KR101382893B1 - Bacteriophage of Pseudomonas aeruginosa and uses thereof - Google Patents

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Abstract

본원은 슈도모나스 에루기노사에 대한 감염성을 갖는 신규한 박테리오파아지, 그 변이체 및 그 프로지니와 그 용도를 개시한다. 본원에 따른 박테리오파아지는 기회감염성 균주인 슈도모나스 에루기노사(Pseudomonas aeruginosa)을 특이적으로 감염하여, 다양한 항생제에 내성을 가져 의료계에서 크게 문제가 병원균인 슈도모나스 균주를 효과적으로 제거하여 항생제로서 사용될 수 있음 물론, 또한 생물막(biofilm)을 형성을 방해하여 식품위생기기 및 의료 기기 등에 대한 방오효과도 제공할 수 있다.The present application discloses novel bacteriophage, variants thereof, and progeny thereof, and uses thereof having infectivity against Pseudomonas aeruginosa. Bacteriophage according to the present invention is specifically infected with Pseudomonas aeruginosa, an opportunistic strain, has resistance to various antibiotics, and can effectively be used as an antibiotic by effectively removing the Pseudomonas strain which is a serious problem in the medical field. In addition, it may interfere with the formation of biofilm, and may also provide an antifouling effect on food hygiene and medical devices.

Description

슈도모나스 에루기노사의 박테리오파아지 및 그 용도 {Bacteriophage of Pseudomonas aeruginosa and uses thereof}Bacteriophage of Pseudomonas aeruginosa and uses approximately} Pseudomonas aeruginosa

본원은 박테리오파아지 및 이의 응용분야에 관한 것이다.
The present application relates to bacteriophages and their applications.

병원균을 제거하기 위해 사용되는 항생제에 대한 내성을 갖는 균의 출현은 전세계적으로 큰 문제를 야기하고 있어, 항생제를 대체할 수 있는 물질의 개발이 시급한 실정이다. The emergence of bacteria resistant to antibiotics used to eliminate pathogens is a major problem in the world and it is urgent to develop a substance that can replace antibiotics.

박테리오파아지는 특정 박테리아를 특이적으로 감염하여, 많은 단백질이 관여하는 복잡한 융해(lysis) 과정을 통해 박테리아를 사멸시키는 박테리아 바이러스이다. 박테리오파아지는 숙주 박테리아에 대한 특이성이 매우 높아 항생제가 본격적으로 개발되기 전 항생제로서의 가능성이 높이 평가되었으나, 박테리오파아지에 대한 부족한 이해 및 본격적인 항생제의 개발과 함께, 그 효용이 줄어드는 추세였다. A bacteriophage is a bacterial virus that specifically infects a specific bacterium and kills the bacteria through a complex lysis process involving many proteins. The bacteriophage was highly specific for host bacteria, so it was highly evaluated as an antibiotic before the antibiotic was developed in earnest. However, the utility of the bacteriophage was reduced with the understanding of bacteriophage and the development of full-fledged antibiotics.

하지만 최근들어 박테리오파아지에 대한 연구결과의 축적과 함께 최근 항생제 남용으로 불거진 문제를 해결하기 위한 대안으로 박테리오파아지를 감염치료 및 방지 등에 사용하는 항생제로서의 개발이 증가하는 추세이다.Recently, however, as a result of accumulation of research results on bacteriophage and the recent problem of antibiotic abuse, bacteriophage has been developed as an antibiotic for the treatment and prevention of infection.

박테리오파아지를 인간 및 가축에 사용하는 것에 관하여 Merril 등 (J INat Rev Drug Discov 2(6): 489-197, 2005)에 기술되어 있다. Merril et al. (J INat Rev Drug Discov 2 (6): 489-197, 2005) for use of bacteriophage for human and livestock.

미국특허 제7674467호는 살모넬라에 대한 박테리오파아지 및 그 용도에 관하여 개시하고 있다. U.S. Patent No. 7674467 discloses a bacteriophage against Salmonella and its use.

미국특허 제7622293호는 슈도모나스에 대한 박테리오파아지 및 그 용도에 관하여 개시하고 있다. U.S. Patent No. 7622293 discloses a bacteriophage against Pseudomonas and uses thereof.

한국특허 제941892호는 살모넬라 갈리나움에 대한 박테리오파아지 및 그 용도에 관하여 개시하고 있다. Korean Patent No. 941892 discloses a bacteriophage against Salmonella gallinum and its use.

하지만 박테리오파아지의 항균제 등으로서의 용도에 관한 다양한 개시에도 불구하고, 신규한 박테리오파아지에 대한 발굴 및 특정 용도에 적합하게 선별된 박테리오파아지에 대한 개발이 여전히 요구된다.
However, despite the various disclosures regarding the use of bacteriophages as antimicrobial agents and the like, there is still a need to develop new bacteriophage antigens and screened bacteriophages suitable for particular applications.

본원은 상기와 같은 문제점을 해결하기 위해 안출된 것으로 슈도모나스 에루기노사에 대한 특이성을 가는 신규한 박테리오파아지 및 그 용도를 제공하고자 한다.
The present invention has been made to solve the above problems to provide a novel bacteriophage with a specificity for Pseudomonas aeruginosa and its use.

한 양태에서 본원은 도 2의 RFLP 패턴 또는 서열번호 1의 서열을 갖으며, 슈도모나스 에루기노사에 대한 융해능을 갖는 박테리오파아지를 제공한다. 한 구현예에서 본원에 따른 박테리오파아지는, 슈도모나스 에루기노사 ATCC 10145, ATCC 27853, ATCC 9027, ATCC 25619, ATCC 13388, 또는 ATCC 15692에 대한 융해능을 갖는다.  In one embodiment the present application provides a bacteriophage having the RFLP pattern of FIG. 2 or the sequence of SEQ ID NO: 1 and having the ability to dissolve Pseudomonas aeruginosa. In one embodiment the bacteriophage according to the present application has a melting capacity for Pseudomonas aeruginosa ATCC 10145, ATCC 27853, ATCC 9027, ATCC 25619, ATCC 13388, or ATCC 15692.

본원은 또한 한국미생물보존센터에 2012년 6월13일자로 기탁번호 KFCC11533P로 기탁된 것인, 박테리오파아지를 제공한다. The present application also provides a bacteriophage, which was deposited with the Korea Microorganism Conservation Center with accession number KFCC11533P, dated June 13, 2012.

본원은 또한 본원에 따른 박테리오파아지와 동일한 생물학적 특성을 나타내는, 프로지니 박테리오파아지를 제공한다. The present invention also provides progeny bacteriophages exhibiting the same biological properties as the bacteriophages according to the present invention.

다른 양태에서 본원은 본원에 따른 박테리오파아지 또는 그 프로지니를 포함하는 슈도모나스 에루기노사 유발성 질환의 예방 또는 치료용 약학적 조성물을 제공한다. In another aspect, the present application provides a pharmaceutical composition for preventing or treating Pseudomonas aeruginosa-induced diseases, including the bacteriophage or progeny thereof according to the present application.

또한 다른 양태에서 본원은 본원에 따른 박테리오파아지 또는 그 프로지니를 포함하는 항생제, 사료첨가제, 소독제 또는 생물막 형성 방지 또는 저해제를 제공한다. In yet another aspect, the present invention provides antibiotics, feed additives, disinfectants, or biofilm formation inhibitors or inhibitors comprising the bacteriophage or its progeny according to the present invention.

또 다른 양태에서 본원은 본원에 따른 생물막 형성 방지 또는 저해제를 박테리아와 접촉하는 단계를 포함하는 생물막 형성 저해 또는 억제 방법을 제공한다.
In another aspect, the present invention provides a method of inhibiting or inhibiting biofilm formation comprising contacting the biofilm formation inhibitor or inhibitor according to the present invention with a bacteria.

본원에 따른 박테리오파아지는 기회감염성 균주인 슈도모나스 에루기노사(Pseudomonas aeruginosa)을 특이적으로 감염하여, 다양한 항생제에 내성을 가져 의료계에서 크게 문제가 병원균인 슈도모나스 균주를 효과적으로 제거하여 사람은 물론 가축의 항생제로서 사용될 수 있음 물론, 또한 생물막(biofilm)을 형성을 방해하여 식품위생기기 및 의료 기기 등에 대한 방오효과도 제공할 수 있다.
Bacteriophage according to the present invention is specifically infected with Pseudomonas aeruginosa, an opportunistic strain, and resistant to various antibiotics, effectively removing the Pseudomonas strain, which is a serious problem in the medical field, to effectively remove human and livestock antibiotics. Of course, it can also be used to prevent the formation of biofilm (biofilm) can also provide an antifouling effect for food hygiene and medical devices and the like.

도 1은 본원에서 규명된 박테리오파아지를 우라닐아세테이트로 네가티브 염색을 한 후 관찰 한 전자현미경 사진으로 스케일바는 100 나노미터이다.
도 2는 본원에서 규명된 박테리오파아지 DNA의 제한효소 분석 결과이다. 각 레인: M1 : lambda DNA 마커 (Hind III + EcoR I); M2 : 1 kb DNA 레더.
도 3은 원에서 규명된 박테리오파아지의 단백질 분석결과이다. 레인 1: 단백질 마커; 레인 2: 본원에 따른 파아지의 분석.
도 4는 본원에서 규명된 박테리오파아지의 흡착 특성을 분석한 것으로 슈도모나스 에루기노사에 MOI 0.1로 감염시킨 후 시간별로 프리 파아지를 측정한 결과이다.
도 5는 본원에서 규명된 박테리오파아지의 원스텝 성장 곡선이다. E: 소실기; L: 잠복기; B: 방출수.
도 6은 본원에서 규명된 박테리오파아지의 온도 및 pH에 대한 안정성 시험 결과이다. (a) 상이한 온도에서 박테리오파아지 배양 후 감염성 박테리오파아지 입자수를 측정한 결과; (b) 상이한 pH에서 박테리오파아지 배양 후 감염성 박테리오파아지 입자수를 측정한 결과이다.
도 7은 본원에서 규명된 박테리오파아지의 박테리아에 대한 성장 억제 (a) 및 생물막 형성 억제 (b) 효과를 측정한 결과이다.
Brief Description of the Drawings Fig. 1 is an electron micrograph of a bacteriophage identified herein after negative staining with uranyl acetate. The scale bar is 100 nanometers.
Figure 2 is a restriction enzyme analysis of the bacteriophage DNA identified herein. Each lane: M1: lambda DNA marker (Hind III + EcoR I); M2: 1 kb DNA leather.
Figure 3 is a protein analysis of the bacteriophage identified in the circle. Lane 1: protein marker; Lane 2: Analysis of the phage according to the present invention.
Figure 4 is a result of analyzing the adsorption characteristics of the bacteriophage identified in the present application is the result of measuring pre-phage by time after infection with Pseudomonas eruginosa MOI 0.1.
5 is a one step growth curve of the bacteriophage identified herein. E: disappearance; L: latent period; B: Number of emissions.
FIG. 6 shows stability test results for temperature and pH of bacteriophage identified herein. (a) measuring the number of infectious bacteriophage particles after culturing the bacteriophage at different temperatures; (b) Infectious bacteriophage particle counts were measured after culturing bacteriophage at different pHs.
Figure 7 is the result of measuring the growth inhibition (a) and biofilm formation inhibition (b) effect on the bacteria of the bacteriophage identified herein.

슈도모나스 에루기노사에는 환경에 흔하게 존재하는 기회감염성 균주로 감염시 주 증상으로 염증 및 패혈증을 일으키는 박테리아로 여러 항생제에 내성을 가진 변종이 발견되어 질병의 치료에 어려움을 가중시킴은 물론 의료장비 등에 생물막(biofilm)을 형성하여 교차감염을 일으켜 이의 해결이 시급한 실정이다.Pseudomonas aeruginosa is an opportunistic infectious strain commonly found in the environment. It is a bacterium that causes inflammation and sepsis due to the main symptom of infection. Many varieties resistant to antibiotics are found, which makes it difficult to treat diseases, (biofilm) to cross infection, which is urgently needed.

이에 본원에서 항생제에 비해 특정 박테리아를 표적으로 하여 선택적으로 제거할 수 있고, 숙주내에서 복제를 통해 지속적인 효과를 볼 수 있으며, 부작용이 없는 슈도모나스 에루기노사에 특이적으로 작용하는 신규한 박테리오파아지 분리하였다. In this context, a novel bacteriophage isolate that targets specific bacteria and can be selectively removed compared to antibiotics, has a lasting effect through replication in the host, and specifically acts on Pseudomonas aeruginosa without side effects. It was.

따라서 한 양태에서 본원은 서열번호 1의 서열을 갖는 슈도모나스 에루기노사에 대한 융해능을 갖는 박테리오파아지, 그 변이체, 유도체 및 프로지니(progeny)에 관한 것이다. 또한 본원의 박테리오파아지는 한국미생물보존센터에 2012년 6월 13일자로, 기탁번호 KFCC11533P로 기탁되었다. Thus, in one embodiment, the present application is directed to bacteriophages, variants, derivatives and progeny thereof having the ability to dissolve Pseudomonas aeruginosa having the sequence of SEQ ID NO: 1. In addition, the bacteriophage of the present application was deposited to the Korea Microorganism Conservation Center on June 13, 2012, accession number KFCC11533P.

본원에 포함되는 변이체는 서열번호 1의 서열의 변이 또는 이에 의해 코딩되는 단백질에 변이를 갖는 것으로 본원에 따른 박테리오파아지와 유전적 및 표현형 특징에서 동일한 것이다. Variants included herein have the same genetic and phenotypic characteristics as the bacteriophage according to the present application having a variation in the sequence of SEQ ID NO: 1 or a protein encoded thereby.

본원에서 사용된 용어 “프로지니“는 그 것이 유래된 본원의 박테리오파아지와 동일한 생물학적 특성을 나타내는 것으로, 연속적 계대 배양 또는 기타 공지된 다른 방법을 통하여 생성된 본원에 따른 박테리오파아지의 복제산물로, 서열번호 1의 서열과 실질적으로 동일하거나, 또는 도 2의 RFLP(Restriction Fragment Length Polymorphism, 제한효소단편길이다형성) 패턴과 실질적으로 동일하다. 전자의 경우 "실질적으로 동일한"은 두 서열사이의 유사도를 나타내는 것으로 공지된 서열비교 프로그램 또는 수동비교 (visual inspection)을 통해 예를 들면, 90% 이상, 특히 95% 이상, 더욱 특히 99% 이상의 유사도를 의미하는 것으로, 아미노산 변이가 수반되거나 또는 되지 않는 핵산 서열의 변이체를 포함하는 것이다. 후자의 경우 "실질적으로 동일한"은 Tenover 등에 의해 개발된 기준에 따른 개체간 변이도를 의미하는 것이다 (Tenover, F.C. et al.,(1995), J. Clin. Microbiol.33:2233-2239). As used herein, the term “progeny” refers to the same biological properties as the bacteriophage of this invention from which it is derived, and is a copy of the bacteriophage according to the present invention produced via continuous passage culture or other known methods, the sequence of It is substantially identical to the sequence of No. 1, or substantially identical to the Restriction Fragment Length Polymorphism (RFLP) pattern of FIG. In the former case, "substantially the same" means, for example, at least 90%, in particular at least 95%, more in particular at least 99%, via sequence comparison programs or visual inspection, which are known to indicate similarities between the two sequences. It means to include a variant of the nucleic acid sequence with or without amino acid variation. In the latter case, "substantially the same" means intersubject variability according to criteria developed by Tenover et al. (Tenover, F.C. et al., (1995), J. Clin. Microbiol. 33: 2233-2239).

본원에 사용된 용어 “유도체”는 본원에 따른 박테리오파아지 또는 그 프로지니를 구성하는 서브유니트 또는 발현산물을 의미하는 것으로, 예를 들면 박테리오파아지 유전체, 유전자 전부 또는 일부, 유전자 발현산물, 박테리오파아지를 구성하는 산물을 포함한다. As used herein, the term " derivative " refers to a bacteriophage or a subunit or expression product constituting the bacteriophage according to the present invention, including, for example, a bacteriophage genome, all or part of a gene, a gene expression product, And the constituent products.

본원의 박테리오파아지는 슈도모나스 에루기노사를 특이적으로 감염한다. 한 구현예에서 상기 슈도모나스 에루기노사는 ATCC (American Type Culture Collection, USA, 미국세포주은행) 15522, ATCC 10145, ATCC 27853, ATCC 9027, ATCC 25619, ATCC 13388, 또는 ATCC 15692이나 이로 제한하는 것은 아니다.
The bacteriophage of the present application specifically infects Pseudomonas aeruginosa. In one embodiment, Pseudomonas aeruginosa ATCC (American Type Culture Collection, USA, US Cell Line Bank) 15522, ATCC 10145, ATCC 27853, ATCC 9027, ATCC 25619, ATCC 13388, or ATCC 15692, but is not limited thereto.

다른 양태에서 본원의 박테리오파아지, 그 유도체, 그 변이체 또는 그 프로지니는 슈도모나스 에루기노사의 성장, 분열, 집락화의 조절, 억제 또는 제어에 사용될 수 있으며, 예를 들면 가공 또는 비가공된 식품의 처리, 보관, 각종 기구, 특히 의료장비 처리, 질병의 치료를 위한 항생제를 포함하는 약학적 조성물로서의 용도를 들 수 있다.
In other embodiments, the bacteriophages, derivatives, variants or progeny thereof of the present invention may be used to control, inhibit or control the growth, division, or colonization of Pseudomonas aeruginosa, for example, treatment of processed or unprocessed food, Storage, various apparatuses, especially medical treatment of diseases, and antibiotics for the treatment of diseases.

한 측면에서 본원의 박테리오파아지는 슈도모나스 에루기노사로 인한 식중독 예방을 위한 가공 비가공 식품 또는 식재료의 처리에 사용될 수 있다. 이 경우, 본원에 따른 박테리오파아지를 대상 식품, 식재료, 또는 장비에 스프레이하거나, 또는 박테리오파아지를 포함하는 용액에 침지할 수 있다. 본원의 박테리오파아지는 다양한 식재료에 사용될 수 있으며, 예를 들면 소고기, 특히 분쇄 쇠고기, 분쇄 쇠고기로 만들어진 가공식품 예를 들면 햄버거, 노지의 발에서 자라는 각종 야채, 예를 들면 상추, 시금치, 파, 음용수, 1차 감염된 식재료 등에 의해 2차 감염의 우려가 있는 식품 들을 들 수 있으나, 이로 제한하는 것은 아니다. In one aspect, the bacteriophage herein may be used to treat unprocessed food or foodstuffs for the prevention of food poisoning caused by Pseudomonas aeruginosa. In this case, the bacteriophage according to the present invention may be sprayed onto the subject food, the food material, or the equipment, or immersed in a solution containing the bacteriophage. The bacteriophage of the present invention may be used in a variety of foodstuffs, for example beef, especially ground beef, processed foods made from ground beef, such as hamburgers, various vegetables that grow on the feet of a nori, such as lettuce, spinach, , And foods that are susceptible to secondary infection by primary infected foodstuffs, but are not limited thereto.

본원의 박테리오파아지는 또한 슈도모나스 에루기노사에 의한 생물막 형성의 제어가 필요한, 가정, 환경, 의료 및 산업 분야에 걸쳐 사용되는 장비에 폭넓게 사용될 수 있다. 예를 들면, 각종 식재료 처리, 식품 가공 등에 사용되는 장비, 각종 의학기구, 의학장비, 의학시설/설비와 같은 물건은 물론 상피세포, 뼈, 치아, 및 혈관내벽 등을 포함하는 각종 생체 조직/기관과 같은 생체조직 및 생체에 적용되는 각종 인공 삽입 보형물에 사용될 수 있다. The bacteriophages herein can also be used extensively in equipment used in the home, environmental, medical and industrial fields where control of biofilm formation by Pseudomonas aeruginosa is required. For example, various kinds of living tissues / tissues including epithelial cells, bones, teeth, and inner wall of vessels as well as objects such as equipment used for various food processing, food processing, various medical instruments, medical equipment, And various artificial implants applied to the living body.

본원의 박테리오파아지는 슈도모나스 에루기노사의 성장, 분열, 집락화의 조절, 제어, 억제 및/또는 생물막 형성의 방지 또는 저해에 효과적인 양으로 사용될 수 있다. 효과적인 양은 처리하고자 하는 대상의 종류 및 그 면적, 및 목적하는 억제/제어의 정도, 처리 시점 등을 포함하는 조건에 맞추어 결정될 수 있으며, 당업자라면 본원의 기재 및 표적 박테리오파아지에 관한 지식을 근거로 적절한 농도를 선택할 수 있을 것이다. 예를 들면 약 1 × 105 내지 1 × 1015 PFU(Plaque Forming Unit)/ml의 농도 또는 약 10-5 내지 105 MOI(Multiplicity of Infection)로 사용될 수 있으며, 하루에 일회 내지 수회 및/또는 수일에 걸쳐 처리될 수 있으며, 초기에 처리하는 것이 유리할 수 있다. 당업자라면 박테리오파아지에 관한 문헌 (Adams, M.H (1959), Methods of study bacterial viruses. Bacteriophages. London, Interscience Publishers, Ltd. 443-519)를 참조하여 적절한 농도를 결정할 수 있을 것이다. 예를 들면 처리하고자하는 표면에 대하여 약 1ml/500cm2의 농도로 처리될 수 있다.The bacteriophage of the present application may be used in an amount effective to inhibit or inhibit the growth, division, colonization, control, inhibition and / or biofilm formation of Pseudomonas aeruginosa. The effective amount can be determined according to the conditions including the type and the area of the object to be treated, the degree of inhibition / control desired, the time of treatment, and the like, and those skilled in the art will appreciate the appropriate amount of the appropriate bacteriophage You will be able to select the concentration. For example, a concentration of about 1 × 10 5 to 1 × 10 15 PFU (Plaque Forming Unit) / ml, or about 10 -5 to 10 5 MOI (multiplicity of infection) It can be processed over several days and it may be advantageous to treat it early. Those skilled in the art will be able to determine appropriate concentrations by reference to the literature on bacteriophage (Adams, MH (1959), Methods of study bacterial viruses. Bacteriophages. London, Interscience Publishers, Ltd. 443-519). For example, at a concentration of about 1 ml / 500 cm < 2 > with respect to the surface to be treated.

본원의 박테리오파아지를 포함하는 조성물은 가정, 산업, 의학, 및 환경분야에서의 구체적인 목적에 맞추어 다양한 형태로 제조될 수 있다. 예를 들면 생체는 물론, 각종 장비, 기구의 세척을 위해, 슈도모나스 에루기노사의 성장, 집락화, 분열의 예방, 제어, 억제, 및/또는 조절에 유효한 양의 박테리오파아지를 포함하는 액체형태, 분무형태 또는 고체형태로 제조될 수 있으며, 목적에 따라 추가의 성분 예를 들면 이로 제한하는 것은 아니나, 계면활성제, 세정제, 제균제, 살균제, 항생제, 곰팡이제거제, 산도조절제, 염료, 색소와 같은 것을 포함할 수 있다. Compositions comprising the bacteriophage of the present invention can be prepared in a variety of forms to meet specific needs in the home, industrial, medical, and environmental fields. For example, in liquid form, including spraying, spraying, spraying, spraying, spraying, spraying, spraying, spraying, spraying or spraying, in an amount effective to prevent, control, inhibit, and / or control the growth, colonization and division of Pseudomonas aeruginosa, And may contain additives such as a surfactant, a detergent, a disinfectant, a bactericide, an antibiotic, a fungicide, an acidity regulator, a dye, and a pigment, depending on the purpose. can do.

한 구현예에서 본원의 박테리오파아지를 포함하는 슈도모나스 에루기노사의 성장, 분열, 집락화의 조절, 제어, 억제 및/또는 생물막 형성의 방지 또는 저해생물막 형성 방지 또는 저해제를 위한 조성물의 경우, 이러한 용도에 효과적인 양의 박테리오파아지를 포함하는 수용액 또는 현탁액으로 제조될 수 있다. 다른 구현예에서는 파우더, 코팅제, 스프레이, 분배형타입, 액체에 투입할 수 있는 캡슐/타블릿형태 등으로 제조될 수 있다. 이들 조성물은 음이온성, 비이온성, 양쪽 이온성 및 생물학적 계면활성제 및 이들의 혼합물과 같은 계면활성제를 추가로 포함할 수 있다.In one embodiment, in the case of a composition for controlling, controlling, inhibiting and / or preventing biofilm formation or inhibiting biofilm formation or inhibiting growth, division, colonization of Pseudomonas aeruginosa comprising the bacteriophage of this invention, An aqueous solution or suspension containing an effective amount of a bacteriophage. In other embodiments, it can be made in powder, coating, spray, dispense type, capsule / tablet form that can be dispensed into liquid. These compositions may further comprise a surfactant such as anionic, nonionic, amphoteric and biological surfactants and mixtures thereof.

다른 구현예에서는 개인위생용품, 예를 들면, 컨택렌즈 소독약, 비누, 샤워젤, 샴푸, 또는 치아, 인공치아 또는 구강의 세정, 세척을 위한 치실, 치약, 치분 또는 가글링 세정제의 형태로 제조될 수 있다. Other embodiments may be made in the form of personal hygiene articles, for example contact lens disinfectants, soaps, shower gels, shampoos, or dental floss, toothpaste, dentifrices or gagging detergents for cleaning, cleaning, have.

다른 구현예에서 의학용 장비/기구/설비의 세정, 세척을 위한 파우더, 코팅제, 스프레이, 물수건(wipe) 형태로 제조될 수 있다. In another embodiment it may be prepared in the form of a powder, coating, spray, wipe for cleaning, cleaning of medical equipment / apparatus / facilities.

다른 구현예에서, 본원의 박테리오파아지를 포함하는 생물막 형성 방지 또는 저해제는 식품가공, 수(water)처리 장치와 같은 산업환경에서 사용될 수 있으며, 첨가제, 액체, 코팅제의 형태로 제조될 수 있다. 첨가제로 제조될 경우, 수관, 쿨링타워, 열교환기에 사용될 수 있다.
In other embodiments, biofilm formation inhibitors or inhibitors comprising the bacteriophages herein may be used in industrial environments such as food processing, water treatment devices, and may be prepared in the form of additives, liquids, and coatings. When manufactured with additives, it can be used in water pipes, cooling towers, heat exchangers.

다른 측면에서 본원은 또한 본원에 따른 박테리오파아지를 포함하는 약학적 조성물에 관한 것이다. 본원에 따른 박테리오파아지는 슈도모나스 에루기노사를 특이적으로 사멸시키므로, 이에 의해 유발되는 각종 질환에 대한 치료, 증상의 경감, 예방 및/또는 억제에 유용하게 사용될 수 있다. 질환의 예로는, 슈도모나스 에루기노사에 의한 식중독, 염증, 폐혈증을 들 수 있다. 구체적으로 중이염, 낭포성 섬유증, 폐렴, 화상, 민성 상처감염 등을 포함하나 이에 국한되지 않는다.In another aspect, the present invention is also directed to a pharmaceutical composition comprising a bacteriophage according to the present invention. Since the bacteriophage according to the present invention specifically kills Pseudomonas aeruginosa, it can be usefully used for treatment, symptom relief, prevention and / or suppression of various diseases caused thereby. Examples of diseases include food poisoning caused by Pseudomonas aeruginosa, inflammation, and sepsis. But are not limited to, otitis media, cystic fibrosis, pneumonia, burns, fungal wound infections, and the like.

본원의 약학적 조성물에 포함되는 약제학적으로 허용되는 담체는 제제시에 통상적으로 이용되는 것으로서, 락토스, 덱스트로스, 수크로스, 솔비톨, 만니톨, 전분, 아카시아 고무, 인산 칼슘, 알기네이트, 젤라틴, 규산 칼슘, 미세결정성 셀룰로스, 폴리비닐피롤리돈, 셀룰로스, 물, 시럽, 메틸 셀룰로스, 메틸히드록시벤조에이트, 프로필히드록시벤조에이트, 활석, 스테아르산 마그네슘 및 미네랄 오일 등을 포함하나, 이에 한정되는 것은 아니다. 본 발명의 약제학적 조성물은 상기 성분들 이외에 윤활제, 습윤제, 감미제, 향미제, 유화제, 현탁제, 보존제 등을 추가로 포함할 수 있다.The pharmaceutically acceptable carriers to be included in the pharmaceutical composition of the present invention are those conventionally used in the present invention and include lactose, dextrose, sucrose, sorbitol, mannitol, starch, acacia rubber, calcium phosphate, alginate, gelatin, silicic acid But are not limited to, calcium, microcrystalline cellulose, polyvinylpyrrolidone, cellulose, water, syrup, methylcellulose, methylhydroxybenzoate, propylhydroxybenzoate, talc, magnesium stearate, It is not. The pharmaceutical composition of the present invention may further contain a lubricant, a wetting agent, a sweetening agent, a flavoring agent, an emulsifying agent, a suspending agent, a preservative, etc. in addition to the above components.

본 발명의 약학적 조성물은 질환 부위에의 도포 또는 분무하는 방법으로 이용할 수 있으며, 그 밖에 경구 투여 또는 비경구 투여를 통해 투여할 수도 있으며, 비경구 투여의 경우 정맥 내 투여, 복강 내 투여, 근육 내 투여, 피하 투여 또는 국부 투여를 이용하여 투여할 수도 있다.The pharmaceutical composition of the present invention can be used as a method of applying or spraying on a diseased site, or may be administered through oral administration or parenteral administration. In the case of parenteral administration, intravenous administration, intraperitoneal administration, Intravenous, subcutaneous, or local administration.

본 발명의 약학적 조성물의 적합한 도포, 분무 및 투여량은 제제화 방법, 투여 방식, 대상이 되는 동물 및 환자의 연령, 체중, 성, 질병 증상의 정도, 음식, 투여 시간, 투여 경로, 배설 속도 및 반응 감응성과 같은 요인들에 의해 다양하며, 보통으로 숙련된 의사나 수의사는 소망하는 치료에 효과적인 투여량을 용이하게 결정 및 처방할 수 있다. 일반적으로, 본 발명의 약학적 조성물은 약 1 × 105 내지 1 × 1015 PFU/ml의 농도로 투여될 수 있다. The appropriate application, spray and dose of the pharmaceutical composition of the present invention may vary depending on factors such as formulation method, administration method, age, body weight, sex, disease symptom level, food, administration time, administration route, And responsiveness, and the ordinarily skilled physician or veterinarian can readily determine and prescribe dosages effective for the desired treatment. In general, the pharmaceutical composition of the present invention may be administered at a concentration of about 1 × 10 5 to 1 × 10 15 PFU / ml.

본 발명의 약학적 조성물은 본 발명이 속하는 기술분야에서 통상의 지식을 가진 자가 용이하게 실시할 수 있는 방법에 따라, 약학적으로 허용되는 담체 및/또는 부형제를 이용하여 제제화 됨으로써 단위 용량 형태로 제조되거나 또는 다용량 용기 내에 내입시켜 제조될 수도 있다. 이때 제형은 오일 또는 수성 매질 중의 용액, 현탁액 또는 유화액 형태이거나 엑스제, 분말제, 과립제, 정제 또는 캅셀제 형태일 수도 있으며, 분산제 또는 안정화제를 추가적으로 포함할 수도 있다.
The pharmaceutical composition of the present invention may be formulated into pharmaceutically acceptable carriers and / or excipients according to a method which can be easily carried out by those skilled in the art, Or may be manufactured by penetrating into a multi-dose container. The formulations may be in the form of solutions, suspensions or emulsions in oils or aqueous media, or in the form of excipients, powders, granules, tablets or capsules, and may additionally contain dispersing or stabilizing agents.

다른 측면에서 본원은 또한 박테리오파아지를 유효성분으로 포함하는 항생제에 관한 것이다. 본원에서, '항생제’라는 방부제, 살균제 및 항균제를 포함하는 것이다. 본원의 항생제는 슈도모나스 에루기노사에 의해 유발되는 각종 질환의 예방, 치료, 증상의 경감, 억제에 사용될 수 있다. In another aspect, the invention also relates to an antibiotic comprising a bacteriophage as an active ingredient. In the present application, it is meant to include antiseptics, antiseptics, bactericides and antimicrobial agents. The antibiotic of the present invention can be used for prevention, treatment, alleviation and suppression of various diseases caused by Pseudomonas aeruginosa.

본원의 박테리오파아지는 기존 항생제에 비하여 슈도모나스 에루기노사에 대한 특이성이 매우 높은 장점을 갖고 있어, 유익한 균은 죽이지 않고 병원균인 슈도모나스만을 선택적으로 제거할 수 있어 부작용이 없는 항생제로서 매우 가치가 높다. 본 발명의 박테리오파아지를 항생 물질로 이용하게 되면 기존의 항생제를 이용하는 것과는 달리 병원균의 내성 내지 저항성(resistance)을 유도하지 않기 때문에 기존의 항생물질에 비하여 제품 수명주기가 긴 신규 항생제로서 이용될 수 있다. 즉 본원의 박테리오파아지를 유효성분으로 포함하는 항생제는 내성 문제를 근본적으로 해결할 수 있기에 그 만큼 항생제로서의 제품수명주기가 길어질 것으로 기대된다. The bacteriophage of the present invention has a very high specificity to Pseudomonas aeruginosa as compared to conventional antibiotics. Therefore, it is highly valuable as an antibiotic without side effects because it can selectively remove the pathogen Pseudomonas without killing beneficial bacteria. Use of the bacteriophage of the present invention as an antibiotic does not induce tolerance or resistance to pathogens, unlike existing antibiotics, and thus can be used as a new antibiotic with a longer product life cycle than conventional antibiotics . That is, antibiotics containing the bacteriophage of the present invention as an active ingredient can fundamentally solve the problem of resistance, so that the product life cycle as antibiotics is expected to be longer.

다른 측면에서 본원은 또한 본원의 박테리오파아지를 유효성분으로 포함하는 소독제에 관한 것이다. In another aspect, the present invention also relates to a disinfecting agent comprising the bacteriophage of the present application as an active ingredient.

본원의 박테리오파아지를 유효성분으로 포함하는 소독제는 특히 식중독 예방 등 식품위생에 그 활용가치가 높다. 식품산업에서 슈도모나스 오염 방지용 소독제 및 식품첨가제로 활용될 수 있으며 또한 축산업 분야에 활용될 수 있다. 또 생활하수처리장에서 방류수 내 슈도모나스 균 제거를 위한 살포에도 활용될 수 있으며 조리 장소 및 조리 설비, 위생시설의 장비, 의료시설 장비, 어린이집과 같은 공공장소의 시설, 장난감 등의 소독제로도 유용하게 사용될 수 있다.
Disinfectants containing the bacteriophage of the present invention as an active ingredient are particularly valuable for food hygiene such as food poisoning prevention. It can be used as food disinfectant and food additive for the prevention of pollution of Pseudomonas in the food industry and can also be used in the field of animal husbandry. In addition, it can be used for spraying Pseudomonas bacteria in effluents from domestic sewage treatment plants.It can also be used as a disinfectant for cooking places, cooking facilities, sanitary facilities, medical facilities, public facilities such as daycare centers, and toys. Can be.

또다른 측면에서 본원은 또한 본원의 박테리오파아지를 유효성분으로 포함하는 사료첨가제 및 음용수를 제공한다. 사람보다 가축에 들어가는 항생제가 더 많으며, 축산, 수산업에서 사용되는 사료 첨가용 항생제 사용량은 전체 항생제 판매량의 54%를 차지한다. 특히 예방 목적 항생제 투여는 내성균 발생 가능성을 높이며, 가축에 잔류하는 항생제는 사람에게 전달될 수 있는 문제가 있다. 항생제가 육류를 통해 인체에 흡수되면 항생제 내성을 유발해 질병의 확산을 부를 수도 있으며 다제 내성균 발생 확률이 높아진다. 본원에 따른 항생제는 기존의 항생제를 대체하여 사료첨가제용 항생물질로 사용될 수 있다. In another aspect, the present invention also provides a feed additive and drinking water comprising the bacteriophage of the present invention as an active ingredient. There are more antibiotics in livestock than humans, and the use of antibiotics in feed and livestock industry accounts for 54% of total antibiotic sales. In particular, administration of antibiotics for preventive purposes increases the possibility of producing resistant bacteria, and antibiotics remaining in livestock can be delivered to humans. If antibiotics are absorbed into human body through meat, they may cause antibiotic resistance and spread the disease and increase the probability of developing multidrug resistant bacteria. The antibiotics according to the present invention can be used as antibiotics for feed additives in place of conventional antibiotics.

본원의 사료첨가제는 건조 또는 액체 상태의 제제 형태일 수 있으며, 하나 또는 그 이상의 효소제제를 첨가할 수도 있다. 첨가되는 효소제제는 건조 또는 액체 상태 모두 가능하며 효소제제로는 리파제(lipase)와 같은 지방 분해효소, 파이트산(phytic acid)를 분해하여 인산염과 이노시톨인산염을 만드는 파이타제(phytase), 녹말과 글리코겐(glycogen) 등에 포함되어 있는 알파-1,4-글리코시드 결합(α-1,4-glycoside bond)을 가수분해하는 효소인 아밀라제(amylase), 유기인산에스테르를 가수분해하는 효소인 포스파타제(phosphatase), 셀룰로스(cellulose)를 분해하는 카르복시메틸셀룰라제(carboxymethylcellulase), 자일로스(xylose)를 분해하는 자일라나제(xylanase), 말토오스(maltose)를 두 분자의 글루코스(glucose)로 가수분해하는 말타제(maltase), 및 사카로스(saccharose)를 가수분해하여 글루코스-프럭토스(glucose-fructose) 혼합물을 만드는 전환효소(invertase) 등과 같은 당 생성 효소로 구성된 군으로부터 선택되어 사용될 수 있다. The feed additives herein may be in the form of dry or liquid form preparations, and one or more enzyme preparations may be added. Enzyme preparations can be added either in dry or liquid form. Enzyme preparations include lipolytic enzymes such as lipases, phytases that break down phytic acid to form phosphates and inositol phosphates, starches and glycogen ( amylase, an enzyme that hydrolyzes alpha-1,4-glycoside bonds in glycogen, phosphatase, an enzyme that hydrolyzes organic phosphate esters, Carboxymethylcellulase that breaks down cellulose, xylanase that breaks down xylose, and maltase that hydrolyzes maltose into two molecules of glucose. And sugar-producing enzymes such as invertase, which hydrolyzes saccharose to form a glucose-fructose mixture. It can be.

또한, 본원의 박테리오파아지를 포함하는 사료첨가제에는 비병원성의 다른 미생물이 추가로 첨가될 수 있다. 첨가될 수 있는 미생물로는 단백질 분해 효소, 지질 분해효소 및 당 전환 효소를 생산할 수 있는 바실러스 서브틸리스(Bacillus subtilis)와 같은 고초균, 소의 위와 같은 혐기적 조건에서 생리적 활성 및 유기물 분해능이 있는 락토바실러스 균주(Lactobacillus sp.), 가축의 체중을 증가시키며 우유의 산유량을 늘리고 사료의 소화 흡수율을 높이는 효과를 보여주는 예를 들면 아스퍼질러스 오리자에(Aspergillus oryzae)와 같은 사상균 및 사카로미세스 세레비지에(Saccharomyces cerevisiae)와 같은 효모가 사용될 수 있다. In addition, the feed additive comprising the bacteriophage of the present invention may be further supplemented with other non-pathogenic microorganisms. Examples of microorganisms that can be added include lactobacilli such as Bacillus subtilis capable of producing proteolytic enzymes, lipolytic enzymes and glycosyltransferases, lactobacilli having physiological activity and organic resolution at anaerobic conditions such as bovine, For example, Lactobacillus sp., Which increases the body weight of livestock and increases the milk yield of milk and increases the digestion rate of feed, such as Aspergillus oryzae, and Saccharomyces cerevisiae such as Aspergillus oryzae Yeast such as Saccharomyces cerevisiae may be used.

또한 각종 곡물 및 대두 단백을 비롯한 땅콩, 완두콩, 사탕무우, 펄프, 곡물 부산물, 동물 내장 가루 및 어분가루 등과 같은 사료원료는 가공되지 않거나 또는 가공된 것을 사용할 수 있다.
Feedstuffs such as peanuts, peas, beet pulp, pulp, grain by-products, animal-viscous powder, fish meal powder, etc., including various grains and soybean proteins, may be processed or processed.

또 다른 양태에서 본원에 따른 박테리오파아지를 이용한 슈도모나스 에루기노사에 의한 생물막 형성의 방지, 억제 또는 저해 방법에 관한 것이다. 본원의 박테리오파아지를 박테리아가 증식할 수 있는 또는 증식하고 있는 표면에 처리하여, 생물막의 형성을 미리 예방하거나, 또는 저해할 수 있다. 상기 박테리아와의 접촉은 물건의 표면을 본원의 방지 또는 저해제로 처리하는 것을 포함한다. 본원의 생물막 형성 방지 또는 저해제는 상기 언급한 바와 같이 목적하는 생물막 형성의 저해에 유효한 양으로 처리 될 수 있다. In another aspect, the present invention relates to a method for preventing, inhibiting or inhibiting biofilm formation by Pseudomonas aeruginosa using a bacteriophage according to the present invention. The bacteriophage of the instant application can be treated on the surface where the bacteria can grow or propagate to prevent or inhibit the formation of the biofilm in advance. Contact with the bacteria includes treating the surface of the article with an anti-proliferative or inhibitory agent of the present invention. The biofilm formation inhibitor or inhibitor herein may be treated in an amount effective to inhibit the formation of the desired biofilm as mentioned above.

상기 표면은 내부 및 외부의 표면을 모두 칭하는 것이며, 단단하거나(고상), 유연한 것을 모두 포함하는 것으로, 생체유래의 것은 물론, 가정, 산업, 환경, 의료 분야에서 사용되는 물건을 포함하는 것이다. 단단한 표면은 이로 제한하는 것은 아니나, 예를 들면 배수관, 글레이즈세라믹, 포설린, 유리, 금속, 나무, 크롬, 플라스틱, 비닐 및 포미카를 들 수 있다. 또한 고상 표면은 피부, 치아와 같은 생물체 유래 조직 또는 기관일 수 있다. 또한 상기 고상 표면은 의료용 물건 유래일 수 있다. 의료용 물건은 각종 의료용 설비, 장비, 기구, 임시 또는 영구용 인공삽입 보형물 예를 들면 렌즈, 인공판막, 페이스메이커, 수술용 핀, 삽입도관, 카테터 등을 일컫는 것이나, 이로 한정하는 것은 아니다.
The surface refers to both the inner and outer surfaces, and includes both hard (solid) and flexible ones, and includes objects used in the home, industrial, environmental, and medical fields as well as living bodies. Solid surfaces include, but are not limited to, drain pipes, glazed ceramics, floors, glass, metal, wood, chrome, plastic, vinyl and cellular. The solid surface may also be an organism-derived tissue or organ such as skin, teeth, or the like. The solid surface may also be derived from a medical article. Medical articles include, but are not limited to, various medical devices, equipment, instruments, temporary or permanent artificial implants such as lenses, prosthetic valves, pacemakers, surgical pins, insertion conduits, catheters, and the like.

이하, 본 발명을 하기의 실시예에 의해 상세히 설명한다. 단, 하기 실시예는 본 발명을 예시하는 것일 뿐, 본 발명의 내용이 하기 실시예에 의해 한정되는 것은 아니다.
Hereinafter, the present invention will be described in detail by the following examples. However, the following examples are illustrative of the present invention, and the contents of the present invention are not limited by the following examples.

본 발명은 달리 언급이 없는 한 세포생물학, 세포배양, 분자생물학, 유전자 형질전환 기술, 미생물학, DNA 재조합기술에 관한 당업자의 기술수준 내인 통상의 기술을 사용하여 실시될 수 있다. 또한 일반적인 기술에 관한 보다 자세한 설명은 Molecular Biotechnology: (Bernard et al., ASM press 1994); Molecular Cloning: A Laboratory Manual, 3rd Ed. (Sambrook et al., Harbor Laboratory Press 2001); Short Protocols in Molecular Biology, 4th Ed. (Ausubel et al. eds., John Wiley &Sons 1999); DNA Cloning, Volumes I and II (Glover ed., 1985)을 참고할 수 있다.
The present invention may be practiced using conventional techniques within the skill of those skilled in the art of cell biology, cell culture, molecular biology, gene transformation techniques, microbiology, DNA recombinant techniques, unless otherwise indicated. A more detailed description of common techniques can also be found in Molecular Biotechnology: (Bernard et al., ASM press 1994); Molecular Cloning: A Laboratory Manual, 3rd Ed. (Sambrook et al., Harbor Laboratory Press 2001); Short Protocols in Molecular Biology, 4th Ed. (Ausubel et al., Eds., John Wiley & Sons 1999); DNA Cloning, Volumes I and II (Glover ed., 1985).

실시예Example

실시예Example 1 균주의 배양조건 Culture conditions of 1 strain

슈도모나스 에루기노사 (ATCC 27853)을 숙주로 사용하였으며, LB(Luria-Bertani) 배지에서 37℃에서 진탕 배양하였다.
Pseudomonas aeruginosa (ATCC 27853) was used as a host and shaken at 37 ° C. in LB (Luria-Bertani) medium.

실시예Example 2  2 박테리오파아지의Bacteriophage 선별,  Selection, RFLPRFLP 및 서열 분석 And sequencing

슈도모나스 에루기노사를 감염하는 파아지를 선별하기 위해서 대한민국 전라남도 나주시 다도면 송학리에 위치한 송학제 저수지의 물을 채취하였다. 상기 채취한 물과 슈도모나스 에루기노사를 37℃에서 3 시간 진탕배양 한 후, 500rpm으로 20분간 원심분리하여 상등액을 회수하였다. 이어 상등액을 멸균된 막 필터(0.45μm)로 여과하였다. 여과한 시료를 이중 아가층 플라크 분석법(double agar layer plaque assay)을 사용하였다. 요약하면, 5 ml 윗층 (top) 아가에 상기 숙주 박테리아와 파아지 배양액을 0.1 MOI로 섞어 아가 플레이트에 붓고 37℃에서 24 시간 동안 배양하여 플라크를 수득하였다.Water was collected from Songhak Reservoir located in Songhak-ri, Dado-myeon, Naju-si, Jeollanam-do, Korea, in order to screen phages infected with Pseudomonas eruginosa. The sampled water and Pseudomonas aeruginosa were shaken at 37 ° C. for 3 hours, and centrifuged at 500 rpm for 20 minutes to recover the supernatant. The supernatant was then filtered through a sterile membrane filter (0.45 μm). A double agar layer plaque assay was used for the filtered samples. In summary, the host bacteria and phage cultures were mixed with 0.1 MOI in 5 ml top agar and poured into agar plates and incubated at 37 ° C. for 24 hours to obtain plaques.

이어 상기 박테리오파아지로부터 유전체에 대한 서열분석 및 RFLP 분석을 실시하였다. 200 ml LB 배지에 슈도모나스 에루기노사를 OD600=0.5까지 배양한 후, 여기에 여과한 박테리오파아지 109 PFU/ml 또는 0.1 MOI로 감염시켜 용균하였다. Subsequently, genome sequencing and RFLP analysis were performed from the bacteriophage. Pseudomonas aeruginosa was cultured in 200 ml of LB medium to OD 600 = 0.5, and then infected with 10 9 PFU / ml or 0.1 MOI of the filtered bacteriophage.

이 후 여기에 염화나트륨을 최종농도 1M이 되도록 추가한 후 4℃에 1시간 두었다. 이어 11000xg 에서 10분간 원심분리 한 후 침전물에 PEG (polyethylene glycol 8000)를 10% (w/v)로 넣고 4℃에 1시간 두었다. 이어 11000xg 에서 10분간 원심분리 한 후, 상층액을 제거하고, 침전물을 SM 완충액 (100mM NaCl, 10mM MgSO4(heptahydrate), 50mM Tris-HCl, pH 7.5)으로 현탁하였다. 여기에 클로로포름을 1:1의 비율로 넣고 볼텍스한 후 3000xg으로 15분간 원심분리하여 상층액을 얻었다. 폴리카보네이트 시험관에 40% 글리세롤 3ml을 넣고, 이어 5% 글리세롤 4ml을 섞이지 않게 넣었다. 여기에 상기 준비한 파아지 시료를 넣고 4℃에서 15000xg로 1시간 원심분리하였다. 이어 상등액을 제거한 후 침전물을 SM 완충액으로 재현탁하였다. 박테리오파아지 유전체 DNA는 phage DNA isolation kit (Norgen biotek corp.)를 제조사의 방법대로 사용하여 분리하였다. Thereafter, sodium chloride was added to a final concentration of 1 M and then placed at 4 ° C for 1 hour. After centrifugation at 11000xg for 10 minutes, PEG (polyethylene glycol 8000) was added to the precipitate at 10% (w / v) for 1 hour at 4 ° C. After centrifugation at 11000xg for 10 minutes, the supernatant was removed, and the precipitate was suspended in SM buffer (100 mM NaCl, 10 mM MgSO 4 (heptahydrate), 50 mM Tris-HCl, pH 7.5). To this was added chloroform at a ratio of 1: 1, vortexed, and centrifuged at 3000xg for 15 minutes to obtain supernatant. 3 ml of 40% glycerol was added to a polycarbonate test tube, followed by 4 ml of 5% glycerol. The prepared phage sample was added thereto and centrifuged at 15000 × g for 1 hour at 4 ° C. The supernatant was then removed and the precipitate was resuspended in SM buffer. Bacteriophage genomic DNA was isolated using phage DNA isolation kit (Norgen biotek corp.) According to manufacturer's instructions.

RFLP (restriction length polymorphism) 분석을 위해 상기와 같이 분리된 유전체를 BamH I, Hind III, EcoR V 제한효소를 이용하여 절단한 후 0.8% 아가로즈 젤로 전기영동하여 절단 양상을 조사하였다. 결과는 도 2에 기재되어 있다. For the analysis of restriction length polymorphism (RFLP), the isolated genome was digested with BamH I, Hind III, and EcoR V restriction enzymes, followed by electrophoresis with 0.8% agarose gel. The results are described in FIG.

상기와 같이 분리된 총 유전체에 대한 염기서열을 분석하였다. 서열분석은 샷건 (shotgun) 클로닝을 통해 무작위 서열분석 결과를 조합하여 수행하였다((주) 마크로젠, Roche 454 차세대 유전체 분석기). The nucleotide sequence of the thus isolated total genome was analyzed. Sequence analysis was performed by combining shot sequence analysis with shotgun cloning (Macrogen, Roche 454 Next Generation Genome Analyzer).

수득한 서열에 대하여 서열비교 프로그램인 BLAST 서치를 한 결과 기존에 알려지지 않은 새로운 파이지임을 확인하였다(비교결과는 나타내지 않음). 유전체 분석 결과 총 길이 72,321 bp의 선형의 이중나선 DNA임을 확인하였(서열번호 1 참조)으며, PA26으로 명명하였다.
As a result of BLAST search, a sequence comparison program for the obtained sequence, it was confirmed that the sequence was a new sequence unknown to the existing sequence (the comparison result is not shown). Genomic analysis confirmed that the total length of 72,321 bp linear double helix DNA (see SEQ ID NO: 1), it was named PA26.

실시예Example 3 투과전자현미경을 이용한 바이러스 형태 분석  3 Analysis of virus type using transmission electron microscope

실시예 2에서 수득한 박테리오파아지의 형태를 분석하기 위하여, 염화세슘(CsCl) 밀도 구배법(밀도: 1.15g/ml, 1.45 g/ml,, 1.50 g/ml 및 1.70 g/ml)을 이용한 원심분리(38,000 rpm, 22시간, 4℃)를 통하여 박테리오파지를 정제한 다음 이를 formvar carbon film (200 mesh copper grids)에 떨어뜨린 후, 2% 유라닐 아세테이트(Uranyl acetate)로 염색(negative staining)하고 건조한 후 투과전자현미경 (LIBRA 120 Energy-Filtering Transmission Electron Microscope (Carl Zeiss))을 통하여 그 형태를 촬영하였다. To analyze the morphology of the bacteriophage obtained in Example 2, centrifugation using a cesium chloride (CsCl) density gradient method (density 1.15 g / ml, 1.45 g / ml, 1.50 g / ml and 1.70 g / ml) The bacteriophage was purified through separation (38,000 rpm, 22 hours, 4 ° C) and then dropped on formvar carbon film (200 mesh copper grids), followed by negative staining with 2% Uranyl acetate The shape was photographed through a transmission electron microscope (LIBRA 120 Energy-Filtering Transmission Electron Microscope (Carl Zeiss)).

결과는 도 1에 있다. 분리된 박테리오파지는 직경이 약 110nm인 20면체 머리 (icosahedral head)를 가지며 160nm의 긴 꼬리를 가진 형태학적 분류상 미오비리대 과 박테리오파아지 속하는 것으로 판단되었다.
The results are shown in Fig. The isolated bacteriophages were considered to belong to the Myobiridae and the bacteriophages with icosahedral heads with a diameter of about 110 nm and long tails of 160 nm.

실시예 4 Example 4 박테리오파아지Bacteriophage 구조 단백질 분석 Structural protein analysis

실시예 2에서 분리된 박테리오파아지 1010 PFU에 시료완충액 (SDS 10% w/v, 10 mM DTT, glycerol 20% v/v, 0.2M tris-HCl, pH 6.8, bromophenol blue 0.05%w/v) 4 ㎕를 혼합한 후, 3분간 끓이고, 12% SDS-PAGE 젤에 로딩하여 전기영동하고, 분리된 밴드는 쿠마시블루 (coomassie blue) G-250로 염색하여 가시화하였다. 결과는 도 3에 기재되어 있다. 분석 결과 PA26은 14개 정도의 단백질로 구성 되어있으며, 분자량은 15에서 130 kDa 범위이며, 가장 주가되는 단백질의 분자량은 65 kDa 이었다.
Sample buffer solution (SDS 10% w / v, 10 mM DTT, glycerol 20% v / v, 0.2M tris-HCl, pH 6.8, bromophenol blue 0.05% w / v) in 10 10 PFU of bacteriophage isolated in Example 2 After mixing 4 μl, it was boiled for 3 minutes, loaded onto a 12% SDS-PAGE gel, and electrophoresed, and the separated bands were visualized by staining with Coomassie blue G-250. The results are described in FIG. As a result of analysis, PA26 was composed of 14 proteins. The molecular weight ranged from 15 to 130 kDa, and the most important protein was 65 kDa.

실시예Example 5  5 박테리오파아지Bacteriophage 성장 및 흡착 특징 분석 Growth and adsorption characterization

슈도모나스 에루기노사를 OD600=0.5까지 배양한 후 0.1 MOI의 실시예 2에서 분리된 박테리오파아지로 감염하였다. 이 후 37℃에서 교반 배양하면서, 0, 5, 10, 20분 각각에서 시료를 채취하여 실시예 1에서 기술한 이중 아가층 플라크 분석법을 이용하여 박테리오파아지 수를 확인 하였다. Pseudomonas aeruginosa was cultured to OD 600 = 0.5 and then infected with the bacteriophage isolated in Example 2 of 0.1 MOI. Thereafter, while stirring and incubating at 37 ° C, samples were taken at 0, 5, 10, and 20 minutes, respectively, and the number of bacteriophage was confirmed using the double agar layer plaque assay described in Example 1.

결과는 도 4에 기재되어 있다. 흡착은 박테리오파아지가 숙주를 감염하기 위한 첫 단계로, 프리파아지 수가 5분이 지났을 때, 10% 미만이었고, 10분 후에는 1% 미만이었다. 따라서 5분내에 90% 이상의 빠른 흡착이 일어나는 것을 알 수 있다. The results are described in FIG. Adsorption was the first step for bacteriophage to infect the host, less than 10% when the number of prephages was more than 5 minutes and less than 1% after 10 minutes. Therefore, it can be seen that rapid adsorption of 90% or more occurs within 5 minutes.

원스텝 성장 분석은 슈도모나스 에루기노사를 OD600=0.5까지 배양한 후 까지 키운 후 0.1 MOI의 실시예 2에서 분리된 박테리오파아지로 감염하였다. 이어 37℃에서 5분간 박테리오파아지 흡착(adsorption)이 일어나도록 한 후 13000rpm으로 5분간 원심분리하여 프리 파아지를 제거하였다. 이 후 20 ml LB 배지로 침전물 현탁하고, 37℃에서 교반하면서 배양하였다. 이어 배양 중 시료를 5분 간격으로 2개씩 채취해서 그 중 하나는 클로로포름(1% v/v)을 처리하여 파아지 농도(phage titer)를 측정하였고, 다른 하나는 클로로포름을 처리하지 않고, 파아지 농도 (phage titer)를 측정하였다. 파아지 농도는 실시예 1에서 기술한 이중 아가층 플라크 분석법을 사용하여 수행하였다. One-step growth assays were incubated with Pseudomonas aeruginosa up to OD 600 = 0.5, followed by infection with bacteriophage isolated in Example 2 of 0.1 MOI. After allowing the bacteriophage adsorption to occur at 37 ° C for 5 minutes, the pre-phage was removed by centrifugation at 13000 rpm for 5 minutes. The precipitate was then suspended in 20 ml LB medium and incubated with stirring at 37 ° C. Subsequently, two samples were taken at 5 minute intervals during incubation, one of which was treated with chloroform (1% v / v) to measure phage titer, and the other was not treated with chloroform, and the phage concentration ( phage titer) was measured. Phage concentration was performed using the double agar layer plaque assay described in Example 1. [

원스텝성장 분석을 통해 PA26의 잠복기 소실기 (eclipse period) 및 파아지 방출 수(burst size) 를 확인하였다. 결과는 도 5에 기재되어 있다. PA-26의 소실기는 10분, 잠복기는 15분이었으며, 방출수는 252로 나타났다.
One-step growth analysis confirmed the eclipse period and burst size of PA26. The results are described in FIG. The disappearance of PA-26 was 10 minutes and the incubation time was 15 minutes, and the discharge number was 252.

실시예Example 6  6 박테리오파아지의Bacteriophage 온도 및  Temperature and pHpH 안정성 분석 Stability analysis

상이한 pH의 완충액 (2M sodium acetate pH3, 4, 5, 및 6; 2M Tris-Cl pH7, 8, 9; 2M glycine pH 10 및 11)을 준비하였다. 상기 완충액과 4 X 106PFU/ml의 파아지를 1:1의 비율로 혼합하여, 온도 및 pH에 대한 안정성을 분석하였다. Different pH buffers (2M sodium acetate pH3, 4, 5, and 6; 2M Tris-Cl pH7, 8, 9; 2M glycine pH 10 and 11) were prepared. The buffer and phages of 4 × 10 6 PFU / ml were mixed at a ratio of 1: 1 to analyze stability for temperature and pH.

온도에 대한 안정성 분석을 위해서는 상기와 같이 SM 완충액으로 희석한 파아지를 각 온도 (4℃, 37℃, 45℃, 55℃, 65℃, 80℃)에서 1시간 배양 하였다. 이 후 플라크 분석 (RIZVI S and MORA PT. 1963. Nature 200:1324-1325) 통하여 서로 다른 온도에서 PA26의 안정성을 확인하였다. 결과는 도 6의 (a)에 기재되어 있다. PA26은 4-37℃에서는 약 100%의 안정성을 보였으며. 45℃에서는 안정성이 약 30% 감소하였으며, 65℃ 이상에서는 99% 이상 감소하는 것으로 나타났다. For stability analysis on temperature, the phage diluted with SM buffer as described above was incubated for 1 hour at each temperature (4 ° C, 37 ° C, 45 ° C, 55 ° C, 65 ° C, 80 ° C). Subsequent plaque analysis (RIZVI S and MORA PT. 1963. Nature 200: 1324-1325) confirmed the stability of PA26 at different temperatures. The results are described in Figure 6 (a). PA26 showed about 100% stability at 4-37 ° C. Stability decreased by about 30% at 45 ° C and decreased by more than 99% above 65 ° C.

상기 각 완충액에서 파아지의 pH에 대한 안정성을 분석하였다. 결과는 도 6의 (b)에 있다. PA26은 pH 7에서 가장 안정함을 확인하였고, pH 6과 pH 8에서도 90% 이상 안정한 것을 확인하였다. 그 외의 pH에서는 파아지의 안정성이 40% 이상 감소함을 확인하였고 pH 3에서는 파아지가 관찰되지 않았다. The stability of phage to pH in each buffer was analyzed. The result is in FIG. 6 (b). PA26 was found to be the most stable at pH 7, and was found to be more than 90% stable at pH 6 and pH 8. At other pHs, the stability of the phage was reduced by more than 40%, and no phage was observed at pH 3.

슈도모나스 에루기노사의 성장 온도는 4-45℃ 이고 최적 온도는 37℃ 이며 최적 pH는 pH 7인 것을 고려할때 이 조건에서 본원의 파아지는 안정하다는 것을 나타낸다.
Considering that the growth temperature of Pseudomonas aeruginosa is 4-45 ° C., the optimum temperature is 37 ° C., and the optimum pH is pH 7, the phages of the present application are stable under these conditions.

실시예Example 7  7 박테리오파아지에On a bacteriophage 의한 슈도모나스  By Pseudomonas 에루기노사Eruginosa 성장억제 및  Growth inhibition and 생물막Biofilm 형성 억제 분석 Formation Inhibition Assay

박테리아에 의한 생물막 형성 억제효과는 기본적으로 Knezevic and Petrovic 논문(Knezevic and Petrovic, 2008, J Microbiol Methods. 74(2-3):114-8.)에 기재된 것과 동일하게 수행되었다. 요약하면, 96웰 플레이트에 슈도모나스 에루기노사를 1 X 106 CFU/ml로 접종 하였다. 이어 여기에 PA26 파아지를 다양한 100, 10-2 및 10-4 MOI로 감염시켰다. 대조군 웰의 경우파아지를 처리하지 않았다. 이어 플레이트를 37℃, 120 rpm으로 18시간 배양 하였다. 이 후 부유 세포는 제거하고 PBS (phosphate-buffered saline)로 각 웰을 2회 세척한 후, 공기 건조하였다. 이어 40 % 메탄올로 15분간 고정하고, 플레이트를 공기 건조한 후 0.4% 크리스탈 바이올렛 용액으로 15분간 염색하였다. 이어 흐르는 물로 세척한 후 공기 건조하고 33% 아세트산을 추가한 후 20분간 배양하였다. 생물막 형성 정도는 96 웰 플레이트 판독기 (ELISA reader, BioRad)를 이용하여 595 nm에서 흡광도를 측정하였다. 세번의 실험을 독립적으로 수행하여 평균값을 사용하였다. The inhibitory effect of biofilm formation by bacteria was basically performed in the same manner as described in Knezevic and Petrovic paper (Knezevic and Petrovic, 2008, J Microbiol Methods. 74 (2-3): 114-8.). In summary, 96 well plates were inoculated with Pseudomonas aeruginosa at 1 × 10 6 CFU / ml. PA26 phages were then infected with various 10 0 , 10 −2 and 10 −4 MOIs. Phage was not treated for control wells. The plates were then incubated at 37 ° C. and 120 rpm for 18 hours. Thereafter, the suspended cells were removed, and each well was washed twice with PBS (phosphate-buffered saline), followed by air drying. Then fixed for 15 minutes with 40% methanol, the plate was air dried and stained with 0.4% crystal violet solution for 15 minutes. Subsequently, the mixture was washed with running water, air dried, and incubated for 20 minutes after adding 33% acetic acid. The degree of biofilm formation was measured at 595 nm using a 96 well plate reader (ELISA reader, BioRad). Three experiments were performed independently to use the mean value.

박테리아의 성장억제 여부를 확인하기 위해서는 상기와 같이 각각의 MOI의 PA26으로 슈도모나스 에루기노사를 감염한 후 시간별로 OD를 측정하였다. 결과는 도 7에 기재되어 있다. 도 7에 나타난 바와 같이. PA26은 효과적으로 슈도모나스 에루기노사 특이적으로 이의 성장 및 생물막 형성을 효과적으로 저해하는 것으로 나타났다. 도 7에 나타난 바와 같이, MOI 0.01 이상에서는 95% 이상의 생물막 형성을 억제하는 것으로 나타났다. In order to confirm the growth inhibition of bacteria, as described above, after infection with Pseudomonas aeruginosa with PA26 of each MOI, OD was measured by time. The results are described in FIG. As shown in FIG. 7. PA26 has been shown to effectively inhibit Pseudomonas aeruginosa specifically its growth and biofilm formation. As shown in FIG. 7, it was shown that the MOI 0.01 or more inhibits the biofilm formation of 95% or more.

또한 슈도모나스 에루기노사 ATCC 15522, ATCC 10145, ATCC 9027, ATCC 25619, ATCC 13388, 및 ATCC 15692에 대하여도 위와 같이 감염실험을 수행하였다 결과는 표 1에 기재되어 있다. PA26은 ATCC 15522를 제외한 실험대상 모든 슈도모나스 strain에 감염할 수 있는 넓은 숙주범위를 가진다는 것을 나타낸다. Pseudomonas aeruginosa ATCC 15522, ATCC 10145, ATCC 9027, ATCC 25619, ATCC 13388, and ATCC 15692 were also performed as described above. The results are shown in Table 1. PA26 shows a broad host range capable of infecting all Pseudomonas strains except ATCC 15522.

슈도모나스 에루기노사 Pseudomonas Eruginosa 감염도Infection degree ATCC 15522ATCC 15522 -- ATCC 10145ATCC 10145 ++ ATCC 27853ATCC 27853 ++ ATCC 9027ATCC 9027 ++ ATCC 25619ATCC 25619 ++ ATCC 13388ATCC 13388 ++ ATCC 15692ATCC 15692 ++

서열목록 전자파일 첨부Attach an electronic file to a sequence list

Claims (10)

도 2의 제한효소단편길이다형성 (RFLP) 패턴 또는 서열번호 1의 서열을 갖는 박테리오파아지로, 상기 박테리오파아지는 슈도모나스 에루기노사에 대한 융해능을 갖는, 박테리오파아지.
A bacteriophage having a restriction enzyme fragment length polymorphism (RFLP) pattern of FIG. 2 or a sequence of SEQ ID NO: 1, wherein the bacteriophage has a melting ability against Pseudomonas aeruginosa.
제 1 항에 있어서, 상기 슈도모나스 에루기노사는 미국세포주은행 (ATCC) 10145, 미국세포주은행 (ATCC) 27853, 미국세포주은행 (ATCC) 9027, 미국세포주은행 (ATCC) 25619, 미국세포주은행 (ATCC) 13388, 또는 미국세포주은행 (ATCC) 15692인, 박테리오파아지.
The method of claim 1, wherein the Pseudomonas aeruginosa US Cell Line Bank (ATCC) 10145, US Cell Line Bank (ATCC) 27853, US Cell Line Bank (ATCC) 9027, US Cell Line Bank (ATCC) 25619, US Cell Line Bank (ATCC) 13388 Or bacteriophage, which is the American Cell Line Bank (ATCC) 15692.
제 1 항에 따른 박테리오파아지의 프로지니(progeny)로, 상기 박테리오파아지와 동일한 생물학적 특성을 나타내는, 프로지니 박테리오파아지.
Progeny of the bacteriophage according to claim 1, which exhibits the same biological properties as the bacteriophage.
제 1 항에 있어서, 상기 박테리오파아지는 한국미생물보존센터에 2012년 6월13일자로 기탁번호 KFCC11533P로 기탁된 것인, 박테리오파아지.
The bacteriophage according to claim 1, wherein the bacteriophage has been deposited with the Korea Microorganism Conservation Center under the accession number KFCC11533P as of June 13, 2012.
삭제delete 제 1 항 내지 제 4 항 중 어느 한 항에 따른 박테리오파아지를 포함하는 항생제.
An antibiotic comprising the bacteriophage according to any one of claims 1 to 4.
제 1 항 내지 제 4 항 중 어느 한 항에 따른 박테리오파아지를 포함하는 사료첨가제.
Feed additive comprising a bacteriophage according to any one of claims 1 to 4.
제 1 항 내지 제 4 항 중 어느 한 항에 따른 박테리오파아지를 포함하는 소독제.
Disinfectant comprising a bacteriophage according to any one of claims 1 to 4.
제 1 항 내지 제 4 항 중 어느 한 항에 따른 박테리오파아지를 포함하는 생물막 형성 방지 또는 저해제.
An agent for preventing or inhibiting biofilm formation comprising the bacteriophage according to any one of claims 1 to 4.
제 9 항에 따른 생물막 형성 방지 또는 저해제를 슈도모나스 에루기노사와 접촉하는 단계를 포함하는 생물막 형성 저해 또는 억제 방법. 10. A method for inhibiting or inhibiting biofilm formation, comprising contacting a biofilm formation preventing or inhibitor according to claim 9 with Pseudomonas aeruginosa.
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