KR101168052B1 - Kits for Determining a Diabetes Mellitus and Uses Thereof - Google Patents

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Abstract

본 발명은 인간 당뇨병 진단용 키트 및 진단방법에 관한 것이다. 본 발명의 단일뉴클레오타이드 다형성(SNPs)인 APOA5(Apolipoprotein A5) 유전자 프로모터의 -1131 위치의 C 대립 유전자(APOA5-1131T>C)는 인간, 특히 한국인 여성에서 당뇨병을 진단하는 데 이용될 수 있다. 따라서, 본 발명의 SNPs를 포함하는 본 발명의 키트 및 방법은 매우 효과적이고 용이하게 인간 당뇨병을 진단할 수 있다.The present invention relates to a kit for diagnosing and diagnosing human diabetes. The C allele ( APOA5 -1131T> C) at the -1131 position of the APOA5 (Apolipoprotein A5) gene promoter, the single nucleotide polymorphisms (SNPs) of the present invention, can be used to diagnose diabetes in humans, especially Korean women. Accordingly, the kits and methods of the present invention comprising the SNPs of the present invention can diagnose human diabetes very effectively and easily.

아포지단백질 A5, SNP, 트리글리세라이드, 당뇨병, 심혈관 합병증 Apolipoprotein A5, SNP, Triglycerides, Diabetes, Cardiovascular Complications

Description

인간 당뇨병 진단용 키트 및 이의 이용{Kits for Determining a Diabetes Mellitus and Uses Thereof}Kits for Determining a Diabetes Mellitus and Uses Thereof}

본 발명은 인간 당뇨병 진단용 키트 및 진단방법에 관한 것이다.The present invention relates to a kit for diagnosing and diagnosing human diabetes.

아폴지단백질 A5 유전자(APOA5)는 인간의 금식 및 식이상태 모두에서 트리글리세라이드(TG) 대사에 포함되어 있다[1-3]. APOA5 유전자의 여러 통상적인 단일뉴클레오타이드 다형성(single nucleotide polymorphisms, SNPs) 중에서, APOA5 유전자 프로모터의 -1131 위치의 C 대립 유전자(allele; APOA5-1131T>C)가 고트리글리세라이드 혈증(hypertriglyceridemia) 및 많은 한민족집단에서 관상동맥 질환(Coronary Artery Disease, CAD)의 증가된 위험과 가장 밀접하게 연관성을 나타냈다. APOA5-1131SNP 상의 C 대립 유전자의 빈도는 집단 내에서도 다양한데, 이는 서양 사람들과 비교하여 동아시아인에게서 상대적으로 높다(중국인 및 일본인의 33% 및 한국인의 28-30%)[2, 4-9]. 본 발명자들의 이전 연구들에서, APOA5-1131C 대립 유전자는 더 높은 TG 레벨과 연관되어 있었으며, 통상적인 환경 인자들과는 독립적으로 한국인에서 더 높은 심혈관 질환(cardiovascular disease, CVD)에 관여 하는 인자로 유의하게 규명되었다[2, 10]. Apolloprotein A5 gene ( APOA5 ) is involved in triglyceride (TG) metabolism in both the fasting and dietary states of humans [1-3]. Among many common single nucleotide polymorphisms (SNPs) of the APOA5 gene, the C allele at the -1131 position of the APOA5 gene promoter ( APOA5 -1131T> C) is associated with hypertriglyceridemia and many Korean populations. Was most closely associated with an increased risk of coronary artery disease (CAD). The frequency of the C allele on APOA5-1131SNP also varies within the population, which is relatively high in East Asians (33% in Chinese and Japanese and 28-30% in Korean) compared to Westerners [2, 4-9]. In previous studies by the present inventors, APOA5 -1131C allele was associated with more high TG level, the typical environmental factors independently from those higher cardiovascular disease in Korean identify significant factor involved in the (cardiovascular disease, CVD) [2, 10].

고트리글리세라이드 혈증은 CVD에서 고전적인 위험 인자(risk factor)일 뿐 아니라 당뇨병(diabetes mellitus, DM)에서 지질 이상(abnormalities)을 유발하는 통상적으로 알려진 위험 인자이다. 또한, 고트리글리세라이드 혈증은 제2형 당뇨병에서 유발되는 아테롬성동맥경화증에 대한 독립(independent) 위험 인자이다[11, 12]. 결과적으로, APOA5 유전자는 제2형 당뇨병에서 혈관성 합병증의 발생 또는 당뇨병 자체의 발생을 위한 유력한 후보로서 각광받아 왔다. 하지만, 결과들은 아직까지 불일치하고 있는 상태이다. Zhai 등은 DM 환자에서 APOA5-1131C 대립 유전자의 빈도가 당뇨병이 없는 환자들의 대립 유전자 빈도보다 현저하게 더 높다는 것을 보고하였다[13]. CC 동형접합체(homozygote)가 TT 유전자형보다 DM의 위험이 약 3.75배 정도 더 높았으며 DM 환자 중에서 C 보인자들(C carriers)이 혈장 내 TG, 총-콜레스테롤 및 LDL-콜레스테롤의 레벨 증가에 기여하였지만, 인슐린 저항성(insulin resistance)에 대해 어떠한 효과도 없었다. Yan 등은 중국인 집단의 제2형 당뇨병에서 APOA5-1131C 대립 유전자와 TG 간의 증가된 연관성을 보였고 TT 환자들보다 C 보인자들에서 CAD를 가진 제2형 당뇨병의 위험이 두 배 정도 증가하였음을 발견하였다[14]. 하지만, 성별, 낮은 HDL-콜레스테롤 및 더 높은 TG, 및 흡연에 대한 보정(adjustment)은 증가된 위험을 현저하게 약화시켰다. 한편, Talmud 등은 15년 동안 건강한 UK 남자들에 대한 지속적인(follow-up) 연구를 통해 제2형 당뇨병의 발병 위험에 APOA5 유전자형(-1131T>C 및 S19W)의 효과가 없다고 보고하였다(Northwick Park Heart Study II; 15). 하지만, 한국인 집단에서 당뇨 병과 APOA5-1131T>C 다형성 간의 관계에 대한 어떠한 연구도 없었다.Hypertriglyceridemia is not only a classic risk factor in CVD but also a commonly known risk factor that causes lipid abnormalities in diabetes mellitus (DM). Hypertriglyceridemia is also an independent risk factor for atherosclerosis caused by type 2 diabetes [11, 12]. As a result, the APOA5 gene has been in the spotlight as a potential candidate for the development of vascular complications in type 2 diabetes or the development of diabetes itself. However, the results are still inconsistent. Zhai et al. Reported that the frequency of the APOA5 -1131C allele in DM patients was significantly higher than the frequency of the allele in patients without diabetes [13]. CC homozygote (homozygote) had a 3.75-fold higher risk of DM than TT genotype and C carriers in DM patients contributed to increased levels of TG, total-cholesterol and LDL-cholesterol in plasma. There was no effect on insulin resistance. Yan et al. Found an increased association between APOA5 -1131C allele and TG in type 2 diabetes in the Chinese population, and found that the risk of type 2 diabetes with CAD in C carriers was more than doubled in patients with TT. [14]. However, gender, low HDL-cholesterol and higher TG, and adjustment to smoking significantly diminished the increased risk. Meanwhile, Talmud et al. Reported a 15-year follow-up study of healthy UK men that had no effect of the APOA5 genotypes (-1131T> C and S19W) on the risk of developing type 2 diabetes (Northwick Park Heart). Study II; 15). However, there were no studies on the relationship between diabetes and APOA5 -1131T> C polymorphism in the Korean population.

본 명세서 전체에 걸쳐 다수의 논문 및 특허문헌이 참조되고 그 인용이 표시되어 있다. 인용된 논문 및 특허문헌의 개시 내용은 그 전체로서 본 명세서에 참조로 삽입되어 본 발명이 속하는 기술 분야의 수준 및 본 발명의 내용이 보다 명확하게 설명된다.Numerous papers and patent documents are referenced and cited throughout this specification. The disclosures of the cited papers and patent documents are incorporated herein by reference in their entirety to better understand the state of the art to which the present invention pertains and the content of the present invention.

본 발명자들은 인간의 당뇨병을 진단하기 위한 신규한 방법을 개발하고자 노력하였다. 그 결과, 본 발명자들은 인간 아포지단백질 A5(APOA5) 유전자 프로모터의 -1131 위치의 C 대립 유전자(allele; APOA5-1131T>C)의 단일뉴클레오타이드 다형성(single nucleotide polymorphisms, SNPs)이 한국인 여성들에서 당뇨병의 위험도와 높은 연관성을 가지며, 상술한 C 대립 유전자가 CC 동형접합체(homozygote)일 경우 TT 또는 TG 유전자형(genotype)인 경우보다 당뇨병 및 심혈관 합병증의 위험도가 더욱 더 증가한다는 것을 발견함으로써, 본 발명을 완성하게 되었다.The inventors have sought to develop new methods for diagnosing diabetes in humans. As a result, the present inventors have found that human apolipoprotein A5 (APOA5) C allele of the -1131 position of the promoter gene; single nucleotide polymorphism of (allele APOA5 -1131T> C) ( single nucleotide polymorphisms, SNPs) the risk of diabetes in Korean women The present invention is completed by finding that the C allele described above is a CC homozygote, and the risk of diabetes and cardiovascular complications is increased more than that of the TT or TG genotype. It became.

따라서, 본 발명의 목적은 인간 당뇨병 진단용 키트를 제공하는 데 있다.Accordingly, it is an object of the present invention to provide a kit for diagnosing human diabetes.

본 발명의 다른 목적은 인간 당뇨병 진단방법을 제공하는 데 있다.Another object of the present invention is to provide a method for diagnosing human diabetes.

본 발명의 다른 목적 및 이점은 하기의 발명의 상세한 설명, 청구범위 및 도면에 의해 보다 명확하게 된다.Other objects and advantages of the present invention will become more apparent from the following detailed description of the invention, claims and drawings.

본 발명의 일 양태에 따르면, 본 발명은 서열목록 제1서열인 APOA5(Apolipoprotein A5) 유전자 프로모터의 -1131 위치의 C 뉴클레오타이드(APOA5-1131T>C)를 포함하는 C 대립 유전자의 10-100개의 연속 뉴클레오타이드 서열에 특이적으로 결합하는 프라이머 또는 프로브를 포함하는 인간 당뇨병 진단용 키트를 제공한다.According to an aspect of the present invention, the present invention provides 10-100 consecutive sequences of the C allele comprising the C nucleotide ( APOA5 -1131T> C) at the -1131 position of the APOA5 gene promoter, which is SEQ ID NO: 1 It provides a kit for diagnosing human diabetes comprising a primer or probe that specifically binds to the nucleotide sequence.

본 발명자들은 인간의 당뇨병을 진단하기 위한 신규한 방법을 개발하고자 노력하였다. 그 결과, 본 발명자들은 인간 아포지단백질 A5(APOA5) 유전자 프로모터의 -1131 위치의 C 대립 유전자(allele; APOA5-1131T>C)의 단일뉴클레오타이드 다형성(single nucleotide polymorphisms, SNPs)이 한국인 여성들에서 당뇨병의 위험도와 높은 연관성을 가지며, 상술한 C 대립 유전자가 CC 동형접합체(homozygote)일 경우 TT 또는 TG 유전자형(genotype)인 경우보다 당뇨병 및 심혈관 합병증의 위험도가 더욱 더 증가한다는 것을 발견하였다.The inventors have sought to develop new methods for diagnosing diabetes in humans. As a result, the present inventors have found that human apolipoprotein A5 (APOA5) C allele of the -1131 position of the promoter gene; single nucleotide polymorphism of (allele APOA5 -1131T> C) ( single nucleotide polymorphisms, SNPs) the risk of diabetes in Korean women It has been found that the C allele described above has an increased risk of diabetes and cardiovascular complications than the TT or TG genotype.

본 발명은 아포지단백질 A5과 당뇨병의 연관성을 한국인 여성들에게서 조사하였다.The present invention investigated the association of apolipoprotein A5 with diabetes in Korean women.

아포지단백질 A5는 관상동맥 질환(Coronary Artery Disease, CAD)의 주요한 위험인자인 혈장 트리글리세라이드 레벨의 결정적인 결정인자(determinant)로, VLDL(very low-density lipoprotein), HDL(high-density lipoprotein) 또는 킬로마이크론(chylomicrons) 등을 포함하는 지단백질의 한 요소이다. 아포지단백질 A5는 LDL-R 유전자 패밀리 수용체와 상호작용하여 지단백질 대사에 영향을 미친다(Nilsson SK, Christensen S, Raarup MK, Ryan RO, Nielsen MS and Olivecrona G, Endocytosis of apolipoprotein AV by members of the low density lipoprotein receptor and the Vps10p domain receptor families. J. Biol. Chem., 283: 25920-25927(2008)).Apolipoprotein A5 is a determinant of plasma triglyceride levels, a major risk factor for coronary artery disease (CAD), and is very low-density lipoprotein (VLDL), high-density lipoprotein (HDL), or kilo It is an element of lipoproteins, including chylomicrons. Apolipoprotein A5 interacts with LDL-R gene family receptors to affect lipoprotein metabolism (Nilsson SK, Christensen S, Raarup MK, Ryan RO, Nielsen MS and Olivecrona G, Endocytosis of apolipoprotein AV by members of the low density lipoprotein receptor and the Vps10p domain receptor families.J. Biol. Chem. , 283: 25920-25927 (2008)).

본 발명에 따르면, 본 발명의 APOA5-1131T>C는 당뇨병과 매우 밀접한 연관성을 나타낸다. 본 발명의 키트는 서열목록 제1서열인 APOA5(Apolipoprotein A5) 유전자 프로모터의 -1131 위치의 C 뉴클레오타이드(APOA5-1131T>C)를 포함하는 C 대립 유전자의 10-100개의 연속 뉴클레오타이드 서열에 특이적으로 결합하는 프라이머 또는 프로브를 포함하며, 상기 C 뉴클레오타이드를 상보적으로 표현하면 G 뉴클레오타이드이고 이를 이용하여 인간 당뇨병을 진단할 수 있다. 보다 바람직하게는, 본 발명의 키트는 한국인 여성들에게 이용될 수 있다.According to the invention, the present invention APOA5 -1131T> C shows a very close correlation with diabetes. The kit of the present invention specifically relates to 10-100 consecutive nucleotide sequences of the C allele comprising the C nucleotide ( APOA5 -1131T> C) at the -1131 position of the APOA5 gene promoter, SEQ ID NO: 1 Comprising a binding primer or probe, Complementary expression of the C nucleotides are G nucleotides can be used to diagnose human diabetes. More preferably, the kit of the present invention can be used for Korean women.

본 명세서에서 용어, “뉴클레오타이드”는 단일가닥 또는 이중가닥 형태로 존재하는 디옥시리보뉴클레오타이드 또는 리보뉴클레오타이드이며, 다르게 특별하게 언급되어 있지 않은 한 자연의 뉴클레오타이드의 유사체를 포함한다 (Scheit, Nucleotide Analogs, John Wiley, New York(1980); Uhlman 및 Peyman, Chemical Reviews, 90:543-584(1990)).As used herein, the term “nucleotide” is a deoxyribonucleotide or ribonucleotide that exists in single- or double-stranded form, and includes analogs of natural nucleotides unless otherwise specified (Scheit, Nucleotide Analogs, John Wiley, New York (1980); Uhlman and Peyman, Chemical Reviews , 90: 543-584 (1990).

본 발명은 APOA5(Apolipoprotein A5) 유전자 프로모터 뉴클레오타이드 서열에서 -1131 위치의 뉴클레오타이드가 “C”인 대립 유전자에 관한 것이나, 이러한 대립유전자 뉴클레오타이드가 이중가닥의 gDNA(genomic DNA)에서 발견되는 경우, 상기한 뉴클레오타이드 서열에 대하여 상보적인 뉴클레오타이드 서열도 포함하는 것으로 해석된다. 즉, 상보적인 뉴클레오타이드 서열에서 단일뉴클레오타이드 다형성(single nucleotide polymorphisms, SNPs)인 “C ”는 “T”가 된다. 이러한 측면에서, 본 명세서의 모든 서열은, 특별한 언급이 없는 한, gDNA에서 센스 가닥에 있는 서열을 기준으로 한 것이다.The present invention relates to an allele in which the nucleotide at the -1131 position in the APOA5 (Apolipoprotein A5) gene promoter nucleotide sequence is "C", but when such an allele nucleotide is found in a double stranded genomic DNA (gDNA) It is also understood to include nucleotide sequences that are complementary to the sequence. In other words, "C", which is a single nucleotide polymorphism (SNPs), becomes "T" in the complementary nucleotide sequence. In this aspect, all sequences herein are based on sequences in the sense strand in gDNA, unless otherwise noted.

본 명세서에서 “단일뉴클레오타이드 다형성(single nucleotide polymorphisms, SNPs)”은 게놈에서 단일염기(A, T, C 또는 G)가 종의 멤버들 간 또는 한 개체(individual)의 쌍 염색체 간에 다른 경우에 발생하는 DNA 서열의 다양성을 의미한다. 예를 들어, 서로 다른 개체의 세 개의 DNA 단편들(예: AAGT[A/A]AG, AAGT[A/G]AG, AAGT[G/G]AG, 본 발명의 SNP에서 -1131T/C는 A/G의 상보적인 염기로 표기하였음)처럼 단일염기에서 차이를 포함하는 경우, 두 개의 대립 유전자(C 또는 T)라고 부르며, 일반적으로 거의 모든 SNPs는 두 개의 대립 유전자를 가진다. 한 집단(population)내에서, SNPs는 소수 대립인자 빈도(minor allele frequency, MAF; 특정 집단에서 발견되는 유전자위치(locus)에서 가장 낮은 대립인자 빈도)로 할당될 수 있다. 인간 집단 내에서 변이성(variations)이 존재하며, 지질학적 또는 민족적 군에서 공통적인 하나의 SNP 대립 유전자는 매우 희귀하다. 단일염기는 폴리뉴클레오타이드 서열에 변화(대체), 제거(결실) 또는 첨가(삽입)될 수 있다. SNP는 번역 프레임의 변화를 유발할 수 있다. As used herein, “single nucleotide polymorphisms” (SNPs) are those that occur when a single base (A, T, C, or G) in the genome differs between members of a species or between paired individual chromosomes of an individual. Refers to the diversity of DNA sequences. For example, three DNA fragments from different individuals (eg AAGT [A / A] AG, AAGT [A / G] AG, AAGT [G / G] AG, -1131T / C in the SNP of the present invention is expressed as a complementary base of A / G ) When included, it is called two alleles (C or T), and generally all SNPs have two alleles. Within a population, SNPs may be assigned a minor allele frequency (MAF; the lowest allele frequency at the locus found in a particular population). Variations exist within the human population, and one SNP allele common in geological or ethnic groups is very rare. Single bases can be altered (replaced), removed (deleted) or added (inserted) to the polynucleotide sequence. SNPs can cause changes in the translation frame.

단일뉴클레오타이드 다형성은 유전자의 코딩 서열, 유전자의 비-코딩 부위 또는 유전자 사이의 내부 지역(intergenic regions)에 포함될 수 있다. 유전자의 코딩 서열 내의 SNP는 유전암호의 중복성(degeneracy)으로 인해 반드시 타겟 단백질의 아미노산 서열 상에 변화를 일으키지는 않는다. 동일한 폴리펩타이드 서열을 형성하는 SNP는 동의적(synonymous)이라 하고(때때로, 침묵 돌연변이라 불리움), 다른 폴리펩타이드 서열을 형성하는 SNP의 경우 비-동의적(non-synonymous)이라고 한다. 비-동의적 SNP는 미스센스 또는 넌센스일 수 있으며, 미스센스 변화는 다른 아미노산을 발생시키는 반면에 넌센스 변화는 비성숙 종결코돈을 형성한다. 단백질-코딩 부위가 아닌 곳에 존재하는 SNP는 유전자 사일런싱, 전사인자 결합 또는 비-코딩 RNA 서열을 유발시킬 수 있다.Mononucleotide polymorphisms can be included in coding sequences of genes, non-coding regions of genes or intergenic regions between genes. SNPs in the coding sequence of a gene do not necessarily cause a change in the amino acid sequence of the target protein due to the degeneracy of the genetic code. SNPs that form the same polypeptide sequence are called synonymous (sometimes called silent mutations), and non-synonymous for SNPs that form other polypeptide sequences. Non-synonymous SNPs can be missense or nonsense, where the missense change results in another amino acid, while the nonsense change forms a nonmature termination codon. SNPs that are not at the protein-coding site can cause gene silencing, transcription factor binding or non-coding RNA sequences.

인간의 DNA 서열 상의 변이성은 병의 발병 및 인간이 어떻게 병원체, 화학물질, 약물, 백신 및 다른 시약에 반응하는 가에 영향을 미칠 수 있다. 또한, SNPs는 맞춤형 의약의 개념을 실현하기 위한 중요한 도구(key enabler)로 생각된다. 무엇보다도, 최근에 마커로서 활발하게 개발되고 있는 SNPs는 질병을 가지거나 또는 가지지 않는 군들 간에 게놈 부위를 비교함으로써 질병을 진단하는 생의학적 연구에서 가장 중요하다. SNPs는 인간 게놈의 가장 많은 변이이며, 1.9 kb 당 하나의 SNP 비율로 존재하는 것으로 추측되고 있다(Sachidanandam et al., 2001). SNPs는 매우 안정된 유전적 마커이고, 때때로 표현형에 직접적인 영향을 미치며, 자동화된 유전자형규명 시스템에 매우 적합하다(Landegren et al., 1998; Isaksson et al., 2000). 또한, SNPs 연구는 곡식 및 가축 육성 프로그램에서도 중요하다.Variability on human DNA sequences can affect the onset of disease and how humans respond to pathogens, chemicals, drugs, vaccines, and other reagents. SNPs are also considered to be key enablers for realizing the concept of personalized medicine. Above all, SNPs, which are being actively developed as markers recently, are the most important in biomedical research to diagnose diseases by comparing genomic regions between groups with or without disease. SNPs are the largest variation of the human genome, and are believed to exist at one SNP ratio per 1.9 kb (Sachidanandam et al., 2001). SNPs are very stable genetic markers, sometimes directly affecting the phenotype, and are well suited for automated genotyping systems (Landegren et al., 1998; Isaksson et al., 2000). SNPs research is also important in grain and livestock raising programs.

본 발명에 따르면, 본 발명은 서열목록 제 1 서열의 폴리뉴클레오타이드에 어닐링할 수 있으며, 서열목록 제 1 서열의 -1131번째 뉴클레오타이드를 포함하는 폴리뉴클레오타이드를 증폭할 수 있도록 제작된 프라이머쌍을 포함하는 인간 당뇨병 진단용 키트를 포함한다.According to the present invention, the present invention can be annealed to a polynucleotide of SEQ ID NO: 1 sequence, and comprises a primer pair designed to amplify a polynucleotide comprising the -1131 nucleotide of SEQ ID NO: 1 sequence Diabetic diagnostic kits.

바람직하게는, 상기 프라이머쌍 중에서 전방향 프라이머는 서열목록 제 1 서열에서 -1131번째 뉴클레오타이드에 해당하는 인간 당뇨병-관련 단일뉴클레오타이드 다형성(SNP) 염기에 인접한 서열과 어닐링할 수 있는 뉴클레오타이드 서열을 포 함하며, 상기 전방향 프라이머의 3’-말단은 상기 SNP 염기에 상보적인 염기를 갖는다.Preferably, the forward primer among the primer pairs includes a nucleotide sequence capable of annealing with a sequence adjacent to a human diabetes-associated mononucleotide polymorphism (SNP) base corresponding to the -1131 nucleotide in SEQ ID NO: 1; , 3′-end of the forward primer has a base complementary to the SNP base.

본 발명의 바람직한 구현예에 따르면, 본 발명의 방법은 유전자 증폭 또는 마이크로어레이일 수 있다. 보다 바람직하게는, 본 발명의 증폭은 PCR(polymerase chain reaction)에 따라 실시된다. 본 발명의 바람직한 구현예에 따르면, 본 발명의 프라이머는 유전자 증폭 반응(amplification reactions)에 이용된다.According to a preferred embodiment of the invention, the method of the invention may be gene amplification or microarray. More preferably, the amplification of the present invention is carried out according to a polymerase chain reaction (PCR). According to a preferred embodiment of the present invention, the primers of the present invention are used for gene amplification reactions.

본 명세서에 기재된 용어“증폭 반응”은 핵산 분자를 증폭하는 반응을 의미한다. 다양한 증폭 반응들이 당업계에 보고 되어 있으며, 이는 중합효소 연쇄반응(PCR)(미국 특허 제4,683,195, 4,683,202, 및 4,800,159호), 역전사-중합효소 연쇄반응(RT-PCR)(Sambrook 등, Molecular Cloning. A Laboratory Manual, 3rd ed. Cold Spring Harbor Press(2001)), Miller, H. I.(WO 89/06700) 및 Davey, C. 등(EP 329,822)의 방법, 리가아제 연쇄 반응(ligase chain reaction; LCR)(17, 18), Gap-LCR(WO 90/01069), 복구 연쇄 반응(repair chain reaction; EP 439,182), 전사-중재 증폭(transcription-mediated amplification; TMA)(19) (WO 88/10315), 자가 유지 염기서열 복제(self sustained sequence replication)(20)(WO 90/06995), 타깃 폴리뉴클레오티드 염기서열의 선택적 증폭(selective amplification of target polynucleotide sequences)(미국 특허 제6,410,276호), 컨센서스 서열 프라이밍 중합효소 연쇄 반응(consensus sequence primed polymerase chain reaction; CP-PCR)(미국 특허 제4,437,975호), 임의적 프라이밍 중합효소 연쇄 반응(arbitrarily primed polymerase chain reaction; AP-PCR)(미국 특허 제5,413,909호 및 제5,861,245호), 핵산 염기서열 기반 증폭(nucleic acid sequence based amplification; NASBA)(미국 특허 제5,130,238호, 제5,409,818호, 제5,554,517호, 및 제6,063,603호), 가닥 치환 증폭(strand displacement amplification)(21, 22) 및 고리-중재 항온성 증폭(loop-mediated isothermal amplification; LAMP)(23)를 포함하나, 이에 한정되지는 않는다. 사용 가능한 다른 증폭 방법들은 미국특허 제5,242,794, 5,494,810, 4,988,617호 및 미국 특허 제09/854,317호에 기술되어 있다.As used herein, the term “amplification reaction” means a reaction that amplifies a nucleic acid molecule. Various amplification reactions are reported in the art, which include polymerase chain reaction (PCR) (US Pat. Nos. 4,683,195, 4,683,202, and 4,800,159), reverse transcriptase-polymerase chain reaction (RT-PCR) (Sambrook et al., Molecular Cloning. A Laboratory Manual , 3rd ed.Cold Spring Harbor Press (2001)), Miller, HI (WO 89/06700) and Davey, C. et al. (EP 329,822), ligase chain reaction (LCR) ( 17, 18), Gap-LCR (WO 90/01069), repair chain reaction (EP 439,182), transcription-mediated amplification (TMA) (19) (WO 88/10315), autologous Self sustained sequence replication (20) (WO 90/06995), selective amplification of target polynucleotide sequences (US Pat. No. 6,410,276), consensus sequence priming polymerase chain Consensus sequence primed polymerase chain reaction (CP-PCR) (US Pat. No. 4,437,975), optionally Arbitrarily primed polymerase chain reaction (AP-PCR) (US Pat. Nos. 5,413,909 and 5,861,245), nucleic acid sequence based amplification (NASBA) (US Pat. No. 5,130,238, 5,409,818, 5,554,517, and 6,063,603), strand displacement amplification (21, 22) and loop-mediated isothermal amplification; LAMP) 23, but is not limited thereto. Other amplification methods that can be used are described in US Pat. Nos. 5,242,794, 5,494,810, 4,988,617 and US Pat. No. 09 / 854,317.

PCR은 가장 잘 알려진 핵산 증폭 방법으로, 그의 많은 변형과 응용들이 개발되어 있다. 예를 들어, PCR의 특이성 또는 민감성을 증진시키기 위해 전통적인 PCR 절차를 변형시켜 터치다운(touchdown) PCR, 핫 스타트(hot start) PCR, 네스티드(nested) PCR 및 부스터(booster) PCR이 개발되었다. 또한, 실시간(real-time) PCR, 분별 디스플레이 PCR(differential display PCR: DD-PCR), cDNA 말단의 신속 증폭(rapid amplification of cDNA ends: RACE), 멀티플렉스 PCR, 인버스 중합효소 연쇄반응(inverse polymerase chain reaction: IPCR), 벡토레트(vectorette) PCR 및 TAIL-PCR(thermal asymmetric interlaced PCR)이 특정한 응용을 위해 개발되었다. PCR에 대한 자세한 내용은 McPherson, M.J., 및 Moller, S.G. PCR. BIOS Scientific Publishers, Springer-Verlag New York Berlin Heidelberg, N.Y. (2000)에 기재되어 있으며, 그의 교시사항은 본 명세서에 참조로 삽입된다.PCR is the best known nucleic acid amplification method, and many modifications and applications thereof have been developed. For example, touchdown PCR, hot start PCR, nested PCR, and booster PCR have been developed by modifying traditional PCR procedures to enhance the specificity or sensitivity of PCR. In addition, real-time PCR, differential display PCR (DD-PCR), rapid amplification of cDNA ends (RACE), multiplex PCR, inverse polymerase chain reaction (inverse polymerase) chain reaction (IPCR), vectorette PCR and thermal asymmetric interlaced PCR (TAIL-PCR) have been developed for specific applications. For more information on PCR, see McPherson, MJ, and Moller, SG PCR . BIOS Scientific Publishers, Springer-Verlag New York Berlin, Heidelberg, NY (2000), the teachings of which are incorporated herein by reference.

본 발명의 진단용 키트를 프라이머를 이용하여 실시하는 경우에는, 유전자 증폭 반응을 실시하여 본 발명의 마커의 뉴클레오티드 서열을 분석하여 진단한다. 본 발명은 본 발명의 마커의 뉴클레오티드 서열을 검출하는 것이기 때문에, 분석 대상의 시료(예컨대, 게놈 DNA)에서 본 발명의 마커의 뉴클레오티드 서열을 결정함으로써 조사하여 MS 또는 DM을 결정할 수 있다.When the diagnostic kit of the present invention is carried out using a primer, a gene amplification reaction is performed to analyze the nucleotide sequence of the marker of the present invention. Since the present invention is to detect the nucleotide sequence of the marker of the present invention, the MS or DM can be determined by investigating by determining the nucleotide sequence of the marker of the present invention in a sample (eg, genomic DNA) to be analyzed.

본 발명의 가장 바람직한 구현예에서, 증폭 과정은 미국특허 제4,683,195호, 제4,683,202호 및 제4,800,159호에 개시된 PCR(polymerase chain reaction)에 따라 실시된다.In the most preferred embodiment of the invention, the amplification process is carried out according to the polymerase chain reaction (PCR) disclosed in US Pat. Nos. 4,683,195, 4,683,202 and 4,800,159.

본 명세서에서 사용되는 용어 “프라이머”는 올리고뉴클레오타이드를 의미하는 것으로, 핵산쇄(주형)에 상보적인 프라이머 연장 산물의 합성이 유도되는 조건, 즉, 뉴클레오타이드와 DNA 중합효소와 같은 중합제의 존재, 그리고 적합한 온도와 pH의 조건에서 합성의 개시점으로 작용할 수 있다. 바람직하게는, 프라이머는 디옥시리보뉴클레오타이드이며 단일쇄이다. 본 발명에서 이용되는 프라이머는 자연(naturally occurring) dNMP(즉, dAMP, dGMP, dCMP 및 dTMP), 변형 뉴클레오타이드 또는 비-자연 뉴클레오타이드를 포함할 수 있다. 또한, 프라이머는 리보뉴클레오타이드도 포함할 수 있다.As used herein, the term “primer” refers to an oligonucleotide, which is a condition in which the synthesis of a primer extension product complementary to a nucleic acid chain (template) is induced, i.e., the presence of a polymerizer such as nucleotide and DNA polymerase, and It can serve as a starting point for the synthesis at conditions of suitable temperature and pH. Preferably, the primer is deoxyribonucleotide and single chain. Primers used in the present invention may comprise naturally occurring dNMP (ie, dAMP, dGMP, dCMP and dTMP), modified nucleotides or non-natural nucleotides. In addition, the primer may also include ribonucleotides.

본 명세서에서 용어 “연장 프라이머(extension primer)"는 타겟 핵산에 어닐링 되어 주형-의존성 핵산 중합효소에 의해 타겟 핵산에 상보적인 서열을 형성하는 프라이머를 의미한다. 이 연장 프라이머는 고정화 프로브가 어닐링 되어 있는 위치까지 연장되어 프로브가 어닐링 되어 있는 부위를 차지한다.As used herein, the term "extension primer" refers to a primer that is annealed to a target nucleic acid to form a sequence complementary to the target nucleic acid by a template-dependent nucleic acid polymerase. The extension primer is an annealed probe. It extends to position to occupy the region where the probe is annealed.

본 발명에서 이용되는 연장 프라이머는 타겟 핵산의 제1위치에 상보적인 혼 성화 뉴클레오타이드 서열을 포함한다. 용어 “상보적”은 소정의 어닐링 또는 혼성화 조건하에서 프라이머 또는 프로브가 타겟 핵산 서열에 선택적으로 혼성화할 정도로 충분히 상보적인 것을 의미하며, 실질적으로 상보적(substantially complementary) 및 완전히 상보적(perfectly complementary)인 것을 모두 포괄하는 의미를 가지며, 바람직하게는 완전히 상보적인 것을 의미한다. 본 명세서에서, 프라이머 서열과 관련하여 사용되는 용어, “실질적으로 상보적인 서열”은 완전히 일치되는 서열뿐만 아니라, 특정 서열에 어닐링하여 프라이머 역할을 할 수 있는 범위 내에서, 비교 대상의 서열과 부분적으로 불일치되는 서열도 포함되는 의미이다.The extension primer used in the present invention includes a hybridizing nucleotide sequence complementary to the first position of the target nucleic acid. The term “complementary” means that the primer or probe is sufficiently complementary to selectively hybridize to a target nucleic acid sequence under certain annealing or hybridization conditions, and is substantially complementary and perfectly complementary. It has the meaning encompassing all, and preferably means completely complementary. As used herein, the term “substantially complementary sequence” as used in connection with a primer sequence is intended to partially match the sequence to be compared, as well as to the exact match, as well as to the extent that it may serve as a primer by annealing to a particular sequence. Mismatched sequences are also included.

프라이머는, 중합제의 존재 하에서 연장 산물의 합성을 프라이밍시킬 수 있을 정도로 충분히 길어야 한다. 프라이머의 적합한 길이는 다수의 요소, 예컨대, 온도, 응용분야 및 프라이머의 소스(source)에 따라 결정되지만 전형적으로 15-30 뉴클레오타이드이다. 짧은 프라이머 분자는 주형과 충분히 안정된 혼성 복합체를 형성하기 위하여 일반적으로 보다 낮은 온도를 요구한다. 용어 “어닐링” 또는 “프라이밍”은 주형 핵산에 올리고디옥시뉴클레오타이드 또는 핵산이 병치(apposition)되는 것을 의미하며, 상기 병치는 중합효소가 뉴클레오타이드를 중합시켜 주형 핵산 또는 그의 일부분에 상보적인 핵산 분자를 형성하게 한다.The primer should be long enough to prime the synthesis of the extension product in the presence of the polymerizer. Suitable lengths of the primers depend on a number of factors, such as temperature, application and source of the primer, but are typically 15-30 nucleotides. Short primer molecules generally require lower temperatures to form hybrid complexes that are sufficiently stable with the template. The term “annealing” or “priming” refers to the placement of an oligodioxynucleotide or nucleic acid into a template nucleic acid, where the polymerase polymerizes the nucleotide to form a nucleic acid molecule that is complementary to the template nucleic acid or portion thereof. Let's do it.

프라이머의 서열은 주형의 일부 서열과 완전하게 상보적인 서열을 가질 필요는 없으며, 주형과 혼성화 되어 프라이머 고유의 작용을 할 수 있는 범위 내에서의 충분한 상보성을 가지면 충분하다. 따라서 본 발명에서의 프라이머는 주형인 상 술한 뉴클레오티드 서열에 완벽하게 상보적인 서열을 가질 필요는 없으며, 이 유전자 서열에 혼성화되어 프라이머 작용을 할 수 있는 범위 내에서 충분한 상보성을 가지면 충분하다. 이러한 프라이머의 디자인은 상술한 뉴클레오티드 서열을 참조하여 당업자에 의해 용이하게 실시할 수 있으며, 예컨대, 프라이머 디자인용 프로그램(예: PRIMER 3 프로그램)을 이용하여 할 수 있다.The sequence of the primer does not need to have a sequence completely complementary to a partial sequence of the template, and it is sufficient if the primer has sufficient complementarity within a range capable of hybridizing with the template and acting as a primer. Therefore, the primer in the present invention does not need to have a sequence that is perfectly complementary to the above-described nucleotide sequence as a template, and it is sufficient to have sufficient complementarity within a range capable of hybridizing to the gene sequence to act as a primer. The design of such primers can be easily carried out by those skilled in the art with reference to the above-described nucleotide sequence, for example, by using a program for primer design (eg, PRIMER 3 program).

프라이머 제작 시 참조하여야 하는 본 발명 타겟의 뉴클레오타이드 서열은 GenBank에서 확인할 수 있다. 예컨대, 본 발명의 타겟인 서열목록 제1서열인 APOA5(Apolipoprotein A5) 유전자 프로모터의 -1131 위치의 C 뉴클레오타이드(APOA5-1131T>C)를 포함하는 C 대립 유전자(유전자 접근 번호: rs662799)에 뉴클레오타이드 서열이 개시되어 있으며, 이 서열을 참조하여 프라이머를 디자인할 수 있다. 서열목록 제1서열에서 기재된 27번째 뉴클레오타이드인 ‘R’은 A/G를 의미한다. 바람직하게는, 프라이머쌍 중에서 전방향 프라이머는 서열목록 제 1 서열에서 -1131번째 뉴클레오타이드에 해당하는 인간 당뇨병-관련 단일뉴클레오타이드 다형성(SNP) 염기에 인접한 서열과 어닐링할 수 있는 뉴클레오타이드 서열을 포함하며, 전방향 프라이머의 3’-말단은 상기 SNP 염기에 상보적인 염기를 갖는다.The nucleotide sequence of the target of the present invention to be referred to in the preparation of the primer can be found in GenBank. For example, the nucleotide sequence of the C allele (gene accession number: rs662799) including the C nucleotide ( APOA5 -1131T> C) at the -1131 position of the APOA5 gene promoter (SEQ ID NO: 1), which is the target sequence of the present invention, is listed. Is disclosed and primers can be designed with reference to this sequence. 'R', the 27th nucleotide set forth in SEQ ID NO: 1, means A / G. Preferably, the forward primers among the primer pairs comprise a nucleotide sequence capable of annealing with a sequence adjacent to a human diabetes-associated mononucleotide polymorphism (SNP) base corresponding to the −1131 nucleotide in SEQ ID NO: 1; The 3′-end of the aromatic primer has a base complementary to the SNP base.

본 명세서에서, 용어 “핵산 분자”는 DNA(gDNA 및 cDNA) 그리고 RNA 분자를 포괄적으로 포함하는 의미를 갖으며, 핵산 분자에서 기본 구성 단위인 뉴클레오타이드는 자연의 뉴클레오타이드뿐만 아니라, 당 또는 염기 부위가 변형된 유사체 (analogue)도 포함한다(Scheit, Nucleotide Analogs, John Wiley, New York(1980); Uhlman 및 Peyman, Chemical Reviews, 90:543-584(1990)).As used herein, the term “nucleic acid molecule” is meant to encompass DNA (gDNA and cDNA) and RNA molecules inclusively, and the nucleotides, which are the basic structural units in nucleic acid molecules, modify not only natural nucleotides, but also sugar or base sites. Analogues (Scheit, Nucleotide Analogs, John Wiley, New York (1980); Uhlman and Peyman, Chemical Reviews , 90: 543-584 (1990)).

본 발명의 키트에서 출발물질이 gDNA인 경우, gDNA의 분리는 당업계에 공지된 통상의 방법에 따라 실시될 수 있다(참조: Rogers & Bendich (1994)). If the starting material in the kit of the invention is gDNA, isolation of gDNA can be carried out according to conventional methods known in the art (Rogers & Bendich (1994)).

출발물질이 mRNA인 경우에는, 당업계에 공지된 통상의 방법에 총 RNA를 분리하여 실시된다(참조: Sambrook, J. et al., Molecular Cloning. A Laboratory Manual, 3rd ed. Cold Spring Harbor Press(2001); Tesniere, C. et al., Plant Mol. Biol. Rep., 9:242(1991); Ausubel, F.M. et al., Current Protocols in Molecular Biology, John Willey & Sons(1987); 및 Chomczynski, P. et al., Anal. Biochem. 162:156(1987)). 분리된 총 RNA는 역전사효소를 이용하여 cDNA로 합성된다. 상기 총 RNA는 인간(예컨대, 당뇨병 환자)로부터 분리된 것이기 때문에, mRNA의 말단에는 폴리-A 테일을 갖고 있으며, 이러한 서열 특성을 이용한 올리고 dT 프라이머 및 역전사 효소를 이용하여 cDNA을 용이하게 합성할 수 있다(참조: PNAS USA, 85:8998(1988); Libert F, et al., Science, 244:569(1989); 및 Sambrook, J. et al., Molecular Cloning. A Laboratory Manual, 3rd ed. Cold Spring Harbor Press(2001)).If the starting material is mRNA, total RNA is isolated and performed by conventional methods known in the art (see Sambrook, J. et al., Molecular Cloning. A Laboratory Manual , 3rd ed. Cold Spring Harbor Press ( 2001); Tesniere, C. et al., Plant Mol. Biol. Rep. , 9: 242 (1991); Ausubel, FM et al., Current Protocols in Molecular Biology , John Willey & Sons (1987); and Chomczynski, P. et al., Anal.Biochem. 162: 156 (1987)). The isolated total RNA is synthesized into cDNA using reverse transcriptase. Since the total RNA is isolated from humans (e.g., diabetic patients), the end of the mRNA has a poly-A tail, and cDNA can be easily synthesized using oligo dT primer and reverse transcriptase using this sequence characteristic. ( PNAS USA , 85: 8998 (1988); Libert F, et al., Science , 244: 569 (1989); and Sambrook, J. et al., Molecular Cloning.A Laboratory Manual , 3rd ed.Cold). Spring Harbor Press (2001).

본 발명의 키트에 있어서, 상기 특정 서열을 규명하는 데 이용되는 당업계에 공지된 다양한 방법을 응용하여 실시될 수 있다. 예를 들어, 본 발명에 응용될 수 있는 기술은, 형광 인 시투 혼성화 (FISH), 직접적 DNA 서열결정, PFGE 분석, 서던 블롯 분석, 단일-가닥 컨퍼메이션 분석(SSCA, Orita et al., PNAS, USA 86:2776(1989)), RNase 보호 분석(Finkelstein et al., Genomics, 7:167(1990)), 닷트 블롯 분석, 변성 구배 젤 전기영동(DGGE, Wartell et al., Nucl.Acids Res., 18:2699(1990)), 뉴클레오타이드 미스매치를 인식하는 단백질(예: E. coli의 mutS 단백질)을 이용하는 방법(Modrich, Ann. Rev. Genet., 25:229-253(1991)), 및 대립형-특이 PCR을 포함하나, 이에 한정되는 것은 아니다.In the kit of the present invention, it can be carried out by applying a variety of methods known in the art used to identify the specific sequence. For example, techniques applicable to the present invention include fluorescence phosphorylation hybridization (FISH), direct DNA sequencing, PFGE analysis, southern blot analysis, single-strand conformation analysis (SSCA, Orita et al., PNAS, USA 86: 2776 (1989)), RNase protection assay (Finkelstein et al., Genomics , 7: 167 (1990)), dot blot analysis, denaturation gradient gel electrophoresis (DGGE, Wartell et al., Nucl. Acids Res. , 18: 2699 (1990)), methods using proteins that recognize nucleotide mismatches (e.g., mutS proteins of E. coli ) (Modrich, Ann. Rev. Genet. , 25: 229-253 (1991)), and Allele-specific PCR, including but not limited to.

서열변화가 단일-가닥 분자내 염기 결합의 차이를 초래하여, 이동성이 다른 밴드를 출현하게 하는 데, SSCA는 이 밴드를 검출한다. DGGE 분석은 변성 구배 젤을 이용하여, 야생형 서열과 다른 이동성을 나타내는 서열을 검출한다. Sequence changes result in differences in base bonds within single-stranded molecules, resulting in different bands of mobility, which SSCA detects. DGGE analysis uses denaturation gradient gels to detect sequences that exhibit mobility different from wild-type sequences.

다른 기술들은 일반적으로 본 발명의 SNP를 포함하는 서열에 상보적인 프로브 또는 프라이머를 이용한다.Other techniques generally employ probes or primers that are complementary to sequences comprising the SNPs of the invention.

예를 들어, RNase 보호 분석에서, 본 발명의 SNP를 포함하는 서열에 상보적인 리보프로브가 이용된다. 상기 리보프로브와 인간으로부터 분리한 DNA 또는 mRNA를 혼성화시키고, 이어 미스매치를 검출할 수 있는 RNase A 효소로 절단한다. 만일, 미스매치가 있어 RNase A가 인식을 한 경우에는, 보다 작은 밴드가 관찰된다. For example, in RNase protection assays riboprobes complementary to the sequences comprising the SNPs of the invention are used. The riboprobe and DNA or mRNA isolated from humans are hybridized and then cleaved with an RNase A enzyme capable of detecting mismatches. If there is a mismatch and RNase A recognizes, a smaller band is observed.

혼성화 시그널을 이용하는 분석에서, 본 발명의 SNP를 포함하는 서열에 상보적인 프로브가 이용된다. 이러한 기술에서, 프로브와 타깃 서열의 혼성화 시그널을 검출하여 직접적으로 DM 또는 MS 여부를 결정한다.In assays using hybridization signals, probes complementary to the sequences comprising the SNPs of the invention are used. In this technique, hybridization signals of probes and target sequences are detected to directly determine DM or MS.

본 명세서에서, 용어 “프로브”는 특정 뉴클레오타이드 서열에 혼성화될 수 있는 디옥시리보뉴클레오타이드 및 리보뉴클레오타이드를 포함하는 자연 또는 변형되는 모노머 또는 결합을 갖는 선형의 올리고머를 의미한다. 바람직하게는, 프로브는 혼성화에서의 최대 효율을 위하여 단일가닥이다. 프로브는 바람직하게는 디 옥시리보뉴클레오타이드이다.As used herein, the term “probe” refers to a linear oligomer having naturally occurring or modified monomers or bonds, including deoxyribonucleotides and ribonucleotides that can hybridize to a particular nucleotide sequence. Preferably, the probe is single stranded for maximum efficiency in hybridization. The probe is preferably deoxyribonucleotide.

본 발명에 이용되는 프로브로서, 상기 SNP를 포함하는 서열에 완전하게(perfectly) 상보적인 서열이 이용될 수 있으나, 특이적 혼성화를 방해하지 않는 범위 내에서 실질적으로(substantially) 상보적인 서열이 이용될 수도 있다. 바람직하게는, 본 발명에 이용되는 프로브는 서열목록 제 1 서열에서 -1131번째 뉴클레오타이드를 포함하는 10-30개의 연속 뉴클레오타이드 잔기를 포함하는 서열에 혼성화될 수 있는 서열을 포함한다. 보다 바람직하게는, 상기 프로브의 3’-말단 또는 5’-말단은 상기 SNP 염기에 상보적인 염기를 갖는다. 일반적으로, 혼성화에 의해 형성되는 듀플렉스(duplex)의 안정성은 말단의 서열의 일치에 의해 결정되는 경향이 있기 때문에, 3’-말단 또는 5’-말단에 SNP 염기에 상보적인 염기를 갖는 프로브에서 말단 부분이 혼성화되지 않으면, 이러한 듀플렉스는 엄격한 조건에서 해체될 수 있다. As the probe used in the present invention, a sequence perfectly complementary to the sequence including the SNP may be used, but a sequence complementarily complementary to a range that does not prevent specific hybridization may be used. It may be. Preferably, the probe used in the present invention comprises a sequence capable of hybridizing to a sequence comprising 10-30 contiguous nucleotide residues comprising the -1131 nucleotide in the SEQ ID NO: 1 sequence. More preferably, the 3′-end or 5′-end of the probe has a base complementary to the SNP base. Generally, the stability of duplexes formed by hybridization tends to be determined by the consensus of the sequences of the ends, so that the ends in probes having bases complementary to the SNP base at the 3'- or 5'-ends If the parts are not hybridized, these duplexes can be dismantled under stringent conditions.

혼성화에 적합한 조건은 Joseph Sambrook, et al., Molecular Cloning, A Laboratory Manual, Cold Spring Harbor Laboratory Press, Cold Spring Harbor, N.Y.(2001) 및 Haymes, B. D., et al., Nucleic Acid Hybridization, A Practical Approach, IRL Press, Washington, D.C. (1985)에 개시된 사항을 참조하여 결정할 수 있다. 혼성화에 이용되는 엄격한 조건(stringent condition)은 온도, 이온세기(완충액 농도) 및 유기 용매와 같은 화합물의 존재 등을 조절하여 결정될 수 있다. 이러한 엄격한 조건은 혼성화되는 서열에 의존하여 다르게 결정될 수 있다.Conditions suitable for hybridization include Joseph Sambrook, et al., Molecular Cloning, A Laboratory Manual , Cold Spring Harbor Laboratory Press, Cold Spring Harbor, NY (2001) and Haymes, BD, et al., Nucleic Acid Hybridization, A Practical Approach , Decisions may be made with reference to those disclosed in IRL Press, Washington, DC (1985). Stringent conditions used for hybridization can be determined by adjusting the temperature, ionic strength (buffer concentration), the presence of compounds such as organic solvents, and the like. Such stringent conditions can be determined differently depending on the sequence being hybridized.

본 발명의 바람직한 구현예에 따르면, 본 발명의 C 대립 유전자를 가진 인간 은 당뇨병의 위험도가 증가한다.According to a preferred embodiment of the invention, humans with the C allele of the invention increase the risk of diabetes.

본 발명의 바람직한 구현예에 따르면, 본 발명의 C 대립 유전자는 CC 동형접합체(homozygote)이다. 보다 바람직하게는, 본 발명의 C 대립 유전자가 CC 동형접합체일 경우, TT 또는 TC 유전자형(genotype)인 경우보다 인간 당뇨병 및 심혈관 합병증의 위험도가 더욱 더 증가한다.According to a preferred embodiment of the invention, the C allele of the invention is a CC homozygous. More preferably, when the C allele of the present invention is a CC homozygotes, the risk of human diabetes and cardiovascular complications is increased even more than when TT or TC genotypes are present.

본 발명의 바람직한 구현예에 따르면, 상술한 심혈관 합병증은 고트리글리세라이드 혈증, 울혈성 심부전, 심비대증, 부정맥, 관상동맥질환(coronary artery disease, CAD) 또는 심혈관질환(cardiovascular disease, CVD)을 포함하지만, 이에 한정되는 것은 아니다.According to a preferred embodiment of the present invention, the cardiovascular complications described above include hypertriglyceridemia, congestive heart failure, cardiac hypertrophy, arrhythmia, coronary artery disease (CAD) or cardiovascular disease (CVD), It is not limited to this.

본 발명의 바람직한 구현예에 따르면, 상술한 관상동맥질환은 심근경색, 협심증, 다른 만성 관상동맥질환, 아테롬성동맥경화증, 급성 관상동맥 증후군(예컨대, 불안정협심증, NSTEMI(non-ST-elevation myocardial infarction) 또는 STEMI(ST-elevation myocardial infarction)), PAOD(peripheral arterial occlusive disease) 또는 뇌혈관 발작을 포함하지만, 이에 한정되는 것은 아니다.According to a preferred embodiment of the present invention, the above-described coronary artery disease is myocardial infarction, angina pectoris, other chronic coronary artery disease, atherosclerosis, acute coronary syndrome (eg, unstable angina pectoris, non-ST-elevation myocardial infarction (NSTEMI)). Or ST-elevation myocardial infarction (STEMI), peripheral arterial occlusive disease (PAOD), or cerebrovascular seizures.

본 발명의 바람직한 구현예에 따르면, 본 발명의 SNPs와 당뇨병 간의 연관성은 교차비(odds rate, OR)로 계산한다. 본 명세서의 용어 “교차비(odds rate, OR)”는 두 그룹에서 특정질병 또는 사건이 발생할 확률을 비교하는 값을 의미한다. 일반적으로, 교차비의 계산은 다음과 같이 실시한다.According to a preferred embodiment of the present invention, the association between the SNPs of the present invention and diabetes is calculated by the odds rate (OR). As used herein, the term “odds rate (OR)” means a value that compares the probability that a particular disease or event will occur in two groups. In general, the calculation of the ratio is carried out as follows.

변수variable 질병 또는 사건Disease or event U radish U aa bb radish cc dd

OR = (a/b)/(c/d).OR = (a / b) / (c / d).

본 발명에 따르면, 본 발명의 교차비 결과를 통해 건강한 대조군, 및 대사 이상(metabolic abnormalities, MA; MS/IFG) 또는 당뇨병 환자들 간의 유전자형 분포 및 대립 유전자 빈도를 비교할 수 있다. 보다 상세하게는, 교차비가 1인 경우 두 군에서 발생률이 같다는 것을 의미하며, 교차비가 1보다 클 경우, 건강한 대조군보다 대사 이상 또는 당뇨병 환자들에서 발생률이 더 크다는 것을 나타낸다.According to the present invention, the genotype distribution and allele frequency between healthy controls and metabolic abnormalities (MA / MSG / IFG) or diabetic patients can be compared through the results of the ratio of the present invention. More specifically, a crossover ratio of 1 means that the incidence is the same in both groups, and a crossover ratio of greater than 1 indicates a greater incidence in patients with metabolic disorders or diabetes than healthy controls.

본 발명의 바람직한 구현예에 따르면, 본 발명의 교차비는 1.1-10.0, 보다 바람직하게는 1.2-9.0, 보다 더 바람직하게는 1.3-8.0 및 가장 바람직하게는 1.4-7.0의 값을 나타낸다.According to a preferred embodiment of the invention, the crossover ratio of the invention exhibits values of 1.1-10.0, more preferably 1.2-9.0, even more preferably 1.3-8.0 and most preferably 1.4-7.0.

본 발명의 바람직한 구현예에 따르면, 본 발명의 교차비는 나이, 체질량지수(body mass index, BMI), 폐경기, 흡연, 음주, 대사 증후군(metabolic syndrome, MS) 및 지질 약물로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 변수로 조정되어 계산한다.According to a preferred embodiment of the present invention, the ratio of the present invention is one or more selected from the group consisting of age, body mass index (BMI), menopause, smoking, drinking, metabolic syndrome (MS) and lipid drugs Calculate by adjusting to a variable.

본 발명의 바람직한 구현예에 따르면, 본 발명의 MS는 >80 cm의 허리둘레(여성), ≥150 mg/dl의 트리글리세라이드(TG), <50 mg/dl의 HDL(high-density lipoprotein)-콜레스테롤(여성), ≥130/≥85 mmHg의 혈압 및 ≥100 mg/dl의 공복 혈당(fasting glucose)으로 구성된 군으로부터 적어도 세 가지 이상의 구성요소를 포함한다.According to a preferred embodiment of the present invention, the MS of the present invention has a waist circumference (female) of> 80 cm, ≥150 mg / dl of triglyceride (TG), and <50 mg / dl of high-density lipoprotein (HDL)- At least three or more components from the group consisting of cholesterol (female), blood pressure of ≧ 130 / ≧ 85 mmHg and fasting glucose of ≧ 100 mg / dl.

본 발명의 다른 양태에 따르면, 본 발명은 인간 당뇨병 진단에 필요한 정보를 제공하기 위하여 인간의 생물학적 시료에 있는 서열번호 제1서열로 이루어진 뉴클레오타이드 서열(APOA5-1131T>C)을 확인하는 방법을 통한 인간 당뇨병 진단방법으로, 상기 뉴클레오타이드 서열이 C를 포함하고 조정된 교차비(adjusted OR)가 1.4-7.0으로 측정되면 당뇨병으로 판단된다.According to another aspect of the present invention, the present invention provides a method for identifying a human nucleotide sequence ( APOA5 -1131T> C) consisting of SEQ ID NO: 1 in human biological samples to provide information for diagnosing human diabetes. In diagnosing diabetes, if the nucleotide sequence comprises C and the adjusted OR is measured to be 1.4-7.0, it is determined to be diabetes.

본 발명의 방법은 상술한 프라이머를 필수 구성요소로 하는 바, 프라이머에 대한 상세한 설명은 본 발명의 방법에 이용되는 프라이머에도 적용된다. 따라서, 반복적인 기재에 따른 본 명세서의 과도한 복잡성을 피하기 위하여 그 기재를 생략한다.Since the method of the present invention is an essential component of the above-described primer, the detailed description of the primer also applies to the primer used in the method of the present invention. Therefore, the description is omitted to avoid excessive complexity of the present specification in accordance with the repeated description.

본 발명의 방법이 PCR 증폭 과정에 적용되는 경우, 본 발명의 방법은 선택적으로, PCR 증폭에 필요한 시약, 예컨대, 완충액, DNA 중합효소(예컨대, Thermus aquaticus (Taq), Thermus thermophilus (Tth), Thermus filiformis, Thermis flavus, Thermococcus literalis 또는 Pyrococcus furiosus (Pfu)로부터 수득한 열 안정성 DNA 중합효소), DNA 중합 효소 조인자 및 dNTPs를 포함할 수 있다. 본 발명의 방법은 상기한 시약 성분을 포함하는 다수의 별도 패키징 또는 컴파트먼트로 제작될 수 있다.When the method of the present invention is applied to a PCR amplification process, the method of the present invention may optionally include reagents necessary for PCR amplification, such as buffers, DNA polymerases (eg, Thermus aquaticus (Taq), Thermus thermophilus (Tth), Thermus ). filiformis , Thermis flavus , Thermococcus literalis or thermally stable DNA polymerase obtained from Pyrococcus furiosus (Pfu)), DNA polymerase cofactors and dNTPs. The method of the present invention can be prepared in a number of separate packaging or compartments comprising the reagent components described above.

본 명세서에서 용어 “진단”은 특정 질병 또는 질환에 대한 한 객체의 감수성(susceptibility)을 판정하는 것, 한 객체가 특정 질병 또는 질환을 현재 가지고 있는 지 여부를 판정하는 것(예컨대, 대사 이상 또는 당뇨병의 동정), 특정 질병 또는 질환에 걸린 한 객체의 예후(prognosis)를 판정하는 것, 또는 테라메트릭스(therametrics)(예컨대, 치료 효능에 대한 정보를 제공하기 위하여 객체의 상태를 모니터링 하는 것)을 포함한다.As used herein, the term “diagnosis” refers to determining the susceptibility of an object to a particular disease or condition, determining whether an object currently has a particular disease or condition (eg, metabolic abnormalities or diabetes mellitus). Identification), determining the prognosis of an object with a particular disease or condition, or terrametrics (e.g., monitoring the condition of an object to provide information about treatment efficacy). do.

본 발명의 바람직한 구현예에 따르면, 본 발명의 방법은 혈청 지질 프로파일, 아포지단백질 A1, A5 및 B, 글루코오스 또는 혈장 LDL(low-density lipoprotein) 입자 크기를 분석하는 것을 추가적으로 포함할 수 있다.According to a preferred embodiment of the present invention, the methods of the present invention may further comprise analyzing serum lipid profiles, apolipoproteins A1, A5 and B, glucose or plasma low-density lipoprotein (LDL) particle sizes.

본 발명의 바람직한 구현예에 따르면, 본 발명의 방법은 유전자 증폭 또는 마이크로어레이를 이용한다.According to a preferred embodiment of the invention, the method of the invention uses gene amplification or microarray.

본 발명의 특징 및 이점을 요약하면 다음과 같다:The features and advantages of the present invention are summarized as follows:

(ⅰ) 본 발명은 인간 당뇨병 진단용 키트 및 진단방법에 관한 것이다.(Iii) The present invention relates to a kit for diagnosing and diagnosing human diabetes.

(ⅱ) 본 발명의 단일뉴클레오타이드 다형성(SNPs)인 APOA5(Apolipoprotein A5) 유전자 프로모터의 -1131 위치의 C 대립 유전자(APOA5-1131T>C)는 인간, 특히 한국인 여성에서 당뇨병을 진단하는 데 이용될 수 있다.(Ii) The C allele ( APOA5 -1131T> C) at the -1131 position of the APOA5 gene promoter, the single nucleotide polymorphism (SNPs) of the present invention, can be used to diagnose diabetes in humans, particularly Korean women. have.

(ⅲ) 본 발명의 SNP를 포함하는 본 발명의 키트 및 방법은 매우 효과적이고 용이하게 인간 당뇨병을 진단할 수 있다.(Iii) The kits and methods of the present invention comprising the SNPs of the present invention can diagnose human diabetes very effectively and easily.

이하, 실시예를 통하여 본 발명을 더욱 상세히 설명하고자 한다. 이들 실시예는 오로지 본 발명을 보다 구체적으로 설명하기 위한 것으로, 본 발명의 요지에 따라 본 발명의 범위가 이들 실시예에 의해 제한되지 않는다는 것은 당업계에서 통상의 지식을 가진 자에 있어서 자명할 것이다.Hereinafter, the present invention will be described in more detail with reference to Examples. It is to be understood by those skilled in the art that these embodiments are only for describing the present invention in more detail and that the scope of the present invention is not limited by these embodiments in accordance with the gist of the present invention .

실시예 1Example 1

실험 재료 및 실험 방법Experimental Materials and Experimental Methods

연구 집단Study group

모든 참여자들은 세브란스 병원의 일상적인 조사(routine check-up; 2007년 1월~2008년 10월)동안 건강증진센터로부터 지원받은 한국인 여성들이었다. 배제 기준(exclusion criteria)은 정형외과적 제한, 이전 6개월 동안 몸무게 감소/증가, 혈관질환에 대한 진단들, 임상적 또는 병력에 의한 암, 신장 질환, 간 질환, 갑상선 질환, 또는 급성 또는 만성 염증성 질환을 포함하였다. 연구 참여자들은 다음과 같은 세 가지 군으로 분류되었다: 건강한 대조군, 당뇨병 및 대사 이상(metabolic abnormalities, MA). 건강한 대조군은 진단된 질환 또는 MA 중 어떠한 것들도 가지고 있지 않은 참여자들로 제한하였다. 추가적으로, 건강한 대조군은 어떠한 약물(항고혈압제, 항이상지질혈증제, 항혈전제 및 항당뇨병제)도 복용하고 있지 않았다. MA는 대사 증후군(MS) 또는 공복 혈당 장애(impaired fasting glucose, IFG)를 포함하였다. MS의 정의는 미국국립콜레스테롤 교육위원회-성인치료패널III(NCEP-ATPIII) 지침, 아시아-태평양 지침 및 미국당뇨병학회 지침의 변 형에 따랐다. MS의 정의는 >80 cm의 허리둘레(여성), ≥150 mg/dl의 트리글리세라이드(TG), <50 mg/dl의 HDL-콜레스테롤(여성), ≥130/≥85 mmHg의 혈압 또는 ≥100 mg/dl의 공복 혈당(fasting glucose) 중 적어도 세 가지 이상의 구성요소를 포함하였지만, 100 내지 125 mg/dl의 공복 혈당은 미국당뇨병학회 지침에 따라 실질적으로 IFG로 분류되었다. 당뇨병(Diabetes mellitus, DM)은 병원으로부터 받은 DM의 진단 및 의사에 의해 처방된 혈당강하제를 복용하거나 또는 스크리닝을 통해 ≥126 mg/ml의 공복 혈당인 경우를 포함한다. 최종적으로, 본 연구는 건강한 대조군(n = 2,033), DM(n = 304) 및 MA(n = 1,113)로 구성된 3,450명의 개별 한국여성들을 대상으로 하였다. 모든 환자들로부터 서면 동의서를 받았으며, 프로토콜은 연세대학교 심사위원회(Institute of Review Board of Yonsei University)에 의해 승인되었다.All participants were Korean women supported by the Health Promotion Center during the routine check-up of Severance Hospital (January 2007-October 2008). Exclusion criteria include orthopedic limitations, weight loss / increase in the previous six months, diagnoses of vascular disease, cancer or kidney disease, liver disease, thyroid disease, or acute or chronic inflammatory by clinical or medical history. Disease included. Study participants were divided into three groups: healthy controls, diabetes and metabolic abnormalities (MA). Healthy controls were limited to participants who did not have any of the diagnosed diseases or MA. In addition, healthy controls were not taking any medications (antihypertensive, antidyslipidemic, antithrombotic and antidiabetic). MA included metabolic syndrome (MS) or impaired fasting glucose (IFG). The definition of MS was in accordance with variations of the National Cholesterol Board of Education-Adult Therapy Panel III (NCEP-ATPIII) guidelines, the Asia-Pacific guidelines and the American Diabetes Association Guidelines. Definition of MS is waist circumference (female)> 80 cm, triglyceride (TG) ≥ 150 mg / dl, HDL-cholesterol (female) <50 mg / dl, blood pressure ≥130 / ≥85 mmHg or ≥100 Although at least three or more components of fasting glucose of mg / dl were included, fasting blood glucose of 100-125 mg / dl was substantially classified as IFG according to the American Diabetes Association guidelines. Diabetes (Diabetes mellitus, DM) includes cases of fasting blood glucose of ≧ 126 mg / ml via the screening or screening of a hypoglycemic agent prescribed by a doctor and diagnosed with DM from a hospital. Finally, the study included 3,450 individual Korean women consisting of a healthy control group (n = 2,033), DM (n = 304), and MA (n = 1,113). Written informed consent was obtained from all patients, and the protocol was approved by the Institute of Review Board of Yonsei University.

비만지표들, 혈압 측정 및 혈액 수득Obesity indicators, blood pressure measurement and blood gain

체중 및 키를 오전에 신발을 벗고 옷을 입지 않은 상태에서 측정하였다. 혈압은 휴식한 지 20분 후 앉아 있는 환자의 왼쪽 팔에서 자동혈압 모니터(TM-2654; A&D, Tokyo, 일본)를 이용하여 측정하였다. 하룻밤 동안의 공복 기를 거친 후, 정맥의 혈액 표본을 EDTA-처리된 또는 보통의 튜브에 수득해 원심분리하여 혈장 또는 혈청을 얻었으며 분석 때까지 -0℃에 저장하였다.Body weight and height were measured in the morning without shoes and without clothes. Blood pressure was measured using an automatic blood pressure monitor (TM-2654; A & D, Tokyo, Japan) in the left arm of the sitting patient 20 minutes after resting. After an overnight fasting period, venous blood samples were obtained in EDTA-treated or regular tubes, centrifuged to obtain plasma or serum and stored at −0 ° C. until analysis.

APOA5 APOA5 -1131T>C 유전자형 검사(genotyping)C genotyping

제조자의 프로토콜에 따라 상업적으로 유용한 DNA 분리 키트(WIZARDR Genomic DNA purification kit, Promega Corp., Madison, WI)를 이용하여 게놈 DNA를 5 ml의 총 혈액으로부터 추출하였다. 표 1의 프라이머를 사용한 단일 프라이머 연장 기법을 이용한 SNP-IT™ 어세이(SNPstream 25K™ System, Orchid Biosystems, NJ)에 의한 -1131T>C 유전자형 검사를 실시하였다. ELISA 판독기로 노란색 및/또는 파란색 발색의 결과들을 분석하였으며 QCReview™ 프로그램을 이용하여 최종 유전자형 콜(genotype calls)을 산정하였다.Genomic DNA was extracted from 5 ml of total blood using a commercially available DNA isolation kit (WIZARDR Genomic DNA purification kit, Promega Corp., Madison, Wis.) According to the manufacturer's protocol. -1131T> C genotyping was performed by SNP-IT ™ assay (SNPstream 25K ™ System, Orchid Biosystems, NJ) using a single primer extension technique using the primers of Table 1. The results of yellow and / or blue coloration were analyzed with an ELISA reader and final genotype calls were calculated using the QCReview ™ program.

프라이머 서열.Primer sequence. 형태shape 프라이머primer PCR-F PCR-F TGAAGATGAGATGGCAAGAG TGAAGATGAGATGGCAAGAG PCR-L PCR-L atttgggcttgctctcctatttgggcttgctctcct SNP 프라이머SNP Primer GAGCCCCAGGAACTGGAGCGAAAGTGAGCCCCAGGAACTGGAGCGAAAGT

혈청 지질 프로파일, 아포지단백질 A1 및 B, 및 혈당Serum Lipid Profile, Apolipoproteins A1 and B, and Blood Sugar

TG 및 총 콜레스테롤의 혈청 농도를 Hitachi 7150 자동분석기(Hitachi Ltd. Tokyo, 일본)에서 상업적으로 유용한 키트를 이용하여 측정하였다. 킬로미크론(chylomicron)을 침전시키기 위해 덱스트란 설페이트 마그네슘을 이용한 후, 상등액으로부터 저-밀도 지방단백질(LDL) 및 고-밀도 지방단백질(HDL) 콜레스테롤을 효소 방법으로 측정하였다. LDL 콜레스테롤을 프리데발트 공식을 이용하여 <4.52 mol/l(400 mg/ml)의 TG 농도를 가진 환자들에서 간접적으로 측정하였다. ≥4.52 mol/l 이상의 TG 농도를 가진 환자들에서, LDL 콜레스테롤은 Hitachi 7150 분석기를 이용한 효소 방법을 통해 직접적으로 측정하였다. 혈청 아포지단백질 A1 및 B는 특이적인 항-혈청(Roche, Switzerland)을 이용하여 340 nm에서 탁도측정법(turbidometry)에 의해 결정하였다. 혈당는 Beckman 글루코오스 분석기(Beckman Instruments, Irvine, CA)에서 글루코오스 옥시다제 방법을 이용하여 측정하였다.Serum concentrations of TG and total cholesterol were measured using commercially available kits on a Hitachi 7150 automated analyzer (Hitachi Ltd. Tokyo, Japan). After using dextran sulfate magnesium to precipitate chylomicron, low-density lipoprotein (LDL) and high-density lipoprotein (HDL) cholesterol from the supernatant was measured by enzymatic method. LDL cholesterol was measured indirectly in patients with TG concentrations of <4.52 mol / l (400 mg / ml) using the Friedewald formula. In patients with TG concentrations of> 4.52 mol / l, LDL cholesterol was measured directly by enzymatic methods using a Hitachi 7150 analyzer. Serum apolipoproteins A1 and B were determined by turbidometry at 340 nm using specific anti-serum (Roche, Switzerland). Blood glucose was measured using the glucose oxidase method on a Beckman glucose analyzer (Beckman Instruments, Irvine, Calif.).

혈장 아포지단백질 A5Plasma Apolipoprotein A5

효소 면역어세이(Human Apolipoprotein A ELISA Kit, Millipore, MO)를 이용하여 혈장 아포지단백질 A5(ApoaA5) 농도를 측정하였다. 결과적인 발색 반응을 450 nm에서 Victor2(Perkin Elmer life sciences, Turka, Finland)를 이용하여 판독하였다. 인트라- 및 인터-어세이 CV는 각각 2.46% 및 7.45%였다.Plasma apolipoprotein A5 (ApoaA5) concentrations were measured using an enzyme immunoassay (Human Apolipoprotein A ELISA Kit, Millipore, MO). The resulting color reaction was read at 450 nm using Victor 2 (Perkin Elmer life sciences, Turka, Finland). Intra- and inter-assay CVs were 2.46% and 7.45%, respectively.

혈장 LDL 입자 크기Plasma LDL particle size

연속적인 부양(sequential flotation) 초원심분리로 분리된 LDL의 입자 크기 분포(1.019-1.063 g/ml)를 2-16%의 선형구배 아크릴아마이드(Alamo Gels Inc., San Antonio, TX)를 포함하는 상업적으로 유용한 비-변성 폴리아크릴아마이드 슬랩을 이용한 동공-구배 리포 단백질 시스템(CBS Scientific, CA)으로 측정하였다. 각 밴드의 상대적인 이동율[relative migration(Rf) rate]을 평가하기 위해, 라텍스 비드(30nm)(Duke Scientific Corporation, Palo Alto, CA, USA), 티로글로불린(17 nm; GE Healthcare, Buckinghamshire, UK), 아포페리틴(12.2 nm; GE Healthcare, Buckinghamshire, UK) 및 카탈라제(10.4 nm; GE Healthcare, Buckinghamshire, UK)의 표준 형태들(standards)을 이용하였다. 젤을 GS-800 계산된 이미징 밀도측정기(Bio-Rad Laboratories, Graz, Austria)로 스캔하였다. 표준 형태들의 Rf 값에 따라 LDL 입자 크기를 계산하였다.The particle size distribution (1.019-1.063 g / ml) of LDL separated by continuous flotation ultracentrifugation contained 2-16% linear gradient acrylamide (Alamo Gels Inc., San Antonio, TX). Measurements were made with a pupil-gradient lipoprotein system (CBS Scientific, CA) using commercially available non-modified polyacrylamide slabs. To assess the relative migration (Rf) rate of each band, latex beads (30 nm) (Duke Scientific Corporation, Palo Alto, Calif., USA), thyroglobulin (17 nm; GE Healthcare, Buckinghamshire, UK), Standards of apoferritin (12.2 nm; GE Healthcare, Buckinghamshire, UK) and catalase (10.4 nm; GE Healthcare, Buckinghamshire, UK) were used. Gels were scanned with a GS-800 calculated imaging densitometer (Bio-Rad Laboratories, Graz, Austria). LDL particle size was calculated according to the Rf values of the standard forms.

통계 분석Statistical analysis

윈도우용 SPSS version 12.0(Statistical Package for the Social Science, SPSS Inc, Chicago, IL)을 이용하여 통계 분석을 실시하였다. PS version 2.1(power and sample size calculation, Nashville, Tenn)을 이용하여 시료 크기를 체크하였다. Executive SNP Analyzer 1.0(http://www.istech.info/SilicoSNP/index.html)를 이용하여 하디-바인베르그 평형(Hardy-Weinberg Equilibrium)에 대해 조사하였다. 건강한 대조군 및 MA(MS/IFG) 또는 당뇨병 환자들 간의 유전자형 분포 및 대립 유전자 빈도를 카이스퀘어 테스트(χ2 test)로 비교하였다. DM과 유전자형의 연관성을 복잡한 인자들이 조정된 카이스퀘어 테스트의 교차비[odds ratio(OR); 95% 신뢰구간(confidence intervals, CIs)]를 이용하여 계산하였다. 각 환자 군들[건강한 대조군, 대사 이상(MA) 및 DM] 간의 차이, 또는 조정된 또는 조정되지 않은 각 환자 군 내의 유전자형 군들 간의 차이를 비교하기 위해 일원변량 분석(one-way ANOVA)을 시행하고 본페로니(Bonferroni) 방법을 실시하였다. APOA5-1131T>C와 관계된 공복 혈당 및 TG 간의 상관성을 조사하기 위해, 피어슨 상관관계 분석 및 편상관관계 분석(partial correlation test)을 실시하였다. 각 변수(variables)를 정상 분포 패턴에 대해 조사하였으며 유의적으로 기울어진 변수들을 로그-전환시켰다. 상술한 목적을 위해, 평균값이 전환되지 않고 조정되지 않은 값들을 이용하여 제시되었다. 결과들을 평균값 ± 표준오차 또는 백분율로 표시하였으며 p<0.05의 양쪽꼬리검정값(two-tailed value of p<0.05)을 통계적으로 유의하다고 간주하였다.Statistical analysis was performed using SPSS version 12.0 for Windows (Statistical Package for the Social Science, SPSS Inc, Chicago, IL). Sample size was checked using PS version 2.1 (power and sample size calculation, Nashville, Tenn). The Hardy-Weinberg Equilibrium was investigated using Executive SNP Analyzer 1.0 (http://www.istech.info/SilicoSNP/index.html). Genotype distributions and allele frequencies between healthy controls and MA (MS / IFG) or diabetic patients were compared by the chi square test (χ2 test). Odds ratio (OR) of the Chisquare test with complex factors associated with DM genotype; 95% confidence intervals (CIs)]. One-way ANOVA was performed and compared to compare the differences between each patient group (healthy control, metabolic abnormalities (MA) and DM) or between genotype groups within each patient group, adjusted or unadjusted. The Ferroni method was carried out. To investigate the correlation between fasting blood glucose and TG associated with APOA5 -1131T> C, Pearson correlation analysis and partial correlation test were performed. Each variable was examined for a normal distribution pattern and log-converted significantly tilted variables. For the above purposes, the mean value has been presented using unconverted and unadjusted values. Results were expressed as mean ± standard error or percentage and the two-tailed value of p <0.05 of p <0.05 was considered statistically significant.

실험 결과Experiment result

연구 대상들의 특징Characteristics of the study subjects

표 3은 3,450명의 연구 대상들의 일반적인 특징을 보여준다. 건강한 대조군(N = 2,033)에 비교하여 MA(n = 1133) 및 DM(n = 304) 환자들의 나이 및 BMI의 평균값, 및 폐경기 후의 비율이 더 높았다. 세 군들 간의 흡연 및 알코올 중독(consumption)의 비율은 유의적으로 차이가 보이지 않았다. 수축기 혈압이 건강한 대조군보다 MA 및 DM 환자들에서 더 높았다(p<0.001). 이완기 혈압 및 총 콜레스테롤 레벨은 다른 두 군들보다 MA 환자들에서 더 높았다(p<0.001). 공복기 TG 및 ApoB는 MA 여성들에서 가장 높았고 건강한 대조군에서 가장 낮았다(p<0.001). HDL-콜레스테롤 및 ApoA1 레벨은 건강한 대조군에서 가장 높았으며 MA 여성들에서 가장 낮았다(p<0.001). ApoA5 레벨은 건강한 대조군 보다 MA 및 DM 환자들에서 더 낮았고(p<0.001), LDL 입자 크기는 MA 군에서 더 낮았다. 공복 혈당 레벨은 건강한 대조군과 비교하여 DM 환자에서 가장 높았으며 MA 군에서 더 높았다(p<0.001). 이러한 패턴은 나이, BMI 및 폐경기 상태를 고려한 후에도 여전히 유효하였다. 또한, 각 군들 간의 LDL 콜레스테롤 레벨에서의 유의한 차이가 조정 후에 사라졌다(p0=0.006, p1=0.072).Table 3 shows the general characteristics of 3,450 study subjects. The age and mean values of BMI, and postmenopausal rates of patients with MA (n = 1133) and DM (n = 304) were higher compared to healthy controls (N = 2,033). There was no significant difference in the rates of smoking and alcohol consumption between the three groups. Systolic blood pressure was higher in MA and DM patients than in healthy controls (p <0.001). Diastolic blood pressure and total cholesterol levels were higher in MA patients than in the other two groups (p <0.001). Fasting TG and ApoB were highest in MA women and lowest in healthy controls (p <0.001). HDL-cholesterol and ApoA1 levels were highest in healthy controls and lowest in MA women (p <0.001). ApoA5 levels were lower in the MA and DM patients than the healthy control (p <0.001) and LDL particle size was lower in the MA group. Fasting blood glucose levels were highest in DM patients and higher in MA group compared to healthy controls (p <0.001). This pattern was still valid after considering age, BMI and menopausal conditions. In addition, significant differences in LDL cholesterol levels between the groups disappeared after adjustment (p0 = 0.006, p1 = 0.072).

연구 대상군들의 인구 및 대사 지표들(n = 3,450명의 여성들).Population and metabolic indicators of the study population (n = 3,450 women). 건강한 대조군
(n = 2,033)
Healthy control
(n = 2,033)
MA
(n = 1,113)
MA
(n = 1,113)
DM
(n = 304)
DM
(n = 304)
p0 p 0 p1 p 1
나이(년)Age (years) 54.6 ± 0.354.6 ± 0.3 59.7 ± 0.359.7 ± 0.3 62.1 ± 0.562.1 ± 0.5 <0.001<0.001 -- 체질량지수
(BMI, kg/m2)
Body mass index
(BMI, kg / m 2 )
23.4 ± 0.123.4 ± 0.1 25.4 ± 0.125.4 ± 0.1 25.1 ± 0.225.1 ± 0.2 <0.001<0.001 --
폐경 후(%)After menopause (%) 64.764.7 82.882.8 89.489.4 <0.05<0.05 -- 현재 흡연(%)Current smoking (%) 2.42.4 1.81.8 2.02.0 n.s.n.s. -- 현재 음주(%)Current alcohol consumption (%) 31.931.9 24.224.2 16.216.2 n.s.n.s. -- 수축기 혈압(mmHg)
이완기 혈압(mmHg)
Systolic Blood Pressure (mmHg)
Diastolic Blood Pressure (mmHg)
120.8 ± 0.3b
73.8 ± 0.2b
120.8 ± 0.3 b
73.8 ± 0.2 b
133.0 ± 0.5a
79.9 ± 0.3a
133.0 ± 0.5 a
79.9 ± 0.3 a
132.1 ± 1.1a
76.9 ± 0.6b
132.1 ± 1.1 a
76.9 ± 0.6 b
<0.001
<0.001
<0.001
<0.001
<0.001
<0.001
<0.001
<0.001
트리글리세라이드
(mg/dL)Φ
Triglycerides
(mg / dL) Φ
94.5 ± 0.8c 94.5 ± 0.8 c 170.7 ± 2.5a 170.7 ± 2.5 a 151.6 ± 5.9b 151.6 ± 5.9 b <0.001<0.001 <0.001<0.001
총-콜레스테롤
(mg/dL)
Total-cholesterol
(mg / dL)
194.3 ± 0.8b 194.3 ± 0.8 b 200.1 ± 1.1a 200.1 ± 1.1 a 194.9 ± 2.3b 194.9 ± 2.3 b <0.001<0.001 0.0330.033
HDL-콜레스테롤
(mg/dL)
HDL-cholesterol
(mg / dL)
60.3 ± 0.3a 60.3 ± 0.3 a 47.1 ± 0.4c 47.1 ± 0.4 c 51.3 ± 0.7b 51.3 ± 0.7 b <0.001<0.001 <0.001<0.001
LDL-콜레스테롤
(mg/dL)
LDL-cholesterol
(mg / dL)
115.0 ± 0.7115.0 ± 0.7 118.7 ± 1.1118.7 ± 1.1 114.2 ± 2.2114.2 ± 2.2 0.0060.006 0.0720.072
아포지단백질 A1
(mg/dL)
Apolipoprotein A1
(mg / dL)
149.4 ± 0.7a 149.4 ± 0.7 a 135.6 ± 0.8c 135.6 ± 0.8 c 140.8 ± 1.4b 140.8 ± 1.4 b <0.001<0.001 <0.001<0.001
아포지단백질 B
(mg/dL)
Apolipoprotein B
(mg / dL)
81.8 ± 0.5c 81.8 ± 0.5 c 94.3 ± 0.7a 94.3 ± 0.7 a 88.5 ± 1.4b 88.5 ± 1.4 b <0.001<0.001 <0.001<0.001
아포지단백질 A5
(mg/dL)Φ
Apolipoprotein A5
(mg / dL) Φ
250.4 ± 7.0a 250.4 ± 7.0 a 213.8 ± 8.2b 213.8 ± 8.2 b 187.1 ± 6.6b 187.1 ± 6.6 b <0.001<0.001 <0.001<0.001
LDL 입자 크기(nm)Φ LDL particle size (nm) Φ 24.3 ± 0.03a 24.3 ± 0.03 a 23.9 ± 0.04b 23.9 ± 0.04 b 24.2 ± 0.09a 24.2 ± 0.09 a <0.001<0.001 <0.001<0.001 혈당(mg/dL)Φ Blood sugar (mg / dL) Φ 83.6 ± 0.2c 83.6 ± 0.2 c 89.5 ± 0.4b 89.5 ± 0.4 b 127.1 ± 2.1a 127.1 ± 2.1 a <0.001<0.001 <0.001<0.001

평균값 ± 표준오차. Mean ± Standard Error.

MA: 대사 증후군 또는 공복 혈당 장애 같은 대사 이상, DM: 당뇨병, n.s.: 유의성 없음(no significant), P0: 보정되지 않은 p-값, P1: 나이, BMI 및 폐경 상태에 대해 보정된 p-값.MA: metabolic abnormalities such as metabolic syndrome or fasting blood glucose disorders, DM: diabetes, ns: no significant, P 0 : uncorrected p-value, P 1 : corrected p- for age, BMI and menopause value.

Φ는 보정되거나 또는 보정되지 않은 변수가 로그-전환되거나, 일원변량 분석(one-way ANOVA)을 시행하고 본페로니 방법에 의해 테스트된 지표들을 나타낸다. Φ represents the indicators for which the corrected or uncorrected variables are log-converted, one-way ANOVA, and tested by Bonferroni's method.

같은 열의 같은 알파펫을 공유하는 것은 나이 및 체질량지수에 대한 보정 후 두 군들 간의 유의적이 차이가 없음을 나타낸다.Sharing the same alphapet in the same row indicates that there was no significant difference between the two groups after correction for age and body mass index.

APOA5APOA5 -1131T>C 다형성(polymorphism)의 분포Distribution of -1131T> C polymorphism

건강한 대조군, MA 및 DM 뿐만 아니라, 전체 집단에서의 유전자형 분포를 하디-바인베르그 평형으로 각각 조사하였다. 전체 집단에서 -1131T>C의 소수 대립인자 빈도(minor allele frequency, MAF)는 이전에 한국인에서 관찰된 결과와 일치되는 0.29였다[2, 10]. 건강한 대조군에서 -1131T>C 다형성의 유전자형 분포는 다른 두 군들의 분포(MA: 0.319, DM: 0.327)와 유의하게 차이가 있었다(P<0.05). Genotype distributions across the entire population, as well as healthy controls, MA and DM, were examined by Hardy-Weinberg equilibrium respectively. The minor allele frequency (MAF) of -1131T> C in the entire population was 0.29, consistent with the results observed previously in Koreans [2, 10]. The genotype distribution of -1131T> C polymorphism in the healthy control group was significantly different from that of the other two groups (MA: 0.319, DM: 0.327) (P <0.05).

지질 프로파일, 아포지단백질 및 LDL 입자 크기와 Lipid profile, apolipoprotein and LDL particle size APOA5APOA5 -1131T>C 다형성(polymorphism)과의 연관성Association with -1131T> C polymorphism

나이, BMI, 수축기 혈압 및 이완기 혈압 같은 일반적인 특징은 각 대상 군(건강한 대조군, MA 및 DM)의 APOA5-1131T>C 유전자형에 따라 차이가 나지 않았다(표 4). 폐경기 후의 비율, 현재 흡연 및 알코올 중독의 각 유전자형 군들에서 어떠한 유의한 차이도 관찰되지 않았다(결과를 보이지 않음).Age, BMI, systolic blood pressure and diastolic blood pressure common characteristics did not differ according to APOA5 -1131T> C of each genotype subjects (healthy controls, MA and DM) (Table 4). No significant differences were observed in each genotype group after postmenopausal, current smoking and alcoholism (no results).

한국인 여성들(n = 3,450명)에서 지질 프로파일, 아포지단백질 및 LDL 입자 크기와 APOA5-1131T>C 다형성 간의 연관성.Association between Lipid Profile, Apolipoprotein and LDL Particle Size and APOA5 -1131T> C Polymorphism in Korean Women (n = 3,450). TTTT TCTC CCCC 건강한 대조군
TT(n = 1,096)
TC(n = 798)
CC(n = 139)


Healthy control
TT (n = 1,096)
TC (n = 798)
CC (n = 139)


나이(년)Age (years) 55.1 ± 0.455.1 ± 0.4 54.2 ± 0.454.2 ± 0.4 52.9 ± 1.152.9 ± 1.1
체질량지수 (kg/m2)Body mass index (kg / m 2 ) 23.6 ± 0.123.6 ± 0.1 23.3 ± 0.123.3 ± 0.1 22.9 ± 0.222.9 ± 0.2 수축기 혈압(mmHg)Systolic Blood Pressure (mmHg) 121.7 ± 0.5121.7 ± 0.5 120.0 ± 0.6120.0 ± 0.6 117.8 ± 1.3117.8 ± 1.3 이완기 혈압(mmHg)Diastolic Blood Pressure (mmHg) 74.3 ± 0.374.3 ± 0.3 73.3 ± 0.473.3 ± 0.4 72.0 ± 0.872.0 ± 0.8 총-콜레스테롤 (mg/dL)Total Cholesterol (mg / dL) 194.4 ± 1.1194.4 ± 1.1 194.5 ± 1.2194.5 ± 1.2 192.5 ± 3.2192.5 ± 3.2 LDL-콜레스테롤 (mg/dL)LDL-cholesterol (mg / dL) 114.9 ± 1.0114.9 ± 1.0 114.9 ± 1.1114.9 ± 1.1 115.9 ± 2.8115.9 ± 2.8 Apo A1 (mg/dL)Apo A1 (mg / dL) 150.9 ± 0.7a 150.9 ± 0.7 a 149.2 ± 1.1a 149.2 ± 1.1 a 140.6 ± 2.8b 140.6 ± 2.8 b Apo B (mg/dL)Apo B (mg / dL) 81.1 ± 0.781.1 ± 0.7 82.1 ± 0.882.1 ± 0.8 85.3 ± 2.185.3 ± 2.1 LDL 입자 크기(nm)Φ LDL particle size (nm) Φ 24.3 ± 0.04a 24.3 ± 0.04 a 24.3 ± 0.04ab 24.3 ± 0.04 ab 24.1 ± 0.09b 24.1 ± 0.09 b MA
TT(n = 514)
TC(n = 489)
CC(n = 110)
MA
TT (n = 514)
TC (n = 489)
CC (n = 110)
나이(년)Age (years) 60.5 ± 0.560.5 ± 0.5 58.9 ± 0.558.9 ± 0.5 59.6 ± 1.159.6 ± 1.1
체질량지수 (kg/m2)Body mass index (kg / m 2 ) 25.4 ± 0.125.4 ± 0.1 25.3 ± 0.125.3 ± 0.1 25.8 ± 0.325.8 ± 0.3 수축기 혈압(mmHg)Systolic Blood Pressure (mmHg) 133.0 ± 0.7133.0 ± 0.7 132.4 ± 0.7132.4 ± 0.7 135.1 ± 1.7135.1 ± 1.7 이완기 혈압(mmHg)Diastolic Blood Pressure (mmHg) 79.9 ± 0.479.9 ± 0.4 79.6 ± 0.579.6 ± 0.5 81.2 ± 1.181.2 ± 1.1 총-콜레스테롤 (mg/dL)Total Cholesterol (mg / dL) 197.4 ± 1.7b 197.4 ± 1.7 b 204.3 ± 1.7a 204.3 ± 1.7 a 194.5 ± 3.7b 194.5 ± 3.7 b LDL-콜레스테롤 (mg/dL)LDL-cholesterol (mg / dL) 118.6 ± 1.5a 118.6 ± 1.5 a 121.0 ± 1.6a 121.0 ± 1.6 a 109.6 ± 3.7b 109.6 ± 3.7 b Apo A1 (mg/dL)Apo A1 (mg / dL) 135.2 ± 1.1a 135.2 ± 1.1 a 137.8 ± 1.2a 137.8 ± 1.2 a 128.3 ± 2.3b 128.3 ± 2.3 b Apo B (mg/dL)Apo B (mg / dL) 92.2 ± 1.1b 92.2 ± 1.1 b 96.2 ± 1.1a 96.2 ± 1.1 a 95.6 ± 2.4ab 95.6 ± 2.4 ab LDL 입자 크기(nm)Φ LDL particle size (nm) Φ 23.9 ± 0.0623.9 ± 0.06 23.9 ± 0.0623.9 ± 0.06 23.7 ± 0.1523.7 ± 0.15 DM
TT(n = 139)
TC(n = 131)
CC(n = 34)
DM
TT (n = 139)
TC (n = 131)
CC (n = 34)
나이(년)Age (years) 62.9 ± 0.762.9 ± 0.7 61.7 ± 0.961.7 ± 0.9 60.4 ± 1.860.4 ± 1.8
체질량지수 (kg/m2)Body mass index (kg / m 2 ) 25.0 ± 0.325.0 ± 0.3 25.3 ± 0.325.3 ± 0.3 24.6 ± 0.424.6 ± 0.4 수축기 혈압(mmHg)Systolic Blood Pressure (mmHg) 132.8 ± 1.7132.8 ± 1.7 131.6 ± 1.6131.6 ± 1.6 131.2 ± 2.5131.2 ± 2.5 이완기 혈압(mmHg)Diastolic Blood Pressure (mmHg) 76.9 ± 1.076.9 ± 1.0 77.0 ± 0.977.0 ± 0.9 76.3 ± 1.476.3 ± 1.4 총-콜레스테롤 (mg/dL)Total Cholesterol (mg / dL) 196.8 ± 3.3196.8 ± 3.3 192.8 ± 3.5192.8 ± 3.5 195.3 ± 6.8195.3 ± 6.8 LDL-콜레스테롤 (mg/dL)LDL-cholesterol (mg / dL) 115.4 ± 3.2115.4 ± 3.2 113.9 ± 3.4113.9 ± 3.4 110.7 ± 6.2110.7 ± 6.2 Apo A1 (mg/dL)Apo A1 (mg / dL) 143.1 ± 2.2143.1 ± 2.2 139.9 ± 2.0139.9 ± 2.0 134.6 ± 4.4134.6 ± 4.4 Apo B (mg/dL)Apo B (mg / dL) 88.4 ± 2.188.4 ± 2.1 87.6 ± 2.287.6 ± 2.2 91.8 ± 4.591.8 ± 4.5 LDL 입자 크기(nm)Φ LDL particle size (nm) Φ 24.3 ± 0.1424.3 ± 0.14 24.1 ± 0.1424.1 ± 0.14 24.1 ± 0.2524.1 ± 0.25

평균값 ± 표준오차. Mean ± Standard Error.

MA: 대사 증후군 또는 공복 혈당 장애 같은 대사 이상, DM: 당뇨병, BP: 혈압, Apo: 아포지단백질MA: metabolic abnormalities such as metabolic syndrome or fasting blood glucose disorders, DM: diabetes, BP: blood pressure, Apo: apolipoprotein

Φ는 보정되거나 또는 보정되지 않은 변수가 로그-전환되거나, 일원변량 분석(one-way ANOVA)을 시행하고 본페로니 방법에 의해 테스트된 지표들을 나타낸다. Φ represents the indicators for which the corrected or uncorrected variables are log-converted, one-way ANOVA, and tested by Bonferroni's method.

같은 열의 같은 알파펫을 공유하는 것은 나이 및 체질량지수에 대한 조정 후 두 군들 간의 유의적이 차이가 없음을 나타낸다.Sharing the same alphapet in the same row indicates no significant difference between the two groups after adjustment for age and body mass index.

건강한 대조군 및 MA 환자들에서, C 보인자들, 특히 CC 동형접합체들은 TT 유전자형보다 TG의 레벨이 높았다(p0). 이러한 패턴은 나이, BMI, 폐경기, 흡연 및 음주 등을 보정한 후에도 유지되었다(p1; 도 1). 하지만, 혈장 ApoA5 또는/및 지질 약물 복용에 대한 보정은 유의적인 차이를 약화시켰다(p2 및 p3). 한편, DM 환자에서 CC 동형접합체는 TT 또는 TG 유전자형보다 더 높은 TG 레벨을 일관되게 나타냈다(p0, p1 및 p3). 세 가지 대상 군들에서 CC 동형접합체는 보정 전(p0) 및 후(p1)에 TT 또는 TC 유전자형보다 더 낮은 HDL-콜레스테롤의 레벨을 가졌다(도 1). 하지만, 혈장 ApoA5(p2) 및/또는 지질 약물 중독(p3)에 대한 추가적인 보정은 유의적인 차이를 약화시켰다. 혈장 ApoA5 레벨에 있어서, 건강한 대조군 및 MA 환자의 CC 동형접합체의 C 보인자는 보정 전(p0) 및 후(p1)에 다른 유전자형에 비해 더욱 더 낮은 레벨을 가졌다. 하지만, MA 여성들에서는 통계적인 유의성이 지질 약물복용에 대한 추가적인 보정 후에 사라졌다. 한편, 보정 전(p0) 및 후(p1 및 p4)에 DM 환자들에게서 어떠한 유의적인 자이도 관찰되지 않았다(도 1).In healthy control and MA patients, C carriers, particularly CC homozygotes, had higher levels of TG than TT genotype (p0). This pattern was maintained even after adjusting for age, BMI, menopause, smoking and drinking (p1; FIG. 1). However, corrections for plasma ApoA5 or / and lipid drug intake have diminished significant differences (p2 and p3). On the other hand, CC homozygotes in DM patients consistently showed higher TG levels than TT or TG genotypes (p0, p1 and p3). CC homozygotes in the three subject groups had lower HDL-cholesterol levels than the TT or TC genotype before (p0) and after (p1) correction (FIG. 1). However, further corrections for plasma ApoA5 (p2) and / or lipid drug intoxication (p3) weakened significant differences. For plasma ApoA5 levels, the C carriers of the CC homozygotes of healthy controls and MA patients had lower levels than other genotypes before (p0) and after (p1) correction. However, in MA women, statistical significance disappeared after further correction of lipid drug intake. On the other hand, no significant gyration was observed in DM patients before (p0) and after (p1 and p4) (FIG. 1).

또한, 표 4는 각 대상 군에서 총 콜레스테롤, LDL 콜레스테롤, ApoA1, ApoB 및 LDL 입자 크기와 유전자형 간의 연관성을 제시한다. 총 콜레스테롤, LDL 콜레스테롤 및 ApoB의 혈장 레벨은 건강한 대조군 및 DM 환자들 모두에서 유전자형에 따라 유의하게 다르지 않았다. 한편, MA 환자들의 총 콜레스테롤 및 ApoB가 TC 유전자형에서 현저하게 더 높았으며, MA 환자들의 LDL 콜레스테롤은 CC 유전자형에서 더 낮았다. 또한, 건강한 대조군 및 MA 여성들에서 ApoA1 레벨은 다른 유전자형보다 CC 유전자형에서 더 낮았고 건강한 대조군에서 LDL 입자 크기는 CC 유전자형보다 TT 유전자형에서 더 높았다. 한편, 공복 혈당은 모든 환자 군들에서 유전자형에 따라 유의하게 다르지 않았다(건강한 대조군의 경우, TT:83.7±0.2, TC:83.5±0.3, CC:83.6±0.8 mg/dL; MA 환자의 경우, TT:89.5±0.6, TC:89.8±0.6, CC:88.6±1.1 mg/dL; DM 환자의 경우, TT:129.0 3.0, TC:125.7 3.2, CC:124.6 7.5 mg/dL). 또한, 항고혈압제, 지질 강하제 또는 구강 혈당강하제 같은 의약의 비율은 MA 및 DM 환자들에서 유전자형에 따라 유의하게 다르지 않았다(결과를 보이지 않음).Table 4 also shows the association between total cholesterol, LDL cholesterol, ApoA1, ApoB and LDL particle sizes and genotypes in each subject group. Plasma levels of total cholesterol, LDL cholesterol and ApoB did not differ significantly by genotype in both healthy controls and DM patients. On the other hand, total cholesterol and ApoB in MA patients were significantly higher in TC genotype, and LDL cholesterol in MA patients was lower in CC genotype. In addition, ApoA1 levels in the healthy control and MA women were lower in the CC genotype than in the other genotypes, and in the healthy control, the LDL particle size was higher in the TT genotype than in the CC genotype. Fasting blood glucose, on the other hand, did not differ significantly between genotypes in all patient groups (TT: 83.7 ± 0.2, TC: 83.5 ± 0.3, CC: 83.6 ± 0.8 mg / dL for healthy controls; TT: for MA patients). 89.5 ± 0.6, TC: 89.8 ± 0.6, CC: 88.6 ± 1.1 mg / dL; TT: 129.0 3.0, TC: 125.7 3.2, CC: 124.6 7.5 mg / dL for DM patients). In addition, the proportion of medications, such as antihypertensives, lipid lowering agents or oral hypoglycemic agents, did not differ significantly by genotype in MA and DM patients (no results).

APOA5APOA5 -1131T>C 유전자형에 따른 당뇨병의 상대적 위험도Relative risk of diabetes mellitus according to

소수 C 대립 유전자의 보인자들을 TT 동형접합체(참조군)와 비교하였다(표 5). C 보인자들은 TT 유전자형보다 현저하게 더 높은 DM의 위험도를 나타냈다[OR0 1.39(95% CI, 1.09-1.77), P=0.008]. 이러한 현상은 나이, BMI, 폐경기, 흡연 및 음주에 대한 보정 후에도 여전하였다[OR1 1.61(95% CI, 1.23-2.10), P<0.001]. 특히, CC 유전자형은 TT 유전자형보다 훨씬 더 높은 증가된 위험도를 보였다[OR0 1.93(95% CI, 1.27-2.92), P=0.002, OR1 2.35(95% CI, 1.46-3.77), P<0.001]. MA의 위험도에서도 유사한 패턴이 관찰되었지만, DM에서 나타난 위험도에 비해 더 약하였다. 추가적인 대사 증후군에 대한 조정 후에도, C 보인자들은 여전히 뚜렷하게 더 높은 DM의 위험도를 가졌다[OR2 1.98(95% CI, 1.09-3.59), p=0.024]. CC 동형접합체도 높은 위험도를 나타냈으나 일시적인 경향이었다[OR2 2.51(95% CI, 0.90-6.96), p=0.078].Carriers of minor C alleles were compared to TT homozygotes (reference group) (Table 5). C carriers showed a significantly higher risk of DM than the TT genotype [OR 0 1.39 (95% CI, 1.09-1.77), P = 0.008]. This phenomenon was still present after correction for age, BMI, menopause, smoking and drinking [OR 1 1.61 (95% CI, 1.23-2.10), P <0.001]. In particular, the CC genotype showed a much higher increased risk than the TT genotype [OR 0 1.93 (95% CI, 1.27-2.92), P = 0.002, OR 1 2.35 (95% CI, 1.46-3.77), P <0.001 ]. Similar patterns were observed for the risk of MA, but weaker than those for DM. After adjustment for additional metabolic syndrome, C carriers still had a significantly higher risk of DM [OR 2 1.98 (95% CI, 1.09-3.59), p = 0.024]. CC homozygotes also showed a high risk, but were transient (OR 2 2.51 (95% CI, 0.90-6.96), p = 0.078).

APOA5-1131T>C 유전자형에 따른 당뇨병의 교차비(OR). Odds ratio of diabetes according to APOA5-1131T> C genotype (OR). 조정되지 않은 교차비
(OR0)
Unadjusted Cross Ratio
(OR 0 )
조정된 교차비1
(OR1)
Adjusted Cross Ratio 1
(OR 1 )
조정된 교차비(OR2)Adjusted crossover ratio (OR 2 )
MAMA DMDM MAMA DMDM DMDM TT1 TT 1 1One 1One 1One 1One 1One C 보인자
(TC+CC)
C carrier
(TC + CC)
OR
(95% CI2)
OR
(95% CI 2 )
1.363
(1.177-1.578)
1.363
(1.177-1.578)
1.388
(1.090-1.768)
1.388
(1.090-1.768)
1.466
(1.248-1.721)
1.466
(1.248-1.721)
1.608
(1.233-2.098)
1.608
(1.233-2.098)
1.983
(1.094-3.593)
1.983
(1.094-3.593)
p-값p-value <0.001<0.001 0.0080.008 <0.001<0.001 <0.001<0.001 0.0240.024 CCCC OR
(95% CI2)
OR
(95% CI 2 )
1.687
(1.287-2.213)
1.687
(1.287-2.213)
1.929
(1.274-2.929)
1.929
(1.274-2.929)
1.913
(1.423-2.573)
1.913
(1.423-2.573)
2.348
(1.463-3.769)
2.348
(1.463-3.769)
2.511
(0.903-6.598)
2.511
(0.903-6.598)
p-값p-value <0.001<0.001 0.0020.002 <0.001<0.001 <0.001<0.001 0.0780.078

1참조, 2신뢰구간, MA: 대사 증후군 또는 공복 혈당 장애 같은 대사 이상, DM: 당뇨병. 1 See, 2 confidence intervals, MA: metabolic abnormalities such as metabolic syndrome or fasting blood glucose disorders, DM: diabetes.

MA 또는 DM과 유전자형 간의 연관성은 보정되거나 또는 보정되지 않은 카이스퀘어 테스트의 교차비[odds ratio(OR); 95% 신뢰구간(confidence intervals, CIs)]를 이용하여 계산하였다.The association between MA or DM and genotypes is determined by the odds ratio (OR) of the corrected or uncorrected chi-square test; 95% confidence intervals (CIs)].

OR0: 보정되지 않은 교차비, OR1: 나이, BMI, 폐경기, 흡연 및 음주에 대해 조정된 교차비, OR2: 나이, BMI, 폐경기, 흡연, 음주 및 대사 증후군에 대해 보정된 교차비.OR 0 : uncorrected crossover ratio, OR 1 : adjusted crossover ratio for age, BMI, menopause, smoking and drinking, OR 2 : corrected crossover ratio for age, BMI, menopause, smoking, drinking and metabolic syndrome.

트리글리세라이드에 대한 For triglycerides APOA5APOA5 -1131T>C 및 공복 혈당의 연관 효과Association effect of -1131T> C and fasting blood glucose

표 6은 APOA5-1131T>C 유전자형과 관계된 공복 혈당 및 TG 간의 연관성을 나타낸다. 공복 혈당 레벨은 DM 환자들(R0: r=0.148, p=0.010) 뿐 아니라, 전체 집단(R0: r=0.142, p<0.001)에서 TG 레벨과 양성적으로(positively) 연관되어 있었다. 이들 두 개의 변수들도 총 집단(R0)의 각 유전자형 아군에서 양성적으로 연관되어 있었다. 한편, DM 환자들은 C 보인자들(R0: r=0.165, p=0.035), 특히 CC 동형접합체들(R0: r=0.395, p=0.021)에서만 양성 연관성을 나타내며 TT 유전자형(R0: r=0.139, p=0.102)에서는 보이지 않는다. 이러한 패턴은 나이, BMI, 폐경기, 흡연, 음주 및 지질 약물복용에 대한 보정 후에도 여전히 유지하였다(R1). 각 환자 군들은 공복 혈당 레벨에 따라서 두 군으로 구분되었다(중앙값: 건강한 대조군, 84 mg/dl; MA, 87 mg/dl; 및 DM, 122 mg/dl)(도 2). 건강한 대조군 및 MA 여성들은 조정 전 및 후의 공복 혈당 레벨에도 불구하고 TT 유전자형보다 C 보인자뿐 아니라 CC 동형접합체에서 더 높은 TG 레벨을 나타냈다. 한편, DM 환자들은 공복 혈당 레벨이 122 mg/dl 미만일 경우 TG 레벨과 유전자형 간의 유의한 연관성을 나타내지 않은 반면에 CC 환자들은 공복 혈당 레벨이 ≥122 mg/dl인 경우 매우 현저하게 높은 TG 레벨을 나타냈다. 이러한 패턴은 보정 후에도 유지되었다.Table 6 shows the correlation between fasting plasma glucose and TG and associated APOA5 -1131T> C genotype. Fasting blood glucose levels were positively associated with TG levels in the entire population (R0: r = 0.142, p <0.001) as well as DM patients (R0: r = 0.148, p = 0.010). These two variables were also positively associated with each genotype subgroup of the total population (R0). DM patients, on the other hand, have a positive association only with C carriers (R0: r = 0.165, p = 0.035), especially CC homozygotes (R0: r = 0.395, p = 0.021) and show a TT genotype (R0: r = 0.139). , p = 0.102). This pattern was still maintained after correction for age, BMI, menopause, smoking, drinking and lipid drug intake (R1). Each patient group was divided into two groups according to fasting blood glucose levels (median: healthy control group, 84 mg / dl; MA, 87 mg / dl; and DM, 122 mg / dl) (FIG. 2). Healthy control and MA women showed higher TG levels in CC homozygotes as well as C carriers than TT genotype despite fasting blood glucose levels before and after adjustment. On the other hand, DM patients did not show a significant association between TG levels and genotypes when fasting glucose levels were below 122 mg / dl, whereas CC patients showed very high TG levels when fasting glucose levels were ≥122 mg / dl. . This pattern was maintained even after correction.

APOA5-1131T>C 유전자형에 따른 당뇨병의 교차비(OR). Odds ratio of diabetes according to APOA5-1131T> C genotype (OR). APOA5-1131T>C 유전자형에 따른 According to APOA5 -1131T> C genotype gun TTTT C 보인자(TC+CC)C carrier (TC + CC) CCCC R0R0 R1R1 R0R0 R1R1 R0R0 R1R1 R0R0 R1R1 총 집단
(n = 3,450)
Total collective
(n = 3,450)
rr 0.1420.142 0.1300.130 0.1440.144 0.1050.105 0.1390.139 0.0960.096 0.1830.183 0.1500.150
pp <0.001<0.001 0.0020.002 <0.001<0.001 <0.001<0.001 <0.001<0.001 <0.001<0.001 0.0020.002 0.0130.013 DM
(n = 304)
DM
(n = 304)
rr 0.1480.148 0.1460.146 0.1390.139 0.1130.113 0.1650.165 0.1680.168 0.3950.395 0.4510.451
pp 0.0100.010 0.0150.015 0.1020.102 0.2190.219 0.0350.035 0.0390.039 0.0210.021 0.0270.027

r: 상관계수, p: p-값, R0: 보정되지 않은 값, R1: 나이, BMI, 폐경기, 흡연 및 음주에 대해 보정된 값. r : correlation coefficient, p : p-value, R0: uncorrected value, R1: corrected value for age, BMI, menopause, smoking and drinking.

추가 논의 사항Further discussion

본 발명의 결과들은 APOA5-1131C 대립 유전자가 한국 여성들에게서 당뇨병의 증가된 위험에 기여할 수 있으며; C 보인자들이 현저하게 증가된 DM의 위험도를 나타내고 그 위험도가 CC 동형접합체에서 더욱 더 높다는 것을 최초로 제시한다. 이러한 현상은 나이, BMI, 폐경기, 흡연, 음주 및 폐경기 상태에 대한 보정 후에도 유효하였다. 대사 증후군에 대한 추가적인 조정을 거친 후에도 C 보인자들은 현저하게 높은 DM의 위험도를 여전히 나타냈다. 본 연구는 C 보인자들에서 더 높은 DM의 위험도(2-3.75배)를 보고한 중국인들에 대한 Zhai 등[13] 및 Yan 등[14]의 연구들과 동일 선상에 있으나 이들 연구의 유의적인 연관성은 성, HDL-콜레스테롤, TG, 흡연 등의 보정 후에 약화되었다. 또한, 영국의 건강한 남자들에 대한 15년 동안 지속적인 연구(Northwick Park Heart Study II)는 제2형 당뇨병의 발병 위험도 상에 APOA5 유전자형(1131T>C 또는 S19W)의 영향(impact)이 없음을 보여줬다[15]. 본 발명의 결과들과의 이러한 불일치는 환자 특성 및 민족성에서의 차이에서 기인할 수 있다. 본 연구에서, 환자들은 모두 한국인 여성들이었으며 당뇨병 환자들은 어떠한 심혈관 질환도 가지지 않았으나, 다른 연구들은 남성 및 여성 모두[13, 14], 또는 남성들만[15]을 포함하였으며 일부는 관상동맥질환을 가지는 당뇨병 환자들을 포함하였다[14]. 또한, 집단 간의 대립 유전자 빈도에서의 차이가 고려될 수 있다. APOA5-1131 SNP에서 소수 C 대립 유전자 빈도는 서양사람(9~16%)보다 동아시아인(28~30%)에서 더 높다는 것이 잘 알려져 있다[2, 4-9]. 또한, 소수 대립 유전자빈도는 같은 아시아 지역에서 조차 집단들 간에 다를 수 있으며; 본 연구에서의 건강한 대상들의 소수 C 대립 유전자 빈도는 0.265였지만 Zhai 등[13] 및 Yan 등[14]의 연구들은 각각 우리의 연구보다 약간 더 높은 0.296 및 0.277이었다.The results of the present invention indicate that the APOA5-1131C allele may contribute to an increased risk of diabetes in Korean women; It is the first to suggest that the C carriers show a significantly increased risk of DM and that the risk is even higher in CC homozygotes. This phenomenon was effective even after correction for age, BMI, menopause, smoking, drinking and menopause status. After further adjustment for metabolic syndrome, C carriers still displayed a significantly higher risk of DM. This study is in line with the studies of Zhai et al. [13] and Yan et al. [14] in China, who reported higher DM risk (2-3.75 times) in C carriers, but the significance of these studies was significant. Association was weakened after correction of sex, HDL-cholesterol, TG, smoking, and the like. In addition, a 15-year continuous study of healthy men in the UK (Northwick Park Heart Study II) showed no impact of the APOA5 genotype (1131T> C or S19W) on the risk of developing type 2 diabetes [15]. ]. This discrepancy with the results of the present invention may be due to differences in patient characteristics and ethnicity. In this study, the patients were all Korean women and the diabetics did not have any cardiovascular disease, but other studies included both males and females [13, 14] or only males [15] and some had coronary artery disease. Patients were included [14]. In addition, differences in allele frequencies between populations may be considered. Decimal C allele frequencies in APOA5 -1131 SNP is It is well known than Westerners (9-16%) is higher in the East (28 to 30%) [2, 4-9]. In addition, minor allele frequencies may differ between groups even in the same Asian region; Although the prime C allele frequency of healthy subjects in this study was 0.265, the studies of Zhai et al. [13] and Yan et al. [14] were 0.296 and 0.277, slightly higher than ours, respectively.

APOA5-1131T>C는 고트리글리세라이드 혈증 및 다양한 민족집단에서 증가된 CVD의 위험도와 강하게 연관되어 있다[2, 4, 10, 16]. 또한, 고트리글리세라이드 혈증은 DM에서 보여지고 제2형 당뇨병에서 심혈관합병증의 서로 다른 위험인자로 일반적으로 관찰된다[11, 12]. 본 연구에서, TG 레벨은 MA 환자에서 가장 높았으며 건강한 대조군과 비교하여 DM 환자에서 더 높았다. 반면에, TG 레벨은 세 가지 환자 군들에서 TT 유전자형보다 C 보인자들, 특히 CC 동형접합체에게서 더 높았고 그 유의성이 나이, BMI, 흡연, 음주 및 폐경기 같은 혼란변수들(confounders)에 대한 보정 후에도 유지되었다. 혈장 ApoA5 레벨 및/또는 지질 약물에 대한 추가적인 보정은 DM 환자들에게서 그 유의성을 여전히 유지하였으나 건강한 대조군 및 MA 여성들에게서 유의성을 약화시켰다. ApoA5는 리포 단백질 리파제(LPL)와의 직접적인 상호작용 및 LPL-매개된 혈장 TG의 가수분해에 의해 TG를 순환시키는 조절에서 중요한 역할을 수행한다[17, 18]. 여러 연구들이 ApoA5 레벨이 건강한 사람들보다 CAD 또는 DM 환자들에서 더 낮다는 것을 보고하였다[19-21]. Nowak 등의 연구에 따르면, ApoA5 발현은 인슐린 저항성에 의해 하향-조절되며 혈장 레벨이 뒤따르는 인슐린 주입에 의해 감소되었다[22]. 또한, ApoA5의 더 낮은 레벨은 TG 레벨과 반대로 움직이는 APOA5-1131의 C 대립 유전자[10]와 연관되어 있다. 본 연구에서, DM 환자들은 건강한 대조군보다 ApoA5의 더 낮은 레벨을 가졌으며 유전자형과 특별한 연관성을 가지지 않은 반면에, 건강한 대조군 및 MA 환자의 CC 동형접합체에서 C 보인자들은 더 낮은 레벨의 ApoA5을 보였다. 일반적으로 DM 환자들에게서 일어나는 고인슐린혈증 및 인슐린 저항성은 APOA5-1131T>C 유전자형과 연관된 효과를 마스킹하는 것처럼 ApoA5 발현을 현저하게 하향-조절시킬 수 있을 것으로 사료된다. 하지만, 공복 혈당 레벨은 세 가지 환자 군들에서 유전자형에 따라 다르지 않았다. 유사한 결과가 Zhai 등의 보고[13]에서 관찰되었는데, 이 보고에서 건강한 대조군 및 제2형 당뇨병 모두에서 인슐린 저항성의 프로파일과의 유전자형 연관성이 공복 레벨에서 뚜렷하게 나타나지 않았다. 건강한 대조군 및 CAD 환자들에 대한 본 발명자들의 이전 연구도 혈당의 공복 레벨 및 항상성 모델 측정법(homeostasis model assessment)으로 계산된 인슐린 저항성과의 유의적인 유전자형 연관성을 나타내지 않았다[10]. 한편, Chiu 등은 APOA5 V150M이 공복 혈당레벨과 연관되어 있지 않지만, 고혈당클램프(hyperglycemic clamping)동안 더 높은 1기 및 2기 인슐린 반응과 유의하게 연관되어 있다는 흥미로운 결과를 보고하였다[23]. 이러한 결과는 본 발명과 다른 SNP로부터 유래한 결과였지만 혈당의 식후 레벨, 또는 공복 상태보다는 오히려 고혈당클램프 또는 당부하검사 동안 인슐린을 측정하는 것이 혈당 또는 인슐린 반응과 APOA5-1131T>C 간의 직접적인 연관성을 조사하기 위해 더 관련성이 있다는 것을 제시해 주었다. APOA5-1131T > C is strongly associated with the risk of hypertriglyceridemia and increased CVD in various ethnic groups [2, 4, 10, 16]. Hypertriglyceridemia is also seen in DM and is commonly observed as a different risk factor for cardiovascular complications in type 2 diabetes [11, 12]. In this study, TG levels were highest in MA patients and higher in DM patients compared to healthy controls. In contrast, TG levels were higher in C-carriers, especially CC homozygotes, than in TT genotypes in three patient groups, and their significance was maintained even after correction for confounders such as age, BMI, smoking, drinking and menopause. It became. Further corrections to plasma ApoA5 levels and / or lipid drugs still retained their significance in DM patients but diminished in healthy control and MA women. ApoA5 plays an important role in the regulation of circulating TG by direct interaction with lipoprotein lipase (LPL) and hydrolysis of LPL-mediated plasma TG [17, 18]. Several studies have reported that ApoA5 levels are lower in CAD or DM patients than in healthy people [19-21]. According to Nowak et al., ApoA5 expression was down-regulated by insulin resistance and reduced by insulin infusion followed by plasma levels [22]. In addition, lower levels of ApoA5 are associated with the C allele of APOA5 -1131 [10], which moves opposite to TG levels. In this study, DM patients had lower levels of ApoA5 than healthy controls and had no particular association with genotypes, whereas C carriers in CC homozygotes of healthy controls and MA patients showed lower levels of ApoA5. In general, hyperinsulinemia and insulin resistance occurring in DM patients may be able to significantly down-regulate ApoA5 expression as masking the effects associated with the APOA5 -1131T> C genotype. However, fasting blood glucose levels did not vary by genotype in the three patient groups. Similar results were observed in Zhai et al. [13], in which the genotype association with the profile of insulin resistance in both healthy controls and type 2 diabetes was not apparent at the fasting level. Our previous studies on healthy control and CAD patients did not show significant genotype associations with fasting levels of blood glucose and insulin resistance calculated by homeostasis model assessment [10]. Chiu et al., On the other hand, reported interesting results that APOA5 V150M was not associated with fasting blood glucose levels, but was significantly associated with higher stage 1 and 2 insulin responses during hyperglycemic clamping [23]. These results were derived from different SNPs from the present invention, but the measurement of insulin during hyperglycemic clamp or glucose load test rather than postprandial levels of blood glucose or fasting state investigated the direct association between blood glucose or insulin response and APOA5 -1131T> C. To make it more relevant.

한편, 공복 혈당 레벨은 TG 레벨과 양의 상관관계에 있었으며, 이는 아군의 유전자형 뿐 아니라, 전체 집단에서도 관찰되었다. 흥미롭게도, DM 환자들은 TT 동형접합체가 아니라 C 보인자들만, 특히 CC 동형접합체에서만 양의 관련성을 나타냈다. 또한, 더 높은 공복 혈당(≥122 mg/dl)을 가진 CC 환자들은 현저하게 더 높은 TG 레벨을 나타냈다. 이러한 결과들은 고혈당혈증을 가진 CC 환자들이 심혈관합병증의 위험에 더욱 쉽게 노출될 수 있는 고트리글리세라이드 혈증에 더욱 더 민감하다는 것을 의미할 수 있다.On the other hand, fasting blood glucose levels were positively correlated with TG levels, which were observed not only in the genotype of the allies, but also in the entire population. Interestingly, DM patients showed a positive association only with C carriers, not only with CC homozygotes, but with TT homozygotes. In addition, CC patients with higher fasting blood glucose (≧ 122 mg / dl) showed significantly higher TG levels. These results may mean that CC patients with hyperglycemia are more sensitive to hypertriglyceridemia, which may be more easily exposed to the risk of cardiovascular complications.

본 발명의 연구결과는 여러 가지 한계를 가진다. 연구 대상 환자들이 한국인 여성들이어서 본 발명의 결과들을 남성들 또는 한국인 집단의 임상적 및 생화학적 특성들과 다를 수 있는 민족 표본들에 적용하지 못할 수도 있다. 이러한 환자군-대조군 연구는 노출(exposure) 및 결과들(outcomes)이 시간적으로 한 시점에서 수집되기 때문에 시간 순차 연관성(time sequential associations)을 평가하기 위해 고안되지 않는다. 식후 당부하검사 또는 고혈당클램프 테스트가 혈당 및 인슐린 상태의 조절에서 APOA5-1131C 대립 유전자의 직접적인 기여를 조사하기 위해 필요할 수 있다. 또한, APOA5 유전자의 다른 SNP들(예컨대, V150M, G185C) 또는 다른 관계된 유전자들(즉, APOA1/C3/A4)의 분석이 DM 위험도와의 연관성을 해석하기 위해 고려될 필요가 있다[1, 23]. 이러한 제한들에도 불구하고, 본 연구의 신규 발견들은 APOA5-1131C 대립 유전자가 한국인 여성에서 증가된 DM의 위험도에 서로 독립적으로 기여할 수 있다는 것을 의미한다. 추가적으로, 특히 더 높은 공복 혈당 레벨을 가진 DM 환자들의 CC 동형접합체에서 관찰된 매우 높은 TG 레벨은 고혈당혈증을 가진 APOA5-1131T>C의 CC 동형접합체가 심혈관합병증의 위험에 더 민감할 수 있다는 것을 제시해 준다.The research results of the present invention have various limitations. The patients studied are Korean women and may not apply the results of the present invention to ethnic specimens that may differ from the clinical and biochemical characteristics of the males or Korean population. Such patient-control studies are not designed to assess time sequential associations because exposures and outcomes are collected at one point in time. Postprandial glucose tolerance test or a hyperglycemic clamp test may be necessary to investigate the direct contribution of APOA5 -1131C allele in the regulation of blood sugar and insulin state. In addition, analysis of other SNPs of the APOA5 gene (eg, V150M, G185C) or other related genes (ie APOA1 / C3 / A4 ) needs to be considered to interpret the association with DM risk [1, 23]. ]. Despite these limitations, the new findings in this study indicate that the APOA5-1131C allele can independently contribute to the increased risk of DM in Korean women. In addition, the very high TG levels observed in CC homozygotes, especially in DM patients with higher fasting glucose levels, suggest that CC homozygotes of APOA5 -1131T> C with hyperglycemia may be more susceptible to cardiovascular complications. give.

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도 1은 APOA5-1131T>C 다형성(polymorphism)에 따른 트리글리세라이드, HDL-콜레스테롤 및 아포지단백질 A5의 혈장 레벨을 측정한 결과이다. 측정된 트리글리세라이드, HDL-콜레스테롤 및 아포지단백질 A5의 혈장 레벨을 평균값 ± 표준오차로 나타냈다. Φ는 조정되거나 또는 조정되지 않은 변수가 로그-전환되거나, 일원변량 분석(one-way ANOVA)을 시행하고 본페로니 방법에 의해 테스트된 지표들을 나타낸다. 같은 열의 같은 알파펫을 공유하는 것은 나이 및 체질량지수에 대한 보정 후 두 군들 간의 유의적이 차이가 없음을 나타낸다. P0: 보정되지 않은 p-값, P1: 나이, 체질량지수(BMI), 폐경기, 흡연, 음주 및 ApoA5에 대해 보정된 p-값, P3: 나이, 체질량지수(BMI), 폐경기, 흡연, 음주, ApoA5 및 지질 약물에 대해 보정된 p-값, P4: 나이, 체질량지수(BMI), 폐경기, 흡연, 음주 및 지질 약물에 대해 보정된 p-값. 건강한 대조군(TT: n = 1096, TC: n = 798, CC: n = 139), MA(TT: n = 514, TC: n = 489, CC: n = 110), DM(TT: n = 139, TC: n = 131, CC: n = 34). MA는 대사 증후군 또는 공복 혈당 장애 같은 대사 이상을 나타내며, DM은 당뇨병(diabetes mellitus)을 나타낸다.1 is APOA5 -1131T> is the result of a triglyceride according to the C polymorphism (polymorphism), measuring the blood plasma levels of HDL- cholesterol and apolipoprotein A5. The measured plasma levels of triglycerides, HDL-cholesterol and apolipoprotein A5 are shown as mean ± standard error. Φ represents the indicators for which adjusted or unadjusted variables are log-converted, one-way ANOVA, and tested by Bonferroni's method. Sharing the same alphapet in the same row indicates that there was no significant difference between the two groups after correction for age and body mass index. P0: uncorrected p-value, P1: age, body mass index (BMI), menopause, smoking, drinking and p-value corrected for ApoA5, P3: age, body mass index (BMI), menopause, smoking, drinking, P-value corrected for ApoA5 and lipid drug, P4: age, body mass index (BMI), p-value corrected for menopause, smoking, drinking and lipid drugs. Healthy control group (TT: n = 1096, TC: n = 798, CC: n = 139), MA (TT: n = 514, TC: n = 489, CC: n = 110), DM (TT: n = 139 , TC: n = 131, CC: n = 34). MA represents metabolic abnormalities such as metabolic syndrome or fasting blood glucose disorders, and DM represents diabetes mellitus.

도 2는 당뇨병에서 혈장 트리글리세라이드Φ(mg/ml) 상에 APOA5-1131T>C 유전자형 및 공복 혈당의 시너지 효과를 보여주는 결과이다. 측정된 혈장 트리글리세라이드의 혈장 레벨을 평균값 ± 표준오차로 나타냈다. Φ는 로그-전환되어 테스트되거나(*p<0.05, **p<0.01, ***p<0.01); 나이, 체질량지수(BMI), 폐경기, 흡연 및 음주로 조정된 후 각 대상 군에서 TT 환자들과 비교되어 테스트되거나(†p<0.01, ‡p<0.001); 나이, 체질량지수(BMI), 폐경기, 흡연, 음주, ApoA5(건강한 대조군) 및 지질 약물(MA 및 DM)로 조정된 후 각 대상 군에서 TT 환자들과 비교되어 테스트된 것이다. 건강한 대조군, MA 및 DM 여성들에서 공복 혈당의 중앙값이 각각 84, 87 및 122 mg/dl로 나타났다. MA는 대사 증후군 또는 공복 혈당 장애 같은 대사 이상을 나타내며, DM은 당뇨병(diabetes mellitus)을 나타낸다.FIG. 2 shows the synergistic effects of APOA5-1131T> C genotype and fasting blood glucose on plasma triglyceride Φ (mg / ml) in diabetes . The plasma levels of the measured plasma triglycerides are shown as mean ± standard error. Φ is log-converted and tested ( * p <0.05, ** p <0.01, *** p <0.01); Were adjusted to age, body mass index (BMI), menopause, smoking and drinking and then tested compared to TT patients in each subject group († p <0.01, ‡ p <0.001); Age, body mass index (BMI), menopause, smoking, drinking, ApoA5 (healthy controls), and lipid drugs (MA and DM) were adjusted and then compared to TT patients in each subject group. Median fasting blood glucose levels were 84, 87 and 122 mg / dl, respectively, in healthy controls, MA and DM women. MA represents metabolic abnormalities such as metabolic syndrome or fasting blood glucose disorders, and DM represents diabetes mellitus.

<110> Yonsei University <120> Kits for Determining a Diabetes Mellitus and Uses Thereof <160> 1 <170> KopatentIn 1.71 <210> 1 <211> 52 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 1 tgagccccag gaactggagc gaaagtraga tttgccccat gaggaaaagc tg 52 <110> Yonsei University <120> Kits for Determining a Diabetes Mellitus and Uses Thereof <160> 1 <170> Kopatentin 1.71 <210> 1 <211> 52 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 1 tgagccccag gaactggagc gaaagtraga tttgccccat gaggaaaagc tg 52  

Claims (15)

서열목록 제1서열인 APOA5(Apolipoprotein A5) 유전자 프로모터의 -1131 위치의 C 뉴클레오타이드(APOA5-1131T>C)를 포함하는 C 대립 유전자의 10-100개의 연속 뉴클레오타이드 서열에 특이적으로 결합하는 프라이머 또는 프로브를 포함하는 한국인 여성 당뇨병 진단용 키트로 상기 C 대립 유전자는 CC 동형접합체(homozygote)이고, 나이, 체질량지수(body mass index, BMI), 폐경기, 흡연, 음주 및 대사 증후군(metabolic syndrome, MS)으로 조정된 교차비(adjusted odds rate)가 1.4-7.0의 범위로 계산되는 경우 당뇨병으로 진단되는 것을 특징으로 하는 한국인 여성 당뇨병 진단용 키트.A primer or probe that specifically binds to 10-100 consecutive nucleotide sequences of the C allele comprising the C nucleotide at position -1131 ( APOA5 -1131T> C) of the APOA5 gene promoter, SEQ ID NO: 1 Korean female diabetes diagnostic kit comprising the C allele is CC homozygotes (homozygote), adjusted to age, body mass index (BMI), menopause, smoking, drinking and metabolic syndrome (MS) Korean female diabetes diagnosis kit, characterized in that diagnosed as diabetes when the adjusted odds rate (calculated in the range of 1.4-7.0). 삭제delete 삭제delete 삭제delete 삭제delete 삭제delete 삭제delete 삭제delete 삭제delete 삭제delete 제 1 항에 있어서, 상기 MS는 >80 cm의 허리둘레(여성), ≥150 mg/dl의 트리글리세라이드(TG), <50 mg/dl의 HDL(high-density lipoprotein)-콜레스테롤(여성), ≥130/≥85 mmHg의 혈압 및 ≥100 mg/dl의 공복 혈당(fasting glucose)으로 구성된 군으로부터 적어도 세 가지 이상의 구성요소를 포함하는 것을 특징으로 하는 한국인 여성 당뇨병 진단용 키트.The method of claim 1, wherein the MS has a waist circumference (female) of> 80 cm, ≥150 mg / dl of triglyceride (TG), <50 mg / dl of high-density lipoprotein (HDL) -cholesterol (female), Korean female diabetes diagnosis kit, characterized in that it comprises at least three or more components from the group consisting of blood pressure of ≥130 / ≥85 mmHg and fasting glucose of ≥ 100 mg / dl. 제 1 항에 있어서, 상기 키트는 혈청 지질 프로파일, 아포지단백질 A1, A5 및 B, 혈당 또는 혈장 LDL(low-density lipoprotein) 입자 크기를 분석하는 것을 추가적으로 포함하는 것을 특징으로 하는 한국인 여성 당뇨병 진단용 키트.The kit for diagnosing Korean female diabetes according to claim 1, wherein the kit further comprises analyzing serum lipid profiles, apolipoproteins A1, A5 and B, blood glucose or plasma LDL (low-density lipoprotein) particle sizes. 삭제delete 삭제delete 삭제delete
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