JPWO2015174414A1 - 翻訳エンハンサー - Google Patents
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Abstract
Description
[1]翻訳エンハンサー活性を有する塩基配列からなる下記(a)から(f)のいずれか1つのDNAである:
(a)配列番号1の塩基配列からなるDNA、
(b)配列番号2の塩基配列からなるDNA、
(c)配列番号3の塩基配列からなるDNA、
(d)上記(a)〜(c)のいずれか1つのDNAにおいて1個又は数個の塩基が欠失、置換、又は付加されたDNA、
(e)上記(a)〜(d)のいずれか1つのDNAと相補的なDNAとストリンジェントな条件下でハイブリダイズするDNA、
(f)上記(a)〜(e)のいずれか1つのDNAと相同性が80%以上の塩基配列からなるDNA。
[2][1]に記載のDNAを含む組換えベクターである。
[3][1]に記載のDNAがプロモーターと構造遺伝子との間に挿入されている[2]に記載の組換えベクターである。
[4][2]又は[3]に記載の組換えベクターで形質転換された形質転換体である。
[5]植物細胞、植物組織、植物器官、植物体、及び種子からなる群より選択されるいずれか1つである[4]に記載の形質転換体である。
[6][1]に記載のDNAに対応するRNAとタンパク質をコードするRNAとを含む翻訳用RNAを用いて、上記タンパク質を合成するタンパク質合成方法である。
[7][1]に記載のDNAと構造遺伝子とを含む組換えベクターを用いて形質転換体を得ることと、上記形質転換体を培養することと、を含む[6]に記載のタンパク質合成方法である。
[8]上記翻訳用RNAとインビトロ無細胞系タンパク質合成用反応液とを接触させることを含む[6]に記載のタンパク質合成方法である。
[9]更に、[1]に記載のDNAと構造遺伝子とを含む鋳型DNAから上記翻訳用RNAを合成することを含む[8]に記載のタンパク質合成方法である。
[10][1]に記載のDNAの翻訳エンハンサーとしての使用である。
本開示のDNAは、翻訳エンハンサー活性を有する塩基配列からなる下記(a)〜(f)のいずれか1つのDNAである。
(a)配列番号1の塩基配列からなるDNA、
(b)配列番号2の塩基配列からなるDNA、
(c)配列番号3の塩基配列からなるDNA、
(d)上記(a)〜(c)のいずれか1つのDNAにおいて1個又は数個の塩基が欠失、置換、又は付加されたDNA、
(e)上記(a)〜(d)のいずれか1つのDNAと相補的なDNAとストリンジェントな条件下でハイブリダイズするDNA、
(f)上記(a)〜(e)のいずれか1つのDNAと相同性が80%以上の塩基配列からなるDNA。
また、本開示の使用は、本開示のDNAの翻訳エンハンサーとしての使用である。
本開示の組換えベクターは、本開示のDNAを含むものである。本開示の組換えベクターは、任意のベクターに本開示のDNAを連結(挿入)することにより得ることができる。
本開示の形質転換体は、本開示の組換えベクターで形質転換されたものである。本開示の形質転換体は、本開示の組換えベクターを、目的の構造遺伝子が発現し得るように宿主中に導入することにより得ることができる。
裸子植物としては、具体的には、ソテツ科のソテツ等、イチョウ科のイチョウ、マツ科のアカマツ、クロマツ、モミ、トウヒ等、スギ科のスギ等、イチイ科のイチイ等が挙げられるが、これらに限定されるものではない。
単子葉植物としては、具体的には、イネ科のイネ、コムギ、オオムギ、カラスムギ、ライムギ、キビ、アワ、ヒエ、トウモロコシ、シコクビエ、モロコシ、タケ、ヨシ、ススキ、アマランサス、ミスカンサス、スイッチグラス、ソルガム等、サトイモ科のサトイモ等、ヤシ科のヤシ、ナツメヤシ等、バショウ科のバナナ等が挙げられるが、これらに限定されるものではない。
双子葉植物としては、具体的には、アブラナ科のシロイヌナズナ、ナタネ等、ナス科のタバコ、トマト、ジャガイモ等、ウリ科のメロン、カボチャ等、マメ科のダイズ等、アオイ科のワタ等、キク科のキク等、ツバキ科のチャ等、ブドウ科のブドウ等、トウダイグサ科のナンヨウアブラギリ、タイワンアブラギリ等が挙げられるが、これらに限定されるものではない。宿主としては、単子葉植物及び双子葉植物がより好適であり、イネ又はシロイヌナズナがより好適である。
本開示のタンパク質合成方法は、本開示のDNAに対応するRNAと目的とするタンパク質をコードするRNAとを含む翻訳用RNAを用いて、当該タンパク質を合成するタンパク質合成方法である。
本開示のタンパク質合成方法によれば、上記翻訳用RNAから目的とするタンパク質への翻訳が促進されるので、本開示のDNAに対応するRNAを目的とするタンパク質をコードするRNAと共存させない場合に比し、目的とするタンパク質の合成量を増加させることができる。
本開示のタンパク質合成方法は、本開示のDNAと発現の目的となる構造遺伝子とを含む組換えベクターを用いて形質転換体を得ることと、上記形質転換体を培養することと、を含むタンパク質合成方法とすることができる。
上記の連結は、具体的には例えば、適当なベクターを選択し、そこに本開示のDNA及び発現の目的となる構造遺伝子を、適切な配向で挿入して組換えベクターを作製することにより容易に行うことができる。この組換えベクターは、本開示のDNAの5’上流側に転写を促進させるためのプロモーター配列を有することが好ましく、構造遺伝子の3’下流側に転写を終結させるためのターミネーターを有することが好ましい。上記の連結に用いることができるベクター、プロモーター、及びターミネーター、並びにベクターへのDNAの挿入の方法は、既述の本開示の組換えベクターと同様であり、好ましい態様も同様である。
上記形質転換体が植物の場合、発現の目的となる構造遺伝子としては、除草剤耐性遺伝子、ビタミン合成に関わる遺伝子、ポリフェノール(カテキン等)の合成に関わる遺伝子、花の色素の遺伝子、抗菌ペプチドの合成に関わる遺伝子、抗原ペプチド(アレルゲン、毒素)の低減に関わる遺伝子等が挙げられる。
上記形質転換体が例えばイネ科植物(イネ、コムギ、オオムギ、カラスムギ、ライムギ、キビ、アワ、ヒエ、トウモロコシ、シコクビエ、モロコシ等)や果実をつける植物等の食用植物の場合、上記形質転換体を栽培することで、種子(穀物)や果実、その他の可食部における、発現の目的となる構造遺伝子でコードされるタンパク質の含有量を増加させることができる。上記タンパク質が酵素の場合には、その酵素に関する代謝産物についても、種子(穀物)や果実、その他の可食部における含有量を増加させることができる。
大腸菌や酵母菌等の微生物を宿主として得られた前記形質転換体を培養する培地としては、微生物が資化し得る炭素源、窒素源、無機塩類等を含有し、上記形質転換体の培養を効率的に行うことができる培地であれば、天然培地、合成培地のいずれを用いてもよい。
上記微生物の培養は、通常、振盪培養、通気撹拌培養等の好気的条件下、37℃で行う。なお、培地のpHの調整は、無機又は有機酸、アルカリ溶液等を用いて行う。培養中は必要に応じてアンピシリン、テトラサイクリン等の抗生物質を培地に添加してもよい。
上記形質転換体が植物体である場合は、圃場、ガラスハウス等で栽培又は水耕培養することができる。
まず、セルラーゼ、ペクチナーゼ等の酵素を用いた細胞溶解処理、超音波破砕処理、液体窒素で凍結させた後、液体窒素中で乳鉢等を用いて磨り潰す処理などにより細胞を破壊する。その後、適宜、抽出用溶液を加えて目的のタンパク質及び/又は代謝産物を含む溶液を抽出し、次いで、濾過、遠心分離等を用いて不溶物を除去し、粗タンパク質溶液又は代謝産物を含む溶液を得る。上記粗タンパク質溶液からタンパク質をさらに精製するには、通常のタンパク質精製法を使用することができる。例えば、硫安塩析法、イオン交換クロマトグラフィー、疎水クロマトグラフィー、ゲルろ過クロマトグラフィー、アフィニティークロマトグラフィー、電気泳動法等を、単独又は適宜組み合わせることにより行う。また、代謝産物を含む溶液から代謝産物をさらに精製するには、従来から知られている精製手法を使用することができる。例えば、溶媒抽出、イオン交換クロマトグラフィー、疎水クロマトグラフィー、ゲルろ過クロマトグラフィー、高速液体クロマトグラフィー等を、単独又は適宜組み合わせることにより行う。
本開示のタンパク質合成方法は、上記翻訳用RNAとインビトロ無細胞系タンパク質合成用反応液とを接触させること、を含むタンパク質合成方法(以下、「インビトロ無細胞系タンパク質合成方法」ともいう。)とすることができる。
インビトロ無細胞系タンパク質合成方法は、インビトロで、上記翻訳用RNAとインビトロ無細胞系タンパク質合成用反応液(以下、単に「反応液」ともいう。)とを接触させることで、上記翻訳用RNAからタンパク質の翻訳反応を行い、目的とするタンパク質を合成することができる。
上記翻訳用RNAと上記反応液とを接触させる方法としては、任意の方法で行えばよく、例えば、上記反応液に上記翻訳用RNAを添加してもよく、上記翻訳用RNAを含む溶液に上記反応液を投入してもよい。また、上記反応液に上記翻訳用RNAを連続的に添加してもよく、定期的に添加してもよい。
翻訳反応の終了後は、目的とするタンパク質を、常法により精製すればよい。具体的には、タンパク質の単離精製に用いられる一般的な生化学的方法、例えば硫酸アンモニウム沈殿、ゲルクロマトグラフィー、イオン交換クロマトグラフィー、アフィニティークロマトグラフィー等を単独で又は適宜組み合わせて用いることにより、タンパク質を単離精製することができる。
上記の連結は、具体的には例えば、適当なベクターを選択し、そこに本開示のDNA及び発現の目的となる構造遺伝子を、適切な配向で挿入して組換えベクターを作製することにより容易に行うことができる。この組換えベクターは、本開示のDNAの5’上流側に転写を促進させるためのプロモーター配列を有することが好ましく、構造遺伝子の3’下流側に転写を終結させるためのターミネーターを有することが好ましい。上記の連結に用いることができるベクター、プロモーター、及びターミネーター、並びにベクターへのDNAの挿入の方法は、既述の本開示の組換えベクターと同様であり、好ましい態様も同様である。
カリフラワーモザイクウイルス35SプロモーターとGUS遺伝子との間に本開示のDNAが挿入された形質転換用プラスミドと、参考として本開示のDNAの代わりにOsMac1遺伝子の5’UTR(UTRc)が挿入された形質転換用プラスミドとを後述する方法により作製した。
実施例1で用いたものと同じ形質転換用プラスミドのうちOsMac1−UTRc::GUS及びOsMac3−UTR::GUSと、対照の35S::GUSとを、実施例1と同様の方法で作製したシロイヌナズナのプロトプラスト細胞に実施例1と同様の方法で導入し、形質転換体を作製した。次いで、実施例1と同様の方法で翻訳効率を評価した。結果を図4に示す。図中のエラーバーは標準偏差(n=3)を示す。
pBI221(Jefferson, R. A., EMBO J., 6, 3901-3907(1987))の35S promoter-GUS-Nos terminatorに相当するコーディング領域をPCRプライマー(配列番号7、8)を用いて増幅した。増幅した断片をpENTR/D-TOPO(Invitrogen社)に挿入してpENTR-35S-GUS-Terを得た。
次いで、OsMac1、OsMac2、及びOsMac3の各遺伝子の完全長cDNA(イネゲノムリソースセンター(茨城県つくば市)より入手)の5’UTRを、5’末端に制限酵素BamHI(OsMac2及びOsMac3)又はXbaI(OsMac1)による切断部位を付加したPCRプライマー(配列番号9、10(OsMac1用)、配列番号11、12(OsMac2用)、配列番号13、14(OsMac3用))を用いてそれぞれ増幅した。増幅した断片をBamHI又はXbaIで切断し、pENTR-35S-GUSのGUS遺伝子の上流に位置するBamHI又はXbaIサイトに挿入してpENTR-35S-5'UTR-GUSを得た。
次いで、pENTR-35S-5'UTR-GUSとpGWB1(Nakagawa et al., 2007)とをLRクロナーゼ(Invitrogen社)を用いて反応させ、pGWB1-35S-5'UTR-GUSを作製した。得られたプラスミドの35S-5'UTR-GUSをBPクロナーゼ(Invitrogen社)を用いてpDONR 221(Invitrogen社)に置換して、実施例1、2で使用する形質転換用プラスミドを作製した。
以上の工程は、いずれも製品に付属の説明書に従って行った。
全RNAは既報(Imamura et al., Plant Cell Physiol. 48: 1108−1120 (2007))に従い培養細胞から作製した。一本鎖cDNAは1μgの全RNAからReverTra−Ace cDNA合成キットのoligo−dT(20)プライマー(東洋紡株式会社)を用いて合成した。得られたcDNAは、既報(She et al., Plant Cell 22: 3280−3294 (2010))に従い、半定量RT−PCRにおける各遺伝子の転写産物の検出に用いた。半定量RT−PCRは、GUS遺伝子の塩基配列に基づいて作製したプライマー(配列番号15、16)を用いて行った。
OsMac1若しくはOsMac3の5’UTR、又はOsMac3−UTR(d1−160)と、DsRed2−3FLAGとを導入したプラスミドを用いて、小麦胚芽無細胞タンパク質合成系における翻訳効率を評価した。
pEU-E01-MCS(株式会社セルフリーサイエンス)のΩ配列(E01)以外の領域を、5’末端に制限酵素SpeIによる切断部位を付加したPCRプライマー(配列番号17、18)を用いて増幅した。増幅した断片をSpeIで切断し、Ligation high(東洋紡株式会社)を用いてライゲーションさせ、pEU-MCSを作製した。
次いで、pDsRed2ベクター(タカラバイオ株式会社)のDsRed2遺伝子領域を、5’末端に制限酵素BamHIによる切断部位を付加したPCRプライマー(配列番号19)と、制限酵素SalIによる切断部位及び3×FLAG遺伝子配列を付加したPCRプライマー(配列番号20)とを用いて増幅した。増幅した断片をBamHI及びSalIで切断し、pEU-MCSのMCS領域内のBamHI及びSalIサイトに挿入してpEU-MCS-DsRed2-3FLAGを得た。
次いで、OsMac1及びOsMac3の5’UTR、並びにOsMac3−UTR(d1−160)を、5’末端に制限酵素NotI(フォワードプライマー)又はBamHI(リバースプライマー)による切断部位を付加したPCRプライマー(配列番号21、22(OsMac1用)、配列番号23、24(OsMac3用)、配列番号24、25(OsMac3−UTR(d1−160)用))を用いてそれぞれ増幅した。増幅した断片をNotI及びBamHIで切断し、pEU-MCS-DsRed2-3FLAGのDsRed2−3FLAG遺伝子の上流に位置するNotI及びBamHIサイトに挿入して、pEU-OsMac1-DsRed2-3FLAG、pEU-OsMac3-DsRed2-3FLAG、及びpEU-OsMac3-UTR(d1-160)-DsRed2-3FLAGをそれぞれ得た。
以上の工程は、いずれも製品に付属の説明書に従って行った。
pEU-OsMac1-DsRed2-3FLAG、pEU-OsMac3-DsRed2-3FLAG、及びpEU-OsMac3-UTR(d1-160)-DsRed2-3FLAGのそれぞれについて、JETSTAR2.0(株式会社ベリタス)を用いてプラスミドDNAを大量に精製し、濃度を1μg/μLに調整した。以降の小麦胚芽無細胞タンパク質合成は、Premium PLUS Kit(株式会社セルフリーサイエンス)を用いて、製品に付属の説明書に従って行った。
図5に示すように、pEU-OsMac3-DsRed2-3FLAGを用いた場合のタンパク質量は、pEU-OsMac1-DsRed2-3FLAGを用いた場合のタンパク質量に比べて2.4倍であった。また、pEU-OsMac3-UTR(d1-160)-DsRed2-3FLAGを用いた場合のタンパク質量は、pEU-OsMac1-DsRed2-3FLAGを用いた場合のタンパク質量に比べて7.0倍であった。この結果は、配列番号3の塩基配列からなるDNAが翻訳効率及び汎用性に優れる翻訳エンハンサーとして特に有用であることを示している。
カリフラワーモザイクウイルス35SプロモーターとGUS遺伝子との間に、OsMac3の5’UTR、OsMac3−UTR(s152−156)、OsMac3−UTR(d1−160)、又はOsMac3−UTR(s137−139)を挿入し、形質転換用プラスミドとして、OsMac3−UTR::GUS、OsMac3−UTR(s152−156)::GUS、OsMac3−UTR(d1−160)::GUS、及びOsMac3−UTR(s137−139)::GUSを作製した。そして、この形質転換用プラスミドを用いて、イネ培養細胞における翻訳効率を評価した。
配列番号5の塩基配列からなるOsMac3−UTR(s152−156)、配列番号3の塩基配列からなるOsMac3−UTR(d1−160)、及び配列番号6の塩基配列からなるOsMac3−UTR(s137−139)の3’末端及び5’末端に制限酵素BamHIによる切断部位を付加したDNAを全合成で作製した。
次いで、得られた3種類のDNAをBamHIで切断し、実施例1と同様にして作製したpENTR-35S-GUSのGUS遺伝子の上流に位置するBamHIサイトに挿入してpENTR-35S-OsMac3_5'UTR-GUSを得た。次いで、pENTR-35S-OsMac3_5'UTR-GUSとpGWB1(Nakagawa et al, 2007)とをLRクロナーゼ(Invitrogen社)を用いて反応させ、pGWB1-35S-OsMac3_5'UTR-GUSを作製した。得られたプラスミドの35S-OsMac3_5'UTR-GUSをBPクロナーゼ(Invitrogen社)を用いてpDONR 221(Invitrogen社)に置換して、実施例4で使用する形質転換用プラスミドを作製した。
以上の工程は、いずれも製品に付属の説明書に従って行った。
本明細書に記載された全ての文献、特許出願、及び技術規格は、個々の文献、特許出願、及び技術規格が参照により取り込まれることが具体的かつ個々に記された場合と同程度に、本明細書中に参照により取り込まれる。
Claims (10)
- 翻訳エンハンサー活性を有する塩基配列からなる下記(a)から(f)のいずれか1つのDNA:
(a)配列番号1の塩基配列からなるDNA、
(b)配列番号2の塩基配列からなるDNA、
(c)配列番号3の塩基配列からなるDNA、
(d)前記(a)〜(c)のいずれか1つのDNAにおいて1個又は数個の塩基が欠失、置換、又は付加されたDNA、
(e)前記(a)〜(d)のいずれか1つのDNAと相補的なDNAとストリンジェントな条件下でハイブリダイズするDNA、
(f)前記(a)〜(e)のいずれか1つのDNAと相同性が80%以上の塩基配列からなるDNA。 - 請求項1に記載のDNAを含む組換えベクター。
- 請求項1に記載のDNAがプロモーターと構造遺伝子との間に挿入されている請求項2に記載の組換えベクター。
- 請求項2又は請求項3に記載の組換えベクターで形質転換された形質転換体。
- 植物細胞、植物組織、植物器官、植物体、及び種子からなる群より選択されるいずれか1つである請求項4に記載の形質転換体。
- 請求項1に記載のDNAに対応するRNAとタンパク質をコードするRNAとを含む翻訳用RNAを用いて、前記タンパク質を合成するタンパク質合成方法。
- 請求項1に記載のDNAと構造遺伝子とを含む組換えベクターを用いて形質転換体を得ることと、前記形質転換体を培養することと、を含む請求項6に記載のタンパク質合成方法。
- 前記翻訳用RNAとインビトロ無細胞系タンパク質合成用反応液とを接触させることを含む請求項6に記載のタンパク質合成方法。
- 更に、請求項1に記載のDNAと構造遺伝子とを含む鋳型DNAから前記翻訳用RNAを合成することを含む請求項8に記載のタンパク質合成方法。
- 請求項1に記載のDNAの翻訳エンハンサーとしての使用。
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