KR100997044B1 - Sigma factor r and a method for increasing production of antibiotics using sigma factor r - Google Patents

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Abstract

본 발명은 스트렙토마이세스 (Streptomyces) 속의 방선균에서 동정된 시그마 인자 R (sigR) 유전자를 이용하여 스트렙토마이세스 속의 방선균에서 의학적으로 유용한 물질의 생산을 증가시키는 방법, 이를 위한 발현 벡터, 및 이 발현 벡터로 형질전환된 스트렙토마이세스 속의 방선균에 관한 것이다. 본 발명에 의하여 균형있게 성장하면서도 의학적으로 유용한 물질의 생산성이 개선된 스트렙토마이세스 속의 방선균이 제공될 수 있다.The present invention is Streptomyces (Streptomyces) in the by using the sigma factor R (sigR) gene isolated from Streptomyces method for increasing the production of medically useful substances in Streptomyces genus Streptomyces, the expression vector therefor, and the expression vector It relates to actinomycetes of the genus Streptomyces transformed into. According to the present invention, actinomycetes in Streptomyces can be provided in which the productivity of a medically useful substance is improved while being balanced.

Description

시그마 인자 R 및 이를 이용한 항생제 생산 증가 방법 {SIGMA FACTOR R AND A METHOD FOR INCREASING PRODUCTION OF ANTIBIOTICS USING SIGMA FACTOR R}SIGMA FACTOR R AND A METHOD FOR INCREASING PRODUCTION OF ANTIBIOTICS USING SIGMA FACTOR R}

본 발명은 스트렙토마이세스 (Streptomyces) 속의 방선균에서 동정된 시그마 인자 R (sigR) 유전자를 이용하여 스트렙토마이세스 속의 방선균에서 의학적으로 유용한 물질의 생산을 증가시키는 방법, 이를 위한 발현 벡터, 및 이 발현 벡터로 형질전환된 스트렙토마이세스 속의 방선균에 관한 것이다.The present invention is Streptomyces (Streptomyces) in the by using the sigma factor R (sigR) gene isolated from Streptomyces method for increasing the production of medically useful substances in Streptomyces genus Streptomyces, the expression vector therefor, and the expression vector It relates to actinomycetes of the genus Streptomyces transformed into.

스트렙토마이세스 속의 방선균은 다양한 2차 대사산물을 생산하는 능력이 있으며, 이 2차 대사산물은 항생제, 항진균제, 항암제 등 의학적으로 유용한 물질로서 활용될 수 있다는 것이 잘 알려져 있다 (Chater et al., Trends Genet., 5: 372-377, 1990; Hopwood et al., Proc. R. Soc. Lond. Series, 235: 2257-2269, 1987; Nakamura et al., Biocechno. Bioproc. Eng., 8: 37-40, 2004). 이미, 많은 수의 의학적으로 유용한 물질이 스트렙토마이세스 속의 방선균으로부터 분리되었으며, 예를 들어, 아미노글리코시드, 안트라시클린, 글리코펩티드, β-락탐, 마크로리드, 핵산계, 펩티드계, 폴리엔 등의 다양한 종류의 화학구조를 가진 물질들이 스트렙토마이세스 속의 방선균에서 유래된 것으로 알려져 있다.Actinomycetes in Streptomyces are known to be capable of producing a variety of secondary metabolites, which can be used as medically useful substances such as antibiotics, antifungal agents, and anticancer drugs (Chater et al., Trends Genet., 5: 372-377, 1990; Hopwood et al., Proc. R. Soc.Lond.Series, 235: 2257-2269, 1987; Nakamura et al., Biocechno.Bioproc.Eng., 8: 37- 40, 2004). Already, a large number of medically useful substances have been isolated from actinomycetes in Streptomyces, for example aminoglycosides, anthracyclines, glycopeptides, β-lactams, macrolides, nucleic acid systems, peptide systems, polyenes, etc. It is known that substances with various chemical structures of are derived from actinomycetes in Streptomyces.

이러한 스트렙토마이세스 속의 방선균과 같이 의학적으로 유용한 물질을 자체적으로 생산할 수 있는 균주에 있어서, 이 균주가 균형있게 성장할 수 있으면서도 이러한 유용한 물질의 생산성이 향상되고 나아가 이렇게 향상된 생산성이 지속적으로 유지될 수 있는 균주를 만드는 것이 이 기술분야의 연구자들의 궁극적인 목표이다.In a strain capable of producing a medically useful substance on its own, such as actinomycetes of Streptomyces, the strain can grow in a balanced manner while also improving the productivity of this useful substance and further maintaining this improved productivity. To create the ultimate goal is for researchers in this field of technology.

이에 따라 다양한 균주, 특히 스트렙토마이세스 속의 방선균에서 이 균주가 자체적으로 갖는 의학적으로 유용한 물질의 생산성을 향상시키기 위한 많은 노력들이 진행되어 왔다. 종전에는 무작위로 만들어진 돌연변이체를 연구하거나 또는 생산을 원하는 유용한 물질의 전구체를 균주에 공급하는 연구가 주로 이루어졌지만, 최근에는 유전자 및 단백질의 재조합 기술, 게놈 시퀀싱, 생물정보학, 단백질체학 등 최신의 생물학 기법의 발달에 따라 더욱 광범위한 시도가 이루어지고 있다 (Bentley et al., Nature, 417:141, 2002; Lee et al., J. Mircobiol Biotechnol. 16: 331-348, 2006; Paradkar et al., Crit. Rev. Microbiol. 23:1, 2003). 이러한 방법들에는, 재조합 DNA 기술을 사용하여 의학적으로 유용한 물질을 생산하는 유전자를 직접적으로 도입하는 방법, 이 생산 유전자의 발현을 조절하는 부분적인 조절 인자를 도입하는 방법, 필요없는 생합성 유전자를 제거하는 방법, 속도제한 단계 (rate limiting step) 에 따른 제한을 해소해주는 신진대사 엔지니어링 (metabolic engineering) 방법, 항생제의 조절 (regulation) 을 통하여 항생제의 생산성을 늘리는 방법 등을 예로 들 수 있다 (Rohlin et al., Curr. Opin. Microbiol. 4:330, 2001; Butler et al. Appl. Environ. Microbiol. 66:3960, 2000; Fujii et al., J. Bacteriol 178:3402, 1996; Stutzman-engwall et al., J. Bacteriol 174:144, 1992).Accordingly, many efforts have been made to improve productivity of various strains, particularly actinomycetes of Streptomyces sp. In the past, researches on randomly generated mutants or feeding precursors of useful substances to be produced into strains have been mainly conducted, but recently, the latest biology such as recombinant technology of genes and proteins, genome sequencing, bioinformatics, proteomics, etc. More extensive attempts are being made with the development of the technique (Bentley et al., Nature, 417: 141, 2002; Lee et al., J. Mircobiol Biotechnol. 16: 331-348, 2006; Paradkar et al., Crit Rev. Microbiol. 23: 1, 2003). These methods include the use of recombinant DNA technology to directly introduce genes that produce medically useful substances, introduce partial regulatory factors that regulate the expression of these genes, and remove unwanted biosynthetic genes. Methods include metabolic engineering, which eliminates limitations in the rate limiting step, and increased productivity of antibiotics through regulation of antibiotics (Rohlin et al. , Curr. Opin.Microbiol. 4: 330, 2001; Butler et al. Appl.Environ.Microbiol. 66: 3960, 2000; Fujii et al., J. Bacteriol 178: 3402, 1996; Stutzman-engwall et al., J. Bacteriol 174: 144, 1992).

대한민국 공개특허공보 제2006-0018190호에서는, 스트렙토마이세스 속 방선균에 전사활성체로서 기능하는 afsR (A-factor synthesis R) 유전자를 도입함으로써 항생제로서 기능할 수 있는 감마-액티노로딘의 생산성을 향상시킨 것이 보고되어 있다.Korean Patent Laid-Open Publication No. 2006-0018190 improves the productivity of gamma-actinolodine that can function as an antibiotic by introducing an afsR (A-factor synthesis R) gene that functions as a transcriptional activator to Streptomyces spp. Has been reported.

한편, 종전에 생합성 유전자의 직접적 제어 방법에 집중하던 것에서 벗어나, 최근에는 스트렙토마이세스 속의 방선균의 전체적인 물질대사를 조절하는 방향으로 연구가 진행되고 있다. 이는, 스트렙토마이세스 속의 방선균에서 특정 대사산물의 생산에 단순히 그 유전자 또는 그 유전자를 포함하는 클러스터 (cluster) 만이 역할을 하는 것이 아니라, 1차 및 2차 대사의 전반적인 균형, 조절, 및 통제가 관여한다는 점을 인식하기 시작한 것이 기인한다. 특히, 스트렙토마이세스 속의 방선균이 의학적으로 유용한 2차 대사산물을 생산할 때 받는 외부 스트레스를 연구하여, 저항성을 크게 키우면서 동시에 2차 대사산물의 생산성을 향상시킬 수 있는 인자를 개발하기 위한 노력들이 진행되어 왔으며, 이러한 노력들은 외부 스트레스에 반응하여 스트렙토마이세스 속의 방선균 내에서 발현이 증가하는 시그마 인자 (sigma factor) 나 샤페론들에 대한 연구들로 이어졌다 (Mark et al. 17:5776, 1998; Perry Chou, Appa. Microbiol. Biotechnol. 76:521, 2007).On the other hand, beyond the focus on the direct control method of biosynthetic genes in recent years, research has been progressed toward controlling the overall metabolism of actinomycetes in Streptomyces. It is not simply the gene or cluster containing the gene that plays a role in the production of certain metabolites in actinomycetes in Streptomyces, but the overall balance, regulation, and control of primary and secondary metabolism. It is due to the fact that we started to recognize that In particular, efforts have been made to study the external stresses caused by actinomycetes in Streptomyces to produce medically useful secondary metabolites, and to develop factors that can significantly increase resistance and improve the productivity of secondary metabolites. These efforts have led to studies of sigma factors or chaperones that increase expression in actinomycetes in Streptomyces in response to external stress (Mark et al. 17: 5776, 1998; Perry Chou, Appa. Microbiol. Biotechnol. 76: 521, 2007).

시그마 인자는 원핵생물의 RNA 중합효소의 구성 부분 중 하나이다. 원핵생물의 RNA 중합효소는 여러 구성 부분으로 이루어지는데, α2, β, 및 β'으로 이 루어진 것을 핵심 효소 (core enzyme) 라 칭하며, 이 핵심 효소에 시그마 인자 σ가 결합한 것을 전효소 (holoenzyme) 라 칭한다. 핵심 효소는 RNA를 신장시킬 수 있는 능력은 갖지만 프로모터 (promoter) 를 선택적으로 인식할 수 있는 능력은 갖지 못하는 반면, 전효소는 프로모터를 선택적으로 인식할 수 있는 능력을 아울러 갖는다. 이러한 핵심 효소와 전효소의 차이는 시그마 인자에 기인하는 것이며, 즉 시그마 인자는 프로모터의 선택성에 관여하여 외부 상황에 따른 미생물의 선택적 유전자 발현에 중요한 역할을 담당한다. 스트렙토마이세스 속의 방선균과 같은 원핵생물은 다양한 외부 상황에 대응하기 위하여 필요한 다양한 종류의 시그마 인자를 보유하고 있으며, 외부 상황을 인식하고 이에 적절한 시그마 인자의 생산을 증가시켜서, 결국 외부 상황에 적합한 유전자의 집단적인 발현이 가능하게 되는 것이다.Sigma factor is one component of prokaryotic RNA polymerase. The prokaryotic RNA polymerase is composed of several components, consisting of α2, β, and β ', called core enzymes, and the binding of the sigma factor σ to the core enzymes is called a holoenzyme. It is called. Core enzymes have the ability to stretch RNA, but not the ability to selectively recognize promoters, while proenzymes have the ability to selectively recognize promoters. The difference between the core enzyme and the preenzyme is due to the sigma factor, that is, the sigma factor plays an important role in the selective gene expression of the microorganism according to the external situation by participating in the selectivity of the promoter. Prokaryotes, such as actinomycetes in Streptomyces, possess various types of sigma factors necessary to cope with various external situations, and recognize the external situation and increase the production of appropriate sigma factors, thereby eventually leading to Collective expression becomes possible.

이중 시그마 인자 R (SigR) 은 산화 스트레스 (oxidative stress) 에 관여하는 것이며, 종전에는 sigR 유전자의 발현이 디아미드라는 산화제의 스트레스에 대항하는 티오레독신을 활성화시킨다는 보고가 있었다 (Mark et al., EMBO J 19:5776, 1998). 그러나, 이 sigR 유전자를 도입 및 과발현시킴으로써 스트렙토마이세스 속의 방선균의 성장능력이 향상될 뿐만 아니라 항생제, 항진균제, 항암제 등과 같은 의학적으로 유용한 물질의 생산성까지도 향상시킬 수 있음을 시사하는 보고는 아직까지 없었다.Sigma factor R (SigR) is involved in oxidative stress, and the expression of the sigR gene has previously been reported to activate thioredoxin against the stress of an oxidant called diamide (Mark et al., EMBO J 19: 5776, 1998). However, there have been no reports suggesting that the introduction and overexpression of the sigR gene not only improves the growth capacity of actinomycetes in Streptomyces, but also improves the productivity of medically useful substances such as antibiotics, antifungal agents and anticancer agents.

본 발명은 스트렙토마이세스 속의 방선균에서 동정된 sigR 유전자를 이용하여 스트렙토마이세스 속의 방선균에서 의학적으로 유용한 물질의 생산을 증가시키는 방법, 이를 위한 발현 벡터, 및 이 발현 벡터로 형질전환된 스트렙토마이세스 속의 방선균을 제공하는 것을 목적으로 한다.The present invention provides a method for increasing the production of medically useful substances in actinomycetes in Streptomyces using the sigR gene identified in Actinomycetes in Streptomyces, an expression vector for this, and a strain in Streptomyces transformed with the expression vector. It aims to provide actinomycetes.

본 발명의 발명자들은 많은 연구 끝에, 스트렙토마이세스 속의 방선균에서 유래한 sigR 유전자의 DNA를 스트렙토마이세스 속의 방선균에 도입하고 과발현시킴으로써, 야생형의 방선균보다 성장능력이 개선되면서 항생제, 항진균제, 항암제 등과 같은 의학적으로 유용한 물질의 생산성이 향상되는 형질전환된 스트렙토마이세스 속의 방선균을 제공할 수 있음을 알게 되었다.The inventors of the present invention, after a lot of research, by introducing and overexpressing the DNA of the sigR gene derived from actinomycetes of Streptomyces genus to actinomycetes of Streptomyces, while improving the growth ability than wild-type actinomycetes, such as antibiotics, antifungal agents, anticancer drugs It has been found that the actinomycetes of the transformed Streptomyces genus can improve the productivity of useful substances.

즉, 본 발명은,That is, the present invention,

(1) 스트렙토마이세스 (Streptomyces) 속의 방선균에서 유래한 시그마 인자 R (sigR) 유전자의 염기서열로 이루어진 DNA 절편을 포함하는, 스트렙토마이세스 속의 방선균을 형질전환하여 항생제, 항진균제, 및 항암제로 이루어진 군으로부터 선택되는 의학적으로 유용한 물질의 생산성을 향상시키기 위한 발현 벡터.(1) A group consisting of antibiotics, antifungal agents, and anticancer agents by transforming actinomycetes of Streptomyces, comprising DNA fragments consisting of DNA sequences consisting of the sequencing of the sigma factor R (sigR) gene derived from actinomycetes of Streptomyces . Expression vectors for enhancing the productivity of medically useful substances selected from.

(2) (1)에 있어서, sigR 유전자의 염기서열이 서열번호 1의 염기서열인 발현 벡터.(2) The expression vector according to (1), wherein the nucleotide sequence of the sigR gene is the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 1.

(3) (1)에 있어서, 스트렙토마이세스 속의 방선균에서 유래한 afsR 유전자의 염기서열로 이루어진 DNA 절편을 추가로 포함하는 발현 벡터.(3) The expression vector according to (1), further comprising a DNA fragment consisting of the nucleotide sequence of the afsR gene derived from actinomycetes of Streptomyces spp.

(4) (3)에 있어서, afsR 유전자의 염기서열이 서열번호 3의 염기서열인 발현 벡터.(4) The expression vector according to (3), wherein the nucleotide sequence of the afsR gene is the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 3.

(5) (1) 내지 (4) 중 어느 하나의 발현 벡터로 형질전환된 스트렙토마이세스 속의 방선균.(5) Actinomycetes of the genus Streptomyces transformed with the expression vector of any one of (1) to (4).

(6) (5)에 있어서, 형질전환되는 스트렙토마이세스 속의 방선균이 스트렙토마이세스 리비단스 (Streptomyces lividans) 또는 스트렙토마이세스 코엘리칼라 (Streptomyces coelicolor) 인 스트렙토마이세스 속의 방선균.(6) The method according to (5), wherein the actinomycetes in the transformed Streptomyces genus Streptomyces actinomycetes of the genus Streptomyces, lividans ) or Streptomyces coelicolor .

(7) (1) 내지 (4) 중 어느 하나의 스트렙토마이세스 속의 방선균을 형질전환시키는 단계를 포함하는, 스트렙토마이세스 속의 방선균에서 항생제, 항진균제, 및 항암제로 이루어진 군으로부터 선택되는 의학적으로 유용한 물질의 생산성을 향상시키는 방법.(7) A medically useful substance selected from the group consisting of antibiotics, antifungal agents, and anticancer agents in actinomycetes in Streptomyces, comprising transforming actinomycetes in Streptomyces in any one of (1) to (4). To improve your productivity.

(8) (7)에 있어서, 형질전환되는 스트렙토마이세스 속의 방선균이 스트렙토마이세스 리비단스 또는 스트렙토마이세스 코엘리칼라인 방법.(8) The method according to (7), wherein the actinomycetes in the Streptomyces genus to be transformed are Streptomyces lividans or Streptomyces coelicolor.

에 관한 것이다.It is about.

본 발명에서 사용되는 스트렙토마이세스 속의 방선균 유래의 sigR 유전자의 DNA는 다양한 종에서 그 서열이 보고되어 있다. 예를 들어, 스트렙토마이세스 코엘리칼라, 스트렙토마이세스 아베르미틸리스 (Streptomyces avermitilis) 등의 종의 sigR 유전자의 DNA의 염기서열은 당업계에 공개되어 있는 생물정보학 데이터베이스 (예를 들어, NCBI에서 제공하는 데이터베이스) 로부터 쉽게 입수가 가능하 다. 아울러, 분자생물학 및 미생물학에 관하여 평균적인 지식을 가지고 있는 당업자라면, 공지된 sigR의 유전자에 기초한 상동성 연구를 통하여 다른 스트렙토마이세스 속의 방선균에서도 sigR 유전자를 쉽게 찾아내고 이를 분리 및 분석하여 그 염기서열을 알아낼 수 있다.The DNA of the sigR gene derived from actinomycetes of the genus Streptomyces used in the present invention has been reported in its sequence in various species. For example, Streptomyces coelicolor, Streptomyces Avermitilis DNA sequences of sigR genes of species such as avermitilis ) are readily available from bioinformatics databases (eg, databases provided by NCBI) that are publicly known in the art. In addition, those skilled in the art with an average knowledge of molecular biology and microbiology can easily find, isolate and analyze the sigR gene in other actinomycetes of Streptomyces through known homology studies based on known sigR genes. Can be found.

본 발명자가 증폭해낸 스트렙토마이세스 코엘리칼라의 sigR 유전자의 DNA의 염기서열을 서열번호 1로 나타낸다. 또한, 이 sigR 유전자가 코딩하는 단백질의 아미노산 서열을 서열번호 2로 나타낸다.The base sequence of the DNA of the sigR gene of Streptomyces coelicolor amplified by the present inventor is shown by SEQ ID NO: 1. The amino acid sequence of the protein encoded by this sigR gene is shown by SEQ ID NO: 2.

본 발명에서 사용되는 sigR 유전자는, 이것이 스트렙토마이세스 속의 임의의 방선균에서 유래한 것이고 또한 스트렙토마이세스 속의 임의의 방선균 내에서 sigR 유전자로서 기능을 할 수 있는 것인 한 어떠한 것이라도 본 발명이 목적하는 효과의 달성을 위해서 사용될 수 있다. 예를 들어, 현재 당업계에 공지되어 있는 스트렙토마이세스 코엘리칼라, 스트렙토마이세스 아베르미틸리스 등의 sigR 유전자는 본 발명이 목적하는 효과의 달성을 위해서 사용될 수 있다.The sigR gene used in the present invention may be any object so long as it is derived from any actinomycetes in Streptomyces and can function as the sigR gene in any actinomycetes in Streptomyces. Can be used to achieve the effect. For example, sigR genes such as Streptomyces coelicolor, Streptomyces avermitilis, and the like, which are known in the art, can be used to achieve the desired effect of the present invention.

나아가, 스트렙토마이세스 속 이외의 다른 미생물, 예를 들어 사카로폴리스포라 (Saccharopolyspora) 속의 미생물 또는 살리니스포라 (Salinispora) 속의 미생물의 경우에도 sigR과 유사한 서열 및 유사한 기능을 갖는 유전자가 존재할 수 있는데, 이러한 경우에는 이들 미생물에서 유래한 sigR과 유사한 유전자도 본 발명과 동일한 방식으로 활용될 수도 있으며, 본 발명이 목적하는 효과와 유사한 효과를 발휘할 수도 있을 것이다.There is further, a gene having a police Fora (Saccharopolyspora) in the microorganism or salrini spokes La (Salinispora) sequence and similar functions similar to the sigR even in the case of the genus microorganism as saccharide, for other microorganisms, for example, other than the genus Streptomyces can be present, In this case, genes similar to sigR derived from these microorganisms may be utilized in the same manner as the present invention, and may have an effect similar to the desired effect of the present invention.

"의학적으로 유용한 물질"은 인간 또는 동물에게 도움을 주는 임의의 물질이 다. 대표적으로, 항생제, 항진균제, 항암제 등이 스트렙토마이세스 속의 방선균이 생산할 수 있는 의학적으로 유용한 물질이며, 이는 당업계에 이미 잘 알려져 있다 (Ikeda H., et al., Nat. Biotechnol. 21: 526-531, 2003; Brawner M., et al., Curr Opin Biotechnol 2 (5): 674-81, 1991; Payne G., et al., Appl Microbiol Biotechnol 33 (4): 395-400, 1990; Binnie C., et al., Trends Biotechnol 15 (8): 315-20, 1997). 본 발명은 이러한 의학적으로 유용한 물질의 생산을 향상시키는 효과를 갖는데, 이 효과에는 항생제, 항진균제, 항암제 등의 구체적인 종류는 큰 영향을 미치지 않는다. 즉, 본 발명에 의하여 생산이 향상되는 항생제, 항진균제, 항암제는 그 종류가 특별히 제한되지 않으며, 스트렙토마이세스 속의 방선균이 생산할 수 있는 임의의 종류일 수 있다.A "medically useful substance" is any substance that helps humans or animals. Typically, antibiotics, antifungal agents, anticancer agents and the like are medically useful substances that can be produced by actinomycetes in Streptomyces, which are well known in the art (Ikeda H., et al., Nat. Biotechnol. 21: 526-). 531, 2003; Brawner M., et al., Curr Opin Biotechnol 2 (5): 674-81, 1991; Payne G., et al., Appl Microbiol Biotechnol 33 (4): 395-400, 1990; Binnie C , et al., Trends Biotechnol 15 (8): 315-20, 1997). The present invention has the effect of improving the production of such medically useful substances, the specific kinds of antibiotics, antifungal agents, anticancer agents and the like does not have a great effect on this effect. That is, the antibiotics, antifungals, and anticancer agents whose production is improved by the present invention are not particularly limited, and may be any kind that actinomycetes of Streptomyces genus can produce.

본 발명에 의하여 생산성이 향상될 수 있는 항생제의 예로는, 액티노로딘 [스트렙토마이세스 코엘리칼라], 아베르멕틴 [스트렙토마이세스 아베르미틸리스], 스트렙토마이신 [스트렙토마이세스 그리세우스 (Streptomyces griseus)], 테트라시클린 [스트렙토마이세스 리모수스 (Streptomyces rimosus)], 반코마이신 [스트렙토마이세스 오리엔탈리스 (Streptomyces orientalis)], 리파마이신 [스트렙토마이세스 메디테라네이 (Streptomyces mediterranei)], 클로람페니콜 [스트렙토마이세스 베네주엘라에 (Streptomyces venezuelae)], 퓨로마이신 [스트렙토마이세스 알보니거 (Streptomyces alboniger)], 에리트로마이신 [스트렙토마이세스 에리트레우스 (Streptomyces erythreus)], 네오마이신 [스트렙토마이세스 프라디에 (Streptomyces fradiae)] 등을 들 수 있다.Examples of antibiotics in which productivity can be improved by the present invention include actinolodine [streptomyces coelicolor], avermectin [streptomyces avermitilis], streptomycin [streptomyces gliseus ( Streptomyces griseus )], tetracycline [ Streptomyces rimosus )], vancomycin [ Streptomyces orientalis ]], rifamycin [ Streptomyces mediterranei )], chloramphenicol [ Streptomyces venezuelae )], puromycin [ Streptomyces alboniger )], erythromycin [ Streptomyces erythreus ], neomycin [ Streptomyces fradiae ], etc. are mentioned.

본 발명에 의하여 생산성이 향상될 수 있는 항진균제의 예로는, 니스타틴 [스트렙토마이세스 노우르세이 (Streptomyces noursei)], 암포테리신 B [스트렙토마이세스 노도수스 (Streptomyces nodosus)], 나타마이신 [스트렙토마이세스 나탈렌시스 (Streptomyces natalensis)] 등을 들 수 있다.Examples of antifungal agents which can be improved in productivity by the present invention include nystatin [ Streptomyces noursei )], amphotericin B [ Streptomyces nodosus )], natamycin [ Streptomyces natalensis )].

본 발명에 의하여 생산성이 향상될 수 있는 항암제의 예로는, 미그라스타틴 [스트렙토마이세스 플라텐시스 (Streptomyces platensis)], 독소루비신 [스트렙토마이세스 퓨세티우스 (Streptomyces peucetius)] 등을 들 수 있다.An example of an anticancer agent whose productivity can be improved by the present invention is a migrastatin [streptomyces platensis (Streptomyces platensis)], Doxorubicin [streptomyces fusethius (Streptomyces peucetius)], And the like.

벡터는 외부 DNA 절편을 숙주 세포 등에 도입하는 운반체를 지칭하며, 기본적으로 숙주 세포에 적합한 복제 원점 (replication origin) 을 포함한다. 이러한 벡터는 용도에 따라 다양한 종류로 구분되고 그 구조도 다양하다. 이 중 발현 벡터는 특정 유전자에 관한 외부 DNA 절편을 목표 세포 내에 형질전환시킨 후 이를 그 세포 내에서 발현시키기 위한 벡터를 의미하며, 이러한 발현 벡터는 벡터 내에 통상적으로 복제 원점과 함께 프로모터, 프로모터에 인접한 폴리클로닝 위치 (polycloning site), 선별 표지 (selection marker) 를 포함한다. 외부 DNA 절편은 DNA 제한 효소 및 DNA 리가아제를 사용하여 폴리클로닝 위치 내에 삽입되게 되며, 이 발현 벡터가 숙주세포에 형질전환된 후, 발현 벡터 내의 프로모터에 의하여 외부 DNA 절편의 유전자가 발현되게 된다. 당업계에는 목표 세포의 종류별로 다양한 발현 벡터가 알려져 있다.A vector refers to a carrier that introduces an external DNA fragment into a host cell or the like and basically includes a replication origin suitable for the host cell. Such vectors are classified into various types according to their use, and their structures vary. Among these, an expression vector refers to a vector for transforming an external DNA fragment related to a specific gene into a target cell and then expressing it in the cell, and the expression vector is usually adjacent to a promoter or promoter together with the origin of replication in the vector. Polycloning site, selection marker. The external DNA fragment is inserted into a polycloning position using a DNA restriction enzyme and a DNA ligase, and after the expression vector is transformed into a host cell, the gene of the external DNA fragment is expressed by a promoter in the expression vector. Various expression vectors are known in the art for each type of target cell.

목표 세포 내에 발현 벡터가 도입되어 외부 DNA 절편의 유전자가 발현됨에 있어서, 이 발현은 발현 벡터 내의 프로모터에 의하여 조절을 받게 된다. 따라 서 프로모터를 조절, 변경함으로써 원하는 형태의 발현 양상을 얻는 것이 가능하다. 예를 들어, 구조성 프로모터 (constitutive promoter) 가 발현 벡터에 사용되는 경우에는 세포 내에서 외부 DNA 절편의 유전자의 지속적인 과발현을 일으키게 된다. 한편, 예를 들어, 조절성 프로모터 (conditional promoter) 가 사용되는 경우에는 세포 내에서 외부 DNA 절편의 유전자의 발현의 시점이나 정도의 조절이 가능하게 되며, 일시적인 과발현을 일으킬 수 있게 된다.When an expression vector is introduced into a target cell to express a gene of an external DNA fragment, the expression is regulated by a promoter in the expression vector. Thus, it is possible to obtain a desired form of expression by adjusting and altering the promoter. For example, when a constitutive promoter is used in an expression vector, it causes continuous overexpression of the gene of the foreign DNA fragment in the cell. On the other hand, for example, when a conditional promoter is used, it is possible to control the timing or degree of expression of a gene of an external DNA fragment in a cell, and to cause temporary overexpression.

본 발명에서 형질전환에 사용되는 발현 벡터는, 이 발현 벡터가 스트렙토마이세스 속의 방선균을 형질전환시킬 수 있고, 또한 스트렙토마이세스 속에서 sigR 유전자의 지속적 또는 일시적 과발현을 일으킬 수 있는 임의의 프로모터를 갖는 것인 한 어떠한 것이라도 본 발명이 목적하는 효과의 달성을 위해서 사용될 수 있으며, 그 종류는 특별히 제한되지 않는다. 예를 들어, pIBR25, pIJ459, pMT3206, pANT1200, pBR322, pKC1139 등의 벡터가 스트렙토마이세스 속의 방선균에 대하여 당업계에서 흔히 사용되는 발현 벡터이다. 바람직하게는 pIBR25가 사용될 수 있다.The expression vector used for transformation in the present invention may have any promoter capable of transforming actinomycetes in Streptomyces and also causing continuous or transient overexpression of the sigR gene in Streptomyces. Any thing as long as the present invention can be used to achieve the desired effect, the kind is not particularly limited. For example, vectors such as pIBR25, pIJ459, pMT3206, pANT1200, pBR322, pKC1139 and the like are expression vectors commonly used in the art for actinomycetes in Streptomyces. Preferably pIBR25 may be used.

본 발명에서 발현 벡터의 제작, 스트렙토마이세스 속의 방선균의 형질전환 등은 통상의 유전공학적 기술을 사용하여 수행될 수 있다. 이러한 통상의 유전공학적 기술에 사용되는 시료, 공정 등은 당업계에 잘 알려져 있으며, 발현 벡터의 종류, 스트렙토마이세스 속의 방선균에 속하는 구체적인 종 등에 따라서 구체적인 공정이나 시료를 조절할 수 있는데, 이는 당업자의 통상의 창작 및 상식 범위 내에 속하는 것이다. 예를 들어, 당업자는 공지문헌 [J. Sambrook, et al., "Molecular Cloning: A Laboratory Manual"; F.M. Ausubel, et al., "Current Protocols in Molecular Biology"; A.L. Demain, et al., "Manual of Industrial Microbiology and Biotechnology"; M.J. Gait, et al., "Oligonucleotide Synthesis"; Mullis, et al., "PCR: The Polymerase Chain Reaction"] 을 참고하여 구체적인 실시 형태에 따라 적절한 시료 및 공정을 선택할 수 있다. sigR 유전자의 DNA 절편을 포함하는 발현 벡터가 제작되고 이 발현 벡터가 스트렙토마이세스 속의 방선균 세포에 정상적으로 도입되고 과발현될 수 있는 한, 이 형질전환에 사용되는 시료의 종류 및 공정의 양상은 특별히 제한되지 않는다.In the present invention, the production of expression vectors, transformation of actinomycetes in Streptomyces, and the like may be performed using conventional genetic engineering techniques. Samples, processes, and the like used in such conventional genetic engineering techniques are well known in the art, and specific processes or samples may be adjusted according to the type of expression vector, specific species belonging to actinomycetes in Streptomyces, and the like. It's within the scope of creation and common sense. For example, those skilled in the art will be familiar with the literature [J. Sambrook, et al., "Molecular Cloning: A Laboratory Manual"; F.M. Ausubel, et al., "Current Protocols in Molecular Biology"; A.L. Demain, et al., "Manual of Industrial Microbiology and Biotechnology"; M.J. Gait, et al., "Oligonucleotide Synthesis"; Mullis, et al., "PCR: The Polymerase Chain Reaction"] may select appropriate samples and processes according to specific embodiments. As long as an expression vector comprising a DNA fragment of the sigR gene is constructed and the expression vector can be normally introduced and overexpressed into actinomycetes cells of Streptomyces, the type and process of the sample used for this transformation are not particularly limited. Do not.

다양한 종류의 스트렙토마이세스 속의 방선균들은 스스로 특정의 항생제, 항진균제, 항암제 등을 생산하고 있거나, 또는 특정의 항생제, 항진균제, 항암제 등을 생산할 수 있는 능력을 가지고 있다. 본 발명에서 사용되는 형질전환용 방선균은, 이것이 스트렙토마이세스 속에 속하는 것이고 목적하는 의학적으로 유용한 물질을 생산하고 있거나 생산할 수 있는 능력이 있는 것인 한 어떠한 종의 방선균이더라도 본 발명이 목적하는 효과의 달성을 위해서 사용될 수 있다.Actinomycetes in various types of Streptomyces are capable of producing specific antibiotics, antifungal agents, anticancer agents, or the like, or have the ability to produce specific antibiotics, antifungal agents, anticancer agents, and the like. The actinomycetes for transformation used in the present invention can achieve any desired effect of the actinomycetes of any species so long as it belongs to Streptomyces genus and is capable of producing or capable of producing a desired medically useful substance. Can be used for

예를 들어, 항생제 액티노로딘을 생산하는 스트렙토마이세스 코엘리칼라, 항생제 아베르멕틴을 생산하는 스트렙토마이세스 아베르미틸리스, 항생제 스트렙토마이신을 생산하는 스트렙토마이세스 그리세우스, 항생제 테트라시클린을 생산하는 스트렙토마이세스 리모수스, 항생제 반코마이신을 생산하는 스트렙토마이세스 오리엔탈리스, 항생제 리파마이신을 생산하는 스트렙토마이세스 메디테라네이, 항생제 클로람페니콜을 생산하는 스트렙토마이세스 베네주엘라에, 항생제 퓨로마이신을 생 산하는 스트렙토마이세스 알보니거, 항생제 에리트로마이신을 생산하는 스트렙토마이세스 에리트레우스, 항생제 네오마이신을 생산하는 스트렙토마이세스 프라디에, 항진균제 니스타틴을 생산하는 스트렙토마이세스 노우르세이, 항진균제 암포테리신 B를 생산하는 스트렙토마이세스 노도수스, 항진균제 나타마이신을 생산하는 스트렙토마이세스 나탈렌시스, 항암제 미그라스타틴을 생산하는 스트렙토마이세스 플라텐시스, 항암제 독소루비신을 생산하는 스트렙토마이세스 퓨세티우스 등이 본 발명에서 사용될 수 있다.For example, Streptomyces coelicolor, which produces the antibiotic actinolodine, Streptomyces avermitilis, which produces the antibiotic avermectin, Streptomyces griceus, which produces the antibiotic streptomycin, antibiotic tetracycline Produces Streptomyces rimosus, which produces antibiotics, Streptomyces Orientalis, which produces the antibiotic vancomycin, Streptomyces Mediterranea, which produces the antibiotic rifamycin, and Streptomyces Venezuela, which produces the antibiotic chloramphenicol, and antibiotic puromycin. Streptomyces alboniger, Streptomyces erythrius, which produces the antibiotic erythromycin, Streptomyces pradier, which produces the antibiotic neomycin, Streptomyces norus, which produces the antifungal nystatin, and antifungal amphoteric God B Streptomyces nodosus to produce, Streptomyces natalenes to produce the antifungal agent natamycin, Streptomyces platensis to produce the anti-cancer drug mygrastatin, Streptomyces fusethius to produce the anticancer drug doxorubicin, etc. Can be used in

본 발명에서 사용되는 스트렙토마이세스 속의 방선균 유래의 afsR 유전자의 DNA는 다양한 종에서 그 서열이 보고되어 있다. (Ikeda, H. et al., Nat. Biotechnol. 21(5), 526-531; Horinouchi, S. et al., Gene 95(1), 49-56; Palaniappan, N. et al., Chem. Biol. 13(7), 753-764; Parajuli, N. et al., Res. Microbiol. 156(5-6), 707-712; Sekurova, O. et al, FEMS Microbiol. Lett. 177(2), 297-304; Umeyama, T. et al., Microbiology (Reading, Engl.) 145.PT 9) 2281-2292; Oliynyk, M. et al., Mol. Microbiol. 49(5), 1179-1190). 아울러, 분자생물학 및 미생물학에 관하여 평균적인 지식을 가지고 있는 당업자라면, 상동성 연구를 통하여 다른 스트렙토마이세스 속의 방선균에서도 afsR 유전자를 쉽게 찾아내고 이를 분리 및 분석하여 그 염기서열을 알아낼 수 있다. afsR 유전자와 관련하여 대한민국 공개특허공보 제2006-0018190호의 모든 내용은 본 명세서에 혼입된다.The DNA of the afsR gene derived from actinomycetes of Streptomyces genus used in the present invention has been reported in its sequence in various species. (Ikeda, H. et al., Nat. Biotechnol. 21 (5), 526-531; Horinouchi, S. et al., Gene 95 (1), 49-56; Palaniappan, N. et al., Chem. Biol. 13 (7), 753-764; Parajuli, N. et al., Res.Microbiol.156 (5-6), 707-712; Sekurova, O. et al, FEMS Microbiol.Lett.177 (2) Umeyama, T. et al., Microbiology (Reading, Engl.) 145. PT 9) 2281-2292; Oliynyk, M. et al., Mol. Microbiol. 49 (5), 1179-1190). In addition, those skilled in the art with an average knowledge of molecular biology and microbiology can easily find the afsR gene in other actinomycetes of Streptomyces genus through homology studies, and isolate and analyze the nucleotide sequence. All contents of Korean Patent Laid-Open Publication No. 2006-0018190 with respect to the afsR gene are incorporated herein.

본 발명자가 증폭해낸 스트렙토마이세스 코엘리칼라의 afsR 유전자의 DNA의 염기서열을 서열번호 3으로 나타낸다. 또한, 이 afsR 유전자가 코딩하는 단백질의 아미노산 서열을 서열번호 4로 나타낸다.The base sequence of the DNA of the afsR gene of Streptomyces coelicolor amplified by the present inventor is shown in SEQ ID NO: 3. The amino acid sequence of the protein encoded by this afsR gene is shown by SEQ ID NO: 4.

본 발명에서 사용되는 afsR 유전자는, 이것이 스트렙토마이세스 속의 임의의 방선균에서 유래한 것이고 또한 스트렙토마이세스 속의 임의의 방선균 내에서 afsR 유전자로서 기능을 할 수 있는 것인 한 어떠한 것이라도 본 발명이 목적하는 효과의 달성을 위해서 사용될 수 있다. 예를 들어, 서열번호 3의 afsR 유전자는 본 발명이 목적하는 효과의 달성을 위해서 사용될 수 있다.The afsR gene used in the present invention may be any object as long as it is derived from any actinomycetes in Streptomyces and can function as an afsR gene in any actinomycetes in Streptomyces. Can be used to achieve the effect. For example, the afsR gene of SEQ ID NO: 3 can be used to achieve the desired effect of the present invention.

본 발명의 하나의 국면에서, 스트렙토마이세스 속의 방선균에서 유래한 sigR 유전자의 염기서열로 이루어진 DNA 절편을 포함하는, 스트렙토마이세스 속의 방선균을 형질전환하여 항생제, 항진균제, 및 항암제로 이루어진 군으로부터 선택되는 의학적으로 유용한 물질의 생산성을 향상시키기 위한 발현 벡터가 제공된다. 이 벡터는 스트렙토마이세스 속의 방선균을 형질전환시켜서 방선균의 성장능력과 함께 의학적으로 유용한 물질의 생산성을 향상시키기 위한 용도를 갖는다. 이러한 용도를 갖는 발현 벡터는 당업계에 공지된 바 없는 신규한 것이다.In one aspect of the invention, the actinomycetes of Streptomyces, including DNA fragments consisting of the nucleotide sequence of the sigR gene derived from actinomycetes of Streptomyces genus, is transformed to be selected from the group consisting of antibiotics, antifungal agents, and anticancer agents Expression vectors are provided for improving the productivity of medically useful substances. This vector has the purpose of transforming actinomycetes in Streptomyces to improve the growth ability of actinomycetes and the productivity of medically useful substances. Expression vectors with this use are novel which are not known in the art.

바람직하게는, 상기 sigR 유전자는 스트렙토마이세스 코엘리칼라에서 유래한 것이며, 그 염기서열은 서열번호 1의 염기서열과 같다.Preferably, the sigR gene is derived from Streptomyces coelicolor, the nucleotide sequence is the same as the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 1.

또한 바람직하게는, 상기 발현 벡터에는 스트렙토마이세스 속의 방선균에서 유래한 sigR 유전자의 염기서열로 이루어진 DNA 절편과 함께 스트렙토마이세스 속의 방선균에서 유래한 afsR 유전자의 염기서열로 이루어진 DNA 절편을 추가로 포함한다. 이로써 종래 알려진 afsR 유전자로 인한 효과에 본 발명에서 개시하는 sigR 유전자로 인한 효과가 중첩적으로 발휘되어 보다 우수한 효과를 발휘할 수 있게 된다.Also preferably, the expression vector further includes a DNA fragment consisting of a nucleotide sequence of the sigR gene derived from actinomycetes in Streptomyces and a DNA fragment consisting of the nucleotide sequence of the afsR gene derived from Actinomycetes in Streptomyces. . As a result, the effect of the sigR gene disclosed in the present invention is superimposed on the effect of the conventionally known afsR gene, and thus it is possible to exert an excellent effect.

특히 바람직하게는, 상기 afsR 유전자는 스트렙토마이세스 코엘리칼라에서 유래한 것이며, 그 염기서열은 서열번호 3의 염기서열과 같다.Particularly preferably, the afsR gene is derived from Streptomyces coelicolor, and its nucleotide sequence is the same as that of SEQ ID NO: 3.

본 발명의 또 다른 국면에서, 상기 발현 벡터로 형질전환된 스트렙토마이세스 속의 방선균이 제공된다. 이 형질전환된 스트렙토마이세스 속의 방선균은 성장능력과 함께 의학적으로 유용한 물질의 생산성을 향상되게 된다. 이러한 효과를 갖는 스트렙토마이세스 속의 방선균은 당업계에 공지된 바 없는 신규한 것이다.In another aspect of the present invention, actinomycetes of the genus Streptomyces transformed with the expression vector are provided. Actinomycetes in the transformed Streptomyces genus will increase the productivity and the productivity of medically useful substances. Actinomycetes of the genus Streptomyces with this effect are novel and are not known in the art.

바람직하게는, 상기 형질전환되는 스트렙토마이세스 속의 방선균은 스트렙토마이세스 리비단스 또는 스트렙토마이세스 코엘리칼라이다.Preferably, the actinomycetes in the transformed Streptomyces genus is Streptomyces lividans or Streptomyces coelicolor.

본 발명의 또 다른 국면에서, 상기 발현벡터로 스트렙토마이세스 속의 방선균을 형질전환시키는 단계를 포함하는, 스트렙토마이세스 속의 방선균에서 항생제, 항진균제, 및 항암제로 이루어진 군으로부터 선택되는 의학적으로 유용한 물질의 생산성을 향상시키는 방법이 제공된다. 이는 스트렙토마이세스 속의 방선균의 성장능력과 함께 의학적으로 유용한 물질의 생산성을 향상시킬 수 있는 방법이다. 이러한 효과를 갖는 스트렙토마이세스 속의 방선균의 형질전환 방법은 당업계에 공지된 바 없는 신규한 것이다.In another aspect of the present invention, the productivity of a medically useful substance selected from the group consisting of antibiotics, antifungal agents, and anticancer agents in actinomycetes in Streptomyces, comprising transforming actinomycetes in Streptomyces with the expression vector. Provided are methods for improving this. This is a method that can improve the productivity of the actinomycetes in Streptomyces and medically useful substances. Methods of transforming actinomycetes in Streptomyces with this effect are novel which are not known in the art.

바람직하게는, 상기 형질전환되는 스트렙토마이세스 속의 방선균은 스트렙토마이세스 리비단스 또는 스트렙토마이세스 코엘리칼라이다.Preferably, the actinomycetes in the transformed Streptomyces genus is Streptomyces lividans or Streptomyces coelicolor.

서열목록Sequence Listing

서열번호 1: 스트렙토마이세스 코엘리칼라의 sigR 유전자의 DNA의 염기서열SEQ ID NO: 1: base sequence of DNA of sigR gene of Streptomyces coelicolor

서열번호 2: 스트렙토마이세스 코엘리칼라의 sigR 유전자가 코딩하는 단백질의 아미노산 서열SEQ ID NO: 2 amino acid sequence of a protein encoded by the sigR gene of Streptomyces coelicolor

서열번호 3: 스트렙토마이세스 코엘리칼라의 afsR 유전자의 DNA의 염기서열SEQ ID NO: 3: nucleotide sequence of the DNA of the afsR gene of Streptomyces coelicolor

서열번호 4: 스트렙토마이세스 코엘리칼라의 afsR 유전자가 코딩하는 단백질의 아미노산 서열SEQ ID NO: 4: amino acid sequence of the protein encoded by the afsR gene of Streptomyces coelicolor

서열번호 5: 스트렙토마이세스 코엘리칼라의 sigR 유전자를 증폭해내기 위한 프라이머 Primer-FSEQ ID NO: 5: Primer-F for amplifying the sigR gene of Streptomyces coelicolor

서열번호 6: 스트렙토마이세스 코엘리칼라의 sigR 유전자를 증폭해내기 위한 프라이머 Primer-RSEQ ID NO: 6: Primer-R for amplifying the sigR gene of Streptomyces coelicolor

서열번호 7: 스트렙토마이세스 코엘리칼라의 afsR 유전자를 증폭해내기 위한 프라이머 afsR-FSEQ ID NO: 7: Primer afsR-F for amplifying the afsR gene of Streptomyces coelicolor

서열번호 8: 스트렙토마이세스 코엘리칼라의 afsR 유전자를 증폭해내기 위한 프라이머 afsR-RSEQ ID NO: 8: primers afsR-R for amplifying the afsR gene of Streptomyces coelicolor

미생물 기탁Microbial deposit

sigR 유전자의 DNA와 afsR 유전자의 DNA 양자 모두가 삽입된 pIBR25 발현 벡터 (pIBR25-sigR-afsR) 로 형질전환된 스트렙토마이세스 코엘리칼라 A3(2)M145 (BGC12) 를 농업생명공학연구원에 기탁하였으며, 그 수탁번호는 KACC 91361P이다.Streptomyces coelicolor A3 (2) M145 (BGC12) transformed with the pIBR25 expression vector (pIBR25-sigR-afsR) containing both the DNA of the sigR gene and the DNA of the afsR gene was deposited with the Institute of Agricultural Biotechnology. The accession number is KACC 91361P.

본 발명에 따르면, 스트렙토마이세스 속의 방선균에서 유래한 sigR 유전자의 DNA를 스트렙토마이세스 속의 방선균에 도입하고 과발현시킴으로써, 야생형의 방선균보다 성장능력이 개선되면서 항생제, 항진균제, 항암제 등과 같은 의학적으로 유용한 물질의 생산성이 향상되는 형질전환된 스트렙토마이세스 속의 방선균을 제공할 수 있다.According to the present invention, by introducing and overexpressing the DNA of the sigR gene derived from actinomycetes of Streptomyces genus to actinomycetes of Streptomyces, the growth ability of the actinomycetes of the wild type, while improving the growth ability of antibiotics, antifungal agents, anticancer agents, etc. Actinomycetes of the transformed Streptomyces genus can be provided with improved productivity.

본 발명은 다음과 같은 본 발명을 대표할 수 있는 실시예로 더욱 상세하게 기술된다. 그러나, 이는 설명적인 목적만을 위한 것이고 본 발명의 범주를 결코 제한하는 것은 아니다.The invention is described in more detail by the following examples which can represent the invention. However, this is for illustrative purposes only and does not in any way limit the scope of the invention.

<< 실시예Example 1> 1>

스트렙토마이세스Streptomyces 코엘리칼라 유래의  From coelicolor sigRsigR 유전자의 동정 및 발현 벡터의 제작 Gene Identification and Expression Vector Construction

스트렙토마이세스 코엘리칼라 유래의 sigR 유전자를 동정하기 위하여, 스트렙토마이세스 코엘리칼라의 염기서열 데이터베이스 (http://stereptomyces.org.kr) 를 참고하였다. 이 데이터베이스에 기초하여 다음의 두 프라이머를 고안하였다:To identify the sigR gene derived from Streptomyces coelicolor, the Streptomyces coelicolor sequencing database (http://stereptomyces.org.kr) was referred to. Based on this database, two primers were devised:

Primer-F : aaa aaa gga tcc tgc caa gac cgc ccc tat (서열번호 5)Primer-F: aaa aaa gga tcc tgc caa gac cgc ccc tat (SEQ ID NO: 5)

Primer-R : aaa aaa tct aga tca tga ccc cga gcc ttt (서열번호 6)Primer-R: aaa aaa tct aga tca tga ccc cga gcc ttt (SEQ ID NO: 6)

스트렙토마이세스 코엘리칼라 A3(2)M145 (서울대학교 미생물 자원센터의 기탁번호 20364로부터 입수가능함) 의 게놈을 통상의 방법으로 추출해낸 후, 상기 두 프라이머를 사용하여 PCR 증폭반응 [2.5 U 의 Taq-DNA 폴리머레이즈, 10% 디메틸설폭사이드, 2.5 pmol 의 프라이머, 0.2 mM dNTP 및 0.1 μg 의 게놈 DNA를 적정버퍼에 녹여 50 μl 로 맞추어, 94℃에서 변성, 65℃에서 어닐링, 74℃에서 신장의 순환을 30회 반복함] 을 사용하여 스트렙토마이세스 코엘리칼라 A3(2)M145 유래의 sigR 유전자의 DNA (서열번호 1) 를 증폭해내었다.The genome of Streptomyces coelicolor A3 (2) M145 (available from Accession No. 20364 of Seoul National University Microbiological Resource Center) was extracted by a conventional method, and then PCR amplification reaction using the two primers [Taq of 2.5 U]. DNA polymerase, 10% dimethylsulfoxide, 2.5 pmol primer, 0.2 mM dNTP and 0.1 μg of genomic DNA were dissolved in a titration buffer to 50 μl, denaturated at 94 ° C., annealed at 65 ° C., kidney at 74 ° C. Repeated 30 cycles] was used to amplify the DNA (SEQ ID NO: 1) of the sigR gene from Streptomyces coelicolor A3 (2) M145.

DNA 재조합 기술을 사용하여, 증폭된 sigR 유전자의 DNA를 pIBR25 발현 벡터 내에 삽입하였다. pIBR25 발현 벡터의 구성 및 sigR 유전자의 DNA가 삽입된 pIBR25 발현 벡터 (pIBR25-sigR) 의 구성을 도 1 에 나타낸다. Using DNA recombination techniques, the DNA of the amplified sigR gene was inserted into the pIBR25 expression vector. The configuration of the pIBR25 expression vector and the configuration of the pIBR25 expression vector (pIBR25-sigR) into which the DNA of the sigR gene is inserted are shown in FIG. 1.

<< 실시예Example 2> 2>

sigRsigR 유전자가 도입되어 과발현된  Overexpressed genes 스트렙토마이세스Streptomyces 리비단스에서의At Lividans 액티노로딘Actinorodin 생산성 productivity

R5- 배지 50 ml 이 있는 200 ml 플라스크에 스트렙토마이세스 리비단스 (KCTC 1167) 를 접종하고 2일간 배양하였다. 배양물을 원심분리하여 상청액을 제거하고, 10.3% 수크로오스 15 ml 로 세포를 3회 세척하였다. 분리된 세포에 리소자임 20 mg 을 첨가한 P-완충액 [수크로오스 (10.3%) 25 ml, 증류수 75 ml, 미량성분 용액 0.2 ml, K2SO4 (2.5%) 1 ml 를 혼합한 후 이 혼합액 9.3 ml 에 CaCl2 (5M) 0.2 ml 및 트리스-말레산 완충액 0.5 ml 을 혼합하여 10 ml 을 제조함, 여기서 미량성분 용액은 ZnCl2 40 mg, FeCl3ㆍ6H2O 200 mg, CuCl2ㆍ2H2O 10 mg, MnCl2ㆍ4H2O 10 mg, Na2B4O7ㆍ10H2O 10 mg, 및 (NH4)6Mo7O24ㆍ4H2O 10 mg 에 증류수 적량을 첨 가하여 2 ml 을 제조함] 20 ml 을 첨가하고, 30℃에서 1 시간 15 분간 배양한 후, 솜으로 세포액을 여과해내어 여과해낸 세포액에 존재하는 프로토플라스트를 수득하였다. 이 프로토플라스트를 원심분리하여 상청액을 제거하여 고농도의 프로토플라스트를 수득한 뒤, pIBR25-sigR 벡터가 용해되어 있는 용액 10 μl 를 수득된 프로토플라스트에 첨가하고, 신속하게 폴리에틸렌글리칸과 T-완충액 [수크로오스 103 g, K2SO4 0.25 g, MgCl2ㆍ6H2O 2.02 g, 미량성분 용액 2 ml, 및 증류수 적량을 혼합하여 800 ml 의 용액이 되도록 한 후, 이 용액 80 ml 에 KH2PO4 (0.5%) 1 ml, CaCl2ㆍ2H2O (3.68%) 10 ml, 및 TES 완충액 (5.73%, pH7.2) 10 ml 을 혼합하여 101 ml 을 제조함, 여기서 미량성분 용액은 ZnCl2 40 mg, FeCl3ㆍ6H2O 200 mg, CuCl2ㆍ2H2O 10 mg, MnCl2ㆍ4H2O 10 mg, Na2B4O7ㆍ10H2O 10 mg, 및 (NH4)6Mo7O24ㆍ4H2O 10 mg 에 증류수 적량을 첨가하여 2 ml 을 제조함] 이 1:2 비율로 섞인 용액과 T-완충액을 각각 500 μl 씩 차례로 첨가하여 혼합하였다. 이 혼합액을 R5- 고체배지 상에 플레이팅하고, 30℃에서 24 시간 동안 배양한 후, 티오스트렙톤을 이용한 선별과정을 거쳐서, sigR 유전자가 도입되어 과발현되는 형질전환 스트렙토마이세스 리비단스 (BGL11) 를 수득하였다.A 200 ml flask with 50 ml of R5-media was inoculated with Streptomyces lividans (KCTC 1167) and incubated for 2 days. The culture was centrifuged to remove the supernatant and the cells washed three times with 15 ml of 10.3% sucrose. P-buffer with 20 mg of lysozyme added to the isolated cells [25 ml of sucrose (10.3%), 75 ml of distilled water, 0.2 ml of trace component solution, 1 ml of K 2 SO 4 (2.5%), and 9.3 ml of this mixture 10 ml is prepared by mixing 0.2 ml of CaCl 2 (5M) and 0.5 ml of tris-maleic acid buffer, where the trace component solution is 40 mg of ZnCl 2 , FeCl 3 .6H 2 O 200 mg, CuCl 2 .2H 2 O. 2 ml of 10 mg, MnCl 2 4H 2 O 10 mg, Na 2 B 4 O 7 10H 2 O 10 mg, and (NH 4 ) 6 Mo 7 O 24 4H 2 O 10 mg were added to make 2 ml. 20 ml were added, and incubated at 30 ° C. for 1 hour and 15 minutes, the cell solution was filtered with cotton to obtain a protoplasm present in the filtered cell solution. The protoplasts were centrifuged to remove the supernatant to obtain a high concentration of the protoplasts, and then 10 μl of the solution in which the pIBR25-sigR vector was dissolved was added to the obtained protoplasts. Buffer [103 g of sucrose, 0.25 g of K 2 SO 4 , 2.02 g of MgCl 2 .6H 2 O, 2 ml of a trace component solution, and an appropriate amount of distilled water are mixed to make an 800 ml solution, and then 80 ml of the solution is KH. 2 PO 4 (0.5%) 1 ml, CaCl 2 and 2H 2 O (3.68%) 10 ml, and TES buffer solution (5.73%, pH7.2) prepared a 101 ml mixture of 10 ml, wherein the minor constituent solution is ZnCl 2 40 mg, FeCl 3 6H 2 O 200 mg, CuCl 2 2H 2 O 10 mg, MnCl 2 4H 2 O 10 mg, Na 2 B 4 O 7 10H 2 O 10 mg, and (NH 4 ) 2 ml was prepared by adding a suitable amount of distilled water to 10 mg of 6Mo 7 O 24 4H 2 O] and a solution mixed with a 1: 2 ratio and 500 μl of T-buffer, respectively, were added sequentially and mixed. The mixed solution was plated on an R5-solid medium, incubated at 30 ° C. for 24 hours, followed by a screening process using thiostrepton, and transformed Streptomyces lividans (BGL11) over which the sigR gene was introduced. Obtained.

야생형 스트렙토마이세스 리비단스 (BGL00) 및 sigR 유전자가 도입되어 과발현되는 형질전환 스트렙토마이세스 리비단스 (BGL11) 를 R5- 고체배지 상에서 30℃의 온도로 72시간 동안 배양하였다.The wild type Streptomyces lividans (BGL00) and sigR genes were introduced and overexpressed, transformed Streptomyces lividans (BGL11) were incubated for 72 hours at a temperature of 30 ° C. on R5-solid medium.

액티노로딘은 항생제로 기능할 수 있는 의학적으로 유용한 물질이고, 이 액티노로딘은 기본적으로 청색을 띠며, 이 청색의 유무 및 정도에 따라 액티노로딘의 생산 여부 및 생산량을 추정할 수 있다.Actinordine is a medically useful substance that can function as an antibiotic, and the actinordine is basically blue, and it is possible to estimate the production and production of actinordinin according to the presence and degree of blue.

액티노로딘을 검출한 결과를 도 2 에 나타내었다. 도 2 에서 확인할 수 있는 바와 같이, 야생형의 스트렙토마이세스 리비단스 (BGL00) 는 액티노로딘을 실질적으로 전혀 생산하지 않는 반면, sigR 유전자가 도입되어 과발현되는 형질전환 스트렙토마이세스 리비단스 (BGL11) 는 다량의 액티노로딘을 생산하였다. 이 결과는, sigR 유전자가 도입되어 과발현되는 스트렙토마이세스 속의 방선균은 야생형 상태에서는 생산하지 않는 항생제도 생산할 수 있게 됨을 증명한다.The result of detecting actinolodine is shown in FIG. As can be seen in FIG. 2, wild-type Streptomyces lividans (BGL00) produce substantially no activinin, whereas transformed Streptomyces lividans (BGL11), which is overexpressed by the introduction of the sigR gene, A large amount of actinolodine was produced. The results demonstrate that actinomycetes in Streptomyces, overexpressed with the sigR gene, can produce antibiotics that do not produce in the wild-type state.

<< 실시예Example 3> 3>

sigRsigR 유전자가 도입되어 과발현되는  Overexpressed genes 스트렙토마이세스Streptomyces 코엘리칼라의Coelicolor 성장능력 및  Growth capacity and 액티노로딘Actinorodin 생산성 productivity

그람양성균인 스트렙토마이세스 코엘리칼라 A3(2)M145 (서울대학교 미생물 자원센터의 기탁번호 20364로부터 입수가능함) 를 사용하는 것을 제외하고는 실시예 2에서와 동일한 방식으로 형질전환하여, sigR 유전자가 도입되어 과발현되는 형질전환 스트렙토마이세스 코엘리칼라 (BGC11) 을 제조하였다.The sigR gene was transformed in the same manner as in Example 2, except that the Gram-positive bacterium Streptomyces coelicolor A3 (2) M145 (available from Accession No. 20364 of the Seoul National University Microbial Resources Center) was used. A transgenic Streptomyces coelicolor (BGC11) was introduced to overexpress.

야생형 스트렙토마이세스 코엘리칼라 (BGC00) 및 sigR 유전자가 도입되어 과발현되는 형질전환 스트렙토마이세스 코엘리칼라 (BGC11) 를 15 mL의 R5- 배지 내에서 30℃의 온도로 144시간 동안 230 rpm 에서 배양하였다. 이후 일정 시간 간격으로 세포의 무게 및 액티노로딘의 생산량을 측정하였다.Wild-type Streptomyces coelicolor (BGC00) and transformed Streptomyces coelicolor (BGC11) overexpressed with the sigR gene were incubated at 230 rpm for 144 hours at a temperature of 30 ° C. in 15 mL of R5- medium. It was. Thereafter, the cell weight and the production of actinolodine were measured at regular intervals.

세포의 무게의 측정은, 배양액 1 ml 을 에펜도르프 튜브에 담고 원심분리하여 상청액을 분리한 후 젖은 세포의 무게를 저울로 측정하는 방식으로 수행하였다.The measurement of the weight of the cells was carried out by placing 1 ml of the culture solution in an Eppendorf tube, centrifuging to separate the supernatant, and measuring the weight of the wet cells with a balance.

액티노로딘의 생산량의 측정은, 상기 분리된 상청액 400 μl 에 50 μl 의 KOH (1N) 을 첨가하고 혼합한 후, UV 분광기로 630 nm 파장 영역에서의 흡광도를 측정하는 방식으로 수행하였다.The measurement of the production of actinolodine was performed by adding 50 μl of KOH (1N) to 400 μl of the separated supernatant, mixing the mixture, and measuring absorbance in the 630 nm wavelength region with a UV spectrometer.

세포의 무게 및 액티노로딘의 생산량의 측정 결과를 도 3 에 나타내었다. 도 3 의 그래프에서 확인할 수 있는 바와 같이, sigR 유전자가 도입되어 과발현되는 형질전환 스트렙토마이세스 코엘리칼라 (BGC11) 가 항생제 액티노로딘을 생산하는 시기인 정지기에서 야생형의 스트렙토마이세스 코엘리칼라 (BGC00) 보다 세포 무게가 무거웠으며 생산되는 액티노로딘 양도 더 많았다. 이 결과는 스트렙토마이세스 속의 방선균에 sigR이 도입 및 과발현됨으로써 야생형의 방선균에 비해 세포의 성장능력이 개선될 뿐만 아니라 항생제의 생산성도 향상되게 된다는 것을 증명한다.The measurement results of the weight of the cells and the production amount of actinolodine are shown in FIG. 3. As can be seen in the graph of FIG. 3, the wild-type Streptomyces coelicolor in the stationary phase at which the transforming Streptomyces coelicolor (BGC11), which is introduced and overexpressed by the sigR gene, produces the antibiotic actinolodine The cell weight was heavier than that of (BGC00) and the amount of actinolodine produced was higher. These results demonstrate that sigR is introduced and overexpressed in actinomycetes in Streptomyces, which not only improves cell growth capacity but also improves the productivity of antibiotics compared to wild type actinomycetes.

<< 실시예Example 4> 4>

스트렙토마이세스Streptomyces 코엘리칼라Coelicala 유래의  Origin afsRafsR 유전자의 동정 및 발현 벡터의 제작 Gene Identification and Expression Vector Construction

다음의 두 프라미머를 사용하는 것을 제외하고는 실시예 1에서와 동일한 방식으로, afsR 유전자의 DNA (서열번호 3) 를 증폭해냈다.The DNA of the afsR gene (SEQ ID NO: 3) was amplified in the same manner as in Example 1 except that the following two primers were used.

afsR-F : aaa aaa tct aga aag ctg atg gag aac ctg (서열번호 7)afsR-F: aaa aaa tct aga aag ctg atg gag aac ctg (SEQ ID NO: 7)

afsR-R : aaa aaa aag ctt tca ccg cgc cac act gcg (서열번호 8)afsR-R: aaa aaa aag ctt tca ccg cgc cac act gcg (SEQ ID NO: 8)

DNA 재조합 기술을 사용하여, 증폭된 afsR 유전자의 DNA를 pIBR25 발현 벡터에 삽입하였다. 또한, 이와는 별도로 실시예 1에서 동정된 sigR 유전자의 DNA 및 afsR 유전자의 DNA 양자 모두를 pIBR25 발현 벡터에 삽입하였다. afsR 유전자의 DNA가 삽입된 pIBR25 발현 벡터 (pIBR25-afsR) 및 sigR 유전자의 DNA와 afsR 유전자의 DNA 양자 모두가 삽입된 pIBR25 발현 벡터 (pIBR25-sigR-afsR) 의 구성을 도 4 에 나타내었다.Using DNA recombination techniques, the DNA of the amplified afsR gene was inserted into the pIBR25 expression vector. In addition, separately from both the DNA of the sigR gene and the DNA of the afsR gene identified in Example 1 were inserted into the pIBR25 expression vector. The configuration of the pIBR25 expression vector (pIBR25-afsR) into which the DNA of the afsR gene was inserted and the pIBR25 expression vector (pIBR25-sigR-afsR) into which both the DNA of the sigR gene and the DNA of the afsR gene were inserted are shown in FIG. 4.

<< 실시예Example 5> 5>

sigRsigR 유전자와  Gene and afsRafsR 유전자 양자 모두가 도입된  Both genes introduced 스트렙토마이세스Streptomyces 코엘리칼라에서의In Coelicolor 액티노로딘Actinorodin 생산성 productivity

pIBR25-afsR 및 그람양성균인 스트렙토마이세스 코엘리칼라 A3(2)M145 (서울대학교 미생물 자원센터의 기탁번호 20364로부터 입수가능함) 를 사용하는 것을 제외하고는 실시예 2에서와 동일한 방식으로 형질전환하여, afsR 유전자가 도입되어 과발현되는 형질전환 스트렙토마이세스 코엘리칼라 (BGC01) 을 제조하였다. 또한, 이와는 별도로 pIBR25-sigR-afsR 및 그람양성균인 스트렙토마이세스 코엘리칼라 A3(2)M145 (서울대학교 미생물 자원센터의 기탁번호 20364로부터 입수가능함) 를 사용하는 것을 제외하고는 실시예 2에서와 동일한 방식으로 형질전환하여, sigR 유전자와 afsR 유전자 양자 모두가 도입되어 과발현되는 형질전환 스트렙토마이세스 코엘리칼라 (BGC12) 을 제조하였다. BGC12를 농업생명공학연구원에 기탁하였으며 그 수탁번호는 KACC 91361P이다.Transformation was carried out in the same manner as in Example 2 except for using pIBR25-afsR and Gram-positive bacteria Streptomyces coelicolor A3 (2) M145 (available from Accession No. 20364 of the Seoul National University Microbial Resources Center). , transgenic Streptomyces coelicolor (BGC01) was introduced to which the afsR gene was introduced and overexpressed. In addition, except that pIBR25-sigR-afsR and Gram-positive bacteria Streptomyces coelicolor A3 (2) M145 (available from Accession No. 20364 of Seoul National University Microbial Resource Center) were used separately from Transformation was performed in the same manner to prepare a transgenic Streptomyces coelicolor (BGC12) in which both the sigR gene and afsR gene were introduced and overexpressed. BGC12 was deposited with the Institute of Agricultural Biotechnology and its accession number is KACC 91361P.

야생형 스트렙토마이세스 코엘리칼라 (BGC00), sigR 유전자가 도입되어 과발 현되는 형질전환 스트렙토마이세스 코엘리칼라 (BGC11), afsR 유전자가 도입되어 과발현되는 형질전환 스트렙토마이세스 코엘리칼라 (BGC01), 및 sigR 유전자와 afsR 유전자 양자 모두가 도입되어 과발현되는 형질전환 스트렙토마이세스 코엘리칼라 (BGC12) 을 실시예 3에서와 동일한 방식으로 배양하고 세포의 무게 및 액티노로딘의 생산량을 측정하였다.Wild-type Streptomyces coelicolor (BGC00), transgenic Streptomyces coelicolor (BGC11) introduced with sigR gene, transgenic Streptomyces coelicolor (BGC01) overexpressed with afsR gene introduced, And transformed Streptomyces coelicolor (BGC12), in which both the sigR gene and the afsR gene were introduced and overexpressed, were cultured in the same manner as in Example 3, and the weight of the cells and the production of actinolodine were measured.

세포의 무게 및 액티노로딘의 생산량의 측정 결과를 도 5 에 나타내었다. 도 5 의 그래프에서 확인할 수 있는 바와 같이, sigR 유전자와 afsR 유전자 양자 모두가 도입되어 과발현되는 형질전환 스트렙토마이세스 코엘리칼라 (BGC12) 는 다른 세 종류의 스트렙토마이세스 코엘리칼라 (BGC00, BGC11, 및 BGC01) 보다 특히 액티노로딘의 생산량에서 우월성을 나타내었다. 특히 주목하여야 할 것은, sigR 유전자와 afsR 유전자 양자 모두가 도입되어 과발현되는 형질전환 스트렙토마이세스 코엘리칼라 (BGC12) 가 afsR 유전자가 도입되어 과발현되는 형질전환 스트렙토마이세스 코엘리칼라 (BGC01) 와 비교할 때 액티노로딘의 생산량이 상당히 우수하였다는 점이다. 이 결과는, sigR의 도입 효과는 afsR을 도입한 효과에 중첩될 수 있다는 것이며, 즉 sigR 및 afsR을 동시에 도입하여 과발현시킴으로써 특히 항생제 생산량에 있어서 각각의 유전자의 효과가 중첩되어 더욱 우수한 효과를 발휘할 수 있음을 증명한다.The measurement results of the weight of the cells and the production amount of actinolodine are shown in FIG. 5. As can be seen in the graph of FIG. 5, the transgenic Streptomyces coelicolor (BGC12), which is overexpressed by introducing both the sigR gene and the afsR gene, has three other types of Streptomyces coelicolor (BGC00, BGC11, And BGC01) more particularly in the production of actinolodine. Of particular note is that transgenic Streptomyces coelicolor (BGC12), in which both the sigR and afsR genes are introduced and overexpressed, is compared to trans Streptomyces coelicolor (BGC01) in which the afsR gene is introduced and overexpressed. The production of actinolodine was quite good. This result indicates that the effect of introducing sigR can be superimposed on the effect of introducing afsR, that is, by introducing and overexpressing sigR and afsR at the same time, the effect of individual genes can be exerted, especially in the production of antibiotics. Prove that there is.

도 1 은 pIBR25 발현 벡터의 구성 및 sigR 유전자의 DNA가 삽입된 pIBR25 발현 벡터 (pIBR25-sigR) 의 구성을 나타낸 것이다.1 shows the construction of a pIBR25 expression vector and the construction of a pIBR25 expression vector (pIBR25-sigR) into which DNA of the sigR gene is inserted.

도 2 는 야생형 스트렙토마이세스 리비단스 (BGL00) 및 sigR 유전자가 도입되어 과발현되는 형질전환 스트렙토마이세스 리비단스 (BGL11) 의 배양 후 항생제인 액티노로딘을 검출한 결과를 나타낸 것이다.Figure 2 shows the results of the detection of the antibiotic activinodin after the culture of the transformed Streptomyces Lividans (BGL00) and sigR gene is overexpressed transformed Streptomyces Lividans (BGL11).

도 3 은 야생형 스트렙토마이세스 코엘리칼라 (BGC00) 및 sigR 유전자가 도입되어 과발현되는 형질전환 스트렙토마이세스 코엘리칼라 (BGC11) 의 배양 후 세포의 무게 및 액티노로딘의 생산량의 측정 결과를 나타낸 것이다.Figure 3 shows the results of measuring the weight of the cells and the production of actinorodin after the culture of the transformed Streptomyces coelicolor (BGC11) over-expressed by introducing wild-type Streptomyces coelicolor (BGC00) and sigR gene .

도 4 는 afsR 유전자의 DNA가 삽입된 pIBR25 발현 벡터 (pIBR25-afsR) 및 sigR 유전자의 DNA와 afsR 유전자의 DNA 양자 모두가 삽입된 pIBR25 발현 벡터 (pIBR25-sigR-afsR) 의 구성을 나타낸 것이다.4 shows the construction of a pIBR25 expression vector (pIBR25-afsR) into which the DNA of the afsR gene is inserted and a pIBR25 expression vector (pIBR25-sigR-afsR) into which both the DNA of the sigR gene and the DNA of the afsR gene are inserted.

도 5 는 야생형 스트렙토마이세스 코엘리칼라 (BGC00), sigR 유전자가 도입되어 과발현되는 형질전환 스트렙토마이세스 코엘리칼라 (BGC11), afsR 유전자가 도입되어 과발현되는 형질전환 스트렙토마이세스 코엘리칼라 (BGC01), 및 sigR 유전자와 afsR 유전자 양자 모두가 도입되어 과발현되는 형질전환 스트렙토마이세스 코엘리칼라 (BGC12) 의 배양 후 세포의 무게 및 액티노로딘의 생산량의 측정 결과를 나타낸 것이다.FIG. 5 shows wild-type Streptomyces coelicolor (BGC00), transgenic Streptomyces coelicolor (BGC11) introduced by overexpression of sigR gene, and transgenic Streptomyces coelicolor (BGC01) overexpressed by introduction of afsR gene. ), And the results of measurement of the weight of cells and the production of actinolodine after the culture of the transformed Streptomyces coelicolor (BGC12), which is introduced and overexpressed by both the sigR gene and the afsR gene.

<110> SEOUL NATIONAL UNIVERSITY INDUSTRY FOUNDATION <120> Sigma Factor R And A Method For Increasing Production Of Antibiotics Using Sigma Factor R <130> Y07KP-083 <160> 8 <170> KopatentIn 1.71 <210> 1 <211> 684 <212> DNA <213> Streptomyces coelicolor <220> <221> gene <222> (1)..(684) <223> sigR <400> 1 gtgggtccgg tcactgggac cgacgcaggg accgaacacg gccaggcgga gcagcccgag 60 ggccggggta cgggcgcgga gtcgaccgcg gagcgcagcg cgcgcttcga gcgggacgcg 120 ctggagttcc tcgaccagat gtactcggcc gcgctgcgca tgacgcgtaa tccggccgac 180 gccgaggacc tggtgcagga gacctacgcc aaggcgtacg cgtccttcca ccagttccgc 240 gagggcacca acctcaaggc gtggctgtac cgcatcctca ccaacacctt catcaactcg 300 taccgcaaga agcagcgcga accccagcgc agcgcggccg aggagatcga ggactggcag 360 ctcgcccgtg ccgagtcgca catgtcgacg ggtctgcgct ccgcggagtc gcaggcgctc 420 gaccacctgc ccgactcgga cgtgaagcag gcgctccagg cgatccccga ggaattccgt 480 atcgccgtgt atctggcgga cgtcgagggc tttgcctaca aggagatcgc ggacatcatg 540 gggacaccca tcggtacggt gatgtcccgg ctgcaccgtg gacgccgtca gctgcgcggc 600 atgctggagg actacgcccg cgaccgcggt ctggtccccg ccggcgccgg agagtcgaac 660 gaagcgaaag gctcggggtc atga 684 <210> 2 <211> 227 <212> PRT <213> Streptomyces coelicolor <220> <221> PEPTIDE <222> (1)..(227) <223> sigR <400> 2 Met Gly Pro Val Thr Gly Thr Asp Ala Gly Thr Glu His Gly Gln Ala 1 5 10 15 Glu Gln Pro Glu Gly Arg Gly Thr Gly Ala Glu Ser Thr Ala Glu Arg 20 25 30 Ser Ala Arg Phe Glu Arg Asp Ala Leu Glu Phe Leu Asp Gln Met Tyr 35 40 45 Ser Ala Ala Leu Arg Met Thr Arg Asn Pro Ala Asp Ala Glu Asp Leu 50 55 60 Val Gln Glu Thr Tyr Ala Lys Ala Tyr Ala Ser Phe His Gln Phe Arg 65 70 75 80 Glu Gly Thr Asn Leu Lys Ala Trp Leu Tyr Arg Ile Leu Thr Asn Thr 85 90 95 Phe Ile Asn Ser Tyr Arg Lys Lys Gln Arg Glu Pro Gln Arg Ser Ala 100 105 110 Ala Glu Glu Ile Glu Asp Trp Gln Leu Ala Arg Ala Glu Ser His Met 115 120 125 Ser Thr Gly Leu Arg Ser Ala Glu Ser Gln Ala Leu Asp His Leu Pro 130 135 140 Asp Ser Asp Val Lys Gln Ala Leu Gln Ala Ile Pro Glu Glu Phe Arg 145 150 155 160 Ile Ala Val Tyr Leu Ala Asp Val 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(2982) <223> afsR <400> 3 atggacggtg gaccgcgggt tccggagcag cggcgtcccg gattcccggc ggaagaggag 60 gaatcgggcg cgctgcgctt cggtgtgctc gggccggtgc gcgcctggcg ggacggggag 120 acgctggcca ccggctcccc gcagcagcgc gcgctgctgg ccgccctgct gctgcgcgag 180 ggccgtacgg ccacggccgg cgagctgatc gacgccctgt ggggcgagga accgccgtcg 240 caggcgctgg cggcggtgcg gacgtacgcg tcccggctgc ggaaggtcct cgacccgggg 300 gtgctggtca gcgagtccgg cgggtacgcc gtgcggggcc tcgccgaggg ggcgctggac 360 ctggcgcggg cccaggacct ggcctcggcg gccgagaagg ccaggagcgc cggggacctg 420 tgccacgccc gtgacctgct gcgccgggcg ctggacctgt gggacggcga ggtgctggcc 480 ggcgtgccgg ggccgtacgc gcagacgcag cgggtccgtc tcggcgaatg gcggctccaa 540 ctcctcgaaa cccgcctcga catggacctc gaccagggct gtcacgccga ggcggtctcg 600 gaactgacgg cgctgaccgc ggcgcacccg ctgcgcgaac gcctgcgcga gctgctgatg 660 ctggccctgt accgcagcgg ccgccaggcg gaggcgctcg ccgtctacgc ggacacgcgc 720 cgcctgctcg ccgacgagct gggcgtcgac ccgcgccccg gcctccagga actccagcag 780 cgcatcctcc aggccgaccc ggccctggcc gagctctcgg cggccaccgc ggagaccgcg 840 acggccacgc tgcgcccggc gcaactgccc gcgaccgttt ccgacttcac cggccgcgcg 900 gccttcgtcc gggagctgag cgacgtactg tccgccgcgt ccggggagtc ggcgtcgggc 960 cgcgtgatgg cggtctcggc gctggccggc atcggcggcg tcggcaagac gaccctcgcg 1020 gtgcacgtcg cccaccgggc gcgggccgcc ttcccggacg ggcagctgta cgtcgacctc 1080 cagggcgcgg gcgcgcggcc cgcggagccg gagacggtgc tcggttcctt cctgcgggcc 1140 ctgggcacgg ccgactcggc catcccggac tccctggagg agcgcgccgc cctctaccgc 1200 tccgtcctgg acggccgccg tgtcctggtc ctgctggaca acgcccgcga cgccgcccag 1260 gtgcggcccc tgctgcccgg cacggacggg tgcgcggcgc tggtgacggc acgggtgcgg 1320 atggtggacc tcgccggggc gcacctggtc gacctggacg tgatggcgcc cgaggaggcg 1380 ctggccctct tcacgaagat cgtgggcgag gagcgggtgg cctcggaacg gcaggcggcg 1440 ctcgacgtgg tcggcgcgtg cggtttcctg ccgctggcga tccgcatcgc cgcgtcccgg 1500 ctggccgccc gccgcacctg gacggtctcg gtcctggccg cgaagctggc ggacgaacgg 1560 cgccggctgg acgagctgca ggccggcgac caggcggtcg aggccacctt cgaactgggc 1620 tacggccagc tggaaccggc ccaggcccgc gccttccgcc tgctgggcct ggccgacggc 1680 ccggacatct ccctcgcggc ggcggcggcc gtactggacc tcccggcgca ggacacggag 1740 gacctcctgg agtccctggt cgacacctcg ctgctcgaat cggcggcccc gggccgctac 1800 cgcttccacg acctggtccg cctctacgcg cgtgcctgcg cggaacggac ggaacgggac 1860 gggaacgcgc cgagcgagcg gggggcggcg ctgtcgcggc tgctggactt ctacctggcg 1920 acggcggcgg gggtgtacgc gatcgagcgg ccgggggacc ggctggtgga cggcctggag 1980 ccgacggagt acccggggct gacgttcacc gagggctcgg cggcgctgga ctggctgtac 2040 acggaggccg cgccgctgct ggcgtgcgtg cggcagtccg ccgggacggc caggctgcgg 2100 cgggcggtgg atctgctgtg ggcggccaag gacctgacgg agtccggcgc gaactcacac 2160 cagtacgagg cgacggccag ggcgatgtgc gacgccaccg gttccgctgc ggacacccgc 2220 gccgagggaa gggctcgcac cgttctcagc gatgtgctcc tggtgtccgg tcgcatcgag 2280 catgccgagg aagaggcacg gctggccatg cggctggcgg gctccgccga ggactcggcc 2340 gccgtgagct gggtcgccaa caaccgagga ctcgtctgcc tgcaccagcg ccggtacgcc 2400 gagggcaagg gcctcttcca ccaggccatc gcgggtttcc gggcaacgga caaccgcgcg 2460 ggcgaggcgt ccgcgttgtc gaacctctcc cgtgcccagc tcggcatggg caacgtcgcg 2520 gaggccgtcg acatcgcccg gcaaggactc gcggtgtacg cggagctggg ccgcaccatg 2580 cgcctcgcca acggccactt cgccctggga gtggcactga ccagggcagg ccggcacgaa 2640 gaggcactgg gcgagttcgc cgaggcgctg gacctcttcg gggaccaccg gcagcgcctg 2700 tgggagggcg ccaccaactt ccgcctcgcc gaggtgcacc tggccgccgg acgcccctcc 2760 tcggcggccc agcacgccga gcaggcactc gccctgggat gcatcggggg cgaccggatg 2820 cggggcaacg tcctggctct gctgggacgc gccctgtcgg ccctgggcca ggcggaccgc 2880 gcgcgagcgt gctggcgcga ggcgctcagc ctctacgagc agcacgacgc ccaggaggtc 2940 ggcgaggtaa gggcgttgct ggctcgcagt gtggcgcggt ga 2982 <210> 4 <211> 993 <212> PRT <213> Streptomyces coelicolor <220> <221> PEPTIDE (222) (1) .. (993) <223> afsR <400> 4 Met Asp Gly Gly Pro Arg Val Pro Glu Gln Arg Arg Pro Gly Phe Pro   1 5 10 15 Ala Glu Glu Glu Glu Ser Gly Ala Leu Arg Phe Gly Val Leu Gly Pro              20 25 30 Val Arg Ala Trp Arg Asp Gly Glu Thr Leu Ala Thr Gly Ser Pro Gln          35 40 45 Gln Arg Ala Leu Leu Ala Ala Leu Leu Leu Arg Glu Gly Arg Thr Ala      50 55 60 Thr Ala Gly Glu Leu Ile Asp Ala Leu Trp Gly Glu Glu Pro Pro Ser  65 70 75 80 Gln Ala Leu Ala Ala Val Arg Thr Tyr Ala Ser Arg Leu Arg Lys Val                  85 90 95 Leu Asp Pro Gly Val Leu Val Ser Glu Ser Gly Gly Tyr Ala Val Arg             100 105 110 Gly Leu Ala Glu Gly Ala Leu Asp Leu Ala Arg Ala Gln Asp Leu Ala         115 120 125 Ser Ala Ala Glu Lys Ala Arg Ser Ala Gly Asp Leu Cys His Ala Arg     130 135 140 Asp Leu Leu Arg Arg Ala Leu Asp Leu Trp Asp Gly Glu Val Leu Ala 145 150 155 160 Gly Val Pro Gly Pro Tyr Ala Gln Thr Gln Arg Val Arg Leu Gly Glu                 165 170 175 Trp Arg Leu Gln Leu Leu Glu Thr Arg Leu Asp Met Asp Leu Asp Gln             180 185 190 Gly Cys His Ala Glu Ala Val Ser Glu Leu Thr Ala Leu Thr Ala Ala         195 200 205 His Pro Leu Arg Glu Arg Leu Arg Glu Leu Leu Met Leu Ala Leu Tyr     210 215 220 Arg Ser Gly Arg Gln Ala Glu Ala Leu Ala Val Tyr Ala Asp Thr Arg 225 230 235 240 Arg Leu Leu Ala Asp Glu Leu Gly Val Asp Pro Arg Pro Gly Leu Gln                 245 250 255 Glu Leu Gln Gln Arg Ile Leu Gln Ala Asp Pro Ala Leu Ala Glu Leu             260 265 270 Ser Ala Ala Thr Ala Glu Thr Ala Thr Ala Thr Leu Arg Pro Ala Gln         275 280 285 Leu Pro Ala Thr Val Ser Asp Phe Thr Gly Arg Ala Ala Phe Val Arg     290 295 300 Glu Leu Ser Asp Val Leu Ser Ala Ala Ser Gly Glu Ser Ala Ser Gly 305 310 315 320 Arg Val Met Ala Val Ser Ala Leu Ala Gly Ile Gly Gly Val Gly Lys                 325 330 335 Thr Thr Leu Ala Val His Val Ala His Arg Ala Arg Ala Ala Phe Pro             340 345 350 Asp Gly Gln Leu Tyr Val Asp Leu Gln Gly Ala Gly Ala Arg Pro Ala         355 360 365 Glu Pro Glu Thr Val Leu Gly Ser Phe Leu Arg Ala Leu Gly Thr Ala     370 375 380 Asp Ser Ala Ile Pro Asp Ser Leu Glu Glu Arg Ala Ala Leu Tyr Arg 385 390 395 400 Ser Val Leu Asp Gly Arg Arg Val Leu Val Leu Leu Asp Asn Ala Arg                 405 410 415 Asp Ala Ala Gln Val Arg Pro Leu Leu Pro Gly Thr Asp Gly Cys Ala             420 425 430 Ala Leu Val Thr Ala Arg Val Arg Met Val Asp Leu Ala Gly Ala His         435 440 445 Leu Val Asp Leu Asp Val Met Ala Pro Glu Glu Ala Leu Ala Leu Phe     450 455 460 Thr Lys Ile Val Gly Glu Glu Arg Val Ala Ser Glu Arg Gln Ala Ala 465 470 475 480 Leu Asp Val Val Gly Ala Cys Gly Phe Leu Pro Leu Ala Ile Arg Ile                 485 490 495 Ala Ala Ser Arg Leu Ala Ala Arg Arg Thr Trp Thr Val Ser Val Leu             500 505 510 Ala Ala Lys Leu Ala Asp Glu Arg Arg Arg Leu Asp Glu Leu Gln Ala         515 520 525 Gly Asp Gln Ala Val Glu Ala Thr Phe Glu Leu Gly Tyr Gly Gln Leu     530 535 540 Glu Pro Ala Gln Ala Arg Ala Phe Arg Leu Leu Gly Leu Ala Asp Gly 545 550 555 560 Pro Asp Ile Ser Leu Ala Ala Ala Ala Ala Val Leu Asp Leu Pro Ala                 565 570 575 Gln Asp Thr Glu Asp Leu Leu Glu Ser Leu Val Asp Thr Ser Leu Leu             580 585 590 Glu Ser Ala Ala Pro Gly Arg Tyr Arg Phe His Asp Leu Val Arg Leu         595 600 605 Tyr Ala Arg Ala Cys Ala Glu Arg Thr Glu Arg Asp Gly Asn Ala Pro     610 615 620 Ser Glu Arg Gly Ala Ala Leu Ser Arg Leu Leu Asp Phe Tyr Leu Ala 625 630 635 640 Thr Ala Ala Gly Val Tyr Ala Ile Glu Arg Pro Gly Asp Arg Leu Val                 645 650 655 Asp Gly Leu Glu Pro Thr Glu Tyr Pro Gly Leu Thr Phe Thr Glu Gly             660 665 670 Ser Ala Ala Leu Asp Trp Leu Tyr Thr Glu Ala Ala Pro Leu Leu Ala         675 680 685 Cys Val Arg Gln Ser Ala Gly Thr Ala Arg Leu Arg Arg Ala Val Asp     690 695 700 Leu Leu Trp Ala Ala Lys Asp Leu Thr Glu Ser Gly Ala Asn Ser His 705 710 715 720 Gln Tyr Glu Ala Thr Ala Arg Ala Met Cys Asp Ala Thr Gly Ser Ala                 725 730 735 Ala Asp Thr Arg Ala Glu Gly Arg Ala Arg Thr Val Leu Ser Asp Val             740 745 750 Leu Leu Val Ser Gly Arg Ile Glu His Ala Glu Glu Glu Ala Arg Leu         755 760 765 Ala Met Arg Leu Ala Gly Ser Ala Glu Asp Ser Ala Ala Val Ser Trp     770 775 780 Val Ala Asn Asn Arg Gly Leu Val Cys Leu His Gln Arg Arg Tyr Ala 785 790 795 800 Glu Gly Lys Gly Leu Phe His Gln Ala Ile Ala Gly Phe Arg Ala Thr                 805 810 815 Asp Asn Arg Ala Gly Glu Ala Ser Ala Leu Ser Asn Leu Ser Arg Ala             820 825 830 Gln Leu Gly Met Gly Asn Val Ala Glu Ala Val Asp Ile Ala Arg Gln         835 840 845 Gly Leu Ala Val Tyr Ala Glu Leu Gly Arg Thr Met Arg Leu Ala Asn     850 855 860 Gly His Phe Ala Leu Gly Val Ala Leu Thr Arg Ala Gly Arg His Glu 865 870 875 880 Glu Ala Leu Gly Glu Phe Ala Glu Ala Leu Asp Leu Phe Gly Asp His                 885 890 895 Arg Gln Arg Leu Trp Glu Gly Ala Thr Asn Phe Arg Leu Ala Glu Val             900 905 910 His Leu Ala Ala Gly Arg Pro Ser Ser Ala Ala Gln His Ala Glu Gln         915 920 925 Ala Leu Ala Leu Gly Cys Ile Gly Gly Asp Arg Met Arg Gly Asn Val     930 935 940 Leu Ala Leu Leu Gly Arg Ala Leu Ser Ala Leu Gly Gln Ala Asp Arg 945 950 955 960 Ala Arg Ala Cys Trp Arg Glu Ala Leu Ser Leu Tyr Glu Gln His Asp                 965 970 975 Ala Gln Glu Val Gly Glu Val Arg Ala Leu Leu Ala Arg Ser Val Ala             980 985 990 Arg     <210> 5 <211> 30 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> primer <400> 5 aaaaaaggat cctgccaaga ccgcccctat 30 <210> 6 <211> 30 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> primer <400> 6 aaaaaatcta gatcatgacc ccgagccttt 30 <210> 7 <211> 30 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> primer <400> 7 aaaaaatcta gaaagctgat ggagaacctg 30 <210> 8 <211> 30 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> primer <400> 8 aaaaaaaagc tttcaccgcg ccacactgcg 30  

Claims (8)

스트렙토마이세스 리비단스 (Streptomyces lividans) 또는 스트렙토마이세스 코엘리칼라 (Streptomyces coelicolor)에서 유래한 시그마 인자 R (sigR) 유전자의 염기서열로 이루어진 DNA 절편을 포함하는, 스트렙토마이세스 리비단스 (Streptomyces lividans) 또는 스트렙토마이세스 코엘리칼라 (Streptomyces coelicolor)를 형질전환하여 항생제, 항진균제, 및 항암제로 이루어진 군으로부터 선택되는 의학적으로 유용한 물질의 생산성을 향상시키기 위한 발현 벡터.Streptomyces Libby thiooxidans (Streptomyces lividans) or Streptomyces nose Eli collar (Streptomyces coelicolor) (Streptomyces lividans) , Streptomyces Libby thiooxidans comprising a DNA fragment consisting of a nucleotide sequence of the sigma factor R (sigR) gene derived from Or an expression vector for transforming Streptomyces coelicolor to improve the productivity of a medically useful substance selected from the group consisting of antibiotics, antifungal agents, and anticancer agents. 제 1 항에 있어서, sigR 유전자의 염기서열이 서열번호 1의 염기서열인 발현 벡터.The expression vector according to claim 1, wherein the nucleotide sequence of the sigR gene is the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 1. 제 1 항에 있어서, 스트렙토마이세스 리비단스 (Streptomyces lividans) 또는 스트렙토마이세스 코엘리칼라 (Streptomyces coelicolor)에서 유래한 afsR(A-인자 합성 조절자, A-factor synthesis regulator) 유전자의 염기서열로 이루어진 DNA 절편을 추가로 포함하는 발현 벡터.According to claim 1, consisting of the nucleotide sequence of Streptomyces Libby thiooxidans (Streptomyces lividans) or Streptomyces nose Eli collar (Streptomyces coelicolor) a afsR (A- factor synthesis modulators, A-factor synthesis regulator) gene derived from An expression vector further comprising a DNA fragment. 제 3 항에 있어서, afsR(A-인자 합성 조절자, A-factor synthesis regulator) 유전자의 염기서열이 서열번호 3의 염기서열인 발현 벡터.The expression vector according to claim 3, wherein the nucleotide sequence of the afsR (A-factor synthesis regulator) gene is the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 3. 제 1 항 내지 제 4 항 중 어느 한 항의 발현 벡터로 형질전환된 스트렙토마이세스 리비단스 (Streptomyces lividans) 또는 스트렙토마이세스 코엘리칼라 (Streptomyces coelicolor). Streptomyces lividans or Streptomyces coelicolor transformed with the expression vector of any one of claims 1 to 4. 삭제delete 제 1 항 내지 제 4 항 중 어느 한 항의 발현 벡터로 스트렙토마이세스 리비단스 (Streptomyces lividans) 또는 스트렙토마이세스 코엘리칼라 (Streptomyces coelicolor)를 형질전환시키는 단계를 포함하는, 스트렙토마이세스 리비단스 (Streptomyces lividans) 또는 스트렙토마이세스 코엘리칼라 (Streptomyces coelicolor)에서 항생제, 항진균제, 및 항암제로 이루어진 군으로부터 선택되는 의학적으로 유용한 물질의 생산성을 향상시키는 방법.Any one of claims 1 to 4 to any one of the expression vectors Streptomyces Libby thiooxidans (Streptomyces lividans) or Streptomyces nose Eli collar (Streptomyces coelicolor) transformants, Streptomyces Libby thiooxidans (Streptomyces, comprising the step of conversion of wherein lividans ) or Streptomyces coelicolor for improving the productivity of a medically useful substance selected from the group consisting of antibiotics, antifungal agents, and anticancer agents. 삭제delete
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