KR102486284B1 - A method for regulating differentiation of germinal center B cells to plasma cells regulating glycogen synthase kinase 3 and composition therefor - Google Patents
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Abstract
본 발명은 글리코겐 신타제 키나제 3을 조절하여 배 중심 B 세포에서 형질 세포로의 분화를 조절하는 방법, 글리코겐 신타제 키나제 3를 유효성분으로 포함하는 배 중심 B 세포에서 형질 세포로의 분화 조절용 조성물, 글리코겐 신타제 키나제 3 억제제를 유효성분으로 포함하는 배 중심 B 세포에서 형질 세포로의 분화 촉진용 조성물 및 백신 생산 증대용 조성물에 관한 것이다.The present invention provides a method for regulating the differentiation of germinal center B cells into plasma cells by regulating glycogen synthase kinase 3, a composition for regulating the differentiation of germinal center B cells into plasma cells comprising glycogen synthase kinase 3 as an active ingredient, The present invention relates to a composition for promoting differentiation from germinal center B cells into plasma cells and a composition for increasing vaccine production comprising a glycogen synthase kinase 3 inhibitor as an active ingredient.
Description
본 발명은 글리코겐 신타제 키나제 3을 조절하여 배 중심 B 세포에서 형질 세포로의 분화를 조절하는 방법 및 그 조성물에 관한 것이다.The present invention relates to methods and compositions for regulating differentiation of germinal center B cells into plasma cells by modulating
항체 분비 형질 세포(PC) 및 기억 B 세포(MBC)의 발전은 체액성 면역의 핵심 이벤트이다. 배 중심(GC) 경험이 있는 PC는 침입하는 병원체로부터 숙주를 보호하는 고친화성 클래스 전환 항체를 분비하며, MBC는 동일한 항원으로 두 번째 도전시 PC로 신속하게 분화하여 효과적인 면역을 담당한다. The development of antibody secreting plasma cells (PCs) and memory B cells (MBCs) are key events in humoral immunity. Germinal center (GC)-experienced PCs secrete high-affinity class-switching antibodies that protect the host from invading pathogens, and MBC rapidly differentiates into PCs upon a second challenge with the same antigen, responsible for effective immunity.
이러한 이펙터 B 세포의 생성에 대한 적절한 조절은 면역 항상성에 필수적이다. 따라서 GC B 세포가 자신의 운명을 결정하기 위해 선택되고 GC 반응 동안 분화를 지시하는 GC 반응의 기본 메커니즘을 밝히는 것은 면역 반응을 이해하고 백신 개발을 안내하는 기본 사항이다.Proper regulation of the generation of these effector B cells is essential for immune homeostasis. Therefore, elucidating the mechanisms underlying the GC response by which GC B cells are selected to determine their fate and directing their differentiation during the GC response is fundamental to understanding the immune response and guiding vaccine development.
적절한 GC B 세포의 선택은 GC의 밝은 영역(LZ)과 어두운 영역(DZ) 사이의 순환적 재진입 중에 발생하며, 체세포 과돌연변이를 동반하여 다양한 친화성을 가진 B 세포 수용체 (BCR)의 새로운 버전을 생성한다. Selection of appropriate GC B cells occurs during cyclic re-entry between the light zone (LZ) and dark zone (DZ) of GCs, accompanied by somatic hypermutation to generate new versions of the B-cell receptor (BCR) with varying affinities. generate
BCR 수준이 높은 CXCR4hiCD83lo (또는 CD86lo) DZ B 세포는 BCR 다운스트림 신호 전달 경로를 통해 LZ로 이동하여 여포 수상 세포 표면에 표시된 항원에 대한 결합을 위해 서로 경쟁하고 그들을 제한된 수의 T 여포 헬퍼(Tfh) 세포에 프리젠트한다. CXCR4hiCD83lo (or CD86lo) DZ B cells with high BCR levels migrate to the LZ via the BCR downstream signaling pathway, where they compete with each other for binding to antigens displayed on the follicular dendritic cell surface and recruit them to a limited number of T follicle helpers (Tfh). present to the cell.
LZ에서 DZ로의 전이는 CXCR4loCD83hi(또는 CD86hi) LZ B 세포가 Tfh 세포로부터 강한 CD40 및 IL-21 신호를 수신하는 고친화성 BCR로 인해 Tfh 세포와 성공적으로 결합할 때 상향 조절된 CXCR4 발현에 대한 반응으로 발생한다. DZ에서 선택된 LZ B 세포의 증식을 위한 세포주기 진입은 또한 전사 인자 c-Myc 및 Foxo1의 기능에 의존하는 방식으로 LZ에서 DZ 로의 전환 동안 발생한다. DZ와 LZ 사이에서 양성으로 선택된 GC B 세포의 조절된 반복적인 순환은 GC 반응의 핵심 이벤트 중 하나 인 이펙터 B 세포의 프로제니 생성과 커플된다. 이 높은 친화성 기반 선택 모델은 GC B 세포가 Tfh 세포 사이의 약하거나 강한 상호 작용을 구별하는 특정 메커니즘의 존재를 전제로 한다. 그러나 자세한 메커니즘은 아직 밝혀지지 않았다.The LZ to DZ transition is in response to upregulated CXCR4 expression when CXCR4loCD83hi (or CD86hi) LZ B cells successfully associate with Tfh cells due to their high-affinity BCR receiving strong CD40 and IL-21 signals from Tfh cells. Occurs. Cell cycle entry for proliferation of selected LZ B cells in the DZ also occurs during the LZ to DZ transition in a manner dependent on the function of the transcription factors c-Myc and Foxo1. Regulated recurrent cycling of positively selected GC B cells between the DZ and LZ is coupled with progeny generation of effector B cells, which is one of the key events of the GC response. This high-affinity-based selection model presupposes the existence of specific mechanisms by which GC B cells discriminate between weak and strong interactions between Tfh cells. However, the detailed mechanism has not yet been elucidated.
[선행 특허 문헌][Prior Patent Literature]
대한민국특허공개번호 10-2018-0066263Korean Patent Publication No. 10-2018-0066263
본 발명은 상기의 필요성에 의하여 안출된 것으로 본 발명의 목적은 배 중심 B 세포에서 형질 세포로의 분화 기작을 규명하는 것이다.The present invention was made in response to the above needs, and an object of the present invention is to investigate the differentiation mechanism from germinal center B cells into plasma cells.
상기의 목적을 달성하기 위하여 본 발명은 글리코겐 신타제 키나제 3을 조절하여 배 중심 B 세포에서 형질 세포로의 분화를 조절하는 방법을 제공한다.In order to achieve the above object, the present invention provides a method for regulating the differentiation of germinal center B cells into plasma cells by regulating
본 발명의 일 구현예에 있어서, 상기 방법은 상기 글리코겐 신타제 키나제 3를 억제하는 경우 배 중심 B 세포에서 형질 세포로의 분화가 촉진되는 것이 바람직하나 이에 한정되지 아니한다.In one embodiment of the present invention, the method preferably promotes differentiation of germinal center B cells into plasma cells when
본 발명의 다른 구현예에 있어서, 상기 글리코겐 신타제 키나제 3는 서열번호 1(Glycogen synthase kinase-3 alpha) 또는 서열번호 2(Glycogen synthase kinase-3 beta)의 아미노산 서열로 이루어진 것이 바람직하나 이에 한정되지 아니한다.In another embodiment of the present invention, the
또 본 발명은 글리코겐 신타제 키나제 3를 유효성분으로 포함하는 배 중심 B 세포에서 형질 세포로의 분화 조절용 조성물을 제공한다.In addition, the present invention provides a composition for regulating the differentiation of germinal center B cells into plasma cells, comprising
본 발명의 다른 구현예에 있어서, 상기 글리코겐 신타제 키나제 3는 서열번호 1 또는 서열번호 2의 아미노산 서열로 이루어진 것이 바람직하나 이에 한정되지 아니한다.In another embodiment of the present invention, the
또한 본 발명은 글리코겐 신타제 키나제 3 억제제를 유효성분으로 포함하는 배 중심 B 세포에서 형질 세포로의 분화 촉진용 조성물을 제공한다.In addition, the present invention provides a composition for promoting differentiation from germinal center B cells into plasma cells, comprising a
본 발명에 있어서, 상기 글리코겐 신타제 키나제 3 억제제는 화합물, 항체, 또는 핵산 물질인 것이 바람직하고, 상기 글리코겐 신타제 키나제 3 억제제는 하기 화학식 1의 화합물인 CHIR99021인 것이 더욱 바람직하나 이에 한정되지 아니한다.In the present invention, the
[화학식 1][Formula 1]
또 본 발명은 글리코겐 신타제 키나제 3 억제제를 유효성분으로 포함하는 백신 생산 증대용 조성물을 제공한다.In addition, the present invention provides a composition for increasing vaccine production comprising a
본 발명에 있어서, 상기 글리코겐 신타제 키나제 3 억제제는 화합물, 항체, 또는 핵산 물질인 것이 바람직하고, 상기 글리코겐 신타제 키나제 3 억제제는 하기 화학식 1의 화합물인 CHIR99021인 것이 더욱 바람직하나 이에 한정되지 아니한다.In the present invention, the
[화학식 1][Formula 1]
이하 본 발명을 설명한다.The present invention will be described below.
배 중심 (germinal center, 이하 'GC'라 함)의 B 세포는 전사 인자의 적절한 활동을 수행하기 위해 번역되는 수용체에 의해 수신되는 신호에 따라 형질 세포 (plasma cell, 이하 'PC'라 함) 또는 기억 B 세포를 형성하도록 프로그래밍된다.B cells of the germinal center (hereinafter referred to as 'GC') are either plasma cells (hereinafter referred to as 'PC') or programmed to form memory B cells.
그러나 GC 반응을 완료하기 위한 이 프로세스의 기반이 되는 정확한 메커니즘은 명확하지 않다. However, the exact mechanism underlying this process to complete the GC reaction is not clear.
본 발명자들은 글리코겐 신타제 키나제 3 (glycogen synthase kinase 3, 이하 'GSK3'라 함)가 GC B 세포 및 포스트 GC 과정의 c-Myc 의존적 양성 선택을 매개한다는 가설을 세웠고, 이 가설을 테스트하기 위해, GC B 세포를 PC로 분화하고 LZ에서 DZ 로의 전환에 대한 GSK3의 영향을 조사했다. 이는 포지티브로 선택된 GC B 세포와 PC 형성을 위한 필수 이벤트의 결과이다. 본 발명자들의 결과는 PC 운명에 전념하는 GC B 세포의 양성 선택에서 GSK3의 주요 역할을 강조할 수 있다.We hypothesized that glycogen synthase kinase 3 (hereinafter referred to as 'GSK3') mediates c-Myc-dependent positive selection of GC B cells and post-GC processes, and to test this hypothesis, GC B cells were differentiated into PCs and the effect of GSK3 on LZ to DZ conversion was investigated. This is a result of positively selected GC B cells and essential events for PC formation. Our results can highlight the key role of GSK3 in the positive selection of GC B cells committed to a PC fate.
본 발명에서, 우리는 GC B 세포에서 GSK3의 유전적 절제 및 약리학적 억제가 다크 (DZ) B 세포 특성의 획득과 함께 PC 형성에 대한 세포 운명 결정을 촉진한다는 것을 보여준다. In the present invention, we show that genetic ablation and pharmacological inhibition of GSK3 in GC B cells promote cell fate decisions towards PC formation with acquisition of dark (DZ) B cell properties.
기전적으로 CD40L 및 IL-21로 자극하면 GSK3 비활성화는 전사 인자 Foxo1 및 c-Myc를 상승적으로 유도하여 IRF4를 포함하여 PC 분화에 필요한 주요 전사 인자 수준을 증가시킨다. 전사 인자의 이러한 GSK3 매개된 변경은 차례로 DZ 전환과 그에 따른 PC 운명 약속을 촉진했다. 따라서 본 발명의 결과는 GC B 세포의 외부 신호를 해석하여 주요 전사 인자에 의해 매개되는 PC를 형성하는 업스트림 마스터 조절자를 보여준다.Mechanistically, upon stimulation with CD40L and IL-21, GSK3 inactivation synergistically induces the transcription factors Foxo1 and c-Myc, increasing levels of key transcription factors required for PC differentiation, including IRF4. These GSK3-mediated alterations of transcription factors in turn promoted DZ conversion and consequent PC fate commitment. Our results thus reveal an upstream master regulator that interprets the extrinsic signals of GC B cells to form PCs mediated by key transcription factors.
이하 본 발명을 상세하게 설명한다.Hereinafter, the present invention will be described in detail.
CD40L 및 IL-21 매개 c-Myc 유도는 유도된 GC B 세포에서 GSK3에 의존함CD40L and IL-21 mediated c-Myc induction is dependent on GSK3 in induced GC B cells
GSK3는 c-Myc 단백질을 직접 인산화하여 분해를 촉진하기 때문에, GSK3는 CD40L 및 IL-21 신호 전달의 하류에 작용하여 GC B 세포에서 c-Myc의 세포 수준을 조절한다고 가정했다. 이 가능성을 테스트하기 위해, 우리는 IL-4가 보충된 CD40L 및 BAFF 발현 피더 세포(CD40LB)에 대한 나이브 여포 B 세포 (FoB)로 4일 동안 배양하여 시험관 내 유도된 GC(iGC) B 세포를 생성했다. Since GSK3 directly phosphorylates c-Myc protein to promote its degradation, we hypothesized that GSK3 regulates cellular levels of c-Myc in GC B cells by acting downstream of CD40L and IL-21 signaling. To test this possibility, we in vitro induced GC (iGC) B cells by culturing for 4 days with naïve follicular B cells (FoB) on CD40L and BAFF expressing feeder cells (CD40LB) supplemented with IL-4. Created.
CD40L 및 IL-21로 iGC B 세포를 자극한 후, GSK3는 Ser9에서 인산화되는 것으로 나타냈고, 이는 CD40L 및 IL-21 자극시 GSK3 비활성화를 나타낸다(그림 1A). 중요한 것은, iGC B 세포의 c-Myc 발현 수준은 CD40L 및 IL-21 자극의 양에 따라 달라졌다는 것이다 (그림 1B). After stimulation of iGC B cells with CD40L and IL-21, GSK3 was shown to be phosphorylated at Ser9, indicating GSK3 inactivation upon CD40L and IL-21 stimulation (Fig. 1A). Importantly, c-Myc expression levels in iGC B cells varied with the amount of CD40L and IL-21 stimulation (Fig. 1B).
따라서 GSK3 키나아제 활성은 GC B 세포에서 c-Myc의 세포 수준의 CD40L 및 IL-21 매개 결정에 관여할 가능성이 매우 높다.Therefore, it is very likely that GSK3 kinase activity is involved in CD40L- and IL-21-mediated determination of cellular levels of c-Myc in GC B cells.
이 가능성을 직접 테스트하기 위해 본 발명자들은 야생형(GSK3 WT), 늘 활성을 가지는(GSK3 9A)를 발현하는 iGC B세포, 또는 Gsk3 f/f에서 생성된 null iGC B 세포로 레트로 바이러스 트랜스덕션을 통해 GSK3의 키나제-dead(GSK3 K85A) 형태를 발현하는 Gsk3f/f; Cg1Cre 녹아웃 (이하 GSK3 KO라고 함) FoB 세포를 생성하였다(그림 1C). To directly test this possibility, we retrovirally transduced iGC B cells expressing wild-type (GSK3 WT), constitutively active (GSK3 9A), or null iGC B cells generated from Gsk3 f/f. Gsk3f/f, which expresses the kinase-dead (GSK3 K85A) form of GSK3; Cg1Cre knockout (hereafter referred to as GSK3 KO) FoB cells were generated (Figure 1C).
GSK3 결핍은 보충된 IL-21로 CD40LB에서 6 시간 자극시 Gsk3 f/f iGC B 세포(이하 CTL로 지칭)에 비해 c-Myc의 상승적 유도를 초래했다 (그림 1D). GSK3 depletion resulted in synergistic induction of c-Myc compared to Gsk3 f/f iGC B cells (hereafter referred to as CTL) upon 6 h stimulation in CD40LB with supplemented IL-21 (Fig. 1D).
또한, GSK3 WT를 사용한 재구성은 c-Myc 발현 수준을 RV-Mock 감염된 GSK3-null iGC B 세포의 수준으로 감소시켰으며 (그림 1D), 이것은 c-Myc의 세포 레벨 결정과 관련하여 GSK3의 조절 역할을 시사한다. In addition, reconstitution with GSK3 WT reduced the c-Myc expression level to that of RV-Mock-infected GSK3-null iGC B cells (Fig. 1D), indicating a regulatory role of GSK3 in determining cellular levels of c-Myc. suggests
GC B 세포에서. 더 중요한 것은 GSK3 S9A 도입은 GSK3-null iGC B 세포에서 c-Myc의 분해를 초래한 반면, GSK3 K85A- 발현 B 세포는 동일한 조건에서 c-Myc 분해를 유도하지 않았다 (그림 1D). in GC B cells. More importantly, introduction of GSK3 S9A resulted in c-Myc degradation in GSK3-null iGC B cells, whereas GSK3 K85A-expressing B cells did not induce c-Myc degradation under the same conditions (Fig. 1D).
따라서, 우리는 CD40L 및 IL-21 자극에 대한 GSK3 키나제 활성을 조절하는 것이 GC B 세포에서 c-Myc의 세포 수준을 결정하는 필수 조절 모드 중 하나라는 결론을 내렸으며, 이는 GSK3가 GC 반응 중에서 특히 포스트 GC B 세포 운명 약속 및 포지티브하게 선택된 GC B 세포의 분화에서 조절 역할을 할 수 있음을 시사한다.Therefore, we conclude that regulating GSK3 kinase activity in response to CD40L and IL-21 stimulation is one of the essential regulatory modes determining the cellular level of c-Myc in GC B cells, suggesting that GSK3 plays a particularly important role in GC responses. post-GC B cell fate commitment and may play a regulatory role in the differentiation of positively selected GC B cells.
GSK3 결핍은 인 비트로 PC 분화 촉진GSK3 deficiency promotes PC differentiation in vitro
c-Myc 발현이 LZ GC B 세포의 양성 선택 및 PC 생성과 밀접하게 관련되어 있다는 점을 감안할 때, 포스트 GC B 세포 운명 결정과 PC 분화 동안 GC B 세포에서 GSK3의 자세한 역할을 조사했다. Given that c-Myc expression is closely related to positive selection and PC generation in LZ GC B cells, we investigated the detailed role of GSK3 in GC B cells during post-GC B cell fate decisions and PC differentiation.
세포 및 분자 수준에서 post-GC B 세포에서 GSK3의 역할을 더 잘 이해하기 위해 iGC B 세포 배양 시스템을 채택했다. 이 시스템에서 이펙터 B 세포는 연속적인 iGC B 세포 배양 및 포스트 iGC B 세포 배양에 의해 생성될 수 있다. To better understand the role of GSK3 in post-GC B cells at the cellular and molecular level, we adopted the iGC B cell culture system. Effector B cells in this system can be generated by continuous iGC B cell culture and post iGC B cell culture.
iGC B 세포는 4 일의 배양에 의해 생성되고,이어서 CD138+ 항체-분비 세포 (ASC)의 생성을 유도하기 위해 IL-21 보충과 함께 4 일 동안 더 배양되었다(도 2A). iGC B cells were generated by 4 days of culture, followed by further culture for 4 days with IL-21 supplementation to induce the generation of CD138+ antibody-secreting cells (ASCs) (FIG. 2A).
따라서, 우리는 이펙터 B 세포 분화 이벤트에서 GC B 세포 생성을 기능적으로 분석할 수 있으며, 생체 내 시스템을 사용하여 실현할 수 없는 GC B 세포 형성 후 포스트 GC B 세포 운명 결정 및 PC 분화를 팔로우할 수 있다. Thus, we can functionally analyze GC B cell generation in effector B cell differentiation events, following post GC B cell fate determination and PC differentiation after GC B cell formation, which is not feasible using an in vivo system. .
우리는 먼저 CTL 또는 GSK3 KO 마우스의 나이브 여포 B 세포에서 iGC B 세포를 생성했다. CTL 및 GSK3 KO 마우스 모두의 iGC B 세포는 FAS 및 GL-7의 유사한 발현 수준을 보였으며 4 일째에 유사한 수의 iGC B 세포를 생성했다 (그림 2B). 따라서 GSK3 고갈은 GC B 세포 분화 자체에 최소한의 영향을 미쳤다.We first generated iGC B cells from naive follicular B cells of CTL or GSK3 KO mice. iGC B cells from both CTL and GSK3 KO mice showed similar expression levels of FAS and GL-7 and generated similar numbers of iGC B cells at day 4 (Fig. 2B). Thus, GSK3 depletion had minimal effect on GC B cell differentiation itself.
GSK 후 반응에서 GSK3의 역할을 추가로 평가하기 위해, CTL 또는 GSK3 KO 마우스의 동일한 수의 iGC B 세포를 포스트 iGC B 세포 배양에 처리했다. To further evaluate the role of GSK3 in the post-GSK response, equal numbers of iGC B cells from CTL or GSK3 KO mice were treated post-iGC B cell culture.
놀랍게도 GSK3 KO 마우스의 유도된 형질 아세포(iPB)에서 CD138+ ASC의 빈도는 iGC B 세포를 4 일 배양 한 후 CTL iPB에서보다 훨씬 높았으며(그림 2C), 그들은 분비된 항체에서 기능적이었다(그림 2D).Surprisingly, the frequency of CD138+ ASCs in induced plasmablasts (iPBs) from GSK3 KO mice was much higher than that in CTL iPBs after 4-day culture of iGC B cells (Figure 2C), and they were functional in secreted antibodies (Figure 2D). .
CD138+ ASC 생성은 증식과 포지티브하게 연관되므로, CD138+ ASC의 향상된 생성은 GSK3 KO iGC B 세포의 증식에 유리할 수 있다. 그러나 우리는 3 일째에 증식에서 CTL과 GSK3KO iGC B 세포 사이의 유의한 차이를 감지할 수 없었으며 (그림 2E), 이는 CD138+ ASC의 향상된 생성이 가속화된 세포 분열의 결과가 아님을 시사한다. 대신에, GSK3 결핍은 PC 분화를 시작하는 iGC B 세포에 대한 유익한 단서가 될 수 있다. 왜냐하면 IRF4 및 Pax5(PC 분화의 주요 조절자)가 iGC B 세포에서 PC 분화 후 iGC B 배양 2 일 후 GSK3 KO 마우스 유래 iGC B 세포에서 PC 분화를 위하여 각각 빠르게 유도되고 하향 조절되었기 때문이다(도 2F, G). Since CD138+ ASC production is positively associated with proliferation, enhanced production of CD138+ ASCs may benefit proliferation of GSK3 KO iGC B cells. However, we could not detect a significant difference between CTL and GSK3KO iGC B cells in proliferation at day 3 (Figure 2E), suggesting that the enhanced generation of CD138+ ASCs is not a result of accelerated cell division. Instead, GSK3 deficiency could be an informative clue for iGC B cells to initiate PC differentiation. This is because IRF4 and Pax5 (key regulators of PC differentiation) were rapidly induced and downregulated for PC differentiation in iGC B cells derived from GSK3 KO mice, respectively, after 2 days of iGC B culture after PC differentiation in iGC B cells (Fig. 2F). , G).
또한, iGC B 세포 배양 후 2 일째에 GSK3 KO iGC B 세포로부터 Blimp-1 발현은 고도로 상향 조절되었고(그림 2H), CD138+ 형질 아세포는 빠르게 생성되었다(그림 2I). 요약하면, GSK3 결핍은 PC 분화를 시작하는 내부 단서로 기능하여 시험관 내에서 신속한 ASC 생성을 초래할 가능성이 매우 높다.In addition, Blimp-1 expression was highly upregulated from GSK3 KO iGC B cells on
GC B 세포의 GSK3 결핍은 생체 내 항체 생산을 저하시킴GSK3 deficiency in GC B cells lowers antibody production in vivo
GSK3 결핍 상태에서 신속한 PC 분화가 일어나는 것을 확인하기 위해 GSK3 KO 마우스에서 항원에 대한 체액성 면역을 평가했다. To confirm that rapid PC differentiation occurs in the presence of GSK3 deficiency, we evaluated humoral immunity against antigens in GSK3 KO mice.
그러나 GSK3 KO 마우스는 NP-OVA/Alum으로 면역화한 후 낮은 친화성 및 높은 친화성 NP 특이 IgG1 항체 생산에 결함이 있는 반면, 항원 특이 IgM 항체 생산은 CTL 마우스와 비슷했다. However, GSK3 KO mice were defective in low- and high-affinity NP-specific IgG1 antibody production after immunization with NP-OVA/Alum, whereas antigen-specific IgM antibody production was comparable to CTL mice.
이는 활성화된 B 세포에서 GSK3 발현이 ASC 생성에 필수적임을 시사한다. 특히, 이러한 결과는 GC 형성 또는 유지의 결함과 관련이 없을 수 있다. 왜냐하면 IgG1 + GC B 세포는 OVA/LPS/Alum으로 면역화한 후에도 비록 CTL 마우스보다 ~ 50 % 더 낮은 GC B 세포 수를 가지고 있음에도 불구하고 GSK3 KO 마우스에서 여전히 생성되었기 때문이다. This suggests that GSK3 expression in activated B cells is essential for ASC generation. In particular, these results may not be related to defects in GC formation or maintenance. This is because IgG1 + GC B cells were still generated in GSK3 KO mice after immunization with OVA/LPS/Alum, although they had ~50% lower GC B cell numbers than CTL mice.
참고로, GSK3 발현은 IgG1+ 및 IgG1- FAS + CD38lo GC B 세포에서 효과적으로 파괴되었다. 대신, GSK3 KO 마우스에서 IgG1+ CD138+ ASC가 거의 검출되지 않았기 때문에 CD138+ ASC의 생성은 GSK3 결핍에 의해 심각한 영향을 받을 수 있다. Of note, GSK3 expression was effectively disrupted in IgG1+ and IgG1- FAS + CD38lo GC B cells. Instead, the generation of CD138+ ASCs may be severely affected by GSK3 deficiency, as few IgG1+ CD138+ ASCs were detected in GSK3 KO mice.
이러한 결과는 위에서 설명한 시험관 내 시스템의 발견과 대조적이며, GC B 세포에서 GSK3의 존재가 인 비보에서 GC B 세포 풀을 유지하고 ASC를 생성하는 데 필수적임을 나타낸다.These results contrast with findings from the in vitro system described above and indicate that the presence of GSK3 in GC B cells is essential for maintaining the GC B cell pool and generating ASCs in vivo.
GSK3 결핍 및 GSK3 억제는 GC B 세포에서 기능적으로 구별됨GSK3 deficiency and GSK3 inhibition are functionally distinct in GC B cells
본 발명자들은 GSK3 결핍이 GC 반응 동안 결코 발생하지 않기 때문에 GSK3 활성의 억제는 GSK3 절제 이상의 생리적 조건을 나타낸다고 추측했다. 대안으로, GSK3 활성은 외부 신호를 통해 유발된 신호 전달 경로 및 GC B 세포에서 PKA 및 AKT와 같은 내부 신호 전달 조절자에 의해 조절될 수 있다. We speculated that inhibition of GSK3 activity represents a physiological condition beyond GSK3 ablation, as GSK3 deficiency never occurs during the GC response. Alternatively, GSK3 activity can be regulated by signaling pathways triggered through external signals and by internal signaling regulators such as PKA and AKT in GC B cells.
실제로 GSK3 KO 마우스에서 iPB의 절대 수는 현저하게 감소한 반면, iPB의 수는 특정 약리학적 억제제인 CHIR99021로 GSK3 키나제 활성을 억제했을 때 CTL 마우스의 수와 비슷했다(그림 3A). Indeed, while the absolute number of iPBs was significantly reduced in GSK3 KO mice, the number of iPBs was similar to that of CTL mice when GSK3 kinase activity was inhibited with the specific pharmacological inhibitor CHIR99021 (Fig. 3A).
이 발견은 GSK3 KO 마우스에서 손상된 체액성 면역이 포도당과 산소가 제한된 GC에서 세포 사멸로 인한 것일 가능성이 높기 때문에 ASC 생성에서 GSK3의 역할에 관한 역설적인 생체 내 및 시험관 내 결과를 조정하는 통찰력을 제공한다.This finding provides insight reconciling paradoxical in vivo and in vitro results regarding the role of GSK3 in ASC generation, as impaired humoral immunity in GSK3 KO mice is most likely due to cell death in glucose and oxygen-limited GCs. do.
이 가능성을 평가하기 위해, CTL 또는 GSK3 KO iGC B 세포를 iGC B 후 배양 동안 저 포도당 및 저 산소 상태에 노출하였다. 실제로 GSK3가 결핍된 iGC B 세포는 저 포도당 및 저 산소 상태에서 세포 사멸에 매우 취약했다(그림 3B, C). To evaluate this possibility, CTL or GSK3 KO iGC B cells were exposed to low glucose and hypoxic conditions during culture after iGC B. Indeed, iGC B cells deficient in GSK3 were highly susceptible to apoptosis under low glucose and hypoxic conditions (Fig. 3B, C).
그러나 CHIR99021 처리된 iGC B 세포는 동일한 조건에서 세포 자멸사를 유도하지 않았다(그림 3B, C). However, CHIR99021-treated iGC B cells did not induce apoptosis under the same conditions (Fig. 3B, C).
이 결과는 GSK3 활성 억제가 대사 요구와 ROS 생성을 증가시켜 GC B 세포에서 GSK3 결핍 상태와 유사한 세포 사멸을 유도해야 한다고 가정했기 때문에 놀랍다. This result is surprising because we hypothesized that inhibition of GSK3 activity should induce apoptosis similar to the GSK3-deficient condition in GC B cells by increasing metabolic demand and ROS production.
CHIR99021을 통한 GSK3 억제는 또한 세포 크기를 확대 (그림 3D)하고 해당 활성을 증가시켰으며(그림 3E), 결국 ROS 생산을 증가시켰으며(그림 3F), 대사 요구가 증가했음을 나타낸다. GSK3 inhibition via CHIR99021 also enlarged cell size (Fig. 3D) and increased glycolytic activity (Fig. 3E), which in turn increased ROS production (Fig. 3F), indicating increased metabolic demands.
이러한 예상치 못한 결과는 GC B 세포에서 GSK3 결핍 및 GSK3 억제가 다른 생물학적 메커니즘을 가질 수 있음을 강력하게 시사하며, 대사 체크 포인트 조절 자로서의 주요 기능 외에도 GSK3에 대한 추가 역할을 암시한다.These unexpected results strongly suggest that GSK3 deficiency and GSK3 inhibition in GC B cells may have different biological mechanisms, suggesting additional roles for GSK3 besides its main function as a metabolic checkpoint regulator.
GSK3 억제는 PC 분화 프로그램을 잠금 해제함GSK3 inhibition unlocks the PC differentiation program
우리는 다음으로 GSK3 KO iGC B 세포에서 관찰된 바와 같이 GSK3의 약리학 적 억제가 PC 생성을 위한 지침 신호로 작용하는지 여부를 테스트했다. We next tested whether pharmacological inhibition of GSK3 acts as a guidance signal for PC generation, as observed in GSK3 KO iGC B cells.
CD40LB 시스템에서 포스트 iGC B 세포 배양 동안 GSK3 억제는 GSK3 KO B 세포와 유사한 기능적 CD138 + ASC 생성을 촉진했다(그림 4A, B). GSK3 inhibition during post-iGC B cell culture in the CD40LB system promoted the generation of functional CD138 + ASCs similar to GSK3 KO B cells (Fig. 4A, B).
다음으로, 우리는 iGC 후 배양 4 일 동안 CD138+ 세포 출현의 동역학을 조사했다. 배양 첫 2 일 동안 CD138+ 빈도에는 뚜렷한 차이가 없었다. 그러나 CD138+ PC의 촉진된 생성은 분명히 이후에 발생했다(그림 4C). Next, we investigated the kinetics of CD138+ cell emergence during 4 days of culture after iGC. There was no apparent difference in CD138+ frequencies during the first 2 days of culture. However, accelerated generation of CD138+ PCs apparently occurred later (Figure 4C).
CHIR99021 처리에 의한 CD138+ ASC의 향상된 생성은 PC를 생성하거나 CD138+ ASC를 증폭하는 후속 기능을 위해 처음 2 일 동안 받은 iGC B 세포에 대한 지침으로 인해 발생할 수 있다. 이러한 가능성을 해결하기 위해 우리는 처음 2 일 동안 만 iGC B 세포의 GSK3 활성을 억제한 다음 GSK3 억제제가 없는 상태에서 2 일 더 대조군 iGC B 세포와 공동 배양했다(그림 4D). 2 일 동안 CHIR99021-전처리된 세포는 CHIR99021의 부재하에 대조군 세포에 의해 생성된 세포에 비해 더 많은 CD138+ ASC를 형성하는 경향이 있었다 (도 4E). 이러한 데이터는 GC B 세포의 비활성 GSK3가 CD138 + PC의 개체 발생 이전에 PC를 생성하기 위한 지침적 단서로 기능한다는 것을 강력하게 시사하며, 우리는 이것이 PC를 위한 변경된 전사 네트워크 때문이라고 생각했다.Enhanced generation of CD138+ ASCs by CHIR99021 treatment may result from instructions to iGC B cells received during the first 2 days for their subsequent function to generate PCs or amplify CD138+ ASCs. To address this possibility, we inhibited the GSK3 activity of iGC B cells only for the first 2 days and then co-cultured them with control iGC B cells for 2 more days in the absence of GSK3 inhibitor (Fig. 4D). CHIR99021-pretreated cells for 2 days tended to form more CD138+ ASCs compared to cells generated by control cells in the absence of CHIR99021 (FIG. 4E). These data strongly suggest that inactive GSK3 in GC B cells functions as a guiding cue to generate PCs prior to ontogeny of CD138+ PCs, and we attributed this to an altered transcriptional network for PCs.
이 가설을 테스트하고 세포 운명의 GSK3 매개 변경에 대한 더 많은 기작적 통찰력을 얻기 위해, 우리는 포스트 iGC B 배양 시스템에서 GSK3 억제제로 36 시간 동안 배양된 GSK3 불활성화된 post-iGC B 세포의 유전자 발현 프로파일링을 수행했다. 그런 다음 DMSO 처리된 대조군 세포와 비교하여 전사체 변화를 비교했다.To test this hypothesis and gain more mechanistic insights into GSK3-mediated alterations of cell fate, we investigated the gene expression of GSK3-inactivated post-iGC B cells cultured for 36 h with GSK3 inhibitors in a post-iGC B culture system. profiling was performed. We then compared transcriptome changes compared to DMSO-treated control cells.
GSK3- 억제된 post-iGC B 세포의 유전자 발현 프로파일은 DMSO 대조군의 유전자 발현 프로파일과 명확하게 구별되었다. The gene expression profile of GSK3-suppressed post-iGC B cells was clearly distinct from that of the DMSO control group.
우리는 134 개의 상향 조절된 유전자와 273 개의 하향 조절된 유전자를 포함하여 407 개의 다르게 발현된 유전자[DEGs; Q 값 <0.05, 폴드 변화 (|fc|)≥ 2]을 동정하였다(그림 4F). We identified 407 differentially expressed genes [DEGs; Q value <0.05, fold change (|fc|) ≥ 2] were identified (Fig. 4F).
이 407 개의 GSK3 반응성 유전자는 B 세포 활성화, B 세포 분화, 주요 조직 적합성 등급 II(MHCII)에 대한 항원 제시 및 세포 자멸사를 포함한 여러 생물학적 과정에 관여했다. These 407 GSK3-responsive genes were involved in several biological processes, including B-cell activation, B-cell differentiation, antigen presentation to major histocompatibility class II (MHCII), and apoptosis.
중요하게도, Bach2, Bcl6 및 Pax5가 감소하고 Irf4, Xbp1 및 Prdm1 발현이 유도된 PC의 투입을 위하여 이펙터 B 세포 분화의 전사 조절 인자의 발현이 변경되었다(그림 4G). Importantly, expression of transcriptional regulators of effector B cell differentiation was altered for PC input with reduced Bach2, Bcl6 and Pax5 and induced Irf4, Xbp1 and Prdm1 expression (Fig. 4G).
이러한 결과는 비활성 GSK3가 CD138 발현에 의한 PC 전구체로 지시되기 전에 빠르게 발생하는 PC 분화를 위하여 전사 프로그램을 변경하는 내부 단서로 기능한다는 것을 강력하게 제안한다.These results strongly suggest that inactive GSK3 functions as an internal cue to alter the transcriptional program for rapidly occurring PC differentiation before being directed to PC progenitors by CD138 expression.
GSK3 유도된 PC 분화는 IRF4 및 Bach2 발현에 의존함GSK3-induced PC differentiation depends on IRF4 and Bach2 expression
GSK3 억제에 의해 변경된 형질 세포 조절 유전자 중(그림 4G), IRF4의 세포 수준이 포스트 GSK B PC 분화로 세포 운명 결정의 주요 매개체이기 때문에 증가된 Irf4 발현이 비활성 GSK3 매개 증가된 CD138+ ASC 생성에 기능적으로 책임이 있는 것으로 간주되었다. Among the plasma cell regulatory genes altered by GSK3 inhibition (Figure 4G), increased Irf4 expression is functionally responsible for inactive GSK3-mediated increased CD138+ ASC generation, as cellular levels of IRF4 are a key mediator of cell fate decisions towards post-GSK B PC differentiation. was considered responsible.
이 가설을 검증하기 위해 GSK3 억제 iGC B 세포에서 Irf4를 표적으로 하는 짧은 헤어핀 RNA (shRNA)의 레트로 바이러스 도입을 통해 IRF4의 세포 수준을 감소시킨 다음 CD138+ ASC 생성에 미치는 영향을 조사했다. To test this hypothesis, we reduced cellular levels of IRF4 through retroviral introduction of Irf4-targeting short hairpin RNA (shRNA) in GSK3-suppressed iGC B cells and then investigated its effect on CD138+ ASC generation.
실제로, GSK3 매개 증가된 CD138 + ASC 생성은 효과적으로 제거되었다.Indeed, GSK3-mediated increased CD138 + ASC production was effectively eliminated.
Bach2는 포스트 GC B 세포 운명 약속의 또 다른 주요 매개체이며, 그 발현은 GC B 이후 세포를 MBC로 안내하는 동시에 PC 분화를 방지한다. Bach2 is another key mediator of post-GC B cell fate commitment, and its expression guides post-GC B cells to MBC while preventing PC differentiation.
그림 4G에서 볼 수 있 듯이, Bach2 발현은 GSK3 억제 후 iGC B 세포에서도 하향 조절되었으며, 따라서 GSK3 억제시 Irf4 유도보다 약간 더 일찍 발생했다, As shown in Figure 4G, Bach2 expression was also downregulated in iGC B cells after GSK3 inhibition, thus occurring slightly earlier than Irf4 induction upon GSK3 inhibition.
감소된 Bach2 발현이 또한 향상된 CD138+ ASC 생성의 원인 일 수 있음을 시사한다.suggesting that reduced Bach2 expression may also be responsible for enhanced CD138+ ASC generation.
이 가능성을 검증하기 위해 Bach2 발현 레트로 바이러스 벡터를 CHIR99021 처리된 iGC B 세포에 도입하여 CD138 + ASC 생성을 거의 완전히 방지했다. 이러한 결과는 GSK3 비활성화가 PC 운명 약속의 잘 확립된 전사 프로그램을 자극함을 나타낸다.To validate this possibility, introduction of a Bach2-expressing retroviral vector into CHIR99021-treated iGC B cells almost completely prevented CD138 + ASC generation. These results indicate that GSK3 inactivation stimulates a well-established transcriptional program of PC fate commitment.
c-Myc는 GSK3 매개된 시너지 IRF4 유도를 관여c-Myc is involved in GSK3-mediated synergistic IRF4 induction
GSK3의 기질인 c-Myc는 GC 반응의 핵심 조절자이므로 GC B 세포의 양성 선택을 매개 할 수 있다. As c-Myc, a substrate of GSK3, is a key regulator of GC responses, it can mediate positive selection of GC B cells.
c-Myc는 다양한 생물학적 과정에 관여하는 모든 유전자의 1/3을 조절하고 B 세포에서 Pax5 및 Irf4 발현을 직접 제어하는 것으로 제안되었기 때문에, 우리는 c-Myc가 비활성 GSK3에 의해 시작되는 전사 재프로그래밍의 중요한 매개체라고 생각했다. Since c-Myc regulates one-third of all genes involved in various biological processes and has been proposed to directly control Pax5 and Irf4 expression in B cells, we investigated c-Myc as a transcriptional reprogramming initiated by inactive GSK3. was considered an important medium for
이 가설을 검증하기 위해 먼저 GSK3가 비활성화된 포스트 iGC B 세포에서 c-Myc 발현 수준을 조사하고 24 시간 동안 지속된 자극 후 12 시간에 c-Myc의 시너지 유도를 발견했다 (그림 5A). To test this hypothesis, we first examined c-Myc expression levels in GSK3-inactivated post-iGC B cells and found synergistic induction of c-Myc at 12 h after stimulation lasted for 24 h (Fig. 5A).
다음으로, c-Myc가 GSK3 매개 변경된 유전자 발현을 담당하는 경우 이러한 유전자 발현 프로파일이 공유될 것이라고 추론했기 때문에 c-Myc+ GC B 세포와 GSK3 억제 iGC B 세포 간의 유전자 발현 프로파일을 비교했다. Next, we compared gene expression profiles between c-Myc+ GC B cells and GSK3-suppressed iGC B cells, as we inferred that these gene expression profiles would be shared if c-Myc was responsible for GSK3-mediated altered gene expression.
우리는 면역화된 마우스에서 분류된 c-Myc+ 및 c-Myc-GC B 세포의 공개된 데이터 세트를 재분석하고 425 DEGs(Q 값 <0.05, |fc| ≥ 2)를 발견했다. We reanalyzed a published data set of c-Myc+ and c-Myc-GC B cells sorted from immunized mice and found 425 DEGs (Q value <0.05, |fc| ≥ 2).
이전 실험에서 확인된 407 개의 GSK3 반응성 유전자 중 DEG의 8.8 % (상향 조절된 유전자 134 개 중 14 개, 하향 조절된 유전자 274 개 중 22 개)가 c-Myc 반응성 유전자와 중첩되었다(그림 5B). Of the 407 GSK3-responsive genes identified in previous experiments, 8.8% of the DEGs (14 out of 134 up-regulated genes and 22 out of 274 down-regulated genes) overlapped with c-Myc-responsive genes (Fig. 5B).
그러나 중첩된 유전자의 86 % (31/36)는 c-Myc 발현과 양의 상관 관계가 있었으며(그림 5C), 이는 c-Myc가 유전자 발현 프로파일의 GSK3 매개 변경에 부분적으로 기여할 수 있음을 시사한다. However, 86% (31/36) of overlapping genes were positively correlated with c-Myc expression (Fig. 5C), suggesting that c-Myc may partially contribute to GSK3-mediated alterations in gene expression profiles. .
중요한 것은 Irf4와 Bach2가 모두 양의 상관 관계가있는 유전자에 포함되었다는 것이다 (그림 5C). 이러한 결과는 c-Myc가 GSK3 매개 변경된 유전자 발현의 유일한 책임 요인은 아니지만, 직접 또는 간접적으로 Irf4 유도 및 Bach2 억제를 통해 구체적으로 GSK3 매개 GC B 세포 운명에 영향을 미칠 수 있음을 시사한다.Importantly, both Irf4 and Bach2 were included in the positively correlated genes (Fig. 5C). These results suggest that c-Myc is not the sole responsible factor for GSK3-mediated altered gene expression, but may directly or indirectly affect GSK3-mediated GC B cell fate through Irf4 induction and Bach2 inhibition.
c-Myc가 실제로 포스트 GC B 세포에서 Irf4 및 Bach2를 조절하는지 테스트하기 위해, 우리는 cmyc f/f iGC B 세포를 생성한 다음, Cre 재조합 효소의 레트로 바이러스 도입을 통해 포스트 iGC B 세포에서 c-Myc 기능을 억제했다. To test whether c-Myc indeed regulates Irf4 and Bach2 in post-GC B cells, we generated cmyc f/f iGC B cells, then retroviral introduction of Cre recombinase to induce c-Myc in post-iGC B cells. inhibited Myc function.
바이러스에 감염된 포스트 iGC B 세포에서 c-Myc 기능은 대조군보다 작은 세포 크기로 표시된 바와 같이 효율적으로 제거되었다(그림 5D). 이것은 Irf4 유도의 폐지 (그림 5E)를 가져 왔고, 따라서 GSK3 억제 포스트-iGC B 세포에서 IRF4의 세포 수준을 감소시켰다(그림 5F). 그러나 Bach2 억제는 c-Myc에 부분적으로만 의존했다(그림 5G). In virus-infected post-iGC B cells, c-Myc function was efficiently eliminated as indicated by smaller cell sizes than controls (Fig. 5D). This resulted in abrogation of Irf4 induction (Fig. 5E) and thus reduced cellular levels of IRF4 in GSK3-suppressed post-iGC B cells (Fig. 5F). However, Bach2 inhibition was only partially dependent on c-Myc (Fig. 5G).
이러한 결과는 GC B 세포가 PC 전구체로 커밋되도록하는 세포 IRF4 발현 수준이 GSK3-c-Myc 조절 축을 통해 결정된다는 것을 강력하게 시사한다.These results strongly suggest that the cellular IRF4 expression level that allows GC B cells to commit to PC progenitors is determined through the GSK3-c-Myc regulatory axis.
비활성 GSK3는 GC B 세포의 LZ에서 DZ 로의 전환을 촉진함Inactive GSK3 promotes LZ to DZ conversion in GC B cells
LZ와 DZ 사이의 주기적 여정은 포지티브하게 선택된 GC B 세포의 주요 특징이며 GC B 이후 세포 운명 약속과 관련이 있다. Cyclic journey between LZ and DZ is a key feature of positively selected GC B cells and is related to cell fate commitment after GC B.
선택된 LZ B 세포가 PC 전구체를 형성하고 DZ에서 더 분화한 다음 거기에서 GC를 빠져 나간다는 사실이 밝혀졌다. 따라서 GSK3 비활성화에 의한 PC 운명 약속에 대한 전사적 재 프로그래밍은 LZ에서 DZ 로의 전환을 수반하고 GSK3에 의해 규제 될 수도 있다. It has been shown that selected LZ B cells form PC progenitors, further differentiate in the DZ, and exit the GC from there. Thus, transcriptional reprogramming to PC fate commitment by GSK3 inactivation involves LZ to DZ conversion and may also be regulated by GSK3.
먼저, 우리는 GSK3 억제된 포스트 iGC B 세포에서 Cd83 및 Cd86의 감소된 발현을 관찰했다(그림 4F).First, we observed reduced expression of Cd83 and Cd86 in GSK3-suppressed post-iGC B cells (Fig. 4F).
Cd83 및 Cd86은 LZ B 세포의 특징적인 유전자이며, CXCR4 상향 조절에 의한 발현 손실은 DZ 전이에 필요하다. 이러한 데이터는 CXCR4가 DZ에서의 위치 지정에 중요하기 때문에 포스트 iGC B 세포 배양 기간 동안 GSK3 억제에 의해 상향 조절되는지 여부를 조사하도록 했다. 실제로, GSK3 비활성화는 포스트 iGC B 세포 배양에서 Cxcr4 유도를 자극하고(그림 6A) CXCR4hi CD83lo DZ- 유사 B 세포의 생성을 증가했다(그림 6B).Cd83 and Cd86 are characteristic genes of LZ B cells, and loss of expression by CXCR4 upregulation is required for DZ metastasis. These data prompted us to investigate whether CXCR4 is upregulated by GSK3 inhibition during the post-iGC B cell culture period, as it is important for localization in the DZ. Indeed, GSK3 inactivation stimulated Cxcr4 induction in post-iGC B cell cultures (Figure 6A) and increased the generation of CXCR4hi CD83lo DZ-like B cells (Figure 6B).
Foxo1은 LZ에서 DZ 로의 전환의 주요 조절 자 중 하나이므로 GSK3가 포스트 iGC B 세포에서 Foxo1 발현을 조절하여 LZ에서 DZ 로의 전환을 조절할 수 있다고 추론했다. 실제로, 비활성 GSK3 매개된 DZ-유사 B 세포 생성은 Foxo1의 상승적 유도를 동반했다(그림 6C). 그러나 Foxo1 유전자 발현은 GSK3 비활성화에 의해 변경되지 않았으며(그림 6D), GSK3가 Foxo1 안정성을 제어 할 수 있으므로 GC B 세포의 LZ에서 DZ 로의 전환을 조절할 수 있음을 나타냅낸다.As Foxo1 is one of the key regulators of the LZ to DZ transition, we reasoned that GSK3 could control the LZ to DZ transition by regulating Foxo1 expression in post-iGC B cells. Indeed, inactive GSK3-mediated DZ-like B cell generation was accompanied by synergistic induction of Foxo1 (Fig. 6C). However, Foxo1 gene expression was not altered by GSK3 inactivation (Fig. 6D), indicating that GSK3 can control Foxo1 stability and thus the LZ to DZ transition in GC B cells.
다음으로 LZ 및 DZ B 세포의 유전자 발현 프로파일을 재분석한 결과, 315 개의 유전자가 차별적으로 발현되었음을 발견했다(Q 값 <0.05, | fc | ≥ 2). 이 중 48 개 유전자는 GSK3 반응성 유전자와 공통 DEG였으며, DZ B 세포의 유전자 발현 프로파일은 CHIR99021 처리 후 iGC B 세포의 유전자 발현 프로파일과 밀접하게 밀집되어 있다 (그림 6E, F). 또한 48 개의 공통 DEG (표 S4) 중 25 개 유전자는 LZ 또는 DZ B 세포 시그니처 유전자였다. 전체적으로, 이러한 결과는 포지티브하게 선택된 포스트 GC B 세포의 또 다른 기능적 특징 인 LZ에서 DZ 로의 전환이 GSK3 비활성화에 의해 촉진된다는 것을 강력하게 시사한다.Next, we reanalyzed the gene expression profiles of LZ and DZ B cells and found that 315 genes were differentially expressed (Q value <0.05, |fc| ≥ 2). Of these, 48 genes were common DEGs with GSK3-responsive genes, and the gene expression profile of DZ B cells clustered closely with that of iGC B cells after CHIR99021 treatment (Fig. 6E, F). In addition, 25 genes among 48 common DEGs (Table S4) were LZ or DZ B cell signature genes. Altogether, these results strongly suggest that LZ to DZ conversion, another functional hallmark of positively selected post-GC B cells, is promoted by GSK3 inactivation.
본 발명을 통하여 알 수 있는 바와 같이, GSK3 단백질 활성을 조절하여 형질 세포로 분화를 촉진시킨다는 알 수 있고, 이것은 형질 세포의 분화와 생존을 높이는데 GSK3가 큰 역할을 할 것이라는 것을 예상할 수 있다.As can be seen through the present invention, it can be seen that differentiation into plasma cells is promoted by regulating GSK3 protein activity, and this can be expected that GSK3 will play a significant role in enhancing the differentiation and survival of plasma cells.
도 1은 CD40L 및 IL-21 매개 c-Myc 발현은 GSK3 키나제 활성에 의존한다는 R것을 나타낸 그림.
(A) agonistic CD40 항체 (25ug/ml) 및 IL-21 (50ng/ml) 자극(n = 3)시 iGC B 세포에서 인산화된 GSK3의 면역 블롯 분석(왼쪽) 및 막대 그래프 (오른쪽).
(B) 기재된 바와 같이 상이한 농도에서 작용성 CD40 항체 및 IL-21을 갖는 자극된 iGC B 세포에서 c-Myc의 면역 블롯 분석.
(C) GSK3를 GSK3-null iGC B 세포로 재구성하는 실험 계획.
(D) IL-21 (50 ng/ml)로 CD40LB에서 6 시간 자극시 재구성된 Thy1.1+ iGC B 세포의 c-Myc, GSK3? 및 GSK3? 인산화에 대한 면역 블롯 분석.
야생형 또는 돌연변이 형태의 GSK3- 발현 레트로 바이러스(RV)-감염 Thy1.1 + iGC B 세포를 분리하고 자극을 받았다. 표시된 면역 블롯 분석의 데이터는 세 가지 독립적인 실험을 대표.
도 2는 iGC B 세포의 GSK3 부재는 CD138 + ASC 생성을 촉진하는 것을 나타낸 그림.
(A) 시험관 내 iGC B 세포 및 포스트 iGC B 세포 배양의 실험 계획.
(B) 인 비트로 배양 시스템에서 FAS+ GL7+ iGC B 세포의 유세포 분석 분석(왼쪽) 및 FAS+ GL7+ iGC B 세포의 절대 수(오른쪽)(n = 7).
(C) 포스트 iGC B 세포 배양 4 일째에 CD138+ ASC의 빈도(n = 4).
(D) ELISA에 의해 결정된 iPB- 분비 IgG1 수준 (n = 3).
(E) 포스트 iGC B 세포 배양 3 일째에 CTV 표지된 iGC B 세포의 증식. 세 가지 독립적인 실험의 대표적인 데이터가 표시.
포스트 iGC B 세포 배양 2 일째에 IRF4(F), Pax5(G) 및 Blimp-1(H)의 세포 내 염색 및 평균 형광 강도 (MFI) (n = 4).
(I) 포스트 iGC B 세포 배양 2 일째에 CD19+ CD138+ 세포의 유세포 분석 분석 (왼쪽) 및 CD19+ CD138+ 세포의 백분율 (오른쪽) (n = 5).
도 3은 GSK3 비활성화는 iGC B 세포의 대사 요구를 증가시키는 것을 나타낸 그림.
(A) 포스트 iGC B 세포 배양 4 일째에 CTL, CHIR99021 (3μM) 처리된 CTL 또는 GSK3KO CD19+ iPB의 절대 수 (n = 4).
저-포도당 및 저산소 상태에서 1 일째에 Annexin V + PI + apoptotic post-iGC B 세포의 유세포 분석(B) 및 빈도(C) (n = 5).
(D) 포스트 -iGC B 세포 배양 1 일째에 포스트-iGC B 세포의 세포 크기. 세 가지 독립적인 실험의 대표적인 데이터가 표시.
(E) 1.5 일째에 포스트 iGC B 세포의 기초 및 최대 해당 활성(n = 3).
(F) 1 일째에 post-iGC B 세포에서 미토콘드리아 ROS의 수준 (n = 3).
도 4는 GSK3 비활성화는 ASC 생성을 위해 전사 네트워크를 변경하는 것을 나타내는 그림.
(A) 포스트 iGC B 세포 배양 4 일째에 iPB (n = 4)의 CD19+ CD138+ 세포의 유세포 분석 (왼쪽) 및 빈도 (오른쪽).
(B) ELISA에 의해 결정된 iPB- 분비 IgG1 수준 (n = 6).
(C) 포스트 iGC B 세포 배양 2 일 또는 4 일에 CD138+ 세포의 빈도 (n = 3).
(D) DMSO 또는 CHIR99021(3 μM) 사전 노출된 포스트 iGC B 세포와의 공동 배양의 실험 계획.
(E) 공동 배양 실험의 2 일 또는 4 일에 CD138+ 세포의 유세포 분석. 세 가지 독립적인 실험의 대표적인 데이터가 표시.
(F) 포스트 iGC B 세포 배양 1.5 일째에 DMSO 또는 CHIR99021- 처리된 iGC B 후 세포로부터의 유전자 발현 프로파일의 볼케이노 플롯.
(G) 선택된 이펙터 B 세포 분화 조절 유전자의 클러스터링된 히트 맵.
도 5는 c-Myc는 GSK3 매개 IRF4 유도의 매개체인 것을 나타낸 그림.
(A) 표시된 시점에서 iGC B 세포 및 post-iGC B 세포에서 c-Myc의 면역 블롯 분석. 막대 그래프는 β- 액틴 수준 (n = 3)으로 정규화된 상대적 c-Myc 발현 수준을 나타냄.
(B) GSK3 반응 유전자 및 c-Myc 반응 유전자의 공통 DEG는 두 가지 다른 기준으로 분석. 숫자는 유전자의 양을 나타냄.
(C) 공통 DEG 사이에서 양의 상관 관계가 있는 중복 유전자의 수 및 목록.
(D-G) cmyc f/f FoB 세포에서 생성된 iGC B 세포는 대조군 또는 Cre 재조합 효소 인코딩 레트로 바이러스로 감염됨. 바이러스에 감염된 iGC B 세포는 포스트 iGC B 세포 배양에 사용되었다.
(D) 포스트 -iGC B 배양 1 일째에 cmyc f/f 포스트-iGC B 세포의 세포 크기.
(E) 포스트 iGC B 배양 1.5 일째에 cmyc f/f 포스트 iGC B 세포에서 Irf4의 RT-PCR 분석 (n = 3).
(F) CHIR99021 (n = 5)의 존재하에 포스트 iGC B 배양 1.5 일째에 cmyc f/f 포스트 iGC B 세포에서 IRF4의 세포 수준.
(G) 포스트 -iGC B 배양 1 일째에 cmyc f/f 포스트-iGC B 세포에서 Bach2의 RT-PCR 분석 (n = 3).
도 6은 LZ에서 DZ 로의 전환은 GSK3 활성에 의해 조절되는 것을 나타내는 그림.
(A) 2 일째에 포스트 iGC B 세포에서 Cxcr4 발현의 RT-PCR 분석 (n = 4).
(B) 포스트 iGC B 배양 2 일 또는 4 일에 다크 존(DZ; CXCR4hiCD83lo) 또는 라이트 존 (LZ; CXCR4loCD83hi)-유사 B 세포의 빈도 (n = 3).
(C) 표시된 시점에서 iGC B 및 post-iGC B 세포에서 Foxo1 발현의 면역 블롯 분석. 막대 그래프는 β- 액틴 수준 (n = 3)으로 정규화된 Foxo1 발현 수준을 나타냄.
(D) 포스트 -iGC B 배양 2 일째에 Foxo1의 RT-PCR 분석 (n = 4).
(E) LZ/DZ-DEG 및 GSK3 반응성 유전자의 48 개 공통 DEG의 클러스터링된 히트 맵. 빨간색은 DZ 또는 LZ 시그니처 유전자를 나타냄.
(F) 48 개의 공통 DEG의 주성분 분석 플롯.1 is a diagram showing that CD40L and IL-21-mediated c-Myc expression is dependent on GSK3 kinase activity.
(A) Immunoblot analysis (left) and bar graph (right) of phosphorylated GSK3 in iGC B cells upon stimulation with agonistic CD40 antibody (25ug/ml) and IL-21 (50ng/ml) (n = 3).
(B) Immunoblot analysis of c-Myc in iGC B cells stimulated with functional CD40 antibody and IL-21 at different concentrations as described.
(C) Scheme of experiments to reconstitute GSK3 into GSK3-null iGC B cells.
(D) c-Myc, GSK3 of reconstituted Thy1.1+ iGC B cells upon stimulation for 6 h in CD40LB with IL-21 (50 ng/ml)? and GSK3? Immunoblot analysis for phosphorylation.
Wild-type or mutant GSK3-expressing retrovirus (RV)-infected Thy1.1 + iGC B cells were isolated and stimulated. Data from immunoblot analysis shown are representative of three independent experiments.
Figure 2 shows that the absence of GSK3 in iGC B cells promotes CD138 + ASC generation.
(A) Experimental scheme of in vitro iGC B cell and post iGC B cell culture.
(B) Flow cytometry analysis of FAS+ GL7+ iGC B cells (left) and absolute numbers of FAS+ GL7+ iGC B cells (right) in the in vitro culture system (n = 7).
(C) Frequency of CD138+ ASCs at
(D) iPB-secreted IgG1 levels determined by ELISA (n = 3).
(E) Proliferation of CTV-labeled iGC B cells at
Intracellular staining and mean fluorescence intensity (MFI) of IRF4 (F), Pax5 (G) and Blimp-1 (H) on
(I) Flow cytometry analysis of CD19+CD138+ cells (left) and percentage of CD19+CD138+ cells (right) at
Figure 3 shows that GSK3 inactivation increases the metabolic demand of iGC B cells.
(A) Absolute numbers of CTL, CHIR99021 (3 μM) treated CTL or GSK3KO CD19+ iPBs at
Flow cytometric analysis (B) and frequency (C) of Annexin V + PI + apoptotic post-iGC B cells at
(D) Cell size of post-iGC B cells at
(E) Basal and maximal glycolytic activity of post iGC B cells at day 1.5 (n = 3).
(F) Levels of mitochondrial ROS in post-iGC B cells at day 1 (n = 3).
Figure 4 shows that GSK3 inactivation alters the transcriptional network for ASC generation.
(A) Flow cytometric analysis (left) and frequency (right) of CD19+CD138+ cells in iPBs (n = 4) at
(B) iPB-secreted IgG1 levels determined by ELISA (n = 6).
(C) Frequency of CD138+ cells on
(D) Experimental scheme of co-culture with DMSO or CHIR99021 (3 μM) pre-exposed post iGC B cells.
(E) Flow cytometric analysis of CD138+ cells on
(F) Volcano plot of gene expression profiles from cells after DMSO or CHIR99021-treated iGC B at day 1.5 post iGC B cell culture.
(G) Clustered heat map of selected effector B cell differentiation regulatory genes.
Figure 5 is a diagram showing that c-Myc is a mediator of GSK3-mediated IRF4 induction.
(A) Immunoblot analysis of c-Myc in iGC B cells and post-iGC B cells at the indicated time points. Bar graphs represent relative c-Myc expression levels normalized to β-actin levels (n = 3).
(B) Common DEGs of GSK3 responsive gene and c-Myc responsive gene analyzed by two different criteria. Numbers indicate the amount of genes.
(C) Number and list of positively correlated overlapping genes among common DEGs.
(DG) iGC B cells generated from cmyc f/f FoB cells were infected with control or Cre recombinase-encoding retroviruses. Virus-infected iGC B cells were used for post-iGC B cell culture.
(D) Cell size of cmyc f/f post-iGC B cells at
(E) RT-PCR analysis of Irf4 in cmyc f/f post iGC B cells at day 1.5 of post iGC B culture (n = 3).
(F) Cellular levels of IRF4 in cmyc f/f post-iGC B cells at day 1.5 of post-iGC B culture in the presence of CHIR99021 (n = 5).
(G) RT-PCR analysis of Bach2 in cmyc f/f post-iGC B cells at
6 is a diagram showing that the conversion of LZ to DZ is regulated by GSK3 activity.
(A) RT-PCR analysis of Cxcr4 expression in post-iGC B cells at day 2 (n = 4).
(B) Frequency of dark zone (DZ; CXCR4hiCD83lo) or light zone (LZ; CXCR4loCD83hi)-like B cells on
(C) Immunoblot analysis of Foxo1 expression in iGC B and post-iGC B cells at indicated time points. Bar graph represents Foxo1 expression levels normalized to β-actin levels (n = 3).
(D) RT-PCR analysis of Foxo1 on
(E) Clustered heatmap of 48 common DEGs of LZ/DZ-DEG and GSK3 responsive genes. Red indicates DZ or LZ signature genes.
(F) Principal component analysis plot of the 48 common DEGs.
이하 비한정적인 실시예를 통하여 본 발명을 더욱 상세하게 설명한다. 단 하기 실시예는 본 발명을 예시하기 위한 의도로 기재된 것으로서 본 발명의 범위는 하기 실시예에 의하여 제한되는 것으로 해석되지 아니한다.Hereinafter, the present invention will be described in more detail through non-limiting examples. However, the following examples are described with the intention of illustrating the present invention, and the scope of the present invention is not construed as being limited by the following examples.
본 발명에 사용된 Gsk3 f/f 및 Gsk3 f/f 마우스는 Dr. J. Woodgett (Mount Sinai Hospital & Lunenfeld-Tanenbaum Research Institute)에 의해 제공되었고 Cγ1Cre 마우스와 교배되었다. cmyc f/f 및 Cγ1Cre 마우스는 Changchun Xiao (The Scripps Research Institute)에서 제공했다. 모든 실험에 8-10 주령 생쥐를 사용했다. 모든 마우스는 강원 대학교 동물 실험 센터에서 관리하고 강원대학교 동물 관리 및 사용위원회의 지침에 따라 사용했다.The Gsk3 f/f and Gsk3 f/f mice used in the present invention were prepared by Dr. J. Woodgett (Mount Sinai Hospital & Lunenfeld-Tanenbaum Research Institute) and crossed with Cγ1Cre mice. cmyc f/f and Cγ1Cre mice were provided by Changchun Xiao (The Scripps Research Institute). Mice aged 8–10 weeks were used for all experiments. All mice were managed by the Animal Research Center of Kangwon National University and used according to the guidelines of the Animal Care and Use Committee of Kangwon National University.
실시예 1: 여포 B 세포 분리Example 1: Follicular B cell isolation
다양한 실험 마우스로부터 비장 세포를 수집하고 적혈구를 ACK 파쇄 완충액 (Gibco)으로 파쇄시켰다. 적혈구가 파쇄된 비장 세포는 4℃에 20 분 동안 항-CD5 (PE), 항-CD9 (PE), 항-CD43 (PE), 항-CD93 (PE) 및 항-Ter119 (PE) 항체로 염색되었다. 염색된 비장 세포를 MACS 완충액 [0.5 % 소 혈청 알부민 (BSA), DPBS 중 2mM 에틸렌디아민테트라아세트산]으로 세척하고 항-PE 비드(Miltenyi Biotec)와 함께 4 °C에서 20 분 동안 배양했다. 모낭 B 세포는 LS 컬럼 (Miltenyi Biotec)을 사용하여 네가티브하게 분리되었다. 분리된 CD21int CD23 + 여포 B 세포(> 97 %)를 시험 관내 iGC B 배양에 사용했다.Splenocytes were collected from various experimental mice and red blood cells were disrupted with ACK lysis buffer (Gibco). Red blood cell disrupted splenocytes were stained with anti-CD5 (PE), anti-CD9 (PE), anti-CD43 (PE), anti-CD93 (PE) and anti-Ter119 (PE) antibodies for 20 minutes at 4°C. It became. Stained splenocytes were washed with MACS buffer [0.5% bovine serum albumin (BSA), 2 mM ethylenediaminetetraacetic acid in DPBS] and incubated with anti-PE beads (Miltenyi Biotec) for 20 min at 4 °C. Follicular B cells were negatively isolated using LS columns (Miltenyi Biotec). Isolated CD21int CD23 + follicular B cells (>97%) were used for iGC B culture in vitro.
실시예 2: 시험관 내 iGC B 세포 및 포스트 iGC B 세포 배양Example 2: In vitro iGC B cell and post iGC B cell culture
CD40LB 세포는 10 % 소 태아 혈청 및 1 % 페니실린/스트렙토 마이신(Gibco)이 포함된 Dulbecco의 변형된 Eagle 배지 Glutamax(Gibco)에서 유지되었다. CD40LB 세포는 Gammacell 40 Exactor (Best Theratronics)를 사용하여 100 Gy에서 조사한 후 in vitro iGC B 세포 및 post-iGC B 세포 배양의 피더 세포로 사용했다. CD40LB cells were maintained in Dulbecco's modified Eagle's medium Glutamax (Gibco) with 10% fetal bovine serum and 1% penicillin/streptomycin (Gibco). CD40LB cells were irradiated at 100 Gy using the
iGC B 세포를 생성하기 위해, 분리된 여포 B 세포(2 x 105)를 방사선 조사 된 CD40LB 세포에서 뮤린 IL-4 (1 ng / ml, Peprotech)가 보충된 완전 RPMI1640-Glutamax 배지 (Gibco)와 함께 4 일 동안 배양했다. To generate iGC B cells, isolated follicular B cells (2 x 10 5 ) were cultured from irradiated CD40LB cells with complete RPMI1640-Glutamax medium (Gibco) supplemented with murine IL-4 (1 ng/ml, Peprotech). were incubated for 4 days.
iGC B 세포는 LS 컬럼이 있는 비오틴 항-H-2Kd (Biolegend) 및 항 비오틴 비드 (Miltenyi Biotec)를 사용하여 CD40LB 세포를 고갈시켜 수확하고 정제했다. 정제된 iGC B 세포는 레스팅을 위해 37 °C에서 완전 RPMI 배지에서 12 시간 동안 CD40LB 없이 배양되었다. iGC B cells were harvested and purified by depletion of CD40LB cells using biotin anti-H-2Kd (Biolegend) and anti-biotin beads (Miltenyi Biotec) with an LS column. Purified iGC B cells were cultured without CD40LB for 12 h in complete RPMI medium at 37 °C for resting.
post-iGC B 세포 배양을 위해, 휴지된 iGC B 세포(60mm 배양 접시 당 2 x 105 세포 또는 12 웰 플레이트의 웰당 2 x 104 세포)를 1, 1.5, 2 또는 4 일 동안 조사 된 CD40LB 세포에서 뮤린 IL-21( 10 ng/ml, Peprotech)을 포함하는 완전 RPMI 배지에서 배양했고, CD40LB 고갈 후 추가 분석에 사용했다. For post-iGC B cell culture, resting iGC B cells (2 × 10 5 cells per 60 mm culture dish or 2 × 10 4 cells per well of a 12-well plate) were irradiated with irradiated CD40LB cells for 1, 1.5, 2 or 4 days. were cultured in complete RPMI medium containing murine IL-21 (10 ng/ml, Peprotech) and used for further analysis after CD40LB depletion.
인 비트로 증식 및 공동 배양 실험을 위해 iGC B 세포 또는 post-iGC B 세포는 제조업체 지침에 따라 carboxyfluorescein succinimidyl ester(CFSE; 5μM, Invitrogen) 또는 CellTrace Violet (CTV; 5μM, Invitrogen)으로 표지되었고 포스트 iGC B 세포 배양 조건에서 사용되었다. For in vitro proliferation and co-culture experiments, iGC B cells or post-iGC B cells were labeled with carboxyfluorescein succinimidyl ester (CFSE; 5 μM, Invitrogen) or CellTrace Violet (CTV; 5 μM, Invitrogen) according to manufacturer instructions and post-iGC B cells culture conditions were used.
iPB에서 분비된 IgG1 항체의 정량화를 위해, post-iGC B 세포를 post-iGC B 세포 배양 4 일째에 수확하고 피더 세포가 없는 완전 RPMI1640-Glutamax 배지에서 24 시간 동안 추가로 배양했고(웰당 1 x 105 세포/96-웰 플레이트), 배양 배지를 효소 결합 면역 분석 (ELISA)을 수행하였다.For quantification of secreted IgG1 antibodies from iPBs, post-iGC B cells were harvested on
면역 블롯 분석을 위해, 레스트된 iGC B 세포(48 웰 플레이트의 웰당 1 x 106 세포)를 다양한 농도로 1 시간 동안 (GSK3의 인산화 또는 4 시간 동안 작용성 CD40 항체 (BioXcell) 및 뮤린 IL-21 (Peprotech)로 활성화하였다. 활성화된 iGCB 세포를 야생형 또는 돌연변이 형태의 GSK3를 암호화하는 Thy1.1 발현 레트로 바이러스에 감염시킨 다음 Thy1.1 + 세포를 anti-Thy1.1(PE) (Biolegend) 및 anti-PE microbead (Miltenyi Biotec)를 사용하여 마그네틱 활성화된 세포 분류 분리로 정제하였다. 레스트된 Thy1.1+ 세포(48 웰 플레이트의 웰당 1 x 106 세포)를 CD40LB 피더 세포에서 6 시간 동안 자극했고, 면역 블롯 분석을 실시했다.For immunoblot analysis, rested iGC B cells (1 x 10 6 cells per well of a 48-well plate) were incubated at various concentrations for 1 hour (phosphorylation of GSK3 or agonistic CD40 antibody (BioXcell) and murine IL-21 for 4 hours). (Peprotech).Activated iGCB cells were infected with Thy1.1-expressing retroviruses encoding wild-type or mutant forms of GSK3, and then Thy1.1 + cells were infected with anti-Thy1.1(PE) (Biolegend) and anti-Thy1.1 (Biolegend). -PE microbeads (Miltenyi Biotec) were used to purify by magnetically activated cell sorting.Rested Thy1.1+ cells (1 x 10 6 cells per well of a 48-well plate) were stimulated on CD40LB feeder cells for 6 hours; Immunoblot analysis was performed.
실시예 3: 면역화Example 3: Immunization
Gsk3 f/f; Gsk3 f/f; Cg1Cre 및 대조군 Gsk3 f/f; Gsk3 f/f) 마우스에 25μl 의 Immject Alum (Thermo Fisher Scientific)과 50 μg의 ovalbumin (Sigma-Aldrich)과 5 μg의 LPS (Sigma-Aldrich)를 포함하는 25 μl의 1x PBS를 혼합하여 제조된 50μl의 오발부민/알럼/LPS를 피하 주사했다. Gsk3 f/f; Gsk3 f/f; Cg1Cre and control Gsk3 f/f; 50 μl prepared by mixing 25 μl of Immject Alum (Thermo Fisher Scientific) with 25 μl of 1x PBS containing 50 μg of ovalbumin (Sigma-Aldrich) and 5 μg of LPS (Sigma-Aldrich) for Gsk3 f/f) mice. of ovalbumin/alum/LPS was injected subcutaneously.
유세포 분석에 의한 GC 반응의 평가를 위해 면역화 후 10 일에 마우스를 희생시켰다. NP- 특이적 항체의 ELISA를 수행하기 위해 Immject Alum (Thermo Fisher Scientific) 25μl와 NP-Ovalbumin (Biosearch) 50μg이 포함된 1x PBS 25μl를 혼합하여 준비한 NP-OVA / Alum으로 마우스를 피하 면역화했다. 면역화 후 매주 21 일까지 혈청을 수집하였다.Mice were sacrificed 10 days after immunization for evaluation of GC responses by flow cytometry. To perform ELISA of NP-specific antibodies, mice were immunized subcutaneously with NP-OVA/Alum prepared by mixing 25 μl of Immject Alum (Thermo Fisher Scientific) and 25 μl of 1x PBS containing 50 μg of NP-Ovalbumin (Biosearch). Serum was collected weekly up to 21 days after immunization.
실시예 4: 유세포 분석Example 4: Flow Cytometry
IRF4, Blimp1 및 Pax5의 세포 내 발현은 유세포 분석으로 측정되었다.Intracellular expression of IRF4, Blimp1 and Pax5 was measured by flow cytometry.
Post-iGC B 세포는 고정/투과 완충액 (eBioscience)으로 4 °C에서 1 시간 동안 고정되었다. 염색 항체를 Permeabilization Buffer (eBioscience)에 희석하고 세포 내 염색을 37 °C에서 30 분 동안 수행했다. 하기 항체도 사용되었다: anti-IRF4 (PE), anti-Blimp1 (PE) 및 anti-Pax5 (PE). Post-iGC B cells were fixed for 1 hour at 4 °C with fixation/permeabilization buffer (eBioscience). The staining antibody was diluted in Permeabilization Buffer (eBioscience) and intracellular staining was performed at 37 °C for 30 min. The following antibodies were also used: anti-IRF4 (PE), anti-Blimp1 (PE) and anti-Pax5 (PE).
표면 마커 염색을 위해 하기 항체를 유세포 분석에 사용했다: anti-CD19 (PE/cy7), anti-CD138 (APC), anti-CD83 (PE), anti-CXCR4 (Biotin), streptavidin (APC), anti -FAS (PE), anti-FAS (BV510), anti-CD38 (PE/cy7) 및 anti-B220 (APC /cy7). For surface marker staining, the following antibodies were used for flow cytometric analysis: anti-CD19 (PE/cy7), anti-CD138 (APC), anti-CD83 (PE), anti-CXCR4 (Biotin), streptavidin (APC), anti -FAS (PE), anti-FAS (BV510), anti-CD38 (PE/cy7) and anti-B220 (APC/cy7).
미토콘드리아 ROS 측정을 위해 배양 1 일째에 포스트 iGC B 세포를 먼저 표면 마커에 대해 염색한 다음 5 % CO2 인큐베이터에서 37 °C에서 mitoSOX (5 μM, Invitrogen)로 염색했다.For mitochondrial ROS measurement, post iGC B cells on
실시예 5: ELISAExample 5: ELISA
ELISA 플레이트를 NP1-4 -BSA 또는 NP20-BSA (PBS에서 10 ug/ml, Biosearch Technologies)로 코팅하여 전체 또는 고 친화성 NP-특이적 항체를 각각 정량화했다. ELISA plates were coated with NP1-4-BSA or NP20-BSA (10 ug/ml in PBS, Biosearch Technologies) to quantify total or high affinity NP-specific antibodies, respectively.
차단은 0.5 % BSA가 있는 PBS에서 37 ℃에서 2 시간 동안 수행되었다. 마우스로부터 수집된 혈청을 희석하고 37 °C에서 2 시간 동안 배양하기 위해 플레이트에 로딩하였다. 플레이트를 0.05 % Tween (PBS-T)을 포함하는 PBS로 3 회 세척하였다. 마우스 IgM 및 IgG1 (Southernbiotech)에 대한 비오틴-접합된 1 차 항체를 웰에 첨가하고 0.5 % BSA가 있는 PBS에서 37 °C에서 1 시간 동안 추가로 배양했다. 세 번의 세척 단계 후, 스트렙타비딘-호스래디쉬 퍼옥시다제(HRP) (Biolegend)를 첨가하고 플레이트를 0.5 % BSA가 있는 PBS에서 37 °C에서 1 시간 동안 다시 인큐베이션하였다. Blocking was performed for 2 h at 37 °C in PBS with 0.5% BSA. Serum collected from mice was diluted and loaded onto plates for incubation at 37 °C for 2 h. Plates were washed 3 times with PBS containing 0.05% Tween (PBS-T). Biotin-conjugated primary antibodies against mouse IgM and IgG1 (Southernbiotech) were added to the wells and further incubated for 1 h at 37 °C in PBS with 0.5% BSA. After three washing steps, streptavidin-horseradish peroxidase (HRP) (Biolegend) was added and the plate was incubated again for 1 h at 37 °C in PBS with 0.5% BSA.
배양 후, 웰을 PBS-T로 3 회 세척하고 5ml의 3,30,5,50- 테트라 메틸 벤지딘 디하이드로클로라이드 수화물(TMB) 용액(BD Bioscience)으로 전개시켰다. 0.5M HCl 용액으로 반응을 중지한 다음 Synergy H1 마이크로 플레이트 리더 (BioTek)에서 정량화했다. iPB에서 분비된 IgG1의 정량화를 위해, 정제된 염소 항-마우스 Ig 카파 및 람다 경쇄 항체 (PBS에서 2.5 ug / ml, Southernbiotech)를 ELISA 플레이트에 코팅하고 비오틴이 결합된 항-마우스 IgG1 항체 (Southernbiotech)를 검출에 사용하였다.After incubation, the wells were washed three times with PBS-T and developed with 5 ml of 3,30,5,50-tetra methyl benzidine dihydrochloride hydrate (TMB) solution (BD Bioscience). Reactions were stopped with 0.5 M HCl solution and then quantified on a Synergy H1 microplate reader (BioTek). For quantification of secreted IgG1 from iPBs, ELISA plates were coated with purified goat anti-mouse Ig kappa and lambda light chain antibodies (2.5 ug/ml in PBS, Southernbiotech) and biotin-conjugated anti-mouse IgG1 antibody (Southernbiotech) was used for detection.
실시예 6: ELISPOT (Enzyme-linked immunospot) 분석Example 6: ELISPOT (Enzyme-linked immunospot) analysis
ELISPOT 분석은 IgG1 + ASC의 검출을 위해 수행되었다. 멀티 스크린 막 여과 96-웰 플레이트 (EMD Millipore, cat # MAIPSWU10)를 4 °C에서 밤새 염소 항-마우스 IgG1 (2.4 ㎍ / ml, Southernbiotech)로 코팅했다. ELISPOT assay was performed for detection of IgG1 + ASC. Multi-screen membrane filtration 96-well plates (EMD Millipore, cat # MAIPSWU10) were coated with goat anti-mouse IgG1 (2.4 μg/ml, Southernbiotech) overnight at 4 °C.
차단은 PBS 중 1 % 젤라틴으로 37 °C에서 2 시간 동안 수행되었다. PBS-T로 3 회 세척한 후 iPB를 각 웰에 넣고 37 °C에서 4 시간 동안 배양했다. 플레이트를 PBS-T로 3 회 세척하고 비오틴화된 항-마우스 IgG1 (1 : 1000, Southernbiotech)으로 1 시간 동안 배양 한 다음 streptavidin-HRP (1 : 1000, Biolegend)로 2 시간 동안 배양했다. 세 번의 세척 단계 후, 색상은 AEC 용액 (아세테이트 완충액 pH 5.1 + AEC Stock + 3 % H2O2)에서 전개되었다. AEC Stock은 3-아미노-9-에틸 카르 바졸 (Sigma Aldrich)을 디메틸포르마이드에 용해시켜 제조했다. 스팟은 입체 현미경으로 수동으로 카운트하였다.Blocking was performed with 1% gelatin in PBS for 2 h at 37 °C. After washing three times with PBS-T, iPB was added to each well and incubated at 37 °C for 4 hours. Plates were washed three times with PBS-T and incubated with biotinylated anti-mouse IgG1 (1:1000, Southernbiotech) for 1 hour followed by streptavidin-HRP (1:1000, Biolegend) for 2 hours. After three washing steps, color developed in AEC solution (Acetate buffer pH 5.1 + AEC Stock + 3% H2O2). AEC Stock was prepared by dissolving 3-amino-9-ethyl carbazole (Sigma Aldrich) in dimethylformide. Spots were manually counted under a stereomicroscope.
실시예 7:세포 사멸 분석Example 7: Cell death assay
정제된 iGC B 세포를 저산소 상태(4 % O2, 37 °C, 5 % CO2) 및 저 포도당 (1mM) 하에서 하루 동안 포스트 iGC B 세포 배양 조건에서 배양하였다. 세포를 수확하고 제조업체의 지침에 따라 Annexin V/PI 세포 사멸 키트 (eBioscience)를 사용하여 세포 사멸을 정량화했다. 요약하면, 세포를 Annexin V (20 μl 완충액에 1 μl, 1:20) 4 °C에서 20 분 동안 배양한 다음 프로피듐 요오드화물(PI; 40 μl 완충액에 1 μl, 1:40) 5 회 실온에서 어두운 곳에서 배양하였다.Purified iGC B cells were cultured under hypoxia (4% O2, 37 °C, 5% CO2) and low glucose (1 mM) for one day post iGC B cell culture conditions. Cells were harvested and cell death was quantified using the Annexin V/PI Cell Kill Kit (eBioscience) according to the manufacturer's instructions. Briefly, cells were incubated with Annexin V (1 μl in 20 μl buffer, 1:20) at 4 °C for 20 min, followed by propidium iodide (PI; 1 μl in 40 μl buffer, 1:40) 5 times at room temperature. incubated in the dark.
실시예 8:면역 블롯 분석Example 8: Immunoblot analysis
분류된 GC B 세포, 정제된 iGC B 세포 및 post-iGC B 세포를 PBS로 세척하고 1x 포스파타제 억제제 칵테일 (GenDEPOT) 및 1x 프로테아제 억제제 칵테일 (GenDEPOT)이 보충된 1x RIPA 버퍼 (Cell Signaling Technology)에서 얼음 위에서 30 분 동안 배양하여 파쇄되었다. Sorted GC B cells, purified iGC B cells, and post-iGC B cells were washed with PBS and incubated on ice in 1x RIPA buffer (Cell Signaling Technology) supplemented with 1x phosphatase inhibitor cocktail (GenDEPOT) and 1x protease inhibitor cocktail (GenDEPOT). It was disrupted by incubating for 30 minutes on top.
세포 파쇄물을 나트륨 도데실 설페이트-폴리 아크릴아미드 겔 전기 영동 겔에서 분리하고 폴리비닐리덴플루오라이드 막 (GE Healthcare)으로 옮겼다. The cell lysate was separated on a sodium dodecyl sulfate-polyacrylamide gel electrophoresis gel and transferred to a polyvinylidenefluoride membrane (GE Healthcare).
블롯은 2.5 % (wt / vol) 탈지유(Cell Signaling Technologies) 및 1x TBS-T 버퍼 (10mM Tris-HCl, pH 8.0 및 150mM NaCl, 0.1% 트윈 -20)에 희석된 1 차 항체로 4 °C에서 밤새 배양되었다. Blots were performed at 4 °C with primary antibodies diluted in 2.5% (wt/vol) skim milk (Cell Signaling Technologies) and 1x TBS-T buffer (10 mM Tris-HCl, pH 8.0 and 150 mM NaCl, 0.1% Tween-20). Incubated overnight.
모든 막은 ImageQuant LAS 500 (GE Healthcare)을 사용하여 스캔하고 이미지는 ImageJ (NIH Software)로 분석했다. Immunoblotting은 anti-c-Myc (Cell Signaling Technologies), anti-FOXO1 (Cell Signaling Technologies), anti-pGSK3β (Cell Signaling Technologies), anti-GSK3β (Santacruz) 및 β- 액틴-HRP (Santa Cruz Biotechnology)로 수행되었다. 2 차 항체로는 항 토끼 IgG-HRP (Cell Signaling Technologies)를 사용했다.All membranes were scanned using an ImageQuant LAS 500 (GE Healthcare) and images were analyzed with ImageJ (NIH Software). Immunoblotting was performed with anti-c-Myc (Cell Signaling Technologies), anti-FOXO1 (Cell Signaling Technologies), anti-pGSK3β (Cell Signaling Technologies), anti-GSK3β (Santacruz) and β-actin-HRP (Santa Cruz Biotechnology) It became. Anti-rabbit IgG-HRP (Cell Signaling Technologies) was used as the secondary antibody.
실시예 9:실시간 중합 효소 연쇄 반응 (PCR)Example 9: Real-Time Polymerase Chain Reaction (PCR)
전체 RNA는 Trizol Reagent (Invitrogen)를 사용하여 추출하고 제조업체의 지침에 따라 iScript gDNA clear cDNA 합성 키트 (Bio-Rad)를 사용하여 cDNA 합성을 수행했다. RT-PCR은 Applied Biosystems 7500 시스템 (Thermo Fisher Scientific)에서 Maxima SYBR Green / ROX RT-PCR Master Mix (Thermo Fisher Scientific)를 사용하여 수행되었다. 프라이머 지정은 표 1에 나열되어 있다.Total RNA was extracted using Trizol Reagent (Invitrogen) and cDNA synthesis was performed using the iScript gDNA clear cDNA synthesis kit (Bio-Rad) according to the manufacturer's instructions. RT-PCR was performed using Maxima SYBR Green/ROX RT-PCR Master Mix (Thermo Fisher Scientific) on an Applied Biosystems 7500 system (Thermo Fisher Scientific). Primer assignments are listed in Table 1.
실시예 10:실시간 대사 분석Example 10: Real-time Metabolic Analysis
산소 소비율(OCR) 및 세포 외 산성화율(ECAR)은 1mM HEPES를 포함하고 페놀레드, 중탄산나트륨, 포도당, L- 글루타민 및 피루브산 나트륨을 포함하지 않는 비 완충 XP RPMI 배지, pH 7.4 (Agilent Technologies)에서 포스트 iGC B 세포(1.5 x 105 세포/웰)에서 제조업체의 지침에 따라 측정되었다. Oxygen consumption rate (OCR) and extracellular acidification rate (ECAR) were measured in unbuffered XP RPMI medium, pH 7.4 (Agilent Technologies) with 1 mM HEPES and without phenol red, sodium bicarbonate, glucose, L-glutamine and sodium pyruvate. Post iGC B cells (1.5 x 10 5 cells/well) were measured according to the manufacturer's instructions.
모든 대사 분석은 XFp 엑스트라셀룰라 플럭스 분석기 (Agilent Technologies)로 수행되었다. 데이터는 Wave (Agilent 소프트웨어)로 분석되었다.All metabolic analyzes were performed with an XFp Extracellular Flux Analyzer (Agilent Technologies). Data were analyzed with Wave (Agilent software).
실시예 11:플라스미드 및 레트로 바이러스 유전자 도입Example 11: Plasmid and retroviral gene introduction
Cre recombinase (MSCV-Cre, Addgene 플라스미드 # 320824)와 윤지희 (한양 대학교)가 제공하는 쥐 Bach2의 cDNA를 Thy-1.1 발현 레트로 바이러스 벡터 (Addgene 플라스미드 # 17442)에 삽입하였다. Cre recombinase (MSCV-Cre, Addgene plasmid # 320824) and mouse Bach2 cDNA provided by Jihee Yoon (Hanyang University) were inserted into a Thy-1.1 expressing retroviral vector (Addgene plasmid # 17442).
shRNA 발현을 위해, 대조군 또는 Irf4 특이적 shRNA를 인코딩하는 어닐링된 shRNA 프라이머를 제한 효소 부위를 포함하는 링커 프라이머로 증폭하고 pLMP-GFP 벡터에 삽입했다. For shRNA expression, annealed shRNA primers encoding control or Irf4-specific shRNAs were amplified with linker primers containing restriction enzyme sites and inserted into the pLMP-GFP vector.
S-Eco 패킹 세포는 JetPrime 형질 감염 키트 (Polyplus)로 형질 감염되었고 레트로 바이러스 상청액은 형질 감염 48 시간 후에 수집되었다. 레트로 바이러스 감염의 경우, 3 일 배양된 iGC B 세포를 폴리브렌 (8 μg / ml, Merck Milipore)이 보충된 레트로 바이러스 상청액으로 1500 xg에서 30 °C에서 90 분 동안 스핀 감염시킨 후 하루 더 iGC B 세포 배양 시스템에서 배양을 실시했다. S-Eco packing cells were transfected with the JetPrime transfection kit (Polyplus) and retroviral supernatants were collected 48 h after transfection. For retroviral infection, iGC B cells cultured for 3 days were spin-infected with retroviral supernatant supplemented with polybrene (8 μg/ml, Merck Milipore) at 1500 xg at 30 °C for 90 min, followed by another day of iGC B infection. Cultivation was carried out in a cell culture system.
레트로 바이러스에 감염된 iGC B 세포를 수확하여 포스트 iGC B 세포 배양 시스템으로 사용했다. GSK3 재구성을 위해, 뮤린 Gsk3를 iGCB 세포의 cDNA에서 증폭시키고 Thy-1.1- 발현 레트로 바이러스 벡터 (Addgene 플라스미드 # 17442)에 클로닝했다. 제조업체의 지침에 따라 QuickChange Lightning Multi Site-Directed Mutagenesis Kit (Agilent Technologies)를 사용하여 GSK3의 돌연변이 형태를 발현하는 레트로 바이러스 벡터를 생성하기 위해 부위 지정 돌연변이 유발을 수행했다. 실험에 사용된 모든 플라스미드는 시퀀싱되고 확인되었다. 프라이머 지정은 표 1에 나열되어 있다.Retrovirus-infected iGC B cells were harvested and used as a post-iGC B cell culture system. For GSK3 reconstruction, murine Gsk3 was amplified from cDNA of iGCB cells and cloned into a Thy-1.1-expressing retroviral vector (Addgene plasmid #17442). Site-directed mutagenesis was performed to generate retroviral vectors expressing mutant forms of GSK3 using the QuickChange Lightning Multi Site-Directed Mutagenesis Kit (Agilent Technologies) according to the manufacturer's instructions. All plasmids used in the experiments were sequenced and verified. Primer assignments are listed in Table 1.
실시예 12: 세포주기 분석Example 12: Cell cycle analysis
세포주기 분포는 PI 통합 후 유세포 분석에 의해 분석되었다. Cell cycle distribution was analyzed by flow cytometry after PI incorporation.
요약하면, 수확된 포스트 iGC B 세포를 PBS로 세척하고 차가운 70 % 에탄올로 고정시켰다. 그 후 세포를 PBS로 2 회 세척하고 PBS에 희석한 RNase (100 ㎍ / ml, Worthington Biochemical)로 넌 CO2 배양기에서 37 °C에서 1 시간 동안 배양했다. 세포를 PBS로 다시 세척하고 PI 용액 (50 μg / ml, Sigma Aldrich)로 배양 한 후 즉시 FACSVerse ™ 유세포 분석기 (BD Biosciences)로 분석했다.Briefly, harvested post-iGC B cells were washed with PBS and fixed with cold 70% ethanol. Cells were then washed twice with PBS and incubated with RNase (100 μg/ml, Worthington Biochemical) diluted in PBS for 1 hour at 37 °C in a non-CO2 incubator. Cells were washed again with PBS, incubated with PI solution (50 μg/ml, Sigma Aldrich) and immediately analyzed by FACSVerse™ flow cytometer (BD Biosciences).
실시예 13:세포 분류Example 13: Cell Sorting
GSK3 발현의 면역 블롯팅을 위해, 면역화된 마우스로부터 드레이닝 림프절의 단일 세포를 준비하고 GC B 세포에 대해 염색하였다. IgG1+ FAS+ CD38low 및 IgG1- FAS+ CD38low GC B 세포를 분류하고 면역 블롯 분석을 수행했다. For immunoblotting of GSK3 expression, single cells from draining lymph nodes from immunized mice were prepared and stained for GC B cells. IgG1+ FAS+ CD38low and IgG1- FAS+ CD38low GC B cells were sorted and subjected to immunoblot analysis.
IRF4- 녹다운 또는 Bach2 과발현의 ELISA 및 ELISPOT를 수행하기 위해, 바이러스에 감염된 GFP+ CD19+ (IRF4- 녹다운 또는 대조군) 또는 Thy1.1+ CD19+ (Bach2-과발현 또는 대조군) 세포를 분류하였다. RNA-시퀀싱 분석을 위해, 36 시간 동안 CHIR99021 또는 DMSO로 처리된 CD19+ post-iGC B 세포를 분류하고 전체 RNA 분리를 실시하였다. 모든 분류 과정은 FACSAria II 유세포 분석기 (BD Biosciences)를 사용하여 수행되었다.To perform ELISA and ELISPOT of IRF4- knockdown or Bach2 overexpression, virus-infected GFP+ CD19+ (IRF4- knockdown or control) or Thy1.1+ CD19+ (Bach2-overexpression or control) cells were sorted. For RNA-sequencing analysis, CD19+ post-iGC B cells treated with CHIR99021 or DMSO for 36 hours were sorted and subjected to total RNA isolation. All sorting procedures were performed using a FACSAria II flow cytometer (BD Biosciences).
실시예 14:RNA 시퀀싱Example 14: RNA sequencing
제조사 지침에 따라 RNAeasy 키트 (QIAGEN)를 사용하여 분류된 post-iGC B 세포로부터 총 RNA를 분리했다. Illumina TruSeq Stranded mRNA Sample Prep Kit (Illumina, Inc., San Diego, CA, USA, # RS-122-2101)를 라이브러리 구성에 사용했다. 그런 다음 색인화된 라이브러리를 Illumina NovaSeq 플랫폼(Illumina, Inc., San Diego, CA, USA)에 제출하고 페어드 엔드(2 x 100bp) 시퀀싱을 Macrogen Incorporated에서 수행했다. Total RNA was isolated from sorted post-iGC B cells using the RNAeasy kit (QIAGEN) according to the manufacturer's instructions. The Illumina TruSeq Stranded mRNA Sample Prep Kit (Illumina, Inc., San Diego, CA, USA, #RS-122-2101) was used for library construction. The indexed libraries were then submitted to the Illumina NovaSeq platform (Illumina, Inc., San Diego, CA, USA) and paired-end (2 x 100bp) sequencing was performed by Macrogen Incorporated.
RNA-sequencing 데이터 분석을 위해 TopHat2 (54)로 정렬과 주석을 처리했다. Mus musculus 게놈 (UCSC의 버전 mm10)의 Fasta 및 gtf 파일을 정렬 및 주석에 대한 참조로 사용했다. Alignment and annotation were performed with TopHat2 (54) for RNA-sequencing data analysis. Fasta and gtf files of the Mus musculus genome (version mm10 from UCSC) were used as references for alignment and annotation.
동일한 Fasta 및 gtf 파일을 사용하여 Cufflinks, Cuffnorm 및 Cuffdiff는 각각 백만분율 (FPKM) 값의 킬로베이스 당 조각을 계산하고, 라이브러리 크기를 정규화하고, DEG를 식별하기 위해 각각 수행되었다. Using the same Fasta and gtf files, Cufflinks, Cuffnorm and Cuffdiff were performed to calculate fragments per kilobase of parts per million (FPKM) values, normalize library size, and identify DEGs, respectively.
모든 샘플에서 FPKM이 0인 유전자를 제외한 후 log (FPKM + 1) 값을 다운 스트림 분석에 사용했다. DMSO/CHIR 및 DZ/LZ 내에서 Quantile 정규화를 수행한 후 Q 값 <0.05 및 |fc|≥ 2에 따라 유의한 DEG를 추정했다. After excluding genes with an FPKM of 0 in all samples, the log (FPKM + 1) values were used for downstream analysis. After performing quantile normalization within DMSO/CHIR and DZ/LZ, significant DEGs were estimated according to Q values <0.05 and |fc|≥ 2.
모든 플롯은 R (v.3.5.3) (오스트리아 비엔나, 통계 컴퓨팅을위한 R 재단)으로 구성되었다. 유전자 온톨로지(GO) 분석은 DAVID (v6.8)를 사용하여 수행되었다. 낮은 P 값을 가진 GO 용어는 그림 S2C, D를 구성하기 위해 생물학적 공정 범주에서만 선택되었다. All plots were constructed in R (v.3.5.3) (R Foundation for Statistical Computing, Vienna, Austria). Gene Ontology (GO) analysis was performed using DAVID (v6.8). GO terms with low P values were selected only from the biological process category to construct Fig. S2C,D.
DMSO/CHIR 및 LZ/DZ 비교 사이에 공통적으로 중요한 DEG를 식별하기 위해 각 실험의 DEG 목록이 겹쳤으며 총 12 개 샘플에서 얻은 48 개의 공통 DEG를 히트 맵 및 PCA (주성분 분석) 플롯 구성에 사용했다.DEG lists from each experiment were overlaid to identify common significant DEGs between the DMSO/CHIR and LZ/DZ comparisons, and 48 common DEGs from a total of 12 samples were used for heat map and principal component analysis (PCA) plot construction. .
본 발명에서 DZ 및 LZ 분석을 위해 Foxo1 (+/+) DZ 및 Foxo1 (+/+)의 FastQ 파일은 SRA (Sequence Read Archive)에서 다운로드되었다. For DZ and LZ analysis in this study, Foxo1 (+/+) DZ and Foxo1 (+/+) FastQ files were downloaded from the Sequence Read Archive (SRA).
SRP096690. 단일 엔드 읽기는 위에서 설명한 것과 동일한 파이프 라인으로 처리되었다. c-Myc 반응성 유전자의 목록은 Dominguez-Sola et al.의 보충 표 2에서 얻었다. GFPMYC + 및 GFPMYC-의 공개 CEL 파일은 GEO (Gene Expression Omnibus);에섹션 번호 GSE38304에서 다운로드했다. SRP096690. Single-ended reads were processed with the same pipeline as described above. A list of c-Myc responsive genes was obtained from Supplementary Table 2 from Dominguez-Sola et al. Publication CEL files of GFPMYC+ and GFPMYC− were downloaded from Gene Expression Omnibus (GEO); section number GSE38304.
본 발명에서 P 값은 양측 스튜던트 t- 검정을 사용하여 결정되었다. 통계적 유의성은 P <0.05에서 판단되었다. 모든 데이터 포인트와 'n'값은 생물학적 반복을 나타낸다. GraphPad Prism 7 소프트웨어는 통계 분석에 사용되었다.In the present study, P values were determined using a two-tailed Student's t-test. Statistical significance was judged at P<0.05. All data points and 'n' values represent biological repeats.
표 1은 본 발명에 사용한 재료들의 정보Table 1 is information on the materials used in the present invention
<110> KNU-Industry Cooperation Foundation <120> A method for regulating differentiation of germinal center B cells to plasma cells regulating glycogen synthase kinase 3 and composition therefor <130> P20-0118HS <160> 2 <170> KoPatentIn 3.0 <210> 1 <211> 490 <212> PRT <213> Mus musculus <400> 1 Met Ser Gly Gly Gly Pro Ser Gly Gly Gly Pro Gly Gly Ser Gly Arg 1 5 10 15 Ala Arg Thr Ser Ser Phe Ala Glu Pro Gly Gly Gly Gly Gly Gly Gly 20 25 30 Gly Gly Gly Pro Gly Gly Ser Ala Ser Gly Pro Gly Gly Thr Gly Gly 35 40 45 Gly Lys Ala Ser Val Gly Ala Met Gly Gly Gly Val Gly Ala Ser Ser 50 55 60 Ser Gly Gly Gly Pro Ser Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Pro 65 70 75 80 Gly Ala Gly Thr Ser Phe Pro Pro Pro Gly Val Lys Leu Gly Arg Asp 85 90 95 Ser Gly Lys Val Thr Thr Val Val Ala Thr Val Gly Gln Gly Pro Glu 100 105 110 Arg Ser Gln Glu Val Ala Tyr Thr Asp Ile Lys Val Ile Gly Asn Gly 115 120 125 Ser Phe Gly Val Val Tyr Gln Ala Arg Leu Ala Glu Thr Arg Glu Leu 130 135 140 Val Ala Ile Lys Lys Val Leu Gln Asp Lys Arg Phe Lys Asn Arg Glu 145 150 155 160 Leu Gln Ile Met Arg Lys Leu Asp His Cys Asn Ile Val Arg Leu Arg 165 170 175 Tyr Phe Phe Tyr Ser Ser Gly Glu Lys Lys Asp Glu Leu Tyr Leu Asn 180 185 190 Leu Val Leu Glu Tyr Val Pro Glu Thr Val Tyr Arg Val Ala Arg His 195 200 205 Phe Thr Lys Ala Lys Leu Ile Thr Pro Ile Ile Tyr Ile Lys Val Tyr 210 215 220 Met Tyr Gln Leu Phe Arg Ser Leu Ala Tyr Ile His Ser Gln Gly Val 225 230 235 240 Cys His Arg Asp Ile Lys Pro Gln Asn Leu Leu Val Asp Pro Asp Thr 245 250 255 Ala Val Leu Lys Leu Cys Asp Phe Gly Ser Ala Lys Gln Leu Val Arg 260 265 270 Gly Glu Pro Asn Val Ser Tyr Ile Cys Ser Arg Tyr Tyr Arg Ala Pro 275 280 285 Glu Leu Ile Phe Gly Ala Thr Asp Tyr Thr Ser Ser Ile Asp Val Trp 290 295 300 Ser Ala Gly Cys Val Leu Ala Glu Leu Leu Leu Gly Gln Pro Ile Phe 305 310 315 320 Pro Gly Asp Ser Gly Val Asp Gln Leu Val Glu Ile Ile Lys Val Leu 325 330 335 Gly Thr Pro Thr Arg Glu Gln Ile Arg Glu Met Asn Pro Asn Tyr Thr 340 345 350 Glu Phe Lys Phe Pro Gln Ile Lys Ala His Pro Trp Thr Lys Val Phe 355 360 365 Lys Ser Ser Lys Thr Pro Pro Glu Ala Ile Ala Leu Cys Ser Ser Leu 370 375 380 Leu Glu Tyr Thr Pro Ser Ser Arg Leu Ser Pro Leu Glu Ala Cys Ala 385 390 395 400 His Ser Phe Phe Asp Glu Leu Arg Arg Leu Gly Ala Gln Leu Pro Asn 405 410 415 Asp Arg Pro Leu Pro Pro Leu Phe Asn Phe Ser Pro Gly Glu Leu Ser 420 425 430 Ile Gln Pro Ser Leu Asn Ala Ile Leu Ile Pro Pro His Leu Arg Ser 435 440 445 Pro Ala Gly Pro Ala Ser Pro Leu Thr Thr Ser Tyr Asn Pro Ser Ser 450 455 460 Gln Ala Leu Thr Glu Ala Gln Thr Gly Gln Asp Trp Gln Pro Ser Asp 465 470 475 480 Ala Thr Thr Ala Thr Leu Ala Ser Ser Ser 485 490 <210> 2 <211> 420 <212> PRT <213> Mus musculus <400> 2 Met Ser Gly Arg Pro Arg Thr Thr Ser Phe Ala Glu Ser Cys Lys Pro 1 5 10 15 Val Gln Gln Pro Ser Ala Phe Gly Ser Met Lys Val Ser Arg Asp Lys 20 25 30 Asp Gly Ser Lys Val Thr Thr Val Val Ala Thr Pro Gly Gln Gly Pro 35 40 45 Asp Arg Pro Gln Glu Val Ser Tyr Thr Asp Thr Lys Val Ile Gly Asn 50 55 60 Gly Ser Phe Gly Val Val Tyr Gln Ala Lys Leu Cys Asp Ser Gly Glu 65 70 75 80 Leu Val Ala Ile Lys Lys Val Leu Gln Asp Lys Arg Phe Lys Asn Arg 85 90 95 Glu Leu Gln Ile Met Arg Lys Leu Asp His Cys Asn Ile Val Arg Leu 100 105 110 Arg Tyr Phe Phe Tyr Ser Ser Gly Glu Lys Lys Asp Glu Val Tyr Leu 115 120 125 Asn Leu Val Leu Asp Tyr Val Pro Glu Thr Val Tyr Arg Val Ala Arg 130 135 140 His Tyr Ser Arg Ala Lys Gln Thr Leu Pro Val Ile Tyr Val Lys Leu 145 150 155 160 Tyr Met Tyr Gln Leu Phe Arg Ser Leu Ala Tyr Ile His Ser Phe Gly 165 170 175 Ile Cys His Arg Asp Ile Lys Pro Gln Asn Leu Leu Leu Asp Pro Asp 180 185 190 Thr Ala Val Leu Lys Leu Cys Asp Phe Gly Ser Ala Lys Gln Leu Val 195 200 205 Arg Gly Glu Pro Asn Val Ser Tyr Ile Cys Ser Arg Tyr Tyr Arg Ala 210 215 220 Pro Glu Leu Ile Phe Gly Ala Thr Asp Tyr Thr Ser Ser Ile Asp Val 225 230 235 240 Trp Ser Ala Gly Cys Val Leu Ala Glu Leu Leu Leu Gly Gln Pro Ile 245 250 255 Phe Pro Gly Asp Ser Gly Val Asp Gln Leu Val Glu Ile Ile Lys Val 260 265 270 Leu Gly Thr Pro Thr Arg Glu Gln Ile Arg Glu Met Asn Pro Asn Tyr 275 280 285 Thr Glu Phe Lys Phe Pro Gln Ile Lys Ala His Pro Trp Thr Lys Val 290 295 300 Phe Arg Pro Arg Thr Pro Pro Glu Ala Ile Ala Leu Cys Ser Arg Leu 305 310 315 320 Leu Glu Tyr Thr Pro Thr Ala Arg Leu Thr Pro Leu Glu Ala Cys Ala 325 330 335 His Ser Phe Phe Asp Glu Leu Arg Asp Pro Asn Val Lys Leu Pro Asn 340 345 350 Gly Arg Asp Thr Pro Ala Leu Phe Asn Phe Thr Thr Gln Glu Leu Ser 355 360 365 Ser Asn Pro Pro Leu Ala Thr Ile Leu Ile Pro Pro His Ala Arg Ile 370 375 380 Gln Ala Ala Ala Ser Pro Pro Ala Asn Ala Thr Ala Ala Ser Asp Thr 385 390 395 400 Asn Ala Gly Asp Arg Gly Gln Thr Asn Asn Ala Ala Ser Ala Ser Ala 405 410 415 Ser Asn Ser Thr 420 <110> KNU-Industry Cooperation Foundation <120> A method for regulating differentiation of germinal center B cells to plasma cells regulating glycogen synthase kinase 3 and composition therefor <130> P20-0118HS <160> 2 <170> KoPatentIn 3.0 <210> 1 <211> 490 <212> PRT 213 <213> <400> 1 Met Ser Gly Gly Gly Pro Ser Gly Gly Gly Pro Gly Gly Ser Gly Arg 1 5 10 15 Ala Arg Thr Ser Ser Phe Ala Glu Pro Gly Gly Gly Gly Gly Gly Gly 20 25 30 Gly Gly Gly Pro Gly Gly Ser Ala Ser Gly Pro Gly Gly Thr Gly Gly 35 40 45 Gly Lys Ala Ser Val Gly Ala Met Gly Gly Gly Val Gly Ala Ser Ser 50 55 60 Ser Gly Gly Gly Pro Ser Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Pro 65 70 75 80 Gly Ala Gly Thr Ser Phe Pro Pro Pro Gly Val Lys Leu Gly Arg Asp 85 90 95 Ser Gly Lys Val Thr Thr Val Val Ala Thr Val Gly Gln Gly Pro Glu 100 105 110 Arg Ser Gln Glu Val Ala Tyr Thr Asp Ile Lys Val Ile Gly Asn Gly 115 120 125 Ser Phe Gly Val Val Tyr Gln Ala Arg Leu Ala Glu Thr Arg Glu Leu 130 135 140 Val Ala Ile Lys Lys Val Leu Gln Asp Lys Arg Phe Lys Asn Arg Glu 145 150 155 160 Leu Gln Ile Met Arg Lys Leu Asp His Cys Asn Ile Val Arg Leu Arg 165 170 175 Tyr Phe Phe Tyr Ser Ser Gly Glu Lys Lys Asp Glu Leu Tyr Leu Asn 180 185 190 Leu Val Leu Glu Tyr Val Pro Glu Thr Val Tyr Arg Val Ala Arg His 195 200 205 Phe Thr Lys Ala Lys Leu Ile Thr Pro Ile Ile Tyr Ile Lys Val Tyr 210 215 220 Met Tyr Gln Leu Phe Arg Ser Leu Ala Tyr Ile His Ser Gln Gly Val 225 230 235 240 Cys His Arg Asp Ile Lys Pro Gln Asn Leu Leu Val Asp Pro Asp Thr 245 250 255 Ala Val Leu Lys Leu Cys Asp Phe Gly Ser Ala Lys Gln Leu Val Arg 260 265 270 Gly Glu Pro Asn Val Ser Tyr Ile Cys Ser Arg Tyr Tyr Arg Ala Pro 275 280 285 Glu Leu Ile Phe Gly Ala Thr Asp Tyr Thr Ser Ser Ile Asp Val Trp 290 295 300 Ser Ala Gly Cys Val Leu Ala Glu Leu Leu Leu Gly Gln Pro Ile Phe 305 310 315 320 Pro Gly Asp Ser Gly Val Asp Gln Leu Val Glu Ile Ile Lys Val Leu 325 330 335 Gly Thr Pro Thr Arg Glu Gln Ile Arg Glu Met Asn Pro Asn Tyr Thr 340 345 350 Glu Phe Lys Phe Pro Gln Ile Lys Ala His Pro Trp Thr Lys Val Phe 355 360 365 Lys Ser Ser Lys Thr Pro Pro Glu Ala Ile Ala Leu Cys Ser Ser Leu 370 375 380 Leu Glu Tyr Thr Pro Ser Ser Arg Leu Ser Pro Leu Glu Ala Cys Ala 385 390 395 400 His Ser Phe Phe Asp Glu Leu Arg Arg Leu Gly Ala Gln Leu Pro Asn 405 410 415 Asp Arg Pro Leu Pro Pro Leu Phe Asn Phe Ser Pro Gly Glu Leu Ser 420 425 430 Ile Gln Pro Ser Leu Asn Ala Ile Leu Ile Pro Pro His Leu Arg Ser 435 440 445 Pro Ala Gly Pro Ala Ser Pro Leu Thr Thr Ser Tyr Asn Pro Ser Ser 450 455 460 Gln Ala Leu Thr Glu Ala Gln Thr Gly Gln Asp Trp Gln Pro Ser Asp 465 470 475 480 Ala Thr Thr Ala Thr Leu Ala Ser Ser Ser 485 490 <210> 2 <211> 420 <212> PRT 213 <213> <400> 2 Met Ser Gly Arg Pro Arg Thr Thr Ser Phe Ala Glu Ser Cys Lys Pro 1 5 10 15 Val Gln Gln Pro Ser Ala Phe Gly Ser Met Lys Val Ser Arg Asp Lys 20 25 30 Asp Gly Ser Lys Val Thr Thr Val Val Ala Thr Pro Gly Gln Gly Pro 35 40 45 Asp Arg Pro Gln Glu Val Ser Tyr Thr Asp Thr Lys Val Ile Gly Asn 50 55 60 Gly Ser Phe Gly Val Val Tyr Gln Ala Lys Leu Cys Asp Ser Gly Glu 65 70 75 80 Leu Val Ala Ile Lys Lys Val Leu Gln Asp Lys Arg Phe Lys Asn Arg 85 90 95 Glu Leu Gln Ile Met Arg Lys Leu Asp His Cys Asn Ile Val Arg Leu 100 105 110 Arg Tyr Phe Phe Tyr Ser Ser Gly Glu Lys Lys Asp Glu Val Tyr Leu 115 120 125 Asn Leu Val Leu Asp Tyr Val Pro Glu Thr Val Tyr Arg Val Ala Arg 130 135 140 His Tyr Ser Arg Ala Lys Gln Thr Leu Pro Val Ile Tyr Val Lys Leu 145 150 155 160 Tyr Met Tyr Gln Leu Phe Arg Ser Leu Ala Tyr Ile His Ser Phe Gly 165 170 175 Ile Cys His Arg Asp Ile Lys Pro Gln Asn Leu Leu Leu Asp Pro Asp 180 185 190 Thr Ala Val Leu Lys Leu Cys Asp Phe Gly Ser Ala Lys Gln Leu Val 195 200 205 Arg Gly Glu Pro Asn Val Ser Tyr Ile Cys Ser Arg Tyr Tyr Arg Ala 210 215 220 Pro Glu Leu Ile Phe Gly Ala Thr Asp Tyr Thr Ser Ser Ile Asp Val 225 230 235 240 Trp Ser Ala Gly Cys Val Leu Ala Glu Leu Leu Leu Gly Gln Pro Ile 245 250 255 Phe Pro Gly Asp Ser Gly Val Asp Gln Leu Val Glu Ile Ile Lys Val 260 265 270 Leu Gly Thr Pro Thr Arg Glu Gln Ile Arg Glu Met Asn Pro Asn Tyr 275 280 285 Thr Glu Phe Lys Phe Pro Gln Ile Lys Ala His Pro Trp Thr Lys Val 290 295 300 Phe Arg Pro Arg Thr Pro Pro Glu Ala Ile Ala Leu Cys Ser Arg Leu 305 310 315 320 Leu Glu Tyr Thr Pro Thr Ala Arg Leu Thr Pro Leu Glu Ala Cys Ala 325 330 335 His Ser Phe Phe Asp Glu Leu Arg Asp Pro Asn Val Lys Leu Pro Asn 340 345 350 Gly Arg Asp Thr Pro Ala Leu Phe Asn Phe Thr Thr Gln Glu Leu Ser 355 360 365 Ser Asn Pro Pro Leu Ala Thr Ile Leu Ile Pro Pro His Ala Arg Ile 370 375 380 Gln Ala Ala Ala Ser Pro Pro Ala Asn Ala Thr Ala Ala Ser Asp Thr 385 390 395 400 Asn Ala Gly Asp Arg Gly Gln Thr Asn Asn Ala Ala Ser Ala Ser Ala 405 410 415 Ser Asn Ser Thr 420
Claims (11)
[화학식 1]
In vitro, by treating germinal center (GC) B cells with the compound of Formula 1 for 2 days, the expression of Bach2, Bcl6 and Pax5 in the cells was reduced and the expression of Xbp1 and Prdm1 was induced in the cells compared to the case where the compound was not treated. How to.
[Formula 1]
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Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
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CN117106714B (en) * | 2023-10-11 | 2024-01-26 | 苏州艾凯利元生物科技有限公司 | Method for preparing B cells |
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2020
- 2020-09-02 KR KR1020200111655A patent/KR102486284B1/en active IP Right Grant
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Title |
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Adv Biol Regul. 2017, 65:5-15.* |
J Exp Med. 2017, 214(5):1259-1267. |
Life Sci Alliance. 2019, 2(6):e201900506.* |
Also Published As
Publication number | Publication date |
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KR20220029995A (en) | 2022-03-10 |
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