KR102531666B1 - Composition for diagnostic african swine fever using two recombinant antigens and diagnostic kits comprising thereof - Google Patents
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Abstract
본 발명은 아프리카돼지열병 바이러스 (African swine fever Virus; ASFV) 감염 여부를 진단하기 위해 2종의 재조합 항원을 포함하는 아프리카돼지열병 진단용 항원 조성물, 이를 이용하는 아프리카 돼지열병 진단용 키트 및 아프리카 돼지열병 진단을 위한 정보 제공 방법에 관한 것으로, 본 발명의 항원 조성물을 이용하면 아프리카 돼지열병 항체를 검출함으로써, 진단 정확도가 우수하고, 키트로 제공되어 사용이 간편하고 신속하다.The present invention relates to an antigen composition for diagnosing African swine fever virus (ASFV) containing two recombinant antigens for diagnosing African swine fever virus (ASFV) infection, a kit for diagnosing African swine fever using the same, and a composition for diagnosing African swine fever It relates to a method for providing information. By detecting African swine fever antibodies using the antigen composition of the present invention, diagnostic accuracy is excellent, and it is provided as a kit, which is simple and quick to use.
Description
본 발명은 아프리카돼지열병 바이러스 (African swine fever Virus; ASFV) 감염 여부를 진단하기 위해 2종의 재조합 항원을 이용하는 아프리카돼지열병 진단용 항원 조성물, 이를 포함하는 아프리카 돼지열병 진단용 키트 및 아프리카 돼지열병 진단을 위한 정보 제공 방법에 관한 것이다.The present invention is an antigen composition for diagnosing African swine fever virus (ASFV) using two recombinant antigens to diagnose African swine fever virus (ASFV) infection, a kit for diagnosing African swine fever including the same, and a composition for diagnosing African swine fever It is about how information is provided.
아프리카돼지열병 (African swine fever; ASF)은 아스파비리대(Asfarviridae)에 속하는 아프리카돼지열병 바이러스 (African swine fever virus; ASFV) 감염에 의한 돼지 전염병이다. 1921년 케냐에서 최초 발생 보고가 있은 후, 주로 사하라 이남 지역에서 발생 보고가 있었고, 2007년 이후로 흑해 연안인 죠지아 (Georgia), 아르메니아 (Armenia), 아제르바이잔 (Azerbaijan) 등 아프리카 이외 지역에서 그 발생 범위가 늘어나기 시작하였다. 특히 최근에는 러시아에서 동서로 그 발생이 확산되고 있으며, 우리나라와 교류가 많은 중국 및 동남아시아에서의 발병 사례가 급증하고 있다.African swine fever (ASF) is an infectious disease of pigs caused by infection with the African swine fever virus (ASFV) belonging to the Asfarviridae family. After the first occurrence was reported in Kenya in 1921, there were reports of occurrence mainly in the sub-Saharan region, and since 2007, the extent of occurrence in regions outside of Africa such as Georgia, Armenia, and Azerbaijan, along the Black Sea coast started to increase. In particular, recently, the outbreak has been spreading from Russia to the east and west, and cases of outbreaks in China and Southeast Asia, which have many exchanges with Korea, are rapidly increasing.
아프리카 돼지열병 바이러스는 일반 환경에 매우 저항성이 강하다. 아프리카 돼지열병 바이러스의 감염력은 실온에서 18개월 이상, 햄과 같은 식육제품에서는 6개월 이상 유지된다. 또한, 열에도 매우 강하여 56 ℃에서 최소 1시간 이상 노출하여야만 감염력이 없어지는 특성이 있는 것으로 알려져 있다.African swine fever virus is highly resistant to the general environment. The infectivity of African swine fever virus is maintained for more than 18 months at room temperature and for more than 6 months in meat products such as ham. In addition, it is known that it is very strong against heat and has a characteristic that infectivity disappears only when exposed to 56 ° C for at least 1 hour.
아프리카 돼지열병은 돼지에 감염시 폐사율이 100%에 이르는 심각한 질병임에도 불구하고 이 질병에 대한 상용화된 백신은 없는 상태이다. 유럽지역에서 아프리카 돼지열병이 다시 확산되고 아시아 대륙까지 전파되면서 과거 제대로 진행되지 못했던 백신의 개발 연구에 이목이 집중되고 있다. 하지만 안전성 문제로 약독화 생독 백신은 개발이 제한적인 상황이고 이전의 실험적 연구에서도 큰 효과를 거두지 못하였다. 사독 백신 또한 방어에 효과적인 제품을 개발하는데 넘어야 산이 많다. 예를 들어, ASFV는 다른 바이러스보다 크고 복잡한 구조를 가지고 있어 무력화시키기에 효과적인 부위가 명확히 알려져 있지 않다.Although African swine fever is a serious disease with a mortality rate of up to 100% when infected with pigs, there is no commercially available vaccine for this disease. As African swine fever spreads again in Europe and spreads to the Asian continent, attention is focused on the development of vaccines that have not progressed properly in the past. However, due to safety issues, the development of live attenuated vaccines is limited, and previous experimental studies have not been successful. There are many obstacles to overcome in developing a dead poison vaccine that is effective in defense. For example, ASFV has a larger and more complex structure than other viruses, so the effective site for incapacitating it is not clearly known.
아프리카 돼지열병 바이러스는 일반적인 RNA 바이러스들의 10배 수준으로 많은 유전자를 가지고 있다. 유전자가 크다 보니 유전자로부터 만들어질 수 있는 단백질 종류도 많으며, ASFV 유전체 (genome)는 통상 적어도 151개의 ORF를 암호화하는 것으로 알려져 있다. 아프리카 돼지열병 바이러스는 구조 단백질 개수도 많아 바이러스의 크기 자체가 다른 바이러스보다 훨씬 커서 돼지 써코바이러스 (Porcine circovirus)의 10배 이상, 돼지생식기 호흡기증후군 바이러스 (Porcine reproductive and respiratory syndrome virus; PRRS)의 4~5 배 크기에 달한다. 이렇게 아프리카 돼지열병 바이러스가 크고 복잡하다 보니 면역도 어려워 아직도 효과적인 백신이 개발되어 있지 못한 실정이다.African swine fever virus has 10 times as many genes as common RNA viruses. Since the gene is large, there are many types of proteins that can be made from the gene, and the ASFV genome is known to encode at least 151 ORFs. African swine fever virus has a large number of structural proteins, and the size of the virus itself is much larger than other viruses. It reaches 5 times its size. As the African swine fever virus is large and complex, immunity is difficult, so no effective vaccine has yet been developed.
아프리카 돼지열병의 확진을 위해서는 진단 검사가 필수적이다. 진단 검사는 혈액 및 내부 장기에서 ASFV를 검출하거나 감염 돼지의 혈청에서 항체를 검출하는 방법이 있다. 항체를 검사하는 경우, 샘플은 감염 후 8~21일 사이의 회복기에 있는 감염 돼지의 혈청이 이상적이다. 감염돈의 혈청을 이용한 항체 검출법은 상용화된 효소면역분석법 (Enzyme Linked Immunosorbent assay; ELISA) 등을 이용하여 1차 선별검사를 진행하고 면역탁본법 (Immunoblot test; IB), 면역과산화효소시험 (immuno-peroxidase test; IPT), 간접형광항체법 (Indirect Immunofluorescence; IFA)을 통해 최종 평가할 수 있다. ASF는 질병의 진행 단계가 빠르고 다양하며 불현성 감염된 돼지도 존재할 수 있으므로 실험실에서는 반드시 항원 및 항체 검사를 함께 수행하여 정확하게 감염 여부를 파악해야 한다.Diagnostic tests are essential to confirm the diagnosis of African swine fever. Diagnostic tests include methods for detecting ASFV in blood and internal organs or detecting antibodies in the serum of infected pigs. If testing for antibodies, the sample should ideally be serum from infected pigs in the convalescent phase between 8 and 21 days post infection. The antibody detection method using the serum of infected pigs is performed by first screening using a commercially available enzyme-linked immunosorbent assay (ELISA), etc., followed by an immunoblot test (IB), an immuno-peroxidase test (immuno- Peroxidase test; IPT) and indirect fluorescence antibody method (Indirect Immunofluorescence; IFA) can be used for final evaluation. Because ASF progresses rapidly and varies, and pigs with subclinical infection may also exist, the laboratory must perform both antigen and antibody tests to accurately determine the presence of infection.
이에, 상업적으로 제공이 가능하고, 사용이 간편하며 신속ㆍ정확하게 ASFV의 감염 여부를 진단할 수 있는 관련 기술의 개발이 시급한 실정이다.Accordingly, there is an urgent need to develop a related technology that can be provided commercially, is easy to use, and can quickly and accurately diagnose whether or not ASFV is infected.
이에 본 발명자들은 아프리카 돼지열병 (African swine fever; ASF)의 감염여부를 신속하고 간편하면서도 높은 정확도로 진단할 수 있는 항원 조성물 및 이를 이용한 아프리카 돼지열병 진단용 키트를 제작하기 위해 노력하였다.Accordingly, the present inventors have endeavored to produce an antigen composition capable of diagnosing African swine fever (ASF) infection quickly, simply, and with high accuracy, and a kit for diagnosing African swine fever using the same.
그 결과 서열번호 7의 아미노산 서열을 포함하는 펩타이드 및 서열번호 8의 아미노산 서열을 포함하는 펩타이드를 이용하는 진단용 항원 조성물, 및 이를 포함하는 키트는 신속ㆍ간편하고 높은 정확도로 아프리카 돼지열병을 진단할 수 있음을 확인하였다.As a result, a diagnostic antigen composition using a peptide comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 7 and a peptide comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 8, and a kit containing the same can diagnose African swine fever quickly, simply and with high accuracy. confirmed.
이에, 본 발명의 목적은 아프리카 돼지열병 (ASF) 진단용 항원 조성물을 제공하는 것이다.Accordingly, an object of the present invention is to provide an antigen composition for diagnosis of African swine fever (ASF).
본 발명의 다른 목적은 아프리카 돼지열병 항원 단백질 발현용 벡터를 제공하는 것이다.Another object of the present invention is to provide a vector for expressing African swine fever antigen protein.
본 발명의 또 다른 목적은 아프리카 돼지열병 (ASFV) 항원 단백질을 암호화하는 염기서열 증폭용 프라이머 세트 조성물을 제공하는 것이다.Another object of the present invention is to provide a primer set composition for amplifying a nucleotide sequence encoding an African swine fever (ASFV) antigen protein.
본 발명의 또 다른 목적은 아프리카 돼지열병 진단용 키트를 제공하는 것이다.Another object of the present invention is to provide a kit for diagnosing African swine fever.
본 발명의 또 다른 목적은 아프리카 돼지열병 진단을 위한 정보 제공 방법을 제공하는 것이다.Another object of the present invention is to provide an information providing method for diagnosing African swine fever.
본 발명은 아프리카 돼지열병 (African swine fever; ASF) 진단용 항원 조성물, 이를 포함하는 아프리카 돼지열병 진단용 키트 및 아프리카 돼지열병 진단을 위한 정보 제공 방법에 관한 것이다.The present invention relates to an antigen composition for diagnosing African swine fever (ASF), a kit for diagnosing African swine fever including the same, and a method for providing information for diagnosing African swine fever.
이하 본 발명을 더욱 자세히 설명하고자 한다.Hereinafter, the present invention will be described in more detail.
본 발명의 일 예는 서열번호 7의 아미노산 서열을 포함하는 펩타이드; 및An example of the present invention is a peptide comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 7; and
서열번호 8의 아미노산 서열을 포함하는 펩타이드;를 포함하는 아프리카 돼지열병 (African swine fever; ASF) 진단용 항원 조성물에 관한 것이다.It relates to an antigen composition for diagnosis of African swine fever (ASF) comprising: a peptide comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 8.
본 발명에 있어서 서열번호 7의 아미노산 서열을 포함하는 펩타이드는 아프리카 돼지열병 바이러스의 구조 단백질인 p22로부터 유래된 재조합 항원 단백질일 수 있다.In the present invention, the peptide comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 7 may be a recombinant antigenic protein derived from p22, a structural protein of African swine fever virus.
본 발명에 있어서 서열번호 8의 아미노산 서열을 포함하는 펩타이드는 아프리카 돼지열병 바이러스의 구조 단백질인 p30로부터 유래된 재조합 항원 단백질일 수 있다.In the present invention, the peptide comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 8 may be a recombinant antigenic protein derived from p30, a structural protein of African swine fever virus.
재조합 항원 단백질은 서열번호 7 또는 서열번호 8의 아미노산 서열을 포함하는 펩타이드일 수 있으며, 예를 들어, 이 펩타이드와 약 70% 이상, 약 80% 이상, 약 90% 이상, 약 95% 이상, 약 98% 이상, 또는 약 99% 이상의 상동성을 가져 기능적으로 동등한 단백질일 수 있다.The recombinant antigen protein may be a peptide comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 7 or SEQ ID NO: 8, for example, about 70% or more, about 80% or more, about 90% or more, about 95% or more, about It may be a functionally equivalent protein having a homology of 98% or more, or about 99% or more.
본 발명에 있어서 항원 조성물에 포함된 서열번호 7의 아미노산 서열을 포함하는 펩타이드 농도는 0.3 내지 0.7 ug/mL, 0.3 내지 0.6 ug/mL, 0.4 내지 0.7 ug/mL, 0.4 내지 0.6 ug/mL 또는 0.5 ug/mL일 수 있으며, 예를 들어, 0.5 ug/mL일 수 있으나, 이에 한정되는 것은 아니다.In the present invention, the concentration of the peptide comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 7 included in the antigen composition is 0.3 to 0.7 ug/mL, 0.3 to 0.6 ug/mL, 0.4 to 0.7 ug/mL, 0.4 to 0.6 ug/mL or 0.5 It may be ug/mL, for example, 0.5 ug/mL, but is not limited thereto.
본 발명에 있어서 항원 조성물에 포함된 서열번호 8의 아미노산 서열을 포함하는 펩타이드 농도는 0.7 내지 1.3 ug/mL, 0.7 내지 1.2 ug/mL, 0.7 내지 1.1 ug/mL, 0.8 내지 1.3 ug/mL, 0.8 내지 1.2 ug/mL, 0.8 내지 1.1 ug/mL, 0.9 내지 1.3 ug/mL, 0.9 내지 1.2 ug/mL 또는 0.9 내지 1.1 ug/mL일 수 있으며, 예를 들어, 1.0 ug/mL일 수 있으나, 이에 한정되는 것은 아니다.In the present invention, the concentration of the peptide comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 8 included in the antigen composition is 0.7 to 1.3 ug/mL, 0.7 to 1.2 ug/mL, 0.7 to 1.1 ug/mL, 0.8 to 1.3 ug/mL, 0.8 to 1.2 ug/mL, 0.8 to 1.1 ug/mL, 0.9 to 1.3 ug/mL, 0.9 to 1.2 ug/mL, or 0.9 to 1.1 ug/mL, for example, 1.0 ug/mL, but It is not limited.
본 발명의 일 구체예에서, 항원 조성물에 포함된 서열번호 7의 아미노산 서열을 포함하는 펩타이드 농도는 0.5 ug/mL이고, 서열번호 8의 아미노산 서열을 포함하는 펩타이드 농도는 1.0 ug/mL일 수 있다.In one embodiment of the present invention, the concentration of the peptide comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 7 included in the antigen composition may be 0.5 ug/mL, and the concentration of the peptide comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 8 may be 1.0 ug/mL. .
본 발명의 다른 일 예는 서열번호 5의 염기서열을 포함하는 제1 재조합 벡터; 및 서열번호 6의 염기서열을 포함하는 제2 재조합 벡터;를 포함하는 아프리카 돼지열병 (ASF) 항원 단백질 발현용 벡터에 관한 것이다.Another example of the present invention is a first recombinant vector comprising the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 5; And a second recombinant vector comprising the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 6; relates to a vector for expressing African swine fever (ASF) antigen protein.
서열번호 5의 염기서열은 서열번호 7의 아미노산 서열을 암호화하는 염기서열일 수 있다.The nucleotide sequence of SEQ ID NO: 5 may be a nucleotide sequence encoding the amino acid sequence of SEQ ID NO: 7.
서열번호 6의 염기서열은 서열번호 8의 아미노산 서열을 암호화하는 염기서열일 수 있다.The nucleotide sequence of SEQ ID NO: 6 may be a nucleotide sequence encoding the amino acid sequence of SEQ ID NO: 8.
본 명세서에서, 용어 "벡터 (vector)"는 숙주 세포에서 목적 유전자를 발현시키기 위한 수단을 의미한다. 예를 들어, 플라스미드 벡터, 코즈미드 벡터 및 박테리오파아지 벡터, 아데노바이러스 벡터, 레트로바이러스 벡터 및 아데노연관 바이러스 벡터와 같은 바이러스 벡터를 포함한다. 상기 재조합 벡터로 사용될 수 있는 벡터는 당업계에서 종종 사용되는 플라스미드 (예를 들면, pSC101, pGV1106, pACYC177, ColE1, pKT230, pME290, pBR322, pUC8/9, pUC6, pBD9, pHC79, pIJ61, pLAFR1, pHV14, pGEX 시리즈, pET 시리즈 및 pUC19 등), 파지 (예를 들면, λgt4λ, λ-Charon, λΔz1 및 M13 등) 또는 바이러스 (예를 들면, SV40 등)를 조작하여 제작될 수 있으나 이에 제한되지 않는다.As used herein, the term "vector" means a means for expressing a gene of interest in a host cell. Examples include viral vectors such as plasmid vectors, cosmid vectors and bacteriophage vectors, adenoviral vectors, retroviral vectors and adeno-associated viral vectors. Vectors that can be used as the recombinant vector are plasmids often used in the art (eg, pSC101, pGV1106, pACYC177, ColE1, pKT230, pME290, pBR322, pUC8/9, pUC6, pBD9, pHC79, pIJ61, pLAFR1, pHV14 , pGEX series, pET series, and pUC19, etc.), phages (eg, λgt4λ, λ-Charon, λΔz1, and M13, etc.) or viruses (eg, SV40, etc.), but are not limited thereto.
본 발명에 있어서 재조합 벡터는 전형적으로 클로닝을 위한 벡터 또는 발현을 위한 벡터로서 구축될 수 있다. 발현용 벡터는 당업계에서 식물, 동물 또는 미생물에서 외래의 단백질을 발현하는 데 사용되는 통상의 것을 사용할 수 있다. 또한, 재조합 벡터는 당업계에 공지된 다양한 방법을 통해 구축될 수 있다.In the present invention, a recombinant vector can typically be constructed as a vector for cloning or a vector for expression. An expression vector may be a conventional vector used in the art to express foreign proteins in plants, animals, or microorganisms. In addition, the recombinant vector can be constructed through various methods known in the art.
본 발명에 있어서 재조합 벡터는 원핵 세포 또는 진핵 세포를 숙주로 하여 구축될 수 있다. 예를 들어, 사용되는 벡터가 발현 벡터이고, 원핵 세포를 숙주로 하는 경우에는, 전사를 진행시킬 수 있는 강력한 프로모터 (예를 들어, pLλ프로모터, CMV 프로모터, trp 프로모터, lac 프로모터, tac 프로모터, T7 프로모터 등), 해독의 개시를 위한 라이보좀 결합 자리 및 전사/해독 종결 서열을 포함하는 것이 일반적이다. 진핵 세포를 숙주로 하는 경우에는, 벡터에 포함되는 진핵 세포에서 작동하는 복제원점은 f1 복제원점, SV40 복제원점, pMB1 복제원점, 아데노 복제원점, AAV 복제원점 및 BBV 복제원점 등을 포함하나, 이에 한정되는 것은 아니다. 또한, 포유동물 세포의 게놈으로부터 유래된 프로모터 (예를 들어, 메탈로티오닌 프로모터) 또는 포유동물 바이러스로부터 유래된 프로모터 (예를 들어, 아데노바이러스 후기 프로모터, 백시니아 바이러스 7.5K 프로모터, SV40 프로모터, 사이토메갈로바이러스 프로모터 및 HSV의 tk 프로모터)가 이용될 수 있으며, 전사 종결 서열로서 폴리아데닐화 서열을 일반적으로 갖는다.In the present invention, the recombinant vector can be constructed using a prokaryotic cell or a eukaryotic cell as a host. For example, when the vector used is an expression vector and a prokaryotic cell is used as a host, a strong promoter capable of promoting transcription (e.g., pLλ promoter, CMV promoter, trp promoter, lac promoter, tac promoter, T7 promoter, etc.), a ribosome binding site for initiation of translation, and a transcription/translation termination sequence. In the case of using a eukaryotic cell as a host, the origin of replication operating in the eukaryotic cell included in the vector includes the f1 origin of replication, the SV40 origin of replication, the pMB1 origin of replication, the adeno origin of replication, the AAV origin of replication and the BBV origin of replication, etc. It is not limited. In addition, promoters derived from the genome of mammalian cells (eg, metallotionine promoter) or promoters derived from mammalian viruses (eg, adenovirus late promoter, vaccinia virus 7.5K promoter, SV40 promoter, The cytomegalovirus promoter and the tk promoter of HSV) can be used, and usually have a polyadenylation sequence as a transcription termination sequence.
숙주로는 예를 들어, 대장균, 효모, 동물세포, 식물세포, 또는 곤충세포 등을 포함할 수 있다. 원핵세포는 예를 들어, E. coli JM109, E. coli BL21, E. coli RR1, E. coli LE392, E. coli B, E. coli X 1776, E. coli W3110, 바실러스 서브틸리스, 바실러스 츄린겐시스와 같은 바실러스 속 균주, 그리고 살모넬라 티피무리움, 세라티아 마르세슨스 및 다양한 슈도모나스 종과 같은 장내균과 균주 등이 있으며, 진핵 세포에 형질 전환시키는 경우에는 숙주 세포로서, 효모 (Saccharomyce cerevisiae), 곤충 세포, 식물 세포 및 동물 세포, 예를 들어, Sp2/0, CHO (Chinese hamster ovary) K1, CHO DG44, PER.C6, W138, BHK, COS7, 293, HepG2, Huh7, 3T3, RIN, MDCK 세포주 등이 이용될 수 있으나, 이에 제한되는 것은 아니다.Hosts may include, for example, Escherichia coli, yeast, animal cells, plant cells, or insect cells. Prokaryotes include, for example, E. coli JM109, E. coli BL21, E. coli RR1, E. coli LE392, E. coli B, E. coli X 1776, E. coli W3110, Bacillus subtilis, Bacillus chew There are strains of the genus Bacillus, such as Lingensis, and intestinal bacteria and strains, such as Salmonella typhimurium, Serratia marcessons, and various Pseudomonas species. In case of transformation into eukaryotic cells, as host cells, yeast (Saccharomyce cerevisiae), insects cells, plant cells and animal cells, such as Sp2/0, CHO (Chinese hamster ovary) K1, CHO DG44, PER.C6, W138, BHK, COS7, 293, HepG2, Huh7, 3T3, RIN, MDCK cell lines, etc. This may be used, but is not limited thereto.
본 발명에 있어서 서열번호 5의 염기서열 또는 이와 실질적 동일성을 갖는 염기서열; 및 서열번호 6의 염기서열 또는 이와 실질적 동일성을 갖는 염기서열;은 각기 하나의 벡터에 도입되는 것일 수 있다.In the present invention, the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 5 or a nucleotide sequence having substantial identity thereto; and a nucleotide sequence of SEQ ID NO: 6 or a nucleotide sequence substantially identical thereto; each may be introduced into one vector.
본 명세서에서 용어 “실질적 동일성”은 각각의 뉴클레오타이드 서열과 임의의 다른 뉴클레오타이드 서열을 최대한 대응되도록 정렬하고, 그 서열을 분석하여, 임의의 다른 뉴클레오타이드 서열이 각각의 뉴클레오타이드 서열과 70% 이상, 90% 이상, 또는 98% 이상의 서열 상동성을 갖는 것을 의미한다.As used herein, the term "substantial identity" means that each nucleotide sequence and any other nucleotide sequence are aligned so as to correspond as much as possible, and the sequence is analyzed so that any other nucleotide sequence is 70% or more, 90% or more with each nucleotide sequence. , or having 98% or more sequence homology.
본 발명의 또 다른 일 예는 서열번호 1의 정방향 프라이머 및 서열번호 2의 역방향 프라이머를 포함하는 제1 프라이머 세트; 및 서열번호 3의 정방향 프라이머 및 서열번호 4의 역방향 프라이머를 포함하는 제2 프라이머 세트;를 포함하고,Another example of the present invention is a first primer set comprising a forward primer of SEQ ID NO: 1 and a reverse primer of SEQ ID NO: 2; And a second primer set comprising a forward primer of SEQ ID NO: 3 and a reverse primer of SEQ ID NO: 4;
아프리카 돼지열병 (ASF) 항원 단백질을 암호화하는 염기서열 증폭용 프라이머 세트 조성물에 관한 것이다.It relates to a primer set composition for amplifying a nucleotide sequence encoding an African swine fever (ASF) antigen protein.
증폭된 아프리카 돼지열병 항원 단백질을 암호화하는 염기서열은 아프리카 돼지열병 (ASF) 항원 단백질 발현용 벡터에 도입되는 것일 수 있다.The nucleotide sequence encoding the amplified African swine fever antigen protein may be introduced into a vector for expressing the African swine fever (ASF) antigen protein.
본 발명의 일 구체예에서, 서열번호 1의 정방향 프라이머 및 서열번호 2의 역방향 프라이머를 포함하는 제1 프라이머 세트는 아프리카 돼지열병 바이러스의 구조 단백질인 p22을 암호화하는 염기서열에 특이적인 것일 수 있다.In one embodiment of the present invention, the first primer set including the forward primer of SEQ ID NO: 1 and the reverse primer of SEQ ID NO: 2 may be specific for a nucleotide sequence encoding p22, a structural protein of African swine fever virus.
본 발명의 일 구체예에서, 서열번호 3의 정방향 프라이머 및 서열번호 4의 역방향 프라이머를 포함하는 제2 프라이머 세트는 아프리카 돼지열병 바이러스의 구조 단백질인 p30을 암호화하는 염기서열에 특이적인 것일 수 있다.In one embodiment of the present invention, the second primer set including the forward primer of SEQ ID NO: 3 and the reverse primer of SEQ ID NO: 4 may be specific for a nucleotide sequence encoding p30, a structural protein of African swine fever virus.
본 명세서에서 용어 "프라이머 (primer)"는 핵산 가닥 (템플레이트, template)에 상보적인 프라이머 연장 산물의 합성이 유도되는 조건 하에서, 즉, 뉴클레오타이드와 DNA 중합효소와 같은 중합제의 존재 시, 그리고 적합한 온도와 pH에서 합성의 개시점으로 작용할 수 있는 올리고뉴클레오타이드를 의미하는 것일 수 있다.As used herein, the term "primer" refers to a condition in which synthesis of a primer extension product complementary to a nucleic acid strand (template) is induced, that is, in the presence of nucleotides and a polymerizing agent such as DNA polymerase, and at a suitable temperature. And it may mean an oligonucleotide that can act as a starting point of synthesis at pH.
본 발명의 프라이머 세트 조성물은 해당 프라이머의 기본 성질을 변화시키지 않는 추가의 특징을 혼입할 수 있다. 추가의 특징은 자연 발생 (naturally occurring) dNMP (즉, dAMP, dGMP, dCMP 및 dTMP), 변형 뉴클레오타이드, 또는 비-자연 뉴클레오타이드를 의미하는 것일 수 있으나, 이에 한정되는 것은 아니다.The primer set compositions of the present invention may incorporate additional features that do not alter the basic properties of the primers in question. Additional characteristics may refer to, but is not limited to, naturally occurring dNMPs (i.e., dAMP, dGMP, dCMP and dTMP), modified nucleotides, or non-natural nucleotides.
프라이머는 중합제의 존재하에서 연장 산물의 합성을 프라이밍시킬 수 있을 정도로 충분히 길어야 한다. 프라이머의 정확한 길이는 예컨대, 온도, 응용분야 및 프라이머의 소스 (source)를 포함한 복수의 요소에 따라 결정될 것이다.The primer must be long enough to prime the synthesis of the extension product in the presence of the polymerization agent. The exact length of the primer will depend on a number of factors including, for example, temperature, application and source of the primer.
본 명세서에서 용어 "어닐링" 또는 "프라이밍"은 템플레이트 핵산에 올리고데옥시뉴클레오타이드 또는 핵산이 병치 (apposition)되는 것을 의미하며, 상기 병치는 중합효소가 뉴클레오타이드를 중합시켜 템플레이트 핵산 또는 그의 일부분에 상보적인 핵산 분자를 형성하게 한다.As used herein, the term "annealing" or "priming" refers to the apposition of an oligodeoxynucleotide or nucleic acid to a template nucleic acid, wherein the apposition is such that a polymerase polymerizes the nucleotides to form a nucleic acid complementary to the template nucleic acid or a portion thereof. to form molecules.
본 발명에 이용되는 프라이머는 주형의 한 부위에 혼성화 또는 어닐링되어, 이중쇄 구조를 형성할 수 있다.The primer used in the present invention may be hybridized or annealed to one site of the template to form a double-stranded structure.
본 명세서에서 용어 "혼성화 (hybridization)"는 상보적인 단일 가닥 핵산들이 이중-가닥 핵산을 형성하는 것을 의미한다. 혼성화는 완전히 일치하거나 일부 미스매치로 실질적으로 일치하는 2개의 핵산 가닥 사이에서 일어날 수 있다. 혼성화를 위한 상보성은 혼성화 조건, 특히 온도에 따라 달라질 수 있다. 본 명세서에서의 용어 "어닐링"과 "혼성화"는 차이가 없으며 본 명세서에서 혼용된다.As used herein, the term "hybridization" means that complementary single-stranded nucleic acids form a double-stranded nucleic acid. Hybridization can occur between two nucleic acid strands that are completely identical or substantially identical with some mismatches. Complementarity for hybridization may vary depending on hybridization conditions, particularly temperature. There is no difference between the terms "annealing" and "hybridization" in the present specification and are used interchangeably in the present specification.
본 발명의 일 구체예에서, 서열번호 1의 정방향 프라이머 및 서열번호 2의 역방향 프라이머를 포함하는 프라이머 세트 조성물은 p22 항원 단백질을 암호화하는 서열번호 5의 염기서열과 상보적으로 결합하는 것일 수 있다.In one embodiment of the present invention, the primer set composition including the forward primer of SEQ ID NO: 1 and the reverse primer of SEQ ID NO: 2 may complementarily bind to the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 5 encoding the p22 antigen protein.
본 발명의 일 구체예에서, 서열번호 3의 정방향 프라이머 및 서열번호 4의 역방향 프라이머를 포함하는 프라이머 세트 조성물은 p30 항원 단백질을 암호화하는 서열번호 6의 염기서열과 상보적으로 결합하는 것일 수 있다.In one embodiment of the present invention, the primer set composition including the forward primer of SEQ ID NO: 3 and the reverse primer of SEQ ID NO: 4 may complementarily bind to the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 6 encoding the p30 antigen protein.
본 발명의 또 다른 일 예는 본 발명의 또 다른 일 예는 아프리카 돼지열병 (African swine fever; ASF) 진단용 키트에 관한 것이다.Another embodiment of the present invention relates to a kit for diagnosing African swine fever (ASF).
본 발명에 있어서 진단용 키트는 서열번호 7의 아미노산 서열을 포함하는 펩타이드; 및 서열번호 8의 아미노산 서열을 포함하는 펩타이드;를 포함하는 것일 수 있으나, 이에 한정되는 것은 아니다.In the present invention, the diagnostic kit includes a peptide comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 7; And a peptide comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 8; may include, but is not limited thereto.
본 발명에 있어서 키트에 포함된 서열번호 7의 아미노산 서열을 포함하는 펩타이드 농도는 0.3 내지 0.7 ug/mL, 0.3 내지 0.6 ug/mL, 0.4 내지 0.7 ug/mL, 0.4 내지 0.6 ug/mL 또는 0.5 ug/mL일 수 있으며, 예를 들어, 0.5 ug/mL일 수 있으나, 이에 한정되는 것은 아니다.In the present invention, the concentration of the peptide containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 7 included in the kit is 0.3 to 0.7 ug/mL, 0.3 to 0.6 ug/mL, 0.4 to 0.7 ug/mL, 0.4 to 0.6 ug/mL or 0.5 ug /mL may be, for example, 0.5 ug/mL, but is not limited thereto.
본 발명에 있어서 키트에 포함된 서열번호 8의 아미노산 서열을 포함하는 펩타이드 농도는 0.7 내지 1.3 ug/mL, 0.7 내지 1.2 ug/mL, 0.7 내지 1.1 ug/mL, 0.8 내지 1.3 ug/mL, 0.8 내지 1.2 ug/mL, 0.8 내지 1.1 ug/mL, 0.9 내지 1.3 ug/mL, 0.9 내지 1.2 ug/mL 또는 0.9 내지 1.1 ug/mL일 수 있으며, 예를 들어, 1.0 ug/mL일 수 있으나, 이에 한정되는 것은 아니다.In the present invention, the concentration of the peptide comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 8 included in the kit is 0.7 to 1.3 ug / mL, 0.7 to 1.2 ug / mL, 0.7 to 1.1 ug / mL, 0.8 to 1.3 ug / mL, 0.8 to It may be 1.2 ug/mL, 0.8 to 1.1 ug/mL, 0.9 to 1.3 ug/mL, 0.9 to 1.2 ug/mL, or 0.9 to 1.1 ug/mL, for example, 1.0 ug/mL, but is not limited thereto. it is not going to be
본 발명의 일 구체예에서, 키트에 포함된 서열번호 7의 아미노산 서열을 포함하는 펩타이드 농도는 0.5 ug/mL이고, 서열번호 8의 아미노산 서열을 포함하는 펩타이드 농도는 1.0 ug/mL일 수 있다.In one embodiment of the present invention, the concentration of the peptide containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 7 included in the kit may be 0.5 ug/mL, and the concentration of the peptide containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 8 may be 1.0 ug/mL.
본 발명에 있어서 키트는 표면에 펩타이드가 코팅된 것일 수 있다.In the present invention, the kit may have a peptide coated on its surface.
본 발명에 있어서 키트는 항원-항체 반응을 이용하는 것일 수 있다.In the present invention, the kit may use an antigen-antibody reaction.
본 발명에 있어서 키트는 아프리카 돼지열병 바이러스 I형에 감염되거나, II형에 감염되거나, 또는 동시에 I형과 II형에 감염되었는지 여부를 진단하는 것일 수 있다.In the present invention, the kit may diagnose whether or not infected with African swine fever virus type I, type II, or both types I and II at the same time.
본 발명에 있어서 키트는 발색효소를 추가로 포함할 수 있다.In the present invention, the kit may further include a chromogenic enzyme.
본 발명에 있어서 발색효소는 Q dot (Quantum dot), HRPO (Horseradish peroxidase), 염기성 탈인산화효소 (Alkaline phosphatase), 글루코오즈 옥시다아제 (Glucose Oxidase), 루시퍼라아제 (luciferase), 베타-디-갈락토시다아제 (β말산탈수소효소 (malate dehydrogenase; MDH) 및 아세틸콜린에스터라아제 (acetylcholinesterase)로 이루어진 군으로부터 선택되는 1종의 효소와 프로틴 A가 컨쥬게이션 (conjugation)된 것일 수 있으며, 예를 들어, HRPO와 프로틴 A가 컨쥬게이션된 HRPO 컨쥬게이트 (HRPO Conjugate)인 것일 수 있으나, 이에 한정되는 것은 아니다.In the present invention, the coloring enzyme is Q dot (Quantum dot), HRPO (Horseradish peroxidase), basic dephosphorylation enzyme (Alkaline phosphatase), glucose oxidase (Glucose Oxidase), luciferase (luciferase), beta-D-galacto Sidase (β malate dehydrogenase (MDH) and one enzyme selected from the group consisting of acetylcholinesterase (acetylcholinesterase) and protein A may be conjugated (conjugation), for example, HRPO and protein A may be conjugated HRPO conjugate (HRPO conjugate), but is not limited thereto.
본 발명의 일 구현예에서, HRPO 컨쥬게이트는 Protein A (Microprotein, cat. no. A100L20) 및 겨자무과산화효소 (horseradish peroxidase; HRP)와 프로틴 A (Protein A)를 컨쥬게이션 (Conjugation)함으로써 생성되는 것일 수 있다.In one embodiment of the present invention, the HRPO conjugate is produced by conjugating Protein A (Microprotein, cat. no. A100L20) and horseradish peroxidase (HRP) with Protein A. it could be
HRPO 컨쥬게이트는 검체 내 특이 항원에 대한 항체와 결합하여 발색 반응을 나타낼 수 있다. 이 때 발색이 나타나지 않는다면, 검체 내 컨쥬게이트와 반응하는 특이 항원에 대한 항체가 없음을 의미한다. 즉, 검체 내 항체가 없다면 키트 표면에 코팅된 항원 단백질에 어떠한 항체도 결합하지 못하고 발색 반응도 나타나지 않는다.The HRPO conjugate may exhibit a color reaction by binding to an antibody against a specific antigen in a specimen. At this time, if color development does not appear, it means that there is no antibody against the specific antigen reacting with the conjugate in the specimen. That is, if there is no antibody in the sample, no antibody binds to the antigen protein coated on the surface of the kit and no color reaction occurs.
본 발명의 일 구체예에서, 키트는 HRPO 컨쥬게이트 (Horseradish peroxidase Conjugate)를 추가로 포함할 수 있다.In one embodiment of the present invention, the kit may further include HRPO conjugate (Horseradish peroxidase conjugate).
본 발명의 또 다른 일 예는 다음의 단계를 포함하는 아프리카 돼지열병 (African swine fever; ASF) 진단을 위한 정보 제공 방법에 관한 것이다:Another example of the present invention relates to a method for providing information for diagnosing African swine fever (ASF), which includes the following steps:
시료를 준비하는 준비 단계; 및preparation step of preparing a sample; and
시료를 서열번호 7의 아미노산 서열을 포함하는 펩타이드 및 서열번호 8의 아미노산 서열을 포함하는 펩타이드와 접촉시키는 접촉 단계.A contact step of contacting a sample with a peptide comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 7 and a peptide comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 8.
본 발명에 있어서 시료는 아프리카 돼지열병 바이러스 I형 (African swine fever virus type I; ASFV type I) 및 아프리카 돼지열병 바이러스 II형 (ASFV type II)으로 이루어진 군으로부터 선택되는 1종 이상의 바이러스, 및 이의 항체를 포함하는 것일 수 있다.In the present invention, the sample is at least one virus selected from the group consisting of African swine fever virus type I (ASFV type I) and African swine fever virus type II (ASFV type II), and antibodies thereof. It may contain.
본 발명에 있어서 시료는 혈액, 혈장, 혈청, 림프, 소변, 눈물, 윤활액, 타액, 상처 유체 및 뇌척수액으로 이루어진 군으로부터 선택되는 1종 이상으로부터 분리된 것일 수 있으며, 예를 들어, 혈청으로부터 분리된 것일 수 있으나, 이에 한정되는 것은 아니다.In the present invention, the sample may be separated from at least one selected from the group consisting of blood, plasma, serum, lymph, urine, tears, synovial fluid, saliva, wound fluid, and cerebrospinal fluid, and, for example, separated from serum It may be, but is not limited thereto.
본 발명에 있어서 접촉 단계는 시료를 서열번호 7의 아미노산 서열을 포함하는 펩타이드 및 서열번호 8의 아미노산 서열을 포함하는 펩타이드와 접촉시키는 것일 수 있다. 이를 통해, 항원-항체 반응 (antigen-antibody reaction)이 진행될 수 있다.In the present invention, the contacting step may be contacting a sample with a peptide comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 7 and a peptide comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 8. Through this, an antigen-antibody reaction may proceed.
본 발명에 있어서 접촉 단계는 20 내지 30 ℃, 20 내지 29 ℃, 20 내지 28 ℃, 21 내지 30 ℃, 21 내지 29 ℃, 21 내지 28 ℃, 22 내지 30 ℃, 22 내지 29℃ 또는 22 내지 28 ℃의 온도 조건에서 수행되는 것일 수 있으며, 예를 들어, 22 내지 28 ℃의 온도 조건 (상온)에서 수행되는 것일 수 있으나, 이에 한정되는 것은 아니다.In the present invention, the contacting step is 20 to 30 ℃, 20 to 29 ℃, 20 to 28 ℃, 21 to 30 ℃, 21 to 29 ℃, 21 to 28 ℃, 22 to 30 ℃, 22 to 29 ℃ or 22 to 28 ℃ It may be performed at a temperature condition of ℃, for example, it may be performed at a temperature condition (room temperature) of 22 to 28 ℃, but is not limited thereto.
본 발명의 일 구현예에서, 정보 제공 방법은 접촉 단계를 수행한 시료를 발색효소와 접촉시키는 발색 단계를 추가로 포함할 수 있다.In one embodiment of the present invention, the information providing method may further include a color development step of contacting the sample subjected to the contact step with a color enzyme.
본 발명의 일 구체예에서, 발색효소는 HRPO (Horseradish peroxidase) 및 Protein A가 컨쥬게이션 (conjugation)된 HRPO 컨쥬게이트 (conjugate)일 수 있다.In one embodiment of the present invention, the chromogenic enzyme may be a HRPO conjugate in which Horseradish peroxidase (HRPO) and Protein A are conjugated.
HRPO 컨쥬게이트는 검체 내 특이 항원에 대한 항체와 결합하여 발색 반응을 나타낼 수 있다. 이 때 발색이 나타나지 않는다면, 검체 내 컨쥬게이트와 반응하는 특이 항원에 대한 항체가 없음을 의미한다. 즉, 발색 단계에서 발색 반응이 나타나지 않는다면 검체 내 항체가 없음을 의미한다.The HRPO conjugate may exhibit a color reaction by binding to an antibody against a specific antigen in a specimen. At this time, if color development does not appear, it means that there is no antibody against the specific antigen reacting with the conjugate in the specimen. That is, if a color reaction does not appear in the color development step, it means that there is no antibody in the sample.
본 발명의 정보 제공 방법은 시료에 아프리카 돼지열병 바이러스의 항체가 존재하는지를 확인함으로써, 대상체가 아프리카 돼지열병에 감염되었는지 여부를 간편하고 신속하게 확인하여 정보를 제공할 수 있다.The information providing method of the present invention can provide information by simply and quickly confirming whether a subject is infected with African swine fever by confirming whether an antibody of African swine fever virus is present in a sample.
본 발명은 아프리카돼지열병 바이러스 (African swine fever Virus; ASFV) 감염 여부를 진단하기 위해 2종의 재조합 항원을 포함하는 아프리카돼지열병 진단용 항원 조성물, 이를 이용하는 아프리카 돼지열병 진단용 키트 및 아프리카 돼지열병 진단을 위한 정보 제공 방법에 관한 것으로, 본 발명의 항원 조성물을 이용하면 아프리카 돼지열병 항체를 검출함으로써, 진단 정확도가 우수하고, 키트로 제공되어 사용이 간편하고 신속하다.The present invention relates to an antigen composition for diagnosing African swine fever virus (ASFV) containing two recombinant antigens for diagnosing African swine fever virus (ASFV) infection, a kit for diagnosing African swine fever using the same, and a composition for diagnosing African swine fever It relates to a method for providing information. By detecting African swine fever antibodies using the antigen composition of the present invention, diagnostic accuracy is excellent, and it is provided as a kit, which is simple and quick to use.
도 1은 본 발명의 일 실험예에 따라 항원 단백질인 p22 및 p30으로부터 재조합 항원에서 발현시키려는 부위를 나타낸 모식도이다.
도 2a 및 2b는 본 발명의 일 실험예에 따라 p22 및 p30을 암호화하는 염기서열을 포함한 플라스미드가 DH5a 대장균에 도입되었는지를 전기영동법으로 확인한 것이다.
도 3a 및 3b는 본 발명의 일 실험예에 따라 재조합된 p22 및 p30 단백질의 발현을 확인한 SDS-PAGE 사진이다.
도 4a 및 4b는 본 발명의 일 실험예에 따라 재조합된 p22 및 p30 단백질을 정제한 SDS-PAGE 사진이다.
도 5는 ASFV 유전자 II형 (파주 분리)에 대하여, 본 발명의 키트를 이용한 반응성 측정 결과를 나타낸 것이다.
도 6a 내지 6c는 ASFV 유전자 II형 (파주 분리)에 대하여, 상용화된 종래의 키트 (ID Screen Confirmation ELISA, ID Screen Competition ELISA 및 INgezim PPA COMPAC ELISA)를 이용한 반응성 측정 결과를 나타낸 것이다.
도 7은 ASFV 유전자 I형 (OURT 88/3)에 대하여, 본 발명의 키트를 이용한 반응성 측정 결과를 나타낸 것이다.
도 8a 내지 8c는 ASFV 유전자 I형 (OURT 88/3)에 대하여, 상용화된 종래의 키트 (ID Screen Confirmation ELISA, ID Screen Competition ELISA 및 INgezim PPA COMPAC ELISA)를 이용한 반응성 측정 결과를 나타낸 것이다.
도 9는 ASFV 비발생 지역의 항혈청에 대하여, 본 발명의 키트를 이용한 반응성 측정 결과를 나타낸 것이다.1 is a schematic diagram showing a site to be expressed in a recombinant antigen from antigen proteins p22 and p30 according to an experimental example of the present invention.
2a and 2b show electrophoresis to confirm whether plasmids containing the nucleotide sequences encoding p22 and p30 were introduced into DH5a E. coli according to an experimental example of the present invention.
3a and 3b are SDS-PAGE photographs confirming the expression of recombinant p22 and p30 proteins according to an experimental example of the present invention.
4a and 4b are SDS-PAGE photographs of purified recombinant p22 and p30 proteins according to an experimental example of the present invention.
Figure 5 shows the results of measuring reactivity using the kit of the present invention with respect to ASFV gene type II (separation from Paju).
6a to 6c show the reactivity measurement results using commercially available conventional kits (ID Screen Confirmation ELISA, ID Screen Competition ELISA, and Ingezim PPA COMPAC ELISA) for ASFV gene type II (separation from Paju).
Figure 7 shows the results of measuring reactivity using the kit of the present invention with respect to ASFV gene type I (OURT 88/3).
8a to 8c show reactivity measurement results using commercially available conventional kits (ID Screen Confirmation ELISA, ID Screen Competition ELISA, and INgezim PPA COMPAC ELISA) for ASFV gene type I (OURT 88/3).
Figure 9 shows the results of measuring reactivity using the kit of the present invention with respect to antiserum in areas where ASFV does not occur.
이하, 실험예를 통하여 본 발명을 더욱 상세히 설명하고자 한다. 이들 실험예는 오로지 본 발명을 보다 구체적으로 설명하기 위한 것으로, 본 발명의 요지에 따라 본 발명의 범위가 이들 실험예에 의해 제한되지 않는다는 것은 당 업계에서 통상의 지식을 가진 자에 있어서 자명할 것이다.Hereinafter, the present invention will be described in more detail through experimental examples. These experimental examples are only for explaining the present invention in more detail, and it will be apparent to those skilled in the art that the scope of the present invention is not limited by these experimental examples according to the gist of the present invention. .
실험예 1. ASFV의 재조합 항원 유전자 클로닝Experimental Example 1. ASFV recombinant antigen gene cloning
아프리카 돼지콜레라 바이러스 (African swine fever virus; ASFV)의 구조 단백질인 p22 및 p30의 발현을 위해, AccuPower® ProFi Taq PCR PreMix를 이용하여 에스토니아-2014주로부터 20 ul의 DNA 시료를 준비하였다. 발현하려는 p22-TM 및 p30의 부위를 도 1에 모식도로 나타내었다.For the expression of p22 and p30, which are structural proteins of African swine fever virus (ASFV), 20 ul of DNA samples were prepared from Estonia-2014 using AccuPower ® ProFi Taq PCR PreMix. The sites of p22-TM and p30 to be expressed are schematically shown in FIG. 1 .
p22 및 p30을 암호화하는 염기서열의 중합효소연쇄반응 (Polymerase chain reaction; PCR)은 변성 (denaturation) (94 ℃, 30초), 어닐링 (annealing) (55 ℃, 30초), 연장 (extension) (72 ℃, 60초)으로 1회의 사이클 (cycle)을 구성하여 총 30 사이클을 수행하였고, 마지막 사이클을 수행한 후 72 ℃에서 5분 동안 유지하였다. PCR 증폭에 이용된 ASFV 재조합 항원 프라이머 서열은 표 1에 나타내었다.Polymerase chain reaction (PCR) of the nucleotide sequences encoding p22 and p30 was denaturation (94 ℃, 30 seconds), annealing (55 ℃, 30 seconds), extension (extension ( 72 °C, 60 seconds) to configure a total of 30 cycles by configuring one cycle, and after performing the last cycle, it was maintained at 72 °C for 5 minutes. ASFV recombinant antigen primer sequences used for PCR amplification are shown in Table 1.
합성된 p22-TM, p30 의 유전자 단편을 각각 pET32a (Novagen) 벡터의 MCS (multiple coloning site)에 존재하는 제한효소 자리인 BamHIㆍXhoI을 이용하여 p22-TM을 클로닝하고, 그리고 EcoRIㆍSalI을 이용하여 p30을 클로닝하였다. 형질전환은 열 충격법 (Heat shock)을 이용하여 DH5a 대장균에 삽입함으로써 수행되었다. 이후, 플라스미드 DNA를 추출하고 제한효소를 처리함으로써 도입 유전자의 서열을 확인하여, 그 결과를 도 2a 및 2b에 나타내었다.The synthesized p22-TM and p30 gene fragments were cloned into p22-TM using BamHI·XhoI, a restriction enzyme site present in the MCS (multiple coloning site) of the pET32a (Novagen) vector, respectively, and then using EcoRI·SalI. to clone p30. Transformation was performed by inserting into DH5a E. coli using heat shock. Thereafter, the sequence of the transgene was confirmed by extracting the plasmid DNA and treating it with a restriction enzyme, and the results are shown in FIGS. 2a and 2b.
도입 유전자의 서열은 표 2에 나타내었다.The sequences of transgenes are shown in Table 2.
nucleotidep22-TM
nucleotide
nucleotidep30
nucleotide
표 2의 도입 유전자로부터 발현된 재조합 항원의 아미노산 서열은 표 3에 나타내었다.The amino acid sequences of the recombinant antigens expressed from the transgenes in Table 2 are shown in Table 3.
polypeptidep22-TM
polypeptide
polypeptidep30
polypeptide
실험예 2. ASFV 재조합 항원의 발현Experimental Example 2. Expression of ASFV recombinant antigen
p22-TM 플라스미드와 p30 플라스미드로 BL21(DE3) 발현 대장균을 형질 전환하여 재조합 항원의 발현을 확인하였다.Expression of the recombinant antigen was confirmed by transforming E. coli expressing BL21(DE3) with the p22-TM plasmid and the p30 plasmid.
OD600 값이 0.5일 때, 1 mM 이소프로필 β티오갈락토피라노사이드 (Isopropyl βIPTG)로 인덕션하여 37 ℃에서 4시간 동안 배양하였다. 이후, 배양액은 6,000 rpm, 15분, 4 ℃ 조건에서 원심분리하여 수확하였다. 재조합 항원의 발현 여부의 확인을 위하여, SDS-PAGE (Sodium dodecyl sulfate-Polyacrylamide Gel Electrophoresis)를 수행하였고, 그 결과를 도 3a 및 3b에 나타내었다.When the OD600 value was 0.5, induction was performed with 1 mM isopropyl β-thiogalactopyranoside (Isopropyl βIPTG) and incubated at 37° C. for 4 hours. Thereafter, the culture medium was harvested by centrifugation at 6,000 rpm, 15 minutes, and 4 °C. To confirm the expression of the recombinant antigen, SDS-PAGE (Sodium dodecyl sulfate-Polyacrylamide Gel Electrophoresis) was performed, and the results are shown in FIGS. 3a and 3b.
도 3a 및 3b에서 확인할 수 있듯이, Lane 3 및 Lane 4의 밴드가 진한 것으로 보아 각각의 ASFV 재조합 항원은 적절히 발현되었다.As can be seen in Figures 3a and 3b, the bands of
실험예 3. ASFV 재조합 항원의 정제Experimental Example 3. Purification of ASFV recombinant antigen
재조합 항원 (항원 단백질)의 정제는 재조합 항원의 C-말단 (C-terminal)에 존재하는 6X His tag을 이용하여 니켈 (Ni) 친화성 크로마토그래피로 정제 조건을 확립하였다. 크로마토그래피 정제는 AKTA Start (GE 헬스케어)를 이용하였다. HiTrap Chelating HP 컬럼 (GE Healthecare)에 0.1 M NiSO4 [Nickel(II) sulfate] 용액을 흘려준 후 증류수 (DW)로 세척하여 컬럼을 준비하였다.The recombinant antigen (antigen protein) was purified by nickel (Ni) affinity chromatography using a 6X His tag present at the C-terminus of the recombinant antigen. Chromatographic purification was performed using AKTA Start (GE Healthcare). A HiTrap Chelating HP column (GE Healthecare) was washed with distilled water (DW) after flowing 0.1 M NiSO 4 [Nickel(II) sulfate] solution to prepare the column.
재조합 항원의 정제를 위해 대장균 침전물을 20 mM 이미다졸 (Imidazole)이 포함된 50 mM Tris-base, 150 mM NaCl pH 8.7 용액으로 현탁하였다. 현탁한 대장균 침전물은 초음파 분쇄기 (Sonicator)를 이용하여 파쇄한 후 12,578 x g에서 10분 동안 원심 분리하여 (A50S-8 No.7 Rotor, 한일), 상등액 (단백질 추출액)을 수득하였다.For purification of the recombinant antigen, E. coli precipitates were suspended in a 50 mM Tris-base, 150 mM NaCl pH 8.7 solution containing 20 mM imidazole. The suspended E. coli precipitate was disrupted using a sonicator and then centrifuged at 12,578 x g for 10 minutes (A50S-8 No.7 Rotor, Hanil) to obtain a supernatant (protein extract).
단백질 추출액은 Millipore 0.45 um 시린지 필터 (syringe filter)로 여과하였고, 20 mM 이미다졸이 포함된 50 mM Tris-base, 150 mM NaCl pH 8.7 버퍼로 평형화된 HiTrap Chelating HP 컬럼 (GE 헬스케어)에 로딩하였다.The protein extract was filtered through a Millipore 0.45 um syringe filter and loaded onto a HiTrap Chelating HP column (GE Healthcare) equilibrated with 50 mM Tris-base and 150 mM NaCl pH 8.7 buffer containing 20 mM imidazole. .
컬럼의 비드에 결합된 단백질은 100 mM 이미다졸이 포함된 50 mM Tris-base, 150 mM NaCl pH 8.7 세척 버퍼로 세척한 후, 500 mM 이미다졸이 들어있는 버퍼로 재조합 항원의 용출을 수행하였다. 용출된 단백질은 14 kDa 컷-오프 투석 튜빙 (Cut-off dialtsis tubing, 시그마)을 이용하여, 50 mM 탄산염-탄산수소염 (Carbonate-Bicarbonate) pH 9.6 버퍼에 대해 하룻밤 동안 1번, 그리고 6시간 동안 1번 투석하였다.The protein bound to the beads on the column was washed with a 50 mM Tris-base, 150 mM NaCl pH 8.7 wash buffer containing 100 mM imidazole, and then the recombinant antigen was eluted with a buffer containing 500 mM imidazole. The eluted protein was incubated in 50 mM Carbonate-Bicarbonate pH 9.6 buffer once overnight and once for 6 hours using 14 kDa cut-off dialtsis tubing (Sigma). dialyzed once.
투석한 단백질을 회수하여 BCA 단백질 어세이 키트 (Thermo Scientific)를 이용하여 정량하고, 단백질 (항원 단백질)의 순도는 SDS-PAGE로 확인하여, 그 결과를 도 4a, 4b 및 표 4에 나타내었다. The dialyzed protein was recovered and quantified using a BCA protein assay kit (Thermo Scientific), and the purity of the protein (antigen protein) was confirmed by SDS-PAGE. The results are shown in FIGS. 4a and 4b and Table 4.
(2배 희석)ASFV p22
(2-fold dilution)
(원액)ASFV p30
(undiluted solution)
ASFV 항원 시료의 농도는 표 4에 나타난 것과 같이 A와 B well의 흡광도 값에 시료 희석 비율을 곱하여 얻은 값의 평균값으로 계산하였으며, BSA control의 농도는 2 mg/mL이다. 항원 시료 희석 방법은 A well은 희석하지 않고 얻은 수치값이며 B~H well까지 2진 희석으로 항원 시료를 희석하여 수치값을 얻었다. 이런 계산법으로 나타내면 ASFV p22 항원의 농도는 4.1 mg/mL이고, ASFV p30의 농도는 1.2 mg/mL 이었다.As shown in Table 4, the concentration of the ASFV antigen sample was calculated as the average value obtained by multiplying the absorbance values of A and B wells by the sample dilution rate, and the concentration of the BSA control was 2 mg/mL. As for the antigen sample dilution method, A well was a numerical value obtained without dilution, and a numerical value was obtained by diluting the antigen sample by binary dilution from B to H wells. According to this calculation method, the concentration of ASFV p22 antigen was 4.1 mg/mL and the concentration of ASFV p30 was 1.2 mg/mL.
실험예 4. ASFV 재조합 항원을 이용한 항체 진단 키트의 제작 및 성능 평가Experimental Example 4. Preparation and performance evaluation of antibody diagnostic kit using ASFV recombinant antigen
4-1. ASFV 감염 양성 혈청 구축4-1. Establishment of ASFV infection-positive sera
약 8주령의 일반 돼지 10두를 준비하였다. 돼지는 5두씩 2개의 군으로 나누고, 1군에는 ASF OURT 88/3 바이러스 [약독화 ASFV(유전형 I형)]를 104 TCID50 (Tissue Culture Infective Dose 50%) 만큼 근육 주사로 접종하고 (표 5의 개체번호 8-6 내지 8-10), 다른 1군에는 국내 분리 파주 1차 [국내 발생 ASFV(유전형 II형)] 바이러스를 10 HAD50/ml 만큼 근육 주사로 접종하였다 (표 6의 개체 번호 7-1 내지 7-5).Ten normal pigs of about 8 weeks of age were prepared. Pigs were divided into 2 groups of 5 heads, and ASF OURT 88/3 virus [attenuated ASFV (genotype I)] was inoculated into 1 group by intramuscular injection as much as 10 4 TCID50 (Tissue
접종 후, 0 내지 28일 동안 경시별 채혈을 진행하여 혈청을 분리하였고, 혈청은 ELISA (Enzyme-Linked Immunosorbent Assay) 및 IPT (Indirect Immunoperoxidase Test)를 이용하여 ASFV 항체를 측정하여 역가를 평가하였다. 평가 결과는 표 5 및 6에 나타내었다.After inoculation, blood was collected over time from 0 to 28 days to separate serum, and the serum titer was evaluated by measuring ASFV antibody using ELISA (Enzyme-Linked Immunosorbent Assay) and IPT (Indirect Immunoperoxidase Test). The evaluation results are shown in Tables 5 and 6.
번호individual
TiterIPT
Titer
DPI*: 접종 후 경과일 (day of post-infection), N/T**: 폐사DPI * : Day of post-infection, N/T ** : Death
표 5의 개체번호 8-7은 접종 14일 경과 후 안락사하였다.Individual numbers 8-7 in Table 5 were euthanized after 14 days of inoculation.
번호individual
TiterIPT
Titer
표 6의 모든 개체는 접종 7일 내지 17일 경과 후 폐사하였다.All individuals in Table 6 died after 7 to 17 days of inoculation.
4-2. ASFV 음성 혈청 구축4-2. Establishment of ASFV-negative sera
ASFV 비발생 지역인 미국의 2017년 야외 샘플 (541개 샘플)과 국내 ASFV 발생 전인 2012년 야외 샘플 (592개 샘플)을 모아 평가에 사용하였다.Outdoor samples (541 samples) in 2017 in the United States, an area where ASFV did not occur, and outdoor samples (592 samples) in 2012, before ASFV occurred in Korea, were collected and used for evaluation.
4-3. ASFV 항원 단백질 부동화 키트의 제작4-3. Construction of ASFV antigen protein immobilization kit
ASFV 항원 단백질의 플레이트 부착 농도는 표 7에 나타난 것과 같이 ASFV 항원 단백질 p22 및 p30의 혼합 비율을 다르게 하여 얻은 실험값으로 농도를 설정하였다. 항원 단백질 혼합 비율을 비교한 결과, ID.vet사에서 판매하는 ASFV 감염혈청을 희석한 샘플 (Sample 1)을 가장 민감하게 표현하는 혼합 비율은 p22를 0.50 ug/mL 농도로, p30을 1.00 ug/mL의 농도로 혼합한 실험 조건인 것으로 나타났다.As shown in Table 7, the concentration of the ASFV antigen protein on the plate was set to an experimental value obtained by varying the mixing ratio of the ASFV antigen protein p22 and p30. As a result of comparing the antigen protein mixing ratio, the mixing ratio most sensitive to the diluted sample (Sample 1) of ASFV-infected serum sold by ID.vet was p22 at a concentration of 0.50 ug/mL and p30 at a concentration of 1.00 ug/mL. It was found that the experimental conditions were mixed at a concentration of mL.
p30 (1.00 ug/mL)p22 (0.50 ug/mL)+
p30 (1.00 μg/mL)
p30 (0.50 ug/mL)p22 (0.25 ug/mL) +
p30 (0.50 μg/mL)
p30 (2.00 ug/mL)p22 (1.00 ug/mL)+
p30 (2.00 μg/mL)
ValueS/P
Value
ValueS/P
Value
ValueS/P
Value
이에, 96웰 마이크로플레이트 (well microplate)에 ASFV 항원 단백질 p22 [발현숙주세포 BL21 (DE3)]를 0.50 ug/mL 농도로, p30 [발현숙주세포 BL21 (DE3)]을 1.00 ug/mL의 농도로 하여 웰 당 100 ul씩 가하여 플레이트 표면에 부착시킨 후, 반응하지 않은 재조합 항원 단백질은 세척하여 제거하였다.Accordingly, ASFV antigen protein p22 [expression host cell BL21 (DE3)] at a concentration of 0.50 ug/mL and p30 [expression host cell BL21 (DE3)] at a concentration of 1.00 ug/mL were placed in a 96-well microplate. After adding 100 ul per well to attach to the plate surface, unreacted recombinant antigen proteins were removed by washing.
1% Casein-PBS-T blocking 용액을 웰 당 200 ul씩 분주하고 25 ℃ 조건에서 2 시간 동안 반응시킨 후, 인산 완충용액-tween 20 [0.05% tween-20 (v/v%)이 포함된 인산완충용액, pH 7.4; 이하, PBS-T]으로 3회 세척하여, 키트를 제작하였다.After dispensing 200 ul of 1% Casein-PBS-T blocking solution per well and reacting at 25 ° C for 2 hours, phosphate buffer-tween 20 [0.05% tween-20 (v / v%) phosphoric acid containing buffer solution, pH 7.4; Hereinafter, washed three times with [PBS-T] to prepare a kit.
4-4. 효소 면역 측정법의 반응성 평가 시험4-4. Enzyme immunoassay reactivity evaluation test
(1) HRPO 컨쥬게이트 준비(1) HRPO conjugate preparation
Protein A (Microprotein, cat. no. A100L20) 및 겨자무과산화효소 (horseradish peroxidase; HRP)를 컨쥬게이션한 HRPO 컨쥬게이트 (Conjugate)를 컨쥬게이트 희석 버퍼 (인산완충용액-tween 20 0.05%, pH 7.4)에 5 ng/ml로 희석하여 이용하였다.Protein A (Microprotein, cat. no. A100L20) and horseradish peroxidase (HRP) conjugated HRPO conjugate (Conjugate) were mixed with conjugate dilution buffer (Phosphate buffer solution-
(2) 검체 희석 버퍼 (specimen dilution buffer)(2) Specimen dilution buffer
돼지 혈청 검체를 희석하기 위한 검체 희석 버퍼는 PBS-T를 사용하였다.PBS-T was used as a sample dilution buffer for diluting porcine serum samples.
(3) 반응성 평가(3) Evaluation of reactivity
키트에 ASFV 감염에 의한 항혈청 및 다양한 음성 항혈청을 1:100으로 희석한 후 96웰 플레이트의 각 웰에 100 ul씩 가하여 45분 동안 실온 (25 ± 3 ℃에서 반응시키고, PBS-T 용액으로 3회 세척하여 반응하지 않은 검체를 제거하였다. After diluting 1:100 antiserum by ASFV infection and various negative antisera in the kit, 100 ul each was added to each well of a 96-well plate, reacted at room temperature (25 ± 3 ° C) for 45 minutes, and 3 times with PBS-T solution. Unreacted samples were removed by washing.
다음으로 HRPO 컨쥬게이트를 0.005 ug/mL 농도로 가하여 30분 동안 실온 (25 ± 3 ℃)에서 반응시키고, PBS-T로 3회 세척하였다. HRPO 컨쥬게이트 항체는 검체 내 특이 항원에 대한 항체와 결합하여 발색 반응을 나타낸다. 발색이 나타나지 않는다면, 검체 내 컨쥬게이트와 반응하는 특이 항원에 대한 항체가 없음을 의미한다. 검체 내 항체가 없다면 코팅된 항원 단백질에 어떠한 항체도 결합하지 못하고 발색 반응이 나타나지 않게 된다.Next, the HRPO conjugate was added at a concentration of 0.005 ug/mL, reacted at room temperature (25 ± 3 °C) for 30 minutes, and washed three times with PBS-T. The HRPO conjugated antibody exhibits a color reaction by binding to an antibody against a specific antigen in a specimen. If color development does not appear, it means that there is no antibody against the specific antigen reacting with the conjugate in the sample. If there is no antibody in the specimen, no antibody binds to the coated antigen protein and no color reaction occurs.
반응하지 않은 HRPO 컨쥬게이트를 세척한 후, 퍼옥시다제의 기질용액 (TMB substrate solution)을 가하여 반응시키고 황산 (sulfuric acid, H2SO4) 0.5 M을 플레이트의 각 웰에 50 ul씩 분주한 뒤, Sunrise ELISA reader (Tecan)를 이용하여 450 nm에서 흡광도를 측정하여 항원에 대한 반응성을 측정하였다.After washing the unreacted HRPO conjugate, peroxidase substrate solution (TMB substrate solution) was added for reaction, and sulfuric acid (H 2 SO 4 ) 0.5 M was dispensed by 50 ul into each well of the plate. , Reactivity to the antigen was measured by measuring absorbance at 450 nm using a Sunrise ELISA reader (Tecan).
먼저, ASFV 유전자 II형 (파주 분리)에 대하여, 본 발명의 키트를 이용한 반응성 측정 결과는 도 5에 나타내었고, 상용화된 종래의 키트 (ID Screen Confirmation ELISA, ID Screen Competition ELISA 및 INgezim PPA COMPAC ELISA)를 이용한 반응성 측정 결과는 도 6a 내지 6c에 나타내었다. [빨간색 절취선은 Positive cut-off line (upper dotted line), 파란색 절취선은 Suspected cut-off line (lower dotted line)을 나타낸 것임] 여기서, cut-off line이란 양음성 판정기준을 의미한다. suspected cut-off line은 제품마다 양성 또는 음성, 즉 2개로만 판정하지 않고 의양성이란 구간을 설정하여 키트의 판정기준을 총 3가지로 나누어 의양성 구간을 판정하는 기준점을 의미한다.First, for ASFV gene type II (Paju isolation), the reactivity measurement results using the kit of the present invention are shown in FIG. Reactivity measurement results using are shown in Figures 6a to 6c. [The red perforated line represents the Positive cut-off line (upper dotted line), and the blue perforated line represents the Suspected cut-off line (lower dotted line)] Here, the cut-off line means a positive-negative criterion. The suspected cut-off line means a reference point for determining the false-positive interval by dividing the kit's criteria into three categories by setting a section of positive or negative, that is, not determining only two, that is, positive or negative for each product.
도 5의 실험값은 표 8에, 도 6a 내지 6c의 실험값은 표 9 내지 11에 나타내었다.The experimental values of FIG. 5 are shown in Table 8, and the experimental values of FIGS. 6a to 6c are shown in Tables 9 to 11.
번호individual
ValueS/P
Value
ValueS/P
Value
ValueS/P
Value
ValueS/P
Value
ValueS/P
Value
번호individual
ValuePI (%)
Value
ValuePI (%)
Value
번호individual
ValueS/P (%)
Value
ValueS/P (%)
Value
번호individual
ValueS/P (%)
Value
도 5 및 도 6a 내지 6c, 표 8 내지 11에서 확인할 수 있듯이, 유전자 II형 검체에 대하여 ASFV 재조합 항원 (p22+p30)으로 플레이트가 코팅된 본 발명의 키트는 종래의 상용화된 키트들 보다 월등히 높은 반응성을 나타내었다.As can be seen in Figures 5 and 6a to 6c and Tables 8 to 11, the kit of the present invention, in which the plate is coated with ASFV recombinant antigen (p22 + p30) for gene type II specimens, has a significantly higher level than conventional commercially available kits. showed reactivity.
다음으로, ASFV 유전자 I형 (OURT 88/3)에 대하여, 본 발명의 키트를 이용한 반응성 측정 결과는 도 7에 나타내었고, 상용화된 종래의 키트 (ID Screen Confirmation ELISA, ID Screen Competition ELISA 및 INgezim PPA COMPAC ELISA)를 이용한 반응성 측정 결과는 도 8a 내지 8c에 나타내었다.Next, for ASFV gene type I (OURT 88/3), the reactivity measurement results using the kit of the present invention are shown in Figure 7, and commercially available conventional kits (ID Screen Confirmation ELISA, ID Screen Competition ELISA and INgezim PPA The reactivity measurement results using COMPAC ELISA) are shown in FIGS. 8a to 8c.
도 7의 실험값은 표 12에, 도 8a 내지 8c의 실험값은 표 13 내지 15에 나타내었다.The experimental values of FIG. 7 are shown in Table 12, and the experimental values of FIGS. 8A to 8C are shown in Tables 13 to 15.
번호individual
ValueS/P
Value
ValueS/P
Value
ValueS/P
Value
ValueS/P
Value
ValueS/P
Value
번호individual
ValueBlocking (%)
Value
ValueBlocking (%)
Value
번호individual
ValueS/P (%)
Value
ValueS/P (%)
Value
ValueS/P (%)
Value
번호individual
ValuePI (%)
Value
도 7 및 도 8a 내지 8c, 표 12 내지 15에서 확인할 수 있듯이, 유전자 II형 검체에 대한 결과와 달리 유전자 I형 검체에 대하여 본 발명의 키트는 종래의 상용화된 키트와 비슷한 반응성을 나타내었다.As can be seen in FIGS. 7 and 8a to 8c and Tables 12 to 15, unlike the results for the gene type II sample, the kit of the present invention showed similar reactivity to the conventional commercially available kit for the gene type I sample.
다음으로, ASFV 비발생 지역의 항혈청을 반응시킨 결과를 도 9 및 표 16에 나타내었다.Next, the results of reacting the antiserum in the ASFV non-occurring region are shown in FIG. 9 and Table 16.
(n)Frequency
(n)
도 9 및 표 16에서 확인할 수 있듯이, ASFV 재조합 항원 (p22+p30)으로 플레이트가 코팅된 본 발명의 키트는 99.8% (n=1,133)의 항혈청에 대하여 음성인 것으로 나타났다.As can be seen in Figure 9 and Table 16, the kit of the present invention coated with ASFV recombinant antigen (p22+p30) was negative for 99.8% (n = 1,133) of the antiserum.
따라서, 본 발명의 p22 및 p30 항원 단백질 (2종)로 플레이트가 코팅된 키트는 ASFV에 감염되었는지 여부를 신속하고 간편하게 검출할 수 있으며, ASFV 비발생 지역 항혈청에 대하여 음성을 나타내는 것으로 보아 높은 정확도로 ASFV 감염 여부를 판정할 수 있다.Therefore, the kit coated with the p22 and p30 antigen proteins (two types) of the present invention can detect ASFV infection quickly and easily, and can be detected with high accuracy as it is negative for antiserum in areas where ASFV does not occur. ASFV infection can be determined.
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<110> MEDIAN Diagnostics Inc. REPUBLIC OF KOREA(Animal and Plant Quarantine Agency) <120> COMPOSITION FOR DIAGNOSTIC AFRICAN SWINE FEVER USING TWO RECOMBINANT ANTIGENS AND DIAGNOSTIC KITS COMPRISING THEREOF <130> PN210072 <160> 8 <170> KoPatentIn 3.0 <210> 1 <211> 30 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> ASFV p22 Forward <400> 1 cgggatccta taagaaacaa caaccaccga 30 <210> 2 <211> 30 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> ASFV p22 Reverse <400> 2 ccctcgagtg catgtttatg atttctaggt 30 <210> 3 <211> 45 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> ASFV p30 Forward <400> 3 aacggattta agatcatctt cacaagttgt gtttcatgcg ggtag 45 <210> 4 <211> 45 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> ASFV p30 Reverse <400> 4 ctacccgcat gaaacacaac ttgtgaagat gatcttaaat ccgtt 45 <210> 5 <211> 969 <212> DNA <213> Unknown <220> <223> p22-TM nucleotide <400> 5 atgagcgata aaattattca cctgactgac gacagttttg acacggatgt actcaaagcg 60 gacggggcga tcctcgtcga tttctgggca gagtggtgcg gtccgtgcaa aatgatcgcc 120 ccgattctgg atgaaatcgc 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<213> Unknown <220> <223> p30 nucleotide <400> 6 atgagcgata aaattattca cctgactgac gacagttttg acacggatgt actcaaagcg 60 gacggggcga tcctcgtcga tttctgggca gagtggtgcg gtccgtgcaa aatgatcgcc 120 ccgattctgg atgaaatcgc tgacgaatat cagggcaaac tgaccgttgc aaaactgaac 180 atcgatcaaa accctggcac tgcgccgaaa tatggcatcc gtggtatccc gactctgctg 240 ctgttcaaaa acggtgaagt ggcggcaacc aaagtgggtg cactgtctaa aggtcagttg 300 aaagagttcc tcgacgctaa cctggccggt tctggttctg gccatatgca ccatcatcat 360 catcattctt ctggtctggt gccacgcggt tctggtatga aagaaaccgc tgctgctaaa 420 ttcgaacgcc agcacatgga cagcccagat ctgggtaccg acgacgacga caaggccatg 480 gctgatatcg gatccgaatt catggatttt attttaaata tatccatgaa aatggaggtc 540 atcttcaaaa cggatttaag atcatcttca caagttgtgt ttcatgcggg tagtctgtat 600 aattggtttt ctgttgagat tatcaatagc ggtagaattg ttacgaccgc tataaaaaca 660 ttgcttagta ctgttaagta tgatattgtg aaatctgctc gtatatatgc agggcaaggg 720 tatactgaac atcaggctca agaagaatgg aatatgattc tgcatgtgct gtttgaagag 780 gagacggaat cctcagcatc ttcggagaac attcatgaaa aaaatgataa tgaaaccaat 840 gaatgcacat cctcctttga aacgttgttt gagcaagagc cctcatcgga ggtacctaaa 900 gactccaagc tgtatatgct tgcacaaaag actgtgcaac atattgaaca atatggaaag 960 gcacctgatt ttaacaaggt tattagagca cataatttta ttcaaaccat ttatggaacc 1020 cctctaaagg aagaagaaaa agaggtggta agactcatgg ttattaaact tttaaaaaaa 1080 aaagtcgaca agcttgcggc cgcactcgag caccaccacc accaccactg a 1131 <210> 7 <211> 322 <212> PRT <213> Unknown <220> <223> p22-TM polypeptide <400> 7 Met Ser Asp Lys Ile Ile His Leu Thr Asp Asp Ser Phe Asp Thr Asp 1 5 10 15 Val Leu Lys Ala Asp Gly Ala Ile Leu Val Asp Phe Trp Ala Glu Trp 20 25 30 Cys Gly Pro Cys Lys Met Ile Ala Pro Ile Leu Asp Glu Ile Ala Asp 35 40 45 Glu Tyr Gln Gly Lys Leu Thr Val Ala Lys Leu Asn Ile Asp Gln Asn 50 55 60 Pro Gly Thr Ala Pro Lys Tyr Gly Ile Arg Gly Ile Pro Thr Leu Leu 65 70 75 80 Leu Phe Lys Asn Gly Glu Val Ala Ala Thr Lys Val Gly Ala Leu Ser 85 90 95 Lys Gly Gln Leu Lys Glu Phe Leu Asp Ala Asn Leu Ala Gly Ser Gly 100 105 110 Ser Gly His Met His 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tgacgaatat cagggcaaac tgaccgttgc aaaactgaac 180 atcgatcaaa accctggcac tgcgccgaaa tatggcatcc gtggtatccc gactctgctg 240 ctgttcaaaa acggtgaagt ggcggcaacc aaagtgggtg cactgtctaa aggtcagttg 300 aaagagttcc tcgacgctaa cctggccggt tctggttctg gccatatgca ccatcatcat 360 catcattctt ctggtctggt gccacgcggt tctggtatga aagaaaccgc tgctgctaaa 420 ttcgaacgcc agcacatgga cagcccagat ctgggtaccg acgacgacga caaggccatg 480 gctgatatcg gatcctataa gaaacaacaa ccaccgaaaa aggtctgtaa agtagataaa 540 gattgtggta gtggagagca ttgtgttcgt ggatcatgta gctcattgag ctgcttagat 600 gccgtaaaaa tggacaaacg aaatattaag atagattcta agatttcctc atgcgaattc 660 actcccaatt tttaccgttt tacggatact gctgctgatg agcagcaaga atttggaaaa 720 acacggcatc ctataaaaat aactccatct ccaagtgaat cccatagccc ccaagaggtg 780 tgtgaaaaat attgttcatg gggaaccgat gactgtacag gttgggaata tgttggtgat 840 gaaaaggagg gaacatgtta tgtatataat aatccacatc acccggttct taaatatggt 900 aaggatcaca tcatagcctt acctagaaat cataaacatg cactcgagca ccaccaccac 960 caccactga 969 <210> 6 <211> 1131 <212> DNA 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attcatgaaa aaaatgataa tgaaaccaat 840 gaatgcacat cctcctttga aacgttgttt gagcaagagc cctcatcgga ggtacctaaa 900 gactccaagc tgtatatgct tgcacaaaag actgtgcaac atattgaaca atatggaaag 960 gcacctgatt ttaacaaggt tattagagca cataatttta ttcaaaccat ttatggaacc 1020 cctctaaagg aagaagaaaa agaggtggta agactcatgg ttattaaact tttaaaaaaa 1080 aaagtcgaca agcttgcggc cgcactcgag caccaccacc accaccactg a 1131 <210> 7 <211> 322 <212> PRT <213> unknown <220> <223> p22-TM polypeptide <400> 7 Met Ser Asp Lys Ile Ile His Leu Thr Asp Asp Ser Phe Asp Thr Asp 1 5 10 15 Val Leu Lys Ala Asp Gly Ala Ile Leu Val Asp Phe Trp Ala Glu Trp 20 25 30 Cys Gly Pro Cys Lys Met Ile Ala Pro Ile Leu Asp Glu Ile Ala Asp 35 40 45 Glu Tyr Gln Gly Lys Leu Thr Val Ala Lys Leu Asn Ile Asp Gln Asn 50 55 60 Pro Gly Thr Ala Pro Lys Tyr Gly Ile Arg Gly Ile Pro Thr Leu Leu 65 70 75 80 Leu Phe Lys Asn Gly Glu Val Ala Ala Thr Lys Val Gly Ala Leu Ser 85 90 95 Lys Gly Gln Leu Lys Glu Phe Leu Asp Ala Asn Leu Ala Gly Ser Gly 100 105 110 Ser Gly His Met His His His His His His Ser Ser Gly Leu Val Pro 115 120 125 Arg Gly Ser Gly Met Lys Glu Thr Ala Ala Ala Lys Phe Glu Arg Gln 130 135 140 His Met Asp Ser Pro Asp Leu Gly Thr Asp Asp Asp Asp Lys Ala Met 145 150 155 160 Ala Asp Ile Gly Ser Tyr Lys Lys Gln Gln Pro Pro Lys Lys Val Cys 165 170 175 Lys Val Asp Lys Asp Cys Gly Ser Gly Glu His Cys Val Arg Gly Ser 180 185 190 Cys Ser Ser Leu Ser Cys Leu Asp Ala Val Lys Met Asp Lys Arg Asn 195 200 205 Ile Lys Ile Asp Ser Lys Ile Ser Ser Cys Glu Phe Thr Pro Asn Phe 210 215 220 Tyr Arg Phe Thr Asp Thr Ala Ala Asp Glu Gln Gln Glu Phe Gly Lys 225 230 235 240 Thr Arg His Pro Ile Lys Ile Thr Pro Ser Pro Ser Glu Ser His Ser 245 250 255 Pro Gln Glu Val Cys Glu Lys Tyr Cys Ser Trp Gly Thr Asp Asp Cys 260 265 270 Thr Gly Trp Glu Tyr Val Gly Asp Glu Lys Glu Gly Thr Cys Tyr Val 275 280 285 Tyr Asn Asn Pro His His Pro Val Leu Lys Tyr Gly Lys Asp His Ile 290 295 300 Ile Ala Leu Pro Arg Asn His Lys His Ala Leu Glu His His His His 305 310 315 320 His His <210> 8 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Claims (8)
서열번호 8의 아미노산 서열을 포함하는 펩타이드를 1.00 ug/mL의 농도;
로 포함하는 아프리카 돼지열병 (African swine fever; ASF) I형 및 II형 동시 진단용 항원 조성물.A peptide containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 7 at a concentration of 0.50 ug/mL; and
A concentration of 1.00 ug/mL of the peptide comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 8;
An antigenic composition for simultaneous diagnosis of African swine fever (ASF) type I and type II comprising the.
서열번호 8의 아미노산 서열을 포함하는 펩타이드를 1.00 ug/mL의 농도;
로 포함하는 아프리카 돼지열병 (ASF) I형 및 II형 동시 진단용 키트.A peptide containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 7 at a concentration of 0.50 ug/mL; and
A concentration of 1.00 ug/mL of the peptide comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 8;
A kit for simultaneous diagnosis of African swine fever (ASF) type I and type II, comprising:
시료를 준비하는 준비 단계; 및
시료를 서열번호 7의 아미노산 서열을 포함하는 펩타이드를 0.50 ug/mL 농도 및 서열번호 8의 아미노산 서열을 포함하는 펩타이드를 1.00 ug/mL의 농도로 포함하는 조성물과 접촉시키는 접촉 단계.A method of providing information for the simultaneous diagnosis of African swine fever (ASF) types I and II, which includes the following steps:
preparation step of preparing a sample; and
A contacting step of contacting the sample with a composition comprising the peptide comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 7 at a concentration of 0.50 ug/mL and the peptide comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 8 at a concentration of 1.00 ug/mL.
The information providing method according to claim 7, wherein the contacting step is performed at a temperature condition of 20 to 30 °C.
Priority Applications (1)
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Non-Patent Citations (3)
Title |
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Ana Camacho et al, Virology (1991), vol 181, pp 251-257. |
Farideh Rasooli et al, RPS (2019.), vol 14, no 6, pp 554-565. |
J M Oviedo et al, Journal of Virological Methods (1997.), vol 64, pp 27-35. |
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