KR102585823B1 - System and method for determining camera performance based on image for genetic analysis - Google Patents
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Abstract
유전자 분석용 이미지에 기초하여 카메라 성능을 판단하는 시스템에 관한 것이며, 카메라 성능 판단 시스템은 유전자 샘플을 포함하는 테스트 시트; 상기 테스트 시트의 주변부에 광을 조사하는 광 조사부; 상기 테스트 시트를 촬영하여 유전자 분석용 이미지를 생성하는 대상 카메라; 상기 유전자 분석용 이미지를 기초로 상기 유전자 분석용 이미지의 밝기 정도를 분석하는 밝기 분석부; 및 상기 밝기 정도에 기초하여 상기 대상 카메라의 유전자 분석용 성능 정도를 판단하는 판단부를 포함할 수 있다.It relates to a system for determining camera performance based on images for genetic analysis, wherein the camera performance determining system includes: a test sheet containing a genetic sample; a light irradiation unit that irradiates light to a peripheral area of the test sheet; a target camera that photographs the test sheet and generates an image for genetic analysis; a brightness analysis unit that analyzes the brightness level of the image for genetic analysis based on the image for genetic analysis; and a determination unit that determines the degree of performance of the target camera for genetic analysis based on the brightness level.
Description
본원은 유전자 분석용 이미지에 기초하여 카메라 성능을 판단하는 시스템 및 방법에 관한 것이다.This application relates to a system and method for determining camera performance based on images for genetic analysis.
바이오 이미징(Bio-imaging)이란 세포에서 일어나는 현상을 영상으로 만드는 기술로서, 신약 개발 및 질병 진단 등에 꼭 필요한 핵심 기술이다. 바이오 이미징(Bio-imaging)은 생명공학뿐만 아니라 물리, 화학, 기계 및 전자 같은 여러 분야의 융합 기술이 필요하고, 최근에 이르러서는 나노 기술과 연계하여 살아 있는 세포 또는 분자 수준에서 일어나는 현상을 영상으로 볼 수 있도록 이용된다.Bio-imaging is a technology that creates images of phenomena occurring in cells, and is a core technology essential for new drug development and disease diagnosis. Bio-imaging requires convergence technologies from various fields such as physics, chemistry, mechanics, and electronics as well as biotechnology, and has recently been linked with nanotechnology to image phenomena occurring at the level of living cells or molecules. It is used so that it can be seen.
유전자 정보는 DNA 혹은 RNA에 포함되어 있고, 극소량의 유전체를 이용한 분석 기술은 전술했듯이 다양한 분야에서 응용되고 있는데, 미량의 유전자를 증폭하는 분자생물학적 기술인 중합효소 연쇄반응(PCR)을 이용한다. 그리고, PCR이 수행된 산물의 증폭 여부를 확인하고 유전자 정보, 핵산 또는 단백질을 분석하기 위해 해당 산물에 전기영동 과정이 수행된다.Genetic information is contained in DNA or RNA, and as mentioned above, analysis technology using a very small amount of the genome is applied in various fields, using polymerase chain reaction (PCR), a molecular biological technology that amplifies a small amount of genes. Then, an electrophoresis process is performed on the PCR product to confirm whether it has been amplified and to analyze genetic information, nucleic acids, or proteins.
바이오 이미징에 이용되는 전기영동(Electrophoresis)은 주로 생체 고분자들의 성질을 연구하고, 그것들을 분석, 분리, 정제하는 중요한 방법 중에 하나이다. 전기영동은 DNA, RNA나 단백질 같은 것들이 고유의 전하를 띠고 있고, 그것들이 어떤 전기장에 놓이게 되면 이동할 수 있다는 사실을 기본으로 하고 있다. DNA 전기영동은 크기, 전하 또는 구조가 다른 DNA 조각을 분리하는 기본적인 방법이고, DNA는 구조 상 백본(Backbone)의 인산기(Phosphate group)를 가지고 있어 전기영동에 사용되는 버퍼(Buffer)안에서 음전하를 띄고 있으며 두 전극 사이에 위치했을 때 (+)극으로 움직이는 기본적인 원리를 가지고 있다. 이때, 아가로스(Agarose)나 폴리아크릴아미드(Polyacrylamide)와 같은 젤 지지체(Gel Matrix) 사이를 DNA 분자가 통과하는 속도는 분자량이 커질수록, 젤(Gel)의 농도가 높을수록 늦어지게 된다. DNA의 이동거리에 따라 DNA 순서나 단백질의 종류 또는 양을 조사하는데 이용된다.Electrophoresis, used in bioimaging, is one of the important methods for studying the properties of biopolymers and analyzing, separating, and purifying them. Electrophoresis is based on the fact that things like DNA, RNA, and proteins have an inherent charge and can move when placed in an electric field. DNA electrophoresis is a basic method of separating DNA fragments of different sizes, charges, or structures. DNA has a phosphate group in its backbone structure, so it carries a negative charge in the buffer used for electrophoresis. It has the basic principle of moving to the (+) pole when placed between two electrodes. At this time, the speed at which DNA molecules pass through a gel matrix such as agarose or polyacrylamide becomes slower as the molecular weight increases and the gel concentration increases. It is used to investigate the DNA sequence or the type or amount of protein depending on the distance the DNA moves.
아가로스 젤은 해상도는 낮지만, DNA 단편을 200bp에서부터 50kb까지 분리할 수 있으며 사용이 간편하고, 다루기가 쉽기 때문에 현재 가장 많이 사용되고 있는 전기영동이다. 아가로스는 해초로부터 추출되는 물질로서 선형 중합체의 형태를 하고 있다. 아가로스 젤은 적당한 완충용액(TAE buffer)에 녹여서 원하는 크기의 틀에 부어지며, 젤이 굳은 후에 사용된다. 젤이 굳는 동안 아가로스는 지지체(matrix) 형태가 되며, 그 밀도는 아가로스의 농도(%)에 따라 정해진다. 이러한 젤에 전기장이 주어지면, 음전하를 띠는 DNA는 양극으로 이동한다. 이때 DNA가 이동하는 정도는 여러 가지 요인의 영향을 받는다. 아가로스 젤 전기영동 시 DNA 분자의 크기가 클수록, 아가로스의 농도가 높을수록 DNA가 느리게 이동한다. 또한, DNA형태(구조)에 따라 이동속도가 다르다. 일반적으로 supercoiled DNA가 가장 빨리 이동하고, 그 다음으로 linear DNA, open circular DNA의 순으로 빠르게 이동한다.Although agarose gel has low resolution, it can separate DNA fragments from 200bp to 50kb and is simple to use and handle, so it is currently the most widely used electrophoresis. Agarose is a substance extracted from seaweed and is in the form of a linear polymer. Agarose gel is dissolved in an appropriate buffer solution (TAE buffer), poured into a mold of the desired size, and used after the gel hardens. While the gel hardens, agarose becomes a matrix, and its density is determined by the concentration (%) of agarose. When an electric field is applied to this gel, the negatively charged DNA moves to the positive electrode. At this time, the extent to which DNA moves is influenced by several factors. During agarose gel electrophoresis, the larger the size of the DNA molecule and the higher the agarose concentration, the slower the DNA moves. Additionally, the movement speed varies depending on the DNA type (structure). In general, supercoiled DNA moves fastest, followed by linear DNA and open circular DNA.
이렇듯 바이오 이미징에 있어서, 전기영동 장치와 추가적으로 젤 다큐먼트 시스템(Gel document system) 장치가 사용된다. 젤 다큐먼트 시스템은 전기영동이 끝난 아가로스 젤을 촬영하고 촬영한 영상을 분석하여 사용자가 유전자의 염기 서열 혹은 크기 등을 알 수 있도록 하는데, 상세하게는 염색된 분자(DNA, RNA, Protein)들이 광의 파장에 반응하여 발광하는 현상을 이용하여 전기영동이 끝난 후 이동된 지점을 디지털 카메라를 통해 이동거리 등의 영상을 촬영하여 이미지 파일로 제공하는 장치이다.In this way, in bio-imaging, an electrophoresis device and additionally a gel document system device are used. The gel document system photographs the agarose gel after electrophoresis and analyzes the captured images to allow users to know the base sequence or size of the gene. In detail, the stained molecules (DNA, RNA, Protein) are used in a wide range of ways. It is a device that uses the phenomenon of light emission in response to a wavelength to capture images of the moved point after electrophoresis is completed, such as the distance traveled, and provides it as an image file.
상용 젤 다큐먼트 시스템에 사용되는 촬영 기기들은 큰 이미지 센서로 촬영을 할수록 좋은 품질의 영상을 획득할 수 있기 때문에, 가격이 비싸고 성능이 우수한 CCD 카메라 혹은 CMOS 센서를 사용한 DSLR 카메라들이 주로 사용된다.Since the imaging devices used in commercial gel document systems can acquire better quality images by shooting with larger image sensors, expensive and high-performance CCD cameras or DSLR cameras using CMOS sensors are mainly used.
그러나, 이러한 종래의 이미지 센서들은 가격 부담은 물론 크기 또한 크다. 종래의 이미지 센서의 일 예인 DSLR 카메라 같은 경우 초점거리가 최소 30cm 이상 유지되어야 하므로 전체 젤 다큐먼트 시스템의 크기를 소형화 하기 어려운 문제가 있다.However, these conventional image sensors are not only expensive but also large in size. In the case of a DSLR camera, which is an example of a conventional image sensor, the focal length must be maintained at least 30 cm, so it is difficult to miniaturize the entire gel document system.
본원의 배경이 되는 기술은 한국등록특허공보 제10-1185912호에 개시되어 있다.The technology behind this application is disclosed in Korean Patent Publication No. 10-1185912.
본원은 전술한 종래 기술의 문제점을 해결하기 위한 것으로서, 젤 다큐먼트 시스템의 크기를 소형화 하기 어려운 문제를 해결할 수 있는 ~시스템 및 방법을 제공하려는 것을 목적으로 한다.The purpose of this application is to solve the problems of the prior art described above, and to provide a system and method that can solve the problem of difficulty in miniaturizing the size of the gel document system.
본원은 전술한 종래 기술의 문제점을 해결하기 위한 것으로서, 종래의 고성능 카메라를 사용하여 발생되는 고비용 문제를 해결할 수 있는 ~시스템 및 방법을 제공하려는 것을 목적으로 한다.The purpose of this application is to solve the problems of the prior art described above, and to provide a system and method that can solve the high cost problem caused by using a conventional high-performance camera.
다만, 본원의 실시예가 이루고자 하는 기술적 과제는 상기된 바와 같은 기술적 과제들로 한정되지 않으며, 또 다른 기술적 과제들이 존재할 수 있다.However, the technical challenges sought to be achieved by the embodiments of the present application are not limited to the technical challenges described above, and other technical challenges may exist.
상기한 기술적 과제를 달성하기 위한 기술적 수단으로서, 본원의 일 실시예에 따른 유전자 분석용 이미지에 기초하여 카메라 성능을 판단하는 시스템은 유전자 샘플을 포함하는 테스트 시트; 상기 테스트 시트의 주변부에 광을 조사하는 광 조사부; 상기 테스트 시트를 촬영하여 유전자 분석용 이미지를 생성하는 대상 카메라; 상기 유전자 분석용 이미지를 기초로 상기 유전자 분석용 이미지의 밝기 정도를 분석하는 밝기 분석부; 및 상기 밝기 정도에 기초하여 상기 대상 카메라의 유전자 분석용 성능 정도를 판단하는 판단부를 포함할 수 있다.As a technical means for achieving the above-mentioned technical problem, a system for determining camera performance based on an image for genetic analysis according to an embodiment of the present application includes a test sheet including a genetic sample; a light irradiation unit that irradiates light to a peripheral area of the test sheet; a target camera that photographs the test sheet and generates an image for genetic analysis; a brightness analysis unit that analyzes the brightness level of the image for genetic analysis based on the image for genetic analysis; and a determination unit that determines the degree of performance of the target camera for genetic analysis based on the brightness level.
본원의 일 실시예에 따르면, 상기 광 조사부는, 상기 광의 밝기 정도를 제1밝기 정도 내지 제2밝기 정도로 조절하여 조사하되, 상기 제1밝기 정도는 상기 제2밝기 정도 보다 광의 밝기 정도가 약할 수 있다.According to an embodiment of the present application, the light irradiation unit irradiates the light by adjusting the brightness level of the light to a first brightness level to a second brightness level, but the first brightness level may be weaker than the second brightness level. there is.
본원의 일 실시예에 따르면, 상기 광 조사부가 상기 제1밝기 정도에서부터 상기 제2밝기 정도까지 상기 광의 밝기 정도를 조절하며 상기 테스트 시트의 주변부에 상기 광을 조사하는 동안, 상기 대상 카메라가 상기 테스트 시트를 촬영하여 밝기 변화 유전자 분석용 이미지를 생성할 수 있다.According to one embodiment of the present application, while the light irradiation unit adjusts the brightness level of the light from the first brightness level to the second brightness level and irradiates the light to the periphery of the test sheet, the target camera performs the test. By photographing the sheet, images for genetic analysis of brightness changes can be created.
본원의 일 실시예에 따르면, 상기 밝기 분석부는 상기 밝기 변화 유전자 분석용 이미지를 기초로 상기 밝기 변화 유전자 분석용 이미지의 밝기 정도를 분석할 수 있다.According to an embodiment of the present application, the brightness analysis unit may analyze the brightness level of the image for brightness change gene analysis based on the image for brightness change gene analysis.
본원의 일 실시예에 따르면, 상기 판단부는, 상기 밝기 변화 유전자 분석용 이미지의 밝기 정도에 기초한 밝기 변화 정도가 기 설정된 범위 내에 존재하면, 상기 유전자 분석용 성능 정도를 판단함에 있어서 상기 대상 카메라가 적합하다고 판단할 수 있다.According to an embodiment of the present application, the determination unit determines that the target camera is suitable in determining the degree of performance for genetic analysis if the degree of brightness change based on the degree of brightness of the image for genetic analysis of brightness change exists within a preset range. It can be judged that it is.
본원의 일 실시예에 따르면, 상기 카메라 성능 판단 시스템은, 상기 테스트 시트의 주변부에 자외선을 조사하는 자외선 조사기를 더 포함할 수 있다.According to an embodiment of the present application, the camera performance determination system may further include an ultraviolet irradiator that irradiates ultraviolet rays to the periphery of the test sheet.
본원의 일 실시예에 따르면, 상기 대상 카메라는, 개방형 플랫폼 카메라, CCD 카메라 및 CMOS 카메라 중 적어도 하나를 포함할 수 있다.According to an embodiment of the present application, the target camera may include at least one of an open platform camera, a CCD camera, and a CMOS camera.
본원의 일 실시예에 따르면, 상기 대상 카메라는, 필터를 포함할 수 있다.According to an embodiment of the present application, the target camera may include a filter.
본원의 일 실시예에 따르면, 상기 대상 카메라는, 상기 테스트 시트의 상부에 위치하는 것일 수 있다.According to an embodiment of the present application, the target camera may be located on top of the test sheet.
본원의 일 실시예에 따르면, 상기 평가 시스템은, 암실 안에서 수행되는 것일 수 있다.According to an embodiment of the present application, the evaluation system may be performed in a dark room.
본원의 일 실시예에 따르면, 상기 대상 카메라는, 상기 밝기 정도에 상관 없이 반사율이 일정한 것일 수 있다.According to an embodiment of the present application, the target camera may have a constant reflectance regardless of the brightness level.
본원의 일 실시예에 따르면, 상기 테스트 시트는, 유전자 샘플을 포함하되, 상기 유전자 샘플에 중합효소 연쇄반응(PCR, Polymerase Chain Reaction)이 수행되어 유전자가 증폭되고, 증폭된 상기 유전자 샘플에 전기 영동이 수행된 것일 수 있다.According to one embodiment of the present application, the test sheet includes a genetic sample, a polymerase chain reaction (PCR) is performed on the genetic sample, the gene is amplified, and the amplified genetic sample is subjected to electrophoresis. This may have been done.
본원의 일 실시예에 따르면, 상기 광 조사부는, LED조명 및 디퓨저를 포함할 수 있다.According to an embodiment of the present application, the light irradiation unit may include LED lighting and a diffuser.
본원의 일 실시예에 따른 유전자 분석용 이미지에 기초하여 카메라 성능을 판단하는 방법은, 광 조사부가 유전자 샘플을 포함하는 테스트 시트의 주변부에 광을 조사하는 단계; 대상 카메라가 상기 테스트 시트를 촬영하여 유전자 분석용 이미지를 생성하는 단계; 밝기 분석부가 상기 유전자 분석용 이미지를 기초로 상기 유전자 분석용 이미지의 밝기 정도를 분석하는 단계; 및 판단부가 상기 밝기 정도에 기초하여 상기 대상 카메라의 유전자 분석용 성능 정도를 판단하는 단계를 포함할 수 있다.A method of determining camera performance based on an image for genetic analysis according to an embodiment of the present application includes the steps of a light irradiation unit irradiating light to the periphery of a test sheet containing a genetic sample; generating an image for genetic analysis by having a target camera photograph the test sheet; A brightness analysis unit analyzing the brightness level of the image for genetic analysis based on the image for genetic analysis; and a step of determining, by a determination unit, a performance level for genetic analysis of the target camera based on the brightness level.
상술한 과제 해결 수단은 단지 예시적인 것으로서, 본원을 제한하려는 의도로 해석되지 않아야 한다. 상술한 예시적인 실시예 외에도, 도면 및 발명의 상세한 설명에 추가적인 실시예가 존재할 수 있다.The above-described means of solving the problem are merely illustrative and should not be construed as intended to limit the present application. In addition to the exemplary embodiments described above, additional embodiments may be present in the drawings and detailed description of the invention.
전술한 본원의 과제 해결 수단에 의하면, 바이오 이미징에 있어서 종래의 고성능 대형 카메라가 아닌 개방형 플랫폼 기반의 소형 카메라를 사용가능하도록 함으로써, 전체 젤 다큐먼트 시스템의 크기를 소형화 할 수 있는 효과가 있다.According to the above-described means of solving the problem of the present application, it is possible to use a small camera based on an open platform rather than a conventional high-performance large camera in bio-imaging, which has the effect of miniaturizing the size of the entire gel document system.
전술한 본원의 과제 해결 수단에 의하면, 바이오 이미징에 있어서 종래의 고비용의 고성능 카메라가 아닌 상대적으로 저렴한 개방형 플랫폼 기반의 카메라를 사용가능하도록 함으로써, 전체 젤 다큐먼트 시스템의 소모 비용을 낮출 수 있다.According to the above-described means of solving the problem of the present application, the consumption cost of the entire gel document system can be reduced by enabling the use of a relatively inexpensive open platform-based camera rather than the conventional high-cost, high-performance camera in bio-imaging.
다만, 본원에서 얻을 수 있는 효과는 상기된 바와 같은 효과들로 한정되지 않으며, 또 다른 효과들이 존재할 수 있다.However, the effects that can be obtained herein are not limited to the effects described above, and other effects may exist.
도 1은 본원의 일 실시예에 따른 유전자 분석용 이미지에 기초하여 카메라 성능을 판단하는 시스템의 개략적인 구성도이다.
도 2는 본원의 일 실시예에 따른 유전자 분석용 이미지에 기초하여 카메라 성능을 판단하는 시스템의 개략적인 블록도이다.
도 3은 본원의 일 실시예에 따른 유전자 분석용 성능 판단에 예시되는 카메라 표를 도시한 도면이다.
도 4는 본원의 일 실시예에 따른 유전자 분석용 이미지에 기초하여 카메라 성능을 판단하는 시스템의 배치 예시를 도시한 도면이다.
도 5는 본원의 일 실시예에 따른 유전자 분석용 이미지에 기초하여 카메라 성능을 판단하는 시스템의 카메라의 밝기와 노출 정도를 예시한 도면이다.
도 6은 본원의 일 실시예에 따른 유전자 분석용 이미지에 기초하여 카메라 성능을 판단하는 시스템의 실 구조를 도시한 도면이다.
도 7은 본원의 일 실시예에 따른 카메라 별 1차 변수 관계도를 도시한 도면이다.
도 8은 본원의 일 실시예에 따른 카메라 별 1차 PWM에 따른 기울기 그래프를 도시한 도면이다.
도 9는 본원의 일 실시예에 따른 카메라 차수 별 PWM에 따른 에러 그래프를 도시한 도면이다.
도 10은 본원의 일 실시예에 따른 카메라의 3차 변수에 대한 비교 그래프를 도시한 도면이다.
도 11은 본원의 일 실시예에 따른 대상 카메라의 촬영 규격 비교 예시를 도시한 도면이다.
도 12는 본원의 일 실시예에 따른 유전자 분석용 이미지에 기초하여 카메라 성능을 판단하는 시스템의 외면 및 내부 구조를 도시한 도면이다.
도 13은 본원의 일 실시예에 따른 유전자 분석용 이미지를 도시한 도면이다.
도 14는 본원의 일 실시예에 따른 카메라 별 실험 결과를 도시한 도면이다.
도 15는 본원의 일 실시예에 따른 유전자 분석용 이미지의 대역 분석을 도시한 도면이다.
도 16은 본원의 일 실시예에 따른 ~장치의 제어 방법에 대한 동작 흐름도이다.1 is a schematic diagram of a system for determining camera performance based on images for genetic analysis according to an embodiment of the present application.
Figure 2 is a schematic block diagram of a system for determining camera performance based on images for genetic analysis according to an embodiment of the present application.
Figure 3 is a diagram illustrating a camera table exemplified in determining performance for genetic analysis according to an embodiment of the present application.
Figure 4 is a diagram showing an example of the arrangement of a system for determining camera performance based on images for genetic analysis according to an embodiment of the present application.
Figure 5 is a diagram illustrating the brightness and exposure level of a camera in a system that determines camera performance based on images for genetic analysis according to an embodiment of the present application.
Figure 6 is a diagram showing the actual structure of a system for determining camera performance based on images for genetic analysis according to an embodiment of the present application.
Figure 7 is a diagram showing the relationship between primary variables for each camera according to an embodiment of the present application.
Figure 8 is a diagram showing a slope graph according to the primary PWM for each camera according to an embodiment of the present application.
Figure 9 is a diagram showing an error graph according to PWM for each camera order according to an embodiment of the present application.
FIG. 10 is a diagram illustrating a comparison graph for tertiary variables of a camera according to an embodiment of the present application.
Figure 11 is a diagram illustrating an example of comparing shooting standards of target cameras according to an embodiment of the present application.
Figure 12 is a diagram showing the exterior and internal structure of a system for determining camera performance based on images for genetic analysis according to an embodiment of the present application.
Figure 13 is a diagram showing an image for genetic analysis according to an embodiment of the present application.
Figure 14 is a diagram showing the results of an experiment for each camera according to an embodiment of the present application.
Figure 15 is a diagram illustrating band analysis of an image for genetic analysis according to an embodiment of the present application.
Figure 16 is an operation flowchart of a method for controlling a device according to an embodiment of the present application.
아래에서는 첨부한 도면을 참조하여 본원이 속하는 기술 분야에서 통상의 지식을 가진 자가 용이하게 실시할 수 있도록 본원의 실시예를 상세히 설명한다. 그러나 본원은 여러 가지 상이한 형태로 구현될 수 있으며 여기에서 설명하는 실시예에 한정되지 않는다. 그리고 도면에서 본원을 명확하게 설명하기 위해서 설명과 관계없는 부분은 생략하였으며, 명세서 전체를 통하여 유사한 부분에 대해서는 유사한 도면 부호를 붙였다.Below, with reference to the attached drawings, embodiments of the present application will be described in detail so that those skilled in the art can easily implement them. However, the present application may be implemented in various different forms and is not limited to the embodiments described herein. In order to clearly explain the present application in the drawings, parts that are not related to the description are omitted, and similar reference numerals are assigned to similar parts throughout the specification.
본원 명세서 전체에서, 어떤 부분이 다른 부분과 "연결"되어 있다고 할 때, 이는 "직접적으로 연결"되어 있는 경우뿐 아니라, 그 중간에 다른 소자를 사이에 두고 "전기적으로 연결" 또는 "간접적으로 연결"되어 있는 경우도 포함한다. Throughout this specification, when a part is said to be “connected” to another part, this means not only “directly connected” but also “electrically connected” or “indirectly connected” with another element in between. "Includes cases where it is.
본원 명세서 전체에서, 어떤 부재가 다른 부재 "상에", "상부에", "상단에", "하에", "하부에", "하단에" 위치하고 있다고 할 때, 이는 어떤 부재가 다른 부재에 접해 있는 경우뿐 아니라 두 부재 사이에 또 다른 부재가 존재하는 경우도 포함한다.Throughout this specification, when a member is said to be located “on”, “above”, “at the top”, “below”, “at the bottom”, or “at the bottom” of another member, this means that a member is located on another member. This includes not only cases where they are in contact, but also cases where another member exists between two members.
본원 명세서 전체에서, 어떤 부분이 어떤 구성 요소를 "포함"한다고 할 때, 이는 특별히 반대되는 기재가 없는 한 다른 구성 요소를 제외하는 것이 아니라 다른 구성 요소를 더 포함할 수 있는 것을 의미한다.Throughout the specification of the present application, when a part "includes" a certain component, this means that it may further include other components rather than excluding other components unless specifically stated to the contrary.
도 1은 본원의 일 실시예에 따른 유전자 분석용 이미지에 기초하여 카메라 성능을 판단하는 시스템의 개략적인 구성도이다.1 is a schematic diagram of a system for determining camera performance based on images for genetic analysis according to an embodiment of the present application.
도 1을 참조하면, 유전자 분석용 이미지에 기초하여 카메라 성능을 판단하는 시스템(100)은 테스트 시트(110)의 주변부에 광 조사부(120)가 광을 조사하고, 테스트 시트(110)를 대상 카메라(130)가 촬영하여 유전자 분석용 이미지를 생성하고, 카메라 성능 판단 장치(140)가 유전자 분석용 이미지를 기초로 밝기 정도를 분석하고, 밝기 정도에 기초하여 대상 카메라(130)의 유전자 분석용 성능 정도를 판단할 수 있다.Referring to FIG. 1, in the
본원의 일 실시예에 따르면, 유전자 분석용 이미지에 기초하여 카메라 성능을 판단하는 시스템(100)은 사용자 단말(미도시)로 광 조사 메뉴, 촬영 메뉴, 밝기 분석 메뉴 및 카메라 성능 판단 메뉴를 제공할 수 있다. 예를 들어, 유전자 분석용 이미지에 기초하여 카메라 성능을 판단하는 시스템(100)이 제공하는 어플리케이션 프로그램을 사용자 단말(미도시)이 다운로드하여 설치하고, 설치된 어플리케이션을 통해 광 조사 메뉴, 촬영 메뉴, 밝기 분석 메뉴 및 카메라 성능 판단 메뉴가 제공될 수 있다.According to an embodiment of the present application, the
유전자 분석용 이미지에 기초하여 카메라 성능을 판단하는 시스템(100)은 사용자 단말(미도시)과 데이터, 콘텐츠, 각종 통신 신호를 네트워크를 통해 송수신하고, 데이터 저장 및 처리의 기능을 가지는 모든 종류의 서버, 단말, 또는 디바이스를 포함할 수 있다.The
사용자 단말(미도시)은 네트워크를 통해 유전자 분석용 이미지에 기초하여 카메라 성능을 판단하는 시스템(100)과 연동되는 디바이스로서, 예를 들면, 스마트폰(Smartphone), 스마트패드(Smart Pad), 태블릿 PC, 웨어러블 디바이스 등과 PCS(Personal Communication System), GSM(Global System for Mobile communication), PDC(Personal Digital Cellular), PHS(Personal Handyphone System), PDA(Personal Digital Assistant), IMT(International Mobile Telecommunication)-2000, CDMA(Code Division Multiple Access)-2000, W-CDMA(W-Code Division Multiple Access), Wibro(Wireless Broadband Internet) 단말기 같은 모든 종류의 무선 통신 장치 및 데스크탑 컴퓨터, 스마트 TV와 같은 고정용 단말기일 수도 있다. A user terminal (not shown) is a device that is linked to the
유전자 분석용 이미지에 기초하여 카메라 성능을 판단하는 시스템(100)에 포함된 광 조사부(120), 대상 카메라(130), 카메라 성능 판단 장치(140)(이하 '본 장치(140)'라고 한다.) 및 사용자 단말(미도시) 간의 정보 공유를 위한 네트워크(200)의 일 예로는 3GPP(3rd Generation Partnership Project) 네트워크, LTE(Long Term Evolution) 네트워크, 5G 네트워크, WIMAX(World Interoperability for Microwave Access) 네트워크, 유무선 인터넷(Internet), LAN(Local Area Network), Wireless LAN(Wireless Local Area Network), WAN(Wide Area Network), PAN(Personal Area Network), 블루투스(Bluetooth) 네트워크, Wifi 네트워크, NFC(Near Field Communication) 네트워크, 위성 방송 네트워크, 아날로그 방송 네트워크, DMB(Digital Multimedia Broadcasting) 네트워크 등이 포함될 수 있으며, 이에 한정된 것은 아니다.Included in the
유전자 분석용 이미지에 기초하여 카메라 성능을 판단하는 시스템(100)(이하 '본 시스템(100)'이라고 한다.)은 종래의 젤 다큐먼트 시스템(Gel-document system)에 기인한 것일 수 있다.The system 100 (hereinafter referred to as 'this system 100') for determining camera performance based on images for genetic analysis may be based on a conventional gel-document system.
본원의 일 실시예에 따르면, 대상 카메라(130)는 필터를 포함할 수 있다.According to an embodiment of the present application, the
도 2는 본원의 일 실시예에 따른 유전자 분석용 이미지에 기초하여 카메라 성능을 판단하는 시스템(100)의 개략적인 블록도이다.Figure 2 is a schematic block diagram of a
도 2를 참조하면, 유전자 분석용 이미지에 기초하여 카메라 성능을 판단하는 시스템(100)은 유전자 샘플을 포함하는 테스트 시트(110); 테스트 시트(110)의 주변부에 광을 조사하는 광 조사부(120); 테스트 시트(110)를 촬영하여 유전자 분석용 이미지를 생성하는 대상 카메라(130); 유전자 분석용 이미지를 기초로 유전자 분석용 이미지의 밝기 정도를 분석하는 밝기 분석부(141); 및 밝기 정도에 기초하여 대상 카메라(130)의 유전자 분석용 성능 정도를 판단하는 판단부(142)를 포함할 수 있다.Referring to FIG. 2, the
또한, 유전자 분석용 이미지에 기초하여 카메라 성능을 판단하는 시스템(100)은 테스트 시트(110)의 주변부에 자외선을 조사하는 자외선 조사기를 더 포함하고, 자외선 조사기는 사용자 단말(미도시)과 네트워크(200)로 연결될 수 있다.In addition, the
본원의 일 실시예에 따르면, 테스트 시트(110)는 유전자 샘플을 포함할 수 있다.According to one embodiment of the present application, the
일 예로, 유전자 샘플(유전자 정보)은 DNA 및 RNA 등을 포함할 수 있다.As an example, a genetic sample (genetic information) may include DNA and RNA.
본원의 일 실시예에 따르면, 테스트 시트(110)는, 유전자 샘플을 포함하되, 유전자 샘플에 중합효소 연쇄반응(PCR, Polymerase Chain Reaction)이 수행되어 유전자가 증폭되고, 증폭된 유전자 샘플에 전기 영동이 수행된 것일 수 있다.According to an embodiment of the present application, the
본원의 일 실시예에 따르면, 광 조사부(120)는 테스트 시트(110)의 주변부에 광을 조사할 수 있다.According to one embodiment of the present application, the
본원의 일 실시예에 따르면, 대상 카메라(130)는 테스트 시트(110)를 촬영하여 유전자 분석용 이미지를 생성할 수 있다.According to an embodiment of the present application, the
본원의 일 실시예에 따르면, 밝기 분석부(141)는 유전자 분석용 이미지를 기초로 유전자 분석용 이미지의 밝기 정도를 분석할 수 있다.According to an embodiment of the present application, the
본원의 일 실시예에 따르면, 판단부(142)는 밝기 정도에 기초하여 대상 카메라(130)의 유전자 분석용 성능 정도를 판단할 수 있다.According to an embodiment of the present application, the
도 3은 본원의 일 실시예에 따른 유전자 분석용 성능 판단에 예시되는 카메라 표를 도시한 도면이다.Figure 3 is a diagram illustrating a camera table exemplified in determining performance for genetic analysis according to an embodiment of the present application.
도 3을 참조하면, 본 명세서에서 본 시스템(100)은 종래의 DSLR 카메라와 가격과 크기가 다른 3가지 개방형 플랫폼 기반 카메라를 대상 카메라(130)의 예시로서 기술한다. 모바일 기기의 발달로 초소형 고성능 개방형 플랫폼 기반의 카메라를 저렴한 가격에 쉽게 구할 수 있게 되었고, 초소형 고성능 개방형 플랫폼 기반의 카메라는 크기가 작고 초점거리가 짧은 장점이 있어 우수한 사양과 가성비의 젤 다큐먼트 시스템(Gel-document system)의 구현이 가능하다. 그러므로, 예시로서 본 시스템(100)은 종래의 젤 다큐먼트 시스템에 사용되는 DSLR 카메라의 밝기를 기준으로 가격과 크기가 다른 3가지의 개방형 플랫폼 기반 카메라의 밝기 정도에 따른 기울기의 선형성을 비교하는 에뮬레이션 실험을 통해 선형성이 우수한 카메라를 대상 카메라(130)로서 선정하였다. 선형성이 우수하다는 것은 다른 카메라의 기울기에 비해 상대적으로 직선에 가까운 기울기를 가지는 것을 의미할 수 있다.Referring to FIG. 3, in this specification, the
일 예로, 본 시스템(100)은 대상 카메라(130)로 선정된 3개의 개방형 플랫폼 기반 카메라와 상용 장비에 주로 사용되는 DSLR 카메라의 성능을 비교하기 위해 Canon 1100D, Sony IMX179, AR0130으로 아가로스 젤의 전기영동 후의 테스트 시트(110)를 촬영하여 유전자 분석용 이미지의 밝기 정도의 대역 볼륨(Band volume)을 비교 분석할 수 있다. 이 때, DSLR 카메라의 최대 이득이 상대적으로 가장 좋을 수 있으나, 표준 최대 이득을 AR0130의 최대 이득으로 조정하면 DSLR 카메라의 이득은 AR0130의 이득과 유사할 수 있다. 따라서, DSLR 카메라가 AR0130으로 대체되더라도 충분한 유전자 분석용 성능을 가질 수 있을 것이라고 기대되며, 이는 개방형 플랫폼 기반의 카메라로도 저비용 및 소형의 젤 다큐먼트 시스템(Gel-document system) 구현이 가능함을 보여줄 수 있다.As an example, this
또한, 도 3을 참조하면, DSLR은 EOS-1100D를 포함하고, 개방형 플랫폼 기반의 카메라는 IMX179, AR0130 및 PICAM을 포함할 수 있다.Additionally, referring to FIG. 3, the DSLR may include the EOS-1100D, and the open platform-based camera may include the IMX179, AR0130, and PICAM.
본원의 일 실시예에 따르면, 대상 카메라(130)는, 개방형 플랫폼 카메라, CCD 카메라 및 CMOS 카메라 중 적어도 하나를 포함할 수 있다.According to an embodiment of the present application, the
CCD 카메라는 가격 비싸지만 성능이 우수하고, CMOS 카메라는 CMOS 센서를 구비한 카메라로서 DSLR을 포함할 수 있다.CCD cameras are expensive but have excellent performance, and CMOS cameras are cameras equipped with a CMOS sensor and can include DSLR cameras.
일 예로, 대상 카메라(130)가 개방형 플랫폼 카메라를 포함하되, CCD 카메라 및 CMOS 카메라 중 적어도 하나를 더 포함하면, CCD 카메라 및 CMOS 카메라 중 적어도 하나의 카메라가 개방형 플랫폼 카메라의 유전자 분석용 성능 판단에 있어서의 기준으로서 대상 카메라(130)에 포함될 수 있다.As an example, if the
도 4는 본원의 일 실시예에 따른 유전자 분석용 이미지에 기초하여 카메라 성능을 판단하는 시스템(100)의 배치 예시를 도시한 도면이다.FIG. 4 is a diagram illustrating an example of the arrangement of the
도 4(a)를 참조하면, 본 시스템(100)은 테스트 시트(110), 광 조사부(120), 대상 카메라(130) 및 본 장치(140)를 포함하되, 광 조사부(120)는 녹색 LED(Green LED) 및 디퓨저(Diffuser)를 포함하고, 대상 카메라(130)는 전술했듯이 EOS 1100D, AR0130, PICAM 및 IMX 179를 포함하고, 본 장치(140)는 PC 및 대상 카메라(130) 및 조명 제어용 마이크로 컨트롤러(예를 들어, 아두이노 우노(Arduino Uno))를 포함할 수 있다. 카메라 및 조명 제어용 마이크로 컨트롤러는 USB 케이블로 PC와 연결될 수 있다. 녹색 LED는 조명으로 사용되고, 마이크로 컨트롤러는 PWM(펄스 폭 변조)을 제어하여 밝기를 변경할 수 있다.Referring to FIG. 4(a), the
도 4(b)를 참조하면, 본 시스템(100)에서 녹색 LED와 대상 카메라(130)의 고정 위치를 확인할 수 있다. 본 시스템(100)은 암실을 포함할 수 있고, 본 시스템(100)에서 대상 카메라(130)의 높이는, 대상 카메라(130)로 테스트 시트(110)를 촬영할 때 너비의 비율이 80%인 위치에 고정될 수 있다. IMX179 카메라를 제외하고, 테스트 시트(110) 위 300mm 높이에 EOS 1100D, AR0130 및 PICAM이 위치하고, IMX179 카메라는 테스트 시트(110) 위 110mm 높이에 위치하고, 녹색 LED는 테스트 시트(110) 위 75mm에 위치할 수 있다. EOS 1100D, AR0130, PICAM 및 IMX 179는 DuxGelDoc(제조사: Biomedux Co., Ltd.)에 설치된 IMX 179 카메라의 PWM100 기울기를 기준으로 설정될 수 있다.Referring to FIG. 4(b), the fixed positions of the green LED and
본원의 일 실시예에 따르면, 광 조사부(120)는 광의 밝기 정도를 제1밝기 정도 내지 제2밝기 정도로 조절하여 조사하되, 제1밝기 정도는 제2밝기 정도 보다 광의 밝기 정도가 약할 수 있다.According to an embodiment of the present application, the
일 예로, 광 조사부(120)는 본 장치(140)에 의해 제어될 수 있다. 제 1 밝기는 PWM 100 미만의 임의의 값에 대응되는 밝기이되, 제 2 밝기 보다 광의 세기가 약한 것일 수 있다. 제 2 밝기는 PWM 0 초과 PWM 100 이하의 임의의 값에 대응되는 밝기이되, 제 1 밝기 보다 광의 세기가 강한 것일 수 있다. 광 조사부(120)는 기 설정된 시간 동안 광을 조사할 수 있다. 광 조사 시간 동안 광 조사부(120)는 광의 밝기를 기 설정된 수만큼 변화시키되, 광의 밝기 유지 시간은 기 설정된 시간 동안인 것일 수 있다.As an example, the
본원의 일 실시예에 따르면, 광 조사부(120)가 제1밝기 정도에서부터 제2밝기 정도까지 밝기 정도를 조절하며 테스트 시트(110)의 주변부에 광을 조사하는 동안, 대상 카메라(130)가 테스트 시트(110)를 촬영하여 밝기 변화 유전자 분석용 이미지를 생성할 수 있다.According to an embodiment of the present application, while the
일 예로, 밝기 변화 유전자 분석용 이미지는 광 조사 시간 동안 광의 밝기 변화가 기 설정된 횟수만큼 이루어진 것이 반영된 것일 수 있다. 대상 카메라(130)가 복수 개 존재하면, 밝기 변화 유전자 분석용 이미지 또한 복수 개 존재할 수 있다.For example, an image for genetic analysis of brightness changes may reflect changes in brightness of light a preset number of times during the light irradiation time. If there are a plurality of
본원의 일 실시예에 따르면, 대상 카메라(130)는, 테스트 시트(110)의 상부에 위치하는 것일 수 있다.According to one embodiment of the present application, the
대상 카메라(130)는 테스트 시트(110)를 온전히 촬영할 수 있는 테스트 시트(110)의 상부에 위치할 수 있다. 본 시스템(100)은 암실을 포함하고, 암실의 내부에 테스트 시트(110), 광 조사부(120) 및 대상 카메라(130)가 위치하도록 하되, 테스트 시트(110)부터 암실의 천정까지의 거리의 4:1에 위치하는 지점에 대상 카메라(130)가 위치할 수 있다. 대상 카메라(130)의 높이는 대상 카메라(130)로 테스트 시트(110)를 촬영할 때 너비의 비율이 80%인 위치에 고정될 수 있다.The
본원의 일 실시예에 따르면, 광 조사부(120)는, LED조명 및 디퓨저를 포함할 수 있다.According to an embodiment of the present application, the
일 예로, 광 조사부(120)는 LED 조명 및 디퓨저를 포함하되, 광원의 종류와 색깔이 이에 한정되는 것은 아니다. 또한, 광 조사부(120)는 복수의 LED 조명 및 디퓨저를 포함할 수 있다.For example, the
도 5는 본원의 일 실시예에 따른 유전자 분석용 이미지에 기초하여 카메라 성능을 판단하는 시스템(100)의 카메라의 밝기와 노출 정도를 예시한 도면이다.FIG. 5 is a diagram illustrating the brightness and exposure level of the camera of the
도 5를 참조하면, EOS 1100D, AR0130, PICAM 및 IMX 179의 PWM이 100일 때의 기울기와 노출 정도(초)를 확인할 수 있다. Referring to Figure 5, you can check the slope and exposure degree (seconds) when the PWM of EOS 1100D, AR0130, PICAM, and IMX 179 is 100.
도 6은 본원의 일 실시예에 따른 유전자 분석용 이미지에 기초하여 카메라 성능을 판단하는 시스템(100)의 실 구조를 도시한 도면이다.FIG. 6 is a diagram illustrating the actual structure of a
도 6(a)를 참조하면, 도 4(b)의 본 시스템(100)의 일 실시 구조를 확인할 수 있다. 또한, 본 시스템(100)은 DuxGelDoc의 조명과 유사한 조명 밝기 정도를 광 조사부(120)가 조사하도록 설정하기 위해 마이크로 컨트롤러(예를 들어, Arduino Uno)에서 PWM 신호를 변경하여 광 조사부(120)에 포함된 녹색 LED(예를 들어, 제품번호: C503B-GAS-CB0F0792CT-ND, Digikey, USA)와 디퓨저(3M 3635-70, 2set)로 구성된 조명 부분을 조정할 수 있다.Referring to FIG. 6(a), one implementation structure of the
도 6(b)를 참조하면, 본 시스템(100)은 암실(Dark room)을 포함하고, 유전자 분석용 카메라 성능 판단이 암실 안에서 수행될 수 있다.Referring to FIG. 6(b), the
일 예로, 제1방법에서 본 시스템(100)의 유전자 분석용 카메라 성능 판단 방법의 정확성을 확인하기 위해 본 시스템(100)은 두 가지 실험을 수행할 수 있다. 첫번째 실험에서 본 시스템(100)은 빛의 밝기와 상관 없이 반사율이 일정한지 분석할 수 있다. 두번째 실험에서 본 시스템(100)은 유전자 분석용 이미지 분석을 어떤 차수의 방정식으로 맞추면 가정 정확한 유전자 분석용 카메라 성능 판단 결과를 도출할 수 있는지 분석하되, 하기 4가지 식(식1 내지 식4)을 사용할 수 있다.As an example, in the first method, the
(식1) (Equation 1)
(식2) (Equation 2)
(식3) (Equation 3)
(식4) (Equation 4)
본 시스템(100)은 전술한 두 가지 실험을 진행하기 전에 각 대상 카메라(130)의 픽셀 단위를 일치시키기 위해 (식1)을 통해 PWM=ω인(밝기 정도가 임의의 밝기 정도인) 유전자 분석용 이미지의 분석에서 픽셀 위치를 0내지 1로 정규화할 수 있다. 본 시스템(100)은 (식2)를 통해 복수 차수의 다항식 피팅을 수행하여 다항식 계수를 구할 수 있다. 본 시스템(100)은 (식2)에서 구한 매개변수의 함수값을 다항식 값을 통해 (식3)을 도출할 수 있다.Before performing the two experiments described above, the
본 시스템(100)은 첫번째 실험을 검증하기 위해 0과 1 사이의 100개 요소에 각각의 유전자 분석용 이미지의 밝기 정도(PWM=[100, 80, 60, 40, 20])로 (식3)에서 파생된 함수 값을 곱하여 선형 플롯을 그릴 수 있다. 본 시스템(100)은 linspace 함수를 사용하여 대상 카메라(130)의 유전자 이미지 분석용 성능을 판단하기 위해 대상 카메라(130)의 PWM 100 매개변수에 상수 0.8, 0.6, 0.4, 0.2를 곱한 함수에 linspace 함수를 사용하여 0과 1 사이의 10개 요소를 곱하고 선형 플롯에 점선으로 표시할 수 있다. 이 때 PWM 100인 유전자 분석용 이미지는 상대적으로 가장 밝은 조명 조건에서 촬영한 것이므로 본 시스템(100)은 PWM 100 파라미터를 기준으로 할 수 있다. 본 시스템(100)은 두번째 실험에서 빛의 밝기에 따른 그래프 상의 기울기 변화를 (식3)에서 구한 함수의 기울기에 대한 PWM 대 기울기를 플로팅(plotting)하여 검증할 수 있다. 본 시스템(100)은 (식4)를 이용하여 각 대상 카메라(130)의 1차 방정식부터 6차 방정식까지의 오차를 계산할 수 있다. 전술한 제1방법에서 얻은 오류의 선형성을 비교하기 위해, 본 시스템(100)은 사용한 대상 카메라(130)의 각 차수에 대한 PWM 대 오류를 표시할 수 있다. 이 때 사용된 모든 대상 카메라(130)는 PWM=[100, 80, 60, 40, 20]의 순서로 촬영될 수 있다.In order to verify the first experiment, this
일 예로, 본 시스템(100)은 제2방법에서 대상 카메라(130)로 EOS 1100D, AR0130, PICAM 및 IMX 179를 포함하고, 전술한 대상 카메라(130) 4대에 대한 유전자 분석용 성능 판단을 진행할 수 있다. 본 시스템(100)은 각 대상 카메라(130) 별 상대적으로 가장 밝은 조명에서 촬영된 PWM 100인 유전자 분석용 이미지를 피팅(fitting)하여 얻은 다항식 매개변수들을 통해, PWM 80부터 20까지에 대해 오차가 가장 적은 상수 값을 찾고 그 때의 오차를 비교할 수 있다. 본 시스템(100)은 PWM 100의 매개변수 값을 하기의 (식5)를 통해 구하고, 그에 대한 함수값과 오차는 하기 (식6) 및 (식7)을 통해 계산할 수 있다.As an example, the
(식5) (Equation 5)
(식6) (Equation 6)
(식7) (Equation 7)
PWM=[80, 60, 40, 20]이면, 본 시스템(100)은 오류를 최소화하는 상수를 얻기 위해 하기 3가지 방정식(식8 내지 식10)을 사용할 수 있다.If PWM=[80, 60, 40, 20], the
본 시스템(100)은 전술한 식을 통해 구한 상수의 선형성을 각 대상 카메라(130)의 3차 파라미터에 대한 PWM 대 상수를 통해 확인할 수 있다. 오류를 최소화하는 상수 d가 곱해지면 오류 값의 결과가 PWM 대 오류 플롯을 통해 표시될 수 있다. 이 때 상수 d=[1, 0.8, 0.6, 0.4, 0.2] 베이스라인 또한 표시될 수 있다.The
(식8) (Equation 8)
(식9) (Equation 9)
(식10) (Equation 10)
본원의 일 실시예에 따르면, 평가 시스템은, 암실 안에서 수행되는 것일 수 있다.According to one embodiment of the present application, the evaluation system may be performed in a dark room.
도 7은 본원의 일 실시예에 따른 카메라 별 1차 변수 관계도를 도시한 도면이다.Figure 7 is a diagram showing the relationship between primary variables for each camera according to an embodiment of the present application.
도 7을 참조하면, 도 7(a)는 대상 카메라(130)인 DSLR의 1차 변수에 대한 관계도이고, 도 7(b)는 대상 카메라(130)인 IMX179의 1차 변수에 대한 관계도이고, 도 7(c)는 대상 카메라(130)인 AR0130의 1차 변수에 대한 관계도이고, 도 7(d)는 대상 카메라(130)인 PICAM의 1차 변수에 대한 관계도임을 확인할 수 있다.Referring to FIG. 7, FIG. 7(a) is a relationship diagram for the primary variable of the DSLR, which is the
도 7은 제1방법의 첫번째 실험 조건을 확인하기 위해 그려진 플롯(plot)으로 x축은 linspace 함수를 사용하여 곱한 정수 범위 0부터 1을 의미하고, y축은 pwm 밝기 정도를 나타내는 것일 수 있다. 도 7을 참조하면, 대상 카메라(130) 4대에서 각각의 유전자 분석용 이미지의 밝기 정도에 대한 매개변수로 생성한 함수를 사용하여 그린 파란색 선이 PWM 100 매개변수에 상수 0.8, 0.6, 0.4, 0.2를 곱하여 생성한 함수로 그린 빨간색 점과 일치함을 확인할 수 있다. 이는 광 조사부(120)의 밝기와 관계 없이 각 대상 카메라(130)의 반사율이 일정함을 확인할 수 있다.Figure 7 is a plot drawn to confirm the first experimental conditions of the first method. The x-axis represents an integer range from 0 to 1 multiplied using the linspace function, and the y-axis may represent the PWM brightness level. Referring to FIG. 7, the blue line drawn using the function created as a parameter for the brightness level of each image for genetic analysis in the four
본원의 일 실시예에 따르면, 대상 카메라(130)는, 밝기 정도에 상관 없이 반사율이 일정한 것일 수 있다.According to an embodiment of the present application, the
일 예로, 대상 카메라(130)의 유전자 분석용 이미지의 밝기 정도에 기초한 반사율이 일정하지 않으면, 판단부(142)는 대상 카메라(130)가 유전자 분석용 성능에 있어서 부적합하다고 판단할 수 있다.For example, if the reflectance based on the brightness of the image for genetic analysis of the
도 8은 본원의 일 실시예에 따른 카메라 별 1차 PWM에 따른 기울기 그래프를 도시한 도면이다.Figure 8 is a diagram showing a slope graph according to the primary PWM for each camera according to an embodiment of the present application.
도 8을 참조하면, 두번째 실험의 결과를 플로팅한 것을 확인할 수 있고, 도 8에서 모든 대상 카메라(130)의 밝기에 따른 기울기 변화가 비례함을 확인할 수 있다. 대상 카메라(130)의 유전자 분석용 성능이 좋을수록, 광 조사부(120)의 밝기 정도에 기초한 기울기가 선형적이라고 할 수 있다. 4대의 대상 카메라(130) 중 AR0130의 기울기가 상대적으로 가장 직선적임을 확인할 수 있다.Referring to FIG. 8, it can be seen that the results of the second experiment are plotted, and it can be seen in FIG. 8 that the slope change according to the brightness of all
도 9는 본원의 일 실시예에 따른 카메라 차수 별 PWM에 따른 에러 그래프를 도시한 도면이다.Figure 9 is a diagram showing an error graph according to PWM for each camera order according to an embodiment of the present application.
도 9를 참조하면, 그래프는 각 대상 카메라(130) 차수 별 PWM과 에러의 관계를 나타냄을 확인할 수 있다. 전술한 실험에서 광 조사부(120)의 광 조사가 균일하게 이루어지지 않기 때문에 1차식만으로 결론을 내리기 어려우므로 차수를 올려가면서 분석될 수 있다. 1차 방정식부터 6차 방정식까지의 오차를 비교한 결과, 모든 대상 카메라(130)의 오차가 3차 이상일 때 큰 차이가 없음을 확인할 수 있다. 정리하자면, 3차 이상의 경우에도 유사한 결과를 나타내므로, 유전자 분석용 이미지의 밝기 정도 분석 과정에서 1차 내지 3차 방정식으로도 충분한 결과를 얻을 수 있음을 확인할 수 있다.Referring to FIG. 9, it can be seen that the graph shows the relationship between PWM and error for each
도 10은 본원의 일 실시예에 따른 카메라의 3차 변수에 대한 비교 그래프를 도시한 도면이다.FIG. 10 is a diagram illustrating a comparison graph for tertiary variables of a camera according to an embodiment of the present application.
도 10(a)를 참조하면, 대상 카메라(130)의 3차 변수에 대한 비교 그래프에서의 상수를 확인할 수 있고, 도 10(b)를 참조하면, 대상 카메라(130)의 3차 변수에 대한 비교 그래프에서의 오류값을 확인할 수 있다.Referring to FIG. 10(a), you can check the constant in the comparison graph for the tertiary variable of the
일 예로, 본 시스템(100)은 제1방법에서의 두번째 실험 결과를 기초로 하여 제2방법에서 3차 매개변수를 기준으로 상수와 오차 비교를 진행할 수 있다. 또한, 제2방법의 결과를 그래프로 도시한 도 10(a)를 통해 상수 기준선과 상대적으로 가장 유사한 즉, 상대적으로 가장 선형적인 카메라를 확인해본 결과 4대의 대상 카메라(130) 중에서 AR0130의 결과가 상대적으로 가장 선형적인 것(직선에 가까운 것)일 수 있다. 또한, 도 10(b)의 결과처럼 AR0130의 오차가 상대적으로 가장 작은 것을 확인할 수 있다. 제1방법의 결과 및 제2방법의 결과를 토대로, 4대의 대상 카메라(130) 중 상대적으로 가장 선형적인 AR0130이 가장 성능이 우수함을 확인할 수 있다. 따라서 이 경우 실제 전기 영동 테스트 후 아가로스 젤 영상 분석 실험에서 사용될 카메라로 AR0130이 선정될 수 있다.As an example, the
도 11은 본원의 일 실시예에 따른 대상 카메라(130)의 촬영 규격 비교 예시를 도시한 도면이다.FIG. 11 is a diagram illustrating an example of comparing the shooting standards of the
일 예로 도 11에 도시된 Image size(이미지 크기)를 통해 확인할 수 있듯이, 사용한 대상 카메라(130)의 이미지 픽셀 단위가 모두 다르므로, 정확한 비교를 위해서 본 시스템(100)은 서로 다른 픽셀 단위로 촬영된 유전자 분석용 이미지를 OpenCV 함수인 cv2.getPerspectiveTransform() 및 cv2.warpPerspective()를 사용하여 동일하게 맞추는 작업을 진행한 후 실험별 분석에 사용할 밴드 이미지(Band image)를 출력할 수 있다. 테스트 시트(110)에 포함된 아가로스 젤의 밝기 정도가 자외선 조사기에 의해 조사된 자외선(UV)으로 인해 감소할 수 있으므로 복수의 대상 카메라(130)가 실험 시 아가로스 젤을 교대로 촬영함으로써 비교될 수 있다. 예를 들어, 제1대상 카메라(130)와 제2대상 카메라(130)의 비교 시 테스트 시트(110) 2개를 이용하여 본 시스템(100)이 제1대상 카메라(130) → 제2대상 카메라(130) → 제1대상 카메라(130) 순으로 제1아가로스 젤을 촬영하고, 제2대상 카메라(130) → 제1대상 카메라(130) → 제2대상 카메라(130) 순으로 제2아가로스 젤을 촬영하고 나서 촬영된 유전자 분석용 이미지의 밴드 볼륨(Band volume)을 비교할 수 있다.As an example, as can be seen through the Image size shown in FIG. 11, the image pixel units of the
예를 들어, 본 시스템(100)은 대상 카메라(130)로써 DSLR과 AR0130의 비교를 수행할 때, 본 시스템(100)은 아가로스 젤 2개를 이용하여 DSLR → AR0130 → DSLR 순서로 첫번째 아가로스 젤을 촬영(실험1)하고, AR0130 → DSLR → AR0130 순으로 두번째 아가로스 젤을 촬영(실험2)한 다음 촬영된 유전자 분석용 이미지의 밴드 볼륨(Band volume)을 비교할 수 있다. AR0130 및 IMX179의 비교도 전술한 예와 동일하게 진행될 수 있다.For example, when the
예를 들어, 본 시스템(100)은 대상 카메라(130)로써 AR0130과 IMX179의 비교를 수행할 때, 본 시스템(100)은 아가로스 젤 2개를 이용하여 AR0130 → IMX179 → AR0130 순서로 첫번째 아가로스 젤을 촬영(실험3)하고, IMX179 → AR0130 → IMX179 순으로 두번째 아가로스 젤을 촬영(실험4) 한 다음 촬영된 유전자 분석용 이미지의 밴드 볼륨(Band volume)을 비교할 수 있다.For example, when the
일 예로, 선택된 복수의 대상 카메라(130)의 성능을 비교하기 위해, 테스트 시트(110)에 포함된 유전자 아가로스 젤에 PCR이 진행되고 나서 증폭된 DNA 샘플에 뉴클리에이스프리 워터(Nuclease-free water)가 첨가되어 1, 1/2, 1/5, 1/10, 1/20 농도로 희석될 수 있다. 전술한 농도가 다른 5 종류의 시약이 아가로스 젤에 삽입되어 25분 동안 전기 영동이 실시된 후 선택한 적어도 하나 이상의 대상 카메라(130)로 촬영을 하고, 촬영된 영상의 분석을 진행할 수 있다. 대상 카메라(130)들의 촬영 환경은 도 11과 같이 설정될 수 있다. 대상 카메라(130)는 자외선 조사기가 테스트 시트(110)에 120초 동안 자외선을 조사하고 나서 테스트 시트(110)를 촬영할 수 있다.As an example, in order to compare the performance of a plurality of selected
도 12는 본원의 일 실시예에 따른 유전자 분석용 이미지에 기초하여 카메라 성능을 판단하는 시스템(100)의 외면 및 내부 구조를 도시한 도면이다.FIG. 12 is a diagram illustrating the external surface and internal structure of a
일 예로 도 12(a)를 참조하면, 본 시스템(100)의 외면을 도시한 것이고, 도 12(b)를 참조하면, 본 시스템(100)의 내부 구조를 도시한 것임을 확인할 수 있다.As an example, referring to FIG. 12(a), it can be seen that the outer surface of the
일 예로, 본 시스템(100)은 자외선 조사기를 포함하고, 자외선 조사기가 테스트 시트(110)의 주변부에 자외선을 조사할 수 있다. 예를 들어 자외선 조사기는 UV 투광기(제조사: MAESTROGEN, 제품명: UV Transilluminator_UUV-01 UltraSlim, Viewing Size: 8*15 cm, UV Lamp: T5-6W-301 1pc, Filter: UltraSafe UV 차단)와 같은 제품일 수 있으나, 이에 한정되는 것은 아니다.As an example, the
일 예로, 본 시스템(100)은 암실을 포함하고, 암실 내부에 테스트 시트(110), 광 조사부(120), 대상 카메라(130) 및 자외선 조사기가 위치할 수 있다. 예를 들어, 암실은 흑색 아크릴 재질의 외면 케이스일 수 있으나, 이에 한정되는 것은 아니다.As an example, the
일 예로, 대상 카메라(130)는 발광 필터를 장착할 수 있다. 예를 들어, 발광 필터는 Tiffen's Orange Filter(제조사: Tiffen, 제품명: Tiffen 58mm 21 Filter(Orange), Size: 58mm, Photo Filter Effect Type: Ultraviolet)와 같은 제품일 수 있으나, 이에 한정되는 것은 아니다.As an example, the
도 13은 본원의 일 실시예에 따른 유전자 분석용 이미지를 도시한 도면이다.Figure 13 is a diagram showing an image for genetic analysis according to an embodiment of the present application.
도 13(a) 및 도 13(b)를 참조하여 예를 들면, 각각의 유전자 분석용 이미지에 포함된 밴드(Band) 이미지는 후술될 도 15에서와 같이 본 시스템(100)에 포함된 젤 분석기(Gel analyzer)를 사용하여 분석된 밴드 볼륨(Band volume)을 통해 유전자 분석용 카메라 성능 비교에 사용될 수 있다. 본 시스템(100)은 대상 카메라(130)의 유전자 분석용 성능 비교를 위해 대상 카메라(130) 별 유전자 분석용 이미지에 포함된 밴드 볼륨(Band volume)에 대한 결정 계수(Coefficient of Determination: R2)를 구하고, 밴드 볼륨에 대한 결정 계수의 크기에 따라 제일 큰 수치를 1위로 하여 대상 카메라(130)에 순위(Rank)를 매겨 비교하되, 전술한 (실험1) 및 (실험3)의 유전자 분석용 이미지의 밴드 볼륨(Band volume) R2의 평균값과 (실험2)의 유전자 분석용 이미지의 R2값을 비교하고, 기울기 또한 비교할 수 있다. 이 때 AR0130과 IMX179는 최대 노출(Exposure)로 설정될 수 있기 때문에 밝기 정도에 대한 비교도 함께 분석될 수 있다.For example, with reference to FIGS. 13(a) and 13(b), the band image included in each image for genetic analysis is a gel analyzer included in the
본원의 일 실시예에 따르면, 카메라 성능 판단 시스템은, 테스트 시트(110)의 주변부에 자외선을 조사하는 자외선 조사기를 더 포함할 수 있다.According to an embodiment of the present application, the camera performance determination system may further include an ultraviolet irradiator that irradiates ultraviolet rays to the periphery of the
일 예로, 본 시스템(100)은 암실을 포함하되, 자외선 조사기가 암실 내부에 위치하고, 자외선 조사기는 적어도 하나 이상일 수 있다. 자외선 조사기는 본 장치(140)에 의해 제어될 수 있다. 테스트 시트(110)는 유전자를 포함하는 아가로스 젤을 포함하되, 아가로스 젤에 유전자 염색제(예를 들어, EtBr)가 첨가되고, 자외선 조사기에 의해 조사된 자외선으로 인해 염색된 유전자가 가시광선을 발광하는 것일 수 있다.As an example, the
도 14는 본원의 일 실시예에 따른 카메라 별 실험 결과를 도시한 도면이다.Figure 14 is a diagram showing the results of an experiment for each camera according to an embodiment of the present application.
도 14를 참조하여 예를 들면, 본 시스템(100)은 전술한 (실험1), (실험2), (실험3) 및 (실험4)에서 각 대상 카메라(130)들의 밴드 볼륨(Band volume)을 비교하여 산출된 결정 계수(Coefficient of Determination: R2) 및 순위에 대한 결과가 도 14에서와 같이 도시될 수 있다. 본 시스템(100)은 전술한 (실험1) 및 (실험2)에 기초하여 DSLR과 AR0130을 비교하자면, DSLR이 상대적으로 유전자 분석용 성능이 더 우수하다고 판단하고, 전술한 (실험 3) 및 (실험 4)에 기초하여 AR0130과 IMX179를 비교하자면, AR0130이 상대적으로 유전자 분석용 성능이 더 우수하다고 판단할 수 있다.For example, with reference to FIG. 14, the
도 15는 본원의 일 실시예에 따른 유전자 분석용 이미지의 대역 분석을 도시한 도면이다.Figure 15 is a diagram illustrating band analysis of an image for genetic analysis according to an embodiment of the present application.
도 15를 참조하여 예를 들면, 도 15는 (실험1) 내지 (실험4)의 1, 3번째 이미지의 밴드 볼륨(Band volume)의 평균과 2번째 이미지의 볼륨(Volume) 비교 결과임을 확인할 수 있다. DSLR과 AR0130의 선형성이 유사하며, 기울기를 비교했을 때 두 실험에서 큰 차이를 보이지 않음을 확인할 수 있다. 이는 기준이 되는 대상 카메라(130)인 DSLR의 노출(Exposure)과 AR0130의 최대 노출(Exposure)이 유사하게 설정되었음을 확인할 수 있다. 마찬가지로 AR0130과 IMX179 비교에서는 AR0130의 선형성이 더 좋고, 기울기를 비교한 결과 AR0130이 농도를 밝기로 상대적으로 더 잘 표현할 수 있다.For example, with reference to FIG. 15, it can be seen that FIG. 15 is the result of comparing the average band volume of the first and third images of (Experiment 1) to (Experiment 4) with the volume of the second image. there is. It can be seen that the linearity of DSLR and AR0130 is similar, and there is no significant difference between the two experiments when comparing the slopes. It can be confirmed that the exposure of the DSLR, which is the
본원의 일 실시예에 따르면, 밝기 분석부(141)는 밝기 변화 유전자 분석용 이미지를 기초로 밝기 변화 유전자 분석용 이미지의 밝기 정도를 분석할 수 있다.According to an embodiment of the present application, the
본원의 일 실시예에 따르면, 판단부(142)는, 밝기 변화 유전자 분석용 이미지의 밝기 정도에 기초한 밝기 변화 정도가 기 설정된 범위 내에 존재하면, 유전자 분석용 성능 정도를 판단함에 있어서 대상 카메라(130)가 적합하다고 판단할 수 있다.According to an embodiment of the present application, the
이하에서는 상기에 자세히 설명된 내용을 기반으로, 본원의 동작 흐름을 간단히 살펴보기로 한다.Below, we will briefly look at the operation flow of the present application based on the details described above.
도 16은 본원의 일 실시예에 따른 유전자 분석용 이미지에 기초하여 카메라 성능을 판단하는 방법에 대한 동작 흐름도이다.Figure 16 is an operation flowchart of a method for determining camera performance based on an image for genetic analysis according to an embodiment of the present application.
도 16에 도시된 유전자 분석용 이미지에 기초하여 카메라 성능을 판단하는 방법은 앞서 설명된 유전자 분석용 이미지에 기초하여 카메라 성능을 판단하는 시스템(100)에 의하여 수행될 수 있다. 따라서, 이하 생략된 내용이라고 하더라도 유전자 분석용 이미지에 기초하여 카메라 성능을 판단하는 시스템(100)에 대하여 설명된 내용은 유전자 분석용 이미지에 기초하여 카메라 성능을 판단하는 방법에 대한 설명에도 동일하게 적용될 수 있다.The method of determining camera performance based on the image for genetic analysis shown in FIG. 16 may be performed by the
S11 단계에서, 광 조사부(120)가 유전자 샘플을 포함하는 테스트 시트(110)의 주변부에 광을 조사할 수 있다.In step S11, the
S12 단계에서, 대상 카메라(130)가 테스트 시트(110)를 촬영하여 유전자 분석용 이미지를 생성할 수 있다.In step S12, the
S13 단계에서, 밝기 분석부(141)가 유전자 분석용 이미지를 기초로 유전자 분석용 이미지의 밝기 정도를 분석할 수 있다.In step S13, the
S14 단계에서, 판단부(142)가 밝기 정도에 기초하여 대상 카메라(130)의 유전자 분석용 성능 정도를 판단할 수 있다.In step S14, the
상술한 설명에서, 단계 S11 내지 S14는 본원의 구현예에 따라서, 추가적인 단계들로 더 분할되거나, 더 적은 단계들로 조합될 수 있다. 또한, 일부 단계는 필요에 따라 생략될 수도 있고, 단계 간의 순서가 변경될 수도 있다.In the above description, steps S11 to S14 may be further divided into additional steps or combined into fewer steps, depending on the implementation of the present disclosure. Additionally, some steps may be omitted or the order between steps may be changed as needed.
본원의 일 실시 예에 따른 유전자 분석용 이미지에 기초하여 카메라 성능을 판단하는 방법은 다양한 컴퓨터 수단을 통하여 수행될 수 있는 프로그램 명령 형태로 구현되어 컴퓨터 판독 가능 매체에 기록될 수 있다. 상기 컴퓨터 판독 가능 매체는 프로그램 명령, 데이터 파일, 데이터 구조 등을 단독으로 또는 조합하여 포함할 수 있다. 상기 매체에 기록되는 프로그램 명령은 본 발명을 위하여 특별히 설계되고 구성된 것들이거나 컴퓨터 소프트웨어 당업자에게 공지되어 사용 가능한 것일 수도 있다. 컴퓨터 판독 가능 기록 매체의 예에는 하드 디스크, 플로피 디스크 및 자기 테이프와 같은 자기 매체(magnetic media), CD-ROM, DVD와 같은 광기록 매체(optical media), 플롭티컬 디스크(floptical disk)와 같은 자기-광 매체(magneto-optical media), 및 롬(ROM), 램(RAM), 플래시 메모리 등과 같은 프로그램 명령을 저장하고 수행하도록 특별히 구성된 하드웨어 장치가 포함된다. 프로그램 명령의 예에는 컴파일러에 의해 만들어지는 것과 같은 기계어 코드뿐만 아니라 인터프리터 등을 사용해서 컴퓨터에 의해서 실행될 수 있는 고급 언어 코드를 포함한다. 상기된 하드웨어 장치는 본 발명의 동작을 수행하기 위해 하나 이상의 소프트웨어 모듈로서 작동하도록 구성될 수 있으며, 그 역도 마찬가지이다.The method of determining camera performance based on images for genetic analysis according to an embodiment of the present application may be implemented in the form of program instructions that can be executed through various computer means and recorded on a computer-readable medium. The computer-readable medium may include program instructions, data files, data structures, etc., singly or in combination. Program instructions recorded on the medium may be specially designed and constructed for the present invention or may be known and usable by those skilled in the art of computer software. Examples of computer-readable recording media include magnetic media such as hard disks, floppy disks, and magnetic tapes, optical media such as CD-ROMs and DVDs, and magnetic media such as floptical disks. -Includes optical media (magneto-optical media) and hardware devices specifically configured to store and execute program instructions, such as ROM, RAM, flash memory, etc. Examples of program instructions include machine language code, such as that produced by a compiler, as well as high-level language code that can be executed by a computer using an interpreter, etc. The hardware devices described above may be configured to operate as one or more software modules to perform the operations of the present invention, and vice versa.
또한, 전술한 유전자 분석용 이미지에 기초하여 카메라 성능을 판단하는 방법은 기록 매체에 저장되는 컴퓨터에 의해 실행되는 컴퓨터 프로그램 또는 애플리케이션의 형태로도 구현될 수 있다.Additionally, the method of determining camera performance based on the above-described image for genetic analysis may also be implemented in the form of a computer program or application executed by a computer stored in a recording medium.
전술한 본원의 설명은 예시를 위한 것이며, 본원이 속하는 기술분야의 통상의 지식을 가진 자는 본원의 기술적 사상이나 필수적인 특징을 변경하지 않고서 다른 구체적인 형태로 쉽게 변형이 가능하다는 것을 이해할 수 있을 것이다. 그러므로 이상에서 기술한 실시예들은 모든 면에서 예시적인 것이며 한정적이 아닌 것으로 이해해야만 한다. 예를 들어, 단일형으로 설명되어 있는 각 구성 요소는 분산되어 실시될 수도 있으며, 마찬가지로 분산된 것으로 설명되어 있는 구성 요소들도 결합된 형태로 실시될 수 있다.The description of the present application described above is for illustrative purposes, and those skilled in the art will understand that the present application can be easily modified into other specific forms without changing its technical idea or essential features. Therefore, the embodiments described above should be understood in all respects as illustrative and not restrictive. For example, each component described as unitary may be implemented in a distributed manner, and similarly, components described as distributed may also be implemented in a combined form.
본원의 범위는 상기 상세한 설명보다는 후술하는 특허청구범위에 의하여 나타내어지며, 특허청구범위의 의미 및 범위 그리고 그 균등 개념으로부터 도출되는 모든 변경 또는 변형된 형태가 본원의 범위에 포함되는 것으로 해석되어야 한다.The scope of the present application is indicated by the claims described below rather than the detailed description above, and all changes or modified forms derived from the meaning and scope of the claims and their equivalent concepts should be construed as being included in the scope of the present application.
100: 유전자 분석용 이미지에 기초하여 카메라 성능을 판단하는 시스템
110: 테스트 시트
120: 광 조사부
130: 대상 카메라
140: 유전자 분석용 이미지에 기초하여 카메라 성능을 판단하는 장치
141: 밝기 분석부
142: 판단부100: System for determining camera performance based on images for genetic analysis
110: test sheet
120: Light irradiation unit
130: target camera
140: Device for determining camera performance based on images for genetic analysis
141: Brightness analysis unit
142: Judgment unit
Claims (15)
유전자 샘플을 포함하는 테스트 시트;
상기 테스트 시트의 주변부에 광을 조사하는 광 조사부;
상기 테스트 시트를 촬영하여 유전자 분석용 이미지를 생성하는 대상 카메라;
상기 유전자 분석용 이미지를 기초로 상기 유전자 분석용 이미지의 밝기 정도를 분석하는 밝기 분석부; 및
상기 밝기 정도에 기초하여 상기 대상 카메라의 유전자 분석용 성능 정도를 판단하는 판단부,
를 포함하되,
상기 광 조사부는,
상기 광의 밝기 정도를 제1밝기 정도 내지 제2밝기 정도로 조절하여 조사하되,
상기 제1밝기 정도는,
상기 제2밝기 정도 보다 광의 밝기 정도가 약한 것이고,
상기 광 조사부가 상기 제1밝기 정도에서부터 상기 제2밝기 정도까지 상기 광의 밝기 정도를 조절하며 상기 테스트 시트의 주변부에 상기 광을 조사하는 동안, 상기 대상 카메라가 상기 테스트 시트를 촬영하여 밝기 변화 유전자 분석용 이미지를 생성하고,
상기 판단부는,
상기 밝기 변화 유전자 분석용 이미지의 밝기 정도에 기초한 밝기 변화 정도가 기 설정된 범위 내에 존재하면, 상기 대상 카메라의 반사율에 기초하여 상기 대상 카메라의 유전자 분석용 성능 정도를 적합으로 판단하는 것인,
카메라 성능 판단 시스템.In a system for determining camera performance based on images for genetic analysis,
A test sheet containing a genetic sample;
a light irradiation unit that irradiates light to a peripheral area of the test sheet;
a target camera that photographs the test sheet and generates an image for genetic analysis;
a brightness analysis unit that analyzes the brightness level of the image for genetic analysis based on the image for genetic analysis; and
A determination unit that determines the degree of performance of the target camera for genetic analysis based on the brightness level,
Including,
The light irradiation unit,
The brightness of the light is adjusted to a first brightness level to a second brightness level,
The first brightness level is,
The brightness level of the light is weaker than the second brightness level,
While the light irradiation unit adjusts the brightness level of the light from the first brightness level to the second brightness level and irradiates the light to the periphery of the test sheet, the target camera photographs the test sheet and analyzes the brightness change gene. Create a dragon image,
The judgment department,
If the degree of brightness change based on the brightness degree of the image for genetic analysis of the brightness change exists within a preset range, the degree of performance for genetic analysis of the target camera is determined to be appropriate based on the reflectance of the target camera,
Camera performance judgment system.
상기 밝기 분석부는,
상기 밝기 변화 유전자 분석용 이미지를 기초로 상기 밝기 변화 유전자 분석용 이미지의 밝기 정도를 분석하는 것인,
카메라 성능 판단 시스템.According to paragraph 1,
The brightness analysis unit,
Analyzing the brightness level of the image for brightness change gene analysis based on the image for brightness change gene analysis,
Camera performance judgment system.
상기 카메라 성능 판단 시스템은,
상기 테스트 시트의 주변부에 자외선을 조사하는 자외선 조사기를 더 포함하는 것인,
카메라 성능 판단 시스템.According to paragraph 1,
The camera performance judgment system is,
Further comprising an ultraviolet irradiator that irradiates ultraviolet rays to the periphery of the test sheet,
Camera performance judgment system.
상기 대상 카메라는,
개방형 플랫폼 카메라, CCD 카메라 및 CMOS 카메라 중 적어도 하나를 포함하는,
카메라 성능 판단 시스템.According to paragraph 1,
The target camera is,
Comprising at least one of an open platform camera, a CCD camera, and a CMOS camera,
Camera performance judgment system.
상기 대상 카메라는,
필터를 포함하는 것인,
카메라 성능 판단 시스템.According to paragraph 1,
The target camera is,
which includes a filter,
Camera performance judgment system.
상기 대상 카메라는,
상기 테스트 시트의 상부에 위치하는 것인,
카메라 성능 판단 시스템.According to paragraph 1,
The target camera is,
Located at the top of the test sheet,
Camera performance judgment system.
상기 카메라 성능 판단 시스템은,
암실 안에서 수행되는 것인,
카메라 성능 판단 시스템.According to paragraph 1,
The camera performance judgment system is,
Performed in a darkroom,
Camera performance judgment system.
상기 테스트 시트는,
유전자 샘플을 포함하되, 상기 유전자 샘플에 중합효소 연쇄반응(PCR, Polymerase Chain Reaction)이 수행되어 유전자가 증폭되고, 증폭된 상기 유전자 샘플에 전기 영동이 수행된 것인,
카메라 성능 판단 시스템.According to paragraph 1,
The test sheet is,
Including a genetic sample, wherein a polymerase chain reaction (PCR) is performed on the genetic sample to amplify the gene, and electrophoresis is performed on the amplified genetic sample,
Camera performance judgment system.
상기 광 조사부는,
LED조명 및 디퓨저를 포함하는 것인,
카메라 성능 판단 시스템.According to paragraph 1,
The light irradiation unit,
Including LED lights and diffusers,
Camera performance judgment system.
광 조사부가 유전자 샘플을 포함하는 테스트 시트의 주변부에 광을 조사하는 단계;
대상 카메라가 상기 테스트 시트를 촬영하여 유전자 분석용 이미지를 생성하는 단계;
밝기 분석부가 상기 유전자 분석용 이미지를 기초로 상기 유전자 분석용 이미지의 밝기 정도를 분석하는 단계; 및
판단부가 상기 밝기 정도에 기초하여 상기 대상 카메라의 유전자 분석용 성능 정도를 판단하는 단계,
를 포함하되,
상기 광을 조사하는 단계는,
상기 광의 밝기 정도를 제1밝기 정도 내지 제2밝기 정도로 조절하여 조사하고,
상기 제1밝기 정도는,
상기 제2밝기 정도 보다 광의 밝기 정도가 약한 것이고,
상기 유전자 분석용 이미지를 생성하는 단계는,
상기 광 조사부가 상기 제1밝기 정도에서부터 상기 제2밝기 정도까지 상기 광의 밝기 정도를 조절하며 상기 테스트 시트의 주변부에 상기 광을 조사하는 동안, 상기 대상 카메라가 상기 테스트 시트를 촬영하여 밝기 변화 유전자 분석용 이미지를 생성하고,
상기 판단하는 단계는,
상기 밝기 변화 유전자 분석용 이미지의 밝기 정도에 기초한 밝기 변화 정도가 기 설정된 범위 내에 존재하면, 상기 대상 카메라의 반사율에 기초하여 상기 대상 카메라의 유전자 분석용 성능 정도를 적합으로 판단하는 것인,
카메라 성능 판단 방법.In a method performed by a camera performance determination system and determining camera performance based on images for genetic analysis,
A light irradiation unit irradiating light to the periphery of a test sheet containing a genetic sample;
generating an image for genetic analysis by having a target camera photograph the test sheet;
A brightness analysis unit analyzing the brightness level of the image for genetic analysis based on the image for genetic analysis; and
A determination unit determining the level of performance for genetic analysis of the target camera based on the brightness level,
Including,
The step of irradiating the light is,
The brightness of the light is adjusted to a first brightness level to a second brightness level and irradiated,
The first brightness level is,
The brightness level of the light is weaker than the second brightness level,
The step of generating an image for genetic analysis is,
While the light irradiation unit adjusts the brightness level of the light from the first brightness level to the second brightness level and irradiates the light to the periphery of the test sheet, the target camera photographs the test sheet and analyzes the brightness change gene. Create a dragon image,
The above judgment step is,
If the degree of brightness change based on the brightness degree of the image for genetic analysis of the brightness change exists within a preset range, the degree of performance for genetic analysis of the target camera is determined to be appropriate based on the reflectance of the target camera,
How to judge camera performance.
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Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
KR1020220014652A KR102585823B1 (en) | 2022-02-04 | 2022-02-04 | System and method for determining camera performance based on image for genetic analysis |
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KR20110099412A (en) * | 2010-03-02 | 2011-09-08 | 삼성전자주식회사 | Apparatus and method for rendering according to ray tracing using reflection map and transparency map |
US9625387B2 (en) * | 2014-09-16 | 2017-04-18 | Lawrence Livermore National Security, Llc | System and method for controlling depth of imaging in tissues using fluorescence microscopy under ultraviolet excitation following staining with fluorescing agents |
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2022
- 2022-02-04 KR KR1020220014652A patent/KR102585823B1/en active IP Right Grant
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Non-Patent Citations (1)
Title |
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신상철 외5, "보급형 DNA 젤 이미징을 위한 카메라 성능 비교", 한국정보기술학회논문지, 2012.06.12.* |
Also Published As
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KR20230118283A (en) | 2023-08-11 |
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