KR102320430B1 - Use of miR-135b, miR-135a and their target gene AMOTL2 for medulloblastoma - Google Patents

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Abstract

본 발명은 수모세포종의 전이 또는 재발 가능성 예측을 위한 miR-135b 및 miR-135a, 예후 예측을 위한 상기 miRNA의 표적 유전자 AMOTL2 및 상기 miRNA의 억제제를 유효성분으로 포함하는 수모세포종의 예방 또는 치료용 약학적 조성물 등에 관한 것으로서, 본 발명에 따른 수모세포종의 전이 또는 재발 가능성 예측용 바이오마커 및 예후 예측용 바이오마커를 이용하면, 난치병인 수모세포종 환자를 치료하는데 있어서 miR-135b 또는 miR-135a의 발현 수준을 측정함으로써 종양의 전이 및 재발 가능성을 예측할 수 있고, 상기 miRNA의 표적 유전자인 AMOTL2의 발현 수준을 측정함으로써 환자의 예후를 예측할 수 있다. 나아가, 상기 miRNA의 발현을 인위적으로 억제시킴으로써 AMOTL2의 발현 증가를 유도하고, 이를 통하여 수모세포종을 효과적으로 예방하고 치료할 수 있을 것으로 기대된다.The present invention provides a pharmaceutical for the prevention or treatment of medulloblastoma comprising miR-135b and miR-135a for predicting the possibility of metastasis or recurrence of medulloblastoma, the miRNA target gene AMOTL2 for predicting the prognosis, and an inhibitor of the miRNA as active ingredients When using the biomarker for predicting metastasis or recurrence of medulloblastoma and the biomarker for predicting the prognosis according to the present invention as a pharmaceutical composition, etc., the expression level of miR-135b or miR-135a in treating an incurable medulloblastoma patient By measuring , the possibility of tumor metastasis and recurrence can be predicted, and the prognosis of a patient can be predicted by measuring the expression level of AMOTL2, a target gene of the miRNA. Furthermore, by artificially suppressing the expression of the miRNA to induce an increase in the expression of AMOTL2, it is expected to be able to effectively prevent and treat medulloblastoma.

Description

수모세포종에 대한 miR-135b, miR-135a 및 이들의 표적 유전자 AMOTL2의 용도 {Use of miR-135b, miR-135a and their target gene AMOTL2 for medulloblastoma}{Use of miR-135b, miR-135a and their target gene AMOTL2 for medulloblastoma}

본 발명은 수모세포종의 전이 또는 재발 가능성 예측을 위한 miRNA, 예후 예측을 위한 상기 miRNA의 표적 유전자 AMOTL2의 용도 및 상기 miRNA의 억제제를 유효성분으로 포함하는 수모세포종의 예방 또는 치료용 약학적 조성물 등에 관한 것이다.The present invention relates to a pharmaceutical composition for preventing or treating medulloblastoma, comprising the miRNA for predicting the possibility of metastasis or recurrence of medulloblastoma, the use of the miRNA target gene AMOTL2 for predicting the prognosis, and an inhibitor of the miRNA as an active ingredient, etc. will be.

뇌종양은 줄기세포 특성을 가지는 작은 소집단 세포를 포함하고 있는데, 이들 세포는 종양의 발생, 진행, 전이 및 재발에 중요한 역할을 한다. 또한, 이들 소집단 세포는 스페로이드(spheroid) 형성 능력을 가지며, 종양 개시 세포(tumor initiating cell, TIC)라고도 불리는 암 줄기세포(cancer stem cells, CSCs)의 농축이라고 말할 수 있다. 이들은 자기 재생(self-renewal) 및 이종(heterogeneous) 암세포 계통으로의 분화가 가능한 것으로 알려져 있다. 상기와 같은 세포에 대한 연구는 가장 흔한 악성(malignant) 소아 뇌종양인 수모세포종(medulloblastoma)에서 보고된바 있다.Brain tumors contain a small subpopulation of cells with stem cell characteristics, which play an important role in tumor development, progression, metastasis and recurrence. In addition, these subpopulation cells have the ability to form spheroids and can be said to be an enrichment of cancer stem cells (CSCs), also called tumor initiating cells (TIC). They are known to be capable of differentiation into self-renewal and heterogeneous cancer cell lineages. Studies on such cells have been reported in medulloblastoma, the most common malignant pediatric brain tumor.

수술과 보조 요법(adjuvant therapies)의 발전으로 수모세포종에 대한 치유율은 점점 더 높아지고 있다. 특히, 수모세포종 환자의 최근 5년 생존율은 75%에 도달하였다. 그러나 기존 요법에 반응하지 않는 나머지 25%는 결국 재발과 전이로 인하여 다시 악화된다. 게다가 생존자들은 항암 화학요법(chemotherapy)의 심각한 부작용 및 장기적인 방사선요법에 의한 후유증으로부터 자유롭지 못한 실정이다. 따라서, 치료 내성의 원인을 식별하고 안전하고 효과적인 치료 방법을 개발하기 위해서는 수모세포종에 대한 더 나은 분자생물학적, 세포생물학적 이해가 필요하다.With advances in surgery and adjuvant therapies, the cure rate for medulloblastoma is increasing. In particular, the recent 5-year survival rate of medulloblastoma patients has reached 75%. However, the remaining 25% who do not respond to conventional therapy eventually worsen again due to recurrence and metastasis. In addition, the survivors are not free from the serious side effects of chemotherapy and the sequelae of long-term radiotherapy. Therefore, a better understanding of the molecular and cell biology of medulloblastoma is needed to identify the causes of treatment resistance and develop safe and effective treatment methods.

많은 뇌종양의 임상적 복잡성은 중추신경계(central nervous system, CNS) 특유의 미세환경(microenvironment) 및 세포내/세포간 상호 작용과 관련되어 있다. 이러한 점은 뇌종양을 의학적 도전으로 만드는데 기여한다. The clinical complexity of many brain tumors is related to the central nervous system (CNS)-specific microenvironment and intracellular/intercellular interactions. This contributes to making brain tumors a medical challenge.

세포외 소포체(extracellular vesicles, EVs)는 세포 상호 작용의 형태 중 하나로서, 암의 발생, 전이 및 재발을 위한 환경을 제공할 수 있다. 엑소좀을 포함하는 종양-분비 EVs는 국소 및 원격 미세환경에서 종양세포와 기질세포 사이의 소통에서 중추적인 역할을 한다. EVs는 세포의 증식, 분화, 세포사멸(apoptosis), 대사 및 약물에 대한 내성과 같은 생물학적 기능을 조절할 수 있는 선택된 마이크로 RNA(miRNAs)를 함유한다. 선행 연구를 통해 암 줄기세포 유래 세포외 소포체가 유전자 정보를 전달하고 암 발생에 유리한 미세환경을 조성하는 매개체로서 작용하며, 이들은 종양세포 특이적 miRNAs를 포함하고 있는 것으로 밝혀졌다.Extracellular vesicles (EVs) are one of the forms of cell interaction and can provide an environment for the development, metastasis and recurrence of cancer. Tumor-secreting EVs containing exosomes play a pivotal role in communication between tumor cells and stromal cells in local and remote microenvironments. EVs contain selected microRNAs (miRNAs) that can modulate biological functions such as cell proliferation, differentiation, apoptosis, metabolism and drug resistance. Through previous studies, it was found that cancer stem cell-derived extracellular vesicles act as mediators that transmit genetic information and create a microenvironment favorable for cancer development, and that they contain tumor cell-specific miRNAs.

현재 수모세포종에 대한 분자 유전학적 연구가 광범위하게 진행되고 있으며 계속해서 진전을 보이고는 있지만, 수모세포종의 세포외 소포체에 대한 연구는 여전히 더 탐구하여야 할 연구 분야로 남아있다. 수모세포종의 뇌종양 스페로이드 형성 세포(brain tumor spheroid-forming cells, BTSCs)에서의 주요한 EVs-miRNAs 및 이들의 생물학적 역할은 아직 밝혀진바 없다.Although molecular genetic studies of medulloblastoma are currently extensive and continue to make progress, the study of the extracellular endoplasmic reticulum of medulloblastoma remains an area of research to be further explored. The major EVs-miRNAs and their biological roles in brain tumor spheroid-forming cells (BTSCs) of medulloblastoma have not yet been elucidated.

J. Wu, Z. Qu, Z.W. Fei, J.H. Wu, C.P. Jiang, Role of stem cell-derived exosomes in cancer, Oncol Lett 13(5) (2017) 2855-2866. J. Wu, Z. Qu, Z. W. Fei, J. H. Wu, C.P. Jiang, Role of stem cell-derived exosomes in cancer, Oncol Lett 13(5) (2017) 2855-2866.

본 발명은 상술한 문제점을 해결하기 위하여 안출된 것으로서, 본 발명의 목적은 miR-135b 및 miR-135a로 이루어진 군에서 선택된 어느 하나 이상을 유효성분으로 포함하는, 수모세포종의 전이 또는 재발 가능성 예측용 바이오마커 조성물을 제공하는 것이다.The present invention has been devised to solve the above problems, and an object of the present invention is to predict the possibility of metastasis or recurrence of medulloblastoma, including any one or more selected from the group consisting of miR-135b and miR-135a as an active ingredient To provide a biomarker composition.

본 발명의 다른 목적은, AMOTL2 유전자를 유효성분으로 포함하는, 수모세포종 환자의 예후 예측용 바이오마커 조성물을 제공하는 것이다.Another object of the present invention is to provide a biomarker composition for predicting the prognosis of a medulloblastoma patient, comprising the AMOTL2 gene as an active ingredient.

본 발명의 또 다른 목적은, miR-135b 및 miR-135a로 이루어진 군에서 선택된 어느 하나 이상에 대한 억제제를 유효성분으로 포함하는, 수모세포종의 예방 또는 치료용 약학적 조성물을 제공하는 것이다.Another object of the present invention is to provide a pharmaceutical composition for preventing or treating medulloblastoma, comprising an inhibitor for at least one selected from the group consisting of miR-135b and miR-135a as an active ingredient.

그러나 본 발명이 이루고자 하는 기술적 과제는 이상에서 언급한 과제에 제한되지 않으며, 언급되지 않은 또 다른 과제들은 아래의 기재로부터 본 발명이 속하는 기술 분야에서 통상의 지식을 가진 자에게 명확하게 이해될 수 있을 것이다.However, the technical task to be achieved by the present invention is not limited to the tasks mentioned above, and other tasks not mentioned can be clearly understood by those of ordinary skill in the art to which the present invention belongs from the following description. will be.

상기와 같은 본 발명의 목적을 달성하기 위해서, 본 발명은 miR-135b 및 miR-135a로 이루어진 군에서 선택된 어느 하나 이상을 유효성분으로 포함하는, 수모세포종의 전이 또는 재발 가능성 예측용 바이오마커 조성물을 제공한다.In order to achieve the object of the present invention as described above, the present invention provides a biomarker composition for predicting metastasis or recurrence of medulloblastoma, comprising as an active ingredient any one or more selected from the group consisting of miR-135b and miR-135a. to provide.

또한, 본 발명은 miR-135b 및 miR-135a로 이루어진 군에서 선택된 어느 하나 이상의 발현 수준을 측정하는 제제를 포함하는, 수모세포종의 전이 또는 재발 가능성 예측용 조성물을 제공한다.In addition, the present invention provides a composition for predicting the possibility of metastasis or recurrence of medulloblastoma, comprising an agent for measuring the expression level of any one or more selected from the group consisting of miR-135b and miR-135a.

더욱이, 본 발명은 miR-135b 및 miR-135a로 이루어진 군에서 선택된 어느 하나 이상의 발현 수준을 측정하는 제제를 포함하는, 수모세포종의 전이 또는 재발 가능성 예측용 키트를 제공한다.Furthermore, the present invention provides a kit for predicting the possibility of metastasis or recurrence of medulloblastoma, comprising an agent for measuring the expression level of any one or more selected from the group consisting of miR-135b and miR-135a.

본 발명의 일 구현예에 있어서, 상기 miR-135b 또는 miR-135a는 수모세포종의 뇌종양 스페로이드 형성 세포(brain tumor spheroid-forming cells) 또는 이로부터 유래한 세포외 소포체(extracellular vesicles)에서 특이적으로 발현이 증가되는 것일 수 있으나, 이에 제한되는 것은 아니다.In one embodiment of the present invention, the miR-135b or miR-135a is specifically in brain tumor spheroid-forming cells of medulloblastoma or extracellular vesicles derived therefrom. The expression may be increased, but is not limited thereto.

본 발명의 다른 구현예에 있어서, 상기 miR-135b 또는 miR-135a는 AMOTL2(angiomotin-like 2) 유전자의 발현을 억제할 수 있으나, 이에 제한되는 것은 아니다.In another embodiment of the present invention, the miR-135b or miR-135a may inhibit the expression of angiomotin-like 2 (AMOTL2) gene, but is not limited thereto.

본 발명의 또 다른 구현예에 있어서, 상기 제제는 miR-135b 또는 miR-135a에 특이적으로 결합하는 안티센스 올리고뉴클레오타이드, 프라이머 세트, 프로브 및 항체로 이루어진 군으로부터 선택되는 1종 이상을 포함하는 것일 수 있으나, 이에 제한되는 것은 아니다.In another embodiment of the present invention, the agent may include one or more selected from the group consisting of antisense oligonucleotides, primer sets, probes, and antibodies that specifically bind to miR-135b or miR-135a. However, the present invention is not limited thereto.

본 발명의 또 다른 구현예에 있어서 상기 키트는 RT-PCR 키트 또는 DNA 칩인 것일 수 있으나, 이에 제한되는 것은 아니다.In another embodiment of the present invention, the kit may be an RT-PCR kit or a DNA chip, but is not limited thereto.

또한, 본 발명은 AMOTL2 유전자를 유효성분으로 포함하는, 수모세포종 환자의 예후 예측용 바이오마커 조성물을 제공한다.In addition, the present invention provides a biomarker composition for predicting the prognosis of a medulloblastoma patient, comprising the AMOTL2 gene as an active ingredient.

더욱이, 본 발명은 AMOTL2 유전자의 발현 수준을 측정하는 제제를 포함하는, 수모세포종 환자의 예후 예측용 조성물을 제공한다.Furthermore, the present invention provides a composition for predicting the prognosis of a medulloblastoma patient, comprising an agent for measuring the expression level of the AMOTL2 gene.

뿐만 아니라, 본 발명은 AMOTL2 유전자의 발현 수준을 측정하는 제제를 포함하는, 수모세포종 환자의 예후 예측용 키트를 제공한다.In addition, the present invention provides a kit for predicting the prognosis of a medulloblastoma patient, comprising an agent for measuring the expression level of the AMOTL2 gene.

본 발명의 일 구현예에 있어서, 상기 수모세포종은 그룹 3 수모세포종 또는 그룹 4 수모세포종일 수 있으나, 이에 제한되는 것은 아니다.In one embodiment of the present invention, the medulloblastoma may be a group 3 medulloblastoma or a group 4 medulloblastoma, but is not limited thereto.

본 발명의 다른 구현예에 있어서, 상기 AMOTL2 유전자는 수모세포종의 뇌종양 스페로이드 형성 세포에서 특이적으로 발현이 감소되는 것일 수 있으나, 이에 제한되는 것은 아니다.In another embodiment of the present invention, the AMOTL2 gene may be specifically reduced in expression in medulloblastoma brain tumor spheroid-forming cells, but is not limited thereto.

본 발명의 또 다른 구현예에 있어서, 상기 AMOTL2 유전자는 miR-135b 및 miR-135a로 이루어진 군에서 선택된 어느 하나 이상에 의해 발현이 억제되는 것일 수 있으나, 이에 제한되는 것은 아니다.In another embodiment of the present invention, the expression of the AMOTL2 gene may be suppressed by any one or more selected from the group consisting of miR-135b and miR-135a, but is not limited thereto.

본 발명의 또 다른 구현예에 있어서, 상기 제제는 AMOTL2 유전자에 특이적으로 결합하는 안티센스 올리고뉴클레오타이드, 프라이머 세트, 프로브 및 항체로 이루어진 군으로부터 선택되는 1종 이상을 포함하는 것일 수 있으나, 이에 제한되는 것은 아니다.In another embodiment of the present invention, the agent may include one or more selected from the group consisting of antisense oligonucleotides, primer sets, probes, and antibodies that specifically bind to the AMOTL2 gene, but is limited thereto it is not

또한, 본 발명은 miR-135b 및 miR-135a로 이루어진 군에서 선택된 어느 하나 이상에 대한 억제제를 유효성분으로 포함하는, 수모세포종의 예방 또는 치료용 약학적 조성물을 제공한다.In addition, the present invention provides a pharmaceutical composition for preventing or treating medulloblastoma, comprising an inhibitor for at least one selected from the group consisting of miR-135b and miR-135a as an active ingredient.

더욱이, 본 발명은 miR-135b 및 miR-135a로 이루어진 군에서 선택된 어느 하나 이상에 대한 억제제를 개체에 투여하는 단계를 포함하는, 수모세포종의 예방 또는 치료 방법을 제공한다.Furthermore, the present invention provides a method for preventing or treating medulloblastoma, comprising administering to a subject an inhibitor for at least one selected from the group consisting of miR-135b and miR-135a.

뿐만 아니라, 본 발명은 miR-135b 및 miR-135a로 이루어진 군에서 선택된 어느 하나 이상에 대한 억제제의, 수모세포종에 대한 예방 또는 치료 용도를 제공한다.In addition, the present invention provides the use of an inhibitor for any one or more selected from the group consisting of miR-135b and miR-135a for preventing or treating medulloblastoma.

본 발명의 일 구현예에 있어서, 상기 miR-135b 또는 miR-135a는 수모세포종의 뇌종양 스페로이드 형성 세포 또는 이로부터 유래한 세포외 소포체에서 유래한 것일 수 있으나, 이에 제한되는 것은 아니다.In one embodiment of the present invention, the miR-135b or miR-135a may be derived from brain tumor spheroid-forming cells of medulloblastoma or extracellular vesicles derived therefrom, but is not limited thereto.

본 발명의 다른 구현예에 있어서, 상기 조성물은 종양구(tumorsphere)의 형성을 억제하는 것일 수 있으나, 이에 제한되는 것은 아니다.In another embodiment of the present invention, the composition may inhibit the formation of tumor spheres, but is not limited thereto.

본 발명의 또 다른 구현예에 있어서, 상기 조성물은 수모세포종의 생존력 또는 재생력을 저하시키거나 재발을 억제하는 것일 수 있으나, 이에 제한되는 것은 아니다.In another embodiment of the present invention, the composition may reduce the viability or regeneration of medulloblastoma or inhibit recurrence, but is not limited thereto.

본 발명의 또 다른 구현예에 있어서, 상기 조성물은 AMOTL2 유전자의 발현을 증가시키는 것일 수 있으나, 이에 제한되는 것은 아니다.In another embodiment of the present invention, the composition may increase the expression of the AMOTL2 gene, but is not limited thereto.

본 발명의 또 다른 구현예에 있어서, 상기 억제제는 miR-135b 또는 miR-135a에 상보적으로 결합하는 안티센스 올리고뉴클레오타이드, 이중가닥 siRNA(small interfering RNA), shRNA(short hairpin RNA) 및 리보자임으로 이루어진 군으로부터 선택되는 1종 이상인 것일 수 있으나, 이에 제한되는 것은 아니다.In another embodiment of the present invention, the inhibitor is an antisense oligonucleotide complementary to miR-135b or miR-135a, double-stranded siRNA (small interfering RNA), shRNA (short hairpin RNA) and a ribozyme consisting of It may be one or more selected from the group, but is not limited thereto.

본 발명의 또 다른 구현예에 있어서, 상기 안티센스 올리고뉴클레오타이드는 리보뉴클레오타이드, 디옥시리보뉴클레오타이드, 2'-O-변형 올리고뉴클레오타이드, 포스포로티오에이트-백본 디옥시리보뉴클레오타이드, PNA(peptide nucleic acid) 또는 LNA(locked nucleic acid)인 것일 수 있으나, 이에 제한되는 것은 아니다.In another embodiment of the present invention, the antisense oligonucleotide is ribonucleotide, deoxyribonucleotide, 2'-O-modified oligonucleotide, phosphorothioate-backbone deoxyribonucleotide, PNA (peptide nucleic acid) or LNA (locked nucleic acid) acid), but is not limited thereto.

본 발명에 따른 수모세포종의 전이 또는 재발 가능성 예측용 바이오마커 및 예후 예측용 바이오마커를 이용하면, 난치병인 수모세포종 환자를 치료하는데 있어서 miR-135b 또는 miR-135a의 발현 수준을 측정함으로써 종양의 전이 및 재발 가능성을 예측할 수 있고, 상기 miRNA의 표적 유전자인 AMOTL2의 발현 수준을 측정함으로써 환자의 예후를 예측할 수 있는 효과가 있다. 나아가, 상기 miRNA의 발현을 인위적으로 억제시킴으로써 AMOTL2의 발현 증가를 유도하고, 이를 통하여 수모세포종을 효과적으로 예방하고 치료할 수 있을 것으로 기대된다.By using the biomarker for predicting the metastasis or recurrence of medulloblastoma and the biomarker for predicting the prognosis according to the present invention, tumor metastasis by measuring the expression level of miR-135b or miR-135a in treating an incurable medulloblastoma patient And the possibility of recurrence can be predicted, and the prognosis of the patient can be predicted by measuring the expression level of AMOTL2, which is the target gene of the miRNA. Furthermore, by artificially suppressing the expression of the miRNA to induce an increase in the expression of AMOTL2, it is expected to be able to effectively prevent and treat medulloblastoma.

도 1a 내지 도 1f는 벌크 종양 세포(BTCs) 또는 뇌종양 스페로이드 형성 세포(BTSCs) 및 이들로부터 방출된 세포외 소포체(BTCs-EVs 또는 BTSCs-EVs)의 특성을 분석한 도이다: (도 1a) 부착성 BTCs 및 스페로이드 형성 BTSCs의 표현형을 보여주는 대표 현미경 이미지(scale bar, 100μm); (도 1b) 줄기세포 마커 네스틴(nestin; 녹색) 및 무사시(musashi; 적색)의 발현을 나타낸 도(scale bar, 100μm); (도 1c 및 도 1f) 플로틸린(flotillin)-1 및 칼넥신(calnexin)의 발현을 비교한 웨스턴 블롯 결과; (도 1d) 특징적인 원형의 엑소좀 구조를 갖는 분리된 소포로 나타난 EVs의 투과전자현미경(TEM) 이미지; (도 1e) 직경 10 내지 200nm 범위의 크기 분포를 나타낸 나노 입자 추적 분석(NTA) 결과.
도 2a 내지 도 2d는 수모세포종 환자의 BTCs 및 BTSCs에서 miRNA의 발현을 분석한 도이다: (도 2a 및 도 2b) BTCs와 비교한 BTSCs의 miRNA 발현 분석 히트맵 및 BTCs-EVs와 비교한 BTSCs-EVs의 miRNA 발현 분석 히트맵(적색 또는 녹색은 각각 상대적으로 높거나 낮은 발현을 나타냄, P <0.05에서 유의한 차이); (도 2c) BTSCs(파란색)와 BTSCs-EVs(분홍색)에서 차등적으로 발현된 miRNA의 개수를 나타낸 벤다이어그램; (도 2d) BTCs와 비교하여 BTSCs에서 miR-135b 및 miR135a의 발현 수준을 RT-qPCR로 분석한 결과(*** P<0.001).
도 3a 내지 도 3d는 BTSCs에서 miR-135b 및 miR-135a의 기능을 분석한 도이다: (도 3a) 항-miR-135b, 항-miR-135a 또는 항-miR-NC(음성 대조군)로 형질감염된 BTSCs에서 miR-135b 또는 miRNA-135a 수준을 RT-qPCR로 분석한 그래프; (도 3b) miR-135b 또는 miR-135a의 억제에 따른 세포 생존력 비교 그래프; (도 3c) miR-135b 또는 miR-135a의 억제에 따른 종양구(tumorsphere) 형성 능력을 나태낸 그래프; (도 3d) miR-135b 또는 miR-135a의 억제에 따른 네스틴(Nestin; 녹색 형광) 및 무사시(MSI1; 적색 형광)의 발현을 면역형광법으로 나타낸 이미지.
도 4a 및 도 4b는 BTSCs에서 mRNA 표적화된 miRNA의 통합 분석 및 검증 결과를 나타낸 도이다: (도 4a) BTCs와 BTSCs 사이의 차등적 유전자 발현을 분석한 히트맵; (도 4b) miR-135b 또는 miR-135a의 예측된 표적 유전자 AMOTL2, STAT6 및 GPX8의 발현을 RT-qPCR로 분석한 결과(*** P<0.001).
도 5a 내지 도 5e는 miR-135b 및/또는 miR-135a에 의한 표적 유전자 AMOTL2, STAT3 및 GPX8와의 상관관계 및 이들 유전자의 신호전달 경로를 나타낸 도이다: (도 5a 및 도 5b) miR-135b 및 miR-135a와 이들의 표적 유전자 AMOTL2 상관계수를 수모세포종의 각 하위그룹 별로 나타낸 도(miR-135b, R=-0.92006, P<0.0001; miR-135a R=-0.82885, P<0.0001); (도 5c) miR-135b 또는 miR-135a의 억제에 따른 AMOTL2의 발현을 분석한 그래프; (도 5d 및 도 5e) BTSCs에서 히포 신호전달(hippo signaling) 및 밀착연접 경로(tight junction pathway)의 AMOTL2 발현 패턴을 시각화한 도.
도 6a 및 도 6b는 두 개의 독립적인 집단(cohort)에서 AMOTL2의 발현 수준과 소아 수모세포종의 잔존 평균수명(survival probability)을 로그-순위 테스트를 통한 카플란-마이어 생존분석을 이용하여 나타낸 도로서, 도 6a는 한국인 환자 30명(SNUH 집단)을, 도 6b는 MAGIC(medulloblastoma advanced genomics international consortium) 집단을 대상으로 분석한 결과이다.
1A to 1F are diagrams analyzing the characteristics of bulk tumor cells (BTCs) or brain tumor spheroid forming cells (BTSCs) and extracellular vesicles (BTCs-EVs or BTSCs-EVs) released therefrom: ( FIG. 1A ) Representative microscopic images showing the phenotypes of adherent BTCs and spheroid-forming BTSCs (scale bar, 100 μm); (FIG. 1B) A diagram showing the expression of stem cell markers nestin (nestin; green) and musashi (red) (scale bar, 100 μm); (FIGS. 1c and 1f) Western blot results comparing the expression of flotillin-1 and calnexin; (FIG. 1d) Transmission electron microscopy (TEM) image of EVs shown as isolated vesicles with a characteristic circular exosome structure; (FIG. 1e) Nanoparticle tracking analysis (NTA) results showing a size distribution ranging from 10 to 200 nm in diameter.
2A to 2D are diagrams analyzing the expression of miRNA in BTCs and BTSCs of medulloblastoma patients: ( FIGS. 2A and 2B ) Heat map of miRNA expression analysis of BTSCs compared to BTCs and BTSCs- compared to BTCs-EVs miRNA expression analysis heat map of EVs (red or green indicates relatively high or low expression, respectively, significant difference at P <0.05); (Fig. 2c) Venn diagram showing the number of differentially expressed miRNAs in BTSCs (blue) and BTSCs-EVs (pink); (Fig. 2d) RT-qPCR analysis of the expression levels of miR-135b and miR135a in BTSCs compared to BTCs (***P<0.001).
3A to 3D are diagrams analyzing the functions of miR-135b and miR-135a in BTSCs: ( FIG. 3A ) Transfection with anti-miR-135b, anti-miR-135a or anti-miR-NC (negative control) RT-qPCR analysis of miR-135b or miRNA-135a levels in infected BTSCs; (FIG. 3B) a graph comparing cell viability according to the inhibition of miR-135b or miR-135a; ( FIG. 3C ) a graph showing the ability to form tumorspheres according to the inhibition of miR-135b or miR-135a; ( FIG. 3D ) Images showing the expression of nestin (Nestin; green fluorescence) and Musashi (MSI1; red fluorescence) according to the inhibition of miR-135b or miR-135a by immunofluorescence.
4a and 4b are diagrams showing the results of the integrated analysis and verification of mRNA-targeted miRNAs in BTSCs: ( FIG. 4a ) a heat map analyzing differential gene expression between BTCs and BTSCs; (FIG. 4B) RT-qPCR analysis of the expression of the predicted target genes AMOTL2, STAT6 and GPX8 of miR-135b or miR-135a (*** P<0.001).
5A to 5E are diagrams showing the correlation with target genes AMOTL2, STAT3 and GPX8 by miR-135b and/or miR-135a and signaling pathways of these genes: ( FIGS. 5A and 5B ) miR-135b and A diagram showing the correlation coefficient between miR-135a and its target gene AMOTL2 for each subgroup of medulloblastoma (miR-135b, R=-0.92006, P<0.0001; miR-135a R=-0.82885, P<0.0001); (FIG. 5c) a graph analyzing the expression of AMOTL2 according to the inhibition of miR-135b or miR-135a; (FIGS. 5D and 5E) Visualization of AMOTL2 expression patterns of hippo signaling and tight junction pathways in BTSCs.
6A and 6B are roads showing the expression level of AMOTL2 and the survival probability of pediatric medulloblastoma in two independent cohorts using Kaplan-Meier survival analysis through log-rank test; Figure 6a is a result of analysis of 30 Korean patients (SNUH group), Figure 6b is a target MAGIC (medulloblastoma advanced genomics international consortium) group.

엑소좀(exosome)을 포함하는 종양에서 분비된 세포외 소포체(extracellular vesicles, EVs)는 종양의 발달, 진행, 전이 및 재발과 관련하여 세포간 상호 작용을 조절하는 중요한 인자로 여겨진다. EVs에 대한 연구가 활발히 진행되고는 있지만, 수모세포종의 뇌종양 스페로이드 형성 세포(BTSCs)로부터 유래된 EVs-miRNA에 대한 생물학적 이해는 전반적으로 모호하였다. 본 발명자들은 벌크 종양 세포(BTCs)와의 비교를 통한 수모세포종 BTSCs에서의 특정 세포성 miRNA 및 EVs-miRNA를 탐구하였고, 그들의 생물학적 잠재 기능을 밝혀냄으로써 본 발명을 완성하였다.Extracellular vesicles (EVs) secreted from tumors, including exosomes, are considered to be important factors regulating intercellular interactions with respect to tumor development, progression, metastasis and recurrence. Although studies on EVs have been actively conducted, the biological understanding of EVs-miRNAs derived from brain tumor spheroid-forming cells (BTSCs) of medulloblastoma is generally ambiguous. We have explored specific cellular miRNAs and EVs-miRNAs in medulloblastoma BTSCs through comparison with bulk tumor cells (BTCs), and completed the present invention by revealing their potential biological functions.

BTCs 및 BTSCs를 수모세포종 조직으로부터 분리하고 (N = 10) 상이한 조건 하에서 배양하였다. 나노스트링(NanoString)®을 통해 BTCs에서와 비교하여 BTSCs에서 세포 및 EVs로부터 유래한 특정 miRNA를 분석함으로써 차등적으로 발현된 miRNA를 분석하였다. miRNA 분석 결과는 rt-PCR(real-time polymerase chain reaction)로 검증하였다. 상향 조절된 miRNA를 억제하기 위해, 각각에 대한 특정 억제제를 BTSCs로 형질 감염(transfection)시켰다. 특성 및 기능에 대한 분석은 세포 생존(cell survival), 한계희석법(limiting dilution), 면역형광법 (immunofluorescence) 및 웨스턴 블롯(western blot) 분석에 의해 평가하였다. miRNAs의 표적 mRNAs, 이들의 상관관계 및 예측된 신호전달 경로는 생물 정보학에 기초한 통합 분석에 의해 결정되었다(실험예 참조).BTCs and BTSCs were isolated from medulloblastoma tissue (N = 10) and cultured under different conditions. Differentially expressed miRNAs were analyzed by analyzing specific miRNAs derived from cells and EVs in BTSCs compared to those in BTCs via NanoString ® . miRNA analysis results were verified by rt-PCR (real-time polymerase chain reaction). In order to inhibit the up-regulated miRNA, a specific inhibitor for each was transfected with BTSCs. Analysis of characteristics and functions was evaluated by cell survival, limiting dilution, immunofluorescence and western blot analysis. The target mRNAs of miRNAs, their correlations and predicted signaling pathways were determined by bioinformatics-based integrated analysis (see Experimental Examples).

본 발명의 일 실시예에서는, BTCs와 비교하여 BTSCs로부터 유래한 세포 및 EVs 둘 다에서 동시에 증가된 24개의 miRNA를 확인하였다. 그 결과 BTSCs에서 miR-135b 및 miR135a가 가장 유의하게 증가하였다(실시예 2 참조).In one embodiment of the present invention, compared to BTCs, 24 miRNAs that were simultaneously increased in both cells and EVs derived from BTSCs were identified. As a result, miR-135b and miR135a were most significantly increased in BTSCs (see Example 2).

본 발명의 다른 실시예에서는, miR-135b 또는 miR-135a의 억제 후 세포 생존력, 자기 재생(self-renewal) 및 줄기 세포 마커의 발현이 현저하게 감소됨을 확인하였다(실시예 3 참조).In another embodiment of the present invention, it was confirmed that cell viability, self-renewal and expression of stem cell markers were significantly reduced after inhibition of miR-135b or miR-135a (see Example 3).

본 발명의 또 다른 실시예에서는, mRNA와 miRNAs 데이터의 통합 분석을 통해, miR-135b와 miR-135a 둘 다에 의해 표적화되는 AMOTL2(angiomotin-like 2) 및 miR-135a에 의해서만 표적화되는 STAT6과 GPX8이 현저하게 감소함을 발견하였다(실시예 4 참조).In another embodiment of the present invention, through integrated analysis of mRNA and miRNAs data, AMOTL2 (angiomotin-like 2) targeted by both miR-135b and miR-135a and STAT6 and GPX8 targeted only by miR-135a was found to be significantly reduced (see Example 4).

본 발명의 또 다른 실시예에서는, 그룹 3 및 그룹 4 소아 수모세포종 환자에서 AMOTL2의 낮은 발현은 전반적으로 열악한 생존율과 유의하게 관련되어 있음을 확인하였다(실시예 5 참조).In another example of the present invention, it was confirmed that low expression of AMOTL2 in group 3 and group 4 pediatric medulloblastoma patients was significantly associated with poor overall survival (see Example 5).

상기 결과를 종합하면 miR-135b 또는 miR-135a는 AMOTL2의 조절을 통해 BTSCs의 줄기세포능을 억제할 수 있으며, 따라서 상기 miRNA는 수모세포종의 BTSCs에서 종양의 자기재생(self-renewal) 및 증식(proliferation)에 있어 중요한 역할을 담당하고 있음을 시사하는 것이다.Summarizing the above results, miR-135b or miR-135a can inhibit the stem cell ability of BTSCs through the regulation of AMOTL2. This suggests that it plays an important role in proliferation.

따라서, 본 발명은 miR-135b 및 miR-135a로 이루어진 군에서 선택된 어느 하나 이상을 유효성분으로 포함하는, 수모세포종의 전이 또는 재발 가능성 예측용 바이오마커 조성물을 제공할 수 있다.Accordingly, the present invention can provide a biomarker composition for predicting the possibility of metastasis or recurrence of medulloblastoma, comprising at least one selected from the group consisting of miR-135b and miR-135a as an active ingredient.

본 명세서에서 사용된 용어 “바이오마커”는, 생물학적 현상의 존재와 정량적 또는 정성적으로 연관된 분자를 의미하며, 본 발명의 바이오마커는 수모세포종의 전이 가능성 또는 재발 가능성을 예측하거나 진단해내기 위한 기준이 되는 유전자, 보다 구체적으로는 miRNA를 지칭한다. 수모세포종의 뇌종양 스페로이드 형성 세포(BTSCs)는 종양의 자기재생, 증식에 있어 핵심적인 역할을 하며, 특히 종양을 구성하는 벌크 종양 세포(BTCs)는 다른 종류의 세포로는 분화가 불가능하나, BTSCs는 줄기세포능, 즉 다분화능을 가지기 때문에, 다른 종류의 세포로 분화가 가능하여 전이에 있어서도 중추적인 역할을 담당하는 세포이다. 본 발명자들은 상기 BTSCs에서만 miR-135b 및 miR-135a가 특이적으로 발현이 증가하는 사실을 발견하였다. 따라서, 상기 miRNA의 발현 수준이 높을수록 BTSCs의 비율이 높다는 것을 의미하고, BTSCs의 비율이 높을수록 종양의 자기재생능력, 증식력, 전이 능력이 전반적으로 증가하게 되므로 종양의 전이 또는 재발 가능성이 증가하게 되는 것이다.As used herein, the term “biomarker” refers to a molecule quantitatively or qualitatively related to the presence of a biological phenomenon, and the biomarker of the present invention is a criterion for predicting or diagnosing the metastatic potential or recurrence potential of medulloblastoma. It refers to a gene, more specifically miRNA. Medulloblastoma brain tumor spheroid-forming cells (BTSCs) play a key role in tumor self-renewal and proliferation. is a cell that plays a pivotal role in metastasis as it can differentiate into other types of cells because it has stem cell ability, i.e., pluripotency. The present inventors found that the expression of miR-135b and miR-135a specifically increased only in the BTSCs. Therefore, the higher the expression level of the miRNA, the higher the ratio of BTSCs, and the higher the ratio of BTSCs, the more the tumor's self-renewal ability, proliferative power, and metastatic ability increase overall, so the possibility of tumor metastasis or recurrence increases. will become

본 발명에 따른 “miR-135b”는 성숙한 has-miR-135b-5p를 의미하는 것으로서, 서열번호 1로 표시되는 염기서열을 포함하거나, 서열번호 1로 표시되는 염기서열로 이루어질 수 있다.“miR-135b” according to the present invention refers to mature has-miR-135b-5p, and may include the nucleotide sequence shown in SEQ ID NO: 1 or may consist of the nucleotide sequence shown in SEQ ID NO: 1.

본 발명에 따른 “miR-135a”는 성숙한 has-miR-135a-5p를 의미하는 것으로서, 서열번호 2로 표시되는 염기서열을 포함하거나, 서열번호 2로 표시되는 염기서열로 이루어질 수 있다.“miR-135a” according to the present invention refers to mature has-miR-135a-5p, and may include the nucleotide sequence shown in SEQ ID NO: 2 or may consist of the nucleotide sequence shown in SEQ ID NO: 2.

본 명세서에서 사용된 용어 “전이”는, 다른 조직에서 암을 형성시키기 위하여 혈관 및 림프관을 통해 본래 종양 부위로부터 암 세포가 이동하는 것을 의미한다. 전이는 또한 떨어져 있는 부위에서 성장하는 2차 암에 대해 사용되는 용어이다.As used herein, the term “metastasis” refers to the movement of cancer cells from the original tumor site through blood vessels and lymphatic vessels to form cancer in other tissues. Metastasis is also a term used for secondary cancers that grow at distant sites.

본 명세서에서 사용된 용어 “재발”은, 경감 기간 후에 암의 재출현을 의미한다. 이는 초기 암으로부터 세포의 불완전한 제거에 기인한 것일 수 있고, 국소적으로 (초기 암과 동일한 부위), 국지적으로 (초기 암 부근, 가능하게는 림프절 또는 조직에), 및/또는 전이의 결과로서 멀리서 발생할 수 있다.As used herein, the term “relapse” refers to the reappearance of cancer after a period of remission. This may be due to incomplete removal of cells from the initial cancer, locally (same site as the initial cancer), locally (near the initial cancer, possibly in lymph nodes or tissues), and/or distant as a result of metastasis can occur

본 발명의 다른 양태로서, 본 발명은 miR-135b 및 miR-135a로 이루어진 군에서 선택된 어느 하나 이상의 발현 수준을 측정하는 제제를 포함하는, 수모세포종의 전이 또는 재발 가능성 예측용 조성물을 제공한다.As another aspect of the present invention, the present invention provides a composition for predicting the possibility of metastasis or recurrence of medulloblastoma, comprising an agent for measuring the expression level of any one or more selected from the group consisting of miR-135b and miR-135a.

본 발명의 또 다른 양태로서, 본 발명은 miR-135b 및 miR-135a로 이루어진 군에서 선택된 어느 하나 이상의 발현 수준을 측정하는 제제를 포함하는, 수모세포종의 전이 또는 재발 가능성 예측용 키트를 제공한다.As another aspect of the present invention, the present invention provides a kit for predicting the possibility of metastasis or recurrence of medulloblastoma, comprising an agent for measuring the expression level of any one or more selected from the group consisting of miR-135b and miR-135a.

본 발명에 있어서, 상기 miR-135b 또는 miR-135a는 수모세포종의 뇌종양 스페로이드 형성 세포(brain tumor spheroid-forming cells) 또는 이로부터 유래한 세포외 소포체(extracellular vesicles)에서 특이적으로 발현이 증가되는 것일 수 있으나, 이에 제한되는 것은 아니다.In the present invention, the miR-135b or miR-135a is specifically increased in expression in brain tumor spheroid-forming cells of medulloblastoma or extracellular vesicles derived therefrom. may be, but is not limited thereto.

본 명세서에서 사용된 용어 “세포외 소포체(extracellular vesicles) 및 EVs”는, 지질 이중층 또는 마이셀에 의해서 함유된 세포로부터의 유체, 거대-분자, 용질, 및 대사체로 이루어진 약 10nm 내지 10μm 크기의 소포체를 지칭한다. 본 명세서에서 언급되는 EVs는 세포-유래 EVs이다. 용어 “EVs”는 또한 세포-유래 EVs, 예컨대 신경 EVs에서 발견되는 생물활성 분자를 함유하도록 조작된 지질 소포를 포함한다. 이들 용어는 엑소좀 및 에토좀 둘 모두를 포함한다. 엑소좀은 다소포체(MVB)의 엑소사이토시스(exocytosis) 상에 배출된다. 에토좀은 원형질 막에서 조립되어, 그것으로부터 방출된 소포이다.As used herein, the term “extracellular vesicles and EVs” refers to vesicles with a size of about 10 nm to 10 μm consisting of a lipid bilayer or fluid, macro-molecules, solutes, and metabolites from cells contained by micelles. refers to EVs referred to herein are cell-derived EVs. The term “EVs” also includes lipid vesicles engineered to contain bioactive molecules found in cell-derived EVs, such as neuronal EVs. These terms include both exosomes and etosomes. Exosomes are released onto exocytosis of the multivesicular body (MVB). Etosomes are vesicles that assemble at the plasma membrane and are released from it.

본 발명에 있어서, 상기 miR-135b 또는 miR-135a는 이들의 표적 유전자인 AMOTL2(angiomotin-like 2)의 발현을 억제할 수 있다.In the present invention, the miR-135b or miR-135a may inhibit the expression of their target gene AMOTL2 (angiomotin-like 2).

본 명세서에 사용된 용어 “AMOTL2”는 “Angiomotin-like 2” 유전자를 의미하는 것으로서, 이로부터 4가지의 동형(isoform) 단백질이 발현되는 것으로 알려져있다. AMOTL2 유전자는, 예를 들어 서열번호 3, 서열번호 4, 서열번호 5 또는 서열번호 6로 표시되는 염기서열을 포함하거나, 서열번호 3, 서열번호 4, 서열번호 5 또는 서열번호 6로 표시되는 염기서열로 이루어질 수 있으며, 서열번호 3, 서열번호 4, 서열번호 5 또는 서열번호 6의 염기서열과 80% 이상, 더욱 바람직하게는 90% 이상, 더더욱 바람직하게는 95% 이상의 서열 상동성을 가지는 염기서열로 이루어질 수 있다. 예를 들면, 70%, 71%, 72%, 73%, 74%, 75%, 76%, 77%, 78%, 79%, 80%, 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 100%의 서열 상동성을 갖는 염기서열을 포함한다. 염기열에 대한 "서열 상동성의 %"는 두 개의 최적으로 배열된 서열과 비교 영역을 비교함으로써 확인되며, 비교 영역에서의 염기서열의 일부는 두 서열의 최적 배열에 대한 참고 서열(추가 또는 삭제를 포함하지 않음)에 비해 추가 또는 삭제(즉, 갭)를 포함할 수 있다.As used herein, the term “AMOTL2” refers to an “Angiomotin-like 2” gene, from which four isoform proteins are known to be expressed. The AMOTL2 gene includes, for example, a nucleotide sequence represented by SEQ ID NO: 3, SEQ ID NO: 4, SEQ ID NO: 5 or SEQ ID NO: 6, or a base represented by SEQ ID NO: 3, SEQ ID NO: 4, SEQ ID NO: 5 or SEQ ID NO: 6 It may consist of a sequence, and has a sequence homology of 80% or more, more preferably 90% or more, even more preferably 95% or more to the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 3, SEQ ID NO: 4, SEQ ID NO: 5 or SEQ ID NO: 6 It may consist of a sequence. For example, 70%, 71%, 72%, 73%, 74%, 75%, 76%, 77%, 78%, 79%, 80%, 81%, 82%, 83%, 84%, 85 %, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 100% sequence homology It includes a nucleotide sequence having The "% of sequence homology" for a base sequence is determined by comparing two optimally aligned sequences with a comparison region, and a portion of the sequence in the comparison region is a reference sequence (including additions or deletions) to the optimal alignment of the two sequences. additions or deletions (ie, gaps) compared to not).

본 발명에 있어서, 상기 제제는 miR-135b 또는 miR-135a에 특이적으로 결합하는 안티센스 올리고뉴클레오타이드, 프라이머 세트, 프로브 및 항체로 이루어진 군으로부터 선택되는 1종 이상을 포함하는 것일 수 있으나, 이에 제한되는 것은 아니다.In the present invention, the agent may include one or more selected from the group consisting of antisense oligonucleotides, primer sets, probes and antibodies that specifically bind to miR-135b or miR-135a, but is limited thereto it is not

본 발명에 있어서 상기 키트는 RT-PCR 키트 또는 DNA 칩인 것일 수 있으나, 이에 제한되는 것은 아니다.In the present invention, the kit may be an RT-PCR kit or a DNA chip, but is not limited thereto.

본 발명의 또 다른 양태로서, 본 발명은 하기의 단계를 포함하는 수모세포종의 전이 또는 재발 가능성 예측 방법 또는 이를 예측하기 위한 정보제공방법을 제공한다:As another aspect of the present invention, the present invention provides a method for predicting metastasis or recurrence of medulloblastoma or an information providing method for predicting the same, comprising the steps of:

(a) 수모세포종 환자의 시료에서 miR-135b 및 miR-135a로 이루어진 군에서 선택된 어느 하나 이상의 발현 수준을 측정하는 단계; 및(a) measuring the expression level of any one or more selected from the group consisting of miR-135b and miR-135a in a sample from a medulloblastoma patient; and

(b) 상기 miR-135b 및 miR-135a로 이루어진 군에서 선택된 어느 하나 이상의 발현 수준이 높을수록 전이 또는 재발 가능성을 높게 판단하는 단계.(b) determining that the higher the expression level of any one or more selected from the group consisting of miR-135b and miR-135a, the higher the possibility of metastasis or recurrence.

본 발명의 다른 양태로서, 본 발명은 AMOTL2 유전자를 유효성분으로 포함하는, 수모세포종 환자의 예후 예측용 바이오마커 조성물을 제공한다.As another aspect of the present invention, the present invention provides a biomarker composition for predicting the prognosis of a medulloblastoma patient, comprising the AMOTL2 gene as an active ingredient.

본 발명의 또 다른 양태로서, 본 발명은 AMOTL2 유전자의 발현 수준을 측정하는 제제를 포함하는, 수모세포종 환자의 예후 예측용 조성물을 제공한다.As another aspect of the present invention, the present invention provides a composition for predicting the prognosis of a medulloblastoma patient, comprising an agent for measuring the expression level of the AMOTL2 gene.

본 발명의 또 다른 양태로서, 본 발명은 AMOTL2 유전자의 발현 수준을 측정하는 제제를 포함하는, 수모세포종 환자의 예후 예측용 키트를 제공한다.As another aspect of the present invention, the present invention provides a kit for predicting the prognosis of a medulloblastoma patient, comprising an agent for measuring the expression level of the AMOTL2 gene.

본 발명에 있어서, 상기 수모세포종은 그룹 3 수모세포종 또는 그룹 4 수모세포종일 수 있으나, 이에 제한되는 것은 아니다.In the present invention, the medulloblastoma may be a group 3 medulloblastoma or a group 4 medulloblastoma, but is not limited thereto.

본 발명에 있어서, 상기 상기 AMOTL2 유전자는 수모세포종의 뇌종양 스페로이드 형성 세포에서 특이적으로 발현이 감소되는 것일 수 있으나, 이에 제한되는 것은 아니다.In the present invention, the AMOTL2 gene may be specifically reduced in expression in medulloblastoma brain tumor spheroid-forming cells, but is not limited thereto.

본 발명에 있어서, 상기 상기 AMOTL2 유전자는 miR-135b 및 miR-135a로 이루어진 군에서 선택된 어느 하나 이상에 의해 발현이 억제되는 것일 수 있으나, 이에 제한되는 것은 아니다.In the present invention, the expression of the AMOTL2 gene may be inhibited by any one or more selected from the group consisting of miR-135b and miR-135a, but is not limited thereto.

본 발명에 있어서, 상기 제제는 AMOTL2 유전자에 특이적으로 결합하는 안티센스 올리고뉴클레오타이드, 프라이머 세트, 프로브 및 항체로 이루어진 군으로부터 선택되는 1종 이상을 포함하는 것일 수 있으나, 이에 제한되는 것은 아니다.In the present invention, the agent may include one or more selected from the group consisting of antisense oligonucleotides, primer sets, probes, and antibodies that specifically bind to the AMOTL2 gene, but is not limited thereto.

본 명세서에서 사용된 용어 “프라이머”란, DNA 합성의 기시점이 되는 짧은 유전자 서열로써, 진단, DNA 시퀀싱 등에 이용할 목적으로 합성된 올리고뉴클레오타이드를 의미한다. 상기 프라이머들은 통상적으로 15 내지 30 염기쌍의 길이로 합성하여 사용할 수 있으나, 사용 목적에 따라 달라질 수 있으며, 공지된 방법으로 메틸화, 캡화등으로 변형시킬 수 있다. 프라이머는 적절한 완충용액 및 온도에서 중합반응(즉, DNA 중합효소 또는 역전사효소)을 위한 시약 및 상이한 4가지 뉴클레오사이드 트리포스페이트의 존재하에서 DNA 합성을 개시할 수 있다.As used herein, the term “primer” refers to an oligonucleotide synthesized for use in diagnosis, DNA sequencing, etc. as a short gene sequence serving as a starting point of DNA synthesis. The primers can be synthesized and used with a length of typically 15 to 30 base pairs, but may vary depending on the purpose of use, and may be modified by methylation, capping, etc. by a known method. Primers are capable of initiating DNA synthesis in the presence of reagents for polymerization (ie, DNA polymerase or reverse transcriptase) and four different nucleoside triphosphates in appropriate buffers and temperatures.

본 명세서에서 사용된 용어 “프로브”란, 효소 화학적인 분리정제 또는 합성과정을 거쳐 제작된 수 염기 내지 수백 염기길이의 RNA와 특이적으로 결합할 수 있는 핵산을 의미한다. 방사성 동위원소나 효소 등을 표지하여 RNA의 존재 유무를 확인할 수 있으며, 공지된 방법으로 디자인하고 변형시켜 사용할 수 있다.As used herein, the term “probe” refers to a nucleic acid capable of specifically binding to RNA having a length of several bases to several hundreds of bases produced through an enzymatic chemical separation, purification or synthesis process. The presence or absence of RNA can be checked by labeling radioactive isotopes or enzymes, and can be designed and modified by a known method.

본 명세서에서 사용된 용어 “항체”란, 항원성 부위에 대하여 지시되는 특이적인 면역 글로불린을 의미한다. 상기 항체는 수모세포종의 전이 또는 재발 가능성 예측용 바이오마커인 miR-135b 또는 miR-135a 각각에 특이적으로 결합하는 항체 또는 수모세포종 환자의 예후 예측용 바이오마커인 AMOTL2 유전자에 특이적으로 결합하는 항체를 의미한다. 상기 항체는 당해 기술분야의 통상적인 방법에 따라 제조할 수 있다. 상기 항체의 형태는 폴리클로날 항체 또는 모노클로날 항체를 포함하며, 모든 면역글로불린 항체가 포함된다. 상기 항체는 2개의 전체 길이의 경쇄 및 2개의 전체 길이의 중쇄를 갖는 완전한 형태뿐만 아니라, 2개의 경쇄 및 2개의 중쇄를 갖는 완전한 형태 온전한 항체의 구조를 갖지는 않지만, 항원성 부위에 대해 지시되는 특이적인 항원결합부위(결합 도메인)를 가져 항원 결합 기능을 보유하고 있는, 항체 분자의 기능적 단편 또한 포함한다.As used herein, the term “antibody” refers to a specific immunoglobulin directed against an antigenic site. The antibody is an antibody that specifically binds to each of miR-135b or miR-135a, which are biomarkers for predicting metastasis or recurrence of medulloblastoma, or an antibody that specifically binds to the AMOTL2 gene, which is a biomarker for predicting the prognosis of medulloblastoma patients. means The antibody can be prepared according to a conventional method in the art. The form of the antibody includes a polyclonal antibody or a monoclonal antibody, and all immunoglobulin antibodies are included. The antibody does not have the structure of a complete antibody with two full-length light chains and two full-length heavy chains, as well as a complete form with two light and two heavy chains, but is directed against an antigenic site. It also includes a functional fragment of an antibody molecule having a specific antigen-binding site (binding domain) and retaining an antigen-binding function.

miR-135b, miR-135a 또는 AMOTL2 유전자의 뉴클레오타이드 서열은 알려져 있으므로, 당업자는 상기 서열을 바탕으로 이들 유전자의 서열에 대해 특이적으로 결합하는 프라이머 또는 프로브를 당해 기술 분야의 통상적인 방법에 따라 디자인할 수 있다.Since the nucleotide sequence of the miR-135b, miR-135a or AMOTL2 gene is known, a person skilled in the art can design a primer or probe that specifically binds to the sequence of these genes based on the sequence according to a conventional method in the art. can

본 발명의 키트는 상기한 성분 이외에도, 다른 성분들을 추가적으로 포함할 수 있다. 예를 들어, 본 발명의 키트가 PCR 증폭 과정에 적용되는 경우에는, 본 발명의 키트는 선택적으로, PCR 증폭에 필요한 시약, 예컨대, 완충액, DNA 중합효소[예컨대, Thermus aquaticus (Taq), Thermus thermophilus (Tth), Thermus filiformis, Thermis flavus, Thermococcus literalis 또는 Pyrococcus furiosus (Pfu)로부터 수득한 열 안정성 DNA 중합효소], DNA 중합 효소 조인자 및 dNTPs를 포함할 수 있다. 본 발명의 키트는 상기한 시약 성분을 포함하는 다수의 별도 패키징 또는 컴파트먼트로 제작될 수 있다. 본 발명의 바람직한 구현예에 따르면, 본 발명의 키트는 마이크로어레이일 수 있다. 본 발명의 바람직한 구현예에 따르면, 본 발명의 키트는 유전자 증폭 키트이다. 본 발명의 키트가 마이크로어레이인 경우에는, 마이크로어레이의 고상표면에 프로브가 고정화 되어 있다. 본 발명의 키트가 유전자 증폭 키트인 경우에는 프라이머를 포함한다.The kit of the present invention may additionally include other components in addition to the above components. For example, when the kit of the present invention is applied to a PCR amplification process, the kit of the present invention is optionally a reagent necessary for PCR amplification, such as a buffer, a DNA polymerase [eg, Thermus aquaticus (Taq), Thermus thermophilus (Tth), Thermus filiformis, Thermis flavus, Thermococcus literalis or thermostable DNA polymerase obtained from Pyrococcus furiosus (Pfu)], DNA polymerase cofactors and dNTPs. The kit of the present invention may be manufactured in a number of separate packaging or compartments containing the reagent components described above. According to a preferred embodiment of the present invention, the kit of the present invention may be a microarray. According to a preferred embodiment of the present invention, the kit of the present invention is a gene amplification kit. When the kit of the present invention is a microarray, a probe is immobilized on the solid surface of the microarray. When the kit of the present invention is a gene amplification kit, primers are included.

본 발명의 다른 양태로서, 본 발명은 하기의 단계를 포함하는 수모세포종 환자의 예후 예측 방법을 제공한다:As another aspect of the present invention, the present invention provides a method for predicting the prognosis of a medulloblastoma patient, comprising the steps of:

(a) 수모세포종 환자의 시료에서 AMOTL2 유전자 또는 단백질의 발현 수준을 측정하는 단계; 및(a) measuring the expression level of the AMOTL2 gene or protein in a sample from a medulloblastoma patient; and

(b) 상기 측정된 AMOTL2의 발현 수준이 높을수록 수모세포종 환자의 잔존 기대수명이 높을 것으로 판단하는 단계.(b) determining that the higher the measured expression level of AMOTL2, the higher the remaining life expectancy of the medulloblastoma patient.

본 발명의 다른 양태로서, 본 발명은 miR-135b 및 miR-135a로 이루어진 군에서 선택된 어느 하나 이상에 대한 억제제를 유효성분으로 포함하는, 수모세포종의 예방 또는 치료용 약학적 조성물을 제공한다.As another aspect of the present invention, the present invention provides a pharmaceutical composition for preventing or treating medulloblastoma, comprising an inhibitor for at least one selected from the group consisting of miR-135b and miR-135a as an active ingredient.

본 명세서에서 사용된 용어, “예방”이란 본 발명에 따른 조성물의 투여에 의해 수모세포종 증상을 차단하거나, 수모세포종 증상을 억제 또는 지연시키는 모든 행위를 의미한다.As used herein, the term “prevention” refers to any action that blocks medulloblastoma symptoms or suppresses or delays medulloblastoma symptoms by administering the composition according to the present invention.

본 명세서에서 사용된 용어, “치료”란 본 발명에 따른 조성물의 투여에 의해 수모세포종 증세가 호전되거나 이롭게 변경되는 모든 행위를 의미한다.As used herein, the term “treatment” refers to any action in which medulloblastoma symptoms are improved or beneficially changed by administration of the composition according to the present invention.

한편, 본 발명에 따른 약학적 조성물은 유효성분 이외에 약학적 조성물로 제조하기 위하여 통상적으로 사용하는 적절한 담체, 부형제 및/또는 희석제를 더 포함할 수 있다. 또한, 통상의 방법에 따라 산제, 과립제, 정제, 캡슐제, 현탁액, 에멀젼, 시럽, 에어로졸 등의 경구형 제형, 외용제, 좌제 및 멸균 주사용액의 형태로 제형화하여 사용될 수 있다.On the other hand, the pharmaceutical composition according to the present invention may further include an appropriate carrier, excipient and/or diluent commonly used to prepare a pharmaceutical composition in addition to the active ingredient. In addition, according to a conventional method, it can be formulated in the form of powders, granules, tablets, capsules, suspensions, emulsions, syrups, aerosols, etc., external preparations, suppositories, and sterile injection solutions.

상기 조성물에 포함될 수 있는 담체, 부형제 및 희석제로는 락토오스, 덱스트로오스, 수크로오스, 소르비톨, 만니톨, 자일리톨, 에리스리톨, 말티톨, 전분, 아카시아 고무, 알지네이트, 젤라틴, 칼슘 포스페이트, 칼슘 실리케이트, 셀룰로오스, 메틸 셀룰로오스, 미정질 셀룰로오스, 폴리비닐 피롤리돈, 물, 메틸히드록시 벤조에이트, 프로필히드록시 벤조에이트, 탈크, 마그네슘 스테아레이트, 및 광물유 등이 있다. 상기 조성물을 제제화할 경우에는 보통 사용하는 충진제, 증량제, 결합제, 습윤제, 붕해제, 계면활성제 등의 희석제 또는 부형제를 사용하여 조제할 수 있다.Carriers, excipients and diluents that may be included in the composition include lactose, dextrose, sucrose, sorbitol, mannitol, xylitol, erythritol, maltitol, starch, acacia gum, alginate, gelatin, calcium phosphate, calcium silicate, cellulose, methyl cellulose , microcrystalline cellulose, polyvinyl pyrrolidone, water, methyl hydroxy benzoate, propyl hydroxy benzoate, talc, magnesium stearate, and mineral oil. When formulating the composition, it can be prepared using a diluent or excipient such as a filler, an extender, a binder, a wetting agent, a disintegrant, and a surfactant usually used.

본 발명에 따른 약학적 조성물은 약학적으로 유효한 양으로 투여된다. 본 발명에 있어서, “약학적으로 유효한 양”은 의학적 치료에 적용 가능한 합리적인 수혜/위험 비율로 질환을 치료하기에 충분한 양을 의미하며, 유효용량 수준은 환자의 질환의 종류, 중증도, 약물의 활성, 약물에 대한 민감도, 투여 시간, 투여 경로 및 배출비율, 치료기간, 동시 사용되는 약물을 포함한 요소 및 기타 의학 분야에 잘 알려진 요소에 따라 결정될 수 있다.The pharmaceutical composition according to the present invention is administered in a pharmaceutically effective amount. In the present invention, "pharmaceutically effective amount" means an amount sufficient to treat a disease at a reasonable benefit/risk ratio applicable to medical treatment, and the effective dose level is the type, severity, and drug activity of the patient. , sensitivity to drug, administration time, administration route and excretion rate, treatment period, factors including concurrent drugs, and other factors well known in the medical field.

상기한 요소들을 모두 고려하여 부작용 없이 최소한의 양으로 최대 효과를 얻을 수 있는 양을 투여하는 것이 중요하며, 이는 당업자에 의해 결정될 수 있다. 구체적으로, 본 발명에 따른 약학적 조성물의 유효량은 환자의 연령, 성별, 상태, 체중, 체내에서 활성 성분의 흡수도, 불활성율 및 배설속도, 질병종류, 병용되는 약물에 따라 달라질 수 있다.In consideration of all of the above factors, it is important to administer an amount that can obtain the maximum effect with a minimum amount without side effects, which can be determined by a person skilled in the art. Specifically, the effective amount of the pharmaceutical composition according to the present invention may vary depending on the patient's age, sex, condition, weight, absorption of the active ingredient in the body, inactivation rate and excretion rate, disease type, and drugs used in combination.

본 발명의 약학적 조성물은 개체에게 다양한 경로로 투여될 수 있다. 예를 들면, 경구 투여, 비강 내 투여, 경기관지 투여, 동맥 주사, 정맥 주사, 피하 주사, 근육 주사 또는 복강 내 주사에 의해 투여될 수 있으며, 종양 조직에 직접 주사하여 투여될 수 있다. 일일 투여량은 하루 일회 내지 수회 나누어 투여할 수 있다.The pharmaceutical composition of the present invention may be administered to an individual by various routes. For example, it may be administered by oral administration, intranasal administration, transbronchial administration, arterial injection, intravenous injection, subcutaneous injection, intramuscular injection or intraperitoneal injection, and may be administered by direct injection into tumor tissue. The daily dosage may be administered once or divided into several times a day.

본 발명에 있어서, 상기 miR-135b 또는 miR-135a는 수모세포종의 뇌종양 스페로이드 형성 세포 또는 이로부터 유래한 세포외 소포체에서 유래한 것일 수 있으나, 이에 제한되는 것은 아니다.In the present invention, the miR-135b or miR-135a may be derived from brain tumor spheroid-forming cells of medulloblastoma or extracellular vesicles derived therefrom, but is not limited thereto.

본 발명에 있어서, 상기 조성물은 종양구(tumorsphere)의 형성을 억제하는 것일 수 있으나, 이에 제한되는 것은 아니다.In the present invention, the composition may inhibit the formation of tumor spheres, but is not limited thereto.

본 명세서에서 사용된 용어 “종양구(tumorsphere)”는, 암 또는 종양 조직을 구성하는 세포 중 줄기세포(stem cells)와 유사한 특성을 가지는 일부의 세포가 형성하는 세포응집체를 의미한다.As used herein, the term “tumorsphere” refers to a cell aggregate formed by some cells having characteristics similar to stem cells among cells constituting cancer or tumor tissue.

본 발명에 있어서, 상기 조성물은 수모세포종의 생존력 또는 재생력을 저하시키거나 재발을 억제하는 것일 수 있으나, 이에 제한되는 것은 아니다.In the present invention, the composition may reduce the viability or regeneration of medulloblastoma or inhibit recurrence, but is not limited thereto.

본 발명에 있어서, 상기 조성물은 AMOTL2 유전자의 발현을 증가시키는 것일 수 있으나, 이에 제한되는 것은 아니다.In the present invention, the composition may increase the expression of the AMOTL2 gene, but is not limited thereto.

본 발명에 있어서, 상기 억제제는 miR-135b 또는 miR-135a에 상보적으로 결합하는 안티센스 올리고뉴클레오타이드, 이중가닥 siRNA(small interfering RNA), shRNA(short hairpin RNA) 및 리보자임으로 이루어진 군으로부터 선택되는 1종 이상인 것일 수 있으나, 이에 제한되는 것은 아니다.In the present invention, the inhibitor is an antisense oligonucleotide complementary to miR-135b or miR-135a, double-stranded siRNA (small interfering RNA), shRNA (short hairpin RNA) and ribozyme 1 selected from the group consisting of It may be more than a species, but is not limited thereto.

본 명세서에서 사용된 용어, “안티센스 올리고뉴클레오타이드”는 타겟으로 하는 miRNA, 특히 miRNA의 씨드(seed) 서열에 대한 상보적인 서열을 가지고 있어 miRNA와 이합체(duplex)를 형성할 수 있는 핵산-기반 분자를 포괄한다. 따라서, 본 명세서에서 용어 “안티센스 올리고뉴클레오타이드”는 “상보적 핵산-기반 억제제”로 기재될 수 있다.As used herein, the term “antisense oligonucleotide” refers to a nucleic acid-based molecule capable of forming a duplex with a miRNA by having a sequence complementary to a seed sequence of a target miRNA, particularly miRNA. encompasses Accordingly, the term “antisense oligonucleotide” herein may be described as a “complementary nucleic acid-based inhibitor”.

본 명세서에서 안티센스 올리고뉴클레오타이드를 언급하면서 사용되는 용어 “상보적”은 소정의 혼성화 또는 어닐링(annealing) 조건, 바람직하게는 생리학적 조건 하에서 안티센스 올리고뉴클레오타이드가 상기 miRNA 타겟에 선택적으로 혼성화 할 정도로 충분히 상보적인 것을 의미하며, 실질적으로 상보적(substantially complementary) 및 완전히 상보적(perfectly complementary)인 것을 모두 포괄하는 의미를 가지며, 바람직하게는 완전히 상보적인 것을 의미한다.As used herein, the term “complementary” when referring to an antisense oligonucleotide means that the antisense oligonucleotide is sufficiently complementary to selectively hybridize to the miRNA target under predetermined hybridization or annealing conditions, preferably physiological conditions. It means that it has a meaning encompassing both substantially complementary and perfectly complementary, and preferably means completely complementary.

본 발명에서 안티센스 올리고뉴클레오타이드는 다양한 분자를 포함한다. 안티센스 올리고뉴클레오타이드는 DNA 또는 RNA 분자이며, 보다 바람직하게는 RNA 분자이다. 선택적으로, 본 발명에서 이용되는 안티센스 올리고뉴클레오타이드는 리보뉴클레오타이드(RNA), 디옥시리보뉴클레오타이드(DNA), 2'-O-변형 올리고뉴클레오타이드, 포스포로티오에이트-백본 디옥시리보뉴클레오타이드, PNA(peptide nucleic acid) 또는 LNA(locked nucleic acid)이다. 2'-O-변형 올리고뉴클레오타이드는, 예를 들면 2'-O-알킬 올리고뉴클레오타이드, 2'-O-C1-3 알킬 올리고뉴클레오타이드 또는 2'-O-C1-3 메틸 올리고뉴클레오타이드 등일 수 있다.Antisense oligonucleotides in the present invention include various molecules. The antisense oligonucleotide is a DNA or RNA molecule, more preferably an RNA molecule. Optionally, the antisense oligonucleotide used in the present invention is ribonucleotide (RNA), deoxyribonucleotide (DNA), 2'-O-modified oligonucleotide, phosphorothioate-backbone deoxyribonucleotide, PNA (peptide nucleic acid) or LNA (locked nucleic acid). The 2'-O-modified oligonucleotide may be, for example, a 2'-O-alkyl oligonucleotide, a 2'-O-C1-3 alkyl oligonucleotide, or a 2'-O-C1-3 methyl oligonucleotide.

본 명세서에서 사용된 용어, “siRNA, shRNA 및 miRNA”는 RNA 방해 또는 유전자 사일런싱(silencing)을 매개하기 위하여 주로 목적 유전자로부터 전사된 mRNA에 결합하여, 상기 mRNA의 해독을 저해하는 핵산 분자를 의미한다. 상기 miRNA, siRNA 및 shRNA는 표적 유전자의 발현을 해독수준에서 억제할 수 있기 때문에, 효율적인 유전자 넉다운(knockdown) 방법 또는 유전자치료 방법에 사용될 수 있다.As used herein, the terms “siRNA, shRNA and miRNA” refer to nucleic acid molecules that bind to mRNA transcribed from a target gene mainly to mediate RNA interference or gene silencing, thereby inhibiting the translation of the mRNA. do. Since the miRNA, siRNA and shRNA can inhibit the expression of a target gene at a translational level, they can be used in an efficient gene knockdown method or gene therapy method.

본 명세서에서 사용된 용어, “리보자임”은 표적 RNA 분자 내 특정 뉴클레오타이드 서열을 인식하여 부위 특이적으로 절단시킴으로써 표적 유전자의 단백질 발현을 억제할 수 있다.As used herein, the term “ribozyme” may inhibit protein expression of a target gene by recognizing a specific nucleotide sequence in a target RNA molecule and cleaving it site-specifically.

본 명세서에서 사용된 용어, “PNA”는 핵산 모방체, 예를 들어, DNA 모방체를 의미하고, 여기에서 데옥시리보오스 포스페이트 백본은 슈도펩타이드 백본으로 치환되고 단지 원래 4개의 뉴클레오염기가 유지된다. PNA의 중성의 백본은 낮은 이온성 강도의 조건 하에 DNA 및 RNA에 특이적인 하이브리드를 제공하는 것으로 알려져 있으며, 전사 또는 번역 억제를 유도하거나 복제를 억제하여 유전자 발현의 서열-특이적 조절에 대한 안티센스 또는 항원 제제로서 사용될 수 있다.As used herein, the term "PNA" refers to a nucleic acid mimic, e.g., a DNA mimic, wherein the deoxyribose phosphate backbone is substituted with a pseudopeptide backbone and only the original four nucleobases are retained. . The neutral backbone of PNA is known to provide specific hybridization to DNA and RNA under conditions of low ionic strength, inducing transcriptional or translational repression, or inhibiting replication, resulting in antisense or antisense to sequence-specific regulation of gene expression. It can be used as an antigen preparation.

본 발명의 또 다른 양태로서, 본 발명은 하기의 단계를 포함하는, 수모세포종 치료제의 스크리닝 방법을 제공한다:In another aspect of the present invention, the present invention provides a method for screening a therapeutic agent for medulloblastoma, comprising the steps of:

(a) 시료에 피검물질을 처리하는 단계;(a) processing the test substance in the sample;

(b) 상기 시료에서 miR-135b, miR-135a 또는 AMOTL2 유전자의 발현 수준을 측정하는 단계; 및(b) measuring the expression level of miR-135b, miR-135a or AMOTL2 gene in the sample; and

(c) 상기 miR-135b 또는 miR-135a의 발현 수준이 감소하는 경우 또는 AMOTL2 유전자의 발현 수준이 증가하는 경우 피검물질이 수모세포종 치료 효과가 있는 것으로 판정하는 단계.(c) when the expression level of miR-135b or miR-135a decreases or when the expression level of AMOTL2 gene increases, determining that the test material has an effect on treating medulloblastoma.

본 명세서 및 청구범위에 사용된 용어나 단어는 통상적이거나 사전적인 의미로 한정해서 해석되어서는 아니 되며, 발명자는 그 자신의 발명을 가장 최선의 방법으로 설명하기 위해 용어의 개념을 적절하게 정의할 수 있다는 원칙에 입각하여 본 발명의 기술적 사상에 부합하는 의미와 개념으로 해석되어야만 한다.The terms or words used in the present specification and claims should not be construed as being limited to their ordinary or dictionary meanings, and the inventor may properly define the concept of the term in order to best describe his invention. It should be interpreted as meaning and concept consistent with the technical idea of the present invention based on the principle that there is.

이하, 본 발명의 이해를 돕기 위하여 바람직한 실시예를 제시한다. 그러나 하기의 실시예는 본 발명을 보다 쉽게 이해하기 위하여 제공되는 것일 뿐, 하기 실시예에 의해 본 발명의 내용이 한정되는 것은 아니다.Hereinafter, preferred examples are presented to help the understanding of the present invention. However, the following examples are only provided for easier understanding of the present invention, and the contents of the present invention are not limited by the following examples.

[실시예][Example]

실험 재료 및 방법Experimental materials and methods

1. 환자 및 샘플1. Patient and Sample

서울대학교 어린이 병원에서 수술을 받은 수모세포종 환자로부터 신선한 종양 조직(N=10)을 얻었다. 종양 조직 샘플은 적합한 환자 및/또는 그들의 부모로부터 서면 동의서를 받아 사용하였다. 1차 세포 배양(primary cell culture)을 위해, 종양 조직을 절제한 후 6 시간 이내에 처리하였다. 급속 동결된(snap-frozen) 조직은 하위그룹(subgroup) 분석을 위해 사용하였다. 10명의 환자 샘플 중에서, 환자 번호 1-9는 모든 분석에 사용되었고, 번호 10은 분석 결과에 따라 miR-135b, miR-135a 및 AMOTL2(angiomotin-like 2)의 발현 수준을 검증한 후 기능적 분석에만 사용되었다.Fresh tumor tissue (N=10) was obtained from a medulloblastoma patient who underwent surgery at Seoul National University Children's Hospital. Tumor tissue samples were used with written consent from appropriate patients and/or their parents. For primary cell culture, the tumor tissue was excised and processed within 6 hours. Snap-frozen tissues were used for subgroup analysis. Among the 10 patient samples, patient numbers 1-9 were used for all analyses, and number 10 was used only for functional analysis after verifying the expression levels of miR-135b, miR-135a and AMOTL2 (angiomotin-like 2) according to the analysis results. was used

2. 세포 배양2. Cell Culture

신선한 종양 조직(N=10)을 수득하고 효소를 이용하여 단일 세포로 해리시켰다. 한 명의 환자로부터 수득한 단일 세포는 기존에 알려진 방법에 따라 벌크 종양 세포(bulk tumor cells, BTCs) 및 뇌종양 스페로이드 형성 세포(brain tumor spheroid-forming cells, BTSCs)로 분리하여 개별적으로 배양하였다. BTCs는 10% Exo-FBS™(엑소좀이 고갈된 소태아혈청; System Biosciences, 미국) 및 페니실린-스트렙토마이신(Life Technologies, 미국)으로 보충된 DMEM (Dulbecco's modified eagle's medium; Invitrogen, 미국)에서 배양하였다. BTSCs는 2mM L-글루타민, N2 보충제(Invitrogen), B27 보충제 (Invitrogen), 20ng/ml의 인간 재조합 상피세포성장인자(epidermal growth factor, EGF; R&D system, 미국) 및 기본 섬유아세포성장인자(basic fibroblast growth factor, bFGF; R&D system)를 함유하는 신경기저 배지(neurobasal medium; Invitrogen)에서 배양하였다. 각 세포의 계대배양(subculture)은 BTCs에 TrypLE™ Express (Invitrogen) 및 BTSCs에 Accutase™(Invitrogen)를 처리함으로써 수행되었다. 모든 세포는 초기 계대(<4)만 실험에 사용하였고, 가습된 대기에서 5% CO2로 37℃에서 유지되었다. 추가적인 기능 연구에서는 그룹 4에 해당하는 BTSCs만 사용하였다.Fresh tumor tissue (N=10) was obtained and dissociated into single cells using enzymes. Single cells obtained from one patient were separated into bulk tumor cells (BTCs) and brain tumor spheroid-forming cells (BTSCs) according to a known method and cultured individually. BTCs were cultured in DMEM (Dulbecco's modified eagle's medium; Invitrogen, USA) supplemented with 10% Exo-FBS™ (exosome-depleted fetal bovine serum; System Biosciences, USA) and penicillin-streptomycin (Life Technologies, USA). did. BTSCs contain 2 mM L-glutamine, N2 supplement (Invitrogen), B27 supplement (Invitrogen), 20 ng/ml human recombinant epidermal growth factor (EGF; R&D system, USA) and basic fibroblast growth factor (basic fibroblast growth factor). Growth factor, bFGF; R&D system) containing a neurobasal medium (neurobasal medium; Invitrogen) was cultured. Subculture of each cell was performed by treating BTCs with TrypLE™ Express (Invitrogen) and BTSCs with Accutase™ (Invitrogen). All cells were only used for the initial passage (<4) experiments and were maintained at 37° C. with 5% CO 2 in a humidified atmosphere. In additional functional studies, only BTSCs corresponding to group 4 were used.

3. 면역형광법(Immunofluorescence)3. Immunofluorescence

세포를 8-well Lab-Tek 챔버 슬라이드(Nunc) 상에 플레이팅하고, 1차 항체: 네스틴(1:200; Chemicon, 미국) 및 무사시(Musashi; 1:100; Neuromics, 미국)를 사용하여 면역형광 연구를 수행하였다. 2차 항체 Alexa Fluor 488이 컨쥬게이트된 염소 항-마우스 IgG 및 Alexa Fluor 594가 컨쥬게이트된 염소 항-토끼 IgG(1:200; Invitrogen)를 처리한 다음, DAPI(4′,6-diamidino-2-phenylindole)를 함유하는 안티페이딩(antifading) 용액(Vector Laboratories, 미국)을 사용하여 대비염색 하였다. 형광 이미지는 공초점 현미경(Leica, 독일)에 의해 얻었다.Cells were plated on 8-well Lab-Tek chamber slides (Nunc) and using primary antibodies: Nestin (1:200; Chemicon, USA) and Musashi (1:100; Neuromics, USA) Immunofluorescence studies were performed. Goat anti-mouse IgG conjugated with secondary antibody Alexa Fluor 488 and goat anti-rabbit IgG conjugated with Alexa Fluor 594 (1:200; Invitrogen), followed by DAPI (4′,6-diamidino-2 -phenylindole) containing antifading solution (Vector Laboratories, USA) was used for counterstaining. Fluorescence images were obtained by confocal microscopy (Leica, Germany).

4. 엑소좀(exosomes)을 포함하는 세포외 소포체(EVs)의 분리4. Isolation of Extracellular Vesicles (EVs) Containing Exosomes

엑소좀을 포함하는 EVs는 조건 배지(conditioned media)에서 miRCURY 엑소좀 키트(Exiqon, 덴마크)를 사용하여 제조사의 지침에 따라 분리되었다. 세포 및 세포 단편을 제거하기 위해, 샘플을 3,200g에서 5분 동안 원심분리 하였다. 침전 버퍼를 상등액에 첨가하고 -20℃에서 12시간 동안 냉각시켜 EVs 침전시켰다. 3,200g에서 30분 동안 원심분리하여 수집된 EVs 펠렛을 20μL의 PBS(phosphate-buffered saline)에 용해시켰다.EVs containing exosomes were isolated from conditioned media using the miRCURY exosome kit (Exiqon, Denmark) according to the manufacturer's instructions. To remove cells and cell fragments, samples were centrifuged at 3,200 g for 5 minutes. Precipitation buffer was added to the supernatant and cooled at -20 °C for 12 hours to precipitate EVs. The EVs pellet collected by centrifugation at 3,200 g for 30 minutes was dissolved in 20 μL of phosphate-buffered saline (PBS).

5. 나노입자 추적 분석(Nanoparticle tracking analysis, NTA)5. Nanoparticle tracking analysis (NTA)

EVs의 크기, 농도 및 분포를 분석하기 위해 나노사이트 NS3000 시스템 (NanoSight Technology Malvern, 영국)을 갖춘 NTA가 사용되었다. 샘플을 프레임 당 20-100개의 오브젝트와 일치하도록 희석하고, 나노사이트 샘플 챔버에 부드럽게 주입하였다. 작은 입자의 정확하고 일관된 검출을 보장하기 위해, 기존에 보고된 바에 따라 검출 임계값을 7로 유지하였다. 데이터는 NTA 분석 소프트웨어 (ver. 2.3)를 사용하여 분석되었다.An NTA equipped with a NanoSight NS3000 system (NanoSight Technology Malvern, UK) was used to analyze the size, concentration and distribution of EVs. Samples were diluted to match 20-100 objects per frame and gently injected into the nanosite sample chamber. To ensure accurate and consistent detection of small particles, the detection threshold was kept at 7 as previously reported. Data were analyzed using NTA analysis software (ver. 2.3).

6. 투과전자현미경(Transmission electron microscopy, TEM)6. Transmission electron microscopy (TEM)

형태학적 조사를 위해, TEM(HT7700; Hitachi Ltd., 일본)을 서울대학교 이미징 코어 시설에 의해 수행하였다. 간단히, EVs를 4% 파라포름알데히드와 혼합하고, 실온(RT)에서 폼바르/탄소 코팅 그리드(formvar/carbon-coated grid)에 20분 동안 포매(embedding)하였다. 포매된 EVs를 PBS로 세척하고, 1% 글루타르알데히드(glutaraldehyde)에 5분 동안 고정시킨 다음, 포화 수용성 옥살산우라닐(uranyl oxalate)로 염색하였다. 이어서, 샘플을 얼음상에서 0.4% 아세트산 우라닐(uranyl acetate) 및 1.8% 메틸 셀룰로스(methylcellulose)에 10분 동안 포매하였다. 샘플은 TEM(JEOL, 미국)에 의해 시각화하기 전에 실온에서 건조하였다. EVs는 마이크로 BCA 단백질 분석(Thermo Fisher Scientific, 미국)에 의해 정량화하였다.For morphological investigations, TEM (HT7700; Hitachi Ltd., Japan) was performed by Seoul National University Imaging Core Facility. Briefly, EVs were mixed with 4% paraformaldehyde and embedded in a formvar/carbon-coated grid at room temperature (RT) for 20 min. The embedded EVs were washed with PBS, fixed in 1% glutaraldehyde for 5 minutes, and then stained with saturated aqueous uranyl oxalate (uranyl oxalate). Then, the sample was embedded in 0.4% uranyl acetate and 1.8% methylcellulose on ice for 10 minutes. Samples were dried at room temperature prior to visualization by TEM (JEOL, USA). EVs were quantified by micro BCA protein assay (Thermo Fisher Scientific, USA).

7. 웨스턴 블롯팅 (Western Blotting)7. Western Blotting

세포의 단백질 및 EVs는 프로테아제 억제제 칵테일을 함유한 RIPA 버퍼(GenDEPOT, 미국)를 이용하여 추출하였다. 단백질 농도는 BCA 단백질 분석 키트(Pierce, Thermo Fisher Scientific)에 의해 정량화하였다. 4-12% 구배의 SDS-PAGE(sodium dodecyl sulfate polyacrylamide gel electrophoresis)를 사용하여 동일한 양의 단백질을 분리하고, 제조사의 지침에 따라 iBlot 2 블롯팅 시스템(Life Technologies)에 의해 니트로 셀룰로오스(nitrocellulose) 멤브레인으로 트랜스퍼 하였다. 상기 멤브레인을 5% 탈지유로 블로킹(blocking)한 후, 1차 항체: 플로틸린-1 (1:500; Abcam, 미국), 칼넥신 (1:500; Cell signaling Technology, 미국) 및 β- 액틴(1:10,000; Sigma-Aldrich, 미국)으로 표지하였다. 이어서, 멤브레인을 HRP(horseradish peroxidase)가 컨쥬게이트된 2차 항체와 함께 배양하고, 면역 반응성 단백질을 강화된 Novex™ ECL Chemiluminescent Substrate Reagent 키트(Invitrogen)를 사용하여 시각화하였다.Cellular proteins and EVs were extracted using RIPA buffer (GenDEPOT, USA) containing a protease inhibitor cocktail. Protein concentration was quantified by BCA Protein Assay Kit (Pierce, Thermo Fisher Scientific). Equal amounts of protein were separated using 4-12% gradient SDS-PAGE (sodium dodecyl sulfate polyacrylamide gel electrophoresis), and nitrocellulose membranes were separated by iBlot 2 blotting system (Life Technologies) according to the manufacturer's instructions. was transferred to After blocking the membrane with 5% skim milk, primary antibodies: flotilin-1 (1:500; Abcam, USA), calnexin (1:500; Cell signaling Technology, USA) and β-actin ( 1:10,000; Sigma-Aldrich, USA). Then, the membrane was incubated with a horseradish peroxidase (HRP)-conjugated secondary antibody, and the immunoreactive protein was visualized using Novex™ ECL Chemiluminescent Substrate Reagent Kit (Invitrogen) enriched for immune response.

8. RNA 분리8. RNA Isolation

miRNA를 포함하는 총 RNA는 제조사의 지침에 따라 miRNasy 키트 (Qiagen, 독일)를 사용하여 분리하였다. 정제된 RNA의 품질은 Nanodrop 200 및 Agilent 2100 Bioanalyzer(Agilent Technologies, 미국)에 의해 확인되었다.Total RNA including miRNA was isolated using the miRNasy kit (Qiagen, Germany) according to the manufacturer's instructions. The quality of purified RNA was confirmed by Nanodrop 200 and Agilent 2100 Bioanalyzer (Agilent Technologies, USA).

9.9. NanoString nCounter 분석NanoString nCounter Analysis

miRNA 프로파일링 분석은 제조사의 프로토콜에 따라 800 인간 v3 miRNA 발현 분석을 사용하여 NanoString nCounter(NanoString Technologies, Inc., 미국)에 의해 평가되었다. 간단히 말해, NanoString nCounter 플랫폼에는 총 RNA와 각 miRNA에 맞게 조정된 캡처(capture) 쌍 및 리포터 프로브(reporter probe) 쌍을 혼합하는 과정, 하이브리드화, 과량의 프로브를 세척하는 과정, 표면에 프로브가 결합된 miRNA를 고정하는 과정 및 리포터 프로브에서 색상 코드 바 태그(color-coded bar tags)를 스캔하는 과정이 포함되어 있다. 급속 동결된 조직으로부터 샘플 당 80 내지 100ng의 총 RNA를 각 샘플당 총 부피 3μL의 입력 물질로 사용하였다. 모든 혼성화 반응은 65℃에서 18시간 동안 인큐베이션 하였고, 최대-밀도 스캔(555 관측시야)을 선택하였다.miRNA profiling assays were assessed by a NanoString nCounter (NanoString Technologies, Inc., USA) using an 800 human v3 miRNA expression assay according to the manufacturer's protocol. In brief, the NanoString nCounter platform includes the process of mixing total RNA and capture and reporter probe pairs tailored for each miRNA, hybridization, washing excess probes, and binding of probes to the surface. It includes the process of fixing the miRNA and scanning the color-coded bar tags in the reporter probe. 80-100 ng of total RNA per sample from snap-frozen tissue was used as input material with a total volume of 3 μL per sample. All hybridization reactions were incubated at 65° C. for 18 hours, and a maximum-density scan (555 field of view) was selected.

수모세포종에 대한 분자 하위그룹을 확인하기 위해, nCounter Elements TagSets를 기존에 서술된 바에 따라 적용하였다. 클래스 예측 분석(class prediction analysis)은 M. Taylor 박사(캐나다 토론토)가 제공한 알고리즘을 사용하여 수행하였다.To identify molecular subgroups for medulloblastoma, nCounter Elements TagSets were applied as previously described. Class prediction analysis was performed using the algorithm provided by Dr. M. Taylor (Toronto, Canada).

10. RNA 시퀀싱 분석을 통한 mRNA 프로파일링10. mRNA Profiling via RNA Sequencing Analysis

BTSCs 및 BTCs로부터 추출한 총 RNA를 TruSeq Stranded mRNA LT Sample Prep 키트와 함께 페어드-엔드(paired-end) 라이브러리의 제조에 사용하였다. 구체적으로, 정제된 RNAs를 무작위로 단편화하고, 단편화된 RNAs를 역전사에 의해 cDNA로 변환하였다. 상기 cDNA 단편의 양쪽 끝을 어댑터로 결찰시켰다. 이들을 시퀀싱에 적합한 양으로 PCR에 의해 증폭시킨 후, 삽입 크기가 200-400bp인 cDNA 단편을 선택하여 NovaSeq 6000 시스템에서 페어드-엔드 방식으로 시퀀싱하였다.Total RNA extracted from BTSCs and BTCs was used together with the TruSeq Stranded mRNA LT Sample Prep Kit to prepare paired-end libraries. Specifically, purified RNAs were randomly fragmented, and the fragmented RNAs were converted into cDNA by reverse transcription. Both ends of the cDNA fragment were ligated with adapters. After they were amplified by PCR in an amount suitable for sequencing, cDNA fragments with an insertion size of 200-400 bp were selected and sequenced in a paired-end manner in a NovaSeq 6000 system.

원시 데이터로부터 어댑터 및 저품질 서열을 트리밍한 후, 트리밍된 RNAseq 데이터를 Bowtie2 및 HISAT2 소프트웨어를 사용하여 인간 게놈(hg19)에 맵핑하였다. StringTie 소프트웨어를 사용하여, 전사체 어셈블리를 수행하고 FPKM(Fragment Per Kilobase of transcript per Million mapped reads) 값을 계산하였다.After trimming the adapter and low quality sequences from the raw data, the trimmed RNAseq data were mapped to the human genome (hg19) using Bowtie2 and HISAT2 software. Using StringTie software, transcript assembly was performed and Fragment Per Kilobase of transcript per Million mapped reads (FPKM) values were calculated.

11. 차별적으로 발현된 mRNA 및 miRNA의 분석11. Analysis of differentially expressed mRNA and miRNA

R 프로그래밍 언어로(버전 3.5.1)로 작성된 리마 패키지(limma package)를 사용하여, 정규화(normalize)된 mRNA 및 miRNA 데이터 세트에서 차등적으로 발현된 유전자를 확인하였다. log2 배수 변화가 ≥2 또는 ≤-2 및 FDR(false discovery rate) <0.05를 나타내는 mRNA 및 miRNA는 차등적으로 발현된 것으로 간주하였다.Differentially expressed genes were identified in normalized mRNA and miRNA data sets using the limma package written in the R programming language (version 3.5.1). mRNAs and miRNAs with a log2 fold change of ≥2 or ≤-2 and a false discovery rate (FDR) <0.05 were considered differentially expressed.

12. miRNA의 표적 유전자 예측을 위한 생물정보(bioinformatics) 분석12. Bioinformatics analysis for the prediction of miRNA target genes

12개의 대표적인 miRNA 표적 데이터베이스, PhenomiR, DIANA-microT, ElMMo, MicroCosm, miRBase, miRanda, miRDB, PicTar, PITA, TargetScan, miRecords 및 miRTarBase를 사용하여, 차별적으로 발현되는 miRNA에 대한 후보 표적 유전자를 선택하였다. 표적 유전자를 분석할 때, 편견이나 불충분을 피하기 위해, 하나 또는 두 개의 개별 데이터베이스에 의존하기보다는 상기 12개 miRNA 표적 데이터베이스의 포괄적인 자원을 이용하였다. 후보 표적 유전자를 선택할 때, 본 발명자들은 다음과 같은 기준을 유지하였다: 상기 언급된 대표적인 miRNA 표적 데이터베이스 중 적어도 3개의 데이터베이스에 의해 동시에 예측된 표적 유전자 또는 적어도 하나의 이전 조사에서 연구 검증에 의해 확인된 표적 유전자.Twelve representative miRNA target databases, PhenomiR, DIANA-microT, ElMMo, MicroCosm, miRBase, miRanda, miRDB, PicTar, PITA, TargetScan, miRecords, and miRTarBase were used to select candidate target genes for differentially expressed miRNAs. To avoid bias or insufficiency when analyzing target genes, we utilized the comprehensive resources of the 12 miRNA target databases, rather than relying on one or two separate databases. In selecting candidate target genes, we maintained the following criteria: target genes predicted simultaneously by at least three of the aforementioned representative miRNA target databases or confirmed by study validation in at least one previous investigation. target gene.

13. miRNA 및 mRNA의 통합 분석13. Integrated analysis of miRNA and mRNA

샘플에 대한 RNAseq 데이터 세트에서, 상기에서 선택된 후보 miRNA 표적 유전자와 mRNA (log2 배수 변화 ≥2 또는 ≤-2, p 값 <0.05 및 FDR <0.05)를 비교함으로써, 최종적으로 표적 유전자를 선택하였다. 표적 유전자에 대한 확신을 보장하기 위해, 샘플에서 miRNA와 mRNA 사이의 발현에 있어서 통계적으로 유의한 음의 상관 관계(피어슨 상관계수 <-0.7)를 나타내는 표적 유전자에 우선 순위(검증 테스트를 위해)를 부여하였다. DAVID(Database for Annotation, Visualization and Integrated Discovery) 및 KEGG(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes) 데이터베이스를 사용하여 대상 유전자에 대한 GO(gene ontology) 및 경로 분석을 수행하였다.In the RNAseq data set for the sample, the target gene was finally selected by comparing the candidate miRNA target gene selected above with the mRNA (log2 fold change ≥2 or ≤-2, p value <0.05 and FDR <0.05). To ensure confidence in the target gene, priority (for validation tests) to target genes that exhibit a statistically significant negative correlation (Pearson correlation coefficient <-0.7) in expression between miRNA and mRNA in the sample was given. Gene ontology (GO) and pathway analysis were performed on target genes using Database for Annotation, Visualization and Integrated Discovery (DAVID) and Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes (KEGG) databases.

14. RT-qPCR (Reverse transcription and quantitative real-time polymerase chain reaction)14. RT-qPCR (Reverse transcription and quantitative real-time polymerase chain reaction)

총 RNA를 추출하고, 제조사의 지침에 따라 RT 키트(Qiagen)를 사용하여 cDNA를 생성하였다. ABI 실시간 PCR 검출 시스템 및 특정 프라이머를 갖는 SYBR Green 마스터 믹스 키트를 사용한 RT-qPCR을 수행하여 선택된 유전자의 발현을 측정하였다. 모든 시약 및 프라이머는 Qiagen으로부터 공급받았다. RUN6B는 세포에서 miRNA 발현을 정규화(normalize)하기 위해 사용되었다. EVs에 대하여는 공지된 컨트롤 또는 하우스키핑(housekeeping) miRNA가 없기 때문에, 본 발명자들은 정규화를 위한 컨트롤로서 RNA 추출 전에 스파이크-인(spiked-in) 예쁜꼬마선충(Caenorhabditis elegans) miRNA를 QIAzol에 직접 사용하는 전략을 채택하였다. 각각의 유전자의 상대적인 발현은 기존에 알려진 방법에 따라 비교 임계값 사이클 방법(comparative threshold cycle method)을 사용하여 계산하였다.Total RNA was extracted and cDNA was generated using an RT kit (Qiagen) according to the manufacturer's instructions. RT-qPCR using the ABI real-time PCR detection system and the SYBR Green master mix kit with specific primers was performed to measure the expression of selected genes. All reagents and primers were supplied from Qiagen. RUN6B was used to normalize miRNA expression in cells. Since there are no known control or housekeeping miRNAs for EVs, we used spiked-in Caenorhabditis elegans miRNAs directly into QIAzol prior to RNA extraction as a control for normalization. strategy was adopted. The relative expression of each gene was calculated using a comparative threshold cycle method according to a known method.

15. miRNA 억제제의 15. miRNA inhibitors in vitroin vitro 형질주입(transfection) transfection

miRNA 억제제의 형질주입을 위해, 50% 컨플루언시(confluency) 시점의 BTSCs를 준비하고, 이어서 20nM의 항-miR-135b(Qiagen; 카탈로그 번호, MIN0000758; 제품번호, 219300) 및 항-miR-135a(Qiagen; 카탈로그 번호, MIN0000428; 제품번호, 219300)를 BTSCs에 형질주입시켜 각각의 miRNA를 억제하였다. 동일한 농도 및 조건하에서 miScript 억제제 음성 대조군(항-miR-NC)을 miRNA 억제 실험에 대한 대조군으로 사용하였다. 제조사의 프로토콜에 따라 RNAimax 시약(Thermo Fisher Scientific)을 사용하여 일시적 형질주입을 수행하였다. 형질주입 4시간 후, 세포를 정상 성장 배지로 교체하고 48시간 동안 배양하였다. 형질전환 효율은 상기에서 기술한 바와 같이 RT-qPCR에 의해 평가되었고, 모든 기능적 연구는 48시간이 경과한 시점에 수행하였다.For transfection of miRNA inhibitors, BTSCs at 50% confluency were prepared, followed by 20 nM of anti-miR-135b (Qiagen; catalog number, MIN0000758; catalog number, 219300) and anti-miR- 135a (Qiagen; catalog number, MIN0000428; product number, 219300) was transfected into BTSCs to inhibit each miRNA. A miScript inhibitor negative control (anti-miR-NC) was used as a control for miRNA inhibition experiments under the same concentration and conditions. Transient transfection was performed using RNAimax reagent (Thermo Fisher Scientific) according to the manufacturer's protocol. 4 hours after transfection, cells were replaced with normal growth medium and incubated for 48 hours. Transformation efficiency was assessed by RT-qPCR as described above, and all functional studies were performed at 48 hours.

16. 세포 생존력 측정(Cell viability assay)16. Cell viability assay

miRNA 억제제의 형질주입 후 세포 생존력 분석은 비색법(colorimetric) 세포 계수 키트-8 (CCK; Dojindo Molecular Technologies, 미국)을 사용하여 평가하였다. 450nm에서 자외선(UV) 흡수 스펙트럼의 판독을 통한 생존 세포의 정량화는 제조사의 지침에 따라 Versamax 마이크로 플레이트에서 수행되었다. 모든 실험은 3회 반복 수행되었다. 세포 생존율은 miRNA 억제제가 처리된 세포에 대한 대조군 세포의 흡광도의 비(ratio)로 계산되었다.Cell viability assays after transfection of miRNA inhibitors were evaluated using a colorimetric cell counting kit-8 (CCK; Dojindo Molecular Technologies, USA). Quantification of viable cells by reading the ultraviolet (UV) absorption spectrum at 450 nm was performed on a Versamax microplate according to the manufacturer's instructions. All experiments were repeated three times. Cell viability was calculated as the ratio of absorbance of control cells to miRNA inhibitor-treated cells.

17. 한계희석 분석 (Limiting dilution assay)17. Limiting dilution assay

자가 재생 능력을 평가하기 위해, 기존에 알려진 방법에 따라 한계희석 분석을 수행하였다. miRNA 억제제의 형질주입 후, 세포(1×103)를 48-well 초저 클러스터 플레이트(ultra-law cluster plater; Costar)상에서 배양하였다. 한계희석 분석을 위해, 종양구(tumorspheres)를 단일 세포로 해리한 후 다양한 시딩(seeding) 밀도 (100μL 중 5-300 cells/well)를 갖는 96-well 플레이트로 옮겼다. 데이터는 ELDA(Extreme Limiting Dilution Analysis) 소프트웨어 웹 인터페이스(http://bioinf.wehi.edu.au/software/elda/)를 사용하여 분석하였다.In order to evaluate the self-renewal ability, limiting dilution analysis was performed according to a known method. After transfection with miRNA inhibitors, cells (1×10 3 ) were cultured on a 48-well ultra-law cluster plater (Costar). For limiting dilution analysis, tumorspheres were dissociated into single cells and transferred to 96-well plates with various seeding densities (5-300 cells/well in 100 μL). Data were analyzed using Extreme Limiting Dilution Analysis (ELDA) software web interface (http://bioinf.wehi.edu.au/software/elda/).

18. 두 소아 수모세포종 집단(cohort)에서 AMOTL2 유전자 발현에 따른 생존 분석18. Survival analysis according to AMOTL2 gene expression in two juvenile medulloblastoma cohorts

AMOTL2의 발현 수준과 전체 생존 결과의 연관성을 조사하기 위해, 30명의 한국인 환자 및 530명의 MAGIC(Medulloblastoma Advanced Genomic International Consortium)의 환자(18세 미만)로부터 얻은 두 개의 독립적인 소아 수모세포종 집단(cohort)에서 로그-순위(log-rank) 테스트를 수행하였다. 로그-순위 테스트에서, 환자는 각 집단의 샘플에 걸쳐 AMOTL2 발현에 대한 3개의 컷오프(cutoff) 지점, 0.25, 0.5 또는 0.75 분위수(quantile) 중 하나에서 고발현군과 저발현군으로 분류되었다. 이어서, 두 그룹 사이에 생존 분포를 비교하고, 가장 큰 p-값을 갖는 컷오프 지점을 각각의 최종 로그-순위 테스트에 대해 선택하였다. 모든 분석은 각 수모세포종의 하위그룹에서 반복되었다. 30개의 한국 수모세포종 집단의 하위그룹화는 CodeSet으로부터 22개의 마커 유전자의 발현 프로파일에 기초한 자율 추정된 계층적 군집화(unsupervised hierarchical clustering) 및 PAM(partitioning around medoids)을 사용하여 수행되었다.To investigate the association of AMOTL2 expression levels with overall survival outcomes, two independent pediatric medulloblastoma cohorts were obtained from 30 Korean patients and 530 Medulloblastoma Advanced Genomic International Consortium (MAGIC) patients (<18 years of age). A log-rank test was performed. In the log-rank test, patients were classified into high and low expression groups at one of three cutoff points, 0.25, 0.5, or 0.75 quantiles for AMOTL2 expression across samples in each cohort. The survival distributions were then compared between the two groups, and the cutoff point with the largest p-value was chosen for each final log-rank test. All analyzes were repeated in each subgroup of medulloblastoma. Subgrouping of 30 Korean medulloblastoma populations was performed using unsupervised hierarchical clustering and partitioning around medoids (PAM) based on the expression profiles of 22 marker genes from CodeSet.

19. 통계적 분석19. Statistical Analysis

모든 통계적 분석은 SPSS 19.0 소프트웨어 (SPSS, 미국) 및 GraphPad Prism 5.0 (GraphPad Software, Inc., 미국)을 사용하여 수행되었다. 데이터는 평균±표준편차(mean±SD)로 제시하였다. 두 개 이상의 그룹 사이에서 발생한 차이를 확인하기 위해, 일원분산분석(One-way analysis of variance)에 이은 튜키 사후검정(Tukey post-hoc test)를 사용하였고, t-검정(t-test)은 두 그룹 간의 차이를 확인하기 위해 사용하였다. 모든 실험은 독립적으로 적어도 세 번 반복하였다. P-값이 <0.05인 경우 통계적으로 유의한 것으로 간주되었다.All statistical analyzes were performed using SPSS 19.0 software (SPSS, USA) and GraphPad Prism 5.0 (GraphPad Software, Inc., USA). Data are presented as mean±SD. To check the differences between two or more groups, a one-way analysis of variance followed by a Tukey post-hoc test was used, and the t-test was It was used to identify differences between groups. All experiments were independently repeated at least three times. A P-value of <0.05 was considered statistically significant.

실시예 1: 수모세포종 환자의 1차 배양 세포 및 세포외 소포체의 특성 분석Example 1: Characterization of primary cultured cells and extracellular vesicles from medulloblastoma patients

모든 실험에 앞서, 본 발명자들은 분리된 세포 및 엑소좀을 포함하는 세포 유래 세포외 소포체(EVs)의 특성 분석을 수행하였다. 상이한 배양 조건 하에서 배양된 BTCs 및 BTSCs의 형태(morphology)는 계대 번호 5 이하에서 각각 전자에서는 부착세포(adherent cells)에 부착되고, 후자에서는 부유하는 스페로이드 형성 세포에 부착된다(도 1a). 부유하는 BTSCs는 암 줄기세포/전구세포가 풍부한 것으로 여겨진다. BTCs 및 BTSCs에서 네스틴(nestin) 및 무사시(musashi)와 같은 줄기세포 마커의 발현을 확인하였다. 특히 도 1b에서 나타낸 바와 같이 네스틴은 매우 적은 수의 BTCs 세포에서만 발현되었으며, 무사시의 발현은 발견되지 않았다. 이와 달리, BTSCs는 네스틴과 무사시 모두 매우 강력하게 발현되었음을 확인하였다. 또한, 도 1c에 나타난 바와 같이, 면역 블롯팅(immunoblotting) 결과에서는 BTCs 및 BTSCs 둘 다에서 양의 칼넥신(calnexin) 발현 및 음의 플로틸린(floatillin)-1을 나타냈다.Prior to all experiments, we performed characterization of isolated cells and cell-derived extracellular vesicles (EVs) containing exosomes. The morphology of BTCs and BTSCs cultured under different culture conditions was adhered to adherent cells in the former and to floating spheroid-forming cells in the latter, respectively, at passage number 5 and lower (Fig. 1a). Suspended BTSCs are believed to be rich in cancer stem/progenitor cells. Expression of stem cell markers such as nestin and musashi was confirmed in BTCs and BTSCs. In particular, as shown in FIG. 1b , nestin was expressed only in a very small number of BTCs cells, and the expression of Musashi was not found. In contrast, it was confirmed that BTSCs were very strongly expressed in both nestin and musashi. In addition, as shown in FIG. 1c , the results of immunoblotting showed positive calnexin expression and negative floatillin-1 in both BTCs and BTSCs.

BTCs 및 BTSCs로부터 유래된 EVs의 특성을 확인하였다. TEM에서는 원형의 이중-지질막 소포체를 나타냈다(도 1d). NTA에서는 직경 10-200nm 범위의 입자 크기 분포를 나타내었고, 대부분의 입자는 엑소좀 치수(85.8±6.8nm)에 해당하는 크기 범위에서 검출되었다(도 1e). 면역 블롯팅에서는 플로틸린-1의 소포성 농축과 칼넥신 및 β-액틴이 부재함이 드러났다(도 1f).The characteristics of EVs derived from BTCs and BTSCs were confirmed. TEM showed circular double-lipid membrane vesicles (Fig. 1d). NTA showed a particle size distribution in the range of 10-200 nm in diameter, and most of the particles were detected in the size range corresponding to the exosome dimension (85.8 ± 6.8 nm) (Fig. 1e). Immunoblotting revealed vesicular enrichment of flotilin-1 and the absence of calnexin and β-actin ( FIG. 1f ).

실시예 2: BTCs와 BTSCs 사이의 세포 및 EVs-miRNA의 비교 분석Example 2: Comparative analysis of cells and EVs-miRNA between BTCs and BTSCs

먼저, 본 발명자들은 수모세포종의 하위그룹을 식별하기 위해 22개의 하위그룹 특이적인 시그니처 유전자에 대한 유전자 프로파일링을 수행하였다. 클래스 예측 분석을 통해 WNT, SHH, 그룹 3 및 그룹 4 수모세포종을 확인하였다. 다음으로, NanoString nCounter miRNA 어레이를 이용하여 BTCs와 비교하였을 때 BTSCs를 갖는 개체에서 세포 및 EVs의 miRNA 프로파일링을 수행하였다.First, we performed gene profiling of 22 subgroup-specific signature genes to identify subgroups of medulloblastoma. Class prediction analysis identified WNT, SHH, group 3 and group 4 medulloblastoma. Next, miRNA profiling of cells and EVs in individuals with BTSCs compared to BTCs was performed using the NanoString nCounter miRNA array.

그 결과 도 2a 및 도 2b에 나타난 바와 같이, 차등적으로 발현된 miRNA (differentially expressed miRNA, 이하 'DEmiR'라 함) 분석을 통해 86개의 miRNA가 BTCs와 비교하여 BTSCs에서 통계적으로 유의미하게 발현됨을 보여주었다. EVs의 경우에는, 48개의 miRNA가 BTCs-유래 EVs(BTCs-EVs)와 비교하여 BTSCs-유래 EVs (BTSCs-EVs)에서 차등적으로 발현되었다. BTSCs-EVs 및 BTSCs 모두에서, 24개의 miRNAs가 상향 조절되었다는 흥미로운 관찰과 함께 25개의 miRNAs가 현저하게 변화되었음이 확인되었다(도 2c의 벤다이어그램 참조). 이들 중, miR-1246은 BTSCs에서 상향 조절되었지만 BTSCs-EV에서는 하향 조절되었다. 추가적인 기능 분석을 위해, 본 발명자들은 miR-135b와 miR-135a를 선택했는데, 이 둘은 BTSCs와 BTSCs-EVs 모두에서 가장 높은 통계적 유의성과 배수 변화를 보여주었기 때문이다. 상기 두 개의 miRNA에 대한 차등적 발현은 BTCs 및 BTSCs에서 RT-qPCR에 의해 확인되었다. 즉, 도 2d에 나타난 바와 같이 miR-135b 및 miR-135a 모두 BTCs와 비교하여 BTSCs에서 현저하게 상향 조절되었음이 확인되었다.As a result, as shown in FIGS. 2a and 2b, 86 miRNAs were statistically significantly expressed in BTSCs compared to BTCs through differentially expressed miRNA (hereinafter referred to as 'DEmiR') analysis. gave. In the case of EVs, 48 miRNAs were differentially expressed in BTSCs-derived EVs (BTSCs-EVs) compared to BTCs-derived EVs (BTCs-EVs). In both BTSCs-EVs and BTSCs, it was confirmed that 25 miRNAs were significantly altered, with the interesting observation that 24 miRNAs were upregulated (see Venn diagram in Fig. 2c). Of these, miR-1246 was upregulated in BTSCs but downregulated in BTSCs-EVs. For further functional analysis, we selected miR-135b and miR-135a because they showed the highest statistical significance and fold change in both BTSCs and BTSCs-EVs. Differential expression of the two miRNAs was confirmed by RT-qPCR in BTCs and BTSCs. That is, it was confirmed that both miR-135b and miR-135a were significantly upregulated in BTSCs compared to BTCs, as shown in FIG. 2d .

실시예 3: miR-135b 또는 miRNA-135a 억제에 의한 BTSCs의 기능적 조절Example 3: Functional regulation of BTSCs by miR-135b or miRNA-135a inhibition

다음으로, 분비된 miR-135b 및 miR-135a가 BTSCs의 줄기세포능 (stemness)에 영향을 미침으로써 미세환경 수준에서 기능을 갖는지 조사하였다. BTSCs의 기능, 메커니즘 및 신호전달 경로에 대한 miR-135b 및 miR-135a의 효과를 결정하기 위해, 본 발명자들은 그룹 4 BTSCs에 대한 억제 실험을 수행하였다. 항-miR (miRNA 억제제) 처리 후, miR-135b 및 miR-135a 발현 수준은 각각 항-miR-NC (대조군)에 비해 유의하게 감소하였다(도 3a).Next, it was investigated whether the secreted miR-135b and miR-135a had a function at the microenvironment level by affecting the stemness of BTSCs. To determine the effect of miR-135b and miR-135a on the function, mechanism and signaling pathway of BTSCs, we performed inhibition experiments on group 4 BTSCs. After anti-miR (miRNA inhibitor) treatment, miR-135b and miR-135a expression levels were significantly decreased compared to anti-miR-NC (control), respectively ( FIG. 3A ).

또한, 도 3b에 나타난 바와 같이, 세포 생존력(cell viability) 분석을 통해 모든 BTSCs에서 miR-135b 또는 miR-135a의 억제 후 48시간이 경과된 시점에서 세포 생존율이 현저하게 감소되었음이 확인되었다.In addition, as shown in FIG. 3b , it was confirmed that cell viability was significantly reduced at 48 hours after miR-135b or miR-135a inhibition in all BTSCs through cell viability analysis.

나아가 항-miRNA 처리 후에는 구(sphere) 형성 능력이 감소하고(도 3c) 줄기세포 관련 마커의 발현이 감소되었다(도 3d).Furthermore, after anti-miRNA treatment, the ability to form spheres was reduced (FIG. 3C) and the expression of stem cell-related markers was decreased (FIG. 3D).

상기 결과를 종합하면, miR-135b 또는 miR-135a의 억제에 의해 BTSCs의 자기재생(self-renewal) 능력 및 줄기 세포 마커의 발현을 억제할 수 있음을 시사하는 것이다.Taken together, these results suggest that inhibition of miR-135b or miR-135a can inhibit the self-renewal ability of BTSCs and the expression of stem cell markers.

실시예 4: miRNA의 표적 예측을 통한 miRNA 및 mRNA 발현의 통합 분석Example 4: Integrated analysis of miRNA and mRNA expression through miRNA target prediction

본 발명자들은 마이크로어레이(microarray)에서 하향 조절된 mRNA로 상향 조절된 miRNA의 예측된 표적 mRNA를 분석하였고, 반대로 상향 조절된 mRNA로 하향 조절된 miRNA의 예측된 표적 mRNA를 분석하였다. 상기 방법에 기초하여, 총 325개의 유의미한 miRNA-mRNA 쌍이 예측되었으며, 109개의 차등적으로 발현된 miRNA 및 1,640개의 mRNA로 구성되었다. 750개의 현저하게 감소된 mRNA 중에서 199개의 유전자가 23개의 상향 조절된 miRNA의 예측된 표적이었다(도 4a).The present inventors analyzed the predicted target mRNA of up-regulated miRNA as down-regulated mRNA in a microarray, and on the contrary, the predicted target mRNA of down-regulated miRNA with up-regulated mRNA was analyzed. Based on this method, a total of 325 significant miRNA-mRNA pairs were predicted, consisting of 109 differentially expressed miRNAs and 1,640 mRNAs. Of the 750 significantly reduced mRNAs, 199 genes were predicted targets of 23 up-regulated miRNAs (Fig. 4a).

miR-135b 및/또는 miR-135a의 표적 mRNA를 선택, 확인 및 분석하였다 (N=10). 그 결과 도 4b에서 나타난 바와 같이, miR-135b가 단 하나의 유전자, AMOLT2를 목표로 하고, miR-135a는 AMOTL2, STAT6(signal transducer and activator of transcription 6) 및 GPX8(glutathione peroxidase 8)를 목표로 한다는 사실을 발견하였다. 특히, AMOTL2는 miR-135b 및 miR-135a 둘 다에 의해 표적화되었으며, AMOTL2의 발현 수준은 miR-135b (R=-0.92006; P<0.0001) 및 miR-135a (R=-0.82885; P<0.0001) 의 발현 수준과 음의 상관 관계를 보였다(도 5a 및 도 5b). 또한, STAT6 (R=-0.85386; P <0.0001) 및 GPX8 (R=-0.81841; P <0.0001)은 miR-135a와 관련이 있었다(도 5a 및 도 5b, N = 10). 다만, 수모세포종의 하위그룹에 따른 유의한 차이는 나타나지 않았으며, 모든 군에서 유사한 패턴의 연관성이 관찰되었다. 이러한 결과는 miR-135b 및 miR-135a의 높은 발현 수준이 AMOTL2을 표적화하고 이의 발현을 하향 조절할 수 있음을 암시 하는 것이다.Target mRNAs of miR-135b and/or miR-135a were selected, identified and analyzed (N=10). As a result, as shown in Figure 4b, miR-135b targets only one gene, AMOLT2, and miR-135a targets AMOTL2, STAT6 (signal transducer and activator of transcription 6) and GPX8 (glutathione peroxidase 8). found that it does. In particular, AMOTL2 was targeted by both miR-135b and miR-135a, and the expression level of AMOTL2 was found in miR-135b (R=-0.92006; P<0.0001) and miR-135a (R=-0.82885; P<0.0001). showed a negative correlation with the expression level of ( FIGS. 5A and 5B ). In addition, STAT6 (R=-0.85386; P<0.0001) and GPX8 (R=-0.81841; P<0.0001) were associated with miR-135a ( FIGS. 5A and 5B , N=10). However, there was no significant difference according to the subgroups of medulloblastoma, and a similar pattern of association was observed in all groups. These results suggest that high expression levels of miR-135b and miR-135a can target AMOTL2 and downregulate its expression.

AMOTL2가 miR-135b 또는 miR-135a에 의해 조절되는지 여부를 추가로 입증하기 위해, miR-135b 및 miR-135a의 억제 후 AMOTL2의 발현 수준을 RT-PCR에 의해 조사하였다. 그 결과 도 5c에 나타난 바와 같이, 대조군과 비교하여 AMOTL2의 발현은 각각 miR-135b 및 miR-135a의 억제에 의해 15.7배 및 5.3배 더 높아지는 것을 확인하였다. 상기와 같은 결과는 BTSCs 상에서 miR-135a 및 miR-135a가 적어도 부분적으로는 AMOTL2의 발현을 상향 조절함으로써 기능한다는 사실을 지지하는 것이다.To further demonstrate whether AMOTL2 is regulated by miR-135b or miR-135a, the expression level of AMOTL2 after inhibition of miR-135b and miR-135a was investigated by RT-PCR. As a result, as shown in FIG. 5c, it was confirmed that the expression of AMOTL2 was 15.7-fold and 5.3-fold higher by inhibition of miR-135b and miR-135a, respectively, compared to the control group. These results support the fact that miR-135a and miR-135a on BTSCs function, at least in part, by upregulating the expression of AMOTL2.

miR-135b의 표적인 AMOTL2와 관련된 생물학적 경로를 탐색하기 위해, 본 발명자들은 KEGG 경로 분석을 사용하였다. 그 결과, 도 5d 및 도 5e에 나타난 바와 같이, AMOTL2와 관련된 Hippo 및 밀착연접(tight junction) 경로를 발견하였다. RNA-seq 결과를 바탕으로, 상향 조절된 유전자(빨간색) 및 하향 조절된 유전자(녹색)를 확인하였다.To explore the biological pathway associated with AMOTL2, the target of miR-135b, we used KEGG pathway analysis. As a result, as shown in FIGS. 5d and 5e, Hippo and tight junction pathways related to AMOTL2 were found. Based on the RNA-seq results, up-regulated genes (red) and down-regulated genes (green) were identified.

실시예 5: 수모세포종 환자의 전반적인 생존 결과와 AMOTL2 발현의 관계Example 5: Relationship between overall survival outcome and AMOTL2 expression in medulloblastoma patients

두 개의 독립적인 집단(SNUH 및 MAGIC)에서 AMOTL2의 발현 수준과 임상 결과 사이의 연관성을 평가하였다. 생존 분석은 AMOTL2의 높은 발현이 그룹 3 및 그룹 4의 소아 수모세포종 환자에서 좋은 예후와 유의하게 관련되어 있으며, 이는 상기 두 개의 독립적인 집단에서 일관되게 관찰되었다(도 6a 및 도 6b 참조).The association between the expression level of AMOTL2 and clinical outcome in two independent populations (SNUH and MAGIC) was evaluated. Survival analysis showed that high expression of AMOTL2 was significantly associated with good prognosis in group 3 and group 4 pediatric medulloblastoma patients, which was consistently observed in these two independent populations (see FIGS. 6A and 6B ).

전술한 본 발명의 설명은 예시를 위한 것이며, 본 발명이 속하는 기술분야의 통상의 지식을 가진 자는 본 발명의 기술적 사상이나 필수적인 특징을 변경하지 않고서 다른 구체적인 형태로 쉽게 변형이 가능하다는 것을 이해할 수 있을 것이다. 그러므로 이상에서 기술한 실시예들은 모든 면에서 예시적인 것이며 한정적이 아닌 것으로 이해해야만 한다.The above description of the present invention is for illustration, and those of ordinary skill in the art to which the present invention pertains can understand that it can be easily modified into other specific forms without changing the technical spirit or essential features of the present invention. will be. Therefore, it should be understood that the embodiments described above are illustrative in all respects and not restrictive.

<110> SEOUL NATIONAL UNIVERSITY HOSPITAL <120> Use of miR-135b, miR-135a and their target gene AMOTL2 for medulloblastoma <130> MP19-280 <160> 6 <170> KoPatentIn 3.0 <210> 1 <211> 23 <212> RNA <213> Homo sapiens <400> 1 uauggcuuuu cauuccuaug uga 23 <210> 2 <211> 23 <212> RNA <213> Homo sapiens <400> 2 uauggcuuuu uauuccuaug uga 23 <210> 3 <211> 4991 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 3 ctcactgtgt gtgactctgg gcacgctgct taagctctct gagccctggt gtcctcattt 60 acaacacagg gatgataaca gaactccgtt ggagggtgct tggcagggct gaatcggatg 120 actgggcgaa aagccagcgg tggcacacct tgcactctgc gtaaaggggc gcctattatc 180 accttgggga agaactggac agagcgcctg gcggcgggtg attcagttgg gtgctctggg 240 gccaggtgcc accggccatt gtccaggcag ctgtgtgcaa gccaaagaag catgaggaca 300 ctggaagact cctcggggac agtcctgcac cgcctcatcc aggagcagct gcgctacggc 360 aacctgactg agacgcgcac gctgctagcc atccagcagc aggccctgag gggtggggct 420 ggaactgggg gtacagggag cccccaggcc tccctggaga tcctggcccc agaggacagt 480 caggtgctgc agcaggccac caggcaggag ccccagggcc 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aatgtaaaca tggctgtttt gttatgccac 4260 cctgtaccag gattgctgcc gcattccact gggtataaca gtattttaat taaaaaaaaa 4320 taattaaaag tgatgtcttt gcacaggtga gactttgcac tgagggaagg gaaagggtga 4380 ggattttggg gggccaccca agtcatagtc caatctcttc aaggacccaa gatagaattt 4440 aggaattttg tgaagctgca ttaaggatag agttggaatg aggatgtggc tggcattttt 4500 cccctttcat agataacatt tcttgaaggc tgggagggga aggagggcct ggcagatggc 4560 agcctcccga ggtagggctg tgttctaatc agctttgttc ggccacacgc tgtggttatc 4620 cacagtggga gtgggtgtcc aaagatggct ttatccttcc cccactcctt ttcccactcc 4680 cacctagcac ataaagtttt gtccgaaacc atccagaagg ccaggcacca tgcagaggac 4740 attcaagaat gtgcatgttc ttagccaccg cctccctcct ttgctgtgac atcaccactc 4800 tttcctgatg ctcaggaaag catattgctc caattcaaaa ttaaagaaag ccattctca 4859 <210> 6 <211> 4852 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 6 acacacacag ccggagtccc ctcccgcagc aaccccagga cacgcgtggt acagcccttg 60 ctgtcgtccc gtcgatgggt ttagggatga agggtgctct ggggccaggt gccaccggcc 120 attgtccagg cagctgtgtg caagccaaag aagcatgagg acactggaag 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tccacctgct gtggaggggc cagtgagtgc ccaggcctcc tcagccacct cgggcagtgc 1080 ccacctggcc cagatggagg ccgtgctgag ggagaatgcc aggctgcaga gagacaatga 1140 gcggctgcag agggagctgg agagctctgc ggagaaggct ggccgcattg agaagctgga 1200 aagcgaaatc cagcggctct ctgaggccca tgagagcctg accagagcct cctccaagcg 1260 tgaggccctg gagaagacca tgcggaacaa gatggacagt gaaatgagga ggctgcaaga 1320 cttcaaccgg gatcttagag agagattgga atctgcaaat cgccgcctgg caagcaagac 1380 acaggaggcc caggccggca gtcaggacat ggtggccaag ctgcttgctc agagctacga 1440 acagcagcag gagcaagaga agctggagcg agagatggca ctgctgcgcg gcgccatcga 1500 ggaccagcgg cggcgtgccg agctgctgga gcaggctctg ggcaatgcgc agggccgggc 1560 agctcgagcc gaagaggagc tgcgcaagaa gcaggcctat gtggagaaag tggagcggct 1620 gcagcaggcg ctcgggcagc tgcaggcagc ctgtgagaag cgggagcagc tggagctgcg 1680 tctgcggact cgcctggagc aggaactcaa ggccctgcgt gcacagcaga gacaggcagg 1740 tgccccaggt ggtagcagtg gcagtggtgg gtctccagag ctcagcgccc tgcgactgtc 1800 agaacaactg cgagagaagg aggagcagat cctggcgctg gaggccgaca tgaccaagtg 1860 ggagcagaag tatttggagg aacgtgccat gaggcagttt gccatggatg cggctgccac 1920 ggctgctgct cagcgtgaca ccactctcat ccgacattcc ccccagccct cacccagcag 1980 cagcttcaat gagggtctgc tcactggtgg ccacaggcat caggagatgg aaagcaggtt 2040 aaaggtgctc catgcccaga tcctggagaa ggatgcagtg atcaaggtcc ttcagcagcg 2100 ctccaggaga gaccctggca aggccatcca gggctccctg cggcctgcca agtcggtgcc 2160 atctgttttc gcggctgcgg cagcaggaac ccagggctgg caagggctct cttctagtga 2220 gcgacaaaca gcagacgccc ctgctcggct gactacagac agagcaccca cagaggagcc 2280 agtggtcaca gctccccctg ctgcccatgc caaacacggg agcagagatg ggagcaccca 2340 gactgagggc cccccagaca gcacctccac ctgcctgcca ccggagcctg acagccttct 2400 ggggtgcagc agtagccaga gagcagcctc tctggactct gtagctacat ccagagtcca 2460 ggacttgtca gacatggtgg agatactgat ctgaaggagg tggtgcttca ggactctgag 2520 ccattctctc ccctcctctg ccctgtgcca ctctcagcca tttcagcagc cccgtcaacc 2580 gctgctccgt ccctttcccc agccagacac tcattcccat tgaccatctg gtcccaggag 2640 ctcaggagga ggaccccagg ggagaggaga gctgtgagag caccggcacc cccagaagac 2700 tctgcttctt agcccacatt cctccgggcc ttatggagaa tgaggattca gccttgactt 2760 cttgcccaag gcctgctact ggggtagcaa ctgacagctc agaaaggagc tgagctccct 2820 ctgccctgcc agttgtcagt caggcaggga gggagtggct gtgttggttt ggggaactaa 2880 tttccacgga cggctgcccg tggacaccag gtggactggt tcactaatca agtcagccat 2940 attgttctct ggctaagttt ggttccagcc aacgtcatct gctcttcagt tcctcactgc 3000 cttcttggga tactaagact tgaatttttt ggggactatt aagggtgtta gtcttggaga 3060 agacacagcc tcaccttctc acttgctgtg ggtgaggggc catttaagtg gactgggaga 3120 cagtgcgcag tttgtatata attccctttc ttgtggaaca gaagactgag gcctgcaggt 3180 tccgatgtgt ctccatgggc tgtgctcccc tcttcctact gtcagtttct gaaacttctg 3240 actggcctcc cagttatgcc tcctcctcaa gttcctggcc cgtggatgtt aaagctgctc 3300 gattcccagg atctcggctg ccttttcctc tatcttgagc cctataaatg cccacgggac 3360 ccccaccacc agcctcttga agtggctcca cagctcctgt ccctggaaca tcctgtcagt 3420 ttggtcataa accctgagcc agatgaaatg agccaccgtg aacagacatc tgccatgccc 3480 ccaggtgggc ttcggtggcc ctacccggta ccagttcttt ctgagaaact ggagatgtct 3540 tgttagcata agtgtcttca ttcccacctg gagggtttgg gagaggagca aagcagttga 3600 aaactagtta atgagctaca agagtcaaat agtcctctga atggagcccc catcacaaaa 3660 cagtgcccag gaggctggct cctcaagcta cccatgccca gcgccctaaa gcagcaccag 3720 atgctttgga attggggtga aacacccaca tggcagcctg ctagcagcag tgactttgac 3780 ttctggtctt aaagagtccc tcacttcagc cccaggagct attggtgggt tttagcagtt 3840 ttgtctttac cgtttttagt tctccttgat tctttgtttt cttcctttat cgtttttagg 3900 tttggtatgt gttgttttat ttccatggtt cctcaagttt cctttttaaa catttgcatt 3960 tgctggacaa ttgcaatttt ttttaaaaaa ttcccctacc cctgtttaaa gctgaaaaat 4020 acatttggtt catgtgcatt gtttacaaag caaaaagaaa aaagaggaaa aaaaggcaaa 4080 aaatattgtg aaagaaaaaa aacaacttaa tatattttgg attaatattt ggtatttctt 4140 ttaaagtatt ttttgtgctg tgaacatttt ctgccaaaga ccatgatgtg tgtctgtatg 4200 tttaagttat cgtaaatatt taaaatgtaa acatggctgt tttgttatgc caccctgtac 4260 caggattgct gccgcattcc actgggtata acagtatttt aattaaaaaa aaataattaa 4320 aagtgatgtc tttgcacagg tgagactttg cactgaggga agggaaaggg tgaggatttt 4380 ggggggccac ccaagtcata gtccaatctc ttcaaggacc caagatagaa tttaggaatt 4440 ttgtgaagct gcattaagga tagagttgga atgaggatgt ggctggcatt tttccccttt 4500 catagataac atttcttgaa ggctgggagg ggaaggaggg cctggcagat ggcagcctcc 4560 cgaggtaggg ctgtgttcta atcagctttg ttcggccaca cgctgtggtt atccacagtg 4620 ggagtgggtg tccaaagatg gctttatcct tcccccactc cttttcccac tccccacctag 4680 cacataaagt tttgtccgaa accatccaga aggccaggca ccatgcagag gacattcaag 4740 aatgtgcatg ttcttagcca ccgcctccct cctttgctgt gacatcacca ctctttcctg 4800 atgctcagga aagcatattg ctccaattca aaattaaaga aagccattct ca 4852

Claims (23)

삭제delete 삭제delete 삭제delete 삭제delete 삭제delete 삭제delete 삭제delete 삭제delete AMOTL2 유전자를 유효성분으로 포함하고,
수모세포종은 그룹 3 수모세포종 또는 그룹 4 수모세포종인 것을 특징으로 하는, 수모세포종 환자의 예후 예측용 바이오마커 조성물.
AMOTL2 gene as an active ingredient,
The medulloblastoma is a biomarker composition for predicting the prognosis of a medulloblastoma patient, characterized in that it is a group 3 medulloblastoma or a group 4 medulloblastoma.
삭제delete 제9항에 있어서,
상기 AMOTL2 유전자는 수모세포종의 뇌종양 스페로이드 형성 세포에서 특이적으로 발현이 감소되는 것을 특징으로 하는, 수모세포종 환자의 예후 예측용 바이오마커 조성물.
10. The method of claim 9,
The AMOTL2 gene is characterized in that the expression is specifically reduced in brain tumor spheroid-forming cells of medulloblastoma, a biomarker composition for predicting the prognosis of medulloblastoma patients.
제9항에 있어서,
상기 AMOTL2 유전자는 miR-135b 및 miR-135a로 이루어진 군에서 선택된 어느 하나 이상에 의해 발현이 억제되는 것을 특징으로 하는, 수모세포종 환자의 예후 예측용 바이오마커 조성물.
10. The method of claim 9,
The AMOTL2 gene is a biomarker composition for predicting the prognosis of medulloblastoma patients, characterized in that the expression is inhibited by any one or more selected from the group consisting of miR-135b and miR-135a.
AMOTL2 유전자의 발현 수준을 측정하는 제제를 포함하는, 수모세포종 환자의 예후 예측용 조성물.
A composition for predicting the prognosis of a medulloblastoma patient, comprising an agent for measuring the expression level of AMOTL2 gene.
제13항에 있어서,
상기 제제는 AMOTL2 유전자에 특이적으로 결합하는 안티센스 올리고뉴클레오타이드, 프라이머 세트, 프로브 및 항체로 이루어진 군으로부터 선택되는 1종 이상을 포함하는 것을 특징으로 하는, 수모세포종 환자의 예후 예측용 조성물.
14. The method of claim 13,
The composition for predicting the prognosis of a medulloblastoma patient, characterized in that it comprises at least one selected from the group consisting of antisense oligonucleotides, primer sets, probes and antibodies that specifically bind to the AMOTL2 gene.
AMOTL2 유전자의 발현 수준을 측정하는 제제를 포함하는, 수모세포종 환자의 예후 예측용 키트.
A kit for predicting the prognosis of a medulloblastoma patient, comprising an agent for measuring the expression level of the AMOTL2 gene.
제15항에 있어서,
상기 제제는 AMOTL2 유전자에 특이적으로 결합하는 안티센스 올리고뉴클레오타이드, 프라이머 세트, 프로브 및 항체로 이루어진 군으로부터 선택되는 1종 이상을 포함하는 것을 특징으로 하는, 수모세포종 환자의 예후 예측용 키트.
16. The method of claim 15,
The agent is a kit for predicting the prognosis of a medulloblastoma patient, characterized in that it comprises at least one selected from the group consisting of antisense oligonucleotides, primer sets, probes, and antibodies that specifically bind to the AMOTL2 gene.
삭제delete 삭제delete 삭제delete 삭제delete 삭제delete 삭제delete 삭제delete
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J Cancer Res Ther . Oct-Dec 2010;6(4):521-9. doi: 10.4103/0973-1482.77072.
Stem Cells. 2015 May;33(5):1377-89. doi: 10.1002/stem.1958.

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