KR20090038597A - Signal detecting method for trace of biomolecule using photolytic oligomer and nano particle - Google Patents

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Abstract

A signal detecting method for the extremely small amount of bio-molecule using photodegradable oligomer and nano-particles is provided to enable an operator to obtain amplified signals more than those of the actual amount of bio-molecule by labeling the photodegradable oligomer on the nano-particles coupled with bio-molecules. A signal detecting method for the extremely small amount of bio-molecule comprises the following steps of: catching a target bio-molecule in a sample with a probe; coupling the caught target bio-molecule with nano-particles; coupling the nano-particles with a photodegradable oligomer; and decomposing a boding site of the nano-particles and the photodegradable oligomer through light irradiation and detecting signals of target bio-molecule from the oligomer obtained by decomposition.

Description

광분해성 올리고머 및 나노 입자를 이용한 극미량의 생체분자에 대한 신호 검출 방법 {SIGNAL DETECTING METHOD FOR TRACE OF BIOMOLECULE USING PHOTOLYTIC OLIGOMER AND NANO PARTICLE}Signal detection method for trace biomolecules using photodegradable oligomers and nanoparticles {SIGNAL DETECTING METHOD FOR TRACE OF BIOMOLECULE USING PHOTOLYTIC OLIGOMER AND NANO PARTICLE}

본 발명은 광분해성 올리고머 및 나노 입자를 이용하여 극미량으로 존재하는 생체분자에 대한 신호를 검출하는 방법에 관한 것이다. 본 발명은 정보통신부 및 정보통신연구진흥원의 IT원천기술개발사업의 일환으로 수행한 연구로부터 도출된 것이다[과제관리번호: 2006-S-074-02, 과제명: 나노 입자를 이용한 고성능 바이오 센서 시스템].The present invention relates to a method for detecting signals for biomolecules present in trace amounts using photodegradable oligomers and nanoparticles. The present invention is derived from research conducted as part of the IT source technology development project of the Ministry of Information and Communication and the Ministry of Information and Communication Research and Development. [Task Management Number: 2006-S-074-02, Title: High-performance biosensor system using nanoparticles ].

미량의 생체 물질을 검출, 분석하는 것은 생명공학 및 의학 분야에 있어서 매우 중요한 일이다. 특히, 암이나 급성 질병 등으로부터 환자의 생명을 구하고 질병의 전파를 막기 위해서는, 질병의 원인 및 발병 가능성을 파악하는 시점이 빠를수록 좋다. 따라서, 질병의 진전 정도 및 발병 가능성을 파악하기 위한 미량의 생체 물질의 검출, 분석을 위한 기술들이 개발되어 왔다. Detecting and analyzing traces of biological material is very important for biotechnology and medicine. In particular, in order to save the patient's life from cancer or acute disease and to prevent the spread of the disease, the earlier the time for identifying the cause and possibility of the disease is better. Therefore, techniques have been developed for the detection and analysis of trace biomaterials to determine the extent of disease progression and the likelihood of onset.

그 중 DNA 분석의 경우, 1980년대에 중합효소연쇄반응(PCR, Polymerase Chain Reaction)이 고안된 후 특정 DNA의 일부를 손쉽게 증폭할 수 있게 되어 목표 유전자에 대한 연구가 손쉽게 되었다. 그러나, 실제로 직접적으로 질병의 원인이 되는 단백질에 대한 검출, 분석은 장비 및 기술의 발전에 전적으로 의존하고 있어, 극미량 존재하는 단백질의 검출, 분석은 현재로서는 어려운 상황이며, 상기와 같은 난점을 극복하고자 많은 연구가 선행되어 왔다.Among them, in the case of DNA analysis, polymerase chain reaction (PCR) was devised in the 1980s, so that a part of specific DNA could be easily amplified, so that research on a target gene was easy. However, the detection and analysis of the protein directly causing the disease is completely dependent on the development of equipment and technology, and the detection and analysis of the trace amount of protein is difficult at present. Many studies have been preceded.

생체 내 미량의 단백질, 일례로서 정상적인 생물 유체 내에 존재하는 자유 사이토카인(cytokine) 또는 케모카인(kemokine)의 농도를 분석하는 방법 중 가장 광범위 하게 사용되는 효소결합면역흡착분석법(Enzyme Linked ImmunoSorbent Assay, ELISA)의 경우, 항원과 1차 항체는 동일 몰 비로 결합하며, 검출 한계가 약 6 피코몰(picomole)인 것으로 알려져 있다. 따라서, 통상적인 ELISA으로는 정상적인 인간 혈장 내의 인터루킨-8(IL-8)을 검출할 수 없다고 알려져 있다. 또한, 상기 ELISA는 항원 및 1차 항체의 결합 여부를, 서양고추냉이 퍼옥시다제(Horse Radish Peroxidase, HRP) 등과 같은 별도의 효소 또는 발광 물질등을 표지(labeling)한 2차 항체를 사용하여, 전기적인 신호나 광신호를 획득하여 분석한다. 상기와 같은 2차 항체 및 별도의 효소를 사용하는 경우, 분석에 필요한 시간 및 비용이 상승하고, 사용하는 물질들이 생체 물질들이기 때문에 보관 시간 및 방법에 따라 분석 결과가 다르게 나타나는 단점이 존재한다. 또한, 단백질이 극미량(일반적으로 femto mole/ml 미만) 존재하는 경우는 직접적인 분석이 불가능하므로 추가적으로 시료를 더 많이 확보하고, 크로마토그래피(chromatography) 방법 등을 사용하여 시료의 농도를 높여 분석하고 있으며, 이를 위해 인력 및 시간 등이 소요되는 단점이 있다. Enzyme Linked ImmunoSorbent Assay (ELISA), the most widely used method of analyzing the concentration of free cytokines or kemokines present in normal biological fluids, for example in vivo biological fluids In this case, the antigen and the primary antibody bind in the same molar ratio, and the detection limit is known to be about 6 picomoles. Therefore, it is known that conventional ELISA cannot detect interleukin-8 (IL-8) in normal human plasma. In addition, the ELISA uses a secondary antibody labeled with an enzyme or a luminescent substance such as horseradish peroxidase (HRP), etc., for binding of the antigen and the primary antibody, Acquire and analyze electrical or optical signals. In the case of using the secondary antibody and a separate enzyme as described above, there is a disadvantage in that the time and cost required for the assay are increased, and the results of the assay differ depending on the storage time and method since the materials used are biological materials. In addition, if there is a very small amount of protein (generally less than femto mole / ml), it is impossible to directly analyze, so additional samples are secured and the concentration of the sample is increased by using a chromatography method. There is a disadvantage in that manpower and time are required for this.

또한, 상기의 ELISA를 포함하는 대부분의 단백질 분석 방법은 반응 과정 중 분석하고자 하는 단백질 자체가 변성되어, 반응을 거친 단백질에 대한 추가적인 분석은 이론적으로 거의 불가능하다고 할 수 있다. In addition, most protein analysis methods including the ELISA may denature the protein to be analyzed during the reaction process, and thus, further analysis of the reacted protein may be almost impossible.

상기와 같은 검출 한계의 극복을 위한 시도의 일례로서, 나노입자 기재의 바이오-바코드(bio-bar-code) DNA를 이용하여 증폭된 신호를 확보하고자 한 바가 개시된 바 있다 (Nam JM et al ., Science, 2003; 301: 1884). 그러나, 상기 선행기술은 바이오-바코드 DNA의 분리와 결합에 융해 온도(Tm)를 이용해야 하므로 시스템 전체의 온도를 상승, 하강시켜야 하는 필요가 발생하며, 이로인해 항원-항체 반응에 의한 결합이 붕괴될 수 있다. 또한, 금 자성입자에 결합하는 분자로는 설프하이드릴기(-SH)를 갖는 물질에 한정되므로, 유연한 운용이 어렵다. 또한, 단백질의 분석을 위해 표적물질의 다른 부위를 인식하는 이차 항체가 반드시 필요한 단점이 있다.As an example of an attempt to overcome the above detection limit, it has been disclosed to secure an amplified signal using nano-based bio-bar-code DNA (Nam JM et. al . , Science, 2003; 301: 1884). However, since the prior art requires the use of the melting temperature (Tm) for the separation and binding of the bio-barcode DNA, there is a need to raise and lower the temperature of the entire system, thereby disrupting the binding by the antigen-antibody reaction. Can be. In addition, the molecule that binds to the gold magnetic particles is limited to a substance having a sulfhydryl group (-SH), and thus, flexible operation is difficult. In addition, there is a disadvantage that a secondary antibody that recognizes other sites of the target material is necessary for the analysis of the protein.

DNA에 편입될 수 있는 광분해성 물질들이 생체 물질의 연결자(linker)에 이용되고 있으며, 그 이유는 하기와 같다. 연결자에 결합된 해당 생체 물질을 분리해야 할 경우, 일반적인 DNA 연결자는 화학반응 및 열에 의한 분리를 요구하여 해당 생체 물질이 변성될 가능성에 노출되는데 반하여, 광분해성 물질은 일정 범위의 광을 조사하는 것으로 쉽게 분리되므로 분석 대상 물질의 변성이 최소화되는 장점이 있다. 둘째는, 비드나 기판에서 상기 생체 물질을 분리하는 경우, 일반적인 DNA 연결자는 DNA의 혼성화(hybridization) 또는 탈혼성화(dehybridization)를 위한 일정 시간을 요구하는데 반하여, 광분해성 물질을 포함하는 연결자는 최장 수분 내에 분석 대상 물질을 분리해낼 수 있다. Photodegradable materials that can be incorporated into DNA are used for linkers of biological materials, and the reason is as follows. When it is necessary to separate the biological material bound to the linker, the general DNA linker requires chemical reaction and heat separation to expose the biomaterial to denaturation, whereas the photodegradable material is irradiated with a range of light. Since it is easily separated, the denaturation of the analyte is minimized. Secondly, when separating the biological material from the beads or substrate, the general DNA connector requires a certain time for hybridization or dehybridization of DNA, whereas the connector including the photodegradable material is the longest moisture. The analyte can be separated within.

이에, 본 발명자들은 표적 생체 분자를 포획하여 나노 입자를 결합시킨 후, 상기 나노 입자에, 광분해성 물질이 올리고머 서열 내에 편입된 광분해성 올리고머를 표지하는 것을 포함하는 검출 방법을 이용하여 극미량의 표적 생체 분자에 대한 분석을 수행한 결과, 샘플을 농축하지 않으면서도 상기 올리고머에 의한 신호 증폭에 의해 종래의 검출 한도를 극복하는 것을 관찰하여 본 발명을 완성하였다. Therefore, the inventors capture a target biomolecule and bind the nanoparticles, and then, to the nanoparticles, a trace amount of the target biomarker is detected by using a detection method including labeling the photodegradable oligomer incorporated in the oligomer sequence. As a result of analyzing the molecules, the present invention was completed by observing that the conventional detection limit was overcome by signal amplification by the oligomer without concentrating the sample.

따라서, 본 발명의 목적은 샘플 내에서 극미량으로 존재하는 생체 분자, 특히 단백질을 분석하는데 있어 2차 항체 및 효소 등을 사용하는 대신, 상기 생체분자를 포획하여 나노 입자를 결합시킨 후, 상기 나노 입자에 신호증폭용 광분해성 올리고머를 표지하여 실제 생체분자의 양보다 더욱 증폭된 신호를 획득할 수 있는 극미량의 생체분자에 대한 신호 검출 방법을 제공하는 것이다.Accordingly, an object of the present invention is to capture the biomolecules and bind the nanoparticles, instead of using secondary antibodies, enzymes, and the like to analyze the biomolecules, particularly proteins, present in trace amounts in the sample, and then the nanoparticles. The present invention provides a signal detection method for a trace amount of biomolecules capable of obtaining a signal amplified more than the actual amount of biomolecules by labeling a photodegradable oligomer for signal amplification.

상기 목적의 달성을 위하여, 본 발명은 In order to achieve the above object, the present invention

샘플 내의 표적생체분자를 프로브로 포획하는 단계; Capturing the target biomolecule in the sample with the probe;

상기 포획된 표적생체분자와 나노입자를 결합시키는 단계; Binding the captured target biomolecule with nanoparticles;

상기 결합된 나노입자와 신호증폭용 광분해성 올리고머를 결합시키는 신호증폭단계; A signal amplifying step of coupling the combined nanoparticles with a photodegradable oligomer for signal amplification;

광조사에 의하여 상기 나노입자와 신호증폭용 광분해성 올리고머간의 결합을 분해하고, 상기 분해에 의하여 얻어진 올리고머로부터 상기 표적생체분자에 대한 신호를 검출하는 신호검출단계를 포함하는 생체분자에 대한 신호 검출방법을 제공한다.Signal detection method for a biomolecule comprising a signal detection step of decomposing the bond between the nanoparticles and the photodegradable oligomer for signal amplification by light irradiation, and detecting the signal for the target biomolecule from the oligomer obtained by the decomposition To provide.

이하에서는 본 발명에 대해 상세히 설명한다.Hereinafter, the present invention will be described in detail.

본 발명에 따른 검출 방법은, 샘플 내에서 femto mole/ml 수준의 극미량으로 존재하는 생체분자를 분석하는데 있어, 표적생체분자에 상기 나노 입자를 결합시킨 후, 상기 나노 입자에 신호증폭용 광분해성 올리고머를 표지하고, 광조사하여 분리된 신호증폭용 올리고머들을 통상적인 DNA 분석법으로 분석함으로써, 샘플의 다량 확보, 표적생체분자의 변성, 고가의 비용 또는 오랜 시간이 요구되는 분석 방법과는 달리 신속하고 저렴하며 정확한, 샘플의 분석이 가능해진다. 따라서, 본 발명은 샘플 중에 존재하는 극미량의 생체분자를 광분해 반응을 이용하여 기존의 방법보다 쉽고도 저렴하게 분석할 수 있는 방법이다. In the detection method according to the present invention, in analyzing a biomolecule present in a trace amount of femto mole / ml level in a sample, after binding the nanoparticles to a target biomolecule, a photodegradable oligomer for signal amplification on the nanoparticles By analyzing the signal amplification oligomers separated by light irradiation, and using conventional DNA analysis, a large amount of sample, denaturation of target biomolecules, high cost, or a long time is required, unlike an analytical method requiring a long time. Accurate analysis of the sample is possible. Therefore, the present invention is a method that can be analyzed easily and cheaply than conventional methods by using a photolysis reaction of a trace amount of biomolecule present in the sample.

먼저, 프로브(Probe)를 구성하기 위해, 제3 결합물질 고정화수단으로 피복된 자성입자와, 상기 자성입자에 결합할 수 있는 제3 결합물질을 갖는 연결용 광분해성 올리고머를 준비한다. First, in order to construct a probe, a connection photodegradable oligomer having magnetic particles coated with a third binding material immobilization means and a third binding material capable of binding to the magnetic particles is prepared.

상기 자성입자는, 내부에 산화철 등을 포함하여 외부자기장에 대해 자화되는 특성을 띠는 폴리머인 것이 바람직하고, 폴리스티렌인 것이 더욱 바람직하다. The magnetic particles are preferably polymers having iron oxide and the like magnetized to an external magnetic field, and more preferably polystyrene.

본 발명에 따른 결합 물질 고정화 수단은 비오틴, 스트렙트아비딘, 아비딘, 압타머(aptamer), 렉틴(lectin), DNA, RNA, 리간드, 조효소(coenzyme), 무기이온, 효소보조인자(cofactor), 당, 지질 및 기질을 포함하는 군으로부터 선택되는 하나인 것을 특징으로 한다. 본 발명의 일실시예에서는 결합물질 고정화 수단으로서 스트렙트아비딘이 사용되었으나 이에 한정되는 것은 아니다. The binding substance immobilization means according to the present invention is biotin, streptavidin, avidin, aptamer, lectin, DNA, RNA, ligand, coenzyme, inorganic ion, cofactor, sugar It is characterized in that one selected from the group comprising a lipid and a substrate. In one embodiment of the present invention, streptavidin was used as a binder immobilization means, but is not limited thereto.

상기 연결용 광분해성 올리고머는, 자성입자와 포획자를 연결하기 위한 올리고머로서, 3' 부위에 상기 자성입자에 코팅된 결합물질 고정화수단과 화학결합하 는 결합물질을 포함하고, 그 서열 내에 광분해성 물질을 포함하는 것을 특징으로 한다. 본 발명의 일 실시예에서는, 상기 결합물질로서, 상기 결합물질 고정화수단인 스트렙트아비딘에 대해 공유결합하는 비오틴이 사용되었으나, 이에 한정되는 것은 아니며 결합물질 고정화수단에 따라 그에 결합하는 물질로 조정될 수 있다. 상기 광분해성 물질은 DNA에 편입될 수 있는 광분해성 물질이라면 가능하고, 바람직하게는 포스포라미다이트(phosphoramidite)화합물, 더욱 바람직하게는 하기의 화학식을 갖는 PC-o-니트로페닐-CE-포스포라미다이트(PC-o-nitrophenyl-CE-phosphoramidite; [o-Nitrophenyl-1-O-(2-cyanoethyl-N,N-diisopropylphosphoramidyl)-3-O-(4,4´-dimethoxytriphenylmethyl)-1,3-propandiol])일 수 있다. The linking photodegradable oligomer is an oligomer for connecting the magnetic particles and the trapping agent, and includes a binding material chemically bonded to a binding material immobilization means coated on the magnetic particles at a 3 ′ region, and the photodegradable material in the sequence Characterized in that it comprises a. In one embodiment of the present invention, as the binding material, biotin covalently bonded to the streptavidin as the binding material immobilization means was used, but is not limited thereto, and may be adjusted to a material binding thereto according to the binding material immobilization means. have. The photodegradable material may be a photodegradable material that can be incorporated into DNA, preferably a phosphoramidite compound, more preferably PC-o-nitrophenyl-CE-phosphora having the formula Midite (PC-o-nitrophenyl-CE-phosphoramidite; [o-Nitrophenyl-1-O- (2-cyanoethyl-N, N-diisopropylphosphoramidyl) -3-O- (4,4´-dimethoxytriphenylmethyl) -1,3 -propandiol]).

[화학식][Formula]

Figure 112007073939394-PAT00001
Figure 112007073939394-PAT00001

본 발명의 일 실시예에서 제조된 연결용 광분해성 올리고머의 서열은 3'-비오틴-AAA-N-AAA-5'으로 기재될 수 있으며, 상기에서 A는 아데닌(Adenine)을 나타내고, N은 PC-o-니트로페닐-CE-포스포라미다이트를 나타낸다. 또한, 본 발명의 일 실시예에서는 상기 광분해성 물질인 PC-o-니트로페닐-CE-포스포라미다이트가 분해되어 2개의 일인산 단편을 생성하는 파장인 200 내지 400nm의 파장의 광을 사용하 나, 이에 한정되는 것은 아니며, 사용되는 광분해성 물질을 분해하는데 충분한 파장의 광선이면 사용이 가능하다.The sequence of the linking photodegradable oligomer prepared in one embodiment of the present invention may be described as 3′-biotin-AAA-N-AAA-5 ′, wherein A represents adenine and N represents PC -o-nitrophenyl-CE-phosphoramidite. In addition, in one embodiment of the present invention using a light of a wavelength of 200 to 400nm which is a wavelength at which the photo-degradable material PC-o-nitrophenyl-CE-phosphoramidite is decomposed to produce two monophosphate fragments. However, the present invention is not limited thereto, and any light ray having a wavelength sufficient to decompose the photodegradable material used may be used.

상기 자성입자와 연결용 광분해성 올리고머간의 결합량은 자성입자의 용적에 따라 조정하는 것이 바람직하다. The amount of bonding between the magnetic particles and the photodegradable oligomer for connection is preferably adjusted according to the volume of the magnetic particles.

본 발명에 따른 올리고머는, DNA 또는 DNA 유사체이며, 상기 DNA 유사체는 PNA, TNA 및 GNA를 포함하는 군으로부터 선택됨이 바람직하다.The oligomers according to the invention are DNA or DNA analogues, said DNA analogues being preferably selected from the group comprising PNA, TNA and GNA.

다음으로, 상기 연결용 광분해성 올리고머의 5' 부위의 인산기에, 표적생체분자와 결합하는 포획자를 고정화시키며, 이로서 프로브가 완성된다. 본 발명의 일 실시예에서는, 상기 연결용 광분해성 올리고머의 5' 부위의 인산기와 포획자인 항-DcR3(NT) 항체의 아민기를 컨쥬게이트(conjugate)하여 고정화시키기 위해, 카르보디이미드 가교제 EDC(1-ethyl-3-[3-dimethylaminopropyl]carbodiimide hydrochloride)와 이미다졸을 사용하여 상기 연결용 광분해성 올리고머의 5' 부위의 인산기를 포스포릴이미다졸리드(phosphorylimidazolide)로 변환시킨 뒤 항-DcR3(NT) 항체의 아민기와 결합시켜 고정화하여 프로브를 완성하였으나, 이에 한정되는 것은 아니다. 본 발명에서 포획자는, 표적생체분자를 포획하기 위한 물질로서, 표적생체분자에 대해 항원-항체 반응으로 결합하는 생체분자라면 모두 가능하다. 본 발명의 일 실시예에서는, 포획자로서 DcR3의 항체인 항-DcR3를 사용하였으나, 만약 항-DcR3을 표적생체분자로서 분석하고 싶다면, 항원인 DcR3을 포획자로서 사용할 수 있다. 따라서, 상기 표적생체분자와 상기 포획자는 상호간 항원-항체 반응으로 결합할 수 있는 분자, 예를 들어 면역원이 될 수 있는 단백질, 펩티드, 합텐 및 상기 단백질, 펩티드 및 합텐에 대한 항체일 수 있으나, 이에 한정되는 것은 아니다.Next, the phosphate group in the 5 ′ region of the linking photodegradable oligomer is immobilized with a trapping agent that binds to the target biomolecule, thereby completing the probe. In one embodiment of the present invention, the carbodiimide crosslinker EDC (1 -ethyl-3- [3-dimethylaminopropyl] carbodiimide hydrochloride) and imidazole were used to convert the phosphate group at the 5 'site of the linking photodegradable oligomer into phosphoryllimidazolide, followed by anti-DcR3 (NT 1) Immobilized by binding to the amine group of the antibody to complete the probe, but is not limited thereto. In the present invention, the capture agent is a substance for capturing the target biomolecule, and may be any biomolecule that binds to the target biomolecule in an antigen-antibody reaction. In one embodiment of the present invention, anti-DcR3, an antibody of DcR3, was used as a capturer. However, if anti-DcR3 is to be analyzed as a target biomolecule, the antigen DcR3 can be used as a capturer. Thus, the target biomolecule and the trapping agent may be molecules capable of binding to each other by an antigen-antibody reaction, for example, proteins, peptides, haptens and antibodies to the proteins, peptides and haptens that may be immunogens, It is not limited.

따라서, 본 발명에 있어서, 프로브는 Thus, in the present invention, the probe

서열 내에 광분해성 물질을 포함하는 광분해성 올리고머; Photodegradable oligomers comprising a photodegradable substance in a sequence;

상기 광분해성 올리고머의 일단에 고정된 자성입자; 및 Magnetic particles fixed to one end of the photodegradable oligomer; And

상기 광분해성 올리고머의 타단에 고정되어 상기 표적생체분자와 결합하는 포획자를 포함하는 것을 특징으로 한다.It is fixed to the other end of the photodegradable oligomer is characterized in that it comprises a trap to bind to the target biomolecule.

다음으로, 샘플 내 표적생체분자가 상기 프로브의 포획자와 결합될 수 있는 조건 하에서 상기 프로브에 샘플을 접촉시켜, 프로브-표적생체분자 복합체를 생성한다. Next, the sample is contacted with the probe under conditions that allow the target biomolecule in the sample to bind with the trap of the probe to generate a probe-target biomolecule complex.

본 발명에 따른 샘플은 바이러스, 박테리아, 세포 또는 조직 유래 추출물, 파쇄물(lysate) 또는 정제물, 혈액, 혈장, 혈청, 림프, 골수액, 타액, 안구액, 정액, 뇌추출물, 척수액, 관절액, 흉선액, 복수 및 양막액으로 이루어진 군으로부터 선택될 수 있다.Samples according to the invention are extracts from virus, bacteria, cells or tissues, lysates or purified products, blood, plasma, serum, lymph, bone marrow fluid, saliva, ocular fluid, semen, brain extracts, spinal fluid, joint fluids, thymus Fluid, ascites and amniotic fluid.

다음으로, 본 발명의 나노입자를 표적생체분자에 결합시키기 위해, 상기 포획자와 결합된 표적생체분자를, 나노입자표면에 고정된 제1 결합물질 고정화수단에 화학결합하는 제1 결합물질로 표지한다. 본 발명의 결합물질은 상기 표적생체분자 의 표면에 존재하는 기능기, 예를 들어 일차 아민기, 설프하이드릴(sulfhydryl)기, 카르보닐기, 카르복시기를 포함하는 기능기에 표지될 수 있는 물질이라면 한정되지 않는다. 상기 기능기와 반응하여 결합물질을 표지할 수 있는 물질의 일부 예는 다음과 같으나, 이에 한정되는 것은 아니다. 일차 아민기와 반응하는 물질로는 이미도에스테르(imidoester) 화합물, N-하이드록시숙신이미드 등을 들 수 있고, 설프하이드릴기와 반응하는 물질로는 말레이미드(Malemide), 할로아세틸류(Haloacetyls), 피리딜 디설파이드(pyridyl disulfide) 등을 들 수 있으며, 카르보닐기와 반응하는 물질로는 카르보디이미드(carbodiimides)류 등을 들 수 있고, 카르복시기와 반응하는 물질로는 일차 아민류 또는 히드라지드류(Hydrazides) 등을 들 수 있다. 본 발명의 일실시예에서는 비오티닐화(biotinylation)를 채택함에 있어, 표적생체분자의 일차 아민기와 반응하는 N-하이드록시숙신이미드를 이용하여, 결합 물질인 비오틴을 표지하였다. 이로써, 본 발명은 그 일 실시예에 나타난 바와 같이 표적생체분자에 대한 신호 검출 정확도가 높아지게 되는데, 그 이유는 상기 포획자를 연결용 광분해성 올리고머에 결합시키는 단계에서, 포획자의 아민기가 이미 선점되어 버렸기 때문에, 표적생체분자의 아민기에 선택적으로 비오틴을 표지할 수 있기 때문이다. 비오티닐화 이후, 남은 시약 및 불필요한 염을 제거하기 위해 세척을 하는 경우, pH 변화에 의한 포획자와 표적생체분자간의 결합이 분리되지 않도록 주의하여야 한다.Next, in order to bind the nanoparticles of the present invention to the target biomolecules, the target biomolecules bound to the traps are labeled with a first binding agent chemically bonded to the first binding agent immobilization means immobilized on the surface of the nanoparticles. do. The binding substance of the present invention is not limited as long as it is a substance that can be labeled with a functional group on the surface of the target biomolecule, such as a primary amine group, a sulfhydryl group, a carbonyl group, or a carboxyl group. . Some examples of materials capable of labeling a binding material by reacting with the functional group are as follows, but are not limited thereto. Examples of the material that reacts with the primary amine group include an imidoester compound and N-hydroxysuccinimide, and examples of the material that reacts with the sulfhydryl group include maleimide, haloacetyls, Pyridyl disulfide, and the like, and a substance that reacts with a carbonyl group may include carbodiimides, and the like, which may react with carboxyl groups such as primary amines or hydrazides, and the like. Can be mentioned. In one embodiment of the present invention, in adopting biotinylation, biotin, a binding substance, was labeled using N-hydroxysuccinimide reacting with the primary amine group of the target biomolecule. As a result, the present invention improves the signal detection accuracy of the target biomolecule as shown in the embodiment, because the amine group of the capture has already been preempted in the step of binding the capture to the photodegradable oligomer for linkage. This is because biotin can be selectively labeled with the amine group of the target biomolecule. After biotinylation, when washing to remove residual reagents and unnecessary salts, care must be taken to ensure that the binding between the capture and target biomolecules is not separated by pH changes.

다음으로, 상기 제1 결합물질 (예를 들어, 비오틴)로 표지화된 표적생체분자 와, 상기 제1 결합물질과 화학결합하는 제1 결합물질 고정화수단 (예를 들어, 스트렙트아비딘)이 코팅된 나노 입자를 혼합하여 결합시킨다. 그 후, 추가적 단계로서, 상기에 언급한 범위의 광조사에 의해 상기 프로브 내의 광분해성 물질을 분해하여 자성입자를 제거하여, 포획자-표적생체분자-나노입자 복합체를 생성할 수 있다. Next, the target biomolecule labeled with the first binding agent (for example, biotin) and the first binding agent immobilization means (for example, streptavidin) are chemically bonded to the first binding agent. The nanoparticles are mixed and combined. Thereafter, as an additional step, the photodegradable material in the probe can be decomposed by light irradiation in the above-mentioned range to remove the magnetic particles, thereby producing a captureer-target biomolecule-nanoparticle complex.

본 발명의 나노입자로, 금, 은, 실리카 및 폴리스티렌을 포함하는 군으로부터 선택되는 하나의 소재를 포함하는 미소구체(microsphere)를 사용할 수 있으며, 상기 나노 입자는 본 발명의 결합물질 고정화 수단으로 코팅된 것을 특징으로 한다. 상기 결합물질 고정화 수단으로 코팅된 나노 입자는 직경이 1 ㎛ 미만인 것이 바람직하지만, 특별히 한정되는 것은 아니다. As the nanoparticles of the present invention, microspheres including one material selected from the group consisting of gold, silver, silica and polystyrene may be used, and the nanoparticles may be coated with the binder immobilization means of the present invention. It is characterized by. Nanoparticles coated with the binder immobilization means preferably have a diameter of less than 1 μm, but are not particularly limited.

상기 포획자-표적생체분자-나노입자 복합체에, 나노입자 표면에 코팅된 제2 결합물질 고정화수단에 화학결합하는 제2 결합물질이 표지된 신호증폭용 광분해성 올리고머로 표지하여 신호를 증폭한다. Signals are amplified by labeling the capture-target biomolecule-nanoparticle complex with a photodegradable oligomer for signal amplification labeled with a second binding agent chemically bonded to a second binding agent immobilization means coated on the surface of the nanoparticles.

본 발명의 제1 결합물질 고정화수단, 제2 결합물질 고정화수단, 제3 결합물질 고정화수단은 동일하거나 상이하게 임의로 조정할 수 있다. 이에 따라, 상기 결합물질 고정화수단에 결합하는 제1 결합물질, 제2 결합물질 및 제3 결합물질도 실험에 따라 동일하거나 상이하게 임의로 조정할 수 있다. 본 발명에 있어서, 바람직한 제1, 제2 및 제3 결합물질 고정화 수단은 스트렙트아비딘이고, 상기 제1, 제2 및 제3 결합물질은 비오틴이다.The first binding material immobilization means, the second binding material immobilization means, and the third binding material immobilization means of the present invention may be arbitrarily adjusted to be the same or different. Accordingly, the first binding material, the second binding material, and the third binding material that bind to the binding material fixing means may be arbitrarily adjusted to be the same or different depending on the experiment. In the present invention, preferred first, second and third binder immobilization means are streptavidin and the first, second and third binder are biotin.

본 발명의 일 실시예의 신호증폭용 광분해성 올리고머는, 나노 입자에 표지 되기 위한 올리고머로서, 5' 부위에 제2 결합물질, 바람직하게는 비오틴을 포함하고, 그 서열 내에 광분해성 물질을 포함하는 것을 특징으로 한다. 본 발명의 일 실시예에서 제조된 신호증폭용 광분해성 올리고머의 서열은 5'-비오틴-AAA-N-GGGGGGGGGGGGG-3'으로 기재될 수 있으며, 상기에서 G는 구아닌(Guanine)을 나타내며, A는 아데닌을 나타내며, N은 광분해성 물질, 즉 PC-o-니트로페닐-CE-포스포라미다이트를 나타낸다. The photodegradable oligomer for signal amplification according to an embodiment of the present invention is an oligomer for labeling nanoparticles, and includes a second binding material, preferably biotin, at a 5 ′ region and a photodegradable material in the sequence. It features. The sequence of the signal amplification photodegradable oligomer prepared in one embodiment of the present invention may be described as 5′-biotin-AAA-N-GGGGGGGGGGGGG-3 ′, wherein G represents guanine, and A is Adenine, N represents a photodegradable substance, ie PC-o-nitrophenyl-CE-phosphoramide.

본 발명에 있어서 용어 ˝생체분자에 대한 신호″란, 목적하는 표적생체분자에 결합된 나노입자에 표지된 다수의 올리고머의 정량적 수치가 광학적, 전기화학적, 전자적 신호 등으로 변환된 것을 나타내며, 상기 신호의 검출 정도를 분석하여 표적생체분자의 정성적 및/또는 정량적 검출이 가능한 것이다.In the present invention, the term "signal for biomolecule" refers to the conversion of quantitative values of a plurality of oligomers labeled on nanoparticles bound to a target biomolecule into optical, electrochemical, electronic signals, and the like. The qualitative and / or quantitative detection of target biomolecules is possible by analyzing the degree of detection.

본 발명의 일 실시예에서 상기 나노 입자를 제거하여 신호증폭용 올리고머만을 분리해내기 위해, 상기 광분해성 물질인 PC-o-니트로페닐-CE-포스포라미다이트가 분해되어 2개의 일인산 단편을 생성하는 파장인 200 내지 400nm의 파장의 광을 사용하나, 이에 한정되는 것은 아니며, 사용되는 광분해성 물질을 분해하는데 충분한 파장의 광선이면 사용이 가능하다.In one embodiment of the present invention to remove the nanoparticles to separate only the signal amplification oligomer, the photo-degradable material PC-o-nitrophenyl-CE-phosphoramidite is decomposed two monophosphate fragments Light having a wavelength of 200 to 400 nm, which is a generated wavelength, is used, but is not limited thereto. Any light having a wavelength sufficient to decompose the photodegradable material used may be used.

수합한 상기 신호증폭용 올리고머는 검출기기, 예를 들어 통상적인 DNA 정량을 위한 UV-VIS 분광광도계를 사용하거나, LC-MS 또는 MALDI-TOF를 이용하여 검출, 분석할 수 있으며, 실제 분석하고자 적용한 표적생체분자의 몰수보다 더 많은 DNA를 확보할 수 있으므로 표적생체분자를 증폭된 신호로서 검출할 수 있는 장점이 있다.The collected signal amplification oligomers can be detected and analyzed using a detector such as a UV-VIS spectrophotometer for conventional DNA quantification, or using LC-MS or MALDI-TOF. Since more DNA can be obtained than the number of moles of the target biomolecule, there is an advantage of detecting the target biomolecule as an amplified signal.

본 발명의 검출 방법을 통해, 분석하고자 하는 표적생체분자가 femto mole/㎖ 수준의 극미량으로 존재하는 경우, 추가적으로 시료의 농도를 높이거나 농도를 높이지 않고서도, 상기 표적생체분자의 변성을 거의 유발하지 않는 상태에서 표적생체분자에 대한 신호의 검출이 가능한 효과가 있다. 또한, 상기의 검출이 종료된 이후에도, 상기의 검출 결과를 신호 증폭용 올리고머 형태로서 보관할 수 있으므로 신뢰성 있는 분석 결과를 장기간 확보할 수 있다.Through the detection method of the present invention, when the target biomolecule to be analyzed is present in a very small amount of femto mole / ml level, the degeneration of the target biomolecule is almost induced without additionally increasing the concentration or increasing the concentration of the sample. Without this, there is an effect that can detect the signal to the target biomolecule. Further, even after the above detection is completed, the above detection result can be stored as an oligomer for signal amplification, so that a reliable analysis result can be secured for a long time.

이하, 본 발명을 실시예를 이용하여 더욱 상세하게 설명한다. 그러나 하기 실시예는 본 발명을 예시하기 위한 것으로서 본 발명은 하기 실시예에 의해 한정되지 않고 다양하게 수정 및 변경될 수 있다. Hereinafter, the present invention will be described in more detail with reference to Examples. However, the following examples are provided to illustrate the present invention, and the present invention is not limited to the following examples and may be variously modified and changed.

참조예Reference Example . . 올리고머Oligomer 합성 synthesis

1-1. 1-1. PCPC -o--o- nitrophenylnitrophenyl -- CECE -- phosphoramiditephosphoramidite 가 편입된 연결용 For connection with 올리고머를Oligomer 합성하는 단계 Synthesizing

주식회사 바이오니아(대전, 한국)에 합성을 의뢰하여, 3'-비오틴-AAA-N-AAA-5'의 서열을 갖는 연결용 광분해성 올리고머를 준비하였다. 상기 서열 중 A는 아데닌(adenine), N은 광분해성 물질인 PC-o-nitrophenyl-CE-phosphoramidite(P/N 212393, Bruker daltonics)을 의미한다. Synthesis was requested to Bioneer (Daejeon, Korea) to prepare a photodegradable oligomer having a sequence of 3′-biotin-AAA-N-AAA-5 ′. In the sequence, A means adenine and N means photo-degradable PC-o-nitrophenyl-CE-phosphoramidite (P / N 212393, Bruker daltonics).

1-2. 1-2. PCPC -o--o- nitrophenylnitrophenyl -- CECE -- phosphoramiditephosphoramidite 가 편입된 신호증폭용 For signal amplification 올리고머를Oligomer 합성하는 단계 Synthesizing

주식회사 바이오니아(대전, 한국)에 합성을 의뢰하여, 5'-비오틴-AAA-N-GGGGGGGGGGGGG-3'의 서열을 갖는 신호증폭용 광분해성 올리고머를 준비하였다. 상기 서열 중 A는 아데닌(adenine), G는 구아닌(guanine), N은 광분해성 물질인 PC-o-nitrophenyl-CE-phosphoramidite(P/N 212393, Bruker daltonics)을 의미한다 By requesting synthesis to Bioneer (Daejeon, Korea), a photo-degradable oligomer for signal amplification having a sequence of 5′-Biotin-AAA-N-GGGGGGGGGGGGG-3 ′ was prepared. In the sequence, A means adenine, G means guanine, and N means photo-degradable PC-o-nitrophenyl-CE-phosphoramidite (P / N 212393, Bruker daltonics).

실시예Example . .

1-1. 1-1. 표적생체분자에On target biomolecules 대한  About 프로브Probe (( probeprobe ) 제조) Produce

A. 연결용 A. For connection 올리고머Oligomer - 자성입자 복합체Magnetic particle complex

표면에 스트렙트아비딘이 코팅된 자성입자인 Dynabeads®M-280(Invitrogen Dynal AS, Oslo, Norway) 현탁액 100㎕를 2X B&W 버퍼(10mM Tris-HCl(pH 7.5), 1mM EDTA, 2.0M NaCl) 100㎕로 3회 세척하였다. 이때, 상기 Dynabeads®M-280 100㎕은 200 피코몰(picomoles)의 비오티닐화 올리고머와 결합이 가능한 양이다. 상기 세척 후의 자성입자 100㎕을 2X B&W 버퍼 100㎕로 다시 부유시켜, 자성입자 용액을 제조하였다. 100 μl of a suspension of Dynabeads ® M-280 (Invitrogen Dynal AS, Oslo, Norway), a magnetic particle coated with streptavidin on the surface, was added to 2X B & W buffer (10 mM Tris-HCl (pH 7.5), 1 mM EDTA, 2.0 M NaCl) 100 Wash three times with μl. In this case, the Dynabeads ® M-280 100㎕ is capable of binding both with biotinylated oligomers of 200 picomolar (picomoles). 100 µl of the magnetic particles after the washing was suspended again with 100 µl of 2X B & W buffer to prepare a magnetic particle solution.

상기 참고예 1-1에서 준비한, 비오티닐화된 연결용 올리고머 10㎕(1,000 피코몰)을 190㎕의 초순수에 희석시켜 올리고머액을 제조하였다.The oligomer solution was prepared by diluting 10 μl (1,000 picomolar) of the biotinylated linkage oligomer prepared in Reference Example 1-1 in 190 μl of ultrapure water.

상기 자성입자 용액 100㎕와 상기 올리고머액 100㎕을 혼합하고, 실온에서 10~20분간 느리게 교반하며 반응시켰다. 반응 중 때때로 살살 쳐주며 혼합하였다. 혼합액 중에는 상기 올리고머가 500 피코몰/200㎕(즉, 2.5 피코몰/㎕) 존재한다. 반응이 완전히 종결된 후 상등액 중에는 연결용 올리고머가 1.5 피코몰/㎕이 존재하게 된다. 반응의 진행 정도를 파악하기 위해, NanoDrop(ND-1000 spectrophotometer, NanoDrop, USA)으로 분석하였다.100 μl of the magnetic particle solution and 100 μl of the oligomer solution were mixed and reacted with slow stirring at room temperature for 10-20 minutes. Mix gently, occasionally during the reaction. In the mixed solution, the oligomer is present in 500 picomol / 200 μl (ie, 2.5 picomol / μl). After completion of the reaction, 1.5 picomolar / μl of the linking oligomer is present in the supernatant. To determine the progress of the reaction, it was analyzed by NanoDrop (ND-1000 spectrophotometer, NanoDrop, USA).

반응이 끝난 것을 확인한 후, 자석을 이용하여 연결용 올리고머가 결합된 자성입자를 분리하고, 1X B&W 버퍼 100㎕로 3번 세척하고, B&W 버퍼 75㎕로 다시 부유시킨다.After confirming that the reaction is completed, the magnetic particles bound to the oligomer for coupling using a magnet, separated, washed three times with 100 μl of 1 × B & W buffer, and suspended again with 75 μl of B & W buffer.

B. B. 프로브Probe (연결용 (For connection 올리고머Oligomer -자성입자-Magnetic Particles 포획자Catcher 복합체) Complex)

본 실시예의 목표 분석물인 DcR3(NT) 펩타이드(905-219, Assay Design, Inc., USA) 항원에 대한 포획자(항체)인 항-DcR3(NT)(DcR3(3H5/DcR3), Cat No.sc-53685, Santa Cruz, USA) 10㎕(100㎍ IgG/1.0㎖ PBS)를 0.5mΜ 이미다졸 용액(pH 6.0) 90㎕에 녹여두었다.Anti-DcR3 (NT) (DcR3 (3H5 / DcR3), Cat No. 2, which is a capturer (antibody) to the DcR3 (NT) peptide (905-219, Assay Design, Inc., USA) antigen, which is the target analyte of this example. sc-53685, Santa Cruz, USA) 10 μl (100 μg IgG / 1.0 mL PBS) was dissolved in 90 μl of 0.5 mM imidazole solution (pH 6.0).

하기의 방법을 이용하여, 상기 B에서 준비한 복합체 중 연결용 올리고머의 5'-인산기에 항-DcR3(NT)를 결합시켰다. Using the following method, anti-DcR3 (NT) was bound to the 5′-phosphate group of the linking oligomer in the complex prepared in B.

상기 A에서 준비해둔 연결용 올리고머-자성입자 용액 75㎕이 담긴 마이크로튜브(microcentrifuge tube)에, 1.25㎎의 EDC(1-ethyl-3[3-dimethylaminopropyl]carbodiimide hydrochloride, #22980, PIERCE, USA)를 투입하고 볼텍스(vortex)하여 EDC를 완전히 녹였다. 그 후, 즉시 상기에서 준비해둔 항- DcR3(NT)/이미다졸 용액 50㎕를 투입하였다. 내용물이 완전히 녹을 때까지 볼텍스한 후, 원심분리하여 내용물을 모았다. 여기에 0.5M 이미다졸 용액(pH 6.0) 200㎕을 첨가하여 실온에서 24시간 반응시켰다. 비반응한 EDC를 제거하고, 자석을 이용하여 항체가 결합된 연결용 올리고머-자성입자를 분리한 후, PBS로 3회 세척후 100㎕의 PBS 버퍼에 녹여 두었다. 이렇게 하여 도 3과 같은 구조의 프로브가 마련되었다.1.25 mg of EDC (1-ethyl-3 [3-dimethylaminopropyl] carbodiimide hydrochloride, # 22980, PIERCE, USA) was added to a microcentrifuge tube containing 75 μl of the oligomeric-magnetic particle solution prepared in A. Inject and vortex to completely dissolve the EDC. Immediately thereafter, 50 µl of the anti-DcR3 (NT) / imidazole solution prepared above was added thereto. The contents were vortexed until the contents were completely dissolved and then centrifuged to collect the contents. 200 µl of 0.5 M imidazole solution (pH 6.0) was added thereto and allowed to react at room temperature for 24 hours. The unreacted EDC was removed, and the antibody-linked oligomer-magnetic particles were separated using a magnet, washed three times with PBS, and then dissolved in 100 μl of PBS buffer. In this way, a probe having a structure as shown in FIG. 3 was provided.

프로브에 항체가 결합이 되었는지 체크하기 위해, 바이오라드 사의 단백질 분석 표준 용액(Bio-rad protein assay standard Ⅱ, CAT No: 500-0007, USA) 및 micro-BCA 방법을 이용하여 표준 곡선을 만들고 이에 따라 정량을 하였으며, 그 결과를 도 7b에 나타내었다.To check if the antibody is bound to the probe, a standard curve is prepared using Biorad protein assay standard II (CAT No: 500-0007, USA) and the micro-BCA method and accordingly Quantification was carried out and the results are shown in FIG. 7B.

1-2. 1-2. 프로브Probe -- 표적생체분자Target biomolecule 복합체 제조 Composite manufacturing

본 실시예의 표적생체분자인 DcR3(NT) 항원은, 당업자에게 항체 공급 업체로 알려진 바와 같은 ELISA 기법(Santa-Cruz, Inc., USA)을 인용하여, 하기와 같은 방법으로 상기 실시예 1-1에서 제조한 프로브의 항체에 결합시켰다. The target biomolecule DcR3 (NT) antigen of this Example was cited by ELISA technique (Santa-Cruz, Inc., USA), which is known to those skilled in the art as an antibody supplier. It was bound to the antibody of the probe prepared in.

우선 항원인 DcR3(NT) 펩타이드(2mg/ml)를 10ng/㎖, 100pg/㎖, 1.0pg/㎖가 되도록 PBS로 희석하였다. 상기 희석된 용액 각 25㎕와 상기 1-1의 B에서 준비한 프로브 25㎕를 각각 섞은 후, 실온에서 1시간 반응 시켰다. 그 후, 기타 비반응 물질 및 잔류물을 제거하기 위하여 자석을 이용하여 분리하고 다시 각 50㎕의 PBS에 녹여두었다. First, the antigen DcR3 (NT) peptide (2 mg / ml) was diluted with PBS to 10 ng / ml, 100 pg / ml, 1.0 pg / ml. Each 25 μl of the diluted solution and 25 μl of the probe prepared in B of 1-1 were mixed, and then reacted at room temperature for 1 hour. Thereafter, in order to remove other unreacted substances and residues, they were separated by using a magnet and dissolved in each 50 µl of PBS.

프로브와 표적생체분자의 결합을 체크하기 위해, 바이오라드 사의 단백질 분석 표준 용액(Bio-rad protein assay standard Ⅱ, CAT No: 500-0007, USA) 및 micro-BCA 방법을 이용하여 표준 곡선을 만들고 이에 따라 정량을 하였으며, 그 결과를 도 7c에 나타내었다.To check the binding of the probe to the target biomolecules, a standard curve was created using Biorad's Protein-Analysis Standard Solution (Bio-rad protein assay standard II, CAT No: 500-0007, USA) and the micro-BCA method. It was quantified according to the results, it is shown in Figure 7c.

1-3. 1-3. 표적생체분자의Target biomolecule 선택적 표지화  Selective labeling

상기 실시예 1-2의 프로브-표적생체분자 복합체에, 결합물질 고정화수단(스트렙트아비딘)이 코팅된 나노입자(실리카 미소구체)를 결합시키기 위한 결합물질의 표지화를 위해, 비오티닐화 키트(EZ-Link sulfo NHS biotinylation kit, P/N 21217, PIERCE, USA)를 사용하여, 제조사의 지시에 따라 하기와 같이 비오티닐화(biotinylation)를 수행하였다. Biotinylation kit for labeling the binding material for binding the nanoparticles (silica microspheres) coated with the binding material immobilization means (streptavidin) to the probe-target biomolecule complex of Example 1-2, Using EZ-Link sulfo NHS biotinylation kit, P / N 21217, PIERCE, USA), biotinylation was performed as described below according to the manufacturer's instructions.

우선 2.2mg 의 Sulfo-NHS-비오틴을 500㎕의 초순수에 녹인 후, 이중 10㎕를 상기 1-2에서 준비한 용액 각각에 분주하고 실온에서 약 1시간 정도 반응시켰다. 반응시 부드러운 교반이 이루어지도록 롤러믹서(roller mixer)를 이용하였다. 반응이 완료되면 자석으로 분리하고 100㎕ 정도의 PBS 용액을 이용하여 3회 세척한 뒤, 각 50㎕의 PBS 용액에 녹였다. 이때, 본 발명에서는 항원 선택적인 비오티닐화가 수행되는데 그 이유는, 항체가 상기 연결용 올리고머에 결합할 당시, 항체의 아민기가 선점되어 버렸기 때문이다. 비오티닐화를 수행한 후, 남은 시약 및 불필요한 염을 제거하기 위해 자석을 이용하여 프로브-표적생체분자 복합체를 분리한 후, 2M NaCl TE 버퍼를 이용하여 3회 세척하였다. 이때, 항원과 항체가 분리되는 것을 방지하기 위해, pH가 변화되지 않도록 유의하여야 한다. 세척 후에는 2M NaCl TE 버퍼 (100 ㎕)에 녹였다. First, 2.2 mg of Sulfo-NHS-biotin was dissolved in 500 µl of ultrapure water, and 10 µl of the solution was dispensed into each of the solutions prepared in 1-2 above, and reacted at room temperature for about 1 hour. A roller mixer was used to achieve gentle stirring during the reaction. When the reaction was completed, separated by a magnet and washed three times with 100 μl PBS solution, and dissolved in each 50 μl PBS solution. At this time, the antigen-selective biotinylation is performed in the present invention because the amine group of the antibody has preempted when the antibody binds to the linking oligomer. After biotinylation was performed, the probe-target biomolecule complex was separated using a magnet to remove remaining reagents and unnecessary salts, and then washed three times using 2M NaCl TE buffer. At this time, to prevent separation of the antigen and antibody, care should be taken not to change the pH. After washing it was dissolved in 2M NaCl TE buffer (100 μl).

1-4. 1-4. 프로브Probe -- 표적생체분자Target biomolecule -나노입자 복합체 생성-Nanoparticle Complex

본 발명의 나노입자인, 스트렙트아비딘이 코팅된 실리카 미소구체(Streptavidin-coated silica microsphere, #CS01N, Bang's Laboratories, Inc., USA)를 적합한 방법으로 미리 적절히 세척한 후, 초순수 (100 ㎕)에 녹였다. 이를 상기 2M NaCl TE 버퍼에 녹여둔 표적생체분자-프로브 복합체 용액과 동량으로 혼합하였다. 실온에서 20분간, up-down 방식으로 부드럽게 혼합한 후, 자석을 이용하여 프로브-표적생체분자-나노입자 복합체를 분리하였다. 분리한 복합체를 2M NaCl TE 버퍼를 이용하여 3회 정도 세척하고, 2M NaCl TE 버퍼(100 ㎕)에 녹였다. Streptavidin-coated silica microspheres (# CS01N, Bang's Laboratories, Inc., USA), the nanoparticles of the present invention, were appropriately washed in a suitable manner in advance and then washed in ultrapure water (100 μl). Melted. This was mixed in the same amount with the target biomolecule-probe complex solution dissolved in the 2M NaCl TE buffer. After mixing for 20 minutes at room temperature in an up-down manner, the probe-target biomolecule-nanoparticle complex was separated using a magnet. The separated complex was washed three times with 2M NaCl TE buffer and dissolved in 2M NaCl TE buffer (100 µl).

1-5. 1-5. 광조사하여Lightly 프로브Probe 내 자성입자 제거 Remove Magnetic Particles

상기 실시예 1-4에서 준비해둔 프로브-표적생체분자-나노입자 복합체 용액 (농도별 각 50㎕)을 석영제 반응용기에 넣고 자외선 조사기(UV illuminator, Longlife filter, Spectroline사) 에서 365 nm 및 254 nm의 파장을 동시에 사용하여 15분간 광을 조사하였다. 조사를 하는 도중에 입자가 침전되지 않도록 가끔씩 흔들어 주었다. 그 후, 자석을 이용하여 자성입자 M-280을 분리한 후 상등액을 취하였다. 분리한 상등액은 2M NaCl TE 버퍼를 이용하여 3회 정도 세척한 후, 2M NaCl TE 버퍼 10㎕에 녹여두었다.The probe-target biomolecule-nanoparticle complex solution (50 μl for each concentration) prepared in Example 1-4 was placed in a quartz reaction vessel and 365 nm and 254 in an ultraviolet illuminator (UV illuminator, Longlife filter, Spectroline). Light was irradiated for 15 minutes using the wavelength of nm simultaneously. During the irradiation, the particles were occasionally shaken to prevent the particles from settling. Then, after separating the magnetic particles M-280 using a magnet, the supernatant was taken. The separated supernatant was washed three times with 2M NaCl TE buffer, and then dissolved in 10 μl of 2M NaCl TE buffer.

1-6. 신호증폭용 1-6. Signal amplification 광분해성Photodegradable 올리고머로With oligomer 나노입자 표지 Nanoparticle Label

상기 1-5의 항체-항원-나노입자 복합체 용액 10㎕에, 참조예 2에서 합성한 신호증폭용 광분해성 올리고머(100 ㎕)를 넣고 20분간 반응시켰다. 스트렙트아비딘과 비오틴의 결합성질을 이용해 표지한 후, 표지되지 않은 올리고머를 제거하기 위해 원심분리하고, 최종적으로 10㎕의 초순수에 녹였다. To 10 µl of the antibody-antigen-nanoparticle complex solution 1-5 above, a photodegradable oligomer (100 µl) synthesized in Reference Example 2 was added and allowed to react for 20 minutes. After labeling using the streptavidin and biotin binding properties, centrifugation was performed to remove unlabeled oligomers and finally dissolved in 10 μl of ultrapure water.

1-7. 1-7. 광조사하여Lightly 항체-항원-나노입자 복합체 제거 Antibody-antigen-nanoparticle complex removal

상기 실시예 1-6에서 준비해둔 항체-항원-실리카 미소구체 복합체 용액 10㎕을 석영제 반응용기에 넣고 자외선 조사기에서 365 nm 및 254 nm의 파장을 동시에 사용하여 5분간 광을 조사하였다. 그 후, 14,000 rpm에서 원심분리하여 항원-항체-나노입자 복합체를 제거하고 상등액을 취하여 신호증폭용 올리고머를 수합하였다. 10 μl of the antibody-antigen-silica microsphere complex solution prepared in Example 1-6 was placed in a quartz reaction vessel and irradiated with light for 5 minutes using a wavelength of 365 nm and 254 nm in an ultraviolet irradiator. Subsequently, the antigen-antibody-nanoparticle complex was removed by centrifugation at 14,000 rpm, and the supernatant was collected to collect oligomers for signal amplification.

시험예Test Example . . 올리고머에On oligomers 의한  by 신호증폭성Signal amplification 확인 Confirm

상기 실시예 1-7에서 분리한 상등액은 UV-VIS 분광광도계(UV-VIS spectrophotometer, 모델번호, 제조사, 국가)를 이용하여, 올리고뉴클레오티드의 합성회사인 바이오니아(대전, 한국)에서 공급한 양을 표준으로하여 260/280nm에서 표준곡선을 작성하여 이에 따라 정량을 수행하였으며, 그 결과를 도 6에 도시하였다.The supernatant separated in Example 1-7 was supplied using the UV-VIS spectrophotometer (UV-VIS spectrophotometer, model number, manufacturer, country), the amount supplied from Bionia (Daejeon, Korea), a synthesis company of oligonucleotides As a standard, a standard curve was prepared at 260/280 nm, and quantification was performed accordingly, and the results are shown in FIG. 6.

도 6에 나타난 바와 같이, 본 발명의 분석 방법을 이용하였을 때 1 피코그람 /ml의 DcR3을 처리한 경우에도, 대조구에 비해 올리고머의 수치가 확연하게 나타남을 알 수 있으며, 항원을 100 picogram/ml로 처리한 경우까지도 선형성(linearity)이 좋게 나타나, 본원 발명의 분석 방법이 극미량의 생체분자, 특히 단백질에 대한 신호 증폭에 효과적임을 알 수 있다. As shown in Figure 6, even when treated with 1 picogram / ml of DcR3 when using the analysis method of the present invention, it can be seen that the oligomer value is clearly displayed compared to the control, antigen 100 picogram / ml Even when treated with, the linearity (linearity) is good, it can be seen that the analysis method of the present invention is effective in amplifying the signal for a trace amount of biomolecules, especially proteins.

도 1은 본 발명의 검출 방법의 일실시예를 나타내는 개요도이다. 1 is a schematic diagram showing an embodiment of a detection method of the present invention.

도 2는 본 발명의 광분해성 물질을 갖는 올리고머를 합성한 모식도로서, 상기의 광분해성 물질은 PC-o-니트로페닐-CE-포스포라미다이트(PC-o-nitrophenyl-CE-phosphoramidite)이다. Figure 2 is a schematic diagram of the oligomer having a photodegradable material of the present invention, the photodegradable material is PC-o-nitrophenyl-CE-phosphoramidite (PC-o-nitrophenyl-CE-phosphoramidite).

도 3은 자성입자에, 광분해성 물질을 갖는 올리고머와 관련 항체가 결합되어 있는 모식도이다. 3 is a schematic diagram in which an oligomer having a photodegradable substance and an associated antibody are bound to magnetic particles.

도 4는 본 발명에 사용되는 프로브에, 측정하고자 하는 표적생체분자인 항원 DcR3을 결합시킨 것을 나타내는 모식도이다. 4 is a schematic diagram showing the binding of antigen DcR3, a target biomolecule to be measured, to a probe used in the present invention.

도 5는 신호증폭용 광분해성 올리고머를 광조사하여 분리하기 직전의 모식도이다. 5 is a schematic view of the signal immediately before the photolytic oligomer for separation by light irradiation.

도 6은 항원 DcR3의 양을 바꾸어 가면서 항원 DcR3에 대한 신호를 검출, 분석한 결과를 나타내는 그래프이다. 대조액인 PBS 버퍼에 비교할 때, 1.0 pg/ml의 항원 존재시 매우 높은 반응성을 나타내며, 100 ng/ml 정도까지 직선성(linearity)를 나타낸다. 6 is a graph showing the results of detecting and analyzing a signal for antigen DcR3 while varying the amount of antigen DcR3. Compared to the control PBS buffer, it shows very high reactivity in the presence of 1.0 pg / ml of antigen and linearity up to about 100 ng / ml.

도 7a는 자성입자에 연결용 광분해성 올리고머가 결합했는지 여부를 알아보기 위해, 반응전과 반응후에 반응용기에 남아있는 연결용 광분해성 올리고머의 양을 측정하여 나타낸 그래프이다. Figure 7a is a graph showing the measurement of the amount of the photodegradable oligomer for the remaining in the reaction vessel before and after the reaction to determine whether the linking photodegradable oligomer to the magnetic particles.

도 7b는 프로브에 항체가 결합했는지 여부를 알아보기 위해, 반응전과 반응후에 반응용기에 남아있는 항체의 양을 측정하여 나타낸 그래프이다.Figure 7b is a graph showing the measurement of the amount of antibody remaining in the reaction vessel before and after the reaction to determine whether the antibody bound to the probe.

도 7c는 항체와 항원의 결합 여부를 알아보기 위해, 반응전과 반응후에 반응용기에 남아있는 항원의 양을 측정하여 나타낸 그래프이다. Figure 7c is a graph showing the measurement of the amount of antigen remaining in the reaction vessel before and after the reaction, in order to determine whether the antibody and the antigen binding.

Claims (17)

샘플 내의 표적생체분자를 프로브로 포획하는 단계; Capturing the target biomolecule in the sample with the probe; 상기 포획된 표적생체분자와 나노입자를 결합시키는 단계; Binding the captured target biomolecule with nanoparticles; 상기 결합된 나노입자와 신호증폭용 광분해성 올리고머를 결합시키는 신호증폭단계; A signal amplifying step of coupling the combined nanoparticles with a photodegradable oligomer for signal amplification; 광조사에 의하여, 상기 나노입자와 결합한 신호증폭용 광분해성 올리고머의 결합부위를 분해하고, 상기 분해에 의하여 얻어진 올리고머로부터 상기 표적생체분자에 대한 신호를 검출하는 신호검출단계;A signal detection step of decomposing a binding site of the photodegradable oligomer for signal amplification combined with the nanoparticles by light irradiation and detecting a signal for the target biomolecule from the oligomer obtained by the decomposition; 를 포함하는, 생체분자에 대한 신호 검출 방법.Signal detection method for a biomolecule comprising a. 청구항 1에 있어서, The method according to claim 1, 상기 표적생체분자와 나노입자 간의 결합 및 상기 나노입자와 신호증폭용 광분해성 올리고머의 결합은, 결합물질 고정화 수단 및 여기에 결합하는 결합물질 간의 화학결합에 의해 이루어지는 것을 특징으로 하는, 생체분자에 대한 신호 검출 방법.The binding between the target biomolecule and the nanoparticles and the binding of the nanoparticle and the photodegradable oligomer for signal amplification are achieved by chemical bonding between a binding material immobilization means and a binding material bound thereto. Signal detection method. 청구항 2에 있어서,The method according to claim 2, 상기 결합물질 고정화 수단은, 비오틴, 스트렙트아비딘, 아비딘, 압타머(aptamer), 렉틴(lectin), DNA, RNA, 리간드, 조효소(coenzyme), 무기이온, 효소 보조인자(cofactor), 당, 지질 및 기질을 포함하는 군에서 선택되고,The binder immobilization means, biotin, streptavidin, avidin, aptamer, lectin, DNA, RNA, ligand, coenzyme, inorganic ion, enzyme cofactor, sugar, lipid And a substrate comprising a substrate, 상기 결합물질은, 상기 결합물질 고정화 수단과 화학결합하는 물질 중에서 선택되는 것을 특징으로 하는, 생체분자에 대한 신호 검출 방법.The binding material is a signal detection method for a biomolecule, characterized in that selected from the substance chemically bonded to the binding material immobilization means. 청구항 2에 있어서,The method according to claim 2, 상기 표적생체분자와 상기 나노입자 간의 결합은, 상기 포획된 표적생체분자에 고정된 제1 결합물질 및 상기 나노입자에 고정된 제1 결합물질 고정화 수단 간의 화학결합에 의해 이루어지고, The binding between the target biomolecule and the nanoparticles is made by chemical bonding between the first binding material immobilized on the captured target biomolecule and the first binding material immobilization means immobilized on the nanoparticle, 상기 나노입자와 상기 신호증폭용 광분해성 올리고머 간의 결합은, 상기 나노입자에 고정된 제2 결합물질 및 상기 신호증폭용 광분해성 올리고머에 고정된 제2 결합물질 고정화 수단 간의 화학결합에 의해 이루어지는 것을 특징으로 하는, 생체분자에 대한 신호 검출 방법.Bonding between the nanoparticles and the signal-amplifying photodegradable oligomer is made by a chemical bond between a second binding material immobilized on the nanoparticles and a second binding material immobilization means immobilized on the signal-amplifying photodegradable oligomer A signal detection method for a biomolecule. 청구항 4에 있어서, 상기 제1 및 제2 결합물질 고정화 수단은 스트렙트아비딘이고, 상기 제1 및 제2 결합물질은 비오틴인 것을 특징으로 하는, 생체분자에 대한 신호 검출 방법.The method according to claim 4, wherein the first and second binder immobilization means is streptavidin, and the first and second binder are biotin. 청구항 1에 있어서, 상기 나노입자는 결합물질 고정화 수단으로 코팅된 것을 특징으로 하는, 생체분자에 대한 신호 검출 방법.The method of claim 1, wherein the nanoparticles are coated with a binder immobilization means. 청구항 1 내지 청구항 6 중 어느 한 항에 있어서, 상기 나노입자는 금, 은, 실리카 및 폴리스티렌을 포함하는 군으로부터 선택되는 하나의 소재를 포함하는 것을 특징으로 하는 생체분자에 대한 신호 검출 방법. The method according to any one of claims 1 to 6, wherein the nanoparticles comprise one material selected from the group consisting of gold, silver, silica and polystyrene. 청구항 1에 있어서, 상기 프로브는 The method according to claim 1, wherein the probe 서열 내에 광분해성 물질를 포함하는 광분해성 올리고머; Photodegradable oligomers comprising a photodegradable substance in the sequence; 상기 광분해성 올리고머의 일단에 고정된 자성입자; 및 Magnetic particles fixed to one end of the photodegradable oligomer; And 상기 광분해성 올리고머의 타단에 고정되어 상기 표적생체분자와 결합하는 포획자;A capturer fixed to the other end of the photodegradable oligomer to bind to the target biomolecule; 를 포함하는 것을 특징으로 하는, 생체분자에 대한 신호 검출 방법.Signal detection method for a biomolecule, characterized in that it comprises a. 청구항 8에 있어서, The method according to claim 8, 상기 자성입자와 상기 광분해성 올리고머는 제3 결합물질과 제3 결합물질 고정화 수단에 의하여 서로 고정되어 있고,The magnetic particles and the photodegradable oligomer are fixed to each other by a third binder and a third binder immobilization means, 상기 제3 결합물질 고정화 수단은 스트렙트아비딘이고, 상기 제3 결합물질은 비오틴인 것을 특징으로 하는, 생체분자에 대한 신호 검출 방법.And said third binding agent immobilizing means is streptavidin and said third binding agent is biotin. 청구항 8에 있어서, The method according to claim 8, 상기 신호증폭단계 전에, 광조사에 의하여 상기 프로브 내 올리고머 내의 광분해성 물질을 분해하여 자성입자를 제거하는 단계를 더욱 포함하는 것을 특징으로 하는, 생체분자에 대한 신호 검출 방법.Before the signal amplification step, further comprising the step of decomposing the photodegradable material in the oligomer in the probe by light irradiation to remove the magnetic particles, signal detection method for a biomolecule. 청구항 1 또는 청구항 8에 있어서, 상기 올리고머는 DNA 또는 DNA 유사체인 것을 특징으로 하는, 생체분자에 대한 신호 검출 방법.The method of claim 1 or 8, wherein the oligomer is a DNA or a DNA analogue, signal detection method for a biomolecule. 청구항 8에 있어서, 상기 광분해성 물질은 DNA에 편입할 수 있는 광분해성 물질인 것을 특징으로 하는 생체분자에 대한 신호 검출 방법.The method of claim 8, wherein the photodegradable material is a photodegradable material that can be incorporated into DNA. 청구항 12에 있어서, 상기 광분해성 물질은 포스포라미다이트(phosphoramidite) 화합물을 포함하는 것을 특징으로 하는, 생체분자에 대한 신호 검출 방법. The method of claim 12, wherein the photodegradable material comprises a phosphoramidite compound. 청구항 13에 있어서, 상기 포스포라미다이트 화합물은 PC-o-니트로페닐-CE-포스포라미다이트(PC-o-nitrophenyl-CE-phosphoramidite)인 것을 특징으로 하는, 생체분자에 대한 신호 검출 방법.The method according to claim 13, wherein the phosphoramidite compound is PC-o-nitrophenyl-CE-phosphoramidite, characterized in that the signal detection method for a biomolecule. 청구항 14에 있어서, 상기 광조사는 상기 포스포라미다이트 화합물이 분해되는 파장인 200 내지 400nm의 광을 이용하여 수행하는 것을 특징으로 하는, 생체분자에 대한 신호 검출 방법. The method of claim 14, wherein the light irradiation is performed using light having a wavelength of 200 to 400 nm, which is a wavelength at which the phosphoramidite compound is decomposed. 청구항 1 또는 청구항 8에 있어서, 상기 표적생체분자 또는 상기 포획자는 각각 단백질, 펩티드, 합텐 및 상기 단백질, 펩티드 및 합텐에 대한 항체를 포함하는 군에서 선택되는 것을 특징으로 하는, 생체분자에 대한 신호 검출 방법. The signal detection method of claim 1 or 8, wherein the target biomolecule or the capture agent is selected from the group comprising a protein, a peptide, a hapten and an antibody against the protein, the peptide and the hapten, respectively. Way. 청구항 1에 있어서, 상기 샘플은 바이러스, 박테리아, 세포 또는 조직 유래 추출물, 파쇄물(lysate) 또는 정제물, 혈액, 혈장, 혈청, 림프, 골수액, 타액, 안구액, 정액, 뇌추출물, 척수액, 관절액, 흉선액, 복수 및 양막액으로 이루어진 군에서 선택되는 것을 특징으로 하는, 생체분자에 대한 신호 검출 방법. The method of claim 1, wherein the sample is a virus, bacteria, cell or tissue-derived extract, lysate or purified product, blood, plasma, serum, lymph, bone marrow fluid, saliva, ocular fluid, semen, brain extract, spinal fluid, joint fluid , Thymic fluid, ascites and amniotic fluid, characterized in that the signal detection method for biomolecules.
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