KR20110128008A - Method for identifying novel tumor antigen by using rna-transduced antigen presenting cells - Google Patents

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Abstract

PURPOSE: A method for identifying a novel tumor antigen using RNA-transduced antigen presenting cells is provided to develop a vaccine for cancer. CONSTITUTION: A method for identifying tumor antigens comprises: a step of preparing animal-derived candidate tumor antigen gene-transduced antigen presenting cell vaccine; a step of confirming immune response and anti-tumor effect of the vaccine; a step of identifying human candidate tumor antigen having sequence homology with anti-tumorous tumor antigen; and a step of detecting an apitope of the tumor antigen. The candidate tumor antigen gene contains a base sequence of sequence number 3. The antigen presenting cell vaccine is manufactured by transferring candidate tumor antigen gene RNA to a cell having an antigen presenting ability.

Description

RNA 전이 항원 제시 세포를 이용한 신규 종양항원의 규명 방법{Method for identifying novel tumor antigen by using RNA-transduced antigen presenting cells}Method for identifying novel tumor antigen by using RNA-transduced antigen presenting cells

본 발명은 RNA 전이 항원 제시 세포를 이용한 신규 종양항원의 규명 방법에 관한 것으로, 보다 상세하게는 동물의 종양항원으로 규명되지 않은 후보 종양항원 유전자가 전이된 항원-제시 세포 백신을 이용하여 개선된 역면역학적 접근을 통해 세포성 면역치료의 표적이 될 수 있는 인간 종양항원을 효과적으로 발굴할 수 있는 RNA 전이 항원 제시 세포를 이용한 신규 종양항원의 규명 방법에 관한 것이다.
The present invention relates to a method for the identification of new tumor antigens using RNA transfer antigen presenting cells, and more particularly, to an improved aspect using an antigen-presenting cell vaccine to which candidate tumor antigen genes which have not been identified as animal tumor antigens have been transferred. The present invention relates to a method for identifying novel tumor antigens using RNA transfer antigen presenting cells that can effectively detect human tumor antigens that can be targeted for cellular immunotherapy through an epidemiological approach.

현재 암은 심장질환 등과 더불어 인류의 최대 질병 중의 하나로 의학의 발달에도 불구하고 암의 원인을 아직도 확실하게 알지 못하며 치료방법도 뚜렷하지 않다. 현재 사용되고 있는 3대 암치료법은 수술요법, 방사선 요법 및 화학요법 등이 있는데 암의 성질에 따라 각각의 치료 방법이 한계를 갖고 있어서 단독 또는 복합적으로 사용되고 있으나 아직 이러한 치료방법에 의해 암을 완치하지 못하고 환자에게 심한 부작용과 고통을 수반하고 있는 실정이다.Currently, cancer is one of the biggest diseases of mankind along with heart disease, and despite the development of medicine, the cause of cancer is still not clearly known, and the treatment method is not clear. The three major cancer treatments currently in use include surgery, radiation therapy, and chemotherapy. Each treatment method has limitations depending on the nature of the cancer. The situation is accompanied by severe side effects and pain in the patient.

가장 최근에는 면역학적 방법을 활용해 암을 치료하려는 새로운 시도가 주로 동물 실험을 통해 활발히 진행되고 있는데 이를 총칭하여 암백신 또는 면역학적 치료법이라 한다. 제 4의 암치료법이라 불리는 암백신은 암세포가 지니는 종양특이 항원에 대한 면역반응 특이 세포인 살해 T 세포를 유도하여 생체 내 면역기능을 활성화시키고 암세포를 공격하여 제거하는 것으로 유망한 치료법으로 제시되고 있다.Most recently, new attempts to treat cancer using immunological methods have been actively conducted mainly through animal experiments, collectively called cancer vaccines or immunological treatments. The cancer vaccine, called the fourth cancer therapy, has been suggested as a promising treatment by inducing killing T cells, which are immune response-specific cells to tumor-specific antigens, to activate immune functions in vivo and attack and remove cancer cells.

암백신 개발에 가장 중요한 초점은 항원 특이 T 세포 반응을 생성하는 것으로 암세포는 인체의 면역감시 체계를 벗어나기 위해 면역 억제 물질을 분비, 보조 자극인자 발현 억제 등 여러 가지 도피기전을 갖고 있는데 이 모두가 결국은 세포독성 T 세포를 비롯한 인체의 살해세포들이 종양세포에 대해 특이적으로 활성화하는 것을 억제하기 위함이다. 따라서 암에 대한 면역치료요법의 성공 여부는 ‘어떤 종양 특이적 항원을 어떻게 효과적으로 인체의 면역체계가 인식하도록 만드는가’에 달려있다고 할 수 있다.The most important focus of cancer vaccine development is to produce antigen-specific T cell responses. Cancer cells have several escape mechanisms, such as secreting immunosuppressive substances and suppressing the expression of costimulatory factors to escape the body's immune surveillance system. The purpose of the present invention is to inhibit specific activation of tumor cells by killer cells of human body including cytotoxic T cells. Thus, the success of immunotherapy for cancer depends on how certain tumor-specific antigens are effectively recognized by the body's immune system.

임상적으로 성공적인 특이 종양 면역치료를 위해서는 암세포에서 발현하는 단백질 중에서 효과적으로 항종양 효과를 유도할 수 있는 많은 수의 새로운 ‘종양항원(tumor antigen)'의 발굴이 필요하다. Clinically successful specific tumor immunotherapy requires the discovery of a number of new 'tumor antigens' that can effectively induce antitumor effects among proteins expressed in cancer cells.

고전적 유전학 (classical genetics)의 개념은 관찰된 표현형을 중심으로 연관된 유전인자를 규명하는 것으로, 기존의 종양항원 동정 방법은 첫 번째, 세포성 면역반응을 기초로 한 것으로 암세포와 특이적으로 반응하여 활성화된 T 세포 클론을 찾고 여기에 결합하고 있는 펩타이드를 분리 정제한 다음 서열을 분석함으로써 펩타이드가 유래한 단백질을 밝혀내는 것이다. 두 번째, 종양환자의 혈청으로부터 얻은 항체를 이용하여 암세포에서 발현하는 종양항원을 항원항체 반응으로 확인하는 방법으로 ‘SEREX(serologic analysis of recombinant cDNA expression libraries)'라는 기술이 대표적이다. 그러나 종양 특이 T 세포 클론은 확보와 유지가 어렵고 T세포 클론으로 종양항원을 규명하는 단계가 복잡하여 많은 시간이 소요되어 효율성이 낮다는 문제점이 있다. 또한 종양항원에 대한 항체를 이용한 종양항원 발굴은 이미 많은 연구가 이루어져 항체를 이용한 새로운 종양항원의 발견이 한계점에 도달하였다. The concept of classical genetics is to identify related genetic factors based on observed phenotypes. The conventional method of identifying tumor antigens is based on a cellular immune response. By identifying the T-cell clones isolated, the peptides bound to them are isolated and purified, and the sequences are analyzed to identify the proteins from which the peptides are derived. Second, a method called 'serologic analysis of recombinant cDNA expression libraries (SEREX)' is a method for identifying tumor antigens expressed in cancer cells using antigen antibodies using antibodies obtained from the serum of tumor patients. However, tumor-specific T cell clones are difficult to secure and maintain, and the complexity of identifying tumor antigens with T-cell clones requires a lot of time, resulting in low efficiency. In addition, the discovery of tumor antigens using antibodies to tumor antigens has already been studied, and the discovery of new tumor antigens using antibodies has reached the limit.

최근 주변학문의 발달로 인해 종양항원의 동정은 ‘역면역학적 (reverse immunology)’ 접근을 통해 이루어지고 있다. 역면역학적 접근은 생물정보학의 발달과 정교한 면역학적 분석기술의 개발로 가능하게 되었다. 생물정보학의 발달로 유전자 발현 프로필(Gene Expression Profiling)을 통해 정상세포와 종양세포에서 비교하여 과발현된 유전자의 검색이 가능해지고, HLA-결합 모티프를 기초로 예견된 항원 결정기로부터 합성된 후보 종양항원 펩타이드가 동정되었다.Due to the recent development of periphery, the identification of tumor antigens is made through a 'reverse immunology' approach. An immunological approach has been made possible by the development of bioinformatics and the development of sophisticated immunological analytical techniques. Advances in bioinformatics allow gene expression profiling to detect overexpressed genes compared to normal and tumor cells, and candidate tumor antigen peptides synthesized from antigenic determinants predicted based on HLA-binding motifs. I was identified.

또한, 면역학적 기술의 발전은 펩타이드-특이 T 세포를 ELISPOT 과 테트라머(tetramer) 기술을 이용하여 세포 수준에서 정량적, 정성적으로 분석하여 종양항원임을 확인하는 것이 가능하도록 하다. In addition, advances in immunological techniques have enabled peptide-specific T cells to be identified as tumor antigens by quantitative and qualitative analysis at the cellular level using ELISPOT and tetramer technology.

하지만 최근의 역면역학적 시도에 의한 종양항원 동정의 한계는 1) 펩타이드을 예견하는 것이 복잡하고 펩타이드 합성과 정제는 많은 시간과 비용이 소요되며, 2) 유전자를 이용하는 방법은 유전자 전이 효율이 매우 낮아 효과적인 면역반응을 유도할 수 없다는 어려움이 있다. 따라서 효과적이고 신속하게 후보 종양항원 유전자를 스크리닝하는데 문제가 있다.
However, the limitations of tumor antigen identification by recent immuno-immunological trials are 1) complex predicting peptides and synthesis and purification of peptides require a lot of time and cost. There is a difficulty in inducing a reaction. Therefore, there is a problem in screening candidate tumor antigen genes effectively and quickly.

본 발명의 목적은 역면역학적 방법을 개선하여 세포성 면역치료의 표적이 될 수 있는 새로운 종양항원을 효과적으로 발굴할 수 있는 종양항원의 규명 방법을 제공하는 것이다.
SUMMARY OF THE INVENTION An object of the present invention is to provide a method for identifying tumor antigens, which can effectively discover new tumor antigens that can be targeted for cellular immunotherapy by improving the immunological method.

상기 목적을 달성하기 위하여, 본 발명은In order to achieve the above object, the present invention

인간을 제외한 동물 유래의 후보 종양항원 유전자가 전이된 항원-제시 세포 백신을 제조하는 단계;Preparing an antigen-presenting cell vaccine to which candidate tumor antigen genes derived from animals other than humans have been transferred;

상기 백신의 면역반응 및 항종양 효과를 확인하는 단계; Identifying the immune response and antitumor effect of the vaccine;

상기 항종양성 종양항원과 서열 상동성이 있는 인간 후보 종양항원을 동정하는 단계; 및Identifying a human candidate tumor antigen having sequence homology with said antitumor tumor antigen; And

종양항원의 항원결정기를 규명하는 단계를 포함하는 종양항원의 규명 방법을 제공한다.
It provides a method for identifying a tumor antigen comprising the step of identifying the epitope of the tumor antigen.

본 발명은 개선된 역면역학적 접근을 통한 새로운 종양항원 유전자 또는 기존의 기능과 특성이 알려져 있는 종양 관련 유전자 산물을 종양항원으로 사용할 수 있는 지를 신속하게 탐색함으로써 방어적 종양 면역반응에 가장 중요한 종양 특이 T 세포 면역 반응의 표적이 되는 새로운 종양항원의 발굴 체계를 구축하는 선도적 기반 연구(Platform technology)가 될 것으로 사료된다. The present invention provides a tumor-specific T that is most important for protective tumor immune response by rapidly searching for new tumor antigen genes or tumor related gene products of known functions and characteristics through improved immuno-immunological approaches. It is expected to be a leading platform technology to establish a system for discovering new tumor antigens that target cellular immune responses.

또한, 본 발명은 대부분의 종양에서 널리 이용될 수 있는 면역학적 표적으로 종양항원을 발굴함으로써 암백신 또는 입양 T 세포 면역 치료법을 개발할 수 있다.
In addition, the present invention can develop cancer vaccines or adoptive T cell immunotherapy by discovering tumor antigens as immunological targets that are widely available in most tumors.

도 1은 다양한 종양세포주와 정상 생쥐의 조직에서 Top2α의 발현을 도시한 것이다.
도 2는 MC38 세포주 용해물을 탑재한 수지상세포로 접종한 생쥐에서 Top2α와 서바이빈에 특이한 T 세포 반응을 도시한 것이다.
도 3은 Top2αC RNA/DC 접종에 의한 Top2α-특이적 면역반응 유도를 도시한 것이다.
도 4는 Top2α 발현 세포에 대한 세포독성 T 세포의 활성을 도시한 것이다.
도 5 내지 7은 생쥐 종양 모델에서 Top2αC RNA/DC 접종에 의한 항종양 효과를 도시한 것이다.
도 8은 Top2αC RNA/DC 접종한 MC38 종양 모델에서 CD4와 CD8 T 세포의 부재의 효과를 도시한 것이다.
도 9는 Top2αC RNA/DC 접종한 생쥐에서 예견된 펩타이드에 의한 IFN-γ의 생산과 p1327 펩타이드가 탑재된 수지상세포에 의한 항종양 효과를 도시한 것이다.
도 10은 본 발명의 역면역학적 접근을 통한 세포성 면역 치료의 표적 종양항원 발굴 체계를 도식적으로 나타낸 것이다.
1 shows the expression of Top2α in the tissues of various tumor cell lines and normal mice.
Figure 2 shows the T cell response specific for Top2α and survivin in mice inoculated with dendritic cells loaded with MC38 cell line lysate.
3 shows the induction of Top2α-specific immune responses by Top2αC RNA / DC inoculation.
4 depicts the activity of cytotoxic T cells on Top2α expressing cells.
5 to 7 show antitumor effects by Top2αC RNA / DC inoculation in mouse tumor models.
8 shows the effect of the absence of CD4 and CD8 T cells in the MC38 tumor model inoculated with Top2αC RNA / DC.
Figure 9 shows the production of IFN-γ by the peptide predicted in the Top2αC RNA / DC inoculated mice and the anti-tumor effect by dendritic cells loaded with p1327 peptide.
10 is a schematic representation of a target tumor antigen discovery system for cellular immune treatment via an immunoimmunological approach of the present invention.

이하, 본 발명의 구성을 구체적으로 설명한다.EMBODIMENT OF THE INVENTION Hereinafter, the structure of this invention is demonstrated concretely.

본 발명은The present invention

인간을 제외한 동물 유래의 후보 종양항원 유전자가 전이된 항원-제시 세포 백신을 제조하는 단계;Preparing an antigen-presenting cell vaccine to which candidate tumor antigen genes derived from animals other than humans have been transferred;

상기 백신의 면역반응 및 항종양 효과를 확인하는 단계; Identifying the immune response and antitumor effect of the vaccine;

상기 항종양성 종양항원과 서열 상동성이 있는 인간 후보 종양항원을 동정하는 단계; 및Identifying a human candidate tumor antigen having sequence homology with said antitumor tumor antigen; And

종양항원의 항원결정기를 규명하는 단계를 포함하는 종양항원의 규명 방법에 관한 것이다.It relates to a method for identifying a tumor antigen comprising the step of identifying the epitope of the tumor antigen.

본 발명의 종양항원의 규명 방법을 단계별로 구체적으로 설명하면 다음과 같다.Referring to the method of identification of tumor antigen of the present invention in detail as follows.

제1단계는 인간을 제외한 동물 유래의 후보 종양항원 유전자가 탑재된 항원-제시 세포를 제조하는 단계이다.The first step is to prepare antigen-presenting cells loaded with candidate tumor antigen genes derived from animals other than humans.

본 명세서에서, "탑재 (loading 또는 pulsing)"란 수지상세포와 같은 항원-제시 세포(antigen presenting cell, APC)가 항원을 포획하여 분해한 후 이를 MHC 분자에 실어 표면에 표출하는 것으로써, 이와 같이 항원이 탑재된 세포는 강력한 항원 특이적인 T 림프구의 활성을 유도한다.In the present specification, "loading or pulsing" refers to an antigen presenting cell (APC), such as dendritic cells, that captures and degrades an antigen and loads it on an MHC molecule to express it on the surface. Antigen loaded cells induce the activity of potent antigen specific T lymphocytes.

상기 후보 종양항원 유전자는 인간을 제외한 동물 유래의 종양세포주에서 특이적으로 발현되는 유전자를 사용할 수 있다.The candidate tumor antigen gene may be a gene that is specifically expressed in tumor cell lines derived from animals other than humans.

따라서, 상기 종양항원은 토포아이소머라아제 2 알파 (Topoisomerase II α) 단백질 전장 또는 C-말단 유래의 단편을 코딩하는 유전자를 포함할 수 있으나, 이에 특별히 제한하는 것은 아니다. Thus, the tumor antigen may include, but is not particularly limited to, a gene encoding a fragment of the Topoisomerase II alpha full length or C-terminus.

상기 C-말단 유래의 단편은 마우스 유래의 서열번호 3에 기재된 염기서열을 포함할 수 있다. 또한, 상기 염기서열 중 1 이상의 염기가 치환, 결실 또는 부가된 변이 서열을 사용할 수 있으나, 이에 특별히 제한하는 것은 아니다. The fragment derived from the C-terminal may include the nucleotide sequence set forth in SEQ ID NO: 3 derived from a mouse. In addition, a variant sequence in which one or more bases are substituted, deleted or added to the base sequence may be used, but is not particularly limited thereto.

상기 후보 종양항원 유전자는 DNA 또는 RNA 형태일 수 있다. 바람직하게는 RNA 형태일 수 있다.
The candidate tumor antigen gene may be in the form of DNA or RNA. Preferably in the form of RNA.

상기 항원-제시 세포 백신은 후보 종양항원 유전자 RNA를 항원-제시능을 갖는 세포에 전달시켜 제조할 수 있다. The antigen-presenting cell vaccine can be prepared by delivering candidate tumor antigen gene RNA to a cell having antigen-presenting ability.

상기 항원-제시능을 갖는 세포는 종양항원을 제시할 수 있는 MHC 클래스 I 항원 또는 II 항원, 또는 HLA 항원을 세포 표면에 발현하는 세포로서, 예를 들어, 수지상세포, 단핵세포, CD4 T 세포, B 세포, 또는 γδ T(gamma delta T) 세포 등을 사용할 수 있다. 상기 CD4 T 세포, B 세포, 또는 γδ T 세포는 미경험(naive) 상태, 활성화 상태, 또는 증폭(expansion)된 상태인 것을 사용할 수 있다. 보다 바람직하게는, 수지상세포를 사용할 수 있다. The antigen-presenting cells are cells expressing MHC class I or II antigens or HLA antigens capable of presenting tumor antigens on the cell surface, for example, dendritic cells, monocytes, CD4 T cells, B cells or gamma delta T cells can be used. The CD4 T cells, B cells, or γδ T cells may be used in a naive state, an activated state, or an amplified state. More preferably, dendritic cells can be used.

상기 수지상세포는 마크로파지 보다 약 50배 높은 수준의 MHC 분자들을 발현함으로써 T 수용체의 고용을 위한 더 많은 펩타이드/MHC 리간드를 제공하게 되고 또한 T 세포 활성화에 매우 중요한 고정 분자와 공동분자(costimulatory molecule)를 매우 높은 수준으로 발현한다. T 세포 특이 케모카인을 코드화하는 유전자들 또한 T 세포 반응을 유도하는 수지상세포의 강한 활성도를 더해주어 결과적으로 종양 특이 T 세포를 효과적으로 유발할 수 있다. The dendritic cells express about 50 times higher levels of MHC molecules than macrophages, providing more peptides / MHC ligands for the employment of T receptors, and also providing fixed and costimulatory molecules that are critical for T cell activation. It is expressed at very high levels. Genes encoding T cell specific chemokines can also add strong activity of dendritic cells to induce T cell responses, resulting in effective tumor specific T cells.

상기 항원-제시 세포 백신은 예컨대, Such antigen-presenting cell vaccines are, for example,

골수세포로부터 림프구를 분리하는 단계; Separating lymphocytes from myeloid cells;

인간을 제외한 동물 유래의 후보 종양항원을 코딩하는 유전자 RNA를 상기 세포에 탑재하는 단계; 및Mounting the gene RNA encoding candidate tumor antigens derived from animals other than humans into the cells; And

상기 세포를 성숙시키는 단계를 거쳐 제조할 수 있다.It may be prepared by the step of maturing the cells.

보다 구체적으로 예컨대, More specifically,

(a) GM-CSF 및 IL-4를 첨가하여 골수세포로부터 수지상세포를 유도하는 단계; (a) adding GM-CSF and IL-4 to induce dendritic cells from bone marrow cells;

(b) 토포아이소머라아제 2 알파의 C-말단 유래의 단백질 단편, 펩타이드 또는 이들과 기능적으로 동등한 특성을 갖는 유도체를 코딩하는 유전자 RNA를 수지상세포에 탑재하는 단계; 및 (b) loading the dendritic cells with gene RNA encoding protein fragments, peptides derived from the C-terminus of topoisomerase 2 alpha, or derivatives having functionally equivalent properties thereof; And

(c) 상기 Top2αC-말단 RNA 탑재 수지상세포에 성숙유도인자로 LPS를 첨가하여 수지상세포를 성숙시키는 단계를 거쳐 제조할 수 있다.(C) can be prepared by the step of maturing dendritic cells by adding LPS as a mature inducer to the Top2α-C-terminal RNA loaded dendritic cells.

Top2α C-말단 RNA 는 Top2α C-말단 RNA 를 벡터에 주입한 것을 T7 RNA 폴리머라아제와 혼합하여 인 비트로 트랜스크립션을 수행하여 제조할 수 있으며, 벡터로는 pcDNA3.1 TOPO 벡터 등을 사용할 수 있으나 이로 제한되지 않는다.Top2α C-terminal RNA can be prepared by injecting Top2α C-terminal RNA into the vector and mixing it with T7 RNA polymerase to perform in vitro transcription. As a vector, pcDNA3.1 TOPO vector can be used. But not limited to this.

상기 단계 (b)의 Top2α C-말단 RNA 탑재는 전기충격법(electroporation)을 통해 수행될 수 있으며, 단계 (c)는 GM-CSF를 10~20ng/mL 농도로, IL-4를 10~20ng/mL 농도로, LPS 1㎍/mL 농도로 첨가하고 12시간 내지 2일, 구체적으로 1일간 배양하는 과정을 거쳐 수행될 수 있다.
Top2α C-terminal RNA loading of step (b) can be carried out by electroporation, step (c) is 10-20ng / mL of GM-CSF, 10-20ng IL-4 The concentration of / mL, LPS may be carried out by adding a concentration of 1 μg / mL and incubating for 12 hours to 2 days, specifically 1 day.

상기 수지상세포로의 항원의 전달은 다양한 형태로 이루어져 왔는데, 펩타이드는 항원 특이 면역 반응을 유도할 수 있으나 종양 항원의 제한된 부분만을 제시하므로 강한 면역 반응을 유발하기 어렵고, 종양 분쇄물(tumor lysate)은 알려지지 않은 항원까지도 면역반응을 유발할 수 있지만 자가 항원에 대한 면역 반응에 의한 부작용이 일어날 수 있으며, DNA는 유전자 전이 효율이 매우 낮아 항원의 제시가 효과적이지 못하다. 아데노바이러스는 효과적으로 수지상세포로 항원을 전달 할 수 있으나 아데노바이러스 생산에 많은 시간과 노동력이 요구된다. 이에 반해 특이 종양 항원의 RNA을 전기충격법으로 수지상세포로 전달할 경우 항원의 높은 전이율을 보이고, 세포독성이 적고, 단백질로 빠르게 발현하며, 임상적으로 적용이 가능하다는 장점이 있다. 또한 RNA 형태로 전달된 종양항원은 수지상세포에서 MHC 클래스 I과 MHC 클래스 II 모두를 제시함으로써 세포 살해 T 세포와 보조 T 세포를 동시에 활성화시켜 종양항원에 대한 특이 면역반응을 극대화 할 수 있는 특징이 있다. The delivery of the antigen to the dendritic cells has been made in various forms, the peptide can induce an antigen-specific immune response, but because it presents only a limited portion of the tumor antigen, it is difficult to induce a strong immune response, tumor lysate Even unknown antigens can induce immune responses, but side effects due to immune responses to autologous antigens can occur, and DNA is very low in gene transfer efficiency, making antigen presentation difficult. Adenoviruses can effectively deliver antigens to dendritic cells, but require a lot of time and labor to produce adenoviruses. On the contrary, when the RNA of specific tumor antigen is delivered to dendritic cells by the electroshock method, the antigen shows high metastasis rate, less cytotoxicity, rapid expression as protein, and clinical application. In addition, tumor antigens delivered in RNA form are characterized by maximizing specific immune responses to tumor antigens by simultaneously activating cell killer T cells and secondary T cells by presenting both MHC class I and MHC class II in dendritic cells. .

본 발명의 종양항원의 규명 방법에 있어서, 제2단계는 상기 항원-제시 세포 백신의 면역반응 및 항종양 효과를 확인함으로써 종양항원임을 규명하는 단계이다.In the method for identifying the tumor antigen of the present invention, the second step is to identify the tumor antigen by confirming the immune response and anti-tumor effect of the antigen-presenting cell vaccine.

상기 항원-제시 세포 백신의 면역반응은 동물 종양 모델에서 분리된 후보 종양항원 특이적 T 세포의 사이토카인 분비능 또는 종양세포 살해능을 조사하여 확인할 수 있다.The immune response of the antigen-presenting cell vaccine can be confirmed by examining cytokine secretion or tumor cell killing ability of candidate tumor antigen-specific T cells isolated from animal tumor models.

보다 구체적으로, 항원-제시 세포 백신의 면역반응은 More specifically, the immune response of the antigen-presenting cell vaccine is

후보 종양항원 RNA가 전이된 항원-제시 세포를 마우스에 백신접종하는 단계;Vaccinating the mouse with antigen-presenting cells transfected with candidate tumor antigen RNA;

상기 마우스 비장에서 T 세포를 분리하고, 종양세포로 재 자극하는 단계; 및Isolating T cells from the mouse spleen and restimulating with tumor cells; And

항종양 T 세포의 사이토카인 분비능 조사 단계를 거쳐 규명할 수 있다.The cytokine secretion of anti-tumor T cells can be identified through the step of investigation.

상기 사이토카인은 IFN-γ 등을 포함할 수 있다.The cytokine may include IFN-γ and the like.

상기 사이토카인 분비능 조사는 사이토카인 특이 항체가 부착된 플레이트에서 표적세포에서 종양항원을 발현시킨 것과 재자극을 받은 T 세포를 배양하여 ELISPOT를 시행하여 실시할 수 있으나, 이에 특별히 제한하는 것은 아니다. The cytokine secretion investigation may be carried out by ELISPOT by culturing tumor cells expressed in target cells in a plate to which a cytokine specific antibody is attached and re-stimulating T cells, but are not particularly limited thereto.

상기 T 세포의 종양세포 살해능은 51Cr 방출 분석을 실시하여 조사할 수 있으나, 이에 특별히 제한하는 것은 아니다. Tumor cell killing ability of the T cells may be investigated by performing a 51 Cr release assay, but is not particularly limited thereto.

또한, 상기 항원-제시 세포 백신의 항종양 효과는 상기 백신을 동물 종양 모델 또는 이종 종양 모델에 접종하여 종양의 부피 또는 생존일수를 조사하여 확인할 수 있다.In addition, the anti-tumor effect of the antigen-presenting cell vaccine can be confirmed by inoculating the vaccine into an animal tumor model or a heterogeneous tumor model by examining the volume or the number of days of survival of the tumor.

보다 구체적으로, 동물 종양 모델을 이용하는 경우,More specifically, when using an animal tumor model,

종양항원이 탑재된 항원-제시 세포를 동물 모델에 백신접종하는 단계; Vaccination of the antigen-presenting cells with tumor antigens in an animal model;

종양세포를 상기 동물 모델에 주사하는 단계; 및Injecting tumor cells into the animal model; And

상기 동물 모델에서 형성된 종양의 크기 또는 생존일수를 조사하는 단계를 거쳐 항원-제시 세포 백신의 항종양 예방 효과를 확인할 수 있다.The antitumor prevention effect of the antigen-presenting cell vaccine can be confirmed by examining the size or the number of days of survival of the tumor formed in the animal model.

또는, or,

종양세포를 동물 모델에 주사하는 단계;Injecting tumor cells into an animal model;

종양항원이 탑재된 항원-제시 세포를 상기 동물 모델에 백신접종하는 단계; 및Vaccinating the animal model with antigen-presenting cells loaded with tumor antigens; And

상기 동물 모델에서 형성된 종양의 부피 또는 생존일수를 조사하는 단계를 거쳐 항원-제시 세포 백신의 항종양 치료 효과를 확인할 수 있다.The antitumor treatment effect of the antigen-presenting cell vaccine can be confirmed by examining the volume or the number of days of survival of the tumor formed in the animal model.

상기 종양의 부피는 2개의 직각치수(perpendicular dimensions)에서 캘리퍼(caliper) 측정기에 의해 측정할 수 있다. 종양의 부피는 다음 식을 이용하여 확인할 수 있다.The tumor volume can be measured by a caliper meter in two perpendicular dimensions. Tumor volume can be confirmed using the following equation.

종양의 부피= (short dimension)2 × (long dimension)/2 Tumor volume = (short dimension) 2 × (long dimension) / 2

또한, 이종 종양 모델을 이용하는 경우,In addition, when using a heterogeneous tumor model,

종양항원에 특이적인 T 세포 클론을 누드 마우스에 주사하는 단계; Injecting T cell clones specific for tumor antigen into nude mice;

인간 유래의 종양세포를 상기 누드 마우스에 주사하는 단계; 및Injecting human-derived tumor cells into the nude mouse; And

상기 누드 마우스의 생존일수를 조사하는 단계를 거쳐 항원-제시 세포 백신의 항종양 예방 효과를 확인할 수 있다.The anti-tumor prevention effect of the antigen-presenting cell vaccine can be confirmed by examining the survival days of the nude mouse.

또는,or,

인간 유래의 종양세포를 누드 마우스에 주사하는 단계;Injecting human derived tumor cells into nude mice;

종양항원에 특이적인 T 세포 클론을 상기 누드 마우스에 주사하는 단계; 및Injecting said T cell clone specific for tumor antigen into said nude mouse; And

상기 누드 마우스의 생존일수를 조사하는 단계를 거쳐 항원-제시 세포 백신의 항종양 치료 효과를 확인할 수 있다.
The antitumor treatment effect of the antigen-presenting cell vaccine can be confirmed by examining the survival days of the nude mouse.

또한, 상기 항종양 T 세포의 특성을 분석하기 위해, 배양된 세포의 CD8+ 세포 살해 T 세포, CD4+ 보조 T 세포 및 NK 세포의 분포를 확인하기 위하여 세포 표면의 항원형을 분석할 수 있다. In addition, in order to characterize the anti-tumor T cells, the cell surface antigenicity can be analyzed to confirm the distribution of CD8 + cell killing T cells, CD4 + helper T cells and NK cells of the cultured cells.

상기 항원형 분석은 배양된 항종양 T 세포를1% BSA가 포함된 PBS로 세척하고 형광물질이 결합된 CD3, CD4, CD8, CD56, CD14, CD19에 대한 항체를 첨가하여 반응시킨 후 유세포 측정기를 이용하여 측정하며, ELISPOT을 이용하여 특이 펩타이드의 면역원성의 증가 여부를 분석하여 항원형에 따른 면역 유도능을 확인하여 실시할 수 있으나, 이에 특별히 제한하는 것은 아니다.
The antigen-type analysis was carried out by washing the cultured anti-tumor T cells with PBS containing 1% BSA and reacting by adding antibodies to CD3, CD4, CD8, CD56, CD14, and CD19 to which the fluorescent material was bound. It is measured by using, ELISPOT can be carried out by analyzing the immunogenicity of the specific peptide to increase the immunogenic ability according to the antigen type, but is not particularly limited thereto.

본 발명의 종양항원의 규명 방법에 있어서, 제3단계는 동물 종양항원과 서열 상동성이 있는 인간 후보 종양항원을 검색하고, 이의 면역반응 또는 항종양 효과를 확인함으로써 인간 종양항원임을 동정하는 단계이다.In the method for identifying tumor antigens of the present invention, the third step is to identify human tumor antigens by searching for human candidate tumor antigens having sequence homology with animal tumor antigens and confirming their immune response or anti-tumor effect. .

상기 동물 종양항원과 인간 종양항원의 상동성 검색은 http://www.ncbi.nlm.nih.gov/blast; http://www.ch.embnet.org/software/LALIGN를 통해 실시할 수 있으나, 이에 특별히 제한하는 것은 아니다. Homology search between the animal tumor antigen and human tumor antigen is http://www.ncbi.nlm.nih.gov/blast ; This can be done via http://www.ch.embnet.org/software/LALIGN , but is not particularly limited thereto.

상기 상동성 검색을 통해 선정된 인간 후보 종양항원의 동정 단계는Identification of human candidate tumor antigens selected through the homology search

분리된 림프구를 인간 후보 종양항원 유전자가 전이된 항원-제시 세포 백신으로 자극하여 인간 종양항원 특이 세포 살해 T 세포를 시험관내 유도하는 단계; 및Stimulating the isolated lymphocytes with an antigen-presenting cell vaccine transfected with a human candidate tumor antigen gene to induce human tumor antigen specific cell killing T cells in vitro; And

상기 T 세포의 사이토카인 분비능 또는 종양세포 살해능을 조사하는 단계를 포함할 수 있다.It may include the step of examining the cytokine secretion ability or tumor cell killing ability of the T cells.

상기 T 세포의 사이토카인 분비능 또는 종양세포 살해능은 ELISPOT, 또는 51Cr 방출 분석을 통해 조사할 수 있으나, 이에 특별히 제한하는 것은 아니다.The cytokine secretion or tumor cell killing ability of the T cells may be investigated by ELISPOT, or 51 Cr release assay, but is not particularly limited thereto.

또한, 상기 항종양 효과가 입증된 인간 종양항원에 대한 세포성 면역반응을 종양환자의 혈액에서 분리한 세포를 이용하여 측정할 수 있다.
In addition, cellular immune responses against human tumor antigens, which have been demonstrated antitumor effect, can be measured using cells isolated from the blood of tumor patients.

본 발명의 종양항원의 규명 방법에 있어서, 제4단계는 인간 또는 동물 종양항원 특이 세포 살해 T 세포를 유도하고, 상기 T 세포로부터 종양항원의 항원결정기를 규명하는 단계이다. In the method for identifying tumor antigens of the present invention, the fourth step is to induce human or animal tumor antigen specific cell killing T cells and to identify epitopes of tumor antigens from the T cells.

상기 종양항원 특이 세포 살해 T 세포는 종양환자에서 후보 종양항원에 대해 특이적으로 반응하는 세포 살해 T 세포 유도하고 클로닝하여 종양항원 특이 T 세포 클론을 확보할 수 있다.The tumor antigen-specific cell killer T cells can be induced and cloned to kill cell T cells that specifically respond to candidate tumor antigens in tumor patients to obtain tumor antigen-specific T cell clones.

상기 종양항원의 항원결정기를 규명하는 단계는 Identifying the epitope of the tumor antigen is

종양항원 특이 세포 살해 T 세포 클론에서 HLA 항원 결합 특이성이 있는 펩타이드를 분석하는 단계; 및Analyzing peptides having HLA antigen binding specificity in tumor antigen specific cell killing T cell clones; And

상기 펩타이드의 면역반응 또는 항종양 효과를 조사하는 단계를 포함할 수 있다.Investigating the immune response or anti-tumor effect of the peptide.

상기 항원결정기는 인간 또는 동물의 종양항원 특이 세포 살해 T 세포 클론에서 HLA 항원 결합 특이성이 있는 펩타이드를 분석하여 동정할 수 있다. The epitope can be identified by analyzing peptides having HLA antigen binding specificity in tumor antigen specific cell killing T cell clones of humans or animals.

보다 구체적으로, 다양한 HLA형에 따른 종양 항원 유래 펩타이드를 생물정보학 프로그램(http://www.syfpeithi.de, http://www-bimas.dt.nih.gov)을 이용하여 예견하여 제작할 수 있다. More specifically, tumor antigen-derived peptides according to various HLA types can be predicted and produced using bioinformatics programs (http://www.syfpeithi.de, http://www-bimas.dt.nih.gov). .

합성된 펩타이드를 탑재한 항원-제시 세포를 동물 모델에 백신접종한 후 인간 또는 동물 종양항원에 특이적인 T 세포를 유도하여 다양한 펩타이드를 탑재한 항원-제시 세포와 반응시키고, ELISPOT과 51Cr 방출 분석을 시행하여 면역반응을 조사하거나, 동물 종양 모델에 펩타이드를 탑재한 항원-제시 세포를 백신접종하여 항종양 효과를 관찰하여 항원결정기를 규명할 수 있다. Antigen-presenting cells carrying the synthesized peptides were vaccinated in an animal model, and then induced T cells specific for human or animal tumor antigens to react with antigen-presenting cells carrying various peptides, followed by ELISPOT and 51 Cr release assay. Antigen determinants can be identified by investigating the immune response by vaccinating or vaccinating antigen-presenting cells with peptides in animal tumor models.

상기 항원결정기는 서열번호 5의 아미노산 서열을 포함할 수 있으나, 이에 특별히 제한하는 것은 아니다.
The epitope may include the amino acid sequence of SEQ ID NO: 5, but is not particularly limited thereto.

이하, 본 발명에 따르는 실시예 통하여 본 발명을 보다 상세히 설명하나, 본 발명의 범위가 하기 제시된 실시예에 의해 제한되는 것은 아니다.
Hereinafter, the present invention will be described in more detail with reference to Examples of the present invention, but the scope of the present invention is not limited by the following Examples.

<예비실험예 1> 실험 동물 및 암세포 배양Preliminary Experimental Example 1 Experimental Animal and Cancer Cell Culture

6-8주령의 암컷 C57BL/6 마우스 (H-2b)를 오리엔트 바이오(가평, 경기도, 한국)에서 구입하여 사용하였다. 6-8 week old female C57BL / 6 mice (H- 2b ) were purchased from Orient Bio (Gapyeong, Gyeonggi-do, Korea) and used.

GL26 (H-2b; 신경교종), MC-38 및 MC-38-cea2 (H-2b; 대장암), B16F10 (H-2b; 악성흑색종) 및 CT26 (H-2d; 대장암)를 10% 열불활성 우태아혈청 (fetal bovine serum, FBS, Gibco, Grand Island, NY, USA), 2 mM 글루타민 (glutamine), 100 U/mL 페니실린 (penicillin), 및 100 ㎍/mL 스트렙토마이신 (streptomycin) 공급 하에 완전 DMEM (complete Dulbecco's Moified Eagle Medeum)에서 배양하였다.GL26 (H-2 b ; glioma), MC-38 and MC-38-cea2 (H-2 b ; colorectal cancer), B16F10 (H-2 b ; malignant melanoma) and CT26 (H-2 d ; colon Cancer) 10% heat inactivated fetal bovine serum (fetal bovine serum, FBS, Gibco, Grand Island, NY, USA), 2 mM glutamine, 100 U / mL penicillin, and 100 μg / mL streptomycin The cells were cultured in complete DMEM (complete Dulbecco's Moified Eagle Medeum) with a streptomycin.

EL4 (H-2b; 림프종) 및 YAC-1 (H-2a; 림프종)을 10% 열불활성 우태아혈청, 2 mM 글루타민, 100 U/mL 페니실린 및 100 ㎍/mL 스트렙토마이신 공급 하에 완전 RPMI-1640 (Cambrex) 배지에서 배양하였다.EL4 (H-2 b ; Lymphoma) and YAC-1 (H-2 a ; Lymphoma) were given complete RPMI under 10% heat inactivated fetal bovine serum, 2 mM glutamine, 100 U / mL penicillin and 100 μg / mL streptomycin. Incubated in -1640 (Cambrex) medium.

GL26은 Dr. Yu (Cedars Sinai Medical Center, Los Angeles, CA, USA), 인간 CEA를 발현하는 MC-38-cea2는 Dr. Schlom (Division of Tumor Immunology and Biology, NIH, Bethesda, MD, USA), MC-38, EL4, B16F10, CT26 및 YAC-1는 American Type Culture Collection (ATCC, Manassas, VA, USA) 에서 구입하였다.
GL26 is Yu (Cedars Sinai Medical Center, Los Angeles, CA, USA), MC-38-cea2 expressing human CEA Schlom (Division of Tumor Immunology and Biology, NIH, Bethesda, MD, USA), MC-38, EL4, B16F10, CT26 and YAC-1 were purchased from the American Type Culture Collection (ATCC, Manassas, VA, USA).

<예비실험예 2> 통계학적 분석(Statistical analysis)Preliminary Experimental Example 2 Statistical Analysis

실험결과는 평균값±표준편차(SD) 또는 표준오차(SE)로 나타냈다. 통계학적 분석은 생존 확인 데이터를 제외하고 Student's t-test를 사용하여 수행하였다. 생존 확인 데이터는 카플란-메이어 테스트(Kaplan-Meier test)를 사용하여 분석하였고, 로그-랭크 테스트(log-rank test)를 사용하여 다른 그룹과 비교하였다. p 값 < 0.05는 통계학적으로 유의한 차이가 있는 것으로 보았다.
The experimental results were expressed as mean ± standard deviation (SD) or standard error (SE). Statistical analysis was performed using Student's t- test except for survival confirmation data. Survival confirmation data were analyzed using the Kaplan-Meier test and compared with other groups using the log-rank test. The p value <0.05 was considered to be statistically significant.

<실시예 1> Top2αC RNA가 탑재된 수지상세포 백신의 제조Example 1 Preparation of Dendritic Cell Vaccine on Top2αC RNA

<1-1> Top2αC의 클로닝<1-1> Cloning of Top2αC

본 발명에서 사용된 마우스 Top2α의 C-말단 부위이며, 아미노산 잔기 1263-1528 (Top2αC)로 구성되어 있다. GL26으로부터 마우스 Top2αC에 대한 역-전사 mRNA를 중합효소 연쇄반응(polymerase chain reaction, PCR) 증폭을 위한 주형으로 사용하였다. PCR 조건은 하기와 같다: 94℃에서 2분; 94℃에서 15초 및 72℃에서 1분의 30사이클; 72℃에서 10분.The C-terminal part of mouse Top2α used in the present invention, and is composed of amino acid residues 1263-1528 (Top2αC). Reverse-transcription mRNA for mouse Top2αC from GL26 was used as a template for polymerase chain reaction (PCR) amplification. PCR conditions were as follows: 2 minutes at 94 ° C; 30 cycles of 15 seconds at 94 ° C and one minute at 72 ° C; 10 minutes at 72 ° C.

각 Top2αC에 대한 프라이머는 5'-CTGAGGATGGTGCAGAAGAAAGAGCCGGT-3'(forward primer) 및 5'-TGCCTCAGAAGAGGTCGTCATCGTCATCGAA-3'(reverse primer)였다. PCR 산물을 pcDNA3.1 TOPO 벡터 (Invitrogen, Grand island, NY, USA)에 주입하였다. 클로닝된 유전자를 염기서열 분석을 통해 확인하였다.
Primers for each Top2αC were 5'-CTGAGGATGGTGCAGAAGAAAGAGCCGGT-3 '(forward primer) and 5'-TGCCTCAGAAGAGGTCGTCATCGTCATCGAA-3' (reverse primer). PCR products were injected into the pcDNA3.1 TOPO vector (Invitrogen, Grand island, NY, USA). The cloned gene was confirmed by sequencing.

<1-2> 골수-유래 수지상세포 배양 <1-2> Bone marrow-derived dendritic cell culture

수지상세포를 획득하기 위해 6-8주령의 암컷 C57BL/6 생쥐의 대퇴골 및 경골의 골수로부터 골수세포를 채취한 후, 저장성 완충액(hypotonic buffer, 9.84 g/L NH4Cl, 1 g/L KHCO3, 및 0.1 mM EDTA)을 이용하여 적혈구를 제거하였다. 상기 세포를 무혈청 RPMI-1640 배지로 2회 세척한 후 20 ng/mL 뮤린(murine) 과립구 대식세포 콜로니 자극인자(granulocyte-macrophage colony-stimulating factor, GM-CSF, R&D Systems, Minneapolis, MN, USA) 및 20 ng/mL 재조합 뮤린 인터루킨-4(recombinant murine interleukin-4, IL-4, R&D System)을 함유하는 완전 RPMI-1640에서 5×106 cells/well 농도로 배양하였다. 48시간 후, 비유착성 세포(non-adherent cells)를 제거하고, GM-CSF 및 IL-4을 포함하는 완전 배지를 보충하였다. 배양 6일째, 비유착성 및 루즈하게 유착하는 세포(수지상세포)를 모아 RNA 전기충격법(electroporation)에 사용하였다.
In order to obtain dendritic cells, bone marrow cells were collected from femur and tibia bone of 6-8 week-old female C57BL / 6 mice, followed by hypotonic buffer, 9.84 g / L NH 4 Cl, 1 g / L KHCO 3 , And 0.1 mM EDTA) to remove red blood cells. After washing the cells twice with serum-free RPMI-1640 medium, 20 ng / mL murine granulocyte macrophage colony-stimulating factor, GM-CSF, R & D Systems, Minneapolis, MN, USA ) And 20 ng / mL recombinant murine interleukin-4 (IL-4, R & D System) at 5 × 10 6 cells / well concentration in complete RPMI-1640. After 48 hours, non-adherent cells were removed and supplemented with complete medium containing GM-CSF and IL-4. On day 6 of culture, non-adhesive and loosely adherent cells (dendritic cells) were collected and used for RNA electroporation.

<1-3> 수지상세포내로 RNA 전기충격<1-3> RNA electric shock into dendritic cells

Top2αC/pcDNA3.1 TOPO 플라스미드를 Sma I으로 절단하고, T7 RNA 폴리머라아제와 함께 인 비트로 트랜스크립션 (IVT)을 수행하였다 (제조업체의 설명서에 따라 수행함, Ambion mMESSAGE mMACHINE T7 Ultra kit, Austin, TX, USA). IVT RNA의 생성을 아가로오스 젤 전기영동하고, RNA 농도를 분광광도측정법으로 측정하였다. RNA 샘플을 분주(aliquot) 하여 -70℃에 저장하였다. 배양 6일 후, 수지상세포를 Opti-MEM 배지에 2.5×107 cells/mL 농도가 되도록 현탁액을 만들고, 세포 현탁액 200 ㎕를 2-mm 큐벳에 넣고 20 ㎍의 RNA를 첨가하였다. 세포 현탁액을 일렉트로포레이터(ElectroSquarePorator, ECM 830, BTX, San Diego, CA, USA)에 넣고, 300V 전류를 500 ㎲ 동안 주었다. 세포를 즉시 큐벳에서 제거하고 GM-CSF, IL-4 및 LPS (1㎍/mL: Sigma, Saint Louis, MO, USA)을 함유하는 완전 배지를 넣어 24시간 동안 수지상세포가 완전히 성숙하게 하였다. 수지상세포의 전기충격법에 의한 전이 효율을 FACS 분석을 통해 GFP RNA로 측정하였다.
Top2αC / pcDNA3.1 TOPO plasmids were digested with Sma I and performed in vitro transcription (IVT) with T7 RNA polymerase (performed by manufacturer's instructions, Ambion mMESSAGE mMACHINE T7 Ultra kit, Austin, TX , USA). Production of IVT RNA was agarose gel electrophoresis and RNA concentration was measured by spectrophotometry. RNA samples were aliquoted and stored at -70 ° C. After 6 days of incubation, the dendritic cells were prepared in a Opti-MEM medium at a concentration of 2.5 × 10 7 cells / mL, and 200 μl of the cell suspension was placed in a 2-mm cuvette and 20 μg of RNA was added thereto. The cell suspension was placed in an electroporator (ElectroSquarePorator, ECM 830, BTX, San Diego, Calif., USA) and given 300V current for 500 mA. The cells were immediately removed from the cuvette and the complete media containing GM-CSF, IL-4 and LPS (1 μg / mL: Sigma, Saint Louis, MO, USA) was added to allow the dendritic cells to fully mature for 24 hours. The transfer efficiency by dendritic cell electroshock method was measured by GFP RNA through FACS analysis.

<1-4> 종양 분쇄물 (tumor lysate)의 제조<1-4> Preparation of tumor lysate

MC38, MC-38-cea2 또는 B16F10 세포를 1×107 cells/mL의 농도로 PBS에 재분주하였다. 세포 현탁액을 액화질소로 냉동시키고, 37℃ 항온 수조에서 해동하였다. 냉동/해동 사이클을 급히 연속하여 4회 반복하였다. 600 rpm 으로 10분간 원심분리하여 큰 파티클을 제거하였다. 상등액을 0.2㎛ 필터에 통과시키고 분주하여 -70℃에 보관하였다. 용해물의 단백질 농도를 비신코닌산 어세이(Pierce)를 사용하여 측정하였다. 수지상세포를 MC-38 종양 분쇄물(100 ㎍/mL)과 함께 16 내지 18시간 동안 배양하여 MC-38 종양 분쇄물을 탑재하였다.
MC38, MC-38-cea2 or B16F10 cells were re-inoculated into PBS at a concentration of 1 × 10 7 cells / mL. The cell suspension was frozen with liquid nitrogen and thawed in a 37 ° C. constant temperature water bath. The freeze / thaw cycle was repeated four times in rapid succession. Large particles were removed by centrifugation at 600 rpm for 10 minutes. The supernatant was passed through a 0.2 μm filter and aliquoted and stored at −70 ° C. Protein concentration of the lysate was measured using a non-cinconic acid assay (Pierce). Dendritic cells were incubated with MC-38 tumor lysate (100 μg / mL) for 16-18 hours to load MC-38 tumor lysate.

<실험예 1> 웨스턴 블랏팅Experimental Example 1 Western Blotting

마우스 조직을 외과용 매스로 곱게 갈아 작은 조각으로 제조하고, 이를 1 mM DTT, 1 mM 페닐메탄설포닐 플루오라이드, 10 ㎍/mL 아포로티닌(aporotinin), 및 5 ㎍/mL 의 루펩틴(leupeptin)을 함유하는 RIPA 완충액에 현탁하였다. 현탁액을 Precellys24 lyser (Bertin Technologies, Cedex, France)을 사용하여 균질화하였다. 암세포를 같은 완충액에 용해하였다. 단백질 농도를 비신코닌산 어세이(bicinchoninic acid assay, Pierce, Rockford, IL, USA)로 측정하였다. 총 단백질 (50 ㎍)을 8% 폴리아크릴아마이드 겔 상에 분리하여 놓고, 니트로셀룰로오스 멤브레인(Schleicher & Schuell, Dassel, Germany) 상에 블랏팅한 후 항-Top2α 항체(Epitomics, Burlingame, CA, USA)와 함께 배양하였다. 증강 화학발광 (enhanced chemiluminescence, ECL) 염색기법(Amersham Pharmacia, Freiburg, Germany)으로 밴드를 가시화하였다.
The mouse tissue is ground finely into surgical mass and made into small pieces, which are 1 mM DTT, 1 mM phenylmethanesulfonyl fluoride, 10 μg / mL aporotinin, and 5 μg / mL of leupeptin. Suspension in RIPA buffer. The suspension was homogenized using Precellys24 lyser (Bertin Technologies, Cedex, France). Cancer cells were lysed in the same buffer. Protein concentrations were measured by a bicinchoninic acid assay (Pierinch, Rockford, IL, USA). Total protein (50 μg) was isolated on 8% polyacrylamide gel, blotted onto nitrocellulose membrane (Schleicher & Schuell, Dassel, Germany) and then anti-Top2α antibody (Epitomics, Burlingame, CA, USA) Incubated with Bands were visualized by enhanced chemiluminescence (ECL) staining (Amersham Pharmacia, Freiburg, Germany).

뮤린 종양 세포 라인에서 Top2α의 발현을 항-Top2α 항체를 사용하여 웨스턴 블랏팅으로 측정한 결과, 도 1에 도시한 바와 같이 Top2α 단백질이 MC-38 및 GL26을 포함하는 다양한 뮤린 종양 세포주에서 발현됨을 알 수 있었다.Expression of Top2α in murine tumor cell lines was measured by Western blotting using an anti-Top2α antibody, indicating that Top2α protein is expressed in various murine tumor cell lines, including MC-38 and GL26, as shown in FIG. Could.

정상 뮤린 조직에서의 Top2α 발현을 골수, 뇌, 비장, 림프절, 폐, 신장, 간 및 대장에서 측정하였으나, 도 1b에 나타난 바와 같이 비장을 제외하고 다른 조직에서는 Top2α가 발현되지 않았다.Top2α expression in normal murine tissues was measured in bone marrow, brain, spleen, lymph node, lung, kidney, liver, and large intestine. However, as shown in FIG. 1B, Top2α was not expressed in other tissues except the spleen.

<실험예 2> CD4+ 및 CD8+ T 림프구의 분리Experimental Example 2 Isolation of CD4 + and CD8 + T Lymphocytes

CD4+ 및 CD8+ T 림프구 면역반응 측정을 위해, 비장림프구(splenocyte)를 CD4 또는 CD8에 특이적인 모노클로날 항체와 컨쥬게이션된 마그네틱 비드(magnetic antibody cell sorter [MACS]; Miltenyi Biotec, Bergisch Gladbach, Germany)와 4℃에서 15분간 반응시켰다. 배양 후, 세포를 2mM EDTA를 함유하는 PBS로 세척하고 MACS 마그네틱 분리 컬럼을 통과시켰다. 분리 후 각 T 림프구의 순도는 FACS 분석결과 > 90%이었다.
For measuring CD4 + and CD8 + T lymphocyte immune responses, splenocytes were conjugated with monoclonal antibodies specific for CD4 or CD8 magnetic beads (MACS); Miltenyi Biotec, Bergisch Gladbach, Germany) at 15 ° C. for 15 minutes. After incubation, cells were washed with PBS containing 2 mM EDTA and passed through a MACS magnetic separation column. After isolation, the purity of each T lymphocyte was> 90% by FACS analysis.

<실험예 3> ELISPOT 어세이 (Enzyme-linked ImmunoSpot assay)Experimental Example 3 ELISPOT Assay (Enzyme-linked ImmunoSpot Assay)

ELISPOT 키트는 BD Bioscience (Qume Drive, San Jose, CA, USA)에서 구입하여 사용하였으며, 제조업체의 설명서에 따라 실험하였다. The ELISPOT kit was purchased from BD Bioscience (Qume Drive, San Jose, Calif., USA) and used and tested according to the manufacturer's instructions.

비장림프구 (5×104 cells/well)를 항-마우스 IFN-γ 항체로 코팅된 96-웰 플레이트에 씨딩하였다. Top2αC RNA/DC, MC-38TL/DC, SuvRNA/DC 및 수지상세포를 표적세포로 넣었다. 플레이트를 37℃에서 20시간 동안 배양하였다. 세포를 제거하고, 플레이트를 세척완충액으로 3회 세척하였다. 그 다음 비오틴 표지된 항-마우스 IFN-γ 항체를 세포에 첨가하고, 실온에서 2시간 동안 배양하였다. 3회 세척 후 스트렙타비딘-호올스래디쉬 퍼옥시다아제(streptavidin-horseradish peroxidase)를 각 웰에 첨가하고, 실온에서 1시간 동안 배양하였다. 세척 후 발색성 기재 (3-아미노-9-에틸 카바졸 [AEC])를 각 웰에 첨가하였다. 스팟이 생긴 후 증류수로 반응을 종결(quench)하고, 플레이트를 암실에서 하룻밤 동안 건조시켰다. IFN-γ 분비 세포에 해당하는 스팟의 수를 자동 AID-ELISPOT-리더 (Strassberg, Germany)를 사용하여 측정하였다.
Splenocytes (5 × 10 4 cells / well) were seeded in 96-well plates coated with anti-mouse IFN-γ antibody. Top2αC RNA / DC, MC-38TL / DC, SuvRNA / DC and dendritic cells were put into target cells. Plates were incubated at 37 ° C. for 20 hours. The cells were removed and the plates washed three times with wash buffer. Biotin labeled anti-mouse IFN- [gamma] antibodies were then added to the cells and incubated for 2 hours at room temperature. After three washes, streptavidin-Holradish peroxidase was added to each well and incubated for 1 hour at room temperature. After washing a chromogenic substrate (3-amino-9-ethyl carbazole [AEC]) was added to each well. After spots were formed the reaction was quenched with distilled water and the plate was dried overnight in the dark. The number of spots corresponding to IFN-γ secreting cells was measured using an automatic AID-ELISPOT-reader (Strassberg, Germany).

MC-38 종양 분쇄물이 탑재된 DC(수지상세포) (MC-38TL/DC)가 백신접종된 마우스가 Top2α에 대응한 면역반응을 일으키는지 여부를 알아보기 위하여, IFN-γ 분비 세포의 수를 EILSPOT 어세이를 통해 측정해 보았다. 본 실험에 사용된 Top2α는 C-말단 부위이며, 아미노산 잔기 1263-1528이다. MC-38은 서바이빈 및 Top2α를포함하는 몇몇 종양 항원을 발현하는 것으로 나타났기 때문에 C57BL/6 마우스에 대해 MC-38TL/DC를 백신접종하였다. 두 번째 백신접종 후 1주 후, 비장세포를 추출하여 다양한 표적세포로 활성화시켰다. To determine whether mice vaccinated with DC (dendritic cells) (MC-38TL / DC) loaded with MC-38 tumor lysate produced an immune response corresponding to Top2α, the number of IFN-γ secreting cells was counted. Measurements were made using an EILSPOT assay. Top2α used in this experiment is the C-terminal site and amino acid residues 1263-1528. MC-38 was vaccinated against C57BL / 6 mice because MC-38 was shown to express several tumor antigens including survivin and Top2α. One week after the second vaccination, the splenocytes were extracted and activated into various target cells.

Top2αC RNA/DC 로 자극하였을 때 IFN-γ 분비 세포의 수가 항원이 탑재되지 않은 수지상세포로 자극된 경우보다 현저하게 증가하는 것으로 나타났다. MC-38TL/DC 및 서바이빈을 RNA가 트랜스팩션된 DC(SurRNA/DC)로 자극했을 때 또한 비장세포 중의 IFN-γ 분비 세포의 수가 더 높은 수준으로 감지되었다 (도 2 참조). CEA가 탑재된 DC, 관련없는 종양항원, 및 탑재되지 않은 DC가 Top2α 음성 세포로 사용되었다.When stimulated with Top2αC RNA / DC, the number of IFN-γ secreting cells was found to be significantly increased than when stimulated with dendritic cells without antigen. When MC-38TL / DC and survivin were stimulated with RNA transfected DC (SurRNA / DC), also the higher levels of IFN-γ secreting cells in splenocytes were detected (see FIG. 2). DCs loaded with CEA, unrelated tumor antigens, and unloaded DCs were used as Top2α negative cells.

상기 결과는 마우스에서 몇몇 종양 항원에 대한 면역 반응이 MC-38TL/DC를 백신접종함으로써 유도되며, Top2αC RNA/DC가 Top2α 항원결정기를 제시(present)할 수 있음을 알 수 있다.
The results indicate that the immune response to several tumor antigens in mice is induced by vaccination of MC-38TL / DC, and Top2αC RNA / DC can present Top2α epitopes.

생체 내에서 Top2αC RNA/DC에 의해 유도되는 면역반응을 측정하기 위하여, Top2αC RNA 3차 백신접종 후 Top2α 특이적 IFN-γ 분비 T 림프구를 ELISPOT으로 정량분석하였다. Top2αC RNA/DC에 의해 활성화되었을 때, 비장세포, CD4+ 및 CD8+ T 림프구에서의 IFN-γ 분비 세포의 빈도는 DC를 백신접종한 것에 비하여 Top2αC RNA/DC를 백신접종한 마우스에서 현저히 높은 것으로 나타났다. Top2αC-특이적 CD4+ T 림프구의 빈도가 CD8+ T 림프구의 빈도보다 더 높았다. To measure the immune response induced by Top2αC RNA / DC in vivo, Top2α specific IFN-γ secreting T lymphocytes after Top2αC RNA tertiary vaccination were quantified by ELISPOT. When activated by Top2αC RNA / DC, the frequency of IFN-γ secreting cells in splenocytes, CD4 + and CD8 + T lymphocytes was significantly higher in mice vaccinated with Top2αC RNA / DC compared to vaccinated DC. appear. The frequency of Top2αC-specific CD4 + T lymphocytes was higher than that of CD8 + T lymphocytes.

Top2α를 발현하는 종양 세포주인 MC38의 종양 분쇄물이 탑재된 DC로 활성화시킨 경우, 비장세포에서 IFN-γ 분비 세포가 높은 빈도를 나타내는 것으로 관찰되었다 (도 3a).When activated with DC loaded with tumor lysate of MC38, a tumor cell line expressing Top2α, it was observed that IFN-γ secreting cells show high frequency in splenocytes (FIG. 3A).

Top2αC-특이적 CTL (세포독성 T 림프구)의 세포독성을 다양한 표적세포에서 측정하였다. Top2αC RNA/DC를 백신접종한 C57BL/6 마우스로부터의 T 림프구의 경우, 40의 E/T 비율에서 Top2α- 발현 세포로서 MC-38 (H-2b), GL26 (H-2b) 및 Top2αC RNA/DC (H-2b) 에 대응하여 사멸 활성을 보였으나, Top2α-미발현 세포로서 탑재되지 않은 DC에 대하여는 매우 낮은 세포용해(lysis)를 나타낼 뿐이었다 (도 4a 내지 4d).Cytotoxicity of Top2αC-specific CTLs (cytotoxic T lymphocytes) was measured in various target cells. For T lymphocytes from C57BL / 6 mice vaccinated with Top2αC RNA / DC, MC-38 (H-2 b ), GL26 (H-2 b ) and Top2αC as Top2α-expressing cells at an E / T ratio of 40 It showed killing activity in response to RNA / DC (H- 2b ), but showed only very low lysis for DCs that were not loaded as Top2α-unexpressing cells (FIGS. 4A-4D).

YAC-1 (H-2a)는 낮은 세포용해를 나타냈고, 이는 표적세포에 대응한 사멸 활성이 NK 세포에 의해 영향 받지 않음을 나타낸다 (도 4e). CT26, H-2d 단수체형인 Top2α-발현 세포는 C57BL/6 마우스로부터의 Top2α-특이적 T 림프구가 H-2b MHC 클래스 I 분자로 한정되어 있으므로 용해되지 않을 것이다.YAC-1 (H-2 a ) showed low cytolysis, indicating that killing activity corresponding to target cells was not affected by NK cells (FIG. 4E). CT26, a Top2α- cells expressing H-2 d singular body will not melt because it is limited to Top2α- specific T lymphocytes are MHC class I molecule H-2 b from the C57BL / 6 mouse.

상기 결과를 통해 Top2αC RNA/DC 백신접종을 통해 Top2α-특이적 면역 반응이 생체내에서 성공적으로 유도됨을 알 수 있다.
The results show that Top2α-specific immune responses were successfully induced in vivo through Top2αC RNA / DC vaccination.

<실험예 4> 세포독성 분석Experimental Example 4 Cytotoxicity Analysis

표준 51Cr-방출 분석을 수행하였다. 비장림프구를 각 마우스로부터 추출하여, 인 비트로에서 4% 파라포름알데하이드-고정 MC-38 세포로 5일 동안 재활성화시킨 후 작동세포로 사용하였다. 5% CO2, 37℃에서 1시간 동안 1×106 세포당 100 mCi [51Cr]-소듐 크로메이트로 표지된 MC-38, GL26, Top2αC RNA/DC, DC, YAC-1, 및 CT26을 표적세포로 사용하였다. 각 웰의 상등액 100 ㎕를 수거하여, 감마 카운터로 방사능을 측정하였다. Standard 51 Cr-emission analysis was performed. Splenocytes were extracted from each mouse and reactivated with 4% paraformaldehyde-fixed MC-38 cells in vitro for 5 days before being used as effector cells. Targets MC-38, GL26, Top2αC RNA / DC, DC, YAC-1, and CT26 labeled with 100% Ci [ 51 Cr] -sodium chromate per 1 × 10 6 cells at 5% CO 2 , 37 ° C. for 1 hour. Used as a cell. 100 μl of the supernatant of each well was collected and radioactivity was measured with a gamma counter.

특이적 세포용해(lysis)율=100×[(실험방출-자발적방출)/(최대방출-자발적방출)]Specific lysis rate = 100 × [(experimental release-voluntary release) / (maximum release-voluntary release)]

상기 자발적방출 및 최대방출은 각각 배지 및 2% 트리톤 X100의 존재 하에서 방사능을 측정하였다.The spontaneous release and maximal release were measured for radioactivity in the presence of medium and 2% Triton X100, respectively.

<실험예 5> 종양 모델 및 수지상세포 백신접종Experimental Example 5 Tumor Model and Dendritic Vaccination

MC-38 종양 모델을 제조하기 위해, C57BL/6 마우스 (6-8주령)에 MC-38 세포(2×105 cells)를 피하주사 하였다. MC-38 세포 접종 2일 후, 마우스에 대해 1×106 cells Top2αC RNA/DC, MC38TL/DC, p1327/DC, 또는 DC를 3주 동안 1주에 1회씩 피하주사 하였다.To prepare the MC-38 tumor model, C57BL / 6 mice (6-8 weeks old) were injected subcutaneously with MC-38 cells (2 × 10 5 cells). Two days after MC-38 cell inoculation, mice were injected subcutaneously with 1 × 10 6 cells Top2αC RNA / DC, MC38TL / DC, p1327 / DC, or DC once a week for three weeks.

MC-38-cea2 종양 모델을 제조하기 위해, C57BL/6 마우스 (6-8주령)에 MC-38-cea2 세포(1×106 cells)를 피하주사 하였다. MC-38-cea2 접종 후 10, 17, 24일 째, 마우스에 대해 1×106 cells Top2αC RNA/DC/DC, MC-38-cea2TL/DC, 또는 DC를 피하주사 하였다.To prepare the MC-38-cea2 tumor model, C57BL / 6 mice (6-8 weeks old) were injected subcutaneously with MC-38-cea2 cells (1 × 10 6 cells). At 10, 17 and 24 days after MC-38-cea2 inoculation, mice were injected subcutaneously with 1 × 10 6 cells Top2αC RNA / DC / DC, MC-38-cea2TL / DC, or DC.

B16F10 종양 모델을 제조하기 위해, C57BL/6 마우스 (6-8주령)에 MC-38 세포(2×105 cells)를 피하주사 하였다. B16F10 접종 후 1일째, 마우스에 1×106 cells Top2αC RNA/DC, B16F10TL/DC, 또는 DC을 3주 동안 1주에 1회 피하주사 하였다.To prepare a B16F10 tumor model, C57BL / 6 mice (6-8 weeks old) were injected subcutaneously with MC-38 cells (2 × 10 5 cells). One day after B16F10 inoculation, mice were injected subcutaneously with 1 × 10 6 cells Top2αC RNA / DC, B16F10TL / DC, or DC once a week for three weeks.

GL26 종양 모델을 제조하기 위해, C57BL/6 마우스 (6-8주령)에 GL26 세포(1×106 cells)를 피하주사 하였다. GL26 세포 접종 전 14일째, 7일째에, 마우스에 1×106 cells Top2αC RNA/DC, SuvRNA/DC, GFPRNA/DC, 또는 DC를 피하주사 하였다.To prepare the GL26 tumor model, GL57 cells (1 × 10 6 cells) were subcutaneously injected into C57BL / 6 mice (6-8 weeks old). On day 14 and day 7 before GL26 cell inoculation, mice were injected subcutaneously with 1 × 10 6 cells Top2αC RNA / DC, SuvRNA / DC, GFPRNA / DC, or DC.

GL26 신경교종 세포의 두개내(intracranial) 이식을 위해, C57BL/6 마우스 (6-8주령)을 케타민/자일라진(ketamine/xylazine)으로 마취하였다. 머리를 면도하고, 두개골을 노출시켰다. 실험동물을 작은 동물 이어바(earbar)로 정위 프레임(stereotactic frame)내에 위치시켰다. 드레멜 드릴로 대략 두정 및 시상봉합부위(coronal and sagittal sutures (bregma))의 교점 옆 2 mm, 뒤 1 mm의 버홀(burr hole)을 만들었다. For intracranial transplantation of GL26 glioma cells, C57BL / 6 mice (6-8 weeks old) were anesthetized with ketamine / xylazine. The head was shaved and the skull exposed. The experimental animals were placed in a stereotactic frame with small animal earbars. A dremel drill made burr holes approximately 2 mm behind and 1 mm behind the intersection of the coronal and sagittal sutures (bregma).

GL26 세포(1×104 cells)를 해밀턴 시린지를 사용하여 4 ㎕ 의 부피로 3mm 깊이에 주사하였다. 마우스에 1×106 cells Top2αC RNA/DC 또는 DC를 GL26 이식 후 4, 11 및 18일째에 피하로 백신접종하였다. 항원없이 전이과정을 거친 DC를 음성 대조군으로 사용하였다. 종양 성장 또는 생존 감소를 음성 대조군과 비교하였다.
GL26 cells (1 × 10 4 cells) were injected at a depth of 3 mm in a volume of 4 μl using a Hamilton syringe. Mice were vaccinated subcutaneously at 4, 11 and 18 days after GL26 implantation with 1 × 10 6 cells Top2αC RNA / DC or DC. DCs that had undergone metastasis without antigen were used as negative controls. Tumor growth or survival reduction was compared to the negative control.

Top2α가 MC-38, MC-38-cea2, B16F10 및 GL26을 포함하는 다양한 종양 세포주에서 발현되기 때문에, MC-38, MC-38-cea2, B16F10 피하 종양 모델 및 확립된 GL26 두개내 및 피하 종양 모델에서의 Top2αC RNA/DC의 항암 효과를 측정하였다. Because Top2α is expressed in various tumor cell lines, including MC-38, MC-38-cea2, B16F10, and GL26, MC-38, MC-38-cea2, B16F10 subcutaneous tumor models and established GL26 intracranial and subcutaneous tumor models The anticancer effect of Top2αC RNA / DC at was measured.

MC-38, MC-38-cea2, B16F10 종양 모델에서, Top2αC RNA/DC로 백신접종한 마우스의 경우 DC 접종 마우스에 비하여 종양 성장이 저해되는 것으로 나타났다 (p<0.05, 도 5a,b, 도 6c). GL26 접종 4일 후, Top2αC RNA/DC 접종 마우스는 DC 접종 마우스에 비하여 현저하게 오래 생존하는 것으로 나타났다 (p<0.05). Top2αC RNA/DC 접종 마우스 중 20%가 종양 이식 후 85일 이상 생존했다 (도 6d). GL26 피하 종양 모델에서, Top2αC RNA/DC 접종 마우스의 경우 7마리 중 5마리에서 종양 발생이 저해되는 것으로 나타났으나, DC 접종 마우스에서는 7마리 모두 종양이 생성되었다(도 7).
In the MC-38, MC-38-cea2, and B16F10 tumor models, mice vaccinated with Top2αC RNA / DC showed inhibition of tumor growth compared to DC vaccinated mice ( p <0.05, Figures 5a, b, 6c). ). Four days after GL26 inoculation, Top2αC RNA / DC inoculated mice appeared to survive significantly longer than DC inoculated mice ( p <0.05). 20% of Top2αC RNA / DC inoculated mice survived more than 85 days after tumor transplantation (FIG. 6D). In the GL26 subcutaneous tumor model, tumor development was inhibited in 5 of 7 mice in Top2αC RNA / DC-inoculated mice, but all 7 tumors were produced in DC-inoculated mice (FIG. 7).

<실험예 6> 생체내에서의 T 림프구 아군의 부재Experimental Example 6 Absence of T Lymphocyte Subgroups in Vivo

어떤 타입의 T 림프구가 MC-38 종양 모델에 있어서의 항암 효과에 관계된 것인지 알아보기 위하여, 항-CD4 모노클로날 항체 (GK1.5; eBioscience) 및 항-CD8 모노클로날 항체(2.43: a gift from Prof. Byoung S. Kwon in Ulsan University, Ulsan, Korea)를 0, 7, 14일째에 MC-38 종양 모델에 백신접종하여 CD4+ 및 CD8+ T 림프구를 제거하였다 (CD4 및 CD8에 특이적인 항체를 사용하여 FACS 분석을 하여 처리 동안 CD4 및 CD8 이 소멸 (>95%)되었음을 증명하였다. 대조군으로 종양 항원이 없는 수지상세포를 정상 종양 성장을 위해 백신접종함).To determine what type of T lymphocytes are involved in anticancer effects in the MC-38 tumor model, anti-CD4 monoclonal antibodies (GK1.5; eBioscience) and anti-CD8 monoclonal antibodies (2.43: a gift) from Prof. Byoung S. Kwon in Ulsan University, Ulsan, Korea) to vaccinate the MC-38 tumor model on day 0, 7, 14 to remove CD4 + and CD8 + T lymphocytes (antibodies specific for CD4 and CD8) FACS analysis was used to demonstrate that CD4 and CD8 disappeared (> 95%) during treatment, dendritic cells without tumor antigen were vaccinated for normal tumor growth as a control.

CD8+ T 림프구가 소멸되었을 때 Top2αC RNA/DC 백신접종에 의한 종양 성장 억제능은 거의 완벽하게 사라졌다 (도 8). 그러나, CD4+ T 림프구가 제거된 경우 Top2αC RNA/DC 백신접종에 의한 항암효능에 영향이 없었다. 이러한 결과를 토대로 Top2αC RNA/DC 백신접종에 의해 생체 내에서 종양 성장의 저해에 관여하는 것은 CD8+ T 림프구임을 알 수 있다.
Tumor growth inhibition by Top2αC RNA / DC vaccination disappeared almost completely when CD8 + T lymphocytes disappeared (FIG. 8). However, the removal of CD4 + T lymphocytes did not affect the anticancer efficacy by Top2αC RNA / DC vaccination. Based on these results, it can be seen that CD8 + T lymphocytes are involved in the inhibition of tumor growth in vivo by Top2αC RNA / DC vaccination.

<실험예 7> 펩타이드 에피토프(Peptide epitopes)Experimental Example 7 Peptide Epitopes

펩타이드 모티프 스코어링 시스템(peptide motif scoring system, BIMAS; Bioinformatics and Molecular Analysis Section of NIH; http://www-bismas.cit.nih.gov. and SYFPEITHI; http://www.syfpeithi.de)을 사용하여 잠재적으로 H-2Kb에 바인딩할 수 있는 Top2αC 유래 펩타이드에 대해 검토하였다. 2개 프로그램을 사용하여 높은 예상점수를 갖는 5개 펩타이드를 선택하여 분석하였다 (표 1). 합성 펩타이드를 HPLC(high-performance liquid chromatography)로 90%의 최소 순도로 정제하였다. CEA526 (526-533: EAQNTTYL) 펩타이드를 음성 대조군으로 사용하였다.Using the peptide motif scoring system (BIMAS; Bioinformatics and Molecular Analysis Section of NIH; http://www-bismas.cit.nih.gov. And SYFPEITHI; http://www.syfpeithi.de ) We examined potential Top2αC derived peptides that could potentially bind H-2K b . Two programs were used to select and analyze five peptides with high expected scores (Table 1). Synthetic peptides were purified to 90% minimum purity by high-performance liquid chromatography (HPLC). CEA526 (526-533: EAQNTTYL) peptide was used as a negative control.

MHC 클래스 I 분자 (H-2Kb)에 높은 스코어로 바인딩하는 5개 Top2αC 유래 펩타이드를 BIMAS 및 SYFPEITHI 프로그램으로 선택하였고, Top2αC의 T 림프구 에피토프를 결정하기 위하여 Top2αC RNA/DC 를 백신접종한 마우스로부터의 비장세포를 Top2αC 유래 펩타이드로 자극시키고 IFN-γ 생성을 ELISA로 측정하였다. 다른 펩타이드에 비하여 P1327 (DSDEDFSGL)로 활성화된 비장세포가 높은 수준의 IFN-γ를 생성하는 것으로 나타났다 (도 9a). p1327 펄스된 수지상세포로 백신접종한 경우 (p1327/DC) 펩타이드가 탑재되지 않은 DC에 비하여 MC-38의 종양 성장이 현저하게 억제되는 것으로 나타났다 (도 9b). 생체내에서 p1327/DC에 의해 유도되는 면역반응을 측정하기 위하여, p1327/DC로 3차 백신접종한 후 Top2α 특이적 IFN-γ-분비 T 림프구를 ELISPOT 어세이를 사용하여 정량분석하였다. IFN-γ-분비 T 림프구의 빈도는 Top2αC RNA/DC 및 p1327/DC에 의해 자극되었을 때, 펩타이드가 탑재되지 않은 DC 및 CEA526 펩타이드-탑재된 DC(CEA526/DC)로 자극시킨 경우에 비하여 현저하게 증가하였다. p1327/DC로 백신접종한 마우스로부터의 비장세포는 MC-38 종양 세포에 대하여 세포독성을 나타냈다 (도 9d). 이러한 결과를 토대로 p1327이 Top2αC 부위에 위치하는 T 림프구 에피토프의 하나일 수 있음을 알 수 있다.Five Top2αC-derived peptides that bind high scores to MHC class I molecules (H-2Kb) were selected with the BIMAS and SYFPEITHI programs and spleens from mice vaccinated with Top2αC RNA / DC to determine T2 lymphocyte epitopes of Top2αC Cells were stimulated with Top2αC derived peptides and IFN-γ production was measured by ELISA. Compared to other peptides, splenocytes activated with P1327 (DSDEDFSGL) produced high levels of IFN-γ (FIG. 9A). Vaccination with p1327 pulsed dendritic cells (p1327 / DC) showed significantly suppressed tumor growth of MC-38 as compared to DC without peptide (FIG. 9B). To measure the immune response induced by p1327 / DC in vivo, Top2α specific IFN-γ-secreting T lymphocytes were quantitated using ELISPOT assays after tertiary vaccination with p1327 / DC. The frequency of IFN-γ-secreting T lymphocytes was significantly higher when stimulated with Top2αC RNA / DC and p1327 / DC compared to when stimulated with unloaded DC and CEA526 peptide-loaded DC (CEA526 / DC). Increased. Splenocytes from mice vaccinated with p1327 / DC showed cytotoxicity against MC-38 tumor cells (FIG. 9D). Based on these results, it can be seen that p1327 may be one of T lymphocyte epitopes located at the Top2αC site.

Figure pat00001
Figure pat00001

<실험예 8> ELISA (Enzyme-linked immunosorbent assay)Experimental Example 8 ELISA (Enzyme-linked immunosorbent assay)

Top2αC RNA/DC 를 백신접종 한 마우스의 비장림프구 (2×105 cells/200㎕)를 펩타이드 1㎍/mL과 함께 둥근바닥 96-웰 플레이트에 배양하였다. 3일 후, 플레이트를 원심분리하고 각 웰의 상등액 100㎕를 제거하였다. IFN-γ 생성 수준을 ELISA(eBioscience, San Diego, USA)로 측정하였다.
Spleen lymphocytes (2 × 10 5 cells / 200 μl) of mice vaccinated with Top2αC RNA / DC were incubated in round bottom 96-well plates with 1 μg / mL of peptide. After 3 days, the plates were centrifuged and 100 μl of supernatant from each well was removed. IFN- [gamma] production levels were measured by ELISA (eBioscience, San Diego, USA).

<110> CATHOLIC UNIVERSITY INDUSTRY ACADEMIC COOPERATION FOUNDATION <120> Method for identifying novel tumor antigen by using RNA-transduced antigen presenting cells <160> 5 <170> KopatentIn 1.71 <210> 1 <211> 1083 <212> DNA <213> Homo sapiens <220> <221> CDS <222> (1)..(1080) <400> 1 atg aca ttt att gaa gaa ttg gag gct gtt gaa gcc aag gaa aaa caa 48 Met Thr Phe Ile Glu Glu Leu Glu Ala Val Glu Ala Lys Glu Lys Gln 1 5 10 15 gat gaa caa gtc gga ctt cct ggg aaa ggg ggg aag gcc aag ggg aaa 96 Asp Glu Gln Val Gly Leu Pro Gly Lys Gly Gly Lys Ala Lys Gly Lys 20 25 30 aaa aca caa atg gct gaa gtt ttg cct tct ccg cgt ggt caa aga gtc 144 Lys Thr Gln Met Ala Glu Val Leu Pro Ser Pro Arg Gly Gln Arg Val 35 40 45 att cca cga ata acc ata gaa atg aaa gca gag gca gaa aag aaa aat 192 Ile Pro Arg Ile Thr Ile Glu Met Lys Ala Glu Ala Glu Lys Lys Asn 50 55 60 aaa aag aaa att aag aat gaa aat act gaa gga agc cct caa gaa gat 240 Lys Lys Lys Ile Lys Asn Glu Asn Thr Glu Gly Ser Pro Gln Glu Asp 65 70 75 80 ggt gtg gaa cta gaa ggc cta aaa caa aga tta gaa aag aaa cag aaa 288 Gly Val Glu Leu Glu Gly Leu Lys Gln Arg Leu Glu Lys Lys Gln Lys 85 90 95 aga gaa cca ggt aca aag aca aag aaa caa act aca ttg gca ttt aag 336 Arg Glu Pro Gly Thr Lys Thr Lys Lys Gln Thr Thr Leu Ala Phe Lys 100 105 110 cca atc aaa aaa gga aag aag aga aat ccc tgg tct gat tca gaa tca 384 Pro Ile Lys Lys Gly Lys Lys Arg Asn Pro Trp Ser Asp Ser Glu Ser 115 120 125 gat agg agc agt gac gaa agt aat ttt gat gtc cct cca cga gaa aca 432 Asp Arg Ser Ser Asp Glu Ser Asn Phe Asp Val Pro Pro Arg Glu Thr 130 135 140 gag cca cgg aga gca gca aca aaa aca aaa ttc aca atg gat ttg gat 480 Glu Pro Arg Arg Ala Ala Thr Lys Thr Lys Phe Thr Met Asp Leu Asp 145 150 155 160 tca gat gaa gat ttc tca gat ttt gat gaa aaa act gat gat gaa gat 528 Ser Asp Glu Asp Phe Ser Asp Phe Asp Glu Lys Thr Asp Asp Glu Asp 165 170 175 ttt gtc cca tca gat gct agt cca cct aag acc aaa act tcc cca aaa 576 Phe Val Pro Ser Asp Ala Ser Pro Pro Lys Thr Lys Thr Ser Pro Lys 180 185 190 ctt agt aac aaa gaa ctg aaa cca cag aaa agt gtc gtg tca gac ctt 624 Leu Ser Asn Lys Glu Leu Lys Pro Gln Lys Ser Val Val Ser Asp Leu 195 200 205 gaa gct gat gat gtt aag ggc agt gta cca ctg tct tca agc cct cct 672 Glu Ala Asp Asp Val Lys Gly Ser Val Pro Leu Ser Ser Ser Pro Pro 210 215 220 gct aca cat ttc cca gat gaa act gaa att aca aac cca gtt cct aaa 720 Ala Thr His Phe Pro Asp Glu Thr Glu Ile Thr Asn Pro Val Pro Lys 225 230 235 240 aag aat gtg aca gtg aag aag aca gca gca aaa agt cag tct tcc acc 768 Lys Asn Val Thr Val Lys Lys Thr Ala Ala Lys Ser Gln Ser Ser Thr 245 250 255 tcc act acc ggt gcc aaa aaa agg gct gcc cca aaa gga act aaa agg 816 Ser Thr Thr Gly Ala Lys Lys Arg Ala Ala Pro Lys Gly Thr Lys Arg 260 265 270 gat cca gct ttg aat tct ggt gtc tct caa aag cct gat cct gcc aaa 864 Asp Pro Ala Leu Asn Ser Gly Val Ser Gln Lys Pro Asp Pro Ala Lys 275 280 285 acc aag aat cgc cgc aaa agg aag cca tcc act tct gat gat tct gac 912 Thr Lys Asn Arg Arg Lys Arg Lys Pro Ser Thr Ser Asp Asp Ser Asp 290 295 300 tct aat ttt gag aaa att gtt tcg aaa gca gtc aca agc aag aaa tcc 960 Ser Asn Phe Glu Lys Ile Val Ser Lys Ala Val Thr Ser Lys Lys Ser 305 310 315 320 aag ggg gag agt gat gac ttc cat atg gac ttt gac tca gct gtg gct 1008 Lys Gly Glu Ser Asp Asp Phe His Met Asp Phe Asp Ser Ala Val Ala 325 330 335 cct cgg gca aaa tct gta cgg gca aag aaa cct ata aag tac ctg gaa 1056 Pro Arg Ala Lys Ser Val Arg Ala Lys Lys Pro Ile Lys Tyr Leu Glu 340 345 350 gag tca gat gaa gat gat ctg ttt taa 1083 Glu Ser Asp Glu Asp Asp Leu Phe 355 360 <210> 2 <211> 360 <212> PRT <213> Homo sapiens <400> 2 Met Thr Phe Ile Glu Glu Leu Glu Ala Val Glu Ala Lys Glu Lys Gln 1 5 10 15 Asp Glu Gln Val Gly Leu Pro Gly Lys Gly Gly Lys Ala Lys Gly Lys 20 25 30 Lys Thr Gln Met Ala Glu Val Leu Pro Ser Pro Arg Gly Gln Arg Val 35 40 45 Ile Pro Arg Ile Thr Ile Glu Met Lys Ala Glu Ala Glu Lys Lys Asn 50 55 60 Lys Lys Lys Ile Lys Asn Glu Asn Thr Glu Gly Ser Pro Gln Glu Asp 65 70 75 80 Gly Val Glu Leu Glu Gly Leu Lys Gln Arg Leu Glu Lys Lys Gln Lys 85 90 95 Arg Glu Pro Gly Thr Lys Thr Lys Lys Gln Thr Thr Leu Ala Phe Lys 100 105 110 Pro Ile Lys Lys Gly Lys Lys Arg Asn Pro Trp Ser Asp Ser Glu Ser 115 120 125 Asp Arg Ser Ser Asp Glu Ser Asn Phe Asp Val Pro Pro Arg Glu Thr 130 135 140 Glu Pro Arg Arg Ala Ala Thr Lys Thr Lys Phe Thr Met Asp Leu Asp 145 150 155 160 Ser Asp Glu Asp Phe Ser Asp Phe Asp Glu Lys Thr Asp Asp Glu Asp 165 170 175 Phe Val Pro Ser Asp Ala Ser Pro Pro Lys Thr Lys Thr Ser Pro Lys 180 185 190 Leu Ser Asn Lys Glu Leu Lys Pro Gln Lys Ser Val Val Ser Asp Leu 195 200 205 Glu Ala Asp Asp Val Lys Gly Ser Val Pro Leu Ser Ser Ser Pro Pro 210 215 220 Ala Thr His Phe Pro Asp Glu Thr Glu Ile Thr Asn Pro Val Pro Lys 225 230 235 240 Lys Asn Val Thr Val Lys Lys Thr Ala Ala Lys Ser Gln Ser Ser Thr 245 250 255 Ser Thr Thr Gly Ala Lys Lys Arg Ala Ala Pro Lys Gly Thr Lys Arg 260 265 270 Asp Pro Ala Leu Asn Ser Gly Val Ser Gln Lys Pro Asp Pro Ala Lys 275 280 285 Thr Lys Asn Arg Arg Lys Arg Lys Pro Ser Thr Ser Asp Asp Ser Asp 290 295 300 Ser Asn Phe Glu Lys Ile Val Ser Lys Ala Val Thr Ser Lys Lys Ser 305 310 315 320 Lys Gly Glu Ser Asp Asp Phe His Met Asp Phe Asp Ser Ala Val Ala 325 330 335 Pro Arg Ala Lys Ser Val Arg Ala Lys Lys Pro Ile Lys Tyr Leu Glu 340 345 350 Glu Ser Asp Glu Asp Asp Leu Phe 355 360 <210> 3 <211> 801 <212> DNA <213> Mouse <220> <221> CDS <222> (1)..(798) <400> 3 atg gtg cag aag aaa gag cca ggt gca aag aag cag act aca ttg ccg 48 Met Val Gln Lys Lys Glu Pro Gly Ala Lys Lys Gln Thr Thr Leu Pro 1 5 10 15 ttt aag cct gtc aaa aaa ggg agg aag aaa aac ccc tgg tct gac tct 96 Phe Lys Pro Val Lys Lys Gly Arg Lys Lys Asn Pro Trp Ser Asp Ser 20 25 30 gag tca gac gtg agc agt aat gaa agt aac gtt gat gtc cct cct cga 144 Glu Ser Asp Val Ser Ser Asn Glu Ser Asn Val Asp Val Pro Pro Arg 35 40 45 caa aaa gag caa aga agt gct gca gca aaa gcc aaa ttc aca gtg gat 192 Gln Lys Glu Gln Arg Ser Ala Ala Ala Lys Ala Lys Phe Thr Val Asp 50 55 60 tta gac tcg gat gaa gat ttc tca ggt ttg gat gag aag gat gag gat 240 Leu Asp Ser Asp Glu Asp Phe Ser Gly Leu Asp Glu Lys Asp Glu Asp 65 70 75 80 gaa gat ttc ctc cca tta gat gct act cca cct aag gcc aaa atc ccc 288 Glu Asp Phe Leu Pro Leu Asp Ala Thr Pro Pro Lys Ala Lys Ile Pro 85 90 95 cca aaa aat act aaa aaa gca ctg aag acc cag gga agc tcc atg tcg 336 Pro Lys Asn Thr Lys Lys Ala Leu Lys Thr Gln Gly Ser Ser Met Ser 100 105 110 gtt gat ctt gaa agt gat gtt aag gac agt gtg cca gct tct cca ggc 384 Val Asp Leu Glu Ser Asp Val Lys Asp Ser Val Pro Ala Ser Pro Gly 115 120 125 gtt cct gct gct gac ttc cca gcg gaa act gaa cag tca aag cca tcc 432 Val Pro Ala Ala Asp Phe Pro Ala Glu Thr Glu Gln Ser Lys Pro Ser 130 135 140 aaa aag acc gtg gga gtg aag aag aca gca acc aaa agc cag tct tca 480 Lys Lys Thr Val Gly Val Lys Lys Thr Ala Thr Lys Ser Gln Ser Ser 145 150 155 160 gtc tcc act gct ggt acc aaa aag aga gct gcg cca aag gga acc aaa 528 Val Ser Thr Ala Gly Thr Lys Lys Arg Ala Ala Pro Lys Gly Thr Lys 165 170 175 tca gat tca gcc ttg agt gct cgt gtc tcg gaa aaa cct gct cct gcc 576 Ser Asp Ser Ala Leu Ser Ala Arg Val Ser Glu Lys Pro Ala Pro Ala 180 185 190 aaa gcc aag aac agt cgc aaa agg aag cca tct tct tct gat agc tct 624 Lys Ala Lys Asn Ser Arg Lys Arg Lys Pro Ser Ser Ser Asp Ser Ser 195 200 205 gac tct gat ttt gag aga gca att tct aaa ggt gcc acg agc aag aaa 672 Asp Ser Asp Phe Glu Arg Ala Ile Ser Lys Gly Ala Thr Ser Lys Lys 210 215 220 gca aag gga gag gaa cag gac ttc cct gtg gac ttg gaa gac acg ata 720 Ala Lys Gly Glu Glu Gln Asp Phe Pro Val Asp Leu Glu Asp Thr Ile 225 230 235 240 gct cct cga gcc aaa tct gac cgg gcg agg aag cca att aag tac ctg 768 Ala Pro Arg Ala Lys Ser Asp Arg Ala Arg Lys Pro Ile Lys Tyr Leu 245 250 255 gag gag tcc gat gac gat gac gac ctc ttc tg a 801 Glu Glu Ser Asp Asp Asp Asp Asp Leu Phe 260 265 <210> 4 <211> 266 <212> PRT <213> Mouse <400> 4 Met Val Gln Lys Lys Glu Pro Gly Ala Lys Lys Gln Thr Thr Leu Pro 1 5 10 15 Phe Lys Pro Val Lys Lys Gly Arg Lys Lys Asn Pro Trp Ser Asp Ser 20 25 30 Glu Ser Asp Val Ser Ser Asn Glu Ser Asn Val Asp Val Pro Pro Arg 35 40 45 Gln Lys Glu Gln Arg Ser Ala Ala Ala Lys Ala Lys Phe Thr Val Asp 50 55 60 Leu Asp Ser Asp Glu Asp Phe Ser Gly Leu Asp Glu Lys Asp Glu Asp 65 70 75 80 Glu Asp Phe Leu Pro Leu Asp Ala Thr Pro Pro Lys Ala Lys Ile Pro 85 90 95 Pro Lys Asn Thr Lys Lys Ala Leu Lys Thr Gln Gly Ser Ser Met Ser 100 105 110 Val Asp Leu Glu Ser Asp Val Lys Asp Ser Val Pro Ala Ser Pro Gly 115 120 125 Val Pro Ala Ala Asp Phe Pro Ala Glu Thr Glu Gln Ser Lys Pro Ser 130 135 140 Lys Lys Thr Val Gly Val Lys Lys Thr Ala Thr Lys Ser Gln Ser Ser 145 150 155 160 Val Ser Thr Ala Gly Thr Lys Lys Arg Ala Ala Pro Lys Gly Thr Lys 165 170 175 Ser Asp Ser Ala Leu Ser Ala Arg Val Ser Glu Lys Pro Ala Pro Ala 180 185 190 Lys Ala Lys Asn Ser Arg Lys Arg Lys Pro Ser Ser Ser Asp Ser Ser 195 200 205 Asp Ser Asp Phe Glu Arg Ala Ile Ser Lys Gly Ala Thr Ser Lys Lys 210 215 220 Ala Lys Gly Glu Glu Gln Asp Phe Pro Val Asp Leu Glu Asp Thr Ile 225 230 235 240 Ala Pro Arg Ala Lys Ser Asp Arg Ala Arg Lys Pro Ile Lys Tyr Leu 245 250 255 Glu Glu Ser Asp Asp Asp Asp Asp Leu Phe 260 265 <210> 5 <211> 9 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Peptide name: p1327 <400> 5 Asp Ser Asp Glu Asp Phe Ser Gly Leu 1 5 <110> CATHOLIC UNIVERSITY INDUSTRY ACADEMIC COOPERATION FOUNDATION <120> Method for identifying novel tumor antigen by using          RNA-transduced antigen presenting cells <160> 5 <170> KopatentIn 1.71 <210> 1 <211> 1083 <212> DNA <213> Homo sapiens <220> <221> CDS (222) (1) .. (1080) <400> 1 atg aca ttt att gaa gaa ttg gag gct gtt gaa gcc aag gaa aaa caa 48 Met Thr Phe Ile Glu Glu Leu Glu Ala Val Glu Ala Lys Glu Lys Gln   1 5 10 15 gat gaa caa gtc gga ctt cct ggg aaa ggg ggg aag gcc aag ggg aaa 96 Asp Glu Gln Val Gly Leu Pro Gly Lys Gly Gly Lys Ala Lys Gly Lys              20 25 30 aaa aca caa atg gct gaa gtt ttg cct tct ccg cgt ggt caa aga gtc 144 Lys Thr Gln Met Ala Glu Val Leu Pro Ser Pro Arg Gly Gln Arg Val          35 40 45 att cca cga ata acc ata gaa atg aaa gca gag gca gaa aag aaa aat 192 Ile Pro Arg Ile Thr Ile Glu Met Lys Ala Glu Ala Glu Lys Lys Asn      50 55 60 aaa aag aaa att aag aat gaa aat act gaa gga agc cct caa gaa gat 240 Lys Lys Lys Ile Lys Asn Glu Asn Thr Glu Gly Ser Pro Gln Glu Asp  65 70 75 80 ggt gtg gaa cta gaa ggc cta aaa caa aga tta gaa aag aaa cag aaa 288 Gly Val Glu Leu Glu Gly Leu Lys Gln Arg Leu Glu Lys Lys Gln Lys                  85 90 95 aga gaa cca ggt aca aag aca aag aaa caa act aca ttg gca ttt aag 336 Arg Glu Pro Gly Thr Lys Thr Lys Lys Gln Thr Thr Leu Ala Phe Lys             100 105 110 cca atc aaa aaa gga aag aag aga aat ccc tgg tct gat tca gaa tca 384 Pro Ile Lys Lys Gly Lys Lys Arg Asn Pro Trp Ser Asp Ser Glu Ser         115 120 125 gat agg agc agt gac gaa agt aat ttt gat gtc cct cca cga gaa aca 432 Asp Arg Ser Ser Asp Glu Ser Asn Phe Asp Val Pro Pro Arg Glu Thr     130 135 140 gag cca cgg aga gca gca aca aaa aca aaa ttc aca atg gat ttg gat 480 Glu Pro Arg Arg Ala Ala Thr Lys Thr Lys Phe Thr Met Asp Leu Asp 145 150 155 160 tca gat gaa gat ttc tca gat ttt gat gaa aaa act gat gat gaa gat 528 Ser Asp Glu Asp Phe Ser Asp Phe Asp Glu Lys Thr Asp Asp Glu Asp                 165 170 175 ttt gtc cca tca gat gct agt cca cct aag acc aaa act tcc cca aaa 576 Phe Val Pro Ser Asp Ala Ser Pro Pro Lys Thr Lys Thr Ser Pro Lys             180 185 190 ctt agt aac aaa gaa ctg aaa cca cag aaa agt gtc gtg tca gac ctt 624 Leu Ser Asn Lys Glu Leu Lys Pro Gln Lys Ser Val Val Ser Asp Leu         195 200 205 gaa gct gat gat gtt aag ggc agt gta cca ctg tct tca agc cct cct 672 Glu Ala Asp Asp Val Lys Gly Ser Val Pro Leu Ser Ser Ser Pro Pro     210 215 220 gct aca cat ttc cca gat gaa act gaa att aca aac cca gtt cct aaa 720 Ala Thr His Phe Pro Asp Glu Thr Glu Ile Thr Asn Pro Val Pro Lys 225 230 235 240 aag aat gtg aca gtg aag aag aca gca gca aaa agt cag tct tcc acc 768 Lys Asn Val Thr Val Lys Lys Thr Ala Ala Lys Ser Gln Ser Ser Thr                 245 250 255 tcc act acc ggt gcc aaa aaa agg gct gcc cca aaa gga act aaa agg 816 Ser Thr Thr Gly Ala Lys Lys Arg Ala Ala Pro Lys Gly Thr Lys Arg             260 265 270 gat cca gct ttg aat tct ggt gtc tct caa aag cct gat cct gcc aaa 864 Asp Pro Ala Leu Asn Ser Gly Val Ser Gln Lys Pro Asp Pro Ala Lys         275 280 285 acc aag aat cgc cgc aaa agg aag cca tcc act tct gat gat tct gac 912 Thr Lys Asn Arg Arg Lys Arg Lys Pro Ser Thr Ser Asp Asp Ser Asp     290 295 300 tct aat ttt gag aaa att gtt tcg aaa gca gtc aca agc aag aaa tcc 960 Ser Asn Phe Glu Lys Ile Val Ser Lys Ala Val Thr Ser Lys Lys Ser 305 310 315 320 aag ggg gag agt gat gac ttc cat atg gac ttt gac tca gct gtg gct 1008 Lys Gly Glu Ser Asp Asp Phe His Met Asp Phe Asp Ser Ala Val Ala                 325 330 335 cct cgg gca aaa tct gta cgg gca aag aaa cct ata aag tac ctg gaa 1056 Pro Arg Ala Lys Ser Val Arg Ala Lys Lys Pro Ile Lys Tyr Leu Glu             340 345 350 gag tca gat gaa gat gat ctg ttt taa 1083 Glu Ser Asp Glu Asp Asp Leu Phe         355 360 <210> 2 <211> 360 <212> PRT <213> Homo sapiens <400> 2 Met Thr Phe Ile Glu Glu Leu Glu Ala Val Glu Ala Lys Glu Lys Gln   1 5 10 15 Asp Glu Gln Val Gly Leu Pro Gly Lys Gly Gly Lys Ala Lys Gly Lys              20 25 30 Lys Thr Gln Met Ala Glu Val Leu Pro Ser Pro Arg Gly Gln Arg Val          35 40 45 Ile Pro Arg Ile Thr Ile Glu Met Lys Ala Glu Ala Glu Lys Lys Asn      50 55 60 Lys Lys Lys Ile Lys Asn Glu Asn Thr Glu Gly Ser Pro Gln Glu Asp  65 70 75 80 Gly Val Glu Leu Glu Gly Leu Lys Gln Arg Leu Glu Lys Lys Gln Lys                  85 90 95 Arg Glu Pro Gly Thr Lys Thr Lys Lys Gln Thr Thr Leu Ala Phe Lys             100 105 110 Pro Ile Lys Lys Gly Lys Lys Arg Asn Pro Trp Ser Asp Ser Glu Ser         115 120 125 Asp Arg Ser Ser Asp Glu Ser Asn Phe Asp Val Pro Pro Arg Glu Thr     130 135 140 Glu Pro Arg Arg Ala Ala Thr Lys Thr Lys Phe Thr Met Asp Leu Asp 145 150 155 160 Ser Asp Glu Asp Phe Ser Asp Phe Asp Glu Lys Thr Asp Asp Glu Asp                 165 170 175 Phe Val Pro Ser Asp Ala Ser Pro Pro Lys Thr Lys Thr Ser Pro Lys             180 185 190 Leu Ser Asn Lys Glu Leu Lys Pro Gln Lys Ser Val Val Ser Asp Leu         195 200 205 Glu Ala Asp Asp Val Lys Gly Ser Val Pro Leu Ser Ser Ser Pro Pro     210 215 220 Ala Thr His Phe Pro Asp Glu Thr Glu Ile Thr Asn Pro Val Pro Lys 225 230 235 240 Lys Asn Val Thr Val Lys Lys Thr Ala Ala Lys Ser Gln Ser Ser Thr                 245 250 255 Ser Thr Thr Gly Ala Lys Lys Arg Ala Ala Pro Lys Gly Thr Lys Arg             260 265 270 Asp Pro Ala Leu Asn Ser Gly Val Ser Gln Lys Pro Asp Pro Ala Lys         275 280 285 Thr Lys Asn Arg Arg Lys Arg Lys Pro Ser Thr Ser Asp Asp Ser Asp     290 295 300 Ser Asn Phe Glu Lys Ile Val Ser Lys Ala Val Thr Ser Lys Lys Ser 305 310 315 320 Lys Gly Glu Ser Asp Asp Phe His Met Asp Phe Asp Ser Ala Val Ala                 325 330 335 Pro Arg Ala Lys Ser Val Arg Ala Lys Lys Pro Ile Lys Tyr Leu Glu             340 345 350 Glu Ser Asp Glu Asp Asp Leu Phe         355 360 <210> 3 <211> 801 <212> DNA <213> Mouse <220> <221> CDS (222) (1) .. (798) <400> 3 atg gtg cag aag aaa gag cca ggt gca aag aag cag act aca ttg ccg 48 Met Val Gln Lys Lys Glu Pro Gly Ala Lys Lys Gln Thr Thr Leu Pro   1 5 10 15 ttt aag cct gtc aaa aaa ggg agg aag aaa aac ccc tgg tct gac tct 96 Phe Lys Pro Val Lys Lys Gly Arg Lys Lys Asn Pro Trp Ser Asp Ser              20 25 30 gag tca gac gtg agc agt aat gaa agt aac gtt gat gtc cct cct cga 144 Glu Ser Asp Val Ser Ser Asn Glu Ser Asn Val Asp Val Pro Pro Arg          35 40 45 caa aaa gag caa aga agt gct gca gca aaa gcc aaa ttc aca gtg gat 192 Gln Lys Glu Gln Arg Ser Ala Ala Ala Lys Ala Lys Phe Thr Val Asp      50 55 60 tta gac tcg gat gaa gat ttc tca ggt ttg gat gag aag gat gag gat 240 Leu Asp Ser Asp Glu Asp Phe Ser Gly Leu Asp Glu Lys Asp Glu Asp  65 70 75 80 gaa gat ttc ctc cca tta gat gct act cca cct aag gcc aaa atc ccc 288 Glu Asp Phe Leu Pro Leu Asp Ala Thr Pro Pro Lys Ala Lys Ile Pro                  85 90 95 cca aaa aat act aaa aaa gca ctg aag acc cag gga agc tcc atg tcg 336 Pro Lys Asn Thr Lys Lys Ala Leu Lys Thr Gln Gly Ser Ser Met Ser             100 105 110 gtt gat ctt gaa agt gat gtt aag gac agt gtg cca gct tct cca ggc 384 Val Asp Leu Glu Ser Asp Val Lys Asp Ser Val Pro Ala Ser Pro Gly         115 120 125 gtt cct gct gct gac ttc cca gcg gaa act gaa cag tca aag cca tcc 432 Val Pro Ala Ala Asp Phe Pro Ala Glu Thr Glu Gln Ser Lys Pro Ser     130 135 140 aaa aag acc gtg gga gtg aag aag aca gca acc aaa agc cag tct tca 480 Lys Lys Thr Val Gly Val Lys Lys Thr Ala Thr Lys Ser Gln Ser Ser 145 150 155 160 gtc tcc act gct ggt acc aaa aag aga gct gcg cca aag gga acc aaa 528 Val Ser Thr Ala Gly Thr Lys Lys Arg Ala Ala Pro Lys Gly Thr Lys                 165 170 175 tca gat tca gcc ttg agt gct cgt gtc tcg gaa aaa cct gct cct gcc 576 Ser Asp Ser Ala Leu Ser Ala Arg Val Ser Glu Lys Pro Ala Pro Ala             180 185 190 aaa gcc aag aac agt cgc aaa agg aag cca tct tct tct gat agc tct 624 Lys Ala Lys Asn Ser Arg Lys Arg Lys Pro Ser Ser Ser Asp Ser Ser         195 200 205 gac tct gat ttt gag aga gca att tct aaa ggt gcc acg agc aag aaa 672 Asp Ser Asp Phe Glu Arg Ala Ile Ser Lys Gly Ala Thr Ser Lys Lys     210 215 220 gca aag gga gag gaa cag gac ttc cct gtg gac ttg gaa gac acg ata 720 Ala Lys Gly Glu Glu Gln Asp Phe Pro Val Asp Leu Glu Asp Thr Ile 225 230 235 240 gct cct cga gcc aaa tct gac cgg gcg agg aag cca att aag tac ctg 768 Ala Pro Arg Ala Lys Ser Asp Arg Ala Arg Lys Pro Ile Lys Tyr Leu                 245 250 255 gag gag tcc gat gac gat gac gac ctc ttc tg a 801 Glu Glu Ser Asp Asp Asp Asp Asp Leu Phe             260 265 <210> 4 <211> 266 <212> PRT <213> Mouse <400> 4 Met Val Gln Lys Lys Glu Pro Gly Ala Lys Lys Gln Thr Thr Leu Pro   1 5 10 15 Phe Lys Pro Val Lys Lys Gly Arg Lys Lys Asn Pro Trp Ser Asp Ser              20 25 30 Glu Ser Asp Val Ser Ser Asn Glu Ser Asn Val Asp Val Pro Pro Arg          35 40 45 Gln Lys Glu Gln Arg Ser Ala Ala Ala Lys Ala Lys Phe Thr Val Asp      50 55 60 Leu Asp Ser Asp Glu Asp Phe Ser Gly Leu Asp Glu Lys Asp Glu Asp  65 70 75 80 Glu Asp Phe Leu Pro Leu Asp Ala Thr Pro Pro Lys Ala Lys Ile Pro                  85 90 95 Pro Lys Asn Thr Lys Lys Ala Leu Lys Thr Gln Gly Ser Ser Met Ser             100 105 110 Val Asp Leu Glu Ser Asp Val Lys Asp Ser Val Pro Ala Ser Pro Gly         115 120 125 Val Pro Ala Ala Asp Phe Pro Ala Glu Thr Glu Gln Ser Lys Pro Ser     130 135 140 Lys Lys Thr Val Gly Val Lys Lys Thr Ala Thr Lys Ser Gln Ser Ser 145 150 155 160 Val Ser Thr Ala Gly Thr Lys Lys Arg Ala Ala Pro Lys Gly Thr Lys                 165 170 175 Ser Asp Ser Ala Leu Ser Ala Arg Val Ser Glu Lys Pro Ala Pro Ala             180 185 190 Lys Ala Lys Asn Ser Arg Lys Arg Lys Pro Ser Ser Ser Asp Ser Ser         195 200 205 Asp Ser Asp Phe Glu Arg Ala Ile Ser Lys Gly Ala Thr Ser Lys Lys     210 215 220 Ala Lys Gly Glu Glu Gln Asp Phe Pro Val Asp Leu Glu Asp Thr Ile 225 230 235 240 Ala Pro Arg Ala Lys Ser Asp Arg Ala Arg Lys Pro Ile Lys Tyr Leu                 245 250 255 Glu Glu Ser Asp Asp Asp Asp Asp Leu Phe             260 265 <210> 5 <211> 9 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Peptide name: p1327 <400> 5 Asp Ser Asp Glu Asp Phe Ser Gly Leu   1 5

Claims (12)

인간을 제외한 동물 유래의 후보 종양항원 유전자가 전이된 항원-제시 세포 백신을 제조하는 단계;
상기 백신의 면역반응 및 항종양 효과를 확인하는 단계;
상기 항종양성 종양항원과 서열 상동성이 있는 인간 후보 종양항원을 동정하는 단계; 및
종양항원의 항원결정기를 규명하는 단계를 포함하는 종양항원의 규명 방법.
Preparing an antigen-presenting cell vaccine to which candidate tumor antigen genes derived from animals other than humans have been transferred;
Identifying the immune response and antitumor effect of the vaccine;
Identifying a human candidate tumor antigen having sequence homology with said antitumor tumor antigen; And
Method for identifying a tumor antigen comprising the step of identifying the epitope of the tumor antigen.
제1항에 있어서,
후보 종양항원 유전자는 토포아이소머라아제 2 알파 (Topoisomerase II α) 단백질 전장 또는 C-말단 유래의 단편을 코딩하는 유전자를 포함하는 종양항원의 규명 방법.
The method of claim 1,
The candidate tumor antigen gene is a method for identifying a tumor antigen comprising a gene encoding a fragment of the Topoisomerase II alpha full length or C-terminus.
제1항에 있어서,
후보 종양항원 유전자는 서열목록 서열번호 3에 기재된 염기서열을 포함하는 종양항원의 규명 방법.
The method of claim 1,
Candidate tumor antigen gene is a method for identifying a tumor antigen comprising the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 3.
제1항에 있어서,
후보 종양항원 유전자는 DNA 또는 RNA 형태인 종양항원의 규명 방법.
The method of claim 1,
Candidate tumor antigen genes are DNA or RNA forms.
제1항에 있어서,
항원-제시 세포 백신은 후보 종양항원 유전자 RNA를 항원-제시능을 갖는 세포에 전달하여 제조하는 종양항원의 규명 방법.
The method of claim 1,
An antigen-presenting cell vaccine is a method for identification of tumor antigens prepared by delivering candidate tumor antigen gene RNA to cells with antigen-presenting ability.
제5항에 있어서,
항원-제시능을 갖는 세포는 수지상세포, 단핵세포, CD4 T 세포, B 세포 및 γδ T(gamma delta T) 세포로 이루어진 군으로부터 선택된 하나 이상인 종양항원의 규명 방법.
The method of claim 5,
A cell having an antigen-presenting ability is at least one selected from the group consisting of dendritic cells, monocytes, CD4 T cells, B cells and γδ T (gamma delta T) cells.
제6항에 있어서,
CD4 T 세포, B 세포, 또는 γδ T 세포는 미경험(naive) 상태, 활성화 상태, 또는 증폭(expansion)된 상태인 종양항원의 규명 방법.
The method of claim 6,
CD4 T cells, B cells, or γδ T cells are naïve, activated, or amplified state.
제5항에 있어서,
유전자 전달은 전기충격법을 통해 실시하는 종양항원의 규명 방법.
The method of claim 5,
Gene transfer is a method for identifying tumor antigens that are carried out by electroshock method.
제1항에 있어서,
항원-제시 세포 백신의 면역반응은 동물 종양 모델에서 분리된 후보 종양항원 특이적인 T 세포의 사이토카인 분비능 또는 종양세포 살해능을 조사하여 확인하는 종양항원의 규명 방법.
The method of claim 1,
Immune response of antigen-presenting cell vaccines is a method of identification of tumor antigens confirmed by examining the cytokine secretion or tumor cell killing ability of candidate tumor antigen-specific T cells isolated from animal tumor models.
제1항에 있어서,
항원-제시 세포 백신의 항종양 효과는 상기 백신을 동물 종양 모델 또는 이종 종양 모델에 접종하여 종양의 부피 또는 생존일수를 조사하여 확인하는 종양항원의 규명 방법.
The method of claim 1,
Antitumor effect of the antigen-presenting cell vaccine is confirmed by inoculating the vaccine into an animal tumor model or a heterogeneous tumor model and examining the tumor volume or the number of days of survival.
제1항에 있어서, 인간 후보 종양항원의 동정 단계는
분리된 림프구를 인간 후보 종양항원 유전자가 전이된 항원-제시 세포 백신으로 자극하여 인간 종양항원 특이 세포 살해 T 세포를 시험관내 유도하는 단계; 및
상기 T 세포의 사이토카인 분비능 또는 종양세포 살해능을 조사하는 단계를 포함하는 종양항원의 규명 방법.
The method of claim 1, wherein the step of identifying human candidate tumor antigens is
Stimulating the isolated lymphocytes with an antigen-presenting cell vaccine transfected with a human candidate tumor antigen gene to induce human tumor antigen specific cell killing T cells in vitro; And
Method of identifying a tumor antigen comprising the step of investigating the cytokine secretion capacity or tumor cell killing ability of the T cells.
제1항에 있어서, 종양항원의 항원결정기를 규명하는 단계는
종양항원 특이 세포 살해 T 세포 클론에서 HLA 항원 결합 특이성이 있는 펩타이드를 분석하는 단계; 및
상기 펩타이드의 면역반응 또는 항종양 효과를 조사하는 단계를 포함하는 종양항원의 규명 방법.
The method of claim 1, wherein the determining the epitope of the tumor antigen is
Analyzing peptides having HLA antigen binding specificity in tumor antigen specific cell killing T cell clones; And
Method for identifying a tumor antigen comprising the step of examining the immune response or anti-tumor effect of the peptide.
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