KR100199994B1 - Process for preparing phb from xylose using recombinant e. coli - Google Patents

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Abstract

본 발명은 재조합 대장균을 이용하여 크실로스(xylose)로부터 PHB(poly-3-hydroxybutyrate)를 제조하는 방법에 관한 것이다. 좀 더 구체적으로, 본 발명은 알칼리게 네스 유트로퍼스(Alxaligenes eutrophus)의 PHB 합성 유전자를 포함한 재조합 플라스미드(plasmid)로 크실로스 이용가능의 대장균을 형질전환시키고, 그를 크실로스 함유 재비에서 배양하는 PHB의 제조방법에 관한 것이다. 본 발명에 의하면, 6종의 재조합 대장균(DSM 499(pSYL105), DSM 499(pSYL107), DSM 6056(pSYL105), DSM 6056(pSYL107), KCTC 2223(pSYL105) 및 KCTC 2223(pSYL107)에 의해 크실로스로부터 PHB의 생산이 가능하며, 다양한 복합질소원의 소량 첨가에 의하여 PHB 샌산능을 향상시킬 수 있고, 특히 재조합 대장균 DSM 499(pSYL107)과 DSM 6056(pSYL107)를 이용하여 PHB를 보다 효과적으로 제조할 수 있다. 또한, 본 발명은 크실로스를 주성분으로 하며 자연계에 널리 존재하는 헤미셀롤로스부터 PHB를 제조할 수도 있으모, PHB의 경제적인 생산에도 유용하다.The present invention relates to a method for producing a poly-3-hydroxybutyrate (PHB) from xylose using recombinant E. coli. More specifically, the present invention relates to a PHB transforming Escherichia coli of xylose available with a recombinant plasmid containing PHB synthetic gene of Alxaligenes eutrophus and culturing it in a xylose-containing ash. It relates to a manufacturing method of. According to the present invention, xylose by six recombinant E. coli (DSM 499 (pSYL105), DSM 499 (pSYL107), DSM 6056 (pSYL105), DSM 6056 (pSYL107), KCTC 2223 (pSYL105) and KCTC 2223 (pSYL107) PHB can be produced, and PHB acidity can be improved by adding small amounts of various complex nitrogen sources, and PHB can be produced more effectively using recombinant E. coli DSM 499 (pSYL107) and DSM 6056 (pSYL107). In addition, the present invention can be produced PHB from hemicellulose, which is mainly composed of xylose and is widely present in nature, and is also useful for economic production of PHB.

Description

재조합 대장균을 이용하여 크실로스(xylose)로부터 PHB(poly-3-hydroxybutyrate)를 제조하는 방법Method for producing PH-3-polybutyrate from xylose using recombinant E. coli

본 발명은 재조합 대장균을 이용하여 크실로스(xylose)로부터 PHB(poly-3-hydroxybutyrate)를 제조하는 방법에 관한 것이다. 좀 더 구체적으로, 본 발명은 알칼리게네스 유트로퍼스(Alcaligenes eutrophus)의 PHB 합성 유전자를 포함한 재조합 플라스미드(plasmid)로 크실로스 이용가능의 대장균을 형질전환시키고, 그를 크실로스 함유 배지에서 배양하는 PHB의 제조방법에 관한 것이다.The present invention relates to a method for producing a poly-3-hydroxybutyrate (PHB) from xylose using recombinant E. coli. More specifically, the present invention transforms Escherichia coli of xylose available into a recombinant plasmid containing a PHB synthetic gene of Alcaligenes eutrophus, which is cultured in a xylose-containing medium. It relates to a manufacturing method of.

최근 생분해성 고분자 재료로 각광받고 있는 PHB는 미생물에 의해 합성, 축적되는 에너지 저장물질이다. PHB는 기종의 화학합성 고분자와 물리 화학 기계적 성질이 비슷하고, 생체 적합성(biocompatibility) 및 생분해성이 우수하여 자연계에서 일정시간 경과하면 미생물에 으해 물과이산화탄소로 완전분해가 되므로,환경친화 플라스틱 원료로 각광을 받고 있다. 특히 , 의 분해산물인 3-하이드록시부티레이트(3-hydroxybutyrate)는 인간 뿐만 아니라, 동물의 체내에 존재하는대사 산물이어서 수술용 봉합사 및 약물 전달 시스템(drug delivery system) 등에의 용도로 개발 되고 잇으나, 높은 생산단가 때문에 아직까지 범용의 포장재나 용기로는 사용되지 못하고 있다.PHB, which has recently been spotlighted as a biodegradable polymer material, is an energy storage material synthesized and accumulated by microorganisms. PHB has similar physicochemical and mechanical properties to other types of chemical synthetic polymers, and has excellent biocompatibility and biodegradability. After a certain time in nature, PHB is completely decomposed into water and carbon dioxide. I am in the limelight. In particular, 3-hydroxybutyrate, a degradation product of, is a metabolic product present in the body of animals as well as humans, so it is being developed for use in surgical sutures and drug delivery systems. Due to its high production cost, it is still not used as a general packaging material or container.

따라서, PHB의 경제적인 생산을 위하여, PHB 생산균주로 알려진 알칼리게네스 유트로퍼스(Alcaligenes eutrophus)와 알칼리게네스 레이터스(Alcaligenes latus) 등이 집중적으로 연구되었고(참조: USP 4,433,053: Anderson and Daws, Micrebiol.Rev., 54:450-472(1990)), 최근에는 몇몇의 연구자들에 의해 알칼리게네스 유트로퍼스의 의 합성유전자를 대장균에 클로닝함으로써, 재조합 비생물에 의한 의 생산도 가능하게 되었다(참조: WO 89/00202; Slater et al., J. Bacteriol., 170:4431-4436(1988); Schubert et al., J. Bacteriol., 170:5837-5847(1988); Peoples and Sinskey, J. Biol. Chem., 264:15298-15303(1989)).Therefore, for the economic production of PHB, Algengenes eutrophus and Alcaligenes latus, which are known as PHB producing strains, have been intensively studied (see USP 4,433,053: Anderson and Daws). , Micrebiol. Rev., 54: 450-472 (1990)), and recently, several researchers have cloned the synthetic genes of Alkaligenes eutropus into E. coli to enable production of recombinant abiotic. WO 89/00202; Slater et al., J. Bacteriol., 170: 4431-4436 (1988); Schubert et al., J. Bacteriol., 170: 5837-5847 (1988); Peoples and Sinskey J. Biol. Chem., 264: 15298-15303 (1989).

본 발명자 역시 재조합 대장균에 의해 경제적으로를 생산할 수 있는 방법을 강구하고자, 높은 복제수를 갖는 플라스미드의 개발, 플라스미드의 안정화, 형질전환용 균주의 개발, 재조합 미생물의 고농도 배양기술 개발 및 합성 촉진을 위한 배양조건 확립 등에 대한 연구를 수행하여 왔다. 이러한 연구를 통하여 복제수가 각기 다른 플라스미드 pSYL101 및 pSYL102, 이들을 안정화시키기 위하여 프라스미드 R1의 parB 영역(참조;Gerdes, Bio/Technol., 6:1402(1988))을 전기 플라스미드에 삽입시켜 제조한 pSYL103과 pSYL104를 대장균 XL1-Blue에 도입하여 합성농을 비교한 결과, 높은 복제수의 플라스미드를 사용하여야 PHB의 생산이 높음을 확인할 수 있었다(참조: Lee et al., Ann, NY Acad. Sc., 721:43-53(1994); Lee et al., J. Biotechnol., 32:203-211(1994)).In order to find a method that can be economically produced by recombinant E. coli, the present inventors have also developed a plasmid having a high copy number, stabilization of the plasmid, development of transformation strain, development of high concentration culture technology of recombinant microorganism and promotion of synthesis. Research has been conducted on establishing culture conditions. In this study, the plasmids pSYL101 and pSYL102 having different numbers of copies, pSYL103 prepared by inserting the parB region of plasmid R1 (Gerdes, Bio / Technol., 6: 1402 (1988)) into an electric plasmid to stabilize them, As a result of comparing pSYL104 to Escherichia coli XL1-Blue, it was confirmed that high copy number plasmid was used to produce high PHB (Lee et al., Ann, NY Acad. Sc., 721). : 43-53 (1994); Lee et al., J. Biotechnol., 32: 203-211 (1994).

또한, 대장균 XL1-Blue, 대장균 DH5

Figure kpo00009
, 대장균 JM109, 대장균 B, 대장균 W, 대장균 K12 등 여러 종류의 대장균에 높은 복제수를 가지면서 안정한 플라스미드 pSYL105를 도입하여, PHB 합성속도 및 수율 등에 대한 연구를 수행한 결과, 균주특성에 따라 PHB 합성속도와 수율 등이 다름을 확인하였다(참조: Lee et al., Biotechnol. Bioeng., 44:1337-1347(1994)).In addition, E. coli XL1-Blue, E. coli DH5
Figure kpo00009
Introduced stable plasmid pSYL105 with high copy number to E. coli, E. coli JM109, E. coli B, E. coli K, E. coli K12, PHB synthesis rate and yield The rate and yield were confirmed to be different (Lee et al., Biotechnol. Bioeng., 44: 1337-1347 (1994)).

아울러, PHB 합성 촉진을 위한 재조합 미생물르이 배양조건에 대한 연구를 통하여, 복합배지에 비해 저가의 단순배지에서는 PHB 합성능이 낮음을 알아내었다. 따라서, 경제적으로 고농도의 PHB를 제조할 수 있는 배양방법이 요구되었고, 이러한 방법으로 소량의 복합질소원이 첨가된 단순배지를 이용하는 방법이 제시되었으며, 트립톤(tryptone), 카사미노산(xasamino acid)혹은 카제인 가수분해물(casein hydrolysate) 등의 복합질소원을 소량(0.5 내지 5g/L)첨가함으로써, PHB 합성을 증진시킬 수 있음을 확인하였다(참조: Lee and Chang, J. Environ. Polymer Degrad., 2:169-176(1994). 또한, 전기의 복합질소원 대신에 아미노산이나 올레산(oleicacid)의 첨가로도 PHB 합성을 향상시킬 수 있음을 확인하였다(참조: Lee et al., J. Ferment. Bioeng., 79:177-180(1995)).In addition, through the study of the recombinant microorganism culture conditions for promoting PHB synthesis, it was found that PHB synthesis ability is lower in low-cost simple medium compared to the complex medium. Therefore, there was a need for a culture method capable of producing a high concentration of PHB, and a method using a simple medium with a small amount of complex nitrogen source was proposed in this way, tryptone, xasamino acid or It was confirmed that addition of a small amount (0.5 to 5 g / L) of complex nitrogen sources such as casein hydrolysate can enhance PHB synthesis (Lee and Chang, J. Environ. Polymer Degrad., 2: 169-176 (1994) Also, it was confirmed that the addition of amino acids or oleic acid instead of the former complex nitrogen source can improve PHB synthesis (Lee et al., J. Ferment. Bioeng., 79: 177-180 (1995).

한편, PHB의 생산성을 높이기 위하여 유가식 배양법을 개발하여 39시간만에 건조균체 농도 101g/L, PHB 농도 81g/L를 얻을수 있었다(참조 :Lee et al., J. Biotechnol., 32:203-211(1994)). 또한 복합질소원이 소량첨가된 단순배지에서도 유가식 배양에 의해 80g/L의 PHB를 얻을 수 있어서, 재조합 대장균에 의한 PHB의 생산이 매우 효과적임을 확인할 수있었다(참조: Lee and Chang, J. Environ.Polymer Degrad., 2:169-176(1994)).Meanwhile, in order to increase the productivity of PHB, a fed-batch culture method was developed to obtain 101 g / L of dry cell concentration and 81 g / L of PHB concentration in 39 hours (Lee et al., J. Biotechnol., 32: 203-). 211 (1994). In addition, even in a simple medium containing a small amount of complex nitrogen source, 80g / L PHB can be obtained by fed-batch culture, and it was confirmed that the production of PHB by recombinant Escherichia coli was very effective (Lee and Chang, J. Environ. Polymer Degrad., 2: 169-176 (1994)).

아울러, 재조합 대장균에 의한 PHB 생산시 균체가 필라멘테션에 의해 길어져서 세포의 성장이 둔화 혹은 정지되므로, 균체의 배양효율이 떨어질 뿐만 아니라, PHB의 생산성도 낮아진다는 문제점이 노출되어 왔는바, 이에 본 발명자는재조합 대장균의 필라멘테이션 현상을 억제 또는 방지하기 위한 연구를 거듭한 결과,필라멘테이션을 억제할 수 있는 필수 세포분열 단백질(ftsZ)의 유전자 및 PHB 유전자를 포함한 재조합 플라스미드 pSYL107을 제조하고, 그로 형질전환된 재조합 대장균이 배양시 필라멘테이션 현상을 나타내지 않으며, 고농도로 PHB를 제조할 수 있음을 밝혔다(참조; S. Y. Lee, Biotechnol. Lett., 16:1247-1252(1994): S. Y Lee. Kor, J Appl. Microbiol. Biotechnol., 22:614-620(1994): Lee and Lee, J. Environ. Polymer Degrad., 4:131-134(1996)).In addition, the production of PHB by recombinant E. coli is prolonged by filamentation, which slows down or stops the growth of cells, thereby reducing the cultivation efficiency of the cells and lowering the productivity of PHB. As a result of repeated studies to inhibit or prevent the filamentation phenomenon of recombinant E. coli, the present inventors have prepared a recombinant plasmid pSYL107 containing a gene of essential cell division protein (ftsZ) and a PHB gene capable of inhibiting filamentation. It has been shown that recombinant E. coli transformed therewith exhibits no filamentation phenomenon in culture and can produce PHB at high concentrations (see SY Lee, Biotechnol. Lett., 16: 1247-1252 (1994): S. Y Lee Kor, J Appl. Microbiol.Biotechnol., 22: 614-620 (1994): Lee and Lee, J. Environ.Polymer Degrad., 4: 131-134 (1996).

그러나 상술한 연구는 모두 포도당을 주 탄소원으로 하므로, 그의 결과 얻은 PHB의 생산단가는 포도당의 가격에 많이 의존한다. 따라서, 포도당 대신에 저가의 탄소원을 원료로하여 PHB를 제조하면, 그의 생산단가는 상당히 낮아질 수 있다.However, since the above studies all use glucose as the main carbon source, the resulting production cost of PHB depends a lot on the price of glucose. Therefore, if PHB is produced using a low-cost carbon source instead of glucose, its production cost can be significantly lowered.

크실로스는 자연계에 존재하고 있는 유용자원중 셀롤로스 다음으로 많은 부분을 차지하고 있는 헤미셀롤로스의 주요 성분이 되고 있다. 그러나, 크실로스를 효율적으로 이용하는 균주는 포도당 이용 균주에 비해 상대적으로 적은 편이어서, 크실로스의 효과적인 이용 방안이요구되고 있다.Xylose has become a major component of hemicellulose, which accounts for the largest portion of the available resources in the natural world after cellulose. However, since strains using xylose efficiently are relatively smaller than glucose-using strains, there is a demand for effective use of xylose.

지금까지 생분해성 고분자 PHB의 생산을 위해 널리 사용되어온 알칼리게네스 종이나 메탄올 자화균 등은 크실로스를 탄소원으로하여 성장할 수 없으나, 대장균중의 일부는 그를 탄소원으로 성장할 수 있다.Alkali genes or methanol magnetization bacteria, which have been widely used for the production of biodegradable polymer PHB, cannot grow using xylose as a carbon source, but some of E. coli can grow as a carbon source.

이에, 본 발명자는 PHB 합성 유전자가 클로닝된 제조합 플라스미드 pSYL105 또는pSYL107을, 크실로스를 탄소원으로 이용할 수 있는 3종의 대장균에 도입시킨 다음, 크실로스 함유 배지에서 효율적으로 PHB를 생산하는 재조합 대장균을 선별하고 본 발명을 완성하게 되었다.Therefore, the present inventors introduced the recombinant plasmid pSYL105 or pSYL107, in which the PHB synthetic gene was cloned, into three types of E. coli, which can use xylose as a carbon source, and then, recombinant E. coli efficiently producing PHB in xylose-containing medium. Selection and completion of the present invention.

결국, 본 발명의 목적은 PHB 합성 유전자를 포함한 재조합 플라스미드로 크실로스 이용가능의 대장균을 형질전환시키고, 이 형질전환체를 크실로스 함유 배지에서 배양하는 PHB의 제조 방법을 제공하는 것이다.After all, an object of the present invention is to provide a method for producing PHB, wherein the recombinant plasmid containing PHB synthetic gene is transformed into E. coli xylose, and the transformant is cultured in xylose-containing medium.

제1도는 재조합 플라스미드 pSYL105의 유전자 지도를 나타낸다.1 shows a genetic map of recombinant plasmid pSYL105.

제2도는 재조합 플라스미드 pSYL107의 유전자 지도를 나타낸다.2 shows a genetic map of recombinant plasmid pSYL107.

이하 본 발명을 보다 구체적으로 설명하고자 한다.Hereinafter, the present invention will be described in more detail.

우선, 크실로스를 탄소원으로하여 성장할 수잇는 것으로 알려진 대장균이 크실로스가 첨가된 PHB 생산배지에서 성장하는 지를 알아보기 위하여, 단순배지(KH2PO413.5 g/L, (NH4)2HPO44g/L, MgSO47H2O 1.4 g/L, 시트르산(citric acid) 1.7 g/L, FeSO47H2O 0.1 g/L, CaCl22H2O 0.02 g/L, ZnSO47H2O 0.022 g/L, MnSO44H2O 0.005g/L, CuSO45H2O 0.01 g/L, (NH4)6Mo7O244H2O 0.001 g/L, Na2B4O710H2O 0.002 g/L 및 티아민(thiamine)0.01 g/L으로 구성된 배지)에 크실로슬를 첨가하여, 공지의 대장균 균주들을 대상으로 3종의 크실로스 이용가능 대장균(Escherichia coli) 즉, E. coli B(DSM 499), E. coli TG1(DSM 6056) 및 E. coli W3110(KCTC 2223)을 선별하고, 그후 PHB 생산배지에서 성장정도를 알아보았다. 그 결과, 전술한 균주들은 크실로스가 첨가된 PHB 생산배지에서 성장함을 확인 하였다.First, to determine whether E. coli, which is known to be able to grow with xylose as a carbon source, grows in PHB production medium containing xylose, it is simple medium (KH 2 PO 4 13.5 g / L, (NH 4 ) 2 HPO 4 4 g / L, MgSO 4 7H 2 O 1.4 g / L, citric acid 1.7 g / L, FeSO 4 7H 2 O 0.1 g / L, CaCl 2 2H 2 O 0.02 g / L, ZnSO 4 7H 2 O 0.022 g / L, MnSO 4 4H 2 O 0.005 g / L, CuSO 4 5H 2 O 0.01 g / L, (NH 4 ) 6 Mo 7 O 24 4H 2 O 0.001 g / L, Na 2 B 4 O 7 10H 2 O Xylose was added to a medium consisting of 0.002 g / L and thiamine 0.01 g / L, and three xylose available Escherichia coli, E. coli B ( DSM 499), E. coli TG1 (DSM 6056) and E. coli W3110 (KCTC 2223) were screened and then grown in PHB production medium. As a result, the above-mentioned strains were confirmed to grow in the PHB production medium to which xylose was added.

전기 3종의 대장균을 PHB(poly-3-hydroxybutyrate)함성 우전자가 클로닝된 플라스미드, 바람직하게는 베타-락타메이즈, 알칼리게네스 유트로퍼스이 PHB 합성유전자 및 플라스미드 R1의 parB 영역을 포함하는 재조합 플라스미드 pSYL105에 필수 세포분열 단백질(ftsZ)의 유전자를 삽입시켜 제조한 제조합 플라스미드 pSYL107(참조: S. Y. Lee Biotechnol. Lett., 16:1247-1252(1994))로 각각 형질전환시켰다. 이때, PHB 합성유전자는 알칵리게네스 유트로퍼스 유래의 PHB 합성 유전자 뿐만 아니라, 다른 박테리아 유래의 PHB 합성 유전자도 사용될 수 있다.The first three E. coli plasmids cloned with a poly-3-hydroxybutyrate (PHB) -containing mutant, preferably beta-lactamase, Alkogen genes Eutropus is a recombinant plasmid containing the PHB syngene and the parB region of plasmid R1. Each was transformed with the synthetic plasmid pSYL107 (SY Lee Biotechnol. Lett., 16: 1247-1252 (1994)) prepared by inserting the gene of essential cell division protein (ftsZ) into pSYL105. In this case, the PHB synthetic gene may be used not only PHB synthetic gene derived from Alkagenes eutropus, but also PHB synthetic gene derived from other bacteria.

이렇게 얻은 형질전환체들을 크실로스 함유 재비, 바람직하게는 크실로스을 10 내지 100g/L의 논도로 포함한 상기 단순배지. 혹은 크실로스을 10 내지 100g/L의 농도로 포함하고 복합질소원이 0.1 내지 10 g/L첨가된 상기 단순배지에서 배양하고, 최종 건조균체농도, PHB 농도 및 PHB 함량(건조균체농도당 PHB농도의페센트(%))을 결정하였다. 이때, pSYL105의 형질전환체는 20

Figure kpo00010
내지 40
Figure kpo00011
, 보다 바람직하게는 25
Figure kpo00012
내지 38
Figure kpo00013
, 가장 바람직하게는 37
Figure kpo00014
에서 배양하였고, pSYL107의 형질전환체는 미니셀(minicell)의 형성을 방지하기 위하여 20
Figure kpo00015
내지 40
Figure kpo00016
, 보다 바람직하게는 25
Figure kpo00017
내지 35
Figure kpo00018
, 가장 바람직하게는 30
Figure kpo00019
에서 배양하였다(참조: Lee, Biotechnol. Lett., 16:1247-1252(1994))The simple medium comprising the transformants thus obtained contains a xylose-containing ash ratio, preferably xylose at a degree of 10 to 100 g / L. Or cultured in the simple medium containing xylose at a concentration of 10 to 100 g / L and adding 0.1 to 10 g / L of the complex nitrogen source, and final dry cell concentration, PHB concentration and PHB content (PHB concentration per dry cell concentration). Cents). At this time, the transformant of pSYL105 is 20
Figure kpo00010
To 40
Figure kpo00011
, More preferably 25
Figure kpo00012
To 38
Figure kpo00013
, Most preferably 37
Figure kpo00014
And pSYL107 transformants were cultured at 20 to prevent minicell formation.
Figure kpo00015
To 40
Figure kpo00016
, More preferably 25
Figure kpo00017
To 35
Figure kpo00018
, Most preferably 30
Figure kpo00019
(Lee, Biotechnol. Lett., 16: 1247-1252 (1994))

그 결과, 6종의 형질전환체 모두는 크실로스로부터 PHB를 생산할 수 있었으며, 단순배지보다는 복합질소원이 첨가된 단순배지에서의 PHB 생산능이 더욱 우수하였다.As a result, all six transformants were able to produce PHB from xylose, and PHB production ability was better in simple medium containing complex nitrogen source than simple medium.

상기에서, 복합질소원으로는 트립톤(tryptone), 효모 추출물, 펩톤(peptone), 카사미노산(casamino acid), 코튼 시드 가수분해물(cotton seed hydrolysate), 육즙 추출물(beef liquor) 또는 소이빈 가수분해물(soyvean hydrelysate) 등이 사용될 수 있다. 또한, 본 발명에서는 크실로스 대신에 그를 주성분으로 하는 헤미셀롤로스의 가수분해물을 사용할 수 있다.In the complex nitrogen source, tryptone, yeast extract, peptone, casamino acid, cotton seed hydrolysate, juicy liquor or soybean hydrolyzate ( soyvean hydrelysate) and the like can be used. In addition, in this invention, the hydrolyzate of hemicellulose can be used instead of xylose.

본 발명에 의하면, PHB 합성유전자를 포함한 재조합 플라스미드로 크실로스 이용가능의 대장균을 형질전환시키고, 이 형질전환체를 크실로스 함유 배지에서 배양하여 PHB를 효과적으로 생산할 수 있으며, 복합질소원의 소량첨가에 의해 PHB 합성농을 향상시킬 수 있었다. 또한, 본 발명은 크실로스를 주성분으로 하며 자연계에 널리 존재하는 헤미셀롤로스부터 PHB를 제조할 수 있으므로, PHB의 경제적인 생산에 도 유용하다.According to the present invention, a recombinant plasmid containing a PHB synthetic gene can be transformed into E. coli xylose, and the transformant can be cultured in a xylose-containing medium to effectively produce PHB. PHB synthetic concentrations could be improved. In addition, the present invention is useful for economical production of PHB, since the main component of xylose can be produced PHB from hemicellulose, which is widely present in nature.

이하, 실시예를 통하여 본 발명을 더욱 상세히 설명하고자 한다. 이들 실시예는 오로지 본 발명을 보다 구체적으로 설명하기 위한 것으로, 본 발명의 요지에 따라 본 발명의 범위가 이들 실시예에 의해 제한되지 않는다는 것은 당업계에서 통상의 지식을 가진 자에게 있어서 자명할 것이다.Hereinafter, the present invention will be described in more detail with reference to Examples. These examples are only for illustrating the present invention in more detail, it will be apparent to those of ordinary skill in the art that the scope of the present invention is not limited by these examples in accordance with the gist of the present invention. .

[실시예 1]Example 1

크실로스를 탄소원으로 하는 PHB 생산배지에서의 대장균 성장 확인Confirmation of Escherichia Coli Growth in PHB Production Medium Using Xylose as Carbon Source

크실로스를 탄소원으로 한 PHB 생산의 단순배지에서 공지의 크실로스 이용가능 대장균이 성장하는지를 알아보기 위하여, 하기 표 1의 단순배지에 크실로스를 20 g/L 첨가하고, 공지의 크실로스 이용가능 균주인 3종의 대장균 즉, E. coli B(DSM 499), E. coli TG1(DSM 6056) 및 E. coli W3110(KCTC 2223)을 플라스크 배양하면서 그들의 성장능을 결정한 결과, 전기 대장균 균주들이 크실로스를 탄소원으로하여 성장하는 것으로 밝혀졌다, 따라서 하기의 실시예에서는 이 3종의 균주를 형질전환용 균주로 이용하였다.In order to determine whether the known xylose available Escherichia coli grow in a simple medium of PHB production using xylose as a carbon source, 20 g / L of xylose was added to the simple medium of Table 1 below, and the known xylose available strain Three Escherichia coli strains, namely E. coli B (DSM 499), E. coli TG1 (DSM 6056), and E. coli W3110 (KCTC 2223), were cultured in flask flasks. Was found to grow as a carbon source, therefore, in the following examples, these three strains were used as strains for transformation.

Figure kpo00002
Figure kpo00002

[실시예 2]Example 2

크실로스로부터 PHB 합성유전자 및 플라스미드 R1의 parB 영역을 포함하는 재조합 플라스미드 pSYL105(참조 : 제 1도: Lee et al., Biotechnol.Bioeng., 44: 1337-1347(1994))와 전기 pSYL105에 필수 세포분열 단백질(ftsZ)의 유전자를 삽입시켜 제조한 재조합 플라스미드 pSYL107(참조: 제 2도는: S.Y. Lee, Biotechnol. Lett., 16:1247-1252(1994))로 실시예 1에서 성장이확인된 3종의 대장균을 각각 형질전환시켰다. 이때, 형질전환은 일렉트로포레이션(electroporation) 방법으로 수행하였다.(참조: Dower et al., Nucleic Acids Res., 16:6127-6145(1988)).Recombinant plasmid pSYL105 (see FIG. 1: Lee et al., Biotechnol. Bioeng., 44: 1337-1347 (1994)) comprising the PHB syngene from xylose and the parB region of plasmid R1, and cells essential for pSYL105 Three species confirmed growth in Example 1 by recombinant plasmid pSYL107 (see FIG. 2: SY Lee, Biotechnol. Lett., 16: 1247-1252 (1994)) prepared by inserting the gene of the cleavage protein (ftsZ). Of E. coli were transformed. At this time, transformation was performed by an electroporation method (Dower et al., Nucleic Acids Res., 16: 6127-6145 (1988)).

이렇게 제조한 6종의 형질전환체에서 플라스미드를 분리하고 제한 효소로 절단하여 전기영동함으로써, 전기 형질전환체들은 pSYL105 또는pSYL107를 정확히 포함하고 있는 것으로 확인되었으며, 그들을 각각 DSM 499(6),DSM 499(pSYL107), DSM 6056(pSYL105), DSM 6056(pSYL107), KCTC 2223(pSYL105) 및 KCTC 2223(pSYL107)이라 명명하였다.By separating the plasmids from the six transformants thus prepared, and digesting them with restriction enzymes, electrophoresis was confirmed that the electrotransformants contained exactly pSYL105 or pSYL107, and they were respectively identified as DSM 499 (6) and DSM 499. (pSYL107), DSM 6056 (pSYL105), DSM 6056 (pSYL107), KCTC 2223 (pSYL105) and KCTC 2223 (pSYL107).

[실시예 3]Example 3

크실호스로부터 PHB의 제조Preparation of PHB from Xylhose

크실로스를 주 탄소원으로 하는 배지에 상기에서 제조한 재조합 대장균을 배양하여 PHB를 효율적으로 제조하였다.PHB was efficiently prepared by culturing the recombinant E. coli prepared above in a medium containing xylose as the main carbon source.

[실시예 3-1]Example 3-1

최적 크실로스 농도의결정Determination of Optimal Xylose Concentration

크실로스로부터의 PHB 생산능을 살펴보기에 앞서, 균주의 성장에 최적이 SZMTLF로스 농도를 결정하고자, 상기 표 1의 단순배지에 크실로스를 20,50,80,120g/L의 농도가 되도록첨가하여 4종의 배지를 준비한 다음, 실시예 2에서 얻은 6종의 형질전환체를 접종하고 60시간 배양하여, 600NM에서의 흡광도(OD)를 측정하였다(참조 : 표 2) 이때,pSYL105 형질전환체는 37

Figure kpo00020
, pSYL107 형질전환체는 30
Figure kpo00021
에서 배양하였다.Prior to examining the PHB production capacity from xylose, to determine the optimal SZMTLF loss concentration for the growth of the strain, by adding xylose to the concentration of 20,50,80,120 g / L to the simple medium of Table 1 After preparing four kinds of medium, six kinds of transformants obtained in Example 2 were inoculated and incubated for 60 hours to measure absorbance (OD) at 600 NM (see Table 2). 37
Figure kpo00020
, pSYL107 transformants were 30
Figure kpo00021
Incubated at.

Figure kpo00003
Figure kpo00003

상기 표 2에서 보즛이, 탄소원 소모에 비해 가장 우수한 균주 성장을 제공하는 최적 크실로스 농도는 형질전환체에 따라 상이하게 나타났는 바, DSM 499(pSYL105)는 50 g/L: DSM 499(pSYL107)은 80 g/L DSM 6065(pSYL105)는 20 g/L; DSM 6056(pSYL107)은 20 g/L; KCTC 2223(pSYL105)는 20 g/L; KCTC 2223(pSYL107)은 20 g/L의 크실로스 농도에서 최적의 성장을 나타내었다.In addition, in Table 2, the optimum xylose concentration providing the best strain growth compared to carbon source consumption was different depending on the transformant, and DSM 499 (pSYL105) was 50 g / L: DSM 499 (pSYL107). Silver 80 g / L DSM 6065 (pSYL105) at 20 g / L; DSM 6056 (pSYL107) is 20 g / L; KCTC 2223 (pSYL105) at 20 g / L; KCTC 2223 (pSYL107) showed optimal growth at a xylose concentration of 20 g / L.

[실시예 3-2]Example 3-2

크실로스 함유 단순배지에서 PHB의 제조Preparation of PHB in Xylose-Containing Simple Medium

실시예 3-1에서 결정한 최적 농도로 크실로스를 함유한 단순배지 50mL를 250mL 플라스크에 넣고, 해당 크실로스 농도에서 최적의 성장을 나타내는 형질전환체를 각각 접종하고 60시간 진탕배양하여 PHB 생산능을 결정하였다. 이때 pSYL105 형질전환체는 37

Figure kpo00022
, pSYL107 형질전환체는 30
Figure kpo00023
에서 배양하였다. PHB 생산농은 공지의 방법으로 측정하는 건조균체농도. PHB농도, PHB 함유량으로 결정하였으며 (참조: Lee at al., Biotechnol. Bioeng,. 44: 1337-1347(1994)), 그 결과를 표 3에 나타내었다.50 mL of simple medium containing xylose was added to a 250 mL flask at the optimum concentration determined in Example 3-1, and each strain was inoculated with the transformant showing the optimal growth at the corresponding xylose concentration and shaken for 60 hours to induce PHB production capacity. Decided. Wherein the pSYL105 transformant is 37
Figure kpo00022
, pSYL107 transformants were 30
Figure kpo00023
Incubated at. PHB production concentration is the dry cell concentration measured by a known method. PHB concentration was determined by the PHB content (Lee at al., Biotechnol. Bioeng ,. 44: 1337-1347 (1994)), and the results are shown in Table 3.

Figure kpo00004
Figure kpo00004

상기 표 3에서 보듯이, 6종의 형질전환체 모두 크실로스로부터 PHB를 생상할 수있었는데, 그 중에서도 2종의 재조합 대장균 DSM 499(pSYL107)과 DSM 6056(pSYL107)이 보다 효율적으로 PHB를 생산함을 알수 잇었다.As shown in Table 3, all six transformants were able to produce PHB from xylose, among which two recombinant E. coli DSM 499 (pSYL107) and DSM 6056 (pSYL107) produced PHB more efficiently. I could see.

[실시예 3-3]Example 3-3

복합질소원이 첨가된 크실로스 함유 단순배지에서의 PHB 제조Preparation of PHB in Xylose-Containing Simple Medium Added Complex Nitrogen

제조합 대장균을 이용한 포도당으로부터의 PHB 생산시, 복합질소원의 소량 첨가가 PHB 합성을 증대시킬 수있다는 보고 (참조 : Lee and Chang, J. Environ. Polymer degrad., 2:169-176(1994))를 근거로하여 크실로스로부터의 PHB 합성시에도 복합질소원의 첨가가 PHB 합성을 증대시킬 수 있는지 알아보기 위하여, 크실로스 함유 단순배지에 하기 표 4의 복합질소원이 소량 첨가된다는 점을 제외하고는, 실시예3-2와 동일한 방법으로 각각의 재조합 대장균을 배양한 다음, 균체성장과 PHB 농도를 측정하였다(참조: 표 5). 이때, 복합질소원은 고수율의 PHB 생산을제공하는 것으로 이미 보고된 농도로 첨가하였다(참조 : Lee and chang, J. Environ. Polymer degrad., 2: 169-176(1994)).In the production of PHB from glucose using preparative E. coli, small amounts of complex nitrogen sources may increase PHB synthesis (Lee and Chang, J. Environ. Polymer degrad., 2: 169-176 (1994)) In order to determine whether addition of a composite nitrogen source may increase PHB synthesis even when synthesizing PHB from xylose on the basis of the above, except that a small amount of the composite nitrogen source of Table 4 is added to the xylose-containing simple medium, After incubating each recombinant E. coli in the same manner as in Example 3-2, cell growth and PHB concentration were measured (see Table 5). At this time, the complex nitrogen source was added at a concentration already reported to provide high yield of PHB production (Lee and chang, J. Environ. Polymer degrad., 2: 169-176 (1994)).

Figure kpo00005
Figure kpo00005

Figure kpo00006
Figure kpo00006

상기 표 5에서 보듯이, 복합질소원의 소량 첨가에 의하여 재조합 대장균주의 PHB 합성능이 향상되었으며, 그 향상효과는 499(pSYL107)과 dsm 6056(pSYL107)의 경우에 더욱 큼을 알 수 있었다. 특히, DSM 400(pSYL107)의 경우 소이빈 가수분해물의 첨가시 PHB 농도가 3.91 g/L,PHB 함량이 71.4%로서 매우 효과적이었고, 저가의 콘스팁리커 참가시에도 PHB 농도가 3.17 g/L, PHB 함량이 62.2%로서 매우 효과적임을 알 수 있었다. 또한, DSM 6056(pSYL107)의 경우에도, 효모 추출물, 카사미노산, 코튼 시드 가수분해물 혹은 소이빈 가수분해물의 첨가시 농도는 3 g/L를 초과하고, PHB 함량도 60%이상이어서, 전기 복합질소원의 첨가에의해 매우 효과적인 PHB 생산이 가능함을 알 수 있었다. 전기 복합질소원 중에서도 소이빈 가수분해물의 첨가시, DSM 6056(pSYL107)에 의해 생산되는 PHB 농도는 4.40g/L PHB 함량은 74%에 육박하여 가장 효과적임을 확인하였는 바, 20 g/L의 크실로스로부터 생산된 PHB 4.4 g/L를 기준으로할 때, 그의 수율은 크실로스 g당 PHB 0.22 g으로 매우 높음을 알 수 있었다.As shown in Table 5, the PHB synthesis ability of the recombinant E. coli strain was improved by the addition of a small amount of a composite nitrogen source, the improvement effect was found to be greater in the case of 499 (pSYL107) and dsm 6056 (pSYL107). Especially, in case of DSM 400 (pSYL107), PHB concentration was 3.91 g / L and PHB content was 71.4% when soybean hydrolyzate was added, and PHB concentration was 3.17 g / L even at low cost cornspiker. The PHB content was found to be very effective as 62.2%. In addition, even in the case of DSM 6056 (pSYL107), the concentration of the yeast extract, casamino acid, cotton seed hydrolyzate or soybean hydrolyzate is more than 3 g / L and the PHB content is 60% or more. It can be seen that the addition of the very effective PHB production. The addition of soybean hydrolyzate among the above composite nitrogen sources showed that the PHB concentration produced by DSM 6056 (pSYL107) was the most effective, reaching 4.40 g / L PHB content of 74%, and 20 g / L xylose. Based on 4.4 g / L of PHB produced from it, the yield was found to be very high, 0.22 g of PHB per g of xylose.

이상에서 상세히 설명하였듯이, 본 발명은 알칼리게네스 유트로퍼스이 PHB 합성 유전자가 클로닝된 플라스미드로 형질전환된 재조합 대장균을 이용하여크실로스로부터 PHB를 제조하는 방법을 제공한다. 본 발명에 의하면, 6종의 재조합 대장균(DSM 499(pSYL105),DSM499(pSYL107), DSM 6056 (pSYL105), DSM 6056(pSYL107), KCTC 2223(pSYL105), 및 KCTC 2223(pSYL107)에 의해 크실로스로부터 PHB의 생산이 가능하며, 특히 재조합 대장균 DSM 499(pSYL107)과 DSM 6056(pSYL107)를 이용하여 고농도의 PHB를 보다 효과적으로 제조할 수 있고, 다양한 복합질소원의 소량 첨가에 의하여 PHB 생산능을 향상시킬 수 있다. 또한, 본 발명은 크실로스를 주성분으로 하며 자연계에 널리 존재하는 헤미셀롤로스로부터 PHB를 제조할 수도 있으므로, PHB의 경제적인 생산에도 유용하다.As described in detail above, the present invention provides a method for producing PHB from xylose using a recombinant E. coli transformed with a plasmid cloned with an alkali genes eutropus cloned PHB synthetic gene. According to the present invention, xylose by six recombinant E. coli (DSM 499 (pSYL105), DSM499 (pSYL107), DSM 6056 (pSYL105), DSM 6056 (pSYL107), KCTC 2223 (pSYL105), and KCTC 2223 (pSYL107) PHB production is possible, and in particular, high concentration of PHB can be produced more effectively by using recombinant E. coli DSM 499 (pSYL107) and DSM 6056 (pSYL107), and improve the PHB production ability by adding small amount of various complex nitrogen sources. In addition, the present invention is also useful for economical production of PHB, since PHB can be prepared from hemicellulose, which is mainly composed of xylose and is widely present in nature.

Claims (6)

크실로스(xylose)를 탄소원으로 이용하는 대장균(Escherichia coli)을 PHB(poly-3-hydroxybutyrate) 합성 유전자가 클로닝된 플라스미드로 형질 전환시키고, 이 형질전환체를 탄소원으로 크실로스를 함유하는 배지에서 배양하는 공정을 포함하는 PHB의 제조방법.Escherichia coli using xylose as a carbon source was transformed into a plasmid cloned with a poly-3-hydroxybutyrate (PHB) synthetic gene, and the transformant was cultured in a medium containing xylose as a carbon source. Method for producing a PHB comprising the step. 크실로스를 탄소원으로 이용하는 대장균(Escherichia cole)은 E. coli B(DSM 499), E. coli TG1(DSM 6056) 또는 E. coli W3110(KCTC 2223)인 것을 특징으로 하는 PHB의 제조방법.Escherichia coli using xylose as a carbon source is E. coli B (DSM 499), E. coli TG1 (DSM 6056) or E. coli W3110 (KCTC 2223). 플라스미드는 베타-락타메이즈, PHB 합성유전자 및 플라스미드 R1의 parB 영역을 포함하는 pSYL105, 혹은 베타-락타메이즈 PHB 합성 유전자, 플라스미드 R1의 parB 영역 및 필수 세포분열 단백질(ftsZ)의 유전자를 포함하는 pSYL107인 rut을 특징으로 하는 PHB의제조방법.The plasmid is pSYL105 comprising the beta-lactamase, the PHB syngene and the parB region of plasmid R1, or pSYL107 comprising the beta-lactamase PHB synthetic gene, the parB region of plasmid R1 and the gene of essential cell division protein (ftsZ). PHB manufacturing method characterized by rut. 제1항에 있어서 크실로스 함유 배지는 KH2PO413.5 g/L, (NH4)2HOP44 g/L, MgSO47H2O 1.4 g/L, 시트르산(citric acid) 1.7 g/L, FeSO47H2O 0.1 g/L, CaCl22H2O 0.02 g/L, ZnSO47H2O 0.022 g/L, MnSO44H2O 0.005 g/L, CuSO45H2O 0.01 g/L, (NH4)6Mo7O244H2O 0.001 g/L, Na2B4O710H2O 0.002 g/L 및 티아민(thiamine)0.01 G/l로 구성된 단순배지 혹은 복합질소원이 0.1 내지 10 G/l로 첨가된 전기의 단순배지에, 크실로스 도는 헤미셀롤로스 가수분해물을 첨가한 배지인 것을 특징으로 하는 H2O의 제조방법.The method of claim 1, wherein the xylose-containing medium is KH 2 PO 4 13.5 g / L, (NH 4 ) 2 HOP 4 4 g / L, MgSO 4 7H 2 O 1.4 g / L, citric acid 1.7 g / L , FeSO 4 7H 2 O 0.1 g / L, CaCl 2 2H 2 O 0.02 g / L, ZnSO 4 7H 2 O 0.022 g / L, MnSO 4 4H 2 O 0.005 g / L, CuSO 4 5H 2 O 0.01 g / L , (NH 4 ) 6 Mo 7 O 24 4H 2 O 0.001 g / L, Na 2 B 4 O 7 10H 2 O 0.002 g / L and thiamine (0.01 G / l) of simple medium or complex nitrogen source 0.1 to Method for producing H 2 O, characterized in that the medium to which the xylose or hemicellulosic hydrolyzate is added to a simple medium of electricity added at 10 G / l. 제4항에 있어서, 복합질소우너은 트립톤(tryptone), 효모 추출물, 펩톤(peptone), 카사미노산(casamino acid), 코튼 시드 가수분해물(cotton seed hydrolysate), 육즙 추출물(beef extract),카제인 가수분해물(casein hydrolysate), 콘스팁리커(corn steep liquor) 및 소이빈 가수분해물(soybean hydrolysate)로 구성된 그룹으로부터 선택되는 1종 이상의 질소원인 것을 특징으로하는 PHB의 제조방법.The method of claim 4, wherein the complex nitrogen source is tryptone, yeast extract, peptone, casamino acid, cotton seed hydrolysate, juicy extract, casein hydrolyzate A method for producing PHB, characterized in that it is at least one nitrogen source selected from the group consisting of casein hydrolysate, corn steep liquor and soybean hydrolysate. 제1항 또는 제4항에 있어서, 크실로스는 10 내지 100g/L의 농도롤 첨가되는 것을 특징으로 하는 PHB의제조방법.The method for producing PHB according to claim 1 or 4, wherein xylose is added in a concentration of 10 to 100 g / L.
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