KR101458821B1 - Plasma biomarker composition for distinguishing aecopd from copd and the method of detecting the same - Google Patents

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Abstract

본 발명은 급성악화 만성폐쇄성 폐질환(AECOPD) 및 만성폐쇄성 폐질환(COPD) 구별용 플라즈마 바이오마커 조성물 및 그 검출 방법에 관한 것이다.
본 발명은 레티노산 수용체 알파(RAR alpha), 니네인 이소폼 CRA_a(Ninein isoform CRA_a, 니네인 GSK3B 상호작용 단백질과 결합하는 동형단백질), 알파-1 안티드립신(A1pi), 티로실-DNA 포스포디에스테라아제 2, T cell 수용체 델타 체인, Human Igm RF*와 Igg1 Fc간의 자가면역 복합체(Autoimmune Complex)의 크리스탈 구조(COAC), 세르핀 펩티다아제 저해제 멤버 6(serpin peptidase inhibitor member 6), 보체 인자 B 프리프로단백질(complement factor B preproprotein), 크리그 바운드 투 씨3씨의 체인 B(Chain B, Crig Bound To C3c) 및 WDR1(WD repeat-containing protein 1 isoform 1, WD 반복 동형단백질 1)를 모두 포함하는 급성 악화 만성폐쇄성폐질환(AECOPD)과 만성폐쇄성폐질환(COPD) 구별용 플라즈마 바이오마커 조성물을 제공한다.
본 발명에 의하면 플라즈마에서 분리한 특정 단백질 발현 정도가 증가 또는 감소하는지 여부에 따라, AECOPD의 발생위험을 예측할 수 있으며, COPD 환자와 AECOPD 환자를 구별하여 진단할 수 있으며, AECOPD의 예방, 초기진단 및 치료분야에 유용하게 이용될 수 있다.
The present invention relates to a plasma biomarker composition for distinguishing between acute exacerbation chronic obstructive pulmonary disease (AECOPD) and chronic obstructive pulmonary disease (COPD), and a method for detecting the same.
The present invention relates to a pharmaceutical composition comprising retinoic acid receptor alpha (RAR alpha), Ninein isoform CRA_a, a homologous protein that binds to the Ninein GSK3B interacting protein, alpha-1 antidripsin (Alpi), tyrosyl- (COAC), serpin peptidase inhibitor member (6), complement factor B (6), and T-cell receptor delta chain, human Igm RF * and Igg1 Fc, (WD repeat-containing protein 1 isoform 1, WD repetitive homologous protein 1), a complement factor B preproprotein, Chain B of Crig Bound To 3, and WDR1 The present invention provides a plasma biomarker composition for distinguishing between acute exacerbation chronic obstructive pulmonary disease (AECOPD) and chronic obstructive pulmonary disease (COPD).
According to the present invention, it is possible to predict the risk of developing AECOPD according to whether or not the degree of expression of specific protein isolated from plasma is increased or decreased. It is possible to distinguish between COPD patients and AECOPD patients, And can be usefully used in therapeutic fields.

Description

급성 악화 만성폐쇄성폐질환(AECOPD)과 만성폐쇄성폐질환(COPD) 구별용 플라즈마 바이오마커 조성물 및 그 검출방법{PLASMA BIOMARKER COMPOSITION FOR DISTINGUISHING AECOPD FROM COPD AND THE METHOD OF DETECTING THE SAME} TECHNICAL FIELD [0001] The present invention relates to a plasma biomarker composition for distinguishing between acute exacerbation chronic obstructive pulmonary disease (AECOPD) and chronic obstructive pulmonary disease (COPD), and a method for detecting the plasma biomarker composition.

본 발명은 급성악화 만성폐쇄성 폐질환(AECOPD) 및 만성폐쇄성 폐질환(COPD) 구별용 플라즈마 바이오마커 조성물 및 그 검출 방법에 관한 것이다. The present invention relates to a plasma biomarker composition for distinguishing between acute exacerbation chronic obstructive pulmonary disease (AECOPD) and chronic obstructive pulmonary disease (COPD), and a method for detecting the same.

만성폐쇄성 폐질환(chronic obstructive pulmonary disease, COPD)는 폐의 만성적, 진행성 하기도 감염질환이다. WHO의 2004년도 추정에 따르면, 현재 6400만이 COPD를 앓고 있으며, 3 백만 여명이 COPD로 사망했으며, 이는 그 해의 세계 사망률의 5%에 해당한다. COPD는 이제 주요 질병의 원인이며, 미국에서 3번째 사망원인이다. 전체 COPD 사망자는 이후 10여 년 이상까지 점자 증가할 것이며, 특별히 담배 연기의 노출 등의 위험 요인을 없애는 등의 제한이 없는 한, 2030년까지 전세계적으로 사망원인 3위로 예측된다. Chronic obstructive pulmonary disease (COPD) is a chronic, progressive, infectious disease of the lung. According to WHO estimates in 2004, 64 million people currently suffer from COPD and 3 million people die from COPD, accounting for 5% of the world 's death rate for the year. COPD is now the leading cause of disease and is the third leading cause of death in the United States. The total COPD deaths will increase to more than 10 years later and will be the third leading cause of death worldwide by 2030, unless there are restrictions, such as the elimination of risk factors, such as exposure to tobacco smoke in particular.

급성 악화의 빈도, 이전 병력 및 ICU 지원 등은 COPD 환자 사이에 사망과 관계된 중요한 임상학적 징후로 간주되어 왔다. 따라서, 급성 악화 위험 및 연이은 병원 입원을 한 환자를 밝히는 것이 중요하며, 이러한 합병증을 피하기 위한 조치를 취하는 것이 중요하다. The frequency of acute exacerbation, previous history, and ICU support have been considered important clinical manifestations related to death among COPD patients. Therefore, it is important to identify patients at risk of acute exacerbation and subsequent hospital admissions, and it is important to take steps to avoid such complications.

1초당 노력성 호기량(FEV1)은 COPD 환자의 사망과 관계있는 것으로 밝혀진 바, 이전 년도의 악화 증상 및 빈도는 악화 위험의 증가, 입원기간 및 사망이 증가와 관련이 있음을 보여주고 있다. 나이, 공존이환(comorbidity, 두 만성질환을 동시에 앓는 상태), 높은 정도의 기능적 호흡곤란 및 낮은 BMI(body-mass index)는 잦은 악화와 병원 입원의 위험과 상당히 관련되어 있다. 이러한 임상학적 파라미터의 조합구성으로서, BODE 지수는 COPD 환자에서 사망 위험을 예측하는데 하나의 파라미터보다 나음을 보여준다. 그러나, 이러한 임상학적 파라미터는 각각의 환자에게 적용시키기에 충분히 정확한 예측은 아니다. 이러한 COPD의 병원입원 및 사망률을 예측하기 위해 다른 지표의 개발이 필요하다.St. expiratory volume in 1 second effort (FEV 1) shows that there is a connection with the bar, worsening the symptoms of the previous year and the incidence is increasing the risk of deterioration, increased length of hospital stay and mortality have been found in relation to the death of patients with COPD. The age, comorbidity, and severity of functional dyspnea and low body-mass index (BMI) are significantly associated with frequent deterioration and hospitalization risk. As a combination of these clinical parameters, the BODE index shows better than one parameter in predicting mortality risk in COPD patients. However, these clinical parameters are not sufficiently accurate predictions to be applied to each patient. Other indicators are needed to predict hospital admission and mortality of these COPDs.

말초혈액(peripheral bloods)에서, CRP, 피브리노겐, α10-안티트립신, 에오탁신, IL-4, IL-8, MCP-1 및 VEGF와 TNFRII 및 VCAM-1의 용해 형태는 COPD의 급격한 악화와 관계되는 것으로 보고되어 왔으며, 장래 병원 입원 위험의 증가와 관련되어 있다. 어떤 단일의 바이오마커도 널리 인정되고 있지 않음에도 불구하고, 이러한 바이오마커들은 COPD 진행의 임상학적 예측에 유용한 것으로 기대된다. In peripheral bloods, the dissolution profile of CRP, fibrinogen, alpha10-antitrypsin, eotaxin, IL-4, IL-8, MCP-I and VEGF and TNFRII and VCAM-1 is associated with a rapid aggravation of COPD And is associated with an increased risk of hospital admissions in the future. Although no single biomarker is widely accepted, these biomarkers are expected to be useful in the clinical prediction of COPD progression.

따라서, 그러한 단백질들이 질병의 초기 진단, 예측 및 치료에 도움이 될 것이므로, 다른 COPD-특이적 단백질의 조사가 중요한 이슈가 되고 있다. COPD의 단백질학적 기여를 이해하기 위해 대규모, 대량, 전체 프로테옴 스터디가 필요하다. 최근 연구에서, 발명자들은 안정적인 COPD 환자와 악성 COPD 환자에게서 얻은 플라즈마의 단백질 발현을 비교함으로써, COPD 환자의 악화 관련 병원입원을 예측하기 위한 새로운 단백질 마커를 개발하였다. Therefore, investigation of other COPD-specific proteins is an important issue as such proteins will be helpful in the early diagnosis, prediction and treatment of disease. To understand the proteomic contribution of COPD, a large-scale, large-scale, full-proteomic study is required. In a recent study, the inventors developed a novel protein marker for predicting worsening hospital admission in COPD patients by comparing plasma protein expression from stable COPD patients and malignant COPD patients.

본 발명은 상기한 문제점을 해결하기 위해 제안된 것으로, 본 발명은 급성 악화 만성폐쇄성 폐질환(AECOPD) 및 만성폐쇄성 폐질환(COPD) 구별용 플라즈마 바이오마커 조성물, 검출키트 및 그 검출방법을 제공하는 것을 목적으로 한다. The present invention has been proposed in order to solve the above problems, and provides a plasma biomarker composition for distinguishing acute exacerbation chronic obstructive pulmonary disease (AECOPD) and chronic obstructive pulmonary disease (COPD), a detection kit, .

상기와 같은 목적을 달성하기 위한 본 발명은 레티노산 수용체 알파(RAR alpha), 니네인 이소폼 CRA_a(Ninein isoform CRA_a, 니네인 GSK3B 상호작용 단백질과 결합하는 동형단백질), 알파-1 안티드립신(A1pi), 티로실-DNA 포스포디에스테라아제 2, T cell 수용체 델타 체인, Human Igm RF*와 Igg1 Fc간의 자가면역 복합체(Autoimmune Complex)의 크리스탈 구조(COAC), 세르핀 펩티다아제 저해제 멤버 6(serpin peptidase inhibitor member 6), 보체 인자 B 프리프로단백질(complement factor B preproprotein), C3c에 결합된 크리그의 체인 B(Chain B, Crig Bound To C3c) 및 WDR1(WD repeat-containing protein 1 isoform 1, WD 반복 동형단백질 1)를 모두 포함하는 급성 악화 만성폐쇄성폐질환(AECOPD)과 만성폐쇄성폐질환(COPD) 구별용 플라즈마 바이오마커 조성물을 제공한다.In order to achieve the above object, the present invention provides a pharmaceutical composition comprising retinoic acid receptor alpha (RAR alpha), Ninein isoform CRA_a, a homologous protein binding to Ninein GSK3B interacting protein, alpha-1 antidepressin A1ci), tyrosyl-DNA phosphodiesterase 2, the T cell receptor delta chain, the crystal structure of the autoimmune complex between human Igm RF * and Igg1 Fc (COAC), the serpin peptidase inhibitor 6 member 6), complement factor B preproprotein, chain B bound to C3c (Chain B, Crig Bound To C3c) and WDR1 (WD repeat-containing protein 1 isoform 1, WD repeat homologous protein 1 < / RTI > of the plasma biomarker composition for acute exacerbation chronic obstructive pulmonary disease (AECOPD) and chronic obstructive pulmonary disease (COPD).

또한, 본 발명은 레티노산 수용체 알파(RAR alpha)를 포함하는 것을 특징으로 하는 급성 악화 만성폐쇄성폐질환(AECOPD)과 만성폐쇄성폐질환(COPD) 구별용 플라즈마 바이오마커 조성물을 제공한다. The present invention also provides a plasma biomarker composition for distinguishing between acute exacerbation chronic obstructive pulmonary disease (AECOPD) and chronic obstructive pulmonary disease (COPD), characterized by comprising retinoic acid receptor alpha (RAR alpha).

또한, 본 발명은 상기 플라즈마 바이오마커 조성물을 급성 악화 만성폐쇄성폐질환(AECOPD)과 만성폐쇄성폐질환(COPD) 구별 진단용 키트를 제공한다.The present invention also provides a kit for diagnosing acute exacerbation chronic obstructive pulmonary disease (AECOPD) and chronic obstructive pulmonary disease (COPD) by the plasma biomarker composition.

또한, 본 발명은 대상자의 플라즈마에서 대상자의 플라즈마에서 레티노산 수용체 알파(RAR alpha), 니네인 이소폼 CRA_a(Ninein isoform CRA_a, 니네인 GSK3B 상호작용 단백질과 결합하는 동형단백질), 알파-1 안티드립신(A1pi), 티로실-DNA 포스포디에스테라아제 2 또는 T cell 수용체 델타 체인 중 어느 하나 이상이 증가하거나, Human Igm RF*와 Igg1 Fc간의 자가면역 복합체(Autoimmune Complex)의 크리스탈 구조(COAC), 세르핀 펩티다아제 저해제 멤버 6(serpin peptidase inhibitor member 6), 보체 인자 B 프리프로단백질(complement factor B preproprotein), C3c에 결합된 크리그의 체인 B(Chain B, Crig Bound To C3c) 및 WDR1(WD repeat-containing protein 1 isoform 1, WD 반복 동형단백질 1)중 어느 하나 이상이 감소하는지 여부를 조사하여 급성 악화 만성폐쇄성폐질환(AECOPD) 진행 여부를 검출하기 위해 제1항 또는 제2항의 플라즈마 바이오마커를 이용하여 급성 악화 만성폐쇄성폐질환(AECOPD)과 만성폐쇄성폐질환(COPD) 구별하는데 필요한 정보를 제공하기 위하여, 플라즈마 바이오 마커를 검출하는 방법을 제공한다. The present invention also relates to a method of treating a subject's plasma in plasma of a subject comprising administering to the subject plasma a therapeutically effective amount of at least one of RET alpha, (A1pi), tyrosyl-DNA phosphodiesterase 2 or T cell receptor delta chains, or the crystal structure (COAC) of the autoimmune complex between Human Igm RF * and Igg1 Fc, Serpin peptidase inhibitor member 6, complement factor B preproprotein, Chain B and Crig Bound To C3c bound to C3c, and WD repeat-containing protein 1 isoform 1, WD repetitive homoprotein 1) is reduced in order to detect progression of acute exacerbation chronic obstructive pulmonary disease (AECOPD) In order to use the lightning biomarkers providing acute exacerbation of chronic obstructive pulmonary disease (AECOPD) and chronic obstructive pulmonary disease (COPD) information needed to differentiate, there is provided a method for detecting a plasma biomarker.

본 발명에 의하면 플라즈마에서 분리한 특정 단백질 발현 정도가 증가 또는 감소하는지 여부에 따라, AECOPD의 발생위험을 예측할 수 있으며, COPD 환자와 AECOPD 환자를 구별하여 진단할 수 있으며, AECOPD의 예방, 초기진단 및 치료분야에 유용하게 이용될 수 있다. According to the present invention, it is possible to predict the risk of developing AECOPD according to whether or not the degree of expression of specific protein isolated from plasma is increased or decreased. It is possible to distinguish between COPD patients and AECOPD patients, And can be usefully used in therapeutic fields.

도 1a은 COPD 안정기 및 악화 환자에서의 2DE 및 MALDI-TOF/TOF에 의한 17개 플라즈마 단백질을 동정한 것을 나타낸 것이다.
도 1b는 도 1a에서 동정된 단백질들의 상대 강도를 나타낸 것이다.
도 2는 COPD 환자의 안정상태 및 악화상태에서의 플라즈마에서 레티노산 수용체 알파(RAR alpha)를 측정한 결과이다.
도 3은 대조군 (n=37)과 COPD 환자(n=35)에서 레티노산 수용체 알파(RAR alpha) 수준을 비교한 그래프이다.
도 4는 레티노산 수용체 알파(RAR alpha) 단백질의 수신자 조작 곡선(receiver operating curve(ROC) 분석 그래프이다. ROCs는 안정상태의 COPD 대상자에서 레티노산 수용체 알파(RAR alpha) 수준으로 만들어졌다.
Figure 1 A shows the results of 2DE and MALDI-TOF / TOF in 17 patients with COPD ballast and worsening patients Plasma proteins were identified.
FIG. 1B shows the relative intensities of the proteins identified in FIG. 1A.
Figure 2 shows the results of measurement of the retinoic acid receptor alpha (RAR alpha) in plasma in the steady and worsened states of COPD patients.
Figure 3 is a graph comparing levels of retinoic acid receptor alpha (RAR alpha) in the control (n = 37) and COPD patients (n = 35).
Figure 4 is a receiver operating curve (ROC) analysis graph of the retinoic acid receptor alpha (RAR alpha) protein. ROCs were made at the level of the retinoic acid receptor alpha (RAR alpha) in the COPD subjects in the steady state.

본 발명은 급성악화 만성폐쇄성 폐질환(AECOPD) 및 만성폐쇄성 폐질환(COPD) 을 구별하기 위해 플라즈마에 존재하는 단백질의 발현 변화를 통한 플라즈마 바이오마커 조성물 및 그 검출 방법에 관한 것이다. TECHNICAL FIELD The present invention relates to a plasma biomarker composition through a change in the expression of proteins present in a plasma to distinguish between acute exacerbation chronic obstructive pulmonary disease (AECOPD) and chronic obstructive pulmonary disease (COPD), and a method for detecting the same.

이하, 실시예를 통해 본 발명을 상세히 설명하기로 한다. 하기에 제시된 실시예는 예시적인 것으로 이 분야에서 통상의 지식을 가지는 자는 본 발명의 기술적 사상을 벗어나지 않는 범위에서 제시된 실시예에 대한 다양한 변형 및 수정 발명을 만들 수 있을 것이다. 이러한 변형 및 수정 발명에 의하여 본 발명의 범위는 제한되지 않는다.
Hereinafter, the present invention will be described in detail with reference to examples. It will be apparent to those skilled in the art that various modifications and variations can be made in the present invention without departing from the spirit or scope of the invention. The scope of the present invention is not limited by these variations and modifications.

[[ 실시예Example 1 : 대상자] 1: subject]

COPD 환자와 대조군의 특징을 표 1에 요약하였다. 대조군(n = 37)과 COPD (n = 35)는 한국인이며, 연구의 참가자들에게는 정보 서면 동의를 받았고, 프로토콜은 윤리위원회의 승인을 받았다(No. 2012-005). Table 1 summarizes the characteristics of COPD patients and controls. The control group ( n = 37) and COPD ( n = 35) were Korean, participants in the study received informed consent and the protocol was approved by the Ethics Committee (No. 2012-005).

모든 환자들은 의사의 진단과 치료를 받았고, COPD(GOLD) 가이드라인에 대해 Global Initiative가 승인하였다[14]. 간단히 말해, COPD의 임상학적 진단은 호흡곤란, 만성 기침 또는 객담을 호소하는 흡연자 및 과거 흡연자(년간 10 팩이상)을 대상으로 하였다. 본 발명에서, COPD 환자들은 초기 사후 기관지 확장제(initial post-bronchodilator) FEV1/FVC가 0.70 미만이고, FEV1% 가 70% 미만인 경우를 포함한다. All patients received physician diagnosis and treatment, and the Global Initiative approved the COPD (GOLD) guideline [14]. Briefly, the clinical diagnosis of COPD included smokers who complained of respiratory distress, chronic cough, or sputum, and older smokers (more than 10 packs a year). In the present invention, patients with COPD include those with an initial post-bronchodilator FEV1 / FVC of less than 0.70 and an FEV1% of less than 70%.

모든 대상자들은 2달의 정기적인 주기로 적어도 3년간 증세와 폐 기능을 관찰하였다. COPD의 안정적인 상태는 흉부 감염의 증상 없이 30일 동안 상기 유지 치료에 대한 치료가 더 이상 필요하지 않은 상태로 정의한다. All subjects observed symptoms and pulmonary function for at least 3 years with a 2-month periodic cycle. A stable state of COPD is defined as a condition in which no further treatment for maintenance therapy is needed for 30 days without symptoms of chest infection.

급성 악화로 인한 병원 입원의 징후는 다음과 같다 : 호흡곤란의 강도의 현저한 증가, 저산소증 징후, 말초 부종의 출현 및 화농성 객담, 발열, 증가된 ESR 및 CRP를 동반하는 백혈구 증가증(leukocytosis). Signs of hospitalization due to acute exacerbations include: Significant increase in the severity of dyspnea, signs of hypoxia, appearance of peripheral edema, and purulent sputum, fever, leukocytosis with increased ESR and CRP.

악화를 야기하는 원인균의 기록은 박테리아 배양 및 객담의 호흡기 바이러스 PCR에 의해 수행되었다. 본 연구 이전에 기관지 천식 또는 기관지 확장(bronchiectasis), 결핵 및 종양 또는 다른 면역계 질환과 같은 다른 폐질환으로 진단받은 환자들은 배제되었다. Records of causative agents causing aggravation were performed by culture of bacteria and respiratory virus PCR of sputum. Patients previously diagnosed with bronchial asthma or other pulmonary diseases such as bronchiectasis, tuberculosis and tumors or other immune system diseases were excluded prior to this study.

대조군은 호흡기 증상에 대한 설문지에 부정적으로 대답한 일반인으로서, FEV1 > 75% 예측값, FEV1/FVC>70% 및 단순 흉부 방사선에서 정상 소견을 가지는 사람들로 선정하였다. The control group was selected as those who responded negatively to the questionnaire on respiratory symptoms, with FEV1> 75% predicted, FEV1 / FVC> 70%, and normal chest radiograph.

본 연구 대상자들의 말초 정맥혈을 에틸린디아민 테트라아세틱 에시드( ethylenediamine tetraacetic acid,(EDTA, 혈액당 0.20 g/10 mL))를 포함하는 튜브에 수집하였으며, 플라즈마는 전체 혈액으로부터 2000rpm에서 15분간 즉시 원심분리에 의해 분리되었으며, 표본은 -80℃에 보관되었다. 급성 악화 샘플도 임상학적 개입 전 악화 진단 직후 수집되었다.
Peripheral venous blood of the subjects was collected in a tube containing ethylenediamine tetraacetic acid (EDTA, 0.20 g / 10 mL per blood) and the plasma was centrifuged at 2000 rpm for 15 minutes Separated by separation, specimens were stored at -80 ° C. Acute exacerbation samples were also collected shortly after the diagnosis of deteriorating preclinical intervention.

[[ 실시예Example 2 :  2 : 플라즈마plasma 준비 및 2차원 겔-전기영동(2 Preparation and 2-D Gel-Electrophoresis (2 DEDE )])]

8개의 대조군과 각 8개의 COPD 안정 및 악화 상태의 전체 24개의 플라즈마 샘플은 2DE로 분리하였다. 각각의 임상학적 특징은 표 1에 요약하였다. A total of 24 plasma samples of 8 control and 8 COPD stable and deteriorated states were separated by 2DE. Each clinical feature is summarized in Table 1.

<표 1> 본 연구 대상자들의 임상학적 특징<Table 1> Clinical characteristics of subjects

Figure 112012100877426-pat00001
Figure 112012100877426-pat00001

상술한 바와 같이 1mg의 단백질을 이용하여 IPGphor system (Amersham Biosciences)에서 등전점 전기영동(IEF)에 Immobiline DryStrips (24 cm, pH 3-10, pH 3-7; Amersham Biosciences)이 사용되었다[15]. IEF 후에, 단백질은 Ettan Dalt II system (AP Biotech)을 이용하여 5 - 18.5% SDS-폴리아크릴아마이드 겔에서 분리되었다. 각각의 분리 후에, 겔은 Coomassie brilliant blue G-250로 염색하였다. 염색된 겔의 디지탈화된 이미지는 ImageMaster 2D (ver. 4.0, Amersham Pharmacia Biotech)를 이용하여 분석되었다. Coomassie-염색된 스팟은 정규화된 부피 즉, 전체 스팟 부피합으로 나눈 스팟의 부피에 기초하여 정량화되었다.
Immobiline DryStrips (24 cm, pH 3-10, pH 3-7; Amersham Biosciences) was used for isoelectric focusing (IEF) in IPGphor system (Amersham Biosciences) using 1 mg protein as described above [15]. After IEF, the proteins were separated on a 5 - 18.5% SDS-polyacrylamide gel using the Ettan Dalt II system (AP Biotech). After each separation, the gel was stained with Coomassie brilliant blue G-250. The digitized image of the stained gel was analyzed using ImageMaster 2D (ver. 4.0, Amersham Pharmacia Biotech). Coomassie-stained spots were quantified based on the normalized volume, i.e., the volume of the spot divided by the sum of the total spot volumes.

[[ 실시예Example 3 :  3: 인트라Intra -겔 분해 및 질량분석기 분석]- Gel decomposition and mass spectrometry analysis]

다르게 발현된 단백질 스팟은 겔로부터 절단되고, 더 작은 조각으로 잘려져서, 트립신(Promega)으로 분해한 후, MALDI-TOF를 수행하였다[16]. MALDI-TOF 질량 스펙트로메트리(MS) 분석을 위해, 트립신 펩타이드는 POROS®R2 컬럼(Applied Biosystems)에 농축되었다. 40% 메탄올, 100% 아세토니트릴 및 50mM 암모늄 바이카보네이트(ammonium bicarbonate)로 연속적으로 컬럼을 세척한 후에, 상기 샘플들은 컬럼에 적용시켜, 2ml의 cyano-4-hydroxycinnamic acid에서 희석시키고, Voyager DE PROMALDI-TOF spectrometer (Applied Biosystems)를 이용하여 MALDI-TOF 스펙트럼을 얻었다. monoisotopic peaks를 이용하여, MSFit program (http://prospector.ucsf.edu/ucsfhtml3.4/msfit.htm)으로 단백질 데이터베이스 검색을 수행하였다. 첫 번째 분석에서 50 ppm 이내의 질량 오차로 진행되었다; 시스템은 초기 분석에서 얻어진 단백질 리스트를 이용하여 20 ppm에서 연속적으로 재측정되었다. 상기 스펙트럼은 초기에 트립신 자기분해 산물을 이용하여 측정되었다. Swiss-Prot 및 NCBI 데이터베이스에 대한 펩타이드 매칭 및 단백질 검색은 Mascot (http://www.matrixscience.com/) 및 Pro Found (http://prowl.rockefeller.edu/)을 이용하여 수행되었다.
The differentially expressed protein spots were cleaved from the gel, cut into smaller pieces, digested with trypsin (Promega) and then subjected to MALDI-TOF [16]. For MALDI-TOF mass spectrometry (MS) analysis, trypsin peptides were concentrated on a POROS® R2 column (Applied Biosystems). After continuously washing the column with 40% methanol, 100% acetonitrile and 50 mM ammonium bicarbonate, the samples were applied to a column, diluted with 2 ml of cyano-4-hydroxycinnamic acid, loaded onto a Voyager DE PROMALDI- TOF spectrometer (Applied Biosystems) to obtain MALDI-TOF spectra. Monoisotopic peaks were used to perform protein database searches with the MSFit program (http://prospector.ucsf.edu/ucsfhtml3.4/msfit.htm). The first analysis proceeded with a mass error within 50 ppm; The system was re-measured continuously at 20 ppm using the protein list from the initial analysis. The spectrum was initially measured using trypsin autodisperse products. Peptide matching and protein searches for Swiss-Prot and NCBI databases were performed using Mascot (http://www.matrixscience.com/) and Pro Found (http://prowl.rockefeller.edu/) .

[[ 실시예Example 4 :  4 : ELISAELISA 를 이용한 Using 플라즈마에서In the plasma RARRAR α 측정]α measurement]

37개의 정상 대조군과 35개의 COPD 안정상태의 플라즈마 샘플은 ELISA(Uscn Life Science Inc.)를 수행하였고, COPD 14개 대상은 악화기에서 추가적인 RARα 측정을 하였다. 더 낮은 탐지 수준은 0.063ng/ml이다. 이 한계값 이하의 값은 통계적 분석 목적을 위해 제로로 가정한다. 37 normal control and 35 COPD steady-state plasma samples were performed by ELISA (Uscn Life Science Inc.), and COPD 14 subjects were subjected to additional RARα measurements in the aggravated phase. The lower detection level is 0.063 ng / ml. Values below this threshold are assumed to be zero for statistical analysis purposes.

[[ 실시예Example 5 : 통계] 5: Statistics]

통계적 분석은 SPSS 13.0를 이용하여 수행되었다. Mann-Whitney U test (2개의 독립 샘플) 및 Wilcoxon signed rank sum test (2개의 관련 샘플)이 2DE 스팟에서의 밀도와 RARα 농도에서의 차이에 FEV1 조정으로 적용되었다. 연관 분석은 급성 악화 수와 RARα 단백질의 수준과 같은 임상학적 파라미터간에 SPSS 13.0 를 이용하여 수행되었다. 이전 3년간 병원에 입원한 환자와 그렇지 않은 사람을 얼마나 잘 구별하는지를 측정하기 위해, 수신자 조작특성 곡선(receiver operating charicteristic(ROC) curve)하의 영역을 이용하여 식별여부를 분석하였다. 모든 데이터는 평균값과 SD로 표현되었으며, 유의성은 P < 0.05로 정의된다.
Statistical analysis was performed using SPSS 13.0. The Mann-Whitney U test (two independent samples) and the Wilcoxon signed rank sum test (two related samples) were applied as FEV1 adjustments to the difference in density and RARalpha concentration at 2DE spots. Association analysis was performed using SPSS 13.0 between clinical parameters such as the number of acute exacerbations and the level of RARα protein. In order to determine how well the patients were admitted to the hospital for the previous three years, we used the area under the receiver operating char- acteristic curve (ROC). All data are expressed as means and SD, with significance defined as P <0.05.

[[ 실시예Example 6 : 결과 - 연구 대상자의 임상학적 특징]  6: Results - Clinical characteristics of the study subjects]

임상학적 특징은 표 1에 요약하였다. 본 발명자는 COPD 남성환자와 대조군을 선택하였다. 모든 COPD 대상자는 흡연자 또는 과거 흡연자(>년간 10 팩)인 반면, 대조군 10%는 비흡연자였다. 모든 대조군 대상자는 사후 기관지확장제(post bronchodilator) FEV1/FVC > 0.7인 반면, 모든 COPD 대상자는< 0.7 값을 가진다.Clinical features are summarized in Table 1. We chose COPD male patients and controls. All COPD subjects were smokers or former smokers (> 10 packs per year), whereas 10% of controls were non-smokers. All control subjects were post bronchodilator FEV1 / FVC> 0.7, while all COPD subjects had a value of <0.7.

BMI는 대조군과 비교하여 COPD 그룹에서 약간 낮게 나타났으나, 차이는 근소하였다(P>0.05). 플라즈마를 2DE 시킨 COPD 대상자(n=8)에서, FEV1은 안정상태와 비교할 때, 악성 상태에서 현저히 감소하였다(p<0.001). 전체 35 COPD 대상자들은 이후 기간 동안 악화로 인한 병원 입원의 여부에 의해 계층화되었다. 21 개체는 입원하였고, 그들은 입원하지 않은 COPD 대상자들(n=14)에 비해, 현저히 낮은 FEV1, FVC 및 FEV1/FVC 비율을 가지고 있었다. 21 개체 중, 14 개체는 입원일에 플라즈마 샘플을 조사하였다. 급성 악화의 원인은 박테리아 감염(n=1)과 바이러스 감염(n=4)이었다. 원인인자(n=7)는 기록화되지 않았다.
BMI was slightly lower in the COPD group compared to the control group, but the difference was slight (P> 0.05). In COPD subjects (n = 8) with 2DE plasma, FEV1 was significantly reduced in malignant conditions compared to steady state (p <0.001). All 35 COPD subjects were stratified by hospital admission due to deterioration during the following period. 21 subjects were hospitalized and they had significantly lower FEV1, FVC, and FEV1 / FVC ratios compared to non-hospitalized COPD subjects (n = 14). Of the 21 individuals, 14 were irradiated with plasma samples on the day of hospital admission. The causes of acute exacerbation were bacterial infection (n = 1) and viral infection (n = 4). Causal factors (n = 7) were not documented.

[[ 실시예Example 7 :  7: COPDCOPD 안정기 및 악화  Stabilizer and deterioration 환자에서의In patients 2 2 DEDE  And MALDIMALDI -- TOFTOF // TOFTOF 에 의한 On by 플라즈Plasma 마 단백질 동정] However,

쿠마시 블루 염색 후, 일반 대조군에서 중간값 561(범위, 430-730) 단백질 스팟, COPD를 갖는 안정기 대상자에서의 중간값 555(범위 452-653) 단백질 스팟 및 악화 대상자에서의 중간값 566(범위, 477-696)이 1mg의 플라즈마 단백질에서 탐지되었다. 17개 단백질은 COPD를 가지는 8 대상자의 안정기 및 악화기 간의 상대적 강도에서 현저한 차이를 나타내었다(도 1a). 스팟에서 상대 강도(%)는 도 1b에 나타내었고, 동정한 단백질 스팟의 위치는 마스터 이미지에 나타난다. 그들 중, 7개 스팟은 현저히 증가한 반면, 다른 10개 스팟은 안정기와 비교해서, 악화상태에서 감소되었다.
Median value 561 (range, 430-730) protein spot in the control, median 555 (range 452-653) in the ballistic subject with COPD after the coomassie blue staining and median value 566 , 477-696) was detected in 1 mg of plasma protein. 17 proteins showed a significant difference in the relative strength between the stabilizer and the aggravator of 8 subjects with COPD (Fig. 1a). The relative intensity (%) in the spot is shown in FIG. 1B, and the position of the identified protein spot appears in the master image. Of these, 7 spots increased significantly, while the other 10 spots were reduced in deteriorated state compared to ballast.

[[ 실시예Example 8 :  8 : MALDIMALDI -- TOFTOF MSMS 에 의한 단백질 동정]&Lt; / RTI &gt;

이들 스팟은 겔에서 분리되어, 트립신으로 in-gel 분해상태로 배양된 후, MALDI-TOF/TOF로 확인하였다. 결과는 표 2에 요약하였다. 레티노산 수용체 알파 (RAR alpha, 스팟 13), 니네인(Ninein) (GSK3B 상호작용 단백질) isoform CRA_a (스팟 5), 알파-1 안티드립신(A1pi, 스팟 8), 피브리노겐 감마(스팟 1), 티로실-DNA 포스포디에스테라아제 2(스팟 14) 및 T cell 수용체 델타 체인(스팟 15)는 COPD 악화의 플라즈마에서는 증가한 반면, 피브린 베타(스팟 2, 3, 4), Human Igm RF*와 Igg1 Fc간의 자가면역 복합체(Autoimmune Complex)의 크리스탈 구조(COAC, spot 6), 트렌스페린(스팟 7), 세르핀 펩티다아제 저해제 멤버 6(serpin peptidase inhibitor member 6 (Serpin B6), 스팟 9), 보체 인자 B 프리프로단백질(complement factor B preproprotein) (스팟 10), C3c에 결합된 크리그의 체인 B(Chain B, Crig Bound To C3c) 및 WDR1(WD repeat-containing protein 1 isoform 1, WD 반복 동형단백질 1, 스팟 12)은 감소하였다. These spots were separated from the gel, cultured in an in-gel degradation state with trypsin, and then confirmed with MALDI-TOF / TOF. The results are summarized in Table 2. (RAR alpha, spot 13), Ninein (GSK3B interacting protein) isoform CRA_a (spot 5), alpha-1 antidripsin (A1pi, spot 8), fibrinogen gamma (spot 1) While the tyrosyl-DNA phosphodiesterase 2 (spot 14) and the T cell receptor delta chain (spot 15) increased in the plasma of COPD deterioration, fibrin beta (spots 2, 3 and 4), human Igm RF * and Igg1 Fc (COAC, spot 6), trans- ferrin (spot 7), serpin peptidase inhibitor member 6 (Serpin B6), spot 9), complement factor B prepro- (WD repeat-containing protein 1 isoform 1, WD repetitive homologous protein 1, spot 12), complementer B preproprotein (spot 10), chain B bound to C3c (Chain B and Crig Bound To C3c) Respectively.

피브리노겐 감마 및 피브린 베타는 응고 단백질이다. 니네인(Ninein, GSK3B 상호작용 단백질)은 세포골격(cytoskeleton)이다. COAC 및 트렌스페린은 면역 반응 단백질에 포함된다. 보체인자 B(Complement factor B), C3c에 결합된 크리그의 체인 B(Chain B, Crig Bound To C3c), 알파-1 안티드립신(A1pi) 및 세르핀 펩티다아제 저해제 멤버 6(serpin peptidase inhibitor member 6)는 감염 단백질에 포함된다. WD repeat 함유 단백질 1, 레티노산 수용체 알파(RAR alpha), 티로실-DNA 포스포디에스테라아제 2, T cell 수용체 델타 체인은 신호 전달 변경유전자(modifier)이다.
Fibrinogen gamma and fibrin beta are coagulation proteins. Ninein, a GSK3B interacting protein, is a cytoskeleton. COAC and transperine are involved in the immune response protein. Serpin peptidase inhibitor member 6, Alpha-1 antidripsin (A1pi) and Serpin peptidase inhibitor member 6 (Chain B, Crig Bound To C3c) Are included in the infectious protein. WD repeat containing protein 1, retinoic acid receptor alpha (RAR alpha), tyrosyl-DNA phosphodiesterase 2, T cell receptor delta chain are signaling modifiers.

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[[ 실시예Example 9 :  9: COPDCOPD 안정기 및  Ballast and 악화기의Worsening 플라즈마에서In the plasma 레티노산Retinoic acid 수용체 알파의 변화] Changes in receptor alpha]

안정기로부터 악화시에 레티노산 수용체 알파(RAR alpha) 단백질 수준의 변화를 증명하기 위해, COPD 환자의 안정상태 및 악화상태에서의 플라즈마에서 레티노산 수용체 알파(RAR alpha)를 측정하였다(n=15, 도 2). 이들 중, 12 개체는 안정기와 비교해서, 악화기에서 레티노산 수용체 알파(RAR alpha)의 수준이 증가함을 보여준다. 레티노산 수용체 알파(RAR alpha)의 평균 농도는 안정기 상태와 비교해서, 악화기에서 2배 높게 상승하였다.
To demonstrate a change in retinoic acid receptor alpha (RAR alpha) protein levels upon exacerbation from the ballast, the retinoic acid receptor alpha (RAR alpha) was measured in plasma in the steady state and aggravated state of COPD patients (n = 15, 2). Of these, 12 individuals show an increase in levels of retinoic acid receptor alpha (RAR alpha) in the exacerbations compared to the balloons. The mean concentration of retinoic acid receptor alpha (RAR alpha) was 2-fold higher in the exacerbated group compared to the ballast condition.

[[ 실시예Example 10 : 안정기에서  10: At the ballast 레티노산Retinoic acid 수용체 알파 수준과 병원 입원 빈도와의 관계] Relationship between Alpha Level of Receptor and Hospital Incidence Frequency]

안정상태에서의 레티노산 수용체 알파(RAR alpha) 단백질 수준이 악화로 인한 병원 입원 빈도와 관계가 있는지 여부를 증명하기 위해, 대조군 (n=37)과 COPD 환자(n=35)에서 레티노산 수용체 알파(RAR alpha) 수준을 비교하였다(도 3). COPD 환자는 병원 악화의 빈도에 의해 계층화되었다.In the control (n = 37) and COPD patients (n = 35), the retinoic acid receptor alpha (RAR alpha) protein level in the steady state correlated with the hospital admission frequency due to deterioration (RAR alpha) levels (Figure 3). Patients with COPD were stratified by the frequency of hospital worsening.

입원하지 않은 COPD 대상자(n=14)는 대조군의 레티노산 수용체 알파(RAR alpha) 수준과 비슷하였다(p>0.05). 병원 입원을 한 COPD 대상자(n=21)는 입원하지 않은 COPD 대상자 일반대조군과 비교하여 현저히 높은 수준이었다(P=0.0004). 연간 0.4 번 이상의 입원 COPD 대상자(n=10)는 매우 높은 레티노산 수용체 알파(RAR alpha) 단백질을 가지며, 연간 0.4번 미만의 입원 COPD 대상자(n=11)는 중간 수준이었다. Patients in the COPD group (n = 14) who were not hospitalized were similar to the RAR alpha levels of the control group (p> 0.05). The COPD subjects (n = 21) who were admitted to the hospital were significantly higher than those who were not admitted to the hospital ( P = 0.0004). At least 0.4 inpatient COPD subjects per year (n = 10) had very high retinoic acid receptor alpha (RAR alpha) protein levels, and less than 0.4 inpatient COPD subjects per year (n = 11) were intermediate.

레티노산 수용체 알파(RAR alpha) 단백질의 수신자 조작 곡선(receiver operating curve(ROC) 분석은 COPD에서 악화의 예측변수이다. ROCs는 안정상태의 COPD 대상자(n=35, 도 4)에서 레티노산 수용체 알파(RAR alpha) 수준으로 만들어졌다. 플라즈마수준의 분산 추정을 이용하여, 95% 신뢰도 구간으로 측정하였다. 레티노산 수용체 알파(RAR alpha)의 ROC 분석은 0.844 곡선 아래의 영역을 차지한다(도 2). 레티노산 수용체 알파(RAR alpha)의 0.154 ng/ml의 컷오오프는 71.4% 의 민감도와 92.8%의 특이도로 병원 입원을 예측한다. The receiver operating curve (ROC) analysis of the retinoic acid receptor alpha (RAR alpha) protein is a predictor of deterioration in COPD. ROCs were measured in the resting COPD subjects (n = 35, Figure 4) (RAR alpha) levels were measured at 95% confidence intervals using plasma level variance estimates. The ROC analysis of retinoic acid receptor alpha (RAR alpha) occupies the area below the 0.844 curve (Figure 2) The 0.154 ng / ml cutoff of retinoic acid receptor alpha (RAR alpha) predicts hospital admission with a sensitivity of 71.4% and a specificity of 92.8%.

[ 검토 ] [ Review ]

본 발명에서, 17 단백질 스팟은 안정기의 COPD 대상자와 비교해서, 악화상태에서 플라즈마에 다르게 발현되는 것으로 밝혀졌다. 이들 중, 레티노산 수용체 알파(RAR alpha)의 리간드로서, 레티노산(RA)는 폐 발생과 회복과 관련이 있기 때문에, RAR-알파를 증명하였다[17]. In the present invention, 17 protein spots were found to be differentially expressed in the plasma in the deteriorated state, as compared to the COPD subjects of the ballast. Of these, retinoic acid (RA), as a ligand for the retinoic acid receptor alpha (RAR alpha), has been demonstrated to be RAR-alpha because it is associated with lung development and recovery [17].

대조군 및 COPD 대상자를 이용한 입증 실험에서, 레티노산 수용체 알파(RAR alpha)의 농도는 안정기 대상자와 비교하여 악화 대상자에게서 2배 이상 증가하였다. 또한, 안정기에서의 수준은 병원 입원의 빈도와 관련이 있었다. 이 데이터는 레티노산 수용체 알파(RAR alpha)의 플라즈마 농도는 COPD의 병원 입원을 예측하는 마커가 될 수 있을 것이다. 이는 COPD의 악화로 인인한 병원입원과 RAR 수준과의 관계를 처음으로 연구한 것이다. In the control and COPD validation trials, the concentration of retinoic acid receptor alpha (RAR alpha) increased more than two fold in the subjects who were exacerbated compared to the control subjects. Also, the level at the ballast was related to the frequency of hospital admission. This data suggests that the plasma concentration of retinoic acid receptor alpha (RAR alpha) may be a predictor of hospital admission for COPD. This is the first study of the relationship between hospital admission and RAR level due to the deterioration of COPD.

RA는 폐포의 유지를 위해 일생 필요하다. 음식물로서 레티놀이 부족한 실험쥐에서 폐포를 상실하였고, 기종(emphysema)의 특성을 나타내었다[18]. 모든 트렌스 레티놀(ATRA), 비타민 A의 이동형태(transport form)는 주로, 간 뿐만 아니라, 폐에서 저장형태로 작용하는 레티닐 에스테라아제(retinyl esters)로 가역적으로 변환된다[19]. RA is a lifelong need to maintain alveoli. In experimental mice lacking retinol as food, the alveoli was lost and showed the characteristic of emphysema [18]. All transport retinol (ATRA), the transport form of vitamin A, is reversibly converted to retinyl esters, which act primarily as a storage form in the lungs as well as the liver [19].

본 실험에서, ATRA는 MMP-9가 감소되도록 조절하고, TIMP-1 발현 폐포 마크로파아지가 증가되도록 조절한다[20]. 더욱이, 기종 환자에게 ATRA 투여는 플라즈마 MMP-9 및 MMP-9 효소 활성을 감소시킨다[21]. 따라서, ATRA는 COPD의 프로테아제-안티-프로테아제 불균형을 회복시킬 수 있다. 현저하게, 흡연자는 레티노이드산 및 레티놀의 플라즈마 수준이 증가되는 경향을 나타내며, 이들 모두는 폐의 레티노이드 수준을 보충시킬 수 있는 반면, 담배연기에 노출로부터 유래하는 산화스트레스는 RAR 발현을 감소시킨다[23]. 본 발명에서, 모든 COPD 대상자들은 과거 또는 현재의 흡연자이기 때문에, 일반 대조군의 90%을 흡연자 및 과거 흡연자로 일치시켰다. In this experiment, ATRA is regulated so that MMP-9 is decreased and the phage is increased by TIMP-1-induced alveolar macrophage [20]. Moreover, administration of ATRA to model patients reduces plasma MMP-9 and MMP-9 enzyme activity [21]. Thus, ATRA can restore the protease-anti-protease imbalance of COPD. Significantly, smokers have a tendency to increase plasma levels of retinoic acid and retinol, all of which can supplement the retinoid levels of the lungs, whereas oxidative stress resulting from exposure to tobacco smoke reduces RAR expression [23 ]. In the present invention, since all COPD subjects are past or present smokers, 90% of the general control group were matched to smokers and past smokers.

폐에서 구조 세포의 세포자살(Apoptosis)는 COPD 발병에서 중요한 업스트림 활동일 수 있다. COPD의 폐에서 세포자살 폐포 상피 및 내피 세포가 증가된다[24]. 세포자살 과정은 폐 조직의 파괴 및 기종의 발생을 야기하는 이러한 구조세포의 증식의 증가에 의해 상호균형이 되는 것은 아니다[25]. 폐에서 세포자살은 골격 근육[26] 및 순환하는 T cell[27]을 포함하는 폐 밖에서 일어나기 때문에, RAR과 같은 세포질 내 단백질은 말초 혈액에서 탐지되지 않는다. 이 시점에서, 안정기 COPD의 플라즈마 RAR에서의 상승 및 악화에서의 더 큰 증가의 원인은 밝혀지지 않았다. Apoptosis of rescue cells in the lungs can be an important upstream activity in COPD outbreaks. In COPD lungs, apoptosis and endothelial cell apoptosis are increased [24]. Cellular suicide processes are not mutually balanced by the increase in the proliferation of these structural cells causing destruction of lung tissue and development of the model [25]. Cellular suicide in the lungs occurs outside the lungs, including skeletal muscle [26] and circulating T cells [27], so intracellular proteins such as RAR are not detected in peripheral blood. At this point, the cause of the greater increase in the rise and deterioration of the plasma RAR of the ballast COPD was not revealed.

그러나, COPD에서 폐 발생에서의 레티노산과의 관계 및 폐조직 내 및 폐조직 간 세포자살의 증가를 고려할 때, COPD 악화에서 강조되는 세포자살 세포로부터 RAR의 증가가 유도될 수 있다. 증가된 세포간 턴오버를 위한 마커로서, 세포자살-특이적 단백질의 체계적인 방출은 COPD 진행과 동반된다. 세포자살 최종산물 카스파아제-절단 사이토케라틴-18 및 히스톤-연관-DNA-단편의 시럼 함량이 COPD 환자의 말초혈액에서 증가하였다[28]. However, an increase in RAR can be induced from apoptotic cells, which are stressed in COPD exacerbation, in consideration of the relationship between COPD with retinoic acid in lung development and the increase in apoptosis in lung tissue and lung tissue. As a marker for increased intercellular turnover, the systemic release of apoptotic-specific proteins is accompanied by COPD progression. The cytoskeletal content of cytoskeletal-18 and histone-associated-DNA-fragments increased in the peripheral blood of patients with COPD [28].

본 발명에서, 니네인(Ninein)은 악화 시에 현저히 증가하였다. 흥미롭게도, 니네인(Ninein) 유전자 수준은 흡연 COPD의 소기도 상피(small airway epithelium)에서 증가하였다[29]. 니네인(Ninein)은 상피세포에서 중심체 기능 및 미세소관의 고정에 중요한 단백질 중의 하나이다. 기도 상피는 담배 흡연에 대한 첫 번째 방어선이며, 흡연자의 기도 상피는 비흡연자와 비교해서 유전자 발현에서의 현저한 변화를 입증한다[30,31]. 기도 상피와 폐 기종에서 COPD 악화의 시작을 고려할 때, 때, 상피로부터 방출된 분자들은 COPD 악화 대상자의 말초혈액에서 증가할 수 있다. WD repeat-containing protein 1은 액틴 필라멘트 분해와 관련된 세포질 단백질이다. 미세소관-의존적 섬모 및 플라겔라 구조의 조립 및 유지는 intraflagellar transport (IFT)에 의존한다. 전방(Anterograde) IFT는 섬모 내의 단백질을 이동하는 수단으로서 작용하며, 후방(retrograde) IFT는 섬모 기부(ciliary base)로 되돌아가는 IFT 기관(machinery)을 재활용하는데 사용된다[32]. In the present invention, Ninein significantly increased at the time of exacerbation. Interestingly, the Ninein gene level was increased in the small airway epithelium of smoking COPD [29]. Ninein (Ninein) is one of the proteins important for the fixation of the microtubule and the pancreatic function in epithelial cells. The airway epithelium is the first line of defense against cigarette smoking and the airway epithelium of smokers demonstrates a significant change in gene expression compared to non-smokers [30,31]. Considering the onset of COPD exacerbation in airway epithelium and pulmonary fibrosis, molecules released from the epithelium may increase in the peripheral blood of subjects subject to COPD exacerbation. WD repeat-containing protein 1 is a cytoplasmic protein involved in actin filament degradation. The assembly and maintenance of microtubule-dependent ciliary and plagiar structures depends on intraflagellar transport (IFT). Anterograde IFT acts as a means of transporting proteins in the ciliary body and retrograde IFT is used to recycle IFT machinery back into the ciliary base [32].

만성폐쇄성 폐질환(COPD) 대상자의 비강 섬모(nasal cilia)에서 섬모 박동(Ciliary beating)이 하락한다[33]. 분자 메카니즘은 아직 명확히 밝혀져 있지 않으나, 낮은 수준의 WD repeat-함유 단백질 1은 감소된 섬모 운동을 통한 COPD 악화와 관련이 있을 수 있다. 티로실-DNA 포스포에스테라아제 1은 topoisomerases I 와 II에 의해 유도되는 DNA 손상을 회복한다[34]. 이러한 단백질의 증가는 COPD에서 세포자살의 증가로부터 유도될 수 있다. Ciliary beatings decline in nasal cilia of subjects with COPD [33]. The molecular mechanism has not yet been elucidated, but a low level of WD repeat-containing protein 1 may be associated with decreased CODD through ciliary movement. Tyrosyl-DNA phosphoesterase 1 restores DNA damage induced by topoisomerases I and II [34]. This increase in protein can be induced from an increase in apoptosis in COPD.

본 발명에서, T cell 수용체 델타 체인은 COPD에서 증가되며, 악화상태에서 더욱 증가된다. T-림포사이트는 COPD의 염증반응에 참여하는 주요한 감염 실행세포 및 조절 세포이다. TCR-γδ 림포사이트는 전체 T-cell 부분모집단(subpopulation)의 단지 5%에 해당한다. 그러나, 이들은 점막 항상성(mucosal homeostasis) 및 조직 손상에 대한 회복 반응에 주요한 역할을 한다[35]. 회전율 및 BAL γδ-림포사이트는 비흡연자보다 정상 폐기능을 가지는 흡연자에서 높으며, 이 반응은 COPD 환자에서 둔화된다[36]. 그러나, T-cell 수용체 델타 체인은 본 연구의 말초 혈액에서 증가되며, 이는 COPD에서 T-cell 수용체 델타 체인의 다른 측면을 나타내는 것이다. In the present invention, the T cell receptor delta chain is increased in COPD and is further increased in the aggravated state. T-lymphocytes are the major infectious and regulatory cells involved in the inflammatory response of COPD. TCR-γδ lymphocytes correspond to only 5% of the total T-cell subpopulation. However, they play a major role in the recovery response to mucosal homeostasis and tissue damage [35]. Turnover and BAL γδ-lymphocytes are higher in smokers with normal lung function than non-smokers, and this response is slowed in COPD patients [36]. However, the T-cell receptor delta chain is increased in the peripheral blood of this study, which represents another aspect of the T-cell receptor delta chain in COPD.

본 발명에서, 안정기의 COPD에 비해 악화기에서 A1pi(alpha-1-antitrypsin, SERPINA1)는 증가된 반면, Serpin B6는 감소되었다. Serpins은 프로테아제를 저해할 수 있는 단백질 세트로 처음 발견된 구조와 유사한 구조를 갖는 단백질 그룹이다. 알파-1 안티드립신(A1pi)는 트립신, 키모트립신, 트롬빈 및 박테리아 프로테아제들과 뿐만 아니라, elastase와 우세하게 복합체를 형성한다[37]. In the present invention, A1p (alpha-1-antitrypsin, SERPINA1) was increased in the aggravated group compared to COPD of the ballast, while Serpin B6 was decreased. Serpins are a group of proteins that have structures similar to those found initially in a set of proteins that can inhibit proteases. Alpha-1 antidrypsin (A1pi) predominantly complexes with elastase as well as trypsin, chymotrypsin, thrombin and bacterial proteases [37].

이것이 없는 경우, 호중구 엘라스타아제(neutrophil elastase)는 엘라스틴(elastin)으로 분해되어, 기종을 일으킨다. 알파-1 안티드립신(A1pi)의 증가는 안정적인 COPD에서도 존재함이 보고되고 있으며, 본 발명에서 증명된 바와 같이, COPD 악화기에서 심해진다.In the absence of this, neutrophil elastase is degraded into elastin, causing the model. An increase in alpha-1 antidepressant synthase (A1pi) has also been reported to be present in stable COPD and, as demonstrated in the present invention, is exacerbated in COPD exacerbations.

Serpin B6는 myelomonocytes의 세포질 단편, 모세혈관 내피세포, 혈소판 및 상피세포에 존재하는 세린 프로테나아제 저해제(serine proteinase inhibitor)이다. Serpin B6는 cathepsin G와 같은 내생 멤브레인-관련 세린 프로테나아제에 결합한다[38]. 완전한 액포가 식균작용(phagocytosis)동안 파괴될 때, Serpin B6는 빠르게 세포 내부로 방출되는 모든 프로테나아제를 비활성화시킨다. 세포간 cathepsin G 제어는 이것이 세포자살 전 프로테나아제인 caspase-7 를 활성화시키기 때문에, 특히 더 중요할 수 있다[39]. 따라서, 본 발명에서 낮은 수준의 Serpin B6는 폐 세포 또는 전신 조직의 세포자살의 증가를 야기할 수 있다[40]. Serpin B6 is a serine proteinase inhibitor present in cytoplasmic fragments of myelomonocytes, capillary endothelial cells, platelets and epithelial cells. Serpin B6 binds to endogenous membrane-associated serine proteases such as cathepsin G [38]. When the complete vacuole is destroyed during phagocytosis, Serpin B6 deactivates all of the proteases released into the cell rapidly. Intercellular cathepsin G regulation may be particularly important, as this activates caspase-7, a cell apoptotic protease [39]. Thus, in the present invention, low levels of Serpin B6 may result in increased apoptosis of lung or systemic tissues [40].

응고 단백질에서, 악화시에 피브리노겐 감마는 증가된 반면, 피브린 베타는 감소되었다. 이들은 혈액응고 과정 동안, 간에서 먼저 합성되어 트롬빈에서 피브린으로 변환되는 급성 단계 당단백질(acute phase glycoproteins)이다. 피브리노겐 수준 및 COPD의 존재 및 사망률간의 강한 관계가 있다는 증거가 있다[14]. 피브리노겐은 알파, 베타 및 감마의 3개 폴리펩티드 체인의 이합체(dimer)이다[41]. 3개 체인 모두는 피브리노겐의 정상 기능에 중요하지만, 얽힌 3차 구조로 인해, 감마 체인은 응혈 인자(clotting factors), 성장인자 및 인테그린(integrin)과 상호작용하는 많은 사이트를 포함한다[42]. In the coagulation proteins, fibrinogen gamma was increased while fibrin beta was decreased upon aging. These are acute phase glycoproteins that are first synthesized in the liver and converted from thrombin to fibrin during the blood coagulation process. There is evidence that there is a strong relationship between fibrinogen levels and the presence and mortality of COPD [14]. Fibrinogen is a dimer of three polypeptide chains, alpha, beta and gamma [41]. All three chains are important for the normal function of fibrinogen, but due to the tangled tertiary structure, the gamma chain contains many sites that interact with clotting factors, growth factors and integrins [42].

본 발명에서, 스팟 2, 3 및 4는 피브린 베타로 밝혀졌다. 스팟 3과 4는 5.95의 pIs를 가지는 반면, 스팟 2는 6.25의 pIs를 가지므로, 스팟 3과 4는 스팟 2의 전사 후 수정으로 보인다. 모든 스팟은 안정기의 COPD와 비교해서, COPD 악화기에서 현저히 감소되었다. 현재, 본 연구에서 악화과정이 피브리노겐 베타의 양의 감소와 연관되는 이유는 알려지지 않았다. In the present invention, spots 2, 3 and 4 were found to be fibrin beta. Since spots 3 and 4 have a pIs of 5.95, while spots 2 have pIs of 6.25, spots 3 and 4 appear to be modifications after transfer of spot 2. All spots were significantly reduced in the COPD exacerbator compared to the ballast COPD. Currently, the reason why the deterioration process is associated with a decrease in the amount of fibrinogen beta in this study is unknown.

트렌스페린(Transferrin)은 생리 유체에서 자유 철이온의 수준을 조절하는 철이온 결합 혈액 플라즈마 당단백질이다. 트렌스페린은 또한, 선천적인 면역 시스템과 관련되어 있다. 철과 결합(iron withholding) 되는 과정을 통해, 박테리아 생존을 방해하여, 자유 철이온의 농도를 낮도록 환경을 조성함으로써, 철과 결합하며, 점막에서 발견된다. 하기도(lower respiratory tract)에서 감소된 트렌스페린 농도는 COPD로 인한 호흡기 결함이 있는 환자에서 산화 상처와 박테리아 감염에 대한 방어를 감소시킬 수 있다. 내장 단백질 저장은 알부민, 프리알부민 또는 트렌스페린과 같은 혈액 파라미터를 이용하여 분석된다. 단백질-칼로리 영양실조가 COPD환자 및 급성 호흡기 장애를 가진 환자에게서 나타날 수 있다[43]. 본 연구에서, BMI는 COPD 에서 현저히 낮고, 이는 COPD 악화기에서 서서히 감소되며, 이는 COPD에서 손상된 영양상태를 암시하는 것이다. Transferrin is an iron-ion-binding plasma plasma glycoprotein that regulates the level of free iron ion in physiological fluids. Transferrin is also associated with the innate immune system. Through the process of iron withholding, iron is combined with iron by inhibiting bacterial viability, creating an environment that lowers the free iron ion concentration, and is found in mucous membranes. Decreased transreneglene concentrations in the lower respiratory tract can reduce defense against oxidative injuries and bacterial infections in patients with respiratory defects due to COPD. In vivo protein storage is analyzed using blood parameters such as albumin, prealbumin or trans-perrine. Protein-caloric malnutrition can be seen in COPD patients and patients with acute respiratory disorders [43]. In this study, BMI is significantly lower in COPD, which is slowly reduced in COPD exacerbations, suggesting impaired nutritional status in COPD.

감염은 COPD의 발병 과정의 중요한 과정 중 하나이며, 이는 COPD 환자의 염증세포 증가 및 기관지폐포세척액(bronchoalveolar lavage fluid), 거담 및 폐 조직에 있는 감염 매개자의 과생산 또는 과소생산의 특징을 가진다[44]. 급성 악화 동안 발생하는 전신 염증 hypo-reactions이 발생하며, 이는 급성 악화로 인한 것인지 그로부터 발생하는 것인지는 불명확하다. Infection is one of the key processes in the onset of COPD, characterized by increased inflammatory cells in COPD patients and over- or under-production of infection mediators in bronchoalveolar lavage fluid, germane, and lung tissue [44 ]. Systemic inflammatory hypo-reactions occur during acute exacerbations, whether it is due to acute exacerbations or not.

이러한 매개자의 변화가 본 발명에서 관찰되지는 않았으나, 주요 악화 증상에서 플라즈마 CRP 농도, serum interleukin (IL)-6 및 copeptin은 COPD 악화의 확인에 유용하다[45], [46], [47]. 이는 본 발명과 다른 연구들 사이에 악화의 다른 타입의 사용으로부터 유래하는 것일 수 있다.Plasma CRP levels, serum interleukin (IL) -6 and copeptin are useful in identifying COPD aggravation [45, 46, 47], although major changes in these mediators have not been observed in the present invention. This may be due to the use of other types of deterioration between the present invention and other studies.

COPD에서 악화의 정의는 논쟁의 여지가 있다[48]. 증상이나 폐 기능이 전적으로 이에 의존적인 경우, 그 기준은 환자나 의사에 따라 매우 주관적이다. 본 발명에서, 발명자들은 병원에 입원한 COPD 악화 대상자로 정하였다. 이는 본 발명에서 대상자들이 다른 연구에서 보다 COPD 악화증상이 더 심한 것임을 나타낸다[16], [47]. The definition of aggravation in COPD is controversial [48]. If symptoms or pulmonary function are entirely dependent on the criteria, the criteria are highly subjective, depending on the patient or physician. In the present invention, the inventors designated COPD patients who were admitted to the hospital as subjects to be exacerbated. This indicates that the subjects of the present invention have more severe symptoms of COPD deterioration than other studies [16, 47].

요약하면, 발명자들은 COPD 악화를 예측하기 위한 새로운 후보 플라즈마 바이오 마커로서, 2 DE와 MALDI-TOF/TOF를 이용하여 COPD 안정기와 악화기에서 플라즈마에서 17 단백질들이 다르게 발현되는 것을 확인하였다. 이들 중에서, 일반 대조군과 COPD 대상자의 플라즈마에서 RARα의 정량 측정을 수행하였다. 안정상태의 플라즈마에서, 레티노산 수용체 알파(RAR alpha) 단백질 수준은 COPD 악화로 인한 병원입원의 존재 및 빈도와 관련이 있었다. 0.154 ng/ml 레티노산 수용체 알파(RAR alpha)의 cut-off는 악화로 인한 병원입원에 대해 71.4% 민감도와 92.8%의 특이도를 나타내었다. 이러한 결과는 악화 COPD에서 단백질 마커의 새로운 관점을 제공할 수 있다. In summary, the inventors have identified that 17 proteins are differentially expressed in plasma at the COPD ballast and aggravator using 2 DE and MALDI-TOF / TOF as new candidate plasma biomarkers for predicting COPD deterioration. Of these, quantitative determination of RAR alpha was performed in the plasma of the general control group and COPD subjects. In steady-state plasma, retinoic acid receptor alpha (RAR alpha) protein levels were associated with the presence and frequency of hospitalization due to COPD worsening. The cut-off of 0.154 ng / ml retinoic acid receptor alpha (RAR alpha) showed 71.4% sensitivity and 92.8% specificity for hospitalization due to exacerbations. These results can provide a new perspective of protein markers in deteriorating COPD.

Claims (4)

레티노산 수용체 알파(RAR alpha), 니네인 이소폼 CRA_a(Ninein isoform CRA_a, 니네인 GSK3B 상호작용 단백질과 결합하는 동형단백질), 알파-1 안티드립신(A1pi), 티로실-DNA 포스포디에스테라아제 2, T cell 수용체 델타 체인, Human Igm RF*와 Igg1 Fc간의 자가면역 복합체(Autoimmune Complex)의 크리스탈 구조(COAC), 세르핀 펩티다아제 저해제 멤버 6(serpin peptidase inhibitor member 6), 보체 인자 B 프리프로단백질(complement factor B preproprotein), 크리그 바운드 투 씨3씨의 체인 B(Chain B, Crig Bound To C3c) 및 WDR1(WD repeat-containing protein 1 isoform 1, WD 반복 동형단백질 1)를 모두 포함하는 급성 악화 만성폐쇄성폐질환(AECOPD)과 만성폐쇄성폐질환(COPD) 구별용 플라즈마 바이오마커 조성물. Retinoic acid receptor alpha (RAR alpha), Ninein isoform CRA_a, homologous protein binding to Ninein GSK3B interacting protein, alpha-1 antidrypsin (A1pi), tyrosyl-DNA phosphodiesterase 2 , The T cell receptor delta chain, the crystal structure of the autoimmune complex between human Igm RF * and Igg1 Fc (COAC), the serpin peptidase inhibitor member 6, the complement factor B preproprotein complement factor B preproprotein, Chain B, Crig Bound To C3c) and WDR1 (WD repeat-containing protein 1 isoform 1, WD repeat homoprotein 1) A plasma biomarker composition for distinguishing between obstructive pulmonary disease (AECOPD) and chronic obstructive pulmonary disease (COPD). 레티노산 수용체 알파(RAR alpha)를 포함하는 것을 특징으로 하는 급성 악화 만성폐쇄성폐질환(AECOPD)과 만성폐쇄성폐질환(COPD) 구별용 플라즈마 바이오마커 조성물. A plasma biomarker composition for distinguishing between acute exacerbation chronic obstructive pulmonary disease (AECOPD) and chronic obstructive pulmonary disease (COPD), characterized by comprising retinoic acid receptor alpha (RAR alpha). 제1항 또는 제2항의 플라즈마 바이오마커 조성물을 포함하는 급성 악화 만성폐쇄성폐질환(AECOPD)과 만성폐쇄성폐질환(COPD) 구별 진단용 키트. A kit for the diagnosis of acute exacerbation chronic obstructive pulmonary disease (AECOPD) and chronic obstructive pulmonary disease (COPD) comprising the plasma biomarker composition according to claim 1 or 2. 대상자의 플라즈마에서 레티노산 수용체 알파(RAR alpha), 니네인 이소폼 CRA_a(Ninein isoform CRA_a, 니네인 GSK3B 상호작용 단백질과 결합하는 동형단백질), 알파-1 안티드립신(A1pi), 티로실-DNA 포스포디에스테라아제 2 또는 T cell 수용체 델타 체인 중 어느 하나 이상이 증가하거나,
Human Igm RF*와 Igg1 Fc간의 자가면역 복합체(Autoimmune Complex)의 크리스탈 구조(COAC), 세르핀 펩티다아제 저해제 멤버 6(serpin peptidase inhibitor member 6), 보체 인자 B 프리프로단백질(complement factor B preproprotein), 크리그 바운드 투 씨3씨의 체인 B(Chain B, Crig Bound To C3c) 및 WDR1(WD repeat-containing protein 1 isoform 1, WD 반복 동형단백질 1)중 어느 하나 이상이 감소하는지 여부를 조사하여
급성 악화 만성폐쇄성폐질환(AECOPD) 진행 여부를 검출하기 위해 제1항 또는 제2항의 플라즈마 바이오마커를 이용하여 급성 악화 만성폐쇄성폐질환(AECOPD)과 만성폐쇄성폐질환(COPD) 구별하는데 필요한 정보를 제공하기 위하여, 플라즈마 바이오 마커를 검출하는 방법.

(RAR alpha), Ninein isoform CRA_a, a homologous protein that binds to the Ninein GSK3B interacting protein, alpha-1 antidrypsin (A1pi), tyrosyl-DNA One or more of the phosphodiesterase 2 or T cell receptor delta chains is increased,
The crystal structure (COAC) of the autoimmune complex between human Igm RF * and Igg1 Fc, the serpin peptidase inhibitor member 6, the complement factor B preproprotein, (Chain B, Crig Bound To C3c) and WDR1 (WD repeat-containing protein 1 isoform 1, WD repeat homoprotein 1) of the Bound Tryptic 3 seed
(AECOPD) and chronic obstructive pulmonary disease (COPD) using the plasma biomarker of claim 1 or 2 for the detection of progression of acute exacerbation chronic obstructive pulmonary disease (AECOPD) Wherein the plasma biomarker is a plasma biomarker.

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