KR101372363B1 - Method for Screening Anti-Viral Agents - Google Patents

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Abstract

본 발명은 항바이러스제 스크리닝 방법에 관한 것으로, 보다 상세하게는, 다음의 단계를 포함하는 항바이러스제의 스크리닝 방법이다: (a) 형광단백질을 인코딩하는 뉴클레오타이드 서열을 포함하는 식물바이러스로 감염된 바이러스-감염 식물체를 제조하는 단계; (b) 상기 바이러스-감염 식물체에 분석대상의 시료를 처리하는 단계; 및 (c) 상기 시료가 처리된 바이러스-감염 식물체에서 상기 형광단백질로부터 발생되는 형광 시그널을 측정하는 단계; 상기 시료가 처리되지 않은 대조군과 비교하여, 상기 형광단백질로부터 발생되는 형광 시그널이 감소되는 것으로 측정된 경우에는 상기 시료는 항바이러스제로 판정된다. 종래의 기술과 비교하여, 본 발명의 항바이러스제 스크리닝 방법은 다수의 시료를 동시에 신속하게 검정 할 수 있다.The present invention relates to a method for screening an antiviral agent, and more particularly, to a method for screening an antiviral agent comprising the following steps: (a) a virus-infected plant infected with a plant virus comprising a nucleotide sequence encoding a fluorescent protein Preparing a; (b) treating the sample of analysis to the virus-infected plant; And (c) measuring a fluorescence signal generated from the fluorescent protein in the virus-infected plant treated with the sample; The sample is determined to be an antiviral agent when it is determined that the fluorescence signal generated from the fluoroprotein is reduced compared to the untreated control sample. Compared with the prior art, the antiviral screening method of the present invention can rapidly assay multiple samples simultaneously.

Description

항바이러스제 스크리닝 방법{Method for Screening Anti-Viral Agents}Method for Screening Anti-Viral Agents

본 발명은 항바이러스제 스크리닝 방법에 관한 것이다.
The present invention relates to antiviral screening methods.

식물바이러스는 전 세계적으로 약 1,200여종 이상이 분리 보고되어 있으며, 이들 중 상당수가 농작물에 경제적인 피해를 주고 있다. 특히, 국내에서는 1998년 수박에 발생한 CGMMV(Cucumber Green Mottle Mosaic Tobamovirus)에 의해 전국적으로 463 ha(Choi, 2001) 및 500여 억원의 경제적 피해를 입었고, CMV(Cytomegalovirus) 등의 바이러스에 의해 고추에 매년 300여 억원의 피해가 발생하고 있다. 또한, 벼에서는 RSV(Respiratory syncytial virus, Lee et al ., 2008)가 2001년 경기, 강화지역의 약 4,663 ha, 2007년 전북 부안, 충남 서천 지역의 약 5,000 ha에서 발생하여 수량에 막대한 피해를 초래하는 등 바이러스로 인한 경제적 피해가 전국적으로 크게 확산되고 있다. 이러한 바이러스의 직접적인 방제수단이 없기 때문에 피해확산 저지에 많은 어려움이 있어 새로운 식물바이러스 방제제 개발에 많은 연구자들이 노력을 하고 있다. 그러나 이러한 새로운 식물바이러스 방제제 개발은 물질 개발도 힘들지만, 개발된 물질에 대한 효과를 검정하는데도 많은 시간이 소요하게 되어 상용화되기 까지 많은 시간과 노동이 필요하다.
More than 1,200 plant viruses have been reported worldwide, many of them causing economic damage to crops. In particular, Korea suffered economic damage of 463 ha (Choi, 2001) and KRW 50 billion nationwide by CGMMV (Cucumber Green Mottle Mosaic Tobamovirus), which occurred in watermelon in 1998, and annually in peppers caused by viruses such as CMV (Cytomegalovirus). More than 30 billion won is incurred. In rice, RSV (Respiratory syncytial virus, Lee et al . (2008), which occurred at about 4,663 ha in Gyeonggi, Ganghwa, and 5,000 ha in 2007, in Buan, Jeonbuk, and Seocheon, South Chungcheong Province, caused huge damages in yield. . Since there is no direct control of such viruses, many researchers are trying to develop new plant virus control agents because of the difficulty in preventing the spread of damage. However, while the development of new plant virus control agents is difficult to develop materials, it also takes a lot of time and labor to commercialize the effects on the developed materials.

본 명세서 전체에 걸쳐 다수의 논문 및 특허문헌이 참조되고 그 인용이 표시되어 있다. 인용된 논문 및 특허문헌의 개시 내용은 그 전체로서 본 명세서에 참조로 삽입되어 본 발명이 속하는 기술 분야의 수준 및 본 발명의 내용이 보다 명확하게 설명된다.
Numerous papers and patent documents are referenced and cited throughout this specification. The disclosures of the cited papers and patent documents are incorporated herein by reference in their entirety to better understand the state of the art to which the present invention pertains and the content of the present invention.

본 발명자들은 병원성을 나타내는 식물 바이러스를 방제하기 위한 신속한 스크리닝 방법을 개발하고자 노력하였다. 그 결과, 본 발명자들은 형광단백질을 인코딩하는 뉴클레오타이드 서열을 포함하는 식물바이러스로 감염된 바이러스-감염 식물체를 이용한 항바이러스제의 스크리닝 방법을 구축함으로써 본 발명을 완성하였다.The inventors have sought to develop a rapid screening method for controlling pathogenic plant viruses. As a result, the present inventors completed the present invention by constructing a method for screening an antiviral agent using a virus-infected plant infected with a plant virus comprising a nucleotide sequence encoding a fluorescent protein.

따라서, 본 발명의 목적은 항바이러스제의 스크리닝 방법을 제공하는 데 있다.
Accordingly, it is an object of the present invention to provide a method for screening an antiviral agent.

본 발명의 다른 목적 및 이점은 하기의 발명의 상세한 설명, 청구범위 및 도면에 의해 보다 명확하게 된다.
Other objects and advantages of the present invention will become more apparent from the following detailed description of the invention, claims and drawings.

본 발명의 일 양태에 따르면, 본 발명은 다음의 단계를 포함하는 항바이러스제의 스크리닝 방법을 제공한다:According to one aspect of the invention, the invention provides a method for screening an antiviral agent comprising the following steps:

(a) 형광단백질을 인코딩하는 뉴클레오타이드 서열을 포함하는 식물바이러스로 감염된 바이러스-감염 식물체를 제조하는 단계;(a) preparing a virus-infected plant infected with a plant virus comprising a nucleotide sequence encoding a fluorescent protein;

(b) 상기 바이러스-감염 식물체에 분석대상의 시료를 처리하는 단계; 및(b) treating the sample of analysis to the virus-infected plant; And

(c) 상기 시료가 처리된 바이러스-감염 식물체에서 상기 형광단백질로부터 발생되는 형광 시그널을 측정하는 단계; 상기 시료가 처리되지 않은 대조군과 비교하여, 상기 형광단백질로부터 발생되는 형광 시그널이 감소되는 것으로 측정된 경우에는 상기 시료는 항바이러스제로 판정된다.
(c) measuring a fluorescence signal generated from the fluoroprotein in the virus-infected plant treated with the sample; The sample is determined to be an antiviral agent when it is determined that the fluorescence signal generated from the fluoroprotein is reduced compared to the untreated control sample.

본 발명자들은 병원성을 나타내는 식물 바이러스를 방제하기 위한 신속한 스크리닝 방법을 개발하고자 노력하였다. 그 결과, 본 발명자들은 형광단백질을 인코딩하는 뉴클레오타이드 서열을 포함하는 식물바이러스로 감염된 바이러스-감염 식물체를 이용한 항바이러스제의 스크리닝 방법을 구축하였다.
The inventors have sought to develop a rapid screening method for controlling pathogenic plant viruses. As a result, the inventors have established a method for screening antiviral agents using virus-infected plants infected with plant viruses comprising nucleotide sequences encoding fluorescent proteins.

이하에서, 본 발명의 스크리닝 방법을 각 단계에 따라 상세히 설명한다.Hereinafter, the screening method of the present invention will be described in detail for each step.

단계 (a): 바이러스-감염 식물체의 제조 Step (a): Preparation of Virus-Infected Plant

본 발명의 주요한 특징 중 하나는 형광단백질을 인코딩하는 뉴클레오타이드 서열을 포함하는 식물바이러스로 감염된 바이러스-감염 식물체를 제조한다.One of the main features of the present invention is the preparation of virus-infected plants infected with plant viruses comprising nucleotide sequences encoding fluorescent proteins.

본 명세서에서 용어 ‘형광단백질’은 GFP(Green Fluorescent Protein), RFP(Red Fluorescent Protein), CFP(Cyan Fluorescent Protein), YFP(Yellow Fluorescent Protein), BFP(Blue Fluorescent Protein), EGFP(Enhanced Green Fluorescent Protein), ECFP(Enhanced Cyan Fluorescent Protein), EYFP(Enhanced Yellow Fluorescent Protein), ERFP(Enhanced Red Fluorescent Protein) 또는 EBFP(Enhanced Blue Fluorescent Protein)이다.As used herein, the term 'fluorescent protein' refers to Green Fluorescent Protein (GFP), Red Fluorescent Protein (RFP), Cyan Fluorescent Protein (CFP), Yellow Fluorescent Protein (YFP), Blue Fluorescent Protein (BFP), Enhanced Green Fluorescent Protein (EGFP). ), Enhanced Cyan Fluorescent Protein (ECFP), Enhanced Yellow Fluorescent Protein (EYFP), Enhanced Red Fluorescent Protein (ERFP), or Enhanced Blue Fluorescent Protein (EBFP).

본 발명의 바람직한 구현예에 따르면, 상기 형광단백질은 GFP(Green Fluorescent Protein)이다.According to a preferred embodiment of the present invention, the fluorescent protein is GFP (Green Fluorescent Protein).

바람직하게는, 본 발명의 스크리닝 방법에 이용할 수 있는 식물 바이러스는 TMV(Tobacco mosaic virus), PepMoV(Pepper mottle virus), BBWV(3 strains BBWV-1, BBWV-2, BBWV-3; Broad bean wilt virus), BCMV(Bean common mosaic virus), ButMV(Butterbur mosaic virus), BYMV(bean yellow mosaic virus), CarMV(Carnation mottle virus), ChYNMV(Chinese yam necrotic mosaic virus), CLV(Carnation latent virus), CMV(Cucumber mosaic virus), CVB(Chrysanthemum virus B), CymMV(Cymbidium mosaic virus), DVS(Daphne virus S), GarLV(Garlic latent virus), GarV(Garlic allexivirus), KLV(Kalanchoe latent virus), LacRSV(Lilac ringspot virus), LSV(Lily symptomless virus), LYSV(leek yellow stripe virus), NeLV(Nerine latent virus), NLV(Narcissus latent virus), OFV(Orchid fleck virus), ORSV(Odontoglossum ringspot virus), PeMoV(Peanut mottle virus), PepMoV(Pepper mottle virus), PVM(Potato virus M), PVS(Potato virus S), SLV(Shallot latent virus) 또는 TRV(Tobacco rattle virus)이고, 보다 바람직하게는, TMV(Tobacco Mosaic Virus) 또는 PepMoV(Pepper Mottle Virus)이다.Preferably, the plant virus that can be used in the screening method of the present invention is Tobacco mosaic virus (TMV), Pepper mottle virus (PepMoV), BBWV (3 strains BBWV-1, BBWV-2, BBWV-3; Broad bean wilt virus ), Bean common mosaic virus (BCMV), Butterbur mosaic virus (BMV), bean yellow mosaic virus (BYMV), Carnation mottle virus (CarMV), Chinese yam necrotic mosaic virus (ChYNMV), Carnation latent virus (CLV), CMV ( Cucumber mosaic virus), Chrysanthemum virus B (CVB), Cymbidium mosaic virus (CymMV), Daphne virus S (DVS), Garlic latent virus (GarLV), Garlic allexivirus (GarV), Kalanchoe latent virus (KLV), and LalacRSpot (Lilac ringspot) virus), LSV (Lily symptomless virus), LYSV (leek yellow stripe virus), NeLV (Nerine latent virus), NLV (Narcissus latent virus), OFV (Orchid fleck virus), ORSV (Odontoglossum ringspot virus), PeMoV (Peanut mottle) virus), PepMoV (Pepper mottle virus), PVM (Potato virus M), PVS (Potato virus S), SLV (Shallot latent virus) or TRV (Tobacco rattle virus), more preferred It is a TMV (Tobacco Mosaic Virus) or PepMoV (Pepper Mottle Virus).

본 발명의 형광단백질을 인코딩하는 뉴클레오타이드 서열을 포함하는 식물바이러스를 식물체에 감염시켜 바이러스-감염 식물체를 제조한다.A plant virus comprising a nucleotide sequence encoding the fluorescent protein of the present invention is infected with a plant to prepare a virus-infected plant.

본 명세서에서, 용어 ‘식물체’는 성숙한 식물뿐만 아니라 성숙한 식물로 발육할 있는 식물 세포, 식물 조직, 식물 기관(예컨대, 식물의 잎) 및 식물의 종자 등을 모두 포함하는 의미로서 이해된다.As used herein, the term “plant” is understood as including all plant cells, plant tissues, plant organs (eg, leaves of plants), seeds of plants, and the like that can develop into mature plants.

바람직하게는, 상기 식물체는 담배 속(Nicotiana spp.), 아시네타 속(Acineta spp.), 나도풍란(Aerides japonicum), 마늘(Allium sativum), 땅콩(Arachis hypogaea), 아란세라 속(Aranthera spp.), 새우란(Calanthe discolor), 고추(Capsicum annuum), 카틀레야 속(Cattleya spp.), 명아주(Chenopodium amaranticolor), 국화(Chrysanthemum morifolium), 크로커스 속(Crocus spp.), 심비디움 속(Cymbidium spp.), 천리향(Daphne odora), 덴드로비움 속(Dendrobium spp.), 카네이션(Dianthus caryophyllus), 마(Dioscorea oposita cultivars), 도리테높시스 속(Doritaenopsis spp.), 에피덴드럼 속(Epidendrum spp.), 글라디올러스(Gladiolus hybridus), 글라마토필럽 속(Grammatophyllum spp.), 칼랑코에(Kalanchoe blossfeldiana), 백합 속(Lilium spp.), 리카스테 속(Lycaste spp.), 토마토(Lycopersicon esculentum), 수선화 속(Narcissus spp.), 네린(Nerine bowdenii cultivars), 오돈토글로썸 속(Odontoglossum spp.), 머위(Petasites officinalis), 팔레높시스 속(Phalenopsis spp.), 포티나라 속(Potinara spp.), 감자(Solanum tuberosum), 라일락(Syringa vulgaris), 번행초(Tetragonia expansa), 반다 속(Vanda spp.), 잠두(Vicia faba), 동부(Vigna unguiculata) 또는 지고페타럼 속(Zygopetalum spp.)이고, 보다 바람직하게는 담배(Nicotiana) 속 식물체이며, 가장 바람직하게는, Nicotiana benthamiana Nicotiana tabacum 식물체이다.Preferably, the plant is Nicotiana spp., Acineta spp., Aerides japonicum ), garlic ( Allium sativum ), Peanut ( Arachis hypogaea), Aran in Serra (Aranthera spp.), shrimps field (Calanthe discolor ), pepper ( Capsicum annuum ), Cattleya spp., Chenopodium amaranticolor ), chrysanthemum ( Chrysanthemum morifolium ), Crocus spp., Cymbidium spp., Daphne odora ), Dendrobium spp., Carnation ( Dianthus) caryophyllus ), hippo ( Dioscorea oposita cultivars ), Doritaenopsis spp., Epidendrum spp., Gladiolus hybridus ), Grammatophyllum spp., Kalanchoe blossfeldiana ), Lilium spp., Lycaste spp., Tomato ( Lycopersicon esculentum ), Narcissus spp., Nerine bowdenii cultivars , Odontoglossum spp., Petasites officinalis ), Phalenopsis spp., Potinara spp., Potato ( Solanum) tuberosum ), lilac ( Syringa vulgaris ), Burntweed ( Tetragonia) expansa ), Vanda spp., Vicia faba ), Eastern ( Vigna unguiculata ) or genus Zygopetalum spp., more preferably Nicotiana genus plants, most preferably Nicotiana benthamiana And Nicotiana tabacum It is a plant.

바람직하게는, 상기 단계(b)의 식물체는 식물의 잎이고, 보다 바람직하게는 잎의 절편 디스크이다.Preferably, the plant of step (b) is a leaf of a plant, more preferably a leaf disc of leaf.

본 발명의 바람직한 구현예에 따르면, 외래 형광단백질을 발현하는 식물바이러스는 PepMoV의 지놈 서열에 형광단백질-코딩 뉴클레오타이드 서열이 인 프레임으로 삽입된 서열(참조: 도 11) 또는 TMV의 지놈 서열에 형광단백질-코딩 뉴클레오타이드 서열이 인 프레임으로 삽입된 서열을 이용하여 제작된다.According to a preferred embodiment of the present invention, the plant virus expressing a foreign fluorescent protein is a sequence in which the fluorescent protein-coding nucleotide sequence is inserted in-frame in the genome sequence of PepMoV (see FIG. 11) or the fluorescent protein in the genome sequence of TMV. -The coding nucleotide sequence is constructed using the sequence inserted in frame.

본 발명은 바이러스-감염 식물체를 제조하는데 있어, 상기 형광단백질을 인코딩하는 뉴클레오타이드 서열을 포함하는 식물바이러스를 식물체에 접종하는 직접 접종방법 뿐 아니라, 형광단백질을 인코딩하는 뉴클레오타이드 서열을 식물체에 도입하여 바이러스의 생성을 유도하고 이를 물리적 처리(예컨대, 그라이딩)하여 다른 식물체에 접종하는 간접방법을 포함한다.In the present invention, in the production of a virus-infected plant, a direct inoculation method of inoculating plants with a plant virus comprising the nucleotide sequence encoding the fluorescent protein, as well as a nucleotide sequence encoding the fluorescent protein to the plant to introduce the virus Indirect methods of inducing production and physical treatment (eg, grinding) to inoculate other plants.

상기 간접방법을 실시함에 있어서, 외래성 뉴클레오타이드 서열을 식물체에 도입하는 방법은 당업계에 일반적으로 공지된 방법(Methods of Enzymology, Vol. 153, 1987, Wu and Grossman 편집, Academic Press; 그 내용은 본 명세서에 참조로서 삽입된다)에 따라 실시될 수 있다. 외래성 폴리뉴클레오티드를 플라스미드나 바이러스 등과 같은 벡터 등의 운반체에 삽입하여 식물을 형질전환시킬 수 있고, 아그로박테리움 박테리아를 매개체로 사용할 수 있으며(Chilton 등, 1977, Cell 11:263:271; 그 내용은 본 명세서에 참조로서 삽입된다), 직접 외래성 폴리뉴클레오티드를 식물 세포내로 도입시켜 식물을 형질전환시킬 수 있다(Lorz 등, 1985, Mol. Genet. 199:178-182; 그 내용은 본 명세서에 참조로서 삽입된다). 예를 들어, T-DNA 부위를 포함하지 않는 벡터를 이용하는 경우에는 전기천공법(electroporation), 입자충격법(microparticle bombardment), 폴리에틸렌 글리콜 침전법(polyethylene glycol-mediated uptake)을 이용할 수 있다.
In carrying out the indirect method, a method of introducing an exogenous nucleotide sequence into a plant is a method generally known in the art (Methods of Enzymology, Vol. 153, 1987, Wu and Grossman Edit, Academic Press; Is incorporated by reference). The exogenous polynucleotide can be inserted into a carrier such as a vector such as a plasmid or a virus to transform the plant, and Agrobacterium bacteria can be used as a medium (Chilton et al., 1977, Cell 11: 263: 271; Plants can be transformed by introducing foreign polynucleotides directly into plant cells (Lorz et al., 1985, Mol. Genet. 199: 178-182; the content of which is incorporated herein by reference). Inserted). For example, when a vector not containing a T-DNA region is used, electroporation, microparticle bombardment, and polyethylene glycol-mediated uptake may be used.

단계 (b): 시료의 처리 Step (b): Processing of Sample

본 발명의 방법에 따르면, 형광단백질을 인코딩하는 뉴클레오타이드 서열을 포함하는 식물바이러스로 감염된 바이러스-감염 식물체에 분석대상의 시료를 처리한다. According to the method of the present invention, a sample of analyte is treated to a virus-infected plant infected with a plant virus comprising a nucleotide sequence encoding a fluorescent protein.

본 명세서에서, 용어 ‘시료’는 식물바이러스의 감염성 또는 생존에 영향을 미치는 지 여부를 검사하기 위하여 스크리닝에서 이용되는 미지의 물질을 의미한다. As used herein, the term 'sample' refers to an unknown substance used in screening to test whether it affects the infectivity or survival of a plant virus.

상기 시료는 화학물질, 항체, 단백질, 펩타이드, 뉴클레오타이드, 안티센스-RNA, siRNA(small interference RNA) 및 천연물 추출물을 포함하나, 이에 한정되는 것은 아니다. 본 발명의 스크리닝 방법에 의해 분석되는 시료는 단일 화합물 또는 화합물들의 혼합물(예컨대, 세포 또는 조직 배양물)이다. 시료는 합성 또는 천연 화합물의 라이브러리로부터 얻을 수 있다. 이러한 화합물의 라이브러리를 얻는 방법은 당업계에 공지되어 있다. 합성 화합물 라이브러리는 Maybridge Chemical Co.(UK), Comgenex(USA), Brandon Associates(USA), Microsource(USA) 및 Sigma-Aldrich(USA)에서 상업적으로 구입 가능하며, 천연 화합물의 라이브러리는 Pan Laboratories(USA) 및 MycoSearch(USA)에서 상업적으로 구입 가능하다. 시료는 당업계에 공지된 다양한 조합 라이브러리 방법에 의해 얻을 수 있으며, 예를 들어, 생물학적 라이브러리, 공간 어드레서블 패러럴 고상 또는 액상 라이브러리(spatially addressable parallel solid phase or solution phase libraries), 디컨볼루션이 요구되는 합성 라이브러리 방법, “1-비드 1-화합물” 라이브러리 방법, 그리고 친화성 크로마토그래피 선별을 이용하는 합성 라이브러리 방법에 의해 얻을 수 있다. 분자 라이브러리의 합성 방법은, DeWitt et al., Proc . Natl . Acad . Sci . U.S.A. 90, 6909, 1993; Erb et al. Proc . Natl . Acad . Sci . U.S.A. 91, 11422, 1994; Zuckermann et al., J. Med . Chem . 37, 2678, 1994; Cho et al., Science 261, 1303, 1993; Carell et al., Angew . Chem . Int . Ed . Engl. 33, 2059, 1994; Carell et al., Angew . Chem . Int . Ed . Engl . 33, 2061; Gallop et al., J. Med. Chem . 37, 1233, 1994 등에 개시되어 있다.The sample includes, but is not limited to, chemicals, antibodies, proteins, peptides, nucleotides, antisense-RNAs, small interference RNAs (siRNAs), and natural extracts. The sample analyzed by the screening method of the present invention is a single compound or a mixture of compounds (eg, a cell or tissue culture). Samples can be obtained from libraries of synthetic or natural compounds. Methods for obtaining libraries of such compounds are known in the art. Synthetic compound libraries are commercially available from Maybridge Chemical Co., Comgenex (USA), Brandon Associates (USA), Microsource (USA) and Sigma-Aldrich (USA) ) And MycoSearch (USA). Samples can be obtained by a variety of combinatorial library methods known in the art, for example biological libraries, spatially addressable parallel solid phase or solution phase libraries, deconvolution required By a synthetic library method, a “1-bead 1-compound” library method, and a synthetic library method using affinity chromatography screening. Methods of synthesizing molecular libraries are described in DeWitt et al., Proc . Natl . Acad . Sci . USA 90, 6909, 1993; Erb et al. Proc . Natl . Acad . Sci . USA 91, 11422, 1994; Zuckermann et al., J. Med . Chem . 37, 2678, 1994; Cho et al., Science 261, 1303, 1993; Carell et al., Angew . Chem . Int . Ed . Engl. 33,2059,1994; Carell et al., Angew . Chem . Int . Ed . Engl . 33, 2061; Gallop et al., J. Med. Chem . 37, 1233, 1994, and the like.

본 발명의 분석대상의 시료를 형광단백질을 인코딩하는 뉴클레오타이드 서열을 포함하는 식물바이러스로 감염된 바이러스-감염 식물체에 처리하는 방법은 당업계에 공지된 다앙한 방법을 이용하여 실시될 수 있으며, 본 발명의 바람직한 구현예에 따르면, 형광단백질을 인코딩하는 뉴클레오타이드 서열을 포함하는 식물바이러스로 감염된 바이러스-감염 식물체를 절편 디스크로 절편화하여 분석대상의 시료를 포함하는 액체 배지[예컨대, MS(Murashige-Skoog's)]를 처리한다.The method of treating a sample of the analyte of the present invention to a virus-infected plant infected with a plant virus comprising a nucleotide sequence encoding a fluorescent protein may be carried out using various methods known in the art. According to a preferred embodiment, a virus-infected plant infected with a plant virus comprising a nucleotide sequence encoding a fluorescent protein is fragmented into a section disk to contain a liquid medium containing a sample of analysis (eg, MS (Murashige-Skoog's)]. To process

본 발명의 주요한 특징 중 하나는 형광단백질을 인코딩하는 뉴클레오타이드 서열을 포함하는 식물바이러스로 감염된 바이러스-감염 식물체를 절편 디스크로 절편화 하는 것이다. 식물체의 잎을 절편 디스크로 절편화 하는 경우, 다수의 시료를 신속하게 동시에 스크리닝 할 수 있다.
One of the main features of the present invention is the fragmentation of virus-infected plants infected with plant viruses comprising nucleotide sequences encoding fluorescent proteins into fragment disks. When the leaves of the plant are sliced into slice discs, multiple samples can be screened quickly and simultaneously.

단계 (c): 형광시그널의 측정 Step (c): Measurement of Fluorescence Signal

마지막으로, 본 발명의 분석대상의 시료가 처리된 형광단백질을 인코딩하는 뉴클레오타이드 서열을 포함하는 식물바이러스로 감염된 바이러스-감염 식물체로부터 발생되는 형광 시그널을 측정한다.Finally, the fluorescence signal generated from a virus-infected plant infected with a plant virus comprising a nucleotide sequence encoding the treated fluorescent protein of the sample of analysis of the present invention is measured.

바람직한 구현예에 따르면, 본 발명의 단계 (c)에서 형광시그널의 측정은 당업계에 공지된 다양한 방법을 이용하여 실시될 수 있으며, 가장 바람직하게는 형광현미경을 이용하여 실시한다.According to a preferred embodiment, the measurement of the fluorescent signal in step (c) of the present invention can be carried out using a variety of methods known in the art, most preferably using a fluorescence microscope.

본 발명의 분석대상의 시료가 처리된 형광단백질을 인코딩하는 뉴클레오타이드 서열을 포함하는 식물바이러스로 감염된 바이러스-감염 식물체로부터 발생되는 형광 시그널이 시료가 처리되지 않은 대조군과 비교하여, 상기 형광단백질로부터 발생되는 형광 시그널이 감소되는 것으로 측정된 경우에는 상기 시료는 항바이러스제로 판정된다.A fluorescent signal generated from a virus-infected plant infected with a plant virus comprising a nucleotide sequence encoding a fluorescent protein treated with a sample of the analyte of the present invention is generated from the fluorescent protein, compared to a control without the sample. If it is determined that the fluorescence signal is reduced, the sample is determined to be an antiviral agent.

본 명세서에서, 용어 ‘감소’는 시료가 처리되지 않은 대조군과 비교하여 시료가 처리된 형광단백질을 인코딩하는 뉴클레오타이드 서열을 포함하는 식물바이러스로 감염된 바이러스-감염 식물체로부터 발생되는 형광 시그널(예컨대, 통상적인 형광측정기를 이용한 측정한 형광 시그널의 세기)의 10-100% 감소이고, 바람직하게는, 30-100% 감소이며, 보다 바람직하게는 50-100% 감소이고, 가장 바람직하게는 80-100% 감소이다.
As used herein, the term 'decrease' refers to a fluorescence signal generated from a virus-infected plant that is infected with a plant virus that includes a nucleotide sequence that encodes a fluorescent protein to which the sample has been treated as compared to a control that has not been sampled (eg, conventional 10-100% reduction, preferably 30-100% reduction, more preferably 50-100% reduction, and most preferably 80-100% reduction). to be.

본 발명의 다른 양태에 따르면, 본 발명은 다음의 단계를 포함하는 항바이러스제의 스크리닝 방법을 제공한다:According to another aspect of the invention, the invention provides a method for screening an antiviral agent comprising the following steps:

(a) 식물체에 분석대상의 시료를 처리하는 단계;(a) processing a sample of analyte on a plant;

(b) 형광단백질을 인코딩하는 뉴클레오타이드 서열로 형질전환 되고 상기 형광단백질을 발현하는 식물바이러스를 상기 시료 처리된 식물체에 접종하는 단계; 및(b) inoculating the sample treated plant with a plant virus transformed with a nucleotide sequence encoding a fluorescent protein and expressing the fluorescent protein; And

(c) 상기 식물체에서 상기 형광단백질로부터 발생되는 형광 시그널을 측정하는 단계; 상기 시료가 처리되지 않은 대조군과 비교하여, 상기 형광단백질로부터 발생되는 형광 시그널이 감소되는 것으로 측정된 경우에는 상기 시료는 항바이러스제로 판정된다.(c) measuring the fluorescent signal generated from the fluorescent protein in the plant; The sample is determined to be an antiviral agent when it is determined that the fluorescence signal generated from the fluoroprotein is reduced compared to the untreated control sample.

본 발명의 방법은 상기 스크리닝 방법의 단계 (a) 및 단계 (b)의 순서를 달리한 방법으로, 이 둘 사이에 공통된 내용은 본 명세서의 과도한 복잡성을 피하기 위하여, 그 기재를 생략한다.
The method of the present invention is a method in which the steps of (a) and (b) of the screening method are reversed, and the contents common between the two are omitted in order to avoid excessive complexity of the present specification.

본 발명의 특징 및 이점을 요약하면 다음과 같다: The features and advantages of the present invention are summarized as follows:

(a) 본 발명은 항바이러스제 스크리닝 방법을 제공한다.(a) The present invention provides an antiviral screening method.

(b) 본 발명의 항바이러스제 스크리닝 방법은 다수의 시료를 동시에 신속하게 검정 할 수 있다.(b) The antiviral screening method of the present invention can rapidly assay multiple samples simultaneously.

(c) 본 발명의 항바이러스제 스크리닝 방법은 기존의 RT-PCR 방법과 비교하여 보다 경제적인 방법이다.
(c) The antiviral screening method of the present invention is more economical compared to the existing RT-PCR method.

도 1은 PepMoV-GFP를 접종한 N. tabacum cv. Samsun nn을 보여준다.
도 2는 PepMoV-GFP를 접종한 N. tabacum cv. Samsun nn의 대조군을 보여준다.
도 3는 0.2%, 0.4% 및 1% 농도의 월드스타에코의 PepMoV-GFP에 대한 항바이러스 활성을 확인한 결과를 보여준다.
도 4은 0.2%, 0.4% 및 1% 농도의 굿모닝의 PepMoV-GFP에 대한 항바이러스 활성을 확인한 결과를 보여준다.
도 5은 0.5%, 1.0% 및 2.0% 농도의 KN1020의 PepMoV-GFP에 대한 항바이러스 활성을 확인한 결과를 보여준다.
도 5는 0.2%, 0.4% 및 1% 농도의 각각 월드스타에코, 굿모닝 및 KN1020의 TMV-GFP에 대한 항바이러스 활성을 RT-PCR로 확인한 결과를 보여준다. 도 5a는 PepMoV 특이적인 프라이머를 이용한 RT-PCR 결과이고, 도 5b는 GFP 특이적인 프라이머를 이용한 RT-PCR 결과이다. 도 5a 및 도 5b의 M열은 1 kb 마커이고, 1열 내지 3열은 1.0%, 0.4% 및 0.2% 농도의 월드스타에코이며, 4열 내지 6열은 1.0%, 0.4% 및 0.2% 농도의 굿모닝이고, 7열 내지 9열은 2.0%, 1.0% 및 0.5% 농도의 KN1020에 대한 결과이다. ‘-’열 및 ‘+’열은 음성대조군 및 양성대조군을 나타낸다.
도 6은 TMV를 접종한 잎을 절편화한 항바이러스제 스크리닝 방법을 이미지화하여 보여준다.
도 7은 0.2%, 0.4% 및 1.0% 농도의 월드스타에코의 TMV-GFP에 대한 항바이러스 활성을 확인한 결과를 보여준다.
도 8은 0.2%, 0.4% 및 1.0% 농도의 굿모닝의 TMV-GFP에 대한 항바이러스 활성을 확인한 결과를 보여준다.
도 9는 0.2%, 0.4% 및 1% 농도의 KN1020의 TMV-GFP에 대한 항바이러스 활성을 확인한 결과를 보여준다.
도 10은 0.5%, 1.0% 및 2.0% 농도의 각각 월드스타에코, 굿모닝 및 KN1020의 TMV-GFP에 대한 항바이러스 활성을 RT-PCR로 확인한 결과를 보여준다.
도 11은 PepMoV-GFP(pSP6PepMoV-Vb1/GFP)의 벡터를 도식화하여 나타낸다. NIb는 Nuclear Inclusion b이고, CP는 Coat Protein이며, P1 및 P3은 Protein 1 및 Protein 3이고, HC-Pro는 Helper Component Protease이며, Cl은 Cylindrical Inclusion이고, Vpg는 'Viral protein linked to the genome'이며, Pro는 Protease이다.
도 12는 TMV-GFP의 벡터를 도식화하여 나타낸다. T7은 T7 프로모터이고, RdRP는 RNA-dependent RNA Polymerase이며, MP는 Movement Protein이고, CP는 Coat Protein이다.
1 shows N. tabacum cv. Inoculated with PepMoV-GFP. Show Samsun nn
Figure 2 is N. tabacum cv. Inoculated with PepMoV-GFP. Show control of Samsun nn.
Figure 3 shows the results confirming the antiviral activity against PepMoV-GFP of World Star Eco concentration of 0.2%, 0.4% and 1%.
4 shows the results of confirming antiviral activity against PepMoV-GFP of Good Morning at concentrations of 0.2%, 0.4% and 1%.
5 shows the results of confirming antiviral activity against PepMoV-GFP of KN1020 at concentrations of 0.5%, 1.0% and 2.0%.
Figure 5 shows the results confirmed by RT-PCR antiviral activity against TMV-GFP of World Star Eco, Good Morning and KN1020 at 0.2%, 0.4% and 1% concentration, respectively. FIG. 5A shows the results of RT-PCR using PepMoV specific primers, and FIG. 5B shows the results of RT-PCR using GFP specific primers. Columns M in FIGS. 5A and 5B are 1 kb markers, columns 1 to 3 are World Star Eco at 1.0%, 0.4% and 0.2% concentrations, and columns 4 to 6 are 1.0%, 0.4% and 0.2% concentrations. Good morning, and columns 7 to 9 are the results for KN1020 at 2.0%, 1.0% and 0.5% concentrations. Columns '-' and '+' indicate negative and positive controls.
Figure 6 shows the image of the antiviral screening method of sectioning leaves inoculated with TMV.
Figure 7 shows the results confirming the antiviral activity against TMV-GFP of World Star Eco concentration of 0.2%, 0.4% and 1.0%.
8 shows the results of confirming antiviral activity against TMV-GFP of Good Morning at concentrations of 0.2%, 0.4% and 1.0%.
9 shows the results of confirming antiviral activity against TMV-GFP of KN1020 at concentrations of 0.2%, 0.4% and 1%.
Figure 10 shows the results confirmed by RT-PCR antiviral activity against TMV-GFP of World Star Eco, Good Morning and KN1020 at concentrations of 0.5%, 1.0% and 2.0%, respectively.
Fig. 11 schematically shows a vector of PepMoV-GFP (pSP6PepMoV-Vb1 / GFP). NIb is Nuclear Inclusion b, CP is Coat Protein, P1 and P3 are Protein 1 and Protein 3, HC-Pro is Helper Component Protease, Cl is Cylindrical Inclusion, Vpg is 'Viral protein linked to the genome' , Pro is Protease.
12 shows a schematic of the vector of TMV-GFP. T7 is the T7 promoter, RdRP is the RNA-dependent RNA Polymerase, MP is the Movement Protein, and CP is the Coat Protein.

이하, 실시예를 통하여 본 발명을 더욱 상세히 설명하고자 한다. 이들 실시예는 오로지 본 발명을 보다 구체적으로 설명하기 위한 것으로, 본 발명의 요지에 따라 본 발명의 범위가 이들 실시예에 의해 제한되지 않는다는 것은 당업계에서 통상의 지식을 가진 자에 있어서 자명할 것이다.
Hereinafter, the present invention will be described in more detail with reference to Examples. It is to be understood by those skilled in the art that these embodiments are only for describing the present invention in more detail and that the scope of the present invention is not limited by these embodiments in accordance with the gist of the present invention .

실시예Example

실험 방법Experimental Method

항바이러스제Antiviral agent

아시네토박터 안티비랄리스(Acinetobacter antiviralis) 및 슈도모나스 올레오보란스(Pseudomonas oleovorans) 배양 배지 유래의 항바이러스제인 각각 월드스타에코(경농 중앙연구소, 대한민국) 및 굿모닝(경농 중앙연구소, 대한민국)과 식물 세포 추출물 유래의 KN1020(강원도농업기술원, 대한민국)을 사용하였다.World Stae Eco (National Institute of Agricultural Research, Korea) and Good Morning (National Institute of Agricultural Research, Korea) and plant cell extracts, respectively, antiviral agents derived from Acinetobacter antiviralis and Pseudomonas oleovorans culture medium KN1020 (Gangwon-do Agricultural Research and Extension Services, Korea) was used.

항바이러스제는 증류수 또는 MS 배지에 적정농도로 희석하였다. 월드스타에코 및 굿모닝은 1.0%, 4.0% 및 0.2% 농도로 실험하였고, KN1020은 2.0%, 1.0% 및 0.5% 농도로 실험하였다.The antiviral agent was diluted to distilled water or MS medium at an appropriate concentration. World Star Eco and Good Morning were tested at 1.0%, 4.0% and 0.2% concentrations, and KN1020 at 2.0%, 1.0% and 0.5% concentrations.

식물바이러스Plant viruses

항바이러스 활성을 실험하기위해, TMV(Tobacco Mosaic Virus, U1주) 및 PepMoV(Pepper Mottle Virus)를 사용하였다. TMV는 TMV의 전신감염기주(systemic host)인 Nicotiana tabacum cv. Samsun nn.에서 유지하였다. To test antiviral activity, TMV (Tobacco Mosaic Virus, U1) and PepMoV (Pepper Mottle Virus) were used. TMV is the systemic host of TMV, Nicotiana tabacum cv. Maintained at Samsun nn.

항바이러스 활성을 실험하기 위해, TMV 및 PepMoV에 GFP(Green Fluorscence Protein)이 표지된 TMV-GFP(Shailaja et al., 1999) 및 PepMoV-GFP[SP6PepMoV-Vb1/GFP(도 11), Lee et al., 2011]를 사용하였다. 상기 TMV-GFP 또는 PepMoV-GFP의 제조방법을 간단히 설명하면 다음과 같다:To test antiviral activity, TMV-GFP (Shailaja et al., 1999) and PepMoV-GFP (SP6PepMoV-Vb1 / GFP (FIG. 11), labeled with TMG and PepMoV with Green Fluorscence Protein (GFP), Lee et al. , 2011]. Brief description of the preparation method of the TMV-GFP or PepMoV-GFP is as follows:

KpnI 제한효소로 처리된 TMV-GFP 1056의 100 ng을 T7 RNA 폴리머라아제(Promega, 미국) 4U 또는 SacII 제한효소로 처리된 pSP6PepMoV-Vb1/GFP 100 ng을 SP6 RNA 폴리머라아제(Promega, 미국) 4U와 전사 최적화 5X 버퍼 10 ㎕, 100 mM DTT 5 ㎕, 2. 5mM rNTPs mix (rATP, rUTP 및 rCTP) 10 ㎕, 0.5 mM rGTP 10 ㎕, 2.5 mM RNA Cap analog(New England Biolabs, 잉글랜드) 5 ㎕를 넣고 증류수로 총 50 ㎕로 맞춘 후, 37℃에 1시간 처리하여 전사체를 제조한다.100 ng of TMV-GFP 1056 treated with KpnI restriction enzyme was added to T7 RNA polymerase (Promega, USA) and 100 ng of pSP6PepMoV-Vb1 / GFP treated with 4U or SacII restriction enzyme was added to SP6 RNA polymerase (Promega, USA). 10 μl of 4U and transcription optimization 5X buffer, 5 μl of 100 mM DTT, 2.5 μl rNTPs mix (rATP, rUTP and rCTP) 10 μl, 0.5 mM rGTP 10 μl, 2.5 mM RNA Cap analog (New England Biolabs, England) 5 μl After adding to 50 μl total with distilled water, and treated for 1 hour at 37 ℃ to prepare a transcript.

제조된 전사체를 정식하여 2주된 Nicotiana benthamiana에 카보런덤(Carborundum)을 처리한 잎 표면에 접종을 한다(mechanical inoculation). 접종 7일-14일 후 UV 램프로 GFP가 발현되는 잎의 즙액을 사용하여 항바이러스제 스크리닝 방법에 이용되는 잎 절편을 제작할 식물체에 접종하여 GFP를 발현하였다. Nicotiana, two weeks old, prepared by transcript benthamiana is inoculated on carborundum-treated leaf surfaces (mechanical inoculation). 7-14 days after the inoculation, GFP was expressed by inoculating the plants to be prepared with leaf fragments used in the antiviral screening method using the juice of the leaves expressing the GFP with a UV lamp.

TMV-GFP는 TMV-U1에서 유래된 5‘NTR, 레플리카아제 및 이동 단백질로 구성되어있다. TMV-GFP는 전신감염기주인 N. benthamiana에서 유지하였다.TMV-GFP consists of 5'NTR, replicaase and transfer proteins derived from TMV-U1. TMV-GFP was maintained in N. benthamiana , a systemic infection host.

모든 바이러스는 서울여자대학교의 식물 바이러스 유전자은행으로부터 제공받았다.
All viruses were provided by the Plant Virus Gene Bank of Seoul Women's University.

식물체Plant

TMV에 대한 항바이러스 활성을 시험하기 위해 담배(N. tobacum cv. Samaun NN)를 사용하였다. N. benthamianaN. tabacum cv. Samsun nn을 TMV-GFP 및 PepMoV-GFP의 숙주로 각각 사용하였다. 각 실험에서 유사한 성장단계의 식물체를 사용하였으며, 온실에서 16시간의 광주기로 유지하였다.Tobacco ( N. tobacum cv. Samaun NN) was used to test antiviral activity against TMV. N. benthamiana and N. tabacum cv. Samsun nn was used as a host for TMV-GFP and PepMoV-GFP, respectively. In each experiment, plants with similar growth stages were used and maintained in a greenhouse for 16 hours.

모든 식물체는 서울여자대학교의 식물바이러스은행(Plant Virus GenBank; PVGB)으로부터 제공받았다.
All plants were provided by Plant Virus GenBank (PVGB) of Seoul Women's University.

항바이러스제 잎 절편 스크리닝 시스템Antiviral Leaf Slice Screening System

TMV-GFP에 대한 항바이러스 활성을 스크리닝하기 위해, N. benthamiana에 TMV-GFP를 접종하고 감염된 잎을 절편화하여 플레이트에 배치하였다. 트윈 20을 포함하는 증류수로 잎 표면을 5분 동안 세척한 후에, 잎 표면을 70% 에탄올(트윈 20 포함)로 30초 동안 소독하고 2% 차아염소산(트윈 20 포함)으로 5분 동안 세척 후 증류수로 세척하였다. 0.5 ㎖ 튜브를 사용하여 대략 0.5 ㎝ 직경의 잎 절편을 분리하고 배양배지에 띄웠다. 모든 단계는 클린-벤치에서 수행하였다.To screen antiviral activity against TMV-GFP, N. benthamiana was inoculated with TMV-GFP and infected leaves were sectioned and placed on plates. After washing the surface of the leaves for 5 minutes with distilled water containing Tween 20, disinfect the surface of the leaves with 70% ethanol (including twin 20) for 30 seconds and after washing for 5 minutes with 2% hypochlorous acid (including twin 20) Washed with. A 0.5 ml tube was used to separate leaf sections approximately 0.5 cm in diameter and float in culture medium. All steps were performed in a clean-bench.

비타민(2.0 ㎎/ℓ 글라이신, 100 ㎎/ℓ 미오-이노시톨, 0.5 ㎎/ℓ 니코틴산, 0.5 ㎎/ℓ 피리독신 및 0.1 ㎎/ℓ 티아민) 및 20 g/ℓ 수크로오즈를 포함하는 MS(Murashige-Skoog's) 액체 배지를 잎 절편 배양에 사용하였다(Murashige and Skoog, Duchefa, 네덜란드). 각 항바이러스제(월드스타에코, 굿모닝 및 KN1020)을 포함하는 배양배지의 항바이러스 활성을 분석하였다. 항바이러스제를 MS 액체 배지에 적정한 농도로 희석하였다. 월드스타에코 및 굿모닝은 1.0%, 0.4% 및 0.2% 농도로 희석하였고, KN1020은 2.0%, 1.0% 및 0.5% 농도로 희석하였다. 잎 절편 배양물에 24-웰 배양 플레이트(SPL, 대한민국)을 사용하였다. 각 웰은 적정한 농도의 항바이러스제를 포함하는 1.5 ㎖ MS 배지를 포함한다.MS (Murashige-Skoog's) comprising vitamins (2.0 mg / l glycine, 100 mg / l myo-inositol, 0.5 mg / l nicotinic acid, 0.5 mg / l pyridoxine and 0.1 mg / l thiamine) and 20 g / l sucrose ) Liquid medium was used for leaf section culture (Murashige and Skoog, Duchefa, The Netherlands). The antiviral activity of the culture medium containing each antiviral agent (World Star Eco, Good Morning and KN1020) was analyzed. Antiviral agents were diluted to the appropriate concentration in MS liquid medium. World Star Eco and Good Morning were diluted to 1.0%, 0.4% and 0.2% concentrations and KN1020 to 2.0%, 1.0% and 0.5% concentrations. 24-well culture plates (SPL, South Korea) were used for the leaf section culture. Each well contains 1.5 ml MS medium containing the appropriate concentration of antiviral agent.

모든 잎 절편을 7일 동안 상온에서 인큐베이션 하였다. 매일 형광 및 가시광선 하에 관찰하여 항바이러스제를 조사하였다. 잎 절편에 바이러스의 존재를 RT-PCR을 통해 확인하였다.
All leaf sections were incubated at room temperature for 7 days. Antiviral agents were examined daily by observing under fluorescence and visible light. The presence of virus in the leaf sections was confirmed by RT-PCR.

항바이러스제 Antiviral agent 전신기주Telegraph 스크리닝 시스템 Screening systems

PepMoV-GFP에 대한 항바이러스 활성을 분석하기 위해 N. tabacum cv. Samsun nn을 사용하였다. 잎에 트윈 20을 포함하는 월드스타에코, 굿모닝 또는 KN1020을 브러쉬로 처리하였다. 대조군으로 트윈 20을 포함하는 증류수를 잎에 처리하였다. 항바이러스제를 적정한 농도로 증류수에 희석하였다. 월드스타에코 및 굿모닝은 1.0%, 0.4% 및 0.2% 농도로 실험하였고, KN1020은 2.0%, 1.0% 및 0.5% 농도로 실험하였다.To analyze antiviral activity against PepMoV-GFP, N. tabacum cv. Samsun nn was used. The leaves were treated with World Star Eco, Good Morning or KN1020 containing Tween 20 with a brush. As a control, distilled water containing Tween 20 was treated to the leaves. Antiviral agents were diluted in distilled water at appropriate concentrations. World Star Eco and Good Morning were tested at 1.0%, 0.4% and 0.2% concentrations, and KN1020 was tested at 2.0%, 1.0% and 0.5% concentrations.

1시간 후에, 각 잎에 PepMoV-GFP를 접종하였다. 바이러스 접종물을 준비하기 위해, 전신 감염된 0.01 g N. tabacum cv. Samsun nn 잎을 2 ㎖ 접종 버퍼(0.01 M 인산칼륨 버퍼, pH 7.2)에서 그라이딩 하였다. 카르보룬덤(Carborundum, Fisher Scientific, 미국)을 사용하여 바이러스를 N. tabacum cv. Samsun nn 잎에 접종하였다. 식물은 온실에서 16시간 광주기 및 25℃ 조건으로 유지하였다.
After 1 hour, each leaf was inoculated with PepMoV-GFP. To prepare virus inoculum, systemic infected 0.01 g N. tabacum cv. Samsun nn leaves were ground in 2 ml inoculation buffer (0.01 M potassium phosphate buffer, pH 7.2). The virus was mobilized using N. tabacum cv. Using Carborundum (fisher Scientific, USA). Samsun nn leaves were inoculated. The plants were maintained in a greenhouse for 16 hours photoperiod and 25 ° C.

식물의 Botanical RNARNA 분리 detach

잎 절편의 총 RNA를 추출하였다. 잎 절편 및 잎 조직을 1.5 ㎖ 튜브의 추출 용액(50 mM Tris-Cl(pH 8.0), 10 mM EDTA, 0.1% SDS 및 0.1% 2-머캅토에탄올)에 넣어 균질화하였다. 반응 혼합물을 페놀:클로로포름:이소아밀아코올(PCI, 25:24:1, v/v/v)로 2번 추출하였다. 총 RNA를 3배 부피의 완전 에탄올을 처리하여 침전시키고 -80℃에서 30분 동안 보관하였다. 원심분리 후, 침전된 총 RNA를 70% 에탄올로 세척하고 진공 원심분리기(Tomy, 미국)로 건조하였다. RNA 추출의 결과물을 RNase-프리 증류수에 용해하였다.
Total RNA of the leaf sections was extracted. Leaf sections and leaf tissues were homogenized in 1.5 ml tubes of extraction solution (50 mM Tris-Cl, pH 8.0), 10 mM EDTA, 0.1% SDS and 0.1% 2-mercaptoethanol. The reaction mixture was extracted twice with phenol: chloroform: isoamyl alcohol (PCI, 25: 24: 1, v / v / v). Total RNA was precipitated by treatment with three volumes of complete ethanol and stored at −80 ° C. for 30 minutes. After centrifugation, the total RNA precipitated was washed with 70% ethanol and dried in a vacuum centrifuge (Tomy, USA). The result of RNA extraction was dissolved in RNase-free distilled water.

RTRT -- PCRPCR

잎-절편으로부터 추출한 RNA를 기질로하여 RT-PCR을 수행하였다. RT 반응은 42℃에서 60분 동안 3 ㎕ 총 RNA, 50 mM KCl, 4 mM MgCl2, 10 mM DTT, 2.5 mM 각 dNTP 혼합물, 0.5 ㎕ 10 pMol 역방향 프라이머 및 6.7 유닛 M-MuLV 역전사효소(Fermentas, 미국)을 포함하는 50 mM Tris-HCl 버퍼(pH 8.3)에서 My CyclerTM Thermal Cycler(Bio-rad, 미국)로 실시하였다.RT-PCR was performed using RNA extracted from the leaf-section as a substrate. RT reaction was performed at 42 ° C. for 60 minutes at 3 μl total RNA, 50 mM KCl, 4 mM MgCl 2, 10 mM DTT, 2.5 mM each dNTP mixture, 0.5 μl 10 pMol reverse primer and 6.7 unit M-MuLV reverse transcriptase (Fermentas, USA ) Was performed with My Cycler Thermal Cycler (Bio-rad, USA) in 50 mM Tris-HCl buffer (pH 8.3).

합성 cDNA, PCR 버퍼(10 mM Tris-HCl(pH 8.3), 1.5 mM MgCl2 및 50 mM KCl), 10 pMol 프라이머 쌍(정방향 프라이머 및 역방향 프라이머) 및 2.5 mM 각 dNTP 혼합물을 포함하는 30 ㎕에 1.7 유닛 재조합 Taq DNA 폴리머라아제(Takara, 일본)을 사용하여 cDNA를 증폭하였다. cDNA를 MyCyclerTM Thermal Cycler(Bio-Rad, 미국)을 사용하여 30 사이클 증폭하였다. 변성은 94℃로 30초 동안 실시하였고 프라이머 어닐링은 55-58℃(프라이머에 따라 다름)에서 30초 동안 실시하였으며, DNA 신장은 72℃에서 1분 동안 실시하였다. 30 사이클이 종료되고 10분 동안 72℃에서 연장하였다. RT-PCR 산물을 1.0% 아가로즈 젤 전기영동 및 이티디움 브로마이드(Ethidium bromide; EtBr) 젤 염색을 통해 확인하였다.1.7 in 30 μl containing synthetic cDNA, PCR buffer (10 mM Tris-HCl, pH 8.3), 1.5 mM MgCl 2 and 50 mM KCl, 10 pMol primer pairs (forward and reverse primers) and 2.5 mM of each dNTP mixture CDNA was amplified using unit recombinant Taq DNA polymerase (Takara, Japan). cDNA was amplified 30 cycles using MyCycler Thermal Cycler (Bio-Rad, USA). Denaturation was performed at 94 ° C. for 30 seconds, primer annealing was performed at 55-58 ° C. (depending on the primer) for 30 seconds, and DNA extension was performed at 72 ° C. for 1 minute. 30 cycles were complete and extended at 72 ° C. for 10 minutes. RT-PCR products were identified through 1.0% agarose gel electrophoresis and Ethidium bromide (EtBr) gel staining.

PePMoV-GFP 및 TMV-GFP를 확인하기 위한 프라이머를 표 1에 나타내었다. PePMoV-GFP를 검출하기 위해, PePMoV-CP 및 turboGFP 프라이머를 사용하였고, TMV-GFP 검출을 위해, TMVp50 프라이머를 사용하였다.Primers for identifying PePMoV-GFP and TMV-GFP are shown in Table 1. PePMoV-CP and turboGFP primers were used to detect PePMoV-GFP and TMVp50 primers were used for TMV-GFP detection.

Figure 112012023888219-pat00001
Figure 112012023888219-pat00001

실험 결과Experiment result

PepMoVPepMoV 에 대한 항바이러스 활성Antiviral activity against

PepMoV에 대한 항바이러스제(월드스타에코, 굿모닝 및 KN1020)의 항바이러스 활성을 시험하였다. 월드스타에코 및 굿모닝은 1.0%, 0.4% 및 0.2% 농도로 처리하였고, KN1020은 2.0%, 1.0% 및 0.5% 농도로 처리하였다. N. tobacum cv. Samsun nn의 잎에 항바이러스제를 처리하고 한 시간 후, PepMoV-GFP를 접종하였다.The antiviral activity of antiviral agents (World Star Eco, Good Morning and KN1020) against PepMoV was tested. World Star Eco and Good Morning were treated at 1.0%, 0.4% and 0.2% concentrations, and KN1020 at 2.0%, 1.0% and 0.5% concentrations. N. tobacum cv. The leaves of Samsun nn were treated with antiviral agents and one hour later, inoculated with PepMoV-GFP.

접종 후 4일에, 0.4% 및 0.2% 농도의 월드스타에코를 처리한 잎은 대조군과 비교하여 낮은 GFP 발현을 나타내었고, 0.5% 농도의 KN1020을 처리한 입은 대조군과 비교하여 변화를 나타내지 않았다. 대조적으로, 다른 처리군에서는 GFP 발현을 나타내지 않았다(도 1 내지 도 4).Four days after inoculation, the leaves treated with 0.4% and 0.2% of World Star Eco showed low GFP expression compared to the control, and the mouth treated with 0.5% KN1020 showed no change compared to the control. In contrast, no other treatment group showed GFP expression (FIGS. 1-4).

접종 후 8일에, 0.4% 및 0.2% 농도의 월드스타에코 및 1.0%, 0.4% 및 0.2% 농도를 처리한 굿모닝은 대조군과 비교하여 낮은 GFP 발현을 나타내었다. 0.5% 농도의 KN1020을 처리한 잎은 대조군과 비교하여 변화를 나타내지 않았다. 대조적으로 1.0% 농도의 월드스타에코 및 2.0% 및 1.0% 농도의 KN1020을 처리한 잎에서는 GFP 발현을 나타내지 않았다(도 1 내지 도 4). At 8 days post inoculation, Good Morning treated with 0.4% and 0.2% World Star Eco and 1.0%, 0.4% and 0.2% concentrations showed lower GFP expression compared to the control. Leaves treated with 0.5% concentration of KN1020 showed no change compared to the control. In contrast, the leaves treated with 1.0% WorldStar Eco and 2.0% and 1.0% KN1020 did not show GFP expression (FIGS. 1-4).

접종 후 12일 및 16일에, 모든 농도의 월드스타에코 및 굿모닝을 처리한 잎에서 대조군과 차이를 보이지 않았다. 그러나, 2.0% 및 1.0% 농도의 KN1020를 처리한 잎에서는 GFP를 나타내지 않았다(도 1 내지 도 4).At 12 and 16 days after inoculation, there was no difference from the control in the leaves treated with all concentrations of World Star Eco and Good Morning. However, leaves treated with KN1020 at 2.0% and 1.0% concentrations did not show GFP (FIGS. 1-4).

월드스타에코, 굿모닝 및 KN1020을 처리한 잎을 PepMoV 및 GFP에 특이적인 프라이머를 이용하여 RT-PCR을 실시하였다. 1.0% 및 2.0% 농도의 KN1020을 처리한 잎은 PepMoV 및 GFP에 특이적인 프라이머에 의한 밴드가 관찰되지 않았다(도 5).
World Star Eco, Good Morning and KN1020 treated leaves were subjected to RT-PCR using primers specific for PepMoV and GFP. Leaves treated with KN1020 at 1.0% and 2.0% concentrations did not show bands by primers specific for PepMoV and GFP (FIG. 5).

TMVTMV 에 대한 항바이러스 활성Antiviral activity against

항바이러스제의 대량 검정 시스템을 이용하여 항바이러스 후보 물질(월드스타에코, 굿모닝 및 KN1020)을 각각의 농도별로 처리하여 일주일 동안 GFP 발현량을 관찰하였다. 그 결과, 월드스타에코 및 굿모닝을 처리한 잎 절편에서는 농도와 상관없이 7일까지 GFP가 관찰되었으나(도 6 및 도 7), 1.0% 및 0.4% KN1020에서는 처리 하루 후부터 GFP 발현량이 줄어들고, 0.2% KN1020에서는 처리 이틀 후부터 GFP 발현량이 줄어들어 7일 날에는 GFP가 관찰되지 않았다(도 7). 이 결과를 검증하기 위해 7일 날 UV램프로 GFP 발현량을 관찰한 잎 절편의 총 RNA을 분리하여 RT-PCR 분석을 수행하였고, 월드스타에코 및 굿모닝을 처리한 잎 절편에서는 농도와 상관없이 모두 감염된 바이러스가 검정되었다(도 10). 반면에 KN1020을 처리한 잎 절편의 총 RNA에 대한 RT-PCR 분석 결과는 KN1020의 처리된 농도와 상관없이 감염된 바이러스가 검출되지 않았다(도 9 및 도 10). 이러한 결과는 항바이러스 대량 검정 시스템에서의 GFP 발현관찰 결과와 동일한 결과를 보여주는 것으로 분석에 대한 신뢰도를 검증할 수 있었다. 본 연구에서 개발된 항바이러스 대량 검정 시스템은 새로운 항바이러스 물질을 검정하기 위해 기존에 사용되었던 RT-PCR분석을 대체할 수 있고, 더 나아가 시간과 비용이 경제적인 장점을 가지고 있다.
Antiviral candidates (World Star Eco, Good Morning, and KN1020) were treated at different concentrations using a mass assay system of antiviral agents to observe GFP expression levels for one week. As a result, in the leaf sections treated with World Star Eco and Good Morning, GFP was observed up to 7 days irrespective of the concentration (Figs. 6 and 7), but in 1.0% and 0.4% KN1020, GFP expression decreased after one day of treatment, and 0.2%. In KN1020, GFP expression was decreased from two days after treatment, and thus GFP was not observed on day 7 (FIG. 7). To verify this result, RT-PCR analysis was carried out by separating total RNA of leaf fragments which observed GFP expression with UV lamps on the 7th day, and World Star Eco and Good Morning treated leaf fragments regardless of concentration. Infected virus was assayed (FIG. 10). On the other hand, RT-PCR analysis of the total RNA of KN1020-treated leaf sections showed that no infected virus was detected regardless of the treated concentration of KN1020 (FIGS. 9 and 10). These results showed the same results as the GFP expression observation results in the antiviral mass assay system, which could verify the reliability of the analysis. The antiviral mass assay system developed in this study can replace the RT-PCR assays used to test new antiviral agents, furthermore, has the economic advantages of time and cost.

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이상으로 본 발명의 특정한 부분을 상세히 기술하였는바, 당업계의 통상의 지식을 가진 자에게 있어서 이러한 구체적인 기술은 단지 바람직한 구현예일 뿐이며, 이에 본 발명의 범위가 제한되는 것이 아닌 점은 명백하다. 따라서 본 발명의 실질적인 범위는 첨부된 청구항과 그의 등가물에 의하여 정의된다고 할 것이다.
While the present invention has been particularly shown and described with reference to exemplary embodiments thereof, it is to be understood that the same is by way of illustration and example only and is not to be construed as limiting the scope of the present invention. It is therefore intended that the scope of the invention be defined by the claims appended hereto and their equivalents.

Claims (8)

다음의 단계를 포함하는 항바이러스제의 스크리닝 방법:
(a) 형광단백질을 인코딩하는 뉴클레오타이드 서열을 포함하는 TMV(Tobacco Mosaic Virus) 또는 PepMoV(Pepper Mottle Virus)로 감염된 바이러스-감염 식물체를 제조하는 단계;
(b) 상기 바이러스-감염 식물체에 분석대상의 시료를 처리하는 단계; 및
(c) 상기 시료가 처리된 바이러스-감염 식물체에서 상기 형광단백질로부터 발생되는 형광 시그널을 측정하는 단계; 상기 시료가 처리되지 않은 대조군과 비교하여, 상기 형광단백질로부터 발생되는 형광 시그널이 감소되는 것으로 측정된 경우에는 상기 시료는 항바이러스제로 판정된다.
Screening method of antiviral agent comprising the following steps:
(a) preparing a virus-infected plant infected with Tobacco Mosaic Virus (TMV) or Peptper Mottle Virus (PepMoV) comprising a nucleotide sequence encoding a fluorescent protein;
(b) treating the sample of analysis to the virus-infected plant; And
(c) measuring a fluorescence signal generated from the fluoroprotein in the virus-infected plant treated with the sample; The sample is determined to be an antiviral agent when it is determined that the fluorescence signal generated from the fluoroprotein is reduced compared to the untreated control sample.
다음의 단계를 포함하는 항바이러스제의 스크리닝 방법:
(a) 식물체에 분석대상의 시료를 처리하는 단계;
(b) 형광단백질을 인코딩하는 뉴클레오타이드 서열로 형질전환 되고 상기 형광단백질을 발현하는 TMV(Tobacco Mosaic Virus) 또는 PepMoV(Pepper Mottle Virus)를 상기 시료 처리된 식물체에 접종하는 단계; 및
(c) 상기 식물체에서 상기 형광단백질로부터 발생되는 형광 시그널을 측정하는 단계; 상기 시료가 처리되지 않은 대조군과 비교하여, 상기 형광단백질로부터 발생되는 형광 시그널이 감소되는 것으로 측정된 경우에는 상기 시료는 항바이러스제로 판정된다.
Screening method of antiviral agent comprising the following steps:
(a) processing a sample of analyte on a plant;
(b) inoculating the sample treated plant with a Tobacco Mosaic Virus (TMV) or Peptper Mottle Virus (PepMoV) transformed with a nucleotide sequence encoding a fluorescent protein and expressing the fluorescent protein; And
(c) measuring the fluorescent signal generated from the fluorescent protein in the plant; The sample is determined to be an antiviral agent when it is determined that the fluorescence signal generated from the fluoroprotein is reduced compared to the untreated control sample.
삭제delete 삭제delete 제 1 항 또는 제 2 항에 있어서, 상기 식물체는 담배(Nicotiana spp.), 아시네타(Acineta spp.), 나도풍란(Aerides japonicum), 마늘(Allium sativum), 땅콩(Arachis hypogaea), 아란세라(Aranthera spp.), 새우란(Calanthe discolor), 고추(Capsicum annuum), 카틀레야(Cattleya spp.), 명아주(Chenopodium amaranticolor), 국화(Chrysanthemum morifolium), 크로커스(Crocus spp.), 심비디움(Cymbidium spp.), 천리향(Daphne odora), 덴드로비움(Dendrobium spp.), 카네이션(Dianthus caryophyllus), 마(Dioscorea oposita cultivars), 도리테높시스(Doritaenopsis spp.), 에피덴드럼(Epidendrum spp.), 글라디올러스(Gladiolus hybridus), 글라마토필럽(Grammatophyllum spp.), 칼랑코에(Kalanchoe blossfeldiana), 백합(Lilium spp.), 리카스테(Lycaste spp.), 토마토(Lycopersicon esculentum), 수선화(Narcissus spp.), 네린(Nerine bowdenii cultivars), 오돈토글로썸(Odontoglossum spp.), 머위(Petasites officinalis), 팔레높시스(Phalenopsis spp.), 포티나라(Potinara spp.), 감자(Solanum tuberosum), 라일락(Syringa vulgaris), 번행초(Tetragonia expansa), 반다(Vanda spp.), 잠두(Vicia faba), 동부(Vigna unguiculata) 또는 지고페타럼(Zygopetalum spp.)인 것을 특징으로 하는 방법.
The method of claim 1 or claim 2, wherein the plant is a tobacco (Nicotiana spp.), Know Neta (Acineta spp.), I pungran (Aerides japonicum), garlic (Allium sativum), peanut (Arachis hypogaea), Aran sera ( Aranthera spp.), Calanthe discolor , Capsicum annuum , Cattleya spp., Chenopodium amaranticolor , Chrysanthemum morifolium , Crocus spp., Cymbidium spp. , Daphne odora , Dendrobium spp., Carnation ( Dianthus caryophyllus ), Hemp ( Dioscorea oposita cultivars ), Doritaenopsis spp., Epidendrum spp., Gladiolus hybrid ( Gladiolus hybrid ), Grammatophyllum spp., Kalanchoe blossfeldiana , Lilium spp., Lycaste spp., Tomato ( Lycopersicon esculentum ), Narcissus ( Narcissus spp.), Nerine bowdenii cultivars ), Odontoglossum spp., Butterbur ( Petasites officinalis), Palais higher system (Phalenopsis spp.), Fourteen Countries (Potinara spp.), Potato (Solanum tuberosum), lilac (Syringa vulgaris), tetragonia tetragonioides (Tetragonia expansa), Vanda (Vanda spp.), Broad bean (Vicia faba ), Eastern ( Vigna unguiculata ) or zygopetalum spp.
제 5 항에 있어서, 상기 식물체는 담배(Nicotiana spp.)인 것을 특징으로 하는 방법.
6. The method according to claim 5, wherein the plant is Nicotiana spp.
제 1 항에 있어서, 상기 단계(b)의 식물체는 식물의 잎인 것을 특징으로 하는 방법.
The method of claim 1, wherein the plant of step (b) is a leaf of a plant.
제 7 항에 있어서, 상기 식물의 잎은 잎의 절편 디스크인 것을 특징으로 하는 방법.8. The method of claim 7, wherein the leaf of the plant is a slice disc of the leaf.
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