JPS61257186A - Novel dna and hybrid dna - Google Patents

Novel dna and hybrid dna

Info

Publication number
JPS61257186A
JPS61257186A JP9810885A JP9810885A JPS61257186A JP S61257186 A JPS61257186 A JP S61257186A JP 9810885 A JP9810885 A JP 9810885A JP 9810885 A JP9810885 A JP 9810885A JP S61257186 A JPS61257186 A JP S61257186A
Authority
JP
Japan
Prior art keywords
dna
double
stranded
hybrid
minutes
Prior art date
Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
Pending
Application number
JP9810885A
Other languages
Japanese (ja)
Inventor
Tsutae Morinaga
森永 傳
Kinichiro Miura
謹一郎 三浦
Kunitada Shimotoono
邦忠 下遠野
Masato Ikegami
正人 池上
Yataro Ichikawa
市川 彌太郎
Current Assignee (The listed assignees may be inaccurate. Google has not performed a legal analysis and makes no representation or warranty as to the accuracy of the list.)
Teijin Ltd
Original Assignee
Teijin Ltd
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Teijin Ltd filed Critical Teijin Ltd
Priority to JP9810885A priority Critical patent/JPS61257186A/en
Publication of JPS61257186A publication Critical patent/JPS61257186A/en
Pending legal-status Critical Current

Links

Classifications

    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K14/00Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
    • C07K14/005Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from viruses
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N2750/00MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA ssDNA viruses
    • C12N2750/00011Details
    • C12N2750/12011Geminiviridae
    • C12N2750/12022New viral proteins or individual genes, new structural or functional aspects of known viral proteins or genes

Abstract

PURPOSE:To provide a double-chain vector derived from the single-chain DNA of bean golden mossaic virus and having improved technological handleability in genetic recombination technique. CONSTITUTION:The DNA of formula having two or more chains was produced from the single-chain DNA of bean golden massaic virus (BGMV) (a kind of gemini virus) and having a length of 2585 bases. The double-chain DNA was incised with a restriction enzyme and integrated with other biological vector incised with the same restriction enzyme to obtain a hybrid DNA.

Description

【発明の詳細な説明】 本発明は、ビーンゴールデンモザイクウイルス(Bea
n Golden Mo5aic Virus:以下こ
れを“B G M V ”と略称することがある)に関
連するDNA及びそれを組み込んだハイブリッドDNA
に関する。更に詳しく説明するとBGMVの一本鎖DN
Aを二本鎖化して得られたDNA、このDNAを他の生
物用ベクターに組み込んで得られたハイブリッドDNA
、このハイブリッドDNAを増殖することによって得ら
れたハイブリッドDNA1このハイブリットDNAから
BGMV由来のDNA断片部分のみを取り出して閉環結
合して得られたDNA及びBGMVの複製型DNAに関
する。
DETAILED DESCRIPTION OF THE INVENTION The present invention is directed to the use of bean golden mosaic virus (Bea
DNA related to Golden Mo5aic Virus (hereinafter sometimes abbreviated as "BGMV") and hybrid DNA incorporating it
Regarding. To explain in more detail, the single-stranded DN of BGMV
DNA obtained by double-stranding A, hybrid DNA obtained by incorporating this DNA into a vector for other organisms
, Hybrid DNA 1 obtained by propagating this hybrid DNA relates to DNA obtained by extracting only the BGMV-derived DNA fragment portion from this hybrid DNA and performing ring-closing ligation, and replicative DNA of BGMV.

1迷iL ウィルスからのDNAM伝子は、最近遺伝子組み換え技
術において、広くベクターとして開発され利用されてい
る。そのようなベクターを与えるウィルスの例としては
シミアンウィルス(S’V)40やポリオーマウィルス
の如きパボバウイルス。
The DNAM gene from the iL virus has recently been widely developed and used as a vector in genetic recombination technology. Examples of viruses that provide such vectors are Pabovaviruses such as Simian Virus (S'V) 40 and Polyomavirus.

パピロマウイルス、アデノウィルスの如きものが知られ
ている。しかしこれらの公知のベクターは動物系のベク
ターとして見出されたものであって、植物系の細胞中で
は増殖しない。従ってこれら公知のベクターは植物遺伝
子組み換え用のベクターとして利用出来ない。
Papillomaviruses and adenoviruses are known. However, these known vectors were discovered as animal-based vectors and do not proliferate in plant-based cells. Therefore, these known vectors cannot be used as vectors for plant genetic recombination.

現在までに植物遺伝子組み換え用ベクターとして利用可
能性のあるものとしては、例えばトマトやタバコなどの
双子葉類植物に腫瘍を作るアグロバクテリウムチューム
ファシイエン(A grobacterium tum
efaciens)が有している核外遺伝子のTiプラ
スミド、キャベツや白菜などに病気を起すカリフラワー
モザイクウィルスからのDNA遺伝子などが知られてい
るのみである。これら以外に植物遺伝子組み換え用ベク
ターとして適切なものは未だ開発されていない。更に植
物遺伝子組み換え用のベクターになりつる可能性のある
DNA遺伝子を有する植物ウィルスは前掲のカリフラワ
ーモザイクウィルス以外は知られていなかったと云って
J:い。
To date, vectors that can be used as plant genetic modification vectors include Agrobacterium tumphaensis, which causes tumors in dicotyledonous plants such as tomatoes and tobacco.
The only known examples are the Ti plasmid, an extranuclear gene possessed by P. efaciens), and the DNA gene from cauliflower mosaic virus, which causes diseases in cabbage and Chinese cabbage. Other than these, vectors suitable for plant genetic recombination have not yet been developed. Furthermore, other than the above-mentioned cauliflower mosaic virus, there are no known plant viruses that have DNA genes that can be used as vectors for plant genetic modification.

最近米国のイリノイ大学のロバート・エム・グツドマン
(Robert、  M、 Goodman)らは熱帯
性の植物ウィルスであるBGMVは、その直径が約18
0mの2つの粒子が対合した如き形態で1個のピリオン
をなすものでありその核酸を解析した結果、このウィル
スの遺伝子が約2500塩基の大きさの環状一本鎖のり
、NAであることを見出し報告している。
Recently, Robert M. Goodman and his colleagues at the University of Illinois in the United States have discovered that BGMV, a tropical plant virus, has a diameter of about 18 mm.
It looks like two 0m particles paired together to form a single pillion, and analysis of its nucleic acid revealed that the gene of this virus is NA, a circular single-stranded polymer with a size of approximately 2500 bases. is reported under the heading.

[V irology 83171 (1977) 、
  V 1roloay 97388(1979)参照
]。
[Virology 83171 (1977),
V 1roloay 97388 (1979)].

このような約18nmの直径を有する2つの粒子が対合
した如き形態で1個のピリオンをなし、しかもその遺伝
子が環状の一本鎖である様な植物ウィルスがその模数種
類発見されこれら一群のウィルスは゛′ジエミニウイル
ス群”と呼ばれている。
A large number of plant viruses have been discovered that have the shape of two particles with a diameter of approximately 18 nm paired together to form a pillion, and whose gene is a circular single strand. These viruses are called the ``dieminivirus group.''

前述したように植物のDNA型ウィルスはカリフラワー
モザイクウィルスとジエミニウイルスとが知られている
に過ぎず、植物遺伝子組み換え用ベクターの開発の目標
遺伝子組み換え用ベクターの開発の目標としてジエミニ
ウイルスは極めて期待出来る。
As mentioned above, the only known plant DNA viruses are cauliflower mosaic virus and dieminivirus, and dieminivirus is extremely important as a goal for the development of vectors for genetic recombination in plants. I can expect it.

従来、植物遺伝子組み換え用ベクターに関して提案され
ている前記Tiプラスミドやカリフラワーモザイクウィ
ルスは感染する植物つまり宿主植物が双子葉類限られて
いるのに対し、ジエミニウイルスは双子葉類のみならず
、人類にとって重要穀物である麦、トウモロコシの如き
単子葉類も宿主となりうるので、このジエミニウイルス
のDNAを植物遺伝子組み換え用のためにベクター化す
ることはその自体極めて意味あることである。
Conventionally, the Ti plasmid and cauliflower mosaic virus, which have been proposed as vectors for plant genetic modification, can only infect dicotyledonous plants, that is, host plants, whereas dieminivirus can be used not only for dicotyledonous plants but also for humans. Since monocots such as wheat and corn, which are important grains for this virus, can also serve as hosts, it is extremely meaningful to convert the DNA of this dieminivirus into a vector for genetically modifying plants.

一方カリフラワーモザイクウイルスは植物細胞の細胞質
内で増殖するのに対し、ジエミニウイルスは細胞質内で
もまた核の中でも増殖する。このことはジエミニウイル
スをベクター化した場合、植物の核遺伝子そのものを改
変し得る可能性が高いことを示している。従って、ジエ
ミニウイルスのDNAをベクター化することが出来れば
そのこと自体工業的に価値あることであることは明白で
ある。
On the other hand, cauliflower mosaic virus multiplies within the cytoplasm of plant cells, whereas dieminivirus multiplies both within the cytoplasm and nucleus. This indicates that when dieminivirus is used as a vector, it is highly likely that the nuclear genes of plants themselves can be modified. Therefore, it is clear that if it is possible to convert dieminivirus DNA into a vector, it would be of industrial value in itself.

水JLLΔ眉」し そこで本発明者らは、ジエミニウイルスの一種であるビ
ーンゴールアンモザイクウイルス(BGMV)の−重鎖
DNA遺伝子組み換え操作において技術的に取り扱い易
い二本鎖化しベクターとすること、それを組み込んだハ
イブリッドDNAなどについて研究を進めた結果本発明
に到達したものである。
Therefore, the present inventors made the heavy chain DNA of Bean Goal Ann Mosaic Virus (BGMV), which is a type of dieminivirus, into a double-stranded vector that is technically easy to handle in genetic recombination operations. The present invention was achieved as a result of research into hybrid DNA incorporating this.

すなわち、本発明によれば、BGMVからの(1)長さ
が2585塩基の一本鎖DNAを少くとも部分的に二本
鎖化して得られたDNAであり図1の塩基配列を示すD
NA (以下これをDNA−aと略す)及びQ)長さが
2647塩基の一本lDNAを少くとも部分的に二本鎖
化して得られたDNAであり図2塩基配列を示すDNA
 (以下これをDNA−bと略す)がまた、本発明によ
れば、前記二本鎖化したDNA−a及びDNA−bを制
限酵素で分解し、同じ制限酵素で開裂した他の生物用ベ
クターを組み込んで得られたハイブリッドDNA、この
ハイブリッドDNAを元のベクターのの宿主に戻して増
殖を行って得られたハイブリッドDNA、このハイブリ
ットDNAを制限酵素で分解し次いで閉環結合すること
により得られた図1又は2の塩基配列を示すDNAが提
供される。
That is, according to the present invention, (1) DNA obtained by at least partially double-stranding a single-stranded DNA with a length of 2585 bases and having the base sequence shown in FIG.
NA (hereinafter abbreviated as DNA-a) and Q) DNA obtained by at least partially double-stranding a single DNA with a length of 2647 bases and showing the base sequence in Figure 2.
(hereinafter abbreviated as DNA-b), according to the present invention, the double-stranded DNA-a and DNA-b are digested with restriction enzymes, and other biological vectors cleaved with the same restriction enzymes are prepared. hybrid DNA obtained by integrating this hybrid DNA into the host of the original vector and propagating it; DNA showing the base sequence of FIG. 1 or 2 is provided.

ビーンゴールアンモザイクウイルス(BGMV)は中南
米においてインゲン豆類にゴールテンモザイク様の病気
を起すウィルスであり、p hytopatholoq
y 67 (NQl ) 37 (1977)記載の方
法で感染植物から下記の如く純化しその一本鎖DNAを
分離・精製することができる。
Bean gall mosaic virus (BGMV) is a virus that causes a gorten mosaic-like disease in common beans in Central and South America, and is a phytopatholoq virus.
y 67 (NQl) 37 (1977), the single-stranded DNA can be isolated and purified from infected plants as described below.

(1)  B G M Vからの一本鎖DNAの分離前
記文献記載の方法により感染植物からウィルスを耗化し
、付いて得られた純化ウィルス約500μ9を30m 
M  Tris HCj (PH= 7.6) 1%S
O8,プロテエネースKIOμg/a+Jl液にて2分
間振盪し、次にフェノール100μ文で3回タンパク質
抽出を行う。水層から溶解フェノールをエーテル抽出に
より除き、次にエタノール沈澱法によりウィルスの一本
鎖DNAを分離・精製し得る。
(1) Isolation of single-stranded DNA from BGM V Viruses were depleted from infected plants by the method described in the above literature, and approximately 500 μ9 of the purified virus obtained was incubated at 30 m
M Tris HCj (PH= 7.6) 1%S
Shake for 2 minutes with O8, proteinase KIO μg/a + Jl solution, and then perform protein extraction three times with 100 μg of phenol. Dissolved phenol is removed from the aqueous layer by ether extraction, and then the single-stranded DNA of the virus can be separated and purified by ethanol precipitation.

f2+BDMVの一本lDNAの二本鎖化上記の如くし
て得た一本鎖DNAを次にin vitrOで二本鎖化
する。この二本鎖化においては一本鎖DNA1μ3当り
、ブライマーを0.002〜2000μグの割合で使用
するのが好ましい。ブライマーとしては、ジエイ・エム
・ティラー(J、M、Tayler )らのB 1Oc
hilica et  B 1ophysicaAct
a、 442325 (1976)記載の方法を改変し
て修生胸腺ONへをDNaSe工で分解して得たオリゴ
ヌクレオチドを使用することが出来る。本発明は後述す
る実施例記載の如(、この改変した方法で得られるブラ
イマーを使用した。このオリゴヌクレオチドをブライマ
ーとして使用する場合のブライマーの口は前記−重鎖D
NA1μg当り50〜400μ9の割合が適当である。
Double-stranding of f2+BDMV single-stranded DNA The single-stranded DNA obtained as described above is then double-stranded in vitro. In this double-stranded formation, it is preferable to use 0.002 to 2000 μg of brimer per 1 μ3 of single-stranded DNA. As a brimer, B 1Oc by J.M. Taylor et al.
hilica et B 1ophysicaAct
A, 442325 (1976) can be modified to use oligonucleotides obtained by decomposing regenerating thymic ON with DNASe. In the present invention, a brimer obtained by this modified method was used as described in the Examples below. When this oligonucleotide is used as a brimer, the brimer opening is
A ratio of 50 to 400 μ9 per μg of NA is suitable.

またBGMVの一本鎖DNAに対しブライマーとして少
くとも10塩基を含み且つ全く相補的な配列を有する純
化DNAを使用する場合には、ブライマーの使用割合は
一本鎖DNA1μg当り、0.002μg〜1μび、更
に0.004μg〜0.02μ9であってもよい。
Furthermore, when using purified DNA containing at least 10 bases and having a completely complementary sequence to the single-stranded DNA of BGMV, the ratio of the primer used is 0.002 μg to 1 μg per 1 μg of single-stranded DNA. and further may be 0.004μg to 0.02μ9.

前述の割合で一本鎖DNAに対してブライマーを添加混
合して後、該混合液を好ましくは50〜80℃、特に6
0〜70℃の温度に1〜10分間、好ましくは3〜7分
間維持し次いで必要ならば約O℃もしくはそれ以外の温
度に急冷する。しかる操作により、ブライマーDNAが
ウィルス−重鎖DNA上の相補塩基配列の個所に付着す
る。
After adding and mixing the brimer to the single-stranded DNA at the above-mentioned ratio, the mixture is preferably heated at 50 to 80°C, especially at 60°C.
A temperature of 0 to 70°C is maintained for 1 to 10 minutes, preferably 3 to 7 minutes, and then, if necessary, rapidly cooled to a temperature of about 0°C or higher. By this operation, the primer DNA is attached to the complementary base sequence on the virus-heavy chain DNA.

次にデオキシアデノシン三リン酸(dATT)、デオキ
シシチジン三リン酸(dCTP)、デオキシグアノシン
三リン酸(d GTP)及びデオキシチミジン三リン酸
(dTTP)のそれぞれを最終濃度10〜300μM1
好ましくは50〜150IMの範囲となるように添加使
用する。
Next, deoxyadenosine triphosphate (dATT), deoxycytidine triphosphate (dCTP), deoxyguanosine triphosphate (dGTP), and deoxythymidine triphosphate (dTTP) were each added to a final concentration of 10 to 300 μM.
It is preferably added in a range of 50 to 150 IM.

この際、例えばd CTPの一部をα−32p−デオキ
シシチジン三リン酸(α−321) −d CTP)に
置換しておくと、その後の反応において二本鎖化の進行
度合、二本鎖化DNAの追跡が容易となるので便利であ
る。また酵素反応を促進するためMg”(例えば塩化マ
グネシウム、硫酸マグネシウムなど)を1〜501M1
好ましくは5〜20Il1Mの濃度範囲で使用する。な
お水層illにおいてrMJは特にことわらない限りr
moJl/uJの濃゛度単位を意味する。反応系内のI
)Hは7.2〜9、好ましくは7.6〜8.4の範囲に
維持されるように緩衝剤、例えばTris H(J (
1187,6〜8.4)を30〜300IM、好ましく
は70〜20011Mの濃度となるように使用するのが
有利である。
At this time, for example, by substituting a part of dCTP with α-32p-deoxycytidine triphosphate (α-321)-dCTP), the degree of progress of double-strand formation and the double-stranded This is convenient because it makes it easy to trace the oxidized DNA. In addition, Mg" (e.g. magnesium chloride, magnesium sulfate, etc.) is added to promote the enzyme reaction.
It is preferably used in a concentration range of 5 to 20 Il1M. Note that in the water layer ill, rMJ is r unless otherwise specified.
It means the concentration unit of moJl/uJ. I in the reaction system
)H is maintained in the range 7.2-9, preferably 7.6-8.4 using a buffer such as Tris H(J (
1187,6-8.4) in a concentration of 30-300 IM, preferably 70-20011M.

なお混合液全体の僅は、ウィルス一本IQDNA1μg
当り、1〜1000μ文、好ましくは10〜500μ旦
の範囲とするのがよい。また酵素安定剤として通常使用
されるものを用いることは効果的であり、その例として
は例えばα−メルカプトエタノール、ジチオスレイトー
ル(DTT)が挙げられる。安定剤は混合液中の濃度と
して0.1〜5(重器)%、好ましくは0.5〜2(i
li量)%の範囲で用いることができる。
The entire mixture contains 1 μg of IQ DNA per virus.
The amount is preferably in the range of 1 to 1000 μm, preferably 10 to 500 μm. It is also effective to use commonly used enzyme stabilizers, such as α-mercaptoethanol and dithiothreitol (DTT). The concentration of the stabilizer in the mixed solution is 0.1 to 5% (heavy equipment), preferably 0.5 to 2% (i.e.
It can be used within a range of (Li amount)%.

次に二本鎖化用の酵素を作用させるが、その二本鎖化の
ための酵素としては例えばエイビアン・ミニロブラスト
シス・ウィルス(AMV)の逆転写酵素、T4−DNA
ポリメラーゼ、大腸菌DNAポリメラーゼ■、DNAボ
リメラーeI・ラージフラグメント(タレノーエンザイ
ム)などを挙げられる。このうちAMVの逆転写酵素又
はDNAポリメラーゼトラージフラグメントが好ましい
Next, a double-stranded enzyme is applied, such as Avian miniloblastosis virus (AMV) reverse transcriptase, T4-DNA, etc.
Examples include polymerase, Escherichia coli DNA polymerase (■), and DNA polymerase eI large fragment (Talenor enzyme). Among these, AMV reverse transcriptase or DNA polymerase trage fragment is preferred.

二本鎖化酵素の使用割合は、主としてその種類によって
左右される。例えばAMVの逆転写酵素は[生化学工業
■製コード120248]を使用する場合には一本鎖D
NA1μg当り、1〜20ユニツト、好ましくは5〜1
0ユニツト使用するのが有効である。1ユニツトより少
ないと二本鎖化が充分に行なわれにくくなることがある
。二本鎖化酵素を加えた後、先ず10〜30℃、好まし
くは15〜25℃温度で2〜30分間、好ましくは5〜
20分間反応させ次いで30〜45℃、好ましくは35
〜40℃の温度で30〜180分間、好ましくは50〜
120分間反応させるのが有利である。
The proportion of double-stranded enzyme used depends primarily on its type. For example, when using AMV reverse transcriptase [Code 120248 manufactured by Seikagaku Corporation], single-strand D
1 to 20 units, preferably 5 to 1 units per μg of NA
It is effective to use 0 units. If the number is less than 1 unit, it may be difficult to form double strands sufficiently. After adding the double-stranded enzyme, firstly at a temperature of 10-30°C, preferably 15-25°C for 2-30 minutes, preferably 5-30°C.
React for 20 minutes and then heat at 30-45°C, preferably at 35°C.
30-180 minutes at a temperature of ~40°C, preferably 50-180 minutes
A reaction time of 120 minutes is advantageous.

反応は停止させるには反応混合液に例えば水飽和フェノ
ール或いはEDTA水溶液(pH= 8.0)などの停
止剤を加えればよい。その際水飽和フェノールの場合は
反応混合液に対し1/10〜2容聞倍加え振盪後延伸に
より水層のみを分離分取すればよく、またEDTA水溶
液の場合には混合液中存在するMg” ”を補足するに
充分な車使用すればよい。かくして反応停止処理を行っ
たDNA含有水溶液から二本鎖化したDNAを分離すれ
ばよく、好ましく分離操作はゲル口過による方法である
。その場合の一興体例について説明すると、二本鎖化し
たDNA含有水溶液を、S ephadex G −1
0[ファルマシア・ファインケミカル■製コやBiog
el  T)30  [バイオ・う111コなどのゲル
口過剤を用いて分画を行ない各両分の32p強度を測定
し、各両分中で最初に出てくる321)強度の高い高分
子母のDNA含有画分を集め、これをエタノール又はイ
ソプロパツール中で沈澱を行なえば二本鎖化したDNA
が得られる。かくして分離された二本鎖化DNAは、B
GMVの一本鎖DNAに基づく二本鎖化DNA以外のプ
ライマーDNAを可成り含んでいることがある。この傾
向はブライマーとして前記修生胸腺DNAからのオリゴ
ヌクレオチドを用いた場合に著しい。
The reaction can be stopped by adding a terminating agent such as water-saturated phenol or EDTA aqueous solution (pH=8.0) to the reaction mixture. At this time, in the case of water-saturated phenol, it is sufficient to add 1/10 to 2 times the volume of the reaction mixture, shake it, and then stretch to separate only the aqueous layer, and in the case of an EDTA aqueous solution, Mg present in the mixture You just need to use enough cars to supplement ``''. The double-stranded DNA may be separated from the DNA-containing aqueous solution subjected to the reaction termination treatment, and the separation operation is preferably performed by gel filtration. To explain an example of a chemical compound in that case, a double-stranded DNA-containing aqueous solution is treated with Sephadex G-1
0 [Pharmacia Fine Chemicals Co., Ltd. Biog
el T) 30 [Perform fractionation using a gel filtration agent such as Bio U111 Co., and measure the 32p intensity of each fraction. Collect the mother DNA-containing fractions and precipitate them in ethanol or isopropanol to obtain double-stranded DNA.
is obtained. The double-stranded DNA thus separated is B
It may contain a considerable amount of primer DNA other than double-stranded DNA based on the single-stranded DNA of GMV. This tendency is remarkable when oligonucleotides from the regenerated thymus DNA are used as primers.

従って、そのような場合二本鎖化したDNAを一層高純
度とするために、再度精製することが望ましい。この精
製は前述した如きゲル口過による方法を用いて行うこと
ができる。その−具体例を示寸と、−重鎖DNA20μ
3から出発した場合、前記二本鎖化DNAを水100〜
500μ文に溶解し10 mM  Tris  H(J
 (1)H= 7.4) 、100mMNa C1水溶
液で平衡化したS ephadex  Q −50又は
B iogel p30を充填した分離能を高めたカラ
ムにてゲル口過を行なう。溶出液として10 mMTr
is H(J (pH= 7.4) 、100mM  
Na C1を使用しボイドボリームのうら32pカウン
トの高い画分を集め、エタノール又はイソプロパツール
中で沈澱を行ない高純度のBGMVの二本鎖化DNAを
得ることができる。
Therefore, in such cases, it is desirable to purify the double-stranded DNA again to make it even more pure. This purification can be carried out using the gel filtration method described above. -Specific examples are given below, -Heavy chain DNA 20μ
When starting from 3, the double-stranded DNA was diluted with water 100~
Dissolve 10 mM Tris H (J
(1) Gel filtration is performed using a column with increased separation capacity packed with Sephadex Q-50 or Biogel p30 equilibrated with 100 mM NaCl aqueous solution (H=7.4). 10 mMTr as eluent
is H(J (pH = 7.4), 100mM
A fraction with a high 32p count at the bottom of the void volume is collected using Na Cl and precipitated in ethanol or isopropanol to obtain highly pure double-stranded BGMV DNA.

(3)  二本鎖化DNA 前記したBGMVにおけるジエミニウイルスは2種のD
NAが存在し前記の如く二本鎖化して得られたDNAも
また2種存在する。この2種の二本鎖化DNAは、それ
ぞれのDNAに分子1iliすることができ、またクロ
ーニング化して分けることができる。また二本鎖化する
前に(つまり一本鎖DNAの状態で)それぞれを分離し
、それぞれについて同様に二本鎖化を行うこともできる
(3) Double-stranded DNA There are two types of dieminivirus in BGMV mentioned above.
There are also two types of DNAs that contain NA and are double-stranded as described above. These two types of double-stranded DNA can be made into individual DNA molecules, or can be cloned and separated. It is also possible to separate each DNA before making it into double strands (in other words, in the state of single stranded DNA) and make them into double strands in the same way.

BGMVの一本鎖DNAの混合物を2種のDNAに分離
するには所謂バストランドセパレーション″と呼ばれて
いる方法、[例えばマニアナイスらの著書“Mo1ec
ular  Cfoning−A  L abator
yManual ”第180〜185頁記載の方法]つ
よりゲル電気泳動法による方法やまたDNA混合物の塩
化セシウム溶液にいずれか一方のDNAのみに相補的な
りNA断片を加えて平衡密度勾配遠心により一本鎖のま
まで残ったDNAと、一部分二本鎖化されたDNAとの
密度差を利用して分離する決方を採用することが可能で
ある。
In order to separate a mixture of single-stranded DNA of BGMV into two types of DNA, a method called "Basstrand separation" [for example, in the book "Mo1ec" by Maninais et al.
ular Cfoning-A Labator
[Method described on pages 180 to 185 of yManual] A method using twin gel electrophoresis, or a DNA fragment complementary to either one of the DNAs is added to a cesium chloride solution of the DNA mixture, and a single DNA fragment is separated by equilibrium density gradient centrifugation. It is possible to adopt a method of separating DNA that remains as a strand and partially double-stranded DNA by utilizing the density difference.

しかし二種のDNAの分離は一本鎖DNA混合物を二本
鎖化して後、例えばプラスミドpBR322などへクロ
ーニングし分離するのが行い易い。
However, separation of two types of DNA can be easily carried out by converting a single-stranded DNA mixture into double-stranded DNA, cloning it into, for example, plasmid pBR322, and separating it.

この分離法については後に詳細に説明する。This separation method will be explained in detail later.

かくしてBGMVからのDNAを二本鎖化して得られた
DNAは、その一方が2585塩U対(以下“塩基対″
を’bp”と略称することがある)の大きさを有し図1
の塩基配列を示す。また他方は2647塩基対(bp)
の大きさを有し図2の塩基配列を示す。
In this way, the DNA obtained by double-stranding the DNA from BGMV has 2585 salt U pairs (hereinafter referred to as "base pairs") on one side.
Figure 1
The base sequence of The other one is 2647 base pairs (bp)
It has the size of , and shows the nucleotide sequence in Figure 2.

本発明による二本鎖化DNAは、いずれも一本領DNA
に対して少くとも部分的に二本鎖化されていればよく完
全に全領域に亘って二本鎖化されていることは必ずしも
必要ではない。
The double-stranded DNA according to the present invention is all single-stranded DNA.
It is sufficient that the protein is at least partially double-stranded, and it is not necessarily necessary that the entire region is double-stranded.

本発明の二本鎖化DNAは例えば植物遺伝子組み換え用
のベクターとして使用されるので、そのために該DNA
を成る酵素によって切断して使用される。その場合切断
しようとする個所が少くとも二本鎖化されていさえずれ
ば後のクローニング化又は増殖によって二本鎖されてい
ない部位は修復され完全に二本鎖化される。従って本発
明の二本鎖化DNAは少くとも部分的に二本鎖化されて
いればよいが、望ましくは一本鎖DNAの塩基対して少
くとも80%、好ましくは少くとも90%が二本鎖化さ
れていればよい。
The double-stranded DNA of the present invention is used, for example, as a vector for plant genetic recombination.
It is used by cutting it with an enzyme consisting of In this case, if the site to be cut is at least double-stranded, the non-double-stranded site will be repaired by subsequent cloning or multiplication, and the DNA will become completely double-stranded. Therefore, the double-stranded DNA of the present invention only needs to be at least partially double-stranded, but preferably at least 80%, preferably at least 90% of the base pairs of the single-stranded DNA are double-stranded. It is fine as long as it is chained.

本発明による二本鎖化DNAで、図1に示すDNAは、
矢印(1)のATGから矢印(2]のTGAに亘ってオ
ーブンリーディングフレーム(以下゛○RF ”と略称
する)1があり、このフレーム内には、矢印(1)のA
TGから始まって図1の右方向へ三塩基セットのいわゆ
る゛コドン″をアミノ酸に対応させていくと、矢印(2
)のTGAで終止するまで、いわゆる“ユニバーサルコ
ドン表″に従ったアミノ酸配列のタンパク質がコードさ
れている。尚、矢印(1)から矢印(2)の間の途中の
コドンにアミノ酸翻訳の終止コドンTAA、TAG又は
TGAは現われない。
The double-stranded DNA according to the present invention, shown in FIG.
There is an oven reading frame (hereinafter abbreviated as "○RF") 1 extending from ATG of arrow (1) to TGA of arrow (2), and within this frame, ATG of arrow (1)
Starting from TG and moving toward the right in Figure 1, we can see the arrows (2
), the protein is encoded with an amino acid sequence according to the so-called "universal codon table" until the end with TGA. Note that the amino acid translation stop codon TAA, TAG, or TGA does not appear in the intermediate codon between arrow (1) and arrow (2).

図1に示すDNAには同様に矢印(3)のGTAから図
1の左方向へ矢印(4)のAATまでの0RF2にも別
のタンパク質がコードされている。本発明による二本鎖
化DNAで図2に示すDNAでは矢印(5)で示すAT
Gより図2の右方向へ矢印(6)で示すTAAまでの0
RF3にタンパク質がコードされている。同様に矢印+
7) G T Aより図2の左方向へ矢印(81(7)
AATまr(7)ORF4に、矢印(9) Jl: リ
図2の左方向へ矢印(2)のGATまでの0RF5に、
矢印Ql)のATGより図2の右方向−へ矢印02)の
TGAまでの0RF6に、矢印03のGTAより図2の
左方向へ矢印a4のAATまでの0RF7に、矢印(1
51のGTAより図2の左方向へ矢印(財)のAATま
でのPRF8に、矢印071のGTAより図2の左方向
へ矢印08)のAATまでの0RF9に、夫々別々のタ
ンパク質がコードされている。以上0RF1〜9にコー
ドされるタンパク質のアミノ酸配列をユニバーサルコド
ン表に従って翻訳したものが、夫々図3〜11である。
Similarly, in the DNA shown in FIG. 1, another protein is encoded in 0RF2 from GTA shown by arrow (3) to AAT shown by arrow (4) in the left direction of FIG. In the double-stranded DNA according to the present invention shown in FIG. 2, the AT indicated by the arrow (5)
0 from G to TAA shown by arrow (6) in the right direction in Figure 2
The protein is encoded by RF3. Similarly arrow +
7) Click the arrow (81(7)) to the left in Figure 2 from GTA.
AATmar (7) to ORF4, arrow (9) Jl: To the left of Figure 2, arrow (2) to 0RF5 to GAT,
From ATG of arrow Ql) to 0RF6 to TGA of arrow 02) to the right in FIG. 2, to 0RF7 from GTA of arrow 03 to AAT of arrow a4 to the left of FIG.
Separate proteins are encoded in PRF8 from GTA 51 to AAT shown by arrow 08) to the left in Figure 2, and in 0RF9 from GTA 071 to AAT shown by arrow 08) to the left in Figure 2. There is. The amino acid sequences of the proteins encoded by 0RF1-9 are translated according to the universal codon table and are shown in FIGS. 3-11, respectively.

夫々アミノ酸翻訳開始コドンATG (対応するアミノ
酸はメチオニン;MET)より始まって終止コドンの1
つ手前のコドンまでがDNAの塩基配列で示してあり、
その下に夫々のコドンに対応するアミノ酸で示されてい
る。
Each starts from the amino acid translation start codon ATG (the corresponding amino acid is methionine; MET) and ends at the stop codon.
The DNA base sequence is shown up to the previous codon.
The amino acids corresponding to each codon are shown below.

図3は0RF1を示し、0RFIの内には、2か所の矢
印のATGから翻訳開始されるタンパク質がコードされ
ている可能性がある。図4に示す0RF2に於ては2か
所の矢印ATGから翻訳開始されるタンパク質がコード
されている可能性がある。図6に示す0RF4に於ては
矢印のATGか・らタンパク質がコードされている。
FIG. 3 shows 0RF1, and there is a possibility that 0RF1 encodes a protein whose translation is initiated from the ATG indicated by two arrows. 0RF2 shown in FIG. 4 may encode a protein whose translation is initiated from the two arrows ATG. In 0RF4 shown in FIG. 6, a protein is encoded from ATG indicated by an arrow.

図7に示す0RF5に於ては、矢印ATGから合成が開
始するタンパク質をコードしている可能性がある。図8
に示ず0RF6に於ては、矢印ATGから合成が開始す
るタンパク質をコードしている可能性がある。
0RF5 shown in FIG. 7 may encode a protein whose synthesis starts from the arrow ATG. Figure 8
0RF6, which is not shown, may encode a protein whose synthesis starts from the arrow ATG.

図9に示す0RF7に於ては、矢印ATGから合成が開
始するタンパク質をコードしている可能性がある。図1
0に示す0RF8に於ては、矢印ATGから合成が開始
するタンパク質をコードしている可能性がある。
0RF7 shown in FIG. 9 may encode a protein whose synthesis starts from the arrow ATG. Figure 1
0RF8 shown at 0 may encode a protein whose synthesis starts from the arrow ATG.

図11に示す0RF9に於ては、矢印ATGから合成が
開始するタンパク質をヒートしている可能性がある。
In 0RF9 shown in FIG. 11, there is a possibility that the protein whose synthesis starts from the arrow ATG is heated.

本発明の二本鎖化DNA−a及び−bは、それぞれ単独
又は組合せて植物遺伝子組み換え用のベクターとして使
用することができる。またDNA−a又は−bはその特
定の制限部位を制限酵素で開裂させ線状のDNAとする
ことが出来る。このDNAを同じ制限酵素で切り出した
第三のDNAとほぼ同じモル割合で混合し、従来公知の
方法でDNA結合酵素(例えばT4−DNAリガーゼ)
により結合させ■a又はIbの特定部位に第三のDNA
が入った環状のDNAとすることが出来る。
The double-stranded DNAs-a and -b of the present invention can be used alone or in combination as a vector for plant genetic recombination. Further, DNA-a or -b can be cleaved at a specific restriction site with a restriction enzyme to form linear DNA. This DNA is mixed with a third DNA cut out using the same restriction enzyme at approximately the same molar ratio, and a DNA binding enzyme (e.g. T4-DNA ligase) is added using a conventionally known method.
③ A third DNA is attached to a specific site of a or Ib by
It can be a circular DNA containing.

ここで第三のDNAとは従来の植物に新しい形質をもち
らし得る遺伝子をコードしたDNA断片を主たるものと
する。かかるものとして例えば、抗生物質抵抗遺伝子例
えばカナマイシン耐性遺伝子、ネオマイシン耐性遺伝子
、メソトレキセート耐性遺伝子など、除草剤耐性遺伝子
(グリホセート耐性遺伝子、アトラジン耐性遺伝子、ス
ルフロン耐性遺伝子、パラコート耐性遺伝子など)、成
る種の貯蔵タンパク質遺伝子(例えばファゼオリン、グ
リシニン、ゼインなどをコードした遺伝子)などが挙げ
られる。またこれらの二つ以上を組み合わせたものは、
形質転換した植物体を選び出すのにより効果的になり得
るので、第三のDNAとして好ましい。かかる第三のD
NAを本発明のDNAに挿入する際、その挿入部位に制
限は受けないが、前述の0RF1〜9のタンパク質コー
ド域を利用して挿入することは好ましいことである。
Here, the third DNA mainly refers to DNA fragments encoding genes that can impart new traits to conventional plants. These include, for example, antibiotic resistance genes such as kanamycin resistance genes, neomycin resistance genes, methotrexate resistance genes, herbicide resistance genes (glyphosate resistance genes, atrazine resistance genes, sulfuron resistance genes, paraquat resistance genes, etc.); Examples include protein genes (eg, genes encoding phaseolin, glycinin, zein, etc.). Also, a combination of two or more of these
It is preferred as the third DNA because it can be more effective in selecting transformed plants. Such third D
When inserting NA into the DNA of the present invention, there are no restrictions on the insertion site, but it is preferable to insert using the protein coding region of 0RF1-9 described above.

1つのORFの中のタンパク質合成開始コドンATG以
下終止コドンまでを取り除き、そこへATG以下終止コ
ドンまで含む第三のDNAを同一方向に導入結合さける
ことは、本発明のDNAの有する[)NA複、製能力を
有効に利用でき、第三のDNAがコードしでいるタンパ
ク質の働きを充分に発現させる為に好ましいことである
Removing the protein synthesis start codon ATG and ending with the stop codon in one ORF, and introducing therein a third DNA containing ATG and ending with the stop codon in the same direction, avoids the [)NA duplication of the DNA of the present invention. This is preferable because the production capacity can be used effectively and the function of the protein encoded by the third DNA can be fully expressed.

第三のDNAに抗生物質(例えばカナマイシンやネオマ
イシン)に対して耐性を与える遺伝子がコードされてい
る場合、DNA−a又は−bに対してこの第三のDNA
を組み込んだDNAを用いることによって、植物細胞を
形質転換させその抗生物質(例えばカナマイシンやネオ
マイシン)耐性の細胞とすることが出来る。
If the third DNA encodes a gene that confers resistance to antibiotics (e.g. kanamycin or neomycin), this third DNA is
By using DNA into which a plant has been incorporated, plant cells can be transformed into cells resistant to the antibiotic (for example, kanamycin or neomycin).

第三のDNAに除草剤(例えばグリホセート)耐性の遺
伝子がコードされている場合、DNA−a又は−bにこ
の耐性遺伝子を組み込んだDNAを用いることにより植
物細胞を形質転換させその除草剤(例えばグリホセート
)耐性の細胞とすることが出来る。
If the third DNA encodes a gene resistant to a herbicide (e.g. glyphosate), plant cells are transformed by using DNA in which this resistance gene has been incorporated into DNA-a or -b, and the herbicide (e.g. glyphosate) resistant cells.

この場合の形質転換の方法としては、例えばプロトプラ
スト化された植物細胞にCa ” ” 、ポリエチレン
グリコールの存在下又はCa+“の存在下高pH状態で
上記DNAを作用させる方法、更に植物細胞の中へ上記
DNAを機械的に導入する方法(マイクロインジェクシ
ョン)などがある。
In this case, the transformation method includes, for example, a method in which the above-mentioned DNA is applied to a protoplast-formed plant cell in the presence of Ca, polyethylene glycol, or Ca+ in a high pH state, and further into the plant cell. There is a method of mechanically introducing the above-mentioned DNA (microinjection).

また、本発明の二本鎖化DNA−a又は−bを、好まし
くは成る1箇所で切断し得る酵素、例えばHind m
、 Cfa I、 B 0JITI、 Xll1nI又
はEC0RVにて分解し、これを同一制限酵素で開裂し
た下記の如き他の生物用ベクターに組み込むことが出来
る。この場合の他の生物用ベクターとしては、従来公知
のもの例えば大腸菌用のプラスミドベクター(例えばp
BR322,pBR325,pBR328,pMB9.
1)KO2,など)コスミッドベクター(例えば11K
 Y 2662など)、ファージベクター(例えばシャ
ロン1など)、枯草菌用のプラスミドベクター(例えば
l)U B 110. pU B 112. l)S 
A 0501゜pvp4.  p TA1060.  
pTA1020. p C194゜pC221,l)0
223など〉、酵母菌用のベクター(例えばYRp7.
 YEp13.Y Ip32. pYCL。
Further, an enzyme capable of cleaving the double-stranded DNA-a or -b of the present invention preferably at one site, such as Hind m
, CfaI, B0JITI, Xll1nI, or EC0RV, and can be inserted into other biological vectors cleaved with the same restriction enzymes as shown below. In this case, other biological vectors include conventionally known vectors, such as plasmid vectors for E. coli (e.g. p
BR322, pBR325, pBR328, pMB9.
1) KO2, etc.) cosmid vectors (e.g. 11K
Y 2662, etc.), phage vectors (e.g. Sharon 1, etc.), plasmid vectors for Bacillus subtilis (e.g. l) U B 110. pU B 112. l)S
A 0501゜pvp4. pTA1060.
pTA1020. pC194゜pC221,l)0
223 etc.), yeast vectors (e.g. YRp7.
YEp13. Y Ip32. pYCL.

pYC2など)などを使用することが出来る。pYC2, etc.) can be used.

これら他の生物用ベクターとのハイブリッドDNAのU
A製の方法は、二本鎖化されたDNA−aとDNA−b
との混合物を例えばHindlI[にて完全に分解して
おき、これを他の生物用ベクター例えば大腸菌用プラス
ミド1IBR322のHindI[[分解物と混合し、
DNA結合酵素(例えばT4−DNAリガーゼ)にて結
合環化させることによりDNA−aと1)BR322と
のハイブリッドDNAを得ることが出来る。
U of hybrid DNA with these other biological vectors
A method uses double-stranded DNA-a and DNA-b.
Completely digest the mixture with, for example, HindlI, and mix this with the digested product of Hindl[[ of other biological vectors, such as plasmid 1IBR322 for E. coli.
A hybrid DNA of DNA-a and 1) BR322 can be obtained by cyclization using a DNA-binding enzyme (for example, T4-DNA ligase).

また同様に、二本鎖化されたDNA−aとDNA−bと
の混合物をCJaIで完全分解しておき、これを1)B
R322のCjaI分解物と混合し、DNA結合酵素に
て結合環化させることによりDNA−bと1)BR32
2とのハイブリッドDNAを得ることが出来る。
Similarly, a mixture of double-stranded DNA-a and DNA-b was completely decomposed with CJaI, and then 1) B
DNA-b and 1) BR32 by mixing with a CjaI-digested product of R322 and cyclizing it with a DNA binding enzyme.
Hybrid DNA with 2 can be obtained.

これらハイブリッドDNAを得る際、結合させたい2つ
のDNAはほぼ等モルの割合で混合しておいた方が、よ
り効率よく目的のハイブリッドDNAを得ることが出来
る。また他の生物用ベクターは制限酵素で開裂された後
に、アルカリホスファターゼ処理を行ないDNAの5′
末端の脱リン酸反応を行なっておくことは、ハイブリッ
ドDNAを調製する際に、他の生物用ベクターのみで自
己環化することを大部分防止できるので好ましいことで
ある。
When obtaining these hybrid DNAs, the desired hybrid DNAs can be obtained more efficiently if the two DNAs to be combined are mixed in approximately equimolar proportions. Other biological vectors are cleaved with restriction enzymes and then treated with alkaline phosphatase to cleave the 5' DNA.
It is preferable to perform a terminal dephosphorylation reaction in preparing a hybrid DNA, since it is possible to largely prevent self-circularization using only vectors for other organisms.

かくして得られたハイブリッドDNAもまた図1又は図
2のDNAと同様に、少くとも部分的に二本鎖化された
ものであり植物遺伝子組み換え用ベクターとして使用す
ることができる。
The hybrid DNA thus obtained is also at least partially double-stranded, like the DNA shown in FIG. 1 or 2, and can be used as a vector for plant genetic recombination.

このハイブリッドDNAは元の伯の生物用ベクターの宿
主、例えば大腸菌用ベクターとのハイブリッドDNAの
場合は大腸菌へ、また枯草菌用ベクターとのハイブリッ
ドDNAの場合は枯草菌へ、ざらにWfE菌用ベクター
とのハイブリッドDNAの場合は酵母菌へ、公知の方法
に従って例えば大腸菌や枯草菌の場合は公知の方法によ
り、コンピテントセルとなし形質転換し、酵母菌の場合
はザイモリエス処理してスフェロプラストとなして形質
転換し、適当な薬剤耐性又は栄養要求性を使って形質転
換体を選び出すか又はコロニーハイブリダイゼーション
等を行って選び出すことが出来る。
This hybrid DNA is transferred to the host of the original biological vector, for example, to E. coli in the case of a hybrid DNA with a vector for E. coli, to Bacillus subtilis in the case of a hybrid DNA with a vector for Bacillus subtilis, and to a vector for WfE bacteria. In the case of hybrid DNA with E. coli or Bacillus subtilis, it is transformed into competent cells according to known methods, and in the case of yeast, it is treated with Zymolyses to form spheroplasts. Transformants can be selected by using appropriate drug resistance or auxotrophy, or by performing colony hybridization or the like.

この方法の一興体例について更に詳しく説明すると例え
ばハイブリッドDNAが図1のHindl[Iの分解物
(図2のDNAの場合はCfaI分解物)と大腸菌プラ
スミドのDBR322のHindl[[分解物(DNA
−bの場合は(JaI分解物)とをT4−DNAリガー
ゼで結合したハイブリッドDNAである、場合、このハ
イブリッドDNAをマンデルとヒガの方法[J、 Mo
1. Biol、53159  (1970)参照]に
より大腸菌HB 101を形質転換しアンピシリン50
μg/mf1を含有する寒天(L−Agar )プレー
トの上に生じたコロニーに対し、グルンシュタインとホ
グネスの方法[P rOc、N atl、  Acad
、  Sci、 723961 ]によりコロニーハイ
ブリダイゼーションを行ない(この際、32p −ラベ
ルしたBGMVのDNAをプローブとして使用する)、
32pラベル化したBGMvのDNAとハイブリダイズ
するDNAを持つコロニーを選び出す。この様にして図
1(又は2)のDNAとプラスミド1)BR322とが
Hindl[I(2の場合C1a丁)の個所で結合した
ハイブリッドDNAにより形質転換した大腸菌HB 1
01を得ることが出来る。
To explain in more detail one example of this method, for example, hybrid DNA is a mixture of the Hindl[I digested product of Figure 1 (CfaI digested product in the case of the DNA in Figure 2) and the Hindl[[digested DNA
In the case of -b, it is a hybrid DNA obtained by ligating (JaI digested product) with T4-DNA ligase.
1. Biol, 53159 (1970)] and ampicillin 50
Colonies generated on agar (L-Agar) plates containing μg/mf1 were analyzed using the method of Grunstein and Hogness [PrOc, Natl, Acad
, Sci, 723961] (in this case, 32p-labeled BGMV DNA is used as a probe),
Colonies having DNA that hybridizes with 32p-labeled BGMv DNA are selected. In this way, Escherichia coli HB 1 was transformed with the hybrid DNA in which the DNA of FIG.
01 can be obtained.

かくして得られた形質転換体から公知の方法によってハ
イブリッドDNAを分離することが出来る。分離された
ハイブリッドDNAは全体に亘って完全に二本鎖化され
ており、前述の様に第三のDNAを組み込み植物細胞を
形質転換することが出来、また大腸菌などの内でも増殖
することが可能である。
Hybrid DNA can be isolated from the transformant thus obtained by a known method. The separated hybrid DNA is completely double-stranded throughout, and as mentioned above, it can be transformed into plant cells by incorporating a third DNA, and can also be grown in E. coli etc. It is possible.

目的とするハイブリッドDNAを大口に調製するために
ハイブリッドDNAを含有する菌株を増殖させ、必要に
応じてハイブリッドDNAのみを増幅させる操作を行な
い菌体を溶菌させ、ハイブリッドDNAを含有する水溶
液からDNAを分離すればよい。ハイブリッドDNAが
例えば大腸菌用のプラスミドI)BR322とのハイブ
リッドDNAである場合には該ハイブリッドDNAを含
む大腸菌形質転換体から例えばマニアナイスらの実験l
lMo1ecular  C1onina−A  La
boratoryManual J  [Co1d S
pring l−1arbor L aborator
y(1982) ]第88〜94頁記載の方法によって
ハイブリッドDNAの増幅及び各溶菌法を使ってDNA
を得、セシウムクロライドの平衡密度勾配法を用いコバ
レントリークローズドサーキュラー(以下、”ccc”
と略す)型のハイブリッドDNAのみを分離することが
可能となる。
In order to prepare a large quantity of the desired hybrid DNA, a bacterial strain containing the hybrid DNA is grown, and if necessary, an operation is performed to amplify only the hybrid DNA to lyse the bacterial cells, and the DNA is extracted from the aqueous solution containing the hybrid DNA. Just separate it. When the hybrid DNA is, for example, a hybrid DNA with plasmid I) BR322 for Escherichia coli, the E. coli transformant containing the hybrid DNA is extracted from the E. coli transformant, for example, according to the experiment of Maninais et al.
lMo1ecular C1onina-A La
boratoryManual J [Co1d S
pring l-1arbor Laborator
y (1982)], pages 88 to 94, and amplification of the hybrid DNA using each lysis method.
The covalently closed circular (hereinafter referred to as "ccc")
It becomes possible to separate only hybrid DNA of the type (abbreviated as ).

また、この様にして分離されたハイブリッドDNAをク
ローニングに使用したものと同じ制限酵素で分解するこ
とにより図1(又は2)のDNA断片とベクターDNA
断片とに分けることが出来る。好ましくは図1(又は2
)のDNA断片を分離し、次に74−DNAリガーゼな
どを用いて結合環化する。図1(又は2)のDNA断片
のみを分離するには一般にアガロースゲル電気泳動を行
ない図1(又は2)にDNA断片のバンド部分のゲルを
切り取り上記アニアテイスらの実験車の第164〜17
2頁記載の種々の方法に従って、ゲルよりDNA断片を
分離し精製することが出来る。かくして分離させたDN
A断片は知られた方法により、例えばT4−DNAリガ
ーゼを用いて結合環化し、この際図1(又は2)のDN
Aが1個のみで自己環化したもののほかに2個以上が結
合環化したのが一部形成される。この1個のみが自己環
化したものがアガロースゲル電気泳動にて見掛は上3.
3K bpのバンドとなる。このバンド部分のゲルから
前述と同様DNAを抽出精製することが出来る。このD
NAは環全体に亘って完全に二本鎖化されており植物遺
伝子組み換え用ベクターとして有用である。
In addition, by decomposing the hybrid DNA isolated in this way with the same restriction enzyme used for cloning, the DNA fragment shown in Figure 1 (or 2) and vector DNA can be obtained.
It can be divided into fragments. Preferably Figure 1 (or 2
) is separated and then ligated and circularized using 74-DNA ligase or the like. To separate only the DNA fragments shown in Figure 1 (or 2), agarose gel electrophoresis is generally performed, and the band portions of the DNA fragments shown in Figure 1 (or 2) are cut out from the gel and Nos. 164 to 17 of the experimental vehicle of Aniatides et al.
DNA fragments can be separated and purified from the gel according to various methods described on page 2. The DN thus separated
The A fragment is ligated and circularized by known methods, e.g. using T4-DNA ligase, with the DNA of FIG. 1 (or 2)
In addition to those in which only one A is self-cyclized, some are formed in which two or more A are bonded and cyclized. Only one of these self-cyclized molecules appeared on agarose gel electrophoresis as above 3.
It becomes a 3K bp band. DNA can be extracted and purified from this banded gel in the same manner as described above. This D
NA is completely double-stranded throughout the ring and is useful as a vector for plant genetic recombination.

クローニングで得たDNAは、しばしばdamメチラー
ゼ遺伝子を持った大腸菌内で複製させると特定の塩基配
列例えばGATCのアデニンの6位のNがメチル化され
、特定の制限酵素による分解を受けなくすることが出来
る。本発明のDNA−aは、かかるメチル化を受けてな
い場合は、C!a■で2箇所切断されるが、メチル化を
受けると、その1箇所はGATCGATCなる塩基配列
の為にCfaIによる切断を受けなくなる。かかる事実
は、本発明のDNA−aを植物ベクターとして、C!a
■部位で組み換えDNAを作る場合に有利に利用できる
When DNA obtained through cloning is often replicated in E. coli that has the dam methylase gene, certain base sequences, such as the N at position 6 of adenine in GATC, are methylated to prevent it from being degraded by specific restriction enzymes. I can do it. When the DNA-a of the present invention is not subjected to such methylation, C! It is cleaved at two places by a■, but when it is methylated, one of the places is not cleaved by CfaI because of the base sequence GATCGATC. This fact indicates that when the DNA-a of the present invention is used as a plant vector, C! a
■It can be advantageously used when producing recombinant DNA at the site.

またクローニングで得たDNAもウィルスから直接取り
出したDNAと同様にウィルスとして同じ感染性を有し
ている。
Furthermore, DNA obtained by cloning has the same infectivity as a virus, as does DNA directly extracted from a virus.

本発明ニ於て、DNA−a及びDNA−bの塩基配列は
、いわゆるM aXam  G i Ibert法[M
 eth。
In the present invention, the base sequences of DNA-a and DNA-b are determined by the so-called MaXam Gi Ibert method [M
eth.

ds in E naymology 65499〜5
60 (1980) ]及びDNA断片を、J 、 M
essingらが開発したM 137アージベクターに
てクローニゲし[J、 Messinget al、 
Nucl、Ac1ds  Res、、 9309−32
1(1981) ] 、 F、 5anaerらが開発
したいわゆるdideoxy法[F、 5anaer 
at at、  J、 Mol。
ds in E naymology 65499-5
60 (1980)] and DNA fragments, J.M.
Cloning was performed using the M137 vector developed by Messing et al. [J, Messing et al.
Nucl, Ac1ds Res, 9309-32
1 (1981)], the so-called dideoxy method developed by F. 5anaer et al. [F. 5anaer et al.
at at, J, Mol.

Biol、、 143161−178  (1980)
 ]により、決定を行なったものである。
Biol, 143161-178 (1980)
], the decision was made.

DNA−aの塩基配列が本発明の図1であり、DNA−
bの塩基配列が図2である。尚図11図2に於て、二本
鎖の上段は左側の5′−末端から3′−末端方向への配
列を示し下段には上段に対し相補的な配列が左側の3′
−末端より5′−末端方向の配列を示している。更に図
1に於て上段の左側の塩基の5′末端のTは、3′末端
の第2585番目の塩基Tとリン酸基を介して夫々5′
−23′−結合して環状DNAを形成している。また同
時に下段の左側の塩基の3′末端のAは、下段の5′末
端の第2585番目塩基Aとリン酸基を介して3’−,
5’ −結合して環状DNAを形成している。図2に於
ても、同様に上段の左側の塩基の5′末端の王は3′末
端の第2647番目の塩基Gと結合して環状DNAを形
成している。同時に下段の左側の塩基の3′末端Aは5
′末端の第2647番目の塩基Cとリン酸基を介して結
合して環状DNAを形成している。つまり、DNA−a
及び−bはそれぞれ環状のDNAである。
The base sequence of DNA-a is shown in Figure 1 of the present invention, and DNA-a
The base sequence of b is shown in Figure 2. In Figure 11 and Figure 2, the upper row of the duplex shows the sequence from the 5'-end on the left to the 3'-end, and the lower row shows the sequence complementary to the upper row from the 3'-end on the left.
The sequence is shown in the direction from the -end to the 5'-end. Furthermore, in Figure 1, the T at the 5' end of the base on the left side of the upper row is connected to the 2585th base T at the 3' end via the phosphate group, respectively.
-23'-linked to form circular DNA. At the same time, A at the 3' end of the base on the left side of the lower row is 3'-,
5'-linked to form circular DNA. In FIG. 2, similarly, the 5'-terminus of the bases on the left side of the upper row is combined with the 2647th base G at the 3'-terminus to form a circular DNA. At the same time, the 3' end A of the base on the left in the bottom row is 5
It is bonded to the 2647th base C at the 'terminus via a phosphate group to form a circular DNA. In other words, DNA-a
and -b are each circular DNAs.

以下実施例を掲げて本発明を詳述するが本発明はこれに
限定を受けるものではない。
The present invention will be described in detail below with reference to Examples, but the present invention is not limited thereto.

a  シスの   1 BGMV感染したトップクロップ葉57grを250t
ulノ0.1M ’) ン酸ナトリウムー1On+ME
DTAバッファ  (pi−1=  7.8)  (シ
スチェイン1.3gr含右)中にて磨砕し二重ガーゼで
濾過し、濾液を10000(:、 −40分間4℃にて
遠心し205dの上清を得た。この上清に食塩2.4S
J、次いでポリエチレングリコール(ly1w7800
〜9000)  8.2grを加え4℃で1時間撹拌後
、10000Gで25分間4℃にて遠心した。上清を除
き沈澱したポリエチレングリコールペレット部に、1M
リン酸ナトリウムバッファー (pl−1=  7.8
) 10−を加え均一化し、これを10000G 30
分間、4℃にて遠心し、上清取り出し、この上清をベッ
クマン社製超遠心機S W2O,1o −ターを用いて
3万rpm 4時間4℃にて遠心し粗ウィルスを沈澱と
して得た。この粗ウィルスを0,5dの0.1Mリン酸
ナトリウムバッファー(pH=7.8)に均一化した後
、10−40%の連続シヨ糖茫度勾配遠心(上記同様の
5W40.10−ターを使用し3.2万rpm 3時間
4℃)を行い、遠心後遠心チューブの底部より0.6d
づつ分画分取した。各両分の吸光度A260を測定しフ
ラクションNα9〜16にウィルスのピークが見られ、
この画分を集め2倍量の0.1Mリン酸ナトリウムバッ
ファー(pH= 7.8)を加え均一化して、5w40
.10−ターにて3.5万rpm 3時間4℃で再度ウ
ィルスのペレットを得、これを0.5IR1の0,1M
リン酸ナトリウムバッファー(1lH= 7.8)に均
一化し再び10−40%シヨ糖連続密度勾配遠心(2,
9万l’pm 3時間4’C3w40.10−ター)し
、遠心チューブの底部より0.6dづつ分画分取した。
250t of 57gr of BGMV-infected top crop leaves of a.cis.
ulno0.1M') Sodium chloride-1On+ME
Grind in DTA buffer (pi-1 = 7.8) (contains 1.3gr of cischain), filter through double gauze, centrifuge the filtrate at 10,000 (:, -40 minutes at 4°C), and A supernatant was obtained. To this supernatant, 2.4S of salt was added.
J, then polyethylene glycol (ly1w7800
~9000) was added and stirred at 4°C for 1 hour, followed by centrifugation at 10000G for 25 minutes at 4°C. Remove the supernatant and add 1M to the precipitated polyethylene glycol pellet.
Sodium phosphate buffer (pl-1=7.8
) Add 10- to make it uniform, and make this 10000G 30
The supernatant was centrifuged at 4°C for 4 minutes, the supernatant was removed, and the supernatant was centrifuged at 4°C for 4 hours at 30,000 rpm using a Beckman ultracentrifuge SW2O, 1O-ter to obtain the crude virus as a precipitate. . This crude virus was homogenized in 0.5 d of 0.1 M sodium phosphate buffer (pH = 7.8), and then subjected to continuous 10-40% sucrose gradient centrifugation (same 5W 40.10-ter as above). After centrifugation, centrifuge the tube for 0.6 d from the bottom of the centrifuge tube.
Fractions were collected one by one. The absorbance A260 of each fraction was measured, and a virus peak was observed in fractions Nα9 to 16.
These fractions were collected and homogenized by adding twice the amount of 0.1M sodium phosphate buffer (pH = 7.8), and the 5w40
.. A virus pellet was obtained again at 4°C for 3 hours at 35,000 rpm in a 10-meter machine, and this was added to 0.1M of 0.5IR1.
Homogenize in sodium phosphate buffer (1lH = 7.8) and repeat 10-40% sucrose continuous density gradient centrifugation (2,
The mixture was heated at 90,000 l'pm for 3 hours (4'C3w40.10-ter), and 0.6d fractions were collected from the bottom of the centrifuge tube.

フラクションNO,13〜18にウィルスピークのみが
得られ、この両分を集め、2倍量の0.1Mリン酸ナト
リウムバッファー(pH= 7.8)を加え均−化後3
.6万rpa+ 3時間半4℃3w40,10−ターに
てウィルスを沈澱させ精製BGMVを得た。
Only virus peaks were obtained in fractions No. 13 to 18, and both fractions were collected and equalized by adding twice the amount of 0.1M sodium phosphate buffer (pH = 7.8).
.. The virus was precipitated at 60,000 rpm for 3 and a half hours at 4° C. at 3w40,10°C to obtain purified BGMV.

b イシス  −   NA −−の  ・上記精製B
GMVに750μ旦の滅菌水、15μ旦のI M Fr
1s H(J (pi−17,6) 、75μ隻の10
%ドデシル硫酸す1〜リウム(SDS)7.5μ文のプ
ロテネースK(1μg/μρ液)を加え2分間室温で振
盪し次いで10 mMTris HCf (DH7,6
> −1mM E D T A水溶液で飽和したフェノ
ール700μ文を加え3分間振盪し、エツベンドルフ小
型遠心機にて5分間遠心し水層を取り出した。この水層
に同様のフェノール抽出操作をさらに2回行い最終的に
水層950μ隻を得、次に水層に対しクロロホルム70
0μ文を加え2分間振盪後、水層を取り出しこの水層に
エーテル700μ文を加えフェノールの抽出を行う。こ
の抽出操作を3回行った。
b Isis-NA-- ・Above purification B
GMV with 750 μm of sterile water, 15 μm of I M Fr
1s H(J (pi-17,6), 10 of 75μ ship
% sodium dodecyl sulfate (SDS) and 7.5 µm of proteinase K (1 µg/µρ solution), shaken at room temperature for 2 minutes, and then mixed with 10 mM Tris HCf (DH7,6
>-700μ of phenol saturated with 1mM EDTA aqueous solution was added, shaken for 3 minutes, centrifuged for 5 minutes in an Etzbendorf small centrifuge, and the aqueous layer was taken out. This aqueous layer was subjected to the same phenol extraction procedure twice more to obtain a final aqueous layer of 950 μm, and then the aqueous layer was extracted with 70 μm of chloroform.
After adding 0 µm of water and shaking for 2 minutes, the aqueous layer was taken out and 700 µm of ether was added to this aqueous layer to extract phenol. This extraction operation was performed three times.

得られた水層1000μρに100μすの3M酢酸ナト
リウムバッファー(+)84.8)及びエタノール2.
5111i!を加え一20℃−昼夜保持し、ベックマン
長遠心機、5w50.10−ターにて3,5万rpm2
0分間遠心しDNAを沈澱として得た。このDNAを1
0mMTris HCj O,1mMEDTA水溶液e
ooμuに溶解しBGMV−重鎖DNA0.5μg/μ
旦水溶液とした。
Add 100μ of 3M sodium acetate buffer (+) 84.8) and ethanol to 1000μρ of the resulting aqueous layer.
5111i! and kept at 20°C day and night, and centrifuged at 350,000 rpm in a Beckman long centrifuge, 5w50.10-tar.
Centrifugation was performed for 0 minutes to obtain DNA as a precipitate. This DNA 1
0mM Tris HCj O, 1mM EDTA aqueous solution e
0.5 μg/μ of BGMV-heavy chain DNA dissolved in ooμu
It was made into an aqueous solution.

Ic BGMV一本11DNAのin vitro二 
 鎖化;BGMV−重鎖DNA(0,5μg/μ文)2
μUに滅菌水155μJ1.1MTris HCj (
pH=8.0) 30μ旦、下記の方法により調製され
た6牛胸腺DNAオリゴヌクレオチド(16,6μg/
μm)12μ文を混合し70℃3分間保持し次いで0℃
に急冷後、0℃の状態に保持しながら、8011MM!
IICj230μm、o、smMデオキシアデノシン三
リン酸、0.8mMデオキシグアノシン三リン酸及び0
.8111Mデオキシチミジン三リン酸のそれぞれを3
0μ文、0.8111Mデオキシシチジン三リンRすμ
文及びデオキシシチジン5′−[α−32p]三リン酸
(アマシャジャパン社製的3oooc; /11m+0
1.10iCi/ateコ一ド番号pB 10205)
  2.4μす及びAMV逆転写酵素(生化学工業コー
ド120248.5ユニツト/μ旦)2μ旦加え20℃
10分間次いで37℃1時間半反応させた後、フェノー
ル50μ旦を加え振盪後エツベンドルフ遠心機にて5分
間遠心し、水層をゲル濾過した。ゲル濾過は101MT
ris HCj (1)H7,4) −0,IMNa 
Cf水溶液で予め平衡化したS ephadex Q 
−75(ファルマシアファインケミカルス社製〉を径6
層の管に5Id充填したカラムを通して行った。反応液
を乗せた後4滴(約100μ文)づつ分取し、夫々の両
分の321)強度を測定した。画分Nα5〜12に最初
のピークが現われ、Nα15以後に未反応のα−32p
−デオキシシチヂン三リン酸によるピークが認められた
。画分N(15〜12を集め60μ文の3MNa C1
,1,8mfl、のエタノールを加え−20℃3時間保
持し25000rpn+20分間(ヘツクマン超遠心t
aSW50.10−ター)、遠心し上清を除き、新たに
一20℃冷却した70%エタノール水溶液2Idを加え
2万rpm 2分間遠心し上清を除いた。沈澱DNAを
20#l#lHg1.5分間減圧乾燥した。得られたD
NAを1  iMTris HCIに溶解し、in V
itrOで二本鎖化したDNAを得る。
Ic BGMV 11 DNA in vitro 2
Chaining; BGMV-heavy chain DNA (0.5 μg/μ sentence) 2
Add 155 μJ of sterile water to μU, 1.1M Tris HCj (
pH = 8.0) At 30 μl, 6 bovine thymus DNA oligonucleotides (16.6 μg/
μm) Mix 12 μm and hold at 70℃ for 3 minutes, then 0℃
After rapidly cooling to 8011MM while keeping it at 0℃!
IICj 230μm, o, smM deoxyadenosine triphosphate, 0.8mM deoxyguanosine triphosphate and 0
.. 3 each of 8111M deoxythymidine triphosphate
0μ sentence, 0.8111M deoxycytidine triphosphorus μ
and deoxycytidine 5'-[α-32p]triphosphate (manufactured by Amasya Japan Co., Ltd. 3oooc; /11m+0
1.10iCi/ate code number pB 10205)
Add 2.4 μm and 2 μm of AMV reverse transcriptase (Seikagaku code 120248.5 units/μ day) at 20°C.
After reacting for 10 minutes at 37° C. for 1.5 hours, 50 μl of phenol was added, shaken, and centrifuged for 5 minutes in an Etzbendorf centrifuge, and the aqueous layer was gel-filtered. Gel filtration is 101MT
ris HCj (1)H7,4) -0,IMNa
Sephadex Q pre-equilibrated with Cf aqueous solution
-75 (manufactured by Pharmacia Fine Chemicals) with a diameter of 6
The layer tube was passed through a column packed with 5Id. After applying the reaction solution, 4 drops (approximately 100 μm) were taken out and the intensity of both portions was measured. The first peak appears in fraction Nα5-12, and unreacted α-32p appears after Nα15.
-A peak due to deoxycytidine triphosphate was observed. Fraction N (collect 15-12 and add 60μ of 3M Na C1
, 1.8 mfl of ethanol was added, kept at -20°C for 3 hours, and then heated at 25,000 rpm for 20 minutes (Hetsuman ultracentrifugation t
aSW50.10-ter), centrifuged and removed the supernatant, added a fresh 70% ethanol aqueous solution 2Id cooled to -20°C, centrifuged at 20,000 rpm for 2 minutes, and removed the supernatant. The precipitated DNA was dried under reduced pressure at 20 #1 #1 Hg for 1.5 minutes. Obtained D
NA was dissolved in 1 iMTris HCI and in V
Obtain double-stranded DNA with itrO.

(32pの強度は46x 10’ cpsであった)生
駒 DNAオリゴヌクレオチドの調製1牛胸腺D N 
A 66I115Fを0.IMNa C110mMM。
(The intensity of 32p was 46x 10' cps) Preparation of Ikoma DNA Oligonucleotides 1 Bovine Thymus DN
A 66I115F 0. IMNa C110mMM.

C12,10+aMTris HCf (pH7,4)
  6.6dに溶解し、DNaseI[ミリボア・コー
ポレーション社製(2182ユニツト/グ)]460μ
グを加え37℃3時間インキコベートし0.2M E 
D T A O,66mを加え反応を停止させた。この
反応液に対し7dの水飽和フェノールにてタンパク質抽
出を3回行い次いで水層からフェノールを除去するため
にエーテル7メによる抽出を3回行った。得られた水層
にエタノール20−を加え一20℃2時間放置後400
0Gで4分間遠心しDNAペレットを得た。このDNA
ペレットを0.5dの0.IM N a CI 10m
MTris H(J (pH7,4)に溶解し、0.I
MNaCjlolMTris HCf (1)l−17
,4)で予め平衡化したS epl+adex G −
75(ファルマシア社製)(カラム長42cttr、カ
ラム径0.5cIR)によりゲル濾過を行い約1.2d
づつ分取した。Nα10〜32番のクラクションに大き
なピークが見られ、Nα16〜26の画分を集め(全發
12.5ad! )エタノール311tlを加えて一2
0℃30分間放置後遠心(4000G 8分)して得ら
れるDNAペレットを11dの蒸留水に溶解したちのく
DNA11度16.6119/d)をブライマーDNA
とした。
C12,10+aMTris HCf (pH7,4)
DNase I [manufactured by Millibore Corporation (2182 units/g)] 460μ
0.2 M E
DTA O, 66m was added to stop the reaction. This reaction solution was subjected to protein extraction three times with 7d water-saturated phenol, and then extracted three times with 7d ether to remove phenol from the aqueous layer. Add 20% of ethanol to the resulting aqueous layer and leave at 20°C for 2 hours.
Centrifugation was performed at 0G for 4 minutes to obtain a DNA pellet. this DNA
Pellet was 0.5d. IM Na CI 10m
Dissolved in MTris H(J (pH 7,4), 0.I
MNaCjlolMTris HCf (1)l-17
, 4) pre-equilibrated S epl+adex G −
75 (manufactured by Pharmacia) (column length 42 cttr, column diameter 0.5 cIR) for approximately 1.2 d.
Aliquots were taken one by one. A large peak was seen in the horns of Nα 10 to 32, and the fractions of Nα 16 to 26 were collected (12.5 ad!).
After standing at 0°C for 30 minutes, centrifuge (4000G, 8 minutes) and dissolve the resulting DNA pellet in 11d of distilled water.
And so.

比較例1 修生胸腺DNAオリゴヌクレオチド[16,6μり/μ
旦)を12μρの変わりに 1.5μU使用する外は1
Cの実験と全く同様の条件で二本鎖化実験を行ったとこ
ろ高分子DNAの部分に32pのカウントは8 x 1
0’ cpmであった1Cの場合と比べ115以下の二
本鎖化しか起ていないことがわかる。
Comparative Example 1 Renovating thymus DNA oligonucleotide [16.6μ/μ
1) except when using 1.5μU instead of 12μρ
When a double-stranded experiment was conducted under exactly the same conditions as experiment C, the count of 32p in the polymeric DNA part was 8 x 1.
It can be seen that only 115 or less double strands have occurred compared to the case of 1C which was 0' cpm.

比較例2 プライマーをジエイ・エム・テエイラーらのBioch
imica et  Biophysica Acta
  422325(1976)の方法で調製した修生胸
腺DNAからのプライマーミクスチャ−(DNA1度5
μg/μ文)40p文を、1C実験のオリゴヌクレオチ
ド(16,6μg/μ塁)12μ旦の変わりに使用し、
滅菌水155μすの変わりに127μす使用し外はすべ
て1C実験と全く同様にして二本鎖化を行った。
Comparative Example 2 The primer was Bioch by G.M. Theiler et al.
imica et Biophysica Acta
Primer mixture (DNA 1 degree 5
μg/μ base) 40p protein was used in place of the oligonucleotide (16,6 μg/μ base) 12μ base in the 1C experiment,
Double stranding was carried out in the same manner as in the 1C experiment except that 127 μl of sterile water was used instead of 155 μl.

高分子DNA部分の32pの強度は15x 10’ c
pm t’あった。本比較例2で得られた二本鎖化DN
Aを侵述の1dの実験と全く同様の条件で制限酵素C2
a I  Hind I[I、 Sa uIなどで分解
し、以下1dの実験と全く同様にオートラジオグマフィ
ーまで行ったところHindII[分解したものはDN
Aがアガロースゲルのスロット位置から全く動いていな
かった。またその他の制限酵素で分解したものも、一部
はスロット位置に止まっており、ゲルの内を泳動したD
NAもかなりスミアとなって1dの場合程キレイなバン
ドではなかった。
The strength of 32p in the polymeric DNA part is 15x 10' c
There was pm t'. Double-stranded DN obtained in Comparative Example 2
Restriction enzyme C2 was added under exactly the same conditions as in the experiment 1d using A.
a I Hind I [I, Sa u I, etc., and autoradiography was carried out in exactly the same way as in experiment 1d below, and Hind II [the decomposed product was DN
A did not move at all from its slot position in the agarose gel. In addition, some of the substances digested with other restriction enzymes remained in the slot position, and D
The NA was also quite smeared and the band was not as clean as in the case of 1d.

lcで得た32pラベルした二本鎖DNA(32p強度
46X10’ Clam / 100μ旦)3μす(3
2p強度7300cpm )に対し4μ文の制限酵素分
解用バッファ −[100mMTris HCf (p
H7,9) 、 70 mMMgs2C12、70mM
β−メルカプトエタノール、0.1%牛血清アルブミン
を基本液として、CfaI分解ではこの基本液を制限酵
素分解用バッフアート呼び、Aval 、 Hind 
m、 B(l 磨■、 KpnI。
3μ of 32p-labeled double-stranded DNA (32p strength 46 x 10' Clam / 100μ) obtained by lc (3μ
2p strength 7300cpm) and 4μ restriction enzyme digestion buffer - [100mM Tris HCf (p
H7,9), 70mM Mgs2C12, 70mM
β-mercaptoethanol and 0.1% bovine serum albumin are used as the basic solution. In CfaI digestion, this basic solution is called buffer art for restriction enzyme digestion, Aval, Hind.
m, B(l ma■, KpnI.

PstI、 xln工分解では上の基本液に更ニNaC
1が500 Ill Mとなるまで添加された液を制限
酵素分解用バッファーと呼びまたSa ul、Ncol
、ECOR■分解では基本液に更にNaC1が1500
111Mとなる様に添加された液を制限酵素分解バッフ
ァーと呼ぶ。]4μ塁4μ留水32μ旦及び制限酵素A
vat  (21ニツト/μn) 、Bgin (6ユ
ニツト/、C1り 、X1nI (6ユニツト/μJl
>Nco工(3,5ユニツト/μJl)、EcoRV 
(4,51ニット/u1. Hind m (5ユニツ
ト/μN)、5aUI(6−Lニット/1lfl> 、
Cfa I (5ユニツト/μ交)[の制限酵素のうち
CjaIEOORVはべ一すンガーマンハイム社製AV
aIはベセスダ・リサーヂラボラトリー社製、NC0T
、XmnIはニューイングランドバイオラプス社製それ
以外は宝酒造■製である。コ4ユニットを添加し37℃
4時間以上DNAの分解を行った。
In PstI, xln decomposition, further NaC is added to the above base solution.
The solution in which 1 is added until it reaches 500 IllM is called the restriction enzyme digestion buffer.
, in ECOR■ decomposition, 1500 NaCl is added to the base solution.
The solution added to give a concentration of 111M is called a restriction enzyme digestion buffer. ] 4 μ base, 4 μ distilled water, 32 μ μ base, and restriction enzyme A
vat (21 nits/μn), Bgin (6 units/, C1, X1nI (6 units/μJl)
>Nco engineering (3,5 units/μJl), EcoRV
(4,51 nits/u1. Hind m (5 units/μN), 5aUI (6-L nits/1lfl>,
Among the restriction enzymes of Cfa I (5 units/μ cross), CjaIEOORV is based on AV manufactured by Berger Mannheim.
aI is manufactured by Bethesda Research Laboratory, Inc., NC0T
, XmnI are manufactured by New England Biolapse Co., and the others are manufactured by Takara Shuzo ■. Add 4 units of water at 37°C.
DNA degradation was performed for more than 4 hours.

なお二種の制限酵素で分解する場合は、まず低塩濃度用
酵素を添加し、その酵素に適した塩濃度にて、37℃4
時間加水分解し、次により高塩濃度用酵素に適した塩濃
度に調製し、高塩濃度用酵素を添加して、更に37℃4
時間加水分解した。加水分解後8μ文の0.25%ブロ
モフェノールブルー50%グリセロール10%SDSの
溶液を加え、65℃5分間熱処理を行い、次に1.5%
アガロースゲル電気泳動を行った。アガロースはシグマ
社のタイプ■電気泳動用を使用した。電気泳動バッファ
ーとしては40 mM l”リスアセテート、2n+M
EDTA (1)H8,0)水溶液を用いた。厚さ5r
Hの水平ゲルにて1.5V/cI11の電圧にて11〜
15時間電気泳動を行った。この電気泳動の際、DNA
断片のサイズマーカーとしてλ−DNA0.5μ3をE
 COR■及びHindll[で完全分解したもの及び
pBR322D N A 002u gをTaqIで完
全分解したものを使用した。電気泳動終了後、アガロー
スゲルを取り出し、ゲル乾燥板にてアガロースゲルを乾
燥後本文記載のマニアテイスらの実験用のp470〜4
72記載の要領にてオートラジオグラフィーを実施した
。その結果分解され各種制限酵素により観察されたDN
A断片のサイズを記すと表1の様になった。
When decomposing with two types of restriction enzymes, first add a low-salt concentration enzyme, and then incubate at 37°C at a salt concentration suitable for the enzyme.
Hydrolyze for a few hours, then adjust the salt concentration to be suitable for the enzyme for high salt concentration, add the enzyme for high salt concentration, and further
Hydrolyzed for hours. After hydrolysis, 8μ of a solution of 0.25% bromophenol blue 50% glycerol 10% SDS was added, heat treated at 65°C for 5 minutes, and then 1.5%
Agarose gel electrophoresis was performed. The agarose used was Sigma's type ■ for electrophoresis. Electrophoresis buffer: 40 mM l”lis acetate, 2n+M
An EDTA (1)H8,0) aqueous solution was used. Thickness 5r
11 ~ at a voltage of 1.5 V/cI11 in a horizontal gel of H
Electrophoresis was performed for 15 hours. During this electrophoresis, DNA
E
Completely digested with COR and Hindll and pBR322D N A 002ug completely digested with TaqI were used. After electrophoresis, take out the agarose gel, dry it on a gel drying plate, and use p470-4 for the experiment by Maniathes et al. described in the text.
Autoradiography was performed as described in 72. As a result, DN was degraded and observed using various restriction enzymes.
Table 1 shows the sizes of the A fragments.

尚、オートラジオグラフィー後、観察されたDNA断片
は、その断片の大きさに比べ濃く出る断片群をAグルー
プに、また断片の大きさに比べ淡く出る断片群を8グル
ープに分類することができる。
Furthermore, the DNA fragments observed after autoradiography can be classified into Group A, which is a group of fragments that appear more densely compared to the size of the fragment, and groups of 8, which are a group of fragments that appear faintly compared to the size of the fragment. .

また、括弧内の3.3は、DNAがオーブンサークル(
0,C,)の状態で、線状のDNAサイズマーカーに対
し見掛は上の分子量が3.3K bpである如く示して
いる。この表よりA群の断片を生ずるD N A 43
制限酵素分解する前はオープンサークル(0,C,)状
で大きさが約2.58 Kbpと考えられる。同様にB
群の断片を生ずるDNAは制限酵素分解する前はO20
状で大きさが2.65 Kbt)と記載される。
Also, 3.3 in parentheses indicates that DNA is an oven circle (
0,C,), the apparent molecular weight of the linear DNA size marker is 3.3K bp. From this table, DNA 43 that produces fragments of group A
Before being digested with restriction enzymes, it is thought to be in the shape of an open circle (0, C,) and approximately 2.58 Kbp in size. Similarly B
The DNA that produces the group fragments is O20 before being digested with restriction enzymes.
It is described as having a size of 2.65 Kbt).

次に各種制限酵素単独による分類、及び二種の組み合せ
による分解、これらの分解パターンを分析することによ
り、各種制限酵素切断点の相対位置関係が決定され、A
群のDNA断片を生ずる無傷のDNAについての制限酵
素切断地図として図3が得られ、B群のDNAについて
無傷DNAについての制限酵素切断地図として図4が得
られた。
Next, by classifying each restriction enzyme alone and degrading it by a combination of the two types, and analyzing these decomposition patterns, the relative positional relationships of the various restriction enzyme cleavage points were determined, and A
Figure 3 was obtained as a restriction enzyme cleavage map for the intact DNA that gave rise to DNA fragments of group B, and Figure 4 was obtained as a restriction enzyme cleavage map for the intact DNA for the DNA of group B.

表1 1eニー   N の)lindI[I    と− 
゛実施例1cで得られた二本鎖化DNA100μ旦溶液
うち50pMを、予め10 mMTris HCf (
pH7,4) 、100 m MNa CR水溶液で平
衡化した3i。
Table 1 1e knee N) lindI [I and -
50 pM of the 100μ solution of the double-stranded DNA obtained in Example 1c was added in advance to 10 mM Tris HCf (
3i equilibrated with 100 m M Na CR aqueous solution (pH 7.4).

gel p30を径6 mrtr、長さ30 cmに充
填したカラムにて、ゲル濾過を行った。溶出液として1
0mMTris H(J (・H7,4) 、100m
MNa C1水溶液を使い、4滴(約400αU>づつ
分取した。第11〜21画分に32pの高いカウントの
ピークが見られ、分画液の光学密度0D260を測定し
たら第28画分からODの値が増加し始め以後の両分で
は大きな値を示した。二本鎖化DNAの部分である第1
7〜21画分を集め(2,1m> 、これに3M酢酸ナ
トリウム水溶液(1)84.8>  200μ旦及びエ
タノール4aeを加え一20℃2時間保持後ベックマン
超遠心1asw50.10−ターにて30000rpm
30分間遠心した。上清を捨て、新たに一20℃75%
エタノール5dを加え20000rpm2分間遠心し、
再び上清を捨てDNAベレットを得た。2#1lll−
1c12分間真空乾燥後、このDNAペレットを蒸溜水
50μすに溶解しこのDNA溶液50μ旦に対し、前記
制限酵素)−1indl1分解用バッファー(実施例1
c記述)6μ旦及び制限酵素HindI[[3μ文を加
え37℃4時間反応させた。次に10tl!lの酵母t
 RNA (2μ9/μm)溶液及び蒸留水70μ旦を
加え、更に水飽和フェノール100μ文を加え振盪後遠
心して水層のみを取り出し、この水層からエーテル抽出
3回によりフェノールを取り除いた。
Gel filtration was performed using a column filled with gel p30 with a diameter of 6 mrtr and a length of 30 cm. 1 as eluent
0mM Tris H(J (・H7,4), 100m
Using MNa C1 aqueous solution, 4 drops (approximately 400 αU> each) were fractionated. A high count peak of 32p was seen in the 11th to 21st fractions, and when the optical density 0D260 of the fractionated liquid was measured, the OD was found in the 28th fraction. The value started to increase and showed large values in both parts.
Collect fractions 7 to 21 (2.1m>), add 3M sodium acetate aqueous solution (1) 84.8>200μ and 4ae of ethanol, hold at 20°C for 2 hours, and then perform Beckman ultracentrifugation in a 1ASW50.10-tar. 30000rpm
Centrifuged for 30 minutes. Discard the supernatant and reheat to 75% at 20°C.
Add 5 d of ethanol and centrifuge at 20,000 rpm for 2 minutes.
The supernatant was discarded again to obtain a DNA pellet. 2#1llll-
After vacuum drying for 12 minutes, this DNA pellet was dissolved in 50μ of distilled water, and 50μ of this DNA solution was added with the restriction enzyme)-1indl1 digestion buffer (Example 1).
Description) 6 μl and restriction enzyme HindI were added and reacted at 37° C. for 4 hours. Next 10tl! l yeast t
An RNA (2 μ9/μm) solution and 70 μm of distilled water were added, and 100 μl of water-saturated phenol was added, followed by shaking and centrifugation to remove only the aqueous layer. From this aqueous layer, phenol was removed by extraction with ether three times.

3Mの酢酸す1−リウム(1))]= 4.8> 10
μす及びエタノール350μ文加え一20℃4時間放置
後高速遠心し得られたDNAベレットを乾燥後17μ磨
の蒸溜水に溶解した。
3M sodium acetate (1)] = 4.8 > 10
After adding 350 µm of water and ethanol and leaving it for 4 hours at -20°C, it was centrifuged at high speed. The resulting DNA pellet was dried and dissolved in 17 µm of distilled water.

このDNA17μ旦溶液に対し下記に示”J−pBR3
22のHindll[/アルカリボス入アターゼ処理(
DNA1μg/μ、Q)液1μρ及びDNA結合酵素用
バッフ 7−[650m MTriS HCj (pH
=7.4) 、65 IIIMMg CI2.10 m
MDTT、 4  mMA T P 、 40 mM 
 3 permidine水溶液12μ文及びT4  
DNAリガーゼ(宝酒造社製コード噛2010B  1
,2コニツ1−/μfi)0.5μ文を加え14℃22
時間反応させ、次に65℃5分間処理を行いハイブリッ
ドDNAを得る。
For this DNA 17 μm solution, the following “J-pBR3
22 Hindll [/atase treatment with alkali boss (
DNA 1μg/μ, Q) solution 1μρ and DNA-binding enzyme buffer 7-[650m MTriS HCj (pH
=7.4), 65 IIIMMg CI2.10 m
MDTT, 4mM ATP, 40mM
3 Permidine aqueous solution 12μ and T4
DNA ligase (Code Kami 2010B 1 manufactured by Takara Shuzo Co., Ltd.
, 2 pieces 1-/μfi) add 0.5μ and 14℃22
The mixture is reacted for a period of time, and then treated at 65° C. for 5 minutes to obtain hybrid DNA.

次にこのハイブリッドDNAを用いて大腸菌H3101
のコンピテントセルを形質転換する。
Next, using this hybrid DNA, E. coli H3101
Transform competent cells.

ラスミドpBR322DNA50μ9を含む340μ隻
水溶液に前記HindIII制限酵素用バッファー40
μ磨及びI−(indl[[20μ文を加え37℃10
時間反応後1 MTris HCj (1)H8,0>
を44μl加え、バクテリアアルカラインホスファター
ゼ(RAP)(W orthington社製 0.4
ユニツト/μU)10μ文加え65℃7時間処理した。
Add 40 μl of the above HindIII restriction enzyme buffer to a 340 μl aqueous solution containing 50 μ9 of lasmid pBR322 DNA.
μ polish and add I-(indl [[20μ
After reaction time 1 MTris HCj (1) H8,0>
Add 44 μl of bacterial alkaline phosphatase (RAP) (0.4
10 μm (unit/μU) was added and treated at 65° C. for 7 hours.

この反応によりDNAの5′末端が脱リン酸化される。This reaction dephosphorylates the 5' end of DNA.

この反応液に対し水飽和フェノール400μ旦にて除タ
ンパクを行った。次いでフェノール/クロロホルム(4
/1容槓比)混合液400μpで2回、更に除タンパン
を行い、最後に600μ磨のエーテルにて3回水溶液か
らフェノール成分抽出を行った。
This reaction solution was subjected to protein removal using 400 µm of water-saturated phenol. Then phenol/chloroform (4
/1 volume ratio) The mixed solution was further removed with 400 μp twice to remove tampan, and finally the phenol component was extracted from the aqueous solution three times with 600 μp of ether.

水層350μ旦に3M酢酸ナトリウム30μ文、エタノ
ール1100μ旦を加え一20℃2時間放置後高速遠心
し、得られたDNApelletを乾燥後50μ旦の蒸
留水に溶解した。これを1)BR322のl−1ind
ll/アルカリホスファターゼ処理(DN/’Mlμg
/μ文)液とする。
To 350 μm of the aqueous layer, 30 μm of 3M sodium acetate and 1100 μm of ethanol were added, and after standing at -20° C. for 2 hours, it was centrifuged at high speed. The resulting DNA pellet was dried and dissolved in 50 μm of distilled water. 1) BR322 l-1ind
ll/alkaline phosphatase treatment (DN/'Mlμg
/μ sentence) liquid.

大腸菌1−lB107のシングルコロニーを培養液L−
broth 5  mlに移し37℃11時間振盪培養
した。
A single colony of E. coli 1-lB107 was grown in culture medium L-
The mixture was transferred to 5 ml of broth and cultured with shaking at 37°C for 11 hours.

この2 meを新しイL −broth200dに接種
し、37℃2時間20分振盪培養し0D600が0.4
0となった時点で、培養液を0℃に冷11 L、、トミ
ーの冷却高速延伸機Nα90−ターにて5000rpm
 5分間遠心した。上清は捨て、沈澱した大腸菌を50
ηの101MNacj水に均質に分散させ、再び高速遠
心(Nα40−ター500Orpm 5分間し菌を沈澱
させこの菌ペレットに60戒の301MCaCf水を加
え全体を均質化O℃で20分間保持した。
This 2me was inoculated into fresh L-broth 200d and cultured with shaking at 37°C for 2 hours and 20 minutes until the 0D600 was 0.4.
When the temperature reached 0, the culture solution was cooled to 0°C for 11 L, and 5000 rpm using Tomy's cooling high-speed stretching machine Nα90-tar.
Centrifuged for 5 minutes. Discard the supernatant and remove the precipitated E. coli
The bacteria were homogeneously dispersed in 101 M Nacj water of η and centrifuged again at high speed (Nα 40-tar, 500 Orpm for 5 minutes) to precipitate the bacteria. To this bacterial pellet, 60 M CaCf water was added and the whole was homogenized and kept at 0°C for 20 minutes.

再び高速遠心(Na 40−ター、4000rpm 5
分間)上清を捨て菌ベレットに10rd、の30 m〜
ICaCfz、15%グリセ1」−ル水溶液を加え緩や
かに全体を均質化し、200μ旦づつ 1.5mlのエ
ツペンドルフチューブに文注し、−80℃に凍結保持す
る。このCaC92処理した大腸菌1−IBlolを(
゛コンビプントセル°”と呼び)形質転換した。形質転
換はこのコンビプントセルを0℃に戻し、T4DNAリ
ガーゼにて結合反応を行ったハイブリットDNA水溶液
を加え、O℃40分間保持し、次いで42℃2分聞加温
した。次に1−broth 1.5 dを加え37℃1
時間保持し、この培養液をアンピシリン50μ9/d含
有する1−agarプレート(直径9α)8枚に1枚当
り約200μpづつ撒き拡げた。37℃16時間保持し
41ケの形質転換したl−lB101のコロニーをf!
?た。この41ケのコロニーから前記マニアテイスらの
実験1 p328記載の3oiling  Lysis
法によりプラスミドDNAのミニ調製を行い、次にプラ
スミドDNAを)lindl1分解した。その結果2.
58 Kbp、  1.f33 Kbp、  1.02
 Kbl)を含むプラスミドを得た。2.58 Kbp
断片と1)BR322とのハイブリッドDNAをpBG
Hlo、  pBGHloのDNAG、t pBR32
2の宿主大腸菌の内で?!2製増殖したものでSIヌク
レアーゼを作用させても全く変化を受けずDNA全体に
亘って完全に二本鎖化していた。
High-speed centrifugation again (Na 40-ter, 4000 rpm 5
10 minutes) Discard the supernatant and place it in a pellet pellet for 30 m
Add ICaCfz and a 15% aqueous glycerinol solution to gently homogenize the whole, dispense 200μ aliquots into 1.5ml Eppendorf tubes, and keep frozen at -80°C. This CaC92-treated E. coli 1-IBlol (
Transformation was performed by returning the combipunto cells to 0°C, adding an aqueous hybrid DNA solution that had been subjected to a ligation reaction using T4 DNA ligase, holding at 0°C for 40 minutes, and then incubating the combipunto cells at 0°C for 40 minutes. It was heated for 2 minutes at 37°C. Next, 1.5 d of 1-broth was added and heated at 37°C.
After holding for a period of time, this culture solution was spread on eight 1-agar plates (diameter 9α) containing 50 μ9/d of ampicillin at a rate of about 200 μp per plate. After keeping at 37°C for 16 hours, 41 transformed l-lB101 colonies were transferred to f!
? Ta. From these 41 colonies, 3 oiling lysis described in Experiment 1 of Maniathes et al., p. 328 was obtained.
A mini-preparation of plasmid DNA was performed by the method, and then the plasmid DNA was digested with )lindl1. As a result 2.
58 Kbp, 1. f33 Kbp, 1.02
A plasmid containing Kbl) was obtained. 2.58 Kbp
The hybrid DNA of the fragment and 1) BR322 is transferred to pBG.
Hlo, pBGHlo DNAG, t pBR32
Within host E. coli of 2? ! Even when SI nuclease was applied to the DNA grown from the second product, there was no change at all, and the entire DNA was completely double-stranded.

Ieの実験に於て二本鎖化DNA及びpBR322をH
indI[分解するところをClaI分解するのに変え
て(分解の際塩濃度はCfat分解用の低濃度に変更)
Ieとほぼ同一の操作を行い、CIa1分解された二本
鎖化DNAの滅菌水17μ文及びpBR322のC1a
l/アルカリホスフアターゼ処理(DNAIμg/μ旦
)液1μ文及び前記DNA結合酵素用バッファー2μす
及びT4DNAリガーゼ0.5μ文を用いて14℃22
時間反応させ[eの実験と同様にしてハイブリッドDN
Aを得た。このハイブリッドDNAを用いて、leの実
験と同様にしてハイブリッドDNAを得た。このハイブ
リッドDNAを用いて、Ieと同様の操作より大腸菌H
B1oiコンビプントセルの形質転換を行い41りの形
質転換体を得た。この41ケのコロニーをIOの場合と
同様BoilingLysislG、:ヨリブラスミl
’ D N Aのミニ調製を行い、このプラスミドDN
AをClaI分解した。その結果2.65Kbp、  
1.33 Kbp、  1,25 Kbpの断片を含む
3種のハイブリッドプラスミドを得た。2.65 Kb
p断片を含むハイブリッドプラスミドDNAの1つを1
1B G C10,とした。tlB G C10は大腸
菌の内で複製増殖したものでStヌクレアーゼを作用さ
せても全く変化を受(プずDNA全体に亘って完全に二
本鎖化していた。
In the Ie experiment, double-stranded DNA and pBR322 were
indI [change the decomposition to ClaI decomposition (change the salt concentration during decomposition to a low concentration for Cfat decomposition)
Perform almost the same procedure as Ie, and add 17μ of sterile water of CIa1-digested double-stranded DNA and CIa of pBR322.
Using 1 μl of alkaline phosphatase treatment (DNAI μg/μ) solution, 2 μl of the DNA binding enzyme buffer, and 0.5 μl of T4 DNA ligase at 14°C 22
[Hybrid DN
I got an A. Using this hybrid DNA, hybrid DNA was obtained in the same manner as in the le experiment. Using this hybrid DNA, E. coli H
B1oi combipunto cells were transformed and 41 transformants were obtained. These 41 colonies are boiled as in the case of IO.
' Perform mini DNA preparation and use this plasmid DNA
A was digested with ClaI. As a result, 2.65Kbp,
Three hybrid plasmids containing fragments of 1.33 Kbp and 1.25 Kbp were obtained. 2.65 Kb
One of the hybrid plasmid DNAs containing the p fragment was
1B G C10. tlB G C10 was replicated in Escherichia coli and underwent no changes even when treated with St nuclease (the entire DNA was completely double-stranded).

ハイブリッドDNA  1lBGH10及びps G 
C10夫々20μ9を夫々HindII[20ユニツト
、CIa120ユニット使用し夫々の前記制限酵素用バ
ッファーにより塩濃度を設定し、total 400M
塁にて37℃10時間加水分解した。次に0.8%アガ
ロースゲル(スロット幅1.5111111.長さ6C
IIi、深さ7m、ゲル環13cm)を使用し1V/c
II+で10時間電気泳動後、2.58 Kbp、  
2.65 Kbpバンド部分のゲルを切り取り前記マニ
アナイスらの実験書p164〜5記載の方法でDNAを
ゲルより抽出し、次に同書p166の方法に従ってDN
Aを精製した。ともに滅菌水50μU (DNA約0.
1μg/μす)に溶解した。この線状の夫々のDNA水
溶液20μ文に夫々前記DNA連結酵素用バッファ−5
μ文、滅菌水25μ文。
Hybrid DNA 11BGH10 and ps G
Using 20 μ9 each of C10, 20 units of HindII, and 120 units of CIa, the salt concentration was set using the restriction enzyme buffer described above, and a total of 400 M
Hydrolysis was carried out at 37°C for 10 hours. Next, 0.8% agarose gel (slot width 1.5111111. length 6C)
IIi, depth 7m, gel ring 13cm) using 1V/c
After 10 hours of electrophoresis with II+, 2.58 Kbp,
Cut out the gel in the 2.65 Kbp band and extract DNA from the gel using the method described in the experimental book by Maniais et al., p. 164-5, and then extract the DNA according to the method described in p. 166 of the same book.
A was purified. 50 μU of sterile water (approximately 0.0 μU of DNA) for both.
1μg/μs). Add the DNA ligating enzyme buffer 5 to 20μ of each linear DNA aqueous solution.
μ-mon, sterile water 25 μ-mon.

T4−DNAリガーゼ0.5μ旦を加え12℃19時間
反応させた後、再び上と同様に0.8%アガロースゲル
電気泳動を行い、見掛は上の大ぎざ3.3K bpのD
NAバンド部分をゲルごと切り出し前述と同様の方法で
DNAのみを抽出精製した。このDNAは夫々環状の図
1のDNA及び図2のDNAになっていると考えられる
。次にこのDNA夫々に滅菌水10μ文を加え、その2
μ文に対し、夫々Hind m、 CIaIによる部分
分解を行った。部分分解は、DNAの2μ旦溶液に前記
制限酵素用バッファーを5μ磨、滅菌水43μす加え、
更に図1(7)DNAの方にはHindIIIを0,5
ユニツト、図2のDNAの方にはClaI  O,5ユ
ニット加え、37℃で5分、10分、30分反応させ夫
々の反応物を0.8%アガロースゲル電気泳動を行いサ
イズの変化を見た。5分、10分、30分と反応さぼる
に従い3.3Kbpのバンドが徐々に減少し図1のD 
N A及び図2のDNAの線状DNA 2.58 Kb
p、  2.65 Kbp。
After adding 0.5μ of T4-DNA ligase and reacting for 19 hours at 12°C, 0.8% agarose gel electrophoresis was performed again in the same manner as above.
The NA band portion was cut out along with the gel, and only the DNA was extracted and purified in the same manner as described above. It is thought that this DNA is circular as shown in FIG. 1 and as shown in FIG. 2, respectively. Next, add 10μ of sterile water to each of these DNAs, and
The μ sentence was partially decomposed using Hind m and CIaI, respectively. For partial decomposition, add 5μ of the restriction enzyme buffer to a 2μ solution of DNA, add 43μ of sterilized water,
Furthermore, 0.5 HindIII was added to the DNA in Figure 1 (7).
Add 5 units of ClaI O to the DNA shown in Figure 2, react at 37°C for 5 minutes, 10 minutes, and 30 minutes. Each reaction product was subjected to 0.8% agarose gel electrophoresis to observe changes in size. Ta. As the reaction slowed down for 5, 10, and 30 minutes, the 3.3 Kbp band gradually decreased, as shown in Fig. 1D.
Linear DNA of NA and Figure 2 DNA 2.58 Kb
p, 2.65 Kbp.

のバンドが増加し、それ以外のバンドは認められなかっ
た。このことから上のDNAはともに一晒体で環状とな
ったものであり夫々図11図2のDNAと考えられる。
bands increased, and no other bands were recognized. From this, it is thought that the above DNAs are both monolithic and circular, and are the DNAs shown in FIGS. 11 and 2, respectively.

IhクローニングDNAによる感染性;leで得たハイ
ブリッドDNA 1lBGH10(2,3μg/μρ)
50B文に211MMCl C1210μ麦、前記Hi
ndI[制限酵素用バッファー26μp。
Infectivity with Ih cloned DNA; hybrid DNA obtained with le 11BGH10 (2.3μg/μρ)
50B, 211MMCl C1210μ barley, Hi
ndI [restriction enzyme buffer 26 μp.

Hindn[8μu、滅菌水156μ、(を加え37℃
10時間処理し、更に65℃5分間処理後NaCl及び
クエン酸ナトリウムを夫々0.15 M、  0.01
5Mとなるまで添加し。この液をりO−ニングA−DN
A液とした。■rで得たハイブリッドDNA pBGC
10 (0,68μg/u fl ’)  200μi
に2mMM。
Add Hindn [8μu, sterile water 156μ, (37℃
After treatment for 10 hours and further treatment at 65°C for 5 minutes, NaCl and sodium citrate were added at 0.15 M and 0.01, respectively.
Add until it reaches 5M. Pour this liquid into O-ning A-DN.
It was made into liquid A. ■Hybrid DNA pBGC obtained with r
10 (0,68μg/u fl') 200μi
to 2mMM.

(J220μΩ、前記(JaI制限酵素用バッファー2
6μfl、 (Ja 1101i、Q、滅菌水4μすを
加え、37℃10時間処理し、更に65℃5分間処理俊
、Nacl及びクエン酸す1〜リウムを夫々0.15 
M、  0.015Mとなるまで添加した。この液をク
ローニングB−DNΔ液とした。クローニングA−DN
A液及びB−DNA液の夫々160μ旦を混合し、この
混合液を昼間状態で14時間30℃、夜間状態で10時
間27℃、湿度80%以上に設定したバイオトロン(小
糸製作所(株コントトロン)中で、発芽後6日月のトッ
プクロップインゲンの若葉の表面に、セライトとともに
滅菌手袋を使用しこすりつけ接種したく混合液30μ文
/1個体トップクロップインゲン)全部で10個体にに
接種した。バイオトロン内の条件は接種後も前記同様に
維持してトップクロップインゲン本葉にビーンゴールア
ンモザ・イタ病の発病を観察した。接種後10日日目ビ
ーンゴールモザイク病が10個体ともに顕著に認められ
た。
(J220 μΩ, the above (JaI restriction enzyme buffer 2
Add 6 μfl, (Ja 1101i, Q, 4 μl of sterilized water, treat at 37°C for 10 hours, and further treat at 65°C for 5 minutes.)
M, was added until it became 0.015M. This solution was designated as Cloning B-DNΔ solution. Cloning A-DN
160 µm of each of A solution and B-DNA solution were mixed, and this mixed solution was placed in a biotron (Koito Manufacturing Co., Ltd. Control Co., Ltd.) set at 30 °C for 14 hours during the day, 27 °C for 10 hours at night, and a humidity of 80% or higher. A total of 10 plants were inoculated by rubbing the mixture with Celite on the surface of young leaves of top-cropped kidney beans, 6 days after germination, using sterile gloves in Tron). . The conditions in the biotron were maintained as described above even after inoculation, and the onset of bean gall antrum mosa ita disease was observed on the true leaves of top-cropped kidney beans. On the 10th day after inoculation, bean gall mosaic disease was clearly observed in all 10 individuals.

尚コントロールとして、DNA液をl)B G +−1
10でなく  1)BR322約20μ9をト1ind
lI[分解した液、及びpB G C1Orなく  I
)BR322約20μ7をcpa■分解した液を用い′
c4個休に体種し同様の感染性テスl〜を行ったが、い
ずれの41171体ともモザイク病は生ぜす正常の生育
を示した。
As a control, the DNA solution was used as a control.
Instead of 10 1) BR322 approximately 20μ9 to 1ind
lI [digested solution and pB G C1 Or I
) Using a solution obtained by decomposing approximately 20 μ7 of BR322 to cpa
A similar infectivity test was carried out on 4 specimens, but all 41,171 specimens showed normal growth, although mosaic disease does not occur.

以上のことは図1 DNA、図2DNAが植物の遺伝子
組み換えに有用なことを示している。
The above shows that the DNA in Figure 1 and the DNA in Figure 2 are useful for genetic recombination of plants.

【図面の簡単な説明】[Brief explanation of drawings]

図1−(11〜(4+は本発明のDNA−aの塩基配列
を示す。 図1中矢印(1) A T G及び矢印(2) T’ 
G Aは0RF1の開始及び終止の]トンを示す。また
矢印(3)GTA及び矢印(/1)AATは0RF2の
開始及び終止のコドンを示す。 図2− (1)〜(4)は本発明のDNA−bの塩基配
列を示す。図2中、矢印(5)ATG及び矢印(61T
 A Aは0RF3の開始及び終止のコドンを示す。矢
印(刀GTA及び矢印(8)AATは0RF4の開始及
び終止のコドンを示す。矢印(9) G T A及び矢
印00)GATは0RF5の開始及び終止のコドンを示
ず。 矢印[It)ATG及び矢印02)TGAは0RF6の
開始及び終止のコドンを示す。矢印Gel G T A
及び矢印04)AATは0RF7の開始及び終lLのコ
ドンを示す。矢印(15] G T A及び矢印06)
AATは0RF8の開始及び終止のコドンを示す。矢印
07)GTA及び矢印□□□△ATは0RF9の開始及
び終止のコドンを示す。 図3は0RFIの塩基配列と夫々のコドンに対応したア
ミノ酸の配列を示ず。矢印のATG (MET)は複数
のタンパク質の合成開始点を示す。 図4〜11は夫々0RF2〜9の塩基配列及びそのコド
ンに対応したアミノ酸配列を示す。矢印のATG (M
ET)は夫々に於ける複数のタンパク質合成間始点を示
す。 第1図−(1) Lfflljl、lL+1Lal/AIaA目L;Li
UAljL; Itj rTGT^GTT^GATT^
TTCA13^TT^CTT第2回−(え)
Figure 1 - (11 to (4+) indicate the base sequence of DNA-a of the present invention. In Figure 1, arrows (1) A T G and arrow (2) T'
GA indicates the start and end of 0RF1. Further, arrow (3) GTA and arrow (/1) AAT indicate the start and stop codons of ORF2. Figure 2-(1) to (4) show the base sequence of DNA-b of the present invention. In FIG. 2, arrow (5) ATG and arrow (61T
AA indicates the start and stop codons of ORF3. Arrows (Katana GTA and arrow (8) AAT indicate the start and stop codons of 0RF4. Arrow (9) G T A and arrow 00) GAT do not indicate the start and stop codons of 0RF5. Arrows [It) ATG and arrows 02) TGA indicate the start and stop codons of ORF6. Arrow Gel G T A
and arrow 04) AAT indicates the start and end IL codons of ORF7. Arrow (15) G T A and arrow 06)
AAT indicates the start and stop codons of 0RF8. Arrow 07) GTA and arrow □□□△AT indicate the start and stop codons of ORF9. FIG. 3 does not show the base sequence of 0RFI and the amino acid sequence corresponding to each codon. The arrow ATG (MET) indicates the starting point for the synthesis of multiple proteins. 4 to 11 show the base sequences of 0RF2 to 0RF9 and the amino acid sequences corresponding to their codons, respectively. Arrow ATG (M
ET) indicates the starting point during multiple protein syntheses. Figure 1-(1) Lfflljl, 1L+1Lal/AIaA L;Li
UAljL; Itj rTGT^GTT^GATT^
TTCA13^TT^CTT 2nd - (e)

Claims (1)

【特許請求の範囲】 1、図1に示される塩基配列を有する環状の二本鎖DN
A。 2、他の生物用ベクターDNAを、第1項記載のDNA
に組み込んで得られるハイブリッドDNA。 3、他の生物用ベクターDNAが、大腸菌・酵母菌又は
枯草菌の菌体内で自己増殖可能なるDNAから選ばれた
、第2項記載のハイブリッドDNA。 4、図2に示される塩基配列を有する環状の二本鎖DN
A。 5、他の生物用ベクターDNAを、第4項記載のDNA
に組み込んで得られるハイブリッドDNA。 6、他の生物用ベクターDNAが、大腸菌・酵母菌又は
枯草菌の菌体内で自己増殖可能なるDNAから選ばれた
、第5項記載のハイブリッドDNA。
[Claims] 1. Circular double-stranded DNA having the base sequence shown in FIG. 1
A. 2. Add the vector DNA for other organisms to the DNA described in Section 1.
Hybrid DNA obtained by integrating into. 3. The hybrid DNA according to item 2, wherein the vector DNA for other organisms is selected from DNAs capable of self-replication within the cells of Escherichia coli, yeast, or Bacillus subtilis. 4. Circular double-stranded DNA having the base sequence shown in Figure 2
A. 5. Add the vector DNA for other organisms to the DNA described in Section 4.
Hybrid DNA obtained by integrating into. 6. The hybrid DNA according to item 5, wherein the vector DNA for other organisms is selected from DNAs capable of self-replication within the cells of Escherichia coli, yeast, or Bacillus subtilis.
JP9810885A 1985-05-10 1985-05-10 Novel dna and hybrid dna Pending JPS61257186A (en)

Priority Applications (1)

Application Number Priority Date Filing Date Title
JP9810885A JPS61257186A (en) 1985-05-10 1985-05-10 Novel dna and hybrid dna

Applications Claiming Priority (1)

Application Number Priority Date Filing Date Title
JP9810885A JPS61257186A (en) 1985-05-10 1985-05-10 Novel dna and hybrid dna

Publications (1)

Publication Number Publication Date
JPS61257186A true JPS61257186A (en) 1986-11-14

Family

ID=14211128

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
JP9810885A Pending JPS61257186A (en) 1985-05-10 1985-05-10 Novel dna and hybrid dna

Country Status (1)

Country Link
JP (1) JPS61257186A (en)

Cited By (3)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
JPS62175187A (en) * 1985-10-25 1987-07-31 モンサント コンパニ− Novel plant vector
JPS63126486A (en) * 1986-11-17 1988-05-30 Teijin Ltd Hybrid dna tandem containing dna fragment of gemini virus
US6080915A (en) * 1989-06-22 2000-06-27 Occidental Chemical Corporation Constructs encoding degradation enzymes for aromatic compounds and transgenic plants containing same

Citations (1)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
JPS6054684A (en) * 1983-09-05 1985-03-29 Teijin Ltd Novel dna and hybrid dna

Patent Citations (1)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
JPS6054684A (en) * 1983-09-05 1985-03-29 Teijin Ltd Novel dna and hybrid dna

Cited By (3)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
JPS62175187A (en) * 1985-10-25 1987-07-31 モンサント コンパニ− Novel plant vector
JPS63126486A (en) * 1986-11-17 1988-05-30 Teijin Ltd Hybrid dna tandem containing dna fragment of gemini virus
US6080915A (en) * 1989-06-22 2000-06-27 Occidental Chemical Corporation Constructs encoding degradation enzymes for aromatic compounds and transgenic plants containing same

Similar Documents

Publication Publication Date Title
CN107083392B (en) CRISPR/Cpf1 gene editing system and application thereof in mycobacteria
JPH0258916B2 (en)
JP6423338B2 (en) RNA-directed DNA cleavage by Cas9-crRNA complex
WO2017043656A1 (en) Method for converting genome sequence of gram-positive bacterium by specifically converting nucleic acid base of targeted dna sequence, and molecular complex used in same
US20160237451A1 (en) Conferring resistance to geminiviruses in plants using crispr/cas systems
JP6552969B2 (en) Library preparation method for directed evolution
JPH04346787A (en) Method for obtaining dnarecombinant vector, microorganism and dna, method for obtaining recombinant protein and recombinant protein
CA3228222A1 (en) Class ii, type v crispr systems
CN105602972B (en) Method based on CRISPR-Cas9 engineered ex vivo adenovirus vector
Lee et al. Small high-yielding binary Ti vectors pLSU with co-directional replicons for Agrobacterium tumefaciens-mediated transformation of higher plants
JPS61257186A (en) Novel dna and hybrid dna
Wassenegger Advantages and disadvantages of using PCR techniques to characterize transgenic plants
CN113166741A (en) Multiple deterministic assembly of DNA libraries
Sam et al. DESIGN AND TRANSFER OF OsSWEET14-EDITING T-DNA CONSTRUCT TO BAC THOM 7 RICE CULTIVAR.
JP7125727B1 (en) Compositions for modifying nucleic acid sequences and methods for modifying target sites in nucleic acid sequences
JPH0258915B2 (en)
Wassenegger Application of PCR to transgenic plants
JP2024509048A (en) CRISPR-related transposon system and its usage
JP2024509047A (en) CRISPR-related transposon system and its usage
JPS61202692A (en) Novel dna and hybrid dna
KR101925465B1 (en) Infectious clone of Croton yellow vein mosaic alpha-satellite DNA and uses thereof
JPH0549272B2 (en)
JPH0549271B2 (en)
Bose et al. A Brief Introduction to Recombinant DNA Technology
JP2514297B2 (en) BGMV DNA mixture