KR101626721B1 - 사각망 순열패턴매칭을 위한 효율적인 알고리즘 - Google Patents
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Abstract
최근 순열패턴매칭(permutation pattern matching)에서 패턴형태에 따라 다양한 연구들이 진행되고 있다. 이 중 연속패턴(consecutive pattern)의 경우 주가지수와 같은 시계열자료 분석, 두 악보간의 유사성 분석에 응용될 수 있다고 알려져 있다. 사각망패턴(boxed mesh pattern)은 연속패턴의 일반화된 형태로 연속패턴의 경우 연속된 값들의 상대적인 순서를 고려하는 반면에 사각망패턴은 비연속적인 값들의 상대적인 순서를 고려한다. 사각망 순열패턴매칭문제(boxed mesh permutation pattern matching problem)는 패턴 와 텍스트 가 주어졌을 때, P의 사각망패턴과 매치되는 모든 T의 부분서열(subsequence)을 찾는 문제이다. 이에 따라 본 발명에서는 기존의 알고리즘을 개선하여, 시간에 사각망 순열패턴매칭문제를 해결하는 새로운 알고리즘을 제안한다.
Description
아래의 설명은 사각망 순열패턴매칭을 위한 알고리즘에 관한 것이다.
순열패턴매칭문제(permutation pattern matching problem)는 패턴 P와 텍스트 T가 주어졌을 때, P와 순서동형(order-isomorphic)인 부분서열(subsequence)이 존재하는지 판단하는 문제이다. 최근 순열패턴매칭에서 패턴형태에 따라 다양한 연구들이 진행되고 있다.
순열패턴의 변형 중 하나인 연속패턴(consecutive pattern)의 경우 주가지수와 같은 시계열자료 분석, 두 악보간의 유사성분석에 응용가능성이 밝혀져 활발히 연구되고 있다. 사각망패턴(boxed mesh pattern)은 연속패턴의 일반화된 형태로 연속 패턴의 경우 연속된 값들의 상대적인 순서를 고려하는 반면에 사각망패턴은 비연속적인 값들의 상대적인 순서를 고려한다. 사각망패턴은 패턴회피(pattern avoidance) 측면에서 연구되었다. 패턴회피는 주어진 패턴과 순서동형인 부분서열을 포함하지 않는 텍스트 순열의 개수를 세는 문제이다. 그 후, 알고리즘에서는 사각망패턴에 대한 패턴매칭문제를 정의하고 처음으로 다항시간(polynomial time) 알고리즘을 제시하였다. 사각망 순열패턴매칭문제(boxed mesh permutation pattern matching problem)는 패턴 와 텍스트 가 주어졌을 때, P의 사각망패턴과 매치되는 모든 T의 부분서열을 찾는 문제이다. 사각망 순열패턴매칭문제를 해결하는 알고리즘으로는 알고리즘이 알려져 있다.
일 실시예에 따르면, 사각망 순열패턴매칭을 수행하는 방법은, 상수시간에 비교가능한 문자집합을 나타내는 상의 패턴 와 텍스트 가 주어짐에 따라, 와 를 획득하고, 빈 순위통계트리 과 를 생성하는 전처리 단계; 및 상기 T의 접두사 에 대하여 각각의 P와 순서동형인 부분서열이 있는지 여부를 검사하는 탐색 단계를 포함할 수 있다.
일측에 따르면, 상기 와 를 획득하고, 빈 순위통계트리 과 를 생성하는 전처리 단계는, 상기와 를 획득함에 따라 순위통계트리를 이용하여 시간에 도출하는 단계를 포함하고, 상기 는, 상기 상에서 P가 주어졌을 때, 각 문자의 순위(rank)를 저장한 서열을 의미하고, 상기 는, 순위별 위치를 저장한 서열을 의미하는 것을 포함할 수 있다.
또 다른 일측에 따르면, 상기 T의 접두사 에 대하여 각각의 P와 순서동형인 부분서열이 있는지 여부를 검사하는 탐색 단계는, 부터 까지 역순으로 각각의 문자 를과 에 순서대로 삽입하는 단계; 를 삽입한 후, 상기 로부터 를 첫번째 문자, 를 마지막 문자로 하는 를 획득하고, 상기 와 상기 P가 순서동형일 경우 를 출력하는 단계; 및 에 포함된 부분서열을 찾는 과정이 끝난 후 상기 과 상기 에 저장된 원소들을 삭제하는 단계를 포함할 수 있다.
또 다른 일측에 따르면, 상기 T의 접두사 에 대하여 각각의 P와 순서동형인 부분서열이 있는지 여부를 검사하는 탐색 단계는, 상기 를 삽입할 경우, 짝(pair) 을 에 삽입하고, 짝 을 에 삽입하는 단계; 및 의 값을 이라고 정의하고, 상기 를 삽입한 후 상기 에서 의 순위 과 순위가 1인 원소 를 도출하되, 일 경우, 상기 에서 를 삭제하고 상기 에서 를 삭제하는 단계를 포함할 수 있다.
또 다른 일측에 따르면, 상기 T의 접두사 에 대하여 각각의 P와 순서동형인 부분서열이 있는지 여부를 검사하는 탐색 단계는, 상기 의 원소의 개수가 m보다 클 경우, 에서 순위가 m+1인 가장 큰 원소 를 구하고, 상기 과 상기 에서 각각 와 를 삭제하는 단계를 포함할 수 있다.
또 다른 일측에 따르면, 상기 T의 접두사 에 대하여 각각의 P와 순서동형인 부분서열이 있는지 여부를 검사하는 탐색 단계는, 상기 의 원소의 개수가 m이고, 를 포함하고 있는 경우, 트리를 중위순회(inorder traversal)하여 위치순으로 정렬된 를 출력하는 단계를 포함할 수 있다.
도 1은 좌표평면 상의 패턴 P와 텍스트 T를 나타낸 도면이다.
도 2는 일 실시예에 따른 사각망 순열패턴매칭을 수행하는 장치의 블록도를 나타낸 도면이다.
도 3은 일 실시예에 따른 사각망 순열패턴매칭을 수행하는 장치의 사각망 순열패턴매칭을 수행하는 방법을 나타낸 흐름도이다.
도 2는 일 실시예에 따른 사각망 순열패턴매칭을 수행하는 장치의 블록도를 나타낸 도면이다.
도 3은 일 실시예에 따른 사각망 순열패턴매칭을 수행하는 장치의 사각망 순열패턴매칭을 수행하는 방법을 나타낸 흐름도이다.
이하, 실시예를 첨부한 도면을 참조하여 상세히 설명한다.
도 2는 일 실시예에 따른 사각망 순열패턴매칭을 수행하는 장치의 블록도를 나타낸 도면이다.
사각망 순열패턴매칭을 수행하는 장치(200)는 시간에 사각망 순열패턴매칭문제를 해결하기 위한 것으로, 전처리부(210) 및 탐색부(220)를 포함할 수 있다. 전처리부(210) 및 탐색부(220)는 도 3의 단계들(210~220)을 수행하기 위하여 구성될 수 있다.
는 상수시간에 비교가능한 문자집합을 나타내며, 는 의 크기를 나타낸다. 상의 문자열 의 길이를 로, 의 번째 문자는 로 표기한다. 는 문자들의 연속된 형태 로 표현한다. 이때, 문자열 안에 포함된 모든 문자들은 서로 다르다고 가정한다. 문자열 의 번째부터 번째까지의 부분문자열은 로 표기하고, 를 의 접두사(prefix)라 하자. 집합 은 로 표기한다.
상의 문자열 가 주어졌을 때, 각 문자의 순위(rank)를 저장한 서열을 라 하고, 순위별 위치를 저장한 서열을 라 하자. 즉, 는 로 정의되며, 는 일 때, 로 정의된다. 예를 들어, 이 주어졌을 때, 이며, 이다. 는 를 이용하여 시간에 구할 수 있으며, 는 의 문자들을 정렬함으로써 시간에 구할 수 있음을 쉽게 알 수 있다.
상의 동일한 길이의 두 문자열 와 가 주어졌을 때, 모든 에 대해 ""를 만족하면 로 표기하고, 와 는 서로 순서동형이라 하자. 두 문자열 와 가 서로 순서동형인지는 두 문자열의 가장 작은 값부터 가장 큰 값까지 서로 동일한 위치에 존재하는지 확인함으로써 알 수 있으며 방법은 다음과 같다. 모든 에 대해 ""가 만족하는지 확인한다. 위 과정은 가 주어졌을 때 시간이 걸린다. 따라서 가 주어졌을 때 시간에 두 문자열 와 가 서로 순서동형인지 확인할 수 있다.
좌표평면 상의 네 개의 점 , , , 를 꼭짓점으로 하는 직사각형 영역을 로 표기하자. 는 좌표평면 상에, 일 때, 점 로 표현할 수 있다. 도 1은 좌표평면 상의 패턴 P와 텍스트 T를 나타낸 도면으로, 텍스트 와 패턴 를 좌표평면 상에 표현한 그림이다. 회색으로 칠해진 부분은 앞서 설명한 직사각형 영역들을 나타낸다. 원형 테투리로 감싼 점은 영역의 경계에 위치한 점을 나타낸 것으로, 의 경우 3개의 점이 의 경계에 위치해있다. 다음으로 사각망패턴과 사각망 순열패턴매칭문제를 정의하자.
1. 사각망 패턴
2. 사각망 순열패턴매칭문제
상의 패턴 P와 텍스트 T가 주어졌을 때, T를 표현한 좌표평면에서 임의의 직사각형 영역 R에 속한 점들의 서열을 라 하자. 이때, P가 와 서로 순서동형이면 P의 사각망패턴은 R에서 T의 부분서열 와 매치되었다고 하자. 사각망 순열패턴매칭문제는 P의 사각망패턴과 매치되는 모든 T의 부분서열을 찾는 문제이다.
예를 들면, 도 1에서 P=(1, 4, 2, 3)의 사각망패턴은 이고, T를 표현한 좌표평면에서 영역 에 포함된 점들의 서열은 이다. 이때, 와 P는 서로 순서동형이므로 P의 사각망패턴은 영역 에서 와 매치된다. 도 1에서 P의 사각망패턴은 , , 에서 각각 , , 과 매치된다.
순위통계트리(order-statistics tree)는 균형이진탐색트리(balanced binary search tree)에 순위(rank)를 이용한 검색기능을 추가한 자료구조이다. 트리가 저장한 원소의 개수가 n개일 때, 시간에 트리에 저장된 원소의 개수를 구하고, 시간에 하나의 원소에 대한 삽입, 삭제, 검색연산을 수행한다. 또한, 원소의 값을 입력으로 주었을 때 시간에 원소의 순위를 반환하며, 반대로 원소의 순위를 입력으로 주었을 때 시간에 해당 순위를 가진 원소를 반환한다. 순위통계트리는 각 노드에, 해당 노드를 루트(root)로 하는 서브트리(subtree)에 속한 원소의 개수를 저장한다. 검색된 원소의 순위는 다음과 같은 방식으로 구할 수 있다. 검색과정에서 오른쪽서브트리로 내려갈 때, 순위 값에 왼쪽서브트리의 원소의 개수와 1을 더한다. 원소를 찾을 때까지 위 과정을 반복하며, 마지막으로 찾은 원소의 완쪽서브트리의 원소의 개수를 더한다. 순위가 주어졌을 때 원소를 찾는 연산도 이와 유사한데, 각 단계에서 지금까지 계산된 순위 값과 구하고자 하는 순위 값을 비교하면서 왼쪽서브트리로 갈 것인 것 오른쪽서브트리로 갈 것인지를 선택하면 된다.
3. 사각망 순열패턴매칭 알고리즘
상의 패턴 와 텍스트 가 주어졌을 때, 알고리즘은 전처리단계(310)와 탐색단계(320)로 나뉜다. 전처리부(210)는 와 를 구하고, 탐색단계를 위한 빈 순위통계트리 과 를 생성한다(310). 와 는 앞에서 설명한 바와 같이, 순위통계트리를 이용하여 시간에 구할 수 있다.
탐색부(220)는 T의 접두사 에 대해서 각각 P와 순서동형인 부분서열이 있는지 검사한다(320). 접두사 에서 P와 순서동형인 부분서열을 찾는 과정은 다음과 같다. 부터 까지 역순으로 각 문자 를 과 에 순서대로 삽입한다. 를 삽입한 후, 로부터 를 첫 번째 문자, 를 마지막 문자로 하는 를 구하고, 와 P가 순서동형일 경우 를 출력한다. 에 포함된 부분서열을 찾는 과정이 끝난 후 과 에 저장된 원소들은 모두 삭제한다.
이제 를 과 에 삽입하고, P와 순서동형인 를 구하는 과정을 자세히 살펴보자. 를 삽입할 때, 짝(pair) 을 에 삽입하고, 짝 을 에 삽입한다. 순위통계트리는 각 짝의 첫 번째 원소를 기준으로 정렬하고 연산을 수행한다. 의 값을 이라고 하자. 를 삽입한 후 에서 의 순위 과 순위가 1인 원소 를 구한다. 만약 일 경우, 에서 를 삭제하고, 에서 를 삭제한다. 다음으로 의 원소의 개수가 m보다 클 경우, 에서 순위가 m+1, 즉 가장 큰 원소 를 구하고, 과 에서 각각 와 를 삭제한다. 마지막으로 의 원소의 개수가 m이고, 를 포함하고 있는 경우, 트리를 중위순회(inorder traversal)하여 위치순으로 정렬된 를 얻는다. 가 존재할 경우 앞에서 설명한 바와 같이, 를 이용하여 와 P가 순서동형인지 판단하고, 순서동형일 경우 를 출력한다.
위 과정이 를 첫 번째 문자, 를 마지막 문자로 하는 가 포함된 직사각형 영역을 올바르게 구하는지 생각해보자. P와 순서동형이기 위해서는 를 기준으로 직사각형 영역을 그렸을 때, 영역 안에 보다 작은 원소의 개수가 개, 보다 큰 원소의 개수는 개가 되어야 한다. 이는 곧 이고 의 원소의 개수가 m보다 작거나 같아야 한다는 것을 의미한다. 따라서 알고리즘은 가 포함된 직사각형 영역을 올바르게 구한다.
다음으로 도 1에서 P가 에서 와 매치되는 과정을 살펴보자. 접미사 에 포함된 부분서열을 찾는 단계에서 알고리즘은 부터 까지 차례대로 무자를 과 에 삽입한다. 은 삭제연산 없이 삽입되며, 을 삽입한 후, 의 순위는 가 된다. 의 값은 이고, 이므로, 순위가 1인 원소 은 과 에서 삭제된다. 마찬가지로, 가 삽입된 후 이 삭제된다. 이 후 삭제연산 없이 가 삽입된다. 가 삽입된 후 트리의 원소의 개수가 가 되고 에서 가장 큰 원소인 가 삭제된다. 마찬가지로 이 삽입되고 이 삭제된다. 를 삽입한 후, 이므로 에서 순위가 1인 원소인 이 삭제된다. 삭제 후 의 원소의 개수가 m이고 가 에 포함되어 있으므로 를 중위순회하여 을 구하고, P와 순서동형인지 판단한다. 둘은 순서동형이므로 를 출력한다.
마지막으로 알고리즘의 시간복잡도를 살펴보자. 전처리 단계는 앞서 설명하대로 시간이 걸린다. 탐색단계는 n-m+1개의 접두사에 대해서 각 접두사의 문자들을 과 에 삽입하는 총 단계가 존재한다. 개의 각 단계에서 가장 많은 시간이 걸리는 연산은 중위순회와 순서동형을 판단하는 부분이고, 과 에 포함된 원소의 개수는 최대 m+1이므로 이를 수행하기 위해서는 시간이 걸린다. 따라서 탐색단계는 총 시간이 걸린다. 그러므로 사각망 순열패턴매칭 알고리즘은 총 시간이 걸린다.
이상에서 설명된 장치는 하드웨어 구성요소, 소프트웨어 구성요소, 및/또는 하드웨어 구성요소 및 소프트웨어 구성요소의 조합으로 구현될 수 있다. 예를 들어, 실시예들에서 설명된 장치 및 구성요소는, 예를 들어, 프로세서, 콘트롤러, ALU(arithmetic logic unit), 디지털 신호 프로세서(digital signal processor), 마이크로컴퓨터, FPGA(field programmable gate array), PLU(programmable logic unit), 마이크로프로세서, 또는 명령(instruction)을 실행하고 응답할 수 있는 다른 어떠한 장치와 같이, 하나 이상의 범용 컴퓨터 또는 특수 목적 컴퓨터를 이용하여 구현될 수 있다. 처리 장치는 운영 체제(OS) 및 상기 운영 체제 상에서 수행되는 하나 이상의 소프트웨어 애플리케이션을 수행할 수 있다. 또한, 처리 장치는 소프트웨어의 실행에 응답하여, 데이터를 접근, 저장, 조작, 처리 및 생성할 수도 있다. 이해의 편의를 위하여, 처리 장치는 하나가 사용되는 것으로 설명된 경우도 있지만, 해당 기술분야에서 통상의 지식을 가진 자는, 처리 장치가 복수 개의 처리 요소(processing element) 및/또는 복수 유형의 처리 요소를 포함할 수 있음을 알 수 있다. 예를 들어, 처리 장치는 복수 개의 프로세서 또는 하나의 프로세서 및 하나의 콘트롤러를 포함할 수 있다. 또한, 병렬 프로세서(parallel processor)와 같은, 다른 처리 구성(processing configuration)도 가능하다.
소프트웨어는 컴퓨터 프로그램(computer program), 코드(code), 명령(instruction), 또는 이들 중 하나 이상의 조합을 포함할 수 있으며, 원하는 대로 동작하도록 처리 장치를 구성하거나 독립적으로 또는 결합적으로(collectively) 처리 장치를 명령할 수 있다. 소프트웨어 및/또는 데이터는, 처리 장치에 의하여 해석되거나 처리 장치에 명령 또는 데이터를 제공하기 위하여, 어떤 유형의 기계, 구성요소(component), 물리적 장치, 가상 장치(virtual equipment), 컴퓨터 저장 매체 또는 장치, 또는 전송되는 신호 파(signal wave)에 영구적으로, 또는 일시적으로 구체화(embody)될 수 있다. 소프트웨어는 네트워크로 연결된 컴퓨터 시스템 상에 분산되어서, 분산된 방법으로 저장되거나 실행될 수도 있다. 소프트웨어 및 데이터는 하나 이상의 컴퓨터 판독 가능 기록 매체에 저장될 수 있다.
실시예에 따른 방법은 다양한 컴퓨터 수단을 통하여 수행될 수 있는 프로그램 명령 형태로 구현되어 컴퓨터 판독 가능 매체에 기록될 수 있다. 상기 컴퓨터 판독 가능 매체는 프로그램 명령, 데이터 파일, 데이터 구조 등을 단독으로 또는 조합하여 포함할 수 있다. 상기 매체에 기록되는 프로그램 명령은 실시예를 위하여 특별히 설계되고 구성된 것들이거나 컴퓨터 소프트웨어 당업자에게 공지되어 사용 가능한 것일 수도 있다. 컴퓨터 판독 가능 기록 매체의 예에는 하드 디스크, 플로피 디스크 및 자기 테이프와 같은 자기 매체(magnetic media), CD-ROM, DVD와 같은 광기록 매체(optical media), 플롭티컬 디스크(floptical disk)와 같은 자기-광 매체(magneto-optical media), 및 롬(ROM), 램(RAM), 플래시 메모리 등과 같은 프로그램 명령을 저장하고 수행하도록 특별히 구성된 하드웨어 장치가 포함된다. 프로그램 명령의 예에는 컴파일러에 의해 만들어지는 것과 같은 기계어 코드뿐만 아니라 인터프리터 등을 사용해서 컴퓨터에 의해서 실행될 수 있는 고급 언어 코드를 포함한다. 상기된 하드웨어 장치는 실시예의 동작을 수행하기 위해 하나 이상의 소프트웨어 모듈로서 작동하도록 구성될 수 있으며, 그 역도 마찬가지이다.
이상과 같이 실시예들이 비록 한정된 실시예와 도면에 의해 설명되었으나, 해당 기술분야에서 통상의 지식을 가진 자라면 상기의 기재로부터 다양한 수정 및 변형이 가능하다. 예를 들어, 설명된 기술들이 설명된 방법과 다른 순서로 수행되거나, 및/또는 설명된 시스템, 구조, 장치, 회로 등의 구성요소들이 설명된 방법과 다른 형태로 결합 또는 조합되거나, 다른 구성요소 또는 균등물에 의하여 대치되거나 치환되더라도 적절한 결과가 달성될 수 있다.
그러므로, 다른 구현들, 다른 실시예들 및 특허청구범위와 균등한 것들도 후술하는 특허청구범위의 범위에 속한다.
Claims (8)
Priority Applications (1)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
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KR1020150090010A KR101626721B1 (ko) | 2015-06-24 | 2015-06-24 | 사각망 순열패턴매칭을 위한 효율적인 알고리즘 |
Applications Claiming Priority (1)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
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KR1020150090010A KR101626721B1 (ko) | 2015-06-24 | 2015-06-24 | 사각망 순열패턴매칭을 위한 효율적인 알고리즘 |
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KR101626721B1 true KR101626721B1 (ko) | 2016-06-02 |
Family
ID=56135833
Family Applications (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
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KR1020150090010A KR101626721B1 (ko) | 2015-06-24 | 2015-06-24 | 사각망 순열패턴매칭을 위한 효율적인 알고리즘 |
Country Status (1)
Country | Link |
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KR (1) | KR101626721B1 (ko) |
Cited By (1)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
KR20190048100A (ko) * | 2017-10-30 | 2019-05-09 | 인하대학교 산학협력단 | 사각망 순열패턴매칭을 위한 병렬 알고리즘 |
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2015
- 2015-06-24 KR KR1020150090010A patent/KR101626721B1/ko active IP Right Grant
Non-Patent Citations (3)
Title |
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Cited By (2)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
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KR20190048100A (ko) * | 2017-10-30 | 2019-05-09 | 인하대학교 산학협력단 | 사각망 순열패턴매칭을 위한 병렬 알고리즘 |
KR102050372B1 (ko) | 2017-10-30 | 2019-11-29 | 인하대학교 산학협력단 | 사각망 순열패턴매칭을 위한 병렬 알고리즘 |
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