KR20110115742A - Marker proteins for identifying hempseed and an identification kit for hempseed - Google Patents

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Abstract

본 발명은 대마 종자 중 청삼 종자와 보성 종자를 구분할 수 있는 마커에 관한 것으로서, 좀더 자세히는 마취성분인 테트라하이드로카나비놀 함량이 낮은 청삼 종자와 테트라하이드로카나비놀 함량이 높은 보성 종자를 간단한 방법으로 구분할 수 있는 마커와 이를 이용한 키트에 관한 것이다.The present invention relates to a marker that can distinguish blue ginseng seed and complementary seed among hemp seeds, and more particularly, a simple method of blue ginseng seed having low tetrahydrocanabinol content and high tetrahydrocanabinol content as an anesthetic component. It relates to a marker that can be divided into a kit using the same.

Description

대마 종자 구분용 마커 단백질 및 이를 이용한 대마 종자 구분용 키트{Marker Proteins for Identifying Hempseed and An Identification Kit for Hempseed}Marker protein for identifying hemp seeds and kit for distinguishing hemp seeds using the same

본 발명은 대마 종자 중 청삼 종자와 보성 종자를 구분할 수 있는 마커에 관한 것으로서, 좀더 자세히는 마취성분인 테트라하이드로카나비놀 함량이 낮은 대마인 청삼의 종자와 테트라하이드로카나비놀 함량이 높은 대마인 보성의 종자를 간단한 방법으로 구분할 수 있는 마커와 이를 이용한 키트에 관한 것이다.The present invention relates to a marker that can distinguish blue ginseng seed and boseong seed among hemp seeds, and more specifically, the hemp seed of blue ginseng, which is low in anhydrous tetrahydrocanabinol, and high in hemp bovine hemp seed. The present invention relates to a marker that can distinguish seeds by a simple method and a kit using the same.

대마(hemp)는 학명이 카나비스 사티바(Cannabis sativa)이고, 삼이라고도 불리며 줄기의 인피섬유는 캔버스, 리넨, 티백, 지폐, 담배 마는 종이 그리고 의류 등으로 사용되고(Callaway, J. C. (2004) Hempseed as a nutritional resource: An overview. Euphytica, 140, 65-72), 종자는 조미용이나 기름을 짜는데 사용되며, 꽃으로부터 생리활성물질을 분리하여 일부 의약품으로 사용되기도 하었다.Hemp is the scientific name Cannabis sativa , also called hemp, and the bast fibers of the stem are used for canvas, linen, tea bags, bills, rolling papers, and clothing (Callaway, JC (2004) Hempseed as A nutritional resource: An overview.Euphytica, 140, 65-72), seeds are used for seasoning or squeezing oil and have been used in some medicines to separate bioactive substances from flowers.

대마의 줄기, 잎 그리고 꽃에는 테트라하이드로카나비놀(Tetrahydrocannabinol; THC)이라는 마취성분의 물질이 포함되어 있다고 알려져 있어 대마의 이용이 감소하였다. 하지만 대마의 뿌리와 종자 및 섬유에는 테트라하이드로카나비놀 성분이 거의 포함되어 있지 않으며 대마의 유효성분들에 대한 연구와 이를 바탕으로 한 제품개발이 일부 선진국에서 활발하게 진행되고 있다.Hemp stems, leaves and flowers are known to contain an anesthetic substance called Tetrahydrocannabinol (THC), reducing the use of hemp. However, the roots, seeds and fibers of hemp contain little tetrahydrocannabinol, and research on active ingredients of hemp and the development of products based on these are being actively conducted in some developed countries.

대마섬유는 오래 전부터 사용해온 천연섬유의 하나로 인장강도가 크고 섬유길이가 길며 셀룰로오스의 함량이 매우 높고 리그닌의 함량은 매우 낮은 우수한 섬유소재로 특히 염분에 강하고 물에 젖게 되면 더욱 질겨지는 특성이 있다. 또한 대마섬유는 향균작용, 탈취, 방충효과가 뛰어나고 자외선을 잘 흡수하며 통풍성이 좋기 때문에 각종 의류용 섬유 및 산업용 필터소재, 식품포장재로서 개발이 가능하다. 또한, 실내 장식용품, 커튼, 침구제품, 카페트 등과 기능성 특수제지, 건축용 단열재 생산에도 대마섬유가 이용되고 있으며 자동차의 내, 외장재로도 사용되고 있다. Hemp fiber is a natural fiber that has been used for a long time. It is an excellent fiber material with high tensile strength, long fiber length, very high cellulose content and very low lignin content. In addition, hemp fiber has excellent antibacterial action, deodorization, insect repellent effect, absorbs ultraviolet rays and has good ventilation, so it can be developed as various clothing fibers, industrial filter materials and food packaging materials. In addition, hemp fibers are also used in the production of interior decorative items, curtains, bedding products, carpets, functional special papers, and insulation for construction, and are also used as interior and exterior materials for automobiles.

대마섬유의 많은 장점과 더불어 대마 종자의 일종인 청삼에는 양질의 불포화 지방산인 리놀산과 리놀렌산이 80% 이상 함유되어 있고 다른 식물류에서 흔히 찾아볼 수 없는 감마 리놀렌산(GLA)을 함유하고 있으면서도 포화지방산은 함유하지 않는다. 이러한 불포화지방산은 심혈관 질환과 제2형 당뇨병의 예방과 치료에 효과가 있는 것으로 알려져 있다. 그리고 청삼에는 특히 성장에 필수적인 아르지닌, 메티오닌, 히스티딘 그리고 시스테인이 다량 포함되어 있다. 또한, 트립신 억제제 및 올리고당이 포함되어 있지 않고 다량의 필수지방산이 포함되어 있으며 토코페롤 및 여러 가지 비타민 A, B, C, D 및 E가 함유되어 있다(Hullar, I., Meleg, I., Fekete, S. and Romvari, R. (1999) Studies on the energy content of pigeon feeds I. Determination of digestibility and metabolizable energy content. Poult. Sci., 78, 1757-1762).In addition to the many benefits of hemp fiber, hemp seed, Cheongsam, contains more than 80% of the high quality unsaturated fatty acids linoleic and linolenic acid, and contains saturated fatty acid but gamma linolenic acid (GLA), which is not commonly found in other plants. I never do that. Such unsaturated fatty acids are known to be effective in the prevention and treatment of cardiovascular diseases and type 2 diabetes. Cheongsam also contains high amounts of arginine, methionine, histidine and cysteine, which are essential for growth. It also does not contain trypsin inhibitors and oligosaccharides and contains large amounts of essential fatty acids and contains tocopherols and various vitamins A, B, C, D and E (Hullar, I., Meleg, I., Fekete, S. and Romvari, R. (1999) Studies on the energy content of pigeon feeds I. Determination of digestibility and metabolizable energy content.Poult. Sci., 78, 1757-1762).

뿐만 아니라, 대마 종자 오일은 피부와 모세혈관으로의 흡수가 빠르고 효과가 우수하므로 귀, 코와 목의 질병과 피부질환, 아토피 피부염 치료제 그리고 기능성 화장품으로 개발되고 있으며, 순환기관의 질병 치료, 노화 방지, 당뇨치료 효과와 심장혈관질환의 예방 및 치료에 탁월한 효과를 나타낸다(Grigoriev, O. V. (2002) Application of hempseed (Cannabis sativa L.) oil in the treatment of ear, nose and throat (ENT) disorders. J. Ind. Hemp, 7, 5-15, Callaway, J., Schwab, U., Harvima, I., Halonen, P., Mykkanen, O., Hyvonen, P. and Jarvinen, T. (2005) Efficacy of dietary hempseed oil in patients with atopic dermatitis. J. Dermatolog. Treat. 16, 87-94).In addition, hemp seed oil has been developed as a quick and effective absorber for skin and capillaries, and has been developed as a treatment for diseases of the ears, nose and throat, skin diseases, atopic dermatitis and functional cosmetics. , for the prevention and treatment of cardiovascular disease and diabetes therapy shows excellent effects (Grigoriev, OV (2002) Application of hempseed (Cannabis sativa L.) oil in the treatment of ear, nose and throat (ENT) disorders. J. Ind. Hemp , 7, 5-15, Callaway, J., Schwab, U., Harvima, I., Halonen, P., Mykkanen, O., Hyvonen, P. and Jarvinen, T. (2005) Efficacy of dietary hempseed oil in patients with atopic dermatitis.J. Dermatolog. Treat . 16, 87-94).

그러나, 테트라하이드로카나비놀을 함유한 대마는 마약성분을 함유하였다는 이유로 관계 법령에 따라 재배가 엄격히 금지되고 있다. 그리하여, 최근에는 테트라하이드로카나비놀 함량이 낮은 저마약형 신품종인 청삼이 개발되었다.However, hemp containing tetrahydrocannabinol is strictly prohibited according to related laws because of its drug content. Thus, recently, a new low-dose type of ginseng with low tetrahydrocannabinol content has been developed.

그러나, 청삼 종자와 종래 테트라하이드로카나비놀을 함유한 보성 종자는 외관상으로는 크기와 색상 등이 동일하여 이를 구별하기가 매우 어렵다.
However, the blue ginseng seed and the complementary seed containing the conventional tetrahydrocannabinol have the same size and color in appearance and are very difficult to distinguish them.

따라서, 본 발명은 대마 종자 중 청삼 종자와 보성 종자를 용이하게 구별할 수 있는 바이오마커를 제공하려는 것을 목적으로 한다.Accordingly, an object of the present invention is to provide a biomarker that can easily distinguish between blue ginseng seed and complementary seed among hemp seeds.

또한, 본 발명은 대마 종자 중 청삼 종자와 보성 종자를 구별할 수 있는 바이오마커를 포함하는 키트 및 이를 이용한 대마 종자 구별방법을 제공하려는 것을 목적으로 한다.
Another object of the present invention is to provide a kit comprising a biomarker capable of distinguishing blue ginseng seed and complementary seed from hemp seeds, and a method for distinguishing hemp seeds using the same.

상기 목적을 달성하기 위하여 본 발명자들은 2차원 전기영동기술을 이용하여 청삼과 보성 두 종자의 전체 단백질을 확인한 결과, 청삼 종자에서는 총 695개의 단백질을, 보성 종자에서는 총 722개의 단백질 스팟을 분리할 수 있었다(도 1, 2). 또한, 확인된 단백질 스팟 중에서 청삼 종자에서는 명확히 나타나지만, 보성 종자에서는 확인되지 않는 단백질을 선별하여 이를 청삼 종자를 확인하는 용도로 이용할 수 있음을 밝혀내어 이를 이용한 대마 종자 구분용 키트를 발명하기에 이르렀다.In order to achieve the above object, the present inventors confirmed the total protein of two seeds of Cheongsam and Boseong using two-dimensional electrophoresis technology, and the total of 695 proteins in Cheongsam seed and 722 protein spots in Bosung seed can be separated. (FIG. 1, 2). In addition, the identified protein spots are clearly shown in the blue ginseng seed, but not identified in the complementary seed was selected to identify this can be used for the purpose of identifying the blue ginseng seed to invent the hemp seed classification kit using the same.

이차원 전기영동한 겔을 12개의 구역으로 나누어 각 구역에서 발현한 단백질을 비교한 결과 두 종자에서 공통적으로 발현되는 단백질은 총 26개였다.Two-dimensional electrophoresis gels were divided into 12 sections and the proteins expressed in each section were compared. A total of 26 proteins were expressed in both seeds.

또한 청삼 종자에서만 발현되고 보성 종자에서는 발현되지 않는 단백질 중 청삼 종자 단백질의 8번과 12번 구역에서만 발현하는 특이 단백질 5개를 동정할 수 있었다(도 3). In addition, it was possible to identify five specific proteins expressed only in the 8th and 12th regions of the blue ginseng seed protein among the proteins expressed only in the blue ginseng seed and not in the complementary seed (FIG. 3).

본 발명에 따른 청삼 종자 확인 마커 단백질은 막전이 수송단백질(Transmembrane trafficking protein; 분자량: 23kDa, 스팟 127번)과 펩타이도글라이칸 생합성에 관여하는 효소인 인산-N-아세틸뮤라모일-펜타펩타이드 전이효소(phospho-N-acetylmuramoyl-pentapeptide-transferase; 분자량: 38kDa, 스팟 132번), 펩타이딜-프롤릴 시스-트랜스 아이소머레이즈(peptidyl-prolyl cis-trans isomerase; 분자량: 18kDa, 스팟 133번), 엽록체 인산글리세르산 카이네이즈(chloroplast phosphoglycerate kinase; 분자량: 32kDa, 스팟 146번) 그리고 글리세르알데하이드-3-인산 탈수소효소(glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase; 분자량: 21kDa, 스팟 147번)로 이루어진 그룹 중 선택된 1종 이상이다. 이 마커 단백질들은 pH 8~10에서 발현되며, 보성 종자의 2차원 전기영동에서는 찾아볼 수 없었다. 따라서, 이 단백질들의 이차원 전기영동겔 상에서의 위치와 스팟 존재 여부를 통하여 청삼 종자와 보성 종자를 용이하게 구분할 수 있게 된다. 즉, pH 8~10, 분자량 40kDa 이하의 영역에서 상기 다섯 가지 단백질 스팟이 확인되면 청삼 종자이고, 그렇지 않은 경우 보성 종자임을 알 수 있는 것이다.
The blue ginseng seed identification marker protein according to the present invention is a transmembrane trafficking protein (molecular weight: 23 kDa, spot 127) and a phosphate-N-acetylmuramoyl-pentapeptide, an enzyme involved in peptidoglycan biosynthesis. Phospho-N-acetylmuramoyl-pentapeptide-transferase (molecular weight: 38 kDa, spot 132), peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (molecular weight: 18 kDa, spot 133) ), A group consisting of chloroplast phosphoglycerate kinase (molecular weight: 32 kDa, spot 146) and glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase (molecular weight: 21 kDa, spot 147) It is one or more selected. These marker proteins are expressed at pH 8-10 and could not be found in two-dimensional electrophoresis of complementary seeds. Therefore, it is possible to easily distinguish the blue ginseng seed and the complementary seed through the location and the presence of spots on the two-dimensional electrophoretic gel of these proteins. That is, when the five protein spots are identified in the region of pH 8 to 10 and a molecular weight of 40 kDa or less, the blue ginseng seed may be seen, and the seed may be complementary seed.

상기 다섯 가지 마커 단백질의 특징은 아래와 같다.The characteristics of the five marker proteins are as follows.

막전이 수송단백질(Transmembrane trafficking protein)은 단백질 합성 후 단백질의 분비와 수송으로 인한 단백질 변형에 관련된 단백질로서 세포막 구성의 필수 요소 중 하나이다.Transmembrane trafficking protein is a protein involved in protein modification due to secretion and transport of protein after protein synthesis and is one of the essential elements of cell membrane composition.

인산-N-아세틸뮤라모일-펜타펩타이드 전이효소(Phospho-N-acetylmuramoyl-pentapeptide-transferase)는 UDP-Mur2Ac(oyl-L-ala-γ-D-Glu-L-Lys-D-Ala-D-Ala) + 운데카프레닐 인산(undecaprenyl phosphate) UMP + Mur2Ac(oyl-L-Ala-γ-D-Glu-L-Lys-D-Ala-D-Ala)-이인산운데카프레놀(diphosphoundecaprenol) 반응을 촉매하는 효소로서, 이 효소의 두 기질은 UDP-Mur2Ac(oyl-L-ala-γ-D-Glu-L-Lys-D-Ala-D-Ala)과 운데카프레닐 인산(undecaprenyl phosphate)이고, 산물은 UMP, Mur2Ac(oyl-L-Ala-γ-D-Glu-L-Lys-D-Ala-D-Ala)- 그리고 이인산운데카프레놀(diphosphoundecaprenol)이다. 이 효소는 전이효소군에 포함되며, 막 구성에 필수적인 물질로 펩타이도글라이칸 생합성에 관여한다 (The initial stage in peptidoglycan synthesis. IV. Solubilization of phospho-N-acetylmuranyl-pentapeptide translocase. Heydanek, M. G. Jr & Neuhaus, F. C. Biochemistry, 8: 1474-1481 (1969)).Phospho-N-acetylmuramoyl-pentapeptide-transferase is a phosphate-N-acetylmuramoyl-pentapeptide-transferase. UDP-Mur 2 Ac (oyl-L-ala-γ-D-Glu-L-Lys-D-Ala) -D-Ala) + undecaprenyl phosphate UMP + Mur 2 Ac (oyl-L-Ala-γ-D-Glu-L-Lys-D-Ala-D-Ala) -diphosphate undecapre An enzyme that catalyzes the reaction of diphosphoundecaprenol, the two substrates of which are UDP-Mur 2 Ac (oyl-L-ala-γ-D-Glu-L-Lys-D-Ala-D-Ala) and Undeka Prenyl phosphate (undecaprenyl phosphate), the product is UMP, Mur 2 Ac (oyl-L-Ala-γ-D-Glu-L-Lys-D-Ala-D-Ala)-and diphosphoundecaprenol diphosphate )to be. This enzyme is included in the transferase family and is involved in peptidoglycan biosynthesis as an essential material for membrane composition (The initial stage in peptidoglycan synthesis. IV.Solubilization of phospho-N-acetylmuranyl-pentapeptide translocase. Heydanek, MG Jr. & Neuhaus, FC Biochemistry, 8: 1474-1481 (1969)).

펩타이딜-프롤릴 시스-트랜스 아이소머레이즈(Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase)는 접히지 않은(unfolded) 단백질과 올리고 펩타이드 내 프롤린 펩타이드(Xaa-Pro)의 시스-트랜스 이성체로 바꾸는 과정을 가속화시키는 효소이다. 시스(cis) 형태의 펩타이드 결합은 트랜스(trans) 형태의 결합과 비교해 불안정하다. 이 효소는 FK506-결합 단백질(FK506 binding proteins; FKBPs), 사이클로필린(cyclophilines), 파뷸린(parvulins) 그리고 세린/트레오닌 인산화효소 2A 활성인자(Ser/Thr phosphatase 2A activator)인 PIPA의 4개 그룹으로 나뉜다 (Engineering of monomeric FK506-binding protein 22 with peptidyl prolyl cis-trans isomerase. Importance of a V-shaped dimeric structure for binding to protein substrate. Budiman, C., Bando, K., Angkawidjaja, C., Koga, Y., Takano, K. and Kanaya, S. FEBS J., 276: 4091-4101 (2009)).Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase accelerates the process of converting unfolded proteins into cis-trans isomers of proline peptides (Xaa-Pro) in oligopeptides. It is an enzyme. Cis-type peptide bonds are unstable compared to trans-type bonds. It is a group of four groups of PIPA, FK506-binding proteins (FKBPs), cyclophilines, parvulins, and Ser / Thr phosphatase 2A activator. (Engineering of monomeric FK506-binding protein 22 with peptidyl prolyl cis-trans isomerase.Importance of a V-shaped dimeric structure for binding to protein substrate.Budiman, C., Bando, K., Angkawidjaja, C., Koga, Y , Takano, K. and Kanaya, S. FEBS J., 276: 4091-4101 (2009)).

엽록체 인산글리세르산 카이네이즈(Chloroplast phosphoglycerate kinase)는 엽록체의 기질에 포함되어 있는 효소로 캘빈 회로의 가역반응을 촉매하여 ATP의 존재하에 3-인산글리세르산을 1,3-이인산글리세르산(diphosphoglycerate)으로 전환시킨다. 인산글리세르산 카이네이즈는 광합성 탄소 물질대사뿐 아니라 해당과정과 당신생과정에 관여하는 중요한 효소로 식물에서는 엽록체와 세포질에 주로 존재하지만 대부분의 식물에서 인산글리세르산 카이네이즈 활성은 주로 엽록체에 존재한다(purification and cDNA isolation of chloroplastic phosphoglycerate kinase from chlamydomonas reinhardtii, kitayama, M. & Togasaki, R. K. Plant Physiol., 107: 393-400 (1995)).Chloroplast phosphoglycerate kinase (Chloroplast phosphoglycerate kinase) is an enzyme contained in the substrate of chloroplast, which catalyzes the reversible reaction of the Calvin cycle. diphosphoglycerate). Glycerate phosphate kinase is an important enzyme involved in glycolysis and your life cycle as well as photosynthetic carbon metabolism.In plants, the phosphate kinase activity is mainly in the chloroplast. purification and cDNA isolation of chloroplastic phosphoglycerate kinase from chlamydomonas reinhardtii, kitayama, M. & Togasaki, RK Plant Physiol., 107: 393-400 (1995)).

글리세르알데하이드-3-인산 탈수소효소(Glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase)는 산화환원효소로 해당과정에서 글리세르산-3-인산(glycerate-3-phosphate)을 1,3-이인산글리세르산(bisphosphoglycerate)으로 인산화시키고 유일한 산화 반응인 NAD+를 NADH로 환원시키는 반응을 촉매하여 세포 내에서 에너지 생산에 중추적인 역할을 한다. 세포 내에서 세포질과 핵 그리고 막에 고루 분포하고, 에너지 생산에 중요한 역할을 하며, 해당 기능(glycolytic function) 이외에도 막 융합, 인산전이 활성, 마이크로튜블 묶기(microtubule bundling), 핵 RNA를 외부로 전달(nuclear RNA export), DNA 복제 및 DNA 재생(repair) 등의 다양한 기능을 갖는다.
Glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase (Glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase) is an oxidoreductase and glycerin-3-phosphate in the process, 1,3-diphosphate ( It phosphorylates bisphosphoglycerate and catalyzes the only oxidation reaction, NAD + to NADH, which plays a pivotal role in the production of energy in cells. It is distributed evenly in the cytoplasm, nucleus and membrane within the cell, plays an important role in energy production, and in addition to its glycolytic function, membrane fusion, phosphate transfer activity, microtubule bundling, and nuclear RNA transfer to the outside ( nuclear RNA export, DNA replication and DNA repair (repair), and a variety of functions.

본 발명은 The present invention

막전이 수송단백질(Transmembrane trafficking protein; 분자량: 23kDa);Transmembrane trafficking protein (molecular weight: 23 kDa);

인산-N-아세틸뮤라모일-펜타펩타이드 전이효소(phospho-N-acetylmuramoyl-pentapeptide-transferase; 분자량: 38kDa);Phospho-N-acetylmuramoyl-pentapeptide-transferase (molecular weight: 38 kDa);

펩타이딜-프롤릴 시스-트랜스 아이소머레이즈(peptidyl-prolyl cis-trans isomerase; 분자량: 18kDa); Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (molecular weight: 18 kDa);

엽록체 인산글리세르산 카이네이즈(chloroplast phosphoglycerate kinase; 분자량: 32kDa); 및 Chloroplast phosphoglycerate kinase (molecular weight: 32 kDa); And

글리세르알데하이드-3-인산 탈수소효소(glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase; 분자량: 21kDa) 중 선택된 1종 이상의 마커 단백질 또는 그의 면역원성 단편에 특이적으로 결합하는 항체를 포함하는 청삼 종자와 보성 종자 구분용 키트를 제공한다.For distinguishing blue ginseng seed from complementary seed comprising antibodies that specifically bind to one or more marker proteins selected from glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase (molecular weight: 21 kDa) or immunogenic fragments thereof Provide the kit.

또한, 본 발명은 상기 키트가 ELISA(Enzyme linked immunosorbent assay)용 키트인 것을 특징으로 한다.In addition, the present invention is characterized in that the kit is a kit for ELISA (Enzyme linked immunosorbent assay).

또한, 본 발명은 In addition,

막전이 수송단백질(Transmembrane trafficking protein; 분자량: 23kDa);Transmembrane trafficking protein (molecular weight: 23 kDa);

인산-N-아세틸뮤라모일-펜타펩타이드 전이효소(phospho-N-acetylmuramoyl-pentapeptide-transferase; 분자량: 38kDa);Phospho-N-acetylmuramoyl-pentapeptide-transferase (molecular weight: 38 kDa);

펩타이딜-프롤릴 시스-트랜스 아이소머레이즈(peptidyl-prolyl cis-trans isomerase; 분자량: 18kDa); Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (molecular weight: 18 kDa);

엽록체 인산글리세르산 카이네이즈(chloroplast phosphoglycerate kinase; 분자량: 32kDa); 및 Chloroplast phosphoglycerate kinase (molecular weight: 32 kDa); And

글리세르알데하이드-3-인산 탈수소효소(glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase; 분자량: 21kDa) 중 선택된 1종 이상의 마커 단백질 또는 그의 면역원성 단편에 특이적으로 결합하는 항체를 미확인 종자 시료와 접촉시키는 단계를 포함하는 청삼 종자와 보성 종자를 구분하는 방법을 제공한다.Contacting an unidentified seed sample with an antibody that specifically binds one or more marker proteins or immunogenic fragments thereof selected from glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase (molecular weight: 21 kDa) It provides a way to distinguish between Cheongsam seeds and Boseong seeds.

상기 방법은The method

a) 분석할 미확인 종자 시료를 제공하는 단계;a) providing an unidentified seed sample to be analyzed;

b) 상기 시료와 상기 마커 단백질에 특이적으로 결합하는 항체를 접촉시키는 단계;b) contacting said sample with an antibody that specifically binds said marker protein;

c) 항원-항체 복합체를 정량 검출하는 단계; 및c) quantitatively detecting the antigen-antibody complex; And

d) 상기 c) 단계 검출 결과를 청삼 종자 대조군과 비교하는 단계;를 포함하는 것을 특징으로 한다.
d) comparing the detection result of step c) with the blue ginseng seed control group.

상기 면역원성 단편은 외부 숙주에 주입하였을 때 반응성 항체를 생산할 수 있는 상기 단백질 중 일부를 말하는 것이다.The immunogenic fragment refers to some of the proteins that can produce reactive antibodies when injected into an external host.

본 발명은 상기 마커 단백질 또는 그 면역원성 단편에 특이적으로 결합하는 항체를 제공한다. 상기 본 발명의 항체는 종래 본 발명이 속하는 기술분야에서 통상의 지식을 가진 자에게 널리 알려진 방법에 따라 제조할 수 있다.The present invention provides an antibody that specifically binds to the marker protein or immunogenic fragment thereof. The antibody of the present invention can be prepared according to methods well known to those skilled in the art to which the present invention pertains.

본 발명은 청삼 종자 대조군과 비교하여 상기 마커 단백질의 발현 여부 또는 발현량 비교로 청삼 종자인지 보성 종자인지를 구분하는 것을 특징으로 하는 대마 종자 구분용 키트를 제공한다. 상기 키트에는 ELISA(Enzyme linked immunosorbent assay)용 키트가 포함된다.
The present invention provides a kit for distinguishing hemp seeds, characterized in that it distinguishes between the green ginseng seed and the complementary seed by comparing the expression of the marker protein or the amount of expression compared to the blue ginseng seed control group. The kit includes a kit for an Enzyme linked immunosorbent assay (ELISA).

본 발명에서 "마커"는 대마 종자인 청삼 종자를 다른 대마 종자인 보성 종자와 구분할 수 있는 물질로, 상기 마커 단백질에 대한 폴리펩타이드 마커일 수 있으며, 이들 마커들은 보성 종자에 비해 청삼 종자에서 발현이 증가하거나 2차원 전기영동시 그 단백질 스팟을 명확히 확인할 수 있는 특징을 나타낸다.In the present invention, the "marker" is a substance that can distinguish the hemp seed, Cheongsam seed, from other hemp seeds, the complementary seed, and may be a polypeptide marker for the marker protein, and these markers may be expressed in the blue ginseng seed as compared to the seed. Increasing or two-dimensional electrophoresis indicates that the protein spot can be clearly identified.

따라서, 종자 시료 중의 마커 단백질 존재 또는 발현량을 확인함으로써 청삼 종자인지 보성 종자인지를 구분할 수 있다. 종자 시료에서 단백질을 분리하는 과정은 공지의 공정을 이용하여 수행할 수 있으며, 단백질의 양은 당업자에게 알려진 다양한 방법으로 측정할 수 있다.Therefore, by checking the presence or expression of the marker protein in the seed sample, it is possible to distinguish whether it is a blue ginseng seed or a complementary seed. Separation of the protein from the seed sample can be carried out using a known process, the amount of protein can be measured by various methods known to those skilled in the art.

본 발명에서 "단백질 수준 측정"이란 시료에서 청삼 종자에서 발현되거나 많이 발현되는 상기 마커 단백질의 발현 여부 또는 발현 정도를 확인하는 과정으로서 바람직하게는 상기 마커 단백질에 대하여 특이적으로 결합하는 항체를 이용하여 단백질의 양을 확인한다.In the present invention, "protein level measurement" is a process of confirming the expression level or expression level of the marker protein expressed or much expressed in blue ginseng seed in a sample, preferably by using an antibody that specifically binds to the marker protein. Check the amount of protein.

"항체"란 항원성 부위에 대해서 지시되는 특이적인 단백질 분자를 의미한다. 본 발명의 목적상 항체는 상기 마커 단백질에 대해 특이적으로 결합하는 항체를 의미하며, 폴리클론 항체, 모노클론 항체 및 재조합 항체를 모두 포함한다."Antibody" means a specific protein molecule directed against an antigenic site. For the purposes of the present invention, an antibody means an antibody that specifically binds to the marker protein, and includes all polyclonal antibodies, monoclonal antibodies, and recombinant antibodies.

항체를 이용하여 단백질 수준을 측정하는 분석방법으로는 웨스턴 블랏, ELISA(Enzyme linked immunosorbent assay), RIA(Radioimmunoassay), 방사면역 확산법(Radioimmunodiffusion), 오크털로니(Ouchterlony) 면역확산법, 로켓 면역전기영동, 조직면역염색, 면역침전분석(Immunoprecipitation), 보체고정분석(Complement fixation assay), FACS, 단백질 칩 등이 있으며, 기재된 방법으로 제한되는 것은 아니다.Assays for measuring protein levels using antibodies include Western blot, Enzyme linked immunosorbent assay (ELISA), Radioimmunoassay (RIA), Radioimmunodiffusion, Ouchterlony immunodiffusion, Rocket immunoelectrophoresis, Tissue immunostaining, immunoprecipitation, complement fixation assay, FACS, protein chips, and the like, are not limited to the described methods.

위와 같은 분석방법을 통하여 청삼 종자의 항원-항체 복합체의 형성량과 미확인 대마 종자의 항원-항체 복합체의 형성량을 비교할 수 있고, 마커 단백질의 유의한 발현 또는 발현량 증가 여부를 판단하여 미확인 대마 종자가 청삼 종자인지 보성 종자인지를 확인할 수 있다.Through the above analysis method, it is possible to compare the amount of antigen-antibody complex formation of Chongsam seed and the amount of antigen-antibody complex formation of unidentified hemp seed, and to determine whether significant expression or increased expression level of marker protein is identified. It can be determined whether the seed is a blue ginseng seed or Boseong seed.

"항원-항체 복합체"란 상기 마커 단백질과 이에 특이적인 항체의 결합물을 의미하고, 항원-항체 복합체의 형성량은 검출 라벨(detection label)의 신호 크기를 통하여 정량적으로 측정할 수 있다. 검출 라벨은 효소, 형광물질, 리간드, 발광물질, 미소입자(microparticle), 레독스 분자 및 방사선 동위원소로 이루어진 그룹 중에서 선택할 수 있으며, 상기 기재된 물질로 제한되는 것은 아니다. 검출 라벨로 효소를 사용하는 경우 이용할 수 있는 효소로는 β-글루쿠로니다제, β-D-글루코시다제, β-D-갈락토시다제, 우레아제, 퍼옥시다아제 또는 알칼라인 포스파타아제, 아세틸콜린에스터라아제, 글루코스 옥시다아제, 헥소키나아제 등이 있으며, 상기 기재된 범위로 제한되지 않는다. 형광물질로는 플루오레신, 피코시아닌, 플루오레스카민 등이 있고, 상기 기재된 물질로 제한되는 것은 아니다. 리간드로는 바이오틴 유도체 등이 있고, 이에 제한되지는 않는다. 발광물질로는 루시페린 등이 있고, 이에 제한되지는 않는다. 미소입자로는 콜로이드 금 등이 있고, 이에 제한되는 것은 아니다. 레독스 분자로는 퀴논, 1,4-벤조퀴논, 하이드로퀴논 등이 있고, 이에 제한되는 것은 아니다. 방사선 동위원소에는 3H,14C 등이 포함되며, 이에 제한되는 것은 아니다."Antigen-antibody complex" means a combination of the marker protein and an antibody specific thereto, and the amount of antigen-antibody complex formed can be quantitatively determined through the signal size of the detection label. The detection label can be selected from the group consisting of enzymes, fluorescent materials, ligands, luminescent materials, microparticles, redox molecules and radioisotopes, but is not limited to the materials described above. When enzymes are used as detection labels, the available enzymes include β-glucuronidase, β-D-glucosidase, β-D-galactosidase, urease, peroxidase or alkaline phosphatase, acetyl Cholinesterase, glucose oxidase, hexokinase and the like, and are not limited to the ranges described above. Fluorescent materials include fluorescein, phycocyanin, fluorescarmine and the like, and are not limited to the above-described materials. Ligands include, but are not limited to, biotin derivatives. Luminescent materials include luciferin and the like, but are not limited thereto. The microparticles include colloidal gold and the like, but are not limited thereto. Redox molecules include, but are not limited to, quinone, 1,4-benzoquinone, hydroquinone, and the like. Radioisotopes include, but are not limited to, 3 H, 14 C, and the like.

단백질 발현수준 측정은 바람직하게는 ELISA(Enzyme-Linked ImmunoSorbent Assay)를 이용한다. ELISA로는 고체 지지체에 부착된 항체와 항원의 복합체에서 항원을 인지하는 표지된 또다른 항체를 이용하는 직접적 샌드위치 ELISA, 고체 지지체에 부착된 항체와 항원의 복합체에서 항원을 인지하는 또다른 항체와 반응시킨 후 이 항체를 인지하는 표지된 2차 항체를 이용하는 간접적 샌드위치 ELISA 등 다양한 ELISA 방법을 포함한다. 좀더 바람직하게는 고체 지지체에 항체를 부착시키고 시료를 반응시킨 후 항원-항체 복합체의 항원을 인지하는 표지된 항체를 부착시켜 효소적으로 발색시키거나, 항원-항체 복합체의 항원을 인지하는 항체에 대해 표지된 2차 항체를 부착시켜 효소적으로 발색시키는 샌드위치 ELISA 방법에 의해서 검출한다. 상기 마커 단백질과 항체의 복합체 형성 정도를 확인하여 청삼 종자 여부를 확인할 수 있는 것이다.The protein expression level is preferably measured using ELISA (Enzyme-Linked ImmunoSorbent Assay). In ELISA, a direct sandwich ELISA using another labeled antibody that recognizes the antigen in the complex of the antibody and the antibody attached to the solid support, and reacted with another antibody that recognizes the antigen in the complex of the antibody and antigen attached to the solid support Various ELISA methods include an indirect sandwich ELISA using a labeled secondary antibody that recognizes this antibody. More preferably, the antibody is attached to a solid support and reacted with a sample, followed by enzymatic color development by attaching a labeled antibody that recognizes the antigen of the antigen-antibody complex, or an antibody that recognizes the antigen of the antigen-antibody complex. It is detected by the sandwich ELISA method which attaches a labeled secondary antibody and enzymatically develops. By confirming the degree of complex formation of the marker protein and the antibody will be able to determine whether the blue ginseng seed.

또 다른 방법으로 마커에 대한 하나 이상의 항체가 기판 위 정해진 위치에 배열되어 고밀도로 고정화되어 있는 단백질 칩을 이용할 수 있다. 단백질 칩을 이용하여 시료를 분석하는 방법은 시료에서 단백질을 분리하고, 분리한 단백질을 단백질 칩과 혼성화시켜 항원-항체 복합체를 형성시키고 이를 판독하여 단백질의 존재 또는 발현 정도를 확인하여 청삼 종자 여부를 확인할 수 있다.Alternatively, one or more antibodies against the marker may be arranged at a predetermined position on the substrate to use a protein chip immobilized at a high density. In the method of analyzing a sample using a protein chip, the protein is separated from the sample, and the separated protein is hybridized with the protein chip to form an antigen-antibody complex. You can check it.

또 다른 방법으로 마커에 대한 항체를 이용하여 웨스턴 블랏팅을 하는 것이다. 시료에서 전체 단백질을 분리하고, 이것을 전기영동하여 단백질을 크기에 따라 분리한 다음 나이트로셀룰로스 막으로 이동시켜 항체와 반응시킨다. 생성된 항원-항체 복합체의 양을 표지된 항체를 이용하여 확인함으로써 청삼 종자 여부를 확인할 수 있다.Another method is western blotting using antibodies to markers. The whole protein is isolated from the sample, which is electrophoresed to separate the protein according to size and then transferred to the nitrocellulose membrane to react with the antibody. The amount of the generated antigen-antibody complex can be confirmed by using the labeled antibody to determine whether or not the blue ginseng seed.

위와 같은 검출방법들은 청삼 종자의 마커 단백질 발현량과 미확인 종자에서의 마커 단백질의 발현량을 비교하는 단계를 포함한다. 단백질의 수준은 마커 단백질의 절대적 또는 상대적 차이로 나타낼 수 있다.Such detection methods include comparing the expression levels of marker proteins in unidentified seeds with the marker protein expression levels of blue ginseng seed. The level of protein can be expressed in terms of absolute or relative differences in marker proteins.

본 발명은 상기 마커 단백질에 특이적으로 결합하는 항체를 포함하는 대마 종자 구분용 키트에 관한 것이다.The present invention relates to a hemp seed classification kit comprising an antibody that specifically binds to the marker protein.

본 발명에서 상기 5종의 마커 단백질이 청삼 종자 확인 마커로 규명되었으므로, 이를 이용하여 항체를 생성하는 것은 당업계에 널리 공지된 기술을 이용하여 용이하게 제조할 수 있다. 본 발명이 속하는 기술분야에 널리 알려진 바에 따라, 폴리클론 항체는 상기 마커 단백질 항원을 동물에 주사하여 동물로부터 채혈하여 항체를 포함하는 혈청을 얻는다. 동물로는 염소, 토끼, 돼지 등 임의의 동물 숙주를 이용하여 제조할 수 있다. 모노클론 항체는 본 발명이 속하는 기술분야에 널리 알려진 대로 하이브리도마 방법(hybridoma method)(Kohler & Milstein(1976) European J. Immunology 6:511-519 참조) 또는 파지 항체 라이브러리(Clackson et al., Nature, 352:624-628, 1991; Marks et al, J. Mol. Biol., 222:58, 1-597, 1991) 기술을 이용하여 제조할 수 있다.Since the five marker proteins have been identified as the blue ginseng seed identification marker in the present invention, the production of antibodies using the same can be easily prepared using techniques well known in the art. As is well known in the art, polyclonal antibodies are injected into an animal and collected from the animal to obtain a serum comprising the antibody. Animals can be prepared using any animal host such as goat, rabbit, pig. Monoclonal antibodies are known in the art to which the present invention pertains, such as the hybridoma method (see Kohler & Milstein (1976) European J. Immunology 6 : 511-519) or phage antibody libraries (Clackson et al., Nature , 352 : 624-628, 1991; Marks et al, J. Mol. Biol. , 222 : 58, 1-597, 1991).

하이브리도마 방법은 마커 단백질 항원을 주사한 마우스와 같은 면역학적으로 적합한 숙주동물의 세포를 이용하고, 다른 하나는 암 또는 골수종 세포주를 이용한다. 이러한 두 종류의 세포들을 폴리에틸렌글라이콜과 같은 본 발명이 속하는 기술분야에 널리 공지된 방법으로 융합시킨 후 항체생산 세포를 표준적인 조직 배양방법으로 증식시킨다. 한계 희석법(limited dilution technique)에 의한 서브클로닝에 의해 균일한 세포 집단을 얻은 후 마커 단백질에 대해 특이적인 항체를 생산할 수 있는 하이브리도마를 표준 기술에 따라 시험관 내 또는 생체 내에서 대량 배양한다.Hybridoma methods utilize cells of an immunologically suitable host animal, such as a mouse injected with a marker protein antigen, and the other uses a cancer or myeloma cell line. These two kinds of cells are fused by methods well known in the art, such as polyethylene glycol, and then antibody-producing cells are propagated by standard tissue culture methods. After obtaining a uniform cell population by subcloning by the limited dilution technique, hybridomas capable of producing antibodies specific for the marker protein are mass cultured in vitro or in vivo according to standard techniques.

파지 항체 라이브러리 방법은 마커 단백질에 대한 항체 유전자를 획득하여 이를 파지(phage)의 표면에 융합 단백질 형태로 발현하여 항체 라이브러리를 시험관 내에서 제작하고, 이 라이브러리로부터 마커 단백질과 결합하는 모노클론 항체를 분리, 제작하는 방법이다.The phage antibody library method obtains an antibody gene for a marker protein and expresses it in the form of a fusion protein on the surface of the phage to prepare an antibody library in vitro, and isolates the monoclonal antibody binding to the marker protein from the library. , How to make.

상기 방법에 의하여 제조된 항체는 전기영동, 투석, 이온교환 크로마토그래피, 친화 크로마토그래피 등의 방법으로 분리할 수 있다.Antibodies prepared by the above method can be separated by electrophoresis, dialysis, ion exchange chromatography, affinity chromatography and the like.

본 발명의 키트에 포함되는 항체는 2개의 전체 길이 경쇄(light chain) 및 2개의 전체 길이 중쇄(heavy chain)를 가지는 완전한 형태뿐만 아니라, 항체 분자의 기능적인 단편을 포함한다. 항체 분자의 기능적 단편이란 적어도 항원 결합기능을 보유하고 있는 단편을 뜻하며, Fab, F(ab'), F(ab')2, F(ab)2 및 Fv 등이 있다.Antibodies included in the kits of the present invention include functional fragments of antibody molecules, as well as complete forms having two full length light chains and two full length heavy chains. The functional fragment of an antibody molecule means a fragment which retains at least antigen binding function, and includes Fab, F (ab '), F (ab') 2 , F (ab) 2 and Fv.

마커 단백질에 특이적으로 결합하는 항체를 포함하는 본 발명의 대마 종자 구분용 키트는 바람직하게는 ELISA용 진단키트로서, 대조군 단백질에 특이적인 항체를 포함할 수 있으며, 그 밖에도 항원-항체 복합체를 검출할 수 있는 시약, 예컨대 표지된 2차 항체, 발색단, 항체와 컨쥬게이트된 효소 및 그 기질 또는 항체와 결합할 수 있는 다른 물질 등을 포함할 수 있다.
The hemp seed separation kit of the present invention comprising an antibody that specifically binds to a marker protein is preferably a diagnostic kit for ELISA, and may include an antibody specific for a control protein, in addition to detecting an antigen-antibody complex. Reagents, such as labeled secondary antibodies, chromophores, enzymes conjugated with the antibody and other substrates or other substances capable of binding to the antibody, and the like.

본 발명에 의한 청삼 종자 확인용 마커는 5개의 단백질 중 1종 이상 단백질의 발현 여부 또는 발현량 변화를 탐지함으로써 미확인 대마 종자가 청삼 종자인지를 용이하게, 그리고 특이적으로 검출할 수 있다.The marker for identifying ginseng seed according to the present invention can easily and specifically detect whether an unidentified hemp seed is a blue ginseng seed by detecting the expression or change in the expression amount of one or more proteins among the five proteins.

도 1은 청삼 종자 전체 단백질의 이차원 전기영동 결과를 나타낸 사진이다.
도 2는 보성 종자 전체 단백질의 이차원 전기영동 결과를 나타낸 사진이다.
도 3은 도 1과 도 2를 비교하여 청삼 종자에서만 발현하는 특이 단백질을 확인한 결과이다. (A): 청삼 종자 단백질, (B): 보성 종자 단백질
Figure 1 is a photograph showing the results of two-dimensional electrophoresis of the whole protein ginseng seed.
Figure 2 is a photograph showing the results of two-dimensional electrophoresis of the whole seed seed protein.
3 is a result of confirming the specific protein expressed only in the blue ginseng seed compared to FIG. (A): blue ginseng seed protein, (B): complementary seed protein

이하 본 발명의 구성을 실시예에 의하여 상세히 설명한다. 그러나, 본 발명의 범위가 실시예의 기재에 의하여 한정되는 것은 아니다.
Hereinafter, the configuration of the present invention will be described in detail by examples. However, the scope of the present invention is not limited by the description of the examples.

<실시예 1: 단백질 추출>Example 1: Protein Extraction

완전히 껍질을 제거한 청삼 종자와 보성 종자 각각 1g을 액체질소로 얼린 다음 균질기로 파쇄한 후, 0.01M 인산나트륨(sodium phosphate; pH 7.5)과 0.6M 수크로스가 포함되어 있는 0.01M 인산나트륨 완충용액(pH 7.5)에서 한 번 더 파쇄하였다. 파쇄된 시료를 4℃, 16,000rpm에서 30분 동안 원심분리한 뒤 얻어진 상등액에 차가운 10%(v/v) 트리클로로아세트산을 처리하여 단백질을 추출하였다. 추출된 단백질에 남아 있는 각각의 물질을 제거하기 위해 5회 반복하여 세척하였고, 추출된 단백질은 -70℃에 보관하면서 사용하였다.
1 g of each ginseng seed and complementary seed, completely peeled, were frozen with liquid nitrogen and crushed with a homogenizer, and then 0.01M sodium phosphate buffer solution containing 0.01M sodium phosphate (pH 7.5) and 0.6M sucrose ( crushed once more at pH 7.5). The crushed sample was centrifuged at 4 ° C., 16,000 rpm for 30 minutes, and the obtained supernatant was treated with cold 10% (v / v) trichloroacetic acid to extract protein. Washing was repeated five times to remove each substance remaining in the extracted protein, the extracted protein was used while stored at -70 ℃.

<실시예 2: 등전점 전기영동>Example 2: Isoelectric Point Electrophoresis

청삼 종자와 보성 종자에서 추출한 단백질의 총량은 1㎎이 되게 하였고, 450㎕의 재수화용액(7M 우레아, 2M 티오우레아, 4.5% CHAPS, 0.25% 양쪽성 전해질(ampholytes), 100mM DTE)을 사용하여 단백질을 녹였다. 450㎕의 재수화용액에 녹아있는 각 조건의 단백질을 IPG 홀더에 주입하였고, 등전점 전기영동을 위하여 단백질이 가진 pH에 따라 이동할 수 있도록 만들어진 24㎝ 고정 건조 스트립(immobilized dry strip, pH 3~10 NL, GE Healthcare Bio-Science)을 이용하여 18시간 동안 재수화시켰다. 200 V/ 200 Vhrs, 500 V/ 500 Vhrs, 1,000 V/ 1,000 Vhrs, 8,000 V/ 13,500 Vhrs, 8,000 V/ 100,000 Vhrs 조건에서 단백질이 가진 pH에 따라 전기장에서 이동시켰다.
The total amount of protein extracted from blue ginseng seed and complementary seed was 1 mg, and 450 μl of rehydration solution (7M urea, 2M thiourea, 4.5% CHAPS, 0.25% ampholytes, 100mM DTE) was used. The protein was dissolved. A protein of each condition dissolved in 450 µl of rehydration solution was injected into an IPG holder, and a 24 cm immobilized dry strip (pH 3-10 NL) made to move according to the pH of the protein for isoelectric electrophoresis. , GE Healthcare Bio-Science) was rehydrated for 18 hours. In the field of 200 V / 200 Vhrs, 500 V / 500 Vhrs, 1,000 V / 1,000 Vhrs, 8,000 V / 13,500 Vhrs, 8,000 V / 100,000 Vhrs conditions were moved in the electric field according to the pH of the protein.

<실시예 3: 평형화>Example 3: Equilibration

등전점 전기영동이 끝난 스트립은 1차 평형화 완충용액(6M 우레아, 0.375M Tris-HCl(pH 8.8), 20% 글리세롤, 2% SDS, 25% 아크릴아마이드, 2mM TBP)에서 각각 20분간 1차 평형화를 실시한 후, 2차 평형화 완충용액(6M 우레아, 0.375M Tris-HCl (pH 8.8), 20% 글리세롤, 2% SDS, 25% 아크릴아마이드, 2mM TBP)에서 20분간 2차 평형화를 실시하였다.
Strips subjected to isoelectric point electrophoresis were subjected to primary equilibration in primary equilibration buffer (6M urea, 0.375M Tris-HCl, pH 8.8), 20% glycerol, 2% SDS, 25% acrylamide, 2mM TBP for 20 minutes each. After the second equilibration buffer (6M urea, 0.375M Tris-HCl (pH 8.8), 20% glycerol, 2% SDS, 25% acrylamide, 2mM TBP) was subjected to the second equilibration for 20 minutes.

<실시예 4: SDS-폴리아크릴아마이드 겔 전기영동>Example 4: SDS-polyacrylamide gel electrophoresis

8% ~ 16% 아크릴아마이드 겔을 만든 후 등전점 전기이동을 완료한 스트립을 겔 위에 얹고, 그 위에 0.5% 아가로스 겔로 고정시킨 뒤 이차원 전기이동을 실시하였다. 2시간 동안 겔 당 5mA씩 전류를 주어 우선 전개시킨 후, 10시간 동안 겔 당 18mA씩 전류를 주어 단백질을 분자량에 따라 이동시켰다.
After the 8% ~ 16% acrylamide gel was made, a strip of which isoelectric point electrophoresis was completed was placed on the gel, fixed with 0.5% agarose gel, and then subjected to two-dimensional electrophoresis. The current was first developed by giving a current of 5 mA per gel for 2 hours, and then the protein was moved according to the molecular weight by giving a current of 18 mA per gel for 10 hours.

<실시예 5: 겔 염색 및 탈색>Example 5: Gel Dyeing and Decolorization

전개가 끝난 겔을 쿠마시 블루 G-250 염색 용액 (34% 메탄올, 0.1% 쿠마시 블루 G-250, 17% 황산암모늄, 3% 인산)을 사용하여 겔에서 분리된 단백질을 확인할 수 있도록 12시간 이상 염색한 후 1% 아세트산을 이용하여 탈색하였다.The developed gel was run for 12 hours using a Coomassie Blue G-250 staining solution (34% methanol, 0.1% Coomassie Blue G-250, 17% Ammonium Sulfate, 3% Phosphoric Acid) to identify proteins isolated from the gel. After the abnormal staining, it was decolorized using 1% acetic acid.

<실시예 6: 겔 이미지 분석>Example 6: Gel Image Analysis

겔 이미지 분석을 위해 UMAX powerLook 1100으로 염색한 겔을 스캔한 후 ImageMaster 2D Platinum 6.0 (2D software, GE Healthcare Bio-Science)으로 이미지 분석을 실시하였다. 정확한 분석을 위하여 한 조건 당 3장의 겔을 분석하였다.
For gel image analysis, gels stained with UMAX powerLook 1100 were scanned and image analyzed with ImageMaster 2D Platinum 6.0 (2D software, GE Healthcare Bio-Science). Three gels per condition were analyzed for accurate analysis.

<실시예 7: NanoLC-MS/MS 분석>Example 7: NanoLC-MS / MS Analysis

NanoLC-MS/MS 분석을 위해 각 스팟을 트립신(trypsin)으로 인-젤 다이제스천(in-gel digestion)한 후, 스팟들의 펩타이드들을 agilent 110 Series nano-LC와 LTQ-mass spectrometer(Thermo Electron, San Jose, CA)로 분석하였다. LC-MS/MS 분석에 사용된 모세관 컬럼(150㎜×0.075㎜)은 Proxeon(Odense M, Denmark)에서 구입하였으며, 슬러리는 5㎛, 100Å 포어 사이즈의 Magic C18 정지상(stationary phase) (Michrom Bioresources, Auburn, CA)으로 패킹하였다. LC 분리를 위한 이동상 A는 0.1% 포름산을 함유하는 증류수이고, 이동상 B는 0.1% 포름산을 함유하는 아세토나이트릴이었다. 크로마토그래피 경사는 50분간 5% B에서 35% D 직선증가와 0 분간 541% B에서 61% B의 직선증가, 5분간 561% B에서 81% B 직선증가하는 것으로 셋업하였다. 유속은 분리(splitting) 분당 300㎖를 유지하였다. 매스 스펙트럼(Mass spectra)은 MS/MS 스캔 후 전체 매스 스캔으로 얻은 데이터(data-dependent acquisition with full mass scan:5410-1810 m/z)로 얻었다. 얻어진 수 MS/MS 스캔은 LTQ에서 rm마이크로스캔 (microscans)의 평균이었다. 이온 트랜스퍼 튜브의 온도는 200℃로 맞추어졌으며, 스프레이는 1.5.0-2.0kV였다. 정상화된 콜리전 (collision) 에너지는 MS/MS에 대해 35%로 맞추어졌다. Sequest 소프트웨어가 펩타이드 서열을 동정하기 위해 사용되었다. 신뢰성 높은 결과를 얻기 위해, delatCn = 0.1과 Rsp = 4의 조건을 적용하였고, Xcorr의 경우, 전하 상태(Charge state) 1+에서는 Xcorr = 1.5를 적용하였고, 전하 상태 2+에서는 Xcorr = 2.0, 전하 상태 3+에서는 Xcorr = 2.5를 적용하였으며, 펩타이드 확률(peptide probability) > 0.1을 적용하여 단백질 동정을 확정범위(cutoff)로 사용하였다.
After in-gel digestion of each spot with trypsin for NanoLC-MS / MS analysis, the peptides of the spots were agilent 110 Series nano-LC and LTQ-mass spectrometer (Thermo Electron, San Jose, CA). The capillary column (150 mm × 0.075 mm) used for LC-MS / MS analysis was purchased from Proxeon (Odense M, Denmark), and the slurry was a Magic C18 stationary phase (5 µm, 100 mm pore size) (Michrom Bioresources, Auburn, CA). Mobile phase A for LC separation was distilled water containing 0.1% formic acid and mobile phase B was acetonitrile containing 0.1% formic acid. The chromatographic gradient was set up as 35% D linear increase at 5% B for 50 minutes, 61% B linear increase at 541% B for 0 minutes, and 81% B linear increase at 561% B for 5 minutes. The flow rate was maintained at 300 ml per minute splitting. Mass spectra were obtained with data-dependent acquisition with full mass scan (5410-1810 m / z) after MS / MS scan. The obtained several MS / MS scans were the average of rmmicroscans in LTQ. The temperature of the ion transfer tube was set at 200 ° C. and the spray was 1.5.0-2.0 kV. Normalized collision energy was set at 35% for MS / MS. Sequest software was used to identify peptide sequences. In order to obtain reliable results, the conditions of delatCn = 0.1 and Rsp = 4 were applied, Xcorr = 1.5 in Charge state 1+, Xcorr = 2.0, Charge in charge state 2+ In state 3+, Xcorr = 2.5 was applied, and peptide probability> 0.1 was used to identify proteins as cutoffs.

..

Claims (4)

막전이 수송단백질(Transmembrane trafficking protein; 분자량: 23kDa);
인산-N-아세틸뮤라모일-펜타펩타이드 전이효소(phospho-N-acetylmuramoyl-pentapeptide-transferase; 분자량: 38kDa);
펩타이딜-프롤릴 시스-트랜스 아이소머레이즈(peptidyl-prolyl cis-trans isomerase; 분자량: 18kDa);
엽록체 인산글리세르산 카이네이즈(chloroplast phosphoglycerate kinase; 분자량: 32kDa); 및
글리세르알데하이드-3-인산 탈수소효소(glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase; 분자량: 21kDa) 중 선택된 1종 이상의 마커 단백질 또는 그의 면역원성 단편에 특이적으로 결합하는 항체를 포함하는 청삼 종자와 보성 종자 구분용 키트.
Transmembrane trafficking protein (molecular weight: 23 kDa);
Phospho-N-acetylmuramoyl-pentapeptide-transferase (molecular weight: 38 kDa);
Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (molecular weight: 18 kDa);
Chloroplast phosphoglycerate kinase (molecular weight: 32 kDa); And
For distinguishing blue ginseng seed from complementary seed comprising antibodies that specifically bind to one or more marker proteins selected from glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase (molecular weight: 21 kDa) or immunogenic fragments thereof Kit.
제1항에 있어서,
상기 키트는 ELISA(Enzyme linked immunosorbent assay)용 키트인 것을 특징으로 하는 진단 키트.
The method of claim 1,
The kit is a diagnostic kit, characterized in that the kit for ELISA (Enzyme linked immunosorbent assay).
막전이 수송단백질(Transmembrane trafficking protein; 분자량: 23kDa);
인산-N-아세틸뮤라모일-펜타펩타이드 전이효소(phospho-N-acetylmuramoyl-pentapeptide-transferase; 분자량: 38kDa);
펩타이딜-프롤릴 시스-트랜스 아이소머레이즈(peptidyl-prolyl cis-trans isomerase; 분자량: 18kDa);
엽록체 인산글리세르산 카이네이즈(chloroplast phosphoglycerate kinase; 분자량: 32kDa); 및
글리세르알데하이드-3-인산 탈수소효소(glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase; 분자량: 21kDa) 중 선택된 1종 이상의 마커 단백질 또는 그의 면역원성 단편에 특이적으로 결합하는 항체를 미확인 종자 시료와 접촉시키는 단계를 포함하는 청삼 종자와 보성 종자를 구분하는 방법.
Transmembrane trafficking protein (molecular weight: 23 kDa);
Phospho-N-acetylmuramoyl-pentapeptide-transferase (molecular weight: 38 kDa);
Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (molecular weight: 18 kDa);
Chloroplast phosphoglycerate kinase (molecular weight: 32 kDa); And
Contacting an unidentified seed sample with an antibody that specifically binds one or more marker proteins or immunogenic fragments thereof selected from glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase (molecular weight: 21 kDa) How to distinguish between Cheongsam seeds and Boseong seeds.
제3항에 있어서,
a) 분석할 미확인 종자 시료를 제공하는 단계;
b) 상기 시료와 상기 마커 단백질에 특이적으로 결합하는 항체를 접촉시키는 단계;
c) 항원-항체 복합체를 정량 검출하는 단계; 및
d) 상기 c) 단계 검출 결과를 청삼 종자 대조군과 비교하는 단계;를 포함하는 것을 특징으로 하는 방법.
The method of claim 3,
a) providing an unidentified seed sample to be analyzed;
b) contacting said sample with an antibody that specifically binds said marker protein;
c) quantitatively detecting the antigen-antibody complex; And
d) comparing the detection result of step c) with the blue ginseng seed control group.
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