KR101316085B1 - Microbacterium oxydans Having Property for Degrading Laminarin and Alginic acid - Google Patents

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Abstract

본 발명은 라미나린 및 알긴산 분해능을 가지는 미생물에 관한 것으로, 더욱 상세하게는 처리하기 어려운 갈조류 가공공정에서 발생되거나 갈조류 추출 공정 중에 발생되는 부산물인 라미나린 및 알긴산 분해능을 가지는 마이크로박테리움 옥시단스에 관한 것이다.
상기라미나린 및 알긴산 분해능을 가지는 미생물은 국립농업과학원 농업유전자원센터에 수탁번호 KACC91657P로 기탁된 마이크로박테리움 옥시단스 FS4(Microbacterium oxydans FS4)인 것을 특징으로 한다.
본 발명에 의하면, 처리하기 어려운 갈조류 가공공정에서 발생되거나 갈조류 추출 공정 중에 발생되는 부산물인 라미나린 및 알긴산으로부터 글루코오스 등의 환원당을 생산할 수 있어 환경보호 효과가 있으며, 생리활성물질이나 바이오에탄올 생산 등으로 재활용할 수 있는 효과가 있다.
The present invention relates to microorganisms having laminarin and alginic acid resolution, and more particularly, to microbacterium oxydans having laminarin and alginic acid resolution, which are by-products generated during processing of brown algae that are difficult to process or during extraction of brown algae. will be.
The microorganisms having laminarin and alginic acid resolution are characterized in that the microbacterium oxydans FS4 ( Microbacterium oxydans FS4) deposited with the accession number KACC91657P in the National Institute of Agricultural Science.
According to the present invention, it is possible to produce reducing sugars, such as glucose, from laminarin and alginic acid, which are by-products generated during the processing of brown algae, which are difficult to process, or during the extraction of brown algae, and thus have an environmental protection effect. It has the effect of recycling.

Description

라미나린 및 알긴산 분해능을 가지는 마이크로박테리움 옥시단스 {Microbacterium oxydans Having Property for Degrading Laminarin and Alginic acid}Microbacterium oxydans Having Property for Degrading Laminarin and Alginic acid}

본 발명은 라미나린 및 알긴산 분해능을 가지는 미생물에 관한 것으로, 더욱 상세하게는 처리하기 어려운 갈조류 가공공정에서 발생되거나 갈조류 추출 공정 중에 발생되는 부산물인 라미나린 및 알긴산 분해능을 가지는 마이크로박테리움 옥시단스에 관한 것이다.
The present invention relates to microorganisms having laminarin and alginic acid resolution, and more particularly, to microbacterium oxydans having laminarin and alginic acid resolution, which are by-products generated during processing of brown algae that are difficult to process or during extraction of brown algae. will be.

현재 세계적으로 기후변화협약과 환경규제가 강화됨에 따라 석유 및 석탄을 대체할 수 있고, 안정적이며 환경 친화적인 에너지를 개발하기 위한 바이오, 수소, 태양 등의 신재생에너지의 연구가 활발히 진행되고 있다. As the climate change convention and environmental regulations are strengthened around the world, researches on renewable energy such as bio, hydrogen, and solar to replace petroleum and coal, and to develop stable and environmentally friendly energy are being actively conducted.

미국, 브라질, 독일과 같은 신재생에너지 생산의 선도국가에서는 바이오 에너지 생산의 원료로 주로 사탕수수, 옥수수 등의 곡물류와 임업 및 농업 부산물인 목질계 자원들을 이용하는 연구 및 생산을 진행하고 있으나, 식량난 문제와 작물 종류에 따른 지배 면적 한정성 및 영양분 공급의 어려움 그리고 셀룰로오스 이외의 헤미셀룰로오스, 리그닌 등의 추가 전처리 공정에 의한 경제성과 같은 문제로 곡물류와 목질계 자원을 이용한 바이오 연료 생산의 한계가 드러나고 있다.Leading countries in renewable energy production, such as the United States, Brazil, and Germany, are conducting research and production using raw materials such as sugarcane and corn as raw materials for bioenergy production, and wood-based resources as forestry and agricultural by-products. The limitation of biofuel production using grains and wood-based resources has been revealed due to problems such as limitation of governing area and difficulty in supplying nutrients according to the types of crops, and economic efficiency by additional pretreatment processes such as hemicellulose and lignin other than cellulose.

이러한 문제점들을 해결하기 위하여, 최근에는 많은 섬유질 및 다양한 다당류에 의해 세포벽이 구성 되어 있는 해양조류가 새로운 바이오 에너지 원료로서 주목을 받고 있다. 해조류를 주로 생산하는 나라는 한국, 일본, 중국, 인도네시아 등의 아시아 국가들이며, 육상보다 넓은 재배 가능한 바다 면적을 보유하고 있다. 또한, 해조류는 목재와 식물계 셀룰로오스보다 빠른 속도로 성장하며, 광합성 반응으로 공기 중 이산화탄소를 흡수하므로 온실 가스를 줄일 수 있는 효과가 있고, 해조류 내 리그닌의 함량이 적어 전처리 공정을 간소화 할 수 있어서 바이오 연료 원료로서의 많은 잠재성을 내포하고 있다. 우리나라의 전체 수산물 생산량 중 약 25%를 차지하는 해조류 중 우리나라 기후에 맞는 갈조류가 대부분 양식되고 있으며, 이러한 대형 해조류는 60~95 % 정도가 수분이며, 나머지 성분들 가운데 50% 이상은 탄수화물로 이루어져 있다. 대형 해조류는 종에 따라 구성하고 있는 다당류의 종류 및 결합 형태가 다양한데, 특히 다시마, 미역과 같은 갈조류는 녹색식물과 유사성이 많으며, 구조 다당류로 셀룰로오즈가 5.7% ~ 14.3% 구성되며, 세포 사이에는 점질성 다당류인 알긴산, 퓨코이단 및 저장성 다당류인 라미나린 등으로 구성되어 있다.
In order to solve these problems, marine algae, in which cell walls are composed of many fibers and various polysaccharides, have recently attracted attention as a new bioenergy source. The main producers of seaweed are Asian countries such as Korea, Japan, China, and Indonesia, and they have a larger cultivable ocean area than land. In addition, algae grows faster than wood and plant-based cellulose, and absorbs carbon dioxide in the air through photosynthetic reactions, thereby reducing greenhouse gases, and simplifying pretreatment processes because of less lignin content in seaweeds. It has many potentials as a raw material. Among the seaweeds accounting for about 25% of Korea's aquatic production, most of the brown algae that are suitable for the climate of Korea are farmed. About 60-95% of these large seaweeds are water, and more than 50% of the rest are carbohydrates. Large algae have various types and binding forms of polysaccharides according to species. Especially, brown algae such as kelp and seaweed have many similarities to green plants, and 5.7% to 14.3% of cellulose is composed of structural polysaccharides. It is composed of alginic acid, fucoidan, which is a sex polysaccharide, and laminarin, which is a hypotonic polysaccharide.

갈조류 가공 공정 및 추출에서 발생되는 부산물인 라미나린은 β-1,3-글루코오즈 결합이 주 골격이며, 부분적으로 β-1,6-글루코오즈 결합으로 구성되어 있고, 알긴산은 D-만뉴론산과 L-글루론산이 β-1,4 결합으로 구성되어 있으며, 호모폴리머 형태로 결합된 폴리만뉴론산(MM), 폴리글루론산(GG) 형태 또는 두 성분이 혼합된 헤테로폴리머(MG) 형태가 일정하지 않게 섞여져 구성되어 있다. 따라서 토양, 갯벌, 해저 동물의 내장 등에서 순수 분리한 라미나린 및 알긴산을 분해하는 미생물을 이용하면, 분해 결과로 에탄올 생산에 필요한 글루코오스 산뿐만 아니라, 분해반응시 생성되는 이탄당, 삼탄당, 올리고당 등과 같은 분해 대사산물들이 유용한 생리활성물질로 될 수 있다. 현재까지 갈조류로부터 알칼리, 산 또는 효소 처리 등의 가공 방법을 통해 해조다당류인 알긴산, 퓨코이단을 추출하여 식품 첨가제, 건강 식량 자원으로서 산업적으로 많이 유용하게 이용되고 있다. 그러나 갈조류 자체의 분해하기 어려운 복잡한 구조로 인해 바이오 연료 생산용 기질로서 사용하기에 어려움이 있으며, 현재 이용되고 있는 물질 이외에 발생되는 부산물 및 폐기물들의 처리가 문제점으로 남아 있다. 한국은 OECD 가입 회원국으로서 폐기물 해양투기를 규제하는 런던협약이 채택한 '96 의정서'를 의무적으로 따라야 할 입장이어서, 2012년 이후에는 폐기되는 해조류 처리문제로 인한 대란이 발생될 가능성을 배제할 수 없다.Laminarine, a by-product of brown algae processing and extraction, is composed mainly of β-1,3-glucose bonds and partially composed of β-1,6-glucose bonds. L-Gluronic acid is composed of β-1,4 bonds, polymanneuronic acid (MM), polygluronic acid (GG) form bonded in the homopolymer form or heteropolymer (MG) form a mixture of the two components It is composed of mixed irregularly. Therefore, using microorganisms that decompose laminarin and alginic acid, which are purely separated from soil, mud flats, and intestines of seabed animals, not only glucose acid required for ethanol production, but also peat sugar, samtan sugar, oligosaccharide, etc. The same degradation metabolites can be useful bioactives. To date, algae, alginic acid, and fucoidan, which are algae polysaccharides, are extracted from brown algae through processing such as alkali, acid, or enzyme treatment, and are widely used as food additives and health food resources. However, it is difficult to use as a substrate for biofuel production due to the complicated structure of brown algae itself, and the treatment of by-products and wastes generated in addition to the materials currently used remains a problem. As a member of the OECD, Korea is obliged to follow the '96 Protocol, adopted by the London Convention on Waste Dumping, which cannot be ruled out as a result of the disposal of seaweeds discarded after 2012.

이와 관련하여, 한국 공개특허 제2010-0087959호는 알긴산 분해 효소를 생산하는 신규 미생물, 바실러스 에스피 N7151-B를 개시하였고, 한국 등록특허 제0985841호는 알긴산 분해 효소를 생산하는 신규 미생물 슈도모나스에스피 N7151-6를 개시하였으며, 한국 공개특허 제2008-0006931호는 해양 미생물 비브리오 에스피. 에스21 균주를 이용한 알긴산 분해효소의 제조방법을 개시한 바 있으나, 알긴산뿐만 아니라 라미나린 분해능을 가지며, 보다 효소활성이 뛰어난 미생물에 대한 개발이 절실한 실정이다.
In this regard, Korean Unexamined Patent Publication No. 2010-0087959 discloses a new microorganism producing alginate degrading enzyme, Bacillus sp. N7151-Z, and Korean Patent No. 0985841 discloses a novel microorganism Pseudomonas sp. N7151-producing alginate degrading enzyme. 6, Korean Patent Laid-Open No. 2008-0006931 discloses marine microorganisms Vibrio sp. Although a method for preparing alginic acid degrading enzyme using S21 strain has been disclosed, it is urgent to develop microorganisms having not only alginic acid but also laminarin degrading ability and excellent enzymatic activity.

이에, 본 발명자들은 처리에 어려움이 있는 갈조류 가공공정에서 발생되거나 갈조류 추출 공정 중에 발생되는 부산물인 라미나린 및 알긴산을 재활용하는 방법을 개발하고자 예의 노력한 결과, 순수 분리한 마이크로박테리움 옥시단스 FS4(수탁번호 KACC91657P)를 이용할 경우 라미나린 및 알긴산을 분해하여, 바이오에탄올 및 생리활성물질을 생산할 수 있다는 것을 확인하고 본 발명을 완성하게 되었다.
Accordingly, the present inventors have made intensive efforts to develop a method for recycling laminarin and alginic acid, which are by-products generated in the brown algae processing process, which are difficult to process, or generated during the brown algae extraction process, and thus purely isolated microbacterium oxydans FS4 No. KACC91657P) was used to decompose laminarin and alginic acid to produce bioethanol and bioactive substances, thus completing the present invention.

본 발명의 목적은 갈조류 구성 다당류 중 저장성 다당류인 라미나린 및 알긴산을 효과적으로 분해할 수 있는 미생물을 제공하는데 있다. It is an object of the present invention to provide a microorganism capable of effectively decomposing laminin and alginic acid, which are storage polysaccharides, among brown algae constituent polysaccharides.

본 발명의 다른 목적은 라미나린 또는 알긴산 분해효소의 제조방법 및 라미나린 또는 알긴산 분해방법을 제공하는데 있다.Another object of the present invention is to provide a method for preparing laminarin or alginic acid degrading enzyme and a method for degrading laminarin or alginic acid.

본 발명의 또 다른 목적은 바이오에탄올 생산에 이용되는 글루코오스 및 생리활성물질인 올리고당을 라미나린으로부터 생산하는 방법을 제공하는데 있다.
Still another object of the present invention is to provide a method for producing oligosaccharides, which are glucose and bioactive substances used in bioethanol production, from laminarin.

상기 목적을 달성하기 위하여, 본 발명은 국립농업과학원 농업유전자원센터에 수탁번호 KACC91657P로 기탁된 마이크로박테리움 옥시단스 FS4(Microbacterium oxydans FS4)를 제공한다.In order to achieve the above object, the present invention provides a micro tumefaciens oxy thiooxidans FS4 (Microbacterium oxydans FS4) deposited as accession No. KACC91657P the National Genetic Resources Center, Agricultural Research agriculture.

본 발명에 있어서, 상기 마이크로박테리움 옥시단스 FS4는 라미나린 분해효소능 및 알긴산 분해 효소능을 가지는 것을 특징으로 한다.In the present invention, the microbacterium oxidans FS4 is characterized by having a laminarin degrading enzyme ability and alginic acid degrading enzyme ability.

본 발명에 있어서, 상기 마이크로박테리움 옥시단스 FS4는 서열번호 3의 16S -rDNA를 갖는 것을 특징으로 한다. In the present invention, the microbacterium oxidans FS4 is characterized by having the 16S -rDNA of SEQ ID NO: 3.

본 발명은 또한, 상기 마이크로박테리움 옥시단스 FS4를 배양하는 것을 특징으로 하는 라미나린 또는 알긴산 분해효소의 제조방법을 제공한다.The present invention also provides a method for producing laminarin or alginic acid degrading enzyme, characterized in that the culture of the microbacterium oxidans FS4.

본 발명은 또한, 상기 방법에 의해 제조된 라미나린 분해효소 또는 상기 라미나린 분해효소를 함유하는 마이크로박테리움 옥시단스 FS4 균체를 이용하는 것을 특징으로 하는 라미나린의 분해방법을 제공한다.The present invention also provides a method for decomposing laminarin, which comprises using a laminarin degrading enzyme prepared by the above method or a microbacterium oxydans FS4 cell containing the laminarin degrading enzyme.

본 발명은 또한, 상기 방법에 의해 제조된 알긴산 분해효소 또는 상기 알긴산 분해효소를 함유하는 마이크로박테리움 옥시단스 FS4 균체를 이용하는 것을 특징으로 하는 알긴산의 분해방법을 제공한다.
The present invention also provides a method for decomposing alginic acid, which comprises using an alginic acid degrading enzyme prepared by the above method or a microbacterium oxydans FS4 cell containing the alginic acid degrading enzyme.

본 발명은 갈조류의 주요 다당류 성분인 라미나린 및 알긴산을 효과적으로 분해하여 유용물질을 생산할 수 있는 미생물을 제공하는 효과가 있다. 발명에 의하면, 처리에 어려움이 있는 갈조류 가공공정에서 발생되거나 갈조류 추출 공정 중에 발생되는 부산물인 라미나린 및 알긴산으로부터 글루코오스 등의 환원당을 생산할 수 있어 환경보호 효과가 있으며, 생리활성물질이나 바이오에탄올 생산 등으로 재활용할 수 있는 효과가 있다.
The present invention has an effect of providing a microorganism capable of effectively dissolving laminin and alginic acid which are the major polysaccharide components of brown algae to produce useful substances. According to the present invention, it is possible to produce reducing sugars such as glucose from laminarin and alginic acid, which are by-products generated during the processing of brown algae, which are difficult to process, or during the extraction of brown algae, and thus have an environmental protection effect. The effect can be recycled into.

도 1은 라미나린 액체배지에 분리한 6종의 균주 (A) FS1, (B) FS2, (C) FS3, (D) FS4, (E) FS5, (F) FS6 을 접종하여 튜브 단위에서 라미나린 분해능을 나타낸 결과이다[pH (▲); Cell density (●); Toatl reducing sugars (■)].
도 2는 분리 균주를 15일간 100 ml 플라스크에서 배양 시, 라미나린 분해반응을 나타낸 결과이다[pH (▲); Cell density (●); Total reducing sugars (■), Glucose (◆)].
도 3은 라미나린 각 농도 별 (a) 1 g/L, (b) 5 g/L, (c) 10 g/L 마이크로박테리움 옥시단스 FS4의 라미나린 분해반응결과를 나타낸 그래프이다[pH (▲); Cell density (●); Total reducing sugars (■), Glucose (◆)].
도 4는 라미나린 5 g/L 농도에서 (a) 0일, (b) 3일, (c) 6일, (d) 9일, (e) 12일, (f) 15일 동안 마이크로박테리움 옥시단스 FS4에 의한 라미나린 분해 배양액의 HPLC 분석 결과를 나타낸 그래프이다[1: Laminarin, 2: Oligo-saccharides 3: Glucose].
도 5는 라미나린 10 g/L 농도에서 (a) 0일, (b) 3일, (c) 6일, (d) 9일, (e) 12일, (f) 15일 동안 마이크로박테리움 옥시단스 FS4에 의한 라미나린 분해 배양액의 HPLC 분석 결과를 나타낸 그래프이다[1: Laminarin, 2: Oligo-saccharides, 3: Glucose].
도 6은 라미나린 고체 평판 배지에 분리 균주를 (a) 0일, (b) 2일, (c) 4일, (d) 6일 간 37℃에서 배양하였을 때 라미나린 분해에 의한 투명환(clear zone)을 형성하는 모습을 나타내는 결과이다.
도 7은 알긴산 고체 평판 배지에 마이크로박테리움 옥시단스 FS4를 (a) 0일, (b) 2일, (c) 4일, (d) 6일간 37℃에서 배양하였을 때 알긴산 분해에 의한 투명환(clear zone)을 형성하는 모습을 나타내는 결과이다.
도 8은 피로코구스 푸리오수스 균주로부터 얻어낸 β-1,3-glucanase 유전자를 대장균을 이용하여 대량 발현한 후, 분리·정제한 β-1,3-glucanase를 7일간 (a) 37℃, (b) 60℃에서 반응시킨 라미나린 분해반응 결과이다[pH (▲); Total reducing sugars (■)].
도 9는 피로코구스 푸리오수스 균주로부터 얻어낸 β-1,3-glucanase 유전자를 대장균을 이용하여 대량 발현한 후, 분리·정제한 β-1,3-glucanase를 15일간 37℃에서 반응시킨 라미나린 분해반응 결과이다[pH (▲); Total reducing sugars (■), Glucose (◆)].
1 is inoculated with the six strains (A) FS1, (B) FS2, (C) FS3, (D) FS4, (E) FS5, (F) FS6 separated in a laminarin liquid medium in a tube unit This is the result showing naryn resolution [pH (▲); Cell density (●); Toatl reducing sugars (■)].
Figure 2 shows the results of laminin degradation when incubated in a 100 ml flask for 15 days to isolate strains [pH (▲); Cell density (●); Total reducing sugars (■), Glucose (◆)].
Figure 3 is a graph showing the results of laminarin decomposition of (a) 1 g / L, (b) 5 g / L, (c) 10 g / L Microbacterium oxydans FS4 for each concentration of laminarin [pH ( ▲); Cell density (●); Total reducing sugars (■), Glucose (◆)].
Figure 4 Laminarin 5 g / L Laminarin digested cultures with microbacterium oxydans FS4 for (a) 0 days, (b) 3 days, (c) 6 days, (d) 9 days, (e) 12 days, and (f) 15 days at concentration. HPLC shows the result of HPLC analysis [1: Laminarin, 2: Oligo-saccharides 3: Glucose].
5 laminarin 10 g / L Laminarin digested cultures with microbacterium oxydans FS4 for (a) 0 days, (b) 3 days, (c) 6 days, (d) 9 days, (e) 12 days, and (f) 15 days at concentration. HPLC shows the result of HPLC analysis [1: Laminarin, 2: Oligo-saccharides, 3: Glucose].
Figure 6 is a clear ring by laminarin degradation when the isolated strain in a laminarin solid plate medium (a) 0 days, (b) 2 days, (c) 4 days, (d) 6 days at 37 ℃ ( This shows the appearance of forming a clear zone.
7 is a clear ring by alginate degradation when microbacterium oxydans FS4 is incubated at 37 ° C. for (a) 0 days, (b) 2 days, (c) 4 days, and (d) 6 days in an alginate solid plate medium. This is a result showing the appearance of forming a (clear zone).
Figure 8 shows the large amount of β-1,3-glucanase gene obtained from the pyrococcus puriosus strain using E. coli, and then isolated and purified β-1,3-glucanase for 7 days (a) 37 ℃, (b) Laminarin decomposition reaction was carried out at 60 ℃ [pH (▲); Total reducing sugars (■)].
9 shows a large amount of β-1,3-glucanase gene obtained from Pycococcus puriosus strain using Escherichia coli, followed by reaction of isolated and purified β-1,3-glucanase at 37 ° C. for 15 days. Narine decomposition result [pH (▲); Total reducing sugars (■), Glucose (◆)].

본 발명에서는 갈조류 가공공정 및 추출공정에서 발생되는 폐기 해조다당류인 라미나린 및 알긴산을 효율적으로 분해할 수 있는 미생물을 흙, 해수, 갯벌 등 다양한 환경에서 수집된 샘플로부터 분리하고, 상기 순수분리 미생물이 라미나린 및 알긴산을 분해능을 가지고 있다는 것을 확인하였다. In the present invention, microorganisms capable of efficiently decomposing laminin and alginic acid, which are waste algae polysaccharides generated in brown algae processing and extraction processes, are separated from samples collected in various environments such as soil, seawater, and tidal flats. It was confirmed that laminarin and alginic acid had a resolution.

즉, 본 발명의 일 실시예에서는 토양, 갯벌 및 해산 동물의 내장으로부터 라미나린을 분해하는 FS1~FS6 균주를 분리하고, 이중 FS4가 가장 높은 라미나린 분해능을 가지고 있음을 확인한 다음, FS4 균주의 16S-rDNA를 확인하여, 마이크로박테리움 옥시단스 균주로 동정하고, 이를 국립농업과학원 농업유전자원센터에 수탁번호 KACC91657P로 수탁하였다.That is, in one embodiment of the present invention, FS1 to FS6 strains that decompose laminarin from the intestines of soil, mud flats and marine animals are separated, and double FS4 has the highest laminarine resolution, and then 16S of FS4 strain -rDNA was identified and identified as a microbacterium oxydans strain, which was deposited with the accession number KACC91657P at the National Institute of Agricultural Science.

또한, 본 발명의 다른 실시예에서는 FS4 균주가 라미나린 뿐만 아니라 알긴산 분해능을 가지고 있다는 것을 확인할 수 있었다.In addition, in another embodiment of the present invention it was confirmed that the FS4 strain has an alginate resolution as well as laminarin.

따라서, 본 발명은 일 관점에서, 국립농업과학원 농업유전자원센터에 수탁번호 KACC91657P로 기탁된 마이크로박테리움 옥시단스 FS4(Microbacterium oxydans FS4)에 관한 것이다.Accordingly, the present invention relates to In one aspect, the National Academy of Agricultural Sciences agricultural genetic accession No. KACC91657P micro tumefaciens oxy thiooxidans FS4 (Microbacterium oxydans FS4) deposited in the center.

상기 마이크로박테리움 옥시단스 FS4는 라미나린 분해효소능 및 알긴산 분해 효소능을 가지는 것을 특징으로 한다. The microbacterium oxidans FS4 is characterized by having the ability to laminarin degrading enzyme and alginic acid degrading enzyme.

또한, 상기 마이크로박테리움 옥시단스 FS4는 서열번호 3의 16S-rDNA를 갖는 것을 특징으로 한다.
In addition, the microbacterium oxidans FS4 is characterized by having the 16S-rDNA of SEQ ID NO: 3.

한편, 본 발명자는 상기 라미나린 분해효소능 및 알긴산 분해 효소능을 가지고 있는 마이크로박테리움 옥시단스 FS4를 배양하면 라미나린 분해효소 또는 알긴산 분해효소가 생성되므로, 이를 분리하면 라미나린 분해효소 또는 알긴산 분해효소를 제조할 수 있을 것으로 예측하였다.On the other hand, the present inventors cultivate the microbacterium oxydans FS4 having the laminarin degrading enzyme ability and the alginic acid degrading enzyme ability to produce a laminarin degrading enzyme or alginic acid degrading enzyme, so when separated from the laminarin degrading enzyme or alginic acid degrading It was predicted that the enzyme could be prepared.

따라서, 본 발명은 다른 관점에서 상기 마이크로박테리움 옥시단스 FS4를 배양하는 것을 특징으로 하는 라미나린 또는 알긴산 분해효소의 제조방법에 관한 것이다.Accordingly, the present invention relates to a method for producing laminarin or alginic acid degrading enzyme, characterized in that the microbacterium oxidans FS4 is cultured in another aspect.

상기 마이크로박테리움 옥시단스 FS4의 배양을 위한 배지는 균주의 성장이 원활히 이루어지는 한 크게 제한되지 않으나, 균주의 원활한 생장과 라미나린 또는 알긴산 분해 효소의 대량 생산을 위하여 상기 배지에 라미나린 또는 알긴산을 포함하는 것이 바람직하다.The medium for culturing the microbacterium oxydans FS4 is not limited as long as the growth of the strain is smooth, but includes the laminarin or alginic acid in the medium for the smooth growth of the strain and mass production of laminarin or alginic acid degrading enzyme It is desirable to.

상기 라미나린 분해효소 또는 알긴산 분해효소는 다음과 같은 통상의 방법으로 배양액으로부터 회수할 수 있다.The laminarin degrading enzyme or alginic acid degrading enzyme can be recovered from the culture by the following conventional method.

배양액으로부터 원심분리를 이용해 상등액을 회수한 후, 0.45 um로 여과 후, 암모늄 설페이트를 이용하여 농축 후 이용할 수 있다. 또한, 배양액으로부터 라미나린 또는 알긴산 분해 효소의 수거는 겔 전지영동, 투석, 염 침전, 이온교환 크로마토그래피, 친화성 크로마토그래피, FPLC(Fast performance liquidchromatography) 등의 당업계에 공지된 방법을 이용하여 분리, 정제할 수 있다.
The supernatant is recovered from the culture by centrifugation, filtered at 0.45 um, and then concentrated using ammonium sulfate. In addition, the collection of laminarin or alginic acid degrading enzyme from the culture medium is separated using methods known in the art, such as gel electrophoresis, dialysis, salt precipitation, ion exchange chromatography, affinity chromatography, FPLC (Fast performance liquidchromatography). Can be purified.

한편, 상기 마이크로박테리움 옥시단스 FS4를 이용하여 라미나린을 분해시키면, 바이오에탄올 생산에 이용되는 글루코오스 및 생리활성물질인 올리고당을 제조할 수 있을 것으로 예측하였다.On the other hand, by decomposing laminarin using the microbacterium oxydans FS4, it was predicted that oligosaccharides, which are glucose and bioactive substances used for bioethanol production, could be prepared.

본 발명의 다른 실시예에서는 마이크로박테리움 옥시단스 FS4(수탁번호: KACC91657P)를 라미나린을 함유하는 배지에서 배양한 결과, 글루코오스 및 올리고당이 생성되는 것을 확인할 수 있었다.In another embodiment of the present invention, the microbacterium oxydans FS4 (Accession Number: KACC91657P) was cultured in a medium containing laminarin, it was confirmed that glucose and oligosaccharides are produced.

따라서, 본 발명은 또 다른 관점에서, 상기 방법에 의해 제조된 라미나린 분해효소 또는 상기 라미나린 분해효소를 함유하는 마이크로박테리움 옥시단스 FS4 균체를 이용하는 것을 특징으로 하는 라미나린의 분해방법에 관한 것이다.Therefore, in another aspect, the present invention relates to a method for decomposing laminarin, which comprises using a laminarin degrading enzyme prepared by the above method or a microbacterium oxydans FS4 cell containing the laminarin degrading enzyme. .

라미나린은 상기 라미나린 분해효소 또는 상기 라미나린 분해효소를 함유하는 마이크로박테리움 옥시단스 FS4 균체에 의하여 글루코오스 및 올리고당으로 분해된다.Laminarin is broken down into glucose and oligosaccharides by the microbacterium oxydans FS4 cells containing the laminarin degrading enzyme or the laminarin degrading enzyme.

상기 올리고당으로는 라미나린다이오즈, 라미나린트리오즈, 라미나린헵타오즈 등을 예시할 수 있다.
Examples of the oligosaccharides include lamina Lindaose, laminarine triose, laminarineheptaose, and the like.

본 발명은 또 다른 관점에서, 상기 방법에 의해 제조된 알긴산 분해효소 또는 상기 알긴산 분해효소를 함유하는 마이크로박테리움 옥시단스 FS4 균체를 이용하는 것을 특징으로 하는 알긴산의 분해방법에 관한 것이다.In another aspect, the present invention relates to a method for decomposing alginic acid, which comprises using alginate degrading enzyme prepared by the above method or microbacterium oxydans FS4 cells containing the alginic acid degrading enzyme.

본 발명에 있어서, 상기 마이크로박테리움 옥시단스 균체 FS4는 마이크로박테리움 옥시단스 FS4 배양액, 마이크로박테리움 옥시단스 FS4 파쇄물까지 포함하는 용어이다.
In the present invention, the microbacterium oxidans bacteria FS4 is a term that includes the microbacterium oxydans FS4 culture and the microbacterium oxydans FS4 lysate.

[실시예][Example]

이하, 실시예를 통하여 본 발명을 더욱 상세히 설명하고자 한다. 이들 실시예는 오로지 본 발명을 예시하기 위한 것으로, 본 발명의 범위가 이들 실시예에 의해 제한되는 것으로 해석되지 않는 것은 당업계에서 통상의 지식을 가진 자에게 있어서 자명할 것이다. Hereinafter, the present invention will be described in more detail with reference to Examples. It is to be understood by those skilled in the art that these embodiments are only for illustrating the present invention and that the scope of the present invention is not construed as being limited by these embodiments.

실시예 1. 라미나린 분해 미생물의 순수분리Example 1 Pure Separation of Laminarin Degrading Microorganisms

낙동강 주변 토양 및 습지, 그리고 해삼 및 군소의 내장으로부터 채취한 샘플에서 효과적으로 라미나린을 분해하는 세균을 분리하였다. Bacteria that effectively degrade laminarin were isolated from samples taken from the soil and wetlands around the Nakdong River, and from the guts of sea cucumbers and small fish.

채취해온 샘플을 250-ml 플라스크의 다시마 첨가 배지(NH4Cl 0.1g/L, 다시마 조각 1㎝ × 1㎝ 이하, pH 6.8)에 접종하여 8일간 37℃, 180 rpm에서 진탕 배양한 후, 각각 0.8% 영양 배지(Nutrient broth, pH 6.8)에 1.5% 한천을 첨가한 고체배지에 도말하였다. 배양된 각 미생물은 순수한 콜로니로 분리될 때까지 계속하여 새로운 고체배지에 도말하여 각 균주를 최종 순수 분리하였다. 분리된 순수 균주는 4℃에 보관하면서 2주에 한 번씩 계대배양 하였다.Samples were collected and inoculated in a 250-ml flask of kelp addition medium (NH 4 Cl 0.1g / L, kelp pieces 1 cm × 1 cm or less, pH 6.8), followed by shaking culture at 37 ° C. and 180 rpm for 8 days, respectively. It was plated on a solid medium containing 1.5% agar in 0.8% nutrient medium (Nutrient broth, pH 6.8). Each of the cultured microorganisms was continuously plated on a new solid medium until pure colonies were separated, and each strain was finally purified. The isolated pure strains were subcultured every 2 weeks with storage at 4 ℃.

상기 분리된 순수 균주에서 유용한 미생물을 스크리닝하기 위하여, 라미나린 배지(Laminarin 1 g/L, MgSO4 0.1 g/L, NaCl 0.1 g/L, CaCl2 0.1g /L, (NH4)2SO4 2g/L, KH2PO4 0.5 g/L, Mineral 0.5 ml, Vitamin 0.5 ml, pH 6.8)에 1.5% 한천을 첨가한 고체배지에 상기 순수 균주를 도말하였다.In order to screen useful microorganisms in the isolated pure strain, laminarin medium (Laminarin 1 g / L, MgSO 4 0.1 g / L, NaCl 0.1 g / L, CaCl 2 0.1 g / L, (NH 4 ) 2 SO 4 2 g / L, 0.5 g / L of KH 2 PO 4 , 0.5 ml of Mineral, 0.5 ml of Vitamin, pH 6.8) and the pure strain was added to a solid medium to which 1.5% agar was added.

그 결과, 라미나린 한천배지에서 순수 콜로니를 형성하는 6종의 균주를 확인하였고, 상기 분리된 6개 균주를 FS1~FS6으로 명명하였다.
As a result, six strains forming pure colonies in laminarin agar medium were identified, and the six isolates were named FS1 to FS6.

실시예 2: 라미나린 분해 미생물의 선별 Example 2 Screening of Laminarin Degrading Microorganisms

실시예 1에서 분리한 6개의 순수 균주 중에서 서로에 대한 길항물질을 생산하는지 여부를 확인하기 위하여 라미나린 고체 배지에 서로 교차 되도록 도말하여 37℃에서 2일 동안 배양하였으며, 각 균주들을 15 ml 튜브 내의 8 ml 라미나린 액체배지에 접종하여 37℃, 180 rpm에서 8일간 진탕배양을 하며, 균주의 성장 곡선, 총 환원당과 pH를 측정하여 라미나린 분해능을 실험하였다.In order to confirm whether or not to produce an antagonist against each other among the six pure strains isolated in Example 1 was plated to cross each other in laminarin solid medium and incubated for 2 days at 37 ℃, each strain in a 15 ml tube Inoculated in 8 ml laminarin liquid medium was shaken for 8 days at 37 ℃, 180 rpm, the growth curve, total reducing sugar and pH of the strain was measured to test the laminarin resolution.

그 결과, 분리된 6종의 균주는 서로에게 길항물질을 생산하지 않는 균주임을 확인하였고, 라미나린 액체 배지에서 가장 높은 분해능을 보인 균주가 FS4임을 확인하였다(도 1).
As a result, it was confirmed that the six isolates are strains that do not produce antagonists to each other, and that the strain showing the highest resolution in laminarin liquid medium is FS4 (FIG. 1).

실시예 3. 라미나린 분해 미생물의 동정 및 기탁Example 3. Identification and Deposit of Laminarin Degrading Microorganisms

실시예 2에서 가장 높은 라미나린 분해능을 보인 FS4 균주를 그람염색(Gram staining), 카탈라제 테스트, 콜로니 형태 및 현미경 검사를 통하여 1차적으로 균주를 동정하였다. FS4 strain showing the highest laminarin resolution in Example 2 was identified primarily through Gram staining, catalase test, colony morphology and microscopic examination.

상기 FS4 균주는 영양 상태에서 활발한 운동성을 가지고, 0.5~1 μm의 넓이와 0.1~1.5 μm의 길이를 가지는 그람 양성의 간균이며, 서로 집단(cluster)을 이루고 있는 것으로 확인되었다. 그리고 0.8% 영양 고체 배지, 1% 라미나린 고체배지에 37℃, 2일간 배양하였을 때, 각각 노란색 콜로니와 흰색 콜로니를 형성하였으며, 카탈라제 테스트 결과, 양성임을 나타내었다. The FS4 strain is a gram-positive bacillus having a vigorous motility in a nutrient state, having a width of 0.5-1 μm and a length of 0.1-1.5 μm, and is clustered with each other. And when cultured in 0.8% nutrient solid medium, 1% laminarin solid medium at 37 ℃, 2 days, yellow colonies and white colonies were formed, respectively, catalase test results, it was shown to be positive.

2차 동정은 16S rDNA(16S rRNA coding gene) 염기서열에 기초한 분자계통분류학적 방법을 수행하였다. 각 균주의 염색체 DNA는 AccuPrep 염색체 DNA 추출 킷트(바이오니아, 한국)를 사용하여 분리하였으며, 분리된 DNA를 주형으로 하여 하기의 서열번호 1 및 서열번호 2의 프라이머를 이용하여 PCR을 수행하였다.Secondary identification was performed by molecular sifting based on 16S rDNA (16S rRNA coding gene) sequence. Chromosomal DNA of each strain was isolated using AccuPrep chromosome DNA extraction kit (Bionia, Korea), PCR was performed using the primers of SEQ ID NO: 1 and SEQ ID NO: 2 with the isolated DNA as a template.

PCR은 다음의 조건에서 수행하였다. 초기 변형은 95℃에서 5분간 실행하였고, 30 싸이클 증폭은 95℃에서 10초간, 55℃에서 30초간, 72℃에서 30초간 이루어졌으며, 최종 신장단계는 72℃에서 7분간 수행하였다.PCR was performed under the following conditions. Initial modification was performed at 95 ° C. for 5 minutes, 30 cycle amplification was performed at 95 ° C. for 10 seconds, 55 ° C. for 30 seconds, and 72 ° C. for 30 seconds, and the final stretching step was performed at 72 ° C. for 7 minutes.

PCR 수행결과, 각각의 균주에서 약 1500bp 크기 단편의 16S-rDNA 유전자가 증폭되었다. As a result of PCR, approximately 1500 bp fragment of 16S-rDNA gene was amplified in each strain.

[서열번호 1]: 5'-CCAGCAGCCGCGGTAATACG-3'[SEQ ID NO 1]: 5'-CCAGCAGCCGCGGTAATACG-3 '

[서열번호 2]: 5'-TACCAGGGTATCTAATCC-3'
[SEQ ID NO 2]: 5'-TACCAGGGTATCTAATCC-3 '

증폭된 PCR product는 (주)마크로젠에 16S-rDNA sequencing 분석을 의뢰한 후, FS4 균주의 16S-rDNA 부분 서열(서열번호 3)을 확인하고, BioEdit Sequence Alignment Editor(ver. 5.0.9, Hall, T., Nucleic Acids Symposium Series, 41: 95, 1999)를 이용하여 GenBank의 Advanced BLAST(http://www.ncbi.nlm.nih.gov)에서 상동성 검색을 수행하였다(Altschul et al., Nucleic Acids Res., 25: 3389, 1997).The amplified PCR product was commissioned by Macrogen Co., Ltd. for 16S-rDNA sequencing analysis, and then confirmed the 16S-rDNA subsequence (SEQ ID NO: 3) of the FS4 strain, and the BioEdit Sequence Alignment Editor (ver. 5.0.9, Hall, Homology searches were performed in GenBank's Advanced BLAST (http://www.ncbi.nlm.nih.gov) using T., Nucleic Acids Symposium Series , 41: 95, 1999 (Altschul et al ., Nucleic) . Acids Res. , 25: 3389, 1997).

그 결과, FS4 균주는 마이크로박테리움 옥시단스 종으로 동정되었다(표 1 참조).As a result, the FS4 strain was identified as Microbacterium oxidans species (see Table 1).

미생물microbe 16S-rDNA
크기
16S-rDNA
size
GenBank
Accession No.
GenBank
Accession No.
균주명Strain name 상동성Homology
FS4FS4 1429 bp 1429 bp HQ113206.1HQ113206.1 Microbacterium oxydansMicrobacterium oxydans 98%98%

마이크로박테리움 옥시단스로 동정된 FS4 균주는 2010년 8월 3일자로 국립농업과학원 농업유전자원센터에 수탁하였다(수탁번호: KACC91657P).
The FS4 strain identified as microbacterium oxydans was entrusted to the National Institute of Agricultural Science, Agricultural and Genetic Resources Center on August 3, 2010 (Accession Number: KACC91657P).

실시예 4. 마이크로박테리움 옥시단스 FS4의 라미나린 분해능 측정Example 4 Determination of Laminarin Resolution of Microbacterium Oxydans FS4

마이크로박테리움 옥시단스 FS4 균주의 라미나린을 분해능 및 유용물질 생산 가능성을 확인하였다.Laminarin of the microbacterium oxydans FS4 strain was confirmed the resolution and the possibility of producing useful substances.

마이크로박테리움 옥시단스 FS4 균주는 0.1% 라미나린 액체 배지에서 대수 증식기가 끝났을 때 원심분리로 수확한 후, 사용하였다.Microbacterium oxydans FS4 strain was used after harvesting by centrifugation at the end of the logarithmic growth phase in 0.1% laminarin liquid medium.

40 ml 라미나린 액체 배지가 담겨진 100 ml 플라스크에, 상기 균주 80 ㎍(wet cell)을 접종하여 37℃, 180 rpm에서 15일간 분해반응을 수행하였다. 생분해반응을 수행하는 동안 3일 간격으로 플라스크 내의 샘플을 채취하여 분해반응의 특성을 분석하였다. 분해반응 동안 배양 배지 내 pH의 변화는 pH meter (이스텍, 한국)을 이용해 측정하였으며, 균주의 농도는 3배로 희석한 샘플을 큐벳에 담은 후, 분광광도계(한빛 나노 바이오테크, 한국)를 이용하여 특정 파장(375 nm)에서 측정하였다. 분해반응에서 생성되는 총 환원당(Total Reducing sugars)의 농도는 배양액을 원심 분리(7000 rpm, 10분)한 상등액 100 ㎕과 1 ml DNS (3.5-dinitrosalicylic acid) 용액을 vortex를 이용하여 균일하게 혼합한 다음, 끓는 물에서 10분간 반응 시킨 후, 5분간 냉수에서 식힌 다음, 분광광도계를 이용하여 570 nm 파장에서 그 값을 측정하였다. A 100 ml flask containing 40 ml laminarin liquid medium was inoculated with 80 µg (wet cell) of the strain, and the degradation reaction was performed at 37 ° C. and 180 rpm for 15 days. During the biodegradation reaction, samples in the flask were taken at three day intervals to characterize the degradation reaction. Changes in pH in the culture medium during the degradation reaction were measured using a pH meter (ISTECH, Korea), and the concentration of the strain was measured by using a spectrophotometer (Hanbit Nano Biotech, Korea), after diluting the sample diluted three-fold in cuvettes. Measurement was made at a specific wavelength (375 nm). The total reducing sugars produced during the decomposition reaction were uniformly mixed with 100 μl of the supernatant obtained by centrifugation (7000 rpm, 10 minutes) and 1 ml DNS (3.5-dinitrosalicylic acid) solution using vortex. Then, after reacting for 10 minutes in boiling water, and then cooled in cold water for 5 minutes, the value was measured at a wavelength of 570 nm using a spectrophotometer.

또한, 라미나린 분해반응으로 생성되는 글루코오스(glucose) 및 다른 올리고당의 농도는 Sugar-pakTM 1 (Waters,6.5×300㎜) 컬럼을 사용한 HPLC/RID(Agilent Technologies 1200 series, USA)를 통하여 분석하였다. 분석용 용매는 0.8 ml/min 유속의 물을 사용하였으며, 디텍터와 오븐 온도는 각각 35℃와 80℃로 설정하여 분석하였다.In addition, the concentration of glucose and other oligosaccharides produced by laminarin digestion was analyzed by HPLC / RID (Agilent Technologies 1200 series, USA) using Sugar-pak TM 1 (Waters, 6.5 × 300 mm) column. . As the solvent for analysis, water of 0.8 ml / min flow rate was used, and the detector and oven temperatures were set to 35 ° C. and 80 ° C., respectively.

라미나린의 분해 결과를 살펴보면, 배양 초기 6.8 이었던 pH는 점점 감소하여 배양 15일의 최종 pH 값은 3.98이였으며, 균주의 밀도는 배양 9일 때 가장 높은 값을 보이며, 그 이후 일정한 농도로 유지한다는 것을 알 수 있었다. 생성된 총 환원당과 글루코오즈 농도는 각각 4.23 g/L 및 2.23 g/L이었으며, 화학양론적으로 볼 때, 라미나린이 분해되면 환원당으로 글루코오스 외에 올리고당과 같은 중간대사산물이 생성될 수 있음을 알 수 있었다(도 2).
In the result of decomposition of laminarin, the pH of 6.8 was gradually decreased, and the final pH value of 15 days of cultivation was 3.98. I could see that. The total reducing sugar and glucose concentration produced were 4.23 g / L, respectively. And 2.23 g / L, stoichiometrically, it was found that when the laminarin is decomposed, an intermediate metabolite such as oligosaccharide can be produced in addition to glucose as a reducing sugar (FIG. 2).

실시예 5. 라미나린 농도별 마이크로박테리움 옥시단스 FS4의 분해반응Example 5 Decomposition of Microbacterium Oxydans FS4 by Laminarin Concentration

다양한 라미나린 농도(1, 5 및 10 g/L)에서의 마이크로박테리움 옥시단스FS4 균주의 분해능을 확인하였다.The resolution of the microbacterium oxydans FS4 strains at various laminarin concentrations (1, 5 and 10 g / L) was confirmed.

배양은 각각의 다른 농도의 라미나린이 함유된 액체 배지에 0.2%(w/v) 상기균주를 접종하여 37℃, 180 rpm에서 15일간 배양하였고, 상기 실시예 4와 동일한 방법으로 라미나린 분해능을 확인하였다.The culture was inoculated with 0.2% (w / v) of the strain in a liquid medium containing different concentrations of laminarin and incubated at 37 ° C. and 180 rpm for 15 days, and the laminarin resolution was measured in the same manner as in Example 4. Confirmed.

각 라미나린 농도별 분해실험 결과를 살펴보면, 1 g/L의 라미나린 농도에서는 분해반응이 잘 일어나지 않아 총 환원당 및 글루코오스의 농도가 측정되지 못했고, 5 g/L와 10 g/L 라미나린 농도에서는 라미나린이 분해되면서 초기 pH 값 6.8에서 배양 6일 후에는 각각 4.18 및 4.07로 감소된 것을 확인하였다. 5 g/L 라미나린 농도에서는 배양 15일 후 생성된 총 환원당과 글루코오스의 농도가 각각 2.04 g/L 및 0.85 g/L이었으며, 10 g/L 라미나린 농도에서는 총 환원당과 글루코오스의 농도가 각각 5.54 g/L 및 3.36 g/L이 생성되었음을 확인하였다. 1 g/L 라미나린 농도를 사용하여 얻은 결과와 비교해 보면 확연하게 그 분해능의 차이를 알 수 있었다(도 3).In the results of the decomposition experiments for each laminarin concentration, the decomposition reaction did not occur well at the concentration of laminarin of 1 g / L, the total reducing sugar and glucose concentration was not measured, 5 g / L and 10 g / L The laminarin concentration was confirmed to be reduced to 4.18 and 4.07 after 6 days of culture at the initial pH value of 6.8 as the laminarin was decomposed. 5 g / L At laminarin concentration, the total reducing sugar and glucose concentration after 15 days of culture were 2.04 g / L, respectively. And 0.85 g / L, 10 g / L At laminarin concentrations, the total reducing sugar and glucose concentrations were 5.54 g / L, respectively. And 3.36 g / L were generated. Compared with the results obtained using the 1 g / L laminarin concentration it was clearly seen the difference in the resolution (Fig. 3).

5 g/L 및 10 g/L 라미나린 농도에서 채취한 미생물 배양액을 HPLC로 분석한 결과, 반응시간이 경과함에 따라 라미나린이 분해되면서 그 농도가 감소됨을 알 수 있었으며, 라미나린이 분해되면서 생성되는 환원당으로 글루코오스 외에 이탄당, 삼탄당 등의 중간대사산물이 생성됨을 확인하였다(도 4, 도 5). 5 g / L and 10 g / L As a result of analyzing the microbial cultures collected at the laminarin concentration by HPLC, it was found that as the reaction time elapsed, the concentration of the laminarin decreased and the concentration decreased.In addition to glucose, peat sugar and samtan are reduced sugars. It was confirmed that intermediate metabolites such as sugar were produced (FIGS. 4 and 5).

라미나린 각 농도별 분해 실험결과에서 10 g/L의 라미나린 농도에서 가장 좋은 분해반응이 일어남을 알 수 있었다.
In the results of the decomposition experiment for each concentration of laminarin, it was found that the best decomposition reaction occurred at the concentration of laminarin of 10 g / L.

실시예 6. 마이크로박테리움 옥시단스 FS4의 라미나린 및 알긴산 분해능 측정Example 6 Determination of Laminarin and Alginic Acid Resolution of Microbacterium Oxydans FS4

마이크로박테리움 옥시단스 FS4 균주가 라미나린 외에 갈조류의 대표적 다당류인 알긴산을 분해할 수 있는 능력이 있음을 확인하였다.It was confirmed that the microbacterium oxydans FS4 strain is capable of degrading alginic acid, which is a representative polysaccharide of brown algae, in addition to laminarin.

상기 균주가 라미나린 및 알긴산을 분해할 수 있는 능력을 관찰하기 위하여, 라미나린 배지(Laminarin 0.1 g/L, MgSO4 0.1 g/L, NaCl 0.1 g/L, CaCl2 0.1 g/L, (NH4)2SO4 2 g/L, KH2PO4 0.5 g/L, Mineral 0.5 ml, Vitamin 0.5ml, pH 6.8)와 알긴산 배지(Peptone 0.5 g/L, Sodium alginate 0.1 g/L, pH 6.8)에 1.5% 한천을 첨가한 고체 평판 배지의 중앙에 2일간 영양 액체 배지(0.8% Nutrient broth)에서 배양한 마이크로박테리움 옥시단스 FS4 균주 배양액 10 ㎕을 점적(drop)하여 건조시킨 후, 37℃ 배양기에서 배양하였다. 상기 균주가 배지 위에 콜로니를 형성한 후, 라미나린 평판배지에는 0.5%(w/v) 콩고레드 용액 10 ml을 투여하여 15분간 염색하고 나서 1 M NaCl로 2회 탈색을 한 다음, 콩고레드 용액으로 인해서 붉게 염색된 평판배지 상의 콜로니 주변에 노란색의 환의 형성 유무 및 시간에 따른 투명환의 크기 변화를 관찰 하였다(Lee, D. S., et al., Cloning and expression of a β-1,3-glucanase gene from Bacillus circulans KCTC3004 in Escherichia coli. Biotechnology letters 17 (4): 355-360, 1995). 알긴산 평판배지에는 10% cetylpyridinium chloride monohydrate(CPC)를 10 ml 투여하여 10분간 반응 시킨 다음, 액을 제거한 후 증류수로 배지 표면을 수세하여 10% CPC에 의해서 불투명한 색으로 변한 배지 상에서 콜로니 주변의 투명환 형성 유무 및 크기의 변화를 관찰하였다(Peter, G., et al., Plate assay for simultaneous detection of alginate lyases and determination of substrate specificity. Amerian Society of Microbiology 56 (7): 2265-2267, 1990). In order to observe the ability of the strain to degrade laminarin and alginic acid, laminarin medium (Laminarin 0.1 g / L, MgSO 4 0.1 g / L, NaCl 0.1 g / L, CaCl 2 0.1 g / L, (NH 4 ) 2 SO 4 2 g / L, 0.5 g / L KH 2 PO 4 , 0.5 ml of Mineral, 0.5 ml of Vitamin, pH 6.8) and a solid flat medium containing 1.5% agar in Alginate medium (Peptone 0.5 g / L, Sodium alginate 0.1 g / L, pH 6.8) 10 μl of the microbacterium oxydans FS4 strain culture medium incubated in nutrient liquid medium (0.8% Nutrient broth) for 2 days was dropped and dried, followed by incubation in a 37 ° C. incubator. After the strain formed colonies on the medium, the laminarin plate medium was stained for 15 minutes by administering 10 ml of 0.5% (w / v) Congo red solution, and then decolorized twice with 1 M NaCl, followed by Congo red solution. The presence of yellow ring formation around colonies on red stained plate medium and the change in size of transparent ring with time (Lee, DS, et al., Cloning and expression of a β-1,3-glucanase gene from Bacillus circulans KCTC3004 in Escherichia coli.Biotechnology letters 17 (4): 355-360, 1995). 10 ml of 10% cetylpyridinium chloride monohydrate (CPC) was applied to the alginic acid plate medium for 10 minutes.Then, the solution was removed and the surface of the medium was washed with distilled water to make the color opaque by 10% CPC. Ring formation and changes in size were observed (Peter, G., et al., Plate assay for simultaneous detection of alginate lyases and determination of substrate specificity. Amerian Society of Microbiology 56 (7): 2265-2267, 1990).

상기의 방법대로 실험한 결과, 라미나린 평판배지에서 배양된 콜로니 주변이 2일, 4일, 6일이 지남에 따라 반지름이 1 ㎝, 1.5 ㎝, 1.9 ㎝인 노란색 환이 형성되어 시간이 경과하면서 마이크로박테리움 옥시단스 FS4 균주의 라미나린의 분해에 의해 그 환의 크기가 점차 커지는 것을 확인하였고(도 6), 알긴산 평판배지에서도 콜로니 주변의 투명한 환이 2일, 4일, 6일이 지남에 따라 마이크로박테리움 옥시단스 FS4 균주의 알긴산의 분해에 의해 환의 반지름이 1 ㎝, 1.7 ㎝, 1.9 ㎝로 점차 커지는 것을 확인하였다(도 7).As a result of the experiment, as a result of the 2, 4, and 6 days of colonies cultured in laminarin plate medium, yellow rings having a radius of 1 cm, 1.5 cm, and 1.9 cm were formed, and micro It was confirmed that the ring size gradually increased by the degradation of laminarin of the Bacterium oxydans FS4 strain (FIG. 6), and in the alginate plate medium, the transparent ring around the colonies was changed to 2, 4 and 6 days. It was confirmed that the radius of the ring gradually increased to 1 cm, 1.7 cm, and 1.9 cm by decomposition of alginic acid of the Leeum oxydans FS4 strain (FIG. 7).

즉, 마이크로박테리움 옥시단스 FS4 균주는 갈조류가 함유하는 다당류 중 라미나린 외의 알긴산도 분해하는 능력을 가지고 있음을 확인하였다.
That is, it was confirmed that the microbacterium oxidans FS4 strain has the ability to decompose alginic acid other than laminarin among the polysaccharides contained in brown algae.

비교예 1. 피로코쿠스 푸리오수스 균주로부터 분리·정제한 β-1,3-glucanase의 라미나린 분해능 비교 Comparative Example 1. Comparison of laminin resolution of β-1,3-glucanase isolated and purified from pyrococcus puriosus strains

마이크로박테리움 옥시단스 FS4 균주의 라미나린 분해능을 비교하기 위하여, 호열성 세균인 피로코구스 푸리오수스 균주(수탁번호: KCCM 41005)로부터 얻은 β-1,3-glucanase 유전자를 대장균(E. coli)에서 대량 발현 시킨 후 분리·정제(Kim, D.G., et al., Applicaiton of β-1,3-glucanase from pyrococcus furisous for ethanol production using laminarin. Journal of Life Science 21 (1): 6, 69-73. 2011)한 효소를 균주 기탁자의 동의·협조를 얻어 실험에 사용하였다.In order to compare the laminarin resolution of the microbacterium oxydans FS4 strain, β-1,3-glucanase gene obtained from the pyrococcus puriosus strain (Accession No .: KCCM 41005), which is a thermophilic bacterium, was isolated from E. coli. (Kim, DG, et al., Applicaiton of β-1,3-glucanase from pyrococcus furisous for ethanol production using laminarin.Journal of Life Science 21 (1): 6, 69-73) 2011) An enzyme was used for the experiment with the consent and cooperation of the deposit depositor.

5 ㎍/ml 농도의 β-1,3-glucanase 효소를 50 mM Tris-HCl buffer(pH 7.5)에 1% 라미나린을 첨가하여 37℃ 및 60℃에서 180 rpm으로 7일간 반응시켜 라미나린이 분해되는 것을 분석하였다. 라미나린 분해반응 동안 용액 내 pH의 변화는 pH meter(이스텍, 한국)를 이용해 측정하였으며, 생성되는 총 환원당 농도는 100 ㎕ 효소 분해반응액과 1 ml의 DNS(3.5-dinitrosalicylic acid) 용액을 vortex를 이용하여 균일하게 혼합하고, 끓는 물에서 10분간 반응 시킨 후, 5분간 냉수에서 식힌 다음, 샘플을 큐벳에 담아 분광광도계(한빛 나노 바이오테크, 한국)을 이용하여 570 nm 파장에서 그 값을 측정하였다.Β-1,3-glucanase enzyme at 5 ㎍ / ml concentration was added to 50 mM Tris-HCl buffer (pH 7.5) and 1% laminarin was reacted at 180 rpm at 37 ℃ and 60 ℃ for 7 days to decompose laminarin. Was analyzed. The pH change in the solution during the laminarin digestion reaction was measured using a pH meter (ISTECH, Korea). The total reducing sugar concentration produced was 100 μl of enzyme digestion solution and 1 ml of DNS (3.5-dinitrosalicylic acid) solution. The mixture was uniformly mixed, reacted in boiling water for 10 minutes, cooled in cold water for 5 minutes, and the sample was put in a cuvette and measured at 570 nm using a spectrophotometer (Hanbit Nano Biotech, Korea). .

β-1,3-glucanase 효소의 라미나린 분해실험 결과, 37℃ 및 60℃에서의 각 분해반응 동안 용액 내 pH 변화는 없었으나, 60℃의 분해반응에서 생성된 총 환원당의 양이 37℃에서 생성된 양보다 많았다(도 8). 이 결과와 상기 실시예 4의 결과(도2)를 비교해 보면, 15일간 마이크로박테리움 옥시단스 FS4 균주에 의한 라미나린 분해반응 결과에서 생성된 최대 총환원당 농도는 4.84 g/L이었고, β-1,3-glucanase 효소에 의해 37℃ 및 60℃에서 생성된 총환원당 농도는 각각 5.88 g/L, 7.13 g/L로 조금 더 많은 양이 생성되었다.Laminarin decomposition of β-1,3-glucanase enzyme showed no pH change in solution during each degradation reaction at 37 ° C and 60 ° C, but the total amount of reducing sugars produced at the decomposition reaction at 60 ° C was increased at 37 ° C. More than the amount produced (FIG. 8). Comparing this result with the result of Example 4 (FIG. 2), the maximum total reduction sugar concentration produced in the result of laminarin degradation by the microbacterium oxydans FS4 strain for 15 days was 4.84 g / L, β-1 The total reducing sugar concentrations produced at 37 ° C. and 60 ° C. by, 3-glucanase enzyme were 5.88 g / L and 7.13 g / L, respectively.

이러한 차이는 실험에 사용한 마이크로박테리움 옥시단스 FS4 균주가 지닌 라미나린 분해효소의 양이 5 ㎍/ml 농도의 β-1,3-glucanase 효소보다 적은 양일 수도 있고, 마이크로박테리움 옥시단스 FS4 균주에 의한 라미나린 분해반응이 최적 조건에서 이루어지지 않았기 때문에 낮은 농도의 환원당이 생성될 수 있는 것으로 추측된다. 그러나 미생물 자체를 이용한 라미나린의 분해반응이 분리·정제한 효소의 반응보다 상대적으로 크게 떨어지지 않으면, 효소를 분리·정제하여 반응시키는 것에 비해 마이크로박테리움 옥시단스 FS4 균주를 이용하여 라미나린을 분해시키는 것이 더욱 경제적이라는 것은 자명한 사실이다.
The difference may be that the amount of laminin degrading enzyme in the microbacterium oxydans FS4 strain used in the experiment may be less than that of β-1,3-glucanase enzyme at a concentration of 5 ㎍ / ml, It is estimated that low concentrations of reducing sugars can be produced because the laminarin decomposition reaction was not performed under optimal conditions. However, if the decomposition reaction of laminarin using microorganisms does not fall significantly compared to the reaction of the purified and purified enzymes, the microorganism oxidase FS4 strain is used to decompose the laminarin compared to the isolated and purified enzymes. It is obvious that is more economic.

5 ㎍/ml 농도의 β-1,3-glucanase 효소를 기초 배지(MgSO4 0.1 g/L, NaCl 0.1 g/L, CaCl2 0.1 g/L, (NH4)2SO4 2 g/L, KH2PO4 0.5 g/L, Mineral 0.5 ml, Vitamin 0.5 ml, pH 6.8)에 1% 라미나린를 첨가한 용액에서 37℃, 180 rpm으로 15일간 라미나린 분해반응을 수행하였다. 라미나린 분해반응 동안 용액 내 일어나는 pH의 변화는 상기 방법과 동일하게 측정하였다. 글루코오스 및 다른 올리고다당의 생성 농도는 Sugar-pakTM 1(Waters,6.5×300 ㎜) 컬럼을 사용하여 상기 실시예 4와 동일하게 분석하였다. Β-1,3-glucanase enzyme at a concentration of 5 μg / ml was treated with basal medium (MgSO 4 0.1 g / L, NaCl 0.1 g / L, CaCl 2 0.1 g / L, (NH 4 ) 2 SO 4 2 g / L, KH 2 PO 4 0.5 g / L, Mineral 0.5 ml, Vitamin 0.5 ml, pH 6.8) in a solution of 1% laminarin was added to the laminarin decomposition reaction for 15 days at 37 ℃, 180 rpm. The pH change occurring in the solution during the laminarin decomposition reaction was measured in the same manner as the above method. Production concentrations of glucose and other oligopolysaccharides were analyzed in the same manner as in Example 4 above using a Sugar-pak 1 (Waters, 6.5 × 300 mm) column.

그 결과, 라미나린 분해반응 동안 pH값의 변화는 크지 않았으나, 환원당과 글루코오스의 최종 농도는 각각 6.24 g/L, 1.13 g/L로 총 환원당 생성 중 글루코오스로의 생성 비율은 낮았다(도 9). 상기 실시예 4의 마이크로박테리움 옥시단스 FS4 균주 자체를 이용한 라미나린 분해반응 결과(도2)와 분리·정제된 β-1,3-glucanase 효소에 의한 라미나린 분해반응을 비교해 보면, 마이크로박테리움 옥시단스 FS4 균주에 의해 생성되는 총환원당의 농도는 상대적으로 낮으나, 총환원당 중 글루코오스로의 생성 비율은 훨씬 높다는 것을 확인하였고, 결과적으로 마이크로박테리움 옥시단스 FS4 균주에 의한 라미나린 분해가 바이오에탄올의 생산 등에 더 유용하게 사용될 수 있음을 알 수 있었다.
As a result, the pH value did not change significantly during the laminarin decomposition reaction, but the final concentrations of reducing sugar and glucose were 6.24 g / L and 1.13 g / L, respectively. Comparing the results of laminarin digestion using the microbacterium oxydans FS4 strain of Example 4 itself (FIG. 2) and laminarin digestion by the isolated and purified β-1,3-glucanase enzyme, microbacterium The concentration of total reduced sugars produced by the oxydans FS4 strain was relatively low, but the production rate of glucose in the total reduced sugars was much higher. As a result, the degradation of laminarin by the microbacterium oxydans FS4 strain resulted in bioethanol. It can be seen that it can be used more useful for production.

이상으로 본 발명 내용의 특정한 부분을 상세히 기술하였는바, 당업계의 통상의 지식을 가진 자에게 있어서 이러한 구체적 기술은 단지 바람직한 실시 양태일 뿐이며, 이에 의해 본 발명의 범위가 제한되는 것이 아닌 점은 명백할 것이다. 따라서 본 발명의 실질적인 범위는 첨부된 청구항들과 그것들의 등가물에 의하여 정의된다고 할 것이다.
While the present invention has been particularly shown and described with reference to specific embodiments thereof, those skilled in the art will appreciate that such specific embodiments are merely preferred embodiments and that the scope of the present invention is not limited thereto will be. It is therefore intended that the scope of the invention be defined by the claims appended hereto and their equivalents.

농업생명공학연구원Agricultural Biotechnology Research Institute KACC91657PKACC91657P 2011080320110803

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Claims (8)

국립농업과학원 농업유전자원센터에 수탁번호 KACC91657P로 기탁된 마이크로박테리움 옥시단스 FS4(Microbacterium oxydans FS4).
Microbacterium oxydans FS4 deposited with KACC91657P with accession to the National Institute of Agricultural Science.
제1항에 있어서, 상기 마이크로박테리움 옥시단스 FS4는 라미나린 분해효소능 및 알긴산 분해 효소능을 가지는 것을 특징으로 하는 마이크로박테리움 옥시단스 FS4(Microbacterium oxydans FS4).
The method of claim 1, wherein the microbacterium oxydans FS4 ( microbacterium oxydans FS4) characterized in that it has the ability of laminin degrading enzyme and alginic acid degrading enzyme.
제1항에 있어서, 상기 마이크로박테리움 옥시단스 FS4는 서열번호 3의 16S-rDNA를 갖는 것을 특징으로 하는 마이크로박테리움 옥시단스 FS4(Microbacterium oxydans FS4).
The method of claim 1, wherein the microbacterium oxydans FS4 ( Microbacterium oxydans FS4), characterized in that having a 16S-rDNA of SEQ ID NO: 3.
제1항의 마이크로박테리움 옥시단스 FS4를 배양하는 것을 특징으로 하는 라미나린 또는 알긴산 분해효소의 제조방법.
A method for producing laminarin or alginic acid degrading enzyme, comprising culturing the microbacterium oxydans FS4 of claim 1.
제4항에 있어서, 상기 마이크로박테리움 옥시단스 FS4는 라미나린 또는 알긴산을 함유하는 배지에서 배양하는 것을 특징으로 하는 제조방법.
The method according to claim 4, wherein the microbacterium oxydans FS4 is cultured in a medium containing laminarine or alginic acid.
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