JPH11164691A - 胚盤胞ｃＤＮＡ - Google Patents
胚盤胞ｃＤＮＡInfo
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- JPH11164691A JPH11164691A JP10103115A JP10311598A JPH11164691A JP H11164691 A JPH11164691 A JP H11164691A JP 10103115 A JP10103115 A JP 10103115A JP 10311598 A JP10311598 A JP 10311598A JP H11164691 A JPH11164691 A JP H11164691A
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Abstract
(57)【要約】
【課題】胚形成の系統的研究、初期前着床胚形成を調節
する分子機構についての研究に極めて有用である胚盤胞
期に発現している新規な遺伝子を提供すること。 【解決手段】配列表に記載された塩基配列のいずれかか
らなるか配列表に記載された塩基配列のいずれかを含む
一本鎖ＤＮＡ、配列表に記載された塩基配列において、
１つ以上のヌクレオチドが付加され、１つ以上のヌクレ
オチドが欠如し、及び／又は１つ以上のヌクレオチドが
置換されている塩基配列からなるか、前記付加、欠如及
び／又は置換を有する塩基配列を含む一本鎖DNA、また
は前記一本鎖ＤＮＡに相補的な一本鎖ＤＮＡ。
する分子機構についての研究に極めて有用である胚盤胞
期に発現している新規な遺伝子を提供すること。 【解決手段】配列表に記載された塩基配列のいずれかか
らなるか配列表に記載された塩基配列のいずれかを含む
一本鎖ＤＮＡ、配列表に記載された塩基配列において、
１つ以上のヌクレオチドが付加され、１つ以上のヌクレ
オチドが欠如し、及び／又は１つ以上のヌクレオチドが
置換されている塩基配列からなるか、前記付加、欠如及
び／又は置換を有する塩基配列を含む一本鎖DNA、また
は前記一本鎖ＤＮＡに相補的な一本鎖ＤＮＡ。
Description
【０００１】
【発明の属する技術分野】本発明は、胚盤胞ｃＤＮＡ由
来の一本鎖DNA、この一本鎖DNAからなるDNAプローブ及
びDNAプライマーに関する。さらに本発明は、胚盤胞ｃ
ＤＮＡ由来の一本鎖DNAを含む二本鎖ＤＮＡに関する。
来の一本鎖DNA、この一本鎖DNAからなるDNAプローブ及
びDNAプライマーに関する。さらに本発明は、胚盤胞ｃ
ＤＮＡ由来の一本鎖DNAを含む二本鎖ＤＮＡに関する。
【０００２】
【従来の技術】多様なヒト組織および細胞株に由来する
３００を超えるｃＤＮＡライブラリーから単離された多
数のヒト発現配列タグ（ＥＳＴｓ）が、ｄｂＥＳＴに提
出されている（Adams 他 1995; BoguskiおよびSchuler
1995；Hillier 他 1996 ）。しかしながら、初期胚期の
間に発現した遺伝子は、ヒト胚の研究における倫理的理
由のために単離されていない。
３００を超えるｃＤＮＡライブラリーから単離された多
数のヒト発現配列タグ（ＥＳＴｓ）が、ｄｂＥＳＴに提
出されている（Adams 他 1995; BoguskiおよびSchuler
1995；Hillier 他 1996 ）。しかしながら、初期胚期の
間に発現した遺伝子は、ヒト胚の研究における倫理的理
由のために単離されていない。
【０００３】母方のプログラムは、２細胞期の間に置き
換わることが知られており、この時に接合体ゲノムは十
分に転写的に活性になり、母方のｍＲＮＡの集団は退化
する（BachvarovaおよびDe Leon 1980）。２および４細
胞期において、単一の卵割球はマウスに発達する一方、
８細胞期の後に全ての卵割球はそのような分化全能性を
喪失しており、これは細胞の発達潜在能力の段階的制限
を示している（Pedersen 1986 ）。遺伝子の発現に一般
的に関連するゲノム全体に渡る脱メチル化が８細胞期お
よび胚盤胞期の間の前着床発生の間に生じることが多い
ことが報告されている（Kafri 他 1992 ；Monk他 1991
）。胚当たりのポリ（Ａ）含有量も２細胞期から胚盤
胞期で５倍増加することが報告されている（Clegg およ
びPiko 1983 ）。これら一連の証拠は、多くの遺伝子が
発生カスケードの間にオンになることを示唆している。
換わることが知られており、この時に接合体ゲノムは十
分に転写的に活性になり、母方のｍＲＮＡの集団は退化
する（BachvarovaおよびDe Leon 1980）。２および４細
胞期において、単一の卵割球はマウスに発達する一方、
８細胞期の後に全ての卵割球はそのような分化全能性を
喪失しており、これは細胞の発達潜在能力の段階的制限
を示している（Pedersen 1986 ）。遺伝子の発現に一般
的に関連するゲノム全体に渡る脱メチル化が８細胞期お
よび胚盤胞期の間の前着床発生の間に生じることが多い
ことが報告されている（Kafri 他 1992 ；Monk他 1991
）。胚当たりのポリ（Ａ）含有量も２細胞期から胚盤
胞期で５倍増加することが報告されている（Clegg およ
びPiko 1983 ）。これら一連の証拠は、多くの遺伝子が
発生カスケードの間にオンになることを示唆している。
【０００４】
【発明が解決しようとする課題】胚盤胞期において、最
初の分化事象が生じ、２つの別個の細胞系統：栄養外胚
葉および内細胞塊の生成が生じる。これらの２つの系統
は形態学的および生化学的側面において相違しているの
で、多くの種類の分化関連遺伝子がこの段階で存在して
いると仮定するのが合理的である。即ち、この胚盤胞期
に発現している遺伝子を同定し特性決定することは重要
である。しかしながら、胚の数および胚から抽出するこ
とができるＲＮＡの量が比較的少ないため、哺乳動物遺
伝子についてはこれは困難な話である。その結果、胚形
成の系統的研究は未だなされておらず、初期前着床胚形
成を調節する分子機構について何も分かっていない。
初の分化事象が生じ、２つの別個の細胞系統：栄養外胚
葉および内細胞塊の生成が生じる。これらの２つの系統
は形態学的および生化学的側面において相違しているの
で、多くの種類の分化関連遺伝子がこの段階で存在して
いると仮定するのが合理的である。即ち、この胚盤胞期
に発現している遺伝子を同定し特性決定することは重要
である。しかしながら、胚の数および胚から抽出するこ
とができるＲＮＡの量が比較的少ないため、哺乳動物遺
伝子についてはこれは困難な話である。その結果、胚形
成の系統的研究は未だなされておらず、初期前着床胚形
成を調節する分子機構について何も分かっていない。
【０００５】２次元タンパク質ゲル電気泳動および分別
表示を使用して、マウス胚形成の間の遺伝子発現の変化
が調べられている（Shi 他 1994 ；ZimmermannおよびSc
hultz 1994）。しかし、これらの方法を使用して発見さ
れた遺伝子の数は限られている。ランダムに選択したｃ
ＤＮＡクローンの一回の配列決定により、新規遺伝子を
効率的に同定し、多様な組織または細胞株での遺伝子発
現のパターンを決定することができる。しかし、今日ま
での所、少量のＲＮＡから慣用的方法（Rothstein 他 1
993 ）によってｃＤＮＡライブラリーを構築することが
困難であるため、前着床期を調べるためのＥＳＴプロジ
ェクトは殆ど存在しない。
表示を使用して、マウス胚形成の間の遺伝子発現の変化
が調べられている（Shi 他 1994 ；ZimmermannおよびSc
hultz 1994）。しかし、これらの方法を使用して発見さ
れた遺伝子の数は限られている。ランダムに選択したｃ
ＤＮＡクローンの一回の配列決定により、新規遺伝子を
効率的に同定し、多様な組織または細胞株での遺伝子発
現のパターンを決定することができる。しかし、今日ま
での所、少量のＲＮＡから慣用的方法（Rothstein 他 1
993 ）によってｃＤＮＡライブラリーを構築することが
困難であるため、前着床期を調べるためのＥＳＴプロジ
ェクトは殆ど存在しない。
【０００６】ｃＤＮＡライブラリーの構築のために、Ｐ
ＣＲに基づく方法が開発されてこれらの問題が解決され
ようとしている（Belyavsky 他 1989 ；Korneev 他 199
4 ；Welsh 他 1990 ）。しかし、増幅操作中により短い
クローンが富裕化され、また過剰の数のサイクルにより
多くの人工物が増幅されるなどの他の問題が生じ、この
ためＰＣＲ増幅ｃＤＮＡライブラリーの使用は制限され
る。また、ＰＣＲ増幅では大部分の場合、ポリ（ｄＴ）
プライミングを使用しているので、そのようなライブラ
リーに含まれる大部分のクローンでＮ−末端タンパク質
コード領域は欠けている。
ＣＲに基づく方法が開発されてこれらの問題が解決され
ようとしている（Belyavsky 他 1989 ；Korneev 他 199
4 ；Welsh 他 1990 ）。しかし、増幅操作中により短い
クローンが富裕化され、また過剰の数のサイクルにより
多くの人工物が増幅されるなどの他の問題が生じ、この
ためＰＣＲ増幅ｃＤＮＡライブラリーの使用は制限され
る。また、ＰＣＲ増幅では大部分の場合、ポリ（ｄＴ）
プライミングを使用しているので、そのようなライブラ
リーに含まれる大部分のクローンでＮ−末端タンパク質
コード領域は欠けている。
【０００７】本発明の目的は、胚形成の系統的研究、初
期前着床胚形成を調節する分子機構についての研究に極
めて有用である胚盤胞期に発現している遺伝子を同定
し、特性決定して新規な遺伝子を提供することにある。
期前着床胚形成を調節する分子機構についての研究に極
めて有用である胚盤胞期に発現している遺伝子を同定
し、特性決定して新規な遺伝子を提供することにある。
【０００８】本発明者は、最近、ＰＣＲに基づいた新し
い方法が開発されて、高い割合の全長ｃＤＮＡを含む高
品質ｃＤＮＡライブラリーを作製した（特願平８−２９
１５００号）。この技術を使用して、本発明者は、マウ
ス胚盤胞ＲＮＡからライブラリーを構築したが、このラ
イブラリーは、ＰＣＲに基づいたライブラリー構築シス
テムで得られた従来報告されたｃＤＮＡよりも長いｃＤ
ＮＡインサートを含んでいることが判明した。さらに、
前着床期の分子構造をより良く理解するために、本発明
者はマウス胚盤胞中における最初の３，９９５クローン
の配列分析を行ったところ、６７種の新たな遺伝子を見
出して本発明を完成した。
い方法が開発されて、高い割合の全長ｃＤＮＡを含む高
品質ｃＤＮＡライブラリーを作製した（特願平８−２９
１５００号）。この技術を使用して、本発明者は、マウ
ス胚盤胞ＲＮＡからライブラリーを構築したが、このラ
イブラリーは、ＰＣＲに基づいたライブラリー構築シス
テムで得られた従来報告されたｃＤＮＡよりも長いｃＤ
ＮＡインサートを含んでいることが判明した。さらに、
前着床期の分子構造をより良く理解するために、本発明
者はマウス胚盤胞中における最初の３，９９５クローン
の配列分析を行ったところ、６７種の新たな遺伝子を見
出して本発明を完成した。
【０００９】
【課題を解決するための手段】本発明は、配列番号１〜
６７に記載された塩基配列のいずれかからなるかまたは
配列番号１〜６７に記載された塩基配列のいずれかを含
む一本鎖ＤＮＡ、若しくは前記一本鎖ＤＮＡに相補的な
一本鎖ＤＮＡに関する。さらに本発明は、配列番号１〜
６７に記載された塩基配列において、１つ以上のヌクレ
オチドが付加され、１つ以上のヌクレオチドが欠如し、
及び／又は１つ以上のヌクレオチドが置換されている塩
基配列からなるか、または前記付加、欠如及び／又は置
換を有する塩基配列を含む一本鎖DNA、若しくは前記一
本鎖ＤＮＡに相補的な一本鎖ＤＮＡに関する。また、本
発明は、配列番号６８〜１２６に記載された塩基配列の
いずれかからなるかまたは配列番号６８〜１２６に記載
された塩基配列のいずれかを含む一本鎖ＤＮＡ、若しく
は前記一本鎖ＤＮＡに相補的な一本鎖ＤＮＡに関する。
さらに本発明は、配列番号６８〜１２６に記載された塩
基配列において、１つ以上のヌクレオチドが付加され、
１つ以上のヌクレオチドが欠如し、及び／又は１つ以上
のヌクレオチドが置換されている塩基配列からなるか、
または前記付加、欠如及び／又は置換を有する塩基配列
を含む一本鎖DNA、若しくは前記一本鎖ＤＮＡに相補的
な一本鎖ＤＮＡに関する。また本発明は、上記本発明の
一本鎖DNAからなるDNAプローブまたはDNAプライマーに
関する。さらに本発明は、上記本発明の一本鎖DNA、及
び前記一本鎖ＤＮＡに相補的な一本鎖ＤＮＡからなる二
本鎖ＤＮＡに関する。
６７に記載された塩基配列のいずれかからなるかまたは
配列番号１〜６７に記載された塩基配列のいずれかを含
む一本鎖ＤＮＡ、若しくは前記一本鎖ＤＮＡに相補的な
一本鎖ＤＮＡに関する。さらに本発明は、配列番号１〜
６７に記載された塩基配列において、１つ以上のヌクレ
オチドが付加され、１つ以上のヌクレオチドが欠如し、
及び／又は１つ以上のヌクレオチドが置換されている塩
基配列からなるか、または前記付加、欠如及び／又は置
換を有する塩基配列を含む一本鎖DNA、若しくは前記一
本鎖ＤＮＡに相補的な一本鎖ＤＮＡに関する。また、本
発明は、配列番号６８〜１２６に記載された塩基配列の
いずれかからなるかまたは配列番号６８〜１２６に記載
された塩基配列のいずれかを含む一本鎖ＤＮＡ、若しく
は前記一本鎖ＤＮＡに相補的な一本鎖ＤＮＡに関する。
さらに本発明は、配列番号６８〜１２６に記載された塩
基配列において、１つ以上のヌクレオチドが付加され、
１つ以上のヌクレオチドが欠如し、及び／又は１つ以上
のヌクレオチドが置換されている塩基配列からなるか、
または前記付加、欠如及び／又は置換を有する塩基配列
を含む一本鎖DNA、若しくは前記一本鎖ＤＮＡに相補的
な一本鎖ＤＮＡに関する。また本発明は、上記本発明の
一本鎖DNAからなるDNAプローブまたはDNAプライマーに
関する。さらに本発明は、上記本発明の一本鎖DNA、及
び前記一本鎖ＤＮＡに相補的な一本鎖ＤＮＡからなる二
本鎖ＤＮＡに関する。
【００１０】
【発明の実施の形態】本発明で使用したライブラリーの
特徴 妊馬血清（ＰＭＳ）誘導過剰排卵は、雌１匹当たり複数
の胚を入手するか、全ての胚で期を同調させるために、
多くの胚研究において使用されている。しかしながら、
自然状態の遺伝子発現をホルモン効果のものと区別する
ことは困難である。さらに、培地中での胚の培養は複数
の遺伝子の発現に影響を及ぼすことが報告されている
（Ho他1994）。
特徴 妊馬血清（ＰＭＳ）誘導過剰排卵は、雌１匹当たり複数
の胚を入手するか、全ての胚で期を同調させるために、
多くの胚研究において使用されている。しかしながら、
自然状態の遺伝子発現をホルモン効果のものと区別する
ことは困難である。さらに、培地中での胚の培養は複数
の遺伝子の発現に影響を及ぼすことが報告されている
（Ho他1994）。
【００１１】本発明では、過剰排卵および胚培養の影響
を除外するために、３００個の胚盤胞を、天然のつがい
のＣ５７ＢＬ／６マウスから性交後３．５日に（ｄ．
ｐ，ｃ）直接回収した。０．３５μｇの全ＲＮＡを３０
０個の胚盤胞から調製し、オリゴｄＴプライミングした
ｃＤＮＡライブラリーを構築した。ポリ（Ａ）テイルを
有するｃＤＮＡ、キメラｃＤＮＡおよび全長インサート
を含有するｃＤＮＡの集団を同定するために、全部で４
８０個のプラスミドを単離し、両方の末端の配列を決定
した。その結果、ミトコンドリア転写物、反復要素およ
びポリ（Ａ）テイル単独のみなどのような非情報的クロ
ーンを排除して、１８４個のクローンが既知のマウス遺
伝子とともに同定された。ｒＲＮＡ、ゲノムＤＮＡまた
はキメラクローンから生じた配列は存在しなかった。ま
た、全てのクローンが３０から１２０のポリ（Ａ）テイ
ルを含んでいたという事実から、ｃＤＮＡが３’ポリ
（Ａ）部位から合成されたことが確認された。このライ
ブラリーの平均インサート長は、アガロース電気泳動か
ら約１．３５ｋｂであると見積もられた（ｎ＝５０
０）。インサート長の分布は０．５〜４．５ｋｂであっ
た。
を除外するために、３００個の胚盤胞を、天然のつがい
のＣ５７ＢＬ／６マウスから性交後３．５日に（ｄ．
ｐ，ｃ）直接回収した。０．３５μｇの全ＲＮＡを３０
０個の胚盤胞から調製し、オリゴｄＴプライミングした
ｃＤＮＡライブラリーを構築した。ポリ（Ａ）テイルを
有するｃＤＮＡ、キメラｃＤＮＡおよび全長インサート
を含有するｃＤＮＡの集団を同定するために、全部で４
８０個のプラスミドを単離し、両方の末端の配列を決定
した。その結果、ミトコンドリア転写物、反復要素およ
びポリ（Ａ）テイル単独のみなどのような非情報的クロ
ーンを排除して、１８４個のクローンが既知のマウス遺
伝子とともに同定された。ｒＲＮＡ、ゲノムＤＮＡまた
はキメラクローンから生じた配列は存在しなかった。ま
た、全てのクローンが３０から１２０のポリ（Ａ）テイ
ルを含んでいたという事実から、ｃＤＮＡが３’ポリ
（Ａ）部位から合成されたことが確認された。このライ
ブラリーの平均インサート長は、アガロース電気泳動か
ら約１．３５ｋｂであると見積もられた（ｎ＝５０
０）。インサート長の分布は０．５〜４．５ｋｂであっ
た。
【００１２】配列情報の収集 ４，２２４クローンの全形質転換体をｃＤＮＡライブラ
リーからランダムに選択し、一回の配列決定により分析
した。３’末端からのクローンの配列決定分析は組織の
発現パターンを分析するために幅広く使用されている。
しかし、本発明ではクローンの５’末端からの配列決定
を主に行った。本発明においてこの戦略を選択した理由
は以下のとおりである。１）高い頻度の全長ｃＤＮＡク
ローンを含有することが報告されている、キャップファ
インダー（ＣａｐＦｉｎｄｅｒ）ｃＤＮＡライブラリー
の効率を評価したい。２）３’ＵＴＲの非コード領域は
一般に５’ＵＴＲのものより長いために、５’ＵＴＲか
ら配列決定することによってコード領域に到達する可能
性がより高まる。本発明者は、マウスはヒトよりも少な
い遺伝子およびＥＳＴｓの数を有するために、マウスの
５’末端からの配列決定を行うことにした。
リーからランダムに選択し、一回の配列決定により分析
した。３’末端からのクローンの配列決定分析は組織の
発現パターンを分析するために幅広く使用されている。
しかし、本発明ではクローンの５’末端からの配列決定
を主に行った。本発明においてこの戦略を選択した理由
は以下のとおりである。１）高い頻度の全長ｃＤＮＡク
ローンを含有することが報告されている、キャップファ
インダー（ＣａｐＦｉｎｄｅｒ）ｃＤＮＡライブラリー
の効率を評価したい。２）３’ＵＴＲの非コード領域は
一般に５’ＵＴＲのものより長いために、５’ＵＴＲか
ら配列決定することによってコード領域に到達する可能
性がより高まる。本発明者は、マウスはヒトよりも少な
い遺伝子およびＥＳＴｓの数を有するために、マウスの
５’末端からの配列決定を行うことにした。
【００１３】全部で４８０個のプラスミドクローンを単
離し、両方の末端の配列を決定した。残りの３，７４４
個のクローンのうち、ＰＣＲによって増幅することがで
きた３，５１５個は５’末端から配列決定した。これら
のうち、いかなるデータベースとも適合しなかった３９
４個のクローンは、再度３’末端から配列決定した。各
ｃＤＮＡクローンの配列を、プログラムＢＬＡＳＴＮを
使用して豊富でないヌクレオチドおよびペプチドデータ
ベースに対して比較した。データベースに適合しなかっ
たクローンはさらに、ｄｂＥＳＴに対して比較した。結
果は表１に示す。
離し、両方の末端の配列を決定した。残りの３，７４４
個のクローンのうち、ＰＣＲによって増幅することがで
きた３，５１５個は５’末端から配列決定した。これら
のうち、いかなるデータベースとも適合しなかった３９
４個のクローンは、再度３’末端から配列決定した。各
ｃＤＮＡクローンの配列を、プログラムＢＬＡＳＴＮを
使用して豊富でないヌクレオチドおよびペプチドデータ
ベースに対して比較した。データベースに適合しなかっ
たクローンはさらに、ｄｂＥＳＴに対して比較した。結
果は表１に示す。
【００１４】
【表１】
【００１５】配列決定に成功した３，９９５個のクロー
ンのうち、５４９個（１４．１％）は非情報的なものと
分類された。残りの３，４４６個のクローンは９３７個
の異なる遺伝子にグループ分けされた（表１）。これら
のうち、４６５種は既知の遺伝子と同一または類似であ
った。他方、４０６種はＥＳＴｓと類似性を示し、６７
種はデータベースのいかなるものとも有意な類似性を示
さなかった。ＥＳＴｓとの類似性を示した４０６種は、
マウス１０〜１７．５ｄ．ｐ．ｃ．胚および多様なヒト
組織から誘導され（データは示さず）、これらの遺伝子
がマウス胚期を通じて発現していることが示唆される。
一回だけ配列決定された５５６個のクローンはシングル
トンと称された。４６５個の既知の遺伝子のうち、２１
３遺伝子は他の生物のマウス相同体であった。
ンのうち、５４９個（１４．１％）は非情報的なものと
分類された。残りの３，４４６個のクローンは９３７個
の異なる遺伝子にグループ分けされた（表１）。これら
のうち、４６５種は既知の遺伝子と同一または類似であ
った。他方、４０６種はＥＳＴｓと類似性を示し、６７
種はデータベースのいかなるものとも有意な類似性を示
さなかった。ＥＳＴｓとの類似性を示した４０６種は、
マウス１０〜１７．５ｄ．ｐ．ｃ．胚および多様なヒト
組織から誘導され（データは示さず）、これらの遺伝子
がマウス胚期を通じて発現していることが示唆される。
一回だけ配列決定された５５６個のクローンはシングル
トンと称された。４６５個の既知の遺伝子のうち、２１
３遺伝子は他の生物のマウス相同体であった。
【００１６】７４個のクローン（６７種）は、データベ
ースのいかなるものとも有意の類似性を示さず、これら
の遺伝子が胚盤胞期においてのみ発現しているか、以前
のＥＳＴプロジェクトでは見出されなかった非常に稀な
転写物であることが示唆される。これら６７種の新規な
遺伝子の配列は、配列１〜６７として配列表に示す。さ
らに、既知の遺伝子またはＥＳＴｓと類似性は示すが、
１５ｂｐ以上連続した新規な配列（リピートやｐｏｌｙ
Ａを含まない）を有するクローンが５１種あった。これ
らも、配列全体としては新規であり、本発明に含まれ、
配列６８〜１２６として配列表に示す。
ースのいかなるものとも有意の類似性を示さず、これら
の遺伝子が胚盤胞期においてのみ発現しているか、以前
のＥＳＴプロジェクトでは見出されなかった非常に稀な
転写物であることが示唆される。これら６７種の新規な
遺伝子の配列は、配列１〜６７として配列表に示す。さ
らに、既知の遺伝子またはＥＳＴｓと類似性は示すが、
１５ｂｐ以上連続した新規な配列（リピートやｐｏｌｙ
Ａを含まない）を有するクローンが５１種あった。これ
らも、配列全体としては新規であり、本発明に含まれ、
配列６８〜１２６として配列表に示す。
【００１７】上記配列１〜１２６のクローンについて、
さらにＢＬＡＳＴＸ分析を使用して分析した。その結
果、これらのクローンの一部はアミノ酸レベルにおい
て、公知のアミノ酸配列と部分的または有意な相同性を
示すことが分かった。例えば、配列１０２の０１Ｂ００
０５８ＰＤ１７Ｃは、カルモデュリン（calmodulin）と
４４．４％の相同性を示した。配列３４の０１Ｂ０００
５４ＬＬ０３Ｃは、仮想タンパク質（サッカロミセス
セレビシアエ由来のタンパク質）と４２．９％の相同性
を示した。配列５３の０１Ｂ０００６３ＬＬ２２Ｃはシ
ナフトジャニン(synaphtohanin)と４１．９％の相同性
を示した。配列３１の０１Ｂ０００５３ＫＮ０６Ｃは有
望な核抗原と４０％の相同性を示した。配列４２の０１
Ｂ０００５９ＱＢ１３Ｃは、ホメオティック・プロテイ
ン・スパルトメジャー(homeotic protein spalt-major)
と４０％の相同性を示した。種の間で保存されているこ
れらの遺伝子は、生命の発生または維持において決定的
な役割を果していると考えられる。
さらにＢＬＡＳＴＸ分析を使用して分析した。その結
果、これらのクローンの一部はアミノ酸レベルにおい
て、公知のアミノ酸配列と部分的または有意な相同性を
示すことが分かった。例えば、配列１０２の０１Ｂ００
０５８ＰＤ１７Ｃは、カルモデュリン（calmodulin）と
４４．４％の相同性を示した。配列３４の０１Ｂ０００
５４ＬＬ０３Ｃは、仮想タンパク質（サッカロミセス
セレビシアエ由来のタンパク質）と４２．９％の相同性
を示した。配列５３の０１Ｂ０００６３ＬＬ２２Ｃはシ
ナフトジャニン(synaphtohanin)と４１．９％の相同性
を示した。配列３１の０１Ｂ０００５３ＫＮ０６Ｃは有
望な核抗原と４０％の相同性を示した。配列４２の０１
Ｂ０００５９ＱＢ１３Ｃは、ホメオティック・プロテイ
ン・スパルトメジャー(homeotic protein spalt-major)
と４０％の相同性を示した。種の間で保存されているこ
れらの遺伝子は、生命の発生または維持において決定的
な役割を果していると考えられる。
【００１８】高品質ｃＤＮＡライブラリーは大規模配列
決定のために常に理想的であるとは限らない。配列の余
分な部分は減少すべきである一方、稀な遺伝子を同定す
る可能性を増加すべきであるけれども、標準化の方法は
稀な遺伝子を単離して、組織で変化するライブラリーの
複雑性を増加させるのに十分ではない（Bonaldo 他 199
6 ）。ここで、本発明者は、主として出発材料が少量で
あるために、ＰＣＲに基づいた方法を使用して胚盤胞か
らのｃＤＮＡライブラリーを構築した。一般に、ＰＣＲ
に基づいた方法を使用するｃＤＮＡライブラリーは、特
定の遺伝子の富裕化などの幾らかの増幅偏りを有するこ
とが報告されている。即ち、多くの種類の転写物を発現
しているこのライブラリー中に稀な転写物が発現してお
り、５５６（１４％）個のクローンがシングレトンであ
るという事実から見て、このライブラリーは、胚盤胞期
のＲＮＡ発現パターンを象徴している偏りのないもので
あると考えるのが妥当である。
決定のために常に理想的であるとは限らない。配列の余
分な部分は減少すべきである一方、稀な遺伝子を同定す
る可能性を増加すべきであるけれども、標準化の方法は
稀な遺伝子を単離して、組織で変化するライブラリーの
複雑性を増加させるのに十分ではない（Bonaldo 他 199
6 ）。ここで、本発明者は、主として出発材料が少量で
あるために、ＰＣＲに基づいた方法を使用して胚盤胞か
らのｃＤＮＡライブラリーを構築した。一般に、ＰＣＲ
に基づいた方法を使用するｃＤＮＡライブラリーは、特
定の遺伝子の富裕化などの幾らかの増幅偏りを有するこ
とが報告されている。即ち、多くの種類の転写物を発現
しているこのライブラリー中に稀な転写物が発現してお
り、５５６（１４％）個のクローンがシングレトンであ
るという事実から見て、このライブラリーは、胚盤胞期
のＲＮＡ発現パターンを象徴している偏りのないもので
あると考えるのが妥当である。
【００１９】ヒトゲノムは約５０，０００〜１００，０
００の遺伝子を含むと見積もられている（Fields他 199
4 ）。最近、大規模ｃＤＮＡ配列決定の努力により、組
織特異的ライブラリーから膨大な数のＥＳＴｓが同定さ
れた。ｄｂＥＳＴは現在、３’ＥＳＴｓの比較により５
０，０００の別個の遺伝子を表しており、全遺伝子の約
半分以上が発見されたことを示している（Schuler 他 1
996 ）。未同定遺伝子の残りが属するカテゴリーの一つ
は「胚形成に関連した転写物」のものである。この期は
最も劇的かつ興味ある段階であるけれども、胚の入手可
能性がないこと並びにこの期の細胞型を特徴付けるため
の分子プローブが存在しないことから、この期の分子的
事象は十分には理解されていない。十分な量のヒトの初
期胚組織入手することが困難であること、並びに哺乳動
物の胚形成および発生に関与する遺伝子が種の間で保存
されていることを考慮に入れると、胚マウスｃＤＮＡの
特徴決定が、ヒト胚形成への研究およびヒトゲノムプロ
ジェクト自体に不可欠である。マウスの胚発生の間に発
現する遺伝子を分析する他の利点は、トランスジェニッ
クまたは遺伝子ターゲッティングシステムがマウスでは
十分に確立しているということである（Hogan 他 1994
）。
００の遺伝子を含むと見積もられている（Fields他 199
4 ）。最近、大規模ｃＤＮＡ配列決定の努力により、組
織特異的ライブラリーから膨大な数のＥＳＴｓが同定さ
れた。ｄｂＥＳＴは現在、３’ＥＳＴｓの比較により５
０，０００の別個の遺伝子を表しており、全遺伝子の約
半分以上が発見されたことを示している（Schuler 他 1
996 ）。未同定遺伝子の残りが属するカテゴリーの一つ
は「胚形成に関連した転写物」のものである。この期は
最も劇的かつ興味ある段階であるけれども、胚の入手可
能性がないこと並びにこの期の細胞型を特徴付けるため
の分子プローブが存在しないことから、この期の分子的
事象は十分には理解されていない。十分な量のヒトの初
期胚組織入手することが困難であること、並びに哺乳動
物の胚形成および発生に関与する遺伝子が種の間で保存
されていることを考慮に入れると、胚マウスｃＤＮＡの
特徴決定が、ヒト胚形成への研究およびヒトゲノムプロ
ジェクト自体に不可欠である。マウスの胚発生の間に発
現する遺伝子を分析する他の利点は、トランスジェニッ
クまたは遺伝子ターゲッティングシステムがマウスでは
十分に確立しているということである（Hogan 他 1994
）。
【００２０】本発明者は、胚盤胞期を特徴付けるための
分子プローブの良好な候補となり得る６７種の全く新規
な遺伝子及び一部分既知の遺伝子またはＥＳＴｓと類似
性は示すが全体としては新規な５１種の遺伝子を同定し
た。新規な遺伝子を全長ｃＤＮＡ配列決定によって特徴
付けし、既知の機能的ドメインとのホモロジー検索を行
い、さらに、組織または発生期における発現パターンの
さらなる分析、および発見されたｃＤＮＡの染色体マッ
ピングにより、胚盤胞期における発生の分子的特徴の理
解が容易になる。
分子プローブの良好な候補となり得る６７種の全く新規
な遺伝子及び一部分既知の遺伝子またはＥＳＴｓと類似
性は示すが全体としては新規な５１種の遺伝子を同定し
た。新規な遺伝子を全長ｃＤＮＡ配列決定によって特徴
付けし、既知の機能的ドメインとのホモロジー検索を行
い、さらに、組織または発生期における発現パターンの
さらなる分析、および発見されたｃＤＮＡの染色体マッ
ピングにより、胚盤胞期における発生の分子的特徴の理
解が容易になる。
【００２１】
【実施例】胚盤胞ｃＤＮＡライブラリーの構築 ３００個の胚盤胞をＣ５７Ｂ１／６マウスの天然のつが
いから３．５ｄ．ｐ．ｃ．に回収した。全ＲＮＡを、標
準方法の改良を使用して胚盤胞から回収した（Carninci
他 1996 ）。ｃＤＮＡライブラリーを、キャップファイ
ンダー（CapFinder ）ｃＤＮＡライブラリー構築キット
を使用して製造業者の説明に従って構築した。簡単に言
うと、第１鎖ｃＤＮＡを、ＭＭＬＶ逆転写酵素（ＲＴａ
ｓｅ）および２３ｄＴ残基を含むプライマー（３’プラ
イマー）を使用して０．３５μｇの全ＲＮＡから合成し
た。ＲＴａｓｅがｍＲＮＡの５’末端に達した時に、酵
素のターミナルトランスフェラーゼ活性は、第１鎖の
３’末端にさらに数個の追加のデオキシシチジンヌクレ
オチドを追加した。３’末端に３個のデオキシグアニン
ヌクレオチド（キャップスイッチ（Capswitch ）オリ
ゴ）を有するオリゴヌクレオチドが第１鎖ｃＤＮＡの
３’末端にアニーリングし、ＲＴａｓｅが第１鎖をさら
に伸長した。２本鎖ｃＤＮＡを、キャップスイッチオリ
ゴおよび３’プライマーに相補的な５’プライマー、
０．５ＵのEX TaqおよびEX Taq緩衝液（Takara）により
増幅した。ＰＣＲは、９５℃で３０秒間；６８℃で５分
間を２０サイクル行った。２本鎖ｃＤＮＡの末端をＴ４
ＤＮＡポリメラーゼで平滑化し、次いでＥｃｏＲＩア
ダプターをＴ４リガーゼを使用して連結した。ｃＤＮＡ
をｃＤＮＡ分画カラム（CLONTECH）を使用して分画し、
ＥｃｏＲＩ切断ベクターラムダTriplEX （CLONTECH）中
にクローニングし、２．９×１０6 個の組み換え体を生
成した。細菌形質転換体を、Ｃｒｅリコンビナーゼが発
現しているE.coli株ＢＭ２３．５を感染させることによ
って得た。ランダムに拾い上げた２．７×１０3 個のク
ローンを、自動コロニーピッカーＱ−ｂｏｔ（Genetix
）を使用して３８４穴プレート中に直接置いた。
いから３．５ｄ．ｐ．ｃ．に回収した。全ＲＮＡを、標
準方法の改良を使用して胚盤胞から回収した（Carninci
他 1996 ）。ｃＤＮＡライブラリーを、キャップファイ
ンダー（CapFinder ）ｃＤＮＡライブラリー構築キット
を使用して製造業者の説明に従って構築した。簡単に言
うと、第１鎖ｃＤＮＡを、ＭＭＬＶ逆転写酵素（ＲＴａ
ｓｅ）および２３ｄＴ残基を含むプライマー（３’プラ
イマー）を使用して０．３５μｇの全ＲＮＡから合成し
た。ＲＴａｓｅがｍＲＮＡの５’末端に達した時に、酵
素のターミナルトランスフェラーゼ活性は、第１鎖の
３’末端にさらに数個の追加のデオキシシチジンヌクレ
オチドを追加した。３’末端に３個のデオキシグアニン
ヌクレオチド（キャップスイッチ（Capswitch ）オリ
ゴ）を有するオリゴヌクレオチドが第１鎖ｃＤＮＡの
３’末端にアニーリングし、ＲＴａｓｅが第１鎖をさら
に伸長した。２本鎖ｃＤＮＡを、キャップスイッチオリ
ゴおよび３’プライマーに相補的な５’プライマー、
０．５ＵのEX TaqおよびEX Taq緩衝液（Takara）により
増幅した。ＰＣＲは、９５℃で３０秒間；６８℃で５分
間を２０サイクル行った。２本鎖ｃＤＮＡの末端をＴ４
ＤＮＡポリメラーゼで平滑化し、次いでＥｃｏＲＩア
ダプターをＴ４リガーゼを使用して連結した。ｃＤＮＡ
をｃＤＮＡ分画カラム（CLONTECH）を使用して分画し、
ＥｃｏＲＩ切断ベクターラムダTriplEX （CLONTECH）中
にクローニングし、２．９×１０6 個の組み換え体を生
成した。細菌形質転換体を、Ｃｒｅリコンビナーゼが発
現しているE.coli株ＢＭ２３．５を感染させることによ
って得た。ランダムに拾い上げた２．７×１０3 個のク
ローンを、自動コロニーピッカーＱ−ｂｏｔ（Genetix
）を使用して３８４穴プレート中に直接置いた。
【００２２】稀な転写物のスクリーニング このライブラリーが稀な転写物を含むかどうかを調べる
ために、ドットブロット分析を行った。プローブをＲＴ
−ＰＣＲを使用して調製した。第１鎖ｃＤＮＡを、４０
ＵのSuperscript II（ＢＲＬ）、５０ｍＭのトリス塩酸
（ｐＨ８．３）、７５ｍＭのＫＣｌ、３ｍＭのＭｇＣｌ
2 、１ピコモルのオリゴ（ｄＴ）プライマー、１０ｍＭ
のＤＴＴ、０．５ｍＭのｄＮＴＰｓ中において、１０μ
ｇのポリ（Ａ）＋ｍＲＮＡから合成した。ＰＣＲは、
０．２μｇの第１鎖ｃＤＮＡ、２５０μＭの各ｄＮＴＰ
ｓおよび各プライマー、０．５ＵのEX TaqおよびEX Taq
緩衝液（Takara）を含む反応混合液により実施した。各
サイクルは、９６℃で３０秒間、６０℃で３０秒間およ
び７２℃で１分間の２５サイクルから構成した。本発明
者は、５’−ＴＣＴＣＴＣＣＴＧＧＡＣＴＧＧＴＴＡＴ
ＣＴＴＧＴ−３’および５’−ＡＴＧＧＴＣＴＴＧＧＡ
ＡＧＣＧＡＡＡＴＧ−３’のプライマーセットを使用し
て、マウスＨｏｘ２．１のｍＲＮＡを増幅し、５’−Ｇ
ＣＴＴＣＣＣＡＧＡＧＧＡＧＡＴＧＴＣＴＧＴＧＧ−
３’および５’−ＴＣＴＧＧＡＡＧＡＧＧＴＧＡＧＧＡ
ＣＴＧＧＡＧ−３’のプライマーセットを使用して、マ
ウスｃ−ｆｏｓのｍＲＮＡを増幅した。２２ｃｍ×２２
ｃｍフィルター中に約２０，０００クローンを含む高密
度フィルターをＱ−ｂｏｔ（Genetix ）によって作製し
た。プローブをＥＣＬ標識キット（Amersham）を使用し
て製造業者の説明に従って標識した。
ために、ドットブロット分析を行った。プローブをＲＴ
−ＰＣＲを使用して調製した。第１鎖ｃＤＮＡを、４０
ＵのSuperscript II（ＢＲＬ）、５０ｍＭのトリス塩酸
（ｐＨ８．３）、７５ｍＭのＫＣｌ、３ｍＭのＭｇＣｌ
2 、１ピコモルのオリゴ（ｄＴ）プライマー、１０ｍＭ
のＤＴＴ、０．５ｍＭのｄＮＴＰｓ中において、１０μ
ｇのポリ（Ａ）＋ｍＲＮＡから合成した。ＰＣＲは、
０．２μｇの第１鎖ｃＤＮＡ、２５０μＭの各ｄＮＴＰ
ｓおよび各プライマー、０．５ＵのEX TaqおよびEX Taq
緩衝液（Takara）を含む反応混合液により実施した。各
サイクルは、９６℃で３０秒間、６０℃で３０秒間およ
び７２℃で１分間の２５サイクルから構成した。本発明
者は、５’−ＴＣＴＣＴＣＣＴＧＧＡＣＴＧＧＴＴＡＴ
ＣＴＴＧＴ−３’および５’−ＡＴＧＧＴＣＴＴＧＧＡ
ＡＧＣＧＡＡＡＴＧ−３’のプライマーセットを使用し
て、マウスＨｏｘ２．１のｍＲＮＡを増幅し、５’−Ｇ
ＣＴＴＣＣＣＡＧＡＧＧＡＧＡＴＧＴＣＴＧＴＧＧ−
３’および５’−ＴＣＴＧＧＡＡＧＡＧＧＴＧＡＧＧＡ
ＣＴＧＧＡＧ−３’のプライマーセットを使用して、マ
ウスｃ−ｆｏｓのｍＲＮＡを増幅した。２２ｃｍ×２２
ｃｍフィルター中に約２０，０００クローンを含む高密
度フィルターをＱ−ｂｏｔ（Genetix ）によって作製し
た。プローブをＥＣＬ標識キット（Amersham）を使用し
て製造業者の説明に従って標識した。
【００２３】自動化ＤＮＡ配列決定 全部で３９９５クローンを配列決定して分析した。幾つ
のクローンがポリ（Ａ）テイルを含み、幾つのクローン
がキメラであるかを同定するために、全部で４８０個の
プラスミドをＰＩ−１００自動化プラスミド単離システ
ム（Kurabo, Osaka, Japan）を使用して単離し、両末端
をベクター隣接プライマー、Trip 5（５’−ＧＣＣＡＴ
ＴＧＴＧＴＴＧＧＴＡＣＣＣＧＧ−３’）およびTrip 3
（５’−ＣＴＡＧＡＧＴＣＧＡＣＧＧＡＴＣＣＴＧＣＡ
−３’）を使用して配列決定した。ｃＤＮＡ種を同定す
るために、残りのｃＤＮＡクローンをTrip 5およびTrip
3を使用して３０サイクルの増幅（９６℃で３０秒間、
６０℃で３０秒間、７２℃で５分間）により増幅した。
インサート長の大きさを見積もるために、ＰＣＲ産物を
１％アガロースゲル電気泳動に付した。次いで、ＰＣＲ
産物を小エビのアルカリホスファターゼ（Amersham）に
より精製し、５’−ネステッド（nested）プライマー
（５’−ＴＡＣＧＧＣＴＧＣＧＡＧＡＡ ＧＡＣＧＡＣ
ＡＡＡ−３’）および３’−ｄＭＴプライマー（Khan他
1991 ）による配列決定に付した。配列決定は色素ター
ミネーターサイクル配列決定キットおよび３７７シーク
エンサー（ＡＢＩ）により実施した。
のクローンがポリ（Ａ）テイルを含み、幾つのクローン
がキメラであるかを同定するために、全部で４８０個の
プラスミドをＰＩ−１００自動化プラスミド単離システ
ム（Kurabo, Osaka, Japan）を使用して単離し、両末端
をベクター隣接プライマー、Trip 5（５’−ＧＣＣＡＴ
ＴＧＴＧＴＴＧＧＴＡＣＣＣＧＧ−３’）およびTrip 3
（５’−ＣＴＡＧＡＧＴＣＧＡＣＧＧＡＴＣＣＴＧＣＡ
−３’）を使用して配列決定した。ｃＤＮＡ種を同定す
るために、残りのｃＤＮＡクローンをTrip 5およびTrip
3を使用して３０サイクルの増幅（９６℃で３０秒間、
６０℃で３０秒間、７２℃で５分間）により増幅した。
インサート長の大きさを見積もるために、ＰＣＲ産物を
１％アガロースゲル電気泳動に付した。次いで、ＰＣＲ
産物を小エビのアルカリホスファターゼ（Amersham）に
より精製し、５’−ネステッド（nested）プライマー
（５’−ＴＡＣＧＧＣＴＧＣＧＡＧＡＡ ＧＡＣＧＡＣ
ＡＡＡ−３’）および３’−ｄＭＴプライマー（Khan他
1991 ）による配列決定に付した。配列決定は色素ター
ミネーターサイクル配列決定キットおよび３７７シーク
エンサー（ＡＢＩ）により実施した。
【００２４】データベース比較 ヌクレオチドおよびタンパク質検索を、豊富でない核酸
配列データベースに対して、バイオテクノロジー情報国
立センター（ＮＣＢＩ，リリース９８）においてＢＬＡ
ＳＴＮを使用して実施した。＜１０-１５のＰ値（Ｐ
値；ｐ＝ポアソン分布における確率の最小和）を有する
配列は、既知遺伝子と同一であるか、既知遺伝子との部
分的ホモロジーを有するものと見なされた。ＢＬＡＳＴ
分析により未知であると決定されたＤＮＡ配列は、ｄｂ
ＥＳＴプログラムを使用してさらなる分析に付した。１
２６個の新規クローンをＢＬＡＳＴＸプログラムによっ
てタンパク質データベースと比較した。基準は、≧３０
アミノ酸残基の長さで≧４０％の同一性である。
配列データベースに対して、バイオテクノロジー情報国
立センター（ＮＣＢＩ，リリース９８）においてＢＬＡ
ＳＴＮを使用して実施した。＜１０-１５のＰ値（Ｐ
値；ｐ＝ポアソン分布における確率の最小和）を有する
配列は、既知遺伝子と同一であるか、既知遺伝子との部
分的ホモロジーを有するものと見なされた。ＢＬＡＳＴ
分析により未知であると決定されたＤＮＡ配列は、ｄｂ
ＥＳＴプログラムを使用してさらなる分析に付した。１
２６個の新規クローンをＢＬＡＳＴＸプログラムによっ
てタンパク質データベースと比較した。基準は、≧３０
アミノ酸残基の長さで≧４０％の同一性である。
【００２５】
【配列表】配列番号：1 配列の長さ：167 配列の型：核酸 鎖の数：一本鎖 トボロジー：直鎖状 配列の種類：ｃＤＮＡ クローン名：00B001770X00C 配列： 1 GGAAGAAGTC CATTCCCTAA TGCCTCTCCG AGGATCCAGC AAAAGGGAAG 51 CCCGCCAGAG GACAAAAAAC AGGAAGAAGG GAGGAACAGA AAGGAGAGGA 101 GGAACAATTC AAAACAAAGG GTCGGAGGCA AAGAGGAGAA AAAAAAAAAA 151 AAAAAAAAAA AAAAAAA 配列番号：2 配列の長さ：341 配列の型：核酸 鎖の数：一本鎖 トボロジー：直鎖状 配列の種類：ｃＤＮＡ クローン名：00B006380X00F 配列： 1 ATGGTNGGGT CTNTTCCGTC TGAGGATGGT CATCGACGGA GTGTGAGCTT 51 TCTTAAANNG CGNGGGNTGT AGTTCTGGGA CTTCCTCATT TCTTNGTTAT 101 TTGGGGAGTC TCTGGTGCNG GAAATCACCC GACAGCGANT CAGNTTTCGG 151 GGGCTTGNAT CTTTGCAGAA TCTGACTGTG TAGATTGTGG ATCGTTCTAC 201 GGGTGGNGCG GGTATTTATC CGACGATTGG TGGTGGAAGT TTTAATGGTG 251 ATAGATTATG TGGGTGAGTC AGGATCTTGT TATNGCAATC ACGGAGGTGT 301 AACGATNCTC CTACGGCTAT TCAATAAAAN TACTCAAAAA A 配列番号：3 配列の長さ：591 配列の型：核酸 鎖の数：一本鎖 トボロジー：直鎖状 配列の種類：ｃＤＮＡ クローン名：00B006500X00R 配列： 1 GATAAATTNG GATACNTCAG AATGANAGAA GCAGAAGGGG TGAAGATTCA 51 ATAAACCTGT AAGCTGGAGA GTAAGAAGGC TGCCCGGNGG TTAGNTTGGA 101 ATTTTTTCAG TTCCAACAAA NGTTTTTNTT GGACACNAGC CNNTGGTTAA 151 CNTGGNTAAA NTAGGGGAAA GGGCACAGAG ATGGGGNNGG ATNTTTCTTC 201 CATNTCNAGA AAGTCTGGGG ATGATGAGAA GCTGAAGAAA CGGAAGGAGA 251 GATTNGGGAT TGTGACAAGT TCAGNTGGAA CTGGAACCAC AGAGGATACA 301 GAGGCAAAGA AAAGAAAAAG AGCAGAGCGT TTTGGAATTG CATAATGAAA 351 AGTTCGTGCT TTCTGCACCA TAGTGTTTTC CATTTCTCAA ATTTTTGTTG 401 GTTTTATATA TACATACACA CCCCTACCTA CCTACCTATT TACATACACA 451 GTCATGTGCC TCACAGTGAG GAAGCATGTA CGTTTGGTAC ATCCTTGAAT 501 TCAGTAGCAG TTTTATTTAA CTGCTTTTNT GCGTTTAAGA TTGTTGTGGT 551 TTTTGTTTTT AATTATTTTT GCTTATTAAT AAAAAAGGAA G 配列番号：4 配列の長さ：480 配列の型：核酸 鎖の数：一本鎖 トボロジー：直鎖状 配列の種類：ｃＤＮＡ クローン名：00B007830X00F 配列： 1 GGACAAGGGG AAAGTGATCG TCGCCGGAAG TCAGATCGTC TGGCTCGGGG 51 ANCCCCCNCG CGCCATGCCG TCCGAAGAAA TACCTTCCNA GCAGCGCCGG 101 GAGCTTTGAA ACAAAGAANT GGAANGAATG TCCGGCTCCA TCCGGGGAGC 151 AAGCACCCCA CCCAAGATCC CAGTTGATTT ATTGAACGAT TCAANGGGGG 201 GAGAAAGCAG CTGCCCCNTC CTGGGACAAA GACCANAGTT CCTGNNTGCC 251 TGGACCACGT GTAACATTGA ANCGAGCNCN TCTAGANTNA TCNNNACGGC 301 GCTTGGCAGC TCANTGCTTA ACCAAAGCCT TCCTCCNTCC TGGNTTGAAT 351 GGGGCCCACC NTGGTGAGTG TGTCCACTCC CCTCTCCNAA AGTGTTCTAA 401 AAGTGGGGAG AGATGAAAAA CGGTTCCTGT TNCTTTGGTT TNTGCCTCCC 451 CNGGAGACAN TCCCGGAAAC GCCNTGGGTT 配列番号：5 配列の長さ：466 配列の型：核酸 鎖の数：一本鎖 トボロジー：直鎖状 配列の種類：ｃＤＮＡ クローン名：00B008420X00F 配列： 1 GACCNAANAA TTNTNTAGAC CATCCGTAAN GNAAAGAGGG AATGGTGGCC 51 GCCCAGGGGG AAGTATTNTA TTCGGCTGCG CNGTNCCTGG ACGTNGTTTA 101 CACAACANAA TNGTGGGCGG TATAGCGGTC TCTTTCGGCT GGGTCGGGCT 151 CAGGAANTTA GTANTGCATT CNTTTTAGTG GGGCNGCATC TGTAGGTTAA 201 ACAGGATNGA TTATAACTCN CACNANCGAT ACTAAACACA AACATTTTGA 251 CAATGCGAGA ATATGTGGGT TANAACGATG GAANTCCCGC TGCCAGACGA 301 TCCGATTGGN TCAAATTGCG GGAGTTCAGT CATTCAACCG GCGGTGAATA 351 ACAAGTAGAG AAATGTGTGC GCGCGCCTGG CTGTTGGGTT GGATATCTTC 401 TGTTTGTGAG AATGGGNTAG ATAGAGGGGG CTTGTTTTNT GATGATTCGT 451 TTCATAACGT ATTTAA 配列番号：6 配列の長さ：508 配列の型：核酸 鎖の数：一本鎖 トボロジー：直鎖状 配列の種類：ｃＤＮＡ クローン名：00B008470X00R 配列： 1 GATCCCGTAC GNGGGAAAGA GGTGTGACTT CGCGTCGTTC ANCAGCCTTG 51 TCGGTCACGG GGGGTGAGGT CTACTGTGAC AGCNAGCGCA TCACGGTAGA 101 CCNGACATGA CAACGTGCAG GGGCTTATGG GGAGACTATG TACGCTGTCG 151 GCTCGGATCG AGTTCGATCA GATTACGCAG TCCTTCGTTG GGGATGTCGA 201 TCAANATTGG TCGGGCGATG GTTCAGGCAG GGCTTTGTGC TTTGAAACAT 251 TGGGTTCCTC CAAGGTACAT ANCCAAGTTC GTGACCGAAG CGGAGGTAGT 301 CATAGGGGAC TTATTCAAAA TTTTTCTNTN TCTGTATCGG TTGAGTAAAT 351 TTTCTGGTCA AGACTAGAAG TGGGGAACTG GGCGATCAGA TGGGTTTCAG 401 TATGGGGATT TAAAAGCAGG GAGATAGCAG CAAGTTCGGA ACTTCACGTC 451 ATTATACATA ATTAACTGTA ATTTTGACAG CCGCTTGGAT TTTTAAAGAA 501 TTTTTGAG 配列番号：7 配列の長さ：783 配列の型：核酸 鎖の数：一本鎖 トボロジー：直鎖状 配列の種類：ｃＤＮＡ クローン名：00B009990X00F 配列： 1 GGCCTTTTTG GAATGGAGAC AGCAGAAGAG AAGCCTGACC AGACTTGGAA 51 CTGAAGCACC TTAAGGACAA AAGAAAGACT TGCTGAGCTC GCTCACAGAC 101 CTTCTAGAGC AGCGCTGGGC TCATGGATCT GGAGATTATG GACAGAAGAT 151 AATGTAGATG TTATAACCAG GCCAGCGTCC TGTGGTAAAG GGTGTCTTTA 201 GATCACTGTT TCGTCGGTAT AGGTAAATGA CATGAAGAAC ATCTTTATAG 251 GCAGGGGATG AGAATCTGAG ATGAAGAAAA GAAGCTCCCC TGATGGACCA 301 TTCTAAGCTA CTGTCNGAAG CAGGATCCAT ANAACTTAAG GACATGATTG 351 CNACAATTAT CANACATTGG CCTCTTAGGT CATGGTGATC TTTTAGTATT 401 TTGGCTTTCT GCTGTCCTTT CATAAAGGAA CCTCATTTTT AGCTTCTATT 451 GAAGATATAA AATCATCTCA TAGTATTTTC TCATTACTAG GAGCTGTAAA 501 TCACTTCAAA GCTGTCTTTC TCCTTGATCA TTTGCATATC AAAGTATTTC 551 TCTTGAGTAC GGTGATCTCT CCCCTGTGGT TTGCTGTGTA CAGTTCTCTC 601 TGGATCCTAN GGCCTAGGGA AGTGTGGATC CCAGTGACTG GTGTTTTCTA 651 CGTAAANCTT TTTGTTGGCT CTTNCTGGGA AGACAATGGG GAAGGGCCAG 701 GGCNNCCTGT TCCTTGCTGG GTTTGACCTT CCCGCTCCGC CTCCGGGTTC 751 CCTGCCGAAA CCCCTTTACC TCCTCAATTG GGA 配列番号：8 配列の長さ：429 配列の型：核酸 鎖の数：一本鎖 トボロジー：直鎖状 配列の種類：ｃＤＮＡ クローン名：00B010620X00R 配列： 1 TTCCTTCNGG GATCNGGCAG TGAACAGANG GTGTTNGAGG ANACAACCCG 51 GACAGGATGT NTGNTGTTAC ATGCCAGGAG CGAGTTCAAC AGCATCCAAG 101 CCNTAAGGCA GAGCCTGGAC CAATATGGTG GNGGCATGNT GCGCTTGTTC 151 CNAAGGTATT TNTTNATGNG CAAATCCGGG GAGGAGGGGA GATTNACCTG 201 TTTTTCCGCT TTCCTCCNGG GACACGGGGA AATTCGGGCA GATAATTGAA 251 TTTTTTGGTC CCATTANACA NCCACAGTNA CNGGGATTGT TTGNTCCTTC 301 CCGGGGCTTC NACTTNTTCC NNGAANGGAA CAGAAGCTAG GTGCTNAGAT 351 AAACCTGGTC AAATATTTTA AATCAGGATT NTNTTTTTTT CTCAGCCTAA 401 GAGCTTAAGT GGCTATTTAN GTAGTTTTA 配列番号：9 配列の長さ：223 配列の型：核酸 鎖の数：一本鎖 トボロジー：直鎖状 配列の種類：ｃＤＮＡ クローン名：01B00002EC13R 配列： 1 GGGTGTGGTA GTGGCTGTNT TCAATCCCAA CGCTCAGGAG GTGGAGGCCT 51 CCTGNATNTC TGTCAGTTCA AGGCCAGCCT GGGTTATNTT AGAGAGTTCA 101 AGGCCAGCCT GGGTTATNTT AGAGAGTTCT AGGCCAGCCA AGGTTAATGC 151 TGAGACACTG TCTCAGAAGA AGTGCACAAA GTTTGGCAAG GCAGAAGTGC 201 AGATTCAGAC AGCCCGAGGG GAA 配列番号：10 配列の長さ：50 配列の型：核酸 鎖の数：一本鎖 トボロジー：直鎖状 配列の種類：ｃＤＮＡ クローン名：01B00002EK23C 配列： 1 GGCGNCTTCA CTTGGGAAGG AAAAANATGC TGGTTTTCAA TGGTAAAGAT 配列番号：11 配列の長さ：127 配列の型：核酸 鎖の数：一本鎖 トボロジー：直鎖状 配列の種類：ｃＤＮＡ クローン名：01B00044KK18C 配列： 1 GGANCCGGAA CAANATGATG CGGGTGANCT GGGGAACAAA AGAAAACNGN 51 GAAATGTGCG ACTATGANGC GGATGCTCTN TCTGAGAGAC GAGCGACTTA 101 AAANAAGGAG ATAGGTTGAA CCCTAAA 配列番号：12 配列の長さ：384 配列の型：核酸 鎖の数：一本鎖 トボロジー：直鎖状 配列の種類：ｃＤＮＡ クローン名：01B00047NG22C 配列： 1 AGATCTGACC TAAAACCGGG CACCACGACG CCGGCATTTC CCGAGAATAC 51 ACTGACAAGA ACTAAAGCGA AGAATTCTCT TCTCTTTCAC TGCGGAGACC 101 AANAACCCGA TCCGTACTCC 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配列の種類：ｃＤＮＡ クローン名：01B00063LB10C 配列： 1 GCANTGCANA ATTCCTANAT AACACAGATG CAAAATTACT AAGGAAACTG 51 CAGGCTCAAG AAATAGCCAG ACAAGCAGCA CAAATAAAAC TTTTGAGAAA 101 ACTTCAGAAG CAGGAACAGG CACGGGTTGC CAAAGAAGCT AAAAAACAGC 151 AAGCGATAAT GGCTGCGGAA GAGAAGCGCA AACAGGAAAG AACAGATGAA 201 GATTATAAAG CAGTAGGGAA AAAATTAAGA GAATACAGCA AATCAGAATG 251 GGAAAGAAAA NGAACTGAGA GCTCANCAGA TTCTCGAGGC TGAGAGAGAA 301 AAAGAA 配列番号：109 配列の長さ：237 配列の型：核酸 鎖の数：一本鎖 トボロジー：直鎖状 配列の種類：ｃＤＮＡ クローン名：01B00063LJ17C 配列： 1 GTCAAATTTA ACTTTTTATT TTGGGGACTG GAGAGGCTGC TCAGCAGTTA 51 AGACCATTGC TGCTCTTCTA GAGGATGAAG GCTTGATTCC CAGCACCCAC 101 ATGGCTACTC ACAGTGGTTT AACTCCAGTC CACCCTCTTC TGGACTCCCC 151 CCCCACCCCC CCACCATGTA CACAGGTGAA CAGGTGATGC ACANACATAC 201 ATGCAGACAA AACATCCATA CACGTAAAAT AAATAAA 配列番号：110 配列の長さ：274 配列の型：核酸 鎖の数：一本鎖 トボロジー：直鎖状 配列の種類：ｃＤＮＡ クローン名：01B00064ML21D 配列： 1 AGACACCGCT CGCTCTGCTG GTNGTAGCTC TNGGGGTCAC GAGTGTATCA 51 NGTGAAATTA TTTTTNTGGT GTAAGAGATT TTCATAATTA TNTGGATAGC 101 NTTATATTGA TAAAAGAATA ATTTTTTAAA TGNTACAAAA AGTTCACTTG 151 TTACTGCAAA ATTCTNNGAA TTTNACANAA ATTCAGTATT TTTTTTTACC 201 CNNTGAANGA CTATAATTGT GTTTTAATTC TGCAGAATTA AACTTTTACT 251 TCATATTTCC AGTNTAATCC TGNA 配列番号：111 配列の長さ：578 配列の型：核酸 鎖の数：一本鎖 トボロジー：直鎖状 配列の種類：ｃＤＮＡ クローン名：01B00066OC11C 配列： 1 GGCGGCCGGG GAANTTATGG CGGAACATTC CAGAACGGGA GCCNTTGCTT 51 TTANGGGGGG GGGGGGCCCC CCCTACGANC ANNTCAAAAC AANNAAGCGG 101 GTTTCTGCCT GGGGGANAAA ACCGGGCAAG GAAAAAACTC CCTCGGGTAC 151 TACAAAGAAA TATCGGGTCT AGGCTTCAAG ACNCCTAAAG AAGCTATTGA 201 AGGGTTNCCT ACATANACAA AGAAAATGCC CCTTCACTGG TTAACGTCTC 251 CNTCCGAAGG TCGGATCCTG TCTGGTTGTC GTTGACNAAA AATGAAAGAT 301 GCANAAGGAC CATTGTCATC CGCCGGGGAC TATCTCCTTT ACATCCGAAA 351 AGTTACAATC CGCTTTGAAA AANCGTCNCC AAGAACATTT TCTTGTTGTC 401 CCCCAACCCC TGTCCCCCTG TTTTCAGGGA ATGTNNANAT CNGAAAACAT 451 TGTCCCNTTT GGGAGAATTG CNNGCCCCCC GAACCAANAN TGTTNCNATT 501 CCATGTTNCT CCAAGGTCNC CAANGGCTGC CNGCNCCAAA AAAACNNTTT 551 CANAAATTTC TNAAGGGGAC TCCTGGCC 配列番号：112 配列の長さ：499 配列の型：核酸 鎖の数：一本鎖 トボロジー：直鎖状 配列の種類：ｃＤＮＡ クローン名：01B00067PA23C 配列： 1 GGATCCGTCC GGGCAGCGAG CGCTCGCCGT CGGGTCCCAC GGAGAACCGG 51 TGGCTGAAGC CGTACTATTT TATAACAGTC ATGGAGATCA GTGACGATGT 101 TACAAACCCA GAACAACTTT GGAAAATGAA GCCAAAGGGA AACCTGGAAG 151 ATGACAGTTA CTCGACTAAG GACTCGGGAG AGACGAGCAT GCTGAAAAGA 201 CCGGGGCTCT CGCACTTGCA GCACGCGGTC CACGTCGATG CCTTTGACTG 251 CCCCTCCGAG CTTCAGCACA CGCAGGAATT CTTTCCAAAC TGGCGCTTGC 301 CAGTGAAAGT CGCTGCCATC ATATCATCCC TGACTTTCCT GTNCACACTT 351 CTGAGGGAAA TCATCTACCC GTTAGTAACT TCCCGTGAAC AATATTTTTA 401 TAAAATTCCN ATCCTGGGTT ATTAACNAAG TCTTGCCAAT GGTCGCCATT 451 ACCCTCTTGG CACTGGTCTA TTTGCCACGA GAGTTAGCGG CAGTTGTNC 配列番号：113 配列の長さ：293 配列の型：核酸 鎖の数：一本鎖 トボロジー：直鎖状 配列の種類：ｃＤＮＡ クローン名：01B00067PE16D 配列： 1 GCACTTGGGA GGCNGAGGCA GGCGGATTTC TGAGTTCGAG GCCTGCCTGG 51 TNTACAGAGT GAGTTCCNGG ACAGCCNGGG CTACACAGAG AAACCCNGTC 101 TTGANNAAAC AAAAAGGTTN GGCTAGTATT TGGAGANAGA AGATTAGNNA 151 ATGGAAGTGA AAGACGAAGA AGACATACAG GAAGGTGAAG AAAAAGCTGT 201 TNGAGAAGAT AGGNAAATAG AAGACAAAGC ATCTTTNGAA GACAGAAAAG 251 GTACTTAAAG GCACAGGTAG TNGGAAGCCG AAGAATAGAA GAA 配列番号：114 配列の長さ：530 配列の型：核酸 鎖の数：一本鎖 トボロジー：直鎖状 配列の種類：ｃＤＮＡ クローン名：01B00067PP13C 配列： 1 GCAGCGCGGA NGCCGGGANG NTTCGAATCT TCCTGCACCG TGTCTTCCTG 51 GACGCTGTGA TGCATCACGT CGTNACGATA GTGGACCTCT GAAACTTCCA 101 NCCCAAAGAG TAAACCAGAG AATCTTGGAG AAGCCCCAGA GAACTGCGCT 151 GATGGCATCC TCCACGTCAC CGCCNAGGTC ACCTTCTGGG AGGATTTTGA 201 CTCATGATAC AATCTATTTT CCTCAAAGTA ATATCATCTC ANAGTTGCTT 251 CCCTGGTACC TGAGGTACAC TCCTCCAGAA GTCCCCAGCA CCANCGTCAT 301 AACCAAGTTT ATACTGGTTA ACTGTCCTTG GAATGAANGC ATCGAATACC 351 NAGCTGGAGA TACAGATGAC CCNCCAGGAA TTACTCAGAA CCCTGTCATC 401 AATGGGAATG TAACCCTGAG TGATGGGCNC AGCAACNCAN AAGAAGACGT 451 GGAGGATGAC ACCCAGTTGG CGCTCCNAAG CAACCTTTCA GTTCACTGTC 501 CAACGCTTCA GCAGACTGGA GTGAGTCAAA 配列番号：115 配列の長さ：298 配列の型：核酸 鎖の数：一本鎖 トボロジー：直鎖状 配列の種類：ｃＤＮＡ クローン名：01B00071KD23C 配列： 1 GGAAGANCGG TGCCAACATG GCGGNCGCCT GGCCCGCGGG TCGGGCTTCC 51 CCAGCGGNGG GGCCTCCGGG CCTTCTCCGC ACCCTGTGGC TCGTNACGGT 101 CGCCGCGGGA CACTGTGGGG CTGCTGCCTC TGGCNCTNTC GGGGGCAANN 151 AAACCCCAAT TTTGAGNACC TCAGGGTTGG GACAATATNT TTNTAAAAAA 201 CCAAAAATAA TTTGATNCTC CCCAAAAAAC ATTTTATTTT TCAAACTACN 251 CACCCCTTTT TCATTTTTNC CNCCCCCCAA AANAACTTTT AAGGAATT 配列番号：116 配列の長さ：321 配列の型：核酸 鎖の数：一本鎖 トボロジー：直鎖状 配列の種類：ｃＤＮＡ クローン名：01B00071KG20C 配列： 1 GGATTCATCA TTGTCAAAGT AAATATTTTT TATTTATANG ATATACNGTT 51 AACTATTTGG GTTGTATGAA AATATACTCC TTGTCCTTTA CAAAGCTTGC 101 TTACATTCAT NTGCCATTTA ACATGAATNA GGAAATCCAT TTATGGAATT 151 ACAATNACAN TGACCCAATC GCTCTGCCAA TCAANCCACN CGGGCTNTTT 201 TGTNCNANTA AATTTTNGTN CCNATTTAAA TTTAATAAAT TTAATTTTTT 251 TAAATACAAA TTTCCANTGA GGGGCTTTTN CACCCCCANG GGTCCAATTN 301 CCNNGTATTT TTTTTCCCAT T 配列番号：117 配列の長さ：480 配列の型：核酸 鎖の数：一本鎖 トボロジー：直鎖状 配列の種類：ｃＤＮＡ クローン名：01B00071KI04C 配列： 1 GGATGGAATT ANACTTTGGA AGACAGACAG AGCTCTGAGC CATCTCTCCA 51 GCCCAAAGCT GACTTTATTA CAGGAGAACG TTATGTTACT TCTCCGATGC 101 ATTTGCTGAG TTATAAACTA TAAAAAAATG GTGAGGCCAN CAGGTGTTCA 151 AGGTGGTTTA AATCTTTCAG TCCTCTTAAG CCTCACTCCA NAACTACAAC 201 TCCCGAAAGG GTCCACNTCC TCGCCCAAGG GGCGGGGCCT CACGCAAGGA 251 NAAGGACCAC AACTCCCAGA AAGCTCCNCT CCTTGTCCCG CCAAAAACAA 301 AATGGCCGGG ANAATCTCTG CCTTCCTCAA AAANGCCTGG GCGAANGACC 351 GGTGCTGGTG GTGTCCTTCN CTGTCNGGGG CCNCNCTATA ATTATGCCCA 401 TGATTACCCC NACACCAAGT NTGCTAACCA TGATCAANAA GGCNCNCCCN 451 ACAACTACCN ATGNCNGTTT AAAAAANAAC 配列番号：118 配列の長さ：299 配列の型：核酸 鎖の数：一本鎖 トボロジー：直鎖状 配列の種類：ｃＤＮＡ クローン名：01B00072LG06D 配列： 1 GGACATTCAG ATTCCACACA AATTCTCCNG CGTGTGTGTC TGTCTGTCAT 51 TNATCCACGN TTTCCCCACC CGCGTCGNGA GACCCCGTTC CACGCAGACA 101 CAGGGACCCA AANGGNTGAA GTTTTCAANT ATTGTTCCAG TNTCNNCCTG 151 CGTNCCACCA TGTTTNTGAA ANTATAAGCA AGNCCTGTGG AGNCCCTTTT 201 GGGCCCACTT GNCCGGAGTC TGACATTGGT CAAGGACAAG GAAATGGTTA 251 AAACTCTATC TGCTGGTTGT TCNCCCCTTG ANTAAGTTTT ATTCGNTAG 配列番号：119 配列の長さ：291 配列の型：核酸 鎖の数：一本鎖 トボロジー：直鎖状 配列の種類：ｃＤＮＡ クローン名：01B00072LN20C 配列： 1 GGANCGGAGC NGGACGNCGT NNGTATGGTC TNGACTCGGT CCTCGTCGTC 51 TGCACTGCTG TCCCGANACG GCGCGATGTC GCGGGCAACN ATCCTGANNT 101 CCGGTCCGGT CAAAAATTCT CGGTGCGGGT CCAAATACCC TGTTTTGGCT 151 TTGGGTCTGT CCCNAANACT GCNTTTTCCC TTTAGGGAAA AAGGGGACCC 201 CAGGCTNATT GGCNCCTGCN CGGATTTCNN CCACCAAGGT NGGCCCCNAG 251GTGGGGTNAA NTNCCCTGTT TCTTNCCTTT GCTCCGGCTC C 配列番号：120 配列の長さ：440 配列の型：核酸 鎖の数：一本鎖 トポロジー：直鎖状 配列の種類：ｃＤＮＡ クローン名：01B00050HK23C 配列： 1 GGCGGCGCCG CCTTCCGCGC TGTCCCTGGG CTCGGCCACT GCGAGGTTCC 51 NCTCAAGACG CAGCGCCATA TCAAGTGGGC GAGGATGCCG TACGAGATCG 101 NGAAGGTGTN CGCCAGCCTC CCCCANGTGG AAACGGGGCG TCNCTAATAT 151 CCTCNGTGGA GACCCCAGGG GCNATCNTTT CCTCTACACC AATGGCAAGT 201 GCGTCATCCT AANAAACATC GATAACCCTG CTATTGCTGA TATCTACACA 251 GAACATGCCC NTCAAGTGGT ANTAGCCNAG TATGCNCCCA GCGGATTCTA 301 CATTGCTTCT GGAGACATCT CTGGGAAGCT AAGGATCTGG GATNCCNCCA 351 CNCAAGGAGC ANCNTCTNAA GTTTGAGTNC CNCCTTTCCC TGGGGAANAT 401 CAAGGANATT GCCTGGACCG ANGACNGTAA GAAGATCCCC 配列番号：121 配列の長さ：556 配列の型：核酸 鎖の数：一本鎖 トポロジー：直鎖状 配列の種類：ｃＤＮＡ クローン名：01B00054LM19C 配列： 1 GGAACCGGCT GTGACGTTCT GGATCCGGCT GCAAGATGAG CCTGGGGCCG 51 TGACAGGTGA AATGGTGATG AGTTACGCAA GCTGCACAGA TAATTAAGTA 101 GCAGAGATTA GAACTCAGGT TTCCTGCCTC CCAAGGTTGT TAAACATGAG 151 CCTGCGGAAG CAAACCCCTA GCGACTTCTT AAAGCAGATC ATCGGACGGC 201 CAGTTGTGGT GAAATTAAAT TCTGGCGTGG ATTATCGAGG GGTCCTGGCC 251 TGCCTGGATG GCTACATGAA TATAGCCCTG GAACAGACAG AGGAGTATGT 301 AAATGGACAG CTGAAGAATA AGTACGGAGA TGCGTTCATC CGANGAAACA 351 ATGTGCTGTA CATAAGTACA CAGAANAAGC GGATGTGAAN ACACCAGGAG 401 GCAGTGCTCT TCNGANATGG ATANATNAAG TGGTTTTGGT TCTCTTACCA 451 TCTTANTTGG CCTGTTTTCA TGGTGGCTGG TGGGGGTTTG TTTGTTTGTT 501 TGTTTAATNG ACCTTGGAAT AAGATANAAG TNTTGCTTAC CANATCGACT 551 CTTNAT 配列番号：122 配列の長さ：616 配列の型：核酸 鎖の数：一本鎖 トポロジー：直鎖状 配列の種類：ｃＤＮＡ クローン名：01B00058PO07C 配列： 1 GGTTGCTGAT GTTCGGCGGG GTTTTCATCA TGGAAGCTCT CGCGGCGGGA 51 TCTGTCTCGT GCGACTGTGG CTGCTGCTCC TATCGTTCTT ACTGGGCTTC 101 AGCGCGGGAT CTGCCATCGA CTGGCGGGAA CCCGAANGCA AGGAAGTATG 151 GGATTATGTG ACTGTCCGAA AGGATGCCCA CATGTTCTGG TGGCTCTATT 201 ATGCCACCAA CCCTTGCAAG AACTTTTCAG AGCTGCCCCT GGTCATGTGG 251 CTTCAGGGTG GTCCGGGTGG TTCTAGCACT GGATTTGGAA ACTTTGAAGA 301 AATCGGCCCT CTTGACACCC AACTCAAGCC TCGAAATACT ACCTGGCTGC 351 AGTGGGCCAG TCTCCTGTTT GTGGATAATC CCGTGGGCAC GGGCTTCAGC 401 TATGTCAACA CAACAGATGC CTACGCAAAN GACCTGGACA CNGTGGCTTC 451 CGACATGATG GTTCTCCTGA AATCCTTCTT TGATTGCCAT AAAGAATCCA 501 GACGGTTCCA TTCTACATTT TCTCANAATC CTACNGANGA AANATGCTGC 551 TGACATCANT GTANAACTTT ACAAGGCTGT TCANCAAGGG ACCATTAANT 601 NCAACTTTTC TGGGGT 配列番号：123 配列の長さ：586 配列の型：核酸 鎖の数：一本鎖 トポロジー：直鎖状 配列の種類：ｃＤＮＡ クローン名：01B00061JC20D 配列： 1 CAGTTGAGTC NGAGGACCAG GTNNGGTTNT TTTGGGGAGC CTGTNTGCTG 51 NGAATTTCTC TTGGGGAGGA GTAGNGGAGA TTCAGACNGT GTTTTCTGAA 101 AACTAAAAAG ACTGATCTCA GTAACTTCTG AATCCAGTGC CNATCATNTG 151 CCTTTGNTGG TCCATTTTGG GGTNTACTGA GTCTGGTTTT TCTCATAAAA 201 GTAAGTAGAA CCCAGGCCTT TACCCCAAAT GGANTCTANT GCCTTGAACT 251 GGCCCAATAG TCNGAAGACA GGCATCCATA GAAGAAAAAC CAGTTGATAC 301 AGGATGGTGG AACTAGAAGC CAGGCAGCTA ACTCTGTAGA AAAGGAAATG 351 GTATCAGGCC ATTTTCCAGA GCTTATATGG CCTGAGAGAA ATCAGATGAT 401 CAGTATGGCC CTCATGTTAA AAGGAGCCAA AGATGTCTGC ATTGTCCTAC 451 TGTCTTGTTA CGTTACACTG TTCAGAACTT AGATAAGTTA AAGAATCTGT 501 CTAAGGCACT TGAAAGATGT TATTTATTCA ATAAATATTT ATCGTGTTCA 551 CTGTATTTTT ATCTTTGGTC TTAAAACACA AAGCAC 配列番号：124 配列の長さ：182 配列の型：核酸 鎖の数：一本鎖 トポロジー：直鎖状 配列の種類：ｃＤＮＡ クローン名：01B00064MI09C 配列： 1 GNAGGGGAAA GACTAGAAAG AGGCTTAGTG GTTAAGATTC TCACTGCTCA 51 NCTGAAGGTT CTGANTNCAA TTCCCAGTAC ACACATGTCA GGTTACAACT 101 GTCTCGATGC CATCTTCTGG TGTGAAGGTG TACATGCAAN GAGAAGGTAC 151 CCATATACAT AAAAAAAGAG AGATGACGCA AA 配列番号：125 配列の長さ：419 配列の型：核酸 鎖の数：一本鎖 トポロジー：直鎖状 配列の種類：ｃＤＮＡ クローン名：01B00067PI19C 配列： 1 GCTTAACTCC GGCCGGGGTC CTCGCTCGAG CTACGAGTTG TGTCGTCGAT 51 AGGTTCGAGG ATATTGGAGC TCCAGCCACA ATGATTGAGG TGGTTTGCAA 101 CGACCGTCTC GGAAAGAAAG TCCGCGTTAA GTCACCGATG ACACCATCGG 151 CGACTTGAAG AAACTGATAG CTGCTCAAAC TGGCACCCGC TGAAACAAGA 201 TCGTTCTTAA AAAGTGGTAC ACGATTTTTA AGGACCACGT GTCTCTGGGA 251 GATTATGAAA TCCACGATGG GATGAACCTG GAGCTTTATT ACCAGTAGAG 301 GGGGATTCCT TCTCCTCCTC GCCCTGCTCT GCCCTGCCCT CCTCTCCCAT 351 CCTCATCTGA CACTGGTGTA GATGGTCATT TTTAACAGTT CACATGAATA 401 AAAACTTGGC TGCTGAAAA 配列番号：126 配列の長さ：464 配列の型：核酸 鎖の数：一本鎖 トポロジー：直鎖状 配列の種類：ｃＤＮＡ クローン名：01B00072LC02C 配列： 1 GGCTAATGCG GCGAGCTGAG CTGCCGGCAC CATGCAGTCG GGACGGCGTA 51 ATCTGGAATA CACTAGGAAA CAAGCAGTTC TGTTCTTTCA AAATAAGAAC 101 CAAGACTCAG GGCTTCTGCA GAAATGAATA CAGTCTGACT GGTCTGTGCA 151 ATCGGTCGTC CTGTCCTCTG GCAAATAGTC AGTATGCTAC CATTAAAGAA 201 NAGAAAGGGC AGTGCTACCT GTACATGAAG GTTATAGAGC GAGCAGCTTT 251 TCCCAGGCGT CTCTGGGAAC GGGTCCGGCT TAGTAAAAAC TATGAAAAAG 301 CACTGGAACA AATAGATGAA AATCTGATCT ATTGGCCCCG CTTTATCAGA 351 CACAAATGTN AGCAGAGGTT TACCAANATA ACCCAGTACC TGATTCGAAT 401 CAGAAAACTT ACACTGAAGC GACAGAGGAA GCTTGTTCCT TTGAGTAAGA 451 AGGTAAAAAA AAAA
Claims (7)
- 【請求項１】 配列番号１〜６７に記載された塩基配列
のいずれかからなるかまたは配列番号１〜６７に記載さ
れた塩基配列のいずれかを含む一本鎖ＤＮＡ、若しくは
前記一本鎖ＤＮＡに相補的な一本鎖ＤＮＡ。 - 【請求項２】 配列番号１〜６７に記載された塩基配列
において、１つ以上のヌクレオチドが付加され、１つ以
上のヌクレオチドが欠如し、及び／又は１つ以上のヌク
レオチドが置換されている塩基配列からなるか、または
前記付加、欠如及び／又は置換を有する塩基配列を含む
一本鎖DNA、若しくは前記一本鎖ＤＮＡに相補的な一本
鎖ＤＮＡ。 - 【請求項３】 配列番号６８〜１２６に記載された塩基
配列のいずれかからなるかまたは配列番号６８〜１２６
に記載された塩基配列のいずれかを含む一本鎖ＤＮＡ、
若しくは前記一本鎖ＤＮＡに相補的な一本鎖ＤＮＡ。 - 【請求項４】 配列番号６８〜１２６に記載された塩基
配列において、１つ以上のヌクレオチドが付加され、１
つ以上のヌクレオチドが欠如し、及び／又は１つ以上の
ヌクレオチドが置換されている塩基配列からなるか、ま
たは前記付加、欠如及び／又は置換を有する塩基配列を
含む一本鎖DNA、若しくは前記一本鎖ＤＮＡに相補的な
一本鎖ＤＮＡ。 - 【請求項５】 請求項１〜４のいずれか１項に記載の一
本鎖DNAからなるDNAプローブ。 - 【請求項６】 請求項１〜４のいずれか１項に記載の一
本鎖DNAからなるDNAプライマー。 - 【請求項７】 請求項１〜４のいずれか１項に記載の一
本鎖DNA、及び前記一本鎖ＤＮＡに相補的な一本鎖ＤＮ
Ａからなる二本鎖ＤＮＡ。
Priority Applications (1)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| JP10103115A JPH11164691A (ja) | 1997-10-03 | 1998-04-14 | 胚盤胞ｃＤＮＡ |
Applications Claiming Priority (3)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| JP9-271781 | 1997-10-03 | ||
| JP27178197 | 1997-10-03 | ||
| JP10103115A JPH11164691A (ja) | 1997-10-03 | 1998-04-14 | 胚盤胞ｃＤＮＡ |
Publications (1)
| Publication Number | Publication Date |
|---|---|
| JPH11164691A true JPH11164691A (ja) | 1999-06-22 |
Family
ID=26443766
Family Applications (1)
| Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
|---|---|---|---|
| JP10103115A Pending JPH11164691A (ja) | 1997-10-03 | 1998-04-14 | 胚盤胞ｃＤＮＡ |
Country Status (1)
| Country | Link |
|---|---|
| JP (1) | JPH11164691A (ja) |
Cited By (7)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
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1998
- 1998-04-14 JP JP10103115A patent/JPH11164691A/ja active Pending
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