KR100706464B1 - 혼성화 및 에스피알 검출을 위한 장치 및 방법 - Google Patents

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Abstract

혼성화 챔버를 제공하는 장치 및 방법이다. 혼성화 챔버는 혼성화 프레임 및 검출 프레임을 갖는다. 혼성화 프레임은 혼성화 챔버를 둘러싸고 분리가능하게 결합되는 하우징 내에 격납될 수 있다.
혼성화, 검출, 혼성화 챔버, 혼성화 프레임, 검출 프레임

Description

혼성화 및 에스피알 검출을 위한 장치 및 방법{APPARATUS AND METHOD FOR HYBRIDIZATION AND SPR DETECTION}
본 교시는 혼성화(hybridization) 분석을 포함하는, 생물학적 표본을 갖는 고체 표면상의 반응을 수행하기 위한 장치 및 방법에 관한 것이다. 이러한 장치는 혼성화 및 검출의 상기 과정을 향상시킨다.
생물학 분야에서, 고체 표면상의 반응은 혼성화 분석에 사용될 수 있다. 고체 표면상의 결합 쌍(binding pair)의 공지 구성부분은 혼성화 유체에서 듀플렉스(duplex)를 형성하기 위하여 생물학 표본으로부터 결합 쌍의 목표 구성부분과 혼성화할 수 있다. 고체 표면상의 듀플렉스된 결합 쌍의 패턴(pattern)은 생물학 표본에 관한 정보를 제공한다. 고체 표면상의 패턴은 고체 표면상의 결합 쌍의 공지 구성부분과 관련한 정보를 나타내기 위하여 검출될 수 있다. 혼성화 중에는 고체 표면 위의 공간을 제어하고, 검출 중에는 고체 표면에 대한 접근 경로를 제공하는 것이 바람직하다.
공정 중에는 혼성화 유체의 누출 또는 증발을 감소시키고, 반응 온도, 지속시간, 혼합 및 다른 혼성화 변수에 관하여 정밀한 제어상태를 유지하기 위하여 밀봉된 혼성화 챔버(chamber)를 갖는 것이 바람직하다. 혼성화 파라미터는 400rpm의 교반을 18~24시간 동안 55℃ 정도의 상승 온도를 포함한다. 혼성화 챔버를 밀봉하는 하우징은 주변 환경으로부터 밀봉될 수 있는 혼성화 챔버를 수용하기 위한 용기를 제공할 수 있다.
다양한 실시예에 따르면, 혼성화 장치는 기판과 검출 프레임, 혼성화 프레임 및 상기 기판의 일부를 포함하는 혼성화 챔버를 포함할 수 있고, 상기 검출 프레임은 상기 기판에 위치되고, 상기 혼성화 프레임은 상기 검출 프레임에 근접하게 위치되어 상기 혼성화 챔버를 형성한다. 다양한 실시예에 따르면, 혼성화 장치는 베이스와 커버를 포함하는 하우징과, 마이크로 어레이(microarray)를 포함하는 기판-상기 기판은 상기 베이스 내에 위치됨-과, 프레임과 상기 기판의 일부를 포함하는 혼성화 챔버로 이루어질 수 있고, 상기 커버는 상기 혼성화 챔버를 밀폐시키기 위하여 상기 베이스와 분리가능하게 결합하고, 상기 커버는 충진 장비가 상기 마이크로 어레이와 접촉하는 것을 방지하기 위한 유입 포트(port)를 포함한다.
다양한 실시예에 따르면, 혼성화 방법은 베이스와 커버를 포함하는 하우징을 제공하는 단계와, 마이크로 어레이를 포함하는 기판을 제공하는 단계와, 프레임과 상기 기판의 일부를 포함하는 혼성화 챔버를 제공하는 단계와, 상기 혼성화 챔버를 밀폐시키고 상기 프레임을 압박하기 위하여 상기 커버를 상기 베이스에 분리가능하게 결합시키는 단계로 이루어질 수 있다.
다양한 실시예에 따르면, 혼성화 장치는 베이스와 커버를 포함하는 하우징-상기 베이스와 커버는 분리가능하게 결합됨-과, 마이크로 어레이를 포함하는 기판-상기 하우징은 상기 기판을 격납시키도록 형성됨-과, 검출 프레임-상기 검출 프레임은 상기 기판 위에 위치되고, 상기 검출 프레임과 기판은 검출 공간을 형성함-과, 혼성화 프레임-상기 혼성화 프레임, 상기 기판 및 상기 커버는 혼성화 공간을 형성하고, 상기 혼성화 공간과 상기 검출 공간은 상기 마이크로 어레이와 유체 접촉을 함-을 포함할 수 있다. 다양한 실시예에 따르면, 혼성화 장치는 마이크로 어레이를 포함하는 기판-상기 기판은 결합층과 지지체를 포함함-과, 프레임과 상기 기판의 일부를 포함하는 혼성화 챔버-상기 프레임은 상기 결합층을 통해서 상기 지지체 상에 위치되고 상기 결합층은 흡수용 흑화제를 포함함-을 포함할 수 있다.
다양한 실시예에 따르면, 혼성화 장치는 기판과, 검출 프레임과 커버와 상기 기판의 일부를 포함하는 혼성화 챔버를 포함할 수 있고, 상기 커버는 상기 기판의 일부 위에 혼성화 유체를 분산시키기 위한 공동을 포함하고, 상기 검출 프레임은 상기 기판 위에 위치하고, 상기 기판은 SPR 검출을 위해 구성된다. 다양한 실시예에 따르면, 혼성화 장치는 커버를 포함하는 하우징과, 마이크로 어레이를 포함하는 기판과, 프레임과 상기 기판의 일부를 포함하는 혼성화 챔버를 포함할 수 있고, 상기 커버는 상기 마이크로 어레이 상의 혼성화 유체를 분산하기 위한 공동을 포함하고, 상기 커버는 상기 혼성화 챔버를 밀봉하기 위한 상기 프레임과 결합하고, 상기 커버는 유입 포트를 포함하고, 상기 기판은 SPR 검출을 위해 구성된다.
다양한 실시예에 따르면, 혼성화 방법은 커버를 포함하는 하우징을 제공하는 단계와, 마이크로 어레이를 포함하는 기판을 제공하는 단계와, 프레임과 상기 기판의 일부를 포함하는 혼성화 챔버를 제공하는 단계와, 상기 마이크로 어레이 상의 혼성화 유체를 분산시키고, SPR에 의해 혼성화를 검출하는 것을 포함할 수 있다.
전술한 일반적인 설명과 다양한 실시예에 관한 후술하는 설명은 다양하고 설명을 위한 것이며, 한정적인 것은 아니다.
본 명세서와 합체되고 본 명세서의 일부를 구성하는 첨부된 도면은 다양한 실시예를 도시한다.
도 1A∼도 1C는 인접한 검출 및 혼성화 프레임의 다양한 실시예를 도시한다;
도 2A∼도 2C는 커버의 다양한 실시예를 도시한다;
도 3∼도 4는 조립되고 조립해제된 장치의 다양한 실시예를 도시한다;
도 5A∼도 5D는 유입 포트 및 융기부의 다양한 실시예를 도시한다;
도 6∼도 11은 조립 및 조립해제된 장치의 다양한 실시예를 도시한다;
도 12는 검출을 위한 커버 슬립을 갖는 기판과 검출 프레임의 다양한 실시예를 도시한다;
도 13은 챔버와 마이크로 어레이의 배열을 형성하는 다수의 격벽을 갖는 기판 및 검출 프레임의 다양한 실시예를 도시한다;
도 14는 SPR 검출을 위한 커버를 갖는 기판 및 검출 프레임의 다양한 실시예를 도시한다;
도 15는 혼성화 유체의 흐름통과를 위한 유입 포트와 배출 포트의 다양한 실시예를 도시한다;
도 16은 유입 포트와 배출 포트를 갖는 커버의 다양한 실시예를 도시한다;
도 17A∼도 17F는 지지부, 접착층, 결합층 및 마이크로 어레이에 검출 프레임의 부착을 나타내기 위하여 확대된 기판의 다양한 실시예를 도시한다;
도 18은 캡의 다양한 실시예를 도시한다;
도 19는 SPR 결합의 다양한 실시예를 도시한다.
문헌은 다양한 실시예와 첨부된 도면에 도시된 예가 제시될 것이다. 가능한 경우에는 언제나, 동일한 참조부호는 동일하거나 유사한 부분에 관한 도면이나 설명에 사용된다.
이하에서 사용되는 용어 "혼성화"는 특정한 결합 쌍의 두개의 구성부분 사이에서 듀플렉스를 형성하는 공정을 의미한다. 특정한 결합 쌍은 폴리뉴클레오티드(polynucleotide)의 전체적으로 또는 부분적으로 상보적인 가닥(complementary strand)이다. 여기에서 사용되는 용어 "폴리뉴클레오티드"는, 자연적으로 존재하는 폴리뉴클레오티드의 상사기관을 포함하며 폴리뉴클레오티드의 길이의 어떠한 제한을 두지 않는다는 것은 분자생물학 기술분야의 당업자에게 이해될 수 있을 것이다. 폴리뉴클레오티드 가닥 중의 하나는 고체 기판상에 고정될 수 있다.
혼성화에 사용되는 폴리뉴클레오티드 가닥은 듀플렉스의 검출을 용이하게 하기 위하여 검출할 수 있는 표지를 라벨(label)로 나타낼 수 있다. 검출할 수 있는 표지의 예는 형광 염료, 방사성 동위원소, 효소 또는 다른 표지를 포함할 수 있지만 이에 한정되지 않는다. 다양한 실시예에 따르면, 검출은 검출할 수 있는 표지를 검지하는 CCD 카메라에 의해 제공될 수 있다. 혼성화에 사용되는 폴리뉴클레오티드 가닥은 라벨되지 않을 수 있다. 라벨되지 않은 결합 쌍의 혼성화는 표면 플라즈몬 공명(surface plasmon resonance; SPR)에 의해 검출될 수 있다.
혼성화는 상이한 물질 사이의 구조-활성 관계를 이해하고, 단일염기다형성(single nucleotide polymorphisms; SNPs)을 검출 및 스크린(screening)하고, 알려지지 않은 물질을 배열하는 것을 포함하는 다양한 목적으로 사용될 수 있다. 용어 "특정 결합 쌍"은 비특정 분자 상호작용의 바닥 상태 이상으로 검출될 수 있는 특성으로 서로 결합하는 한 쌍의 분자들을 의미한다. 특정 결합 쌍의 예로는 항체-항원[또는 합텐(hapten)]쌍, 리간드-수용체(ligand-receptor) 쌍, 비오틴-아비딘(biotin-avidin) 쌍, 상보적인 베이스 쌍을 갖는 폴리뉴클레오티드, 핵산 결합 단백질 및 동종 핵산 배열, 다수의 다중-단백질 복합체 및 이와 유사한 것들을 포함할 수 있지만, 이에 한정하지 않는다. 각각의 특정 결합 쌍은 두 개의 구성부분 또는 주어진 특정 결합 쌍의 어느 한쪽의 구성부분과 특별히 결합할 수 있는 부가적인 복합물을 포함할 수 있다.
다양한 실시예에 따르면, 혼성화 장치는 액상 또는 기판상에 결합된 폴리뉴클레오티드를 갖는 혼성화 챔버를 제공할 수 있다. 설명의 목적을 위하여, 상기 형상은 마이크로 어레이를 형성하는 기판상에 결합된 폴리뉴클레오티드를 설명한다. 마이크로 어레이는 제곱 미터당 4 결합 싸이트(site) 또는 제곱 미터당 10⁴결합 싸이트까지의 밀도를 가질 수 있다. 결합 싸이트는 핀 스포팅(pin spotting), 잉크분사(ink-jetting), 사진 식각(photo-lithography) 및 고밀도 증착(deposition) 기 술분야에서 알려진 다른 방법에 의해 기판상에 위치될 수 있다. 도면에 도시된 상기 형상은 액상의 뉴클레오티드(nucleotides)의 혼성화 장치에 쉽게 적용할 수 있다.
다양한 실시예에 따르면, 이하에서 사용되는 "SPR"은 혼성화 및 다른 단백질-핵산 산 결합(protein-nucleic acid binding)을 측정하는데 사용될 수 있는 표면-감응(surface-sensitive) 및 광 검출 방법을 나타낸다. SPR은 자유전자금속(예를 들면 금, 은, 구리, 카드늄, 알루미늄)과 공기, 물과 같은 벌크 매질(bulk medium) 사이의 계면에서 물질의 두께와 굴절률에 감응할 수 있다. 마이크로 어레이는 금속 기판상에 증착될 수 있다. SPR은 대체로 단색성이고 비간섭성이고 근적외선인 광원, 예를 들면 레이저 빔 또는 발광 다이오드(light-emitting diode; 이하에서는 LED라고 정의한다)와 같은 광원에 의해 발생되는 소멸파(evanescent wave)를 사용할 수 있다. 상기 파는 금속상에 충돌하기 위한 입사 평면에 대해 선형적으로 평면편광일 수 있다. 금속은 상기 기판의 박막부를 형성하기 위하여 유리 또는 폴리카보네이트(polycarbonate)와 같은 플라스틱을 포함하는 지지체 상에서 코팅될 수 있다. 기판은 완전히 비금속으로 제작될 수 있다.
다양한 실시예에 따르면, 도 19에 도시된 바와 같이, 기판은 프리즘[크레치만 프리즘 결합(Kretschmann Prism Coupling)]과 결합될 수 있거나 회절격자[회절격자 결합(Grating Coupling)]와 결합될 수 있다. SPR은 굴절률과 입사광 파장 및 도 19의 θ에 의해 나타나는 입사각의 보정결합을 위해, 입사광선으로부터의 광자가 상기 금속 내에서 표면 플라즈몬 방식으로 입사되고 흡수될 때, 프리즘-금속 계 면(크레치만 프리즘 결합) 또는 회절격자 계면(회절격자 결합)으로부터 반사되는 광도의 감소로써 관측될 수 있다. 다양한 실시예에 따르면 가장 많은 광자 흡수, 따라서 최저 반사 광도를 위한 입사각은 한정될 수 있다. 기판의 금속 표면상의 혼성화는 최저 반사 광도를 위한 입사각을 변경함으로써 반사율을 변경시킬 수 있다. 입사각의 변경은 혼성화 유체와 접촉하는 금속 표면상의 물질의 부착 또는 감소를 검출하는데 사용될 수 있다.
다양한 실시예에 따르면, 특정 결합쌍의 결합은 마이크로 어레이의 두께를 증가시킬 수 있어서 마이크로 어레이는 결합의 존재를 나타낼 수 있는 입사각의 변경을 제공할 수 있다. 입사각의 위치 또는 입사각과 근사한 고정각에서의 반사율 중 하나를 측정함으로써, 결합 위치에서 결합의 존재 또는 부재가 검출될 수 있다. SPR은 상대적으로 빠르고 라벨링(labeling) 없이 수행될 수 있다. 검출은 고정각에서 CCD 카메라에 의해 제공될 수 있다. SPR 이미지는 상이한 결합 위치로부터 반사된 광도의 변화로부터 발생한다. 투명한 커버를 갖는 혼성화 챔버는 SPR을 검출하기 위해 사용될 수 있다.
다양한 실시예에 따르면, 회절격자-결합 SPR은 적어도 1.0cm × 1.0cm의 표면적을 갖는 마이크로 어레이로부터 CCD 카메라 검출기에 의해 관측될 수 있다. CCD 카메라는 마이크로 어레이상에서 결합 위치의 전체 매트릭스(matrix)의 동시 검출을 제공할 수 있다.
다양한 실시예에 따르면, 도 1A∼도 1C 는 검출 프레임 및 혼성화 프레임의 상대적인 위치를 나타내는 혼성화 장치를 도시한다. 이러한 실시예는 하우징 또는 장치와 관련될 수 있다. 다양한 실시예에 따르면, 장치는 혼성화 챔버를 형성하기 위하여 서로 지지될 수 있도록 턱(jaws)과 유사하게 구성된 뚜껑 및 홀더를 제공할 수 있다. 도 1A∼도 1C에서 완전한 하우징 또는 장치는 도시되지 않는다. 검출 프레임(14)는 마이크로 어레이(12)를 결합하는 기판(10) 상에 위치될 수 있다. 혼성화 프레임(16)은 전술한 검출 프레임 부근에 위치될 수 있어서 커버/뚜껑(18)(상기 하우징 실시예에서는 커버이고 상기 장치 실시예에서는 뚜껑임)로 씰(seal)을 형성할 수 있다. 다양한 실시예에 따르면, 혼성화 프레임(16)은 씰을 더 잘 형성하기 위하여 압축가능할 수 있다. 압축가능한 물질은 재료과학 기술 분야에서 알려져 있다. 다양한 실시예에 따르면, 상기 혼성화 프레임 및/또는 상기 검출 프레임은 실리콘 고무(Silicone Rubber), FDA 승인된 실리콘 고무, EPDM 고무, 네오프렘(Neoprame)(CR) 고무, SRB 고무, 니트릴(Nitrile)(NBR) 고무, 부틸(Butyl) 고무, 하이파론(Hypalon)(CSM) 고무, 폴리우레탄(Polyurethane)(PU)고무, 비트론(vitron) 고무 및 폴리티메틸실록산(polydimethylsiloxane)[다우코닝의 Slygard™ 탄성중합체(elastomer)]에서 선택된 적어도 하나의 탄성 물질로 구성될 수 있다.
이하에서 사용된 용어 "프레임"은 개스킷(gasket), 링(ring), 씰을 의미한다. 프레임은 전체 형상 및/또는 단면이 각을 이루고 있거나 원형일 수 있다. 프레임은 압축성이 있고 탄성 중합체 물질로 구성될 수 있다. 프레임은 포트와 같은 유체를 이송하는 임의의 내부 수단 또는 프레임 내의 반응 리세스(reaction recess)와 같은 상기 이송된 유체를 혼합하는 수단을 포함하지 않는다. 프레임은 혼성화 챔버 내에서 용기의 용해를 허용하지 않는다. 프레임은 단일하고 다중 부재를 포함하지 않는다. 프레임은 격자판과 같은 다중 프레임으로 분리되지 않는다. 이하에서 사용되는 용어 "검출 프레임"은 검출 챔버를 형성하고 기판상에 부착되는 프레임을 의미한다. 이하에서 사용되는 용어 "혼성화 프레임"은, 검출 프레임 상에 위치하거나 또는 검출 프레임 부근에 위치하거나 인접하여 위치하여 검출 프레임 외측에 위치함으로써 검출 프레임을 갖거나, 검출 프레임을 생략한 혼성화 챔버를 형성하는 프레임을 의미한다.
이하에서 사용되는 용어 "인접한"은 각각 동일한 폭을 갖거나 또는 둘 중 하나가 넓은 상태에서 일측의 상판에 일체로 있도록 상호 접하거나, 동일한 중심을 갖거나 둘 중 하나가 중심에서 벗어나 있는 상태에서 측면으로 서로 접촉하도록 서로 인접하거나, 서로 인접하지 않지만 일측을 둘러싸는 타측과 근거리로 떨어져 있도록 서로 인근에 위치하는 것을 모두 포함하는 검출 및 혼성화 프레임의 위치를 나타낸다.
다양한 실시예에 따르면, 도 1A는 혼성화 프레임(16)이 검출 프레임(14) 상에 위치할 수 있음을 도시한다. 다양한 실시예에 따르면, 검출 프레임(14)은 검출시에 더 큰 안정성을 제공하기 위해 혼성화 프레임(16)보다 더 견고할 수 있다. 혼성화 프레임(16)은 밀봉된 혼성화 챔버를 형성하기 위하여 검출 프레임(14) 및 커버/뚜껑(18) 사이에서 압축될 수 있다. 도 1B는 검출 프레임(14)에 인접하여 위치될 수 있는 혼성화 프레임(16)이 도시된다. 혼성화 프레임(16)은 밀봉된 혼성화 챔버를 형성하기 위하여 기판(10) 및 커버/뚜껑(18) 사이에서 압축될 수 있다. 도 1C는 검출 프레임(14) 부근에 위치될 수 있는 혼성화 프레임(16)을 도시한다. 혼성화 프레임(16)은 밀봉된 혼성화 챔버를 형성하기 위하여 기판(10) 및 커버/뚜껑(18) 사이에서 압축될 수 있다. 비록 도 1A∼도 1C에 도시된 상기 검출 및 혼성화 프레임이 직선형이지만, 상기 검출 및 혼성화 프레임은 원형, 타원형 및 이들의 조합을 포함하는 임의의 형상일 수 있다. 하기에 설명하는 바와 같이, 상기 혼성화 프레임은 혼성화 공간과 검출 공간이 겹치는 것을 포함할 수 있다.
다양한 실시예에 따르면, 상기 검출 프레임 및 상기 혼성화 프레임은 혼성화 챔버 및 검출 챔버 둘다 구성하는 단일 프레임으로 대체될 수 있다. SPR 검출 실시예에서, 상기 혼성화 챔버는 상기 검출 챔버도 될 수 있다. 상기 두 프레임의 실시예에 도시된 상기 형상은 단일 프레임 실시예에 있어서 유사하게 이익이 있을 수 있다는 것은 당해 기술분야의 동업자들에게 자명하다.
다양한 실시예에 따르면, 혼성화 장치는 하우징 또는 장치를 포함할 수 있다. 도 1A∼도 1C에 도시된 바와 같이, 혼성화 장치는 하우징 또는 하우징 없는 장치 중 하나와 관련 있을 수 있다. 카트리지(cartridge)에서 상기 하우징의 상기 커버 및 베이스는 장치의 상기 뚜껑 및 홀더에서와 유사한 방식으로 조작할 수 있다. 다양한 실시예에 따르면, 도 2∼도 11 및 도 14∼도 16은 하우징과 관련 있을 수 있다. 다양한 실시예에 따르면, 하우징은 공정(조제, 결합 반응, 세척, 건조 등)을 위하여 장치 내에서 위치될 수 있고, 도 2∼도 11 및 도 14∼도 16에 도시된 상기 형상으로 인한 이익이 있을 수 있다. 상기 하우징은 검출 장치에서 제거될 수 있거나 검출은 상기 장치에서 일어날 수 있다.
다양한 실시예에 따르면, 도 2A∼도 2C는 상이한 커버를 갖는 하우징을 사용한 혼성화 장치를 도시한다. 도 2A∼도 2C는 검출 프레임(14)이 마이크로 어레이(12)를 결합하는 기판(10) 상에 위치할 수 있고, 혼성화 프레임(16)은 검출 프레임(14) 상에 위치될 수 있음을 도시한다. 상기 혼성화 챔버를 둘러싸는 커버(18)를 갖는 씰을 형성하기 위하여 혼성화 프레임(16)은 압축될 수 있다. 다양한 실시예에 따르면, 상기 검출 프레임 및 혼성화 프레임은 전술한 바와 같이 서로 근접하여 위치할 수 있다. 도 2A∼도 2C는 커버(18)가 융기부(22) 및 유입 포트(20)를 가질 수 있음을 도시한다. 도 2A에 도시된 바와 같이 융기부(22)는, 커버(18)가 기판(10) 상의 마이크로 어레이(12)와 대부분 평행하도록 커버(18)의 상부면으로부터 돌출될 수 있다. 도 2B 및 도 2C에 도시된 바와 같이 커버(18)가 기판(10) 상의 마이크로 어레이(12)와 대부분 평행하지 않도록 융기부(22)는 상기 커버의 일부가 될 수 있고, 반구형 또는 아치형이 될 수 있다. 도 2B는 반구형 돔(dome)을 가질 수 있는 융기부(22)를 도시한다. 도 2C는 수직형 아치 또는 비스듬한 아치를 가질 수 있는 융기부(22)를 도시한다. 돔 또는 아치의 임의의 다른 변형 또는 조합은 상기 혼성화 챔버의 상기 혼성화 공간을 증가하는데 이용할 수 있다. 도 2C에 도시한 바와 같이, 포트(20)는 융기부(22)의 일측으로 이동할 수 있다. 상기 포트는 반드시 중심위치는 아니며 상기 융기부 또는 상기 커버의 다른 부분 상의 임의의 지점일 수 있다. 상기 융기부는 상기 커버와 달리 상기 커버와 결합하는 분리된 부품일 수 있다.
다양한 실시예에 따르면, 상기 혼성화 챔버는 300마이크로리터(microliter) 이하의 혼성화 공간을 제공한다. 혼성화 유체의 상기 양은 1.0마이크로리터에서 50 마이크로리터일 수 있다.
다양한 실시예에 따르면, 도 2∼도 11 및 도 14∼도 16은 커버와 베이스를 갖는 하우징을 포함하는 혼성화 장치를 도시한다. 다양한 실시예에 따르면, 하우징은 체결 위치에서 조립될 수 있고, 체결 해제 위치에서 분해될 수 있다. 상기 하우징은 자체적으로 상판과 압축판을 포함할 수 있는 커버를 포함할 수 있다. 상기 압축판은 융기부, 유입 포트 및 상기 혼성화 유체에 의해 치환된 가스가 대기로 배출되는 것을 허용하기 위한 배출 포트를 포함할 수 있다. 상기 유입 포트 및 배출 포트는 혼성화 유체가 캡(cap)에 의해 상기 혼성화 챔버에서 이탈되는 것을 방지하도록 차단될 수 있다. 다양한 실시예에 따르면, 상기 캡은 유입 포트 상판의 씰링 테이프(sealing tape)일 수 있고, 상기 융기부(예를 들면 도 3 및 도 4)를 둘러쌀 수 있고, 또는 상기 유입 포트(예를 들면 도 5D)를 막을 수 있다. 체결 위치에서의 상기 커버 및 베이스는 상기 베이스 기판의 일부를 노출하는 윈도(window)를 형성할 수 있다. 바코드(bar code)는 기판에 위치될 수 있고, 상기 윈도를 통해 접근되거나 읽을 수 있다. 상기 상판은 상기 압축판의 융기부가 돌출할 수 있도록 개구를 제공할 수 있다. 상기 상판 및 베이스는 분리가능하게 결합하는 기구를 포함할 수 있다. 상기 압축판은 혼성화 프레임과 결합하기 위하여 융기부에 대해 반대측 상에 기립부를 가질 수 있다. 상기 커버를 상판 및 압축판으로 분리하는 것은, 상기 상판을 가압, 슬라이딩(sliding), 회전 및/또는 플리핑(flipping)하는 것에 의해 체결 위치로 이동시킬 수 있는 분리가능하게 결합하는 기구를 제공할 수 있다. 아래로 가압하는 것은 혼성화 프레임 상의 상기 압축판을 사용할 수 있다. 슬라이딩, 회전 및/또는 플리핑은 상기 압축판의 이동 없이 상기 상판을 상기 체결 위치로 이 동한다. 상기 상판은 역방향으로 슬라이딩, 회전 및/또는 플리핑함으로써 분리할 수 있다. 다양한 실시예에 따르면, 혼성화 방법은 상기 장치 및 이러한 작용에 따른 상기 커버 및 베이스를 분리가능하게 결합하는 것을 포함한다.
다양한 실시예에 따르면, 바코드는 상기 기판상에 위치될 수 있다. 용어 "바코드"는 상기 마이크로 어레이 및/또는 혼성화를 확인하는 것을 포함하여 상기 기판을 확인할 수 있는 임의의 표지를 뜻한다. 상기 바코드는 일차원(예를 들면 막대), 이차원(예를 들면 점 행렬), 또는 삼차원[예를 들면 홀로그램(hologram)]일 수 있다. 상기 기판상에 바코드를 위치하는 것은, 하기에 설명하는 바와 같이, 상기 라벨 상에 인쇄된 바코드를 포함하는 첩착 라벨을 위치하는 것, 대조색의 다층 불투명 코팅(coating)을 위치하는 것 또는 상기 기판에 직접 표시하는 것을 포함할 수 있다. 다양한 실시예에 따르면, 바코드는 상기 하우징 또는 프레임 상에 위치될 수 있다.
다양한 실시예에 따르면, 바코드는 표시에 의해 금속 기판상에 직접 위치될 수 있다. 상기 바코드는 레이저 또는 LED로부터의 광선에 의해 상기 금속 기판에 표시될 수 있다. 상기 바코드는, 상기 기판이 상기 판독 장치부터의 광선에 노출된 후 상기 기판으로부터의 반사된 레이저 빛을 판독할 수 있는 판독 장치로 판독할 수 있도록 상기 기판 내에서의 깊이로 표시될 수 있다. 상기 바코드는, 상기 기판으로부터 반사된 입사광이 백색 배경 위의 검은색 또는 검은색 배경 위의 흰색과 같은 상기 바코드를 나타낼 수 있도록 상기 기판내의 깊이로 상기 기판상에 마크될 수 있다. 다양한 실시예에 따르면, 상기 바코드는 단일한 단계 또는 다양한 단계로 위치될 수 있다. 상기 기판 표면은 상기 표면상의 금속 찌꺼기를 제거함으로써 수정될 수 있다. 제거작용은 상기 바코드를 위치하기 위한 균일한 표면을 제공할 수 있고, 반사광 패턴의 일정한 굴절각을 정할 수 있다. 상기 기판 표면은 바코드가 표시될 수 있다. 상기 표시된 바코드는 판독 장치로부터의 광선에 상기 바코드를 노출시킴으로서 판독될 수 있다. 상기 판독기는 상기 표시된 바코드가 상기 판독 장치에 의해 판독되는 것을 허용하기 위해 배경에 대해 충분한 명암을 제공하는지 여부를 측정하기 위하여 위치될 수 있다. 다양한 실시예에 따르면 상기 바코드는 1.27×10-5미터 내지 2.54×10-5미터의 깊이로 상기 기판상에 마크될 수 있다.
다양한 실시예에 따르면 상기 커버와 베이스를 포함하는 상기 하우징은 몰딩 플라스틱(molding plastic)을 주입함으로써 제작될 수 있다. 몰딩을 주입하는 것은 상기 하우징의 생산 비용을 감소시킬 수 있고, 혼성화 공정 후에 폐기될 수 있는 일회용 용기를 제공할 수 있다. 상기 하우징은 아크릴로니트릴-부타디엔-스티렌(acrylonitrile-butadiene-styrene) 플라스틱, 폴리우레탄(polyurethane), 폴리염화비닐(polyvinylchloride), 폴리카보네이트(polycarbonate), 폴리에틸렌(polyethylene), TEFLON™, 폴리스티렌(polystyrene), KALREZ™ 또는 소비재 생산 기술분야에서 알려진 다른 물질로 구성될 수 있다.
이하에서 사용되는 용어 "분리가능하게 결합된" 또는 "분리가능하게 결합하는" 은 이들이 혼성화 중에 체결 위치일 수 있고, 이때 검출을 위하여 상기 기판에 접근하는 것을 허용하기 위하여 분리될 수 있도록 상기 커버 및 베이스를 결합하는 것을 의미한다. 상기 베이스 및 커버는 분리가능하게 결합하는 기구에 의해 분리될 수 있도록 결합될 수 있다. 분리가능하게 결합하는 기구의 다양한 실시예는 하기에 설명된다. 다양한 실시예에 따르면, 상기 체결 위치는 상기 커버 및 베이스가 결합된 상태에서 몇 가지 형태의 교반이 일어날 수 있다. 이러한 교반 형태는 상기 하우징을 기울이고, 상기 하우징을 회전하고, 상기 하우징을 앞뒤로 움직이고, 상기 하우징을 원형으로 움직이고 상기 하우징을 축 부근에서 회전하는 것을 포함한다.
도 3은 조립되고 체결 위치인 하우징의 실시예를 도시한다. 도 4는 분해된 도 3의 상기 하우징을 도시한다. 상기 하우징은 분리가능하게 결합하는 기구(40)에 의해 상기 결합 위치에서 지지되는 커버(18) 및 베이스(32)를 포함한다. 분리가능하게 결합하는 기구(40)는 아래로 가압 및 클램핑(clamping)에 의해 커버(18)를 상기 결합 위치로 이동할 수 있다. 커버(18)는 분리가능하게 결합하는 기구(40)를 클램핑 해제하고 위로 당김으로써 분리될 수 있다. 커버(18)의 만곡부는 윈도(38)를 형성할 수 있다. 기판(10)에 위치한 바코드(미도시)는 윈도(38)를 통해 판독될 수 있다. 캡(36)은 상기 혼성화 챔버로부터 유출되는 혼성화 유체를 차단할 수 있다. 도 6은 분리된 상기 하우징을 도시한다. 캡(36)은 테더(tether; 60)를 통해 혼성화 프레임과 연결될 수 있다. 캡(36) 및 혼성화 프레임(16) 양쪽 모두는 검출을 위해 상기 기판으로 접근하는 것을 제공하도록 제거될 수 있다.
다양한 실시예에 따르면, 도 6은 조립되고 결합 위치에 있는 하우징을 도시한다. 도 7A는 분리된 도 6의 하우징을 도시한다. 상기 하우징은 베이스(32) 및 커버(18)를 포함할 수 있다. 커버(18)는 상판(30) 및 압축판(34)을 포함할 수 있다. 상판(30) 및 베이스(32)는 분리가능하게 결합하는 기구(40)를 포함할 수 있다. 상판(30)은 상판(30)을 수동으로 조작하기 위한 핸들(80), 기판(10) 상에 위치한 상기 바코드(미도시)에 접근하기 위한 윈도(38)를 포함할 수 있다. 상판(30)은 압축판(34)의 융기부(22)가 돌출하는 것을 허용하는 개구를 포함할 수 있다. 분리가능하게 결합하는 기구(40)는 상판(30)을 회전함으로써 결합 위치로 움직일 수 있다. 커버(18)를 상판(30) 및 압축판(34)으로 분리하는 것은 압축판(34)을 회전하지 않고 상기 상판을 회전함으로써 결합 위치로 이동시킬 수 있는 분리가능하게 결합하는 기구(40)를 위해 제공될 수 있다. 상판(30)의 회전은 혼성화 프레임(16)를 결합하기 위해 압축판(34)을 아래로 누를 수 있다. 상판(34)은 반대 방향으로 회전하고 위로 당김으로써 분리될 수 있다. 베이스(32)의 하부면은 다른 하우징의 상판 위에 하우징의 적층을 제공하는 만곡부를 포함한다. 다양한 실시예에 따르면, 도 7C는 핸들(80), 융기부(22) 및 캡(36)이 둘 이상의 하우징의 적층을 허용하기 위하여 만곡부(90)에 고정될 수 있음을 도시한다. 도 7B는 서로의 상판에 적층된 하우징을 도시한다. 다양한 실시예에 따르면, 압축판(34)은 혼성화 프레임(16)의 압축을 제공하기 위하여 불균일한 두께를 가질 수 있다. 도 7D는 불균일한 두께를 갖는 압축판(34')을 도시한다.
다양한 실시예에 따르면, 도 8은 조립되지만 체결 위치에 있지 않은 하우징을 예시한다. 압축판(34)은 베이스(32)에 위치될 수 있다. 상판(30)은 베이스(32)에 힌지될 수 있다. 상판(30)은 베이스(32)의 양 측면에 힌지된 2개 부분으로 나누어질 수 있다. 다양한 실시예에 따르면, 상판(30)은 베이스(32)의 일 측면에 힌지될 수 있거나 또는 상판은 2개 부분 이상으로 나누어질 수 있다. 상판(30)은 커버가 체결 위치까지 이동하게 되는 때 압축판(34)을 압축시키도록 리브(100)를 포함할 수 있다. 상판(30)의 2개 부분은 커버가 체결 위치에 있는 때 압축판(34)의 융기부(22)가 상판(30)을 통해서 돌출할 수 있도록 개구를 형성할 수 있다. 상판(30)과 베이스(32)는 분리가능하게 결합하는 기구(40)를 포함할 수 있다. 분리가능하게 결합하는 기구(40)는 상판(30)이 힌지부를 따라서 체결 위치로 플립되는 때 상판(30)을 베이스(32)에 클램프 시킬 수 있다. 상판(30)을 베이스(32)에 클램핑 시키는 것은 혼성화 프레임(미도시)을 결합시키기 위하여 리브(100)가 압축판(34)을 아래로 누르도록 힘을 인가할 수 있다. 상판(30)은 분리가능하게 결합하는 기구(40)를 클램핑 해제함으로써 해제될 수 있다.
다양한 실시예에 따르면, 도 9A∼도 9B는 조립되지 않은 하우징과 조립된 하우징을 각각 예시한다. 도 9A는 상판(30)과 압축판(34)을 포함하는 커버(18)와 조립하지 않은 하우징을 도시한다. 압축판(34)은 융기부(22)와 유입 포트(20)를 포함할 수 있다. 상판(30)은 폐쇄 단부를 갖는 "매치-박스"(match-box)에 유사한 5면(five sides)을 포함할 수 있다. 베이스(32)는 베이스(32)를 상판(30)으로 밀고 이로부터 당기기 위한 핸들(80)을 포함할 수 있다. 상판(30)은 리브(100)를 포함할 수 있다. 압축판(34)은 압축판(34)이 베이스(32)에 위치하는 때 그리고 베이스(32)가 체결 위치까지 상판(30)으로 밀려지는 때 상판(34)을 압박하기 위한 경사형 리브를 포함할 수 있다. 도 9B는 조립된 하우징의 측면도를 도시한다. 파선은 베이스(32)와, 압축판(34)과, 리브(100)를 포함하는 하우징의 내부를 도시한다. 상 판(30)은 융기부(22)가 상판(30) 위로 돌출하도록 허용하는 개구를 포함할 수 있다. 핸들(80)은 상판(30)의 개방 단부로부터 돌출할 수 있다. 리브(100)와 압축판(34)의 경사형 리브는 분리가능하게 결합하는 기구를 제공하고 압축판(34)을 압박할 수 있다. 베이스(32)를 상판(30)으로 미는 것은 혼성화 프레임(미도시)에 결합시키기 위하여 리브(100)가 압축판(34)을 아래로 누르도록 강제할 수 있다. 베이스(34)는 핸들(80)을 상판(30)으로부터 멀어지게 수평방향으로 당김으로써 분리될 수 있다.
다양한 실시예에 따르면, 도 10은 조립해제되면서 조립되는 하우징을 도시한다. 도 10은 상판(30)과 압축판(34)을 포함할 수 있는 커버(18)와 조립해제된 하우징을 도시한다. 상판(30)은 상판(30)을 체결 위치까지 회전시키기 위한 핸들(80)을 포함할 수 있다. 캡(36)은 혼성화 유체가 압축판(34)의 융기부(22)에 있는 유입 포트(20)를 통해서 혼성화 챔버로부터 배출하는 것을 차단할 수 있다. 상판(30)은 압축판(34)의 융기부(22)가 상술된 상판(30)을 돌출시키도록 허용하기 위한 개구를 포함할 수 있다. 베이스(32)와 상판(30)은 분리가능하게 결합하는 기구(40)를 포함할 수 있다. 분리가능하게 결합하는 기구(40)는 상판(30)을 체결 위치까지 이동시키기 위하여 상판(30)이 회전하는 때 가이드를 따라서 이동하는 프롱(prong)을 포함할 수 있다. 커버(18)를 상판(30)과 압축판(34)으로 분리시키는 것은 압축판(34)의 회전 없이 상판(30)을 회전시킴으로써 체결 위치에서 이동하게 되는 분리가능하게 결합하는 기구(40)에 적합하다. 상판(30)을 회전시키는 것은 혼성화 프레임(16)에 결합하기 위하여 압축판(34)을 아래로 누를 수 있다. 상판(34) 은 반대방향으로 회전시키고 상방으로 당김으로써 해제될 수 있다. 베이스(32)는 기판(10)의 밑면에 대한 접근경로를 제공하는 윈도(120)를 포함할 수 있다. 기판(10)의 밑면에 위치될 수 있는 바코드는 윈도(120)를 통해서 접근될 수 있다.
다양한 실시예에 따르면, 도 11은 상이한 분리가능하게 결합하는 기구를 구비한 것을 제외하고 도 6에 도시된 하우징에 유사한 조립된 하우징의 저면도를 도시한다. 베이스(32)는 기판(10)에 대한 가시적 접근(visual access)을 제공하는 개구를 포함할 수 있다. 분리가능하게 결합하는 기구(40)는 상판(30)과 베이스(32)를 체결 위치에 유지할 수 있다. 도 10은 상판(30)을 체결 위치로 이동시키도록 상판(30)이 회전하게 되는 때 가이드를 따라서 이동할 수 있는 프롱을 포함할 수 있는 분리가능하게 결합하는 기구(40)를 도시한다. 도 11은 상판(30)을 체결 위치로 이동시키도록 상판(30)이 회전하게 되는 때 가이드를 따라서 이동할 수 있는 프롱을 포함할 수 있는 분리가능하게 결합하는 기구(40)를 도시하고, 상기 가이드는 상기 프롱을 상기 가이드에 삽입하는 동안 및/또는 회전하는 동안 상판(30)과 베이스(32) 사이에서 약간의 유연성을 제공하는 가요성 탭(flexible tab)을 제공할 수 있다.
다양한 실시예에 따르면, 하우징은 배치공정 혼성화 또는 연속공정 혼성화에 적용할 수 있다. 배치공정 혼성화의 특성이 배출 포트를 부가함으로써 연속공정 혼성화에 적용될 수 있다는 것을 기술분야의 숙련된 당업자에 의해서 이해된다. 또한, 연속공정 혼성화의 특성은 배출 포트를 제거함으로써 배치공정 혼성화에 적용될 수 있다는 것도 기술분야의 숙련된 당업자에 의해서 이해된다. 또한, 배치공 정 혼성화와 연속공정 혼성화의 조합에 있어서, 이들의 특성은 적용될 수 있다는 것도 기술분야의 숙련된 당업자에 의해서 이해된다.
다양한 실시예에 따르면, 도 14∼도 16은 커버가 기판인 베이스와 직접 결합하고 있는 하우징을 포함하는 혼성화 장치를 도시한다. 기판이 베이스에 위치되는 하우징의 특성이 기판이 베이스인 하우징에 적용될 수 있다는 것이 기술분야의 숙련된 당업자에 의해서 이해된다. 또한, 기판이 베이스인 하우징의 특성이 기판이 베이스에 위치되는 하우징에 적용될 수 있다는 것도 기술분야의 숙련된 당업자에 의해서 이해된다.
다양한 실시예에 따르면, 도 14는 커버(18)와 기판(10)을 포함하는 하우징을 도시하고, 여기에서 기판은 베이스이다. 커버(18)는 윈도(150)를 포함할 수 있다. 윈도(150)는 커버(18)의 일부일 수 있거나 또는 커버(18)의 표면에 형성하는 투명재료일 수 있다. 커버(18)는 유입 포트(20)와 배출 포트(160)를 포함한다. 검출 프레임(14)(또한 혼성화 프레임임)은 커버(18)와 기판(10) 사이에 위치될 수 있다. 기판(10)은 SPR에 적합하게 개조될 수 있다. 기판(10)은 자유전자 금속을 포함한다. 기판(10)은 금속으로 제작될 수 있거나 또는 기판(10)은 금속 박막으로 피복된 지지체를 포함할 수 있다. 다양한 실시예에 따르면, 도 19(a)에 도시된 바와 같이, 기판(10)은 격자(190)에 결합될 수 있다. 다양한 실시예에 따르면, 도 19(b)에 도시된 바와 같이, 기판(10)은 프리즘(192)에 결합될 수 있다. 도 19는 플라즈몬의 진행 방향을 나타내는 입사각(θ)과 화살표를 격자 또는 프리즘에 도시한다. 다양한 실시예에 따르면, 도 14에 도시된 바와 같이, 혼성화 챔버에 있는 마이크로 어레이, 격자 또는 프리즘이 광원으로부터의 빛이 검출기에 접근하는 경로를 제공하기 위하여 윈도(150)와 정렬될 수 있다.
다양한 실시예에 따르면, 도 16은 커버(18)의 바닥을 도시한다. 커버(18)는 유입 포트(20) 또는 배출 포트(160)로부터의 혼성화 유체를 분배하거나 또는 수집할 수 있는 공동(72)을 포함할 수 있다. 다양한 실시예에 따르면, 커버(18)는 공동(72)을 갖는 유입 포트(20)를 포함할 수 있다. 공동(72)은 균일한 팽창부 또는 점층적인 팽창부를 포함할 수 있다. 공동(72)은 마이크로 어레이를 포함하는 기판의 일부 위에 혼성화 유체를 분배시킬 수 있다. 혼성화 유체의 분배는 혼성화 유체와 마이크로 어레이 사이의 균일한 접촉을 제공할 수 있다. 커버(18)는 검출 프레임(14)과 커버(18) 모두와 친화성이 있는 점착제로 검출 프레임(14)에 결합될 수 있다. 점착제는 분리가능한 결합 또는 영구적인 결합을 제공한다.
다양한 실시예에 따르면, 도 15는 기판이 베이스일 수 있는 하우징을 도시한다. 다양한 실시예에 따르면, 상술된 베이스는 도 15에 도시된 커버와 함께 사용될 수 있다. 도 15는 커버(18)가 상판(30)과 압축판(34)을 포함할 수 있다는 것을 도시한다. 상판(30)은 2개의 융기부(22)를 포함할 수 있다. 하나의 융기부(22)는 유입 포트(20)를 포함하고 다른 융기부는 배출 포트(160)를 포함한다. 압축판(34)은 혼성화 프레임(16)을 상판(30)이 기판(10)에 접촉하는 때 기판(10)에 부착될 수 있는 검출 프레임(14)에 압착한다. 도 16은 상판(30)의 바닥을 도시한다. 상판(30)은 유입 포트(20)에 인접한 분배 공동(72)을 포함할 수 있다. 분배 공동(72)은 혼성화 프레임(16)의 내부면에 위치될 수 있고 혼성화 챔버 내에서 기판(10)의 일부 위에 혼성화 액체를 분배시키기 위하여 포개어지는 폭(telescoping width)을 제공할 수 있다. 혼성화 챔버로부터 혼성화 액체를 수집하기 위하여 배출 포트(160)에 인접한 유사한 구조체일 수 있다.
다양한 실시예에 따르면, 분리가능하게 결합하는 기구는 일단 소정 압축이 달성되면 커버를 체결 위치까지 이동시키는 스프링 탭, 프롱 및 가이드, 가요성 탭을 포함할 수 있다. 이들에 부가해서, 패키징의 기술분야에서 공지된 다양한 분리가능한 패스너(fastener)는 분리가능하게 결합하는 기구로서 사용될 수 있다.
하우징의 다양한 실시예의 특성을 조합하거나 또는 선택하는 것이 하우징을 특정 응용 및 혼성화에 적합한 공정 환경에 적용할 수 있다는 것을 기술분야의 숙련된 당업자들은 이해한다. 상술된 특성들의 많은 변경은 본 설명에서 고려된다.
다양한 실시예에 따르면, 도 5A∼도 5D는 커버의 유입 포트와 융기부를 나타낸다. 도 5A∼도 5D는 상기 융기부가 커버의 상부면으로부터 돌출할 수 있다는 점에서 도 2A에 유사한 융기부를 나타낸다. 도 5A∼도 5D와 합체하여 묘사된 구조는 또한 상기 융기부가 커버의 일부일 수 있다는 점에서 도 2B와 도 2C에 도시된 융기부에 적용될 수 있다. 도 5A∼도 5D와 합체하여 묘사된 구조는 부품들을 커버로부터 분리시킨 융기부들에 적용될 수 있다. 도 5A∼도 5D와 합체하여 묘사된 구조는 융기부들이 없는 커버에서 유입 포트들에 직접 적용될 수 있다. 도 5A는 유입 포트(20)와, 충진 공동(70; filling cavity)과 분배 공동(72; dispensing cavity)을 포함하는 융기부(22)의 단면을 도시한다. 충진 공동(70)과 분배 공동(72)은 수직의 중첩부(vertical overlap) 및 약간 수평의 중첩부(slight horizontal overlap) 와 유체 접촉할 수 있다. 상기 수평의 중첩부는 충진 장비(filling device)에 적합한 정지부를 제공할 수 있다. 상기 충진 장비는 혼성화 챔버(hybridization chamber)에 혼성화 유체를 제공할 수 있지만 상기 정지부는 상기 충진 장비가 상기 분배 공동(72)과 혼성화 챔버 아래의 기판에 접촉하는 것을 방지한다.
본 명세서에서 사용된 용어 "충진 장비"는 혼성화 유체를 혼성화 챔버에 제공하기 위한 장치를 말한다. 충진 장비는 이에 한정되지는 않지만 피펫(pipette), 주사기(syringe), 튜브(tube) 및 실험실의 유체 또는 제조업의 유체를 취급하는 분야에서 공지된 다른 장비를 포함할 수 있다. 상기 충진 장비는 자동 또는 수동으로 조작될 수 있다.
도 5B는 융기부(22)의 유입 포트(20)에 위치된 충진 장비(74)의 단면을 도시한다. 유입 포트(20)는 충진 장비(74)가 아래의 기판에 접촉하는 것을 방지하기 위하여 충진 장비(74)를 억제하도록 형성될 수 있다. 유입 포트(20)는 상기 혼성화 유체에 의해서 대체된 가스가 대기로 배출하도록 허용하기 위하여 충진 장비(74) 주위에 개구를 제공하도록 형성될 수 있다. 충진 장비(74)가 억제된 상태에서, 상기 혼성화 유체는 상부 공동(76)으로 분배될 수 있다. 상기 혼성화 유체는 상부 공동(76)을 빈 상태로 남기는 혼성화 공간의 일부만을 충진한다. 도 5C는 융기부(22)의 유입 포트(20)에 위치된 충진 장비(74)의 단면을 도시한다. 융기부(22)는 상기 혼성화 유체에 의해서 대체된 가스가 대기로 배출하도록 허용하는 배출 포트(78)을 포함할 수 있다. 배출 포트(78)는 혼성화 유체의 상당한 양이 혼성화 과정동안 배출하지 않을 정도로 충분히 작은 폭을 갖도록 형성될 수 있거나 또는 유입 포트(20)와 함께 캡(36)에 의해서 덮혀질 수 있다. 도 5D는 융기부(22)의 유입 포트(20)에 위치된 충진 장비(74)의 단면을 도시한다. 유입 포트(20)는 플러그에 의해서 채워지거나 또는 캡(36)의 일부에 의해서 채워질 수 있다. 막혀진 유입 포트(20)는 충진 장비(74)를 억제하도록 형성된다. 상기 플러그 및/또는 캡은 상기 혼성화 유체에 의해서 대체된 가스를 배출하는 반면에 혼성화 프로토콜 동안 기화하는 혼성화 유체를 유지하는 기체투과성 재료로 제작될 수 있다. 융기부(22)는 충진 장비(74)가 하부의 기판에 접촉하는 것을 방지하기 위하여 충진 장비(74)가 상부 공동(76)에 삽입하기에 적합한 깊이를 제공할 수 있다. 유입 포트(20)의 길이 및/또는 폭은 충진 장비(74)가 기판에 접촉하는 것을 방지하기 위하여 형성될 수 있다. 다양한 실시예에 따르면, 커버의 다른 부분들은 상기 유입 포트가 충진 장비에 의해서 점유되는 동안 상기 혼성화 유체에 의해서 대체된 가스를 배출하도록 허용하는 배출 포트를 포함할 수 있다.
다양한 실시예에 따르면, 유입 포트는 원통형 또는 원뿔형으로 형성될 수 있다. 상기 유입 포트는 자동화된 액체 이송 장치로부터 충진 장비 팁(tip) 또는 충진 장비의 테이퍼형 팁을 수용할 수 있는 테이퍼형 홀(hole)일 수 있다. 유입 포트(또는 배출 포트)는 자동화 충진에 적합하게 밸브, 루어(Luer), 오-링 등과 같은 액체 부속품(liquid fitting)을 수용하도록 나사가공될 수 있다. 유입 포트는 캡의 일부 또는 캡으로부터 분리할 수 있는 격막(septum), 테이퍼형 플러그, 나사가공된 플러그 또는 유사한 장비로 밀폐처리될 수 있다.
다양한 실시예에 따르면, 혼성화 유체를 첨가하는 단계는 혼성화의 기술분야에서 공지된 바와 같이 여러번 세정과 시약을 추가하는 단계와 교반시키는 단계를 포함한다. 이 후에, 상기 기판은 하우징으로부터 수동으로 또는 자동으로 분리될 수 있다. 검출 챔버는 검출을 용이하게 하고 검출에 간섭할 수 있는 버블을 검출 챔버로부터 제거하기 위하여 오버레이 유체(overlay fluid)로 충진될 수 있다. 커버 슬립 또는 오버레이는 검출에 적합한 편평 광학면을 제공하도록 검출 프레임에 위치된다.
다양한 실시예에 따르면, 도 12와 도 13은 기판과 검출 챔버를 도시한다. 도 12는 마이크로 어레이(12)를 한정하는 검출 프레임(14)을 갖는 기판(10)을 도시한다. 마이크로 어레이(12)는 도 12에서와 같이 단일하거나 부분별로 나뉠 수 있다. 검출 프레임(14)은 혼성화 프레임 재료보다 더 강성인 재료로 만들어진다. 검출 프레임(14)은 마이크로 어레이(12)에 실질적으로 평행한 커버 슬립(130)이 검출 챔버에서 혼성화 유체의 검출 공간을 둘러싸는 것을 유지하도록 형성된다. 커버 슬립(130)은 검출에 적합하게 투명할 수 있고 유리 또는 플라스틱으로 제작될 수 있다. 하나의 실시예에 있어서, 검출 챔버는 2.0 내지 3.0mm의 검출 공간을 유지할 수 있다. 도 13은 격벽(140; barrier)에 의해서 분리된 마이크로 어레이(142)의 배열을 한정하는 검출 프레임(14)을 갖는 기판(10)을 도시한다. 격벽(140)은 커버 슬립을 검출 프레임(14)에 위치 설정하는 것은 검출기에 의해서 개별적으로 조사(interrogate)될 수 있는 유체적으로 격리된 챔버의 배열을 제공하도록 검출 챔버를 챔버의 배열로 나눈다.
다양한 실시예에 따르면, 도 18A ~ 도 18F는 기판과 검출 프레임의 단면을 도시한다. 도 18A ~ 도 18F는 기판(10)이 지지체(180), 접착층(182) 및 결합층(184)을 포함할 수 있다는 것을 도시한다. 마이크로 어레이(12)는 결합층(184)에 결합한다. 결합층(184)은 나일론(LYLON), 셀루로우스(cellulose), 니트로셀룰로우스(nitrocellulose), 겔(gel), 중합제(polymeric) 또는 고분자 화학의 기술분야에서 공지된 다른 기공성 멤브레인일 수 있다. 결합층(184)은 기판 지지체(180)와 접착층(182) 상에 화학기상증착을 통해서 분사되고, 적층되고, 증착되거나 또는 정전기 증착을 통해서 증착될 수 있다. 지지체(180)는 비흡착성(non-absorbent)일 수 있다. 지지체(180)는 유리, 용융된 실리카, 실리콘, 플라스틱, 금속, 세라믹 또는 중합제일 수 있다. 접착층(182)은 혼성화 챔버를 밀폐시키기 위하여 압력 민감성 아크릴 점착제와 같은 소수성(hydrophobic)일 수 있다. 검출 프레임(14)은 마이크로 어레이 또는 기판(10)에 있는 하나의 층 또는 이들 층의 계면에 점착될 수 있다. 검출 프레임(14)은 그 자체의 점착성을 통해서 또는 이러한 층들의 점착특성을 사용함으로써 이들 각각에 점착될 수 있다. 도 18A는 마이크로 어레이(12)에 점착된 검출 프레임(14)을 도시한다. 도 18B는 결합층(184)과 마이크로 어레이(12)의 계면에 점착된 검출 프레임(14)을 도시한다. 도 18C는 결합층(184)에 점착된 검출 프레임(14)을 도시한다. 도 18D는 결합층(184)과 접착층(182)의 계면에 점착된 검출 프레임(14)을 도시한다. 도 18E는 접착층(182)에 점착된 검출 프레임(14)을 도시한다. 도 18F는 접착층(182)과 지지체(180)의 계면에 점착된 검출 프레임(14)을 도시한다. 이들 점착성 접촉(adhesion contact)의 각각은 혼성화 챔버의 바닥에 적합한 밀봉을 제공한다. 다양한 실시예에 따르면, 검출 프레임(14)은 결합층(184)을 통과해서 접착층(182)에 점착될 수 있다. 지지체(180)는 접착층(182)과 결합층(184)로 피복될 수 있다. 검출 프레임(14)의 외형(outline)은 결합층(184)으로부터 분리될 수 있다. 검출 프레임(14)은 결합층이 제거된 접착층(182)에 위치설정될 수 있다.
다양한 실시예에 따르면, 결합층(184)은 투명하거나 또는 불투명할 수 있다. 결합층(184)은 불투명화하거나 검출 동안 빛의 흡수를 증가시키기 위하여 흑화될 수 있다. 흡수량을 증가시키는 것은 결합층(184)에 의한 빛의 반사량을 감소시키고 검출기에 노이즈 신호를 발생시키는 빛을 감소시킨다. 결합층(184)은 카본 블랙을 그의 조성물에 첨가함으로써 흑화될 수 있다. 결합층(184)은 투명하거나 불명한 특성의 다수의 층을 포함할 수 있다.
다양한 실시예에 따르면, 혼성화 방법은 커버를 포함하는 하우징을 제공하는 단계와, 마이크로 어레이를 포함하는 기판을 제공하는 단계와, 프레임과 상기 기판의 일부를 포함하는 혼성화 챔버를 제공하는 단계와, 상기 마이크로 어레이 상에 혼성화 유체를 분배하는 단계와, SPR에 의해 혼성화를 검출하는 단계를 포함할 수 있다. 상기 기판을 제공하는 단계는 상기 기판에 격자를 결합하는 단계를 포함할 수 있다. 상기 기판을 제공하는 단계는 상기 기판에 프리즘을 결합시키는 단계를 포함할 수 있다.
다양한 실시예에 따르면, 혼성화 방법은 베이스와 커버를 포함하는 하우징을 제공하는 단계와, 마이크로 어레이를 포함하는 기판을 제공하는 단계와, 프레임과 상기 기판의 일부를 포함하는 혼성화 챔버를 제공하는 단계와, 상기 혼성화 챔버를 밀폐시키고 상기 프레임을 압박하기 위하여 상기 베이스에 상기 커버를 분리가능하게 결합시키는 단계를 포함할 수 있다. 상기 분리가능하게 결합시키는 단계는 상기 커버를 체결 위치까지 아래로 가압하고 슬라이딩시키는 단계와, 상기 커버를 체 결 위치까지 아래로 가압하고 클램핑시키는 단계와, 상기 커버를 체결 위치까지 회전시키는 단계와, 상기 베이스를 체결 위치까지 슬라이딩시키는 단계를 포함할 수 있다. 상기 커버는 힌지부(hinged portion)을 포함하여, 상기 분리가능하게 결합시키는 단계는 상기 힌지부를 체결 위치까지 플립(flip)시키고 클램핑시키는 단계를 포함할 수 있다.
다양한 실시예에 따르면, 혼성화 방법은 혼성화 유체를 혼성화 공간에 제공하는 단계와, 상기 유체를 상기 마이크로 어레이로 혼성화시키는 단계와, 상기 커버와 베이스를 분리시키는 단계와, 상기 혼성화 프레임을 제거하는 단계와, 상기 검출 공간을 밀폐시키도록 상기 검출 프레임 위에 커버를 위치시키는 단계와, 상기 마이크로 어레이에서의 혼성화 결과를 검출하는 단계를 포함할 수 있다. 상기 방법은 상기 기판을 베이스 내에 위치시키는 단계와, 상기 혼성화 프레임을 상기 검출 프레임에 근접해서 위치시키는 단계와, 상기 커버와 베이스를 분리가능하게 결합시키는 단계를 포함할 수 있다.
본 명세서와 첨부된 청구범위의 목적을 위하여, 다른 방식으로 표시되지 않았다면, 본 명세서와 청구범위에 사용된 수량, 백분율 및 다른 수치값을 나타내는 모든 숫자는 모든 경우에서 용어 "약"에 의해서 수정될 수 있는 것으로 이해되어야 한다. 따라서, 반대로 표시되지 않았다면, 하기 명세서 및 첨부된 청구범위에 개시된 수치적 매개변수는 본 발명에 의해서 얻어지리라 생각되었던 소정의 특성에 따라서 변할 수 있는 것으로 근접하게 된다. 적어도 청구범위의 요지에 등가의 적용을 한정하는 것으로 의도하지 않은 것으로서, 각 수치적 매개변수는 보고된 유효 숫자(significant digit)의 수치적 관점에서 그리고 보통의 라운딩 테크닉(rounding technique)을 적용함으로써 적어도 해석할 수 있어야 한다.
본 발명의 폭넓은 요지를 개시하는 수치적 범위와 매개변수들이 근사치인 것에도 불구하고 명시된 실시예에 개시된 수치적 값들은 가능한 한 정확한 것으로 보고된다. 어떤 수치적 값은, 그러나, 그들의 개별적인 테스팅 수단에서 발견된 표준편차(standard deviation)로부터 필연적으로 파생하는 특정 오류(error)를 본질적으로 포함한다. 또한, 본 명세서에서 개시된 모든 범주는 본 명세서에서 포함된 모든 서브범주를 포함하는 것으로 이해되어야 한다. 예를 들어, "1 내지 10"의 범주는 1의 최소값과 10의 최대값 사이의 (그리고 이들을 포함하는) 모든 서브범주, 즉 1 이상의 최고값과 10 이하의 최대값을 갖는 모든 서브범주, 예를 들어 5.5 내지 10을 포함한다.
본 명세서와 첨부된 청구범위에서 사용된 바와 같이, 단수 형태는 하나의 지시 대상물로 명백하게 한정되지 않는다면 복수의 지시 대상물을 포함한다. 따라서, 예를 들어, "하나의 기판"에 대한 언급은 2개 이상의 기판을 포함한다. 본 명세서에서 사용된 바와 같이, 용어 "포함하다"와 그의 문법적 변형은 비제한적으로 의도되어, 리스트 또는 다른 방식에서 품목의 인용은 리스트된 품목에 대체되거나 또는 부가될 수 있는 다른 유사한 품목을 배제하려는 것은 아니다.
다양한 수정 및 변형은 본 발명 교시의 사상 또는 요지로부터 벗어나지 않고 본 명세서에 기재된 다양한 실시예에 대해 수행될 수 있다는 것을 기술분야의 숙련 된 당업자들에게 명백할 것이다. 따라서, 본 명세서에 기재된 다양한 실시예들은 첨부된 청구범위의 요지와 그의 등가 내에서 다른 수정 및 변형을 포함한다.

Claims (35)

  1. 기판;
    제 1 압축성의 탄성 물질로 구성되며, 직선형, 각진형, 원형, 타원형 또는 이들의 조합을 포함하는 형상을 갖는 검출 프레임-상기 검출 프레임은 검출 챔버를 형성하기 위해 상기 기판 상에 위치됨-; 및
    제 2 압축성의 탄성 물질로 구성되며, 직선형, 각진형, 원형, 타원형 또는 이들의 조합을 포함하는 형상을 갖는 혼성화 프레임-상기 혼성화 프레임은 상기 혼성화 챔버를 형성하기 위해 상기 검출 프레임에 인접하여 위치됨-을 포함하고,
    여기서 검출 프레임과 혼성화 프레임의 위치는 각각 동일한 폭을 갖거나 또는 둘중 하나가 넓은 상태에서 일측의 상판에 일체로 있도록 상호 접하거나, 동일한 중심을 갖거나 둘 중 하나가 중심에서 벗어나 있는 상태에서 측면으로 서로 접촉하도록 서로 인접하거나, 서로 인접하지 않지만 일측을 둘러싸는 타측과 근거리로 떨어져 있도록 서로 인근에 위치하는 것을 포함하는 혼성화 장치.
  2. 제1항에 있어서,
    상기 기판과 상기 혼성화 챔버에 적합한 하우징을 더 포함하고, 상기 하우징은 베이스와 커버를 포함하고 있는 혼성화 장치.
  3. 제2항에 있어서,
    상기 베이스와 상기 커버는 상기 혼성화 챔버를 밀폐시키기 위하여 분리가능하게 결합하고 있는 혼성화 장치.
  4. 제2항에 있어서,
    상기 혼성화 프레임은 압축가능하고 상기 커버와 함께 밀폐를 형성할 수 있는 혼성화 장치.
  5. 제4항에 있어서,
    상기 커버는 압축판을 포함하고 있는 혼성화 장치.
  6. 제2항에 있어서,
    상기 커버는 융기부를 포함하고 있는 혼성화 장치.
  7. 제6항에 있어서,
    상기 융기부는 유입 포트를 포함하고 있는 혼성화 장치.
  8. 제7항에 있어서,
    상기 유입 포트는 충진 장비가 상기 기판에 접촉하는 것을 방지하는 혼성화 장치.
  9. 제6항에 있어서,
    상기 융기부는 상기 커버의 상부면으로부터 돌출하고 있는 혼성화 장치.
  10. 제6항에 있어서,
    상기 융기부는 상기 커버의 일부인 혼성화 장치.
  11. 제2항에 있어서,
    상기 하우징은 윈도를 더 포함하고, 상기 윈도는 상기 기판에 부착된 바코드에 대한 접근경로를 제공하는 혼성화 장치.
  12. 제2항에 있어서,
    상기 커버는 혼성화 유체 관통유로에 적합한 유입 포트와 배출 포트를 포함하고 있는 혼성화 장치.
  13. 제1항에 있어서,
    홀더와 뚜껑으로 구성된 기구를 더 포함하는 혼성화 장치.
  14. 제13항에 있어서,
    상기 홀더와 뚜껑은 상기 혼성화 챔버를 밀폐시키기 위하여 근접하고 있는 혼성화 장치.
  15. 제1항에 있어서,
    상기 기판의 일부는 상기 마이크로 어레이를 포함하는 혼성화 장치.
  16. 제1항에 있어서,
    상기 혼성화 프레임은 상기 검출 프레임 상에 위치되는 혼성화 장치.
  17. 제1항에 있어서,
    상기 제 1 압축성 탄성 물질은 상기 제 2 압축성 탄성 물질보다 더 강성인 혼성화 장치.
  18. 제17항에 있어서,
    상기 검출 챔버는 다수의 격벽을 포함하고, 상기 다수의 격벽은 챔버 어레이를 형성하고, 상기 챔버 어레이는 마이크로 어레이의 배열과 유체 접촉하고 있는 혼성화 장치.
  19. 베이스와 커버를 포함하는 하우징과;
    마이크로 어레이를 포함하는 기판-상기 기판은 상기 베이스 내에 위치됨-과;
    프레임과 상기 기판의 일부를 포함하는 혼성화 챔버로 이루어지고,
    상기 커버는 상기 혼성화 챔버를 밀폐시키기 위하여 상기 베이스와 분리가능하게 결합하고,
    상기 커버는 충진 장비가 상기 마이크로 어레이와 접촉하는 것을 방지하기 위한 유입 포트를 포함하고 있는 혼성화 장치.
  20. 제19항에 있어서,
    상기 커버는 상기 혼성화 챔버 위에 위치된 융기부를 포함하고 있는 혼성화 장치.
  21. 제20항에 있어서,
    상기 융기부는 상기 유입 포트를 포함하고 있는 혼성화 장치.
  22. 제21항에 있어서,
    상기 융기부는 충진 공동과 분배 공동을 포함하고, 상기 충진 공동과 분배 공동은 상기 충진 장비가 상기 기판의 일부에 접촉하는 것을 방지하도록 정렬되어 있는 혼성화 장치.
  23. 제19항에 있어서,
    상기 유입 포트는 상기 충진 장비가 상기 기판에 접촉하는 것을 방지하기 위하여 상기 충진 장비를 억제하도록 형성되어 있는 혼성화 장치.
  24. 베이스와 커버를 포함하는 하우징을 제공하는 단계와;
    마이크로 어레이를 포함하는 기판을 제공하는 단계와;
    프레임과 상기 기판의 일부를 포함하는 혼성화 챔버를 제공하는 단계와;
    상기 혼성화 챔버를 밀폐시키고 상기 프레임을 압박하기 위하여 상기 커버를 상기 베이스에 분리가능하게 결합시키는 단계로 이루어진 혼성화 방법.
  25. 제24항에 있어서,
    분리가능하게 결합시키는 단계는 상기 커버를 체결 위치까지 아래로 압박하고 슬라이딩시키는 단계를 포함하는 방법.
  26. 제24항에 있어서,
    분리가능하게 결합시키는 단계는 상기 커버를 체결 위치까지 아래로 압박하고 클램핑시키는 단계를 포함하는 방법.
  27. 제24항에 있어서,
    분리가능하게 결합시키는 단계는 상기 커버를 체결 위치까지 회전시키는 단계를 포함하는 방법.
  28. 제24항에 있어서,
    분리가능하게 결합시키는 단계는 상기 베이스를 체결 위치까지 슬라이딩시키 는 단계를 포함하는 방법.
  29. 제24항에 있어서,
    상기 커버는 힌지부를 포함하고, 분리가능하게 결합시키는 단계는 상기 힌지부를 체결 위치까지 플리핑시키고 클램핑시키는 단계를 포함하는 방법.
  30. 베이스와 커버를 포함하는 하우징-상기 베이스와 커버는 분리가능하게 결합됨- 과;
    마이크로 어레이를 포함하는 기판-상기 하우징은 상기 기판을 격납시키도록 형성됨- 과;
    제 1 압축성의 탄성 물질로 구성되며, 직선형, 각진형, 원형, 타원형 또는 이들의 조합을 포함하는 형상을 갖는 검출 프레임- 상기 검출 프레임은 검출 공간을 형성하기 위해 상기 기판 상에 위치됨- 과;
    제 2 압축성의 탄성 물질로 구성되며, 직선형, 각진형, 원형, 타원형 또는 이들의 조합을 포함하는 형상을 갖는 혼성화 프레임- 상기 혼성화 프레임, 상기 기판 및 상기 커버는 혼성화 공간을 형성함-을 포함하고,
    여기서 상기 혼성화 공간 및 상기 검출 공간은 상기 마이크로 어레이와 유체 접촉하고 있는 혼성화 장치.
  31. 제30항의 장치를 사용하는 혼성화 방법에 있어서,
    혼성화 유체를 상기 혼성화 공간에 제공하는 단계와;
    상기 유체를 상기 마이크로 어레이로 혼성화시키는 단계와;
    상기 커버와 베이스를 분리시키는 단계와;
    상기 혼성화 프레임을 제거하는 단계와;
    상기 검출 공간을 밀폐시키기 위하여 상기 검출 프레임 위에 상기 커버를 위치시키는 단계와;
    상기 마이크로 어레이 상에서의 혼성화로부터 결과를 검출하는 단계로 이루어진 혼성화 방법.
  32. 제30항의 장치를 조립하는 방법에 있어서,
    상기 기판을 상기 베이스 내에 위치시키는 단계와;
    상기 혼성화 프레임을 상기 검출 프레임에 근접해서 위치시키는 단계와;
    상기 커버와 상기 베이스를 분리가능하게 결합시키는 단계로 이루어진 조립방법.
  33. 마이크로 어레이를 포함하는 기판-상기 기판은 결합층과 지지체를 포함함-과;
    프레임과 상기 기판의 일부를 포함하는 혼성화 챔버-상기 프레임은 상기 결합층을 통해서 상기 지지체 상에 위치됨-로 이루어지고,
    상기 결합층은 흡수용 흑화제를 포함하고 있는 혼성화 장치.
  34. 제33항에 있어서,
    상기 기판과 혼성화 챔버에 적합한 하우징을 더 포함하고, 상기 하우징은 베이스와 커버를 포함하고 있는 혼성화 장치.
  35. 제34항에 있어서,
    상기 베이스와 상기 커버는 상기 혼성화 챔버를 밀폐시키기 위하여 분리가능능하게 결합하는 혼성화 장치.
KR20057022949A 2003-05-30 2004-05-28 혼성화 및 에스피알 검출을 위한 장치 및 방법 KR100706464B1 (ko)

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US10/448,803 2003-05-30
US10/448,856 2003-05-30
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US10/448,803 US20040241659A1 (en) 2003-05-30 2003-05-30 Apparatus and method for hybridization and SPR detection

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