KR102457733B1 - 유전자 정보에 기반한 품종정보 제공 시스템 및 방법 - Google Patents
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Abstract
본 발명의 실시예에 따르면, 특정 품종의 유전자 정보가 얼마 만큼씩 유사한지를 측정하는 것이 아닌, 해당 품종에만 있는 유전자 마커를 단정적으로 확인하고, 그 품종에 속하는지 아닌지를 명확히 식별함에 따라, 단순 비율을 제공하는 것이 아닌, 실제 각 혼혈동물의 조상중에 어떤 품종들이 있는지를 정확하게 알려주는 효과가 있다.
Description
도 2는 본 발명의 실시예에 따른 유전자 정보에 기반한 품종정보 제공 시스템의 유전자 센터 서버의 구성을 나타낸 도면이다.
도 3은 본 발명의 실시예에 따른 유전자 정보에 기반한 품종정보 제공 방법 중, 데이터 베이스 구축과정을 나타낸 도면이다.
도 4는 본 발명의 실시예에 따른 유전자 정보에 기반한 품종정보 제공 방법 중, 품종정보 제공과정을 나타낸 도면이다.
100 : 유전자 센터 서버 110 : 해독부
120 : 특이마커 도출부 130 : 개체 분류부
140 : 데이터 베이스 150 : 마커 대조부
160 : 품종 특정부
Claims (1)
- 피검 동물로부터 채취된 시료를 해독하는 게놈 해독장치;
상기 게놈 해독장치로부터 시료 해독 결과를 입력받고, 미리 구축된 분자 라이브러리와의 대조를 통해 상기 시료에 대한 유전자 검사를 수행하는 검사 단말기; 및
정보통신망을 통해 원격지에 위치한 하나 이상의 검사 단말기와 연결되어 상기 유전자 검사결과를 전송받고, 상기 검사결과로부터 판단된 피검 동물의 품종과 관련된 하나 이상의 유전자 마커 중, 타 품종과의 특이성을 대표하는 비 공통 유전자를 하나 이상 추출하여 어느 품종인지 판단하고, 품종 의뢰에 따른 품종 정보를 제공하는 유전자 센터 서버를 포함하고,
상기 유전자 센터 서버는,
관리자에 의한 입력 또는 외부 시스템으로부터 전송되는 복수의 동물에 대한 유전자 정보를 수시로 수집하고, 수집된 동물의 유전자 정보의 분석을 수행하는 해독부;
품종별 표준게놈지도를 해독, 조립 또는 전장게놈서열을 해독하거나, DNA chip에 기록된 데이터를 로딩하여 상기 유전자 정보에 포함되는 특이적 유전자 마커를 도출하는 특이마커 도출부;
도출된 특이적 유전자 마커에 따라, 해당 동물을 품종을 분류하는 개체 분류부;
동물 그룹의 특이적인 변이들의 비중복(non-redundant)세트가 정의되며, 해당 세트에 대한 피검 동물의 유전자 정보를 공지의 염기서열 분석 기술인 시퀀싱(sequencing) 및, 개체가 가지는 유전형의 다양성 분석 기술인 제노타이핑(genotyping) 방식으로 생성된 정보가 저장되고, 하나 이상의 동물에 대한 유전자 마커에 따라 분류되는 품종별 유전자 마커를 포함하는 유전자 정보가 저장되는 데이터 베이스;
상기 검사 단말기로부터 피검 동물의 시료를 포함하는 유전자 검사결과를 입력받아, 상기 피검 동물의 시료로부터 도출되는 유전자 마커와, 상기 데이터 베이스를 참조하여 저장된 유전자 정보의 유전자 마커를 대조하는 마커 대조부; 및
유전자 마커의 대조 결과에 따라, 상기 피검 동물의 유전자 정보에 포함된 하나 이상의 특이적 유전자 마커를 도출하여 상기 피검 동물에 대한 단일품종 또는 혼혈품종 여부를 포함하는 품종정보를 상기 검사 단말기에 회신하되, 상기 피검 동물이 혼혈품종일 경우, 존재하는 모든 특이적 유전자 마커에 해당하는 각 품종을 특정하여 상기 품종정보에 반영하고,
상기 피검 동물이 어느 품종 특이적인 유전자 마커를 보유하고 있는지 확인하여 가장 많은 품종 특이적 유전자 마커를 가진 품종을 상기 피검 동물의 품종으로 1개 이상 지정하고,
상기 피검 동물에 둘 이상의 특이적 유전자 마커의 조합이 존재하되, 상기 데이터 베이스에 존재하지 않는 경우, 상기 피검 동물에 대한 유전자 정보를 상기 데이터 베이스에 반영하는 품종 특정부를 포함하고,
상기 품종정보를 판별하는 데 이용되는 유전적 마커는,
단일염기 다형성(single nucleotide polymorphism), 삽입-결실(indel), 반복변이(copy number variants) 및 구조변이(structural variant) 중, 적어도 하나 또는 둘 이상을 조합하여 도출한 것인,
유전자 정보에 기반한 품종정보 제공 시스템.
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