KR20030096986A - Identification composition for non-fermentative gram negative bacilli and identification kit containing the same - Google Patents
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Abstract
Description
[발명이 속하는 기술분야][TECHNICAL FIELD OF THE INVENTION]
본 발명은 비발효 그람 음성균 동정용 조성물 및 그를 이용한 동정키트에 관한 것으로, 보다 상세하게는 미생물의 24가지의 생화학적인 특징을 한번에 확인할 수 있는 검사용 조성물, 동정방법 및 동정키트에 관한 것이다.The present invention relates to a non-fermentative Gram-negative bacterium identification composition and identification kit using the same. More particularly, the present invention relates to a test composition, identification method, and identification kit that can identify 24 kinds of biochemical characteristics of microorganisms at once.
[종래기술][Private Technology]
미생물 동정이란 불명확한 미생물을 생화학적, 형태적, 화학적 또는 분자생물학적 특성들을 이용하여 분류학상의 위치 및 균명을 확인하는 것을 의미한다.Identification of microorganisms refers to the identification and identification of taxonomic locations using biochemical, morphological, chemical or molecular biological properties of unknown microorganisms.
고전적인 미생물 동정방법으로는 AFB 염색, 알베르트(Albert) 염색, 박시트라신(Bacitracin) 검사, 바일-에스큘린(Bile-esc㎕in) 검사, CAMP 검사, 카탈레이즈(Catalase) 검사, 사이트레이트 활용성(CITRATE UTILIZATION) 여부, 디카복실레이즈(DECARBOXYLASE) 검사, DNase 검사, 그람 염색, 인디아 잉크 조제(India ink Preparation), 인돌 검사, 10 % KOH(NaOH) 조제, 메틸 레드 시험, MSA(Mannitolsalt agar) 검사, 6.5% NaCl 검사, 니아신(NIACIN) 검사, 아질산염 검사, 옵토친(Optochin) 검사, 옥시데이즈 검사, 보그스-프로스카우어(Voges-Proskauer) 시험 등이 실시되고 있다.Classic microbial identification methods include AFB staining, Albert staining, Bacitracin test, Bile-escμlin test, CAMP test, Catalase test, and citrate CITRATE UTILIZATION, DECARBOXYLASE test, DNase test, Gram staining, India ink Preparation, Indole test, 10% KOH (NaOH) preparation, Methyl red test, MSA (Mannitolsalt agar) Tests, 6.5% NaCl test, NIACIN test, nitrite test, Optochin test, Oxidase test and Voggs-Proskauer test are conducted.
이러한 방법을 토대로 여러 가지 미생물 동정용 키트가 개발되어 시판되고 있다. 일예로 API 20 E(API 20 Enterobacteriaceae), API 20 NE (API 20 Non-Enterobacteriaceae), API 20 STREP(API 20 Streptococcus), API STAPH(API Staphylococcus), API 20 C AUX API 20 candida), API NH (API Neisseria and Haemophilus), API Listeria(API Listeria), API Coryne(API Coryne), ID 32 GN(Identification system for Gram negative rods), ID 32 C(Identification system for yeasts) 등이 있으며, 상기한 키트들은 특정 균에 한하여 동정할 수 있도록 고안되어 있다.Based on this method, a variety of microorganism identification kits have been developed and are commercially available. For example, API 20 E (API 20 Enterobacteriaceae), API 20 NE (API 20 Non-Enterobacteriaceae), API 20 STREP (API 20 Streptococcus), API STAPH (API Staphylococcus), API 20 C AUX API 20 candida, API NH ( API Neisseria and Haemophilus (API), API Listeria (API Listeria), API Coryne (API Coryne), ID 32 GN (Identification system for Gram negative rods), ID 32 C (Identification system for yeasts), and the like. It is designed to identify only bacteria.
최근에 개발되고 있는 동정방법은 리보솜 rRNA를 PCR로 확인하는 방법이다. 그러나 이러한 방법은 각 균의 rRNA 정보가 확립되어 있어야 하며, 수차례의 PCR 과정을 수행하여야 하는 번거러움이 따를 뿐만 아니라 변이종에 대한 정확한 분석이 어려운 문제점이 있다.A recently developed identification method is a method for identifying ribosomal rRNA by PCR. However, this method has to establish the rRNA information of each bacteria, not only hassle of having to perform several PCR processes, but also has a problem that it is difficult to accurately analyze the mutant species.
한편, 미생물 동정은 병원균의 식별이나 신규, 또는 특정한 환경에서 유용한 미생물의 확인을 위해서는 필수적으로 수행되어야 하는 과정이다. 그러나, 미생물을 동정하기까지 필수적으로 실시하여야 하는 실험과정이 많아 하나의 균주를 동정하기까지 많은 시간과 비용이 소모되고 있는 실정이다.On the other hand, microbial identification is a process that must be performed to identify pathogens or to identify microorganisms useful in a new or specific environment. However, many experiments must be carried out to identify microorganisms, and thus, a lot of time and money are required to identify a strain.
따라서, 미생물의 다양한 특성을 쉽게, 간단하게 확인하여 동정할 수 있는방법의 개발이 필요하다.Therefore, it is necessary to develop a method for easily and simply identifying and identifying various characteristics of microorganisms.
상기 종래기술의 문제점을 해결하기 위하여, 본 발명은 비발효 그람 음성균을 쉽고 간단하게 동정할 수 있는 방법을 제공하는 것을 목적으로 한다.In order to solve the problems of the prior art, an object of the present invention is to provide a method that can easily and simply identify non-fermented Gram-negative bacteria.
또한 본 발명은 당 산화반응, 베타-갈락토시데이즈 활성, 젤라티네이즈 활성, 에스쿨린 가수분해 반응, 유기산 알칼리화 반응, 유레아제 활성, 알기닌 디하이드롤레이즈 활성, 하이드로겐 설페이트 생성반응, 발효여부, 질산 환원반응 및 인돌 생성반응을 각각 확인할 수 있는 동정용 조성물을 제공하는 것을 목적으로 한다.In addition, the present invention is a sugar oxidation reaction, beta-galactosidase activity, gelatinase activity, esculin hydrolysis reaction, organic acid alkalizing reaction, urease activity, arginine dehydrolase activity, hydrogen sulfate production reaction, fermentation, An object of the present invention is to provide a composition for identification, which can identify the nitric acid reduction reaction and the indole production reaction, respectively.
또한 본 발명은 상기의 동정용 조성물을 이용하여 비발효 그람 음성균을 동정할 수 있는 동정키트를 제공하는 것을 목적으로 한다.Another object of the present invention is to provide an identification kit that can identify non-fermented Gram-negative bacteria using the composition for identification.
상기 기술적 과제를 해결하고자, 본 발명은 미생물 현탁액에 대한 당 산화반응, 베타-갈락토시데이즈 활성, 젤라티네이즈 활성, 에스쿨린 가수분해 반응, 유기산 알칼리화 반응, 유레아제 활성, 알기닌 디하이드롤레이즈 활성, 하이드로겐 설페이트 생성반응, 발효여부, 질산 환원반응 및 인돌 생성반응을 각각 확인하여 비발효 그람 음성균을 동정하는 방법을 제공한다.In order to solve the above technical problem, the present invention is a sugar oxidation reaction, beta-galactosidase activity, gelatinase activity, esculin hydrolysis reaction, organic acid alkalizing reaction, urease activity, arginine dehydrolase activity for the microbial suspension It provides a method for identifying non-fermented Gram-negative bacteria by checking the hydrogen sulfate production reaction, fermentation, nitric acid reduction reaction and indole production reaction, respectively.
또한 본 발명은 당 산화반응 검사용 조성물, 베타-갈락토시데이즈 활성 검사용 조성물, 젤라티네이즈 활성 검사용 조성물, 에스쿨린 가수분해 반응 검사용 조성물, 유기산 알칼리화 반응 검사용 조성물, 유레아제 활성 검사용 조성물, 알기닌디하이드롤레이즈 활성 검사용 조성물, 하이드로겐 설페이트 생성반응, 발효여부 검사용 조성물, 질산 환원반응 검사용 조성물 및 인돌 생성반응 검사용 조성물을 포함하는 동정용 조성물을 제공한다.The present invention also provides a composition for testing sugar oxidation reaction, a composition for testing beta-galactosidase activity, a composition for testing gelatinase activity, a composition for esculin hydrolysis reaction, a composition for testing organic acid alkalizing reaction, and a urease activity test. It provides a composition for identification, comprising a composition for the test, arginine dihydrolase activity test composition, hydrogen sulfate production reaction, fermentation test composition, nitric acid reduction test composition and indole production test composition.
또한 본 발명은 상기 검사용 조성물들로 이루어진 군으로부터 1종이상 선택된 조성물을 포함하는 동정용 키트를 제공하는 것을 목적으로 한다.In addition, an object of the present invention is to provide a kit for identification comprising at least one composition selected from the group consisting of the test compositions.
이하 본 발명을 상세하게 설명한다.Hereinafter, the present invention will be described in detail.
본 발명자들은 다양한 동정방법들 중 비발효 그람 음성균만을 간편하게 동정할 수 있는 필수적인 방법들만을 선별하였으며, 각 동정결과의 정확성을 높이기 위하여 각각의 동정방법들에 대한 검사용 조성물들을 최적으로 제조하였다.The present inventors selected only essential methods that can easily identify only non-fermented Gram-negative bacteria among various identification methods, and optimally prepared the test compositions for each identification method in order to increase the accuracy of each identification result.
본 발명의 당 산화반응을 이용한 동정방법은 미생물의 특정 당에 대한 산화력을 구별하는 것으로, 글루코스, 락토스, 슈크로스, 만니톨, 말토스, 만노스, 람노스, 갈락토스, 프럭토스, 자일로스 및 아라비노스에 대한 산화여부를 확인하는 것이다. 산화반응이 발생하면 배지내 pH가 낮아지는데 이러한 현상을 pH 지시제의 색상 변화로 확인하는 것이다. 당 산화반응에 사용할 수 있는 pH 지시제 예로는 BTB(bromothymol blue sodium salt)가 있으며, BTB는 당 산화반응 발생시 노란색을 나타낸다.Identification method using the sugar oxidation reaction of the present invention is to distinguish the oxidizing power of a specific sugar of the microorganism, glucose, lactose, sucrose, mannitol, maltose, mannose, rhamnose, galactose, fructose, xylose and arabinose It is to check the oxidation of the. When oxidation occurs, the pH in the medium is lowered. This phenomenon is confirmed by the color change of the pH indicator. Examples of pH indicators that can be used for the sugar oxidation reaction is bromothymol blue sodium salt (BTB), and BTB is yellow when a sugar oxidation reaction occurs.
상기한 당 산화반응을 확인하기 위하여 당 이용성 검사용 조성물을 제조한다.In order to confirm the above-mentioned sugar oxidation reaction, a sugar usability test composition is prepared.
당 이용성 검사용 조성물은Sugar composition for usability testing
(a) NH4H2PO4, MgSO4·7H20, KCl, 효모추출물, 카사미노산, 폴리 펩톤, 소이펩톤, 트레이스 요소 원액, CaCl2, 비타민 원액, 제 2철 암모염 사이트레이트, BTB를 포함하는 산화반응배지; 및(a) NH 4 H 2 PO 4 , MgSO 4 · 7H 2 0, KCl, yeast extract, casamino acid, polypeptone, soypeptone, trace urea stock solution, CaCl 2 , vitamin stock solution, ferric ammonium citrate, BTB Oxidation reaction medium comprising; And
(b) 글루코스, 락토스, 슈크로스, 만니톨, 말토스, 만노스 람노스 갈락토스, 프럭토스, 자일로스 및 아라비노스로 이루어진 군으로부터 1종 이상 선택된 당을 포함하며, pH 7.0 내지 8.0을 갖는다. 가장 바람직한 pH는 7.6이다.(b) at least one sugar selected from the group consisting of glucose, lactose, sucrose, mannitol, maltose, mannose rhamnose galactose, fructose, xylose and arabinose and having a pH of 7.0 to 8.0. The most preferred pH is 7.6.
상기 트레이스 원액 배지는 소듐 몰립데이트(Na2MoO4·2H2O), 보릭산(H3BO3), 코발트 클로라이드(CoCl2·6H2O), 징크 설페이트(ZnSO4·7H2O), 망간 클로라이드(MnCl2·4H2O), 소듐 셀레나이트(Na2SeO3), 니켈 클로라이드(NiCl2) 및 제 2구리 클로라이드(CuCl2·2H2O)을 포함하고, 상기 비타민 원액은 비타민 B12, 바이오틴, 폴릭산, 리보플라빈, 니코틴산, 리포익산, ρ-아미노벤조익산, 티아민, 칼슘 DL-판토테네이트 및 피리독신을 포함한다.The trace stock solution medium is sodium molybdate (Na 2 MoO 4 · 2H 2 O), boric acid (H 3 BO 3 ), cobalt chloride (CoCl 2 · 6H 2 O), zinc sulfate (ZnSO 4 · 7H 2 O), Manganese chloride (MnCl 2 · 4H 2 O), sodium selenite (Na 2 SeO 3 ), nickel chloride (NiCl 2 ) and cupric chloride (CuCl 2 · 2H 2 O), wherein the vitamin stock solution is vitamin B12 , Biotin, folic acid, riboflavin, nicotinic acid, lipoic acid, p-aminobenzoic acid, thiamine, calcium DL-pantothenate and pyridoxine.
본 발명의 당 이용성 검사용 조성물은 더욱 바람직하게는The composition for testing sugar availability of the present invention more preferably
(a) 1 내지 0.01 중량%의 NH4H2PO4, 1 내지 0.0001 중량%의 MgSO4·7H20, 1 내지 0.001 중량%의 KCl, 1 내지 0.0001 중량%의 효모추출물, 1 내지 0.0001 중량%의 카사미노산, 1 내지 0.0001 중량%의 폴리 펩톤, 1 내지 0.0001 중량%의 소이펩톤,10 내지 0.1 중량%의 트레이스 요소 원액, 1 내지 0.00001 중량%의 CaCl2, 1 내지 0.01 중량%의 비타민 원액, 1 내지 0.0001 중량%의 제 2철 암모염 사이트레이트, 1 내지 0.0001 중량%의 BTB 및 90 내지 99.9999 중량%의 물을 포함하는 산화반응배지 90 내지 97 중량% 및(a) 1 to 0.01 wt% NH 4 H 2 PO 4 , 1 to 0.0001 wt% MgSO 4 · 7H 2 0, 1 to 0.001 wt% KCl, 1 to 0.0001 wt% yeast extract, 1 to 0.0001 wt% % Cassanoic acid, 1 to 0.0001 wt% poly peptone, 1 to 0.0001 wt% soypeptone, 10 to 0.1 wt% trace urea stock, 1 to 0.00001 wt% CaCl 2 , 1 to 0.01 wt% vitamin stock 90-97 wt% of an oxidation medium comprising 1-0.0001 wt% ferric ammonium citrate, 1-0.0001 wt% BTB and 90-99.9999 wt% water and
(b) 글루코스, 락토스, 슈크로스, 만니톨, 말토스, 만노스 람노스 갈락토스, 프럭토스, 자일로스 및 아라비노스로 이루어진 군으로부터 선택된 당 3 내지 10 중량%를 포함한다.(b) 3 to 10% by weight per sugar selected from the group consisting of glucose, lactose, sucrose, mannitol, maltose, mannose rhamnose galactose, fructose, xylose and arabinose.
또한 트레이스 요소 원액은 1 내지 0.001 중량%의 소듐 몰립데이트, 1 내지 0.001 중량%의 보릭산, 1 내지 0.001 중량%의 코발트 클로라이드, 1 내지 0.001 중량%의 징크 설페이트, 1 내지 0.0001 중량%의 망간 클로라이드, 1 내지 0.0001 중량%의 소듐 셀레나이트, 1 내지 0.0001 중량%의 니켈 클로라이드, 1 내지 0.0001 중량%의 제 2구리 클로라이드 및 92 내지 99.999 중량%의 증류수를 포함하는 것이 바람직하고,The trace urea stock solution also contains 1 to 0.001 wt% sodium molybdate, 1 to 0.001 wt% boric acid, 1 to 0.001 wt% cobalt chloride, 1 to 0.001 wt% zinc sulfate, 1 to 0.0001 wt% manganese chloride Preferably, 1 to 0.0001 wt% sodium selenite, 1 to 0.0001 wt% nickel chloride, 1 to 0.0001 wt% cupric chloride, and 92 to 99.999 wt% distilled water,
비타민 원액은 0.01 내지 0.000001 중량%의 비타민 B12, 0.1 내지 0.00001 중량%의 바이오틴, 0.1 내지 0.00001 중량%의 폴릭산, 0.1 내지 0.00001 중량%의 리보플라빈, 0.1 내지 0.00001 중량%의 니코틴산, 0.1 내지 0.00001 중량%의 리포익산, 0.1 내지 0.00001 중량%의 ρ-아미노벤조익산, 0.1 내지 0.00001 중량%의 티아민, 0.1 내지 0.00001 중량%의 칼슘 DL-판토테네이트, 1 내지 0.0001 중량%의 피리독신 및 98 내지 99.999 중량%의 증류수를 포함하는 것이 바람직하다.The vitamin stock solution is 0.01 to 0.000001 wt% vitamin B12, 0.1 to 0.00001 wt% biotin, 0.1 to 0.00001 wt% polyacid, 0.1 to 0.00001 wt% riboflavin, 0.1 to 0.00001 wt% nicotinic acid, 0.1 to 0.00001 wt% Lipoic acid, 0.1-0.00001% by weight of p-aminobenzoic acid, 0.1-0.00001% by weight of thiamin, 0.1-0.00001% by weight of calcium DL-pantothenate, 1-0.0001% by weight of pyridoxine and 98-99.999% by weight It is preferable to contain distilled water of.
본 발명의 당 이용성 검사용 조성물은 당 산화반응이 발생될 경우 조성물 색이 푸른빛에서 노란색으로 변하게 된다. 따라서 임의의 미생물 시료를 글루코스 이용성 검사용 조성물에 반응시켰을 때 조성물이 노란색으로 변하면 사용한 임의의미생물이 글루코스를 에너지원으로 사용하는 균임을 알 수 있게 된다.The sugar usability testing composition of the present invention changes the composition color from blue to yellow when a sugar oxidation reaction occurs. Therefore, when a microorganism sample reacts with the composition for testing glucose availability, the composition turns yellow, indicating that any microorganism used is a bacterium that uses glucose as an energy source.
또한 본 발명은 베타-갈락토시데이즈 활성을 이용한 동정방법 및 검사용 조성물을 제공한다. 동정방법은 베타-갈락토시데이즈를 발현하는 미생물을 선별하기 위한 방법으로, 베타-갈락토시데이즈에 의하여 분해된 화합물이 색을 나타내는 것을 이용하여 확인한다. 상기 화합물의 대표적인 예로는 ONPG(ο-nitrophenyl-β-D-galactopyranoside)가 있으며, ONPG는 베타-갈락토시데이즈에 의해 분해되어 노란색을 나타낸다.The present invention also provides an identification method and a test composition using beta-galactosidase activity. The identification method is a method for screening microorganisms expressing beta-galactosidase, and is identified by using a color of a compound decomposed by beta-galactosidase. A representative example of the compound is ONPG (ο-nitrophenyl-β-D-galactopyranoside), which ONPG is degraded by beta-galactosidase to give yellow color.
본 발명의 베타-갈락토시데이즈 활성 검사용 조성물은 박토 펩톤, Na2HPO4, ONPG 및 증류수를 포함한다. 베타-갈락토시데이즈 활성 검사용 조성물의 바람직한 함량은 (a) 0.1 내지 10 중량%의 박토 펩톤 및 90 내지 99 중량%의 증류수를 포함하는 펩톤 배지 및 (b) 0.001 내지 0.1 중량%의 Na2HPO4, 0.01 내지 1 중량%의 ONPG 및 99 내지 99.99 중량%의 증류수를 포함하는 ONPG 혼합액을 부피비 3:1로 포함하는 것이다.The beta-galactosidase activity test composition of the present invention includes bacto peptone, Na 2 HPO 4 , ONPG and distilled water. A preferred content of the composition for assaying beta-galactosidase activity is (a) a peptone medium comprising 0.1 to 10% by weight of bacto peptone and 90 to 99% by weight of distilled water and (b) 0.001 to 0.1% by weight of Na 2 HPO 4 , ONPG mixed solution containing 0.01 to 1% by weight of ONPG and 99 to 99.99% by weight of distilled water is to contain a volume ratio 3: 1.
본 발명의 베타-갈락토시데이즈 활성 검사용 조성물은 pH 7.0 내지 8.0으로 적정하여 사용할 수 있으며, 가장 바람직하게는 7.3이다.Beta-galactosidase activity test composition of the present invention can be used by titration to pH 7.0 to 8.0, most preferably 7.3.
또한 본 발명은 젤라티네이즈 활성을 이용한 동정방법 및 검사용 조성물을 제공한다. 상기 동정방법은 젤라티네이즈를 발현하는 미생물을 구별하는 것으로, 젤라틴이 분해되면 반응물내 pH가 증가되므로, 이를 pH 지시약으로 젤라티네이즈 반응유무를 확인할 수 있다. 바람직한 pH 지시약은 페놀레드이다. 페놀레드는 pH가 증가할 경우 분홍빛 붉은색을 띤다.The present invention also provides a method for identifying and testing using gelatinase activity. The identification method is to distinguish the microorganisms expressing gelatinase, and since the pH of the reactant is increased when the gelatin is decomposed, it can be confirmed whether or not the gelatinase reaction with the pH indicator. Preferred pH indicators are phenol reds. Phenolic red has a pinkish red color with increasing pH.
젤라티네이즈 활성 검사용 조성물은 0.0001 내지 0.1 중량%의 카시톤, 0.0001 내지 0.1 중량%의 효모 추출물, 0.01 내지 1 중량%의 (NH4)2HPO4, 0.001 내지 0.1 중량%의 KCl, 1 내지 20 중량%의 젤라틴, 0.0001 내지 0.1 중량%의 페놀 레드 및 80 내지 99.99 중량%의 증류수를 포함하며, 조성물의 pH는 6.0 내지 7.0이 바람직하다. 가장 바람직한 pH는 6.5이다.The composition for testing gelatinase activity is 0.0001 to 0.1% by weight of cacitone, 0.0001 to 0.1% by weight of yeast extract, 0.01 to 1% by weight of (NH 4 ) 2HPO 4 , 0.001 to 0.1% by weight of KCl, 1 to 20 Wt% gelatin, 0.0001-0.1 wt% phenol red and 80-99.99 wt% distilled water, with the pH of the composition being preferably 6.0-7.0. The most preferred pH is 6.5.
또한 본 발명은 에스쿨린 가수분해(Esc㎕in hydrolysis; ESC) 반응을 이용한 동정방법 및 검사용 조성물을 제공한다. 동정방법은 미생물의 에스쿨린 가수분해능을 확인하는 것으로, 에스쿨린이 분해되면 Fe3+이온과 결합하여 갈색을 나타내는 것을 확인하는 것이다.In another aspect, the present invention provides an identification method and a test composition using the Esculin hydrolysis (ESC) reaction. The identification method confirms the ability of the microorganism to decompose the esculin, and when decomposed the esculin is combined with Fe 3+ ions to confirm that it is brown.
본 발명의 에스쿨린 가수분해 반응 검사용 조성물은 0.01 내지 1 중량%의 박토 펩톤, 0.01 내지 1 중량%의 에스쿨린, 0.001 내지 0.1 중량%의 페릭사이트레이트 및 98 내지 99.99 중량%의 증류수를 포함한다.The esculin hydrolysis test composition of the present invention comprises 0.01 to 1% by weight of bacto peptone, 0.01 to 1% by weight of esculin, 0.001 to 0.1% by weight of ferric citrate and 98 to 99.99% by weight of distilled water. .
또한 본 발명은 유기산 알칼리화 반응을 이용한 동정방법 및 검사용 조성물을 제공한다. 상기 동정방법은 유기산을 탄소원으로 미생물이 이용할 경우 유기산의 알칼리화 반응으로 인하여 증가하는 pH를 검사하는 것이다. BTB를 pH 지시제로 사용할 경우 알칼리화 반응이 발생하면 푸른색으로 확인된다. 상기 유기산은 글루코네이트, 말레이트, 아디페이트 및 사이트레이트이다.The present invention also provides an identification method and a test composition using an organic acid alkalizing reaction. The identification method is to check the increasing pH due to the alkalizing reaction of the organic acid when the organic acid is used as a carbon source microorganisms. When BTB is used as a pH indicator, it will turn blue when an alkalization reaction occurs. The organic acid is gluconate, malate, adipate and citrate.
유기산 알칼리화 반응 검사용 조성물은 0.001 내지 0.1 중량%의 MgSO4·7H2O,0.01 내지 1 중량%의 NH4H2PO4, 0.01 내지 1 중량%의 K2HPO4, 0.01 내지 1 중량%의 NaCl, 0.0001 내지 0.1 중량%의 BTB, 0.01 내지 5 중량%의 유기산 및 92 내지 99.99 중량%의 증류수를 포함하며, pH는 5.5 내지 6.5가 바람직하다. 가장 바람직한 pH는 6.0이다. 상기 유기산은 글루코네이트, 말레이트, 아디페이트 및 사이트레이트로 이루어진 군으로부터 1종이상 선택된 것이 바람직하며, 4종의 유기산 각각의 검사용 조성물을 제조하여 사용하는 것이 좋다.The composition for testing the organic acid alkalizing reaction is 0.001 to 0.1% by weight of MgSO 4 .7H 2 O, 0.01 to 1% by weight of NH 4 H 2 PO 4 , 0.01 to 1% by weight of K 2 HPO 4 , 0.01 to 1% by weight NaCl, 0.0001 to 0.1 wt% BTB, 0.01 to 5 wt% organic acid and 92 to 99.99 wt% distilled water, with a pH of preferably 5.5 to 6.5. The most preferred pH is 6.0. The organic acid is preferably at least one selected from the group consisting of gluconate, maleate, adipate and citrate, and it is preferable to prepare and use a test composition for each of the four organic acids.
또한 본 발명은 유레아제 활성을 이용한 동정방법 및 검사용 조성물을 제공한다. 상기 동정방법은 유레아제에 의한 암모니아 생성을 확인하여 미생물의 유레아제 발현여부을 확인하는 것이다. 미생물이 유레아제를 발현하는 경우 유레아를 분해하여 암모니아를 생성하게 되고, 이때 pH가 증가한다. pH변화는 크레졸 레드를 이용하여 붉은색으로의 변화를 확인할 수 있다.The present invention also provides an identification method and a test composition using the urease activity. The identification method is to confirm whether the microorganism urease expression by confirming the production of ammonia by the urease. When microorganisms express urease, they break down urea to produce ammonia, at which time the pH increases. The pH change can be confirmed by using red cresol red.
유레아제 활성 검사용 조성물은 0.01 내지 1 중량%의 박토 펩톤, 0.01 내지 1 중량%의 덱스트로즈, 0.01 내지 1 중량%의 NaCl, 0.01 내지 1 중량%의 KH2PO4, 0.0001 내지 0.1 중량%의 크레졸 레드 염화염, 1 내지 20 중량%의 유레아 및 75 내지 99 중량%의 증류수를 포함하며, pH는 6.0 내지 7.5가 바람직하며, 가장 바람직하게는 pH 6.8이다.The urease activity assay composition comprises 0.01 to 1 wt% of bacto peptone, 0.01 to 1 wt% dextrose, 0.01 to 1 wt% NaCl, 0.01 to 1 wt% KH 2 PO 4 , 0.0001 to 0.1 wt% Cresol red chloride of 1 to 20% by weight of urea and 75 to 99% by weight of distilled water, the pH is preferably 6.0 to 7.5, most preferably pH 6.8.
또한 본 발명은 알기닌 디하이드롤레이즈 활성을 이용한 동정방법 및 검사용 조성물을 제공한다. 상기 동정방법은 아미노산의 아민으로의 변형을 확인함으로써 미생물의 알기닌 디하이드롤레이즈 발현여부를 검사하는 것이다. 미생물이 알기닌디하이드롤레이즈를 발현할 경우 아미노산을 아민으로 변형시키고, 이로 인하여 pH가 증가하게 된다. pH 변화는 크레졸 레드를 이용하여 붉은색으로의 변화를 확인할 수 있다.The present invention also provides an identification method and a test composition using the arginine dihydrolase activity. The identification method is to examine the expression of the microorganism arginine dehydrolase by confirming the transformation of amino acids into amines. When a microorganism expresses arginine dihydrolase, it converts amino acids into amines, thereby increasing the pH. The pH change can be confirmed by using red cresol red.
알기닌 디하이드롤레이즈 활성 검사용 조성물은 0.1 내지 10 중량%의 박토 펩톤, 0.01 내지 10 중량%의 효모 추출물, 0.01 내지 1 중량%의 덱스트로즈, 0.01 내지 1 중량%의 한천, 0.01 내지 10 중량%의 L-알기닌, 0.0001 내지 1 중량%의 크레졸 레드 염화물 및 74 내지 99.99 중량%의 증류수를 포함하며, pH는 6.0 내지 7.5가 바람직하다. 가장 바람직한 pH는 6.8이다.The composition for the test of arginine dehydrolase activity is 0.1 to 10% by weight of bacto peptone, 0.01 to 10% by weight of yeast extract, 0.01 to 1% by weight of dextrose, 0.01 to 1% by weight of agar, 0.01 to 10% by weight. L-arginine, 0.0001 to 1% by weight of cresol red chloride and 74 to 99.99% by weight of distilled water, with a pH of preferably 6.0 to 7.5. The most preferred pH is 6.8.
또한 본 발명은 하이드로겐 설페이트 생성반응을 이용한 동정방법 및 검사용 조성물을 제공한다. 이는 미생물의 S 이용성을 구별하는 방법으로, 미생물이 배지내 아미노산으로부터 S를 분리할 경우, S는 H와 결합하여 하이드로겐 설페이드(H2S)를 생성시키고, 검은색을 띄게 된다.In another aspect, the present invention provides an identification method and a test composition using a hydrogen sulfate generation reaction. This is a method of distinguishing S availability of microorganisms. When the microorganism separates S from amino acids in the medium, S binds to H to form hydrogen sulfate (H 2 S), and becomes black.
하이드로겐 설파이드 생성반응 검사용 조성물은 1 내지 10 중량%의 박토 펩톤, 0.001 내지 1 중량%의 패릭 암모늄 사이트레이트, 0.001 내지 1 중량%의 소듐 티오설페이트, 0.001 내지 1 중량%의 메티오닌, 0.001 내지 1 중량%의 시스테인, 0.01 내지 1 중량%의 NaCl 및 85 내지 99.9 중량%의 증류수를 포함하며, pH는 6.8 내지 7.8이 바람직하다. 가장 바람직한 pH는 7.3이다.The composition for testing the hydrogen sulfide production reaction is 1 to 10% by weight of bacto peptone, 0.001 to 1% by weight of paroxy ammonium citrate, 0.001 to 1% by weight of sodium thiosulfate, 0.001 to 1% by weight of methionine, 0.001 to 1 Wt% cysteine, 0.01 to 1 wt% NaCl and 85 to 99.9 wt% distilled water, with a pH of 6.8 to 7.8 being preferred. The most preferred pH is 7.3.
또한 본 발명은 발효반응을 이용한 동정방법 및 검사용 조성물을 제공한다. 이는 미생물의 발효성을 확인하는 것으로, 미생물이 발효군인 경우 글루코스를 발효시켜 pH를 감소시키고, 비발효군인 경우 발효가 이루어지지 않아 pH 변화가 발생되지 않는다. 따라서 pH 변화는 페놀 레드 등의 지시제를 이용하여 발효여부를 구별할 수 있다. 페놀 레드는 산성조건에서 노란색을 나타낸다.In another aspect, the present invention provides an identification method and a test composition using a fermentation reaction. This is to confirm the fermentation of microorganisms, when the microorganism is a fermentation group to reduce the pH by fermenting glucose, in the case of non-fermentation group does not occur pH change does not occur. Therefore, pH change can be distinguished by fermentation using an indicator such as phenol red. Phenolic red is yellow under acidic conditions.
발효 검사용 조성물은 0.1 내지 10 중량%의 폴리펩톤, 0.1 내지 10 중량%의 덱스트로즈, 0.01 내지 1 중량%의 K2HPO4, 0.001 내지 0.1 중량%의 페놀레드, 0.01 내지 1 중량%의 한천 및 78 내지 99.9 중량%의 증류수를 포함하며, pH는 6.5 내지 7.5가 바람직하고, 가장 바람직하게는 pH 6.9이다.The fermentation test composition comprises 0.1 to 10% by weight of polypeptone, 0.1 to 10% by weight of dextrose, 0.01 to 1% by weight of K 2 HPO 4 , 0.001 to 0.1% by weight of phenol red, 0.01 to 1% by weight of Agar and 78-99.9% by weight of distilled water, the pH of which is preferably 6.5-7.5, most preferably pH 6.9.
또한 본 발명은 질산 환원반응을 이용한 동정방법 및 검사용 조성물을 제공한다. 이는 미생물의 질산환원성을 구별하는 방법으로, 질산이 환원되어 아질산이 생성된다. 이때 알파-나프틸아민 및 설판일리산을 반응시켜 색변화로 질산환원반응 발생여부를 확인한다. 질산 환원반응이 발생하면 지시제로 인하여 어두운 보라색으로 나타내게 된다.The present invention also provides an identification method and a test composition using the nitric acid reduction reaction. This is a way to distinguish the nitric acid reduction of microorganisms, nitric acid is reduced to produce nitrous acid. At this time, the reaction of alpha-naphthylamine and sulfanyl acid is confirmed by the color change to generate a nitric acid reduction reaction. When the nitrate reduction reaction occurs, it becomes dark purple due to the indicator.
질산 환원반응 검사용 조성물은 0.1 내지 10 중량%의 질산, 0.01 내지 1 중량%의 KNO3및 89 내지 99 중량%의 증류수를 포함한다. 또한 pH 변화를 색으로 나타내는 지시제로 알파-나프틸아민 용액 및 설판일린산 용액을 포함한다. 상기 지시제는 미생물시료와 질산환원력 검사용 조성물을 반응시킨 후 첨가하는 것이다. 상기 알파-나프틸아민 용액은 5N 아세트산 100 ㎖당 0.1 내지 5 g의 알파-나프틸아민을 혼합하여 제조하며, 상기 설판일린산 용액은 5 N 아세트산 100 ㎖ 당 0.1 내지 5 g의 설판일린산을 혼합하여 제조한다.The nitric acid reduction test composition includes 0.1 to 10% by weight of nitric acid, 0.01 to 1% by weight of KNO 3 and 89 to 99% by weight of distilled water. Also included as color indicators of pH changes include alpha-naphthylamine solution and sulfanylinic acid solution. The indicator is added after reacting the microbial sample and the composition for the test for reducing nitrate. The alpha-naphthylamine solution is prepared by mixing 0.1 to 5 g of alpha-naphthylamine per 100 ml of 5N acetic acid, and the sulfanylic acid solution is used to prepare 0.1 to 5 g of sulfanylic acid per 100 ml of 5N acetic acid. Prepare by mixing.
또한 본 발명은 인돌 생성반응을 이용한 동정방법 및 검사용 조성물을 제공한다. 이는 미생물이 배지내의 트립토판을 분해하여 인돌을 생성하지는 여부를 확인하는 방법이다. 인돌이 생성되는 경우 붉은색을 띄게 되어 인돌 생성을 쉽게 판별할 수 있다.In another aspect, the present invention provides a method for identifying and testing using an indole production reaction. This is a way to determine whether microorganisms break down tryptophan in the medium to produce indole. When indole is produced, the color becomes red so that indole generation can be easily determined.
인돌 생성반응 검사용 조성물은 0.1 내지 20 중량%의 박토 트립판, 0.1 내지 10 중량%의 L-트립토판 및 70 내지 99 중량5의 증류수를 포함하며, pH는 7.0 내지 8.0이 바람직하다. 또한 지시제로 50 내지 200 ㎖의 이소아밀 알콜, 1 내지 20 g의 p-디메틸아미노벤즈알데하이드, 50 내지 200 ㎖의 HCl을 혼합하여 제조한 용액을 사용한다.The indole production test composition comprises 0.1 to 20% by weight of the bacto tryptophan, 0.1 to 10% by weight of L- tryptophan and 70 to 99% by weight of distilled water, the pH is preferably 7.0 to 8.0. In addition, a solution prepared by mixing 50 to 200 ml of isoamyl alcohol, 1 to 20 g of p-dimethylaminobenzaldehyde, and 50 to 200 ml of HCl is used as an indicator.
따라서, 상기에 언급한 동정 방법들 및 조성물들을 각각 사용하여 비발효 그람 음성균을 동정할 수 있다.Thus, each of the above-mentioned identification methods and compositions can be used to identify non-fermented Gram-negative bacteria.
또한 본 발명은 상기한 검사용 조성물들로 이루어진 군으로부터 1종 이상 선택된 조성물을 포함하는 비발효 그람 음성균 동정용 키트를 제공한다.In another aspect, the present invention provides a kit for identifying non-fermentative Gram-negative bacteria comprising at least one composition selected from the group consisting of the above test compositions.
바람직한 동정용 키트는 글루코스 검사용 조성물(GLU), 락토스 검사용 조성물(LAC), 슈크로스 검사용 조성물(SUC), 만니톨 검사용 조성물(MAN), 말토스 검사용 조성물(MAL), 만노스 검사용 조성물(MNN), 람노스 검사용 조성물(RHA), 갈락토스 검사용 조성물(GAL), 프럭토스 검사용 조성물(FRU), 자일로스 검사용 조성물(XYL), 아라비노스 검사용 조성물(ARN), 베타-갈락토시데이즈 검사용 조성물(ONPG), 젤라티네이즈 검사용 조성물(GEL), 에스쿨린 가수분해 검사용 조성물(ESC), 글루코네이트 알킬화 검사용 조성물(GCN), 아디페이트 알킬화 검사용 조성물(ADI), 말레이트 알킬화 검사용 조성물(MAA), 사이트레이트 알킬화 검사용 조성물(CIT), 유레아제 검사용 조성물(URE), 알기닌 디하이드롤레이즈 검사용 조성물(ADH), 하이드로겐 설파이드 검사용 조성물(H2S), 발효 검사용 조성물(F), 질산 환원 반응 검사용 조성물(NIT) 및 인돌 생성 검사용 조성물(IND)을 모두 포함하는 것이다.Preferred kits for identification include glucose test composition (GLU), lactose test composition (LAC), sucrose test composition (SUC), mannitol test composition (MAN), maltose test composition (MAL), mannose test Composition (MNN), rhamnose test composition (RHA), galactose test composition (GAL), fructose test composition (FRU), xylose test composition (XYL), arabinose test composition (ARN), beta -Galactosidase test composition (ONPG), gelatinase test composition (GEL), esculin hydrolysis test composition (ESC), gluconate alkylation test composition (GCN), adipate alkylation test composition ( ADI), malate alkylation test composition (MAA), citrate alkylation test composition (CIT), urease test composition (URE), arginine dihydrolase test composition (ADH), hydrogen sulfide test composition ( H 2 S), composition for fermentation testing (F) , Nitric acid reduction test composition (NIT) and indole production test composition (IND) are included.
동정용 키트의 제조방법은 상기에 언급한 조성물들을 여러개의 웰을 가지는 반응기에 각 웰 당 조성물을 넣어 제조하는 것으로, 더욱 바람직하게는 각 조성물을 웰상에서 건조시키는 것이다.The method of preparing the kit for identification is to prepare the above-mentioned compositions by putting the composition per well into a reactor having several wells, and more preferably to dry each composition on the wells.
동정용 키트의 사용방법은 먼저 동정하고자 하는 미생물을 평판배지에서 배양한 다음 단일 콜로니를 증류수에 탁도 2로 희석한 후 희석액을 검사용 조성물을 포함하는 반응기에 넣어 각 웰에 반응시킨다. 이후 유레아제 검사용 조성물(URE), 알기닌 디하이드롤레이즈 검사용 조성물(ADH), 하이드로겐 설파이드 검사용 조성물(H2S), 발효 검사용 조성물(F)이 있는 웰은 오일로 상층을 덮고, 반응기를 30 ℃배양기에서 24 내지 48시간 배양한 후 각 웰당 색변화를 판독하는 것이다.In the method of using the identification kit, the microorganisms to be identified are first cultured in a plate medium, and then a single colony is diluted in distilled water with turbidity 2, and the diluent is added to the reactor containing the test composition and reacted to each well. Then, the wells containing the urease test composition (URE), the arginine dihydrolase test composition (ADH), the hydrogen sulfide test composition (H 2 S), and the fermentation test composition (F) cover the upper layer with oil, The reactor is incubated in a 30 ° C. incubator for 24 to 48 hours and then the color change per well is read.
본 발명의 동정용 키트의 조성물, 반응, 반응 결과를 하기 표 1에 간략하게 나타내었다.The composition, reaction, and reaction results of the kit for identification of the present invention are briefly shown in Table 1 below.
상기 표 1의 색을 통하여 검사용 조성물의 반응여부를 확인한 다음 그 결과를 미생물 동정용 프로그램에 입력하여 균명을 판독한다. 미생물 동정용 프로그램은 각 미생물별 본 발명의 검사용 조성물의 반응성이 입력되어 있는 데이터를 가지고 있어, 반응여부만을 입력하면 바로 미생물명을 판단해준다. 또한 미생물 동정용 프로그램은 각 미생물별로 특징적인 생화학적인 특성에 따라 검사용 조성물의반응성을 점수로 산정해주어 각 점수의 합계로 쉽게 미생물명을 판단해준다. 이러한 방법은 통상적인 동정용 프로그램에서 사용되는 방법이다.After confirming the reaction of the test composition through the color of Table 1, the result is input to the microorganism identification program to read the name of the strain. The microorganism identification program has data in which the reactivity of the test composition of the present invention for each microorganism is input, and if only the reaction is input, the microorganism name is immediately determined. In addition, the microorganism identification program calculates the reactivity of the test composition as a score according to the characteristic biochemical characteristics of each microorganism, thereby easily determining the name of the microorganism by the sum of each score. This is the method used in conventional identification programs.
일예로, 본 발명의 동정키트에 대한 미생물별 반응성을 미생물 동정용 프로그램에서 산정하는 수치로 하기 표 2에 나타내었다.As an example, the microorganism-specific reactivity for the identification kit of the present invention is shown in Table 2 below as a value for calculating the microorganism identification program.
본 발명의 비발효 그람 음성균 동정용 조성물 및 키트로 동정가능한 균주로는 비장내세균으로서, 대표적으로는 아크로모박터 자일로속시단스 ssp 자일로속시단스(Achromobacter(Alcaligenes)xylosoxidanssspxylosoxidans), 액시네토박터 바우마니(Acinetobacter baumannii), 액시네토박터 해몰리티커스(Acinetobacter haemolyticus), 액시네토박터 루피(Acinetobacter lwoffii), 알칼리게네스 속 균수(Alcaligenes sp, Alcaligenes faecalis), 보르데텔라 브론키십티카(Bordetella bronchiseptica), 브란하멜라 카타르할리스(Branhamella catarrhalis), 부르크홀데리아 세파시아(Burkholderia cepacia), 크리세오박테리움 인돌로게네스(Chryseobacterium indologenes), 크리세오박테리움 멘인고셉티컴(Chryseobaterium meningosepticum), 크리세오모나스 루테올라(Chryseomonas luteola), 플라비모나스 오리지하비탄스(Flavimonas oryzihabitans), 모라셀라 라쿠나타(Moraxella lacunata), 올리겔라 우레올리티카(Oligella ureolytica), 올리겔라 우레트라리스(Oligella urethralis), 슈도모나스 에어루지노사(Pseudomonas aeruginosa), 슈도모나스 플루오레센스(Pseudomonas fluorescens), 슈도모나스 푸티다(Pseudomonas putida), 슈도모나스 스튜체리(Pseudomonas stutzeri), 세와넬라 푸트레팩시엔스(Shewanella putrefaciens), 스핑고박테리움 멀티보럼(Sphingobacterium m㎕tivorum), 스핑고모나스 파우시모빌리스(Sphingomonas paucimobilis), 스테노트로포모나스 말토필리아(Stenotrophomonas maltophilia) 및 위크셀라 비로사(Weeksella virosa) 등이 있다.Strains that can be identified by the non-fermentative Gram-negative bacteria identification composition and kit of the present invention are spleen bacteria, typically Achromobacter ( Alcaligenes ) xylosoxidans ssp xylosoxidans , Acinetobacter baumannii , Acinetobacter haemolyticus , Acinetobacter lwoffii , Alcaligenes sp, Alcaligenes faecalis , Bordetella Bordetella bronchiseptica , Branhamella catarrhalis , Burkholderia cepacia , Chryseobacterium indologenes , Chryseobacterium mendogoceticum Chryseobaterium meningosepticum ), Chryseomonas luteola , Flavimonas oryzihabit ans ), Moraxella lacunata , Oligella ureolytica , Oligella urethralis , Pseudomonas aeruginosa , Pseudomonas aureuginosa , Pseudomonas fluorescens Pseudomonas putida , Pseudomonas stutzeri , Shewanella putrefaciens , Sphingobacterium mμtivorum , Sphingomonas passimobilis ( Sphingomonas paucimobilis ), Stenotrophomonas maltophilia and Weeksella virosa .
본 발명의 비발효 그람 음성균을 동정하는 방법은 기존에 알려진 여러 가지 동정방법을 여러 회 실시하지 않고, 하나의 플레이트상에서 한번에 검사하므로써 쉽고 간단하게 균주를 동정할 수 있으며, 환자의 질병원인 또는 질병을 신속히 판단하여야 하는 병원에서 동정키트로 사용할 수 있다.The method for identifying the non-fermented Gram-negative bacteria of the present invention can be easily and simply identified by testing on one plate at a time without performing various known identification methods several times. It can be used as an identification kit in hospitals that need to be judged quickly.
이하 실시예를 들어 본 발명을 더욱 자세히 설명한다. 하기 실시예는 본 발명을 예시하기 위한 것일 뿐 본 발명의 보호범위가 하기 실시예에 한정되는 것은 아니다.The present invention will be described in more detail with reference to the following Examples. The following examples are only for illustrating the present invention, but the protection scope of the present invention is not limited to the following examples.
실시예 1: 미생물의 당 이용성 검사용 조성물 제조Example 1 Preparation of Composition for Testing Sugar Availability of Microorganisms
미생물이 에너지원으로 사용하는 당이 다르므로, 이를 확인할 수 있는 조성물을 제조하였다. 글루코스, 락토스, 슈크로스, 만니톨, 말토스, 만노스, 람노스, 갈락토스, 프럭토스, 자일로스 및 아라비노스 각각에 대한 이용성을 확인할 수 있는 조성물을 제조하였으며, 미생물을 상기 조성물에 반응시켜 조성물의 색 변화로 반응성을 확인할 수 있도록 고안하였다.Since microorganisms use different sugars as energy sources, a composition capable of confirming this was prepared. A composition was prepared in which the availability of glucose, lactose, sucrose, mannitol, maltose, mannose, rhamnose, galactose, fructose, xylose and arabinose was confirmed, and the microorganisms were reacted with the composition to color the composition. It is designed to confirm the reactivity with the change.
미생물이 특정 당을 에너지원으로 이용하는 경우, 조성물내의 당을 산화시켜 노란색을 나타내고, 이용하지 않을 경우 푸른색을 나타낸다.When the microorganism uses a specific sugar as an energy source, the sugar in the composition is oxidized to yellow, and when not used, it is blue.
1-1. 트레이스 요소 원액제조1-1. Trace Element Stock Production
소듐 몰립데이트(Na2MoO4·2H2O, 덕산) 0.09 g, 보릭산(H3BO3, 덕산) 0.03g, 코발트 클로라이드(CoCl2·6H2O, 덕산) 0.02 g, 징크 설페이트(ZnSO4·7H2O, 덕산) 0.01 g, 0.3 g/㎖망간 클로라이드(MnCl2·4H2O, 덕산) 0.001 ㎖, 0.3 g/㎖ 소듐 셀레나이트(Na2SeO3, 덕산) 0.001 ㎖, 0.2 g/㎖ 니켈 클로라이드(NiCl2·6H2O) 0.001 ㎖, 0.1 g/㎖ 제 2구리 클로라이드(CuCl2·2H2O, 덕산) 0.001 ㎖ 및 증류수를 혼합하여 총 100 ㎖의 트레이스 요소 원액을 제조하였고, 이를 냉장보관하였다.0.09 g of sodium molybdate (Na 2 MoO 4 · 2H 2 O, Duksan), 0.03 g of boric acid (H 3 BO 3 , Duksan), 0.02 g of cobalt chloride (CoCl 2 · 6H 2 O, Duksan), zinc sulfate (ZnSO 4 · 7H 2 O, Duksan) 0.01 g, 0.3 g / ㎖ manganese chloride (MnCl 2 · 4H 2 O, Duksan) 0.001 ㎖, 0.3 g / ㎖ sodium selenite (Na 2 SeO 3, Duksan) 0.001 ㎖, 0.2 g A total of 100 ml of trace urea stock solution was prepared by mixing 0.001 ml / ml nickel chloride (NiCl 2 · 6H 2 O), 0.001 ml of 0.1 g / ml cupric chloride (CuCl 2 · 2H 2 O, Deoksan) and distilled water. It was refrigerated.
1-2. 비타민 원액제조1-2. Vitamin Stock Production
비타민 B12 0.0001 g, 바이오틴(sigma Cat No. B-4501) 0.002 g, 폴릭산(sigma Cat No. F-7876) 0.002 g, 리보플라빈(sigma Cat No. R-4500) 0.005 g, 니코틴산(sigma Cat No. N-33761) 0.005 g, 리포익산(sigma Cat No. T-5625) 0.005 g, ρ-아미노벤조익산(sigma Cat No. A-9878) 0.005 g, 티아민(sigma Cat No. T-4625) 0.005 g, 칼슘 DL-판토테네이트(sigma Cat No. P-2250) 0.005 g 및 피리독신(sigma Cat No. P-9755) 0.01 g을 3차 증류수에 혼합하여 총 1000 ㎖의 비타민 원액을 준비하였다. 비타민 원액은 호일로 빛 접촉을 피한 상태로 냉장보관하였다.0.0001 g of vitamin B12, 0.002 g of biotin (sigma Cat No. B-4501), 0.002 g of polylic acid (sigma Cat No. F-7876), 0.005 g of riboflavin (sigma Cat No. R-4500), nicotinic acid (sigma Cat No N-33761) 0.005 g, lipoic acid (sigma Cat No. T-5625) 0.005 g, ρ-aminobenzoic acid (sigma Cat No. A-9878) 0.005 g, thiamine (sigma Cat No. T-4625) 0.005 g, calcium DL-pantothenate (sigma Cat No. P-2250) and 0.01 g pyridoxine (sigma Cat No. P-9755) were mixed in tertiary distilled water to prepare a total 1000 ml of vitamin stock solution. The vitamin stock solution was refrigerated while avoiding light contact with foil.
1-3. 산화반응 배지 제조1-3. Oxidation Media Preparation
NH4H2PO4(monobasic, 덕산) 0.3 g,MgSO4·7H20(showa) 0.06 g, KCl(덕산) 0.16 g, 효모추출물(difco Cat No.212750) 0.033g, 카사미노산(difco Cat No.223050) 0.033 g, 폴리 펩톤(hispan Cat No.1610.01) 0.066g, 소이펩톤(difco Cat No.211677) 0.033 g 및 트레이스 요소 원액 3 ㎖ 및 3차 증류수를 혼합하여 100 ㎖을 제조한 다음 끓인 후 상온에서 냉각시켰다. 이후 0.0005 g/㎖의 CaCl2(덕산) 0.6 ㎖을 첨가한 다음 pH 7.6으로 조절하였고, 용액이 뿌옇게 흐려지면 끓인다.여기에 비타민 원액 0.3 ㎖, 제 2철 암모염 사이트레이트(0.05 g/㎖, sigma F-5879) 0.6 ㎖ 및 BTB(0.001 g/㎖ 20% 에탄올, showa 0221-5130) 16 ㎖을 혼합한 다음 다시 pH를 7.6으로 조절하였다.NH 4 H 2 PO 4 (monobasic, Deoksan) 0.3 g, MgSO 4 · 7H 2 0 (showa) 0.06 g, KCl (Deoksan) 0.16 g, yeast extract (difco Cat No.212750) 0.033 g, casamino acid (difco Cat No.223050) 0.033 g, polypeptone (hispan Cat No. 1610.01) 0.066 g, soy peptone (difco Cat No. 211677), 0.033 g of trace urea stock solution and 3 ml of tertiary distilled water were mixed to prepare 100 ml and then boiled. After cooling at room temperature. Thereafter, 0.6 ml of 0.0005 g / ml CaCl 2 (Duksan) was added, and then adjusted to pH 7.6, and when the solution became cloudy, it boiled. Here, 0.3 ml of vitamin stock solution and ferric ammonium citrate (0.05 g / ml, 0.6 ml of sigma F-5879) and 16 ml of BTB (0.001 g / ml 20% ethanol, showa 0221-5130) were mixed, and then the pH was adjusted to 7.6 again.
1-4. 미생물의 당 이용성 검사용 조성물 제조1-4. Preparation of composition for testing sugar availability of microorganisms
글루코스(Cat No. 215530, difco), 락토스(Cat No. 215620, difco), 슈크로즈(Cat No. S7903, sigma), 만니톨(Cat No. 0170-17-5, difco), 말토스(Cat No. M-5884, sigma), 만노스(Cat No. M-8296, sigma), 람노스(Cat No. R-3875, sigma), 갈락토스(Cat No. G-6404, sigma), 프럭토스(Cat No. F-0127, sigma), 자일로스(Cat No. X-1500, sigma), 아라비노스(Cat No. A-3256, sigma) 각각 6 g을 산화반응배지 100 ㎖에 첨가한 다음 잘 혼합하고 pH를 7.6으로 조절하였다. 이후 0.2 um의 여과지로 여과한 다음 냉암소에 보관하였다.Glucose (Cat No. 215530, difco), Lactose (Cat No. 215620, difco), Sucrose (Cat No. S7903, sigma), Mannitol (Cat No. 0170-17-5, difco), Maltose (Cat No M-5884, sigma, Mannose (Cat No. M-8296, sigma), Rhamnose (Cat No. R-3875, sigma), Galactose (Cat No. G-6404, sigma), Fructose (Cat No. 6 g each of F-0127, sigma), xylose (Cat No. X-1500, sigma) and arabinose (Cat No. A-3256, sigma) were added to 100 ml of oxidation medium, mixed well and pH Was adjusted to 7.6. After filtration with 0.2 um filter paper and stored in a cool dark place.
1-5. 미생물의 당 이용성 검사용 조성물의 정확성 검증1-5. Accuracy verification of microbial sugar availability test compositions
상기 1-4에서 제조한 조성물을 이용하여 ATCC로부터 분양받은 표준 미생물의 당 이용성을 검증하여 정확성을 확인하였다.The accuracy of the standard microorganisms received from the ATCC using the composition prepared in 1-4 was verified by verifying the accuracy.
상기 1-4의 당 이용성 검사용 조성물을 웰 플레이트에 50 ㎕로 각각 넣고 25 ℃ 건조기에서 건조시켰다.50 μl of the sugar-availability test composition of 1-4 was put in a well plate and dried in a 25 ° C. dryer.
미생물을 평판배지에서 배양한 다음 단일 콜로니를 취하여 탁도 2로 증류수에 희석한 희석액을 제조하였다.The microorganisms were cultured in a plate medium and then a single colony was taken to prepare a dilution diluted in distilled water with turbidity 2.
당 이용성 검사용 조성물이 있는 각 웰에 희석액을 넣고 30 ℃에서 24시간 배양하였다. 배양후 각 웰의 배지 색상변화를 체크하여 노란색을 띄면 +(당을 이용함)으로 푸른색을 띄면 -(당을 이용못함)로 체크하여 하기 표 3에 나타내었다.Diluted solution was added to each well containing the composition for testing sugar availability and incubated at 30 ° C. for 24 hours. After incubation, the color of each well was checked by changing the color of yellow (+) and blue (-using sugar).
표 3에서 확인된 결과는 표준미생물의 당 이용성과 동일한 결과로 나타났다.The results confirmed in Table 3 were the same as the sugar availability of the standard microorganisms.
1-6. 당 이용성 검사용 조성물의 pH 변화에 따른 동정결과1-6. Identification Results According to pH Change of Sugar Solubility Testing Composition
1-4의 방법으로 당 이용성 검사용 조성물을 제조한 수 pH 6.7로 적정하였다. 이후 20균주에 대하여 반응성을 실험하였다(표 4).It was titrated to the water pH 6.7 which prepared the sugar availability test composition by the method of 1-4. Then, the reactivity was tested for 20 strains (Table 4).
표 4에서 표준결과는 각 균주의 생화학적 특성 분석으로 공지된 결과이고, 실험결과는 pH 6.7의 조성물로 실시한 결과이다. 당 이용성 검사용 조성물은 pH 6.7에서는 정확한 반응결과를 확인할 수 없었고, pH 7.6이 최적이었다.In Table 4, the standard result is a result known from the biochemical characterization of each strain, and the experimental result is a result of the composition of pH 6.7. The sugar availability test composition was unable to confirm the exact result at pH 6.7, and pH 7.6 was optimal.
실시예 2: 베타-갈락토시데이즈 활성 검사용 조성물 제조Example 2: Preparation of a composition for beta-galactosidase activity test
미생물의 베타-갈락토시데이즈 활성을 확인하기 위한 조성물로, 미생물이 베타-갈락토시데이즈를 발현하는 경우 ONPG를 분해하여 노란색을 나타내고, 베타-갈락토시데이즈를 발현하지 않는 경우 ONPG를 분해하지 않아 색변화를 나타내지 않는 조성물을 제조하였다.A composition for confirming the beta-galactosidase activity of a microorganism, wherein the microorganism decomposes ONPG when it expresses beta-galactosidase, and yellow when it does not express beta-galactosidase. To prepare a composition exhibiting no color change.
2-1. 1 % 펩톤 배지2-1. 1% peptone medium
박토 펩톤(difco 211677) 0.9 g을 3차 증류수에 혼합하여 100 ㎖을 제조하고가열한 다음 상온에서 냉각시켰다. 이후 펩톤 배지는 pH 7.3으로 조절한 다음 121 ℃에서 15분간 멸균하였다.0.9 g of bacto peptone (difco 211677) was mixed with tertiary distilled water to prepare 100 ml, heated and cooled at room temperature. The peptone medium was then adjusted to pH 7.3 and sterilized at 121 ° C. for 15 minutes.
2-2. ONPG 용액2-2. ONPG Solution
Na2HPO4(showa) 0.042 g을 3차 증류수에 용해시켜 100 ㎖의 혼합액을 제조한 다음 pH 7.3으로 조절한 다음 냉각시켰다. 이후 냉암소에서 ONPG(sigma N-1127) 0.18 g을 혼합액에 첨가하여 ONPG 용액을 제조하였고 냉동보관하였다.0.042 g of Na 2 HPO 4 (showa) was dissolved in tertiary distilled water to prepare a 100 ml mixture, which was then adjusted to pH 7.3 and cooled. Then, ONPG solution was prepared by adding 0.18 g of ONPG (sigma N-1127) to the mixed solution in a cold dark place and storing it in a frozen state.
2-3. 베타-갈락토시데이즈 활성 검사용 조성물2-3. Beta-galactosidase activity test composition
상기에서 준비한 1% 펩톤 배지 및 ONPG 용액을 3:1 부피비로 혼합한 다음 0.2 um 필터로 여과한 다음 냉암소에서 보관하였다.The 1% peptone medium and ONPG solution prepared above were mixed in a 3: 1 volume ratio, filtered through a 0.2 um filter, and then stored in a cool dark place.
2-4. 베타-갈락토시데이즈 활성 검사용 조성물의 정확성 검증2-4. Accuracy Verification of Compositions for Testing Beta-galactosidase Activity
상기 실시예 1-5와 동일한 방법으로 실험하였고, 그 결과는 하기 표 5에 나타내었다.The experiment was carried out in the same manner as in Example 1-5, and the results are shown in Table 5 below.
상기 실험결과, 각 표준미생물은 베타-갈락토시데이즈의 발현유무와 동일하게 반응성을 나타내었다.As a result of the experiment, each standard microorganism showed the same reactivity with the expression of beta-galactosidase.
실시예 3: 젤라티네이즈 활성 검사용 조성물Example 3: Composition for Gelatinase Activity Test
미생물의 젤라틴 용해여부를 확인하기 위한 조성물을 제조하였다. 미생물이 젤라틴을 용해하는 경우 젤라틴이 포함된 조성물의 pH가 증가하여 조성물내 지시제의 색이 분홍빛 붉은색을 나타낸다. 미생물이 젤라틴을 용해시키지 못할 경우 젤라티네이즈 활성 검사용 조성물은 노란색을 나타낸다.A composition was prepared to confirm whether the microorganism dissolved gelatin. When the microorganism dissolves the gelatin, the pH of the composition containing the gelatin increases, so that the color of the indicator in the composition becomes pink red. If the microorganism is unable to dissolve gelatin, the composition for testing gelatinase activity is yellow.
3-1. 조성물 제조3-1. Composition preparation
카시톤(difco 0259-17) 0.033 g, 효모 추출물(difco 212750) 0.033 g, (NH4)2HPO4(덕산) 0.4 g, KCl(덕산) 0.08 g, 젤라틴(difco 0143-17) 8 g, 0.045 g/㎖의 페놀 레드(sigma P-4758) 400 ㎕을 3차 증류수에 혼합하여 GEL 검사용 조성물 100 ㎖을 제조하였고 가열후 상온에서 냉각한 다음 pH6.5로 조절하고 멸균하여 실온보관하였다.0.033 g of citaton (difco 0259-17), 0.033 g of yeast extract (difco 212750), 0.4 g of (NH4) 2HPO4 (Duksan), 0.08 g of KCl (Duksan), 8 g of gelatin (difco 0143-17), 0.045 g / 100 μl of a phenol red (sigma P-4758) was mixed with distilled water in tertiary distilled water to prepare 100 mL of the GEL test composition. After heating, the mixture was cooled to room temperature, adjusted to pH 6.5, sterilized, and stored at room temperature.
3-2. 조성물의 정확성 검증3-2. Validation of the composition's accuracy
상기 실시예 1-5와 동일한 방법으로 실험하였고, 그 결과는 하기 표 6에 나타내었다.The experiment was carried out in the same manner as in Example 1-5, and the results are shown in Table 6 below.
상기 실험결과, 각 표준미생물은 젤라틴 용해여부와 동일하게 젤라티네이즈 활성 검사용 조성물에 대하여 반응성을 나타내었다.As a result of the experiment, each standard microorganism showed reactivity with the composition for testing gelatinase activity in the same manner as gelatin dissolution.
실시예 4: 에스쿨린 가수분해 반응 검사용 조성물 제조Example 4: Preparation of the composition for the test of esculin hydrolysis reaction
미생물의 에스쿨린 가수분해 반응을 측정하기 위한 조성물을 제조하였다. 미생물이 조성물내의 에스쿨린을 분해하면 조성물내 Fe3+이온과 결합하여 갈색을 나타낸다. 분해하지 못할 경우 무색을 나타낸다.A composition for measuring the esculin hydrolysis of microorganisms was prepared. When microorganisms break down esculin in the composition, they bind with Fe 3+ ions in the composition, resulting in brown color. Colorless if not decomposed.
4-1. 에스쿨린 가수분해 반응 검사용 조성물의 제조4-1. Preparation of the composition for the test of esculin hydrolysis reaction
박토 펩톤(difco 211677) 0.5 g, 에스쿨린(sigma E-8250) 0.4 g, 페릭사이트레이트(sigma F-6129) 0.05 g을 3차 증류수에 혼합하여 ESC 검사용 조성물 100 ㎖을 제조하였고 가열후 상온에서 냉각한 다음 멸균하여 냉장보관하였다.0.5 g of bactopeptone (difco 211677), 0.4 g of esculin (sigma E-8250) and 0.05 g of ferric citrate (sigma F-6129) were mixed in distilled water to prepare 100 ml of the ESC test composition. Cooled at and then sterilized and refrigerated.
4-2. 에스쿨린 가수분해 반응 검사용 조성물의 정확성 검증4-2. Accuracy Verification of Compositions for the Test of Esculin Hydrolysis
상기 실시예 1-5와 동일한 방법으로 실험하였고, 그 결과는 하기 표 7에 나타내었다.The experiment was carried out in the same manner as in Example 1-5, and the results are shown in Table 7 below.
표 7에서 나타난 결과는 표준미생물의 에스쿨린 분해여부와 동일하였다.The results shown in Table 7 were the same as whether the standard microorganisms were degraded esculin.
실시예 5: 유기산 알칼리화 반응 검사용 조성물Example 5 Composition for Examining Organic Acid Alkalization Reaction
미생물이 대사과정 중 각 유기산을 탄소원(carbon source)으로 사용하는 지 여부를 측정하기 위한 조성물을 제조하였다.A composition for measuring whether the microorganism uses each organic acid as a carbon source during metabolism was prepared.
미생물이 유기산을 탄소원으로 사용할 경우 조성물은 알킬화되어 조성물의 색이 푸른색으로 변화되며, 이용하지 못할 경우 색 변화없이 노란색을 나타낸다.When a microorganism uses an organic acid as a carbon source, the composition is alkylated to change the color of the composition to blue, and when not available, yellow without color change.
5-1. 글루코네이트 검사용 조성물 제조5-1. Preparation of gluconate test composition
MgSO4·7H2O(shinyo) 0.02 g, NH4H2PO4(monobasic, shinyo) 0.1 g, K2HPO40.1 g, NaCl 0.5 g 및 BTB(BromThymol Blue sodium salt, sigma B-8630) 0.024 g을 증류수에 총 100 ㎖로 혼합하여 가열한 다음 냉각시킨 후 pH를 6.0으로 조절하였다. 이후 글루코네이트(d-Gluconic acid(potassium salt), sigma G-4500) 0.6 g을 혼합하여 다시 pH를 6.0으로 조절한 다음 멸균 후 암냉소에서 보관하였다.0.02 g MgSO 4 7H 2 O (shinyo), 0.1 g NH 4 H 2 PO 4 (monobasic, shinyo), 0.1 g K 2 HPO 4 , 0.5 g NaCl and BTB (BromThymol Blue sodium salt, sigma B-8630) 0.024 g was mixed with distilled water to a total of 100 ml, heated and cooled to adjust the pH to 6.0. Thereafter, 0.6 g of gluconate ( d -Gluconic acid (potassium salt), sigma G-4500) was mixed, and the pH was adjusted to 6.0 again, and then stored in a dark cool place after sterilization.
5-2. 말레이트 검사용 조성물 제조5-2. Preparation of maleate test composition
MgSO4·7H2O(shinyo) 0.02 g, NH4H2PO4(monobasic, shinyo) 0.1 g, K2HPO40.1 g, NaCl 0.5 g 및 BTB(BromThymol Blue sodium salt, sigma B-8630) 0.024 g을 증류수에 총 100 ㎖로 혼합하여 가열한 다음 냉각시킨 후 pH를 6.0으로 조절하였다. 이후 말레이트(DL-Malic acid(disodium salt), sigma M-6773) 1.2 g을 혼합하여 다시 pH를 6.0으로 조절한 다음 멸균 후 암냉소에서 보관하였다.0.02 g MgSO 4 7H 2 O (shinyo), 0.1 g NH 4 H 2 PO 4 (monobasic, shinyo), 0.1 g K 2 HPO 4 , 0.5 g NaCl and BTB (BromThymol Blue sodium salt, sigma B-8630) 0.024 g was mixed with distilled water to a total of 100 ml, heated and cooled to adjust the pH to 6.0. Thereafter, 1.2 g of malate ( DL -Malic acid (disodium salt), sigma M-6773) was mixed to adjust the pH to 6.0 again, and then stored in a dark cool place after sterilization.
5-3. 아디페이트 검사용 조성물 제조5-3. Preparation of adipate test composition
MgSO4·7H2O(shinyo) 0.02 g, NH4H2PO4(monobasic, shinyo) 0.1 g, K2HPO40.1 g, NaCl 0.5 g 및 BTB(BromThymol Blue sodium salt, sigma B-8630) 0.024 g을 증류수에 총 100 ㎖로 혼합하여 가열한 다음 냉각시킨 후 pH를 6.0으로 조절하였다. 이후 아디페이트(Adipic acid, sigma A-5252) 0.6 g을 혼합하여 다시 pH를 6.0으로 조절한 다음 멸균 후 암냉소에서 보관하였다.0.02 g MgSO 4 7H 2 O (shinyo), 0.1 g NH 4 H 2 PO 4 (monobasic, shinyo), 0.1 g K 2 HPO 4 , 0.5 g NaCl and BTB (BromThymol Blue sodium salt, sigma B-8630) 0.024 g was mixed with distilled water to a total of 100 ml, heated and cooled to adjust the pH to 6.0. Thereafter, 0.6 g of adipate (Adipic acid, sigma A-5252) was mixed and adjusted to pH 6.0 again, and then stored in a dark cool after sterilization.
5-4. 사이트레이트 검사용 조성물 제조5-4. Preparation of citrate test composition
MgSO4·7H2O(shinyo) 0.02 g, NH4H2PO4(monobasic, shinyo) 0.1 g, K2HPO40.1 g, NaCl 0.5 g 및 BTB(BromThymol Blue sodium salt, sigma B-8630) 0.024 g을 증류수에 총 100 ㎖로 혼합하여 가열한 다음 냉각시킨 후 pH를 6.0으로 조절하였다. 이후 사이트레이트(Sodium citrate, sigma S-4641) 0.6 g을 혼합하여 다시 pH를 6.0으로 조절한 다음 멸균 후 암냉소에서 보관하였다.0.02 g MgSO 4 7H 2 O (shinyo), 0.1 g NH 4 H 2 PO 4 (monobasic, shinyo), 0.1 g K 2 HPO 4 , 0.5 g NaCl and BTB (BromThymol Blue sodium salt, sigma B-8630) 0.024 g was mixed with distilled water to a total of 100 ml, heated and cooled to adjust the pH to 6.0. Since the citrate (Sodium citrate, sigma S-4641) 0.6 g was mixed again to adjust the pH to 6.0, and then sterilized and stored in a dark cool.
5-5. 유기산 알칼리화 반응 검사용 조성물의 정확성 검증5-5. Accuracy Verification of Composition for Testing Organic Acid Alkali Reaction
상기 실시예 1-5와 동일한 방법으로 실험하였고, 그 결과는 하기 표 8에 나타내었다.The experiment was carried out in the same manner as in Example 1-5, and the results are shown in Table 8 below.
본 발명의 유기산 알칼리화 반응 검사용 조성물로 표준 미생물 반응성을 검사한 결과 각 표준 미생물의 유기산 이용성과 동일한 반응성을 나타내었다.As a result of testing the standard microorganism reactivity with the organic acid alkalizing reaction test composition of the present invention, it showed the same reactivity as the organic acid availability of each standard microorganism.
실시예 6: 유레아제 활성 검사용 조성물Example 6: Composition for Testing Urease Activity
미생물이 유레아로부터 암모니아를 생성할 수 있는 유레아제를 함유하는지 여부를 측정하기 위한 조성물을 제조하였다.A composition was prepared to determine whether the microorganism contains a urease capable of producing ammonia from urea.
유레아제 활성 검사용 조성물은 유레아제가 존재하는 조건에서는 유레아를 분해하여 암모니아를 생성시키고, 이로 인하여 조성물의 pH가 올라가 조성물은 붉은색을 띄게 된다. 반응이 없을 경우 조성물은 색 변화없이 노란색을 띈다.The composition for the urease activity test produces ammonia by decomposing urea in the presence of urease, thereby increasing the pH of the composition and making the composition red. In the absence of reaction, the composition turned yellow without color change.
6-1. 유레아제 활성 검사용 조성물 제조6-1. Preparation of urease activity test composition
박토 펩톤(difco 211677) 0.1 g, 덱스트로스(difco 215530) 0.1 g, NaCl 0.5 g, KH2PO4(shinyo) 0.2 g 및 크레졸 레드 염화염(Cresol red sodium salt, aldrich 11,448-0) 0.015 g을 3차 증류수 80 ㎖로 잘 혼합한 다음 pH 6.8로 조절하여 멸균하였다. 멸균한 80 ㎖의 용액에 0.2 um에서 여과한 유레아 용액 20 ㎖(유레아(sigma, U-0631) 12 g, 증류수)을 혼합한 다음 냉암소에 보관하였다.0.1 g bactopeptone (difco 211677), 0.1 g dextrose (difco 215530), 0.5 g NaCl, 0.2 g KH 2 PO 4 (shinyo) and 0.015 g Cresol red sodium salt (aldrich 11,448-0) The mixture was well mixed with 80 mL of distilled water and then sterilized by adjusting to pH 6.8. 20 ml of urea solution (12 g of urea (sigma, U-0631), distilled water) mixed with a sterilized 80 ml solution at 0.2 um were mixed and stored in a cool dark place.
6-2. 유레아제 활성 검사용 조성물의 정확성 검증6-2. Validation of the composition for testing urease activity
미생물 시료를 각 웰에 첨가한 후 상층에 미네랄 오일로 덮은 것을 제외하고 실시예 1-5와 동일한 방법으로 실험하였고, 그 결과는 하기 표 9에 나타내었다.After adding the microbial sample to each well was tested in the same manner as in Example 1-5 except that the upper layer was covered with mineral oil, the results are shown in Table 9 below.
상기 표 9의 유레아제에 의한 반응여부를 표준미생물의 유레아제 포함여부와 비교한 결과 유레아제 포함여부에 따라 동일한 반응성을 나타냄을 확인할 수 있었다.As a result of comparing the reaction by the urease of Table 9 with the inclusion of the urease of the standard microorganism, it was confirmed that the same reactivity was shown depending on whether the urease was included.
실시예 7: 알기닌 디하이드롤레이즈 활성 검사용 조성물Example 7 Composition for Testing Arginine Dihydrolase Activity
알기닌 디하이드롤레이즈는 아미노산을 아민형태로 변형시키는 효소로, 미생물에 따라 효소의 발현여부가 다르다.Arginine dihydrolase is an enzyme that transforms amino acids into amine forms.
미생물이 알기닌 디하이드롤레이즈를 발현할 경우 조성물내 아미노산을 아민으로 변형시키면서 조성물의 pH를 증가시키고, 이로 인하여 조성물이 붉은 색으로 변화되도록 알기닌 디하이드롤레이즈 검사용 조성물을 제조하였다.When the microorganism expresses arginine dehydrolase, the composition of the test for arginine dehydrolase was prepared such that the pH of the composition was increased while changing the amino acid in the composition to an amine, thereby changing the composition to a red color.
7-1. 알기닌 디하이드롤레이즈 활성 검사용 조성물 제조7-1. Preparation of Arginine Dihydrolase Activity Test Composition
박토 펩톤(difco 211677) 1.5 g, 효모 추출물(difco 212750) 0.9 g, 덱스트로즈(difco 215530) 0.3 g, 한천(difco 214010) 0.1 g, L-알기닌(free acid, sigma) 1.5 g, 크레졸 레드 염화물(aldrich 11,448-0) 0.016 g을 3차 증류수에 혼합하여 총 100 ㎖의 조성물을 제조하고, pH6.8로 조정한 다음 멸균하여 냉장보관하였다.1.5 g of bacto peptone (difco 211677), 0.9 g of yeast extract (difco 212750), 0.3 g of dextrose (difco 215530), 0.1 g of agar (difco 214010), 1.5 g of L-arginine (free acid, sigma), cresol red A total of 100 ml of the composition was prepared by mixing 0.016 g of chloride (aldrich 11,448-0) in tertiary distilled water, adjusted to pH6.8, and then sterilized by refrigeration.
7-2. 알기닌 디하이드롤레이즈 활성 검사용 조성물의 정확성 검증7-2. Accuracy Verification of Compositions for Testing Arginine Dihydrolase Activity
실시예 6-2와 동일한 방법으로 실험하였고, 그 결과는 하기 표 10에 나타내었다.The experiment was carried out in the same manner as in Example 6-2, and the results are shown in Table 10 below.
표 10에서, 표준미생물의 알기닌 디하이드롤레이즈 반응은 알기닌 디하이들레이즈 발현여부와 동일하였다.In Table 10, the standard microorganism arginine dehydrolase reaction was the same as the expression of arginine dehydrase.
실시예 8: 하이드로겐 설파이드(H2S) 생성반응 검사용 조성물Example 8: Composition for testing hydrogen sulfide (H 2 S) production reaction
미생물이 세포외의 아미노산으로부터 S를 분리하여 흡수하는 능력을 측정하기 위하여 분리된 S가 H와 결합하여 검은 색을 나타내도록 하는 조성물을 제조하였다.In order to measure the ability of microorganisms to separate and absorb S from extracellular amino acids, a composition was prepared in which isolated S was combined with H to appear black.
8-1. 하이드로겐 설파이드 생성반응 검사용 조성물 제조8-1. Preparation of hydrogen sulfide generation reaction composition
박토 펩톤(difco 211677) 12.96 g, 패릭 암모늄 사이트레이트(sigma F-5879) 0.18 g, 소듐 티오설페이트(sigma S-1648) 0.18 g, L-메티온(sigma M-6039) 0.15 g, L-시스테인(sigma C-4820) 0.15 g 및 NaCl 0.3 g을 3차 증류수에 녹여 100 ㎖의 조성물을 제조한 후 pH를 7.3으로 조절하였다. 이후 멸균한 다음 냉암소에서 보관하였다.12.96 g of bactopeptone (difco 211677), 0.18 g of parric ammonium citrate (sigma F-5879), 0.18 g of sodium thiosulfate (sigma S-1648), 0.15 g of L-methion (sigma M-6039), L-cysteine (sigma C-4820) 0.15 g and 0.3 g of NaCl were dissolved in tertiary distilled water to prepare a 100 ml composition, and then the pH was adjusted to 7.3. It was then sterilized and stored in a cool dark place.
8-2. 하이드로겐 설파이드 생성반응 검사용 조성물의 정확성 검증8-2. Accuracy Verification of Composition for Testing Hydrogen Sulfide Production
실시예 6-2와 동일한 방법으로 실험하였고, 그 결과는 하기 표 11에 나타내었다.The experiment was carried out in the same manner as in Example 6-2, and the results are shown in Table 11 below.
표 11에서, 사용한 표준미생물 모두 S를 이용하지 않는 미생물로 하이드로겐 설파이드 생성반응 역시 발생하지 않았다.In Table 11, all of the standard microorganisms used did not use hydrogen sulfide generation reactions.
실시예 9: 발효(Fermentation) 검사용 조성물Example 9 Composition for Fermentation Testing
미생물의 혐기조건에서의 발효여부를 확인하기 위하여 당 발효시 감소되는pH를 색변화로 확인할 수 있는 조성물을 제조하였다.In order to confirm the fermentation under anaerobic conditions of the microorganisms, a composition was prepared in which the pH decreased during fermentation by color change.
혐기조건에서 발효가 발생하면 조성물은 노란색을 나타내고, 발생하지 않을 경우 붉은색을 유지하게 된다.When fermentation occurs under anaerobic conditions, the composition is yellow, and if not, it remains red.
9-1. 발효 검사용 조성물의 제조9-1. Preparation of Fermentation Testing Composition
폴리펩톤(hispan 1610.01) 3.15 g, 덱스트로즈(difco 215530) 1.5 g, K2HPO40.1875 g, 페놀레드(sigma P-4758, 0.045 g/㎖) 2 ㎖ 및 한천(difco 214010) 0.12 g을 3차 증류수에 혼합하여 총 100 ㎖의 조성물을 제조하고, 잘 혼합한 다음 pH 6.9로 조정하였다. 이후 멸균하여 냉장보관하였다.3.15 g polypeptone (hispan 1610.01), 1.5 g dextrose (difco 215530), 0.1875 g K 2 HPO 4 , 2 ml phenol red (sigma P-4758, 0.045 g / ml) and 0.12 g agar (difco 214010) A total of 100 ml of the composition was prepared by mixing in tertiary distilled water, mixed well and adjusted to pH 6.9. After sterilization was refrigerated.
9-2. 발효 검사용 조성물의 정확성 검증9-2. Validation of the composition for fermentation testing
실시예 6-2와 동일한 방법으로 실험하였고, 그 결과는 하기 표 12에 나타내었다.The experiment was carried out in the same manner as in Example 6-2, and the results are shown in Table 12 below.
표 12에서, 사용한 표준미생물들 중 혐기조건에서 발효하는 액시네토박터 바우마니 만이 조성물의 색을 노란색으로 변화시켰을 뿐 그 외 미생물은 발효반응을 나타내지 않았다.In Table 12, only Axinebacter Baumani fermented under anaerobic conditions among the standard microorganisms used changed the color of the composition to yellow, and the other microorganisms did not show fermentation reaction.
실시예 10: 질산 환원반응(Nitrate reduction) 검사용 조성물Example 10 Composition for Testing Nitrate Reduction
미생물이 질산을 아질산으로 환원시키는 능력을 측정하기 위한 조성물을 제조하였다. 미생물이 질산을 환원시킬 경우 조성물의 색은 어두운 보랏빛을 나타내고, 환원반응이 일어나지 않을 경우 색변화가 없다.A composition was prepared to determine the ability of a microorganism to reduce nitric acid to nitrous acid. When the microorganisms reduce the nitric acid, the color of the composition is dark purple, and if no reduction reaction occurs, there is no color change.
10-1. 질산 환원반응 검사용 조성물의 제조10-1. Preparation of nitric acid reduction test composition
질산(difco 0268-17) 5.4 g, KNO3(덕산) 0.4 g을 3차 증류수에 혼합하여 100 ㎖의 조성물을 제조한 후 멸균하여 냉장보관하였다.5.4 g of nitric acid (difco 0268-17) and 0.4 g of KNO 3 (Duksan) were mixed with tertiary distilled water to prepare 100 ml of the composition, which was sterilized and refrigerated.
또한 알파-나프틸아민(α-naphthylamine) 0.5 g 및 5 N 아세트산을 포함하는 100 ㎖의 알파-나트틸아민 용액을, 설판일린산(s㎕fanilic acid) 0.8 g 및 5 N 아세트산을 포함하는 100 ㎖의 설판일린산 용액을 각각 제조하였다.In addition, 100 ml of alpha-naphthylamine solution containing 0.5 g of alpha-naphthylamine and 5 N acetic acid was added to 100 ml of 0.8 g of sulfanic acid and 5 N acetic acid. Ml of sulfanylinic acid solution was prepared respectively.
10-2. 질산 환원반응 검사용 조성물의 정확성 검증10-2. Validation of the composition for the test of nitric acid reduction reaction
실시예 1-5와 동일한 방법으로 실험하였고, 이후 알파-나프틸아민 용액과 설판일린산 용액을 50 ㎕ 씩 넣은 후 색변화를 하기 표 13에 기재하였다. 그 결과 질산 환원반응 검사용 조성물은 각 균주의 특성과 일치하는 결과를 나타내었다.The experiment was carried out in the same manner as in Example 1-5, and then 50 μl of the alpha-naphthylamine solution and the sulfanylic acid solution were added, and the color change is described in Table 13 below. As a result, the nitrate reduction test composition showed a result consistent with the characteristics of each strain.
실시예 11: 인돌 생성반응 검사용 조성물Example 11 Indole Formation Test Composition
미생물이 배지내의 트립토판을 분해하여 인돌을 생성하는지의 여부를 판단할 수 있는 인돌 생성반응 검사용 조성물을 제조하였다. 상기 조성물의 인돌 생성여부를 확인하기 위하여 p-디메틸아미노벤즈알데하이드를 지시약으로 사용하였고, 인돌 생성시 붉은 링이 형성되고, 인돌이 생성되지 않았을 경우 색 변화가 나타나지 않는다.An indole production test composition capable of determining whether or not microorganisms decompose tryptophan in a medium to produce indole was prepared. P-dimethylaminobenzaldehyde was used as an indicator to confirm the indole generation of the composition, a red ring is formed when indole is produced, and color change does not appear when indole is not produced.
11-1. 인돌 생성반응 검사용 조성물 제조11-1. Preparation of indole production reaction composition
박토 트립판(difco 0123-17-3) 6 g, L-트립토판(sigma T-0254) 1 g 및 3차 증류수를 혼합하여 총 100 ㎖의 조성물을 제조한 다음 pH를 7.4로 조정하여 멸균하였다.A total of 100 ml of the composition was prepared by mixing 6 g of bacto trypan (difco 0123-17-3), 1 g of L-tryptophan (sigma T-0254), and tertiary distilled water, followed by sterilization by adjusting the pH to 7.4.
또한 지시약으로 이소아밀 알콜 150 ㎖, p-디메틸아미노벤즈알데하이드 10 g, HCL 150 ㎖을 혼합하여 제조하였다. 상기 지시약은 미생물을 인돌 검사용 조성물에서 배양한 후 여기에 50 ㎕을 넣어 색변화를 관찰한다. 반응이 없는 경우 색 변화없이 노란색을 나타내고, 반응이 있는 경우 붉은 색을 나타낸다.In addition, 150 ml of isoamyl alcohol, 10 g of p-dimethylaminobenzaldehyde, and 150 ml of HCL were prepared as an indicator. The indicator is cultured in the indole test composition for microorganisms and put 50 ㎕ to observe the color change. When there is no reaction, it shows yellow without color change, and when there is reaction, it shows red color.
11-2. 인돌 생성반응 검사용 조성물의 정확성 검증11-2. Accuracy Verification of Composition for Testing Indole Production
실시예 1-5와 동일한 방법으로 실험하였고, 이후 지시약을 넣은 후 색변화를 하기 표 14에 기재하였다.The experiment was carried out in the same manner as in Example 1-5, after which the indicator was added and the color change is described in Table 14 below.
실시예 12: 비발효 그람 음성균 동정용 키트 제조Example 12 Preparation of a Kit for Identification of Non Fermented Gram Negative Bacteria
상기 실시예 1 내지 11에서 제조한 총 24개의 조성물을 24웰 마이크로 플레이트의 각 웰에 50 ㎕ 씩 넣고, 25 ℃에서 건조시켜 키트를 제조하였다.A total of 24 compositions prepared in Examples 1 to 11 were placed in 50 μl of each well of a 24-well microplate and dried at 25 ° C. to prepare a kit.
실시예 13: 동정용 키트를 이용하여 미생물 동정Example 13: Identification of Microorganisms Using a Identification Kit
ATCC로부터 분양받은 3종의 미생물(슈도모나스 에어루지노사, 액시네토박터 바우마니, 스테노트로포모나스 말토필리아)을 각각 평판배지에서 배양하고, 탁도 2로 증류수에 희석시킨 다음 이를 실시예 12에서 제조한 동정용 키트에 반응시켰다. 각 검사용 조성물에 따른 색변화를 체크하여 반응발생여부를 하기 표 15에 나타내었으며, 이를 미생물 동정용 프로그램에 입력하였다. 그 결과 접종된 미생물이 각각 슈도모나스 에어루지노사, 액시네토박터 바우마니, 스테노트로포모나스 말토필리아로 동정되었다.Three microorganisms (Pseudomonas aeruginosa, Axinetobacter Baumani, Stenotropomonas maltophilia) received from ATCC were each incubated in a plate medium, diluted in distilled water with turbidity 2, and then, this was It was reacted to the prepared kit for identification. Checking the color change according to the composition for each test to determine whether the reaction is shown in Table 15, which was entered into the program for identifying microorganisms. As a result, the inoculated microorganisms were identified as Pseudomonas aeruginosa, Axinetobacter Baumani, and Stenotropomonas maltophilia, respectively.
실시예 14: 동정용 키트를 이용한 미생물 동정Example 14 Identification of Microorganisms Using a Identification Kit
상기 실시예 12에서 제조한 동정용 키트를 사용하여 여러종의 미생물의 동정결과를 확인하였고, 이를 시판되고 있는 VITEK(bioMeriux), API 20NE(bioMeriux)와 비교하였다.The identification results of various microorganisms were confirmed using the kit for identification prepared in Example 12, which was compared with commercially available VITEK (bioMeriux) and API 20NE (bioMeriux).
총 114 개의 임상시험균주(ATCC)를 대상으로 2002년 3월 내지 4월 사이에 동정하였다. VITEK를 이용한 동정 실험은 서울대학교에서, API 20NE 및 실시예 12의 키트를 이용한 동정 실험은 코메드 생명과학연구소에서 실시하였으며, 결과분석은 코메드 생명과학연구소에서 하여 하기 표 16에 나타내었다.A total of 114 strains (ATCC) were identified between March and April 2002. Identification experiment using VITEK at Seoul National University, identification experiment using the kit of API 20NE and Example 12 was carried out at the Combed Life Science Research Institute, the results analysis is shown in Table 16 by the Combed Life Science Research Institute.
표 16에서, 본 발명의 동정키트는 약 95.6 %의 정확성을 나타내어 기존의 동정키트보다 우수하거나 유사하여, 기존의 동정키트를 대체하여 사용할 수 있다.In Table 16, the identification kit of the present invention shows an accuracy of about 95.6%, which is superior to or similar to the existing identification kit, and can be used to replace the existing identification kit.
상기에 언급한 바와 같이, 본 발명의 비발효 그람 음성균 동정방법은 총 24개의 항목만을 간단하게 검사하여 비장내세균을 동정할 수 있을 뿐만 아니라 우수한 동정율을 가져 세균에 의한 질환을 진단하기 위한 목적으로 사용할 수 있다.As mentioned above, the non-fermentative Gram-negative bacteria identification method of the present invention can not only identify the spleen bacteria by simply examining a total of 24 items, but also has an excellent identification rate for the purpose of diagnosing diseases caused by bacteria. Can be used as
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