JPWO2021030778A5 - - Google Patents

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JPWO2021030778A5
JPWO2021030778A5 JP2022509588A JP2022509588A JPWO2021030778A5 JP WO2021030778 A5 JPWO2021030778 A5 JP WO2021030778A5 JP 2022509588 A JP2022509588 A JP 2022509588A JP 2022509588 A JP2022509588 A JP 2022509588A JP WO2021030778 A5 JPWO2021030778 A5 JP WO2021030778A5
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ある態様において、本発明は以下であってもよい。
[態様1]ヌクレオシド間連結基を介して連結された12~70個の連結ヌクレオシドからなる修飾オリゴヌクレオチドを含むオリゴマー化合物であって、少なくとも1個のヌクレオシドが、修飾糖部分を含み、前記ヌクレオシド間連結基のうちの少なくとも1個が、式XVIIを有し、
式中、式XVIIを有する前記修飾オリゴヌクレオチドの各ヌクレオシド間連結基について独立して、
Xが、OまたはSから選択され、
が、H、C~Cアルキル、及び置換C~Cアルキルから選択され、
Tが、SO、C(=O)R、及びP(=O)Rから選択され、式中、
が、アリール、置換アリール、複素環、置換複素環、芳香族複素環、置換芳香族複素環、ジアゾール、置換ジアゾール、C~Cアルコキシ、C~Cアルキル、C~Cアルケニル、C~Cアルキニル、置換C~Cアルキル、置換C~Cアルケニル、置換C~Cアルキニル、及びコンジュゲート基から選択され、
が、アリール、置換アリール、CH、N(CH、OCH、及びコンジュゲート基から選択され、
が、OCH、OH、C~Cアルキル、置換C~Cアルキル、及びコンジュゲート基から選択され、
が、OCH、OH、C~Cアルキル、及び置換C~Cアルキルから選択される、
前記オリゴマー化合物。
[態様2]ヌクレオシド間連結基を介して連結された12~70個の連結ヌクレオシドからなる修飾オリゴヌクレオチドを含むオリゴマー化合物であって、少なくとも1個のヌクレオシドが、修飾糖部分を含み、前記ヌクレオシド間連結基のうちの少なくとも1個が、式XVIIを有し、
式中、式XVIIを有する前記修飾オリゴヌクレオチドの各ヌクレオシド間連結基について独立して、
Xが、OまたはSから選択され、
が、H、C~Cアルキル、及び置換C~Cアルキルから選択され、
Tが、SO、C(=O)R、及びP(=O)Rから選択され、式中、
が、アリール、置換アリール、複素環、置換複素環、芳香族複素環、置換芳香族複素環、ジアゾール、置換ジアゾール、C~Cアルコキシ、C~Cアルキル、C~Cアルケニル、C~Cアルキニル、置換C~Cアルキル、置換C~Cアルケニル置換C~Cアルキニル、及びコンジュゲート基から選択され、
が、アリール、置換アリール、CH、N(CH、OCH、及びコンジュゲート基から選択され、
が、OCH、OH、C~Cアルキル、置換C~Cアルキル、及びコンジュゲート基から選択され、
が、OCH、OH、C~Cアルキル、及び置換C~Cアルキルから選択されるが、
但し、XがOである場合、及びRがHである場合、Tが、
でないことを条件とする、
前記オリゴマー化合物。
[態様3]少なくとも1個のヌクレオシド間連結基が、ホスホジエステルまたはホスホロチオエートヌクレオシド間連結基である、態様1または態様2に記載のオリゴマー化合物。
[態様4]少なくとも1個のヌクレオシドが、2’-β-D-デオキシリボシル糖部分を含む、態様1~3のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
[態様5]式XVIIの少なくとも1個のヌクレオシド間連結基について、XがOである、態様1~4のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
[態様6]式XVIIの少なくとも1個のヌクレオシド間連結基について、XがSである、態様1~5のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
[態様7]式XVIIの少なくとも1個のヌクレオシド間連結基について、Rが、Hである、態様1または2に記載のオリゴマー化合物。
[態様8]式XVIIの少なくとも1個のヌクレオシド間連結基について、Rが、C~Cアルキルである、態様1または2に記載のオリゴマー化合物。
[態様9]Rが、メチルである、態様6に記載のオリゴマー化合物。
[態様10]式XVIIの少なくとも1個のヌクレオシド間連結基について、Rが、置換C~Cアルキルである、態様1または2に記載のオリゴマー化合物。
[態様11]式XVIIの少なくとも1個のヌクレオシド間連結基について、Tが、コンジュゲート基を含む、態様1~10のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
[態様12]前記コンジュゲート基が、細胞標的化部分を含む、態様11に記載のオリゴマー化合物。
[態様13]前記コンジュゲート基が、炭水化物または炭水化物クラスターを含む、態様11に記載のオリゴマー化合物。
[態様14]前記コンジュゲート基が、少なくとも1つのGalNAcを含む、態様11~13のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
[態様15]前記コンジュゲート基が、C10~C20アルキル鎖を含む、態様11に記載のオリゴマー化合物。
[態様16]前記コンジュゲート基が、C16アルキルを含む、態様15に記載のオリゴマー化合物。
[態様17]式XVIIの少なくとも1個のヌクレオシド間連結基について、Tが、コンジュゲート基を含まない、態様1~10のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
[態様18]式XVIIの少なくとも1個のヌクレオシド間連結基について、Tが、細胞標的化部分を含まない、態様1~10のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
[態様19]式XVIIの少なくとも1個のヌクレオシド間連結基について、Tが、SOである、態様1~18のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
[態様20]Rが、アリールである、態様19に記載のオリゴマー化合物。
[態様21]Rが、置換アリールである、態様19に記載のオリゴマー化合物。
[態様22]Rが、複素環である、態様19に記載のオリゴマー化合物。
[態様23]Rが、置換複素環である、態様19に記載のオリゴマー化合物。
[態様24]Rが、芳香族複素環である、態様19に記載のオリゴマー化合物。
[態様25]Rが、置換芳香族複素環である、態様19に記載のオリゴマー化合物。
[態様26]Rが、ジアゾールである、態様19に記載のオリゴマー化合物。
[態様27]Rが、置換ジアゾールである、態様19に記載のオリゴマー化合物。
[態様28]Rが、アミンである、態様19に記載のオリゴマー化合物。
[態様29]Rが、置換アミンである、態様19に記載のオリゴマー化合物。
[態様30]Rが、C~Cアルコキシ、C~Cアルケニル、またはC1~-アルキニルである、態様19に記載のオリゴマー化合物。
[態様31]Rが、C~C20、C~C、C~C20、C~C、またはC10~C20アルキルである、態様19に記載のオリゴマー化合物。
[態様32]Rが、置換C~C20、C~C、C~C20、C~C、またはC10~C20アルキルである、態様19に記載のオリゴマー化合物。
[態様33]Rが、炭水化物または炭水化物クラスターを含む、態様19に記載のオリゴマー化合物。
[態様34]Rが、少なくとも1つのGalNAcを含む、態様19に記載のオリゴマー化合物。
[態様35]Tが、下記である、態様19に記載のオリゴマー化合物。
[態様36]Tが、下記である、態様19に記載のオリゴマー化合物。
[態様37]Tが、下記である、態様19に記載のオリゴマー化合物。
[態様38]Tが、下記である、態様19に記載のオリゴマー化合物。
[態様39]Tが、下記である、態様19に記載のオリゴマー化合物。
[態様40]Tが、下記である、態様19に記載のオリゴマー化合物。
[態様41]Tが、下記である、態様19に記載のオリゴマー化合物。
[態様42]Tが、下記である、態様19に記載のオリゴマー化合物。
[態様43]Tが、下記である、態様19に記載のオリゴマー化合物。
[態様44]Tが、下記であり、
式中、nが、2~20である、態様19に記載のオリゴマー化合物。
[態様45]nが、15である、態様44に記載のオリゴマー化合物。
[態様46]式XVIIの少なくとも1個のヌクレオシド間連結基について、Tが、C(=O)Rである、態様1~18のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
[態様47]Rが、アリールである、態様46に記載のオリゴマー化合物。
[態様48]Rが、置換アリールである、態様46に記載のオリゴマー化合物。
[態様49]Rが、CHである、態様46に記載のオリゴマー化合物。
[態様50]Rが、N(CHである、態様46に記載のオリゴマー化合物。
[態様51]Rが、OCHである、態様46に記載のオリゴマー化合物。
[態様52]Rが、C~Cアルコキシである、態様46に記載のオリゴマー化合物。
[態様53]Rが、C~C20、C~C、C~C20、C~C、またはC10~C20アルキルである、態様46に記載のオリゴマー化合物。
[態様54]Rが、置換C~C20、C~C、C~C20、C~C、またはC10~C20アルキルである、態様46に記載のオリゴマー化合物。
[態様55]Rが、炭水化物または炭水化物クラスターを含む、態様46に記載のオリゴマー化合物。
[態様56]R23が、少なくとも1つのGalNAcを含む、態様46に記載のオリゴマー化合物。
[態様57]Tが、下記である、態様46に記載のオリゴマー化合物。
[態様58]Tが、下記である、態様46に記載のオリゴマー化合物。
[態様59]Tが、下記である、態様46に記載のオリゴマー化合物。
[態様60]Tが、下記である、態様46に記載のオリゴマー化合物。
[態様61]Tが、下記であり、
式中、nが、2~20である、態様46に記載のオリゴマー化合物。
[態様62]nが、15である、態様61に記載のオリゴマー化合物。
[態様63]式XVIIの少なくとも1個のヌクレオシド間連結基について、Tが、P(=O)Rである、態様1~18のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
[態様64]Rが、OCHである、態様63に記載のオリゴマー化合物。
[態様65]Rが、OHである、態様63に記載のオリゴマー化合物。
[態様66]Rが、C~Cアルキルである、態様63に記載のオリゴマー化合物。
[態様67]Rが、置換C~Cアルキルである、態様63に記載のオリゴマー化合物。
[態様68]Rが、C~C20、C~C、C~C20、C~C、またはC10~C20アルキルである、態様63に記載のオリゴマー化合物。
[態様69]Rが、置換C~C20、C~C、C~C20、C~C、またはC10~C20アルキルである、態様63に記載のオリゴマー化合物。
[態様70]Rが、炭水化物または炭水化物クラスターを含む、態様63に記載のオリゴマー化合物。
[態様71]Rが、少なくとも1つのGalNAcを含む、態様63に記載のオリゴマー化合物。
[態様72]Rが、OCHである、態様63~71のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
[態様73]Rが、OHである、態様63~71のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
[態様74]Rが、C~Cアルキルである、態様63~71のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
[態様75]Rが、置換C~Cアルキルである、態様63~71のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
[態様76]Tが、下記である、態様63に記載のオリゴマー化合物。
[態様77]Tが、下記である、態様63に記載のオリゴマー化合物。
[態様78]Tが、下記であり、
式中、nが、2~20である、態様63に記載のオリゴマー化合物。
[態様79]nが、15である、態様78に記載のオリゴマー化合物。
[態様80]前記修飾オリゴヌクレオチドの少なくとも1個のヌクレオシド間連結基が、式XVIIの連結基ではない、態様1~79のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
[態様81]前記修飾オリゴヌクレオチドの厳密に1個のヌクレオシド間連結基が、式XVIIのヌクレオシド間連結基である、態様1~80のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
[態様82]前記修飾オリゴヌクレオチドの厳密に2個のヌクレオシド間連結基が、式XVIIのヌクレオシド間連結基である、態様1~80のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
[態様83]前記修飾オリゴヌクレオチドの厳密に3個のヌクレオシド間連結基が、式XVIIのヌクレオシド間連結基である、態様1~80のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
[態様84]前記修飾オリゴヌクレオチドの厳密に4個のヌクレオシド間連結基が、式XVIIのヌクレオシド間連結基である、態様1~80のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
[態様85]前記修飾オリゴヌクレオチドの厳密に5個のヌクレオシド間連結基が、式XVIIのヌクレオシド間連結基である、態様1~80のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
[態様86]前記修飾オリゴヌクレオチドの少なくとも6個のヌクレオシド間連結基が、式XVIIのヌクレオシド間連結基である、態様1~80のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
[態様87]式XVIIの少なくとも2個の連結基を有し、前記式XVIIの連結基のうちの少なくとも2個が、互いに同じである、態様1~79または81~86のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
[態様88]式XVIIのヌクレオシド間連結基ではない、前記修飾オリゴヌクレオチドの各ヌクレオシド間連結基が、ホスホジエステルヌクレオシド間連結基またはホスホロチオエートヌクレオシド間連結基のいずれかである、態様1~87のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
[態様89]前記修飾オリゴヌクレオチドの各ヌクレオシド間連結基が、式XVIIのヌクレオシド間連結基である、態様1~80または86のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
[態様90]修飾オリゴヌクレオチドを含むオリゴマー化合物であって、前記修飾オリゴヌクレオチドの少なくとも1つの領域が、構造Aを有し、
式中、
各Bxが、複素環式塩基部分であり、
Xが、OまたはSから選択され、
及びYの各々が、独立して、OHまたはSHから選択され、
、Z、及びZの各々が、独立して、-(CH-X-(CH-から選択され、式中、pが、0または1であり、qが、0または1であり、Xが、O、S、またはN(E)であり、
が、H、C~Cアルキル、及び置換C~Cアルキルから選択され、
Tが、SO、C(=O)R、及びP(=O)Rから選択され、式中、
が、アリール、置換アリール、複素環、置換複素環、芳香族複素環、置換芳香族複素環、ジアゾール、置換ジアゾール、C~Cアルコキシ、C~Cアルキル、C~Cアルケニル、C~Cアルキニル、置換C~Cアルキル、置換C~Cアルケニル置換C~Cアルキニル、及びコンジュゲート基から選択され、
が、アリール、置換アリール、CH、N(CH、OCH、及びコンジュゲート基から選択され、
が、OCH、OH、C~Cアルキル、置換C~Cアルキル、及びコンジ
ュゲート基から選択され、
が、OCH、OH、C~Cアルキル、及び置換C~Cアルキルから選択され、
R1及びGが、JR1からGの架橋を形成するか、またはJR1が、Hであり、Gが、H、OH、ハロゲン、もしくはO-[C(R)(R)]-[(C=O)-X-Rから選択されるかのいずれかであり、
R2及びGが、JR2とGとの架橋を形成するか、またはJR2が、Hであり、Gが、H、OH、ハロゲン、もしくはO-[C(R)(R)]-[(C=O)-X-Rから選択されるかのいずれかであり、
R3及びGが、JR3とGとの架橋を形成するか、またはJR3が、Hであり、Gが、H、OH、ハロゲン、もしくはO-[C(R)(R)]-[(C=O)-X-Rから選択されるかのいずれかであり、
式中、各JからGの架橋が、-CH(CH)-O-または-(CH-O-から独立して選択される式を有し、式中、kが、1~3であり、
各R及びRが、独立して、H、ハロゲン、C~Cアルキル、または置換C~Cアルキルであり、
各Xが、O、S、またはN(E)であり、
が、H、ハロゲン、C~Cアルキル、置換C~Cアルキル、C~Cアルケニル、置換C~Cアルケニル、C~Cアルキニル、置換C~Cアルキニル、またはN(E)(E)であり、
、E、及びEが、各々独立して、H、C~Cアルキル、または置換C~Cアルキルであり、
nが、1~6であり、
mが、0または1であり、
jが、0または1であり、
置換された各基が、ハロゲン、OJ、N(J)(J)、=NJ、SJ、N、CN、OC(=X)J、OC(=X)N(J)(J)、及びC(=Q)N(J)(J)から独立して選択される、1つまたは複数の任意選択で保護される置換基を含み、
が、O、S、またはNJであり、
各J、J、及びJが、独立して、HまたはC~Cアルキルである、
前記オリゴマー化合物。
[態様91]修飾オリゴヌクレオチドを含むオリゴマー化合物であって、前記修飾オリゴヌクレオチドの少なくとも1つの領域が、構造Bを有し、
式中、
各Bxが、複素環式塩基部分であり、
Xが、OまたはSから選択され、
及びYの各々が、独立して、OHまたはSHから選択され、
及びZの各々が、独立して、-(CH-X-(CH-から選択され、式中、pが、0または1であり、qが、0または1であり、Xが、O、S、またはN(E)であり、
が、H、C~Cアルキル、及び置換C~Cアルキルから選択され、
Tが、SO、C(=O)R、及びP(=O)Rから選択され、式中、
が、アリール、置換アリール、複素環、置換複素環、芳香族複素環、置換芳香族複素環、ジアゾール、置換ジアゾール、C~Cアルコキシ、C~Cアルキル、C~Cアルケニル、C~Cアルキニル、置換C~Cアルキル、置換C~Cアルケニル置換C~Cアルキニル、及びコンジュゲート基から選択され、
が、アリール、置換アリール、CH、N(CH、OCH、及びコンジュゲート基から選択され、
が、OCH、OH、C~Cアルキル、置換C~Cアルキル、及びコンジュゲート基から選択され、
が、OCH、OH、C~Cアルキル、及び置換C~Cアルキルから選択され、
R1及びGが、JR1からGの架橋を形成するか、またはJR1が、Hであり、Gが、H、OH、ハロゲン、もしくはO-[C(R)(R)]-[(C=O)-X-Rから選択されるかのいずれかであり、
R2及びGが、JR2とGとの架橋を形成するか、またはJR2が、Hであり、Gが、H、OH、ハロゲン、もしくはO-[C(R)(R)]-[(C=O)-X-Rから選択されるかのいずれかであり、
式中、各JからGの架橋が、-CH(CH)-O-または-(CH-O-か
ら独立して選択される式を有し、式中、kが、1~3であり、
各R及びRが、独立して、H、ハロゲン、C~Cアルキル、または置換C~Cアルキルであり、
各Xが、O、S、またはN(E)であり、
が、H、ハロゲン、C~Cアルキル、置換C~Cアルキル、C~Cアルケニル、置換C~Cアルケニル、C~Cアルキニル、置換C~Cアルキニル、またはN(E)(E)であり、
、E、及びEが、各々独立して、H、C~Cアルキル、または置換C~Cアルキルであり、
nが、1~6であり、
mが、0または1であり、
jが、0または1であり、
置換された各基が、ハロゲン、OJ、N(J)(J)、=NJ、SJ、N、CN、OC(=X)J、OC(=X)N(J)(J)、及びC(=Q)N(J)(J)から独立して選択される、1つまたは複数の任意選択で保護される置換基を含み、
が、O、S、またはNJであり、
各J、J、及びJが、独立して、HまたはC~Cアルキルである、
前記オリゴマー化合物。
[態様92]修飾オリゴヌクレオチドを含むオリゴマー化合物であって、前記修飾オリゴヌクレオチドの少なくとも1つの領域が、構造Cを有し、
式中、
各Bxが、複素環式塩基部分であり、
Xが、OまたはSから選択され、
及びYの各々が、独立して、OHまたはSHから選択され、
及びZの各々が、独立して、-(CH-X-(CH-から選択され、式中、pが、0または1であり、qが、0または1であり、Xが、O、S、またはN(E)であり、
が、H、C~Cアルキル、及び置換C~Cアルキルから選択され、
Tが、SO、C(=O)R、及びP(=O)Rから選択され、式中、
が、アリール、置換アリール、複素環、置換複素環、芳香族複素環、置換芳香族複素環、ジアゾール、置換ジアゾール、C~Cアルコキシ、C~Cアルキル、C~Cアルケニル、C~Cアルキニル、置換C~Cアルキル、置換C~Cアルケニル置換C~Cアルキニル、及びコンジュゲート基から選択され、
が、アリール、置換アリール、CH、N(CH、OCH、及びコンジュゲート基から選択され、
が、OCH、OH、C~Cアルキル、置換C~Cアルキル、及びコンジュゲート基から選択され、
が、OCH、OH、C~Cアルキル、及び置換C~Cアルキルから選択され、
R2及びGが、JR2とGとの架橋を形成するか、またはJR2が、Hであり、Gが、H、OH、ハロゲン、もしくはO-[C(R)(R)]-[(C=O)-X-Rから選択されるかのいずれかであり、
R3及びGが、JR3とGとの架橋を形成するか、またはJR3が、Hであり、Gが、H、OH、ハロゲン、もしくはO-[C(R)(R)]-[(C=O)-X-Rから選択されるかのいずれかであり、
式中、各JからGの架橋が、-CH(CH)-O-または-(CH-O-から独立して選択される式を有し、式中、kが、1~3であり、
各R及びRが、独立して、H、ハロゲン、C~Cアルキル、または置換C~Cアルキルであり、
各Xが、O、S、またはN(E)であり、
が、H、ハロゲン、C~Cアルキル、置換C~Cアルキル、C~Cアルケニル、置換C~Cアルケニル、C~Cアルキニル、置換C~Cアルキニル、またはN(E)(E)であり、
、E、及びEが、各々独立して、H、C~Cアルキル、または置換C~Cアルキルであり、
nが、1~6であり、
mが、0または1であり、
jが、0または1であり、
置換された各基が、ハロゲン、OJ、N(J)(J)、=NJ、SJ、N、CN、OC(=X)J、OC(=X)N(J)(J)、及びC(=Q)N(J)(J)から独立して選択される、1つまたは複数の任意選択で保護される置換基を含み、
が、O、S、またはNJであり、
各J、J、及びJが、独立して、HまたはC~Cアルキルである、
前記オリゴマー化合物。
[態様93]修飾オリゴヌクレオチドを含むオリゴマー化合物であって、前記修飾オリゴヌクレオチドの少なくとも1つの領域が、構造Dを有し、
式中、
各Bxが、複素環式塩基部分であり、
Xが、OまたはSから選択され、
及びYの各々が、独立して、OHまたはSHから選択され、
及びZの各々が、独立して、-(CH-X-(CH-から選択され、式中、pが、0または1であり、qが、0または1であり、Xが、O、S、またはN(E)であり、
が、H、C~Cアルキル、及び置換C~Cアルキルから選択され、
Tが、SO、C(=O)R、及びP(=O)Rから選択され、式中、
が、アリール、置換アリール、複素環、置換複素環、芳香族複素環、置換芳香族複素環、ジアゾール、置換ジアゾール、C~Cアルコキシ、C~Cアルキル、C~Cアルケニル、C~Cアルキニル、置換C~Cアルキル、置換C~Cアルケニル置換C~Cアルキニル、及びコンジュゲート基から選択され、
が、アリール、置換アリール、CH、N(CH、OCH、及びコンジュゲート基から選択され、
が、OCH、OH、C~Cアルキル、置換C~Cアルキル、及びコンジュゲート基から選択され、
が、OCH、OH、C~Cアルキル、及び置換C~Cアルキルから選択され、
R1及びGが、JR1からGの架橋を形成するか、またはJR1が、Hであり、Gが、H、OH、ハロゲン、もしくはO-[C(R)(R)]-[(C=O)-X-Rから選択されるかのいずれかであり、
R2及びGが、JR2とGとの架橋を形成するか、またはJR2が、Hであり、Gが、H、OH、ハロゲン、もしくはO-[C(R)(R)]-[(C=O)-X-Rから選択されるかのいずれかであり、
R3及びGが、JR3とGとの架橋を形成するか、またはJR3が、Hであり、Gが、H、OH、ハロゲン、もしくはO-[C(R)(R)]-[(C=O)-X-Rから選択されるかのいずれかであり、
式中、各JからGの架橋が、-CH(CH)-O-または-(CH-O-から独立して選択される式を有し、式中、kが、1~3であり、
各R及びRが、独立して、H、ハロゲン、C~Cアルキル、または置換C~Cアルキルであり、
各Xが、O、S、またはN(E)であり、
が、H、ハロゲン、C~Cアルキル、置換C~Cアルキル、C~Cアルケニル、置換C~Cアルケニル、C~Cアルキニル、置換C~Cアルキニル、またはN(E)(E)であり、
、E、及びEが、各々独立して、H、C~Cアルキル、または置換C~Cアルキルであり、
nが、1~6であり、
mが、0または1であり、
jが、0または1であり、
置換された各基が、ハロゲン、OJ、N(J)(J)、=NJ、SJ、N、CN、OC(=X)J、OC(=X)N(J)(J)、及びC(=Q)N(J)(J)から独立して選択される、1つまたは複数の任意選択で保護される置換基を含み、
が、O、S、またはNJであり、
各J、J、及びJが、独立して、HまたはC~Cアルキルである、
前記オリゴマー化合物。
[態様94]修飾オリゴヌクレオチドを含むオリゴマー化合物であって、前記修飾オリゴヌクレオチドの少なくとも1つの領域が、構造Eを有し、
式中、
各Bxが、複素環式塩基部分であり、
Xが、OまたはSから選択され、
及びYの各々が、独立して、OHまたはSHから選択され、
及びZの各々が、独立して、-(CH-X-(CH-から選択され、式中、pが、0または1であり、qが、0または1であり、Xが、O、S、またはN(E)であり、
が、H、C~Cアルキル、及び置換C~Cアルキルから選択され、
Tが、SO、C(=O)R、及びP(=O)Rから選択され、式中、
が、アリール、置換アリール、複素環、置換複素環、芳香族複素環、置換芳香族複素環、ジアゾール、置換ジアゾール、C~Cアルコキシ、C~Cアルキル、C~Cアルケニル、C~Cアルキニル、置換C~Cアルキル、置換C~Cアルケニル置換C~Cアルキニル、及びコンジュゲート基から選択され、
が、アリール、置換アリール、CH、N(CH、OCH、及びコンジュゲート基から選択され、
が、OCH、OH、C~Cアルキル、置換C~Cアルキル、及びコンジュゲート基から選択され、
が、OCH、OH、C~Cアルキル、及び置換C~Cアルキルから選択され、
R1及びGが、JR1からGの架橋を形成するか、またはJR1が、Hであり、Gが、H、OH、ハロゲン、もしくはO-[C(R)(R)]-[(C=O)-X-Rから選択されるかのいずれかであり、
R2及びGが、JR2とGとの架橋を形成するか、またはJR2が、Hであり、Gが、H、OH、ハロゲン、もしくはO-[C(R)(R)]-[(C=O)-X-Rから選択されるかのいずれかであり、
R3及びGが、JR3とGとの架橋を形成するか、またはJR3が、Hであり、Gが、H、OH、ハロゲン、もしくはO-[C(R)(R)]-[(C=O)-X-Rから選択されるかのいずれかであり、
式中、各JからGの架橋が、-CH(CH)-O-または-(CH-O-から独立して選択される式を有し、式中、kが、1~3であり、
各R及びRが、独立して、H、ハロゲン、C~Cアルキル、または置換C~Cアルキルであり、
各Xが、O、S、またはN(E)であり、
が、H、ハロゲン、C~Cアルキル、置換C~Cアルキル、C~Cアルケニル、置換C~Cアルケニル、C~Cアルキニル、置換C~Cアルキニル、またはN(E)(E)であり、
、E、及びEが、各々独立して、H、C~Cアルキル、または置換C~Cアルキルであり、
nが、1~6であり、
mが、0または1であり、
jが、0または1であり、
置換された各基が、ハロゲン、OJ、N(J)(J)、=NJ、SJ、N、CN、OC(=X)J、OC(=X)N(J)(J)、及びC(=Q)N(J)(J)から独立して選択される、1つまたは複数の任意選択で保護される置換基を含み、
が、O、S、またはNJであり、
各J、J、及びJが、独立して、HまたはC~Cアルキルである、
前記オリゴマー化合物。
[態様95]修飾オリゴヌクレオチドを含むオリゴマー化合物であって、前記修飾オリゴヌクレオチドの5’末端が、構造Pを有し、
式中、
各Bxが、複素環式塩基部分であり、
Xが、OまたはSから選択され、
Zが、-(CH-X-(CH-であり、式中、pが、0または1であり、qが、0または1であり、Xが、O、S、またはN(E)であり、
が、H、C~Cアルキル、及び置換C~Cアルキルから選択され、
Tが、SO、C(=O)R、及びP(=O)Rから選択され、式中、
が、アリール、置換アリール、複素環、置換複素環、芳香族複素環、置換芳香族複素環、ジアゾール、置換ジアゾール、C~Cアルコキシ、C~Cアルキル、C~Cアルケニル、C~Cアルキニル、置換C~Cアルキル、置換C~Cアルケニル置換C~Cアルキニル、及びコンジュゲート基から選択され、
が、アリール、置換アリール、CH、N(CH、OCH、及びコンジュゲート基から選択され、
が、OCH、OH、C~Cアルキル、置換C~Cアルキル、及びコンジュゲート基から選択され、
が、OCH、OH、C~Cアルキル、及び置換C~Cアルキルから選択され、
及びGが、JからGの架橋を形成するか、またはJが、Hであり、Gが、H、OH、ハロゲン、もしくはO-[C(R)(R)]-[(C=O)-X-Rから選択されるかのいずれかであり、
式中、各JからGの架橋が、-CH(CH)-O-または-(CH-O-から独立して選択される式を有し、式中、kが、1~3であり、
各R及びRが、独立して、H、ハロゲン、C~Cアルキル、または置換C~Cアルキルであり、
各Xが、O、S、またはN(E)であり、
が、H、ハロゲン、C~Cアルキル、置換C~Cアルキル、C~Cアルケニル、置換C~Cアルケニル、C~Cアルキニル、置換C~Cアルキニル、またはN(E)(E)であり、
、E、及びEが、各々独立して、H、C~Cアルキル、または置換C~Cアルキルであり、
nが、1~6であり、
mが、0または1であり、
jが、0または1であり、
置換された各基が、ハロゲン、OJ、N(J)(J)、=NJ、SJ、N、CN、OC(=X)J、OC(=X)N(J)(J)、及びC(=Q)N(J)(J)から独立して選択される、1つまたは複数の任意選択で保護される置換基を含み、
が、O、S、またはNJであり、
各J、J、及びJが、独立して、HまたはC~Cアルキルである、
前記オリゴマー化合物。
[態様96]各ZがOである、態様90~95のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
[態様97]少なくとも1つのGが、H、OH、ハロゲン、C~Cアルコキシ、-O(CHOCH、または-OCH(C=O)NHCHから選択される、態様90~96のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
[態様98]各Gが、H、OH、ハロゲン、C~Cアルコキシ、-O(CHOCH、または-OCH(C=O)NHCHから選択される、態様90~97のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
[態様99]少なくとも1つのJが、少なくとも1つのGと架橋を形成し、前記JからGの架橋が、-CH(CH)-O-または-(CH-O’から選択される式を有し、式中、kが、1~3である、態様90~98のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
[態様100]各J及びGが、架橋を形成し、前記JからGの架橋が、-CH(CH)-O-または-(CH-O-から選択される式を有し、式中、kが、1~3である、態様90~97または99のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
[態様101]少なくとも1つのZが、Oであり、前記対応するJからGの架橋が、式(CH-O-を有し、式中、kが、1である、態様99または100のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
[態様102]構造A、B、C、D、E、またはPの各ヌクレオシドが、立体標準的ヌクレオシドである、態様90~101のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
[態様103]構造A、B、C、D、E、またはPの少なくとも1個のヌクレオシドが、立体非標準的ヌクレオシドである、態様90~101のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
[態様104]JからGの架橋を有する少なくとも1個のヌクレオシドが、α-L-リボシル配置にある、態様99~101または103のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
[態様105]前記修飾オリゴヌクレオチドが、構造A、B、C、D、またはEを有する少なくとも2個、少なくとも3個、少なくとも4個、少なくとも5個、少なくとも6個、少なくとも7個、少なくとも8個、少なくとも9個、または少なくとも10個の領域を含む、態様90~104のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
[態様106]構造A、B、C、D、またはEを有する少なくとも1つの領域が、前記修飾オリゴヌクレオチドの5’末端にある、態様90~105のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
[態様107]構造A、B、C、D、またはEを有する少なくとも1つの領域が、前記修飾オリゴヌクレオチドの3’末端にある、態様90~105のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
[態様108]構造A、B、C、D、またはEを有する少なくとも1つの領域が、前記修飾オリゴヌクレオチドの内部にある、態様90~105のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
[態様109]10~30個の連結ヌクレオシドからなる修飾オリゴヌクレオチドを含むオリゴマー化合物であって、前記修飾オリゴヌクレオチドのある領域が、式(Ng1L1(Ng2L2(Ng3L3を有し、式中、各Nが、ヌクレオシドであり、各Lが、ヌクレオシド間連結基であり、L、及びLの各々が、ホスホジエステルヌクレオシド間連結基、ホスホロチオエートヌクレオシド間連結基、または式XVIIのヌクレオシド間連結基であり、
式中、Lが、不在であるか、またはホスホジエステルヌクレオシド間連結基、ホスホロチオエートヌクレオシド間連結基、もしくは式XVIIのヌクレオシド間連結基であり、
式中、L、L、及びLのうちの少なくとも1つが、式XVIIのヌクレオシド間連結基であり、かつL、L、及びLのうちの少なくとも1つが、ホスホロチオエートまたはホスホジエステルヌクレオシド間連結基であり、
式中、式XVIIを有する前記修飾オリゴヌクレオチドの各ヌクレオシド間連結基について独立して、
Xが、OまたはSから選択され、
が、H、C~Cアルキル、及び置換C~Cアルキルから選択され、
Tが、SO、C(=O)R、及びP(=O)Rから選択され、式中、
が、アリール、置換アリール、複素環、置換複素環、芳香族複素環、置換芳香族複素環、ジアゾール、置換ジアゾール、C~Cアルコキシ、C~Cアルキル、C
~Cアルケニル、C~Cアルキニル、置換C~Cアルキル、置換C~Cアルケニル置換C~Cアルキニル、及びコンジュゲート基から選択され、
が、アリール、置換アリール、CH、N(CH、OCH、及びコンジュゲートから選択され、
が、OCH、OH、C~Cアルキル、置換C~Cアルキル、及びコンジュゲートから選択され、
が、OCH、OH、C~Cアルキル、及び置換C~Cアルキルから選択される、
前記オリゴマー化合物。
[態様110]前記修飾オリゴヌクレオチドが、前記式(Ng1L1(Ng2L2(Ng3L3を有する少なくとも2個、少なくとも3個、少なくとも4個、少なくとも5個、少なくとも6個、少なくとも7個、少なくとも8個、少なくとも9個、または少なくとも10個の領域を含む、態様109に記載のオリゴマー化合物。
[態様111]前記式(Ng1L1(Ng2L2(Ng3L3を有する少なくとも1つの領域が、前記オリゴヌクレオチドの5’末端にある、態様109または110に記載のオリゴマー化合物。
[態様112]前記式(Ng1L1(Ng2L2(Ng3L3を有する少なくとも1つの領域が、前記オリゴヌクレオチドの内部にある、態様109または110に記載のオリゴマー化合物。
[態様113]前記式(Ng1L1(Ng2L2(Ng3L3を有する少なくとも1つの領域が、前記オリゴヌクレオチドの3’末端にある、態様109または110に記載のオリゴマー化合物。
[態様114]前記修飾オリゴヌクレオチドの少なくとも1個のヌクレオシドが、二環式ヌクレオシド及び非二環式置換ヌクレオシドから選択される修飾ヌクレオシドである、態様1~113のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
[態様115]前記修飾オリゴヌクレオチドの少なくとも1個のヌクレオシドが、β-D-LNAヌクレオシド、α-L-LNAヌクレオシド、ENAヌクレオシド、cEtヌクレオシド、2’-MOEヌクレオシド、2’-OMeヌクレオシド、2’-Fヌクレオシド、2’-NMAヌクレオシド、5’-Meヌクレオシド、DNAヌクレオシド、及びRNAヌクレオシドから選択される、態様1~114のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
[態様116]前記修飾オリゴヌクレオチドの各ヌクレオシドが、β-D-LNAヌクレオシド、α-L-LNAヌクレオシド、ENAヌクレオシド、cEtヌクレオシド、2’-MOEヌクレオシド、2’-OMeヌクレオシド、2’-Fヌクレオシド、2’-NMAヌクレオシド、5’-Meヌクレオシド、DNAヌクレオシド、及びRNAヌクレオシドから選択される、態様1~115のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
[態様117]前記修飾オリゴヌクレオチドの少なくとも1個のヌクレオシドが、立体非標準的ヌクレオシドである、態様1~116のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
[態様118]少なくとも1個の立体非標準的ヌクレオシドを、隣接するヌクレオシドに連結する前記ヌクレオシド間連結基が、式XVIIのヌクレオシド間連結基である、態様117に記載のオリゴマー化合物。
[態様119]前記修飾オリゴヌクレオチドの少なくとも2個のヌクレオシドが、立体非標準的ヌクレオシドである、態様117または118に記載のオリゴマー化合物。
[態様120]前記修飾オリゴヌクレオチドの少なくとも2個の立体非標準的ヌクレオシドが、互いに隣接する、態様119に記載のオリゴマー化合物。
[態様121]前記修飾オリゴヌクレオチドの少なくとも2個の立体非標準的ヌクレオシドが、式XVIIのヌクレオシド間連結基で互いに連結されている、態様120に記載のオリゴマー化合物。
[態様122]前記修飾オリゴヌクレオチドの少なくとも1個の立体非標準的ヌクレオシドが、立体非標準的DNAヌクレオシドである、態様117~121のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
[態様123]前記立体非標準的DNAヌクレオシドが、式I、式II、式III、式IV、式V、式VI、及び式VIIを有する立体非標準的DNAヌクレオシドから選択される、態様122に記載のオリゴマー化合物。
[態様124]前記立体非標準的DNAヌクレオシドが、式V及び式IIを有する立体非標準的DNAヌクレオシドから選択される、態様123に記載のオリゴマー化合物。
[態様125]前記オリゴマー化合物の少なくとも1個の立体非標準的ヌクレオシドが、置換立体非標準的ヌクレオシドである、態様117~124のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
[態様126]前記修飾オリゴヌクレオチドの前記少なくとも1個の置換立体非標準的ヌクレオシドの2’置換基が、2’-MOE、2’-OMe、2’-F、または2’-OHから選択される、態様125に記載のオリゴマー化合物。
[態様127]前記修飾オリゴヌクレオチドの各ヌクレオシドが、立体標準的ヌクレオシドである、態様1~126のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
[態様128]前記修飾オリゴヌクレオチドが、12~30個の連結ヌクレオシドからなる、態様1~126のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
[態様129]前記修飾オリゴヌクレオチドが、16~24個の連結ヌクレオシドからなる、態様1~126のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
[態様130]前記修飾オリゴヌクレオチドが、18~22個の連結ヌクレオシドからなる、態様1~126のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
[態様131]前記修飾オリゴヌクレオチドが、16個の連結ヌクレオシドからなる、態様1~129のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
[態様132]前記修飾オリゴヌクレオチドが、17個の連結ヌクレオシドからなる、態様1~129のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
[態様133]前記修飾オリゴヌクレオチドが、18個の連結ヌクレオシドからなる、態様1~130のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
[態様134]前記修飾オリゴヌクレオチドが、19個の連結ヌクレオシドからなる、態様1~130のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
[態様135]前記修飾オリゴヌクレオチドが、20個の連結ヌクレオシドからなる、態様1~130のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
[態様136]前記修飾オリゴヌクレオチドが、21個の連結ヌクレオシドからなる、態様1~130のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
[態様137]前記修飾オリゴヌクレオチドが、22個の連結ヌクレオシドからなる、態様1~130のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
[態様138]前記修飾オリゴヌクレオチドが、23個の連結ヌクレオシドからなる、態様1~129のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
[態様139]前記修飾オリゴヌクレオチドの少なくとも1個のヌクレオシドが、2’-OMeヌクレオシド、2’-Fヌクレオシド、及びRNAヌクレオシドから選択される、態様1~138のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
[態様140]前記修飾オリゴヌクレオチドの少なくとも1個のヌクレオシドが、2’-OMeヌクレオシドであり、かつ前記修飾オリゴヌクレオチドの少なくとも1個のヌクレオシドが、2’-Fヌクレオシドである、態様1~139のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
[態様141]前記修飾オリゴヌクレオチドの各ヌクレオシドが、2’-OMeヌクレオシドまたは2’-Fヌクレオシドから選択される、態様140に記載のオリゴマー化合物。
[態様142]前記修飾オリゴヌクレオチドの少なくとも1個のヌクレオシドが、2’-OMeヌクレオシドであり、前記修飾オリゴヌクレオチドの少なくとも1個のヌクレオシドが、2’-Fヌクレオシドであり、かつ前記修飾オリゴヌクレオチドの少なくとも1個のヌクレオシドが、糖代用物を含む、態様1~140のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
[態様143]前記修飾オリゴヌクレオチドの各ヌクレオシドが、2’-OMeヌクレオシド、2’-Fヌクレオシド、及び糖代用物を含むヌクレオシドから選択される、態様142に記載のオリゴマー化合物。
[態様144]糖代用物を含む前記ヌクレオシドが、
から選択され、式中、Bxが、複素環式塩基部分である、態様142~143のいずれ
かに記載のオリゴマー化合物。
[態様145]糖代用物を含む前記ヌクレオシドが、GNAである、態様144に記載のオリゴマー化合物。
[態様146]前記修飾オリゴヌクレオチドが、モチーフABABAを有する交互のヌクレオシドタイプの領域を有し、式中、各Aが、第1のタイプの立体標準的ヌクレオシドであり、各Bが、第2のタイプの立体標準的ヌクレオシドであり、前記第1のタイプ及び前記第2のタイプが、互いに異なる、態様139~145のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
[態様147]A及びBが、2’-F置換ヌクレオシド、2’-OMe置換ヌクレオシド、及び立体標準的RNAヌクレオシドから選択される、態様146に記載のオリゴマー化合物。
[態様148]前記修飾オリゴヌクレオチドの5’末端が、末端基を含む、態様1~147のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
[態様149]前記末端基が、安定化リン酸基である、態様148に記載のオリゴマー化合物。
[態様150]前記安定化リン酸基が、5’-ビニルホスホネートまたは5’-シクロプロピルホスホネートである、態様149に記載のオリゴマー化合物。
[態様151]前記末端基が、式XXIIを有し、
式中、Zが、OまたはSである、態様148に記載の化合物。
[態様152]前記末端基が、
から選択され、
式中、Rが、OH、OP(=O)OH、OP(=O)SH、メシルホスホロアミデート、または安定化リン酸基であり、
が、H、OH、OMe、MOE、またはハロゲンであり、
Xが、OH、SH、またはNSOであり、
が、アリール、置換アリール、複素環、置換複素環、芳香族複素環、置換芳香族複素環、ジアゾール、置換ジアゾール、C~Cアルコキシ、C~Cアルキル、C~Cアルケニル、C~Cアルキニル、置換C~Cアルキル、置換C~Cアルケニル置換C~Cアルキニル、及びコンジュゲート基から選択される、
態様148に記載のオリゴマー化合物。
[態様153]Gが、HまたはOHから選択され、Xが、SHである、態様152に記載のオリゴマー化合物。
[態様154]態様1~153のいずれかに記載のオリゴマー化合物からなるか、またはそれを含むアンチセンス剤。
[態様155]前記アンチセンス剤が、RNAi剤である、態様154に記載のアンチセンス剤。
[態様156]前記RNAi剤が、RNAiアンチセンスオリゴマー化合物を含む一本鎖RNAi剤であり、前記RNAiアンチセンスオリゴマー化合物が、態様1~151のいずれかに記載のオリゴマー化合物である、態様155に記載のRNAi剤。
[態様157]前記RNAi剤が、RNAiアンチセンスオリゴマー化合物及びRNAiセンスオリゴマー化合物を含むオリゴヌクレオチド二重鎖であり、前記RNAiアンチセンスオリゴマー化合物及び/または前記RNAiセンスオリゴマー化合物が、態様1~153のいずれかに記載のオリゴマー化合物である、態様155に記載のRNAi剤。
[態様158]前記RNAiアンチセンスオリゴマー化合物の少なくとも1個のヌクレオシド間連結基が、式XVIIのヌクレオシド間連結基である、態様156または157に記載のRNAi剤。
[態様159]前記RNAiアンチセンスオリゴマー化合物の少なくとも2個のヌクレオシド間連結基が、独立して選択される式XVIIのヌクレオシド間連結基である、態様156または157に記載のRNAi剤。
[態様160]前記RNAiアンチセンスオリゴマー化合物の最も3’側の5個のヌクレオシド間連結基のうちの少なくとも1個が、式XVIIのヌクレオシド間連結基である、態様156~159のいずれかに記載のRNAi剤。
[態様161]RNAiアンチセンスオリゴマー化合物の最も3’側の5個のヌクレオシド間連結基うちの少なくとも2個が、式XVIIのヌクレオシド間連結基である、態様156~159のいずれかに記載のRNAi剤。
[態様162]最も3’側の3個のヌクレオシド間連結基のうちの1~3個が、式XVIIのヌクレオシド間連結基であり、これらの3個のヌクレオシド間連結基のうちの、式XVIIのヌクレオシド間連結基ではない各々が、ホスホジエステルまたはホスホロチオエートヌクレオシド間連結基である、態様156~161のいずれかに記載のRNAi剤。
[態様163]最も3’側の2個のヌクレオシド間連結基が、式XVIIのヌクレオシド間連結基である、態様162に記載のRNAi剤。
[態様164]最も5’側及び最も5’側の最後から2番目のヌクレオシド間連結基のうちの厳密に一方が、式XVIIのヌクレオシド間連結基である、態様156~163のいずれかに記載のRNAi剤。
[態様165]前記RNAiアンチセンスオリゴヌクレオチドの最も5’側及び最も5’側の最後から2番目のヌクレオシド間連結基のうちの厳密に一方が、式XVIIのヌクレオシド間連結基であり、前記RNAiアンチセンスオリゴヌクレオチドの最も5’側及び最も5’側の最後から2番目のヌクレオシド間連結基のうちの他方が、ホスホジエステル及びホスホロチオエートヌクレオシド間結合から選択され、前記RNAiアンチセンスオリゴヌクレオチドの最も3’側の2個のヌクレオシド間連結基が、式XVIIのヌクレオシド間連結基であり、前記RNAiアンチセンスオリゴヌクレオチドの残りのヌクレオシド間連結基が、ホスホジエステルヌクレオシド間結合である、態様156~164のいずれかに記載のRNAi剤。
[態様166]前記アンチセンスオリゴマー化合物が、3’オーバーハングを含む、態様156~165のいずれかに記載のRNAi剤。
[態様167]前記3’オーバーハングが、2個のヌクレオシドからなる、態様166に記載のRNAi剤。
[態様168]前記RNAiアンチセンスオリゴマー化合物のシード領域内の少なくとも1個のヌクレオシド間連結基が、式XVIIのヌクレオシド間連結基である、態様156~164または166~167のいずれかに記載のRNAi剤。
[態様169]式XVIIの各ヌクレオシド間連結基について、Rが、Hであり、Tが、SOMeである、態様156~168のいずれかに記載のRNAi剤。
[態様170]前記RNAiアンチセンスオリゴマー化合物が、RNAiアンチセンス修飾オリゴヌクレオチドを含み、前記RNAiアンチセンス修飾オリゴヌクレオチドが、23個の連結ヌクレオシドからなり、ヌクレオシド間結合モチーフが、ooooooooooooooooooooaa、aaoooooooooooooooooooo、aaooooooooooooooooooaa、asooooooooooooooooooss、saoooooooooooooooooooo、oooooooooooooooooooaaa、ooooooooooooooooaaaoss、oooooooooooooaaaooooss、ooooooooooaaaoooooooss、oooooooaaaooooooooooss、ooooaaaoooooooooooooss、saoooaoooooooaoaooooss、ssoooaoooooooaoaooooss、またはssooooooooooooooooooaaから選択され、式中、各「a」が、式XVIIのヌクレオシド間結合を表し、各「s」が、ホスホロチオエートヌクレオシド間結合を表し、各「o」が、ホスホジエステルヌクレオシド間結合を表す、態様156~169のいずれかに記載のRNAi剤。
[態様171]前記RNAiアンチセンス修飾オリゴヌクレオチドの前記ヌクレオシド間結合モチーフが、oooooooooooooooooooaa、asooooooooooooooooooss、またはsaooooooooooooooooooooから選択される、態様170に記載のRNAi剤。
[態様172]5’から3’の前記RNAiアンチセンスオリゴマー化合物の糖モチーフが、yfyfyfyfyfyfyfyfyfyfyfyまたはyfyyyfyyyyyyyfyfyyyyyyyであり、式中、「y」が、2’-OMe糖部分を表し、「f」が、2’-F糖部分を表す、態様170または171に記載のRNAi剤。
[態様173]前記RNAiアンチセンスオリゴマー化合物が、RNAiアンチセンス修飾オリゴヌクレオチドを含み、前記RNAiアンチセンス修飾オリゴヌクレオチドが、21個の連結ヌクレオシドからなり、ヌクレオシド間結合モチーフが、aaososososososssssss、ssaaosososososssssss、ssosaaososososssssss、ssososaaosososssssss、ssosososaaososssssss、ssososososaaosssssss、ssosososososaassssss、ssososososososaassss、ssososososososssaass、ssososososososssssaaから選択され、式中、各「a」が、式XVIIのヌクレオシド間結合を表し、各「s」が、ホスホロチオエートヌクレオシド間結合を表し、各「o」が、ホスホジエステルヌクレオシド間結合を表す、態様156~169のいずれかに記載のRNAi剤。
[態様174]前記RNAiアンチセンス修飾オリゴヌクレオチドの前記ヌクレオシド間結合モチーフが、aaososososososssssss、ssaaosososososssssss、ssososaaosososssssss、ssosososaaososssssss、ssososososososssaass、またはssososososososssssaaから選択され、式中、各「a」が、式XVIIのヌクレオシド間結合を表し、各「s」が、ホスホロチオエートヌクレオシド間結合を表し、各「o」が、ホスホジエステルヌクレオシド間結合を表す、態様173に記載のRNAi剤。
[態様175]5’から3’の前記RNAiアンチセンスオリゴマー化合物の糖モチーフが、yfyfyfyfyfyfyfyfyfyfyfyであり、式中、「y」が、2’-OMe糖部分を表し、「f」が、2’-F糖部分を表す、態様173または174に記載のRNAi剤。
[態様176]各「a」が、メシルホスホロアミデート結合である、態様170~175のいずれかに記載のRNAi剤。
[態様177]前記RNAiアンチセンスオリゴマー化合物の少なくとも1つの領域が、構造A、B、C、D、E、またはPを有する、態様156~176のいずれかに記載のRNAi剤。
[態様178]構造A、B、C、D、またはEを有する少なくとも1つの領域が、前記RNAiアンチセンスオリゴマー化合物の前記シード領域内にある、態様177に記載のRNAi剤。
[態様179]構造A、B、C、D、またはEを有する少なくとも1つの領域が、前記RNAiアンチセンスオリゴマー化合物の3’末端にある、態様177に記載のRNAi剤。
[態様180]構造A、B、C、D、E、またはPを有する少なくとも1つの領域が、前記RNAiアンチセンスオリゴマー化合物の5’末端にある、態様177に記載のRNAi剤。
[態様181]前記RNAiアンチセンスオリゴマー化合物の少なくとも1つの領域が、前記式(Ng1L1(Ng2L2(Ng3L3を有し、式中、各Nが、ヌクレオシドであり、各Lが、ヌクレオシド間連結基であり、L、及びLの各々が、ホスホジエステルヌクレオシド間連結基、ホスホロチオエートヌクレオシド間連結基、または式XVIIのヌクレオシド間連結基であり、
式中、Lが、不在であるか、またはホスホジエステルヌクレオシド間連結基、ホスホロチオエートヌクレオシド間連結基、もしくは式XVIIのヌクレオシド間連結基であり、
式中、L、L、及びLのうちの少なくとも1つが、式XVIIのヌクレオシド間連結基であり、かつL、L、及びLのうちの少なくとも1つが、ホスホロチオエートまたはホスホジエステルヌクレオシド間連結基であり、
式中、式XVIIを有する前記RNAiアンチセンスオリゴマー化合物の各ヌクレオシド間連結基について独立して、
Xが、OまたはSから選択され、
が、H、C~Cアルキル、及び置換C~Cアルキルから選択され、
Tが、SO、C(=O)R、及びP(=O)Rから選択され、式中、
が、アリール、置換アリール、複素環、置換複素環、芳香族複素環、置換芳香族複素環、ジアゾール、置換ジアゾール、C~Cアルコキシ、C~Cアルキル、置換C~Cアルキル、及びコンジュゲートから選択され、
が、アリール、置換アリール、CH、N(CH、OCH、及びコンジュゲートから選択され、
が、OCH、OH、C~Cアルキル、置換C~Cアルキル、及びコンジュゲートから選択され、
が、OCH、OH、C~Cアルキル、及び置換C~Cアルキルから選択される、
態様156~180のいずれかに記載のRNAi剤。
[態様182]前記式(Ng1L1(Ng2L2(Ng3L3を有する前記領域が、1個または2個の3’オーバーハングヌクレオシドを含む、態様181に記載のRNAi剤。
[態様183]前記式(Ng1L1(Ng2L2(Ng3L3を有する少なくとも1つの領域が、前記RNAiアンチセンスオリゴマー化合物の3’末端にある、態様181に記載のRNAi剤。
[態様184]L1及びL2が各々、式XVIIのヌクレオシド間結合であり、式中、Rが、Hであり、Tが、SOMeであり、L3が、ホスホジエステルヌクレオシド間結合である、態様183に記載のRNAi剤。
[態様185]前記式(Ng1L1(Ng2L2(Ng3L3を有する少なくとも1つの領域が、前記RNAiアンチセンスオリゴマー化合物の5’末端にある、態様183に記載のRNAi剤。
[態様186]L1またはL2のうちの一方が、式XVIIのヌクレオシド間結合であり、式中、Rが、Hであり、Tが、SOMeであり、L1またはL2のうちの他方が、ホスホロチオエートヌクレオシド間結合であり、L3が、ホスホジエステルヌクレオシド間結合である、態様185に記載のRNAi剤。
[態様187]前記式(Ng1L1(Ng2L2(Ng3L3を有する少なくとも1つの領域が、前記RNAiアンチセンスオリゴマー化合物の前記シード領域内にある、態様181に記載のRNAi剤。
[態様188]標的に相補的である前記RNAiアンチセンスオリゴヌクレオチドの領域が、少なくとも15核酸塩基である、態様156~187のいずれかに記載のRNAi剤。
[態様189]標的に相補的である前記RNAiアンチセンスオリゴヌクレオチドの前記領域が、少なくとも17核酸塩基である、態様156~188のいずれかに記載のRNAi剤。
[態様190]標的に相補的である前記RNAiアンチセンスオリゴヌクレオチドの前記領域が、少なくとも19核酸塩基である、態様156~189のいずれかに記載のRNAi剤。
[態様191]標的に相補的である前記RNAiアンチセンスオリゴヌクレオチドの前記領域が、少なくとも21核酸塩基である、態様156~190のいずれかに記載のRNAi剤。
[態様192]標的に相補的である前記RNAiアンチセンスオリゴヌクレオチドの前記領域が、厳密に19核酸塩基である、態様156~190のいずれかに記載のRNAi剤。
[態様193]標的に相補的である前記RNAiアンチセンスオリゴヌクレオチドの前記領域が、厳密に21核酸塩基である、態様156~191のいずれかに記載のRNAi剤。
[態様194]前記RNAiアンチセンスオリゴマー化合物の少なくとも1個のヌクレオシドが、2’-OMeヌクレオシド、2’-Fヌクレオシド、及びRNAヌクレオシドから選択される、態様156~193のいずれかに記載のRNAi剤。
[態様195]前記RNAiアンチセンスオリゴマー化合物の少なくとも1個のヌクレオシドが、2’-OMeヌクレオシドであり、前記RNAiアンチセンスオリゴマー化合物の少なくとも1個のヌクレオシドが、RNAヌクレオシドである、態様156~194のいずれかに記載のRNAi剤。
[態様196]前記RNAiアンチセンスオリゴマー化合物の少なくとも1個のヌクレオシドが、2’-OMeヌクレオシドであり、前記RNAiアンチセンスオリゴマー化合物の少なくとも1個のヌクレオシドが、2’-Fヌクレオシドである、態様156~195のいずれかに記載のRNAi剤。
[態様197]前記RNAiアンチセンスオリゴマー化合物の各ヌクレオシドが、2’-OMeヌクレオシドまたは2’-Fヌクレオシドから選択される、態様196に記載のRNAi剤。
[態様198]前記RNAiアンチセンスオリゴマー化合物の少なくとも1個のヌクレオシドが、2’-OMeヌクレオシドであり、前記RNAiアンチセンスオリゴマー化合物の少なくとも1個のヌクレオシドが、2’-Fヌクレオシドであり、前記オリゴマー化合物の少なくとも1個のヌクレオシドが、糖代用物を含む、態様156~194のいずれかに記載のRNAi剤。
[態様199]前記RNAiアンチセンスオリゴマー化合物の各ヌクレオシドが、2’-OMeヌクレオシド、2’-Fヌクレオシド、及び糖代用物を含むヌクレオシドから選択される、態様198に記載のRNAi剤。
[態様200]糖代用物を含む前記ヌクレオシドが、
から選択され、式中、Bxが、複素環式塩基部分である、態様198~199のいずれかに記載のRNAi剤。
[態様201]糖代用物を含む前記ヌクレオシドが、GNAである、態様200に記載のRNAi剤。
[態様202]糖代用物を含む少なくとも1個のヌクレオシドが、前記RNAiアンチセンスオリゴマー化合物の最も5’側の9個のヌクレオシドのうちの1個である、態様200または201に記載のRNAi剤。
[態様203]前記オリゴマー化合物が、モチーフABABAを有する交互のヌクレオシドタイプの領域を有し、式中、各Aが、第1のタイプの立体標準的ヌクレオシドであり、各Bが、第2のタイプの立体標準的ヌクレオシドであり、前記第1のタイプ及び前記第2のタイプが、互いに異なる、態様156~202のいずれかに記載のRNAi剤。
[態様204]A及びBが、2’-F置換ヌクレオシド、2’-OMe置換ヌクレオシド、及び立体標準的RNAヌクレオシドから選択される、態様203に記載のRNAi剤。
[態様205]前記RNAiアンチセンスオリゴマー化合物の5’末端が、末端基を含む、態様156~204のいずれかに記載のRNAi剤。
[態様206]前記末端基が、安定化リン酸基である、態様205に記載のRNAi剤。
[態様207]前記安定化リン酸基が、5’-ビニルホスホネートまたは5’-シクロプロピルホスホネートである、態様206に記載のRNAi剤。
[態様208]前記末端基が、式XXIIを有する、態様205に記載のRNAi剤。
[態様209]前記末端基が、
から選択され、
式中、Rが、OH、OP(=O)OH、OP(=O)SH、メシルホスホロアミデート、または安定化リン酸基であり、
が、H、OH、OMe、MOE、またはハロゲンであり、
Xが、OH、SH、またはNSOであり、
が、アリール、置換アリール、複素環、置換複素環、芳香族複素環、置換芳香族複素環、ジアゾール、置換ジアゾール、C~Cアルコキシ、C~Cアルキル、C~Cアルケニル、C~Cアルキニル、置換C~Cアルキル、置換C~Cアルケニル置換C~Cアルキニル、及びコンジュゲート基から選択される、
態様205に記載のRNAi剤。
[態様210]Gが、HまたはOHから選択され、Xが、SHである、態様209に記載のRNAi剤。
[態様211]前記RNAiセンスオリゴマー化合物の少なくとも1個のヌクレオシド間連結基が、式XVIIのヌクレオシド間連結基である、態様157~210に記載のRNAi剤。
[態様212]前記RNAiセンスオリゴマー化合物の最も5’側の5個のヌクレオシド間連結基のうちの少なくとも1個が、式XVIIのヌクレオシド間連結基である、態様211に記載のRNAi剤。
[態様213]前記RNAiセンスオリゴマー化合物の最も5’側の5個のヌクレオシド間連結基のうちの少なくとも2個が、式XVIIのヌクレオシド間連結基である、態様211に記載のRNAi剤。
[態様214]前記RNAiセンスオリゴマー化合物の最も5’側の2個のヌクレオシド間連結基が、式XVIIのヌクレオシド間連結基である、態様211に記載のRNAi剤。
[態様215]前記RNAiセンスオリゴマー化合物の最も3’側の5個のヌクレオシド間連結基のうちの少なくとも1個が、式XVIIのヌクレオシド間連結基である、態様211~214のいずれかに記載のRNAi剤。
[態様216]RNAiセンスオリゴマー化合物の最も3’側の5個のヌクレオシド間連結基のうちの少なくとも2個が、式XVIIのヌクレオシド間連結基である、態様211~214のいずれかに記載のRNAi剤。
[態様217]最も3’側の2個のヌクレオシド間連結基が、式XVIIのヌクレオシド間連結基である、態様211~214のいずれかに記載のRNAi剤。
[態様218]前記RNAiセンスオリゴヌクレオチドの最も3’側の2個及び最も5’側の2個のヌクレオシド間連結基が、式XVIIのヌクレオシド間連結基であり、前記RNAiセンスオリゴヌクレオチドの残りのヌクレオシド間連結基が、ホスホジエステルヌクレオシド間結合である、態様211に記載のRNAi剤。
[態様219]式XVIIの各ヌクレオシド間連結基について、Rが、Hであり、Tが、SOMeである、態様211~218のいずれかに記載のRNAi剤。
[態様220]前記RNAiセンスオリゴマー化合物が、21個の連結ヌクレオシドからなり、ヌクレオシド間結合モチーフが、ooooooooooooooooooaa、aaooooooooooooooooaa、ooooooooooooooooooaa、またはssooooaoaaaoooooooooから選択され、式中、各「a」が、式XVIIのヌクレオシド間結合を表し、各「s」が、ホスホロチオエートヌクレオシド間結合を表し、各「o」が、ホスホジエステルヌクレオシド間結合を表す、態様211~219のいずれかに記載のRNAi剤。
[態様221]前記RNAiセンスオリゴマー化合物の前記ヌクレオシド間結合モチーフが、ooooooooooooooooooaa、aaooooooooooooooooaa、またはooooooooooooooooooaaから選択され、式中、各「a」が、式XVIIのヌクレオシド間結合を表し、各「s」が、ホスホロチオエートヌクレオシド間結合を表し、各「o」が、ホスホジエステルヌクレオシド間結合を表す、態様220に記載のRNAi剤。
[態様222]前記RNAiセンスオリゴマー化合物の糖モチーフが、yyyyyyfyfffyyyyyyyyyyまたはfyfyfyfyfyfyfyfyfyfyfから選択され、式中、「y」が、2’-OMe糖部分を表し、「f」が、2’-F糖部分を表す、態様220または221に記載のRNAi剤。
[態様223]各「a」が、メシルホスホロアミデート結合である、態様220~222のいずれかに記載のRNAi剤。
[態様224]前記RNAiセンスオリゴマー化合物の少なくとも1つの領域が、構造A、B、C、D、E、またはPを有する、態様211~223のいずれかに記載のRNAi剤。
[態様225]構造A、B、C、D、またはEを有する少なくとも1つの領域が、前記RNAiセンスオリゴマー化合物の3’末端にある、態様224に記載のRNAi剤。
[態様226]構造A、B、C、D、またはEを有する少なくとも1つの領域が、前記RNAiセンスオリゴマー化合物の5’末端にある、態様224に記載のRNAi剤。
[態様227]前記RNAiセンスオリゴマー化合物の少なくとも1つの領域が、前記式(Ng1L1(Ng2L2(Ng3L3を有し、式中、各Nが、ヌクレオシドであり、各Lが、ヌクレオシド間連結基であり、L、及びLの各々が、ホスホジエステルヌクレオシド間連結基、ホスホロチオエートヌクレオシド間連結基、または式XVIIのヌクレオシド間連結基であり、
式中、Lが、不在であるか、またはホスホジエステルヌクレオシド間連結基、ホスホロチオエートヌクレオシド間連結基、もしくは式XVIIのヌクレオシド間連結基であり、
式中、L、L、及びLのうちの少なくとも1つが、式XVIIのヌクレオシド間連結基であり、かつL、L、及びLのうちの少なくとも1つが、ホスホロチオエートまたはホスホジエステルヌクレオシド間連結基であり、
式中、式XVIIを有する前記RNAiセンスオリゴマー化合物の各ヌクレオシド間連結基について独立して、
Xが、OまたはSから選択され、
が、H、C~Cアルキル、及び置換C~Cアルキルから選択され、
Tが、SO、C(=O)R、及びP(=O)Rから選択され、式中、
が、アリール、置換アリール、複素環、置換複素環、芳香族複素環、置換芳香族複素環、ジアゾール、置換ジアゾール、C~Cアルコキシ、C~Cアルキル、C~Cアルケニル、C~Cアルキニル、置換C~Cアルキル、置換C~Cアルケニル置換C~Cアルキニル、及びコンジュゲート基から選択され、
が、アリール、置換アリール、CH、N(CH、OCH、及びコンジュゲートから選択され、
が、OCH、OH、C~Cアルキル、置換C~Cアルキル、及びコンジュゲートから選択され、
が、OCH、OH、C~Cアルキル、及び置換C~Cアルキルから選択される、
態様211~226のいずれかに記載のRNAi剤。
[態様228]前記式(Ng1L1(Ng2L2(Ng3L3を有する少なくとも1つの領域が、前記RNAiセンスオリゴマー化合物の3’末端にある、態様227に記載のRNAi剤。
[態様229]L1及びL2が、式XVIIのヌクレオシド間連結基であり、Rが、Hであり、Tが、SOMeであり、L3が、ホスホジエステルヌクレオシド間結合である、態様228に記載のRNAi剤。
[態様230]前記式(Ng1L1(Ng2L2(Ng3L3を有する少なくとも1つの領域が、前記RNAiセンスオリゴマー化合物の5’末端にある、態様227に記載のRNAi剤。
[態様231]L1が、ホスホジエステルヌクレオシド間連結基であり、L2及びL3が各々、式XVIIのヌクレオシド間連結基であり、Rが、Hであり、Tが、SOMeである、態様230に記載のRNAi剤。
[態様232]前記RNAiセンスオリゴマー化合物が、3’末端基及び/または5’末端基を含む、態様157~231のいずれかに記載のRNAi剤。
[態様233]前記RNAiセンスオリゴマー化合物が、コンジュゲート基を含む、態様157~231のいずれかに記載のRNAi剤。
[態様234]前記コンジュゲート基が、細胞標的化部分を含む、態様233に記載のRNAi剤。
[態様235]前記コンジュゲート基が、炭水化物または炭水化物クラスターを含む、態様233に記載のRNAi剤。
[態様236]前記コンジュゲート基が、少なくとも1つのGalNAcを含む、態様233に記載のRNAi剤。
[態様237]前記コンジュゲート基が、C10~C20アルキル鎖を含む、態様233に記載のRNAi剤。
[態様238]前記コンジュゲート基が、C16アルキルを含む、態様233に記載のRNAi剤。
[態様239]前記オリゴヌクレオチド二重鎖の二本鎖領域が、少なくとも15ヌクレオシドである、態様157~238のいずれかに記載のRNAi剤。
[態様240]前記オリゴヌクレオチド二重鎖の二本鎖領域が、少なくとも17ヌクレオシドである、態様157~238のいずれかに記載のRNAi剤。
[態様241]前記オリゴヌクレオチド二重鎖の二本鎖領域が、少なくとも19ヌクレオシドである、態様157~238のいずれかに記載のRNAi剤。
[態様242]前記オリゴヌクレオチド二重鎖の二本鎖領域が、厳密に19ヌクレオシドである、態様157~238のいずれかに記載のRNAi剤。
[態様243]前記修飾オリゴヌクレオチドの各ヌクレオシドが、修飾糖部分を含む修飾ヌクレオシドである、態様1~138のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
[態様244]前記修飾オリゴヌクレオチドの各修飾糖部分が、独立して、二環式糖部分及び2’置換フラノシル糖部分から選択される、態様243に記載のオリゴマー化合物。
[態様245]前記修飾オリゴヌクレオチドの各修飾糖部分が、同じ修飾を含む、態様243または244に記載のオリゴマー化合物。
[態様246]前記修飾オリゴヌクレオチドの各修飾糖部分が、2’-OMe糖部分、2’-MOE糖部分、及び2’-NMA糖部分から選択される、態様243~245のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
[態様247]前記修飾オリゴヌクレオチドの最も3’側の3個のヌクレオシドが、二環式糖部分を含み、前記修飾オリゴヌクレオチドの残りのヌクレオシドが、2’置換フラノシル糖部分を含む、態様243または244に記載のオリゴマー化合物。
[態様248]前記修飾オリゴヌクレオチドの最も3’側の4個のヌクレオシドが、二環式糖部分を含み、前記修飾オリゴヌクレオチドの残りのヌクレオシドが、2’置換フラノシル糖部分を含む、態様243または244に記載のオリゴマー化合物。
[態様249]前記修飾オリゴヌクレオチドの最も3’側の5個のヌクレオシドが、二環式糖部分を含
み、前記修飾オリゴヌクレオチドの残りのヌクレオシドが、2’置換フラノシル糖部分を含む、態様243または244に記載のオリゴマー化合物。
[態様250]前記修飾オリゴヌクレオチドの最も3’側の6個のヌクレオシドが、二環式糖部分を含み、前記修飾オリゴヌクレオチドの残りのヌクレオシドが、2’置換フラノシル糖部分を含む、態様243または244に記載のオリゴマー化合物。
[態様251]前記修飾オリゴヌクレオチドの各二環式糖部分が、cEt、LNA、及びENAの中から選択される、態様243または244のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
[態様252]前記二環式糖部分が、cEtである、態様251に記載のオリゴマー化合物。
[態様253]前記2’置換フラノシル糖部分が、2’-OMe、2’-MOE、及び2’-Fから選択される、態様247~252のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
[態様254]前記修飾オリゴヌクレオチドの最も5’側の10個の連結基のうちの少なくとも1個が、式XVIIのヌクレオシド間連結基である、態様243~253のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
[態様255]前記修飾オリゴヌクレオチドの最も5’側の10個の連結基のうちの少なくとも2個が、式XVIIのヌクレオシド間連結基である、態様254に記載のオリゴマー化合物。
[態様256]前記修飾オリゴヌクレオチドの最も5’側の10個の連結基のうちの少なくとも3個が、式XVIIのヌクレオシド間連結基である、態様254に記載のオリゴマー化合物。
[態様257]前記修飾オリゴヌクレオチドの最も5’側の10個の連結基のうちの少なくとも4個が、式XVIIのヌクレオシド間連結基である、態様254に記載のオリゴマー化合物。
[態様258]前記修飾オリゴヌクレオチドの最も5’側の10個の連結基のうちの少なくとも5個が、式XVIIのヌクレオシド間連結基である、態様254に記載のオリゴマー化合物。
[態様259]前記修飾オリゴヌクレオチドの最も5’側の10個の連結基のうちの少なくとも6個が、式XVIIのヌクレオシド間連結基である、態様254に記載のオリゴマー化合物。
[態様260]最も5’側の2個のヌクレオシド間連結基が、式XVIIのヌクレオシド間連結基である、態様254に記載のオリゴマー化合物。
[態様261]前記修飾オリゴヌクレオチドの最も3’側の10個のヌクレオシド間連結基のうちの少なくとも1個が、式XVIIのヌクレオシド間連結基である、態様243~260のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
[態様262]前記修飾オリゴヌクレオチドの最も3’側の10個のヌクレオシド間連結基のうちの少なくとも2個が、式XVIIのヌクレオシド間連結基である、態様261に記載のオリゴマー化合物。
[態様263]最も3’側の10個のヌクレオシド間連結基のうちの少なくとも3個が、式XVIIのヌクレオシド間連結基である、態様261に記載のオリゴマー化合物。
[態様264]最も3’側の10個のヌクレオシド間連結基のうちの少なくとも4個が、式XVIIのヌクレオシド間連結基である、態様261に記載のオリゴマー化合物。
[態様265]最も3’側の10個のヌクレオシド間連結基のうちの少なくとも5個が、式XVIIのヌクレオシド間連結257である、態様261に記載のオリゴマー化合物。
[態様266]最も3’側の10個のヌクレオシド間連結基のうちの少なくとも6個が、式XVIIのヌクレオシド間連結基である、態様261に記載のオリゴマー化合物。
[態様267]前記オリゴマー化合物の最も3’側の2個のヌクレオシド間連結基が、式XVIIのヌクレオシド間連結基である、態様261に記載のオリゴマー化合物。
[態様268]前記修飾オリゴヌクレオチドが、式XVIIの少なくとも3個の連続したヌクレオシド間連結基の少なくとも1つのブロックを含む、態様239~249のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
[態様269]前記修飾オリゴヌクレオチドが、式XVIIの少なくとも4個の連続したヌクレオシド間連結基の少なくとも1つのブロックを含む、態様239~249のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
[態様270]前記修飾オリゴヌクレオチドが、式XVIIの少なくとも5個の連続したヌクレオシド間連結基の少なくとも1つのブロックを含む、態様239~249のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
[態様271]前記修飾オリゴヌクレオチドが、式XVIIの少なくとも6個の連続したヌクレオシド間連結基の少なくとも1つのブロックを含む、態様239~249のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
[態様272]式XVIIの連続したヌクレオシド間連結基の少なくとも1つのブロックが、前記修飾オリゴヌクレオチドの5’末端にある、態様268~271のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
[態様273]式XVIIの連続したヌクレオシド間連結基の少なくとも1つのブロックが、前記修飾オリゴヌクレオチドの3’末端にある、態様268~271のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
[態様274]前記修飾オリゴヌクレオチドの式XVIIの各ヌクレオシド間連結基について、Rが、Hであり、Tが、SOMeである、態様239~273のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
[態様275]前記修飾オリゴヌクレオチドの前記ヌクレオシド間結合モチーフが、aaaaaasssssssss、sssssaaaaaassss、またはsssssssssaaaaaaから選択され、式中、各「a」が、式XVIIのヌクレオシド間結合を表し、各「s」が、ホスホロチオエートヌクレオシド間結合を表し、各「o」が、ホスホジエステルヌクレオシド間結合を表す、態様239~249のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
[態様276]各「a」が、メシルホスホロアミデートヌクレオシド間結合を表す、態様271に記載のオリゴマー化合物。
[態様277]前記修飾オリゴヌクレオチドが、6~11個の連結ヌクレオシドからなるデオキシ領域を含み、前記デオキシ領域の各ヌクレオシドが、修飾ヌクレオシドまたは立体標準的DNAヌクレオシドのいずれかであり、前記デオキシ領域の少なくとも3個の連続するヌクレオシドが、立体標準的DNAヌクレオシドであり、前記デオキシ領域の3個を超えないヌクレオシドが、修飾ヌクレオシドである、態様1~138のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
[態様278]前記デオキシ領域の少なくとも5個の連続するヌクレオシドが、立体標準的DNAヌクレオシドである、態様277に記載のオリゴマー化合物。
[態様279]前記デオキシ領域の少なくとも6個の連続するヌクレオシドが、立体標準的DNAヌクレオシドである、態様277に記載のオリゴマー化合物。
[態様280]前記デオキシ領域の少なくとも7個の連続するヌクレオシドが、立体標準的DNAヌクレオシドである、態様277に記載のオリゴマー化合物。
[態様281]前記デオキシ領域の少なくとも8個の連続するヌクレオシドが、立体標準的DNAヌクレオシドである、態様277に記載のオリゴマー化合物。
[態様282]前記デオキシ領域が、8~10個の連結ヌクレオシドからなる、態様277~281のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
[態様283]前記デオキシ領域が、9個の連結ヌクレオシドからなる、態様277~281のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
[態様284]前記デオキシ領域が、10個の連結ヌクレオシドからなる、態様277~281のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
[態様285]前記デオキシ領域が、11個の連結ヌクレオシドからなる、態様277~281のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
[態様286]前記デオキシ領域の少なくとも6個のヌクレオシドが、立体標準的DNAヌクレオシドである、態様277~281のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
[態様287]前記デオキシ領域の少なくとも7個のヌクレオシドが、立体標準的DNAヌクレオシドである、態様277~281のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
[態様288]前記デオキシ領域の少なくとも8個のヌクレオシドが、立体標準的DNAヌクレオシドである、態様277~281のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
[態様289]前記デオキシ領域の少なくとも9個のヌクレオシドが、立体標準的DNAヌクレオシドである、態様277~281のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
[態様290]前記デオキシ領域の厳密に2個のヌクレオシドが、修飾ヌクレオシドである、態様277~289のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
[態様291]前記デオキシ領域の厳密に1個のヌクレオシドが、修飾ヌクレオシドである、態様277~290のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
[態様292]前記デオキシ領域の少なくとも1個の修飾ヌクレオシドが、β-D-LNAヌクレオシド、α-L-LNAヌクレオシド、ENAヌクレオシド、cEtヌクレオシド、2’-MOEヌクレオシド、2’-OMeヌクレオシド、2’-Fヌクレオシド、及び5’-アルキルヌクレオシドから選択される立体標準的修飾ヌクレオシドまたは二環式ヌクレオシドである、態様277~291のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
[態様293]前記デオキシ領域の少なくとも1個の修飾ヌクレオシドが、立体非標準的ヌクレオシドである、態様277~292のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
[態様294]前記デオキシ領域の前記少なくとも1個の立体非標準的ヌクレオシドが、立体非標準的DNAヌクレオシドである、態様293に記載のオリゴマー化合物。
[態様295]前記立体非標準的DNAヌクレオシドが、式I、式II、式III、式IV、式V、式VI、及び式VIIを有する立体非標準的DNAヌクレオシドから選択される、態様294に記載のオリゴマー化合物。
[態様296]前記立体非標準的DNAヌクレオシドが、式V及び式IIを有する立体非標準的DNAヌクレオシドから選択される、態様295に記載のオリゴマー化合物。
[態様297]前記デオキシ領域の少なくとも1個の立体非標準的ヌクレオシドが、置換立体非標準的ヌクレオシドである、態様296に記載のオリゴマー化合物。
[態様298]少なくとも1個の置換立体非標準的ヌクレオシドが、2’-MOE、2’-OMe、2’-F、または2’-OHから選択される2’置換基を有する、態様297に記載のオリゴマー化合物。
[態様299]前記デオキシ領域の5’末端から2番目のヌクレオシドが、修飾ヌクレオシドである、態様277~298のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
[態様300]前記デオキシ領域の5’末端から3番目のヌクレオシドが、修飾ヌクレオシドである、態様277~298のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
[態様301]前記デオキシ領域の5’末端から4番目のヌクレオシドが、修飾ヌクレオシドである、態様277~298のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
[態様302]前記デオキシ領域における前記修飾ヌクレオシドが、2’-OMeヌクレオシドである、態様299~301のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
[態様303]前記デオキシ領域の各ヌクレオシドが、立体標準的DNAヌクレオシドである、態様277~292のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
[態様304]前記デオキシ領域内の少なくとも1個のヌクレオシド間連結基が、式XVIIのヌクレオシド間連結基である、態様277~303のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
[態様305]前記デオキシ領域の5’末端から数えて前記デオキシ領域の1番目及び2番目のヌクレオシドを連結している前記ヌクレオシド間連結基が、式XVIIのヌクレオシド間連結基である、態様277~304のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
[態様306]前記デオキシ領域の5’末端から数えて前記デオキシ領域の2番目及び3番目のヌクレオシドを連結している前記ヌクレオシド間連結基が、式XVIIのヌクレオシド間連結基である、態様277~305のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
[態様307]前記デオキシ領域の5’末端から数えて前記デオキシ領域の3番目及び4番目のヌクレオシドを連結している前記ヌクレオシド間連結基が、式XVIIのヌクレオシド間連結基である、態様277~306のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
[態様308]前記デオキシ領域の5’末端から数えて前記デオキシ領域の4番目及び5番目のヌクレオシドを連結している前記ヌクレオシド間連結基が、式XVIIのヌクレオシド間連結基である、態様277~307のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
[態様309]前記デオキシ領域における1個のヌクレオシド間連結基が、式XVIIの連結基であり、前記デオキシ領域のその他のヌクレオシド間連結基が、独立して、ホスホジエステル及びホスホロチオエートヌクレオシド間連結基から選択される、態様277~308のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
[態様310]前記デオキシ領域における2個のヌクレオシド間連結基が、式XVIIの連結基であり、前記デオキシ領域のその他のヌクレオシド間連結基が、独立して、ホスホジエステル及びホスホロチオエートヌクレオシド間連結基から選択される、態様277~308のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
[態様311]前記デオキシ領域における3個のヌクレオシド間連結基が、式XVIIの連結基であり、前記デオキシ領域のその他のヌクレオシド間連結基が、独立して、ホスホジエステル及びホスホロチオエートヌクレオシド間連結基から選択される、態様277~308のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
[態様312]前記デオキシ領域における4個のヌクレオシド間連結基が、式XVIIの連結基であり、前記デオキシ領域のその他のヌクレオシド間連結基が、各ホスホジエステルまたはホスホロチオエートヌクレオシド間連結基である、態様277~308のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
[態様313]前記式XVIIのヌクレオシド間連結基が、前記デオキシ領域の5’末端から数えて、前記デオキシ領域の1番目及び2番目、2番目及び3番目、3番目及び4番目、及び/または4番目及び5番目のヌクレオシドを連結している、態様309~312のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
[態様314]前記デオキシ領域が、構造A、B、C、D、E、またはPを有する少なくとも1つの領域を含む、態様277~313のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
[態様315]構造A、B、C、D、またはEを有する前記領域が、前記デオキシ領域の3’末端にある、態様314に記載のオリゴマー化合物。
[態様316]構造A、B、C、D、E、またはPを有する前記領域が、前記デオキシ領域の5’末端にある、態様314に記載のオリゴマー化合物。
[態様317]前記デオキシ領域が、前記式(Ng1L1(Ng2L2(Ng3L3を有する少なくとも1つの領域を含み、式中、各Nが、ヌクレオシドであり、各Lが、ヌクレオシド間連結基であり、L、及びLの各々が、ホスホジエステルヌクレオシド間連結基、ホスホロチオエートヌクレオシド間連結基、または式XVIIのヌクレオシド間連結基であり、
式中、Lが、不在であるか、またはホスホジエステルヌクレオシド間連結基、ホスホロチオエートヌクレオシド間連結基、もしくは式XVIIのヌクレオシド間連結基であり、
式中、L、L、及びLのうちの少なくとも1つが、式XVIIのヌクレオシド間連結基であり、かつL、L、及びLのうちの少なくとも1つが、ホスホロチオエートまたはホスホジエステルヌクレオシド間連結基であり、
式中、式XVIIを有する前記修飾オリゴヌクレオチドの各ヌクレオシド間連結基について独立して、
Xが、OまたはSから選択され、
が、H、C~Cアルキル、及び置換C~Cアルキルから選択され、
Tが、SO、C(=O)R、及びP(=O)Rから選択され、式中、
が、アリール、置換アリール、複素環、置換複素環、芳香族複素環、置換芳香族複素環、ジアゾール、置換ジアゾール、C~Cアルコキシ、C~Cアルキル、C~Cアルケニル、C~Cアルキニル、置換C~Cアルキル、置換C~Cアルケニル置換C~Cアルキニル、及びコンジュゲート基から選択され、
が、アリール、置換アリール、CH、N(CH、OCH、及びコンジュゲートから選択され、
が、OCH、OH、C~Cアルキル、置換C~Cアルキル、及びコンジュゲートから選択され、
が、OCH、OH、C~Cアルキル、及び置換C~Cアルキルから選択される、
態様277~316のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
[態様318]前記式(Ng1L1(Ng2L2(Ng3L3を有する前記領域が、前記デオキシ領域の3’末端にある、態様317に記載のオリゴマー化合物。
[態様319]前記式(Ng1L1(Ng2L2(Ng3L3を有する前記領域が、前記デオキシ領域の5’末端にある、態様317に記載のオリゴマー化合物。
[態様320]式XVIIの各ヌクレオシド間結合について、Rが、Hであり、Tが、SOMeである、態様304~319のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
[態様321]前記デオキシ領域には、5’側に1~6個の連結された5’領域ヌクレオシドからなる5’領域及び3’側に1~6個の連結された3’領域ヌクレオシドからなる3’領域が隣接し、
前記5’領域の最も3’側のヌクレオシドが、修飾糖部分を含み、
前記3’領域の最も5’側のヌクレオシドが、修飾糖部分を含む、
態様277~320のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
[態様322]前記デオキシ領域が、7~11個の連結ヌクレオシドからなり、下記式を有し、
(Nd1L1(Nd2L2(Nd3L3(Nd4L4[(NL5
式中、Nd1、Nd2、Nd3、Nd4が、独立して、
立体標準的DNAヌクレオシド、立体非標準的DNAヌクレオシド、または2’置換ヌクレオシドの中から選択されるが、但し、Nd1、Nd2、Nd3、またはNd4のうちの1つよりも多くが2’置換ヌクレオシドであることはないことを条件とし、
各Nが、独立して、立体標準的DNAヌクレオシド及び立体非標準的DNAヌクレオシドの中から選択され、
qが、3~8であり、
、L、L、L、及び各Lの各々が、ヌクレオシド間結合であり、
、L、L、Lのうちの少なくとも2つが、式XVIIのヌクレオシド間結合である、
態様321に記載のオリゴマー化合物。
[態様323]Nd1、Nd2、Nd3、またはNd4のうちの1つが、2’置換ヌクレオシドである、態様322に記載のオリゴマー化合物。
[態様324]前記2’置換ヌクレオシドが、2’-OMeヌクレオシドである、態様323に記載のオリゴマー化合物。
[態様325]前記2’-OMeヌクレオシドが、立体標準的2’-OMeヌクレオシドである、態様324に記載のオリゴマー化合物。
[態様326]前記2’置換ヌクレオシドが、Nd2である、態様322~325のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
[態様327]Nd1、Nd2、Nd3、Nd4の各々、及び各Nが、DNAヌクレオシドである、態様322に記載のオリゴマー化合物。
[態様328]各DNAヌクレオシドが、立体標準的DNAヌクレオシドである、態様327に記載のオリゴマー化合物。
[態様329]L及びLが、式XVIIのヌクレオシド間結合である、態様322~328のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
[態様330]L及びLが、式XVIIのヌクレオシド間結合である、態様322~328のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
[態様331]L及びLが、式XVIIのヌクレオシド間結合である、態様322~328のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
[態様332]L、L、及びLが、式XVIIのヌクレオシド間結合である、態様322~328のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
[態様333]L、L、及びLが、式XVIIのヌクレオシド間結合である、態様322~328のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
[態様334]L、L、L、及びLが、式XVIIのヌクレオシド間結合である、態様322~328のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
[態様335]各Lが、ホスホロチオエートヌクレオシド間結合である、態様322~334のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
[態様336]式XVIIのヌクレオシド間結合ではない各ヌクレオシド間結合が、ホスホロチオエートヌクレオシド間結合である、態様322~335に記載のオリゴマー化合物。
[態様337]式XVIIの各ヌクレオシド間結合について、Rが、Hであり、Tが、SOMeである、態様322~336のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
[態様338]前記5’領域が、2~5個の連結ヌクレオシドからなる、態様321~337のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
[態様339]前記5’領域が、3個の連結ヌクレオシドからなる、態様338に記載のオリゴマー化合物。
[態様340]前記5’領域が、5個の連結ヌクレオシドからなる、態様338に記載のオリゴマー化合物。
[態様341]前記5’領域の各ヌクレオシドが、修飾ヌクレオシドである、態様321~340のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
[態様342]前記5’領域の各ヌクレオシドが、修飾糖を含む修飾ヌクレオシドである、態様321~341のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
[態様343]前記5’領域の少なくとも1個のヌクレオシドが、2’置換フラノシル糖部分を含む、態様321~342のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
[態様344]前記5’領域の各ヌクレオシドが、2’置換フラノシル糖部分を含む、態様321~343のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
[態様345]前記5’領域の各2’置換フラノシル糖部分が、2’-MOE、2’-OMe、及び2’-NMAの中から選択される2’置換基を有する、態様321~344のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
[態様346]前記5’領域の少なくとも1個のヌクレオシドが、二環式フラノシル糖部分を含む、態様321~343または345のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
[態様347]前記5’領域の各ヌクレオシドが、二環式フラノシル糖部分を含む、態様321~343または345~346のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
[態様348]前記5’領域の各二環式糖部分が、cEt、LNA、及びENAの中から選択される、態様346または347に記載のオリゴマー化合物。
[態様349]前記5’領域の各二環式糖部分が、cEt糖部分である、態様348に記載のオリゴマー化合物。
[態様350]前記5’領域の少なくとも1個のヌクレオシドが、立体標準的DNAヌクレオシドである、態様321~349のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
[態様351]前記5’領域の少なくとも1個のヌクレオシドが、立体非標準的ヌクレオシドである、態様321~350のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
[態様352]前記5’領域の各核酸塩基が、独立して、チミン、ウラシル、グアニン、シトシン、5-メチルシトシン、及びアデニンの中から選択される、態様321~351のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
[態様353]前記3’領域が、2~5個の連結ヌクレオシドからなる、態様321~352のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
[態様354]前記3’領域が、3個の連結ヌクレオシドからなる、態様353に記載のオリゴマー化合物。
[態様355]前記3’領域が、5個の連結ヌクレオシドからなる、態様353に記載のオリゴマー化合物。
[態様356]前記3’領域の各ヌクレオシドが、修飾ヌクレオシドである、態様321~355のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
[態様357]前記3’領域の各ヌクレオシドが、修飾糖を含む修飾ヌクレオシドである、態様321~356のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
[態様358]前記3’領域の少なくとも1個のヌクレオシドが、2’置換フラノシル糖部分を含む、態様321~356のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
[態様359]前記3’領域の各ヌクレオシドが、2’置換フラノシル糖部分を含む、態様321~358のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
[態様360]前記3’領域の各2’置換フラノシル糖部分が、2’-MOE、2’-OMe、及び2’-NMAの中から選択される2’置換基を有する、態様321~359のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
[態様361]前記3’領域の少なくとも1個のヌクレオシドが、二環式フラノシル糖部分を含む、態様321~358または360のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
[態様362]前記3’領域の各ヌクレオシドが、二環式フラノシル糖部分を含む、態様321~357または361のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
[態様363]前記3’領域の各二環式糖部分が、cEt、LNA、及びENAの中から選択される、態様361または362に記載のオリゴマー化合物。
[態様364]前記3’領域の各二環式糖部分が、cEt糖部分である、態様363に記載のオリゴマー化合物。
[態様365]前記3’領域の少なくとも1個のヌクレオシドが、立体標準的DNAヌクレオシドである、態様321~364のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
[態様366]前記3’領域の少なくとも1個のヌクレオシドが、立体非標準的ヌクレオシドである、態様321~365のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
[態様367]前記3’領域の各核酸塩基が、独立して、チミン、ウラシル、グアニン、シトシン、5-メチルシトシン、及びアデニンの中から選択される、態様321~366のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
[態様368]前記オリゴマー化合物が、ギャップマーである、態様321~367のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
[態様369]前記修飾オリゴヌクレオチドが、kkkddddddddddkkk及びkkkdyddddddddkkkから選択される糖モチーフを有し、式中、各「k」が、cEt糖部分を表し、「y」が、2’-OMe糖部分を表し、各「d」が、β-D-2’-デオキシリボシル糖部分を表す、態様321~368のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
[態様370]前記修飾オリゴヌクレオチドが、ssssssssssssssa、sssssssssssssas、ssssssssssssass、sssssssssssasss、ssssssssssassss、sssssssssasssss、ssssssssassssss、sssssssasssssss、ssssssassssssss、sssssasssssssss、ssssassssssssss、sssasssssssssss、ssassssssssssss、sasssssssssssss、assssssssssssss、sssssssssssssaa、ssssssssssssaas、sssssssssssaass、ssssssssssaasss、sssssssssaassss、ssssssssaasssss、sssssssaassssss、ssssssaasssssss、sssssaassssssss、ssssaasssssssss、sssaassssssssss、ssaasssssssssss、saassssssssssss、aasssssssssssss、aaaaaaaaaaaaaaa、ssaaaaaaaaaaass、ssaaaaaaaaaasss、sssaaaaaaaaasss、aassssssssssaaa、sssaaasssssssss、ssssaaassssssss、sssaaaassssssss、ssaaassssssssss、ssaaaasssssssss、ssaaaaassssssss、ssaaaaaasssssss、ssaaaaaaassssss、ssaaaaaaaasssss、ssaaaaaaaaassss、ssssssssssaaass、sssssssssaaaass、ssssssssaaaaass、sssssssaaaaaass、ssssssaaaaaaass、sssssaaaaaaaass、ssssaaaaaaaaass、sssaaaaaaaaaass、ssasasasasasass、sssasasasasasss、ooossssssssssoo、soossssssssssos、aoosssssssssooa、aoasssssssssaoa、aoaaaassssssaoa、aoossssssssssoa、ooasssssssssaoo、aoosaasssssssoa、aossaasssssssoa、aooaaaasssssaoa、aoossssssaaaaoa、sssssaaasssssss、ssssssaaassssss、sssssssaaasssss、ssssssssaaassss、sssssssssaaasss、ssssaaaasssssss、sssssaaaassssss、ssssssaaaasssss、sssssssaaaassss、ssssssssaaaasss、sssaassssssaass、sssaasssssaasss、sssaassssaassss、sssaasssaasssss、sssaassaassssss、sssaasaasssssss、ssaasssssssaass、ssssaasssssaass、sssssaassssaass、ssssssaasssaass、sssssssaassaass、ssssssssaasaass、ssssaasssaassss、sssssaasaasssss、sssssssssssssss、aaassssssssssss、aaassssssssssaa、aaaaaasssssssss、aoooosaasssssssooaa、aoooossssssssssooaa、sooooaassssssssooss、soooosaasssssssooss、soooossaassssssooss、soooossssssaassooss、sssaaaaasssssss、sssssaaaaaassss、またはsssssssssaaaaaaから選択されるヌクレオシド間結合モチーフを有し、式中、各「a」が、式XVIIのヌクレオシド間結合を表し、各「s」が、ホスホロチオエートヌクレオシド間結合を表し、各「o」が、ホスホジエステルヌクレオシド間結合を表す、態様321~369のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
[態様371]前記修飾オリゴヌクレオチドが、sssaaaassssssss、sssaaasssssssss、ssssaaassssssss、ssssaasssssaass、sssaassssssssss、ssssaasssssssss、sssssaassssssss、またはsssssssssaassssから選択されるヌクレオシド間結合モチーフを有し、式中、各「a」が、式XVIIのヌクレオシド間結合を表し、各「s」が、ホスホロチオエートヌクレオシド間結合を表し、各「o」が、ホスホジエステルヌクレオシド間結合を表す、態様370に記載のオリゴマー化合物。
[態様372]各「a」が、メシルホスホロアミデートヌクレオシド間結合を表す、態様370または371に記載のオリゴマー化合物。
[態様373]前記修飾オリゴヌクレオチドが、CRISPR化合物である、態様1~138のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
[態様374]前記CRISPR化合物が、20~50個または29~32個の連結ヌクレオシドからなる、態様373に記載のオリゴマー化合物。
[態様375]各XがOである、態様90~374のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
[態様376]各XがSである、態様90~374のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
[態様377]少なくとも1つのRが、Hである、態様90~376のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
[態様378]少なくとも1つのRが、C~Cアルキルである、態様90~376のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
[態様379]前記少なくとも1つのRが、メチルである、態様378に記載のオリゴマー化合物。
[態様380]少なくとも1つのRが、置換C~Cアルキルである、態様90~376のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
[態様381]少なくとも1つのTが、コンジュゲート基を含む、態様90~380のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
[態様382]前記コンジュゲート基が、細胞標的化部分を含む、態様381に記載のオリゴマー化合物。
[態様383]前記コンジュゲート基が、炭水化物または炭水化物クラスターを含む、態様381に記載のオリゴマー化合物。
[態様384]前記コンジュゲート基が、少なくとも1つのGalNAcを含む、態様381~383のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
[態様385]前記コンジュゲート基が、C10~C20アルキル鎖を含む、態様381に記載のオリゴマー化合物。
[態様386]前記コンジュゲート基が、C16アルキルを含む、態様385に記載のオリゴマー化合物。
[態様387]少なくとも1つのTが、コンジュゲート基を含まない、態様90~386のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
[態様388]各Tが、コンジュゲート基を含まない、態様90~380のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
[態様389]少なくとも1つのTが、SOである、態様90~388のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
[態様390]Rが、アリールである、態様389に記載のオリゴマー化合物。
[態様391]Rが、置換アリールである、態様389に記載のオリゴマー化合物。
[態様392]Rが、複素環である、態様389に記載のオリゴマー化合物。
[態様393]Rが、置換複素環である、態様389に記載のオリゴマー化合物。
[態様394]Rが、芳香族複素環である、態様389に記載のオリゴマー化合物。
[態様395]Rが、置換芳香族複素環である、態様389に記載のオリゴマー化合物。
[態様396]Rが、ジアゾールである、態様389に記載のオリゴマー化合物。
[態様397]Rが、置換ジアゾールである、態様389に記載のオリゴマー化合物。
[態様398]Rが、アミンである、態様389に記載のオリゴマー化合物。
[態様399]Rが、置換アミンである、態様389に記載のオリゴマー化合物。
[態様400]Rが、C~Cアルコキシ、C~Cアルケニル、またはC~Cアルキニルである、態様389に記載のオリゴマー化合物。
[態様401]Rが、C~C20、C~C、C~C20、C~C、またはC10~C20アルキルである、態様389に記載のオリゴマー化合物。
[態様402]Rが、置換C~C20、C~C、C~C20、C~C、またはC10~C20アルキルである、態様389に記載のオリゴマー化合物。
[態様403]Rが、炭水化物または炭水化物クラスターを含む、態様389に記載のオリゴマー化合物。
[態様404]Rが、少なくとも1つのGalNAcを含む、態様389に記載のオリゴマー化合物。
[態様405]Tが、下記である、態様389に記載のオリゴマー化合物。
[態様406]Tが、下記である、態様389に記載のオリゴマー化合物。
[態様407]Tが、下記である、態様389に記載のオリゴマー化合物。
[態様408]Tが、下記である、態様389に記載のオリゴマー化合物。
[態様409]Tが、下記である、態様389に記載のオリゴマー化合物。
[態様410]Tが、下記である、態様389に記載のオリゴマー化合物。
[態様411]Tが、下記である、態様389に記載のオリゴマー化合物。
[態様412]Tが、下記である、態様389に記載のオリゴマー化合物。
[態様413]Tが、下記である、態様389に記載のオリゴマー化合物。
[態様414]Tが、下記であり、
式中、nが、2~20である、態様389に記載のオリゴマー化合物。
[態様415]nが、15である、態様414に記載のオリゴマー化合物。
[態様416]少なくとも1つのTが、C(=O)Rである、態様90~415のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
[態様417]Rが、アリールである、態様416に記載のオリゴマー化合物。
[態様418]Rが、置換アリールである、態様416に記載のオリゴマー化合物。
[態様419]Rが、CHである、態様416に記載のオリゴマー化合物。
[態様420]Rが、N(CHである、態様416に記載のオリゴマー化合物。
[態様421]Rが、OCHである、態様416に記載のオリゴマー化合物。
[態様422]Rが、C~Cアルコキシである、態様416に記載のオリゴマー化合物。
[態様423]Rが、C~C20、C~C、C~C20、C~C、またはC10~C20アルキルである、態様416に記載のオリゴマー化合物。
[態様424]Rが、置換C~C20、C~C、C~C20、C~C、またはC10~C20アルキルである、態様416に記載のオリゴマー化合物。
[態様425]Rが、炭水化物または炭水化物クラスターを含む、態様416に記載のオリゴマー化合物。
[態様426]R23が、少なくとも1つのGalNAcを含む、態様416に記載のオリゴマー化合物。
[態様427]Tが、下記である、態様416に記載のオリゴマー化合物。
[態様428]Tが、下記である、態様416に記載のオリゴマー化合物。
[態様429]Tが、下記である、態様416に記載のオリゴマー化合物。
[態様430]Tが、下記である、態様416に記載のオリゴマー化合物。
[態様431]Tが、下記であり、
式中、nが、2~20である、態様416に記載のオリゴマー化合物。
[態様432]nが、15である、態様426に記載のオリゴマー化合物。
[態様433]少なくとも1つのTが、P(=O)Rである、態様90~427のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
[態様434]Rが、OCHである、態様433に記載のオリゴマー化合物。
[態様435]Rが、OHである、態様433に記載のオリゴマー化合物。
[態様436]Rが、C~Cアルキルである、態様433に記載のオリゴマー化合物。
[態様437]Rが、置換C~Cアルキルである、態様433に記載のオリゴマー化合物。
[態様438]Rが、C~C20、C~C、C~C20、C~C、またはC10~C20アルキルである、態様433に記載のオリゴマー化合物。
[態様439]Rが、置換C~C20、C~C、C~C20、C~C、またはC10~C20アルキルである、態様433に記載のオリゴマー化合物。
[態様440]Rが、炭水化物または炭水化物クラスターを含む、態様433に記載のオリゴマー化合物。
[態様441]Rが、少なくとも1つのGalNAcを含む、態様433に記載のオリゴマー化合物。
[態様442]Rが、OCHである、態様433~441のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
[態様443]Rが、OHである、態様433~441のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
[態様444]Rが、C~Cアルキルである、態様433~441のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
[態様445]Rが、置換C~Cアルキルである、態様433~441のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
[態様446]Tが、下記である、態様433に記載のオリゴマー化合物。
[態様447]Tが、下記である、態様433に記載のオリゴマー化合物。
[態様448]Tが、下記であり、
式中、nが、2~20である、態様433に記載のオリゴマー化合物。
[態様449]nが、15である、態様448に記載のオリゴマー化合物。
[態様450]ヌクレオシド間連結基を介して連結された12~50個の連結ヌクレオシドからなる修飾オリゴヌクレオチドを含むアンチセンス剤であって、少なくとも1個のヌクレオシド間連結基が、ホスホジエステルまたはホスホロチオエートヌクレオシド間連結基であり、前記ヌクレオシド間連結基のうちの少なくとも1個が、式XXを有し、
式中、式XXを有する前記修飾オリゴヌクレオチドの各ヌクレオシド間連結基について独立して、Xが、OまたはSから選択される、
前記アンチセンス剤。
[態様451]修飾オリゴヌクレオチドを含むアンチセンス剤であって、前記修飾オリゴヌクレオチドの5’末端が、構造Fを有し、
式中、
pが、0~6であり、
qが、0~6であり、
Tが、OHまたはコンジュゲート基であり、
各Bxが、独立して選択される複素環式塩基部分であり、
各Xが、独立して、OHまたはSHから選択され、
各Zが、独立して、O、S、またはNSOMeから選択され、
同じフラノシル糖部分の各J及びGについて、J及びGが、JからGの架橋を形成するか、またはJが、Hであり、Gが、OH、ハロゲン、もしくはO-[C(R)(R)]-[(C=O)-X-Rから選択されるかのいずれかであり、
式中、各JからGの架橋が、-CH(CH)-O-または-(CH-O-から独立して選択される式を有し、式中、kが、1~3であり、
各R及びRが、独立して、H、ハロゲン、C~Cアルキル、または置換C~Cアルキルであり、
各Xが、O、S、またはN(E)であり、
が、H、ハロゲン、C~Cアルキル、置換C~Cアルキル、C~Cアルケニル、置換C~Cアルケニル、C~Cアルキニル、置換C~Cアルキニル、またはN(E)(E)であり、
、E、及びEが、各々独立して、H、C~Cアルキル、または置換C~Cアルキルであり、
nが、1~6であり、
mが、0または1であり、
jが、0または1であり、
置換された各基が、ハロゲン、OJ、N(J)(J)、=NJ、SJ、N、CN、OC(=X)J、OC(=X)N(J)(J)、及びC(=Q)N(J)(J)から独立して選択される、1つまたは複数の任意選択で保護される置換基を含み、
が、O、S、またはNJであり、
各J、J、及びJが、独立して、HまたはC~Cアルキルである、
前記アンチセンス剤。
[態様452]修飾オリゴヌクレオチドを含むアンチセンス剤であって、前記修飾オリゴヌクレオチドの3’末端が、構造Gを有し、
式中、
pが、0~6であり、
qが、1~6であり、
Tが、OHまたはコンジュゲート基であり、
各Bxが、独立して選択される複素環式塩基部分であり、
各Xが、独立して、OHまたはSHから選択され、
各Zが、独立して、O、S、またはNSOMeから選択され、
同じフラノシル糖部分の各J及びGについて、J及びGが、JからGの架橋を形成するか、またはJが、Hであり、Gが、OH、ハロゲン、もしくはO-[C(R)(R)]-[(C=O)-X-Rから選択されるかのいずれかであり、
式中、各JからGの架橋が、-CH(CH)-O-または-(CH-O-から独立して選択される式を有し、式中、kが、1~3であり、
各R及びRが、独立して、H、ハロゲン、C~Cアルキル、または置換C~Cアルキルであり、
各Xが、O、S、またはN(E)であり、
が、H、ハロゲン、C~Cアルキル、置換C~Cアルキル、C~Cアルケニル、置換C~Cアルケニル、C~Cアルキニル、置換C~Cアルキニル、またはN(E)(E)であり、
、E、及びEが、各々独立して、H、C~Cアルキル、または置換C~Cアルキルであり、
nが、1~6であり、
mが、0または1であり、
jが、0または1であり、
置換された各基が、ハロゲン、OJ、N(J)(J)、=NJ、SJ、N、CN、OC(=X)J、OC(=X)N(J)(J)、及びC(=Q)N(J)(J)から独立して選択される、1つまたは複数の任意選択で保護される置換基を含み、
が、O、S、またはNJであり、
各J、J、及びJが、独立して、HまたはC~Cアルキルである、
前記アンチセンス剤。
[態様453]p+qの和が、2、3、4、または5から選択される、態様451または452に記載のアンチセンス剤。
[態様454]修飾オリゴヌクレオチドを含むアンチセンス剤であって、前記修飾オリゴヌクレオチドの5’末端が、構造Hを有し、
式中、
pが、0~5であり、
qが、1~4であり、
Tが、OHまたはコンジュゲート基であり、
各Bxが、独立して選択される複素環式塩基部分であり、
各Xが、独立して、OHまたはSHから選択され、
各Zが、独立して、O、S、またはNSOMeから選択され、
同じフラノシル糖部分の各J及びGについて、J及びGが、JからGの架橋を形成するか、またはJが、Hであり、Gが、OH、ハロゲン、もしくはO-[C(R)(R)]-[(C=O)-X-Rから選択されるかのいずれかであり、
式中、各JからGの架橋が、-CH(CH)-O-または-(CH-O-から独立して選択される式を有し、式中、kが、1~3であり、
各R及びRが、独立して、H、ハロゲン、C~Cアルキル、または置換C~Cアルキルであり、
各Xが、O、S、またはN(E)であり、
が、H、ハロゲン、C~Cアルキル、置換C~Cアルキル、C~Cアルケニル、置換C~Cアルケニル、C~Cアルキニル、置換C~Cアルキニル、またはN(E)(E)であり、
、E、及びEが、各々独立して、H、C~Cアルキル、または置換C~Cアルキルであり、
nが、1~6であり、
mが、0または1であり、
jが、0または1であり、
置換された各基が、ハロゲン、OJ、N(J)(J)、=NJ、SJ、N、CN、OC(=X)J、OC(=X)N(J)(J)、及びC(=Q)N(J)(J)から独立して選択される、1つまたは複数の任意選択で保護される置換基を含み、
が、O、S、またはNJであり、
各J、J、及びJが、独立して、HまたはC~Cアルキルである、
前記アンチセンス剤。
[態様455]修飾オリゴヌクレオチドを含むアンチセンス剤であって、前記修飾オリゴヌクレオチドの5’末端が、構造Iを有し、
式中、
pが、0~5であり、
qが、1~4であり、
Tが、OHまたはコンジュゲート基であり、
各Bxが、独立して選択される複素環式塩基部分であり、
各Xが、独立して、OHまたはSHから選択され、
各Zが、独立して、O、S、またはNSOMeから選択され、
各Rが、Hであるか、または厳密に1つのRが、OMeであり、かつその他のRが、Hであり、
同じフラノシル糖部分の各J及びGについて、J及びGが、JからGの架橋を形成するか、またはJが、Hであり、Gが、OH、ハロゲン、もしくはO-[C(R)(R)]-[(C=O)-X-Rから選択されるかのいずれかであり、
式中、各JからGの架橋が、-CH(CH)-O-または-(CH-O-から独立して選択される式を有し、式中、kが、1~3であり、
各R及びRが、独立して、H、ハロゲン、C~Cアルキル、または置換C~Cアルキルであり、
各Xが、O、S、またはN(E)であり、
が、H、ハロゲン、C~Cアルキル、置換C~Cアルキル、C~Cアルケニル、置換C~Cアルケニル、C~Cアルキニル、置換C~Cアルキニ
ル、またはN(E)(E)であり、
、E、及びEが、各々独立して、H、C~Cアルキル、または置換C~Cアルキルであり、
nが、1~6であり、
mが、0または1であり、
jが、0または1であり、
置換された各基が、ハロゲン、OJ、N(J)(J)、=NJ、SJ、N、CN、OC(=X)J、OC(=X)N(J)(J)、及びC(=Q)N(J)(J)から独立して選択される、1つまたは複数の任意選択で保護される置換基を含み、
が、O、S、またはNJであり、
各J、J、及びJが、独立して、HまたはC~Cアルキルである、
前記アンチセンス剤。
[態様456]厳密に1つのRが、-OMeである、態様455に記載のアンチセンス剤。
[態様457]p+qの和が、2、3、または4である、態様454~456のいずれかに記載のアンチセンス剤。
[態様458]修飾オリゴヌクレオチドを含むアンチセンス剤であって、前記修飾オリゴヌクレオチドの3’末端が、構造Jを有し、
式中、
pが、0~6であり、
Tが、OHまたはコンジュゲート基であり、
各Bxが、独立して選択される複素環式塩基部分であり、
各Xが、独立して、OHまたはSHから選択され、
各Zが、独立して、O、S、またはNSOMeから選択され、
同じフラノシル糖部分の各J及びGについて、J及びGが、JからGの架橋を形
成するか、またはJが、Hであり、Gが、OH、ハロゲン、もしくはO-[C(R)(R)]-[(C=O)-X-Rから選択されるかのいずれかであり、
式中、各JからGの架橋が、-CH(CH)-O-または-(CH-O-から独立して選択される式を有し、式中、kが、1~3であり、
各R及びRが、独立して、H、ハロゲン、C~Cアルキル、または置換C~Cアルキルであり、
各Xが、O、S、またはN(E)であり、
が、H、ハロゲン、C~Cアルキル、置換C~Cアルキル、C~Cアルケニル、置換C~Cアルケニル、C~Cアルキニル、置換C~Cアルキニル、またはN(E)(E)であり、
、E、及びEが、各々独立して、H、C~Cアルキル、または置換C~Cアルキルであり、
nが、1~6であり、
mが、0または1であり、
jが、0または1であり、
置換された各基が、ハロゲン、OJ、N(J)(J)、=NJ、SJ、N、CN、OC(=X)J、OC(=X)N(J)(J)、及びC(=Q)N(J)(J)から独立して選択される、1つまたは複数の任意選択で保護される置換基を含み、
が、O、S、またはNJであり、
各J、J、及びJが、独立して、HまたはC~Cアルキルである、
前記アンチセンス剤。
[態様459]pが、2、3、または4である、態様458に記載のアンチセンス剤。
[態様460]各Jが、Hであり、各Gが、OCHCHOCHである、態様451~459のいずれかに記載のアンチセンス剤。
[態様461]各Jが、Hであり、各Gが、OCHである、態様451~459のいずれかに記載のアンチセンス剤。
[態様462]各J及びGが、JからGの架橋を形成する、態様451~459のいずれかに記載のアンチセンス剤。
[態様463]前記JからGの架橋が、式-CH(CH)-O-を有する、態様462に記載のアンチセンス剤。
[態様464]前記アンチセンス剤が、RNAi剤である、態様450に記載のアンチセンス剤。
[態様465]前記RNAi剤が、RNAiアンチセンス修飾オリゴヌクレオチドを含む一本鎖RNAi剤である、態様464に記載のRNAi剤。
[態様466]前記RNAi剤が、RNAiアンチセンス修飾オリゴヌクレオチド及びRNAiセンス修飾オリゴヌクレオチドを含むオリゴヌクレオチド二重鎖である、態様464に記載のRNAi剤。
[態様467]前記RNAiアンチセンスオリゴヌクレオチドの5’末端が、構造Kを有し、
式中、
が、リン酸、安定化リン酸基、またはメシルホスホロアミデートであり、
各Bxが、独立して選択される複素環式塩基部分であり、
各Xが、独立して、OHまたはSHから選択され、
各Zが、O、S、またはNSOMeから選択され、
少なくとも1つのZが、NSOMeであり、
各Gが、独立して、OH、ハロゲン、もしくはO-[C(R)(R)]-[(C=O)-X-Rから選択され、
各R及びRが、独立して、H、ハロゲン、C~Cアルキル、または置換C~Cアルキルであり、
各Xが、O、S、またはN(E)であり、
が、H、ハロゲン、C~Cアルキル、置換C~Cアルキル、C~Cアルケニル、置換C~Cアルケニル、C~Cアルキニル、置換C~Cアルキニル、またはN(E)(E)であり、
、E、及びEが、各々独立して、H、C~Cアルキル、または置換C~Cアルキルであり、
nが、1~6であり、
mが、0または1であり、
jが、0または1であり、
置換された各基が、ハロゲン、OJ、N(J)(J)、=NJ、SJ、N、CN、OC(=X)J、OC(=X)N(J)(J)、及びC(=Q)N(J)(J)から独立して選択される、1つまたは複数の任意選択で保護される置換基を含み、
が、O、S、またはNJであり、
各J、J、及びJが、独立して、HまたはC~Cアルキルである、
態様465~466のいずれかに記載のRNAi剤。
[態様468]前記安定化リン酸基が、5’-ビニルホスホネートまたは5’-シクロプロピルホスホネートである、態様467に記載のRNAi剤。
[態様469]前記安定化リン酸基が、メシルホスホロアミデートである、態様467に記載のRNAi剤。
[態様470]構造K内の各Gが、独立して、FまたはOMeから選択される、態様467~469のいずれかに記載のRNAi剤。
[態様471]前記RNAiアンチセンスオリゴヌクレオチドの3’末端が、構造Lを有し、
式中、
各Bxが、独立して選択される複素環式塩基部分であり、
各Xが、独立して、OHまたはSHから選択され、
各Zが、O、S、またはNSOMeから選択され、
少なくとも1つのZが、NSOMeであり、
各Gが、独立して、OH、ハロゲン、もしくはO-[C(R)(R)]-[(C=O)-X-Rから選択され、
各R及びRが、独立して、H、ハロゲン、C~Cアルキル、または置換C~Cアルキルであり、
各Xが、O、S、またはN(E)であり、
が、H、ハロゲン、C~Cアルキル、置換C~Cアルキル、C~Cアルケニル、置換C~Cアルケニル、C~Cアルキニル、置換C~Cアルキニル、またはN(E)(E)であり、
、E、及びEが、各々独立して、H、C~Cアルキル、または置換C~Cアルキルであり、
nが、1~6であり、
mが、0または1であり、
jが、0または1であり、
置換された各基が、ハロゲン、OJ、N(J)(J)、=NJ、SJ、N、CN、OC(=X)J、OC(=X)N(J)(J)、及びC(=Q)N(J)(J)から独立して選択される、1つまたは複数の任意選択で保護される置換基を含み、
が、O、S、またはNJであり、
各J、J、及びJが、独立して、HまたはC~Cアルキルである、態様4
65~470のいずれかに記載のRNAi剤。
[態様472]前記RNAiアンチセンスオリゴヌクレオチドの構造L内の各Gが、独立して、FまたはOMeから選択される、態様471に記載のRNAi剤。
[態様473]前記RNAiアンチセンスオリゴヌクレオチドの少なくとも1つの領域が、構造Mを有し、
式中、
各Bxが、独立して選択される複素環式塩基部分であり、
各Xが、独立して、OHまたはSHから選択され、
各Gが、独立して、OH、ハロゲン、もしくはO-[C(R)(R)]-[(C=O)-X-Rから選択され、
各R及びRが、独立して、H、ハロゲン、C~Cアルキル、または置換C~Cアルキルであり、
各Xが、O、S、またはN(E)であり、
が、H、ハロゲン、C~Cアルキル、置換C~Cアルキル、C~Cアルケニル、置換C~Cアルケニル、C~Cアルキニル、置換C~Cアルキニル、またはN(E)(E)であり、
、E、及びEが、各々独立して、H、C~Cアルキル、または置換C~Cアルキルであり、
nが、1~6であり、
mが、0または1であり、
jが、0または1であり、
置換された各基が、ハロゲン、OJ、N(J)(J)、=NJ、SJ、N、CN、OC(=X)J、OC(=X)N(J)(J)、及びC(=Q)N(J)(J)から独立して選択される、1つまたは複数の任意選択で保護される置換基を含み、
が、O、S、またはNJであり、
各J、J、及びJが、独立して、HまたはC~Cアルキルである、
態様465~472のいずれかに記載のRNAi剤。
[態様474]前記RNAiアンチセンスオリゴヌクレオチド内の構造Mの各Gが、FまたはOMeから選択される、態様473に記載のRNAi剤。
[態様475]一方のGが、Fであり、他方のGが、OMeである、態様474に記載のRNAi剤。
[態様476]前記RNAiアンチセンスオリゴヌクレオチドの5’末端が、構造Nを有し、
式中、
Aが、
から選択され、
が、OH、OP(=O)OH、OP(=O)SH、安定化リン酸基、またはメシルホスホロアミデートであり、
が、H、OH、OMe、MOE、またはハロゲンであり、
各Bxが、独立して選択される複素環式塩基部分であり、
各Xが、独立して、OHまたはSHから選択され、
各Gが、独立して、OH、ハロゲン、もしくはO-[C(R)(R)]-[(C=O)-X-Rから選択され、
各R及びRが、独立して、H、ハロゲン、C~Cアルキル、または置換C~Cアルキルであり、
各Xが、O、S、またはN(E)であり、
が、H、ハロゲン、C~Cアルキル、置換C~Cアルキル、C~Cアルケニル、置換C~Cアルケニル、C~Cアルキニル、置換C~Cアルキ
ニル、またはN(E)(E)であり、
、E、及びEが、各々独立して、H、C~Cアルキル、または置換C~Cアルキルであり、
nが、1~6であり、
mが、0または1であり、
jが、0または1であり、
置換された各基が、ハロゲン、OJ、N(J)(J)、=NJ、SJ、N、CN、OC(=X)J、OC(=X)N(J)(J)、及びC(=Q)N(J)(J)から独立して選択される、1つまたは複数の任意選択で保護される置換基を含み、
が、O、S、またはNJであり、
各J、J、及びJが、独立して、HまたはC~Cアルキルである、
態様465~466または471~475のいずれかに記載のRNAi剤。
[態様477]前記RNAiアンチセンスオリゴヌクレオチドの構造N内の各Gが、FまたはOMeから選択される、態様477に記載のRNAi剤。
[態様478]前記RNAiアンチセンスオリゴヌクレオチドの3’末端が、構造Oを有し、
式中、
が、
から選択され、
が、OH、OP(=O)OH、OP(=O)SH、または安定化リン酸基であり、
が、H、OH、OMe、MOE、またはハロゲンであり、
各Bxが、独立して選択される複素環式塩基部分であり、
各Xが、独立して、OHまたはSHから選択され、
各Zが、O、S、またはNSOMeから選択され、
少なくとも1つのZが、NSOMeであり、
各Gが、独立して、OH、ハロゲン、もしくはO-[C(R)(R)]-[(C=O)-X-Rから選択され、
各R及びRが、独立して、H、ハロゲン、C~Cアルキル、または置換C~Cアルキルであり、
各Xが、O、S、またはN(E)であり、
が、H、ハロゲン、C~Cアルキル、置換C~Cアルキル、C~Cアルケニル、置換C~Cアルケニル、C~Cアルキニル、置換C~Cアルキニル、またはN(E)(E)であり、
、E、及びEが、各々独立して、H、C~Cアルキル、または置換C~Cアルキルであり、
nが、1~6であり、
mが、0または1であり、
jが、0または1であり、
置換された各基が、ハロゲン、OJ、N(J)(J)、=NJ、SJ、N、CN、OC(=X)J、OC(=X)N(J)(J)、及びC(=Q)N(J)(J)から独立して選択される、1つまたは複数の任意選択で保護される置換基を含み、
が、O、S、またはNJであり、
各J、J、及びJが、独立して、HまたはC~Cアルキルである、
態様465~469または473~477のいずれかに記載のRNAi剤。
[態様479]前記RNAiアンチセンスオリゴヌクレオチドの構造O内の各Gが、FまたはOMeから選択される、態様478に記載のRNAi剤。
[態様480]前記RNAiセンスオリゴヌクレオチドの5’末端が、構造Kを有し、
式中、
が、リン酸または安定化リン酸基であり、
各Bxが、独立して選択される複素環式塩基部分であり、
各Xが、独立して、OHまたはSHから選択され、
各Zが、O、S、またはNSOMeから選択され、
少なくとも1つのZが、NSOMeであり、
各Gが、独立して、OH、ハロゲン、もしくはO-[C(R)(R)]-[(C=O)-X-Rから選択され、
各R及びRが、独立して、H、ハロゲン、C~Cアルキル、または置換C~Cアルキルであり、
各Xが、O、S、またはN(E)であり、
が、H、ハロゲン、C~Cアルキル、置換C~Cアルキル、C~Cアルケニル、置換C~Cアルケニル、C~Cアルキニル、置換C~Cアルキニル、またはN(E)(E)であり、
、E、及びEが、各々独立して、H、C~Cアルキル、または置換C~Cアルキルであり、
nが、1~6であり、
mが、0または1であり、
jが、0または1であり、
置換された各基が、ハロゲン、OJ、N(J)(J)、=NJ、SJ、N、CN、OC(=X)J、OC(=X)N(J)(J)、及びC(=Q)N(J)(J)から独立して選択される、1つまたは複数の任意選択で保護される置換基を含み、
が、O、S、またはNJであり、
各J、J、及びJが、独立して、HまたはC~Cアルキルである、
態様466に記載のRNAi剤。
[態様481]前記安定化リン酸基が、5’-ビニルホスホネート、5’-シクロプロピルホスホネート、または5’-メシルホスホロアミデートである、態様480に記載のRNAi剤。
[態様482]構造K内の各Gが、独立して、FまたはOMeから選択される、態様480または481に記載のRNAi剤。
[態様483]前記RNAiセンスオリゴヌクレオチドの3’末端が、構造Lを有し、
式中、
各Bxが、独立して選択される複素環式塩基部分であり、
各Xが、独立して、OHまたはSHから選択され、
各Zが、O、S、またはNSOMeから選択され、
少なくとも1つのZが、NSOMeであり、
各Gが、独立して、OH、ハロゲン、もしくはO-[C(R)(R)]-[(C=O)-X-Rから選択され、
各R及びRが、独立して、H、ハロゲン、C~Cアルキル、または置換C~Cアルキルであり、
各Xが、O、S、またはN(E)であり、
が、H、ハロゲン、C~Cアルキル、置換C~Cアルキル、C~Cアルケニル、置換C~Cアルケニル、C~Cアルキニル、置換C~Cアルキニル、またはN(E)(E)であり、
、E、及びEが、各々独立して、H、C~Cアルキル、または置換C~Cアルキルであり、
nが、1~6であり、
mが、0または1であり、
jが、0または1であり、
置換された各基が、ハロゲン、OJ、N(J)(J)、=NJ、SJ、N、CN、OC(=X)J、OC(=X)N(J)(J)、及びC(=Q)N(J)(J)から独立して選択される、1つまたは複数の任意選択で保護される置換基を含み、
が、O、S、またはNJであり、
各J、J、及びJが、独立して、HまたはC~Cアルキルである、
態様466または480~482のいずれかに記載のRNAi剤。
[態様484]前記RNAiセンスオリゴヌクレオチドの構造L内の各Gが、独立して、FまたはOMeから選択される、態様483に記載のRNAi剤。
[態様485]前記RNAiセンスオリゴヌクレオチドの少なくとも1つの領域が、構造Mを有し、
式中、
各Bxが、独立して選択される複素環式塩基部分であり、
各Xが、独立して、OHまたはSHから選択され、
各Gが、独立して、OH、ハロゲン、もしくはO-[C(R)(R)]-[(C=O)-X-Rから選択され、
各R及びRが、独立して、H、ハロゲン、C~Cアルキル、または置換C~Cアルキルであり、
各Xが、O、S、またはN(E)であり、
が、H、ハロゲン、C~Cアルキル、置換C~Cアルキル、C~Cアルケニル、置換C~Cアルケニル、C~Cアルキニル、置換C~Cアルキニル、またはN(E)(E)であり、
、E、及びEが、各々独立して、H、C~Cアルキル、または置換C~Cアルキルであり、
nが、1~6であり、
mが、0または1であり、
jが、0または1であり、
置換された各基が、ハロゲン、OJ、N(J)(J)、=NJ、SJ、N、CN、OC(=X)J、OC(=X)N(J)(J)、及びC(=Q)N(J)(J)から独立して選択される、1つまたは複数の任意選択で保護される置換基を含み、
が、O、S、またはNJであり、
各J、J、及びJが、独立して、HまたはC~Cアルキルである、
態様466または480~484のいずれかに記載のRNAi剤。
[態様486]前記RNAiセンスオリゴヌクレオチド内の構造Mの各Gが、FまたはOMeから選択される、態様485に記載のRNAi剤。
[態様487]一方のGが、Fであり、他方のGが、OMeである、態様486に記載のRNAi剤。
[態様488]前記RNAiセンスオリゴヌクレオチドの5’末端が、構造Nを有し、
式中、
Aが、
から選択され、
が、OH、OP(=O)OH、OP(=O)SH、安定化リン酸基、またはメシルホスホロアミデートであり、
が、H、OH、OMe、MOE、またはハロゲンであり、
各Bxが、独立して選択される複素環式塩基部分であり、
各Xが、独立して、OHまたはSHから選択され、
各Gが、独立して、OH、ハロゲン、もしくはO-[C(R)(R)]-[(C=O)-X-Rから選択され、
各R及びRが、独立して、H、ハロゲン、C~Cアルキル、または置換C~Cアルキルであり、
各Xが、O、S、またはN(E)であり、
が、H、ハロゲン、C~Cアルキル、置換C~Cアルキル、C~Cアルケニル、置換C~Cアルケニル、C~Cアルキニル、置換C~Cアルキニル、またはN(E)(E)であり、
、E、及びEが、各々独立して、H、C~Cアルキル、または置換C~Cアルキルであり、
nが、1~6であり、
mが、0または1であり、
jが、0または1であり、
置換された各基が、ハロゲン、OJ、N(J)(J)、=NJ、SJ、N、CN、OC(=X)J、OC(=X)N(J)(J)、及びC(=Q)N(J)(J)から独立して選択される、1つまたは複数の任意選択で保護される置換基を含み、
が、O、S、またはNJであり、
各J、J、及びJが、独立して、HまたはC~Cアルキルである、
態様466または483~487のいずれかに記載のRNAi剤。
[態様489]前記RNAiセンスオリゴヌクレオチドの構造N内の各Gが、FまたはOMeから選択される、態様487に記載のRNAi剤。
[態様490]前記RNAiセンスオリゴヌクレオチドの3’末端が、構造Oを有し、
式中、
が、
から選択され、
が、OH、OP(=O)OH、OP(=O)SH、または安定化リン酸基であり、
が、H、OH、OMe、MOE、またはハロゲンであり、
各Bxが、独立して選択される複素環式塩基部分であり、
各Xが、独立して、OHまたはSHから選択され、
各Zが、O、S、またはNSOMeから選択され、
少なくとも1つのZが、NSOMeであり、
各Gが、独立して、OH、ハロゲン、もしくはO-[C(R)(R)]-[(C
=O)-X-Rから選択され、
各R及びRが、独立して、H、ハロゲン、C~Cアルキル、または置換C~Cアルキルであり、
各Xが、O、S、またはN(E)であり、
が、H、ハロゲン、C~Cアルキル、置換C~Cアルキル、C~Cアルケニル、置換C~Cアルケニル、C~Cアルキニル、置換C~Cアルキニル、またはN(E)(E)であり、
、E、及びEが、各々独立して、H、C~Cアルキル、または置換C~Cアルキルであり、
nが、1~6であり、
mが、0または1であり、
jが、0または1であり、
置換された各基が、ハロゲン、OJ、N(J)(J)、=NJ、SJ、N、CN、OC(=X)J、OC(=X)N(J)(J)、及びC(=Q)N(J)(J)から独立して選択される、1つまたは複数の任意選択で保護される置換基を含み、
が、O、S、またはNJであり、
各J、J、及びJが、独立して、HまたはC~Cアルキルである、
態様466、480~482、または485~489のいずれかに記載のRNAi剤。
[態様491]前記RNAiセンスオリゴヌクレオチドの構造O内の各Gが、FまたはOMeから選択される、態様490に記載のRNAi剤。
[態様492]少なくとも1つの修飾オリゴヌクレオチドを含み、少なくとも1つの修飾オリゴヌクレオチドの核酸塩基配列が、標的核酸に相補的である、態様1~211または239~479のいずれかに記載のオリゴマー化合物またはアンチセンス剤。
[態様493]前記修飾オリゴヌクレオチドの前記核酸塩基配列が、前記標的核酸に少なくとも80%相補的である、態様492に記載の修飾オリゴヌクレオチド。
[態様494]前記修飾オリゴヌクレオチドの前記核酸塩基配列が、前記標的核酸に少なくとも85%相補的である、態様492に記載の修飾オリゴヌクレオチド。
[態様495]前記修飾オリゴヌクレオチドの前記核酸塩基配列が、前記標的核酸に少なくとも90%相補的である、態様492に記載の修飾オリゴヌクレオチド。
[態様496]前記修飾オリゴヌクレオチドの前記核酸塩基配列が、前記標的核酸に少なくとも95%相補的である、態様492に記載の修飾オリゴヌクレオチド。
[態様497]前記修飾オリゴヌクレオチドの前記核酸塩基配列が、前記標的核酸に100%相補的である、態様492に記載の修飾オリゴヌクレオチド。
[態様498]前記標的核酸が、標的RNAである、態様492~497のいずれかに記載の修飾オリゴヌクレオチド。
[態様499]前記標的RNAが、mRNA、プレmRNA、マイクロRNA、及び非コードRNAから選択される、態様498に記載の修飾オリゴヌクレオチド。
[態様500]前記標的RNAが、マイクロRNAではない、態様499に記載の修飾オリゴヌクレオチド。
[態様501]前記修飾オリゴヌクレオチドが、miR-21に相補的でない、態様1~500のいずれかに記載の修飾オリゴヌクレオチドを含むアンチセンス剤。
[態様502]コンジュゲート基を含む、態様1~501のいずれかに記載のアンチセンス剤。
[態様503]前記コンジュゲート基が、少なくとも1つのGalNAcを含む、態様502に記載のアンチセンス剤。
[態様504]前記コンジュゲート基が、1~5個のリンカーヌクレオシドを含む、態様502または503に記載のアンチセンス剤。
[態様505]態様1~449のいずれかに記載のオリゴマー化合物または態様450~485のいずれかに記載のアンチセンス剤と、薬学的に許容される担体または希釈剤とを含む、薬学的組成物。
[態様506]細胞を、態様1~505のいずれかに記載のオリゴマー化合物、アンチセンス剤、または薬学的組成物に接触させることを含む、方法。
[態様507]細胞内の標的核酸の量または活性を調節する方法であって、前記細胞を、態様1~505のいずれかに記載のオリゴマー化合物、アンチセンス剤、または薬学的組成物に接触させることと、それによって前記標的核酸の量または活性を調節することと、を含む、前記方法。
[態様508]細胞内の標的核酸の量または活性を調節する方法であって、前記細胞を、態様1~505のいずれかに記載のオリゴマー化合物、アンチセンス剤、または薬学的組成物に接触させることを含む、前記方法。
[態様509]標的核酸の量または活性が低減される、態様506~508に記載の方法。
[態様510]標的核酸の量または活性が増加する、態様506~508に記載の方法。
[態様511]前記標的核酸が、少なくとも1つの翻訳抑制エレメントを含み、前記修飾オリゴヌクレオチドが、前記標的核酸の翻訳抑制エレメント領域内の標的部位に相補的である、態様508に記載の方法。
[態様512]前記翻訳抑制エレメント領域が、少なくとも1つのステム-ループ構造を含む、態様511に記載の方法。
[態様513]疾患または病態の処置のための、態様1~505のいずれかに記載のアンチセンス剤または組成物の使用。
[態様514]疾患または病態の処置用の医薬の調製のための、態様1~505のいずれかに記載のアンチセンス剤または組成物の使用。
[態様515]前記オリゴマー化合物または前記アンチセンス剤が、RNAi剤ではなく、親オリゴマー化合物または親アンチセンス剤が、インビトロで細胞毒性である、態様1~504のいずれかに記載のオリゴマー化合物またはアンチセンス剤。
[態様516]前記親オリゴマー化合物または前記親アンチセンス剤が、標準的なインビトロ細胞毒性
アッセイにおいて細胞毒性である、態様515に記載のオリゴマー化合物またはアンチセンス剤。
[態様517]態様1~504のいずれかに記載のオリゴマー化合物またはアンチセンス剤が、インビトロで細胞毒性でない、態様515に記載のオリゴマー化合物またはアンチセンス剤。
[態様518]態様1~504のいずれかに記載のオリゴマー化合物またはアンチセンス剤が、標準的なインビトロ細胞毒性アッセイにおいて細胞毒性でない、態様515~517のいずれかに記載のオリゴマー化合物またはアンチセンス剤。
[態様519]前記アンチセンス剤が、siRNA剤ではなく、前記親アンチセンス剤が、マウスに対して肝毒性である、態様1~504のいずれかに記載のオリゴマー化合物またはアンチセンス剤。
[態様520]前記マウスが、BALB/cマウスであり、50mg/kgの前記親アンチセンス剤が、前記マウスに投与され、前記マウスにおける血漿中ALTレベルが、前記親アンチセンス剤の前記投与から72時間後に測定される、態様519に記載のオリゴマー化合物またはアンチセンス剤。
[態様521]マウスへの50mg/kgの態様1~504のいずれかに記載のオリゴマー化合物またはアンチセンス剤の投与が、前記マウスに対して肝毒性でない、態様519~520のいずれかに記載のオリゴマー化合物またはアンチセンス剤。
[態様522]マウスにおける態様1~504のいずれかに記載のアンチセンス剤の治療指数が、前記親アンチセンス剤の治療指数と比べて増加する、態様1~504のいずれかに記載のオリゴマー化合物またはアンチセンス剤。
[態様523]マウスにおける態様516に記載のアンチセンス剤の前記治療指数が、前記親アンチセンス剤の前記治療指数よりも少なくとも2倍大きい、態様522に記載のオリゴマー化合物またはアンチセンス剤。
[態様524]前記親オリゴマー化合物または前記親アンチセンス剤が、前記親アンチセンス剤において式XVIIの各ヌクレオシド間結合がホスホロチオエートヌクレオシド間結合と置き換えられていることを除いて、態様1~504のいずれかに記載のアンチセンス剤と同一である、態様515~523のいずれかに記載のオリゴマー化合物またはアンチセンス剤。
[態様525]前記オリゴマー化合物または前記アンチセンス剤が、RNAse H剤である、態様515~524のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
[態様526]前記オリゴマー化合物または前記アンチセンス剤が、ギャップマーである、態様515~524のいずれかに記載のオリゴマー化合物またはアンチセンス剤。
[態様527]前記オリゴマー化合物または前記アンチセンス剤が、スプライシングを調節する、態様515~524のいずれかに記載のオリゴマー化合物またはアンチセンス剤。
[態様528]前記オリゴマー化合物または前記アンチセンス剤が、タンパク質発現を増加させる、態様515~524のいずれかに記載のオリゴマー化合物またはアンチセンス剤。
[態様529]前記オリゴマー化合物または前記アンチセンス剤が、RNAi剤であり、親RNAi剤が、インビトロで細胞毒性である、態様1~504のいずれかに記載のオリゴマー化合物またはアンチセンス剤。
[態様530]態様1~504のいずれかに記載のRNAi剤が、インビトロで細胞毒性でない、態様529に記載のオリゴマー化合物またはアンチセンス剤。
[態様531]前記オリゴマー化合物または前記アンチセンス剤が、RNAi剤であり、前記RNAi剤が、標準的なインビトロ細胞毒性アッセイにおいて細胞毒性でない、態様529~530のいずれかに記載のオリゴマー化合物またはアンチセンス剤。
[態様532]前記オリゴマー化合物または前記アンチセンス剤が、RNAi剤であり、前記マウスに対して肝毒性である、態様1~504のいずれかに記載のオリゴマー化合物またはアンチセンス剤。
[態様533]前記マウスが、BALB/cマウスであり、50mg/kgの前記親RNAi剤が、前記マウスに投与され、前記マウスにおける前記血漿中ALTレベルが、前記親RNAi剤の前記投与から72時間後に測定される、態様532に記載のRNAi剤。
[態様534]マウスへの50mg/kgの前記RNAi剤の投与が、前記マウスに対して肝毒性でない、態様532~533のいずれかに記載のRNAi剤。
[態様535]RNAi剤であり、マウスにおける前記RNAi剤の治療指数が、前記親RNAi剤の治療指数と比べて増加する、態様1~504のいずれかに記載のオリゴマー化合物またはアンチセンス剤。
[態様536]マウスにおける態様535に記載のRNAi剤の前記治療指数が、前記親RNAi剤の前記治療指数よりも少なくとも2倍大きい、態様535に記載のRNAi剤。
[態様537]前記親RNAi剤が、前記親RNAi剤において式XVIIの各ヌクレオシド間結合がホスホジエステルヌクレオシド間結合と置き換えられていることを除いて、態様1~504のいずれかに記載のオリゴマー化合物またはアンチセンス剤と同一である、態様526~536のいずれかに記載のRNAi剤。
[態様538]オリゴマー化合物またはアンチセンス剤を設計する方法であって、親オリゴマー化合物もしくはアンチセンス剤または親RNAi剤から出発することと、態様1~504のいずれか1に記載のオリゴマー化合物またはアンチセンス剤に到達するためにその化合物の設計を変更することと、を含む、前記方法。
[態様539]オリゴマー化合物またはアンチセンス剤を設計する方法であって、オリゴマー化合物もしくはアンチセンス剤または親RNAi剤を特定することと、第2のアンチセンス剤に到達するようにその親オリゴマー化合物もしくはアンチセンス剤または親RNAi剤の設計を変更することと、を含み、前記第2のオリゴマー化合物アンチセンス剤が、態様1~504のいずれか1に記載のオリゴマー化合物またはアンチセンス剤である、前記方法。
[態様540]オリゴマー化合物またはアンチセンス剤の肝毒性を改善する方法であって、(i)マウスにおいて300単位/リットル超の血漿中ALTレベルを有する親オリゴマー化合物、親アンチセンス剤、または親RNAi剤を特定するステップと、(ii)態様1~504のいずれか1に記載のオリゴマー化合物またはアンチセンス剤を提供するステップと、を含む、前記方法。
[態様541]前記方法が、前記親オリゴマー化合物、前記親アンチセンス剤、または前記親RNAi剤と比べて改善された治療指数を有するオリゴマー化合物またはアンチセンス剤を設計する、態様540に記載の方法。
[態様542]前記方法が、前記親オリゴマー化合物、前記親アンチセンス剤、または前記親RNAi剤と比べてより低い肝毒性を有するオリゴマー化合物またはアンチセンス剤を設計する、態様540に記載の方法。
[態様543]前記第2のオリゴマー化合物または前記第2のアンチセンス剤が、前記親オリゴマー化合物、前記親アンチセンス剤、または前記親RNAi剤と比べて改善された治療指数を有する、態様540に記載の方法。
[態様544]前記第2のオリゴマー化合物または前記第2のアンチセンス剤が、マウスにおいて前記親オリゴマー化合物、前記親アンチセンス剤、または前記親RNAi剤と比べて低減された肝毒性を有する、態様540に記載の方法。
[態様545]態様1~504のいずれか1に記載のオリゴマー化合物またはアンチセンス剤が、前記親オリゴマー化合物、前記親アンチセンス剤、または前記親RNAi剤と比べて改善された治療指数を有する、態様540に記載の方法。
[態様546]態様1~504のいずれか1に記載のオリゴマー化合物またはアンチセンス剤が、前記親オリゴマー化合物、前記親アンチセンス剤、または前記親RNAi剤と比べて低減された肝毒性を有する、態様540に記載の方法。
[態様547]態様1~504のいずれかに記載のオリゴマー化合物またはアンチセンス剤をマウスに投与することと、態様1~504のいずれかに記載のアンチセンス剤の親オリゴマー化合物、親アンチセンス剤、または親RNAi剤を第2のマウスに別個に投与することと、を含み、態様1~504のいずれかに記載のアンチセンス剤の治療指数が、前記親アンチセンス剤または前記親RNAi剤の治療指数と比べて改善される、方法。
In one aspect, the present invention may be as follows.
[Aspect 1] An oligomeric compound comprising a modified oligonucleotide consisting of 12 to 70 linked nucleosides linked via an internucleoside linking group, wherein at least one nucleoside comprises a modified sugar moiety, and at least one of the linking groups has the formula XVII;
independently for each internucleoside linking group of said modified oligonucleotide having formula XVII,
X is selected from O or S;
R.1but H, C1~C6alkyl, and substituted C1~C6selected from alkyl,
T is SO2R.2, C(=O)R3, and P(=O)R4R.5is selected from, where:
R.2is aryl, substituted aryl, heterocycle, substituted heterocycle, heteroaromatic ring, substituted heteroaromatic ring, diazole, substituted diazole, C1~C6Alkoxy, C1~C6alkyl, C1~C6alkenyl, C1~C6alkynyl, substituted C1~C6alkyl, substituted C1~C6alkenyl, substituted C1~C6selected from alkynyl and conjugate groups;
R.3is aryl, substituted aryl, CH3, N(CH3)2, OCH3, and a conjugate group,
R.4but OCH3, OH, C1~C6alkyl, substituted C1~C6selected from alkyl, and conjugate groups;
R.5but OCH3, OH, C1~C6alkyl, and substituted C1~C6selected from alkyl,
said oligomeric compound.
[Aspect 2] An oligomeric compound comprising a modified oligonucleotide consisting of 12 to 70 linked nucleosides linked via an internucleoside linking group, wherein at least one nucleoside comprises a modified sugar moiety, and at least one of the linking groups has the formula XVII;
independently for each internucleoside linking group of said modified oligonucleotide having formula XVII,
X is selected from O or S;
R.1but H, C1~C6alkyl, and substituted C1~C6selected from alkyl,
T is SO2R.2, C(=O)R3, and P(=O)R4R.5is selected from, where:
R.2is aryl, substituted aryl, heterocycle, substituted heterocycle, heteroaromatic ring, substituted heteroaromatic ring, diazole, substituted diazole, C1~C6Alkoxy, C1~C6alkyl, C1~C6alkenyl, C1~C6alkynyl, substituted C1~C6alkyl, substituted C1~C6alkenyl-substituted C1~C6selected from alkynyl and conjugate groups;
R.3is aryl, substituted aryl, CH3, N(CH3)2, OCH3, and a conjugate group,
R.4but OCH3, OH, C1~C6alkyl, substituted C1~C6selected from alkyl, and conjugate groups;
R.5but OCH3, OH, C1~C6alkyl, and substituted C1~C6selected from alkyl,
provided that when X is O and R1is H, then T is
provided that it is not
said oligomeric compound.
[Aspect 3] The oligomeric compound of aspect 1 or aspect 2, wherein at least one internucleoside linking group is a phosphodiester or phosphorothioate internucleoside linking group.
[Aspect 4] An oligomeric compound according to any of aspects 1 to 3, wherein at least one nucleoside comprises a 2'-β-D-deoxyribosyl sugar moiety.
[Aspect 5] An oligomeric compound according to any of aspects 1 to 4, wherein for at least one internucleoside linking group of Formula XVII, X is O.
[Aspect 6] An oligomeric compound according to any of aspects 1 to 5, wherein for at least one internucleoside linking group of Formula XVII, X is S.
[Aspect 7] For at least one internucleoside linking group of Formula XVII, R1is H. The oligomeric compound according to aspect 1 or 2, wherein is H.
[Aspect 8] For at least one internucleoside linking group of Formula XVII, R1but C1~C6An oligomeric compound according to aspects 1 or 2, which is alkyl.
[Aspect 9] R1is methyl.
[Aspect 10] For at least one internucleoside linking group of Formula XVII, R1is replaced by C1~C6An oligomeric compound according to aspects 1 or 2, which is alkyl.
[Aspect 11] An oligomeric compound according to any of aspects 1 to 10, wherein for at least one internucleoside linking group of Formula XVII, T comprises a conjugate group.
Aspect 12. The oligomeric compound of Aspect 11, wherein said conjugate group comprises a cell-targeting moiety.
Aspect 13. The oligomeric compound of Aspect 11, wherein said conjugate group comprises a carbohydrate or carbohydrate cluster.
Aspect 14. An oligomeric compound according to any of aspects 11-13, wherein said conjugate group comprises at least one GalNAc.
[Aspect 15] The conjugate group is C10~C2012. An oligomeric compound according to aspect 11, comprising an alkyl chain.
[Aspect 16] The conjugate group is C1616. An oligomeric compound according to aspect 15, comprising an alkyl.
[Aspect 17] An oligomeric compound according to any of aspects 1 to 10, wherein for at least one internucleoside linking group of Formula XVII, T does not comprise a conjugate group.
[Aspect 18] An oligomeric compound according to any of aspects 1 to 10, wherein for at least one internucleoside linking group of Formula XVII, T does not comprise a cell-targeting moiety.
[Aspect 19] For at least one internucleoside linking group of Formula XVII, T is SO2R.2The oligomeric compound according to any one of aspects 1-18, which is
[Aspect 20] R220. An oligomeric compound according to aspect 19, wherein is aryl.
[Aspect 21] R220. An oligomeric compound according to aspect 19, wherein is substituted aryl.
[Aspect 22] R2is a heterocyclic ring.
[Aspect 23] R2is a substituted heterocyclic ring.
[Aspect 24] R2is an aromatic heterocycle.
[Aspect 25] R2is a substituted heteroaromatic ring.
[Aspect 26] R2is a diazole.
[Aspect 27] R2is a substituted diazole.
[Aspect 28] R2is an amine.
[Aspect 29] R2is a substituted amine.
[Aspect 30] R2but C1~C6Alkoxy, C1~C6alkenyl, or C1~C.6- an oligomeric compound according to embodiment 19, which is alkynyl.
[Aspect 31] R2but C1~C20, C1~C6, C2~C20, C2~C6, or C10~C2020. An oligomeric compound according to aspect 19, which is alkyl.
[Aspect 32] R2is replaced by C1~C20, C1~C6, C2~C20, C2~C6, or C10~C2020. An oligomeric compound according to aspect 19, which is alkyl.
[Aspect 33] R2comprises a carbohydrate or carbohydrate cluster.
[Aspect 34] R2comprises at least one GalNAc.
[Aspect 35] An oligomeric compound according to aspect 19, wherein T is
[Aspect 36] An oligomeric compound according to aspect 19, wherein T is
[Aspect 37] An oligomeric compound according to aspect 19, wherein T is
[Aspect 38] An oligomeric compound according to aspect 19, wherein T is
[Aspect 39] An oligomeric compound according to aspect 19, wherein T is
[Aspect 40] An oligomeric compound according to aspect 19, wherein T is
[Aspect 41] An oligomeric compound according to aspect 19, wherein T is
[Aspect 42] An oligomeric compound according to aspect 19, wherein T is
[Aspect 43] An oligomeric compound according to aspect 19, wherein T is
[Aspect 44] T is the following,
20. An oligomeric compound according to aspect 19, wherein n is 2-20.
[Aspect 45] An oligomeric compound according to aspect 44, wherein n is 15.
[Aspect 46] For at least one internucleoside linking group of Formula XVII, T is C(=O)R3The oligomeric compound according to any one of aspects 1-18, which is
[Aspect 47] R347. An oligomeric compound according to aspect 46, wherein is aryl.
[Aspect 48] R347. An oligomeric compound according to aspect 46, wherein is substituted aryl.
[Aspect 49] R3is CH347. The oligomeric compound according to aspect 46, which is
[Aspect 50] R3is N(CH3)247. The oligomeric compound according to aspect 46, which is
[Aspect 51] R3but OCH347. The oligomeric compound according to aspect 46, which is
[Aspect 52] R3but C1~C647. An oligomeric compound according to aspect 46, which is alkoxy.
[Aspect 53] R3but C1~C20, C1~C6, C2~C20, C2~C6, or C10~C2047. An oligomeric compound according to aspect 46, which is alkyl.
[Aspect 54] R3is replaced by C1~C20, C1~C6, C2~C20, C2~C6, or C10~C2047. An oligomeric compound according to aspect 46, which is alkyl.
[Aspect 55] R3comprises a carbohydrate or carbohydrate cluster.
[Aspect 56] R23comprises at least one GalNAc.
[Aspect 57] An oligomeric compound according to aspect 46, wherein T is
[Aspect 58] An oligomeric compound according to aspect 46, wherein T is
[Aspect 59] An oligomeric compound according to aspect 46, wherein T is
[Aspect 60] An oligomeric compound according to aspect 46, wherein T is
[Aspect 61] T is the following,
47. An oligomeric compound according to aspect 46, wherein n is 2-20.
[Aspect 62] An oligomeric compound according to aspect 61, wherein n is 15.
[Aspect 63] For at least one internucleoside linking group of Formula XVII, T is P(=O)R4R.5The oligomeric compound according to any one of aspects 1-18, which is
[Aspect 64] R4but OCH364. An oligomeric compound according to aspect 63, which is
[Aspect 65] R464. An oligomeric compound according to aspect 63, wherein is OH.
[Aspect 66] R4but C1~C664. An oligomeric compound according to aspect 63, which is alkyl.
[Aspect 67] R4is replaced by C1~C664. An oligomeric compound according to aspect 63, which is alkyl.
[Aspect 68] R4but C1~C20, C1~C6, C2~C20, C2~C6, or C10~C2064. An oligomeric compound according to aspect 63, which is alkyl.
[Aspect 69] R4is replaced by C1~C20, C1~C6, C2~C20, C2~C6, or C10~C2064. An oligomeric compound according to aspect 63, which is alkyl.
[Aspect 70] R464. An oligomeric compound according to aspect 63, wherein comprises a carbohydrate or carbohydrate cluster.
[Aspect 71] R4comprises at least one GalNAc.
[Aspect 72] R5but OCH372. The oligomeric compound according to any of aspects 63-71, wherein the oligomeric compound is
[Aspect 73] R5is OH.
[Aspect 74] R5but C1~C672. The oligomeric compound according to any of aspects 63-71, which is alkyl.
[Aspect 75] R5is replaced by C1~C672. The oligomeric compound according to any of aspects 63-71, which is alkyl.
[Aspect 76] An oligomeric compound according to aspect 63, wherein T is
[Aspect 77] An oligomeric compound according to aspect 63, wherein T is
[Aspect 78] T is
64. An oligomeric compound according to aspect 63, wherein n is 2-20.
[Aspect 79] An oligomeric compound according to aspect 78, wherein n is 15.
[Aspect 80] An oligomeric compound according to any of aspects 1-79, wherein at least one internucleoside linking group of said modified oligonucleotide is not a linking group of Formula XVII.
[Aspect 81] An oligomeric compound according to any of aspects 1-80, wherein exactly one internucleoside linking group of said modified oligonucleotide is an internucleoside linking group of Formula XVII.
Aspect 82. An oligomeric compound according to any of aspects 1-80, wherein exactly two internucleoside linking groups of said modified oligonucleotide are internucleoside linking groups of Formula XVII.
Aspect 83. An oligomeric compound according to any of aspects 1-80, wherein exactly three internucleoside linking groups of said modified oligonucleotide are internucleoside linking groups of Formula XVII.
[Aspect 84] An oligomeric compound according to any of aspects 1-80, wherein exactly four internucleoside linking groups of said modified oligonucleotide are internucleoside linking groups of Formula XVII.
[Aspect 85] An oligomeric compound according to any of aspects 1-80, wherein exactly five internucleoside linking groups of said modified oligonucleotide are internucleoside linking groups of Formula XVII.
[Aspect 86] An oligomeric compound according to any of aspects 1-80, wherein at least six internucleoside linking groups of said modified oligonucleotide are internucleoside linking groups of Formula XVII.
[Aspect 87] Aspects 1-79 or 81-86, having at least two linking groups of Formula XVII, wherein at least two of said linking groups of Formula XVII are the same as each other. oligomeric compounds.
[Aspect 88] Any of aspects 1 to 87, wherein each internucleoside linking group of said modified oligonucleotide that is not an internucleoside linking group of Formula XVII is either a phosphodiester internucleoside linking group or a phosphorothioate internucleoside linking group. The oligomeric compound according to claim 1.
[Aspect 89] The oligomeric compound of any of aspects 1-80 or 86, wherein each internucleoside linking group of said modified oligonucleotide is an internucleoside linking group of Formula XVII.
[Aspect 90] An oligomeric compound comprising a modified oligonucleotide, wherein at least one region of the modified oligonucleotide has structure A,
During the ceremony,
each Bx is a heterocyclic base moiety;
X is selected from O or S;
Y.1and Y2is independently selected from OH or SH;
Z.1, Z2, and Z3is independently -(CH2)p-XZ.-(CH2)q-, wherein p is 0 or 1, q is 0 or 1, XZ.is O, S, or N (E1) and
R.1but H, C1~C6alkyl, and substituted C1~C6selected from alkyl,
T is SO2R.2, C(=O)R3, and P(=O)R4R.5is selected from, where:
R.2is aryl, substituted aryl, heterocycle, substituted heterocycle, heteroaromatic ring, substituted heteroaromatic ring, diazole, substituted diazole, C1~C6Alkoxy, C1~C6alkyl, C1~C6alkenyl, C1~C6alkynyl, substituted C1~C6alkyl, substituted C1~C6alkenyl-substituted C1~C6selected from alkynyl and conjugate groups;
R.3is aryl, substituted aryl, CH3, N(CH3)2, OCH3, and a conjugate group,
R.4but OCH3, OH, C1~C6alkyl, substituted C1~C6alkyl, and condi
selected from a nucleate group,
R.5but OCH3, OH, C1~C6alkyl, and substituted C1~C6selected from alkyl,
J.R1and G1but JR1to G1or form a bridge of JR1is H, and G1is H, OH, halogen, or O-[C(R6)(R7)]n-[(C=O)m-XG.]j-R8is either selected from
J.R2and G2but JR2and G2or form a cross-link with JR2is H, and G2is H, OH, halogen, or O-[C(R6)(R7)]n-[(C=O)m-XG.]j-R8is either selected from
J.R3and G3but JR3and G3or form a cross-link with JR3is H, and G3is H, OH, halogen, or O-[C(R6)(R7)]n-[(C=O)m-XG.]j-R8is either selected from
In the formula, each JR.The bridge from G to -CH(CH3)-O- or -(CH2)khaving a formula independently selected from -O-, wherein k is from 1 to 3;
Each R6and R7is independently H, halogen, C1~C6alkyl, or substituted C1~C6is an alkyl,
Each XG.is O, S, or N (E1) and
R.8is H, halogen, C1~C6alkyl, substituted C1~C6alkyl, C2~C6alkenyl, substituted C2~C6alkenyl, C2~C6alkynyl, substituted C2~C6alkynyl, or N(E2) (E3) and
E.1, E2, and E3are each independently H, C1~C6alkyl, or substituted C1~C6is an alkyl,
n is 1 to 6,
m is 0 or 1,
j is 0 or 1,
Each substituted group is halogen, OJ1, N(J1) (J2), = NJ1, SJ1, N3, CN, OC (=X2)J1, OC(=X2)N(J1) (J2), and C (=Q2)N(J1) (J2), including one or more optionally protected substituents independently selected from
Q.2is O, S, or NJ3and
Each J1, J2, and J3is independently H or C1~C6is an alkyl
said oligomeric compound.
[Aspect 91] An oligomeric compound comprising a modified oligonucleotide, wherein at least one region of the modified oligonucleotide has structure B,
During the ceremony,
each Bx is a heterocyclic base moiety;
X is selected from O or S;
Y.1and Y2is independently selected from OH or SH;
Z.1and Z2is independently -(CH2)p-XZ.-(CH2)q-, wherein p is 0 or 1, q is 0 or 1, XZ.is O, S, or N (E1) and
R.1but H, C1~C6alkyl, and substituted C1~C6selected from alkyl,
T is SO2R.2, C(=O)R3, and P(=O)R4R.5is selected from, where:
R.2is aryl, substituted aryl, heterocycle, substituted heterocycle, heteroaromatic ring, substituted heteroaromatic ring, diazole, substituted diazole, C1~C6Alkoxy, C1~C6alkyl, C1~C6alkenyl, C1~C6alkynyl, substituted C1~C6alkyl, substituted C1~C6alkenyl-substituted C1~C6selected from alkynyl and conjugate groups;
R.3is aryl, substituted aryl, CH3, N(CH3)2, OCH3, and a conjugate group,
R.4but OCH3, OH, C1~C6alkyl, substituted C1~C6selected from alkyl, and conjugate groups;
R.5but OCH3, OH, C1~C6alkyl, and substituted C1~C6selected from alkyl,
J.R1and G1but JR1to G1or form a bridge of JR1is H, and G1is H, OH, halogen, or O-[C(R6)(R7)]n-[(C=O)m-XG.]j-R8is either selected from
J.R2and G2but JR2and G2or form a bridge with JR2is H, and G2is H, OH, halogen, or O-[C(R6)(R7)]n-[(C=O)m-XG.]j-R8is either selected from
In the formula, each JR.The bridge from G to -CH(CH3)-O- or -(CH2)k-O- or
wherein k is from 1 to 3;
Each R6and R7is independently H, halogen, C1~C6alkyl, or substituted C1~C6is an alkyl,
Each XG.is O, S, or N (E1) and
R.8is H, halogen, C1~C6alkyl, substituted C1~C6alkyl, C2~C6alkenyl, substituted C2~C6alkenyl, C2~C6alkynyl, substituted C2~C6alkynyl, or N(E2) (E3) and
E.1, E2, and E3are each independently H, C1~C6alkyl, or substituted C1~C6is an alkyl,
n is 1 to 6,
m is 0 or 1,
j is 0 or 1,
Each substituted group is halogen, OJ1, N(J1) (J2), = NJ1, SJ1, N3, CN, OC (=X2)J1, OC(=X2)N(J1) (J2), and C (=Q2)N(J1) (J2), including one or more optionally protected substituents independently selected from
Q.2is O, S, or NJ3and
Each J1, J2, and J3is independently H or C1~C6is an alkyl
said oligomeric compound.
[Aspect 92] An oligomeric compound comprising a modified oligonucleotide, wherein at least one region of the modified oligonucleotide has structure C,
During the ceremony,
each Bx is a heterocyclic base moiety;
X is selected from O or S;
Y.1and Y2is independently selected from OH or SH;
Z.2and Z3is independently -(CH2)p-XZ.-(CH2)q-, wherein p is 0 or 1, q is 0 or 1, XZ.is O, S, or N (E1) and
R.1but H, C1~C6alkyl, and substituted C1~C6selected from alkyl,
T is SO2R.2, C(=O)R3, and P(=O)R4R.5is selected from, where:
R.2is aryl, substituted aryl, heterocycle, substituted heterocycle, heteroaromatic ring, substituted heteroaromatic ring, diazole, substituted diazole, C1~C6Alkoxy, C1~C6alkyl, C1~C6alkenyl, C1~C6alkynyl, substituted C1~C6alkyl, substituted C1~C6alkenyl-substituted C1~C6selected from alkynyl and conjugate groups;
R.3is aryl, substituted aryl, CH3, N(CH3)2, OCH3, and a conjugate group,
R.4but OCH3, OH, C1~C6alkyl, substituted C1~C6selected from alkyl, and conjugate groups;
R.5but OCH3, OH, C1~C6alkyl, and substituted C1~C6selected from alkyl,
J.R2and G2but JR2and G2or form a cross-link with JR2is H, and G2is H, OH, halogen, or O-[C(R6)(R7)]n-[(C=O)m-XG.]j-R8is either selected from
J.R3and G3but JR3and G3or form a cross-link with JR3is H, and G3is H, OH, halogen, or O-[C(R6)(R7)]n-[(C=O)m-XG.]j-R8is either selected from
In the formula, each JR.The bridge from G to -CH(CH3)-O- or -(CH2)khaving a formula independently selected from -O-, wherein k is from 1 to 3;
Each R6and R7is independently H, halogen, C1~C6alkyl, or substituted C1~C6is an alkyl,
Each XG.is O, S, or N (E1) and
R.8is H, halogen, C1~C6alkyl, substituted C1~C6alkyl, C2~C6alkenyl, substituted C2~C6alkenyl, C2~C6alkynyl, substituted C2~C6alkynyl, or N(E2) (E3) and
E.1, E2, and E3are each independently H, C1~C6alkyl, or substituted C1~C6is an alkyl,
n is 1 to 6,
m is 0 or 1,
j is 0 or 1,
Each substituted group is halogen, OJ1, N(J1) (J2), = NJ1, SJ1, N3, CN, OC (=X2)J1, OC(=X2)N(J1) (J2), and C (=Q2)N(J1) (J2), including one or more optionally protected substituents independently selected from
Q.2is O, S, or NJ3and
Each J1, J2, and J3is independently H or C1~C6is an alkyl
said oligomeric compound.
[Aspect 93] An oligomeric compound comprising a modified oligonucleotide, wherein at least one region of the modified oligonucleotide has structure D,
During the ceremony,
each Bx is a heterocyclic base moiety;
X is selected from O or S;
Y.1and Y2is independently selected from OH or SH;
Z.2and Z3is independently -(CH2)p-XZ.-(CH2)q-, wherein p is 0 or 1, q is 0 or 1, XZ.is O, S, or N (E1) and
R.1but H, C1~C6alkyl, and substituted C1~C6selected from alkyl,
T is SO2R.2, C(=O)R3, and P(=O)R4R.5is selected from, where:
R.2is aryl, substituted aryl, heterocycle, substituted heterocycle, heteroaromatic ring, substituted heteroaromatic ring, diazole, substituted diazole, C1~C6Alkoxy, C1~C6alkyl, C1~C6alkenyl, C1~C6alkynyl, substituted C1~C6alkyl, substituted C1~C6alkenyl-substituted C1~C6selected from alkynyl and conjugate groups;
R.3is aryl, substituted aryl, CH3, N(CH3)2, OCH3, and a conjugate group,
R.4but OCH3, OH, C1~C6alkyl, substituted C1~C6selected from alkyl, and conjugate groups;
R.5but OCH3, OH, C1~C6alkyl, and substituted C1~C6selected from alkyl,
J.R1and G1but JR1to G1or form a bridge of JR1is H, and G1is H, OH, halogen, or O-[C(R6)(R7)]n-[(C=O)m-XG.]j-R8is either selected from
J.R2and G2but JR2and G2or form a cross-link with JR2is H, and G2is H, OH, halogen, or O-[C(R6)(R7)]n-[(C=O)m-XG.]j-R8is either selected from
J.R3and G3but JR3and G3or form a cross-link with JR3is H, and G3is H, OH, halogen, or O-[C(R6)(R7)]n-[(C=O)m-XG.]j-R8is either selected from
In the formula, each JR.The bridge from G to -CH(CH3)-O- or -(CH2)khaving a formula independently selected from -O-, wherein k is from 1 to 3;
Each R6and R7is independently H, halogen, C1~C6alkyl, or substituted C1~C6is an alkyl,
Each XG.is O, S, or N (E1) and
R.8is H, halogen, C1~C6alkyl, substituted C1~C6alkyl, C2~C6alkenyl, substituted C2~C6alkenyl, C2~C6alkynyl, substituted C2~C6alkynyl, or N(E2) (E3) and
E.1, E2, and E3are each independently H, C1~C6alkyl, or substituted C1~C6is an alkyl,
n is 1 to 6,
m is 0 or 1,
j is 0 or 1,
Each substituted group is halogen, OJ1, N(J1) (J2), = NJ1, SJ1, N3, CN, OC (=X2)J1, OC(=X2)N(J1) (J2), and C (=Q2)N(J1) (J2), including one or more optionally protected substituents independently selected from
Q.2is O, S, or NJ3and
Each J1, J2, and J3is independently H or C1~C6is an alkyl
said oligomeric compound.
[Aspect 94] An oligomeric compound comprising a modified oligonucleotide, wherein at least one region of the modified oligonucleotide has structure E,
During the ceremony,
each Bx is a heterocyclic base moiety;
X is selected from O or S;
Y.1and Y2is independently selected from OH or SH;
Z.2and Z3is independently -(CH2)p-XZ.-(CH2)q-, wherein p is 0 or 1, q is 0 or 1, XZ.is O, S, or N (E1) and
R.1but H, C1~C6alkyl, and substituted C1~C6selected from alkyl,
T is SO2R.2, C(=O)R3, and P(=O)R4R.5is selected from, where:
R.2is aryl, substituted aryl, heterocycle, substituted heterocycle, heteroaromatic ring, substituted heteroaromatic ring, diazole, substituted diazole, C1~C6Alkoxy, C1~C6alkyl, C1~C6alkenyl, C1~C6alkynyl, substituted C1~C6alkyl, substituted C1~C6alkenyl-substituted C1~C6selected from alkynyl and conjugate groups;
R.3is aryl, substituted aryl, CH3, N(CH3)2, OCH3, and a conjugate group,
R.4but OCH3, OH, C1~C6alkyl, substituted C1~C6selected from alkyl, and conjugate groups;
R.5but OCH3, OH, C1~C6alkyl, and substituted C1~C6selected from alkyl,
J.R1and G1but JR1to G1or form a bridge of JR1is H, and G1is H, OH, halogen, or O-[C(R6)(R7)]n-[(C=O)m-XG.]j-R8is either selected from
J.R2and G2but JR2and G2or form a cross-link with JR2is H, and G2is H, OH, halogen, or O-[C(R6)(R7)]n-[(C=O)m-XG.]j-R8is either selected from
J.R3and G3but JR3and G3or form a cross-link with JR3is H, and G3is H, OH, halogen, or O-[C(R6)(R7)]n-[(C=O)m-XG.]j-R8is either selected from
In the formula, each JR.The bridge from G to -CH(CH3)-O- or -(CH2)khaving a formula independently selected from -O-, wherein k is from 1 to 3;
Each R6and R7is independently H, halogen, C1~C6alkyl, or substituted C1~C6is an alkyl,
Each XG.is O, S, or N (E1) and
R.8is H, halogen, C1~C6alkyl, substituted C1~C6alkyl, C2~C6alkenyl, substituted C2~C6alkenyl, C2~C6alkynyl, substituted C2~C6alkynyl, or N(E2) (E3) and
E.1, E2, and E3are each independently H, C1~C6alkyl, or substituted C1~C6is an alkyl,
n is 1 to 6,
m is 0 or 1,
j is 0 or 1,
Each substituted group is halogen, OJ1, N(J1) (J2), = NJ1, SJ1, N3, CN, OC (=X2)J1, OC(=X2)N(J1) (J2), and C (=Q2)N(J1) (J2), including one or more optionally protected substituents independently selected from
Q.2is O, S, or NJ3and
Each J1, J2, and J3is independently H or C1~C6is an alkyl
said oligomeric compound.
[Aspect 95] An oligomeric compound comprising a modified oligonucleotide, wherein the 5' end of the modified oligonucleotide has the structure P,
During the ceremony,
each Bx is a heterocyclic base moiety;
X is selected from O or S;
Z is -(CH2)p-XZ.-(CH2)q-, wherein p is 0 or 1, q is 0 or 1, and XZ.is O, S, or N (E1) and
R.1but H, C1~C6alkyl, and substituted C1~C6selected from alkyl,
T is SO2R.2, C(=O)R3, and P(=O)R4R.5is selected from, where:
R.2is aryl, substituted aryl, heterocycle, substituted heterocycle, heteroaromatic ring, substituted heteroaromatic ring, diazole, substituted diazole, C1~C6Alkoxy, C1~C6alkyl, C1~C6alkenyl, C1~C6alkynyl, substituted C1~C6alkyl, substituted C1~C6alkenyl-substituted C1~C6selected from alkynyl and conjugate groups;
R.3is aryl, substituted aryl, CH3, N(CH3)2, OCH3, and a conjugate group,
R.4but OCH3, OH, C1~C6alkyl, substituted C1~C6selected from alkyl, and conjugate groups;
R.5but OCH3, OH, C1~C6alkyl, and substituted C1~C6selected from alkyl,
J.R.and G is JR.to form a bridge from G, or from JR.is H and G is H, OH, halogen, or O-[C(R6)(R7)]n-[(C=O)m-XG.]j-R8is either selected from
In the formula, each JR.The bridge from G to -CH(CH3)-O- or -(CH2)khaving a formula independently selected from -O-, wherein k is from 1 to 3;
Each R6and R7is independently H, halogen, C1~C6alkyl, or substituted C1~C6is an alkyl,
Each XG.is O, S, or N (E1) and
R.8is H, halogen, C1~C6alkyl, substituted C1~C6alkyl, C2~C6alkenyl, substituted C2~C6alkenyl, C2~C6alkynyl, substituted C2~C6alkynyl, or N(E2) (E3) and
E.1, E2, and E3are each independently H, C1~C6alkyl, or substituted C1~C6is an alkyl,
n is 1 to 6,
m is 0 or 1,
j is 0 or 1,
Each substituted group is halogen, OJ1, N(J1) (J2), = NJ1, SJ1, N3, CN, OC (=X2)J1, OC(=X2)N(J1) (J2), and C (=Q2)N(J1) (J2), including one or more optionally protected substituents independently selected from
Q.2is O, S, or NJ3and
Each J1, J2, and J3is independently H or C1~C6is an alkyl
said oligomeric compound.
[Aspect 96] An oligomeric compound according to any of aspects 90-95, wherein each Z is O.
[Aspect 97] At least one G is H, OH, halogen, C1~C6Alkoxy, —O(CH2)2OCH3, or -OCH2(C=O)NHCH397. The oligomeric compound according to any of aspects 90-96, selected from
[Aspect 98] Each G is H, OH, halogen, C1~C6Alkoxy, —O(CH2)2OCH3, or -OCH2(C=O)NHCH398. The oligomeric compound according to any of aspects 90-97, selected from
[Aspect 99] At least one JR.forms a bridge with at least one G, and the JR.The bridge from G to -CH(CH3)-O- or -(CH2)k99. An oligomeric compound according to any of aspects 90-98, having a formula selected from -O', wherein k is 1-3.
[Aspect 100] Each JR.and G form a bridge, the JR.The bridge from G to -CH(CH3)-O- or -(CH2)k99. An oligomeric compound according to any of aspects 90-97 or 99, having a formula selected from -O-, wherein k is 1-3.
[Aspect 101] At least one Z is O, and the corresponding JR.to G bridges are of the formula (CH2)k101. An oligomeric compound according to any of aspects 99 or 100, having -O-, wherein k is 1.
[Aspect 102] An oligomeric compound according to any of aspects 90 to 101, wherein each nucleoside of structures A, B, C, D, E, or P is a stereocanonical nucleoside.
[Aspect 103] An oligomeric compound according to any of aspects 90 to 101, wherein at least one nucleoside of structures A, B, C, D, E, or P is a stereononcanonical nucleoside.
[Aspect 104] JR.104. The oligomeric compound according to any of aspects 99-101 or 103, wherein at least one nucleoside having a to G bridge is in the α-L-ribosyl configuration.
[Aspect 105] At least 2, at least 3, at least 4, at least 5, at least 6, at least 7, at least 8 modified oligonucleotides having structures A, B, C, D, or E , at least 9, or at least 10 regions.
[Aspect 106] An oligomeric compound according to any of aspects 90 to 105, wherein at least one region having structure A, B, C, D, or E is at the 5' end of said modified oligonucleotide.
[Aspect 107] An oligomeric compound according to any of aspects 90 to 105, wherein at least one region having structure A, B, C, D, or E is at the 3' end of said modified oligonucleotide.
[Aspect 108] An oligomeric compound according to any of aspects 90 to 105, wherein at least one region having structure A, B, C, D, or E is internal to said modified oligonucleotide.
[Aspect 109] An oligomeric compound comprising a modified oligonucleotide consisting of 10 to 30 linked nucleosides, wherein a region of the modified oligonucleotide has the formula (Ng1)L1(Ng2)L2(Ng3)L3, where each Ngis a nucleoside, each L is an internucleoside linking group, and L1, and L2is a phosphodiester internucleoside linking group, a phosphorothioate internucleoside linking group, or an internucleoside linking group of Formula XVII;
In the formula, L3is absent or is a phosphodiester internucleoside linking group, a phosphorothioate internucleoside linking group, or an internucleoside linking group of Formula XVII;
In the formula, L1, L2, and L3is an internucleoside linking group of formula XVII, and L1, L2, and L3is a phosphorothioate or phosphodiester internucleoside linking group;
independently for each internucleoside linking group of said modified oligonucleotide having formula XVII,
X is selected from O or S;
R.1but H, C1~C6alkyl, and substituted C1~C6selected from alkyl,
T is SO2R.2, C(=O)R3, and P(=O)R4R.5is selected from, where:
R.2is aryl, substituted aryl, heterocycle, substituted heterocycle, heteroaromatic ring, substituted heteroaromatic ring, diazole, substituted diazole, C1~C6Alkoxy, C1~C6alkyl, C1
~C6alkenyl, C1~C6alkynyl, substituted C1~C6alkyl, substituted C1~C6alkenyl-substituted C1~C6selected from alkynyl and conjugate groups;
R.3is aryl, substituted aryl, CH3, N(CH3)2, OCH3, and a conjugate,
R.4but OCH3, OH, C1~C6alkyl, substituted C1~C6selected from alkyl, and conjugates;
R.5but OCH3, OH, C1~C6alkyl, and substituted C1~C6selected from alkyl,
said oligomeric compound.
[Aspect 110] The modified oligonucleotide has the formula (Ng1)L1(Ng2)L2(Ng3)L3110. An oligomeric compound according to aspect 109, comprising at least 2, at least 3, at least 4, at least 5, at least 6, at least 7, at least 8, at least 9, or at least 10 regions having .
[Aspect 111] The formula (Ng1)L1(Ng2)L2(Ng3)L3111. An oligomeric compound according to aspects 109 or 110, wherein at least one region having a is at the 5' end of said oligonucleotide.
[Aspect 112] The formula (Ng1)L1(Ng2)L2(Ng3)L3111. An oligomeric compound according to aspects 109 or 110, wherein the at least one region having is internal to said oligonucleotide.
[Aspect 113] The formula (Ng1)L1(Ng2)L2(Ng3)L3111. An oligomeric compound according to aspects 109 or 110, wherein at least one region having a is at the 3' end of said oligonucleotide.
[Aspect 114] An oligomeric compound according to any of aspects 1 to 113, wherein at least one nucleoside of said modified oligonucleotide is a modified nucleoside selected from bicyclic nucleosides and non-bicyclic substituted nucleosides.
[Aspect 115] At least one nucleoside of the modified oligonucleotide is β-D-LNA nucleoside, α-L-LNA nucleoside, ENA nucleoside, cEt nucleoside, 2′-MOE nucleoside, 2′-OMe nucleoside, 2′ 115. An oligomeric compound according to any of aspects 1-114, selected from -F nucleosides, 2'-NMA nucleosides, 5'-Me nucleosides, DNA nucleosides and RNA nucleosides.
[Aspect 116] Each nucleoside of the modified oligonucleotide is a β-D-LNA nucleoside, an α-L-LNA nucleoside, an ENA nucleoside, a cEt nucleoside, a 2′-MOE nucleoside, a 2′-OMe nucleoside, and a 2′-F nucleoside. , 2′-NMA nucleosides, 5′-Me nucleosides, DNA nucleosides and RNA nucleosides.
[Aspect 117] An oligomeric compound according to any of aspects 1 to 116, wherein at least one nucleoside of said modified oligonucleotide is a stereonon-canonical nucleoside.
Aspect 118. An oligomeric compound according to aspect 117, wherein said internucleoside linking group linking at least one stereononcanonical nucleoside to an adjacent nucleoside is an internucleoside linking group of Formula XVII.
Aspect 119. An oligomeric compound according to aspects 117 or 118, wherein at least two nucleosides of said modified oligonucleotide are stereonon-canonical nucleosides.
[Aspect 120] The oligomeric compound of aspect 119, wherein at least two stereononcanonical nucleosides of said modified oligonucleotide are adjacent to each other.
[Aspect 121] An oligomeric compound according to aspect 120, wherein at least two sterically non-canonical nucleosides of said modified oligonucleotide are linked together with an internucleoside linking group of formula XVII.
[Aspect 122] An oligomeric compound according to any of aspects 117 to 121, wherein at least one stereononcanonical nucleoside of said modified oligonucleotide is a stereononcanonical DNA nucleoside.
[Aspect 123] In Aspect 122, wherein the stereononcanonical DNA nucleoside is selected from stereononcanonical DNA nucleosides having Formula I, Formula II, Formula III, Formula IV, Formula V, Formula VI, and Formula VII. The described oligomeric compound.
[Aspect 124] An oligomeric compound according to aspect 123, wherein said stereononcanonical DNA nucleosides are selected from stereononcanonical DNA nucleosides having Formula V and Formula II.
Aspect 125. An oligomeric compound according to any of aspects 117 to 124, wherein at least one stereononcanonical nucleoside of said oligomeric compound is a substituted stereononcanonical nucleoside.
[Aspect 126] The 2' substituent of said at least one substituted stereononcanonical nucleoside of said modified oligonucleotide is selected from 2'-MOE, 2'-OMe, 2'-F, or 2'-OH. 126. The oligomeric compound according to aspect 125, wherein the oligomeric compound is
[Aspect 127] An oligomeric compound according to any of aspects 1 to 126, wherein each nucleoside of said modified oligonucleotide is a stereocanonical nucleoside.
[Aspect 128] An oligomeric compound according to any of aspects 1-126, wherein said modified oligonucleotide consists of 12-30 linked nucleosides.
[Aspect 129] An oligomeric compound according to any of aspects 1-126, wherein said modified oligonucleotide consists of 16-24 linked nucleosides.
[Aspect 130] An oligomeric compound according to any of aspects 1-126, wherein said modified oligonucleotide consists of 18-22 linked nucleosides.
[Aspect 131] An oligomeric compound according to any of aspects 1-129, wherein said modified oligonucleotide consists of 16 linked nucleosides.
[Aspect 132] An oligomeric compound according to any of aspects 1-129, wherein said modified oligonucleotide consists of 17 linked nucleosides.
[Aspect 133] An oligomeric compound according to any of aspects 1-130, wherein said modified oligonucleotide consists of 18 linked nucleosides.
[Aspect 134] An oligomeric compound according to any of aspects 1-130, wherein said modified oligonucleotide consists of 19 linked nucleosides.
[Aspect 135] An oligomeric compound according to any of aspects 1-130, wherein said modified oligonucleotide consists of 20 linked nucleosides.
[Aspect 136] An oligomeric compound according to any of aspects 1-130, wherein said modified oligonucleotide consists of 21 linked nucleosides.
Aspect 137. An oligomeric compound according to any of aspects 1-130, wherein said modified oligonucleotide consists of 22 linked nucleosides.
[Aspect 138] An oligomeric compound according to any of aspects 1-129, wherein said modified oligonucleotide consists of 23 linked nucleosides.
[Aspect 139] An oligomeric compound according to any of aspects 1-138, wherein at least one nucleoside of said modified oligonucleotide is selected from 2'-OMe nucleosides, 2'-F nucleosides and RNA nucleosides.
[Aspect 140] of aspects 1-139, wherein at least one nucleoside of said modified oligonucleotide is a 2'-OMe nucleoside, and at least one nucleoside of said modified oligonucleotide is a 2'-F nucleoside. An oligomeric compound according to any one of the above.
[Aspect 141] An oligomeric compound according to aspect 140, wherein each nucleoside of said modified oligonucleotide is selected from 2'-OMe nucleosides or 2'-F nucleosides.
[Aspect 142] At least one nucleoside of the modified oligonucleotide is a 2'-OMe nucleoside, at least one nucleoside of the modified oligonucleotide is a 2'-F nucleoside, and 141. An oligomeric compound according to any of aspects 1-140, wherein at least one nucleoside comprises a sugar surrogate.
Aspect 143. An oligomeric compound according to aspect 142, wherein each nucleoside of said modified oligonucleotide is selected from 2'-OMe nucleosides, 2'-F nucleosides, and nucleosides containing sugar surrogates.
[Aspect 144] The nucleoside comprising a sugar substitute is
any of aspects 142-143, wherein Bx is a heterocyclic base moiety
The oligomeric compound according to claim 1.
[Aspect 145] An oligomeric compound according to aspect 144, wherein said nucleoside comprising a sugar surrogate is GNA.
[Aspect 146] The modified oligonucleotide has a region of alternating nucleoside types with the motif ABABA, wherein each A is a stereocanonical nucleoside of a first type and each B is a stereocanonical nucleoside of a second type. 146. An oligomeric compound according to any of aspects 139-145, which is a stereocanonical nucleoside of a type, wherein said first type and said second type are different from each other.
[Aspect 147] An oligomeric compound according to aspect 146, wherein A and B are selected from 2'-F substituted nucleosides, 2'-OMe substituted nucleosides, and stereocanonical RNA nucleosides.
[Aspect 148] An oligomeric compound according to any of aspects 1-147, wherein the 5' end of said modified oligonucleotide comprises a terminal group.
[Aspect 149] An oligomeric compound according to aspect 148, wherein said terminal group is a stabilized phosphate group.
Aspect 150. An oligomeric compound according to aspect 149, wherein said stabilizing phosphate group is 5'-vinylphosphonate or 5'-cyclopropylphosphonate.
[Aspect 151] The terminal group has the formula XXII,
149. A compound according to aspect 148, wherein Z is O or S.
[Aspect 152] The terminal group is
is selected from
In the formula, RA.is OH, OP(=O)OH, OP(=O)SH, mesyl phosphoramidate, or a stabilized phosphate group;
G.A.is H, OH, OMe, MOE, or halogen;
X is OH, SH, or NSO2R.2and
R.2is aryl, substituted aryl, heterocycle, substituted heterocycle, heteroaromatic ring, substituted heteroaromatic ring, diazole, substituted diazole, C1~C6Alkoxy, C1~C6alkyl, C1~C6alkenyl, C1~C6alkynyl, substituted C1~C6alkyl, substituted C1~C6alkenyl-substituted C1~C6selected from alkynyl and conjugate groups;
149. An oligomeric compound according to aspect 148.
[Aspect 153] GA.is selected from H or OH, and X is SH.
[Aspect 154] An antisense agent consisting of or comprising an oligomeric compound according to any of aspects 1-153.
[Aspect 155] The antisense agent of aspect 154, wherein the antisense agent is an RNAi agent.
[Aspect 156] According to Aspect 155, the RNAi agent is a single-stranded RNAi agent comprising an RNAi antisense oligomeric compound, and the RNAi antisense oligomeric compound is an oligomeric compound according to any of Aspects 1-151. RNAi agents as described.
[Aspect 157] The RNAi agent is an oligonucleotide duplex comprising an RNAi antisense oligomeric compound and an RNAisense oligomeric compound, and the RNAi antisense oligomeric compound and/or the RNAisense oligomeric compound is the 156. The RNAi agent according to aspect 155, which is an oligomeric compound according to any of aspects.
[Aspect 158] The RNAi agent of aspect 156 or 157, wherein at least one internucleoside linking group of said RNAi antisense oligomeric compound is an internucleoside linking group of Formula XVII.
[Aspect 159] The RNAi agent of aspect 156 or 157, wherein at least two internucleoside linking groups of said RNAi antisense oligomeric compound are independently selected internucleoside linking groups of Formula XVII.
[Aspect 160] According to any of aspects 156 to 159, wherein at least one of the five 3′-most internucleoside linking groups of said RNAi antisense oligomeric compound is an internucleoside linking group of Formula XVII. RNAi agent of.
[Aspect 161] The RNAi according to any of aspects 156 to 159, wherein at least two of the five 3′-most internucleoside linking groups of the RNAi antisense oligomeric compound are internucleoside linking groups of Formula XVII. agent.
[Aspect 162] 1 to 3 of the 3 most 3′ internucleoside linking groups are an internucleoside linking group of formula XVII, and among these 3 internucleoside linking groups of formula XVII 162. The RNAi agent according to any of aspects 156-161, wherein each non-internucleoside linking group of is a phosphodiester or phosphorothioate internucleoside linking group.
[Embodiment 163] An RNAi agent according to embodiment 162, wherein the two 3'-most internucleoside linking groups are an internucleoside linking group of formula XVII.
[Aspect 164] According to any of aspects 156 to 163, wherein exactly one of the 5′-most and the 5′-most penultimate internucleoside linking group is an internucleoside linking group of formula XVII. RNAi agent of.
[Aspect 165] Exactly one of the 5′-most and the 5′-most penultimate internucleoside linking groups of said RNAi antisense oligonucleotide is an internucleoside linking group of formula XVII, and said RNAi the other of the 5'-most and the 5'-most penultimate internucleoside linking groups of the antisense oligonucleotide is selected from phosphodiester and phosphorothioate internucleoside linkages; of embodiments 156-164, wherein the two internucleoside linking groups on the ' side are internucleoside linking groups of Formula XVII, and the remaining internucleoside linking groups of said RNAi antisense oligonucleotide are phosphodiester internucleoside linkages. The RNAi agent according to any one.
[Aspect 166] The RNAi agent of any of aspects 156-165, wherein said antisense oligomeric compound comprises a 3' overhang.
[Aspect 167] The RNAi agent of aspect 166, wherein said 3' overhang consists of two nucleosides.
[Aspect 168] The RNAi of any of aspects 156-164 or 166-167, wherein at least one internucleoside linking group in the seed region of said RNAi antisense oligomeric compound is an internucleoside linking group of Formula XVII. agent.
[Aspect 169] For each internucleoside linking group of Formula XVII, R1is H, and T is SO2The RNAi agent according to any of aspects 156-168, which is Me.
[Aspect 170] The RNAi antisense oligomeric compound comprises an RNAi antisense modified oligonucleotide, the RNAi antisense modified oligonucleotide consists of 23 linked nucleosides, and the internucleoside linkage motif is oooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooo oaaa, asoooooooooooooooooooooss, saoooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooo or oooooaa, wherein each "a" represents an internucleoside linkage of Formula XVII and each "s" is 169. The RNAi agent according to any of aspects 156-169, wherein each "o" represents a phosphorothioate internucleoside linkage and each "o" represents a phosphodiester internucleoside linkage.
[Aspect 171] The RNAi agent of aspect 170, wherein the internucleoside linkage motif of the RNAi antisense modified oligonucleotide is selected from oooooooooooooooooooaa, asoooooooooooooooooooooss, or saoooooooooooooooooooooooo.
[Aspect 172] The sugar motif of said RNAi antisense oligomeric compound from 5′ to 3′ is yfyfyfyfyfyfyfyfyfy or yfyyyfyyyyyyyfyfyyyyyy, wherein “y” represents a 2′-OMe sugar moiety and “f” is 2 172. The RNAi agent of aspect 170 or 171, which represents a '-F sugar moiety.
[Aspect 173] The RNAi antisense oligomeric compound comprises an RNAi antisense modified oligonucleotide, the RNAi antisense modified oligonucleotide consists of 21 linked nucleosides, and the internucleoside linkage motif is aaososososososossssss, ssaaosososososssssss, ssososaaososossssss, ssosososaaososssssss, ssososososaaosssssss s, ssososososososssssaa, wherein each "a" represents an internucleoside linkage of Formula XVII, each "s" represents a phosphorothioate internucleoside linkage, each " 169. The RNAi agent according to any of aspects 156-169, wherein o" represents a phosphodiester internucleoside linkage.
[Aspect 174] The internucleoside binding motif of the RNAi antisense modified oligonucleotide is osssaass, or ssosososososososssssaa, wherein each "a" is an internucleoside linkage of formula XVII 174. The RNAi agent according to aspect 173, wherein each "s" represents a phosphorothioate internucleoside linkage and each "o" represents a phosphodiester internucleoside linkage.
[Aspect 175] The sugar motif of said RNAi antisense oligomeric compound from 5′ to 3′ is yfyfyfyfyfyfyfyfyfy, wherein “y” represents a 2′-OMe sugar moiety and “f” is a 2′- 175. The RNAi agent of aspect 173 or 174, which represents an F sugar moiety.
[Aspect 176] The RNAi agent of any of aspects 170-175, wherein each "a" is a mesyl phosphoramidate linkage.
[Aspect 177] The RNAi agent of any of aspects 156-176, wherein at least one region of said RNAi antisense oligomeric compound has structure A, B, C, D, E, or P.
[Aspect 178] The RNAi agent of aspect 177, wherein at least one region having structure A, B, C, D, or E is within said seed region of said RNAi antisense oligomeric compound.
[Aspect 179] The RNAi agent of aspect 177, wherein at least one region having structure A, B, C, D, or E is at the 3' end of said RNAi antisense oligomeric compound.
[Aspect 180] The RNAi agent of aspect 177, wherein at least one region having structure A, B, C, D, E, or P is at the 5' end of said RNAi antisense oligomeric compound.
[Aspect 181] At least one region of the RNAi antisense oligomeric compound has the formula (Ng1)L1(Ng2)L2(Ng3)L3, where each Ngis a nucleoside, each L is an internucleoside linking group, and L1, and L2is a phosphodiester internucleoside linking group, a phosphorothioate internucleoside linking group, or an internucleoside linking group of Formula XVII;
In the formula, L3is absent or is a phosphodiester internucleoside linking group, a phosphorothioate internucleoside linking group, or an internucleoside linking group of Formula XVII;
In the formula, L1, L2, and L3is an internucleoside linking group of formula XVII, and L1, L2, and L3is a phosphorothioate or phosphodiester internucleoside linking group;
independently for each internucleoside linking group of said RNAi antisense oligomeric compound having formula XVII:
X is selected from O or S;
R.1but H, C1~C6alkyl, and substituted C1~C6selected from alkyl,
T is SO2R.2, C(=O)R3, and P(=O)R4R.5is selected from, where:
R.2is aryl, substituted aryl, heterocycle, substituted heterocycle, heteroaromatic ring, substituted heteroaromatic ring, diazole, substituted diazole, C1~C6Alkoxy, C1~C6alkyl, substituted C1~C6selected from alkyl, and conjugates;
R.3is aryl, substituted aryl, CH3, N(CH3)2, OCH3, and a conjugate,
R.4but OCH3, OH, C1~C6alkyl, substituted C1~C6selected from alkyl, and conjugates;
R.5but OCH3, OH, C1~C6alkyl, and substituted C1~C6selected from alkyl,
An RNAi agent according to any of aspects 156-180.
[Aspect 182] The formula (Ng1)L1(Ng2)L2(Ng3)L3182. The RNAi agent of aspect 181, wherein said region having a comprises one or two 3' overhanging nucleosides.
[Aspect 183] The formula (Ng1)L1(Ng2)L2(Ng3)L3182. The RNAi agent of aspect 181, wherein at least one region having a is at the 3' end of said RNAi antisense oligomeric compound.
[Aspect 184] L1 and L2 are each an internucleoside linkage of Formula XVII, wherein R1is H, and T is SO2184. The RNAi agent according to aspect 183, wherein Me and L3 is a phosphodiester internucleoside linkage.
[Aspect 185] The formula (Ng1)L1(Ng2)L2(Ng3)L3184. The RNAi agent of aspect 183, wherein at least one region having a is at the 5' end of said RNAi antisense oligomeric compound.
[Aspect 186] One of L1 or L2 is an internucleoside linkage of Formula XVII, wherein R1is H, and T is SO2186. The RNAi agent according to aspect 185, wherein Me and the other of L1 or L2 is a phosphorothioate internucleoside linkage and L3 is a phosphodiester internucleoside linkage.
[Aspect 187] The formula (Ng1)L1(Ng2)L2(Ng3)L3182. The RNAi agent of embodiment 181, wherein at least one region having a is within said seed region of said RNAi antisense oligomeric compound.
[Aspect 188] The RNAi agent of any of aspects 156-187, wherein the region of said RNAi antisense oligonucleotide that is complementary to a target is at least 15 nucleobases.
[Aspect 189] The RNAi agent of any of aspects 156-188, wherein said region of said RNAi antisense oligonucleotide that is complementary to a target is at least 17 nucleobases.
[Aspect 190] The RNAi agent of any of aspects 156-189, wherein said region of said RNAi antisense oligonucleotide that is complementary to a target is at least 19 nucleobases.
[Aspect 191] The RNAi agent of any of aspects 156-190, wherein said region of said RNAi antisense oligonucleotide that is complementary to a target is at least 21 nucleobases.
[Aspect 192] The RNAi agent of any of aspects 156-190, wherein said region of said RNAi antisense oligonucleotide that is complementary to a target is exactly 19 nucleobases.
[Aspect 193] The RNAi agent of any of aspects 156-191, wherein said region of said RNAi antisense oligonucleotide that is complementary to a target is exactly 21 nucleobases.
[Aspect 194] The RNAi agent of any of aspects 156 to 193, wherein at least one nucleoside of said RNAi antisense oligomeric compound is selected from 2'-OMe nucleosides, 2'-F nucleosides, and RNA nucleosides. .
[Aspect 195] Aspects 156-194, wherein at least one nucleoside of said RNAi antisense oligomeric compound is a 2'-OMe nucleoside, and at least one nucleoside of said RNAi antisense oligomeric compound is an RNA nucleoside. The RNAi agent according to any one.
Aspect 196 Aspect 156, wherein at least one nucleoside of said RNAi antisense oligomeric compound is a 2'-OMe nucleoside and at least one nucleoside of said RNAi antisense oligomeric compound is a 2'-F nucleoside. 195. The RNAi agent of any one of -195.
[Aspect 197] The RNAi agent of aspect 196, wherein each nucleoside of said RNAi antisense oligomeric compound is selected from 2'-OMe nucleosides or 2'-F nucleosides.
[Aspect 198] At least one nucleoside of said RNAi antisense oligomeric compound is a 2'-OMe nucleoside, at least one nucleoside of said RNAi antisense oligomeric compound is a 2'-F nucleoside, and said oligomer 195. The RNAi agent according to any of aspects 156-194, wherein at least one nucleoside of the compound comprises a sugar surrogate.
[Aspect 199] The RNAi agent of aspect 198, wherein each nucleoside of said RNAi antisense oligomeric compound is selected from 2'-OMe nucleosides, 2'-F nucleosides, and nucleosides comprising sugar surrogates.
[Aspect 200] The nucleoside comprising a sugar substitute is
200. The RNAi agent according to any of aspects 198-199, wherein Bx is a heterocyclic base moiety.
[Aspect 201] The RNAi agent of aspect 200, wherein said nucleoside comprising a sugar surrogate is GNA.
[Aspect 202] The RNAi agent of aspect 200 or 201, wherein at least one nucleoside comprising a sugar surrogate is one of the nine 5'-most nucleosides of said RNAi antisense oligomeric compound.
[Aspect 203] The oligomeric compound has a region of alternating nucleoside types with the motif ABABA, wherein each A is a stereocanonical nucleoside of a first type and each B is a stereocanonical nucleoside of a second type and wherein said first type and said second type are different from each other.
[Aspect 204] The RNAi agent of aspect 203, wherein A and B are selected from 2'-F substituted nucleosides, 2'-OMe substituted nucleosides, and stereocanonical RNA nucleosides.
[Aspect 205] The RNAi agent of any of aspects 156-204, wherein the 5' end of said RNAi antisense oligomeric compound comprises a terminal group.
[Aspect 206] The RNAi agent of aspect 205, wherein the terminal group is a stabilized phosphate group.
[Aspect 207] The RNAi agent of aspect 206, wherein said stabilizing phosphate group is 5'-vinylphosphonate or 5'-cyclopropylphosphonate.
[Aspect 208] The RNAi agent of aspect 205, wherein said terminal group has Formula XXII.
[Aspect 209] The terminal group is
is selected from
In the formula, RA.is OH, OP(=O)OH, OP(=O)SH, mesyl phosphoramidate, or a stabilized phosphate group;
G.A.is H, OH, OMe, MOE, or halogen;
X is OH, SH, or NSO2R.2and
R.2is aryl, substituted aryl, heterocycle, substituted heterocycle, heteroaromatic ring, substituted heteroaromatic ring, diazole, substituted diazole, C1~C6Alkoxy, C1~C6alkyl, C1~C6alkenyl, C1~C6alkynyl, substituted C1~C6alkyl, substituted C1~C6alkenyl-substituted C1~C6selected from alkynyl and conjugate groups;
206. An RNAi agent according to aspect 205.
[Aspect 210] GA.is selected from H or OH, and X is SH.
[Aspect 211] An RNAi agent according to aspects 157-210, wherein at least one internucleoside linking group of said RNAi sense oligomeric compound is an internucleoside linking group of formula XVII.
[Aspect 212] The RNAi agent of aspect 211, wherein at least one of the five 5'-most internucleoside linking groups of said RNAi sense oligomeric compound is an internucleoside linking group of Formula XVII.
[Aspect 213] The RNAi agent of aspect 211, wherein at least two of the five 5'-most internucleoside linking groups of said RNAi sense oligomeric compound are internucleoside linking groups of Formula XVII.
[Aspect 214] The RNAi agent of aspect 211, wherein the two 5'-most internucleoside linking groups of said RNAi sense oligomeric compound are internucleoside linking groups of Formula XVII.
[Aspect 215] Aspects 211 to 214, wherein at least one of the five 3′-most internucleoside linking groups of said RNAi sense oligomeric compound is an internucleoside linking group of Formula XVII. RNAi agent.
[Aspect 216] The RNAi according to any one of aspects 211 to 214, wherein at least two of the five 3′-most internucleoside linking groups of the RNAi sense oligomeric compound are internucleoside linking groups of Formula XVII. agent.
[Aspect 217] The RNAi agent according to any of aspects 211 to 214, wherein the two 3'-most internucleoside linking groups are an internucleoside linking group of Formula XVII.
[Aspect 218] The two 3′-most and two 5′-most internucleoside linking groups of the RNAi sense oligonucleotide are internucleoside linking groups of formula XVII, and the remaining 212. The RNAi agent according to aspect 211, wherein the internucleoside linking group is a phosphodiester internucleoside linkage.
[Aspect 219] For each internucleoside linking group of Formula XVII, R1is H, and T is SO2The RNAi agent according to any of aspects 211-218, which is Me.
[Aspect 220] The RNAisense oligomeric compound consists of 21 linked nucleosides, and the internucleoside linkage motif consists of oooooooooooooooooooaa, aaoooooooooooooooooaa, selected, wherein each "a" is a nucleoside of formula XVII 220. The RNAi agent according to any of aspects 211-219, wherein each "s" represents a phosphorothioate internucleoside linkage and each "o" represents a phosphodiester internucleoside linkage.
[Aspect 221] The internucleoside linkage motif of the RNAisense oligomeric compound is selected from ooooooooooooooooooaa, aaooooooooooooooooooaa, or oooooooooooooooooooaa, wherein each "a" represents an internucleoside linkage of Formula XVII, , represents a phosphorothioate internucleoside linkage, and each "o" represents a phosphodiester internucleoside linkage.
[Aspect 222] The sugar motif of said RNAi-sense oligomeric compound is selected from yyyyyyfffyyyyyyyyyy or fyfyfyfyfyfyfyfyfyf, wherein “y” represents a 2′-OMe sugar moiety and “f” represents a 2′-F sugar moiety. 222. The RNAi agent of aspect 220 or 221, which represents:
[Aspect 223] The RNAi agent of any of aspects 220-222, wherein each "a" is a mesyl phosphoramidate linkage.
[Aspect 224] The RNAi agent of any of aspects 211-223, wherein at least one region of said RNAi sense oligomeric compound has structure A, B, C, D, E, or P.
[Aspect 225] The RNAi agent of aspect 224, wherein at least one region having structure A, B, C, D, or E is at the 3' end of said RNAisense oligomeric compound.
[Aspect 226] The RNAi agent of aspect 224, wherein at least one region having structure A, B, C, D, or E is at the 5' end of said RNAisense oligomeric compound.
[Aspect 227] At least one region of said RNAi sense oligomeric compound has the formula (Ng1)L1(Ng2)L2(Ng3)L3, where each Ngis a nucleoside, each L is an internucleoside linking group, and L1, and L2is a phosphodiester internucleoside linking group, a phosphorothioate internucleoside linking group, or an internucleoside linking group of Formula XVII;
In the formula, L3is absent or is a phosphodiester internucleoside linking group, a phosphorothioate internucleoside linking group, or an internucleoside linking group of Formula XVII;
In the formula, L1, L2, and L3is an internucleoside linking group of formula XVII, and L1, L2, and L3is a phosphorothioate or phosphodiester internucleoside linking group;
wherein independently for each internucleoside linking group of said RNAi sense oligomeric compound having formula XVII:
X is selected from O or S;
R.1but H, C1~C6alkyl, and substituted C1~C6selected from alkyl,
T is SO2R.2, C(=O)R3, and P(=O)R4R.5is selected from, where:
R.2is aryl, substituted aryl, heterocycle, substituted heterocycle, heteroaromatic ring, substituted heteroaromatic ring, diazole, substituted diazole, C1~C6Alkoxy, C1~C6alkyl, C1~C6alkenyl, C1~C6alkynyl, substituted C1~C6alkyl, substituted C1~C6alkenyl-substituted C1~C6selected from alkynyl and conjugate groups;
R.3is aryl, substituted aryl, CH3, N(CH3)2, OCH3, and a conjugate,
R.4but OCH3, OH, C1~C6alkyl, substituted C1~C6selected from alkyl, and conjugates;
R.5but OCH3, OH, C1~C6alkyl, and substituted C1~C6selected from alkyl,
An RNAi agent according to any of aspects 211-226.
[Aspect 228] The formula (Ng1)L1(Ng2)L2(Ng3)L3228. The RNAi agent of aspect 227, wherein at least one region having a is at the 3' end of said RNAi sense oligomeric compound.
[Aspect 229] L1 and L2 are internucleoside linking groups of Formula XVII;1is H, and T is SO2229. The RNAi agent according to aspect 228, wherein Me and L3 is a phosphodiester internucleoside linkage.
[Aspect 230] The formula (Ng1)L1(Ng2)L2(Ng3)L3228. The RNAi agent of aspect 227, wherein at least one region having a is at the 5' end of said RNAi sense oligomeric compound.
[Aspect 231] L1 is a phosphodiester internucleoside linking group, L2 and L3 are each an internucleoside linking group of formula XVII, and R1is H, and T is SO2231. The RNAi agent according to aspect 230, which is Me.
[Aspect 232] The RNAi agent of any of aspects 157-231, wherein said RNAi sense oligomeric compound comprises a 3' end group and/or a 5' end group.
[Aspect 233] The RNAi agent of any of aspects 157-231, wherein said RNAi sense oligomeric compound comprises a conjugate group.
[Aspect 234] The RNAi agent of aspect 233, wherein said conjugate group comprises a cell-targeting moiety.
[Aspect 235] The RNAi agent of aspect 233, wherein said conjugate group comprises a carbohydrate or carbohydrate cluster.
[Aspect 236] The RNAi agent of aspect 233, wherein said conjugate group comprises at least one GalNAc.
[Aspect 237] The conjugate group is C10~C20234. The RNAi agent according to aspect 233, comprising an alkyl chain.
[Aspect 238] The conjugate group is C16234. The RNAi agent of aspect 233, comprising an alkyl.
[Aspect 239] The RNAi agent of any of aspects 157-238, wherein the double-stranded region of said oligonucleotide duplex is at least 15 nucleosides.
[Aspect 240] The RNAi agent of any of aspects 157-238, wherein the double-stranded region of said oligonucleotide duplex is at least 17 nucleosides.
[Aspect 241] The RNAi agent of any of aspects 157-238, wherein the double-stranded region of said oligonucleotide duplex is at least 19 nucleosides.
[Aspect 242] The RNAi agent of any of aspects 157-238, wherein the double-stranded region of said oligonucleotide duplex is exactly 19 nucleosides.
[Aspect 243] An oligomeric compound according to any of aspects 1-138, wherein each nucleoside of said modified oligonucleotide is a modified nucleoside comprising a modified sugar moiety.
[Aspect 244] The oligomeric compound of aspect 243, wherein each modified sugar moiety of said modified oligonucleotide is independently selected from bicyclic sugar moieties and 2'-substituted furanosyl sugar moieties.
[Aspect 245] The oligomeric compound of aspects 243 or 244, wherein each modified sugar moiety of said modified oligonucleotide comprises the same modification.
[Aspect 246] Aspects 243-245, wherein each modified sugar moiety of said modified oligonucleotide is selected from a 2'-OMe sugar moiety, a 2'-MOE sugar moiety, and a 2'-NMA sugar moiety. oligomeric compounds of.
[Aspect 247] Aspect 243 or wherein the three 3′-most nucleosides of said modified oligonucleotide comprise bicyclic sugar moieties and the remaining nucleosides of said modified oligonucleotide comprise 2′ substituted furanosyl sugar moieties; an oligomeric compound according to 244;
[Aspect 248] Aspect 243 or wherein the four 3′-most nucleosides of said modified oligonucleotide comprise bicyclic sugar moieties and the remaining nucleosides of said modified oligonucleotide comprise 2′ substituted furanosyl sugar moieties; an oligomeric compound according to 244;
[Aspect 249] The five 3′-most nucleosides of the modified oligonucleotide contain a bicyclic sugar moiety.
245. The oligomeric compound of aspects 243 or 244, wherein the remaining nucleosides of said modified oligonucleotide comprise a 2'-substituted furanosyl sugar moiety.
[Aspect 250] Aspect 243 or wherein the six 3′-most nucleosides of said modified oligonucleotide comprise bicyclic sugar moieties and the remaining nucleosides of said modified oligonucleotide comprise 2′-substituted furanosyl sugar moieties; an oligomeric compound according to 244;
[Aspect 251] An oligomeric compound according to any of aspects 243 or 244, wherein each bicyclic sugar moiety of said modified oligonucleotide is selected from among cEt, LNA, and ENA.
[Aspect 252] An oligomeric compound according to aspect 251, wherein said bicyclic sugar moiety is cEt.
[Aspect 253] An oligomeric compound according to any of aspects 247-252, wherein said 2'-substituted furanosyl sugar moiety is selected from 2'-OMe, 2'-MOE, and 2'-F.
[Aspect 254] An oligomeric compound according to any of aspects 243-253, wherein at least one of the ten 5'-most linking groups of said modified oligonucleotide is an internucleoside linking group of Formula XVII.
[Aspect 255] An oligomeric compound according to aspect 254, wherein at least two of the ten 5'-most linking groups of said modified oligonucleotide are internucleoside linking groups of Formula XVII.
[Aspect 256] An oligomeric compound according to aspect 254, wherein at least three of the ten 5'-most linking groups of said modified oligonucleotide are internucleoside linking groups of Formula XVII.
[Aspect 257] An oligomeric compound according to aspect 254, wherein at least four of the ten 5'-most linking groups of said modified oligonucleotide are internucleoside linking groups of Formula XVII.
[Aspect 258] An oligomeric compound according to aspect 254, wherein at least 5 of the ten 5'-most linking groups of said modified oligonucleotide are internucleoside linking groups of Formula XVII.
[Aspect 259] An oligomeric compound according to aspect 254, wherein at least six of the ten 5'-most linking groups of said modified oligonucleotide are internucleoside linking groups of Formula XVII.
[Aspect 260] An oligomeric compound according to aspect 254, wherein the two 5'-most internucleoside linking groups are internucleoside linking groups of formula XVII.
[Aspect 261] The oligomer according to any of aspects 243 to 260, wherein at least one of the ten 3'-most internucleoside linking groups of said modified oligonucleotide is an internucleoside linking group of formula XVII. Compound.
[Aspect 262] The oligomeric compound of aspect 261, wherein at least two of the ten 3'-most internucleoside linking groups of said modified oligonucleotide are internucleoside linking groups of Formula XVII.
[Embodiment 263] An oligomeric compound according to embodiment 261, wherein at least three of the ten 3'-most internucleoside linking groups are internucleoside linking groups of Formula XVII.
[Embodiment 264] An oligomeric compound according to embodiment 261, wherein at least four of the ten 3'-most internucleoside linking groups are internucleoside linking groups of Formula XVII.
[Embodiment 265] An oligomeric compound according to embodiment 261, wherein at least 5 of the ten 3'-most internucleoside linking groups are internucleoside linkages 257 of Formula XVII.
[Aspect 266] An oligomeric compound according to aspect 261, wherein at least six of the ten 3'-most internucleoside linking groups are internucleoside linking groups of Formula XVII.
[Aspect 267] An oligomeric compound according to aspect 261, wherein the two 3'-most internucleoside linking groups of said oligomeric compound are internucleoside linking groups of Formula XVII.
[Aspect 268] An oligomeric compound according to any of aspects 239-249, wherein said modified oligonucleotide comprises at least one block of at least three consecutive internucleoside linking groups of Formula XVII.
[Aspect 269] An oligomeric compound according to any of aspects 239-249, wherein said modified oligonucleotide comprises at least one block of at least four consecutive internucleoside linking groups of Formula XVII.
[Aspect 270] An oligomeric compound according to any of aspects 239-249, wherein said modified oligonucleotide comprises at least one block of at least five consecutive internucleoside linking groups of Formula XVII.
[Aspect 271] An oligomeric compound according to any of aspects 239-249, wherein said modified oligonucleotide comprises at least one block of at least six consecutive internucleoside linking groups of Formula XVII.
[Aspect 272] An oligomeric compound according to any of aspects 268-271, wherein at least one block of consecutive internucleoside linking groups of Formula XVII is at the 5' end of said modified oligonucleotide.
[Aspect 273] An oligomeric compound according to any of aspects 268-271, wherein at least one block of consecutive internucleoside linking groups of Formula XVII is at the 3' end of said modified oligonucleotide.
[Aspect 274] For each internucleoside linking group of Formula XVII of the modified oligonucleotide, R1is H, and T is SO2274. The oligomeric compound according to any of aspects 239-273, which is Me.
[Aspect 275] The internucleoside linkage motif of the modified oligonucleotide is selected from aaaaaasssssssss, sssssaaaaasssss, or sssssssssaaaaaa, wherein each "a" represents an internucleoside linkage of Formula XVII and each "s" is 250. An oligomeric compound according to any of aspects 239-249, wherein each "o" represents a phosphorothioate internucleoside linkage and each "o" represents a phosphodiester internucleoside linkage.
[Aspect 276] An oligomeric compound according to aspect 271, wherein each "a" represents a mesyl phosphoramidate internucleoside linkage.
[Aspect 277] The modified oligonucleotide comprises a deoxy region consisting of 6 to 11 linked nucleosides, each nucleoside of the deoxy region is either a modified nucleoside or a stereocanonical DNA nucleoside, and 139. An oligomeric compound according to any of aspects 1-138, wherein at least 3 consecutive nucleosides are stereocanonical DNA nucleosides and no more than 3 nucleosides of said deoxy region are modified nucleosides.
[Aspect 278] An oligomeric compound according to aspect 277, wherein at least five consecutive nucleosides of said deoxy region are stereocanonical DNA nucleosides.
[Aspect 279] An oligomeric compound according to aspect 277, wherein at least 6 consecutive nucleosides of said deoxy region are stereocanonical DNA nucleosides.
[Aspect 280] An oligomeric compound according to aspect 277, wherein at least seven consecutive nucleosides of said deoxy region are stereocanonical DNA nucleosides.
[Aspect 281] An oligomeric compound according to aspect 277, wherein at least 8 contiguous nucleosides of said deoxy region are stereocanonical DNA nucleosides.
[Aspect 282] An oligomeric compound according to any of aspects 277 to 281, wherein said deoxy region consists of 8-10 linked nucleosides.
[Aspect 283] The oligomeric compound of any of aspects 277-281, wherein said deoxy region consists of 9 linked nucleosides.
[Aspect 284] An oligomeric compound according to any of aspects 277-281, wherein said deoxy region consists of 10 linked nucleosides.
[Aspect 285] The oligomeric compound of any of aspects 277-281, wherein said deoxy region consists of 11 linked nucleosides.
[Aspect 286] An oligomeric compound according to any of aspects 277 to 281, wherein at least six nucleosides of said deoxy region are stereocanonical DNA nucleosides.
[Aspect 287] An oligomeric compound according to any of aspects 277 to 281, wherein at least seven nucleosides of said deoxy region are stereocanonical DNA nucleosides.
[Aspect 288] An oligomeric compound according to any of aspects 277 to 281, wherein at least eight nucleosides of said deoxy region are stereocanonical DNA nucleosides.
[Aspect 289] An oligomeric compound according to any of aspects 277 to 281, wherein at least nine nucleosides of said deoxy region are stereocanonical DNA nucleosides.
[Aspect 290] An oligomeric compound according to any of aspects 277 to 289, wherein exactly two nucleosides of said deoxy region are modified nucleosides.
[Aspect 291] An oligomeric compound according to any of aspects 277 to 290, wherein exactly one nucleoside of said deoxy region is a modified nucleoside.
[Aspect 292] At least one modified nucleoside in the deoxy region is β-D-LNA nucleoside, α-L-LNA nucleoside, ENA nucleoside, cEt nucleoside, 2′-MOE nucleoside, 2′-OMe nucleoside, 2′ 292. An oligomeric compound according to any of aspects 277 to 291, which is a stereocanonically modified nucleoside or bicyclic nucleoside selected from -F nucleosides and 5'-alkyl nucleosides.
[Aspect 293] An oligomeric compound according to any of aspects 277 to 292, wherein at least one modified nucleoside in said deoxy region is a stereononcanonical nucleoside.
[Aspect 294] An oligomeric compound according to aspect 293, wherein said at least one stereononcanonical nucleoside of said deoxy region is a stereononcanonical DNA nucleoside.
[Aspect 295] In Aspect 294, wherein the stereononcanonical DNA nucleoside is selected from stereononcanonical DNA nucleosides having Formula I, Formula II, Formula III, Formula IV, Formula V, Formula VI, and Formula VII. The described oligomeric compound.
[Aspect 296] An oligomeric compound according to aspect 295, wherein said stereononcanonical DNA nucleosides are selected from stereononcanonical DNA nucleosides having Formula V and Formula II.
[Aspect 297] An oligomeric compound according to aspect 296, wherein at least one stereononcanonical nucleoside in said deoxy region is a substituted stereononcanonical nucleoside.
[Aspect 298] In aspect 297, wherein the at least one substituted stereononcanonical nucleoside has a 2' substituent selected from 2'-MOE, 2'-OMe, 2'-F, or 2'-OH. The described oligomeric compound.
[Aspect 299] An oligomeric compound according to any of aspects 277 to 298, wherein the second nucleoside from the 5' end of the deoxy region is a modified nucleoside.
[Aspect 300] An oligomeric compound according to any of aspects 277 to 298, wherein the third nucleoside from the 5' end of the deoxy region is a modified nucleoside.
[Aspect 301] An oligomeric compound according to any of aspects 277 to 298, wherein the fourth nucleoside from the 5' end of the deoxy region is a modified nucleoside.
[Aspect 302] An oligomeric compound according to any of aspects 299-301, wherein said modified nucleoside in said deoxy region is a 2'-OMe nucleoside.
[Aspect 303] An oligomeric compound according to any of aspects 277 to 292, wherein each nucleoside of said deoxy region is a stereocanonical DNA nucleoside.
[Aspect 304] An oligomeric compound according to any of aspects 277 to 303, wherein at least one internucleoside linking group in said deoxy region is an internucleoside linking group of Formula XVII.
[Aspect 305] The internucleoside linking group linking the first and second nucleosides of the deoxy region counted from the 5′ end of the deoxy region is an internucleoside linking group of formula XVII, aspects 277- 304. An oligomeric compound according to any of 304.
[Aspect 306] The internucleoside linking group linking the second and third nucleosides of the deoxy region counted from the 5′ end of the deoxy region is an internucleoside linking group of formula XVII, aspects 277- 305. An oligomeric compound according to any of 305.
[Aspect 307] The internucleoside linking group linking the third and fourth nucleosides of the deoxy region counted from the 5′ end of the deoxy region is an internucleoside linking group of formula XVII, aspects 277- 306. An oligomeric compound according to any of 306.
[Aspect 308] The internucleoside linking group linking the 4th and 5th nucleosides of the deoxy region counted from the 5′ end of the deoxy region is an internucleoside linking group of formula XVII, aspects 277- 307. An oligomeric compound according to any of 307.
Aspect 309 One internucleoside linking group in the deoxy region is a linking group of formula XVII, and the other internucleoside linking groups in the deoxy region are independently from phosphodiester and phosphorothioate internucleoside linking groups 309. An oligomeric compound according to any of aspects 277-308 that is selected.
Aspect 310 Two internucleoside linking groups in the deoxy region are linking groups of formula XVII, and the other internucleoside linking groups in the deoxy region are independently from phosphodiester and phosphorothioate internucleoside linking groups 309. An oligomeric compound according to any of aspects 277-308 that is selected.
Aspect 311 Three internucleoside linking groups in the deoxy region are linking groups of Formula XVII, and the other internucleoside linking groups in the deoxy region are independently from phosphodiester and phosphorothioate internucleoside linking groups 309. An oligomeric compound according to any of aspects 277-308 that is selected.
[Embodiment 312] Embodiment wherein the four internucleoside linking groups in the deoxy region are linking groups of Formula XVII, and the other internucleoside linking groups in the deoxy region are each phosphodiester or phosphorothioate internucleoside linking groups. 277-308.
[Aspect 313] The internucleoside linking groups of formula XVII are the first and second, the second and third, the third and fourth, and/or 313. An oligomeric compound according to any of aspects 309-312, wherein the 4th and 5th nucleosides are linked.
[Aspect 314] The oligomeric compound of any of aspects 277-313, wherein said deoxy region comprises at least one region having structure A, B, C, D, E, or P.
[Aspect 315] The oligomeric compound of aspect 314, wherein said region having structure A, B, C, D, or E is at the 3' end of said deoxy region.
[Aspect 316] The oligomeric compound of aspect 314, wherein said region having structure A, B, C, D, E, or P is at the 5' end of said deoxy region.
[Aspect 317] The deoxy region is represented by the formula (Ng1)L1(Ng2)L2(Ng3)L3where each Ngis a nucleoside, each L is an internucleoside linking group, and L1, and L2is a phosphodiester internucleoside linking group, a phosphorothioate internucleoside linking group, or an internucleoside linking group of Formula XVII;
In the formula, L3is absent or is a phosphodiester internucleoside linking group, a phosphorothioate internucleoside linking group, or an internucleoside linking group of Formula XVII;
In the formula, L1, L2, and L3is an internucleoside linking group of formula XVII, and L1, L2, and L3is a phosphorothioate or phosphodiester internucleoside linking group;
independently for each internucleoside linking group of said modified oligonucleotide having formula XVII,
X is selected from O or S;
R.1but H, C1~C6alkyl, and substituted C1~C6selected from alkyl,
T is SO2R.2, C(=O)R3, and P(=O)R4R.5is selected from, where:
R.2is aryl, substituted aryl, heterocycle, substituted heterocycle, heteroaromatic ring, substituted heteroaromatic ring, diazole, substituted diazole, C1~C6Alkoxy, C1~C6alkyl, C1~C6alkenyl, C1~C6alkynyl, substituted C1~C6alkyl, substituted C1~C6alkenyl-substituted C1~C6selected from alkynyl and conjugate groups;
R.3is aryl, substituted aryl, CH3, N(CH3)2, OCH3, and a conjugate,
R.4but OCH3, OH, C1~C6alkyl, substituted C1~C6selected from alkyl, and conjugates;
R.5but OCH3, OH, C1~C6alkyl, and substituted C1~C6selected from alkyl,
An oligomeric compound according to any of aspects 277-316.
[Aspect 318] The formula (Ng1)L1(Ng2)L2(Ng3)L3318. The oligomeric compound of aspect 317, wherein said region having a is at the 3' end of said deoxy region.
[Aspect 319] The formula (Ng1)L1(Ng2)L2(Ng3)L3318. The oligomeric compound of aspect 317, wherein said region having a is at the 5' end of said deoxy region.
[Aspect 320] For each internucleoside linkage of Formula XVII, R1is H, and T is SO2319. The oligomeric compound according to any of aspects 304-319, which is Me.
[Aspect 321] The deoxy region comprises a 5′ region consisting of 1 to 6 linked 5′ region nucleosides on the 5′ side and a 3′ region consisting of 1 to 6 linked 3′ region nucleosides on the 3′ side. the 3′ regions are flanking,
the 3'-most nucleoside of said 5' region comprises a modified sugar moiety;
the 5'-most nucleoside of said 3' region comprises a modified sugar moiety;
An oligomeric compound according to any of aspects 277-320.
[Aspect 322] The deoxy region consists of 7 to 11 linked nucleosides and has the following formula:
(Nd1)L1(Nd2)L2(Nd3)L3(Nd4)L4[(Nd)L5]q,
In the formula, Nd1, Nd2, Nd3, Nd4but independently
selected from stereocanonical DNA nucleosides, stereononcanonical DNA nucleosides, or 2'-substituted nucleosides, with the proviso that Nd1, Nd2, Nd3, or Nd4provided that no more than one of the are 2'-substituted nucleosides,
each Ndis independently selected from stereocanonical DNA nucleosides and stereononcanonical DNA nucleosides;
q is 3 to 8,
L.1, L2, L3, L4, and each L5is an internucleoside linkage,
L.1, L2, L3, L4are internucleoside linkages of formula XVII,
322. An oligomeric compound according to aspect 321.
[Aspect 323] Nd1, Nd2, Nd3, or Nd4323. An oligomeric compound according to aspect 322, wherein one of is a 2'-substituted nucleoside.
Aspect 324. An oligomeric compound according to aspect 323, wherein said 2'-substituted nucleoside is a 2'-OMe nucleoside.
Aspect 325. An oligomeric compound according to aspect 324, wherein said 2'-OMe nucleoside is a stereocanonical 2'-OMe nucleoside.
[Aspect 326] The 2′-substituted nucleoside is Nd2326. The oligomeric compound according to any of aspects 322-325, which is
[Aspect 327] Nd1, Nd2, Nd3, Nd4and each Nd323. An oligomeric compound according to aspect 322, wherein is a DNA nucleoside.
[Aspect 328] An oligomeric compound according to aspect 327, wherein each DNA nucleoside is a stereocanonical DNA nucleoside.
[Aspect 329] L1and L2is an internucleoside linkage of formula XVII. An oligomeric compound according to any of aspects 322-328.
[Aspect 330] L2and L3is an internucleoside linkage of formula XVII. An oligomeric compound according to any of aspects 322-328.
[Aspect 331] L3and L4is an internucleoside linkage of formula XVII. An oligomeric compound according to any of aspects 322-328.
[Aspect 332] L1, L2, and L3is an internucleoside linkage of formula XVII. An oligomeric compound according to any of aspects 322-328.
[Aspect 333] L2, L3, and L4is an internucleoside linkage of formula XVII. An oligomeric compound according to any of aspects 322-328.
[Aspect 334] L1, L2, L3, and L4is an internucleoside linkage of formula XVII. An oligomeric compound according to any of aspects 322-328.
[Aspect 335] Each L5is a phosphorothioate internucleoside linkage.
[Aspect 336] An oligomeric compound according to aspects 322-335, wherein each internucleoside linkage that is not an internucleoside linkage of Formula XVII is a phosphorothioate internucleoside linkage.
[Aspect 337] For each internucleoside linkage of Formula XVII, R1is H, and T is SO2337. The oligomeric compound according to any of aspects 322-336, which is Me.
[Aspect 338] An oligomeric compound according to any of aspects 321-337, wherein said 5' region consists of 2-5 linked nucleosides.
[Embodiment 339] An oligomeric compound according to Embodiment 338, wherein said 5' region consists of three linked nucleosides.
[Embodiment 340] An oligomeric compound according to embodiment 338, wherein said 5' region consists of 5 linked nucleosides.
[Aspect 341] An oligomeric compound according to any of aspects 321 to 340, wherein each nucleoside in the 5' region is a modified nucleoside.
[Aspect 342] An oligomeric compound according to any of aspects 321-341, wherein each nucleoside in the 5' region is a modified nucleoside comprising a modified sugar.
[Embodiment 343] An oligomeric compound according to any of embodiments 321-342, wherein at least one nucleoside of said 5' region comprises a 2'-substituted furanosyl sugar moiety.
[Embodiment 344] An oligomeric compound according to any of embodiments 321-343, wherein each nucleoside of said 5' region comprises a 2'-substituted furanosyl sugar moiety.
[Embodiment 345] Embodiments 321-344, wherein each 2'-substituted furanosyl sugar moiety in said 5' region has a 2' substituent selected from 2'-MOE, 2'-OMe, and 2'-NMA. Oligomeric compound according to any one of
[Embodiment 346] The oligomeric compound of any of embodiments 321-343 or 345, wherein at least one nucleoside of said 5' region comprises a bicyclic furanosyl sugar moiety.
[Embodiment 347] The oligomeric compound of any of embodiments 321-343 or 345-346, wherein each nucleoside in said 5' region comprises a bicyclic furanosyl sugar moiety.
[Aspect 348] An oligomeric compound according to aspects 346 or 347, wherein each bicyclic sugar moiety in the 5' region is selected from among cEt, LNA, and ENA.
[Aspect 349] An oligomeric compound according to aspect 348, wherein each bicyclic sugar moiety in the 5' region is a cEt sugar moiety.
[Aspect 350] An oligomeric compound according to any of aspects 321 to 349, wherein at least one nucleoside of said 5' region is a stereocanonical DNA nucleoside.
[Aspect 351] An oligomeric compound according to any of aspects 321 to 350, wherein at least one nucleoside in the 5' region is a stereononcanonical nucleoside.
[Aspect 352] Aspects 321 to 351, wherein each nucleobase of the 5' region is independently selected from among thymine, uracil, guanine, cytosine, 5-methylcytosine, and adenine. oligomeric compounds.
[Aspect 353] An oligomeric compound according to any of aspects 321-352, wherein said 3' region consists of 2-5 linked nucleosides.
[Embodiment 354] An oligomeric compound according to Embodiment 353, wherein said 3' region consists of three linked nucleosides.
Aspect 355. An oligomeric compound according to aspect 353, wherein said 3' region consists of 5 linked nucleosides.
[Aspect 356] An oligomeric compound according to any of aspects 321-355, wherein each nucleoside in the 3' region is a modified nucleoside.
[Embodiment 357] An oligomeric compound according to any of embodiments 321-356, wherein each nucleoside in the 3' region is a modified nucleoside comprising a modified sugar.
[Embodiment 358] An oligomeric compound according to any of embodiments 321-356, wherein at least one nucleoside of said 3' region comprises a 2'-substituted furanosyl sugar moiety.
[Embodiment 359] The oligomeric compound of any of embodiments 321-358, wherein each nucleoside of said 3' region comprises a 2'-substituted furanosyl sugar moiety.
[Aspect 360] Aspects 321-359, wherein each 2′-substituted furanosyl sugar moiety in said 3′ region has a 2′ substituent selected from 2′-MOE, 2′-OMe, and 2′-NMA. Oligomeric compound according to any one of
[Embodiment 361] The oligomeric compound of any of embodiments 321-358 or 360, wherein at least one nucleoside of said 3' region comprises a bicyclic furanosyl sugar moiety.
[Embodiment 362] The oligomeric compound of any of embodiments 321-357 or 361, wherein each nucleoside in said 3' region comprises a bicyclic furanosyl sugar moiety.
[Aspect 363] An oligomeric compound according to aspects 361 or 362, wherein each bicyclic sugar moiety in the 3' region is selected from among cEt, LNA, and ENA.
[Aspect 364] An oligomeric compound according to aspect 363, wherein each bicyclic sugar moiety in the 3' region is a cEt sugar moiety.
[Aspect 365] An oligomeric compound according to any of aspects 321 to 364, wherein at least one nucleoside of said 3' region is a stereocanonical DNA nucleoside.
[Aspect 366] An oligomeric compound according to any of aspects 321 to 365, wherein at least one nucleoside in the 3' region is a stereononcanonical nucleoside.
[Aspect 367] Aspects 321 to 366, wherein each nucleobase of the 3' region is independently selected from among thymine, uracil, guanine, cytosine, 5-methylcytosine, and adenine. oligomeric compounds.
[Aspect 368] An oligomeric compound according to any of aspects 321 to 367, wherein said oligomeric compound is a gapmer.
[Aspect 369] The modified oligonucleotide has a sugar motif selected from kkkddddddddddkkkk and kkkdyddddddddkkkk, wherein each "k" represents a cEt sugar moiety and "y" represents a 2'-OMe sugar moiety. 369. An oligomeric compound according to any of aspects 321-368, wherein each 'd' represents a β-D-2'-deoxyribosyl sugar moiety.
[Aspect 370] The modified oligonucleotide is sssasssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssss ssssssaa, sssssssssssaas, sssssssssssaass, sssssssssaasss, sssssssssaasssss, a assssssssssss, aaaaaaaaaaaaaaaaa, ssaaaaaaaaaaaaaass, ssaaaaaaaaaaassss, sssaaaaaaaaaaassss, aassssssssssaaa, sssaaaasssssssssssssssssssssssssssssssss aaaassssssss, ssaaaassssssssss, ssaaaaasssssssss, ssaaaaassssssss, ssaaaaasssssss, ssaaaaaaaassssss, ssaaaaaaaassssss, ssaaaaaaaasssss, ssssss ssssaaaass, sssssssssaaaaass, sssssssaaaaass, sssssssaaaaass, ssssssaaaaaaaass, sssssaaaaaaaass, ssssaaaaaaaaaaass, sssaaaaaaaaaaass, ssasasasasass, sssasasas asasss, ooosssssssssoo, soossssssssssos, aoosssssssssoo sssoa, aossaasssssssoa, aooaaaasssssaoa, aoossssssaaaaa, sssssaaassssssssssssssssaaasssssssssssssssaaassssssssssssssaaassssssssssssssaa asss, sssaaaasssssss, sssssaaaaassssss, ssssssaaaaasssss, sssssssaaaaassss, ssssssssaaaasss, sssaasssssssaass, sssaasssssaasss, sssaassssaassss, sssa asssaasssss, sssaassaassssss, sssaasaassssssss, ssaasssssssaass, ssssaassssssaass, sssssaasssssaass, ssssssaasssaass, sssssssaasssaass, ssssssssaasaass, s sssaasssaassss, sssssaasaasssss, sssssssssssssss, aaasssssssssssss, aaasssssssssssaa, aaaaaasssssssssss, aooooosaasssssssssssoaaa, aooooossssssssss oaaa, soooaaaasssssssssss, soooosaassssssssooss, soooossaasssssssooss, soooosssssssaassooss, sssaaaaassssssss, sssssaaaaassss, or sssssssssaaaa has an internucleoside linkage motif selected from a, wherein each "a" represents an internucleoside linkage of Formula XVII and each "s" is 369. An oligomeric compound according to any of aspects 321-369, wherein each "o" represents a phosphorothioate internucleoside linkage and each "o" represents a phosphodiester internucleoside linkage.
[Aspect 371] The modified oligonucleotide is sssaaaassssssss, sssaaassssssss, ssssaaassssssss, ssssaassssssaass, sssaassssssssss, ssssaasssssssss, sssssaassssssss, or sssss having an internucleoside binding motif selected from ssssaassss, wherein each "a" is of formula XVII 371. An oligomeric compound according to aspect 370, wherein each "s" represents an internucleoside linkage, each "s" representing a phosphorothioate internucleoside linkage and each "o" representing a phosphodiester internucleoside linkage.
[Aspect 372] An oligomeric compound according to aspects 370 or 371, wherein each "a" represents a mesylphosphoroamidate internucleoside linkage.
[Aspect 373] An oligomeric compound according to any of aspects 1-138, wherein said modified oligonucleotide is a CRISPR compound.
[Aspect 374] An oligomeric compound according to aspect 373, wherein said CRISPR compound consists of 20-50 or 29-32 linked nucleosides.
[Aspect 375] An oligomeric compound according to any of aspects 90-374, wherein each X is O.
[Aspect 376] An oligomeric compound according to any of aspects 90-374, wherein each X is S.
[Aspect 377] At least one R1is H. The oligomeric compound according to any of aspects 90-376, wherein is H.
[Aspect 378] At least one R1but C1~C6377. The oligomeric compound according to any of aspects 90-376, which is alkyl.
[Aspect 379] The at least one R1379. An oligomeric compound according to aspect 378, wherein is methyl.
[Aspect 380] At least one R1is replaced by C1~C6377. The oligomeric compound according to any of aspects 90-376, which is alkyl.
[Aspect 381] An oligomeric compound according to any of aspects 90-380, wherein at least one T comprises a conjugate group.
[Aspect 382] An oligomeric compound according to aspect 381, wherein said conjugate group comprises a cell-targeting moiety.
[Aspect 383] An oligomeric compound according to aspect 381, wherein said conjugate group comprises a carbohydrate or carbohydrate cluster.
[Aspect 384] An oligomeric compound according to any of aspects 381-383, wherein said conjugate group comprises at least one GalNAc.
[Aspect 385] The conjugate group is C10~C20382. An oligomeric compound according to aspect 381, comprising an alkyl chain.
[Aspect 386] The conjugate group is C16386. The oligomeric compound according to aspect 385, comprising an alkyl.
[Aspect 387] An oligomeric compound according to any of aspects 90-386, wherein at least one T does not comprise a conjugate group.
[Aspect 388] An oligomeric compound according to any of aspects 90-380, wherein each T does not comprise a conjugate group.
[Aspect 389] At least one T is2R.2389. The oligomeric compound according to any of aspects 90-388, wherein the oligomeric compound is
[Aspect 390] R2389. An oligomeric compound according to aspect 389, wherein is aryl.
[Aspect 391] R2389. An oligomeric compound according to aspect 389, wherein is substituted aryl.
[Aspect 392] R2389. An oligomeric compound according to aspect 389, wherein is heterocyclic.
[Aspect 393] R2389. An oligomeric compound according to aspect 389, wherein is a substituted heterocycle.
[Aspect 394] R2389. An oligomeric compound according to aspect 389, wherein is a heteroaromatic ring.
[Aspect 395] R2389. An oligomeric compound according to aspect 389, wherein is a substituted heteroaromatic ring.
[Aspect 396] R2389. An oligomeric compound according to aspect 389, wherein is a diazole.
[Aspect 397] R2389. An oligomeric compound according to aspect 389, wherein is a substituted diazole.
[Aspect 398] R2389. The oligomeric compound according to aspect 389, wherein is an amine.
[Aspect 399] R2389. An oligomeric compound according to aspect 389, wherein is a substituted amine.
[Aspect 400] R2but C1~C6Alkoxy, C1~C6alkenyl, or C1~C6389. The oligomeric compound according to aspect 389, which is alkynyl.
[Aspect 401] R2but C1~C20, C1~C6, C2~C20, C2~C6, or C10~C20390. The oligomeric compound according to aspect 389, which is alkyl.
[Aspect 402] R2is replaced by C1~C20, C1~C6, C2~C20, C2~C6, or C10~C20390. The oligomeric compound according to aspect 389, which is alkyl.
[Aspect 403] R2389. The oligomeric compound according to aspect 389, wherein comprises a carbohydrate or carbohydrate cluster.
[Aspect 404] R2389. The oligomeric compound according to aspect 389, wherein comprises at least one GalNAc.
[Aspect 405] An oligomeric compound according to aspect 389, wherein T is
[Aspect 406] An oligomeric compound according to aspect 389, wherein T is
[Aspect 407] An oligomeric compound according to aspect 389, wherein T is
[Aspect 408] An oligomeric compound according to aspect 389, wherein T is
[Aspect 409] An oligomeric compound according to aspect 389, wherein T is
[Aspect 410] An oligomeric compound according to aspect 389, wherein T is
[Aspect 411] An oligomeric compound according to aspect 389, wherein T is
[Aspect 412] An oligomeric compound according to aspect 389, wherein T is
[Aspect 413] An oligomeric compound according to aspect 389, wherein T is
[Aspect 414] T is
389. An oligomeric compound according to aspect 389, wherein n is 2-20.
[Aspect 415] An oligomeric compound according to aspect 414, wherein n is 15.
[Aspect 416] At least one T is C(=O)R3416. The oligomeric compound according to any of aspects 90-415, which is
[Aspect 417] R3417. An oligomeric compound according to aspect 416, wherein is aryl.
[Aspect 418] R3417. An oligomeric compound according to aspect 416, wherein is substituted aryl.
[Aspect 419] R3is CH3417. The oligomeric compound according to aspect 416, which is
[Aspect 420] R3is N(CH3)2417. The oligomeric compound according to aspect 416, which is
[Aspect 421] R3but OCH3417. The oligomeric compound according to aspect 416, which is
[Aspect 422] R3but C1~C6The oligomeric compound according to aspect 416, which is alkoxy.
[Aspect 423] R3but C1~C20, C1~C6, C2~C20, C2~C6, or C10~C20The oligomeric compound according to aspect 416, which is alkyl.
[Aspect 424] R3is replaced by C1~C20, C1~C6, C2~C20, C2~C6, or C10~C20The oligomeric compound according to aspect 416, which is alkyl.
[Aspect 425] R3comprises a carbohydrate or carbohydrate cluster.
[Aspect 426] R23comprises at least one GalNAc.
[Aspect 427] An oligomeric compound according to aspect 416, wherein T is
[Aspect 428] An oligomeric compound according to aspect 416, wherein T is
[Aspect 429] An oligomeric compound according to aspect 416, wherein T is
[Aspect 430] An oligomeric compound according to aspect 416, wherein T is
[Aspect 431] T is
417. An oligomeric compound according to aspect 416, wherein n is 2-20.
[Aspect 432] An oligomeric compound according to aspect 426, wherein n is 15.
[Aspect 433] At least one T is P(=O)R4R.5428. The oligomeric compound according to any of aspects 90-427, which is
[Aspect 434] R4but OCH3434. The oligomeric compound according to aspect 433, which is
[Aspect 435] R4434. An oligomeric compound according to aspect 433, wherein is OH.
[Aspect 436] R4but C1~C6434. The oligomeric compound according to aspect 433, which is alkyl.
[Aspect 437] R4is replaced by C1~C6434. The oligomeric compound according to aspect 433, which is alkyl.
[Aspect 438] R4but C1~C20, C1~C6, C2~C20, C2~C6, or C10~C20434. The oligomeric compound according to aspect 433, which is alkyl.
[Aspect 439] R4is replaced by C1~C20, C1~C6, C2~C20, C2~C6, or C10~C20434. The oligomeric compound according to aspect 433, which is alkyl.
[Aspect 440] R4comprises a carbohydrate or carbohydrate cluster.
[Aspect 441] R4comprises at least one GalNAc.
[Aspect 442] R5but OCH3The oligomeric compound according to any of aspects 433-441, which is
[Aspect 443] R5The oligomeric compound according to any of aspects 433-441, wherein is OH.
[Aspect 444] R5but C1~C6The oligomeric compound according to any of aspects 433-441, which is alkyl.
[Aspect 445] R5is replaced by C1~C6The oligomeric compound according to any of aspects 433-441, which is alkyl.
[Aspect 446] An oligomeric compound according to aspect 433, wherein T is
[Aspect 447] An oligomeric compound according to aspect 433, wherein T is
[Aspect 448] T is
434. An oligomeric compound according to aspect 433, wherein n is 2-20.
[Aspect 449] An oligomeric compound according to aspect 448, wherein n is 15.
[Aspect 450] An antisense agent comprising a modified oligonucleotide consisting of 12 to 50 linked nucleosides linked via internucleoside linking groups, wherein at least one internucleoside linking group is a phosphodiester or phosphorothioate nucleoside internucleoside linking groups, at least one of said internucleoside linking groups having the formula XX;
wherein, independently for each internucleoside linking group of said modified oligonucleotide having formula XX, X is selected from O or S;
the antisense agent.
[Aspect 451] An antisense agent comprising a modified oligonucleotide, wherein the 5' end of the modified oligonucleotide has structure F,
During the ceremony,
p is 0 to 6,
q is 0 to 6;
T is OH or a conjugate group,
each Bx is an independently selected heterocyclic base moiety;
each X is independently selected from OH or SH;
each Z is independently O, S, or NSO2selected from Me,
Each J of the same furanosyl sugar moietyR.and for G, JR.and G is JR.to form a bridge from G, or from JR.is H and G is OH, halogen, or O-[C(R6)(R7)]n-[(C=O)m-XG.]j-R8is either selected from
In the formula, each JR.The bridge from G to -CH(CH3)-O- or -(CH2)khaving a formula independently selected from -O-, wherein k is from 1 to 3;
Each R6and R7is independently H, halogen, C1~C6alkyl, or substituted C1~C6is an alkyl,
Each XG.is O, S, or N (E1) and
R.8is H, halogen, C1~C6alkyl, substituted C1~C6alkyl, C2~C6alkenyl, substituted C2~C6alkenyl, C2~C6alkynyl, substituted C2~C6alkynyl, or N(E2) (E3) and
E.1, E2, and E3are each independently H, C1~C6alkyl, or substituted C1~C6is an alkyl,
n is 1 to 6,
m is 0 or 1,
j is 0 or 1,
Each substituted group is halogen, OJ1, N(J1) (J2), = NJ1, SJ1, N3, CN, OC (=X2)J1, OC(=X2)N(J1) (J2), and C (=Q2)N(J1) (J2), including one or more optionally protected substituents independently selected from
Q.2is O, S, or NJ3and
Each J1, J2, and J3is independently H or C1~C6is an alkyl
the antisense agent.
[Aspect 452] An antisense agent comprising a modified oligonucleotide, wherein the 3' end of the modified oligonucleotide has structure G,
During the ceremony,
p is 0 to 6,
q is 1 to 6,
T is OH or a conjugate group,
each Bx is an independently selected heterocyclic base moiety;
each X is independently selected from OH or SH;
each Z is independently O, S, or NSO2selected from Me,
Each J of the same furanosyl sugar moietyR.and for G, JR.and G is JR.to form a bridge from G, or from JR.is H and G is OH, halogen, or O-[C(R6)(R7)]n-[(C=O)m-XG.]j-R8is either selected from
In the formula, each JR.The bridge from G to -CH(CH3)-O- or -(CH2)khaving a formula independently selected from -O-, wherein k is from 1 to 3;
Each R6and R7is independently H, halogen, C1~C6alkyl, or substituted C1~C6is an alkyl,
Each XG.is O, S, or N (E1) and
R.8is H, halogen, C1~C6alkyl, substituted C1~C6alkyl, C2~C6alkenyl, substituted C2~C6alkenyl, C2~C6alkynyl, substituted C2~C6alkynyl, or N(E2) (E3) and
E.1, E2, and E3are each independently H, C1~C6alkyl, or substituted C1~C6is an alkyl,
n is 1 to 6,
m is 0 or 1,
j is 0 or 1,
Each substituted group is halogen, OJ1, N(J1) (J2), = NJ1, SJ1, N3, CN, OC (=X2)J1, OC(=X2)N(J1) (J2), and C (=Q2)N(J1) (J2), including one or more optionally protected substituents independently selected from
Q.2is O, S, or NJ3and
Each J1, J2, and J3is independently H or C1~C6is an alkyl
the antisense agent.
[Aspect 453] The antisense agent of aspect 451 or 452, wherein the sum of p+q is selected from 2, 3, 4, or 5.
[Aspect 454] An antisense agent comprising a modified oligonucleotide, wherein the 5' end of the modified oligonucleotide has structure H,
During the ceremony,
p is 0 to 5,
q is 1 to 4,
T is OH or a conjugate group,
each Bx is an independently selected heterocyclic base moiety;
each X is independently selected from OH or SH;
each Z is independently O, S, or NSO2selected from Me,
Each J of the same furanosyl sugar moietyR.and for G, JR.and G is JR.to form a bridge from G, or from JR.is H and G is OH, halogen, or O-[C(R6)(R7)]n-[(C=O)m-XG.]j-R8is either selected from
In the formula, each JR.The bridge from G to -CH(CH3)-O- or -(CH2)khaving a formula independently selected from -O-, wherein k is from 1 to 3;
Each R6and R7is independently H, halogen, C1~C6alkyl, or substituted C1~C6is an alkyl,
Each XG.is O, S, or N (E1) and
R.8is H, halogen, C1~C6alkyl, substituted C1~C6alkyl, C2~C6alkenyl, substituted C2~C6alkenyl, C2~C6alkynyl, substituted C2~C6alkynyl, or N(E2) (E3) and
E.1, E2, and E3are each independently H, C1~C6alkyl, or substituted C1~C6is an alkyl,
n is 1 to 6,
m is 0 or 1,
j is 0 or 1,
Each substituted group is halogen, OJ1, N(J1) (J2), = NJ1, SJ1, N3, CN, OC (=X2)J1, OC(=X2)N(J1) (J2), and C (=Q2)N(J1) (J2), including one or more optionally protected substituents independently selected from
Q.2is O, S, or NJ3and
Each J1, J2, and J3is independently H or C1~C6is an alkyl
the antisense agent.
[Aspect 455] An antisense agent comprising a modified oligonucleotide, wherein the 5' end of the modified oligonucleotide has structure I,
During the ceremony,
p is 0 to 5,
q is 1 to 4,
T is OH or a conjugate group,
each Bx is an independently selected heterocyclic base moiety;
each X is independently selected from OH or SH;
each Z is independently O, S, or NSO2selected from Me,
Each Rqis H or exactly one Rqis OMe and the other Rqis H,
Each J of the same furanosyl sugar moietyR.and for G, JR.and G is JR.to form a bridge from G, or from JR.is H and G is OH, halogen, or O-[C(R6)(R7)]n-[(C=O)m-XG.]j-R8is either selected from
In the formula, each JR.The bridge from G to -CH(CH3)-O- or -(CH2)khaving a formula independently selected from -O-, wherein k is from 1 to 3;
Each R6and R7is independently H, halogen, C1~C6alkyl, or substituted C1~C6is an alkyl,
Each XG.is O, S, or N (E1) and
R.8is H, halogen, C1~C6alkyl, substituted C1~C6alkyl, C2~C6alkenyl, substituted C2~C6alkenyl, C2~C6alkynyl, substituted C2~C6Alkini
or N(E2) (E3) and
E.1, E2, and E3are each independently H, C1~C6alkyl, or substituted C1~C6is an alkyl,
n is 1 to 6,
m is 0 or 1,
j is 0 or 1,
Each substituted group is halogen, OJ1, N(J1) (J2), = NJ1, SJ1, N3, CN, OC (=X2)J1, OC(=X2)N(J1) (J2), and C (=Q2)N(J1) (J2), including one or more optionally protected substituents independently selected from
Q.2is O, S, or NJ3and
Each J1, J2, and J3is independently H or C1~C6is an alkyl
the antisense agent.
[Aspect 456] exactly one Rqis -OMe.
[Aspect 457] The antisense agent of any of aspects 454-456, wherein the sum of p+q is 2, 3, or 4.
[Aspect 458] An antisense agent comprising a modified oligonucleotide, wherein the 3' end of the modified oligonucleotide has structure J,
During the ceremony,
p is 0 to 6,
T is OH or a conjugate group,
each Bx is an independently selected heterocyclic base moiety;
each X is independently selected from OH or SH;
each Z is independently O, S, or NSO2selected from Me,
Each J of the same furanosyl sugar moietyR.and for G, JR.and G is JR.form a bridge from G to
or JR.is H and G is OH, halogen, or O-[C(R6)(R7)]n-[(C=O)m-XG.]j-R8is either selected from
In the formula, each JR.The bridge from G to -CH(CH3)-O- or -(CH2)khaving a formula independently selected from -O-, wherein k is from 1 to 3;
Each R6and R7is independently H, halogen, C1~C6alkyl, or substituted C1~C6is an alkyl,
Each XG.is O, S, or N (E1) and
R.8is H, halogen, C1~C6alkyl, substituted C1~C6alkyl, C2~C6alkenyl, substituted C2~C6alkenyl, C2~C6alkynyl, substituted C2~C6alkynyl, or N(E2) (E3) and
E.1, E2, and E3are each independently H, C1~C6alkyl, or substituted C1~C6is an alkyl,
n is 1 to 6,
m is 0 or 1,
j is 0 or 1,
Each substituted group is halogen, OJ1, N(J1) (J2), = NJ1, SJ1, N3, CN, OC (=X2)J1, OC(=X2)N(J1) (J2), and C (=Q2)N(J1) (J2), including one or more optionally protected substituents independently selected from
Q.2is O, S, or NJ3and
Each J1, J2, and J3is independently H or C1~C6is an alkyl
the antisense agent.
[Aspect 459] The antisense agent of aspect 458, wherein p is 2, 3, or 4.
[Aspect 460] Each JR.is H, and each G is OCH2CH2OCH3459. The antisense agent of any of aspects 451-459, which is
[Aspect 461] Each JR.is H, and each G is OCH3459. The antisense agent of any of aspects 451-459, which is
[Aspect 462] Each JR.and G is JR.459. The antisense agent of any of aspects 451-459, which forms a to G bridge.
[Aspect 463] JR.to G bridges are of the formula —CH(CH3)—O—.
[Aspect 464] The antisense agent of aspect 450, wherein said antisense agent is an RNAi agent.
[Aspect 465] The RNAi agent of aspect 464, wherein said RNAi agent is a single-stranded RNAi agent comprising an RNAi antisense modified oligonucleotide.
[Aspect 466] The RNAi agent of aspect 464, wherein said RNAi agent is an oligonucleotide duplex comprising an RNAi antisense modified oligonucleotide and an RNAi sense modified oligonucleotide.
[Aspect 467] The 5' end of the RNAi antisense oligonucleotide has structure K,
During the ceremony,
R.P.is a phosphate, a stabilized phosphate group, or a mesyl phosphoramidate,
each Bx is an independently selected heterocyclic base moiety;
each X is independently selected from OH or SH;
each Z is O, S, or NSO2selected from Me,
at least one Z is NSO2is Me,
Each G is independently OH, halogen, or O-[C(R6)(R7)]n-[(C=O)m-XG.]j-R8is selected from
Each R6and R7is independently H, halogen, C1~C6alkyl, or substituted C1~C6is an alkyl,
Each XG.is O, S, or N (E1) and
R.8is H, halogen, C1~C6alkyl, substituted C1~C6alkyl, C2~C6alkenyl, substituted C2~C6alkenyl, C2~C6alkynyl, substituted C2~C6alkynyl, or N(E2) (E3) and
E.1, E2, and E3are each independently H, C1~C6alkyl, or substituted C1~C6is an alkyl,
n is 1 to 6,
m is 0 or 1,
j is 0 or 1,
Each substituted group is halogen, OJ1, N(J1) (J2), = NJ1, SJ1, N3, CN, OC (=X2)J1, OC(=X2)N(J1) (J2), and C (=Q2)N(J1) (J2), including one or more optionally protected substituents independently selected from
Q.2is O, S, or NJ3and
Each J1, J2, and J3is independently H or C1~C6is an alkyl
An RNAi agent according to any of aspects 465-466.
[Aspect 468] The RNAi agent of aspect 467, wherein said stabilizing phosphate group is 5'-vinylphosphonate or 5'-cyclopropylphosphonate.
[Aspect 469] The RNAi agent of aspect 467, wherein said stabilizing phosphate group is a mesyl phosphoramidate.
[Aspect 470] The RNAi agent of any of aspects 467-469, wherein each G in structure K is independently selected from F or OMe.
[Aspect 471] The 3′ end of the RNAi antisense oligonucleotide has structure L,
During the ceremony,
each Bx is an independently selected heterocyclic base moiety;
each X is independently selected from OH or SH;
each Z is O, S, or NSO2selected from Me,
at least one Z is NSO2is Me,
Each G is independently OH, halogen, or O-[C(R6)(R7)]n-[(C=O)m-XG.]j-R8is selected from
Each R6and R7is independently H, halogen, C1~C6alkyl, or substituted C1~C6is an alkyl,
Each XG.is O, S, or N (E1) and
R.8is H, halogen, C1~C6alkyl, substituted C1~C6alkyl, C2~C6alkenyl, substituted C2~C6alkenyl, C2~C6alkynyl, substituted C2~C6alkynyl, or N(E2) (E3) and
E.1, E2, and E3are each independently H, C1~C6alkyl, or substituted C1~C6is an alkyl,
n is 1 to 6,
m is 0 or 1,
j is 0 or 1,
Each substituted group is halogen, OJ1, N(J1) (J2), = NJ1, SJ1, N3, CN, OC (=X2)J1, OC(=X2)N(J1) (J2), and C (=Q2)N(J1) (J2), including one or more optionally protected substituents independently selected from
Q.2is O, S, or NJ3and
Each J1, J2, and J3is independently H or C1~C6Aspect 4, which is alkyl
The RNAi agent according to any one of 65-470.
[Aspect 472] The RNAi agent of aspect 471, wherein each G in structure L of said RNAi antisense oligonucleotide is independently selected from F or OMe.
[Aspect 473] at least one region of the RNAi antisense oligonucleotide has structure M,
During the ceremony,
each Bx is an independently selected heterocyclic base moiety;
each X is independently selected from OH or SH;
Each G is independently OH, halogen, or O-[C(R6)(R7)]n-[(C=O)m-XG.]j-R8is selected from
Each R6and R7is independently H, halogen, C1~C6alkyl, or substituted C1~C6is an alkyl,
Each XG.is O, S, or N (E1) and
R.8is H, halogen, C1~C6alkyl, substituted C1~C6alkyl, C2~C6alkenyl, substituted C2~C6alkenyl, C2~C6alkynyl, substituted C2~C6alkynyl, or N(E2) (E3) and
E.1, E2, and E3are each independently H, C1~C6alkyl, or substituted C1~C6is an alkyl,
n is 1 to 6,
m is 0 or 1,
j is 0 or 1,
Each substituted group is halogen, OJ1, N(J1) (J2), = NJ1, SJ1, N3, CN, OC (=X2)J1, OC(=X2)N(J1) (J2), and C (=Q2)N(J1) (J2), including one or more optionally protected substituents independently selected from
Q.2is O, S, or NJ3and
Each J1, J2, and J3is independently H or C1~C6is an alkyl
An RNAi agent according to any of aspects 465-472.
[Aspect 474] The RNAi agent of aspect 473, wherein each G of structure M in said RNAi antisense oligonucleotide is selected from F or OMe.
[Aspect 475] The RNAi agent of aspect 474, wherein one G is F and the other G is OMe.
[Aspect 476] The 5' end of the RNAi antisense oligonucleotide has the structure N,
During the ceremony,
A is
is selected from
R.A.is OH, OP(=O)OH, OP(=O)SH, a stabilized phosphate group, or mesyl phosphoramidate;
G.A.is H, OH, OMe, MOE, or halogen;
each Bx is an independently selected heterocyclic base moiety;
each X is independently selected from OH or SH;
Each G is independently OH, halogen, or O-[C(R6)(R7)]n-[(C=O)m-XG.]j-R8is selected from
Each R6and R7is independently H, halogen, C1~C6alkyl, or substituted C1~C6is an alkyl,
Each XG.is O, S, or N (E1) and
R.8is H, halogen, C1~C6alkyl, substituted C1~C6alkyl, C2~C6alkenyl, substituted C2~C6alkenyl, C2~C6alkynyl, substituted C2~C6Archi
nil, or N(E2) (E3) and
E.1, E2, and E3are each independently H, C1~C6alkyl, or substituted C1~C6is an alkyl,
n is 1 to 6,
m is 0 or 1,
j is 0 or 1,
Each substituted group is halogen, OJ1, N(J1) (J2), = NJ1, SJ1, N3, CN, OC (=X2)J1, OC(=X2)N(J1) (J2), and C (=Q2)N(J1) (J2), including one or more optionally protected substituents independently selected from
Q.2is O, S, or NJ3and
Each J1, J2, and J3is independently H or C1~C6is an alkyl
The RNAi agent of any of aspects 465-466 or 471-475.
[Aspect 477] The RNAi agent of aspect 477, wherein each G in structure N of said RNAi antisense oligonucleotide is selected from F or OMe.
[Aspect 478] the 3' end of the RNAi antisense oligonucleotide has structure O,
During the ceremony,
T.A.but,
is selected from
R.A.is OH, OP(=O)OH, OP(=O)SH, or a stabilized phosphate group;
G.A.is H, OH, OMe, MOE, or halogen;
each Bx is an independently selected heterocyclic base moiety;
each X is independently selected from OH or SH;
each Z is O, S, or NSO2selected from Me,
at least one Z is NSO2is Me,
Each G is independently OH, halogen, or O-[C(R6)(R7)]n-[(C=O)m-XG.]j-R8is selected from
Each R6and R7is independently H, halogen, C1~C6alkyl, or substituted C1~C6is an alkyl,
Each XG.is O, S, or N (E1) and
R.8is H, halogen, C1~C6alkyl, substituted C1~C6alkyl, C2~C6alkenyl, substituted C2~C6alkenyl, C2~C6alkynyl, substituted C2~C6alkynyl, or N(E2) (E3) and
E.1, E2, and E3are each independently H, C1~C6alkyl, or substituted C1~C6is an alkyl,
n is 1 to 6,
m is 0 or 1,
j is 0 or 1,
Each substituted group is halogen, OJ1, N(J1) (J2), = NJ1, SJ1, N3, CN, OC (=X2)J1, OC(=X2)N(J1) (J2), and C (=Q2)N(J1) (J2), including one or more optionally protected substituents independently selected from
Q.2is O, S, or NJ3and
Each J1, J2, and J3is independently H or C1~C6is an alkyl
The RNAi agent of any of aspects 465-469 or 473-477.
[Aspect 479] The RNAi agent of aspect 478, wherein each G in structure O of said RNAi antisense oligonucleotide is selected from F or OMe.
[Aspect 480] The 5′ end of the RNAi sense oligonucleotide has structure K,
During the ceremony,
R.P.is a phosphate or stabilized phosphate group,
each Bx is an independently selected heterocyclic base moiety;
each X is independently selected from OH or SH;
each Z is O, S, or NSO2selected from Me,
at least one Z is NSO2is Me,
Each G is independently OH, halogen, or O-[C(R6)(R7)]n-[(C=O)m-XG.]j-R8is selected from
Each R6and R7is independently H, halogen, C1~C6alkyl, or substituted C1~C6is an alkyl,
Each XG.is O, S, or N (E1) and
R.8is H, halogen, C1~C6alkyl, substituted C1~C6alkyl, C2~C6alkenyl, substituted C2~C6alkenyl, C2~C6alkynyl, substituted C2~C6alkynyl, or N(E2) (E3) and
E.1, E2, and E3are each independently H, C1~C6alkyl, or substituted C1~C6is an alkyl,
n is 1 to 6,
m is 0 or 1,
j is 0 or 1,
Each substituted group is halogen, OJ1, N(J1) (J2), = NJ1, SJ1, N3, CN, OC (=X2)J1, OC(=X2)N(J1) (J2), and C (=Q2)N(J1) (J2), including one or more optionally protected substituents independently selected from
Q.2is O, S, or NJ3and
Each J1, J2, and J3is independently H or C1~C6is an alkyl
An RNAi agent according to aspect 466.
[Aspect 481] The RNAi agent of aspect 480, wherein said stabilizing phosphate group is 5'-vinylphosphonate, 5'-cyclopropylphosphonate, or 5'-mesylphosphoramidate.
[Aspect 482] The RNAi agent of aspects 480 or 481, wherein each G in structure K is independently selected from F or OMe.
[Aspect 483] The 3′ end of the RNAi sense oligonucleotide has structure L,
During the ceremony,
each Bx is an independently selected heterocyclic base moiety;
each X is independently selected from OH or SH;
each Z is O, S, or NSO2selected from Me,
at least one Z is NSO2is Me,
Each G is independently OH, halogen, or O-[C(R6)(R7)]n-[(C=O)m-XG.]j-R8is selected from
Each R6and R7is independently H, halogen, C1~C6alkyl, or substituted C1~C6is an alkyl,
Each XG.is O, S, or N (E1) and
R.8is H, halogen, C1~C6alkyl, substituted C1~C6alkyl, C2~C6alkenyl, substituted C2~C6alkenyl, C2~C6alkynyl, substituted C2~C6alkynyl, or N(E2) (E3) and
E.1, E2, and E3are each independently H, C1~C6alkyl, or substituted C1~C6is an alkyl,
n is 1 to 6,
m is 0 or 1,
j is 0 or 1,
Each substituted group is halogen, OJ1, N(J1) (J2), = NJ1, SJ1, N3, CN, OC (=X2)J1, OC(=X2)N(J1) (J2), and C (=Q2)N(J1) (J2), including one or more optionally protected substituents independently selected from
Q.2is O, S, or NJ3and
Each J1, J2, and J3is independently H or C1~C6is an alkyl
The RNAi agent of any of aspects 466 or 480-482.
[Aspect 484] The RNAi agent of aspect 483, wherein each G in structure L of said RNAi sense oligonucleotide is independently selected from F or OMe.
[Aspect 485] At least one region of the RNAi sense oligonucleotide has structure M,
During the ceremony,
each Bx is an independently selected heterocyclic base moiety;
each X is independently selected from OH or SH;
Each G is independently OH, halogen, or O-[C(R6)(R7)]n-[(C=O)m-XG.]j-R8is selected from
Each R6and R7is independently H, halogen, C1~C6alkyl, or substituted C1~C6is an alkyl,
Each XG.is O, S, or N (E1) and
R.8is H, halogen, C1~C6alkyl, substituted C1~C6alkyl, C2~C6alkenyl, substituted C2~C6alkenyl, C2~C6alkynyl, substituted C2~C6alkynyl, or N(E2) (E3) and
E.1, E2, and E3are each independently H, C1~C6alkyl, or substituted C1~C6is an alkyl,
n is 1 to 6,
m is 0 or 1,
j is 0 or 1,
Each substituted group is halogen, OJ1, N(J1) (J2), = NJ1, SJ1, N3, CN, OC (=X2)J1, OC(=X2)N(J1) (J2), and C (=Q2)N(J1) (J2), including one or more optionally protected substituents independently selected from
Q.2is O, S, or NJ3and
Each J1, J2, and J3is independently H or C1~C6is an alkyl
The RNAi agent of any of aspects 466 or 480-484.
[Aspect 486] The RNAi agent of aspect 485, wherein each G of structure M in said RNAi sense oligonucleotide is selected from F or OMe.
[Aspect 487] The RNAi agent of aspect 486, wherein one G is F and the other G is OMe.
[Aspect 488] the 5' end of the RNAi sense oligonucleotide has the structure N,
During the ceremony,
A is
is selected from
R.A.is OH, OP(=O)OH, OP(=O)SH, a stabilized phosphate group, or mesyl phosphoramidate;
G.A.is H, OH, OMe, MOE, or halogen;
each Bx is an independently selected heterocyclic base moiety;
each X is independently selected from OH or SH;
Each G is independently OH, halogen, or O-[C(R6)(R7)]n-[(C=O)m-XG.]j-R8is selected from
Each R6and R7is independently H, halogen, C1~C6alkyl, or substituted C1~C6is an alkyl,
Each XG.is O, S, or N (E1) and
R.8is H, halogen, C1~C6alkyl, substituted C1~C6alkyl, C2~C6alkenyl, substituted C2~C6alkenyl, C2~C6alkynyl, substituted C2~C6alkynyl, or N(E2) (E3) and
E.1, E2, and E3are each independently H, C1~C6alkyl, or substituted C1~C6is an alkyl,
n is 1 to 6,
m is 0 or 1,
j is 0 or 1,
Each substituted group is halogen, OJ1, N(J1) (J2), = NJ1, SJ1, N3, CN, OC (=X2)J1, OC(=X2)N(J1) (J2), and C (=Q2)N(J1) (J2), including one or more optionally protected substituents independently selected from
Q.2is O, S, or NJ3and
Each J1, J2, and J3is independently H or C1~C6is an alkyl
An RNAi agent according to any of aspects 466 or 483-487.
[Aspect 489] The RNAi agent of aspect 487, wherein each G in structure N of said RNAi sense oligonucleotide is selected from F or OMe.
[Aspect 490] The 3′ end of the RNAi sense oligonucleotide has structure O,
During the ceremony,
T.A.but,
is selected from
R.A.is OH, OP(=O)OH, OP(=O)SH, or a stabilized phosphate group;
G.A.is H, OH, OMe, MOE, or halogen;
each Bx is an independently selected heterocyclic base moiety;
each X is independently selected from OH or SH;
each Z is O, S, or NSO2selected from Me,
at least one Z is NSO2is Me,
Each G is independently OH, halogen, or O-[C(R6)(R7)]n-[(C
= O)m-XG.]j-R8is selected from
Each R6and R7is independently H, halogen, C1~C6alkyl, or substituted C1~C6is an alkyl,
Each XG.is O, S, or N (E1) and
R.8is H, halogen, C1~C6alkyl, substituted C1~C6alkyl, C2~C6alkenyl, substituted C2~C6alkenyl, C2~C6alkynyl, substituted C2~C6alkynyl, or N(E2) (E3) and
E.1, E2, and E3are each independently H, C1~C6alkyl, or substituted C1~C6is an alkyl,
n is 1 to 6,
m is 0 or 1,
j is 0 or 1,
Each substituted group is halogen, OJ1, N(J1) (J2), = NJ1, SJ1, N3, CN, OC (=X2)J1, OC(=X2)N(J1) (J2), and C (=Q2)N(J1) (J2), including one or more optionally protected substituents independently selected from
Q.2is O, S, or NJ3and
Each J1, J2, and J3is independently H or C1~C6is an alkyl
The RNAi agent of any of aspects 466, 480-482, or 485-489.
[Aspect 491] The RNAi agent of aspect 490, wherein each G in structure O of said RNAi sense oligonucleotide is selected from F or OMe.
[Aspect 492] An oligomeric compound according to any of aspects 1-211 or 239-479, comprising at least one modified oligonucleotide, wherein the nucleobase sequence of the at least one modified oligonucleotide is complementary to a target nucleic acid; or antisense agent.
[Aspect 493] The modified oligonucleotide of aspect 492, wherein said nucleobase sequence of said modified oligonucleotide is at least 80% complementary to said target nucleic acid.
[Aspect 494] The modified oligonucleotide of aspect 492, wherein said nucleobase sequence of said modified oligonucleotide is at least 85% complementary to said target nucleic acid.
[Aspect 495] The modified oligonucleotide of aspect 492, wherein said nucleobase sequence of said modified oligonucleotide is at least 90% complementary to said target nucleic acid.
[Aspect 496] The modified oligonucleotide of aspect 492, wherein said nucleobase sequence of said modified oligonucleotide is at least 95% complementary to said target nucleic acid.
[Aspect 497] The modified oligonucleotide of aspect 492, wherein said nucleobase sequence of said modified oligonucleotide is 100% complementary to said target nucleic acid.
[Aspect 498] The modified oligonucleotide of any of aspects 492-497, wherein said target nucleic acid is a target RNA.
[Aspect 499] The modified oligonucleotide of aspect 498, wherein said target RNA is selected from mRNA, pre-mRNA, microRNA, and non-coding RNA.
[Aspect 500] The modified oligonucleotide of aspect 499, wherein said target RNA is not a microRNA.
[Aspect 501] An antisense agent comprising the modified oligonucleotide of any of aspects 1-500, wherein said modified oligonucleotide is not complementary to miR-21.
[Aspect 502] The antisense agent of any of aspects 1-501, comprising a conjugate group.
[Aspect 503] The antisense agent of aspect 502, wherein said conjugate group comprises at least one GalNAc.
[Aspect 504] The antisense agent of aspects 502 or 503, wherein said conjugate group comprises 1-5 linker nucleosides.
[Aspect 505] A pharmaceutical composition comprising an oligomeric compound of any of aspects 1-449 or an antisense agent of any of aspects 450-485 and a pharmaceutically acceptable carrier or diluent. .
[Aspect 506] A method comprising contacting a cell with an oligomeric compound, antisense agent, or pharmaceutical composition of any of aspects 1-505.
[Aspect 507] A method of modulating the amount or activity of a target nucleic acid in a cell, wherein said cell is contacted with an oligomeric compound, antisense agent, or pharmaceutical composition of any of aspects 1-505. and thereby modulating the amount or activity of said target nucleic acid.
[Aspect 508] A method of modulating the amount or activity of a target nucleic acid in a cell, wherein said cell is contacted with an oligomeric compound, antisense agent, or pharmaceutical composition of any of aspects 1-505 The method as described above, comprising:
[Aspect 509] A method according to aspects 506-508, wherein the amount or activity of the target nucleic acid is reduced.
[Aspect 510] A method according to aspects 506-508, wherein the amount or activity of the target nucleic acid is increased.
[Aspect 511] The method of aspect 508, wherein said target nucleic acid comprises at least one translational repression element and said modified oligonucleotide is complementary to a target site within a translational repression element region of said target nucleic acid.
[Aspect 512] A method according to aspect 511, wherein said translational repression element region comprises at least one stem-loop structure.
[Aspect 513] Use of an antisense agent or composition according to any of aspects 1-505 for the treatment of a disease or condition.
[Aspect 514] Use of an antisense agent or composition according to any of aspects 1-505 for the preparation of a medicament for the treatment of a disease or condition.
[Aspect 515] The oligomeric compound or antisense agent of any of aspects 1-504, wherein said oligomeric compound or said antisense agent is not an RNAi agent and the parent oligomeric compound or parent antisense agent is cytotoxic in vitro. sensate.
[Aspect 516] The parent oligomeric compound or the parent antisense agent is a standard in vitro cytotoxic
516. An oligomeric compound or antisense agent according to aspect 515, which is cytotoxic in an assay.
[Aspect 517] An oligomeric compound or antisense agent according to aspect 515, wherein the oligomeric compound or antisense agent according to any of aspects 1-504 is not cytotoxic in vitro.
[Aspect 518] The oligomeric compound or antisense agent of any of aspects 515-517, wherein the oligomeric compound or antisense agent of any of aspects 1-504 is not cytotoxic in a standard in vitro cytotoxicity assay. .
[Aspect 519] The oligomeric compound or antisense agent of any of aspects 1-504, wherein said antisense agent is not an siRNA agent and said parent antisense agent is hepatotoxic to mice.
[Aspect 520] The mouse is a BALB/c mouse, 50 mg/kg of the parent antisense agent is administered to the mouse, and the plasma ALT level in the mouse increases from the administration of the parent antisense agent to 520. An oligomeric compound or antisense agent according to aspect 519, measured after 72 hours.
[Aspect 521] Aspects 519-520, wherein administration of 50 mg/kg of the oligomeric compound or antisense agent of any of aspects 1-504 to a mouse is not hepatotoxic to said mouse. Oligomeric compounds or antisense agents.
[Aspect 522] The oligomeric compound of any of aspects 1-504, wherein the therapeutic index of the antisense agent of any of aspects 1-504 in mice is increased relative to the therapeutic index of said parent antisense agent. or antisense agents.
[Aspect 523] An oligomeric compound or antisense agent according to aspect 522, wherein said therapeutic index of the antisense agent of aspect 516 in mice is at least 2-fold greater than said therapeutic index of said parent antisense agent.
[Aspect 524] The parent oligomeric compound or parent antisense agent is any of aspects 1-504, except that each internucleoside linkage of Formula XVII is replaced in the parent antisense agent with a phosphorothioate internucleoside linkage. 524. An oligomeric compound or antisense agent according to any of aspects 515-523, which is identical to an antisense agent according to any one of aspects 515-523.
[Aspect 525] An oligomeric compound according to any of aspects 515-524, wherein said oligomeric compound or said antisense agent is an RNAse H agent.
[Aspect 526] An oligomeric compound or antisense agent according to any of aspects 515 to 524, wherein said oligomeric compound or said antisense agent is a gapmer.
[Aspect 527] The oligomeric compound or antisense agent of any of aspects 515-524, wherein said oligomeric compound or antisense agent modulates splicing.
[Aspect 528] The oligomeric compound or antisense agent of any of aspects 515-524, wherein said oligomeric compound or said antisense agent increases protein expression.
[Aspect 529] The oligomeric compound or antisense agent of any of aspects 1-504, wherein said oligomeric compound or said antisense agent is an RNAi agent and the parent RNAi agent is cytotoxic in vitro.
[Aspect 530] An oligomeric compound or antisense agent according to aspect 529, wherein the RNAi agent according to any of aspects 1-504 is not cytotoxic in vitro.
[Aspect 531] The oligomeric compound or antisense agent of any of aspects 529-530, wherein said oligomeric compound or said antisense agent is an RNAi agent, and said RNAi agent is not cytotoxic in a standard in vitro cytotoxicity assay. sensate.
[Aspect 532] The oligomeric compound or antisense agent of any of aspects 1-504, wherein said oligomeric compound or said antisense agent is an RNAi agent and is hepatotoxic to said mouse.
[Aspect 533] The mouse is a BALB/c mouse, 50 mg/kg of the parent RNAi agent is administered to the mouse, and the plasma ALT level in the mouse is 72 from the administration of the parent RNAi agent. 533. The RNAi agent according to aspect 532, measured after hours.
[Aspect 534] The RNAi agent of any of aspects 532-533, wherein administration of 50 mg/kg of said RNAi agent to a mouse is not hepatotoxic to said mouse.
[Aspect 535] The oligomeric compound or antisense agent of any of aspects 1-504, which is an RNAi agent, wherein the therapeutic index of said RNAi agent in mice is increased relative to the therapeutic index of said parent RNAi agent.
[Aspect 536] The RNAi agent of aspect 535, wherein said therapeutic index of the RNAi agent of aspect 535 in mice is at least 2-fold greater than said therapeutic index of said parent RNAi agent.
[Aspect 537] The oligomeric compound of any of aspects 1-504, except wherein said parent RNAi agent has each internucleoside linkage of Formula XVII replaced with a phosphodiester internucleoside linkage in said parent RNAi agent. or an RNAi agent according to any of aspects 526-536, which is the same as an antisense agent.
[Aspect 538] A method of designing an oligomeric compound or antisense agent, the method comprising starting from a parent oligomeric compound or antisense agent or parent RNAi agent; redesigning the compound to arrive at the sense agent.
[Aspect 539] A method of designing an oligomeric compound or antisense agent, comprising: identifying an oligomeric compound or antisense agent or parent RNAi agent; and modifying the design of the antisense agent or parent RNAi agent, wherein the second oligomeric compound antisense agent is the oligomeric compound or antisense agent of any one of aspects 1-504. Method.
[Aspect 540] A method of ameliorating hepatotoxicity of an oligomeric compound or antisense agent, comprising: (i) a parent oligomeric compound, parent antisense agent, or parent RNAi having a plasma ALT level greater than 300 units/liter in a mouse; (ii) providing an oligomeric compound or antisense agent according to any one of aspects 1-504.
[Aspect 541] The method of aspect 540, wherein said method designs an oligomeric compound or antisense agent with an improved therapeutic index relative to said parent oligomeric compound, said parent antisense agent, or said parent RNAi agent. .
[Aspect 542] The method of aspect 540, wherein said method designs an oligomeric compound or antisense agent that has lower hepatotoxicity compared to said parent oligomeric compound, said parent antisense agent, or said parent RNAi agent.
[Aspect 543] In aspect 540, wherein said second oligomeric compound or said second antisense agent has an improved therapeutic index compared to said parent oligomeric compound, said parent antisense agent, or said parent RNAi agent. described method.
[Embodiment 544] Embodiment, wherein said second oligomeric compound or said second antisense agent has reduced hepatotoxicity in mice compared to said parent oligomeric compound, said parent antisense agent, or said parent RNAi agent 540. The method described in 540.
[Aspect 545] The oligomeric compound or antisense agent of any one of aspects 1-504 has an improved therapeutic index compared to said parent oligomeric compound, said parent antisense agent, or said parent RNAi agent; 540. The method of aspect 540.
[Aspect 546] The oligomeric compound or antisense agent of any one of aspects 1-504 has reduced hepatotoxicity compared to said parent oligomeric compound, said parent antisense agent, or said parent RNAi agent, 540. The method of aspect 540.
[Aspect 547] Administering to a mouse the oligomeric compound or antisense agent according to any one of aspects 1 to 504, and the parent oligomeric compound or parent antisense agent of the antisense agent according to any one of aspects 1 to 504 , or separately administering a parent RNAi agent to a second mouse, wherein the therapeutic index of the antisense agent of any of aspects 1-504 is equal to that of said parent antisense agent or said parent RNAi agent A method that is improved relative to the therapeutic index.

Claims (19)

ヌクレオシド間連結基を介して連結された12~30個の連結ヌクレオシドからなる修飾オリゴヌクレオチドを含むオリゴマー化合物であって、
少なくとも1個のヌクレオシドが、修飾糖部分を含み、
該修飾オリゴヌクレオチドが、6~11個の連結ヌクレオシドからなるデオキシ領域を含み、該デオキシ領域の各ヌクレオシドは立体標準的DNAヌクレオシドであり、
ヌクレオシド間連結基のうちの少なくとも1個が、式XVIIを有し、
式中、式XVIIを有する該修飾オリゴヌクレオチドの各ヌクレオシド間連結基について独立して、
Xが、OまたはSから選択され、
が、H、C~Cアルキル、及び置換C~Cアルキルから選択され、
Tが、SOであり、式中、
が、アリール、置換アリール、複素環、置換複素環、芳香族複素環、置換芳香族複素環、ジアゾール、置換ジアゾール、C~Cアルコキシ、C~Cアルキル、C~Cアルケニル、C~Cアルキニル、置換C~Cアルキル、置換C~Cアルケニル、置換C~Cアルキニル、及びコンジュゲート基から選択される、
上記オリゴマー化合物。
An oligomeric compound comprising a modified oligonucleotide consisting of 12-30 linked nucleosides linked via an internucleoside linking group,
at least one nucleoside comprises a modified sugar moiety;
said modified oligonucleotide comprises a deoxy region consisting of 6-11 linked nucleosides, each nucleoside of said deoxy region being a stereocanonical DNA nucleoside;
at least one of the internucleoside linking groups has the formula XVII;
independently for each internucleoside linking group of said modified oligonucleotide having formula XVII,
X is selected from O or S;
R 1 is selected from H, C 1 -C 6 alkyl, and substituted C 1 -C 6 alkyl;
T is SO2R2 , wherein
R 2 is aryl, substituted aryl, heterocycle, substituted heterocycle, heteroaromatic ring, substituted heteroaromatic ring, diazole, substituted diazole, C 1 -C 6 alkoxy, C 1 -C 6 alkyl, C 1 -C 6 alkenyl, C 1 -C 6 alkynyl, substituted C 1 -C 6 alkyl, substituted C 1 -C 6 alkenyl, substituted C 1 -C 6 alkynyl, and conjugate groups,
The above oligomeric compound.
デオキシ領域が、前記式(Ng1L1(Ng2L2(Ng3L3を有する少なくとも1つの領域を含み、式中、各Nが、ヌクレオシドであり、各Lが、ヌクレオシド間連結基であり;L、及びLの各々が、ホスホジエステルヌクレオシド間連結基、ホスホロチオエートヌクレオシド間連結基、または式XVIIのヌクレオシド間連結基であり、
式中、Lが、不在であるか、またはホスホジエステルヌクレオシド間連結基、ホスホロチオエートヌクレオシド間連結基、もしくは式XVIIのヌクレオシド間連結基であり;
式中、L、L、及びLのうちの少なくとも1つが、式XVIIのヌクレオシド間連結基であり;かつL、L、及びLのうちの少なくとも1つが、ホスホロチオエートまたはホスホジエステルヌクレオシド間連結基であり、
式中、式XVIIを有する前記修飾オリゴヌクレオチドの各ヌクレオシド間連結基について独立して、
Xが、OまたはSから選択され、
が、H、C~Cアルキル、及び置換C~Cアルキルから選択され、
Tが、SOであり、式中、
が、アリール、置換アリール、複素環、置換複素環、芳香族複素環、置換芳香族複素環、ジアゾール、置換ジアゾール、C~Cアルコキシ、C~Cアルキル、C~Cアルケニル、C~Cアルキニル、置換C~Cアルキル、置換C~Cアルケニル置換C~Cアルキニル、及びコンジュゲート基から選択される、
請求項1に記載のオリゴマー化合物。
The deoxy region comprises at least one region having the formula (N g1 ) L1 (N g2 ) L2 (N g3 ) L3 , wherein each N g is a nucleoside and each L is an internucleoside linking group each of L 1 and L 2 is a phosphodiester internucleoside linking group, a phosphorothioate internucleoside linking group, or an internucleoside linking group of Formula XVII;
wherein L3 is absent or is a phosphodiester internucleoside linking group, a phosphorothioate internucleoside linking group, or an internucleoside linking group of Formula XVII;
wherein at least one of L 1 , L 2 and L 3 is an internucleoside linking group of formula XVII; and at least one of L 1 , L 2 and L 3 is a phosphorothioate or a phosphodiester an internucleoside linking group,
independently for each internucleoside linking group of said modified oligonucleotide having formula XVII,
X is selected from O or S;
R 1 is selected from H, C 1 -C 6 alkyl, and substituted C 1 -C 6 alkyl;
T is SO2R2 , wherein
R 2 is aryl, substituted aryl, heterocycle, substituted heterocycle, heteroaromatic ring, substituted heteroaromatic ring, diazole, substituted diazole, C 1 -C 6 alkoxy, C 1 -C 6 alkyl, C 1 -C 6 alkenyl, C 1 -C 6 alkynyl, substituted C 1 -C 6 alkyl, substituted C 1 -C 6 alkenyl substituted C 1 -C 6 alkynyl, and conjugate groups,
2. The oligomeric compound of claim 1.
XがOであり、及び/又は、デオキシ領域内の少なくとも1個のヌクレオシド間連結基が、式XVIIのヌクレオシド間連結基であり;式XVIIの各ヌクレオシド間結合について、Rが、Hであり、Tが、SOMeである、請求項1又は2に記載のオリゴマー化合物。 X is O and/or at least one internucleoside linking group in the deoxy region is an internucleoside linking group of Formula XVII; for each internucleoside bond of Formula XVII, R 1 is H , T is SO2Me . 式(Ng1L1(Ng2L2(Ng3L3を有する領域が、デオキシ領域の3’末端にあり、又は、式(Ng1L1(Ng2L2(Ng3L3を有する前記領域が、デオキシ領域の5’末端にある、請求項2又は3に記載のオリゴマー化合物。 a region having the formula (N g1 ) L1 (N g2 ) L2 (N g3 ) L3 is at the 3′ end of the deoxy region or has the formula (N g1 ) L1 (N g2 ) L2 (N g3 ) L3 4. An oligomeric compound according to claim 2 or 3, wherein said region is at the 5' end of the deoxy region. デオキシ領域には、5’側に1~6個の連結された5’領域ヌクレオシドからなる5’領域及び3’側に1~6個の連結された3’領域ヌクレオシドからなる3’領域が隣接し、
該5’領域の最も3’側のヌクレオシドが、修飾糖部分を含み、
該3’領域の最も5’側のヌクレオシドが、修飾糖部分を含む、
請求項1~4のいずれか1項に記載のオリゴマー化合物。
The deoxy region is flanked on the 5′ side by a 5′ region consisting of 1 to 6 linked 5′ region nucleosides and on the 3′ side by a 3′ region consisting of 1 to 6 linked 3′ region nucleosides. death,
the 3'-most nucleoside of the 5' region comprises a modified sugar moiety;
the 5'-most nucleoside of the 3' region comprises a modified sugar moiety;
An oligomeric compound according to any one of claims 1-4.
デオキシ領域が、7~11個の連結ヌクレオシドからなり、下記式を有し、
(Nd1L1(Nd2L2(Nd3L3(Nd4L4[(NL5
式中、Nd1、Nd2、Nd3、Nd4、及び各Nの各々が、立体標準的DNAヌクレオシドであり;
qが、3~8であり、
、L、L、L、及び各Lの各々が、ヌクレオシド間結合であり、
、L、L、Lのうちの少なくとも2つが、式XVIIのヌクレオシド間結合である、
請求項5に記載のオリゴマー化合物。
the deoxy region consists of 7-11 linked nucleosides and has the formula
( Nd1 ) L1 ( Nd2 ) L2 ( Nd3 ) L3 ( Nd4 ) L4 [( Nd ) L5 ] q ;
wherein each of Nd1 , Nd2 , Nd3 , Nd4 , and each Nd is a stereocanonical DNA nucleoside;
q is 3 to 8,
each of L 1 , L 2 , L 3 , L 4 , and each L 5 is an internucleoside linkage;
at least two of L 1 , L 2 , L 3 , L 4 are internucleoside linkages of Formula XVII;
6. An oligomeric compound according to claim 5.
及びLが、式XVIIのヌクレオシド間結合である、又は
及びLが、式XVIIのヌクレオシド間結合である、又は
及びLが、式XVIIのヌクレオシド間結合である、又は
、L、及びLが、式XVIIのヌクレオシド間結合である、又は
、L、及びLが、式XVIIのヌクレオシド間結合である、又は
、L、L、及びLが、式XVIIのヌクレオシド間結合である、
請求項6に記載のオリゴマー化合物。
L 1 and L 2 are an internucleoside linkage of formula XVII, or L 2 and L 3 are an internucleoside linkage of formula XVII, or L 3 and L 4 are an internucleoside linkage of formula XVII, or L 1 , L 2 , and L 3 are internucleoside linkages of formula XVII, or L 2 , L 3 , and L 4 are internucleoside linkages of formula XVII, or L 1 , L 2 , L 3 , and L4 are an internucleoside linkage of formula XVII,
7. An oligomeric compound according to claim 6.
各Lが、ホスホロチオエートヌクレオシド間結合である、及び/又は
式XVIIのヌクレオシド間結合ではない各ヌクレオシド間結合が、ホスホロチオエートヌクレオシド間結合である、及び/又は
式XVIIの各ヌクレオシド間結合について、Rが、Hであり、Tが、SOMeである、
請求項6又は7に記載のオリゴマー化合物。
each L5 is a phosphorothioate internucleoside linkage, and/or each internucleoside linkage that is not an internucleoside linkage of formula XVII is a phosphorothioate internucleoside linkage, and/or for each internucleoside linkage of formula XVII, R1 is H and T is SO 2 Me,
8. An oligomeric compound according to claim 6 or 7.
前記3’領域及び/又は前記5’領域が、2~5個の連結ヌクレオシドからなり、例えば、
該3’領域及び/又は該5’領域が、3個の連結ヌクレオシドからなる、又は
該3’領域及び/又は該5’領域が、5個の連結ヌクレオシドからなる、
請求項5~8のいずれか1項に記載のオリゴマー化合物。
the 3′ region and/or the 5′ region consists of 2 to 5 linked nucleosides, for example
said 3′ region and/or said 5′ region consists of 3 linked nucleosides, or said 3′ region and/or said 5′ region consists of 5 linked nucleosides;
An oligomeric compound according to any one of claims 5-8.
前記3’領域及び/又は前記5’領域の各ヌクレオシドが、修飾糖を含む修飾ヌクレオシドである;及び/又は
前記3’領域及び/又は前記5’領域の少なくとも1個のヌクレオシドが、2’置換フラノシル糖部分を含み、場合により、該3’領域及び/又は該5’領域の各2’置換フラノシル糖部分が、2’-MOE、2’-OMe、及び2’-NMAの中から選択される2’置換基を有する;及び/又は
前記3’領域及び/又は前記5’領域の少なくとも1個のヌクレオシドが、二環式フラノシル糖部分を含み、例えば、該3’領域及び/又は該5’領域の各二環式糖部分が、cEt、LNA、及びENAの中から選択され、場合により、該3’領域及び/又は該5’領域の各二環式糖部分が、cEt糖部分である;
請求項5~9のいずれか1項に記載のオリゴマー化合物。
each nucleoside of said 3′ region and/or said 5′ region is a modified nucleoside comprising a modified sugar; and/or at least one nucleoside of said 3′ region and/or said 5′ region is 2′ substituted optionally, each 2'-substituted furanosyl sugar moiety of said 3' region and/or said 5' region is selected from among 2'-MOE, 2'-OMe, and 2'-NMA; and/or at least one nucleoside of said 3′ region and/or said 5′ region comprises a bicyclic furanosyl sugar moiety, e.g. each bicyclic sugar moiety in the ' region is selected from among cEt, LNA, and ENA; optionally each bicyclic sugar moiety in the 3' region and/or the 5' region is a cEt sugar moiety; be;
An oligomeric compound according to any one of claims 5-9.
前記3’領域及び/又は前記5’領域の各ヌクレオシドが、2’置換フラノシル糖部分を含み、場合により、該3’領域及び/又は該5’領域の各2’置換フラノシル糖部分が、2’-MOE、2’-OMe、及び2’-NMAの中から選択される2’置換基を有する;及び/又は
前記5’領域の各ヌクレオシドが、二環式フラノシル糖部分を含み、例えば、該3’領域及び/又は該5’領域の各二環式糖部分が、cEt、LNA、及びENAの中から選択され、場合により、該3’領域及び/又は該5’領域の各二環式糖部分が、cEt糖部分である;
請求項5~10のいずれか1項に記載のオリゴマー化合物。
Each nucleoside of said 3′ region and/or said 5′ region comprises a 2′-substituted furanosyl sugar moiety, optionally each 2′-substituted furanosyl sugar moiety of said 3′ region and/or said 5′ region comprises two has a 2' substituent selected from among '-MOE, 2'-OMe, and 2'-NMA; and/or each nucleoside in said 5' region comprises a bicyclic furanosyl sugar moiety, e.g. each bicyclic sugar moiety of said 3′ region and/or said 5′ region is selected from among cEt, LNA and ENA; the formula sugar moiety is a cEt sugar moiety;
An oligomeric compound according to any one of claims 5-10.
修飾オリゴヌクレオチドの各核酸塩基が、独立して、チミン、ウラシル、グアニン、シトシン、5-メチルシトシン、及びアデニンの中から選択される、請求項1~11のいずれか1項に記載のオリゴマー化合物。 An oligomeric compound according to any one of claims 1 to 11, wherein each nucleobase of the modified oligonucleotide is independently selected among thymine, uracil, guanine, cytosine, 5-methylcytosine and adenine. . 修飾オリゴヌクレオチドが、ssssssssssssssa、sssssssssssssas、ssssssssssssass、sssssssssssasss、ssssssssssassss、sssssssssasssss、ssssssssassssss、sssssssasssssss、ssssssassssssss、sssssasssssssss、ssssassssssssss、sssasssssssssss、ssassssssssssss、sasssssssssssss、assssssssssssss、sssssssssssssaa、ssssssssssssaas、sssssssssssaass、ssssssssssaasss、sssssssssaassss、ssssssssaasssss、sssssssaassssss、ssssssaasssssss、sssssaassssssss、ssssaasssssssss、sssaassssssssss、ssaasssssssssss、saassssssssssss、aasssssssssssss、aaaaaaaaaaaaaaa、ssaaaaaaaaaaass、ssaaaaaaaaaasss、sssaaaaaaaaasss、aassssssssssaaa、sssaaasssssssss、ssssaaassssssss、sssaaaassssssss、ssaaassssssssss、ssaaaasssssssss、ssaaaaassssssss、ssaaaaaasssssss、ssaaaaaaassssss、ssaaaaaaaasssss、ssaaaaaaaaassss、ssssssssssaaass、sssssssssaaaass、ssssssssaaaaass、sssssssaaaaaass、ssssssaaaaaaass、sssssaaaaaaaass、ssssaaaaaaaaass、sssaaaaaaaaaass、ssasasasasasass、sssasasasasasss、ooossssssssssoo、soossssssssssos、aoosssssssssooa、aoasssssssssaoa、aoaaaassssssaoa、aoossssssssssoa、ooasssssssssaoo、aoosaasssssssoa、aossaasssssssoa、aooaaaasssssaoa、aoossssssaaaaoa、sssssaaasssssss、ssssssaaassssss、sssssssaaasssss、ssssssssaaassss、sssssssssaaasss、ssssaaaasssssss、sssssaaaassssss、ssssssaaaasssss、sssssssaaaassss、ssssssssaaaasss、sssaassssssaass、sssaasssssaasss、sssaassssaassss、sssaasssaasssss、sssaassaassssss、sssaasaasssssss、ssaasssssssaass、ssssaasssssaass、sssssaassssaass、ssssssaasssaass、sssssssaassaass、ssssssssaasaass、ssssaasssaassss、sssssaasaasssss、sssssssssssssss、aaassssssssssss、aaassssssssssaa、aaaaaasssssssss、aoooosaasssssssooaa、aoooossssssssssooaa、sooooaassssssssooss、soooosaasssssssooss、soooossaassssssooss、soooossssssaassooss、sssaaaaasssssss、sssssaaaaaassss、またはsssssssssaaaaaaから選択され
るヌクレオシド間結合モチーフを有し、式中、各「a」が、式XVIIのヌクレオシド間結合を表し、各「s」が、ホスホロチオエートヌクレオシド間結合を表し、各「o」が、ホスホジエステルヌクレオシド間結合を表し、例えば、
該修飾オリゴヌクレオチドが、sssaaaassssssss、sssaaasssssssss、ssssaaassssssss、ssssaasssssaass、sssaassssssssss、ssssaasssssssss、sssssaassssssss、またはsssssssssaassssから選択されるヌクレオシド間結合モチーフを有し、式中、各「a」が、式XVIIのヌクレオシド間結合を表し、各「s」が、ホスホロチオエートヌクレオシド間結合を表し、各「o」が、ホスホジエステルヌクレオシド間結合を表す、及び/又は
各「a」が、メシルホスホロアミデートヌクレオシド間結合を表す、
請求項5~12のいずれか1項に記載のオリゴマー化合物。
The modified oligonucleotide is ssss aa, sssssssssssaas, ssssssssssaass . . aaaaassssssss, ssaaaaasssssss, ssaaaaaaaassssss, ssaaaaaaaassssss, ssaaaaaaaasssssssssssssssssaaass, ssssssssaaaass, ssssssssaaaass, sssss ssaaaaass . sssssoa, aoassssssssaoa, aoaaaassssssaoa, aoossssssssssoa, ooassssssssssaoo, aoosassasssssssoa, aossaassssssssoa, aoaaaassssssaoa, aoossssss saaaaaa ssss . a so ooossaasssssssooss . join where each "o" represents a phosphodiester internucleoside linkage, e.g.
The modified oligonucleotide is sssaaaassssssss, sssaaassssssss, ssssaaaassssssss, ssssaasssssaass, sssaasssssssssss, ssssaasssssssss, sssssaassssssss, or ssssssssssaas has an internucleoside linkage motif selected from sss, wherein each "a" is an internucleoside linkage of Formula XVII; wherein each "s" represents a phosphorothioate internucleoside linkage, each "o" represents a phosphodiester internucleoside linkage, and/or each "a" represents a mesyl phosphoramidate internucleoside linkage,
An oligomeric compound according to any one of claims 5-12.
少なくとも1つの修飾オリゴヌクレオチドを含み、少なくとも1つの修飾オリゴヌクレオチドの核酸塩基配列が、標的核酸に相補的であり、場合により、該修飾オリゴヌクレオチドの核酸塩基配列が、標的核酸に少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも95%、又は100%相補的である;及び/又は
標的核酸が、標的RNAである;
請求項1~13のいずれか1項に記載のオリゴマー化合物。
comprising at least one modified oligonucleotide, wherein the nucleobase sequence of at least one modified oligonucleotide is complementary to a target nucleic acid; optionally, the nucleobase sequence of the modified oligonucleotide is at least 80%, at least 85%, at least 90%, at least 95%, or 100% complementary; and/or the target nucleic acid is target RNA;
An oligomeric compound according to any one of claims 1-13.
修飾オリゴヌクレオチドがアンチセンスオリゴヌクレオチドである、請求項1~14のいずれか1項に記載のオリゴマー化合物。 An oligomeric compound according to any one of claims 1-14, wherein the modified oligonucleotide is an antisense oligonucleotide. コンジュゲート基を含み、場合により、該コンジュゲート基が、少なくとも1つのGalNAcを含む、請求項15に記載のオリゴマー化合物。 16. An oligomeric compound according to claim 15, comprising a conjugate group, optionally said conjugate group comprising at least one GalNAc. 請求項1~16のいずれか1項に記載のオリゴマー化合物を含む、薬学的組成物。 A pharmaceutical composition comprising an oligomeric compound according to any one of claims 1-16. 薬学的に許容される担体または希釈剤をさらに含む、請求項17に記載の薬学的組成物。 18. The pharmaceutical composition of Claim 17, further comprising a pharmaceutically acceptable carrier or diluent. 疾患または病態を処置するための、請求項17又は18に記載の薬学的組成物。 19. A pharmaceutical composition according to claim 17 or 18 for treating a disease or condition.
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