KR100504004B1 - Composition for diagnosis of male infertility comprising primers detecting single nucleotide polymorphism at 677th nucleotide of 5,10-methylenetetrahydrofolate reductase gene - Google Patents

Composition for diagnosis of male infertility comprising primers detecting single nucleotide polymorphism at 677th nucleotide of 5,10-methylenetetrahydrofolate reductase gene Download PDF

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Abstract

본 발명은 남성불임 진단용 조성물에 관한 것이다.The present invention relates to a composition for diagnosing male infertility.

본 발명의 조성물은 MTHFR 유전자의 677번 뉴클레오티드를 포함하는 염기서열의 PCR에 사용할 수 있는 프라이머 세트를 포함하며, 상기 프라이머 세트를 사용하여 얻은 PCR 생성물의 파이로시퀀싱에 사용할 수 있는 시퀀스 프라이머를 추가로 포함할 수 있다.The composition of the present invention includes a primer set that can be used for PCR of a nucleotide sequence including 677 nucleotides of the MTHFR gene, and further comprises a sequence primer that can be used for pyro sequencing a PCR product obtained using the primer set. It may include.

본 발명의 조성물이 검출할 수 있는 MTHFR의 677 C->T SNP는 원인불명성 무정자증 및 심각한 희소무력기형정자증의 가능성을 나타내는 유전적 지표가 된다.The 677 C-> T SNPs of MTHFR detectable by the compositions of the present invention are genetic indicators indicating the likelihood of unexplained atherosclerosis and severe rare atresia.

따라서, 본 발명의 조성물은 불임질환의 진단 및 치료방향 설정에 유용하게 사용될 수 있다. Therefore, the composition of the present invention can be usefully used for setting the direction of diagnosis and treatment of infertility diseases.

Description

메틸렌테트라하이드로폴레이트 환원효소 유전자의 677번 뉴클레오티드 위치의 단일 염기 다형성을 검출할 수 있는 프라이머를 포함하는 남성불임 진단용 조성물 {Composition for diagnosis of male infertility comprising primers detecting single nucleotide polymorphism at 677th nucleotide of 5,10-methylenetetrahydrofolate reductase gene}Composition for diagnosis of male infertility comprising primers detecting single nucleotide polymorphism at 677th nucleotide of 5,10 -methylenetetrahydrofolate reductase gene}

본 발명은 남성불임 진단용 조성물에 관한 것이다.The present invention relates to a composition for diagnosing male infertility.

남성불임은 증상의 종류, 원인 및 예후가 매우 다양하여, 정확한 진단 및 치료가 어렵다.Male infertility has a wide variety of symptoms, causes, and prognosis, making it difficult to accurately diagnose and treat.

국제보건기구(WHO: World Health Organization)의 기준에 따르면, 남성불임은 무정자증(azoospermia), 희소정자증(oligospermia), 무력정자증(astheno spermia), 기형정자증(tetrazoospermia), 그리고 각 증상의 복합발생 및 중증도에 따라 희소무력기형정자증(OAT : oligoasthenotetrazoospermia), 심각한 무력기형정자증(severe OAT) 등의 다양한 임상적 증상으로 나타나며, 실제 가장 빈번하게 나타나는 증상은 무정자증, 희소무력기형정자증, 심각한 희소무력기형정자증으로 요약된다.According to the World Health Organization (WHO), male infertility is characterized by azoospermia, oligospermia, astheno spermia, tetrazoospermia, and a combination of symptoms. According to the incidence and severity, various clinical symptoms such as oligoasthenotetrazoospermia (OAT) and severe Severe OAT are shown.Indeed, the most frequent symptoms are spermatosis, rarely deformed spermosis, and severe It is summarized as rare armed anomaly.

무정자증은 사정액 내에 정자가 없는 증상을 의미한다.Aspermatosis refers to a condition in which no sperm is present in the ejaculate.

희소무력기형정자증은 정자의 양이 20*106개 이하인 경우, 운동성(motility)이 정상보다 50% 이하인 경우, 정자기형(molphology)이 4%이상인 경우로써, 이 세가지가 복합적으로 원인이 된다.Rare anomaly spermosis occurs when the amount of sperm is less than 20 * 10 6 , the motility is less than 50% than normal, and the sperm malformation is 4% or more. .

심각한 희소무력기형정자증은 20*106개 이하의 정자를 가지며, 운동성과 형태성이 일반적인 희소무력기형정자증보다 낮은 경우에 내려지는 진단이다.Severe rare dysmorphic spermosis is diagnosed when the sperm has less than 20 * 10 6 sperm and the motility and morphology are lower than that of the common rare disorder.

이처럼 다양한 증상으로 나타나는 남성불임은 그 원인도 다양하며, 유전적 이상(aberration)으로 인한 불임은 전체의 30% 이상을 차지하는 것으로 알려져 있다.Male infertility, which is caused by a variety of symptoms, has various causes, and infertility due to genetic aberration is known to account for more than 30% of the total.

인간의 게놈은 수십만 개의 유전자를 가지고 있으며, 이중 1000여 개 정도의 유전자가 인간의 생식상태를 조절하는 것으로 알려져 있다. 단일유전자의 돌연변이는 생식의 문제들을 일으킬 수 있으나, 한편으로는 배계열 발생(germline development), 남성의 생식선 발달 및 신체적 발달 등은 복잡한 유전적 네트워크에 의해 조절된다.The human genome contains hundreds of thousands of genes, of which about 1,000 genes are known to regulate human reproduction. Monogene mutations can cause reproductive problems, while germline development, gonad development and physical development in men are regulated by complex genetic networks.

유전적 이상은 인간의 정자형성(spermatogenesis) 동안에 일어나며, 현재까지 알려진 바로는 염색체의 수적 또는 구조적 이상(chromosome disorder)을 들 수 있다.Genetic abnormalities occur during spermatogenesis in humans and, to date, are known as numerical or structural abnormalities of chromosomes.

불임남성에서 나타나는 가장 흔한 염색체의 수적 이상은 47,XXY, 또는 모자이크 형태의 46,XY/47XXY 로 특징지어지는 클라인펠터 증후군(Klinefelter syndrome)으로, X염색체의 유사분열시 염색체 비분리 현상(non-disjunction)에 의해 일어나며, 고환의 크기가 작고 무정자증을 나타내는 것이 특징이다. 한편 염색체의 구조적인 이상으로는, 결실(deletion), 중복(duplication), 역위(inversion) 등 염색체의 손상 등을 들 수 있다.The most common numerical abnormality of chromosomes in infertile men is Klinefelter syndrome, which is characterized by 47, XXY, or 46, XY / 47XXY in mosaic form, with non-chromosome segregation during mitosis of the X chromosome. caused by disjunction), characterized by small testicle size and spermatosis. On the other hand, structural abnormalities of chromosomes include damage to chromosomes such as deletion, duplication and inversion.

Y 염색체의 부분 결실(Y-chromosome microdeletion) 또한 남성불임의 많은 원인을 차지한다. Partial deletion of the Y chromosome (Y-chromosome microdeletion) also accounts for many causes of male infertility.

Y 염색체는 단완의 진정염색질 부분(Yp11), 장완의 진정염색질 부분(Yq11), 장완의 이질 염색질 부분(Yq12)의 3부분으로 구성되며, 이들은 남성 생식에 있어 각각 다른 기능을 수행하는 유전자들을 포함하고 있다. Y 염색체의 어느 부위에 결실이 일어났는가에 따라 불임증상 또한 다양하게 나타난다.The Y chromosome consists of three parts, the chromosomal portion of the forearm (Yp11), the chromosomal portion of the forearm (Yq11), and the heterochromatic portion of the forearm (Yq12), which contain genes that perform different functions in male reproduction. Doing. Infertility also depends on which part of the Y chromosome has been deleted.

그 예로, Y 염색체의 장완(Yq11) 부위의 AZF(azoospermic factor) 위치에서 DAZ(Deleted in Azoospermia) 유전자의 미세결실이 일어나면 정자형성과정에 문제가 발생한다. 또한 AZFa 결실 환자는 생식세포(germ cell)가 존재하지 않으며, AZFb 결실 환자는 정자 형성 전의 돌연변이 억제 또는 감수분열(meiosis) 억제를 나타내고, AZFc에서의 결실은 무정자증 또는 심각한 희소정자증과 관련이 있다. For example, microdeletion of the DAZ (Deleted in Azoospermia) gene occurs at the AZF (azoospermic factor) position of the Y chromosome of the Y chromosome. In addition, AZFa-deleted patients do not have germ cells, and AZFb-deleted patients show mutational suppression or meiosis inhibition before spermatogenesis, and deletions in AZFc are associated with atherosclerosis or severe rare spermosis. .

이와 같이 남성불임은 다양한 유전적 원인에 의해 야기되므로, 특정한 불임 증상을 유발하는 유전적 기작이 밝혀져야 해당 불임 증상의 정확한 진단 및 치료가 가능하다.As such, male infertility is caused by a variety of genetic causes, the genetic mechanism that causes a particular infertility symptoms must be revealed to accurately diagnose and treat the infertility symptoms.

그러나 염색체 이상 또는 결실을 제외하고는 아직까지 특정 유전자와 특정 불임 증상 간의 상관관계에 대해 제대로 알려진 바가 없다. 따라서 현재는 특정 불임 증상의 유전적 특성을 고려하지 않은 채, 일반적인 기준에 의해 불임의 진단 및 치료가 행해질 수 밖에 없다. 실제로 남성불임의 상당한 부분을 차지하는 무정자증, 희소무력기형정자증, 심각한 희소무력기형정자증은 원인불명으로 진단되는 경우가 많아, 적절한 치료가 이루어지지 못하는 실정이다.However, apart from chromosomal aberrations or deletions, the correlation between specific genes and specific infertility symptoms is not well known. Therefore, at present, diagnosis and treatment of infertility can only be performed by general criteria without considering the genetic characteristics of specific infertility symptoms. Indeed, a significant proportion of male infertility, rare armed deformity spermosis, severe rare deformity spermosis is often diagnosed as unknown cause, the situation is not adequate treatment.

이에 본 발명에서는 호모시스테인 대사에 관여하는 MTHFR 677 변이 유전자형이 일반적 남성불임과 관련이 있다는 연구결과(Bezord et al., Homozygous Methylenetetrahydrofolate Reductase C677T Mutation and Male Infertility. N Engl J Med 15:1172; 2001)에 착안하여, 상기 유전자의 SNP를 검출함으로써 특정 불임 증상의 정확한 진단 및 치료방향 설정을 가능하게 하는 조성물을 발명하였다.Therefore, in the present invention, MTHFR 677 mutation genotype involved in homocysteine metabolism is associated with general male infertility (Bezord et al., Homozygous Methylenetetrahydrofolate Reductase C677T Mutation and Male Infertility.N Engl J Med 15: 1172; 2001) By inventing the SNPs of the genes, a composition has been invented that enables accurate diagnosis and setting of treatment directions for specific infertility symptoms.

본 발명에서는 MTHFR 유전자의 677번 뉴클레오티드의 SNP를 확인함으로써,원인불명성 무정자증 및 심각한 희소무력기형정자증의 정확한 진단 및 치료방향 설정을 가능하게 하는 조성물을 제공하고자 한다.In the present invention, by identifying the SNP of 677 nucleotides of the MTHFR gene, it is intended to provide a composition that enables the accurate diagnosis and treatment direction of cause unknown spermatosis and severe rare atypical spermatosis.

본 발명은 MTHFR(5,10-methylenetetrahydrofolate reductase) 유전자의 677번 뉴클레오티드(nucleotide) 위치의 SNP(single nucleotide polymorphism: 단일 염기 다형성)를 검출할 수 있는 프라이머(primer)를 포함하는 남성불임 진단용 조성물을 제공한다.The present invention provides a composition for diagnosing male infertility comprising a primer capable of detecting a single nucleotide polymorphism (SNP) at a nucleotide 677 position of a MTHFR (5,10-methylenetetrahydrofolate reductase) gene. do.

본 발명의 조성물은 MTHFR 유전자의 677번 뉴클레오티드를 포함하는 염기서열의 PCR(polymerase chain reaction)에 사용할 수 있는 프라이머 세트를 포함한다.The composition of the present invention includes a primer set that can be used for PCR (polymerase chain reaction) of a nucleotide sequence including 677 nucleotides of the MTHFR gene.

본 발명의 조성물이 포함하는 프라이머 세트는 파이로시퀀싱 (pyrosequencing) 또는 RFLP(Restriction fragment length polymorphism) 분석에 사용될 MTHFR 유전자의 일부분을 증폭하는데 사용된다.The primer set included in the composition of the present invention is used to amplify a portion of the MTHFR gene to be used for pyrosequencing or restriction fragment length polymorphism (RFLP) analysis.

파이로시퀀싱을 위해 사용되는 프라이머 세트의 정방향 프라이머는 구체적으로 서열번호 1의 염기서열을 가지며, 역방향 프라이머는 구체적으로 서열번호 2의 염기서열을 가진다. The forward primer of the primer set used for pyro sequencing specifically has the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 1, the reverse primer specifically has the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 2.

RFLP를 위해 사용되는 프라이머 세트 중 정방향 프라이머는 구체적으로 서열번호 3의 염기서열을 가지며, 역방향 프라이머는 구체적으로 서열번호 4의 염기서열을 가진다.In the primer set used for the RFLP, the forward primer specifically has a nucleotide sequence of SEQ ID NO: 3, and the reverse primer specifically has a nucleotide sequence of SEQ ID NO: 4.

본 발명의 조성물은 상기 프라이머 세트를 사용하여 얻은 PCR 생성물의 파이로시퀀싱에 사용할 수 있는 시퀀스 프라이머를 추가로 포함할 수 있다.The composition of the present invention may further comprise a sequence primer that can be used for pyro sequencing the PCR product obtained using the primer set.

본 발명의 조성물이 포함하는 시퀀스 프라이머는 구체적으로 서열번호 5의 염기서열을 가진다.The sequence primer included in the composition of the present invention specifically has a nucleotide sequence of SEQ ID NO.

본 발명의 조성물에서 프라이머들은 안정성을 유지하기 위해, 분말 상태 또는 증류수나 적절한 완충액에 용해된 상태로 제공될 수 있다. 또한 이후의 실험단계를 위한 정제과정의 효율 및 편리성을 높이기 위해, 바이오틴(biotin) 등을 부착시킬 수 있다.Primers in the composition of the present invention may be provided in a powder state or dissolved in distilled water or a suitable buffer to maintain stability. In addition, in order to increase the efficiency and convenience of the purification process for the subsequent experimental step, biotin (biotin) can be attached.

본 발명의 조성물은 상기 프라이머들 이외에도, 필요에 따라 PCR 반응, 파이로시퀀싱, RFLP 분석에 요구되는 성분들로 이루어질 수 있다.In addition to the primers, the composition of the present invention may be composed of components required for PCR reaction, pyro sequencing, and RFLP analysis, as necessary.

구체적으로 PCR 반응에 요구되는 성분은 dNTP(deoxynucleotide triphosphate), 내열성 중합효소(polymerase), 염화마그네슘 등의 금속이온염 등이 될 수 있고, 시퀀싱에 요구되는 성분은 dNTP, 시쿼나제(Sequenase) 등이 될 수 있으며, RFLP에 필요한 성분은 Hinf1 등의 DNA 제한효소, 효소반응을 위한 완충액 등이 될 수 있다.Specifically, the components required for the PCR reaction may be metal ion salts such as deoxynucleotide triphosphate (dNTP), heat resistant polymerase, magnesium chloride, and the like, and the components required for sequencing include dNTP and sequinase. The components required for RFLP may be DNA restriction enzymes such as Hinf1, buffers for enzyme reactions, and the like.

또한 본 발명의 조성물에는 필요에 따라 각 성분들을 혼합하는데 사용될 튜브, 사용방법을 기재한 지시자료 등이 추가될 수 있다.In addition, the composition of the present invention may be added to the tube to be used for mixing each component, instructions for describing how to use, if necessary.

본 발명의 조성물이 진단할 수 있는 남성불임은 원인불명성 무정자증 또는 원인불명성의 심각한 희소무력기형정자증이다.Male infertility that the compositions of the present invention can be diagnosed is either unexplained atherosclerosis or severe rare atresia of etiology.

본 발명은 불임이 의심되는 남성의 MTHFR 유전자의 677번 뉴클레오티드가 시토신/시토신(C/C), 시토신/티민(C/T), 또는 티민/티민(T/T) 중 어떤 SNP를 나타내는지를 확인하는 방법을 제공한다.The present invention is to determine whether the 677 nucleotides of the MTHFR gene of male suspected of infertility, which SNP of cytosine / cytosine (C / C), cytosine / thymine (C / T), or thymine / thymine (T / T) Provide a way to.

본 발명의 방법에 의해 MTHFR의 677번 위치의 SNP를 확인할 때는, 구체적으로 파이로시퀀싱 또는 RFLP법 중 하나 이상을 사용할 수 있다.When identifying the SNP at position 677 of the MTHFR by the method of the present invention, one or more of pyro sequencing or RFLP method may be specifically used.

파이로시퀀싱법을 사용할 때는, 불임남성으로부터 분리한 DNA를 주형으로 하고 본 발명의 조성물에 포함된 프라이머 세트를 이용하여 PCR 반응을 수행함으로써, MTHFR의 677번 뉴클레오티드가 포함된 염기서열 일부분을 증폭한다.When using the pyro sequencing method, a portion of the nucleotide sequence containing 677 nucleotides of MTHFR is amplified by PCR using a primer set included in the composition of the present invention as a template using DNA isolated from infertility males. .

상기에서 얻은 PCR 생성물과 본 발명의 조성물에 포함된 시퀀스 프라이머를 어닐링시킨 후, 파이로시퀀싱을 수행함으로써 677번 뉴클레오티드의 SNP가 일어났는지를 확인한다.After annealing the PCR product obtained above and the sequence primer included in the composition of the present invention, pyro sequencing was performed to determine whether SNP of 677 nucleotides occurred.

본 발명에서 PCR 반응에 사용되는 프라이머 세트는 PCR의 효율을 높이기 위해, 677번 뉴클레오티드를 기준으로 하여 좌우 50∼100개 정도의 뉴클레오티드를 증폭할 수 있도록 제조된 것을 사용한다. 구체적으로 정방향 프라이머는 서열번호 1의 염기서열을 가지고, 역방향 프라이머는 서열번호 2의 염기서열을 가지는 것이 바람직하다.In the present invention, the primer set used in the PCR reaction is prepared to amplify about 50-100 nucleotides on the left and right on the basis of 677 nucleotides in order to increase the efficiency of PCR. Specifically, the forward primer has a nucleotide sequence of SEQ ID NO: 1, the reverse primer preferably has a nucleotide sequence of SEQ ID NO: 2.

본 발명에서 파이로시퀀싱에 사용되는 시퀀스 프라이머는 시퀀싱의 정확도를 높일 수 있도록, 상기 프라이머 세트를 사용하여 얻은 PCR 생성물의 염기서열 중에서 677번 뉴클레오티드의 5' 방향으로 10∼30개 뉴클레오티드 정도의 간격을 두고 위치하는 서열을 선택한다. 구체적으로 시퀀스 프라이머는 서열번호 3의 염기서열을 가지는 것이 바람직하다.In the present invention, the sequence primer used for pyro sequencing is spaced about 10 to 30 nucleotides in the 5 'direction of 677 nucleotides in the nucleotide sequence of the PCR product obtained using the primer set to increase the accuracy of sequencing. Select the sequence to be placed. Specifically, the sequence primer preferably has a nucleotide sequence of SEQ ID NO: 3.

RFLP법을 사용할 때는, 시료로부터 분리한 DNA를 주형으로 하고 본 발명의 조성물에 포함된 프라이머 세트를 이용하여 PCR 반응을 수행함으로써, MTHFR의 677번 뉴클레오티드가 포함된 염기서열 일부분을 증폭한다. When using the RFLP method, a DNA sequence isolated from a sample is used as a template, and a PCR reaction is performed using a primer set included in the composition of the present invention, thereby amplifying a portion of the nucleotide sequence including 677 nucleotides of MTHFR.

상기에서 얻은 PCR 생성물에 적절한 DNA 제한효소(restriction enzyme)를 첨가하여 반응시킨 후, DNA의 절단 여부를 확인한다. After the reaction by adding the appropriate DNA restriction enzyme (restriction enzyme) to the PCR product obtained above, and check the DNA cleavage.

본 발명에서 PCR 반응에 사용되는 프라이머 세트는 PCR의 효율을 높이면서도 DNA 절단 여부의 확인이 가능해야 하므로, 677번 뉴클레오티드를 포함하여 200개 정도의 뉴클레오티드를 증폭할 수 있도록 제조된 것을 사용한다. 구체적으로 정방향 프라이머는 서열번호 4의 염기서열을 가지며, 역방향 프라이머는 서열번호 5의 염기서열을 가지는 것이 바람직하다.Primer set used in the PCR reaction in the present invention should be able to confirm whether the DNA cleavage while increasing the efficiency of the PCR, using the one prepared to amplify about 200 nucleotides, including 677 nucleotides. Specifically, the forward primer has a nucleotide sequence of SEQ ID NO: 4, the reverse primer preferably has a nucleotide sequence of SEQ ID NO: 5.

본 발명에서 DNA 절단에 사용하는 제한효소는 Hinf1인 것이 바람직하다. 정상 유전자형의 MTHFR로부터 얻어진 단편에는 Hinf1이 인식할 수 있는 부위가 없으나, 667 C->T 변이가 일어난 MTHFR로부터 얻어진 단편은 Hinf1이 인식할 수 있는 절단부위가 생성되어 175bp와 25bp로 분해되므로, 677번 뉴클레오티드 SNP의 발생 여부를 확인할 수 있다.In the present invention, the restriction enzyme used for DNA cleavage is preferably Hinf1. Fragments obtained from the normal genotype MTHFR do not have a region that Hinf1 can recognize, but fragments obtained from the MTHFR that had a 667 C-> T mutation generate a cleavage site that Hinf1 can recognize, and are decomposed into 175bp and 25bp. The occurrence of single nucleotide SNP can be confirmed.

본 발명에서는 상기 방법 외에도 직접 염기 서열 분석(direct sequencing)등 SNP 검출에 사용되는 통상적인 기술을 사용할 수 있다.In the present invention, in addition to the above method, conventional techniques used for SNP detection such as direct sequencing can be used.

이하, 도 1에 도시된 MTHFR 관련 대사과정을 참조하여 MTHFR C677T 유전자 SNP와 원인불명성 무정자증 및 심각한 희소무력기형정자증 간의 상관관계를 설명한다.Hereinafter, the correlation between the MTHFR C677T gene SNP and unknown causative atherosclerosis and severe rare dysmorphic spermosis will be described with reference to the MTHFR-related metabolic process shown in FIG. 1.

도 1에 나타난 바와 같이, MTHFR은 5,10-메틸렌테트라하이드로폴레이트(5, 10-methylenetetrahydrofolate: 5,10-methyleneTHF)를 5-메틸테트라하이드로폴레이트(5-methyltetrahydrofolate: 5- methylTHF)로 전환시키는 효소이다. As shown in Figure 1, MTHFR converts 5,10-methylenetetrahydrofolate (5,10-methylenetetrahydrofolate: 5,10-methyleneTHF) to 5-methyltetrahydrofolate (5-methylTHF) Is an enzyme.

5- methylTHF는 호모시스테인이 메티오닌으로 재메틸화될 때 필요한 메틸기를 공여하기 때문에, 혈중 호모시스테인 농도가 일정수준으로 유지되는데 있어 중요한 인자로 작용한다.Since 5-methylTHF provides the methyl group necessary when homocysteine remethylates with methionine, 5-methylTHF is an important factor in maintaining homocysteine concentration in blood.

그런데, MTHFR의 677번째 뉴클레오티드가 시토신에서 티민으로 전환되면(이하 'MTHFR C677T'이라 한다), 해당 아미노산이 알라닌에서 발린으로 치환된다. MTHFR 정상유전자의 및 MTHFR C677T의 전체 염기서열은 각각 서열번호 6, 서열번호 7과 같다.However, when the 677th nucleotide of MTHFR is converted from cytosine to thymine (hereinafter referred to as 'MTHFR C677T'), the corresponding amino acid is substituted from alanine to valine. The entire nucleotide sequence of MTHFR normal gene and of MTHFR C677T are shown in SEQ ID NO: 6, SEQ ID NO: 7, respectively.

상기 MTHFR C677T 유전자 돌연변이는 MTHFR 효소의 기능에 심각한 저하를 가져오게 되어, 이형접합성 돌연변이인 677CT 유전자형을 가지는 사람은 정상인 677CC 유전자형을 가진 사람과 비교할 때 MRHFR 효소의 기능이 32.4%까지 감소되며, 동형접합성 돌연변이인 677TT 유전자형을 가지는 사람의 경우에는 64.4%까지 감소된다(Chango A et al., The effect of 677C →T and 1298A →C mutations on plasma homocysteine and 5,10-methylenetetrahydrofolate reductase activity in healthy subjects. Br J Nutr 2000;83(6):593-596).The MTHFR C677T gene mutation results in a severe decrease in the function of the MTHFR enzyme, so that the person with the heterozygous mutation 677CT genotype reduces the function of the MRHFR enzyme by 32.4% compared to the person with the normal 677CC genotype, and is homozygous. In humans with the 677TT genotype of mutation, it is reduced by 64.4% (Chango A et al., The effect of 677C → T and 1298A → C mutations on plasma homocysteine and 5,10-methylenetetrahydrofolate reductase activity in healthy subjects.Br J Nutr 2000; 83 (6): 593-596).

이처럼, MTHFR 효소의 기능이 저하되면 5- methyleneTHF가 필요이상으로 축적되어, DNA 합성과정 중 dUMP가 dTMP로 전환하는 과정에 영향을 주게 된다. 그 결과 dTMP가 과잉생산되면 DNA 합성과정은 이상(aberration)을 띠게 되는데, 이러한 결과가 남성불임의 발생과 관련이 있을 것으로 추정된다.As such, the degradation of MTHFR enzyme causes 5-methyleneTHF to accumulate more than necessary, affecting the conversion of dUMP to dTMP during DNA synthesis. As a result, overproduction of dTMP leads to aberration of DNA synthesis, which may be related to male infertility.

또한, MTHFR 677 유전자의 변이로 인해, 도 1에 도시된 대사과정 중 호모시스테인이 메티오닌으로 전환되는 과정에서 재메틸화(remethylation)의 장애가 일어나 상기 과정이 저해됨으로써, 고(高)호모시스테인혈증(hyperhomocysteinemia)을 유발하게 된다.In addition, due to the mutation of the MTHFR 677 gene, a disorder of remethylation occurs during the conversion of homocysteine to methionine in the metabolic process shown in FIG. 1, thereby inhibiting the process, thereby resulting in high homocysteineemia (hyperhomocysteinemia). Will cause.

특히 동형접합성 돌연변이 유전자형(MTHFR 677TT)은 호모시스테인의 축적에 더욱 강력한 영향을 미치며, 호모시스테인 양이 과다하게 증가하면 고환 내 혈관 내벽의 손상을 유발하게 되어 불임을 유발할 것으로 추정된다.In particular, the homozygous mutant genotype (MTHFR 677TT) has a stronger effect on the accumulation of homocysteine, and excessive increase in the amount of homocysteine is likely to cause intestinal vascular wall damage and infertility.

본 발명의 실시예에서 확인되는 바와 같이, MTHFR의 C677T SNP는 염색체의 수적, 구조적 이상 및 Y 염색체 부분 결실에 의한 남성불임과는 상관이 없는 반면, 원인불명성 남성불임의 세부 아형 중 무정자증 또는 심각한 희소무력기형정자증을 나타내는 남성환자에게서 많이 나타난다.As confirmed in the Examples of the present invention, C677T SNP of MTHFR has no correlation with male infertility due to chromosomal numerical, structural abnormality and Y chromosome partial deletion, whereas acute or severe among subtypes of unknown male infertility It is most commonly seen in male patients with rare disabilities.

원인불명성 무정자증 발생은 MTHFR 677 위치의 이형접합성 변이(C/T) 및 동형접합성 변이(T/T)와, 그리고 원인불명성의 심각한 희소무력기형정자증 발생은 MTHFR 677 위치의 동형접합성 변이(T/T)와 밀접한 관련이 있다.Occurrence of unexplained atherosclerosis includes heterozygous mutations (C / T) and homozygous mutations (T / T) at the MTHFR 677 position, and the occurrence of severe rare dysmorphic spermatosis of unknown cause (I / O). / T) is closely related.

따라서, 본 발명의 조성물은 MTHFR의 677 위치의 SNP 분석을 통해 원인불명성 무정자증 및 심각한 희소무력기형정자증 발생의 예측 및 진단을 가능하게 한다.Thus, the compositions of the present invention allow for the prediction and diagnosis of unknown causative atherosclerosis and severe rare atypical spermosis through SNP analysis at position 677 of MTHFR.

즉, 기존의 불임진단검사에서는 원인불명성 남성불임에 대한 진단이 어려웠기 때문에, 진단범위가 염색체 이상과 Y 염색체 부분결실로 인한 남성불임만으로 한정되었던 반면, 본 발명의 조성물은 원인불명성 무정자증과 심각한 희소무력기형정자증의 원인인자 규명을 통하여 정확한 유전적 진단이 이루어지도록 한다.That is, in the existing infertility diagnosis test, because it was difficult to diagnose infertile male infertility, the scope of diagnosis was limited to male infertility due to chromosomal abnormalities and partial deletion of Y chromosome, Finding out the causative factors of severe rare armed spermosis enables accurate genetic diagnosis.

또한 본 발명의 조성물을 사용한 결과, 상기 불임증상을 나타낼 것으로 예상되는 남성에게는 MTHFR 변이효소의 기능보완물질을 투여함으로써 상기 증상들을 예방 또는 치료할 수 있으므로, 본 발명의 조성물은 남성불임의 다양한 아형에 따른 적절한 치료방법을 수립하는데 유용하게 사용될 수 있다.In addition, as a result of using the composition of the present invention, it is possible to prevent or treat the above symptoms by administering a functional supplement of MTHFR mutase to a man expected to exhibit the infertility symptoms, the composition of the present invention according to various subtypes of male infertility It can be useful to establish proper treatment.

예를 들면, 본 발명의 조성물을 사용하여 MTHFR 677 유전자 변이체를 발현하는 것으로 확인된 세포 또는 동물과 시험대상물질을 반응시키고, 상기 시험대상물질이 호모시스테인 농도를 저하시키는지를 확인함으로써, MTHFR 변이효소의 기능보완물질을 스크리닝할 수 있다.For example, using the composition of the present invention by reacting a test substance with a cell or animal identified to express the MTHFR 677 gene variant and confirming that the test substance lowers the homocysteine concentration, Functional supplements can be screened.

이러한 MTHFR 변이효소의 기능보완물질의 탐색은 더 나아가 원인불명성 무정자증 또는 심각한 희소무력기형정자증 치료제의 개발로 이어질 수 있다.The search for supplements of MTHFR mutant enzymes can further lead to the development of therapeutic agents for unknown spermatosis or severe rare atresia.

이하 실시예를 통해 본 발명을 보다 구체적으로 설명하되, 하기 실시예에 본 발명의 범위가 국한되는 것은 아니다. Hereinafter, the present invention will be described in more detail with reference to Examples, but the scope of the present invention is not limited to the following Examples.

[실시예] 본 발명의 조성물에 의한 MTHFR C677T 유전자 변이체 검출 및 원인불명성 무정자증ㆍ심각한 희소무력기형정자증의 진단EXAMPLES Detection of MTHFR C677T Gene Variants and Composition of Unexplained Amorphism and Serious Rare Atypical Spermosis by Compositions of the Present Invention

본 발명의 조성물에 의해 MTHFR C677T 유전자 변이체를 검출하고, 원인불명성 무정자증 및 심각한 희소무력기형정자증을 진단하기 위해, 다음과 같이 실험을 수행하였다.In order to detect the MTHFR C677T gene variant by the composition of the present invention, and to diagnose unidentified atherosclerosis and severe rare asthma malformation, experiments were performed as follows.

1) 본 발명의 조성물 제조1) Preparation of the composition of the present invention

본 발명의 조성물은 두 개의 프라이머 세트와, 파이로시퀀싱을 위한 시퀀스 프라이머를 포함하도록 제조되었다.The composition of the present invention was prepared to include two primer sets and sequence primers for pyrosequencing.

프라이머 세트 중 한 세트는 파이로시퀀싱을 위한 PCR에 사용되며, 정방향 프라이머의 염기서열은 서열번호 1, 역방향 프라이머의 염기서열은 서열번호 2와 같다.One set of primers is used for PCR for pyro sequencing, the base sequence of the forward primer is SEQ ID NO: 1, the base sequence of the reverse primer is SEQ ID NO: 2.

프라이머 세트 중 나머지 한 세트는 RFLP 분석을 위한 PCR에 사용되며, 정방향 프라이머의 염기서열은 서열번호 3, 역방향 프라이머의 염기서열은 서열번호 4와 같다.The other set of primers is used for PCR for RFLP analysis, the base sequence of the forward primer is SEQ ID NO: 3, the reverse sequence of the reverse primer is SEQ ID NO: 4.

시퀀스 프라이머의 염기서열은 서열번호 5와 같다.The base sequence of the sequence primer is the same as SEQ ID NO: 5.

2) 실험대상2) Test subject

포천중문의대 강남 차병원에서 불임으로 진단받은 남성들 중 연구에 동의한 377명의 남성불임 환자군과, 정상인 중에서 자녀를 1명 이상 낳은 396명의 대조군을 연구대상으로 하였다.The subjects were 377 male infertility patients who agreed to the study among men diagnosed with infertility at Gangnam CHA Hospital, Pocheon College of Medicine, and 396 control groups who had more than one child among normal people.

불임환자군에 대해, 다음과 같이 세포유전학적 분석 및 Y-염색체 결실 분석을 수행하여 불임의 원인을 진단하였다.For infertile patients, cytogenetic analysis and Y-chromosome deletion analysis were performed as follows to diagnose the cause of infertility.

세포유전학적 분석은 림프구(lymphocyte)를 배양하여 유사분열중기 (metaphase)로 전개(spread)될 때 수행하였다. DNA는 환자군과 대조군의 말초혈액에서 추출한 백혈구로부터 분리하였고, 또한 하나의 SRY와 12개의 Sequence Tagged Sites(STSs)(AZF-a region: Sy 84, sY86, AZF-b region: sY 134, sY 138, MK5, AZF-c region: sY 152, sY 147, sY 254, sY 255, sPGY1, sY 269, sY 158)를 포함하는 13가지의 위치를 Y 염색체의 프라이머를 사용하여 다중 PCR(multi-PCR)에 의해 증폭시켰다.Cytogenetic analysis was performed when lymphocytes were cultured and spread into metaphase. DNA was isolated from leukocytes extracted from peripheral blood of patients and controls, and also one SRY and 12 Sequence Tagged Sites (STSs) (AZF-a region: Sy 84, sY86, AZF-b region: sY 134, sY 138, MK5, AZF-c region: 13 positions containing sY 152, sY 147, sY 254, sY 255, sPGY1, sY 269, sY 158) were subjected to multiple PCR (multi-PCR) using primers of the Y chromosome By amplification.

그 결과, 불임환자군은 크게 불임 원인이 밝혀진 집단(115명)과 밝혀지지 않은 집단(262명)으로 분류되었다.As a result, the infertility group was divided into two groups (115 people) and unknown groups (262).

원인불명의 불임집단은 진단명에 따라 4가지 아형으로 분류되었으며, 즉 무정자증 281명, 심각한 희소무력기형정자증 59명, 26명의 희소무력기형정자증, 그리고 자발적 유산(spontaneous abortion), 이동고환(retractile testis), 심각한 희소정자증(severe oligo sperm), 사정불능증(difficulty in ejaculation) 등의 증상을 나타내는 나머지 11명으로 구성되었다.The infertility group of unknown cause was classified into four subtypes according to the diagnosis name: 281 adolescents, 59 severe schizophrenia, 26 rare spermatozoa, 26 spontaneous abortion, spontaneous abortion, and retractile testis. testis, severe severe oligo sperm, and difficulty in ejaculation.

3) 파이로시퀀싱 분석3) Pyro Sequencing Analysis

파이로시퀀싱 분석을 위한 DNA는 다음과 같이 준비하였다.DNA for pyrosequencing analysis was prepared as follows.

각 개체로부터 얻은 백혈구로부터 분리한 DNA에 대해, 파이로시퀀싱용 PCR 프라이머 세트(서열번호 1, 서열번호 2)를 사용하여 PCR 기계(MJ research thermal cycler, Waltham, USA)에서 증폭시켰다.DNA isolated from leukocytes obtained from each individual was amplified in a PCR machine (MJ research thermal cycler, Waltham, USA) using a PCR primer set (SEQ ID NO: 1, SEQ ID NO: 2) for pyro sequencing.

677 위치는 113bp가 되도록 하여 생성물을 증폭시키기 위해 어닐링(annealing)을 55℃에서 시키면서 이 과정을 45 사이클(cycle) 반복하였다.이 생성물들은 2% 아가로오스 겔 상에서 전기영동한 후, EtBr(ethidium bromide)로 염색하여 증폭 상태를 관찰하였다.The procedure was repeated for 45 cycles with annealing at 55 ° C. to amplify the product at position 677 to 113 bp. The products were electrophoresed on a 2% agarose gel, followed by EtBr (ethidium). staining with bromide) to observe the amplification status.

바이오틴이 부착된 상태의 PCR 생성물을 스트렙트아비딘(streptavidin)이 있는 수퍼마그네틱 비드(superparamagnetic bead, Dynabeads M280; Dynal, Oslo, Norway)에 고정시켰다. 수산화나트륨 용액에서 고정시킨 PCR 생성물을 항온반응(incubation)시켜 단일 가닥 DNA(single-stranded DNA)를 얻은 후, 0.2M 염산을 가하여 중화하였다.PCR products with biotin attached were immobilized to superparamagnetic beads (streptavidin) with superparamagnetic beads (Dynabeads M280; Dynal, Oslo, Norway). PCR products immobilized in sodium hydroxide solution were incubated to obtain single-stranded DNA, followed by neutralization by addition of 0.2 M hydrochloric acid.

이와 같이 하여 추출한 단일 가닥 DNA에 대해 SNP 분석을 수행하기 위해, 본 발명의 조성물을 이용하여 다음과 같이 파이로시퀀싱을 수행하였다.In order to perform SNP analysis on the single-stranded DNA thus extracted, pyro sequencing was performed using the composition of the present invention as follows.

상기 단일가닥 DNA에 본 발명의 조성물의 시퀀스 프라이머(서열번호 5)를 10pmol 첨가하여 실온에서 1분 동안, 그리고 80℃에서 2분 동안 반응시킨 후, 상온에서 서서히 식혀 어닐링(annealing)되도록 하였다.10 pmol of the sequence primer (SEQ ID NO: 5) of the composition of the present invention was added to the single-stranded DNA to react at room temperature for 1 minute and at 80 ° C. for 2 minutes, and then slowly cooled to room temperature to anneal.

시퀀스 프라이머가 어닐링된 DNA에, 엑소뉴클레아제가 결여된 클레노우 DNA 중합효소(exonuclease deficient(exo-) Klenow DNA polymerase), 아피라제(apyrase), 정제된 루시페라제(purified luciferase), 재조합 ATP 설퍼릴라제(recombinant ATP sulfurylase), 기질 및 dNTP를 가하고, 자동 파이로시퀀싱 장치(kindly supplied by Pyrosequencing AB, Uppsala, Sweden)를 사용하여 실온에서 파이로시퀀싱을 수행하였다.To the sequence primers anneal DNA, exonuclease I devoid of Klenow DNA polymerase (exonuclease deficient (exo -) Klenow DNA polymerase), Bahia cyclase (apyrase), purified luciferase (purified luciferase), recombinant ATP Sulfur Relabin (recombinant ATP sulfurylase), substrate and dNTP were added and pyro sequencing was performed at room temperature using an automated pyro sequencing device (kindly supplied by Pyrosequencing AB, Uppsala, Sweden).

이때 dNTP를 순차적으로 첨가하여 시퀀스 프라이머를 연장시켜주고, 남은 뉴클레오티드는 아피라제에 의해 제거되도록 하였다. 결합된 뉴클레오티드로부터 방출되는 형광신호는 시퀀싱 장치에 장착된 CCD 카메라에 의해 탐지하였다.At this time, the dNTP was added sequentially to extend the sequence primer, and the remaining nucleotides were removed by the apiase. Fluorescence signals emitted from the bound nucleotides were detected by a CCD camera mounted on a sequencing device.

4) RFLP 분석4) RFLP Analysis

RFLP 분석에 사용할 DNA는 다음과 같이 준비하였다.DNA to be used for RFLP analysis was prepared as follows.

각 군의 DNA에 RFLP용 PCR 프라이머 세트(서열번호 3, 서열번호 4)를 첨가하고, 95℃에서 변성시킨 후, 64℃에서 1분 동안 프라이머를 어닐링시키고, 72℃에서 2분 동안 프라이머 연장반응을 시행하는 과정을 30회 반복하여, 198bp 크기의 PCR 산물을 얻었다.PCR primer set for RFLP (SEQ ID NO: 3, SEQ ID NO: 4) was added to each group of DNA, denatured at 95 ° C., annealed the primer at 64 ° C. for 1 minute, and primer extension at 72 ° C. for 2 minutes. The procedure was repeated 30 times to obtain a PCR product of 198bp size.

상기 PCR 산물들에 대해, 제한효소 Hinf1(New England Biolabs, Beverly, MA, USA)을 첨가하여 37℃에서 4시간동안 분해반응을 수행하였다. 제한효소로 처리한 단편들을 3% 아가로오스 겔 상에서 전기영동한 후, EtBr(ethidium bromide)로 염색하여 변이상태를 관찰하였다.For the PCR products, the restriction enzyme Hinf1 (New England Biolabs, Beverly, MA, USA) was added to perform degradation reaction at 37 ° C. for 4 hours. The fragments treated with restriction enzymes were electrophoresed on 3% agarose gel and stained with EtBr (ethidium bromide) to observe the mutated state.

상기 실험에 의해 얻은 각 변이의 파이로시퀀싱 결과 및 그에 상응하는 RFLP 결과를 도 2에 나타내었다.The pyro sequencing results of each variation obtained by the above experiments and the corresponding RFLP results are shown in FIG. 2.

도 2a는 MTHFR의 677 위치의 정상 유전자형(C/C) 및 변이(C/T, T/T)의 파이로시퀀싱 결과이며, 도 2b는 정상대조군과 불임환자군 각각에서의 정상 유전자형(C/C) 및 변이(C/T, T/T)에 대한 RFLP 확인 결과이다.FIG. 2A shows the results of pyro sequencing of normal genotype (C / C) and mutations (C / T, T / T) at position 677 of MTHFR, and FIG. 2B shows normal genotype (C / C) in the normal control and infertile patients, respectively. ) And the result of RFLP check for the variation (C / T, T / T).

5) 결과에 대한 통계분석5) Statistical analysis of the results

각 군의 분류방법에 따른 통계분석은 SAS 통계 소프트웨어를 이용하여, 카이 스퀘어(Chi-square) 검정, 피셔스 이그잭트(Fisher's exact) 검정을 수행하였다. 또한 남성불임에서의 비교 위험도를 측정하기 위하여, 오드 비율값(odd ratio; OR)과 95% 신뢰구간(95 percent confidence intervals, 95% CI)을 사용하였다. For statistical analysis according to the classification method of each group, chi-square test and Fisher's exact test were performed using SAS statistical software. In addition, the odds ratio (OR) and 95 percent confidence intervals (95% CI) were used to measure the comparative risk in male infertility.

통계분석으로 얻은 결과들은 다음과 같다.The results obtained by statistical analysis are as follows.

5-1) 대조군 및 환자군의 전체적인 MTHFR 유전자형의 분포5-1) Overall MTHFR Genotype Distribution in Control and Patient Groups

대조군 및 환자군의 전체적인 유전자형의 분포 양상은 하기 표 1과 같다. Overall genotype distribution patterns of the control and patient groups are shown in Table 1 below.

유전자형\분류Genotype and Classification 정상대조군(%)Normal control group (%) 불임환자군(%)Infertility group (%) OR(95% CI)OR (95% CI) PP 677CC677CC 36.6236.62 28.1228.12 -- -- 677CT677CT 50.5050.50 55.1755.17 1.42(1.03-1.95)1.42 (1.03-1.95) 0.02900.0290 677TT677TT 12.8812.88 16.7116.71 1.69(1.08-2.64)1.69 (1.08-2.64) 0.02070.0207 CT + TTCT + TT 63.3863.38 71.8871.88 1.48(1.09-2.00)1.48 (1.09-2.00) 0.01170.0117 T 대립유전자T allele 38.1338.13 44.3044.30 1.29(1.05-1.58)1.29 (1.05-1.58) 0.01380.0138 1298AA1298AA 67.9367.93 63.4063.40 -- -- 1298AC1298AC 28.0328.03 31.8331.83 -- -- 1298CC1298CC 4.044.04 4.774.77 -- -- AC + CCAC + CC 32.0732.07 36.6036.60 -- -- C 대립유전자C allele 18.0618.06 20.6920.69 -- --

표 1에 나타난 바와 같이, 대조군에서 MTHFR 유전자형은 정상(C/C) 36.6%, 이형접합성 변이(C/T) 50.5%, 동형접합성 변이(T/T) 12.9%의 빈도를 나타내었다.As shown in Table 1, the MTHFR genotype in the control group showed a frequency of 36.6% normal (C / C), 50.5% heterozygous (C / T), and 12.9% homozygous (T / T).

반면 환자군에서는 정상(C/C) 유전자형은 28.1%에 그치고, 변이 유전자형이 이형접합성 변이(C/T) 55.2%, 동형접합성 변이(T/T) 16.71%의 비율을 차지하였으며, 통계학적 유의성을 나타내었다(P<0.05).In the patient group, the normal (C / C) genotype was only 28.1%, and the variant genotype accounted for 55.2% of heterozygous mutations (C / T) and 16.71% of homozygous mutations (T / T). (P <0.05).

한편, MTHFR의 또다른 흔한 유전적 변이인 1298 위치의 변이는, 677 위치의 변이와 달리 대조군과 환자군에 있어서 통계적인 차이를 보이지 않았다(P >0.05).On the other hand, the mutation of position 1298, another common genetic variation of MTHFR, showed no statistical difference between the control group and the patient group, unlike the mutation of position 677 (P> 0.05).

따라서, MTHFR의 SNP 중에서도 C677T 변이가 특히 남성불임과 밀접한 관련이 있음을 알 수 있다.Therefore, it can be seen that among the SNPs of MTHFR, the C677T mutation is closely related to male infertility.

5-2) 불임환자군에서 증상별 아형에 따른 MTHFR 유전자형의 분포5-2) Distribution of MTHFR Genotypes according to Symptom Subtypes in Infertile Patients

불임환자군을 증상별 아형, 즉 무정자증, 희소무력기형정자증, 심각한 희소무력기형정자증의 세 아형으로 분류하였을 때, 각 아형의 MTHFR 유전자형 빈도수는 하기 표 2과 같다.When the infertile patients were classified into three subtypes of symptom-type subtypes, namely, spermatosis, rarely deformed spermosis, and severe rare deformity spermosis, the MTHFR genotype frequency of each subtype is shown in Table 2 below.

분류\유전자형Classification 전자 Genotype 677CC677CC 677CT677CT 677TT677TT CT + TTCT + TT T 대립유전자T allele 정상대조군Normal control 36.62 %(n=145)36.62% (n = 145) 50.50 %(n=200)50.50% (n = 200) 12.88 %(n=51)12.88% (n = 51) 63.38 %(n=251)63.38% (n = 251) 38.13 %(n=302)38.13% (n = 302) 무정자증(n=281)OR(95% CI)PAutism (n = 281) OR (95% CI) P 26.33 %(n=74)--26.33% (n = 74)- 56.94 %(n=160)1.57(1.10-2.22)0.011356.94% (n = 160) 1.57 (1.10-2.22) 0.0113 16.73 %(n=47)1.81(1.11-2.93)0.016416.73% (n = 47) 1.81 (1.11-2.93) 0.0164 73.76 %(n=207)1.62(1.16-2.26)0.004873.76% (n = 207) 1.62 (1.16-2.26) 0.0048 45.20 %(n=254)1.34(1.07-1.67)0.009245.20% (n = 254) 1.34 (1.07-1.67) 0.0092 severe OAT(n=59)OR(95% CI)Psevere OAT (n = 59) OR (95% CI) P 25.42 %(n=15)--25.42% (n = 15)- 50.85 %(n=30)--50.85% (n = 30)- 23.73 %(n=14)2.65(1.20-5.88)0.013623.73% (n = 14) 2.65 (1.20-5.88) 0.0136 74.58 %(n=44)--74.58% (n = 44)- 49.15 %(n=58)1.57(1.06-2.31)0.022449.15% (n = 58) 1.57 (1.06-2.31) 0.0224 OAT(n=26)OR(95% CI)POAT (n = 26) OR (95% CI) P 50.00 %(n=13)--50.00% (n = 13)- 38.46 %(n=10)--38.46% (n = 10)- 11.54 %(n=3)--11.54% (n = 3)- 50.00 %(n=13)--50.00% (n = 13)- 30.77 %(n=16)--30.77% (n = 16)- 나머지 환자군(n=11)OR(95% CI)PRemaining patient group (n = 11) OR (95% CI) P 36.36 %(n=4)--36.36% (n = 4)- 63.64 %(n=7)--63.64% (n = 7)- - --- - 63.64 %(n=7)--63.64% (n = 7)- 31.82 %(n=7)--31.82% (n = 7)-

표 2에 나타난 바와 같이, 무정자증 환자군 및 심각한 희소무력기형정자증 환자군에서 통계적으로 유의하게 MTHFR 667 위치의 유전자 변이가 나타났다.As shown in Table 2, there was a statistically significant genetic variation in the MTHFR 667 position in the sperm patients group and in the patients with severe rare atherosclerosis.

무정자증 환자군은 이형접합성 변이(C/T) 56.9%, 동형접합성 변이(T/T) 16.7%, 이형접합성과 동형접합성을 합친 변이(CT + TT) 73.7%, T 대립유전자(allele) 45.2%의 빈도수를 보이며, 통계적 유의성을 나타내었다 (P<0.05).In the group of patients with atypical disorder, 56.9% of heterozygous mutations (C / T), 16.7% of homozygous mutations (T / T), 73.7% of combined heterozygosity and homozygous (CT + TT), and 45.2% of T allele (allele) Frequency was shown and statistically significant (P <0.05).

심각한 희소무력기형정자증 환자군의 경우, 동형접합성 변이(T/T) 16.73%, T 대립유전자 49.2%의 빈도수를 보였으며, 통계적 유의성을 나타내었다(P<0.05). 특히, 심각한 희소무력기형정자증 환자군의 비교위험도는 유의하게 높은 비교위험도(OR : 2.65, 95% CI : 1.20-5.88)를 보였다.In the patients with severe rare atresia, the frequency of homozygous mutation (T / T) was 16.73% and the T allele was 49.2% with statistical significance (P <0.05). In particular, the comparative risks of patients with severe rare malformations were significantly higher (OR: 2.65, 95% CI: 1.20-5.88).

5-3) 원인불명 불임환자군에서 증상별 아형에 따른 MTHFR유전자형의 분포5-3) Distribution of MTHFR Genotypes According to Symptom Subtypes in Unexplained Infertile Patients

불임환자군을 염색체 이상 등 원인이 알려진 군과, 원인불명군으로 분류하여 여 MTHFR 유전자형 분포를 분석하였다.MTHFR genotype distribution was analyzed by classifying infertile patients into known and unknown causes of chromosomal abnormalities.

염색체 이상으로 인한 불임군의 경우, 변이에 대하여 유의적인 결과를 나타내지 않았으므로, 원인불명 불임군에 대한 통계적 분석결과만을 하기 표 3에 나타내었다.In the case of infertility group due to chromosomal abnormality, no significant result was observed for the mutation, and therefore, only the statistical analysis results for the unknown infertility group are shown in Table 3 below.

분류\유전자형Classification 전자 Genotype 677CC677CC 677CT677CT 677TT677TT CT + TTCT + TT T 대립유전자T allele 정상대조군Normal control 36.62 %(n=145)36.62% (n = 145) 50.50 %(n=200)50.50% (n = 200) 12.88 %(n=51)12.88% (n = 51) 63.38 %(n=251)63.38% (n = 251) 38.13 %(n=302)38.13% (n = 302) 무정자증(n=281)OR(95% CI)PAutism (n = 281) OR (95% CI) P 25.66 %(n=49)--25.66% (n = 49)- 56.54 %(n=108)1.60(1.07-2.38)0.021056.54% (n = 108) 1.60 (1.07-2.38) 0.0210 17.80 %(n=34)1.97(1.15-3.39)0.013217.80% (n = 34) 1.97 (1.15-3.39) 0.0132 74.35 %(n=142)1.67(1.14-2.46)0.0048274.35% (n = 142) 1.67 (1.14-2.46) 0.00482 46.07 %(n=176)1.39(1.08-1.77)0.009546.07% (n = 176) 1.39 (1.08-1.77) 0.0095 severe OAT(n=59)OR(95% CI)Psevere OAT (n = 59) OR (95% CI) P 21.95 %(n=9)--21.95% (n = 9)- 53.66 %(n=22)--53.66% (n = 22)- 24.39 %(n=10)3.16(1.22-8.21)0.014024.39% (n = 10) 3.16 (1.22-8.21) 0.0140 78.05 %(n=32)2.05(0.95-4.42)0.061378.05% (n = 32) 2.05 (0.95-4.42) 0.0613 51.22 %(n=42)1.70(1.08-2.69)0.020951.22% (n = 42) 1.70 (1.08-2.69) 0.0209 OAT(n=26)OR(95% CI)POAT (n = 26) OR (95% CI) P 54.17 %(n=13)--54.17% (n = 13)- 33.33 %(n=8)--33.33% (n = 8)- 12.50 %(n=3)--12.50% (n = 3)- 45.83 %(n=13)--45.83% (n = 13)- 29.17 %(n=14)--29.17% (n = 14)- 나머지 환자군(n=11)OR(95% CI)PRemaining patient group (n = 11) OR (95% CI) P 50.00 %(n=3)--50.00% (n = 3)- 50.00 %(n=3)--50.00% (n = 3)- - --- - 50.00 %(n=3)--50.00% (n = 3)- 25.00 %(n=3)--25.00% (n = 3)-

표 3의 결과는 상기 표 2과 비슷한 양상을 나타내었다.The results of Table 3 showed a similar aspect to Table 2.

무정자증 환자군은 이형접합성 변이(C/T) 56.54%, 동형접합성 변이(T/T) 17.80%, 이형접합성과 동형접합성을 합친 변이(CT + TT) 74.35%, T 대립유전자(allele) 46.07%의 빈도수를 보이며, 통계적 유의성을 나타내었다 (P<0.05).The group of patients with atherosclerosis had a heterozygous mutation (C / T) of 56.54%, a homozygous mutation (T / T) of 17.80%, a heterozygous and homozygous combination of 74.35%, and a T allele of 46.07%. Frequency was shown and statistically significant (P <0.05).

심각한 희소무력기형정자증 환자군의 경우, 동형접합성 변이(T/T) 53.66%, T 대립유전자(allele) 51.22%의 빈도수를 보였으며, 표 2에서보다 더 높은 비교위험도(OR : 3.16, 95% CI : 1.22-8.21) 및 높은 유의성(P=0.0140)을 나타내었다.Patients with severe rare atypical sperm disease had a frequency of 53.66% homozygous mutation (T / T) and 51.22% T allele (OR: 3.16, 95%). CI: 1.22-8.21) and high significance (P = 0.0140).

이상에서, 원인불명성 무정자증 발생은 MTHFR 677 위치의 이형접합성 변이(C/T)(P=0.02) 및 동형접합성 변이(T/T)(P=0.01)와 밀접한 관련이 있음을 알 수 있다.In the above, it can be seen that the incidence of unknown etiology is closely related to heterozygous mutation (C / T) (P = 0.02) and homozygous mutation (T / T) (P = 0.01) at the MTHFR 677 position.

또한, 원인불명성의 심각한 희소무력기형정자증 발생의 경우에는 MTHFR 677 위치의 동형접합성 변이(T/T)가 중요한 유전적 특성이 될 수 있다.In addition, in cases of severe, rare, atypical spermatozoa, the homozygous mutation (T / T) at the MTHFR 677 position may be an important genetic feature.

따라서, MTHFR 677 위치의 SNP를 검출하는 본 발명의 조성물은 원인불명성 무정자증 또는 심각한 희소무력기형정자증의 진단, 그리고 예방 및 조기치료에 사용될 수 있다.Accordingly, the compositions of the present invention which detect SNPs at the MTHFR 677 position can be used for the diagnosis of unexplained atherosclerosis or severe rare atresia, and for the prevention and early treatment.

본 발명의 조성물이 검출할 수 있는 MTHFR의 SNP중, 677 C->T 변이는 남성불임에서 큰 비율을 차지하는 원인불명성 무정자증 및 심각한 희소무력기형정자증의 가능성을 나타내는 유전적 지표가 된다.Among the SNPs of MTHFR that can be detected by the compositions of the present invention, the 677 C-> T mutation is a genetic indicator indicating the likelihood of unexplained atherosclerosis and severe rare atypical spermosis, which account for a large proportion of male infertility.

따라서, 본 발명의 조성물은 남성 불임의 진단에 효과적으로 사용될 수 있다.Therefore, the composition of the present invention can be effectively used for the diagnosis of male infertility.

또한 본 발명의 조성물에 의해 불임인 것으로 판명될 경우, 대상환자에게 MTHFR 변이효소의 기능보완물질을 투여함으로써 상기 증상들을 예방 또는 치료할 수 있으므로, 본 발명의 조성물은 불임의 적절한 치료방향을 결정하는데 유용하게 사용될 수 있다.In addition, the composition of the present invention is useful for determining the appropriate treatment direction of infertility when it is determined that the infertility by the composition of the present invention, by administering a functional supplement of MTHFR mutase to the subject patient. Can be used.

도 1은 MTHFR이 관여하는 대사경로를 나타낸 도이다.1 is a diagram showing metabolic pathways involved in MTHFR.

도 2는 파이로시퀀싱 및 RFLP 분석을 통해 정상군과 남성불임 환자군의 유전자형을 확인한 결과를 나타낸 도이다.Figure 2 shows the results of confirming the genotype of the normal group and male infertility patients through pyro sequencing and RFLP analysis.

<110> LEE, Su Man <120> Composition for diagnosis of male infertility comprising primers detecting single nucleotide polymorphism at 677th nucleotide of 5,10-methylenetetrahydrofolate reductase gene <130> 03P-22 <160> 7 <170> KopatentIn 1.71 <210> 1 <211> 20 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> forward PCR primer amplifying the part of methylenetetrahydrofolate reductase for pyrosequencing <400> 1 tattggcagg ttaccccaaa 20 <210> 2 <211> 20 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> reverse PCR primer amplifying the part of methylenetetrahydrofolate reductase for pyrosequencing <400> 2 gaaaagctgc gtgatgatga 20 <210> 3 <211> 20 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> forward PCR primer amplifying the part of methylenetetrahydrofolate reductase for RFLP analysis <400> 3 tgaaggagaa ggtgtctgcg 20 <210> 4 <211> 20 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> reverse PCR primer amplifying the part of methylenetetrahydrofolate reductase for RFLP analysis <400> 4 aggacggtgc ggtgagagtg 20 <210> 5 <211> 13 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> primer for pyrosequencing <400> 5 ggtgtctgcg gga 13 <210> 6 <211> 302 <212> DNA <213> Homo sapiens <220> <221> gene <222> (1)..(302) <223> human methylenetetrahydrofolate reductase wild type gene <400> 6 ccttgaacag gtggaggcca gcctctcctg actgtcatcc ctattggcag gttaccccaa 60 aggccacccc gaagcaggga gctttgaggc tgacctgaag cacttgaagg agaaggtgtc 120 tgcgggagcc gatttcatca tcacgcagct tttctttgag gctgacacat tcttccgctt 180 tgtgaaggca tgcaccgaca tgggcatcac ttgccccatc gtccccggga tctttcccat 240 ccaggtgagg ggcccaggag agcccataag ctccctccac cccactctca ccgcaccgtc 300 ct 302 <210> 7 <211> 302 <212> DNA <213> Homo sapiens <220> <221> mutation <222> (1)..(302) <223> human methylenetetrahydrofolate reductase C667T mutant gene <400> 7 ccttgaacag gtggaggcca gcctctcctg actgtcatcc ctattggcag gttaccccaa 60 aggccacccc gaagcaggga gctttgaggc tgacctgaag cacttgaagg agaaggtgtc 120 tgcgggagtc gatttcatca tcacgcagct tttctttgag gctgacacat tcttccgctt 180 tgtgaaggca tgcaccgaca tgggcatcac ttgccccatc gtccccggga tctttcccat 240 ccaggtgagg ggcccaggag agcccataag ctccctccac cccactctca ccgcaccgtc 300 ct 302<110> LEE, Su Man <120> Composition for diagnosis of male infertility comprising primers detecting single nucleotide polymorphism at 677th nucleotide of 5,10-methylenetetrahydrofolate reductase gene <130> 03P-22 <160> 7 <170> KopatentIn 1.71 <210> 1 <211> 20 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> forward PCR primer amplifying the part of methylenetetrahydrofolate reductase for pyrosequencing <400> 1 tattggcagg ttaccccaaa 20 <210> 2 <211> 20 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> reverse PCR primer amplifying the part of methylenetetrahydrofolate reductase for pyrosequencing <400> 2 gaaaagctgc gtgatgatga 20 <210> 3 <211> 20 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> forward PCR primer amplifying the part of methylenetetrahydrofolate reductase for RFLP analysis <400> 3 tgaaggagaa ggtgtctgcg 20 <210> 4 <211> 20 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> reverse PCR primer amplifying the part of methylenetetrahydrofolate reductase for RFLP analysis <400> 4 aggacggtgc ggtgagagtg 20 <210> 5 <211> 13 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> primer for pyrosequencing <400> 5 ggtgtctgcg gga 13 <210> 6 <211> 302 <212> DNA <213> Homo sapiens <220> <221> gene (222) (1) .. (302) <223> human methylenetetrahydrofolate reductase wild type gene <400> 6 ccttgaacag gtggaggcca gcctctcctg actgtcatcc ctattggcag gttaccccaa 60 aggccacccc gaagcaggga gctttgaggc tgacctgaag cacttgaagg agaaggtgtc 120 tgcgggagcc gatttcatca tcacgcagct tttctttgag gctgacacat tcttccgctt 180 tgtgaaggca tgcaccgaca tgggcatcac ttgccccatc gtccccggga tctttcccat 240 ccaggtgagg ggcccaggag agcccataag ctccctccac cccactctca ccgcaccgtc 300 ct 302 <210> 7 <211> 302 <212> DNA <213> Homo sapiens <220> <221> mutation (222) (1) .. (302) <223> human methylenetetrahydrofolate reductase C667T mutant gene <400> 7 ccttgaacag gtggaggcca gcctctcctg actgtcatcc ctattggcag gttaccccaa 60 aggccacccc gaagcaggga gctttgaggc tgacctgaag cacttgaagg agaaggtgtc 120 tgcgggagtc gatttcatca tcacgcagct tttctttgag gctgacacat tcttccgctt 180 tgtgaaggca tgcaccgaca tgggcatcac ttgccccatc gtccccggga tctttcccat 240 ccaggtgagg ggcccaggag agcccataag ctccctccac cccactctca ccgcaccgtc 300 ct 302

Claims (16)

MTHFR(5,10-methylenetetrahydrofola1te reductase) 유전자의 677번 뉴클레오티드 위치의 SNP를 검출할 수 있는 프라이머 세트로, 정방향 프라이머는 서열번호 1의 염기서열을 가지며, 역방향 프라이머는 서열번호 2의 염기서열을 갖는 프라이머세트를 포함하는 남성불임 진단용 조성물A primer set capable of detecting SNP at 677 nucleotide position of MTHFR (5,10-methylenetetrahydrofola1te reductase) gene. A forward primer has a nucleotide sequence of SEQ ID NO. 1, and a reverse primer has a nucleotide sequence of SEQ ID NO. Male infertility diagnostic composition comprising the set 삭제delete 삭제delete 삭제delete 삭제delete 제 1항에 있어서, 상기 프라이머 세트를 사용하여 얻은 PCR 생성물의 파이로시퀀싱(pyrosequencing)에 사용할 수 있는 서열번호 5의 염기서열을 갖는 시퀀스 프라이머를 추가로 포함하는 남성불임 진단용 조성물The composition for diagnosing male infertility according to claim 1, further comprising a sequence primer having a nucleotide sequence of SEQ ID NO: 5 that can be used for pyrosequencing of a PCR product obtained using the primer set. 제 6항에 있어서, 남성불임은 원인불명성 무정자증(azoospermia)임을 특징으로 하는 남성불임 진단용 조성물The composition for diagnosing male infertility according to claim 6, wherein the male infertility is azoospermia. 제 6항에 있어서, 남성불임은 원인불명성의 심각한 희소무력기형정자증 (severe oligoasthenotetrazoospermia)임을 특징으로 하는 남성불임 진단용 조성물7. The composition for diagnosing male infertility according to claim 6, wherein the male infertility is severe oligoas the notetrazoospermia of unknown cause. 삭제delete 다음 단계로 이루어지는 MTHFR 677번 뉴클레오티드의 SNP를 확인하는 방법;Identifying a SNP of MTHFR 677 nucleotide consisting of the following steps; (1) 불임남성으로부터 MTHFR DNA를 분리하는 제1단계; (2) 상기에서 분리한MTHFR DNA를 주형으로 하고, 정방향 프라이머는 서열번호 1의 염기서열을 가지며, 역방향 프라이머는 서열번호 2의 염기서열을 갖는 PCR 프라이머 세트를 이용하여 PCR 반응을 수행하는 제2단계; (3) 상기 PCR 생성물과 시퀀스 프라이머를 어닐링시키고 파이로시퀀싱을 수행하는 제3단계; 및 (4) 불임남성의 MTHFR 유전자의 677번 뉴클레오티드가 시토신/시토신(C/C), 시토신/티민(C/T), 또는 티민/티민(T/T) 중 어떤 SNP를 나타내는지를 확인하는 제4단계 (1) the first step of separating MTHFR DNA from infertile men; (2) a second method of performing a PCR reaction using the isolated MTHFR DNA as a template, the forward primer having the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 1, and the reverse primer using the PCR primer set having the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 2; step; (3) a third step of annealing the PCR product and the sequence primer and performing pyro sequencing; And (4) a nucleotide number 677 of the MTHFR gene of infertility male to indicate which SNP of cytosine / cytosine (C / C), cytosine / thymine (C / T), or thymine / thymine (T / T) 4 steps 삭제delete 제 10항에 있어서, 시퀀스 프라이머는 서열번호 5의 염기서열을 가짐을 특징으로 하는 MTHFR 677번 뉴클레오티드의 SNP를 확인하는 방법The method of claim 10, wherein the sequence primer has a nucleotide sequence of SEQ ID NO: 5 method for identifying the SNP of the nucleotide MTHFR 677 삭제delete 삭제delete 삭제delete 677번 뉴클레오티드에서 유전자 변이가 일어난 MTHFR를 발현하는 세포 중 체외로 배출된 세포와 시험대상물질을 반응시키고, 상기 시험대상물질이 혈중 호모시스테인 농도를 저하시키는지를 확인함을 특징으로 하는 MTHFR 변이효소의 기능보완물질 스크리닝 방법The function of the MTHFR mutant enzyme, characterized by reacting the test substance with cells discharged in vitro from MTHFR-expressing cells having a genetic mutation at 677, and confirming that the test substance lowers the homocysteine concentration in blood. Complement Screening Method
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