexes formed by gene-gene binding of (d) an antibody-gene conjugate, (e) an antigen, and (f) a labeling substance-attached secondary antibody. Specifically, (e) adding an antigen and (f) a mixture of a labeling substance-attached secondary antibody to the biochip comprising (a) - (d) (D) an antibody-gene conjugate, (e) an antigen, and (f) a labeling substance-attached 2 (a) A conjugate of the secondary antibody can be formed.

한편, 본 발명에서 연속된 구아닌염기를 인식하는 아미노 캘릭스아렌 유도체(Amino Calixarene derivatives), 이것을 고체기질에 부착시킨 바이오칩은 "9G 유전자칩"이라 하며, 상온에서 10분 이내에 80% 이상의 교잡반응이 가능한 유전자 칩 기술이다 (참고문헌 : Chem. Commun. , 2011년 , 47 / 7101-7103). 이러한 상온교잡 유전자칩에 관련된 기술은 본원 발명자에 의한 한국특허출원 10-2008-0093800호에 개시되어 있으며, 상기 문헌은 본원에 참고로 혼입되어 있다. Amino Calixarene derivatives recognizing a continuous guanine base in the present invention, a biochip attached to a solid substrate, is referred to as a "9G gene chip ", and a hybridization reaction of 80% or more within 10 minutes at room temperature Is a possible gene chip technology (cf. Chem. Commun., 2011, 47 / 7101-7103). Techniques related to such a room temperature hybridization chip are disclosed in Korean Patent Application No. 10-2008-0093800 by the present inventor, which is incorporated herein by reference.

연속된 구아닌 염기가 7 개 이상 부착된 유전자를 다중분자인식에 의해 고정화하여 제조되는 바이오 칩으로 연속된 구아닌 염기와 부착된 특정염기의 길이는 용도에 따라서 13mer 이하인 유전자, 14-17mer인 유전자, 18-21mer인 유전자, 그리고 22mer 이상인 유전자로 설계하여 사용할 수 있다.The length of the guanine base and the specific base attached to the biochip prepared by immobilizing a gene having seven or more consecutive guanine bases by multimolecular recognition can be determined based on the use of a gene of 13 mer or less, -21mer gene, and a gene having more than 22mer gene.

본 발명에서는 항체-유전자 결합체를 사용하여 바이오마커 단백질과 항체의 반응을 활성이 유지되는 용액상에서 진행한 후 이를 9G 유전자 칩 상에서 항체-유전자 결합체를 교잡반응하여 결과를 확인함으로써 기존의 심질환관련 단백질 고정화 방식에서 발생하였던 활성유지, 방향성 문제 및 비특이 결합 문제를 해결하여 심질환 바이오마커 단백질을 피코그램 수준에서, 구체적으로는 1~1000pg/ml, 더욱 구체적으로는 5~800pg/ml, 바람직하게는 10~600 pg/ml, 특히 바람직하게는 25~400 pg/ml의 농도까지 검출할 수 있었다 (도 8 내지 도 9 참조). In the present invention, the reaction of the biomarker protein with the antibody is carried out in a solution in which the activity of the antibody is maintained using the antibody-gene conjugate, and then hybridized with the antibody-gene conjugate on the 9G gene chip. Specificity binding problems that have occurred in the method of the present invention to solve the problem of heart disease biomarker protein at the level of picogram, specifically 1 to 1000 pg / ml, more specifically 5 to 800 pg / ml, preferably 10 To 600 pg / ml, particularly preferably 25 to 400 pg / ml (see Figures 8 to 9).

본 발명에 따르면, 피코그램 수준 이상의 농도에서도 희석방식을 사용하여 측정하거나 표준농도-감도 범위를 확장하여 환산 농도를 결정할 수 있으므로, 상기 농도범위의 상한은 크게 중요하지 않으며, 심질환 바이오마커 단백질을 나노그램 수준 또는 그 이상으로 함유하는 경우에도 본 발명을 적용할 수 있다. 또, 본 발명에서 실험한 25pg/ml 이하의 농도, 더나가서 상술한 5pg/ml 이하의 농도에서도 스캐너의 게인(gain)을 조절하거나 표지물질의 종류를 달리하여 측정하는 것이 가능하므로, 상기 농도 범위의 하한도 본 발명의 방법에 따르면 충분히 극복될 수 있다. According to the present invention, the upper limit of the concentration range is not important, since the concentration can be determined by dilution method or by extending the standard concentration-sensitivity range even at a concentration higher than the picogram level, Gram level or more. In addition, since it is possible to control the gain of the scanner or to measure the kinds of the labeling materials even at a concentration of 25 pg / ml or less and a concentration of 5 pg / ml or less as measured in the present invention, Can be sufficiently overcome according to the method of the present invention.

이를 위해 50-60 종 이상의 탐침 유전자를 설계하여 유전자 칩 상에 고정화한 후 형광이 부착된 상보적인 유전자를 사용하여 칩 상에서 발현되는 형광을 분석하여 그 중 특이도와 민감도가 가장 높은 탐침 유전자를 선정하여 심질환 바이오마커 단백질 중 cTnI, NT proBNP, 그리고 BNP의 농도를 각각 혹은 동시에 하나의 칩 상에서 동시에 검출이 가능하도록 유전자가 고정화되어 있는 바이오 칩을 제작하였다 (도 3 참조).To do this, 50-60 or more probe genes were designed and immobilized on a gene chip, and fluorescence expressed on the chip was analyzed using a complementary gene with fluorescence, and the probe gene with the highest specificity and sensitivity was selected A biochip in which genes were immobilized so that the concentration of cTnI, NT proBNP, and BNP in the cardiovascular biomarker protein can be detected simultaneously or simultaneously on one chip (see FIG. 3).

그럼 다음 유전자 칩 상에 고정화되어 있는 유전자와 상보적인 염기를 가지는 유전자를 사용하여 항체-유전자 결합체를 실시예 1과 같이 제조한 후 정제하였으며, 본 발명에 최적화된 항체-유전자 결합체 제조를 위한 단백질 당 유전자 결합 개수를 확인하기 위하여 정제된 유전자-단백질 결합체를 Nanodrop을 사용하여 단백질 당 결합된 유전자의 개수를 확인하여 고정화된 유전자와 교잡반응하기에 최적인 결합 개수를 선정하였다. 또한 바이오마커 단백질 검출을 위해 표시물질이 부착된 2차 단백질의 결합체를 제조를 실시예 2와 같이 제조하여 정제한 후 Nanodrop을 사용하여 2차 단백질에 결합된 표시물질의 개수를 확인하여 정량분석이 가능하도록 하였다. 이때 사용가능한 표시 물질은 형광체, 효소, 방사능 물질, 미세입자 및 색소 등이 될 수 있으나 본 발명에서는 형광체를 사용하였다. Then, the antibody-gene conjugate was prepared and purified as in Example 1 using a gene having a base complementary to the gene immobilized on the next gene chip, and the protein-protein complex for the preparation of the antibody- In order to confirm the number of gene binding, the optimal number of binding was selected for confirming the number of genes bound to each protein using the purified gene - protein conjugate Nanodrop and hybridizing with the immobilized gene. In order to detect a biomarker protein, a conjugate of a secondary protein having a label attached thereto was prepared and purified as in Example 2. The number of labeled substances bound to the secondary protein was determined using Nanodrop, Respectively. At this time, the display material which can be used may be a phosphor, an enzyme, a radioactive material, a fine particle and a pigment, but a phosphor is used in the present invention.

본 발명에서는 일정 비율의 유전자 혼합고정화 기술을 이용한 표준스팟을 이용한 내부표준을 바이오 칩에 적용하여 검출된 바이오마커 단백질의 감도를 단백질의 양으로 변환하여 분석하는 정량분석용 표준농도-감도 그래프를 작성할 수 있는 기술을 제공하였다 (도 5 내지 도 6 참조). In the present invention, a standard concentration-sensitivity graph for quantitative analysis is prepared by applying an internal standard using a standard spot using a gene mix immobilization technique at a predetermined ratio to a biochip and converting the sensitivity of the detected biomarker protein to a protein amount (See Figs. 5 to 6).

내부표준은 2개 혹은 그 이상의 유전자를 혼합 및 고정화하여 발현되는 감도를 0%부터 100% 사이에서 검출이 가능하도록 표준스팟을 제조하는 기술로서, 예를들면 표준농도를 갖는 표준용액을 사용하여 측정된 표준감도를 수치화하여 그래프화하거나 이미지화하여 테이블로 만든 표준농도-감도 그래프 또는 표준농도-감도 테이블 등에 의해 구현될 수 있는데, 심질환관련 바이오마커 단백질을 분석하기 위하여 사용되는 다양한 검출용 장비를 표준화하고 동시에 심질환 진단을 위한 바이오 칩의 유통 및 보관, 그리고 사용 상 나타날 수 있는 문제를 검증할 수 있는 시스템을 제공할 수 있다. 또한 검출용 장비 사용 시 발생할 수 있는 장비의 문제를 조기에 확인하여 정확한 분석 결과를 제공할 수 있다.The internal standard is a technique for preparing standard spots that can detect the sensitivity of the expression between 0% and 100% by mixing and immobilizing two or more genes. For example, a standard solution having a standard concentration Standard sensitivity-graph or standard concentration-sensitivity table made by digitizing and graphing or standardizing the standardized sensitivity of the biomarker protein, and standardizing various detection apparatuses used for analyzing the biomarker protein related to cardiovascular disease At the same time, it is possible to provide a system that can verify the distribution, storage, and use of biochips for diagnosis of heart disease. Also, it is possible to check the problems of equipment that may occur when using the detection equipment early, and to provide accurate analysis results.

심질환 바이오마커인 cTnI, NT proBNP, BNP 각각에 대해, 예를들어 400pg/ml, 200pg/ml, 100pg/ml, 50pg/ml 및 25pg/ml의 농도를 갖는 표준용액을 제조하고, 이들 표준용액을 특별히 제조된 심질환 바이오마커 단백질 분석용 바이오 칩(도 7 참조)으로써 측정하여 측정감도를 수득하고, 상기 표준용액의 농도 및 측정감도로부터 표준농도-감도 그래프 및/또는 테이블을 작성하였다. 다음으로 검출기의 게인(gain)을 조절하여 검출된 바이오마커 단백질의 감도를 단백질의 양으로 변환하여 실제 농도와 검출 농도를 비교하여 그 일치성을 확인하였다. 결론적으로, 본 발명에서 사용된 심질환 바이오마커 단백질 분석용 바이오칩과 본 발명에 따라 작성된 내부표준 (표준 농도-감도 그래프)에 의한 농도분석 기술의 정확성을 확인하였다.(도 8 참조) Standard solutions having concentrations of, for example, 400 pg / ml, 200 pg / ml, 100 pg / ml, 50 pg / ml and 25 pg / ml were prepared for each of the heart disease biomarkers cTnI, NT proBNP and BNP, The measurement sensitivity was obtained by measuring with a specially prepared biochip for analysis of heart disease biomarker protein (see FIG. 7), and a standard concentration-sensitivity graph and / or table was prepared from the concentration and measurement sensitivity of the standard solution. Next, by adjusting the gain of the detector, the sensitivity of the detected biomarker protein was converted into the amount of protein, and the actual concentration and the detection concentration were compared to confirm the correspondence. In conclusion, the accuracy of the concentration analysis technique by the internal standard (standard concentration-sensitivity graph) prepared according to the present invention and the biochip for analyzing the heart disease biomarker protein used in the present invention was confirmed (see FIG. 8).

또한 심질환 바이오마커인 cTnI, NT proBNP, BNP를 동시에 검출이 가능함을 확인하기 위하여 혈액샘플내 cTnI, NT proBNP, BNP 3가지 단백질을 1/2 에서 1/32 까지 희석하여 측정하여 희석된 비율에 따라서 나타나는 수치가 정확한 비율로 분석됨을 확인할 수 있었다. In order to confirm that cTnI, NT proBNP and BNP, which are cardiovascular biomarkers, can be detected at the same time, the three proteins cTnI, NT proBNP and BNP in the blood sample are diluted from 1/2 to 1/32 and measured according to the diluted ratio It was confirmed that the numerical values are analyzed at an accurate ratio.

이 결과는 본 발명이 심질환 바이오마커 단백질을 1종 혹은 3종을 pg/ml 수준까지 정량적으로 분석하여 심질환 치료과정을 모니터링하여 완치까지 알려줄 수 있는 바이오 칩 기술을 제공함을 보여주는 결과이다. This result shows that the present invention provides biochip technology that can quantitatively analyze one or three kinds of heart disease biomarker protein to pg / ml level, thereby monitoring the treatment of cardiovascular disease and informing it to a complete cure.

본 발명의 하나의 변법에 따르면, 혈액샘플로부터 수득된 측정감도의 수치가 표준농도-감도 그래프의 수치범위 밖이어서 직접적인 농도 환산이 어려운 경우에는, 외삽법 (extrapolateion)으로 환산농도를 추정할 수도 있지만, 혈액샘플을 일정 비율로, 예를들면 1/2 씩 희석하여 측정할 수 있다. 이러한 희석은 측정감도가 전술한 그래프의 수치범위 이내가 될 때까지 수행될 수 있으며, 예를들어 1/2, 1/4, 1/8, 1/16, 1/32의 배율로 희석하여 희석된 샘플들에 대해 동시에 측정할 수도 있도록 바이오칩을 구성할 수 있다. 희석된 샘플에서 수득된 측정감도로부터 희석된 농도가 환산될 수 있으며, 희석비율을 역으로 곱해주면 원래 혈액샘플의 환산농도를 수득할 수 있다. According to one variant of the invention, if the value of the measured sensitivity obtained from the blood sample is outside of the numerical range of the standard concentration-sensitivity graph and it is difficult to directly convert the concentration, the converted concentration can be estimated by extrapolation , And the blood sample can be diluted by a predetermined ratio, for example, by 1/2. This dilution can be performed until the sensitivity of the measurement is within the numerical range of the above-described graph, and diluted to a magnification of, for example, 1/2, 1/4, 1/8, 1/16, 1/32, The biochip can also be configured to measure simultaneously the samples. The diluted concentration can be converted from the measured sensitivity obtained in the diluted sample, and the converted concentration of the original blood sample can be obtained by multiplying the dilution ratio by the inverse.

본 발명의 방법에 따라 수득된 심혈관 바이오마커 단백질의 환산농도는 급성심근경색(AMI)을 진단하거나 이의 진행상황 및 치료상황을 모니터링하는 데 이용될 수 있다. 급성심근경색(AMI)을 진단은 심혈관 바이오마커 단백질들 중의 하나이상의 환산농도가 정해진 수치를 초과한 경우에 심질환 발생의 판단이 내려질 수 있으며, 상기 환산농도의 정체 또는 감소에 의해 심질환의 완화 판단이 내려질 수 있다. 전술한 정해진 수치는 전문기관이나 전문가의 공식적인 견해에 따라 결정될 수 있다. The converted concentration of cardiovascular biomarker protein obtained according to the method of the present invention can be used to diagnose acute myocardial infarction (AMI) or to monitor its progress and treatment status. The diagnosis of acute myocardial infarction (AMI) may be made when the converted concentration of one or more of the cardiovascular biomarker proteins exceeds a predetermined value, and the determination of mitigation of heart disease by stagnation or reduction of the converted concentration Can be dropped. The above-mentioned predetermined figures can be determined according to the official opinions of professional organizations or experts.

본 발명에 따른 바이오마커 단백질의 정량적 분석을 위한 방법론은 하기에 기재된 다른 원발장기질환의 바이오마커에 대해서도 적용할 수 있다:The methodology for quantitative analysis of biomarker proteins according to the present invention is also applicable to the biomarkers of other primary organs diseases described below:

- 폐암: CEA, SCC, NSE, SLX - Lung cancer: CEA, SCC, NSE, SLX

- 간암: AFP, PIVKA-II- Liver cancer: AFP, PIVKA-II

- 췌장암(담낭암, 담도암): CEA, CA 19-9, CA 50, DUPAN-2, Esterase 1, Span-1 Ag, SLX, NCC-ST-439- Pancreatic cancer (gallbladder cancer, bile duct cancer): CEA, CA 19-9, CA 50, DUPAN-2, Esterase 1, Span-1 Ag, SLX, NCC-ST-439

- 위암: CEA, CA 19-9, CA 72-4- Gastric cancer: CEA, CA 19-9, CA 72-4

- 대장암: CEA, CA 19-9, CA 72-4- Colorectal cancer: CEA, CA 19-9, CA 72-4

- 전립선암: PAP, PSA, γ-SmProstate Cancer: PAP, PSA, γ-Sm

- 유방암: CEA, CA 15-3, TPA, NCC-ST-439, BCA 225- Breast cancer: CEA, CA 15-3, TPA, NCC-ST-439, BCA 225

- 자궁암: SCC Antigen, CA 125, CEA, TPA- Uterus cancer: SCC Antigen, CA 125, CEA, TPA

- 난소암: CA 125, CEA, SCC, STN, CA 72-4, SLX- ovarian cancer: CA 125, CEA, SCC, STN, CA 72-4, SLX

- 식도암: SCC, CEA
- Esophageal cancer: SCC, CEA

본 발명의 하나의 변법에 따르면, 항원 단백질을 상기 원발장기 또는 질환의 마커단백질들로 구성된 군에서 하나 이상, 구체적으로는 3~10개를 선택하여 본 발명의 항원 단백질의 정량적 분석 방법을 수행할 수 있으며, 이에 의해 상기 원발장기의 이상 또는 비정상 여부를 판단하거나 상기 질환을 진단할 수 있으며, 더나가서 이의 진행상황 및/또는 치료상황을 모니터링할 수 있다. According to one variation of the present invention, a method for quantitative analysis of the antigen protein of the present invention is carried out by selecting one or more, specifically, 3 to 10, antigen proteins in the group consisting of the marker proteins of the primary organs or diseases Whereby the abnormality or abnormality of the primary organs can be judged, the diagnosis of the disease can be made, and the progress and / or the treatment situation thereof can be monitored.

이하, 본 발명을 하기 실시예에 의하여 더욱 구체적으로 설명한다. 그러나, 본 발명이 이에 한정되는 것은 아니다. Hereinafter, the present invention will be described in more detail with reference to the following examples. However, the present invention is not limited thereto.

실시예 1: 항체-유전자 결합 및 정제 Example 1: Antibody-Gene Binding and Purification

항체-유전자 결합에 사용한 물질은 아래의 표 1에 기재되어 있으며, 사용한 타겟 유전자(TD)의 염기서열은 표 2에 기재되어 있다.The substances used for antibody-gene binding are shown in Table 1 below, and the nucleotide sequences of the target gene (TD) used are shown in Table 2.

실시예 1에서 사용한 물질The material used in Example 1 분자량Molecular Weight 농도density cTnI Ab(capture Antibody)cTnI Ab (capture Antibody) 160,000g/mol160,000 g / mol 7.1mg/ml, 35ul7.1mg / ml, 35ul NT proBNP Ab(capture Antibody)NT proBNP Ab (capture Antibody) 160,000g/mol160,000 g / mol 6mg/ml, 42ul6mg / ml, 42ul BNP Ab(capture Antibody)BNP Ab (capture Antibody) 160,000g/mol160,000 g / mol 6mg/ml, 41ul6mg / ml, 41ul 2-iminothiolane2-iminothiolane 137g/mol137 g / mol 4mg/ml4mg / ml TD06TD06 9000g/mol9000 g / mol 100pmol/ul100 pmol / ul TD01TD01 9000g/mol9000 g / mol 100pmol/ul100 pmol / ul TD10TD10 9000g/mol9000 g / mol 100pmol/ul100 pmol / ul Sulfo-SMCCSulfo-SMCC 436g/mol436 g / mol 80mg/ml80 mg / ml 10 X PBS10 X PBS 500mM EDTA500 mM EDTA

타겟유전자Target gene 염기서열Base sequence TD06TD06 5' - NH2-TTTTTTTTTCGGGCAGGCCATAGCGA5 '- NH 2 -TTTTTTTTTCGGGCAGGCCATAGCGA TD01TD01 5'- NH2-TTTTTTTTTGCGCCTCCCCAAGTCGT5'- NH 2 -TTTTTTTTTGCGCCTCCCCAAGTCGT TD10TD10 5' - NH2-TTTTTTTTTCCGCGCTCGCAAGGTAT5 '- NH 2 -TTTTTTTTTCCGCGCTCGCAAGGTAT

상기 타겟유전자 TD06, TD01, TD10 은 바이오니아사의 제품을 구입하여 사용하였으며, 각 타겟유전자의 5'-쪽에 아민기(-NH2)가 부착되어 있다.The target genes TD06, TD01 and TD10 were purchased from Bioneer, and amine groups (-NH 2 ) were attached to the 5'-side of each target gene.

실시예 1-1: 항체-유전자 결합체 (cTnI Ab-TD06)의 제조Example 1-1: Preparation of antibody-gene conjugate (cTnI Ab-TD06)

cTnI Ab-TD06 의 합성은 도 1에 묘사된 바처럼 3단계로 이루어지며 다음과 같이 실시하였다.The synthesis of cTnI Ab-TD06 was performed in three steps as depicted in FIG. 1 and was performed as follows.

가. (단계 1) TD06-SMCC 합성end. (Step 1) Synthesis of TD06-SMCC

1) 0.6ml 크기의 반응튜브에 TD06 유전자(농도 900ng/ul) 60ul 와 Sulfo-SMCC(농도 80mg/ml) 5ul 를 혼합하였다. 1) 60 μl of the TD06 gene (concentration 900 ng / μl) and 5 μl of Sulfo-SMCC (concentration 80 mg / ml) were mixed in a 0.6 ml reaction tube.

2) 10XPBS 10ul 를 1)의 혼합물에 넣었다. 2) 10 l of 10XPBS was added to the mixture of 1).

3) 500mM EDTA 3ul를 2)의 혼합물에 넣었다.3) 3 ul of 500 mM EDTA was added to the mixture of 2).

4) 반응 혼합물을 상온에서 2시간 동안 반응시켰다.4) The reaction mixture was reacted at room temperature for 2 hours.

5) 반응 후 TD06-SMCC 는 bioWORLD 사의 Sephadex G-25 packed column (3ml size)을 사용하여 정제하였고 이동상은 1XPBS 를 사용하였다.5) After the reaction, TD06-SMCC was purified using BioWORLD Sephadex G-25 packed column (3 ml size) and mobile phase was 1 × PBS.

6) 정제한 TD06-SMCC 는 ND1000 UV/Vis spectrometer 를 이용하여 순도 및 농도를 측정하여 검증하였으며 도 2에 결과가 나타나있으며 TD06-SMCC(농도 202.4ng/ul) 200ul 를 얻었다. 6) The purified TD06-SMCC was verified by measuring its purity and concentration using ND1000 UV / Vis spectrometer. The results are shown in FIG. 2 and 200ul of TD06-SMCC (concentration 202.4ng / ul) was obtained.

나. (단계 2) cTnI Ab-SH의 합성I. (Step 2) Synthesis of cTnI Ab-SH

1) 0.6ml 크기의 반응튜브에 cTnI Ab (농도 7.1mg/ml)35ul 와 2-iminothiolane (농도4mg/ml) 2ul 를 혼합하였다. 1) A reaction tube of 0.6 ml was mixed with 35 ul of cTnI Ab (concentration 7.1 mg / ml) and 2 ul of 2-iminothiolane (concentration 4 mg / ml).

2) 10XPBS 30ul 를 1) 의 혼합물에 넣었다. 2) 30 [mu] l of 10XPBS was added to the mixture of 1).

3) 500mM EDTA 5ul 를 2) 의 혼합물에 넣었다. 3) 5 ul of 500 mM EDTA was added to the mixture of 2).

4) 반응 혼합물을 상온에서 30분 동안 반응시켰다.4) The reaction mixture was reacted at room temperature for 30 minutes.

5) 반응 후 cTnI Ab-SH 는 bioWORLD 사의 Sephadex G-25 packed column (3ml size)을 사용하여 정제하였고 이동상은 1XPBS 를 사용하였다.5) After the reaction, cTnI Ab-SH was purified using a Sephadex G-25 packed column (3 ml size) of bioWORLD Inc. and 1 × PBS was used as the mobile phase.

6) 정제한 cTnI Ab-SH 는 ND1000 UV/Vis spectrometer 를 이용하여 순도 및 농도를 측정하여 검증하였으며 도2에 결과가 나타나있으며 cTnI Ab-SH (농도 1.10mg/ml) 190ul 를 얻었다.6) Purified cTnI Ab-SH was verified by measuring the purity and concentration using ND1000 UV / Vis spectrometer. The results are shown in FIG. 2 and 190 ul of cTnI Ab-SH (concentration 1.10 mg / ml) was obtained.

다. (단계 3) cTnI Ab-TD06 의 합성All. (Step 3) Synthesis of cTnI Ab-TD06

1) 0.6ml 크기의 반응튜브에 단계1에서 합성한 TD06-SMCC(농도 202.4ng/ul) 200ul 와 단계2에서 합성한 cTnI Ab-SH (농도 1.10mg/ml) 190ul 를 혼합하였다. 1) In a reaction tube having a size of 0.6 ml, 200ul of the TD06-SMCC (concentration 202.4ng / ul) synthesized in the step 1 and 190ul of the cTnI Ab-SH (concentration 1.10mg / ml) synthesized in the step 2 were mixed.

2) 반응 혼합물을 37℃에서 30분 동안 반응한 후 4℃에서 1시간 동안 반응하였다.2) The reaction mixture was reacted at 37 ° C for 30 minutes and then at 4 ° C for 1 hour.

3) 반응 후 cTnI Ab-TD06 은 3000 MWCO spin filter(Millipore)를 이용하여 정제하였다. 3) After the reaction, cTnI Ab-TD06 was purified using 3000 MWCO spin filter (Millipore).

4) 정제한 cTnI Ab-TD06 는 ND1000 UV/Vis 스펙트로메터를 이용하여 순도 및 농도를 측정하여 검증하였으며 도2에 결과가 나타나있으며 cTnI Ab-TD06 (농도 2.05mg/ml) 80ul 를 얻었다.4) Purified cTnI Ab-TD06 was verified by measuring its purity and concentration using ND1000 UV / Vis spectrometer. The results are shown in FIG. 2 and 80 ul of cTnI Ab-TD06 (concentration 2.05 mg / ml) was obtained.

실시예 1-2: 항체-유전자 결합체 (NT proBNP Ab-TD01)의 제조Example 1-2: Preparation of antibody-gene conjugate (NT proBNP Ab-TD01)

NT proBNP Ab-TD01의 합성은 NT proBNP Ab (농도 6mg/ml) 42ul 를 사용하여 실시예1-1) 과 동일한 방법으로 합성하여 NT proBNP Ab-TD01 (농도 2.08mg/ml) 80ul 를 얻었으며 도2에 결과가 나타나있다.Synthesis of NT proBNP Ab-TD01 was synthesized in the same manner as in Example 1-1) using 42ul of NT proBNP Ab (concentration 6mg / ml) to obtain 80ul NT proBNP Ab-TD01 (concentration 2.08mg / ml) 2 shows the results.

실시예 1-3: 항체-유전자 결합체 (BNP Ab-TD10)의 제조Example 1-3: Preparation of antibody-gene conjugate (BNP Ab-TD10)

BNP Ab-TD10의 합성은 BNP Ab (농도 6mg/ml) 41ul 실시예1-1) 과 동일한 방법으로 합성하여 BNP Ab-TD06 (농도 2.39mg/ml) 60ul 를 얻었으며 도2에 결과가 나타나있다.
BNP Ab-TD10 was synthesized in the same manner as in Example 1-1) except that 41ul of BNP Ab (concentration 6mg / ml) was obtained and 60ul of BNP Ab-TD06 (concentration 2.39mg / ml) .

실시예 2: 표지물질-2차항체 결합체의 제조 Example 2: Preparation of a labeling substance-secondary antibody conjugate

항원검출신호의 증폭물질로서, 표지물질-2차항체 결합체를 제조하였다. 표지물질로서 형광물질 (Cy5)를 사용하였으며, 하기 표 3에 항체-형광 결합에 사용한 물질들을 기재한다.As the amplification substance of the antigen detection signal, a labeling substance secondary antibody conjugate was prepared. A fluorescent substance (Cy5) was used as a labeling substance, and the substances used for antibody-fluorescent binding are shown in Table 3 below.

실시예 5에서 사용한 물질The material used in Example 5 분자량Molecular Weight 농도density cTnI AB(Secondary Antibody)cTnI AB (Secondary Antibody) 160,000g/mol160,000 g / mol 3.7mg/ml, 65ul3.7mg / ml, 65ul NT proBNP AB(Secondary Antibody)NT proBNP AB (Secondary Antibody) 160,000g/mol160,000 g / mol 8mg/ml, 30ul8mg / ml, 30ul BNP AB(Secondary Antibody)BNP AB (Secondary Antibody) 160,000g/mol160,000 g / mol 7.6mg/ml, 33ul7.6mg / ml, 33ul Cy5-bis NHS esterCy5-bis NHS ester 792g/mol792 g / mol 1pack in DMSO 20ul1 pack in DMSO 20ul 10 X PBS10 X PBS -- -- 500mM EDTA500 mM EDTA -- --

실시예 2-1: 표지물질-2차항체 결합체 (cTnI AB-Cy5)의 제조Example 2-1: Preparation of labeling substance secondary antibody conjugate (cTnI AB-Cy5)

cTnI AB-Cy5 의 합성은 도2 에 나타나있으며 사용한 물질은 표3에 나타나있다. Cy5-bis NHS ester 는 GE Healthcare Life Sciences 사의 Cy5-bis NHS ester 5pack 제품을 구입하여 사용하였다. The synthesis of cTnI AB-Cy5 is shown in FIG. 2 and the materials used are shown in Table 3. Cy5-bis NHS ester was purchased from GE Healthcare Life Sciences, Cy5-bis NHS ester 5pack.

[[ cTnI AB-Cy5 의 합성Synthesis of cTnI AB-Cy5 ]]

1) Cy5-bis NHS ester 1pack 에 DMSO 20ul 를 넣고 혼합한다. 1) Add 20ul DMSO to Cy5-bis NHS ester 1pack and mix.

2) cTnI AB (농도3.7mg/ml) 65ul 가 들어있는 cTnI AB 튜브에 1) 의 Cy5-bis NHS ester 5ul 를 넣었다. 2) 5 ul of Cy5-bis NHS ester of 1) was added to a cTnI AB tube containing 65 ul of cTnI AB (concentration 3.7 mg / ml).

3) 500mM EDTA 3ul 를 상기 2)에 넣고 혼합하였다. 3) 3 ul of 500 mM EDTA was added to the above 2) and mixed.

4) 상기 3)의 혼합물을 상온에서 20 분 동안 반응시켰다.4) The mixture of 3) was reacted at room temperature for 20 minutes.

5) 반응 후 cTnI AB-Cy5 는 bioWORLD 사의 Sephadex G-25 packed column (3ml size)을 사용하여 정제하였고 이동상은 1XPBS 를 사용하였다.5) After the reaction, cTnI AB-Cy5 was purified using BioWORLD Sephadex G-25 packed column (3 ml size) and the mobile phase was 1 × PBS.

6) 정제한 cTnI AB-Cy5 는 ND1000 UV/Vis 스펙트로메터를 이용하여 순도 및 농도를 측정하여 검증하였으며 도2에 결과가 나타나있으며 cTnI AB-Cy5 (농도1.2mg/ml) 180ul를 얻었다.6) Purified cTnI AB-Cy5 was verified by measuring its purity and concentration using ND1000 UV / Vis spectrometer. The results are shown in FIG. 2 and 180ul of cTnI AB-Cy5 (concentration 1.2mg / ml) was obtained.

실시예 2-2: 표지물질-2차항체 결합체 (NT proBNP AB-Cy5)의 제조Example 2-2: Preparation of labeling substance-secondary antibody conjugate (NT proBNP AB-Cy5)

NT proBNP AB-Cy5 의 합성은 NT proBNP AB (농도 8mg/ml) 30ul 를 사용하여 실시예2-1) 와 동일한 방법으로 합성하여 NT proBNP AB-Cy5 (농도1.1mg/ml) 190ul를 얻었으며 도2에 결과가 나타나있다.NT proBNP AB-Cy5 was synthesized in the same manner as in Example 2-1) by using 30ul of NT proBNP AB (concentration 8mg / ml) to obtain 190ul of NT proBNP AB-Cy5 (concentration 1.1mg / ml) 2 shows the results.

실시예 2-3: 표지물질-2차항체 결합체 (BNP AB-Cy5)의 제조Example 2-3: Preparation of labeling substance-secondary antibody binding substance (BNP AB-Cy5)

BNP AB-Cy5 의 합성은 BNP AB (농도 7.6mg/ml) 33ul 를 사용하여 실시예2-1) 와 동일한 방법으로 합성하여 BNP AB-Cy5 (농도1.4mg/ml) 150ul를 얻었으며 도2에 결과가 나타나있다.
The synthesis of BNP AB-Cy5 was carried out in the same manner as in Example 2-1) using 33ul of BNP AB (concentration 7.6mg / ml) to obtain 150ul of BNP AB-Cy5 (concentration 1.4mg / ml) The results are shown.

실시예 3: 단백질 검출용 바이오칩 제조Example 3: Production of biochip for protein detection

문헌 [대한민국 특허 제10호 0786577 의 도 1 및 실시예11]에 기재된 방법에 따라, 9개의 연속된 구아닌 염기를 갖는 9G-올리고유전자 (9G-oligo DNA)를 아미노캘릭스아렌 단분자층 상에 고정화하여 9G-DNA칩을 제조하고, 이를 단백질 검출용 바이오칩으로 사용하였다 (도 3 참조). Oligonucleotide (9G-oligo DNA) having 9 consecutive guanine bases was immobilized on an aminocylic array monolayer according to the method described in Korean Patent No. 10 0786577, FIGS. 1 and 11, 9G-DNA chip was prepared and used as a biochip for protein detection (see FIG. 3).

본 실시예에서 사용된 9G-올리고유전자는 하기 표 4에 기재한다: The 9G-oligo gene used in this example is described in Table 4 below:

올리고
유전자
Oligo
gene
염기서열(5'ㅰ 3')The base sequence (5 ', 3') 농도density
HCHC GGGGGGGGG CTTTATCAT CC ACT GTT CTC GGC ACGGGGGGGGGG CTTTATCAT CC ACT GTT CTC GGC ACG 100pmol/ul100 pmol / ul PCP06PCP06 GGGGGGGGG CTTTATCAT TCG CTA TGG CCT GCC CGGGGGGGGGG CTTTATCAT TCG CTA TGG CCT GCC CG 100pmol/ul100 pmol / ul PCP01PCP01 GGGGGGGGG CTTTATCAT ACG ACT TGG GGA GGC GCGGGGGGGGG CTTTATCAT ACG ACT TGG GGA GGC GC 100pmol/ul100 pmol / ul PCP10PCP10 GGGGGGGGG CTTTATCAT ATA CCT TGC GAG CGC GGGGGGGGGGG CTTTATCAT ATA CCT TGC GAG CGC GG 100pmol/ul100 pmol / ul

실시예 4: 항원 단백질 cTnI, NT proBNP, BNP 의 검출Example 4 Detection of Antigen Proteins cTnI, NT proBNP and BNP

항원 단백질로서 심질환 바이오마커를 검출하는 방법 및 실험과정은 도 4에 도식적으로 설명되어 있다. 심질환 바이오마커 단백질로서 3가지 항원 단백질 cTnI, NP proBNP 및 BNP을 표준샘플로서 준비하여 사용하였다. Methods and experimental procedures for detecting heart disease biomarkers as antigenic proteins are schematically illustrated in FIG. Three antigen proteins cTnI, NP proBNP and BNP were used as standard heart biomarker proteins and used as standard samples.

1) 항원 표준샘플 준비1) Preparation of antigen standard sample

표준샘플은 Hytest 사의 cTnI Ag (0.5mg/ml), NT proBNP Ag(0.9mg/ml), BNP Ag(3.5ng/ml) 을 구입하여 준비하였다. Standard samples were prepared by purchasing cTnI Ag (0.5 mg / ml), NT proBNP Ag (0.9 mg / ml) and BNP Ag (3.5 ng / ml) from Hytest.

항원 단백질 cTnI, NT proBNP 및 BNP을 농도 400pg/ml로 함유하는 표준샘플 1을 제조하고, 이를 1xPBS 용액으로써 1/2 씩 희석하여 농도 200pg/ml, 100pg/ml, 50pg/ml 및 25pg/ml로 함유하는 표준샘플 2~5를 하기 표 5에서처럼 준비하였다. A standard sample 1 containing the antigen proteins cTnI, NT proBNP and BNP at a concentration of 400 pg / ml was prepared and diluted 1/2 × with 1 × PBS solution to a concentration of 200 pg / ml, 100 pg / ml, 50 pg / ml and 25 pg / ml Containing standard samples 2-5 were prepared as in Table 5 below.

ProteinProtein 표준샘플1Standard sample 1 표준샘플2Standard sample 2 표준샘플3Standard sample 3 표준샘플4Standard Sample 4 표준샘플5Standard sample 5 cTnIcTnI 400pg/ml400 pg / ml 200pg/ml200 pg / ml 100pg/ml100 pg / ml 50pg/ml50 pg / ml 25pg/ml25 pg / ml NT proBNPNT proBNP 400pg/ml400 pg / ml 200pg/ml200 pg / ml 100pg/ml100 pg / ml 50pg/ml50 pg / ml 25pg/ml25 pg / ml BNPBNP 400pg/ml400 pg / ml 200pg/ml200 pg / ml 100pg/ml100 pg / ml 50pg/ml50 pg / ml 25pg/ml25 pg / ml

2) 항체(Antibody) 혼합물의 준비2) Preparation of Antibody Mixture

가. 용량 1.5ml의 e-tube에, 항체-유전자 결합체 cTnI Ab-TD06(100ug/ml), NT proBNP Ab-TD01(100ug/ml), 및 BNP Ab-TD10(100ug/ml)을 각각 15ul씩 첨가하였다.end. 15 ul of the antibody-gene conjugate cTnI Ab-TD06 (100 ug / ml), NT proBNP Ab-TD01 (100 ug / ml) and BNP Ab-TD10 (100 ug / ml) were added to an e-tube having a capacity of 1.5 ml .

나. cTnI AB-Cy5(100ug/ml)와 NT proBNP AB-Cy5(100ug/ml), 그리고 BNP AB-Cy5(100ug/ml)를 60ul 씩 넣었다.I. 60 ul of cTnI AB-Cy5 (100 ug / ml), NT proBNP AB-Cy5 (100 ug / ml) and BNP AB-Cy5 (100 ug / ml)

다. 1XPBS 375ul 를 넣어 600ul 의 antibody mixture 를 준비하였다.All. 1XPBS 375ul was added to prepare an antibody mixture of 600ul.

3) 샘플 혼합, 적재 및 인큐베이션3) Sample mixing, loading and incubation

가. 1.5ml 크기의 e-tube 에 각각의 항체 혼합물 100ul와 인큐베이션 버퍼 300ul 씩을 혼합하여 인큐베이션 혼합물을 준비하였다. end. An incubation mixture was prepared by mixing 100ul of each antibody mixture and 300ul of an incubation buffer in an e-tube of 1.5ml size.

나. 표5 의 표준샘플(1~5) 20ul 와 인큐베이션 혼합물 40ul 를 혼합한 후 칩 상에 로딩 후 상온에서 2시간 동안 인큐베이션하였다 I. 20ul of the standard samples (1-5) in Table 5 and 40ul of the incubation mixture were mixed and then loaded on the chip and then incubated at room temperature for 2 hours

4) 세척, 건조 및 스캔4) Wash, dry and scan

인큐베이션 후, 세척용액(4XSSC)에 넣고 2분씩 2회 세척한 후 원심분리기를 이용하여 3000rpm 에서 1분 동안 건조하였다. 건조된 바이오칩은 시판 스캐너 (Scanarray Gx Scanner, Perkin Elmer)를 사용하여 스캔하였다. After the incubation, the cells were washed twice in 2X for 2 minutes in a washing solution (4XSSC), followed by drying at 3000 rpm for 1 minute using a centrifuge. The dried biochip was scanned using a commercial scanner (Scanarray Gx Scanner, Perkin Elmer).

5) 결과 분석5) Analysis of results

도 5 및 표 6은 표준샘플에 대한 측정 결과를 보여준다. 하기 표 6에는 표준농도에 대해 측정된 표준감도가 정리되어 있으며, 도 6에는 표준농도 대 표준감도의 그래프 ("표준샘플 감도 대비 농도 그래프"가 도시되어 있다. Figures 5 and 6 show the measurement results for a standard sample. The standard sensitivities measured for the standard concentrations are summarized in Table 6 below, and the graphs of the standard concentrations versus standard sensitivities ("Standard Sample Sensitivity vs. Concentration Graphs" are shown in FIG.

표준샘플 농도Standard sample concentration 400pg/ml400 pg / ml 200pg/ml200 pg / ml 100pg/ml100 pg / ml 50pg/ml50 pg / ml 25pg/ml25 pg / ml 형광감도
(Gain 90)
Fluorescence sensitivity
(Gain 90)
cTnI cTnI 6500065000 4500045000 2800028000 1700017000 1000010000
NT proBNPNT proBNP 6500065000 4400044000 2800028000 1600016000 1000010000 BNP BNP 6500065000 4500045000 2700027000 1600016000 1000010000

피험자의 혈액샘플을 바이오칩으로 분석하고, 결과된 형광광도 수치를 도 6의 그래프와 비교하면, 피험자의 혈액샘플에 함유된 타겟 단백질의 농도를 분석할 수 있다. The blood sample of the subject is analyzed by biochip, and the resultant fluorescence intensity value is compared with the graph of FIG. 6 to analyze the concentration of the target protein contained in the subject's blood sample.

한편, 이러한 표준 형광감도를 모든 스캔 장비에서 동일한 값으로 얻어낼 수 있게 도 5에서와 같은 내부 표준스팟 (표준농도-감도 테이블)을 제조하였으며, 단백질 농도 분석을 위하여 도 6의 게인 90 (Gain 90)에서 나타난 형광감도를 표준감도로 결정하였다.
An internal standard spot (standard density-sensitivity table) as shown in FIG. 5 was prepared so as to obtain the standard fluorescence sensitivity at the same value in all the scanning equipments. To analyze the protein concentration, a gain 90 ) Was determined as the standard sensitivity.

실시예 5: 내부 표준스팟을 이용한 검출 방법 Example 5: Detection method using internal standard spot

1) 내부 표준스팟을 이용한 검출용 바이오칩 제조1) Manufacture of biochip for detection using internal standard spot

단백질 검출용 바이오칩을 이용하여 바이오마커의 농도를 모르는 테스트분석하는 경우, 측정된 감도를 내부 표준스팟의 감도와 비교분석하여 환산 농도를 결정할 수 있도록 내부 표준스팟 (표준농도-감도 그래프 또는 표준농도-감도테이블)를 제조하였으며, 내부표준스팟 고정화 및 교잡반응에 사용한 물질은 하기 표 7에 기재되어 있다. When analyzing the biomarker concentration using a biochip for protein detection, the internal standard spot (standard concentration-sensitivity graph or standard concentration-sensitivity graph) is set so that the measured sensitivity can be compared with the sensitivity of the internal standard spot and the converted concentration can be determined. Sensitivity tables) were prepared and the materials used for internal standard spot immobilization and hybridization reactions are listed in Table 7 below.

올리고 유전자Oligo gene 염기서열(5'ㅰ 3')The base sequence (5 ', 3') 농도density HCHC GGGGGGGGG CTTTATCAT CC ACT GTT CTC GGC ACGGGGGGGGGG CTTTATCAT CC ACT GTT CTC GGC ACG 100pmol/ul100 pmol / ul NCNC GGGGGGGGG CTTTATTTT TAT AAA TAT AAT ATA ATTGGGGGGGGG CTTTATTTT TAT AAA TAT AAT ATA ATT 100pmol/ul100 pmol / ul HC TD-Cy5HC TD-Cy5 Cy5-TTT TTT CGT GCC GAG AAC AGT GGCy5-TTT TTT CGT GCC GAG AAC AGT GG 1pmol/ul1 pmol / ul

내부 표준스팟 감도는 실시예 4의 표준샘플 400pg/ml ~ 25pg/ml 농도에서 나타나는 모든 감도 65000~10000 수치를 나타낼 수 있도록 하기 표 8에서와 같이 혼합유전자를 사용하였으며, 표준스팟 1 (IS 1), 표준스팟 2 (IS 2), 표준스팟 3 (IS 3) 및 표준스팟 4 (IS 4)에 대하여 각각 HC 유전자의 비율이 각각 5%, 2.5%, 1%, 0.5% 가 되도록 NC 유전자와 혼합하였다. 하기 표 8은 내부표준스팟들의 표준농도를 나타내는 혼합유전자 비율 (HC : NC)을 보여준다. The internal standard spot sensitivity was determined using the mixed gene as shown in Table 8 below so as to be able to show all the sensitivities of 65000 to 10000 values at the concentration of 400 pg / ml to 25 pg / ml of the standard sample of Example 4. The standard spot 1 (IS 1) Mixed with the NC gene so that the HC gene ratios were 5%, 2.5%, 1% and 0.5%, respectively, for the standard spot 2 (IS 2), the standard spot 3 (IS 3) and the standard spot 4 Respectively. Table 8 below shows mixed gene ratios (HC: NC) representing standard concentrations of internal standard spots.

내부표준스팟Internal standard spot 혼합유전자Mixed gene HC 유전자 비율HC gene ratio 농도density HC 유전자HC gene NC 유전자NC gene IS 1IS 1 50ul50ul 950ul950ul 5%5% 10pmol/ul10 pmol / ul IS 2IS 2 25ul25ul 975ul975ul 2.5%2.5% 10pmol/ul10 pmol / ul IS 3IS 3 10ul10ul 990ul990ul 1%One% 10pmol/ul10 pmol / ul IS 4IS 4 5ul5ul 950ul950ul 0.5%0.5% 10pmol/ul10 pmol / ul

표4에 기재된 PCP06, PCP01 및 PCP10 유전자와 표8에 기재된 IS1, IS2, IS3 및 IS4 혼합 유전자를 사용하여, 문헌 [대한민국 특허 제10-0786577호의 실시예 11]에 기재된 방법과 동일하게 수행하여 도 7에 묘사된 바이오칩을 제조하였다. Using the PCP06, PCP01 and PCP10 genes described in Table 4 and the IS1, IS2, IS3 and IS4 mixed genes listed in Table 8, the same procedures as described in Example 11 of Korean Patent No. 10-0786577 The biochip described in 7 was prepared.

2) HC TD-Cy5 를 이용한 내부표준스팟 감도 결정2) Determine internal standard spot sensitivity using HC TD-Cy5

HC 유전자와 상보적인 염기서열을 갖는 HC TD-Cy5 는 4개의 내부표준스팟과 교잡반응 후에 나타난 형광감도가 65000~10000 수준의 모든 수치를 나타낼 수 있도록 도6의 gain 90 에서 나타난 감도를 농도 분석을 위한 내부표준스팟 감도로 결정하였으며 다음과 같이 실시하였다. HC TD-Cy5, which has a nucleotide sequence complementary to the HC gene, is used to analyze the sensitivity at the gain 90 of FIG. 6, so that fluorescence sensitivity after the hybridization reaction with the four internal standard spots can be represented at all levels ranging from 65000 to 10000 The internal standard spot sensitivity was determined as follows.

가. 표9의 HC TD-Cy5(1pmol/ul) 15ul 를 incubation buffer 100ml 와 혼합하여 0.15fmol/ul 농도의 HC TD-Cy5 가 혼합된 incubation mixture 를 준비하였다.end. 15 μl of HC TD-Cy5 (1 pmol / ul) in Table 9 was mixed with 100 ml of incubation buffer to prepare an incubation mixture containing HC TD-Cy5 at a concentration of 0.15 fmol / ul.

나. 1XPBS 30ul 와 가. 에서 준비한 incubation buffer 30ul 를 혼합하여 칩 상에 로딩 후 상온에서 2시간 동안 incubation 하였다.I. 1XPBS 30ul and < RTI ID = And 30 μl of incubation buffer was added to the chip, followed by incubation at room temperature for 2 hours.

다. incubation 후 세척용액(4XSSC)에 넣고 2분씩 2회 세척한 후 원심분리기를 이용하여 3000rpm 에서 1분 동안 건조하였다. 건조된 바이오칩은 Perkin Elmer 의 Scanarray Gx Scanner 에서 스캔 하여 도6 의 gain 90 에서 나타나는 감도를 얻었으며 단백질 분석을 위한 감도 대비 농도 그래프를 사용하여 단백질 농도 분석을 하였다.All. After incubation, the cells were washed with 2x2min of washing solution (4XSSC) and centrifuged at 3000rpm for 1 min. The dried biochip was scanned on a Perkin Elmer Scanarray Gx Scanner to obtain the sensitivity at gain 90 of FIG. 6 and the protein concentration was analyzed using the sensitivity contrast concentration graph for protein analysis.

3) 내부 표준스팟을 이용한 단백질 cTnI, NT proBNP, BNP 검출3) Protein cTnI, NT proBNP, BNP detection using internal standard spot

가. 내부 표준스팟 감도를 이용하여 스캐너 게인(획득치, gain)을 조절하여 cTnI, NT proBNP, BNP 표준샘플의 실제 농도와 본 발명에 따른 단백질 검출용 바이오칩에서 측정된 농도를 비교하였다. 상기 표 5에 기재된 표준샘플 1~5를 이용하여 실시예 4에서와 동일한 방법으로 수행하였다. end. The intensities of the cTnI, NT proBNP, and BNP standard samples were compared with the concentrations measured on the biochip for protein detection according to the present invention by adjusting the scanner gain (gain) using the internal standard spot sensitivity. The same procedure as in Example 4 was carried out using the standard samples 1 to 5 described in Table 5 above.

나. cTnI의 표준샘플 1~5에서 나타난 감도를 내부표준스팟 (표준농도-감도 그래프)을 이용하여 농도로 환산한 결과가 도8 에 나타나 있으며, 실제 사용된 표준농도와 바이오칩으로 측정된 환산농도가 일치하는 결과를 수득하였다. 다른 심질환 바이오마커 NT proBNP 및 BNP에 대해서도, 표준샘플들의 표준농도와 측정감도에서 환산된 환산농도가 동일하게 일치하는 결과를 수득하였다.
I. The results obtained by converting the sensitivities shown in the standard samples 1 to 5 of cTnI into the concentrations using the internal standard spot (standard concentration-sensitivity graph) are shown in FIG. 8, and the actual standard concentrations are matched with the converted concentrations measured by the biochip Lt; / RTI > For the other cardiovascular biomarkers NT proBNP and BNP, the results were also obtained in which the converted concentrations converted from the standard concentrations of the standard samples equally corresponded to the measured sensitivities.

실시예 8: 혈장샘플(serum)의 검출Example 8: Detection of plasma sample (serum)

심혈관 바이오마커의 함유농도는 모르지만 바이오칩으로 측정하여 감도가 65000 이상인 혈장샘플 (샘플 1)을 준비하고, 하기 표 9에 나타낸 바처럼 1/2에서 1/32 까지 1XPBS로써 희석된 샘플 (샘플 2 ~ 6)을 더욱 준비하였다. (Sample 1) having a sensitivity of 65000 or more was prepared by a biochip, although the concentration of the cardiovascular biomarker was unknown, and the sample diluted with 1XPBS from 1/2 to 1/32 as shown in Table 9 6) was further prepared.

샘플1Sample 1 샘플2Sample 2 샘플3Sample 3 샘플4Sample 4 샘플5Sample 5 샘플6Sample 6 혈장샘플 (No. 22)Plasma samples (No. 22) 1/2 희석1/2 dilution 1/4희석1/4 dilution 1/8 희석1/8 dilution 1/16 희석1/16 dilution 1/32 희석1/32 dilution

1) 혈장샘플 30ul 와 1XPBS 30ul 를 혼합하여 1/2 희석하였다.1) 30 ul of plasma sample and 30 ul of 1XPBS were mixed and diluted 1/2.

2) 1)의 희석샘플 30ul 와 1XPBS 30ul 를 혼합하여 1/4 희석하였다. 2) 1) diluted sample 30ul and 1XPBS 30ul were mixed and diluted 1/4.

3) 2)의 희석샘플 30ul 와 1XPBS 30ul 를 혼합하여 1/8 희석하였다. 3) Dilution of 2) 30ul of sample and 30ul of 1XPBS were mixed and diluted 1/8.

4) 3)의 희석샘플 30ul 와 1XPBS 30ul 를 혼합하여 1/16 희석하였다. 4) 30 μl of the diluted sample of 3) and 30 μl of 1XPBS were mixed and diluted 1/16.

5) 4)의 희석샘플 30ul 와 1XPBS 30ul 를 혼합하여 1/23 희석하였다. 5) Dilution of 4) 30ul of sample and 30ul of 1XPBS were mixed and diluted 1/23.

6) 표9의 혈장샘플을 이용하여 실시예4)와 동일한 방법으로 실시하여 결과를 얻었으며 도9에 분석 결과가 나타나있다. 6) Using the plasma samples in Table 9, the results were obtained in the same manner as in Example 4), and the results are shown in FIG.

농도분석 결과를 보면, 정확한 농도를 모르는 혈장샘플에 대하여, 포함된 심질환 바이오마커 단백질 항원인 cTnI 및 NT proBNP는 농도가 1/2 씩 희석된 샘플에서 정확하게 1/2씩 감소된 감도를 가지는 것을 확인하였으며, 400pgml의 높은 농도에서 25pg/ml 의 낮은 농도 까지 피코그램 수준의 농도범위에서 정량적인 농도 분석이 가능함을 확인하였다. Concentration analysis showed that, for plasma samples that did not know the exact concentration, the included coronary heart disease biomarker protein antigens, cTnI and NT proBNP, had sensitivities reduced by exactly 1/2 in the samples diluted by ½ concentration , And it was confirmed that quantitative concentration analysis can be performed at a concentration of a picogram level up to a low concentration of 25 pg / ml at a high concentration of 400 pg ml.

최초 혈장샘플 원액 (샘플 1)에서는 감도가 65000 이상이어서 농도가 400pg/ml 이상이어서 정확한 농도환산이 어렵지만, 이를 1/2 희석한 샘플에서 측정된 감도로부터 환산된 농도는 322pg/ml이어서, 원래의 혈장샘플의 농도는 644pg/ml 인 것으로 결정되었다.In the first plasma sample stock solution (sample 1), the sensitivity was 65000 or more, and the concentration was 400 pg / ml or more, so that it was difficult to accurately convert the concentration. The concentration converted from the sensitivity measured in the 1/2 diluted sample was 322 pg / ml, The plasma sample concentration was determined to be 644 pg / ml.

본 발명은 단백질칩 제조분야 및 이를 이용한 진단 및 치료분야에서 산업적으로 이용될 수 있다. INDUSTRIAL APPLICABILITY The present invention can be industrially used in the field of protein chip manufacturing and diagnosis and treatment using the same.

Claims (17)

하기 단계를 포함하는, 심질환 바이오마커의 정량적 분석 방법:
(1) 바이오칩을 이용하여 항원(antigen)인 심질환 바이오마커 단백질들의 표준농도-감도 그래프를 작성하고,
(2) 피험자의 혈액샘플을 바이오칩으로 분석하여 혈액에 포함된 심질환 바이오마커 단백질들의 측정감도를 수득하고,
(3) 전술한 측정감도를 전술한 표준농도-감도 그래프와 비교하여 심질환 바이오마커 단백질들의 환산 농도를 결정하고,
(4) 상기 수득된 심질환 바이오마커 단백질들의 환산 농도로부터 심질환 진행태 또는 치료상태를 결정함;
여기서, 전술한 바이오칩은 하기 (a)~(d)를 포함하며:
(a) 고체 기질,
(b) 고체기질에의 부착수단 및 연속된 구아닌 염기의 인식 부위를 갖는 아미노캘릭스아렌 유도체,
(c) 연속된 구아닌 염기 및 목적 염기(서열)을 갖는 고정화 유전자, 및
(d) 상기 고정화 유전자에 상보 결합가능한 유전자 및 항체를 결합시킨 항체-유전자 결합체;
여기서, 바이오칩으로 측정하고자 하는 샘플은 (e) 심질환 바이오마커 단백질 항원에 더하여 (f) 표지물질-항체 결합체가 측정 전 또는 측정시에 첨가되며, 전술한 성분 (d)는 바이오칩에 포함되어 있거나, 샘플 첨가 전후에 또는 첨가시에 별도로 첨가될 수 있으며,
여기서, 전술한 아미노캘릭스아렌 유도체는 전술한 부착수단과 고체기질 표면 사이의 화학적 또는 물리적 결합에 의해 고체기질에 부착되어 있고, 전술한 고정화 유전자는 연속된 구아닌 염기에 의해 전술한 고정화 유전자의 연속된 구아닌 염기의 인식부위에 부착되어 있음.
A method for quantitative analysis of heart disease biomarkers comprising the steps of:
(1) A standard concentration-sensitivity graph of anticholinergic biomarker proteins, which are antigens, is prepared using a biochip,
(2) analyzing a subject's blood sample with a biochip to obtain a measurement sensitivity of heart disease biomarker proteins contained in blood,
(3) determining the converted concentration of heart disease biomarker proteins by comparing the measured sensitivities described above with the standard concentration-sensitivity graphs described above,
(4) determining the state of progression of heart disease or the state of treatment from the converted concentration of the obtained heart disease biomarker proteins;
Here, the above-mentioned biochip includes the following (a) to (d)
(a) a solid substrate,
(b) means of attachment to a solid substrate and an amino-calixarene derivative having a recognition site for a continuous guanine base,
(c) an immobilized gene having a continuous guanine base and a desired base (sequence), and
(d) an antibody-gene conjugate obtained by binding a complementary binding gene and an antibody to the immobilized gene;
Here, the sample to be measured by the biochip is (e) a marker substance-antibody conjugate (f) in addition to the heart disease biomarker protein antigen, before or during the measurement, and the component (d) May be added separately before, after, or upon addition of the sample,
Here, the above-mentioned aminocylic arerene derivative is attached to the solid substrate by chemical or physical bonding between the above-mentioned attachment means and the surface of the solid substrate, and the immobilized gene described above is formed by the continuous guanine base, Attached to the recognition site of the guanine base.
제 1 항에 있어서, 전술한 단계 (1)은 하기를 포함하는 것을 특징으로 하는 심질환 바이오마커 단백질의 정량분석 방법:
(1a) 항원인 심질환 바이오마커 단백질 1종 이상을 각각 소정농도로 함유하는 용액 및 이를 정해진 비율로 희석한 용액(들)을 각각 제조함으로써 표준용액을 준비하고,
(1b) 전술한 표준용액들을 바이오칩으로 분석하여 표준감도를 수득하고,
(1c) 전술한 표준농도 및 수득된 표준감도로부터 표준농도-감도 그래프를 작성함.
The method according to claim 1, wherein the step (1) described above comprises quantitatively analyzing heart disease biomarker protein.
A solution containing a predetermined concentration of at least one kind of heart disease biomarker protein (1a) antigen and a solution (s) obtained by diluting the same at a predetermined ratio are prepared,
(1b) The standard solutions described above were analyzed by biochip to obtain a standard sensitivity,
(1c) A standard concentration-sensitivity graph is prepared from the above-mentioned standard concentration and the obtained standard sensitivity.
제 2 항에 있어서, 전술한 표준농도-감도 그래프는 표준농도의 수치 및 표준감도의 수치를 결합한 그래프 형태 대신에 표준농도의 수치 및 표준감도의 이미지를 결합한 테이블 형태 (표준농도-감도 스팟)를 갖는 것을 특징으로 하는 심질환 바이오마커 단백질의 정량분석 방법.The method according to claim 2, wherein the standard density-sensitivity graph is a table (standard density-sensitivity spot) in which standard density values and standard sensitivity images are combined in place of the graph format combining standard density values and standard sensitivity values And measuring the concentration of the biomarker protein. 제 1 항에 있어서, 상기 바이오칩은 성분 (a), (b) 및 (c)를 포함하며, 상기 측정하고자 하는 샘플은 성분 (d)는 성분 (f)와 함께 측정하고자 하는 샘플에 측정의 혼합물을 더욱 포함하는 것을 특징으로 하는 심질환 바이오마커 단백질의 정량분석 방법.The bio-chip according to claim 1, wherein the bio-chip comprises components (a), (b) and (c) Wherein the method comprises the steps of: 제 1 항에 있어서, 전술한 심질환 바이오마커 단백질 항원은 cTnI, NT proBNP 및 BNP로 구성된 군에서 선택되는 1종 이상이고, 전술한 항체는 상기 항원의 항체인 것을 특징으로 하는 심질환 바이오마커 단백질의 정량분석 방법. 2. The method according to claim 1, wherein the heart disease biomarker protein antigen described above is at least one selected from the group consisting of cTnI, NT proBNP and BNP, and the antibody is an antibody of the antigen, Analysis method. 제 1 또는 5 항에 있어서, 전술한 심질환 바이오마커 단백질은 cTnI, NT proBNP 및 BNP를 모두 포함하는 것을 특징으로 하는 심질환 바이오마커 단백질의 정량분석 방법. The method according to any one of claims 1 to 5, wherein said heart disease biomarker protein includes all of cTnI, NT proBNP and BNP. 제 1 항에 있어서, 상기 목적 염기(서열)은 길이가 13mer 이하, 14~17mer, 18~21mer, 또는 22mer 이상인 것을 특징으로 하는 심질환 바이오마커 단백질의 정량분석 방법. The method according to claim 1, wherein the target base (sequence) has a length of 13 mer or less, 14 to 17 mer, 18 to 21 mer, or 22 mer or more. 제 1 항에 있어서, 상기 고체기질은 금, 은, 백금과 같은 금속, 유리, 유리섬유쉬트, 실리콘웨이퍼, 및 수정결정으로 이루어진 군에서 선택되는 것을 특징으로 하는 심질환 바이오마커 단백질의 정량분석 방법. 2. The method according to claim 1, wherein the solid substrate is selected from the group consisting of gold, silver, platinum, glass, glass fiber sheet, silicon wafer, and crystal crystals. 제 1 항에 있어서, 상기 아미노 캘릭스아렌 유도체는 하기 화학식 1 또는 화학식 2로 표시되는 아미노캘릭스아렌 유도체인 것을 특징으로 하는 심질환 바이오마커 단백질의 정량분석 방법:
[화학식 1]
Figure pat00003

[화학식 2]
Figure pat00004


[상기식에서, R1, R2, R3, R4, R5, R6, R7, R8, R'1, R'2, R'3, R'4, R'5, R'6, R'7, R'8은 서로 독립적으로 -H, -CH3, -C2H5, -C3H7, -OCH3, -Cl, -C6H5 ,-OH, -OCH2CH3, -Br, -CF3, -OCH2C6H5, -OC6H5, -OC6H4CH3, -OC6H4C(CH3)3, -OC6H4CF3, -OC6H4Cl, -OCOCH3, -NHCOCH3, -CONHCH3, -CN, COOH, 및 -COOR 로 이루어진 군에서 선택되며, 상기 -COOR 에서 R 은 -CH3 또는 -C2H5 를 나타내며.
Y1, Y2, Y3 및 Y4 는 서로 독립적으로 -H, -(CH2)n-CH=O, -(CH2)n-SH, -(CH2CH2O)m-CH2CH2-CH=O, -(CH2CH2O)m-CH2CH2-SH, -(CH2)m-C6H4-(CH2)c-Z, 및-CO-(CH2)m-1-C6H4-(CH2)c-Z 로 이루어진 군에서 선택된다 (n= 2~15, m= 1~10, c= 0~10, Z 는 -SH, -CHO, -COOH 및 -NH2 로 이루어진 군으로부터 선택되는 기, 그리고 -C6H4- 와 C6H5 는 페닐기로 정의됨)].
The method for quantitative analysis of cardiovascular biomarker protein according to claim 1, wherein the aminoglycos arene derivative is an aminocarboxylarene derivative represented by the following formula 1 or 2:
[Chemical Formula 1]
Figure pat00003

(2)
Figure pat00004


[Wherein, R 1, R 2, R 3, R 4, R 5, R 6, R 7, R 8, R '1, R' 2, R '3, R' 4, R '5, R' 6 , R ' 7 and R' 8 independently of one another are -H, -CH 3 , -C 2 H 5 , -C 3 H 7 , -OCH 3 , -Cl, -C 6 H 5 , -OH, -OCH 2 CH 3, -Br, -CF 3 , -OCH 2 C 6 H 5, -OC 6 H 5, -OC 6 H 4 CH 3, -OC 6 H 4 C (CH 3) 3, -OC 6 H 4 CF 3, -OC 6 H 4 Cl , -OCOCH 3, -NHCOCH 3, -CONHCH 3, -CN, and selected from the group consisting of COOH, and -COOR, in the -COOR R is -CH 3 or -C 2 H 5 .
Y 1, Y 2, Y 3 and Y 4 are independently -H, each other - (CH 2) n-CH = O, - (CH 2) n-SH, - (CH 2 CH 2 O) m-CH 2 CH 2 -CH = O, - ( CH 2 CH 2 O) m-CH 2 CH 2 -SH, - (CH 2) mC 6 H 4 - (CH 2) cZ, and -CO- (CH 2) m- 1-c 6 H 4 - ( CH 2) is selected from the group consisting of cZ (n = 2 ~ 15, m = 1 ~ 10, c = 0 ~ 10, Z is -SH, -CHO, -COOH and -NH 2 , and -C 6 H 4 - and C 6 H 5 are defined as phenyl groups).
제 8 또는 9 항에 있어서, 전술한 고체기질은 금에서 선택되고, 고체기질에의 부착수단으로서 화학식 1 또는 2의 Y1, Y2, Y3 및 Y4 중의 하나 이상이 티올기에서 선택되는 것을 특징으로 하는 심질환 바이오마커 단백질의 정량분석 방법. The method of claim 8 or 9, wherein said solid substrate is selected from gold and wherein at least one of Y 1 , Y 2 , Y 3 and Y 4 of formula (1) or (2) is selected from thiol groups as a means of attachment to a solid substrate Wherein the quantitative analysis of heart disease biomarker protein is performed. 제 8 또는 9 항에 있어서, 전술한 고체기질은 아민 작용기가 부착되어 개질된 유리, 실리콘웨이퍼 및 수정결정으로 이루어진 군에서 선택되고, 고체기질에의 부착수단으로서 화학식 1 또는 2의 Y1, Y2, Y3 및 Y4 중의 하나 이상이 알데히드기에서 선택되고, 이에 의해 전술한 (a) 및 (b)의 연결은 이민기 또는 이를 환원시킨 아민기에서 선택되는 것을 특징으로 하는 심질환 바이오마커 단백질의 정량분석 방법. 8. The method of claim 8 or 9, wherein said solid substrate is selected from the group consisting of glass modified with amine functional groups, silicon wafers and crystal crystals, and wherein Y 1 , Y 2 , Y 3 and Y 4 is selected from aldehyde groups, whereby the linkage of (a) and (b) is selected from an imine group or an amine group reduced therefrom, the quantification of a cardiovascular biomarker protein Analysis method. 제 1 항에 있어서, 전술한 표지물질은 형광체, 효소, 방사능 물질, 미세입자 및 색소로 이루어진 군에서 선택되는 것을 특징으로 하는 심질환 바이오마커 단백질의 정량분석 방법. The method according to claim 1, wherein the labeling substance is selected from the group consisting of phosphors, enzymes, radioactive substances, fine particles and pigments. 제 1 항에 있어서, 전술한 단계 (2)에서 수득된 혈액샘플의 심질환 바이오마커 단백질의 측정감도가 단계 (1)에서 수득된 표준농도-감도 그래프의 범위보다 높으면, 피험자의 혈액샘플을 희석하여 측정감도를 수득하고, 수득된 측정감도 및 희석비율로부터 환산농도를 결정하는 것을 특징으로 하는 심혈관 바이오마커 단백질의 정량분석 방법. The method according to claim 1, wherein if the measurement sensitivity of the heart disease biomarker protein of the blood sample obtained in the step (2) described above is higher than the range of the standard concentration-sensitivity graph obtained in step (1), the blood sample of the subject is diluted Obtaining a measurement sensitivity, and determining a converted concentration from the obtained measurement sensitivity and dilution ratio. 제 1 항에 따른 방법으로 수득된 심혈관 바이오마커 단백질의 농도를 이용하여 급성심근경색(AMI)을 진단하는 방법. A method for diagnosing acute myocardial infarction (AMI) using a concentration of a cardiovascular biomarker protein obtained by the method according to claim 1. 제 1 항에 따른 방법으로 수득된 심혈관 바이오마커 단백질의 농도를 이용하여 급성심근경색(AMI)의 진행상황 및 치료상황을 모니터링하는 방법. A method for monitoring the progress and treatment status of acute myocardial infarction (AMI) using the concentration of the cardiovascular biomarker protein obtained by the method according to claim 1. 제 1 항에 기재된 방법을 사용한 항원 단백질의 정량분석 방법으로서, 항원 단백질을 하기에 기재된 원발장기 질환의 마커단백질로 구성된 군에서 하나 이상 선택되는 것을 특징으로 하는, 항원 단백질의 정량분석 방법:
- 폐암: CEA, SCC, NSE, SLX
- 간암: AFP, PIVKA-II
- 췌장암(담낭암, 담도암): CEA, CA 19-9, CA 50, DUPAN-2, Esterase 1, Span-1 Ag, SLX, NCC-ST-439
- 위암: CEA, CA 19-9, CA 72-4
- 대장암: CEA, CA 19-9, CA 72-4
- 전립선암: PAP, PSA, γ-Sm
- 유방암: CEA, CA 15-3, TPA, NCC-ST-439, BCA 225
- 자궁암: SCC Antigen, CA 125, CEA, TPA
- 난소암: CA 125, CEA, SCC, STN, CA 72-4, SLX
- 식도암: SCC, CEA
A method for quantitative analysis of an antigen protein using the method according to claim 1, wherein the antigen protein is selected from the group consisting of the marker proteins of the following primary organ diseases:
- Lung cancer: CEA, SCC, NSE, SLX
- Liver cancer: AFP, PIVKA-II
- Pancreatic cancer (gallbladder cancer, bile duct cancer): CEA, CA 19-9, CA 50, DUPAN-2, Esterase 1, Span-1 Ag, SLX, NCC-ST-439
- Gastric cancer: CEA, CA 19-9, CA 72-4
- Colorectal cancer: CEA, CA 19-9, CA 72-4
Prostate Cancer: PAP, PSA, γ-Sm
- Breast cancer: CEA, CA 15-3, TPA, NCC-ST-439, BCA 225
- Uterus cancer: SCC Antigen, CA 125, CEA, TPA
- ovarian cancer: CA 125, CEA, SCC, STN, CA 72-4, SLX
- Esophageal cancer: SCC, CEA
제 16 항에 있어서, 전술한 항원은 원발장기 질환의 마커단백질로 구성된 군에서 3~10종을 선택하여 포함하는 것을 특징으로 하는, 항원 단백질의 정량분석 방법. The method for quantitative analysis of antigenic proteins according to claim 16, wherein the antigen is selected from the group consisting of marker proteins of primary organs diseases.
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