JPWO2020033587A5 - - Google Patents

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JPWO2020033587A5
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本発明は、その趣旨または本質的な特徴から逸脱することなく、他の特定の形態で具体化され得る。それゆえ、上記の実施形態は、全ての点において、本明細書に記載される本発明を限定するものではなく、実例であると考えられるべきである。したがって、本発明の範囲は、上記の説明によってではなく、附属の特許請求の範囲によって示され、特許請求の範囲と均等な意味および範囲内に入る全ての変更は、それに包含されることが意図される。
本発明は、例えば以下の項目を提供する。
(項目1)
(a)NKG2Dに結合するFab断片を含む第1の抗原結合部位と;
(b)HER2に結合する一本鎖可変領域断片(scFv)を含む第2の抗原結合部位と;
(c)CD16に結合するのに十分な抗体Fcドメインもしくはその部分、またはCD16に結合する第3の抗原結合部位と
を含むタンパク質。
(項目2)
前記scFvが、Ala-Serを含むヒンジを介して、CD16に結合するのに十分な前記抗体Fcドメインもしくはその部分、またはCD16に結合する前記第3の抗原結合部位に連結している、項目1に記載のタンパク質。
(項目3)
前記scFvが、前記抗体Fcドメインに連結している、項目2に記載のタンパク質。
(項目4)
前記scFvが、重鎖可変ドメインおよび軽鎖可変ドメインを含む、項目1から3のいずれか一項に記載のタンパク質。
(項目5)
前記scFvの前記重鎖可変ドメインが、前記scFvの前記軽鎖可変ドメインとジスルフィド架橋を形成する、項目4に記載のタンパク質。
(項目6)
前記ジスルフィド架橋が、前記重鎖可変ドメインのC44と前記軽鎖可変ドメインのC100との間に形成される、項目5に記載のタンパク質。
(項目7)
前記scFvの前記軽鎖可変ドメインが、フレキシブルリンカーを介して前記scFvの前記重鎖可変ドメインに連結している、項目4から6のいずれか一項に記載のタンパク質。
(項目8)
前記フレキシブルリンカーが、配列番号143のアミノ酸配列を含む、項目7に記載のタンパク質。
(項目9)
前記フレキシブルリンカーが、配列番号143のアミノ酸配列からなる、項目8に記載のタンパク質。
(項目10)
前記軽鎖可変ドメインが、前記重鎖可変ドメインのN末端またはC末端に位置する、項目4から9のいずれか一項に記載のタンパク質。
(項目11)
前記軽鎖可変ドメインが、前記重鎖可変ドメインのN末端に位置する、項目10に記載のタンパク質。
(項目12)
前記Fab断片が、CD16に結合するのに十分な前記抗体Fcドメインもしくはその部分、またはCD16に結合する前記第3の抗原結合部位に連結している、項目1から11のいずれか一項に記載のタンパク質。
(項目13)
NKG2Dに結合する前記第1の抗原結合部位が、
(a)それぞれ、配列番号168、96および169のアミノ酸配列によって表される相補性決定領域1(CDR1)、相補性決定領域2(CDR2)および相補性決定領域3(CDR3)配列を含む重鎖可変ドメイン;ならびにそれぞれ、配列番号99、100および101のアミノ酸配列によって表されるCDR1、CDR2およびCDR3配列を含む軽鎖可変ドメイン;
(b)それぞれ、配列番号168、96および173のアミノ酸配列によって表されるCDR1、CDR2およびCDR3配列を含む重鎖可変ドメイン;ならびにそれぞれ、配列番号99、100および101のアミノ酸配列によって表されるCDR1、CDR2およびCDR3配列を含む軽鎖可変ドメイン;
(c)それぞれ、配列番号95、96および97のアミノ酸配列によって表されるCDR1、CDR2およびCDR3配列を含む重鎖可変ドメイン;ならびにそれぞれ、配列番号99、100および101のアミノ酸配列によって表されるCDR1、CDR2およびCDR3配列を含む軽鎖可変ドメイン;
(d)それぞれ、配列番号166、88および167のアミノ酸配列によって表されるCDR1、CDR2およびCDR3配列を含む重鎖可変ドメイン;ならびにそれぞれ、配列番号91、92および93のアミノ酸配列によって表されるCDR1、CDR2およびCDR3配列を含む軽鎖可変ドメイン;
(e)それぞれ、配列番号162、72および170のアミノ酸配列によって表されるCDR1、CDR2およびCDR3配列を含む重鎖可変ドメイン;ならびにそれぞれ、配列番号107、108および109のアミノ酸配列によって表されるCDR1、CDR2およびCDR3配列を含む軽鎖可変ドメイン;
(f)それぞれ、配列番号162、72および163のアミノ酸配列によって表されるCDR1、CDR2およびCDR3配列を含む重鎖可変ドメイン;ならびにそれぞれ、配列番号75、76および77のアミノ酸配列によって表されるCDR1、CDR2およびCDR3配列を含む軽鎖可変ドメイン;
(g)それぞれ、配列番号164、80および165のアミノ酸配列によって表されるCDR1、CDR2およびCDR3配列を含む重鎖可変ドメイン;ならびにそれぞれ、配列番号75、76および85のアミノ酸配列によって表されるCDR1、CDR2およびCDR3配列を含む軽鎖可変ドメイン;
(h)それぞれ、配列番号168、96および176のアミノ酸配列によって表されるCDR1、CDR2およびCDR3配列を含む重鎖可変ドメイン;ならびにそれぞれ、配列番号99、100および101のアミノ酸配列によって表されるCDR1、CDR2およびCDR3配列を含む軽鎖可変ドメイン;
(i)それぞれ、配列番号168、96および179のアミノ酸配列によって表されるCDR1、CDR2およびCDR3配列を含む重鎖可変ドメイン;ならびにそれぞれ、配列番号99、100および101のアミノ酸配列によって表されるCDR1、CDR2およびCDR3配列を含む軽鎖可変ドメイン;
(j)それぞれ、配列番号168、96および182のアミノ酸配列によって表されるCDR1、CDR2およびCDR3配列を含む重鎖可変ドメイン;ならびにそれぞれ、配列番号99、100および101のアミノ酸配列によって表されるCDR1、CDR2およびCDR3配列を含む軽鎖可変ドメイン;
(k)それぞれ、配列番号168、96および185のアミノ酸配列によって表されるCDR1、CDR2およびCDR3配列を含む重鎖可変ドメイン;ならびにそれぞれ、配列番号99、100および101のアミノ酸配列によって表されるCDR1、CDR2およびCDR3配列を含む軽鎖可変ドメイン;または
(l)それぞれ、配列番号168、96および188のアミノ酸配列によって表されるCDR1、CDR2およびCDR3配列を含む重鎖可変ドメイン;ならびにそれぞれ、配列番号99、100および101のアミノ酸配列によって表されるCDR1、CDR2およびCDR3配列を含む軽鎖可変ドメイン
を含む、項目1から12のいずれか一項に記載のタンパク質。
(項目14)
NKG2Dに結合する前記第1の抗原結合部位が、配列番号86および配列番号94から選択されるアミノ酸配列と少なくとも90%同一の重鎖可変ドメインを含む、項目1から13のいずれか一項に記載のタンパク質。
(項目15)
NKG2Dに結合する前記第1の抗原結合部位が、
(a)配列番号94と少なくとも90%同一の重鎖可変ドメイン、および配列番号98と少なくとも90%同一の軽鎖可変ドメイン;
(b)配列番号144と少なくとも90%同一の重鎖可変ドメイン、および配列番号98と少なくとも90%同一の軽鎖可変ドメイン;または
(c)配列番号86と少なくとも90%同一の重鎖可変ドメイン、および配列番号90と少なくとも90%同一の軽鎖可変ドメイン
を含む、項目1から14のいずれか一項に記載のタンパク質。
(項目16)
NKG2Dに結合する前記第1の抗原結合部位が、
(a)配列番号94と少なくとも95%同一の重鎖可変ドメイン、および配列番号98と少なくとも95%同一の軽鎖可変ドメイン;
(b)配列番号144と少なくとも95%同一の重鎖可変ドメイン、および配列番号98と少なくとも95%同一の軽鎖可変ドメイン;または
(c)配列番号86と少なくとも95%同一の重鎖可変ドメイン、および配列番号90と少なくとも95%同一の軽鎖可変ドメイン
を含む、項目1から15のいずれか一項に記載のタンパク質。
(項目17)
NKG2Dに結合する前記第1の抗原結合部位が、
(a)配列番号94と同一の重鎖可変ドメイン、および配列番号98と同一の軽鎖可変ドメイン;
(b)配列番号144と同一の重鎖可変ドメイン、および配列番号98と同一の軽鎖可変ドメイン;または
(c)配列番号86と同一の重鎖可変ドメイン、および配列番号90と同一の軽鎖可変ドメイン
を含む、項目1から16のいずれか一項に記載のタンパク質。
(項目18)
表面プラズモン共鳴によって測定して、2nM~120nMのK でNKG2Dに結合する、項目1から17のいずれか一項に記載のタンパク質。
(項目19)
HER2に結合する前記第2の抗原結合部位が、
(a)それぞれ、配列番号115、116および117のアミノ酸配列によって表されるCDR1、CDR2およびCDR3配列を含む重鎖可変ドメイン;ならびにそれぞれ、配列番号119、120および121のアミノ酸配列によって表されるCDR1、CDR2およびCDR3配列を含む軽鎖可変ドメイン;
(b)それぞれ、配列番号123、124および125のアミノ酸配列によって表されるCDR1、CDR2およびCDR3配列を含む重鎖可変ドメイン;ならびにそれぞれ、配列番号127、128および129のアミノ酸配列によって表されるCDR1、CDR2およびCDR3配列を含む軽鎖可変ドメイン;または
(c)それぞれ、配列番号131、132および133のアミノ酸配列によって表されるCDR1、CDR2およびCDR3配列を含む重鎖可変ドメイン;ならびにそれぞれ、配列番号135、136および137のアミノ酸配列によって表されるCDR1、CDR2およびCDR3配列を含む軽鎖可変ドメイン
を含む、項目1から18のいずれか一項に記載のタンパク質。
(項目20)
HER2に結合する前記第2の抗原結合部位が、
(a)配列番号195と少なくとも90%同一のアミノ酸配列を含む重鎖可変ドメイン、および配列番号196と少なくとも90%同一のアミノ酸配列を含む軽鎖可変ドメイン;
(b)配列番号197と少なくとも90%同一のアミノ酸配列を含む重鎖可変ドメイン、および配列番号198と少なくとも90%同一のアミノ酸配列を含む軽鎖可変ドメイン;または
(c)配列番号199と少なくとも90%同一のアミノ酸配列を含む重鎖可変ドメイン、および配列番号200と少なくとも90%同一のアミノ酸配列を含む軽鎖可変ドメインを含む、項目1から19のいずれか一項に記載のタンパク質。
(項目21)
HER2に結合する前記第2の抗原結合部位が、
(a)配列番号195と少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含む重鎖可変ドメイン、および配列番号196と少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含む軽鎖可変ドメイン;
(b)配列番号197と少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含む重鎖可変ドメイン、および配列番号198と少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含む軽鎖可変ドメイン;または
(c)配列番号199と少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含む重鎖可変ドメイン、および配列番号200と少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含む軽鎖可変ドメインを含む、項目1から20のいずれか一項に記載のタンパク質。
(項目22)
HER2に結合する前記第2の抗原結合部位が、
(a)配列番号195と同一のアミノ酸配列を含む重鎖可変ドメイン、および配列番号196と同一のアミノ酸配列を含む軽鎖可変ドメイン;
(b)配列番号197と同一のアミノ酸配列を含む重鎖可変ドメイン、および配列番号198と同一のアミノ酸配列を含む軽鎖可変ドメイン;または
(c)配列番号199と同一のアミノ酸配列を含む重鎖可変ドメイン、および配列番号200と同一のアミノ酸配列を含む軽鎖可変ドメイン
を含む、項目1から21のいずれか一項に記載のタンパク質。
(項目23)
HER2に結合する前記第2の抗原結合部位が、配列番号139、配列番号189または配列番号171のアミノ酸配列を含む、項目1から22のいずれか一項に記載のタンパク質。
(項目24)
HER2に結合する前記第2の抗原結合部位が、配列番号139のアミノ酸配列を含む、項目23に記載のタンパク質。
(項目25)
前記抗体Fcドメインが、ヒトIgG1抗体のヒンジおよびCH2ドメインを含む、項目1から24のいずれか一項に記載のタンパク質。
(項目26)
前記抗体Fcドメインが、ヒトIgG1抗体のアミノ酸234~332と少なくとも90%同一のアミノ酸配列を含む、項目25に記載のタンパク質。
(項目27)
前記抗体Fcドメインが、ヒトIgG1のFcドメインと少なくとも90%同一のアミノ酸配列を含み、Q347、Y349、T350、L351、S354、E356、E357、K360、Q362、S364、T366、L368、K370、N390、K392、T394、D399、S400、D401、F405、Y407、K409、T411、K439からなる群から選択される1つまたは複数の位置で異なる、項目25または26に記載のタンパク質。
(項目28)
前記抗体Fcドメインが、Q347R、D399VおよびF405T置換を含むヒトIgG1のFcドメインである、項目1から27のいずれか一項に記載のタンパク質。
(項目29)
前記置換を含む前記抗体Fcドメインが、前記scFvに連結している、項目28に記載のタンパク質。
(項目30)
前記抗体Fcドメインが、K360EおよびK409W置換を含むヒトIgG1のFcドメインである、項目1から29のいずれか一項に記載のタンパク質。
(項目31)
前記置換を含む前記抗体Fcドメインが、前記Fab断片に連結している、項目30に記載のタンパク質。
(項目32)
前記抗体Fcドメインが、T366W置換を含むヒトIgG1のFcドメインである、項目1から27のいずれか一項に記載のタンパク質。
(項目33)
前記置換を含む前記抗体Fcドメインが、前記Fab断片に連結している、項目32に記載のタンパク質。
(項目34)
前記抗体Fcドメインが、T366S、L368AおよびY407V置換を含むヒトIgG1のFcドメインである、項目1から27および32から33のいずれか一項に記載のタンパク質。
(項目35)
前記置換を含む前記抗体Fcドメインが、前記scFvに連結している、項目34に記載のタンパク質。
(項目36)
配列番号141、配列番号145、配列番号147、配列番号194、配列番号155または配列番号148の配列を含む、項目1から35のいずれかに記載のタンパク質。
(項目37)
前記抗体Fcドメインに連結した前記scFvが、配列番号140または配列番号146のアミノ酸配列によって表される、項目1から36のいずれか一項に記載のタンパク質。
(項目38)
(a)配列番号141と少なくとも90%同一のアミノ酸配列を含む第1のポリペプチド;
(b)配列番号140、配列番号190または配列番号192と少なくとも90%同一のアミノ酸配列を含む第2のポリペプチド;および
(c)配列番号142と少なくとも90%同一のアミノ酸配列を含む第3のポリペプチド
を含むタンパク質。
(項目39)
前記第2のポリペプチドが、配列番号140と少なくとも90%同一のアミノ酸配列を含む、項目38に記載のタンパク質。
(項目40)
(a)配列番号141と少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含む第1のポリペプチド;
(b)配列番号140、配列番号190または配列番号192と少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含む第2のポリペプチド;および
(c)配列番号142と少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含む第3のポリペプチド
を含むタンパク質。
(項目41)
前記第2のポリペプチドが、配列番号140と少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含む、項目40に記載のタンパク質。
(項目42)
(a)配列番号141のアミノ酸配列を含む第1のポリペプチド;
(b)配列番号140、配列番号190または配列番号192のアミノ酸配列を含む第2のポリペプチド;および
(c)配列番号142のアミノ酸配列を含む第3のポリペプチド
を含むタンパク質。
(項目43)
前記第2のポリペプチドが、配列番号140のアミノ酸配列を含む、項目42に記載のタンパク質。
(項目44)
前記項目のいずれか一項に記載のタンパク質と、薬学的に許容される担体とを含む製剤。
(項目45)
項目1から43のいずれか一項に記載のタンパク質を発現する1つまたは複数の核酸を含む細胞。
(項目46)
腫瘍細胞死を直接的および/または間接的に増強する方法であって、腫瘍およびナチュラルキラー細胞を、項目1から43のいずれか一項に記載のタンパク質に曝露するステップを含む方法。
(項目47)
がんを処置する方法であって、項目1から43のいずれか一項に記載のタンパク質または項目44に記載の製剤を、患者に投与するステップを含む方法。
(項目48)
前記がんが、乳がん、甲状腺がん、胃がん、腎細胞癌、肺の腺癌、前立腺がん、胆管癌、子宮がん、膵臓がん、結腸直腸がん、卵巣がん、子宮頸がん、頭頸部がん、肺扁平上皮がん、中皮腫、肝臓がん、中皮腫、肉腫および胆嚢がんからなる群から選択される、項目47に記載の方法。
The present invention may be embodied in other specific forms without departing from its spirit or essential characteristics. Therefore, the above-described embodiments are to be considered in all respects as illustrative rather than limiting of the invention described herein. The scope of the invention is, therefore, indicated by the appended claims rather than by the foregoing description, and all changes that come within the meaning and range of equivalency of the claims are intended to be embraced therein. be done.
The present invention provides, for example, the following items.
(Item 1)
(a) a first antigen binding site comprising a Fab fragment that binds to NKG2D;
(b) a second antigen binding site comprising a single chain variable region fragment (scFv) that binds HER2;
(c) an antibody Fc domain or portion thereof sufficient to bind CD16, or a third antigen binding site that binds CD16;
protein containing.
(Item 2)
Item 1, wherein said scFv is linked via an Ala-Ser containing hinge to said antibody Fc domain or portion thereof sufficient to bind CD16, or to said third antigen binding site that binds CD16. Proteins as described in.
(Item 3)
3. The protein of item 2, wherein said scFv is linked to said antibody Fc domain.
(Item 4)
4. The protein of any one of items 1-3, wherein said scFv comprises a heavy chain variable domain and a light chain variable domain.
(Item 5)
5. The protein of item 4, wherein said heavy chain variable domain of said scFv forms a disulfide bridge with said light chain variable domain of said scFv.
(Item 6)
6. The protein of item 5, wherein said disulfide bridge is formed between C44 of said heavy chain variable domain and C100 of said light chain variable domain.
(Item 7)
7. The protein of any one of items 4-6, wherein said light chain variable domain of said scFv is linked to said heavy chain variable domain of said scFv via a flexible linker.
(Item 8)
8. The protein of item 7, wherein said flexible linker comprises the amino acid sequence of SEQ ID NO:143.
(Item 9)
9. The protein of item 8, wherein said flexible linker consists of the amino acid sequence of SEQ ID NO:143.
(Item 10)
10. A protein according to any one of items 4 to 9, wherein said light chain variable domain is located N-terminally or C-terminally to said heavy chain variable domain.
(Item 11)
11. The protein of item 10, wherein said light chain variable domain is located N-terminal to said heavy chain variable domain.
(Item 12)
12. Any one of items 1-11, wherein said Fab fragment is linked to said antibody Fc domain or portion thereof sufficient to bind CD16, or to said third antigen binding site that binds CD16. protein.
(Item 13)
The first antigen-binding site that binds to NKG2D is
(a) a heavy chain comprising complementarity determining region 1 (CDR1), complementarity determining region 2 (CDR2) and complementarity determining region 3 (CDR3) sequences represented by the amino acid sequences of SEQ ID NOs: 168, 96 and 169, respectively a variable domain; and a light chain variable domain comprising the CDR1, CDR2 and CDR3 sequences represented by the amino acid sequences of SEQ ID NOs: 99, 100 and 101, respectively;
(b) a heavy chain variable domain comprising CDR1, CDR2 and CDR3 sequences represented by the amino acid sequences of SEQ ID NOs: 168, 96 and 173, respectively; and CDR1 represented by the amino acid sequences of SEQ ID NOs: 99, 100 and 101, respectively; , a light chain variable domain comprising CDR2 and CDR3 sequences;
(c) a heavy chain variable domain comprising the CDR1, CDR2 and CDR3 sequences represented by the amino acid sequences of SEQ ID NOs:95, 96 and 97, respectively; and CDR1 represented by the amino acid sequences of SEQ ID NOs:99, 100 and 101, respectively; , a light chain variable domain comprising CDR2 and CDR3 sequences;
(d) a heavy chain variable domain comprising CDR1, CDR2 and CDR3 sequences represented by the amino acid sequences of SEQ ID NOs: 166, 88 and 167, respectively; and CDR1 represented by the amino acid sequences of SEQ ID NOs: 91, 92 and 93, respectively; , a light chain variable domain comprising CDR2 and CDR3 sequences;
(e) a heavy chain variable domain comprising CDR1, CDR2 and CDR3 sequences represented by the amino acid sequences of SEQ ID NOs: 162, 72 and 170, respectively; and CDR1 represented by the amino acid sequences of SEQ ID NOs: 107, 108 and 109, respectively; , a light chain variable domain comprising CDR2 and CDR3 sequences;
(f) a heavy chain variable domain comprising CDR1, CDR2 and CDR3 sequences represented by the amino acid sequences of SEQ ID NOs: 162, 72 and 163, respectively; and CDR1 represented by the amino acid sequences of SEQ ID NOs: 75, 76 and 77, respectively; , a light chain variable domain comprising CDR2 and CDR3 sequences;
(g) a heavy chain variable domain comprising CDR1, CDR2 and CDR3 sequences represented by the amino acid sequences of SEQ ID NOs: 164, 80 and 165, respectively; and CDR1 represented by the amino acid sequences of SEQ ID NOs: 75, 76 and 85, respectively; , a light chain variable domain comprising CDR2 and CDR3 sequences;
(h) a heavy chain variable domain comprising CDR1, CDR2 and CDR3 sequences represented by the amino acid sequences of SEQ ID NOs: 168, 96 and 176, respectively; and CDR1 represented by the amino acid sequences of SEQ ID NOs: 99, 100 and 101, respectively; , a light chain variable domain comprising CDR2 and CDR3 sequences;
(i) a heavy chain variable domain comprising CDR1, CDR2 and CDR3 sequences represented by the amino acid sequences of SEQ ID NOs: 168, 96 and 179, respectively; and CDR1 represented by the amino acid sequences of SEQ ID NOs: 99, 100 and 101, respectively; , a light chain variable domain comprising CDR2 and CDR3 sequences;
(j) a heavy chain variable domain comprising CDR1, CDR2 and CDR3 sequences represented by the amino acid sequences of SEQ ID NOs: 168, 96 and 182, respectively; and CDR1 represented by the amino acid sequences of SEQ ID NOs: 99, 100 and 101, respectively; , a light chain variable domain comprising CDR2 and CDR3 sequences;
(k) a heavy chain variable domain comprising CDR1, CDR2 and CDR3 sequences represented by the amino acid sequences of SEQ ID NOs: 168, 96 and 185, respectively; and CDR1 represented by the amino acid sequences of SEQ ID NOs: 99, 100 and 101, respectively; , a light chain variable domain comprising CDR2 and CDR3 sequences; or
(l) a heavy chain variable domain comprising CDR1, CDR2 and CDR3 sequences represented by the amino acid sequences of SEQ ID NOs: 168, 96 and 188, respectively; and CDR1 represented by the amino acid sequences of SEQ ID NOs: 99, 100 and 101, respectively; , a light chain variable domain comprising the CDR2 and CDR3 sequences
13. The protein of any one of items 1 to 12, comprising
(Item 14)
14. according to any one of items 1-13, wherein said first antigen binding site that binds NKG2D comprises a heavy chain variable domain that is at least 90% identical to an amino acid sequence selected from SEQ ID NO:86 and SEQ ID NO:94 protein.
(Item 15)
The first antigen-binding site that binds to NKG2D is
(a) a heavy chain variable domain at least 90% identical to SEQ ID NO:94 and a light chain variable domain at least 90% identical to SEQ ID NO:98;
(b) a heavy chain variable domain at least 90% identical to SEQ ID NO: 144 and a light chain variable domain at least 90% identical to SEQ ID NO: 98; or
(c) a heavy chain variable domain at least 90% identical to SEQ ID NO:86 and a light chain variable domain at least 90% identical to SEQ ID NO:90
15. The protein of any one of items 1 to 14, comprising
(Item 16)
The first antigen-binding site that binds to NKG2D is
(a) a heavy chain variable domain at least 95% identical to SEQ ID NO:94 and a light chain variable domain at least 95% identical to SEQ ID NO:98;
(b) a heavy chain variable domain at least 95% identical to SEQ ID NO: 144 and a light chain variable domain at least 95% identical to SEQ ID NO: 98; or
(c) a heavy chain variable domain at least 95% identical to SEQ ID NO:86 and a light chain variable domain at least 95% identical to SEQ ID NO:90
16. The protein of any one of items 1 to 15, comprising
(Item 17)
The first antigen-binding site that binds to NKG2D is
(a) a heavy chain variable domain identical to SEQ ID NO:94 and a light chain variable domain identical to SEQ ID NO:98;
(b) a heavy chain variable domain identical to SEQ ID NO: 144 and a light chain variable domain identical to SEQ ID NO: 98; or
(c) a heavy chain variable domain identical to SEQ ID NO:86 and a light chain variable domain identical to SEQ ID NO:90
17. The protein of any one of items 1 to 16, comprising
(Item 18)
18. A protein according to any one of items 1 to 17, which binds NKG2D with a K D between 2 nM and 120 nM as measured by surface plasmon resonance .
(Item 19)
wherein the second antigen-binding site that binds to HER2 is
(a) a heavy chain variable domain comprising CDR1, CDR2 and CDR3 sequences represented by the amino acid sequences of SEQ ID NOs: 115, 116 and 117, respectively; and CDR1 represented by the amino acid sequences of SEQ ID NOs: 119, 120 and 121, respectively; , a light chain variable domain comprising CDR2 and CDR3 sequences;
(b) a heavy chain variable domain comprising CDR1, CDR2 and CDR3 sequences represented by the amino acid sequences of SEQ ID NOs: 123, 124 and 125, respectively; and CDR1 represented by the amino acid sequences of SEQ ID NOs: 127, 128 and 129, respectively; , a light chain variable domain comprising CDR2 and CDR3 sequences; or
(c) a heavy chain variable domain comprising CDR1, CDR2 and CDR3 sequences represented by the amino acid sequences of SEQ ID NOs: 131, 132 and 133, respectively; and CDR1 represented by the amino acid sequences of SEQ ID NOs: 135, 136 and 137, respectively; , a light chain variable domain comprising the CDR2 and CDR3 sequences
19. The protein of any one of items 1 to 18, comprising
(Item 20)
wherein the second antigen-binding site that binds to HER2 is
(a) a heavy chain variable domain comprising an amino acid sequence at least 90% identical to SEQ ID NO:195 and a light chain variable domain comprising an amino acid sequence at least 90% identical to SEQ ID NO:196;
(b) a heavy chain variable domain comprising an amino acid sequence at least 90% identical to SEQ ID NO: 197 and a light chain variable domain comprising an amino acid sequence at least 90% identical to SEQ ID NO: 198; or
(c) any one of items 1 to 19, comprising a heavy chain variable domain comprising an amino acid sequence at least 90% identical to SEQ ID NO: 199 and a light chain variable domain comprising an amino acid sequence at least 90% identical to SEQ ID NO: 200; The protein according to the paragraph.
(Item 21)
wherein the second antigen-binding site that binds to HER2 is
(a) a heavy chain variable domain comprising an amino acid sequence at least 95% identical to SEQ ID NO:195 and a light chain variable domain comprising an amino acid sequence at least 95% identical to SEQ ID NO:196;
(b) a heavy chain variable domain comprising an amino acid sequence at least 95% identical to SEQ ID NO: 197 and a light chain variable domain comprising an amino acid sequence at least 95% identical to SEQ ID NO: 198; or
(c) any one of items 1 to 20, comprising a heavy chain variable domain comprising an amino acid sequence at least 95% identical to SEQ ID NO: 199 and a light chain variable domain comprising an amino acid sequence at least 95% identical to SEQ ID NO: 200; The protein according to the paragraph.
(Item 22)
wherein the second antigen-binding site that binds to HER2 is
(a) a heavy chain variable domain comprising an amino acid sequence identical to SEQ ID NO:195 and a light chain variable domain comprising an amino acid sequence identical to SEQ ID NO:196;
(b) a heavy chain variable domain comprising an amino acid sequence identical to SEQ ID NO:197 and a light chain variable domain comprising an amino acid sequence identical to SEQ ID NO:198; or
(c) a heavy chain variable domain comprising an amino acid sequence identical to SEQ ID NO:199 and a light chain variable domain comprising an amino acid sequence identical to SEQ ID NO:200
22. The protein of any one of items 1 to 21, comprising
(Item 23)
23. The protein of any one of items 1-22, wherein said second antigen binding site that binds to HER2 comprises the amino acid sequence of SEQ ID NO:139, SEQ ID NO:189 or SEQ ID NO:171.
(Item 24)
24. The protein of item 23, wherein said second antigen binding site that binds to HER2 comprises the amino acid sequence of SEQ ID NO:139.
(Item 25)
25. The protein of any one of items 1-24, wherein said antibody Fc domain comprises the hinge and CH2 domains of a human IgG1 antibody.
(Item 26)
26. The protein of item 25, wherein said antibody Fc domain comprises an amino acid sequence that is at least 90% identical to amino acids 234-332 of a human IgG1 antibody.
(Item 27)
said antibody Fc domain comprises an amino acid sequence at least 90% identical to the Fc domain of human IgG1, Q347, Y349, T350, L351, S354, E356, E357, K360, Q362, S364, T366, L368, K370, N390, 27. The protein of item 25 or 26, differing at one or more positions selected from the group consisting of K392, T394, D399, S400, D401, F405, Y407, K409, T411, K439.
(Item 28)
28. The protein of any one of items 1-27, wherein said antibody Fc domain is a human IgGl Fc domain comprising Q347R, D399V and F405T substitutions.
(Item 29)
29. The protein of item 28, wherein said antibody Fc domain comprising said substitution is linked to said scFv.
(Item 30)
30. The protein of any one of items 1-29, wherein said antibody Fc domain is a human IgGl Fc domain comprising K360E and K409W substitutions.
(Item 31)
31. The protein of item 30, wherein said antibody Fc domain comprising said substitution is linked to said Fab fragment.
(Item 32)
28. The protein of any one of items 1-27, wherein said antibody Fc domain is a human IgGl Fc domain comprising a T366W substitution.
(Item 33)
33. The protein of item 32, wherein said antibody Fc domain comprising said substitution is linked to said Fab fragment.
(Item 34)
34. The protein of any one of items 1-27 and 32-33, wherein said antibody Fc domain is a human IgGl Fc domain comprising T366S, L368A and Y407V substitutions.
(Item 35)
35. The protein of item 34, wherein said antibody Fc domain comprising said substitution is linked to said scFv.
(Item 36)
36. The protein of any of items 1-35, comprising the sequence of SEQ ID NO: 141, SEQ ID NO: 145, SEQ ID NO: 147, SEQ ID NO: 194, SEQ ID NO: 155 or SEQ ID NO: 148.
(Item 37)
37. The protein of any one of items 1-36, wherein said scFv linked to said antibody Fc domain is represented by the amino acid sequence of SEQ ID NO:140 or SEQ ID NO:146.
(Item 38)
(a) a first polypeptide comprising an amino acid sequence that is at least 90% identical to SEQ ID NO: 141;
(b) a second polypeptide comprising an amino acid sequence that is at least 90% identical to SEQ ID NO: 140, SEQ ID NO: 190 or SEQ ID NO: 192; and
(c) a third polypeptide comprising an amino acid sequence that is at least 90% identical to SEQ ID NO: 142;
protein containing.
(Item 39)
39. The protein of item 38, wherein said second polypeptide comprises an amino acid sequence that is at least 90% identical to SEQ ID NO:140.
(Item 40)
(a) a first polypeptide comprising an amino acid sequence that is at least 95% identical to SEQ ID NO: 141;
(b) a second polypeptide comprising an amino acid sequence that is at least 95% identical to SEQ ID NO: 140, SEQ ID NO: 190 or SEQ ID NO: 192; and
(c) a third polypeptide comprising an amino acid sequence that is at least 95% identical to SEQ ID NO: 142;
protein containing.
(Item 41)
41. The protein of item 40, wherein said second polypeptide comprises an amino acid sequence that is at least 95% identical to SEQ ID NO:140.
(Item 42)
(a) a first polypeptide comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 141;
(b) a second polypeptide comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 140, SEQ ID NO: 190 or SEQ ID NO: 192; and
(c) a third polypeptide comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 142
protein containing.
(Item 43)
43. The protein of item 42, wherein said second polypeptide comprises the amino acid sequence of SEQ ID NO:140.
(Item 44)
A formulation comprising the protein according to any one of the preceding items and a pharmaceutically acceptable carrier.
(Item 45)
44. A cell comprising one or more nucleic acids expressing a protein according to any one of items 1-43.
(Item 46)
44. A method of directly and/or indirectly enhancing tumor cell death, comprising exposing tumor and natural killer cells to a protein according to any one of items 1-43.
(Item 47)
A method of treating cancer comprising administering to a patient a protein according to any one of items 1 to 43 or a formulation according to item 44.
(Item 48)
The cancer is breast cancer, thyroid cancer, gastric cancer, renal cell carcinoma, lung adenocarcinoma, prostate cancer, bile duct cancer, uterine cancer, pancreatic cancer, colorectal cancer, ovarian cancer, cervical cancer 48. The method of item 47, wherein the method is selected from the group consisting of: , head and neck cancer, lung squamous cell carcinoma, mesothelioma, liver cancer, mesothelioma, sarcoma and gallbladder cancer.

Claims (15)

NKG2Dに結合するFab断片、HER2に結合する一本鎖可変領域断片(scFv)およびCD16に結合するのに十分な抗体Fcドメインもしくはその部分、またはCD16を含む、多重特異性結合タンパク質であって、 A multispecific binding protein comprising a Fab fragment that binds NKG2D, a single chain variable region fragment (scFv) that binds HER2 and an antibody Fc domain or portion thereof sufficient to bind CD16, or CD16, wherein
(a)配列番号141のアミノ酸配列を含む第1のポリペプチド; (a) a first polypeptide comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 141;
(b)配列番号140のアミノ酸配列を含む第2のポリペプチド;および (b) a second polypeptide comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 140; and
(c)配列番号142のアミノ酸配列を含む第3のポリペプチド (c) a third polypeptide comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 142
を含む、多重特異性結合タンパク質。A multispecific binding protein, comprising:
請求項1に記載のタンパク質と、薬学的に許容される担体とを含む製剤。 A formulation comprising the protein of claim 1 and a pharmaceutically acceptable carrier. 請求項1に記載のタンパク質を発現する1つまたは複数の核酸を含む細胞。 A cell comprising one or more nucleic acids that express the protein of claim 1 . がんを処置する方法における使用のための組成物であって、請求項1に記載のタンパク質を含み、前記方法が、前記組成物を患者に投与するステップを含む、組成物。 A composition for use in a method of treating cancer comprising the protein of claim 1, said method comprising administering said composition to a patient. 前記がんが、乳がん、甲状腺がん、胃がん、腎細胞癌、肺の腺癌、前立腺がん、胆管癌、子宮がん、膵臓がん、結腸直腸がん、卵巣がん、子宮頸がん、頭頸部がん、肺扁平上皮がん、中皮腫、肝臓がん、中皮腫、肉腫および胆嚢がんからなる群から選択される、請求項4に記載の組成物。 The cancer is breast cancer, thyroid cancer, gastric cancer, renal cell carcinoma, lung adenocarcinoma, prostate cancer, bile duct cancer, uterine cancer, pancreatic cancer, colorectal cancer, ovarian cancer, cervical cancer , head and neck cancer, lung squamous cell carcinoma, mesothelioma, liver cancer, mesothelioma, sarcoma and gallbladder cancer. 前記がんが、胃がんである、請求項4に記載の組成物。 5. The composition of claim 4, wherein said cancer is gastric cancer. 前記がんが、食道がんである、請求項4に記載の組成物。 5. The composition of claim 4, wherein said cancer is esophageal cancer. 前記がんが、乳がんである、請求項4に記載の組成物。 5. The composition of claim 4, wherein said cancer is breast cancer. 前記がんが、膀胱がんである、請求項4に記載の組成物。 5. The composition of claim 4, wherein said cancer is bladder cancer. 前記がんが、肺がんである、請求項4に記載の組成物。 5. The composition of claim 4, wherein said cancer is lung cancer. 前記がんが、肺の腺癌である、請求項4に記載の組成物。 5. The composition of claim 4, wherein the cancer is adenocarcinoma of the lung. 前記がんが、肺扁平上皮がんである、請求項4に記載の組成物。 5. The composition of claim 4, wherein the cancer is lung squamous cell carcinoma. 前記方法が、プログラム細胞死タンパク質1(PD1)を阻害する免疫チェックポイント阻害剤を投与することをさらに含む、請求項4に記載の組成物。 5. The composition of claim 4, wherein said method further comprises administering an immune checkpoint inhibitor that inhibits programmed cell death protein 1 (PD1). 前記方法が、PDL1を阻害する免疫チェックポイント阻害剤を投与することをさらに含む、請求項4に記載の組成物。 5. The composition of claim 4, wherein said method further comprises administering an immune checkpoint inhibitor that inhibits PDL1. 前記方法が、LAG3を阻害する免疫チェックポイント阻害剤を投与することをさらに含む、請求項4に記載の組成物。 5. The composition of claim 4, wherein said method further comprises administering an immune checkpoint inhibitor that inhibits LAG3.
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Families Citing this family (7)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CN110944651A (en) 2017-02-08 2020-03-31 蜻蜓疗法股份有限公司 Multispecific binding proteins for natural killer cell activation and therapeutic uses thereof for treating cancer
CA3054079A1 (en) 2017-02-20 2018-08-23 Dragonfly Therapeutics, Inc. Proteins binding her2, nkg2d and cd16
PE20220278A1 (en) 2018-02-08 2022-02-25 Dragonfly Therapeutics Inc VARIABLE DOMAINS OF ANTIBODIES TARGETING THE NKG2D RECEPTOR
CA3152776A1 (en) * 2019-08-30 2021-03-04 Dragonfly Therapeutics, Inc. Pharmaceutical formulations and dosage regimens for multi-specific binding proteins that bind her2, nkg2d, and cd16 for cancer treatment
WO2021224913A1 (en) * 2020-05-04 2021-11-11 Immunorizon Ltd. Precursor tri-specific antibody constructs and methods of use thereof
CN116023501A (en) * 2021-10-25 2023-04-28 三生国健药业(上海)股份有限公司 Immunotoxin molecule for resisting HER2, and preparation method and application thereof
WO2024081329A1 (en) * 2022-10-12 2024-04-18 Marengo Therapeutics, Inc. Multifunctional molecules binding to tcr and uses thereof

Family Cites Families (24)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
ES2619171T3 (en) * 2003-07-24 2017-06-23 Innate Pharma S.A. Methods and compositions for increasing the efficacy of therapeutic antibodies using compounds for the potentiation of NK lymphocytes
JP2009500346A (en) 2005-06-29 2009-01-08 ユニバーシティー・オブ・マイアミ Antibody-Immune Cell Ligand Fusion Protein for Cancer Treatment
PL2222706T5 (en) 2007-12-14 2017-09-29 Novo Nordisk As Antibodies against human nkg2d and uses thereof
US9273136B2 (en) 2008-08-04 2016-03-01 The United States Of America, As Represented By The Secretary, Department Of Health And Human Services Fully human anti-human NKG2D monoclonal antibodies
UY32808A (en) 2009-07-29 2011-02-28 Abbott Lab IMMUNOGLOBULINS AS A DUAL VARIABLE DOMAIN AND USES OF THE SAME
CN103857699B (en) * 2011-05-24 2016-08-31 泽恩格尼亚股份有限公司 Multivalence and unit price polyspecific complex and application thereof
WO2014079000A1 (en) 2012-11-21 2014-05-30 Wuhan Yzy Biopharma Co., Ltd. Bispecific antibody
US9951145B2 (en) 2012-11-27 2018-04-24 Ajou University Industry—Academic Cooperation Foundation CH3 domain variant pair inducing formation of heterodimer of heavy chain constant region of antibody at high efficiency, method for preparing same, and use thereof
EP3936521A1 (en) 2013-03-15 2022-01-12 Xencor, Inc. Heterodimeric proteins
TW201536810A (en) 2013-07-15 2015-10-01 Novo Nordisk As Antibodies that bind urokinase plasminogen activator
WO2015095412A1 (en) 2013-12-19 2015-06-25 Zhong Wang Bispecific antibody with two single-domain antigen-binding fragments
JP2017512765A (en) * 2014-04-11 2017-05-25 メディミューン,エルエルシー Bispecific HER2 antibody
DK3227311T3 (en) * 2014-12-05 2022-03-07 Xyphos Biosciences Inc Insertable, variable fragments of antibodies and modified A1-A2 domains of NKG2D ligands
BR112017015136A2 (en) 2015-01-14 2018-01-30 Compass Therapeutics Llc multispecific immunomodulator antigen binding construct polypeptide, multispecific immunomodulator antigen binding construct, conjugate, pharmaceutical composition, method for treating an individual with cancer, method for inhibiting or reducing cancer growth, composition, cell, method of making a polypeptide of multispecific immunomodulatory antigen binding construct, vector or vector set and kit
AU2016219785B2 (en) 2015-02-20 2021-10-28 Ohio State Innovation Foundation Bivalent antibody directed against NKG2D and tumor associated antigens
DK3303394T3 (en) * 2015-05-29 2020-07-06 Agenus Inc ANTI-CTLA-4 ANTIBODIES AND PROCEDURES FOR USE THEREOF
EP3371227B8 (en) * 2015-11-04 2022-04-06 City of Hope Chimeric antigen receptors targeting her2
WO2017081190A1 (en) * 2015-11-13 2017-05-18 INSERM (Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale) Anti- nkg2d single domain antibodies and uses thereof
JP7082604B2 (en) 2016-03-21 2022-06-08 マレンゴ・セラピューティクス,インコーポレーテッド Multispecific and multifunctional molecules and their use
JOP20190134A1 (en) * 2016-12-23 2019-06-02 Potenza Therapeutics Inc Anti-neuropilin antigen-binding proteins and methods of use thereof
CA3054079A1 (en) * 2017-02-20 2018-08-23 Dragonfly Therapeutics, Inc. Proteins binding her2, nkg2d and cd16
AU2019218125A1 (en) * 2018-02-08 2020-08-20 Dragonfly Therapeutics, Inc. Combination therapy of cancer involving multi-specific binding proteins that activate natural killer cells
PE20220278A1 (en) * 2018-02-08 2022-02-25 Dragonfly Therapeutics Inc VARIABLE DOMAINS OF ANTIBODIES TARGETING THE NKG2D RECEPTOR
EA202091977A1 (en) 2018-05-28 2021-02-09 Драгонфлай Терапьютикс, Инк. MULTI-SPECIFIC BINDING PROTEINS THAT BIND CD33, NKG2D AND CD16 AND METHODS OF APPLICATION

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