KR20110099333A - Sulfurizing reagents and their use for oligonucleotides synthesis - Google Patents

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KR20110099333A
KR20110099333A KR1020117017343A KR20117017343A KR20110099333A KR 20110099333 A KR20110099333 A KR 20110099333A KR 1020117017343 A KR1020117017343 A KR 1020117017343A KR 20117017343 A KR20117017343 A KR 20117017343A KR 20110099333 A KR20110099333 A KR 20110099333A
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위슬로 아담 마주르
이강 허
빅터 소로킨
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기린두스 아메리카 인코포레이티드
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Abstract

본 발명은 P-S-R 결합을 포함한 하나 이상의 뉴클레오타이드간 결합(internucleotide linkage)과, 둘 이상의 뉴클레오사이드를 포함하는 올리고뉴클레오타이드이며, R은 하기 화학식(I)에 해당된다:

Figure pct00033
(I)
(식 중, A는 동일위치에 치환되는 알킬렌기, 바람직하게는 CH2이고; X 및 Y는 S 및 0 중에서 독립적으로 선택되고; R0은 임의 치환된 탄소-결합된 유기 잔기, 예를 들어 구체적으로는 임의 치환된 알킬 또는 아릴, SRx, ORx 및 NRxRy (Rx 및/또는 Ry는 H 및 유기 잔기 중에서 선택되며 적어도 Rx는 H 이외의 치환기임)로 이루어진 군에서 선택됨). 본 발명의 다른 목적은 올리고뉴클레오타이드 제조에 유용한 황화제 및 그 제조이다.The present invention is at least one internucleotide linkage comprising a PSR linkage and an oligonucleotide comprising at least two nucleosides, wherein R corresponds to formula (I):
Figure pct00033
(I)
Wherein A is an alkylene group substituted at the same position, preferably CH 2 ; X and Y are independently selected from S and 0; R 0 is an optionally substituted carbon-bonded organic moiety, for example Specifically, in the group consisting of optionally substituted alkyl or aryl, SR x , OR x and NR x R y (R x and / or R y is selected from H and organic moieties and at least R x is a substituent other than H) Selected). Another object of the present invention is a sulfiding agent useful for preparing oligonucleotides and the preparation thereof.

Description

황화시약, 및 올리고뉴클레오타이드 합성을 위한 그 용도{SULFURIZING REAGENTS AND THEIR USE FOR OLIGONUCLEOTIDES SYNTHESIS}Sulfurized reagents and their use for oligonucleotide synthesis {SULFURIZING REAGENTS AND THEIR USE FOR OLIGONUCLEOTIDES SYNTHESIS}

본 출원은 2008년 12월 23일자로 출원된 미국 특허출원 제61/140391호의 이점을 주장하며, 그 전체 내용이 본원에 참조로 통합된다.This application claims the benefit of US patent application Ser. No. 61/140391, filed December 23, 2008, the entire contents of which are incorporated herein by reference.

본 발명은 포스포로티오에이트 올리고뉴클레오타이드(phosphorothioate oligonucleotides), 신규 황화시약을 이용한 그 제조, 상기 황화시약 및 그 제조에 관한 것이다.The present invention relates to the preparation of the phosphorothioate oligonucleotides (phosphorothioate oligonucleotides), a novel sulfiding reagent, the sulfiding reagent and the preparation thereof.

올리고뉴클레오타이드는 (몇 가지만 예를 들어, 암, 바이러스성 감염 및 염증성 질환을 비롯한) 각종 질환의 치료용으로 큰 잠재력을 지닌 생약제의 한 종류에 속한다. 올리고뉴클레오타이드를 치료제로서 발전시키는 한 가지 중요한 방법은 올리고머 주쇄를 변형하여, 무엇보다도, 대사내성 및 화학적 안정성을 제공하고 작용부위로의 생체 내 전달을 향상시키는 것이다. 변형된 주쇄 화합물의 예로: PNAs(peptide nucleic acids)(Nielsen, Methods Mol. Biol., 208:3-26, 2002를 참조함), LNAs(locked nucleic acids) (Petersen & Wengel, Trends Biotechnol., 21(2):74-81, 2003을 참조함), 포스포로티오에이트 (Eckstein, Antisense Nucleic Acid Drug Dev., 10(2):117-21, 2000을 참조함), 메틸포스포네이트(Thiviyanathan et al., Biochemistry, 41(3):827-38, 2002를 참조함), 포스포아미데이트 (Gryaznov, Biochem. Biophys. Acta, 1489(1):131-40, 1999; Pruzan et al., Nucleic Acids Res., 30(2):559-68, 2002를 참조함), 티오포스포아미데이트 (Gryaznov et al., Nucleosides Nucleotides Nucleic Acids, 20(4-7):401-10, 2001; Herbert et al., Oncogene, 21(4):638-42, 2002를 참조함)가 포함된다. 포스포로티오에이트의 형성이 가장 유용한 변형에 속하는데 그 이유는 P=O를 P=S 부분(moiety)으로 치환함으로써 올리고뉴클레오타이드가 핵산분해에 내성을 나타내면서 한편으로는 대부분의 경우에 천연 올리고머의 생물학적 특성을 유지하기 때문이다. Oligonucleotides belong to a class of herbal drugs with great potential for the treatment of various diseases (including several, for example, cancer, viral infections and inflammatory diseases). One important way to develop oligonucleotides as therapeutics is to modify the oligomer backbone, among other things to provide metabolic resistance and chemical stability and to enhance in vivo delivery to the site of action. Examples of modified backbone compounds include: peptide nucleic acids (PNAs) (see Nielsen, Methods Mol. Biol., 208: 3-26, 2002), locked nucleic acids (LNAs) (Petersen & Wengel, Trends Biotechnol., 21) (2): 74-81, 2003), phosphorothioate (see Eckstein, Antisense Nucleic Acid Drug Dev., 10 (2): 117-21, 2000), methylphosphonate (Thiviyanathan et al., Biochemistry, 41 (3): 827-38, 2002), phosphoramidate (Gryaznov, Biochem. Biophys. Acta, 1489 (1): 131-40, 1999; Pruzan et al., Nucleic Acids Res., 30 (2): 559-68, 2002), thiophosphoamidate (Gryaznov et al., Nucleosides Nucleotides Nucleic Acids, 20 (4-7): 401-10, 2001; Herbert et al., Oncogene, 21 (4): 638-42, 2002). Formation of phosphorothioates is one of the most useful modifications because the substitution of P═O with the P═S moiety makes the oligonucleotides resistant to nucleolysis, while in most cases the biological oligomers This is because the characteristics are maintained.

포스포로티오에이트는 산화황화반응에 의해 형성될 수 있다(Oligonucleotide synthesis, methods and applications, P. Herdewijn Methods in Molecular Biology, volume 288, Chapter 4, 51-63을 참조함). 이러한 반응에 사용되는 아인산에스테르의 성질 및 예상되는 생성물의 성질에 따라, 기본적으로 두 가지 방법에 의해 포스포로티오에이트를 제조한다. 그 중 한 가지는, 예를 들어, 황 원소, 디벤조일 테트라설파이드, 3-H-1,2-벤조디티올-3-온 1,1-디옥사이드(Beaucage 시약으로도 알려져 있음 (Iyer et al., J. Org. Chem. 55, 4693-4699 (1990) 참조), 테트라에틸티우람 디설파이드(TETD), 디메틸티우람 디설파이드(DTD), 페닐아세틸 디설파이드(PADS) 및 비스(O,O-디이소프로폭시 포스피노티오일)디설파이드(Stec 시약으로 알려져 있음)를 통해 비치환 황원자를 인에 도입하는 것이다. 이들 반응은 포스포아미다이트 방법에 의해 고체 지지체 상에서 올리고뉴클레오타이드를 자동 합성하는데 주로 사용되며, 올리고머의 연장반응 도중에 형성되는 아인산 트리에스테르의 산화황화 단계를 포함한다.Phosphorothioates can be formed by oxidative sulfidation (see Oligonucleotide synthesis, methods and applications, P. Herdewijn Methods in Molecular Biology, volume 288, Chapter 4, 51-63). Depending on the nature of the phosphite ester used in this reaction and the nature of the expected product, phosphorothioate is prepared basically by two methods. One of them is, for example, elemental sulfur, dibenzoyl tetrasulfide, 3-H-1,2-benzodithiol-3-one 1,1-dioxide (also known as Beaucage reagent (Iyer et al., J. Org.Chem. 55, 4693-4699 (1990)), tetraethylthiuram disulfide (TETD), dimethylthiuram disulfide (DTD), phenylacetyl disulfide (PADS) and bis (O, O-disisopro The introduction of unsubstituted sulfur atoms into the phosphorus via a foxy phosphinothioyl) disulfide (known as Stec reagent), these reactions are mainly used for the automatic synthesis of oligonucleotides on a solid support by the phosphoramidite method, Oxidative sulfiding of the phosphorous acid triester formed during the extension of the oligomer.

올리고머 포스포로티오에이트를 제조하기 위한 두 번째 방법은 H-포스포네이트 방법을 이용하는 것으로, 지방족 또는 방향족 치환기를 가진 황원자를 인에 전달시키는 황 전달 시약을 H-포스포네이트 디에스테르와 반응시키는 것이다. 황에 있는 보조 치환기는 합성 조작시 보호기의 역할을 하며, 올리고뉴클레오타이드 제조의 최종 단계에서 일반적으로 절단된다. 이러한 방법은 용액상의 올리고뉴클레오타이드 합성에 특히 적합하다.The second method for preparing oligomeric phosphorothioates is to use the H-phosphonate method, which reacts a H-phosphonate diester with a sulfur transfer reagent that transfers sulfur atoms with aliphatic or aromatic substituents to phosphorus. . Auxiliary substituents on sulfur serve as protecting groups in the synthetic operation and are generally cleaved at the final stage of oligonucleotide preparation. This method is particularly suitable for the synthesis of oligonucleotides in solution.

비치환 황원자를 아인산 에스테르에 도입하는데 이용가능한 시약의 선택의 폭이 넓은 것과는 대조적으로, 보호된 황으로 H-포스포네이트 에스테르를 황화시키는 기(group)의 범위는 한정되어 있다(예컨대, Dreef, et al. Synlett, 481-483, 1990, 미국 특허 제6,506,894호를 참조함). 실제로, 각 단계에서 크로마토그래피 정제가 수행되는 올리고뉴클레오타이드 용액 합성 동안의 이러한 반응에서는 시아노에틸설파이드기만 광범위하게 사용되어 왔다. 올리고뉴클레오타이드 용액 합성에서 중요한 문제점은, 특히 크로마토그래피법을 피하고 단순 정제를 용이하게 하는 형태의 고순도 생성물을 제공하면서 각 합성 단계에서 우수한 특이성을 갖는 높은 기질 전환율을 얻어야 한다는 필요성과 관련이 있다. 경제적인 용액상 합성을 가능하게 하는 방법들이 부족하다는 것을 감안하여, 상업적 규모의 올리고뉴클레오타이드 합성에 용액상 기법이 현재 이용되는 것으로 보이지 않는다. In contrast to the wide choice of reagents available for introducing unsubstituted sulfur atoms into phosphite esters, the range of groups for sulfiding H-phosphonate esters with protected sulfur is limited (eg, Dreef, et al. Synlett, 481-483, 1990, see US Pat. No. 6,506,894. Indeed, only cyanoethylsulfide groups have been used extensively in this reaction during oligonucleotide solution synthesis, where chromatographic purification is performed at each step. An important problem in oligonucleotide solution synthesis relates to the need to obtain high substrate conversions with good specificity at each synthesis step, in particular providing high purity products in the form of avoiding chromatography and facilitating simple purification. Given the lack of methods to enable economical solution phase synthesis, solution phase techniques do not appear to be currently used for commercial scale oligonucleotide synthesis.

이에 본 발명은 신규의 황화시약, 그 제조 방법 및 특히 용액상 포스포로티오에이트 올리고뉴클레오타이드의 경제적이면서 편리한 합성 및 정제에 있어서 상기 황화시약의 용도를 제공하고자 한다.Accordingly, the present invention aims to provide a novel sulfided reagent, a method for preparing the same, and particularly the use of the sulfided reagent in the economical and convenient synthesis and purification of a solution phase phosphorothioate oligonucleotide.

본 발명은 구체적으로 첨부된 청구범위에 기술된 발명에 관한 것이다. 본 발명은 또한 본 명세서, 특히 실시예에 대체로 기술된 방법 및 시약에 관한 것이다. The present invention specifically relates to the invention described in the appended claims. The invention also relates to the methods and reagents generally described herein, particularly in the Examples.

본 발명은 특히 H-포스포네이트 방법을 통해 바람직하게 수행되는 올리고뉴클레오타이드의 합성에서, 기존의 P-S 결합(linkage) 형성 방법보다 많은 장점을 가진다. 예를 들면, 신규 시약을 이용하여 올리고뉴클레오타이드에 전달된 잔기 R은 올리고뉴클레오타이드의 결정화 또는 침전을 용이하게 하여, 크로마토그래피법을 최소한으로 또는 전혀 이용하지 않으면서 생성물의 단순 정제가 가능하게 할 수 있다. 이러한 방법으로 제조되며 2개 내지 적어도 16개의 뉴클레오타이드 단위를 갖는 올리고뉴클레오타이드의 경우, 필요한 올리고뉴클레오타이드를 최종적으로 탈보호시킨 후까지는 크로마토그래피로 정제할 필요가 없다는 것을 발견하였다. 중간생성물 올리고머는, 5'- 및 3'- 위치에서의 임의의 탈보호, 그리고 원한다면 이들 조(crude) 탈보호된 물질을 더 많은 올리고뉴클레오타이드와 커플링하기에 충분히 순수하게 얻어질 수 있다. 다른 장점으로, 본 발명의 방법은, 단순하면서도 크로마토그래피법을 사용하지 않는 정제법의 효율을 최대화시키는 것과 관련하여, 형성된 올리고뉴클레오타이드의 특성을 변형시키는데 사용될 수 있는 다양한 황화시약에 대한 접근성을 제공한다. 본 발명에 따른 방법의 또 다른 장점은, 예를 들어 황-보호 아실옥시메틸렌기 RC(O)-OCH2를 상온 상압조건(mild conditions) 하에서, 예를 들어, 일차 또는 이차 또는 장애(hindered) 아민(예컨대, n-프로필아민 또는 터트-부틸아민)을 이용하여 쉽게 단순절단할 수 있다는 것이다. 아민을 이용한 임의적 처리시, 황-메틸렌 결합을 포함하여, 자발적 절단이 일어남에 따라 P=S 결합이 선명하게 형성된다. 절단 생성물은 용매나 수성 세척액을 이용하여 생성물로부터 쉽게 제거가능하다. 예컨대 염기성 비친핵성 조건 하에서 이를 테면 아실옥시메틸렌기의 안정성 특징 덕분에, 합성 경로를 따라 선택적인 탈보호가 가능하므로, 예를 들면 핵염기 보호기의 절단을 방지함으로써, 합성 방법에 더 많은 유연성이 허용된다.The present invention has many advantages over existing PS linkage formation methods, particularly in the synthesis of oligonucleotides which are preferably carried out via the H-phosphonate method. For example, residue R delivered to oligonucleotides using novel reagents may facilitate crystallization or precipitation of oligonucleotides, allowing simple purification of the product with minimal or no chromatography. . For oligonucleotides prepared in this manner and having from 2 to at least 16 nucleotide units, it has been found that there is no need to purify by chromatography until the required oligonucleotides are finally deprotected. Intermediate oligomers can be obtained with any deprotection at the 5'- and 3'- positions, and if desired pure enough to couple these crude deprotected materials with more oligonucleotides. In another advantage, the methods of the present invention provide access to a variety of sulfiding reagents that can be used to modify the properties of the oligonucleotides formed in connection with maximizing the efficiency of the simple but chromatographic purification. . Another advantage of the process according to the invention is that, for example, sulfur-protected acyloxymethylene groups RC (O) -OCH 2 are subjected to, for example, primary or secondary or hindered conditions under ambient conditions. It can be easily cleaved using amines (eg n-propylamine or tert-butylamine). In optional treatment with amines, spontaneous cleavage occurs, including sulfur-methylene bonds, and P = S bonds are clearly formed. Cleavage products can be easily removed from the product using solvents or aqueous washes. The stability characteristics of acyloxymethylene groups, for example under basic non-nucleophilic conditions, allow selective deprotection along the synthetic route, thus allowing more flexibility in the synthesis process, for example by preventing cleavage of nucleobase protecting groups. do.

특별히 용액상 올리고뉴클레오타이드의 합성을 위한 경제적인 방법을 개발하는데 있어서 중요한 요소는 올리고뉴클레오타이드 사슬 연장의 각 단계에서 전환 생성물의 순도이다. 비록 본 발명에 따른 방법이 생성물의 고수율과 고순도를 보장하더라고, 각 연장주기는 일반적으로 세 단계를 포함하며, 적은 양의 불순물이라도 제거하지 않으면 도중에 축적될 것이므로 제거하는 것이 유리하다. 많은 단계들이 있기 때문에, 크로마토그래피법을 각 단계에서 이용한다는 것은 실제 대규모 올리고뉴클레오타이드 합성에서 경제적으로 실현 가능하지 않을 수 있다. 이에 따라, 본 출원인은 또한 사슬의 연장 과정에서 형성되는 올리고뉴클레오타이드의 정제용으로 크로마토그래피법을 사용하지 않는 방법론을 개시한다.An important factor, especially in developing economical methods for the synthesis of solution phase oligonucleotides, is the purity of the conversion product at each stage of oligonucleotide chain extension. Although the process according to the invention ensures high yield and high purity of the product, each extension period generally comprises three steps, and it is advantageous to remove them, since even small amounts of impurities will accumulate along the way. Because there are many steps, using chromatographic methods at each step may not be economically feasible in actual large scale oligonucleotide synthesis. Accordingly, we also disclose a methodology that does not use chromatography for the purification of oligonucleotides formed in the course of chain extension.

본 발명의 구체적인 제1 목적은 P-S-R 결합을 포함한 하나 이상의 뉴클레오타이드간 결합(internucleotide linkage)과, 둘 이상의 뉴클레오사이드를 포함하는 올리고뉴클레오타이드를 제공하는 것으로, 이때 R은 하기 화학식(I)에 해당된다:It is a first object of the present invention to provide at least one internucleotide linkage comprising a P-S-R bond and an oligonucleotide comprising at least two nucleosides, wherein R corresponds to formula (I):

Figure pct00001
Figure pct00001

(식 중, A는 동일위치에 치환되는 알킬렌기, 바람직하게는 CH2이고; X 및 Y는 S 및 0 중에서 독립적으로 선택되고; R0은 임의 치환된 탄소-결합된 유기 잔기, 예를 들어 구체적으로는 임의 치환된 알킬 또는 아릴, SRx, ORx 및 NRxRy (Rx 및 Ry는 H 및 유기 잔기 중에서 선택되며 적어도 Rx는 H 이외의 치환기임)로 이루어진 군에서 선택됨).Wherein A is an alkylene group substituted at the same position, preferably CH 2 ; X and Y are independently selected from S and 0; R 0 is an optionally substituted carbon-bonded organic moiety, for example Specifically, optionally substituted alkyl or aryl, SR x , OR x and NR x R y (R x and R y are selected from H and organic moieties and at least R x is a substituent other than H) .

가용성 특징에 대해 유리한 특성을 가짐으로써 예를 들어 침전 기법과 추출 기법의 조합에 의해 효과적으로 달성될 수 있는 효율적 정제를 감안한 P-황화 올리고뉴클레오타이드 합성에 있어서, 본 발명에 따른 올리고뉴클레오타이드가 중요한 합성 중간생성물이라는 것이 밝혀졌다. 또한 본 발명에 따른 올리고뉴클레오타이드는 인간 또는 동물의 몸 안에 있는 R기를 절단시킴으로써, 생체 내에 포스포로티오에이트 올리고뉴클레오타이드를 방출할 수 있는 전구약물로서 효과적으로 여겨진다. Synthetic intermediates in which the oligonucleotides according to the invention are important for the synthesis of P-sulphide oligonucleotides having advantageous properties on soluble characteristics, allowing for efficient purification which can be effectively achieved, for example, by a combination of precipitation and extraction techniques. It turned out that In addition, the oligonucleotides according to the present invention are effectively regarded as prodrugs capable of releasing phosphorothioate oligonucleotides in vivo by cleaving R groups in the human or animal body.

본 발명의 구성 내에서 "올리고뉴클레오타이드"란 용어는 핵염기에 연결된 당(sugar) 단위들을 포함한 뉴클레오사이드 단량체 단위들의 올리고머를 구체적으로 지칭하며, 상기 뉴클레오사이드 단량체 단위는 뉴클레오타이드간 결합(internucleotide bond)에 의해 연결되어 있다. "뉴클레오타이드간 결합"은 구체적으로 2개의 뉴클레오사이드 부분 사이의 화학적 결합(chemical linkage)을 가리키는 것으로, 예컨대, 자연에서 발견되는 핵산에 통상 존재하는 포스포디에스테르 결합 또는 합성 핵산 및 핵산 유사물에 통상 존재하는 다른 결합들을 가리킨다. 이러한 뉴클레오타이드간 결합에는 예를 들어 포스포(phospho)기 또는 포스파이트(phosphite)기가 포함될 수 있으며, 포스포기 또는 포스파이트기의 하나 이상의 산소 원자가 치환기로 변형되거나 (예컨대, 황 원자, 또는 모노- 또는 디-알킬 아미노기의 질소 원자와 같은) 다른 원자로 대체되는 결합이 포함될 수 있다. 일반적인 뉴클레오타이드간 결합은 인산의 디에스테르 또는 그 유도체로, 예를 들면, 포스페이트, 티오포스페이트(thiophosphates), 디티오포스페이트, 포스포아미데이트, 티오 포스포아미데이트가 있다. The term "oligonucleotide" within the constitution of the present invention specifically refers to oligomers of nucleoside monomer units including sugar units linked to nucleobases, wherein the nucleoside monomer units are internucleotide bonds. Are connected by "Internucleotide linkage" specifically refers to a chemical linkage between two nucleoside moieties, eg, to phosphodiester bonds or synthetic nucleic acids and nucleic acid analogs that are commonly present in nucleic acids found in nature. Indicates other associations that exist. Such internucleotide bonds may include, for example, a phospho group or a phosphite group, wherein one or more oxygen atoms of the phospho group or phosphite group are modified with a substituent (eg, a sulfur atom, or a mono- or Bonds substituted with other atoms (such as nitrogen atoms of the di-alkyl amino groups) may be included. Common internucleotide linkages are diesters of phosphoric acid or derivatives thereof, for example phosphates, thiophosphates, dithiophosphates, phosphamidates, thiophosphamidates.

"뉴클레오사이드"란 용어는 당에 연결된 핵염기로 구성된 화합물을 구체적으로 지칭한다. 이러한 당으로는, 오각형 고리(furanose ring)(예컨대, 리보스), 2'-디옥시리보스 및 비(non)-오각형 고리(예컨대, 사이클로헥센일, 안하이드로헥시톨, 모르폴리노)가 포함되되, 이에 한정되지는 않는다. 뉴클레오사이드에 포함된 당과 관련하여 이하 표시되는 변형, 치환 및 위치들이 오각형 고리를 참조하여 설명되되, 동일한 변형 및 위치가 다른 당 고리의 유사한 위치에도 적용된다. 당은 추가적으로 변형될 수 있다. 당 변형의 비제한적 예로는 예를 들어 수소; 하이드록시; 메톡시, 에톡시, 알릴옥시, 이소프로폭시, 부톡시, 이소부톡시, 메톡시에틸, 알콕시, 페녹시와 같은 알콕시; 아지도(azido); 아미노; 알킬아미노; 플루오로; 클로로; 및 브로모를 포함하는 오각형 당 고리의 예컨대 2'- 또는 3'-위치(구체적으로는 2'-위치)에서의 변형; 2'-4'- 및 3'-4'-연결된 오각형 당 고리 변형을 특히 언급할 수 있으며, 여기서 오각형 당 고리에서의 변형은 예를 들면 고리 4'-O를 S, CH2, NR, CHF 또는 CF2로 치환하는 것을 포함한다.The term "nucleoside" specifically refers to a compound composed of nucleobases linked to sugars. Such sugars include furanose rings (eg ribose), 2'-deoxyribose and non-pentagonal rings (eg cyclohexenyl, anhydrohexitol, morpholino) It is not limited to this. The modifications, substitutions and positions indicated below with respect to the sugars contained in the nucleosides are described with reference to the pentagonal ring, although the same modifications and positions apply to similar positions of other sugar rings. Sugars can be further modified. Non-limiting examples of sugar modifications include, for example, hydrogen; Hydroxy; Alkoxy such as methoxy, ethoxy, allyloxy, isopropoxy, butoxy, isobutoxy, methoxyethyl, alkoxy, phenoxy; Azido; Amino; Alkylamino; Fluoro; Chloro; And modification at the 2'- or 3'-position (specifically 2'-position) of a pentagonal sugar ring comprising bromo; Particular mention may be made of 2'-4'- and 3'-4'-linked pentagonal sugar ring modifications, wherein the modifications in the pentagonal sugar ring are for example ring 4'-O to S, CH 2 , NR, CHF Or substituted with CF 2 .

"핵염기"란 용어는 특히 상보적인 핵염기 또는 핵염기 유사물과 쌍을 이룰 수 있는 질소-함유 헤테로사이클릭 부분을 구체적으로 지칭하는 것으로 이해하면 된다. 전형적인 핵염기는, 자연발생적 핵염기로서, 퓨린 염기인 아데닌(A) 및 구아닌(G)과, 피리미딘 염기인 티민(T), 사이토신(C) 및 우라실(U)을 포함하며; 다른 합성 및 천연 핵염기를 포함하는 변형된 핵염기로서, 예를 들어 5-메틸사이토신(5-me-C), 5-하이드록시메틸 사이토신, 크산틴, 하이포크산틴, 2-아미노아데닌, 6-메틸 및 아데닌과 구아닌의 다른 알킬 유도체, 2-프로필 및 아데닌과 구아닌의 다른 알킬 유도체, 2-티오우라실, 2-티오티민 및 2-티오사이토신, 5-할로우라실 및 사이토신, 5-프로피닐 우라실 및 사이토신, 그리고 피리미딘 염기의 다른 알키닐 유도체, 6-아조 우라실, 사이토신 및 티민, 5-우라실(pseudouracil), 4-티오우라실, 8-할로, 8-아미노, 8-티올, 8-티오알킬, 8-하이드록실 및 다른 8-치환 아데닌 및 구아닌, 5-할로, 특히는 5-브로모, 5-트리플루오로메틸 및 다른 5-치환 우라실 및 사이토신, 7-메틸구아닌 및 7-메틸아데닌, 2-F-아데닌, 2-아미노-아데닌, 8-아자구아닌 및 8-아자아데닌, 7-디아자구아닌 및 7-디아자아데닌, 3-디아자구아닌 및 3-디아자아데닌, 및 불소화 염기를 포함한다. 추가의 변형된 핵염기로는, 트리사이클릭 피리미딘, 예를 들어 페녹사진 시티딘(1H-피리미도[5,4-b][1,4]벤조옥사진-2(3H)-온), 페노티아진 시티딘(1H-피리미도[5,4-b][1,4]벤조티아진-2(3H)-온), G-클램프, 예를 들어 치환된 페녹사진 시티딘(예컨대, 9-(2-아미노에톡시)-H-피리미도[5,4-b][1,4]벤조옥사진-2(3H)-온), 카바졸 시티딘(2H-피리미도[4,5-b]인돌-2-온), 피리도인돌 시티딘(H-피리도[3',2':4,5]피롤로[2,3-d]피리미딘-2-온)을 포함한다. 잠재적으로 적합한 다른 염기로는, 만능(universal) 염기, 소수성 염기, 프로미스큐어스(promiscuous) 염기 및 크기-확대형 염기가 포함된다.The term "nucleobase" is understood to specifically refer to a nitrogen-containing heterocyclic moiety that can be paired with a complementary nucleobase or nucleobase analog. Typical nucleobases include naturally occurring nucleobases including the purine bases adenine (A) and guanine (G), and the pyrimidine bases thymine (T), cytosine (C) and uracil (U); As modified nucleobases comprising other synthetic and natural nucleobases, for example 5-methylcytosine (5-me-C), 5-hydroxymethyl cytosine, xanthine, hypoxanthine, 2-aminoadenine, 6-methyl and other alkyl derivatives of adenine and guanine, 2-propyl and other alkyl derivatives of adenine and guanine, 2-thiouracil, 2-thiothymine and 2-thiocytosine, 5-halouracil and cytosine, 5- Propynyl uracil and cytosine, and other alkynyl derivatives of the pyrimidine base, 6-azo uracil, cytosine and thymine, 5-urasecil, 4-thiouracil, 8-halo, 8-amino, 8-thiol , 8-thioalkyl, 8-hydroxyl and other 8-substituted adenine and guanine, 5-halo, especially 5-bromo, 5-trifluoromethyl and other 5-substituted uracil and cytosine, 7-methylguanine And 7-methyladenine, 2-F-adenine, 2-amino-adenine, 8-azaguanine and 8-azadenine, 7-diazaguine and 7-diazadenine, 3-diazaguinine and 3-diazadenine, and fluorinated bases. Further modified nucleobases include tricyclic pyrimidines, for example phenoxazine cytidine (1H-pyrimido [5,4-b] [1,4] benzoxazine-2 (3H) -one) , Phenothiazine cytidine (1H-pyrimido [5,4-b] [1,4] benzothiazine-2 (3H) -one), G-clamps such as substituted phenoxazine cytidines (eg , 9- (2-aminoethoxy) -H-pyrimido [5,4-b] [1,4] benzoxazine-2 (3H) -one), carbazole cytidine (2H-pyrimido [4 , 5-b] indol-2-one), pyridoindole cytidine (H-pyrido [3 ', 2': 4,5] pyrrolo [2,3-d] pyrimidin-2-one) Include. Other potentially suitable bases include universal bases, hydrophobic bases, promiscuous bases, and size-enlarging bases.

"올리고뉴클레오타이드"는 보통 약 2개 내지 약 50개의 인접한 아단위를 갖는 뉴클레오사이드 아단위 중합체를 가리킨다. 뉴클레오사이드 아단위들은 다양한 아단위간 결합에 의해 연결될 수 있다. 또한, "올리고뉴클레오타이드"는, 당업자에 공지되어 있는 변형체들, 이를 테면 당 주쇄에 대한 변형체(예컨대, 포스포아미데이트, 포스포로디티오에이트), 당류에 대한 변형체(예컨대, 2'-F, 2'-OMe 같은 2' 치환), 염기에 대한 변형체, 그리고 3' 및 5' 말단에 대한 변형체를 포함한다. 통상, 본 발명에서 올리고뉴클레오타이드는 2 내지 30개의 뉴클레오타이드를 포함한다. 본 발명의 다른 구현예에 의하면, 올리고뉴클레오타이드는 리보뉴클레오사이드, 2'-디옥시리보뉴클레오사이드, 2'-치환된 리보뉴클레오사이드, 2'-4'-고정된-리보뉴클레오사이드, 3'-아미노-리보뉴클레오사이드, 3'-아미노-2'-디옥시리보뉴클레오사이드 중에서 선택되는 뉴클레오사이드를 포함한다."Oligonucleotide" generally refers to a nucleoside subunit polymer having from about 2 to about 50 contiguous subunits. Nucleoside subunits may be linked by various interunit linkages. In addition, “oligonucleotides” include variants known to those skilled in the art, such as variants for sugar backbones (eg, phosphoramidates, phosphorodithioates), variants for sugars (eg, 2′-F, 2 'substitutions, such as 2'-OMe), variants for bases, and variants for 3' and 5 'termini. Typically, oligonucleotides in the present invention comprise 2 to 30 nucleotides. According to another embodiment of the invention, the oligonucleotide is ribonucleoside, 2'-deoxyribonucleoside, 2'-substituted ribonucleoside, 2'-4'-fixed-ribonucleoside, 3 Nucleosides selected from '-amino-ribonucleosides, 3'-amino-2'-deoxyribonucleosides.

본 발명의 일부 올리고뉴클레오타이드에서, R은 메틸렌아실옥시기, 메틸렌카보네이트기 및 메틸렌카바메이트기 중에서 선택된다.In some oligonucleotides of the invention, R is selected from methyleneacyloxy groups, methylenecarbonate groups and methylenecarbamate groups.

R이 메틸렌아실옥시기인 경우에는 바람직하게 화학식 -CH2-O-C(O)-R0 (식 중, R0은 C1-C20의 포화, 불포화, 헤테로사이클릭 또는 방향족, 탄화수소 잔기임)에 해당된다. R0이 포화 탄화수소 잔기인 경우에는 바람직하게 선형, 분지형 또는 고리형 알킬 잔기 중에서 선택된다. R0은 예를 들어 저급알킬 또는 사이클로알킬(C1-C7) 잔기 중에서 선택될 수 있다. 구체적으로 포화 탄화수소 잔기는 메틸, 에틸, n-프로필, 이소프로필, n-부틸, sec-부틸, 터트-부틸 사이클로펜틸 및 사이클로헥실 중에서 중에서 선택된다. 메틸기, 에틸기 또는 n-프로필기가 바람직하다. 에틸기가 더 특히 바람직하다. R0이 방향족 잔기인 경우에는 6 내지 14개의 탄소 원자를 가진 방향족 시스템 중에서 적합하게 선택된다. 구체적으로 방향족 잔기는 예를 들어 아릴 또는 헤테로아릴, 알킬, 사이클로알킬, 헤테로사이클 또는 헤테로치환기(예컨대, 할로겐, 아민, 에테르, 카복실레이트, 니트로, 티올, 설폰산 및 설폰)로 치환가능한 페닐기 및 나프틸기 중에서 선택된다. 페닐기가 바람직하다. R0이 헤테로사이클릭 잔기인 경우에는 환형 탄소 원자를 통해 카보닐기에 결합된 하나 이상의 환형 N, O 또는 S 원자를 함유하는 헤테로사이클 중에서 종종 선택된다. 이러한 헤테로사이클릭 잔기의 구체적인 예에는 피리딘 및 퓨란이 포함된다.When R is a methyleneacyloxy group, it preferably corresponds to the formula -CH 2 -OC (O) -R 0 , wherein R 0 is a saturated, unsaturated, heterocyclic or aromatic, hydrocarbon moiety of C 1 -C 20. . When R 0 is a saturated hydrocarbon residue, it is preferably selected from linear, branched or cyclic alkyl residues. R 0 may for example be selected from lower alkyl or cycloalkyl (C 1 -C 7) residues. Specifically, the saturated hydrocarbon residue is selected from among methyl, ethyl, n-propyl, isopropyl, n-butyl, sec-butyl, tert-butyl cyclopentyl and cyclohexyl. Methyl group, ethyl group or n-propyl group is preferable. Ethyl groups are more particularly preferred. When R 0 is an aromatic moiety, it is suitably selected from aromatic systems having 6 to 14 carbon atoms. Specifically, the aromatic moiety is, for example, a phenyl group and a nap that can be substituted with aryl or heteroaryl, alkyl, cycloalkyl, heterocycle or heterosubstituents (eg halogen, amine, ether, carboxylate, nitro, thiol, sulfonic acid and sulfone). It is selected from the group. Phenyl groups are preferred. When R 0 is a heterocyclic moiety it is often selected from heterocycles containing one or more cyclic N, O or S atoms bonded to a carbonyl group via a cyclic carbon atom. Specific examples of such heterocyclic moieties include pyridine and furan.

특정 양상에 의하면, 올리고뉴클레오타이드는 P-S-R 결합(R은 본원에 기술된 바와 같은 메틸렌아실옥시기임)을 포함하는 2개 이상의 뉴클레오타이드간 결합 및 3개 이상의 뉴클레오타이드를 포함한다. According to certain aspects, the oligonucleotide comprises at least two internucleotide bonds and at least three nucleotides, including a P-S-R bond (R is a methyleneacyloxy group as described herein).

R이 메틸렌카바메이트기인 경우에는 바람직하게 화학식 -CH2-O-C(O)-NRxRy (식 중, Rx 및 Ry는 독립적으로 알킬 또는 (헤테로)아릴 중에서 선택됨)에 해당된다. 바람직하게 Rx 및/또는 Ry는 알킬기이다. 이 경우에 Rx 및/또는 Ry는 예를 들어 저급알킬 또는 사이클로알킬 (C1-C7) 잔기 중에서 선택될 수 있다. 구체적으로 알킬기는 메틸, 에틸, n-프로필, 이소프로필, n-부틸, sec-부틸, 터트 부틸, 사이클로펜틸 및 사이클로헥실 중에서 선택된다. 메틸기, 에틸기 또는 n-프로필기가 바람직하다. 특히 바람직한 양상에 의하면 메틸렌 카바메이트기 내의 Rx 및 Ry는 둘 다, 구체적으로는 이전에 기술한 바와 같은, 알킬기이다. N,N-디메틸 또는 N,N-디에틸기가 더 특히 바람직하다. 본 구현예의 다른 양상에 의하면, Rx 및 Ry는 함께 O, N 및 S 중에서 선택되는 추가 환형 헤테로원자를 임의로 함유한 3 내지 8원 고리를 형성한다. 구체적인 예로는 N-피페리딜 또는 N-피롤리딜기가 포함된다. When R is a methylenecarbamate group, it preferably corresponds to the formula -CH 2 -OC (O) -NR x R y , wherein R x and R y are independently selected from alkyl or (hetero) aryl. Preferably R x and / or R y is an alkyl group. In this case R x and / or R y may for example be selected from lower alkyl or cycloalkyl (C 1 -C 7) residues. Specifically, the alkyl group is selected from methyl, ethyl, n-propyl, isopropyl, n-butyl, sec-butyl, tert butyl, cyclopentyl and cyclohexyl. Methyl group, ethyl group or n-propyl group is preferable. According to a particularly preferred aspect both R x and R y in the methylene carbamate group are alkyl groups, specifically as previously described. More particular preference is given to N, N-dimethyl or N, N-diethyl groups. According to another aspect of this embodiment, R x and R y together form a 3 to 8 membered ring optionally containing an additional cyclic heteroatom selected from O, N and S. Specific examples include N-piperidyl or N-pyrrolidyl groups.

R이 메틸렌카보네이트기인 경우에는 바람직하게 화학식 -CH2-O-C(O)ORx(식 중, Rx는 임의 치환된 알킬, 사이클로알킬 및 (헤테로)아릴기 중에서 선택됨)에 해당된다. 바람직하게, Rx는 알킬기이다. 이 경우 Rx는 예를 들어 저급알킬 또는 사이클로알킬 (C1-C7) 잔기 중에서 선택될 수 있다. 구체적으로 알킬기는 메틸, 에틸, n-프로필, 이소프로필, n-부틸, sec-부틸, 터트 부틸, 사이클로펜틸 및 사이클로헥실 중에서 선택된다. 메틸기, 에틸기 또는 n-프로필기가 바람직하다. 에틸기가 더 특히 바람직하다. Rx가 아릴기인 경우에는 6 내지 14개의 탄소 원자를 가진 방향족 시스템 중에서 적합하게 선택된다. 구체적으로 방향족 잔기는 페닐기 및 나프틸기 중에서 선택된다. 페닐기가 바람직하다. Rx가 헤테로사이클릭 잔기인 경우에는 환형 탄소 원자를 통해 옥시카보닐기에 결합된 하나 이상의 환형 N, O 또는 S 원자를 함유하는 헤테로사이클 중에서 종종 선택된다. 이러한 헤테로사이클릭 잔기의 구체적인 예에는 피리딘 및 퓨란이 포함된다.When R is a methylene carbonate group, it preferably corresponds to the formula -CH 2 -OC (O) OR x , wherein R x is selected from optionally substituted alkyl, cycloalkyl and (hetero) aryl groups. Preferably, R x is an alkyl group. In this case R x can be selected from among lower alkyl or cycloalkyl (C 1 -C 7) residues, for example. Specifically, the alkyl group is selected from methyl, ethyl, n-propyl, isopropyl, n-butyl, sec-butyl, tert butyl, cyclopentyl and cyclohexyl. Methyl group, ethyl group or n-propyl group is preferable. Ethyl groups are more particularly preferred. When R x is an aryl group, it is suitably selected from aromatic systems having 6 to 14 carbon atoms. Specifically, the aromatic residue is selected from phenyl group and naphthyl group. Phenyl groups are preferred. When R x is a heterocyclic moiety it is often selected from heterocycles containing one or more cyclic N, O or S atoms bonded to an oxycarbonyl group via a cyclic carbon atom. Specific examples of such heterocyclic moieties include pyridine and furan.

R이 메틸렌아실옥시기, 메틸렌카보네이트기 및 메틸렌카바메이트기 중에서 선택되는 경우에 대해 앞서 제공된 치환기 Rx, Ry 및 R0의 정의 및 선호사항은 화학식(I)에 있는 X 및/또는 Y가 황(sulfur)인 해당 티오유사체(thioanalogue)에 똑같이 적용된다는 것은 물론이다. 또한 언급한 치환기는 예를 들어 할로겐 또는 알콕시 치환기에 의해 임의치환되거나 또는 예를 들어 연쇄(catenary) 헤테로원자, 특히는 산소를 알킬 사슬에 삽입하여 변형될 수 있음은 물론이다.For the case where R is selected from methyleneacyloxy group, methylenecarbonate group and methylenecarbamate group, the definitions and preferences of the substituents R x , R y and R 0 provided above are such that X and / or Y in formula (I) Of course, the same applies to the corresponding thioanalogue, which is sulfur. It is of course also possible that the substituents mentioned are optionally substituted by, for example, halogen or alkoxy substituents or modified by, for example, inserting a chain heteroatom, in particular oxygen, into the alkyl chain.

본 발명의 구체적인 제2 목적은 화학식 R"-S-R (식 중, R은 본 발명에 따른 올리고뉴클레오타이드에 관해 이전에 정의된 바와 같고, R"는 이탈기임)의 황화제에 관한 것이다. A specific second object of the invention relates to the sulfiding agent of the formula R ″ -S-R, wherein R is as previously defined with respect to the oligonucleotide according to the invention and R ″ is a leaving group.

본 발명에 따른 황화제가, 구체적으로는 올리고뉴클레오타이드 내에 S-보호된 포스포로티오에이트 뉴클레오타이드간 결합을 형성하는데 특히 효율적인 황 전달을 가능하게 한다는 것이 발견되었다. 본 발명에 따른 황화제는 보호된 황을 도입시키며, 상기 보호된 황으로부터 보호기를 선택적 및 효율적으로 절단시킬 수 있다. It has been found that the sulfiding agents according to the invention enable sulfur transfer, which is particularly efficient in forming S-protected phosphorothioate internucleotide bonds, specifically in oligonucleotides. The sulfiding agent according to the present invention introduces protected sulfur and can selectively and efficiently cleave the protecting group from the protected sulfur.

본 발명에 따른 황화제에서, 이탈기 R"는 일반적으로 친전자성 기이다. 종종, R"는 황에 결합된 친전자성 질소 원자를 함유한 기이다. 친전자성 질소 원자는 하나 이상의 전자를 끄는(electron-withdrawing)기로 적합하게 치환된다.In the sulfiding agent according to the invention, the leaving group R ″ is generally an electrophilic group. Often, R ″ is a group containing an electrophilic nitrogen atom bonded to sulfur. Electrophilic nitrogen atoms are suitably substituted with one or more electron-withdrawing groups.

본 발명의 황화제에 대한 특정의 일 구현예에서, 황화제는 화학식(II)에 해당된다:In one particular embodiment of the sulfiding agent of the invention, the sulfiding agent corresponds to formula (II):

Figure pct00002
Figure pct00002

(식 중, RA 및 RB는 서로 동일하거나 상이하며 RA 및 RB 중 적어도 하나는 치환된 설포닐기 또는 아실기 중에서 선택되며, 상기 RA 및 RB는 임의로 함께 고리형 치환기를 형성함).Wherein R A and R B are the same or different from each other and R A and R B At least one of which is selected from a substituted sulfonyl group or acyl group, wherein R A and R B optionally together form a cyclic substituent).

RA 및 RB 중 적어도 하나, 바람직하게는 이들 중 하나가 치환된 설포닐인 경우에는 일반적으로 알킬설포닐기 및 아릴설포닐기 중에서 선택된다. 바람직하게, RA 및 RB 중 적어도 하나가 알킬설포닐기인 경우, 그의 알킬 치환기는 바람직하게 저급알킬 또는 사이클로알킬(C1-C7) 잔기 중에서 선택된다. 구체적으로 알킬기는 메틸, 에틸, n-프로필, 이소프로필, n-부틸, sec-부틸, 터트-부틸, 사이클로펜틸 및 사이클로헥실기 중에서 선택된다. 메틸기, 에틸기 또는 n-프로필기가 바람직하다. 메틸기가 더 특히 바람직하다. RA 및 RB 중 적어도 하나가 아릴설포닐기인 경우, 그의 아릴 치환기는 예를 들어 임의치환된 페닐기이다. RA 및 RB 중 적어도 하나, 바람직하게는 양측 모두가 아실기인 경우에는 일반적으로 알킬아실기 및 아릴아실기 중에서 선택된다. 바람직하게, RA 및 RB 중 적어도 하나가 알킬아실기인 경우, 그의 알킬 치환기는 바람직하게 저급알킬 또는 사이클로알킬(C1-C7) 잔기 중에서 선택된다. 구체적으로 알킬기는 메틸, 에틸, n-프로필, 이소프로필, n-부틸, sec-부틸, 터트-부틸, 사이클로펜틸 및 사이클로헥실기 중에서 선택된다. 메틸기, 에틸기 또는 n-프로필기가 바람직하다. 메틸기, 에틸기 또는 n-프로필기가 바람직하다. 메틸기가 더 특히 바람직하다. 특히 바람직한 구현예에서, RA 및 RB는 함께 고리형 치환기, 바람직하게는 4 내지 7원 고리형 치환기를 형성하는 아실기이다.R A and R B When at least one of, preferably one of them is substituted sulfonyl, it is generally selected from alkylsulfonyl groups and arylsulfonyl groups. Preferably, when at least one of R A and R B is an alkylsulfonyl group, its alkyl substituent is preferably selected from lower alkyl or cycloalkyl (C 1 -C 7) residues. Specifically, the alkyl group is selected from methyl, ethyl, n-propyl, isopropyl, n-butyl, sec-butyl, tert-butyl, cyclopentyl and cyclohexyl groups. Methyl group, ethyl group or n-propyl group is preferable. Methyl groups are more particularly preferred. R A and R B When at least one of is an arylsulfonyl group, its aryl substituent is, for example, an optionally substituted phenyl group. R A and R B When at least one, preferably both sides are acyl groups, they are generally selected from alkylacyl groups and arylacyl groups. Preferably, R A and R B When at least one of is an alkylacyl group, its alkyl substituent is preferably selected from lower alkyl or cycloalkyl (C1-C7) residues. Specifically, the alkyl group is selected from methyl, ethyl, n-propyl, isopropyl, n-butyl, sec-butyl, tert-butyl, cyclopentyl and cyclohexyl groups. Methyl group, ethyl group or n-propyl group is preferable. Methyl group, ethyl group or n-propyl group is preferable. Methyl groups are more particularly preferred. In a particularly preferred embodiment, R A and R B are together an acyl group which forms a cyclic substituent, preferably a 4 to 7 membered cyclic substituent.

특정의 일 구현예에서, 황화제는 화학식(III)에 해당된다:In one particular embodiment, the sulfiding agent corresponds to formula (III):

Figure pct00003
Figure pct00003

(식 중, R1, R3 및 R4는 독립적으로 C1-C20의, 임의의 불포화 또는 방향족의 탄화수소 잔기이며, 바람직하게는 선형 또는 분지형 알킬기 또는 사이클로알킬기임).Wherein R 1 , R 3 and R 4 are independently C 1 -C 20, any unsaturated or aromatic hydrocarbon moiety, preferably a linear or branched alkyl group or a cycloalkyl group.

본 발명에 따른 황화제의 또 다른 특정 구현예에서, R"는 디카복실아미드이다. 본 발명의 구체적인 일 양상에서, 황화제는 화학식(IV)에 해당된다:In another specific embodiment of the sulfiding agent according to the invention, R ″ is dicarboxyamide. In one specific aspect of the invention, the sulfiding agent corresponds to formula (IV):

Figure pct00004
Figure pct00004

(식 중, Z는 -CH2-CH2-, -CH=CH-, -CH2-O-CH2-,

Figure pct00005
로 이루어진 군 중에서 선택되는 기이며, 바람직하게 Z는
Figure pct00006
기임).(Wherein Z is -CH 2 -CH 2- , -CH = CH-, -CH 2 -O-CH 2- ,
Figure pct00005
Group is selected from the group consisting of, preferably Z is
Figure pct00006
Term).

본 발명의 구체적인 제3 목적은 본 발명에 따른 황화제의 합성 방법에 관한 것으로, 상기 방법은 (a) 설퍼릴 할라이드, 바람직하게는 염화 설포릴을 화학식 R-S-C(O)-R2(식 중, R은 앞서 기술한 바와 같고, R2는 유기 잔기로서 바람직하게는 C1-C20 임의의 불포화 또는 방향족 탄화수소 잔기 중에서 선택됨)의 티오아세탈과 반응시켜 화학식 R-S-W (식 중, W는 할로겐이며, 바람직하게는 C1임)의 중간생성물을 생성하는 단계, 및 (b) 상기 중간생성물을 N-설포닐 화합물 또는 N-아실 화합물과 반응시키는 단계를 포함한다. 본 발명의 더 구체적인 구현예에 의하면, 화학식 R1-C(O)-O-CH2-S-C(O)-R2 (식 중, R1 및 R2는 독립적으로 C1-C20 임의의 불포화 또는 방향족 탄화수소 잔기임)의 티오아세탈은 염화 설퍼릴과 반응하여 화학식 R1-C(O)-O-CH2-S-Cl(식 중, R1은 독립적으로 C1-C20, 임의의 불포화 또는 방향족 탄화수소 잔기임)의 중간생성물을 생성한다. 본 발명의 다른 구체적인 구현예에 의하면, 단계 (b)에서 중간생성물은 화학식 R3-S(O)2-NH-R4 (식 중, R3 및 R4는 독립적으로 유기 잔기이며, 바람직하게는 C1-C20 임의의 불포화 또는 방향족 탄화수소 잔기임)의 N-설포닐 화합물과 반응한다.A specific third object of the invention relates to a process for the synthesis of sulfiding agents according to the invention, which process comprises: (a) a sulfuryl halide, preferably sulforyl chloride, of the formula RSC (O) -R 2 R is as previously described, and R 2 is an organic moiety which is preferably reacted with a thioacetal of C 1 -C 20 any unsaturated or aromatic hydrocarbon moiety, wherein the formula RSW (W is halogen, preferably C1), and (b) reacting the intermediate with an N-sulfonyl compound or N-acyl compound. According to a more specific embodiment of the invention, the formula R 1 -C (O) -O-CH 2 -SC (O) -R 2 , wherein R 1 and R 2 are independently C 1 -C 20 any unsaturated or Thioacetals of aromatic hydrocarbon moieties are reacted with sulfuryl chloride to formula R 1 -C (O) -O-CH 2 -S-Cl, wherein R 1 is independently C1-C20, any unsaturated or aromatic Intermediates). According to another specific embodiment of the invention, the intermediate in step (b) is a compound of formula R 3 -S (O) 2 -NH-R 4 Wherein R 3 and R 4 are independently organic moieties and are preferably reacted with N-sulfonyl compounds of C 1 -C 20 any unsaturated or aromatic hydrocarbon moiety.

황화제 합성을 위한 본 발명에 따른 방법에서, 단계 (a)의 반응은 일반적으로 비양성자성 극성 유기 용매 중에, 예를 들면 할로겐화 탄화수소 용매(특히, 염화메틸렌 같은 염소화 탄화수소 용매) 중에 수행된다. In the process according to the invention for the synthesis of sulfiding agents, the reaction of step (a) is generally carried out in an aprotic polar organic solvent, for example in a halogenated hydrocarbon solvent (especially a chlorinated hydrocarbon solvent such as methylene chloride).

황화제 합성을 위한 본 발명에 따른 방법에서, 단계 (a)의 반응은 일반적으로 -80℃ 내지 30℃의 온도에서 수행된다.In the process according to the invention for the synthesis of sulfiding agents, the reaction of step (a) is generally carried out at temperatures of -80 ° C to 30 ° C.

황화제 합성을 위한 본 발명에 따른 방법에서, 단계 (b)의 반응은 일반적으로 비양성자성 극성 유기 용매 중에, 예를 들면 할로겐화 탄화수소 용매(특히, 염화메틸렌 같은 염소화 탄화수소 용매) 중에 수행된다. In the process according to the invention for the sulfiding synthesis, the reaction of step (b) is generally carried out in an aprotic polar organic solvent, for example in halogenated hydrocarbon solvents (especially chlorinated hydrocarbon solvents such as methylene chloride).

황화제 합성을 위한 본 발명에 따른 방법에서, 단계 (b)의 반응은 일반적으로 -20℃ 내지 50℃, 바람직하게는 0℃ 내지 30℃의 온도에서 수행된다.In the process according to the invention for the synthesis of sulfiding agents, the reaction of step (b) is generally carried out at temperatures of -20 ° C to 50 ° C, preferably 0 ° C to 30 ° C.

본 발명의 구체적인 제4 목적은 본 발명에 따른 황화제를 이용하여 올리고뉴클레오타이드를 제조하는 방법에 관한 것이다.A fourth specific object of the present invention relates to a method for preparing oligonucleotides using the sulfiding agent according to the present invention.

일반적으로, 본 발명에 따른 방법은 적어도 (a) 뉴클레오타이드 및 올리고뉴클레오타이드 중에서 선택된 두 반응물질 사이에 인광성 뉴클레오타이드간 결합을 형성하는 커플링 단계 및 (b) 본 발명에 다른 황화제를 사용하여 상기 인광성 뉴클레오타이드간 결합을 황화시키는 단계를 포함한다. 단계 (a) 및 (b)는 황화 올리고뉴클레오타이드의 3' 또는 5'를 탈보호시킨 이후에 반복될 수 있다.In general, the method according to the invention comprises at least (a) a coupling step of forming a phosphorescent internucleotide bond between two reactants selected from nucleotides and oligonucleotides, and (b) the phosphorescence using another sulfiding agent in the present invention. Sulfiding inter-nucleotide bonds. Steps (a) and (b) can be repeated after deprotection of 3 'or 5' of the sulfided oligonucleotide.

바람직하게 상기 제조 방법의 단계 (a)는 H-포스포네이트 모노에스테르염을 보호된 뉴클레오사이드와 커플링시키거나 또는 자유 하이드록시기를 갖는 올리고뉴클레오타이드와 커플링시켜 H-포스포네이트 디에스테르 결합을 형성하는 조작을 포함한다. 이러한 커플링 조작은 바람직하게 용액 상에서 수행된다. Preferably step (a) of the preparation process comprises coupling an H-phosphonate monoester salt with a protected nucleoside or an oligonucleotide having a free hydroxy group to link the H-phosphonate diester Operation to form a. This coupling operation is preferably carried out in solution.

단계 (a)는 바람직하게 극성 비양성자성 유기 용매 중에, 예를 들면 할로겐화 용매 또는 질소-함유 용매, 더 구체적으로 N-헤테로사이클릭 용매 또는 염소화 탄화수소, 훨씬 더 구체적으로는 아세토니트릴 및 피리딘(바람직하게는 피리딘) 중에 수행된다. H-포스포네이트 디에스테르를 형성하는 반응은 바람직하게 카복실산 할라이드, 특히는 염화피발로일(pivaloyl chloride)에 의해 활성화된다.Step (a) is preferably carried out in a polar aprotic organic solvent, for example a halogenated solvent or a nitrogen-containing solvent, more specifically an N-heterocyclic solvent or a chlorinated hydrocarbon, even more specifically acetonitrile and pyridine (preferably Preferably pyridine). The reaction to form the H-phosphonate diester is preferably activated by carboxylic acid halides, in particular pivaloyl chloride.

단계 (a)는 일반적으로 -40℃ 내지 30℃, 바람직하게는 0℃ 내지 20℃의 온도에서 수행된다.Step (a) is generally carried out at a temperature of -40 ° C to 30 ° C, preferably 0 ° C to 20 ° C.

본 발명에 따른 방법의 단계 (a) 및 그 특정 구현예들에서, 액체 반응매질은 일반적으로 반응매질 총 중량에 대해 20 중량% 이상의 H-포스포네이트 올리고뉴클레오타이드를 함유한다. 바람직하게 이 함량은 20% 중량 이상이다. 액체 반응매질은 일반적으로 반응매질 총 중량에 대해 50 중량% 이하의 H-포스포네이트 올리고뉴클레오타이드를 함유한다. In step (a) of the method according to the invention and in certain embodiments thereof, the liquid reaction medium generally contains at least 20% by weight of H-phosphonate oligonucleotide relative to the total weight of the reaction medium. Preferably this content is at least 20% by weight. The liquid reaction medium generally contains up to 50% by weight of H-phosphonate oligonucleotide relative to the total weight of the reaction medium.

단계 (a)의 커플링 생성물, 구체적으로 H-포스포네이트는 단계 (b)에서 단리된 후 황화된다. 바람직하게는 단계 (b)에서 단리 조작 없이 사용될 수도 있다. 형성된 디에스테르의 황화반응은, 적절한 용매에 적합하게 용해된 상태의 황화제를 현장에서 첨가시켜 수행될 수 있거나 또는 반응 혼합물로부터 형성된 디에스테르를 미리 정제시킨 후에 수행될 수 있다.The coupling product of step (a), in particular H-phosphonate, is isolated and then sulfided in step (b). Preferably it may be used without isolation operation in step (b). The sulfidation of the diesters formed may be carried out by in situ addition of sulfiding agents in an appropriately dissolved state in the appropriate solvent or may be carried out after the diesters formed from the reaction mixture have been previously purified.

단계 (b)는 바람직하게 극성 비양성자성 유기 용매 중에, 예를 들면 할로겐화 탄화수소 용매, 구체적으로는 염화메틸렌 같은 염소화 탄화수소 용매를 비롯한 용매 중에 수행된다. 특정 양상에서, 단계 (b)는 할로겐화 탄화수소 용매 및 질소-함유 용매, 더 구체적으로 N-헤테로사이클릭 용매, 바람직하게는 피리딘을 함유한 혼합물 용매에서 수행된다. 구체적으로 단계 (a)의 커플링 생성물이 단리 조작 없이 황화되는 경우에는 피리딘/염화메틸렌 혼합물이 더 특히 바람직하다. Step (b) is preferably carried out in a polar aprotic organic solvent, for example a solvent including a halogenated hydrocarbon solvent, in particular a chlorinated hydrocarbon solvent such as methylene chloride. In certain aspects, step (b) is carried out in a mixture solvent containing a halogenated hydrocarbon solvent and a nitrogen-containing solvent, more specifically an N-heterocyclic solvent, preferably pyridine. More particularly, the pyridine / methylene chloride mixture is more particularly preferred when the coupling product of step (a) is sulfided without isolation operation.

단계 (b)는 일반적으로 -40℃ 내지 30℃, 바람직하게는 0℃ 내지 20℃의 온도에서 수행된다.Step (b) is generally carried out at a temperature of −40 ° C. to 30 ° C., preferably 0 ° C. to 20 ° C.

단계 (b)에서, 황화반응 대상 뉴클레오타이드간 결합의 양에 대한 황화제의 몰비는 일반적으로 1 이상, 종종 1.5 내지 4.0, 바람직하게는 2.0 내지 3.0이다.In step (b), the molar ratio of the sulfiding agent to the amount of internucleoside linkages to be sulfided is generally at least 1, often 1.5 to 4.0, preferably 2.0 to 3.0.

단계 (b)에서, 중간생성물인 H-포스포네이트 디에스테르는 바람직하게 활성제, 특히는 염기에 의해 활성화된다. 적합한 염기로는 알킬아민, 구체적으로 3차 알킬아민이 포함되며, 디이소프로필에틸아민이 바람직하다. In step (b), the intermediate H-phosphonate diester is preferably activated by an active agent, in particular a base. Suitable bases include alkylamines, specifically tertiary alkylamines, with diisopropylethylamine being preferred.

제5 양상에서, 본 발명은, 앞서 본원에 기술한 바와 같이 하나 이상의 P-S-R 결합을 가진 본 발명에 따른 올리고뉴클레오타이드의 정제 방법에 관한 것이다. 본 양상의 일 구현예에 의하면, 상기 방법은 적어도 제2 올리고뉴클레오타이드를 침전시키는 단계를 포함한다. 더 구체적인 구현예에 의하면, 본 방법은 제2 올리고뉴클레오타이드를, 특히는 침전 단계로부터 회수된 고체 물질로부터, 용매를 이용하여 추출하는 단계를 더 포함한다. 추출용으로 적합한 용매로는 극성 유기 용매가 포함된다.In a fifth aspect, the present invention relates to a method for purifying oligonucleotides according to the present invention having one or more P-S-R bonds as described herein above. According to one embodiment of this aspect, the method comprises precipitating at least a second oligonucleotide. According to a more specific embodiment, the method further comprises extracting the second oligonucleotide with a solvent, in particular from the solid material recovered from the precipitation step. Suitable solvents for extraction include polar organic solvents.

이러한 정제는 본 발명의 방법에 따라 수득되는 보호된 올리고뉴클레오타이드의 침전 및 추출 기법을 조합시킴으로써 효과적으로 달성할 수 있는 것으로 밝혀졌다. 주어진 올리고뉴클레오타이드의 서열 및 길이를 고려하여 침전을 위한 정확한 조건을 결정할 수 있다. 침전법은 일반적으로 (a) 올리고뉴클레오타이드를 극성 유기 용매에 용해시키는 단계, 및 (b) 용액이 탁하게 될 때까지 비극성 유기 용매를 첨가하는 단계를 포함한다.It has been found that such purification can be effectively achieved by combining the precipitation and extraction techniques of the protected oligonucleotides obtained according to the process of the invention. The exact conditions for precipitation can be determined by considering the sequence and length of a given oligonucleotide. Precipitation generally comprises (a) dissolving oligonucleotides in a polar organic solvent, and (b) adding a nonpolar organic solvent until the solution becomes cloudy.

본 발명에 따른 올리고뉴클레오타이드는 일반적으로 침전을 통해 단리 및 정제될 수 있다는 것이 밝혀졌다. It has been found that oligonucleotides according to the invention can generally be isolated and purified via precipitation.

단계 (a)에서 올리고뉴클레오타이드를 용해시키는데 사용되는 용매는 바람직하게 염화메틸렌 및 클로로포름 같은 할로겐화 탄화수소; 아세토니트닐 및 피리딘 같은 질소-함유 용매; 및 아세톤 같은 카보닐-함유 용매 중에서 선택된다. The solvent used to dissolve the oligonucleotides in step (a) is preferably a halogenated hydrocarbon such as methylene chloride and chloroform; Nitrogen-containing solvents such as acetonitrile and pyridine; And carbonyl-containing solvents such as acetone.

일반적으로, 단계 (a)에서, 약 0.5(n+1)mL 내지 약 2.0(n+1)mL의 범위 내, 바람직하게는 약 1.0(n+1)mL (n은 포스포로티오에이트 트리에스테르 결합의 밀리몰 수임)의 용매 부피가 사용된다. Generally, in step (a), in the range of about 0.5 (n + 1) mL to about 2.0 (n + 1) mL, preferably about 1.0 (n + 1) mL, where n is phosphorothioate triester Solvent volume) is used.

제2 올리고뉴클레오타이드의 용액이 탁해질 때까지, 용액을 바람직하게는 탄화수소, 예를 들어, 헥산 같은 알칸 용매, 특히 MTBE 같은 에테르 용매 및 이들의 혼합물 (예컨대, 바람직하게는 헥산/MTBE 혼합물) 중에서 선택된 비극성 유기 용매로 처리한다. 다른 특정 구현예에서는, 이렇게 얻은 탁한 용액을 후속으로 침전보조제로 처리한다. Until the solution of the second oligonucleotide becomes cloudy, the solution is preferably selected from hydrocarbons such as alkanes solvents such as hexanes, in particular ether solvents such as MTBE and mixtures thereof (eg preferably hexane / MTBE mixtures) Treated with nonpolar organic solvent. In another specific embodiment, the turbid solution thus obtained is subsequently treated with a precipitation aid.

이러한 경우, 침전보조제는 일반적으로 비활성 다공성 고체 중에서 선택되며, 바람직하게는 셀라이트, 석탄, 목재셀룰로오스, 및 실리카 또는 알루미나 같은 크로마토그래피 고정상 중에서 선택된다.In this case, the precipitation aid is generally selected from inert porous solids, preferably from celite, coal, wood cellulose, and chromatographic stationary phases such as silica or alumina.

이러한 경우, 침전보조제는 일반적으로 약 0.25(n+1)g 내지 약 1.5(n+1)g의 범위 내, 바람직하게는 약 0.75(n+1)g (n은 포스포로티오에이트 트리에스테르 결합의 밀리몰 수임)의 양으로 사용된다.In this case, the precipitation aid is generally in the range of about 0.25 (n + 1) g to about 1.5 (n + 1) g, preferably about 0.75 (n + 1) g (n is a phosphorothioate triester bond) In the millimolar number).

바람직하게, 침전보조제를 첨가하고 난 후 혼합물을 앞서 기술된 바와 같은 비극성 유기 용매의 제2분획으로 처리한다. 상기 분획의 부피는 일반적으로 약 1(n+1)mL 내지 약 4(n+1)mL의 범위에 속하며, 바람직하게는 약 2.0(n+1)mL (n은 포스포로티오에이트 트리에스테르 결합의 밀리몰 수임)이다. Preferably, after addition of the precipitation aid, the mixture is treated with a second fraction of nonpolar organic solvent as described above. The volume of the fraction generally falls in the range of about 1 (n + 1) mL to about 4 (n + 1) mL, preferably about 2.0 (n + 1) mL (n is a phosphorothioate triester bond) Millimolar number).

침전 이후, 특히는 침전보조제를 사용한 경우, 결과로 얻은 혼합물은 일반적으로 고액분리(solid/liquid separation) 조작(바람직하게는 여과 조작)을 거치게 된다. 일반적으로 올리고뉴클레오타이드는 고액분리 조작으로부터 회수되는 고체로부터 회수되며, 특히는 극성 유기 용매를 이용한 추출법에 의해 침전보조제로부터 회수되며, 이때 극성 유기 용매는 바람직하게 카보닐형 용매(예컨대, 아세톤), 질소-함유 용매(예컨대, 아세토니트릴) 및 할로겐화 탄화수소(예컨대, 염화메틸렌 및 클로로포름) 중에서 선택된다. After precipitation, in particular when using a precipitation aid, the resulting mixture is generally subjected to a solid / liquid separation operation (preferably a filtration operation). Oligonucleotides are generally recovered from the solids recovered from the solid-liquid separation operation, in particular from the precipitation aid by extraction with a polar organic solvent, wherein the polar organic solvent is preferably a carbonyl solvent (eg acetone), nitrogen- Containing solvents such as acetonitrile and halogenated hydrocarbons such as methylene chloride and chloroform.

상기 침전 처리로부터 얻은 올리고뉴클레오타이드는 유기 용매 및 물 사이를 분리(partitioning)시킴으로써 더 정제될 수 있다. 이 단계는 보통 수용액층에 용해되는 극성 불순물을 생성물로부터 분리시킨다. 본 구현예에서, 올리로뉴클레오타이드가 적합하게는 유기 용매 중에, 구체적으로는 질소-함유 용매 같은 극성 유기 용매, 특히 아세토니트릴, DMF 같은 포름아미드, 피리딘 같은 N-헤테로사이클, 아세톤 같은 카보닐형 용매, 또는 THF 또는 DMSO 중에 용해된다.Oligonucleotides obtained from the precipitation treatment can be further purified by partitioning between the organic solvent and water. This step usually separates the polar impurities from the product that are dissolved in the aqueous solution layer. In this embodiment, the oligonucleotides are suitably in organic solvents, in particular polar organic solvents such as nitrogen-containing solvents, in particular formamides such as acetonitrile, DMF, N-heterocycles such as pyridine, carbonyl solvents such as acetone, Or in THF or DMSO.

사용되는 유기 용매의 부피는 일반적으로 약 2.0(n+1)mL 내지 약 8.0(n+1)mL의 범위에 속하며, 바람직하게는 약 4.0(n+1)mL (n은 포스포로티오에이트 트리에스테르 결합의 밀리몰 수임)이다. 수성 매질, 구체적으로는 물을 이용하여 용액을 처리한다. 사용되는 수성매질의 부피는 일반적으로 유기 용매의 약 0.5 당량 부피 내지 약 1.5 당량 부피로, 보통은 유기 용매의 약 0.7 당량 부피이다. 수성매질을 이용한 처리가 끝나면, 올리고뉴클레오타이드-함유 층은 일반적으로 분리되며, 적절하다면, 추가 처리하여 정제된 올리고뉴클레오타이드를 얻을 수 있다.The volume of organic solvent used is generally in the range of about 2.0 (n + 1) mL to about 8.0 (n + 1) mL, preferably about 4.0 (n + 1) mL (n is phosphorothioate tree Millimolar number of ester bonds). The solution is treated with an aqueous medium, specifically water. The volume of aqueous medium used is generally from about 0.5 equivalent volumes to about 1.5 equivalent volumes of organic solvent, usually about 0.7 equivalent volumes of organic solvent. At the end of the treatment with the aqueous medium, the oligonucleotide-containing layer is generally separated and, if appropriate, can be further processed to obtain purified oligonucleotides.

본 발명의 구체적인 제6 목적은 하나 이상의 포스포티오에이트기를 갖는 제2 올리고뉴클레오타이드를 제조하는 방법에 관한 것으로, 상기 방법은 (a) 본 발명에 따른 제1 올리고뉴클레오타이드를 제공하는 단계, 및 (b) 상기 제1 올리고뉴클레오타이드로부터 하나 이상의 R기를 절단시켜 하나 이상의 티오포스페이트 결합을 갖는 상기 제2 올리고뉴클레오타이드를 생성하는 단계를 포함한다. 본 발명의 일부 특정 구현예에서, R기는 용액상 제1 올리고뉴클레오타이드를 염기와 반응시켜 절단되며, 이때 염기는 바람직하게 알킬, 사이클로알킬 및 방향족 아민 중에서; 더 바람직하게는 일차 아민, 예를 들어 알킬기가 C1 내지 C8 선형 또는 분지형 알킬 중에서 바람직하게 선택되는 동일하거나 상이한 치환기들을 포함하는 알킬 일차 아민, 또는 이차 알킬아민 중에서; 가장 바람직하게는 n-프로필 및 터트-부틸 아민 중에서 선택되고, 바람직하게 염기는 장애 일차 아민이다.A sixth specific object of the present invention relates to a method for preparing a second oligonucleotide having at least one phosphothioate group, the method comprising the steps of (a) providing a first oligonucleotide according to the present invention, and (b Cutting at least one R group from the first oligonucleotide to produce the second oligonucleotide having at least one thiophosphate bond. In some specific embodiments of the invention, the R group is cleaved by reacting the solution phase first oligonucleotide with a base, wherein the base is preferably in alkyl, cycloalkyl and aromatic amine; More preferably primary amines, for example alkyl primary amines, or secondary alkylamines, wherein the alkyl group comprises the same or different substituents preferably selected from C1 to C8 linear or branched alkyl; Most preferably selected from n-propyl and tert-butyl amines, preferably the base is a hindered primary amine.

특정의 일 구현예에 의하면, 본 발명의 제6 양상에 따른 절단 단계는 입체 장애 염기, 및 일반적으로 N-헤테로방향족 염기로 이루어진 활성제의 존재 하에 수행된다. 바람직하게 활성제는 1,2,4-트리아졸 또는 기타 트리아졸 및 테트라졸 유도체이고, 더 바람직하게 이러한 활성제는 입체 장애 염기, 구체적으로 터트-부틸 아민과 함께 사용된다.According to one particular embodiment, the cleavage step according to the sixth aspect of the invention is carried out in the presence of an sterically hindered base and an active agent which generally consists of an N-heteroaromatic base. Preferably the active agent is 1,2,4-triazole or other triazole and tetrazole derivatives, more preferably such active agent is used in combination with sterically hindered bases, in particular tert-butyl amine.

S-메틸렌-에스테르, -카보네이트 또는 -카바메이트 기의 탈보호는 예를 들면 보호된 뉴클레오타이드를 예컨대 t-부틸아민 같은 입체 장애 염기를 이용하여 처리함으로써 달성할 수 있다. 이들 벌크형 아민이 특히 선택성이 높은데 그 이유는 이들이 핵염기, 특히 카보닐 산소 위치에서 보호된 핵염기와 반응하지 않기 때문이다. 이들 아민은 실제로 핵염기 부분과의 가능한 부가 반응(side-reaction)을 제한하거나 또는 실질적으로 방지시킨다. 표준 조건 하에서 입체 장애 아민과, 예를 들면, S-메틸렌프로파노에이트와의 반응도를 향상시키기 위해, 활성제를 적절하게 첨가시킬 수 있다는 것이 밝혀졌다. 적합한 활성제의 예로는 N-헤테로사이클릭 염기, 예컨대, 디아졸, 트리아졸, 및 이들의 유도체가 포함된다. 본 구현예는 특히 신속하고 효율적인 청정(clean) 탈보호 반응을 가능하게 한다.Deprotection of S-methylene-ester, -carbonate or -carbamate groups can be achieved, for example, by treating the protected nucleotides with sterically hindered bases such as t-butylamine. These bulk amines are particularly highly selective because they do not react with nucleobases, especially nucleobases protected at the carbonyl oxygen position. These amines actually limit or substantially prevent possible side-reaction with the nucleobase moiety. It has been found that the active agent can be appropriately added to improve the reactivity of the hindered amine with, for example, S-methylenepropanoate under standard conditions. Examples of suitable active agents include N-heterocyclic bases such as diazoles, triazoles, and derivatives thereof. This embodiment enables particularly rapid and efficient clean deprotection reactions.

본 발명의 일부 구현예에서, 탈보호 방법은 치환된 아닐린을 염기로 이용하며, 여기서 아닐린의 아릴기는 선형 또는 분지형 알킬 또는 아릴 치환기를 제2 및/또는 6 위치에 함유(예컨대, 2,6-디메틸아닐린 및 2,6-디에틸아닐린)한다.In some embodiments of the invention, the deprotection method utilizes substituted anilines as bases, wherein the aryl groups of the anilines contain linear or branched alkyl or aryl substituents in the second and / or 6 positions (eg, 2,6). Dimethylaniline and 2,6-diethylaniline).

제6 양상에 따른 탈보호 방법은 바람직하게 비양성자성 극성 유기 용매 중에, 예를 들면 질소-함유 용매 중에, 더 구체적으로는 N-헤테로사이클릭 용매 (바람직하게는 피리딘) 중에 수행된다.The deprotection process according to the sixth aspect is preferably carried out in an aprotic polar organic solvent, for example in a nitrogen-containing solvent, more specifically in an N-heterocyclic solvent (preferably pyridine).

제6 양상에 따른 탈보호 방법은 일반적으로 -10℃ 내지 50℃, 바람직하게는 0℃ 내지 30℃의 온도에서 수행된다.The deprotection method according to the sixth aspect is generally carried out at a temperature of -10 ° C to 50 ° C, preferably 0 ° C to 30 ° C.

본 발명의 제6 양상 및 그의 특정 구현예들에서, 액체 반응매질은 일반적으로 반응매질 총 중량에 대해 20 중량% 이상의 제1 올리고뉴클레오타이드를 함유한다. 바람직하게 이 함량은 50 중량% 이상이다.In a sixth aspect of the invention and certain embodiments thereof, the liquid reaction medium generally contains at least 20% by weight of the first oligonucleotide relative to the total weight of the reaction medium. Preferably this content is at least 50% by weight.

본 발명의 제6 양상에서, 사용되는 염기의 양은 일반적으로 5n mmol 내지 15n mmol의 범위에 속하며, 바람직하게는 약 10n mmol (n은 포스포로티오에이트 트리에스테르 결합의 밀리몰 수임)이다. In a sixth aspect of the invention, the amount of base used is generally in the range of 5n mmol to 15n mmol, preferably about 10n mmol (n is the millimolar number of phosphorothioate triester bonds).

본 발명의 제6 양상에서 활성제를 사용하는 경우에, 사용되는 활성제의 양은 일반적으로 0.5n mmol 내지 3n mmol의 범위에 속하며, 바람직하게는 1.5n mmol (n은 포스포로티오에이트 트리에스테르 결합의 밀리몰 수임)이다. In the case of using the active agent in the sixth aspect of the present invention, the amount of active agent used generally falls in the range of 0.5n mmol to 3n mmol, preferably 1.5n mmol (n is millimolar of phosphorothioate triester bond) Commission).

하기의 실시예들은 본 발명을 예시하고자 함이며, 본 발명의 범주를 제한하고자 함이 아니다. The following examples are intended to illustrate the invention and are not intended to limit the scope of the invention.

이들 실시예 및 본 명세서에 걸쳐 사용된 약자들의 정의는 다음과 같다:The definitions of these examples and abbreviations used throughout this specification are as follows:

CH2Cl2는 디클로로메탄, KI는 요오드화칼륨, Na2S2O3은 나트륨 티오설페이트, DME는 디메톡시에탄, DIPEA는 디이소프로필에틸아민, NaCl은 염화나트륨, MTBE는 메틸 터트-부틸 에테르, EtOAc는 에틸아세테이트, HCl은 염산, Na2SO4는 황산나트륨, N2는 이질소(dinitrogen), Br2는 브롬, SO2Cl2는 염화티오닐, NaHCO3은 중탄산나트륨, CDCl3은 중수소치환된 클로로포름, THF는 테트라하이드로퓨란, DMSO는 디메틸설폭사이드, DMF는 N,N-디메틸포름아미드이다.CH 2 Cl 2 is dichloromethane, KI is potassium iodide, Na 2 S 2 O 3 is sodium thiosulfate, DME is dimethoxyethane, DIPEA is diisopropylethylamine, NaCl is sodium chloride, MTBE is methyl tert-butyl ether, EtOAc is ethyl acetate, HCl is hydrochloric acid, Na 2 SO 4 is sodium sulfate, N 2 is dinitrogen, Br 2 is bromine, SO 2 Cl 2 is thionyl chloride, NaHCO 3 is sodium bicarbonate, CDCl 3 is deuterated Chloroform, THF is tetrahydrofuran, DMSO is dimethylsulfoxide, and DMF is N, N-dimethylformamide.

Ap, Gp, Tp는 전술된 바와 같이 A, G 및 T 핵염기에 각각 연결된 전술된 바와 같은 2-디옥시리보오스 핵염기이며, 이때 A, G 및 T는 다음과 같이 보호된다:Ap, Gp, Tp are the 2-deoxyribose nucleobases as described above linked to A, G and T nucleobases respectively as described above, wherein A, G and T are protected as follows:

Ap는 A가 N-(퓨린-6-일)벤즈아미드인 2-디옥시리보오스 핵염기이고, Gp는 G가 N-(6-(2,5-디클로로펜옥시)-퓨린-2-일)이소부티르아미드인 2-디옥시리보오스 핵염기이고, Tp는 T가 5-메틸-4-펜옥시피리미딘-2-온인 핵염기이다. Ap is a 2-dioxyribose nucleobase where A is N- (purin-6-yl) benzamide, and Gp is G-N- (6- (2,5-dichlorophenoxy) -purin-2-yl) isopart It is a 2-dioxyribose nucleobase which is a tyramide, and Tp is a nucleobase whose T is 5-methyl-4- phenoxypyrimidin-2-one.

Ap(S), Gp(S) 및 Tp(S)는 전술된 바와 같이 각각 Ap, Gp 및 Tp에 대응되는 4'O-P-티오메틸 프로피오네이트이다. Ap(H), Gp(H) 및 Tp(H)는 전술된 바와 같이 각각 Ap, Gp 및 Tp에 대응되는 4'O-P-H 프로피오네이트이다. Ap (S), Gp (S) and Tp (S) are 4'O-P-thiomethyl propionate corresponding to Ap, Gp and Tp, respectively, as described above. Ap (H), Gp (H) and Tp (H) are 4'O-P-H propionates corresponding to Ap, Gp and Tp, respectively, as described above.

DMTr은 당업자에 공지되어 있는 비스 파라-메톡시 트리틸 보호기이며, 해당 올리고뉴클레오타이드에 결합되는 경우에 전술된 바와 같이 올리고뉴클레오타이드의 5-O'에 결합된다. Lev는 당업자에 공지되어 있는 펜탄 1,4-디온 보호기이며, 해당 올리고뉴클레오타이드에 결합되는 경우에 전술된 바와 같이 올리고뉴클레오타이드의 3-O'에 결합된다. DMTr is a bis para-methoxy trityl protecting group known to those skilled in the art and when bound to the corresponding oligonucleotide is bound to 5-O 'of the oligonucleotide as described above. Lev is a pentane 1,4-dione protecting group known to those skilled in the art and when bound to the corresponding oligonucleotide, is bound to 3-O 'of the oligonucleotide as described above.

본 발명의 명세서에서 사용된 약어들이 쓰이는 관행을 하기의 반응식들을 통해 더 설명하기로 한다.The practice of using the abbreviations used in the specification of the present invention will be further explained through the following schemes.

Figure pct00007
Figure pct00007

Figure pct00008
Figure pct00008

실시예Example 1:  One: 비스Vis -- 클로로메틸Chloromethyl 디설파이드의Disulfide 합성 synthesis

Figure pct00009
Figure pct00009

1.0 L의 환저 플라스크에 무수 CH2Cl2(200 mL)와 디메틸 디설파이드(27.1mL, 300 mmol)을 투입하였다. 혼합물을 교반시키고 질소 분위기 하에 -78℃까지 냉각시키고, 교반된 혼합물에 걸쳐 염소(Cl2) 기체의 거품을 서서히 발생시켰다. 혼합물이 황색을 띤 녹색 슬러리로 변하였을 때 염소 기체의 첨가를 멈추었다. 저온조(cold bath)를 제거하고 혼합물은 실온까지 자연스럽게 승온되도록 하였다. HCl 진화(evolution) 현상이 용액에서 사라지자 적색 용액이 형성되었다. 혼합물을 먼저 15분 동안 질소로 기포처리하고 이어서 회전증발시켜 휘발성 CH2Cl2를 제거하였다. 잔류물에는 새로운 CH2Cl2(300 mL)를 첨가하였다. 이렇게 얻은 용액을 얼음-물 조 내에서 교반하고, 물(200 mL)에 용해된 KI(139.4g, 840 mmol) 수용액을 서서히 15분에 걸쳐 첨가하였다. 저온조를 제거하고 혼합물을 2 시간 동안 상온에서 교반하였다. 유기층을 분리하고 얼음-물 조 내에서 교반하였으며; I2의 색깔이 사라질 때까지 포화 Na2S2O3 수용액을 서서히 첨가하였다. 유기층을 분리한 후에 물(100 mL)로 세척하였다. 유기층을 Na2SO4 상에서 건조한 후에 농축시켜 생성물(42.2g)을 적색 오일 형태로 수득하였다. 수율: 87.3%. 이렇게 얻은 조생성물을 추가 정제없이 다음 단계를 위해 사용하였다.Anhydrous CH 2 Cl 2 (200 mL) and dimethyl disulfide (27.1 mL, 300 mmol) were added to a 1.0 L round bottom flask. The mixture was stirred and cooled to −78 ° C. under a nitrogen atmosphere, and bubbles of chlorine (Cl 2 ) gas were slowly generated over the stirred mixture. The addition of chlorine gas was stopped when the mixture turned to a yellowish green slurry. The cold bath was removed and the mixture was allowed to warm naturally to room temperature. When the HCl evolution disappeared from the solution, a red solution formed. The mixture was first bubbled with nitrogen for 15 minutes and then rotary evaporated to remove volatile CH 2 Cl 2 . To the residue was added fresh CH 2 Cl 2 (300 mL). The solution thus obtained was stirred in an ice-water bath, and an aqueous solution of KI (139.4 g, 840 mmol) dissolved in water (200 mL) was slowly added over 15 minutes. The cold bath was removed and the mixture was stirred at room temperature for 2 hours. The organic layer was separated and stirred in an ice-water bath; Saturated aqueous Na 2 S 2 O 3 solution was slowly added until the color of I 2 disappeared. The organic layer was separated and washed with water (100 mL). The organic layer was dried over Na 2 S0 4 and concentrated to give the product (42.2 g) in the form of a red oil. Yield: 87.3%. The crude product thus obtained was used for next step without further purification.

실시예Example 2:  2: 비스(프로피오닐옥시메틸)디설파이드의Of bis (propionyloxymethyl) disulfide 합성 synthesis

Figure pct00010
Figure pct00010

1.0 L의 환저 플라스크에 요오드화나트륨(1.50g, 10.0 mmol), 비스-클로로메틸 디설파이드(16.2g, 100 mmol) 및 무수 DME(150 mL)를 투입하였다. 20분 동안 실온에서 교반시킨 후에, 혼합물을 얼음-물 조에서 냉각시키고, 이어서 DIPEA(42.0 mL, 240 mmol)를 첨가한 후, 프로피온산(16.4 mL, 220 mmol)을 첨가하였다. 저온조를 제거하고 혼합물을 18 시간 동안 실온에서 교반하였다. 회전 증발법에 의해 용매 덩어리(bulk)를 제거하였다. 잔류물에 에틸아세테이트(400 mL)를 첨가하고, 혼합물을 물(150 mL x 2)로 세척하고, 이어서 염수(brine)(80 mL)로 세척하였다. 유기층을 농축시키고 잔류물을 실리카 겔 크로마토그래피에 의해 정제시켜 원하는 생성물(9.62g)을 주황색 오일 형태로 수득하였다. 수율: 40.4%.To a 1.0 L round bottom flask was added sodium iodide (1.50 g, 10.0 mmol), bis-chloromethyl disulfide (16.2 g, 100 mmol) and anhydrous DME (150 mL). After stirring for 20 minutes at room temperature, the mixture was cooled in an ice-water bath and then DIPEA (42.0 mL, 240 mmol) was added followed by propionic acid (16.4 mL, 220 mmol). The cold bath was removed and the mixture was stirred for 18 hours at room temperature. Solvent bulk was removed by rotary evaporation. Ethyl acetate (400 mL) was added to the residue, and the mixture was washed with water (150 mL x 2), followed by brine (80 mL). The organic layer was concentrated and the residue was purified by silica gel chromatography to give the desired product (9.62 g) in the form of orange oil. Yield 40.4%.

실시예Example 3: N- 3: N- 메틸methyl 메탄설폰아미드의Methanesulfonamide 합성 synthesis

Figure pct00011
Figure pct00011

얼음-물 조에서 냉각되고 교반된 수성 메틸아민(물 중에 40%, 152 mL, 1.75 mol)에 염화메탄설포닐(38.7 mL, 500 mmol)을 15분에 걸쳐 적가하였다. 첨가시 내부온도를 20 내지 24℃에 유지하였다. 첨가가 끝나면, 저온조를 제거하고 혼합물은 밤새 실온에서 교반하였다. NaCl(40g)을 첨가하고 혼합물을 30분 동안 실온에서 교반하였다. CH2Cl2(150 mL, 100 mL x 2)를 이용하여 혼합물을 추출하였다. Na2SO4 상에서 건조시킨 후, 용매를 증발시켜 원하는 생성물(48.7g)을 무색의 오일 형태로 수득하였다. 수율: 89.2%.To the cooled and stirred aqueous methylamine (40% in water, 152 mL, 1.75 mol) in an ice-water bath was added dropwise over 15 minutes methanesulfonyl chloride (38.7 mL, 500 mmol). The internal temperature was maintained at 20-24 ° C. upon addition. At the end of the addition, the cold bath was removed and the mixture was stirred overnight at room temperature. NaCl (40 g) was added and the mixture was stirred for 30 minutes at room temperature. The mixture was extracted using CH 2 Cl 2 (150 mL, 100 mL × 2). After drying over Na 2 SO 4 , the solvent was evaporated to afford the desired product (48.7 g) as a colorless oil. Yield 89.2%.

실시예Example 4: N- 4: N- 메틸methyl -N--N- 프로피오닐옥시메틸설파닐Propionyloxymethylsulfanyl 메탄설폰아미드의Methanesulfonamide 합성 synthesis

Figure pct00012
Figure pct00012

건조된 100 mL 환저 플라스크에 N-메틸 메탄설폰아미드(1.09g, 10.0 mmol), 피리딘(1.66g, 21.0 mmol), 비스(프로피오닐옥시메틸)디설파이드(1.2g, 5.0 mmol) 및 무수 CH2Cl2(8 mL)를 투입하였다. 혼합물을 질소 하에 실온에서 교반하고, 4 mL의 CH2Cl2에 용해된 Br2(0.882g, 5.52 mmol) 용액을 30분에 걸쳐 적가하였다. 그 결과로 얻은 혼합물을 2시간 동안 실온에서 교반하였다. MTBE(15 mL)를 첨가하고 얻은 혼합물을 여과시켰다. 고형물을 CH2Cl2(5 mL) 및 MTBE(5 mL)의 혼합물로 세척하였다. 여과액을 농축시키고 실리카 겔 크로마토그래피에 의해 정제시켜 원하는 생성물(1.62g)을 무색 오일 형태로 수득하였다. 수율: 71.3%.In a dried 100 mL round bottom flask, N-methyl methanesulfonamide (1.09 g, 10.0 mmol), pyridine (1.66 g, 21.0 mmol), bis (propionyloxymethyl) disulfide (1.2 g, 5.0 mmol) and anhydrous CH 2 Cl 2 (8 mL) was added. The mixture was stirred at room temperature under nitrogen and a solution of Br 2 (0.882 g, 5.52 mmol) dissolved in 4 mL of CH 2 Cl 2 was added dropwise over 30 minutes. The resulting mixture was stirred for 2 hours at room temperature. MTBE (15 mL) was added and the resulting mixture was filtered. The solid was washed with a mixture of CH 2 Cl 2 (5 mL) and MTBE (5 mL). The filtrate was concentrated and purified by silica gel chromatography to give the desired product (1.62 g) in the form of a colorless oil. Yield: 71.3%.

실시예Example 5:  5: 클로로메틸Chloromethyl 프로피오네이트의Propionate 합성 synthesis

Figure pct00013
Figure pct00013

건조된 500 mL 환저 플라스크에 파라포름알데하이드(90.1g, 3000.0 mmol), 무수 염화아연(8.18g, 60.0 mmol)을 투입하였다. 용기를 얼음-물 조에 놓고, 염화프로피오닐(260.6 mL, 3000.0 mmol)을 1시간에 걸쳐 서서히 첨가하였다. 첨가가 끝나면, 혼합물을 질소 하에 18시간 동안 50℃에서 교반하였다. 혼합물을 증류시켜 원하는 생성물(212.2g)을 무색의 오일 형태로 수득하였다. 수율: 58%.Paraformaldehyde (90.1 g, 3000.0 mmol) and anhydrous zinc chloride (8.18 g, 60.0 mmol) were added to a dried 500 mL round bottom flask. The vessel was placed in an ice-water bath and propionyl chloride (260.6 mL, 3000.0 mmol) was added slowly over 1 hour. After the addition, the mixture was stirred at 50 ° C. for 18 hours under nitrogen. The mixture was distilled off to give the desired product (212.2 g) in the form of a colorless oil. Yield 58%.

실시예Example 6: 프로피온산  6: propionic acid 아세틸설파닐메틸Acetylsulfanylmethyl 에스테르의 합성 Synthesis of Ester

Figure pct00014
Figure pct00014

기계식 교반기, 적가 깔때기 및 질소 주입구가 구비된 건조한 2000 mL 3구 환저 플라스크에, 클로로메틸 프로피오네이트(168.0g, 1370.9 mmol), 무수 CH2Cl2(1000 mL), 및 디이소프로필에틸아민(194.9g, 1508.0 mmol)을 투입하였다. 이 용액을 교반하고 얼음-물 조에서 냉각시킨 후, 여기에 티오아세트산(98.0 mL, 1370.9 mmol)을 서서히 30분에 걸쳐 첨가하였다. 첨가가 끝나면, 혼합물을 교반하고 실온까지 서서히 승온시키고, 밤새 실온에서 교반하였다. 대부분의 CH2Cl2를 회전증발시켰다. 이렇게 얻은 혼합물에, 에틸아세테이트(500 mL) 및 MTBE(500 mL)의 혼합물을 첨가하였다. 혼합물을 여과시키고, 고형물을 에틸아세테이트(100 mL) 및 MTBE(100 mL)의 혼합물로 세척하였다. 여과액을 농축시키고, 잔류물을 증류시켜 원하는 생성물(169.8g)을 황색 오일 형태로 수득하였다. 수율: 76.4%.In a dry 2000 mL three neck round bottom flask equipped with a mechanical stirrer, dropping funnel and nitrogen inlet, chloromethyl propionate (168.0 g, 1370.9 mmol), anhydrous CH 2 Cl 2 (1000 mL), and diisopropylethylamine ( 194.9 g, 1508.0 mmol) was added thereto. After the solution was stirred and cooled in an ice-water bath, thioacetic acid (98.0 mL, 1370.9 mmol) was slowly added over 30 minutes. After the addition, the mixture was stirred and slowly warmed up to room temperature and stirred overnight at room temperature. Most of CH 2 Cl 2 was evaporated. To the mixture thus obtained, a mixture of ethyl acetate (500 mL) and MTBE (500 mL) was added. The mixture was filtered and the solid was washed with a mixture of ethyl acetate (100 mL) and MTBE (100 mL). The filtrate was concentrated and the residue was distilled to afford the desired product (169.8 g) in the form of a yellow oil. Yield: 76.4%.

실시예Example 7: N- 7: N- 메틸methyl -N--N- 프로피오닐옥시메틸설파닐Propionyloxymethylsulfanyl 메탄설폰아미드의Methanesulfonamide 합성 synthesis

Figure pct00015
Figure pct00015

건조한 1000 mL 환저 플라스크에 프로피온산 아세틸설파닐메틸 에스테르(70.0g, 431.5 mmol), 무수 CH2Cl2(600 mL)을 투입하였다. 용액을 질소 하에 얼음-물 조에서 교반하고, 염화 설퍼릴(34.6 mL, 431.5 mmol)을 첨가하였다. 첨가가 끝나면, 저온조를 제거하고 혼합물은 1.5시간 동안 실온에서 교반하였다. 혼합물을 회전증발시켜 모든 휘발성 물질을 제거하였다. 잔류물을 80 mL의 무수 CH2Cl2에 용해시켜 용액 A를 수득하였다.Propionate acetylsulfanylmethyl ester (70.0 g, 431.5 mmol) and anhydrous CH 2 Cl 2 (600 mL) were added to a dry 1000 mL round bottom flask. The solution was stirred in an ice-water bath under nitrogen and sulfuryl chloride (34.6 mL, 431.5 mmol) was added. After the addition, the cold bath was removed and the mixture was stirred for 1.5 hours at room temperature. The mixture was rotovap to remove all volatiles. The residue was dissolved in 80 mL of anhydrous CH 2 Cl 2 to give solution A.

다른 건조한 1000 mL 환저 플라스크에 N-메틸 메탄설폰아미드(49.5g, 453.1 mmol), 분자체(4Å, 활성화됨, 5.0g) 및 무수 CH2Cl2(200 mL)를 첨가하였다. 용액을 질소 하에 얼음-물 조에서 교반하고, 무수 피리딘(41.9 mL, 517.8 mmol)을 첨가하였다. 첨가가 끝나면, 상기 용액 A를 15분에 걸쳐 서서히 첨가하였다. 그 결과로 얻은 혼합물을 1.5시간 동안 실온에서 교반하였다. 헥산(200 mL)을 서서히 첨가한 후 얻은 혼합물을 10분 동안 실온에서 교반하였다. 혼합물을 여과시키고, 고형물을 에틸아세테이트: 헥산 = 1:1(80 mL) 혼합물로 세척하였다. 여과액을 농축시키고, 잔류물을 컬럼 상에서 800g의 실리카와, (헥산(2 리터), 에틸아세테이트/헥산(1:9, 3 리터), 에틸아세테이트/헥산(2:8, 4 리터) 및 에틸아세테이트/헥산(3:7, 2 리터) 순서의) 용리액을 이용하여 정제시켰다. 주요 불순물은 20% 에틸아세테이트에서 용출되었고 생성물은 30% 에틸아세테이트에서 용출되었다. 수율: 74.4%.To another dry 1000 mL round bottom flask was added N-methyl methanesulfonamide (49.5 g, 453.1 mmol), molecular sieve (4 cc, activated, 5.0 g) and anhydrous CH 2 Cl 2 (200 mL). The solution was stirred in an ice-water bath under nitrogen and anhydrous pyridine (41.9 mL, 517.8 mmol) was added. After the addition, Solution A was added slowly over 15 minutes. The resulting mixture was stirred for 1.5 hours at room temperature. Hexane (200 mL) was added slowly and the resulting mixture was stirred for 10 minutes at room temperature. The mixture was filtered and the solid was washed with a mixture of ethyl acetate: hexanes = 1: 1 (80 mL). The filtrate was concentrated and the residue was washed with 800 g of silica on a column (hexane (2 liters), ethyl acetate / hexanes (1: 9, 3 liters), ethyl acetate / hexanes (2: 8, 4 liters) and ethyl) Purification using eluent acetate / hexanes (3: 7, 2 liters) sequence. The main impurities eluted in 20% ethyl acetate and the product eluted in 30% ethyl acetate. Yield: 74.4%.

실시예Example 8: N- 8: N- 메탄설폰아미드Methanesulfonamide 숙신이미드의Succinimide 합성 synthesis

Figure pct00016
Figure pct00016

자성 교반기, 열전대, 질소 라인 및 냉각용 얼음조가 구비된 250 mL 3구 환저 플라스크에, 80 mL의 무수 디클로로메탄에 용해된 아세틸설파닐메틸 9.803g(60.43 mmol) 용액을 투입하였다. 플라스크의 내용물을 약 0℃까지 냉각시키고, 이 용액에 총 11.33g(83.94 mmol, 1.38 당량)의 이염화 설퍼릴(sulfuryl dichloride)을 0 내지 5℃의 온도가 유지되는 속도로 서서히 첨가시켰다. 저온조를 제거하고, 반응 혼합물을 추가로 1.5시간 동안 실온에서 교반하였다. 그 결과로 얻은 황색 용액을 회전증발기 상에서 농축시켜 8.88g의 조 아세틸메틸설페닐 클로라이드를 악취를 풍기는 점성 황색 오일 형태로 수득하였다. 이 물질은 숙신이미드의 설페닐화 반응을 위한 다음 단계에서 바로 사용되었다. Into a 250 mL three neck round bottom flask equipped with a magnetic stirrer, a thermocouple, a nitrogen line, and a cooling ice bath, a solution of 9.803 g (60.43 mmol) of acetylsulfanylmethyl dissolved in 80 mL of anhydrous dichloromethane was added. The contents of the flask were cooled to about 0 ° C., and a total of 11.33 g (83.94 mmol, 1.38 equiv) of sulfuric dichloride was slowly added to the solution at a rate that maintained a temperature of 0-5 ° C. The cold bath was removed and the reaction mixture was stirred for an additional 1.5 h at room temperature. The resulting yellow solution was concentrated on a rotary evaporator to yield 8.88 g of crude acetylmethylsulphenyl chloride in the form of a malodorous viscous yellow oil. This material was used directly in the next step for the sulfenylation of succinimide.

자성 교반기, 열전대, 질소 라인 및 냉각용 얼음조가 구비된 250 mL 3구 환저 플라스크에, 80 mL의 무수 디클로로메탄에 용해된, 6.12g(61.76 mmol, 1.02 당량)의 숙신이미드 및 8.17g(80.73 mmol, 1.33 당량)의 트리에틸아민의 혼합물을 투입하였다. 혼합물을 0℃까지 냉각시키고, 20 mL의 무수 디클로로메탄에 용해된 조 아세틸메틸설페닐 클로라이드(8.88g) 용액을 숙신이미드 및 트리에틸아민의 미리 냉각된 현탁액에 0 내지 5℃의 온도가 유지되는 속도로 서서히 첨가시켰다. 첨가가 완료되면, 저온조를 제거하고 그 결과로 얻은 갈색 현탁액을 추가 2시간 동안 실온에서 교반하였다. 반응 혼합물을 냉각수(300 mL) 및 포화 NaHCO3(100 mL)으로 급냉시키고, 디클로로메탄(3x80 mL)으로 추출하였다. 유기층을 합한 후, Na2SO4 상에서 건조시키고 나서 회전증발기 상에서 농축시켜 13g의 어두운 색의 점성 오일을 수득하였다. 이 물질을 용리액으로 EtOAc-헥산 혼합물을 사용하는 실리카 겔 컬럼(120g) 상에서 0 내지 30%의 에탈아세테이트를 이용하여 정제시켜 4.12g의 설펜아미드 N-메탄설폰아미드 숙신이미드를 백색 고형물 형태로 수득하였다. 30% EtOAc-헥산 내 Rf=0.16. 수율: 32%.6.12 g (61.76 mmol, 1.02 eq.) Of succinimide and 8.17 g (80.73) dissolved in 80 mL of anhydrous dichloromethane in a 250 mL three neck round bottom flask equipped with a magnetic stirrer, thermocouple, nitrogen line and cooling bath. mmol, 1.33 equiv) was added a mixture of triethylamine. The mixture was cooled to 0 ° C. and a crude acetylmethylsulphenyl chloride (8.88 g) solution dissolved in 20 mL of anhydrous dichloromethane was maintained at a temperature of 0-5 ° C. in a pre-cooled suspension of succinimide and triethylamine. It was added slowly at the rate which becomes. Once the addition was complete, the cold bath was removed and the resulting brown suspension was stirred for an additional 2 hours at room temperature. The reaction mixture was quenched with chilled water (300 mL) and saturated NaHCO 3 (100 mL) and extracted with dichloromethane (3 × 80 mL). The combined organic layers were then dried over Na 2 SO 4 and concentrated on a rotary evaporator to yield 13 g of dark viscous oil. This material was purified using 0-30% etaacetate on a silica gel column (120 g) using an EtOAc-hexane mixture as eluent to afford 4.12 g of sulfenamide N-methanesulfonamide succinimide in the form of a white solid. It was. R f = 0.16 in 30% EtOAc-hexanes. Yield 32%.

실시예Example 9: 에틸  9: ethyl 아세틸설파닐메틸Acetylsulfanylmethyl 카보네이트의Carbonate 합성 synthesis

Figure pct00017
Figure pct00017

건조한 100 mL 환저 플라스크에 클로로메틸 클로로포메이트(12.9g, 100.0 mmol), 무수 아세토니트릴(300 mL)을 투입하였다. 용액을 얼음-물 조에서 교반하고, 여기에 무수 에탄올(4.6g, 100.0 mL) 및 무수 피리딘(23.7g, 300 ml)의 혼합물을 20분에 걸쳐 서서히 첨가하였다. 첨가가 끝나면, 혼합물을 1시간 동안 실온에서 교반하였다. 요오드화나트륨(1.50g, 10.0 mmol)을 반응 혼합물에 첨가하였다. 혼합물을 얼음-물 조에서 교반하고, 티오아세트산(7.6g, 100 mmol)을 5분에 걸쳐 첨가하였다. 첨가가 끝나면, 저온조를 제거하고 혼합물을 밤새 실온에서 교반하였다. 헥산(600 mL)을 반응 혼합물에 첨가하고 여과시켰다. 여과액을 농축 및 증류시켜 원하는 생성물을 수득하였다.Into a dry 100 mL round bottom flask was added chloromethyl chloroformate (12.9 g, 100.0 mmol) and anhydrous acetonitrile (300 mL). The solution was stirred in an ice-water bath, to which was slowly added a mixture of anhydrous ethanol (4.6 g, 100.0 mL) and anhydrous pyridine (23.7 g, 300 ml) over 20 minutes. After the addition, the mixture was stirred for 1 hour at room temperature. Sodium iodide (1.50 g, 10.0 mmol) was added to the reaction mixture. The mixture was stirred in an ice-water bath and thioacetic acid (7.6 g, 100 mmol) was added over 5 minutes. At the end of the addition, the cold bath was removed and the mixture was stirred overnight at room temperature. Hexane (600 mL) was added to the reaction mixture and filtered. The filtrate was concentrated and distilled to give the desired product.

실시예Example 10: N- 10: N- 메틸methyl -N--N- 에톡시카보닐옥시메틸설파닐Ethoxycarbonyloxymethylsulfanyl 메탄설폰아미드의Methanesulfonamide 합성 synthesis

Figure pct00018
Figure pct00018

건조한 500 mL 환저 플라스크에 에틸 아세틸설파닐메틸 카보네이트(8.9g, 50.0 mmol), 무수 CH2Cl2(200 mL)을 투입하였다. 용액을 질소 하에 얼음-물 조에서 교반하고, 염화 설퍼릴(4.0 mL, 50.0 mmol)을 첨가하였다. 첨가가 끝나면, 저온조를 제거하고 혼합물은 1.5시간 동안 실온에서 교반하였다. 혼합물을 회전증발시켜 모든 휘발성 물질을 제거하였다. 잔류물을 50 mL의 무수 CH2Cl2에 용해시켜 용액 A를 수득하였다.Ethyl acetylsulfanylmethyl carbonate (8.9 g, 50.0 mmol) and anhydrous CH 2 Cl 2 (200 mL) were added to a dry 500 mL round bottom flask. The solution was stirred in an ice-water bath under nitrogen and sulfuryl chloride (4.0 mL, 50.0 mmol) was added. After the addition, the cold bath was removed and the mixture was stirred for 1.5 hours at room temperature. The mixture was rotovap to remove all volatiles. The residue was dissolved in 50 mL of anhydrous CH 2 Cl 2 to give solution A.

다른 건조한 500 mL 환저 플라스크에 N-메틸 메탄설폰아미드(6.0g, 55.0 mmol), 분자체(4Å, 활성화됨, 3.0g) 및 무수 CH2Cl2(150 mL)를 첨가하였다. 혼합물을 질소 하에 얼음-물 조에서 교반하고, 무수 피리딘(5.3 mL, 65.0 mmol)을 첨가하였다. 첨가가 끝나면, 상기 용액 A를 10분에 걸쳐 서서히 첨가하였다. 그 결과로 얻은 혼합물을 1.5시간 동안 실온에서 교반하였다. 헥산(200 mL)을 서서히 첨가한 후 얻은 혼합물을 10분 동안 실온에서 교반하였다. 혼합물을 여과시키고, 고형물을 에틸아세테이트: 헥산 = 1:1(60 mL) 혼합물로 세척하였다. 여과액을 농축시키고, 잔류물을 실리카 겔 컬럼에 의해 정제시켜 원하는 생성물을 수득하였다. To another dry 500 mL round bottom flask was added N-methyl methanesulfonamide (6.0 g, 55.0 mmol), molecular sieve (4 cc, activated, 3.0 g) and anhydrous CH 2 Cl 2 (150 mL). The mixture was stirred in an ice-water bath under nitrogen and anhydrous pyridine (5.3 mL, 65.0 mmol) was added. After the addition, the solution A was added slowly over 10 minutes. The resulting mixture was stirred for 1.5 hours at room temperature. Hexane (200 mL) was added slowly and the resulting mixture was stirred for 10 minutes at room temperature. The mixture was filtered and the solid was washed with a mixture of ethyl acetate: hexanes = 1: 1 (60 mL). The filtrate was concentrated and the residue was purified by silica gel column to give the desired product.

실시예Example 11:  11: 아세틸설파닐메틸Acetylsulfanylmethyl 디메틸카바메이트의Of dimethyl carbamate 합성 synthesis

Figure pct00019
Figure pct00019

건조한 100 mL 환저 플라스크에, 클로로메틸 클로로포메이트(12.9g, 100.0 mmol), 염산 디메틸아민(8.15g, 100 mmol) 및 무수 아세트로니트릴(300 mL)을 투입하였다. 혼합물을 얼음-물 조에서 교반하고, 여기에 N,N-디이소프로필에틸 아민(43.5 mL, 250 mmol)을 30분에 걸쳐 서서히 첨가하였다. 첨가가 끝나면, 혼합물을 1시간 동안 실온에서 교반하였다. 요오드화나트륨(1.50g, 10.0 mmol)을 반응 혼합물에 첨가하였다. 혼합물을 얼음-물 조에서 교반하고, 티오아세트산(7.6g, 100 mmol)을 5분에 걸쳐 첨가하였다. 첨가가 끝나면, 저온조를 제거하고 혼합물을 밤새 실온에서 교반하였다. 헥산(300 mL)을 반응 혼합물에 첨가하고 여과시켰다. 여과액을 농축 및 증류시켜 원하는 생성물을 수득하였다.To a dry 100 mL round bottom flask was added chloromethyl chloroformate (12.9 g, 100.0 mmol), dimethylamine hydrochloride (8.15 g, 100 mmol) and anhydrous acetonitrile (300 mL). The mixture was stirred in an ice-water bath, to which N, N -diisopropylethyl amine (43.5 mL, 250 mmol) was slowly added over 30 minutes. After the addition, the mixture was stirred for 1 hour at room temperature. Sodium iodide (1.50 g, 10.0 mmol) was added to the reaction mixture. The mixture was stirred in an ice-water bath and thioacetic acid (7.6 g, 100 mmol) was added over 5 minutes. At the end of the addition, the cold bath was removed and the mixture was stirred overnight at room temperature. Hexane (300 mL) was added to the reaction mixture and filtered. The filtrate was concentrated and distilled to give the desired product.

실시예Example 12: N- 12: N- 메틸methyl -N--N- 디메틸카바모일옥시메틸설파닐Dimethylcarbamoyloxymethylsulfanyl 메탄설폰아미드의Methanesulfonamide 합성 synthesis

Figure pct00020
Figure pct00020

건조한 500 mL 환저 플라스크에 에틸 아세틸설파닐메틸 디메틸카바네이트(8.9g, 50.0 mmol), 무수 CH2Cl2(200 mL)을 투입하였다. 용액을 질소 하에 얼음-물 조에서 교반하고, 염화 설퍼릴(4.0 mL, 50.0 mmol)을 첨가하였다. 첨가가 끝나면, 저온조를 제거하고 혼합물은 1.5시간 동안 실온에서 교반하였다. 혼합물을 회전증발시켜 모든 휘발성 물질을 제거하였다. 잔류물을 50 mL의 무수 CH2Cl2에 용해시켜 용액 A를 수득하였다.To a dry 500 mL round bottom flask was added ethyl acetylsulfanylmethyl dimethyl carbonate (8.9 g, 50.0 mmol) and anhydrous CH 2 Cl 2 (200 mL). The solution was stirred in an ice-water bath under nitrogen and sulfuryl chloride (4.0 mL, 50.0 mmol) was added. After the addition, the cold bath was removed and the mixture was stirred for 1.5 hours at room temperature. The mixture was rotovap to remove all volatiles. The residue was dissolved in 50 mL of anhydrous CH 2 Cl 2 to give solution A.

다른 건조한 500 mL 환저 플라스크에 N-메틸 메탄설폰아미드(6.0g, 55.0 mmol), 분자체(4Å, 활성화됨, 3.0g) 및 무수 CH2Cl2(150 mL)를 첨가하였다. 혼합물을 질소 하에 얼음-물 조에서 교반하고, 무수 피리딘(5.3 mL, 65.0 mmol)을 첨가하였다. 첨가가 끝나면, 상기 용액 A를 10분에 걸쳐 서서히 첨가하였다. 그 결과로 얻은 혼합물을 1.5시간 동안 실온에서 교반하였다. 헥산(100 mL)을 서서히 첨가한 후 얻은 혼합물을 10분 동안 실온에서 교반하였다. 혼합물을 여과시키고, 고형물을 에틸아세테이트: 헥산 = 1:1(60 mL) 혼합물로 세척하였다. 여과액을 농축시키고, 잔류물을 실리카 겔 컬럼에 의해 정제시켜 원하는 생성물을 수득하였다. To another dry 500 mL round bottom flask was added N-methyl methanesulfonamide (6.0 g, 55.0 mmol), molecular sieve (4 cc, activated, 3.0 g) and anhydrous CH 2 Cl 2 (150 mL). The mixture was stirred in an ice-water bath under nitrogen and anhydrous pyridine (5.3 mL, 65.0 mmol) was added. After the addition, the solution A was added slowly over 10 minutes. The resulting mixture was stirred for 1.5 hours at room temperature. Hexane (100 mL) was added slowly and the resulting mixture was stirred for 10 minutes at room temperature. The mixture was filtered and the solid was washed with a mixture of ethyl acetate: hexanes = 1: 1 (60 mL). The filtrate was concentrated and the residue was purified by silica gel column to give the desired product.

실시예Example 13: 중간생성물 H- 13: intermediate H- 포스포네이트의Phosphonate 단리 단계를 포함하는, 완전보호된 디뉴클레오타이드  Fully protected dinucleotide comprising an isolation step 포스포로티오에이트의Phosphorothioate 합성 synthesis

Figure pct00021
Figure pct00021

실시예 13-1. 1.86g(2.62 mmol, 1.15 당량)의 H-포스포네이트 1 및 0.78g(2.28 mmol)의 3'-보호된 디옥시-티미딘 2의 혼합물을 무수 피리딘(3x25 mL)을 사용하여 동시증발시켰다. 오일성 잔류물을 10 mL의 무수 피리딘에 용해시키고 아르곤 분위기 하에 약 0℃까지 냉각시켰다. 여기에 총 0.56g(4.66 mmol, 2 당량)의 염화피발로일을 주사기를 통해 적가하고, 그 결과로 얻은 혼합물이 상온까지 승온되도록 하였다. 반응물을 추가 15분 동안 교반한 후 50g의 얼음과 100 mL의 희석된 포화 NaHCO3(80 mL의 물과 20 mL의 중탄산나트륨)으로 급냉시켰다. 유기 물질을 디클로로메탄(2x80 mL)으로 추출하고, 추출액을 냉각수(70 mL), 포화 중탄산나트륨(30 mL) 및 염수(10 mL)의 혼합물로 세척하였다. 유기층을 무수 황산나트륨 상에서 건조하고 회전증발기 상에서 농축시켜 6.74g의 조 생성물 3을 투명한 오일 형태로 수득하였다. 31P (162 MHz, CDCl3, δ): 8.58 (s) 및 7.06 (s).Example 13-1. A mixture of 1.86 g (2.62 mmol, 1.15 equiv) of H-phosphonate 1 and 0.78 g (2.28 mmol) of 3'-protected dioxy-thymidine 2 was coevaporated with anhydrous pyridine (3x25 mL). . The oily residue was dissolved in 10 mL of anhydrous pyridine and cooled to about 0 ° C. under argon atmosphere. A total of 0.56 g (4.66 mmol, 2 equivalents) of pivaloyl chloride was added dropwise through a syringe, and the resulting mixture was allowed to warm up to room temperature. The reaction was stirred for an additional 15 minutes and then quenched with 50 g of ice and 100 mL of diluted saturated NaHCO 3 (80 mL of water and 20 mL of sodium bicarbonate). The organics were extracted with dichloromethane (2x80 mL) and the extract was washed with a mixture of chilled water (70 mL), saturated sodium bicarbonate (30 mL) and brine (10 mL). The organic layer was dried over anhydrous sodium sulfate and concentrated on a rotary evaporator to yield 6.74 g of crude product 3 in the form of a clear oil. 31 P (162 MHz, CDCl 3 , δ): 8.58 (s) and 7.06 (s).

20 mL의 무수 피리딘에 용해된 조(crude) H-포스포네이트 3(6.74g)의 용액을 아르곤 분위기 하에서 약 0℃까지 냉각시켰다. 총 1.21g(5.43 mmol, 2.3 당량)의 시제 4를 반응물에 적가하고, 5분 후에는 0.502g(3.88 mmol, 1.7 당량)의 디이소프로필에틸 아민을 또한 플라스크에 투입하였다. 반응물이 상온까지 승온되도록 하고, 추가로 1시간 교반한 후 저온의 희석된 중탄산나트륨(100 mL) 용액을 사용하여 급냉시켰다. 유기 생성물을 디클로로메탄(2x80 mL)으로 추출하고, 물(100 mL)로 세척한 후, 황산나트륨 상에서 건조시켰다. 유기층을 회전증발기 상에서 농축시켜 5.02g의 조 생성물 5(HPLC에 의해 측정하였을 때 약 90% 순도)를 황색 오일 형태로 수득하였다. 31P (162 MHz, CDCl3, δ): 26.77 (s) 및 26.67 (s).A solution of crude H-phosphonate 3 (6.74 g) dissolved in 20 mL of anhydrous pyridine was cooled to about 0 ° C. under argon atmosphere. A total of 1.21 g (5.43 mmol, 2.3 equiv) of reagent 4 was added dropwise to the reaction and after 5 minutes 0.502 g (3.88 mmol, 1.7 equiv) of diisopropylethyl amine was also added to the flask. The reaction was allowed to warm up to room temperature, stirred for an additional 1 hour and then quenched using cold diluted sodium bicarbonate (100 mL) solution. The organic product was extracted with dichloromethane (2x80 mL), washed with water (100 mL) and dried over sodium sulfate. The organic layer was concentrated on a rotary evaporator to yield 5.02 g of crude product 5 (about 90% pure as measured by HPLC) in the form of a yellow oil. 31 P (162 MHz, CDCl 3 , δ): 26.77 (s) and 26.67 (s).

실시예 13-2. 방법 A와 유사하게, H-포스포네이트 1 (1.49g, 2.1 mmol, 1.08 당량) 및 3'-보호된 디옥시티미딘 2(0.66g, 1.94 mmol)를 20 mL의 무수 피리딘 중에 염화피발로일 0.49g(4.06 mmol, 2 당량)의 존재 하에서 반응시킴으로써 중간생성물 H-포스포네이트 3을 얻었다. 반응 혼합물을 냉각수/NaHCO3 수용액/염수의 혼합물로 급냉시킨 후, 디클로로메탄(3x30 mL)을 이용한 추출법에 의해 중간생성물 3을 단리시켰다. 유기 추출액을 물(50 mL), NaHCO3 수용액(20 mL) 및 염수(10 mL)로 세척하였다. Na2SO4로 (약 1분 동안) 건조시킨 후에, 유기층을 원래 부피의 약 1/4까지 농축시키고, 0℃까지 냉각시킨 후, S-전달 시제 4(0.96g, 4.3 mmol, 2.2 당량)를 중간생성물 3에 첨가한 다음에 디이소프로필에틸아민(0.45g, 3.48 mmol, 1.8 당량)을 첨가하였다. 추가 1시간 동안 실온에서 교반하고 난 후, 반응물을 방법 A에 기술된 바와 같이 급냉시켰다. 유기층을 회전증발기 상에서 농축시켜 3.55g의 조생성물 5를 HPLC에 의해 측정된 순도가 91%인 투명한 황색 오일 형태로 수득하였다.Example 13-2. Similar to Method A, H-phosphonate 1 (1.49 g, 2.1 mmol, 1.08 equiv) and 3′-protected dioxythymidine 2 (0.66 g, 1.94 mmol) were converted to pival chloride in 20 mL of anhydrous pyridine. Intermediate H-phosphonate 3 was obtained by reacting in the presence of 0.49 g (4.06 mmol, 2 equivalents) per day. The reaction mixture was quenched with a mixture of chilled water / NaHCO 3 aqueous solution / brine, and then intermediate 3 was isolated by extraction with dichloromethane (3 × 30 mL). The organic extract was washed with water (50 mL), aqueous NaHCO 3 solution (20 mL) and brine (10 mL). After drying with Na 2 SO 4 (for about 1 minute), the organic layer is concentrated to about 1/4 of its original volume, cooled to 0 ° C., and then S-transferant reagent 4 (0.96 g, 4.3 mmol, 2.2 equiv) Was added to intermediate 3 and then diisopropylethylamine (0.45 g, 3.48 mmol, 1.8 equiv) was added. After stirring at room temperature for an additional 1 hour, the reaction was quenched as described in Method A. The organic layer was concentrated on a rotary evaporator to yield 3.55 g of crude product 5 in the form of a clear yellow oil with 91% purity as determined by HPLC.

실시예Example 14:  14: DMTrDMTr -- ApAp (s)T-(s) T- LevLev 의 제조Manufacture

트리에틸암모늄 6-N-(벤조일)-5'-O-(4,4'-디메톡시트리틸)-2'-디옥시아데노신-3'H-포스포네이트(4.94g, 6.0 mmol) 및 3'-O-레불리닐티미딘(1.70g, 5.0 mmol)의 혼합물을 피리딘으로 증발시켜 무수 상태로 만들고, 무수 피리딘(12.5 mL)을 이용하여 희석한 후, 질소 하에 0℃에서 교반하였다. 후속으로는, 염화피발로일(1.24 mL, 10.0 mmol)을 2분에 걸쳐 서서히 첨가하였다. 반응 혼합물을 0℃에서 5분 동안 교반하고, 염화메틸렌(100 mL) 및 1.25N 아세테이트 나트륨-아세트산 완충액(2 x 100 mL) 사이로 격리되었다. 완충액은 190 mL의 1.25N 아세테이트 나트륨 수용액을 10 mL의 1.25N 아세트산 수용액과 혼합시켜 마련하였다. 유기층을 (Na2SO4 상에서) 건조시키고 농축하였다. 잔류물을 50 mL의 톨루엔으로 동시증발시키고, 무수 염화메틸렌(25 mL)에 용해시킨 후, 무수 염화메틸렌(1.0 mL)에 용해된 N-프로피오닐옥시메틸티오-N-메틸 메탄설폰아미드(2.05g, 9.0 mmol)의 용액을 이용하여 질소 하에 0℃에서 처리한 다음에 N,N-디이소프로필에틸아민(0.87 mL, 5.0 mmol)을 첨가하였다. 30분 동안 상온에서 교반한 후에, 용액 A(MTBE:헥산 = 1:2, 37.5 mL)을 10분에 걸쳐 첨가한 후, 이어서 셀라이트(7.5g)를 첨가하였다. 혼합물을 교반하고, 여기에 A의 추가분(37.5 mL)을 30분에 걸쳐 첨가하였다. 추가 30분 동안 계속 교반하고, 혼합물을 여과하였다. 고형물을, 용액 A 및 CH2Cl2가 5:1의 비율로 이루어진 용매 혼합물(60 mL)로 세척하였다. 그런 후에는 고형물을 염화메틸렌(4 x 40 mL)으로 추출하였다. 염화메틸렌 추출액을 농축시켰다. 잔류물을 아세토니트릴(20 mL)에 용해시키고 얼음-물 조에서 교반한 후, 냉각수(14 mL)를 20분에 걸쳐 첨가하였다. 하부층이 염화메틸렌(100 mL) 및 염수 용액(1:1)(60 mL) 사이로 격리되었다. 유기층을 (Na2SO4 상에서) 건조시키고 농축하여 생성물(5.7g)을 백색 고형물 형태로 수득하였다. 수율: 97%. 31P NMR (CDCl3, 121.5 MHz): δ= 26.7, 26.3. Triethylammonium 6- N- (benzoyl) -5'- O- (4,4'-dimethoxytrityl) -2'-dioxyadenosine-3'H-phosphonate (4.94 g, 6.0 mmol) and A mixture of 3′- O -levulinylthymidine (1.70 g, 5.0 mmol) was evaporated to pyridine to anhydrous, diluted with anhydrous pyridine (12.5 mL) and stirred at 0 ° C. under nitrogen. Subsequently, pivaloyl chloride (1.24 mL, 10.0 mmol) was added slowly over 2 minutes. The reaction mixture was stirred at 0 ° C. for 5 minutes and sequestered between methylene chloride (100 mL) and 1.25N acetate sodium-acetic acid buffer (2 × 100 mL). The buffer was prepared by mixing 190 mL of 1.25N acetic acid sodium solution with 10 mL of 1.25N acetic acid aqueous solution. The organic layer was dried (on Na 2 SO 4 ) and concentrated. The residue was co-evaporated with 50 mL of toluene, dissolved in anhydrous methylene chloride (25 mL) and then N -propionyloxymethylthio- N -methyl methanesulfonamide (2.05) dissolved in anhydrous methylene chloride (1.0 mL). g, 9.0 mmol) was treated under nitrogen at 0 ° C. and then N, N -diisopropylethylamine (0.87 mL, 5.0 mmol) was added. After stirring at room temperature for 30 minutes, solution A (MTBE: hexane = 1: 2, 37.5 mL) was added over 10 minutes, followed by celite (7.5 g). The mixture was stirred and added an additional portion of A (37.5 mL) over 30 minutes. Stirring continued for an additional 30 minutes and the mixture was filtered. The solid was washed with a solvent mixture (60 mL) consisting of solution A and CH 2 Cl 2 in a ratio of 5: 1. The solid was then extracted with methylene chloride (4 x 40 mL). The methylene chloride extract was concentrated. The residue was dissolved in acetonitrile (20 mL) and stirred in an ice-water bath, then cooling water (14 mL) was added over 20 minutes. The bottom layer was sequestered between methylene chloride (100 mL) and brine solution (1: 1) (60 mL). The organic layer was dried (on Na 2 SO 4 ) and concentrated to afford the product (5.7 g) in the form of a white solid. Yield: 97%. 31 P NMR (CDCl 3 , 121.5 MHz): δ = 26.7, 26.3.

실시예Example 15:  15: DMTrDMTr -- GpGp (H)의 제조(H) Preparation

피리딘(500 mL)으로 증발시켜 무수 상태로 만든 인산(78.7g, 960.0 mmol)에, 2'-디옥시-6-O-(2,5-디클로로페닐)-5'-O-(4,4'-디메톡시트리틸)-2-N-이소부티릴구아노신(62.8g, 80.0 mmol)을 첨가하고, 혼합물을 피리딘으로 증발시켜 다시 무수 상태로 만들었다. 잔류물을 무수 피리딘(480 mL), 그리고 10℃에서 30분에 걸쳐 첨가시킨 염화피발로일(64.0 mL, 520.0 mmol)로 처리하였다. 반응 혼합물을 실온에서 6시간 동안 교반하고, 농축시켰다. 잔류물을 800 mL의 염화메틸렌에 용해시킨 후에, 냉각수(800 mL) 및 탄산수소 트리에틸암모늄(2.0 N, 400 mL x 2)을 이용하여 순차적으로 세척하였다. 유기층을 (무수 Na2SO4) 상에서 건조시키고, 농축하였다. 잔류물을 80 mL의 염화메틸렌에 용해시키고, 용액 A(MTBE:헥산 = 1:2, 360 mL)를 교반 하에 20분에 걸쳐 첨가한 후, 셀라이트(80g)를 첨가하였다. 다음으로는, 용액 A 추가분(360 mL)을 30분에 걸쳐 서서히 첨가하였다. 혼합물을 여과시키고, 고형물을 MTBE(300 mL)로 세척하였다. 그런 후에는 고형물을 염화메틸렌(200 mL x 4)으로 추출하였다. 염화메틸렌 여과액을 농축시켜 생성물(70.4g)을 백색 포말(foam) 형태로 수득하였다. 수율: 93%. 31P NMR (CDCl3, 121.5 MHz): δ= 2.71.Phosphoric acid (78.7 g, 960.0 mmol) made anhydrous by evaporation with pyridine (500 mL), 2'-dioxy-6- O- (2,5-dichlorophenyl) -5'- O- (4,4 '-Dimethoxytrityl) -2- N -isobutyrylguanosine (62.8 g, 80.0 mmol) was added and the mixture was evaporated to pyridine and brought back to dryness. The residue was treated with anhydrous pyridine (480 mL) and pivaloyl chloride (64.0 mL, 520.0 mmol) added at 10 ° C. over 30 minutes. The reaction mixture was stirred at rt for 6 h and concentrated. The residue was dissolved in 800 mL of methylene chloride and washed sequentially with cooling water (800 mL) and triethylammonium bicarbonate (2.0 N, 400 mL x 2). The organic layer was dried over (anhydrous Na 2 SO 4 ) and concentrated. The residue was dissolved in 80 mL of methylene chloride and solution A (MTBE: hexane = 1: 2, 360 mL) was added over 20 minutes under stirring, followed by Celite (80 g). Next, an additional solution A (360 mL) was added slowly over 30 minutes. The mixture was filtered and the solid was washed with MTBE (300 mL). Then the solid was extracted with methylene chloride (200 mL x 4). The methylene chloride filtrate was concentrated to give the product (70.4 g) in the form of a white foam. Yield 93%. 31 P NMR (CDCl 3 , 121.5 MHz): δ = 2.71.

실시예Example 16:  16: DMTrDMTr -- GpGp (s)T-(s) T- OHOH 의 제조Manufacture

트리에틸암모늄 2'-디옥시-6-O-(2,5-디클로로페닐)-5'-O-(4,4'-디메톡시트리틸)-2-N-이소부티릴구아노신-3'H-포스포네이트(54.9g, 58.0 mmol) 및 3'-O-레불리닐-4-O-페닐티미딘(20.1g, 48.3 mmol)의 혼합물을 피리딘으로 증발시켜 무수 상태로 만들고, 무수 피리딘(121 mL)을 이용하여 희석하였다. 이렇게 얻은 용액을 질소 하에 0℃에서 염화피발로일(11.8 mL, 96.6 mmol)로 5분에 걸쳐 처리하였다. 5분 동안 추가로 교반한 후에, 무수 염화메틸렌(20 mL)에 용해된 N-프로피오닐옥시메틸티오-N-메틸 메탄설폰아미드(22.0g, 96.6 mmol)의 용액에 이어 N,N-디이소프로필에틸아민(8.4 mL, 48.3 mmol)을 첨가하였다. 반응 혼합물을 30분 동안 상온에서 교반시키고, 600 mL의 염화메틸렌을 이용하여 희석하였다. 유기층을 냉각수(600 mL) 및 포화 중탄산나트륨(500 mL x 2)으로 순차적으로 세척하고, (무수 Na2SO4 상에서) 건조시키고, 농축하였다. 잔류물을 97 mL의 염화메틸렌에 용해시키고, 용액 A(MTBE:헥산 = 1:2, 194 mL)를 교반 하에 20분에 걸쳐 첨가한 후, 셀라이트(73g)를 첨가하고, 이어서 용액 A의 추가분(194 mL)을 30분에 걸쳐 첨가하였다. 30분 동안 추가로 교반한 후에, 혼합물을 여과시켰다. 고형물을 MTBE:헥산 = 4:1(200 mL)으로 세척하고, 염화메틸렌(150 mL x 4)으로 추출하였다. 염화메틸렌 여과액을 농축시켜 생성물(68.1g)을 황색 포말 형태로 수득하였다. 31P NMR (CDCl3, 121.5 MHz): δ= 26.9, 26.2. 본 생성물은 추가의 정제 없이 다음 단계에서 사용되었다. 상기 생성물(64g)을 117 mL의 염화메틸렌에 용해시키고 0℃에서 교반시킨 용액에, 피리딘: 아세트산: 하이드라진 모노하이드레이트 = 37.5 mL: 25.0 mL: 2.5 mL(51.6 mmol)의 냉각 혼합물을 첨가하였다. 1시간 동안 0℃에서 교반한 후에, 반응 혼합물을 염화메틸렌(200 mL)으로 희석시키고 냉각수(500 mL)로 세척하였다. 수용액층을 염화메틸렌(100 mL)으로 다시 추출하였다. 염화메틸렌 추출액을 모아서 (무수 Na2SO4 상에서) 건조시키고, 농축하였다. 잔류물을 235 mL의 아세토니트릴에 용해시키고, 얼음-물 조에서 교반하고, 30분에 걸쳐 서서히 첨가시킨 냉각수(188 mL)로 처리하였다. 하부 유기층을 분리하고, 200 mL의 염화메틸렌을 이용하여 희석한 후 (무수 Na2SO4 상에서) 건조시켰다. 농축시킨 후, 잔류물을 94 mL의 염화메틸렌에 용해시키고, 이를 20분에 걸쳐 첨가시킨 용액 A(MTBE:헥산 = 1:2, 94 mL), 셀라이트(70g) 및 다시 30분에 걸쳐 첨가시킨 용액 A(94 mL)으로 순차적으로 교반 하에 처리하였다. 혼합물을 여과시키고, 고형물을 MTBE:헥산 = 4:1(300 mL)으로 세척한 후 염화메틸렌(150 mL x 4)으로 추출하였다. 염화메틸렌 여과액을 농축시켜 생성물(52g)을 황색 포말 형태로 수득하였다. 수율: 87%. 이 생성물은 다음 단계에서 바로 사용되었다. 31P NMR (CDCl3, 121.5 MHz): δ= 28.1, 25.3. Triethylammonium 2'-dioxy-6- O- (2,5-dichlorophenyl) -5'- O- (4,4'-dimethoxytrityl) -2- N -isobutyrylguanosine-3 A mixture of 'H-phosphonate (54.9 g, 58.0 mmol) and 3'- 0 -levulinyl-4- O -phenylthymidine (20.1 g, 48.3 mmol) is evaporated to pyridine, anhydrous, anhydrous Dilution with pyridine (121 mL). The solution so obtained was treated with pivaloyl chloride (11.8 mL, 96.6 mmol) over 5 minutes at 0 ° C. under nitrogen. After further stirring for 5 minutes, a solution of N -propionyloxymethylthio- N -methyl methanesulfonamide (22.0 g, 96.6 mmol) dissolved in anhydrous methylene chloride (20 mL) followed by N, N -diiso Propylethylamine (8.4 mL, 48.3 mmol) was added. The reaction mixture was stirred for 30 minutes at room temperature and diluted with 600 mL of methylene chloride. The organic layer was washed sequentially with chilled water (600 mL) and saturated sodium bicarbonate (500 mL × 2), dried (on anhydrous Na 2 SO 4 ) and concentrated. The residue was dissolved in 97 mL of methylene chloride and solution A (MTBE: hexane = 1: 2, 194 mL) was added over 20 minutes under stirring, followed by addition of celite (73 g), followed by Additional portion (194 mL) was added over 30 minutes. After further stirring for 30 minutes, the mixture was filtered. The solid was washed with MTBE: hexane = 4: 1 (200 mL) and extracted with methylene chloride (150 mL x 4). The methylene chloride filtrate was concentrated to give the product (68.1 g) in the form of a yellow foam. 31 P NMR (CDCl 3 , 121.5 MHz): δ = 26.9, 26.2. This product was used in the next step without further purification. The product (64 g) was dissolved in 117 mL of methylene chloride and stirred at 0 ° C. to a solution of pyridine: acetic acid: hydrazine monohydrate = 37.5 mL: 25.0 mL: 2.5 mL (51.6 mmol) was added. After stirring at 0 ° C. for 1 hour, the reaction mixture was diluted with methylene chloride (200 mL) and washed with cold water (500 mL). The aqueous layer was extracted again with methylene chloride (100 mL). The methylene chloride extracts were combined (on anhydrous Na 2 S0 4 ) and concentrated. The residue was dissolved in 235 mL of acetonitrile, stirred in an ice-water bath and treated with chilled water (188 mL) added slowly over 30 minutes. The lower organic layer was separated, diluted with 200 mL of methylene chloride and dried (on anhydrous Na 2 SO 4 ). After concentration, the residue was dissolved in 94 mL of methylene chloride and added over 20 minutes, solution A (MTBE: hexane = 1: 2, 94 mL), celite (70 g) and again over 30 minutes. Treated sequentially with solution A (94 mL) under stirring. The mixture was filtered and the solid was washed with MTBE: hexane = 4: 1 (300 mL) and then extracted with methylene chloride (150 mL x 4). The methylene chloride filtrate was concentrated to give the product (52 g) in the form of a yellow foam. Yield 87%. This product was used directly in the next step. 31 P NMR (CDCl 3 , 121.5 MHz): δ = 28.1, 25.3.

실시예Example 17:  17: HOHO -- GpGp (s)A-(s) A- LevLev 의 제조Manufacture

트리에틸암모늄 2'-디옥시-6-O-(2,5-디클로로페닐)-5'-O-(4,4'-디메톡시트리틸)-2-N-이소부티릴구아노신-3'H-포스포네이트(45.4g, 48.0 mmol) 및 2'-디옥시-3'-O-레불리닐-6-N-벤조일아데노신(18.1g, 40.0 mmol)의 혼합물을 피리딘으로 증발시켜 무수 상태로 만들었다. 잔류물을 무수 피리딘(100 mL)으로 희석하고, 이렇게 얻은 용액을 질소 하에 0℃에서 염화피발로일(9.9 mL, 80.0 mmol)로 10분에 걸쳐 처리하였다. 반응 혼합물을 0℃에서 5분 동안 추가로 교반한 후에 무수 염화메틸렌(10 mL)에 용해된 N-프로피오닐옥시메틸티오-N-메틸 메탄설폰아미드(18.2g, 80.0 mmol)의 용액에 이어 N,N-디이소프로필에틸아민(7.0 mL, 40.0 mmol)으로 처리하였다. 30분 동안 상온에서 교반시키고, 반응 혼합물을 600 mL의 염화메틸렌으로 희석한 후, 냉각수(600 mL) 및 포화 중탄산나트륨(300 mL x 2)을 이용하여 순차적으로 세척하였다. 유기층을 (무수 Na2SO4) 상에서 건조시키고, 농축하였다. 잔류물을 80 mL의 염화메틸렌에 용해시키고, 20분에 걸친 용액 A(MTBE:헥산 = 1:2, 160 mL), 셀라이트(60g), 및 30분에 걸친 용액 A의 추가분(160 mL)을 이용하여 순차적으로 처리하였다. 30분 동안 추가로 교반한 후에, 혼합물을 여과시켰다. 고형물을 MTBE:헥산 = 4:1(200 mL)으로 세척하고, 염화메틸렌(150 mL x 4)으로 추출하였다. 염화메틸렌 여과액을 농축시켰다. 잔류물을 160 mL의 아세토니트릴에 용해시키고, 얼음-물 조에서 교반한 후, 냉각수(112 mL)로 30분에 걸쳐 처리하였다. 하부 유기층이 분리되어 염화메틸렌(320 mL) 및 물(320 mL) 사이로 격리되었다. 유기층을 (무수 Na2SO4 상에서) 건조시키고 농축하여 생성물(64.1g)을 황색 포말 형태로 수득하였다. 본 생성물은 추가의 정제 없이 다음 단계에서 사용되었다. 31P NMR (CDCl3, 121.5 MHz): δ= 26.2, 26.0. Triethylammonium 2'-dioxy-6- O- (2,5-dichlorophenyl) -5'- O- (4,4'-dimethoxytrityl) -2- N -isobutyrylguanosine-3 A mixture of 'H-phosphonate (45.4 g, 48.0 mmol) and 2'-dioxy-3'- 0 -levulinyl-6- N -benzoyladenosine (18.1 g, 40.0 mmol) was evaporated to pyridine Made into a state. The residue was diluted with anhydrous pyridine (100 mL) and the resulting solution was treated with pivaloyl chloride (9.9 mL, 80.0 mmol) over 10 minutes at 0 ° C. under nitrogen. The reaction mixture was further stirred at 0 ° C. for 5 minutes and then a solution of N -propionyloxymethylthio- N -methyl methanesulfonamide (18.2 g, 80.0 mmol) dissolved in anhydrous methylene chloride (10 mL) followed by N Treated with , N -diisopropylethylamine (7.0 mL, 40.0 mmol). After stirring at room temperature for 30 minutes, the reaction mixture was diluted with 600 mL of methylene chloride and washed sequentially with cooling water (600 mL) and saturated sodium bicarbonate (300 mL x 2). The organic layer was dried over (anhydrous Na 2 SO 4 ) and concentrated. The residue was dissolved in 80 mL of methylene chloride and solution A (MTBE: hexane = 1: 2, 160 mL) over 20 minutes, celite (60 g), and an additional portion of Solution A over 160 minutes (160 mL) It was processed sequentially using. After further stirring for 30 minutes, the mixture was filtered. The solid was washed with MTBE: hexane = 4: 1 (200 mL) and extracted with methylene chloride (150 mL x 4). The methylene chloride filtrate was concentrated. The residue was dissolved in 160 mL of acetonitrile and stirred in an ice-water bath and then treated with chilled water (112 mL) over 30 minutes. The lower organic layer was separated and sequestered between methylene chloride (320 mL) and water (320 mL). The organic layer was dried (on anhydrous Na 2 SO 4 ) and concentrated to give the product (64.1 g) in the form of a yellow foam. This product was used in the next step without further purification. 31 P NMR (CDCl 3 , 121.5 MHz): δ = 26.2, 26.0.

상기 생성물(64.0g)을 120 mL의 염화메틸렌에 용해시키고 0℃에서 교반시킨 용액에, 피롤(13.9 mL, 200.0 mmol)을 첨가시키고나서 디클로로아세트산(16.5 mL, 200.0 mmol)을 20분에 걸쳐 첨가하였다. 1시간 동안 0℃에서 교반한 후에, 반응 혼합물을 포화 중탄산나트륨(200 mL)으로 급냉시켰다. 수용액층을 염화메틸렌(60 mL x 2)으로 추출하고, 염화메틸렌 추출액을 모아서 (무수 Na2SO4 상에서) 건조시키고, 농축하였다. 잔류물을 80 mL의 염화메틸렌에 용해시키고, 이를 15분에 걸쳐 첨가시킨 용액 A(MTBE:헥산 = 1:1, 100 mL), 셀라이트(60g) 및 다시 30분에 걸쳐 첨가시킨 용액 A 추가분(100 mL)으로 순차적으로 처리하였다. 혼합물을 여과시키고, 고형물을 MTBE(150 mL x 2)로 세척한 후 염화메틸렌(200 mL x 4)으로 추출하였다. 염화메틸렌 여과액을 농축시키고나서, 160 mL의 아세토니트릴에 용해시키고 얼음-물 조에서 교반하고, 냉각수(144 mL)로 20분에 걸쳐 처리하였다. 하부 유기층이 분리되어 염화메틸렌(320 mL) 및 염수 용액(1:1)(320 mL) 사이로 격리되었다. 유기층을 (무수 Na2SO4 상에서) 건조시키고 농축하여 생성물(40.5g)을 회백색(off-white)의 고형물 형태로 수득하였다. 수율: 92%. 31P NMR (CDCl3, 121.5 MHz): δ= 26.4, 26.2. To the solution (64.0 g) was dissolved in 120 mL of methylene chloride and stirred at 0 ° C., pyrrole (13.9 mL, 200.0 mmol) was added followed by dichloroacetic acid (16.5 mL, 200.0 mmol) over 20 minutes. It was. After stirring at 0 ° C. for 1 hour, the reaction mixture was quenched with saturated sodium bicarbonate (200 mL). The aqueous layer was extracted with methylene chloride (60 mL × 2), the methylene chloride extracts were combined (on anhydrous Na 2 SO 4 ) and concentrated. The residue was dissolved in 80 mL of methylene chloride and added over 15 minutes solution A (MTBE: hexane = 1: 1, 100 mL), celite (60 g) and again added solution A over 30 minutes (100 mL) was treated sequentially. The mixture was filtered and the solid was washed with MTBE (150 mL x 2) and extracted with methylene chloride (200 mL x 4). The methylene chloride filtrate was concentrated, dissolved in 160 mL of acetonitrile and stirred in an ice-water bath and treated with cold water (144 mL) over 20 minutes. The lower organic layer was separated and segregated between methylene chloride (320 mL) and brine solution (1: 1) (320 mL). The organic layer was dried (on anhydrous Na 2 SO 4 ) and concentrated to give the product (40.5 g) in the form of off-white solid. Yield 92%. 31 P NMR (CDCl 3 , 121.5 MHz): δ = 26.4, 26.2.

실시예Example 18:  18: DMTrDMTr -- GpGp (s)(s) TpTp (H)의 제조(H) Preparation

인산(29.8g, 364.0 mmol)을 피리딘(182 mL)으로 증발시켜 무수 상태로 만들었다. 잔류물에, DMTr-Gp (s)T-OH(33.0g, 26.0 mmol)을 첨가하고 얻은 혼합물을 피리딘으로 증발시켜 다시 무수 상태로 만들었다. 혼합물을 무수 피리딘(130 mL)으로 희석하고, 10℃에서 30분에 걸쳐 첨가시킨 염화피발로일(24.0 mL, 195.0 mmol)로 처리하였다. 혼합물을 실온에서 16시간 동안 교반하고, 농축시키고, 잔류물을 400 mL의 염화메틸렌에 용해하였다. 이렇게 얻은 용액을 냉각수(400 mL) 및 탄산수소 트리에틸암모늄(2.0 N, 200 mL x 3)으로 순차적으로 세척하였다. 유기층을 (무수 Na2SO4 상에서) 건조시키고, 농축하였다. 150 mL의 톨루엔을 이용하여 동시증발시킨 후, 잔류물을 52 mL의 염화메틸렌에 용해시키고, 20분에 걸친 용액 A(MTBE:헥산 = 1:1, 78 mL), 셀라이트(39g), 및 30분에 걸친 용액 A의 추가분(78 mL)을 이용하여 순차적으로 처리하였다. 혼합물을 여과시키고, 고형물을 용액 A 및 CH2Cl2가 5:1의 비율로 이루어진 용매 혼합물(180 mL)로 세척하였다. 고형물을 염화메틸렌(150 mL x 4)으로 추출하고 여과액을 농축시켜 생성물(33.1g)을 회백색의 포말 형태로 수득하였다. 수율: 89%. 31P NMR (CDCl3, 121.5 MHz): δ= 26.9, 25.4, 3.0, 2.9.Phosphoric acid (29.8 g, 364.0 mmol) was evaporated to pyridine (182 mL) to anhydrous. To the residue, DMTr- Gp (s) T- OH (33.0 g, 26.0 mmol) was added and the resulting mixture was evaporated to pyridine and brought back to dryness. The mixture was diluted with anhydrous pyridine (130 mL) and treated with pivaloyl chloride (24.0 mL, 195.0 mmol) added at 10 ° C. over 30 minutes. The mixture was stirred at rt for 16 h, concentrated and the residue was dissolved in 400 mL of methylene chloride. The solution thus obtained was washed sequentially with chilled water (400 mL) and triethylammonium bicarbonate (2.0 N, 200 mL x 3). The organic layer was dried (on anhydrous Na 2 SO 4 ) and concentrated. After co-evaporation with 150 mL of toluene, the residue was dissolved in 52 mL of methylene chloride, solution A (MTBE: hexane = 1: 1, 78 mL), celite (39 g), and over 20 min. Treatment was carried out sequentially using an additional portion of Solution A (78 mL) over 30 minutes. The mixture was filtered and the solid was washed with a solvent mixture (180 mL) consisting of solution A and CH 2 Cl 2 in a ratio of 5: 1. The solid was extracted with methylene chloride (150 mL x 4) and the filtrate was concentrated to give the product (33.1 g) in the form of an off white foam. Yield 89%. 31 P NMR (CDCl 3 , 121.5 MHz): δ = 26.9, 25.4, 3.0, 2.9.

실시예Example 19:  19: DMTrDMTr -- GpGp (s)(s) TpTp (s)(s) GpGp (s)A-(s) A- OHOH 의 제조Manufacture

DMTr-Gp (s) Tp(H)(28.6g, 20.0 mmol) 및 HO-Gp (s)A-Lev(16.9g, 15.4 mmol)의 트리에틸암모늄염 혼합물을 피리딘으로 증발시켜 무수 상태로 만들었다. 잔류물을 무수 피리딘(62.0 mL)으로 희석하고, 질소 하에 0℃에서 염화피발로일(4.8 mL, 38.5 mmol)로 5분에 걸쳐 처리하였다. 0℃에서 10분 동안 추가로 교반한 후에, 무수 염화메틸렌(10 mL)에 용해된 N-프로피오닐옥시메틸티오-N-메틸 메탄설폰아미드(7.0g, 30.8 mmol)의 용액에 이어 N,N-디이소프로필에틸아민(2.7 mL, 15.4 mmol)으로 처리하였다. 1시간 동안 상온에서 교반시키고, 반응 혼합물을 450 mL의 염화메틸렌으로 희석한 후, 냉각수(450 mL) 및 포화 중탄산나트륨(300 mL x 2)으로 순차적으로 세척하였다. 유기층을 (무수 Na2SO4 상에서) 건조시키고, 농축하였다. 100 mL의 톨루엔을 이용하여 동시증발시킨 후, 잔류물을 62 mL의 염화메틸렌에 용해시키고, 20분에 걸친 용액 A(MTBE:헥산 = 1:1, 124 mL), 셀라이트(46.2g), 및 30분에 걸친 용액 A의 추가분(124 mL)을 이용하여 순차적으로 처리하였다. 30분 동안 추가로 교반한 후에, 혼합물을 여과시키고, 고형물을 용액 A: CH2Cl2 = 6:1 (140 mL)로 세척하였다. 그런 후에는 고형물을 염화메틸렌(150 mL x 4)으로 세척하였다. 염화메틸렌 여과액을 농축시켰다. 잔류물을 123 mL의 아세토니트릴에 용해시키고, 얼음조에서 교반하면서, 냉각수(86 mL)로 20분에 걸쳐 처리하였다. 하부 유기층이 분리되어 염화메틸렌(300 mL) 및 염수 용액(1:1)(200 mL) 사이로 격리되었다. 유기층을 (무수 Na2SO4 상에서) 건조시키고 농축하여 생성물 DMTr-Gp (s) Tp (s) Gp (s)A-Lev(43.4g)을 황색 포말 형태로 수득하였다. 본 생성물은 추가 정제 없이 다음 단계에서 사용되었다. 31P NMR (CDCl3, 121.5 MHz): δ= 27.9-25.8(m). A mixture of triethylammonium salts of DMTr- Gp (s) T p (H) (28.6 g, 20.0 mmol) and HO- Gp (s) A -Lev (16.9 g, 15.4 mmol) was evaporated to pyridine to anhydrous. The residue was diluted with anhydrous pyridine (62.0 mL) and treated with pivaloyl chloride (4.8 mL, 38.5 mmol) over 5 minutes at 0 ° C. under nitrogen. After 10 min of further stirring at 0 ° C., a solution of N -propionyloxymethylthio- N -methyl methanesulfonamide (7.0 g, 30.8 mmol) dissolved in anhydrous methylene chloride (10 mL) was followed by N, N Treated with diisopropylethylamine (2.7 mL, 15.4 mmol). After stirring for 1 hour at room temperature, the reaction mixture was diluted with 450 mL of methylene chloride, and washed sequentially with cooling water (450 mL) and saturated sodium bicarbonate (300 mL x 2). The organic layer was dried (on anhydrous Na 2 SO 4 ) and concentrated. After co-evaporation with 100 mL of toluene, the residue was dissolved in 62 mL of methylene chloride, solution A (MTBE: hexane = 1: 1, 124 mL), celite (46.2 g), over 20 minutes, And an additional portion of Solution A (124 mL) over 30 minutes. After additional stirring for 30 minutes, the mixture was filtered and the solid was washed with solution A: CH 2 Cl 2 = 6: 1 (140 mL). The solid was then washed with methylene chloride (150 mL x 4). The methylene chloride filtrate was concentrated. The residue was dissolved in 123 mL of acetonitrile and treated with cold water (86 mL) over 20 minutes with stirring in an ice bath. The lower organic layer was separated and segregated between methylene chloride (300 mL) and brine solution (1: 1) (200 mL). The organic layer was dried (on anhydrous Na 2 SO 4 ) and concentrated to give the product DMTr- Gp (s) Tp (s) Gp (s) A -Lev (43.4 g) in the form of a yellow foam. This product was used in the next step without further purification. 31 P NMR (CDCl 3 , 121.5 MHz): δ = 27.9-25.8 (m).

DMTr-Gp (s) Tp (s) Gp (s)A-Lev(38.0g)을 38.0mL의 염화메틸렌에 용해시키고 0℃에서 교반시킨 용액에, 피리딘: 아세트산: 하이드라진 모노하이드레이트 = 14.3 mL: 9.5 mL: 0.95 mL(19.5 mmol)의 냉각 혼합물을 첨가하였다. 40분 동안 0℃에서 교반한 후에, 반응 혼합물을 염화메틸렌(450 mL)으로 희석시키고 냉각수(300 mL x 2) 및 염수(150 mL)로 세척하였다. 염화메틸렌층을 (Na2SO4 상에서) 건조시키고, 농축하였다. 100 mL의 톨루엔을 이용하여 동시증발시킨 후, 잔류물을 60 mL의 염화메틸렌에 용해시키고, 교반 하에 20분에 걸쳐 용액 A(MTBE:헥산 = 1:1, 90 mL)를 첨가한 후 이어서 셀라이트(45g)를 첨가하였다. 혼합물을 교반하고 용액 A 추가분(90 mL)을 30분에 걸쳐 첨가하였다. 혼합물을 여과시키고, 고형물을 용액 A 및 CH2Cl2가 5:1의 비율로 이루어진 용매 혼합물(150 mL)로 세척하였다. 고형물을 염화메틸렌(150 mL x 4)으로 추출하고, 추출액을 농축시키고 잔류물은 에틸아세테이트 내 아세토니트릴 0-80%의 구배를 이용하여 짧은 실리카 컬럼을 통해 정제되었다. 생성물 분획들을 농축시켜 생성물(26.9g)을 황색 포말 형태로 수득하였다. 수율: 82%, 31P NMR (CDCl3, 121.5 MHz): δ= 27.6-26.0(m).DMTr- Gp (s) Tp (s) Gp (s) A- Lev (38.0 g) was dissolved in 38.0 mL of methylene chloride and stirred at 0 ° C., pyridine: acetic acid: hydrazine monohydrate = 14.3 mL: 9.5 mL: 0.95 mL (19.5 mmol) of cooling mixture was added. After stirring for 40 minutes at 0 ° C., the reaction mixture was diluted with methylene chloride (450 mL) and washed with cold water (300 mL × 2) and brine (150 mL). The methylene chloride layer was dried (on Na 2 SO 4 ) and concentrated. After co-evaporation with 100 mL of toluene, the residue is dissolved in 60 mL of methylene chloride and solution A (MTBE: hexane = 1: 1, 90 mL) is added over 20 minutes under stirring followed by a cell Light (45 g) was added. The mixture was stirred and an additional solution A (90 mL) was added over 30 minutes. The mixture was filtered and the solid was washed with a solvent mixture (150 mL) consisting of solution A and CH 2 Cl 2 in a ratio of 5: 1. The solid was extracted with methylene chloride (150 mL x 4), the extract was concentrated and the residue was purified through a short silica column using a gradient of 0-80% acetonitrile in ethyl acetate. The product fractions were concentrated to give the product (26.9 g) in the form of a yellow foam. Yield: 82%, 31 P NMR (CDCl 3 , 121.5 MHz): δ = 27.6-26.0 (m).

실시예Example 20:  20: HOHO -- GpGp (s)(s) TpTp (s)(s) GpGp (s)A(s) A -- LevLev 의 제조Manufacture

DMTr-Gp (s) Tp (s) Gp (s)A-Lev(7.2g, 2.84 mmol)을 14mL의 염화메틸렌에 용해시키고 0℃에서 교반시킨 용액에, 피롤(2.0 mL, 28.4 mmol)에 이어서, 디클로로아세트산(2.34 mL, 28.4 mmol)을 3분에 걸쳐 첨가하였다. 30분 동안 0℃에서 교반한 후에, 반응 혼합물을 14 mL의 염화메틸렌으로 희석하고나서, 여기에 포화 중탄산나트륨(50 mL)을 서서히 첨가하였다. 수용액층을 염화메틸렌(40 mL)으로 추출하고, 염화메틸렌 추출액을 모아서 (무수 Na2SO4 상에서) 건조시키고, 농축하였다. 잔류물을 30 mL의 염화메틸렌에 용해시키고, 용액 A(MTBE:헥산 = 2:1, 45.0 mL), 셀라이트(9.0g) 및 다시 30분에 걸쳐 첨가시킨 용액 A 추가분(45.0 mL)을 이용하여 순차적으로 처리하였다. 혼합물을 여과시키고, 고형물을 MTBE(40 mL x 2)로 세척한 후 염화메틸렌(50 mL x 4)으로 추출하였다. 염화메틸렌 추출액을 농축시키고, 잔류물을 28.4 mL의 아세토니트릴에 용해시킨 후 얼음조 내에서 교반하면서 냉각수(28.4 mL)로 20분에 걸쳐 처리하였다. 유기층을 염화메틸렌(80 mL)으로 희석하고 (무수 Na2SO4 상에서) 건조시키고 농축하여 생성물(5.7g)을 회백색의 고형물 형태로 수득하였다. 수율: 95%. 31P NMR (CDCl3, 121.5 MHz): δ= 27.4-26.2(m). DMTr- Gp (s) Tp (s) Gp (s) A -Lev (7.2 g, 2.84 mmol) was dissolved in 14 mL of methylene chloride and stirred at 0 ° C. followed by pyrrole (2.0 mL, 28.4 mmol) , Dichloroacetic acid (2.34 mL, 28.4 mmol) was added over 3 minutes. After stirring at 0 ° C. for 30 minutes, the reaction mixture was diluted with 14 mL of methylene chloride, and then saturated sodium bicarbonate (50 mL) was added slowly. The aqueous layer was extracted with methylene chloride (40 mL), the methylene chloride extracts were combined (on anhydrous Na 2 SO 4 ) and concentrated. The residue was dissolved in 30 mL of methylene chloride, using solution A (MTBE: hexane = 2: 1, 45.0 mL), celite (9.0 g) and a further solution A solution (45.0 mL) added over 30 minutes. And sequentially processed. The mixture was filtered and the solid was washed with MTBE (40 mL x 2) and extracted with methylene chloride (50 mL x 4). The methylene chloride extract was concentrated and the residue was dissolved in 28.4 mL of acetonitrile and treated with cold water (28.4 mL) over 20 minutes with stirring in an ice bath. The organic layer was diluted with methylene chloride (80 mL), dried (on anhydrous Na 2 SO 4 ) and concentrated to give the product (5.7 g) in the form of an off-white solid. Yield 95%. 31 P NMR (CDCl 3 , 121.5 MHz): δ = 27.4-26.2 (m).

실시예Example 21:  21: DMTrDMTr -- GpGp (s)(s) TpTp (s)(s) GpGp (s)(s) ApAp (H)의 제조(H) Preparation

인산(4.7g, 57.3 mmol)을 피리딘(29 mL)으로 증발시키고, DMTr-Gp(s)Tp(s)Gp(s)A-OH(8.7g, 3.58 mmol)와 혼합하였다. 혼합물에 피리딘을 첨가시켜 증발시킴으로써 혼합물을 무수 상태로 만들고, 무수 피리딘(29.0 mL)을 이용하여 희석하였다. 혼합물을 교반하고 여기에 염화피발로일(3.75 mL, 30.4 mmol)을 10℃에서 5분에 걸쳐 첨가하였다. 이렇게 얻은 혼합물을 실온에서 6시간 동안 교반하고 농축시켰다. 잔류물을 200 mL의 염화메틸렌에 용해시키고, 냉각수(100 mL) 및 탄산수소 트리에틸암모늄(2.0N, 100 mL x 3)을 이용하여 순차적으로 세척하였다. 유기층을 (무수 Na2SO4 상에서) 건조시키고 농축하여 생성물(9.15g)을 회백색의 포말 형태로 수득하였다. 수율: 98%. 31P NMR (CDCl3, 121.5 MHz): δ= 27.5-25.8(m), 2.9, 2.8.Phosphoric acid (4.7 g, 57.3 mmol) was evaporated with pyridine (29 mL) and mixed with DMTr- Gp (s) Tp (s) Gp (s) A- OH (8.7 g, 3.58 mmol). The mixture was made anhydrous by adding pyridine to the mixture and evaporated with anhydrous pyridine (29.0 mL). The mixture was stirred and thereto was added pivaloyl chloride (3.75 mL, 30.4 mmol) at 10 ° C. over 5 minutes. The resulting mixture was stirred at rt for 6 h and concentrated. The residue was dissolved in 200 mL of methylene chloride and washed sequentially with cooling water (100 mL) and triethylammonium bicarbonate (2.0 N, 100 mL x 3). The organic layer was dried (on anhydrous Na 2 SO 4 ) and concentrated to give the product (9.15 g) in the form of an off white foam. Yield: 98%. 31 P NMR (CDCl 3 , 121.5 MHz): δ = 27.5-25.8 (m), 2.9, 2.8.

실시예Example 22:  22: HOHO -- GpGp (s)(s) TpTp (s)(s) GpGp (s)(s) ApAp (s)(s) GpGp (s)(s) TpTp (s)(s) GpGp (s)A-(s) A- LevLev 의 제조Manufacture

DMTr-Gp (s) Tp (s) Gp (s) Ap(H)(10.1g, 3.9 mmol) 및 HO-Gp (s) Tp (s) Gp (s)A-Lev(6.7g, 3.0 mmol)의 트리에틸암모늄염 혼합물을 피리딘으로 증발시켜 무수 상태로 만들고 무수 피리딘(15.0 mL)을 이용하여 희석시켰다. 이렇게 얻은 혼합물을 0℃에서 교반하면서 염화피발로일(1.1 mL, 9.0 mmol)을 2분에 걸쳐 서서히 첨가하였다. 혼합물을 30분 동안 상온에서 교반하고, 다시 0℃에서 냉각시킨 후, 무수 염화메틸렌(2.0 mL)에 용해된 N-프로피오닐옥시메틸티오-N-메틸 메탄설폰아미드(1.70g, 7.5 mmol)의 용액에 이어 N,N-디이소프로필에틸아민(0.78 mL, 4.5 mmol)을 첨가하였다. 반응 혼합물을 1시간 동안 상온에서 교반하고, 300 mL의 염화메틸렌을 이용하여 희석시켰다. 유기층을 냉각수(300 mL) 및 포화 중탄산나트륨(200 mL)으로 순차적으로 세척하고나서, (무수 Na2SO4 상에서) 건조시키고 농축하였다. 잔류물을 염화메틸렌(24 mL)에 용해시키고, 10분에 걸친 용액 A(MTBE:헥산 = 1:1, 48 mL), 셀라이트(18g), 및 30분에 걸친 용액 A의 추가분(48 mL)을 이용하여 순차적으로 처리하였다. 30분 동안 교반한 후에, 혼합물을 여과시키고, 고형물을 MTBE:헥산 = 2:1(60 mL)으로 세척하고, 염화메틸렌(50 mL x 4)으로 추출하였다. 염화메틸렌 추출액을 농축시키고; 잔류물을 아세토니트릴(48 mL)에 용해시키고, 얼음-물 조에서 교반하면서, 냉각수(34 mL)로 20분에 걸쳐 처리하였다. 하부층이 분리되어 염화메틸렌(150 mL) 및 염수 용액(1:1)(160 mL) 사이로 격리되었다. 유기층을 (무수 Na2SO4 상에서) 건조시키고 농축하여 생성물(11.7g)을 회색 고형물 형태로 수득하였다. 31P NMR (CDCl3, 121.5 MHz): δ= 27.7-25.8(m). 본 생성물은 추가의 정제 없이 다음 단계에서 바로 사용되었다. DMTr- Gp (s) Tp (s) Gp (s) Ap (H) (10.1 g, 3.9 mmol) and HO- Gp (s) Tp (s) Gp (s) A -Lev (6.7 g, 3.0 mmol) Triethylammonium salt mixture was evaporated to pyridine to anhydrous and diluted with anhydrous pyridine (15.0 mL). Pivaloyl chloride (1.1 mL, 9.0 mmol) was slowly added over 2 minutes while stirring the mixture thus obtained at 0 ° C. The mixture was stirred at room temperature for 30 minutes, cooled again at 0 ° C., and then dissolved in anhydrous methylene chloride (2.0 mL) of N -propionyloxymethylthio- N -methyl methanesulfonamide (1.70 g, 7.5 mmol). After the solution was added N, N -diisopropylethylamine (0.78 mL, 4.5 mmol). The reaction mixture was stirred at room temperature for 1 hour and diluted with 300 mL of methylene chloride. The organic layer was washed sequentially with chilled water (300 mL) and saturated sodium bicarbonate (200 mL), then dried (on anhydrous Na 2 SO 4 ) and concentrated. The residue was dissolved in methylene chloride (24 mL) and solution A (MTBE: hexane = 1: 1, 48 mL) over 10 minutes, celite (18 g), and an additional portion (48 mL) of Solution A over 30 minutes ) Were processed sequentially. After stirring for 30 minutes, the mixture was filtered and the solid was washed with MTBE: hexane = 2: 1 (60 mL) and extracted with methylene chloride (50 mL x 4). Methylene chloride extract is concentrated; The residue was dissolved in acetonitrile (48 mL) and treated with cold water (34 mL) over 20 minutes with stirring in an ice-water bath. The lower layer was separated and segregated between methylene chloride (150 mL) and brine solution (1: 1) (160 mL). The organic layer was dried (on anhydrous Na 2 SO 4 ) and concentrated to afford the product (11.7 g) in the form of a gray solid. 31 P NMR (CDCl 3 , 121.5 MHz): δ = 27.7-25.8 (m). The product was used directly in the next step without further purification.

상기 생성물(11.2g)을 18 mL의 염화메틸렌에 용해시키고 0℃에서 교반시킨 용액에, 피롤(2.85 mL, 41.1 mmol)을 첨가시키고나서 디클로로아세트산(3.2 mL, 38.4 mmol)을 5분에 걸쳐 첨가하였다. 40분 동안 0℃에서 교반한 후에, 포화 중탄산나트륨(40 mL)을 서서히 첨가하여 반응 혼합물을 급냉시켰다. 혼합물을 20 mL의 염화메틸렌으로 희석시키고, 수용액층을 염화메틸렌(40 mL)으로 분리 및 추출하고, 염화메틸렌 추출액을 모아서 (무수 Na2SO4 상에서) 건조시키고, 농축하였다. 잔류물을 28 mL의 염화메틸렌에 용해시키고, 이를 10분에 걸쳐 첨가시킨 용액 A(MTBE:헥산 = 1:1, 28 mL), 셀라이트(16.8g) 및 다시 20분에 걸쳐 첨가시킨 용액 A 추가분(28 mL)으로 순차적으로 처리하였다. 혼합물을 여과시키고; 고형물을 용액 A(40 mL) 및 MTBE(40 mL)로 세척한 후 염화메틸렌(4 x 50 mL)으로 추출하였다. 염화메틸렌 추출액을 농축하고, 짧은 실리카 겔 컬럼을 통해 정제시켰다. 염화메틸렌을 이용하여 컬럼을 용리하였다. 농축 이후, 생성물(8.7g)을 회색 고형물 형태로 수득하였다. 수율: 66%. 31P NMR (CDCl3, 121.5 MHz): δ= 27.8-26.3(m).To this solution (11.2 g) was dissolved in 18 mL of methylene chloride and stirred at 0 ° C., pyrrole (2.85 mL, 41.1 mmol) was added followed by dichloroacetic acid (3.2 mL, 38.4 mmol) over 5 minutes. It was. After stirring for 40 min at 0 ° C., saturated sodium bicarbonate (40 mL) was added slowly to quench the reaction mixture. The mixture was diluted with 20 mL of methylene chloride, the aqueous layer was separated and extracted with methylene chloride (40 mL), the methylene chloride extracts were combined (on anhydrous Na 2 SO 4 ) and concentrated. The residue was dissolved in 28 mL of methylene chloride and added over 10 minutes solution A (MTBE: hexane = 1: 1, 28 mL), celite (16.8 g) and again added solution 20 over 20 minutes. Treated sequentially with additional portion (28 mL). The mixture is filtered; The solid was washed with solution A (40 mL) and MTBE (40 mL) and then extracted with methylene chloride (4 x 50 mL). The methylene chloride extract was concentrated and purified through a short silica gel column. The column was eluted with methylene chloride. After concentration, the product (8.7 g) was obtained in the form of a gray solid. Yield 66%. 31 P NMR (CDCl 3 , 121.5 MHz): δ = 27.8-26.3 (m).

실시예Example 23:  23: HOHO -- GpGp (s)(s) TpTp (s)(s) GpGp (s)(s) ApAp (s)(s) GpGp (s)(s) TpTp (s)(s) GpGp (s)(s) ApAp (s)(s) GpGp (s)(s) TpTp (s)(s) GpGp (s)A-Lev의 제조(s) Preparation of A-Lev ( ( SEQSEQ . . IDID NONO : 1): One)

DMTr-Gp (s) Tp (s) Gp (s) Ap(H)(6.85g, 2.64 mmol) 및 HO-Gp(s)Tp(s)Gp(s)Ap(s)Gp(s)Tp(s)Gp(s)A-Lev(8.2 g, 1.81 mmol)의 트리에틸암모늄염 혼합물을 피리딘으로 증발시켜 무수 상태로 만들었다. 잔류물에 무수 피리딘(14 mL)을 첨가하고, 그 결과로 얻은 용액을 질소 하에 0℃에서 교반하고, 3분에 걸쳐 첨가되는 염화피발로일(0.8 mL, 6.48 mmol)로 처리하였다. 저온조를 제거하고 혼합물을 30분 동안 상온에서 교반하였다. 혼합물을 0℃까지 냉각시키고, 무수 염화메틸렌(2.0 mL)에 용해된 N-프로피오닐옥시메틸티오-N-메틸 메탄설폰아미드(1.23g, 5.40 mmol)의 용액에 이어 N,N-디이소프로필에틸아민(0.56 mL, 3.24 mmol)을 첨가하였다. 1시간 동안 상온에서 교반한 후에, 반응 혼합물을 250 mL의 염화메틸렌으로 희석시키고, 저온의 반포화(semi-saturated) 중탄산나트륨(250 mL)으로 세척하였다. 유기층을 (무수 Na2SO4 상에서) 건조시키고 농축하였다. 잔류물을 50 mL의 톨루엔으로 동시증발시키고, 43 mL의 염화메틸렌에 용해시킨 후, 20분에 걸친 용액 A(MTBE:헥산 = 1:1, 43 mL), 셀라이트(19.4g), 및 30분에 걸친 용액 A의 추가분(43 mL)을 이용하여 순차적으로 처리하였다. 30분 동안 교반한 후에, 혼합물을 여과시키고, 고형물을 용액 A 및 CH2Cl2가 4:1의 비율로 이루어진 용매 혼합물(100 mL x 2)로 세척하였다. 고형물을 염화메틸렌(100 mL x 4)으로 추출하고, 추출액을 농축시켰다. 잔류물을 65 mL의 아세토니트릴에 용해시키고 냉각수(46 mL)로 20분에 걸쳐 처리하였다. 하부 유기층이 분리되어 염화메틸렌(200 mL) 및 염수 용액(1:1)(200 mL) 사이로 격리되었다. 유기층을 (무수 Na2SO4 상에서) 건조시키고 농축하여 생성물(12.8g)을 황색 포말 형태로 수득하였다. 31P NMR (CDCl3, 121.5 MHz): δ= 30.0-24.8(m).DMTr- Gp (s) Tp (s) Gp (s) A p (H) (6.85 g, 2.64 mmol) and HO- Gp (s) Tp (s) Gp (s) Ap (s) Gp (s) Tp The triethylammonium salt mixture of (s) Gp (s) A -Lev (8.2 g, 1.81 mmol) was evaporated to pyridine to anhydrous. Anhydrous pyridine (14 mL) was added to the residue, and the resulting solution was stirred at 0 ° C. under nitrogen and treated with pivaloyl chloride (0.8 mL, 6.48 mmol) added over 3 minutes. The cold bath was removed and the mixture was stirred at room temperature for 30 minutes. The mixture was cooled to 0 ° C. and a solution of N -propionyloxymethylthio- N -methyl methanesulfonamide (1.23 g, 5.40 mmol) dissolved in anhydrous methylene chloride (2.0 mL) followed by N, N -diisopropyl Ethylamine (0.56 mL, 3.24 mmol) was added. After stirring at room temperature for 1 hour, the reaction mixture was diluted with 250 mL of methylene chloride and washed with cold semi-saturated sodium bicarbonate (250 mL). The organic layer was dried (on anhydrous Na 2 SO 4 ) and concentrated. The residue was coevaporated with 50 mL of toluene, dissolved in 43 mL of methylene chloride, and then solution A (MTBE: hexane = 1: 1, 43 mL), celite (19.4 g), and 30 over 20 minutes. Treatment was carried out sequentially using an additional portion of Solution A over 43 minutes (43 mL). After stirring for 30 minutes, the mixture was filtered and the solid was washed with a solvent mixture (100 mL x 2) with Solution A and CH 2 Cl 2 in a ratio of 4: 1. The solid was extracted with methylene chloride (100 mL x 4) and the extract was concentrated. The residue was dissolved in 65 mL of acetonitrile and treated with cold water (46 mL) over 20 minutes. The lower organic layer was separated and segregated between methylene chloride (200 mL) and brine solution (1: 1) (200 mL). The organic layer was dried (on anhydrous Na 2 SO 4 ) and concentrated to give the product (12.8 g) in the form of a yellow foam. 31 P NMR (CDCl 3 , 121.5 MHz): δ = 30.0-24.8 (m).

상기 생성물(12.8g)을 20 mL의 염화메틸렌에 용해시키고 0℃에서 교반시킨 용액에, 피롤(2.64 mL, 38.0 mmol)을 첨가시키고나서 디클로로아세트산(3.0 mL, 36.0 mmol)을 첨가하였다. 30분 동안 0℃에서 교반한 후에, 반응 혼합물을 200 mL의 염화메틸렌으로 희석시키고, 이어서 포화 중탄산나트륨(100 mL)을 서서히 첨가하였다. 유기층을 분리하고, (Na2SO4 상에서) 건조시키고, 농축하였다. 잔류물을 40 mL의 염화메틸렌에 용해시키고, 이를 10분에 걸쳐 첨가시킨 용액 A(MTBE:헥산 = 1:1, 40 mL), 셀라이트(20g) 및 20분에 걸쳐 첨가시킨 용액 A 추가분(80 mL)으로 순차적으로 처리하였다. 혼합물을 여과시키고, 고형물을 용액 A 및 CH2Cl2가 5:1의 비율로 이루어진 용매 혼합물(120 mL)로 세척하였다. 고형물을 염화메틸렌(100 mL x 4)으로 추출하고, 추출액을 농축시켰다. 잔류물을 70 mL의 아세토니트릴에 용해시키고 냉각수(49 mL)로 30분에 걸쳐 처리하였다. 하부 유기층이 분리되어 염화메틸렌(150 mL) 및 염수 용액(1:1)(150 mL) 사이로 격리되었다. 유기층을 (Na2SO4 상에서) 건조시키고 농축하여 생성물(9.2g)을 회백색 고형물 형태로 수득하였다. 이 생성물은 다음 단계에서 바로 사용되었다. 수율: 75%. 31P NMR (CDCl3, 121.5 MHz): δ= 27.7-26.4(m).To this solution (12.8 g) was dissolved in 20 mL of methylene chloride and stirred at 0 ° C., pyrrole (2.64 mL, 38.0 mmol) was added followed by dichloroacetic acid (3.0 mL, 36.0 mmol). After stirring for 30 min at 0 ° C., the reaction mixture was diluted with 200 mL of methylene chloride and then saturated sodium bicarbonate (100 mL) was added slowly. The organic layer was separated, dried (on Na 2 SO 4 ) and concentrated. The residue was dissolved in 40 mL of methylene chloride and added over 10 minutes solution A (MTBE: hexane = 1: 1, 40 mL), celite (20 g) and added solution A addition over 20 minutes ( 80 mL). The mixture was filtered and the solid was washed with a solvent mixture (120 mL) consisting of solution A and CH 2 Cl 2 in a ratio of 5: 1. The solid was extracted with methylene chloride (100 mL x 4) and the extract was concentrated. The residue was dissolved in 70 mL of acetonitrile and treated with cold water (49 mL) over 30 minutes. The lower organic layer was separated and segregated between methylene chloride (150 mL) and brine solution (1: 1) (150 mL). The organic layer was dried (on Na 2 SO 4 ) and concentrated to give the product (9.2 g) in the form of an off-white solid. This product was used directly in the next step. Yield 75%. 31 P NMR (CDCl 3 , 121.5 MHz): δ = 27.7-26.4 (m).

실시예Example 24: HO- 24: HO- GpGp (s)(s) TpTp (s)(s) GpGp (s)(s) ApAp (s)(s) GpGp (s)(s) TpTp (s)(s) GpGp (s)(s) ApAp (s)(s) GpGp (s)(s) TpTp (s)(s) GpGp (s)(s) ApAp (s)(s) GpGp (s)(s) TpTp (s)(s) GpGp (s)A-Lev의 제조 (s) Preparation of A-Lev (( SEQSEQ . . IDID NONO : 2): 2)

DMTr-Gp (s) Tp (s) Gp (s) Ap(H)(3.64g, 1.4 mmol) 및 HO-Gp(s)Tp(s)Gp(s)Ap(s)Gp(s)Tp(s)Gp(s)Ap(s)Gp(s)Tp(s)Gp(s)A-Lev(6.1g, 0.89 mmol)의 트리에틸암모늄염 혼합물을 피리딘으로 증발시켜 무수 상태로 만들었다. 잔류물을 무수 피리딘(10 mL)으로 희석시키고, 질소 하에 0℃에서 3분에 걸쳐 서서히 첨가시킨 염화피발로일(0.37 mL, 3.0 mmol)로 처리하였다. 저온조를 제거하고 혼합물을 1시간 동안 상온에서 교반하였다. 혼합물을 0℃까지 냉각시키고, 무수 염화메틸렌(1.0 mL)에 용해된 N-프로피오닐옥시메틸티오-N-메틸 메탄설폰아미드(568.3 mg, 2.5 mmol)의 용액에 이어 N,N-디이소프로필에틸아민(0.26 mL, 1.5 mmol)을 첨가하였다. 1시간 동안 상온에서 교반한 후에, 반응 혼합물을 120 mL의 염화메틸렌으로 희석시키고, 냉각수(120 mL) 및 반포화 중탄산나트륨(120 mL)으로 순차적으로 세척하였다. 유기층을 (무수 Na2SO4 상에서) 건조시키고 농축하였다. 잔류물을 32 mL의 염화메틸렌에 용해시킨 후, 20분에 걸쳐 첨가시킨 용액 A(MTBE:헥산 = 1:1, 32 mL), 셀라이트(16.0g), 및 30분에 걸쳐 첨가시킨 용액 A의 추가분(64 mL)을 이용하여 순차적으로 처리하였다. 30분 동안 교반한 후에, 혼합물을 여과시키고, 고형물을 용액 A 및 CH2Cl2가 5:1의 비율로 이루어진 용매 혼합물(60 mL)로 세척하였다. 고형물을 염화메틸렌(80 mL x 4)으로 추출하고, 추출액을 농축시켰다. 잔류물을 40 mL의 아세토니트릴에 용해시키고, 교반하면서 냉각수(28 mL)로 20분에 걸쳐 처리하였다. 하부 유기층이 분리되어 염화메틸렌(150 mL) 및 염수 용액(1:1)(150 mL) 사이로 격리되었다. 유기층을 (Na2SO4 상에서) 건조시키고 농축하여 생성물(6.92g)을 황색 고형물 형태로 수득하였다. 31P NMR (CDCl3, 121.5 MHz): δ= 27.6-26.3(m). 본 생성물은 추가의 정제 없이 다음 단계에서 바로 사용되었다. DMTr- Gp (s) Tp (s) Gp (s) A p (H) (3.64 g, 1.4 mmol) and HO- Gp (s) Tp (s) Gp (s) Ap (s) Gp (s) Tp The triethylammonium salt mixture of (s) Gp (s) Ap (s) Gp (s) Tp (s) Gp (s) A- Lev (6.1 g, 0.89 mmol) was evaporated to pyridine to anhydrous. The residue was diluted with anhydrous pyridine (10 mL) and treated with pivaloyl chloride (0.37 mL, 3.0 mmol) added slowly over 3 minutes at 0 ° C. under nitrogen. The cold bath was removed and the mixture was stirred at room temperature for 1 hour. The mixture was cooled to 0 ° C. and a solution of N -propionyloxymethylthio- N -methyl methanesulfonamide (568.3 mg, 2.5 mmol) dissolved in anhydrous methylene chloride (1.0 mL) followed by N, N -diisopropyl Ethylamine (0.26 mL, 1.5 mmol) was added. After stirring at room temperature for 1 hour, the reaction mixture was diluted with 120 mL of methylene chloride and washed sequentially with chilled water (120 mL) and half saturated sodium bicarbonate (120 mL). The organic layer was dried (on anhydrous Na 2 SO 4 ) and concentrated. The residue was dissolved in 32 mL of methylene chloride and then solution A (MTBE: hexane = 1: 1, 32 mL) added over 20 minutes, celite (16.0 g), and solution A added over 30 minutes Treatment was carried out sequentially using an additional portion of (64 mL). After stirring for 30 minutes, the mixture was filtered and the solid was washed with a solvent mixture (60 mL) consisting of solution A and CH 2 Cl 2 in a ratio of 5: 1. The solid was extracted with methylene chloride (80 mL x 4) and the extract was concentrated. The residue was dissolved in 40 mL of acetonitrile and treated with cooling water (28 mL) over 20 minutes with stirring. The lower organic layer was separated and segregated between methylene chloride (150 mL) and brine solution (1: 1) (150 mL). The organic layer was dried (on Na 2 SO 4 ) and concentrated to afford the product (6.92 g) in the form of a yellow solid. 31 P NMR (CDCl 3 , 121.5 MHz): δ = 27.6-26.3 (m). The product was used directly in the next step without further purification.

상기 생성물(6.92g)을 10 mL의 염화메틸렌에 용해시키고 0℃에서 교반시킨 용액에, 피롤(1.74 mL, 25.0 mmol)을 첨가시키고나서 디클로로아세트산(2.0 mL, 24.0 mmol)을 2분에 걸쳐 첨가하였다. 30분 동안 0℃에서 추가로 교반한 후에, 반응 혼합물을 100 mL의 염화메틸렌으로 희석시키고, 이어서 포화 중탄산나트륨(50 mL)을 서서히 첨가하였다. 유기층을 분리하고, 수용액층을 50 mL의 염화메틸렌으로 추출하였다. CH2Cl2 추출액을 모아서 (무수 Na2SO4 상에서) 건조시키고, 농축하였다. 잔류물을 32 mL의 염화메틸렌에 용해시키고, 이를 10분에 걸쳐 첨가시킨 용액 A(MTBE:헥산 = 1:1, 32 mL), 셀라이트(16g) 및 30분에 걸쳐 첨가시킨 용액 A 추가분(64 mL)으로 순차적으로 처리하였다. 혼합물을 여과시키고, 고형물을 용액 A 및 CH2Cl2가 5:1의 비율로 이루어진 용매 혼합물(90 mL)로 세척하였다. 고형물을 염화메틸렌(80 mL x 4)으로 추출하고, 추출액을 농축시켰다. 잔류물을 40 mL의 아세토니트릴에 용해시키고, 혼합물을 얼음조에서 교반하면서, 10분에 걸쳐 첨가시킨 냉각수(28 mL)로 처리하였다. 하부 유기층이 분리되어 염화메틸렌(100 mL) 및 염수 용액(1:1)(100 mL) 사이로 격리되었다. 유기층을 (무수 Na2SO4 상에서) 건조시키고 농축하여 생성물(5.8g)을 황색 고형물 형태로 수득하였다. 수율: 71%. 31P NMR (CDCl3, 121.5 MHz): δ= 27.7-26.3(m).To this solution (6.92 g) was dissolved in 10 mL of methylene chloride and stirred at 0 ° C., pyrrole (1.74 mL, 25.0 mmol) was added followed by dichloroacetic acid (2.0 mL, 24.0 mmol) over 2 minutes. It was. After further stirring at 0 ° C. for 30 minutes, the reaction mixture was diluted with 100 mL of methylene chloride and then saturated sodium bicarbonate (50 mL) was added slowly. The organic layer was separated and the aqueous layer was extracted with 50 mL of methylene chloride. The CH 2 Cl 2 extracts were combined (on anhydrous Na 2 SO 4 ), dried and concentrated. The residue was dissolved in 32 mL of methylene chloride and added over 10 minutes solution A (MTBE: hexane = 1: 1, 32 mL), celite (16 g) and additional solution A added over 30 minutes ( 64 mL). The mixture was filtered and the solid was washed with a solvent mixture (90 mL) consisting of solution A and CH 2 Cl 2 in a ratio of 5: 1. The solid was extracted with methylene chloride (80 mL x 4) and the extract was concentrated. The residue was dissolved in 40 mL of acetonitrile and the mixture was treated with chilled water (28 mL) added over 10 minutes with stirring in an ice bath. The lower organic layer was separated and segregated between methylene chloride (100 mL) and brine solution (1: 1) (100 mL). The organic layer was dried (on anhydrous Na 2 SO 4 ) and concentrated to give the product (5.8 g) in the form of a yellow solid. Yield 71%. 31 P NMR (CDCl 3 , 121.5 MHz): δ = 27.7-26.3 (m).

실시예Example 25: 5'- 25: 5'- OHOH 완전보호된  Fully protected 올리고뉴클레오타이드Oligonucleotides 포스포로티오에이트Phosphorothioate HOHO -- Gp(s)Tp(s)Gp(s)AGp (s) Tp (s) Gp (s) A -Lev의 완전 -Full of Lev 탈보호Deprotection

완전보호된 테트라머 HO-Gp (s) Tp (s) Gp (s)A-Lev(1.38g, 0.62 mmol)을 첨가 피리딘으로 증발시켜 무수 상태로 만들었다. 잔류물에, 1,2,4-트리아졸(192.7 mg, 2.79 mmol), 4Å 분자체(1.5g) 및 무수 피리딘(6.0 mL)을 첨가하였다. 이렇게 얻은 혼합물을 교반하고 질소 하에 0℃까지 냉각시키고, 여기에 터트-부틸아민(1.95 mL, 18.6 mmol)을 첨가하였다. 그 결과로 얻은 혼합물을 4시간 동안 실온에서 교반하였다. 혼합물을 여과시키고, 분자체를 피리딘(5 mL x 2)으로 세척하였다. 여과액을 합친 후, 건조 상태까지 농축시켰다. 이러한 잔류물에, syn-2-피리딘알독심(909 mg, 7.44 mmol)에 이어서 무수 아세토니트릴(10 mL)을 첨가하였다. 혼합물을 교반하고 0℃까지 냉각시키고 나서, 1,8-디아자바이사이클로[5.4.0]운덱-7-엔(1.67 mL, 11.2 mmol)을 첨가하였다. 실온에서 15시간 동안 교반한 후에, MTBE(50 mL)를 10분에 걸쳐 서서히 첨가하였다. 추가로 20분 동안 교반한 후에, 상부의 투명 용액을 경사분리시키고, 잔류물을 에틸아세테이트(20 mL)로 세정하였다. 잔류물을 증발시킴으로써 남아있는 용매를 제거하고, 28% 암모늄 수용액(10.0 mL) 및 2-머캅토에탄올(0.5 mL)의 혼합물에 용해시켰다. 그 결과로 얻은 혼합물을 55℃에서 15시간 동안 가열하였다. 냉각시킨 후에, 혼합물을 이소프로판올: THF = 1:3(80 mL)의 교반 혼합물에 10분에 걸쳐 적가하였다. 추가로 20분 교반한 후에, 상부의 투명 용액을 경사분리시키고, 잔류물을 THF(20 mL)로 세정하였다. 잔류물을 역상 C18 크로마토그래피를 통해 정제시켰다. 이렇게 얻은 생성물을 Amberlite® IR-120(플러스) 이온교환 수지(나트륨 형태)의 컬럼(8 cm x 3 cm 직경)에 투입하였다. 물을 이용하여 컬럼을 용출시키고, 원하는 분획들을 모아서 동결건조시켜, 백색 고형물로서의 생성물 684 mg을 완전 탈보호된 올리고뉴클레오타이드 포스포로티오에이트의 나트륨 형태로 수득하였다. 수율: 83%. 31P NMR (D2O, 121.5 MHz): δ= 55.4-54.6(m).The fully protected tetramer HO- Gp (s) Tp (s) Gp (s) A- Lev (1.38 g, 0.62 mmol) was evaporated with addition pyridine to anhydrous. To the residue, 1,2,4-triazole (192.7 mg, 2.79 mmol), 4 'molecular sieves (1.5 g) and anhydrous pyridine (6.0 mL) were added. The resulting mixture was stirred and cooled to 0 ° C. under nitrogen, to which tert -butylamine (1.95 mL, 18.6 mmol) was added. The resulting mixture was stirred for 4 hours at room temperature. The mixture was filtered and the molecular sieve washed with pyridine (5 mL x 2). The filtrates were combined and concentrated to dryness. To this residue was added syn -2-pyridine aldoxinsim (909 mg, 7.44 mmol) followed by anhydrous acetonitrile (10 mL). The mixture was stirred and cooled to 0 ° C., then 1,8-diazabicyclo [5.4.0] undec-7-ene (1.67 mL, 11.2 mmol) was added. After stirring for 15 hours at room temperature, MTBE (50 mL) was added slowly over 10 minutes. After stirring for a further 20 minutes, the upper clear solution was decanted and the residue was washed with ethyl acetate (20 mL). The remaining solvent was removed by evaporation of the residue and dissolved in a mixture of 28% aqueous ammonium solution (10.0 mL) and 2-mercaptoethanol (0.5 mL). The resulting mixture was heated at 55 ° C. for 15 hours. After cooling, the mixture was added dropwise over 10 minutes to a stirred mixture of isopropanol: THF = 1: 3 (80 mL). After stirring for an additional 20 minutes, the upper clear solution was decanted and the residue was washed with THF (20 mL). The residue was purified via reverse phase C18 chromatography. The product thus obtained was charged into a column (8 cm x 3 cm diameter) of Amberlite ® IR-120 (plus) ion exchange resin (sodium form). The column was eluted with water and the desired fractions were collected and lyophilized to give 684 mg of the product as a white solid in the form of sodium of fully deprotected oligonucleotide phosphorothioate. Yield 83%. 31 P NMR (D 2 O, 121.5 MHz): δ = 55.4-54.6 (m).

실시예Example 26: 하기 반응식에 도시된 바와 같은, 완전보호된  26: fully protected, as shown in the following scheme 디뉴클레오타이드Dinucleotide 포스포로티오에이트의 합성 Synthesis of Phosphorothioate

Figure pct00022
Figure pct00022

트리에틸암모늄 5'-O-(4,4'-디메톡시트리틸)-티미딘-3'-H-포스포네이트(425,9 mg, 0.6 mmol), 3'-O-레불리닐 티미딘(170.2 mg, 0.5 mmol) 및 건조 피리딘(10.0 mL)의 용액을 건조 상태까지 회전증발시켰다. 잔류물을 10 mL의 피리딘에 재용해하고, 다시 건조 상태까지 회전증발시켰다. 잔류물에, 분자체(300 mg, 활성화됨, 3Å) 및 무수 피리딘(5.0 mL)을 첨가하였다. 이렇게 얻은 혼합물을 질소 하에 실온에서 교반하고, 여기에 염화 피발로일(0.22 mL, 1.75 mmol)을 첨가하였다. 5분 동안 실온에서 교반한 후에, CH2Cl2(1.0 mL)에 용해된 N-메틸-N-프로피오닐옥시메틸설파닐 메탄설폰아미드(284.1 mg, 1.25 mmol)의 용액에 이어, DIPEA(0.17 mg, 2.0 mmol)를 첨가하였다. 그 결과로 얻은 혼합물을 30분 동안 실온에서 교반하였다. 에틸아세테이트(30 mL)를 첨가하였다. 혼합물을 여과시키고, 여과액을 물(15 mL), 반포화 중탄산나트륨 수용액(15 mL x 2) 및 염수(15 mL)로 세척하였다. 유기층을 건조 및 증발시켜 1.21g의 연한 황색 오일을 수득하였다. 이러한 조 생성물을 실리카 겔 크로마토그래피(EtOAc/아세톤)를 통해 정제시켜 생성물(389 mg)을 무색 포말 형태로 수득하였다. 수율: 74.4%.Triethylammonium 5'-O- (4,4'-dimethoxytrityl) -thymidine-3'-H-phosphonate (425,9 mg, 0.6 mmol), 3'-0-levulinyl thymi A solution of dine (170.2 mg, 0.5 mmol) and dry pyridine (10.0 mL) was evaporated to dryness. The residue was redissolved in 10 mL of pyridine and again evaporated to dryness. To the residue, molecular sieves (300 mg, activated, 3x) and anhydrous pyridine (5.0 mL) were added. The resulting mixture was stirred at room temperature under nitrogen, to which pivaloyl chloride (0.22 mL, 1.75 mmol) was added. After stirring at room temperature for 5 minutes, a solution of N-methyl-N-propionyloxymethylsulfanyl methanesulfonamide (284.1 mg, 1.25 mmol) dissolved in CH 2 Cl 2 (1.0 mL) was followed by DIPEA (0.17). mg, 2.0 mmol) was added. The resulting mixture was stirred for 30 minutes at room temperature. Ethyl acetate (30 mL) was added. The mixture was filtered and the filtrate was washed with water (15 mL), half-saturated aqueous sodium bicarbonate solution (15 mL x 2) and brine (15 mL). The organic layer was dried and evaporated to yield 1.21 g of pale yellow oil. This crude product was purified via silica gel chromatography (EtOAc / acetone) to give the product (389 mg) in the form of a colorless foam. Yield: 74.4%.

<110> Girindus America Inc <120> Sulfurizing reagents and their use for oligonucleotides synthesis <130> GIR 2008/02 <140> US 61/140,391 <141> 2008-12-23 <160> 2 <170> PatentIn version 3.3 <210> 1 <211> 12 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Synthetic Sequence <220> <221> modified_base <222> (1) <223> N-(6-(2,5-dichlorophenoxy)-purin-2-yl)isobutyramide <220> <221> misc_feature <222> (1)..(11) <223> 4'O-P-thiomethyl propionate <220> <221> modified_base <222> (2) <223> 5-methyl-4-phenoxypyrimidin-2-one <220> <221> modified_base <222> (3) <223> N-(6-(2,5-dichlorophenoxy)-purin-2-yl)isobutyramide <220> <221> modified_base <222> (4) <223> N-(purin-6-yl)benzamide <220> <221> modified_base <222> (5) <223> N-(6-(2,5-dichlorophenoxy)-purin-2-yl)isobutyramide <220> <221> modified_base <222> (6) <223> 5-methyl-4-phenoxypyrimidin-2-one <220> <221> modified_base <222> (7) <223> N-(6-(2,5-dichlorophenoxy)-purin-2-yl)isobutyramide <220> <221> modified_base <222> (8) <223> N-(purin-6-yl)benzamide <220> <221> modified_base <222> (9) <223> N-(6-(2,5-dichlorophenoxy)-purin-2-yl)isobutyramide <220> <221> modified_base <222> (10) <223> 5-methyl-4-phenoxypyrimidin-2-one <220> <221> modified_base <222> (11) <223> N-(6-(2,5-dichlorophenoxy)-purin-2-yl)isobutyramide <220> <221> modified_base <222> (12) <223> 3O'-pentan1,4-dione <220> <221> modified_base <222> (12) <223> N-(purin-6-yl)benzamide <400> 1 gtgagtgagt ga 12 <210> 2 <211> 16 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> synthesis exemple <220> <221> modified_base <222> (1) <223> N-(6-(2,5-dichlorophenoxy)-purin-2-yl)isobutyramide <220> <221> misc_structure <222> (1)..(15) <223> 4'O-P-thiomethyl propionate <220> <221> modified_base <222> (2) <223> 5-methyl-4-phenoxypyrimidin-2-one <220> <221> modified_base <222> (3) <223> N-(6-(2,5-dichlorophenoxy)-purin-2-yl)isobutyramide <220> <221> modified_base <222> (4) <223> N-(purin-6-yl)benzamide <220> <221> modified_base <222> (5) <223> N-(6-(2,5-dichlorophenoxy)-purin-2-yl)isobutyramide <220> <221> modified_base <222> (6) <223> 5-methyl-4-phenoxypyrimidin-2-one <220> <221> modified_base <222> (7) <223> N-(6-(2,5-dichlorophenoxy)-purin-2-yl)isobutyramide <220> <221> modified_base <222> (8) <223> N-(purin-6-yl)benzamide <220> <221> modified_base <222> (9) <223> N-(6-(2,5-dichlorophenoxy)-purin-2-yl)isobutyramide <220> <221> modified_base <222> (10) <223> 5-methyl-4-phenoxypyrimidin-2-one <220> <221> modified_base <222> (11) <223> N-(6-(2,5-dichlorophenoxy)-purin-2-yl)isobutyramide <220> <221> modified_base <222> (12) <223> N-(purin-6-yl)benzamide <220> <221> modified_base <222> (13) <223> N-(6-(2,5-dichlorophenoxy)-purin-2-yl)isobutyramide <220> <221> modified_base <222> (14) <223> 5-methyl-4-phenoxypyrimidin-2-one <220> <221> modified_base <222> (15) <223> N-(6-(2,5-dichlorophenoxy)-purin-2-yl)isobutyramide <220> <221> modified_base <222> (16) <223> N-(purin-6-yl)benzamide <220> <221> misc_feature <222> (16) <223> 3O'-pentan1,4-dione <400> 2 gtgagtgagt gagtga 16 <110> Girindus America Inc <120> Sulfurizing reagents and their use for oligonucleotides synthesis <130> GIR 2008/02 <140> US 61 / 140,391 <141> 2008-12-23 <160> 2 <170> PatentIn version 3.3 <210> 1 <211> 12 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Synthetic Sequence <220> <221> modified_base <222> (1) N- (6- (2,5-dichlorophenoxy) -purin-2-yl) isobutyramide <220> <221> misc_feature (222) (1) .. (11) 4'O-P-thiomethyl propionate <220> <221> modified_base <222> (2) <223> 5-methyl-4-phenoxypyrimidin-2-one <220> <221> modified_base <222> (3) N- (6- (2,5-dichlorophenoxy) -purin-2-yl) isobutyramide <220> <221> modified_base <222> (4) N- (purin-6-yl) benzamide <220> <221> modified_base <222> (5) N- (6- (2,5-dichlorophenoxy) -purin-2-yl) isobutyramide <220> <221> modified_base <222> (6) <223> 5-methyl-4-phenoxypyrimidin-2-one <220> <221> modified_base <222> (7) N- (6- (2,5-dichlorophenoxy) -purin-2-yl) isobutyramide <220> <221> modified_base <222> (8) N- (purin-6-yl) benzamide <220> <221> modified_base <222> (9) N- (6- (2,5-dichlorophenoxy) -purin-2-yl) isobutyramide <220> <221> modified_base <222> (10) <223> 5-methyl-4-phenoxypyrimidin-2-one <220> <221> modified_base <222> (11) N- (6- (2,5-dichlorophenoxy) -purin-2-yl) isobutyramide <220> <221> modified_base <222> (12) <223> 3O'-pentan 1,4-dione <220> <221> modified_base <222> (12) N- (purin-6-yl) benzamide <400> 1 gtgagtgagt ga 12 <210> 2 <211> 16 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> synthesis exemple <220> <221> modified_base <222> (1) N- (6- (2,5-dichlorophenoxy) -purin-2-yl) isobutyramide <220> <221> misc_structure (222) (1) .. (15) 4'O-P-thiomethyl propionate <220> <221> modified_base <222> (2) <223> 5-methyl-4-phenoxypyrimidin-2-one <220> <221> modified_base <222> (3) N- (6- (2,5-dichlorophenoxy) -purin-2-yl) isobutyramide <220> <221> modified_base <222> (4) N- (purin-6-yl) benzamide <220> <221> modified_base <222> (5) N- (6- (2,5-dichlorophenoxy) -purin-2-yl) isobutyramide <220> <221> modified_base <222> (6) <223> 5-methyl-4-phenoxypyrimidin-2-one <220> <221> modified_base <222> (7) N- (6- (2,5-dichlorophenoxy) -purin-2-yl) isobutyramide <220> <221> modified_base <222> (8) N- (purin-6-yl) benzamide <220> <221> modified_base <222> (9) N- (6- (2,5-dichlorophenoxy) -purin-2-yl) isobutyramide <220> <221> modified_base <222> (10) <223> 5-methyl-4-phenoxypyrimidin-2-one <220> <221> modified_base <222> (11) N- (6- (2,5-dichlorophenoxy) -purin-2-yl) isobutyramide <220> <221> modified_base <222> (12) N- (purin-6-yl) benzamide <220> <221> modified_base <222> (13) N- (6- (2,5-dichlorophenoxy) -purin-2-yl) isobutyramide <220> <221> modified_base <222> (14) <223> 5-methyl-4-phenoxypyrimidin-2-one <220> <221> modified_base <222> (15) N- (6- (2,5-dichlorophenoxy) -purin-2-yl) isobutyramide <220> <221> modified_base <222> (16) N- (purin-6-yl) benzamide <220> <221> misc_feature <222> (16) <223> 3O'-pentan 1,4-dione <400> 2 gtgagtgagt gagtga 16

Claims (49)

P-S-R 결합을 포함한 하나 이상의 뉴클레오타이드간 결합(internucleotide linkage)과, 둘 이상의 뉴클레오사이드를 포함하는 올리고뉴클레오타이드이며, R은 하기 화학식(I)에 해당된다:
Figure pct00023

(식 중, A는 동일위치에 치환되는 알킬렌기, 바람직하게는 CH2이고; X 및 Y는 S 및 0 중에서 독립적으로 선택되고; R0은 임의 치환된 탄소-결합된 유기 잔기, 예를 들어 구체적으로는 임의 치환된 알킬 또는 아릴, SRx, ORx 및 NRxRy (Rx 및/또는 Ry는 H 및 유기 잔기 중에서 선택되며 적어도 Rx는 H 이외의 치환기)로 이루어진 군에서 선택됨).
At least one internucleotide linkage comprising a PSR linkage and an oligonucleotide comprising at least two nucleosides, wherein R corresponds to formula (I)
Figure pct00023

Wherein A is an alkylene group substituted at the same position, preferably CH 2 ; X and Y are independently selected from S and 0; R 0 is an optionally substituted carbon-bonded organic moiety, for example Specifically, optionally substituted alkyl or aryl, SR x , OR x and NR x R y , wherein R x and / or R y are selected from H and organic moieties and at least R x is a substituent other than H ).
제1항에 있어서, R이 메틸렌아실옥시기, 메틸렌카보네이트기 및 메틸렌카바메이트기 중에서 선택되는 것인 올리고뉴클레오타이드.The oligonucleotide according to claim 1, wherein R is selected from methyleneacyloxy group, methylenecarbonate group and methylenecarbamate group. 제1항 또는 제2항에 있어서, R은 화학식 -CH2-O-C(O)-R0 (식 중, R0은 C1-C20의 포화, 불포화, 헤테로사이클릭 또는 방향족, 탄화수소 잔기임)에 해당되는 것인 올리고뉴클레오타이드.The compound of claim 1 or 2, wherein R is of the formula -CH 2 -OC (O) -R 0 Wherein R 0 is a saturated, unsaturated, heterocyclic or aromatic, hydrocarbon moiety of C 1 -C 20. 제1항 또는 제2항에 있어서, R은 화학식 -CH2-O-C(O)-NRxRy (식 중, Rx 및 Ry는 독립적으로 알킬 또는 (헤테로)아릴 중에서 선택되고, 바람직하게 Rx 및 Ry는 알킬이거나, 또는 Rx 및 Ry는 함께 O, N 및 S 중에서 선택되는 추가 환형 헤테로원자를 임의로 함유한 3 내지 8원 고리를 형성함)의 메틸렌카바메이트기에 해당되는 것인 올리고뉴클레오타이드.3. The compound of claim 1, wherein R is of the formula —CH 2 —OC (O) —NR × R y , wherein R x and R y are independently selected from alkyl or (hetero) aryl, and preferably R x and R y are alkyl, or R x and R y together form a 3-8 membered ring optionally containing an additional cyclic heteroatom selected from O, N and S) Phosphorus oligonucleotide. 제1항 또는 제2항에 있어서, R은 화학식 -CH2-O-C(O)ORx(식 중, Rx는 임의 치환된 알킬, 사이클로알킬 및 (헤테로)아릴기 중에서 선택됨)의 메틸렌카보네이트기에 해당되는 것인 올리고뉴클레오타이드.3. The methylenecarbonate group of claim 1, wherein R is a group of the formula -CH 2 -OC (O) OR x wherein R x is selected from optionally substituted alkyl, cycloalkyl, and (hetero) aryl groups Oligonucleotides that are applicable. 제2항 내지 제5항 중 어느 한 항에 있어서, Rx는 저급알킬 또는 사이클로알킬 (C1-C7) 잔기, 치환된 페닐기 및 나프틸기를 포함하는 페닐 중에서 선택되는 것인 올리고뉴클레오타이드.6. The oligonucleotide of claim 2, wherein R x is selected from phenyl comprising lower alkyl or cycloalkyl (C 1 -C 7) residues, substituted phenyl groups, and naphthyl groups. 7. 제1항 내지 제6항 중 어느 한 항에 있어서, 2 내지 30개의 뉴클레오타이드를 포함하는 올리고뉴클레오타이드.The oligonucleotide of claim 1, wherein the oligonucleotide comprises 2 to 30 nucleotides. 제1항 내지 제6항 중 어느 한 항에 있어서, 리보뉴클레오사이드, 2'-디옥시리보뉴클레오사이드, 2'-치환된 리보뉴클레오사이드, 2'-4'-고정된-리보뉴클레오사이드, 3'-아미노-리보뉴클레오사이드, 3'-아미노-2'-디옥시리보뉴클레오사이드 중에서 선택되는 뉴클레오사이드를 함유하는 올리고뉴클레오타이드.The ribonucleoside, 2'-deoxyribonucleoside, 2'-substituted ribonucleoside, 2'-4'-fixed-ribonucleoside according to any one of claims 1 to 6 Oligonucleotide containing a nucleoside selected from 3'-amino-ribonucleoside, 3'-amino-2'-deoxyribonucleoside. 제1항 내지 제8항 중 어느 한 항에 있어서, 전구약물로서의 올리고뉴클레오타이드.The oligonucleotide of any one of claims 1 to 8 as prodrug. 하나 이상의 티오포스페이트 결합을 갖는 제2 올리고뉴클레오타이드의 제조 방법이며, (a) 제1항 내지 제8항 중 어느 한 항에 따른 제1 올리고뉴클레오타이드를 제공하는 단계, 및 (b) 상기 제1 올리고뉴클레오타이드로부터 하나 이상의 R기를 절단시켜 하나 이상의 포스포로티오에이트 결합을 갖는 상기 제2 올리고뉴클레오타이드를 생성하는 단계를 포함하는 방법.A method of preparing a second oligonucleotide having at least one thiophosphate bond, the method comprising the steps of: (a) providing a first oligonucleotide according to any one of claims 1 to 8, and (b) said first oligonucleotide Cleaving at least one R group from to produce said second oligonucleotide having at least one phosphorothioate linkage. 제10항에 있어서, R기는, 바람직하게 알킬, 사이클로알킬 및 방향족 아민 중에서; 더 바람직하게는 일차 아민 또는 이차 알킬아민 중에서; 가장 바람직하게는 n-프로필 및 터트-부틸 아민 중에서 선택되는 염기와 용액상 제1 올리고뉴클레오타이드를 반응시켜 절단되는 것인 방법.The compound of claim 10, wherein the R group is preferably in alkyl, cycloalkyl and aromatic amine; More preferably in primary amine or secondary alkylamine; Most preferably, cleaved by reacting a solution selected from a base selected from n-propyl and tert-butyl amine with the first oligonucleotide. 제10항에 있어서, 염기는 장애 일차 아민인 것인 방법.The method of claim 10, wherein the base is a hindered primary amine. 제10항 내지 제12항 중 어느 한 항에 있어서, 절단 단계는 입체 장애 염기, 및 일반적으로 N-헤테로방향족 염기로 이루어진 활성제의 존재 하에 수행되는 것인 방법.13. The method of any one of claims 10-12, wherein the cleavage step is carried out in the presence of an sterically hindered base and an active agent which generally consists of N-heteroaromatic bases. 제24항에 있어서, 제1 염기는, 알킬기가 C1 내지 C20의 선형 또는 분지형 알킬 중에서 선택되는 동일하거나 상이한 치환기들을 포함하는 알킬 일차 아민인 것인 방법. 제24항에 있어서, 제1 염기는, 아릴기가 제2 및/또는 6 위치에서 선형 또는 분지형의 알킬 또는 아릴기를 포함하는 아릴 일차 아민인 것인 방법.The method of claim 24, wherein the first base is an alkyl primary amine having the same or different substituents selected from linear or branched alkyl of C 1 to C 20. The method of claim 24, wherein the first base is an aryl primary amine wherein the aryl group comprises a linear or branched alkyl or aryl group in the second and / or 6 positions. 제24항 또는 제25항에 있어서, 활성제가 1,2,4-트리아졸 또는 기타 트리아졸 및 테트라졸 유도체인 것인 방법.The method of claim 24 or 25, wherein the active agent is 1,2,4-triazole or other triazole and tetrazole derivatives. 제24항 내지 제26항 중 어느 한 항에 따른 올리고뉴클레오타이드를 탈보호시키는 방법이며, 입체 장애 염기가 터트-부틸 아민인 것인 방법.27. A method of deprotecting an oligonucleotide according to any of claims 24 to 26, wherein the hindered base is tert-butyl amine. 제9항 내지 제16항 중 어느 한 항에 있어서, 하나 이상의 티오포스포에이트 결합을 갖는 상기 제2 올리고뉴클레오타이드의 정제 단계를 더 포함하는 방법.The method of any one of claims 9 to 16, further comprising the step of purifying said second oligonucleotide having one or more thiophosphoate linkages. 제17항에 있어서, 제2 올리고뉴클레오타이드를 적어도 침전시키는 단계를 포함하는 방법.The method of claim 17 comprising at least precipitating a second oligonucleotide. 제17항 또는 제18항에 있어서, 제2 올리고뉴클레오타이드를 용매로 추출시키는 단계를 더 포함하는 방법.19. The method of claim 17 or 18, further comprising extracting the second oligonucleotide with a solvent. 제18항 또는 제19항에 있어서, 염화메틸렌, 클로로포름, 아세토니트릴, 아세톤 및 피리딘 중에서 바람직하게 선택되는 극성 유기 용매에 제2 올리고뉴클레오타이드를 용해시키는 단계를 포함하는 방법.The method of claim 18 or 19 comprising dissolving the second oligonucleotide in a polar organic solvent preferably selected from methylene chloride, chloroform, acetonitrile, acetone and pyridine. 제20항에 있어서, 약 0.5(n+1)mL 내지 약 2.0(n+1)mL의 범위 내, 바람직하게는 약 1.0(n+1)mL (n은 포스포로티오에이트 트리에스테르 결합의 밀리몰 수임)의 용매 부피가 사용되는 방법.21. The method of claim 20, wherein in the range of about 0.5 (n + 1) mL to about 2.0 (n + 1) mL, preferably about 1.0 (n + 1) mL (n is millimoles of phosphorothioate triester bonds) Aqueous solvent volume) is used. 제20항 또는 제21항에 있어서, 제2 올리고뉴클레오타이드의 용액이 탁해질 때까지, 상기 용액을 탄화수소, 에테르 용매 및 이들의 혼합물 중에서 바람직하게 선택된 비극성 유기 용매로 처리하는 것인 방법.22. The process according to claim 20 or 21, wherein the solution is treated with a nonpolar organic solvent preferably selected from hydrocarbons, ether solvents and mixtures thereof until the solution of the second oligonucleotide becomes cloudy. 제22항에 있어서, 약 1(n+1)mL 내지 약 4(n+1)mL의 범위 내, 바람직하게는 약 2.0(n+1)mL (n은 포스포로티오에이트 트리에스테르 결합의 밀리몰 수임)의 용매 부피가 사용되는 방법.23. The method of claim 22, wherein in the range of about 1 (n + 1) mL to about 4 (n + 1) mL, preferably about 2.0 (n + 1) mL (n is the millimoles of the phosphorothioate triester bonds Aqueous solvent volume) is used. 제22항 또는 제23항에 있어서, 탁한 용액을 침전보조제로 처리하는 방법.The method according to claim 22 or 23, wherein the turbid solution is treated with a precipitation aid. 제23항에 있어서, 침전보조제는, 셀라이트, 석탄, 목재셀룰로오스, 및 실리카 또는 알루미나 같은 크로마토그래피 고정상 중에서 바람직하게 선택된 비활성 다공성 고체 중에서 선택되는 것인 방법.The method of claim 23, wherein the precipitation aid is selected from inert porous solids preferably selected from celite, coal, wood cellulose, and chromatographic stationary phases such as silica or alumina. 제24항 또는 제25항에 있어서, 침전보조제는 약 0.25(n+1)g 내지 약 1.5(n+1)g의 범위 내, 바람직하게는 약 0.75(n+1)g (n은 포스포로티오에이트 트리에스테르 결합의 밀리몰 수임)의 양으로 사용되는 것인 방법.26. The precipitating aid according to claim 24 or 25, wherein the precipitation aid is in the range of about 0.25 (n + 1) g to about 1.5 (n + 1) g, preferably about 0.75 (n + 1) g (n is phosphoro). Used in the amount of millimolar of thioate triester bonds). 제25항에 있어서, 침전보조제를 첨가하고 난 후 혼합물을 비극성 유기 용매의 제2분획으로 처리하며, 상기 분획의 부피는 일반적으로 약 1(n+1)mL 내지 약 4(n+1)mL의 범위에 속하고, 바람직하게는 약 2.0(n+1)mL (n은 포스포로티오에이트 트리에스테르 결합의 밀리몰 수임)인 것인 방법.26. The process of claim 25, wherein after the addition of the precipitation aid the mixture is treated with a second fraction of a non-polar organic solvent, the volume of the fraction generally being from about 1 (n + 1) mL to about 4 (n + 1) mL And preferably about 2.0 (n + 1) mL (where n is the millimolar number of phosphorothioate triester bonds). 제24항 내지 제27항 중 어느 한 항에 있어서, 침전 단계에서 얻는 고체 물질을 여과시키고 세척하는 방법.28. The method of any of claims 24 to 27, wherein the solid material obtained in the precipitation step is filtered and washed. 제18항 내지 제28항 중 어느 한 항에 있어서, 올리고뉴클레오타이드는 용매를 이용하여 올리고뉴클레오타이드-함유 침전물로부터 추출되는 것인 방법.29. The method of any one of claims 18-28, wherein the oligonucleotide is extracted from the oligonucleotide-containing precipitate using a solvent. 제29항에 있어서, 용매는 아세토니트릴, 아세톤, THF, DMF, DMSO 및 피리딘 중에서 바람직하게 선택되는 극성 유기 용매와, 바람직하게는 물인 수성 매질의 혼합물을 포함하며; 극성 유기 용매/수성 매질의 부피비는 바람직하게 약 0.5 내지 1.5이며, 더 바람직하게는 약 0.7인 것인 방법.The solvent of claim 29 wherein the solvent comprises a mixture of a polar organic solvent preferably selected from acetonitrile, acetone, THF, DMF, DMSO and pyridine, and preferably an aqueous medium which is water; The volume ratio of polar organic solvent / aqueous medium is preferably about 0.5 to 1.5, more preferably about 0.7. 제10항에 있어서, 메틸렌아실옥시기, 메틸렌카바메이트기 또는 메틸렌카보네이트기 중에서 바람직하게 선택되는 R기는, 인간의 몸 또는 동물의 몸에서 절단되는 것인 방법.The method according to claim 10, wherein the R group preferably selected from a methyleneacyloxy group, a methylene carbamate group or a methylene carbonate group is cleaved in the human body or the body of an animal. 화학식 R"-S-R의 황화제이며, R은 하기 화학식(I)에 해당된다:
Figure pct00024

(식 중, A는 동일위치에 치환되는 알킬렌기, 바람직하게는 CH2이고; X 및 Y는 S 및 0 중에서 독립적으로 선택되고; R0은 임의 치환된 알킬 또는 아릴, SRx, ORx 및 NRxRy (Rx 및 Ry는 H 및 유기 잔기 중에서 선택되며 적어도 Rx는 H 이외의 치환기임)로 이루어진 군에서 선택됨)로 이루어진 군에서 선택됨).
A sulfiding agent of formula R ″ -SR, wherein R corresponds to formula (I)
Figure pct00024

Wherein A is an alkylene group substituted at the same position, preferably CH 2 ; X and Y are independently selected from S and 0; R 0 is optionally substituted alkyl or aryl, SR x , OR x and NR x R y (R x and R y are selected from H and organic moieties and at least R x is a substituent other than H).
제32항에 있어서, R은 메틸렌아실옥시기, 메틸렌카바메이트기 또는 메틸렌카보네이트기 중에서 선택되고, R"는 이탈기인 것인 황화제.33. The sulfiding agent of claim 32, wherein R is selected from methyleneacyloxy group, methylenecarbamate group or methylenecarbonate group and R " is a leaving group. 제32항 또는 제33항에 있어서, R은 제1항 내지 제6항 중 어느 한 항에 기재된 바와 같은 황화제.34. The sulfiding agent according to claim 32 or 33, wherein R is as described in any one of claims 1 to 6. 제32항 내지 제34항 중 어느 한 항에 있어서, 하기 화학식(II)에 해당되는 황화제:
Figure pct00025

(식 중, RA 및 RB는 서로 동일하거나 상이하며 RA 및 RB 중 적어도 하나는 치환된 설포닐기 또는 아실기 중에서 선택되며, 상기 RA 및 RB는 임의로 함께 고리형 치환기를 형성함).
35. The sulfiding agent according to any one of claims 32 to 34, which corresponds to formula (II):
Figure pct00025

Wherein R A and R B are the same or different from each other and R A and R B At least one of which is selected from a substituted sulfonyl group or acyl group, wherein R A and R B optionally together form a cyclic substituent).
제32항 내지 제35항 중 어느 한 항에 있어서, R"가 설폰아미드기이며, 바람직하게는 N-치환-N-알킬설포닐인 것인 황화제.36. The sulfiding agent according to any one of claims 32 to 35, wherein R "is a sulfonamide group, preferably N-substituted-N-alkylsulfonyl. 제36항에 있어서, 하기 화학식(III)에 해당되는 황화제:
Figure pct00026

(식 중, R1, R3 및 R4는 독립적으로 C1-C20의 임의의 불포화 또는 방향족의 탄화수소 잔기이며, 바람직하게는 선형 또는 분지형 알킬기 또는 사이클로알킬기임).
37. The sulfiding agent of claim 36 corresponding to formula (III):
Figure pct00026

Wherein R 1 , R 3 and R 4 are independently any unsaturated or aromatic hydrocarbon moiety of C 1 -C 20, preferably a linear or branched alkyl group or a cycloalkyl group.
제32항 내지 제35항 중 어느 한 항에 있어서, R"가 디카복실아미드인 것인 황화제.36. A sulfiding agent according to any one of claims 32 to 35 wherein R "is dicarboxyamide. 제38항에 있어서, 하기 화학식(IV)에 해당되는 황화제:
Figure pct00027

(식 중, Z는 -CH2-CH2-, -CH=CH-, -CH2-O-CH2-,
Figure pct00028
로 이루어진 군 중에서 선택되는 기이며, 바람직하게 Z는
Figure pct00029
기임).
The sulfiding agent according to claim 38, which corresponds to formula (IV):
Figure pct00027

(Wherein Z is -CH 2 -CH 2- , -CH = CH-, -CH 2 -O-CH 2- ,
Figure pct00028
Group is selected from the group consisting of, preferably Z is
Figure pct00029
Term).
올리고뉴클레오타이드의 합성 방법이며, 상기 올리고뉴클레오드의 전구체의 하나 이상의 인광성 뉴클레오타이드간 결합(phosphorus internucleotide linkage)을 황화시키기 위해 제32항 내지 제39항 중 어느 한 항에 따른 황화제를 사용하는 것을 포함하는 방법.A method of synthesizing oligonucleotides, the method comprising using a sulfiding agent according to any one of claims 32 to 39 to sulfide one or more phosphorus internucleotide linkages of the precursor of the oligonucleotide. How to include. 제40항에 있어서, 인광성 뉴클레오타이드간 결합이 H-포스포네이트 디에스테르 결합인 것인 방법.41. The method of claim 40, wherein the phosphorescent internucleotide bond is an H-phosphonate diester bond. 제41항에 있어서, H-포스포네이트 모노에스테르염을 보호된 뉴클레오사이드와 커플링시키거나 또는 자유 하이드록시기를 갖는 올리고뉴클레오타이드와 커플링시켜 H-포스포네이트 디에스테르 결합을 형성하는 단계를 더 포함하는 방법.42. The method of claim 41, wherein coupling the H-phosphonate monoester salt with a protected nucleoside or with an oligonucleotide having a free hydroxyl group to form an H-phosphonate diester bond How to include more. 제41항 또는 제42항에 있어서, 커플링 조작을 용액상에서 수행하는 방법.43. The method of claim 41 or 42, wherein the coupling operation is carried out in solution. 제32항 내지 제37항 중 어느 한 항에 기재된 바와 같은 황화제의 합성 방법이며, (a) 설퍼릴 할라이드, 바람직하게는 염화 설포릴을 화학식 R-S-C(O)-R2(식 중, R은 제1항 내지 제6항에 기재된 바와 같고, R2는 유기 잔기로서 바람직하게는 C1-C20 임의의 불포화 또는 방향족 탄화수소 잔기 중에서 선택됨)의 티오아세탈과 반응시켜 화학식 R-S-W (식 중, W는 할로겐이며, 바람직하게는 C1임)의 중간생성물을 생성하는 단계, 및 (b) 상기 중간생성물을 N-설포닐 화합물 또는 N-아실 화합물과 반응시키는 단계를 포함하는 방법.38. A method of synthesizing a sulfiding agent as described in any one of claims 32-37, wherein (a) a sulfuryl halide, preferably sulforyl chloride, is represented by the formula RSC (O) -R 2 As described in claims 1 to 6, R 2 is an organic moiety, preferably reacted with a thioacetal of C 1 -C 20 any unsaturated or aromatic hydrocarbon moiety, of formula RSW wherein W is halogen , Preferably C1), and (b) reacting the intermediate with an N-sulfonyl compound or N-acyl compound. 제44항에 있어서, 화학식 R1-C(O)-O-CH2-S-C(O)-R2 (식 중, R1 및 R2는 독립적으로 C1-C20 임의의 불포화 또는 방향족 탄화수소 잔기임)의 티오아세탈을 염화 설퍼릴과 반응시켜 화학식 R1-C(O)-O-CH2-S-Cl(식 중, R1은 독립적으로 C1-C20, 임의의 불포화 또는 방향족 탄화수소 잔기임)의 중간생성물을 생성하는 방법.45. The compound of claim 44, wherein formula R 1 -C (O) -O-CH 2 -SC (O) -R 2 Wherein R 1 and R 2 are independently C 1 -C 20 any unsaturated or aromatic hydrocarbon moiety, reacting thioacetal with sulfuryl chloride to give the formula R 1 -C (O) -O-CH 2 -S- A process for producing an intermediate of Cl wherein R 1 is independently C 1 -C 20, any unsaturated or aromatic hydrocarbon residue. 제44항 또는 제45항에 있어서, 단계 (b)에서 중간생성물을 화학식 R3-S(O)2-NH-R4 (식 중, R3 및 R4는 독립적으로 유기 잔기이며, 바람직하게는 C1-C20의 임의의 불포화 또는 방향족 탄화수소 잔기임)의 N-설포닐 화합물과 반응시키는 방법.46. The process of claim 44 or 45, wherein the intermediate in step (b) is a compound of formula R 3 -S (O) 2 -NH-R 4 wherein R 3 and R 4 are independently organic moieties, preferably Is an optionally unsaturated or aromatic hydrocarbon residue of C 1 -C 20. 제44항 또는 제45항에 있어서, 단계 (b)에서 중간생성물을 하기 화학식의 N-아실 화합물과 반응시키는 방법.
Figure pct00030

(식 중, Z는 -CH2-CH-, -CH=CH-, -CH2-O-CH2-,
Figure pct00031
로 이루어진 군 중에서 선택되는 기이며, 바람직하게 Z는
Figure pct00032
기임).
46. The process of claim 44 or 45, wherein in step (b) the intermediate is reacted with an N-acyl compound of formula
Figure pct00030

(Wherein Z is -CH 2 -CH-, -CH = CH-, -CH 2 -O-CH 2- ,
Figure pct00031
Group is selected from the group consisting of, preferably Z is
Figure pct00032
Term).
제45항 내지 제47항 중 어느 한 항에 있어서, R1은 저급알킬 또는 사이클로알킬 (C1-C7) 잔기, 치환된 페닐기 및 나프틸기를 포함하는 페닐 중에서 선택되며, 더 바람직하게는 에틸기인 것인 방법.48. The compound of any one of claims 45 to 47, wherein R 1 is selected from phenyl comprising a lower alkyl or cycloalkyl (C1-C7) moiety, a substituted phenyl group and a naphthyl group, more preferably an ethyl group. How to be. 제44항 내지 제47항 중 어느 한 항에 있어서, R2 , R3 및 R4는 저급알킬 또는 사이클로알킬 (C1-C7) 잔기, 치환된 페닐기 및 나프틸기를 포함하는 페닐 중에서 중에서 선택되며, 더 바람직하게는 메틸기인 것인 방법.48. The compound of any of claims 44-47, wherein R 2 , R 3 and R 4 are selected from among phenyl comprising lower alkyl or cycloalkyl (C 1 -C 7) residues, substituted phenyl groups and naphthyl groups, More preferably a methyl group.
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