KR101535550B1 - Differentiating method between swine infected by wild type classical swine fever virus and recombinant classical swine fever-vaccinated swine, and primer set - Google Patents

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Abstract

본 발명은 돼지열병 야외 바이러스 감염 돼지와 유전자 재조합 돼지열병 백신 접종 돼지의 감별방법 및 이를 위한 프라이머 세트에 관한 것으로, 좀더 상세하게는 돼지열병 바이러스에 대한 특이적 결합성을 갖고 다른 페스티바이러스(BVDV나 BDV)에는 결합하지 않는 프라이머 세트와 유전자 재조합 돼지열병 바이러스에 대한 특이적 결합성을 갖는 프라이머 세트를 이용하여 돼지열병 야외 바이러스 감염 돼지와 유전자 재조합 돼지열병 백신 접종 돼지를 감별하는 방법에 관한 것이다.The present invention relates to a method for distinguishing between pigs infected with an outbreak of swine fever and viruses infected with genetically recombinant swine fever, and a primer set therefor. More particularly, the present invention relates to a method for differentiating povidens, BDV) using a primer set that does not bind and a primer set that has specific binding specificity for a recombinant porcine fowl virus to distinguish between porcine fever outdoor virus-infected pigs and genetically-modified porcine fever vaccinated pigs.

Description

돼지열병 야외 바이러스 감염 돼지와 유전자 재조합 돼지열병 백신 접종 돼지의 감별방법 및 이를 위한 프라이머 세트{Differentiating method between swine infected by wild type classical swine fever virus and recombinant classical swine fever-vaccinated swine, and primer set}(Differentiating method between swine infected by wild type classical swine fever virus and recombinant classical swine fever-vaccinated swine, and primer set)

본 발명은 돼지열병 야외 바이러스 감염 돼지와 유전자 재조합 돼지열병 백신 접종 돼지의 감별방법 및 이를 위한 프라이머 세트에 관한 것으로, 좀더 상세하게는 돼지열병 바이러스에 대한 특이적 결합성을 갖고 다른 페스티바이러스(BVDV나 BDV)에는 결합하지 않는 프라이머 세트와 유전자 재조합 돼지열병 바이러스에 대한 특이적 결합성을 갖는 프라이머 세트를 이용하여 돼지열병 야외 바이러스 감염 돼지와 유전자 재조합 돼지열병 백신 접종 돼지를 감별하는 방법에 관한 것이다.The present invention relates to a method for distinguishing between pigs infected with an outbreak of swine fever and viruses infected with genetically recombinant swine fever, and a primer set therefor. More particularly, the present invention relates to a method for differentiating povidens, BDV) using a primer set that does not bind and a primer set that has specific binding specificity for a recombinant porcine fowl virus to distinguish between porcine fever outdoor virus-infected pigs and genetically-modified porcine fever vaccinated pigs.

돼지열병(classical swine fever)은 고열·식욕결핍·설사나 변비·피부청색증 및 뒷다리를 잘 못쓰거나 비틀거리는 증상을 나타내며 한번 발생하면 치료방법이 없고 감염된 돼지는 전부 죽게 되는 돼지의 질병으로서, 세계동물보건기구(OIE)에서 A급으로 분류하고 있고, 가축전염병예방법에서도 제1종 가축 전염병으로 취급하는 악성 전염병이다. A classical swine fever is a disease of swine which is characterized by high fever, appetite deficiency, diarrhea, constipation, cyanosis of the skin, weakness of the hind legs or staggering symptoms, It is classified as Class A by the Health Organization (OIE), and it is also a malignant epidemic treated as a livestock epidemic in the livestock epidemic prevention law.

돼지열병 병원체는 Flaviviridae의 Pestivirus에 속하는 돼지열병 바이러스(classical swine fever virus : CSFV)로서, 그 감염 경로는 주로 소화기와 호흡기이고, 침입한 바이러스는 편도, 림프절, 실질장기의 세포 등에서 증식하며 바이러스 혈증을 일으키고, 태반 감염도 된다. 또한, 병든 돼지의 분변으로 많은 양의 바이러스가 배출되기도 한다. The swine fever pathogen is a classical swine fever virus (CSFV) belonging to the Pestivirus of Flaviviridae. Its infection path is mainly digestive and respiratory, and the invading virus propagates in the tonsils, lymph nodes, It causes a placenta infection. In addition, a large amount of virus may be excreted in the feces of diseased pigs.

돼지열병은 감염돼지의 이동, 차량, 축산도구, 사람(신발의복) 등 다양한 경로를 통하여 전파되는데, 이와 같은 돼지열병이 발생할 경우 양돈업의 생산성 저하 및 경제적 피해를 야기시킨다. Swine fever spreads through various routes such as the movement of infected pigs, vehicles, livestock tools, and people (shoes apparel). Such swine fever causes loss of productivity and economic damage to the pigtail industry.

한국공개특허 제2010-0121288호에는 유전자재조합 돼지열병 백신바이러스 Flc-LOM-BErns 바이러스 KFCC 11442P, 그의 제조방법이 개시되어 있고, 또한, 한국공개특허 제2010-0121289호에는 유전자재조합 돼지열병 백신바이러스 Flc-LOM 바이러스 KFCC 11441P 및 그의 제조방법이 개시되어 있다.Korean Patent Publication No. 2010-0121288 discloses a recombinant porcine swine fever vaccine virus Flc-LOM-BErns virus KFCC 11442P, a method for producing the same, and Korean Patent Publication No. 2010-0121289 discloses a gene recombinant porcine heat vaccine virus Flc -LOM virus < RTI ID = 0.0 > KFCC 11441P < / RTI >

그러나, 상기 종래기술들은 유전자재조합 돼지열병 백신바이러스 및 그의 제조방법 만을 개시하고 있을 뿐, 상기 유전자재조합 돼지열병 백신바이러스를 백신으로 사용하여 돼지열병 야외 바이러스와 유전적으로 감별할 수 있는 감별방법에 대해서는 전혀 개시되어 있지 않다. However, the above-mentioned prior art discloses only a recombinant porcine swine fever virus vaccine virus and a method for producing the same, and there is no description about a method of genetically identifying a recombinant swine fever vaccine virus as a vaccine, Is not disclosed.

상기한 바와 같이, 돼지열병을 효과적으로 예방하기 위하여 감염 농가를 직접 방문하지 않고, 도축장에 출하되는 돼지의 혈액을 검사하여 야외 감염과 백신접종을 효율적으로 감별할 수 있는 방법이 절실히 요구되고 있다. As described above, in order to effectively prevent swine fever, there is a desperate need for a method for effectively discriminating outdoor infections and vaccination by inspecting the blood of a pig shipped to a slaughterhouse without visiting the infected farmer directly.

본 발명자 들은 상기와 같은 종래기술의 문제점을 해결하고자 연구를 수행하던 중, 프라이머 세트의 특이적 결합성을 이용하여 돼지열병 야외 바이러스 감염 돼지와 유전자 재조합 돼지열병 백신 접종 돼지를 효과적으로 감별할 수 있음을 알아내고, 본 발명을 완성하였다.The inventors of the present invention have conducted studies to solve the problems of the prior art as described above, and have found that the specific binding of the primer set can be used to effectively discriminate pigs infected with an outbreak of swine fever virus and recombinant swine fever vaccine And completed the present invention.

따라서, 본 발명의 목적은 프라이머 세트의 특이적 결합성을 이용하여, 돼지열병 야외 바이러스와 유전자 재조합 돼지열병 바이러스의 항원을 효과적으로 감별할 수 있는, 실시간 중합효소 연쇄반응(RT-PCR)을 통한 돼지열병 야외 바이러스 감염 돼지와 유전자 재조합 돼지열병 백신 접종 돼지의 감별방법을 제공하는 것이다. Accordingly, it is an object of the present invention to provide a method and apparatus for detecting the presence of pigs in pigs through real-time PCR (RT-PCR), which can effectively discriminate the antigen of swine fever outbreak virus and recombinant swine fever virus, It is intended to provide a method for differentiating between pigs infected with fever open-air virus and pigs vaccinated with genetically recombinant pig fever.

본 발명의 다른 목적은 상기 돼지열병 야외 바이러스 감염 돼지와 유전자 재조합 돼지열병 백신 접종 돼지를 효과적으로 감별하기 위한 프라이머 세트를 제공하는 것이다.It is another object of the present invention to provide a primer set for efficiently discriminating the swine fever outdoor virus-infected pigs and the genetically recombinant swine fever vaccinated pigs.

본 발명은 상기한 목적을 달성하기 위하여, 서열번호 1의 정방향 프라이머와 서열번호 2의 역방향 프라이머로 이루어진 프라이머 세트의 돼지열병 바이러스에만 결합하고 다른 페스티바이러스(BVDV나 BDV)에는 결합하지 않는 특이적 결합성, 및 서열번호 3의 정방향 프라이머와 서열번호 4의 역방향 프라이머로 이루어진 프라이머 세트의 유전자 재조합 돼지열병 바이러스에 대한 특이적 결합성을 이용하여 감별하는 단계를 포함하는, 실시간 중합효소 연쇄반응(RT-PCR)을 통한 돼지열병 야외 바이러스 감염 돼지와 유전자 재조합 돼지열병 백신 접종 돼지의 감별방법을 제공한다. In order to achieve the above-mentioned object, the present invention provides a primer set comprising a forward primer of SEQ ID NO: 1 and a reverse primer of SEQ ID NO: 2 and a specific binding which binds only to the pig fever virus and does not bind to other pestiviruses (BVDV or BDV) (RT-PCR), comprising the step of discriminating between the forward primer of SEQ ID NO: 3 and the reverse primer of SEQ ID NO: 4 using the specific binding to the genetically recombinant swine fever virus of the primer set, PCR) to provide a method for differentiating between porcine fever outdoor virus infected pigs and genetically recombinant pig fever vaccinated pigs.

또한, 본 발명은 상기한 목적을 달성하기 위하여, 서열번호 1의 정방향 프라이머와 서열번호 2의 역방향 프라이머로 이루어진 프라이머 세트, 및 서열번호 3의 정방향 프라이머와 서열번호 4의 역방향 프라이머로 이루어진 프라이머 세트로 구성되는, 실시간 중합효소 연쇄반응(RT-PCR)을 통한 돼지열병 야외 바이러스 감염 돼지와 유전자 재조합 돼지열병 백신접종 돼지를 감별하기 위한 프라이머 세트를 제공한다.The present invention also provides a primer set comprising a forward primer of SEQ ID NO: 1, a reverse primer of SEQ ID NO: 2, and a primer set of a forward primer of SEQ ID NO: 3 and a reverse primer of SEQ ID NO: Provides a set of primers to distinguish between swine fever outdoor virus infected pigs and genetically modified pig fever vaccinated pigs through real-time PCR (RT-PCR).

본 발명에 의한 감별방법은, 유전자적 감별을 통하여 돼지열병 야외 바이러스와 유전자 재조합 돼지열병 바이러스의 감별이 용이하고, 돼지열병 백신 바이러스의 변이를 쉽게 추적할 수 있으므로, 돼지열병 야외 바이러스가 감염된 돼지를 조기에 감별하여 제거함으로써, 돼지열병의 청정화에 효과적으로 사용될 수 있다. According to the present invention, it is possible to easily distinguish between the swine fever outbreak virus and the genetically recombinant swine fever virus through genetic discrimination and to easily track the mutation of the swine fever vaccine virus. Therefore, It can be effectively used for the purification of swine fever disease.

도 1은 BVDV Erns 유전자가 삽입된 Flc-LOM BErns 바이러스 KCTC 12304BP의 유전자 구성 모식도를 나타낸다.
도 2는 Flc-LOM-BErns 바이러스 KCTC 12304BP의 BPErns 단백질 발현 유무를 확인한 그림을 나타낸다(anti-CSFV E2 mab 및 BVDV Erns 단백질에 특이적으로 반응하는 anti-BVDV Erns mab이용).
도 3은 Flc-LOM-BErns 바이러스 KCTC 12304BP의 END 세포변성효과의 음성(END -ve)여부를 확인한 그림을 나타낸다.
도 4는 서열번호 1의 정방향 프라이머와 서열번호 2의 역방향 프라이머로 이루어진 프라이머 세트의 돼지열병 바이러스에만 결합하고 다른 Pestivirus(BVDV나 BDV)에는 결합하지 않는 특이적 결합성을 나타낸다.
도 5는 서열번호 3의 정방향 프라이머와 서열번호 4의 역방향 프라이머로 이루어진 프라이머 세트의 Flc-LOM-BErns 바이러스 KCTC 12304BP에 대한 특이적 결합성을 나타낸다.
도 6은 서열번호 3의 정방향 프라이머와 서열번호 4의 역방향 프라이머로 이루어진 프라이머 세트의 감도 테스트 결과를 나타낸다.
FIG. 1 is a schematic diagram of gene composition of Flc-LOM BErns virus KCTC 12304BP into which BVDV Erns gene is inserted.
Figure 2 shows the presence of the BPErns protein expression of the Flc-LOM-BErns virus KCTC 12304BP (using an anti-BVDV Erns mab specific for anti-CSFV E2 mab and BVDV Erns protein).
FIG. 3 shows a picture confirming whether the END cytotoxic effect of the Flc-LOM-BErns virus KCTC 12304BP is negative (END-ve).
FIG. 4 shows specific binding that binds only to the pig fever virus of the primer set consisting of the forward primer of SEQ ID NO. 1 and the reverse primer of SEQ ID NO. 2 and does not bind to other pestivirus (BVDV or BDV).
FIG. 5 shows the specific binding to the Flc-LOM-BErns virus KCTC 12304BP of the primer set consisting of the forward primer of SEQ ID NO: 3 and the reverse primer of SEQ ID NO: 4.
Fig. 6 shows the sensitivity test results of the primer set consisting of the forward primer of SEQ ID NO: 3 and the reverse primer of SEQ ID NO: 4.

본 명세서에서, "돼지열병 야외 바이러스"는 특별한 언급이 없으면, 야외(외부)로부터 감염된 돼지열병 바이러스를 지칭하며, 백신의 기능을 하는 "유전자 재조합 돼지열병 바이러스"와 구별되는 개념이다.
본 발명은 실시간 중합효소 연쇄반응(RT-PCR)을 통한 돼지열병 바이러스 야외 감염 돼지와 유전자 재조합 돼지열병 백신 접종 돼지의 감별방법에 있어서, 서열번호 1의 정방향 프라이머와 서열번호 2의 역방향 프라이머로 이루어진 프라이머 세트의 돼지열병 바이러스에만 결합하고 다른 페스티바이러스(BVDV나 BDV)에는 결합하지 않는 특이적 결합성, 및 서열번호 3의 정방향 프라이머와 서열번호 4의 역방향 프라이머로 이루어진 프라이머 세트의 유전자 재조합 돼지열병 바이러스에 대한 특이적 결합성을 이용하여 감별하는 단계를 포함하는 것을 특징으로 하는, 돼지열병 야외 바이러스 감염 돼지와 유전자 재조합 돼지열병 백신 접종 돼지의 감별방법에 관한 것이다.
In this specification, "swine fever outbreak virus" refers to a swine fever virus infected from the outside (outside), unless otherwise specified, and is a concept distinguished from "genetically modified swine fever virus" which functions as a vaccine.
The present invention relates to a method for differentiating pigs from swine fever virus-infected pigs and genetically-modified pig fever vaccinated pigs by real-time PCR (RT-PCR), comprising a forward primer of SEQ ID NO: 1 and a reverse primer of SEQ ID NO: 2 A specific binding that binds only to the pig fever virus of the primer set and does not bind to other pestiviruses (BVDV or BDV), and the genetically recombinant pig fever virus of the primer set consisting of the forward primer of SEQ ID NO: 3 and the reverse primer of SEQ ID NO: Which is characterized in that it comprises a step of discriminating between pigs infected with an outbreak of swine fever and viruses infected with genetically recombinant swine fever.

본 발명의 감별방법에서, 상기 돼지열병 바이러스에 대한 특이적 결합성은, 상기 서열번호 1의 정방향 프라이머와 서열번호 2의 역방향 프라이머로 이루어진 프라이머 세트가 상기 유전자 재조합 돼지열병 바이러스를 포함한 모든 돼지열병 바이러스에 결합하지만, 같은 Pestivirus속의 소바이러스성설사증 바이러스 및 보더병 바이러스에는 결합하지 않는 것을 특징으로 한다.In the differentiation method of the present invention, the specific binding to the swine fever virus can be confirmed by a primer set consisting of the forward primer of SEQ ID NO: 1 and the reverse primer of SEQ ID NO: 2 in all the pig fever viruses including the recombinant swine fever virus But not to the bovine viral diarrhea virus and the Border Disease virus in the same Pestivirus.

본 발명의 감별방법에서, 상기 유전자 재조합 돼지열병 바이러스에 대한 특이적 결합성은, 상기 서열번호 3의 정방향 프라이머와 서열번호 4의 역방향 프라이머로 이루어진 프라이머 세트가 상기 유전자 재조합 돼지열병 바이러스에만 결합하는 것을 특징으로 한다.In the discrimination method of the present invention, the specific binding to the genetically recombinant swine fever virus is characterized in that a primer set composed of the forward primer of SEQ ID NO: 3 and the reverse primer of SEQ ID NO: 4 binds only to the recombinant swine fever virus .

본 발명의 감별방법에서, 상기 유전자 재조합 돼지열병 바이러스는 Flc-LOM-BErns 바이러스 KCTC 12304BP인 것이 바람직하나, 이에 한정되는 것은 아니다. In the differentiation method of the present invention, the recombinant swine fever virus is preferably Flc-LOM-BErns virus KCTC 12304BP, but is not limited thereto.

상기 Flc-LOM-BErns 바이러스 KCTC 12304BP는 약독화 돼지열병 생백신 제조용 돼지열병 바이러스인 CSFV의 전체 유전자(full-length genome)를 추출하여 전장 cDNA(full-length cDNA)로 작성한 후, 상기 cDNA의 Erns 유전자를 제거하고, 소바이러스성 설사증 바이러스(bovine viral diarrhea virus; BVDV)의 Erns 유전자로 치환하여 재조합된 full-length infectious cDNA를 작성하여 클로닝 한 후, 이를 시험관내에서 genomic RNA로 전사한 다음, 돼지신장세포에 투입(transfection)하여 CSFV의 Erns 유전자가 제거되고, BVDV의 Erns 유전자가 삽입된 유전자 재조합 돼지열병 바이러스로서, 이에 대해서는 한국공개특허 제2010-0121288호에 상세히 개시되어 있다.The Flc-LOM-BErns virus KCTC 12304BP was prepared by extracting the full-length genome of CSFV, a swine fever virus for the production of attenuated swine fever live vaccine, into full-length cDNA, , And the recombinant full-length infectious cDNA was prepared by substituting the Erns gene of bovine viral diarrhea virus (BVDV). Then, the recombinant full-length infectious cDNA was transcribed into genomic RNA in vitro, A gene recombinant swine fever virus in which an Erns gene of CSFV is deleted by transfection into cells and an Erns gene of BVDV is inserted, and this is disclosed in detail in Korean Patent Publication No. 2010-0121288.

본 발명의 감별방법에서, 상기 돼지열병 야외 바이러스는 돼지열병 생백신주로 사용하고 있는 바이러스를 제외한 것을 말한다. In the differentiation method of the present invention, the swine fever outbreak virus refers to a virus except for a virus mainly used for swine fever live vaccine.

또한, 본 발명의 감별방법에서, 상기 백신은 생백신인 것이 바람직하나, 이에 한정되는 것은 아니다. In the method of the present invention, the vaccine is preferably a live vaccine, but is not limited thereto.

본 발명의 다른 태양은, 서열번호 1의 정방향 프라이머와 서열번호 2의 역방향 프라이머로 이루어진 프라이머 세트, 및 서열번호 3의 정방향 프라이머와 서열번호 4의 역방향 프라이머로 이루어진 프라이머 세트로 구성되는, 실시간 중합효소 연쇄반응(RT-PCR)을 통한 돼지열병 야외 바이러스 감염 돼지와 유전자 재조합 돼지열병 백신접종 돼지를 감별하기 위한 프라이머 세트에 관한 것이다. Another aspect of the present invention is a method for producing a primer set comprising a primer set consisting of the forward primer of SEQ ID NO: 1, the reverse primer of SEQ ID NO: 2, and a primer set of the forward primer of SEQ ID NO: 3 and the reverse primer of SEQ ID NO: The present invention relates to a set of primers for discriminating between swine fever outdoor virus infected pigs and recombinant swine fever vaccinated pigs through chain reaction (RT-PCR).

본 발명의 프라이머 세트에서, 상기 유전자 재조합 돼지열병 백신의 바이러스는 Flc-LOM-BErns 바이러스 KCTC 12304BP인 것이 바람직하나, 이에 한정되는 것은 아니다.In the primer set of the present invention, the virus of the genetically modified pig fever vaccine is preferably Flc-LOM-BErns virus KCTC 12304BP, but is not limited thereto.

본 발명의 프라이머 세트에서, 상기 돼지열병 야외 바이러스는 돼지열병 생백신주로 사용하고 있는 바이러스를 제외한 것을 말한다. In the primer set of the present invention, the swine fever outbreak virus refers to a virus except for the virus mainly used for swine fever live vaccine.

또한, 본 발명의 프라이머 세트에서, 상기 백신은 생백신인 것이 바람직하나, 이에 한정되는 것은 아니다.         In the primer set of the present invention, the vaccine is preferably a live vaccine, but is not limited thereto.

이하 실시예를 통하여 본 발명을 보다 상세히 설명한다. 그러나, 이하의 실시예들은 본 발명을 구체적으로 설명하기 위한 것일 뿐, 본 발명의 권리범위를 이에 한정하고자 하는 것은 아니다.
Hereinafter, the present invention will be described in more detail by way of examples. However, the following examples are intended to illustrate the present invention only and are not intended to limit the scope of the present invention.

<< 실시예Example 1>  1> BVDVBVDV ErnsErns 유전자로 치환된  Gene-substituted FlcFlc -- LOMLOM -- BErnsBErns 바이러스  virus KCTCKCTC 12304BP의 제조 Manufacture of 12304BP

본 실시예는 한국공개특허 제2010-0121288호에 개시되어 있는 바와 같이, 돼지열병 Erns 유전자를 BVDV Erns 유전자로 치환하여 바이러스 제조하여, BVDV Erns 단백질을 발현하는 Flc-LOM-BErns 바이러스 KCTC 12304BP를 확인한 후, 상기 유전자 재조합 Flc-LOM-BErns 바이러스 KCTC 12304BP의 생물학적 특성을 조사하였다. As described in Korean Patent Laid-Open No. 2010-0121288, the present Example was carried out by replacing the porcine fever Erns gene with the BVDV Erns gene to prepare a virus and confirming the Flc-LOM-BErns virus KCTC 12304BP expressing the BVDV Erns protein Later, the biological properties of the recombinant Flc-LOM-BErns virus KCTC 12304BP were investigated.

(1). (One). 돼지열병Swine fever ErnsErns 유전자를  Gene BVDVBVDV ErnsErns 유전자로 치환한 바이러스의 제조 Generation of virus-substituted virus

돼지열병 생백신 바이러스인 Flc-LOM strain에서 genomic RNA를 추출하여 전체 RNA에 대한 full-length cDNA를 합성하였다. Genomic RNA was extracted from Flc-LOM strain, a pig fever virus, and full-length cDNA was synthesized for total RNA.

합성된 cDNA에서 Erns 유전자(735bp)를 제거하고, 국내에서 분리한 소바이러스성 설사증 바이러스(bovine viral diarrhea virus) KD26-1 strain의 Erns 유전자(735 bp)를 삽입하여 cDNA를 작성하였다 (하기 표 1 및 표 2 참조). The Erns gene (735 bp) was removed from the synthesized cDNA, and cDNA was prepared by inserting the Erns gene (735 bp) of the KD26-1 strain of bovine viral diarrhea virus isolated from Korea (see Table 1 And Table 2).

Flc-LOM-BErns 바이러스 KCTC 12304BP의 Erns 유전자 치환 위치Erns gene replacement site of Flc-LOM-BErns virus KCTC 12304BP 치환 대상 유전자명 Replacement target gene name 치환에 사용한 유전자 The gene used for substitution 치환 유전자 위치*
Substitution gene location *
ErnsErns BVDV KD26-1
Erns (735bp)
(서열번호 5)
BVDV KD26-1
Erns (735 bp)
(SEQ ID NO: 5)
1115~18491115 ~ 1849

*치환 유전자 위치 : Flc-LOM BErns RNA 염기서열 기준* Replacement gene location: Flc-LOM BErns RNA base sequence

Flc-LOM-BErns KCTC 12304BP 및 BVD 바이러스의 Erns 유전자를 특이적으로 증폭할 수 있는 RT-PCR용 프라이머Flc-LOM-BErns KCTC 12304BP and primers for RT-PCR capable of specifically amplifying the Erns gene of BVD virus 프라이머 명칭Name of the primer 프라이머 염기서열Primer base sequence 증폭위치*
Amplification position *
증폭크기
(bp)
Amplification size
(bp)
BErnsBErns F - 5' ggaagaaatta-gaaaaagcattgctggcatgggcaat 3' (서열번호 6)
R - 5' gatagggcata-tgctccaaaccacgtcttactc 3'
(서열번호 7)
F-5 'ggaagaaatta-gaaaaagcattgctggcatgggcaat 3' (SEQ ID NO: 6)
R-5 'gatagggcata-tgctccaaaccacgtcttactc 3'
(SEQ ID NO: 7)
1115~1140

1828~1849
1115 ~ 1140

1828 ~ 1849
735735

* 증폭위치 : Flc-LOM-BErns 염기서열 기준* Amplification location: Based on the Flc-LOM-BErns sequence

이때, RT-PCR 조건은 30분/42℃, 15분/94℃, (40싸이클: 60초/94℃, 60초/53℃, 60초/72℃), 10분/72℃로 하여 Erns 유전자를 증폭시켰다. The RT-PCR conditions were 30 min / 42 ° C, 15 min / 94 ° C, 40 cycles / 60 sec / 94 ° C, 60 sec / 53 ° C, 60 sec / 72 ° C, The gene was amplified.

Flc-LOM-BErns 바이러스 KCTC 12304BP를 제조하기 위하여, NEB로부터 구입한 pACYC177 플라스미드의 T7 프로모터의 downstream에 클로닝하여 Flc-LOM- BErns 재조합 플라스미드를 작성하였는 바, 그 결과를 도 1에 나타내었다. To prepare Flc-LOM-BErns virus KCTC 12304BP, a Flc-LOM-BErns recombinant plasmid was cloned downstream of the T7 promoter of the pACYC177 plasmid purchased from NEB, and the result is shown in Fig.

상기 Flc-LOM-BErns 재조합 플라스미드를 in vitro에서 전사하여 RNA를 생성하였으며, 리포펙션(lipofectin)에 RNA를 혼합하여 돼지신장세포(porcine kidney 15 : PK15)에 투입(transfection)하였다. The Flc-LOM-BErns recombinant plasmid was transfected in vitro to produce RNA, and RNA was mixed in lipofectin and transfected into porcine kidney 15 (PK15).

RNA가 투입된 세포에서 바이러스가 생성되었으며, 이를 증식시켜 수득한 유전자 재조합 돼지열병 바이러스를 2012년 11월 2일자로, 한국생명자원센터 (KCTC)에 기탁번호 KCTC12304BP로 기탁하였다.
The virus was generated from the cells into which the RNA was added, and the genetically recombinant swine fever virus obtained by propagating the virus was deposited with KCTC12304BP on Nov. 2, 2012 at the Korea Life Resource Center (KCTC).

(2). (2). BVDVBVDV ErnsErns 단백질을 발현하는  Protein-expressing FlcFlc -- LOMLOM -- BErnsBErns 바이러스  virus KCTCKCTC 12304 12304 BPBP 의 확인Confirmation of

96웰 마이크로 플레이트에 단층배양된 돼지신장세포(porcine kidney 15 : PK15)세포가 단층배양되도록 24시간 동안 배양한 후, 세포배양 상층액을 제거하고, 희석된 Flc-LOM-BErns 바이러스 KCTC 12304BP를 100㎕씩 접종하였다. The cell culture supernatant was removed after incubation for 24 hours to monolayer porcine kidney 15 (PK15) cells monolayered in 96-well microplates, and the diluted Flc-LOM-BErns virus KCTC 12304BP Respectively.

37℃ 이산화탄소 배양기에서 4일간 배양한 후 배양 상층액을 모두 제거한 다음, 아세톤/메탄올(1:1) 용액을 100㎕ 씩 96 웰에 첨가한 후, 5분간 고정하였다. 고정액을 제거한 후 돼지열병 바이러스에 특이적으로 반응하는 anti-CSFV E2 mab 및 BVDV Erns 단백질에 특이적으로 반응하는 anti-BVDV Erns mab를 1시간 동안 실온에서 반응시켰다. After incubation for 4 days in a 37 ° C carbon dioxide incubator, all of the culture supernatant was removed and 100 μl of acetone / methanol (1: 1) solution was added to 96 wells and fixed for 5 minutes. After removing the fixative, anti-CSFV E2 mab and anti-BVDV Erns mab specifically reacted with swine fever virus were reacted at room temperature for 1 hour.

10mM 인산 완충액(pH7.2)으로 2회 세척한 후, biotin-labeled anti-mouse IgG를 40분간 실온에서 반응시킨 다음, Avidin-biotin complex HRP conjugate를 40분간 실온에서 추가 반응시켰다. Flc-LOM-BErns 바이러스 KCTC 12304BP가 증식된 돼지 신장세포가 anti-CSFV E2 mab 및 anti-BVDV Erns mab과 반응하여 염색되도록 DAB(diaminobenzidin)를 이용하여 발색한 결과, Flc-LOM-BErns 바이러스 KCTC 12304BP는 anti-CSFV E2 mab 및 anti-BVDV Erns mab에 특이적으로 염색됨으로써, BVDV Erns 유전자가 정확하게 치환되어 Erns 단백질로 발현되고 있음을 확인하였다(도 2 참조).
After washing twice with 10 mM phosphate buffer (pH 7.2), biotin-labeled anti-mouse IgG was reacted at room temperature for 40 min. Then, Avidin-biotin complex HRP conjugate was further reacted at room temperature for 40 min. Flc-LOM-BErns virus KCTC 12304BP was grown using DAB (diaminobenzidine) to react with anti-CSFV E2 mab and anti-BVDV Erns mab to produce stained pig kidney cells. Flc-LOM-BErns virus KCTC 12304BP Were specifically stained for anti-CSFV E2 mab and anti-BVDV Erns mab, confirming that BVDV Erns gene was correctly substituted and expressed as Erns protein (see FIG. 2).

(3). (3). FlcFlc -- LOMLOM -- BErnsBErns 바이러스  virus KCTCKCTC 12304 12304 BPBP 의 생물학적 특성Biological characteristics of

(3-1). (3-1). ENDEND - - veand 생물학적  Biological 마커의Marker 생성 produce

Flc-LOM-BErns 바이러스 KCTC 12304BP를 작성한 후, END(Exaltation of Newcastle Disease virus) 현상에 의한 초대 돼지고환세포(Primary Swine testicle cell; ST cell)의 세포변성 효과(cytopathic effect : CPE)의 유무(+ve, -ve)를 다음과 같이 확인하였다. The presence or absence of cytopathic effect (CPE) of the primary swine testicle cell (ST cell) caused by the Ex (Exaltation of Newcastle Disease virus) phenomenon after preparing Flc-LOM-BErns virus KCTC 12304BP, ve, -ve) were confirmed as follows.

96웰 마이크로 플레이트에 초대 돼지고환세포가 단층 배양되도록 24시간 동안 배양하였다. Flc-LOM-BErns 바이러스 KCTC 12304BP를 8 반복으로 10배 단계로 계단 희석하였다. 초대 돼지고환세포가 단층배양된 96웰 마이크로 플레이트의 세포배양 상층액을 제거하고, 각 희석 단계별로 Flc-LOM-BErns 바이러스 KCTC 12304BP를 100㎕씩 접종하였다. And incubated for 24 hours in a 96-well microplate to allow monoculture of invasive pig testicular cells. The Flc-LOM-BErns virus KCTC 12304BP was stair-diluted in 10-fold steps with 8 replicates. The cell culture supernatant of 96-well microplate with monoculture of the test pig test cells was removed and 100 Fl of Flc-LOM-BErns virus KCTC 12304BP was inoculated by each dilution step.

37℃ 이산화탄소 배양기에서 4일간 배양 후 배양상층액을 모두 제거한 후, 104.0 PFU의 Newcastle disease virus(NDV)를 100㎕씩 첨가하여 2시간 감작하였다. 추가로 100㎕의 세포배양 배지를 추가하여 3일간 배양한 후 세포변성 효과가 출현하는 유무를 관찰한 결과, 기존의 Flc-LOM 바이러스는 세포변성 효과가 뚜렷이 보이는 END +ve의 생물학적 마커가 확인되었으나, Flc-LOM-BErns 바이러스 KCTC 12304BP는 END -ve의 생물학적 마커가 확인됨으로써, Flc-LOM 바이러스와는 다른 특성을 보였다 (도 3 참조).
After incubation for 4 days in a 37 ° C carbon dioxide incubator, the culture supernatant was removed and 100 μl of 10 4.0 PFU of Newcastle disease virus (NDV) was added for sensitization for 2 hours. After addition of 100 μl of the cell culture medium, the cells were incubated for 3 days and the presence or absence of cytopathic effect was observed. As a result, the biological markers of END + ve which showed the cytotoxic effect of the existing Flc-LOM virus were confirmed , Flc-LOM-BErns virus KCTC 12304BP showed different characteristics from the Flc-LOM virus by confirming the biological marker of END-ve (see Fig. 3).

(3-2). 안전성 및 면역원성 확인(3-2). Identify safety and immunogenicity

Flc-LOM-BErns 바이러스 KCTC 12304BP를 40-50 일령 자돈 5마리에 근육접종을 하고, 대조군으로 4 마리의 자돈에 멸균된 인산완충액을 주사하였다. Flc-LOM-BErns virus KCTC 12304BP was inoculated intramuscularly into 5 pigs at 40-50 days of age and injected with sterile phosphate buffer solution to 4 pigs as a control group.

바이러스 접종 후 혈중내 바이러스 함량, 분변 및 비즙에 바이러스 배출 유무를 21일간 관찰한 결과, 접종 후 5-10일 사이에 일시적으로 혈액, 비즙 및 분변에서 바이러스가 관찰되었으나, 임상증상 발현 등의 부작용은 관찰되지 않았다. Viruses were observed in the blood, juice and feces temporarily during 5-10 days after inoculation with the viral contents in the blood, feces and juice, Not observed.

또한, Flc-LOM-BErns 바이러스 KCTC 12304BP를 접종한 후의 백혈구 변화 관찰에서 접종군 및 대조군 모두 정상범위(10,000-30,000/㎣)로 나타났으며, 직장내 체온 변화도 모두 정상으로 확인되어 Flc-LOM-BErns 바이러스 KCTC 12304BP의 안전성이 우수함이 확인되었다. 또한 Flc-LOM-BErns 바이러스 KCTC 12304BP를 접종한 후의 부작용 현상은 관찰되지 않았다. In addition, the white blood cell changes after inoculation with Flc-LOM-BErns virus KCTC 12304BP showed normal range (10,000-30,000 / ㎣) in both inoculation group and control group, -BErns virus KCTC 12304BP was found to be excellent in safety. No adverse events were observed after inoculation with Flc-LOM-BErns virus KCTC 12304BP.

또한, 돼지에서의 면역원성을 확인하기 위해 돼지열병 항체가 음성인 45일령 돼지에 접종하였다. Flc-LOM-BErns 접종군 1차 접종 3주후 평균 128배의 바이러스 중화 항체가를 보였으며, 2차 접종 2주 후 평균 256배 이상의 항체가를 나타내었다. In order to confirm the immunogenicity in pigs, pigs were inoculated at 45 days old pigs which were negative for swine fever antibody. After 3 weeks of the first inoculation with Flc-LOM-BErns inoculation group, the mean antibody titer was 128 times, and the antibody titer was 256 times or more on the 2nd week after the second inoculation.

2차 접종 2주후 돼지열병 강병원성 바이러스인 SW03 strain을 100MLD 근육으로 공격접종하여 방어효과를 조사한 결과, 대조군은 모두 폐사하였으나, Flc-LOM-BErns 바이러스 KCTC 12304BP 접종군은 100% 생존하여 Flc-LOM-BErns 바이러스 KCTC 12304BP를 이용한 돼지열병 백신의 방어효과가 우수함을 확인하였다.
After 2 weeks of the second inoculation, the SW03 strain of swine fever virus SW03 strain was attacked with 100MLD muscle and the protection effect was examined. As a result, all the control group died, but Flc-LOM-BErns virus KCTC 12304BP survived 100% -BErns virus KCTC 12304BP was found to be superior to the pig flu vaccine.

<< 실시예Example 2>  2> FlcFlc -- LOMLOM -- BErnsBErns 바이러스  virus KCTCKCTC 12304 12304 BPBP To 백신주로Vaccine mainly 사용시의 항원 감별 진단법 Differential Diagnosis of Antigen in Use

국내에서 돼지열병은 현재 생백신을 사용하고 있기 때문에, 백신주와 야외주를 감별하는 것이 중요하다. 이에 따라 Flc-LOM-BErns를 백신주로 사용할 경우의 야외주와 감별하는 항원 감별 진단법을 개발하였다.Domestic swine fever Because we are currently using live vaccines, it is important to distinguish between vaccine and open air. Therefore, we have developed a differential diagnosis method that distinguishes from open field when using Flc-LOM-BErns as a vaccine.

본 항원 감별 진단법은 2개의 유전자를 단독으로 증폭시켜 그 증폭여부에 따라 Flc-LOM-BErns 바이러스 KCTC 12304BP와 돼지열병 야외 바이러스를 RT-PCR로 감별하는 방법이다. The differential diagnosis of this antigen is based on the amplification of two genes, and the identification of the Flc-LOM-BErns virus KCTC 12304BP and the outbreak of swine fever virus by RT-PCR according to their amplification.

(1) 항원 감별 진단을 위한 (1) for antigen-specific diagnosis RTRT -- PCRPCR for 프라이머의Primer 제작  making

항원 감별 진단을 위한 RT-PCR용 프라이머는 Flc-LOM-BErns 바이러스 KCTC 12304BP를 바탕으로 제작하였는데, 프라이머 D1 (서열번호 1, 2)은 유전자 재조합 돼지열병 백신 바이러스 뿐만 아니라 돼지열병 바이러스 유전형 1, 2, 3에 모두 결합하기 위하여, 정방향 프라이머에는 1개, 역방향 프라이머에는 2개의 멀티코돈을 넣어 제작하였다. The primers for RT-PCR for the differential diagnosis of the antigens were prepared based on the Flc-LOM-BErns virus KCTC 12304BP. Primer D1 (SEQ ID NOS: 1 and 2) was used for genetic recombination of pig swine fever virus genotype 1, 2 , 3, one forward primer and two reverse primers were used to construct all of the multi codons.

프라이머 D2 (서열번호 3, 4)는 유전자 재조합 돼지열병 바이러스만 결합하도록 제작하였다. Primer D2 (SEQ ID NOS: 3 and 4) was constructed so that only recombinant swine fever viruses were bound.

이때, 프라이머 D1은 78번부터~505번까지의 뉴클레오티드를 증폭시키고, 5'NCR과 Npro gene을 일부 포함하도록 하였으며, 프라이머 D2는 1699번부터 2184번까지의 뉴클레오티드를 증폭시키고, Erns 및 E1 gene을 일부 포함하도록 작성하였으며, 하기 표 3과 같다. Primer D1 amplified the nucleotides 78 to 505 and partially contained 5'NCR and the Npro gene. Primer D2 amplified the nucleotides 1699 to 2184 and amplified the Erns and E1 genes Table 2 &lt; tb &gt; &lt; TABLE &gt;

항원 감별 진단을 위하여 사용한 RT-PCR용 프라이머Primers for RT-PCR used for antigen-specific diagnosis 프라이머 명칭Name of the primer 프라이머 염기서열Primer base sequence 증폭위치*
Amplification position *
D1D1 F: 5'-CGA CGG CCG AAM TGG GCT A-3' (서열번호 1)
R: 5'-TGT TGA YTG TGG GTG TAC CWC-3'(서열번호2)
F: 5'-CGA CGG CCG AAM TGG GCT A-3 '(SEQ ID NO: 1)
R: 5'-TGT TGA YTG TGG GTG TAC CWC-3 '(SEQ ID NO: 2)
78-96

484-505
78-96

484-505
D2D2 F: 5'-CCA GGA TAC TGC TCA TTA CC-3' (서열번호 3)
R: 5'-ACG TCT TCA GTC CTG AGT TC-3' (서열번호 4)
F: 5'-CCA GGA TAC TGC TCA TTA CC-3 '(SEQ ID NO: 3)
R: 5'-ACG TCT TCA GTC CTG AGT TC-3 '(SEQ ID NO: 4)
1699-1718

2165-2184
1699-1718

2165-2184

* 증폭위치 : Flc-LOM-BErns 염기서열 기준* Amplification location: Based on the Flc-LOM-BErns sequence

(2) 항원 감별을 위한 (2) for antigen identification RTRT -- PCRPCR

하기 상기 서열번호 1의 정방향 프라이머와 서열번호 2의 역방향 프라이머를 하나의 프라이머 세트(D1)로 하는 428 bp 크기의 서열번호 8의 5'NCR 유전자, 및 서열번호 3의 정방향 프라이머와 서열번호 4의 역방향 프라이머를 하나의 프라이머 세트(D2)로 하는 486 bp 크기의 서열번호 9의 E-rns-E1 유전자를 이용하여 각각 RT-PCR을 수행하였다.The 5'NCR gene of SEQ ID NO: 8 having a size of 428 bp and the forward primer of SEQ ID NO: 3 and the 5'NCR gene of SEQ ID NO: 4 having the forward primer of SEQ ID NO: 1 and the reverse primer of SEQ ID NO: RT-PCR was carried out using the E-rns-E1 gene of SEQ ID NO: 9 having a size of 486 bp and using the reverse primer as a primer set (D2).

이때, RT-PCR은 30분/42℃, 10분/94℃, (35 싸이클: 30초/94℃, 30초/53℃, 45초/72℃), 10분/72℃의 조건으로 수행하였으며, 증폭된 유전자는 아가로스젤에서 전기영동법으로 확인하였다.
RT-PCR was performed under conditions of 30 minutes / 42 ° C, 10 minutes / 94 ° C, (35 cycles: 30 seconds / 94 ° C, 30 seconds / 53 ° C, 45 seconds / 72 ° C) The amplified gene was confirmed by electrophoresis on agarose gel.

(3). (3). FlcFlc -- LOMLOM -- BErnsBErns 바이러스  virus KCTCKCTC 12304 12304 BPBP Wow 돼지열병Swine fever 야외 감염 바이러스의 감별 Differentiation of outdoor infectious virus

상기와 같이 증폭된 유전자를 확인한 결과, 하기 표 4와 같이, D1 프라이머 세트는 현재 돼지열병 진단용으로 사용하고 있는 것으로 돼지열병에 특이적으로 결합하여 BErns 뿐만이 아니라, 돼지열병 바이러스들은 모두 검출이 되었으나, BVDV에는 결합하지 않았다 (도 4 참조). As a result of confirming the amplified genes as described above, the D1 primer set is currently used for diagnosis of swine fever, as shown in Table 4 below. It was specifically bound to swine fever and not only BErns but also swine fever viruses were detected, But not to BVDV (see Fig. 4).

또한, D2 프라이머 세트는 Flc-LOM-BErns 바이러스 KCTC 12304BP에 특이적으로 결합하는 것으로, 돼지열병 뿐만 아니라 BVDV에도 결합하지 않았으며, 오직 Flc-LOM-BErns 바이러스 KCTC 12304BP에만 결합하였다 (도 5 참조). In addition, the D2 primer set specifically binds to the Flc-LOM-BErns virus KCTC 12304BP and did not bind BVDV as well as swine fever, binding only to the Flc-LOM-BErns virus KCTC 12304BP (see Figure 5) .

특이적 결합 유무Specific binding 프라이머 primer 유전자gene Flc-LOM-
BErns KCTC 12304BP
Flc-LOM-
BErns KCTC 12304BP
돼지열병
바이러스
Swine fever
virus
BVDVBVDV
D1D1 5'NCR5 'NCR OO OO XX D2D2 Erns-E1Erns-E1 OO XX XX

따라서, 상기의 프라이머 세트를 이용하여 Flc-LOM-BErns 바이러스 KCTC 12304BP를 생백신주로 사용할 경우, 돼지열병 야외 바이러스와 항원 감별을 할 수 있음을 알 수 있고, 상기 프라이머 세트 D1은 10 TCID50 정도의 검출 감도를 보이며, 프라이머 세트 D2 역시 유사한 검출 감도를 나타내어, 진단용 프라이머로 사용가능함을 확인할 수 있었다 (도 6 참조).Thus, it can be seen that when the Flc-LOM-BErns virus KCTC 12304BP is used as a live vaccine mainly using the primer set described above, the antigen can be distinguished from an outbreak of swine fever virus. The primer set D1 has a detection rate of about 10 TCID 50 And the primer set D2 also exhibited similar detection sensitivity, confirming that it can be used as a diagnostic primer (see FIG. 6).

본 발명에 의한 감별방법은, 유전자적 감별을 통하여 돼지열병 야외 바이러스와 유전자 재조합 돼지열병 바이러스의 감별이 용이하고, 돼지열병 백신 바이러스의 변이를 쉽게 추적할 수 있으므로, 돼지열병 야외 바이러스가 감염된 돼지를 조기에 감별하여 제거함으로써, 돼지열병의 청정화에 효과적으로 사용될 수 있다. According to the present invention, it is possible to easily distinguish between the swine fever outbreak virus and the genetically recombinant swine fever virus through genetic discrimination and to easily track the mutation of the swine fever vaccine virus. Therefore, It can be effectively used for the purification of swine fever disease.

한국생명공학연구원Korea Biotechnology Research Institute KCTC12304BPKCTC12304BP 2012110220121102

<110> Animal, Plant and Fisheries Quarantine and Inspection Agency, Republic of Korea <120> Differentiating method between swine infected by wild type classical swine fever virus and recombinant classical swine fever-vaccinated swine, and primer set <160> 9 <170> KopatentIn 1.71 <210> 1 <211> 19 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> forward primer_D1 <400> 1 cgacggccga amtgggcta 19 <210> 2 <211> 21 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> reverse primer_D1 <400> 2 tgttgaytgt gggtgtaccw c 21 <210> 3 <211> 20 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> forward primer_D2 <400> 3 ccaggatact gctcattacc 20 <210> 4 <211> 20 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> reverse primer_D2 <400> 4 acgtcttcag tcctgagttc 20 <210> 5 <211> 735 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Bovine Viral Disease Virus gene <400> 5 gaaaaagcat tgctggcatg ggcaataata actatagttt tgtttcaagt tacaatggga 60 gaaaacataa cacagtggaa cctacaagac aatgggacgg aagggataca acgggcaatg 120 tttcaaaggg gtgtgaatag aagtctacat ggaatctggc cagagaaaat ctgtactggt 180 gtcccttccc atctagccac cgatatggaa ctaaaaacaa tccatggtat gatggatgca 240 agtgagaaga ccaactacac gtgttgcaga cttcaacgcc atgagtggaa caagcatggt 300 tggtgcaact ggtacaatat tgaaccctgg attctagtca tgaatagaac ccaagccaat 360 cttactgagg gacaaccacc aagggagtgc gcagtcactt gcaggtatga tagggatagt 420 gacttaaacg tagtaacaca agctagagat agccccacac tcttgacagg ttgcaagaaa 480 ggaaagaact tctcctttgc aggcatactg acgcggggtc cctgcaactt tgaaatagct 540 gcgagtgatg tattattcaa agaacatgac tgcactagta tgttccagga tactgctcat 600 taccttgttg acgggatgac caactcctta gaaaatgcca gacaaggaac cgctaaactg 660 acaacctggt taggcaagca gctcgggata ctagggaaaa agttggaaaa caagagtaag 720 acgtggtttg gagca 735 <210> 6 <211> 37 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> forward primer_BErns <400> 6 ggaagaaatt agaaaaagca ttgctggcat gggcaat 37 <210> 7 <211> 33 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> reverse primer_BErns <400> 7 gatagggcat atgctccaaa ccacgtctta ctc 33 <210> 8 <211> 428 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> 5'NCR <400> 8 cgacggccga actgggctgg ccatgcccgc agtaggacta gcaaacggag ggactagccg 60 tagtggcgag ctccctgggt ggtctaagtc ctgagtacag gacagtcgtc agtagttcga 120 cgtgagcaga agcccacctc gatatgctat gtggacgagg gcatgcccaa gacacacctt 180 aaccctagcg ggggtcgcta gggtgaaatc acaccacgtg atgggagtac gacctgatag 240 ggtgctgcag aggcccacta ttaggctagt ataaaaatct ctgctgtaca tggcacatgg 300 agttgaatca ttttgaactt ttatacgaaa caaacaaaca aaaaccaaag ggagtggagg 360 aaccggtata cgatgccacg gggaaaccat tgtttggaga cccgagtgag gtacacccac 420 aatcaaca 428 <210> 9 <211> 486 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> E-rns-E1 <400> 9 ccaggatact gctcattacc ttgttgacgg gatgaccaac tccttagaaa atgccagaca 60 aggaaccgct aaactgacaa cctggttagg caagcagctc gggatactag ggaaaaagtt 120 ggaaaacaag agtaagacgt ggtttggagc atatgcccta tcaccttact gtaatgtaac 180 aagcaaaata gggtacatat ggtacactaa caactgcacc ccggcttgcc tccccaagaa 240 tacaaagata ataggccccg gtaaatttga cactaatgcg gaggacggaa agattctcca 300 tgagatgggc ggccacctat cagaatttct gctgctctct ctggttgttc tgtctgactt 360 cgcccctgaa acagccagcg cgttatacct cattttgcac tacgtgattc ctcaatccca 420 agaagaacct gaaggctgtg acacaaacca gctgaatcta acagtggaac tcaggactga 480 agacgt 486 <110> Animal, Plant and Fisheries Quarantine and Inspection Agency, Republic of Korea <120> Differentiating method between swine infected by wild type          classical swine fever virus and recombinant classical swine          fever-vaccinated swine, and primer set <160> 9 <170> Kopatentin 1.71 <210> 1 <211> 19 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> forward primer_D1 <400> 1 cgacggccga amtgggcta 19 <210> 2 <211> 21 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> reverse primer_D1 <400> 2 tgttgaytgt gggtgtaccw c 21 <210> 3 <211> 20 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> forward primer_D2 <400> 3 ccaggatact gctcattacc 20 <210> 4 <211> 20 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> reverse primer_D2 <400> 4 acgtcttcag tcctgagttc 20 <210> 5 <211> 735 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Bovine Viral Disease Virus gene <400> 5 gaaaaagcat tgctggcatg ggcaataata actatagttt tgtttcaagt tacaatggga 60 gaaaacataa cacagtggaa cctacaagac aatgggacgg aagggataca acgggcaatg 120 tttcaaaggg gtgtgaatag aagtctacat ggaatctggc cagagaaaat ctgtactggt 180 gtcccttccc atctagccac cgatatggaa ctaaaaacaa tccatggtat gatggatgca 240 agtgagaaga ccaactacac gtgttgcaga cttcaacgcc atgagtggaa caagcatggt 300 tggtgcaact ggtacaatat tgaaccctgg attctagtca tgaatagaac ccaagccaat 360 cttactgagg gacaaccacc aagggagtgc gcagtcactt gcaggtatga tagggatagt 420 gacttaaacg tagtaacaca agctagagat agccccacac tcttgacagg ttgcaagaaa 480 ggaaagaact tctcctttgc aggcatactg acgcggggtc cctgcaactt tgaaatagct 540 gcgagtgatg tattattcaa agaacatgac tgcactagta tgttccagga tactgctcat 600 taccttgttg acgggatgac caactcctta gaaaatgcca gacaaggaac cgctaaactg 660 acaacctggt taggcaagca gctcgggata ctagggaaaa agttggaaaa caagagtaag 720 acgtggtttg gagca 735 <210> 6 <211> 37 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> forward primer_BErns <400> 6 ggaagaaatt agaaaaagca ttgctggcat gggcaat 37 <210> 7 <211> 33 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> reverse primer_BErns <400> 7 gatagggcat atgctccaaa ccacgtctta ctc 33 <210> 8 <211> 428 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <5> NCR <400> 8 cgacggccga actgggctgg ccatgcccgc agtaggacta gcaaacggag ggactagccg 60 tagtggcgag ctccctgggt ggtctaagtc ctgagtacag gacagtcgtc agtagttcga 120 cgtgagcaga agcccacctc gatatgctat gtggacgagg gcatgcccaa gacacacctt 180 aaccctagcg ggggtcgcta gggtgaaatc acaccacgtg atgggagtac gacctgatag 240 ggtgctgcag aggcccacta ttaggctagt ataaaaatct ctgctgtaca tggcacatgg 300 agttgaatca ttttgaactt ttatacgaaa caaacaaaca aaaaccaaag ggagtggagg 360 aaccggtata cgatgccacg gggaaaccat tgtttggaga cccgagtgag gtacacccac 420 aatcaaca 428 <210> 9 <211> 486 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> E-rns-E1 <400> 9 ccaggatact gctcattacc ttgttgacgg gatgaccaac tccttagaaa atgccagaca 60 aggaaccgct aaactgacaa cctggttagg caagcagctc gggatactag ggaaaaagtt 120 ggaaaacaag agtaagacgt ggtttggagc atatgcccta tcaccttact gtaatgtaac 180 aagcaaaata gggtacatat ggtacactaa caactgcacc ccggcttgcc tccccaagaa 240 tacaaagata ataggccccg gtaaatttga cactaatgcg gaggacggaa agattctcca 300 tgagatgggc ggccacctat cagaatttct gctgctctct ctggttgttc tgtctgactt 360 cgcccctgaa acagccagcg cgttatacct cattttgcac tacgtgattc ctcaatccca 420 agaagaacct gaaggctgtg acacaaacca gctgaatcta acagtggaac tcaggactga 480 agacgt 486

Claims (9)

실시간 중합효소 연쇄반응(RT-PCR)을 통한 돼지열병 바이러스 야외 감염 돼지와 유전자 재조합 돼지열병 바이러스 백신 접종 돼지의 감별방법에 있어서,
제1 프라이머 세트의 돼지열병 바이러스에 대한 특이적 결합성 및 제2 프라이머 세트의 유전자 재조합 돼지열병 바이러스에 대한 특이적 결합성을 이용하여 감별하는 단계를 포함하고,
상기 제1 프라이머 세트는 서열번호 1의 정방향 프라이머와 서열번호 2의 역방향 프라이머로 이루어지고, 상기 제2 프라이머 세트는 서열번호 3의 정방향 프라이머와 서열번호 4의 역방향 프라이머로 이루어진 것을 특징으로 하는,
돼지열병 바이러스 야외 감염 돼지와 유전자 재조합 돼지열병 바이러스 백신 접종 돼지의 감별방법.
In a method for differentiating pigs from swine fever virus outbreak pigs and genetically recombinant swine fever virus vaccinated pigs through real-time PCR (RT-PCR)
Utilizing the specific binding of the first primer set to the swine fever virus and the specific binding of the second primer set to the genetically modified swine fever virus,
Wherein the first primer set comprises a forward primer of SEQ ID NO: 1 and a reverse primer of SEQ ID NO: 2, and the second primer set comprises a forward primer of SEQ ID NO: 3 and a reverse primer of SEQ ID NO:
How to differentiate pigs from swine fever virus outbreak pigs and genetically recombinant swine fever virus vaccinated pigs.
제1항에 있어서, 상기 제1 프라이머 세트의 돼지열병 바이러스에 대한 특이적 결합성이, 상기 서열번호 1의 정방향 프라이머와 서열번호 2의 역방향 프라이머로 이루어진 프라이머 세트가 페스티바이러스 속의 돼지열병 바이러스에만 특이적으로 결합하고, 같은 페스티바이러스 속의 소바이러스성설사증 바이러스(BVDV) 및 보더병 바이러스(BDV)에는 결합하지 않는 것을 특징으로 하는 감별방법.The method according to claim 1, wherein the specific binding of the first primer set to the swine fever virus is selected only for the swine fever virus in the pestivirus, wherein the primer set consisting of the forward primer of SEQ ID NO: 1 and the reverse primer of SEQ ID NO: (BVDV) and Border Disease Virus (BDV) in the same pestivirus. 제1항에 있어서, 상기 제2 프라이머 세트의 유전자 재조합 돼지열병 바이러스에 대한 특이적 결합성이, 상기 서열번호 3의 정방향 프라이머와 서열번호 4의 역방향 프라이머로 이루어진 프라이머 세트가 상기 유전자 재조합 돼지열병 바이러스에만 결합하는 것을 특징으로 하는 감별방법.2. The method according to claim 1, wherein the specific binding of the second primer set to the genetically-modified swine fever virus is selected from the group consisting of a forward primer of SEQ ID NO: 3 and a reverse primer of SEQ ID NO: Wherein the first and second signals are coupled only to each other. 제1항 내지 제3항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 유전자 재조합 돼지열병 바이러스가 기탁번호 KCTC 12304BP의 바이러스인 것을 특징으로 하는 감별방법.4. The method according to any one of claims 1 to 3, wherein the genetically-modified swine fever virus is virus of deposit number KCTC 12304BP. 제1항에 있어서, 상기 백신이 생백신인 것을 특징으로 하는 감별방법. The method according to claim 1, wherein the vaccine is a live vaccine. 서열번호 1의 정방향 프라이머와 서열번호 2의 역방향 프라이머로 이루어진 제1 프라이머 세트, 및
서열번호 3의 정방향 프라이머와 서열번호 4의 역방향 프라이머로 이루어진 제2 프라이머 세트로 구성되는,
실시간 중합효소 연쇄반응(RT-PCR)을 통한 돼지열병 바이러스 야외 감염 돼지와 유전자 재조합 돼지열병 바이러스 백신 접종 돼지를 감별하기 위한 프라이머 세트.
A first primer set consisting of the forward primer of SEQ ID NO: 1 and the reverse primer of SEQ ID NO: 2, and
And a second primer set consisting of the forward primer of SEQ ID NO: 3 and the reverse primer of SEQ ID NO:
A set of primers for differentiating pigs from pig-fever virus-infected pigs and genetically-modified pig fever virus vaccine pigs through real-time PCR (RT-PCR).
제6항에 있어서, 상기 유전자 재조합 돼지열병 바이러스가 기탁번호 KCTC 12304BP의 바이러스인 것을 특징으로 하는 프라이머 세트.The primer set according to claim 6, wherein the genetically recombinant swine fever virus is virus of accession number KCTC 12304BP. 제6항에 있어서, 상기 백신이 생백신인 것을 특징으로 하는 프라이머 세트. 7. The primer set according to claim 6, wherein the vaccine is a live vaccine. 삭제delete
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