KR20110021522A - Sumo-ubc9 fusion protein enhnacing sumo modification of target proteins containing a sumo-interacting motif(sim) - Google Patents

Sumo-ubc9 fusion protein enhnacing sumo modification of target proteins containing a sumo-interacting motif(sim) Download PDF

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Abstract

PURPOSE: A novel SUMO conjugation enzyme and a method for screening a SUMO-targeting protein using the same are provided to prepare sumoylated protein and to analyze function. CONSTITUTION: A SUMO conjugation enzyme has an amino acid sequence of sequence number 2. A gene encoding the SUMO conjugation enzyme has a base sequence of sequence number 1. An expression vector producing the SUMO conjugation enzyme contains the gene encoding the SUMO conjugation enzyme. A composition for enhancing interaction with a SUMO target protein contains the SUMO conjugation enzyme or gene thereof as an active ingredient. The SUMO target protein contains SIM(SUMO-interacting motif).

Description

SUMO-interacting motif (SIM)를 포함하는 단백질들의 SUMO modification을 증가시키는 SUMO-Ubc9 융합 단백질{SUMO-Ubc9 fusion protein enhnacing SUMO modification of target proteins containing a SUMO-interacting motif(SIM)} SUMO-Ubc9 fusion protein enhnacing SUMO modification of target proteins containing a SUMO-interacting motif (SIM) to increase the SOMMO-Mc9 fusion protein of proteins containing SMO-Uc9 fusion protein (SIM)

본 발명은 신규한 수모 컨쥬게이션 효소(SUMO conjugation enzyme; small ubiquitin-like modifier conjugation enzyme), 이를 코딩하는 유전자, 이들을 포함하는 수모 표적 단백질과의 상호작용 증가용 조성물, 수모 표적 단백질 동정용 조성물 및 이들을 이용한 수모 표적 단백질의 스크리닝 방법에 관한 것이다. The present invention provides a novel SUMO conjugation enzyme (small ubiquitin-like modifier conjugation enzyme), a gene encoding the same, a composition for increasing interaction with a hair growth target protein including the same, a composition for identifying a hair growth target protein, and a combination thereof. It relates to a screening method of the used hair growth target protein.

수모(small ubiquitin-like modifiers; SUMOs)는 다양한 단백질에 공유 결합적으로 수식되어 세포 내 위치, 단백질의 안정성, 및 다른 단백질 및 핵산과의 상호작용 능력을 변화시킨다. 특히, 단백질의 수모화는 전사, 매크로분자의 이동, 핵산 구조 유지, 핵산 DNA 대사, 세포 신호전달, 및 신경퇴행성장애(neurodegenerative disorders)와 관련된 다양한 단백질의 기능에 영향을 미친 다. Small ubiquitin-like modifiers (SUMOs) are covalently modified to various proteins to alter their location in cells, their stability, and their ability to interact with other proteins and nucleic acids. In particular, hydration of proteins affects the function of various proteins associated with transcription, migration of macromolecules, nucleic acid structure maintenance, nucleic acid DNA metabolism, cell signaling, and neurodegenerative disorders.

단백질의 수모화는 E1, E2, 및 E3 효소에 의하여 매개된다. 구체적으로 수모화 경로에서 수모 전구체 단백질은 C 말단에 존재하는 이중-글리신 모티프(C terminal double-glycine motifs)가 가수분해되고, 가수분해된 수모 전구체 단백질이헤테로메릭 E1 수모 활성화 효소 (SAE1/SAE2)와 티오에스테르(thioester) 결합을 형성함으로써 활성화된 후(ATP 및 Mg2+-의존적 반응), 다시 이동하여 E2 수모 컨쥬게이션 효소 (예를 들어, Ubc9)와의 티오에스테르 결합을 형성한다. 수모는 그 후 E3 수모 연결효소(ligases) 도움을 받거나, 혹은 직접 E2 수모 컨쥬게이션 효소(예를 들어, Ubc9)로부터 기질 단백질의 라이신 잔기로 이동한다.Hydrocyclization of the protein is mediated by the E1, E2, and E3 enzymes. Specifically, in the hair growth pathway, the hair growth precursor protein is hydrolyzed by C terminal double-glycine motifs present at the C terminus, and the hydrolyzed hair growth precursor protein is heteromeric E1 hair activating enzyme (SAE1 / SAE2). and thioester (thioester) after the activation to form a bond (ATP and Mg 2 + - dependent reaction), moves back to form a thioester bond with the conjugated enzyme E2 animal hair (e. g., Ubc9). The hairs are then assisted by E3 hair ligases or migrate directly from the E2 hairs conjugation enzyme (eg, Ubc9) to the lysine residues of the substrate protein.

유비퀴틴화에서는 유비퀴틴 E3 수모 연결효소 군이 기질 특이성을 제공하지만, 수모화의 경우 오직 소수의 포유동물 E3 수모 연결효소 (예를 들어, PIAS family members, RanBP2, 및 Pc2)만이 보고된 바 있다. 수모화에서는 Ubc9가 보존된 모티프인(conserved motif), ψKXE/D (ψ, a bulky hydrophobic residue)를 통하여 표적 단백질의 수정된 라이신 잔기에 직접 결합할 수 있기 때문에, E3 수모 연결효소는 물론 Ubc9도 수모화를 위한 기질 특이성을 조절한다. In ubiquitination, the family of ubiquitin E3 hydrophilases provides substrate specificity, but only a few mammalian E3 hydrophilic enzymes (eg, PIAS family members, RanBP2, and Pc2) have been reported for hydrophilization. In culturing, Ubc9 can bind directly to the modified lysine residues of the target protein via a conserved motif, ψKXE / D (ψ, a bulky hydrophobic residue), so that Ubc9 as well as E3 ligase Modulate substrate specificity for hydrocyclization.

단백질의 수모화는 잘 보존된 세 촉매 작용기(catalytic triad; His, Asp, 및 Cys)를 가지고 있는 센트린/수모(sentrin/SUMO)-특이적 프로테아제 군에 의해 가역적으로 조절된다. Hydrogenation of proteins is reversibly regulated by a group of sentrin / SUMO-specific proteases with three well-conserved catalytic triads (His, Asp, and Cys).

포유동물에서, 세가지 수모 단백질, 수모-1, 수모-2 및 수모-3가 밝혀졌고 수모-1은 수모-2 및 수모 3과 약 45%의 서열 상동성을 가지고, 수모-2 와 수모-3간에는 약 95% 아미노산 서열 상동성을 가진다.In mammals, three hair protein, hair hair-1, hair hair-2 and hair hair-3 have been identified and hair hair-1 has about 45% sequence homology with hair hair-2 and hair hair 3, hair hair-2 and hair hair-3. The liver has about 95% amino acid sequence homology.

수모화는 낮은 수준으로 발생하므로, 수모의 새로운 표적을 동정하고 단백질 수모화에 의한 기능을 이해하는 데에는 많은 제한이 따른다. 최근에, 몇몇 연구들은 Ubc9 활성도가 수모와의 직접 상호작용 또는 수모화에 의해 조절된다고 보고했다. 수모는 Ubc9에 직접 결합하는 것으로 밝혀졌고 이러한 비공유 상호작용은 수모 체인(SUMO chains)의 형성을 촉진한다. Since hair growth occurs at low levels, there are many limitations in identifying new targets of hair and understanding its function by protein hair growth. Recently, several studies have reported that Ubc9 activity is regulated by direct interaction with or induction of hair. The hairs have been found to bind directly to Ubc9 and this non-covalent interaction promotes the formation of SUMO chains.

이에 본원 발명자들은 신규한 수모 컨쥬게이션 효소를 개발하고 intact Ubc9와 비교하여 본원의 신규한 단백질은 Sp100 및 인간 거대세포바이러스(human cytomegalovirus) IE2와 같은 SIM을 포함하는 표적 단백질의 컨쥬게이션 활성도를 현저히 증가시킨다는 것을 발견하고 본원발명을 완성하였다. 아울러, IE2 SIM mutant를 이용한 분석 결과, 본원의 신규한 단백질은 SIM을 포함하는 단백질의 수모화를 증가시킨다는 것을 발견했다. 하기 본원발명의 구체적인 실시예에 기재된 바와 같이 세포 추출물을 통한 풀-다운 분석 결과에 따르면, 본원의 신규한 단백질은 Ubc9 보다 더 다양한 세포 단백질에 결합하였고 더 강한 친화력을 가지고 SIM-포함 단백질과 상호작용을 하였는바, 수모 표적 단백질을 동정하고, SUMO-modified 단백질을 생산하며, 세포의 수모 경로 조절을 위해 유용하게 이용될 수 있을 것으로기대된다.The inventors have therefore developed a novel hair conjugation enzyme and compared to intact Ubc9, the novel protein of the present invention significantly increases the conjugation activity of target proteins including SIMs such as Sp100 and human cytomegalovirus IE2. And the present invention was completed. In addition, analysis using the IE2 SIM mutant revealed that the novel proteins of the present disclosure increase the hydration of proteins comprising SIM. According to the results of the pull-down assay through cell extracts as described in the specific examples of the present invention, the novel proteins of the present invention bind to more diverse cellular proteins than Ubc9 and have a stronger affinity to interact with SIM-containing proteins. As a result, it is expected to be useful for identifying a hair growth target protein, producing a SUMO-modified protein, and regulating the hair growth pathway of cells.

본 발명의 목적은 서열번호 2의 아미노산 서열을 포함하는 신규한 수모 컨쥬게이션 효소(SUMO conjugation enzyme; small ubiquitin-like modifier conjugation enzyme), 서열번호 2의 아미노산 서열을 코딩하는 유전자, 및 이를 포함하여 수모 컨쥬게이션 효소를 생산하는 발현 플라스미드를 제공하기 위한 것이다. An object of the present invention is a novel SUMO conjugation enzyme (SEMO conjugation enzyme; small ubiquitin-like modifier conjugation enzyme) comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 2, genes encoding the amino acid sequence of SEQ ID NO: 2, and To provide an expression plasmid that produces a conjugated enzyme.

본 발명의 목적은 서열번호 2의 아미노산 서열을 포함하는 수모 컨쥬게이션 효소 또는 이를 코딩하는 유전자를 유효성분으로 포함하는 SIM(SUMO-interacting motif) 포함 단백질과의 상호작용 증가용 조성물을 제공하기 위한 것이다. An object of the present invention is to provide a composition for increasing interaction with a SUMO-interacting motif (SIM) containing protein comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 2 or a conjugate conjugation enzyme or a gene encoding the same as an active ingredient. .

본 발명의 목적은 서열번호 2의 아미노산 서열을 포함하는 수모 컨쥬게이션 효소 또는 이를 코딩하는 유전자를 유효성분으로 포함하는 수모 표적 단백질 동정용 조성물 및 이를 이용한 수모 표적 단백질 스크리닝 방법을 제공하기 위한 것이다. It is an object of the present invention to provide a composition for identifying a hair growth target protein comprising a hair growth conjugation enzyme comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 2 or a gene encoding the same, and a method for screening the hair growth target protein using the same.

일 양태로 본 발명은 서열번호 2의 아미노산 서열을 포함하는 신규한 수모 컨쥬게이션 효소(SUMO conjugation enzyme; small ubiquitin-like modifier conjugation enzyme)를 제공한다. In one aspect, the present invention provides a novel SUMO conjugation enzyme (small ubiquitin-like modifier conjugation enzyme) comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 2.

상기 수모 컨쥬게이션 효소는 수모 컨쥬게이션 잔기(K14)가 파괴된 Ubc9의 N-말단에, 이중-글리신 잔기를 포함하는 6개의 카르복실 말단 아미노산이 결실된 수모-1 전구체 단백질의 C-말단을 융합시킨 SUMO-Ubc9 융합 단백질이다(도 1). The hair conjugation enzyme fuses the N-terminus of Ubc9 with the hair conjugation residue (K14) disrupted to the C-terminus of the sumo-1 precursor protein with six carboxyl terminal amino acids including the double-glycine residue. SUMO-Ubc9 fusion protein (FIG. 1).

다른 양태로 본 발명은 서열번호 2의 아미노산 서열을 코딩하는 유전자를 제공한다. 바람직하게는 상기 유전자의 염기서열은 서열번호 1일 수 있으나 이에 제한되지 않는다. In another aspect, the present invention provides a gene encoding an amino acid sequence of SEQ ID NO. Preferably, the base sequence of the gene may be SEQ ID NO: 1, but is not limited thereto.

다른 양태로 본 발명은 상기 유전자를 포함하여 수모 컨쥬게이션 효소를 생산하는 발현 벡터를 제공한다. In another aspect, the present invention provides an expression vector containing the gene to produce a hair conjugation enzyme.

본 발명의 구체적인 실시예에 따르면, pDEST17(Invitrogen), pDEST53(Invitrogen) 등의 플라스미드를 사용하였으나 상기 유전자를 포함하고 서열번호 2의 아미노산 서열을 가진 수모 컨쥬게이션 효소를 발현할 수만 있다면 상기 플라스미드에 제한되지 않는다. According to a specific embodiment of the present invention, plasmids such as pDEST17 (Invitrogen), pDEST53 (Invitrogen), etc. were used, but only if the plasmid was able to express a conjugation conjugate enzyme containing the gene and having the amino acid sequence of SEQ ID NO: 2 It doesn't work.

다른 양태로 본 발명은 서열번호 2의 아미노산 서열을 포함하는 수모 컨쥬게이션 효소 또는 이를 코딩하는 유전자를 유효성분으로 포함하는 수모 표적 단백질과의 상호작용 증가용 조성물을 제공한다. In another aspect, the present invention provides a composition for increasing interaction with a hair growth target protein comprising a hair growth conjugation enzyme comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 2 or a gene encoding the same as an active ingredient.

상기 수모 표적 단백질은 수모 컨쥬게이션 효소와 결합하여 컨쥬게이션 활성화되는 기질 단백질로 바람직하게는 수모 단백질의 C-말단 카르복시기와 이소펩티드 결합이 형성되는 단백질을 모두 포함한다. 수모 표적 단백질의 라이신 잔기의 ε-아미노기에 수모 단백질이 결합하는 것을 수모화(SUMOylation)라 한다. 상기 수모 표적 단백질은 바람직하게는 SIM(SUMO-interacting motif) 영역을 포함하는 SIM 포함 수모 표적 단백질이다. The hair growth target protein is a substrate protein which is conjugated and activated by the hair growth conjugation enzyme, and preferably includes both the C-terminal carboxyl group of the hair growth protein and a protein which forms an isopeptide bond. The binding of the hair protein to the ε-amino group of the lysine residue of the hair hair target protein is called SUMOylation. The hair growth target protein is preferably a SIM containing hair growth target protein comprising a SUMO-interacting motif (SIM) region.

본 발명의 구체적인 실험예에 따르면, 수모 표적 단백질에의 결합 패턴을 분석한 결과 본원의 신규한 수모 컨쥬게이션 효소는 Ubc9에 비해 현저히 증가된 컨쥬게이트 활성도를 갖고 있음을 확인할 수 있었다(도 2B, 도 3C 왼쪽). 또한, 본원의 신규한 수모 컨쥬게이션 효소는 Ubc9에 비해 더 다양한 단백질에 결합하고(도 4A 왼쪽), 기질 단백질과 상당히 높은 결합 친화력을 가짐(도 4A 오른쪽)을 확인할 수 있었다. According to a specific experimental example of the present invention, as a result of analyzing the binding pattern to the hair growth target protein, it was confirmed that the novel hair growth conjugation enzyme of the present invention had a significantly increased conjugate activity compared to Ubc9 (FIG. 2B, FIG. 2). 3C left). In addition, the novel hydrocapital conjugation enzyme of the present application binds to a wider variety of proteins than Ubc9 (Figure 4A left) and has a significantly higher binding affinity with substrate proteins (Figure 4A right).

이에, 상기 수모 표적 단백질과의 상호작용 증가는 예를 들어, 수모 표적 단백질에의 컨쥬게이션 활성도 혹은 친화력(affinity) 증가 또는 상호작용 단백질의 다양성 증가를 포함한다. As such, increased interaction with the hairy target protein includes, for example, increased conjugation activity or affinity to the hairy target protein or increased diversity of the interacting protein.

본 발명의 조성물은 수모화 단백질의 대량생산을 가능하게 하여 단백질의 수모화와 관련 있는 각종 암, 백혈병, 당뇨병, 치매 등의 상관성을 연구하고, 이의 치료제 및 치료 방법을 연구개발하는 수단으로 유용하게 사용될 수 있다. The composition of the present invention enables mass production of hydration proteins, and studies the correlation of various cancers, leukemias, diabetes mellitus, dementia, etc. related to hydration of proteins, and is useful as a means for research and development of the therapeutic agents and treatment methods thereof. Can be used.

또한, 수모 표적 단백질과의 상호 작용을 증가시킴으로써 단백질의 수모화와 관련 있는 각종 암, 백혈병, 당뇨병, 치매 등의 예방 및/또는 치료에도 이용될 수 있다. In addition, it can be used to prevent and / or treat various cancers, leukemias, diabetes mellitus, dementia and the like which are related to protein hydration by increasing the interaction with the vesicle target protein.

다른 양태로 본 발명은 서열번호 2의 아미노산 서열을 포함하는 수모 컨쥬게이션 효소 또는 이를 코딩하는 유전자를 유효성분으로 포함하는 수모 표적 단백질 동정용 조성물을 제공한다. In another aspect, the present invention provides a composition for identifying a hair growth target protein comprising a hair growth conjugation enzyme comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 2 or a gene encoding the same as an active ingredient.

본 발명의 구체적인 실험예에 따르면, 수모 표적 단백질에의 결합 패턴을 분석한 결과 본원의 신규한 수모 컨쥬게이션 효소는 수모 표적 단백질에 결합 친화력을 가지고 컨쥬게이션 활성화하므로 본원의 수모 컨쥬게이션 효소는 수모 표적 단백질을 인지함을 확인할 수 있었다. According to a specific experimental example of the present invention, as a result of analyzing the binding pattern to the hair growth target protein, the novel hair growth conjugation enzyme of the present invention has a binding affinity to the hair growth target protein and conjugates and activates the hair growth conjugation enzyme of the present invention. It was confirmed that the protein is recognized.

본 발명의 조성물은 본원의 유효성분인 수모 컨쥬게이션 효소 외에도, 생물제제에 통상적으로 사용되는 안정화제 및 담체, 보조 활성성분 등을 더 포함할 수 있으며 단백질의 구조 또는 생리활성을 안정하게 유지시키는 완충액 또는 반응액을 포함할 수도 있다. The composition of the present invention may further include a stabilizer and a carrier commonly used in biologics, auxiliary active ingredients, and the like, in addition to the hydrophilic conjugation enzyme, which is an active ingredient of the present application, and a buffer solution that stably maintains the structure or physiological activity of the protein. Alternatively, the reaction solution may be included.

다른 양태로 서열번호 2의 아미노산 서열을 포함하는 수모 컨쥬게이션 효소 또는 이를 코딩하는 유전자를 이용한 수모 표적 단백질 스크리닝 방법을 제공한다. In another aspect, the present invention provides a method for screening a target protein using a hair dye conjugation enzyme comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 2 or a gene encoding the same.

바람직하게는, 1) 기질 단백질에 서열번호 2의 아미노산 서열을 포함하는 수모 컨쥬게이션 효소를 처리하는 단계; 2) 기질 단백질 중 수모화(SUMOylation)된 단백질을 동정하는 단계; 3) 상기 2단계에서 얻어진 결과를 분석하여 수모화된 단백질을 기질 단백질 내 수모 표적 단백질로 결정하는 단계를 포함할 수 있다. Preferably, the method comprises the steps of: 1) treating the matrix protein with a hydrophobic conjugation enzyme comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 2; 2) identifying SUMOylated proteins in the substrate protein; 3) analyzing the results obtained in step 2 may include the step of determining the sieved protein as a sieving target protein in the matrix protein.

1 단계는 기질 단백질에 서열 번호 2의 아미노산 서열을 포함하는 수모 컨쥬게이션 효소를 처리하여 수모화시키는 단계이다. 상기 기질 단백질은 대장균, 효모, 세포주 등에서 분리한 단백질 혼합물이 될 수 있고, 또한 대량 발현하여 분리 정제된, 한 종류의 단백질이 될 수도 있다. In the first step, the substrate protein is hydrolyzed by treating a hydrophilic conjugation enzyme comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 2. The matrix protein may be a protein mixture isolated from E. coli, yeast, cell line, or the like, and may also be one kind of protein purified by mass expression.

2단계는 기질 단백질 중 수모화된 단백질을 동정하는 단계로 당업계에 공지된 다양한 방법으로 수모화된 단백질을 동정할 수 있으나 본 발명의 구체적인 실험예에 따르면 쿠마시 블루 염색법 및 이뮤노블랏팅 방법이 이용될 수 있다. The second step is to identify the hydrocyclized protein in the matrix protein, but the hydrophilized protein can be identified by various methods known in the art, but according to the specific experimental example of the present invention, the Coomassie blue staining method and the immunoblotting method are used. Can be used.

3단계는 2단계에서 얻어진 결과를 분석하여 수모화된 단백질을 수모 표적 단백질로 결정하는 단계이다. In step 3, the result obtained in step 2 is analyzed to determine the hydrolyzed protein as the target hair protein.

상기 수모 표적 단백질은 바람직하게는 SIM(SUMO-interacting motif) 포함 단백질이다. The hair growth target protein is preferably a protein comprising a SUMO-interacting motif (SIM).

본 발명의 구체적인 실험예에 따르면, 본원의 신규한 수모 컨쥬게이션 효소를 이용하여 SIM 포함 기질 단백질과 SIM 결실 기질 단백질의 수모화 패턴을 분석한 결과 SIM 포함 기질 단백질만이 효율적으로 수정(modification), 수모화됨을 확인하였고(도 3B), SIM 결실 기질 단백질에서는 Ubc9와 비슷한 컨쥬게이션 활성도를 보이는 반면 SIM 포함 기질 단백질에서는 Ubc9 보다 현저히 높은 컨쥬게이션 활성도를 보임을 확인하였다. According to a specific experimental example of the present invention, by analyzing the hydration pattern of the SIM-containing substrate protein and SIM-deleted substrate protein using the novel hair-conjugation enzyme of the present application, only SIM-containing substrate protein was efficiently modified, It was confirmed that the conjugation (FIG. 3B), the SIM deletion substrate protein showed similar conjugation activity to Ubc9, while the SIM containing substrate protein showed significantly higher conjugation activity than Ubc9.

이상 발명한 바와 같이, 본원의 신규한 단백질은 Ubc9 보다 더 다양한 세포 단백질에 결합할 수 있고 더 강한 친화력을 가지고 SIM-포함 단백질과 상호작용을 할 수 있으므로, 수모 표적 단백질을 동정하고, SUMO-modified 단백질의 생산뿐만 아니라 세포의 수모 경로 조절에 이용될 수 있을 것으로 기대된다. As described above, the novel proteins of the present disclosure can bind to more diverse cellular proteins than Ubc9 and can interact with SIM-containing proteins with a stronger affinity, thereby identifying the SUMO-modified protein It is expected to be used for the production of proteins as well as for regulating the hair marrow pathway of cells.

이하, 본 발명의 이해를 돕기 위하여 바람직한 실시예를 제시한다. 그러나 하기의 실시예는 본 발명을 보다 쉽게 이해하기 위하여 제공되는 것일 뿐, 실시예에 의해 본 발명의 내용이 한정되는 것은 아니다.Hereinafter, preferred embodiments of the present invention will be described in order to facilitate understanding of the present invention. However, the following examples are provided only for the purpose of easier understanding of the present invention, and the present invention is not limited by the examples.

실시예Example 1. 실험 방법 및 준비  1. Experiment Method and Preparation

1-1. 세포배양 및 일시적 1-1. Cell culture and transient DNADNA 트랜스펙션( Transfection ( CellCell cultureculture andand transienttransient DNADNA transfectiontransfection ))

293T 및 human foreskin fibroblast (HF) cells을 배양하고 [H. R. Lee, D. J. Kim, J. M. Lee, C. Y. Choi, B. Y. Ahn, G. S. Hayward, and J. H. Ahn, Ability of the human cytomegalovirus IE1 protein to modulate sumoylation of PML correlates with its functional activities in transcriptional regulation and infectivity in cultured fibroblast cells, J Virol 78 (2004) 6527-6542.]에 기재된 바와 같이 트랜스펙션하였다. 293T and human foreskin fibroblast (HF) cells were cultured and [H. R. Lee, DJ Kim, JM Lee, CY Choi, BY Ahn, GS Hayward, and JH Ahn, Ability of the human cytomegalovirus IE1 protein to modulate sumoylation of PML correlates with its functional activities in transcriptional regulation and infectivity in cultured fibroblast cells, J Virol 78 (2004) 6527-6542.

1-2. 플라스미드(1-2. Plasmid ( PlasmidsPlasmids ))

GST-SAE2/SAE1 및 His-Ubc9을 발현하는 플라스미드는 [J. H. Ahn, Y. Xu, W. J. Jang, M. J. Matunis, and G. S. Hayward, Evaluation of interactions of human cytomegalovirus immediate-early IE2 regulatory protein with small ubiquitin-like modifiers and their conjugation enzyme Ubc9, J Virol 75 (2001) 3859-3872]에 기재된 바와 동일하다. T7-SUMO-1GG을 발현하는 pET-17b (Novagen)-based plasmid는 채호준님(Chonnam National University, Republic of Korea)을 통해 수급되었다. 게이트웨이 기술(Gateway technology; Invitrogen)을 사용하여, flag-SUMO-1 및 HA-IE2을 발현하는 플라스미드를 pSG5 백그라운드 내에서 생성하고[S. Green, I. Issemann, and E. Sheer, A versatile in vivo and in vitro eukaryotic expression vector for protein engineering, Nucleic Acids Res 16 (1988) 369.], myc-IE2를 위한 발현 플라스미드를 pCS3-MT 백그라운드 위에서 생성하였다. GST-IE1, GST-PML VI, GST-IE2(135-289), 및 GST-Sp100A를 위한 플라스미드 역시 게이트웨이 기술을 사용하여 pGEX-유래 백그라운드 내에서 생성하였다. GST-RanGAP1(NΔ419) 발현 플라스미드는 [D. A. Sampson, M. Wang, and M. J. Matunis, The small ubiquitin-like modifier-1 (SUMO-1) consensus sequence mediates Ubc9 binding and is essential for SUMO-1 modification, J Biol Chem 276 (2001) 21664-21669.]에 기재된 바와 같다.Plasmids expressing GST-SAE2 / SAE1 and His-Ubc9 are described by JH Ahn, Y. Xu, WJ Jang, MJ Matunis, and GS Hayward, Evaluation of interactions of human cytomegalovirus immediate-early IE2 regulatory protein with small ubiquitin-like modifiers and their conjugation enzyme Ubc9, J Virol 75 (2001) 3859-3872. PET-17b (Novagen) -based plasmid, which expresses T7-SUMO-1 GG , was obtained from Chaon Hoon (Chonnam National University, Republic of Korea). Using Gateway technology (Invitrogen), plasmids expressing flag-SUMO-1 and HA-IE2 were generated in the pSG5 background [S. Green, I. Issemann, and E. Sheer, A versatile in vivo and in vitro eukaryotic expression vector for protein engineering, Nucleic Acids Res 16 (1988) 369.], generating expression plasmids for myc-IE2 on the pCS3-MT background It was. Plasmids for GST-IE1, GST-PML VI, GST-IE2 (135-289), and GST-Sp100A were also generated in pGEX-derived background using gateway technology. GST-RanGAP1 (NΔ419) expression plasmids are described by DA Sampson, M. Wang, and MJ Matunis, The small ubiquitin-like modifier-1 (SUMO-1) consensus sequence mediates Ubc9 binding and is essential for SUMO-1 modification, J Biol Chem 276 (2001) 21664-21669.

IE2 SIM-mutant를 발현하는 플라스미드를 생성하기 위하여, 200 및 203 사이의 IVIS 잔기들은 Stratagene QuickChange site-directed mutagenesis protocol을 이용하여 A 잔기들로 대체하였다. Ubc9 K14R mutant 역시 같은 돌연변이생성 프로토콜을 이용하여 생성하였다. His-tagged SUMO-1-Ubc9(K14R) 융합 단백질은 SUMO-1ΔGG(즉, 이중-글리신 잔기를 포함하는 6개의 카르복실 말단 아미노산이 삭제된 끝이 잘린 수모-1) 뒤에 Ubc9를 대체함으로써 pDEST17 (Invitrogen) 백그라운드 내에서 생성하였다. 또한, GFP-Ubc9 및 GFP-SUMO-Ubc9 fusion construct을 위한 플라스미드는 게이트웨이 기술을 사용하여 GFP 뒤에 Ubc9 또는 SUMO-Ubc9를 대체함으로써 pDEST53(Invitrogen) 백그라운드 내에서 생성하였다.To generate plasmids expressing IE2 SIM-mutant, IVIS residues between 200 and 203 were replaced with A residues using the Stratagene QuickChange site-directed mutagenesis protocol. Ubc9 K14R mutants were also generated using the same mutagenesis protocol. His-tagged SUMO-1-Ubc9 (K14R) fusion protein was substituted for pDEST17 (substituted by UMO9 after SUMO-1ΔGG (i.e., truncated sumo-1 with 6 carboxyl terminal amino acids containing double-glycine residues deleted). Invitrogen) in the background. In addition, plasmids for the GFP-Ubc9 and GFP-SUMO-Ubc9 fusion constructs were generated in the pDEST53 (Invitrogen) background by replacing Ubc9 or SUMO-Ubc9 after GFP using gateway technology.

1-3. 인 비트로 1-3. In beat 수모화Confiscation 분석( analysis( InIn vitroin vitro SUMOylationSUMOylation assaysassays ))

재조합 GST 융합 단백질은 제작자의 지시서에 따라, E. coli에서 발현되고 글루타치온-아가로즈 4B (Peptron) 위에서 정제하였다. 히스티딘-태깅된 단백질(His-tagged proteins) 또한 E. coli 내에서 발현되고, Ni-NTA beads(Invitrogen) 위에서 정제하였다. T7-SUMO-1GG 은 E. coli내에서 발현되고 DEAE-Sephacel columns (Bio-Rad) 및 Sephacryl S-200 gel filtration chromatography (Amersham)에서 연속적으로 정제하였다. 전형적인 수모화 반응은 버퍼 내 70 nM GST-SAE2/SAE1, 0.1 ~ 3 μM His-Ubc9 또는 His-SUMO-Ubc9, 및 9 μM SUMO-1GG [50 mM Tris-HCl (pH 7.5), 10 mM MgCl2, 1 mM DTT, 및 5 mM ATP]을 포 함하는 30 μl 내에서 수행하였다. 반응 혼합은 37℃에서 1시간 동안 부화 되도록 하였다. 반응은 β-mercaptoethanol을 포함하는 SDS 샘플 버퍼를 사용하여 종결시켰고, 반응 산물은 sodium dodecyl sulfate (SDS)-polyacrylamide gel electrophoresis (PAGE)의해 분리하였다. Recombinant GST fusion protein was expressed in E. coli and purified on Glutathione-Agarose 4B (Peptron) according to the manufacturer's instructions. Histidine-tagged proteins were also expressed in E. coli and purified on Ni-NTA beads (Invitrogen). T7-SUMO-1GG was expressed in E. coli and subsequently purified by DEAE-Sephacel columns (Bio-Rad) and Sephacryl S-200 gel filtration chromatography (Amersham). Typical hydration reactions include 70 nM GST-SAE2 / SAE1, 0.1-3 μM His-Ubc9 or His-SUMO-Ubc9, and 9 μM SUMO-1 GG [50 mM Tris-HCl (pH 7.5), 10 mM MgCl2 in buffer. , 1 mM DTT, and 5 mM ATP] in 30 μl. The reaction mixture was allowed to hatch for 1 hour at 37 ° C. The reaction was terminated using SDS sample buffer containing β-mercaptoethanol, and the reaction product was separated by sodium dodecyl sulfate (SDS) -polyacrylamide gel electrophoresis (PAGE).

1-4. 항체(1-4. Antibodies ( AntibodiesAntibodies ))

Horseradish peroxidase (HRP), anti-Daxx rabbit PAb (M-112), 및 anti-GST MAb (B-14)로 컨쥬게이트된 Anti-His (H-3) 및 anti-GFP (B-2) 마우스 단일클론항체(MAb)는 Santa Cruz에서 구입하였다. HRP로 컨쥬게이트된 Anti-HA rat MAb (3F10) 및 anti-myc mouse MAb (9E10)는 Roche에서 구입하였다. Anti-flag mouse MAb M2는 Sigma에서 수득하였다. Rabbit anti-PML PAb는 [J. H. Ahn, Y. Xu, W. J. Jang, M. J. Matunis, and G. S. Hayward, Evaluation of interactions of human cytomegalovirus immediate-early IE2 regulatory protein with small ubiquitin-like modifiers and their conjugation enzyme Ubc9, J Virol 75 (2001) 3859-3872.]에 기재된 바와 같고, anti-IE1 PAb는 정제된 IE1 단백질을 사용하여 래빗 내에서 만들어졌고, anti-Sp100 rabbit PAb은 Paul D. Ling (Baylor College of Medicine, Houston, TX, USA)을 통해 수급되었다.Single Anti-His (H-3) and anti-GFP (B-2) mice conjugated with Horseradish peroxidase (HRP), anti-Daxx rabbit PAb (M-112), and anti-GST MAb (B-14) Clonal antibody (MAb) was purchased from Santa Cruz. Anti-HA rat MAb (3F10) and anti-myc mouse MAb (9E10) conjugated with HRP were purchased from Roche. Anti-flag mouse MAb M2 was obtained from Sigma. Rabbit anti-PML PAb is described in J. H. Ahn, Y. Xu, WJ Jang, MJ Matunis, and GS Hayward, Evaluation of interactions of human cytomegalovirus immediate-early IE2 regulatory protein with small ubiquitin-like modifiers and their conjugation enzyme Ubc9, J Virol 75 (2001) 3859- 3872., anti-IE1 PAbs were made in rabbits using purified IE1 protein, and anti-Sp100 rabbit PAbs were obtained from Paul D. Ling (Baylor College of Medicine, Houston, TX, USA). It was supplied.

1-5. 1-5. 이뮤노블롯Immunoblot 분석( analysis( ImmunoblotImmunoblot analysisanalysis ). ).

트랜스펙트된 세포 내에서 수모화 분석을 위해, 세포들은 5 mM NEM을 함유하 는 PBS로 세척하였고, 샘플은 SDS loading buffer 내에서 세포를 끓여서 준비하였다. 정화된 세포 추출물은 그 후 이뮤노블롯팅 표준 절차에 따라 SDS-PAGE를 이용해 분리하였다.For hydrocephalization analysis in transfected cells, cells were washed with PBS containing 5 mM NEM, and samples were prepared by boiling the cells in SDS loading buffer. Purified cell extracts were then isolated using SDS-PAGE according to immunoblotting standard procedures.

1-6. 풀 다운 분석(1-6. Pull-down analysis ( PullPull -- downdown Assays)Assays)

HF cells(2 x 107)은 차가운 PBS, 1% NP-40, 5% 글리세롤, 및 1% 완전한 프로테아즈 저해제 칵테일(complete protease inhibitor cocktail; Sigma)로 용해되었다. 세포 추출물은 Ni-NTA 비즈로 사전-세척과정을 거쳤고, Ni-NTA 아가로즈 비즈에 고정된 His-Ubc9 또는 His-SUMO-Ubc9 융합 단백질 100 μg와 함께 4℃에서 6시간 동안 부화하였다. 비즈는 100 mM NaH2PO4 및 25 mM 이미다졸을 포함하는 20 mM Tris-HCl (pH8.0)로 세척하였다. 결합 단백질들은 100℃에서 SDS loading buffer로 희석되었고 쿠마시 블루 염색(Coomassie Blue staining) 또는 이뮤노블랏팅 분석방법(immunoblotting analysis)에 의해 분석하였다. HF cells (2 x 107) were lysed with cold PBS, 1% NP-40, 5% glycerol, and 1% complete protease inhibitor cocktail (Sigma). Cell extracts were pre-washed with Ni-NTA beads and incubated for 6 hours at 4 ° C. with 100 μg of His-Ubc9 or His-SUMO-Ubc9 fusion proteins immobilized on Ni-NTA agarose beads. Beads were washed with 20 mM Tris-HCl (pH 8.0) containing 100 mM NaH 2 PO 4 and 25 mM imidazole. Binding proteins were diluted in SDS loading buffer at 100 ° C. and analyzed by Coomassie Blue staining or immunoblotting analysis.

실험예Experimental Example 1.  One. wildwild -- typetype Ubc9Ubc9 보다  see SIMSIM 을 포함하는 기질에 현저히 높은 Remarkably high on substrates containing 컨쥬게Conjuge 이팅 활성도를 가지는 Having eating activity SUMOSUMO -- Ubc9Ubc9 융합 단백질 Fusion protein

본래 Ubc9와 비교하여 Ubc9의 N-말단 수모 융합 단백질 컨쥬게이팅 활성도를 증가시키는지 여부를 확인하고자, SUMO-융합 Ubc9(K14R) 융합 컨스트럭트를 만들었다(도 1A). 이 융합 단백질에서, Ubc9의 원래 수모 컨쥬게이션 영역(K14)은 완전히 파괴되었다. Ubc9의 N-말단에 융합된 수모는 이중 글리신 잔기가 부족하므로, 이러 한 수모 분자는 수모 프로테아제에 의해 처리되지 않는다. Ubc9 및 SUMO-Ubc9 단백질 모두는 N-말단에 히스티딘 태깅되어 E. coli에서 발현되었고, 인 비트로 분석의 유용성을 위해 부분적으로 정제하였다(도 1B). 우리는 먼저 RanGAP1(NΔ419), IE1, 및 PML VI와 같은 SIM이 결실된 수모 기질을 사용하여 Ubc9 및 SUMO-Ubc9의 컨쥬게이팅 활성도를 비교하였다. 이들 기질을 사용한 인 비트로 수모화 분석에서, wild-type Ubc9 및 SUMO-Ubc9 융합 단백질의 컨쥬게이팅 활성도는 비슷하였다(도 2A). 그 다음에 우리는 Sp100A 및 HCMV의 IE2(SIM을 포함하는 수모)와 같은 2가지 다른 수모 기질들을 테스트하였다. 인비트로 수모화 분석은 SUMO-Ubc9 융합 단백질이 wild-type Ubc9 보다 Sp100A (2.5배) 및 IE2 (9배) 모두에서 훨씬 현저한 컨쥬게이팅 활성도를 가진다는 것을 보여주었다(도 2B). SUMO-fused Ubc9 (K14R) fusion constructs were made to determine whether to increase the N-terminal hairlo fusion protein conjugating activity of Ubc9 compared to native Ubc9 (FIG. 1A). In this fusion protein, the original hair conjugation region (K14) of Ubc9 was completely destroyed. Since the hairs fused at the N-terminus of Ubc9 lack a double glycine residue, these hairs molecules are not processed by the hair protease. Both Ubc9 and SUMO-Ubc9 proteins were histidine tagged at the N-terminus and expressed in E. coli and partially purified for the utility of in vitro assays (FIG. 1B). We first compared the conjugation activity of Ubc9 and SUMO-Ubc9 using a SIMM-deficient hair marrow substrate such as RanGAP1 (NΔ419), IE1, and PML VI. In in vitro hydrotreatment analysis using these substrates, the conjugation activity of wild-type Ubc9 and SUMO-Ubc9 fusion proteins was similar (FIG. 2A). Then we tested two different hair marrow substrates such as Sp100A and HCMV's IE2 (hair including SIM). In vitro hydrocyclization analysis showed that SUMO-Ubc9 fusion protein had significantly more conjugating activity in both Sp100A (2.5-fold) and IE2 (9-fold) than wild-type Ubc9 (FIG. 2B).

실험예Experimental Example 2.  2. SIMSIM -의존적 방식으로 일어나는 Happening in a dependent manner SUMOSUMO -- Ubc9Ubc9 융합 단백질에 의한  By fusion protein 증가된Increased IE2IE2 수모화Confiscation

SUMO-Ubc9 융합 단백질의 증가된 컨쥬게이팅 활성도가 표적 단백질 내에 SIM을 필요로 하는지를 검토하기 위해, IE2 SIM mutant가 사용되었다. IE2는 SIM(h, hydrophobic; a, acidic; X, any amino acid)의 몇몇 제안된 일치 서열 중 하나(예를 들어, h-h-X-S-X-S/T-a-a-a) 와 유사한 SIM(IVISDSEEE from 200 to 208)을 포함한다. 우리는 IE2(135-289)(수모화 영역(K175 and K180) 및 SIM을 포함) 및 그것의 SIM mutant version, 및 IE2(mSIM)(A 잔기에 200-203 사이 4개의 연속적인 IVIS 잔기로 대체되어 포함되는 것)을 제조하였다(도 3A). In order to examine whether the increased conjugating activity of the SUMO-Ubc9 fusion protein requires SIM in the target protein, an IE2 SIM mutant was used. IE2 SIM is one of several proposed matching sequence of (h, hydrophobic;; a, acidic X, any amino acid) ( for example, h - h -XSXS / T- a - a - a) and is similar to SIM (IVISDSEEE from 200 to 208). We replace IE2 (135-289) (including the hydrophilic region (K175 and K180) and SIM) and its SIM mutant version, and IE2 (mSIM) (4 consecutive IVIS residues between 200-203 at A residues) To be included) (FIG. 3A).

인비트로 수모화 분석에서, SUMO-Ubc9 construct은 효율적으로 wild-type IE2 (전체 IE2의 약 40%)을 수정했으나 SIM mutant은 그렇지 못했다(도 3B, 상단). Ubc9 또는 SUMO-Ubc9 construct에 의한 IE2 SIM mutant의 수모화 수준은 증가하지 않았다(도 3B, 하단). wild-type Ubc9와 비교하여 IE2에 대한 SUMO-Ubc9의 컨쥬게이션 활성도가 증가하기 위해서는 IE2 안에 SIM이 있어야 함을 보여주는 결과이다. 또한 co-transfected cells 내 wild-type Ubc9 및 SUMO-Ubc9의 컨쥬게이션 활성도를 비교하였다. 그 결과는 트랜스펙트된 세포 내에서 wild-type Ubc9 보다 SUMO-Ubc9 융합 단백질의 IE2에 대한 컨쥬게이션 활성도가 훨씬 높았다(도 3C, 왼쪽). 또한 SUMO-Ubc9 construct의 증가된 활성도는 IE2 SIM mutant에서는 탐지되지 않았다(도 3C, 오른쪽). 이러한 결과들은 SUMO-Ubc9 융합 단백질에 의한 IE2의 증가된 수모화가 SIM-의존적인 방식으로 일어난다는 것을 보여준다.In in vitro hydrotreatment analysis, the SUMO-Ubc9 construct efficiently modified wild-type IE2 (approximately 40% of the total IE2) but the SIM mutant did not (Figure 3B, top). The degree of culturing of IE2 SIM mutants by the Ubc9 or SUMO-Ubc9 construct did not increase (FIG. 3B, bottom). Compared to wild-type Ubc9, the result shows that in order to increase the conjugation activity of SUMO-Ubc9 for IE2, SIM must be present in IE2. We also compared the conjugation activity of wild-type Ubc9 and SUMO-Ubc9 in co-transfected cells. The results showed that the conjugation activity for IE2 of the SUMO-Ubc9 fusion protein was much higher than that of wild-type Ubc9 in transfected cells (FIG. 3C, left). In addition, the increased activity of the SUMO-Ubc9 construct was not detected in the IE2 SIM mutant (FIG. 3C, right). These results show that increased hydrophilization of IE2 by the SUMO-Ubc9 fusion protein occurs in a SIM-dependent manner.

실험예Experimental Example 3.  3. Ubc9Ubc9 보다 see SIMSIM -포함 기질과 더 효율적으로 상호작용하는 More efficiently interact with inclusion substrates SUMOSUMO -- Ubc9Ubc9 융합 단백질 Fusion protein

SUMO-Ubc9 융합 단백질이 새로운 수모 기질을 동정하는데 유용한지 여부를 평가하기 위하여, 풀-다운 분석 방법을 이용하여 wild-type Ubc9 및 SUMO-Ubc9 융합 단백질의 세포 단백질에의 결합 패턴을 비교하였다. 그 결과 SUMO-Ubc9이 Ubc9 보다 더 다양한 세포 단백질에 결합한다는 것을 알 수 있었다(도 4A, 왼쪽). To assess whether the SUMO-Ubc9 fusion protein is useful for identifying new hair marrow substrates, the binding patterns of wild-type Ubc9 and SUMO-Ubc9 fusion proteins to cellular proteins were compared using pull-down assay methods. As a result, it was found that SUMO-Ubc9 binds to more diverse cellular proteins than Ubc9 (FIG. 4A, left).

게다가, SUMO-Ubc9 융합 단백질은 2개의 SIM-포함 기질로 알려진, Sp100 proteins 및 Daxx에 상당히 높은 결합 친화력을 나타냈다(도 4A, 오른쪽 2개). 이 러한 데이터는 SUMO-Ubc9가 새로운 기질을 동정하는데에도 유용할 것이라는 가능성을 제시한다. 또한, 이러한 결과들은 SUMO-Ubc9 융합 단백질이 wild-type Ubc9 보다 SIM-포함 수모 표적(Sp100 및 IE2)에 훨씬 높은 컨쥬게이션 활성도를 가진다는 것을 입증한다, 반면 SIM 결실된 수모 표적(RanGAP1(NΔ419), PML VI, 및 IE1)에서는 그들의 활성도가 비슷하였다. 중요한 것은, SUMO-Ubc9 융합 단백질에 의한 IE2의 증가된 수모화를 위해서는 IE2 내 온전한 SIM을 필요로 한다는 것이다. 게다가, 풀-다운 분석 방법을 이용한 결과들은 SUMO-Ubc9 융합 단백질은 SIM-포함 기질에 증가된 결합 활성도를 가진다는 것을 입증하였다. In addition, the SUMO-Ubc9 fusion protein showed significantly higher binding affinity for Sp100 proteins and Daxx, known as two SIM-containing substrates (FIG. 4A, right two). These data suggest that SUMO-Ubc9 may be useful for identifying new substrates. In addition, these results demonstrate that SUMO-Ubc9 fusion proteins have much higher conjugation activity to SIM-containing hair growth targets (Sp100 and IE2) than wild-type Ubc9, whereas SIM deleted hair growth targets (RanGAP1 (NΔ419) , PML VI, and IE1), their activities were similar. Importantly, increased hydrophilization of IE2 by the SUMO-Ubc9 fusion protein requires intact SIM in IE2. In addition, the results using the pull-down assay method demonstrated that the SUMO-Ubc9 fusion protein has increased binding activity to the SIM-containing substrate.

새로운 수모 표적을 동정하고 단백질 수모화의 기능을 이해하는 능력은 대개 수모화의 낮은 수준으로 제한적이다. 이러한 관점에서, 고안된 SUMO-Ubc9 융합 단백질은 인 비트로는 물론 인 비보에서 동정, 생산, 및 SUMO-modified 단백질의 특징 분석에 유용할 것이다. 또한, 상기 결과들은 Ubc9의 수모화가 수모 경로 조절 역할을 한다는 것도 보여준다. SIMs는 수모 표적 뿐만 아니라, PIAS proteins 및 RanBP2와 같은 E3 수모 연결 효소 및 E1의 SAE2에서도 발견되었다. 그러므로, 표적 동정뿐만 아니라, Ubc9의 수모화는 E1 및 E3 효소도 인지한다. 이러한 관점에서, SUMO-Ubc9 융합 단백질은 세포의 수모 경로를 조절하는데에도 유용할 것이다.The ability to identify new hair growth targets and to understand the function of protein hair growth is usually limited to low levels of hair growth. In this regard, the designed SUMO-Ubc9 fusion protein will be useful for identification, production, and characterization of SUMO-modified proteins in vivo as well as in vivo. The results also show that the hydromycinization of Ubc9 plays a role in regulating the hydropathic pathway. SIMs have been found in the hair growth targets as well as in the E3 hair ligation enzymes such as PIAS proteins and RanBP2 and in SAE2 of E1. Therefore, in addition to target identification, hydrocyclization of Ubc9 also recognizes E1 and E3 enzymes. In this regard, the SUMO-Ubc9 fusion protein will also be useful for regulating the hair marrow pathway of cells.

도 1은 1 SUMOSUMO -- Ubc9Ubc9 융합 단백질의 구조를 나타낸 것이다.  The structure of the fusion protein is shown.

(A) Ubc9 및 SUMO-Ubc9 융합 단백질의 구조를 도시한 것이다. (A) The structures of the Ubc9 and SUMO-Ubc9 fusion proteins are shown.

SUMO-Ubc9 융합 단백질에 있어서, C-말단 6개 아미노산이 결실된 수모는 2개 아미노산(Lys 및 Leu) 링커를 통해 Ubc9(K14R)의 N-말단에 융합되었다. 수모 전구체에 일반적인 처리 영역(밑줄친 이중 글리신 잔기 다음)은 화살표로 표시되어 있다. In the SUMO-Ubc9 fusion protein, the hairs with the C-terminal 6 amino acids deleted were fused to the N-terminus of Ubc9 (K14R) via a two amino acid (Lys and Leu) linker. The treatment area common to the hair growth precursor (after the underlined double glycine residues) is indicated by the arrow.

(B) 인 비트로 분석에서 사용된 His-Ubc9 및 His-SUMO-Ubc9 construct의 양(0.5, 1, 및 1.5 μg)을 쿠마시 블루 염색법(Coomassie Blue staining)에 따라 비교한 것이다. (B) The amounts (0.5, 1, and 1.5 μg) of His-Ubc9 and His-SUMO-Ubc9 constructs used in the in vitro assays were compared according to Coomassie Blue staining.

도 2는  2 is Ubc9Ubc9  And SUMOSUMO -- Ubc9Ubc9 융합  fusion 단배질의Homogeneous 다양한 기질에의 인 비트로 수모  Invitro conspiracy to various substrates 컨쥬게이션Conjugation 활성도를 비교한 것이다.  The activity is compared.

(A) His-Ubc9 또는 His-SUMO-Ubc9 (RanGAP1(NΔ419)용; 0.1, 0.2, 0.3 μM/ PML VI 또는 IE1용; 1, 2, 3 μM )의 양을 증가시키면서 GST-RanGAP1(NΔ419), GST-PML VI, 또는 GST-IE1을 사용하여 인 비트로 수모화 반응을 수행하였다. 반응 산물은 SDS-PAGE (RanGAP1(NΔ419)용; 12% / PML VI 또는 IE1용; 8%) 및 anti-GST (for RanGAP1), anti-PML, 또는 anti-IE1 Ab을 이용한 이뮤노블랏팅을 통해 분석하였다. unmodified 및 SUMO-modified 단백질의 양은 Scion Image software (Scion Corporation)를 사용하여 카운팅하여 수량화하였고, 단백질 전체 양을 기준으로 수 정된 단백질 %를 기재하였다.(A) GST-RanGAP1 (NΔ419) while increasing the amount of His-Ubc9 or His-SUMO-Ubc9 (for RanGAP1 (NΔ419); 0.1, 0.2, 0.3 μM / PML VI or IE1; 1, 2, 3 μM) In vitro hydrotreatment was performed using GST-PML VI, or GST-IE1. The reaction product was subjected to immunoblotting with SDS-PAGE (for RanGAP1 (NΔ419); 12% / for PML VI or IE1; 8%) and anti-GST (for RanGAP1), anti-PML, or anti-IE1 Ab. Analyzed. The amount of unmodified and SUMO-modified proteins was counted by counting using Scion Image software (Scion Corporation) and described the percent protein modified based on the total amount of protein.

(B) 인 비트로 수모화 분석 방법과 비슷한 방식으로 GST-Sp100A 또는 GST-IE2(135-289)을 이용하여 수행하였다. 반응 산물은 SDS-PAGE [8% for Sp100A 및 12% for IE2(135-289)] 및 anti-GST [for IE2(135-289)] 또는 anti-Sp100 Abs을 이용하여 이뮤노블랏팅함으로써 분석하였다. 수모화된 단백질의 양은 상기 기재한 바와 같이 정량화하였다. (B) It was performed using GST-Sp100A or GST-IE2 (135-289) in a manner similar to the invitro hydrolysis analysis method. Reaction products were analyzed by immunoblotting using SDS-PAGE [8% for Sp100A and 12% for IE2 (135-289)] and anti-GST [for IE2 (135-289)] or anti-Sp100 Abs. The amount of hydrocyclized protein was quantified as described above.

도 3은 3 is SUMOSUMO -- Ubc9Ubc9 fusionfusion constructconstruct of IE2IE2 수모화는Conspiracy SIMSIM -의존적임을 나타낸 것이다. Indicates dependence.

(A) intact 또는 mutant SIM 및 수모화 영역(K174 및 K180)을 포함하는 IE2 construct. (A) an IE2 construct comprising an intact or mutant SIM and hydrophilic regions (K174 and K180).

(B) 인비트로 수모화 반응은 His-Ubc9 또는 His- SUMO-Ubc9의 양을 증가(1, 2, or 3 μM)시키면서 GST-IE2(135-289) 또는 GST-IE2(135-289/mSIM)를 사용하여 수행하였다. 이 반응 산물은 SDS-PAGE (12%) 및 anti-GST Ab을 이용한 이뮤노블랏팅을 이용하여 분석되었다. 수모화된 단백질의 양은 도 2A에서와 같이 정량화되었다. (B) In vitro hematuration reaction was performed with GST-IE2 (135-289) or GST-IE2 (135-289 / mSIM with increasing amounts of His-Ubc9 or His-SUMO-Ubc9) (1, 2, or 3 μM). ) Was performed. This reaction product was analyzed using immunoblotting with SDS-PAGE (12%) and anti-GST Ab. The amount of sieved protein was quantified as in FIG. 2A.

(C) 플라스미드로 HF cells을 코트랜스펙하였다. 48시간 경과 후, 전체 세포 추출물을 준비하고 SDS-PAGE (8%)을 이용하여 분리하였다. unmodified 또는 SUMO-modified IE2 (full-length)을 탐지하기 위해 anti-myc Ab 및 anti-HA Ab을 이용하여 이뮤노블랏팅을 수행하였다(Top panels). wild-type Ubc9 및 SUMO-Ubc9 fusion construct의 발현 수준은 anti-GFP Ab을 이용한 이뮤노블랏팅에 의해 결정되었다(bottom panels). 단백질 전체 양을 기준으로 수정된 단백질 %를 기재하였다.(C) HF cells were coatfected with plasmid. After 48 hours, whole cell extracts were prepared and separated using SDS-PAGE (8%). Immunoblotting was performed using anti-myc Ab and anti-HA Ab to detect unmodified or SUMO-modified IE2 (full-length) (Top panels). Expression levels of wild-type Ubc9 and SUMO-Ubc9 fusion constructs were determined by immunoblotting with anti-GFP Ab (bottom panels). The% modified protein is described based on the total amount of protein.

도 4는 풀-다운 분석 방법에 의해 4 is by the pull-down analysis method Ubc9Ubc9  And SUMOSUMO -- Ubc9Ubc9 의 세포 단백질에의 결합력을 비교한 것이다. Binding capacity to cellular proteins.

(A) HF 세포들로부터 준비된 사전-세척된 세포 용해물은 His-Ubc9 또는 His-SUMO-Ubc9 융합 단백질과 부화되었다. His-Ubc9 또는 His-SUMO-Ubc9에 결합된 단백질들중 일부가 Ni-NTA 레진으로 정제되고, SDS-PAGE에 의해 분리되고, 쿠마시 블루 염색(왼쪽) 및 anti-Sp100 또는 anti-Daxx Abs에 의한 이뮤노블랏팅(오른쪽 2개)으로 시각화되었다. (A) Pre-washed cell lysates prepared from HF cells were incubated with His-Ubc9 or His-SUMO-Ubc9 fusion proteins. Some of His-Ubc9 or His-SUMO-Ubc9 bound proteins were purified with Ni-NTA resin, isolated by SDS-PAGE, coomassie blue staining (left) and anti-Sp100 or anti-Daxx Abs. By immunoblotting (two on the right).

(B) 쿠마시 블루 염색에 의해 대조군과 비교해, 결합 반응에 사용된 고정된 His-Ubc9 및 His-SUMO-Ubc9 융합 단백질들 중 5%가 나타났다.(B) Coomassie blue staining showed 5% of the fixed His-Ubc9 and His-SUMO-Ubc9 fusion proteins used in the binding reaction compared to the control.

<110> Sungkyunkwan University Foundation for Corporate Collaboration <120> SUMO-Ubc9 fusion protein enhnacing SUMO modification of target proteins containing a SUMO-interacting motif(SIM) <130> PA090293KR <160> 2 <170> KopatentIn 1.71 <210> 1 <211> 765 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> DNA sequence of SUMO-Ubc9 fusion <400> 1 atgtctgacc aggaggcaaa accttcaact gaggacttgg gggataagaa ggaaggtgaa 60 tatattaaac tcaaagtcat tggacaggat agcagtgaga ttcacttcaa agtgaaaatg 120 acaacacatc tcaagaaact caaagaatca tactgtcaaa gacagggtgt tccaatgaat 180 tcactcaggt ttctctttga gggtcagaga attgctgata atcatactcc aaaagaactg 240 ggaatggagg aagaagatgt gattgaagtt tatcaggaac aaacgaagct ttcggggatc 300 gccctcagca gactcgccca ggagaggaga gcatggagga aagaccaccc atttggtttc 360 gtggctgtcc caacaaaaaa tcccgatggc acgatgaacc tcatgaactg ggagtgcgcc 420 attccaggaa agaaagggac tccgtgggaa ggaggcttgt ttaaactacg gatgcttttc 480 aaagatgatt atccatcttc gccaccaaaa tgtaaattcg aaccaccatt atttcacccg 540 aatgtgtacc cttcggggac agtgtgcctg tccatcttag aggaggacaa ggactggagg 600 ccagccatca caatcaaaca gatcctatta ggaatacagg aacttctaaa tgaaccaaat 660 atccaagacc cagctcaagc agaggcctac acgatttact gccaaaacag agtggagtac 720 gagaaaaggg tccgagcaca agccaagaag tttgcgccct cataa 765 <210> 2 <211> 254 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> aminoacid sequence of SUMO-Ubc9 fusion <400> 2 Met Ser Asp Gln Glu Ala Lys Pro Ser Thr Glu Asp Leu Gly Asp Lys 1 5 10 15 Lys Glu Gly Glu Tyr Ile Lys Leu Lys Val Ile Gly Gln Asp Ser Ser 20 25 30 Glu Ile His Phe Lys Val Lys Met Thr Thr His Leu Lys Lys Leu Lys 35 40 45 Glu Ser Tyr Cys Gln Arg Gln Gly Val Pro Met Asn Ser Leu Arg Phe 50 55 60 Leu Phe Glu Gly Gln Arg Ile Ala Asp Asn His Thr Pro Lys Glu Leu 65 70 75 80 Gly Met Glu Glu Glu Asp Val Ile Glu Val Tyr Gln Glu Gln Thr Lys 85 90 95 Leu Ser Gly Ile Ala Leu Ser Arg Leu Ala Gln Glu Arg Arg Ala Trp 100 105 110 Arg Lys Asp His Pro Phe Gly Phe Val Ala Val Pro Thr Lys Asn Pro 115 120 125 Asp Gly Thr Met Asn Leu Met Asn Trp Glu Cys Ala Ile Pro Gly Lys 130 135 140 Lys Gly Thr Pro Trp Glu Gly Gly Leu Phe Lys Leu Arg Met Leu Phe 145 150 155 160 Lys Asp Asp Tyr Pro Ser Ser Pro Pro Lys Cys Lys Phe Glu Pro Pro 165 170 175 Leu Phe His Pro Asn Val Tyr Pro Ser Gly Thr Val Cys Leu Ser Ile 180 185 190 Leu Glu Glu Asp Lys Asp Trp Arg Pro Ala Ile Thr Ile Lys Gln Ile 195 200 205 Leu Leu Gly Ile Gln Glu Leu Leu Asn Glu Pro Asn Ile Gln Asp Pro 210 215 220 Ala Gln Ala Glu Ala Tyr Thr Ile Tyr Cys Gln Asn Arg Val Glu Tyr 225 230 235 240 Glu Lys Arg Val Arg Ala Gln Ala Lys Lys Phe Ala Pro Ser 245 250 <110> Sungkyunkwan University Foundation for Corporate Collaboration <120> SUMO-Ubc9 fusion protein enhnacing SUMO modification of target          proteins containing a SUMO-interacting motif (SIM) <130> PA090293KR <160> 2 <170> KopatentIn 1.71 <210> 1 <211> 765 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> DNA sequence of SUMO-Ubc9 fusion <400> 1 atgtctgacc aggaggcaaa accttcaact gaggacttgg gggataagaa ggaaggtgaa 60 tatattaaac tcaaagtcat tggacaggat agcagtgaga ttcacttcaa agtgaaaatg 120 acaacacatc tcaagaaact caaagaatca tactgtcaaa gacagggtgt tccaatgaat 180 tcactcaggt ttctctttga gggtcagaga attgctgata atcatactcc aaaagaactg 240 ggaatggagg aagaagatgt gattgaagtt tatcaggaac aaacgaagct ttcggggatc 300 gccctcagca gactcgccca ggagaggaga gcatggagga aagaccaccc atttggtttc 360 gtggctgtcc caacaaaaaa tcccgatggc acgatgaacc tcatgaactg ggagtgcgcc 420 attccaggaa agaaagggac tccgtgggaa ggaggcttgt ttaaactacg gatgcttttc 480 aaagatgatt atccatcttc gccaccaaaa tgtaaattcg aaccaccatt atttcacccg 540 aatgtgtacc cttcggggac agtgtgcctg tccatcttag aggaggacaa ggactggagg 600 ccagccatca caatcaaaca gatcctatta ggaatacagg aacttctaaa tgaaccaaat 660 atccaagacc cagctcaagc agaggcctac acgatttact gccaaaacag agtggagtac 720 gagaaaaggg tccgagcaca agccaagaag tttgcgccct cataa 765 <210> 2 <211> 254 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> aminoacid sequence of SUMO-Ubc9 fusion <400> 2 Met Ser Asp Gln Glu Ala Lys Pro Ser Thr Glu Asp Leu Gly Asp Lys   1 5 10 15 Lys Glu Gly Glu Tyr Ile Lys Leu Lys Val Ile Gly Gln Asp Ser Ser              20 25 30 Glu Ile His Phe Lys Val Lys Met Thr Thr His Leu Lys Lys Leu Lys          35 40 45 Glu Ser Tyr Cys Gln Arg Gln Gly Val Pro Met Asn Ser Leu Arg Phe      50 55 60 Leu Phe Glu Gly Gln Arg Ile Ala Asp Asn His Thr Pro Lys Glu Leu  65 70 75 80 Gly Met Glu Glu Glu Asp Val Ile Glu Val Tyr Gln Glu Gln Thr Lys                  85 90 95 Leu Ser Gly Ile Ala Leu Ser Arg Leu Ala Gln Glu Arg Arg Ala Trp             100 105 110 Arg Lys Asp His Pro Phe Gly Phe Val Ala Val Pro Thr Lys Asn Pro         115 120 125 Asp Gly Thr Met Asn Leu Met Asn Trp Glu Cys Ala Ile Pro Gly Lys     130 135 140 Lys Gly Thr Pro Trp Glu Gly Gly Leu Phe Lys Leu Arg Met Leu Phe 145 150 155 160 Lys Asp Asp Tyr Pro Ser Ser Pro Pro Lys Cys Lys Phe Glu Pro Pro                 165 170 175 Leu Phe His Pro Asn Val Tyr Pro Ser Gly Thr Val Cys Leu Ser Ile             180 185 190 Leu Glu Glu Asp Lys Asp Trp Arg Pro Ala Ile Thr Ile Lys Gln Ile         195 200 205 Leu Leu Gly Ile Gln Glu Leu Leu Asn Glu Pro Asn Ile Gln Asp Pro     210 215 220 Ala Gln Ala Glu Ala Tyr Thr Ile Tyr Cys Gln Asn Arg Val Glu Tyr 225 230 235 240 Glu Lys Arg Val Arg Ala Gln Ala Lys Lys Phe Ala Pro Ser                 245 250  

Claims (10)

서열번호 2의 아미노산 서열을 가지는 수모 컨쥬게이션 효소(SUMO conjugation enzyme; small ubiquitin-like modifier conjugation enzyme).SUMO conjugation enzyme (small ubiquitin-like modifier conjugation enzyme) having an amino acid sequence of SEQ ID NO: 2. 제1항의 수모 컨쥬게이션 효소를 코딩하는 유전자.A gene encoding the hydrophilic conjugation enzyme of claim 1. 제2항에 있어서, 상기 유전자의 염기서열은 서열번호 1인 것을 특징으로 하는 유전자. The gene according to claim 2, wherein the nucleotide sequence of the gene is SEQ ID NO: 1. 제2항 또는 제3항의 유전자를 포함하며 수모 컨쥬게이션 효소를 생산하는 발현 벡터. An expression vector comprising the gene of claim 2 or 3, wherein said expression vector produces a hair conjugation enzyme. 제1항의 수모 컨쥬게이션 효소 또는 제2항의 유전자를 유효성분으로 포함하는, 수모 표적 단백질과의 상호작용 증가용 조성물. Claim 1, comprising a conjugation enzyme of claim 1 or the gene of claim 2 as an active ingredient, a composition for increasing the interaction with the hair target protein. 제5항에 있어서, 상기 수모 표적 단백질은 SIM(SUMO-interacting motif)을 포함하는 것을 특징으로 하는 조성물. 6. The composition of claim 5, wherein said hydrocephalus target protein comprises a SUMO-interacting motif (SIM). 제1항의 컨쥬게이션 효소 또는 제2항의 유전자를 유효성분으로 포함하는 수 모 표적 단백질 동정용 조성물.A composition for identifying a hydrophilic target protein comprising the conjugate enzyme of claim 1 or the gene of claim 2 as an active ingredient. 1) 기질 단백질에 제1항의 효소를 처리하는 단계; 2) 기질 단백질 중 수모화(SUMOylation)된 단백질을 동정하는 단계; 및 3) 상기 2단계에서 얻어진 결과를 분석하여 수모화된 단백질을 기질 단백질 내 수모 표적 단백질로 결정하는 단계를 포함하는, 수모 표적 단백질 스크리닝 방법.1) treating the substrate protein with the enzyme of claim 1; 2) identifying SUMOylated proteins in the substrate protein; And 3) analyzing the results obtained in step 2 to determine the hydrolyzed protein as the hairy target protein in the matrix protein. 제8항에 있어서, 상기 2단계의 수모화된 단백질 동정은 쿠마시 블루 염색(Coomassie Blue staining) 또는 이뮤노블랏팅 방법(Immunoblot analysis)을 이용함을 특징으로 하는 수모 표적 단백질 스크리닝 방법.10. The method of claim 8, wherein the step 2 identification of the hydrolyzed protein is Coomassie Blue staining (Coomassie Blue staining) or immunoblotting method (Immunoblot analysis) characterized in that the method for screening the target hair. 제8항 또는 제9항에 있어서, 상기 수모 표적 단백질은 SIM(SUMO-interacting motif)를 포함하는 것을 특징으로 하는 수모 표적 단백질 스크리닝 방법. 10. The method of claim 8 or 9, wherein said hair growth target protein comprises a SUMO-interacting motif (SIM).
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