KR20010104065A - Lumburokinase protein isolated from a earthworm and overexpression method of lumburokinase protein in yeast - Google Patents

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Abstract

본 발명은 지렁이(Lumbricus rubellus)의 신규한 룸부로키나제 유전자 염기서열 및 아미노산 서열을 밝히고, 효모 발현시스템을 이용하여 룸부로키나제 유전자를 대량 발현시키는 방법에 관한 것이다. 본 발명의 효모 발현시스템을 이용하면 높은 순도의 재조합 룸부로키나제 단백질을 쉽게 대량으로 수득할 수 있고, 본 발명에 의하여 발현된 재조합 룸부로키나제 단백질은 피브린분해 활성도가 증가되어 의학적 이용가치가 높다.The present invention relates to a novel rumburokinase gene sequence and amino acid sequence of an earthworm ( Lumbricus rubellus ), and to a method for mass expression of a rumburokinase gene using a yeast expression system. By using the yeast expression system of the present invention, it is possible to easily obtain a large amount of high-purity recombinant rumbaurokinase protein, and the recombinant rumbaurokinase protein expressed by the present invention increases fibrinosis activity and thus has high medical value.

Description

지렁이에서 분리한 룸부로키나제 단백질과 효모에서 룸부로키나제 단백질의 대량발현 방법{Lumburokinase protein isolated from a earthworm and overexpression method of lumburokinase protein in yeast}Lumburokinase protein isolated from a earthworm and overexpression method of lumburokinase protein in yeast}

본 발명은 지렁이에서 분리한 룸부로키나제 단백질과 효모에서 룸부로키나제 단백질을 대량 발현시키는 방법에 관한 것으로, 더욱 상세하게는 지렁이에서 분리한 혈전용해능을 지닌 룸부로키나제 단백질의 아미노산 서열, 룸부로키나제의 염기서열, 상기를 포함하는 발현 벡터 및 룸부로키나제를 발현하는 형질전환된 재조합 숙주인 피키아 파스토리스에 대한 발명이다.The present invention relates to a method for mass expression of lumpurokinase protein isolated from earthworm and yeast, and more particularly, to the amino acid sequence of lumpurokinase protein having thrombolytic ability isolated from earthworm, rumbu A transformed recombinant host that expresses a nucleotide sequence, an expression vector comprising the same and rumbaurokinase Invention for Pichia pastoris.

재조합 기술을 이용하여 목적하는 단백질을 발현시켜 정제하는 방법에 대해서는 이미 많은 특허들이 허여 되어 있다. 특히 효모를 이용하여 단백질을 대량 발현시키는 방법은 목적하는 단백질을 외부로 분비시켜 쉽게 정제할 수 있기에 더욱 유용하게 이용되어지고 있는 숙주이다. 효모인 피키아 파스토리스(Pichia pastoris)는 성장속도가 매우 빨라 배양액 리터당 많은 양의 단백질을 생산해 낼 수 있고 자체 단백질을 분비하는 정도가 매우 낮은 대신, 값싼 단백질 결핍배지(protein-poor medium)에서 외래단백질을 리터당 그램 수준까지 분비시킬 수 있는 큰 장점을 지니고 있다. 또한 피키아 파스토리스내로 형질 도입된 유전자의 전사는 AOX1(alcohol oxidase gene) 프로모터의 엄격한 조절을 받게 되어 알콜 옥시데이즈의 기질인 메탄올 첨가 시 빠르게 전사된다. 따라서 현재 피키아 파스토리스를 숙주로 하여 다양한 단백질을 생산하는 연구들이 진행 중이며 이미 잡종의 단백질을 생산하는 형질 전환된 피키아 파스토리스는 미국특허 제 4,683,293호, 미국특허 제 4,808,537호, 미국특허 제 4,812,405호, 미국특허 제 4,818,700호, 미국특허 제 4,837,148호, 미국특허 제 4,855,231호, 미국특허 제 4,857,467호, 미국특허 제 4,879,231호, 미국특허 제 4,882, 279호, 미국특허 제 4,885,242호, 미국특허 제 4,895,800호, 미국특허 제 4,929,555호, 미국특허 제 5,002,876호, 미국특허 제 5,004,688호, 미국특허 제 5,032,516호, 미국특허 제 5,122,465호, 미국특허 제 5,135,868호, 및 미국특허 제 5,166,329호 등에 공지되어있다.Many patents have already been issued for the method of expressing and purifying a desired protein using recombinant technology. In particular, a method for mass expression of proteins using yeast is a host that is more useful because it can be easily purified by secreting the desired protein to the outside. Yeast, Pichia pastoris , grows very fast and can produce a large amount of protein per liter of culture and produces very low levels of its own protein. Instead, it is used in cheap protein-poor medium. It has the great advantage of releasing protein up to grams per liter. In addition, transcription of genes transduced into Pichia pastoris is subject to strict control of the AOX1 (alcohol oxidase gene) promoter, which is rapidly transcribed upon addition of methanol, the substrate of alcohol oxidase. Therefore, studies are currently underway to produce a variety of proteins using Pichia pastoris as a host, and already transformed Pichia pastoris producing a hybrid protein is disclosed in U.S. Patent Nos. 4,683,293, U.S. Patent 4,808,537, U.S. Patent 4,812,405 US Patent No. 4,818,700, US Patent 4,837,148, US Patent 4,855,231, US Patent 4,857,467, US Patent 4,879,231, US Patent 4,882, 279, US Patent 4,885,242, US Patent 4,895,800 US Patent No. 4,929,555, US Patent 5,002,876, US Patent 5,004,688, US Patent 5,032,516, US Patent 5,122,465, US Patent 5,135,868, US Patent 5,166,329, and the like.

생활수준 및 식생활이 변화하면서 증가되는 성인병 중의 하나가 혈류관계 질환이다. 특히 심근경색, 뇌출혈 등은 혈류관계 질병 중 이상혈전의 형성으로 야기되는 매우 급격한 증가추세에 있는 질환으로 현대사회에 있어 여러 가지 심각한 사회적, 경제적 문제를 발생시키고 있다. 혈류에 관계하는 헤모스테틱 시스템(Hemostatic system)은 혈액을 혈관으로 자유로이 이동시키며 동시에 외부 자극에 의해 혈관이 손상을 받으면 혈액의 손실을 막기 위해 손상된 혈관을 복구한다.(Colman, R.W., Hirsh, J., Marder, V.J., and Salzman, E.W., 1994. Lippincott company, USA) 헤모스테틱 시스템(Hemostatic system)의 구성은 혈관, 혈소판, 그리고 수용성 플라스마 단백질, 이렇게 세 가지로 크게 나눌 수 있다. 혈소판은 혈관에 손상이 발생할 경우 일시적인 방지책으로 작용하고 혈장 단백질과 화학적인 물질이 헤모스테틱 플러그(Hemostatic plug)를 강화하기 위해 사용되어진다. 이러한 혈장 단백질은 혈액의 응고뿐만 아니라 피브린분해(fibrinolysis)에도 사용되어진다. 이렇게 조절이 되어지는 헤모스테틱 시스템(hemostatic system)의존재에도 불구하고 혈전의 생성이 인체 내에서 발생하는데 이것은 트롬보게닉 자극(thrombogenic stimulation)이 외부에서 강하게 일어날 때이다. 주된 트롬보게닉(thrombogenic)인자로는 혈관 내피세포가 떨어져 나가 내피가 혈관에 노출됨으로써 형성된 혈전의 주성분인 혈액세포들과 피브린, 그리고 혈소판들이다. 하지만 그 생성환경에 따라 성분의 변화를 보이는데, 정맥 혈전은 적혈구와 다량의 피브린, 그리고 소량의 혈소판들로 이루어진다. 반면에 동맥 혈전은 주로 혈소판 응집에 의해 구성되며, 피브린은 상대적으로 적은 양이 존재한다. 이러한 혈전은 다양한 질병을 일으키기에 의학적으로 다양한 혈전 치료제들이 개발되어 있다.One of the adult diseases that increases with changing living standards and diet is blood flow disease. In particular, myocardial infarction and cerebral hemorrhage are diseases that are rapidly increasing due to the formation of abnormal blood clots in the blood-related diseases, causing various serious social and economic problems in the modern society. The hemostatic system, which is related to blood flow, freely moves blood to blood vessels, and at the same time repairs damaged blood vessels to prevent blood loss when blood vessels are damaged by external stimuli (Colman, RW, Hirsh, J). , Marder, VJ, and Salzman, EW, 1994. Lippincott company, USA) The composition of the hemostatic system can be broadly divided into three groups: blood vessels, platelets, and water-soluble plasma proteins. Platelets act as a temporary protection against damage to blood vessels, and plasma proteins and chemicals are used to reinforce the hemostatic plug. These plasma proteins are used not only for blood coagulation but also for fibrinolysis. Despite the presence of this regulated hemostatic system, blood clot production occurs in the body when thrombogenic stimulation occurs strongly outside. The main thrombogenic factors are blood cells, fibrin, and platelets, which are the main components of blood clots formed by vascular endothelial cells falling off and exposing the endothelium to blood vessels. However, depending on the production environment, the composition changes. Venous thrombi consist of red blood cells, large amounts of fibrin, and small amounts of platelets. Arterial thrombi, on the other hand, are primarily composed of platelet aggregation, and fibrin is present in relatively small amounts. These clots cause a variety of diseases, so medically various thrombosis treatments have been developed.

지금까지 임상적으로 주로 사용되고 있는 혈전용해제로는 해파린(Gruber, U.F., Saldeen, T., and Brokop, T., 1980, Br Med J, 1, 69), 유로키나제(White, W.F., Borlow, G.H., and Mozen, M.M., 1966. Biochem, 5, 2160), 스트렙토키나제(Davies, M.C., Englert, M.E., and De Renzo, E.C. 1964. J Biol Chem,239(8), 2651-2656), 조직형 프라스미노겐 활성인자(tissue-type plasminogen activator; Brott, T.G., Haley, E.C., and Levy, D.E., 1992. Stroke, 23. 632) 등으로 전세계적으로 상당량 소비되고 있다. 그러나 이들 혈전용해제는 혈전의 주성분인 피브린(fibrin)을 직접 용해하지 않고, 대신 혈액 내에 이미 존재하고 있는 프라스미노겐(plasminogen)을 프라스민(plasmin)으로 활성화시킨 다음 이 프라스민(plasmin)으로 하여금 혈전을 용해시키는 방법으로 혈전을 용해한다. 따라서, 과다한 프라스민(plasmin)이 형성되어 자칫 혈관 벽까지 용해하여 종종 전신 출혈증으로 진전되게 하여 많은 사람의 생명을 위협하기도 한다.The most commonly used thrombolytic agents so far are haparin (Gruber, UF, Saldeen, T., and Brokop, T., 1980, Br Med J, 1, 69), urokinase (White, WF, Borlow, GH). , and Mozen, MM, 1966. Biochem, 5, 2160), Streptokinase (Davies, MC, Englert, ME, and De Renzo, EC 1964. J Biol Chem , 239 (8), 2651-2656), histoplasmic phras Minogen activators (tissue-type plasminogen activator; Brott, TG, Haley, EC, and Levy, DE, 1992, Stroke, 23.632) are consumed in large quantities worldwide. However, these thrombolytic agents do not directly dissolve fibrin, the main component of blood clots, but instead activate plasminogen already present in the blood with plasmin and then cause this plasmin Dissolve blood clots by dissolving them. As a result, too much plasmin is formed and often dissolves to the walls of blood vessels, often leading to systemic hemorrhagic disease, which can threaten the lives of many people.

이러한 문제점을 해결하기 위하여 직접 피브린을 용해하고 혈관 내 다른 단백질은 상대적으로 잘 공격하지 않는 혈전 특이성 용해제 개발을 위하여 피브린에 직접적으로 작용하는 물질에 대해 다양한 원천으로부터 스크리닝이 이루어지고 있다. 현재 많은 연구가 진행된 것으로는 여러 종류의 뱀독에서 분리한 피브린 분해 효소들인데 이들은 피브로라제(fibrolase : Retzios, A.D., and Markland, F.S. 1994. Thromb Res, 74(4), 355-367 : Ahmed, N.K., Tennant, K.D., Markland, F.S., and Lacz, J.P. 1990. Haemostasis, 20(3), 147-154), 바실리스쿠스피브라제(basiliscusfibrases : Retzios, A.D., and Markland, F.Jr. 1992. Biochem, 31(19), 4547-4557), 에이알에히치(ARHs : Lollar, P., Parker , C.G., Kajenski, P.J., Litwiller, R.D., and Fass, D.N. 1987. Biochem, 26(24), 7627-7636), 그리고 아트로사제(atroxase : Tu, A.T., Baker, B., Wongvibulsin, S., Willis, T. 1996. Toxicon, 34(11), 1295-1300), 레베타제(lebetase : Siigur, E., Aaspollu, A., Tu, A.T., and Siigur, J. 1996. Biochem Biophys Res Commun, 224(1), 229-236) 등으로 명명되어 활발히 연구되고 있다. 뱀의 독이 외에도, 국내에서는 전통적인 발효식품인 청국장에서 바실러스속의 CK 11-4라는 균주로부터 28.2 kDa의 프로테아제를 추출하기도 하였고(Kim, W., Choi, K., Kim, Y., Park, H., Choi, J., Lee, Y., Oh, H., Kwon, I., and Lee, S. 1996. Appl Environ Microbiol, 62(7), 2482-2488), 소의 피를 먹고사는 등에(Tabanus fulvus)로부터 플라스미노겐에 비의존적인 피브린 분해 활성을 갖는 세린 단백질 분해효소 종류의 두 단백질(22 kDa 과 27 kDa)을 분리하였다.In order to solve this problem, screening from various sources has been performed on a substance directly acting on fibrin to develop a blood clot-specific soluble agent which directly dissolves fibrin and does not attack other proteins in blood vessels relatively well. Currently, much research has been carried out on fibrinase enzymes isolated from various types of snake venom, which are fibrolase (Retzios, AD, and Markland, FS 1994. Thromb Res, 74 (4), 355-367: Ahmed, NK, Tennant, KD, Markland, FS, and Lacz, JP 1990. Haemostasis, 20 (3), 147-154), basiliscus fibrases: Retzios, AD, and Markland, F.Jr. 1992. Biochem , 31 (19), 4547-4557), ARHs: Lollar, P., Parker, CG, Kajenski, PJ, Litwiller, RD, and Fass, DN 1987. Biochem, 26 (24), 7627- 7636), and atrosa (atrox: Tu, AT, Baker, B., Wongvibulsin, S., Willis, T. 1996. Toxicon, 34 (11), 1295-1300), levetase (Siigur, E , Aaspollu, A., Tu, AT, and Siigur, J. 1996. Biochem Biophys Res Commun, 224 (1), 229-236). In addition to snake venom, Korea also extracted 28.2 kDa protease from Bacillus strain CK 11-4 (Cim. W., Choi, K., Kim, Y., Park, H.). , Choi, J., Lee, Y. , Oh, H., Kwon, I., and Lee, S. 1996. Appl Environ Microbiol, (Tabanus 62 (7), 2482-2488), or the like that feed the bovine blood fulvus ) isolated two proteins (22 kDa and 27 kDa) of the serine protease family having fibrin-independent fibrin-inducing activity.

예로부터 지렁이는 중국, 한국, 일본 등 동양에서 혈관계 질병에 대한 치료제로 널리 쓰여왔다. 그렇지만 그 정확한 기작 및 그 원인에 대해서는 알려지지 않다가 얼마 전 지렁이(Lumbricus rubellus)로부터 혈전용해능을 보이는 6종류의 단백질을 분리하고 그 학명을 인용해 룸부로키나제(LK)라 명명하였다.(Mihara, H., Sumi, H., Yoneta, T., Mizumoto, H., Ikeda, R., Seiki, M., and Maruyama, M. 1991. Jap J Physiol, 41, 461-472) 이 룸부로키나제들은 플라스미노겐이 없는 조건에서도 피브린을 용해할 수 있다. 하기 표 1은 룸부로키나제들의 간단한 생화학적 및 물리적 특성을 나타낸다.Earthworms have been widely used as treatments for vascular diseases in China, Korea, and Japan. However, the exact mechanism and its cause are unknown. Recently, six kinds of thrombolytic proteins were isolated from the worm, Lumbricus rubellus , and the scientific name was cited as Lumburokinase (LK). (Mihara, H., Sumi, H., Yoneta, T., Mizumoto, H., Ikeda, R., Seiki, M., and Maruyama, M. 1991. Jap J Physiol, 41, 461-472) Fibrin can be dissolved even in the absence of plasminogen. Table 1 below shows the simple biochemical and physical properties of rumbaurokinases.

룸부로키나제Lumburokinase II IIII IIIIII 00 1One 22 1One 22 분자량(kDa : 전기영동으로 분석)이소익렉트릭 포인트(by isoelectric focus ing)E1(280 nm)Molecular weight (kDa: analyzed by electrophoresis) by isoelectric focusing E 1 (280 nm) 23.54.1212.523.54.1212.5 27.44.0014.227.44.0014.2 27.03.9012.827.03.9012.8 28.53.8016.628.53.8016.6 34.03.7013.134.03.7013.1 34.23.5212.734.23.5212.7 분류Classification 키모트립신(Chymotrypsin)계Chymotrypsin system 키모트립신계나 트립신계에 속하지 않음Does not belong to chymotrypsin or trypsin system 트립신(Trypsin)계Trypsin system 열 안정성Thermal stability 37℃, pH 2∼10에서 80 이상의 활성도를 가짐;60℃, pH 6∼9에서 60 이상의 활성도를 가짐Has activity above 80 at 37 ° C., pH 2-10; has activity above 60 at 60 ° C., pH 6-9

룸부로키나제들은 온도 및 pH 변화에 안정하고, 프라스미노겐(plasminogen)을 프라스민(plasmin)으로 활성화시키지 않고 대신 피브린(fibrin)만을 선택적으로 분해한다. 또한 혈전형성에 관여하지 않는 알부민(albumin)이나 카제인(casein)과 같은 단백질은 분해하지 않기에 혈액용 혈전용해제로 매우 적절하다. 룸부로키나제는 현재, (1)인공 신장기를 우레탄으로 만들 때 혈전생성 방지용 표면 처리제로 사용되고 있으며, (2)지렁이를 갈아 상층액만을 건조하여 만든 분말제제는 경구용혈전용해제로 사용되고 있다.Lumburokinases are stable to changes in temperature and pH and do not activate plasminogen into plasmin but instead selectively degrade fibrin. In addition, proteins such as albumin or casein, which are not involved in thrombus formation, are not suitable for thrombolysis because they do not degrade. Lumburokinase is currently used as a surface treatment agent for preventing thrombus formation when artificial kidneys are made of urethane. (2) Powder formulations made by drying only the supernatant by grinding earthworms are used as antithrombolytic agents.

또한 룸부로키나제의 정제 방법은 일본의 미하라(Mihara) 등이 공지하였고(일본공개특허 소 58-148824호, 일본공개특허 소 59-63184호, 일본공개특허 소 59-184131호, 일본공개특허 소 64-75431호), 국내에서도 룸부로키나제 분리 정제 방법이 새로이 개발되었다.(국내특허공보 제 92-8369호) 최근에는 디에틸아미노에틸-세파덱스 음이온 교환 (DEAE-Sephadex anion exchange) 컬럼 크로마토그래피 및 ρ-아미노벤즈아미딘(p-amino benzamidine affinity) 컬럼 크로마토그래피만을 사용하여 지렁이로부터 룸부로키나제를 손쉽게 분리하는 방법이 보고되었으며, 룸부로키나제에 의한 피브리노겐의 분해 양상 및 그 잘리는 부위의 서열을 분석하여 룸부로키나제가 리신(Bβ-chain의 133번째와 148번째)의 바로 다음을 가수분해한다는 사실도 알아내었다.(Park, Y.D., Kim, J.W., Min, B.G., Seo, J.W., and Jeong, J.M. 1998. Biotech Let, 20(2), 169-172) 하지만 지렁이에서 직접 룸부로키나제를 분리 정제하는 데에는 많은 시간과 비용이 소요되며 또한 이 방법은 한 종류의 룸부로키나제를 순수하게 분리하는 것이 아니고 지렁이 체내에 있는 최소 5가지 이상의 서로 다른 단백질 분해효소를 한꺼번에 획득하게 된다.In addition, the method for purifying rumburokinase is known from Mihara et al. Of Japan (Japanese Patent Laid-Open No. 58-148824, Japanese Patent Laid-Open No. 59-63184, Japanese Patent Laid-Open No. 59-184131, and Japanese Patent Laid-Open Patent Publication). 64-75431), a new method for separating and purifying lumpurokinase was also developed in Korea. (Domestic Patent No. 92-8369) Recently, DEAE-Sephadex anion exchange column chromatography And p-amino benzamidine affinity column chromatography using a method of easily separating the lumburokinase from the earthworm has been reported, and the cleavage pattern of fibrinogen by rumburokinase and the sequence of the cut site Analysis also revealed that rumbaurokinase hydrolyzes immediately after lysine (133th and 148th of the Bβ-chain) (Park, YD, Kim, JW, Min, BG, Seo, JW, and Jeong). , JM 1998. Biotech Let, 20 (2), 169-172) However, it is very time consuming and expensive to separate and purify rumburokinase directly from earthworms. Instead, the earthworm acquires at least five different proteases in the body at once.

그러므로 지렁이로부터 직접 룸부로키나제를 정제, 분리하는 방법은 정제와 분리 과정에서 소요되는 비용으로 인해 단가가 높고 순수한 한 종의 룸부로키나제를 이용할 수 없을 뿐 아니라, 땅에서 자라는 지렁이가 땅속에 오염되어 있는 중금속을 포함하는 위험성을 내포하고 있다.Therefore, the method of refining and separating lumpurokinase directly from the earthworm is not only able to use a single priced and pure species of lumpurokinase due to the cost of the purification and separation process, but the earthworms are polluted in the ground. Risks involving heavy metals.

상기에 언급한 문제점들을 시정하고자 본 발명은 천연형의 혈전용해능을 가지는 룸부로키나제를 대량생산하기 위한 재조합 벡터를 제공하여 형질 전환된 숙주세포에서 정확한 유도조절을 통한 고수율의 룸부로키나제를 제조하는 것을 목적으로 한다.In order to rectify the above-mentioned problems, the present invention provides a recombinant vector for mass production of a naturally occurring thrombolytic rumbukinase to provide a high yield of lumpurokinase through accurate induction control in transformed host cells. It aims to manufacture.

이에 본 발명은 지렁이(Lumbricus rubellus)에서 새로운 룸부로키나제 단백질의 아미노산 서열을 제공하는 것을 목적으로 한다.Accordingly, an object of the present invention is to provide an amino acid sequence of a new lumpurokinase protein in the earthworm ( Lumbricus rubellus ).

또한 본 발명은 상기를 암호화하는 유전자의 뉴클레오타이드 서열을 제공하는 것을 목적으로 한다.It is also an object of the present invention to provide a nucleotide sequence of a gene encoding the above.

또한 본 발명은 상기 룸부로키나제의 유전자를 포함하고 단백질을 생산 할 수 있는 재조합 벡터를 제공하는 것을 목적으로 한다.In addition, an object of the present invention is to provide a recombinant vector containing the gene of the rumbaurokinase and capable of producing a protein.

또한 본 발명은 재조합 미생물을 이용하여 혈전용해능을 가지는 높은 순도의 재조합 룸부로키나제를 대량으로 제공하는 것을 목적으로 한다.In addition, an object of the present invention is to provide a large amount of high-purity recombinant rumbaurokinase having a thrombolytic ability using a recombinant microorganism.

도 1은 본 발명의 룸부로키나제(LK-Ⅲ-2)의 아미노산 서열과 기존에 밝혀진 룸부로키나제(LK-Ⅲ-1, LK-1T4)의 아미노산 서열을 비교 분석한 것이고,1 is a comparative analysis of the amino acid sequence of Lumburokinase (LK-III-2) of the present invention and the previously known amino acid sequence of Lumburokinase (LK-III-1, LK-1T4),

도 2는 지렁이(Lumbricus rubellus) 내의 기존에 밝혀진 룸부로키나제 유전자(LK-1T4)와 본 발명의 룸부로키나제 유전자(LK-Ⅲ-2)의 염기서열을 비교 분석한 것이고,Figure 2 is a comparative analysis of the nucleotide sequence of the previously known Lumburokinase gene (LK- 1T4 ) and Lumburokinase gene (LK-III-2) of the earthworm ( Lumbricus rubellus ),

도 3은 본 발명의 효모 발현 벡터인 pPIC9K내로 룸부로키나제 유전자의 도입 모식도를 나타낸 것이고,Figure 3 shows the schematic diagram of the introduction of the roomburokinase gene into pPIC9K, the yeast expression vector of the present invention,

도 4는 본 발명에서 재조합 룸부로키나제 유전자를 피키아 파스토리스(Pichia pastoris)에서 발현시켜 SDS-PAGE상에서 확인한 것이고,4 is a recombinant rumburokinase gene expressed in Pichia pastoris in the present invention and confirmed on SDS-PAGE,

도 5는 본 발명의 재조합 룸부로키나제를 항-룸부로키나제로 웨스턴 분석을 수행한 것이고,5 is a Western analysis of the recombinant rumburokinase of the present invention with anti-lumburokinase,

도 6은 본 발명의 룸부로키나제의 활성을 피브린 평판배지에서 측정한 것이고,6 is a measure of the activity of lumburokinase of the present invention in a fibrin plate medium,

도 7은 본 발명의 최종 정제된 재조합 룸부로키나제 단백질을 SDS-PAGE상에서 확인한 것이다.Figure 7 shows the final purified recombinant rumbaurokinase protein of the present invention on SDS-PAGE.

상기의 목적을 달성하기 위하여, 본 발명은 지렁이에서 분리한 혈전용해능을 가진 신규의 룸부로키나제와 상기를 암호화하는 서열번호 1의 염기서열 및 상기의 아미노산 서열 서열번호 2를 제공한다.In order to achieve the above object, the present invention provides a novel rumburokinase having a thrombolytic ability isolated from the earthworm, the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 1 and the amino acid sequence SEQ ID NO: 2.

또한 본 발명은 룸부로키나제를 발현할 수 있는 재조합 벡터를 제공한다.The present invention also provides a recombinant vector capable of expressing rumbaurokinase.

본 발명의 재조합 벡터는 도 3의 pPIC9K/LK가 바람직하다.The recombinant vector of the present invention is preferably pPIC9K / LK of FIG.

또한 본 발명은 상기 재조합 벡터를 발현하는 재조합 숙주세포인 피키아 파스토리스를 제공한다.The present invention also provides a pichia pastoris which is a recombinant host cell expressing the recombinant vector.

본 발명의 피키아 파스토리스는Pichia pastorisKFCC-11166 이 바람직하다. Pichia pastoris of the present invention is preferably Pichia pastoris KFCC-11166.

또한 본 발명은 상기의 형질 전환된 숙주를 배양하여 메탄올로 룸부로키나제의 발현을 유도하고 이를 수득하는 공정을 포함하는 재조합 룸부로키나제 제조방법을 제공한다.In another aspect, the present invention provides a method for producing recombinant rumbaurokinase comprising culturing the transformed host to induce expression of rumbaurokinase with methanol and to obtain the same.

이하 본 발명을 상세하게 설명한다.Hereinafter, the present invention will be described in detail.

본 발명자들은 지렁이에 존재하는 혈전용해능을 가지는 단백질을 분리하고자 지렁이를 마쇄시킨 후 음이온 교환 컬럼 크로마토그래피와 친화성 컬럼 크로마토그래피로 여과하여 피브린 분해 활성도가 높은 분획을 분리하였다. 분리된 단백질의 아미노산 서열을 결정하였고, 쥐에 주사하여 항-룸부로키나제 혈청을 얻었다.The present inventors crushed the earthworm to separate the thrombolytic proteins present in the earthworm and then filtered by anion exchange column chromatography and affinity column chromatography to separate the high fibrin decomposition activity fraction. The amino acid sequence of the isolated protein was determined and injected into mice to obtain anti-lumburokinase serum.

또한 지렁이의 총 세포로부터 mRNA를 분리하여 cDNA 라이브러리를 제조하고 항-룸부로키나제 혈청을 이용하여 룸부로키나제의 cDNA를 클로닝하였다. 클로닝하여 획득한 클론들은 제한 효소지도를 통해 분석하고, 그 중 룸부로키나제-1T4와 동일한 제한 효소지도를 갖는 클론을 선택하여 그의 염기서열을 결정하였다.In addition, cDNA libraries were prepared by separating mRNAs from the total cells of the earthworms, and the cDNA of rumbaurokinase was cloned using anti-lumburokinase serum. Clones obtained by cloning were analyzed by restriction enzyme map, and among them, clones having the same restriction enzyme map as Lumburokinase-1T4 were selected to determine their sequencing.

이렇게 클로닝된 룸부로키나제를 룸부로키나제III-2라 칭하고 pPIC9K 벡터에 삽입하여 재조합 벡터 pPIC9K/LK를 제조하였다.The cloned rumbaurokinase was referred to as rumbaurokinase III-2 and inserted into the pPIC9K vector to prepare a recombinant vector pPIC9K / LK.

본 발명에 사용된 pPIC9K 벡터에는 발현된 단백질을 효모 밖으로 분비시키는 사카로미세스 세레비시아(Saccharomyces cerevisiae)의 알파-인자 리더 서열(α-factor leader sequence)이 포함되어 있고, His, 암피실린, 카나미신 유전자를 포함하고 있어서 숙주 내로 형질 도입여부를 확인할 수 있는 표지로 이용 가능하다.The pPIC9K vector used in the present invention contains Saccharomyces cerevisiae that secretes expressed proteins out of yeast.Saccharomyces cerevisiae)of Alpha-factor leader sequence (α-factor leader sequence) is included, and His, ampicillin, kanamicin genes are included so that it can be used as a label to confirm the transduction into the host.

본 발명의 재조합 숙주세포 피키아 파스토리스 KFCC-11166 의 룸부로키나제 발현을 위하여 값싼 단백질 결핍배지(protein-poor medium)인 BMMY배지가 사용되었고, 30 ℃에서 메탄올로 0.5 씩 첨가하여 48 내지 120시간 동안 발현을 유도하였다. 배양액에 분비되어지는 룸부로키나제는 친화성 컬럼을 수행함으로써 쉽게 분리, 정제한 결과 배양조건이나 배양조에 따라 발현량의 차이가 있지만 최적 조건인 호기성 배양조에서 BMMY배양액에 메탄올 유도 후 96시간 발현시켰을 때 배양액 리터당 0.1 g의 재조합 룸부로키나제를 얻을 수 있었다.BMMY medium, which is a cheap protein-poor medium, was used for the expression of rumbaurokinase in the recombinant host cell Pichia pastoris KFCC-11166 of the present invention, and the mixture was added with 0.5 methanol at 30 ° C. for 48 to 120 hours. Expression was induced. Rumburokinase secreted in the culture solution was easily isolated and purified by performing an affinity column. However, the expression level was different depending on the culture conditions or culture tanks, but the aerobic culture tank was expressed for 96 hours after methanol induction in the aerobic culture medium. 0.1 g of recombinant rumbaurokinase per liter of culture was obtained.

상기의 재조합 룸부로키나제는 천연형의 룸부로키나제와 동일한 혈전용해능을 가지며 기존의 지렁이에서 추출하는 룸부로키나제보다 5배 이상의 수율을 가진다.Recombinant Lumburokinase has the same thrombolytic ability as natural Lumburokinase and has a yield of 5 times or more than that of Lumburokinase extracted from the existing earthworm.

이하, 본 발명을 실시예에 의하여 더욱 상세히 기술하고자 한다. 하기 실시예는 본 발명을 구체적으로 설명하는 것으로, 하기 실시예에 의해 본 발명의 범위가 제한되지 않는다.Hereinafter, the present invention will be described in more detail with reference to Examples. The following examples illustrate the present invention in detail, and the scope of the present invention is not limited by the following examples.

[실시예 1]Example 1

지렁이로부터 룸부로키나제의 순수 분리 및 룸부로키나제의 아미노산서열결정Pure Separation of Lumburokinase from Earthworm and Determination of Amino Acid Sequences of Lumburokinase

(1) 지렁이에서 룸부로키나제 단백질 분리 및 정제(1) Isolation and Purification of Lumburokinase Protein from Earthworms

① 지렁이 추출액 획득① Acquisition of earthworm extract

살아있는 지렁이 3 kg을 수돗물로 깨끗이 씻고 4배 부피의 TBS (10 mM 트리스, 150 mM 염화나트륨, pH 7.4)에 넣고 믹서기로 마쇄시켰다. 이를 상온에서 4일간 교반한 후 12,000 g에서 30분간 4 ℃에서 원심 분리하여 상등액을 취하였다.3 kg of live earthworms were washed with tap water and placed in four volumes of TBS (10 mM Tris, 150 mM sodium chloride, pH 7.4) and ground with a blender. After stirring for 4 days at room temperature, the supernatant was taken by centrifugation at 12,000 g for 30 minutes at 4 ℃.

② 열처리② heat treatment

상기 ①의 상등액에 대하여 60 ℃에서 1시간 동안 열처리하고 12000 g에서 30분간 4℃로 원심 분리하였다. 상등액을 취해 0 ℃에서 0-30 (w/v)의 암모늄 설페이트를 서서히 첨가한 후 원심 분리하고 침전물은 50 mM 트리스 완충용액(pH 8.0)으로 현탁하여 보관하였다. 상등액을 다시 0 ℃에서 30-60 (w/v)의 암모늄 설페이트를 서서히 첨가한 후 원심 분리하여 상등액은 버리고 침전물은 먼저 생긴 침전물과 합쳤다. 이 침전물 현탁액을 50 mM 트리스(pH 8.0) 완충용액으로 투석하였다.The supernatant of ① was heat-treated at 60 ° C. for 1 hour and centrifuged at 12000 g for 30 minutes at 4 ° C. The supernatant was taken and 0-30 (w / v) ammonium sulfate was added slowly at 0 ° C., then centrifuged, and the precipitate was stored suspended in 50 mM Tris buffer (pH 8.0). The supernatant was again slowly added 30-60 (w / v) ammonium sulphate at 0 ° C. and then centrifuged to discard the supernatant and the precipitate combined with the first precipitate. This precipitate suspension was dialyzed with 50 mM Tris pH 8.0 buffer.

③ 음이온 교환 컬럼 수행③ Perform anion exchange column

투석이 끝난 단백질 혼합액을 디에틸아미노에틸 세파덱스 A25컬럼(DEAE-Sephadex A25 column; 5 cm × 100 cm; 너비×길이)에 주입한 후 20 mM 트리스 완충용액(pH 8.0)으로 씻어주었다. 컬럼에 0 - 500 mM 염화나트륨을 직선 구배농도로 분당 3 ㎖ 흘려주면서 8 ㎖씩 분획을 받아 피브린 평판배지(Astrup, T., and Mullertz, S., 1952. Arch Biochem Biophys, 40, 346-351)에 분획의 10 ㎕를 떨어뜨렸다. 평판배지는 37 ℃에서 2시간 반응시킨 후 피브린분해 활성도(fibrinolytic activity)를 측정하였다.The dialysed protein mixture was injected into a diethylaminoethyl Sephadex A25 column (DEAE-Sephadex A25 column; 5 cm x 100 cm; width x length) and washed with 20 mM Tris buffer (pH 8.0). Receive fractions of 8 ml by flowing 3 ml per minute in a linear gradient of 0-500 mM sodium chloride to the column. 10 μl of the fraction was dropped into fibrin plate media (Astrup, T., and Mullertz, S., 1952. Arch Biochem Biophys, 40, 346-351). Plate medium was measured for 2 hours at 37 ℃ fibrinolytic activity (fibrinolytic activity).

④ 친화성 컬럼 수행(affinity column)④ Affinity column

상기 ③의 피브린 활성도가 높은 부분의 분획들을 모아 ρ-아미노벤즈아미딘 세파로즈 6B 컬럼(ρ-aminobenzamidine Sepharose 6B column ; 2.5 cm ×10 cm; 너비 ×길이)에 주입한 후 pH 8.0의 20 mM 트리스 완충용액으로 세척하였다. 용출 완충용액(500 mM 알지닌, 20 mM 소듐아세테이트, pH 5.0)을 유속 1 ㎖/min으로 흘려주면서 1 ㎖씩 분획을 받아 피브린 평판배지에 분획의 5 ㎕를 떨어뜨렸다. 그 후 37 ℃에서 1시간 반응시킨 후 피브린분해 활성(fibrinolytic activity)을 측정하였다. 측정 결과를 토대로 하여 높은 활성을 갖는 분획들을 모아 pH 8.0의 50 mM 트리스 완충용액으로 투석하고 센트리프렙(centriprep : Amicon, USA)으로 농축시켜 룸부로키나제를 획득하였다.The fractions of the high fibrin activity of ③ are collected and injected into a ρ-aminobenzamidine Sepharose 6B column (2.5 cm x 10 cm; width x length) and then 20 mM Tris at pH 8.0. Wash with buffer. The elution buffer (500 mM arginine, 20 mM sodium acetate, pH 5.0) was flowed at a flow rate of 1 ml / min, and fractions were collected in 1 ml portions, and 5 µl of the fraction was dropped on the fibrin plate medium. After the reaction for 1 hour at 37 ℃ fibrinolytic activity (fibrinolytic activity) was measured. Based on the measurement results, the fractions with high activity were collected, dialyzed with 50 mM Tris buffer solution at pH 8.0, and concentrated with centriprep (Amicon, USA) to obtain lumpurokinase.

(2) 아미노산 서열 분석(2) amino acid sequence analysis

분리된 룸부로키나제를 SDS-PAGE에 전기영동으로 변성시키고 코마시 브릴리언트 블루(Coomassie brilliant blue)로 염색을 하여 룸부로키나제의 위치를 확인한 후, 룸부로키나제 부위의 겔을 잘라 전기 용출기(electro-eluter : Bio-Rad)를 사용하여 단백질을 용출 시켰다. 변성된 룸부로키나제 용액에 활성 룸부로키나제 또는 엔도프로테나제 Lys-C를 첨가하여 37 ℃에서 반응시키면서 0분, 10분, 30분, 2시간, 6시간, 18시간마다 소량을 취해 0.4 부피 배의 SDS-PAGE 시료 완충용액을 첨가함으로써 반응을 중지시켰다. 각 시간별로 취한 시료들을 SDS-PAGE로 전기영동하고 잘려진 펩타이드들의 양상들 중 가장 반응이 잘된 시간을 택하여 같은 방법으로 대량 반응시킨 후 SDS-PAGE를 수행하였다. 분획된 펩타이드들을 전기블롯 완충용액(10 mM 3-[사이크로헥실아미노]-1-프로판설포닉 산(CAPS), pH 11, 10 (v/v) 메탄올)상에서 겔로부터 폴리비니덴 디플루로리드(PVDF : polyvinyidene difluoride)막으로 90분간 300 mA로 이동시킨 후 밴드의 위치를 알 수 있도록 염색하였다. 각 염색되어진 밴드의 아미노산 서열 분석은 한국 기초과학 지원 연구소에서 수행하였다. 새로운 룸부로키나제의 아미노산 서열은 서열목록작성 소프트웨어로 서열번호 1로 염기서열은 서열번호 2로 작성하였다.The derivatized rumburokinase was denatured by electrophoresis on SDS-PAGE and stained with Coomassie brilliant blue to confirm the position of the rumburokinase, and then the gel of the rumburokinase site was cut and electrolyzed. -eluter: Bio-Rad) was used to elute the protein. 0.4 ml volume was added every 0 min, 10 min, 30 min, 2 h, 6 h, 18 h while reacting at 37 DEG C with the addition of active Lumburokinase or endoproteinase Lys-C to the denatured lumburokinase solution. The reaction was stopped by adding pear SDS-PAGE sample buffer. SDS-PAGE was performed by mass-reacting the samples taken at each time by electrophoresis on SDS-PAGE and mass-reacting in the same manner by selecting the most responsive time among the cut peptides. Fractionated peptides were polyvinidene diflurolide from gels in electroblot buffer (10 mM 3- [cyclohexylamino] -1-propanesulphonic acid (CAPS), pH 11, 10 (v / v) methanol). (PVDF: polyvinyidene difluoride) membrane was moved to 300 mA for 90 minutes and stained to determine the position of the band. Amino acid sequence analysis of each stained band was performed by the Korea Basic Science Institute. The amino acid sequence of the new rumbaurokinase was prepared by SEQ ID NO: 1 and the base sequence was SEQ ID NO: 2.

도 1에서 새로운 룸부로키나제(LK-Ⅲ-2)와 기존의 룸부로키나제(LK-Ⅲ-1, LK-1T4)들의 아미노산의 서열을 비교하여 도시하였다. 룸부로키나제Ⅲ-2는 룸부로키나제Ⅲ-1과 큰 차이를 보이나, 룸부로키나제1T4와는 역상으로 표시한 4개의 아미노산만이 불일치되고 모두 동일하였다.In FIG. 1, the sequences of amino acids of the new lumpurokinase (LK-III-2) and the existing lumpurokinases (LK-III-1 and LK-1T4) are compared. Although Lumburokinase III-2 showed a large difference from Lumburokinase III-1, only 4 amino acids which were displayed in reverse phase with Lumburokinase 1T4 were inconsistent and all were identical.

[실시예 2]Example 2

룸부로키나제 단백질의 cDNA 라이브러리 제조와 룸부로키나제 유전자 스크리닝Preparation of cDNA Library of Lumburokinase Protein and Screening of Lumburokinase Gene

(1) 지렁이의 cDNA 라이브러리 제조(1) Preparation of Earthworm cDNA Library

① 지렁이의 RNA 추출① RNA extraction of earthworm

살아있는 지렁이를 수돗물로 깨끗이 씻고 24시간 동안 물만 주어 장 속의 노폐물을 배설시킨 후 노폐물은 증류수로 제거하고 지렁이를 액체질소로 얼려 -80 ℃에 보관하였다. 얼어있는 지렁이를 막자사발에 놓고 간헐적으로 액체질소를 첨가하며 가루가 될 때까지 곱게 갈아 지렁이 가루 100 ㎕를 튜브에 넣고 1 ㎖의 울트라스펙 II RNA시약(Ultraspec II RNA Reagent??)을 첨가하여 완전히 녹였다. 얼음에서 5분 동안 반응시킨 후 0.2 ㎖의 클로로포름을 첨가하여 완전히 섞어주고, 다시 얼음에서 5분 동안 반응시켰다. 12,000 g에서 15분 동안 4 ℃로 원심 분리하여상등액을 회수하고 상등액의 0.5 부피 배의 이소프로판울과 0.05 부피 배의 울트라스펙 II RNA시약을 첨가하여 잘 혼합하였다. 상기 혼합액을 원심분리 하여 상등액을 제거하고 70 에탄올로 RNA 펠렛을(pellet) 두 번 세척한 후, 펠렛을 말린다. RNA 펠렛은 디에틸 피로카르보나트(DEPC : diethyl pyrocarbonate)가 혼합된 증류수 50 ㎕로 녹인 다음 다시 원심 분리하여 상등액만을 취하고, 65 ℃에서 5분 동안 반응시킨 후 바로 얼음에 넣어 RNA가 2차 구조를 형성하지 않도록 하였다. 여기에 동량의 2 ×컬럼주입 완충용액(40 mM 트리스, 1 M 리튬클로라이드, 2 mM EDTA, 0.2 (w/v) SDS, pH 7.6)을 첨가하여 RNA 시료를 준비하였다.The live earthworms were washed with tap water, and only 24 hours of water was used to excrete the wastes in the intestine. The wastes were removed with distilled water and the earthworms were frozen in liquid nitrogen and stored at -80 ℃. Place the frozen earthworm in a mortar and pestle, add liquid nitrogen intermittently, grind finely until it becomes powder, add 100 μl of earthworm powder to the tube, add 1 ml of Ultraspec II RNA Reagent ?? Melted. After 5 minutes of reaction on ice, 0.2 ml of chloroform was added to the mixture, and the mixture was reacted for 5 minutes on ice. The supernatant was recovered by centrifugation at 12,000 g for 15 minutes at 4 ° C. and mixed well by adding 0.5 volume of isopropanol and 0.05 volume of Ultraspec II RNA reagent to the supernatant. The mixture was centrifuged to remove the supernatant, washed twice with 70 ethanol RNA pellets, and dried. The RNA pellet was dissolved in 50 µl of distilled water mixed with diethyl pyrocarbonate (DEPC) and centrifuged again to take only the supernatant. After reacting for 5 minutes at 65 ° C, RNA was immediately added to the secondary structure. Was not formed. An RNA sample was prepared by adding the same amount of 2 × column injection buffer (40 mM Tris, 1 M lithium chloride, 2 mM EDTA, 0.2 (w / v) SDS, pH 7.6).

② 올리고 dT 컬럼(oligo dT column) 준비② Preparation of oligo dT column

0.1 g의 올리고 dT 셀룰루즈 파우더를 5 ㎖의 0.1 N 수산화나트륨에 넣어 4 ℃에서 12시간 동안 활성화시켰다. 유리솜으로 끝을 막은 파스테르 피펫에 올리고 dT 셀룰루즈를 고정한 후 1 ㎖의 0.1 N 수산화나트륨, 5 ㎖의 디에틸 피로카르보나트가 혼합된 증류수, 그리고 5 ㎖의 1 ×컬럼 주입 완충용액으로 차례대로 세척하여 평형화시켰다.0.1 g of oligo dT cellulose powder was added to 5 ml of 0.1 N sodium hydroxide and activated at 4 ° C. for 12 hours. Oligo dT cellulose was fixed in the finished pipette pipette with glass wool, followed by distilled water mixed with 1 ml of 0.1 N sodium hydroxide, 5 ml of diethyl pyrocarbonat, and 5 ml of 1 × column injection buffer. Wash and equilibrate.

③ mRNA 분리③ mRNA isolation

상기 ①의 RNA 시료를 상기 ②의 컬럼에 주입하고 10 ㎖의 1 ×컬럼주입 완충용액으로 세척하였다. 또한 상기 RNA 시료를 3 ㎖의 용출 완충용액(10 mM 트리스, 1 mM EDTA, 0.05 SDS, pH 7.6)으로 용출시키면서 260 nm에서 흡광도를 측정하여, mRNA가 포함되어 있는 분획을 모았다. 분획은 페놀 익스트렉션한 후 에탄올로 침전시켜 최종적으로 45 ㎕의 용액에 농축시켜 mRNA를 획득하였다.The RNA sample of ① was injected into the column of ② and washed with 10 ml of 1 × column injection buffer. In addition, the RNA sample was eluted with 3 ml of elution buffer (10 mM Tris, 1 mM EDTA, 0.05 SDS, pH 7.6) and the absorbance was measured at 260 nm to collect the fraction containing mRNA. Fractions were phenol extracted, precipitated with ethanol and finally concentrated to 45 μl of solution to obtain mRNA.

④ cDNA 합성④ cDNA synthesis

일차 가닥(1st-strand) cDNA와 이차 가닥(2nd-strand) cDNA은 다음과 같은 방법을 통하여 합성하였다. 상기 ③의 mRNA 용액 15 ㎕에 80 ℃에서 5분 동안 열을 가한 후 얼음에서 5분 동안 방치하였다. 여기에 올리고 dT 프라이머, dNTPs, RNase 저해제(inhibitor)와 뮤린 역 전사효소(murine reverse transcriptase)를 첨가한 후 37 ℃에서 2시간 동안 반응시켜 mRNA를 주형으로 한 일차 cDNA가닥을 합성하였다. 합성된 일차 cDNA가닥 반응물에 RNase H와 대장균 DNA 중합효소I, [α-32P] dCTP를 첨가하여 16 ℃에서 5시간 동안 반응시킨 후 대장균 DNA 접합효소와 T4 박테리오파지 폴리뉴클레오티드 카이네이즈를 첨가하고, 상온에서 30분지나 pH 8.0의 EDTA를 넣어 최종적으로 이중 가닥의 cDNA를 합성하였다. 이중 가닥의 cDNA는 페놀 익스트렉션한 후 에탄올로 침전시켜 60 ㎕의 TE 완충용액으로 현탁시켰다.The primary strand (1 st -strand) cDNA and the secondary strand (2 nd -strand) cDNA were synthesized by the following method. 15 μl of the mRNA solution of ③ was heated at 80 ° C. for 5 minutes and then left on ice for 5 minutes. The oligo dT primers, dNTPs, RNase inhibitors and murine reverse transcriptase were added thereto, and then reacted at 37 ° C. for 2 hours to synthesize primary cDNA strands containing mRNA. RNase H, E. coli DNA polymerase I, and [α- 32 P] dCTP were added to the synthesized primary cDNA strand reactant at 16 ° C. for 5 hours, followed by addition of E. coli DNA conjugated enzyme and T4 bacteriophage polynucleotide kinase. In 30 minutes or at pH 8.0 was added EDTA finally synthesized double stranded cDNA. Double stranded cDNA was phenol extracted and then precipitated with ethanol and suspended in 60 μl of TE buffer.

이중가닥 cDNA의 수선과 메틸화를 위하여 60 ㎕의 이중가닥 cDNA 에 S-아데노실-L-메티오닌(S-adenosyl-L-methionine)과 EcoRI-메틸레이즈를 첨가하고 37 ℃에서 1시간 동안 반응시킨 후 68 ℃에서 15분 동안 열처리하였다. 이것을 페놀 익스트렉션한 후 에탄올로 침전시켜 최종 29 ㎕의 TE 완충용액으로 현탁시켰다. 상기 현탁액에 68 ℃에서 5분 동안 열을 가하고 37 ℃로 식힌 후, dNTPs와 박테리오파지 T4 중합효소를 첨가하여 37 ℃에서 30분 동안 반응시켰다. 이어 EDTA로 반응을 중지시키고 페놀 익스트렉션한 후 에탄올로 침전하여 cDNA를 13 ㎕의 10 mM 트리스 완충용액으로 현탁하였다.For repair and methylation of double-stranded cDNA, S-adenosyl-L-methionine and EcoRI-methylase were added to 60 μl of double-stranded cDNA and reacted at 37 ° C. for 1 hour. Heat treated at 68 ° C. for 15 minutes. It was phenol extracted and precipitated with ethanol and suspended in final 29 μl of TE buffer. The suspension was heated at 68 ° C. for 5 minutes, cooled to 37 ° C., and then reacted at 37 ° C. for 30 minutes by adding dNTPs and bacteriophage T4 polymerase. The reaction was then stopped with EDTA, phenol extracted and precipitated with ethanol to suspend cDNA with 13 μl of 10 mM Tris buffer.

⑤ 룸부로키나제 cDNA 라이브러리 제조⑤ Preparation of Lumburokinase cDNA Library

상기 ④의 cDNA에 EcoRI 린커(linker)를 접합시켰다. 13 ㎕의 cDNA 용액에 하기 반응물을 혼합하여 16 ℃에서 12시간동안 반응시켰다.EcoRI linker was conjugated to cDNA of ④ above. The following reaction mixture was mixed with 13 μl of cDNA solution and reacted at 16 ° C. for 12 hours.

10 ×접합효소 완충용액10 × Conjugate Enzyme Buffer 2 ㎕2 μl 500 ng/㎕ EcoRI 린커(linker)500 ng / μl EcoRI linker 2 ㎕2 μl 1 U/㎕ T4 DNA 접합효소1 U / μl T4 DNA Conjugase 1 ㎕1 μl 10 mM ATP10 mM ATP 2 ㎕2 μl

상기 반응물의 0.5 ㎕는 새 튜브에 옮겨 놓고, 반응물의 19.5 ㎕는 68 ℃에서 15분 동안 열처리하여 반응을 중지시키고 얼음에 5분 동안 방치한 후 하기의 용액들을 혼합하여 37 ℃에서 2시간 동안 반응시켰다.0.5 μl of the reactant was transferred to a new tube, and 19.5 μl of the reactant was heat treated at 68 ° C. for 15 minutes to stop the reaction, and allowed to stand on ice for 5 minutes, followed by mixing the following solutions for 2 hours at 37 ° C. I was.

10 ×EcoRI 완충용액 (H)10 × EcoRI buffer (H) 20 ㎕20 μl 12 U/㎕ EcoRI12 U / μl EcoRI 2 ㎕2 μl 멸균수Sterile water 150 ㎕150 μl

반응이 끝나고 EcoRI의 절편이 형성된 cDNA를 정제하여 20 ㎕, 10 mM 트리스 완충용액으로 현탁시켰다.After completion of the reaction, the cDNA in which the EcoRI fragment was formed was purified and suspended in 20 µl, 10 mM Tris buffer.

상기 cDNA를 람다 박테리오파지에 클로닝하기 위하여 람다 박테리오파지의 프리지/쏘 추출액(freeze /thaw extract)을 -80℃에서 꺼내 녹인 후 4 ㎕의 cDNA를 첨가하여 얼음에 방치하고 소닉 익스트렉트(sonic extract) 15 ㎕를 더 첨가하여 섞은 뒤 상온에서 2시간 동안 반응시켰다. 여기에 500 ㎕의 SM 완충용액 (50 mM 트리스, 100 mM 염화나트륨, 8 mM 황하마그네슘, 0.1 (w/v) 겔라틴, pH 7.5)과 20 ㎕의 클로로포름을 첨가하고 30초 동안 원심 분리한 후 상등액을 취하여 4 ℃에 보관하였다.To clone the cDNA into lambda bacteriophage, freeze / thaw extract of lambda bacteriophage was removed at -80 ° C, dissolved, and 4 µl of cDNA was added to the ice and left on ice and sonic extract. 15 μl was further added and mixed, followed by reaction at room temperature for 2 hours. To this was added 500 μl of SM buffer (50 mM Tris, 100 mM sodium chloride, 8 mM magnesium sulfide, 0.1 (w / v) gelatin, pH 7.5) and 20 μl of chloroform, followed by centrifugation for 30 seconds, and then the supernatant. Was taken and stored at 4 ° C.

⑥ cDNA library의 적정(titration)과 증폭⑥ titration and amplification of cDNA library

6개의 배양관에 200 ㎕의 대장균(Y1090, A600=0.5)을 넣고 각 튜브에 cDNA 라이브러리를 1/10∼1/106로 희석한 용액을 20 ㎕ 씩 첨가하여 3 7 ℃에서 15분 동안 배양하였다. 5 ㎖의 NZY 위층 아가(50 ℃, 1 /v) NZ 아민(카세인 하이드로리세이트), 0.5 (w/v) 효모추출액, 0.5 (w/v) 염화나트륨, 0.2 (w/v) 수화황하마그네슘, 0.7 (w/v) 한천)를 튜브에 첨가하고, IPTG와 X-gal의 최종 농도가 각각 1.5 mM, 1.2 mM이 되도록 혼합한 후 밑층 1.5 (w/v) NZY 한천 평판배지 위에 도말하였다. 위층 한천배지가 굳은 뒤 37 ℃에서 8시간 동안 배양하고 콜로니 색상을 분석하여 플라그 형성 단위를 적정하였다. 적정에 의거하여 2 ×104pfu/20 ㎕ 와 200 ㎕의 대장균 배양액(A600=0.5)을 배양관에 섞어 37 ℃에서 15분 동안 배양한 후 5 ㎖의 NZY 위층 한천배지를 첨가하여 NZY 밑층 한천 평판배지에 도말하였다. 37 ℃에서 4시간 동안 배양 후 플라그가 나타나면 3 ㎖의 SM 완충용액을 평판배지에 부어 박테리오파지가 평판배지에서 나와 SM 완충용액으로 혼합되도록 4 ℃에서 12시간 반응시켰다. 박테리아파지가 혼합된 SM 완충용액을 모아 50 ㎕의 클로로포름을 첨가하고 30초 동안 원심 분리하여 상등액을 4 ℃에 보관하였다.Put 200 μl of E. coli (Y1090, A 600 = 0.5) into 6 culture tubes and add 20 μl of the solution diluted 1/10 to 1/10 6 of the cDNA library to each tube for 15 minutes at 3 7 ℃. Incubated. 5 ml NZY upper layer agar (50 ° C., 1 / v) NZ amine (casein hydrolysate), 0.5 (w / v) yeast extract, 0.5 (w / v) sodium chloride, 0.2 (w / v) magnesium hydride, 0.7 (w / v) agar) was added to the tube, mixed with IPTG and X-gal so that the final concentrations were 1.5 mM and 1.2 mM, respectively, and then plated on the lower 1.5 (w / v) NZY agar plate medium. After the upper agar medium was hardened, the cells were incubated at 37 ° C. for 8 hours and the colony color was analyzed to titrate plaque forming units. Based on the titration, 2 × 10 4 pfu / 20 μl and 200 μl of E. coli culture (A 600 = 0.5) were mixed in a culture tube and incubated at 37 ° C. for 15 minutes, followed by the addition of 5 ml of NZY upper layer agar medium. Plated on agar plate. After incubation for 4 hours at 37 ℃, when plaque appeared 3 ml of SM buffer solution was poured into the plate medium and reacted for 12 hours at 4 ℃ so that the bacteriophage out of the plate medium and mixed with the SM buffer solution. SM buffer solution mixed with bacterial phage was collected, 50 μl of chloroform was added, and the supernatant was stored at 4 ° C. by centrifugation for 30 seconds.

(2) cDNA 라이브러리로부터 룸부로키나제 유전자 스크리닝(2) Screening of rumbaurokinase genes from cDNA libraries

cDNA 라이브러리로부터 룸부로키나제 유전자를 스크리닝하기 위하여 룸부로키나제 단백질을 탐침할 수 있는 항-룸부로키나제를 제조하였다.An anti-lumburokinase was prepared that can probe the rumbaurokinase protein for screening the rumbaurokinase gene from the cDNA library.

① 항-룸부로키나제의 혈청 생산① Serum Production of Anti-Lumburokinase

실시예 1에서 정제된 룸부로키나제를 SDS-PAGE상에서 분획하고 룸부로키나제(34 kDa)부분의 겔을 잘게 자른 후 동량의 프레운드 어드쥬번트(Freund's adjuvant)를 하기의 용액과 같이 섞었다.The lumpurokinase purified in Example 1 was fractionated on SDS-PAGE, the gel of lumpurokinase (34 kDa) was chopped and the same amount of Freund's adjuvant was mixed with the following solution.

1차 주사용 : 완전체 어드쥬번트(Complete adjuvant)1st injection: Complete adjuvant

2차-4차 주사용 : 불완전체 어드쥬번트(Incomplete adjuvant)2nd-4th injections: Incomplete adjuvant

구멍이 작은 주사기로 상기의 혼합물을 5회 통과시켜 최대한 잘게 부수고 하기 날짜와 같이 실험용 흰 쥐(ICR strain) 한 마리당 50 ㎍의 룸부로키나제를 주사하였다.The mixture was pulverized as fine as possible by passing the mixture five times with a small pore syringe, and 50 μg of rumbaurokinase was injected per experimental white rat (ICR strain) as described below.

2차 주사 : 1차 주사 후 15일째Second injection: 15 days after first injection

3차 주사 : 2차 주사 후 15일째3rd injection: 15 days after 2nd injection

4차 주사 : 3차 주사 후 10일째4 th injection: 10 days after 3 th injection

혈액채취는 4차 주사 후 5일째 되는 날 심장채혈법으로 채혈하여 혈액은 상온에서 10분 동안 방치한 후 12,000 g로 15분간 원심분리하고, 상등액을 새로운 튜브에 옮겨 -80 ℃에 보관하였다.Blood was collected by cardiac collection on the fifth day after the fourth injection. Blood was left at room temperature for 10 minutes, then centrifuged at 12,000 g for 15 minutes, and the supernatant was transferred to a new tube and stored at -80 ° C.

② cDNA 라이브러리에서 룸부로키나제 유전자 스크리닝② Screening of Lumburokinase Genes in cDNA Libraries

ⅰ) 일차 스크리닝Iii) primary screening

cDNA 라이브러리를 한천 평판배지 한 개당 2 ×104플라그가 나타나도록 대장균에 감염시키고 37 ℃에서 배양하였다. 직경이 1 ㎜ 정도의 플라그가 보일 때 10 mM IPTG 용액에 적신 후 말린 나이트로 셀룰루즈 막을 배지위에 덮고 37 ℃에서 12시간 배양하였다. 잉크로 막과 한천배지에 동일한 위치를 표시한 후 막을 블로킹 완충용액 (10 mM 트리스, 150 mM 염화나트륨, 0.05 트윈-20, 0.2 보바인 시럼 알부민, pH 7.4)으로 세척하고 항-룸부로키나제 혈청을 블로킹 완충용액에 1/5000으로 희석시킨 일차 항체용액에서 12시간 일차 반응시켰다. 다시 막을 블로킹 완충용액으로 세척하고, 항-마우스 면역단백질-G 알칼린 포스포테즈 컨쥬게트(anti-mouse IgG alkaline phosphotase(AP)-conjugate)가 1/3000으로 희석된 블로킹 완충용액에서 90분 동안 이차 반응시켰다. 이차 항체 반응까지 수행한 막은 발색용액에서 5-10분 동안 발색 반응시킴으로써 막상에서 진한 보라색으로 발색반응을 나타내는 양성 플라그 부분을 한천 평판배지와 대조하여 그 부분의 한천배지를 파낸 후 1 ㎖의 SM 완충용액와 50 ㎕의 클로로포름이 들어있는 튜브에 넣고 4 ℃에 보관하였다.The cDNA library was infected with E. coli and cultured at 37 ° C. to show 2 × 10 4 plaques per agar plate medium. When plaques with a diameter of about 1 mm were seen, they were soaked in 10 mM IPTG solution and dried with cellulose membranes on the medium and incubated at 37 ° C. for 12 hours. Mark the same location on the membrane and agar medium with ink, then wash the membrane with blocking buffer (10 mM Tris, 150 mM sodium chloride, 0.05 Tween-20, 0.2 bovine syrum albumin, pH 7.4) and wash the anti-lumburokinase serum. Primary reaction was carried out for 12 hours in primary antibody solution diluted to 1/5000 in blocking buffer solution. The membrane was again washed with blocking buffer and 90 minutes in blocking buffer diluted anti-mouse IgG alkaline phosphotase (AP) -conjugate with 1/3000 dilution. The reaction was secondary. Membranes that have undergone secondary antibody reaction are colored for 5-10 minutes in a color solution, and the positive plaque portion, which develops dark purple on the membrane, is dug up against the agar plate in agar, and then 1 ml of SM buffer The solution was placed in a tube containing 50 μl of chloroform and stored at 4 ° C.

ⅱ) 2,3,4차 스크리닝Ii) 2nd, 3rd and 4th screening

2차, 3차, 4차 스크리닝은 각각 전 단계 스크리닝에서 얻은 양성 플라그가 포함된 SM 완충용액을 1/100-1/1000으로 희석하여 1차와 같은 방법으로 양성 플라그를 스크리닝하고, 최종적으로 하나의 플라그로부터 유래된 모든 플라그들이 양성으로 나타날 때까지 수행하여 총 8개의 양성 플라그를 찾았다.In the 2nd, 3rd, and 4th screening, SM buffer containing positive plaques obtained in the previous step screening was diluted to 1 / 100-1 / 1000, respectively, to screen positive plaques in the same manner as in the first step. A total of eight positive plaques were found by performing until all the plaques derived from the plaques showed positive.

(2) 룸부로키나제의 염기서열 결정(2) Determination of Base Sequence of Lumburokinase

① λDNA 준비① λ DNA Preparation

8개의 양성 플라그 배양액과 숙주 박테리아 배양액을 1:400부피 비율로 37 ℃에서 15분 동안 배양 후 80 ㎖의 L-mal-mag-배지(1 트립톤, 0.5 효모추출액, 0.5 염화나트륨, 8 mM 수화황하마그네슘, 10 mM트리스, 0.2 말토스, pH 7.5)로 옮겨 37℃에서 3시간 배양하였다. 배양액이 맑아지면서 세포 찌꺼기가 생긴 후 50 ㎕의 클로로포름을 넣고 1시간 더 배양하여 박테리아를 완전히 분해시킨 후 DNase I(Amersham사)와 RNase A(Sigma사)를 최종 농도가 각각 175 U/㎖과 4550 U/㎖이 되게 첨가하여 1시간 더 배양하였다. 배양액에 염화나트륨을 최종 1 M 되도록 첨가하고 완전히 녹여 얼음에서 1시간 동안 방치한 후, 12,000 g에서 15분간 4 ℃로 원심 분리하여 형성된 상등액을 새 튜브에 옮겼다. 상등액에 폴리에틸렌 글리콜(PEG: Polyethylene glycol #8000)을 최종 0.1 g/㎖ 되게 첨가하고 완전히 녹여 얼음에서 2시간 동안 방치한 후 원심 분리하여 상등액은 버리고 1 ㎖의 SM 완충용액으로 침전물을 완전히 용해시켰다. 용해물을 500 ㎕씩 튜브에 옮겨 클로로포름으로 폴리에틸렌 글리콜을 침전시킨 후 상등액을 취하였다. EDTA, SDS, 프로테이즈 K를 각각 최종 농도가 25 mM, 0.32 (w/v), 0.26 ㎎/㎖ 되게 상등액에 첨가한 후 65 ℃에서 30분 동안 반응시켜 캡시드 단백질을 분해하였다. 마지막으로 상등액에 페놀 익스트렉션, 이소프로판올, 에탄올 침전과정을 수행하여 최종 40 ㎕의 TE 완충용액으로 람다 DNA를 용해시켰다. 이와 같은 방법으로 양성 플라그에서 8개의 람다 DNA를 획득하였다.Eight positive plaque cultures and host bacterial cultures were cultured in a 1: 400 volume ratio at 37 ° C. for 15 minutes, followed by 80 ml of L-mal-mag-medium (1 tryptone, 0.5 yeast extract, 0.5 sodium chloride, under 8 mM hydration). Magnesium, 10 mM tris, 0.2 maltose, pH 7.5) and incubated at 37 ° C. for 3 hours. After the cell was cleared, cell debris formed, 50 μl of chloroform was added and incubated for 1 hour to completely decompose the bacteria. U / mL was added and incubated for 1 hour. Sodium chloride was added to the culture solution to the final 1 M, completely dissolved and left for 1 hour on ice, and then the supernatant formed by centrifugation at 12,000 g for 15 minutes at 4 ℃ was transferred to a new tube. To the supernatant, polyethylene glycol (PEG: Polyethylene glycol # 8000) was added to a final 0.1 g / ml, completely dissolved, and left for 2 hours in ice. The supernatant was discarded by centrifugation and the precipitate was completely dissolved in 1 ml of SM buffer. 500 μl of the lysate was transferred to a tube to precipitate polyethylene glycol with chloroform, and the supernatant was taken. EDTA, SDS, and Protease K were respectively added to the supernatant to a final concentration of 25 mM, 0.32 (w / v) and 0.26 mg / ml, and then reacted at 65 ° C. for 30 minutes to decompose the capsid protein. Finally, the supernatant was subjected to phenol extraction, isopropanol, and ethanol precipitation to dissolve lambda DNA in the final 40 μl of TE buffer. In this way, eight lambda DNAs were obtained from positive plaques.

② 람다(lamda) DNA의 형질전환 및 서브클로닝② Transformation and subcloning of lambda DNA

획득한 8개의 람다 DNA를 EcoRI으로 절단하여 아가로즈겔 전기영동을 통해 삽입된 룸부로키나제 DNA조각을 확인하여 잘라내었다. 0.5 ㎖ 튜브에 작은 구멍을 뚫고 유리 솜으로 막은 후 룸부로키나제 DNA조각이 포함되어있는 겔 조각을 넣었다. 이 0.5 ㎖-튜브를 1.5 ㎖-튜브에 넣고 여러 회 원심분리를 하여 겔로부터 DNA를 용출시켰다. 또한 pGEM-7Zf (+)플라스미드(Promega) 또는 pGEX-5X-1 플라스미드(Pharmacia)를 EcoRI으로 절단하고 소의 장에서 추출한 알칼린 포스파테즈(CIAP : calf intestinal alkaline phospha tase)를 처리하여 셀프 접합을 방지하였다. 상기의 플라스미드와 전기영동으로 분리한 상기 룸부로키나제 DNA를 1:2의 몰 비율로 접합시켰다. 그 후 대장균(E. coliJM109)에 룸부로키나제 DNA가 접합된 플라스미드를 열 충격으로 형질도입하였다. 또한 형질 전환된 대장균을 배양하여 플라스미드를 분리하였다.The eight lambda DNAs obtained were digested with EcoRI and cut out by identifying the rumbaurokinase DNA fragment inserted through agarose gel electrophoresis. A small hole was made in a 0.5 ml tube, closed with glass wool, and a piece of gel containing Lumburokinase DNA fragment was added. The 0.5 ml tube was placed in 1.5 ml tube and centrifuged several times to elute DNA from the gel. In addition, self-conjugation was performed by cutting pGEM-7Zf (+) plasmid (Promega) or pGEX-5X-1 plasmid (Pharmacia) with EcoRI and treating calf intestinal alkaline phosphatase (CIAP) extracted from bovine intestine. Prevented. The plasmid and the lumpurokinase DNA isolated by electrophoresis were conjugated in a molar ratio of 1: 2. Subsequently, a plasmid conjugated with Lumburokinase DNA to E. coli JM109 was transduced by heat shock. In addition, the transformed E. coli was cultured to isolate the plasmid.

③ 제한효소 지도와 염기서열 분석③ Restriction Enzyme Map and Sequence Analysis

상기 ②에서 획득한 8종의 플라스미드를 NcoI (5'-ccatgg-3'), KpnI (5'-ggtacc-3'), BamHI (5'-ggatcc-3'), PstI (5'-ctgcag-3')의 4가지 제한효소로 절단하여 아가로즈젤 전기영동 상에서 나타나는 밴드들의 위치를 비교하여 각 클론들의 제한효소 지도를 결정한 후, 같은 지도를 갖는 클론들끼리 3그룹으로 묶었다. 이 각 그룹들의 지도를 유전자은행 데이타베이스(GenBank database : http://www.ncbi.nlm.nih.gov)에서 검색하여 룸부로키나제-Ⅲ-1(U25648), 룸부로키나제-1T4(U25643)와 비교하여 룸부로키나제-1T4와 가장 유사한 하나의 클론을 선택하였고, (주)바이오니아에 DNA 염기서열 분석을 의뢰하였다.The eight plasmids obtained in ② were NcoI (5'-ccatgg-3 '), KpnI (5'-ggtacc-3'), BamHI (5'-ggatcc-3 '), PstI (5'-ctgcag- The restriction enzyme maps of the clones were determined by comparing the positions of the bands on the agarose gel electrophoresis by cutting with four restriction enzymes of 3 ′), and then, the clones having the same map were grouped into three groups. The maps of these groups were retrieved from the GenBank database (http://www.ncbi.nlm.nih.gov) to find out Lumburokinase-III-1 (U25648) and Lumburokinase-1T4 (U25643). Compared with, one clone most similar to rumbaurokinase-1T4 was selected, and DNA sequence analysis was commissioned to Bioneer Co., Ltd.

획득한 염기서열은 DNATRANS 프로그램(Genome Center/KRIBB, http://genome.kribb.re.kr)을 사용하여 아미노산 서열로 전환하였고, 각각의 염기서열 또는 아미노산 서열들을 비교하기 위하여 CLUSTA-W 프로그램(Genome Center/KRIBB, http://genome. kribb.re.kr)을 사용하였다.The obtained nucleotide sequences were converted into amino acid sequences using the DNATRANS program (Genome Center / KRIBB, http://genome.kribb.re.kr), and the CLUSTA-W program (CLUSTA-W program) was used to compare the respective nucleotide sequences or amino acid sequences. Genome Center / KRIBB, http://genome.kribb.re.kr).

도 2에 룸부로키나제(LK-Ⅲ-2)의 염기서열을 룸부로키나제-1T4와 비교하였다. 룸부로키나제(LK-Ⅲ-2)는 룸부로키나제-1T4와 아미노산 서열의 유사성이 높았다. 역상표시는 아미노산 서열이 다른 것을 표시한 것이다.In FIG. 2, the nucleotide sequence of rumbaurokinase (LK-III-2) was compared with rumbaurokinase-1T4. Lumburokinase (LK-III-2) had a high similarity between Lumburokinase-1T4 and the amino acid sequence. Reversed display indicates that the amino acid sequence is different.

[실시예 3]Example 3

재조합 벡터제조와 재조합 룸부로키나제의 대량발현Recombinant Vector Production and Mass Expression of Recombinant Lumburokinase

① 재조합 벡터 pPIC9K/LK 플라스미드 제조① Preparation of recombinant vector pPIC9K / LK plasmid

도 3에서 도시한 바와 같이 실시예 2에서 제조한 pGEM-7Zf/LK 플라스미드내의 룸부로키나제Ⅲ-2 유전자를 AvrII 제한 효소로 분리시킨 후 SnaBI과 AvrII제한 효소로 잘린 pPIC9K 벡터에 접합시켜(ligation) pPIC9K/LK를 제조하였다.As shown in FIG. 3, the Lumburokinase III-2 gene in the pGEM-7Zf / LK plasmid prepared in Example 2 was isolated by AvrII restriction enzyme and then conjugated to pPIC9K vector cut by SnaBI and AvrII restriction enzyme. pPIC9K / LK was prepared.

② pPIC9K/LK 벡터의 피키아 파스토리스로의 형질전환② Transformation of pPIC9K / LK vector into Pichia pastoris

pPIC9K/LK 벡터를 SalI(Promega)로 잘라 선형화시킨 뒤, 진클린 II 키트(Geneclean II kit:BIO101 comp)로 순수 정제하여 다시 멸균수로 녹였다. 이렇게 준비된 pPIC9K/LK 벡터를 인비트로겐(Invitrogen)사의 스피로플라스트(spheroplast) 제조시약 및 방법을 통해 피키아 파스토리스 GS115(his4)에 형질전환 시키는 방법은 다음과 같다. 먼저 YPD 배지에서 미드로그상태(mid-log phase)로 배양한 GS115를 수득한 후 멸균수, SED(19 ml 의 1 M 소르비탈, 25 mM EDTA(pH 8.0), 1 ml의 1 M DTT), 1 M 소르비톨로 차례로 세척한 후 20 ml의 SCE(1 M 소르비톨, 1 mM EDTA, 10 mM 소듐 사이트레이트 완충용액, pH 5.8) 완충용액에 재부유시켜 10 ml씩 두 개로 나누었다. 한 튜브는자이몰네즈(Zymolase)의 적정처리 시간을 결정하는데 사용하였다. 방법은 자이몰네즈 처리 전부터 처리 후 50분까지 5분 간격을 두고 반응시킨 샘플에 각각 800 ㎕의 5 SDS를 첨가하여 스펙트로포토미터에서 800 nm의 흡광도를 측정하였다. 그 결과에 의하여 나머지 튜브의 세포들은 7.5 ㎕의 자이몰네즈를 처리하여 약 70 스피로플라스트를 만들었다. 여기에 SalI 처리로 선형화된 pPIC9K/LK를 형질도입시켰다. SalI으로 선형화된 pPIC9K/LK는 효모 GS115(his4) genome의 his4 site에 삽입되지만, his4 플라스미드 유전자는 손상 받지 않으므로 형질전환체는 His+Mut+표현형을 나타내게 된다. 그러므로 형질 전환된 효모세포는 pPIC9K 벡터에 포함된 HIS4 유전자를 발현함으로써 HIS-평판배지 상에서 선별될 수 있다. 여기서 일차로 선별된 세포들을 배지내의 G418 설페이트농도(2.0 mg/ml, 3.0 mg/ml, 4.0 mg/ml)에 따라 세포들을 키워 선별하였다. pPIC9K 벡터에는 세균에서 유래된 카나마이신 유전자를 가지고 있으며 이 유전자는 피키아 파스토리스가 G418 설페이트 항생제에 대한 내성을 가지게 하는 역할을 한다. pPIC9K/LKIII-2 의 재조합 유전자가 피키아 파스토리스 내로 형질전환시 카나마이신 유전자도 같이 삽입되며, 다수 복사본 삽입이 되어질수록 G418 설페이트 항생제에의 높은 농도에서도 내성을 가지는 균주가 되어진다. 다수 복사본 삽입과 단백질의 발현양은 정비례관계는 아니지만 대부분 비례적인 관계를 가지고 있으며 2차 균주 선별로써 높은 G418 설페이트 항생제에 내성을 가지는 균주를 얻어 재조합 단백질의 발현양이 높은 균주를 선별하였다.The pPIC9K / LK vector was cut and linearized with SalI (Promega), purified purely with Geneclean II kit (BIO101 comp), and dissolved in sterile water. The pPIC9K / LK vector thus prepared is transformed into Pichia pastoris GS115 ( his4 ) through a reagent and method for manufacturing spirooplast ( Invitrogen ). First, obtain GS115 incubated in a mid-log phase in YPD medium, followed by sterile water, SED (19 ml of 1 M sorbitol, 25 mM EDTA (pH 8.0), 1 ml of 1 M DTT), After washing sequentially with 1 M sorbitol, it was resuspended in 20 ml of SCE (1 M sorbitol, 1 mM EDTA, 10 mM sodium citrate buffer, pH 5.8) buffer and divided into two 10 ml portions. One tube was used to determine the titration time of Zymolase. In the method, the absorbance of 800 nm was measured on a spectrophotometer by adding 800 μl of 5 SDS to the reacted samples at intervals of 5 minutes from before treatment to 50 minutes after treatment with Zymolanes. As a result, the cells of the remaining tubes were treated with 7.5 [mu] l of Zymolanes to produce about 70 spiroplasts. It was transduced with pPIC9K / LK linearized with SalI treatment. Although pPIC9K / LK linearized with SalI is inserted into the his4 site of the yeast GS115 (his4) genome, the his4 plasmid gene is not damaged and the transformant has a His + Mut + phenotype. Therefore, the transformed yeast cells can be selected on HIS - plate medium by expressing the HIS4 gene included in the pPIC9K vector. Here, the primary screened cells were selected by growing the cells according to the G418 sulfate concentration (2.0 mg / ml, 3.0 mg / ml, 4.0 mg / ml) in the medium. The pPIC9K vector contains a kanamycin gene derived from bacteria that makes Pichia pastoris resistant to G418 sulfate antibiotics. When the recombinant gene of pPIC9K / LKIII-2 is transformed into Pichia pastoris, the kanamycin gene is also inserted. As the multiple copies are inserted, the strain becomes resistant even at high concentration to G418 sulfate antibiotic. The multiple copy insertion and the expression level of the protein were not directly proportional but mostly proportional and the strains with high expression level of the recombinant protein were selected by obtaining a strain resistant to high G418 sulfate antibiotics as a secondary strain selection.

?? 피키아 파스토리스에서 재조합 룸부로키나제의 발현?? Expression of Recombinant Lumburokinase in Pichia Pastoris

G418 설페이트농도에 따라 선별된 클론을 25 ml BMGY 배지(1 박토 효모추출액, 2 펩톤, 100 mM 포타슘 포스페이트 pH 6.0, 1.24 효모 질산기, 4×10-5바이오틴, 1 글리세롤)에 각각 접종 후, 240 rpm으로 30 ℃에서 2일간 배양하였다. 원심분리로 효모세포를 모아 0.5 메탄올(Heymann, Germany)이 함유된 200 ml BMMY배지(1 박토 효모추출액, 2 펩톤, 100 mM 포타슘 포스페이트 pH 6.0, 1.24 효모 질산기, 4×10-5바이오틴)에 접종하고, 240 rpm으로 30 ℃에서 배플드 플라스크로 4일간 배양하면서 시간대별(48시간, 72시간, 96시간)로 각각 1 ml의 배양액을 수득하였다. 배양액은 원심분리하여 상층액만을 모아 다음 분석 전까지 -80 ℃로 얼려 보관하였다.Clones selected according to G418 sulfate concentration were inoculated in 25 ml BMGY medium (1 bacterium yeast extract, 2 peptone, 100 mM potassium phosphate pH 6.0, 1.24 yeast nitrate group, 4 × 10 -5 biotin, 1 glycerol), respectively, 240 Incubated at 30 ° C. for 2 days at rpm. The yeast cells were collected by centrifugation and placed in 200 ml BMMY medium (1 bacterium yeast extract, 2 peptone, 100 mM potassium phosphate pH 6.0, 1.24 yeast nitrate group, 4 × 10 -5 biotin) containing 0.5 methanol (Heymann, Germany). Inoculated and incubated for 4 days in a baffle flask at 30 ° C. at 240 rpm to obtain 1 ml of culture each time zone (48 hours, 72 hours, 96 hours). The culture was centrifuged to collect only the supernatant and stored frozen at -80 ° C until the next analysis.

도 4는 본 발명의 룸부로키나제 유전자가 형질 도입된 효모에서 발현되어지는 재조합 룸부로키나제 단백질의 발현 양상을 분석한 것이다. 상기??에서 준비한 배양액 시료 10 ㎕씩을 SDS-샘플 완충용액과 섞은 뒤, 100 ℃에서 10분간 끓여 이를 10 SDS-PAGE로 분석하였다.Figure 4 is an analysis of the expression of the recombinant rumbaurokinase protein expressed in yeast transfected with the rumbaurokinase gene of the present invention. 10 μl of the culture sample prepared above was mixed with SDS-sample buffer, and then boiled at 100 ° C. for 10 minutes, and analyzed by 10 SDS-PAGE.

1번 레인 : 분자량 표준 단백질로 위에서부터 97.4, 66.2, 45.0, 31.0, 21.0, 14.4 kDa의 분자량이다.Lane 1: Molecular weight standard protein, from above, 97.4, 66.2, 45.0, 31.0, 21.0, 14.4 kDa.

2번 레인 : 본 발명의 형질전환체를 YPD-G418 평판배지(1.0 mg/ml)에서 선별하여, BMMY 배지에 접종 후 메탄올로 24시간마다 0.5 로 유도하고 96시간 후에 상층액 10 ㎕를 전기영동한 것이고,Lane 2: The transformant of the present invention was screened in YPD-G418 plate medium (1.0 mg / ml), inoculated into BMMY medium, induced with 0.5 every 24 hours with methanol and electrophoresed with 10 μl of supernatant after 96 hours. One,

3번 레인 : 본 발명의 형질전환체를 YPD-G418 평판배지(2.0 mg/ml)에서 선별하여, BMMY 배지에 접종 후 메탄올로 24시간마다 0.5 로 유도하고 96시간 후에 상층액 10 ㎕를 전기영동한 것이고,Lane 3: The transformant of the present invention was screened in YPD-G418 plate medium (2.0 mg / ml), inoculated into BMMY medium, induced with 0.5 every 24 hours with methanol, and electrophoresis was performed 10 μl of the supernatant after 96 hours. One,

4번 레인 : 본 발명의 형질전환체를 YPD-G418 평판배지(3.0 mg/ml)에서 선별하여, BMMY 배지에 접종 후 메탄올로 24시간마다 0.5 로 유도하고 96시간 후에 상층액 10 ㎕를 전기영동한 것이고,Lane 4: The transformant of the present invention was screened in YPD-G418 plate medium (3.0 mg / ml), inoculated into BMMY medium, induced with 0.5 every 24 hours with methanol and electrophoresed 10 μl of supernatant after 96 hours. One,

5번 레인 : 본 발명의 형질전환체를 YPD-G418 평판배지(4.0 mg/ml)에서 선별하여, BMMY 배지에 접종 후 메탄올로 24시간마다 0.5 로 유도하고 96시간 후에 상층액 10 ㎕를 전기영동한 것이고,Lane 5: The transformant of the present invention was screened in YPD-G418 plate medium (4.0 mg / ml), inoculated into BMMY medium, induced with 0.5 every 24 hours with methanol and electrophoresed with 10 μl of supernatant after 96 hours. One,

도 4에서 나타난 바와 같이 룸부로키나제 단백질은 YPD 1 ml당 3 mg G418 설페이트를 포함하는 배지에서 선별한 재조합 피키아 파스토리스가 메탄올 유도 후 96시간 후에 가장 많이 발현되었다. As shown in FIG. 4, the rumbaurokinase protein was most expressed in the recombinant Pichia pastoris selected in a medium containing 3 mg G418 sulfate per ml of YPD 96 hours after methanol induction.

도 5는 지렁이에서 정제한 룸부로키나제와 발현된 재조합 룸부로키나제를 항-룸부로키나제와 웨스턴 블롯을 한 것으로 32.4 kDa에서 표지되었다.FIG. 5 is a western blot of anti-lumburokinase and recombinant lumpburokinase expressed from worms purified from earthworms and labeled at 32.4 kDa.

1번 레인 : 분자량 표준 단백질, 위에서부터 98, 64, 50, 36, 30, 16 kDa의 분자량을 갖는 단백질이고,Lane 1: molecular weight standard protein, protein from above having a molecular weight of 98, 64, 50, 36, 30, 16 kDa,

2번 레인 : 지렁이(Lumbricus rubellus)로부터 분리 정제한 룸부로키나제와 1/3,125,000으로 희석된 항-룸부로키나제를 반응시킨 것이고,Lane 2: Reaction of the purified lumpurokinase separated from the worm (Lumbricus rubellus ) with anti-lumburokinase diluted to 1 / 3,125,000,

3번 레인 :본 발명의 형질전환체를 YPD-G418 평판배지(3.0 mg/ml)에서 선별하여 배지에 배양하면서 메탄올로 24시간마다 0.5 로 유도하여 96시간 후에 상층액에 발현된 룸부로키나제와 1/125,000으로 희석된 항-룸부로키나제를 반응시킨 것이고,Lane 3: The transformant of the present invention was screened in YPD-G418 plate medium (3.0 mg / ml) and incubated in the medium, induced with 0.5 every 24 hours with methanol, and then expressed with supernatant after 96 hours. Reacted anti-lumburokinase diluted to 1 / 125,000,

4번 레인 : 본 발명의 형질전환체를 YPD-G418 평판배지(3.0 mg/ml)에서 선별하여 배지에 배양하면서 메탄올로 24시간마다 0.5 로 유도하여 48시간 후에 상층액에 발현된 룸부로키나제와 1/625,000으로 희석된 항-룸부로키나제를 반응시킨 것이다.Lane 4: The transformants of the present invention were screened in YPD-G418 plate medium (3.0 mg / ml) and incubated in the medium, induced with 0.5 every 24 hours with methanol, and then expressed with supernatant after 48 hours. Anti-lumburokinase diluted to 1 / 625,000.

도 6은 재조합 룸부로키나제Ⅲ-2 단백질의 피브린 분해 활성도를 발현 시간대 별로 분석한 것으로 배양액에 0.5 메탄올로 유도하면서 48(1), 60(2), 72(3), 96(4) 시간대에 수득한 상층액 5 ㎕씩을 피브린 평판배지에 떨어뜨려 룸부로키나제의 활성을 측정하였다. 피브린 분해능으로 확인한 결과 배양액에 메탄올을 첨가하여 96시간이 지났을때 재조합 룸부로키나제Ⅲ-2 단백질의 활성도가 가장 높았다.FIG. 6 is an analysis of fibrin degrading activity of recombinant Lumburokinase III-2 protein by expression time zone, while inducing culture into 0.5 methanol at 48 (1), 60 (2), 72 (3), and 96 (4) time zones. 5 µl each of the obtained supernatant was dropped onto a fibrin plate medium to measure the activity of rumbaurokinase. As a result of fibrin resolution, recombinant rumburokinase III-2 protein activity was highest when 96 hours of methanol was added to the culture medium.

[실시예 4]Example 4

재조합 룸부로키나제Ⅲ-2 단백질의 정제와 활성도Purification and Activity of Recombinant Lumburokinase III-2 Protein

(1) 재조합 룸부로키나제Ⅲ-2 단백질의 정제(1) Purification of Recombinant Lumburokinase III-2 Protein

본 발명의 형질전환체를 BMMY 배지에 접종 후 메탄올로 24시간마다 0.5 로 유도하고 96시간 후에 상층액을 수득하여 ρ-아미노벤즈아미딘 레진과 섞어 약 12시간 이상 교반해 주었다. 컬럼이 수직이 되도록 스텐드에 장착 후 상층액과 12시간 이상 반응한 레진을 파이펫으로 천천히 컬럼에 3 ml/min의 속도로 펙킹하였다. 펙킹이 끝난 후 20 mM 트리스-염산(pH8.0)으로 충분히 세척을 하였다. 세척 후 용출 완충용액(500 mM 알지닌, 20 mM 소듐아세테이트, pH 5.0)을 유속 1 ㎖/min으로 흘려주면서 1 ㎖씩 분획을 받아 12.5의 SDS-PAGE에서 확인하였다.After inoculating the transformant of the present invention into BMMY medium, 0.5 hours every 24 hours with methanol, and 96 hours later, the supernatant was obtained and mixed with ρ-aminobenzamidine resin and stirred for about 12 hours or more. The resin was reacted with the supernatant for at least 12 hours after mounting on the stand so that the column was vertical, and slowly packed the column at a rate of 3 ml / min with a pipette. After the completion of the packing was washed sufficiently with 20 mM tris-hydrochloric acid (pH 8.0). After washing, the elution buffer solution (500 mM arginine, 20 mM sodium acetate, pH 5.0) was flowed at a flow rate of 1 ml / min, and fractions of 1 ml were checked on SDS-PAGE of 12.5.

도 7은 순수 정제된 룸부로키나제Ⅲ-2 단백질을 SDS-PAGE에서 확인 한 것으로 50번째 분획은 95이상의 순도를 보였다.FIG. 7 shows pure purified Lumburokinase III-2 protein on SDS-PAGE. The 50th fraction showed purity of 95 or more.

1번 레인 : 분자량 표준 단백질로 위에서부터 97.4, 66.2, 45.0, 31.0, 21.0, 14.4 kDa의 분자량이고,Lane 1: Molecular weight standard protein, molecular weight of 97.4, 66.2, 45.0, 31.0, 21.0, 14.4 kDa from above,

2번 레인 : 본 발명의 형질전환체를 배양하고 친화성 컬럼으로 재조합 룸부로키나제를 분리하여 얻은 10번째 친화성 컬럼분획의 분리정제액을 5 ㎕를 전기영동한 것이고,Lane 2: 5 µl of the purified solution of the 10th affinity column fraction obtained by culturing the transformant of the present invention and separating recombinant rumbaurokinase by an affinity column,

3번 레인 : 본 발명의 형질전환체를 배양하고 친화성 컬럼으로 재조합 룸부로키나제를 분리하여 얻은 30번째 친화성 컬럼분획의 분리정제액을 5 ㎕를 전기영동한 것이고,Lane 3: 5 µl of the purified solution of the 30th affinity column fraction obtained by culturing the transformant of the present invention and separating the recombinant rumbaurokinase by an affinity column,

4번 레인 : 본 발명의 형질전환체를 배양하고 친화성 컬럼으로 재조합 룸부로키나제를 분리하여 얻은 50번째 친화성 컬럼분획의 분리정제액을 5 ㎕를 전기영동한 것이고,Lane 4: 5 µl of the purified solution of the 50th affinity column fraction obtained by culturing the transformant of the present invention and separating the recombinant rumbaurokinase by an affinity column,

5번 레인 : 본 발명의 형질전환체를 BMMY 배지에 접종 후 메탄올로 24시간마다 0.5 로 유도하고 96시간 후에 상층액을 수득하여 50 ㎕를 전기영동한 것이다.Lane 5: The transformant of the present invention was inoculated in BMMY medium, and then induced with 0.5 every 24 hours with methanol. After 96 hours, the supernatant was obtained and electrophoresed 50 μl.

상기에서 살펴본 바와 같이, 본 발명의 룸부로키나제 제조방법은 혈전용해능을 가지는 재조합 룸부로키나제를 대량으로 발현하여 정제할 수 있다. 또한 재조합 발현기술을 이용하여 시간과 비용이 절감되므로 저렴한 가격으로 높은 순도의 룸부로키나제를 제공한다.As described above, the method of producing lumpurokinase of the present invention can be purified by expressing a large amount of recombinant lumpurokinase having thrombolytic ability. In addition, time and cost are reduced by using recombinant expression technology, thereby providing high purity of rumbaurokinase at a low price.

또한 지렁이를 분말하여 사용할 때 발생 할 수 있는 중금속 오염가능성이 배제되었고 기존의 방법에 비해 시간이 단축됨으로써 오랜 시간의 추출 과정 동안 낮아질 수 있는 단백질의 활성도를 재조합 발현기술을 이용하여 정제한 단백질과 같은 양의 활성도로 비교해 볼 때 1.5배 정도의 높은 활성도를 가진 룸부로키나제를 제공한다.In addition, the possibility of heavy metal contamination that can occur when using earthworm powder is excluded, and the time is shortened compared to the existing method, and the activity of the protein that can be lowered during the extraction process for a long time, such as a protein purified using recombinant expression technology Lumburokinase is provided with an activity as high as 1.5 times compared to the positive activity.

Claims (6)

지렁이에서 분리한 혈전용해능을 가진 신규의 룸부로키나제; 상기를 암호화하는 서열번호 1의 염기서열; 및 상기는 서열번호 2의 아미노산 서열을 포함하는 룸부로키나제 단백질.Novel lumpurokinase with thrombolytic activity isolated from the earthworm; A nucleotide sequence of SEQ ID NO: 1 encoding the above; And the rumbaurokinase protein comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 2. 제 1항의 유전자를 포함하고 룸부로키나제를 발현할 수 있는 재조합 벡터.A recombinant vector comprising the gene of claim 1 and capable of expressing rumbaurokinase. 제 2항에 있어서, 상기의 발현 벡터는 도 3의 pPIC9K/LK 플라스미드인 재조합 벡터.The recombinant vector of claim 2, wherein the expression vector is a pPIC9K / LK plasmid of FIG. 3. 제 2항의 재조합 벡터를 발현하는 재조합 숙주세포.A recombinant host cell expressing the recombinant vector of claim 2. 제 4항에 있어서, 상기 재조합 숙주세포는Pichia pastorisKFCC-11166.The method of claim 4, wherein the recombinant host cell is Pichia pastoris KFCC-11166. 제 5항의 형질 전환된 숙주를 배양하여 메탄올로 룸부로키나제의 발현을 유도하고 이를 수득하는 공정을 포함하는 재조합 룸부로키나제의 제조방법.A method for producing a recombinant rumbaurokinase comprising culturing the transformed host of claim 5 to induce the expression of rumbaurokinase with methanol and obtaining the same.
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