KR102417668B1 - Salivary gland tissue biomarker for diagnosing xerostomia and use thereof - Google Patents

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Abstract

구강건조증 진단용 조성물, 키트, 및 이를 이용한 구강건조증의 진단 방법을 제공한다. 이에 따르면, 구강건조증을 간편하고 객관적이고, 높은 정확도 및 특이도로 진단하는데 이용할 수 있다.A composition and kit for diagnosing dry mouth disease, and a method for diagnosing dry mouth disease using the same are provided. According to this, it can be used to diagnose dry mouth disease simply and objectively, with high accuracy and specificity.

Description

구강건조증을 진단하기 위한 타액선 조직 바이오마커 및 이의 용도{Salivary gland tissue biomarker for diagnosing xerostomia and use thereof}Salivary gland tissue biomarker for diagnosing xerostomia and use thereof for diagnosing dry mouth

구강건조증을 진단하기 위한 타액선 조직 바이오마커, 이를 이용한 구강건조증 진단용 조성물, 키트 및 이를 이용한 바이오마커의 검출 방법에 관한 것이다.To a salivary gland tissue biomarker for diagnosing dry mouth, a composition and kit for diagnosing dry mouth using the same, and a method for detecting a biomarker using the same.

타액선 기능은 여러가지 상태에 따라 영향을 받게 된다. 구강건조증은 입 안에 침이 없어, 주관적으로 구강 건조함을 느끼는 것이다. 구강건조증으로 인하여 타액선의 기능이 감소하고 윤활 작용 또는 항균 작용의 기능이 떨어지면, 구강에 나타나는 이차 질환으로 치아 우식과 치주 질환이 나타날 수 있다. 구강건조증은 타액 분비 기능 저하 초기 단계에서는 인지하기가 어렵고, 일시적인 구강건조증과 기질적인 구강건조증과 구분이 어려워서, 기질적인 타액선기능저하로 인한 구강건조증은 빠른 진단이 어렵다. 노화에 의한 노인성 구강건조증도 기질적인 타액선 기능저하에 기인한다. 타액선 기능저하에 의한 구강건조증은 병이 진행된 이후에 완치가 어렵고, 치료법 또한 질병을 완전히 치료하는 것이 아니라 증상을 완화해주는데 중점을 두고 있다.Salivary gland function is affected by several conditions. Dry mouth is a subjective feeling of dry mouth because there is no saliva in the mouth. When the function of the salivary glands decreases due to dry mouth and the function of lubricating or antibacterial action decreases, dental caries and periodontal disease may appear as secondary diseases in the oral cavity. Dry mouth disease is difficult to recognize in the early stage of decreased salivary function, and it is difficult to distinguish between temporary dry mouth and organic dry mouth. Geriatric dry mouth due to aging is also caused by organic salivary gland dysfunction. Dry mouth caused by salivary gland dysfunction is difficult to cure after the disease has progressed, and treatment focuses on alleviating symptoms rather than completely curing the disease.

구강건조증은 쇼그렌 증후군, 빈혈, 당뇨, 노화, 약물복용, 신경계 질환 등 다양한 원인으로 발생할 수 있다. 최근, 구강건조증을 갖는 개체의 타액 시료에서 바이오마커를 검출하여 쇼그렌 증후군을 진단 및 치료하는 방법이 개발된 바 있다(미국 특허공고 US9,833,519B2). 그러나, 구강건조증을 진단하기 위한 바이오마커는 개발된 바가 없다.Dry mouth can be caused by various causes, such as Sjogren's syndrome, anemia, diabetes, aging, drug use, and nervous system diseases. Recently, a method for diagnosing and treating Sjogren's syndrome by detecting a biomarker in a saliva sample of an individual having dry mouth has been developed (US Patent Publication No. 9,833,519B2). However, a biomarker for diagnosing dry mouth has not been developed.

따라서, 구강건조증을 신속하고 객관적이고 간편하고 비용이 저렴하게 진단할 수 있고, 진단의 정확도 및 특이도가 높은 바이오마커를 개발할 필요가 있다. Therefore, there is a need to develop a biomarker capable of diagnosing dry mouth disease quickly, objectively, simply and inexpensively, and with high diagnostic accuracy and specificity.

구강건조증 진단용 조성물을 제공한다.Provided is a composition for diagnosing dry mouth.

구강건조증 진단용 키트를 제공한다.Provides a kit for diagnosing dry mouth.

구강건조증의 진단 방법을 제공한다.A method for diagnosing dry mouth is provided.

일 양상은 ANP32E(Acidic leucine-rich nuclear phosphoprotein 32 family member E), SLC25A1(Tricarboxylate transport protein, mitochondrial), CCAR1(Cell division cycle and apoptosis regulator protein 1), PGRMC1(Membrane-associated progesterone receptor component 1), MTARC2(Mitochondrial amidoxime reducing component 2), SORL1(Sortilin-related receptor), ITGA5(Integrin alpha-5), SOD2(Superoxide dismutase [Mn], mitochondrial), ERH(Enhancer of rudimentary homolog), MYH4(Myosin-4), RPS4X(40S ribosomal protein S4, X isoform), RPRD1B(Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B), MYO6(Unconventional myosin-VI), 및 TNNI1(Troponin I, slow skeletal muscle)로 이루어진 군으로부터 선택된 유전자의 발현 수준, 또는 단백질 또는 이의 단편의 발현 수준을 측정하는 제제를 포함하는 구강건조증 진단용 조성물을 제공한다.One aspect is ANP32E (Acid leucine-rich nuclear phosphoprotein 32 family member E), SLC25A1 (Tricarboxylate transport protein, mitochondrial), CCAR1 (Cell division cycle and apoptosis regulator protein 1), PGRMC1 (Membrane-associated progesterone receptor component 1), MTARC2 (Mitochondrial amidoxime reducing component 2), SORL1 (Sortilin-related receptor), ITGA5 (Integrin alpha-5), SOD2 (Superoxide dismutase [Mn], mitochondrial), ERH (Enhancer of rudimentary homolog), MYH4 (Myosin-4), A gene selected from the group consisting of 40S ribosomal protein S4, X isoform (RPS4X), Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B (RPRD1B), Unconventional myosin-VI (MYO6), and Troponin I, slow skeletal muscle (TNNI1). It provides a composition for diagnosing dry mouth, comprising an agent for measuring the expression level of, or the expression level of a protein or fragment thereof.

용어 "구강건조증(xerostomia 또는 dry mouth)"은 침 분비가 줄어들거나 그외 다른 다양한 원인에 의해 입 안이 마르는 증상을 말한다. 구강건조증은 타액선 기능 저하(salivary gland hypofunction)로도 불릴 수 있다. 구강건조증은 쇼그렌 증후군, 빈혈, 당뇨, 영양소 결핍, 노화, 약물 복용(예, 항히스타민제, 정신신경계 작용 약물, 고혈압 치료제), 신경계 질환, 정신적 질환(예, 우울증), 및 방사선요법 등의 원인에 의해 야기될 수 있다. 구강건조증이 유발되면, 건조감 자체로 인하여 음식물을 삼키기가 곤란하고, 말을 하기 어려운 불편감을 느낄 수 있고, 충치(치아우식증) 및 풍치(치주염)의 발생이 증가하고 악화되기 쉽고, 구강 내 곰팡이 감염, 혀 통증, 구취, 미각 이상 등이 유발될 수 있다. 구강건조증은 구강궤양과 같은 구강질환의 발생에도 영향을 미칠 수 있다. 구강건조증은 타액분비량 측정(휴식시 타액 분비량이 0.1 mL/분 이하), 타액 조영술, 조직 검사, 또는 핵의학 검사 방법으로 진단될 수 있다. 또한 타액선 조직검사를 통해서도 진단할 수 있는데, 타액선 조직에서 타액선 실질의 퇴축의 정도로 진단할 수 있다. 쇼그렌 증후군 증후군에서 타액선기능저하에 대한 평가로 타액선 조직내의 면역세포의 침투 양상을 측정하여, 면역세포의 침투가 많은 정도에 따라 스코어 0 내지 6으로 분류할 수 있다.The term "xerostomia or dry mouth" refers to a symptom of dry mouth due to decreased salivation or various other causes. Dry mouth can also be referred to as salivary gland hypofunction. Dry mouth is caused by Sjogren's syndrome, anemia, diabetes, nutritional deficiencies, aging, drug use (e.g., antihistamines, drugs that act on the nervous system, high blood pressure), nervous system disorders, mental disorders (e.g. depression), and radiation therapy. can be caused by When dry mouth is induced, it is difficult to swallow food due to the dryness itself, and you may feel discomfort that it is difficult to speak, the occurrence of tooth decay (dental caries) and tooth decay (periodontitis) increases and is easy to worsen, fungal infection in the mouth, It can cause tongue pain, bad breath, and taste abnormalities. Dry mouth can also affect the development of oral diseases such as oral ulcers. Dry mouth can be diagnosed by measurement of salivation (salivation volume at rest less than 0.1 mL/min), salivography, biopsy, or nuclear medicine examination. It can also be diagnosed through salivary gland biopsy, and it can be diagnosed with the degree of regression of the salivary gland parenchyma in the salivary gland tissue. In Sjögren's syndrome, the infiltration pattern of immune cells in the salivary gland tissue is measured as an evaluation of salivary gland dysfunction, and it can be classified into a score of 0 to 6 depending on the degree of infiltration of the immune cells.

상기 조성물은 타액선 조직 시료에서 검출하기 위한 것일 수 있다. 상기 발현 수준은 정상 대조군의 발현 수준에 비해 증가하는 것일 수 있다.The composition may be for detection in a salivary gland tissue sample. The expression level may be increased compared to the expression level of the normal control.

ANP32E(Acidic leucine-rich nuclear phosphoprotein 32 family member E)는 뉴클레오솜으로부터 히스톤 H2A.Z/H2AZ1의 제거를 특이적으로 매개하는 히스톤 샤페론이다. ANP32E는 LANP-L 또는 LANPL로도 불릴 수 있다. ANP32E는 인간에서 Uniprot 번호 Q9BTT0의 아미노산 서열을 포함할 수 있다. ANP32E는 마우스에서 Uniprot 번호 P97822의 아미노산 서열을 포함할 수 있다.Acidic leucine-rich nuclear phosphoprotein 32 family member E (ANP32E) is a histone chaperone that specifically mediates clearance of histones H2A.Z/H2AZ1 from nucleosomes. ANP32E can also be called LANP-L or LANPL. ANP32E may comprise the amino acid sequence of Uniprot number Q9BTT0 in humans. ANP32E may comprise the amino acid sequence of Uniprot number P97822 in a mouse.

SLC25A1(Tricarboxylate transport protein, mitochondrial)는 미토콘드시아 시트르산염을 세포질 말산염으로의 교환을 매개하는 시트르산염 트랜스포터이다. SLC25A1은 시트르산염 전달 단백질(Citrate transport protein: CTP), Solute carrier family 25 member 1, 또는 Tricarboxylate carrier protein으로도 불릴 수 있다. SLC25A1은 인간에서 Uniprot 번호 P53007의 아미노산 서열을 포함할 수 있다. SLC25A1은 마우스에서 Uniprot 번호 Q8JZU2의 아미노산 서열을 포함할 수 있다.SLC25A1 (Tricarboxylate transport protein, mitochondrial) is a citrate transporter that mediates the exchange of mitochondrial citrate to cytosolic malate. SLC25A1 may also be referred to as citrate transport protein (CTP), solute carrier family 25 member 1, or tricarboxylate carrier protein. SLC25A1 may comprise the amino acid sequence of Uniprot number P53007 in humans. SLC25A1 may comprise the amino acid sequence of Uniprot number Q8JZU2 in a mouse.

CCAR1(Cell division cycle and apoptosis regulator protein 1)은 상류 전사 활성화 단백질로부터 하류 전사 기구로 조절 신호를 전달하는데 관여하는 단백질이다. CCAR1은 CARP-1 또는 Death inducer with SAP domain으로도 불릴 수 있다. CCAR1은 인간에서 Uniprot 번호 Q8IX12의 아미노산 서열을 포함할 수 있다. CCAR1은 마우스에서 Uniprot 번호 Q8CH18의 아미노산 서열을 포함할 수 있다.CCAR1 (Cell division cycle and apoptosis regulator protein 1) is a protein involved in transmitting regulatory signals from an upstream transcriptional activation protein to a downstream transcriptional machinery. CCAR1 may also be referred to as CARP-1 or Death inducer with SAP domain. CCAR1 may comprise the amino acid sequence of Uniprot number Q8IX12 in humans. CCAR1 may comprise the amino acid sequence of Uniprot number Q8CH18 in a mouse.

PGRMC1(Membrane-associated progesterone receptor component 1)은 프로게스테론-결합 단백질 복합체의 성분이다. PGRMC1은 HPR6.6, MPR, Dap1, 또는 IZA로도 불릴 수 있다. PGRMC1은 인간에서 Uniprot 번호 O00264 또는 Q6IB11의 아미노산 서열을 포함할 수 있다. PGRMC1은 마우스에서 Uniprot 번호 O55022의 아미노산 서열을 포함할 수 있다.PGRMC1 (Membrane-associated progesterone receptor component 1) is a component of the progesterone-binding protein complex. PGRMC1 may also be referred to as HPR6.6, MPR, Dap1, or IZA. PGRMC1 may comprise the amino acid sequence of Uniprot No. O00264 or Q6IB11 in humans. PGRMC1 may comprise the amino acid sequence of Uniprot number O55022 in a mouse.

MTARC2(Mitochondrial amidoxime reducing component 2)는 N-산화된 분자의 환원을 촉매할 수 있다. MTARC2는 MOSC2 또는 MARC2로도 불릴 수 있다. MTARC2는 인간에서 Uniprot 번호 Q969Z3의 아미노산 서열을 포함할 수 있다. MTARC2는 마우스에서 Uniprot 번호 Q922Q1의 아미노산 서열을 포함할 수 있다.MTARC2 (Mitochondrial amidoxime reducing component 2) can catalyze the reduction of N-oxidized molecules. MTARC2 may also be referred to as MOSC2 or MARC2. MTARC2 may comprise the amino acid sequence of Uniprot number Q969Z3 in humans. MTARC2 may comprise the amino acid sequence of Uniprot number Q922Q1 in a mouse.

SORL1(Sortilin-related receptor)은 신경 아포리포단백질 E 수용체이다. SORL1은 L(DLR class) A repeats containing, C11orf32, LR11, LRP9, SORLA, SorLA-1, gp250, 또는 sortilin related receptor 1으로도 불릴 수 있다. SORL1은 인간에서 Uniprot 번호 Q92673의 아미노산 서열을 포함할 수 있다. SORL1은 마우스에서 Uniprot 번호 O88307의 아미노산 서열을 포함할 수 있다.SORL1 (Sortilin-related receptor) is a neuronal apolipoprotein E receptor. SORL1 may also be referred to as L (DLR class) A repeats containing, C11orf32, LR11, LRP9, SORLA, SorLA-1, gp250, or sortilin related receptor 1. SORL1 may comprise the amino acid sequence of Uniprot number Q92673 in humans. SORL1 may comprise the amino acid sequence of Uniprot number 088307 in a mouse.

ITGA5(Integrin alpha-5)는 인테그린 알파 사슬 패밀리에 속한다. ITGA5는 CD49e, FNRA, VLA5A, 또는 VLA-5로도 불릴 수 있다. ITGA5는 인간에서 Uniprot 번호 P08648의 아미노산 서열을 포함할 수 있다. ITGA5는 마우스에서 Uniprot 번호 P11688의 아미노산 서열을 포함할 수 있다.ITGA5 (Integrin alpha-5) belongs to the integrin alpha chain family. ITGA5 may also be referred to as CD49e, FNRA, VLA5A, or VLA-5. ITGA5 may comprise the amino acid sequence of Uniprot number P08648 in humans. ITGA5 may comprise the amino acid sequence of Uniprot number P11688 in a mouse.

SOD2(Superoxide dismutase [Mn], mitochondrial)는 망간-의존성 과산화물 불균등화효소(dismutase)이다. SOD2는 IPOB, MNSOD, MVCD6, IPO-B, Mn-SOD, 또는 GClnc1로도 불릴 수 있다. SOD2는 인간에서 Uniprot 번호 P04179의 아미노산 서열을 포함할 수 있다. SOD2는 마우스에서 Uniprot 번호 P09671의 아미노산 서열을 포함할 수 있다.SOD2 (superoxide dismutase [Mn], mitochondrial) is a manganese-dependent superoxide dismutase. SOD2 may also be referred to as IPOB, MNSOD, MVCD6, IPO-B, Mn-SOD, or GClnc1. SOD2 may comprise the amino acid sequence of Uniprot number P04179 in humans. SOD2 may comprise the amino acid sequence of Uniprot number P09671 in a mouse.

ERH(Enhancer of rudimentary homolog)는 피리미딘 생합성에 관련된 유전자의 인핸서이고 세포 주기에 기능을 담당할 수 있다. ERH는 DROER, mRNA splicing and mitosis factor, 또는 ERH mRNA splicing and mitosis factor로도 불릴 수 있다. ERH는 인간에서 Uniprot 번호 P84090의 아미노산 서열을 포함할 수 있다. ERH는 마우스에서 Uniprot 번호 P84089의 아미노산 서열을 포함할 수 있다.ERH (Enhancer of rudimentary homolog) is an enhancer of a gene involved in pyrimidine biosynthesis and may play a role in the cell cycle. ERH may also be referred to as DROER, mRNA splicing and mitosis factor, or ERH mRNA splicing and mitosis factor. ERH may comprise the amino acid sequence of Uniprot number P84090 in humans. ERH may comprise the amino acid sequence of Uniprot number P84089 in a mouse.

MYH4(Myosin-4)는 근육(sarcomeric) 미오신이다. MYH4는 MYH2B, MyHC-2B, MyHC-IIb, 미오신 중쇄 4, 또는 골격근 미오신 주중쇄 4로도 불릴 수 있다. MYH4는 인간에서 Uniprot 번호 Q9Y623의 아미노산 서열을 포함할 수 있다. MYH4는 마우스에서 Uniprot 번호 Q5SX39의 아미노산 서열을 포함할 수 있다.MYH4 (Myosin-4) is a sarcomeric myosin. MYH4 may also be referred to as MYH2B, MyHC-2B, MyHC-IIb, myosin heavy chain 4, or skeletal muscle myosin main heavy chain 4. MYH4 may comprise the amino acid sequence of Uniprot number Q9Y623 in humans. MYH4 may comprise the amino acid sequence of Uniprot number Q5SX39 in a mouse.

RPS4X(40S ribosomal protein S4, X isoform)은 리보솜을 이루는 단백질이다. RPS4X는 CCG2, DXS306, RPS4, S4, SCAR, SCR10, ribosomal protein S4, X-linked, 또는 ribosomal protein S4 X-linked로도 불릴 수 있다. RPS4X는 인간에서 Uniprot 번호 P62701의 아미노산 서열을 포함할 수 있다. RPS4X는 마우스에서 Uniprot 번호 P62702의 아미노산 서열을 포함할 수 있다.RPS4X (40S ribosomal protein S4, X isoform) is a protein constituting the ribosome. RPS4X may also be referred to as CCG2, DXS306, RPS4, S4, SCAR, SCR10, ribosomal protein S4, X-linked, or ribosomal protein S4 X-linked. RPS4X may comprise the amino acid sequence of Uniprot number P62701 in humans. RPS4X may comprise the amino acid sequence of Uniprot number P62702 in a mouse.

RPRD1B(Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B)는 RNA 중합효소 II 서브유닛의 인산화된 C-말단 7펩티드 반복 도메인과 결합하는 단백질이다. RPRD1B는 Cell cycle-related and expression-elevated protein in tumor로도 불릴 수 있다. RPRD1B는 인간에서 Uniprot 번호 Q9NQG5의 아미노산 서열을 포함할 수 있다. RPRD1B는 마우스에서 Uniprot 번호 Q9CSU0의 아미노산 서열을 포함할 수 있다.Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B (RPRD1B) is a protein that binds to the phosphorylated C-terminal 7-peptide repeat domain of the RNA polymerase II subunit. RPRD1B can also be called cell cycle-related and expression-elevated protein in tumor. RPRD1B may comprise the amino acid sequence of Uniprot number Q9NQG5 in humans. RPRD1B may comprise the amino acid sequence of Uniprot number Q9CSU0 in a mouse.

MYO6(Unconventional myosin-VI)는 세포내 소포 및 세포소기관 수송에 관련된 단백질이다. MYO6는 DFNA22, DFNB37, myosin VI, Myo6-008, 또는 Myo6-007로도 불릴 수 있다. MYO6는 인간에서 Uniprot 번호 Q9UM54의 아미노산 서열을 포함할 수 있다. MYO6는 마우스에서 Uniprot 번호 Q64331의 아미노산 서열을 포함할 수 있다.MYO6 (Unconventional myosin-VI) is a protein involved in intracellular vesicle and organelle transport. MYO6 may also be referred to as DFNA22, DFNB37, myosin VI, Myo6-008, or Myo6-007. MYO6 may comprise the amino acid sequence of Uniprot number Q9UM54 in humans. MYO6 may comprise the amino acid sequence of Uniprot number Q64331 in a mouse.

TNNI1(Troponin I, slow skeletal muscle)은 트로포닌 복합체를 이루는 트로포닌 I의 조직-특이적 서브타입이다. TNNI1은 SSTNI, TNN1, 또는 troponin I1, slow skeletal type으로도 불릴 수 있다. TNNI1은 인간에서 Uniprot 번호 P19237의 아미노산 서열을 포함할 수 있다. TNNI1은 마우스에서 Uniprot 번호 Q9WUZ5의 아미노산 서열을 포함할 수 있다.TNNI1 (Troponin I, slow skeletal muscle) is a tissue-specific subtype of troponin I constituting the troponin complex. TNNI1 may also be referred to as SSTNI, TNN1, or troponin I1, slow skeletal type. TNNI1 may comprise the amino acid sequence of Uniprot number P19237 in humans. TNNI1 may comprise the amino acid sequence of Uniprot number Q9WUZ5 in a mouse.

상기 단편(fragment)은 상기 단백질의 일부로서, 면역원성 폴리펩티드일 수 있다.The fragment is a part of the protein and may be an immunogenic polypeptide.

상기 유전자는 상기 단백질을 암호화하는 핵산을 말한다. 상기 유전자의 발현 수준은 상기 단백질을 암호화하는 mRNA의 발현 수준일 수 있다. mRNA의 발현 수준은 mRNA의 상대적 양 또는 절대적인 양일 수 있다. 상기 유전자의 발현 수준을 측정하는 것은 mRNA의 양을 측정하는 것일 수 있다.The gene refers to a nucleic acid encoding the protein. The expression level of the gene may be the expression level of mRNA encoding the protein. The expression level of mRNA may be a relative amount or an absolute amount of mRNA. Measuring the expression level of the gene may be measuring the amount of mRNA.

상기 단백질 또는 이의 단편의 발현 수준은 상기 단백질 또는 이의 단편의 상대적 양 또는 절대적인 양일 수 있다. 상기 단백질 또는 이의 단편의 발현 수준을 측정하는 것은 상기 단백질 또는 이의 단편의 양을 측정하는 것일 수 있다.The expression level of the protein or fragment thereof may be a relative amount or an absolute amount of the protein or fragment thereof. Measuring the expression level of the protein or fragment thereof may be measuring the amount of the protein or fragment thereof.

상기 제제는 상기 단백질 또는 이의 단편에 특이적으로 결합하는 항체 또는 이의 항원 결합 단편, 또는 앱타머(aptamer)일 수 있다. 상기 항체는 폴리클론 항체 또는 모노클론 항체일 수 있다. 용어 "항체(antibody)"는 용어 "면역글로불린(immunoglobulin)"과 상호교환적으로 사용될 수 있다. 상기 항체는 폴리클론 항체 또는 모노클론 항체일 수 있다. 상기 항체는 전장 항체일 수 있다. 상기 항원 결합 단편은 항원 결합 부위를 포함하는 폴리펩티드를 말한다. 상기 항원 결합 단편은 단일-도메인 항체(single-domain antibody), Fab, Fab', 또는 scFv일 수 있다. 상기 항체 또는 항원 결합 단편은 고체 지지체에 부착된 것일 수 있다. 상기 고체 지지체는 예를 들어, 금속 칩, 플레이트, 또는 웰(well)의 표면이다. 상기 항체 또는 항원 결합 단편은 항체 또는 항원 결합 단편일 수 있다. 상기 앱타머는 상기 단백질 또는 이의 단편에 특이적으로 결합하는 단일 가닥의 핵산(DNA, RNA 또는 변형핵산)이나 펩티드일 수 있다.The agent may be an antibody or antigen-binding fragment thereof that specifically binds to the protein or fragment thereof, or an aptamer. The antibody may be a polyclonal antibody or a monoclonal antibody. The term “antibody” may be used interchangeably with the term “immunoglobulin”. The antibody may be a polyclonal antibody or a monoclonal antibody. The antibody may be a full-length antibody. The antigen-binding fragment refers to a polypeptide comprising an antigen-binding site. The antigen-binding fragment may be a single-domain antibody, Fab, Fab', or scFv. The antibody or antigen-binding fragment may be attached to a solid support. The solid support is, for example, a metal chip, a plate, or the surface of a well. The antibody or antigen-binding fragment may be an antibody or antigen-binding fragment. The aptamer may be a single-stranded nucleic acid (DNA, RNA or modified nucleic acid) or peptide that specifically binds to the protein or fragment thereof.

상기 제제는 상기 단백질 또는 이의 단편을 암호화하는 폴리뉴클레오티드와 동일하거나 또는 이에 상보적인 폴리뉴클레오티드를 포함하는 핵산일 수 있다. 상기 핵산은 프라이머, 프로브, 또는 안티센스 올리고뉴클레오티드일 수 있다. 상기 프라이머, 프로브, 또는 안티센스 올리고뉴클레오티드는 그의 말단 또는 내부에 형광 물질, 화학발광물질(chemiluminescent) 또는 방사성 동위원소 등으로 표지된 것일 수 있다.The agent may be a nucleic acid comprising a polynucleotide identical to or complementary to a polynucleotide encoding the protein or fragment thereof. The nucleic acid may be a primer, a probe, or an antisense oligonucleotide. The primer, probe, or antisense oligonucleotide may be labeled with a fluorescent material, chemiluminescent material, or radioactive isotope at the end or inside thereof.

다른 양상은 ANP32E, SLC25A1, CCAR1, PGRMC1, MTARC2, SORL1, ITGA5, SOD2, ERH, MYH4, RPS4X, RPRD1B, MYO6, 및 TNNI1로 이루어진 군으로부터 선택된 유전자의 발현 수준, 또는 단백질 또는 이의 단편의 발현 수준을 측정하는 제제를 포함하는 구강건조증 진단용 키트를 제공한다.Another aspect is the expression level of a gene selected from the group consisting of ANP32E, SLC25A1, CCAR1, PGRMC1, MTARC2, SORL1, ITGA5, SOD2, ERH, MYH4, RPS4X, RPRD1B, MYO6, and TNNI1, or the expression level of a protein or fragment thereof. It provides a kit for diagnosing dry mouth disease including a measuring agent.

ANP32E, SLC25A1, CCAR1, PGRMC1, MTARC2, SORL1, ITGA5, SOD2, ERH, MYH4, RPS4X, RPRD1B, MYO6, TNNI1, 및 구강건조증은 전술한 바와 같다.ANP32E, SLC25A1, CCAR1, PGRMC1, MTARC2, SORL1, ITGA5, SOD2, ERH, MYH4, RPS4X, RPRD1B, MYO6, TNNI1, and xerostomia as described above.

상기 키트는 구강건조증 진단에 필요한 시료를 더 포함할 수 있다. 상기 키트는 고체 지지체, 항체 또는 항원 결합 단편의 면역학적 검출을 위하여 기질, 적합한 완충용액, 발색 효소, 형광물질로 표지된 2차 항체, 또는 발색 기질을 포함할 수 있다. 상기 키트는 핵산 검출을 위하여, 중합효소, 완충제, 핵산, 조효소, 형광물질, 또는 이들의 조합을 포함할 수 있다. 상기 중합 효소는 예를 들어 Taq 중합효소이다.The kit may further include a sample necessary for diagnosing dry mouth. The kit may include a solid support, a substrate for immunological detection of an antibody or antigen-binding fragment, a suitable buffer, a chromogenic enzyme, a secondary antibody labeled with a fluorescent material, or a chromogenic substrate. The kit may include a polymerase, a buffer, a nucleic acid, a coenzyme, a fluorescent material, or a combination thereof for nucleic acid detection. The polymerase is, for example, Taq polymerase.

다른 양상은 구강건조증이 의심되는 개체로부터 분리된 타액선 조직 시료에서 ANP32E, SLC25A1, CCAR1, PGRMC1, MTARC2, SORL1, ITGA5, SOD2, ERH, MYH4, RPS4X, RPRD1B, MYO6, 및 TNNI1로 이루어진 군으로부터 선택된 유전자의 발현 수준, 또는 단백질 또는 이의 단편의 발현 수준을 측정하는 단계; 상기 측정된 발현 수준을 정상 대조군의 발현 수준과 비교하는 단계; 및 상기 발현 수준이 정상 대조군의 발현 수준과 비교하여 증가한 경우, 구강건조증으로 결정하는 단계를 포함하는, 구강건조증 진단 방법 또는 구강건조증의 진단에 필요한 정보를 제공하기 위하여 바이오마커를 검출하는 방법을 제공한다.Another aspect is a gene selected from the group consisting of ANP32E, SLC25A1, CCAR1, PGRMC1, MTARC2, SORL1, ITGA5, SOD2, ERH, MYH4, RPS4X, RPRD1B, MYO6, and TNNI1 in a salivary gland tissue sample isolated from a subject suspected of dry mouth measuring the expression level of, or the expression level of a protein or fragment thereof; comparing the measured expression level with the expression level of a normal control; And when the expression level is increased compared to the expression level of the normal control, it provides a method of detecting a biomarker to provide information necessary for diagnosing dry mouth or dry mouth, comprising the step of determining dry mouth do.

ANP32E, SLC25A1, CCAR1, PGRMC1, MTARC2, SORL1, ITGA5, SOD2, ERH, MYH4, RPS4X, RPRD1B, MYO6, TNNI1, 및 구강건조증은 전술한 바와 같다.ANP32E, SLC25A1, CCAR1, PGRMC1, MTARC2, SORL1, ITGA5, SOD2, ERH, MYH4, RPS4X, RPRD1B, MYO6, TNNI1, and xerostomia as described above.

상기 방법은 구강건조증이 의심되는 개체로부터 분리된 타액선 조직 시료에서 ANP32E, SLC25A1, CCAR1, PGRMC1, MTARC2, SORL1, ITGA5, SOD2, ERH, MYH4, RPS4X, RPRD1B, MYO6, 및 TNNI1로 이루어진 군으로부터 선택된 유전자의 발현 수준, 또는 단백질 또는 이의 단편의 발현 수준을 측정하는 단계를 포함한다.The method comprises a gene selected from the group consisting of ANP32E, SLC25A1, CCAR1, PGRMC1, MTARC2, SORL1, ITGA5, SOD2, ERH, MYH4, RPS4X, RPRD1B, MYO6, and TNNI1 in a salivary gland tissue sample isolated from a subject suspected of dry mouth. measuring the expression level of, or the expression level of a protein or fragment thereof.

상기 개체는 포유동물, 예를 들면, 인간, 소, 말, 돼지, 개, 양, 염소, 또는 고양이일 수 있다. 상기 개체는 구강건조증 장애를 앓고 있거나 구강건조증에 걸린 것으로 의심되는 개체일 수 있다.The subject may be a mammal, such as a human, cow, horse, pig, dog, sheep, goat, or cat. The subject may be suffering from a dry mouth disorder or may be an individual suspected of suffering from dry mouth.

상기 타액선 조직 시료는 상기 개체로부터 수득된 타액선 조직 시료를 말한다. 상기 타액선 조직 시료는 원심분리, 여과 등의 전처리를 거친 시료일 수 있다. 상기 타액선 조직 시료는 타액선 조직 시료로부터 수득된 단백질 시료 또는 핵산 시료를 포함한다.The salivary gland tissue sample refers to a salivary gland tissue sample obtained from the subject. The salivary gland tissue sample may be a sample that has been subjected to pretreatment such as centrifugation and filtration. The salivary gland tissue sample includes a protein sample or a nucleic acid sample obtained from the salivary gland tissue sample.

상기 측정하는 단계는 상기 타액선 조직 시료와, 상기 단백질 또는 이의 단편에 특이적으로 결합하는 항체 또는 이의 항원 결합 단편, 또는 앱타머를 인큐베이션시키거나, 또는 상기 유전자를 코딩하는 폴리뉴클레오티드와 동일하거나 또는 이에 상보적인 폴리뉴클레오티드를 인큐베이션시키는 단계를 포함할 수 있다.In the measuring step, the salivary gland tissue sample is incubated with an antibody or antigen-binding fragment thereof, or an aptamer that specifically binds to the protein or fragment thereof, or the same as or identical to the polynucleotide encoding the gene. incubating the complementary polynucleotide.

상기 측정하는 단계는 전기영동, 면역블로팅, 효소 결합 면역흡착 분석법(Enzyme-Linked Immunosorbent Assay: ELISA), 중합효소 연쇄 반노던 블로팅(Northern blotting), 폴리머라제 증폭 반응(polymerase chain reaction: PCR), 단백질 칩, 면역침강, 마이크로어레이, 전자현미경법(electron microscopy), 또는 이들의 조합으로 수행될 수 있다. 상기 전기영동은 SDS-PAGE, 등전점 전기영동, 2차원 전기영동, 또는 이들의 조합일 수 있다.The measuring step includes electrophoresis, immunoblotting, enzyme-linked immunosorbent assay (ELISA), polymerase chain semi-Northern blotting, polymerase chain reaction (PCR). , protein chip, immunoprecipitation, microarray, electron microscopy, or a combination thereof. The electrophoresis may be SDS-PAGE, isoelectric point electrophoresis, two-dimensional electrophoresis, or a combination thereof.

상기 방법은 측정된 발현 수준을 정상 대조군의 발현 수준과 비교하는 단계를 포함한다. 상기 방법은 ANP32E, SLC25A1, CCAR1, PGRMC1, MTARC2, SORL1, ITGA5, SOD2, ERH, MYH4, RPS4X, RPRD1B, MYO6, 및 TNNI1로 이루어진 군으로부터 선택된 어느 하나의 발현 수준이 정상 대조군의 발현 수준과 비교하여 증가하였는지 확인하는 단계를 포함할 수 있다. 상기 정상 대조군은 구강건조증에 걸리지 않은 군으로서 음성 대조군을 의미한다. 상기 방법에서, 측정된 타액선 조직 시료의 발현 수준의 양이 정상 대조군의 발현 수준에 비해 증가할 수 있다. 예를 들어, 검출된 바이오마커의 양이 정상 대조군의 양 보다 적은 경우, 상기 개체는 구강건조증에 걸리거나 걸릴 확률이 높은 것으로 진단될 수 있다. 구강건조증으로 진단된 개체에 구강 관리, 약물 투여 조절, 타액 대체제 투여, 구강보습제 투여, 구강의 전기 자극 또는 침 등의 치료를 수행할 수 있다.The method comprises comparing the measured expression level to the expression level of a normal control. In the method, the expression level of any one selected from the group consisting of ANP32E, SLC25A1, CCAR1, PGRMC1, MTARC2, SORL1, ITGA5, SOD2, ERH, MYH4, RPS4X, RPRD1B, MYO6, and TNNI1 is compared with that of a normal control group. It may include the step of checking whether the increase. The normal control group is a group that does not have dry mouth and means a negative control group. In the method, the amount of the measured expression level of the salivary gland tissue sample may be increased compared to the expression level of the normal control. For example, when the amount of the detected biomarker is less than that of a normal control, the subject may be diagnosed as having or having a high probability of having dry mouth. Treatments such as oral care, control of drug administration, administration of saliva substitutes, administration of oral moisturizers, electrical stimulation of the oral cavity or acupuncture may be performed on an individual diagnosed with dry mouth.

일 양상에 따른 구강건조증 진단용 조성물, 키트, 및 이를 이용한 구강건조증의 진단 방법에 따르면, 구강건조증을 간편하고 객관적이고, 높은 정확도 및 특이도로 진단하는데 이용할 수 있다.According to the composition and kit for diagnosing dry mouth according to an aspect, and a method for diagnosing dry mouth using the same, it can be used to diagnose dry mouth disease simply, objectively, with high accuracy and specificity.

도 1은 정상 대조군과 구강건조증 환자 그룹의 타액선 조직 시료의 SDS-PAGE 겔 이미지이다(좌: 전체 겔, 우: 분획된 겔).
도 2는 타액선 조직 시료에서 동정된 단백질과 p-값이 0.05 미만으로 통계적으로 유의한 단백질을 분석하여 개수를 나타낸 벤다이어그램이다.
1 is an SDS-PAGE gel image of salivary gland tissue samples from a normal control group and a group of patients with dry mouth (left: whole gel, right: fractionated gel).
2 is a Venn diagram showing the number of proteins identified in a salivary gland tissue sample and proteins having a p-value of less than 0.05 analyzed and statistically significant.

이하 실시예를 통하여 보다 상세하게 설명한다. 그러나, 이들 실시예는 하나 이상의 구체예를 예시적으로 설명하기 위한 것으로 본 발명의 범위가 이들 실시예에 한정되는 것은 아니다.Hereinafter, it will be described in more detail through examples. However, these examples are for illustrative purposes of one or more embodiments, and the scope of the present invention is not limited to these examples.

실시예 1. 구강건조증 환자의 타액선 조직 시료에서 차등 발현된 바이오마커의 확인Example 1. Identification of differentially expressed biomarkers in salivary gland tissue samples from dry mouth patients

1. 구강건조증 환자의 타액선 조직 시료의 준비1. Preparation of salivary gland tissue samples from dry mouth patients

한양대학교로부터 정상 대조군(n=3)과 구강건조증으로 진단된 환자에서 타액선 조직 시료를 수집하였다. 구강 건조증은 타액선 분비와 구강 점막 상태에 대한 임상 검사와 타액선 스캔에서 타액선 기능을 평가하여 진단하였다. 타액선 기능은 타액선 조직 검사를 시행하여 타액선 조직의 상태와 타액선 실질 주변에 림프구의 침투 여부에 따라서 스코어 1 내지 스코어 5로 분류하였다. 스코어 1, 스코어 2, 및 스코어 3 내지 5의 3 군으로 분류하여 타액선 조직 샘플링을 시행하였다. Salivary gland tissue samples were collected from a normal control group (n=3) and a patient diagnosed with dry mouth from Hanyang University. Dry mouth was diagnosed by evaluating salivary gland function in clinical examinations of salivary gland secretion and oral mucosa condition, and salivary gland scans. Salivary gland function was classified into a score of 1 to 5 depending on the condition of the salivary gland tissue and the infiltration of lymphocytes around the parenchyma of the salivary gland by performing a salivary gland biopsy. Salivary gland tissue sampling was performed by classification into 3 groups of score 1, score 2, and score 3 to 5.

타액선 조직 시료의 단백질 분해 또는 변형을 막기 위해, 혈청을 수득한 직후에 수득된 타액선 조직 시료에 단백질 분해효소 저해제로서 cOmplete, Mini EDTA-free 프로테아제 저해제 칵테일(Roche) 및 포스파타아제 저해제로서 PhosSTOP(Roche)을 첨가하였다. 상기 저해제는 제조자의 프로토콜에 따라 1개의 정제를 200 ㎕의 인산완충식염수(phosphate bufffered saline: PBS)에 녹여 50 X로 만든 후, 각 시료에 저해제의 최종 농도 1.5 X가 되도록 첨가하였다. 단백질 추출 효율을 높이기 위해, 가위를 이용하여, 조직 시료를 잘게 잘라준 후, 볼텍싱과 인큐베이션을 반복하여, 조직에 포함된 혈액을 제거하였다.To prevent proteolysis or modification of the salivary gland tissue sample, cOmplete as a protease inhibitor, Mini EDTA-free protease inhibitor cocktail (Roche) and PhosSTOP (Roche) as a phosphatase inhibitor were added to the salivary gland tissue sample obtained immediately after serum was obtained. ) was added. The inhibitor was dissolved in 200 μl of phosphate buffered saline (PBS) according to the manufacturer's protocol to make 50 X, and then added to each sample so that the final concentration of the inhibitor was 1.5 X. In order to increase protein extraction efficiency, using scissors, a tissue sample was cut finely, vortexing and incubation were repeated to remove blood contained in the tissue.

2. 타액선 조직 시료의 농축 및 정량2. Concentration and Quantification of Salivary Gland Tissue Samples

1.에서 혈액을 제거한 조직 시료에 용해 완충액(50 mM Tris-HCl (pH 7.5), 7 M 우레아, 2 M 티오우레아, 1 mM EDTA, 150 mM NaCl, protease and phosphatase inhibitor cocktails(Roche))를 가하였다. 반응물을 볼텍싱, 인큐베이션, 및 초음파 처리를 반복적으로 수행하여, 효율적으로 단백질 추출을 수행하였다. 얻어진 단백질은 브래드포드 분석 키트를 사용하여 정량하였다.Add lysis buffer (50 mM Tris-HCl (pH 7.5), 7 M urea, 2 M thiourea, 1 mM EDTA, 150 mM NaCl, protease and phosphatase inhibitor cocktails (Roche)) to the tissue sample from which blood was removed in 1. did The reaction was repeatedly subjected to vortexing, incubation, and sonication to efficiently perform protein extraction. The obtained protein was quantified using a Bradford assay kit.

3. 질량 분석을 위한 시료의 준비 및 젤 내 분해(In-gel digestion)3. Preparation of samples for mass spectrometry and in-gel digestion

프로테옴 분석을 위해, 2.에서 수득된 2개의 그룹의 6개의 개별 시료 90 ㎍을 NuPAGE 겔(4% 내지 12%의 Bis-Tris 겔, Invitrogen, Carlsbad, CA, USA)을 사용하여 분자량에 따라 분리하였다. 겔을 쿠마시 브릴리언트 블루(Coomassie Brillant Blue R-250)로 염색하였다(도 1). 6개의 개별 시료에 대하여 염색된 젤을 13개의 조각(slice)으로 나누고, 각각의 젤 조각을 마이크로 원심분리 튜브에 옮겼다. 각각의 겔 조각에 함유된 단백질을 56℃에서 이황화 결합을 환원시킨 후, 25℃의 어두운 환경에서 알킬화시키고, 트립신으로 밤새 분해하였다. 이어서, 67%(v/v)의 아세토니트릴(acetonitrile: ACN)/5%(v/v)의 포름산(formic acid: FA)(Wako Pure Chemicals, Osaka, Japan) 용액에서 펩티드를 추출하였다. 추출된 펩티드는 Speedvac에서 건조시킨 후 20 ㎕의 0.4%(v/v) 아세트산에 용해시켰다.For proteome analysis, 90 μg of 6 individual samples from 2 groups obtained in 2. were separated according to molecular weight using NuPAGE gels (Bis-Tris gels from 4% to 12%, Invitrogen, Carlsbad, CA, USA). did The gel was stained with Coomassie Brilliant Blue R-250 (FIG. 1). The stained gel for 6 individual samples was divided into 13 slices, and each gel slice was transferred to a microcentrifuge tube. Proteins contained in each gel piece were reduced by disulfide bonds at 56°C, then alkylated in a dark environment at 25°C, and digested with trypsin overnight. Then, the peptide was extracted from a solution of 67% (v/v) acetonitrile (ACN)/5% (v/v) formic acid (FA) (Wako Pure Chemicals, Osaka, Japan). The extracted peptides were dried in Speedvac and dissolved in 20 μl of 0.4% (v/v) acetic acid.

4. 질량 스펙트럼 분석4. Mass Spectrum Analysis

3.에서 수득한 각각의 시료 10 ㎕를 Eksigent MDLC 시스템(Eksigent Technologies Dublin, CA, USA) 상에서 역상 Magic C18AQ 컬럼(15 cm X 75 ㎛)에 주입하였다. 상기 컬럼을 95%의 완충액 A(0.1%(v/v)의 포름산을 함유하는 100%(v/v)의 물)와 5%(v/v)의 완충액 B(0.1%(v/v)의 포름산을 함유하는 100%(v/v)의 ACN)를 혼합한 완충액으로 평형화시켰다. 작업 유속은 다음의 구배 조건에서 0.35 ㎕/분(min)으로 하였다:10 μl of each sample obtained in 3. was injected onto a reversed-phase Magic C18AQ column (15 cm X 75 μm) on an Eksigent MDLC system (Eksigent Technologies Dublin, CA, USA). The column was mixed with 95% Buffer A (100% (v/v) water containing 0.1% (v/v) formic acid) and 5% (v/v) Buffer B (0.1% (v/v) of 100% (v/v) ACN) containing formic acid) was equilibrated with a mixed buffer. The working flow rate was 0.35 μl/min (min) under the following gradient conditions:

0분 내지 5분에서 100% 완충액 A; 5분 내지 85분에서 92% 완충액 A 및 8% 완충액 B; 85분 내지 90분에서 70% 완충액 A 및 30% 완충액 B; 90분 내지 95분에서 30% 완충액 A 및 70% 완충액 B; 95분 내지 100분에서 30% 완충액 A 및 70% 완충액 B; 및 100분 내지 110분에서 98% 완충액 A 및 2% 완충액 B.100% Buffer A from 0 min to 5 min; 92% Buffer A and 8% Buffer B from 5 min to 85 min; 70% Buffer A and 30% Buffer B from 85 to 90 minutes; 30% Buffer A and 70% Buffer B from 90 min to 95 min; 30% Buffer A and 70% Buffer B from 95 to 100 minutes; and 98% Buffer A and 2% Buffer B from 100 to 110 minutes.

나노 HPLC 시스템을 LTQ XL-Orbitrap 질량 스펙트로미터(Thermo Scientific, San Jose, CA, USA)에 장착하였다. 분무 전압(spray voltage)은 2.5 kV로 설정하였고, 가열된 모세관의 온도는 250℃로 설정하였다. 조사 전체-스캔 MS 스펙트라(Survey full-scan MS spectra)(300 내지 1,800 m/z)를 1 마이크로스캔(microscan) 및 60,000의 해상도(resolution)로 수득하여, 선도물질(precursor)을 선별하고 전하 상태 측정을 위한 미리보기 모드를 설정하였다. 미리보기 조사 스캔으로부터 10 개의 가장 강력한 이온에 대한 MS/MS 스펙트라를 하기와 같은 옵션으로 전체 스캔에 대한 이온 트랩에서 수득하였다: 분리 간격(isolation width), 2 m/z(질량 대 전하); 표준화된 충돌 에너지(collision energy), 35%; 동적 배제 시간(dynamic exclusion duration), 360 초(sec). +1 전하 및 전하 상태가 정해지지 않은 갖는 선도 물질은 데이터-종속적으로(data-dependent) 수득하는 동안 폐기하였다.The nano HPLC system was mounted on an LTQ XL-Orbitrap mass spectrometer (Thermo Scientific, San Jose, CA, USA). The spray voltage was set at 2.5 kV, and the temperature of the heated capillary was set at 250°C. Survey full-scan MS spectra (300-1,800 m/z) were obtained with 1 microscan and a resolution of 60,000 to select precursors and charge states A preview mode for measurement was set. MS/MS spectra for the 10 most potent ions from the preview irradiation scan were obtained in the ion trap for the full scan with the following options: isolation width, 2 m/z (mass versus charge); normalized collision energy, 35%; dynamic exclusion duration, 360 seconds (sec). Lead materials with +1 charge and undetermined charge states were discarded during data-dependent acquisition.

각각의 LC-MS/MS 파일을 MaxQunat1.5.8.3의 Andromeda 알고리즘을 이용하여 분석하였다. MS 및 MS/MS 데이터를 SwissProt 인간 데이터 베이스(January 2019)와 비교 조사하였다. 조사는 두개의 미절단(missed cleavages) 트립신 분해된 펩티드 (tryptic peptide)를 허용하는 것으로 제한하였다. 시스테인(cysteine)의 카르보아미도메틸화(carboamidomethylation)를 고정된 수식화(+57.021 Da)로, 메티오닌 산화를 유동형 수식화(+15.995 Da)로 설정하였다. 질량 허용 범위(mass tolerance)를 MS/MS 데이터에 대하여 0.5 Da 및 MS 데이터에 대하여 15 ppm로 설정하였다. 디코이(decoy) 데이터 베이스 조사를 위해, 0.01의 엄격한 오류 발견 비율(False Discovery Rate: FDR)과 0.05의 완화된 FDR, 총 두개의 목표 수치를 적용하였다. 모든 단백질은 2개 이상의 일치하는 펩티드를 이용하여 동정하였다.Each LC-MS/MS file was analyzed using the Andromeda algorithm of MaxQunat1.5.8.3. MS and MS/MS data were compared against SwissProt human database (January 2019). The investigation was limited to accepting tryptic peptides with two missed cleavages. Carboamidomethylation of cysteine was set as a fixed modification (+57.021 Da) and methionine oxidation as a fluid modification (+15.995 Da). Mass tolerance was set at 0.5 Da for MS/MS data and 15 ppm for MS data. For decoy database research, two target values were applied: a strict false discovery rate (FDR) of 0.01 and a relaxed FDR of 0.05. All proteins were identified using two or more matching peptides.

5. 라벨 프리(Label-free) 정량 분석5. Label-free quantitative analysis

정상 대조군과 구강건조증 환자군의 2개의 그룹에서 타액선 조직 시료를 각각 3개씩 수집한 총 6개의 샘플에 존재하는 단백질들의 상대적인 존재량을 라벨 프리 정량 강도 분석법(Label-free quantification intensity: LFQ 강도)에 기초하여 산출하였다. MaxQunat1.5.8.3을 사용하여 강도를 추출하였다. 이어서, 각각의 단백질에 대한 LFQ 강도를 Perseus를 이용하여, 상대적인 정량분석을 수행하였다. 단백질이 존재하지 않거나 또는 검출 한계 이하인 경우에도, 영점(null) 수치를 보상하였다. 정상 대조군과 구강건조증에 따른 환자군의 그룹 사이의 배수 차이를 계산하기 위하여 normal distribution에서 넓이 0.3 그리고 1.8만큼을 downshift하여 missing value를 채웠다. 통계적인 유의성은 정상 대조군과 구강건조증에 따른 환자군의 3개의 개별 시료로 ANOVA 검정으부터 얻은 LFQ 강도에 대하여 수행하여, p-값이 0.05 미만인 경우 통계적으로 유의한 것으로 간주하였다.Based on the label-free quantification intensity (LFQ intensity), the relative abundance of proteins present in a total of six samples obtained by collecting three salivary gland tissue samples from two groups of the normal control group and the dry mouth group. was calculated. The intensity was extracted using MaxQunat1.5.8.3. Then, the LFQ intensity for each protein was analyzed for relative quantitative analysis using Perseus. Even when no protein was present or below the detection limit, null values were compensated. In order to calculate the fold difference between the normal control group and the group of patients with dry mouth, the area was downshifted by 0.3 and 1.8 from the normal distribution to fill in the missing values. Statistical significance was performed for the LFQ intensity obtained from the ANOVA test with three separate samples of the normal control group and the patient group with dry mouth, and a p-value of less than 0.05 was considered statistically significant.

6. 구강건조증에 따른 환자군과 관련된 타액선 조직 단백질의 동정 및 차등 발현된 단백질의 확인6. Identification of salivary gland tissue proteins related to patient groups according to dry mouth and identification of differentially expressed proteins

LFQ 강도 분석으로부터, 정상 대조군과 구강건조증에 따른 그룹의 6개의 개별 시료에서 총 3119종의 단백질을 동정하였다. 동정된 단백질 중에서, p-값이 0.05 미만인 단백질이 20종을 확인하였다. 동정된 단백질과 p-값이 0.05 미만으로 통계적으로 유의한 단백질을 분석하여 개수를 벤다이어그램으로 나타낸 결과를 도 2에 나타내었다.From the LFQ intensity analysis, a total of 3119 proteins were identified in 6 individual samples of the normal control group and the dry mouth group. Among the identified proteins, 20 proteins with a p-value of less than 0.05 were identified. Fig. 2 shows the results of analyzing the identified proteins and proteins having a p-value of less than 0.05 and showing the number as a Venn diagram.

p-값이 0.05 미만으로 통계적으로 유의한 단백질 중에서 정상 대조군에 비해 발현 수준이 2배 이상 증가하거나 감소하는 단백질을 표 1에 나타내었다. Table 1 shows proteins whose p-value is less than 0.05 and whose expression level is increased or decreased by two or more times compared to the normal control, among proteins that are statistically significant.

UniProt Accession No.UniProt Accession No. 유전자 이름gene name
단백질 명칭

protein name
LFQ 강도
(정상 대조군)
LFQ strength
(normal control)
LFQ 강도
(구강건조증 환자군)
LFQ strength
(Dry mouth disease patient group)
단백질 발현 비율
(구강건조증 환자군/정상 대조군)
Protein expression rate
(dry mouth disease patient group/normal control group)
FDR 보정된 p-값FDR corrected p-value
Q9BTT0Q9BTT0 ANP32EANP32E Acidic leucine-rich nuclear phosphoprotein 32 family member EAcidic leucine-rich nuclear phosphoprotein 32 family member E 3.3.E+063.3.E+06 3.4.E+053.4.E+05 0.1060.106 0.0160.016 P53007P53007 SLC25A1SLC25A1 Tricarboxylate transport protein, mitochondrialTricarboxylate transport protein, mitochondrial 1.1.E+081.1.E+08 4.2.E+074.2.E+07 0.3960.396 0.0170.017 Q8IX12Q8IX12 CCAR1CCAR1 Cell division cycle and apoptosis regulator protein 1Cell division cycle and apoptosis regulator protein 1 4.2.E+064.2.E+06 7.6.E+057.6.E+05 0.1820.182 0.0180.018 O00264O00264 PGRMC1PGRMC1 Membrane-associated progesterone receptor component 1Membrane-associated progesterone receptor component 1 2.6.E+072.6.E+07 1.4.E+071.4.E+07 0.5350.535 0.0200.020 Q969Z3Q969Z3 MTARC2MTARC2 Mitochondrial amidoxime reducing component 2Mitochondrial amidoxime reducing component 2 1.8.E+071.8.E+07 9.7.E+069.7.E+06 0.5420.542 0.0320.032 Q92673Q92673 SORL1SORL1 Sortilin-related receptorSortilin-related receptors 9.6.E+069.6.E+06 1.7.E+061.7.E+06 0.1750.175 0.0330.033 P08648P08648 ITGA5ITGA5 Integrin alpha-5Integrin alpha-5 00 4.5.E+064.5.E+06 정상대조군에서 검출되지 않음Not detected in normal control group 0.0350.035 P04179P04179 SOD2SOD2 Superoxide dismutase [Mn], mitochondrialSuperoxide dismutase [Mn], mitochondrial 1.5.E+081.5.E+08 3.7.E+083.7.E+08 2.5142.514 0.0370.037 P84090P84090 ERHERH Enhancer of rudimentary homologEnhancer of rudimentary homolog 2.8.E+072.8.E+07 1.5.E+071.5.E+07 0.5470.547 0.0390.039 Q9Y623Q9Y623 MYH4MYH4 Myosin-4Myosin-4 2.4.E+072.4.E+07 1.3.E+081.3.E+08 5.4055.405 0.0460.046 P62701P62701 RPS4XRPS4X 40S ribosomal protein S4, X isoform40S ribosomal protein S4, X isoform 6.3.E+086.3.E+08 2.3.E+082.3.E+08 0.3710.371 0.0470.047 Q9NQG5Q9NQG5 RPRD1BRPRD1B Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1BRegulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B 5.6.E+065.6.E+06 00 0
(스코어3 이상에서 검출되지 않음)
0
(Not detected in score 3 or higher)
0.0470.047
Q9UM54Q9UM54 MYO6MYO6 Unconventional myosin-VIUnconventional myosin-VI 2.7.E+072.7.E+07 7.9.E+067.9.E+06 0.2950.295 0.0480.048 P19237P19237 TNNI1TNNI1 Troponin I, slow skeletal muscleTroponin I, slow skeletal muscle 2.4.E+072.4.E+07 1.1.E+081.1.E+08 4.4734.473 0.0480.048

표 1에 나타난 바와 같이, ITGA5, SOD2, MYH4 및 TNNI1는 구강건조증에서 유의하게 발현 수준이 증가하고, ANP32E, SLC25A1, CCAR1, PGRMC1, MTARC2, SORL1, ERH, RPS4X, RPRD1B 및 MYO6는 구강건조증에서 유의하게 발현 수준이 감소함을 확인하였다.As shown in Table 1, expression levels of ITGA5, SOD2, MYH4 and TNNI1 were significantly increased in dry mouth, and ANP32E, SLC25A1, CCAR1, PGRMC1, MTARC2, SORL1, ERH, RPS4X, RPRD1B and MYO6 were significantly increased in dry mouth. It was confirmed that the expression level was decreased.

Claims (13)

MYH4(Myosin-4) 유전자의 발현 수준, 또는 단백질 또는 이의 단편의 발현 수준을 측정하는 제제를 포함하는 구강건조증 진단용 조성물.A composition for diagnosing dry mouth, comprising an agent for measuring the expression level of the MYH4 (Myosin-4) gene, or the expression level of a protein or fragment thereof. 청구항 1에 있어서, 타액선 조직 시료에서 검출하기 위한 것인 조성물.The composition according to claim 1, for detection in a salivary gland tissue sample. 청구항 1에 있어서, 상기 발현 수준은 정상 대조군의 발현 수준에 비해 증가하는 것인 조성물.The composition of claim 1, wherein the expression level is increased compared to the expression level of the normal control. 청구항 1에 있어서, 상기 제제는
상기 단백질 또는 이의 단편에 특이적으로 결합하는 항체 또는 이의 항원 결합 단편, 또는 앱타머; 또는
상기 단백질 또는 이의 단편을 암호화하는 폴리뉴클레오티드와 동일하거나 또는 이에 상보적인 폴리뉴클레오티드를 포함하는 핵산인 것인 조성물.
The method according to claim 1, wherein the agent is
an antibody or antigen-binding fragment thereof, or an aptamer that specifically binds to the protein or fragment thereof; or
The composition is a nucleic acid comprising a polynucleotide identical to or complementary to the polynucleotide encoding the protein or fragment thereof.
청구항 4에 있어서, 상기 항체는 폴리클론 항체 또는 모노클론 항체인 것인 조성물.The composition of claim 4, wherein the antibody is a polyclonal antibody or a monoclonal antibody. 청구항 4에 있어서, 상기 핵산은 프라이머, 프로브, 또는 안티센스 올리고뉴클레오티드인 것인 조성물.The composition of claim 4, wherein the nucleic acid is a primer, a probe, or an antisense oligonucleotide. 청구항 1에 있어서, ANP32E(Acidic leucine-rich nuclear phosphoprotein 32 family member E), SLC25A1(Tricarboxylate transport protein, mitochondrial), CCAR1(Cell division cycle and apoptosis regulator protein 1), PGRMC1(Membrane-associated progesterone receptor component 1), MTARC2(Mitochondrial amidoxime reducing component 2), SORL1(Sortilin-related receptor), ITGA5(Integrin alpha-5), SOD2(Superoxide dismutase [Mn], mitochondrial), ERH(Enhancer of rudimentary homolog), RPS4X(40S ribosomal protein S4, X isoform), RPRD1B(Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B), MYO6(Unconventional myosin-VI), 및 TNNI1(Troponin I, slow skeletal muscle)로 이루어진 군으로부터 선택된 유전자의 발현 수준, 또는 단백질 또는 이의 단편의 발현 수준을 측정하는 제제를 더 포함하는 것인 조성물.The method according to claim 1, ANP32E (Acid leucine-rich nuclear phosphoprotein 32 family member E), SLC25A1 (Tricarboxylate transport protein, mitochondrial), CCAR1 (Cell division cycle and apoptosis regulator protein 1), PGRMC1 (Membrane-associated progesterone receptor component 1) , MTARC2 (Mitochondrial amidoxime reducing component 2), SORL1 (Sortilin-related receptor), ITGA5 (Integrin alpha-5), SOD2 (Superoxide dismutase [Mn], mitochondrial), ERH (Enhancer of rudimentary homolog), RPS4X (40S ribosomal protein) the expression level of a gene selected from the group consisting of S4, X isoform), Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B (RPRD1B), Unconventional myosin-VI (MYO6), and Troponin I, slow skeletal muscle (TNNI1), or The composition further comprising an agent for measuring the expression level of the protein or fragment thereof. MYH4 유전자의 발현 수준, 또는 단백질 또는 이의 단편의 발현 수준을 측정하는 제제를 포함하는 구강건조증 진단용 키트.A kit for diagnosing dry mouth disease, comprising an agent for measuring the expression level of the MYH4 gene, or the expression level of a protein or fragment thereof. 청구항 8에 있어서, ANP32E(Acidic leucine-rich nuclear phosphoprotein 32 family member E), SLC25A1(Tricarboxylate transport protein, mitochondrial), CCAR1(Cell division cycle and apoptosis regulator protein 1), PGRMC1(Membrane-associated progesterone receptor component 1), MTARC2(Mitochondrial amidoxime reducing component 2), SORL1(Sortilin-related receptor), ITGA5(Integrin alpha-5), SOD2(Superoxide dismutase [Mn], mitochondrial), ERH(Enhancer of rudimentary homolog), RPS4X(40S ribosomal protein S4, X isoform), RPRD1B(Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B), MYO6(Unconventional myosin-VI), 및 TNNI1(Troponin I, slow skeletal muscle)로 이루어진 군으로부터 선택된 유전자의 발현 수준, 또는 단백질 또는 이의 단편의 발현 수준을 측정하는 제제를 더 포함하는 것인 키트.The method according to claim 8, ANP32E (Acid leucine-rich nuclear phosphoprotein 32 family member E), SLC25A1 (Tricarboxylate transport protein, mitochondrial), CCAR1 (Cell division cycle and apoptosis regulator protein 1), PGRMC1 (Membrane-associated progesterone receptor component 1) , MTARC2 (Mitochondrial amidoxime reducing component 2), SORL1 (Sortilin-related receptor), ITGA5 (Integrin alpha-5), SOD2 (Superoxide dismutase [Mn], mitochondrial), ERH (Enhancer of rudimentary homolog), RPS4X (40S ribosomal protein) the expression level of a gene selected from the group consisting of S4, X isoform), Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B (RPRD1B), Unconventional myosin-VI (MYO6), and Troponin I, slow skeletal muscle (TNNI1), or The kit further comprising an agent for measuring the expression level of the protein or fragment thereof. 구강건조증이 의심되는 개체로부터 분리된 타액선 조직 시료에서 MYH4 유전자의 발현 수준, 또는 단백질 또는 이의 단편의 발현 수준을 측정하는 단계;
상기 측정된 발현 수준을 정상 대조군의 발현 수준과 비교하는 단계; 및
상기 발현 수준이 정상 대조군의 발현 수준과 비교하여 증가한 경우, 구강건조증으로 결정하는 단계를 포함하는,
구강건조증의 진단에 필요한 정보를 제공하기 위하여 바이오마커를 검출하는 방법.
measuring the expression level of the MYH4 gene or the expression level of a protein or fragment thereof in a salivary gland tissue sample isolated from a subject suspected of dry mouth;
comparing the measured expression level with the expression level of a normal control; and
When the expression level is increased compared to the expression level of the normal control, comprising the step of determining dry mouth,
A method of detecting a biomarker to provide information necessary for the diagnosis of dry mouth.
청구항 10에 있어서, 상기 측정하는 단계는 상기 타액선 조직 시료와, 상기 단백질 또는 이의 단편에 특이적으로 결합하는 항체 또는 이의 항원 결합 단편, 또는 앱타머를 인큐베이션시키거나, 또는 상기 유전자를 코딩하는 폴리뉴클레오티드와 동일하거나 또는 이에 상보적인 폴리뉴클레오티드를 인큐베이션시키는 단계를 포함하는 것인 방법.The method according to claim 10, wherein the measuring comprises incubating the salivary gland tissue sample with an antibody or antigen-binding fragment thereof, or an aptamer that specifically binds to the protein or fragment thereof, or a polynucleotide encoding the gene A method comprising incubating a polynucleotide identical to or complementary thereto. 청구항 10에 있어서, 상기 측정하는 단계는 전기영동, 면역블로팅, 효소 결합 면역흡착 분석법(Enzyme-Linked Immunosorbent Assay: ELISA), 중합효소 연쇄 반응, 노던 블로팅(Northern blotting), 폴리머라제 증폭 반응(polymerase chain reaction: PCR), 단백질 칩, 면역침강, 마이크로어레이, 전자현미경법(electron microscopy), 또는 이들의 조합으로 수행되는 것인 방법.The method according to claim 10, wherein the measuring step is electrophoresis, immunoblotting, enzyme-linked immunosorbent assay (ELISA), polymerase chain reaction, Northern blotting, polymerase amplification reaction ( polymerase chain reaction: PCR), protein chip, immunoprecipitation, microarray, electron microscopy, or a method that is performed by a combination thereof. 청구항 10에 있어서, ANP32E(Acidic leucine-rich nuclear phosphoprotein 32 family member E), SLC25A1(Tricarboxylate transport protein, mitochondrial), CCAR1(Cell division cycle and apoptosis regulator protein 1), PGRMC1(Membrane-associated progesterone receptor component 1), MTARC2(Mitochondrial amidoxime reducing component 2), SORL1(Sortilin-related receptor), ITGA5(Integrin alpha-5), SOD2(Superoxide dismutase [Mn], mitochondrial), ERH(Enhancer of rudimentary homolog), RPS4X(40S ribosomal protein S4, X isoform), RPRD1B(Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B), MYO6(Unconventional myosin-VI), 및 TNNI1(Troponin I, slow skeletal muscle)로 이루어진 군으로부터 선택된 유전자의 발현 수준, 또는 단백질 또는 이의 단편의 발현 수준을 측정하는 단계를 더 포함하는 것인 방법.
The method according to claim 10, ANP32E (Acid leucine-rich nuclear phosphoprotein 32 family member E), SLC25A1 (Tricarboxylate transport protein, mitochondrial), CCAR1 (Cell division cycle and apoptosis regulator protein 1), PGRMC1 (Membrane-associated progesterone receptor component 1) , MTARC2 (Mitochondrial amidoxime reducing component 2), SORL1 (Sortilin-related receptor), ITGA5 (Integrin alpha-5), SOD2 (Superoxide dismutase [Mn], mitochondrial), ERH (Enhancer of rudimentary homolog), RPS4X (40S ribosomal protein) the expression level of a gene selected from the group consisting of S4, X isoform), Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B (RPRD1B), Unconventional myosin-VI (MYO6), and Troponin I, slow skeletal muscle (TNNI1), or The method further comprising the step of measuring the expression level of the protein or fragment thereof.
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