KR100392780B1

KR100392780B1 - 대장균에서 발현된 세포외 신호조절 단백질카이네이즈-2의 정제방법

Info

Publication number: KR100392780B1
Application number: KR1019960061687A
Authority: KR
Inventors: 천 길 박; 중 명 조; 현 호 정
Original assignee: 주식회사 엘지생명과학
Priority date: 1996-12-04
Filing date: 1996-12-04
Publication date: 2003-11-01
Also published as: KR19980043728A

Abstract

본 발명은 대장균에서 봉입체의 형태로 발현되는 미토겐 활성 단백질 카이네이즈(mitogen activated protein kinase: MAPK)인 세포외 신호조절 단백질 카이네이즈-2(extracellular signal-regulated protein kinase-2: ERK-2)의 정제방법에 관한 것으로, ERK-2 단백질이 발현된 재조합 대장균 세포를 파쇄하고, 침전물을 세척하여 봉입체를 회수하고, 봉입체를 우레아 용액에 용해시키고, 음이온 교환 크로마토그래피한 후, 투석 및 원상화하는 단계를 포함하는 본 발명의 정제방법에 의하면, 활성을 갖는 고순도의 ERK-2 단백질을 수득할 수 있다.

Description

대장균에서 발현된 세포외 신호조절 단백질 카이네이즈-2의 정제방법{PURIFICATION METHOD OF ERK-2 EXPRESSED IN E. COLI}

도 1은 본 발명의 정제방법중 음이온 교환 크로마토그래피 단계에서 얻어지는 분획들을 전기영동한 결과이다.

도 2는 본 발명의 방법에 따라 정제된 세포외 신호조절 단백질 카이네이즈-2의 인산화 활성을 측정한 결과이다.

[발명의상세한설명]

[발명의목적]

본 발명은 대장균에서 봉입체의 형태로 발현된 미토겐 활성 단백질 카이네이즈(mitogen activated protein kinase; 이하 MAPK라 칭함)인 세포외 신호조절 단백질 카이네이즈-2(extracellular signal-regulated protein kinase-2: 이하 ERK-2라 칭함)의 정제방법에 관한 것으로, 보다 상세하게는 ERK-2 단백질이 봉입체의 형태로 발현된 대장균에 대하여 세포파쇄, 봉입체의 회수 및 용해, 음이온 교환 크로마토그래피, 투석 및 원상화하는 단계를 통하여, 활성을 갖는 ERK-2 단백질을 고순도로 얻기 위한 정제방법에 관한 것이다.

[발명이속하는기술분야및그분야의종래기술]

세포의 신호전달계는 여러 질병과의 연계성 및 생명현상의 유지를 위해 근본적으로 필요한 세포의 성장분화 등을 조절하며, 따라서 이에 대한 연구는 최근에 가장 각광 받고 있는 분야중 하나가 되고 있다. 특히 MAPK 신호전달 경로는 세포가 성장인자, 사이토카인(cytokine) 그리고 호르몬 등 각종 미토겐에 의한 자극을 받았을 때 작동되며 세포내 중간 전달물질들을 통하여 신호를 핵내부로 전달하는데, 이의 작용기전은 효모로부터 포유동물에 이르기까지 다양한 생명체에서 잘 보존되어 있다(Davis, R. J.,et al., TIBS, 19,470(1994)).

포유동물 세포에는 다양한 형태의 MAPK 경로들이 존재하며 MAPKKK(MAPK Kinase Kinase)→MAPKK(MAPK Kinase)→MAPK의 순서에 의해 신호전달을 수행한다(Neiman, A.,TIGS, 9,390(1993); Marshall, C. J.,Cell, 80,179(1995)). 특히 라스(Ras)가 중요한 신호전달 물질의 하나로 작용하는 Ras-MAPK 신호전달계는 현재 가장 잘 알려져 있는 포유동물의 MAPK 신호전달계인데, 이 신호전달에 관련하는 많은 단백질이 원암유전자(protooncogene) 산물들로서, 이들 유전자의 돌연변이에 의한 이상, 즉 단백질간의 결합이상, 유전자 증폭에 의한 단백질의 과량생산, 성분 단백질들의 활성도 변화 등은 모두 암을 유발하는 원인이 된다.

MAPK는 세포질내의 MAPK 신호전달계 말단에 작용하는 효소로서 세포밖의 신호를 핵내부로 전달하는 중요한 매개체 역할을 하며, 이의 활성변화에 따라 세포의 성장 분화 등 여러 가지 다양한 형태의 생리적인 변화가 조절된다. MAPK는 40kDa 내지 46kDa 크기의 다양한 이성체(isoform)를 가지며, 미엘린 기저 단백질(myelin basic protein)의 트레오닌(Thr) 잔기를 시험관내에서 인산화(phosphorylation)시킨다.

ERK는 고등생물에 존재하는 대표적인 MAPK로서 외부 신호에 의해 트레오닌(Thr)과 티로신(Tyr) 잔기를 인산화시킨다. 이와 같은 트레오닌과 티로신 잔기의 인산화는 MAPK 활성화에 결정적인 역할을 하므로, 이들 아미노산 잔기가 다른 아미노산 잔기로 치환될 경우에는 효소가 활성화되지 않는다는 것이 보고되었다(Robbins, D. J.,et al., J. Biol. Chem. 268,5097(1993)). ERK 유전자들의 클로닝과 단백질에 대한 연구를 통하여 이의 인산화는 이중 인산화 부위(dual-phosphorylation motif)인 트레오닌-글루탐산-티로신 부위내에서 일어난다는 것이 밝혀졌다. 이와 같은 ERK의 인산화는 트레오닌과 티로신의 두 특정 아미노산 잔기들을 인산화시키는 인산화 효소(dual-specificity protein kinase; MEK)에 의해 일어나 활성화되는 것으로 밝혀졌다(Marshall, C, J.,et al., Cell, 80,179(1995)).

MAPK의 또 다른 종류인 JNK(Jun kinase)는 세포가 자외선(ultraviolet light; UV)에 노출되었을 때 전사인자인 c-Jun을 인산화시키는 단백질로서 처음 발견되었다(Hibi, M.,et al., Genes Dev., 7,2135(1993)). 아미노산 서열 분석결과, JNK는 ERK와 매우 유사하며 같은 트레오닌과 티로신 잔기들의 인산화를 통해 활성화되는 것으로 밝혀졌지만, JNK에서 인산화 부위는 트레오닌-프롤린-티로신 부위로써 ERK와는 다른 것으로 보고되었다. 또한 JNK는 UV 이외에 종양괴사인자(TNF), 인터루킨-1(IL-1) 등에 의해서도 활성화되는 것으로 알려졌다(Hibi, M.,et al., Genes Dev., 7,2135(1993)).

p38은 가장 최근에 알려진 MAPK 계통의 인산화 단백질로서 그람음성균의 내부독소(endotoxin)에 노출되었을 때 티로신(Tyr) 잔기가 인산화되는 것에 의해 처음 밝혀졌다(Han, J.,et al., Science, 265,808(1994)). p38은 JNK와 마찬가지로 TNF, IL-1, 당지질(lipopolysaccharide; LPS) 또는 삼투압 변화(osmotic stress) 등에 의해 활성화된다. p38 단백질에 대한 기질 특이성과 ERK 및 JNK 신호전달 경로의 관계는 잘 알려져 있지 않으나, p38은 효모의 HOG1(high-osmolarity glycerol response 1)과 아미노산 서열이 가장 유사하고 Thr-Gly-Tyr의 이중 인산화 부위를 가지고 있으며 효모내에서 발현시켰을 때 HOG1의 기능을 대신할 수 있는 것으로 알려져 있다(Han, J.,et al., Science, 265,808(1994)).

ERK를 활성화시키는 MEK가 JNK나 p38 같은 MAPK는 활성화시키지 않으며(Derijard, B.,et al., Science, 267,682(1995)), 12-o-테트라데카노일포르볼-13-아세테이트(12-o-tetradecanoylphorbol-13-acetate: TPA)가 ERK를 강하게 활성화시키나 JNK 및 p38은 활성화시키지 않는 것으로 보아 이들 사이에는 높은 특이성이 있음을 알 수 있다. 또한 액티노마이신(actinomycin), 오카다산(okadaic acid)과 UV 조사 등은 JNK를 강하게 활성화시키지만 ERK에는 크게 영향을 미치지 않는데, 이와 같은 결과는 MAPK가 특이성 있게 작용한다는 사실을 확인시켜 준다. JNK와 p38 상호간의 관계는 아직 잘 알려져 있지 않지만 같은 미토겐들을 사용하는 것으로 알려져 있다.

최근에 ERK-2의 삼차원적 구조가 장(Zhang) 등에 의해 밝혀짐에 따라(Zhang, F.,et al., Nature, 367,704(1994)), MAPK의 인산화가 단백질의 활성화에 어떻게 영향을 미치는가를 이해할 수 있는 중요한 계기가 되었고 Thr과 Tyr 잔기들 모두의인산화가 MAPK 활성화에 필요한 이유 또한 규명되었을 뿐 아니라, 항암제 개발에도 응용될 것으로 기대되고 있다. MEK에 의해 인산화되는 ERK-2의 Thr183과 Tyr185들은 모든 인산화 단백질들이 그 기능을 수행하는데 필수적인 아미노산 잔기들을 포함하는 키네이즈 도메인(domain) VII와 VIII에 포함되어 있는데, Tyr185는 기질과의 결합에 중요하고 Thr183은 단백질의 활성화에 필요한 아미노산 잔기들의 위치 결정에 중요한 작용을 하는 것으로 밝혀졌다(Zhang, F.,et al., Nature, 367,704(1994)).

한편, ras, src, raf 및 mos 등 원암 유전자들의 이상은 MAPK 신호전달계 내에서 여러 단계의 신호전달 물질들의 활성 상태를 지속시킴으로써 암발생을 유발시키는 것으로 알려져 있다(Gu, Z.,et al., J. Virol., 69,8051(1995); Pelech, S. L.,et al., TIBS, 17,233(1992)). 따라서, ras 등 원암 유전자들의 돌연변이에 의해 발생한 암과 MAPK 활성도와의 상호관계를 알게 되면 MAPK 활성도 조절을 통한 암의 치료방법을 개발할 수 있으며, MAPK의 활성도를 조절하는 치료제가 개발된다면 수용체, ras, raf 같은 다양한 신호전달계의 윗단계(upstream) 성분들의 결함이 원인이 되는 다양한 종류의 암에 효과적으로 작용하는 중요한 항암제로 될 수 있을 것이다. 이와 같은 중요성에 비해 MAPK의 활성도를 조절할 수 있는 물질의 개발에 관한 연구는 현재 다른 윗단계를 겨냥한 신약개발보다 극히 미진할 뿐 아니라 실용화 단계에 있는 것은 거의 없는 실정이다.

MAPK 단백질 치료제의 개발은 MAPK 단백질에 대하여 억제 활성을 갖는 물질을 검색하여 그 기본구조를 확인하고, 이를 근간으로 다양한 억제제를 합성한 후,단백질 결정구조를 통해 합성된 물질과 단백질과의 결합구조를 확인하는 과정을 거치게 된다. 따라서 활성을 갖는 MAPK 단백질이 치료제의 개발에 필수적으로 요구된다.

이에 본 발명자들은 유전자 재조합 기술을 이용하여 ERK-2 단백질을 대장균에서 대량 발현시킨 바 있다(대한민국 특허 출원 제 96-41219 호). 그런데, 이와 같이 대장균에서 대량으로 발현되는 ERK-2 단백질은 대부분 봉입체의 형태를 갖고 있으므로 ERK-2의 검색 및 단백질 구조 연구를 위해서는 정제과정중 원상화 단계가 반드시 필요하게 된다. 따라서, 본 발명자들은 재조합 대장균에서 봉입체의 형태로 발현된 ERK-2를 활성 형태로 정제하기 위한 방법을 연구한 결과, 봉입체를 우레아를 이용하여 용해하여 이온 교환 크로마토그래피 단계를 거치는 정제방법에 의해 원래의 활성을 갖는 ERK-2를 수득할 수 있게 됨으로써 본 발명의 완성에 이르게 되었다.

[발명이이루고자하는기술적과제]

본 발명의 목적은 형질전환된 대장균으로부터 봉입체의 형태로 발현되는 ERK-2를 활성을 갖도록 정제하여 고수율로 수득할 수 있는 방법을 제공하는 것이다.

[발명의구성및작용]

상기 목적에 따라, 본 발명에서는 재조합 대장균으로부터 발현된 세포외 신호조절 단백질 카이네이즈-2의 정제방법에 있어서, 세포외 신호조절 단백질 카이네이즈-2가 발현된 재조합 대장균 세포를 파쇄하고, 불용성 침전물을 세척하여 봉입체를 회수하고, 봉입체를 우레아 용액에 용해시키고, 음이온 교환 크로마토그래피, 투석 및 원상화하는 단계를 포함하는 방법을 제공한다.

이하, 본 발명을 좀더 상세하게 설명한다.

본 발명에서는 우선 ERK-2 유전자를 포함하는 발현벡터로 형질전환된 재조합 대장균을 배양하여 얻은 세포 침전물에 완충용액을 가하여 현탁시킨 후 초음파 분쇄기로 파쇄시키고 고속 원심분리하여 가용성 단백질이 포함된 상층액을 제거하고 봉입체가 포함된 불용성 침전물을 얻는다. 불용성 침전물을 트리톤 X-100을 함유하는 완충용액으로 세척하여 봉입체를 회수하고, 여기에 우레아 용액을 가하여 용해시킨 후 원심분리하여 상층액을 회수한다.

이어서 상층액에 트리스와 우레아가 포함된 완충용액을 가하고, 동일한 완충용액으로 평형화시킨 음이온 교환 수지에 흡착시켜 오염 단백질을 제거한 다음, 0 내지 0.5M 선형 농도구배의 염화나트륨 용액으로 용출시킨다. ERK-2를 함유하는 분획을 수집하여 황산암모늄 용액에서 투석시킨 후 투석막내의 침전된 단백질을 원심분리하여 회수한다.

침전물에 우레아 용액을 가하여 용해시킨 후 용해된 단백질을 트리스-HCl, NaCl 및 EDTA가 포함된 완충용액으로 희석하여 원상화함으로써 활성을 갖는 고순도의 ERK-2 단백질을 수득할 수 있다.

이하, 본 발명을 하기 실시예에 의거하여 더욱 상세하게 설명하고자 한다. 단, 하기 실시예는 본 발명을 예시하기 위한 것일 뿐, 본 발명의 범위가 이들 만으로 제한되는 것은 아니다.

실 시 예 1

(단계 1) 세포파쇄 및 가용성 단백질의 제거

ERK-2 단백질을 발현하도록 형질전환된 재조합 대장균(KCTC 0260BP)을 M9 배지에서 배양하여 얻은 세포 침전물 약 20g(젖은 무게)에 200㎖의 완충용액 1(50mM 트리스, 150mM NaCl, 1mM EDTA, pH 8.0)을 가하여 현탁시킨 후, 얼음 중탕에서 초음파 분쇄기(Ultrasonic homogenizer 4710: Cole-Parmer, USA)로 50%의 출력과 50%의 효율 사이클(duty-cycle)에서 약 2 분간 초음파 처리하여 세포를 파쇄시켰다. 이와 같이 하여 얻은 세포 균질액을 고속 원심 분리기(Beckman JS-21M, Rotor JA-14)로 10,000 rpm에서 30 분간 원심분리하여 가용성 단백질의 상층액을 제거하고 불용성 침전물을 얻었다.

(단계 2) 불용성 침전물의 세척

상기 완충용액 1에 트리톤 X-100을 1%가 되도록 첨가한 용액 200㎖를 상기 단계 1에서 얻은 불용성 침전물에 넣고 균질화기(Heavy duty homogenizer: Cole-Parmer, USA)를 이용하여 현탁시킨 후, 고속 원심분리기로 10,000 rpm에서 30 분간 원심분리하여 침전물인 봉입체를 회수하였다.

(단계 3) 봉입체의 용해

상기 단계 2에서 얻은 봉입체에 150㎖의 8M 우레아 용액을 가하고, 1 시간 동안 용해시킨 후, 고속 원심분리하여 용해되지 않은 침전물을 제거하고 상층액 만을 취하였다.

(단계 4) 음이온 교환 크로마토그래피

단계 3에서 얻은 상층액에 동일한 부피의 완충용액 2(50mM 트리스, pH 8.0, 8M 우레아)를 가한 후, 완충용액 2로 평형화시킨 Q-세파로즈 칼럼(Pharmacia XK 50/20, Sweden)에 분당 2㎖의 속도로 통과시켰다. 이어서 100㎖의 완충용액 2를 칼럼에 흘려 이온 교환수지에 흡착되지 않는 단백질을 제거한 다음, 0 내지 0.5M 선형 농도구배의 염화나트륨을 포함하는 800㎖의 완충용액 2를 가하여 수지에 흡착되어 있던 단백질들을 분당 2㎖의 속도로 용출시켜 각 10㎖의 분획들을 수집하였다. 수집된 분획들을 15% SDS-폴리아크릴아미드 젤 전기영동하여 ERK-2 단백질을 포함하는 특정 분획들 만을 별도로 수집하여 취합하였다.

도 1은 본 발명의 정제방법중 음이온 교환 크로마토그래피 단계에서 얻어지는 분획들을 전기영동한 결과이다. 여기에서 제 1 열은 표준 분자량 단백질의 시료를 나타낸 것이고, 제 2 열은 이온 교환수지에 투입되는 단백질 용액을 나타낸 것이고, 제 3 열은 이온 교환수지에 흡착되지 않고 빠져 나가는 단백질을 나타낸 것이고, 제 4 열은 용출하여 취합된 분획을 나타낸 것이다.

(단계 5) 투석

단계 4에서 취합한 단백질 용액을 투석막(Spectrum Co, USA, MW Cut-off: 12000)에 넣은 후, 30% 황산암모늄 용액에서 투석하였다. 투석막내에 단백질이 침전되면 5,000rpm으로 20분간 원심분리하여 침전된 단백질을 수거하였다.

(단계 6) 원상화

상기의 단계 5에서 얻은 침전물에 5㎖의 8M 우레아 용액을 가하여 용해하였다. 용해된 단백질을 50㎖의 완충용액 3(25mM 트리스-HCl, pH 7.5, 150mM NaCl,1mM EDTA)으로 희석하여 원상화하였다.

확 인 예 : 인산화 측정

실시예에서 정제된 ERK-2 단백질의 활성을 미엘린 기저 단백질(myeline basic protein; 이하 MBP라 칭함)의 인산화를 통해 관찰하였다. 상기 실시예에 따라 정제된 ERK-2 단백질 20ng에 MBP를 각각 0ng, 100ng, 200ng 및 400ng씩 넣고, 방사선 동위원소 γ-³²P를 포함하는 ATP(Amersham사, 미국) 2㎕씩을 넣어 준 후, 전체 부피가 100㎕가 되도록 반응 완충용액(30mM HEPES, pH 8.0, 1mM DTT, 1mM 벤자미딘, 10mM MgCl₂)을 넣었다. 37℃에서 1 시간 동안 방치하여 반응시킨 후 얼음 그릇에 넣어 반응을 종결시켰다. 각 시료에 동량의 전기영동용 시료 용액을 넣고 12% 아크릴아미드 젤 전기영동한 후, 건조기에서 젤을 건조시키고 방사선용 필름에서 감광하여 발색시켰다.

도 2는 본 발명의 방법에 따라 정제된 ERK-2의 인산화 활성을 측정한 결과이다. 여기에서 제 1 열은 표준 분자량 단백질의 시료를 나타낸 것이고, 제 2 열 내지 제 5 열은 각각 0ng, 100ng, 200ng 및 400ng의 MBP를 넣어준 시료를 나타낸 것으로, 본 발명의 방법에 따라 정제된 ERK-2가 고유한 인산화 특성을 갖고 있음을 확인할 수 있다.

[발명의효과]

본 발명에 따라, ERK-2 단백질이 발현된 재조합 대장균 세포를 파쇄하여 봉입체를 회수하고, 우레아 용액에 용해시키고, 음이온 교환 크로마토그래피한 후,투석 및 원상화하는 단계를 포함하는 정제방법에 의하면 원래의 활성을 갖는 세포외 신호조절 단백질 카이네이즈-2를 고순도로 수득할 수 있다.

Claims

1) 세포외 신호조절 단백질 카이네이즈-2가 발현된 재조합 대장균 세포를 파쇄하는 단계;

2) 불용성 침전물을 세척하여 봉입체를 회수하는 단계;

3) 봉입체를 우레아 용액에 용해시키는 단계;

4) 음이온 교환 크로마토그래피 및 투석을 수행하여 침전 단백질을 얻는 단계; 및

5) 침전 단백질을 우레아 용액에 용해시켜 원상화하는 단계를 포함하는, 재조합 대장균에서 발현된 세포외 신호조절 단백질 카이네이즈-2의 정제방법.

제 1 항에 있어서,

상기 단계 2)에서 불용성 침전물을 트리톤 X-100을 함유하는 완충용액으로 세척하는 것을 특징으로 하는 정제방법.

제 1 항에 있어서,

상기 단계 4)의 음이온 교환 크로마토그래피가 트리스와 우레아를 포함하는 완충용액 중 0 내지 0.5 M 농도구배의 염화나트륨으로 용출시키는 것을 특징으로 하는 정제방법.

제 1 항에 있어서,

상기 단계 4)의 투석에 황산암모늄을 사용하는 것을 특징으로 하는 정제방법.

제 1 항에 있어서,

상기 단계 5)의 원상화를 우레아 용액 중 트리스-HCl, NaCl 및 EDTA를 포함하는 완충용액으로 희석하여 실시하는 것을 특징으로 하는 정제방법.