KR100811385B1 - 26- Method for preparing Microorganism expressing Xylene monooxygenase and Method for production of 26-naphthalene dicarboxylic acid using the microorganism - Google Patents

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Abstract

본 발명은 자일렌 모노옥시게나제를 발현하는 재조합 미생물의 제조방법과 이를 이용한 2,6-나프탈렌 디카르복실산의 제조방법에 관한 것으로, 보다 상세하게는 슈도모나스 푸티다(Pseudomonas putida) 유래의 자일렌 모노옥시게나제(Xylene monooxygenase)를 암호화하는 유전자를 얻는 단계; 상기 유전자를 재조합 발현벡터에 삽입하는 단계; 및 상기 발현벡터로 숙주세포를 형질 전환하는 단계를 포함하는 방법으로 재조합 미생물을 수득하고, 이 미생물을 이용하여 2,6-디메틸나프탈렌을 산화시킴으로써 2,6-나프탈렌 디카르복실산을 제조하는 방법에 관한 것으로 본 발명의 방법을 이용할 경우 생물학적 공정에 의해 효율적으로 2,6-나프탈렌 디카르복실산을 제공할 수 있다.
The present invention relates to a method for preparing a recombinant microorganism expressing xylene monooxygenase and a method for preparing 2,6-naphthalene dicarboxylic acid using the same, and more particularly, xyl derived from Pseudomonas putida Obtaining a gene encoding Xylene monooxygenase; Inserting the gene into a recombinant expression vector; And obtaining a recombinant microorganism by the method comprising transforming the host cell with the expression vector, and producing 2,6-naphthalene dicarboxylic acid by oxidizing 2,6-dimethylnaphthalene using the microorganism. When the method of the present invention is used, it is possible to efficiently provide 2,6-naphthalene dicarboxylic acid by a biological process.

자일렌 모노옥시게나제, xylM/A 유전자, 2,6-디메틸나프탈렌, 2,6-나프탈렌 디카르복실산Xylene monooxygenase, xylM / A gene, 2,6-dimethylnaphthalene, 2,6-naphthalene dicarboxylic acid

Description

자일렌 모노옥시게나제를 발현하는 재조합 미생물의 제조방법과 이를 이용한 2,6-나프탈렌 디카르복실산의 제조방법 {Method for preparing Microorganism expressing Xylene monooxygenase and Method for production of 2,6-naphthalene dicarboxylic acid using the microorganism} Method for preparing microorganism expressing Xylene monooxygenase and Method for production of 2,6-naphthalene dicarboxylic acid using the microorganism}             

도 1은 상부의 TOL 대사 경로 효소 및 상부의 TOL 오페론의 xyl 유전자들에 의한 단계별 산화 기작을 나타낸 도면이다.1 is a diagram showing the step-by-step oxidation mechanism by the upper TOL metabolic pathway enzyme and the upper TOL operon xyl genes.

도 2는 슈도모나스 푸티다 유래의 자일렌 모노옥시게나제를 암호화하는 유전자를 포함하는 재조합 발현벡터 ForexT-xylM/A의 개열 지도이다.2 is a cleavage map of a recombinant expression vector ForexTxylM / A comprising a gene encoding xylene monooxygenase derived from Pseudomonas putida.

도 3은 자일렌 모노옥시게나제에 의해 2,6-디메틸나프탈렌으로부터 2,6-나프탈렌 디카르복실산으로 전환되는 산화경로를 나타낸 도면이다.3 is a diagram showing an oxidation path converted from 2,6-dimethylnaphthalene to 2,6-naphthalene dicarboxylic acid by xylene monooxygenase.

도 4는 자일렌 모노옥시게나제가 삽입된 재조합 미생물에 의한 2,6-나프탈렌 디카르복실산 생산을 확인할 수 있는 고성능 액체크로마토그래피 분석 그래프이다.
4 is a high performance liquid chromatography analysis graph capable of confirming 2,6-naphthalene dicarboxylic acid production by recombinant microorganisms in which xylene monooxygenase is inserted.

본 발명은 자일렌 모노옥시게나제를 발현하는 재조합 미생물의 제조방법 및 이를 이용한 2,6-나프탈렌 디카르복실산(2,6-Naphthalene dicarboxylic acid; 2,6-NDA)의 제조방법에 관한 것으로, 보다 상세하게는 슈도모나스 푸티다(Pseudomonas putida; mt-2 (ATCC 33015)) 유래의 자일렌 모노옥시게나제(Xylene monooxygenase)를 암호화하는 유전자를 얻는 단계; 상기 유전자를 재조합 발현벡터에 삽입하는 단계; 및 상기 발현벡터로 숙주세포를 형질 전환하는 단계를 포함하는 자일렌 모노옥시게나제를 발현하는 미생물의 제조방법 및 이로부터 수득된 미생물을 이용하여 2,6-디메틸나프탈레이트(2,6-dimethyl naphthalate; 2,6-DMN)를 산화시켜 2,6-나프탈렌 디카르복실산을 제조하는 방법에 관한 것이다.The present invention relates to a method for preparing a recombinant microorganism expressing xylene monooxygenase and a method for preparing 2,6-naphthalene dicarboxylic acid (2,6-NDA) using the same. In more detail, obtaining a gene encoding Xylene monooxygenase from Pseudomonas putida ( mt-2 (ATCC 33015)); Inserting the gene into a recombinant expression vector; And 2,6-dimethylnaphthalate (2,6-dimethyl) using a method for producing a xylene monooxygenase-expressing microorganism comprising transforming a host cell with the expression vector and a microorganism obtained therefrom. Naphthalate; 2,6-DMN) to a method for producing 2,6-naphthalene dicarboxylic acid.

2,6-나프탈렌 디카르복실산은 폴리에스테르 및 폴리아미드와 같은 고성능 중합체 물질의 제조에 유용한 단량체이다. 대표적인 고성능 중합체 물질 중에 폴리에틸렌 2,6-나프탈레이트(이하, "PEN"이라 함.)가 있는데, 현재는 2,6-나프탈렌 디카복실레이트(2,6-naphthalene dicarboxylate; 이하 NDC)와 에틸렌 글리콜의 중합반응으로 합성하고 있다. PEN으로부터 제조된 고강도 섬유는 타이어 코드를 제조하는 데 사용될 수 있고, PEN으로부터 제조된 필름은 자기 기록 테이프 또는 전자 부품을 제조하는데 유용하다. 또한, 테레프탈산(Terephthalic acid)과 2,6-NDA 또는 디메틸-2,6-나프탈렌 디카복실레이트와의 혼합물로부터 제조된 폴리에스테르는 기체 확산에 대한 저항성과 같은 독특한 특성을 갖는 것으로 밝혀졌으며, 이러한 특성은 이들을 음료수 용기 또는 기타 식품용 용기를 제조하는데 유용하다.2,6-naphthalene dicarboxylic acid is a monomer useful in the preparation of high performance polymeric materials such as polyesters and polyamides. Representative high performance polymer materials include polyethylene 2,6-naphthalate (hereinafter referred to as "PEN"), which is now known as 2,6-naphthalene dicarboxylate (NDC) and ethylene glycol. It is synthesized by polymerization. High strength fibers made from PEN can be used to make tire cords, and films made from PEN are useful for making magnetic recording tapes or electronic components. In addition, polyesters prepared from mixtures of terephthalic acid with 2,6-NDA or dimethyl-2,6-naphthalene dicarboxylate have been found to have unique properties such as resistance to gas diffusion. These are useful for making beverage containers or other food containers.

2,6-NDA는 가장 편리하게는 산화 반응용 산소 공급원으로서 분자 산소, 특히 공기를 사용하고 액상 중금속 촉매를 사용하여 2,6-DMN을 산화시켜 제조한다. 이러한 산화 반응 동안, 2,6-DMN의 나프탈렌 환에 존재하는 메틸 치환체는 카르복실기로 산화된다. 이러한 액상 반응에 의해 2,6-DMN을 2,6-NDA로 산화시키는 방법은 공지되어 있는 것으로 예를 들면, 하퍼(Harper) 등의 미국 특허 제 5,183,933호에는 산화 반응 혼합물에 첨가된 다량의 망간 및 코발트 산화 촉매 금속을 사용하여 2,6-DMN을 2,6-NDA로 산화시키는 방법이 기재되어 있다. 그러나 이러한 화학적 방법에 의한 2,6-NDA의 생산은 환경오염과 고온, 고압으로 인한 폭발의 위험, 사용 장치 규모의 대형화와 에너지의 과다 소비로 인하여 제조 공정 비용이 매우 많이 요구되는 단점이 있다.2,6-NDA is most conveniently prepared by using molecular oxygen, in particular air, as the oxygen source for the oxidation reaction and oxidizing 2,6-DMN using a liquid heavy metal catalyst. During this oxidation reaction, the methyl substituents present on the naphthalene ring of 2,6-DMN are oxidized to carboxyl groups. A method for oxidizing 2,6-DMN to 2,6-NDA by such a liquid phase reaction is well known. For example, US Pat. No. 5,183,933 to Harper et al. Discloses a large amount of manganese added to the oxidation reaction mixture. And a method of oxidizing 2,6-DMN to 2,6-NDA using a cobalt oxidation catalyst metal. However, the production of 2,6-NDA by such a chemical method has a disadvantage that the manufacturing process cost is very high due to the environmental pollution, the risk of explosion due to high temperature and high pressure, the size of the equipment used and the excessive consumption of energy.

한편, 일반적으로 생물학적 공정을 이용한 화학물질의 생산에는 다음과 같은 이점이 있다. 첫째는 생물학적 반응의 촉매역할을 하는 효소는 기질 특이성이 있으므로 반응물질이 혼합물인 경우에 특정 기질에만 반응을 할 수 있다는 것이고, 둘째는 생물학적 공정이 효소의 조절에 의해 단계적으로 진행되기 때문에 반응 중에 생산되는 중간체를 보다 쉽게 분리해낼 수 있다는 것이다. 또한 생물학적 공정은 일반적으로 화학공정에 비해 환경오염의 우려가 적다는 것도 추가적인 이점이 될 수 있다. 이러한 이점들 때문에 본 발명에서는 생물학적인 방법으로 2,6-디메틸나프탈렌을 산화시켜 2,6-나프탈렌 디카르복실산을 제조하고자 한다.
On the other hand, in general, the production of chemicals using biological processes has the following advantages. The first is that enzymes that catalyze biological reactions have substrate specificities, so that when the reactants are mixtures, they can react only on specific substrates. It is easier to separate intermediate intermediates. In addition, biological processes generally have less concern about environmental pollution than chemical processes. Because of these advantages, the present invention seeks to produce 2,6-naphthalene dicarboxylic acid by oxidizing 2,6-dimethylnaphthalene by a biological method.

슈도모나스 푸티다 (Pseudomonas putida) mt-2의 TOL 플라스미드 pWWO 등에 의해 코딩되는 자일렌 모노옥시게나제 (Xylene monooxygenase ; 이하 "XMO"라고 함 .)는 톨루엔 (Toluene) 및 자일렌 (Xylene)의 분해에 핵심적인 역할을 하는 효소 시스템이다. XMO는 알킬 히드록시라제 족(alkyl hydroxyrase family)에 속하며 방향족 고리의 메틸기를 선택적으로 가수분해한다. 이는 메타 (meta)-이화 경로를 통해 크렙스 회로의 기질로 변환될 수 있는 카르복실산 유도체를 형성하는 대사 경로의 초기단계에 사용되는 효소이다. XMO는 XylMXylA 유전자에 의해 코딩되는 2개의 폴리펩타이드 서브유닛으로 구성된다. XylA에 의해 코딩되는 NADH 수용자 리덕타제(NADH acceptor reductase)는 NADH로부터의 환원 당량을 막에 위치한 XylM에 의해 코딩되는 히드록시라제로 수송하는 전자 수송 단백질이다. 도 1은 상부의 TOL 대사 경로 효소 및 상부의 TOL 오페론의 xyl 유전자들의 조직화 (organization)에 의해 톨루엔에서 벤질 알콜, 벤즈알데히드 및 벤조산으로의 단계별 산화를 나타낸다. XMO는 자일렌 모노옥시게나제를 나타내고, BADH는 벤질 알콜 디히드로제나제를 나타내고, BZDH는 벤즈알데히드 디히드로제나제를 나타낸다. Pu는 상부의 TOL 오페론 프로모터를 지시하고, xylWxylN은 그 기능이 알려지지 않은 유전자이다. xylMxylA 유전자에 의해 코딩되는 효소인 XMO는 알칸 쇄 이화 경로의 제 1효소이다. 대사 경로의 제 2효소인 BADH는 기질이 장쇄 알콜인 아연-함유 디히드로지나제 족의 동종이량체 구성원인 벤질 알콜 디히드로제나제이다. 이 효소는 xylB 유전자에 의해 코딩된다. 대사 경로의 제 3효소인 BZDH는 역시 동종이량체인 벤즈알데히드 디히드로제나제로, xylC 유전자에 의해 코딩되는 효소이다. Xylene monooxygenase (hereinafter referred to as "XMO") encoded by TOL plasmid pWWO of Pseudomonas putida mt-2 is used for the decomposition of toluene and xylene. It is an enzyme system that plays a key role. XMO belongs to the alkyl hydroxyrase family and selectively hydrolyzes methyl groups of aromatic rings. It is an enzyme used in the early stages of metabolic pathways to form carboxylic acid derivatives that can be converted to substrates of the Krebs cycle via the meta-catabolic pathway. XMO consists of two polypeptide subunits encoded by the XylM and XylA genes. (Acceptor NADH reductase) NADH recipient reductase encoded by the XylA hydratase is the electron transport protein to transport zero-hydroxy-la encoded by the XylM in the reduction equivalent of the film from the NADH. 1 shows stepwise oxidation of toluene to benzyl alcohol, benzaldehyde and benzoic acid by the organization of the upper TOL metabolic pathway enzyme and the xyl genes of the upper TOL operon. XMO stands for xylene monooxygenase, BADH stands for benzyl alcohol dehydrogenase and BZDH stands for benzaldehyde dehydrogenase. P u indicates the upper TOL operon promoter, and xylW and xylN are genes whose function is unknown. XMO , the enzyme encoded by the xylM and xylA genes, is the first enzyme in the alkane chain catabolic pathway. BADH, the second enzyme of the metabolic pathway, is benzyl alcohol dehydrogenase, a homodimer member of the zinc-containing dehydrogenase family whose substrate is a long chain alcohol. This enzyme is encoded by the xylB gene. BZDH, the third enzyme of the metabolic pathway, is also a homodimer, benzaldehyde dehydrogenase , an enzyme encoded by the xylC gene.

현재까지 톨루엔과 자일렌과 같은 방향족 화합물의 메틸기를 생물학적으로 산화시키는 방법은 보고 되어 있다. XMO를 이용하여 방향족 알데히드 및 카르복실산을 제조하는 방법이 대한민국 특허출원 2002-7005344호에 보고 되었으나, 단핵 방향족 고리를 가지고 있는 화합물의 산화만을 증명하였다. 따라서 본 발명자들은 xylMxylA 유전자를 포함하는 재조합 발현벡터와 전기 발현벡터에 의하여 형질 전환된 재조합 미생물을 이용하여 다핵 방향족 고리를 갖고 있는 2,6-DMN을 산화시켜서 2,6-NDA를 제조하고자 예의 연구한 결과 본 발명에 이르게 되었다.
To date, a method of biologically oxidizing methyl groups of aromatic compounds such as toluene and xylene has been reported. A method for preparing aromatic aldehydes and carboxylic acids using XMO has been reported in Korean Patent Application No. 2002-7005344, but only the oxidation of a compound having a mononuclear aromatic ring was demonstrated. Accordingly, the present inventors have attempted to prepare 2,6-NDA by oxidizing 2,6-DMN having a multinuclear aromatic ring using a recombinant microorganism transformed by an electric expression vector and a recombinant expression vector including xylM and xylA genes. As a result of intensive research, the present invention has been reached.

본 발명은 상기와 같은 종래기술의 문제점을 해결하기 위한 것으로, 슈도모나스 푸티다 유래의 자일렌 모노옥시게나제를 발현하는 재조합 미생물을 제조하고, 이를 이용하여 생물학적인 방법으로 2,6-디메틸나프탈렌을 산화시켜 2,6-나프탈렌 디카르복실산을 제조하고자 하는 것이다.The present invention is to solve the problems of the prior art as described above, to prepare a recombinant microorganism expressing xylene monooxygenase derived from Pseudomonas putida, using 2,6-dimethylnaphthalene in a biological method Oxidation is intended to produce 2,6-naphthalene dicarboxylic acid.

상기 목적을 달성하기 위한 본 발명의 한 측면은 슈도모나스 푸티다(Pseudomonas putida) 유래의 자일렌 모노옥시게나제(Xylene monooxygenase)를 암호화하는 유전자를 얻는 단계; 상기 유전자를 재조합 발현벡터에 삽입하는 단계; 및 상기 발현벡터로 숙주세포를 형질 전환하는 단계를 포함하는 자일렌 모노옥시게나제를 발현하는 미생물의 제조방법을 제공하는 것이다.One aspect of the present invention for achieving the above object is to obtain a gene encoding a xylene monooxygenase derived from Pseudomonas putida ( Pseudomonas putida ); Inserting the gene into a recombinant expression vector; And it provides a method for producing a microorganism expressing xylene monooxygenase comprising the step of transforming the host cell with the expression vector.

상기 목적을 달성하기 위한 본 발명의 다른 한 측면은 상기 방법에 의해 제조된 자일렌 모노옥시게나제를 발현하는 미생물을 제공하는 것이다. Another aspect of the present invention for achieving the above object is to provide a microorganism expressing xylene monooxygenase produced by the above method.                         

상기 목적을 달성하기 위한 본 발명의 또 다른 한 측면은 상기 미생물을 이용하여 2,6-디메틸나프탈렌을 포함하는 배지에 배양함으로써 2,6-디메틸 나프탈렌 디카르복실산 화합물을 제조하는 방법을 제공하는 것이다.
Another aspect of the present invention for achieving the above object is to provide a method for producing a 2,6-dimethyl naphthalene dicarboxylic acid compound by culturing in a medium containing 2,6-dimethylnaphthalene using the microorganism. will be.

이하, 본 발명에 관하여 보다 상세하게 설명하기로 한다.Hereinafter, the present invention will be described in more detail.

본 발명에 따른 자일렌 모노옥시게나제를 발현하는 재조합 미생물의 제조 방법은 슈도모나스 푸티다(Pseudomonas putida) 유래의 자일렌 모노옥시게나제(Xylene monooxygenase)를 암호화하는 유전자를 얻는 단계; 상기 유전자를 재조합 발현벡터에 삽입하는 단계; 및 상기 발현벡터로 숙주세포를 형질 전환하는 단계를 포함하여 구성된다.Method for producing a recombinant microorganism expressing xylene monooxygenase according to the present invention comprises the steps of obtaining a gene encoding xylene monooxygenase derived from Pseudomonas putida ; Inserting the gene into a recombinant expression vector; And transforming the host cell with the expression vector.

상기 자일렌 모노옥시게나제를 암호화하는 유전자를 얻는 단계는 공지의 방법 에 따라 수행될 수 있다. 본 발명에서는 자이렌 모노옥시게나제를 암호화하는 유전자로서, 약 2.3kb 크기를 가지며 서열 1을 포함하고, 슈도모나스 푸티다 (Pseudomonas putida) mt-2로부터 유래된 유전자(이하, "xylM/A"라 함.)를 클로닝하여 이용한다. 바람직하게는 슈도모나스 푸티다(Pseudomonas putida) mt-2 유래의 xylM/A를 암호화하는 유전자를 클로닝하기 위하여 플라스미드 DNA(pWWO)를 주형 DNA로 하여 xylM/A 로부터 제작한 프라이머 1(5'-ATGGACACGCTTCGTTATTACC-3': 서열번호 2) 및 프라이머 2(5'-CTAGCAAGGAGGTCTATTATAAA-3': 서열번호 3)를 사용하여 중합효소 연쇄반응(PCR)을 수행함으로써 자일렌 모노옥시게나제를 암호화하는 유전 자를 수득할 수 있다.
Obtaining a gene encoding the xylene monooxygenase may be performed according to a known method. In the present invention, a gene encoding a xylene monooxygenase, having a size of about 2.3 kb and comprising SEQ ID NO: 1, is a gene derived from Pseudomonas putida mt-2 (hereinafter, referred to as " xylM / A "). Clone .) Preferably, to clone a gene encoding xylM / A derived from Pseudomonas putida mt-2, primer 1 (5'-ATGGACACGCTTCGTTATTACC-) prepared from xylM / A using plasmid DNA (pWWO) as a template DNA. Genes encoding xylene monooxygenase can be obtained by performing polymerase chain reaction (PCR) using 3 ': SEQ ID NO: 2) and primer 2 (5'-CTAGCAAGGAGGTCTATTATAAA-3': SEQ ID NO: 3). have.

상기 유전자가 삽입된 재조합 발현벡터는 상기 방법으로 클로닝된 슈도모나스 푸티다 mt-2 유래의 유전자를 이 유전자에 기능적으로 작동 가능한(functionally operated) 프로모터와 연결함으로써 얻을 수 있다.The recombinant expression vector into which the gene is inserted can be obtained by linking a gene derived from Pseudomonas putida mt-2 cloned by the above method with a functionally operated promoter to the gene.

상기 발현벡터로 선택될 수 있는 것으로는 공지의 Forex-T 벡터 (TaKaRa), pUC119 (TaKaRa), pBluescript계열 벡터 (Stratagene), pET계열 벡터 (Merck) 등을 예로 들 수 있고, 상기 프로모터로는 T7 프로모터, T3 프로모터, Sp6 프로모터 등을 이용할 수 있다. Examples of the expression vector may include a known Forex-T vector (TaKaRa), pUC119 (TaKaRa), pBluescript family vector (Stratagene), pET family vector (Merck), and the like. Promoters, T3 promoters, Sp6 promoters and the like can be used.

바람직하게는 상기 단계에서 클로닝된 서열 1로 표시되는 약 2.3kb 크기의 DNA 절편을 분리하고 이를 Forex-T 벡터에 재조합하여 도 2로 표시되는 발현벡터 ForexT-XylM/A를 제조한다.
Preferably, the DNA fragment of about 2.3 kb represented by SEQ ID NO. 1 cloned in the above step is isolated and recombined into a Forex-T vector to prepare the expression vector ForexT- XylM / A shown in FIG. 2.

상기 단계에서 제조된 발현벡터를 이용하여 재조합 미생물을 제조하는 과정 역시 공지의 방법을 통해 진행될 수 있다. The process of preparing a recombinant microorganism using the expression vector prepared in the above step may also be carried out through a known method.

상기 재조합 미생물을 제조하기 위한 숙주 세포로는 공지의 MC1061(E. coli), JM109(E. coli), XL1-Blue(E. coli), 및 DH5αF'(E. coli) 등을 예로 들 수 있고, 형질전환 방법으로는 열충격(heat shock)과 전기충격법(electroporation) 등을 이용할 수 있으나 이에 한정되는 것은 아니다.Examples of host cells for preparing the recombinant microorganism include MC1061 ( E. coli ), JM109 ( E. coli ), XL1-Blue ( E. coli ), and DH5αF '( E. coli ). As a transformation method, heat shock and electroporation may be used, but the present invention is not limited thereto.

바람직하게는 통상의 형질전환 방법을 이용하여 E. coli MC1061에 상기에서 제조된 ForexT-XylM/A 발현벡터를 도입함으로써 자일렌 모노옥시게나제를 발현하는 재조합 미생물을 수득할 수 있다.
Preferably Recombinant microorganisms expressing xylene monooxygenase can be obtained by introducing the ForexT- XylM / A expression vector prepared above into E. coli MC1061 using conventional transformation methods.

한편, 상기 단계를 거쳐 제조된 재조합 미생물을 자일렌 모노옥시게나제의 기질로 작용할 수 있는 물질과 함께 배양할 경우, 기질을 산화시킴으로써 원하는 산물을 수득할 수 있다. 배양 배지 환경 및 조건은 당업자가 공지의 방법으로부터 수득하고자 하는 물질에 따라 적합하게 조절할 수 있다.On the other hand, when the recombinant microorganism prepared by the above step is incubated with a substance that can act as a substrate of xylene monooxygenase, the desired product can be obtained by oxidizing the substrate. Culture medium conditions and conditions can be appropriately adjusted depending on the materials desired by those skilled in the art to obtain from known methods.

예들 들어, 본 발명의 재조합 미생물을 2,6-DMN이 포함된 배지에서 배양하면 도 3과 같은 대사과정이 진행된다. 2,6-DMN으로부터 2,6-NDA가 생성되는 과정에서 자일렌 모노옥시게나제의 발현에 의해 2,6-DMN의 양쪽 메틸(-CH3) 치환기가 -CH2OH, -COH, -COOH로 전환된 형태의 중간체가 생성된다.For example, when the recombinant microorganism of the present invention is cultured in a medium containing 2,6-DMN, metabolic processes as shown in FIG. 3 proceed. In the process of generating 2,6-NDA from 2,6-DMN, both methyl (-CH 3 ) substituents of 2,6-DMN are substituted with -CH 2 OH, -COH,-by expression of xylene monooxygenase. An intermediate in the form converted to COOH is produced.

한편, 상기 재조합 미생물 MC1061(ForexT-XylM/A)의 배양에 따른 XylM/A을 발현하는 재조합 미생물을 확인하기 위한 방법으로서, 인디고(Indigo)가 자일렌 모노옥시게나제에 의해 인돌(Indole)로 전환되면서 푸른색 콜로니가 형성되는 인디고 발생반응을 응용할 수 있다. 바람직하게는 재조합 미생물 MC1061(ForexT-XylM/A)을 엠피실린(ampicillin, 100mg/L)이 포함된 LB 액체배지에 접종해서 진탕배양 한 후, 1mM 인디고(Indigo)와 엠피실린 (ampicillin, 100mg/L)이 포함된 LB 고체배지에 상기의 배양액을 100㎕ 도말하여 37℃ 배양기에서 24시간 배양한 뒤에 푸른색을 띄는 콜로니를 최종 선택한다. On the other hand, as a method for identifying a recombinant microorganism expressing XylM / A according to the culture of the recombinant microorganism MC1061 (ForexT- XylM / A ), Indigo (Indigo) to the indole (Xdole) by xylene monooxygenase Indigo-generating reactions in which blue colonies form as they are converted can be applied. Preferably, the inoculated recombinant microorganism MC1061 (ForexT- XylM / A ) in an LB liquid medium containing ampicillin (ampicillin, 100mg / L) and cultured with shaking, followed by 1mM Indigo and ampicillin (100mg / L). 100 μl of the culture solution was applied to the LB solid medium containing L) and incubated in a 37 ° C. incubator for 24 hours to finally select blue colonies.

또한 상기의 재조합 미생물 MC1061(ForexT-XylM/A)을 DMN 1000ppm과 엠피실린(ampicillin, 100mg/L)이 포함된 LB 액체배지에 접종하여 37℃에서 충분한 시간동안 진탕배양한 후, 농축하여 HPLC 분석을 통해 자일렌 모노옥시게나제(XylM/A)의 발현에 의해 2,6-DMN이 산화되어 2,6-NDA가 생산되는 것을 확인할 수 있다.
In addition, the recombinant microorganism MC1061 (ForexT- XylM / A ) was inoculated in LB liquid medium containing 1000 ppm DMN and ampicillin (ampicillin, 100mg / L), shaken and cultured at 37 ° C. for a sufficient time, and then concentrated and analyzed by HPLC. It can be seen that through the expression of xylene monooxygenase ( XylM / A) 2,6-DMN is oxidized to produce 2,6-NDA.

이하, 실시예를 통하여 본 발명을 보다 상세히 설명하고자 하나 이하의 실시예는 단지 본 발명을 보다 구체적으로 설명하기 위한 것으로, 본 발명의 범위를 제한하고자 하는 것은 아니다. 특히, 본 발명의 서열 1로 나타나는 슈도모나스 푸티다 유래의 xylM/A 유전자와 관련하여서는 단순히 여기에 제시한 DNA 염기서열만 포함하는 것이 아니라, 여러 방법을 통한 돌연변이 (mutation) 도입에 의하여 새로운 성질을 갖게 된 유전자도 포함하는 것이다. 즉, 유전자의 성질을 변화시키거나 목적에 부합하는 유전자로 제조하기 위하여 인위적으로 합성 뉴클레오타이드에 의한 돌연변이, 화학적 돌연변이, 또는 유도물질에 의한 무작위적 돌연변이 도입 등을 통하여 변화된 DNA 염기서열을 갖게 하여 다른 성질을 갖는 유전자를 제조할 수 있다. 또한 중합 효소 연쇄 반응을 이용한 기술에 의한 돌연변이 도입에 의하여 새로운 성질의 유전자를 제조할 수도 있다.
Hereinafter, one or more exemplary embodiments will be described in more detail with reference to the following examples, which are intended to illustrate the present invention in more detail, and are not intended to limit the scope of the present invention. In particular, in relation to the xylM / A gene derived from Pseudomonas putida, which is represented by SEQ ID NO: 1 of the present invention, it does not merely include the DNA sequence shown here, but has new properties by introducing mutations through various methods. It includes genes that have been used. In other words, in order to change the properties of the gene or to produce a gene that meets the purpose, the DNA sequence is changed through artificial mutation, chemical mutation, or random mutation introduction by an inducer. Genes having can be prepared. In addition, a gene having a new property can be produced by introducing a mutation by a technique using a polymerase chain reaction.

실시예 1Example 1 : : XylM/AXylM / A 유전자의 클로닝 Cloning of genes

슈도모나스 푸티다 (Pseudomonas putida) mt-2 유래의 xylM/A를 암호화하는 유전자를 클로닝하기 위하여, 먼저 플라스미드 DNA(pWWO)를 분리하였다 (참조 : Sambrook et al., Molecular Cloning, A Laboratory Manual 2nd Ed., Cold Spring Harbor Laboratory Press, Cold Spring Harbor, NY, 1989). 상기 분리한 플라스미드 DNA(pWWO)를 주형 DNA로 하여 xylM/A (참조 : GenBank Sequence Database, D63341)로부터 제작한 프라이머 1(5'-ATGGACACGCTTCGTTATTACC-3': 서열 번호 1) 및 프라이머 2(5'-CTAGCAAGGAGGTCTATTATAAA-3': 서열 번호 2)를 사용하여 중합효소 연쇄반응을 수행하였다. 중합효소 연쇄반응은, 첫 번째 변성(denaturation)을 94℃에서 5분간 1회 수행하였고, 이후 두 번째 변성은 94℃에서 1분간, 교잡(annealing)은 58℃에서 1분간, 연장(extension)은 72℃에서 2분간 수행하였으며, 이를 40회 반복하였다. 이와 같은 방법으로 얻어진 절편에서 서열 1로 표시되는 약 2.3kb 크기의 DNA 절편을 분리하고 이를 Forex-T 벡터에 재조합하여 도 2에 나타나는 것과 같은 발현벡터 ForexT- XylM/A를 제조하였다.
To clone a gene encoding xylM / A from Pseudomonas putida mt-2, plasmid DNA (pWWO) was first isolated (Sambrook et al., Molecular Cloning, A Laboratory Manual 2nd Ed. Cold Spring Harbor Laboratory Press, Cold Spring Harbor, NY, 1989). Primer 1 (5'-ATGGACACGCTTCGTTATTACC-3 ': SEQ ID NO: 1) and primer 2 (5'-) prepared from xylM / A (GenBank Sequence Database, D63341) using the isolated plasmid DNA (pWWO) as template DNA. The polymerase chain reaction was carried out using CTAGCAAGGAGGTCTATTATAAA-3 ': SEQ ID NO: 2). In the polymerase chain reaction, the first denaturation was performed once at 94 ° C. for 5 minutes, then the second denaturation was performed at 94 ° C. for 1 minute, the annealing at 58 ° C. for 1 minute, and the extension was 2 min at 72 ° C., which was repeated 40 times. DNA fragments of about 2.3 kb represented by SEQ ID NO: 1 were isolated from the fragments obtained by the above method and recombined into a Forex-T vector to prepare an expression vector ForexT- XylM / A as shown in FIG. 2.

실시예 2Example 2 : 클로닝된 유전자 분석Cloned Gene Analysis

클로닝된 재조합 벡터(ForexT-XylM/A)의 염기서열 분석을 위하여, 두 벡터의 개열지도를 토대로 EcoRI, KpnI, BamH1, PstI, 및 HindⅢ를 이용하여 벡터를 절단하고, 각각의 조각을 M13mp18과 M13mp19에 서브클로닝(subcloning)하였으며, 이들을 AmpliTaq DNA 중합효소를 이용한 ABI PRISM BigDye primer cycle-sequencing kit (Perkin-Elmer, 미국)를 이용하여 서열 분석하였다. 이 때, 두 가닥 DNA의 양쪽 방향을 다 읽기 위하여 부분적으로 합성 뉴클레오타이드를 만들었으며, 이를 통하여 염기서열을 분석하고 재확인하였다.
For sequencing of the cloned recombinant vector (ForexT- XylM / A ), the vector was cleaved using EcoRI, KpnI, BamH1, PstI, and HindIII based on the cleavage maps of the two vectors, and each fragment was digested with M13mp18 and M13mp19. Subcloning was performed, and they were sequenced using an ABI PRISM BigDye primer cycle-sequencing kit (Perkin-Elmer, USA) using AmpliTaq DNA polymerase. At this time, in order to read both directions of both strands of DNA, partially synthesized nucleotides were made, and the sequence was analyzed and reconfirmed.

실시예 3Example 3 : : XylM/AXylM / A 를 분비하는 재조합 미생물의 제조Of recombinant microorganisms secreting

ForexT-XylM/A를 칼슘클로라이드 방법을 이용하여 (참조 : Sambrook et al., Molecular Cloning, A Laboratory Manual 2nd Ed., Cold Spring Harbor Laboratory Press, Cold Spring Harbor, NY, 1989) 대장균 MC1061에 도입하고 엠피실린 (ampicillin, 100mg/L)과 박토-아가 (bacto-agar, 15g/L)가 첨가된 LB 평판배지 (이스트 추출물, 5g/L ; 트립톤, 10g/L ; NaCl, 10g/L)에서 선별하여 재조합 미생물 MC1061(ForexT-XylM/A)을 제조하였다. 클로닝된 DNA 절편의 유전자 염기서열을 분석하여, GenBank에 등록된 염기서열과 비교해 본 결과, xylM/A 유전자임을 확인할 수 있었다.
ForexT- XylM / A was introduced into E. coli MC1061 using the calcium chloride method (Sambrook et al., Molecular Cloning, A Laboratory Manual 2nd Ed., Cold Spring Harbor Laboratory Press, Cold Spring Harbor, NY, 1989). Screened in LB plate medium (yeast extract, 5g / L; tryptone, 10g / L; NaCl, 10g / L) with acillin (ampicillin, 100mg / L) and bacto-agar (15g / L) Recombinant microbial MC1061 (ForexT- XylM / A ) was prepared. The gene sequence of the cloned DNA fragment was analyzed and compared with the base sequence registered in GenBank. As a result, it was confirmed that the gene was xylM / A.

실시예 4Example 4 : 인디고 발색반응에 의한 : Indigo color reaction xylM/AxylM / A 발현 확인 Expression confirmation

재조합 미생물의 배양에 따른 XylM/A의 발현을 확인하기 위하여 실시예 1에서 제조한 ForexT-XylM/A를 사용하여 형질 전환시킨 재조합 미생물 MC1061(ForexT-XylM/A)과, 대조군으로서 재조합 발현벡터가 포함되지 않은 야생주 MC1061을 동일한 조건으로 배양하여 발현된 xylM/A의 활성을 측정하였다. 인디고(Indigo)가 모노옥시게나제에 의해 인돌(Indole)로 전환되면서 푸른색 콜로니가 형성되는 인디고 발색반응을 이용해 xylM/A의 발현을 확인하였다. 두 종류의 대장균을 각각 엠피실린 (ampicillin, 100mg/L)이 포함된 5ml LB 액체배지에 접종한 다음, 25℃ 내지 45℃의 온도, 특히 37℃에서 충분한 시간동안 진탕배양 하였다. 1mM 인디고(Indigo) 와 엠피실린 (ampicillin, 100mg/L)이 포함된 LB 고체배지에 상기의 배양액을 100㎕ 도말하여 37℃ 배양기에서 24시간 배양한 뒤에 푸른색 콜로니의 형성여부를 관찰하였다. 그 결과 재조합 발현벡터가 포함되지 않은 대조군에서는 푸른색 콜로니가 형성되지 않은 반면, ForexT-XylM/A를 사용하여 형질 전환시킨 재조합 미생물 MC1061(ForexT-XylM/A)에서는 푸른색 콜로니가 형성되는 것이 확인되었다.
Was transformed using the ForexT- XylM / A prepared in Example 1 to confirm that the XylM / A expression in accordance with the culture of a recombinant microorganism the recombinant microorganism MC1061 (ForexT- XylM / A), and a recombinant expression vector as a control Wild lines MC1061 not included were cultured under the same conditions to measure the activity of the expressed xylM / A. The expression of xylM / A was confirmed using an indigo color reaction in which Indigo was converted to Indole by monooxygenase to form blue colonies. Two types of E. coli were inoculated in 5 ml LB liquid medium containing ampicillin (100 mg / L), respectively, and then shaken for a sufficient time at a temperature of 25 ° C. to 45 ° C., particularly 37 ° C. 100 L of the culture solution was smeared in an LB solid medium containing 1 mM Indigo and ampicillin (ampicillin, 100 mg / L) and incubated in a 37 ° C. incubator for 24 hours to observe the formation of blue colonies. On the other hand the result is not formed in the control group that does not include the recombinant expression vector is the blue colonies, it is confirmed that the ForexT- XylM / transfected recombinant microorganism that switching the A MC1061 (ForexT- XylM / A) forming a blue colonies It became.

실시예 5Example 5 : : XylM/AXylM / A 가 삽입된 재조합 미생물에 의한 NDA 생산 확인 NDA Production by Recombinant Recombinant Microorganisms

XylM/A의 발현에 의해 2,6-DMN이 산화되어 2,6-NDA가 생산되는지 확인하기 위해 재조합 미생물 MC1061(ForexT-XylM/A)과 2,6-DMN의 반응실험을 실시하였다. 재조합 미생물 MC1061(ForexT-XylM/A)을 엠피실린 (ampicillin, 100mg/L)이 포함된 5ml LB 액체배지에 접종한 다음, 25℃ 내지 45℃의 온도, 특히 37℃에서 충분한 시간동안 진탕배양 하였다. 하기 표 1과 같은 조성의 배지에 상기 배양액 1%를 접종한 후 37℃ 배양기에서 48시간 동안 진탕 배양하였다. 배양액을 둥근바닥 플라스크에 넣고 건조 증발기로 배양액을 증발시키고 DMSO로 남은 건조분말을 용해시킨 후, 표 2에 나타난 조건으로 고성능 액체크로마토그래피(HPLC)로 분석하여 2,6-NDA 생산 능력을 측정하였다. 도 4의 HPLC 분석 결과에서 보듯이, 재조합 미생물 MC1061(ForexT-XylM/A)에 의해 2,6-DMN이 2,6-NDA로 전환되었음을 확인할 수 있다. 또한 2,6-DMN이 2,6-NDA로 산화되는 과정에서 생성되는 여러 가지 중간체 화합물들도 기체 크로마토그래피/질량분석기로 확인한 결과, 각각 2-하이드록시메틸-6-나프타알데하이드, 2-메틸-6-나프토산, 및 2,6-디메틸나프타알데하이드으로 밝혀졌다. Reaction experiment of recombinant microorganism MC1061 (ForexT- XylM / A ) and 2,6-DMN was carried out to confirm that 2,6-DMN is oxidized by the expression of XylM / A to produce 2,6-NDA. Recombinant microorganism MC1061 (ForexT- XylM / A ) was inoculated into 5 ml LB liquid medium containing ampicillin (ampicillin, 100 mg / L), and then shaken for a sufficient time at a temperature of 25 ° C. to 45 ° C., particularly 37 ° C. . After inoculating 1% of the culture solution into the medium of the composition shown in Table 1, the culture was shaken for 48 hours in a 37 ℃ incubator. The culture solution was placed in a round-bottom flask, the culture solution was evaporated with a dry evaporator, and the remaining dry powder was dissolved in DMSO, and then analyzed by high performance liquid chromatography (HPLC) under the conditions shown in Table 2 to measure 2,6-NDA production capacity. . As shown in the HPLC analysis results of FIG. 4, it can be seen that 2,6-DMN was converted to 2,6-NDA by the recombinant microorganism MC1061 (ForexT- XylM / A ). In addition, various intermediate compounds produced during the oxidation of 2,6-DMN to 2,6-NDA were also identified by gas chromatography / mass spectrometry. 2-hydroxymethyl-6-naphthaaldehyde, 2-methyl -6-naphthoic acid, and 2,6-dimethylnaphthaaldehyde.

조성Furtherance 함량content 이스트 추출물Yeast extract 5 g/L5 g / L 트립톤Trypton 10 g/L10 g / L NaClNaCl 10 g/L10 g / L 2,6-DMN2,6-DMN 1 g/L1 g / L 엠피실린Empicillin 100 mg/L100 mg / L DMSODMSO 10 mL10 mL

HPLCHPLC LC 10-ADVP(SHIMADZU)LC 10-AD VP (SHIMADZU) 컬럼column XTerraTMRP18 (4.6 ㅧ 50 mm, Waters)XTerra TM RP18 (4.6 ㅧ 50 mm, Waters) 검출기Detector UV 240 nm UV 240 nm 컬럼 온도Column temperature 40℃ 40 ℃ 유속Flow rate 1 ml/min. 1 ml / min. 주입 부피Injection volume 20 ㎕ 20 μl 이동상 (mobile phase)Mobile phase 시간 (min)Time (min) 0.3% 인산0.3% phosphoric acid 아세토니트릴Acetonitrile 00 9898 22 55 9292 88 2828 5252 4848 3030 2020 8080 3535 55 9595 3636 9898 22 4949 9898 22

본 발명의 슈도모나스 푸티다(Pseudomonas putida) 유래의 xylM/A 유전자를 발현하는 재조합 미생물을 이용하면 폴리에틸렌 나프탈레이트의 단량체인 2,6-나프탈렌 디카르복실산의 생물학적 공정에 의하여 용이하게 생산할 수 있다.The recombinant microorganism expressing the xylM / A gene derived from Pseudomonas putida of the present invention can be easily produced by a biological process of 2,6-naphthalene dicarboxylic acid which is a monomer of polyethylene naphthalate.

서열목록 전자파일 첨부 Attach sequence list electronic file  

Claims (5)

서열번호 1로 표시되는 xylM/A 유전자를 얻는 단계; 상기 유전자를 Forex-T, pUC119, pBluscript 및 pET로 이루어진 군에서 선택된 재조합 발현벡터에 삽입하는 단계; 상기 발현벡터로 MC1061(E. coli), JM109(E. coli), XL1-Blue(E. coli) 및 DH5αF'(E. coli)로 이루어진 군에서 선택된 숙주세포를 형질 전환하는 단계를 포함하는 자일렌 모노옥시게나제를 발현하는 미생물을 제조하는 단계; 및 상기 미생물을 2,6-디메틸나프탈렌을 포함하는 배지에서 배양함으로써 하기 화학식 1의 화합물을 제조하는 방법: Obtaining a xylM / A gene represented by SEQ ID NO: 1; Inserting the gene into a recombinant expression vector selected from the group consisting of Forex-T, pUC119, pBluscript and pET; Xyl comprising the step of transforming the host cell selected from the group consisting of MC1061 ( E. coli ), JM109 ( E. coli ), XL1-Blue ( E. coli ) and DH5αF '( E. coli ) with the expression vector. Preparing a microorganism expressing ren monooxygenase; And culturing the microorganism in a medium containing 2,6-dimethylnaphthalene.
Figure 112007091900190-pat00006
Figure 112007091900190-pat00006
상기 식에서, R1 및 R2는 각각 독립적으로 -CH2OH, -COH, 또는 -COOH이다.Wherein R 1 and R 2 are each independently —CH 2 OH, —COH, or —COOH.
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