KR101970885B1 - Pharmaceutical composition for treating or preventing filariasis and screening methods therefore - Google Patents

Pharmaceutical composition for treating or preventing filariasis and screening methods therefore Download PDF

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Abstract

본 발명은 사상충증(filariasis) 치료용 또는 예방용 약학적 조성물, 및 이의 스크리닝 방법에 관한 것이다. 구체적으로 사상충의 calumenin에 특이적으로 결합하는 사상충증 치료용 또는 예방용 약학적 조성물 및 이의 컴퓨터 프로그램을 통하여 리간드 라이브러리(ligand library)를 스크리닝(screening) 하는 방법에 관한 것이다.
본 발명의 사상충증(filariasis) 치료용 약학적 조성물은 기존의 사상충증 치료제와 달리 사상충에 대해서 특이적이고 선택적인 치료가 가능하고, 인체에 대한 부작용을 감소시킬 수 있으며, 성충 사상충을 효과적으로 사멸시킬 수 있다.
The present invention relates to a pharmaceutical composition for treating or preventing filariasis, and a screening method therefor. And more particularly to a pharmaceutical composition for treating or preventing onchocerciasis which specifically binds to calumenin of a willowworm, and a method for screening a ligand library through a computer program thereof.
The pharmaceutical composition for the treatment of filariasis of the present invention is capable of treating a selective and selective treatment for the pathogen, unlike the conventional treatment for river blindness, and can reduce adverse effects on the human body, and can effectively kill adults.

Description

사상충증 치료용 또는 예방용 약학적 조성물 및 이의 스크리닝 방법 {Pharmaceutical composition for treating or preventing filariasis and screening methods therefore}TECHNICAL FIELD The present invention relates to a pharmaceutical composition for treating or preventing onchocerciasis and a method for screening the same,

본 발명은 사상충증(filariasis) 치료용 또는 예방용 약학적 조성물 및 이의 스크리닝 방법에 관한 것으로서, 보다 구체적으로 사상충의 calumenin에 특이적으로 결합하는 사상충증 치료용 약물을 포함하는 약학적 조성물 및 이를 컴퓨터 프로그램을 통하여 스크리닝 하는 방법에 관한 것이다. The present invention relates to a pharmaceutical composition for treating or preventing filariasis and a method for screening the composition, and more particularly, to a pharmaceutical composition comprising a drug for treating onchocerciasis which specifically binds to calumenin of a willowworm, Lt; / RTI >

림프사상충증(Lymphatic filariasis) 및 회선사상충증(Onchocerciasis)은 사상충 선충에 의해 감염되는 주요 열대성 질병이다. 림프사상충증은 모기를 매개로 하여(Culex, Anopheles and Aedes spp.) 전염되며, 전세계 54개국의 9억 7,400만명이 이 질병으로 위협 받는다(Cobo, 2016). 반크롭트 사상충(Wuchereria bancrofti), 말레이사상충(Brugia malayi) 및 티몰사상충(Brugia timori)이 림프사상충증의 주요 원인이 된다.Lymphatic filariasis and onchocerciasis are the major tropical diseases infected by the wasp nematode. Onchocerciasis is transmitted via mosquitoes (Culex, Anopheles and Aedes spp.), And 974 million people in 54 countries are threatened with this disease (Cobo, 2016). Wuchereria bancrofti, Brugia malayi and Brugia timori are the main causes of onchocerciasis.

림프사상충증이 만성화되면, 사지(四肢)의 림프 부종(조직 부종) 또는 피부 조직이 응축되는 코끼리증(elephantiasis)이 발병할 수 있다. 회선사상충(Onchocerca volvulus)에 의한 회선사상충증(onchocerciasis=river blindness)은 먹파리(Simulium spp.)에 의해 사하라 사막 이남의 아프리카 31개국, 라틴 아메리카 3개국, 예멘에서 전파된다(WHO, 2016). 만성 감염은 가려움증과 피부 손상을 초래하고 영구적 실명이 발생할 수 있는 안구 질병을 유발한다. Chlamydia inlithiasis can result in limb swelling of the extremities (edema of the tissue) or elephantiasis in which the skin tissue condenses. Onchocerciasis = river blindness caused by onchocerca volvulus is spread in 31 African sub-Saharan Africa, three Latin American countries, and Yemen (WHO, 2016) by Simulium spp. Chronic infections lead to itching and skin damage and eye diseases that can lead to permanent blindness.

이러한 인간의 사상충증에 대한 치료 방법에는 매개체의 제어 및 집단 약물 투여(massive drug administration, MDA)가 있다. 그러나 수많은 노력에도 불구하고, 질병의 통제와 치료는 백신의 부재 또는 집단 약물 투여(MDA)에 사용되는 약물의 제한적인 효과 때문에 성공하지 못했다. 현재 다이에틸카바마진(Diethylcarbamazine, DEC), 알벤다졸(Albendazole, ALB) 및 이버멕틴(Ivermectin, IVM)이 집단 약물 투여 방법에서 사용된다(Hoerauf, 2008). 림프사상충증에는 다이에틸카바마진, 알벤다졸, 이버멕틴 중 두 가지 약물의 병행 투여가 가능하지만, 회선사상충증의 치료 약물은 이버멕틴이 유일하여, 약물에 대한 내성이 발생하는 문제가 있다(Cobo, 2016; Cupp et al., 2011). Methods for treating such onchocerciasis include mediator control and massive drug administration (MDA). Despite numerous efforts, however, control and treatment of the disease has not been successful due to the absence of a vaccine or the limited effect of drugs used in group drug administration (MDA). Currently, diethylcarbamazine (DEC), albendazole (ALB), and Ivermectin (IVM) are used in group drug administration methods (Hoerauf, 2008). In addition, two drugs, diethylcarbamazine, albendazole and ivermectin, can be administered concurrently with onchocerciasis due to lymphadenopathy. However, ivermectin is the only treatment drug for onchocerciasis, and resistance to drugs is generated (Cobo, Cupp et al., 2011).

상기의 문제점을 해결하기 위해서 새로운 분자를 표적으로 하는 신약의 개발이 필요하다. 신약은 성충 사상충의 살충 효과가 우수하거나, 성충 사상충에 대한 불임 효과가 장기적이어야 하며, 기생충 살충으로 인한 심각한 부작용이 없어야 한다. 또한, 어린이, 임신여성 및 모유 수유 여성에게 안전해야 한다. In order to solve the above problems, it is necessary to develop a new drug targeting a new molecule. New drugs should have a good insecticidal effect on adult insect pests, have a long-term effect on insect pests, and have no serious side effects from parasite insects. It should also be safe for children, pregnant women and breastfeeding women.

선충의 큐티클은 외부로부터의 약물 전달에 깊이 관여하기 때문에, 돌연변이의 큐티클 결함은 신약 개발과 관련하여 매우 의미있다(Fetterer and Rhoads, 1993; Geary et al., 1995; Ho et al., 1990; Sheehy et al., 2000, Thompson et al., 1993). 더욱, 콜라겐으로 구성된 세포 외 매트릭스인 선충의 큐티클은 선충의 발달과 생존에 중요하다. 따라서 큐티클 발달과 관련된 많은 효소와 샤페론(chaperones)이 기생 선충의 잠재적 약물 표적으로 제안되었다(Frand et al., 2005; Page et al., 2014).Since cuticle nematodes are deeply involved in drug delivery from the outside, mutation cuticle defects are highly relevant for drug development (Fetterer and Rhoads, 1993; Geary et al., 1995; Ho et al., 1990; Sheehy et al., 2000, Thompson et al., 1993). Furthermore, the cuticle of the nematode, an extracellular matrix composed of collagen, is important for nematode development and survival. Thus, many enzymes and chaperones associated with cuticle development have been proposed as potential drug targets for parasitic nematodes (Frand et al., 2005; Page et al., 2014).

최근에 단백질 구조를 예측하는 컴퓨터 알고리즘이 발전하여, 아미노산 서열로부터 목적 단백질의 3차원(3D) 구조를 예측할 수 있게 되었다(Zhang, 2008b). 이러한 예측 단백질 모델은 컴퓨터 상에서 가상 화합물 스크리닝(virtual compound screening) 및 리간드 결합 연구에 적용될 수 있고, 이러한 새로운 지표를 이용하여 FDA에 승인된 약을 신약으로 재창출하는 것은 임상 시험 시간과 비용에 있어서 효율적이다(Chong and Sullivan, 2007). Recently, computer algorithms for predicting protein structure have been developed, enabling the prediction of the three-dimensional (3D) structure of the target protein from amino acid sequences (Zhang, 2008b). These predictive protein models can be applied to virtual compound screening and ligand binding studies on a computer, and using these new indicators to regenerate FDA-approved drugs into new drugs is an efficient, (Chong and Sullivan, 2007).

본 발명자는 소포체(ER)에 존재하는 Ca2+ 결합 단백질인 칼루미닌(calumenin)을 새로운 약물의 표적 단백질로 선정하였다.The present inventors have selected calumenin, a Ca 2+ binding protein present in the ER as a target protein for a new drug.

따라서, 본 발명에서는 선충(C. elegans, B. malayi 및 O. volvulus)의 calumenin 및 인간(H. sapiens) calumenin의 구조 모델링 결과를 분석하여, 대상 약물의 가상 스크리닝을 통해 사상충증 치료용 약물을 개발하고자 하였다. Therefore, in the present invention, the structural modeling results of calumenin and human (H. sapiens) calumenin of nematodes (C. elegans, B. malayi and O. volvulus) were analyzed and a drug for treatment of river blindness was developed through virtual screening of the target drug .

기존의 사상충증 치료제는 (ⅰ) 미세사상충을 배출하는 성충 사상충을 사멸시키지 못하는 문제, (ⅱ) 약물에 대한 내성이 생기는 문제, (ⅲ) 사상충에 대한 특이성 및 선택성이 낮은 문제를 갖고 있었다. Conventional treatments for onchocerciasis have problems in that (i) they do not kill adult pathogens that excrete microcephaly, (ii) they cause resistance to drugs, and (iii) they have low specificity and selectivity for pathogens.

본 발명자들은 이를 해결하기 위해, 사상충에 대한 특이적 표적으로 calumenin을 선정하여 사상충의 calumenin에 특이적으로 결합하는 새로운 사상충증 치료제를 개발하였다.In order to solve this problem, the present inventors have selected calumenin as a specific target for insect pests and have developed a novel treatment for river insect pestis that specifically binds to calumenin of the pathogens.

본 발명자는 이트라코나졸(Itraconazole), 이다루비신(Idarubicin), 팔리페리돈(Paliperidone) 및 다우노루비신(Daunorubicin)의 사상충증 치료용 신규한 용도를 확인하여, 본 발명에 이르게 되었다.The present inventor has identified a novel use for the treatment of onchocerciasis of Itraconazole, Idarubicin, Paliperidone and Daunorubicin, leading to the present invention.

본 발명은 이트라코나졸(Itraconazole), 이다루비신(Idarubicin), 팔리페리돈(Paliperidone) 및 다우노루비신(Daunorubicin)으로 이루어진 군에서 선택되는 하나 이상의 화합물 또는 이들의 염을 포함하는 사상충증(filariasis) 치료용 또는 예방용 약학적 조성물을 제공한다.The present invention relates to a pharmaceutical composition for the treatment of filariasis comprising at least one compound selected from the group consisting of Itraconazole, Idarubicin, Paliperidone and Daunorubicin, A pharmaceutical composition for prevention is provided.

본 발명은 또한 사상충의 칼루미닌(calumenin)에 특이적으로 결합하는 사상충증 치료용 의약품의 스크리닝 방법을 제공한다. The present invention also provides a screening method for treating onchocerciasis, which specifically binds to calumenin of the pathogen.

본 발명은 여기에 제한되지 않으며, 언급되지 않은 또 다른 목적들은 아래의 기재로부터 통상의 기술자에게 명확하게 이해될 수 있다.The present invention is not limited thereto, and other objects not mentioned may be clearly understood by those skilled in the art from the following description.

본 발명은 이트라코나졸(Itraconazole), 이다루비신(Idarubicin), 팔리페리돈(Paliperidone) 및 다우노루비신(Daunorubicin)으로 이루어진 군에서 선택되는 하나 이상의 화합물 또는 이들의 염을 포함하는 사상충증(filariasis) 치료용 약학적 조성물을 제공한다.The present invention relates to a pharmaceutical composition for the treatment of filariasis comprising at least one compound selected from the group consisting of Itraconazole, Idarubicin, Paliperidone and Daunorubicin, Gt;

또한, 본 발명의 상기 화합물 또는 이들의 염은 사상충증을 일으키는 사상충의 calumenin과 특이적으로 결합할 수 있다. In addition, the compound of the present invention or a salt thereof can specifically bind to calumenin of onion flukes causing onchocerciasis.

또한, 상기 화합물 또는 이들의 염은 사상충증을 일으키는 사상충의 큐티클(cuticle) 생성을 억제할 수 있다.In addition, the compound or a salt thereof can inhibit the production of cuticle of onion flies causing onchocerciasis.

본 발명자들은 인간 calumenin에 상대적으로 낮은 결합 친화력을 가지며, 선충의 calumenin에 대한 특이성을 갖는 약물 후보 물질을 선별하기 위해, 선충 calumenin에만 높은 친화성을 나타내는 화학 물질을 분류했다. 그 결과, Itraconazole, Idarubicin, Paliperidone 및 Daunorubicin hydrochloride을 유효 물질의 후보로 선정하였으나, 이에 제한되지 않는다. The present inventors have classified chemicals exhibiting high affinity only to the nematode calumenin in order to select drug candidates having a relatively low binding affinity to human calumenin and having specificity for calumenin of the nematode. As a result, Itraconazole, Idarubicin, Paliperidone, and Daunorubicin hydrochloride were selected as candidates for the active substance, but not limited thereto.

Itraconazole은 스테롤 생합성(sterol biosynthesis)에 관여한다. Itraconazole은 lanosterol을 곰팡이 세포막의 필수 성분인 ergosterol으로 전환시키는 lanosterol 14-

Figure 112017085161968-pat00001
-demethylase 효소를 억제하여, 항진균 효과가 있는 것으로 알려져 있다(Carrillo-Munoz et al., 2006; Gachotte et al., 1997; Henry et. al., 2000).Itraconazole is involved in sterol biosynthesis. Itraconazole has been shown to reduce lanosterol to ergosterol, an essential component of the cell membrane,
Figure 112017085161968-pat00001
-demethylase enzyme (Carrillo-Munoz et al., 2006; Gachotte et al., 1997; Henry et al., 2000).

Idarubicin은 daunorubicin hydrochloride의 4-demethoxy 유사체로서, 이들과 동일한 약리학적 성질을 나타내며(Bigioni et al., 1994; Fukushima et al., 1993; Hollingshead and Faulds, 1991), 백혈병 치료제로 알려져 있다. Idarubicin is a 4-demethoxy analogue of daunorubicin hydrochloride and has the same pharmacological properties as these (Bigioni et al., 1994; Fukushima et al., 1993; Hollingshead and Faulds, 1991).

Paliperidone은 도파민 D2 수용체 길항제 및 세로토닌 5-HT2 수용체에 대한 길항제로서 작용함으로써 정신분열증을 치료 효과를 나타낸다(Cohen, 1994; He and Richardson, 1995; Leysen et. al., 1994).Paliperidone has a therapeutic effect on schizophrenia by acting as a dopamine D2 receptor antagonist and antagonist to the serotonin 5-HT2 receptor (Cohen, 1994; He and Richardson, 1995; Leysen et al., 1994).

Daunorubicin은 이중 가닥 DNA를 삽입함으로써 DNA와 RNA 합성을 억제하는 강력한 항암제로 알려져 있다(Aubel-Sadron and Londos-Gagliardi, 1984). 또한 DNA topoisomerase II의 억제제 역할을 하여 DNA 복제, 복구 및 RNA 및 단백질 합성을 억제한다 (Zunino and Capranico, 1990). Daunorubicin is known to be a potent anticancer drug that inhibits DNA and RNA synthesis by inserting double-stranded DNA (Aubel-Sadron and Londos-Gagliardi, 1984). It also acts as an inhibitor of DNA topoisomerase II, inhibiting DNA replication, repair, and RNA and protein synthesis (Zunino and Capranico, 1990).

바람직하게, 본 발명은 이트라코나졸(Itraconazole) 또는 이들의 염을 포함하는 사상충증(filariasis) 치료용 또는 예방용 약학적 조성물을 제공한다.Preferably, the present invention provides a pharmaceutical composition for treating or preventing filariasis comprising itraconazole or a salt thereof.

효모, 식물, 곤충 및 포유 동물에는 복잡한 스테롤 생합성 경로가 있으나, 자유 생활(free living) 선충 및 기생 생활 선충은 스테롤을 합성 할 수 없으므로 생존을 위해 외인성 스테롤을 보충해야 한다(Chitwood, 1999; Hieb and Rothstein, 1968). 이는 스테롤이 자유 생활 선충과 기생 선충의 탈피호르몬(ecdysteroid)의 전구체이기 때문에, 본 발명자는 스테롤 생합성의 억제제인 Itraconazole이 사상충증 치료제로서의 가능성이 높다고 판단하였으며, 본 발명의 스크리닝 방법을 통하여 이를 확인하였다.There are complex sterol biosynthetic pathways in yeast, plants, insects and mammals, but free living and parasitic nematodes can not synthesize sterols and thus need to supplement the exogenous sterols for survival (Chitwood, 1999; Hieb and Rothstein, 1968). Since the sterol is a precursor of free living nematode and parasitic nematode ecdysteroid, the present inventor has determined that itraconazole, which is an inhibitor of sterol biosynthesis, has a high possibility as a treatment for onchocerciasis, and confirmed this through the screening method of the present invention.

또한, 본 발명의 약학적 조성물은 다이에틸카바마진(Diethylcarbamazine, DEC), 멕티잔(Mectizan), 알벤다졸(Albendazole) 및 이버멕틴(Ivermectine)으로 이루어진 군에서 선택되는 하나 이상의 화합물을 추가로 포함할 수 있다. The pharmaceutical composition of the present invention may further comprise at least one compound selected from the group consisting of Diethylcarbamazine (DEC), Mectizan, Albendazole and Ivermectine can do.

본 발명의 상기 사상충증은 림프사상충증(lymphatic filariasis) 또는 회선사상충증(onchocerciasis)일 수 있다. 또한, 본 발명의 상기 사상충증의 원인이 되는 사상충이 말레이사상충(Brugia malayi) 또는 회선사상충(Onchocerca volvulus)일 수 있으나, 이에 제한되지 않는다.The onchocerciasis of the present invention may be lymphatic filariasis or onchocerciasis. In addition, the causal organism causing the onchocerciasis of the present invention may be, but is not limited to, Brugia malayi or Onchocerca volvulus.

본 발명은 사상충의 칼루미닌(calumenin)에 특이적으로 결합하는 사상충증 치료용 의약품의 스크리닝(screening) 방법을 제공한다. The present invention provides a screening method of a drug for treating onchocerciasis which specifically binds to calumenin of the pathogen.

상기 사상충증 치료용 의약품의 스크리닝(screening) 방법은 하기의 단계를 포함할 수 있다:The screening method for treating onchocerciasis may include the following steps:

(a) 사상충의 칼루미닌(calumenin) 및 인간의 칼루미닌(calumenin)의 3D 구조를 예측하는 단계;(a) predicting the 3D structure of californicin and calumenin of the wasp strand;

(b) 사상충의 칼루미닌(calumenin)과 인간의 칼루미닌(calumenin) 간의 3D 구조 상동성을 측정하는 단계;(b) measuring the 3D structural homology between calmainin of californium and calumenin of human;

(c) 후보 물질 리간드 라이브러리(ligand library)에서 선택되는 하나 이상의 리간드를 사상충의 칼루미닌(calumenin) 및 인간의 칼루미닌(calumenin)과 도킹시키는 단계; 및(c) docking one or more ligands selected from a candidate material ligand library with calmenin and calumenin of the wasp strand; And

(d) 상기 도킹된 리간드와 칼루미닌(calumenin) 간의 결합 친화도를 분석하여 사상충의 칼루미닌(calumenin)에 특이적으로 결합하는 리간드를 선택하는 단계. (d) analyzing the binding affinity between the docked ligand and calumenin to select a ligand that specifically binds to calumenin of the pathogen.

상기 (a) 단계의 3D 구조는 I-TASSER 프로그램을 통하여 예측될 수 있으나, 이에 제한되지 않는다.The 3D structure of the step (a) can be predicted through the I-TASSER program, but is not limited thereto.

상기 (b) 단계의 상동성은 PyMOL 프로그램을 통하여 RMSD 값으로 측정할 수 있으나, 이에 제한되지 않는다.The homology of step (b) may be measured by RMSD value through the PyMOL program, but is not limited thereto.

상기 (c) 단계의 도킹은 AutoDock Vina를 포함한 PyRx 컴퓨터 프로그램을 이용할 수 있으며, 이에 제한되지 않는다.The docking in step (c) may use a PyRx computer program including AutoDock Vina, but is not limited thereto.

상기 (d) 단계의 결합 친화도는 컴퓨터 프로그램을 통해 리간드와 칼루미닌(calumenin) 간의 결합 에너지를 통해 계산할 수 있으며, 이에 제한되지 않는다.The binding affinity of step (d) may be calculated through binding energy between the ligand and calumenin through a computer program, but is not limited thereto.

본 발명의 사상충증(filariasis) 치료 또는 예방용 약학적 조성물은 기존의 사상충증 치료제와 달리 사상충에 대해서 특이적이고 선택적인 치료가 가능하고, 인체에 대한 부작용을 감소시킬 수 있으며, 성충 사상충을 효과적으로 사멸시킬 수 있다.The pharmaceutical composition for the treatment or prevention of filariasis of the present invention is capable of treating a selective and selective treatment for a pathogen, unlike the conventional treatment for river blindness, capable of reducing adverse effects on the human body, have.

또한, 본 발명의 사상충증 치료용 의약품의 스크리닝 방법은 사전에 사상충 치료에 대한 효과를 예측할 수 있어, 의약품 개발에 대한 엄청난 비용과 시간을 절약할 수 있다.In addition, the screening method of the medicament for treating onchocerciasis of the present invention can predict the effect on the treatment of onionism in advance, which can save enormous cost and time for drug development.

도 1은 C. elegans의 calumenin(Ce_calu), B. malayi의 calumenin(Bm_calu), O. volvulus의 calumenin(Ov_calu) 및 H. sapiens의 calumenin(Hs_calu)의 아미노산 서열을 나타낸다.
도 2는 C. elegans의 calumenin(Ce_calu), B. malayi의 calumenin(Bm_calu), O. volvulus의 calumenin(Ov_calu) 및 H. sapiens의 calumenin(Hs_calu)의 3D 구조를 나타낸다.
도 3은 사상충 및 인간의 calumenin 간의 구조 정렬을 통하여 RMSD 값을 계산한 결과를 나타낸다.
도 4는 Itraconazole의 화학식, 3D 구조 및 Itraconazole이 CeCALU-1에 도킹하는 형태를 나타낸다.
도 5는 Albendazole 또는 Ivermectin에 대한 calu-1(tm1783) 돌연변이의 민감도를 측정한 실험 결과를 나타낸다.
도 6은 Itraconazole에 대한 calu-1(tm1783)의 저항성을 측정한 실험 결과를 나타낸다.
Figure 1 shows the amino acid sequences of calumenin (Ce_calu) of C. elegans, calumenin (Bm_calu) of B. malayi, calumenin (Ov_calu) of O. volvulus and calumenin (Hs_calu) of H. sapiens.
Fig. 2 shows the 3D structure of calumenin (Ce_calu) of C. elegans, calumenin (Bm_calu) of B. malayi, calumenin (Ov_calu) of O. volvulus and calumenin (Hs_calu) of H. sapiens.
Figure 3 shows the results of calculating the RMSD values through structural alignment between the canine and human calumenin.
Figure 4 shows the Itraconazole formula, 3D structure, and Itraconazole docking to CeCALU-1.
Figure 5 shows the results of the assay for the sensitivity of calu-1 (tm1783) mutations to Albendazole or Ivermectin.
Figure 6 shows the results of an experiment measuring the resistance of calu-1 (tm1783) to Itraconazole.

달리 정의되지 않는 한, 본 명세서에서 사용되는 모든 기술 용어 및 과학 용어는 본 분야의 통상의 기술자에 의해 일반적으로 이해되는 것과 동일한 의미를 가진다. 본 명세서에 기술된 것과 유사하거나, 또는 등가인 임의의 방법 및 물질은 본 명세서에 개시된 실시태양을 실시하는 데 사용될 수 있다.Unless otherwise defined, all technical and scientific terms used herein have the same meaning as commonly understood by one of ordinary skill in the art. Any methods and materials similar or equivalent to those described herein can be used to practice the embodiments disclosed herein.

"칼루미닌(calumenin)"은 소포체에 존재하고, Ca2+와 결합하는 효소로서, CALU 유전자에 의해서 코딩된다. "Calumenin" is an enzyme that exists in the endoplasmic reticulum and binds to Ca 2+, and is encoded by the CALU gene.

본 명세서에 사용된 용어 "리간드"란 생체 분자에 결합할 수 있는 분자이다. 일부 리간드는 활성 부위와 결합하지만, 촉매성 변환은 일어나지 않는다. 예로는 약물 디자인 분야에서 평가되는 리간드를 포함한다. 상기 리간드는 약리학적 목적으로 표적 생체분자와 비공유적으로 결합할 수 있는 그의 능력에 대해 선택되는 소형 분자일 수 있다. 일부 경우에서, 리간드는 생체 분자의 천연 거동을 강화시키거나, 활성화시키거나, 또는 억제시킬 수 있는 능력에 대해 평가된다.The term " ligand " as used herein is a molecule capable of binding to a biomolecule. Some ligands bind to the active site, but no catalytic conversion occurs. Examples include ligands that are evaluated in the field of drug design. The ligand may be a small molecule selected for its ability to non-covalently bind to a target biomolecule for pharmacological purposes. In some cases, the ligand is evaluated for its ability to enhance, activate, or inhibit the natural behavior of the biomolecule.

본 명세서에 사용된 용어 "라이브러리"는 2개 이상의 상이한 분자, 문자열, 및/또는 모델, 예컨대, 핵산 서열(예컨대, 유전자, 올리고뉴클레오티드 등) 또는 그로부터의 발현 생성물(예컨대, 효소 또는 다른 단백질)로 이루어진 집합을 의미한다. 라이브러리는 일반적으로 다수의 상이한 분자를 포함한다. 예를 들어, 라이브러리는 전형적으로 약 10개 이상의 상이한 분자를 포함한다. 거대 라이브러리는 전형적으로 약 100개 이상의 상이한 분자, 더욱 전형적으로, 약 1,000개 이상의 상이한 분자를 포함한다. 일부 적용을 위해, 라이브러리는 적어도 약 10,000개 이상의 상이한 분자를 포함한다. The term " library " as used herein refers to a nucleic acid sequence (e.g., a gene, oligonucleotide, etc.) or an expression product (e.g., an enzyme or other protein) therefrom of two or more different molecules, . Libraries generally contain a large number of different molecules. For example, a library typically comprises about ten or more different molecules. The macromolecule typically contains about 100 or more different molecules, more typically, about 1,000 or more different molecules. For some applications, the library comprises at least about 10,000 different molecules.

본 명세서에 사용된 용어 "도킹(docking)"이란 분자(예컨대, 기질 또는 리간드)와 생체 분자(예컨대, 효소 또는 단백질)의 활성 부위의 결합을 시뮬레이션하거나, 특징화(characterize)하는 컴퓨터에 의한 프로세스를 의미한다. 도킹은 전형적으로 "도커" 컴퓨터 프로그램을 사용하여 컴퓨터 시스템에서 실행된다.The term " docking " as used herein refers to a process by a computer that simulates or characterizes the binding of the active site of a molecule (e.g., a substrate or ligand) to a biomolecule (e.g., . Docking is typically performed on a computer system using a " doorker " computer program.

본 명세서에 사용된 용어 "스크리닝"이란 하나 이상의 생체분자의 하나 이상의 특성을 측정하는 프로세스를 의미한다. 예를 들어, 전형적인 스크리닝 프로세스는 하나 이상의 라이브러리의 하나 이상의 구성원의 하나 이상의 특성을 측정하는 것을 포함한다. 스크리닝은 생체분자의 전산 모델 및 생체분자의 가상 환경을 사용하여 전산적으로 수행될 수 있다.The term " screening " as used herein refers to a process of measuring one or more characteristics of one or more biomolecules. For example, a typical screening process involves measuring one or more characteristics of one or more members of one or more libraries. Screening can be performed computationally using computational models of biomolecules and virtual environments of biomolecules.

본 명세서에 사용된 용어 "상동성"은 구조적 상동성(structural homology)을 의미하며, 구조적 상동성이란, 특징적인 아미노산 서열로 인해서 삼차원(3D) 형태로 접혀서(folding) 존재하는 두 개 이상의 단백질의 삼차원 구조 간의 상대적인 동일성을 의미한다. 구조적 상동성은 0% 내지 100% 범위 내에서 결정되고, 두 개 또는 그 이상의 삼차원 구조 사이의 거리 차이, RMSD 및 TM-score 등을 이용하여 상동성을 계산할 수 있는 상업적으로 유용한 컴퓨터 프로그램을 사용하여 결정될 수 있다. 본 발명에서는 "PyMOL" 컴퓨터 프로그램을 이용하여 계산하였다.As used herein, the term " homology " refers to structural homology, and structural homology refers to the structural homology of two or more proteins that are folded in a three-dimensional (3D) Dimensional structure. Structural homology is determined within the range of 0% to 100%, and is determined using commercially available computer programs that can calculate homology using distance differences between two or more three-dimensional structures, RMSD and TM-score, etc. . In the present invention, calculation was performed using a " PyMOL " computer program.

또한, "서열 상동성"은 대상 서열과 비교하여 하나 또는 수 개의 부가, 결실 및/또는 치환을 갖는 아미노산 서열 또는 뉴클레오티드 서열과의 상동성을 포함하는 것으로 해석된다.In addition, " sequence homology " is interpreted to include homology with an amino acid sequence or a nucleotide sequence having one or several additions, deletions and / or substitutions compared to the subject sequence.

본 명세서에 사용된 용어 "I-TASSER(Iterative Threading ASSEmbly Refinement)"는 아미노산 서열로부터 단백질 분자의 입체 구조 모델을 예측하는 생물 정보학적 프로그램을 의미한다.As used herein, the term " I-TASSER (Iterative Threading ASSEmbly Refinement) " refers to a bioinformatic program that predicts a stereostructure model of a protein molecule from an amino acid sequence.

본 명세서에 사용된 용어 "PyRx"는 약물 표적에 대한 화합물의 라이브러리를 스크리닝하는데 사용할 수 있는 Virtual Screening 소프트웨어를 의미한다.As used herein, the term " PyRx " refers to Virtual Screening software that can be used to screen libraries of compounds for drug targets.

본 명세서에 사용된 용어 "AutoDock Vina"은 단백질과 리간드 간의 도킹에 효과적인 분자 모델링 시뮬레이션 소프트웨어를 의미한다. The term " AutoDock Vina " as used herein refers to molecular modeling simulation software effective for docking proteins and ligands.

본 발명의 약학적 조성물은 약제학적으로 허용되는 담체를 포함한다. 본 발명의 약학적 조성물에 포함되는 담체는 통상적으로 사용되는 것으로서, 락토스, 덱스트로스, 수크로스, 솔비톨, 만니톨, 전분, 아카시아 고무, 인산 칼슘, 알기네이트, 젤라틴, 규산 칼슘, 미세결정성 셀룰로스, 폴리비닐피롤리돈, 셀룰로스, 물, 시럽, 메틸 셀룰로스, 메틸히드록시벤조에이트, 프로필히드록시벤조에이트, 활석, 스테아르산 마그네슘 및 미네랄 오일 등을 포함하나, 이에 한정되는 것은 아니다.The pharmaceutical composition of the present invention includes a pharmaceutically acceptable carrier. Carriers included in the pharmaceutical composition of the present invention are those conventionally used and include lactose, dextrose, sucrose, sorbitol, mannitol, starch, acacia rubber, calcium phosphate, alginate, gelatin, calcium silicate, microcrystalline cellulose, But are not limited to, polyvinylpyrrolidone, cellulose, water, syrup, methylcellulose, methylhydroxybenzoate, propylhydroxybenzoate, talc, magnesium stearate and mineral oil.

본 발명의 약학적 조성물은 상기 성분들 이외에 윤활제, 습윤제, 감미제, 향미제, 유화제, 현탁제 및 보존제 등을 추가로 포함할 수 있다.The pharmaceutical composition of the present invention may further contain a lubricant, a wetting agent, a sweetening agent, a flavoring agent, an emulsifying agent, a suspending agent, a preservative, etc. in addition to the above components.

본 발명의 약학적 조성물의 적합한 투여량은 제제화 방법, 투여 방식, 환자의 연령, 체중, 성, 병적 상태, 음식, 투여 시간, 투여 경로, 배설 속도 및 반응 감응성과 같은 요인들에 의해 다양하게 처방될 수 있다. The appropriate dosage of the pharmaceutical composition of the present invention may vary depending on such factors as formulation method, administration method, age, body weight, sex, pathological condition, food, administration time, route of administration, excretion rate, .

본 발명의 약학적 조성물은 경구 또는 비경구로 투여될 수 있고, 비경구로 투여되는 경우, 정맥내 주입, 피하주입, 근육 주입, 복강 주입, 경피 투여 등으로 투여될 수 있다.The pharmaceutical composition of the present invention can be administered orally or parenterally, and when administered parenterally, it can be administered by intravenous injection, subcutaneous injection, muscle injection, intraperitoneal injection, transdermal administration, and the like.

[실시예][Example]

본 발명에서는 선충의 calumenin과 인간의 calumenin 간의 상동성을 평가하고, 가상 스크리닝을 통하여 여러가지 화합물의 사상충증 치료제로서의 용도를 확인하였다. 이에 대한 가능성을 확인하기 위하여 C. elegans의 calumenin 돌연변이 모델 및 C. elegans의 야생형 및 C. elegans의 콜라겐 생합성에 관여하는 prolyl 4- hydroxylase의

Figure 112017085161968-pat00002
subunit이 결실된 dpy-18(e364) 돌연변이 모델을 사용하여 시험하였다.In the present invention, the homology between the calumenin of the nematode and the human calumenin was evaluated, and the use of various compounds as a treatment for onchocerciasis was confirmed through virtual screening. To confirm the possibility of this, the calumenin mutant model of C. elegans and the prolyl 4-hydroxylase involved in the collagen biosynthesis of C. elegans wild type and C. elegans
Figure 112017085161968-pat00002
were tested using the dpy-18 (e364) mutant model in which the subunit was deleted.

[실시예 1] 타겟 단백질의 구조 모델링 및 상동성 평가[Example 1] Structural modeling and homology evaluation of target protein

타겟 단백질의 아미노산 서열The amino acid sequence of the target protein

CeCALU-1(GenBank 기탁 번호 AAF34189.1), BmCALU-1(Bm5089), OvCALU-1(OVOC5386) 및 HsCALU-1(GenBank 기탁 번호 AAB97725.1)의 아미노산 서열을 사용하여 각 종(species)의 calumenin 구조를 예측했다. The amino acid sequences of CeCALU-1 (GenBank Accession No. AAF34189.1), BmCALU-1 (Bm5089), OvCALU-1 (OVOC5386), and HsCALU-1 (GenBank Accession No. AAB97725.1) Predicted structure.

도 1에서 C. elegans의 calumenin(Ce_calu), B. malayi의 calumenin(Bm_calu), O. volvulus의 calumenin(Ov_calu) 및 H. sapiens의 calumenin(Hs_calu)의 아미노산 서열 정렬을 나타내었고, 그 중에서 칼슘과 결합하는 5개의 EF hands motif를 자홍색, 주황색, 노랑색, 빨강색, 청록색의 순서대로 나타내었으며, 인간 calumenin의 추가적인 EF hands motif는 파랑색과 녹색으로 나타내었다. Clustal X를 이용하여 다중 서열 정렬 하였으며, GeneDoc을 이용해 정렬 데이터를 시각화하였다. Figure 1 shows the amino acid sequence alignment of C. elegans calumenin (Ce_calu), B. malayi calumenin (Bm_calu), O. volvulus calumenin (Ov_calu) and H. sapiens calumenin (Hs_calu) Five EF hands motifs were combined in magenta, orange, yellow, red, and cyan order. Additional EF hands motifs of human calumenin were shown in blue and green. Clustal X was used for multiple sequence alignment, and the alignment data was visualized using GeneDoc.

도 1의 아미노산 서열 정렬을 통해서, 인간 및 선충의 calumenin 간에 구조적 차이를 확인하였다. Through the amino acid sequence alignment of Figure 1, structural differences between human and nematode calumenin were identified.

C. elegans의 caluemnin(CeCALU-1)은 나머지 사상충 선충의 calumenin과 72%의 서열 상동성이 있다. 반면에, 인간의 calumenin(HsCALU-1)은 C. elegans의 calumenin과 45%의 서열 상동성을, B. malayi의 calumenin(BmCALU-1)과 43%의 서열 상동성을, O. volvulus의 calumenin(OvCALU-1)과 44%의 서열 상동성을 가지는 것을 확인하였다.Caluemnin (CeCALU-1) from C. elegans is 72% homologous to calumenin of the other weevil nematodes. On the other hand, human calumenin (HsCALU-1) showed 45% sequence homology with calumenin of C. elegans and 43% sequence homology with calumenin (BmCALU-1) of B. malayi with calumenin of O. volvulus (OvCALU-1) and 44% sequence homology.

사상충의 calumenin은 5개로 추정되는 EF hands motif(칼슘이 결합하는 단백질)를 가지고 있으나, 인간 calumenin은 EF hands motif를 7개 가지고 있는 점 및 선충에만 C-terminal ER 보존 신호로 PAEL이 있다는 점에서 차이를 나타내었다.  Calumenin has five EF hands motifs (calcium binding proteins), but human calumenin has seven EF hands motifs and PAEL is a C-terminal ER conserved signal only in nematodes. Respectively.

타겟 단백질의 3D 구조 및 상동성 평가3D structure and homology evaluation of target protein

단백질 구조 예측 모델은 I-TASSER(Roy et al., 2010; Yang et al., 2015; Yang and Zhang, 2015; Zhang, 2008a)를 이용하여 분석하였고, PyMOL(The PyMOL Molecular Graphics System, Version 1.8 Schrodinger, LLC)을 이용해 시각화했다(도 2). The predicted model of protein structure was analyzed using I-TASSER (Roy et al., 2010; Yang et al., 2015; Yang and Zhang, 2015; Zhang, 2008a) and PyMOL (The PyMOL Molecular Graphics System, Version 1.8 Schrodinger , LLC) (Fig. 2).

도 2A는 C. elegans의 calumenin(CeCALU-1), 도 2B는 B. malayi의 calumenin(BmCALU-1), 도 2C는 O. volvulus의 calumenin(OvCALU-1), 도 2D는 H. sapiens의 calumenin(HsCALU-1)을 나타낸 것이다. 도 2의 모든 구조는 PyMOL을 사용하여 나타내었고, Ca2+가 결합하는 EF hands motif를 도 1와 같은 방법의 유채색으로 표시하였다.FIG. 2C shows calumenin (OvCALU-1) of O. volvulus, FIG. 2D shows calumenin (OvCALU-1) of H. sapiens, (HsCALU-1). All of the structures in FIG. 2 are shown using PyMOL, and the EF hands motif to which Ca 2+ binds is represented by the chromatic color of the method shown in FIG.

도 2에 따르면, 3개의 선충 calumenin의 전반적인 구조는 비슷하지만 인간 calumenin의 예측 구조와는 다르다는 것을 알 수 있다. 이러한 구조적 차이는 선충의 calumenin이 선택적이고, 특이적인 사상충증(Filariasis) 약물의 타겟 단백질이 될 수 있다는 것을 의미한다.2, it can be seen that the overall structure of the three nematode calumenins is similar, but different from the predicted structure of human calumenin. This structural difference implies that the nematode calumenin is the target protein of the selective and specific Filariasis drug.

각 단백질 모델의 신뢰도는 C-score에 의해 정량적으로 측정되었으며, C-score는 템플릿 정렬의 유의성과 구조 조립 시뮬레이션의 수렴 매개 변수를 기반으로 계산되었다. C-score는 a confidence score로서, 모델링에 사용한 주형(template)과의 서열 유의성과 구조 조립 시뮬레이션에서의 수렴 매개 변수를 기반으로 계산한다. I-TASSER 통계에 따르면, 일반적으로 C-score는 -5 내지 2의 값을 가지며, C-score > -1.5인 경우 정확한 위상(global topology)을 나타낸다.The reliability of each protein model was quantitatively determined by the C-score, and the C-score was calculated based on the template alignment significance and the convergence parameter of the structural assembly simulation. The C-score is a confidence score, calculated based on the significance of the sequence with the template used for modeling and the convergence parameter in the structural assembly simulation. According to I-TASSER statistics, the C-score generally has a value between -5 and 2, and a C-score> -1.5 indicates a global topology.

또한 모델링 예측 품질(the quality of the modeling prediction)을 측정하기 위해 TM-score 및 RMSD(root-mean-square deviation)를 계산했다. RMSD와 TM-score(Zhang and Skolnick, 2004)는 예측 모델과 기본 구조 사이의 거리를 측정하여 두 구조 간의 구조적 유사성을 평가하는 척도이다.The TM-score and root-mean-square deviation (RMSD) were also calculated to measure the quality of the modeling predictions. RMSD and TM-score (Zhang and Skolnick, 2004) measure the structural similarity between two structures by measuring the distance between the predicted model and the underlying structure.

TM-score는 template modeling score로서 두 단백질간의 3차원 구조의 차이를 측정한 파라미터이다.The TM-score is a template modeling score, a parameter that measures the difference in three-dimensional structure between two proteins.

TM-score에서는 큰 거리의 오차를 작은 거리의 오차보다 낮은 비중으로 계산하여, 값을 더 정확하게 만든다(Zhang and Skolnick, 2004). 정의에 따르면, TM-score ≤ 0.17은 임의의 유사성을 의미하고 TM-score > 0.5는 정확한 위상(global topology) 모델을 나타낸다(표 1).In the TM-score, the larger the distance error is calculated as the lower specific gravity than the smaller distance error, making the value more accurate (Zhang and Skolnick, 2004). By definition, TM-score ≤ 0.17 means any similarity, and TM-score> 0.5 indicates a global topology model (Table 1).

RMSD 분석은 SuperPose를 이용하여 주형에 대한 평균 편차로 계산한다. SuperPose 웹 서버는 변형된 쿼터니언 고유치 접근방법(quaterion eigenvalue approaches)을 이용한 짝짓기(pairwise) 및 다중 단백질 구조 겹치기(superposition)를 계산한다. 상동성이 높은 주형인 경우, 전통적인 비교 모델링(CM)의 RMSD 값이 1 내지 2Å인 모델이 생성된다(Marti-Renom et al., 2000). threading과 상동성이 낮은 주형에 대해 비교 모델링(CM)을 한 경우에는 루프 영역(loop region)에서 에러(error)가 있을 수 있고, RMSD 값이 2 내지 5Å의 범위에 있다(Roy et al., 2010, Zhang, 2009).The RMSD analysis is calculated as the average deviation for the template using SuperPose. The SuperPose web server computes pairwise and multiple protein structure superposition using modified quaternion eigenvalue approaches. In the case of highly homogeneous templates, a model with a RMSD value of 1 to 2 Å is generated for traditional comparative modeling (Marti-Renom et al., 2000). In case of comparative modeling (CM) for a template with low homology to threading, there may be an error in the loop region and the RMSD value is in the range of 2 to 5 Å (Roy et al. 2010, Zhang, 2009).

각 모델에 대한 C-score, TM-score 및 RMSD를 하기 표 1에 나타내었다.The C-score, TM-score and RMSD for each model are shown in Table 1 below.

Figure 112017085161968-pat00003
Figure 112017085161968-pat00003

본 발명의 각 calumenin 간의 RMSD를 계산하기 위해 각 calumenin모델을 구조 정렬(structural alignment)하였다(도 3). 도 3A는 C. elegans calumenin(CeCALU-1)과 B. malayi calumenin(BmCALU-1)의 구조 정렬을, 도 3B)는 C. elegans calumenin(CeCALU-1)과 O. volvulus calumenin(OvCALU-1)의 구조 정렬을, 도 3C는 B. malayi calumenin (BmCALU-1)과 O. volvulus calumenin(OvCALU-1)의 구조 정렬을, 도 3D는 C. elegans calumenin(CeCALU-1)과 H. sapiens calumenin(HsCALU-1)의 구조 정렬을 나타낸 것이다. In order to calculate the RMSD between each calumenin of the present invention, each calumenin model was subjected to structural alignment (Fig. 3). FIG. 3A shows the structural alignment of C. elegans calumenin (CeCALU-1) and B. malayi calumenin (BmCALU-1), FIG. 3B shows C. elegans calumenin (CeCALU-1) and O. volvulus calumenin (OvCALU- 3C shows the structural alignment of B. malayi calumenin (BmCALU-1) and O. volvulus calumenin (OvCALU-1), FIG. 3D shows C. elegans calumenin (CeCALU-1) and H. sapiens calumenin HsCALU-1).

CeCALU-1은 녹색으로, BmCALU-1은 회색(도 3A) 또는 자주색(도 3C)으로, OvCALU-1 및 HsCALU-1은 회색으로 표시했으며, EF hands motif는 상기 도 1의 방법과 동일하게 표시하였다.  1 was green, BmCALU-1 was gray (FIG. 3A) or purple (FIG. 3C), OvCALU-1 and HsCALU-1 were gray and EF hands motif was displayed in the same manner as in FIG. Respectively.

도 3에 의해 선충의 calumenin 간에는 겹치는 구조가 많으나, 인간과 선충의 calumenin 간에는 겹치는 구조가 적다는 것을 알 수 있다. FIG. 3 shows that there are many overlapping structures between the calumenin of the nematode, but the overlapping structure between the human and the calumenin of the nematode is small.

CeCALU-1 모델은 BmCALU-1(RMSD = 1.038Å, 도 4A) 및 OvCALU-1 모델(RMSD = 1.263Å, 도 4B)과 높은 구조적 유사성을 보였으나, HsCALU-1 모델과는 RMSD 값 차이가 컸다(20.627Å). 이는 선충과 인간 calumenin 구조 간에 유의미한 차이가 있음을 의미한다. BmCALU-1 모델과 OvCALU-1 모델은 RMSD 값 차이가 1.260Å(도 3C)을 가져 상호간 높은 구조적 유사성을 보였으나, HsCALU-1(RMSD = 19.877Å 및 19.918Å)과는 다른 구조적 특징을 보였다(도 4). The CeCALU-1 model showed high structural similarity with BmCALU-1 (RMSD = 1.038Å, Fig. 4A) and OvCALU-1 model (RMSD = 1.263Å, Fig. 4B) (20.627A). This implies that there is a significant difference between nematode and human calumenin structure. The BmCALU-1 model and the OvCALU-1 model showed structural similarities with each other due to the RMSD value difference of 1.260 Å (Fig. 3C), but showed different structural features from HsCALU-1 (RMSD = 19.877 Å and 19.918 Å) 4).

이러한 결과는 선충의 종이 달라도 선충 간에는 calumenin 구조가 잘 보존되지만, 인간의 calumenin 구조와는 명백히 구별된다는 것을 의미한다. 이것은 선충의 calumenin이 사상충증(Filariasis) 치료용 약물의 선택적이고 특이적인 타겟이 될 수 있다는 것을 의미한다. These results indicate that the calumenin structure is well preserved among the nematode even if the nematode is different, but it is clearly distinguished from the human calumenin structure. This means that the nematode calumenin can be a selective and specific target for the treatment of filariasis.

[실시예 2] 분자 도킹에 의한 가상 약물 스크리닝[Example 2] Virtual drug screening by molecular docking

리간드 라이브러리 선정 Selection of ligand library

1,701개의 상업적으로 이용 가능한 약물이 포함된 분자 집단(Zdd library)은 ZINC database(the ZINC drug database Version 12, http://zinc.docking.org, Irwin and Shoichet, 2005)로부터 얻었다. 1,701 화합물의 Zdd 라이브러리는 오픈 소스 가상 스크리닝 소프트웨어인 PyRx를 사용하여 선별되었다(Dallakyan and Olson, 2015).A molecular population (Zdd library) containing 1,701 commercially available drugs was obtained from the ZINC database (ZINC drug database Version 12, http://zinc.docking.org, Irwin and Shoichet, 2005). The Zdd library of 1,701 compounds was screened using PyRx, an open-source virtual screening software (Dallakyan and Olson, 2015).

분자 도킹 분석Molecular docking analysis

PyRx/AutoDock Vina(Version 0.8) 프로그램을 이용하여 예상되는 calumenin의 3D 모델에 분자 도킹을 하는 화합물을 선별하였다. We used the PyRx / AutoDock Vina (Version 0.8) program to select compounds that will molecular dock into the expected 3D model of calumenin.

각 caluemnin 모델과 리간드(ligand) 간의 결합 에너지를 측정하여 스크리닝하였다. 구체적으로 인간 calumenin(HsCALU-1)에 결합하지 않으면서 선충의 calumenin(CeCALU-1, BmCALU-1 및 OvCALU-1)에 특이적으로 결합하는 화합물을 찾기 위해 CeCALU-1, BmCALU-1, OvCALU-1 및 HsCALU-1의 개별 3D 구조를 이용하여 리간드를 선별했다. The binding energy between each caluemnin model and the ligand was measured and screened. BcCALU-1, BcCALU-1, and OvCALU-1 to specifically bind to calumenin (CeCALU-1, BmCALU-1 and OvCALU-1) of nematode without binding to human calumenin (HsCALU- 1 and HsCALU-1 were used to select ligands.

선별된 리간드를 CeCALU-1 모델과 리간드 사이의 결합 에너지가 작은 순서대로, 즉 리간드와 CeCALU-1 모델 간의 친화도가 높은 순서대로 표 2에 나열하였고, BmCALU-1, OvCALU-1 또는 HsCALU-1 모델에 대한 결합 친화도 순위를 기재하였다.The selected ligands are listed in Table 2 in the order of decreasing binding energy between the CeCALU-1 model and the ligand, that is, in the order of higher affinity between the ligand and the CeCALU-1 model, and BmCALU-1, OvCALU-1 or HsCALU- The order of binding affinity for the model is described.

Figure 112017085161968-pat00004
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Figure 112017085161968-pat00005
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인간 calumenin에 상대적으로 낮은 결합 친화력을 가지며, 선충의 calumenin에 대한 특이성을 갖는 사상충증 치료 또는 예방용 약물을 선별하기 위해, 선충 calumenin(CeCALU-1, BmCALU-1 및 OvCALU-1)에만 높은 친화성을 나타내는 화학 물질을 분류했다. 그 결과, Itraconazole, Idarubicin, Paliperidone 및 Daunorubicin hydrochloride을 유효 물질의 후보로 선정하였다. High affinity only to the nematode calumenin (CeCALU-1, BmCALU-1, and OvCALU-1) was used to screen drugs for treatment or prevention of onchocerciasis with relatively low binding affinity to human calumenin and specificity to calumenin of the nematode The chemicals that they represent are classified. As a result, Itraconazole, Idarubicin, Paliperidone and Daunorubicin hydrochloride were selected as candidates of active substances.

상기 [표 2]에서 보는 바와 같이, Itraconazole, Idarubicin, Paliperidone 및 Daunorubicin hydrochloride는 높은 선충 특이성을 갖는 것으로 확인되었으며, Itraconazole이 가장 높은 선충 특이성을 가지는 것으로 나타났다.As shown in Table 2, Itraconazole, Idarubicin, Paliperidone and Daunorubicin hydrochloride have high nematode specificity and itraconazole has the highest nematode specificity.

Itraconazole과 CeCALU-1의 calumenin 간의 도킹 상태는 PyMOL를 이용하여 시각화 하였다(도 4). Itraconazole의 화학적 구조 및 3D 구조를 도 4A에 나타내었다. 도 4B 내지 4E에서 Itraconazole과 CeCALU-1의 자세한 도킹 방식을 PyMOL를 이용하여 시각화하였다. Itraconazole은 CeCALU-1의 결합 포켓(binding pocket)과 도킹하며, 세 번째 EF hand motif(노란색으로 표시)에 연결된다. The docking state between Itraconazole and CeCALU-1 calumenin was visualized using PyMOL (Fig. 4). The chemical and 3D structures of Itraconazole are shown in Figure 4A. 4B to 4E, detailed docking schemes of Itraconazole and CeCALU-1 were visualized using PyMOL. Itraconazole is docked with the binding pocket of CeCALU-1 and connected to the third EF hand motif (marked yellow).

도 4를 통해 Itraconazole이 CeCALU-1의 calumenin과 안정적으로 결합한다는 것을 확인하였다. FIG. 4 shows that itraconazole is stably bound to calumenin of CeCALU-1.

[실시예 3] Itracozole과 calumenin 연관성 검증 [Example 3] Relationship between Itracozole and calumenin

실험의 준비Preparation of experiments

Itraconazole의 사상충증 치료 효과를 검증하기 위해, C. elegans 야생형인 N2(대조군), C. elegans의 콜라겐 생합성에 관여하는 prolyl 4- hydroxylase의

Figure 112017085161968-pat00006
subunit이 결실된 dpy-18(e364) 돌연변이(비교예), C. elegans의 calumenin이 결실된 calu-1(tm1783) 돌연변이(실시예)를 준비하였다. 대조군, 비교예 및 실시예는 L4 단계의 유충에서 24시간 키운 성충(1 day-old adult)으로 준비하였다. In order to examine the effectiveness of itraconazole in the treatment of onchocerciasis, N2 (control), C. elegans, prolyl 4-hydroxylase involved in collagen biosynthesis of C. elegans
Figure 112017085161968-pat00006
(e364) mutant in which the subunit was deleted (comparative example) and calu-1 (tm1783) mutant (example) in which C. elegans calumenin was deleted were prepared. The control, comparative, and example were prepared as adult (1 day-old adult) for 24 hours in L4 stage larvae.

상기 대조군 및 비교예는 the Caenorhabditis Genetics Center(CGC)에서 입수했고, 상기 실시예는 National BioResource Project(Japan)에서 입수했으며, 기생충 사육 방법은 표준 방법에 따랐다(Brenner, 1974). The control and comparative examples were obtained from the Caenorhabditis Genetics Center (CGC), which was obtained from the National BioResource Project (Japan) and the parasite method was followed by standard methods (Brenner, 1974).

상기 대조군, 비교예 및 실시예에 Albendazole(실험 1), Ivermectin(실험 2) 및 Itraconazole(실험 3)을 각각 처리하였다. 상기 Albendazole 및 상기 Ivermectin은 기존의 사상충증 치료제이고, Albendazole은 benzimidazole 계열의 약제이다. Ivermectin은 Streptomyces avermitilis에 의해 생산되는 항기생충성 항생물질인 Avermectin의 한 종류이다.Albendazole (Experiment 1), Ivermectin (Experiment 2) and Itraconazole (Experiment 3) were treated with the control, comparative and example, respectively. Albendazole and Ivermectin are conventional treatments for onchocerciasis, and albendazole is a benzimidazole-based drug. Ivermectin is a class of Avermectin, an anti-parasitic antibiotic produced by Streptomyces avermitilis.

상기 실험 1과 실험 2에서는 OP50 영양원이 포함된 고형 선충 성장 배지(nematode growth media, NGM)가 이용되었고, 실험 3에서는 80%(v/v)농도의 M9 buffer(22 mM KH2PO4, 42.3 mM Na2HPO4 and 85.6 mM NaCl) 및 20%(v/v) 농도의 OP50를 포함하는 액체 배양액이 사용되었다. 정확한 실험을 위하여 Itraconazole에 대한 실험용 선충 성장 배지에 콜레스테롤을 제외하였다. In Experiment 1 and 2, solid nematode growth media (NGM) containing OP50 nutrient was used. In Experiment 3, M9 buffer (22 mM KH2PO4, 42.3 mM Na2HPO4 and 80% 85.6 mM NaCl) and OP50 at a concentration of 20% (v / v) were used. Cholesterol was removed from the experimental nematode growth medium for Itraconazole for accurate experiments.

실험Experiment

실험 1 및 실험 2는 고형 성장 배지(solid plate)를 이용하였으며, 1 plate 당 10 내지 15마리의 대조군, 비교예 및 실시예를 올려놓고 20°C에서 배양하며 실험하였다. 실험 3은 96 well culture plate(Cat#32096, SPL, Republic of Korea)의 각 well에 상기 액체 배양액 100 ㎕ 및 기생충 1마리를 넣고, 20°C에서 배양하였다.Experiments 1 and 2 were performed using a solid growth plate and 10 to 15 control plates, comparative examples and examples per plate were incubated at 20 ° C. In Experiment 3, 100 μl of the liquid culture medium and 1 parasite were placed in each well of a 96-well culture plate (Cat # 32096, SPL, Republic of Korea) and cultured at 20 ° C.

실험 1은 3일 동안 Albendazole에 노출시켜서 24시간 간격으로 대조군, 비교예 및 실시예의 생존율을 측정하였고, 실험 2는 2일 동안 Ivermectin에 노출시켜서 24시간 간격으로 대조군, 비교예 및 실시예의 생존율을 측정하였으며, 실험 3은 3일 동안 Itraconazole에 노출시켜서 24시간 간격으로 대조군, 비교예 및 실시예의 생존율을 측정하였다. 상기 측정은 최소 3번 반복하였다. In Experiment 1, the survival rate of the control group, the comparative example and the example was measured at 24 hours after exposure to Albendazole for 3 days, and the survival rate of the control group, the comparative example and the example was measured at 24 hour intervals by exposure to Ivermectin for 2 days , And experiment 3 was performed for 3 days and exposed to Itraconazole at 24 hour intervals to measure the survival rate of the control group, the comparative example and the example. The measurements were repeated at least three times.

기생충은 플레이트를 건드렸을 때 반응이 없는 경우와 기생충의 인두 움직임(pharyngeal pumping)이 없는 경우에도 죽은 것으로 간주하였다. 기생충이 플레이트 밖으로 기어 나온 경우에는 숫자를 세지 않았다.The parasite was considered dead when the plate was touched and there was no response and no pharyngeal pumping of the parasite. When the parasite came out of the plate, it did not count the number.

실험 1에서는 albendazole의 농도를 0, 6.25, 12.5 및 25 μM으로 조절했고, 실험 2에서는 Ivermectin의 농도를 0, 1.2, 2.4, 4.8 및 9.6 nM으로 조절했으며, 실험 3에서는 Itraconazole의 농도를 20, 40, 80 및 160 μM으로 조절하였다. In Experiment 1, the concentration of albendazole was adjusted to 0, 6.25, 12.5 and 25 μM. In Experiment 2, the concentration of Ivermectin was adjusted to 0, 1.2, 2.4, 4.8 and 9.6 nM, , 80 and 160 [mu] M, respectively.

결과 result

실험 1의 결과는 도 5A에 나타냈고, 실험 2의 결과는 도 5B에 나타냈으며, 실험 3의 결과는 도 6에 나타냈다. The results of Experiment 1 are shown in FIG. 5A, the results of Experiment 2 are shown in FIG. 5B, and the results of Experiment 3 are shown in FIG.

실험 1에서 실시예는 대조군에 비해 Albendazole의 농도에 따라 민감한 반응을 보였다(도 5A). 비교예는 대조군에 비해 Albendazole에 대한 민감성이 높았지만, 실시예 보다는 상대적으로 낮았다. In Experiment 1, the experimental group showed a more sensitive response to Albendazole than the control group (Fig. 5A). The control group was more sensitive to albendazole than the control group, but was relatively lower than the control group.

실험 2에서 비교예와 실시예는 Ivermectin에 대한 비슷한 정도의 민감성이 나타났다. 대조군과의 차이는 Ivermectin을 투여한지 2일 후부터 나타났다. In Experiment 2, the comparative examples and the examples showed similar sensitivity to Ivermectin. Differences from the control group occurred 2 days after administration of Ivermectin.

이러한 결과는 큐티클(cuticle)의 결실이 기생충에 대한 효과적인 약물 전달을 유도할 수 있으며, 정상 표피 발달에 중요한 요소인 calumenin이 새로운 약물 표적이 될 수 있음을 의미한다.These results indicate that deletion of cuticle can induce effective drug delivery to parasites and calumenin, an important factor in normal epidermal development, can be a new drug target.

실험 3에서 실시예는 대조군 및 비교예 보다 Itraconazole에 대해 더 많은 내성을 가지는 표현형으로 나타났다(도 6). Calumenin 결손된 돌연변이 선충에 해당하는 실시예의 생존율은 160 μM Itraconazole에서 90% 이상이었지만, 대조군 및 비교예의 생존율은 같은 농도에서 약 74%와 38%를 나타내었다. 결과적으로, Itraconazole이 선충의 calumenin을 선택적이고 특이적으로 억제함으로써 사상충증의 치료 및 예방하는 효과를 갖는 것을 확인하였다.In Experiment 3, the example showed a more resistant phenotype to Itraconazole than the control and comparative examples (Fig. 6). Survival rates of the Calumenin-deficient mutant nematodes were greater than 90% in 160 μM Itraconazole, but survival rates of the control and comparative examples were about 74% and 38% at the same concentrations. As a result, Itraconazole selectively and specifically inhibited calumenin of the nematode, indicating that it has an effect of treating and preventing onchocerciasis.

Claims (12)

삭제delete 이트라코나졸(Itraconazole) 또는 이의 염을 포함하는 사상충증(filariasis) 치료용 또는 예방용 약학적 조성물.
A pharmaceutical composition for the treatment or prevention of filariasis comprising itraconazole or a salt thereof.
제2항에 있어서, 상기 이트라코나졸이 사상충증을 일으키는 사상충의 칼루미닌(calumenin)과 결합하는 것을 특징으로 하는 약학적 조성물.
3. The pharmaceutical composition according to claim 2, wherein the itraconazole is combined with calmenin of onchocerciasis causing onchocerciasis.
제2항에 있어서, 상기 이트라코나졸이 사상충증을 일으키는 사상충의 큐티클(cuticle) 생성을 억제하는 것을 특징으로 하는 약학적 조성물.
3. The pharmaceutical composition according to claim 2, wherein the itraconazole inhibits the production of cuticle of onchocerciasis causing onchocerciasis.
제2항에 있어서, 상기 사상충증은 림프사상충증(lymphatic filariasis) 또는 회선사상충증(onchocerciasis)인 것을 특징으로 하는 약학적 조성물.
3. The pharmaceutical composition according to claim 2, wherein the onchocerciasis is lymphatic filariasis or onchocerciasis.
제2항에 있어서, 상기 사상충증의 원인이 되는 사상충이 말레이사상충(Brugia malayi) 또는 회선사상충(Onchocerca volvulus)인 것을 특징으로 하는 약학적 조성물.
[Claim 3] The pharmaceutical composition according to claim 2, wherein the causal organism causing onchocerciasis is Brugia malayi or Onchocerca volvulus.
제2항에 있어서, 상기 약학적 조성물은 다이에틸카바마진(Diethylcarbamazine, DEC), 멕티잔(Mectizan), 알벤다졸(Albendazole) 및 이버멕틴(Ivermectine)으로 이루어진 군에서 선택되는 하나 이상의 화합물을 추가로 포함하는 것을 특징으로 하는 사상충증(filariasis) 치료용 또는 예방용 약학적 조성물.The pharmaceutical composition according to claim 2, wherein the pharmaceutical composition further comprises one or more compounds selected from the group consisting of Diethylcarbamazine (DEC), Mectizan, Albendazole, and Ivermectine Or a pharmaceutically acceptable salt, solvate or prodrug thereof. 삭제delete 삭제delete 삭제delete 삭제delete 삭제delete
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