JPWO2005070859A1 - Fluorous carrier and method for producing oligonucleotide derivative using the same - Google Patents

Abstract

The present invention provides a carrier capable of mass synthesis of a biopolymer such as a nucleic acid and reusable as necessary. By using a fluorous carrier represented by the following formula (1a), Mass synthesis of molecules becomes possible. [In the formula, R 1, R 2 and R 3 are each independently the same or different and are each a fluorine-containing hydrocarbon group which may have a substituent, an oxygen atom, a nitrogen atom, It may be interrupted by a sulfur atom or a silicon atom. ]

Description

  The present invention relates to a fluorous carrier, a nucleoside bound to a fluorous carrier, and a method for producing an oligonucleotide derivative using the nucleoside.

  Chemically synthesized nucleic acids are important substances that are indispensable for molecular biology and medical research. For example, synthetic DNA is routinely used in cutting-edge research fields such as base sequence determination, gene diagnosis, and nucleic acid medicine in the Human Genome Project. Until now, the amount of synthetic DNA required for individual studies has been negligible, and DNA chemical synthesis methods have been optimized for low-volume synthesis in order to respond quickly to these small and diverse demands. An automated solid-phase synthesis method has been established.

［式中、Ｒ^１、Ｒ^２及びＲ^３は、それぞれ、互いに独立し、同一または異なって、フッ素を有する炭化水素基であり、置換基を有していてもよく、酸素原子、窒素原子、硫黄原子、又は、ケイ素原子で中断されていてもよい。］
本発明の第１態様の一側面において、Ｒ^１、Ｒ^２及びＲ^３が、それぞれ、互いに独立し、同一または異なって、下記式（Ａ）で示されるフルオロアルキル基、

［式中、Ｂ^１及びＢ^２は、それぞれ、互いに独立し、同一または異なって、水素原子、又は、置換基を有していてもよいＣ_１〜Ｃ_２０炭化水素基であり、ｍは０〜１０の整数であり、ｎは０〜２０の整数である。］又は、下記式（Ｂ）で示される、モノ若しくはポリフルオロアルキルオキシベンジル基

［式中、Ｂ^３及びＢ^４は、それぞれ、互いに独立し、同一または異なって、水素原子、又は、置換基を有していてもよいＣ_１〜Ｃ_２０炭化水素基であり、ｐはそれぞれ、互いに独立し、同一または異なって０〜２０の整数であり、ｑはそれぞれ、互いに独立し、同一または異なって０〜１０の整数であり、ｒは１〜３の整数である。］であることが好ましい。
本発明の第１態様の他の側面では、下記式（１ｂ）で示されるフルオラス担体が提供される。

［式中、Ａ^１、Ａ^２、Ａ^３、Ａ^４、Ａ^５、Ａ^６、Ａ^７、Ａ^８及びＡ^９は、それぞれ、互いに独立し、同一または異なって、フッ素を有する炭化水素基であり、置換基を有していてもよく、酸素原子、窒素原子、硫黄原子、又は、ケイ素原子で中断されていてもよく、
Ｙは、−Ｏ−、−ＮＡ^１０−（式中、Ａ^１０は水素原子又はＣ_１〜Ｃ_１０アルキル基である）、又は、−Ｓ−である。］
本発明の第１態様の他の側面において、Ａ^１、Ａ^２、Ａ^３、Ａ^４、Ａ^５、Ａ^６、Ａ^７、Ａ^８及びＡ^９が、それぞれ、互いに独立し、同一または異なって、下記式（Ａ）で示されるフルオロアルキル基、

［式中、Ｂ^１及びＢ^２は、それぞれ、互いに独立し、同一または異なって、水素原子、又は、置換基を有していてもよいＣ_１〜Ｃ_２０炭化水素基であり、ｍは０〜１０の整数であり、ｎは０〜２０の整数である。］又は、下記式（Ｂ）で示される、モノ若しくはポリフルオロアルキルオキシベンジル基

［式中、Ｂ^３及びＢ^４は、それぞれ、互いに独立し、同一または異なって、水素原子、又は、置換基を有していてもよいＣ_１〜Ｃ_２０炭化水素基であり、ｐはそれぞれ、互いに独立し、同一または異なって０〜２０の整数であり、ｑはそれぞれ、互いに独立し、同一または異なって０〜１０の整数であり、ｒは１〜３の整数］であることが好ましい。
本発明の第１態様において、フルオラス担体は生体高分子の合成に用いられることが好ましい。
本発明の第２態様において、本発明の第１態様で提供されるフルオラス担体を含む置換基を３’−位に導入したヌクレオシドが提供される。
本発明の第２態様の一側面では、下記式（２ａ）で示される、ヌクレオシドが提供される。

［式中、Ｒ^１、Ｒ^２及びＲ^３は、それぞれ、互いに独立し、同一または異なって、フッ素を有する炭化水素基であり、置換基を有していてもよく、酸素原子、窒素原子、硫黄原子、又は、ケイ素原子で中断されていてもよく、Ｂ^５は、無保護若しくはアミノ基が保護されたピリミジン塩基若しくはプリン塩基、又はそれらの誘導体を表し、Ｘ^１は、水素原子、ジメトキシトリチル基、又は、モノメトキシトリチル基であり、Ｘ^２は、水素原子、ヒドロキシ基、アルコキシ基、アルケニルオキシ基、アシルオキシ基、又は、トリアルキルシリルオキシ基であり、Ｙは、−Ｏ−、−ＮＡ^１０−（式中、Ａ^１０は水素原子又はＣ_１〜Ｃ_１０アルキル基である）、又は、−Ｓ−であり、Ｚは、−（ＣＨ_２）_ｉ−（式中、ｉは０〜３の整数である）、又は、置換基を有していてもよいフェニレン基を表す。］
本発明の第２態様の一側面において、Ｒ^１、Ｒ^２及びＲ^３が、それぞれ、互いに独立し、同一または異なって、下記式（Ａ）で示されるフルオロアルキル基、

［式中、Ｂ^１及びＢ^２は、それぞれ、互いに独立し、同一または異なって、水素原子、又は、置換基を有していてもよいＣ_１〜Ｃ_２０炭化水素基であり、ｍは０〜１０の整数であり、ｎは０〜２０の整数である。］又は、下記式（Ｂ）で示される、モノ若しくはポリフルオロアルキルオキシベンジル基

［式中、Ｂ^３及びＢ^４は、それぞれ、互いに独立し、同一または異なって、水素原子、又は、置換基を有していてもよいＣ_１〜Ｃ_２０炭化水素基であり、ｐはそれぞれ、互いに独立し、同一または異なって０〜２０の整数であり、ｑはそれぞれ、互いに独立し、同一または異なって０〜１０の整数であり、ｒは１〜３の整数］であることが好ましい。
本発明の第２態様の一側面の一態様では、下記式（２ｂ）で示される、ヌクレオシドが提供される。

［式中、Ｂ^５、Ｘ^１、Ｘ^２、Ｙ及びＺは、前記と同義を示す。
Ａ^１、Ａ^２、Ａ^３、Ａ^４、Ａ^５、Ａ^６、Ａ^７、Ａ^８及びＡ^９は、それぞれ、互いに独立し、同一または異なって、フッ素を有する炭化水素基であり、置換基を有していてもよく、酸素原子、窒素原子、硫黄原子、又は、ケイ素原子で中断されていてもよい。］
本発明の本発明の第２態様の一側面の一態様において、Ａ^１、Ａ^２、Ａ^３、Ａ^４、Ａ^５、Ａ^６、Ａ^７、Ａ^８及びＡ^９が、それぞれ、互いに独立し、同一または異なって、下記式（Ａ）で示されるフルオロアルキル基、

［式中、Ｂ^１及びＢ^２は、それぞれ、互いに独立し、同一または異なって、水素原子、又は、置換基を有していてもよいＣ_１〜Ｃ_２０炭化水素基であり、ｍは０〜１０の整数であり、ｎは０〜２０の整数である。］又は、下記式（Ｂ）で示される、モノ若しくはポリフルオロアルキルオキシベンジル基

［式中、Ｂ^３及びＢ^４は、それぞれ、互いに独立し、同一または異なって、水素原子、又は、置換基を有していてもよいＣ_１〜Ｃ_２０炭化水素基であり、ｐはそれぞれ、互いに独立し、同一または異なって０〜２０の整数であり、ｑはそれぞれ、互いに独立し、同一または異なって０〜１０の整数であり、ｒは１〜３の整数］であることが好ましい。
本発明の第２態様の一側面において、Ｂ^５に導入された保護基が、下記式（Ｃ）で示されるフルオロアルキル基

［式中、Ｅ^１及びＥ^２は、それぞれ、互いに独立し、同一または異なって、水素原子、又は、置換基を有していてもよいＣ_１〜Ｃ_２０炭化水素基であり、ｍは０〜１０の整数であり、ｎは０〜２０の整数である。］又は、下記式（Ｄ）で示される、モノ若しくはポリフルオロアルキルオキシベンジル基

［式中、Ｅ^３及びＥ^４は、それぞれ、互いに独立し、同一または異なって、水素原子、又は、置換基を有していてもよいＣ_１〜Ｃ_２０炭化水素基であり、ｐはそれぞれ、互いに独立し、同一または異なって０〜２０の整数であり、ｑはそれぞれ、互いに独立し、同一または異なって０〜１０の整数であり、ｒは１〜３の整数］であることが好ましい。
本発明の第３態様では、下記式（２ａ）で示されるヌクレオシドと

［式中、Ｒ^１、Ｒ^２及びＲ^３は、それぞれ、互いに独立し、同一または異なって、フッ素を有する炭化水素基であり、置換基を有していてもよく、酸素原子、窒素原子、硫黄原子、又は、ケイ素原子で中断されていてもよく、Ｂ^５は、無保護若しくはアミノ基が保護されたピリミジン塩基若しくはプリン塩基、又はそれらの誘導体を表し、Ｘ^１は、水素原子であり、Ｘ^２は、水素原子、ヒドロキシ基、アルコキシ基、アルケニルオキシ基、アシルオキシ基、又は、トリアルキルシリルオキシ基であり、Ｙは、−Ｏ−、−ＮＡ^１０−（式中、Ａ^１０は水素原子又はＣ_１〜Ｃ_１０アルキル基である）、又は、−Ｓ−であり、Ｚは、−（ＣＨ_２）_ｉ−（式中、ｉは０〜３の整数である）、又は、置換基を有していてもよいフェニレン基を表す。］ 縮合剤存在下、下記式（３）で示されるホスホネートと

［式中、Ｂ^６は、無保護若しくはアミノ基が保護されたピリミジン塩基若しくはプリン塩
基、又はそれらの誘導体を表し、Ｘ^３は、ジメトキシトリチル基、又は、モノメトキシト
リチル基であり、Ｘ^４は、水素原子、ヒドロキシ基、アルコキシ基、アルケニルオキシ基
、アシルオキシ基、又は、トリアルキルシリルオキシ基を表す。］を反応させ、下記式（
４ａ）で示される二量体を製造する方法が提供される。

［式中、Ｂ^５、Ｂ^６、Ｘ^２、Ｘ^３、Ｘ^４、Ｙ、Ｚ、Ｒ^１、Ｒ^２及びＲ^３は、前記と同義を表す。］
本発明の第３態様の一態様として、前記式（２ａ）で示されるヌクレオシドが下記式（２ｂ）で示されるヌクレオシドであり、

［式中、Ｂ^５、Ｘ^１、Ｘ^２、Ｙ及びＺは、前記と同義である。
Ａ^１、Ａ^２、Ａ^３、Ａ^４、Ａ^５、Ａ^６、Ａ^７、Ａ^８及びＡ^９は、それぞれ、互いに独立し、同一または異なって、フッ素を有する炭化水素基であり、置換基を有していてもよく、酸素原子、窒素原子、硫黄原子、又は、ケイ素原子で中断されていてもよい。］ 製造される前記二量体が、下記式（４ｂ）で示される二量体である二量体を製造する方法が提供される。

［式中、Ｂ^５、Ｂ^６、Ｘ^２、Ｘ^３、Ｘ^４、Ｙ、Ｚ、Ａ^１、Ａ^２、Ａ^３、Ａ^４、Ａ^５、Ａ^６、Ａ^７、Ａ^８及びＡ^９は、前記と同義を表す。］
本発明の第４態様では、下記式（５ａ）で示されるオリゴヌクレオチド誘導体と、

［式中、Ｒ^１、Ｒ^２及びＲ^３は、それぞれ、互いに独立し、同一または異って、フッ素を有する炭化水素基であり、置換基を有していてもよく、酸素原子、窒素原子、硫黄原子、又は、ケイ素原子で中断されていてもよく、Ｂ^５は、無保護若しくはアミノ基が保護されたピリミジン塩基若しくはプリン塩基、又はそれらの誘導体を表し、Ｂ^６は、それぞれ、互いに独立し、同一または異なって、無保護若しくはアミノ基が保護されたピリミジン塩基若しくはプリン塩基、又はそれらの誘導体を表し、Ｘ^２は、水素原子、ヒドロキシ基、アルコキシ基、アルケニルオキシ基、アシルオキシ基、又は、トリアルキルシリルオキシ基を表し、Ｘ^３は、ジメトキシトリチル基、又は、モノメトキシトリチル基であり、Ｘ^４は、それぞれ、互いに独立し、同一または異なって、水素原子、ヒドロキシ基、アルコキシ基、アルケニルオキシ基、アシルオキシ基、又は、トリアルキルシリルオキシ基を表し、ｓは１以上の整数を示す。］ 脱保護試薬とを反応させて、Ｘ^３を脱離させた後、縮合剤存在下、下記式（３）で示されるホスホネートと

［式中、Ｂ^６、Ｘ^３及びＸ^４は、前記と同義を表す。］を反応させることを特徴とする、下記式（６ａ）で示されるオリゴヌクレオチド誘導体の製造方法が提供される。

［式中、Ｂ^５、Ｂ^６、Ｘ^２、Ｘ^３、Ｘ^４、Ｙ、Ｚ、ｓ、Ｒ^１、Ｒ^２及びＲ^３は、前記と同義を表す。］
本発明の第４態様の一側面では、前記式（５ａ）で示されるオリゴヌクレオチド誘導体が下記式（５ｂ）で示されるオリゴヌクレオチド誘導体であり、

［式中、Ｂ^５、Ｂ^６、Ｘ^２、Ｘ^３、Ｘ^４及びｓは、前記と同義である。Ａ^１、Ａ^２、Ａ^３、Ａ^４、Ａ^５、Ａ^６、Ａ^７、Ａ^８及びＡ^９は、それぞれ、互いに独立し、同一または異なって、フッ素を有する炭化水素基であり、置換基を有していてもよく、酸素原子、窒素原子、硫黄原子、又は、ケイ素原子で中断されていてもよい。］ 製造される前記オリゴヌクレオチド誘導体が、下記式（６ｂ）で示されるオリゴヌクレオチド誘導体である、オリゴヌクレオチド誘導体の製造方法が提供される。

［式中、Ｂ^５、Ｂ^６、Ｘ^２、Ｘ^３、Ｘ^４、Ｙ、Ｚ、ｓ、Ａ^１、Ａ^２、Ａ^３、Ａ^４、Ａ^５、Ａ^６、Ａ^７、Ａ^８及びＡ^９は、前記と同義を表す。］
本発明により、核酸等の生体高分子の合成に有用な担体を提供することができ、これにより生体高分子の大量合成を簡便に行うことができる。また、生体高分子の合成に使用した本発明にかかるフルオラス担体は再利用が可能である。On the other hand, in recent years, nucleic acids and their analogs are being put into practical use as pharmaceuticals such as antisense nucleic acids, ribozymes and siRNAs, or new attempts to use nucleic acids as new functional materials have been actively conducted. In view of this, it is certain that the demand for synthetic nucleic acids will increase dramatically in the future. However, existing nucleic acid solid-phase synthesis methods optimized for rapid small-scale synthesis employ inefficient reactions with a large excess of reagents and are simply scaled up for large-scale synthesis. Then, it is not effective at all chemically and economically.
On the other hand, according to the liquid phase synthesis method capable of large-scale synthesis by stoichiometric reaction, it is necessary to go through a complicated process in which the product must be isolated using column chromatography at each stage, After all it is not economically effective.
As a result of intensive studies to solve the above-mentioned problems, the present inventors have developed a fluorous synthesis method capable of performing a multistage reaction only by an extraction operation while taking advantage of liquid phase synthesis capable of mass synthesis. Applied to nucleic acid synthesis, using fluorous dendron as a new carrier with high fluorine content, extending the oligonucleotide chain only by extraction using a fluorous solvent without purification by column chromatography I found that I can do it.
That is, in one aspect of the first aspect of the present invention, a fluorous carrier represented by the following formula (1a) is provided.

[Wherein, R ¹ , R ² and R ³ are each independently the same or different, and are a hydrocarbon group having fluorine, which may have a substituent, an oxygen atom, a nitrogen atom, It may be interrupted by a sulfur atom or a silicon atom. ]
In one aspect of the first embodiment of the present invention, R ¹ , R ² and R ³ are each independently the same or different, a fluoroalkyl group represented by the following formula (A),

[Wherein, B ¹ and B ² are each independently the same or different and are a hydrogen atom or a C _{1 to} C ₂₀ hydrocarbon group which may have a substituent, and m is 0. Is an integer of -10, and n is an integer of 0-20. Or a mono- or polyfluoroalkyloxybenzyl group represented by the following formula (B)

[Wherein, B ³ and B ⁴ are each independently the same or different and are a hydrogen atom or a C _{1 to} C ₂₀ hydrocarbon group optionally having a substituent, and p is each Are independently the same or different and are each an integer of 0 to 20, q is independently of each other and is the same or different and is an integer of 0 to 10, and r is an integer of 1 to 3. ] Is preferable.
In another aspect of the first embodiment of the present invention, a fluorous carrier represented by the following formula (1b) is provided.

[Wherein, A ¹ , A ² , A ³ , A ⁴ , A ⁵ , A ⁶ , A ⁷ , A ⁸ and A ⁹ are each independently the same or different and represent a hydrocarbon group having fluorine. Yes, may have a substituent, and may be interrupted by an oxygen atom, a nitrogen atom, a sulfur atom, or a silicon atom,
Y is —O—, —NA ¹⁰ — (wherein A ¹⁰ is a hydrogen atom or a C _{1 to} C ₁₀ alkyl group), or —S—. ]
In another aspect of the first aspect of the present invention, A ¹ , A ² , A ³ , A ⁴ , A ⁵ , A ⁶ , A ⁷ , A ⁸ and A ⁹ are each independently the same or different. A fluoroalkyl group represented by the following formula (A),

[Wherein, B ¹ and B ² are each independently the same or different and are a hydrogen atom or a C _{1 to} C ₂₀ hydrocarbon group which may have a substituent, and m is 0. Is an integer of -10, and n is an integer of 0-20. Or a mono- or polyfluoroalkyloxybenzyl group represented by the following formula (B)

[Wherein, B ³ and B ⁴ are each independently the same or different and are a hydrogen atom or a C _{1 to} C ₂₀ hydrocarbon group optionally having a substituent, and p is each Are independently the same or different and are each an integer of 0 to 20, q is independently of each other and is the same or different and is an integer of 0 to 10, and r is preferably an integer of 1 to 3. .
In the first aspect of the present invention, the fluorous carrier is preferably used for biopolymer synthesis.
In the second aspect of the present invention, there is provided a nucleoside in which a substituent containing the fluorous carrier provided in the first aspect of the present invention is introduced at the 3′-position.
In one aspect of the second embodiment of the present invention, a nucleoside represented by the following formula (2a) is provided.

[Wherein, R ¹ , R ² and R ³ are each independently the same or different, and are a hydrocarbon group having fluorine, which may have a substituent, an oxygen atom, a nitrogen atom, B ⁵ may be interrupted by a sulfur atom or a silicon atom, B ⁵ represents an unprotected or amino group-protected pyrimidine base or purine base, or a derivative thereof, and X ¹ represents a hydrogen atom, dimethoxytrityl. X ² is a hydrogen atom, a hydroxy group, an alkoxy group, an alkenyloxy group, an acyloxy group, or a trialkylsilyloxy group, and Y is —O— or —NA. ¹⁰ − (wherein A ¹⁰ is a hydrogen atom or a C _{1 to} C ₁₀ alkyl group) or —S—, and Z is — (CH ₂ ) _i — (where i is 0 to 3). Integer There), or a phenylene group which may have a substituent. ]
In one aspect of the second embodiment of the present invention, R ¹ , R ² and R ³ are each independently the same or different, a fluoroalkyl group represented by the following formula (A),

[Wherein, B ¹ and B ² are each independently the same or different and are a hydrogen atom or a C _{1 to} C ₂₀ hydrocarbon group which may have a substituent, and m is 0. Is an integer of -10, and n is an integer of 0-20. Or a mono- or polyfluoroalkyloxybenzyl group represented by the following formula (B)

[Wherein, B ³ and B ⁴ are each independently the same or different and are a hydrogen atom or a C _{1 to} C ₂₀ hydrocarbon group optionally having a substituent, and p is each Are independently the same or different and are each an integer of 0 to 20, q is independently of each other and is the same or different and is an integer of 0 to 10, and r is preferably an integer of 1 to 3. .
In one embodiment of one aspect of the second embodiment of the present invention, a nucleoside represented by the following formula (2b) is provided.

[Wherein, B ⁵ , X ¹ , X ² , Y and Z have the same meaning as described above.
A ¹ , A ² , A ³ , A ⁴ , A ⁵ , A ⁶ , A ⁷ , A ⁸ and A ⁹ are each independently the same or different, and are a hydrocarbon group having fluorine and a substituent. And may be interrupted by an oxygen atom, a nitrogen atom, a sulfur atom, or a silicon atom. ]
In one embodiment of one aspect of the second embodiment of the present invention, A ¹ , A ² , A ³ , A ⁴ , A ⁵ , A ⁶ , A ⁷ , A ⁸ and A ⁹ are each independently of each other. , The same or different, a fluoroalkyl group represented by the following formula (A),

[Wherein, B ¹ and B ² are each independently the same or different and are a hydrogen atom or a C _{1 to} C ₂₀ hydrocarbon group which may have a substituent, and m is 0. Is an integer of -10, and n is an integer of 0-20. Or a mono- or polyfluoroalkyloxybenzyl group represented by the following formula (B)

[Wherein, B ³ and B ⁴ are each independently the same or different and are a hydrogen atom or a C _{1 to} C ₂₀ hydrocarbon group optionally having a substituent, and p is each Are independently the same or different and are each an integer of 0 to 20, q is independently of each other and is the same or different and is an integer of 0 to 10, and r is preferably an integer of 1 to 3. .
In one aspect of the second embodiment of the present invention, the protecting group introduced into B ⁵ is a fluoroalkyl group represented by the following formula (C):

[Wherein, E ¹ and E ² are each independently the same or different and are a hydrogen atom or a C _{1 to} C ₂₀ hydrocarbon group optionally having a substituent, and m is 0. Is an integer of -10, and n is an integer of 0-20. Or a mono- or polyfluoroalkyloxybenzyl group represented by the following formula (D)

[Wherein, E ³ and E ⁴ are each independently the same or different and each represents a hydrogen atom or a C _{1 to} C ₂₀ hydrocarbon group which may have a substituent, and p represents Are independently the same or different and are each an integer of 0 to 20, q is independently of each other and is the same or different and is an integer of 0 to 10, and r is preferably an integer of 1 to 3. .
In the third aspect of the present invention, a nucleoside represented by the following formula (2a) and

[Wherein, R ¹ , R ² and R ³ are each independently the same or different, and are a hydrocarbon group having fluorine, which may have a substituent, an oxygen atom, a nitrogen atom, B ⁵ may be interrupted by a sulfur atom or a silicon atom, B ⁵ represents an unprotected or amino-protected pyrimidine base or purine base, or a derivative thereof, X ¹ is a hydrogen atom, X ² represents a hydrogen atom, a hydroxy group, an alkoxy group, an alkenyloxy group, an acyloxy group, or a trialkylsilyloxy group, and Y represents —O— or —NA ¹⁰ — (wherein A ¹⁰ represents a hydrogen atom. or _C 1 _{-C 10} alkyl group), or a -S-, Z _{is, - (CH 2) i -} ( wherein, i is an integer of 0 to 3), or, a substituent Optional phenylene group Represent. In the presence of a condensing agent, a phosphonate represented by the following formula (3)

[Wherein, B ⁶ represents an unprotected or amino group-protected pyrimidine base or purine base, or a derivative thereof, X ³ represents a dimethoxytrityl group or a monomethoxytrityl group, and X ⁴ represents Represents a hydrogen atom, a hydroxy group, an alkoxy group, an alkenyloxy group, an acyloxy group, or a trialkylsilyloxy group. ] Is reacted, and the following formula (
A method for producing the dimer shown in 4a) is provided.

[Wherein, B ⁵ , B ⁶ , X ² , X ³ , X ⁴ , Y, Z, R ¹ , R ² and R ³ have the same meanings as described above. ]
As one aspect of the third aspect of the present invention, the nucleoside represented by the formula (2a) is a nucleoside represented by the following formula (2b),

[Wherein, B ⁵ , X ¹ , X ² , Y and Z are as defined above.
A ¹ , A ² , A ³ , A ⁴ , A ⁵ , A ⁶ , A ⁷ , A ⁸ and A ⁹ are each independently the same or different, and are a hydrocarbon group having fluorine and a substituent. And may be interrupted by an oxygen atom, a nitrogen atom, a sulfur atom, or a silicon atom. A method for producing a dimer in which the produced dimer is a dimer represented by the following formula (4b) is provided.

[Wherein B ⁵ , B ⁶ , X ² , X ³ , X ⁴ , Y, Z, A ¹ , A ² , A ³ , A ⁴ , A ⁵ , A ⁶ , A ⁷ , A ⁸ and A ⁹ are Represents the same meaning as described above. ]
In the fourth aspect of the present invention, an oligonucleotide derivative represented by the following formula (5a):

[Wherein, R ¹ , R ² and R ³ are each independently the same or different and are a hydrocarbon group having fluorine, which may have a substituent, an oxygen atom, a nitrogen atom ^May be interrupted by a sulfur atom or a silicon atom, and B ⁵ represents an unprotected or amino group-protected pyrimidine base or purine base, or a derivative thereof, and B ⁶ are independently of each other. And the same or different and represents an unprotected or amino-protected pyrimidine base or purine base, or a derivative thereof, X ² represents a hydrogen atom, a hydroxy group, an alkoxy group, an alkenyloxy group, an acyloxy group, or represents trialkylsilyl group, X ³ is dimethoxytrityl group, or a mono-methoxytrityl group, X ^4, respectively, to each other Standing city, same or different, a hydrogen atom, hydroxy group, an alkoxy group, an alkenyloxy group, an acyloxy group, or represents a trialkyl silyl group, s represents an integer of 1 or more. ] Is reacted with a deprotecting reagent, after the X ³ desorbed, and phosphonate represented by the presence of a condensing agent, the following formula (3)

[Wherein, B ⁶ , X ³ and X ⁴ are as defined above. The method for producing an oligonucleotide derivative represented by the following formula (6a) is provided.

[Wherein, B ⁵ , B ⁶ , X ² , X ³ , X ⁴ , Y, Z, s, R ¹ , R ² and R ³ represent the same meaning as described above. ]
In one aspect of the fourth aspect of the present invention, the oligonucleotide derivative represented by the formula (5a) is an oligonucleotide derivative represented by the following formula (5b),

[Wherein, B ⁵ , B ⁶ , X ² , X ³ , X ⁴ and s are as defined above. A ¹ , A ² , A ³ , A ⁴ , A ⁵ , A ⁶ , A ⁷ , A ⁸ and A ⁹ are each independently the same or different, and are a hydrocarbon group having fluorine and a substituent. And may be interrupted by an oxygen atom, a nitrogen atom, a sulfur atom, or a silicon atom. There is provided a method for producing an oligonucleotide derivative, wherein the produced oligonucleotide derivative is an oligonucleotide derivative represented by the following formula (6b).

[Wherein, B ⁵ , B ⁶ , X ² , X ³ , X ⁴ , Y, Z, s, A ¹ , A ² , A ³ , A ⁴ , A ⁵ , A ⁶ , A ⁷ , A ⁸ and A ⁹ represents the same meaning as described above. ]
According to the present invention, a carrier useful for the synthesis of a biopolymer such as a nucleic acid can be provided, whereby a large amount of biopolymer can be easily synthesized. The fluorous carrier according to the present invention used for biopolymer synthesis can be reused.

上記式中、Ｒ^１、Ｒ^２及びＲ^３は、それぞれ、互いに独立し、同一または異なって、フッ素を有する炭化水素基である。
本明細書において、「炭化水素基」とは、例えば、Ｃ_１〜Ｃ_２０炭化水素基であり、飽和若しくは不飽和の非環式であってもよいし、飽和若しくは不飽和の環式であってもよい。Ｃ_１〜Ｃ_２０炭化水素基が非環式の場合には、線状でもよいし、枝分かれでもよい。「Ｃ_１〜Ｃ_２０炭化水素基」には、Ｃ_１〜Ｃ_２０アルキル基、Ｃ_２〜Ｃ_２０アルケニル基、Ｃ_２〜Ｃ_２０アルキニル基、Ｃ_４〜Ｃ_２０アルキルジエニル基、Ｃ_６〜Ｃ_１８アリール基、Ｃ_７〜Ｃ_２０アルキルアリール基、Ｃ_７〜Ｃ_２０アリールアルキル基、Ｃ_４〜Ｃ_２０シクロアルキル基、Ｃ_４〜Ｃ_２０シクロアルケニル基、（Ｃ_３〜Ｃ_１０シクロアルキル）Ｃ_１〜Ｃ_１０アルキル基などが含まれる。
本明細書において、「Ｃ_１〜Ｃ_２０アルキル基」は、Ｃ_１〜Ｃ_１０アルキル基であることが好ましく、Ｃ_１〜Ｃ_６アルキル基であることが更に好ましい。アルキル基の例としては、制限するわけではないが、メチル、エチル、プロピル、イソプロピル、ｎ−ブチル、ｓｅｃ−ブチル、ｔｅｒｔ−ブチル、ペンチル、ヘキシル、ドデカニル等を挙げることができる。
本明細書において、「Ｃ_２〜Ｃ_２０アルケニル基」は、Ｃ_２〜Ｃ_１０アルケニル基であることが好ましく、Ｃ_２〜Ｃ_６アルケニル基であることが更に好ましい。アルケニル基の例としては、制限するわけではないが、ビニル、アリル、プロペニル、イソプロペニル、２−メチル−１−プロペニル、２−メチルアリル、２−ブテニル等を挙げることができる。
本明細書において、「Ｃ_２〜Ｃ_２０アルキニル基」は、Ｃ_２〜Ｃ_１０アルキニル基であることが好ましく、Ｃ_２〜Ｃ_６アルキニル基であることが更に好ましい。アルキニル基の例としては、制限するわけではないが、エチニル、１−プロピニル、２−プロピニル、１−ブチニル、２−ブチニル、３−ブチニル、１−ペンチニル、２−ペンチニル、３−ペンチニル、４−ペンチニル等を挙げることができる。
本明細書において、「Ｃ_４〜Ｃ_２０アルキルジエニル基」は、Ｃ_４〜Ｃ_１０アルキルジエニル基であることが好ましく、Ｃ_４〜Ｃ_６アルキルジエニル基であることが更に好ましい。アルキルジエニル基の例としては、制限するわけではないが、１，３−ブタジエニル等を挙げることができる。
本明細書において、「Ｃ_６〜Ｃ_１８アリール基」は、Ｃ_６〜Ｃ_１０アリール基であることが好ましい。アリール基の例としては、制限するわけではないが、フェニル、１−ナフチル、２−ナフチル、インデニル、ビフェニリル、アントリル、フェナントリル等を挙げることができる。
本明細書において、「Ｃ_７〜Ｃ_２０アルキルアリール基」は、Ｃ_７〜Ｃ_１２アルキルアリール基であることが好ましい。アルキルアリール基の例としては、制限するわけではないが、ｏ−トリル、ｍ−トリル、ｐ−トリル、２，３−キシリル、２，４−キシリル、２，５−キシリル、ｏ−クメニル、ｍ−クメニル、ｐ−クメニル、メシチル等を挙げることができる。
本明細書において、「Ｃ_７〜Ｃ_２０アリールアルキル基」は、Ｃ_７〜Ｃ_１２アリールアルキル基であることが好ましい。アリールアルキル基の例としては、制限するわけではないが、ベンジル、フェネチル、ジフェニルメチル、トリフェニルメチル、１−ナフチルメチル、２−ナフチルメチル、２，２−ジフェニルエチル、３−フェニルプロピル、４−フェニルブチル、５−フェニルペンチル等を挙げることができる。
本明細書において、「Ｃ_４〜Ｃ_２０シクロアルキル基」は、Ｃ_４〜Ｃ_１０シクロアルキル基であることが好ましい。シクロアルキル基の例としては、制限するわけではないが、シクロプロピル、シクロブチル、シクロペンチル、シクロヘキシル等を挙げることができる。
本明細書において、「Ｃ_４〜Ｃ_２０シクロアルケニル基」は、Ｃ_４〜Ｃ_１０シクロアルケニル基であることが好ましい。シクロアルケニル基の例としては、制限するわけではないが、シクロプロペニル、シクロブテニル、２−シクロペテン−１−イル、２−シクロヘキセン−１−イル、３−シクロヘキセン−１−イル等を挙げることができる。
上記式（１ａ）中、Ｒ^１、Ｒ^２及びＲ^３で示される「炭化水素基」には、置換基が導入されていてもよい。この置換基としては、例えば、Ｃ_１〜Ｃ_１０アルコキシ基（例えば、メトキシ、エトキシ、プロポキシ、ブトキシ等）、Ｃ_６〜Ｃ_１０アリールオキシ基（例えば、フェニルオキシ、ナフチルオキシ、ビフェニルオキシ等）、アミノ基、水酸基、シアノ基、又はシリル基などを挙げることができる。この場合、置換基は、置換可能な位置に１個以上導入されていてもよく、好ましくは１個〜４個導入されていてもよい。置換基数が２個以上である場合、各置換基は同一であっても異なっていてもよい。
また、上記式（１ａ）中、Ｒ^１、Ｒ^２及びＲ^３で示される「炭化水素基」は、酸素原子、窒素原子、硫黄原子、又は、ケイ素原子で中断されていてもよく、中断される場合には、酸素原子で中断されていることが好ましい。
上記式（１ａ）中、Ｒ^１、Ｒ^２及びＲ^３で示される「炭化水素基」はフッ素を有する。炭化水素基に結合したフッ素の量は特に制限はないが、上記式（１ａ）で示されるフルオラス担体が、フルオラス合成法（フルオロカーボンが水や有機溶媒等と混じり合わず、親フルオロカーボン性化合物のみを良く溶かす性質を利用した合成法）の担体として用いられる場合には、当該フルオラス担体及び担体に結合した分子がフルオラス溶媒に溶解し、かつフルオラス溶媒を用いる抽出でフルオラス層に回収できるフッ素含有率が必要となる。
例えば、上記式（１ａ）で示されるフルオラス担体中の炭素原子数を１としたときのフッ素原子数の割合は、フルオラス合成で合成される分子の分子量やフッ素含有率にもよるが、１以上であることが好ましく、１．１以上であることがより好ましく、１．２以上であることが更に好ましい。
上記式（１ａ）中、Ｒ^１、Ｒ^２及びＲ^３は、それぞれ、互いに独立し、同一または異なって、下記式（Ａ）で示されるフルオロアルキル基、

又は、下記式（Ｂ）で示される、モノ若しくはポリフルオロアルキルオキシベンジル基

であることが好ましい。
Ｒ^１、Ｒ^２及びＲ^３を上記のような置換基とすることで、上記式（１ａ）で示されるフルオラス担体を酸性や塩基性条件下で極めて安定にすることができ、フルオラス合成の担体として用いる場合には、合成されたオリゴマー鎖延長反応後の脱保護反応でも分解しないフルオラス担体とすることができる。
上記式（Ａ）中、Ｂ^１及びＢ^２は、それぞれ、互いに独立し、同一または異なって、水素原子、又は、置換基を有していてもよいＣ_１〜Ｃ_２０炭化水素基である。
上記式（Ａ）中、Ｂ^１及びＢ^２で示される「炭化水素基」には、置換基が導入されていてもよい。この置換基としては、例えば、Ｃ_１〜Ｃ_１０炭化水素基（例えば、メチル、エチル、プロピル、ブチル、フェニル、ナフチル、インデニル、トリル、キシリル、ベンジル等）、Ｃ_１〜Ｃ_１０アルコキシ基（例えば、メトキシ、エトキシ、プロポキシ、ブトキシ等）、Ｃ_６〜Ｃ_１０アリールオキシ基（例えば、フェニルオキシ、ナフチルオキシ、ビフェニルオキシ等）、アミノ基、水酸基、ハロゲン原子（例えば、フッ素、塩素、臭素、ヨウ素）又はシリル基などを挙げることができる。この場合、置換基は、置換可能な位置に１個以上導入されていてもよく、好ましくは１個〜４個導入されていてもよい。置換基数が２個以上である場合、各置換基は同一であっても異なっていてもよい。
上記式（Ａ）において、Ｂ^１及びＢ^２は、水素原子、メチル基、エチル基であることが好ましく、水素原子であることがより好ましい。
上記式（Ａ）中、ｍは、０〜１０の整数であり、２〜７であることが好ましく、３〜５であることがより好ましい。
上記式（Ａ）中、ｎは、０〜２０の整数であり、３〜１５であることが好ましく、６〜１０であることがより好ましい。
上記式（Ｂ）中、Ｂ^３及びＢ^４は、それぞれ、互いに独立し、同一または異なって、水素原子、又は、置換基を有していてもよいＣ_１〜Ｃ_２０炭化水素基である。
上記式（Ｂ）中、Ｂ^３及びＢ^４で示される「炭化水素基」には、置換基が導入されていてもよい。この置換基としては、例えば、Ｃ_１〜Ｃ_１０炭化水素基（例えば、メチル、エチル、プロピル、ブチル、フェニル、ナフチル、インデニル、トリル、キシリル、ベンジル等）、Ｃ_１〜Ｃ_１０アルコキシ基（例えば、メトキシ、エトキシ、プロポキシ、ブトキシ等）、Ｃ_６〜Ｃ_１０アリールオキシ基（例えば、フェニルオキシ、ナフチルオキシ、ビフェニルオキシ等）、アミノ基、水酸基、ハロゲン原子（例えば、フッ素、塩素、臭素、ヨウ素）又はシリル基などを挙げることができる。この場合、置換基は、置換可能な位置に１個以上導入されていてもよく、好ましくは１個〜４個導入されていてもよい。置換基数が２個以上である場合、各置換基は同一であっても異なっていてもよい。
上記式（Ｂ）において、Ｂ^３及びＢ^４は、水素原子、メチル基、エチル基であることが好ましく、水素原子であることがより好ましい。
上記式（Ｂ）中、ｐは、それぞれ、互いに独立し、同一または異なって０〜２０の整数であり、３〜１５であることが好ましく、６〜１０であることがより好ましい。
上記式（Ｂ）中、ｑは、それぞれ、互いに独立し、同一または異なって０〜１０の整数であり、２〜７であることが好ましく、３〜５であることがより好ましい。
上記式（Ｂ）中、ｒは、１〜３の整数であり、２〜３であることが好ましく、３であることがより好ましい。
ここで、上記式（Ｂ）中、ｒが３とは、たとえば、下記のような化合物を示す。

［上記式中、ｐ及びｑは、上記と同義である。］
上記式（１ａ）で示されるフルオラス担体は、生体高分子合成、特に生体高分子をフルオラス合成する際の担体として好適に使用することができる。
本明細書において、「生体高分子」とは、デオキシリボ核酸（ＤＮＡ）、リボ核酸（ＲＮＡ）、ペプチド核酸（ＰＮＡ）、オキシペプチド核酸（ＯＰＮＡ）などの核酸、ペプチド、タンパク質、多糖類などが挙げられる。
ここで「生体」とあるが、本明細書では生体内で生成される天然物に限られず、生体内で生成される高分子を人為的に改変したもの、人為的に創り出されたものも含まれる。例えば、デオキシリボ核酸はアデニン、シトシン、グアニン、チミンなどの天然塩基から合成される核酸は当然に含まれ、それ以外にも、人工的に創られた非天然型核酸塩基から合成される核酸も含めることができる。また、核酸のリン酸ジエステル結合や糖骨格を修飾した非天然型核酸類縁体も含めることができる。また、リボ核酸も同様にアデニン、シトシン、グアニン、ウラシルなどの天然塩基から合成されるＲＮＡ、これら塩基に類似した非天然型核酸塩基から合成されるＲＮＡ、リン酸ジエステル結合や糖骨格を修飾した非天然型核酸類縁体も含めることができる。また、ＲＮＡの種類にはｍＲＮＡ、ｔＲＮＡ、ｒＲＮＡ以外にもｄｓＲＮＡ、ｓｉＲＮＡ、ヘアピンＲＮＡ、マイクロＲＮＡ、リボザイムなども含まれる。
上記式（１ａ）で示されるフルオラス担体は、末端が水酸基であるため、フルオラス合成の担体として用いる場合でも回収再利用が可能となる。すなわち、オリゴマー合成の最終工程である濃アンモニア水処理により、末端水酸基が遊離した出発物質に変換することができる。
上記式（１ａ）で示されるフルオラス担体は、例えば、下記スキームにしたがって製造することができる。

［式中、Ｒ^１、Ｒ^２及びＲ^３は、上記と同義である。Ｘはハロゲン原子を示す。］
上記スキームにおいて、典型的には、メチル ３，４，５−トリヒドロキシベンゾエート（Ｉ）と、ハロゲン化物の溶液に、炭酸カリウムを加えて反応させ、得られた反応性生物を水素化アルミニウムリチウム等で還元してフルオラス担体（１ａ）を得る。
上記スキームにおいて、置換基の付加反応は、好ましくは０℃〜１００℃の温度範囲で行われ、特に好ましくは５０℃〜７０℃の温度範囲で行われる。還元反応は、好ましくは０℃〜１００℃の温度範囲で行われ、特に好ましくは２０℃〜４０℃の温度範囲で行われる。圧力は、いずれの反応も常圧が好ましい。
上記スキームにおいて、溶媒としては、メチル ３，４，５−トリヒドロキシベンゾエート、ハロゲン化物、及び生成物を溶解することができる溶媒が好ましく、例えば、エーテル系溶媒、例えばテトラヒドロフラン又はジエチルエーテル；塩化メチレンのようなハロゲン化炭化水素；ｏ−ジクロロベンゼンのようなハロゲン化芳香族炭化水素；Ｎ，Ｎ−ジメチルホルムアミド等のアミド、ジメチルスルホキシド等のスルホキシド；ベンゼン、トルエン等の芳香族炭化水素；又はこれらとフルオラス溶媒の混合溶媒が好ましい。フルオラス溶媒としては、例えば、ペルフルオロヘキサン等のペルフルオロアルカン、ペルフルオロブチルエチルエーテル等のペルフルオロアルキルエーテルを挙げることができる。有機溶媒とペルフルオロアルキルエーテルとの混合溶媒を用いる場合は、その体積割合が、２〜０．５：１であることが好ましく、約１：１であることがより好ましい。
本発明の第１態様の他の側面では、下記式（１ｂ）で示されるフルオラス担体が提供される。

上記式（１ｂ）中、Ａ^１、Ａ^２、Ａ^３、Ａ^４、Ａ^５、Ａ^６、Ａ^７、Ａ^８及びＡ^９は、それぞれ、互いに独立し、同一または異なって、フッ素を有する炭化水素基である。
上記式（１ｂ）中、Ａ^１、Ａ^２、Ａ^３、Ａ^４、Ａ^５、Ａ^６、Ａ^７、Ａ^８及びＡ^９で示される「炭化水素基」には、置換基が導入されていてもよい。この置換基としては、例えば、Ｃ_１〜Ｃ_１０アルコキシ基（例えば、メトキシ、エトキシ、プロポキシ、ブトキシ等）、Ｃ_６〜Ｃ_１０アリールオキシ基（例えば、フェニルオキシ、ナフチルオキシ、ビフェニルオキシ等）、アミノ基、水酸基、シアノ基、又はシリル基などを挙げることができる。この場合、置換基は、置換可能な位置に１個以上導入されていてもよく、好ましくは１個〜４個導入されていてもよい。置換基数が２個以上である場合、各置換基は同一であっても異なっていてもよい。
また、上記式（１ｂ）中、Ａ^１、Ａ^２、Ａ^３、Ａ^４、Ａ^５、Ａ^６、Ａ^７、Ａ^８及びＡ^９で示される「炭化水素基」は、酸素原子、窒素原子、硫黄原子、又は、ケイ素原子で中断されていてもよく、中断されている場合には、酸素原子で中断されていることが好ましい。
上記式（１ｂ）中、Ａ^１、Ａ^２、Ａ^３、Ａ^４、Ａ^５、Ａ^６、Ａ^７、Ａ^８及びＡ^９で示される「炭化水素基」はフッ素を有する。特に、上記式（１ｂ）で示されるフルオラス担体が、フルオラス合成の担体として用いられる場合には、上記式（１ａ）の場合と同様、当該フルオラス担体及び担体に結合した分子がフルオラス溶媒に溶解し、かつフルオラス溶媒を用いる抽出でフルオラス層に回収できるフッ素含有率が必要となる。
例えば、上記式（１ｂ）で示されるフルオラス担体中の炭素原子数を１としたときのフッ素原子数の割合は、フルオラス合成で合成される分子の分子量やフッ素含有率にもよるが、１以上であることが好ましく、１．１以上であることがより好ましく、１．２以上であることが更に好ましい。
上記式（１ｂ）中、Ｙは、−Ｏ−、−ＮＡ^１０−（式中、Ａ^１０は水素原子又はＣ_１〜Ｃ_１０アルキル基である）、又は、−Ｓ−であり、上記式（１ｂ）が回収再利用可能なフルオラス担体として用いられる場合には、Ｙは−Ｏ−であることが好ましい。
上記式（１ｂ）中、Ａ^１、Ａ^２、Ａ^３、Ａ^４、Ａ^５、Ａ^６、Ａ^７、Ａ^８及びＡ^９は、それぞれ、互いに独立し、同一または異なって、下記式（Ａ）で示されるフルオロアルキル基、

又は、下記式（Ｂ）で示される、モノ若しくはポリフルオロアルキルオキシベンジル基

であることが好ましい。
Ａ^１、Ａ^２、Ａ^３、Ａ^４、Ａ^５、Ａ^６、Ａ^７、Ａ^８及びＡ^９を上記のような置換基とすることで、上記式（１ｂ）で示されるフルオラス担体を酸性や塩基性条件下で極めて安定にすることができ、フルオラス合成の担体として用いる場合には、合成されたオリゴマー鎖延長反応後の脱保護反応でも分解しないフルオラス担体とすることができる。
上記式（Ａ）中、Ｂ^１及びＢ^２は、それぞれ、互いに独立し、同一または異なって、水素原子、又は、置換基を有していてもよいＣ_１〜Ｃ_２０炭化水素基である。
上記式（Ａ）中、Ｂ^１及びＢ^２で示される「炭化水素基」には、置換基が導入されていてもよい。この置換基としては、例えば、Ｃ_１〜Ｃ_１０炭化水素基（例えば、メチル、エチル、プロピル、ブチル、フェニル、ナフチル、インデニル、トリル、キシリル、ベンジル等）、Ｃ_１〜Ｃ_１０アルコキシ基（例えば、メトキシ、エトキシ、プロポキシ、ブトキシ等）、Ｃ_６〜Ｃ_１０アリールオキシ基（例えば、フェニルオキシ、ナフチルオキシ、ビフェニルオキシ等）、アミノ基、水酸基、ハロゲン原子（例えば、フッ素、塩素、臭素、ヨウ素）又はシリル基などを挙げることができる。この場合、置換基は、置換可能な位置に１個以上導入されていてもよく、好ましくは１個〜４個導入されていてもよい。置換基数が２個以上である場合、各置換基は同一であっても異なっていてもよい。
上記式（Ａ）において、Ｂ^１及びＢ^２は、水素原子、メチル基、エチル基であることが好ましく、水素原子であることがより好ましい。
上記式（Ａ）中、ｍは、０〜１０の整数であり、２〜７であることが好ましく、３〜５であることがより好ましい。
上記式（Ａ）中、ｎは、０〜２０の整数であり、３〜１５であることが好ましく、６〜１０であることがより好ましい。
上記式（Ｂ）中、Ｂ^３及びＢ^４は、それぞれ、互いに独立し、同一または異なって、水素原子、又は、置換基を有していてもよいＣ_１〜Ｃ_２０炭化水素基である。
上記式（Ｂ）中、Ｂ^３及びＢ^４で示される「炭化水素基」には、置換基が導入されていてもよい。この置換基としては、例えば、Ｃ_１〜Ｃ_１０炭化水素基（例えば、メチル、エチル、プロピル、ブチル、フェニル、ナフチル、インデニル、トリル、キシリル、ベンジル等）、Ｃ_１−Ｃ_１０アルコキシ基（例えば、メトキシ、エトキシ、プロポキシ、ブトキシ等）、Ｃ_６〜Ｃ_１０アリールオキシ基（例えば、フェニルオキシ、ナフチルオキシ、ビフェニルオキシ等）、アミノ基、水酸基、ハロゲン原子（例えば、フッ素、塩素、臭素、ヨウ素）又はシリル基などを挙げることができる。この場合、置換基は、置換可能な位置に１個以上導入されていてもよく、好ましくは１個〜４個導入されていてもよい。置換基数が２個以上である場合、各置換基は同一であっても異なっていてもよい。
上記式（Ｂ）において、Ｂ^３及びＢ^４は、水素原子、メチル基、エチル基であることが好ましく、水素原子であることがより好ましい。
上記式（Ｂ）中、ｐは、それぞれ、互いに独立し、同一または異なって０〜２０の整数であり、３〜１５であることが好ましく、６〜１０であることがより好ましい。
上記式（Ｂ）中、ｑは、それぞれ、互いに独立し、同一または異なって０〜１０の整数であり、２〜７であることが好ましく、３〜５であることがより好ましい。
上記式（Ｂ）中、ｒは、１〜３の整数であり、２〜３であることが好ましく、３であることがより好ましい。
上記式（１ｂ）で示されるフルオラス担体は、生体高分子合成、特に生体高分子をフルオラス合成する際の担体として好適に使用することができる。
上記式（１ｂ）で示されるフルオラス担体は、例えば、Ｙが−Ｏ−の場合は下記スキームにしたがって製造することができる。

［式中、Ａ^１、Ａ^２、Ａ^３、Ａ^４、Ａ^５、Ａ^６、Ａ^７、Ａ^８及びＡ^９は、上記と同義である。Ｘはハロゲン原子を示す。］
上記スキームにおいて、典型的には、メチル ３，４，５−トリヒドロキシベンゾエート（Ｉ）と、ハロゲン化物（ＩＩ）の溶液に、炭酸カリウムを加えて反応させ、得られた反応性生物を水素化アルミニウムリチウム等で還元してフルオラス担体（１ｂ）を得る。
上記スキームにおいて、置換基の付加反応は、好ましくは０℃〜１００℃の温度範囲で行われ、特に好ましくは５０℃〜７０℃の温度範囲で行われる。還元反応は、好ましくは０℃〜１００℃の温度範囲で行われ、特に好ましくは２０℃〜４０℃の温度範囲で行われる。圧力は、いずれの反応も常圧が好ましい。
上記スキームにおいて、溶媒としては、メチル ３，４，５−トリヒドロキシベンゾエート、ハロゲン化物及び生成物を溶解することができる溶媒が好ましく、例えば、エーテル系溶媒、例えばテトラヒドロフラン又はジエチルエーテル；塩化メチレンのようなハロゲン化炭化水素；ｏ−ジクロロベンゼンのようなハロゲン化芳香族炭化水素；Ｎ，Ｎ−ジメチルホルムアミド等のアミド、ジメチルスルホキシド等のスルホキシド；ベンゼン、トルエン等の芳香族炭化水素；又はこれらとフルオラス溶媒の混合溶媒が好ましい。フルオラス溶媒としては、例えば、ペルフルオロヘキサン等のペルフルオロアルカン、ペルフルオロブチルエチルエーテル等のペルフルオロアルキルエーテルを挙げることができる。有機溶媒とペルフルオロアルキルエーテルとの混合溶媒を用いる場合は、その体積割合が、２〜０．５：１であることが好ましく、約１：１であることがより好ましい。
本発明の第２態様では、上述した本発明の第１態様で提供されるフルオラス担体を含む置換基を３’−位に導入したヌクレオシドが提供される。
具体的には、下記式（２ａ）で示されるヌクレオシドが提供される。

［式中、Ｒ^１、Ｒ^２、Ｒ^３及びＹは、前記と同義である。］
更に、上記式（２ａ）の一態様として、下記式（２ｂ）で示される、ヌクレオシドを挙げることができる。

［式中、Ａ^１、Ａ^２、Ａ^３、Ａ^４、Ａ^５、Ａ^６、Ａ^７、Ａ^８、Ａ^９及びＹは、前記と同義である。］
上記式（２ａ）中のＹ、Ｒ^１、Ｒ^２及びＲ^３、並びに、上記式（２ｂ）中のＹ、Ａ^１、Ａ^２、Ａ^３、Ａ^４、Ａ^５、Ａ^６、Ａ^７、Ａ^８及びＡ^９は、本発明の第１態様において説明したのと同様である。
上記式（２ａ）及び式（２ｂ）中、Ｂ^５は、無保護若しくはアミノ基が保護されたピリミジン塩基若しくはプリン塩基、又はそれらの誘導体である。ピリジン塩基としては、チミン、シトシン、ウラシル等を挙げることができ、プリン塩基としては、アデニン、グアニン等を挙げることができる。
Ｂ^５中のアミノ基は、通常の核酸合成で用いられる保護基、例えば、アセチル（Ａｃ）、ベンゾイル（Ｂｚ）、イソプロピルカルボニル（ｉＢｕ）、フェノキシアセチル（ＰＡＣ）、４−（ｔ−ブチル）フェノキシアセチル（ＢＰＡ）、アリルオキシカルボニル（ＡＯＣ）、２−［（ｔ−ブチルジフェニルシリルオキシ）メチル］ベンゾイル（ＳｉＯＭＢ）、２−（アセチルメチル）ベンゾイル（ＡＭＢ）、２−アジドベンゾイル（ＡＺＭＢ）等の保護基によって保護されていてもよい。
また、本発明の第２態様にかかるヌクレオシドを比較的長鎖のオリゴマー合成に用いる場合には、鎖長延長に伴う生成物のフッ素含有率の低下を抑制する観点から、フルオラス保護基を導入することが好ましい。このようなフルオラス保護基としては、下記式（Ｃ）で示されるフルオロアルキル基

又は、下記式（Ｄ）で示される、モノ若しくはポリフルオロアルキルオキシベンジル基

を好ましく挙げることができる。
上記式（Ｃ）中、Ｅ^１及びＥ^２は、それぞれ、互いに独立し、同一または異なって、水素原子、又は、置換基を有していてもよいＣ_１〜Ｃ_２０炭化水素基である。
上記式（Ｃ）中、Ｅ^１及びＥ^２で示される「炭化水素基」には、置換基が導入されていてもよい。この置換基としては、例えば、Ｃ_１〜Ｃ_１０炭化水素基（例えば、メチル、エチル、プロピル、ブチル、フェニル、ナフチル、インデニル、トリル、キシリル、ベンジル等）、Ｃ_１〜Ｃ_１０アルコキシ基（例えば、メトキシ、エトキシ、プロポキシ、ブトキシ等）、Ｃ_６〜Ｃ_１０アリールオキシ基（例えば、フェニルオキシ、ナフチルオキシ、ビフェニルオキシ等）、アミノ基、水酸基、ハロゲン原子（例えば、フッ素、塩素、臭素、ヨウ素）又はシリル基などを挙げることができる。この場合、置換基は、置換可能な位置に１個以上導入されていてもよく、好ましくは１個〜４個導入されていてもよい。置換基数が２個以上である場合、各置換基は同一であっても異なっていてもよい。
上記式（Ｃ）において、Ｅ^１及びＥ^２は、水素原子、メチル基、エチル基であることが好ましく、水素原子であることがより好ましい。
上記式（Ｃ）中、ｍは、０〜１０の整数であり、２〜７であることが好ましく、３〜５であることがより好ましい。
上記式（Ｃ）中、ｎは、０〜２０の整数であり、３〜１５であることが好ましく、６〜１０であることがより好ましい。
上記式（Ｄ）中、Ｅ^３及びＥ^４は、それぞれ、互いに独立し、同一または異なって、水素原子、又は、置換基を有していてもよいＣ_１〜Ｃ_２０炭化水素基である。
上記式（Ｄ）中、Ｅ^３及びＥ^４で示される「炭化水素基」には、置換基が導入されていてもよい。この置換基としては、例えば、Ｃ_１〜Ｃ_１０炭化水素基（例えば、メチル、エチル、プロピル、ブチル、フェニル、ナフチル、インデニル、トリル、キシリル、ベンジル等）、Ｃ_１〜Ｃ_１０アルコキシ基（例えば、メトキシ、エトキシ、プロポキシ、ブトキシ等）、Ｃ_６〜Ｃ_１０アリールオキシ基（例えば、フェニルオキシ、ナフチルオキシ、ビフェニルオキシ等）、アミノ基、水酸基、ハロゲン原子（例えば、フッ素、塩素、臭素、ヨウ素）又はシリル基などを挙げることができる。この場合、置換基は、置換可能な位置に１個以上導入されていてもよく、好ましくは１個〜４個導入されていてもよい。置換基数が２個以上である場合、各置換基は同一であっても異なっていてもよい。
上記式（Ｄ）において、Ｅ^３及びＥ^４は、水素原子、メチル基、エチル基であることが好ましく、水素原子であることがより好ましい。
上記式（Ｄ）中、ｐは、それぞれ、互いに独立し、同一または異なって０〜２０の整数であり、３〜１５であることが好ましく、６〜１０であることがより好ましい。
上記式（Ｄ）中、ｑは、それぞれ、互いに独立し、同一または異なって０〜１０の整数であり、２〜７であることが好ましく、３〜５であることがより好ましい。
上記式（Ｄ）中、ｒは、１〜３の整数であり、２〜３であることが好ましく、３であることがより好ましい。
上記式（２ａ）及び式（２ｂ）中、Ｘ^１は、水素原子、ジメトキシトリチル基、又は、モノメトキシトリチル基であり、水素原子、又は、ジメトキシトリチル基であることが好ましい。
上記式（２ａ）及び式（２ｂ）中、Ｘ^２は、水素原子、ヒドロキシ基、アルコキシ基、アルケニルオキシ基、アシルオキシ基、又は、トリアルキルシリルオキシ基である。
本明細書において、「アルコキシ基」としては、制限するわけではないが、メトキシ、エトキシ、プロポキシ、ブトキシ、ペンチルオキシ等を挙げることができる。
本明細書において、「アルケニルオキシ基」としては、制限するわけではないが、ビニルオキシ、アリルオキシ、１−プロペニルオキシ、イソプロペニルオキシ、２−メチル−１−プロペニルオキシ、２−メチルアリルオキシ、２−ブテニルオキシ等を挙げることができる。
本明細書において、「アシルオキシ基」としては、制限するわけではないが、Ｃ_１〜Ｃ_６アルキル−カルボニルオキシ（たとえばメチルカルボニルオキシ、エチルカルボニルオキシ等）、Ｃ_６〜Ｃ_１０アリール−カルボニル（たとえばベンゾイルオキシ）などが挙げられる。
本明細書において、「トリアルキルシリルオキシ基」としては、制限するわけではないが、トリメチルシリルオキシ基、トリエチルシリルオキシ基などを挙げることができる。
上記式（２ａ）及び式（２ｂ）中、Ｘ^２は、水素原子、ヒドロキシ基、メトキシ基であることが好ましい。
上記式（２ａ）及び式（２ｂ）中、Ｚは、−（ＣＨ_２）_ｉ−（式中、ｉは０〜３の整数である）、又は、置換基を有していてもよいフェニレン基を表す。
上記式（２ａ）及び式（２ｂ）中、−（ＣＨ_２）_ｉ−のｉは，０〜３の整数であり、１〜２であることが好ましく、２であることがより好ましい。
上記式（２ａ）及び式（２ｂ）中、Ｚで示される「フェニレン基」には、置換基が導入されていてもよい。この置換基としては、例えば、Ｃ_１〜Ｃ_１０炭化水素基（例えば、メチル、エチル、プロピル、ブチル、フェニル、ナフチル、インデニル、トリル、キシリル、ベンジル等）、Ｃ_１〜Ｃ_１０アルコキシ基（例えば、メトキシ、エトキシ、プロポキシ、ブトキシ等）、Ｃ_６〜Ｃ_１０アリールオキシ基（例えば、フェニルオキシ、ナフチルオキシ、ビフェニルオキシ等）、アミノ基、水酸基、ハロゲン原子（例えば、フッ素、塩素、臭素、ヨウ素）又はシリル基などを挙げることができる。この場合、置換基は、置換可能な位置に１個以上導入されていてもよく、好ましくは１個〜４個導入されていてもよい。置換基数が２個以上である場合、各置換基は同一であっても異なっていてもよい。
上記式（２ａ）で示されるヌクレオシドは、例えば、下記スキームにしたがって製造することができる。

［式中、Ｒ^１、Ｒ^２、Ｒ^３、Ｂ^５、Ｘ^１、Ｘ^２、Ｙ及びＺは、上記と同義である。ＤＢＵは、１，８−ジアザビシクロ［５．４．０］−ウンデカ−７−エンを示す。］
上記スキームにおいて、典型的には、ヌクレオシド誘導体（ＩＩＩ）と、ベンゼン誘導体（ＩＶ）の溶液に、３−ニトロ−１，２，４−トリアゾール−１−イルトリス（ピロリジン−１−イル）ホスホニウム ヘキサフルオロホスフェート（ＰｙＮＴＰ）とトリエチルアミンを加えて反応させ、ヌクレオシド（２ａ）を得る。
上記スキームにおいて、好ましくは０℃〜１００℃の温度範囲で行われ、特に好ましくは２０℃〜４０℃の温度範囲で行われる。圧力は、常圧が好ましい。
上記スキームにおいて、溶媒としては、ヌクレオシド誘導体（ＩＩＩ）、ベンゼン誘導体（ＩＶ）及び生成物を溶解することができる溶媒が好ましく、例えば、エーテル系溶媒、例えばテトラヒドロフラン又はジエチルエーテル；塩化メチレンのようなハロゲン化炭化水素；ｏ−ジクロロベンゼンのようなハロゲン化芳香族炭化水素；Ｎ，Ｎ−ジメチルホルムアミド等のアミド、ジメチルスルホキシド等のスルホキシド；ベンゼン、トルエン、ピリジン等の芳香族炭化水素；またはこれらとフルオラス溶媒の混合溶媒が好ましい。フルオラス溶媒としては、例えば、ペルフルオロヘキサン等のペルフルオロアルカン、ペルフルオロブチルエチルエーテル等のペルフルオロアルキルエーテルを挙げることができる。有機溶媒とペルフルオロアルキルエーテルとの混合溶媒を用いる場合は、その体積割合が、２〜０．５：１であることが好ましく、約１：１であることがより好ましい。
上記式（２ｂ）で示されるヌクレオシドも、同様のスキームにしたがって製造することができる。
本発明の第３態様では、本発明の第２態様で提供されるヌクレオシドを用いた二量体の製造方法が提供される。
具体的には、下記式（２ａ）で示されるヌクレオシドと、縮合剤存在下、下記式（３）で示されるホスホネートとを反応させ、下記式（４ａ）で示される二量体を製造する方法が提供される。

［式中、Ｂ^５、Ｘ^２、Ｙ、Ｚ、Ｒ^１、Ｒ^２及びＲ^３は、前記と同義を表す。］
また、本発明の第３態様の一側面としては、下記式（２ｂ）で示されるヌクレオシドと、縮合剤存在下、下記式（３）で示されるホスホネートとを反応させ、下記式（４ｂ）で示される二量体を製造する方法が提供される。

［式中、Ｂ^５、Ｘ^２、Ｙ、Ｚ、Ａ^１、Ａ^２、Ａ^３、Ａ^４、Ａ^５、Ａ^６、Ａ^７、Ａ^８及びＡ^９は、前記と同義を表す。］
上記式中、Ｂ^５、Ｘ^１、Ｘ^２、Ｙ、Ｚ、Ｒ^１、Ｒ^２及びＲ^３についての説明は、本発明の第１態様〜第２態様においてしたのと同様である。
上記式中、Ｘ^１は、水素原子を示す。
本発明の第３態様では、下記式（３）で示されるホスホネートを使用する。

上記式（３）中、Ｂ^６は、無保護若しくはアミノ基が保護されたピリミジン塩基若しくはプリン塩基、又はそれらの誘導体である。ピリジン塩基としては、チミン、シトシン、ウラシル等を挙げることができ、プリン塩基としては、アデニン、グアニン等を挙げることができる。
Ｂ^６中のアミノ基は、通常の核酸合成で用いられる保護基、例えば、アセチル基（Ａｃ）、ベンゾイル（Ｂｚ）、イソプロピルカルボニル（ｉＢｕ）、フェノキシアセチル（ＰＡＣ）、４−（ｔ−ブチル）フェノキシアセチル（ＢＰＡ）、アリルオキシカルボニル（ＡＯＣ）、２−［（ｔ−ブチルジフェニルシリルオキシ）メチル］ベンゾイル（ＳｉＯＭＢ）、２−（アセチルメチル）ベンゾイル（ＡＭＢ）、２−アジドベンゾイル（ＡＺＭＢ）等の保護基によって保護されていてもよい。
また、本発明の第３態様の一側面において、鎖長延長に伴う生成物のフッ素含有率の低下を抑制する観点から、フルオラス保護基を導入することが好ましい。このようなフルオラス保護基としては、下記式（Ｃ）で示されるフルオロアルキル基

又は、下記式（Ｄ）で示される、モノ若しくはポリフルオロアルキルオキシベンジル基

を好ましく挙げることができる。
上記式（Ｃ）中、Ｅ^１及びＥ^２は、それぞれ、互いに独立し、同一または異なって、水素原子、又は、置換基を有していてもよいＣ_１〜Ｃ_２０炭化水素基である。
上記式（Ｃ）中、Ｅ^１及びＥ^２で示される「炭化水素基」には、置換基が導入されていてもよい。この置換基としては、例えば、Ｃ_１〜Ｃ_１０炭化水素基（例えば、メチル、エチル、プロピル、ブチル、フェニル、ナフチル、インデニル、トリル、キシリル、ベンジル等）、Ｃ_１〜Ｃ_１０アルコキシ基（例えば、メトキシ、エトキシ、プロポキシ、ブトキシ等）、Ｃ_６〜Ｃ_１０アリールオキシ基（例えば、フェニルオキシ、ナフチルオキシ、ビフェニルオキシ等）、アミノ基、水酸基、ハロゲン原子（例えば、フッ素、塩素、臭素、ヨウ素）又はシリル基などを挙げることができる。この場合、置換基は、置換可能な位置に１個以上導入されていてもよく、好ましくは１個〜４個導入されていてもよい。置換基数が２個以上である場合、各置換基は同一であっても異なっていてもよい。
上記式（Ｃ）において、Ｅ^１及びＥ^２は、水素原子、メチル基、エチル基であることが好ましく、水素原子であることがより好ましい。
上記式（Ｃ）中、ｍは、０〜１０の整数であり、２〜７であることが好ましく、３〜５であることがより好ましい。
上記式（Ｃ）中、ｎは、０〜２０の整数であり、３〜１５であることが好ましく、６〜１０であることがより好ましい。
上記式（Ｄ）中、Ｅ^３及びＥ^４は、それぞれ、互いに独立し、同一または異なって、水素原子、又は、置換基を有していてもよいＣ_１〜Ｃ_２０炭化水素基である。
上記式（Ｄ）中、Ｅ^３及びＥ^４で示される「炭化水素基」には、置換基が導入されていてもよい。この置換基としては、例えば、Ｃ_１〜Ｃ_１０炭化水素基（例えば、メチル、エチル、プロピル、ブチル、フェニル、ナフチル、インデニル、トリル、キシリル、ベンジル等）、Ｃ_１〜Ｃ_１０アルコキシ基（例えば、メトキシ、エトキシ、プロポキシ、ブトキシ等）、Ｃ_６〜Ｃ_１０アリールオキシ基（例えば、フェニルオキシ、ナフチルオキシ、ビフェニルオキシ等）、アミノ基、水酸基、ハロゲン原子（例えば、フッ素、塩素、臭素、ヨウ素）又はシリル基などを挙げることができる。この場合、置換基は、置換可能な位置に１個以上導入されていてもよく、好ましくは１個〜４個導入されていてもよい。置換基数が２個以上である場合、各置換基は同一であっても異なっていてもよい。
上記式（Ｄ）において、Ｅ^３及びＥ^４は、水素原子、メチル基、エチル基であることが好ましく、水素原子であることがより好ましい。
上記式（Ｄ）中、ｐは、それぞれ、互いに独立し、同一または異なって０〜２０の整数であり、３〜１５であることが好ましく、６〜１０であることがより好ましい。
上記式（Ｄ）中、ｑは、それぞれ、互いに独立し、同一または異なって０〜１０の整数であり、２〜７であることが好ましく、３〜５であることがより好ましい。
上記式（Ｄ）中、ｒは、１〜３の整数であり、２〜３であることが好ましく、３であることがより好ましい。
本発明の第３態様において、上記式（３）中、Ｘ^３は、ジメトキシトリチル基、又は、モノメトキシトリチル基であり、ジメトキシトリチル基であることが好ましい。
上記式（３）中、Ｘ^４は、水素原子、ヒドロキシ基、アルコキシ基、アルケニルオキシ基、アシルオキシ基、又は、トリアルキルシリルオキシ基であり、水素原子、ヒドロキシ基、又はメトキシ基であることが好ましい。
本発明の第３態様において、使用される上記式（３）で示されるホスホネートの量は、縮合反応を定量的に進行させるために、上記式（２ａ）あるいは上記式（２ｂ）で示されるヌクレオシド１モルに対して１モル〜１０モル用いることが好ましく、１モル〜５モル用いることが更に好ましく、１モル〜１．５モル用いることが更になお好ましい。
本発明の第３態様にかかる二量体の製造方法では、縮合剤を用いる。縮合剤としては、２−（ベンゾトリアゾール１−イルオキシ）−１，３−ジメチル−２−ピロリジン−１−イル−１，３，２−ジアザホスホリジニウム ヘキサフルオロホスフェート（ＢＯＭＰ）、Ｎ，Ｎ−ビス（２−オキソ−３−オキサゾリジニル）ホスホニッククロリド（ＢｏｐＣｌ）、３−ニトロ−１，２，４−トリアゾール−１−イルトリス（ピロリジン−１−イル）ホスホニウム ヘキサフルオロホスフェート（ＰｙＮＴＰ）等を挙げることができ、ＢＯＭＰ又はＰｙＮＴＰを好ましく用いることができる。
本発明の第３態様において、縮合剤は、反応を定量的に進行させるために、上記式（２ａ）で示されるヌクレオシド１モルあるいは上記式（２ｂ）で示されるヌクレオシド１モルに、１モル〜２０モル用いることが好ましく、１モル〜１０モル用いることが更に好ましく、１モル〜５モル用いることが更になお好ましい。
本発明の第３態様において、典型的には、ヌクレオシド（２ａ）あるいはヌクレオシド（２ｂ）の溶液に、上記式（３）で示されるホスホネートを溶解して加え、縮合剤を添加し、攪拌して二量体（４ａ）あるいは二量体（４ｂ）を得る。ヌクレオシド（２ａ）あるいはヌクレオシド（２ｂ）は単離されたものを用いる必要はなく、溶液中で調製されたヌクレオシドをそのまま用いても良い。
本発明の第３態様において、溶媒としてはフルオラス溶媒が好ましい。例えば、ペルフルオロヘキサン等のペルフルオロアルカン、ペルフルオロブチルエチルエーテル等のペルフルオロアルキルエーテル、及びそれらとピリジンの混合溶媒を挙げることができる。ピリジンとペルフルオロアルキルエーテルとの混合溶媒を用いる場合は、その体積割合が、２〜０．５：１であることが好ましく、約１：１であることがより好ましい。
本発明の第３態様において、反応温度としては、好ましくは０℃〜１００℃の温度範囲で行われ、特に好ましくは２０℃〜４０℃の温度範囲で行われる。圧力は、常圧が好ましい。
本発明の第４態様では、下記式（５ａ）で示されるオリゴヌクレオチド誘導体と、脱保護試薬とを反応させて、Ｘ^３を脱離させた後、縮合剤存在下、下記式（３）で示されるホスホネートとを反応させることを特徴とする、下記式（６ａ）で示されるオリゴヌクレオチド誘導体の製造方法が提供される。

［式中、Ｂ^５、Ｂ^６、Ｘ^２、Ｘ^３、Ｘ^４、Ｙ、Ｚ、Ｒ^１、Ｒ^２及びＲ^３は、前記と同義を表す。］
また、本発明の第４態様の一側面としては、下記式（５ｂ）で示されるオリゴヌクレオチド誘導体と、脱保護試薬とを反応させて、Ｘ^３を脱離させた後、縮合剤存在下、下記式（３）で示されるホスホネートとを反応させることを特徴とする、下記式（６ｂ）で示されるオリゴヌクレオチド誘導体の製造方法が提供される。

［式中、Ｂ^５、Ｂ^６、Ｘ^２、Ｘ^３、Ｘ^４、Ｙ、Ｚ、Ａ^１、Ａ^２、Ａ^３、Ａ^４、Ａ^５、Ａ^６、Ａ^７、Ａ^８及びＡ^９は、前記と同義を表す。］
本発明の第４態様にしたがって脱保護反応及び縮合反応を繰り返すことで、任意の鎖長までオリゴヌグレオチド鎖を延長することができる。また、任意の核酸塩基を有するホスホネートを用いることで任意の塩基配列を有するオリゴマーを合成することができる。
上記式中、Ｂ^５、Ｂ^６、Ｘ^２、Ｘ^３、Ｘ^４、Ｙ、Ｚ、Ｒ^１、Ｒ^２、Ｒ^３、Ａ^１、Ａ^２、Ａ^３、Ａ^４、Ａ^５、Ａ^６、Ａ^７、Ａ^８及びＡ^９についての説明は、本発明の第１態様〜第３態様においてしたのと同様である。
本発明の第４態様において、まず、上記式（５ａ）あるいは上記式（５ｂ）で示されるオリゴヌクレオチド誘導体と脱保護試薬とを反応させて、Ｘ^３を脱離させる。
ここで、上記式（５ａ）及び上記式（５ａ）中、ｓは、１以上の整数を示し、１〜１００であることが好ましく、１０〜７０であることがより好ましく、１０〜３０であることが更に好ましい。
本発明の第４態様において、脱保護試薬は、たとえば、トリフルオロ酢酸を好ましく挙げることができる。
本発明の第４態様において、脱保護試薬は、反応を完結させるために、上記式（５ａ）あるいは上記式（５ｂ）で示されるオリゴヌクレオチド誘導体１モルに対して、２モル〜２０モル用いることが好ましく、３モル〜１０モル用いることが更に好ましく、５モル〜８モル用いることが更になお好ましい。
本発明の第４態様において、上記式（５ａ）あるいは上記式（５ｂ）で示されるオリゴヌクレオチド誘導体と脱保護試薬とを反応させてＸ^３を脱離させた後、本発明の第３態様にかかる縮合反応と同様の縮合反応を行い、上記式（６ａ）あるいは上記式（６ｂ）で示されるオリゴヌクレオチド誘導体を製造する。
本発明の第４態様において、使用される上記式（３）で示されるホスホネートの量は、縮合反応を定量的に進行させるために、上記式（５ａ）あるいは上記式（５ｂ）で示されるオリゴヌクレオチド誘導体１モルに対して１モル〜１０モル用いることが好ましく、１モル〜５モル用いることが更に好ましく、１モル〜１．５モル用いることが更になお好ましい。
本発明の第４態様で用いられる縮合剤は、本発明の第３態様で説明したのと同様である。本発明の第４態様において、縮合剤は、反応を定量的に進行させるために、上記式（５ａ）あるいは上記式（５ｂ）で示されるオリゴヌクレオチド誘導体１モルに、では１モル〜２０モル用いることが好ましく、１モル〜１０モル用いることが更に好ましく、１モル〜５モル用いることが更になお好ましい。
本発明の第４態様において、典型的には、上記式（５ａ）あるいは（５ｂ）で示されるオリゴヌクレオチド誘導体の溶液に、脱保護試薬を加え、生成物を得る。次いで、生成物の溶液に、上記式（３）で示されるホスホネートを加え、縮合剤を添加し、攪拌してオリゴヌクレオチド誘導体（６ａ）あるいはオリゴヌクレオチド誘導体（６ｂ）を得る。
本発明の第４態様において、脱保護反応の溶媒としてはフルオラス溶媒が好ましい。例えば、ペルフルオロヘキサン等のペルフルオロアルカン、ペルフルオロブチルエチルエーテル等のペルフルオロアルキルエーテル、及びそれらの混合溶媒を挙げることができる。ペルフルオロヘキサンとペルフルオロブチルエチルエーテルとの混合溶媒を用いる場合は、その体積割合が、５〜０．５：１であることが好ましく、約１．５：１であることがより好ましい。
本発明の第４態様において、縮合反応の溶媒としてはフルオラス溶媒が好ましい。例えば、ペルフルオロヘキサン等のペルフルオロアルカン、ペルフルオロブチルエチルエーテル等のペルフルオロアルキルエーテル、及びそれらとピリジンの混合溶媒を挙げることができる。ピリジンとペルフルオロアルキルエーテルとの混合溶媒を用いる場合は、その体積割合が、２〜０．５：１であることが好ましく、約１：１であることがより好ましい。
反応温度としては、好ましくは０℃〜１００℃の温度範囲で行われ、特に好ましくは２０℃〜４０℃の温度範囲で行われる。圧力は、常圧が好ましい。
本発明の第４態様によって任意の鎖長を有するオリゴヌクレオチド誘導体が得られた場合には、まず、５’−末端のＸ^３を本発明の第４態様において説明した脱保護反応によって除去する。
次いで、得られた５’−位に遊離の水酸基を有するオリゴマーを、ヨウ素の有機溶媒（例えばピリジン）−フルオラス溶媒（例えばペルフルオロブチルエチルエーテル）−水の溶液に溶解し、室温で撹拌し、飽和ＮａＨＳＯ_３水溶液を加えて過剰のヨウ素を還元した後、ペルフルオロヘキサン等のペルフルオロアルカン溶媒を加えて希釈して分液ロートに移し、飽和炭酸水素トリエチルアンモニウム水溶液で抽出することで、３’−末端にフルオラス担体が結合したリン酸ジエステル結合を有するオリゴヌクレオチド誘導体がフルオラス層に回収される。
上記の要領で回収されたオリゴマーをピリジン−ペルフルオロブチルエチルエーテル−メタノール性アンモニア溶液に懸濁して反応させ、反応混合物に水とペルフルオロブチルエチルエーテルを加え、水層をペルフルオロブチルエチルエーテルで抽出する。これにより、フルオラス担体はフルオラス層に回収される。一方、目的とするＤＮＡのオリゴマーは水層にアンモニウム塩として回収される。In one aspect of the first embodiment of the present invention, a fluorous carrier represented by the following formula (1a) is provided.

In the above formula, R ¹ , R ² And R ³ Are each independently the same or different, and are hydrocarbon groups having fluorine.
In the present specification, the “hydrocarbon group” means, for example, C ₁ ~ C ₂₀ It is a hydrocarbon group and may be saturated or unsaturated acyclic, or saturated or unsaturated cyclic. C ₁ ~ C ₂₀ When the hydrocarbon group is acyclic, it may be linear or branched. "C ₁ ~ C ₂₀ Hydrocarbon group includes C ₁ ~ C ₂₀ Alkyl group, C ₂ ~ C ₂₀ Alkenyl group, C ₂ ~ C ₂₀ Alkynyl group, C ₄ ~ C ₂₀ Alkyldienyl group, C ₆ ~ C ₁₈ Aryl group, C ₇ ~ C ₂₀ Alkylaryl group, C ₇ ~ C ₂₀ Arylalkyl group, C ₄ ~ C ₂₀ A cycloalkyl group, C ₄ ~ C ₂₀ A cycloalkenyl group, (C ₃ ~ C ₁₀ Cycloalkyl) C ₁ ~ C ₁₀ Alkyl groups and the like are included.
In this specification, “C ₁ ~ C ₂₀ “Alkyl group” means C ₁ ~ C ₁₀ It is preferably an alkyl group, C ₁ ~ C ₆ More preferably, it is an alkyl group. Examples of alkyl groups include, but are not limited to, methyl, ethyl, propyl, isopropyl, n-butyl, sec-butyl, tert-butyl, pentyl, hexyl, dodecanyl and the like.
In this specification, “C ₂ ~ C ₂₀ An alkenyl group is C ₂ ~ C ₁₀ An alkenyl group is preferred, and C ₂ ~ C ₆ More preferably, it is an alkenyl group. Examples of alkenyl groups include, but are not limited to, vinyl, allyl, propenyl, isopropenyl, 2-methyl-1-propenyl, 2-methylallyl, 2-butenyl and the like.
In this specification, “C ₂ ~ C ₂₀ An alkynyl group is C ₂ ~ C ₁₀ Preferably it is an alkynyl group, C ₂ ~ C ₆ More preferably, it is an alkynyl group. Examples of alkynyl groups include, but are not limited to, ethynyl, 1-propynyl, 2-propynyl, 1-butynyl, 2-butynyl, 3-butynyl, 1-pentynyl, 2-pentynyl, 3-pentynyl, 4- A pentynyl etc. can be mentioned.
In this specification, “C ₄ ~ C ₂₀ An alkyldienyl group is C ₄ ~ C ₁₀ It is preferably an alkyldienyl group, C ₄ ~ C ₆ More preferably, it is an alkyldienyl group. Examples of alkyldienyl groups include, but are not limited to, 1,3-butadienyl and the like.
In this specification, “C ₆ ~ C ₁₈ "Aryl group" means C ₆ ~ C ₁₀ An aryl group is preferred. Examples of the aryl group include, but are not limited to, phenyl, 1-naphthyl, 2-naphthyl, indenyl, biphenylyl, anthryl, phenanthryl and the like.
In this specification, “C ₇ ~ C ₂₀ An alkylaryl group is C ₇ ~ C ₁₂ An alkylaryl group is preferred. Examples of alkylaryl groups include, but are not limited to, o-tolyl, m-tolyl, p-tolyl, 2,3-xylyl, 2,4-xylyl, 2,5-xylyl, o-cumenyl, m -Cumenyl, p-cumenyl, mesityl and the like can be mentioned.
In this specification, “C ₇ ~ C ₂₀ An arylalkyl group is C ₇ ~ C ₁₂ An arylalkyl group is preferred. Examples of arylalkyl groups include, but are not limited to, benzyl, phenethyl, diphenylmethyl, triphenylmethyl, 1-naphthylmethyl, 2-naphthylmethyl, 2,2-diphenylethyl, 3-phenylpropyl, 4-phenyl Examples include phenylbutyl and 5-phenylpentyl.
In this specification, “C ₄ ~ C ₂₀ A cycloalkyl group is C ₄ ~ C ₁₀ A cycloalkyl group is preferred. Examples of cycloalkyl groups include, but are not limited to, cyclopropyl, cyclobutyl, cyclopentyl, cyclohexyl and the like.
In this specification, “C ₄ ~ C ₂₀ “Cycloalkenyl group” means C ₄ ~ C ₁₀ A cycloalkenyl group is preferred. Examples of cycloalkenyl groups include, but are not limited to, cyclopropenyl, cyclobutenyl, 2-cyclopenten-1-yl, 2-cyclohexen-1-yl, 3-cyclohexen-1-yl, and the like.
In the above formula (1a), R ¹ , R ² And R ³ In the “hydrocarbon group” represented by the above, a substituent may be introduced. As this substituent, for example, C ₁ ~ C ₁₀ An alkoxy group (for example, methoxy, ethoxy, propoxy, butoxy, etc.), C ₆ ~ C ₁₀ An aryloxy group (for example, phenyloxy, naphthyloxy, biphenyloxy, etc.), an amino group, a hydroxyl group, a cyano group, or a silyl group can be exemplified. In this case, one or more substituents may be introduced at substitutable positions, and preferably 1 to 4 substituents may be introduced. When the number of substituents is 2 or more, each substituent may be the same or different.
In the above formula (1a), R ¹ , R ² And R ³ The “hydrocarbon group” represented by may be interrupted by an oxygen atom, a nitrogen atom, a sulfur atom, or a silicon atom, and when interrupted, it is preferably interrupted by an oxygen atom.
In the above formula (1a), R ¹ , R ² And R ³ The “hydrocarbon group” represented by has fluorine. The amount of fluorine bonded to the hydrocarbon group is not particularly limited, but the fluorous carrier represented by the above formula (1a) is a fluorous synthetic method (the fluorocarbon is not mixed with water or an organic solvent, and only the parent fluorocarbon compound is used. In the case of being used as a carrier in a synthesis method using a property that dissolves well, the fluorine content is such that the fluorous carrier and the molecule bound to the carrier are dissolved in the fluorous solvent and can be recovered in the fluorous layer by extraction using the fluorous solvent. Necessary.
For example, the ratio of the number of fluorine atoms when the number of carbon atoms in the fluorous carrier represented by the above formula (1a) is 1 depends on the molecular weight and fluorine content of the molecule synthesized by the fluorous synthesis, but is 1 or more. Preferably, it is 1.1 or more, more preferably 1.2 or more.
In the above formula (1a), R ¹ , R ² And R ³ Are independently of each other, the same or different, a fluoroalkyl group represented by the following formula (A),

Or a mono- or polyfluoroalkyloxybenzyl group represented by the following formula (B)

It is preferable that
R ¹ , R ² And R ³ Can be made extremely stable under acidic or basic conditions, and can be synthesized when used as a carrier for fluorous synthesis. In addition, a fluorous carrier that does not decompose even in a deprotection reaction after the oligomer chain extension reaction can be obtained.
In the above formula (A), B ¹ And B ² Are independently of each other, the same or different and each may have a hydrogen atom or a substituent. ₁ ~ C ₂₀ It is a hydrocarbon group.
In the above formula (A), B ¹ And B ² In the “hydrocarbon group” represented by the above, a substituent may be introduced. As this substituent, for example, C ₁ ~ C ₁₀ Hydrocarbon group (eg, methyl, ethyl, propyl, butyl, phenyl, naphthyl, indenyl, tolyl, xylyl, benzyl, etc.), C ₁ ~ C ₁₀ An alkoxy group (for example, methoxy, ethoxy, propoxy, butoxy, etc.), C ₆ ~ C ₁₀ An aryloxy group (for example, phenyloxy, naphthyloxy, biphenyloxy, etc.), an amino group, a hydroxyl group, a halogen atom (for example, fluorine, chlorine, bromine, iodine) or a silyl group can be exemplified. In this case, one or more substituents may be introduced at substitutable positions, and preferably 1 to 4 substituents may be introduced. When the number of substituents is 2 or more, each substituent may be the same or different.
In the above formula (A), B ¹ And B ² Is preferably a hydrogen atom, a methyl group or an ethyl group, more preferably a hydrogen atom.
In said formula (A), m is an integer of 0-10, it is preferable that it is 2-7, and it is more preferable that it is 3-5.
In said formula (A), n is an integer of 0-20, it is preferable that it is 3-15, and it is more preferable that it is 6-10.
In the above formula (B), B ³ And B ⁴ Are independently of each other, the same or different and each may have a hydrogen atom or a substituent. ₁ ~ C ₂₀ It is a hydrocarbon group.
In the above formula (B), B ³ And B ⁴ In the “hydrocarbon group” represented by the above, a substituent may be introduced. As this substituent, for example, C ₁ ~ C ₁₀ Hydrocarbon group (eg, methyl, ethyl, propyl, butyl, phenyl, naphthyl, indenyl, tolyl, xylyl, benzyl, etc.), C ₁ ~ C ₁₀ An alkoxy group (for example, methoxy, ethoxy, propoxy, butoxy, etc.), C ₆ ~ C ₁₀ An aryloxy group (for example, phenyloxy, naphthyloxy, biphenyloxy, etc.), an amino group, a hydroxyl group, a halogen atom (for example, fluorine, chlorine, bromine, iodine) or a silyl group can be exemplified. In this case, one or more substituents may be introduced at substitutable positions, and preferably 1 to 4 substituents may be introduced. When the number of substituents is 2 or more, each substituent may be the same or different.
In the above formula (B), B ³ And B ⁴ Is preferably a hydrogen atom, a methyl group or an ethyl group, more preferably a hydrogen atom.
In said formula (B), p is mutually independent, is the same or different, and is an integer of 0-20, It is preferable that it is 3-15, and it is more preferable that it is 6-10.
In said formula (B), q is mutually independent, is the same or different, and is an integer of 0-10, It is preferable that it is 2-7, It is more preferable that it is 3-5.
In said formula (B), r is an integer of 1-3, it is preferable that it is 2-3, and it is more preferable that it is 3.
Here, in the above formula (B), r is 3, for example, the following compound.

[Wherein, p and q are as defined above. ]
The fluorous carrier represented by the above formula (1a) can be suitably used as a carrier for biopolymer synthesis, in particular, for fluorous synthesis of biopolymers.
In this specification, “biopolymer” includes nucleic acids such as deoxyribonucleic acid (DNA), ribonucleic acid (RNA), peptide nucleic acid (PNA), and oxypeptide nucleic acid (OPNA), peptides, proteins, polysaccharides, and the like. It is done.
The term “living body” is used herein, but it is not limited to natural products produced in vivo in this specification, and includes artificially modified macromolecules produced in vivo and those created artificially. It is. For example, deoxyribonucleic acid naturally includes nucleic acids synthesized from natural bases such as adenine, cytosine, guanine, and thymine, and also includes nucleic acids synthesized from artificially created non-natural nucleobases. be able to. In addition, non-natural nucleic acid analogs in which a phosphodiester bond of a nucleic acid or a sugar skeleton is modified can also be included. Similarly, RNA synthesized from natural bases such as adenine, cytosine, guanine, uracil, RNA synthesized from non-natural nucleobases similar to these bases, phosphodiester bonds and sugar skeletons have been modified. Non-natural nucleic acid analogs can also be included. In addition to mRNA, tRNA, and rRNA, RNA types include dsRNA, siRNA, hairpin RNA, microRNA, ribozyme, and the like.
Since the terminal of the fluorous carrier represented by the above formula (1a) is a hydroxyl group, it can be recovered and reused even when used as a carrier for fluorous synthesis. That is, it can be converted into a starting material from which a terminal hydroxyl group is liberated by treatment with concentrated ammonia water, which is the final step of oligomer synthesis.
The fluorous carrier represented by the above formula (1a) can be produced, for example, according to the following scheme.

[Wherein R ¹ , R ² And R ³ Is as defined above. X represents a halogen atom. ]
In the above scheme, typically, methyl 3,4,5-trihydroxybenzoate (I) is reacted with a halide solution by adding potassium carbonate, and the resulting reactive organism is reacted with lithium aluminum hydride or the like. To obtain a fluorous carrier (1a).
In the above scheme, the addition reaction of the substituent is preferably performed in a temperature range of 0 ° C to 100 ° C, particularly preferably in a temperature range of 50 ° C to 70 ° C. The reduction reaction is preferably performed in a temperature range of 0 ° C. to 100 ° C., particularly preferably in a temperature range of 20 ° C. to 40 ° C. The pressure is preferably normal pressure for any reaction.
In the above scheme, the solvent is preferably a solvent capable of dissolving methyl 3,4,5-trihydroxybenzoate, halide, and product, such as an ether solvent such as tetrahydrofuran or diethyl ether; Halogenated hydrocarbons such as o-dichlorobenzene; Amides such as N, N-dimethylformamide; Sulfoxides such as dimethyl sulfoxide; Aromatic hydrocarbons such as benzene and toluene; A mixed solvent of a fluorous solvent is preferred. Examples of the fluorous solvent include perfluoroalkanes such as perfluorohexane and perfluoroalkyl ethers such as perfluorobutyl ethyl ether. When a mixed solvent of an organic solvent and perfluoroalkyl ether is used, the volume ratio is preferably 2 to 0.5: 1, more preferably about 1: 1.
In another aspect of the first embodiment of the present invention, a fluorous carrier represented by the following formula (1b) is provided.

In the above formula (1b), A ¹ , A ² , A ³ , A ⁴ , A ⁵ , A ⁶ , A ⁷ , A ⁸ And A ⁹ Are each independently the same or different, and are hydrocarbon groups having fluorine.
In the above formula (1b), A ¹ , A ² , A ³ , A ⁴ , A ⁵ , A ⁶ , A ⁷ , A ⁸ And A ⁹ In the “hydrocarbon group” represented by the above, a substituent may be introduced. As this substituent, for example, C ₁ ~ C ₁₀ An alkoxy group (for example, methoxy, ethoxy, propoxy, butoxy, etc.), C ₆ ~ C ₁₀ An aryloxy group (for example, phenyloxy, naphthyloxy, biphenyloxy, etc.), an amino group, a hydroxyl group, a cyano group, or a silyl group can be exemplified. In this case, one or more substituents may be introduced at substitutable positions, and preferably 1 to 4 substituents may be introduced. When the number of substituents is 2 or more, each substituent may be the same or different.
In the above formula (1b), A ¹ , A ² , A ³ , A ⁴ , A ⁵ , A ⁶ , A ⁷ , A ⁸ And A ⁹ The “hydrocarbon group” represented by may be interrupted by an oxygen atom, a nitrogen atom, a sulfur atom, or a silicon atom, and when interrupted, it is preferably interrupted by an oxygen atom.
In the above formula (1b), A ¹ , A ² , A ³ , A ⁴ , A ⁵ , A ⁶ , A ⁷ , A ⁸ And A ⁹ The “hydrocarbon group” represented by has fluorine. In particular, when the fluorous carrier represented by the above formula (1b) is used as a carrier for fluorous synthesis, as in the case of the above formula (1a), the fluorous carrier and the molecule bound to the carrier are dissolved in the fluorous solvent. In addition, a fluorine content that can be recovered in the fluorous layer by extraction using a fluorous solvent is required.
For example, the ratio of the number of fluorine atoms when the number of carbon atoms in the fluorous carrier represented by the above formula (1b) is 1 depends on the molecular weight and fluorine content of the molecule synthesized by the fluorous synthesis, but is 1 or more. Preferably, it is 1.1 or more, more preferably 1.2 or more.
In the above formula (1b), Y represents —O— or —NA. ¹⁰ -(Where A ¹⁰ Is a hydrogen atom or C ₁ ~ C ₁₀ Is an alkyl group), or -S-, and when the above formula (1b) is used as a recoverable and reusable fluorous carrier, Y is preferably -O-.
In the above formula (1b), A ¹ , A ² , A ³ , A ⁴ , A ⁵ , A ⁶ , A ⁷ , A ⁸ And A ⁹ Are independently of each other, the same or different, a fluoroalkyl group represented by the following formula (A),

Or a mono- or polyfluoroalkyloxybenzyl group represented by the following formula (B)

It is preferable that
A ¹ , A ² , A ³ , A ⁴ , A ⁵ , A ⁶ , A ⁷ , A ⁸ And A ⁹ Can be made extremely stable under acidic and basic conditions, and can be synthesized when used as a carrier for fluorous synthesis. In addition, a fluorous carrier that does not decompose even in a deprotection reaction after the oligomer chain extension reaction can be obtained.
In the above formula (A), B ¹ And B ² Are independently of each other, the same or different and each may have a hydrogen atom or a substituent. ₁ ~ C ₂₀ It is a hydrocarbon group.
In the above formula (A), B ¹ And B ² In the “hydrocarbon group” represented by the above, a substituent may be introduced. As this substituent, for example, C ₁ ~ C ₁₀ Hydrocarbon group (eg, methyl, ethyl, propyl, butyl, phenyl, naphthyl, indenyl, tolyl, xylyl, benzyl, etc.), C ₁ ~ C ₁₀ An alkoxy group (for example, methoxy, ethoxy, propoxy, butoxy, etc.), C ₆ ~ C ₁₀ An aryloxy group (for example, phenyloxy, naphthyloxy, biphenyloxy, etc.), an amino group, a hydroxyl group, a halogen atom (for example, fluorine, chlorine, bromine, iodine) or a silyl group can be exemplified. In this case, one or more substituents may be introduced at substitutable positions, and preferably 1 to 4 substituents may be introduced. When the number of substituents is 2 or more, each substituent may be the same or different.
In the above formula (A), B ¹ And B ² Is preferably a hydrogen atom, a methyl group or an ethyl group, more preferably a hydrogen atom.
In said formula (A), m is an integer of 0-10, it is preferable that it is 2-7, and it is more preferable that it is 3-5.
In said formula (A), n is an integer of 0-20, it is preferable that it is 3-15, and it is more preferable that it is 6-10.
In the above formula (B), B ³ And B ⁴ Are independently of each other, the same or different and each may have a hydrogen atom or a substituent. ₁ ~ C ₂₀ It is a hydrocarbon group.
In the above formula (B), B ³ And B ⁴ In the “hydrocarbon group” represented by the above, a substituent may be introduced. As this substituent, for example, C ₁ ~ C ₁₀ Hydrocarbon group (eg, methyl, ethyl, propyl, butyl, phenyl, naphthyl, indenyl, tolyl, xylyl, benzyl, etc.), C ₁ -C ₁₀ An alkoxy group (for example, methoxy, ethoxy, propoxy, butoxy, etc.), C ₆ ~ C ₁₀ An aryloxy group (for example, phenyloxy, naphthyloxy, biphenyloxy, etc.), an amino group, a hydroxyl group, a halogen atom (for example, fluorine, chlorine, bromine, iodine) or a silyl group can be exemplified. In this case, one or more substituents may be introduced at substitutable positions, and preferably 1 to 4 substituents may be introduced. When the number of substituents is 2 or more, each substituent may be the same or different.
In the above formula (B), B ³ And B ⁴ Is preferably a hydrogen atom, a methyl group or an ethyl group, more preferably a hydrogen atom.
In said formula (B), p is mutually independent, is the same or different, and is an integer of 0-20, It is preferable that it is 3-15, and it is more preferable that it is 6-10.
In said formula (B), q is mutually independent, is the same or different, and is an integer of 0-10, It is preferable that it is 2-7, It is more preferable that it is 3-5.
In said formula (B), r is an integer of 1-3, it is preferable that it is 2-3, and it is more preferable that it is 3.
The fluorous carrier represented by the above formula (1b) can be suitably used as a carrier for biopolymer synthesis, in particular, for fluorous synthesis of biopolymers.
The fluorous carrier represented by the above formula (1b) can be produced according to the following scheme when, for example, Y is —O—.

[Where A ¹ , A ² , A ³ , A ⁴ , A ⁵ , A ⁶ , A ⁷ , A ⁸ And A ⁹ Is as defined above. X represents a halogen atom. ]
In the above scheme, typically, a solution of methyl 3,4,5-trihydroxybenzoate (I) and halide (II) is reacted by adding potassium carbonate, and the resulting reactive organism is hydrogenated. Reduction with aluminum lithium or the like gives a fluorous carrier (1b).
In the above scheme, the addition reaction of the substituent is preferably performed in a temperature range of 0 ° C to 100 ° C, particularly preferably in a temperature range of 50 ° C to 70 ° C. The reduction reaction is preferably performed in a temperature range of 0 ° C. to 100 ° C., particularly preferably in a temperature range of 20 ° C. to 40 ° C. The pressure is preferably normal pressure for any reaction.
In the above scheme, the solvent is preferably a solvent capable of dissolving methyl 3,4,5-trihydroxybenzoate, halide and product, such as an ether solvent such as tetrahydrofuran or diethyl ether; Halogenated hydrocarbons; halogenated aromatic hydrocarbons such as o-dichlorobenzene; amides such as N, N-dimethylformamide; sulfoxides such as dimethyl sulfoxide; aromatic hydrocarbons such as benzene and toluene; or these and fluorous A mixed solvent of solvents is preferred. Examples of the fluorous solvent include perfluoroalkanes such as perfluorohexane and perfluoroalkyl ethers such as perfluorobutyl ethyl ether. When a mixed solvent of an organic solvent and perfluoroalkyl ether is used, the volume ratio is preferably 2 to 0.5: 1, more preferably about 1: 1.
In the second aspect of the present invention, there is provided a nucleoside in which a substituent containing the fluorous carrier provided in the first aspect of the present invention is introduced at the 3′-position.
Specifically, a nucleoside represented by the following formula (2a) is provided.

[Wherein R ¹ , R ² , R ³ And Y are as defined above. ]
Furthermore, as one embodiment of the above formula (2a), a nucleoside represented by the following formula (2b) can be exemplified.

[Where A ¹ , A ² , A ³ , A ⁴ , A ⁵ , A ⁶ , A ⁷ , A ⁸ , A ⁹ And Y are as defined above. ]
Y and R in the above formula (2a) ¹ , R ² And R ³ And Y and A in the above formula (2b) ¹ , A ² , A ³ , A ⁴ , A ⁵ , A ⁶ , A ⁷ , A ⁸ And A ⁹ These are the same as described in the first aspect of the present invention.
In the above formula (2a) and formula (2b), B ⁵ Is an unprotected or amino-protected pyrimidine base or purine base, or a derivative thereof. Examples of the pyridine base include thymine, cytosine, uracil and the like, and examples of the purine base include adenine and guanine.
B ⁵ The amino group therein is a protecting group used in normal nucleic acid synthesis, such as acetyl (Ac), benzoyl (Bz), isopropylcarbonyl (iBu), phenoxyacetyl (PAC), 4- (t-butyl) phenoxyacetyl ( Protecting groups such as BPA), allyloxycarbonyl (AOC), 2-[(t-butyldiphenylsilyloxy) methyl] benzoyl (SiOMB), 2- (acetylmethyl) benzoyl (AMB), 2-azidobenzoyl (AZMB) It may be protected by.
Further, when the nucleoside according to the second aspect of the present invention is used for the synthesis of a relatively long chain oligomer, a fluoros protecting group is introduced from the viewpoint of suppressing the decrease in the fluorine content of the product accompanying the chain length extension. It is preferable. As such a fluoros protecting group, a fluoroalkyl group represented by the following formula (C):

Or a mono- or polyfluoroalkyloxybenzyl group represented by the following formula (D)

Can be preferably mentioned.
In the above formula (C), E ¹ And E ² Are independently of each other, the same or different and each may have a hydrogen atom or a substituent. ₁ ~ C ₂₀ It is a hydrocarbon group.
In the above formula (C), E ¹ And E ² In the “hydrocarbon group” represented by the above, a substituent may be introduced. As this substituent, for example, C ₁ ~ C ₁₀ Hydrocarbon group (eg, methyl, ethyl, propyl, butyl, phenyl, naphthyl, indenyl, tolyl, xylyl, benzyl, etc.), C ₁ ~ C ₁₀ An alkoxy group (for example, methoxy, ethoxy, propoxy, butoxy, etc.), C ₆ ~ C ₁₀ An aryloxy group (for example, phenyloxy, naphthyloxy, biphenyloxy, etc.), an amino group, a hydroxyl group, a halogen atom (for example, fluorine, chlorine, bromine, iodine) or a silyl group can be exemplified. In this case, one or more substituents may be introduced at substitutable positions, and preferably 1 to 4 substituents may be introduced. When the number of substituents is 2 or more, each substituent may be the same or different.
In the above formula (C), E ¹ And E ² Is preferably a hydrogen atom, a methyl group or an ethyl group, more preferably a hydrogen atom.
In said formula (C), m is an integer of 0-10, it is preferable that it is 2-7, and it is more preferable that it is 3-5.
In said formula (C), n is an integer of 0-20, it is preferable that it is 3-15, and it is more preferable that it is 6-10.
In the above formula (D), E ³ And E ⁴ Are independently of each other, the same or different and each may have a hydrogen atom or a substituent. ₁ ~ C ₂₀ It is a hydrocarbon group.
In the above formula (D), E ³ And E ⁴ In the “hydrocarbon group” represented by the above, a substituent may be introduced. As this substituent, for example, C ₁ ~ C ₁₀ Hydrocarbon group (eg, methyl, ethyl, propyl, butyl, phenyl, naphthyl, indenyl, tolyl, xylyl, benzyl, etc.), C ₁ ~ C ₁₀ An alkoxy group (for example, methoxy, ethoxy, propoxy, butoxy, etc.), C ₆ ~ C ₁₀ An aryloxy group (for example, phenyloxy, naphthyloxy, biphenyloxy, etc.), an amino group, a hydroxyl group, a halogen atom (for example, fluorine, chlorine, bromine, iodine) or a silyl group can be exemplified. In this case, one or more substituents may be introduced at substitutable positions, and preferably 1 to 4 substituents may be introduced. When the number of substituents is 2 or more, each substituent may be the same or different.
In the above formula (D), E ³ And E ⁴ Is preferably a hydrogen atom, a methyl group or an ethyl group, more preferably a hydrogen atom.
In said formula (D), p is mutually independent, is the same or different, is an integer of 0-20, It is preferable that it is 3-15, It is more preferable that it is 6-10.
In said formula (D), q is mutually independent, is the same or different, and is an integer of 0-10, It is preferable that it is 2-7, It is more preferable that it is 3-5.
In said formula (D), r is an integer of 1-3, it is preferable that it is 2-3, and it is more preferable that it is 3.
In the above formula (2a) and formula (2b), X ¹ Is a hydrogen atom, a dimethoxytrityl group or a monomethoxytrityl group, preferably a hydrogen atom or a dimethoxytrityl group.
In the above formula (2a) and formula (2b), X ² Is a hydrogen atom, a hydroxy group, an alkoxy group, an alkenyloxy group, an acyloxy group, or a trialkylsilyloxy group.
In the present specification, examples of the “alkoxy group” include, but are not limited to, methoxy, ethoxy, propoxy, butoxy, pentyloxy and the like.
In the present specification, the “alkenyloxy group” is not limited, but includes vinyloxy, allyloxy, 1-propenyloxy, isopropenyloxy, 2-methyl-1-propenyloxy, 2-methylallyloxy, 2- Examples include butenyloxy.
In the present specification, the “acyloxy group” is not limited, but may be C ₁ ~ C ₆ Alkyl-carbonyloxy (eg methylcarbonyloxy, ethylcarbonyloxy, etc.), C ₆ ~ C ₁₀ Aryl-carbonyl (for example, benzoyloxy) and the like.
In the present specification, examples of the “trialkylsilyloxy group” include, but are not limited to, a trimethylsilyloxy group and a triethylsilyloxy group.
In the above formula (2a) and formula (2b), X ² Is preferably a hydrogen atom, a hydroxy group, or a methoxy group.
In the above formulas (2a) and (2b), Z represents — (CH ₂ ) _i -(In formula, i is an integer of 0-3) or the phenylene group which may have a substituent is represented.
In the above formula (2a) and formula (2b), — (CH ₂ ) _i I of − is an integer of 0 to 3, preferably 1 to 2, and more preferably 2.
In the above formulas (2a) and (2b), a substituent may be introduced into the “phenylene group” represented by Z. As this substituent, for example, C ₁ ~ C ₁₀ Hydrocarbon group (eg, methyl, ethyl, propyl, butyl, phenyl, naphthyl, indenyl, tolyl, xylyl, benzyl, etc.), C ₁ ~ C ₁₀ An alkoxy group (for example, methoxy, ethoxy, propoxy, butoxy, etc.), C ₆ ~ C ₁₀ An aryloxy group (for example, phenyloxy, naphthyloxy, biphenyloxy, etc.), an amino group, a hydroxyl group, a halogen atom (for example, fluorine, chlorine, bromine, iodine) or a silyl group can be exemplified. In this case, one or more substituents may be introduced at substitutable positions, and preferably 1 to 4 substituents may be introduced. When the number of substituents is 2 or more, each substituent may be the same or different.
The nucleoside represented by the above formula (2a) can be produced, for example, according to the following scheme.

[Wherein R ¹ , R ² , R ³ , B ⁵ , X ¹ , X ² , Y and Z are as defined above. DBU represents 1,8-diazabicyclo [5.4.0] -undec-7-ene. ]
In the above scheme, typically, a solution of nucleoside derivative (III) and benzene derivative (IV) is added to 3-nitro-1,2,4-triazol-1-yltris (pyrrolidin-1-yl) phosphonium hexafluoro. Phosphate (PyNTP) and triethylamine are added and reacted to give nucleoside (2a).
In the above scheme, it is preferably carried out in a temperature range of 0 ° C. to 100 ° C., particularly preferably in a temperature range of 20 ° C. to 40 ° C. The pressure is preferably normal pressure.
In the above scheme, the solvent is preferably a solvent capable of dissolving the nucleoside derivative (III), the benzene derivative (IV) and the product, such as an ether solvent such as tetrahydrofuran or diethyl ether; a halogen such as methylene chloride. Halogenated aromatic hydrocarbons such as o-dichlorobenzene; amides such as N, N-dimethylformamide; sulfoxides such as dimethyl sulfoxide; aromatic hydrocarbons such as benzene, toluene and pyridine; or these and fluorous A mixed solvent of solvents is preferred. Examples of the fluorous solvent include perfluoroalkanes such as perfluorohexane and perfluoroalkyl ethers such as perfluorobutyl ethyl ether. When a mixed solvent of an organic solvent and perfluoroalkyl ether is used, the volume ratio is preferably 2 to 0.5: 1, more preferably about 1: 1.
The nucleoside represented by the above formula (2b) can also be produced according to a similar scheme.
In the third aspect of the present invention, a method for producing a dimer using the nucleoside provided in the second aspect of the present invention is provided.
Specifically, a method for producing a dimer represented by the following formula (4a) by reacting a nucleoside represented by the following formula (2a) with a phosphonate represented by the following formula (3) in the presence of a condensing agent. Is provided.

[Wherein B ⁵ , X ² , Y, Z, R ¹ , R ² And R ³ Represents the same meaning as described above. ]
Further, as one aspect of the third embodiment of the present invention, a nucleoside represented by the following formula (2b) is reacted with a phosphonate represented by the following formula (3) in the presence of a condensing agent, and the following formula (4b): A method of producing the indicated dimer is provided.

[Wherein B ⁵ , X ² , Y, Z, A ¹ , A ² , A ³ , A ⁴ , A ⁵ , A ⁶ , A ⁷ , A ⁸ And A ⁹ Represents the same meaning as described above. ]
In the above formula, B ⁵ , X ¹ , X ² , Y, Z, R ¹ , R ² And R ³ The explanation about is the same as that in the first to second aspects of the present invention.
In the above formula, X ¹ Represents a hydrogen atom.
In the third aspect of the present invention, a phosphonate represented by the following formula (3) is used.

In the above formula (3), B ⁶ Is an unprotected or amino-protected pyrimidine base or purine base, or a derivative thereof. Examples of the pyridine base include thymine, cytosine, uracil and the like, and examples of the purine base include adenine and guanine.
B ⁶ The amino group therein is a protecting group used in normal nucleic acid synthesis, for example, acetyl group (Ac), benzoyl (Bz), isopropylcarbonyl (iBu), phenoxyacetyl (PAC), 4- (t-butyl) phenoxyacetyl. Protection of (BPA), allyloxycarbonyl (AOC), 2-[(t-butyldiphenylsilyloxy) methyl] benzoyl (SiOMB), 2- (acetylmethyl) benzoyl (AMB), 2-azidobenzoyl (AZMB), etc. It may be protected by a group.
In addition, in one aspect of the third aspect of the present invention, it is preferable to introduce a fluoros protecting group from the viewpoint of suppressing a decrease in the fluorine content of the product accompanying chain extension. As such a fluoros protecting group, a fluoroalkyl group represented by the following formula (C):

Or a mono- or polyfluoroalkyloxybenzyl group represented by the following formula (D)

Can be preferably mentioned.
In the above formula (C), E ¹ And E ² Are independently of each other, the same or different and each may have a hydrogen atom or a substituent. ₁ ~ C ₂₀ It is a hydrocarbon group.
In the above formula (C), E ¹ And E ² In the “hydrocarbon group” represented by the above, a substituent may be introduced. As this substituent, for example, C ₁ ~ C ₁₀ Hydrocarbon group (eg, methyl, ethyl, propyl, butyl, phenyl, naphthyl, indenyl, tolyl, xylyl, benzyl, etc.), C ₁ ~ C ₁₀ An alkoxy group (for example, methoxy, ethoxy, propoxy, butoxy, etc.), C ₆ ~ C ₁₀ An aryloxy group (for example, phenyloxy, naphthyloxy, biphenyloxy, etc.), an amino group, a hydroxyl group, a halogen atom (for example, fluorine, chlorine, bromine, iodine) or a silyl group can be exemplified. In this case, one or more substituents may be introduced at substitutable positions, and preferably 1 to 4 substituents may be introduced. When the number of substituents is 2 or more, each substituent may be the same or different.
In the above formula (C), E ¹ And E ² Is preferably a hydrogen atom, a methyl group or an ethyl group, more preferably a hydrogen atom.
In said formula (C), m is an integer of 0-10, it is preferable that it is 2-7, and it is more preferable that it is 3-5.
In said formula (C), n is an integer of 0-20, it is preferable that it is 3-15, and it is more preferable that it is 6-10.
In the above formula (D), E ³ And E ⁴ Are independently of each other, the same or different and each may have a hydrogen atom or a substituent. ₁ ~ C ₂₀ It is a hydrocarbon group.
In the above formula (D), E ³ And E ⁴ In the “hydrocarbon group” represented by the above, a substituent may be introduced. As this substituent, for example, C ₁ ~ C ₁₀ Hydrocarbon group (eg, methyl, ethyl, propyl, butyl, phenyl, naphthyl, indenyl, tolyl, xylyl, benzyl, etc.), C ₁ ~ C ₁₀ An alkoxy group (for example, methoxy, ethoxy, propoxy, butoxy, etc.), C ₆ ~ C ₁₀ An aryloxy group (for example, phenyloxy, naphthyloxy, biphenyloxy, etc.), an amino group, a hydroxyl group, a halogen atom (for example, fluorine, chlorine, bromine, iodine) or a silyl group can be exemplified. In this case, one or more substituents may be introduced at substitutable positions, and preferably 1 to 4 substituents may be introduced. When the number of substituents is 2 or more, each substituent may be the same or different.
In the above formula (D), E ³ And E ⁴ Is preferably a hydrogen atom, a methyl group or an ethyl group, more preferably a hydrogen atom.
In said formula (D), p is mutually independent, is the same or different, is an integer of 0-20, It is preferable that it is 3-15, It is more preferable that it is 6-10.
In said formula (D), q is mutually independent, is the same or different, and is an integer of 0-10, It is preferable that it is 2-7, It is more preferable that it is 3-5.
In said formula (D), r is an integer of 1-3, it is preferable that it is 2-3, and it is more preferable that it is 3.
In the third aspect of the present invention, in the above formula (3), X ³ Is a dimethoxytrityl group or a monomethoxytrityl group, preferably a dimethoxytrityl group.
In the above formula (3), X ⁴ Is a hydrogen atom, a hydroxy group, an alkoxy group, an alkenyloxy group, an acyloxy group or a trialkylsilyloxy group, preferably a hydrogen atom, a hydroxy group or a methoxy group.
In the third aspect of the present invention, the amount of the phosphonate represented by the above formula (3) used is the nucleoside represented by the above formula (2a) or the above formula (2b) in order to quantitatively advance the condensation reaction. It is preferable to use 1 mol to 10 mol with respect to 1 mol, more preferably 1 mol to 5 mol, still more preferably 1 mol to 1.5 mol.
In the method for producing a dimer according to the third aspect of the present invention, a condensing agent is used. As the condensing agent, 2- (benzotriazol 1-yloxy) -1,3-dimethyl-2-pyrrolidin-1-yl-1,3,2-diazaphosphoridinium hexafluorophosphate (BOMP), N, N -Bis (2-oxo-3-oxazolidinyl) phosphonic chloride (BopCl), 3-nitro-1,2,4-triazol-1-yltris (pyrrolidin-1-yl) phosphonium hexafluorophosphate (PyNTP), etc. BOMP or PyNTP can be preferably used.
In the third aspect of the present invention, the condensing agent is used in an amount of 1 mol to 1 mol of the nucleoside represented by the above formula (2a) or 1 mol of the nucleoside represented by the above formula (2b) in order to allow the reaction to proceed quantitatively. It is preferable to use 20 mol, more preferably 1 mol to 10 mol, still more preferably 1 mol to 5 mol.
In the third aspect of the present invention, typically, the phosphonate represented by the above formula (3) is dissolved and added to the nucleoside (2a) or nucleoside (2b) solution, the condensing agent is added, and the mixture is stirred. Dimer (4a) or dimer (4b) is obtained. The nucleoside (2a) or nucleoside (2b) is not required to be an isolated one, and a nucleoside prepared in a solution may be used as it is.
In the third aspect of the present invention, the solvent is preferably a fluorous solvent. For example, perfluoroalkanes such as perfluorohexane, perfluoroalkyl ethers such as perfluorobutyl ethyl ether, and a mixed solvent of them and pyridine can be mentioned. When a mixed solvent of pyridine and perfluoroalkyl ether is used, the volume ratio is preferably 2 to 0.5: 1, and more preferably about 1: 1.
In the third embodiment of the present invention, the reaction temperature is preferably 0 to 100 ° C., particularly preferably 20 to 40 ° C. The pressure is preferably normal pressure.
In the fourth aspect of the present invention, an oligonucleotide derivative represented by the following formula (5a) is reacted with a deprotection reagent to give X ³ After desorbing, a method for producing an oligonucleotide derivative represented by the following formula (6a) is provided, which comprises reacting with a phosphonate represented by the following formula (3) in the presence of a condensing agent.

[Wherein B ⁵ , B ⁶ , X ² , X ³ , X ⁴ , Y, Z, R ¹ , R ² And R ³ Represents the same meaning as described above. ]
Further, according to one aspect of the fourth aspect of the present invention, an oligonucleotide derivative represented by the following formula (5b) is reacted with a deprotection reagent to produce X ³ After desorbing, there is provided a method for producing an oligonucleotide derivative represented by the following formula (6b), characterized by reacting with a phosphonate represented by the following formula (3) in the presence of a condensing agent.

[Wherein B ⁵ , B ⁶ , X ² , X ³ , X ⁴ , Y, Z, A ¹ , A ² , A ³ , A ⁴ , A ⁵ , A ⁶ , A ⁷ , A ⁸ And A ⁹ Represents the same meaning as described above. ]
By repeating the deprotection reaction and the condensation reaction according to the fourth aspect of the present invention, the oligonucleotide chain can be extended to an arbitrary chain length. Moreover, the oligomer which has arbitrary base sequences is compoundable by using the phosphonate which has arbitrary nucleobases.
In the above formula, B ⁵ , B ⁶ , X ² , X ³ , X ⁴ , Y, Z, R ¹ , R ² , R ³ , A ¹ , A ² , A ³ , A ⁴ , A ⁵ , A ⁶ , A ⁷ , A ⁸ And A ⁹ The explanation about is the same as that described in the first to third aspects of the present invention.
In the fourth aspect of the present invention, first, an oligonucleotide derivative represented by the above formula (5a) or the above formula (5b) is reacted with a deprotection reagent to give X ³ Is removed.
Here, in said formula (5a) and said formula (5a), s shows an integer greater than or equal to 1, It is preferable that it is 1-100, It is more preferable that it is 10-70, It is 10-30. More preferably.
In the fourth aspect of the present invention, the deprotection reagent can preferably include, for example, trifluoroacetic acid.
In the fourth aspect of the present invention, the deprotection reagent is used in an amount of 2 to 20 mol with respect to 1 mol of the oligonucleotide derivative represented by the above formula (5a) or the above formula (5b) in order to complete the reaction. Are preferably used, more preferably 3 to 10 mol, still more preferably 5 to 8 mol.
In the fourth aspect of the present invention, the oligonucleotide derivative represented by the above formula (5a) or the above formula (5b) is reacted with a deprotection reagent to produce X ³ Then, a condensation reaction similar to the condensation reaction according to the third aspect of the present invention is performed to produce an oligonucleotide derivative represented by the above formula (6a) or the above formula (6b).
In the fourth aspect of the present invention, the amount of the phosphonate represented by the above formula (3) used is the amount of the oligo represented by the above formula (5a) or the above formula (5b) in order to allow the condensation reaction to proceed quantitatively. It is preferable to use 1 mol to 10 mol, more preferably 1 mol to 5 mol, still more preferably 1 mol to 1.5 mol, relative to 1 mol of the nucleotide derivative.
The condensing agent used in the fourth aspect of the present invention is the same as described in the third aspect of the present invention. In the fourth aspect of the present invention, the condensing agent is used in an amount of 1 to 20 mol per mol of the oligonucleotide derivative represented by the above formula (5a) or the above formula (5b) in order to allow the reaction to proceed quantitatively. It is preferable to use 1 mol to 10 mol, still more preferable to use 1 mol to 5 mol.
In the fourth aspect of the present invention, typically, a deprotection reagent is added to a solution of the oligonucleotide derivative represented by the above formula (5a) or (5b) to obtain a product. Next, the phosphonate represented by the above formula (3) is added to the product solution, the condensing agent is added, and the mixture is stirred to obtain the oligonucleotide derivative (6a) or the oligonucleotide derivative (6b).
In the fourth embodiment of the present invention, the solvent for the deprotection reaction is preferably a fluorous solvent. Examples thereof include perfluoroalkanes such as perfluorohexane, perfluoroalkyl ethers such as perfluorobutyl ethyl ether, and mixed solvents thereof. When a mixed solvent of perfluorohexane and perfluorobutyl ethyl ether is used, the volume ratio is preferably 5 to 0.5: 1, more preferably about 1.5: 1.
In the fourth embodiment of the present invention, the solvent for the condensation reaction is preferably a fluorous solvent. For example, perfluoroalkanes such as perfluorohexane, perfluoroalkyl ethers such as perfluorobutyl ethyl ether, and a mixed solvent of them and pyridine can be mentioned. When a mixed solvent of pyridine and perfluoroalkyl ether is used, the volume ratio is preferably 2 to 0.5: 1, and more preferably about 1: 1.
The reaction temperature is preferably 0 to 100 ° C., particularly preferably 20 to 40 ° C. The pressure is preferably normal pressure.
When an oligonucleotide derivative having an arbitrary chain length is obtained according to the fourth aspect of the present invention, first, the 5′-terminal X ³ Is removed by the deprotection reaction described in the fourth embodiment of the present invention.
Subsequently, the obtained oligomer having a free hydroxyl group at the 5′-position is dissolved in an organic solvent of iodine (for example, pyridine) -fluorus solvent (for example, perfluorobutyl ethyl ether) -water, stirred at room temperature, and saturated. NaHSO ₃ After adding excess aqueous solution to reduce excess iodine, dilute by adding a perfluoroalkane solvent such as perfluorohexane, transfer to a separatory funnel, and extract with a saturated aqueous triethylammonium hydrogen carbonate solution to remove the fluorous carrier at the 3'-end. An oligonucleotide derivative having a phosphodiester bond bonded to is recovered in the fluorous layer.
The oligomer recovered as described above is reacted in a pyridine-perfluorobutyl ethyl ether-methanolic ammonia solution, water and perfluorobutyl ethyl ether are added to the reaction mixture, and the aqueous layer is extracted with perfluorobutyl ethyl ether. As a result, the fluorous carrier is recovered in the fluorous layer. On the other hand, the target oligomer of DNA is recovered as an ammonium salt in the aqueous layer.

メチル３，４，５−トリヒドロキシベンゾエート（２．８ｇ，１５ｍｍｏｌ）と１−ブロモ−３−パーフルオロオクチルプロパン（２７ｇ，５０ｍｍｏｌ）をＴＨＦ（１５０ｍｌ）に溶解し、Ｋ_２ＣＯ_３（１９ｇ，１４０ｍｍｏｌ）を加えて６５℃に加熱し、その後１８−クラウン−６（１．２ｇ，４．５ｍｍｏｌ）加え、６５℃で８時間反応させた。反応混合物を氷水（１．５ｌ）に注ぎ、生じた固体を吸引濾過した後に冷水で洗浄した。減圧下乾燥させた固体をエタノール（３０ｍｌ）から再結晶して淡黄色針状結晶の表題化合物（２１ｇ，８９％）を得た。

［実施例１］
３，４，５−トリス（３−パーフルオロオクチルプロパン−１−イルオキシ）ベンジルアルコール

参考例１で得られた３，４，５−トリス（３−パーフルオロオクチルプロパン−１−イルオキシ）ベンゾエート（１９ｇ，１２ｍｍｏｌ）をＴＨＦ（１２０ｍｌ）に溶解し、ＬｉＡｌＨ_４（０．９２ｇ，２４ｍｍｏｌ）を加えて窒素雰囲気下、室温で１時間撹拌した。０℃に冷却し、水（１２０ｍｌ）、１Ｍ塩酸水溶液（５０ｍｌ）を加えて反応を停止した。エーテル（２７０ｍｌ）で３回抽出した後、エーテル層を合わせ、無水硫酸マグネシウムを加えて乾燥させた後に濾過した。濾液を減圧留去し、減圧下乾燥させて表題化合物（１８ｇ，９９％）を乳白色の固体として得た。

参考例２
３，４，５−トリス（３−パーフルオロオクチルプロパン−１−イルオキシ）ベンジルクロリド

実施例１で得られた３，４，５−トリス（３−パーフルオロオクチルプロパン−１−イルオキシ）ベンジルアルコール（１７ｇ，１１ｍｍｏｌ）を無水エーテル（１１０ｍｌ）に溶解し、触媒としてＤＭＦ（０．０５０ｍｌ）を加えた。塩化チオニル（１．１ｍｌ，１５ｍｍｏｌ）を加えて窒素雰囲気下室温で１時間撹拌した。減圧下溶媒と過剰の試薬を留去して表題化合物（１７ｇ，１００％）を白色固体として得た。

参考例３
メチル３，４，５，−トリス［３’，４’，５’−トリス（３−パーフルオロオクチルプロパン−１−イルオキシ）ベンジルオキシ］ベンゾエート

メチル３，４，５−トリヒドロキシベンゾエート（０．６１ｇ，３．３ｍｍｏｌ）と、参考例２で得られた３，４，５−トリス（３−パーフルオロオクチルプロパン−１−イルオキシ）ベンジルクロリド（１８ｇ，１１ｍｍｏｌ）をＴＨＦ（１１０ｍｌ）に溶解し、Ｋ_２ＣＯ_３（４．１ｇ，３０ｍｍｏｌ）を加えて６５℃に加熱し、その後１８−クラウン−６（０．２６ｇ，１．０ｍｍｏｌ）加え、６５℃で２０時間反応させた。その後、炭酸カリウム（４．１ｇ，３０ｍｍｏｌ）、１８−クラウン−６（０．２６ｇ，１．０ｍｍｏｌ）、安息香酸（１．２ｇ，１０ｍｍｏｌ）を加え、さらに８時間反応させた。反応混合物を氷水（１．５ｌ）に注ぎ、生じた固体を吸引濾過した後に冷水で洗浄した。得られた固体をクロロホルムで洗浄することにより乳白色固体の表題化合物（１５ｇ，９５％）を得た。

［実施例２］
メチル３，４，５−トリス［３’，４’，５’−トリス（３−パーフルオロオクチルプロパン−１−イルオキシ）ベンジルオキシ］ベンジルアルコール

参考例３で得られたメチル３，４，５−トリス［３’，４’，５’−トリス（３−パーフルオロオクチルプロパン−１−イルオキシ）ベンジルオキシ］ベンゾエート（１６ｇ，３．３ｍｍｏｌ）をＴＨＦ（８０ｍｌ）に溶解し、ＬｉＡｌＨ_４（０．６３ｇ，１７ｍｍｏｌ）を加えて窒素雰囲気下、１時間還流した。０℃に冷却し、水（１２０ｍｌ）、１Ｍ塩酸水溶液（５０ｍｌ）を加えて反応を停止した。ＦＣ−７２（１００ｍｌ）で３回抽出した後、ＦＣ−７２層を合わせ、無水硫酸ナトリウムを加えて乾燥させた後に濾過した。濾液を減圧留去し、減圧下乾燥させて目的物（１３ｇ，８４％）を乳白色の固体として得た。

［実施例３］
５’−Ｏ−ジメトキシトリチルチミジン−３’−イル３，４，５−トリス（３−パーフルオロオクチルプロパン−１−イルオキシ）ベンジル スクシネート

実施例１で得られた３，４，５−トリス（３−パーフルオロオクチルプロパン−１−イルオキシ）ベンジルアルコール（０．２３ｇ，０．１５ｍｍｏｌ）と、１，８−ジアザビシクロ［５．４．０］ウンデカ−７−エニウム５’−Ｏ−ジメトキシトリチルチミジン−３’−イル スクシネート（０．１４ｇ，０．１８ｍｍｏｌ）を無水ピリジンで３回、無水ＴＨＦで３回共沸乾燥した後に無水ＴＨＦ（１．５ｍｌ）に溶解した。３−ニトロ−１，２，４−トリアゾール−１−イル トリス（ピロリジン−１−イル）ホスホニウム ヘキサフルオロホスフェート（ＰｙＮＴＰ，０．１８ｇ，０．３６ｍｍｏｌ）とトリエチルアミン（０．０４６ｇ，０．４５ｍｍｏｌ）を加え、室温で１５分間撹拌した。反応液をクロロホルム（１０ｍｌ）で希釈して分液ロートに移し、リン酸バッファー（ｐＨ７．０，１５ｍｌ）で３回抽出した。有機層を無水硫酸ナトリウムで乾燥させた後に濾過して、濾液を減圧留去した残渣をシリカゲルカラムクロマトグラフィー（シリカゲル，１０ｇ，ヘキサン−酢酸エチル）で精製し、表題化合物（０．２５ｇ，７６％）を無色のフォーム状固体として得た。

［実施例４］
フルオラスデンドロン担体（実施例１）を用いるオリゴヌクレオチドのフルオラス合成
（Ｓｔｅｐ １）５’−Ｏ−ＤＭＴｒ基の除去
実施例３で得られた化合物（０．１１ｇ，０．０５０ｍｍｏｌ）をパーフルオロヘキサン（３ｍｌ）とＣ_４Ｆ_９ＯＥｔ（２ｍｌ）の混合溶媒に溶解し、トリフルオロ酢酸（０．０５０ｍｌ）を加えて室温で１０分間撹拌した。パーフルオロヘキサン（２５ｍｌ）で希釈して分液ロートに移し、５％ ＮａＨＣＯ_３水溶液（２０ｍｌ）で３回抽出した（この時、トリフルオロ酢酸ナトリウムとオリゴマー合成時に５’−位に遊離の水酸基を有する過剰のモノマーはこの操作で水層に除去される）。次に，フルオラス層をメタノール（２０ｍｌ）で３回抽出した（ＤＭＴｒ基の残渣はメタノール層に除去される）。目的物を含むフルオラス層を分取して無水硫酸ナトリウムを加えて乾燥させた後に濾過し、濾液を減圧留去してチミジン−３’−イル３，４，５−トリス（３−パーフルオロオクチルプロパン−１−イルオキシ）ベンジル スクシネート（０．０８１ｇ，８８％）を得た。
（Ｓｔｅｐ ２）縮合反応
上記Ｓｔｅｐ １で得られたチミジン−３’−イル３，４，５−トリス（３−パーフルオロオクチルプロパン−１−イルオキシ）ベンジル スクシネート（０．０９２ｇ，０．０５０ｍｍｏｌ）と、１，８−ジアザビシクロ［５．４．０］ウンデカ−７−エニウム５’−Ｏ−ジメトキシトリチルチミジン−３’−イル ホスホネート（０．０４６ｇ，０．０６０ｍｍｏｌ）を無水ピリジンで３回共沸乾燥した後に無水ピリジン（０．５０ｍｌ）に溶解し、アルゴン雰囲気下ＢｏｐＣｌ（０．０２６ｇ，０．１０ｍｍｏｌ）を加えて１０分間撹拌した。反応混合物にパーフルオロヘキサン（３ｍｌ）を加え、５％ ＮａＨＣＯ_３水溶液（３ｍｌ）で３回抽出した。これらの抽出操作で縮合剤の残渣、ピリジン、モノマーのカウンターカチオン等はすべて水層に除去される。パーフルオロヘキサン層に無水硫酸ナトリウムを加えて乾燥させた後に濾過し、濾液を減圧留去し、分子量２４５１のＨ−ホスホネート結合を有する２量体（０．１０５ｇ，８６％）を得た。
さらに、Ｓｔｅｐ １とＳｔｅｐ ２を繰り返し、分子量２７４０のＨ−ホスホネート結合を有する３量体
を得た。
（Ｓｔｅｐ ３）酸化反応
上記の要領で得られたオリゴマーの５’−末端の保護基を上記Ｓｔｅｐ １の操作で除去する。得られた５’−位に遊離の水酸基を有するオリゴマーをヨウ素（０．０７６ｇ，０．３ｍｍｏｌ）のピリジン−Ｃ_４Ｆ_９ＯＥｔ−水（４９：４９：２，ｖ／ｖ／ｖ）溶液（１０ｍｌ）に溶解し、室温で１０分間撹拌した。少量の飽和ＮａＨＳＯ_３水溶液を加えて過剰のヨウ素を還元した後に、パーフルオロヘキサン（１０ｍｌ）を加えて希釈して分液ロートに移した。飽和炭酸水素トリエチルアンモニウム水溶液で３回抽出し、有機層に無水硫酸ナトリウムを加えて乾燥した。硫酸ナトリウムを濾過して除去し、溶媒を減圧留去してリン酸ジエステル結合を有する３量体を得た。
同様の操作を繰り返すことで、任意の鎖長を持つオリゴマーを合成することができる。
（Ｓｔｅｐ ４）脱保護反応とフルオラスデンドロンの回収
Ｓｔｅｐ ３で得られたオリゴマーから、以下の要領に従うことでフルオラス担体を回収することができる。
Ｓｔｅｐ ３で得られたフルオラスデンドロンに結合したオリゴマーをピリジン−Ｃ_４Ｆ_９ＯＥｔ−メタノール性アンモニア（１：１：３，ｖ／ｖ／ｖ）溶液（１０ｍｌ）に懸濁し、密封して５５℃に加熱して１２時間反応させる。室温まで冷却し、アンモニアを減圧留去する。反応混合物に水（１０ｍｌ）とＣ_４Ｆ_９ＯＥｔ（１０ｍｌ）を加え、水層をＣ_４Ｆ_９ＯＥｔで３回抽出する。この時、フルオラスデンドロンは有機層に回収される。水層を凍結乾燥して、ＤＮＡの３量体をアンモニウム塩として得ることができる。
［実施例５］
５’−Ｏ−ジメトキシトリチルチミジン−３’−イル３，４，５−トリス［３’，４’，５’−トリス（３−パーフルオロオクチルプロパン−１−イルオキシ）ベンジルオキシ］ベンジル スクシネート

実施例２で得られたメチル３，４，５−トリス［３’，４’，５’−トリス（３−パーフルオロオクチルプロパン−１−イルオキシ）ベンジルオキシ］ベンジルアルコール（２．４ｇ，０．５０ｍｍｏｌ）と、１，８−ジアザビシクロ［５．４．０］ウンデカ−７−エニウム５’−Ｏ−ジメトキシトリチルチミジン−３’−イル スクシネート（０．４８ｇ，０．６０ｍｍｏｌ）を無水ピリジンで３回、無水ＴＨＦで３回共沸乾燥した後に無水ＴＨＦ−Ｃ_４Ｆ_９ＯＥｔ（２０：１，ｖ／ｖ）（５０ｍｌ）を加え、４５℃に加熱して溶解した。３−ニトロ−１，２，４−トリアゾール−１−イル トリス（ピロリジン−１−イル）ホスホニウム ヘキサフルオロホスフェート（ＰｙＮＴＰ，０．６０ｇ，１．２ｍｍｏｌ）とトリエチルアミン（０．２１ｇ，１．５ｍｍｏｌ）を加え、４５℃で１５分間撹拌した。反応液をＦＣ−７２（３０ｍｌ）で希釈して分液ロートに移し、５％炭酸水素ナトリウム水溶液（５０ｍｌ）とクロロホルム（５０ｍｌ）で３回抽出した。ＦＣ−７２層を無水硫酸ナトリウムで乾燥させた後に濾過して、濾液を減圧留去し、表題化合物（２．３ｇ，９０％）を乳白色固体として得た。

［実施例６］
フルオラスデンドロン担体（実施例２）を用いるオリゴヌクレオチドのフルオラス合成
（Ｓｔｅｐ １）５’−Ｏ−ＤＭＴｒ基の除去
実施例５で得られた化合物（２．７ｇ，０．５０ｍｍｏｌ）をパーフルオロヘキサン（２５ｍｌ）とα，α，α−トリフルオロトルエン（２５ｍｌ）の混合溶媒に溶解し、トリフルオロ酢酸（０．５０ｍｌ）を加えて室温で３分間撹拌した。パーフルオロヘキサン（５０ｍｌ）で希釈して分液ロートに移し、５％ ＮａＨＣＯ_３水溶液（５０ｍｌ）とトルエン（５０ｍｌ）で３回抽出した（この時、トリフルオロ酢酸ナトリウムとオリゴマー合成時に５’−位に遊離の水酸基を有する過剰のモノマーはこの操作で水層に除去され、ＤＭＴｒ基の残渣はトルエン層に除去される）。目的物を含むフルオラス層を分取して無水硫酸ナトリウムを加えて乾燥させた後に濾過し、濾液を減圧留去してチミジン−３’−イル３，４，５−トリス［３’，４’，５’−トリス（３−パーフルオロオクチルプロパン−１−イルオキシ）ベンジルオキシ］ベンジルスクシネート（１．９ｇ，８８％）を乳白色固体として得た。
（Ｓｔｅｐ ２）縮合反応
上記Ｓｔｅｐ １で得られたチミジン−３’−イル３，４，５−トリス［３’，４’，５’−トリス（３−パーフルオロオクチルプロパン−１−イルオキシ）ベンジルオキシ］ベンジルスクシネート（１．０ｇ，０．２０ｍｍｏｌ）と、１，８−ジアザビシクロ［５．４．０］ウンデカ−７−エニウム５’−Ｏ−ジメトキシトリチルチミジン−３’−イル ホスホネート（０．１８ｇ，０．２４ｍｍｏｌ）を無水ピリジンで３回共沸乾燥した後に無水ピリジン（０．５０ｍｌ）に溶解し、アルゴン雰囲気下ＰｙＮＴＰ（０．２４ｇ，０．４８ｍｍｏｌ）を加えて４５℃で５分撹拌した。反応混合物にパーフルオロヘキサン（５０ｍｌ）を加え、５％ＮａＨＣＯ_３水溶液（１００ｍｌ））、クロロホルム（１００ｍｌ）で３回抽出した。この抽出操作で縮合剤の残渣、ピリジン、は水層に、モノマーのカウンターカチオンは有機層に除去される。パーフルオロヘキサン層に無水硫酸ナトリウムを加えて乾燥させた後に濾過し、濾液を減圧留去し、分子量５６２７のＨ−ホスホネート結合を有する２量体（１．１ｇ，９６％）を得た。
さらに、Ｓｔｅｐ １とＳｔｅｐ ２を繰り返し、分子量５９１５のＨ−ホスホネート結合を有する３量体を得た。
（Ｓｔｅｐ ３）酸化反応
上記の要領で得られたオリゴマーの５’−末端の保護基を上記Ｓｔｅｐ １の操作で除去する。得られた５’−位に遊離の水酸基を有するオリゴマーをヨウ素（０．０７６ｇ，０．３ｍｍｏｌ）のピリジン−Ｃ_４Ｆ_９ＯＥｔ−水（４９：４９：２，ｖ／ｖ／ｖ）溶液（１０ｍｌ）に溶解し、室温で１０分間撹拌した。少量の飽和ＮａＨＳＯ_３水溶液を加えて過剰のヨウ素を還元した後に、パーフルオロヘキサン（１０ｍｌ）を加えて希釈して分液ロートに移した。飽和炭酸水素トリエチルアンモニウム水溶液で３回抽出し、有機層に無水硫酸ナトリウムを加えて乾燥した。硫酸ナトリウ厶を濾過して除去し、溶媒を減圧留去してリン酸ジエステル結合を有する３量体を得た。
同様の操作を繰り返すことで、任意の鎖長を持つオリゴマーを合成することができる。
（Ｓｔｅｐ ４）脱保護反応とフルオラスデンドロンの回収
Ｓｔｅｐ ３で得られたオリゴマーから、以下の要領に従うことでフルオラス担体を回収することができる。
Ｓｔｅｐ ３で得られたフルオラスデンドロンに結合したオリゴマーをピリジン−Ｃ_４Ｆ_９ＯＥｔ−メタノール性アンモニア（１：１：３，ｖ／ｖ／ｖ）溶液（１０ｍｌ）に懸濁し、密封して５５℃に加熱して１２時間反応させる。室温まで冷却し、アンモニアを減圧留去する。反応混合物に水（１０ｍｌ）とＣ_４Ｆ_９ＯＥｔ（１０ｍｌ）を加え、水層をＣ_４Ｆ_９ＯＥｔで３回抽出する。この時、フルオラスデンドロンは有機層に回収される。水層を凍結乾燥して、ＤＮＡの３量体をアンモニウム塩として得ることができる。Hereinafter, the present invention will be described based on examples. However, the present invention is not limited to the following examples.
A commercially available reagent was used as it was.
Reference example 1
Methyl 3,4,5-tris (3-perfluorooctylpropan-1-yloxy) benzoate

Methyl 3,4,5-trihydroxybenzoate (2.8 g, 15 mmol) and 1-bromo-3-perfluorooctylpropane (27 g, 50 mmol) were dissolved in THF (150 ml), and K ₂ CO ₃ (19 g, 140 mmol) was dissolved. ) Was added and heated to 65 ° C., then 18-crown-6 (1.2 g, 4.5 mmol) was added and reacted at 65 ° C. for 8 hours. The reaction mixture was poured into ice water (1.5 l) and the resulting solid was filtered with suction and washed with cold water. The solid dried under reduced pressure was recrystallized from ethanol (30 ml) to give the title compound (21 g, 89%) as pale yellow needles.

[Example 1]
3,4,5-tris (3-perfluorooctylpropan-1-yloxy) benzyl alcohol

3,4,5-Tris (3-perfluorooctylpropan-1-yloxy) benzoate (19 g, 12 mmol) obtained in Reference Example 1 was dissolved in THF (120 ml), and LiAlH ₄ (0.92 g, 24 mmol) was dissolved. And stirred at room temperature for 1 hour under a nitrogen atmosphere. After cooling to 0 ° C., water (120 ml) and 1M aqueous hydrochloric acid (50 ml) were added to stop the reaction. After extracting three times with ether (270 ml), the ether layers were combined, dried over anhydrous magnesium sulfate and filtered. The filtrate was evaporated under reduced pressure and dried under reduced pressure to give the title compound (18 g, 99%) as a milky white solid.

Reference example 2
3,4,5-tris (3-perfluorooctylpropan-1-yloxy) benzyl chloride

3,4,5-Tris (3-perfluorooctylpropan-1-yloxy) benzyl alcohol (17 g, 11 mmol) obtained in Example 1 was dissolved in anhydrous ether (110 ml), and DMF (0.050 ml) was used as a catalyst. ) Was added. Thionyl chloride (1.1 ml, 15 mmol) was added, and the mixture was stirred at room temperature for 1 hour under a nitrogen atmosphere. The solvent and excess reagent were distilled off under reduced pressure to obtain the title compound (17 g, 100%) as a white solid.

Reference example 3
Methyl 3,4,5, -tris [3 ', 4', 5'-tris (3-perfluorooctylpropan-1-yloxy) benzyloxy] benzoate

Methyl 3,4,5-trihydroxybenzoate (0.61 g, 3.3 mmol) and 3,4,5-tris (3-perfluorooctylpropan-1-yloxy) benzyl chloride obtained in Reference Example 2 ( 18 g, 11 mmol) dissolved in THF (110 ml), K ₂ CO ₃ (4.1 g, 30 mmol) was added and heated to 65 ° C., then 18-crown-6 (0.26 g, 1.0 mmol) was added, The reaction was carried out at 65 ° C. for 20 hours. Thereafter, potassium carbonate (4.1 g, 30 mmol), 18-crown-6 (0.26 g, 1.0 mmol) and benzoic acid (1.2 g, 10 mmol) were added, and the mixture was further reacted for 8 hours. The reaction mixture was poured into ice water (1.5 l) and the resulting solid was filtered with suction and washed with cold water. The obtained solid was washed with chloroform to give the title compound (15 g, 95%) as a milky white solid.

[Example 2]
Methyl 3,4,5-tris [3 ′, 4 ′, 5′-tris (3-perfluorooctylpropan-1-yloxy) benzyloxy] benzyl alcohol

Methyl 3,4,5-tris [3 ′, 4 ′, 5′-tris (3-perfluorooctylpropan-1-yloxy) benzyloxy] benzoate (16 g, 3.3 mmol) obtained in Reference Example 3 was used. was dissolved in _{THF (80ml), LiAlH 4 (} 0.63g, 17mmol) under nitrogen atmosphere and the mixture was refluxed for 1 hour. After cooling to 0 ° C., water (120 ml) and 1M aqueous hydrochloric acid (50 ml) were added to stop the reaction. After extracting three times with FC-72 (100 ml), the FC-72 layers were combined, dried over anhydrous sodium sulfate and filtered. The filtrate was evaporated under reduced pressure and dried under reduced pressure to obtain the desired product (13 g, 84%) as a milky white solid.

[Example 3]
5′-O-dimethoxytritylthymidine-3′-yl 3,4,5-tris (3-perfluorooctylpropan-1-yloxy) benzyl succinate

3,4,5-tris (3-perfluorooctylpropan-1-yloxy) benzyl alcohol (0.23 g, 0.15 mmol) obtained in Example 1 and 1,8-diazabicyclo [5.4.0] ] Undec-7-enium 5'-O-dimethoxytritylthymidin-3'-yl succinate (0.14 g, 0.18 mmol) was azeotropically dried three times with anhydrous pyridine and three times with anhydrous THF, then anhydrous THF (1 .5 ml). 3-nitro-1,2,4-triazol-1-yl tris (pyrrolidin-1-yl) phosphonium hexafluorophosphate (PyNTP, 0.18 g, 0.36 mmol) and triethylamine (0.046 g, 0.45 mmol) In addition, the mixture was stirred at room temperature for 15 minutes. The reaction solution was diluted with chloroform (10 ml), transferred to a separatory funnel, and extracted three times with phosphate buffer (pH 7.0, 15 ml). The organic layer was dried over anhydrous sodium sulfate and filtered, and the filtrate was evaporated under reduced pressure. The residue was purified by silica gel column chromatography (silica gel, 10 g, hexane-ethyl acetate) to give the title compound (0.25 g, 76%). ) Was obtained as a colorless foamy solid.

[Example 4]
Fluorous Synthesis of Oligonucleotide Using Fluorous Dendron Carrier (Example 1) (Step 1) Removal of 5′-O-DMTr Group The compound (0.11 g, 0.050 mmol) obtained in Example 3 was added to perfluorohexane ( 3 ml) and C ₄ F ₉ OEt (2 ml), trifluoroacetic acid (0.050 ml) was added, and the mixture was stirred at room temperature for 10 minutes. Dilute with perfluorohexane (25 ml), transfer to a separatory funnel, and extract 3 times with 5% aqueous NaHCO ₃ solution (20 ml). (At this time, free hydroxyl group at the 5′-position during synthesis of sodium trifluoroacetate and oligomer) Excess monomer having is removed to the aqueous layer by this operation). Next, the fluorous layer was extracted three times with methanol (20 ml) (DMTr group residue was removed to the methanol layer). The fluorous layer containing the desired product was separated, dried over anhydrous sodium sulfate and filtered, and the filtrate was distilled off under reduced pressure to obtain thymidine-3′-yl3,4,5-tris (3-perfluorooctyl). Propane-1-yloxy) benzyl succinate (0.081 g, 88%) was obtained.
(Step 2) Condensation reaction Thymidine-3′-yl3,4,5-tris (3-perfluorooctylpropan-1-yloxy) benzyl succinate (0.092 g, 0.050 mmol) obtained in Step 1 above and 1,8-diazabicyclo [5.4.0] undec-7-enium 5′-O-dimethoxytritylthymidin-3′-yl phosphonate (0.046 g, 0.060 mmol) azeotropically dried three times with anhydrous pyridine After dissolving in anhydrous pyridine (0.50 ml), BopCl (0.026 g, 0.10 mmol) was added under an argon atmosphere and stirred for 10 minutes. To the reaction mixture was added perfluorohexane (3 ml), and the mixture was extracted 3 times with 5% aqueous NaHCO ₃ (3 ml). By these extraction operations, the residue of the condensing agent, pyridine, monomer counter cation, etc. are all removed to the aqueous layer. Anhydrous sodium sulfate was added to the perfluorohexane layer and dried, followed by filtration. The filtrate was distilled off under reduced pressure to obtain a dimer (0.105 g, 86%) having an H-phosphonate bond having a molecular weight of 2451.
Further, Step 1 and Step 2 were repeated to obtain a trimer having an H-phosphonate bond having a molecular weight of 2740.
(Step 3) Oxidation Reaction The protecting group at the 5′-end of the oligomer obtained in the above manner is removed by the operation of Step 1 above. The resulting oligomer having a free hydroxyl group at the 5′-position was dissolved in a pyridine-C ₄ F ₉ OEt-water (49: 49: 2, v / v / v) solution of iodine (0.076 g, 0.3 mmol) ( 10 ml) and stirred at room temperature for 10 minutes. A small amount of saturated aqueous NaHSO ₃ solution was added to reduce excess iodine, and then diluted with perfluorohexane (10 ml) and transferred to a separatory funnel. Extraction was performed 3 times with a saturated aqueous solution of triethylammonium hydrogen carbonate, and the organic layer was dried over anhydrous sodium sulfate. Sodium sulfate was removed by filtration, and the solvent was distilled off under reduced pressure to obtain a trimer having a phosphodiester bond.
By repeating the same operation, an oligomer having an arbitrary chain length can be synthesized.
(Step 4) Deprotection Reaction and Recovery of Fluorous Dendron A fluorous carrier can be recovered from the oligomer obtained in Step 3 by following the following procedure.
The oligomer bound to the fluorodendron obtained in Step 3 was suspended in a pyridine-C ₄ F ₉ OEt-methanolic ammonia (1: 1: 3, v / v / v) solution (10 ml), sealed, and sealed at 55 ° C. To react for 12 hours. Cool to room temperature and remove the ammonia in vacuo. Water (10 ml) and C ₄ F ₉ OEt (10 ml) are added to the reaction mixture, and the aqueous layer is extracted 3 times with C ₄ F ₉ OEt. At this time, the fluorodendron is recovered in the organic layer. The aqueous layer can be lyophilized to obtain the DNA trimer as an ammonium salt.
[Example 5]
5′-O-dimethoxytritylthymidine-3′-yl3,4,5-tris [3 ′, 4 ′, 5′-tris (3-perfluorooctylpropan-1-yloxy) benzyloxy] benzyl succinate

Methyl 3,4,5-tris [3 ′, 4 ′, 5′-tris (3-perfluorooctylpropan-1-yloxy) benzyloxy] benzyl alcohol (2.4 g, 0. 3) obtained in Example 2. 50 mmol) and 1,8-diazabicyclo [5.4.0] undec-7-enium 5′-O-dimethoxytritylthymidin-3′-yl succinate (0.48 g, 0.60 mmol) three times with anhydrous pyridine. After azeotropic drying with anhydrous THF three times, anhydrous THF-C ₄ F ₉ OEt (20: 1, v / v) (50 ml) was added and dissolved by heating to 45 ° C. 3-nitro-1,2,4-triazol-1-yl tris (pyrrolidin-1-yl) phosphonium hexafluorophosphate (PyNTP, 0.60 g, 1.2 mmol) and triethylamine (0.21 g, 1.5 mmol) In addition, the mixture was stirred at 45 ° C. for 15 minutes. The reaction solution was diluted with FC-72 (30 ml), transferred to a separatory funnel, and extracted three times with 5% aqueous sodium hydrogen carbonate solution (50 ml) and chloroform (50 ml). The FC-72 layer was dried over anhydrous sodium sulfate and filtered, and the filtrate was evaporated under reduced pressure to give the title compound (2.3 g, 90%) as a milky white solid.

[Example 6]
Fluorous Synthesis of Oligonucleotide Using Fluorous Dendron Carrier (Example 2) (Step 1) Removal of 5′-O-DMTr Group The compound (2.7 g, 0.50 mmol) obtained in Example 5 was converted to perfluorohexane ( 25 ml) and α, α, α-trifluorotoluene (25 ml), trifluoroacetic acid (0.50 ml) was added, and the mixture was stirred at room temperature for 3 minutes. Diluted with perfluorohexane (50 ml), transferred to a separatory funnel and extracted three times with 5% aqueous NaHCO ₃ solution (50 ml) and toluene (50 ml) (at this time 5'-position during synthesis of sodium trifluoroacetate and oligomer) The excess monomer having a free hydroxyl group is removed to the aqueous layer by this operation, and the DMTr group residue is removed to the toluene layer). The fluorous layer containing the desired product was separated, dried over anhydrous sodium sulfate and then filtered. The filtrate was distilled off under reduced pressure to obtain thymidine-3′-yl3,4,5-tris [3 ′, 4 ′. , 5′-Tris (3-perfluorooctylpropan-1-yloxy) benzyloxy] benzyl succinate (1.9 g, 88%) was obtained as an opalescent solid.
(Step 2) Condensation reaction Thymidine-3′-yl3,4,5-tris [3 ′, 4 ′, 5′-tris (3-perfluorooctylpropan-1-yloxy) benzyl obtained in Step 1 above Oxy] benzyl succinate (1.0 g, 0.20 mmol) and 1,8-diazabicyclo [5.4.0] undec-7-enium 5′-O-dimethoxytritylthymidin-3′-yl phosphonate (0 .18 g, 0.24 mmol) was azeotropically dried three times with anhydrous pyridine and then dissolved in anhydrous pyridine (0.50 ml), and PyNTP (0.24 g, 0.48 mmol) was added under an argon atmosphere at 45 ° C. for 5 minutes. Stir. Perfluorohexane (50 ml) was added to the reaction mixture, and the mixture was extracted 3 times with 5% NaHCO ₃ aqueous solution (100 ml)) and chloroform (100 ml). By this extraction operation, the residue of the condensing agent, pyridine, is removed in the aqueous layer, and the counter cation of the monomer is removed in the organic layer. Anhydrous sodium sulfate was added to the perfluorohexane layer and dried, followed by filtration. The filtrate was distilled off under reduced pressure to obtain a dimer (1.1 g, 96%) having an H-phosphonate bond having a molecular weight of 5627.
Further, Step 1 and Step 2 were repeated to obtain a trimer having an H-phosphonate bond having a molecular weight of 5915.
(Step 3) Oxidation Reaction The protecting group at the 5′-end of the oligomer obtained in the above manner is removed by the operation of Step 1 above. The resulting oligomer having a free hydroxyl group at the 5′-position was dissolved in a pyridine-C ₄ F ₉ OEt-water (49: 49: 2, v / v / v) solution of iodine (0.076 g, 0.3 mmol) ( 10 ml) and stirred at room temperature for 10 minutes. A small amount of saturated aqueous NaHSO ₃ solution was added to reduce excess iodine, and then diluted with perfluorohexane (10 ml) and transferred to a separatory funnel. Extraction was performed 3 times with a saturated aqueous solution of triethylammonium hydrogen carbonate, and the organic layer was dried over anhydrous sodium sulfate. The sodium sulfate residue was removed by filtration, and the solvent was distilled off under reduced pressure to obtain a trimer having a phosphodiester bond.
By repeating the same operation, an oligomer having an arbitrary chain length can be synthesized.
(Step 4) Deprotection Reaction and Recovery of Fluorous Dendron A fluorous carrier can be recovered from the oligomer obtained in Step 3 by following the following procedure.
The oligomer bound to the fluorodendron obtained in Step 3 was suspended in a pyridine-C ₄ F ₉ OEt-methanolic ammonia (1: 1: 3, v / v / v) solution (10 ml), sealed, and sealed at 55 ° C. To react for 12 hours. Cool to room temperature and remove the ammonia in vacuo. Water (10 ml) and C ₄ F ₉ OEt (10 ml) are added to the reaction mixture, and the aqueous layer is extracted 3 times with C ₄ F ₉ OEt. At this time, the fluorodendron is recovered in the organic layer. The aqueous layer can be lyophilized to obtain the DNA trimer as an ammonium salt.

Claims (15)

A fluorous carrier represented by the following formula (1a).

[Wherein, R ¹ , R ² and R ³ are each independently the same or different, and are a hydrocarbon group having fluorine, which may have a substituent, an oxygen atom, a nitrogen atom, It may be interrupted by a sulfur atom or a silicon atom. ] R ¹ , R ² and R ³ are each independently the same or different and each represents a fluoroalkyl group represented by the following formula (A),

[Wherein, B ¹ and B ² are each independently the same or different and are a hydrogen atom or a C _{1 to} C ₂₀ hydrocarbon group which may have a substituent, and m is 0. Is an integer of -10, and n is an integer of 0-20. ]
Or a mono- or polyfluoroalkyloxybenzyl group represented by the following formula (B)

[Wherein, B ³ and B ⁴ are each independently the same or different and are a hydrogen atom or a C _{1 to} C ₂₀ hydrocarbon group optionally having a substituent, and p is each Are independently the same or different and are each an integer of 0 to 20, q is independently of each other and is the same or different and is an integer of 0 to 10, and r is an integer of 1 to 3. The fluorous carrier according to claim 1, wherein A fluorous carrier represented by the following formula (1b).

[Wherein, A ¹ , A ² , A ³ , A ⁴ , A ⁵ , A ⁶ , A ⁷ , A ⁸ and A ⁹ are each independently the same or different and represent a hydrocarbon group having fluorine. Yes, may have a substituent, and may be interrupted by an oxygen atom, a nitrogen atom, a sulfur atom, or a silicon atom,
Y is —O—, —NA ¹⁰ — (wherein A ¹⁰ is a hydrogen atom or a C _{1 to} C ₁₀ alkyl group), or —S—. ] A ¹ , A ² , A ³ , A ⁴ , A ⁵ , A ⁶ , A ⁷ , A ⁸ and A ⁹ are each independently the same or different, and a fluoroalkyl group represented by the following formula (A) ,

[Wherein, B ¹ and B ² are each independently the same or different and are a hydrogen atom or a C _{1 to} C ₂₀ hydrocarbon group which may have a substituent, and m is 0. Is an integer of -10, and n is an integer of 0-20. ]
Or a mono- or polyfluoroalkyloxybenzyl group represented by the following formula (B)

[Wherein, B ³ and B ⁴ are each independently the same or different and are a hydrogen atom or a C _{1 to} C ₂₀ hydrocarbon group optionally having a substituent, and p is each Independent of each other, and the same or different and an integer of 0 to 20, q is independent of each other and is the same or different and an integer of 0 to 10, and r is an integer of 1 to 3. 4. The fluorous carrier according to 3. The fluorous carrier according to claim 1, which is used for biopolymer synthesis. The nucleoside which introduce | transduced the substituent containing the fluorous carrier of Claims 1-5 in 3'-position. A nucleoside represented by the following formula (2a).

[Wherein R ¹ , R ² and R ³ are each independently the same or different and are a hydrocarbon group having fluorine, which may have a substituent, an oxygen atom, a nitrogen atom, It may be interrupted by a sulfur atom or a silicon atom,
B ⁵ represents an unprotected or amino group-protected pyrimidine base or purine base, or a derivative thereof;
X ¹ is a hydrogen atom, a dimethoxytrityl group, or a monomethoxytrityl group,
X ² is a hydrogen atom, a hydroxy group, an alkoxy group, an alkenyloxy group, an acyloxy group, or a trialkylsilyloxy group,
Y ^{is, -O -, - NA 10 -} ( ^{wherein, A 10} is a hydrogen atom or a _C 1 _{-C 10} alkyl group), or a -S-,
Z _{is, - (CH 2) i -} ( wherein, i is an integer of 0 to 3), or, a phenylene group which may have a substituent. ] R ¹ , R ² and R ³ are each independently the same or different and each represents a fluoroalkyl group represented by the following formula (A),

[Wherein, B ¹ and B ² are each independently the same or different and are a hydrogen atom or a C _{1 to} C ₂₀ hydrocarbon group which may have a substituent, and m is 0. Is an integer of -10, and n is an integer of 0-20. ]
Or a mono- or polyfluoroalkyloxybenzyl group represented by the following formula (B)

[Wherein, B ³ and B ⁴ are each independently the same or different and are a hydrogen atom or a C _{1 to} C ₂₀ hydrocarbon group optionally having a substituent, and p is each Are independently the same or different and are each an integer of 0 to 20, q is independently of each other and is the same or different and is an integer of 0 to 10, and r is an integer of 1 to 3. The nucleoside according to 7. The nucleoside according to claim 7, wherein the nucleoside represented by the formula (2a) is a nucleoside represented by the following formula (2b).

[Wherein, B ⁵ , X ¹ , X ² , Y and Z are as defined above.
A ¹ , A ² , A ³ , A ⁴ , A ⁵ , A ⁸ , A ⁷ , A ⁸ and A ⁹ are each independently the same or different, and are a hydrocarbon group having fluorine, and a substituent And may be interrupted by an oxygen atom, a nitrogen atom, a sulfur atom, or a silicon atom. ] A ¹ , A ² , A ³ , A ⁴ , A ⁵ , A ⁶ , A ⁷ , A ⁸ and A ⁹ are each independently the same or different, and a fluoroalkyl group represented by the following formula (A) ,

[Wherein, B ¹ and B ² are each independently the same or different and are a hydrogen atom or a C _{1 to} C ₂₀ hydrocarbon group which may have a substituent, and m is 0. Is an integer of -10, and n is an integer of 0-20. ]
Or a mono- or polyfluoroalkyloxybenzyl group represented by the following formula (B)

[Wherein, B ³ and B ⁴ are each independently the same or different and are a hydrogen atom or a C _{1 to} C ₂₀ hydrocarbon group optionally having a substituent, and p is each Independent of each other, and the same or different and an integer of 0 to 20, q is independent of each other and is the same or different and an integer of 0 to 10, and r is an integer of 1 to 3. 9. The nucleoside according to 9. The protecting group introduced into B ⁵ is a fluoroalkyl group represented by the following formula (C)

[Wherein, E ¹ and E ² are each independently the same or different and are a hydrogen atom or a C _{1 to} C ₂₀ hydrocarbon group optionally having a substituent, and m is 0. Is an integer of -10, and n is an integer of 0-20. ]
Or a mono- or polyfluoroalkyloxybenzyl group represented by the following formula (D)

[Wherein, E ³ and E ⁴ are each independently the same or different and each represents a hydrogen atom or a C _{1 to} C ₂₀ hydrocarbon group which may have a substituent, and p represents Are independently the same or different and are each an integer of 0 to 20, q is independently of each other and is the same or different and is an integer of 0 to 10, and r is an integer of 1 to 3. The nucleoside according to any one of 7 to 10. A nucleoside represented by the following formula (2a):

[Wherein R ¹ , R ² and R ³ are each independently the same or different and are a hydrocarbon group having fluorine, which may have a substituent, an oxygen atom, a nitrogen atom, It may be interrupted by a sulfur atom or a silicon atom,
B ⁵ represents an unprotected or amino group-protected pyrimidine base or purine base, or a derivative thereof;
X ¹ is a hydrogen atom,
X ² is a hydrogen atom, a hydroxy group, an alkoxy group, an alkenyloxy group, an acyloxy group, or a trialkylsilyloxy group,
Y ^{is, -O -, - NA 10 -} ( ^{wherein, A 10} is a hydrogen atom or a _C 1 _{-C 10} alkyl group), or a -S-,
Z _{is, - (CH 2) i -} ( wherein, i is an integer of 0 to 3), or, a phenylene group which may have a substituent. ]
In the presence of a condensing agent, a phosphonate represented by the following formula (3):

[In the formula, B ⁶ represents a pyrimidine base or a purine base with no protection or an amino group protected, or a derivative thereof;
X ³ is a dimethoxytrityl group or a monomethoxytrityl group,
X ⁴ represents a hydrogen atom, a hydroxy group, an alkoxy group, an alkenyloxy group, an acyloxy group, or a trialkylsilyloxy group. ]
To produce a dimer represented by the following formula (4a).

[Wherein, B ⁵ , B ⁶ , X ² , X ³ , X ⁴ , Y, Z, R ¹ , R ² and R ³ have the same meanings as described above. ] The nucleoside represented by the formula (2a) is a nucleoside represented by the following formula (2b),

[Wherein, B ⁵ , X ¹ , X ² , Y and Z are as defined above.
A ¹ , A ² , A ³ , A ⁴ , A ⁵ , A ⁶ , A ⁷ , A ⁸ and A ⁹ are each independently the same or different, and are a hydrocarbon group having fluorine and a substituent. And may be interrupted by an oxygen atom, a nitrogen atom, a sulfur atom, or a silicon atom. ]
The method for producing a dimer according to claim 12, wherein the produced dimer is a dimer represented by the following formula (4b).

[Wherein B ⁵ , B ⁶ , X ² , X ³ , X ⁴ , Y, Z, A ¹ , A ² , A ³ , A ⁴ , A ⁵ , A ⁶ , A ⁷ , A ⁸ and A ⁹ are Represents the same meaning as described above. ] An oligonucleotide derivative represented by the following formula (5a);

[Wherein R ¹ , R ² and R ³ are each independently the same or different and are a hydrocarbon group having fluorine, which may have a substituent, an oxygen atom, a nitrogen atom, It may be interrupted by a sulfur atom or a silicon atom,
B ⁵ represents an unprotected or amino group-protected pyrimidine base or purine base, or a derivative thereof;
Each of B ⁶ is independently of each other and is the same or different and represents an unprotected or amino-protected pyrimidine base or purine base, or a derivative thereof;
X ² represents a hydrogen atom, a hydroxy group, an alkoxy group, an alkenyloxy group, an acyloxy group, or a trialkylsilyloxy group,
X ³ is a dimethoxytrityl group or a monomethoxytrityl group,
X ⁴ is independently of each other and the same or different and represents a hydrogen atom, a hydroxy group, an alkoxy group, an alkenyloxy group, an acyloxy group, or a trialkylsilyloxy group,
s represents an integer of 1 or more. ]
By reacting a deprotecting reagent, after the X ³ desorbed, and phosphonate represented by the presence of a condensing agent, the following formula (3)

[Wherein, B ⁶ , X ³ and X ⁴ are as defined above. ]
A process for producing an oligonucleotide derivative represented by the following formula (6a), wherein:

[Wherein, B ⁵ , B ⁶ , X ² , X ³ , X ⁴ , Y, Z, s, R ¹ , R ² and R ³ represent the same meaning as described above. ] The oligonucleotide derivative represented by the formula (5a) is an oligonucleotide derivative represented by the following formula (5b),

[Wherein, B ⁵ , B ⁶ , X ² , X ³ , X ⁴ and s are as defined above.
A ¹ , A ² , A ³ , A ⁴ , A ⁵ , A ⁶ , A ⁷ , A ⁸ and A ⁹ are each independently the same or different, and are a hydrocarbon group having fluorine and a substituent. And may be interrupted by an oxygen atom, a nitrogen atom, a sulfur atom, or a silicon atom. ]
The manufacturing method of the oligonucleotide derivative of Claim 14 whose said oligonucleotide derivative manufactured is an oligonucleotide derivative shown by following formula (6b).

[Wherein, B ⁵ , B ⁶ , X ² , X ³ , X ⁴ , Y, Z, s, A ¹ , A ² , A ³ , A ⁴ , A ⁵ , A ⁶ , A ⁷ , A ⁸ and A ⁹ represents the same meaning as described above. ]