JPWO2016166800A1 - Experimental data recording apparatus, computer program, experimental data, experimental data recording method, experimental data display apparatus, and experimental data display method - Google Patents

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Abstract

生化学及び生物・生命工学の少なくとも一方の分野におけるプロトコルに基づく実験の記録である実験データを記録する実験データ記録装置(1)であって、実験器具の動作記録を受信する受信部(21)と、実験固有のIDである実験IDをプロトコルに固有のプロトコルIDと紐付けて記録する実験ID記録部(12)と、受信した前記動作記録のそれぞれを、前記プロトコルに含まれる複数の手順のうち、対応する手順と関連付けて記録する動作記録記録部(25)と、を有する実験データ記録装置(1)。An experimental data recording device (1) for recording experimental data that is a record of an experiment based on a protocol in at least one of biochemistry and biological / biotechnology fields, and receiving unit (21) for receiving an operation record of an experimental instrument And an experiment ID recording unit (12) for recording an experiment ID, which is an ID unique to the experiment, in association with a protocol ID unique to the protocol, and each of the received operation records of a plurality of procedures included in the protocol. Among them, an experimental data recording device (1) having an operation recording unit (25) for recording in association with a corresponding procedure.

Description

本発明は、実験データ記録装置、コンピュータプログラム、実験データ、実験データ記録方法、実験データ表示装置及び実験データ表示方法に関する。   The present invention relates to an experimental data recording device, a computer program, experimental data, an experimental data recording method, an experimental data display device, and an experimental data display method.

生化学や生物・生命工学等の分野における実験(一連の検査や培養、増幅といった試料に対してする操作をいう。)の結果を正しく評価するには、その実験が、あらかじめ設定した手順及び条件通りに確実に行われていることが検証可能に記録される必要がある。実験における作業手順や条件は一般にプロトコルと呼びならわされており、ある実験がプロトコル通りに正しく行われたか否かは、実験者が各自の実験ノートにする記述に頼って判断されることになる。   In order to correctly evaluate the results of experiments in the fields of biochemistry, biology, biotechnology, etc. (referred to as a series of tests, cultures, and amplifications), the experiment requires preset procedures and conditions. It must be documented verifiably that it is done as expected. The work procedure and conditions in an experiment are generally called a protocol, and whether an experiment was correctly performed according to the protocol is determined by the experimenter depending on the description in their experiment notes. .

本発明の解決しようとする課題は、プロトコルに基づく実験の記録を、客観性かつ高い信頼性を持って記録することである。   The problem to be solved by the present invention is to record a record of an experiment based on a protocol with objectivity and high reliability.

本発明の一側面に係る実験データ記録装置は、生化学及び生物・生命工学の少なくとも一方の分野におけるプロトコルに基づく実験の記録である実験データを記録する実験データ記録装置であって、実験器具の動作記録を受信する受信部と、実験固有のIDである実験IDをプロトコルに固有のプロトコルIDと紐付けて記録する実験ID記録部と、受信した前記動作記録のそれぞれを、前記プロトコルに含まれる複数の手順のうち、対応する手順と関連付けて記録する動作記録記録部と、を有する。   An experimental data recording apparatus according to an aspect of the present invention is an experimental data recording apparatus that records experimental data that is a record of an experiment based on a protocol in at least one of biochemistry and biological / biotechnology fields. The protocol includes a reception unit that receives an operation record, an experiment ID recording unit that records an experiment ID that is an experiment-specific ID in association with a protocol ID unique to a protocol, and the received operation record. An operation recording and recording unit for recording in association with the corresponding procedure among the plurality of procedures;

また、本発明の一側面に係る実験データ記録装置は、さらに、実験の対象となった試料のIDである対象試料IDを、前記実験IDと紐付けて記録する対象試料ID記録部と、実験の結果得られた試料のIDである結果試料IDを、前記実験IDと紐付けて記録する結果試料ID記録部と、を有してよい。   The experiment data recording apparatus according to one aspect of the present invention further includes a target sample ID recording unit that records a target sample ID, which is an ID of a sample subjected to the experiment, in association with the experiment ID, and an experiment. And a result sample ID recording unit that records the result sample ID, which is the ID of the sample obtained as a result of the above, in association with the experiment ID.

また、本発明の一側面に係る実験データ記録装置は、さらに、実験環境データを、前記実験IDと紐付けて記録する実験環境データ記録部を有してよい。   The experiment data recording apparatus according to one aspect of the present invention may further include an experiment environment data recording unit that records experiment environment data in association with the experiment ID.

また、本発明の一側面に係る実験データ記録装置では、前記実験器具には、実験者が直接操作する器具が含まれてよい。   In the experimental data recording apparatus according to one aspect of the present invention, the experimental instrument may include an instrument directly operated by an experimenter.

また、本発明の一側面に係る実験データ記録装置では、前記実験器具には、電動ピペットが含まれてよい。   In the experimental data recording apparatus according to one aspect of the present invention, the experimental instrument may include an electric pipette.

また、本発明の一側面に係る実験データ記録装置は、さらに、実験中に、実験に係るプロトコルをモニタに表示する実験中プロトコル表示部を有してよい。   The experimental data recording apparatus according to one aspect of the present invention may further include an in-experiment protocol display unit that displays a protocol related to the experiment on the monitor during the experiment.

また、本発明の一側面に係る実験データ記録装置では、前記実験器具は、前記プロトコルに基づいて実験を実行するロボットが含まれてよい。   In the experimental data recording apparatus according to one aspect of the present invention, the experimental instrument may include a robot that performs an experiment based on the protocol.

また、本発明の一側面に係る実験データ記録装置は、さらに、実験毎に、前記実験IDを発行する実験ID発行部を有してよい。   The experiment data recording apparatus according to one aspect of the present invention may further include an experiment ID issuing unit that issues the experiment ID for each experiment.

また、本発明の一側面に係る実験データ記録装置では、前記実験ID発行部は、外部の実験ID生成装置により生成された実験IDを取得してよい。   In the experiment data recording apparatus according to one aspect of the present invention, the experiment ID issuing unit may acquire an experiment ID generated by an external experiment ID generation apparatus.

また、本発明の一側面に係る実験データ記録装置は、さらに、前記実験データに改ざん防止処理を施す改ざん防止部を有してよい。   The experimental data recording apparatus according to an aspect of the present invention may further include a tampering prevention unit that performs tampering prevention processing on the experimental data.

また、本発明の一側面に係る実験データ記録装置では、前記改ざん防止部は、少なくとも、前記動作記録記録部による動作記録の記録の度に、改ざん防止処理を施してよい。   In the experimental data recording apparatus according to one aspect of the present invention, the tampering prevention unit may perform a tampering prevention process at least every time the operation recording is recorded by the operation recording unit.

また、本発明の一側面に係る実験データ記録装置は、さらに、外部の実験データ格納装置に、得られた前記実験データを格納する実験データ格納部を有してよい。   The experimental data recording device according to one aspect of the present invention may further include an experimental data storage unit that stores the obtained experimental data in an external experimental data storage device.

また、本発明の一側面に係る実験データ記録装置は、さらに、実験の結果得られた試料に対する分析結果のデータである分析データを、当該試料の結果試料IDに紐付けて記録する分析データ記録部を有してよい。   The experiment data recording apparatus according to one aspect of the present invention further includes analysis data recording for recording analysis data, which is analysis result data for a sample obtained as a result of an experiment, in association with a result sample ID of the sample. May have a part.

また、本発明の一側面に係る実験データ記録装置は、さらに、実験が行われたプロトコルを表示する実験後プロトコル表示部と、前記プロトコルに含まれる手順それぞれに対応づけて、前記プロトコルに対応する前記実験データに含まれる動作記録を表示する動作記録表示部と、を有してよい。   The experiment data recording apparatus according to one aspect of the present invention further corresponds to the protocol by associating the protocol display unit for displaying the protocol in which the experiment has been performed with each of the procedures included in the protocol. An operation record display unit for displaying an operation record included in the experimental data.

また、本発明の別の一側面に係るコンピュータプログラムは、コンピュータを、上述のいずれかの実験データ記録装置として機能させる。   A computer program according to another aspect of the present invention causes a computer to function as any of the above-described experimental data recording devices.

また、本発明の別の一側面に係る実験データは、生化学及び生物・生命工学の少なくとも一方の分野におけるプロトコルに基づく実験の記録である実験データであって、プロトコルに固有のプロトコルIDと紐付けられた、実験固有のIDである実験IDと、前記プロトコルに含まれる対応する手順と関連付けられた、実験器具の動作記録と、を含む。   The experimental data according to another aspect of the present invention is experimental data that is a record of an experiment based on a protocol in at least one of biochemistry and biological / biotechnology, and is associated with a protocol ID unique to the protocol. An experiment ID, which is an ID unique to the experiment, and an operation record of the laboratory instrument associated with the corresponding procedure included in the protocol.

また、本発明の別の一側面に係る実験データ記録方法は、生化学及び生物・生命工学の少なくとも一方の分野におけるプロトコルに基づく実験の記録である実験データを記録する実験データ記録方法であって、実験器具の動作記録を受信し、実験固有のIDである実験IDをプロトコルに固有のプロトコルIDと紐付けて記録し、受信した前記動作記録のそれぞれを、前記プロトコルに含まれる複数の手順のうち、対応する手順と紐付けて記録する。   An experimental data recording method according to another aspect of the present invention is an experimental data recording method for recording experimental data that is a record of an experiment based on a protocol in at least one of biochemistry and biological / biotechnology fields. , Receiving an operation record of the experimental instrument, recording an experiment ID, which is an ID unique to the experiment, in association with a protocol ID unique to the protocol, and receiving each of the received operation records of a plurality of procedures included in the protocol Of these, it is recorded in association with the corresponding procedure.

また、本発明の別の一側面に係る実験データ表示装置は、生化学及び生物・生命工学の少なくとも一方の分野におけるプロトコルに基づく実験の記録である実験データに関して、実験が行われたプロトコルを表示する実験後プロトコル表示部と、前記プロトコルに含まれる手順それぞれに対応づけて、前記プロトコルに対応する前記実験データに含まれる、実験に用いられた動作記録を表示する動作記録表示部と、を有する。   In addition, an experimental data display device according to another aspect of the present invention displays a protocol in which an experiment has been performed with respect to experimental data that is a record of an experiment based on a protocol in at least one of biochemistry and biological / biotechnology. A post-experiment protocol display section, and an operation record display section for displaying an operation record used in the experiment included in the experiment data corresponding to the protocol in association with each procedure included in the protocol. .

また、本発明の一側面に係る実験データ表示装置では、さらに、前記実験データに対応する分析データを表示する分析データ表示部を有してよい。   The experimental data display device according to one aspect of the present invention may further include an analytical data display unit that displays analytical data corresponding to the experimental data.

また、本発明の別の一側面に係る実験データ表示方法は、生化学及び生物・生命工学の少なくとも一方の分野におけるプロトコルに基づく実験の記録である実験データに関して、実験が行われたプロトコルを表示し、前記プロトコルに含まれる手順それぞれに対応づけて、前記プロトコルに対応する前記実験データに含まれる、実験に用いられた実験器具の動作記録を表示する。   In addition, an experimental data display method according to another aspect of the present invention displays a protocol in which an experiment has been performed with respect to experimental data that is a record of an experiment based on a protocol in at least one of biochemistry and biological / biotechnology. Then, in association with each procedure included in the protocol, an operation record of the laboratory instrument used in the experiment included in the experiment data corresponding to the protocol is displayed.

本発明の実施形態に係る実験データ記録装置の物理的な構成を示すブロック図である。It is a block diagram which shows the physical structure of the experimental data recording apparatus which concerns on embodiment of this invention. 本発明の実施形態に係る実験データ記録装置の機能ブロック図である。It is a functional block diagram of the experiment data recording device concerning the embodiment of the present invention. プロトコルの一例を示す図である。It is a figure which shows an example of a protocol. 実験データ記録装置を含む、実験システム全体を示す概念図である。It is a conceptual diagram which shows the whole experiment system containing an experiment data recording device. 実験データがプロトコルチャート上に重ね合わせて表示されている様子の一例を示す図である。It is a figure which shows an example of a mode that the experimental data is displayed superimposed on the protocol chart. 実験データ記録装置が実験データを記録する動作を示すフロー図である。It is a flowchart which shows the operation | movement which an experimental data recording device records experimental data. 実験データ記録装置が実験データをプロトコルチャートに重ね合わせて表示する動作を示すフロー図である。It is a flowchart which shows the operation | movement which an experimental data recording device superimposes and displays experimental data on a protocol chart. 本発明の実施形態の変形例に係る実験データ記録装置の機能ブロック図である。It is a functional block diagram of the experiment data recording device concerning the modification of the embodiment of the present invention. 実験データ表示装置の機能ブロック図である。It is a functional block diagram of an experimental data display device.

本発明の発明者の見地によれば、実験ノートによる実験の記録には、実験者による主観や人為的ミスが介在する余地があり、重要な実験に対して、その結果の検証に多大な時間と労力が必要とされる場合がある。また、実験ノートへの正確かつ十分な記録を求めることは、実験者にとり負担となり、実験の作業効率や、研究活動そのものの生産性を低下させることになりかねない。   According to the viewpoint of the inventor of the present invention, the recording of the experiment by the experiment notebook has room for subjectivity and human error by the experimenter, and it takes a lot of time to verify the result for an important experiment. And labor may be required. In addition, seeking accurate and sufficient records in the experiment notebook is a burden on the experimenter and may reduce the work efficiency of the experiment and the productivity of the research activity itself.

そこで、本発明の発明者は、プロトコルに基づく実験の記録を、客観性かつ高い信頼性を持って記録することについて鋭意研究開発を行った結果、新規かつ独創的な実験データ記録装置等を発明するに至った。以下、かかる実験データ記録装置等をその実施形態を通じ図面を参照しつつ詳述する。   Therefore, the inventor of the present invention has invented a novel and original experiment data recording device, etc. as a result of earnest research and development on recording an experiment record based on a protocol with objectivity and high reliability. It came to do. Hereinafter, such an experimental data recording device and the like will be described in detail with reference to the drawings through the embodiment.

図1は、本発明の実施形態に係る実験データ記録装置1の物理的な構成を示すブロック図である。実験データ記録装置1自体は、専用の機器であってもよいが、ここでは一般的なコンピュータを使用して実現されている。すなわち、市販のコンピュータにおいて、当該コンピュータを実験データ記録装置1として動作させるコンピュータプログラムを実行することによりかかるコンピュータを実験データ記録装置1として使用する。かかるコンピュータプログラムは、一般にアプリケーションソフトウェアの形で提供され、コンピュータにインストールされて使用される。当該アプリケーションソフトウェアは、CD−ROMやDVD−ROMその他のコンピュータ読み取り可能な適宜の情報記録媒体に記録されて提供されてよく、また、インターネット等の各種の情報通信ネットワークを通じて提供されてもよい。あるいは、情報通信ネットワークを通じて遠隔地にあるサーバによりその機能が提供される、いわゆるクラウドコンピューティングにより実現されてもよい。   FIG. 1 is a block diagram showing a physical configuration of an experimental data recording apparatus 1 according to an embodiment of the present invention. The experimental data recording device 1 itself may be a dedicated device, but here is realized using a general computer. That is, in a commercially available computer, the computer is used as the experimental data recording device 1 by executing a computer program that causes the computer to operate as the experimental data recording device 1. Such a computer program is generally provided in the form of application software, and is used by being installed in a computer. The application software may be provided by being recorded on an appropriate computer-readable information recording medium such as a CD-ROM, DVD-ROM, or may be provided through various information communication networks such as the Internet. Alternatively, it may be realized by so-called cloud computing in which the function is provided by a server at a remote place through an information communication network.

図1に示した構成は、実験データ記録装置1として用いられる一般的なコンピュータを示しており、CPU(Central Processing Unit)1a、RAM(Random Access Memory)1b、外部記憶装置1c、GC(Graphics Controller)1d、入力デバイス1e及びI/O(Input/Output)1fがデータバス1gにより相互に電気信号のやり取りができるよう接続されている。ここで、外部記憶装置1cはHDD(Hard Disk Drive)やSSD(Solid State Drive)等の静的に情報を記録できる装置である。またGC1dからの信号はフラットパネルディスプレイ等の、使用者が視覚的に画像を認識するモニタ1hに出力され、画像として表示される。入力デバイス1eはキーボードやマウス、タッチパネル等の、ユーザが情報を入力するための機器であり、I/O1fは実験データ記録装置1が外部の機器と情報をやり取りするためのインタフェースである。   The configuration shown in FIG. 1 shows a general computer used as the experimental data recording device 1, and includes a CPU (Central Processing Unit) 1a, a RAM (Random Access Memory) 1b, an external storage device 1c, and a GC (Graphics Controller). ) 1d, the input device 1e and the I / O (Input / Output) 1f are connected to each other via the data bus 1g so that electrical signals can be exchanged. Here, the external storage device 1c is a device capable of recording information statically, such as an HDD (Hard Disk Drive) or an SSD (Solid State Drive). The signal from the GC 1d is output to a monitor 1h such as a flat panel display where the user visually recognizes the image and displayed as an image. The input device 1e is a device for a user to input information, such as a keyboard, a mouse, and a touch panel, and the I / O 1f is an interface for the experimental data recording device 1 to exchange information with an external device.

図2は、本実施形態に係る実験データ記録装置1の機能ブロック図である。なお、ここで示した機能ブロックは、実験データ記録装置1が有する機能に着目して示したものであり、必ずしも各機能ブロックに1対1に対応する物理的構成が存在することを有しない。いくらかの機能ブロックは実験データ記録装置1のCPU1a等の情報処理装置が特定のソフトウェアを実行することにより実現され、またいくらかの機能ブロックは実験データ記録装置1のRAM1b等の情報記憶装置に特定の記憶領域が割り当てられることにより実現される。   FIG. 2 is a functional block diagram of the experimental data recording apparatus 1 according to this embodiment. Note that the functional blocks shown here are shown paying attention to the functions of the experimental data recording apparatus 1 and do not necessarily have a physical configuration corresponding to each functional block. Some functional blocks are realized by an information processing device such as the CPU 1a of the experimental data recording apparatus 1 executing specific software, and some functional blocks are specific to an information storage device such as the RAM 1b of the experimental data recording device 1. This is realized by allocating a storage area.

実験データ記録装置1は、プロトコルを示す電子データであるプロトコルデータを記憶するプロトコルデータ記憶部10、実験データを記憶する実験データ記憶部11を有しており、実験の際に得られる実験データを、その実験が基いたプロトコルを示すプロトコルデータと関連付けて記録するものである。ここで、プロトコルは、生化学や生物・生命工学等の分野において試料に対しなされる前処理等の作業手順及び条件を指しており、プロトコルに含まれる個々の手順を、指定された条件及び順番で行うことにより、所定の実験がなされるよう記述されるものである。なお、プロトコルは、通常、生化学又は生物・生命工学等の分野における実験(狭義の実験に留まらず、特定の手順でサンプルや試薬、試料等に所定の処理を施すことを含み、生産や製造行為等も含む)の実施者又は計画者が計画通りの実験を行ったり、実験内容を記録・伝達したりする等のために記載するものである。したがって、ここで言うプロトコルは、上述の通り、1又は2以上の作業手順等を含めば、特定の記載形式に限定されるものではない。また、プロトコルに含まれる作業手順の数や質、内容等は、プロトコル作成者の意図に依存するものであるから、これらもまた限定されるものではない。さらに、ここで言うプロトコルが用いられる技術分野は、生化学又は生物・生命工学のみに限定されるわけではないが、本明細書では、少なくとも、生化学及び生物・生命工学の一方が含まれるものとする。プロトコルデータには、当該プロトコルを一意に特定する情報であるプロトコルIDと、プロトコルに含まれる個々の手順を意味する手順データが含まれる。また、実験データは、プロトコルに基づく実験において、実験そのものや実験の各種条件、実験において用いられた各種器具の動作記録等の、実験に関する各種情報を指す。特に、実験データには、実験そのものを一意に特定する情報である実験IDと、実験に用いられた各種器具の動作記録が含まれる。   The experimental data recording apparatus 1 includes a protocol data storage unit 10 that stores protocol data that is electronic data indicating a protocol, and an experimental data storage unit 11 that stores experimental data, and stores experimental data obtained during an experiment. The data is recorded in association with protocol data indicating the protocol on which the experiment is based. Here, the protocol refers to work procedures and conditions such as pretreatment performed on samples in the fields of biochemistry, biology / biotechnology, etc., and the individual procedures included in the protocol are designated by specified conditions and order. It is described that a predetermined experiment is performed by performing the above. The protocol usually includes experiments in the field of biochemistry or biology / biotechnology (not limited to experiments in a narrow sense, but includes performing predetermined treatments on samples, reagents, samples, etc. in a specific procedure, and It is described so that an implementer or planner (including actions etc.) conducts experiments as planned or records / transmits the contents of experiments. Therefore, the protocol referred to here is not limited to a specific description format as long as it includes one or more work procedures as described above. Further, since the number, quality, contents, etc. of work procedures included in the protocol depend on the intention of the protocol creator, these are not limited. Furthermore, the technical field in which the protocol used here is not limited to biochemistry or bio / biotechnology, but in this specification, at least one of biochemistry and bio / biotechnology is included. And The protocol data includes a protocol ID, which is information for uniquely identifying the protocol, and procedure data indicating individual procedures included in the protocol. The experimental data refers to various information related to the experiment, such as the experiment itself, various conditions of the experiment, and operation records of various instruments used in the experiment. In particular, the experiment data includes an experiment ID, which is information for uniquely identifying the experiment itself, and operation records of various instruments used in the experiment.

なお、プロトコルデータ記憶部10、又は後述するプロトコルサーバ32、或いはこれらの両方は、プロトコルIDに紐づけられた1又は複数のプロトコルデータを記憶してよく、プロトコルIDからプロトコルデータを特定することができる等、一般的なデータベース類似の機能を有していてよい。   Note that the protocol data storage unit 10, the protocol server 32 described later, or both of them may store one or a plurality of protocol data associated with the protocol ID, and may specify the protocol data from the protocol ID. For example, it may have a function similar to a general database.

実験データ記録装置1は、実験データに含まれる各種情報を実験の際に記録する種々の記録部を含んでいる。実験ID記録部12は、実験を行う際に、実験IDをプロトコルIDに紐づけて、実験データとして実験データ記憶部11に記録する。この紐づけは、具体的には、実験データ中にプロトコルIDと実験IDの両方が含まれることにより、実験IDにより特定される実験が、プロトコルIDにより特定されるプロトコルに基づいてなされたことが示される。なお、実験データに、プロトコルデータそのものを付加してもよい。実験IDは、実験毎に、実験ID発行部13により発行される。   The experimental data recording device 1 includes various recording units that record various information included in the experimental data during the experiment. When performing the experiment, the experiment ID recording unit 12 associates the experiment ID with the protocol ID and records the experiment ID in the experiment data storage unit 11. Specifically, this association indicates that the experiment specified by the experiment ID is based on the protocol specified by the protocol ID by including both the protocol ID and the experiment ID in the experiment data. Indicated. Note that the protocol data itself may be added to the experimental data. The experiment ID is issued by the experiment ID issuing unit 13 for each experiment.

なお、実験データ記憶部11、又は後述する実験データ格納装置26、或いはこれらの両方もまた、プロトコルID及び実験IDに紐づけられた1又は複数の実験データを記憶してよく、実験IDから実験データを特定したり、プロトコルIDから実験データを検索したりすることができる等、一般的なデータベース類似の機能を有していてよい。   Note that the experiment data storage unit 11 or the experiment data storage device 26 described later, or both of them may also store one or a plurality of experiment data associated with the protocol ID and the experiment ID. It may have a function similar to a general database, such as being able to specify data or search experimental data from a protocol ID.

実験ID発行部13は、実験IDを自ら生成するものであってもよいが、通信部20を介して接続される、外部の実験ID生成装置24により生成された実験IDを取得するものであってもよい。実験ID生成装置24を、インターネット等の電気通信回線を介して通信可能なwebサーバとして、複数の実験データ記録装置1に共通に設置することで、異なる実験データ記録装置1においても重複することなく、実験IDを一意に発行することができる。あるいは、実験ID発行部13により発行する実験IDにある種の制限、例えば、実験データ記録装置1に固有に設定されたIDを実験IDの一部として使用する等を施すことにより、実験IDの一意性を担保してもよい。いずれにせよ、実験IDは実験ごとに固有のものとして発行され、以下に説明する実験データに含まれる種々の情報は、この実験IDと紐付けて記録されるから、これら種々の情報がどの実験についての情報であるのかが明確に記録されることになる。   The experiment ID issuing unit 13 may generate the experiment ID by itself, but acquires the experiment ID generated by the external experiment ID generating device 24 connected via the communication unit 20. May be. By installing the experiment ID generating device 24 as a web server that can communicate via an electric communication line such as the Internet in common to a plurality of experimental data recording devices 1, there is no duplication in different experimental data recording devices 1. The experiment ID can be issued uniquely. Alternatively, by giving a certain restriction to the experiment ID issued by the experiment ID issuing unit 13, for example, using an ID uniquely set in the experiment data recording device 1 as a part of the experiment ID, Uniqueness may be guaranteed. In any case, the experiment ID is issued as unique to each experiment, and various information included in the experiment data described below is recorded in association with this experiment ID. It will be clearly recorded whether it is information about.

実験環境データ記録部14は、実験についての実験環境データを実験データとして実験データ記憶部11に記録する。実験環境データは、実験そのものについての条件を示すデータであり、少なくとも、実験者、実験場所、実験日時、実験器具を示すデータのいずれかが含まれる。実験者は、直接実験を行った人物又は実験に責任を持つ人物を特定する情報であり、実験場所は実験を行った建物や部屋、ブース番号等の場所を特定する情報であり、実験日時は実験を行った日時を特定する情報であり、実験の開始時刻や、これに加えて終了時刻を含んでよい。そして、実験器具を示すデータは、実験に用いられた実験器具を特定する情報である。例えば、後述するように、実験器具が電動ピペットである場合には、その電動ピペットのシリアル番号等の固有のIDが実験器具を特定する情報に相当する。実験器具が複数用いられた場合、例えば、複数の電動ピペットが用いられたり、電動ピペットに加え顕微鏡が用いられたりした場合には、それぞれの実験器具固有のIDが全て実験器具を示すデータとして、実験環境データに含まれてよい。実験環境データもまた、実験が真正に行われたことを示す重要なデータとして活用できる。   The experiment environment data recording unit 14 records the experiment environment data regarding the experiment in the experiment data storage unit 11 as experiment data. The experimental environment data is data indicating conditions for the experiment itself, and includes at least one of data indicating the experimenter, the experiment place, the experiment date and time, and the experimental instrument. The experimenter is information that identifies the person who directly performed the experiment or the person responsible for the experiment, and the experiment location is information that identifies the location of the building, room, booth number, etc. where the experiment was performed, This information specifies the date and time when the experiment was performed, and may include the start time of the experiment and the end time in addition to this. The data indicating the experimental instrument is information that identifies the experimental instrument used in the experiment. For example, as will be described later, when the experimental instrument is an electric pipette, a unique ID such as a serial number of the electric pipette corresponds to information for specifying the experimental instrument. When a plurality of experimental instruments are used, for example, when a plurality of electric pipettes are used, or when a microscope is used in addition to the electric pipettes, the IDs unique to each experimental instrument are all data indicating the experimental instruments, It may be included in the experimental environment data. The experimental environment data can also be used as important data indicating that the experiment has been carried out genuinely.

対象試料ID記録部15は、実験に用いた試料を特定する情報である対象試料IDを実験データとして実験データ記憶部11に記録する。また、結果試料ID記録部16は、実験に用いた試料に対して各種操作を施した結果得られる、実験の結果物としての試料を特定する情報である結果試料IDを実験データとして実験データ記憶部11に記録する。これにより、実験に用いられた対象試料と、実験の結果得られた結果試料を正確に特定できる。対象試料ID及び結果試料IDは、例えば、試料が格納された試験管やペトリ皿等の容器に付された容器を示すIDを、リーダ17により読み取り、対象試料ID又は結果試料IDとして用いてよい。   The target sample ID recording unit 15 records the target sample ID, which is information for specifying the sample used in the experiment, in the experimental data storage unit 11 as experimental data. In addition, the result sample ID recording unit 16 stores the result sample ID, which is information for specifying the sample as a result of the experiment, obtained as a result of performing various operations on the sample used in the experiment as experiment data. Part 11 is recorded. Thereby, the target sample used for the experiment and the result sample obtained as a result of the experiment can be accurately specified. As the target sample ID and the result sample ID, for example, an ID indicating a container attached to a container such as a test tube or a Petri dish in which the sample is stored may be read by the reader 17 and used as the target sample ID or the result sample ID. .

動作記録記録部18は、実験において用いられた各種器具の動作記録を実験データとして実験データ記憶部11に記録する。ここで、動作記録は、実験に用いた実験器具19の動作の記録であり、通信部20を介して受信部21により受信される。動作記録の具体的な例については後述する。動作記録は、プロトコルに含まれる個々の手順が、具体的な実験器具19を用いて現実に行われたことを記録するものであるので、動作記録記録部18は、動作記録のそれぞれを、プロトコルデータ中の対応する手順データに紐づけて記録する。これにより、実験データに含まれる動作記録のそれぞれが、プロトコルに含まれる複数の手順のうち、どの手順に対応しているのかを特定できる。   The operation record recording unit 18 records operation records of various instruments used in the experiment in the experiment data storage unit 11 as experiment data. Here, the operation record is a record of the operation of the experimental instrument 19 used in the experiment, and is received by the receiving unit 21 via the communication unit 20. A specific example of operation recording will be described later. Since the operation record records that each procedure included in the protocol is actually performed using a specific experimental instrument 19, the operation record recording unit 18 stores each of the operation records in the protocol. Record in association with the corresponding procedure data in the data. Thereby, it is possible to identify which procedure corresponds to each of the operation records included in the experimental data among the plurality of procedures included in the protocol.

分析データ記録部22は、実験が終了した後得られた結果試料を、外部の分析機23により分析した結果の情報である分析データを、実験データとして実験データ記憶部11に記録する。このとき、分析機23による分析がなされた試料を特定するため、分析データ記録部22は、分析データを結果試料IDと紐づけて記録する。この分析データには、分析対象となった試料の情報に加え、分析環境に関する情報、例えば、分析に用いた分析機を特定するIDや、各種分析条件、分析日時を示す情報が含まれてよい。これにより、実験データにより、実験の事実のみならず、得られた結果までも合わせて評価できることになる。また、結果試料IDは、実験IDと紐付けられているため、分析データは、実験IDとも紐づけられることになる。   The analysis data recording unit 22 records, in the experiment data storage unit 11, analysis data, which is information obtained as a result of analyzing the result sample obtained after the experiment is completed by the external analyzer 23. At this time, in order to specify the sample analyzed by the analyzer 23, the analysis data recording unit 22 records the analysis data in association with the result sample ID. The analysis data may include information on the analysis environment, for example, an ID for identifying the analyzer used for the analysis, various analysis conditions, and information indicating the analysis date and time in addition to the information on the sample to be analyzed. . As a result, not only the fact of the experiment but also the obtained result can be evaluated based on the experimental data. Since the result sample ID is associated with the experiment ID, the analysis data is also associated with the experiment ID.

実験データ格納部25は、以上説明した各種の記録部により記録され、実験データ記憶部11に記憶された実験データを、通信部20を介して外部の実験データ格納装置26に格納する。実験データ格納装置26がインターネット等の電気通信回線を介して通信可能なwebサーバとして設置されているものである場合、格納された実験データは、実験データ記録装置1以外の機器からも閲覧可能であり、また、実験者以外の第三者からも閲覧可能となる。実験データの機密性を確保し、また閲覧可能な者を制限するために、実験データ格納装置26に格納される実験データに、パスワードを付加したり、閲覧制限を付加し、対応する閲覧権限を持つ者に閲覧を制限するようにしたりしてもよい。また、この実験データ格納部25による実験データの格納は、改ざん防止部33を通じて、実験データに適宜の改ざん防止処理を施すとよい。改ざん防止部33は、実験データに公知の改ざん防止処理、例えば、電子証明を付与したり、非公開のハッシュ関数によるハッシュ値を付加する等により、電子データの改ざんを防止する。これにより、実験データに人為的な操作がなされたり、データの破損が検出可能となり、実験データの信頼性・正確性が保たれる。   The experimental data storage unit 25 stores the experimental data recorded by the various recording units described above and stored in the experimental data storage unit 11 in the external experimental data storage device 26 via the communication unit 20. When the experimental data storage device 26 is installed as a web server that can communicate via an electric communication line such as the Internet, the stored experimental data can be viewed from devices other than the experimental data recording device 1. Yes, and can be viewed from third parties other than the experimenter. In order to ensure the confidentiality of the experimental data and to restrict who can view it, the experiment data stored in the experimental data storage device 26 is given a password or a viewing restriction, and the corresponding viewing authority is granted. The viewing may be restricted to those who have it. In addition, the experiment data storage unit 25 may store the experiment data through the tampering prevention unit 33 so that the experiment data is appropriately tampered with. The falsification preventing unit 33 prevents falsification of electronic data by performing a known falsification preventing process on the experimental data, for example, by giving an electronic certificate or adding a hash value by a private hash function. This makes it possible to perform an artificial operation on the experimental data or to detect data corruption, thereby maintaining the reliability and accuracy of the experimental data.

通信部20は、実験データ記録装置1と外部の各種機器との電気的通信を行う。通信部20は、図1のI/O1fにより実現され、その通信の有線/無線の別や使用する通信規格は問わない。特に、通信部20は、実験器具19と通信し、その動作記録を受信部21に受信させる。   The communication unit 20 performs electrical communication between the experimental data recording device 1 and various external devices. The communication unit 20 is realized by the I / O 1f shown in FIG. 1, and it does not matter whether the communication is wired / wireless or the communication standard used. In particular, the communication unit 20 communicates with the experimental instrument 19 and causes the reception unit 21 to receive an operation record thereof.

実験中プロトコル表示部27は、実験中に、プロトコルデータ記憶部10に記憶されたプロトコルデータに基づいて、実験に用いられるプロトコルをモニタ1h上に表示する。これにより、実験者が実験器具19を直接操作して実験を行う場合に、実験者がプロトコルを確認しながら操作を行うことができる。そのような実験者が直接操作すべき実験器具19としては、例えば電動ピペットや、顕微鏡が挙げられる。また、実験器具19がロボットであり、ロボット制御装置がプロトコルデータを解釈して実験を自動で行う場合等には、実験中プロトコル表示部27により、実験に立ち会う実験者が、ロボットがプロトコルに含まれるどの操作を行っているのかを確認することができる。   The experimental protocol display unit 27 displays the protocol used for the experiment on the monitor 1h based on the protocol data stored in the protocol data storage unit 10 during the experiment. Thereby, when an experimenter performs an experiment by directly operating the experimental instrument 19, the experimenter can perform an operation while confirming the protocol. Examples of the experimental instrument 19 to be directly operated by such an experimenter include an electric pipette and a microscope. In addition, when the experimental instrument 19 is a robot and the robot controller interprets the protocol data and automatically performs the experiment, an experimenter who witnesses the experiment is included in the protocol by the protocol display unit 27 during the experiment. You can check which operation is being performed.

実験後プロトコル表示部28は、実験が行われたプロトコルについて、プロトコルデータ記憶部10に記憶されたプロトコルデータ、又は、実験データ記憶部11に記憶された実験データにプロトコルデータが含まれる場合には、当該プロトコルデータに基づいて、当該プロトコルをモニタ1h上に表示する。さらに、動作記録表示部29は、実験データ記憶部11に記憶された実験データに基づいて、モニタ1h上に表示されたプロトコルに含まれる手順それぞれに対応付けて、動作記録をモニタ1h上に同時に表示する。このように、モニタ1h上で、プロトコルと実験データとを、個々の手順に動作記録を対応付けて表示することにより、実験に含まれる個々の手順が、実際にどのように行われたかが直ちに把握できる。また、分析データ表示部30は、さらに、外部の分析機23により得られた分析データを、実験により得られた結果試料と対応付けてモニタ1h上に表示する。これにより、実験が依拠したプロトコルと、その実験の履歴、並びに、実験の結果得られた分析データが互いに関連付けて示され、これら情報は互いに紐づいているため、プロトコルに基づく実験の記録が、客観性かつ高い信頼性をもって示されることになる。また、この記録は実験データ記録装置1により自動的に記録されるから、実験を記録するために、実験ノートに細かな記入を求めるなど実験者に余計な負担をかけることがない。   The post-experiment protocol display unit 28, when the protocol is included in the protocol data stored in the protocol data storage unit 10 or the experimental data stored in the experiment data storage unit 11 for the protocol in which the experiment was performed Based on the protocol data, the protocol is displayed on the monitor 1h. Further, the operation record display unit 29 simultaneously records the operation record on the monitor 1h in association with each procedure included in the protocol displayed on the monitor 1h based on the experiment data stored in the experiment data storage unit 11. indicate. In this way, the protocol and experiment data are displayed on the monitor 1h in association with the operation records of the individual procedures, so that it is possible to immediately grasp how the individual procedures included in the experiment were actually performed. it can. The analysis data display unit 30 further displays the analysis data obtained by the external analyzer 23 on the monitor 1h in association with the result sample obtained by the experiment. As a result, the protocol on which the experiment was based, the history of the experiment, and the analysis data obtained as a result of the experiment are shown in association with each other, and these information are linked to each other. It will be shown with objectivity and high reliability. Further, since this recording is automatically recorded by the experimental data recording apparatus 1, there is no extra burden on the experimenter such as requiring detailed entry in the experiment notebook in order to record the experiment.

図3は、表示部27又はプロトコル表示部28によりモニタ1hに表示されるプロトコルの一例を示す図である。ここで示すように、プロトコルは、図表(チャート)の形式で、プロトコルに含まれる各手順とその実行順や条件、実験に用いる器具が明瞭に示されている。以降、プロトコルを図表の形式で示したものをプロトコルチャートと称する。なお、図3に示されたプロトコルチャートはその一部分である。   FIG. 3 is a diagram illustrating an example of a protocol displayed on the monitor 1 h by the display unit 27 or the protocol display unit 28. As shown here, the protocol is in the form of a chart (chart), and clearly shows each procedure included in the protocol, its execution order and conditions, and instruments used in the experiment. Hereinafter, the protocol in the form of a chart is referred to as a protocol chart. Note that the protocol chart shown in FIG. 3 is a part thereof.

より詳細には、この例で示すプロトコルチャートでは、実験に用いる試料を収容し、また試料に各種操作を加える上で使用する容器ごとに、その手順を上から下に縦に並べて示している。実験に用いる容器は、横に並べて示され、縦軸に沿った一連の手順は、一の容器に対して順に行われることが明示される。   More specifically, in the protocol chart shown in this example, the sample used for the experiment is accommodated, and the procedure is arranged vertically from top to bottom for each container used for various operations on the sample. The containers used for the experiment are shown side by side, and it is clearly shown that a series of procedures along the vertical axis are sequentially performed on one container.

容器は、容器の初期状態を意味するシンボル100aと容器の最終状態を意味するシンボル100bによって表され、その容器又はその容器に収容された試料の流れは、容器シンボル100aから容器シンボル100bへと向かう縦の矢印により示されている。容器や、容器に収容された試料になされる手順は、個々の手順を示すシンボル100cにより示されている。ここでは、手順が容器から内容物を取り出す操作(例えば、内容物の廃棄を意味する「Discard」等)である場合には、縦の矢印から引き出される矢印、容器に内容物を加える操作(たとえば、試薬などの添加を意味する「Add」等)である場合には、縦の矢印に合流する矢印により、また、容器単独で行う操作(例えば、細胞のかき取りを意味する「Scrape」や、遠心分離を意味する「Centrifuge」等)は縦の矢印上にシンボル100cを配置することにより個々の手順がどのようなものであるかが視覚的に分かりやすく表示されている。個々のシンボル100cには、それぞれ、用いる試薬や分量などの条件が示される。実験における手順の実行順は、各シンボルの配置位置により、すなわち、上から下の優先順位で、また、高さが同じシンボルの場合には左から右の優先順位で実行するものと定められているため、各手順の実行順もまた一意に示されている。   The container is represented by a symbol 100a that represents the initial state of the container and a symbol 100b that represents the final state of the container, and the flow of the container or the sample contained in the container is directed from the container symbol 100a to the container symbol 100b. It is indicated by a vertical arrow. The procedure performed on the container or the sample contained in the container is indicated by a symbol 100c indicating the individual procedure. Here, when the procedure is an operation of taking out the contents from the container (for example, “Discard” or the like meaning disposal of the contents), an arrow drawn from the vertical arrow, an operation of adding the contents to the container (for example, , "Add" meaning the addition of a reagent, etc.), an operation that is performed by an arrow that merges with a vertical arrow, or an operation performed by a container alone (for example, "Scrape" meaning scraping of cells, In the case of “Centrifuge” or the like, which means centrifugation, a symbol 100c is arranged on a vertical arrow, so that each procedure is displayed in a visually easy-to-understand manner. Each symbol 100c indicates conditions such as a reagent to be used and a quantity. The order of execution of the procedures in the experiment is determined according to the arrangement position of each symbol, that is, in order of priority from top to bottom, or from left to right in the case of symbols having the same height. Therefore, the execution order of each procedure is also uniquely indicated.

プロトコルデータ記憶部10に記憶されるプロトコルデータは、図3に示すようなプロトコルに一意に付与されたプロトコルIDと、プロトコルに示される各手順を示す手順データを含んでいる。ここで、手順データは、図3に示した個々のシンボルに対応するデータである。実験中プロトコル表示部27は、かかるプロトコルデータを解釈し、モニタ1h上に、図3に示すような態様でプロトコルチャートを表示する。なお、図3に示したプロトコルチャートは一例であり、プロトコルを表現する形式として、異なる形式でプロトコルを示しても差し支えないが、少なくとも、プロトコルに含まれる個々の手順はそれぞれ独立して明示される。   The protocol data stored in the protocol data storage unit 10 includes a protocol ID uniquely assigned to the protocol as shown in FIG. 3 and procedure data indicating each procedure indicated in the protocol. Here, the procedure data is data corresponding to the individual symbols shown in FIG. The in-experiment protocol display unit 27 interprets the protocol data and displays a protocol chart on the monitor 1h in a manner as shown in FIG. Note that the protocol chart shown in FIG. 3 is an example, and the protocol may be expressed in a different format as a format for expressing the protocol, but at least individual procedures included in the protocol are specified independently. .

図4は、実験データ記録装置1を含む、実験システム全体を示す概念図である。同図では、インターネット等に代表される広域電気通信回線に種々の機器が互いに通信可能に接続されている様子を示している。   FIG. 4 is a conceptual diagram showing the entire experimental system including the experimental data recording device 1. This figure shows a state in which various devices are communicably connected to a wide area telecommunication line represented by the Internet or the like.

図中左下に示した実験データ記録装置1は、実験器具19の例として実験者が直接操作する器具である電動ピペットが接続されており、実験者が行う実験についての記録を実験データ記録装置1で記録することを意図したものである。実験データ記録装置1には、別途用意された(または、実験データ記録装置1自体を兼用してもよい)プロトコル作成装置31により作成されたプロトコルデータが読み込まれるようにしてよい。   The experiment data recording apparatus 1 shown in the lower left of the figure is connected to an electric pipette that is an instrument directly operated by an experimenter as an example of the experiment instrument 19, and records the experiment performed by the experimenter. It is intended to be recorded with. The experimental data recording device 1 may be configured to read protocol data created by a protocol creation device 31 that is separately prepared (or may also serve as the experimental data recording device 1 itself).

図中右下に示した実験データ記録装置1は、実験器具19の例として自動装置、ここでは汎用のロボットが接続されており、プロトコルデータに基づく実験をロボットの自動制御により実行し、その記録を実験データ記録装置1で記録することを意図したものである。この実験データ記録装置1には、電気通信回線を通して接続されたサーバであるプロトコルサーバ32に蓄積されたプロトコルデータがダウンロードされ、かかるプロトコルデータに基づいて実験が記録され、またロボットが制御されてよい。プロトコルサーバ32には、実験を行う主体となる実験者が作成したプロトコルデータのみならず、第三者が作成した多数のプロトコルデータが蓄積されていてよく、これにより、他の研究者による実験の追試を容易に行ったり、他の研究者が作成したプロトコルを利用して新たな実験を行ったりすることができるなど、知的資産としてのプロトコルの有効活用が図られる。   The experiment data recording apparatus 1 shown at the lower right in the figure is connected to an automatic device, here a general-purpose robot, as an example of the experimental instrument 19, and performs an experiment based on protocol data by automatic control of the robot, and records it. Is intended to be recorded by the experimental data recording device 1. The experimental data recording apparatus 1 may download protocol data stored in a protocol server 32, which is a server connected through a telecommunication line, record experiments based on the protocol data, and control the robot. . The protocol server 32 may store not only the protocol data created by the experimenter who is the subject of the experiment, but also a large number of protocol data created by a third party. The protocol can be used effectively as an intellectual asset, such as making it easy to make additional tests or conducting new experiments using protocols created by other researchers.

電気通信回線には、その他、分析機23、実験ID生成装置24及び実験データ格納装置26等が実験データ記録装置1と通信可能に接続されていてよい。これら機器については、すでに述べたとおりである。   In addition, the analyzer 23, the experiment ID generation device 24, the experiment data storage device 26, and the like may be connected to the experiment data recording device 1 so as to be communicable with the telecommunication line. These devices have already been described.

以上示した実験システムを通じて、実験データ記録装置1が収集記録した実験データは、ユーザからの要求等に基づいて、実験データ記録装置1のモニタ1h上に、図2に示した実験後プロトコル表示部28、動作記録表示部29及び分析データ表示部30によりプロトコルチャートに重ね合わせて表示される。図5は、実験データがプロトコルチャート上に重ね合わせて表示されている様子の一例を示す図である。   The experimental data collected and recorded by the experimental data recording device 1 through the experimental system shown above is displayed on the monitor 1h of the experimental data recording device 1 on the monitor 1h of the experimental data recording device 1 based on a request from the user. 28, the operation record display unit 29 and the analysis data display unit 30 display them superimposed on the protocol chart. FIG. 5 is a diagram illustrating an example of a state in which experimental data is displayed superimposed on the protocol chart.

実験後プロトコル表示部28がモニタ1h上にプロトコルチャートを表示する点については、先に説明した実験中プロトコル表示部27によるものとおおむね同様である。ここでは、図3に示したものと同じプロトコルチャートが示されているものとし、各種シンボル100によりプロトコルが示される点も同様である。   The point that the post-experiment protocol display unit 28 displays the protocol chart on the monitor 1h is almost the same as that by the in-experiment protocol display unit 27 described above. Here, it is assumed that the same protocol chart as that shown in FIG. 3 is shown, and the protocol is indicated by various symbols 100.

動作記録表示部29は、実験データに含まれる動作記録を、プロトコルチャート上の各シンボルの近傍に表示する。これにより、動作記録と、プロトコルに含まれる手順とが対応付けられて示されることになる。図5に示した例では、例えば、左上のシンボル100aに対し、対象試料名(「サンプル1」)とその対象試料ID(「1400010」)、試料が準備された時刻が、又そのすぐ下のシンボル100cに対しては、使用した実験器具名(「ピペット4」)とそのID(「450341」)、使用したチップとその個体番号(「チップ4340」及び「2689912」)、液体を吸引廃棄した分量の実測値(「627μL」)、手順が実行された時刻が示される。同様に、その下のシンボル100cでは使用した試薬のID(「156710」)が、さらにその下のシンボル100cでは用いたスクレーパの個体番号(「156710」)がそれぞれ時刻とともに示されている。このように、動作記録表示部29は、実験器具の動作記録を、個々の手順に対応付けて表示し、動作記録には、使用した器具や消耗品、試薬、時刻、作動量(分量や時間)等が含まれる。   The operation record display unit 29 displays the operation record included in the experimental data in the vicinity of each symbol on the protocol chart. As a result, the operation record and the procedure included in the protocol are displayed in association with each other. In the example illustrated in FIG. 5, for example, the target sample name (“Sample 1”), the target sample ID (“1400010”), and the time when the sample was prepared are directly below the symbol 100a at the upper left. For the symbol 100c, the name of the experimental instrument used ("Pipette 4") and its ID ("450341"), the used chip and its individual number ("Tips 4340" and "2689912"), and the liquid were aspirated and discarded. The measured value of the quantity (“627 μL”) and the time when the procedure was executed are shown. Similarly, the symbol 100c below it indicates the ID of the reagent used (“156710”), and further the symbol 100c below it indicates the individual number of the scraper used (“156710”) along with the time. As described above, the operation record display unit 29 displays the operation record of the experimental instrument in association with each procedure, and the operation record includes the used instrument, consumable, reagent, time, and operation amount (amount and time). ) Etc. are included.

さらにその下のシンボル100cは試料の容器間の移送を指示するものであるが、ここで符号101に示したように、実験中に撮影された実際の試料の写真などの画像や、実験中に計測記録された温度、pHなどの物理量を、合わせて動作記録として示してよい。このようにすることにより、プロトコルに基づく実験が確かに行われたこと、また、個々の手順がどのように実施されたか、その過程で試料がどのように変化したかを詳細に追跡することが可能となる。   Further, the symbol 100c below it indicates the transfer of the sample between the containers. As indicated by reference numeral 101 here, an image such as a photograph of the actual sample taken during the experiment, or during the experiment. Physical quantities such as temperature and pH measured and recorded may be shown together as operation records. In this way, it is possible to track in detail how the protocol-based experiments were performed, how individual procedures were performed, and how the sample changed during the process. It becomes possible.

また、プロトコル上部に符号102で示すように、種々の実験環境データを実験ID並びにプロトコルIDとともに示してよい。これにより、実験が行われた状況、たとえば、その実験は何時、誰によりなされたか、といったこともまた誤りなく確認されることになる。   Further, as indicated by reference numeral 102 at the top of the protocol, various experimental environment data may be indicated together with the experimental ID and protocol ID. As a result, the situation in which the experiment was performed, for example, when and by whom the experiment was performed, can also be confirmed without error.

さらに、分析データ表示部30は、モニタ1h上に、プロトコルチャート及び実験データと併せて、分析データを符号103に示すように表示する。この分析データの表示形式は一例であるが、これは対象試料IDが1400010であるサンプル1についての分析データであり、分析対象となった結果試料IDは9400010であること、分析結果について何らかの基準による判断(例えば、信頼できる実験結果である等)がOKであったことが示されている。なお、表示されている分析データの右上に「LOG」とあるが、この例では、この部分を選択することにより、分析データに換えて、実験データのより詳細な情報(細かな数値など)が表示されるようになっている。   Further, the analysis data display unit 30 displays the analysis data as indicated by reference numeral 103 on the monitor 1h together with the protocol chart and the experimental data. The display format of this analysis data is an example, but this is analysis data for sample 1 whose target sample ID is 1400010, the result sample ID as the analysis target is 9400010, and the analysis result is based on some criteria It is shown that the judgment (for example, a reliable experimental result) was OK. Note that “LOG” is displayed at the upper right of the displayed analysis data. In this example, by selecting this part, more detailed information (such as detailed numerical values) of the experimental data can be substituted for the analysis data. It is displayed.

また、同一のプロトコルによる一連の実験において、複数の対象試料について実験がなされた場合、これを対象試料ごとに切り替えて表示できるようにしてもよい。図5に示した例では、プロトコルチャート右上にタブ104が示されており、閲覧したい対象試料IDに応じたタブを選択することにより、それぞれの対象試料ごとの実験データ及び分析データが表示されるようになっている。なお、分析データの表示にあたって、複数の対象試料についての分析データを重ね合わせるなどして比較表示することとしてもよい。また、表示の切り替えを対象試料ごとでなく、結果試料ごととしてもよい。   Further, when a plurality of target samples are tested in a series of experiments based on the same protocol, these may be switched and displayed for each target sample. In the example shown in FIG. 5, a tab 104 is shown on the upper right side of the protocol chart. By selecting a tab corresponding to a target sample ID to be browsed, experimental data and analysis data for each target sample are displayed. It is like that. In displaying the analysis data, the analysis data for a plurality of target samples may be compared and displayed, for example. Further, the display may be switched not only for each target sample but for each result sample.

図6は、実験データ記録装置1が実験データを記録する動作を示すフロー図である。なお、このフローは一例として示したものであり、必ずしもここで示した全ての動作がなされることを要求するものではない。   FIG. 6 is a flowchart showing an operation of recording the experimental data by the experimental data recording apparatus 1. This flow is shown as an example, and does not necessarily require that all operations shown here are performed.

まず、ステップST1にて、プロトコルデータ記憶部10にプロトコルサーバ32などからプロトコルデータをダウンロードし、読み込む。プロトコルデータには、プロトコルIDと手順データが含まれている。   First, in step ST1, protocol data is downloaded from the protocol server 32 or the like to the protocol data storage unit 10 and read. The protocol data includes a protocol ID and procedure data.

続くステップST2にて、読み込んだプロトコルデータに基づいて、表示部27によりプロトコルチャートを表示する。   In subsequent step ST2, a protocol chart is displayed on the display unit 27 based on the read protocol data.

ステップST3では、実験ID発行部13が実験IDを発行し、実験ID記録部12が当該実験IDを記録する。実験IDの発行は、例えば、実験ID発行部13が実験ID生成装置24に実験IDを生成させることによりなされる。   In step ST3, the experiment ID issuing unit 13 issues an experiment ID, and the experiment ID recording unit 12 records the experiment ID. The experiment ID is issued, for example, when the experiment ID issuing unit 13 causes the experiment ID generating device 24 to generate an experiment ID.

ステップST4では、実験環境データ記録部14が、各種機器から必要な情報を収集し、記録する。ここでの各種機器は、実験環境データとして必要な情報に依存しており、例えば、実験者のIDであれば、IDカードリーダであってよいし、実験に用いる実験器具のIDであれば、実験器具そのものであってよい。   In step ST4, the experimental environment data recording unit 14 collects and records necessary information from various devices. Various devices here depend on information necessary as experimental environment data. For example, an ID of an experimenter may be an ID card reader, or an ID of an experimental instrument used in an experiment. It may be a laboratory instrument itself.

ステップST5では、対象試料ID記録部15が、実験に用いる対象試料のIDを記録する。対象試料IDは、例えば、リーダ17により読み取られてよい。   In step ST5, the target sample ID recording unit 15 records the ID of the target sample used for the experiment. The target sample ID may be read by the reader 17, for example.

ステップST6では、受信部21が、実験に用いる実験器具19の動作記録を受信し、動作記録記録部18が当該動作記録を記録する。この記録は、プロトコルに含まれる手順が実行される間、それぞれの手順について行われ、収集される個々の動作記録は、プロトコルに含まれる対応する各手順に紐づけて記録される。   In step ST6, the receiving unit 21 receives an operation record of the experimental instrument 19 used for the experiment, and the operation record recording unit 18 records the operation record. This recording is performed for each procedure while the procedure included in the protocol is executed, and each operation record collected is recorded in association with each corresponding procedure included in the protocol.

ステップST7では、結果試料ID記録部16が、実験の結果得られた結果試料のIDを記録する。この結果試料IDもまた、例えば、リーダ17により読み取られてよい。   In step ST7, the result sample ID recording unit 16 records the ID of the result sample obtained as a result of the experiment. As a result, the sample ID may also be read by the reader 17, for example.

ステップST8では、分析データ記録部22が、分析機23から得られる分析データを記録する。分析データは、分析に供された結果試料の結果試料IDに紐づけられる。   In step ST8, the analysis data recording unit 22 records the analysis data obtained from the analyzer 23. The analysis data is linked to the result sample ID of the result sample subjected to the analysis.

ステップST9では、こうして得られた実験データに改ざん防止部33による改ざん防止処理を施し、さらに続くステップST10では、実験データ格納部25により、当該実験データ格納装置26に格納する。これにより、プロトコルIDと紐づけられ、改ざん防止処理が施された実験データが自動的に記録されることになる。   In step ST9, the experiment data obtained in this way is subjected to a falsification preventing process by the falsification preventing unit 33, and in a further subsequent step ST10, the experiment data storage unit 25 stores the data in the experiment data storage device 26. As a result, experimental data associated with the protocol ID and subjected to the tampering prevention process is automatically recorded.

図7は、実験データ記録装置1が実験データをプロトコルチャートに重ね合わせて表示する動作を示すフロー図である。なお、このフローは一例として示したものであり、必ずしもここで示した全ての動作がなされることを要求するものではない。   FIG. 7 is a flowchart showing an operation in which the experimental data recording apparatus 1 displays the experimental data superimposed on the protocol chart. This flow is shown as an example, and does not necessarily require that all operations shown here are performed.

まずステップST11にて、表示したい実験データを実験データ格納装置26から読み込み、実験データ記憶部11に記憶する。表示したい実験データがすでに記憶済みの場合、このステップは不要である。   First, in step ST11, experimental data to be displayed is read from the experimental data storage device 26 and stored in the experimental data storage unit 11. This step is not necessary if the experimental data to be displayed has already been stored.

続くステップST12で、実験データに紐づけられたプロトコルIDを持つプロトコルデータを、プロトコルサーバ32よりダウンロードし、プロトコルデータ記憶部10に記憶する。プロトコルIDは、プロトコルに一意に付与されるIDであるから、プロトコルIDに基づいて、実験データを得る際に用いた正しいプロトコルがダウンロードされることになる。なお、実験データにプロトコルデータが含まれている場合、このステップは不要である。   In subsequent step ST12, the protocol data having the protocol ID associated with the experimental data is downloaded from the protocol server 32 and stored in the protocol data storage unit 10. Since the protocol ID is an ID uniquely assigned to the protocol, the correct protocol used when obtaining the experimental data is downloaded based on the protocol ID. Note that this step is not necessary when protocol data is included in the experimental data.

ステップST13で、プロトコル表示部28によりプロトコルチャートを表示し、続くステップST14で動作記録表示部29により動作記録をプロトコルチャート中の手順を示すシンボルと関連付けて表示し、さらに、ステップST15で分析データ表示部30により、分析データを表示する。このようにして表示された結果は、図5に例示した通りである。   In step ST13, a protocol chart is displayed by the protocol display unit 28, and in the subsequent step ST14, the operation record display unit 29 displays the operation record in association with a symbol indicating the procedure in the protocol chart. Further, in step ST15, the analysis data is displayed. The analysis data is displayed by the unit 30. The results displayed in this way are as illustrated in FIG.

以上の説明では、改ざん防止部33は、実験データ格納部25が、実験データ記憶部に記憶された実験データを実験データ格納装置に格納する際に、改ざん防止処理を施す例を説明した。この例に対し、改ざん防止処理をより強化した変形例に係る実験データ記録装置1の機能ブロック図を図8に示す。   In the above description, the example in which the falsification preventing unit 33 performs the falsification preventing process when the experimental data storage unit 25 stores the experimental data stored in the experimental data storage unit in the experimental data storage device has been described. FIG. 8 shows a functional block diagram of the experimental data recording apparatus 1 according to a modified example in which tampering prevention processing is further strengthened with respect to this example.

本実施形態に係る実験データ記録装置1では、改ざん防止部33は、実験データ格納部25と通信部20の間ではなく、実験データ記録装置1が有する各記録部、ここでは、実験ID記録部12、実験環境データ記録部14、対象試料ID記録部15、結果試料ID記録部16、動作記録記録部18及び分析データ記録部22と実験データ記憶部11の間に介在するように配置されている。そして、各記録部による各種情報の記録の度に、改ざん防止処理が施される。   In the experimental data recording apparatus 1 according to the present embodiment, the falsification preventing unit 33 is not between the experimental data storage unit 25 and the communication unit 20 but each recording unit included in the experimental data recording device 1, here, an experiment ID recording unit. 12, the experiment environment data recording unit 14, the target sample ID recording unit 15, the result sample ID recording unit 16, the operation recording recording unit 18, and the analysis data recording unit 22 and the experiment data storage unit 11. Yes. A tampering prevention process is performed each time various information is recorded by each recording unit.

これにより、実験データ格納装置26に格納される前の、実験データ記憶部11に記憶されている段階における実験データにも改ざん防止処理が施されるから、改ざん防止処理が施される前の実験データに対し不正な改ざんを行うことが極めて困難となる。   As a result, the tampering prevention process is also performed on the experiment data stored in the experiment data storage unit 11 before being stored in the experiment data storage device 26. Therefore, the experiment before the tampering prevention process is performed. It is extremely difficult to tamper with data.

なお、本変形例における改ざん防止部33による改ざん防止処理は、必ずしも、実験データ記録装置1が有する全ての記録部による各種情報の記録に対しなされずともよく、改ざんを防止すべき事情が認められる情報についてのみ行うようにしてもよい。例えば、少なくとも、動作記録記録部18による動作記録の記録の度に改ざん防止処理を施すようにしてよい。   It should be noted that the falsification preventing process by the falsification preventing unit 33 in the present modification does not necessarily have to be performed on the recording of various types of information by all the recording units included in the experimental data recording apparatus 1, and there are circumstances that should prevent falsification. You may make it carry out only about information. For example, the tampering prevention process may be performed at least every time the operation record recording unit 18 records the operation record.

以上示した実施形態に係る実験データ記録装置1では、実験データ記録装置1が実験データをプロトコルチャートに重ね合わせて表示する動作も行っていた。しかしながら、発明者の見地によれば、実験データをプロトコルと併せ閲覧したいという要求は、実験者のみに限定されるものでなく、実験結果を検証し、また参考としたい第三者によってもなされうるものである。このとき、第三者からは、閲覧しようとする実験結果が、確かにプロトコル通りになされたこと、またその結果が真正であり、客観性・正確性が担保されたものであると確認できれば、結果の検証に必要とされる多大な時間と労力を省略できるなどメリットが大きいと考えられる。   In the experimental data recording device 1 according to the embodiment described above, the experimental data recording device 1 also performs an operation of displaying the experimental data superimposed on the protocol chart. However, according to the inventor's point of view, the request to view the experimental data together with the protocol is not limited to the experimenter, but can be made by a third party who wants to verify and refer to the experimental results. Is. At this time, if the third party can confirm that the experimental result to be viewed is indeed in accordance with the protocol, and that the result is authentic, objective and accurate, It is thought that there is a great merit such that a lot of time and labor required for verification of the results can be omitted.

そこで、発明者は、さらに、実験データをプロトコルと関連付け、客観性かつ高い信頼性を持って表示する実験データ表示装置2をも、実験データ記録装置1と併せて発明するに至ったので、以下にかかる実験データ表示装置2を説明する。   Therefore, the inventor has further invented the experimental data display device 2 that associates the experimental data with the protocol and displays the objective data with high reliability in combination with the experimental data recording device 1. The experimental data display apparatus 2 concerning will be described.

実験データ表示装置2の物理的構成は、実験データ記録装置1と同じであるから、図1を援用し、その重複する説明は省略するものとする。実験データ表示装置2は、一般的なコンピュータ上で、同コンピュータを、実験データ表示装置2として動作させるためのプログラムを実行することにより実現される点についても実験データ記録装置1と同様である。   Since the physical configuration of the experimental data display device 2 is the same as that of the experimental data recording device 1, FIG. 1 is used, and redundant description thereof is omitted. The experimental data display device 2 is the same as the experimental data recording device 1 in that it is realized by executing a program for operating the computer as the experimental data display device 2 on a general computer.

図8は、実験データ表示装置2の機能ブロック図である。なお、実験データ表示装置2は、その機能上、実験データ記録装置1と共通する構成を含むため、同図中、実験データ記録装置1について図2に示したものと同様の機能ブロックについては同符号を付し、重複する説明は省略するものとする。   FIG. 8 is a functional block diagram of the experimental data display device 2. Since the experimental data display device 2 includes the same configuration as the experimental data recording device 1 in terms of its functions, the same functional blocks as those shown in FIG. 2 for the experimental data recording device 1 in FIG. Reference numerals are assigned, and duplicate descriptions are omitted.

実験データ読込部34は、通信部20を介し、実験データ格納装置26より表示したい実験データを読み込み、実験データ記憶部11に記憶する。また、プロトコルデータ読込部35は、読み込んだ実験データに紐づけられたプロトコルIDを持つプロトコルデータを、プロトコルサーバ32より読み込み、プロトコルデータ記憶部10に記憶する。   The experiment data reading unit 34 reads the experiment data to be displayed from the experiment data storage device 26 via the communication unit 20 and stores it in the experiment data storage unit 11. The protocol data reading unit 35 reads protocol data having a protocol ID associated with the read experimental data from the protocol server 32 and stores it in the protocol data storage unit 10.

実験後プロトコル表示部28、動作記録表示部29及び分析データ表示部30の動作は、先に説明した実験データ記録装置1のものと同じである。また、実験データ表示装置2の動作は、図7で説明したものと同じである。   The operations of the post-experiment protocol display unit 28, the operation record display unit 29, and the analysis data display unit 30 are the same as those of the experimental data recording apparatus 1 described above. The operation of the experimental data display device 2 is the same as that described with reference to FIG.

このように、プロトコルIDと紐づいた動作データに基づいて、プロトコルデータを特定し読み込み、プロトコルチャートに重ね合わせて動作データ、及び分析データを表示することにより、実験データをプロトコルと関連付け、客観性かつ高い信頼性を持って表示することができる。   In this way, based on the operation data associated with the protocol ID, the protocol data is specified and read, and the operation data and analysis data are displayed superimposed on the protocol chart, thereby associating the experimental data with the protocol and providing objectivity. And it can display with high reliability.

以上説明した実施形態の構成は具体例として示したものであり、本明細書にて開示される発明をこれら具体例の構成そのものに限定することは意図されていない。当業者はこれら開示された実施形態に種々の変形を加えてもよく、また、開示されたフローチャートに示した制御は、同等の機能を奏する他の制御に置き換えてもよい。本明細書にて開示される発明の技術的範囲は、そのようになされた変形をも含むものと理解すべきである。   The configuration of the embodiment described above is shown as a specific example, and the invention disclosed in this specification is not intended to be limited to the configuration of the specific example itself. Those skilled in the art may add various modifications to these disclosed embodiments, and the control shown in the disclosed flowchart may be replaced with another control that has an equivalent function. It should be understood that the technical scope of the invention disclosed herein includes such modifications.

Claims (20)

生化学及び生物・生命工学の少なくとも一方の分野におけるプロトコルに基づく実験の記録である実験データを記録する実験データ記録装置であって、
実験器具の動作記録を受信する受信部と、
実験固有のIDである実験IDをプロトコルに固有のプロトコルIDと紐付けて記録する実験ID記録部と、
受信した前記動作記録のそれぞれを、前記プロトコルに含まれる複数の手順のうち、対応する手順と関連付けて記録する動作記録記録部と、
を有する実験データ記録装置。
An experimental data recording device for recording experimental data, which is a record of an experiment based on a protocol in at least one of biochemistry and biological / biotechnology,
A receiving unit for receiving an operation record of the experimental instrument;
An experiment ID recording unit for recording an experiment ID, which is an experiment-specific ID, in association with a protocol ID unique to the protocol;
An operation record recording unit that records each of the received operation records in association with a corresponding procedure among a plurality of procedures included in the protocol;
An experimental data recording apparatus.
実験の対象となった試料のIDである対象試料IDを、前記実験IDと紐付けて記録する対象試料ID記録部と、
実験の結果得られた試料のIDである結果試料IDを、前記実験IDと紐付けて記録する結果試料ID記録部と、
を有する請求項1に記載の実験データ記録装置。
A target sample ID recording unit that records a target sample ID, which is an ID of a sample subjected to the experiment, in association with the experiment ID;
A result sample ID recording unit that records a result sample ID, which is an ID of a sample obtained as a result of the experiment, in association with the experiment ID;
The experimental data recording apparatus according to claim 1, comprising:
実験環境データを、前記実験IDと紐付けて記録する実験環境データ記録部を有する請求項1又は2に記載の実験データ記録装置。   The experiment data recording apparatus according to claim 1, further comprising an experiment environment data recording unit that records experiment environment data in association with the experiment ID. 前記実験器具には、実験者が直接操作する器具が含まれる請求項1〜3のいずれか1項に記載の実験データ記録装置。   The experimental data recording apparatus according to claim 1, wherein the experimental instrument includes an instrument that is directly operated by an experimenter. 前記実験器具には、電動ピペットが含まれる請求項4に記載の実験データ記録装置。   The experimental data recording apparatus according to claim 4, wherein the experimental instrument includes an electric pipette. 実験中に、実験に係るプロトコルをモニタに表示する実験中プロトコル表示部を有する請求項4又は5に記載の実験データ記録装置。   The experiment data recording apparatus according to claim 4 or 5, further comprising an in-experiment protocol display unit for displaying a protocol related to an experiment on a monitor during the experiment. 前記実験器具は、前記プロトコルに基づいて実験を実行するロボットが含まれる請求項1〜3のいずれか1項に記載の実験データ記録装置。   The experimental data recording apparatus according to claim 1, wherein the experimental instrument includes a robot that performs an experiment based on the protocol. 実験毎に、前記実験IDを発行する実験ID発行部を有する請求項1〜7のいずれか1項に記載の実験データ記録装置。   The experiment data recording apparatus according to claim 1, further comprising an experiment ID issuing unit that issues the experiment ID for each experiment. 前記実験ID発行部は、外部の実験ID生成装置により生成された実験IDを取得する請求項8に記載の実験データ記録装置。   The experiment data recording device according to claim 8, wherein the experiment ID issuing unit acquires an experiment ID generated by an external experiment ID generation device. 前記実験データに改ざん防止処理を施す改ざん防止部を有する請求項1〜9のいずれか1項に記載の実験データ記録装置。   The experimental data recording apparatus according to claim 1, further comprising a falsification preventing unit that performs a falsification preventing process on the experimental data. 前記改ざん防止部は、少なくとも、前記動作記録記録部による動作記録の記録の度に、改ざん防止処理を施す請求項10に記載の実験データ記録装置。   The experimental data recording apparatus according to claim 10, wherein the tampering prevention unit performs a tampering prevention process at least every time the operation recording unit records the operation record. 外部の実験データ格納装置に、得られた前記実験データを格納する実験データ格納部を有する請求項1〜10のいずれか1項に記載の実験データ記録装置。   The experimental data recording device according to claim 1, further comprising an experimental data storage unit that stores the obtained experimental data in an external experimental data storage device. 実験の結果得られた試料に対する分析結果のデータである分析データを、当該試料の結果試料IDに紐付けて記録する分析データ記録部を有する請求項1〜12のいずれか1項に記載の実験データ記録装置。   The experiment according to any one of claims 1 to 12, further comprising an analysis data recording unit that records analysis data, which is analysis result data for a sample obtained as a result of the experiment, in association with a result sample ID of the sample. Data recording device. 実験が行われたプロトコルを表示する実験後プロトコル表示部と、
前記プロトコルに含まれる手順それぞれに対応づけて、前記プロトコルに対応する前記実験データに含まれる動作記録を表示する動作記録表示部と、
を有する請求項1〜13のいずれか1項に記載の実験データ記録装置。
A post-experiment protocol display that displays the protocol in which the experiment was performed;
In association with each procedure included in the protocol, an operation record display unit that displays an operation record included in the experimental data corresponding to the protocol;
The experimental data recording device according to any one of claims 1 to 13, which has
コンピュータを、請求項1〜14のいずれか1項に記載の実験データ記録装置として機能させるコンピュータプログラム。   A computer program for causing a computer to function as the experimental data recording device according to claim 1. 生化学及び生物・生命工学の少なくとも一方の分野におけるプロトコルに基づく実験の記録である実験データであって、
プロトコルに固有のプロトコルIDと紐付けられた、実験固有のIDである実験IDと、
前記プロトコルに含まれる対応する手順と関連付けられた、実験器具の動作記録と、
を含む実験データ。
Experimental data that is a record of experiments based on protocols in at least one of biochemistry and biological / biotechnology fields,
An experiment ID, which is an experiment-specific ID associated with a protocol ID unique to the protocol;
A record of the operation of the laboratory instrument associated with the corresponding procedure included in the protocol;
Experimental data including
生化学及び生物・生命工学の少なくとも一方の分野におけるプロトコルに基づく実験の記録である実験データを記録する実験データ記録方法であって、
実験器具の動作記録を受信し、
実験固有のIDである実験IDをプロトコルに固有のプロトコルIDと紐付けて記録し、
受信した前記動作記録のそれぞれを、前記プロトコルに含まれる複数の手順のうち、対応する手順と紐付けて記録する、
実験データ記録方法。
An experimental data recording method for recording experimental data, which is a record of an experiment based on a protocol in at least one of biochemistry and biological / biotechnology,
Receives test equipment operation records,
Record the experiment ID, which is an ID unique to the experiment, in association with the protocol ID unique to the protocol,
Each of the received operation records is recorded in association with a corresponding procedure among a plurality of procedures included in the protocol.
Experimental data recording method.
生化学及び生物・生命工学の少なくとも一方の分野におけるプロトコルに基づく実験の記録である実験データに関して、
実験が行われたプロトコルを表示する実験後プロトコル表示部と、
前記プロトコルに含まれる手順それぞれに対応づけて、前記プロトコルに対応する前記実験データに含まれる、実験に用いられた実験器具の動作記録を表示する動作記録表示部と、
を有する実験データ表示装置。
Regarding experimental data, which are records of experiments based on protocols in biochemistry and / or biotechnology / biological engineering,
A post-experiment protocol display that displays the protocol in which the experiment was performed;
In association with each procedure included in the protocol, an operation record display unit that displays an operation record of the experimental instrument used in the experiment, included in the experiment data corresponding to the protocol,
An experimental data display device.
前記実験データに対応する分析データを表示する分析データ表示部を有する請求項18に記載の実験データ表示装置。   The experimental data display device according to claim 18, further comprising an analytical data display unit that displays analytical data corresponding to the experimental data. 生化学及び生物・生命工学の少なくとも一方の分野におけるプロトコルに基づく実験の記録である実験データに関して、
実験が行われたプロトコルを表示し、
前記プロトコルに含まれる手順それぞれに対応づけて、前記プロトコルに対応する前記実験データに含まれる、実験に用いられた実験器具の動作記録を表示する、
実験データ表示方法。
Regarding experimental data, which are records of experiments based on protocols in biochemistry and / or biotechnology / biological engineering,
Displays the protocol the experiment was conducted on
Corresponding to each of the procedures included in the protocol, the operation record of the experimental instrument used in the experiment included in the experimental data corresponding to the protocol is displayed.
Experimental data display method.
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Families Citing this family (4)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
JP2018000010A (en) * 2016-06-27 2018-01-11 清水建設株式会社 Culture management system
US10635509B2 (en) * 2016-11-17 2020-04-28 Sung Jin Cho System and method for creating and managing an interactive network of applications
JP7107526B2 (en) * 2018-08-27 2022-07-27 株式会社エビデント Experiment information management system, experiment notebook system, experiment notebook generation device, screen generation device, experiment information management method, and program
JP2021153534A (en) * 2020-03-30 2021-10-07 株式会社安川電機 Processed product production apparatus, processed product production method, program for processed product production apparatus, and processed product production system

Citations (6)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
JP2001511529A (en) * 1997-07-25 2001-08-14 アフィメトリックス インコーポレイテッド Method and apparatus for providing a bioinformatics database
JP2004530860A (en) * 2000-01-11 2004-10-07 クリニカル・マイクロ・センサーズ・インコーポレイテッド Biochip multiplexing device and method
JP2004534207A (en) * 2001-02-14 2004-11-11 テイボテク・ビーブイビーエイ Method and apparatus for providing automatic information management for high-throughput sorting
JP2006178691A (en) * 2004-12-21 2006-07-06 Hitachi Ltd Assay selection apparatus, assay selection method and program
JP2008519285A (en) * 2004-11-05 2008-06-05 インヴィトロジェン コーポレーション Compositions and methods for using radio frequency identifiers in biological sciences
JP2008521437A (en) * 2004-11-30 2008-06-26 マックスサイト インコーポレーティッド Computerized electroporation

Family Cites Families (1)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US20080031774A1 (en) * 2006-03-13 2008-02-07 Sage Science, Inc. Apparatus for Guiding Sample and Reagent Manipulations and Receptacles for Holding Same

Patent Citations (6)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
JP2001511529A (en) * 1997-07-25 2001-08-14 アフィメトリックス インコーポレイテッド Method and apparatus for providing a bioinformatics database
JP2004530860A (en) * 2000-01-11 2004-10-07 クリニカル・マイクロ・センサーズ・インコーポレイテッド Biochip multiplexing device and method
JP2004534207A (en) * 2001-02-14 2004-11-11 テイボテク・ビーブイビーエイ Method and apparatus for providing automatic information management for high-throughput sorting
JP2008519285A (en) * 2004-11-05 2008-06-05 インヴィトロジェン コーポレーション Compositions and methods for using radio frequency identifiers in biological sciences
JP2008521437A (en) * 2004-11-30 2008-06-26 マックスサイト インコーポレーティッド Computerized electroporation
JP2006178691A (en) * 2004-12-21 2006-07-06 Hitachi Ltd Assay selection apparatus, assay selection method and program

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