KR102348291B1 - Method for predicting the treatment response of a cancer patient - Google Patents

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Abstract

본 발명은 암 환자의 치료 반응성을 예측하는 방법에 관한 것으로, 보다 상세하게는 암 환자에 있어서 치료에 따른 반응 효율과 환자의 치료 후 예후를 예측함으로써, 환자 별 적절한 치료 방법을 선택할 수 있는 방법에 관한 것이다.The present invention relates to a method for predicting the treatment responsiveness of a cancer patient, and more particularly, to a method for selecting an appropriate treatment method for each patient by predicting the response efficiency according to treatment and the prognosis of the patient after treatment in cancer patients. it's about

Description

암 환자의 치료 반응성을 예측하는 방법{Method for predicting the treatment response of a cancer patient}Method for predicting the treatment response of a cancer patient

본 발명은 암 환자의 치료 반응성을 예측하는 방법에 관한 것으로, 보다 상세하게는 암 환자에 있어서 치료에 따른 반응 효율과 치료 후 예후를 예측함으로써, 환자 별 적절한 치료 방법을 선택할 수 있는 방법에 관한 것이다. The present invention relates to a method for predicting the treatment responsiveness of a cancer patient, and more particularly, to a method for selecting an appropriate treatment method for each patient by predicting the response efficiency according to treatment and the prognosis after treatment in cancer patients .

인간의 몸을 구성하고 있는 가장 작은 단위인 세포는 정상적일 때 세포 내 조절 기능에 의해 분열하며 성장하고 죽어 없어지기도 하면서 세포 수 균형을 유지한다. 어떤 원인으로 세포가 손상을 받는 경우, 치료를 받아 회복하여 정상적인 세포로 역할을 하게 되지만, 회복이 안 된 경우는 스스로 죽게 된다. 그러나 여러 가지 이유로 인해 이러한 증식과 억제가 조절되지 않는 비정상적인 세포들이 과다하게 증식할 뿐만 아니라, 주위 조직 및 장기에 침입하여 종괴 형성 및 정상 조직의 파괴를 초래하는 상태를 암(cancer)이라 정의한다. 암은 이렇듯 억제가 안 되는 세포의 증식으로, 정상적인 세포와 장기의 구조와 기능을 파괴하기에 그 진단과 치료의 중요성은 매우 크다.Cells, the smallest unit constituting the human body, divide and grow, die and disappear due to intracellular regulatory functions when normal, maintaining cell number balance. If a cell is damaged for some reason, it recovers through treatment and functions as a normal cell, but if there is no recovery, it dies on its own. However, for various reasons, abnormal cells whose proliferation and inhibition are not controlled not only proliferate excessively, but also invade surrounding tissues and organs, resulting in mass formation and destruction of normal tissues, which is defined as cancer. Cancer is the proliferation of cells that cannot be suppressed, and it destroys the structure and function of normal cells and organs, so the diagnosis and treatment are very important.

한편, 위암(Gastric cancer)은 2000년 700,349명의 사망에서 두 번째 원인으로, 세계에서 가장 일반적으로 진단된 네 번째 암이다. 몇 가지 역학적 및 조직병리학적 특징들을 갖는 단일 이질적 질환으로 간주하고 있다. 위암 치료는 주로 환자를 수술만으로 또는 수술과 화학요법으로 치료하여야 하는지를 결정하는 TNM(tumor, node, metastasis) 병기 결정 같은 임상적 파라미터에 근거한다. 위암은 유방암 및 대장암 등과 달리 TNM 병기 시스템에 따라서 1기에서 4기까지 명확하게 차이가 난다. 즉, 1기의 경우에는 5년 생존율이 90% 이상이며, 4기의 경우에는 20% 이하로 큰 차이를 보인다. 그러므로 TNM 병기 시스템의 예후 예측력이 매우 뛰어남을 알 수 있다[참고문헌, 7th edition of the AJCC cancer staging Manual: stomach. AnnSurgOncol 2010;17:3077-3079]. 상기 병기 시스템에 기반을 두어 위암은 흔히 조기 위암(Early Gastric Cancer), 국소진행형(Locally Advanced Gastric Cancer), 국소 침윤형(Locally Advanced Invasive Gastric Cancer) 및 전이 위암(Metastatic Gastric Cancer) 등으로 나눌 수 있다.On the other hand, gastric cancer is the second most common cause of death in 700,349 deaths in 2000, and is the fourth most commonly diagnosed cancer in the world. It is considered a single heterogeneous disease with several epidemiological and histopathological features. Gastric cancer treatment is primarily based on clinical parameters such as tumor, node, metastasis (TNM) staging that determines whether a patient should be treated with surgery alone or with surgery and chemotherapy. Unlike breast cancer and colorectal cancer, gastric cancer clearly differs from stage 1 to stage 4 according to the TNM staging system. That is, in the case of stage 1, the 5-year survival rate is more than 90%, and in case of stage 4, it shows a big difference of 20% or less. Therefore, it can be seen that the prognostic predictive power of the TNM staging system is very good [Reference, 7th edition of the AJCC cancer staging Manual: stomach. AnnSurgOncol 2010;17:3077-3079]. Based on the staging system, gastric cancer is often divided into Early Gastric Cancer, Locally Advanced Gastric Cancer, Locally Advanced Invasive Gastric Cancer, and Metastatic Gastric Cancer. .

암의 치료법은 외과적 수술, 방사선 치료법, 항암 화학 요법으로 크게 나눌 수 있으며, 위암은 수술 실시가 가능하여 외과적 수술이 흔히 사용되고 있다. 하지만 외과적 수술을 받더라도, 암이 진행성인 경우 재발률이 매우 높다. 따라서, 재발을 예방하고, 위암 환자들의 예후를 개선하기 위해 외과적 수술 후 화학요법이나, 화학-방사선요법을 포함한 다학제적 치료가 도입되었다. 그러나 이들 치료 방법이 환자들에서 일반적인 임상 결과를 개선하기는 하나 종양의 임상병리학적 이질성과, 같은 병기에 있는 환자들의 다른 결과는 보조 화학요법의 임무를 예측하는데 한계가 있어 개별 환자들에 대한 최적 접근이 부족한 상태이다. Cancer treatment can be broadly divided into surgery, radiation therapy, and chemotherapy. For gastric cancer, surgery is possible, so surgery is commonly used. However, even after surgery, if the cancer is advanced, the recurrence rate is very high. Therefore, in order to prevent recurrence and improve the prognosis of gastric cancer patients, multidisciplinary treatment including chemotherapy or chemo-radiation after surgery has been introduced. However, although these treatment methods improve the general clinical outcome in patients, the clinicopathological heterogeneity of the tumor and the different outcomes of patients in the same stage have limitations in predicting the task of adjuvant chemotherapy. access is lacking.

최근의 진전에도 불구하고 발병적으로 별개의 종양 유형에 대해 특이적 치료 섭생을 표적화하고, 궁극적으로 성과를 최대화시키기 위하여 종양 치료를 개인화하기 위한 암 치료의 도전과제들이 남아있다. 따라서, 각종 치료 선택사항들에 대한 환자 반응에 관한 예측적 정보를 동시에 제공하는 시험을 필요로 하고 있다.Despite recent advances, challenges in cancer therapy remain to target specific treatment regimens to pathologically distinct tumor types and ultimately to personalize tumor therapy to maximize outcome. Therefore, there is a need for trials that simultaneously provide predictive information on patient response to various treatment options.

본 발명의 일 목적은 암 환자의 치료 반응성을 예측하는 방법에 관한 것이다. One object of the present invention relates to a method for predicting the treatment responsiveness of a cancer patient.

본 발명의 다른 목적은 암 환자의 치료 반응성 예측용 조성물에 관한 것이다. Another object of the present invention relates to a composition for predicting therapeutic responsiveness in cancer patients.

본 발명의 또 다른 목적은 암 환자의 치료 반응성 예측용 조성물을 포함하는 키트에 관한 것이다. Another object of the present invention relates to a kit comprising a composition for predicting therapeutic responsiveness of cancer patients.

그러나 본 발명이 이루고자 하는 기술적 과제는 이상에서 언급한 과제에 제한되지 않으며, 언급되지 않은 또 다른 과제들은 아래의 기재로부터 당업계에서 통상의 지식을 가진 자에게 명확하게 이해될 수 있을 것이다.However, the technical problem to be achieved by the present invention is not limited to the above-mentioned problems, and other problems not mentioned will be clearly understood by those of ordinary skill in the art from the following description.

본 발명의 발명자들은, 암 환자 중에서도 특히 위암 환자에 있어서, 미세부수체 불안정성(microsatellites instability, MSI)이 높은 경우, 예후는 좋으나 표준 항암 치료법에 대한 반응성이 낮을 것으로 예측되어 외과적 절제술을 수행하였음에도 불구하고 일부 재발하는 환자에게서 특정 바이오마커가 특징적으로 낮게 발현되는 것을 발견하여 본 발명에 이르게 되었다. The inventors of the present invention found that, among cancer patients, especially gastric cancer patients, when microsatellites instability (MSI) is high, the prognosis is good, but the reactivity to standard anticancer therapy is predicted to be low. and found that a specific biomarker was characteristically low in some recurrent patients, leading to the present invention.

본 발명의 일 구현 예에 따르면, (a) 암 환자로부터 분리한 시료에서 미세부수체 불안정성(microsatellite instability, MSI)을 측정하는 단계; 및 (b) 상기 미세부수체 불안정성이 높은 것으로 평가되는 경우의 암 환자로부터 분리한 시료에서 GZMA(granzyme A), GZMB(granzyme B), CXCL9(C-X-C motif chemokine ligand 9), CXCL10(C-X-C motif chemokine ligand 10) 및 IL32(interleukin 32)로 이루어진 군에서 선택된 1종 이상의 단백질 또는 이를 코딩하는 유전자의 mRNA의 발현 수준을 측정하는 단계를 포함하는, 암 환자의 치료 반응성을 예측하는 방법에 관한 것이다. According to an embodiment of the present invention, (a) measuring microsatellite instability (MSI) in a sample isolated from a cancer patient; and (b) GZMA (granzyme A), GZMB (granzyme B), CXCL9 (CXC motif chemokine ligand 9), and CXCL10 (CXC motif chemokine ligand) from samples isolated from cancer patients when the microsatellite instability is evaluated to be high. 10) and IL32 (interleukin 32), it relates to a method for predicting treatment responsiveness of a cancer patient, comprising measuring the mRNA expression level of one or more proteins selected from the group consisting of or a gene encoding the same.

본 발명에서 상기 치료 반응성 평가의 대상이 되는 암은, 그 종류를 특별히 제한하지 않으며, 예를 들면, 위암, 뇌암, 폐암, 비소세포성폐암, 결장암, 골암, 췌장암, 피부암, 두부 또는 경부 암, 피부 또는 안구내 흑색종, 자궁암, 난소암, 직장암, 항문부근암, 결장암, 유방암, 나팔관암종, 자궁내막암종, 자궁경부암종, 질암종, 음문암종, 호지킨병(Hodgkin's disease), 식도암, 소장암, 내분비선암, 갑상선암, 부갑상선암, 부신암, 연조직 육종, 요도암, 음경암, 전립선암, 만성 또는 급성 백혈병, 림프구 림프종, 방광암, 신장 또는 수뇨관 암, 신장세포 암종, 신장골반 암종, 중추신경계(CNS; central nervous system) 종양, 1차 CNS 림프종, 척수 종양, 및 뇌하수체 선종으로 이루어진 군에서 선택될 수 있고, 바람직하게는 위암일 수 있다.In the present invention, the type of cancer to be evaluated for treatment responsiveness is not particularly limited, and for example, gastric cancer, brain cancer, lung cancer, non-small cell lung cancer, colon cancer, bone cancer, pancreatic cancer, skin cancer, head or neck cancer, Skin or intraocular melanoma, uterine cancer, ovarian cancer, rectal cancer, perianal cancer, colon cancer, breast cancer, fallopian tube carcinoma, endometrial carcinoma, cervical carcinoma, vaginal carcinoma, vulvar carcinoma, Hodgkin's disease, esophageal cancer, small intestine Cancer, endocrine adenocarcinoma, thyroid cancer, parathyroid cancer, adrenal cancer, soft tissue sarcoma, urethral cancer, penile cancer, prostate cancer, chronic or acute leukemia, lymphocytic lymphoma, bladder cancer, kidney or ureter cancer, renal cell carcinoma, renal pelvic carcinoma, central nervous system (CNS; central nervous system) tumor, it may be selected from the group consisting of primary CNS lymphoma, spinal cord tumor, and pituitary adenoma, preferably gastric cancer.

본 발명에서 상기 "미세부수체 (Microsatellites)"란 진핵세포 (eukaryotes) 유전자 전역에 걸쳐 분포하는 모노-, 디-, 트리- 및 테트라뉴클레오타이드 형태의 짧은 반복 염기서열을 의미한다. 일반적으로 이러한 반복 서열은 염색체 내에서 10 내지 40번 정도 단순반복 (tandem repeat)된 형태로 존재한다. 또한, 본 발명에서 상기 "미세부수체 불안정성 (Microsatellites instability; MSI)" 이란 상기 미세부수체 유전자에 짧은 염기 결손 또는 삽입에 의한 돌연변이가 일어난 것으로, 주로 DNA 부정합 수선 시스템의 결함에 의해 유발되는 미세부수체의 유전적 불안정성을 의미한다. "유전적 불안정성(genomic instability)" 이란 DNA의 손상, 변화 및 변이가 축적되어 정상 세포가 종양 세포로 형질변환 되는 것을 의미한다. 미국 국립 암 연구소에서 권장하는 다섯 개의 미세부수체 표지자(microsatellite marker)로 BAT26, D5S346, BAT25, D17S250 및 D2S123를 제시하였는데, 환자의 종양에서 상기 표지자들이 정상조직에 비하여 불안전성이 있을 때 그 표지자가 불안정하다고 정의하며, 이 표지자들 중 두 개 이상의 표지자에서 불안정성을 보이는 경우, "미세부수체 불안정성이 높은(high degree of microsatellite instability, MSI-H)" 경우로 정의하고, 한 개의 표지자에서만 불안정성을 보이면 "미세부수체 불안정성이 낮은(low degree of microsatellite instability, MSI-L)" 경우로 정의하며, 다섯 개의 표지자 모두에서 불안정성을 보이지 않으면 "미세부수체가 안정한(microsatellite stable, MSS)" 경우로 정의한다. 다만, 경우에 따라서 짝지어진 종양 및 정상 조직을 얻을 수 없는 경우, 종양 조직에서 다섯 개의 모노뉴클레오타이드 마커인 BAT25, BAT26, NR21, NR22 (혹은 NR27) 및 NR24를 미세부수체 표지자로 사용할 수 있는데, 이 경우 불안정성을 보이는 표지자가 세 개 이상인 경우 미세부수체 불안정성이 높은 MSI-H로 정의하고, 한 개 또는 두 개의 표지자에서 불안정성이 있는 경우 미세부수체 불안정성이 낮은 MSI-L로 정의하며, 다섯 개의 표지자 모두에서 불안정성이 없는 경우 미세부수체가 안정한 MSS로 정의하였다.In the present invention, the term "microsatellites" refers to short repeating nucleotide sequences in the form of mono-, di-, tri- and tetranucleotides distributed throughout the gene of eukaryotes. In general, such a repeating sequence exists in the form of 10 to 40 simple repetitions (tandem repeat) in the chromosome. Also, in the present invention, the term "Microsatellites instability (MSI)" refers to mutations caused by short base deletions or insertions in the microsatellite gene, and is mainly caused by defects in the DNA mismatch repair system. refers to the genetic instability of the body. "Genomic instability" refers to the transformation of normal cells into tumor cells due to the accumulation of DNA damage, changes and mutations. BAT26, D5S346, BAT25, D17S250, and D2S123 were presented as five microsatellite markers recommended by the National Cancer Institute of the United States. If two or more of these markers show instability, it is defined as "high degree of microsatellite instability (MSI-H)", and if only one marker shows instability, " It is defined as a case of low degree of microsatellite instability (MSI-L), and if it does not show instability in all five markers, it is defined as a case of “microsatellite stable (MSS)”. However, in some cases, when mated tumor and normal tissue cannot be obtained, five mononucleotide markers, BAT25, BAT26, NR21, NR22 (or NR27) and NR24, can be used as microsatellite markers in tumor tissue. If there are three or more markers showing instability, it is defined as MSI-H with high microsatellite instability, and when there is instability in one or two markers, it is defined as MSI-L with low microsatellite instability, and five markers. If there was no instability in all cases, the microsatellite was defined as a stable MSS.

본 발명에서 상기 미세부수체 불안정성의 분석 방법을 특별히 제한하지 않으나, 예를 들면, 상기 미국 국립 암연구소에서 권장한 다섯 개의 미세부수체 표지자(microsatellite marker; BAT26, D5S346, BAT25, D17S250, D2S123) 혹은 BAT25, BAT26, NR21, NR22(또는 NR27) 및 NR24의 미세부수체 표지자를 형광 표지 시발체를 이용한 중합효소 연쇄반응을 통하여 측정한 뒤, 초기변성 과정은 95℃에서 15분간 시행하고, 94℃에서 1분, 58℃에서 1분, 72℃에서 1분으로 총 30주기 시행한 후, 최종 증폭 과정을 72℃에서 5분간 시행할 수 있으나, 이에 제한되는 것은 아니며, 측정 온도 및 시간은 적절히 조절할 수 있다. 이후, 반응이 끝난 시료에 GeneScan 500 ROX size standard (Applied Biosystems, Foster, CA, USA)와 Hi-Di Formamide (Applied Biosystems, Foster, CA, USA) 10 L을 섞은 후 95℃에서 5분간 반응시키고 얼음에 넣어 차갑게 한 뒤 위 시료를 3100 Genetic Analyzer (Applied Biosystems, Foster, CA, USA)에서 fragment analysis를 시행하며 수행될 수 있으나, 이에 제한되는 것은 아니다. 단, 상기 실험 시 사용되는 프라이머의 서열은 특별히 제한하지 않으며, 당해 기술분야에서 일반적으로 사용되는 상기 미세부수체에 대한 프라이머를 사용할 수 있으며, 비제한적 예시로 original Bethesda panel을 사용할 수 있다. In the present invention, the method for analyzing microsatellite instability is not particularly limited, but, for example, the five microsatellite markers (BAT26, D5S346, BAT25, D17S250, D2S123) or After measuring the microsatellite markers of BAT25, BAT26, NR21, NR22 (or NR27) and NR24 through a polymerase chain reaction using a fluorescently labeled primer, the initial denaturation process was carried out at 95°C for 15 minutes, and at 94°C for 1 minute. Min, after a total of 30 cycles of 1 minute at 58°C and 1 minute at 72°C, the final amplification process may be performed at 72°C for 5 minutes, but is not limited thereto, and the measurement temperature and time can be appropriately adjusted . After that, 10 L of GeneScan 500 ROX size standard (Applied Biosystems, Foster, CA, USA) and Hi-Di Formamide (Applied Biosystems, Foster, CA, USA) were mixed with the reaction sample, and reacted at 95°C for 5 minutes, then ice After cooling, the sample above may be subjected to fragment analysis in 3100 Genetic Analyzer (Applied Biosystems, Foster, CA, USA), but is not limited thereto. However, the sequence of the primer used in the experiment is not particularly limited, and the primer for the microsatellite generally used in the art may be used, and the original Bethesda panel may be used as a non-limiting example.

본 발명에서 상기 “시료”란 암 환자 개체로부터 분리한 전혈, 혈장, 혈액, 타액, 뇨, 객담, 림프액 및 세포간액과 같은 시료 등을 포함하나, 이에 제한되지 않는다.In the present invention, the "sample" includes, but is not limited to, samples such as whole blood, plasma, blood, saliva, urine, sputum, lymph and intercellular fluid isolated from a cancer patient individual.

본 발명에서는 1차적으로, 상기와 같이 암 환자, 바람직하게는 위암 환자로부터 채취한 시료에 대하여 미세부수체 불안정성을 분석한 결과, 상기 미세부수체 불안정성이 높은 것으로 평가되는 경우, 외과적 절제 치료법, 화학적 치료법 및 방사선 치료법 중 적어도 하나의 치료법, 보다 바람직하게는 외과적 절제 치료법에 대하여 반응성이 높아, 치료 후 재발 가능성이 낮고 예후가 좋을 것으로 예측할 수 있다. In the present invention, as a result of analyzing microsatellite instability on samples collected from cancer patients, preferably gastric cancer patients, as described above, when the microsatellite instability is evaluated to be high, surgical excision therapy; At least one of chemotherapy and radiation therapy, and more preferably, it is highly responsive to surgical excision therapy, so it can be predicted that the likelihood of recurrence after treatment is low and the prognosis is good.

다만, 본 발명에서 상기와 같이 미세부수체 불안정성을 분석한 결과, 상기 미세부수체 불안정성이 높은 것으로 평가되었으나, 하기의 바이오마커의 발현 수준이 낮은 경우 표준 항암 치료법에 대한 반응성이 낮고 이후 재발할 가능성이 매우 높을 것으로 예측할 수 있다. However, in the present invention, as a result of analyzing microsatellite instability as described above, the microsatellite instability was evaluated to be high, but when the expression level of the following biomarkers is low, the reactivity to standard anticancer therapy is low and the possibility of recurrence thereafter This can be expected to be very high.

구체적으로, 본 발명에서는 상기와 같이 미세부수체 불안정성 분석 결과, 미세부수체 불안정성이 높은 것으로 평가된 암 환자로부터 분리한 시료에서 GZMA, GZMB, CXCL9, CXCL10 및 IL32으로 이루어진 군에서 선택된 1종 이상의 단백질 또는 이를 코딩하는 유전자의 mRNA의 발현 수준을 측정할 수 있다. Specifically, in the present invention, one or more proteins selected from the group consisting of GZMA, GZMB, CXCL9, CXCL10 and IL32 from a sample isolated from a cancer patient evaluated as having high microsatellite instability as a result of the microsatellite instability analysis as described above. Alternatively, the mRNA expression level of a gene encoding it may be measured.

본 발명에서, 상기 바이오마커인 GZMA, GZMB, CXCL9, CXCL10 및 IL32의 발현 수준 측정 또는 비교 분석 방법으로는 단백질 칩 분석, 면역측정법, 리간드 바인딩 어세이, MALDI-TOF(Matrix Assisted Laser Desorption/Ionization Time of Flight Mass Spectrometry) 분석, SELDI-TOF(Sulface Enhanced Laser Desorption/Ionization Time of Flight Mass Spectrometry) 분석, 방사선 면역분석, 방사 면역 확산법, 오우크테로니 면역 확산법, 로케트 면역전기영동, 조직면역 염색, 보체 고정 분석법, 2차원 전기영동 분석, 액상 크로마토그래피-질량분석(liquid chromatography-Mass Spectrometry, LC-MS), LC-MS/MS(liquid chromatography-Mass Spectrometry/ Mass Spectrometry), 웨스턴 블랏팅 및 ELISA(enzyme linked immunosorbentassay) 등이 있으나 이에 제한되는 것은 아니다.In the present invention, the biomarkers GZMA, GZMB, CXCL9, CXCL10 and IL32 expression level measurement or comparative analysis methods include protein chip analysis, immunoassay, ligand binding assay, MALDI-TOF (Matrix Assisted Laser Desorption/Ionization Time) of Flight Mass Spectrometry) analysis, SELDI-TOF (Sulface Enhanced Laser Desorption/Ionization Time of Flight Mass Spectrometry) analysis, radioimmunoassay, radioimmunodiffusion method, octeroni immunodiffusion method, rocket immunoelectrophoresis, tissue immunostaining, complement Stationary methods, two-dimensional electrophoresis analysis, liquid chromatography-Mass Spectrometry (LC-MS), liquid chromatography-Mass Spectrometry/Mass Spectrometry (LC-MS/MS), Western blotting and ELISA (enzyme linked immunosorbent assay), but is not limited thereto.

본 발명에서, 상기 바이오마커인 GZMA, GZMB, CXCL9, CXCL10 및 IL32의 발현 수준은 상기 GZMA, GZMB, CXCL9, CXCL10 또는 IL32에 특이적으로 결합하는 항체, 올리고펩타이드, 리간드, PNA(peptide nucleic acid) 및 앱타머(aptamer)로 이루어진 군에서 선택된 1종 이상을 사용하여 측정할 수 있다. 본 발명에서 상기 GZMA, GZMB, CXCL9, CXCL10 및 IL32의 서열 정보는 각각 서열번호 1 내지 5와 같으므로, 당업자라면 이를 바탕으로 상기 단백질에 특이적인 항체, 올리고펩타이드, 리간드, PNA 또는 앱타머를 용이하게 설계할 수 있을 것이다.In the present invention, the expression level of the biomarkers GZMA, GZMB, CXCL9, CXCL10 and IL32 is an antibody, oligopeptide, ligand, PNA (peptide nucleic acid) that specifically binds to the GZMA, GZMB, CXCL9, CXCL10 or IL32. And it can be measured using one or more selected from the group consisting of aptamer (aptamer). In the present invention, the sequence information of GZMA, GZMB, CXCL9, CXCL10 and IL32 is the same as SEQ ID NOs: 1 to 5, respectively, so those skilled in the art can easily find antibodies, oligopeptides, ligands, PNAs or aptamers specific to the protein based on this. will be able to design

본 발명에 상기 "항체"는 항원과 특이적으로 결합하여 항원-항체 반응을 일으키는 물질을 가리킨다. 본 발명의 목적상, 항체는 GZMA, GZMB, CXCL9, CXCL10 또는 IL32에 대해 특이적으로 결합하는 항체를 의미한다. 본 발명의 항체는 다클론 항체, 단클론 항체 및 재조합 항체를 모두 포함한다. 상기 항체는 당업계에 널리 공지된 기술을 이용하여 용이하게 제조될 수 있다. 예를 들어, 다클론 항체는 상기 GZMA, GZMB, CXCL9, CXCL10 또는 IL32의 항원을 동물에 주사하고 동물로부터 채혈하여 항체를 포함하는 혈청을 수득하는 과정을 포함하는 당업계에 널리 공지된 방법에 의해 생산될 수 있다. 이러한 다클론 항체는 염소, 토끼, 양, 원숭이, 말, 돼지, 소, 개 등의 임의의 동물로부터 제조될 수 있다. 또한, 단클론 항체는 당업계에 널리 공지된 하이브리도마 방법(hybridoma method; Kohler 및 Milstein (1976) European Journal of Immunology 6:511-519 참조), 또는 파지 항체 라이브러리 기술(Clackson et al, Nature, 352:624-628, 1991; Marks et al, J. Mol. Biol., 222:58, 1-597, 1991 참조)을 이용하여 제조될 수 있다. 상기 방법으로 제조된 항체는 겔 전기영동, 투석, 염 침전, 이온교환 크로마토그래피, 친화성 크로마토그래피 등의 방법을 이용하여 분리, 정제될 수 있다. 또한, 본 발명의 항체는 2개의 전장의 경쇄 및 2개의 전장의 중쇄를 갖는 완전한 형태뿐만 아니라, 항체 분자의 기능적인 단편을 포함한다. 항체 분자의 기능적인 단편이란, 적어도 항원 결합 기능을 보유하고 있는 단편을 의미하며, Fab, F(ab'), F(ab')2 및 Fv 등이 있다.In the present invention, the "antibody" refers to a substance that specifically binds to an antigen and causes an antigen-antibody reaction. For the purposes of the present invention, an antibody refers to an antibody that specifically binds to GZMA, GZMB, CXCL9, CXCL10 or IL32. Antibodies of the present invention include polyclonal antibodies, monoclonal antibodies and recombinant antibodies. The antibody can be readily prepared using techniques well known in the art. For example, the polyclonal antibody is prepared by injecting the antigen of GZMA, GZMB, CXCL9, CXCL10 or IL32 into an animal and collecting blood from the animal to obtain a serum containing the antibody by a method well known in the art. can be produced Such polyclonal antibodies can be prepared from any animal such as goat, rabbit, sheep, monkey, horse, pig, cow, dog, and the like. In addition, monoclonal antibodies can be prepared using the hybridoma method well known in the art (see Kohler and Milstein (1976) European Journal of Immunology 6:511-519), or the phage antibody library technology (Clackson et al, Nature, 352). :624-628, 1991; Marks et al, J. Mol. Biol., 222:58, 1-597, 1991). The antibody prepared by the above method may be separated and purified using methods such as gel electrophoresis, dialysis, salt precipitation, ion exchange chromatography, and affinity chromatography. In addition, the antibodies of the present invention include functional fragments of antibody molecules as well as complete forms having two full-length light chains and two full-length heavy chains. A functional fragment of an antibody molecule means a fragment having at least an antigen-binding function, and includes Fab, F(ab'), F(ab')2 and Fv.

본 발명에 상기 "PNA(Peptide Nucleic Acid)"는 인공적으로 합성된, DNA 또는 RNA와 비슷한 중합체를 가리키며, 1991년 덴마크 코펜하겐 대학교의 Nielsen, Egholm, Berg와 Buchardt 교수에 의해 처음으로 소개되었다. DNA는 인산-리보스당 골격을 갖는데 반해, PNA는 펩타이드 결합에 의해 연결된 반복된 N-(2-아미노에틸)-글리신 골격을 가지며, 이로 인해 DNA 또는 RNA에 대한 결합력과 안정성이 크게 증가되어 분자 생물학, 진단 분석 및 안티센스 치료법에 사용되고 있다. PNA는 문헌[Nielsen PE, Egholm M, Berg RH, Buchardt O (December 1991). "Sequence-selective recognition of DNA by strand displacement with a thymine-substituted polyamide". Science 254 (5037): 1497-1500]에 상세하게 개시되어 있다.In the present invention, the "PNA (Peptide Nucleic Acid)" refers to an artificially synthesized polymer similar to DNA or RNA, and was first introduced by Professors Nielsen, Egholm, Berg and Buchardt of the University of Copenhagen, Denmark in 1991. Whereas DNA has a phosphate-ribose sugar backbone, PNA has a repeated N-(2-aminoethyl)-glycine backbone linked by peptide bonds, which greatly increases binding strength and stability to DNA or RNA, resulting in molecular biology , diagnostic assays and antisense therapy. PNA is described in Nielsen PE, Egholm M, Berg RH, Buchardt O (December 1991). "Sequence-selective recognition of DNA by strand displacement with a thymine-substituted polyamide". Science 254 (5037): 1497-1500.

본 발명에서 상기 "앱타머"는 올리고핵산 또는 펩타이드 분자이며, 앱타머의 일반적인 내용은 문헌[Bock LC et al., Nature 355(6360):5646(1992); Hoppe-Seyler F, Butz K "Peptide aptamers: powerful new tools for molecular medicine". J Mol Med. 78(8):42630(2000); Cohen BA, Colas P, Brent R. "An artificial cell-cycle inhibitor isolated from a combinatorial library". Proc Natl Acad Sci USA. 95(24): 142727(1998)]에 상세하게 개시되어 있다.In the present invention, the "aptamer" is an oligonucleic acid or peptide molecule, and the general information of the aptamer is described in Bock LC et al., Nature 355(6360):5646(1992); Hoppe-Seyler F, Butz K "Peptide aptamers: powerful new tools for molecular medicine". J Mol Med. 78(8):42630(2000); Cohen BA, Colas P, Brent R. "An artificial cell-cycle inhibitor isolated from a combinatorial library". Proc Natl Acad Sci USA. 95(24): 142727 (1998).

또한, 본 발명에서 상기 GZMA, GZMB, CXCL9, CXCL10 또는 IL32를 코딩하는 유전자의 mRNA의 발현 수준을 측정하는 방법으로는 역전사 중합효소반응(RT-PCR), 경쟁적 역전사 중합효소반응(Competitive RT-PCR), 실시간 역전사 중합효소반응(Real-time RT-PCR), RNase 보호 분석법(RPA; RNase protection assay), 노던 블랏팅(Northern blotting), DNA 칩 등이 있으나 이에 제한되는 것은 아니다. In the present invention, as a method for measuring the mRNA expression level of the gene encoding GZMA, GZMB, CXCL9, CXCL10 or IL32, reverse transcription polymerase reaction (RT-PCR), competitive reverse transcription polymerase reaction (Competitive RT-PCR) ), real-time reverse transcription polymerase reaction (Real-time RT-PCR), RNase protection assay (RPA), Northern blotting, DNA chip, etc., but are not limited thereto.

본 발명에서, 상기 바이오마커인 GZMA, GZMB, CXCL9, CXCL10 및 IL32를 코딩하는 유전자의 mRNA의 발현 수준은 상기 GZMA, GZMB, CXCL9, CXCL10 및 IL32로 이루어진 군에서 선택된 1종 이상의 단백질을 코딩하는 유전자의 mRNA에 특이적으로 결합하는 프라이머, 프로브 및 안티센스 뉴클레오티드로 이루어진 군에서 선택된 1종 이상을 사용하여 측정할 수 있다. 본 발명에서 상기 GZMA, GZMB, CXCL9, CXCL10 및 IL32의 서열 정보는 각각 서열번호 1 내지 5와 같으므로, 당업자라면 이를 바탕으로 상기 단백질을 암호화하는 유전자에 특이적인 프라이머, 프로브 또는 안티센스 뉴클레오티드를 용이하게 설계할 수 있을 것이다. In the present invention, the mRNA expression level of the genes encoding the biomarkers GZMA, GZMB, CXCL9, CXCL10 and IL32 is a gene encoding one or more proteins selected from the group consisting of GZMA, GZMB, CXCL9, CXCL10 and IL32. It can be measured using one or more selected from the group consisting of primers, probes, and antisense nucleotides that specifically bind to mRNA. In the present invention, the sequence information of GZMA, GZMB, CXCL9, CXCL10 and IL32 is the same as SEQ ID NOs: 1 to 5, respectively, so those skilled in the art can easily prepare primers, probes or antisense nucleotides specific for the gene encoding the protein based on this. you will be able to design

본 발명에서 상기 "프라이머"는 표적 유전자 서열을 인지하는 단편으로서, 정방향 및 역방향의 프라이머 쌍을 포함하나, 바람직하게는, 특이성 및 민감성을 가지는 분석 결과를 제공하는 프라이머 쌍이다. 프라이머의 핵산 서열이 시료 내 존재하는 비-표적 서열과 불일치하는 서열이어서, 상보적인 프라이머 결합 부위를 함유하는 표적 유전자 서열만 증폭하고 비특이적 증폭을 유발하지 않는 프라이머일 때, 높은 특이성이 부여될 수 있다.In the present invention, the "primer" is a fragment recognizing a target gene sequence, including a pair of forward and reverse primers, but preferably, a primer pair that provides analysis results having specificity and sensitivity. High specificity can be conferred when the primer's nucleic acid sequence is a sequence that is inconsistent with a non-target sequence present in the sample, thus amplifying only the target gene sequence containing the complementary primer binding site and not causing non-specific amplification. .

본 발명에서 상기 "프로브"란 시료 내의 검출하고자 하는 표적 물질과 특이적으로 결합할 수 있는 물질을 의미하며, 상기 결합을 통하여 특이적으로 시료 내의 표적 물질의 존재를 확인할 수 있는 물질을 의미한다. 프로브의 종류는 당업계에서 통상적으로 사용되는 물질로서 제한은 없으나, 바람직하게는 PNA(peptide nucleic acid), LNA(locked nucleic acid), 펩타이드, 폴리펩타이드, 단백질, RNA 또는 DNA일 수 있으며, 가장 바람직하게는 PNA일 수 있다. 보다 구체적으로, 상기 프로브는 바이오 물질로서 생물에서 유래되거나 이와 유사한 것 또는 생체 외에서 제조된 것을 포함하는 것으로, 예를 들어, 효소, 단백질, 항체, 미생물, 동식물 세포 및 기관, 신경세포, DNA, 및 RNA일 수 있으며, DNA는 cDNA, 게놈 DNA, 올리고뉴클레오타이드를 포함하며, RNA는 게놈 RNA, mRNA, 올리고뉴클레오타이드를 포함하며, 단백질의 예로는 항체, 항원, 효소, 펩타이드 등을 포함할 수 있다.In the present invention, the "probe" refers to a substance capable of specifically binding to a target substance to be detected in a sample, and refers to a substance capable of specifically confirming the presence of a target substance in a sample through the binding. The type of probe is not limited as a material commonly used in the art, but preferably PNA (peptide nucleic acid), LNA (locked nucleic acid), peptide, polypeptide, protein, RNA or DNA, and most preferably For example, it may be PNA. More specifically, the probe is a biomaterial derived from or similar thereto, or manufactured in vitro, and includes, for example, enzymes, proteins, antibodies, microorganisms, animal and plant cells and organs, neurons, DNA, and It may be RNA, and DNA includes cDNA, genomic DNA, and oligonucleotides, RNA includes genomic RNA, mRNA, and oligonucleotides, and examples of proteins include antibodies, antigens, enzymes, peptides, and the like.

본 발명에서 상기 "안티센스"는 안티센스 올리고머가 왓슨-크릭 염기쌍 형성에 의해 RNA 내의 표적 서열과 혼성화되어, 표적서열 내에서 전형적으로 mRNA와 RNA:올리고머 헤테로이중체의 형성을 허용하는, 뉴클레오티드 염기의 서열 및 서브유닛간 백본을 갖는 올리고머를 의미한다. 올리고머는 표적 서열에 대한 정확한 서열 상보성 또는 근사 상보성을 가질 수 있다.In the present invention, the "antisense" means that the antisense oligomer is hybridized with a target sequence in RNA by Watson-Crick base pairing, and typically mRNA and RNA in the target sequence: A sequence of nucleotide bases allowing the formation of an oligomeric heteroduplex and oligomers having an inter-subunit backbone. An oligomer may have exact sequence complementarity or approximate complementarity to a target sequence.

본 발명에서는 상기와 같은 과정을 통하여 GZMA, GZMB, CXCL9, CXCL10 및 IL32으로 이루어진 군에서 선택된 1종 이상의 단백질 또는 이를 코딩하는 mRNA의 발현 수준이 대조군에 비하여 낮은 경우, 표준 항암 치료법에 대한 치료 반응성이 낮고, 재발율이 높으며, 예후가 나쁠 것으로 예측할 수 있다. In the present invention, when the expression level of one or more proteins selected from the group consisting of GZMA, GZMB, CXCL9, CXCL10 and IL32 or the mRNA encoding them is lower than that of the control group through the process as described above, the treatment responsiveness to standard anticancer therapy is Low, high recurrence rate, and poor prognosis can be predicted.

본 발명의 일 실시예에서 상기 대조군은 해당 암 환자의 모집단의 중앙값(해당 암 환자의 평균값)일 수 있다. In an embodiment of the present invention, the control group may be a median value (average value of the cancer patients) of the population of cancer patients.

본 발명의 다른 실시예에서는 상기 대조군은 해당 암 환자 중 재발이 발생하지 않은 환자로, 즉 해당 암 환자 중 치료 후 완치된 환자로부터 얻어진 시료일 수 있다. In another embodiment of the present invention, the control group may be a sample obtained from a patient with no recurrence among the cancer patients, that is, from a patient who has been cured after treatment among the cancer patients.

본 발명에서 "완치"란 암 환자가 외과적 절제 치료법, 화학적 치료법 또는 방사선 치료법 등을 받은 이후 재발하지 않고 완전히 나은 상태를 의미한다. In the present invention, “cure” refers to a state in which a cancer patient is completely cured without recurrence after undergoing surgical excision therapy, chemical therapy, or radiation therapy.

본 발명에서는 임상적으로는 상기와 같이 위암 환자 중에서 미세부수체 불안정성이 높은 것으로 평가되고, GZMA, GZMB, CXCL9, CXCL10 및 IL32으로 이루어진 군에서 선택된 1종 이상의 단백질 또는 이를 코딩하는 유전자의 mRNA의 발현 수준이 대조군에 비해 감소한 경우 치료 반응성이 낮을 것으로 예측되는 외과적 절제 치료법 및 화학적 치료법보다는 면역 치료법을 수행하는 것으로 결정하도록 정보를 제공할 수 있다. In the present invention, as described above, it is clinically evaluated that microsatellite instability is high among gastric cancer patients, and mRNA expression of one or more proteins selected from the group consisting of GZMA, GZMB, CXCL9, CXCL10 and IL32 or a gene encoding the same Reduced levels compared to controls may inform the decision to perform immunotherapy rather than surgical excision therapy and chemotherapy, which are predicted to be less responsive to treatment.

본 발명의 다른 구현 예에 따르면, GZMA, GZMB, CXCL9, CXCL10 및 IL32으로 이루어진 군에서 선택된 1종 이상의 단백질의 발현 수준을 측정하는 제제를 포함하는, 암 환자의 치료 반응성 예측용 조성물에 관한 것이다. According to another embodiment of the present invention, GZMA, GZMB, CXCL9, CXCL10, and relates to a composition for predicting treatment responsiveness of a cancer patient comprising an agent for measuring the expression level of one or more proteins selected from the group consisting of IL32.

본 발명에서 상기 GZMA, GZMB, CXCL9, CXCL10 및 IL32 단백질의 발현 수준을 측정하는 제제는 상기 단백질에 특이적으로 결합하는 항체, 올리고펩타이드, 리간드, PNA(peptide nucleic acid) 및 앱타머(aptamer)로 이루어진 군에서 선택된 1종 이상을 포함할 수 있다.In the present invention, the agent for measuring the expression level of the GZMA, GZMB, CXCL9, CXCL10 and IL32 protein is an antibody, oligopeptide, ligand, PNA (peptide nucleic acid) and an aptamer that specifically binds to the protein. It may include one or more selected from the group consisting of.

본 발명에서 상기 GZMA, GZMB, CXCL9, CXCL10 및 IL32의 단백질과, 그에 특이적인 항체, 올리고펩타이드, 리간드, PNA 및 앱타머와, 암 환자에 관한 기재는 상기 방법에 관한 기재와 중복되어 이하 그 기재를 생략한다. In the present invention, the GZMA, GZMB, CXCL9, CXCL10 and IL32 proteins, antibodies, oligopeptides, ligands, PNAs and aptamers specific thereto, and the description of cancer patients overlap with the description of the method and are described below. omit

본 발명의 조성물은 미세부수체 불안정성 정도를 측정하기 위한 것으로, BAT26, D5S346, BAT25, D17S250 및 D2S123 유전자 각각에 대하여 특이적인 프라이머를 추가로 더 포함할 수 있다. 본 발명에 따른 BAT26, D5S346, BAT25, D17S250 및 D2S123 유전자의 정보는 알려져 있으므로, 당업자라면 이를 바탕으로 상기 유전자에 특이적으로 결합하는 프라이머를 용이하게 디자인할 수 있을 것이다.The composition of the present invention is for measuring the degree of microsatellite instability, and may further include primers specific for each of the BAT26, D5S346, BAT25, D17S250 and D2S123 genes. Since information on the BAT26, D5S346, BAT25, D17S250 and D2S123 genes according to the present invention is known, those skilled in the art will be able to easily design a primer that specifically binds to the gene based on this.

또한, 본 발명의 조성물은 미세부수체 불안정성 정도를 측정하기 위한 것으로, BAT25, BAT26, NR21, NR22(혹은 NR27) 및 NR24 유전자 각각에 대하여 특이적인 프라이머를 추가로 더 포함할 수 있다. 본 발명에 따른 BAT25, BAT26, NR21, NR22(혹은 NR27) 및 NR24 유전자의 정보는 알려져 있으므로, 당업자라면 이를 바탕으로 상기 유전자에 특이적으로 결합하는 프라이머를 용이하게 디자인할 수 있을 것이다.In addition, the composition of the present invention is for measuring the degree of microsatellite instability, BAT25, BAT26, NR21, NR22 (or NR27) and NR24 It may further comprise a specific primer for each gene. Since the information on the BAT25, BAT26, NR21, NR22 (or NR27) and NR24 genes according to the present invention is known, those skilled in the art will be able to easily design a primer that specifically binds to the gene based on this.

본 발명의 또 다른 구현 예에 따르면, GZMA, GZMB, CXCL9, CXCL10 및 IL32으로 이루어진 군에서 선택된 1종 이상의 단백질을 코딩하는 유전자의 mRNA의 발현 수준을 측정하는 제제를 포함하는, 암 환자의 치료 반응성 예측용 조성물에 관한 것이다. According to another embodiment of the present invention, GZMA, GZMB, CXCL9, CXCL10, and comprising an agent for measuring the mRNA expression level of a gene encoding one or more proteins selected from the group consisting of IL32, Therapeutic responsiveness of a cancer patient It relates to a composition for prediction.

본 발명에서 상기 mRNA의 발현 수준을 측정하는 제제는 상기 mRNA에 특이적으로 결합하는 프라이머, 프로브 및 안티센스 뉴클레오티드로 이루어진 군에서 선택된 1종 이상을 포함할 수 있다. In the present invention, the agent for measuring the expression level of the mRNA may include one or more selected from the group consisting of a primer, a probe, and an antisense nucleotide that specifically binds to the mRNA.

본 발명에서 상기 GZMA, GZMB, CXCL9, CXCL10 및 IL32의 단백질을 코딩하는 유전자의 mRNA와, 그에 특이적인 프라이머, 프로브 및 안티센스 뉴클레오티드와, 암 환자에 관한 기재는 상기 방법에 관한 기재와 중복되어 이하 그 기재를 생략한다. In the present invention, the mRNA of the gene encoding the GZMA, GZMB, CXCL9, CXCL10 and IL32 proteins, primers, probes, and antisense nucleotides specific thereto, and the description of the cancer patient overlap with the description of the method. omit the description.

본 발명의 조성물은 미세부수체 불안정성 정도를 측정하기 위한 것으로, BAT26, D5S346, BAT25, D17S250 및 D2S123 유전자 각각에 대하여 특이적인 프라이머를 추가로 더 포함할 수 있다. 본 발명에 따른 BAT26, D5S346, BAT25, D17S250 및 D2S123 유전자의 정보는 알려져 있으므로, 당업자라면 이를 바탕으로 상기 유전자에 특이적으로 결합하는 프라이머를 용이하게 디자인할 수 있을 것이다.The composition of the present invention is for measuring the degree of microsatellite instability, and may further include primers specific for each of the BAT26, D5S346, BAT25, D17S250 and D2S123 genes. Since information on the BAT26, D5S346, BAT25, D17S250 and D2S123 genes according to the present invention is known, those skilled in the art will be able to easily design a primer that specifically binds to the gene based on this.

또한, 본 발명의 조성물은 미세부수체 불안정성 정도를 측정하기 위한 것으로, BAT25, BAT26, NR21, NR22(혹은 NR27) 및 NR24 유전자 각각에 대하여 특이적인 프라이머를 추가로 더 포함할 수 있다. 본 발명에 따른 BAT25, BAT26, NR21, NR22(혹은 NR27) 및 NR24 유전자의 정보는 알려져 있으므로, 당업자라면 이를 바탕으로 상기 유전자에 특이적으로 결합하는 프라이머를 용이하게 디자인할 수 있을 것이다.In addition, the composition of the present invention is for measuring the degree of microsatellite instability, BAT25, BAT26, NR21, NR22 (or NR27) and NR24 It may further comprise a specific primer for each gene. Since the information on the BAT25, BAT26, NR21, NR22 (or NR27) and NR24 genes according to the present invention is known, those skilled in the art will be able to easily design a primer that specifically binds to the gene based on this.

본 발명에서는 상기 조성물을 이용하여 암 환자로부터 측정된 시료에 있어서 미세부수체 불안정성의 정도와 GZMA, GZMB, CXCL9, CXCL10 또는 IL32의 단백질 또는 이를 코딩하는 유전자의 mRNA의 발현 수준을 측정한 후 대조군과 대비함으로써 표준 항암 치료법에 대한 치료 반응성과 예후로 재발 여부를 예측할 수 있다. In the present invention, the degree of microsatellite instability and the mRNA expression level of the GZMA, GZMB, CXCL9, CXCL10 or IL32 protein or the gene encoding the same in the sample measured from the cancer patient using the composition were measured and then compared with the control group. By preparing for it, it is possible to predict whether recurrence occurs with the treatment responsiveness and prognosis to standard chemotherapy.

보다 구체적으로 암 환자로부터 측정된 시료가 미세부수체 불안정성의 높은 것으로 측정되고, GZMA, GZMB, CXCL9, CXCL10 및 IL32으로 이루어진 군에서 선택된 1종 이상의 단백질 또는 이를 코딩하는 mRNA의 발현 수준이 대조군에 비하여 낮은 경우, 표준 항암 치료법에 대한 치료 반응성이 낮으며, 재발 가능성이 높을 것으로 예측할 수 있다. More specifically, a sample measured from a cancer patient is measured to have high microsatellite instability, and the expression level of one or more proteins selected from the group consisting of GZMA, GZMB, CXCL9, CXCL10 and IL32 or mRNA encoding the same is higher than that of the control group. If it is low, it can be predicted that the treatment responsiveness to standard anticancer therapy is low and the likelihood of recurrence is high.

본 발명의 일 실시예에서 상기 대조군은 해당 암 환자의 모집단의 중앙값(해당 암 환자의 평균값)일 수 있다. In an embodiment of the present invention, the control group may be a median value (average value of the cancer patients) of the population of cancer patients.

본 발명의 다른 실시예에서는 상기 대조군은 해당 암 환자 중 재발이 발생하지 않은 환자로, 즉 해당 암 환자 중 치료 후 완치된 환자로부터 얻어진 시료일 수 있다. In another embodiment of the present invention, the control group may be a sample obtained from a patient with no recurrence among the cancer patients, that is, from a patient who has been cured after treatment among the cancer patients.

본 발명의 조성물을 이용하여 암 환자로부터 측정된 시료가 미세부수체 불안정성의 높은 것으로 측정되고, GZMA, GZMB, CXCL9, CXCL10 및 IL32으로 이루어진 군에서 선택된 1종 이상의 단백질 또는 이를 코딩하는 mRNA의 발현 수준이 대조군에 비하여 낮은 경우, 환자에게 치료 반응성이 낮을 것으로 예측되는 외과적 절제 치료법 및 화학적 치료법보다는 면역 치료법을 수행하는 것으로 결정하도록 정보를 제공할 수 있다. A sample measured from a cancer patient using the composition of the present invention is measured to have high microsatellite instability, and expression level of one or more proteins selected from the group consisting of GZMA, GZMB, CXCL9, CXCL10 and IL32 or mRNA encoding the same If it is low compared to this control, the patient may be informed to decide to undergo immunotherapy rather than surgical excision therapy and chemotherapy, which are predicted to have low therapeutic responsiveness.

본 발명의 또 다른 구현 예에 따르면, 본 발명에 따른 조성물을 포함하는 암 환자의 치료 반응성 예측용 키트에 관한 것이다. According to another embodiment of the present invention, it relates to a kit for predicting treatment responsiveness of a cancer patient comprising the composition according to the present invention.

이처럼, 본 발명은 암 환자의 표준 항암 치료법에 대한 반응성을 정밀하게 예측함으로써 생존 확률 또는 생존 기간을 높이고, 불필요한 치료법을 수행하지 않음으로써 비용을 줄이고 환자에게 고통을 덜어줄 수 있다.As such, the present invention can increase the survival probability or survival period by precisely predicting the reactivity of a cancer patient to standard anticancer therapy, and reduce cost and relieve pain to the patient by not performing unnecessary therapy.

본 발명은 암 환자로부터 채취한 시료로부터 미세부수체 불안정성 및 GZMA, GZMB, CXCL9, CXCL10 및/또는 IL32의 바이오마커의 발현 수준을 측정함으로써 재발 가능성과 치료 반응성을 높은 정확도로 예측할 수 있어, 환자가 향후 적절한 치료를 계획할 수 있어 국민 건강 수준을 보다 드높일 수 있다. The present invention can predict relapse probability and treatment responsiveness with high accuracy by measuring the expression levels of biomarkers of microsatellite instability and GZMA, GZMB, CXCL9, CXCL10 and/or IL32 from a sample taken from a cancer patient. In the future, appropriate treatment can be planned, which can further raise the level of public health.

도 1은 본 발명의 실시예 2에서 65명의 MSI-H 위암 환자 중 위암이 재발한 군과 위암이 재발하지 않은 군에서 유전자 발현 수준의 차이를 히트맵(heatmap)으로 나타낸 것이다.1 is a heatmap showing the difference in gene expression level between a group in which gastric cancer recurred and a group in which gastric cancer did not recur among 65 MSI-H gastric cancer patients in Example 2 of the present invention.

이하, 본 발명을 하기의 실시예에 의해 상세히 설명한다. 단, 하기 실시예는 본 발명을 예시하는 것일 뿐, 본 발명의 내용이 하기 실시예에 의해 한정되는 것은 아니다.Hereinafter, the present invention will be described in detail with reference to the following examples. However, the following examples are only illustrative of the present invention, and the content of the present invention is not limited by the following examples.

실시예 Example

[실시예 1] 미세부수체 불안정성(microsatellite instability, MSI) 확인[Example 1] Confirmation of microsatellite instability (MSI)

300명의 위암 환자로부터 채취한 위암 조직 샘플로부터 PCR을 위한 DNA를 추출하였다. MSI를 확인하기 위하여, 국립 암 연구소(National Cancer Institute, NCI)에서 미세부수체 불안정성을 정의하는데 권장하고 있는 다섯 개의 모노뉴클레오티드의 반복 마커인 BAT25, BAT26, NR21, NR22 및 NR24를 미세부수체 불안정성 마커로 사용하였다. 10× 버퍼 (Roche, Mannheim, Germany) 2 μl, MgCl2 1.7-2.5 mmol/L, 하기 표 1의 프라이머쌍 0.3 μM, 데옥시뉴클레오티드 트리포스페이트(deoxynucleotide triphosphate) 250 μM, 및 DNA 중합효소 2.5 units (Roche)를 포함하는 반응 용액 20 μl 내에서 50 ng의 DNA를 증폭하였다. 증폭에 있어서 초기 변성 공정은 94℃에서 5분 동안 수행하고, 이후 94℃에서 1분, 55℃에서 1분, 72℃에서 1분으로 30회 반복 수행하고, 72℃에서 10분 동안 최종 신장 반응을 수행하였다. DNA for PCR was extracted from gastric cancer tissue samples taken from 300 gastric cancer patients. To confirm MSI, the five mononucleotide repeat markers BAT25, BAT26, NR21, NR22 and NR24 recommended by the National Cancer Institute (NCI) to define microsatellite instability were used as microsatellite instability markers. was used as 2 μl of 10× buffer (Roche, Mannheim, Germany), MgCl 2 50 ng DNA in 20 μl of a reaction solution containing 1.7-2.5 mmol/L, 0.3 μM of the primer pair of Table 1, 250 μM of deoxynucleotide triphosphate, and 2.5 units of DNA polymerase (Roche) was amplified. In the amplification, the initial denaturation process was performed at 94°C for 5 minutes, then repeated 30 times for 1 minute at 94°C, 1 minute at 55°C, and 1 minute at 72°C, and final extension reaction at 72°C for 10 minutes. was performed.

이후, 각 조각의 분리를 위하여 ABI Prism 3100 Genetic Analyzer에서 증폭 시료 0.7 μL를 GeneScan 500 Size Standard 0.3 μL 및 HiDi 포름아마이드 9 μL와 결합시켰다. Genetic Analyzer 오븐의 온도가 60℃에 달하면 15 kV를 인가하며 전기영동을 시작하였다. POP-4를 분리 용매로 사용하였다. 형광 세기를 디지털 정보로 전환한 뒤 ABI Prism 3100 Data Collection software로 처리하여 데이터를 실시간으로 확보하였다. Then, 0.7 µL of the amplified sample was combined with 0.3 µL of GeneScan 500 Size Standard and 9 µL of HiDi formamide in ABI Prism 3100 Genetic Analyzer for separation of each fragment. When the temperature of the Genetic Analyzer oven reached 60°C, 15 kV was applied and electrophoresis was started. POP-4 was used as the separation solvent. After converting the fluorescence intensity into digital information, the data was acquired in real time by processing with ABI Prism 3100 Data Collection software.

MSI 결과를 분석함에 있어서 상기 5가지 마커, BAT25, BAT26, NR21, NR22 및 NR24 중 3개 이상의 마커에서 미세부수체의 이동(shift)이 관찰되면, 이는 미세부수체 불안정성이 높은 것(microsatellite instability-high, MSI-H)으로 평가하고, 5가지 마커 중 하나 혹은 두가지의 경우에서만 관찰되는 경우 미세부수체 불안정성이 낮은 것(microsatellite instability-low, MSI-L)으로 평가하며, 5가지 마커 모두에서 이동이 관찰되지 않은 경우는 미세부수체가 안정한 것으로 평가하였다. In analyzing the MSI results, if a shift of microsatellite is observed in three or more of the five markers, BAT25, BAT26, NR21, NR22, and NR24, it indicates that microsatellite instability is high (microsatellite instability- high, MSI-H), microsatellite instability-low (MSI-L) when observed only in one or two of the five markers, and shift in all five markers If this was not observed, the microsatellite was evaluated as stable.

그 결과 총 300명의 위암 환자 중 65명의 환자에게서는 BAT25, BAT26, NR21, NR22 및 NR24 중 3개 이상의 마커에서 미세부수체의 이동(shift)이 관찰되어 '미세부수체 불안정성이 높은 것'으로 확인되었고, 나머지 235명의 환자에게서는 BAT25, BAT26, NR21, NR22 및 NR24 중 두 개 이하의 마커에서만 미세부수체의 이동이 관찰되거나 혹은 5가지 마커 모두에서 관찰되지 않았다. As a result, microsatellite shift was observed in three or more markers among BAT25, BAT26, NR21, NR22, and NR24 in 65 patients out of a total of 300 gastric cancer patients, which was confirmed as 'high microsatellite instability'. , and in the remaining 235 patients, microsatellite migration was observed only at two or less of BAT25, BAT26, NR21, NR22 and NR24 markers or none of the 5 markers.

미세부수체microsatellite 유전자gene GenBank 숫자GenBank numbers 반복
(Repeat)
repeat
(Repeat)
프라이머 서열primer sequence 평균 PCR 생산물 사이즈Average PCR product size
BAT26BAT26 hMSH2hMSH2 U04045U04045 26 A intron 526 A intron 5 tgactacttttgacttcagcc
aaccattcaacatttttaaccc
tgactacttttgacttcagcc
aaccattcaacatttttaaccc
120bp120bp
BAT25BAT25 c-kitc-kit X06182X06182 25 T intron 1625 T intron 16 tcgcctccaagaatgtaagt
tctgcattttaactatggctc
tcgcctccaagaatgtaagt
tctgcattttaactatggctc
124bp124bp
NR24NR24 Zinc finger 2Zinc finger 2 X60152X60152 24 T 3'UTR24T 3'UTR ccattgctgaattttacctc
attgtgccattgcattccaa
ccattgctgaattttacctc
attgtgccattgcattccaa
132bp132bp
NR21NR21 SLC7A8SLC7A8 XM_033393XM_033393 21 T 5'UTR21T 5'UTR taaatgtatgtctcccctgg
attcctactccgcattcaca
taaatgtatgtctcccctgg
attcctactccgcattcaca
103bp103bp
NR22NR22 Transmembrane precursor protein B5Transmembrane precursor protein B5 L38961L38961 22 T 3'UTR22T 3'UTR gaggcttgtcaaggacataa
aattcggatgccatccagtt
gaggcttgtcaaggacataa
aattcggatgccatccagtt
142bp142bp

[[ 실시예Example 2] 재발 관련 2] Relapse-related 바이오마커의of biomarkers 확인 Confirm

상기 실시예 1에서 미세부수체 불안정성이 높은 것으로 판단된 65명 위암 환자의 유전자 발현 데이터의 원 데이터 (raw data, Affymetrix Human Genome U133 PLUS 2.0 Array)를 통계패키지인 R 중 GCRMA package를 이용하여 normalization 및 log2 치환을 시킨 후 nsFiltering 기능을 이용하여 Entrez Gene ID와 매치를 시키고, 중복되는 Gene ID인 경우 분산이 (variance) 큰 유전자를 선택하여, 전체 중 분산이 작은 경우와 Affymetrix quality control probe sets 필터링을 거친 후 최종 분석을 진행하였다. 미세부수체 불안정성이 높은 65명의 위암 환자 중에서도 외과적 절제술 이후 위암이 재발한 군과 그렇지 않은 군으로 구분한 후 두 군 간의 유전자 발현 정도가 차이가 나는 유전자 정보(different expression gene, DEG)를 Limma package를 이용하여 보정된 p-value가 0.05이하인 경우에 있어서 재발한 군과 그렇지 않은 군 간의 유전자 발현 차이가 나는 유전자 리스트를 확보하고(표 2), 그 리스트를 이용하여 유전자 발현을 히트맵(heatmap)으로 나타내었다(도 1). The raw data (raw data, Affymetrix Human Genome U133 PLUS 2.0 Array) of the gene expression data of 65 gastric cancer patients judged to have high microsatellite instability in Example 1 was normalized and After log2 substitution, match with Entrez Gene ID using nsFiltering function. In case of overlapping Gene ID, genes with large variance are selected, and Affymetrix quality control probe sets are filtered with small variance among all. After that, the final analysis was performed. Among 65 gastric cancer patients with high microsatellite instability, after surgical resection, gastric cancer recurred and non-recurred groups were classified, and then the gene information (different expression gene, DEG) that differed in the gene expression level between the two groups was included in the Limma package. When the corrected p-value is less than 0.05, obtain a gene list with a difference in gene expression between the relapsed group and the non-relapsed group (Table 2), and use the list to calculate gene expression as a heatmap shown as (FIG. 1).

유전자gene logFClogFC 평균 발현수준mean expression level tt P.ValueP.Value adj.P.Valadj.P.Val BB 발현 수준 비교Expression level comparison C2C2 -1.33339-1.33339 5.0039885.003988 -4.41236-4.41236 3.81E-053.81E-05 0.034570.03457 2.0534652.053465 lowlow GZMBGZMB -2.19639-2.19639 8.6891868.689186 -4.39416-4.39416 4.07E-054.07E-05 0.034570.03457 1.9962451.996245 lowlow ADAMDEC1ADAMDEC1 -1.82127-1.82127 9.1440999.144099 -4.33932-4.33932 4.95E-054.95E-05 0.034570.03457 1.8245241.824524 lowlow ZNF616ZNF616 -0.8335-0.8335 5.7131465.713146 -4.30408-4.30408 5.60E-055.60E-05 0.034570.03457 1.7147821.714782 lowlow TNFRSF11ATNFRSF11A -1.70815-1.70815 6.4389426.438942 -4.27129-4.27129 6.29E-056.29E-05 0.034570.03457 1.6130811.613081 lowlow CXCL9CXCL9 -2.07572-2.07572 10.3294810.32948 -4.17757-4.17757 8.73E-058.73E-05 0.034570.03457 1.3247481.324748 lowlow HLA-DPB1HLA-DPB1 -1.19257-1.19257 12.3605512.36055 -4.1356-4.1356 0.0001010.000101 0.034570.03457 1.1967361.196736 lowlow HLA-DRB6HLA-DRB6 -1.20956-1.20956 8.5475798.547579 -4.13283-4.13283 0.0001020.000102 0.034570.03457 1.1883041.188304 lowlow NFE2L3NFE2L3 -1.1931-1.1931 8.4656258.465625 -4.12409-4.12409 0.0001050.000105 0.034570.03457 1.1617581.161758 lowlow CXCL10CXCL10 -1.91347-1.91347 10.1533110.15331 -4.06324-4.06324 0.000130.00013 0.035380.03538 0.9777490.977749 lowlow IL2RBIL2RB -1.35432-1.35432 7.687277.68727 -4.05827-4.05827 0.0001320.000132 0.035380.03538 0.9627820.962782 lowlow IL7IL7 -1.53258-1.53258 7.492927.49292 -4.00717-4.00717 0.0001570.000157 0.0387830.038783 0.8095690.809569 lowlow GZMAGZMA -1.81444-1.81444 9.0051749.005174 -3.98166-3.98166 0.0001710.000171 0.0400520.040052 0.7335140.733514 lowlow FBXO6FBXO6 -0.96418-0.96418 8.9158368.915836 -3.96902-3.96902 0.0001790.000179 0.0400520.040052 0.6959340.695934 lowlow IL32IL32 -1.46458-1.46458 7.0156457.015645 -3.93369-3.93369 0.0002020.000202 0.0400520.040052 0.5912480.591248 lowlow SORDSORD -1.59889-1.59889 6.0135976.013597 -3.92289-3.92289 0.0002090.000209 0.0400520.040052 0.5593580.559358 lowlow CXCL13CXCL13 -2.32393-2.32393 9.1588279.158827 -3.92108-3.92108 0.000210.00021 0.0400520.040052 0.5540330.554033 lowlow CXCR6CXCR6 -1.13127-1.13127 6.3103036.310303 -3.91621-3.91621 0.0002140.000214 0.0400520.040052 0.5396760.539676 lowlow ETV7ETV7 -1.45842-1.45842 6.3067286.306728 -3.90989-3.90989 0.0002180.000218 0.0400520.040052 0.5210330.521033 lowlow CD74CD74 -1.25827-1.25827 11.5822411.58224 -3.90443-3.90443 0.0002220.000222 0.0400520.040052 0.5049740.504974 lowlow LYSMD2LYSMD2 -0.6948-0.6948 10.4647510.46475 -3.89925-3.89925 0.0002260.000226 0.0400520.040052 0.4897420.489742 lowlow AGPAT5AGPAT5 -0.8099-0.8099 6.733176.73317 -3.88969-3.88969 0.0002340.000234 0.0400520.040052 0.4616710.461671 lowlow CD2CD2 -1.31146-1.31146 7.414727.41472 -3.87946-3.87946 0.0002420.000242 0.0400520.040052 0.4316460.431646 lowlow HLA-DMAHLA-DMA -1.32384-1.32384 10.3890310.38903 -3.78399-3.78399 0.0003320.000332 0.0470520.047052 0.1539330.153933 lowlow MAP1BMAP1B 1.320831.32083 6.4769086.476908 5.2480865.248086 1.71E-061.71E-06 0.0174240.017424 4.7948454.794845 highhigh RTN4RTN4 0.7875280.787528 2.8966372.896637 4.9885264.988526 4.59E-064.59E-06 0.023390.02339 3.9220033.922003 highhigh STOX2STOX2 1.848471.84847 4.251254.25125 4.598264.59826 1.95E-051.95E-05 0.034570.03457 2.6447282.644728 highhigh DDX17DDX17 0.8825810.882581 4.31064.3106 4.5617164.561716 2.23E-052.23E-05 0.034570.03457 2.5275642.527564 highhigh CTSFCTSF 1.0533571.053357 5.5444875.544487 4.4551034.455103 3.27E-053.27E-05 0.034570.03457 2.1883482.188348 highhigh MEG3MEG3 0.8879270.887927 3.0403683.040368 4.4331554.433155 3.54E-053.54E-05 0.034570.03457 2.1190092.119009 highhigh MCAMMCAM 0.942020.94202 8.294618.29461 4.3737854.373785 4.38E-054.38E-05 0.034570.03457 1.9323161.932316 highhigh GUCY1A2GUCY1A2 1.1214741.121474 3.7583083.758308 4.3506954.350695 4.75E-054.75E-05 0.034570.03457 1.8600591.860059 highhigh AMOTL1AMOTL1 1.2923751.292375 6.3551136.355113 4.2832644.283264 6.03E-056.03E-05 0.034570.03457 1.6501761.650176 highhigh TRPC1TRPC1 1.1648571.164857 3.2623063.262306 4.2804684.280468 6.09E-056.09E-05 0.034570.03457 1.6415131.641513 highhigh UQCRC2UQCRC2 0.4818290.481829 2.6216852.621685 4.2635694.263569 6.46E-056.46E-05 0.034570.03457 1.5892051.589205 highhigh EMCNEMCN 1.1112931.111293 5.0095685.0009568 4.2504474.250447 6.77E-056.77E-05 0.034570.03457 1.5486631.548663 highhigh SRSF3SRSF3 1.1951851.195185 3.6806513.680651 4.2395224.239522 7.03E-057.03E-05 0.034570.03457 1.5149581.514958 highhigh AKAP12AKAP12 2.2289552.228955 5.7475795.747579 4.2245734.224573 7.41E-057.41E-05 0.034570.03457 1.4689191.468919 highhigh DCHS1DCHS1 1.0453521.045352 5.8342235.834223 4.200174.20017 8.07E-058.07E-05 0.034570.03457 1.393951.39395 highhigh TAGLNTAGLN 1.38231.3823 8.5439158.543915 4.1873044.187304 8.44E-058.44E-05 0.034570.03457 1.3545191.354519 highhigh SHANK3SHANK3 0.5441670.544167 2.5945922.594592 4.1772074.177207 8.74E-058.74E-05 0.034570.03457 1.3236221.323622 highhigh GJC1GJC1 1.1072781.107278 6.7450626.745062 4.1535774.153577 9.49E-059.49E-05 0.034570.03457 1.2514731.251473 highhigh MPDZMPDZ 1.0823361.082336 4.8624364.862436 4.1522094.152209 9.54E-059.54E-05 0.034570.03457 1.2473021.247302 highhigh ACTA2ACTA2 1.0925451.092545 11.3465111.34651 4.1510834.151083 9.57E-059.57E-05 0.034570.03457 1.243871.24387 highhigh PPP1R14APPP1R14A 1.2129081.212908 4.0534924.053492 4.1508164.150816 9.58E-059.58E-05 0.034570.03457 1.2430571.243057 highhigh TCEAL7TCEAL7 1.1684251.168425 3.8444953.844495 4.1496654.149665 9.62E-059.62E-05 0.034570.03457 1.2395491.239549 highhigh ZNF667-AS1ZNF667-AS1 0.8333640.833364 3.839383.83938 4.0977774.097777 0.0001150.000115 0.035380.03538 1.0820011.082001 highhigh FGFR1FGFR1 0.9526030.952603 5.0873385.087338 4.0968664.096866 0.0001150.000115 0.035380.03538 1.0792441.079244 highhigh HEYLHEYL 0.9522020.952202 4.1499924.149992 4.0748184.074818 0.0001250.000125 0.035380.03538 1.0126461.012646 highhigh BRE-AS1BRE-AS1 0.9302760.930276 2.7725232.772523 4.0660374.066037 0.0001280.000128 0.035380.03538 0.9861780.986178 highhigh FAM127AFAM127A 1.1268161.126816 6.7982376.798237 4.0599244.059924 0.0001310.000131 0.035380.03538 0.9677710.967771 highhigh DIP2CDIP2C 0.8485270.848527 7.1810127.181012 4.0210074.021007 0.000150.00015 0.0382170.038217 0.8509610.850961 highhigh ZSCAN18ZSCAN18 1.4220341.422034 5.1565265.156526 4.0207424.020742 0.000150.00015 0.0382170.038217 0.8501680.850168 highhigh ARHGEF10ARHGEF10 1.1530341.153034 6.1256476.125647 4.002124.00212 0.000160.00016 0.0387830.038783 0.7945040.794504 highhigh SLIT2SLIT2 0.9797510.979751 3.135233.13523 3.9672523.967252 0.000180.00018 0.0400520.040052 0.6906830.690683 highhigh LDOC1LDOC1 0.9157010.915701 2.9958532.995853 3.9581683.958168 0.0001850.000185 0.0400520.040052 0.6637220.663722 highhigh TGFB1I1TGFB1I1 1.0694641.069464 7.2655257.265525 3.9441053.944105 0.0001950.000195 0.0400520.040052 0.6220550.622055 highhigh AOC3AOC3 1.1706951.170695 6.8610946.861094 3.9366243.936624 0.00020.0002 0.0400520.040052 0.5999240.599924 highhigh FAM127BFAM127B 1.3749181.374918 4.4698374.469837 3.9121363.912136 0.0002170.000217 0.0400520.040052 0.527660.52766 highhigh KLF7KLF7 0.997740.99774 5.5755965.575596 3.8960773.896077 0.0002290.000229 0.0400520.040052 0.4804170.480417 highhigh CRYZL1CRYZL1 0.5496430.549643 4.6842114.684211 3.8918413.891841 0.0002320.000232 0.0400520.040052 0.4679740.467974 highhigh LRRC17LRRC17 1.3387491.338749 4.0956274.095627 3.8822283.882228 0.000240.00024 0.0400520.040052 0.4397660.439766 highhigh CC2D2ACC2D2A 0.7352340.735234 3.6557153.655715 3.8692973.869297 0.000250.00025 0.0400520.040052 0.4018910.401891 highhigh VIMVIM 0.9911290.991129 4.466474.46647 3.8658233.865823 0.0002530.000253 0.0400520.040052 0.3917250.391725 highhigh ENPEPENPEP 1.2263771.226377 5.5048865.504886 3.8653093.865309 0.0002540.000254 0.0400520.040052 0.3902230.390223 highhigh CHD1LCHD1L 0.8093650.809365 3.3338883.333888 3.8631913.863191 0.0002550.000255 0.0400520.040052 0.3840290.384029 highhigh MYL9MYL9 1.217511.21751 5.3148015.314801 3.8513833.851383 0.0002660.000266 0.0410120.041012 0.3495440.349544 highhigh PTPRMPTPRM 0.7978990.797899 7.5243217.524321 3.8470243.847024 0.000270.00027 0.0410120.041012 0.3368270.336827 highhigh ARMCX2ARMCX2 1.3629511.362951 6.3833156.383315 3.8385643.838564 0.0002770.000277 0.0415650.041565 0.3121730.312173 highhigh CNPY4CNPY4 0.5141180.514118 5.298285.29828 3.8254123.825412 0.000290.00029 0.0427960.042796 0.2739140.273914 highhigh RAI14RAI14 0.8515790.851579 9.4295139.429513 3.8183313.818331 0.0002970.000297 0.0431890.043189 0.2533470.253347 highhigh FERMT2FERMT2 1.1024021.102402 5.2691865.269186 3.7875913.787591 0.0003280.000328 0.0470520.047052 0.1643350.164335 highhigh

상기 도 1 에서 두번째 행에 붉은 색으로 나타낸 부분이 위암이 재발한 환자에 해당하는데, 위암 절제술 후 재발한 환자의 경우 재발하지 않고 완치된 환자와 비교하여 GZMA, GZMB, CXCL9, CXCL10 및 IL32의 발현 수준이 유의적으로 감소되어 짙은 파란색으로 나타난 것을 확인할 수 있다. The portion indicated in red in the second row in FIG. 1 corresponds to a patient with recurrence of gastric cancer. In the case of a patient who recurred after gastric cancer resection, the expression of GZMA, GZMB, CXCL9, CXCL10 and IL32 compared to a patient who did not relapse and was cured. It can be seen that the level was significantly decreased and displayed in dark blue.

상기 표 2에서 logFC는 위암 절제술 후 위암이 재발하지 않고 완치된 환자에서 각 유전자의 발현 수준 대비 재발한 환자에 있어서 각 유전자의 발현 수준의 값을 log2로 수치화한 값이다. 상기 표 1에서도 GZMA, GZMB, CXCL9, CXCL10 및 IL32의 경우 위암 절제술 후 재발하지 않고 완치된 환자보다 재발한 환자에 있어서 그 발현 수준이 유의적으로 감소한 것을 볼 수 있다. In Table 2, logFC is a value obtained by quantifying the expression level of each gene in log2 compared to the expression level of each gene in a patient who has not recovered from gastric cancer after gastric cancer resection. Also in Table 1 above, it can be seen that the expression levels of GZMA, GZMB, CXCL9, CXCL10 and IL32 were significantly reduced in patients who did not relapse after gastric cancer resection and recovered compared to patients who had relapsed.

본 발명에서 암 환자에 있어서 미세부수체 불안정성이 높은 것으로 평가되고, GZMA, GZMB, CXCL9, CXCL10 및 IL32의 바이오마커의 발현 수준이 해당 암 환자의 평균값, 혹은 해당 암 환자 중 재발이 발생하지 않은 환자의 발현 수준보다 낮은 경우, 표준 항암 치료법에 대한 치료 반응성이 낮고 재발율이 높을 것으로 예측할 수 있으며, 더 나아가 이러한 환자에게는 표준 항암 치료법보다는 면역 치료법으로의 치료 계획을 설계할 수 있다. In the present invention, the microsatellite instability is evaluated to be high in cancer patients, and the expression levels of the biomarkers of GZMA, GZMB, CXCL9, CXCL10 and IL32 are the average value of the cancer patients, or patients with no recurrence among the cancer patients. If the expression level is lower than the expression level of , it can be predicted that the treatment responsiveness to standard anticancer therapy is low and the recurrence rate is high, and furthermore, for these patients, a treatment plan with immunotherapy rather than standard anticancer therapy can be designed.

이상으로 본 발명의 특정한 부분을 상세히 기술하였는바, 당업계의 통상의 지식을 가진 자에게 있어서 이러한 구체적인 기술은 단지 바람직한 구현 예일 뿐이며, 이에 본 발명의 범위가 제한되는 것이 아닌 점은 명백하다. 따라서 본 발명의 실질적인 범위는 첨부된 청구항과 그의 등가물에 의하여 정의된다고 할 것이다.As described above in detail a specific part of the present invention, for those of ordinary skill in the art, this specific description is only a preferred embodiment, and it is clear that the scope of the present invention is not limited thereto. Accordingly, the substantial scope of the present invention will be defined by the appended claims and their equivalents.

<110> Industry-Academic Cooperation Foundation, Yonsei University <120> Method for predicting the treatment response of a cancer patient <130> DPB167334 <160> 5 <170> KoPatentIn 3.0 <210> 1 <211> 262 <212> PRT <213> Homo sapiens <400> 1 Met Arg Asn Ser Tyr Arg Phe Leu Ala Ser Ser Leu Ser Val Val Val 1 5 10 15 Ser Leu Leu Leu Ile Pro Glu Asp Val Cys Glu Lys Ile Ile Gly Gly 20 25 30 Asn Glu Val Thr Pro His Ser Arg Pro Tyr Met Val Leu Leu Ser Leu 35 40 45 Asp Arg Lys Thr Ile Cys Ala Gly Ala Leu Ile Ala Lys Asp Trp Val 50 55 60 Leu Thr Ala Ala His Cys Asn Leu Asn Lys Arg Ser Gln Val Ile Leu 65 70 75 80 Gly Ala His Ser Ile Thr Arg Glu Glu Pro Thr Lys Gln Ile Met Leu 85 90 95 Val Lys Lys Glu Phe Pro Tyr Pro Cys Tyr Asp Pro Ala Thr Arg Glu 100 105 110 Gly Asp Leu Lys Leu Leu Gln Leu Thr Glu Lys Ala Lys Ile Asn Lys 115 120 125 Tyr Val Thr Ile Leu His Leu Pro Lys Lys Gly Asp Asp Val Lys Pro 130 135 140 Gly Thr Met Cys Gln Val Ala Gly Trp Gly Arg Thr His Asn Ser Ala 145 150 155 160 Ser Trp Ser Asp Thr Leu Arg Glu Val Asn Ile Thr Ile Ile Asp Arg 165 170 175 Lys Val Cys Asn Asp Arg Asn His Tyr Asn Phe Asn Pro Val Ile Gly 180 185 190 Met Asn Met Val Cys Ala Gly Ser Leu Arg Gly Gly Arg Asp Ser Cys 195 200 205 Asn Gly Asp Ser Gly Ser Pro Leu Leu Cys Glu Gly Val Phe Arg Gly 210 215 220 Val Thr Ser Phe Gly Leu Glu Asn Lys Cys Gly Asp Pro Arg Gly Pro 225 230 235 240 Gly Val Tyr Ile Leu Leu Ser Lys Lys His Leu Asn Trp Ile Ile Met 245 250 255 Thr Ile Lys Gly Ala Val 260 <210> 2 <211> 247 <212> PRT <213> Homo sapiens <400> 2 Met Gln Pro Ile Leu Leu Leu Leu Ala Phe Leu Leu Leu Pro Arg Ala 1 5 10 15 Asp Ala Gly Glu Ile Ile Gly Gly His Glu Ala Lys Pro His Ser Arg 20 25 30 Pro Tyr Met Ala Tyr Leu Met Ile Trp Asp Gln Lys Ser Leu Lys Arg 35 40 45 Cys Gly Gly Phe Leu Ile Gln Asp Asp Phe Val Leu Thr Ala Ala His 50 55 60 Cys Trp Gly Ser Ser Ile Asn Val Thr Leu Gly Ala His Asn Ile Lys 65 70 75 80 Glu Gln Glu Pro Thr Gln Gln Phe Ile Pro Val Lys Arg Pro Ile Pro 85 90 95 His Pro Ala Tyr Asn Pro Lys Asn Phe Ser Asn Asp Ile Met Leu Leu 100 105 110 Gln Leu Glu Arg Lys Ala Lys Arg Thr Arg Ala Val Gln Pro Leu Arg 115 120 125 Leu Pro Ser Asn Lys Ala Gln Val Lys Pro Gly Gln Thr Cys Ser Val 130 135 140 Ala Gly Trp Gly Gln Thr Ala Pro Leu Gly Lys His Ser His Thr Leu 145 150 155 160 Gln Glu Val Lys Met Thr Val Gln Glu Asp Arg Lys Cys Glu Ser Asp 165 170 175 Leu Arg His Tyr Tyr Asp Ser Thr Ile Glu Leu Cys Val Gly Asp Pro 180 185 190 Glu Ile Lys Lys Thr Ser Phe Lys Gly Asp Ser Gly Gly Pro Leu Val 195 200 205 Cys Asn Lys Val Ala Gln Gly Ile Val Ser Tyr Gly Arg Asn Asn Gly 210 215 220 Met Pro Pro Arg Ala Cys Thr Lys Val Ser Ser Phe Val His Trp Ile 225 230 235 240 Lys Lys Thr Met Lys Arg His 245 <210> 3 <211> 125 <212> PRT <213> Homo sapiens <400> 3 Met Lys Lys Ser Gly Val Leu Phe Leu Leu Gly Ile Ile Leu Leu Val 1 5 10 15 Leu Ile Gly Val Gln Gly Thr Pro Val Val Arg Lys Gly Arg Cys Ser 20 25 30 Cys Ile Ser Thr Asn Gln Gly Thr Ile His Leu Gln Ser Leu Lys Asp 35 40 45 Leu Lys Gln Phe Ala Pro Ser Pro Ser Cys Glu Lys Ile Glu Ile Ile 50 55 60 Ala Thr Leu Lys Asn Gly Val Gln Thr Cys Leu Asn Pro Asp Ser Ala 65 70 75 80 Asp Val Lys Glu Leu Ile Lys Lys Trp Glu Lys Gln Val Ser Gln Lys 85 90 95 Lys Lys Gln Lys Asn Gly Lys Lys His Gln Lys Lys Lys Val Leu Lys 100 105 110 Val Arg Lys Ser Gln Arg Ser Arg Gln Lys Lys Thr Thr 115 120 125 <210> 4 <211> 98 <212> PRT <213> Homo sapiens <400> 4 Met Asn Gln Thr Ala Ile Leu Ile Cys Cys Leu Ile Phe Leu Thr Leu 1 5 10 15 Ser Gly Ile Gln Gly Val Pro Leu Ser Arg Thr Val Arg Cys Thr Cys 20 25 30 Ile Ser Ile Ser Asn Gln Pro Val Asn Pro Arg Ser Leu Glu Lys Leu 35 40 45 Glu Ile Ile Pro Ala Ser Gln Phe Cys Pro Arg Val Glu Ile Ile Ala 50 55 60 Thr Met Lys Lys Lys Gly Glu Lys Arg Cys Leu Asn Pro Glu Ser Lys 65 70 75 80 Ala Ile Lys Asn Leu Leu Lys Ala Val Ser Lys Glu Arg Ser Lys Arg 85 90 95 Ser Pro <210> 5 <211> 234 <212> PRT <213> Homo sapiens <400> 5 Met Cys Phe Pro Lys Val Leu Ser Asp Asp Met Lys Lys Leu Lys Ala 1 5 10 15 Arg Met Val Met Leu Leu Pro Thr Ser Ala Gln Gly Leu Gly Ala Trp 20 25 30 Val Ser Ala Cys Asp Thr Glu Asp Thr Val Gly His Leu Gly Pro Trp 35 40 45 Arg Asp Lys Asp Pro Ala Leu Trp Cys Gln Leu Cys Leu Ser Ser Gln 50 55 60 His Gln Ala Ile Glu Arg Phe Tyr Asp Lys Met Gln Asn Ala Glu Ser 65 70 75 80 Gly Arg Gly Gln Val Met Ser Ser Leu Ala Glu Leu Glu Asp Asp Phe 85 90 95 Lys Glu Gly Tyr Leu Glu Thr Val Ala Ala Tyr Tyr Glu Glu Gln His 100 105 110 Pro Glu Leu Thr Pro Leu Leu Glu Lys Glu Arg Asp Gly Leu Arg Cys 115 120 125 Arg Gly Asn Arg Ser Pro Val Pro Asp Val Glu Asp Pro Ala Thr Glu 130 135 140 Glu Pro Gly Glu Ser Phe Cys Asp Lys Val Met Arg Trp Phe Gln Ala 145 150 155 160 Met Leu Gln Arg Leu Gln Thr Trp Trp His Gly Val Leu Ala Trp Val 165 170 175 Lys Glu Lys Val Val Ala Leu Val His Ala Val Gln Ala Leu Trp Lys 180 185 190 Gln Phe Gln Ser Phe Cys Cys Ser Leu Ser Glu Leu Phe Met Ser Ser 195 200 205 Phe Gln Ser Tyr Gly Ala Pro Arg Gly Asp Lys Glu Glu Leu Thr Pro 210 215 220 Gln Lys Cys Ser Glu Pro Gln Ser Ser Lys 225 230 <110> Industry-Academic Cooperation Foundation, Yonsei University <120> Method for predicting the treatment response of a cancer patient <130> DPB167334 <160> 5 <170> KoPatentIn 3.0 <210> 1 <211> 262 <212> PRT <213> Homo sapiens <400> 1 Met Arg Asn Ser Tyr Arg Phe Leu Ala Ser Ser Leu Ser Val Val Val 1 5 10 15 Ser Leu Leu Leu Ile Pro Glu Asp Val Cys Glu Lys Ile Ile Gly Gly 20 25 30 Asn Glu Val Thr Pro His Ser Arg Pro Tyr Met Val Leu Leu Ser Leu 35 40 45 Asp Arg Lys Thr Ile Cys Ala Gly Ala Leu Ile Ala Lys Asp Trp Val 50 55 60 Leu Thr Ala Ala His Cys Asn Leu Asn Lys Arg Ser Gln Val Ile Leu 65 70 75 80 Gly Ala His Ser Ile Thr Arg Glu Glu Pro Thr Lys Gln Ile Met Leu 85 90 95 Val Lys Lys Glu Phe Pro Tyr Pro Cys Tyr Asp Pro Ala Thr Arg Glu 100 105 110 Gly Asp Leu Lys Leu Leu Gln Leu Thr Glu Lys Ala Lys Ile Asn Lys 115 120 125 Tyr Val Thr Ile Leu His Leu Pro Lys Lys Gly Asp Asp Val Lys Pro 130 135 140 Gly Thr Met Cys Gln Val Ala Gly Trp Gly Arg Thr His Asn Ser Ala 145 150 155 160 Ser Trp Ser Asp Thr Leu Arg Glu Val Asn Ile Thr Ile Ile Asp Arg 165 170 175 Lys Val Cys Asn Asp Arg Asn His Tyr Asn Phe Asn Pro Val Ile Gly 180 185 190 Met Asn Met Val Cys Ala Gly Ser Leu Arg Gly Gly Arg Asp Ser Cys 195 200 205 Asn Gly Asp Ser Gly Ser Pro Leu Leu Cys Glu Gly Val Phe Arg Gly 210 215 220 Val Thr Ser Phe Gly Leu Glu Asn Lys Cys Gly Asp Pro Arg Gly Pro 225 230 235 240 Gly Val Tyr Ile Leu Leu Ser Lys Lys His Leu Asn Trp Ile Ile Met 245 250 255 Thr Ile Lys Gly Ala Val 260 <210> 2 <211> 247 <212> PRT <213> Homo sapiens <400> 2 Met Gln Pro Ile Leu Leu Leu Leu Ala Phe Leu Leu Leu Pro Arg Ala 1 5 10 15 Asp Ala Gly Glu Ile Ile Gly Gly His Glu Ala Lys Pro His Ser Arg 20 25 30 Pro Tyr Met Ala Tyr Leu Met Ile Trp Asp Gln Lys Ser Leu Lys Arg 35 40 45 Cys Gly Gly Phe Leu Ile Gln Asp Asp Phe Val Leu Thr Ala Ala His 50 55 60 Cys Trp Gly Ser Ser Ile Asn Val Thr Leu Gly Ala His Asn Ile Lys 65 70 75 80 Glu Gln Glu Pro Thr Gln Gln Phe Ile Pro Val Lys Arg Pro Ile Pro 85 90 95 His Pro Ala Tyr Asn Pro Lys Asn Phe Ser Asn Asp Ile Met Leu Leu 100 105 110 Gln Leu Glu Arg Lys Ala Lys Arg Thr Arg Ala Val Gln Pro Leu Arg 115 120 125 Leu Pro Ser Asn Lys Ala Gln Val Lys Pro Gly Gln Thr Cys Ser Val 130 135 140 Ala Gly Trp Gly Gln Thr Ala Pro Leu Gly Lys His Ser His Thr Leu 145 150 155 160 Gln Glu Val Lys Met Thr Val Gln Glu Asp Arg Lys Cys Glu Ser Asp 165 170 175 Leu Arg His Tyr Tyr Asp Ser Thr Ile Glu Leu Cys Val Gly Asp Pro 180 185 190 Glu Ile Lys Lys Thr Ser Phe Lys Gly Asp Ser Gly Gly Pro Leu Val 195 200 205 Cys Asn Lys Val Ala Gln Gly Ile Val Ser Tyr Gly Arg Asn Asn Gly 210 215 220 Met Pro Pro Arg Ala Cys Thr Lys Val Ser Ser Phe Val His Trp Ile 225 230 235 240 Lys Lys Thr Met Lys Arg His 245 <210> 3 <211> 125 <212> PRT <213> Homo sapiens <400> 3 Met Lys Lys Ser Gly Val Leu Phe Leu Leu Leu Gly Ile Ile Leu Leu Val 1 5 10 15 Leu Ile Gly Val Gln Gly Thr Pro Val Val Arg Lys Gly Arg Cys Ser 20 25 30 Cys Ile Ser Thr Asn Gln Gly Thr Ile His Leu Gln Ser Leu Lys Asp 35 40 45 Leu Lys Gln Phe Ala Pro Ser Pro Ser Cys Glu Lys Ile Glu Ile Ile 50 55 60 Ala Thr Leu Lys Asn Gly Val Gln Thr Cys Leu Asn Pro Asp Ser Ala 65 70 75 80 Asp Val Lys Glu Leu Ile Lys Lys Trp Glu Lys Gln Val Ser Gln Lys 85 90 95 Lys Lys Gln Lys Asn Gly Lys Lys His Gln Lys Lys Lys Val Leu Lys 100 105 110 Val Arg Lys Ser Gln Arg Ser Arg Gln Lys Lys Thr Thr 115 120 125 <210> 4 <211> 98 <212> PRT <213> Homo sapiens <400> 4 Met Asn Gln Thr Ala Ile Leu Ile Cys Cys Leu Ile Phe Leu Thr Leu 1 5 10 15 Ser Gly Ile Gln Gly Val Pro Leu Ser Arg Thr Val Arg Cys Thr Cys 20 25 30 Ile Ser Ile Ser Asn Gln Pro Val Asn Pro Arg Ser Leu Glu Lys Leu 35 40 45 Glu Ile Ile Pro Ala Ser Gln Phe Cys Pro Arg Val Glu Ile Ile Ala 50 55 60 Thr Met Lys Lys Lys Gly Glu Lys Arg Cys Leu Asn Pro Glu Ser Lys 65 70 75 80 Ala Ile Lys Asn Leu Leu Lys Ala Val Ser Lys Glu Arg Ser Lys Arg 85 90 95 Ser Pro <210> 5 <211> 234 <212> PRT <213> Homo sapiens <400> 5 Met Cys Phe Pro Lys Val Leu Ser Asp Asp Met Lys Lys Leu Lys Ala 1 5 10 15 Arg Met Val Met Leu Leu Pro Thr Ser Ala Gln Gly Leu Gly Ala Trp 20 25 30 Val Ser Ala Cys Asp Thr Glu Asp Thr Val Gly His Leu Gly Pro Trp 35 40 45 Arg Asp Lys Asp Pro Ala Leu Trp Cys Gln Leu Cys Leu Ser Ser Gln 50 55 60 His Gln Ala Ile Glu Arg Phe Tyr Asp Lys Met Gln Asn Ala Glu Ser 65 70 75 80 Gly Arg Gly Gln Val Met Ser Ser Leu Ala Glu Leu Glu Asp Asp Phe 85 90 95 Lys Glu Gly Tyr Leu Glu Thr Val Ala Ala Tyr Tyr Glu Glu Gln His 100 105 110 Pro Glu Leu Thr Pro Leu Leu Glu Lys Glu Arg Asp Gly Leu Arg Cys 115 120 125 Arg Gly Asn Arg Ser Pro Val Pro Asp Val Glu Asp Pro Ala Thr Glu 130 135 140 Glu Pro Gly Glu Ser Phe Cys Asp Lys Val Met Arg Trp Phe Gln Ala 145 150 155 160 Met Leu Gln Arg Leu Gln Thr Trp Trp His Gly Val Leu Ala Trp Val 165 170 175 Lys Glu Lys Val Val Ala Leu Val His Ala Val Gln Ala Leu Trp Lys 180 185 190 Gln Phe Gln Ser Phe Cys Cys Ser Leu Ser Glu Leu Phe Met Ser Ser 195 200 205 Phe Gln Ser Tyr Gly Ala Pro Arg Gly Asp Lys Glu Glu Leu Thr Pro 210 215 220 Gln Lys Cys Ser Glu Pro Gln Ser Ser Lys 225 230

Claims (20)

(a) 암 환자로부터 분리한 시료에서 미세부수체 불안정성(microsatellite instability, MSI)을 측정하는 단계;
(b) 상기 미세부수체 불안정성이 높은 것으로 평가되는 경우의 암 환자로부터 분리한 시료에서 GZMA(granzyme A), GZMB(granzyme B), CXCL9(C-X-C motif chemokine ligand 9), CXCL10(C-X-C motif chemokine ligand 10) 및 IL32(interleukin 32)로 이루어진 군에서 선택된 1종 이상의 단백질 또는 이를 코딩하는 유전자의 mRNA의 발현 수준을 측정하는 단계; 및
상기 (b)에서 측정된 GZMA, GZMB, CXCL9, CXCL10 및 IL32으로 이루어진 군에서 선택된 1종 이상의 단백질 또는 이를 코딩하는 유전자의 mRNA의 발현 수준이 대조군에 비하여 낮은 경우, 상기 암 환자는 외과적 절제술 후 재발율이 높을 것으로 예측하는 단계를 포함하고,
상기 암 환자는 위암 환자이며,
상기 미세부수체 불안정성이 높은 것으로 평가되는 경우는 (1) 암 환자로부터 분리한 시료에서 BAT26, D5S346, BAT25, D17S250 및 D2S123 중 2개 이상의 미세부수체 표지자의 DNA 손상, 변화 또는 변이가 확인된 경우; 또는 (2) 암 환자로부터 분리한 시료에서 BAT25; BAT26; NR21; NR22 또는 NR27; 및 NR24의 미세부수체 표지자(microsatellite marker) 중 3개 이상의 미세부수체 표지자의 DNA 손상, 변화 또는 변이가 확인된 경우인, 암 환자의 치료 반응성을 예측하는 방법.
(a) measuring microsatellite instability (MSI) in a sample isolated from a cancer patient;
(b) GZMA (granzyme A), GZMB (granzyme B), CXCL9 (CXC motif chemokine ligand 9), CXCL10 (CXC motif chemokine ligand 10) from samples isolated from cancer patients when the microsatellite instability is evaluated to be high ) and IL32 (interleukin 32) measuring the mRNA expression level of one or more proteins selected from the group consisting of or a gene encoding the same; and
When the mRNA expression level of one or more proteins selected from the group consisting of GZMA, GZMB, CXCL9, CXCL10 and IL32 measured in (b) or a gene encoding them is lower than that of the control group, the cancer patient is treated after surgical resection Including the step of predicting that the recurrence rate will be high,
The cancer patient is a gastric cancer patient,
When the microsatellite instability is evaluated as high (1) DNA damage, change or mutation of two or more microsatellite markers among BAT26, D5S346, BAT25, D17S250 and D2S123 is confirmed in a sample isolated from a cancer patient ; or (2) BAT25 in a sample isolated from a cancer patient; BAT26; NR21; NR22 or NR27; and DNA damage, change or mutation of three or more microsatellite markers among NR24 microsatellite markers. A method for predicting treatment responsiveness in cancer patients.
삭제delete 삭제delete 삭제delete 삭제delete 제1항에 있어서,
상기 GZMA는 서열번호 1로 표시되고, 상기 GZMB는 서열번호 2로 표시되며, 상기 CXCL9은 서열번호 3으로 표시되고, 상기 CXCL10은 서열번호 4로 표시되며, 상기 IL32는 서열번호 5로 표시되는 것인, 암 환자의 치료 반응성을 예측하는 방법.
According to claim 1,
The GZMA is represented by SEQ ID NO: 1, the GZMB is represented by SEQ ID NO: 2, the CXCL9 is represented by SEQ ID NO: 3, the CXCL10 is represented by SEQ ID NO: 4, and the IL32 is represented by SEQ ID NO: 5 Phosphorus, a method for predicting treatment responsiveness in cancer patients.
삭제delete 삭제delete 제1항에 있어서,
상기 대조군은 해당 암 환자 중 재발이 발생하지 않은 환자로부터 얻어진 시료에서 측정된 GZMA, GZMB, CXCL9, CXCL10 및 IL32으로 이루어진 군에서 선택된 1종 이상의 단백질 또는 이를 코딩하는 유전자의 mRNA의 발현 수준인 것인, 암 환자의 치료 반응성을 예측하는 방법.
According to claim 1,
The control group is the mRNA expression level of one or more proteins selected from the group consisting of GZMA, GZMB, CXCL9, CXCL10 and IL32, or a gene encoding the same, measured from a sample obtained from a patient with no recurrence among the cancer patients. , a method for predicting treatment responsiveness in cancer patients.
제1항에 있어서,
상기 (b)에서 측정된 GZMA, GZMB, CXCL9, CXCL10 및 IL32으로 이루어진 군에서 선택된 1종 이상의 단백질 또는 이를 코딩하는 유전자의 mRNA의 발현 수준이 대조군에 비하여 낮은 경우, 표준 항암 치료법에 대한 치료 반응성이 낮을 것으로 예측하는 단계를 포함하는, 암 환자의 치료 반응성을 예측하는 방법.
According to claim 1,
When the mRNA expression level of one or more proteins selected from the group consisting of GZMA, GZMB, CXCL9, CXCL10 and IL32 measured in (b) or a gene encoding them is lower than that of the control group, the treatment responsiveness to standard anticancer therapy is A method of predicting treatment responsiveness in a cancer patient, comprising predicting to be low.
GZMA(granzyme A), GZMB(granzyme B), CXCL9(C-X-C motif chemokine ligand 9), CXCL10(C-X-C motif chemokine ligand 10) 및 IL32(interleukin 32)로 이루어진 군에서 선택된 1종 이상의 단백질의 발현 수준을 측정하는 제제를 포함하는, 암 환자의 치료 반응성 예측용 조성물로,
상기 암은 미세부수체 불안정성이 높은 위암이고,
상기 미세부수체 불안정성이 높은 암은 (1) 암 환자로부터 분리한 시료에서 BAT26, D5S346, BAT25, D17S250 및 D2S123 중 2개 이상의 미세부수체 표지자의 DNA 손상, 변화 또는 변이가 확인된 경우; 또는 (2) 암 환자로부터 분리한 시료에서 BAT25; BAT26; NR21; NR22 또는 NR27; 및 NR24의 미세부수체 표지자(microsatellite marker) 중 3개 이상의 미세부수체 표지자의 DNA 손상, 변화 또는 변이가 확인된 경우이고,
상기 암 환자에서 측정된 GZMA, GZMB, CXCL9, CXCL10 및 IL32으로 이루어진 군에서 선택된 1종 이상의 단백질의 발현 수준이 대조군에 비하여 낮은 경우, 상기 암 환자는 외과적 절제술 후 재발율이 높을 것으로 예측되는, 조성물.
Measuring the expression level of one or more proteins selected from the group consisting of GZMA (granzyme A), GZMB (granzyme B), CXCL9 (CXC motif chemokine ligand 9), CXCL10 (CXC motif chemokine ligand 10) and IL32 (interleukin 32) A composition for predicting therapeutic responsiveness in cancer patients, comprising the agent,
The cancer is gastric cancer with high microsatellite instability,
The cancer with high microsatellite instability is (1) when DNA damage, change or mutation of two or more microsatellite markers among BAT26, D5S346, BAT25, D17S250 and D2S123 is confirmed in a sample isolated from a cancer patient; or (2) BAT25 in a sample isolated from a cancer patient; BAT26; NR21; NR22 or NR27; and DNA damage, change or mutation of three or more microsatellite markers among the NR24 microsatellite markers,
When the expression level of one or more proteins selected from the group consisting of GZMA, GZMB, CXCL9, CXCL10 and IL32 measured in the cancer patient is lower than that of the control group, the cancer patient is predicted to have a high recurrence rate after surgical resection, composition .
제11항에 있어서,
상기 단백질의 발현 수준을 측정하는 제제는 상기 단백질에 특이적으로 결합하는 항체, 올리고펩타이드, 리간드, PNA(peptide nucleic acid) 및 앱타머(aptamer)로 이루어진 군에서 선택된 1종 이상을 포함하는, 암 환자의 치료 반응성 예측용 조성물.
12. The method of claim 11,
The agent for measuring the expression level of the protein comprises at least one selected from the group consisting of an antibody, oligopeptide, ligand, PNA (peptide nucleic acid) and aptamer that specifically binds to the protein, cancer A composition for predicting a patient's therapeutic responsiveness.
제11항에 있어서,
상기 조성물은 BAT26, D5S346, BAT25, D17S250 및 D2S123 유전자 각각에 대하여 특이적인 프라이머를 추가로 더 포함하는, 암 환자의 치료 반응성 예측용 조성물.
12. The method of claim 11,
The composition further comprises a primer specific for each of BAT26, D5S346, BAT25, D17S250 and D2S123 genes, the composition for predicting treatment responsiveness of cancer patients.
제11항에 있어서,
상기 조성물은 BAT25; BAT26; NR21; NR22 또는 NR27; 및 NR24 유전자 각각에 대하여 특이적인 프라이머를 추가로 더 포함하는, 암 환자의 치료 반응성 예측용 조성물.
12. The method of claim 11,
The composition comprises BAT25; BAT26; NR21; NR22 or NR27; And further comprising a primer specific for each of the NR24 gene, a composition for predicting treatment responsiveness of cancer patients.
제11항 내지 제14항 중 어느 한 항의 조성물을 포함하는 암 환자의 치료 반응성 예측용 키트로,
상기 암은 미세부수체 불안정성이 높은 위암이고,
상기 미세부수체 불안정성이 높은 암은 (1) 암 환자로부터 분리한 시료에서 BAT26, D5S346, BAT25, D17S250 및 D2S123 중 2개 이상의 미세부수체 표지자의 DNA 손상, 변화 또는 변이가 확인된 경우; 또는 (2) 암 환자로부터 분리한 시료에서 BAT25; BAT26; NR21; NR22 또는 NR27; 및 NR24의 미세부수체 표지자(microsatellite marker) 중 3개 이상의 미세부수체 표지자의 DNA 손상, 변화 또는 변이가 확인된 경우이고,
상기 암 환자에서 측정된 GZMA, GZMB, CXCL9, CXCL10 및 IL32으로 이루어진 군에서 선택된 1종 이상의 단백질의 발현 수준이 대조군에 비하여 낮은 경우, 상기 암 환자는 외과적 절제술 후 재발율이 높을 것으로 예측되는, 키트.
15. A kit for predicting therapeutic responsiveness of a cancer patient comprising the composition of any one of claims 11 to 14,
The cancer is gastric cancer with high microsatellite instability,
The cancer with high microsatellite instability is (1) when DNA damage, change or mutation of two or more microsatellite markers among BAT26, D5S346, BAT25, D17S250 and D2S123 is confirmed in a sample isolated from a cancer patient; or (2) BAT25 in a sample isolated from a cancer patient; BAT26; NR21; NR22 or NR27; and DNA damage, change or mutation of three or more microsatellite markers among the NR24 microsatellite markers,
When the expression level of one or more proteins selected from the group consisting of GZMA, GZMB, CXCL9, CXCL10 and IL32 measured in the cancer patient is lower than that in the control group, the cancer patient is predicted to have a high recurrence rate after surgical resection, kit .
GZMA(granzyme A), GZMB(granzyme B), CXCL9(C-X-C motif chemokine ligand 9), CXCL10(C-X-C motif chemokine ligand 10) 및 IL32(interleukin 32)로 이루어진 군에서 선택된 1종 이상의 단백질을 코딩하는 유전자의 mRNA의 발현 수준을 측정하는 제제를 포함하는, 암 환자의 치료 반응성 예측용 조성물로,
상기 암은 미세부수체 불안정성이 높은 위암이고,
상기 미세부수체 불안정성이 높은 암은 (1) 암 환자로부터 분리한 시료에서 BAT26, D5S346, BAT25, D17S250 및 D2S123 중 2개 이상의 미세부수체 표지자의 DNA 손상, 변화 또는 변이가 확인된 경우; 또는 (2) 암 환자로부터 분리한 시료에서 BAT25; BAT26; NR21; NR22 또는 NR27; 및 NR24의 미세부수체 표지자(microsatellite marker) 중 3개 이상의 미세부수체 표지자의 DNA 손상, 변화 또는 변이가 확인된 경우이고,
상기 암 환자에서 측정된 GZMA, GZMB, CXCL9, CXCL10 및 IL32으로 이루어진 군에서 선택된 1종 이상의 단백질을 코딩하는 유전자의 mRNA의 발현 수준이 대조군에 비하여 낮은 경우, 상기 암 환자는 외과적 절제술 후 재발율이 높을 것으로 예측되는, 조성물.
mRNA of a gene encoding one or more proteins selected from the group consisting of GZMA (granzyme A), GZMB (granzyme B), CXCL9 (CXC motif chemokine ligand 9), CXCL10 (CXC motif chemokine ligand 10), and IL32 (interleukin 32) A composition for predicting treatment responsiveness of cancer patients, comprising an agent for measuring the expression level of
The cancer is gastric cancer with high microsatellite instability,
The cancer with high microsatellite instability is (1) when DNA damage, change or mutation of two or more microsatellite markers among BAT26, D5S346, BAT25, D17S250 and D2S123 is confirmed in a sample isolated from a cancer patient; or (2) BAT25 in a sample isolated from a cancer patient; BAT26; NR21; NR22 or NR27; and DNA damage, change or mutation of three or more microsatellite markers among the NR24 microsatellite markers,
When the mRNA expression level of a gene encoding one or more proteins selected from the group consisting of GZMA, GZMB, CXCL9, CXCL10 and IL32 measured in the cancer patient is lower than that of the control group, the cancer patient has a lower recurrence rate after surgical resection The composition, which is expected to be high.
제16항에 있어서,
상기 mRNA의 발현 수준을 측정하는 제제는 상기 mRNA에 특이적으로 결합하는 프라이머, 프로브 및 안티센스 뉴클레오티드로 이루어진 군에서 선택된 1종 이상을 포함하는, 암 환자의 치료 반응성 예측용 조성물.
17. The method of claim 16,
The agent for measuring the expression level of the mRNA comprises at least one selected from the group consisting of primers, probes and antisense nucleotides that specifically bind to the mRNA, a composition for predicting treatment responsiveness of cancer patients.
제16항에 있어서,
상기 조성물은 BAT26, D5S346, BAT25, D17S250 및 D2S123 유전자 각각에 대하여 특이적인 프라이머를 추가로 더 포함하는, 암 환자의 치료 반응성 예측용 조성물.
17. The method of claim 16,
The composition further comprises a primer specific for each of BAT26, D5S346, BAT25, D17S250 and D2S123 genes, the composition for predicting treatment responsiveness of cancer patients.
제16항에 있어서,
상기 조성물은 BAT25; BAT26; NR21; NR22 또는 NR27; 및 NR24 유전자 각각에 대하여 특이적인 프라이머를 추가로 더 포함하는, 암 환자의 치료 반응성 예측용 조성물.
17. The method of claim 16,
The composition comprises BAT25; BAT26; NR21; NR22 or NR27; And further comprising a primer specific for each of the NR24 gene, a composition for predicting treatment responsiveness of cancer patients.
제16항 내지 제19항 중 어느 한 항의 조성물을 포함하는 암 환자의 치료 반응성 예측용 키트로,
상기 암은 미세부수체 불안정성이 높은 위암이고,
상기 미세부수체 불안정성이 높은 암은 (1) 암 환자로부터 분리한 시료에서 BAT26, D5S346, BAT25, D17S250 및 D2S123 중 2개 이상의 미세부수체 표지자의 DNA 손상, 변화 또는 변이가 확인된 경우; 또는 (2) 암 환자로부터 분리한 시료에서 BAT25; BAT26; NR21; NR22 또는 NR27; 및 NR24의 미세부수체 표지자(microsatellite marker) 중 3개 이상의 미세부수체 표지자의 DNA 손상, 변화 또는 변이가 확인된 경우이고,
상기 암 환자에서 측정된 GZMA, GZMB, CXCL9, CXCL10 및 IL32으로 이루어진 군에서 선택된 1종 이상의 단백질을 코딩하는 유전자의 mRNA의 발현 수준이 대조군에 비하여 낮은 경우, 상기 암 환자는 외과적 절제술 후 재발율이 높을 것으로 예측되는, 키트.
A kit for predicting therapeutic responsiveness of a cancer patient comprising the composition of any one of claims 16 to 19,
The cancer is gastric cancer with high microsatellite instability,
The cancer with high microsatellite instability is (1) when DNA damage, change or mutation of two or more microsatellite markers among BAT26, D5S346, BAT25, D17S250 and D2S123 is confirmed in a sample isolated from a cancer patient; or (2) BAT25 in a sample isolated from a cancer patient; BAT26; NR21; NR22 or NR27; and DNA damage, change or mutation of three or more microsatellite markers among the NR24 microsatellite markers,
When the mRNA expression level of a gene encoding one or more proteins selected from the group consisting of GZMA, GZMB, CXCL9, CXCL10 and IL32 measured in the cancer patient is lower than that of the control group, the cancer patient has a lower recurrence rate after surgical resection Expected to be high, the kit.
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