JPWO2014077279A1 - Xkr8の機能を調節する物質のスクリーニング方法 - Google Patents
Xkr8の機能を調節する物質のスクリーニング方法 Download PDFInfo
- Publication number
- JPWO2014077279A1 JPWO2014077279A1 JP2014547004A JP2014547004A JPWO2014077279A1 JP WO2014077279 A1 JPWO2014077279 A1 JP WO2014077279A1 JP 2014547004 A JP2014547004 A JP 2014547004A JP 2014547004 A JP2014547004 A JP 2014547004A JP WO2014077279 A1 JPWO2014077279 A1 JP WO2014077279A1
- Authority
- JP
- Japan
- Prior art keywords
- xkr8
- cells
- cell
- function
- membrane
- Prior art date
- Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
- Granted
Links
- 239000000126 substance Substances 0.000 title claims abstract description 65
- 238000000034 method Methods 0.000 title claims abstract description 21
- 238000012216 screening Methods 0.000 title claims abstract description 7
- 230000001105 regulatory effect Effects 0.000 title description 3
- 210000004027 cell Anatomy 0.000 claims abstract description 205
- 210000000170 cell membrane Anatomy 0.000 claims abstract description 33
- 150000003904 phospholipids Chemical class 0.000 claims abstract description 20
- TZCPCKNHXULUIY-RGULYWFUSA-N 1,2-distearoyl-sn-glycero-3-phosphoserine Chemical compound CCCCCCCCCCCCCCCCCC(=O)OC[C@H](COP(O)(=O)OC[C@H](N)C(O)=O)OC(=O)CCCCCCCCCCCCCCCCC TZCPCKNHXULUIY-RGULYWFUSA-N 0.000 claims description 84
- ZWZWYGMENQVNFU-UHFFFAOYSA-N Glycerophosphorylserin Natural products OC(=O)C(N)COP(O)(=O)OCC(O)CO ZWZWYGMENQVNFU-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 83
- 230000006907 apoptotic process Effects 0.000 claims description 35
- JZNWSCPGTDBMEW-UHFFFAOYSA-N Glycerophosphorylethanolamin Natural products NCCOP(O)(=O)OCC(O)CO JZNWSCPGTDBMEW-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 23
- 239000012528 membrane Substances 0.000 claims description 23
- 150000008104 phosphatidylethanolamines Chemical class 0.000 claims description 22
- WTJKGGKOPKCXLL-RRHRGVEJSA-N phosphatidylcholine Chemical compound CCCCCCCCCCCCCCCC(=O)OC[C@H](COP([O-])(=O)OCC[N+](C)(C)C)OC(=O)CCCCCCCC=CCCCCCCCC WTJKGGKOPKCXLL-RRHRGVEJSA-N 0.000 claims description 16
- 230000007423 decrease Effects 0.000 claims description 10
- 201000010099 disease Diseases 0.000 claims description 6
- 208000037265 diseases, disorders, signs and symptoms Diseases 0.000 claims description 6
- 208000023275 Autoimmune disease Diseases 0.000 claims description 3
- 206010028980 Neoplasm Diseases 0.000 claims description 3
- 201000011510 cancer Diseases 0.000 claims description 3
- 239000003814 drug Substances 0.000 claims description 2
- 229940079593 drug Drugs 0.000 claims 1
- 101000649231 Homo sapiens XK-related protein 8 Proteins 0.000 description 55
- 102100027905 XK-related protein 8 Human genes 0.000 description 44
- 102000011727 Caspases Human genes 0.000 description 27
- 108010076667 Caspases Proteins 0.000 description 27
- 108090000623 proteins and genes Proteins 0.000 description 27
- 230000001640 apoptogenic effect Effects 0.000 description 26
- 230000006870 function Effects 0.000 description 25
- 230000014509 gene expression Effects 0.000 description 25
- 241000282414 Homo sapiens Species 0.000 description 24
- 101000649232 Mus musculus XK-related protein 8 Proteins 0.000 description 23
- 241000699666 Mus <mouse, genus> Species 0.000 description 21
- HKSZLNNOFSGOKW-UHFFFAOYSA-N ent-staurosporine Natural products C12=C3N4C5=CC=CC=C5C3=C3CNC(=O)C3=C2C2=CC=CC=C2N1C1CC(NC)C(OC)C4(C)O1 HKSZLNNOFSGOKW-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 21
- HKSZLNNOFSGOKW-FYTWVXJKSA-N staurosporine Chemical compound C12=C3N4C5=CC=CC=C5C3=C3CNC(=O)C3=C2C2=CC=CC=C2N1[C@H]1C[C@@H](NC)[C@@H](OC)[C@]4(C)O1 HKSZLNNOFSGOKW-FYTWVXJKSA-N 0.000 description 21
- CGPUWJWCVCFERF-UHFFFAOYSA-N staurosporine Natural products C12=C3N4C5=CC=CC=C5C3=C3CNC(=O)C3=C2C2=CC=CC=C2N1C1CC(NC)C(OC)C4(OC)O1 CGPUWJWCVCFERF-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 21
- 108091027967 Small hairpin RNA Proteins 0.000 description 19
- 239000004055 small Interfering RNA Substances 0.000 description 19
- 102100031988 Tumor necrosis factor ligand superfamily member 6 Human genes 0.000 description 18
- 108050002568 Tumor necrosis factor ligand superfamily member 6 Proteins 0.000 description 18
- 230000000694 effects Effects 0.000 description 18
- 239000011575 calcium Substances 0.000 description 16
- 239000002299 complementary DNA Substances 0.000 description 16
- 241001430294 unidentified retrovirus Species 0.000 description 15
- 108090000397 Caspase 3 Proteins 0.000 description 14
- 102100029855 Caspase-3 Human genes 0.000 description 14
- 108020004414 DNA Proteins 0.000 description 14
- 230000001419 dependent effect Effects 0.000 description 14
- 102100036523 Anoctamin-6 Human genes 0.000 description 13
- 101000928362 Homo sapiens Anoctamin-6 Proteins 0.000 description 13
- 230000004913 activation Effects 0.000 description 13
- 150000002632 lipids Chemical class 0.000 description 13
- XAUDJQYHKZQPEU-KVQBGUIXSA-N 5-aza-2'-deoxycytidine Chemical compound O=C1N=C(N)N=CN1[C@@H]1O[C@H](CO)[C@@H](O)C1 XAUDJQYHKZQPEU-KVQBGUIXSA-N 0.000 description 12
- 108020004999 messenger RNA Proteins 0.000 description 12
- 238000012512 characterization method Methods 0.000 description 11
- HEMHJVSKTPXQMS-UHFFFAOYSA-M sodium hydroxide Inorganic materials [OH-].[Na+] HEMHJVSKTPXQMS-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 11
- 239000013598 vector Substances 0.000 description 11
- 241000699670 Mus sp. Species 0.000 description 10
- 108091029523 CpG island Proteins 0.000 description 9
- PEDCQBHIVMGVHV-UHFFFAOYSA-N Glycerine Chemical compound OCC(O)CO PEDCQBHIVMGVHV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 9
- 101100210438 Mus musculus Xkr8 gene Proteins 0.000 description 9
- 108090000216 Phospholipid Transfer Proteins Proteins 0.000 description 9
- 102000003867 Phospholipid Transfer Proteins Human genes 0.000 description 9
- 210000000943 fetal thymocyte Anatomy 0.000 description 9
- XJMOSONTPMZWPB-UHFFFAOYSA-M propidium iodide Chemical compound [I-].[I-].C12=CC(N)=CC=C2C2=CC=C(N)C=C2[N+](CCC[N+](C)(CC)CC)=C1C1=CC=CC=C1 XJMOSONTPMZWPB-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 9
- 102000004169 proteins and genes Human genes 0.000 description 9
- FAPWRFPIFSIZLT-UHFFFAOYSA-M Sodium chloride Chemical compound [Na+].[Cl-] FAPWRFPIFSIZLT-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 8
- 108090000765 processed proteins & peptides Proteins 0.000 description 8
- RXWNCPJZOCPEPQ-NVWDDTSBSA-N puromycin Chemical compound C1=CC(OC)=CC=C1C[C@H](N)C(=O)N[C@H]1[C@@H](O)[C@H](N2C3=NC=NC(=C3N=C2)N(C)C)O[C@@H]1CO RXWNCPJZOCPEPQ-NVWDDTSBSA-N 0.000 description 8
- 238000003753 real-time PCR Methods 0.000 description 8
- 238000001262 western blot Methods 0.000 description 8
- 150000001413 amino acids Chemical group 0.000 description 7
- 239000000872 buffer Substances 0.000 description 7
- 230000001939 inductive effect Effects 0.000 description 7
- 230000001404 mediated effect Effects 0.000 description 7
- 108091029430 CpG site Proteins 0.000 description 6
- 239000013592 cell lysate Substances 0.000 description 6
- 238000003776 cleavage reaction Methods 0.000 description 6
- 239000002609 medium Substances 0.000 description 6
- 238000010369 molecular cloning Methods 0.000 description 6
- 230000007017 scission Effects 0.000 description 6
- 108090000672 Annexin A5 Proteins 0.000 description 5
- 102000004121 Annexin A5 Human genes 0.000 description 5
- 102100038026 DNA fragmentation factor subunit alpha Human genes 0.000 description 5
- 101710182628 DNA fragmentation factor subunit alpha Proteins 0.000 description 5
- 241000283973 Oryctolagus cuniculus Species 0.000 description 5
- 238000005119 centrifugation Methods 0.000 description 5
- 238000000684 flow cytometry Methods 0.000 description 5
- 238000001943 fluorescence-activated cell sorting Methods 0.000 description 5
- 108020001507 fusion proteins Proteins 0.000 description 5
- 102000037865 fusion proteins Human genes 0.000 description 5
- 230000002062 proliferating effect Effects 0.000 description 5
- 230000004044 response Effects 0.000 description 5
- OYPRJOBELJOOCE-UHFFFAOYSA-N Calcium Chemical compound [Ca] OYPRJOBELJOOCE-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- 108010054576 Deoxyribonuclease EcoRI Proteins 0.000 description 4
- 241001465754 Metazoa Species 0.000 description 4
- 238000003782 apoptosis assay Methods 0.000 description 4
- 230000023555 blood coagulation Effects 0.000 description 4
- 229910052791 calcium Inorganic materials 0.000 description 4
- 230000030833 cell death Effects 0.000 description 4
- 238000011161 development Methods 0.000 description 4
- 230000006718 epigenetic regulation Effects 0.000 description 4
- 239000012634 fragment Substances 0.000 description 4
- 102000046109 human Xkr8 Human genes 0.000 description 4
- 210000002540 macrophage Anatomy 0.000 description 4
- 230000011987 methylation Effects 0.000 description 4
- 238000007069 methylation reaction Methods 0.000 description 4
- 230000005522 programmed cell death Effects 0.000 description 4
- 229950010131 puromycin Drugs 0.000 description 4
- 239000011780 sodium chloride Substances 0.000 description 4
- 238000010186 staining Methods 0.000 description 4
- 238000009281 ultraviolet germicidal irradiation Methods 0.000 description 4
- DGVVWUTYPXICAM-UHFFFAOYSA-N β‐Mercaptoethanol Chemical compound OCCS DGVVWUTYPXICAM-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- 108091032973 (ribonucleotides)n+m Proteins 0.000 description 3
- LSNNMFCWUKXFEE-UHFFFAOYSA-M Bisulfite Chemical compound OS([O-])=O LSNNMFCWUKXFEE-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 3
- 241000283707 Capra Species 0.000 description 3
- 102000004190 Enzymes Human genes 0.000 description 3
- 108090000790 Enzymes Proteins 0.000 description 3
- 108010063738 Interleukins Proteins 0.000 description 3
- 102000015696 Interleukins Human genes 0.000 description 3
- OKKJLVBELUTLKV-UHFFFAOYSA-N Methanol Chemical compound OC OKKJLVBELUTLKV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 241001529936 Murinae Species 0.000 description 3
- 101100537545 Mus musculus Fas gene Proteins 0.000 description 3
- 238000004458 analytical method Methods 0.000 description 3
- 210000003719 b-lymphocyte Anatomy 0.000 description 3
- 210000004899 c-terminal region Anatomy 0.000 description 3
- 230000002950 deficient Effects 0.000 description 3
- 238000010790 dilution Methods 0.000 description 3
- 239000012895 dilution Substances 0.000 description 3
- 229940088598 enzyme Drugs 0.000 description 3
- 239000013613 expression plasmid Substances 0.000 description 3
- 210000002950 fibroblast Anatomy 0.000 description 3
- 239000001963 growth medium Substances 0.000 description 3
- 125000003104 hexanoyl group Chemical group O=C([*])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])[H] 0.000 description 3
- 239000002555 ionophore Substances 0.000 description 3
- 230000000236 ionophoric effect Effects 0.000 description 3
- 230000000670 limiting effect Effects 0.000 description 3
- 238000007855 methylation-specific PCR Methods 0.000 description 3
- 239000002773 nucleotide Substances 0.000 description 3
- 125000003729 nucleotide group Chemical group 0.000 description 3
- 125000002924 primary amino group Chemical group [H]N([H])* 0.000 description 3
- 239000000047 product Substances 0.000 description 3
- 230000002441 reversible effect Effects 0.000 description 3
- 241000894007 species Species 0.000 description 3
- 210000001519 tissue Anatomy 0.000 description 3
- 230000009466 transformation Effects 0.000 description 3
- PMHUSCHKTSTQEP-UHFFFAOYSA-N (4-carbamimidoylphenyl)methanesulfonyl fluoride Chemical compound NC(=N)C1=CC=C(CS(F)(=O)=O)C=C1 PMHUSCHKTSTQEP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- QKNYBSVHEMOAJP-UHFFFAOYSA-N 2-amino-2-(hydroxymethyl)propane-1,3-diol;hydron;chloride Chemical compound Cl.OCC(N)(CO)CO QKNYBSVHEMOAJP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 241000251468 Actinopterygii Species 0.000 description 2
- 241000244203 Caenorhabditis elegans Species 0.000 description 2
- 102000004091 Caspase-8 Human genes 0.000 description 2
- 108090000538 Caspase-8 Proteins 0.000 description 2
- 108091006146 Channels Proteins 0.000 description 2
- 239000006144 Dulbecco’s modified Eagle's medium Substances 0.000 description 2
- 101150064015 FAS gene Proteins 0.000 description 2
- 108700039691 Genetic Promoter Regions Proteins 0.000 description 2
- 239000012981 Hank's balanced salt solution Substances 0.000 description 2
- 241000701044 Human gammaherpesvirus 4 Species 0.000 description 2
- 101710191666 Lactadherin Proteins 0.000 description 2
- 102100039648 Lactadherin Human genes 0.000 description 2
- 102000018697 Membrane Proteins Human genes 0.000 description 2
- 108010052285 Membrane Proteins Proteins 0.000 description 2
- 241000276569 Oryzias latipes Species 0.000 description 2
- 238000002944 PCR assay Methods 0.000 description 2
- 102100032361 Pannexin-1 Human genes 0.000 description 2
- 101710165201 Pannexin-1 Proteins 0.000 description 2
- 229930040373 Paraformaldehyde Natural products 0.000 description 2
- 102000011755 Phosphoglycerate Kinase Human genes 0.000 description 2
- 239000012980 RPMI-1640 medium Substances 0.000 description 2
- 241000700159 Rattus Species 0.000 description 2
- 108010008281 Recombinant Fusion Proteins Proteins 0.000 description 2
- 102000007056 Recombinant Fusion Proteins Human genes 0.000 description 2
- 239000006146 Roswell Park Memorial Institute medium Substances 0.000 description 2
- 101001099217 Thermotoga maritima (strain ATCC 43589 / DSM 3109 / JCM 10099 / NBRC 100826 / MSB8) Triosephosphate isomerase Proteins 0.000 description 2
- 108700009124 Transcription Initiation Site Proteins 0.000 description 2
- 102000041666 XK family Human genes 0.000 description 2
- 108091034967 XK family Proteins 0.000 description 2
- 241000269370 Xenopus <genus> Species 0.000 description 2
- YDBDYTGWMRUUSN-PERJAUJZSA-N [(e,2s,3r)-3-hydroxy-2-[6-[(4-nitro-2,1,3-benzoxadiazol-7-yl)amino]hexanoylamino]octadec-4-enyl] 2-(trimethylazaniumyl)ethyl phosphate Chemical compound CCCCCCCCCCCCC\C=C\[C@@H](O)[C@H](COP([O-])(=O)OCC[N+](C)(C)C)NC(=O)CCCCCNC1=CC=C([N+]([O-])=O)C2=NON=C12 YDBDYTGWMRUUSN-PERJAUJZSA-N 0.000 description 2
- 229940024606 amino acid Drugs 0.000 description 2
- 230000000692 anti-sense effect Effects 0.000 description 2
- 210000004369 blood Anatomy 0.000 description 2
- 239000008280 blood Substances 0.000 description 2
- 238000009395 breeding Methods 0.000 description 2
- 230000001488 breeding effect Effects 0.000 description 2
- 230000002759 chromosomal effect Effects 0.000 description 2
- 239000012228 culture supernatant Substances 0.000 description 2
- 210000000805 cytoplasm Anatomy 0.000 description 2
- 230000001086 cytosolic effect Effects 0.000 description 2
- 230000034994 death Effects 0.000 description 2
- 231100000517 death Toxicity 0.000 description 2
- 238000001962 electrophoresis Methods 0.000 description 2
- 238000004520 electroporation Methods 0.000 description 2
- 210000002472 endoplasmic reticulum Anatomy 0.000 description 2
- 230000002708 enhancing effect Effects 0.000 description 2
- 230000001605 fetal effect Effects 0.000 description 2
- 238000011534 incubation Methods 0.000 description 2
- 230000002401 inhibitory effect Effects 0.000 description 2
- 230000003993 interaction Effects 0.000 description 2
- 230000003834 intracellular effect Effects 0.000 description 2
- 238000002955 isolation Methods 0.000 description 2
- 210000000265 leukocyte Anatomy 0.000 description 2
- 210000004698 lymphocyte Anatomy 0.000 description 2
- 238000004519 manufacturing process Methods 0.000 description 2
- 244000005700 microbiome Species 0.000 description 2
- 108700024542 myc Genes Proteins 0.000 description 2
- 238000004806 packaging method and process Methods 0.000 description 2
- 229920002866 paraformaldehyde Polymers 0.000 description 2
- 230000037361 pathway Effects 0.000 description 2
- 210000005259 peripheral blood Anatomy 0.000 description 2
- 239000011886 peripheral blood Substances 0.000 description 2
- 239000013612 plasmid Substances 0.000 description 2
- 238000003757 reverse transcription PCR Methods 0.000 description 2
- 239000011435 rock Substances 0.000 description 2
- -1 small molecule compounds Chemical class 0.000 description 2
- 230000008685 targeting Effects 0.000 description 2
- 210000001541 thymus gland Anatomy 0.000 description 2
- 238000005406 washing Methods 0.000 description 2
- UEIYTKSRDAAVTP-UHFFFAOYSA-N (4-aminophenyl)methanesulfonyl fluoride Chemical compound NC1=CC=C(CS(F)(=O)=O)C=C1 UEIYTKSRDAAVTP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- UMCMPZBLKLEWAF-BCTGSCMUSA-N 3-[(3-cholamidopropyl)dimethylammonio]propane-1-sulfonate Chemical compound C([C@H]1C[C@H]2O)[C@H](O)CC[C@]1(C)[C@@H]1[C@@H]2[C@@H]2CC[C@H]([C@@H](CCC(=O)NCCC[N+](C)(C)CCCS([O-])(=O)=O)C)[C@@]2(C)[C@@H](O)C1 UMCMPZBLKLEWAF-BCTGSCMUSA-N 0.000 description 1
- 208000030507 AIDS Diseases 0.000 description 1
- 102000007469 Actins Human genes 0.000 description 1
- 108010085238 Actins Proteins 0.000 description 1
- HJCMDXDYPOUFDY-WHFBIAKZSA-N Ala-Gln Chemical compound C[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCC(N)=O HJCMDXDYPOUFDY-WHFBIAKZSA-N 0.000 description 1
- 108700028369 Alleles Proteins 0.000 description 1
- 208000024827 Alzheimer disease Diseases 0.000 description 1
- 108010039209 Blood Coagulation Factors Proteins 0.000 description 1
- 102000015081 Blood Coagulation Factors Human genes 0.000 description 1
- 101000918303 Bos taurus Exostosin-2 Proteins 0.000 description 1
- 108091003079 Bovine Serum Albumin Proteins 0.000 description 1
- 108700031361 Brachyury Proteins 0.000 description 1
- 208000014644 Brain disease Diseases 0.000 description 1
- 108090000567 Caspase 7 Proteins 0.000 description 1
- 102100038902 Caspase-7 Human genes 0.000 description 1
- 102000053642 Catalytic RNA Human genes 0.000 description 1
- 108090000994 Catalytic RNA Proteins 0.000 description 1
- 241000282693 Cercopithecidae Species 0.000 description 1
- 108020004635 Complementary DNA Proteins 0.000 description 1
- 101000637625 Cricetulus griseus GTP-binding protein SAR1b Proteins 0.000 description 1
- IVOMOUWHDPKRLL-KQYNXXCUSA-N Cyclic adenosine monophosphate Chemical compound C([C@H]1O2)OP(O)(=O)O[C@H]1[C@@H](O)[C@@H]2N1C(N=CN=C2N)=C2N=C1 IVOMOUWHDPKRLL-KQYNXXCUSA-N 0.000 description 1
- 241000701022 Cytomegalovirus Species 0.000 description 1
- 102100038023 DNA fragmentation factor subunit beta Human genes 0.000 description 1
- 238000001712 DNA sequencing Methods 0.000 description 1
- 101100447432 Danio rerio gapdh-2 gene Proteins 0.000 description 1
- 102000016607 Diphtheria Toxin Human genes 0.000 description 1
- 108010053187 Diphtheria Toxin Proteins 0.000 description 1
- KCXVZYZYPLLWCC-UHFFFAOYSA-N EDTA Chemical compound OC(=O)CN(CC(O)=O)CCN(CC(O)=O)CC(O)=O KCXVZYZYPLLWCC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 241000196324 Embryophyta Species 0.000 description 1
- 241001302160 Escherichia coli str. K-12 substr. DH10B Species 0.000 description 1
- 241000206602 Eukaryota Species 0.000 description 1
- 108010074105 Factor Va Proteins 0.000 description 1
- 108010074860 Factor Xa Proteins 0.000 description 1
- 108010039471 Fas Ligand Protein Proteins 0.000 description 1
- 102000015212 Fas Ligand Protein Human genes 0.000 description 1
- 102000009123 Fibrin Human genes 0.000 description 1
- 108010073385 Fibrin Proteins 0.000 description 1
- BWGVNKXGVNDBDI-UHFFFAOYSA-N Fibrin monomer Chemical compound CNC(=O)CNC(=O)CN BWGVNKXGVNDBDI-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 108010049003 Fibrinogen Proteins 0.000 description 1
- 102000008946 Fibrinogen Human genes 0.000 description 1
- 108010001498 Galectin 1 Proteins 0.000 description 1
- 102100021736 Galectin-1 Human genes 0.000 description 1
- 101150112014 Gapdh gene Proteins 0.000 description 1
- 108700023372 Glycosyltransferases Proteins 0.000 description 1
- 102000051366 Glycosyltransferases Human genes 0.000 description 1
- 102000004269 Granulocyte Colony-Stimulating Factor Human genes 0.000 description 1
- 108010017080 Granulocyte Colony-Stimulating Factor Proteins 0.000 description 1
- 241000282412 Homo Species 0.000 description 1
- 101000756632 Homo sapiens Actin, cytoplasmic 1 Proteins 0.000 description 1
- 101000971879 Homo sapiens Kell blood group glycoprotein Proteins 0.000 description 1
- 101000638161 Homo sapiens Tumor necrosis factor ligand superfamily member 6 Proteins 0.000 description 1
- 101000611023 Homo sapiens Tumor necrosis factor receptor superfamily member 6 Proteins 0.000 description 1
- 101000666450 Homo sapiens XK-related protein 2 Proteins 0.000 description 1
- 101000666458 Homo sapiens XK-related protein 3 Proteins 0.000 description 1
- 101150025117 IL3 gene Proteins 0.000 description 1
- 108060003951 Immunoglobulin Proteins 0.000 description 1
- 108700005091 Immunoglobulin Genes Proteins 0.000 description 1
- 102100034343 Integrase Human genes 0.000 description 1
- 102100021447 Kell blood group glycoprotein Human genes 0.000 description 1
- AGPKZVBTJJNPAG-WHFBIAKZSA-N L-isoleucine Chemical compound CC[C@H](C)[C@H](N)C(O)=O AGPKZVBTJJNPAG-WHFBIAKZSA-N 0.000 description 1
- 206010025323 Lymphomas Diseases 0.000 description 1
- 102000043131 MHC class II family Human genes 0.000 description 1
- 108091054438 MHC class II family Proteins 0.000 description 1
- 241000124008 Mammalia Species 0.000 description 1
- 208000021964 McLeod neuroacanthocytosis syndrome Diseases 0.000 description 1
- 208000026486 McLeod syndrome Diseases 0.000 description 1
- 102000003939 Membrane transport proteins Human genes 0.000 description 1
- 108090000301 Membrane transport proteins Proteins 0.000 description 1
- 101100011486 Mus musculus Elf4 gene Proteins 0.000 description 1
- 101001033276 Mus musculus Interleukin-3 Proteins 0.000 description 1
- 101001043808 Mus musculus Interleukin-7 Proteins 0.000 description 1
- 101710135898 Myc proto-oncogene protein Proteins 0.000 description 1
- 102100038895 Myc proto-oncogene protein Human genes 0.000 description 1
- 108010057466 NF-kappa B Proteins 0.000 description 1
- 102000003945 NF-kappa B Human genes 0.000 description 1
- 229930193140 Neomycin Natural products 0.000 description 1
- 108091092724 Noncoding DNA Proteins 0.000 description 1
- 108091028043 Nucleic acid sequence Proteins 0.000 description 1
- 108091034117 Oligonucleotide Proteins 0.000 description 1
- 108700020796 Oncogene Proteins 0.000 description 1
- 108700026244 Open Reading Frames Proteins 0.000 description 1
- 238000010222 PCR analysis Methods 0.000 description 1
- 101150041227 PMX gene Proteins 0.000 description 1
- 239000002033 PVDF binder Substances 0.000 description 1
- 102000035195 Peptidases Human genes 0.000 description 1
- 108091005804 Peptidases Proteins 0.000 description 1
- 102000003992 Peroxidases Human genes 0.000 description 1
- 206010057249 Phagocytosis Diseases 0.000 description 1
- 239000004365 Protease Substances 0.000 description 1
- 229940124158 Protease/peptidase inhibitor Drugs 0.000 description 1
- 108010094028 Prothrombin Proteins 0.000 description 1
- 102100027378 Prothrombin Human genes 0.000 description 1
- 239000012083 RIPA buffer Substances 0.000 description 1
- 108091034057 RNA (poly(A)) Proteins 0.000 description 1
- 108010092799 RNA-directed DNA polymerase Proteins 0.000 description 1
- 206010038997 Retroviral infections Diseases 0.000 description 1
- 239000012722 SDS sample buffer Substances 0.000 description 1
- 230000021194 SRP-dependent cotranslational protein targeting to membrane Effects 0.000 description 1
- CGNLCCVKSWNSDG-UHFFFAOYSA-N SYBR Green I Chemical compound CN(C)CCCN(CCC)C1=CC(C=C2N(C3=CC=CC=C3S2)C)=C2C=CC=CC2=[N+]1C1=CC=CC=C1 CGNLCCVKSWNSDG-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 101001010097 Shigella phage SfV Bactoprenol-linked glucose translocase Proteins 0.000 description 1
- 108020004459 Small interfering RNA Proteins 0.000 description 1
- DWAQJAXMDSEUJJ-UHFFFAOYSA-M Sodium bisulfite Chemical compound [Na+].OS([O-])=O DWAQJAXMDSEUJJ-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 1
- 108010090804 Streptavidin Proteins 0.000 description 1
- 210000001744 T-lymphocyte Anatomy 0.000 description 1
- 241001441724 Tetraodontidae Species 0.000 description 1
- 108090000190 Thrombin Proteins 0.000 description 1
- 102000006601 Thymidine Kinase Human genes 0.000 description 1
- 108020004440 Thymidine kinase Proteins 0.000 description 1
- 108091023040 Transcription factor Proteins 0.000 description 1
- 102000040945 Transcription factor Human genes 0.000 description 1
- 101710150448 Transcriptional regulator Myc Proteins 0.000 description 1
- 229920004890 Triton X-100 Polymers 0.000 description 1
- 239000013504 Triton X-100 Substances 0.000 description 1
- 102400000084 Tumor necrosis factor ligand superfamily member 6, soluble form Human genes 0.000 description 1
- 101800000859 Tumor necrosis factor ligand superfamily member 6, soluble form Proteins 0.000 description 1
- 102100040403 Tumor necrosis factor receptor superfamily member 6 Human genes 0.000 description 1
- 102100038350 XK-related protein 2 Human genes 0.000 description 1
- 102100038348 XK-related protein 3 Human genes 0.000 description 1
- 230000005856 abnormality Effects 0.000 description 1
- 238000009825 accumulation Methods 0.000 description 1
- 230000009471 action Effects 0.000 description 1
- 239000011543 agarose gel Substances 0.000 description 1
- 230000001093 anti-cancer Effects 0.000 description 1
- 239000000427 antigen Substances 0.000 description 1
- 108091007433 antigens Proteins 0.000 description 1
- 102000036639 antigens Human genes 0.000 description 1
- 230000005784 autoimmunity Effects 0.000 description 1
- 230000001908 autoinhibitory effect Effects 0.000 description 1
- 230000031018 biological processes and functions Effects 0.000 description 1
- 230000015572 biosynthetic process Effects 0.000 description 1
- 210000002459 blastocyst Anatomy 0.000 description 1
- 239000003114 blood coagulation factor Substances 0.000 description 1
- 229940019700 blood coagulation factors Drugs 0.000 description 1
- UDSAIICHUKSCKT-UHFFFAOYSA-N bromophenol blue Chemical compound C1=C(Br)C(O)=C(Br)C=C1C1(C=2C=C(Br)C(O)=C(Br)C=2)C2=CC=CC=C2S(=O)(=O)O1 UDSAIICHUKSCKT-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 108010042238 caspase-activated deoxyribonuclease Proteins 0.000 description 1
- 230000015556 catabolic process Effects 0.000 description 1
- 101150055276 ced-3 gene Proteins 0.000 description 1
- 101150100617 ced-8 gene Proteins 0.000 description 1
- 230000003915 cell function Effects 0.000 description 1
- 230000010261 cell growth Effects 0.000 description 1
- 230000001413 cellular effect Effects 0.000 description 1
- 230000005754 cellular signaling Effects 0.000 description 1
- 238000006243 chemical reaction Methods 0.000 description 1
- 208000037976 chronic inflammation Diseases 0.000 description 1
- 208000037893 chronic inflammatory disorder Diseases 0.000 description 1
- 238000010367 cloning Methods 0.000 description 1
- 150000001875 compounds Chemical class 0.000 description 1
- 238000010276 construction Methods 0.000 description 1
- 238000012258 culturing Methods 0.000 description 1
- 230000003013 cytotoxicity Effects 0.000 description 1
- 231100000135 cytotoxicity Toxicity 0.000 description 1
- 238000006731 degradation reaction Methods 0.000 description 1
- 230000003111 delayed effect Effects 0.000 description 1
- 238000012217 deletion Methods 0.000 description 1
- 230000037430 deletion Effects 0.000 description 1
- 239000012649 demethylating agent Substances 0.000 description 1
- 229960003964 deoxycholic acid Drugs 0.000 description 1
- KXGVEGMKQFWNSR-LLQZFEROSA-N deoxycholic acid Chemical compound C([C@H]1CC2)[C@H](O)CC[C@]1(C)[C@@H]1[C@@H]2[C@@H]2CC[C@H]([C@@H](CCC(O)=O)C)[C@@]2(C)[C@@H](O)C1 KXGVEGMKQFWNSR-LLQZFEROSA-N 0.000 description 1
- 238000001514 detection method Methods 0.000 description 1
- 230000027721 electron transport chain Effects 0.000 description 1
- 239000003623 enhancer Substances 0.000 description 1
- 230000001973 epigenetic effect Effects 0.000 description 1
- 210000003743 erythrocyte Anatomy 0.000 description 1
- 210000003013 erythroid precursor cell Anatomy 0.000 description 1
- 239000003797 essential amino acid Substances 0.000 description 1
- 235000020776 essential amino acid Nutrition 0.000 description 1
- DNJIEGIFACGWOD-UHFFFAOYSA-N ethyl mercaptane Natural products CCS DNJIEGIFACGWOD-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 238000011156 evaluation Methods 0.000 description 1
- 230000029142 excretion Effects 0.000 description 1
- 238000002474 experimental method Methods 0.000 description 1
- 238000001400 expression cloning Methods 0.000 description 1
- 102000018823 fas Receptor Human genes 0.000 description 1
- 239000012894 fetal calf serum Substances 0.000 description 1
- 229950003499 fibrin Drugs 0.000 description 1
- 229940012952 fibrinogen Drugs 0.000 description 1
- 238000000799 fluorescence microscopy Methods 0.000 description 1
- 239000007850 fluorescent dye Substances 0.000 description 1
- 230000004927 fusion Effects 0.000 description 1
- 108010027225 gag-pol Fusion Proteins Proteins 0.000 description 1
- 230000002068 genetic effect Effects 0.000 description 1
- 238000012268 genome sequencing Methods 0.000 description 1
- 210000004602 germ cell Anatomy 0.000 description 1
- 108700014210 glycosyltransferase activity proteins Proteins 0.000 description 1
- 230000012010 growth Effects 0.000 description 1
- 230000006801 homologous recombination Effects 0.000 description 1
- 238000002744 homologous recombination Methods 0.000 description 1
- 102000018358 immunoglobulin Human genes 0.000 description 1
- 238000001727 in vivo Methods 0.000 description 1
- 230000006882 induction of apoptosis Effects 0.000 description 1
- 208000015181 infectious disease Diseases 0.000 description 1
- 239000003112 inhibitor Substances 0.000 description 1
- 239000002198 insoluble material Substances 0.000 description 1
- 229960000310 isoleucine Drugs 0.000 description 1
- AGPKZVBTJJNPAG-UHFFFAOYSA-N isoleucine Natural products CCC(C)C(N)C(O)=O AGPKZVBTJJNPAG-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 238000011813 knockout mouse model Methods 0.000 description 1
- 230000001665 lethal effect Effects 0.000 description 1
- 208000032839 leukemia Diseases 0.000 description 1
- 238000001638 lipofection Methods 0.000 description 1
- 230000033001 locomotion Effects 0.000 description 1
- 239000006166 lysate Substances 0.000 description 1
- 239000012139 lysis buffer Substances 0.000 description 1
- 239000000463 material Substances 0.000 description 1
- 235000012054 meals Nutrition 0.000 description 1
- 230000007246 mechanism Effects 0.000 description 1
- 108091070501 miRNA Proteins 0.000 description 1
- 239000002679 microRNA Substances 0.000 description 1
- 230000004898 mitochondrial function Effects 0.000 description 1
- 239000000203 mixture Substances 0.000 description 1
- 239000003068 molecular probe Substances 0.000 description 1
- 210000005087 mononuclear cell Anatomy 0.000 description 1
- 210000003205 muscle Anatomy 0.000 description 1
- 208000025113 myeloid leukemia Diseases 0.000 description 1
- 239000005445 natural material Substances 0.000 description 1
- 229960004927 neomycin Drugs 0.000 description 1
- 108020004707 nucleic acids Proteins 0.000 description 1
- 102000039446 nucleic acids Human genes 0.000 description 1
- 150000007523 nucleic acids Chemical class 0.000 description 1
- 244000045947 parasite Species 0.000 description 1
- 239000002245 particle Substances 0.000 description 1
- 239000000137 peptide hydrolase inhibitor Substances 0.000 description 1
- 230000035699 permeability Effects 0.000 description 1
- 108040007629 peroxidase activity proteins Proteins 0.000 description 1
- 210000001539 phagocyte Anatomy 0.000 description 1
- 230000008782 phagocytosis Effects 0.000 description 1
- 230000026731 phosphorylation Effects 0.000 description 1
- 238000006366 phosphorylation reaction Methods 0.000 description 1
- 229920002981 polyvinylidene fluoride Polymers 0.000 description 1
- 239000011148 porous material Substances 0.000 description 1
- 102000004196 processed proteins & peptides Human genes 0.000 description 1
- 238000012545 processing Methods 0.000 description 1
- 239000003805 procoagulant Substances 0.000 description 1
- 229940039716 prothrombin Drugs 0.000 description 1
- 238000000746 purification Methods 0.000 description 1
- 108700042226 ras Genes Proteins 0.000 description 1
- 239000011541 reaction mixture Substances 0.000 description 1
- 238000012755 real-time RT-PCR analysis Methods 0.000 description 1
- 108020003175 receptors Proteins 0.000 description 1
- 102000005962 receptors Human genes 0.000 description 1
- 230000002829 reductive effect Effects 0.000 description 1
- 230000025600 response to UV Effects 0.000 description 1
- 108010056030 retronectin Proteins 0.000 description 1
- 230000001177 retroviral effect Effects 0.000 description 1
- 108091092562 ribozyme Proteins 0.000 description 1
- 239000000523 sample Substances 0.000 description 1
- 238000012163 sequencing technique Methods 0.000 description 1
- 230000015607 signal release Effects 0.000 description 1
- 150000003384 small molecules Chemical class 0.000 description 1
- 238000002415 sodium dodecyl sulfate polyacrylamide gel electrophoresis Methods 0.000 description 1
- 235000010267 sodium hydrogen sulphite Nutrition 0.000 description 1
- 230000008010 sperm capacitation Effects 0.000 description 1
- WQDSRJBTLILEEK-UHFFFAOYSA-N sulfurous acid Chemical compound OS(O)=O.OS(O)=O WQDSRJBTLILEEK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 230000009392 systemic autoimmunity Effects 0.000 description 1
- 210000001550 testis Anatomy 0.000 description 1
- 229940124597 therapeutic agent Drugs 0.000 description 1
- 229960004072 thrombin Drugs 0.000 description 1
- 230000035897 transcription Effects 0.000 description 1
- 238000013518 transcription Methods 0.000 description 1
- 238000012546 transfer Methods 0.000 description 1
- 230000001131 transforming effect Effects 0.000 description 1
- 238000011830 transgenic mouse model Methods 0.000 description 1
- 230000001052 transient effect Effects 0.000 description 1
- 230000010474 transient expression Effects 0.000 description 1
- 108091005703 transmembrane proteins Proteins 0.000 description 1
- 102000035160 transmembrane proteins Human genes 0.000 description 1
- 230000001960 triggered effect Effects 0.000 description 1
- GPRLSGONYQIRFK-MNYXATJNSA-N triton Chemical compound [3H+] GPRLSGONYQIRFK-MNYXATJNSA-N 0.000 description 1
- 241000701161 unidentified adenovirus Species 0.000 description 1
- 230000003612 virological effect Effects 0.000 description 1
Images
Classifications
-
- G—PHYSICS
- G01—MEASURING; TESTING
- G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
- G01N33/00—Investigating or analysing materials by specific methods not covered by groups G01N1/00 - G01N31/00
- G01N33/48—Biological material, e.g. blood, urine; Haemocytometers
- G01N33/50—Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing
- G01N33/5005—Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing involving human or animal cells
- G01N33/5008—Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing involving human or animal cells for testing or evaluating the effect of chemical or biological compounds, e.g. drugs, cosmetics
- G01N33/5011—Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing involving human or animal cells for testing or evaluating the effect of chemical or biological compounds, e.g. drugs, cosmetics for testing antineoplastic activity
-
- G—PHYSICS
- G01—MEASURING; TESTING
- G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
- G01N33/00—Investigating or analysing materials by specific methods not covered by groups G01N1/00 - G01N31/00
- G01N33/48—Biological material, e.g. blood, urine; Haemocytometers
- G01N33/50—Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing
- G01N33/5005—Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing involving human or animal cells
- G01N33/5008—Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing involving human or animal cells for testing or evaluating the effect of chemical or biological compounds, e.g. drugs, cosmetics
-
- G—PHYSICS
- G01—MEASURING; TESTING
- G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
- G01N2405/00—Assays, e.g. immunoassays or enzyme assays, involving lipids
- G01N2405/04—Phospholipids, i.e. phosphoglycerides
-
- G—PHYSICS
- G01—MEASURING; TESTING
- G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
- G01N2500/00—Screening for compounds of potential therapeutic value
- G01N2500/10—Screening for compounds of potential therapeutic value involving cells
Landscapes
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Engineering & Computer Science (AREA)
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Biomedical Technology (AREA)
- Immunology (AREA)
- Hematology (AREA)
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Urology & Nephrology (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- Tropical Medicine & Parasitology (AREA)
- Analytical Chemistry (AREA)
- Microbiology (AREA)
- Biotechnology (AREA)
- Toxicology (AREA)
- Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
- Food Science & Technology (AREA)
- Medicinal Chemistry (AREA)
- Physics & Mathematics (AREA)
- Cell Biology (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- General Physics & Mathematics (AREA)
- Pathology (AREA)
- Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)
- Medicines That Contain Protein Lipid Enzymes And Other Medicines (AREA)
- Micro-Organisms Or Cultivation Processes Thereof (AREA)
- Investigating Or Analysing Biological Materials (AREA)
Abstract
Description
Xkr8の機能を調節する物質のスクリーニング方法であって、以下の工程を含む方法:
(1)Xkr8発現細胞と、Xkr8の機能を調節する物質の候補物質とを接触させる工程、および
(2)該細胞の細胞膜におけるリン脂質の分布を変化させる候補物質を選択する工程。
(1)細胞株、組換タンパク質、抗体、および材料
マウスインターロイキン(IL-3)依存性Ba/F3細胞50は、RPMI(10%ウシ胎児血清(FCS, Gibco)、45 単位/ml マウスIL-3、および50μM β-メルカプトエタノール含有)で維持した。ヒトPLB-98551、Jurkat (ATCC TIB152)、Namalwa (ATCC CRL-1432)、およびRaji (ATCC CCL-86) 細胞は、RPMI1640 (10% FCSおよび50μMβ-メルカプトエタノール含有)にて増殖させた。Plat-Eパッケージング細胞52は、DMEM (10% FCS含有)にて増殖させた。組換マウスIL-353およびヒトFasL54は、既報のとおり調製した。ウサギ抗活性型カスパーゼ3 mAbは、Cell Signalingから入手した。マウス抗ヒトICAD mAbはMedical & Biological Laboratories (MBL)から入手し、Alexa 488- およびAlexa 568- 標識ヤギ抗ウサギIgGはInvitrogenから入手した。スタウロスポリンは協和発酵キリンより提供を受けた。
Ba/F3-PS19細胞由来のポリ(A) RNAを用いて、ランダムヘキサマーをプライマーとして使用して二本鎖cDNAを合成し、BstXIアダプターを既報のとおり連結した55。長さ1.0-2.5 kbのDNA断片を1%アガロースゲルでの電気泳動によりサイズ分画し、Bst XIで消化したpMXsベクター56にライゲートした。E. coli DH10B細胞 (ElectroMax DH10B; Invitrogen) をエレクトロポレーションにより形質転換して、約1.3 x 106 クローンを得た。cDNAライブラリー由来のプラスミドDNAを用いて、Plat-E細胞においてレトロウイルスを産生し、遠心分離により濃縮し、既報のとおりBa/F3細胞に感染させた55。A23187で処理した細胞を、氷上で、Cy5-Annexin V (Biovision)により15分間、および5μg/ml ヨウ化プロピジウム (PI)により2分間、染色し、FACSAria (BD Biosciences)でソートした。レトロウイルスベクターに組み込まれたcDNAは、Ba/F3細胞形質転換体由来のDNAを用いて、既報のとおりPCRにより同定した55。
mXkr8 (GenBank NM_201368) およびhXkr8 (GenBank NM_018053) の全長コーディング配列を、それぞれBa/F3細胞およびNamalwa細胞からRT-PCRにより調製した。使用したプライマーは以下のとおりである(各プライマーにおいて、Bam HIまたはEco RI 認識配列を下線で示す。):
mXkr8: 5’-ATATGGATCCATCATGCCTCTGTCCGTGCACCA-3’ (配列番号7)および 5’-ATATGAATTCGAGGACTCCATTCAGCTGCA-3’ (配列番号8)
hXkr8: 5’-ATATGGATCCGCCATGCCCTGGTCGTCCCGCGG-3’ (配列番号9)および5’-ATATGAATTCTCCCTTCACTGGCGAAGCAG-3’ (配列番号10)
GFP配列をpMXs puroのEco RI部位とXho I部位の間に挿入することにより、pMXs puro c-GFPを構築した。次いで、Xkr8 cDNAをpMXs puro c-FLAG55またはpMXs puro c-GFPのBam HI/Eco RI部位に挿入し、C末端にFLAGタグまたはGFPタグを有するタンパク質を発現させた。mXkr8のD351A/D354A (2DA)変異体およびhXkr8のD352A/D355A (2DA) 変異体を作成するため、マウスおよびヒトXkr8 cDNAを、変異ヌクレオチドを有する以下の30ヌクレオチドのプライマーを用いた組換PCR57により変異させた:
mXkr8 2DA: 5’-GGGACCCTGCCCTCGTGGCTGGGACCCTAG-3’, (配列番号11)および 5’-CTAGGGTCCCAGCCACGAGGGCAGGGTCCC-3’ (配列番号12)
hXkr8 2DA: 5’-AAGCCCGACCCTGCCCAGGTAGCCGGGGCC-3’ (配列番号13)および5’-GGCCCCGGCTACCTGGGCAGGGTCGGGCTT-3’ (配列番号14)
hXkr8のC末端欠失変異体を構築するため、以下の変異型リバースプライマー: 5’-CGAGATCTGAATTCTCAGTCTACCTGGTCAGGGTCGG-3’ (配列番号15)(Eco RI認識配列を下線で示す)を用いてPCRを行い、pMXs puroベクターに挿入した。
mXkr8のための、ピューロマイシン抵抗性遺伝子を有するpRS shRNAベクターにおけるshRNA発現プラスミド4種類は、OriGeneより購入した。4つの配列のうち、shRNAに最適な標的配列は5’-GAATCTGTGCCATCGCCTTGTTCTCAGCT-3’ (配列番号16)であった。pRSにおけるスクランブルshRNAもまた、OriGeneより購入した。Ba/F3にshRNAを含むレトロウイルスを感染させ、WR19Lにはエレクトロポレーションにより導入した。1.0μg/mlピューロマイシンを含む培地中で培養することにより安定な形質転換体を限界希釈によりクローニングした。Xkr8 mRNAはリアルタイムRT-PCRにより定量した。
Xkr8をコンディショナルに標的化したマウスは、Unitechに特別注文して作成した。 説明すると、FRT配列で挟まれたホスホグリセリン酸キナーゼ(PGK) プロモーター誘導性ネオマイシン耐性(neo) 遺伝子を有するneo-loxP カセットをXkr8遺伝子のイントロン3に挿入した。エクソン3を含む1.0-kbのDNAフラグメントを対応する配列とP1 (loxP)配列において交差する遺伝子座を有するフラグメントと置き換えた。チミジンキナーゼ (tk) プロモーターに誘導されるジフテリア毒素A断片 (DT-A)をベクターの5’末端に挿入した。マウスBruce-4h胚性幹 (ES) 細胞58にターゲティングベクターを導入し、G418耐性クローンをPCRにより相同組換についてスクリーニングした。陽性クローンを胚盤胞に注射し、Xkr8+/NeoFRTマウスを作成した。Xkr8+/NeoFRT マウスを、サイトメガロウイルスエンハンサー−トリβ-アクチンハイブリットプロモーター(CAG)誘導性のフリッパーゼ変異体 (FLPe) 遺伝子(CAG-FLPe)59を有するトランスジェニックマウスと交配し、得られたマウスをC57BL/6に戻し交配して、Xkr8+/floxマウスを得た。いずれのマウスも京都大学における特定の飼育室(SPF, 特定された微生物や寄生虫が存在しない飼育室)で飼育し、動物実験は全て京都大学に認可されたプロトコールにしたがって実施した。
不死化胎児胸腺細胞株 (IFET) は、胎児胸腺細胞を既報のとおりH-rasV12およびc-mycにより不死化することで樹立した60, 61。説明すると、Xkr8+/floxマウス同士を交配し、胎児胸腺細胞を胎生 (E) 14.5日で得た。H-rasV12 およびc-mycの遺伝子を有するレトロウイルスを pCX4ベクター62を用いてPlat-E細胞で産生し、RetroNectinコートプレート (Takara Bio) に、室温で2,000 x gにて2-3時間遠心分離することにより結合させた。400 x gにて5分間遠心分離することにより、レトロウイルスをコートしたプレートに胸腺細胞を接着させ、DMEM(10% FCS、1 x 非必須アミノ酸、10 mM Hepes-NaOHバッファー (pH 7.4)、50μM β-メルカプトエタノール、5 ng/ml マウスIL-763 (PeproTech)、およびGlutaMax(商標) (Gibco)含有)にて培養した。得られたIFET細胞にAdeno-Cre (Adenovirus Cre/loxP, Takara Bio)を感染させ、限界希釈によりクローニングした。Xkr8-/-アリルを有するクローンを、以下のプライマーを用いたPCRにより選択した (野生型特異的センスプライマー: 5’-CTCATTGCTGATGTGGGTGACAATA-3’ (配列番号17); 変異型特異的センスプライマー: 5’-AGGCTTTTCTCTACTTTTGATGGAG-3’ (配列番号18); および共通のアンチセンスプライマー: 5’-CATTATCTTCCTCACTGGCTGAATC-3’ (配列番号19))。
pMX-puroベクターをPlat-E細胞に導入することにより、マウスおよびヒトXkr8cDNAを有するレトロウイルスを作製し、遠心分離により濃縮し、Ba/F3細胞およびXkr8-/- IFET細胞に感染させた。安定な形質転換体を、ピューロマイシン含有培地(Ba/F3細胞について1.0μg/ml、IFET細胞について2.0μg/ml)にて選択し、組換タンパク質の発現を抗Flag (Clone M2, Sigma)または抗GFP (Clone JL8, Clontech)によるウェスタンブロッティングにより確認した。レトロウイルスによる形質転換によってマウスFas cDNA64をIFET細胞に導入し、その発現を抗マウスFas mAb (Jo2)65によるフローサイトメトリーにより確認した。ヒトPLB-985およびマウスWR19L細胞を両種性レトロウイルスエンベロープまたはVSVγエンベロープによるレトロウイルス感染により形質転換した。説明すると、pMXsレトロウイルスベクター、pGP (Takara Bio) (gag-pol融合タンパク質用)、およびpE-ampho (Takara Bio)またはpCMV-VSV-G-RSV-Rev (理化学研究所三好博士より供与)を一緒に293T細胞に導入することにより、レトロウイルスを産生した。培養上清中のウイルス粒子を遠心分離により濃縮し、細胞株を形質転換した。Xkr8-GFPを293T細胞で発現させるため、Fugene 6 (Promega)を用いたリポフェクションにより、293T細胞にpMXs puroXkr8-GFPを導入した。安定な形質転換体は、1.0μg/ml ピューロマイシンを含む培地で選択した。
細胞にFasLまたはスタウロスポリンを処理し、あるいはUV照射し、アポトーシスを誘導した。説明すると、5 x 105細胞(培養培地500μl中)を、37℃で、10-400単位/ml hFasLと1.2-2.0時間、あるいは10μM スタウロスポリンと1.5-4.0時間、インキュベートした。UV照射では、StrataLinker UVオーブン (Stratagene)において、1 x 106細胞(PBS2 ml中)に500-2000 J/m2 (254 nm)にてUV照射し、10% FCS含有RPMI1640(4 ml)中で37℃にて1.5-2.0時間インキュベートした。Ca2+イオノフォア誘発PtdSer露出をモニターするため、細胞 (5 x 105細胞)をAnnexin V染色バッファー (10 mM Hepes-NaOHバッファー [pH7.4]、140 mM NaClおよび2.5 mM CaCl2含有) 500μl中で20℃にて3分間インキュベートし、3.0-10μM A23187で処理し、FACSAriaで20℃にて解析した。
細胞表面に露出するPtdSerおよびPtdEtnを検出するため、細胞を氷上で2500-5000倍希釈のCy5-Annexin V (Biovision)または800倍希釈のビオチン-Ro09-019866で15分間染色し、続いて1.0μg/ml APC-ストレプトアビジン (Annexin V染色バッファー中)により5μg/mlヨウ化プロピジウム(PI)の存在下染色し、FACSAriaまたはFACSCalibur (BD Biosciences)により解析した。PtdChoおよびSMの取り込みを評価するため、1 x 106細胞 (1 mM CaCl2含有HBSS (HBSS-Ca) 0.5 ml 中)を氷上で7分間インキュベートした。等量の200 nM 1-オレイル-2-{6-[(7-ニトロ-2-1,3-ベンゾオキサジアゾール-4-イル)アミノ]ヘキサノイル}-sn-グリセロ-3-ホスホコリン(NBD-PC)(Avanti Polar Lipids)またはN-[6-[(7-ニトロ-2-1,3-ベンゾオキサジアゾール-4-イル)アミノ]ヘキサノイル]-スフィンゴシン-1-ホスホコリン(NBD-SM) (Avanti Polar Lipids) (HBSS-Ca中)を添加し、20℃でインキュベートした。一部(150μl)を150μl HBSS (5μg/ml 脂肪酸不含BSA (Sigma-Aldrich)および500 nM Sytoxblue (Molecular Probes)含有)と混合し、FACSAriaにより解析した。
ヒトPLB-985細胞を5-アザ-2’-デオキシシチジン (DAC, Sigma-Aldrich)で処理するため、1.0 x 106細胞(10% FCS含有RPMI10 ml中)を0.5 mM DACと7日間インキュベートした。DACは不安定な化合物であるため、DAC含有培地は24時間毎に交換した。DAC処理後、細胞を3つに分けた。1つはPtdSer露出の解析のためのFACS用、1つはXkr8遺伝子発現のためのリアルタイムRT-PCR 用、1つはメチル化特異的PCR解析用である67。バイサルファイトゲノムシークエンスのため、キット(MethyEasy Xceed, Human Genetic Signatures)を用いてDNAを亜硫酸水素塩で修飾した。説明すると、3μgのDNAを37℃で15分間0.3 M NaOH中でインキュベートすることにより変性させ、インキュベーション時間を90分に変更した点を除き供給元のプロトコールにしたがい亜硫酸水素ナトリウムで処理した。修飾したDNAを95℃で20分間変性させ、処理したDNAに特異的なプライマー(TTAGGGATTAGAATGTGTTT (配列番号20)および CCTATACAAATAACCCAACT (配列番号21))を用いてPCRにより増幅した。EpiTaq HSポリメラーゼ (Takara Bio) を用いてPCRを7-40サイクル実施し、配列決定のため生成物をpGEM-Teasyベクターにクローニングした。
ヒトおよびマウス細胞株並びに様々なマウス組織に由来する全RNAを、Superscript III 逆転写酵素 (Invitrogen) またはHigh Capacity RNA-to-cDNA(商標) キット (Applied Biosystems)を用いて逆転写した。生成物の一部を、LightCycler(商標)480 SYBR Green I Master (Roche Diagnostics)を含む反応混合物中で増幅した。リアルタイムRT-PCR用のプライマーは以下のとおりである:
mXkr8: 5’-GCGACGCCACAGCTCACACT-3’ (配列番号22)および 5’-CCCCAGCAGCAGCAGGTTCC-3’ (配列番号23)
mGapdh: 5’-AGCAGGCATCTGAGGGCCCA-3’ (配列番号24)および 5’-GAGAGCAATGCCAGCCCCGG-3’ (配列番号25)
hXkr8: 5’-AGGCCGGGCCATCATCCACT-3’ (配列番号26)および 5’-TGCGCCTGTTCTGAGGCAGC-3’ (配列番号27)
ヒトβ-アクチン: 5’-GCATCCTCACCCTGAAGTAC-3’ (配列番号28)および5’-CTTAATGTCACGCACGATTTC-3’ (配列番号29)
特異的mRNAは、LightCycler Systemが参照としてのそれぞれの直線化プラスミドDNAについてPCRによる集積の対数期の立ち上がりを検出した時点で、定量した。
hXkr8-GFPまたはhXkr8 2DA-GFPを発現するPLB-985細胞形質転換体から、既報のとおり膜画分を調製した53。次いで、膜を溶解バッファー (20 mM Tris-HCl [pH 7.2]、140 mM NaCl、1% Triton X-100、10% グリセロール、および1 mM (p-アミノフェニル) メタンスルホニルフルオリド (APMSF))に懸濁することにより可溶化した。不溶性物質を遠心分離により除去した後、膜タンパク質 (20μg) を、37℃で1時間、3単位の各組換ヒトカスパーゼ (Biovision)と、50 mM Hepes-NaOH (pH 7.4)、50 mM NaCl、5% (v/v) グリセロール、5 mM DTT、10 mM EDTA、0.1 mM APMSF、および0.1% CHAPS(100μl)中でインキュベートし、ウェスタンブロッティングにより解析した。
RIPAバッファー (50 mM Hepes-NaOH バッファー [pH 8.0]、1% NP-40、0.1% SDS、0.5%デオキシコール酸ナトリウム、150 mM NaCl、および10%プロテアーゼ阻害剤カクテル)中で細胞を溶解した。溶解物を5 x SDSサンプルバッファー (200 mM Tris-HCl [pH 6.8]、10% SDS、25% グリセロール、5% β-メルカプトエタノール、および0.05% ブロモフェノールブルー)と混合し、Xkr8-GFPの検出のため室温で1時間インキュベートし、あるいは他のタンパク質の検出のため5分間煮沸した。タンパク質を10-20%勾配SDS-PAGE (Bio Craft)上の電気泳動により分離し、PVDF メンブレン (Millipore)に転写した。メンブレンに3000倍希釈マウス抗GFP mAb、3000倍希釈マウス抗ヒトICAD mAb、または3000倍希釈ウサギ抗活性型カスパーゼ3 mAbを結合させ、続いて1,000倍希釈HRP結合ヤギ抗マウスまたはウサギ免疫グロブリン (Dako)とともにインキュベートした。ペルオキシダーゼ活性は、Western Lightning(商標)-ECL システム (PerkinElmer)により検出した。
(1)マウスXkr8のクローニング
本発明者らは以前に、PtdSerを多く露出する細胞をFACSによりソーティングし増殖させることを繰り返すことで、PtdSerを高レベルに発現するマウスBa/F3細胞のサブライン(Ba/F3-PS19)を樹立している15。Ca2+依存性リン脂質スクランブラーゼであるTMEM16Fは、2.5 kb以上のcDNAで構築したBa/F3-PS19のcDNAライブラリーから単離した。アポトーシス性のPtdSer露出に関与するスクランブラーゼを探索するため、長さ1.0〜2.5 kbのBa/F3-PS19 cDNAによりcDNAライブラリーを調製し、Ba/F3細胞に導入した。PtdSerを効率的に露出する細胞のFACSによる選別と増殖を5回繰り返し、選別した細胞を限界希釈した。この工程により、恒常的にPtdSer を露出する細胞株(LD-PS5-2-2)を樹立した(図1a)。LD-PS5-2-2細胞には、複数の膜貫通領域を有する401アミノ酸のタンパク質であるマウスXkr8をコードするcDNAのみが組み込まれていた。
以前の報告と一致して17,18、ヒトPLB-985白血病株およびRajiリンパ腫株は、スタウロスポリン、UV、またはFasLなどのアポトーシス性刺激によってPtdSerを発現せず、スタウロスポリンに応答してPtdSerを発現するヒトNamalwa細胞およびJurkat細胞とは非常に対照的であった(図2a)。リアルタイムRT-PCR解析によれば、PLB-985細胞およびRaji細胞におけるXkr8 mRNAレベルは、それぞれNamalwa細胞の8%および9%であった(図2b)。PLB-985細胞またはRaji細胞にhXkr8発現プラスミドを導入すると、これらの形質転換体は、効率的にスタウロスポリン、UV照射、またはFasLに応答してPtdSerを露出し、カスパーゼ活性化は増強しなかった(図2c)。これらの結果は、PLB-985細胞およびRaji細胞がPtdSerを露出できないのはXkr8遺伝子の発現の欠如によることを示唆する。
リン脂質スクランブラーゼは、細胞膜において非特異的にリン脂質を移動させることができる酵素として定義される20。Xkr8を介するスクランブラーゼ活性について調べるため、ヒトPLB-985およびhXkr8を発現するその形質転換体をスタウロスポリンで処理した。4時間後、ICAD (ICAD-LおよびICAD-S)はPLB-985およびそのhXkr8発現形質転換体において同様に十分に切断されていた(図4a)。PtdSer露出で観察されたように、親PLB-985細胞およびhXkr8形質転換体をPtdEtn結合ペプチドであるRO09-019821 (ROペプチド)を用いて解析すると、どちらの細胞も増殖中はPtdEtnを露出しなかった(図4b)。一方、スタウロスポリン処理hXkr8発現PLB-985細胞は、ROペプチドにより染色されPtdEtnの発現が示されたが、親細胞では染色されなかった。PtdChoおよびSMについてのスクランブル活性は、1-オレオイル-2-{6-[(7-ニトロ-2-1,3-ベンゾオキサジアゾール-4-イル)アミノ]ヘキサノイル}-sn-グリセロ-3-ホスホコリン (NBD-PC)、またはN-[6-[(7-nitro-2-1,3- ベンゾオキサジアゾール-4-イル)アミノ] ヘキサノイル]-スフィンゴシン-1-ホスホコリン (NBD-SM)の取り込みにより調べた。図4cおよび4dに示されるように、NBD-PCおよびNBD-SMは増殖中のPLB-985細胞またはhXkr8形質転換体では取り込まれなかった。一方、NBD-PCおよびNBD-SMは、スタウロスポリンを処理したhXkr8形質転換体では取り込まれたが、親細胞では取り込まれなかった。これらの結果は、Xkr8がアポトーシス細胞死の間に活性化され、非特異的スクランブラーゼとして機能することを示す。このXkr8の非特異的スクランブリング活性は、Ca2+依存性リン脂質スクランブラーゼであるTMEM16Fと類似していた15。しかしながら、アポトーシス誘導性のPtdSer露出とは異なり、PLB-985細胞およびhXkr8形質転換体におけるCa2+誘導性のPtdSer露出は同じ速度で生じ(図8)、このことはXkr8がCa2+依存性のPtdSer露出には影響しないことを示唆する。
Xkr8はXKファミリーのメンバーであり22、そのホモログは哺乳類、魚類、および両生類に存在する(図5a)。TMpred (http://www.ch.embnet.org/software/TMPRED_form.html)およびTMHMM (http://www.cbs.dtu.dk/services/TMHMM-2.0/)を含むトポロジー予測プログラムを用いて、各種由来のXkr8のアミノ酸配列の解析により、6つから8つの膜貫通領域という予測の不一致が生じた。Xkr8タンパク質の全体構造が種間で保存されているとすれば、Xkr8は6つの膜貫通領域を有し、N末端およびC末端が細胞質内に存在すると考えられる(図5b)。オンラインサーチツール(CASVM, http://www.casbase.org/casvm/index.html)により、ヒト、マウス、ラット、フグ、メダカ、およびXenopusのXkr8のC末端細胞内領域に、よく保存された カスパーゼ3認識配列23が同定された(図5a)。
PtdSerはアポトーシスを起こしたほとんどの細胞で細胞表面に暴露される。それゆえ、mXkr8 mRNAは、精巣で非常に高く発現し、心臓および筋肉での発現が低い点を除き、様々なマウス組織で普遍的かつほぼ同程度に発現している(図6a)。リン脂質スクランブリングにおけるXkr8の役割を調べ、またそのリン脂質スクランブリング活性をTMEM16Fと比較するため、Xkr8欠損胎児胸腺細胞株 (IFET) を樹立した(図6b)。FasLに応答して、Xkr8flox/flox IFET細胞およびTMEM16F-/- IFET細胞は迅速にPtdSerを露出した(図6c)。これに対して、Xkr8-/- IFET細胞はこの処理に対してPtdSerを露出しなかったが、カスパーゼ3 は同様に活性化されていた。Xkr8-/- IFET細胞にmXkr8 cDNAを有するレトロウイルスを感染させると、この形質転換体はFasLに応答してPtdSerを露出した。一方、Ca2+ イオノフォアはXkr8flox/flo IFET細胞およびXkr8-/- IFET細胞においてPtdSerの露出を誘導したが、TMEM16F-/- IFET細胞では誘導しなかった(図6d)。これらの結果から、Xkr8はアポトーシス性のPtdSer露出に関与し、TMEM16FはCa2+誘導性のPtdSer露出に関与することがわかる。
1. Jacobson, M. D., Weil, M., & Raff, M. C., Programmed cell death in animal development. Cell 88, 347-354 (1997).
2. Vaux, D. L. & Korsmeyer, S. J., Cell death in development. Cell 96, 245-254 (1999).
3. Nagata, S., Apoptosis by death factor. Cell 88, 355-365 (1997).
4. Strasser, A., O'Connor, L., & Dixit, V. M., Apoptosis signaling. Annu. Rev. Biochem. 69, 217-245 (2000).
5. Nagata, S., DNA degradation in development and programmed cell death. Annu. Rev. Immunol. 23, 853-875 (2005).
6. Enari, M. et al., A caspase-activated DNase that degrades DNA during apoptosis, and its inhibitor ICAD. Nature 391, 43-50 (1998).
7. Coleman, M. et al., Membrane blebbing during apoptosis results from caspase-mediated activation of ROCK I. Nat. Cell Biol. 3, 339-345 (2001).
8. Sebbagh, M. et al., Caspase-3-mediated cleavage of ROCK I induces MLC phosphorylation and apoptotic membrane blebbing. Nat. Cell Biol. 3, 346-352 (2001).
9. Fadok, V. A. et al., Exposure of phosphatidylserine on the surface of apoptotic lymphocytes triggers specific recognition and removal by macrophages. J. Immunol. 148, 2207-2216 (1992).
10. Leventis, P. A. & Grinstein, S., The Distribution and Function of Phosphatidylserine in Cellular Membranes. Annu. Rev. Biophys. 39, 407-427 (2010).
11. Ravichandran, K. S. & Lorenz, U., Engulfment of apoptotic cells: signals for a good meal. Nat. Rev. Immunol. 7, 964-974 (2007).
12. Nagata, S., Hanayama, R., & Kawane, K., Autoimmunity and the clearance of dead cells. Cell 140, 619-630 (2010).
13. Zwaal, R., Comfurius, P., & Bevers, E., Lipid-protein interactions in blood coagulation. Biochim. Biophys. Acta 1376, 433-453 (1998).
14. Bevers, E. & Williamson, P., Phospholipid scramblase: an update. FEBS Lett. 584, 2724-2730 (2010).
15. Suzuki, J., Umeda, M., Sims, P. J., & Nagata, S., Calcium-dependent phospholipid scrambling by TMEM16F. Nature 468, 834-838 (2010).
16. Williamson, P. et al., Phospholipid scramblase activation pathways in lymphocytes. Biochemistry 40, 8065-8072 (2001).
17. Fadeel, B. et al., Phosphatidylserine exposure during apoptosis is a cell-type-specific event and does not correlate with plasma membrane phospholipid scramblase expression. Biochem. Biophys. Res. Commun. 266, 504-511 (1999).
18. Fadok, V. A., de Cathelineau, A., Daleke, D. L., Henson, P. M., & Bratton, D. L., Loss of phospholipid asymmetry and surface exposure of phosphatidylserine is required for phagocytosis of apoptotic cells by macrophages and fibroblasts. J. Biol. Chem. 276, 1071-1077 (2001).
19. Herman, J. G., Graff, J. R., Myohanen, S., Nelkin, B. D., & Baylin, S. B., Methylation-specific PCR: a novel PCR assay for methylation status of CpG islands. Proc. Natl. Acad. Sci. USA 93, 9821-9826 (1996).
20. Balasubramanian, K. & Schroit, A., Aminophospholipid asymmetry: A matter of life and death. Annu. Rev. Physiol. 65, 701-734 (2003).
21. Emoto, K., Toyama-Sorimachi, N., Karasuyama, H., Inoue, K., & Umeda, M., Exposure of phosphatidylethanolamine on the surface of apoptotic cells. Exp. Cell Res. 232, 430-434 (1997).
22. Calenda, G. et al., Identification of two new members, XPLAC and XTES, of the XK family. Gene 370, 6-16 (2006).
23. Timmer, J. C. & Salvesen, G. S., Caspase substrates. Cell Death Differ. 14, 66-72 (2007).
24. Martin, S. J., Finucane, D. M., Amarante-Mendes, G. P., O'Brien, G. A., & Green, D. R., Phosphatidylserine externalization during CD95-induced apoptosis of cells and cytoplasts requires ICE/CED-3 protease activity. J. Biol. Chem. 271, 28753-28756 (1996).
25. Giraudo, C. G. & Maccioni, H. J. F., Endoplasmic reticulum export of glycosyltransferases depends on interaction of a cytoplasmic dibasic motif with Sar1. Mol. Biol. Cell. 14, 3753-3766 (2003).
26. Barlowe, C., Signals for COPII-dependent export from the ER: what's the ticket out? Trends Cell Biol. 13, 295-300 (2003).
27. Ho, M. et al., Isolation of the gene for McLeod syndrome that encodes a novel membrane transport protein. Cell 77, 869-880 (1994).
28. Russo, D., Redman, C., & Lee, S., Association of XK and Kell blood group proteins. The Journal of biological chemistry 273, 13950-13956 (1998).
29. Schoenwaelder, S. M. et al., Two distinct pathways regulate platelet phosphatidylserine exposure and procoagulant function. Blood 114, 663-666 (2009).
30. Ricci, J.-E. et al., Disruption of mitochondrial function during apoptosis is mediated by caspase cleavage of the p75 subunit of complex I of the electron transport chain. Cell 117, 773-786 (2004).
31. Gleiss, B., Gogvadze, V., Orrenius, S., & Fadeel, B., Fas-triggered phosphatidylserine exposure is modulated by intracellular ATP. FEBS Lett. 519, 153-158 (2002).
32. Fadeel, B. & Orrenius, S., Apoptosis: a basic biological phenomenon with wide-ranging implications in human disease. J. Inter. Med. 258, 479-517 (2005).
33. Sandilos, J. K. et al., Pannexin 1, an ATP Release Channel, Is Activated by Caspase Cleavage of Its Pore-associated C-terminal Autoinhibitory Region. J. Biol. Chem. 287, 11303-11311 (2012).
34. Chekeni, F. B. et al., Pannexin 1 channels mediate 'find-me' signal release and membrane permeability during apoptosis. Nature 467, 863-867 (2010).
35. Bratton, D. et al., Appearance of phosphatidylserine on apoptotic cells requires calcium-mediated nonspecific flip-flop and is enhanced by loss of the aminophospholipid translocase. J. Biol. Chem. 272, 26159-26165 (1997).
36. Hampton, M., Vanags, D., Porn-Ares, M., & Orrenius, S., Involvement of extracellular calcium in phosphatidylserine exposure during apoptosis. FEBS Lett. 399, 277-282 (1996).
37. van den Eijnde, S. et al., Cell surface exposure of phosphatidylserine during apoptosis is phylogenetically conserved. Apoptosis 3, 9-16 (1998).
38. Venegas, V. & Zhou, Z., Two alternative mechanisms that regulate the presentation of apoptotic cell engulfment signal in Caenorhabditis elegans. Mol. Biol. Cell 18, 3180-3192 (2007).
39. Ellis, R. E., Jacobson, D. M., & Horvitz, H. R., Genes required for the engulfment of cell corpses during programmed cell death in Caenorhabditis elegans. Genetics 129, 79-94. (1991).
40. Stanfield, G. & Horvitz, H., The ced-8 gene controls the timing of programmed cell deaths in C. elegans. Mol. Cell 5, 423-433 (2000).
41. Munoz, L. E., Lauber, K., Schiller, M., Manfredi, A. A., & Herrmann, M., The role of defective clearance of apoptotic cells in systemic autoimmunity. Nat. Rev. Rheumatol. 6, 280-289 (2010).
42. Franks, A. L. & Slansky, J. E., Multiple associations between a broad spectrum of autoimmune diseases, chronic inflammatory diseases and cancer. Anticancer Res. 32, 1119-1136 (2012).
43. Yoshida, H. et al., Phosphatidylserine-dependent engulfment by macrophages of nuclei from erythroid precursor cells. Nature 437, 754-758 (2005).
44. Connor, J., Pak, C. C., & Schroit, A. J., Exposure of phosphatidylserine in the outer leaflet of human red blood cells. Relationship to cell density, cell age, and clearance by mononuclear cells. J. Biol. Chem. 269, 2399-2404 (1994).
45. Stowell, S. R. et al., Galectin-1 induces reversible phosphatidylserine exposure at the plasma membrane. Mol. Biol. Cell 20, 1408-1418 (2009).
46. van den Eijnde, S. et al., Transient expression of phosphatidylserine at cell-cell contact areas is required for myotube formation. J. Cell Sci. 114, 3631-3642 (2001).
47. Gadella, B. & Harrison, R., Capacitation induces cyclic adenosine 3',5'-monophosphate-dependent, but apoptosis-unrelated, exposure of aminophospholipids at the apical head plasma membrane of boar sperm cells. Biol. Reprod. 67, 340-350 (2002).
48. Marguet, D., Luciani, M. F., Moynault, A., Williamson, P., & Chimini, G., Engulfment of apoptotic cells involves the redistribution of membrane phosphatidylserine on phagocyte and prey. Nat. Cell Biol. 1, 454-456 (1999).
49. Imao, T. & Nagata, S., Apaf-1- and Caspase-8-independent apoptosis. Cell Death Differ, in press (2012).
50. Palacios, R. & Steinmetz, M., Il-3-dependent mouse clones that express B-220 surface antigen, contain Ig genes in germ-line configuration, and generate B lymphocytes in vivo. Cell 41, 727-734 (1985).
51. Tucker, K. A., Lilly, M. B., Heck, L., & Rado, T. A., Characterization of a new human diploid myeloid leukemia cell line (PLB-985) with granulocytic and monocytic differentiating capacity. Blood 70, 372-378 (1987).
52. Morita, S., Kojima, T., & Kitamura, T., Plat-E: an efficient and stable system for transient packaging of retroviruses. Gene Ther. 7, 1063-1066 (2000).
53. Fukunaga, R., Ishizaka-Ikeda, E., & Nagata, S., Purification and characterization of the receptor for murine granulocyte colony-stimulating factor. J. Biol. Chem. 265, 14008-14015 (1990).
54. Shiraishi, T. et al., Increased cytotoxicity of soluble Fas ligand by fusing isoleucine zipper motif. Biochem. Biophys. Res. Commun. 322, 197-202 (2004).
55. Suzuki, J., Umeda, M., Sims, P. J., & Nagata, S., Calcium-dependent phospholipid scrambling by TMEM16F. Nature 468, 834-838 (2010).
56. Kitamura, T. et al., Retrovirus-mediated gene transfer and expression cloning: powerful tools in functional genomics. Exp. Hematol. 31, 1007-1014 (2003).
57. Higuchi, R., Recombinant PCR in PCR protocols: A guide to methods and applications (Academic Press, San Diego, 1990), pp. 177-188.
58. Kontgen, F., Suss, G., Stewart, C., Steinmetz, M., & Bluethmann, H., Targeted disruption of the MHC class II Aa gene in C57BL/6 mice. Int. Immunol. 5, 957-964 (1993).
59. Kanki, H., Suzuki, H., & Itohara, S., High-efficiency CAG-FLPe deleter mice in C57BL/6J background. Exp. Anim. 55, 137-141 (2006).
60. Cattermole, J. A. et al., Isolation of murine fetal thymus cell lines after infection with recombinant retroviruses containing the v-myc and v-Ha-ras oncogenes. J. Immunol. 142, 3746-3753 (1989).
61. Imao, T. & Nagata, S., Apaf-1- and Caspase-8-independent apoptosis. Cell Death Differ, in press (2012).
62. Akagi, T., Sasai, K., & Hanafusa, H., Refractory nature of normal human diploid fibroblasts with respect to oncogene-mediated transformation. Proc. Natl. Acad. Sci. USA 100, 13567-13572 (2003).
63. Watson, J. D., Morrissey, P. J., Namen, A. E., Conlon, P. J., & Widmer, M. B., Effect of IL-7 on the growth of fetal thymocytes in culture. J. Immunol. 143, 1215-1222 (1989).
64. Watanabe-Fukunaga, R. et al., The cDNA structure, expression, and chromosomal assignment of the mouse Fas antigen. J. Immunol. 148, 1274-1279 (1992).
65. Ogasawara, J. et al., Lethal effect of the anti-Fas antibody in mice. Nature 364, 806-809 (1993).
66. Aoki, Y., Uenaka, T., Aoki, J., Umeda, M., & Inoue, K., A novel peptide probe for studying the transbilayer movement of phosphatidylethanolamine. J. Biochem. 116, 291-297 (1994).
67. Herman, J. G., Graff, J. R., Myohanen, S., Nelkin, B. D., & Baylin, S. B., Methylation-specific PCR: a novel PCR assay for methylation status of CpG islands. Proc. Natl. Acad. Sci. USA 93, 9821-9826 (1996).
配列番号8:合成プライマー
配列番号9:合成プライマー
配列番号10:合成プライマー
配列番号11:合成プライマー
配列番号12:合成プライマー
配列番号13:合成プライマー
配列番号14:合成プライマー
配列番号15:合成プライマー
配列番号16:shRNAの標的配列
配列番号17:合成プライマー
配列番号18:合成プライマー
配列番号19:合成プライマー
配列番号20:合成プライマー
配列番号21:合成プライマー
配列番号22:合成プライマー
配列番号23:合成プライマー
配列番号24:合成プライマー
配列番号25:合成プライマー
配列番号26:合成プライマー
配列番号27:合成プライマー
配列番号28:合成プライマー
配列番号29:合成プライマー
Claims (9)
- Xkr8の機能を調節する物質のスクリーニング方法であって、以下の工程を含む方法:
(1)Xkr8発現細胞と、Xkr8の機能を調節する物質の候補物質とを接触させる工程、および
(2)該細胞の細胞膜におけるリン脂質の分布を変化させる候補物質を選択する工程。 - リン脂質が、ホスファチジルセリン、ホスファチジルエタノールアミン、ホスファチジルコリン、およびスフィンゴミエリンから選択される、請求項1記載の方法。
- ホスファチジルセリンの細胞膜外葉における分布を増加させる候補物質がXkr8の機能を亢進する物質として選択され、ホスファチジルセリンの細胞膜外葉における分布を減少させる候補物質がXkr8の機能を抑制する物質として選択される、請求項2記載の方法。
- ホスファチジルエタノールアミンの細胞膜外葉における分布を増加させる候補物質がXkr8の機能を亢進する物質として選択され、ホスファチジルエタノールアミンの細胞膜外葉における分布を減少させる候補物質がXkr8の機能を抑制する物質として選択される、請求項2記載の方法。
- ホスファチジルコリンの細胞膜内葉における分布を増加させる候補物質がXkr8の機能を亢進する物質として選択され、ホスファチジルコリンの細胞膜内葉における分布を減少させる候補物質がXkr8の機能を抑制する物質として選択される、請求項2記載の方法。
- スフィンゴミエリンの細胞膜内葉における分布を増加させる候補物質がXkr8の機能を亢進する物質として選択され、スフィンゴミエリンの細胞膜内葉における分布を減少させる候補物質がXkr8の機能を抑制する物質として選択される、請求項2記載の方法。
- アポトーシスが関与する疾患の治療または予防のための薬剤のスクリーニング方法である、請求項1〜6のいずれかに記載の方法。
- アポトーシスが関与する疾患が自己免疫疾患である、請求項7記載の方法。
- アポトーシスが関与する疾患ががんである、請求項7記載の方法。
Applications Claiming Priority (3)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
US201261726147P | 2012-11-14 | 2012-11-14 | |
US61/726,147 | 2012-11-14 | ||
PCT/JP2013/080692 WO2014077279A1 (ja) | 2012-11-14 | 2013-11-13 | Xkr8の機能を調節する物質のスクリーニング方法 |
Publications (2)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
JPWO2014077279A1 true JPWO2014077279A1 (ja) | 2017-01-05 |
JP6229954B2 JP6229954B2 (ja) | 2017-11-15 |
Family
ID=50731190
Family Applications (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
JP2014547004A Active JP6229954B2 (ja) | 2012-11-14 | 2013-11-13 | Xkr8の機能を調節する物質のスクリーニング方法 |
Country Status (4)
Country | Link |
---|---|
US (1) | US9857357B2 (ja) |
EP (1) | EP2921854B1 (ja) |
JP (1) | JP6229954B2 (ja) |
WO (1) | WO2014077279A1 (ja) |
Families Citing this family (3)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
EP3130924B1 (en) | 2014-04-08 | 2019-06-12 | Kyoto University | Method for screening for inhibitor of atp11c or cdc50a |
CA3187875A1 (en) * | 2020-07-23 | 2022-01-27 | Tscan Therapeutics, Inc. | Compositions and methods for identifying epitopes |
AU2022434038A1 (en) * | 2022-01-14 | 2024-08-01 | University Of Pittsburgh-Of The Commonwealth System Of Higher Education | Targeting of xkr8 in therapies |
Citations (2)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
US20030129722A1 (en) * | 1996-04-02 | 2003-07-10 | Therese Wiedmer | Methods and compositions to alter the cell surface expression of phosphatidylserine and other clot-promoting plasma membrane phospholipids |
US20060172958A1 (en) * | 2003-03-13 | 2006-08-03 | Lee Ruey-Min | Phospholipid scramblase 3 |
Family Cites Families (1)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
WO2012029855A1 (ja) | 2010-09-01 | 2012-03-08 | 国立大学法人京都大学 | 血液凝固調節物質のスクリーニング方法 |
-
2013
- 2013-11-13 JP JP2014547004A patent/JP6229954B2/ja active Active
- 2013-11-13 WO PCT/JP2013/080692 patent/WO2014077279A1/ja active Application Filing
- 2013-11-13 EP EP13854768.2A patent/EP2921854B1/en active Active
- 2013-11-13 US US14/440,968 patent/US9857357B2/en active Active
Patent Citations (2)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
US20030129722A1 (en) * | 1996-04-02 | 2003-07-10 | Therese Wiedmer | Methods and compositions to alter the cell surface expression of phosphatidylserine and other clot-promoting plasma membrane phospholipids |
US20060172958A1 (en) * | 2003-03-13 | 2006-08-03 | Lee Ruey-Min | Phospholipid scramblase 3 |
Also Published As
Publication number | Publication date |
---|---|
EP2921854B1 (en) | 2017-09-13 |
JP6229954B2 (ja) | 2017-11-15 |
EP2921854A1 (en) | 2015-09-23 |
US20150301024A1 (en) | 2015-10-22 |
US9857357B2 (en) | 2018-01-02 |
WO2014077279A1 (ja) | 2014-05-22 |
EP2921854A4 (en) | 2016-05-04 |
Similar Documents
Publication | Publication Date | Title |
---|---|---|
Rogers et al. | Gasdermin pores permeabilize mitochondria to augment caspase-3 activation during apoptosis and inflammasome activation | |
Suzuki et al. | Exposure of phosphatidylserine by Xk-related protein family members during apoptosis | |
Nagata et al. | Exposure of phosphatidylserine on the cell surface | |
Benz et al. | Mena/VASP and αII-Spectrin complexes regulate cytoplasmic actin networks in cardiomyocytes and protect from conduction abnormalities and dilated cardiomyopathy | |
Barnes et al. | Compartmentalization of photoreceptor sensory cilia | |
JP6229954B2 (ja) | Xkr8の機能を調節する物質のスクリーニング方法 | |
Hara et al. | Clustering of CARMA1 through SH3–GUK domain interactions is required for its activation of NF-κB signalling | |
Lou et al. | SNX10 promotes phagosome maturation in macrophages and protects mice against Listeria monocytogenes infection | |
Inanç et al. | Abnormal centrosomal structure and duplication in Cep135-deficient vertebrate cells | |
Ouellette et al. | Spatial control of active CDC-42 during collective migration of hypodermal cells in Caenorhabditis elegans | |
Ryoden et al. | Functional expression of the P2X7 ATP receptor requires eros | |
Emperador-Melero et al. | Phosphorylation triggers presynaptic phase separation of Liprin-α3 to control active zone structure | |
US11692999B2 (en) | Method of screening ATP11C or CDC50A inhibitor | |
WO2012029855A1 (ja) | 血液凝固調節物質のスクリーニング方法 | |
Geng | Post-translational modifications of the ligands: Requirement for TAM receptor activation | |
EP2839279B1 (en) | Method for screening a modulator of a tmem16 family member | |
JP2006290848A (ja) | T細胞受容体機能調節用組成物及びそのスクリーニング方法 | |
Turotszy | The role of NARF and other novel progeria-associated genes/proteins in ageing processes. | |
Takada et al. | Drosophila Trus, the orthologue of mammalian PDCD2L, is required for proper cell proliferation, larval developmental timing, and oogenesis | |
領田優太 | Functional expression of the P2X7 ATP receptor | |
ES2351646A1 (es) | Mamífero no humano modificado genéticamente, células y métodos para producirlas. | |
Lui | Characterisation of APC localisation, dynamics and functions at the centrosome | |
Bond | Identification of the Signaling Pathways that Regulate V-ATPase Assembly in Yeast and Dendritic Cells | |
Cui | RNAi knockdown of Nopp140 induces the minute syndrome in Drosophila: A potential model for the human Treacher Collins syndrome | |
Maiti | E2F and survivin-key players in cellular proliferation and transformation |
Legal Events
Date | Code | Title | Description |
---|---|---|---|
A621 | Written request for application examination |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A621 Effective date: 20161014 |
|
TRDD | Decision of grant or rejection written | ||
A01 | Written decision to grant a patent or to grant a registration (utility model) |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A01 Effective date: 20170912 |
|
A61 | First payment of annual fees (during grant procedure) |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A61 Effective date: 20171005 |
|
R150 | Certificate of patent or registration of utility model |
Ref document number: 6229954 Country of ref document: JP Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R150 |
|
R250 | Receipt of annual fees |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R250 |
|
R250 | Receipt of annual fees |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R250 |
|
R250 | Receipt of annual fees |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R250 |
|
R250 | Receipt of annual fees |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R250 |
|
R250 | Receipt of annual fees |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R250 |