JPH11239494A - カスパ―ゼ活性化dnア―ゼ - Google Patents
カスパ―ゼ活性化dnア―ゼInfo
- Publication number
- JPH11239494A JPH11239494A JP10369093A JP36909398A JPH11239494A JP H11239494 A JPH11239494 A JP H11239494A JP 10369093 A JP10369093 A JP 10369093A JP 36909398 A JP36909398 A JP 36909398A JP H11239494 A JPH11239494 A JP H11239494A
- Authority
- JP
- Japan
- Prior art keywords
- cad
- protein
- leu
- caspase
- icad
- Prior art date
- Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
- Withdrawn
Links
- 102100038023 DNA fragmentation factor subunit beta Human genes 0.000 title description 170
- 108010042238 caspase-activated deoxyribonuclease Proteins 0.000 title description 170
- 108090000623 proteins and genes Proteins 0.000 claims abstract description 102
- 102000004169 proteins and genes Human genes 0.000 claims abstract description 74
- 230000000694 effects Effects 0.000 claims abstract description 70
- 108010053770 Deoxyribonucleases Proteins 0.000 claims abstract description 41
- 102000016911 Deoxyribonucleases Human genes 0.000 claims abstract description 41
- 239000013598 vector Substances 0.000 claims abstract description 28
- 125000003275 alpha amino acid group Chemical group 0.000 claims abstract description 17
- 102000011727 Caspases Human genes 0.000 claims abstract description 16
- 108010076667 Caspases Proteins 0.000 claims abstract description 16
- 150000001413 amino acids Chemical class 0.000 claims abstract description 13
- 108020004414 DNA Proteins 0.000 claims description 56
- 239000013604 expression vector Substances 0.000 claims description 9
- FWMNVWWHGCHHJJ-SKKKGAJSSA-N 4-amino-1-[(2r)-6-amino-2-[[(2r)-2-[[(2r)-2-[[(2r)-2-amino-3-phenylpropanoyl]amino]-3-phenylpropanoyl]amino]-4-methylpentanoyl]amino]hexanoyl]piperidine-4-carboxylic acid Chemical compound C([C@H](C(=O)N[C@H](CC(C)C)C(=O)N[C@H](CCCCN)C(=O)N1CCC(N)(CC1)C(O)=O)NC(=O)[C@H](N)CC=1C=CC=CC=1)C1=CC=CC=C1 FWMNVWWHGCHHJJ-SKKKGAJSSA-N 0.000 claims description 7
- 108091028043 Nucleic acid sequence Proteins 0.000 claims description 4
- 230000000295 complement effect Effects 0.000 claims description 4
- 210000004027 cell Anatomy 0.000 abstract description 81
- 239000002299 complementary DNA Substances 0.000 abstract description 33
- 230000006907 apoptotic process Effects 0.000 abstract description 28
- 239000000523 sample Substances 0.000 abstract description 24
- 102100034581 Dihydroorotase Human genes 0.000 abstract description 8
- 102000004190 Enzymes Human genes 0.000 abstract description 8
- 108090000790 Enzymes Proteins 0.000 abstract description 8
- 230000030833 cell death Effects 0.000 abstract description 7
- 239000003153 chemical reaction reagent Substances 0.000 abstract description 5
- 206010042971 T-cell lymphoma Diseases 0.000 abstract description 3
- 208000027585 T-cell non-Hodgkin lymphoma Diseases 0.000 abstract description 3
- 101150019620 CAD gene Proteins 0.000 abstract description 2
- 238000003780 insertion Methods 0.000 abstract description 2
- 230000037431 insertion Effects 0.000 abstract description 2
- 238000012216 screening Methods 0.000 abstract description 2
- 108700031361 Brachyury Proteins 0.000 abstract 1
- 230000007812 deficiency Effects 0.000 abstract 1
- 238000006467 substitution reaction Methods 0.000 abstract 1
- 235000018102 proteins Nutrition 0.000 description 68
- 102100038026 DNA fragmentation factor subunit alpha Human genes 0.000 description 67
- 101710182628 DNA fragmentation factor subunit alpha Proteins 0.000 description 65
- 108090000397 Caspase 3 Proteins 0.000 description 59
- 102000003952 Caspase 3 Human genes 0.000 description 59
- 239000000872 buffer Substances 0.000 description 31
- 210000004940 nucleus Anatomy 0.000 description 31
- 239000000284 extract Substances 0.000 description 22
- 101001032338 Mus musculus Cis-aconitate decarboxylase Proteins 0.000 description 20
- 101000950959 Mus musculus DNA fragmentation factor subunit beta Proteins 0.000 description 20
- 230000015556 catabolic process Effects 0.000 description 20
- 238000006731 degradation reaction Methods 0.000 description 20
- 239000013612 plasmid Substances 0.000 description 18
- FAPWRFPIFSIZLT-UHFFFAOYSA-M sodium chloride Inorganic materials [Na+].[Cl-] FAPWRFPIFSIZLT-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 18
- 238000000034 method Methods 0.000 description 17
- 241000699666 Mus <mouse, genus> Species 0.000 description 16
- 230000014509 gene expression Effects 0.000 description 16
- RWSXRVCMGQZWBV-WDSKDSINSA-N glutathione Chemical compound OC(=O)[C@@H](N)CCC(=O)N[C@@H](CS)C(=O)NCC(O)=O RWSXRVCMGQZWBV-WDSKDSINSA-N 0.000 description 14
- 108090000765 processed proteins & peptides Proteins 0.000 description 14
- 239000011324 bead Substances 0.000 description 12
- 238000000746 purification Methods 0.000 description 12
- 108090000190 Thrombin Proteins 0.000 description 11
- 235000001014 amino acid Nutrition 0.000 description 11
- 230000001640 apoptogenic effect Effects 0.000 description 11
- 239000011780 sodium chloride Substances 0.000 description 11
- 229960004072 thrombin Drugs 0.000 description 11
- PEDCQBHIVMGVHV-UHFFFAOYSA-N Glycerine Chemical compound OCC(O)CO PEDCQBHIVMGVHV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 10
- 239000013611 chromosomal DNA Substances 0.000 description 10
- 238000013518 transcription Methods 0.000 description 10
- 230000035897 transcription Effects 0.000 description 10
- 238000013519 translation Methods 0.000 description 10
- 101150064015 FAS gene Proteins 0.000 description 9
- 210000004671 cell-free system Anatomy 0.000 description 9
- 238000011534 incubation Methods 0.000 description 9
- 101710134681 40 kDa protein Proteins 0.000 description 8
- 238000003556 assay Methods 0.000 description 8
- 108091000126 Dihydroorotase Proteins 0.000 description 7
- 241000588724 Escherichia coli Species 0.000 description 7
- 108010024636 Glutathione Proteins 0.000 description 7
- 102000005720 Glutathione transferase Human genes 0.000 description 7
- 108010070675 Glutathione transferase Proteins 0.000 description 7
- 108010077850 Nuclear Localization Signals Proteins 0.000 description 7
- 230000004913 activation Effects 0.000 description 7
- BFNBIHQBYMNNAN-UHFFFAOYSA-N ammonium sulfate Chemical compound N.N.OS(O)(=O)=O BFNBIHQBYMNNAN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 7
- 229910052921 ammonium sulfate Inorganic materials 0.000 description 7
- 239000000499 gel Substances 0.000 description 7
- 229960003180 glutathione Drugs 0.000 description 7
- 238000009396 hybridization Methods 0.000 description 7
- 108020004999 messenger RNA Proteins 0.000 description 7
- 239000002243 precursor Substances 0.000 description 7
- 239000013615 primer Substances 0.000 description 7
- 239000000047 product Substances 0.000 description 7
- 239000011541 reaction mixture Substances 0.000 description 7
- 210000001519 tissue Anatomy 0.000 description 7
- YBAFDPFAUTYYRW-UHFFFAOYSA-N N-L-alpha-glutamyl-L-leucine Natural products CC(C)CC(C(O)=O)NC(=O)C(N)CCC(O)=O YBAFDPFAUTYYRW-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 6
- 238000012300 Sequence Analysis Methods 0.000 description 6
- 235000011130 ammonium sulphate Nutrition 0.000 description 6
- 108010002077 caspase-activated DNase inhibitor Proteins 0.000 description 6
- 238000001962 electrophoresis Methods 0.000 description 6
- 230000006870 function Effects 0.000 description 6
- 238000000338 in vitro Methods 0.000 description 6
- 239000012528 membrane Substances 0.000 description 6
- 108091032973 (ribonucleotides)n+m Proteins 0.000 description 5
- 208000002109 Argyria Diseases 0.000 description 5
- 108091003079 Bovine Serum Albumin Proteins 0.000 description 5
- 108091026890 Coding region Proteins 0.000 description 5
- 108091034117 Oligonucleotide Proteins 0.000 description 5
- 102000035195 Peptidases Human genes 0.000 description 5
- 108091005804 Peptidases Proteins 0.000 description 5
- 239000004365 Protease Substances 0.000 description 5
- 229940098773 bovine serum albumin Drugs 0.000 description 5
- 210000000805 cytoplasm Anatomy 0.000 description 5
- 230000001086 cytosolic effect Effects 0.000 description 5
- 238000010828 elution Methods 0.000 description 5
- 229940088598 enzyme Drugs 0.000 description 5
- 239000013613 expression plasmid Substances 0.000 description 5
- 238000013467 fragmentation Methods 0.000 description 5
- 238000006062 fragmentation reaction Methods 0.000 description 5
- 235000011187 glycerol Nutrition 0.000 description 5
- 210000001165 lymph node Anatomy 0.000 description 5
- 239000000203 mixture Substances 0.000 description 5
- 238000002264 polyacrylamide gel electrophoresis Methods 0.000 description 5
- 102000004196 processed proteins & peptides Human genes 0.000 description 5
- 230000000717 retained effect Effects 0.000 description 5
- 239000000758 substrate Substances 0.000 description 5
- 102000007260 Deoxyribonuclease I Human genes 0.000 description 4
- 108010008532 Deoxyribonuclease I Proteins 0.000 description 4
- DSFYPIUSAMSERP-IHRRRGAJSA-N Leu-Leu-Arg Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCCN=C(N)N DSFYPIUSAMSERP-IHRRRGAJSA-N 0.000 description 4
- 229920002684 Sepharose Polymers 0.000 description 4
- 230000009471 action Effects 0.000 description 4
- 239000000074 antisense oligonucleotide Substances 0.000 description 4
- 238000012230 antisense oligonucleotides Methods 0.000 description 4
- 108010008355 arginyl-glutamine Proteins 0.000 description 4
- 238000010586 diagram Methods 0.000 description 4
- 108020001507 fusion proteins Proteins 0.000 description 4
- 102000037865 fusion proteins Human genes 0.000 description 4
- 210000004185 liver Anatomy 0.000 description 4
- 230000007246 mechanism Effects 0.000 description 4
- 238000010369 molecular cloning Methods 0.000 description 4
- 239000002773 nucleotide Substances 0.000 description 4
- 125000003729 nucleotide group Chemical group 0.000 description 4
- 229920002401 polyacrylamide Polymers 0.000 description 4
- 239000002244 precipitate Substances 0.000 description 4
- 238000010257 thawing Methods 0.000 description 4
- 238000001262 western blot Methods 0.000 description 4
- SOBIAADAMRHGKH-CIUDSAMLSA-N Ala-Leu-Ser Chemical compound [H]N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O SOBIAADAMRHGKH-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 3
- 241000511343 Chondrostoma nasus Species 0.000 description 3
- 108010033040 Histones Proteins 0.000 description 3
- KAFOIVJDVSZUMD-UHFFFAOYSA-N Leu-Gln-Gln Natural products CC(C)CC(N)C(=O)NC(CCC(N)=O)C(=O)NC(CCC(N)=O)C(O)=O KAFOIVJDVSZUMD-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 108010006519 Molecular Chaperones Proteins 0.000 description 3
- SITLTJHOQZFJGG-UHFFFAOYSA-N N-L-alpha-glutamyl-L-valine Natural products CC(C)C(C(O)=O)NC(=O)C(N)CCC(O)=O SITLTJHOQZFJGG-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 108010079364 N-glycylalanine Proteins 0.000 description 3
- 102000003945 NF-kappa B Human genes 0.000 description 3
- 108010057466 NF-kappa B Proteins 0.000 description 3
- 206010028980 Neoplasm Diseases 0.000 description 3
- 108091000080 Phosphotransferase Proteins 0.000 description 3
- 229920001213 Polysorbate 20 Polymers 0.000 description 3
- 108010090804 Streptavidin Proteins 0.000 description 3
- 108010005233 alanylglutamic acid Proteins 0.000 description 3
- 230000000692 anti-sense effect Effects 0.000 description 3
- 201000011510 cancer Diseases 0.000 description 3
- 238000003776 cleavage reaction Methods 0.000 description 3
- 230000008878 coupling Effects 0.000 description 3
- 238000010168 coupling process Methods 0.000 description 3
- 238000005859 coupling reaction Methods 0.000 description 3
- 238000009826 distribution Methods 0.000 description 3
- 239000012634 fragment Substances 0.000 description 3
- 230000008014 freezing Effects 0.000 description 3
- 238000007710 freezing Methods 0.000 description 3
- VPZXBVLAVMBEQI-UHFFFAOYSA-N glycyl-DL-alpha-alanine Natural products OC(=O)C(C)NC(=O)CN VPZXBVLAVMBEQI-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 238000001114 immunoprecipitation Methods 0.000 description 3
- 239000003112 inhibitor Substances 0.000 description 3
- 108010038320 lysylphenylalanine Proteins 0.000 description 3
- TWRXJAOTZQYOKJ-UHFFFAOYSA-L magnesium chloride Substances [Mg+2].[Cl-].[Cl-] TWRXJAOTZQYOKJ-UHFFFAOYSA-L 0.000 description 3
- 229910001629 magnesium chloride Inorganic materials 0.000 description 3
- 239000003550 marker Substances 0.000 description 3
- YBYRMVIVWMBXKQ-UHFFFAOYSA-N phenyl methane sulfonyl fluoride Natural products FS(=O)(=O)CC1=CC=CC=C1 YBYRMVIVWMBXKQ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 102000020233 phosphotransferase Human genes 0.000 description 3
- 235000010486 polyoxyethylene sorbitan monolaurate Nutrition 0.000 description 3
- 239000000256 polyoxyethylene sorbitan monolaurate Substances 0.000 description 3
- 238000011160 research Methods 0.000 description 3
- 230000007017 scission Effects 0.000 description 3
- 239000000126 substance Substances 0.000 description 3
- 230000001225 therapeutic effect Effects 0.000 description 3
- YBJHBAHKTGYVGT-ZKWXMUAHSA-N (+)-Biotin Chemical compound N1C(=O)N[C@@H]2[C@H](CCCCC(=O)O)SC[C@@H]21 YBJHBAHKTGYVGT-ZKWXMUAHSA-N 0.000 description 2
- UMCMPZBLKLEWAF-BCTGSCMUSA-N 3-[(3-cholamidopropyl)dimethylammonio]propane-1-sulfonate Chemical compound C([C@H]1C[C@H]2O)[C@H](O)CC[C@]1(C)[C@@H]1[C@@H]2[C@@H]2CC[C@H]([C@@H](CCC(=O)NCCC[N+](C)(C)CCCS([O-])(=O)=O)C)[C@@]2(C)[C@@H](O)C1 UMCMPZBLKLEWAF-BCTGSCMUSA-N 0.000 description 2
- CSCPPACGZOOCGX-UHFFFAOYSA-N Acetone Chemical compound CC(C)=O CSCPPACGZOOCGX-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 108010085238 Actins Proteins 0.000 description 2
- YYSWCHMLFJLLBJ-ZLUOBGJFSA-N Ala-Ala-Ser Chemical compound C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O YYSWCHMLFJLLBJ-ZLUOBGJFSA-N 0.000 description 2
- WCBVQNZTOKJWJS-ACZMJKKPSA-N Ala-Cys-Glu Chemical compound [H]N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](CS)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O WCBVQNZTOKJWJS-ACZMJKKPSA-N 0.000 description 2
- IORKCNUBHNIMKY-CIUDSAMLSA-N Ala-Pro-Glu Chemical compound C[C@H](N)C(=O)N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O IORKCNUBHNIMKY-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 2
- DCVYRWFAMZFSDA-ZLUOBGJFSA-N Ala-Ser-Ala Chemical compound [H]N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](C)C(O)=O DCVYRWFAMZFSDA-ZLUOBGJFSA-N 0.000 description 2
- MSWSRLGNLKHDEI-ACZMJKKPSA-N Ala-Ser-Glu Chemical compound [H]N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O MSWSRLGNLKHDEI-ACZMJKKPSA-N 0.000 description 2
- IETUUAHKCHOQHP-KZVJFYERSA-N Ala-Thr-Val Chemical compound CC(C)[C@H](NC(=O)[C@@H](NC(=O)[C@H](C)N)[C@@H](C)O)C(O)=O IETUUAHKCHOQHP-KZVJFYERSA-N 0.000 description 2
- 108020004491 Antisense DNA Proteins 0.000 description 2
- 108020005544 Antisense RNA Proteins 0.000 description 2
- NUBPTCMEOCKWDO-DCAQKATOSA-N Arg-Asn-His Chemical compound C1=C(NC=N1)C[C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC(=O)N)NC(=O)[C@H](CCCN=C(N)N)N NUBPTCMEOCKWDO-DCAQKATOSA-N 0.000 description 2
- DJAIOAKQIOGULM-DCAQKATOSA-N Arg-Glu-Met Chemical compound [H]N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CCSC)C(O)=O DJAIOAKQIOGULM-DCAQKATOSA-N 0.000 description 2
- GOWZVQXTHUCNSQ-NHCYSSNCSA-N Arg-Glu-Val Chemical compound [H]N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(O)=O GOWZVQXTHUCNSQ-NHCYSSNCSA-N 0.000 description 2
- NGYHSXDNNOFHNE-AVGNSLFASA-N Arg-Pro-Leu Chemical compound [H]N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O NGYHSXDNNOFHNE-AVGNSLFASA-N 0.000 description 2
- VYLVOMUVLMGCRF-ZLUOBGJFSA-N Asn-Asp-Ser Chemical compound NC(=O)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O VYLVOMUVLMGCRF-ZLUOBGJFSA-N 0.000 description 2
- QNJIRRVTOXNGMH-GUBZILKMSA-N Asn-Gln-Lys Chemical compound NCCCC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](CCC(N)=O)NC(=O)[C@@H](N)CC(N)=O QNJIRRVTOXNGMH-GUBZILKMSA-N 0.000 description 2
- OLGCWMNDJTWQAG-GUBZILKMSA-N Asn-Glu-Lys Chemical compound NCCCC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](CCC(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CC(N)=O OLGCWMNDJTWQAG-GUBZILKMSA-N 0.000 description 2
- PUUPMDXIHCOPJU-HJGDQZAQSA-N Asn-Thr-Lys Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC(=O)N)N)O PUUPMDXIHCOPJU-HJGDQZAQSA-N 0.000 description 2
- RGKKALNPOYURGE-ZKWXMUAHSA-N Asp-Ala-Val Chemical compound N[C@@H](CC(=O)O)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)O RGKKALNPOYURGE-ZKWXMUAHSA-N 0.000 description 2
- VZNOVQKGJQJOCS-SRVKXCTJSA-N Asp-Asp-Tyr Chemical compound [H]N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(O)=O VZNOVQKGJQJOCS-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 2
- PXLNPFOJZQMXAT-BYULHYEWSA-N Asp-Asp-Val Chemical compound CC(C)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](CC(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CC(O)=O PXLNPFOJZQMXAT-BYULHYEWSA-N 0.000 description 2
- OMMIEVATLAGRCK-BYPYZUCNSA-N Asp-Gly-Gly Chemical compound OC(=O)C[C@H](N)C(=O)NCC(=O)NCC(O)=O OMMIEVATLAGRCK-BYPYZUCNSA-N 0.000 description 2
- SVABRQFIHCSNCI-FOHZUACHSA-N Asp-Gly-Thr Chemical compound [H]N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)NCC(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O SVABRQFIHCSNCI-FOHZUACHSA-N 0.000 description 2
- SPKCGKRUYKMDHP-GUDRVLHUSA-N Asp-Ile-Pro Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)N1CCC[C@@H]1C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC(=O)O)N SPKCGKRUYKMDHP-GUDRVLHUSA-N 0.000 description 2
- XLILXFRAKOYEJX-GUBZILKMSA-N Asp-Leu-Gln Chemical compound [H]N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CCC(N)=O)C(O)=O XLILXFRAKOYEJX-GUBZILKMSA-N 0.000 description 2
- DWOGMPWRQQWPPF-GUBZILKMSA-N Asp-Leu-Glu Chemical compound [H]N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O DWOGMPWRQQWPPF-GUBZILKMSA-N 0.000 description 2
- DPNWSMBUYCLEDG-CIUDSAMLSA-N Asp-Lys-Ser Chemical compound [H]N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O DPNWSMBUYCLEDG-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 2
- 101001107784 Caenorhabditis elegans Deoxyribonuclease-2 Proteins 0.000 description 2
- 108091033380 Coding strand Proteins 0.000 description 2
- 108020004635 Complementary DNA Proteins 0.000 description 2
- 102000001493 Cyclophilins Human genes 0.000 description 2
- 108010068682 Cyclophilins Proteins 0.000 description 2
- GRNOCLDFUNCIDW-ACZMJKKPSA-N Cys-Ala-Glu Chemical compound C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CCC(=O)O)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CS)N GRNOCLDFUNCIDW-ACZMJKKPSA-N 0.000 description 2
- 239000003155 DNA primer Substances 0.000 description 2
- 238000002965 ELISA Methods 0.000 description 2
- LZRMPXRYLLTAJX-GUBZILKMSA-N Gln-Arg-Glu Chemical compound [H]N[C@@H](CCC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O LZRMPXRYLLTAJX-GUBZILKMSA-N 0.000 description 2
- FGYPOQPQTUNESW-IUCAKERBSA-N Gln-Gly-Leu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(=O)O)NC(=O)CNC(=O)[C@H](CCC(=O)N)N FGYPOQPQTUNESW-IUCAKERBSA-N 0.000 description 2
- NROSLUJMIQGFKS-IUCAKERBSA-N Gln-His-Gly Chemical compound C1=C(NC=N1)C[C@@H](C(=O)NCC(=O)O)NC(=O)[C@H](CCC(=O)N)N NROSLUJMIQGFKS-IUCAKERBSA-N 0.000 description 2
- XFAUJGNLHIGXET-AVGNSLFASA-N Gln-Leu-Leu Chemical compound [H]N[C@@H](CCC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O XFAUJGNLHIGXET-AVGNSLFASA-N 0.000 description 2
- IULKWYSYZSURJK-AVGNSLFASA-N Gln-Leu-Lys Chemical compound NC(=O)CC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(O)=O IULKWYSYZSURJK-AVGNSLFASA-N 0.000 description 2
- MFHVAWMMKZBSRQ-ACZMJKKPSA-N Gln-Ser-Cys Chemical compound C(CC(=O)N)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CS)C(=O)O)N MFHVAWMMKZBSRQ-ACZMJKKPSA-N 0.000 description 2
- KPNWAJMEMRCLAL-GUBZILKMSA-N Gln-Ser-Lys Chemical compound C(CCN)C[C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CO)NC(=O)[C@H](CCC(=O)N)N KPNWAJMEMRCLAL-GUBZILKMSA-N 0.000 description 2
- BYKZWDGMJLNFJY-XKBZYTNZSA-N Gln-Ser-Thr Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CO)NC(=O)[C@H](CCC(=O)N)N)O BYKZWDGMJLNFJY-XKBZYTNZSA-N 0.000 description 2
- FHPXTPQBODWBIY-CIUDSAMLSA-N Glu-Ala-Arg Chemical compound [H]N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(O)=O FHPXTPQBODWBIY-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 2
- WZZSKAJIHTUUSG-ACZMJKKPSA-N Glu-Ala-Asp Chemical compound OC(=O)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](C)NC(=O)[C@@H](N)CCC(O)=O WZZSKAJIHTUUSG-ACZMJKKPSA-N 0.000 description 2
- JVSBYEDSSRZQGV-GUBZILKMSA-N Glu-Asp-Leu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](CC(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CCC(O)=O JVSBYEDSSRZQGV-GUBZILKMSA-N 0.000 description 2
- MUSGDMDGNGXULI-DCAQKATOSA-N Glu-Glu-Leu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](CCC(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CCC(O)=O MUSGDMDGNGXULI-DCAQKATOSA-N 0.000 description 2
- UHVIQGKBMXEVGN-WDSKDSINSA-N Glu-Gly-Asn Chemical compound [H]N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(O)=O UHVIQGKBMXEVGN-WDSKDSINSA-N 0.000 description 2
- VSRCAOIHMGCIJK-SRVKXCTJSA-N Glu-Leu-Arg Chemical compound OC(=O)CC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CCCN=C(N)N)C(O)=O VSRCAOIHMGCIJK-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 2
- LZMQSTPFYJLVJB-GUBZILKMSA-N Glu-Leu-Cys Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CS)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CCC(=O)O)N LZMQSTPFYJLVJB-GUBZILKMSA-N 0.000 description 2
- IOUQWHIEQYQVFD-JYJNAYRXSA-N Glu-Leu-Tyr Chemical compound [H]N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(O)=O IOUQWHIEQYQVFD-JYJNAYRXSA-N 0.000 description 2
- FMBWLLMUPXTXFC-SDDRHHMPSA-N Glu-Lys-Pro Chemical compound C1C[C@@H](N(C1)C(=O)[C@H](CCCCN)NC(=O)[C@H](CCC(=O)O)N)C(=O)O FMBWLLMUPXTXFC-SDDRHHMPSA-N 0.000 description 2
- UDEPRBFQTWGLCW-CIUDSAMLSA-N Glu-Pro-Asp Chemical compound [H]N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(O)=O UDEPRBFQTWGLCW-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 2
- QOXDAWODGSIDDI-GUBZILKMSA-N Glu-Ser-Lys Chemical compound C(CCN)C[C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CO)NC(=O)[C@H](CCC(=O)O)N QOXDAWODGSIDDI-GUBZILKMSA-N 0.000 description 2
- BXSZPACYCMNKLS-AVGNSLFASA-N Glu-Ser-Phe Chemical compound [H]N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(O)=O BXSZPACYCMNKLS-AVGNSLFASA-N 0.000 description 2
- YOBGUCWZPXJHTN-BQBZGAKWSA-N Gly-Ser-Arg Chemical compound NCC(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCCN=C(N)N YOBGUCWZPXJHTN-BQBZGAKWSA-N 0.000 description 2
- RIYIFUFFFBIOEU-KBPBESRZSA-N Gly-Tyr-Leu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](NC(=O)CN)CC1=CC=C(O)C=C1 RIYIFUFFFBIOEU-KBPBESRZSA-N 0.000 description 2
- RYAOJUMWLWUGNW-QMMMGPOBSA-N Gly-Val-Gly Chemical compound NCC(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)NCC(O)=O RYAOJUMWLWUGNW-QMMMGPOBSA-N 0.000 description 2
- FNXSYBOHALPRHV-ONGXEEELSA-N Gly-Val-Lys Chemical compound NCC(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCCCN FNXSYBOHALPRHV-ONGXEEELSA-N 0.000 description 2
- RVKIPWVMZANZLI-UHFFFAOYSA-N H-Lys-Trp-OH Natural products C1=CC=C2C(CC(NC(=O)C(N)CCCCN)C(O)=O)=CNC2=C1 RVKIPWVMZANZLI-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 239000007995 HEPES buffer Substances 0.000 description 2
- 108010001336 Horseradish Peroxidase Proteins 0.000 description 2
- HPCFRQWLTRDGHT-AJNGGQMLSA-N Ile-Leu-Leu Chemical compound CC[C@H](C)[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O HPCFRQWLTRDGHT-AJNGGQMLSA-N 0.000 description 2
- GVKKVHNRTUFCCE-BJDJZHNGSA-N Ile-Leu-Ser Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)O)N GVKKVHNRTUFCCE-BJDJZHNGSA-N 0.000 description 2
- PHRWFSFCNJPWRO-PPCPHDFISA-N Ile-Leu-Thr Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)O)N PHRWFSFCNJPWRO-PPCPHDFISA-N 0.000 description 2
- BCISUQVFDGYZBO-QSFUFRPTSA-N Ile-Val-Asp Chemical compound CC[C@H](C)[C@H](N)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC(O)=O BCISUQVFDGYZBO-QSFUFRPTSA-N 0.000 description 2
- PMGDADKJMCOXHX-UHFFFAOYSA-N L-Arginyl-L-glutamin-acetat Natural products NC(=N)NCCCC(N)C(=O)NC(CCC(N)=O)C(O)=O PMGDADKJMCOXHX-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 241000880493 Leptailurus serval Species 0.000 description 2
- KVRKAGGMEWNURO-CIUDSAMLSA-N Leu-Ala-Cys Chemical compound C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CS)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC(C)C)N KVRKAGGMEWNURO-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 2
- MJOZZTKJZQFKDK-GUBZILKMSA-N Leu-Ala-Gln Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCC(N)=O MJOZZTKJZQFKDK-GUBZILKMSA-N 0.000 description 2
- CQQGCWPXDHTTNF-GUBZILKMSA-N Leu-Ala-Glu Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCC(O)=O CQQGCWPXDHTTNF-GUBZILKMSA-N 0.000 description 2
- QPRQGENIBFLVEB-BJDJZHNGSA-N Leu-Ala-Ile Chemical compound [H]N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(O)=O QPRQGENIBFLVEB-BJDJZHNGSA-N 0.000 description 2
- VQPPIMUZCZCOIL-GUBZILKMSA-N Leu-Gln-Ala Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CCC(N)=O)C(=O)N[C@@H](C)C(O)=O VQPPIMUZCZCOIL-GUBZILKMSA-N 0.000 description 2
- KAFOIVJDVSZUMD-DCAQKATOSA-N Leu-Gln-Gln Chemical compound [H]N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CCC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CCC(N)=O)C(O)=O KAFOIVJDVSZUMD-DCAQKATOSA-N 0.000 description 2
- HQUXQAMSWFIRET-AVGNSLFASA-N Leu-Glu-Lys Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCCCN HQUXQAMSWFIRET-AVGNSLFASA-N 0.000 description 2
- WQWSMEOYXJTFRU-GUBZILKMSA-N Leu-Glu-Ser Chemical compound [H]N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O WQWSMEOYXJTFRU-GUBZILKMSA-N 0.000 description 2
- CHJKEDSZNSONPS-DCAQKATOSA-N Leu-Pro-Ser Chemical compound [H]N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O CHJKEDSZNSONPS-DCAQKATOSA-N 0.000 description 2
- XOWMDXHFSBCAKQ-SRVKXCTJSA-N Leu-Ser-Leu Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC(C)C XOWMDXHFSBCAKQ-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 2
- KLSUAWUZBMAZCL-RHYQMDGZSA-N Leu-Thr-Pro Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N1CCC[C@H]1C(O)=O KLSUAWUZBMAZCL-RHYQMDGZSA-N 0.000 description 2
- GDBQQVLCIARPGH-UHFFFAOYSA-N Leupeptin Natural products CC(C)CC(NC(C)=O)C(=O)NC(CC(C)C)C(=O)NC(C=O)CCCN=C(N)N GDBQQVLCIARPGH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- JCVOHUKUYSYBAD-DCAQKATOSA-N Lys-Pro-Cys Chemical compound C1C[C@H](N(C1)C(=O)[C@H](CCCCN)N)C(=O)N[C@@H](CS)C(=O)O JCVOHUKUYSYBAD-DCAQKATOSA-N 0.000 description 2
- 108010053229 Lysyl endopeptidase Proteins 0.000 description 2
- SJDQOYTYNGZZJX-SRVKXCTJSA-N Met-Glu-Leu Chemical compound CSCC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O SJDQOYTYNGZZJX-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 2
- 241001465754 Metazoa Species 0.000 description 2
- 102000005431 Molecular Chaperones Human genes 0.000 description 2
- 241000699670 Mus sp. Species 0.000 description 2
- 108010087066 N2-tryptophyllysine Proteins 0.000 description 2
- 101710163270 Nuclease Proteins 0.000 description 2
- 238000012408 PCR amplification Methods 0.000 description 2
- 108010033276 Peptide Fragments Proteins 0.000 description 2
- 102000007079 Peptide Fragments Human genes 0.000 description 2
- TXKWKTWYTIAZSV-KKUMJFAQSA-N Phe-Leu-Cys Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CS)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC1=CC=CC=C1)N TXKWKTWYTIAZSV-KKUMJFAQSA-N 0.000 description 2
- CDHURCQGUDNBMA-UBHSHLNASA-N Phe-Val-Ala Chemical compound OC(=O)[C@H](C)NC(=O)[C@H](C(C)C)NC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=CC=C1 CDHURCQGUDNBMA-UBHSHLNASA-N 0.000 description 2
- 102000012338 Poly(ADP-ribose) Polymerases Human genes 0.000 description 2
- 108010061844 Poly(ADP-ribose) Polymerases Proteins 0.000 description 2
- 229920000776 Poly(Adenosine diphosphate-ribose) polymerase Polymers 0.000 description 2
- VXCHGLYSIOOZIS-GUBZILKMSA-N Pro-Ala-Arg Chemical compound NC(N)=NCCC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](C)NC(=O)[C@@H]1CCCN1 VXCHGLYSIOOZIS-GUBZILKMSA-N 0.000 description 2
- YFNOUBWUIIJQHF-LPEHRKFASA-N Pro-Asp-Pro Chemical compound C1C[C@H](NC1)C(=O)N[C@@H](CC(=O)O)C(=O)N2CCC[C@@H]2C(=O)O YFNOUBWUIIJQHF-LPEHRKFASA-N 0.000 description 2
- 101710093543 Probable non-specific lipid-transfer protein Proteins 0.000 description 2
- GXXTUIUYTWGPMV-FXQIFTODSA-N Ser-Arg-Ala Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](C)C(O)=O GXXTUIUYTWGPMV-FXQIFTODSA-N 0.000 description 2
- QEDMOZUJTGEIBF-FXQIFTODSA-N Ser-Arg-Asp Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(O)=O QEDMOZUJTGEIBF-FXQIFTODSA-N 0.000 description 2
- HQTKVSCNCDLXSX-BQBZGAKWSA-N Ser-Arg-Gly Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)NCC(O)=O HQTKVSCNCDLXSX-BQBZGAKWSA-N 0.000 description 2
- UOLGINIHBRIECN-FXQIFTODSA-N Ser-Glu-Glu Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O UOLGINIHBRIECN-FXQIFTODSA-N 0.000 description 2
- ZIFYDQAFEMIZII-GUBZILKMSA-N Ser-Leu-Glu Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O ZIFYDQAFEMIZII-GUBZILKMSA-N 0.000 description 2
- FZXOPYUEQGDGMS-ACZMJKKPSA-N Ser-Ser-Gln Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CCC(N)=O)C(O)=O FZXOPYUEQGDGMS-ACZMJKKPSA-N 0.000 description 2
- JCLAFVNDBJMLBC-JBDRJPRFSA-N Ser-Ser-Ile Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(O)=O JCLAFVNDBJMLBC-JBDRJPRFSA-N 0.000 description 2
- NFMPFBCXABPALN-OWLDWWDNSA-N Thr-Ala-Trp Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](CC1=CNC2=CC=CC=C21)C(=O)O)N)O NFMPFBCXABPALN-OWLDWWDNSA-N 0.000 description 2
- MECLEFZMPPOEAC-VOAKCMCISA-N Thr-Leu-Lys Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)O)N)O MECLEFZMPPOEAC-VOAKCMCISA-N 0.000 description 2
- YPBYQWFZAAQMGW-XIRDDKMYSA-N Trp-Lys-Asn Chemical compound C1=CC=C2C(=C1)C(=CN2)C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CC(=O)N)C(=O)O)N YPBYQWFZAAQMGW-XIRDDKMYSA-N 0.000 description 2
- WTRQBSSQBKRNKV-MNSWYVGCSA-N Trp-Thr-Tyr Chemical compound C([C@H](NC(=O)[C@@H](NC(=O)[C@@H](N)CC=1C2=CC=CC=C2NC=1)[C@H](O)C)C(O)=O)C1=CC=C(O)C=C1 WTRQBSSQBKRNKV-MNSWYVGCSA-N 0.000 description 2
- DDRBQONWVBDQOY-GUBZILKMSA-N Val-Ala-Arg Chemical compound CC(C)[C@H](N)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](CCCN=C(N)N)C(O)=O DDRBQONWVBDQOY-GUBZILKMSA-N 0.000 description 2
- RYHUIHUOYRNNIE-NRPADANISA-N Val-Ser-Gln Chemical compound CC(C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CCC(=O)N)C(=O)O)N RYHUIHUOYRNNIE-NRPADANISA-N 0.000 description 2
- 230000003213 activating effect Effects 0.000 description 2
- 238000000246 agarose gel electrophoresis Methods 0.000 description 2
- 108010084217 alanyl-glutamyl-aspartyl-glycine Proteins 0.000 description 2
- 108010087924 alanylproline Proteins 0.000 description 2
- KOSRFJWDECSPRO-UHFFFAOYSA-N alpha-L-glutamyl-L-glutamic acid Natural products OC(=O)CCC(N)C(=O)NC(CCC(O)=O)C(O)=O KOSRFJWDECSPRO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 125000000539 amino acid group Chemical group 0.000 description 2
- 238000003277 amino acid sequence analysis Methods 0.000 description 2
- 239000003816 antisense DNA Substances 0.000 description 2
- 108010052670 arginyl-glutamyl-glutamic acid Proteins 0.000 description 2
- 108010062796 arginyllysine Proteins 0.000 description 2
- 108010060035 arginylproline Proteins 0.000 description 2
- 108010040443 aspartyl-aspartic acid Proteins 0.000 description 2
- 108010038633 aspartylglutamate Proteins 0.000 description 2
- 238000000376 autoradiography Methods 0.000 description 2
- 230000015572 biosynthetic process Effects 0.000 description 2
- 230000000747 cardiac effect Effects 0.000 description 2
- 238000005119 centrifugation Methods 0.000 description 2
- 238000006243 chemical reaction Methods 0.000 description 2
- 238000004440 column chromatography Methods 0.000 description 2
- 239000003184 complementary RNA Substances 0.000 description 2
- 239000000287 crude extract Substances 0.000 description 2
- 238000004520 electroporation Methods 0.000 description 2
- 238000005516 engineering process Methods 0.000 description 2
- HKSZLNNOFSGOKW-UHFFFAOYSA-N ent-staurosporine Natural products C12=C3N4C5=CC=CC=C5C3=C3CNC(=O)C3=C2C2=CC=CC=C2N1C1CC(NC)C(OC)C4(C)O1 HKSZLNNOFSGOKW-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 238000005194 fractionation Methods 0.000 description 2
- 238000002523 gelfiltration Methods 0.000 description 2
- 108010057083 glutamyl-aspartyl-leucine Proteins 0.000 description 2
- 108010055341 glutamyl-glutamic acid Proteins 0.000 description 2
- 108010089804 glycyl-threonine Proteins 0.000 description 2
- 229960002897 heparin Drugs 0.000 description 2
- 229920000669 heparin Polymers 0.000 description 2
- 108010018006 histidylserine Proteins 0.000 description 2
- 108010035817 human DNA fragmentation factor Proteins 0.000 description 2
- 210000004408 hybridoma Anatomy 0.000 description 2
- 238000001727 in vivo Methods 0.000 description 2
- 230000002779 inactivation Effects 0.000 description 2
- 230000001939 inductive effect Effects 0.000 description 2
- 238000002372 labelling Methods 0.000 description 2
- 108010090333 leucyl-lysyl-proline Proteins 0.000 description 2
- 108010057821 leucylproline Proteins 0.000 description 2
- GDBQQVLCIARPGH-ULQDDVLXSA-N leupeptin Chemical compound CC(C)C[C@H](NC(C)=O)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@H](C=O)CCCN=C(N)N GDBQQVLCIARPGH-ULQDDVLXSA-N 0.000 description 2
- 108010052968 leupeptin Proteins 0.000 description 2
- 108010025153 lysyl-alanyl-alanine Proteins 0.000 description 2
- 108010043322 lysyl-tryptophyl-alpha-lysine Proteins 0.000 description 2
- 108010009298 lysylglutamic acid Proteins 0.000 description 2
- 108010054155 lysyllysine Proteins 0.000 description 2
- 238000004519 manufacturing process Methods 0.000 description 2
- KNWQLFOXPQZGPX-UHFFFAOYSA-N methanesulfonyl fluoride Chemical compound CS(F)(=O)=O KNWQLFOXPQZGPX-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 229930182817 methionine Natural products 0.000 description 2
- 108010016686 methionyl-alanyl-serine Proteins 0.000 description 2
- 230000004660 morphological change Effects 0.000 description 2
- 210000000822 natural killer cell Anatomy 0.000 description 2
- 102000039446 nucleic acids Human genes 0.000 description 2
- 108020004707 nucleic acids Proteins 0.000 description 2
- 150000007523 nucleic acids Chemical class 0.000 description 2
- 108010091212 pepstatin Proteins 0.000 description 2
- FAXGPCHRFPCXOO-LXTPJMTPSA-N pepstatin A Chemical compound OC(=O)C[C@H](O)[C@H](CC(C)C)NC(=O)[C@H](C)NC(=O)C[C@H](O)[C@H](CC(C)C)NC(=O)[C@H](C(C)C)NC(=O)[C@H](C(C)C)NC(=O)CC(C)C FAXGPCHRFPCXOO-LXTPJMTPSA-N 0.000 description 2
- 108010012581 phenylalanylglutamate Proteins 0.000 description 2
- 229920001184 polypeptide Polymers 0.000 description 2
- 230000008569 process Effects 0.000 description 2
- 108010015796 prolylisoleucine Proteins 0.000 description 2
- 230000002829 reductive effect Effects 0.000 description 2
- 238000004007 reversed phase HPLC Methods 0.000 description 2
- 239000012723 sample buffer Substances 0.000 description 2
- 238000002741 site-directed mutagenesis Methods 0.000 description 2
- 238000002415 sodium dodecyl sulfate polyacrylamide gel electrophoresis Methods 0.000 description 2
- HEMHJVSKTPXQMS-UHFFFAOYSA-M sodium hydroxide Inorganic materials [OH-].[Na+] HEMHJVSKTPXQMS-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 2
- 241000894007 species Species 0.000 description 2
- 210000000952 spleen Anatomy 0.000 description 2
- 238000010186 staining Methods 0.000 description 2
- HKSZLNNOFSGOKW-FYTWVXJKSA-N staurosporine Chemical compound C12=C3N4C5=CC=CC=C5C3=C3CNC(=O)C3=C2C2=CC=CC=C2N1[C@H]1C[C@@H](NC)[C@@H](OC)[C@]4(C)O1 HKSZLNNOFSGOKW-FYTWVXJKSA-N 0.000 description 2
- CGPUWJWCVCFERF-UHFFFAOYSA-N staurosporine Natural products C12=C3N4C5=CC=CC=C5C3=C3CNC(=O)C3=C2C2=CC=CC=C2N1C1CC(NC)C(OC)C4(OC)O1 CGPUWJWCVCFERF-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 238000003786 synthesis reaction Methods 0.000 description 2
- 230000005945 translocation Effects 0.000 description 2
- 230000001960 triggered effect Effects 0.000 description 2
- 238000005406 washing Methods 0.000 description 2
- YMXHPSHLTSZXKH-RVBZMBCESA-N (2,5-dioxopyrrolidin-1-yl) 5-[(3as,4s,6ar)-2-oxo-1,3,3a,4,6,6a-hexahydrothieno[3,4-d]imidazol-4-yl]pentanoate Chemical compound C([C@H]1[C@H]2NC(=O)N[C@H]2CS1)CCCC(=O)ON1C(=O)CCC1=O YMXHPSHLTSZXKH-RVBZMBCESA-N 0.000 description 1
- PMHUSCHKTSTQEP-UHFFFAOYSA-N (4-carbamimidoylphenyl)methanesulfonyl fluoride Chemical compound NC(=N)C1=CC=C(CS(F)(=O)=O)C=C1 PMHUSCHKTSTQEP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- -1 (7-methoxycoumarin-4-yl) acetyl group Chemical group 0.000 description 1
- 102000040650 (ribonucleotides)n+m Human genes 0.000 description 1
- 125000001917 2,4-dinitrophenyl group Chemical group [H]C1=C([H])C(=C([H])C(=C1*)[N+]([O-])=O)[N+]([O-])=O 0.000 description 1
- QKNYBSVHEMOAJP-UHFFFAOYSA-N 2-amino-2-(hydroxymethyl)propane-1,3-diol;hydron;chloride Chemical compound Cl.OCC(N)(CO)CO QKNYBSVHEMOAJP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- GOJUJUVQIVIZAV-UHFFFAOYSA-N 2-amino-4,6-dichloropyrimidine-5-carbaldehyde Chemical group NC1=NC(Cl)=C(C=O)C(Cl)=N1 GOJUJUVQIVIZAV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 101800000263 Acidic protein Proteins 0.000 description 1
- 102000007469 Actins Human genes 0.000 description 1
- HHGYNJRJIINWAK-FXQIFTODSA-N Ala-Ala-Arg Chemical compound C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCCN=C(N)N HHGYNJRJIINWAK-FXQIFTODSA-N 0.000 description 1
- BUANFPRKJKJSRR-ACZMJKKPSA-N Ala-Ala-Gln Chemical compound C[C@H]([NH3+])C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@H](C([O-])=O)CCC(N)=O BUANFPRKJKJSRR-ACZMJKKPSA-N 0.000 description 1
- QDRGPQWIVZNJQD-CIUDSAMLSA-N Ala-Arg-Gln Chemical compound [H]N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CCC(N)=O)C(O)=O QDRGPQWIVZNJQD-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 1
- XAGIMRPOEJSYER-CIUDSAMLSA-N Ala-Cys-Lys Chemical compound C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CS)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)O)N XAGIMRPOEJSYER-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 1
- FUSPCLTUKXQREV-ACZMJKKPSA-N Ala-Glu-Ala Chemical compound [H]N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](C)C(O)=O FUSPCLTUKXQREV-ACZMJKKPSA-N 0.000 description 1
- HXNNRBHASOSVPG-GUBZILKMSA-N Ala-Glu-Leu Chemical compound [H]N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O HXNNRBHASOSVPG-GUBZILKMSA-N 0.000 description 1
- SMCGQGDVTPFXKB-XPUUQOCRSA-N Ala-Gly-Val Chemical compound CC(C)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)CNC(=O)[C@H](C)N SMCGQGDVTPFXKB-XPUUQOCRSA-N 0.000 description 1
- ADSGHMXEAZJJNF-DCAQKATOSA-N Ala-Pro-Leu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H]1CCCN1C(=O)[C@H](C)N ADSGHMXEAZJJNF-DCAQKATOSA-N 0.000 description 1
- 108090000672 Annexin A5 Proteins 0.000 description 1
- 102000004121 Annexin A5 Human genes 0.000 description 1
- 108010039627 Aprotinin Proteins 0.000 description 1
- VBFJESQBIWCWRL-DCAQKATOSA-N Arg-Ala-Lys Chemical compound NCCCC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](C)NC(=O)[C@@H](N)CCCNC(N)=N VBFJESQBIWCWRL-DCAQKATOSA-N 0.000 description 1
- BVBKBQRPOJFCQM-DCAQKATOSA-N Arg-Asn-Leu Chemical compound [H]N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O BVBKBQRPOJFCQM-DCAQKATOSA-N 0.000 description 1
- OBFTYSPXDRROQO-SRVKXCTJSA-N Arg-Gln-Lys Chemical compound NCCCC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](CCC(N)=O)NC(=O)[C@@H](N)CCCN=C(N)N OBFTYSPXDRROQO-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 1
- UFBURHXMKFQVLM-CIUDSAMLSA-N Arg-Glu-Ser Chemical compound [H]N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O UFBURHXMKFQVLM-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 1
- NVUIWHJLPSZZQC-CYDGBPFRSA-N Arg-Ile-Arg Chemical compound NC(N)=NCCC[C@H](N)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(=O)N[C@@H](CCCN=C(N)N)C(O)=O NVUIWHJLPSZZQC-CYDGBPFRSA-N 0.000 description 1
- OOIMKQRCPJBGPD-XUXIUFHCSA-N Arg-Ile-Leu Chemical compound [H]N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O OOIMKQRCPJBGPD-XUXIUFHCSA-N 0.000 description 1
- YVTHEZNOKSAWRW-DCAQKATOSA-N Arg-Lys-Ala Chemical compound [H]N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](C)C(O)=O YVTHEZNOKSAWRW-DCAQKATOSA-N 0.000 description 1
- RIIVUOJDDQXHRV-SRVKXCTJSA-N Arg-Lys-Gln Chemical compound [H]N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CCC(N)=O)C(O)=O RIIVUOJDDQXHRV-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 1
- NGTYEHIRESTSRX-UWVGGRQHSA-N Arg-Lys-Gly Chemical compound NCCCC[C@@H](C(=O)NCC(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CCCN=C(N)N NGTYEHIRESTSRX-UWVGGRQHSA-N 0.000 description 1
- INXWADWANGLMPJ-JYJNAYRXSA-N Arg-Phe-Arg Chemical compound NC(=N)NCCC[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(O)=O)CC1=CC=CC=C1 INXWADWANGLMPJ-JYJNAYRXSA-N 0.000 description 1
- FVBZXNSRIDVYJS-AVGNSLFASA-N Arg-Pro-Lys Chemical compound NCCCC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H]1CCCN1C(=O)[C@@H](N)CCCN=C(N)N FVBZXNSRIDVYJS-AVGNSLFASA-N 0.000 description 1
- VENMDXUVHSKEIN-GUBZILKMSA-N Arg-Ser-Arg Chemical compound NC(N)=NCCC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CCCN=C(N)N)C(O)=O VENMDXUVHSKEIN-GUBZILKMSA-N 0.000 description 1
- ICRHGPYYXMWHIE-LPEHRKFASA-N Arg-Ser-Pro Chemical compound C1C[C@@H](N(C1)C(=O)[C@H](CO)NC(=O)[C@H](CCCN=C(N)N)N)C(=O)O ICRHGPYYXMWHIE-LPEHRKFASA-N 0.000 description 1
- QHUOOCKNNURZSL-IHRRRGAJSA-N Arg-Tyr-Ser Chemical compound [H]N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O QHUOOCKNNURZSL-IHRRRGAJSA-N 0.000 description 1
- FTCGGKNCJZOPNB-WHFBIAKZSA-N Asn-Gly-Ser Chemical compound NC(=O)C[C@H](N)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O FTCGGKNCJZOPNB-WHFBIAKZSA-N 0.000 description 1
- COWITDLVHMZSIW-CIUDSAMLSA-N Asn-Lys-Ser Chemical compound [H]N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O COWITDLVHMZSIW-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 1
- FHCRKXCTKSHNOE-QEJZJMRPSA-N Asn-Trp-Glu Chemical compound C1=CC=C2C(=C1)C(=CN2)C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CCC(=O)O)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC(=O)N)N FHCRKXCTKSHNOE-QEJZJMRPSA-N 0.000 description 1
- AXXCUABIFZPKPM-BQBZGAKWSA-N Asp-Arg-Gly Chemical compound [H]N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)NCC(O)=O AXXCUABIFZPKPM-BQBZGAKWSA-N 0.000 description 1
- WEDGJJRCJNHYSF-SRVKXCTJSA-N Asp-Cys-Phe Chemical compound C1=CC=C(C=C1)C[C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CS)NC(=O)[C@H](CC(=O)O)N WEDGJJRCJNHYSF-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 1
- HSWYMWGDMPLTTH-FXQIFTODSA-N Asp-Glu-Gln Chemical compound [H]N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CCC(N)=O)C(O)=O HSWYMWGDMPLTTH-FXQIFTODSA-N 0.000 description 1
- TVIZQBFURPLQDV-DJFWLOJKSA-N Asp-His-Ile Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC1=CN=CN1)NC(=O)[C@H](CC(=O)O)N TVIZQBFURPLQDV-DJFWLOJKSA-N 0.000 description 1
- 241000894006 Bacteria Species 0.000 description 1
- 239000012619 Butyl Sepharose® Substances 0.000 description 1
- 102000004018 Caspase 6 Human genes 0.000 description 1
- 108090000425 Caspase 6 Proteins 0.000 description 1
- 241000282693 Cercopithecidae Species 0.000 description 1
- 108010073254 Colicins Proteins 0.000 description 1
- 102000004420 Creatine Kinase Human genes 0.000 description 1
- 108010042126 Creatine kinase Proteins 0.000 description 1
- KEBJBKIASQVRJS-WDSKDSINSA-N Cys-Gln-Gly Chemical compound C(CC(=O)N)[C@@H](C(=O)NCC(=O)O)NC(=O)[C@H](CS)N KEBJBKIASQVRJS-WDSKDSINSA-N 0.000 description 1
- ZEXHDOQQYZKOIB-ACZMJKKPSA-N Cys-Glu-Ser Chemical compound [H]N[C@@H](CS)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O ZEXHDOQQYZKOIB-ACZMJKKPSA-N 0.000 description 1
- HAYVLBZZBDCKRA-SRVKXCTJSA-N Cys-His-Lys Chemical compound C1=C(NC=N1)C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CS)N HAYVLBZZBDCKRA-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 1
- SRIRHERUAMYIOQ-CIUDSAMLSA-N Cys-Leu-Ser Chemical compound [H]N[C@@H](CS)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O SRIRHERUAMYIOQ-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 1
- NAPULYCVEVVFRB-HEIBUPTGSA-N Cys-Thr-Thr Chemical compound C[C@@H](O)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H]([C@@H](C)O)NC(=O)[C@@H](N)CS NAPULYCVEVVFRB-HEIBUPTGSA-N 0.000 description 1
- MHYHLWUGWUBUHF-GUBZILKMSA-N Cys-Val-Arg Chemical compound CC(C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CCCN=C(N)N)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CS)N MHYHLWUGWUBUHF-GUBZILKMSA-N 0.000 description 1
- YQEHNIKPAOPBNH-DCAQKATOSA-N Cys-Val-Lys Chemical compound CC(C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CS)N YQEHNIKPAOPBNH-DCAQKATOSA-N 0.000 description 1
- 102000004127 Cytokines Human genes 0.000 description 1
- 108090000695 Cytokines Proteins 0.000 description 1
- 229920002271 DEAE-Sepharose Polymers 0.000 description 1
- 102000053602 DNA Human genes 0.000 description 1
- 108010041986 DNA Vaccines Proteins 0.000 description 1
- 229940021995 DNA vaccine Drugs 0.000 description 1
- KCXVZYZYPLLWCC-UHFFFAOYSA-N EDTA Chemical compound OC(=O)CN(CC(O)=O)CCN(CC(O)=O)CC(O)=O KCXVZYZYPLLWCC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 238000008157 ELISA kit Methods 0.000 description 1
- 241000233866 Fungi Species 0.000 description 1
- WMOMPXKOKASNBK-PEFMBERDSA-N Gln-Asn-Ile Chemical compound [H]N[C@@H](CCC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(O)=O WMOMPXKOKASNBK-PEFMBERDSA-N 0.000 description 1
- WQWMZOIPXWSZNE-WDSKDSINSA-N Gln-Asp-Gly Chemical compound [H]N[C@@H](CCC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)NCC(O)=O WQWMZOIPXWSZNE-WDSKDSINSA-N 0.000 description 1
- LPYPANUXJGFMGV-FXQIFTODSA-N Gln-Gln-Ala Chemical compound C[C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CCC(=O)N)NC(=O)[C@H](CCC(=O)N)N LPYPANUXJGFMGV-FXQIFTODSA-N 0.000 description 1
- UFNSPPFJOHNXRE-AUTRQRHGSA-N Gln-Gln-Val Chemical compound [H]N[C@@H](CCC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CCC(N)=O)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(O)=O UFNSPPFJOHNXRE-AUTRQRHGSA-N 0.000 description 1
- MFORDNZDKAVNSR-SRVKXCTJSA-N Gln-Pro-Lys Chemical compound NCCCC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H]1CCCN1C(=O)[C@@H](N)CCC(N)=O MFORDNZDKAVNSR-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 1
- LPIKVBWNNVFHCQ-GUBZILKMSA-N Gln-Ser-Leu Chemical compound [H]N[C@@H](CCC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O LPIKVBWNNVFHCQ-GUBZILKMSA-N 0.000 description 1
- RLZBLVSJDFHDBL-KBIXCLLPSA-N Glu-Ala-Ile Chemical compound [H]N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(O)=O RLZBLVSJDFHDBL-KBIXCLLPSA-N 0.000 description 1
- ZOXBSICWUDAOHX-GUBZILKMSA-N Glu-Asn-Leu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](CC(N)=O)NC(=O)[C@@H](N)CCC(O)=O ZOXBSICWUDAOHX-GUBZILKMSA-N 0.000 description 1
- OBIHEDRRSMRKLU-ACZMJKKPSA-N Glu-Cys-Asp Chemical compound C(CC(=O)O)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CS)C(=O)N[C@@H](CC(=O)O)C(=O)O)N OBIHEDRRSMRKLU-ACZMJKKPSA-N 0.000 description 1
- CLROYXHHUZELFX-FXQIFTODSA-N Glu-Gln-Asp Chemical compound [H]N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CCC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(O)=O CLROYXHHUZELFX-FXQIFTODSA-N 0.000 description 1
- BUAKRRKDHSSIKK-IHRRRGAJSA-N Glu-Glu-Tyr Chemical compound OC(=O)CC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CC=C(O)C=C1 BUAKRRKDHSSIKK-IHRRRGAJSA-N 0.000 description 1
- HVYWQYLBVXMXSV-GUBZILKMSA-N Glu-Leu-Ala Chemical compound [H]N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](C)C(O)=O HVYWQYLBVXMXSV-GUBZILKMSA-N 0.000 description 1
- MWMJCGBSIORNCD-AVGNSLFASA-N Glu-Leu-Leu Chemical compound [H]N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O MWMJCGBSIORNCD-AVGNSLFASA-N 0.000 description 1
- AAJHGGDRKHYSDH-GUBZILKMSA-N Glu-Pro-Gln Chemical compound C1C[C@H](N(C1)C(=O)[C@H](CCC(=O)O)N)C(=O)N[C@@H](CCC(=O)N)C(=O)O AAJHGGDRKHYSDH-GUBZILKMSA-N 0.000 description 1
- PAZQYODKOZHXGA-SRVKXCTJSA-N Glu-Pro-His Chemical compound N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](Cc1cnc[nH]1)C(O)=O PAZQYODKOZHXGA-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 1
- TWYSSILQABLLME-HJGDQZAQSA-N Glu-Thr-Arg Chemical compound [H]N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(O)=O TWYSSILQABLLME-HJGDQZAQSA-N 0.000 description 1
- QVXWAFZDWRLXTI-NWLDYVSISA-N Glu-Thr-Trp Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)N[C@@H](CC1=CNC2=CC=CC=C21)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CCC(=O)O)N)O QVXWAFZDWRLXTI-NWLDYVSISA-N 0.000 description 1
- DLISPGXMKZTWQG-IFFSRLJSSA-N Glu-Thr-Val Chemical compound [H]N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(O)=O DLISPGXMKZTWQG-IFFSRLJSSA-N 0.000 description 1
- 101710102075 Glutathione S-transferase 1 Proteins 0.000 description 1
- DBUNZBWUWCIELX-JHEQGTHGSA-N Gly-Thr-Glu Chemical compound [H]NCC(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O DBUNZBWUWCIELX-JHEQGTHGSA-N 0.000 description 1
- HTTJABKRGRZYRN-UHFFFAOYSA-N Heparin Chemical compound OC1C(NC(=O)C)C(O)OC(COS(O)(=O)=O)C1OC1C(OS(O)(=O)=O)C(O)C(OC2C(C(OS(O)(=O)=O)C(OC3C(C(O)C(O)C(O3)C(O)=O)OS(O)(=O)=O)C(CO)O2)NS(O)(=O)=O)C(C(O)=O)O1 HTTJABKRGRZYRN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- FZKFYOXDVWDELO-KBPBESRZSA-N His-Gly-Tyr Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CNC=N1)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(O)=O FZKFYOXDVWDELO-KBPBESRZSA-N 0.000 description 1
- FSOXZQBMPBQKGJ-QSFUFRPTSA-N His-Ile-Ala Chemical compound [O-]C(=O)[C@H](C)NC(=O)[C@H]([C@@H](C)CC)NC(=O)[C@@H]([NH3+])CC1=CN=CN1 FSOXZQBMPBQKGJ-QSFUFRPTSA-N 0.000 description 1
- PZAJPILZRFPYJJ-SRVKXCTJSA-N His-Ser-Leu Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CNC=N1)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O PZAJPILZRFPYJJ-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 1
- XGBVLRJLHUVCNK-DCAQKATOSA-N His-Val-Ser Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CNC=N1)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O XGBVLRJLHUVCNK-DCAQKATOSA-N 0.000 description 1
- GRRNUXAQVGOGFE-UHFFFAOYSA-N Hygromycin-B Natural products OC1C(NC)CC(N)C(O)C1OC1C2OC3(C(C(O)C(O)C(C(N)CO)O3)O)OC2C(O)C(CO)O1 GRRNUXAQVGOGFE-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- UKTUOMWSJPXODT-GUDRVLHUSA-N Ile-Asn-Pro Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC(=O)N)C(=O)N1CCC[C@@H]1C(=O)O)N UKTUOMWSJPXODT-GUDRVLHUSA-N 0.000 description 1
- ZDNORQNHCJUVOV-KBIXCLLPSA-N Ile-Gln-Ala Chemical compound CC[C@H](C)[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CCC(N)=O)C(=O)N[C@@H](C)C(O)=O ZDNORQNHCJUVOV-KBIXCLLPSA-N 0.000 description 1
- DFJJAVZIHDFOGQ-MNXVOIDGSA-N Ile-Glu-Lys Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CCC(=O)O)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)O)N DFJJAVZIHDFOGQ-MNXVOIDGSA-N 0.000 description 1
- PZWBBXHHUSIGKH-OSUNSFLBSA-N Ile-Thr-Arg Chemical compound CC[C@H](C)[C@H](N)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCCN=C(N)N PZWBBXHHUSIGKH-OSUNSFLBSA-N 0.000 description 1
- HQLSBZFLOUHQJK-STECZYCISA-N Ile-Tyr-Arg Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC1=CC=C(C=C1)O)C(=O)N[C@@H](CCCN=C(N)N)C(=O)O)N HQLSBZFLOUHQJK-STECZYCISA-N 0.000 description 1
- 229930010555 Inosine Natural products 0.000 description 1
- UGQMRVRMYYASKQ-KQYNXXCUSA-N Inosine Chemical compound O[C@@H]1[C@H](O)[C@@H](CO)O[C@H]1N1C2=NC=NC(O)=C2N=C1 UGQMRVRMYYASKQ-KQYNXXCUSA-N 0.000 description 1
- 108010079091 KRDS peptide Proteins 0.000 description 1
- QNAYBMKLOCPYGJ-REOHCLBHSA-N L-alanine Chemical compound C[C@H](N)C(O)=O QNAYBMKLOCPYGJ-REOHCLBHSA-N 0.000 description 1
- SENJXOPIZNYLHU-UHFFFAOYSA-N L-leucyl-L-arginine Natural products CC(C)CC(N)C(=O)NC(C(O)=O)CCCN=C(N)N SENJXOPIZNYLHU-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- FFEARJCKVFRZRR-BYPYZUCNSA-N L-methionine Chemical compound CSCC[C@H](N)C(O)=O FFEARJCKVFRZRR-BYPYZUCNSA-N 0.000 description 1
- 108010047294 Lamins Proteins 0.000 description 1
- 102000006835 Lamins Human genes 0.000 description 1
- ZRLUISBDKUWAIZ-CIUDSAMLSA-N Leu-Ala-Asp Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC(O)=O ZRLUISBDKUWAIZ-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 1
- QUAAUWNLWMLERT-IHRRRGAJSA-N Leu-Arg-Leu Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CCCN=C(N)N)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O QUAAUWNLWMLERT-IHRRRGAJSA-N 0.000 description 1
- PPBKJAQJAUHZKX-SRVKXCTJSA-N Leu-Cys-Leu Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CS)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC(C)C PPBKJAQJAUHZKX-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 1
- FOEHRHOBWFQSNW-KATARQTJSA-N Leu-Cys-Thr Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CS)NC(=O)[C@H](CC(C)C)N)O FOEHRHOBWFQSNW-KATARQTJSA-N 0.000 description 1
- OYQUOLRTJHWVSQ-SRVKXCTJSA-N Leu-His-Ser Chemical compound [H]N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CC1=CNC=N1)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O OYQUOLRTJHWVSQ-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 1
- KYIIALJHAOIAHF-KKUMJFAQSA-N Leu-Leu-His Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CN=CN1 KYIIALJHAOIAHF-KKUMJFAQSA-N 0.000 description 1
- RXGLHDWAZQECBI-SRVKXCTJSA-N Leu-Leu-Ser Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O RXGLHDWAZQECBI-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 1
- VCHVSKNMTXWIIP-SRVKXCTJSA-N Leu-Lys-Ser Chemical compound [H]N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O VCHVSKNMTXWIIP-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 1
- UCBPDSYUVAAHCD-UWVGGRQHSA-N Leu-Pro-Gly Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N1CCC[C@H]1C(=O)NCC(O)=O UCBPDSYUVAAHCD-UWVGGRQHSA-N 0.000 description 1
- 208000008771 Lymphadenopathy Diseases 0.000 description 1
- SWWCDAGDQHTKIE-RHYQMDGZSA-N Lys-Arg-Thr Chemical compound [H]N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O SWWCDAGDQHTKIE-RHYQMDGZSA-N 0.000 description 1
- LLSUNJYOSCOOEB-GUBZILKMSA-N Lys-Glu-Asp Chemical compound NCCCC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(O)=O LLSUNJYOSCOOEB-GUBZILKMSA-N 0.000 description 1
- PGLGNCVOWIORQE-SRVKXCTJSA-N Lys-His-Ser Chemical compound [H]N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CC1=CNC=N1)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O PGLGNCVOWIORQE-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 1
- LJADEBULDNKJNK-IHRRRGAJSA-N Lys-Leu-Val Chemical compound CC(C)C[C@H](NC(=O)[C@@H](N)CCCCN)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(O)=O LJADEBULDNKJNK-IHRRRGAJSA-N 0.000 description 1
- ZJWIXBZTAAJERF-IHRRRGAJSA-N Lys-Lys-Arg Chemical compound NCCCC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCCN=C(N)N ZJWIXBZTAAJERF-IHRRRGAJSA-N 0.000 description 1
- CAVRAQIDHUPECU-UVOCVTCTSA-N Lys-Thr-Thr Chemical compound [H]N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O CAVRAQIDHUPECU-UVOCVTCTSA-N 0.000 description 1
- RPEPZINUYHUBKG-FXQIFTODSA-N Met-Cys-Ala Chemical compound [H]N[C@@H](CCSC)C(=O)N[C@@H](CS)C(=O)N[C@@H](C)C(O)=O RPEPZINUYHUBKG-FXQIFTODSA-N 0.000 description 1
- NCFZHKMKRCYQBJ-CIUDSAMLSA-N Met-Cys-Gln Chemical compound CSCC[C@@H](C(=O)N[C@@H](CS)C(=O)N[C@@H](CCC(=O)N)C(=O)O)N NCFZHKMKRCYQBJ-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 1
- 206010027476 Metastases Diseases 0.000 description 1
- 101000950908 Mus musculus DNA fragmentation factor subunit alpha Proteins 0.000 description 1
- 108010021466 Mutant Proteins Proteins 0.000 description 1
- 102000008300 Mutant Proteins Human genes 0.000 description 1
- AUEJLPRZGVVDNU-UHFFFAOYSA-N N-L-tyrosyl-L-leucine Natural products CC(C)CC(C(O)=O)NC(=O)C(N)CC1=CC=C(O)C=C1 AUEJLPRZGVVDNU-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- KZNQNBZMBZJQJO-UHFFFAOYSA-N N-glycyl-L-proline Natural products NCC(=O)N1CCCC1C(O)=O KZNQNBZMBZJQJO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 108010002311 N-glycylglutamic acid Proteins 0.000 description 1
- 108091093105 Nuclear DNA Proteins 0.000 description 1
- 108010047956 Nucleosomes Proteins 0.000 description 1
- 108700026244 Open Reading Frames Proteins 0.000 description 1
- 241000283973 Oryctolagus cuniculus Species 0.000 description 1
- 239000007990 PIPES buffer Substances 0.000 description 1
- 239000002033 PVDF binder Substances 0.000 description 1
- KAGCQPSEVAETCA-JYJNAYRXSA-N Phe-Gln-Leu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CCC(=O)N)NC(=O)[C@H](CC1=CC=CC=C1)N KAGCQPSEVAETCA-JYJNAYRXSA-N 0.000 description 1
- FIRWJEJVFFGXSH-RYUDHWBXSA-N Phe-Glu-Gly Chemical compound OC(=O)CNC(=O)[C@H](CCC(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=CC=C1 FIRWJEJVFFGXSH-RYUDHWBXSA-N 0.000 description 1
- HNFUGJUZJRYUHN-JSGCOSHPSA-N Phe-Gly-Val Chemical compound CC(C)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)CNC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=CC=C1 HNFUGJUZJRYUHN-JSGCOSHPSA-N 0.000 description 1
- YCCUXNNKXDGMAM-KKUMJFAQSA-N Phe-Leu-Ser Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O YCCUXNNKXDGMAM-KKUMJFAQSA-N 0.000 description 1
- IAOZOFPONWDXNT-IXOXFDKPSA-N Phe-Ser-Thr Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O IAOZOFPONWDXNT-IXOXFDKPSA-N 0.000 description 1
- GMWNQSGWWGKTSF-LFSVMHDDSA-N Phe-Thr-Ala Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](C)C(O)=O GMWNQSGWWGKTSF-LFSVMHDDSA-N 0.000 description 1
- 206010035226 Plasma cell myeloma Diseases 0.000 description 1
- 241000276498 Pollachius virens Species 0.000 description 1
- 102000004257 Potassium Channel Human genes 0.000 description 1
- SMCHPSMKAFIERP-FXQIFTODSA-N Pro-Asn-Asp Chemical compound OC(=O)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](CC(=O)N)NC(=O)[C@@H]1CCCN1 SMCHPSMKAFIERP-FXQIFTODSA-N 0.000 description 1
- XZONQWUEBAFQPO-HJGDQZAQSA-N Pro-Gln-Thr Chemical compound [H]N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](CCC(N)=O)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O XZONQWUEBAFQPO-HJGDQZAQSA-N 0.000 description 1
- NMELOOXSGDRBRU-YUMQZZPRSA-N Pro-Glu-Gly Chemical compound OC(=O)CNC(=O)[C@H](CCC(=O)O)NC(=O)[C@@H]1CCCN1 NMELOOXSGDRBRU-YUMQZZPRSA-N 0.000 description 1
- FKLSMYYLJHYPHH-UWVGGRQHSA-N Pro-Gly-Leu Chemical compound [H]N1CCC[C@H]1C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O FKLSMYYLJHYPHH-UWVGGRQHSA-N 0.000 description 1
- OFGUOWQVEGTVNU-DCAQKATOSA-N Pro-Lys-Ala Chemical compound [H]N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](C)C(O)=O OFGUOWQVEGTVNU-DCAQKATOSA-N 0.000 description 1
- ANESFYPBAJPYNJ-SDDRHHMPSA-N Pro-Met-Pro Chemical compound CSCC[C@@H](C(=O)N1CCC[C@@H]1C(=O)O)NC(=O)[C@@H]2CCCN2 ANESFYPBAJPYNJ-SDDRHHMPSA-N 0.000 description 1
- AWQGDZBKQTYNMN-IHRRRGAJSA-N Pro-Phe-Asp Chemical compound C1C[C@H](NC1)C(=O)N[C@@H](CC2=CC=CC=C2)C(=O)N[C@@H](CC(=O)O)C(=O)O AWQGDZBKQTYNMN-IHRRRGAJSA-N 0.000 description 1
- XSXABUHLKPUVLX-JYJNAYRXSA-N Pro-Ser-Trp Chemical compound C1C[C@H](NC1)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CC2=CNC3=CC=CC=C32)C(=O)O XSXABUHLKPUVLX-JYJNAYRXSA-N 0.000 description 1
- 229940124158 Protease/peptidase inhibitor Drugs 0.000 description 1
- 102100031953 Protein 4.2 Human genes 0.000 description 1
- 101710196267 Protein 4.2 Proteins 0.000 description 1
- 101710130181 Protochlorophyllide reductase A, chloroplastic Proteins 0.000 description 1
- 108091034057 RNA (poly(A)) Proteins 0.000 description 1
- 239000013614 RNA sample Substances 0.000 description 1
- 101100221606 Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) COS7 gene Proteins 0.000 description 1
- FIXILCYTSAUERA-FXQIFTODSA-N Ser-Ala-Arg Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(O)=O FIXILCYTSAUERA-FXQIFTODSA-N 0.000 description 1
- PZZJMBYSYAKYPK-UWJYBYFXSA-N Ser-Ala-Tyr Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(O)=O PZZJMBYSYAKYPK-UWJYBYFXSA-N 0.000 description 1
- TUYBIWUZWJUZDD-ACZMJKKPSA-N Ser-Cys-Gln Chemical compound OC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CS)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCC(N)=O TUYBIWUZWJUZDD-ACZMJKKPSA-N 0.000 description 1
- VMLONWHIORGALA-SRVKXCTJSA-N Ser-Leu-Leu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C([O-])=O)NC(=O)[C@H](CC(C)C)NC(=O)[C@@H]([NH3+])CO VMLONWHIORGALA-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 1
- KQNDIKOYWZTZIX-FXQIFTODSA-N Ser-Ser-Arg Chemical compound OC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCCNC(N)=N KQNDIKOYWZTZIX-FXQIFTODSA-N 0.000 description 1
- JGUWRQWULDWNCM-FXQIFTODSA-N Ser-Val-Ser Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O JGUWRQWULDWNCM-FXQIFTODSA-N 0.000 description 1
- 206010041660 Splenomegaly Diseases 0.000 description 1
- 210000001744 T-lymphocyte Anatomy 0.000 description 1
- TYVAWPFQYFPSBR-BFHQHQDPSA-N Thr-Ala-Gly Chemical compound [H]N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)NCC(O)=O TYVAWPFQYFPSBR-BFHQHQDPSA-N 0.000 description 1
- FKIGTIXHSRNKJU-IXOXFDKPSA-N Thr-His-Lys Chemical compound NCCCC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](NC(=O)[C@@H](N)[C@H](O)C)CC1=CN=CN1 FKIGTIXHSRNKJU-IXOXFDKPSA-N 0.000 description 1
- BVOVIGCHYNFJBZ-JXUBOQSCSA-N Thr-Leu-Ala Chemical compound [H]N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](C)C(O)=O BVOVIGCHYNFJBZ-JXUBOQSCSA-N 0.000 description 1
- XZUBGOYOGDRYFC-XGEHTFHBSA-N Thr-Ser-Met Chemical compound [H]N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CCSC)C(O)=O XZUBGOYOGDRYFC-XGEHTFHBSA-N 0.000 description 1
- ADBFWLXCCKIXBQ-XIRDDKMYSA-N Trp-Asn-Leu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC(=O)N)NC(=O)[C@H](CC1=CNC2=CC=CC=C21)N ADBFWLXCCKIXBQ-XIRDDKMYSA-N 0.000 description 1
- DVAAUUVLDFKTAQ-VHWLVUOQSA-N Trp-Asp-Ile Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC(=O)O)NC(=O)[C@H](CC1=CNC2=CC=CC=C21)N DVAAUUVLDFKTAQ-VHWLVUOQSA-N 0.000 description 1
- GIAMKIPJSRZVJB-IHPCNDPISA-N Trp-Phe-Ser Chemical compound C1=CC=C(C=C1)C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC2=CNC3=CC=CC=C32)N GIAMKIPJSRZVJB-IHPCNDPISA-N 0.000 description 1
- 108060008682 Tumor Necrosis Factor Proteins 0.000 description 1
- 102100031988 Tumor necrosis factor ligand superfamily member 6 Human genes 0.000 description 1
- 108050002568 Tumor necrosis factor ligand superfamily member 6 Proteins 0.000 description 1
- HKYTWJOWZTWBQB-AVGNSLFASA-N Tyr-Glu-Asp Chemical compound OC(=O)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](CCC(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=C(O)C=C1 HKYTWJOWZTWBQB-AVGNSLFASA-N 0.000 description 1
- CDHQEOXPWBDFPL-QWRGUYRKSA-N Tyr-Gly-Asn Chemical compound NC(=O)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)CNC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=C(O)C=C1 CDHQEOXPWBDFPL-QWRGUYRKSA-N 0.000 description 1
- PHKQVWWHRYUCJL-HJOGWXRNSA-N Tyr-Phe-Tyr Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(O)=O PHKQVWWHRYUCJL-HJOGWXRNSA-N 0.000 description 1
- 108090000848 Ubiquitin Proteins 0.000 description 1
- 102000044159 Ubiquitin Human genes 0.000 description 1
- VLOYGOZDPGYWFO-LAEOZQHASA-N Val-Asp-Glu Chemical compound CC(C)[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O VLOYGOZDPGYWFO-LAEOZQHASA-N 0.000 description 1
- AAOPYWQQBXHINJ-DZKIICNBSA-N Val-Gln-Tyr Chemical compound CC(C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CCC(=O)N)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=C(C=C1)O)C(=O)O)N AAOPYWQQBXHINJ-DZKIICNBSA-N 0.000 description 1
- SYOMXKPPFZRELL-ONGXEEELSA-N Val-Gly-Lys Chemical compound CC(C)[C@@H](C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)O)N SYOMXKPPFZRELL-ONGXEEELSA-N 0.000 description 1
- OTJMMKPMLUNTQT-AVGNSLFASA-N Val-Leu-Arg Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CCCN=C(N)N)C(=O)O)NC(=O)[C@H](C(C)C)N OTJMMKPMLUNTQT-AVGNSLFASA-N 0.000 description 1
- UMPVMAYCLYMYGA-ONGXEEELSA-N Val-Leu-Gly Chemical compound CC(C)[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)NCC(O)=O UMPVMAYCLYMYGA-ONGXEEELSA-N 0.000 description 1
- NZGOVKLVQNOEKP-YDHLFZDLSA-N Val-Phe-Asn Chemical compound CC(C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)N[C@@H](CC(=O)N)C(=O)O)N NZGOVKLVQNOEKP-YDHLFZDLSA-N 0.000 description 1
- LTTQCQRTSHJPPL-ZKWXMUAHSA-N Val-Ser-Asp Chemical compound CC(C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CC(=O)O)C(=O)O)N LTTQCQRTSHJPPL-ZKWXMUAHSA-N 0.000 description 1
- DLRZGNXCXUGIDG-KKHAAJSZSA-N Val-Thr-Asp Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)N[C@@H](CC(=O)O)C(=O)O)NC(=O)[C@H](C(C)C)N)O DLRZGNXCXUGIDG-KKHAAJSZSA-N 0.000 description 1
- JSOXWWFKRJKTMT-WOPDTQHZSA-N Val-Val-Pro Chemical compound CC(C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)N1CCC[C@@H]1C(=O)O)N JSOXWWFKRJKTMT-WOPDTQHZSA-N 0.000 description 1
- 241000700605 Viruses Species 0.000 description 1
- JLCPHMBAVCMARE-UHFFFAOYSA-N [3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[5-(2-amino-6-oxo-1H-purin-9-yl)-3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[5-(2-amino-6-oxo-1H-purin-9-yl)-3-[[5-(2-amino-6-oxo-1H-purin-9-yl)-3-hydroxyoxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxyoxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxyoxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methyl [5-(6-aminopurin-9-yl)-2-(hydroxymethyl)oxolan-3-yl] hydrogen phosphate Polymers Cc1cn(C2CC(OP(O)(=O)OCC3OC(CC3OP(O)(=O)OCC3OC(CC3O)n3cnc4c3nc(N)[nH]c4=O)n3cnc4c3nc(N)[nH]c4=O)C(COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3CO)n3cnc4c(N)ncnc34)n3ccc(N)nc3=O)n3cnc4c(N)ncnc34)n3ccc(N)nc3=O)n3ccc(N)nc3=O)n3ccc(N)nc3=O)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cc(C)c(=O)[nH]c3=O)n3cc(C)c(=O)[nH]c3=O)n3ccc(N)nc3=O)n3cc(C)c(=O)[nH]c3=O)n3cnc4c3nc(N)[nH]c4=O)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cnc4c(N)ncnc34)O2)c(=O)[nH]c1=O JLCPHMBAVCMARE-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 238000002835 absorbance Methods 0.000 description 1
- 238000001042 affinity chromatography Methods 0.000 description 1
- 235000004279 alanine Nutrition 0.000 description 1
- 239000002246 antineoplastic agent Substances 0.000 description 1
- 229940041181 antineoplastic drug Drugs 0.000 description 1
- 230000005775 apoptotic pathway Effects 0.000 description 1
- 238000013459 approach Methods 0.000 description 1
- 229960004405 aprotinin Drugs 0.000 description 1
- 108010013835 arginine glutamate Proteins 0.000 description 1
- 108010038850 arginyl-isoleucyl-tyrosine Proteins 0.000 description 1
- 108010093581 aspartyl-proline Proteins 0.000 description 1
- GIXWDMTZECRIJT-UHFFFAOYSA-N aurintricarboxylic acid Chemical compound C1=CC(=O)C(C(=O)O)=CC1=C(C=1C=C(C(O)=CC=1)C(O)=O)C1=CC=C(O)C(C(O)=O)=C1 GIXWDMTZECRIJT-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 230000001580 bacterial effect Effects 0.000 description 1
- 238000012742 biochemical analysis Methods 0.000 description 1
- 229960002685 biotin Drugs 0.000 description 1
- 235000020958 biotin Nutrition 0.000 description 1
- 239000011616 biotin Substances 0.000 description 1
- 210000004899 c-terminal region Anatomy 0.000 description 1
- 238000010822 cell death assay Methods 0.000 description 1
- 230000024245 cell differentiation Effects 0.000 description 1
- 230000001876 chaperonelike Effects 0.000 description 1
- 210000000078 claw Anatomy 0.000 description 1
- 238000010367 cloning Methods 0.000 description 1
- 230000004186 co-expression Effects 0.000 description 1
- 238000000749 co-immunoprecipitation Methods 0.000 description 1
- 238000012761 co-transfection Methods 0.000 description 1
- 239000012141 concentrate Substances 0.000 description 1
- 238000009833 condensation Methods 0.000 description 1
- 230000005494 condensation Effects 0.000 description 1
- 238000012790 confirmation Methods 0.000 description 1
- 230000021615 conjugation Effects 0.000 description 1
- 238000012258 culturing Methods 0.000 description 1
- UKJLNMAFNRKWGR-UHFFFAOYSA-N cyclohexatrienamine Chemical group NC1=CC=C=C[CH]1 UKJLNMAFNRKWGR-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 125000000151 cysteine group Chemical group N[C@@H](CS)C(=O)* 0.000 description 1
- 210000001151 cytotoxic T lymphocyte Anatomy 0.000 description 1
- 230000003247 decreasing effect Effects 0.000 description 1
- 230000001419 dependent effect Effects 0.000 description 1
- 238000010494 dissociation reaction Methods 0.000 description 1
- 230000005593 dissociations Effects 0.000 description 1
- 229940079593 drug Drugs 0.000 description 1
- 239000003814 drug Substances 0.000 description 1
- 230000004064 dysfunction Effects 0.000 description 1
- 239000012636 effector Substances 0.000 description 1
- 230000009881 electrostatic interaction Effects 0.000 description 1
- 230000008030 elimination Effects 0.000 description 1
- 238000003379 elimination reaction Methods 0.000 description 1
- 210000003527 eukaryotic cell Anatomy 0.000 description 1
- 239000011536 extraction buffer Substances 0.000 description 1
- 108010052621 fas Receptor Proteins 0.000 description 1
- 102000018823 fas Receptor Human genes 0.000 description 1
- 108010006620 fodrin Proteins 0.000 description 1
- 238000001415 gene therapy Methods 0.000 description 1
- 239000011521 glass Substances 0.000 description 1
- 108010042598 glutamyl-aspartyl-glycine Proteins 0.000 description 1
- 108010008237 glutamyl-valyl-glycine Proteins 0.000 description 1
- 229960004198 guanidine Drugs 0.000 description 1
- 238000010438 heat treatment Methods 0.000 description 1
- 108010040030 histidinoalanine Proteins 0.000 description 1
- 108010028295 histidylhistidine Proteins 0.000 description 1
- 230000013632 homeostatic process Effects 0.000 description 1
- GRRNUXAQVGOGFE-NZSRVPFOSA-N hygromycin B Chemical compound O[C@@H]1[C@@H](NC)C[C@@H](N)[C@H](O)[C@H]1O[C@H]1[C@H]2O[C@@]3([C@@H]([C@@H](O)[C@@H](O)[C@@H](C(N)CO)O3)O)O[C@H]2[C@@H](O)[C@@H](CO)O1 GRRNUXAQVGOGFE-NZSRVPFOSA-N 0.000 description 1
- 229940097277 hygromycin b Drugs 0.000 description 1
- 230000036039 immunity Effects 0.000 description 1
- 230000003053 immunization Effects 0.000 description 1
- 239000012133 immunoprecipitate Substances 0.000 description 1
- 230000001976 improved effect Effects 0.000 description 1
- 238000007901 in situ hybridization Methods 0.000 description 1
- 238000000099 in vitro assay Methods 0.000 description 1
- 238000011065 in-situ storage Methods 0.000 description 1
- 230000002401 inhibitory effect Effects 0.000 description 1
- 230000005764 inhibitory process Effects 0.000 description 1
- ZPNFWUPYTFPOJU-LPYSRVMUSA-N iniprol Chemical compound C([C@H]1C(=O)NCC(=O)NCC(=O)N[C@H]2CSSC[C@H]3C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@H](C(N[C@H](C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CC=4C=CC(O)=CC=4)C(=O)N[C@@H](CC=4C=CC=CC=4)C(=O)N[C@@H](CC=4C=CC(O)=CC=4)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CSSC[C@H](NC(=O)[C@H](CC(O)=O)NC(=O)[C@H](CCC(O)=O)NC(=O)[C@H](C)NC(=O)[C@H](CO)NC(=O)[C@H](CCCCN)NC(=O)[C@H](CC=4C=CC=CC=4)NC(=O)[C@H](CC(N)=O)NC(=O)[C@H](CC(N)=O)NC(=O)[C@H](CCCNC(N)=N)NC(=O)[C@H](CCCCN)NC(=O)[C@H](C)NC(=O)[C@H](CCCNC(N)=N)NC2=O)C(=O)N[C@@H](CCSC)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CSSC[C@H](NC(=O)[C@H](CC=2C=CC=CC=2)NC(=O)[C@H](CC(O)=O)NC(=O)[C@H]2N(CCC2)C(=O)[C@@H](N)CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N2[C@@H](CCC2)C(=O)N2[C@@H](CCC2)C(=O)N[C@@H](CC=2C=CC(O)=CC=2)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)NCC(=O)N2[C@@H](CCC2)C(=O)N3)C(=O)NCC(=O)NCC(=O)N[C@@H](C)C(O)=O)C(=O)N[C@@H](CCC(N)=O)C(=O)N[C@H](C(=O)N[C@@H](CC=2C=CC=CC=2)C(=O)N[C@H](C(=O)N1)C(C)C)[C@@H](C)O)[C@@H](C)CC)=O)[C@@H](C)CC)C1=CC=C(O)C=C1 ZPNFWUPYTFPOJU-LPYSRVMUSA-N 0.000 description 1
- 229960003786 inosine Drugs 0.000 description 1
- 230000003993 interaction Effects 0.000 description 1
- 230000003834 intracellular effect Effects 0.000 description 1
- 210000005061 intracellular organelle Anatomy 0.000 description 1
- 230000002147 killing effect Effects 0.000 description 1
- 210000005053 lamin Anatomy 0.000 description 1
- 108010000761 leucylarginine Proteins 0.000 description 1
- 239000002502 liposome Substances 0.000 description 1
- 230000004807 localization Effects 0.000 description 1
- 210000004072 lung Anatomy 0.000 description 1
- 208000018555 lymphatic system disease Diseases 0.000 description 1
- 210000004698 lymphocyte Anatomy 0.000 description 1
- 210000003712 lysosome Anatomy 0.000 description 1
- 230000001868 lysosomic effect Effects 0.000 description 1
- 108010044348 lysyl-glutamyl-aspartic acid Proteins 0.000 description 1
- 210000004962 mammalian cell Anatomy 0.000 description 1
- 230000010311 mammalian development Effects 0.000 description 1
- 239000000463 material Substances 0.000 description 1
- 230000009401 metastasis Effects 0.000 description 1
- 210000000110 microvilli Anatomy 0.000 description 1
- 229940126619 mouse monoclonal antibody Drugs 0.000 description 1
- 230000035772 mutation Effects 0.000 description 1
- 201000000050 myeloid neoplasm Diseases 0.000 description 1
- 210000002569 neuron Anatomy 0.000 description 1
- 230000003472 neutralizing effect Effects 0.000 description 1
- 230000004987 nonapoptotic effect Effects 0.000 description 1
- 210000001623 nucleosome Anatomy 0.000 description 1
- 210000001672 ovary Anatomy 0.000 description 1
- 230000002018 overexpression Effects 0.000 description 1
- 239000000137 peptide hydrolase inhibitor Substances 0.000 description 1
- 229950007002 phosphocreatine Drugs 0.000 description 1
- 229920002981 polyvinylidene fluoride Polymers 0.000 description 1
- 230000001323 posttranslational effect Effects 0.000 description 1
- 108020001213 potassium channel Proteins 0.000 description 1
- 230000003389 potentiating effect Effects 0.000 description 1
- 238000002360 preparation method Methods 0.000 description 1
- 238000012545 processing Methods 0.000 description 1
- 210000001236 prokaryotic cell Anatomy 0.000 description 1
- 230000035755 proliferation Effects 0.000 description 1
- 230000012846 protein folding Effects 0.000 description 1
- 238000001742 protein purification Methods 0.000 description 1
- 230000017854 proteolysis Effects 0.000 description 1
- 238000010791 quenching Methods 0.000 description 1
- 239000002994 raw material Substances 0.000 description 1
- 108020003175 receptors Proteins 0.000 description 1
- 102000005962 receptors Human genes 0.000 description 1
- 238000005215 recombination Methods 0.000 description 1
- 230000006798 recombination Effects 0.000 description 1
- 238000011084 recovery Methods 0.000 description 1
- 230000008929 regeneration Effects 0.000 description 1
- 238000011069 regeneration method Methods 0.000 description 1
- 230000001105 regulatory effect Effects 0.000 description 1
- 210000001995 reticulocyte Anatomy 0.000 description 1
- 230000002441 reversible effect Effects 0.000 description 1
- 239000013049 sediment Substances 0.000 description 1
- 230000001235 sensitizing effect Effects 0.000 description 1
- 238000012163 sequencing technique Methods 0.000 description 1
- 210000000813 small intestine Anatomy 0.000 description 1
- 239000000243 solution Substances 0.000 description 1
- 239000007858 starting material Substances 0.000 description 1
- 239000000725 suspension Substances 0.000 description 1
- 230000002194 synthesizing effect Effects 0.000 description 1
- 238000010998 test method Methods 0.000 description 1
- 238000012360 testing method Methods 0.000 description 1
- RYYWUUFWQRZTIU-UHFFFAOYSA-K thiophosphate Chemical compound [O-]P([O-])([O-])=S RYYWUUFWQRZTIU-UHFFFAOYSA-K 0.000 description 1
- 108010061238 threonyl-glycine Proteins 0.000 description 1
- 238000012549 training Methods 0.000 description 1
- 238000012546 transfer Methods 0.000 description 1
- 230000009466 transformation Effects 0.000 description 1
- 108700004896 tripeptide FEG Proteins 0.000 description 1
- 108010029384 tryptophyl-histidine Proteins 0.000 description 1
- 210000004881 tumor cell Anatomy 0.000 description 1
- 102000003390 tumor necrosis factor Human genes 0.000 description 1
- 108010078580 tyrosylleucine Proteins 0.000 description 1
- 210000004291 uterus Anatomy 0.000 description 1
- 239000013603 viral vector Substances 0.000 description 1
Landscapes
- Enzymes And Modification Thereof (AREA)
- Micro-Organisms Or Cultivation Processes Thereof (AREA)
- Peptides Or Proteins (AREA)
Abstract
(57)【要約】
【課題】 種々のアポトーシスに関与するカスパーゼで
活性化されるDNアーゼ(CAD)とそれをコードする遺
伝子を提供する。 【解決手段】 マウスのリンパ腫細胞の細胞質画分にカ
スパーゼで活性化されるDNアーゼ(CAD)を確認
し、CADを精製してCADをコードするcDNAを分
離する。
活性化されるDNアーゼ(CAD)とそれをコードする遺
伝子を提供する。 【解決手段】 マウスのリンパ腫細胞の細胞質画分にカ
スパーゼで活性化されるDNアーゼ(CAD)を確認
し、CADを精製してCADをコードするcDNAを分
離する。
Description
【0001】
【発明の属する技術分野】動物の恒常性は細胞の増殖お
よび分化による他に、アポトーシスとして知られている
過程を経る細胞死によっても調節されている[1](本
明細書の一部を構成する引用文献を末尾に列挙し、明細
書中の引用箇所にその文献番号を付した)。余剰な細胞
多数が哺乳類の発育の間にアポトーシスによって除去さ
れる。細胞傷害性T細胞またはナチュラルキラー細胞が
ウイルス感染細胞または腫瘍細胞を殺す時、これらのエ
フェクター細胞は標的細胞内にアポトーシスを誘導する
[2]。アポトーシスによる細胞死は、細胞縮小、核の
凝縮、および微絨毛の消失[3]のような形態的変化を
伴うのが特徴である。アポトーシスの生化学的特徴は染
色体DNAのヌクレオソーム単位への切断であり、これ
が細胞死過程における最終的な打撃であると思われる
[4−6]。これまで、アポトーシスDNA分解の原因
であるヌクレアーゼとしてDNアーゼI、DNアーゼI
I、およびシクロフィリンのような様々なタンパク質が
候補として示唆されてきたが[7−9]、確認はされて
いなかった。
よび分化による他に、アポトーシスとして知られている
過程を経る細胞死によっても調節されている[1](本
明細書の一部を構成する引用文献を末尾に列挙し、明細
書中の引用箇所にその文献番号を付した)。余剰な細胞
多数が哺乳類の発育の間にアポトーシスによって除去さ
れる。細胞傷害性T細胞またはナチュラルキラー細胞が
ウイルス感染細胞または腫瘍細胞を殺す時、これらのエ
フェクター細胞は標的細胞内にアポトーシスを誘導する
[2]。アポトーシスによる細胞死は、細胞縮小、核の
凝縮、および微絨毛の消失[3]のような形態的変化を
伴うのが特徴である。アポトーシスの生化学的特徴は染
色体DNAのヌクレオソーム単位への切断であり、これ
が細胞死過程における最終的な打撃であると思われる
[4−6]。これまで、アポトーシスDNA分解の原因
であるヌクレアーゼとしてDNアーゼI、DNアーゼI
I、およびシクロフィリンのような様々なタンパク質が
候補として示唆されてきたが[7−9]、確認はされて
いなかった。
【0002】
【従来の技術】Fasリガンドは腫瘍壊死因子ファミリ
ーの一員であるが、活性化されたT細胞およびナチュラ
ルキラー細胞に発現され、その受容体であるFasに結
合することによって標的細胞にアポトーシスを誘導する
[2,10]。本発明者らおよび他の研究陣はFasの
活性化は、カスパーゼカスケードの活性化を誘導するこ
とを示した[11−14]。カスパーゼ(アポトーシス
プロテアーゼ)は前駆体型として合成され、アポトーシ
スシグナルがこの前駆体を変換して成熟酵素とし、この
酵素がカスケードの下流にある複数のカスパーゼを切
断、活性化する。今までにカスパーゼファミリーとして
少なくとも10個が確認されており[16]、それらは
基質特異性に基づいて3群のサブグループに分類されて
いる[17,18]。こうしてアポトーシスシグナルに
よって活性化されたカスパーゼはアクチン、ポリ(AD
P−リボース)ポリメラーゼ、フォドリン、およびラミ
ンのような種々の細胞内基質を切断する。これが細胞の
形態学的変化を起こすのかもしれない[19]。
ーの一員であるが、活性化されたT細胞およびナチュラ
ルキラー細胞に発現され、その受容体であるFasに結
合することによって標的細胞にアポトーシスを誘導する
[2,10]。本発明者らおよび他の研究陣はFasの
活性化は、カスパーゼカスケードの活性化を誘導するこ
とを示した[11−14]。カスパーゼ(アポトーシス
プロテアーゼ)は前駆体型として合成され、アポトーシ
スシグナルがこの前駆体を変換して成熟酵素とし、この
酵素がカスケードの下流にある複数のカスパーゼを切
断、活性化する。今までにカスパーゼファミリーとして
少なくとも10個が確認されており[16]、それらは
基質特異性に基づいて3群のサブグループに分類されて
いる[17,18]。こうしてアポトーシスシグナルに
よって活性化されたカスパーゼはアクチン、ポリ(AD
P−リボース)ポリメラーゼ、フォドリン、およびラミ
ンのような種々の細胞内基質を切断する。これが細胞の
形態学的変化を起こすのかもしれない[19]。
【0003】Fasにより誘導されるアポトーシスはD
NAの分解も起こす[20]。Fasによってアポトー
シスを起こしている細胞から得られた細胞質画分は、分
離した核にDNA分解を誘導する因子を含むことが見出
されており、このことはヌクレアーゼまたはその活性化
分子がFas誘発アポトーシスの間に細胞内で作製され
ることを示唆している[21]。生細胞から得た細胞質
分画は核内でDNA分解を起こさないが、その抽出物は
カスパーゼ3処理でアポトーシス誘導性抽出物に変換さ
れる。これは、生細胞がDNA分解を誘導する分子の前
駆体を持っていることを示唆している[12]。
NAの分解も起こす[20]。Fasによってアポトー
シスを起こしている細胞から得られた細胞質画分は、分
離した核にDNA分解を誘導する因子を含むことが見出
されており、このことはヌクレアーゼまたはその活性化
分子がFas誘発アポトーシスの間に細胞内で作製され
ることを示唆している[21]。生細胞から得た細胞質
分画は核内でDNA分解を起こさないが、その抽出物は
カスパーゼ3処理でアポトーシス誘導性抽出物に変換さ
れる。これは、生細胞がDNA分解を誘導する分子の前
駆体を持っていることを示唆している[12]。
【0004】
【発明が解決しようとする課題】アポトーシスの間にD
NA断片化が起きるとの観察以来[6]、数多くの研究
グループがアポトーシス性DNA分解の原因となるDN
アーゼの確認を試みた。しかし、アポトーシスの間に活
性化されるDNアーゼは非常に不安定かつ微量であり、
この酵素の精製は極めて困難であった[26]。DNア
ーゼI、DNアーゼII、シクロフィリン、およびDN
アーゼγを含めて数種の酵素およびタンパク質が候補と
して提案されたが[7−9,27]、これらの候補はど
れもアポトーシスDNアーゼとしての要件全てを満たす
ものではなく、その同定は未解決であった。
NA断片化が起きるとの観察以来[6]、数多くの研究
グループがアポトーシス性DNA分解の原因となるDN
アーゼの確認を試みた。しかし、アポトーシスの間に活
性化されるDNアーゼは非常に不安定かつ微量であり、
この酵素の精製は極めて困難であった[26]。DNア
ーゼI、DNアーゼII、シクロフィリン、およびDN
アーゼγを含めて数種の酵素およびタンパク質が候補と
して提案されたが[7−9,27]、これらの候補はど
れもアポトーシスDNアーゼとしての要件全てを満たす
ものではなく、その同定は未解決であった。
【0005】
【発明の概要】そこで、本発明者らはアポトーシス性D
NA分解の原因となるDNアーゼの検索を行い、細胞抽
出物からカスパーゼ3[12,15]処理で活性化され
る、比較的安定な前駆体としての新たなDNアーゼを確
認した。このDNアーゼの精製とそのcDNAの発現か
ら、これがDNアーゼIまたはDNアーゼIIと同等
か、さらに高い特異性のある活性を持つDNアーゼタン
パク質であることが判明した。このように、本発明者ら
は、カスパーゼ3処理後に核内でDNA分解を起こすこ
とのできるタンパク質を精製することに成功した。この
タンパク質はDNアーゼ活性を持つので、カスパーゼ活
性化DNアーゼ(CAD)と命名した。さらに、マウス
CADcDNAの分子クローニングにより、CADが3
42アミノ酸からなり、C末端に核局在化シグナルを持
つタンパク質であることがわかった。
NA分解の原因となるDNアーゼの検索を行い、細胞抽
出物からカスパーゼ3[12,15]処理で活性化され
る、比較的安定な前駆体としての新たなDNアーゼを確
認した。このDNアーゼの精製とそのcDNAの発現か
ら、これがDNアーゼIまたはDNアーゼIIと同等
か、さらに高い特異性のある活性を持つDNアーゼタン
パク質であることが判明した。このように、本発明者ら
は、カスパーゼ3処理後に核内でDNA分解を起こすこ
とのできるタンパク質を精製することに成功した。この
タンパク質はDNアーゼ活性を持つので、カスパーゼ活
性化DNアーゼ(CAD)と命名した。さらに、マウス
CADcDNAの分子クローニングにより、CADが3
42アミノ酸からなり、C末端に核局在化シグナルを持
つタンパク質であることがわかった。
【0006】本発明は、アポトーシスにおけるDNA分
解に関与するこのカスパーゼ活性化DNアーゼ(CA
D)を基礎とする。詳細には、本発明は、(a)配列番
号2に示されるアミノ酸配列を有するタンパク質および
(b)配列番号2に示されるアミノ酸配列において1も
しくは複数のアミノ酸が欠失、置換および/または付加
されたアミノ酸配列からなりかつ該タンパク質と同等の
DNアーゼ活性を有するタンパク質の中から選択される
DNアーゼ、好ましくはそのDNアーゼ活性がカスパー
ゼを介して活性化されるDNアーゼタンパク質; (2)本発明タンパク質をコードしている遺伝子、好ま
しくはDNA分子、より好ましくは配列番号1に示され
るDNA配列を有する遺伝子; (3)本発明遺伝子を含有するベクター、好ましくは発
現ベクター; (4)本発明発現ベクターにより形質転換された宿主細
胞; (5)本発明遺伝子と相補的な配列を有する、8塩基以
上からなるDNAもしくはRNAまたはそれらの化学的
修飾体; (6)この本発明DNAもしくはRNAまたはそれらの
化学的修飾体を含有するベクター;および (7)本発明タンパク質に対する抗体;に関する。
解に関与するこのカスパーゼ活性化DNアーゼ(CA
D)を基礎とする。詳細には、本発明は、(a)配列番
号2に示されるアミノ酸配列を有するタンパク質および
(b)配列番号2に示されるアミノ酸配列において1も
しくは複数のアミノ酸が欠失、置換および/または付加
されたアミノ酸配列からなりかつ該タンパク質と同等の
DNアーゼ活性を有するタンパク質の中から選択される
DNアーゼ、好ましくはそのDNアーゼ活性がカスパー
ゼを介して活性化されるDNアーゼタンパク質; (2)本発明タンパク質をコードしている遺伝子、好ま
しくはDNA分子、より好ましくは配列番号1に示され
るDNA配列を有する遺伝子; (3)本発明遺伝子を含有するベクター、好ましくは発
現ベクター; (4)本発明発現ベクターにより形質転換された宿主細
胞; (5)本発明遺伝子と相補的な配列を有する、8塩基以
上からなるDNAもしくはRNAまたはそれらの化学的
修飾体; (6)この本発明DNAもしくはRNAまたはそれらの
化学的修飾体を含有するベクター;および (7)本発明タンパク質に対する抗体;に関する。
【0007】
【発明の詳しい説明】(1) 配列番号2に示されるア
ミノ酸配列を有するタンパク質CADはDNアーゼ活性
を有している。COS細胞中に産生させた組換えCAD
の生化学的分析は、殆どのアポトーシス細胞でDNA分
解を阻害するオーリントリカルボン酸[28,29]3
0μM濃度によってCADのDNアーゼ活性が阻害され
ることを示した。また、以下に示すようにCADは種々
の組織にかなり遍在的に発現され、そのアミノ酸配列に
は核局在化シグナルが含まれている。これらのことか
ら、他のDNアーゼがある状況下に一定の役割を演じる
可能性を完全に排除できるものでないが、CADはアポ
トーシスの間にDNA分解を起こすDNアーゼであると
考えられた。
ミノ酸配列を有するタンパク質CADはDNアーゼ活性
を有している。COS細胞中に産生させた組換えCAD
の生化学的分析は、殆どのアポトーシス細胞でDNA分
解を阻害するオーリントリカルボン酸[28,29]3
0μM濃度によってCADのDNアーゼ活性が阻害され
ることを示した。また、以下に示すようにCADは種々
の組織にかなり遍在的に発現され、そのアミノ酸配列に
は核局在化シグナルが含まれている。これらのことか
ら、他のDNアーゼがある状況下に一定の役割を演じる
可能性を完全に排除できるものでないが、CADはアポ
トーシスの間にDNA分解を起こすDNアーゼであると
考えられた。
【0008】CADとしての機能を発揮しうるタンパク
質、すなわち機能性CADタンパク質は、COS細胞お
よび無細胞系中でCADの特異的阻害剤(ICAD)の
存在下にのみ産生され、CADはICADと複合体を形
成していることが見出された。これらの結果はCADが
生細胞内ではICADとの不活性な複合体として存在す
ることを示唆する。アポトーシスシグナルによって活性
化されたカスパーゼはICADを切断してCADを放出
させ、次にこれが核内に入って染色体DNAを分解す
る。CADのこの活性化機序は転写因子NF−κBの活
性化機序と著しく類似している。なお、ICADの過剰
発現はFasの活性化またはスタウロスポリン処理によ
り誘導されるDNA分解を遮断した。
質、すなわち機能性CADタンパク質は、COS細胞お
よび無細胞系中でCADの特異的阻害剤(ICAD)の
存在下にのみ産生され、CADはICADと複合体を形
成していることが見出された。これらの結果はCADが
生細胞内ではICADとの不活性な複合体として存在す
ることを示唆する。アポトーシスシグナルによって活性
化されたカスパーゼはICADを切断してCADを放出
させ、次にこれが核内に入って染色体DNAを分解す
る。CADのこの活性化機序は転写因子NF−κBの活
性化機序と著しく類似している。なお、ICADの過剰
発現はFasの活性化またはスタウロスポリン処理によ
り誘導されるDNA分解を遮断した。
【0009】カスパーゼで活性化されたCADがICA
Dと結合し、また無細胞での転写、翻訳システム中で新
たに合成されたCADはICADとの複合体として回収
されたことから、非アポトーシス細胞における前駆体C
ADは、CADとICADの複合体として存在すると思
われる。部分精製CADを加熱してCADを不活化する
と、ICAD活性はCADを含んでいた画分に見出され
る。CADは等電点8.7を示す塩基性タンパク質であ
り、一方ICADは等電点4.5を示す酸性タンパク質
である。そこで、これらタンパク質2種の相互作用は静
電的相互作用によるものと考えられる。アポトーシス過
程の間に活性化されるプロテアーゼであるカスパーゼ3
[12,15]はICADを切断でき、多分これがIC
ADからのCAD放出を起こす。事実、潜在型およびカ
スパーゼ3活性化型のCADをゲル濾過法で分析する
と、見掛けの分子量は各々80kDaおよび40kDa
であった。アポトーシスの間のこのCAD活性化機序
(図7)は核転写因子NF−κB[30,31]の活性
化について結論された機序に非常に類似している。NF
−κBは細胞質中でI−κBとともに複合体として保持
されている。種々の刺激がキナーゼカスケードを活性化
し、これがI−κBのユビキチン依存性分解へと導び
く。分解したI−κBはNF−κBから解離し、それが
次に核に入って様々な遺伝子の発現を活性化または抑制
する。アポトーシスの経路では、サイトカインを含む種
々の刺激がカスパーゼのプロテアーゼカスケードを活性
化し、それがICADの分解を起こし、CADからの解
離を起こすのであろう。放出されたCADは核内に入る
ことができ、染色体DNAを分解するのであろう。NF
−κBは核局在化シグナルを持ち、I−κBの役割の一
つはこのシグナルを遮蔽してNF−κBの核への移動を
防ぐことにある[32]。CADも核局在化シグナルを
持つ。ICADにはCADのDNアーゼ作用を阻止する
性能があるが、潜在型CADはほとんどが細胞質内に見
出されるので、ICADはCADの核内への移動を阻止
しているのであろう。これらの点を解明するためには、
アポトーシスを引き起こしている細胞内でのCADの分
子的性質および局在を検討する必要があろう。
Dと結合し、また無細胞での転写、翻訳システム中で新
たに合成されたCADはICADとの複合体として回収
されたことから、非アポトーシス細胞における前駆体C
ADは、CADとICADの複合体として存在すると思
われる。部分精製CADを加熱してCADを不活化する
と、ICAD活性はCADを含んでいた画分に見出され
る。CADは等電点8.7を示す塩基性タンパク質であ
り、一方ICADは等電点4.5を示す酸性タンパク質
である。そこで、これらタンパク質2種の相互作用は静
電的相互作用によるものと考えられる。アポトーシス過
程の間に活性化されるプロテアーゼであるカスパーゼ3
[12,15]はICADを切断でき、多分これがIC
ADからのCAD放出を起こす。事実、潜在型およびカ
スパーゼ3活性化型のCADをゲル濾過法で分析する
と、見掛けの分子量は各々80kDaおよび40kDa
であった。アポトーシスの間のこのCAD活性化機序
(図7)は核転写因子NF−κB[30,31]の活性
化について結論された機序に非常に類似している。NF
−κBは細胞質中でI−κBとともに複合体として保持
されている。種々の刺激がキナーゼカスケードを活性化
し、これがI−κBのユビキチン依存性分解へと導び
く。分解したI−κBはNF−κBから解離し、それが
次に核に入って様々な遺伝子の発現を活性化または抑制
する。アポトーシスの経路では、サイトカインを含む種
々の刺激がカスパーゼのプロテアーゼカスケードを活性
化し、それがICADの分解を起こし、CADからの解
離を起こすのであろう。放出されたCADは核内に入る
ことができ、染色体DNAを分解するのであろう。NF
−κBは核局在化シグナルを持ち、I−κBの役割の一
つはこのシグナルを遮蔽してNF−κBの核への移動を
防ぐことにある[32]。CADも核局在化シグナルを
持つ。ICADにはCADのDNアーゼ作用を阻止する
性能があるが、潜在型CADはほとんどが細胞質内に見
出されるので、ICADはCADの核内への移動を阻止
しているのであろう。これらの点を解明するためには、
アポトーシスを引き起こしている細胞内でのCADの分
子的性質および局在を検討する必要があろう。
【0010】ほとんどのDNアーゼおよびプロテアーゼ
は合成されるとすぐにリソソームに隔離される。細胞質
にあるカスパーゼのようなある種のプロテアーゼは不活
性な前駆体型として存在し、種々の刺激がそれらを活性
な酵素に変換する[15]。DNアーゼであるCADが
COS細胞内または無細胞系で合成されても、CAD活
性は起動されず、CAD阻害剤であるICADの存在が
CADの機能的酵素を産生するために必要であった。こ
の機序は、「免疫性タンパク質」と呼ばれる阻害剤とと
もに調和して発現され直ちにそれと複合体を形成するコ
リシン遺伝子がコードする細菌DNアーゼの状況[3
3]と類似している。ICADには、事前に形成された
CADタンパク質からCAD活性を起動する性能がない
ことは、ICADが新生されつつあるCADポリペプチ
ドに正しい折り畳みを可能にする特異的シャペロンとし
て作用することを示唆している。シャペロンは新たなタ
ンパク質折り畳みの間にポリペプチド内またはポリペプ
チド間の正しくない会合を防止し、また非折畳み構造を
保持したまま細胞内オルガネラにタンパク質を誘導する
機能を発揮できるタンパク質である[34]。ほとんど
のシャペロンは多機能性で遍在的であるが、特異的なシ
ャペロン様機能は最近になってカリウムチャネルのβ−
サブユニット[35]および20Sプロテオソームのサ
ブユニットの一つ[36]で確認された。20Sプロテ
オソームのこのサブユニットは前駆体として合成され、
そのサブユニットは会合してプロテオソームになる間に
プロセシングされる。CADもN−末端に余分な2個の
アミノ酸(MetおよびCys)を持つプロテインとし
て合成される。この余分なアミノ酸がICADと会合す
ることによって除去される可能性もある。
は合成されるとすぐにリソソームに隔離される。細胞質
にあるカスパーゼのようなある種のプロテアーゼは不活
性な前駆体型として存在し、種々の刺激がそれらを活性
な酵素に変換する[15]。DNアーゼであるCADが
COS細胞内または無細胞系で合成されても、CAD活
性は起動されず、CAD阻害剤であるICADの存在が
CADの機能的酵素を産生するために必要であった。こ
の機序は、「免疫性タンパク質」と呼ばれる阻害剤とと
もに調和して発現され直ちにそれと複合体を形成するコ
リシン遺伝子がコードする細菌DNアーゼの状況[3
3]と類似している。ICADには、事前に形成された
CADタンパク質からCAD活性を起動する性能がない
ことは、ICADが新生されつつあるCADポリペプチ
ドに正しい折り畳みを可能にする特異的シャペロンとし
て作用することを示唆している。シャペロンは新たなタ
ンパク質折り畳みの間にポリペプチド内またはポリペプ
チド間の正しくない会合を防止し、また非折畳み構造を
保持したまま細胞内オルガネラにタンパク質を誘導する
機能を発揮できるタンパク質である[34]。ほとんど
のシャペロンは多機能性で遍在的であるが、特異的なシ
ャペロン様機能は最近になってカリウムチャネルのβ−
サブユニット[35]および20Sプロテオソームのサ
ブユニットの一つ[36]で確認された。20Sプロテ
オソームのこのサブユニットは前駆体として合成され、
そのサブユニットは会合してプロテオソームになる間に
プロセシングされる。CADもN−末端に余分な2個の
アミノ酸(MetおよびCys)を持つプロテインとし
て合成される。この余分なアミノ酸がICADと会合す
ることによって除去される可能性もある。
【0011】本発明は別の態様として、CADのほか、
配列番号2に示されるアミノ酸配列において1もしくは
複数のアミノ酸が欠失、置換および/または付加された
アミノ酸からなり、かつ上記CADと同等のDNアーゼ
活性を有するタンパク質を包含する。これは、配列番号
1で示されるDNA配列を有する遺伝子を当業者に周知
の方法、例えば部位特異的突然変異誘発(Methods in E
nzymology, 100:448-(1983))やPCR法(Molecular Cl
oning 2nd Edt.15章,Cold Harbor LaboratoryPress (19
89),「PCR A Practical Approach」,IRL Press 200-210
(1991))により変異させ、これを配列番号1に記載の遺
伝子と同様にして発現させることにより、得ることがで
きる。なおここで、欠失、置換および/または付加され
るアミノ酸残基の数は、上記部位特異的突然変異誘発の
周知の方法により欠失、置換および/または付加できる
程度の数を指す。得られた変異タンパク質がカスパーゼ
活性化DNアーゼ活性を有するか否かは、後述する実施
例に記載の、CADの活性検出法と同様にして確認する
ことができる。
配列番号2に示されるアミノ酸配列において1もしくは
複数のアミノ酸が欠失、置換および/または付加された
アミノ酸からなり、かつ上記CADと同等のDNアーゼ
活性を有するタンパク質を包含する。これは、配列番号
1で示されるDNA配列を有する遺伝子を当業者に周知
の方法、例えば部位特異的突然変異誘発(Methods in E
nzymology, 100:448-(1983))やPCR法(Molecular Cl
oning 2nd Edt.15章,Cold Harbor LaboratoryPress (19
89),「PCR A Practical Approach」,IRL Press 200-210
(1991))により変異させ、これを配列番号1に記載の遺
伝子と同様にして発現させることにより、得ることがで
きる。なおここで、欠失、置換および/または付加され
るアミノ酸残基の数は、上記部位特異的突然変異誘発の
周知の方法により欠失、置換および/または付加できる
程度の数を指す。得られた変異タンパク質がカスパーゼ
活性化DNアーゼ活性を有するか否かは、後述する実施
例に記載の、CADの活性検出法と同様にして確認する
ことができる。
【0012】(2)別の態様として、本発明は本発明D
Nアーゼタンパク質をコードしている遺伝子を包含す
る。本発明遺伝子にはDNAおよびRNAが含まれ、好
ましくはDNAである。DNAの場合、cDNA、ゲノ
ミックDNAあるいは合成DNAであり得る。またDN
AおよびRNAいずれも2本鎖でも1本鎖でもあり得
る。1本鎖の場合、コード鎖あるいは非コード鎖であり
得る。より好ましくは配列番号1で示されるDNA配列
を有する遺伝子である。
Nアーゼタンパク質をコードしている遺伝子を包含す
る。本発明遺伝子にはDNAおよびRNAが含まれ、好
ましくはDNAである。DNAの場合、cDNA、ゲノ
ミックDNAあるいは合成DNAであり得る。またDN
AおよびRNAいずれも2本鎖でも1本鎖でもあり得
る。1本鎖の場合、コード鎖あるいは非コード鎖であり
得る。より好ましくは配列番号1で示されるDNA配列
を有する遺伝子である。
【0013】(3)別の態様として、本発明は本発明遺
伝子を含有するベクターを包含する。該ベクターには発
現ベクター、クローニングベクター、治療用ベクターな
どの種々の用途を持つベクターが包含される。好ましく
は発現ベクターである。発現ベクターは本発明タンパク
質の大量生産に利用できる。発現ベクターについての詳
細は以下の項に示す。治療用ベクターは本発明遺伝子を
投与し細胞内に導入する手法に用いられ、ウイルスベク
ター等がある。その他、プラスミドを直接筋肉内に投与
する方法(DNAワクチン法)、リポソーム法等があ
り、これらにもベクターが用いられる。CADは核内に
移行してDNAの分解をもたらすので、癌細胞などを死
滅させる等において、本発明治療用ベクターは遺伝子治
療に有用であろう。
伝子を含有するベクターを包含する。該ベクターには発
現ベクター、クローニングベクター、治療用ベクターな
どの種々の用途を持つベクターが包含される。好ましく
は発現ベクターである。発現ベクターは本発明タンパク
質の大量生産に利用できる。発現ベクターについての詳
細は以下の項に示す。治療用ベクターは本発明遺伝子を
投与し細胞内に導入する手法に用いられ、ウイルスベク
ター等がある。その他、プラスミドを直接筋肉内に投与
する方法(DNAワクチン法)、リポソーム法等があ
り、これらにもベクターが用いられる。CADは核内に
移行してDNAの分解をもたらすので、癌細胞などを死
滅させる等において、本発明治療用ベクターは遺伝子治
療に有用であろう。
【0014】(4)別の態様として、本発明は本発明発
現ベクターにより形質転換された宿主細胞が包含され
る。宿主細胞には原核細胞、真核細胞が含まれ、細菌、
真菌、哺乳動物細胞等が例示される。
現ベクターにより形質転換された宿主細胞が包含され
る。宿主細胞には原核細胞、真核細胞が含まれ、細菌、
真菌、哺乳動物細胞等が例示される。
【0015】(5)別の態様として、本発明は、本発明
遺伝子と相補的な配列を有する、8塩基以上からなるD
NAもしくはRNAまたはそれらの化学的修飾体が包含
される。「相補的な配列を有する」とはいわゆるアンチ
センスオリゴヌクレオチド、アンチセンスRNAあるい
はアンチセンスDNAと呼ばれるものを網羅する意味を
有する。これらは合成装置を用いて人工的に合成した
り、あるいは通常と逆向き(即ちアンチセンス向き)に
遺伝子を発現させることなどによって得ることができ
る。このアンチセンスオリゴヌクレオチドの長さは8−
100塩基、好ましくは8−50塩基である。「化学的
修飾体」とは、本発明アンチセンスオリゴヌクレオチド
の細胞内への移行性または細胞内での安定性が高められ
た修飾体を意味し、例えばホスホロチオエート、アルキ
ルホスホトリエステル、アルキルホスホアミデート等の
誘導体が挙げられる[41]。これらアンチセンスヌク
レオチドはCADの発現を抑制する目的で利用される
他、in situハイブリダイゼーション等の研究用試薬と
しても有用である。投与方法は直接生体内の細胞に導入
するin vivo法等がある。
遺伝子と相補的な配列を有する、8塩基以上からなるD
NAもしくはRNAまたはそれらの化学的修飾体が包含
される。「相補的な配列を有する」とはいわゆるアンチ
センスオリゴヌクレオチド、アンチセンスRNAあるい
はアンチセンスDNAと呼ばれるものを網羅する意味を
有する。これらは合成装置を用いて人工的に合成した
り、あるいは通常と逆向き(即ちアンチセンス向き)に
遺伝子を発現させることなどによって得ることができ
る。このアンチセンスオリゴヌクレオチドの長さは8−
100塩基、好ましくは8−50塩基である。「化学的
修飾体」とは、本発明アンチセンスオリゴヌクレオチド
の細胞内への移行性または細胞内での安定性が高められ
た修飾体を意味し、例えばホスホロチオエート、アルキ
ルホスホトリエステル、アルキルホスホアミデート等の
誘導体が挙げられる[41]。これらアンチセンスヌク
レオチドはCADの発現を抑制する目的で利用される
他、in situハイブリダイゼーション等の研究用試薬と
しても有用である。投与方法は直接生体内の細胞に導入
するin vivo法等がある。
【0016】(6)あるいは、このアンチセンスオリゴ
ヌクレオチドを含有するベクターによって投与すること
もできる。本発明はこのようなベクターも包含する。ベ
クターとしてはウイルスベクター等が挙げられる。
ヌクレオチドを含有するベクターによって投与すること
もできる。本発明はこのようなベクターも包含する。ベ
クターとしてはウイルスベクター等が挙げられる。
【0017】(7)本発明は別の態様として、本発明タ
ンパク質に対する抗体を包含する。該抗体は本発明タン
パク質またはその断片を、例えば文献[42]に記載さ
れている手法を用いてマウスやウサギを免疫することに
より、容易に調製できる。好ましい本発明抗体はモノク
ローナル抗体である。モノクローナル抗体は文献[4
3,44]記載の手法により、免疫したマウスやラット
の脾臓またはリンパ節からリンパ球を取りだし、ミエロ
ーマ細胞と融合させてハイブリドーマを作製し、該ハイ
ブリドーマから入手できる。抗体の用途は、アフィニテ
ィークロマトグラフィー、cDNAライブラリーのスク
リーニング、医薬・診断薬等が挙げられる。CADの機
能を阻害する中和抗体が好ましい。
ンパク質に対する抗体を包含する。該抗体は本発明タン
パク質またはその断片を、例えば文献[42]に記載さ
れている手法を用いてマウスやウサギを免疫することに
より、容易に調製できる。好ましい本発明抗体はモノク
ローナル抗体である。モノクローナル抗体は文献[4
3,44]記載の手法により、免疫したマウスやラット
の脾臓またはリンパ節からリンパ球を取りだし、ミエロ
ーマ細胞と融合させてハイブリドーマを作製し、該ハイ
ブリドーマから入手できる。抗体の用途は、アフィニテ
ィークロマトグラフィー、cDNAライブラリーのスク
リーニング、医薬・診断薬等が挙げられる。CADの機
能を阻害する中和抗体が好ましい。
【0018】
【発明の実施の形態】以下に本発明の実施の態様を説明
する。CADの精製 Fas遺伝子の機能不全突然変異はリンパ節症および巨
脾症を起こす[2]。この突然変異マウスの1種MRL
−lprのリンパ節から得た細胞質抽出物は高レベルの
CAD活性を示し入手し易いので、これをCAD精製の
出発材料として用いるのが好ましい。しかし、CADは
生体内において広汎に発現されているので、他の組織を
用いることもできる。CADは精製の間に自己活性化を
起こし、さらにこの活性化型は不安定で容易に失活す
る。そこで粗製抽出物画分をまずカスパーゼ3の阻害
剤、例えばビオチン化−Asp−Glu−Val−As
p−クロロメチルケトン(bio−DEVD−cmk)
で処理し、抽出物内のカスパーゼ3を不活化する[1
2]。次にCADを硫酸アンモニウム分画、ヘパリンー
アガロース−、リソースQ−、およびリソースS−カラ
ムクロマトグラフィーを含む通常の精製操作によって精
製する。CAD活性は、核内でDNA分解を誘導する性
能またはプラスミドDNAを基質に用いるDNアーゼ活
性を検定して追跡される。粗製抽出物(S−100)は
構成的なDNアーゼ活性を含むであろうが、この活性の
大部分はリソースQカラムクロマトグラフィー等の精製
で除去される。この段階以後、CADのDNアーゼ活性
が核内でのDNA断片化活性とともに共精製される。
する。CADの精製 Fas遺伝子の機能不全突然変異はリンパ節症および巨
脾症を起こす[2]。この突然変異マウスの1種MRL
−lprのリンパ節から得た細胞質抽出物は高レベルの
CAD活性を示し入手し易いので、これをCAD精製の
出発材料として用いるのが好ましい。しかし、CADは
生体内において広汎に発現されているので、他の組織を
用いることもできる。CADは精製の間に自己活性化を
起こし、さらにこの活性化型は不安定で容易に失活す
る。そこで粗製抽出物画分をまずカスパーゼ3の阻害
剤、例えばビオチン化−Asp−Glu−Val−As
p−クロロメチルケトン(bio−DEVD−cmk)
で処理し、抽出物内のカスパーゼ3を不活化する[1
2]。次にCADを硫酸アンモニウム分画、ヘパリンー
アガロース−、リソースQ−、およびリソースS−カラ
ムクロマトグラフィーを含む通常の精製操作によって精
製する。CAD活性は、核内でDNA分解を誘導する性
能またはプラスミドDNAを基質に用いるDNアーゼ活
性を検定して追跡される。粗製抽出物(S−100)は
構成的なDNアーゼ活性を含むであろうが、この活性の
大部分はリソースQカラムクロマトグラフィー等の精製
で除去される。この段階以後、CADのDNアーゼ活性
が核内でのDNA断片化活性とともに共精製される。
【0019】本願と同時係属出願(発明の名称:カスパ
ーゼ活性化DNアーゼの阻害剤:出願日;平成10年1
2月25日)において、本発明者らはヒトDFF45の
マウス類似体であるCAD阻害剤、ICADについて記
載している[22]。ICADは長鎖と短鎖の2種類が
あり、それぞれICAD−LおよびICAD−Sと表
す。前者のアミノ酸配列およびそれをコードするDNA
配列は配列番号4および3に示した。後者のそれらは配
列番号6および5に示した。本発明者らはカスパーゼ3
がICADを切断してその阻害作用を不活化することを
見出したことから(実施例、材料の項参照)、CADが
ICADと複合体を形成しているか、少なくともICA
Dに結合できると考えた。この可能性を検討するため
に、部分的に精製したCAD(リソースS画分)をビオ
チン化した。カスパーゼ3処理後に、サンプルを親和性
カラムGST−DFF45またはその対照カラム(GS
T−revDFF)に負荷した。この対照カラムはDF
F45を逆向きにしてGSTに融合させたものである。
結合したタンパク質をカラムからグルタチオンで溶出
し、溶出液をセイヨウワサビペルオキシダーゼ−複合ス
トレプトアビジンを用いるウェスタンブロッティングで
分析するとGST−DFF45親和性カラムから得た溶
出液に分子量40kDaの特異的バンドが観察された
が、このバンドは対照カラムから得た溶出液にはなかっ
た(図1a)。他方、部分精製CADをカスパーゼ3で
処理せずにDFF45親和性カラムに負荷すると、40
kDaタンパク質はカラムに保持されなかった。さら
に、カスパーゼ3処理サンプルをGST−DFF45親
和性カラムに負荷するとCAD活性は溶出液にのみ見出
された。これらの結果は40kDaタンパク質はCAD
であると思われること、およびそれがヒトのDFF45
またはICADに結合できることを示唆する。潜在型C
ADが上記親和性カラムに結合できないことは、この潜
在型がCADとICADの複合体であり、またカスパー
ゼ3処理がICADからCADを解放することを示唆す
る。このGST−DFF45はトロンビン切断部位を持
ち[23]、DFF45はカスパーゼ3によって切断で
きる[22]。従って、カラムをトロンビンとカスパー
ゼ3の組合せで処理すると40kDaのタンパク質がカ
ラムから溶出した(図1b参照)。トロンビンとカスパ
ーゼ3によって溶出した40kDaのサイズはグルタチ
オンによって溶出したものと同一で、分子量40kDa
のタンパク質(推測上のCAD)はカスパーゼ3によっ
ては切断されないことを示唆する。事実、CADの一次
配列には推測上のカスパーゼ3切断部位は見出されなか
った(下記および図2参照)。
ーゼ活性化DNアーゼの阻害剤:出願日;平成10年1
2月25日)において、本発明者らはヒトDFF45の
マウス類似体であるCAD阻害剤、ICADについて記
載している[22]。ICADは長鎖と短鎖の2種類が
あり、それぞれICAD−LおよびICAD−Sと表
す。前者のアミノ酸配列およびそれをコードするDNA
配列は配列番号4および3に示した。後者のそれらは配
列番号6および5に示した。本発明者らはカスパーゼ3
がICADを切断してその阻害作用を不活化することを
見出したことから(実施例、材料の項参照)、CADが
ICADと複合体を形成しているか、少なくともICA
Dに結合できると考えた。この可能性を検討するため
に、部分的に精製したCAD(リソースS画分)をビオ
チン化した。カスパーゼ3処理後に、サンプルを親和性
カラムGST−DFF45またはその対照カラム(GS
T−revDFF)に負荷した。この対照カラムはDF
F45を逆向きにしてGSTに融合させたものである。
結合したタンパク質をカラムからグルタチオンで溶出
し、溶出液をセイヨウワサビペルオキシダーゼ−複合ス
トレプトアビジンを用いるウェスタンブロッティングで
分析するとGST−DFF45親和性カラムから得た溶
出液に分子量40kDaの特異的バンドが観察された
が、このバンドは対照カラムから得た溶出液にはなかっ
た(図1a)。他方、部分精製CADをカスパーゼ3で
処理せずにDFF45親和性カラムに負荷すると、40
kDaタンパク質はカラムに保持されなかった。さら
に、カスパーゼ3処理サンプルをGST−DFF45親
和性カラムに負荷するとCAD活性は溶出液にのみ見出
された。これらの結果は40kDaタンパク質はCAD
であると思われること、およびそれがヒトのDFF45
またはICADに結合できることを示唆する。潜在型C
ADが上記親和性カラムに結合できないことは、この潜
在型がCADとICADの複合体であり、またカスパー
ゼ3処理がICADからCADを解放することを示唆す
る。このGST−DFF45はトロンビン切断部位を持
ち[23]、DFF45はカスパーゼ3によって切断で
きる[22]。従って、カラムをトロンビンとカスパー
ゼ3の組合せで処理すると40kDaのタンパク質がカ
ラムから溶出した(図1b参照)。トロンビンとカスパ
ーゼ3によって溶出した40kDaのサイズはグルタチ
オンによって溶出したものと同一で、分子量40kDa
のタンパク質(推測上のCAD)はカスパーゼ3によっ
ては切断されないことを示唆する。事実、CADの一次
配列には推測上のカスパーゼ3切断部位は見出されなか
った(下記および図2参照)。
【0020】タンパク質配列分析に十分な量の精製CA
Dを調製するには、リソースS画分をカスパーゼ3で活
性化してGST−DFF45親和性カラムに負荷する。
カスパーゼ3とトロンビンの組合せによる溶出はグルタ
チオンによる溶出よりも効率的なので、このカラムをト
ロンビンとカスパーゼ3で処理する。溶出液は銀染色で
分析すると(図1b)、40kDaにバンドを含んでい
る。この親和性カラムから得られる溶出液は強いCAD
活性を示すはずである。CAD標本をカスパーゼ3で処
理せずに親和性カラムに負荷すると、溶出液中には40
kDaタンパク質もCAD活性も検出されい。よって、
この40kDaタンパク質がCADであると結論され
る。
Dを調製するには、リソースS画分をカスパーゼ3で活
性化してGST−DFF45親和性カラムに負荷する。
カスパーゼ3とトロンビンの組合せによる溶出はグルタ
チオンによる溶出よりも効率的なので、このカラムをト
ロンビンとカスパーゼ3で処理する。溶出液は銀染色で
分析すると(図1b)、40kDaにバンドを含んでい
る。この親和性カラムから得られる溶出液は強いCAD
活性を示すはずである。CAD標本をカスパーゼ3で処
理せずに親和性カラムに負荷すると、溶出液中には40
kDaタンパク質もCAD活性も検出されい。よって、
この40kDaタンパク質がCADであると結論され
る。
【0021】CADcDNAの分子クローニング 分子量40kDaの推測上のCADタンパク質をアミノ
酸配列分析して幾つかのペプチド断片を得る。それに基
づき縮重オリゴヌクレオチドプライマーを設計し、マウ
スT細胞リンパ腫cDNAライブラリーからのPCR増
幅を行う。次いで、得られたPCR産物をコロニーハイ
ブリダイゼーションによるcDNAライブラリーを検索
するためのプローブに用いる。このプローブとハイブリ
ッドを形成するクローンを入手し、その中で完全長コー
ド配列(長さ1.6kb)を有する1個をヌクレオチド
配列分析によって特性解析する。
酸配列分析して幾つかのペプチド断片を得る。それに基
づき縮重オリゴヌクレオチドプライマーを設計し、マウ
スT細胞リンパ腫cDNAライブラリーからのPCR増
幅を行う。次いで、得られたPCR産物をコロニーハイ
ブリダイゼーションによるcDNAライブラリーを検索
するためのプローブに用いる。このプローブとハイブリ
ッドを形成するクローンを入手し、その中で完全長コー
ド配列(長さ1.6kb)を有する1個をヌクレオチド
配列分析によって特性解析する。
【0022】COS細胞および無細胞系でのCAD発現 クローニングしたCADcDNAがCAD活性を持つタ
ンパク質をコードすることを確認するため、CAD発現
プラスミド(pEF−CAD)をCOS細胞に導入し、
細胞抽出物を調製した。図4aに示す通り、未処理抽出
物はDNA分解を誘導しなかったが、抽出物をカスパー
ゼ3処理するとCAD活性を示した。しかしその活性は
空のベクターを遺伝子移入した細胞よりも僅かに(4
倍)高い程度であった。CAD発現レベルが低かったこ
とから、ICADの役割に注目し、CADをICADと
ともに共発現させた。すると、抽出物は非常に強いCA
D活性を示した。図4bに示す通り、共発現させた細胞
内のCAD活性は対照細胞よりも約1000倍強力であ
った。これらの結果はクローニングされたcDNAは本
質的にDNアーゼ活性を持つCADをコードすることを
示す。
ンパク質をコードすることを確認するため、CAD発現
プラスミド(pEF−CAD)をCOS細胞に導入し、
細胞抽出物を調製した。図4aに示す通り、未処理抽出
物はDNA分解を誘導しなかったが、抽出物をカスパー
ゼ3処理するとCAD活性を示した。しかしその活性は
空のベクターを遺伝子移入した細胞よりも僅かに(4
倍)高い程度であった。CAD発現レベルが低かったこ
とから、ICADの役割に注目し、CADをICADと
ともに共発現させた。すると、抽出物は非常に強いCA
D活性を示した。図4bに示す通り、共発現させた細胞
内のCAD活性は対照細胞よりも約1000倍強力であ
った。これらの結果はクローニングされたcDNAは本
質的にDNアーゼ活性を持つCADをコードすることを
示す。
【0023】CADの発現におけるICADの役割を検
討する。転写翻訳共役系を用いる無細胞系において組換
えGST−ICADタンパク質の存在または非存在下に
CADタンパク質を合成させる(図5)。結果、どちら
の場合もCADは分子量40kDaのタンパク質として
合成されるが(図5a)、ICAD非存在下に合成され
たCADはCAD活性を全く示さず、ICAD存在下に
合成されたCADはプラスミドDNAを消化した(図5
b)。また、CAD合成後の反応混合物にICADを加
えても、混合物にはCAD活性は見出せない。これらの
結果は機能性CADはICADの存在下でのみ合成され
ることを示し、新たに合成されたCADはICADと複
合体を形成していることを示唆する。
討する。転写翻訳共役系を用いる無細胞系において組換
えGST−ICADタンパク質の存在または非存在下に
CADタンパク質を合成させる(図5)。結果、どちら
の場合もCADは分子量40kDaのタンパク質として
合成されるが(図5a)、ICAD非存在下に合成され
たCADはCAD活性を全く示さず、ICAD存在下に
合成されたCADはプラスミドDNAを消化した(図5
b)。また、CAD合成後の反応混合物にICADを加
えても、混合物にはCAD活性は見出せない。これらの
結果は機能性CADはICADの存在下でのみ合成され
ることを示し、新たに合成されたCADはICADと複
合体を形成していることを示唆する。
【0024】以下に、図面について詳細に説明する。図
1は、40kDaタンパク質としてCADを確認した電
気泳動写真の模写図である。a .部分精製CAD(リソースS画分、0.1mg)を
ビオチン−N−ヒドロキシサクシンイミドエステル(ピ
アース社)でビオチン化し、6μg/mLのカスパーゼ
3の存在下(レーン2および4)または非存在下(レー
ン1および3)に4℃で一夜処理し、次に5μM−bi
o−DEVD−cmkとともに4℃で30分間インキュ
ベーションしてカスパーゼ3を不活化した。サンプル
(タンパク質16μg)をGST−DFF45親和性ビ
ーズ(容積10μL)(レーン1および2)または対照
GST−revDFF親和性ビーズ(レーン3および
4)に負荷した。ビーズを5mM−グルタチオンを含む
緩衝液D20μLとともに4℃で2時間インキュベーシ
ョンした。ビーズから放出されたタンパク質を4〜20
%勾配ポリアクリルアミドゲル電気泳動によって分析
し、PVDF膜に写した。膜をセイヨウワサビ過酸化酵
素複合ストレプトアビジンでプローブし、ビオチンスト
レプトアビジン複合体を化学発光システム(デュポンN
EN社、ルネッサンス)によって可視化した。分子量マ
ーカー(レインボウマーカー、アマーシャム社)はkD
単位で左側に示した。
1は、40kDaタンパク質としてCADを確認した電
気泳動写真の模写図である。a .部分精製CAD(リソースS画分、0.1mg)を
ビオチン−N−ヒドロキシサクシンイミドエステル(ピ
アース社)でビオチン化し、6μg/mLのカスパーゼ
3の存在下(レーン2および4)または非存在下(レー
ン1および3)に4℃で一夜処理し、次に5μM−bi
o−DEVD−cmkとともに4℃で30分間インキュ
ベーションしてカスパーゼ3を不活化した。サンプル
(タンパク質16μg)をGST−DFF45親和性ビ
ーズ(容積10μL)(レーン1および2)または対照
GST−revDFF親和性ビーズ(レーン3および
4)に負荷した。ビーズを5mM−グルタチオンを含む
緩衝液D20μLとともに4℃で2時間インキュベーシ
ョンした。ビーズから放出されたタンパク質を4〜20
%勾配ポリアクリルアミドゲル電気泳動によって分析
し、PVDF膜に写した。膜をセイヨウワサビ過酸化酵
素複合ストレプトアビジンでプローブし、ビオチンスト
レプトアビジン複合体を化学発光システム(デュポンN
EN社、ルネッサンス)によって可視化した。分子量マ
ーカー(レインボウマーカー、アマーシャム社)はkD
単位で左側に示した。
【0025】b.リソースS画分(タンパク質各2m
g)を2.6μgのカスパーゼ3の存在下(レーン2)
または非存在下(レーン1)に4℃で一夜インキュベー
ションした。カスパーゼ3をbio−DEVD−cmk
で不活化後、サンプルをGST−DFF45親和性カラ
ムに負荷した。親和性カラムから得た溶出液(100μ
L)の所定量(5μL)を10〜20%勾配ポリアクリ
ルアミドゲル電気泳動によって分析し、タンパク質を銀
染色によって可視化した。緩衝液Dを同じ操作:すなわ
ち、GST−DFF45親和性カラムへの結合およびカ
スパーゼ3およびトロンビンによる溶出、に付した。こ
の操作によって得られた溶出液の銀染色をレーン3に示
す。このレーンに見られるタンパク質は大部分がカスパ
ーゼ3、トロンビンおよびGST−DFF45カラムか
ら放出されたタンパク質である。マーカータンパク質の
分子量はkD単位で左側に示した。推測上のCAD、約
40kDaのタンパク質を矢印で示す。c .マウス肝臓核(レーン1および2)またはプラスミ
ドDNA(レーン3および4)を使用して、bで得られ
た親和性カラムから得た溶出液(100μL)中の1μ
L量のCAD活性を測定した。カスパーゼ3処理サンプ
ル、レーン1および3、をGST−DFF45親和性カ
ラムに負荷した。レーン2および4ではサンプルをカス
パーゼ3処理せずに親和性カラムに負荷した。
g)を2.6μgのカスパーゼ3の存在下(レーン2)
または非存在下(レーン1)に4℃で一夜インキュベー
ションした。カスパーゼ3をbio−DEVD−cmk
で不活化後、サンプルをGST−DFF45親和性カラ
ムに負荷した。親和性カラムから得た溶出液(100μ
L)の所定量(5μL)を10〜20%勾配ポリアクリ
ルアミドゲル電気泳動によって分析し、タンパク質を銀
染色によって可視化した。緩衝液Dを同じ操作:すなわ
ち、GST−DFF45親和性カラムへの結合およびカ
スパーゼ3およびトロンビンによる溶出、に付した。こ
の操作によって得られた溶出液の銀染色をレーン3に示
す。このレーンに見られるタンパク質は大部分がカスパ
ーゼ3、トロンビンおよびGST−DFF45カラムか
ら放出されたタンパク質である。マーカータンパク質の
分子量はkD単位で左側に示した。推測上のCAD、約
40kDaのタンパク質を矢印で示す。c .マウス肝臓核(レーン1および2)またはプラスミ
ドDNA(レーン3および4)を使用して、bで得られ
た親和性カラムから得た溶出液(100μL)中の1μ
L量のCAD活性を測定した。カスパーゼ3処理サンプ
ル、レーン1および3、をGST−DFF45親和性カ
ラムに負荷した。レーン2および4ではサンプルをカス
パーゼ3処理せずに親和性カラムに負荷した。
【0026】図2は、cDNA配列から予測したマウス
CADの1文字表示によるアミノ酸配列である。各行の
上側の数字はアミノ酸の位置を示す。アミノ酸はMet
−1から始めて番号付けしてある。精製CADのN−末
端はAla−3に始まる。精製CADから得られたペプ
チド5種に下線を付した。C末端にある推測上の核局在
化シグナルを二重下線で示した。
CADの1文字表示によるアミノ酸配列である。各行の
上側の数字はアミノ酸の位置を示す。アミノ酸はMet
−1から始めて番号付けしてある。精製CADのN−末
端はAla−3に始まる。精製CADから得られたペプ
チド5種に下線を付した。C末端にある推測上の核局在
化シグナルを二重下線で示した。
【0027】図3は、CADmRNAの組織分布を示
す。ポリ(A)RNAは記載した組織からQuick・
Prep(商標)micro・mRNA調製キット(フ
ァルマシア社)を用いて調製した。RNAサンプル(各
2μg)を電気泳動に付し、報告[40]通りにノーザ
ンハイブリダイゼーションによって分析した。32P標識
したマウスCADcDNA(上図)またはヒトEF−1
αcDNA(下図)をプローブに用いた。
す。ポリ(A)RNAは記載した組織からQuick・
Prep(商標)micro・mRNA調製キット(フ
ァルマシア社)を用いて調製した。RNAサンプル(各
2μg)を電気泳動に付し、報告[40]通りにノーザ
ンハイブリダイゼーションによって分析した。32P標識
したマウスCADcDNA(上図)またはヒトEF−1
αcDNA(下図)をプローブに用いた。
【0028】図4は、COS細胞中でのマウスCADの
発現を示す電気泳動写真の模写図である。a .COS細胞にpEF−BOS(レーン1および2)
(MizushimaおよびNagata、Nucleic Acids Res.18,5322
(1990))、pEF−CAD(レーン3および4)、また
はpEF−ICAD−L(レーン5および6)(参考例
1参照)を遺伝子移入するか、またはpEF−CADと
pEF−ICAD−Lを共遺伝子移入(レーン7および
8)して、実施例に記載した通りに細胞抽出物を調製し
た。7.5μg/mLのカスパーゼ3の非存在下(レー
ン1、3、5および7)または存在下(レーン2、4、
6および8)に核(上図)またはプラスミドDNA(下
図)を用いて抽出物の所定量(タンパク質8μg)をC
AD作用について検定した。b .pEF−BOS(レーン1〜4)、pEF−CAD
(レーン5〜8)またはpEF−ICAD−L(レーン
9〜12)を遺伝子移入したか、またはpEF−CAD
とpEF−ICAD−Lを共遺伝子移入(レーン13〜
22)したCOS細胞から細胞抽出物を調製した。各抽
出物からの所定量を7.5μg/mLのカスパーゼ3の
存在下にマウス肝臓核(上図)またはプラスミドDNA
(下図)を用いてCAD活性について検定した。使用し
たタンパク質の量は各レーンの上側に記載した。
発現を示す電気泳動写真の模写図である。a .COS細胞にpEF−BOS(レーン1および2)
(MizushimaおよびNagata、Nucleic Acids Res.18,5322
(1990))、pEF−CAD(レーン3および4)、また
はpEF−ICAD−L(レーン5および6)(参考例
1参照)を遺伝子移入するか、またはpEF−CADと
pEF−ICAD−Lを共遺伝子移入(レーン7および
8)して、実施例に記載した通りに細胞抽出物を調製し
た。7.5μg/mLのカスパーゼ3の非存在下(レー
ン1、3、5および7)または存在下(レーン2、4、
6および8)に核(上図)またはプラスミドDNA(下
図)を用いて抽出物の所定量(タンパク質8μg)をC
AD作用について検定した。b .pEF−BOS(レーン1〜4)、pEF−CAD
(レーン5〜8)またはpEF−ICAD−L(レーン
9〜12)を遺伝子移入したか、またはpEF−CAD
とpEF−ICAD−Lを共遺伝子移入(レーン13〜
22)したCOS細胞から細胞抽出物を調製した。各抽
出物からの所定量を7.5μg/mLのカスパーゼ3の
存在下にマウス肝臓核(上図)またはプラスミドDNA
(下図)を用いてCAD活性について検定した。使用し
たタンパク質の量は各レーンの上側に記載した。
【0029】図5は、無細胞系でのマウスCADの発現
を示す電気泳動写真の模写図である。a .pcDNA−CAD(レーン3および4)または空
ベクター(レーン1および2)を最終容積50μL中で
35S−Metの存在下に試験管内転写翻訳に付した。レ
ーン2および4の反応混合物は160ngのGST−I
CAD−Lを含む。反応後、5μL量を10〜20%勾
配ポリアクリルアミドゲル電気泳動によって分析し、続
いてオートラジオグラフィーに付した。標準タンパク質
の分子量はkD単位で左側に示した。b .マウスCADを最終容積50μL中、160ngの
GST−ICAD−L非存在下(レーン1、2、5、お
よび6)または存在下(レーン3、4、7、および8)
に試験管内転写翻訳系で合成した。3μL量を用い、1
50ngのカスパーゼ3非存在下(レーン1、3、5、
および7)または存在下(レーン2、4、6および8)
に、核(レーン1〜4)またはプラスミドDNA(レー
ン5〜8)でCAD活性を測定した。
を示す電気泳動写真の模写図である。a .pcDNA−CAD(レーン3および4)または空
ベクター(レーン1および2)を最終容積50μL中で
35S−Metの存在下に試験管内転写翻訳に付した。レ
ーン2および4の反応混合物は160ngのGST−I
CAD−Lを含む。反応後、5μL量を10〜20%勾
配ポリアクリルアミドゲル電気泳動によって分析し、続
いてオートラジオグラフィーに付した。標準タンパク質
の分子量はkD単位で左側に示した。b .マウスCADを最終容積50μL中、160ngの
GST−ICAD−L非存在下(レーン1、2、5、お
よび6)または存在下(レーン3、4、7、および8)
に試験管内転写翻訳系で合成した。3μL量を用い、1
50ngのカスパーゼ3非存在下(レーン1、3、5、
および7)または存在下(レーン2、4、6および8)
に、核(レーン1〜4)またはプラスミドDNA(レー
ン5〜8)でCAD活性を測定した。
【0030】図6は、CADのICAD−Lへの結合を
示す電気泳動写真の模写図である。a .マウスCADcDNA(レーン3および4)または
空ベクター(レーン1および2)を最終容積50μL
中、35S−Metの存在下に試験管内転写翻訳に付し
た。レーン2および4の反応混合物には160ngのG
ST−ICAD−Lを含めた。ICAD−Lを抗FLA
G抗体(コダック社、M2抗体)により、免疫沈降し、
沈降物を15μLのサンプル緩衝液中で90℃に5分間
加熱した。溶出したタンパク質を10〜20%勾配ポリ
アクリルアミドゲル電気泳動し、標識されたタンパク質
をオートラジオグラフィーで可視化した。標準タンパク
質の分子量はkD単位で左側に示した。b .マウスCADを160ngのGST−ICAD−L
非存在下(レーン1および2)または存在下(レーン3
および4)に試験管内転写翻訳系で合成した。ICAD
−Lを上記抗FLAG抗体(レーン2、4、6および
8)または対照抗体(レーン1、3、5および7)とと
もに免疫沈降させ、沈降物を10μLの緩衝液Dに懸濁
した。3μL量を用いて150ngのカスパーゼ3存在
下に核(レーン1〜4)またはプラスミドDNA(レー
ン5〜8)でCAD活性を測定した。
示す電気泳動写真の模写図である。a .マウスCADcDNA(レーン3および4)または
空ベクター(レーン1および2)を最終容積50μL
中、35S−Metの存在下に試験管内転写翻訳に付し
た。レーン2および4の反応混合物には160ngのG
ST−ICAD−Lを含めた。ICAD−Lを抗FLA
G抗体(コダック社、M2抗体)により、免疫沈降し、
沈降物を15μLのサンプル緩衝液中で90℃に5分間
加熱した。溶出したタンパク質を10〜20%勾配ポリ
アクリルアミドゲル電気泳動し、標識されたタンパク質
をオートラジオグラフィーで可視化した。標準タンパク
質の分子量はkD単位で左側に示した。b .マウスCADを160ngのGST−ICAD−L
非存在下(レーン1および2)または存在下(レーン3
および4)に試験管内転写翻訳系で合成した。ICAD
−Lを上記抗FLAG抗体(レーン2、4、6および
8)または対照抗体(レーン1、3、5および7)とと
もに免疫沈降させ、沈降物を10μLの緩衝液Dに懸濁
した。3μL量を用いて150ngのカスパーゼ3存在
下に核(レーン1〜4)またはプラスミドDNA(レー
ン5〜8)でCAD活性を測定した。
【0031】図7は、アポトーシスにおけるCADおよ
びICADの機能を示す模式図である。CADタンパク
質が合成される時、ICADはCADの新生鎖に結合し
てその正しい折り畳みを可能にするのであろう。ICA
DはCADと複合体を形成したまま存続してCADのD
Nアーゼ活性を阻害し、また核局在化シグナルを遮蔽し
てCADを細胞質内に留めるのであろう。アポトーシス
刺激がカスパーゼを活性化するとICADが切断され、
放出されたCADは核に入ることができ、そこで染色体
DNAを分解する。
びICADの機能を示す模式図である。CADタンパク
質が合成される時、ICADはCADの新生鎖に結合し
てその正しい折り畳みを可能にするのであろう。ICA
DはCADと複合体を形成したまま存続してCADのD
Nアーゼ活性を阻害し、また核局在化シグナルを遮蔽し
てCADを細胞質内に留めるのであろう。アポトーシス
刺激がカスパーゼを活性化するとICADが切断され、
放出されたCADは核に入ることができ、そこで染色体
DNAを分解する。
【0032】
【実施例】以下の実施例において、本発明をさらに詳細
に説明するが、本発明の範囲はこれらによって何ら限定
されるものではない。材料 組換えカスパーゼ3は文献記載の通りにE.coliで
生産して精製した[37]。ビオチン化−Asp−Gl
u−Val−Asp−クロロメチルケトン(以下、bi
o−DEVD−cmkという)はペプチド研究所に注文
して合成した。タンパク質精製に使用した充填カラムは
全てファルマシア社から入手した。
に説明するが、本発明の範囲はこれらによって何ら限定
されるものではない。材料 組換えカスパーゼ3は文献記載の通りにE.coliで
生産して精製した[37]。ビオチン化−Asp−Gl
u−Val−Asp−クロロメチルケトン(以下、bi
o−DEVD−cmkという)はペプチド研究所に注文
して合成した。タンパク質精製に使用した充填カラムは
全てファルマシア社から入手した。
【0033】CAD検定法 CAD活性はマウス肝臓核を用いるDNA断片化検定
[21]により、またはDNアーゼ活性検定により測定
した。略述すれば、アポトーシス検定のためには核(2
×105個)をサンプルとともに150ngのカスパー
ゼ3を含む20μLの緩衝液A(10mM−HEPES
−KOH、pH7.0、50mM−NaCl、20%
(v/v)グリセリン、40mM−β−グリセロ燐酸、
2mM−MgCl2、5mM−EGTA、0.1mM−
(p−アミノフェニル)メタンスルホニルフルオリド
(APMSF)、5mM−DTT、および1mg/mL
ウシ血清アルブミン)中で30℃で2時間インキュベー
ションした。反応後、DNAを核から抽出し、1.5%
アガロースゲル電気泳動によって分析した。場合によっ
ては、放出されたDNA/ヒストン複合体をベーリンガ
ーマンハイム社から入手したキットを用いるELISA
システムで定量した。DNアーゼの検定には、前記反応
混合物の核をプラスミドDNA1μgと置き換えた。
[21]により、またはDNアーゼ活性検定により測定
した。略述すれば、アポトーシス検定のためには核(2
×105個)をサンプルとともに150ngのカスパー
ゼ3を含む20μLの緩衝液A(10mM−HEPES
−KOH、pH7.0、50mM−NaCl、20%
(v/v)グリセリン、40mM−β−グリセロ燐酸、
2mM−MgCl2、5mM−EGTA、0.1mM−
(p−アミノフェニル)メタンスルホニルフルオリド
(APMSF)、5mM−DTT、および1mg/mL
ウシ血清アルブミン)中で30℃で2時間インキュベー
ションした。反応後、DNAを核から抽出し、1.5%
アガロースゲル電気泳動によって分析した。場合によっ
ては、放出されたDNA/ヒストン複合体をベーリンガ
ーマンハイム社から入手したキットを用いるELISA
システムで定量した。DNアーゼの検定には、前記反応
混合物の核をプラスミドDNA1μgと置き換えた。
【0034】実施例1:CADの精製および配列分析 MRL−lpr/lprマウス(4〜6月齢)をSLC
から購入した。リンパ節(約70.4g)をマウス14
匹から調製し、抽出緩衝液(12.5mM−PIPES
−NaOH、pH7.0、75mM−HEPES−KO
H、pH7.0、12.5mM−KCl、37.5mM
−NaCl、2mM−MgCl2、5mM−EGTA、
1mM−DTT、5mM−サイトカラシンB、1mM−
フェニルメチルスルホニルフルオリド(PMSF)、リ
ューペプチン1μg/mL、ペプスタチンA1μg/m
Lおよび30mM−β−グリセロ燐酸)244mLに懸
濁した。細胞を凍結および解凍の3周期で崩壊し、10
0,000×gで2時間遠心分離した。S−100画分
(タンパク質3150mg)を0.1mMのbio−D
EVD−cmkとともに4℃で30分間インキュベーシ
ョンして、カスパーゼ3を不活化した。次にこのサンプ
ルを25%から50%飽和硫酸アンモニウムで分画し、
緩衝液B(10mM−トリスHCl、pH8.9、50
mM−NaCl、20%(v/v)グリセリン、1mM
−DTT、0.1mM−APMSF、および0.15%
CHAPS)に対して透析し、緩衝液Bと平衡させたH
iTrap−Heparin20mLのカラムに負荷し
た。150mM−NaClを含む緩衝液Bで洗った後、
タンパク質(タンパク質89.6mg)を500mM−
NaClを含む緩衝液Bで溶出し、緩衝液Bと平衡させ
たPD−10カラムを通した。このサンプルを緩衝液B
と平衡させた6mLのリソースQカラムに負荷し、保持
されたタンパク質を150mMから400mMまでの直
線NaCl勾配で溶出した。活性画分(タンパク質1
6.4mg)を集め、緩衝液C(20mM−HEPES
−KOH、pH7.0、20%(v/v)グリセリン、
0.1mM−APMSF、1mM−DTTおよび0.1
5%CHAPS)と平衡させたPD−10カラムを通し
た。このサンプルを緩衝液Cと平衡させたリソースSカ
ラム(容積1mL)に負荷し、保持されたタンパク質を
0mMから500mMまでの直線NaCl勾配15mL
で溶出した。活性画分(タンパク質2mg)を集め、緩
衝液D(10mM−HEPES−KOH、pH7.0、
50mM−NaCl、20%(v/v)グリセリン、4
0mM−β−グリセロ燐酸、2mM−EGTA、0.1
mM−APMSF、1mM−DTT、および0.02%
トゥイーン20)と平衡させたPD−10カラムを通し
た。このサンプルを2.6μgのカスパーゼ3とともに
4℃で一夜インキュベーションし、次に5μM−bio
−DEVD−cmkとともに4℃で30分間インキュベ
ーションしてカスパーゼ3を不活化した。混合物にGS
T−DFF45親和性ビーズ(容積25μL)を加え、
これを次に4℃に2時間放置した。緩衝液Dで洗った
後、ビーズを50μLの緩衝液Dに懸濁した。この懸濁
液に2μgのカスパーゼ3および6μgのトロンビンを
加え、室温で一夜および37℃で1時間で順次インキュ
ベーションした。このビーズを遠心分離して除き、ビー
ズから放出されたタンパク質を集めた。
から購入した。リンパ節(約70.4g)をマウス14
匹から調製し、抽出緩衝液(12.5mM−PIPES
−NaOH、pH7.0、75mM−HEPES−KO
H、pH7.0、12.5mM−KCl、37.5mM
−NaCl、2mM−MgCl2、5mM−EGTA、
1mM−DTT、5mM−サイトカラシンB、1mM−
フェニルメチルスルホニルフルオリド(PMSF)、リ
ューペプチン1μg/mL、ペプスタチンA1μg/m
Lおよび30mM−β−グリセロ燐酸)244mLに懸
濁した。細胞を凍結および解凍の3周期で崩壊し、10
0,000×gで2時間遠心分離した。S−100画分
(タンパク質3150mg)を0.1mMのbio−D
EVD−cmkとともに4℃で30分間インキュベーシ
ョンして、カスパーゼ3を不活化した。次にこのサンプ
ルを25%から50%飽和硫酸アンモニウムで分画し、
緩衝液B(10mM−トリスHCl、pH8.9、50
mM−NaCl、20%(v/v)グリセリン、1mM
−DTT、0.1mM−APMSF、および0.15%
CHAPS)に対して透析し、緩衝液Bと平衡させたH
iTrap−Heparin20mLのカラムに負荷し
た。150mM−NaClを含む緩衝液Bで洗った後、
タンパク質(タンパク質89.6mg)を500mM−
NaClを含む緩衝液Bで溶出し、緩衝液Bと平衡させ
たPD−10カラムを通した。このサンプルを緩衝液B
と平衡させた6mLのリソースQカラムに負荷し、保持
されたタンパク質を150mMから400mMまでの直
線NaCl勾配で溶出した。活性画分(タンパク質1
6.4mg)を集め、緩衝液C(20mM−HEPES
−KOH、pH7.0、20%(v/v)グリセリン、
0.1mM−APMSF、1mM−DTTおよび0.1
5%CHAPS)と平衡させたPD−10カラムを通し
た。このサンプルを緩衝液Cと平衡させたリソースSカ
ラム(容積1mL)に負荷し、保持されたタンパク質を
0mMから500mMまでの直線NaCl勾配15mL
で溶出した。活性画分(タンパク質2mg)を集め、緩
衝液D(10mM−HEPES−KOH、pH7.0、
50mM−NaCl、20%(v/v)グリセリン、4
0mM−β−グリセロ燐酸、2mM−EGTA、0.1
mM−APMSF、1mM−DTT、および0.02%
トゥイーン20)と平衡させたPD−10カラムを通し
た。このサンプルを2.6μgのカスパーゼ3とともに
4℃で一夜インキュベーションし、次に5μM−bio
−DEVD−cmkとともに4℃で30分間インキュベ
ーションしてカスパーゼ3を不活化した。混合物にGS
T−DFF45親和性ビーズ(容積25μL)を加え、
これを次に4℃に2時間放置した。緩衝液Dで洗った
後、ビーズを50μLの緩衝液Dに懸濁した。この懸濁
液に2μgのカスパーゼ3および6μgのトロンビンを
加え、室温で一夜および37℃で1時間で順次インキュ
ベーションした。このビーズを遠心分離して除き、ビー
ズから放出されたタンパク質を集めた。
【0035】このように、タンパク質配列分析に十分な
量の精製CADを調製するため、リソースS画分をカス
パーゼ3で活性化してGST−DFF45親和性カラム
に負荷した。カスパーゼ3とトロンビンの組合せによる
溶出はグルタチオンによる溶出よりも効率的なので、こ
のカラムをトロンビンとカスパーゼ3で処理した。溶出
液は銀染色で分析すると(図1b)、40kDaにバン
ドを含んでいた。35kDa以下にある数個の強いバン
ドはカラムからタンパク質を溶出するために用いたトロ
ンビンとカスパーゼ3に由来するものであった。親和性
カラムから得た溶出液は強いCAD活性を示した。図1
cに示す通り、40kDaタンパク質を1ナノグラム以
下含む溶出液1マイクロリットルは核内染色体DNAを
2時間以内に完全に断片化でき、またプラスミドDNA
を効率的に消化した。CAD標本をカスパーゼ3で処理
せずに親和性カラムに負荷すると、溶出液中には40k
Daタンパク質もCAD活性も検出されなかった(図1
bおよびc)。これらの結果から、本発明者らは40k
Daタンパク質がCADであると結論した。精製の概要
を表1に示す。ここでは核のCAD誘導DNA分解は核
から放出されたヒストン/DNAコンプレックスの量を
測定することによって定量的に検定した。マウスリンパ
節の細胞質画分から出発したCADの全精製率は約18
0000倍で、収率は2.3%であった。
量の精製CADを調製するため、リソースS画分をカス
パーゼ3で活性化してGST−DFF45親和性カラム
に負荷した。カスパーゼ3とトロンビンの組合せによる
溶出はグルタチオンによる溶出よりも効率的なので、こ
のカラムをトロンビンとカスパーゼ3で処理した。溶出
液は銀染色で分析すると(図1b)、40kDaにバン
ドを含んでいた。35kDa以下にある数個の強いバン
ドはカラムからタンパク質を溶出するために用いたトロ
ンビンとカスパーゼ3に由来するものであった。親和性
カラムから得た溶出液は強いCAD活性を示した。図1
cに示す通り、40kDaタンパク質を1ナノグラム以
下含む溶出液1マイクロリットルは核内染色体DNAを
2時間以内に完全に断片化でき、またプラスミドDNA
を効率的に消化した。CAD標本をカスパーゼ3で処理
せずに親和性カラムに負荷すると、溶出液中には40k
Daタンパク質もCAD活性も検出されなかった(図1
bおよびc)。これらの結果から、本発明者らは40k
Daタンパク質がCADであると結論した。精製の概要
を表1に示す。ここでは核のCAD誘導DNA分解は核
から放出されたヒストン/DNAコンプレックスの量を
測定することによって定量的に検定した。マウスリンパ
節の細胞質画分から出発したCADの全精製率は約18
0000倍で、収率は2.3%であった。
【0036】
【表1】マウスCADの精製 段階 タンパク質 全活性 比活性 精製率 収率 (mg)(×1000単位)(単位/μg) (倍) (%) S−100 3150 1493 0.47 100 硫酸アンモニウム 850 960.5 1.13 2 65 ヘパリン 89.6 1333.2 14.9 32 90.2 リソースQ 16.4 944.6 57.6 123 63.9 リソースS 2.0 560.2 280.0 596 37.9GST-DFF45セファロース 0.0004 34.3 85800.0 182553 2.3 S−100画分は14匹のMRL−lpr/lprマウ
スのリンパ節から調製した。CAD活性を測定するには
2×105個の核をサンプルとともに150ngのカス
パーゼ3を含む緩衝液A中で30℃で2時間インキュベ
ーションした。核から放出されたヒストン/DNA複合
体を次にCell・Death・ELISAキットで検
定した。CAD活性1単位はELISA系で405nm
の吸光度1を与える活性として便宜的に定義した。この
検定での10単位はおよそ1μgのプラスミドDNAを
30℃で2時間に分解する活性に対応する。GST−D
FF45セファロースから得た溶出液のCADタンパク
質濃度はSDSポリアクリルアミドゲル電気泳動の銀染
色から推測した。
スのリンパ節から調製した。CAD活性を測定するには
2×105個の核をサンプルとともに150ngのカス
パーゼ3を含む緩衝液A中で30℃で2時間インキュベ
ーションした。核から放出されたヒストン/DNA複合
体を次にCell・Death・ELISAキットで検
定した。CAD活性1単位はELISA系で405nm
の吸光度1を与える活性として便宜的に定義した。この
検定での10単位はおよそ1μgのプラスミドDNAを
30℃で2時間に分解する活性に対応する。GST−D
FF45セファロースから得た溶出液のCADタンパク
質濃度はSDSポリアクリルアミドゲル電気泳動の銀染
色から推測した。
【0037】ペプチド配列分析には、GST−DFF4
5親和性カラムから溶出したサンプルをマイクロコン−
10装置(アミコン社)を用いて濃縮し、10〜20%
勾配ポリアクリルアミドゲル(第一化学社)電気泳動に
よって分画し、ポリビニリジンジフルオリド膜(アプラ
イドバイオシステムズ社、プロブロット)にブロットし
た。ポンソウSで染色後、固定化したCAD(2〜4p
モル)を還元し、S−カルボキシメチル化し、報告[3
8]通りにアクロモバクタープロテアーゼIおよびAs
p−Nを用いて消化した。膜から放出されたペプチドを
Wakosil−II・AR・C18・300Aカラム
(和光純薬)を用いる逆相高速液体クロマトグラフィー
によって分画し、タンパク質配列決定装置(島津、PP
SQ−23)を用いて配列決定した。得られた配列は配
列番号2に記載の配列と一致した。
5親和性カラムから溶出したサンプルをマイクロコン−
10装置(アミコン社)を用いて濃縮し、10〜20%
勾配ポリアクリルアミドゲル(第一化学社)電気泳動に
よって分画し、ポリビニリジンジフルオリド膜(アプラ
イドバイオシステムズ社、プロブロット)にブロットし
た。ポンソウSで染色後、固定化したCAD(2〜4p
モル)を還元し、S−カルボキシメチル化し、報告[3
8]通りにアクロモバクタープロテアーゼIおよびAs
p−Nを用いて消化した。膜から放出されたペプチドを
Wakosil−II・AR・C18・300Aカラム
(和光純薬)を用いる逆相高速液体クロマトグラフィー
によって分画し、タンパク質配列決定装置(島津、PP
SQ−23)を用いて配列決定した。得られた配列は配
列番号2に記載の配列と一致した。
【0038】実施例2:マウスCADcDNAのクロー
ニング 実施例1により得られた分子量40kDaの推測上のC
ADタンパク質をアミノ酸配列分析して5種のペプチド
断片を得た。これらの2種を用いて縮重オリゴヌクレオ
チドプライマーを設計し、マウスT細胞リンパ腫cDN
AライブラリーからのPCR増幅を行った。マウスWR
19L細胞のcDNAライブラリーをpEF−BOSベ
クター(FERM BP−3549;受託日1991年
9月6日)(MizushimaおよびNagata,Nucleic Acids Re
s.18,522(1990))を用いて構築した。このcDNAライ
ブラリーから精製マウスCADのアミノ酸配列に基づい
て設計した次の縮重プライマーを用いるPCRによって
マウスCADcDNAをクローニングした。センスプラ
イマーは5’−AA(A/G)TT(C/T)GGIG
TIGCIGC−3’であり、アンチセンスプライマー
は5’−TGI(C/G)(A/T)IAC(A/G)
TG(A/G)TGIA(A/G)IA(A/G)(A
/G)TC−3’であった。式中、Iはイノシンを示
す。反応混合物はライブラリーから得たプラスミドDN
A1μgと各プライマー100pモルをPCR緩衝液5
0μLに含んでいた。
ニング 実施例1により得られた分子量40kDaの推測上のC
ADタンパク質をアミノ酸配列分析して5種のペプチド
断片を得た。これらの2種を用いて縮重オリゴヌクレオ
チドプライマーを設計し、マウスT細胞リンパ腫cDN
AライブラリーからのPCR増幅を行った。マウスWR
19L細胞のcDNAライブラリーをpEF−BOSベ
クター(FERM BP−3549;受託日1991年
9月6日)(MizushimaおよびNagata,Nucleic Acids Re
s.18,522(1990))を用いて構築した。このcDNAライ
ブラリーから精製マウスCADのアミノ酸配列に基づい
て設計した次の縮重プライマーを用いるPCRによって
マウスCADcDNAをクローニングした。センスプラ
イマーは5’−AA(A/G)TT(C/T)GGIG
TIGCIGC−3’であり、アンチセンスプライマー
は5’−TGI(C/G)(A/T)IAC(A/G)
TG(A/G)TGIA(A/G)IA(A/G)(A
/G)TC−3’であった。式中、Iはイノシンを示
す。反応混合物はライブラリーから得たプラスミドDN
A1μgと各プライマー100pモルをPCR緩衝液5
0μLに含んでいた。
【0039】これにより、322bpの断片が得られ、
これをコロニーハイブリダイゼーションによるcDNA
ライブラリーを検索するためのプローブに用いた。即ち
PCR産物(332bp)をプローブに用い、WR19
LcDNAをコロニーハイブリダイゼーションによって
検索した。このプローブDNAはランダムプライマー標
識キット(ベーリンガーマンハイム社)を用いて32Pで
標識し、実質的に報告[39]通り、コロニーハイブリ
ダイゼーションを行った。1×106個のクローンから
陽性クローン8個を得た。その中で、4個のクローンは
マウスCADの完全長コード配列(長さ1.6kb)を
持っていた。DNA配列決定装置(アプライドバイオシ
ステムズ社、PRIZM310)を用いて、そのうちの
1個のcDNAの両鎖を配列決定した(配列番号1)。
このcDNA(pEF−CAD)は344アミノ酸の読
取り枠を含んでいた(図2)。精製タンパク質から得た
ペプチド配列5種はこのコード配列の中に見出すことが
できた。精製CADのN−末端はコード配列の3番目に
現れるアラニンであることが確認されて、マウスCAD
はN−末端で翻訳後プロセシングを受けるらしいことが
示唆された。成熟タンパク質のN−末端に先行する余分
なメチオニン残基とシステイン残基は様々な種のアクチ
ン遺伝子に見出されている[24]。成熟CADは34
2アミノ酸から構成され、分子量計算値39333Da
はSDS−ポリアクリルアミドゲル電気泳動からの推測
とよく一致する。上記DNA、pEF−CADを大腸菌
に導入したEscherichia coli/pEF−CADは茨城県
つくば市東1丁目1番3号、工業技術院生命工学工業技
術研究所に寄託されている(受託日:平成9年12月1
6日;受託番号:FERM P−16558)。
これをコロニーハイブリダイゼーションによるcDNA
ライブラリーを検索するためのプローブに用いた。即ち
PCR産物(332bp)をプローブに用い、WR19
LcDNAをコロニーハイブリダイゼーションによって
検索した。このプローブDNAはランダムプライマー標
識キット(ベーリンガーマンハイム社)を用いて32Pで
標識し、実質的に報告[39]通り、コロニーハイブリ
ダイゼーションを行った。1×106個のクローンから
陽性クローン8個を得た。その中で、4個のクローンは
マウスCADの完全長コード配列(長さ1.6kb)を
持っていた。DNA配列決定装置(アプライドバイオシ
ステムズ社、PRIZM310)を用いて、そのうちの
1個のcDNAの両鎖を配列決定した(配列番号1)。
このcDNA(pEF−CAD)は344アミノ酸の読
取り枠を含んでいた(図2)。精製タンパク質から得た
ペプチド配列5種はこのコード配列の中に見出すことが
できた。精製CADのN−末端はコード配列の3番目に
現れるアラニンであることが確認されて、マウスCAD
はN−末端で翻訳後プロセシングを受けるらしいことが
示唆された。成熟タンパク質のN−末端に先行する余分
なメチオニン残基とシステイン残基は様々な種のアクチ
ン遺伝子に見出されている[24]。成熟CADは34
2アミノ酸から構成され、分子量計算値39333Da
はSDS−ポリアクリルアミドゲル電気泳動からの推測
とよく一致する。上記DNA、pEF−CADを大腸菌
に導入したEscherichia coli/pEF−CADは茨城県
つくば市東1丁目1番3号、工業技術院生命工学工業技
術研究所に寄託されている(受託日:平成9年12月1
6日;受託番号:FERM P−16558)。
【0040】マウスCADはCys残基に富み(成熟タ
ンパク質中、12残基)、等電点8.7の塩基性タンパ
ク質である。GenBankデータベースのBLAST
検索ではCAD遺伝子と相同的な遺伝子が見当たらず、
CADは新規遺伝子産物であることが判明した。しか
し、C−末端にある15アミノ酸残基からなる配列は核
局在化シグナルの特徴を有し[25]、これはCADが
核内に入って染色体DNAを分解できる事実と符合す
る。CADmRNAの組織分布をノーザンハイブリダイ
ゼーションによって検討したところ、心臓を除く全組織
が約2.5kBのCADmRNAを発現する(図3)こ
とが見出された。肺、小腸、卵巣、子宮および脾のよう
ないくつかの組織はCADmRNAを豊富に発現した。
ンパク質中、12残基)、等電点8.7の塩基性タンパ
ク質である。GenBankデータベースのBLAST
検索ではCAD遺伝子と相同的な遺伝子が見当たらず、
CADは新規遺伝子産物であることが判明した。しか
し、C−末端にある15アミノ酸残基からなる配列は核
局在化シグナルの特徴を有し[25]、これはCADが
核内に入って染色体DNAを分解できる事実と符合す
る。CADmRNAの組織分布をノーザンハイブリダイ
ゼーションによって検討したところ、心臓を除く全組織
が約2.5kBのCADmRNAを発現する(図3)こ
とが見出された。肺、小腸、卵巣、子宮および脾のよう
ないくつかの組織はCADmRNAを豊富に発現した。
【0041】実施例3:COS細胞および無細胞系での
CAD発現 クローニングしたCADcDNAがCAD活性を持つタ
ンパク質をコードすることを確認するため、CAD発現
プラスミド(pEF−CAD)をCOS細胞に導入し、
細胞抽出物を調製した。図4aに示す通り、未処理抽出
物はDNA分解を誘導しなかったが、抽出物をカスパー
ゼ3処理すると空のベクターを遺伝子移入した細胞より
も僅かに(4倍)高いCAD活性を示した。このCAD
発現レベルが低かったのことについて本発明者らは二つ
の可能性を考えた。すなわち、機能性あるCADはIC
ADの非存在下では合成できないのか、または遺伝子移
入した細胞がCADによって直ちに殺されたかのいずれ
かである。これらの可能性を検討するために、COS細
胞にCAD発現プラスミドをCAD活性を阻害すること
になるICAD発現プラスミドとともに導入した。CO
S細胞内のICAD単独の発現は内在性CAD活性を阻
害し、抽出物はカスパーゼ3処理後にさえ全くCAD活
性を示さなかった。他方、CADをICADとともに共
発現すると、抽出物は非常に強いCAD活性を示した。
図4bに示す通り、CADとICADを共遺伝子移入し
た細胞から得た全抽出物の10から20ナノグラムはカ
スパーゼ3で処理すれば、核内染色体DNAを効率的に
切断し、またプラスミドDNAを消化できた。この遺伝
子移入細胞内のCAD活性は空ベクターを遺伝子移入し
た対照細胞よりも約1000倍強力であった。これらの
結果はクローニングしたcDNAは本質的にDNアーゼ
活性を持つCADをコードすることを示す。しかし、こ
の活性はCADがICADと共発現された時のみ、CO
S細胞中に証明できる。
CAD発現 クローニングしたCADcDNAがCAD活性を持つタ
ンパク質をコードすることを確認するため、CAD発現
プラスミド(pEF−CAD)をCOS細胞に導入し、
細胞抽出物を調製した。図4aに示す通り、未処理抽出
物はDNA分解を誘導しなかったが、抽出物をカスパー
ゼ3処理すると空のベクターを遺伝子移入した細胞より
も僅かに(4倍)高いCAD活性を示した。このCAD
発現レベルが低かったのことについて本発明者らは二つ
の可能性を考えた。すなわち、機能性あるCADはIC
ADの非存在下では合成できないのか、または遺伝子移
入した細胞がCADによって直ちに殺されたかのいずれ
かである。これらの可能性を検討するために、COS細
胞にCAD発現プラスミドをCAD活性を阻害すること
になるICAD発現プラスミドとともに導入した。CO
S細胞内のICAD単独の発現は内在性CAD活性を阻
害し、抽出物はカスパーゼ3処理後にさえ全くCAD活
性を示さなかった。他方、CADをICADとともに共
発現すると、抽出物は非常に強いCAD活性を示した。
図4bに示す通り、CADとICADを共遺伝子移入し
た細胞から得た全抽出物の10から20ナノグラムはカ
スパーゼ3で処理すれば、核内染色体DNAを効率的に
切断し、またプラスミドDNAを消化できた。この遺伝
子移入細胞内のCAD活性は空ベクターを遺伝子移入し
た対照細胞よりも約1000倍強力であった。これらの
結果はクローニングしたcDNAは本質的にDNアーゼ
活性を持つCADをコードすることを示す。しかし、こ
の活性はCADがICADと共発現された時のみ、CO
S細胞中に証明できる。
【0042】CADの発現におけるICADの役割を検
討するため、転写翻訳共役系を用いる無細胞系でCAD
タンパク質を合成した。すなわち、CADmRNAをT
7ポリメラーゼで合成し、網状赤血球抽出物中で組換え
GST−ICADタンパク質の存在または非存在下に翻
訳した(図5)。どちらの場合も、CADは分子量40
kDaのタンパク質として合成された(図5a)。IC
AD非存在下に合成されたCADはCAD活性を全く示
さなかったが、ICAD存在下に合成されたCADは、
生成物をカスパーゼ3で活性化した後には効率的に核内
染色体DNAを切断し、プラスミドDNAを消化した
(図5b)。しかし、CAD合成後の反応混合物にIC
ADを加えても、混合物にはCAD活性は見出せなかっ
た。これらの結果は機能性CADはICADの存在下で
のみ合成されることを示し、新たに合成されたCADは
ICADと複合体を形成されていることを示唆する。事
実、FLAGエピトープで標識したICADを抗FLA
G抗体で免疫沈降させると40kDaCADタンパク質
がICADと共沈降し(図6a)、沈降物のカスパーゼ
3処理は核内DNA断片化活性およびDNアーゼ活性を
起動した(図6b)。ICADが抽出物に入っていない
と40kDaタンパク質もCAD活性も観察されず、ま
た対照抗体はCAD活性を沈降させないので、この共免
疫沈降は特異的である。これらの結果から、CADがD
Nアーゼであること、CADがICADと複合体を形成
すること、および活性CADがカスパーゼ3の作用によ
って複合体から放出されることを確認した。
討するため、転写翻訳共役系を用いる無細胞系でCAD
タンパク質を合成した。すなわち、CADmRNAをT
7ポリメラーゼで合成し、網状赤血球抽出物中で組換え
GST−ICADタンパク質の存在または非存在下に翻
訳した(図5)。どちらの場合も、CADは分子量40
kDaのタンパク質として合成された(図5a)。IC
AD非存在下に合成されたCADはCAD活性を全く示
さなかったが、ICAD存在下に合成されたCADは、
生成物をカスパーゼ3で活性化した後には効率的に核内
染色体DNAを切断し、プラスミドDNAを消化した
(図5b)。しかし、CAD合成後の反応混合物にIC
ADを加えても、混合物にはCAD活性は見出せなかっ
た。これらの結果は機能性CADはICADの存在下で
のみ合成されることを示し、新たに合成されたCADは
ICADと複合体を形成されていることを示唆する。事
実、FLAGエピトープで標識したICADを抗FLA
G抗体で免疫沈降させると40kDaCADタンパク質
がICADと共沈降し(図6a)、沈降物のカスパーゼ
3処理は核内DNA断片化活性およびDNアーゼ活性を
起動した(図6b)。ICADが抽出物に入っていない
と40kDaタンパク質もCAD活性も観察されず、ま
た対照抗体はCAD活性を沈降させないので、この共免
疫沈降は特異的である。これらの結果から、CADがD
Nアーゼであること、CADがICADと複合体を形成
すること、および活性CADがカスパーゼ3の作用によ
って複合体から放出されることを確認した。
【0043】実施例4:組換えヒトDFF45と組換え
マウスICAD ヒトDFF45をコードするcDNA[22]はヒトK
T3cDNAライブラリー[20]からPCRによって
分離した。このPCR産物(1kb)をpGEX−2T
[128/129]のグルタチオンS−トランスフェラ
ーゼ(GST)遺伝子と正方向および逆方向に融合した
(各々pGEX−DFFおよびpGEX−revDF
F)。pGEX−2T[128/129]はpGEX−
2T(ファルマシア社)の誘導体であって、これにはF
LAG−エピトープ標識(DYKDDDDKA)および
心筋キナーゼ認識配列(RRASV)[23]がGST
遺伝子の後に挿入されている。このGST−DFF45
融合タンパク質をE.coliのAD202株(Nakano,
H., Yamazaki,T., Ikeda,M., Masai,H., Miyatake,S.お
よびSaito,T.(1994) Nucleic Acid Res.22:543-4)で発
現し、製造社の指示に従ってグルタチオン−セファロー
ス4Bに吸着させた。ビーズは湿ったビーズ1mL当り
約1mgのGST融合タンパク質を保持していた。
マウスICAD ヒトDFF45をコードするcDNA[22]はヒトK
T3cDNAライブラリー[20]からPCRによって
分離した。このPCR産物(1kb)をpGEX−2T
[128/129]のグルタチオンS−トランスフェラ
ーゼ(GST)遺伝子と正方向および逆方向に融合した
(各々pGEX−DFFおよびpGEX−revDF
F)。pGEX−2T[128/129]はpGEX−
2T(ファルマシア社)の誘導体であって、これにはF
LAG−エピトープ標識(DYKDDDDKA)および
心筋キナーゼ認識配列(RRASV)[23]がGST
遺伝子の後に挿入されている。このGST−DFF45
融合タンパク質をE.coliのAD202株(Nakano,
H., Yamazaki,T., Ikeda,M., Masai,H., Miyatake,S.お
よびSaito,T.(1994) Nucleic Acid Res.22:543-4)で発
現し、製造社の指示に従ってグルタチオン−セファロー
ス4Bに吸着させた。ビーズは湿ったビーズ1mL当り
約1mgのGST融合タンパク質を保持していた。
【0044】実施例5:COS細胞への遺伝子移入、試
験管内転写翻訳、および免疫沈降 プラスミドpEF−ICAD−LはマウスICAD−L
の哺乳類発現ベクターである。サルCOS7細胞に報告
[40]通り、電気穿孔によってプラスミドDNAを遺
伝子移入した。37℃で48時間の培養後、細胞を緩衝
液D0.1mLに懸濁し、凍結および解凍の反復によっ
て崩壊させ、細胞の破砕片および核を除去するため15
000rpmで15分間遠心分離した。無細胞系でCA
Dを発現するには、マウスCAD完全長コード配列をp
cDNAI/Ampベクター(インビトローゲン社)の
T7プロモーターの下に置いて、pcDNA−CADと
命名した。製造社の指示に従って、TNTインビトロ転
写/翻訳キット(プロメガ社)を用いる転写翻訳共役系
をCADに適用した。すなわち、pcDNA−CADの
DNA(1μg)をTNT試薬40μLおよび40μC
iの35S−メチオニン(アマーシャム社)とともにGS
T−ICAD−L融合タンパク質160ngの存在下に
30℃で2時間インキュベーションした。ICAD−L
/CAD複合体を免疫沈降させるため、反応混合物を
0.5mLまで緩衝液Dで希釈し、抗FLAG・M2親
和性ビーズ(コダック社、3mgIgG/mLビーズ)
10μLを加えた。4℃で2時間インキュベーションし
た後、ランメリのサンプル緩衝液中、90℃に5分間加
熱して結合したタンパク質を溶出させ、10〜20%勾
配ポリアクリルアミドゲル電気泳動に付し、増感板を用
いてX−OMAT・X線フィルム(コダック社)に感光
させた。
験管内転写翻訳、および免疫沈降 プラスミドpEF−ICAD−LはマウスICAD−L
の哺乳類発現ベクターである。サルCOS7細胞に報告
[40]通り、電気穿孔によってプラスミドDNAを遺
伝子移入した。37℃で48時間の培養後、細胞を緩衝
液D0.1mLに懸濁し、凍結および解凍の反復によっ
て崩壊させ、細胞の破砕片および核を除去するため15
000rpmで15分間遠心分離した。無細胞系でCA
Dを発現するには、マウスCAD完全長コード配列をp
cDNAI/Ampベクター(インビトローゲン社)の
T7プロモーターの下に置いて、pcDNA−CADと
命名した。製造社の指示に従って、TNTインビトロ転
写/翻訳キット(プロメガ社)を用いる転写翻訳共役系
をCADに適用した。すなわち、pcDNA−CADの
DNA(1μg)をTNT試薬40μLおよび40μC
iの35S−メチオニン(アマーシャム社)とともにGS
T−ICAD−L融合タンパク質160ngの存在下に
30℃で2時間インキュベーションした。ICAD−L
/CAD複合体を免疫沈降させるため、反応混合物を
0.5mLまで緩衝液Dで希釈し、抗FLAG・M2親
和性ビーズ(コダック社、3mgIgG/mLビーズ)
10μLを加えた。4℃で2時間インキュベーションし
た後、ランメリのサンプル緩衝液中、90℃に5分間加
熱して結合したタンパク質を溶出させ、10〜20%勾
配ポリアクリルアミドゲル電気泳動に付し、増感板を用
いてX−OMAT・X線フィルム(コダック社)に感光
させた。
【0045】以下に参考例を示す。尚、参考例において
使用したCADおよびICADの検定法は以下の通りで
ある。CADおよびICADの検定法 CAD活性はマウス肝臓核を使用するアポトーシスにつ
いての試験管内検定法によって、または基質としてプラ
スミドDNAを使用するDNアーゼ活性測定法によって
測定した。すなわち、100μg/mLのウシ血清アル
ブミン(BSA)およびATP再生系(2mM−AT
P、10mM−ホスホクレアチン、および50μg/m
Lクレアチンキナーゼ)を含む20μLの緩衝液A(1
0mM−HEPES−KOH、pH7.0、50mM−
NaCl、5mM−MgCl2、5mM−EGTA、1
0%グリセリン、および1mM−DTT)中で75ng
の組換えカスパーゼ3[22]とともにサンプルを4℃
で12時間および30℃で1時間インキュベーションし
た。10μM−Ac−DEVD−cho(ペプチド研究
所)とともに4℃で30分間インキュベーションしてカ
スパーゼ3を不活化後、核(1×106個)を混合物に
加え、4℃で12時間および30℃で1時間インキュベ
ーションした。DNAを核から回収し、1%アガロース
ゲル電気泳動によって分析した。DNアーゼ活性を測定
するには核の代わりに1μgのプラスミドDNAを用い
て30℃で2時間インキュベーションした。
使用したCADおよびICADの検定法は以下の通りで
ある。CADおよびICADの検定法 CAD活性はマウス肝臓核を使用するアポトーシスにつ
いての試験管内検定法によって、または基質としてプラ
スミドDNAを使用するDNアーゼ活性測定法によって
測定した。すなわち、100μg/mLのウシ血清アル
ブミン(BSA)およびATP再生系(2mM−AT
P、10mM−ホスホクレアチン、および50μg/m
Lクレアチンキナーゼ)を含む20μLの緩衝液A(1
0mM−HEPES−KOH、pH7.0、50mM−
NaCl、5mM−MgCl2、5mM−EGTA、1
0%グリセリン、および1mM−DTT)中で75ng
の組換えカスパーゼ3[22]とともにサンプルを4℃
で12時間および30℃で1時間インキュベーションし
た。10μM−Ac−DEVD−cho(ペプチド研究
所)とともに4℃で30分間インキュベーションしてカ
スパーゼ3を不活化後、核(1×106個)を混合物に
加え、4℃で12時間および30℃で1時間インキュベ
ーションした。DNAを核から回収し、1%アガロース
ゲル電気泳動によって分析した。DNアーゼ活性を測定
するには核の代わりに1μgのプラスミドDNAを用い
て30℃で2時間インキュベーションした。
【0046】ICAD活性はCAD活性の阻害を観察す
ることによって測定した。活性化CADの原料として
は、Fas活性化細胞から得た細胞質画分またはカスパ
ーゼ3活性化部分精製マウスCAD(リソースS画分、
前記同時係属出願参照)を使用した(参考例1参照)。
すなわち、マウスW4細胞を0.5μg/mLの抗Fa
sJo2抗体[37]で37℃で20分間処理し、報告
[25]の通りS−100画分を調製した。この画分中
のカスパーゼ3は10μM−Ac−DEVD−choと
ともに4℃で30分間インキュベーションして不活化し
た。部分的に精製したCADについては、CAD(10
0ng)を150ngのカスパーゼ3とともに100μ
g/mLのBSAを含む緩衝液A100μL中で4℃で
12時間および30℃で1時間インキュベーションし、
このカスパーゼ3はAc−DEVD−choで不活化し
た。被験サンプルは最終容積20μL中の活性CAD
(Fas活性化W4細胞から得た細胞抽出物の20μg
または活性化部分精製マウスCADの5ng)に加え
た。4℃で30分間インキュベーションした後、標的と
して核またはプラスミドDNAを使用して残留CAD活
性を前記の通りに測定した。
ることによって測定した。活性化CADの原料として
は、Fas活性化細胞から得た細胞質画分またはカスパ
ーゼ3活性化部分精製マウスCAD(リソースS画分、
前記同時係属出願参照)を使用した(参考例1参照)。
すなわち、マウスW4細胞を0.5μg/mLの抗Fa
sJo2抗体[37]で37℃で20分間処理し、報告
[25]の通りS−100画分を調製した。この画分中
のカスパーゼ3は10μM−Ac−DEVD−choと
ともに4℃で30分間インキュベーションして不活化し
た。部分的に精製したCADについては、CAD(10
0ng)を150ngのカスパーゼ3とともに100μ
g/mLのBSAを含む緩衝液A100μL中で4℃で
12時間および30℃で1時間インキュベーションし、
このカスパーゼ3はAc−DEVD−choで不活化し
た。被験サンプルは最終容積20μL中の活性CAD
(Fas活性化W4細胞から得た細胞抽出物の20μg
または活性化部分精製マウスCADの5ng)に加え
た。4℃で30分間インキュベーションした後、標的と
して核またはプラスミドDNAを使用して残留CAD活
性を前記の通りに測定した。
【0047】参考例1:ICADの精製およびペプチド
の配列決定 プロテアーゼ阻害剤の混合物[1mM−(p−アミノフ
ェニル)メタンスルホニルフルオリド塩酸塩(p−AP
MSF)、1μg/mLアプロチニン、1μg/mLロ
イペプチン、および1μg/mLペプスタチンA]を添
加した緩衝液AにマウスWR19L細胞を懸濁した(2
×109細胞/mL)。細胞をガラス製のダウンスホモ
ジナイザーに移し、凍結および解凍を3周行って崩壊さ
せたが、各解凍サイクルの間にペッスルで摩りつぶし
た。ホモジネートを30000×gで30分間および1
00000×gで12時間遠心分離してS−100画分
を得た。このS−100画分(1710mg)を緩衝液
Aと平衡させたDEAEセファロースFFカラム(容積
170mL、ファルマシア社)に負荷した。カラムを緩
衝液Aで洗い、1700mL中の50〜350mM−直
線状NaCl勾配で溶出した。活性画分(タンパク質1
25mg)を集めて、25%飽和から50%飽和までの
硫酸アンモニウムで分画し、1M−硫酸アンモニウムを
添加した緩衝液B(50mM−NaCl不含緩衝液A)
に溶解した。このサンプルをブチル−セファロース4F
Fカラム(容積18mL、ファルマシア社)に負荷し、
1M−硫酸アンモニウムを添加した緩衝液Bと平衡させ
た。このカラムを1.0から0Mまでの硫酸アンモニウ
ムを直線状濃度減少勾配で含む緩衝液B180mLで溶
出し、続いて緩衝液Bによって溶出した。活性画分を集
めて最終濃度0.8Mになるまで硫酸アンモニウムを加
えた。不溶性物質を除去後、サンプル(タンパク質4.
2mg)をフェニル−スーパロースHR5/5カラム
(ファルマシア社)に負荷し、10mLの緩衝液Bで溶
出した。活性画分(1.3mg)を集め、最終濃度0.
02%になるまでトゥイーン20を加えた。サンプルを
緩衝液C(0.02%トゥイーン20含有緩衝液A)と
平衡させたスーパデックス−200HR10/30ゲル
濾過カラムに負荷した。各活性画分を90℃で15分間
加熱し、100000×gで30分間遠心分離して沈降
物を除いた。ペプチド配列分析のためにはサンプルを1
0〜20%勾配ポリアクリルアミドゲルで電気泳動し、
ポリビニリジンジフルオリド膜(プロブロット、アプラ
イドバイオシステムズ社)にブロットした。ポンソーS
で染色後、固定化したICAD(約10pモル)を還元
し、S−カルボキシメチル化し、報告[38]通りに原
位置でアクロモバクタープロテアーゼIによって消化し
た。膜から溶出したペプチドをワコーシル(Wakos
il)−II、AR・C18・300Aカラム(和光純
薬)を用いる逆相高速液体クロマトグラフィーによって
分画し、タンパク質配列決定装置(島津、PPSQ−2
3型)を使用して配列決定した。
の配列決定 プロテアーゼ阻害剤の混合物[1mM−(p−アミノフ
ェニル)メタンスルホニルフルオリド塩酸塩(p−AP
MSF)、1μg/mLアプロチニン、1μg/mLロ
イペプチン、および1μg/mLペプスタチンA]を添
加した緩衝液AにマウスWR19L細胞を懸濁した(2
×109細胞/mL)。細胞をガラス製のダウンスホモ
ジナイザーに移し、凍結および解凍を3周行って崩壊さ
せたが、各解凍サイクルの間にペッスルで摩りつぶし
た。ホモジネートを30000×gで30分間および1
00000×gで12時間遠心分離してS−100画分
を得た。このS−100画分(1710mg)を緩衝液
Aと平衡させたDEAEセファロースFFカラム(容積
170mL、ファルマシア社)に負荷した。カラムを緩
衝液Aで洗い、1700mL中の50〜350mM−直
線状NaCl勾配で溶出した。活性画分(タンパク質1
25mg)を集めて、25%飽和から50%飽和までの
硫酸アンモニウムで分画し、1M−硫酸アンモニウムを
添加した緩衝液B(50mM−NaCl不含緩衝液A)
に溶解した。このサンプルをブチル−セファロース4F
Fカラム(容積18mL、ファルマシア社)に負荷し、
1M−硫酸アンモニウムを添加した緩衝液Bと平衡させ
た。このカラムを1.0から0Mまでの硫酸アンモニウ
ムを直線状濃度減少勾配で含む緩衝液B180mLで溶
出し、続いて緩衝液Bによって溶出した。活性画分を集
めて最終濃度0.8Mになるまで硫酸アンモニウムを加
えた。不溶性物質を除去後、サンプル(タンパク質4.
2mg)をフェニル−スーパロースHR5/5カラム
(ファルマシア社)に負荷し、10mLの緩衝液Bで溶
出した。活性画分(1.3mg)を集め、最終濃度0.
02%になるまでトゥイーン20を加えた。サンプルを
緩衝液C(0.02%トゥイーン20含有緩衝液A)と
平衡させたスーパデックス−200HR10/30ゲル
濾過カラムに負荷した。各活性画分を90℃で15分間
加熱し、100000×gで30分間遠心分離して沈降
物を除いた。ペプチド配列分析のためにはサンプルを1
0〜20%勾配ポリアクリルアミドゲルで電気泳動し、
ポリビニリジンジフルオリド膜(プロブロット、アプラ
イドバイオシステムズ社)にブロットした。ポンソーS
で染色後、固定化したICAD(約10pモル)を還元
し、S−カルボキシメチル化し、報告[38]通りに原
位置でアクロモバクタープロテアーゼIによって消化し
た。膜から溶出したペプチドをワコーシル(Wakos
il)−II、AR・C18・300Aカラム(和光純
薬)を用いる逆相高速液体クロマトグラフィーによって
分画し、タンパク質配列決定装置(島津、PPSQ−2
3型)を使用して配列決定した。
【0048】ゲルからのICADの回収 ICADは実質的にHagerら[36]に従ってポリ
アクリルアミドゲルから回収した。すなわち、ICAD
100ngをランメリ(Lammelli)のサンプル
緩衝液中で95℃に5分間加熱し、ポリアクリルアミド
ゲル(第一化学)で電気泳動した。ゲルを3〜5mm厚
の細片に切断し、H2Oで洗い、1mLの緩衝液(50
mM−トリスHCl、pH8.0、5mM−DTT、
0.1mM−EDTA、150mM−NaCl、0.1
%SDSおよびBSA0.1mg/mL)中で砕き、室
温で一夜撹拌した。ゲルから溶出したタンパク質を冷ア
セトンで沈降させ、6M−グアニジンHClを含む緩衝
液Cに溶解した。この溶液を室温で20分間インキュベ
ーションし、緩衝液Cに対して室温で透析した。
アクリルアミドゲルから回収した。すなわち、ICAD
100ngをランメリ(Lammelli)のサンプル
緩衝液中で95℃に5分間加熱し、ポリアクリルアミド
ゲル(第一化学)で電気泳動した。ゲルを3〜5mm厚
の細片に切断し、H2Oで洗い、1mLの緩衝液(50
mM−トリスHCl、pH8.0、5mM−DTT、
0.1mM−EDTA、150mM−NaCl、0.1
%SDSおよびBSA0.1mg/mL)中で砕き、室
温で一夜撹拌した。ゲルから溶出したタンパク質を冷ア
セトンで沈降させ、6M−グアニジンHClを含む緩衝
液Cに溶解した。この溶液を室温で20分間インキュベ
ーションし、緩衝液Cに対して室温で透析した。
【0049】参考例2:ICADcDNAの分子クロー
ニング オリゴヌクレオチド2種(5’−GATTCCGATG
GAGGGAC−3’および5’−GATAAACTC
AGCTCTGG−3’)をESTクローン#6157
12から設計した。これは精製ICAD(図3)のペプ
チド配列の一つをコードしている。WR19LのcDN
AライブラリーからcDNA(476bp)をPCRに
よって増幅し、ランダムプライマー標識キット(ベーリ
ンガーマンハイム社)を用いて32Pで標識し、これをプ
ローブに用いてWR19LのcDNAライブラリーを検
索した。コロニーハイブリダイゼーションを報告[3
9]の通りに行って、2×105クローンの中から8個
の陽性クローンを得た。その中で2個のクローンがIC
AD−LのcDNAを、他の2個のクローンがICAD
−SのcDNAを有していた。各型のcDNAから1個
を取り、DNA配列決定装置(ファルマシアアルフレッ
ド社)を用いて両鎖について配列決定した(配列番号3
および5)。
ニング オリゴヌクレオチド2種(5’−GATTCCGATG
GAGGGAC−3’および5’−GATAAACTC
AGCTCTGG−3’)をESTクローン#6157
12から設計した。これは精製ICAD(図3)のペプ
チド配列の一つをコードしている。WR19LのcDN
AライブラリーからcDNA(476bp)をPCRに
よって増幅し、ランダムプライマー標識キット(ベーリ
ンガーマンハイム社)を用いて32Pで標識し、これをプ
ローブに用いてWR19LのcDNAライブラリーを検
索した。コロニーハイブリダイゼーションを報告[3
9]の通りに行って、2×105クローンの中から8個
の陽性クローンを得た。その中で2個のクローンがIC
AD−LのcDNAを、他の2個のクローンがICAD
−SのcDNAを有していた。各型のcDNAから1個
を取り、DNA配列決定装置(ファルマシアアルフレッ
ド社)を用いて両鎖について配列決定した(配列番号3
および5)。
【0050】参考例3: E.coliにおけるICA
Dの発現 D117EおよびD224Eの突然変異体を作製するた
め、ICAD−SおよびICAD−LのcDNAを突然
変異ヌクレオチドを有する20ヌクレオチドのプライマ
ーを用いて組換えPCR法[40]により突然変異させ
た。D117E/D224E二重突然変異体はD117
とD224の間にあるBglII部位を用いてD224
E突然変異体のN−末端側の半分をD117E突然変異
体のものに置換して作製した。野生型および突然変異型
のcDNAをpGEX−2T[128/129]のグル
タチオン−S−トランスフェラーゼ(GST)遺伝子に
融合させた。pGEX−2T[128/129]はpG
EX−2T(ファルマシア社)から読取り枠内にGST
遺伝子に続けてFLAGエピトープ標識(DYKDDD
DKA)および心筋キナーゼ認識部位(RRASV)を
挿入する[41]ことによって誘導した。この融合タン
パク質をE.coliAD202株で発現させ、本質的
に製造社の指示に従ってグルタチオン−セファロース4
B(ファルマシア社)によって精製した。グルタチオン
カラムから溶出した組換えICADを緩衝液C中のNa
Cl勾配によってモノQ・HR5/5カラムで精製し
た。
Dの発現 D117EおよびD224Eの突然変異体を作製するた
め、ICAD−SおよびICAD−LのcDNAを突然
変異ヌクレオチドを有する20ヌクレオチドのプライマ
ーを用いて組換えPCR法[40]により突然変異させ
た。D117E/D224E二重突然変異体はD117
とD224の間にあるBglII部位を用いてD224
E突然変異体のN−末端側の半分をD117E突然変異
体のものに置換して作製した。野生型および突然変異型
のcDNAをpGEX−2T[128/129]のグル
タチオン−S−トランスフェラーゼ(GST)遺伝子に
融合させた。pGEX−2T[128/129]はpG
EX−2T(ファルマシア社)から読取り枠内にGST
遺伝子に続けてFLAGエピトープ標識(DYKDDD
DKA)および心筋キナーゼ認識部位(RRASV)を
挿入する[41]ことによって誘導した。この融合タン
パク質をE.coliAD202株で発現させ、本質的
に製造社の指示に従ってグルタチオン−セファロース4
B(ファルマシア社)によって精製した。グルタチオン
カラムから溶出した組換えICADを緩衝液C中のNa
Cl勾配によってモノQ・HR5/5カラムで精製し
た。
【0051】参考例4: ジャーカット細胞の形質転
換、細胞死検定およびウェスタンブロッティング 野生型のICAD−SおよびICAD−L、およびそれ
らの二重突然変異体のN−末端をFLAGエピトープで
標識し、pEF−BOSベクターに連結した[42]。
ヒトジャーカット細胞にICAD発現プラスミドおよび
pBLIIhygを電気穿孔法により報告[10]通り
に共遺伝子移入した。ハイグロマイシンB(800μg
/mL)耐性の形質転換体を釣り上げて増殖させた。個
々のクローン中のICAD発現を抗−FLAGモノクロ
ーナル抗体(クローンM2、コダック社)を用いるウェ
スタンブロッティングによって分析した。アポトーシス
を起こさせるため、ジャーカット細胞(2.5×105
細胞/mL)を0.5μg/mLのマウス抗ヒトFas
モノクローナル抗体(クローンCH11、MBL社)ま
たは10μM−スタウロスポリンとともに37℃でイン
キュベーションした。細胞死はR&Dシステムズ社から
のキットを用いるアネキシンV法[31]によって検定
した。DNA断片化は報告の通りに検定した[10]。
ポリ(ADP−リボース)ポリメラーゼの蛋白分解はヒ
トポリ(ADP−リボース)ポリメラーゼに対するマウ
スモノクローナル抗体(G.G.Poirier博士提
供)を用いるウェスタンブロッティングによって測定し
た。細胞質中のカスパーゼ3活性を測定するにはカスパ
ーゼ3認識部位を有するペプチド(DEVDAPK)を
強螢光性の(7−メトキシクマリン−4−イル)アセチ
ル基(MCA)およびそれを消光するペプチド研究所の
2,4−ジニトロフェニル(Dnp)基と結合して得ら
れた生成物MCA−DEVDAPK(dnp)を基質と
して使用した。
換、細胞死検定およびウェスタンブロッティング 野生型のICAD−SおよびICAD−L、およびそれ
らの二重突然変異体のN−末端をFLAGエピトープで
標識し、pEF−BOSベクターに連結した[42]。
ヒトジャーカット細胞にICAD発現プラスミドおよび
pBLIIhygを電気穿孔法により報告[10]通り
に共遺伝子移入した。ハイグロマイシンB(800μg
/mL)耐性の形質転換体を釣り上げて増殖させた。個
々のクローン中のICAD発現を抗−FLAGモノクロ
ーナル抗体(クローンM2、コダック社)を用いるウェ
スタンブロッティングによって分析した。アポトーシス
を起こさせるため、ジャーカット細胞(2.5×105
細胞/mL)を0.5μg/mLのマウス抗ヒトFas
モノクローナル抗体(クローンCH11、MBL社)ま
たは10μM−スタウロスポリンとともに37℃でイン
キュベーションした。細胞死はR&Dシステムズ社から
のキットを用いるアネキシンV法[31]によって検定
した。DNA断片化は報告の通りに検定した[10]。
ポリ(ADP−リボース)ポリメラーゼの蛋白分解はヒ
トポリ(ADP−リボース)ポリメラーゼに対するマウ
スモノクローナル抗体(G.G.Poirier博士提
供)を用いるウェスタンブロッティングによって測定し
た。細胞質中のカスパーゼ3活性を測定するにはカスパ
ーゼ3認識部位を有するペプチド(DEVDAPK)を
強螢光性の(7−メトキシクマリン−4−イル)アセチ
ル基(MCA)およびそれを消光するペプチド研究所の
2,4−ジニトロフェニル(Dnp)基と結合して得ら
れた生成物MCA−DEVDAPK(dnp)を基質と
して使用した。
【0052】
【発明の効果】本明細書に記載した発明の成果は、CA
Dが、長い間求められてきたアポトーシスの間に染色体
DNAを切断するDNアーゼであること、を確証したこ
とにある。CADはアポトーシスプロテアーゼ(カスパ
ーゼ)を染色体DNAの分解と結びつけるものであり、
そのCADの確認および分子クローニングは細胞死因子
受容体または抗癌剤の作用に端を発するアポトーシス過
程全体の理解に寄与するものである。また、CADまた
はそれをコードする遺伝子、CADcDNAは、望まし
くない細胞、例えば癌細胞の除去、消滅の促進に、直接
あるいは間接的に利用することができる。さらに、CA
Dはアポトーシスが関与する細胞死に関する研究用試薬
として用いることができる。
Dが、長い間求められてきたアポトーシスの間に染色体
DNAを切断するDNアーゼであること、を確証したこ
とにある。CADはアポトーシスプロテアーゼ(カスパ
ーゼ)を染色体DNAの分解と結びつけるものであり、
そのCADの確認および分子クローニングは細胞死因子
受容体または抗癌剤の作用に端を発するアポトーシス過
程全体の理解に寄与するものである。また、CADまた
はそれをコードする遺伝子、CADcDNAは、望まし
くない細胞、例えば癌細胞の除去、消滅の促進に、直接
あるいは間接的に利用することができる。さらに、CA
Dはアポトーシスが関与する細胞死に関する研究用試薬
として用いることができる。
【0053】 参考文献 1. Jacobson, M.D., Weil, M. & Raff, M.C., Cell, 88, 347-354 (1997). 2. Nagata, S., Cell, 88, 355-365 (1997). 3. Wyllie, A.H., Kerr, J.F.R. & Currie, A.R., Int. Rev. Cytol., 68, 251-306 (1980). 4. Compton, M.M., Cancer Metastasis Rev., 11, 105-119 (1992). 5. Wyllie, A.H., Morris, R.G., Smith, A.L. & Dunlop, D., J. Pathol., 142, 66-77 (1984). 6. Wyllie, A.H., Nature, 284, 555-556 (1980). 7. Peitsch, M.C. et al., EMBO J., 12, 371-377 (1993). 8. Montague, J.W., Huges, F.J. & Cidlowski, J.A., J. Biol. Chem., 272, 6677-6684 (1997). 9. Barry, M. & Eastman, A., Arch. Biochem. Biophys., 300, 440-450 (1993). 10. Nagata, S. & Goldstein, P., Science, 267, 1449-1456 (1995). 11. Enari, M., Hug, H. & Nagata, S., Nature, 375, 78-81 (1995). 12. Enari, M., Talanian, R.V., Wong, W.W. & Nagata, S., Nature, 380, 723-726 (1996). 13. Longthorne, V.& Williams, G., EMBO J., 16, 3805-3812 (1997). 14. Armstrong, R.C., et al., J. Biol. Chem., 271, 16850-16855 (1996). 15. Henkart, P.A., Immunity, 4, 195-201 (1996). 16. Alnemri, E.S. et al., Cell, 87, 171 (1996). 17. Talanian, R.V. et al., J. Biol. Chem., 272, 9677-9682 (1997). 18. Thornberry, N.A. et al., J. Biol. Chem., 272, 17907-17911 (1997). 19. Martin, S. & Green, D., Cell, 82, 349-352 (1995).
【0054】 20. Itoh, N. et al., Cell, 66, 233-243 (1991). 21. Enari, M., Hase, A. & Nagata, S., EMBO J., 14, 5201-5208 (1995). 22. Liu, X., Zou, H., Slaughter, C. & Wang, X., Cell, 89, 175-184 (1997). 23. Blanar, M.A. & Rutter, W.J., Science, 256, 1014-1018 (1992). 24. Zakut, R. et al., Nature, 298, 857-859 (1982). 25. Dingwall, C. & Laskey, R., Trends in Biol. Sci., 16, 478-481 (1991). 26. Cohen, J.J., Duke, R.C., Fadok, V.A. & Sellins, K.S., Annu. Rev. Imunol., 10, 267-293 (1992). 27. Shiokawa, D., Iwamatsu, A. & Tamura, S., Arch. Biochem. Biophys., 346, 15-20 (1997). 28. Batistatou, A.& Green, L., J. Cell Biol., 122, 523-532 (1993). 29. Mogil, R. et al., J. Immunol., 152, 1674-1683 (1994).
【0055】 30. Verma, I., Stevenson, J., Schwarz, E., Van Antwerp, D., & Miyamoto, S., Genes & Develop., 9, 2723-2735 (1995). 31. Baldwin, A., Annu. Rev. Immunol., 14, 649-681 (1996). 32. Beg, A. et al., Genes & Develop., 6, 1899-1913 (1992). 33. Wallis, R. et al., Eur. J. Biochem., 207, 687-695 (1992). 34. Hartl, F.-U., Hlodan, R. & Langer, T., Trends in Biol. Sci., 19, 20-25 (1994). 35. Shi, G. et al., Neuron, 16, 843-852 (1996). 36. Chen, P. & Hochstrasser, M., Cell, 86, 961-972 (1996). 37. Kamens, J. et al., J. Biol. Chem., 270, 15250-15256 (1995). 38. Iwamatsu, A. & Yoshida-Kubomura, N., J. Biochem. (Tokyo), 120, 29-34 (1996). 39. Sambrook, J., Fretsch, E.F. & Maniatis, T., "Molecular Cloning: A Laboratory Manual", in 2nd Eddition, Cold Spring Harbor Lab., Cold Spring Harbor, NY, 1989. 40. Suda, T., Takahasi, T., Goldstein, P. & Nagata, S., Cell, 75, 1169-1178 (1993). 41. "Antisense RNA and DNA" WILET-LISS刊 1992 P.1-50, J.Med.Chem. 36, 1923-1937(1993). 42. Current Protcols In Immunology 2.4.1-2.6.6. 43. Kohler and Milstein, Nature,256,495-497, 1975. 44. Ueda, Proc.Natl.Acad.Sci.USA,79:4386-4390, 1982.
【0056】
【配列表】配列表 SEQUENCE LISTING <110> Osaka Bioscience Institute <120> Caspase-activated DNases <130> 163868 <140> <141> <150> JP 369443/1997 <151> 1997-12-25 <160> 6 <117> Word (MS-DOS text) <210> 1 <211> 1038 <212> DNA <213> human <400> 1 atgtgcgcgg tgctccgcca acccaaatgc gtcaagttgc gagccctaca tagcgcctgc 60 aagttcggcg tggcggcccg gagctgccag gagctgctgc gtaagggctg cgtccgcttc 120 cagctcccga tgcccggttc ccggctgtgc ctgtacgaag atggcacgga ggtgacggac 180 gactgcttcc cgggccttcc caacgacgct gagctcctat tgctcaccgc tggcgagacc 240 tggcatggct atgtgagtga catcacacgt ttcctcagtg tgtttaatga gccacatgcc 300 ggcgtcatcc aggctgcacg gcaactgctg tcagatgagc aggccccact gaggcaaaag 360 ctgctggccg atcttctgca tcacgtgagc cagaatatta ctgcagagac ccgggagcag 420 gacccatcct ggtttgaagg tttggagtcg agattcagga ataagtcggg ctatctgaga 480 tacagctgtg agagtcggat ccggggttac ctaagagagg tgagcgctta cacctctatg 540 gtggatgaag cagctcaaga agagtacctg cgagtccttg gctccatgtg ccagaagctc 600 aaatcggtgc agtacaatgg cagctatttc gacagaggtg cagaggccag cagccgcctc 660 tgtactccag aaggatggtt ctcctgccag ggcccctttg acctggagag ctgtctttcc 720 aagcactcca tcaaccccta tggcaacaga gagagccgga tcctcttcag tacctggaac 780 ctggatcata taatagagaa gaagcgcacc gtggtaccca cgctggctga agccatccag 840 gatgggaggg aggtgaactg ggagtacttc tacagcctgc tcttcactgc cgagaacctg 900 aagctggtgc acatcgcctg ccacaagaag accacacaca agctggagtg cgaccgcagt 960 aggatctatc ggcctcagac aggatccagg aggaagcagc ctgctcggaa gaagcgccct 1020 gctcggaagc gctagtga 1038
【0057】 <210> 2 <211> 344 <212> PRT <213> human <400> 2 Met Cys Ala Val Leu Arg Gln Pro Lys Cys Val Lys Leu Arg Ala 1 5 10 15 Leu His Ser Ala Cys Lys Phe Gly Val Ala Ala Arg Ser Cys Gln 20 25 30 Glu Leu Leu Arg Lys Gly Cys Val Arg Phe Gln Leu Pro Met Pro 35 40 45 Gly Ser Arg Leu Cys Leu Tyr Glu Asp Gly Thr Glu Val Thr Asp 50 55 60 Asp Cys Phe Pro Gly Leu Pro Asn Asp Ala Glu Leu Leu Leu Leu 65 70 75 Thr Ala Gly Glu Thr Trp His Gly Tyr Val Ser Asp Ile Thr Arg 80 85 90 Phe Leu Ser Val Phe Asn Glu Pro His Ala Gly Val Ile Gln Ala 95 100 105 Ala Arg Gln Leu Leu Ser Asp Glu Gln Ala Pro Leu Arg Gln Lys 110 115 120 Leu Leu Ala Asp Leu Leu His His Val Ser Gln Asn Ile Thr Ala 125 130 135 Glu Thr Arg Glu Gln Asp Pro Ser Trp Phe Glu Gly Leu Glu Ser 140 145 150 Arg Phe Arg Asn Lys Ser Gly Tyr Leu Arg Tyr Ser Cys Glu Ser 155 160 165 Arg Ile Arg Gly Tyr Leu Arg Glu Val Ser Ala Tyr Thr Ser Met 170 175 180 Val Asp Glu Ala Ala Gln Glu Glu Tyr Leu Arg Val Leu Gly Ser 185 190 195 Met Cys Gln Lys Leu Lys Ser Val Gln Tyr Asn Gly Ser Tyr Phe 200 205 210 Asp Arg Gly Ala Glu Ala Ser Ser Arg Leu Cys Thr Pro Glu Gly 215 220 225 Trp Phe Ser Cys Gln Gly Pro Phe Asp Leu Glu Ser Cys Leu Ser 230 235 240 Lys His Ser Ile Asn Pro Tyr Gly Asn Arg Glu Ser Arg Ile Leu 245 250 255 Phe Ser Thr Trp Asn Leu Asp His Ile Ile Glu Lys Lys Arg Thr 260 265 270 Val Val Pro Thr Leu Ala Glu Ala Ile Gln Asp Gly Arg Glu Val 275 280 285 Asn Trp Glu Tyr Phe Tyr Ser Leu Leu Phe Thr Ala Glu Asn Leu 290 295 300 Lys Leu Val His Ile Ala Cys His Lys Lys Thr Thr His Lys Leu 305 310 315 Glu Cys Asp Arg Ser Arg Ile Tyr Arg Pro Gln Thr Gly Ser Arg 320 325 330 Arg Lys Gln Pro Ala Arg Lys Lys Arg Pro Ala Arg Lys Arg 335 340 344
【0058】 <210> 3 <211> 996 <212> DNA <213> human <400> 3 atggagctgt cgcggggagc cagcgcccca gacccggacg atgtccggcc tctcaaaccg 60 tgtctgctac gccgcaacca cagccgcgat cagcacggcg tggcagcctc cagtctcgag 120 gagctgagga gcaaagcctg tgaactcctg gccattgata agtccctgac gccgatcacc 180 ctggtcctgg ctgaggacgg gaccatagtg gatgacgatg actacttcct ctgccttcct 240 tccaatacga agtttgtggc gttggcctgc aatgagaagt ggacttataa tgattccgat 300 ggagggacgg cttgggtttc ccaagagtcc tttgaggcag atgagccgga cagcagggca 360 ggggtgaagt ggaagaatgt ggccaggcag ctgaaagaag atctgtccag catcatcctg 420 ctgtcagaag aggacctcca agcgctcatc gacatcccat gtgcagagct ggctcaggaa 480 ctctgccaaa gctgtgccac tgtccagggg ctgcagagca cactccagca ggtgcttgac 540 cagagagagg aagcccgcca gtccaagcag ctcctggaac tttacctcca ggccttggag 600 aaagagggca acatcttgtc caaccagaaa gagtccaaag ctgccctcag tgaagagctg 660 gatgcagttg acacaggcgt cggcagagag atggcttcgg aagtgctgct cagaagccag 720 atccttacca cactgaagga gaagcctgcc ccagagctga gtttatctag tcaggatttg 780 gagtctgtct ccaaggagga tcccaaagcc ctggctgtcg ctctgagctg ggacataagg 840 aaggcagaga cagtccagca ggcctgcacc acggagctcg ccctgcggct gcagcaagtg 900 cagagcttgc attcactcag gaatctatca gcaaggagga gcccactgcc tggggaacca 960 cagcgaccca aacgagccaa acgagactcc tcgtag 996
【0059】 <210> 4 <211> 331 <212> PRT <213> human <400> 4 Met Glu Leu Ser Arg Gly Ala Ser Ala Pro Asp Pro Asp Asp Val 1 5 10 15 Arg Pro Leu Lys Pro Cys Leu Leu Arg Arg Asn His Ser Arg Asp 20 25 30 Gln His Gly Val Ala Ala Ser Ser Leu Glu Glu Leu Arg Ser Lys 35 40 45 Ala Cys Glu Leu Leu Ala Ile Asp Lys Ser Leu Thr Pro Ile Thr 50 55 60 Leu Val Leu Ala Glu Asp Gly Thr Ile Val Asp Asp Asp Asp Tyr 65 70 75 Phe Leu Cys Leu Pro Ser Asn Thr Lys Phe Val Ala Leu Ala Cys 80 85 90 Asn Glu Lys Trp Thr Tyr Asn Asp Ser Asp Gly Gly Thr Ala Trp 95 100 105 Val Ser Gln Glu Ser Phe Glu Ala Asp Glu Pro Asp Ser Arg Ala 110 115 120 Gly Val Lys Trp Lys Asn Val Ala Arg Gln Leu Lys Glu Asp Leu 125 130 135 Ser Ser Ile Ile Leu Leu Ser Glu Glu Asp Leu Gln Ala Leu Ile 140 145 150 Asp Ile Pro Cys Ala Glu Leu Ala Gln Glu Leu Cys Gln Ser Cys 155 160 165 Ala Thr Val Gln Gly Leu Gln Ser Thr Leu Gln Gln Val Leu Asp 170 175 180 Gln Arg Glu Glu Ala Arg Gln Ser Lys Gln Leu Leu Glu Leu Tyr 185 190 195 Leu Gln Ala Leu Glu Lys Glu Gly Asn Ile Leu Ser Asn Gln Lys 200 205 210 Glu Ser Lys Ala Ala Leu Ser Glu Glu Leu Asp Ala Val Asp Thr 215 220 225 Gly Val Gly Arg Glu Met Ala Ser Glu Val Leu Leu Arg Ser Gln 230 235 240 Ile Leu Thr Thr Leu Lys Glu Lys Pro Ala Pro Glu Leu Ser Leu 245 250 255 Ser Ser Gln Asp Leu Glu Ser Val Ser Lys Glu Asp Pro Lys Ala 260 265 270 Leu Ala Val Ala Leu Ser Trp Asp Ile Arg Lys Ala Glu Thr Val 275 280 285 Gln Gln Ala Cys Thr Thr Glu Leu Ala Leu Arg Leu Gln Gln Val 290 295 300 Gln Ser Leu His Ser Leu Arg Asn Leu Ser Ala Arg Arg Ser Pro 305 310 315 Leu Pro Gly Glu Pro Gln Arg Pro Lys Arg Ala Lys Arg Asp Ser 320 325 330 Ser
【0060】 <210> 5 <211> 798 <212> DNA <213> human <400> 5 atggagctgt cgcggggagc cagcgcccca gacccggacg atgtccggcc tctcaaaccg 60 tgtctgctac gccgcaacca cagccgcgat cagcacggcg tggcagcctc cagtctcgag 120 gagctgagga gcaaagcctg tgaactcctg gccattgata agtccctgac gccgatcacc 180 ctggtcctgg ctgaggacgg gaccatagtg gatgacgatg actacttcct ctgccttcct 240 tccaatacga agtttgtggc gttggcctgc aatgagaagt ggacttataa tgattccgat 300 ggagggacgg cttgggtttc ccaagagtcc tttgaggcag atgagccgga cagcagggca 360 ggggtgaagt ggaagaatgt ggccaggcag ctgaaagaag atctgtccag catcatcctg 420 ctgtcagaag aggacctcca agcgctcatc gacatcccat gtgcagagct ggctcaggaa 480 ctctgccaaa gctgtgccac tgtccagggg ctgcagagca cactccagca ggtgcttgac 540 cagagagagg aagcccgcca gtccaagcag ctcctggaac tttacctcca ggccttggag 600 aaagagggca acatcttgtc caaccagaaa gagtccaaag ctgccctcag tgaagagctg 660 gatgcagttg acacaggcgt cggcagagag atggcttcgg aagtgctgct cagaagccag 720 atccttacca cactgaagga gaagcctgcc ccagagctga gtttatctag tcaggatttg 780 gaggtgggca agaactag 798
【0061】 <210> 6 <211> 265 <212> PRT <213> human <400> 6 Met Glu Leu Ser Arg Gly Ala Ser Ala Pro Asp Pro Asp Asp Val 1 5 10 15 Arg Pro Leu Lys Pro Cys Leu Leu Arg Arg Asn His Ser Arg Asp 20 25 30 Gln His Gly Val Ala Ala Ser Ser Leu Glu Glu Leu Arg Ser Lys 35 40 45 Ala Cys Glu Leu Leu Ala Ile Asp Lys Ser Leu Thr Pro Ile Thr 50 55 60 Leu Val Leu Ala Glu Asp Gly Thr Ile Val Asp Asp Asp Asp Tyr 65 70 75 Phe Leu Cys Leu Pro Ser Asn Thr Lys Phe Val Ala Leu Ala Cys 80 85 90 Asn Glu Lys Trp Thr Tyr Asn Asp Ser Asp Gly Gly Thr Ala Trp 95 100 105 Val Ser Gln Glu Ser Phe Glu Ala Asp Glu Pro Asp Ser Arg Ala 110 115 120 Gly Val Lys Trp Lys Asn Val Ala Arg Gln Leu Lys Glu Asp Leu 125 130 135 Ser Ser Ile Ile Leu Leu Ser Glu Glu Asp Leu Gln Ala Leu Ile 140 145 150 Asp Ile Pro Cys Ala Glu Leu Ala Gln Glu Leu Cys Gln Ser Cys 155 160 165 Ala Thr Val Gln Gly Leu Gln Ser Thr Leu Gln Gln Val Leu Asp 170 175 180 Gln Arg Glu Glu Ala Arg Gln Ser Lys Gln Leu Leu Glu Leu Tyr 185 190 195 Leu Gln Ala Leu Glu Lys Glu Gly Asn Ile Leu Ser Asn Gln Lys 200 205 210 Glu Ser Lys Ala Ala Leu Ser Glu Glu Leu Asp Ala Val Asp Thr 215 220 225 Gly Val Gly Arg Glu Met Ala Ser Glu Val Leu Leu Arg Ser Gln 230 235 240 Ile Leu Thr Thr Leu Lys Glu Lys Pro Ala Pro Glu Leu Ser Leu 245 250 255 Ser Ser Gln Asp Leu Glu Val Gly Lys Asn 260 265
【図1】 40kDaタンパク質としてCADを確認し
た電気泳動写真の模写図である。
た電気泳動写真の模写図である。
【図2】 cDNA配列から予測したマウスCADの1
文字表示によるアミノ酸配列である。
文字表示によるアミノ酸配列である。
【図3】 CADmRNAの組織分布を示す。
【図4】 COS細胞中でのマウスCADの発現を示す
電気泳動写真の模写図である。
電気泳動写真の模写図である。
【図5】 無細胞系でのマウスCADの発現を示す電気
泳動写真の模写図である。
泳動写真の模写図である。
【図6】 CADのICAD−Lへの結合を示す電気泳
動写真の模写図である。
動写真の模写図である。
【図7】 アポトーシスにおけるCADおよびICAD
の機能を示す模式図である。
の機能を示す模式図である。
Claims (10)
- 【請求項1】 以下の(a)または(b)から選択され
るDNアーゼ: (a)配列番号2に示されるアミノ酸配列を有するタン
パク質、(b)配列番号2に示されるアミノ酸配列にお
いて1もしくは複数のアミノ酸が欠失、置換および/ま
たは付加されたアミノ酸配列からなり、かつ該タンパク
質と同等のDNアーゼ活性を有するタンパク質。 - 【請求項2】 そのDNアーゼ活性がカスパーゼを介し
て活性化される請求項1記載のDNアーゼ。 - 【請求項3】 請求項1または2記載のDNアーゼをコ
ードしている遺伝子。 - 【請求項4】 配列番号1に示されるDNA配列を有す
る請求項3記載の遺伝子。 - 【請求項5】 請求項3記載の遺伝子を含有するベクタ
ー。 - 【請求項6】 発現ベクターである請求項5記載のベク
ター。 - 【請求項7】 請求項6記載の発現ベクターにより形質
転換された宿主細胞。 - 【請求項8】 請求項3記載の遺伝子と相補的な配列を
有する、8塩基以上からなるDNAもしくはRNAまた
はそれらの化学的修飾体。 - 【請求項9】 請求項8記載のDNAもしくはRNAま
たはそれらの化学的修飾体を含有するベクター。 - 【請求項10】 請求項1または2記載のDNアーゼに
対する抗体。
Priority Applications (1)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
JP10369093A JPH11239494A (ja) | 1997-12-25 | 1998-12-25 | カスパ―ゼ活性化dnア―ゼ |
Applications Claiming Priority (3)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
JP36944397 | 1997-12-25 | ||
JP9-369443 | 1997-12-25 | ||
JP10369093A JPH11239494A (ja) | 1997-12-25 | 1998-12-25 | カスパ―ゼ活性化dnア―ゼ |
Publications (1)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
JPH11239494A true JPH11239494A (ja) | 1999-09-07 |
Family
ID=26582067
Family Applications (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
JP10369093A Withdrawn JPH11239494A (ja) | 1997-12-25 | 1998-12-25 | カスパ―ゼ活性化dnア―ゼ |
Country Status (1)
Country | Link |
---|---|
JP (1) | JPH11239494A (ja) |
-
1998
- 1998-12-25 JP JP10369093A patent/JPH11239494A/ja not_active Withdrawn
Similar Documents
Publication | Publication Date | Title |
---|---|---|
JP2000515734A (ja) | ヒトcAMP依存性プロテインキナーゼインヒビターホモログ | |
US5858675A (en) | Double-stranded RNA-binding protein | |
US5814480A (en) | DNA encoding human metallothioein | |
JP2001521400A (ja) | ケラチノサイト由来カリクレイン | |
US5763220A (en) | Human apoptosis-related calcium-binding protein | |
US20030109004A1 (en) | Novel human pancreatitis-associated protein | |
US5858715A (en) | Human apoptosis-associated protein | |
JP2002511742A (ja) | 新規なヒト・セリンカルボキシペプチダーゼ | |
CA2264546A1 (en) | Two human cathepsin proteins | |
CA2281674A1 (en) | Parg, a gtpase activating protein which interacts with ptpl1 | |
US6015678A (en) | Method for detection of a polynucleotide encoding protein kinase C inhibitor-homolog | |
US5763589A (en) | Human membrane protein | |
US5856130A (en) | Human pathogenesis-related protein | |
WO2000040722A2 (en) | Insulin-synthesis genes | |
JP2001511645A (ja) | ヒトC5a様受容体 | |
US6307021B1 (en) | Human apoptosis regulator | |
JP2001513640A (ja) | 新規なヒト膜貫通4スーパーファミリータンパク質 | |
US5734038A (en) | Human DBI/ACBP-like protein | |
US7179898B1 (en) | Human vanilloid receptor-like receptor | |
US5935817A (en) | cDNA encoding a human cystatin-like protein (CSTIN) | |
JPH11239494A (ja) | カスパ―ゼ活性化dnア―ゼ | |
US20030152989A1 (en) | Novel human integral membrane protein | |
US5851799A (en) | Histone-like protein | |
US6130325A (en) | Human P24 vesicle proteins | |
US5854414A (en) | Human mitochondrial membrane protein |
Legal Events
Date | Code | Title | Description |
---|---|---|---|
A621 | Written request for application examination |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A621 Effective date: 20050616 |
|
A761 | Written withdrawal of application |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A761 Effective date: 20070709 |