JPH0767664A - New ho gene and method for raising conjugative type yeast using yeast having inactivated the same gene - Google Patents

New ho gene and method for raising conjugative type yeast using yeast having inactivated the same gene

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JPH0767664A
JPH0767664A JP6151360A JP15136094A JPH0767664A JP H0767664 A JPH0767664 A JP H0767664A JP 6151360 A JP6151360 A JP 6151360A JP 15136094 A JP15136094 A JP 15136094A JP H0767664 A JPH0767664 A JP H0767664A
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JP
Japan
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gene
yeast
endonuclease
dna
homothalism
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JP6151360A
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Yukio Tamai
幸夫 玉井
Naoyuki Umeki
直行 梅基
Kazumaro Tomizuka
一麿 富塚
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Kirin Brewery Co Ltd
Original Assignee
Kirin Brewery Co Ltd
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Abstract

PURPOSE:To obtain a new HO gene containing a base sequence encoding an endonuclease capable of cleaving a conjugative type gene locus and sufficiently suppressing transfer of yeast to homotalism and smoothly multiplying excellent yeast. CONSTITUTION:Saccharomyces carlsbergens is KBY003 as a beer fermenting yeast is cultured, the yeast is collected, the cells are suspended in a buffer solution, made into a protoplast by a conventional method, mixed with a surfactant, maintained at 65 deg.C for 15 minutes, subjected to complete bacteriolysis, slowly added to a density gradient tube of 10-40 % sucrose and ultracentrifuged to give a chromosomeal DNA. Then the chromosomeal DNA is treated with a restriction enzyme, each fragment is linked to a vector, inserted into Escherichia coli, transformed and screened by a probe having a homothalism (HO) gene sequence to select a positive clone. Its DNA is recovered and treated with a restriction enzyme to give a new HO gene containing a base sequence encoding an endonuclease capable of cleaving a conjugative type gene locus.

Description

【発明の詳細な説明】Detailed Description of the Invention

【0001】[0001]

【産業上の利用分野】本発明は、新規なホモタリズム
(HO)遺伝子、当該HO遺伝子の不活化断片、当該不
活化断片で形質転換したことを特徴とする形質転換酵
母、及び当該形質転換酵母を用いた酵母の育種方法に関
する。
TECHNICAL FIELD The present invention relates to a novel homothalism (HO) gene, an inactivated fragment of the HO gene, a transformed yeast characterized by being transformed with the inactivated fragment, and the transformed yeast. The present invention relates to a yeast breeding method.

【0002】[0002]

【従来の技術】清酒,ワイン,ビール等の酒精飲料、パ
ンやみそ,しょうゆ等の発酵食品におけるアルコールの
生成は全て酵母によって醸し出されるものである。すな
わち、酵母は有史以来人類の日常生活に深く関わり合っ
てきた。そして、さらに近年のバイオテクノロジーの発
達により医薬品の製造にも関わるに至っている。
2. Description of the Related Art Alcohol production in alcoholic beverages such as sake, wine and beer, and fermented foods such as bread, miso and soy sauce is all produced by yeast. That is, yeast has been deeply involved in human daily life since history. Furthermore, due to the recent development of biotechnology, it has become involved in the manufacture of pharmaceuticals.

【0003】酵母の有効利用に際しては、優秀な酵母を
育種することが不可欠である。かかる酵母の育種法とし
ては伝統的方法として、従来からの長年の選抜による育
種方法を挙げることができるが、望ましい形質を得る確
率は低い。これに加えて近年においては、薬剤や放射線
による人為的な突然変異法や細胞融合法、さらに酵母同
士の接合現象を積極的に利用した方法を挙げることがで
きる。
For effective utilization of yeast, it is essential to breed excellent yeast. As a traditional method for breeding such yeast, a conventional breeding method by selection for many years can be mentioned, but the probability of obtaining a desired trait is low. In addition to this, in recent years, artificial mutation methods and cell fusion methods using drugs and radiation, and methods that positively utilize the mating phenomenon between yeasts can be mentioned.

【0004】しかしながら上記突然変異法は、一般的に
突然変異を惹き起こす遺伝子部位の特定をすることが困
難であり、さらに優れた形質の酵母を当該突然変異法に
より得ることができたとしても、これを直接食品等に応
用するのは問題が多い。これに加えて酵母は高次倍数体
であるためミューテーションをかけたとしても、大腸菌
等の細菌類のように、高頻度で所望の性質を有する突然
変異体を得ること自体が困難である。
However, in the above-mentioned mutation method, it is generally difficult to identify the gene site causing the mutation, and even if a yeast having an excellent trait can be obtained by the mutation method, There are many problems in applying this directly to foods and the like. In addition, since yeast is a high-order polyploidy, it is difficult to obtain a mutant having a desired property at a high frequency, like bacteria such as Escherichia coli, even if it is mutated.

【0005】また、細胞融合法によって作出された融合
体の染色体の再編成(rearrangement)について報告され
ており(1992年 農芸化学会 米花ら: 福山大学 生物
工学)、細胞融合法においては、当該方法によりどのよ
うな形質の酵母を得ることができるかを予見することが
難しい面がある。そこで酵母の育種においては、酵母同
士の接合現象を積極的に利用した交配育種を行うことが
広く試みられているが、かかる方法にも欠点がないわけ
ではない。
Further, rearrangement (rearrangement) of the chromosome of the fusion produced by the cell fusion method has been reported (1992, Agricultural Chemistry Society, Yonehana et al .: Fukuyama University, Biotechnology), and in the cell fusion method, this method was used. It is difficult to predict what kind of trait yeast can be obtained. Therefore, in the breeding of yeasts, it has been widely attempted to carry out cross breeding by positively utilizing the mating phenomenon between yeasts, but such a method is not without drawbacks.

【0006】この方法は、融合に比べ、接合頻度が高
い、マーカーが無くとも実施可能、さらに戻し交配が可
能であるという利点を有する。すなわち、有用な酵母の
育種には優れた形質を有する安定な接合型を示す酵母
(ヘテロタリズム株)同士を接合させることにより、2
倍体あるいは高次倍数体の子孫を得ること(ヘテロタリ
ズム)が理想である。しかしながら有用な酵母であり、
現在多方面に応用されているサッカロマイセス(Saccha
romyces)属に属する酵母には、ホモタリズム(HO)遺
伝子と呼ばれる、一時的に接合型胞子を経て非接合型二
倍体あるいは高次倍数体の子孫を生み出す方向(ホモタ
リズム)に誘導する遺伝子が存在する。
[0006] This method has the advantages that the conjugation frequency is high, that it can be carried out without a marker, and that backcrossing is possible, as compared with fusion. That is, by breeding yeasts (heterotalism strains) having a stable zygote having an excellent trait for breeding useful yeasts, 2
The ideal is to obtain a descendant of a polyploid or a higher polyploid (heterotalism). However, it is a useful yeast,
Saccha myces (Saccha myces), which is currently applied in many fields
In yeast belonging to the genus romyces, there is a gene called homotalism (HO) gene that induces non-zygotic diploid or higher polyploid offspring (homotarhythmism) through a zygotic spore transiently. To do.

【0007】かかるHO遺伝子の存在により、所望の形
質を有する胞子は、増殖の過程で自己倍数化されてしま
い、所望の表現形を示す接合型酵母を分離することを困
難ならしめる原因となっている。そこで接合させる際に
接合させようと望む酵母に遺伝的マーカーを付与して低
頻度ながら強制接合を用いる方法や、顕微鏡下で単離し
た胞子と細胞、あるいは胞子同士を接触させ接合させる
方法が用いられている。
Due to the presence of such HO gene, spores having a desired trait are self-multiplied in the process of growth, which makes it difficult to isolate mating yeast having a desired phenotype. There is. Therefore, when conjugating, a method of giving a genetic marker to the yeast to be conjugated and using forcible conjugation at low frequency, or a method of contacting spores and cells isolated under a microscope or spores and conjugating them is used. Has been.

【0008】しかし、実用酵母は通常遺伝的マーカーに
乏しい。また、顕微鏡下の接合は、接合させる胞子の性
格付けを行うことなく接合させることになり、接合株が
分離されて始めてその性質が判明する。このため、接合
頻度が低い醸造酵母では顕微鏡下の膨大な作業の下に、
極めて多数の酵母のスクリーニングが必要となり育種の
上での実用性に乏しい。
However, practical yeasts usually lack genetic markers. In addition, conjugation under a microscope allows spores to be joined without characterizing them, and the qualities of the spores are not known until the zygote is separated. For this reason, brewing yeast, which has a low bonding frequency, undergoes enormous work under a microscope,
It requires screening of an extremely large number of yeasts and is not practical for breeding.

【0009】そこで上記HO遺伝子の所在と、さらに当
該遺伝子の塩基配列を明らかにして、かかるHO遺伝子
に薬剤耐性マーカー等を導入して、その本来の機能を失
わしめたHO遺伝子断片を用いて、育種対象となる酵母
を形質転換して当該酵母のHO遺伝子の機能を失活させ
る試みが行われている。確かにかかる試みは、パン酵母
やビールの上面発酵酵母である、サッカロマイセス セ
ルビシエ(Saccharomyces cerevisiae)には有効である。
Therefore, the location of the HO gene and the nucleotide sequence of the gene are further clarified, and a drug resistance marker or the like is introduced into the HO gene to use a HO gene fragment in which its original function is lost, Attempts have been made to transform the yeast to be bred to inactivate the function of the HO gene of the yeast. Certainly, such an attempt is effective for Saccharomyces cerevisiae, which is baker's yeast and top-fermenting yeast for beer.

【0010】しかしながら、ビール下面酵母であるサッ
カロマイセス カールスベルゲンシス(Saccharomyces c
arlsbergensais) やその他のSaccharomyces 属酵母等に
は、上記HO遺伝子(以下、HO-SC 遺伝子と記載す
る)の他に、他のHO遺伝子の存在が認められ、当該H
O-SC 遺伝子を失活させただけでは、酵母の上記のホモ
タリズムへの移行を十分に阻害することができなかっ
た。
However, Saccharomyces c.
arlsbergensais) and other yeasts of the genus Saccharomyces, the presence of other HO genes in addition to the above-mentioned HO gene (hereinafter referred to as HO-SC gene) is observed.
The inactivation of the O-SC gene could not sufficiently inhibit the transfer of yeast to the above homothalism.

【0011】[0011]

【発明が解決しようとする課題】そこで、本発明が解決
すべき課題は、既に知られているHO-SC 遺伝子以外の
HO遺伝子の所在とその塩基配列を明らかにして、上記
HO-SC 遺伝子との組合せにより、また当該HO-SC 遺
伝子以外のHO遺伝子を単独で用いることにより、酵母
のホモタリズムへの移行を十分に阻害すべき手段を提供
することにある。
Therefore, the problem to be solved by the present invention is to clarify the location of the HO gene other than the already known HO-SC gene and its nucleotide sequence, and to identify the above-mentioned HO-SC gene. It is intended to provide a means for sufficiently inhibiting the transition to yeast homothalism, by using the HO gene other than the HO-SC gene alone.

【0012】[0012]

【課題を解決するための手段】本発明者は、上記課題の
解決のために鋭意検討を重ねた結果、下面発酵ビール酵
母であるサッカロマイセス カールスベルゲンシス(Sac
charomyces carlsbergensais) 及びサッカロマイセス
ウバルム(Saccharomyces uvarum)において、新たなHO
遺伝子の存在を突き止め、当該新たなHO遺伝子の塩基
配列を明らかにして上記課題を解決し得ることを明らか
にした。
Means for Solving the Problems The inventors of the present invention have conducted extensive studies to solve the above-mentioned problems, and as a result, Saccharomyces curlsbergensis (Sac
charomyces carlsbergensais) and Saccharomyces
New HO in Ubarum (Saccharomyces uvarum)
It was clarified that the existence of the gene could be identified and the nucleotide sequence of the new HO gene could be clarified to solve the above problems.

【0013】すなわち、本発明は以下の事項をその要旨
とするものである。 (1) 配列番号1に示すアミノ酸配列を有し、かつ、接合
型遺伝子座を切断することができるエンドヌクレアーゼ
をコードする塩基配列を含むことを特徴とする酵母のエ
ンドヌクレアーゼ遺伝子。 (2) 配列番号4に示すアミノ酸配列を有し、かつ、接合
型遺伝子座を切断することができるエンドヌクレアーゼ
をコードする塩基配列を含むことを特徴とする酵母のエ
ンドヌクレアーゼ遺伝子。
That is, the gist of the present invention is as follows. (1) A yeast endonuclease gene having the amino acid sequence shown in SEQ ID NO: 1 and containing a nucleotide sequence encoding an endonuclease capable of cleaving the mating type locus. (2) A yeast endonuclease gene having the amino acid sequence shown in SEQ ID NO: 4 and containing a nucleotide sequence encoding an endonuclease capable of cleaving the mating type locus.

【0014】(3) エンドヌクレアーゼをコードする塩基
配列が、配列番号3で表されるものである、前記(1) 記
載のエンドヌクレアーゼ遺伝子。 (4) エンドヌクレアーゼをコードする塩基配列が、配列
番号6で表されるものである、前記(2) 記載のエンドヌ
クレアーゼ遺伝子。 (5) 前記(1) 又は(3) 記載のエンドヌクレアーゼ遺伝子
を含む、酵母のホモタリズム遺伝子。
(3) The endonuclease gene according to (1) above, wherein the nucleotide sequence encoding the endonuclease is represented by SEQ ID NO: 3. (4) The endonuclease gene according to (2) above, wherein the base sequence encoding the endonuclease is represented by SEQ ID NO: 6. (5) A yeast homotalism gene containing the endonuclease gene according to (1) or (3) above.

【0015】(6) 前記(2) 又は(4) 記載のエンドヌクレ
アーゼ遺伝子を含む、酵母のホモタリズム遺伝子。 (7) ホモタリズム遺伝子が、配列番号2で表されるもの
である、前記(5) 記載のホモタリズム遺伝子。 (8) ホモタリズム遺伝子が、配列番号5で表されるもの
である、前記(6) 記載のホモタリズム遺伝子。
(6) A yeast homothalism gene containing the endonuclease gene according to (2) or (4) above. (7) The homotalism gene according to (5) above, which is represented by SEQ ID NO: 2. (8) The homotalism gene according to (6) above, which is represented by SEQ ID NO: 5.

【0016】(9) 前記(1) 〜(4) のいずれかに記載のエ
ンドヌクレアーゼ遺伝子の少なくとも一部分の発現抑制
により不活化された酵母のホモタリズム遺伝子断片。 (10) 発現抑制が、制限酵素による切断、挿入、欠失、
置換若しくは付加によるもの、エンドヌクレアーゼ遺伝
子のプロモーター若しくはターミネーター領域に対する
制限酵素による切断、挿入、欠失、置換若しくは付加に
よるもの、該プロモーター若しくはターミネーター領域
に対するマーカー遺伝子の挿入若しくは置換によるも
の、又は該エンドヌクレアーゼ遺伝子のアンチセンスR
NAの導入によるものである、前記(9)記載のホモタリ
ズム遺伝子断片。
(9) A yeast homotalism gene fragment inactivated by suppressing the expression of at least a part of the endonuclease gene according to any one of (1) to (4) above. (10) Suppression of expression by restriction enzyme cleavage, insertion, deletion,
By substitution or addition, by restriction enzyme cleavage, insertion, deletion, substitution or addition to the promoter or terminator region of the endonuclease gene, by insertion or substitution of a marker gene for the promoter or terminator region, or the endonuclease Antisense R of gene
The homotalism gene fragment according to (9) above, which is due to the introduction of NA.

【0017】(11) 前記(1) 〜(4) のいずれかに記載の
エンドヌクレアーゼ遺伝子の一部及びマーカー遺伝子が
組み込まれたホモタリズム遺伝子破壊用YIp 型プラスミ
ド。 (12) 不活化した前記(1) 〜(4) のいずれかに記載のエ
ンドヌクレアーゼ遺伝子及びマーカー遺伝子が組み込ま
れたホモタリズム遺伝子破壊用YIp 型プラスミド。 (13) 前記(9) 又は(10)記載のホモタリズム遺伝子断片
で形質転換を行った形質転換酵母。
(11) A YIp-type plasmid for homotalism gene disruption, which comprises a part of the endonuclease gene and the marker gene according to any one of (1) to (4) above. (12) An inactivated YIp type plasmid for homotalism gene disruption, which incorporates the endonuclease gene and the marker gene according to any one of (1) to (4) above. (13) A transformed yeast transformed with the homotalism gene fragment according to (9) or (10) above.

【0018】(14) 前記(11)記載のホモタリズム遺伝子
破壊用YIp 型プラスミドで形質転換を行った形質転換酵
母。 (15) 前記(12)記載のホモタリズム遺伝子破壊用YIp 型
プラスミドで形質転換を行った形質転換酵母。 (16) 前記(13)〜(15)のいずれかに記載の形質転換酵母
を培養して、ヘテロタリズムに基づく接合型酵母を育種
することを特徴とする酵母の育種方法。
(14) A transformed yeast transformed with the YIp type plasmid for disrupting the homotalism gene according to the above (11). (15) A transformed yeast transformed with the YIp type plasmid for disrupting the homotalism gene according to (12). (16) A method for breeding yeast, which comprises culturing the transformed yeast according to any one of (13) to (15) to breed heterozygous mating yeast.

【0019】以下、本発明について詳細に説明する。 A.配列番号2に示す塩基配列をコードする、酵母のホ
モタリズム遺伝子(以下、本発明HO遺伝子又はHO-B
R 遺伝子若しくはHO-UV 遺伝子と略記する)のクロー
ニング方法について説明する。
The present invention will be described in detail below. A. A yeast homothalism gene (hereinafter referred to as HO gene or HO-B of the present invention) encoding the nucleotide sequence shown in SEQ ID NO: 2.
The cloning method of R gene or HO-UV gene) will be described.

【0020】なお、本発明HO遺伝子であるHO-BR 遺
伝子(配列番号2)及びHO-UV 遺伝子(配列番号5)
中にコードされる酵母の接合型遺伝子座(MAT)を切断す
るエンドヌクレアーゼ(それぞれ配列番号1、配列番号
4で示される)は、サッカロマイセス属酵母の接合型を
支配する遺伝子座(MAT)を特定の部位で切断し、他の遺
伝子座に存在する沈黙型の接合型遺伝子(HML,HMR) との
組換えを開始させることにより、接合型変換を支配する
酵素である。
The HO gene of the present invention, HO-BR gene (SEQ ID NO: 2) and HO-UV gene (SEQ ID NO: 5)
The endonucleases (SEQ ID NO: 1 and SEQ ID NO: 4, respectively) that cleave the yeast mating type locus (MAT) encoded therein identify the locus (MAT) that controls the mating type of Saccharomyces yeast. It is an enzyme that controls zygotic conversion by cleaving at the site and initiating recombination with silenced zygotic genes (HML, HMR) present at other loci.

【0021】本発明HO遺伝子であるHO-BR 遺伝子の
提供源としては、実質的に当該HO-BR 遺伝子を含む遺
伝子を有する酵母であれば特に限定されない。例えば、
ビール下面発酵酵母であるサッカロマイセス. カールス
ベルゲンシス(Saccharomycescarlsbergensis)、サッカ
ロマイセス. バイアナス(Saccharomyces bayanus )
(IFO 1127)、サッカロマイセス. グロボサス(Saccha
romyces globosus)(IFO 10557 )、サッカロマイセ
ス. モナセンシス(Saccharomyces monacensis)(ATCC
0220,IFO 279 )、サッカロマイセス. イヌシタタス(S
accharomyces inusitatus)(IFO 1343)等からクローニン
グすることができる。本発明HO遺伝子の一つであるH
O-UV 遺伝子の供給源は、Saccharomyces bayanus (IFO
1127)、Saccharomyces inusitatus (IFO 1343)、Sacch
aromyces uvarum (IFO 0615)、Saccharomyces heteroge
nicus(IFO 1620)、Pilsen No.1 (IFO2031)等からクロー
ニングすることができる。
The source of the HO-BR gene which is the HO gene of the present invention is not particularly limited as long as it is a yeast having a gene substantially containing the HO-BR gene. For example,
Saccharomyces, a bottom-fermenting yeast of beer. Saccharomyces carlsbergensis, Saccharomyces bayanus
(IFO 1127), Saccharomyces. Globosus (Saccha
romyces globosus) (IFO 10557), Saccharomyces monacensis (ATCC)
0220, IFO 279), Saccharomyces. Inucitatus (S
It can be cloned from accharomyces inusitatus) (IFO 1343) and the like. H which is one of the HO genes of the present invention
The source of the O-UV gene is Saccharomyces bayanus (IFO
1127), Saccharomyces inusitatus (IFO 1343), Sacch
aromyces uvarum (IFO 0615), Saccharomyces heteroge
It can be cloned from nicus (IFO 1620), Pilsen No. 1 (IFO 2031) or the like.

【0022】なお、胞子形成が見られないために、不完
全菌に分類されている酵母であっても、当該HO-BR 又
はHO-UV 遺伝子を有するものであれば、DNA提供源
として利用可能である。本発明において当該クローニン
グ工程は、通常公知の方法(Molecular Cloning (198
9):Methods in Enzymology 194 (1991)) に従って行う
ことができる。
It should be noted that even if the yeast is classified as an incomplete bacterium because sporulation is not observed, any yeast having the HO-BR or HO-UV gene can be used as a DNA source. Is. In the present invention, the cloning step is usually performed by a known method (Molecular Cloning (198
9): It can be performed according to Methods in Enzymology 194 (1991)).

【0023】すなわち、上記酵母の全DNAを抽出
し、当該DNAに由来するDNA断片を組み込んだ遺伝
子導入用ベクターを宿主に導入して上記酵母の遺伝子ラ
イブラリーを調製する。次いで、かかる遺伝子ライブ
ラリーから所望のクローンを選択して、当該クローンを
増幅することにより上記のクローニング工程を実行する
ことができる。
That is, the above-mentioned yeast gene library is prepared by extracting all the above-mentioned yeast DNA and introducing a gene introduction vector into which a DNA fragment derived from the above DNA is incorporated into a host. Then, by selecting a desired clone from such a gene library and amplifying the clone, the above cloning step can be carried out.

【0024】上記酵母の遺伝子ライブラリーの調製 上記酵母の全DNAの抽出は、例えば酵母のプロトプラ
ストを調製して、当該プロトプラストから、通常公知の
DNA抽出法、例えばフェノール抽出法、クロロホルム
抽出法等の常法を用いて行うことができる。なお、上記
の予めプロトプラストを調製する方法の他に、ガラスビ
ーズ等による細胞破砕法等によってもDNAの抽出を行
うことができるが、高分子量のDNAを調製することが
容易であるという点から上記プロトプラスト法を行うの
が好ましい。
Preparation of the above-mentioned yeast gene library For the extraction of the above-mentioned yeast total DNA, for example, yeast protoplasts are prepared, and from these protoplasts, commonly known DNA extraction methods such as phenol extraction method and chloroform extraction method are used. It can be performed using a conventional method. In addition to the above-described method of preparing protoplasts in advance, DNA can be extracted by a cell disruption method using glass beads or the like, but it is easy to prepare a high molecular weight DNA. It is preferable to carry out the protoplast method.

【0025】なお、上記の全DNAを鋳型にして、各種
のHO遺伝子に共通すると考えられる一本鎖DNA断片
をプライマーとするPCR法(PCR Technology Henry
A.Erlich,Stockton press(1989))により所望のHO遺
伝子を特異的に増幅させて上記クローニング工程におけ
る作業を効率化することも可能である。
A PCR method (PCR Technology Henry) using the above-mentioned total DNA as a template and a single-stranded DNA fragment considered to be common to various HO genes as a primer is used.
A. Erlich, Stockton press (1989)) can be used to specifically amplify the desired HO gene to make the cloning process more efficient.

【0026】また、制限酵素処理等の常法により得られ
る、上記のDNAに由来するDNA断片を組み込む遺伝
子導入用ベクターは、酵母用の導入ベクターとして知ら
れるものであれば、いずれのベクターも使用することが
可能である。例えば、酵母染色体のARS 配列を複製起点
とする酵母用マルチコピーベクターであるYRp 型プラス
ミド;酵母の2μm DNAの複製起点を有する酵母用マ
ルチコピーベクターであるYEp 型プラスミド;酵母染色
体のARS 配列を複製起点として有し、かつ酵母染色体の
セントロメアのDNA配列を有する酵母用シングルコピ
ーベクターであるYCp 型プラスミド;酵母の複製起点を
有さない酵母染色体組み込み用ベクターであるYIP 型プ
ラスミド等を挙げることができる。なお、上記の酵母用
の導入ベクターは、文献上公知(朝倉書店刊、日本農芸
学会ABC シリーズ「物質のための遺伝子工学」,p68) で
あり、かつ容易に作製することもできる。さらに、通常
公知の遺伝子ライブラリー調製用ベクターとして知られ
る、pBR 系統,pUC系統, ブルー スクリプト(Blue Scri
pt) 系統の一般に市販されている入手可能な導入用プラ
スミドを用いることができる。また、Charon系統やEMBR
系統等の導入用ファージやコスミド等を広く用いること
ができる。
Any gene transfer vector that is obtained by a conventional method such as restriction enzyme treatment and that incorporates the DNA fragment derived from the above DNA may be used, so long as it is known as a transfer vector for yeast. It is possible to For example, a YRp-type plasmid that is a yeast multicopy vector having an ARS sequence of a yeast chromosome as an origin of replication; a YEp-type plasmid that is a yeast multicopy vector having a yeast 2 μm DNA origin of replication; a yeast chromosome ARS sequence that replicates. YCp-type plasmid, which is a single copy vector for yeast having a centromere DNA sequence of the yeast chromosome as an origin, and YIP-type plasmid, which is a yeast chromosome-integrating vector having no origin of replication of yeast, and the like. . The above-described yeast transfer vector is publicly known (published by Asakura Shoten, ABC Series "Genetic Engineering for Substances", p68), and can be easily prepared. In addition, pBR strains, pUC strains, and Blue Scripts (Blue Scri
Commercially available commercially available transfer plasmids of the pt) strain can be used. Also, Charon system and EMBR
A wide variety of phages, cosmids, etc. for introducing strains can be used.

【0027】調製した導入用ベクターで形質転換又は形
質導入を行う宿主は、上記ベクターの種類に応じたもの
を採用することができる。
The host to be transformed or transduced with the prepared vector for introduction may be selected according to the kind of the above vector.

【0028】クローンの選択 当該遺伝子ライブラリーから所望のクローンを選択し
て、当該クローンを増幅する方法も通常公知の方法を用
いることができる。
Selection of Clone The method of selecting a desired clone from the gene library and amplifying the clone can also be a generally known method.

【0029】すなわち、上記遺伝子ライブラリーから、
所望のHO-BR 遺伝子又はHO-UV遺伝子を有するクロ
ーンをHO遺伝子特有の配列を含む標識プローブを用い
てコロニーハイブリダイゼーション法、プラークハイブ
リダイゼーション法等により選択し、所望のHO-BR 遺
伝子若しくはHO-UV 遺伝子を大腸菌細胞内にて増幅し
て、又は所望のHO-BR 遺伝子若しくはHO-UV 遺伝子
をHO遺伝子特有の配列を含むプライマーを用いてPC
R法で直接増幅して得ることができる。
That is, from the above gene library,
A clone having a desired HO-BR gene or HO-UV gene is selected by a colony hybridization method, a plaque hybridization method or the like using a labeled probe containing a sequence unique to the HO gene, and the desired HO-BR gene or HO- Amplification of the UV gene in E. coli cells or PC of the desired HO-BR gene or HO-UV gene using a primer containing a sequence unique to the HO gene
It can be obtained by directly amplifying by the R method.

【0030】コロニーハイブリダイゼーション法や、プ
ラークハイブリダイゼーション法において使用するプロ
ーブとしては、HO遺伝子の全塩基配列を使用すること
が可能であり、部分的な合成オリゴヌクレオチドを使用
することも可能である。また、ハイブリダイゼーション
及びプローブを洗い落とす際には、完全一致の遺伝子の
場合に比較して、低い温度で実施することが可能であ
る。
As the probe used in the colony hybridization method or the plaque hybridization method, it is possible to use the entire base sequence of the HO gene, and it is also possible to use a partial synthetic oligonucleotide. In addition, when the hybridization and the probe are washed off, it is possible to carry out at a lower temperature as compared with the case of a perfectly matched gene.

【0031】上記方法により得られる所望の遺伝子の塩
基配列の決定及び確認は、例えばマキサム−ギルバート
の化学修飾法(Maxam-Gilbert,Meth.Enzym.,65,499-560
(1980)) やM13 ファージを用いるジデオキシヌクレオチ
ド鎖終結法(Messing,J.and Vieire,J.,Gene,19,269-276
(1982)) 等により行い得る。また、上記の方法により決
定された本発明ホモタリズム遺伝子は、通常公知の化学
合成法、例えばホスファイト-トリエステル法(ネイチ
ャー(Nature),310 ,105(1984)) 等の常法に従って化学
合成することができる。
The nucleotide sequence of the desired gene obtained by the above method can be determined and confirmed by, for example, Maxam-Gilbert, Meth. Enzym., 65 , 499-560.
(1980)) and dideoxynucleotide chain termination method using M13 phage (Messing, J. and Vieire, J., Gene, 19 , 269-276.
(1982)) and so on. Further, the homothalism gene of the present invention determined by the above method is chemically synthesized according to a commonly known chemical synthesis method, for example, a conventional method such as the phosphite-triester method (Nature, 310 , 105 (1984)). be able to.

【0032】さらに、上記の天然物由来のHO遺伝子を
一部用いる半合成によっても本発明HO遺伝子であるH
O-BR 遺伝子又はHO-UV 遺伝子を入手することができ
る。上記方法によって得られる本発明HO遺伝子は、少
なくとも配列番号1又は4に示すアミノ酸配列を有する
酵母のホモタリズム遺伝子を切断するエンドヌクレアー
ゼをコードする当該エンドヌクレアーゼ遺伝子(構造遺
伝子)を含むが、当該構造遺伝子の上流又は下流に他の
配列、例えば当該構造遺伝子のいわゆるプロモーター領
域やターミネター領域、を伴う遺伝子も本発明HO遺伝
子に含まれる。
Further, H which is the HO gene of the present invention can also be obtained by semisynthesis using a part of the above-mentioned HO gene derived from natural products
The O-BR gene or the HO-UV gene can be obtained. The HO gene of the present invention obtained by the above method includes the endonuclease gene (structural gene) encoding an endonuclease that cleaves a yeast homotalism gene having at least the amino acid sequence shown in SEQ ID NO: 1 or 4. Genes with other sequences upstream or downstream of, for example, so-called promoter region or terminator region of the structural gene are also included in the HO gene of the present invention.

【0033】B.形質転換によるHO-BR 遺伝子又はH
O-UV 遺伝子の不活化 形質転換によるHO-BR 遺伝子又はHO-UV 遺伝子の不
活化は、ホモタリズム型の生活環の酵母をヘテロタリズ
ム型の生活環に移行させるために必要である。ここで、
「不活化」とは、HO遺伝子に含まれるエンドヌクレア
ーゼ遺伝子の発現を抑制することにより、該HO遺伝子
の発現を阻害することを意味する。
B. HO-BR gene or H by transformation
Inactivation of O-UV Gene The inactivation of the HO-BR gene or the HO-UV gene by transformation is necessary to transfer the yeast of the homotalism type life cycle to the heterotalism type life cycle. here,
The “inactivation” means inhibiting the expression of the HO gene by suppressing the expression of the endonuclease gene contained in the HO gene.

【0034】かかるHO-BR 遺伝子又はHO-UV 遺伝子
の試験管内における不活化は、通常遺伝子組換え技術と
して用いられている方法を採用し、エンドヌクレアーゼ
遺伝子の発現を抑制することにより行うことができる。
The inactivation of the HO-BR gene or HO-UV gene in vitro can be carried out by suppressing the expression of the endonuclease gene by adopting a method usually used as a gene recombination technique. .

【0035】エンドヌクレアーゼ遺伝子の発現を抑制す
る手段としては、該エンドヌクレアーゼ遺伝子自体の少
なくとも一部分を制限酵素によって切断する場合に限ら
ず、挿入、欠失、置換、付加等を行ってもよく、エンド
ヌクレアーゼ遺伝子の発現を調節するプロモーター領域
又はターミネーター領域内に対する制限酵素による切
断、挿入、欠失、置換、付加等を行ってもよい。また、
該プロモーター領域又はターミネーター領域内に、マー
カー遺伝子を挿入したり、置換することもできる。更
に、エンドヌクレアーゼ遺伝子のアンチセンスRNAを
導入することによって該エンドヌクレアーゼ遺伝子の発
現を抑制してもよい。
The means for suppressing the expression of the endonuclease gene is not limited to the case where at least a part of the endonuclease gene itself is cleaved with a restriction enzyme, and insertion, deletion, substitution, addition, etc. may be performed. Cleavage, insertion, deletion, substitution, addition, etc. by a restriction enzyme may be carried out within the promoter region or terminator region that regulates the expression of the nuclease gene. Also,
A marker gene can be inserted or replaced in the promoter region or terminator region. Furthermore, the expression of the endonuclease gene may be suppressed by introducing antisense RNA of the endonuclease gene.

【0036】本発明においては、不活化したHO-BR 遺
伝子又はHO-UV 遺伝子が酵母中に導入され、当該HO
-BR 遺伝子又はHO-UV 遺伝子が不活化されたことを容
易に確認できる点で、マーカー遺伝子を当該HO-BR 遺
伝子又はHO-UV 遺伝子におけるエンドヌクレアーゼ構
造遺伝子部分、プロモーター領域又はターミネーター領
域に挿入して不活化するのが好ましくまた有利である。
In the present invention, the inactivated HO-BR gene or HO-UV gene is introduced into yeast, and
-In order to easily confirm that the BR gene or HO-UV gene has been inactivated, the marker gene was inserted into the endonuclease structural gene portion, promoter region or terminator region of the HO-BR gene or HO-UV gene. Inactivation is preferred and advantageous.

【0037】本発明において用いられるマーカーは、酵
母において用いることのできるマーカー遺伝子であれば
特に限定されない。例えば、G418, ブラストサイジン
S,シクロヘキシミド,スルホメチュロン・メチル,セ
ルレニン等の化学物質に対する薬剤耐性遺伝子や、CUP1
等の重金属耐性遺伝子を、さらにβ−ガラクトシダーゼ
やα−アセト乳酸脱炭酸酵素(ALDC)等の容易に活性の判
別可能な酵素遺伝子を例示することが可能である。そし
て、これらは優性マーカーであり、高次倍数体酵母に使
用できるという点において好ましいマーカーとして挙げ
ることができる。
The marker used in the present invention is not particularly limited as long as it is a marker gene that can be used in yeast. For example, drug resistance genes against chemical substances such as G418, blasticidin S, cycloheximide, sulfometuron methyl, cerulenin, and CUP1
It is possible to further exemplify such heavy metal resistance genes as the above, and enzyme genes whose activity can be easily discriminated such as β-galactosidase and α-acetolactate decarboxylase (ALDC). These are dominant markers and can be mentioned as preferable markers in that they can be used for high-order polyploid yeast.

【0038】なお、破壊に用いる配列に特異的な配列を
用いれば、PCR 法やコロニーハイブリダイゼーション法
等によっても容易に検出することができる。また酵母の
HO-BR 遺伝子又はHO-UV 遺伝子の不活化は、前記の
マーカーを挿入して不活化したHO-BR 遺伝子断片又は
HO-UV 遺伝子断片;酵母のホモタリズム遺伝子エンド
ヌクレアーゼ遺伝子の一部、及びマーカー遺伝子を組み
込んだホモタリズム遺伝子破壊用YIp 型プラスミド;又
は酵母のホモタリズム遺伝子エンドヌクレアーゼ遺伝
子、及びマーカー遺伝子を組み込んだホモタリズム遺伝
子破壊用YIp 型プラスミド、を用いて酵母遺伝子中のH
O-BR 遺伝子又はHO-UV 遺伝子との組換えを惹起させ
ることによって行う。
If a sequence specific to the sequence used for disruption is used, it can be easily detected by the PCR method, colony hybridization method or the like. The inactivation of the yeast HO-BR gene or HO-UV gene is carried out by inactivating the HO-BR gene fragment or HO-UV gene fragment by inserting the above marker; a part of the yeast homotalism gene endonuclease gene, And a YIp-type plasmid for disrupting a homothalism gene incorporating a marker gene; or a YIp-type plasmid for disrupting a homothalism gene disrupting a yeast homothalism gene endonuclease gene and a marker gene.
It is carried out by inducing recombination with the O-BR gene or the HO-UV gene.

【0039】上記不活化断片の調製は、以下のようにし
て行う。すなわち、上記HO遺伝子に所望のマーカー遺
伝子を組み込んだ不活化遺伝子を宿主中で大量に増幅が
可能な緩和型プラスミドに組込み、当該プラスミドを宿
主中で大量に増幅させて、増幅させた当該緩和型プラス
ミドを分離・精製し、かかるプラスミドに特定の制限酵
素処理を施し、アガロース電気泳動等で分子量分離し
て、所望の不活化断片を得ることができる。このように
して得た不活性断片は、通常はエレクトロポーレーショ
ン法, リチウム法, 若しくはスフェロプラスト法(Meth
ods in Enzymology,vol.194(1991)) 等を用い直接形質
転換を企図する酵母に導入する。
The inactivated fragment is prepared as follows. That is, an inactivating gene in which a desired marker gene is incorporated into the HO gene is incorporated into a mild plasmid that can be amplified in a large amount in a host, the plasmid is amplified in a large amount in the host, and the amplified mild type is amplified. A desired inactivated fragment can be obtained by separating and purifying a plasmid, subjecting the plasmid to a specific restriction enzyme treatment, and separating the molecular weight by agarose electrophoresis or the like. The inactive fragments thus obtained are usually electroporated, lithium, or spheroplasted (Meth
ods in Enzymology, vol. 194 (1991)) and the like, and directly introduced into yeast intended for transformation.

【0040】上記の工程の詳細は、後述する実施例に記
載する。なお、挿入, 欠失, 置換又は付加により不活化
したHO-BR 遺伝子断片又はHO-UV 遺伝子断片を酵母
用ベクター、例えばYIp 型プラスミドに組み込んで、こ
れを常法により酵母細胞中に導入することにより、酵母
細胞を当該ベクターに組込んだ不活化断片で形質転換す
ることができる。
Details of the above steps will be described in Examples described later. The HO-BR gene fragment or HO-UV gene fragment inactivated by insertion, deletion, substitution or addition should be incorporated into a yeast vector, for example, YIp type plasmid, and then introduced into yeast cells by a conventional method. Thus, yeast cells can be transformed with the inactivated fragment incorporated in the vector.

【0041】すなわち、組み込み酵母を形質転換してH
O-BR 遺伝子又はHO-UV 遺伝子を破壊するInternal f
ragment disruption法も採用し得る方法である。さらに
HO-BR 遺伝子又はHO-UV 遺伝子の内部に変異を付加
し、YIp 型プラスミドに組み込み、酵母を形質転換した
後、正常HO-BR 遺伝子又はHO-UV 遺伝子とマーカー
が切除されたクローンをスクリーニングする遺伝子置換
(Popin/Popout) 法を使用することが可能である(Metho
ds in Enzymology,Vol.194,p281-301)。
That is, the integrated yeast is transformed into H
Internal f that disrupts the O-BR or HO-UV gene
The ragment disruption method can also be adopted. Furthermore, mutations were added to the inside of the HO-BR gene or HO-UV gene, the gene was integrated into a YIp type plasmid, yeast was transformed, and then clones in which the normal HO-BR gene or HO-UV gene and the marker were excised were screened. It is possible to use the gene replacement (Popin / Popout) method (Metho
ds in Enzymology, Vol. 194, p281-301).

【0042】なお、前記Internal fragment disruption
法において用いる、酵母のホモタリズム遺伝子エンドヌ
クレアーゼ遺伝子の一部、及びマーカー遺伝子を組み込
んだホモタリズム遺伝子破壊用YIp 型プラスミドの調製
は、HO-SC 遺伝子、HO-BR 遺伝子又はHO-UV 遺伝
子のHOエンドヌクレアーゼアミノ酸配列をコードする
構造遺伝子部分の内部領域を、制限酵素切断による断片
化、又はDNA分解酵素による部分欠失を作製すること
によって調製し、当該YIp 型プラスミドに組み込むこと
により作製することができる。
The above internal fragment disruption
The YIp-type plasmid for disrupting the homothalism gene, in which a part of the yeast homothalism gene endonuclease gene and the marker gene are used in the method, can be prepared by the HO endonuclease of HO-SC gene, HO-BR gene or HO-UV gene. The internal region of the structural gene portion encoding the amino acid sequence can be prepared by fragmentation by restriction enzyme cleavage or partial deletion by DNA degrading enzyme, and incorporation into the YIp type plasmid.

【0043】なお、当該YIp 型プラスミドに用いるマー
カー遺伝子としては、前述の優性マーカー遺伝子を用い
るのが好ましい。このようにして得た、Internal fragm
ent disruption法において用いるホモタリズム遺伝子破
壊用YIp 型プラスミドを用いた酵母の形質転換法として
は通常公知の方法を用いることができる。
As the marker gene used for the YIp type plasmid, it is preferable to use the above dominant marker gene. Internal fragm obtained in this way
As a yeast transformation method using the YIp type plasmid for homotalism gene disruption used in the ent disruption method, a generally known method can be used.

【0044】また、前記Popin/Popout法において用い
る、酵母のホモタリズム遺伝子エンドヌクレアーゼ遺伝
子、及びマーカー遺伝子を組み込んだホモタリズム遺伝
子破壊用YIp 型プラスミドの調製は、HO-SC あるいは
HO-BR あるいはHO-UV 遺伝子を、欠失、置換、挿
入、若しくは付加によって作製することが可能である。
このようにして得た、Popin/Popout法において用いるホ
モタリズム遺伝子破壊用YIp 型プラスミドを用いた酵母
の形質転換法としては、通常公知の方法を用いることが
できる。
Further, the YIp-type plasmid for disrupting the homothalism gene, which is used in the Popin / Popout method and has the yeast homothalism gene endonuclease gene and the marker gene, is prepared by the HO-SC or HO-BR or HO-UV gene. Can be created by deletion, substitution, insertion, or addition.
As the yeast transformation method using the YIp type plasmid for homotalism gene disruption used in the Popin / Popout method thus obtained, a generally known method can be used.

【0045】なお、当該Popin/Popout法においては、得
られた形質転換体から優性マーカーを失った酵母株をス
クリーニングし、得られた候補酵母の染色体DNAとサ
ザン解析、あるいはPCR 法による解析により、正常HO
遺伝子が変異型HO遺伝子に置換されていることを確認
することにより、所望のHO遺伝子の不活化を実行する
ことができる。
In the Popin / Popout method, yeast strains lacking a dominant marker were screened from the obtained transformants, and chromosomal DNA of the obtained candidate yeast and Southern analysis or PCR analysis was performed. Normal HO
By confirming that the gene is replaced with the mutant HO gene, the desired HO gene can be inactivated.

【0046】ところで細胞に導入する不活化断片の種類
は、HO遺伝子の不活化を企図する酵母細胞の種類によ
って異なる。すなわち、HO-SC 遺伝子とHO-BR 遺伝
子の双方を有する酵母のホモタリズムへの移行を防ぐた
めには、当該酵母のHO-SC遺伝子とHO-BR 遺伝子の
双方を不活化する必要がある。このため、導入すること
が必要な不活化断片の種類も、かかる場合は、HO-SC
遺伝子の不活化断片とHO-BR 遺伝子の不活化断片の2
種類を導入する必要がある。また、HO-BR 遺伝子とH
O-UV 遺伝子の双方を有する酵母の場合、HO-BR 遺伝
子の不活化断片とHO-UV 遺伝子の不活化断片の2種類
を導入する必要がある。
The type of inactivating fragment to be introduced into cells differs depending on the type of yeast cell intended to inactivate the HO gene. That is, in order to prevent the transfer of the yeast having both the HO-SC gene and the HO-BR gene to homothalism, it is necessary to inactivate both the HO-SC gene and the HO-BR gene of the yeast. Therefore, the type of inactivated fragment that needs to be introduced, in such a case, HO-SC
2 of inactivated fragment of gene and inactivated fragment of HO-BR gene
Need to introduce types. In addition, the HO-BR gene and H
In the case of yeast having both the O-UV gene, it is necessary to introduce two types, an inactivated fragment of the HO-BR gene and an inactivated fragment of the HO-UV gene.

【0047】上記HO-SC 遺伝子の単離方法、当該遺伝
子の塩基配列については、"David W.Russell et al.,MO
L.AND CELL BIOL.,Vol.6,No12,pp4281-4294(1986)"に記
載されており、当該HO-SC 遺伝子を基に上記と同様の
方法で不活化断片を調製することができる。
For the method of isolating the HO-SC gene and the nucleotide sequence of the gene, see "David W. Russell et al., MO.
L. AND CELL BIOL., Vol. 6, No12, pp4281-4294 (1986) ", and an inactivated fragment can be prepared based on the HO-SC gene in the same manner as above.

【0048】かかるHO-BR 遺伝子とHO-SC 遺伝子の
2種類の不活化断片を導入する必要のある酵母として
は、サッカロマイセス. カールスベルゲンシス(Sacchar
omycescarlsbergensis)、サッカロマイセス.パストリ
アナス(Saccharomyces pastrianus)(IFO 1167)、サッ
カロマイセス.モナセンシス(Saccharomyces monacensi
s)(IFO 0220,IFO 279)等を挙げることができる。また、
HO-BR 遺伝子のみを不活化すれば足る酵母としては、
サッカロマイセス.グロボサス(Saccharomycesglobosu
s)を挙げることができる。
Saccharomyces. Carlsbergensis (Sacchargensis) is a yeast that requires introduction of two types of inactivating fragments of the HO-BR gene and the HO-SC gene.
omycescarlsbergensis), Saccharomyces. Saccharomyces pastrianus (IFO 1167), Saccharomyces. Monacensis (Saccharomyces monacensi
s) (IFO 0220, IFO 279) and the like. Also,
As a yeast that is sufficient if only the HO-BR gene is inactivated,
Saccharomyces. Globosus (Saccharomyces globosu
s).

【0049】HO-UV 遺伝子とHO-BR 遺伝子の2種類
の不活化断片を導入する必要のある酵母としては、サッ
カロマイセス バイアナス(Saccharomyces bayanus )
(IFO 1127)、サッカロマイセス イヌシタタス(Sacch
aromyces inusitatus)(IFO 1343)等を挙げることができ
る。また、HO-UV 遺伝子のみを不活化すれば足りる酵
母としては、サッカロマイセス ウバルム(Saccharomy
ces ubarum) (IFO 0615)、サッカラオマイセス ヘテロ
ジェニカス(Saccharomyces heterogenicus)(IFO 162
0)、Pilsen No.1(IFO 2031) が挙げられる。
Saccharomyces bayanus is a yeast for which it is necessary to introduce two types of inactivating fragments of HO-UV gene and HO-BR gene.
(IFO 1127), Saccharomyces inucitatus (Sacch
aromyces inusitatus) (IFO 1343) and the like. In addition, as a yeast which is sufficient to inactivate only the HO-UV gene, Saccharomyces ubalm (Saccharomyces
ces ubarum) (IFO 0615), Saccharomyces heterogenicus (IFO 162)
0) and Pilsen No. 1 (IFO 2031).

【0050】ただし、上記の分類学上の名称は、糖の資
化性、発酵性に基づいた命名であるため、HO-SC 遺伝
子及びHO-BR やHO-UV 遺伝子の存在には直接係るも
のではない。このため、サザン解析法によりいかなる種
類のHO遺伝子が存在するかを事前に情報を得て、これ
に従ってHO遺伝子の使用と組合せを判断すべきであ
る。なお、上記の方法の他に、HO遺伝子の不活化は、
酵母の細胞内においてアンチセンスRNAを発現させる
ことによって達成することもできる。
However, since the taxonomic names mentioned above are based on sugar assimilation and fermentability, they are directly related to the existence of the HO-SC gene and HO-BR and HO-UV genes. is not. Therefore, it is necessary to obtain information in advance what kind of HO gene is present by Southern analysis, and to judge the use and combination of HO genes according to the information. In addition to the above method, inactivation of the HO gene
It can also be achieved by expressing the antisense RNA in yeast cells.

【0051】C.接合能を保持した形質転換体の分離 接合能を保持した形質転換体を得るためには、染色体上
に存在する、すべてのHO遺伝子を破壊することによっ
ても可能であるが、HO遺伝子のうちのいくつかを不活
化して胞子形成させ、得られた胞子クローンの中から、
HO遺伝子が全て破壊され安定した接合型を示すクロー
ンを分離することも可能であり、かつ有効な方法であ
る。通常の方法で胞子形成させ、マイクロマニピュレー
ター若しくはランダムスポアー法によって胞子クローン
を得ることができる。接合型の検定は、a型あるいはα
型の実験室株との接合を観察することにより容易に実施
できる。
C. Separation of Transformant Retaining Mating Ability In order to obtain a transformant retaining conjugating ability, it is possible to destroy all the HO genes existing on the chromosome. From some of the resulting spore clones, some were inactivated to sporulate,
It is also possible and an effective method to isolate a clone showing a stable mating type in which all the HO genes are destroyed. Spore formation can be performed by a usual method, and a spore clone can be obtained by a micromanipulator or a random spor method. Junction type test is a type or α
This can easily be done by observing the mating of the mold with the laboratory strain.

【0052】[0052]

【実施例】以下、実施例により本発明を説明するが、当
該実施例により本発明の技術的範囲が限定解釈されるも
のではない。
EXAMPLES The present invention will be described below with reference to examples, but the technical scope of the present invention is not limited to the examples.

【0053】〔実施例1〕HO-BR 遺伝子のビール酵母
よりのクローニング a) ビール酵母分子量限定ライブラリーの作製 ビール酵母からのDNA鎖の抽出 1リットルのYPD 培地(酵母エキス10g/l,ペプトン20g/
l,グルコース20g/l)で下面発酵ビール酵母である、サッ
カロマイセス.カールスベルゲンシス(Saccharomyces c
arlsbergensis)KBY003をO.D.=10付近まで培養し、集菌
後、オートクレーブ処理した水で洗浄した。これを菌体
1gあたり2ml のSCE(ソルビトール(1M),EDTA(0.125M),ク
エン酸3ナトリウム(pH7)(0.1M),“ザイモリエース
100T”(生化学工業(株))(0.01%))に懸濁させた後、
37℃で約2時間穏緩かに振盪し、酵母を完全にプロトプ
ラスト化させた。これに、菌体1g あたり、3.5ml のLy
sis Buffer(トリス塩酸緩衝液(pH9)(0.5M),EDTA(0.2
M),ドデシル硫酸ナトリウム(SDS)(3%) )を加えて緩
やかに攪拌した。これを65℃で15分保温し、完全に溶菌
させた。溶菌後、これを室温まで冷却し、あらかじめ日
立超遠心チューブ40PAに作製しておいた23.5mlの10-40
%のシュクロース密度勾配液(塩化ナトリウム(0.8M)、
トリス塩酸緩衝液(pH8)(0.02M) ,EDTA(0.01M),シュー
クロース(10-40%) に10mlずつ静かにのせた。これを、
日立超遠心機SCP85Hを用いて、4℃/26000rpm/3hrで遠
心した。遠心後、コマゴメピペットを用いて、チューブ
底になるべく近いところから液を約5mlずつ回収した。
回収したサンプルを1l のTE緩衝液(トリス塩酸(pH8)
(10mM),EDTA(1ml))で一晩透析した。
[Example 1] Cloning of HO-BR gene from brewer's yeast a) Preparation of library for limiting brewer's yeast molecular weight Extraction of DNA chain from brewer's yeast 1 liter of YPD medium (yeast extract 10 g / l, peptone 20 g) /
Saccharomyces, which is a bottom-fermenting brewer's yeast with l, glucose 20 g / l). Karlsbergensis (Saccharomyces c
arlsbergensis) KBY003 was cultured to an OD of around 10 and the cells were collected and washed with autoclaved water. This is mycelia
2ml per 1g SCE (sorbitol (1M), EDTA (0.125M), trisodium citrate (pH 7) (0.1M), "Zymoly Ace"
After suspending in 100T "(Seikagaku Corporation) (0.01%),
The yeast was completely protoplastized by gentle shaking at 37 ° C for about 2 hours. To this, 3.5 ml of Ly per 1 g of bacterial cells
sis Buffer (Tris-HCl buffer (pH9) (0.5M), EDTA (0.2M)
M) and sodium dodecyl sulfate (SDS) (3%)) were added and gently stirred. This was kept warm at 65 ° C for 15 minutes to completely lyse it. After lysing, cool it to room temperature and prepare 23.5 ml 10-40 of Hitachi ultracentrifuge tube 40PA.
% Sucrose density gradient solution (sodium chloride (0.8M),
10 ml of Tris-HCl buffer (pH8) (0.02M), EDTA (0.01M) and sucrose (10-40%) were gently placed. this,
Using a Hitachi ultracentrifuge SCP85H, centrifugation was performed at 4 ° C / 26000rpm / 3hr. After centrifugation, a Komagome pipette was used to collect about 5 ml of the solution from the place as close as possible to the bottom of the tube.
1 l of TE buffer (Tris-HCl (pH8))
(10 mM), EDTA (1 ml)) was dialyzed overnight.

【0054】DNA鎖の制限酵素による切断 次に、こうして得られた染色体DNAの約20μg をエッ
ペンドルフチューブに取りH Buffer(トリス塩酸緩衝液
(pH7.5 )(50mM),MgCl2(10mM) ,Dithiothreitol(DT
T)(1mM),NaCl(100mM))に溶解し、制限酵素EcoRI (ベ
ーリンガー社製)200 ユニットを添加し37℃で3−4時
間保温した。
Cleavage of DNA Strand by Restriction Enzyme Next, about 20 μg of the chromosomal DNA thus obtained was placed in an Eppendorf tube and added to H Buffer (Tris-HCl buffer (pH 7.5) (50 mM), MgCl 2 (10 mM), Dithiothreitol. (DT
T) (1 mM), NaCl (100 mM)), 200 units of restriction enzyme EcoRI (Boehringer) was added, and the mixture was kept at 37 ° C. for 3 to 4 hours.

【0055】サザン解析による分取分子量の限定と挿
入DNAの調製 完全にEcoRI で切断された染色体DNAの一部を1%ア
ガロースゲル(酢酸緩衝液、EDTA)にアプライし100Vで
2時間泳動した。アガロースゲルを臭化エチジウム溶液
に浸し、DNA分子量マーカーとDNAを染色し泳動状
態を写真等により記録した。このアガロースゲルを用い
てサザン解析(Molecular Cloninng,Manniatis et a
l.,Cold Spring Harbor)に供した。プローブは後述する
方法によって標識したサッカロマイセス セレビシェ由
来のHO遺伝子断片を使用した。得られたオートラジオ
グラムから約7Kb付近に強いシグナルのバンドと約4Kb
付近に弱いシグナルのバンドが得られた。
Limitation of preparative molecular weight by Southern analysis and preparation of inserted DNA A part of the chromosomal DNA completely digested with EcoRI was applied to 1% agarose gel (acetate buffer, EDTA) and electrophoresed at 100 V for 2 hours. The agarose gel was immersed in an ethidium bromide solution, stained with a DNA molecular weight marker and DNA, and the electrophoretic state was recorded by a photograph or the like. Southern analysis using this agarose gel (Molecular Cloninng, Manniatis et a
, Cold Spring Harbor). As a probe, a HO gene fragment derived from Saccharomyces cerevisiae labeled by the method described below was used. From the obtained autoradiogram, a strong signal band at about 7 Kb and about 4 Kb
A weak signal band was obtained in the vicinity.

【0056】前項で述べた完全にEcoRI で切断された染
色体DNA20μg を1%低融点アガロースゲルにて電気
泳動し、分子量マーカーを指標として約3.5Kb から約4.
5Kbの分子量に相当するゲル部分を3分割して回収し
た。それぞれの低融点アガロースゲルからDNA断片
を、加熱融解とフェノール処理に続くエタノール沈澱に
よって得た。これらのDNAの一部を再びサザン解析に
供し陽性シグナルを与える画分のDNAを以下の実験に
供した。
20 μg of the chromosomal DNA completely cleaved with EcoRI described in the previous section was electrophoresed on a 1% low-melting point agarose gel, and from about 3.5 Kb to about 4.
The gel part corresponding to a molecular weight of 5 Kb was collected in three parts. DNA fragments were obtained from each low melting agarose gel by heat melting and phenol treatment followed by ethanol precipitation. A part of these DNAs was again subjected to Southern analysis, and the DNA of the fraction giving a positive signal was subjected to the following experiment.

【0057】ベクターへの連結 pUC119(タカラ酒造製)プラスミドDNA1μg をH bu
ffer中で30ユニットのEcoRI で切断した。2倍量のエタ
ノールでプラスミドDNAを沈澱させ回収し、乾燥後10
0 μl の500mM のトリス塩酸緩衝液(pH8)に懸濁し
た。Bacterial Alkaline Phosphatase(タカラ酒造社
製) 1ユニットを添加し、65℃で1時間反応した。等量
のフェノールを加えボルテックスミキサーで激しく攪拌
し、遠心分離12000rpm/5 分により2層に分離させた。
水層を採取し別のチューブに入れた。このフェノール処
理を3回繰り返したのち、水層に等量のフェノール/ク
ロロホルム(1:1)を加えボルテックスミキサーで激
しく攪拌し、遠心分離12000rpm/3分により2層に分離さ
せ、別のチューブに移した水層に2倍量のエタノールを
加えプラスミドDNAを沈澱で回収した。沈澱を適当量
のTE緩衝液に溶解する。
Ligation to vector 1 μg of pUC119 (Takara Shuzo) plasmid DNA was ligated to Hbu
Cut with 30 units EcoRI in ffer. Precipitate and recover the plasmid DNA with twice the amount of ethanol, and after drying,
It was suspended in 0 μl of 500 mM Tris-HCl buffer (pH 8). One unit of Bacterial Alkaline Phosphatase (Takara Shuzo) was added, and the mixture was reacted at 65 ° C. for 1 hour. An equal amount of phenol was added, and the mixture was vigorously stirred with a vortex mixer, and separated into two layers by centrifugation at 12000 rpm / 5 minutes.
The aqueous layer was collected and placed in another tube. After repeating this phenol treatment three times, add an equal amount of phenol / chloroform (1: 1) to the aqueous layer, stir vigorously with a vortex mixer, separate into two layers by centrifugation 12000 rpm / 3 minutes, and put it in another tube. Two times the amount of ethanol was added to the transferred aqueous layer to recover the plasmid DNA by precipitation. Dissolve the precipitate in an appropriate amount of TE buffer.

【0058】このように処理したpUC119(50ng)と上述の
酵母染色体DNA断片(50ng)とをLigation Kit(タカ
ラ酒造)にて連結した。このLigation Mixtureの一部を
用いて大腸菌DH5株(東洋紡)を形質転換した。方法は
それぞれ当該Kit の実験手法に従った。
The thus treated pUC119 (50 ng) and the above-mentioned yeast chromosomal DNA fragment (50 ng) were ligated with Ligation Kit (Takara Shuzo). A part of this Ligation Mixture was used to transform Escherichia coli DH5 strain (Toyobo). Each method followed the experimental method of the Kit.

【0059】プローブの作製 既知のHO遺伝子(HO-SC 遺伝子) 配列(David W,Ru
ssell 等,Mol.Cell.Biol.,6,4281-4294(1986)) をHO-
BR 遺伝子のクローニングのためのプローブとして使用
するが、上記塩基配列が公知であり、当該HO-BR 遺伝
子をコードするDNA鎖は酵母遺伝子ライブラリー公知
配列の一部を合成し、これをプローブとして用いること
により容易に入手することができる。また、当該公知配
列情報を基にプライマーを合成し、これを用いたPCR 反
応により容易に取得することができる。
Preparation of probe Known HO gene (HO-SC gene) sequence (David W, Ru
ssell et al., Mol. Cell. Biol., 6 , 4281-4294 (1986)).
It is used as a probe for cloning the BR gene, and the above-mentioned nucleotide sequence is known. The DNA chain encoding the HO-BR gene synthesizes a part of the known sequence of the yeast gene library and uses it as a probe. It can be easily obtained. In addition, it can be easily obtained by synthesizing a primer based on the known sequence information and performing a PCR reaction using the primer.

【0060】そこで、酵母サッカロマイセス セレビシ
エ(Saccharomyces cerevisiae)の染色体DNAを通常公
知の方法により抽出し、これをHindIII で完全分解し、
2.5Kb 付近のDNA断片を分離して作製した遺伝子ライ
ブラリーから、HO遺伝子のN末端付近の配列を合成し
たオリゴヌクレオチドを32Pで標識し、プローブとして
用い、HO-SC 遺伝子を取得し、pH03として以後の実験
に使用した。HO−BR遺伝子をクローニングするため
に、プローブとして用いるpH03のHindIII 断片(HO-S
C 遺伝子)を放射性同位元素により標識する方法は、標
識可能な方法であればいずれも用いることができるが、
我々はマルチプライムDNA標識システム(アマシャム
社製)を使用し、方法は添付のプロトコールに従った。
Therefore, the chromosomal DNA of the yeast Saccharomyces cerevisiae was extracted by a commonly known method, and this was completely digested with HindIII,
From a gene library prepared by separating a DNA fragment around 2.5 Kb, an oligonucleotide synthesizing a sequence near the N-terminal of the HO gene was labeled with 32 P and used as a probe to obtain the HO-SC gene, and pH03 Was used in subsequent experiments. The HindIII fragment of pH03 (HO-S used as a probe for cloning the HO-BR gene)
The C gene) can be labeled with a radioisotope as long as it can be labeled,
We used a multiprime DNA labeling system (Amersham), and the method followed the attached protocol.

【0061】コロニーハイブリダイゼーションによる
クローニング 形質転換体をアンピシリン50μg/ml含有LB平板培地
(バクトトリプトン10g/l ,酵母エキス5g/l ,塩化ナ
トリウム5g/l ,寒天15g/l )1枚あたりに200-300 コ
ロニーを形成させた。同じ平板培地にニトロセルロース
フィルターを載せ、現れた形質転換体をレプリカ法にて
ニトロセルロースフィルターに移した。フィルターは種
々発売されているコロニーハイブリダイゼーションに使
用できるものであればいづれのフィルターでも使用可能
である。
Cloning by colony hybridization 200 transformants per LB plate medium containing 50 μg / ml of ampicillin (bactotryptone 10 g / l, yeast extract 5 g / l, sodium chloride 5 g / l, agar 15 g / l) -300 colonies were formed. A nitrocellulose filter was placed on the same plate medium, and the transformant that appeared was transferred to the nitrocellulose filter by the replica method. As the filter, any filter can be used as long as it can be used for various colony hybridizations on the market.

【0062】コロニーハイブリダイゼーションの方法は
マニアチス等によるMolecular Cloning(Cold Spring ha
rbor Laboratory,1982)の方法(p315,p326-328) に従っ
た。なお、ハイブリダイゼーションとフィルターの洗浄
は60℃で行った。オートラジオグラフ上のポジティブな
シグナルを与える位置にあるマスタープレート上のコロ
ニーを分離し、pHOBR-4と挿入方向が逆のpHOBR-5を以
下の工程に供した。
The method of colony hybridization is based on Molecular Cloning (Cold Spring ha
rbor Laboratory, 1982) (p315, p326-328). The hybridization and washing of the filter were performed at 60 ° C. Colonies on the master plate at positions giving a positive signal on the autoradiograph were separated, and pHOBR-5, which had an insertion direction opposite to that of pHOBR-4, was subjected to the following steps.

【0063】b) クローニングされたHO-BR 遺伝子の
塩基配列の決定 pUC119のEcoRI 部位にクローニングされたHO-BR 遺伝
子は、EXOIIIにより一連の欠失を作製し、蛍光プライマ
ーによるダイデオキシ法により塩基配列が決定された。
B) Determination of the nucleotide sequence of the cloned HO-BR gene The HO-BR gene cloned at the EcoRI site of pUC119 was made into a series of deletions by EXOIII, and the nucleotide sequence was determined by the dideoxy method using a fluorescent primer. Was decided.

【0064】すなわち、前記pHOBR-4とpHOBR-5から段
階的欠失プラスミドを作製し、塩基配列の決定に用い
た。まず、プラスミド10μg を制限酵素PstIで切断し、
続いてBamHI で切断し、等量の水飽和したフェノール/
クロロホルム(50:50) で処理し、エタノールによりDN
Aを沈澱として回収した。70%エタノールで沈澱を洗
い、これを減圧乾燥した。このDNAからの欠失の作製
には、宝酒造のキロデレーションキットを用いた。方法
は添付のプロトコールに従った。得られた部分欠失プラ
スミドの塩基配列決定は、アプライドバイオシステム社
の373ADNAシークエンサーを使用し、反応はダイプラ
イマーサイクルシーケンスキット(アプライドバイオシ
ステム社製)を使用した。塩基配列決定の手順は添付の
プロトコールに従った。
That is, a stepwise deletion plasmid was prepared from the above-mentioned pHOBR-4 and pHOBR-5 and used for the determination of the nucleotide sequence. First, 10 μg of plasmid was digested with restriction enzyme PstI,
Subsequent cut with BamHI and an equal volume of water saturated phenol /
Treat with chloroform (50:50) and add DN with ethanol.
A was collected as a precipitate. The precipitate was washed with 70% ethanol and dried under reduced pressure. The deletion from this DNA was prepared using the Takara Shuzo Kiroderation Kit. The method followed the attached protocol. The nucleotide sequence of the obtained partially deleted plasmid was determined by using 373A DNA sequencer manufactured by Applied Biosystems, and the reaction was performed by using a dye primer cycle sequence kit (manufactured by Applied Biosystems). The procedure of nucleotide sequence determination followed the attached protocol.

【0065】その結果、本発明HO遺伝子であるHO-B
R 遺伝子は、配列番号2に示す塩基配列を有することが
明らかになった。また、当該塩基配列から推定される本
発明ホモタリズム遺伝子エンドヌクレアーゼをコードす
る構造遺伝子部分であると推定される塩基配列部分は、
配列番号3に示す通りであり、またかかる塩基配列から
推定される本発明ホモタリズム遺伝子エンドヌクレアー
ゼのアミノ酸配列は配列番号1に示す通りである。
As a result, the HO gene of the present invention, HO-B
It was revealed that the R gene has the base sequence shown in SEQ ID NO: 2. In addition, the nucleotide sequence portion deduced to be the structural gene portion encoding the homothalism gene endonuclease of the present invention deduced from the nucleotide sequence,
It is as shown in SEQ ID NO: 3, and the amino acid sequence of the homotalism gene endonuclease of the present invention deduced from such a nucleotide sequence is as shown in SEQ ID NO: 1.

【0066】なお、上記の工程に供したpHOBR-4を大腸
菌DH5αに組込んだ。かかる形質転換体は、EKB102とし
て、1993年6月7日に、通商産業省工業技術院生命工学
工業技術研究所に、FERM BP-4323として寄託されてい
る。
The pHOBR-4 used in the above steps was incorporated into Escherichia coli DH5α. Such a transformant was deposited as EKB102 on June 7, 1993, at the Institute of Biotechnology, Institute of Biotechnology, Ministry of International Trade and Industry, as FERM BP-4323.

【0067】〔実施例2〕形質転換によるHO遺伝子の
不活化 a) ベクターの作成 G-418 耐性マーカーの作製 酵母のPGK 遺伝子を含む2.9Kb のHindIII 断片(特開平
2-265488 号公報) をpUC18(宝酒造社製) にクローニン
グした。この断片より、図1に示した手段でPGK プロモ
ーターとターミネーターを持つプラスミドpUCPGK21を作
製した。G-418耐性遺伝子をプラスミドpNEO(ファルマ
シア社製)より、図1に示した手順で調製し、pUCPGK21
に連結しpPGKneo2を作製した。
[Example 2] Inactivation of HO gene by transformation a) Construction of vector Construction of G-418 resistance marker A 2.9 Kb HindIII fragment containing the PGK gene of yeast (JP-A-2-265488) was pUC18. (Takara Shuzo). From this fragment, a plasmid pUCPGK21 having a PGK promoter and a terminator was prepared by the procedure shown in FIG. The G-418 resistance gene was prepared from the plasmid pNEO (Pharmacia) by the procedure shown in FIG. 1, and pUCPGK21
To prepare pPGKneo2.

【0068】ブラストサイジン耐性マーカーの作製 酵母のGPD プロモーターと酵母のGPD ターミネーターを
有するプラスミドpSY114P(特開平2-265488 号公報) の
SmaI部位にHindIII リンカーを連結したpSY114H のHind
III 部位にブラストサイジン耐性遺伝子を有するプラス
ミドpSVSbsr(フナコシ製) のHindIII 断片を連結し、図
2に示した手順でpGPDBSR を作製した。
Preparation of blasticidin resistance marker of plasmid pSY114P (JP-A-2-265488) having a yeast GPD promoter and a yeast GPD terminator.
Hind of pSY114H with HindIII linker linked to SmaI site
The HindIII fragment of the plasmid pSVSbsr (manufactured by Funakoshi) having the blasticidin resistance gene at the III site was ligated to prepare pGPDBSR by the procedure shown in FIG.

【0069】HO-SC 破壊用ベクターの作製 HO-SC 遺伝子を含む2.5Kb のHindIII 断片を含むpHO
3から、HO遺伝子のC 末端近傍に存在するARS 配列
(複製開始点)を含まないHindIII 〜SacII 断片を調製
し、Klenow酵素により平滑化した後、EcoRI リンカーを
連結し、pUC18 のEcoRI 部位に連結したpHOK22を作成し
た。pHOK22から図3に示す手順でHO遺伝子のHOエンドヌ
クレアーゼコード領域の内部に存在するBamHI をKlenow
酵素により平滑化した部位に、pPGKNEO2のG-418 耐性遺
伝子を含むSalI断片をKlenow酵素により平滑化して連結
して、pHONEOを作製した。
Construction of vector for HO-SC disruption pHO containing 2.5 Kb HindIII fragment containing HO-SC gene
A HindIII-SacII fragment containing no ARS sequence (origin of replication) near the C-terminal of the HO gene was prepared from 3 and blunted with Klenow enzyme, ligated with EcoRI linker, and ligated to EcoRI site of pUC18. PHOK22 was prepared. From pHOK22, Klenow was used to remove BamHI existing inside the HO endonuclease coding region of the HO gene by the procedure shown in FIG.
The SalI fragment containing the G-418 resistance gene of pPGKNEO2 was blunted with Klenow enzyme and ligated to the enzyme-blunted site to prepare pHONEO.

【0070】HO-BR 破壊用ベクターの作製 図4に示す通り、HO-BR 遺伝子を含むpHOBR 4プラス
ミドからHO-SC 遺伝子のARS 配列に相当する領域を欠
失するため、塩基配列決定の目的で作製した部分欠失プ
ラスミドpHOBR Δ6を用い、このプラスミド上のHO-B
R 遺伝子のBglII 部位を切断後、Klenow酵素により平滑
化したXhoIリンカーを連結してpHOBRXを作製した。pHOB
RXのXhoI部位に、pGPDBRS のブラストサイジン耐性遺伝
子を含むSalI断片を連結し、pHOBRBSRを作製した。
Construction of HO-BR Disruption Vector As shown in FIG. 4, the region corresponding to the ARS sequence of the HO-SC gene was deleted from the pHOBR 4 plasmid containing the HO-BR gene. Using the partially deleted plasmid pHOBR Δ6 prepared, HO-B on this plasmid was used.
After cutting the BglII site of R gene, XhoI linker blunted with Klenow enzyme was ligated to prepare pHOBRX. pHOB
The SalI fragment containing the blasticidin resistance gene of pGPDBRS was ligated to the XhoI site of RX to prepare pHOBRBSR.

【0071】形質転換 下面ビール酵母BFY268の形質転換は以下のようにして行
った。酵母を100ml のYPD 培地でO.D.=16になるまで30
℃で振盪培養した。集菌後、滅菌水で一回洗浄した。続
いて、135mM のトリス塩酸緩衝液(pH8.0)で一回洗浄
し、同じ緩衝液に菌濃度が2×109cells/ml になるよう
に懸濁した。この菌液300μl に10μgのpHOBRBSRのSslI
断片、10μg のpHONEOのEcoRI 断片とキャリアーDNA
としての20μg のCalf thymus DNA(シグマ社)を加
えた。これに1200μl の35%PEG4000(フィルターで無
菌濾過した)を加え、よく攪拌した。この攪拌した液75
0μl をジーンパルサー(バイオラッド社)専用のキュ
ベットに移し、ジーンパルサーを用いて1μF/1000V の
条件で電気パルス処理を一回行った。菌液をキュベット
より15mlチューブに移し、30℃で1時間静置した。菌を
3000rpm/5分遠心して集菌した後、1mlのYPD 培地に懸
濁させて30℃で4時間振盪した。集菌後、600μl の滅
菌水に懸濁させ、150μl ずつ50μg/mlのG-418 と100μ
g/mlのブラストサイジンSを含むYPD 寒天培地に塗布し
た。この寒天培地を30℃で保温して、現われたコロニー
を形質転換体として取得した。
Transformation The bottom brewer's yeast BFY268 was transformed as follows. Add yeast to 100 ml of YPD medium until OD = 16
The cells were cultured with shaking at ℃. After collecting the cells, the cells were washed once with sterile water. Then, the cells were washed once with 135 mM Tris-HCl buffer (pH 8.0) and suspended in the same buffer at a bacterial concentration of 2 × 10 9 cells / ml. 300 μl of this bacterial solution was added to 10 μg of pHOBRBSR SslI.
Fragment, 10 μg pHONEO EcoRI fragment and carrier DNA
20 μg of Calf thymus DNA (Sigma) was added. To this, 1200 μl of 35% PEG4000 (sterilized with a filter) was added and stirred well. This stirred liquid 75
0 μl was transferred to a cuvette dedicated to Gene Pulser (Bio-Rad), and an electric pulse treatment was performed once using the Gene Pulser under the condition of 1 μF / 1000V. The bacterial solution was transferred from the cuvette to a 15 ml tube and left at 30 ° C. for 1 hour. Fungus
The cells were collected by centrifugation at 3000 rpm for 5 minutes, suspended in 1 ml of YPD medium, and shaken at 30 ° C. for 4 hours. After collecting the cells, suspend the cells in 600 μl of sterilized water, and add 150 μl each of 50 μg / ml G-418 and 100 μl.
It was applied to YPD agar medium containing g / ml of blasticidin S. This agar medium was kept warm at 30 ° C., and the colonies that appeared were obtained as transformants.

【0072】b) 接合能を保持した形質転換体の分離 減数分裂による接合能を保持する減数体の分離 G-418 とブラストサイジンSの両方に耐性を示す形質転
換体BFY268-6を、一白金耳とり50mlのYPD 培地に植菌
し、20℃にて一晩培養した。菌体を滅菌水で十分に洗
い、胞子形成培地(酢酸カリウム0.5 %)に懸濁し、20
℃にて振盪培養を行なった。胞子形成を顕微鏡で確認し
た後、酵母細胞をすべて3000回転/ 分、5分間の遠心分
離で集める。
B) Separation of transformants retaining zygosity Separation of meiotic variants retaining zygosity by meiosis Transformants BFY268-6 showing resistance to both G-418 and blasticidin S were The platinum loop was inoculated into 50 ml of YPD medium and cultured at 20 ° C overnight. Wash the cells thoroughly with sterile water, suspend in sporulation medium (potassium acetate 0.5%), and
Shaking culture was performed at ° C. After confirming sporulation under a microscope, all yeast cells are collected by centrifugation at 3000 rpm for 5 minutes.

【0073】5mlの滅菌水に懸濁し、1mg/mlのザイモリ
アーゼ水溶液を0.5ml 加え30℃に一晩振盪させた。界面
活性剤NP-40 の1.5 %(W/V) 溶液5ml を添加し、これを
15分間氷冷した後、超音波発生機(トミー精工製、パワ
ーソニック UR-20P型) にて30秒出力し、50-75 %で胞
子を分散させた。胞子分散液を遠心分離して胞子を沈澱
に集め、5mlの滅菌水に懸濁した。一枚の平板培地に約
300-400 コロニーが出現するように適当に希釈し、50μ
g/mlのG-418 と100μg/mlのブラストサイジンCを含むYP
D 平板培地に広げ30℃にて数日間保存した。これによ
り、現れたコロニーを釣り上げ、接合型検定酵母との接
合能を調べた。
The suspension was suspended in 5 ml of sterilized water, 0.5 ml of a 1 mg / ml zymolyase aqueous solution was added, and the mixture was shaken at 30 ° C. overnight. Add 5 ml of a 1.5% (W / V) solution of the surfactant NP-40 and add it.
After ice-cooling for 15 minutes, an ultrasonic generator (Tomy Seiko Co., Ltd., Powersonic UR-20P type) was used to output for 30 seconds, and spores were dispersed at 50-75%. The spore dispersion was centrifuged to collect the spores, which was then suspended in 5 ml of sterile water. About one plate medium
Dilute appropriately so that 300-400 colonies appear, and add 50 μ
YP with g / ml G-418 and 100 μg / ml blasticidin C
It was spread on a D plate medium and stored at 30 ° C. for several days. Thus, the colonies that appeared were picked up, and the ability to mate with the conjugative-type assay yeast was examined.

【0074】すなわち、得られたコロニーから少量の酵
母を採取し、YPD 培地上で1白金耳のa型テスター株YP
H499(MATa,ura3-52,lys2-801,ade2-101,trp1-Δ62,his
3-Δ200,leu2- Δ1,CUP r ) と混ぜ合わせ30℃で一晩培
養した。培養液の一部を顕鏡し、接合子の存在を観察し
た。さらに、この混合菌体から一部を採取し検定培地(M
gSO4・7H2O(0.2%),(NH4)2SO4(0.2 %),KH2PO4(0.3%),
CaCl2.2H2O(0.0025 %),Yeast Nitrogen Base W/O A.A.
(DIFCO)(0.3 %),カザミノ酸(0.5%),グルコース(4%),
CuSO4(1mM), 寒天(2%))上に塗布した。30℃で1晩培養
し、増殖の認められた場合はα型とした。同様にα型の
テスター株YPH500(MAT α, 接合型以外の遺伝子マーカ
ーは前記YPP499と同じ) を用いて同様の試験を行い、か
かる試験において増殖が認められた場合はa型とした。
That is, a small amount of yeast was collected from the obtained colonies, and 1 platinum loop of a-type tester strain YP was collected on YPD medium.
H499 (MATa, ura3-52, lys2-801, ade2-101, trp1-Δ62, his
3-Δ200, leu2- Δ1, CUP r ) was mixed and cultured at 30 ° C. overnight. A part of the culture solution was observed under a microscope to observe the presence of zygotes. Furthermore, a part of this mixed bacterial cell was collected and assay medium (M
gSO 4 · 7H 2 O (0.2 %), (NH 4) 2 SO 4 (0.2%), KH 2 PO 4 (0.3%),
CaCl 2. 2H 2 O (0.0025% ), Yeast Nitrogen Base W / O AA
(DIFCO) (0.3%), casamino acid (0.5%), glucose (4%),
It was applied on CuSO 4 (1 mM), agar (2%)). It was cultured overnight at 30 ° C., and when growth was observed, it was designated as α type. Similarly, the same test was performed using the α-type tester strain YPH500 (MAT α, the gene markers other than the zygote type are the same as those of YPP499), and when proliferation was observed in such a test, it was designated as a-type.

【0075】結果を、表1に示すが、HO-SC 及びHO
-BR を不活化したビール酵母BFY268からは、a型及びα
型の接合型を有する酵母株が分離された。なお、表1に
おいて、HO遺伝子を不活化しない場合は、顕鏡による
確認を行った。
The results are shown in Table 1. HO-SC and HO
-BR and inactivated brewer's yeast BFY268 include a type and α
A yeast strain having a mating type of type was isolated. In Table 1, when the HO gene was not inactivated, confirmation by a microscope was performed.

【0076】[0076]

【表1】 [Table 1]

【0077】c) 接合可能形質転換体を用いた育種 HO遺伝子を不活化した接合能を有する酵母は、通常のa
型又はα型の接合能を示す。よって、従来から用いられ
てきた接合法をそのまま使用することができる。
C) Breeding using conjugatable transformants Yeast having inactivation of the HO gene and having conjugation ability can be obtained by the usual a
Type or α-type conjugation ability. Therefore, the joining method used conventionally can be used as it is.

【0078】清酒酵母協会7号からの接合型可能株の
分離 清酒酵母協会7号酵母を1平板培地に100-200 コロニー
が現れるように適当に希釈し、YDP 平板培地にプレーテ
ィングした。よく分離したコロニーをつり上げ、YDP 平
板培地上で増殖させてマスタープレートとして保存し
た。マスタープレート上に保存した個々のクローンから
それぞれ少量の菌株をとり、YPD 液体培地を入れた96ウ
エルのマイクロタイタープレートに、1クローン毎に1
ウエルに植菌した。予めYPD 液体培地で培養しておいた
酵母株TESTa株(YPH499 をpHONEOのEcoRI 消化物で形質
転換しG-418 耐性を付与した株) を少量ずつ各ウエルに
加えた。これを30℃で一晩静置培養した後に、遠心分離
(3000rpm,5分)し、分離物を滅菌水で1回洗浄した。
これを滅菌水に再懸濁し、各ウエルの懸濁液を少量ずつ
SD+G-418平板培地(イースト、ナイトロジエン、ベース
(Difco 社製)6.7g/l,グルコース20g/l,アガー20g/l,G-
418 50mg/l) にスポットした。30℃で2〜3日培養し、
増殖の認められたウエルは、添加した2種の酵母が接合
したことから、該当するマスタープレートのクローンの
接合型はa型であると判断した。
Separation of mating type capable strains from Sake Yeast Society No. 7 Yeast Sake Yeast Society No. 7 yeast was appropriately diluted so that 100-200 colonies appeared in one plate medium, and plated on YDP plate medium. Well separated colonies were picked up, grown on YDP plate medium and stored as master plates. A small amount of each strain was taken from each clone stored on the master plate and placed in a 96-well microtiter plate containing YPD liquid medium, one for each clone.
The wells were inoculated. Yeast strain TESTa strain (a strain in which YPH499 was transformed with EcoRI digestion product of pHONEO and imparted with G-418 resistance) preliminarily cultured in YPD liquid medium was added little by little to each well. After statically culturing this at 30 ° C. overnight, it was centrifuged (3000 rpm, 5 minutes), and the separated product was washed once with sterilized water.
Resuspend this in sterile water and add a small amount of the suspension in each well.
SD + G-418 Plate Medium (Yeast, Nitrogen, Base (Difco) 6.7g / l, Glucose 20g / l, Agar 20g / l, G-
418 50 mg / l). Incubate at 30 ℃ for 2-3 days,
In the wells in which the growth was observed, the added two types of yeast were conjugated, so it was judged that the mating type of the clone of the corresponding master plate was a type.

【0079】このようにして、清酒酵母協会7号酵母か
らa型接合型を示すK7-a3 を分離し、後述する実施例に
供した。
In this way, K7-a3 exhibiting a-type mating type was separated from the Sake Yeast Society No. 7 yeast and used for the Examples described later.

【0080】清酒酵母とビール酵母の接合による育種
例 ビール酵母BFY268から分離したa型の接合能を示す酵母
268-a5(MEL+,gal-ho-sc ::G-418 R ,ho-br::BSR ) と、
清酒酵母から分離したα型の接合能を示す酵母K7-α3(m
el-,GAL+,ho) をそれぞれ一白金耳採取し、1mlのYPD
液体培地に植菌した。これを、30℃で一晩静置培養し
た。当該培養液を適当に希釈し、YPGal+G-418 平板培地
(酵母エキス 10g/l, バクトペプトン 20g/l, ガラクト
ース 20g/l,G-418 50mg/l,アガー 20g/l) にプレーティ
ングし、これを30℃で培養した。現れたコロニーを5株
釣り上げ、YPD+BS 100mg/l平板培地で増殖を検定したと
ころ、すべてBS耐性を示した。これらのコロニーはYPGa
l+5-Bromo-4chloro-3-indolyl-α-D-galactopyranoside
( 和光純薬製) 50mg/lの平板培地でコロニーが青色に染
まり、メリビアーゼ陽性であった。
Breeding example by conjugation of sake yeast and brewer's yeast Yeast showing a-type conjugation ability isolated from brewer's yeast BFY268
268-a5 (MEL +, gal-ho-sc :: G-418 R , ho-br :: BS R ),
Yeast K7-α3 (m with α-type conjugation ability isolated from sake yeast
el-, GAL +, ho) for each one platinum loop and 1 ml of YPD
The liquid medium was inoculated. This was statically cultured at 30 ° C. overnight. The culture solution is appropriately diluted and plated on YPGal + G-418 plate medium (yeast extract 10 g / l, bactopeptone 20 g / l, galactose 20 g / l, G-418 50 mg / l, agar 20 g / l). This was cultured at 30 ° C. Five colonies that appeared were picked up and assayed for growth on a YPD + BS 100 mg / l plate medium, and all showed BS resistance. These colonies are YPGa
l + 5-Bromo-4chloro-3-indolyl-α-D-galactopyranoside
(Wako Pure Chemical Industries, Ltd.) Colonies were stained blue with a 50 mg / l plate medium, and were positive for melibiase.

【0081】すなわち、これらのコロニーは268-a5とK7
-α3 の接合株(MEL+,GAL+,G-418 R,BS R ) の性質を示
し、ビール酵母と清酒酵母の交配株であることを示し
た。
That is, these colonies were 268-a5 and K7.
The characteristics of -α3 conjugating strain (MEL +, GAL +, G-418 R , BS R ) were shown, and it was shown to be a hybrid strain of brewer's yeast and sake yeast.

【0082】〔実施例3〕HO-UV 遺伝子のクローニン
グ a)サッカロマイセス ウバラム(Saccharomyces uvar
um)からの分子量限定ライブラリーの作製
[Example 3] Cloning of HO-UV gene a) Saccharomyces uvarum
of molecular weight-limited library from um)

【0083】 サッカロマイセス ウバラムからのD
NA鎖の抽出 5mlのYPD培地でサッカロマイセス ウバラム(Sacc
haromyces uvarum IFO0615)を1〜2日間、30℃で飽和
に達するまで培養し、遠心分離にて集菌後、滅菌水で洗
浄した。菌体を0.5 mlのソルビトール溶液(0.9M ソル
ビトール、0.1M EDTA,Tris緩衝液pH8.0) に懸
濁し、50μLのZymolyase 100T, 0.3mg/mL)及び1μLの
β−メルカプトエタノールを加え、37℃で1時間保温す
る。遠心分離によりプロトプラストを集め、0.5mL のTr
is・EDTA溶液(50mM Tris pH8.0, 20mM EDTA)
に懸濁する。50μL の10%SDS溶液を加え65℃で20分
保温する。5Mの酢酸カリウム200μlを加え、氷中に30
分以上放置する。12,000rpm、5分間遠心し、上清を別
の遠心管に回収する。エタノールを加えDNAを沈殿と
して回収し、別の遠心管に移し300μLのTE緩衝液に溶
解する。50μLのRNaseA溶液(1mg/mL)を加え、
37℃に1時間保温した後、イソプロピルアルコールを加
えて攪拌し、生じたDNAの沈殿を回収する。この方法
で約20mLの酵母培養液を処理し、DNA鎖を抽出した。
D from Saccharomyces ovarum
Extraction of NA chain Saccharomyces ovarum (Sacc) was added to 5 ml of YPD medium.
haromyces uvarum IFO0615) was cultured at 30 ° C. for 1 to 2 days until saturation was reached, and the cells were collected by centrifugation and washed with sterile water. The cells were suspended in 0.5 ml of sorbitol solution (0.9 M sorbitol, 0.1 M EDTA, Tris buffer pH 8.0), 50 μL of Zymolyase 100T, 0.3 mg / mL) and 1 μL of β-mercaptoethanol were added, and the temperature was 37 ° C. Keep it warm for 1 hour. Collect protoplasts by centrifugation and add 0.5 mL of Tr.
is ・ EDTA solution (50mM Tris pH8.0, 20mM EDTA)
Suspended in. Add 50 μL of 10% SDS solution and incubate at 65 ° C for 20 minutes. Add 200 μl of 5M potassium acetate and add 30 μl on ice.
Leave for more than a minute. Centrifuge at 12,000 rpm for 5 minutes, and collect the supernatant in another centrifuge tube. Ethanol is added to collect DNA as a precipitate, which is transferred to another centrifuge tube and dissolved in 300 μL of TE buffer. Add 50 μL of RNase A solution (1 mg / mL),
After incubating at 37 ° C for 1 hour, isopropyl alcohol is added and the mixture is stirred to collect the generated DNA precipitate. About 20 mL of the yeast culture solution was treated by this method to extract the DNA chain.

【0084】 DNA鎖の制限酵素による切断 得られた染色体DNAの約10μgをエッペンドルフチュ
ーブに取り、M buffer(トリス緩衝液pH7.5, 10mM,
MgCl2, 10mM, Dithiothreitol(DTT) 1mM,NaCl 50m
M)に溶解し、制限酵素HindIII(ベーリンガー社製)
100ユニットを添加し、37℃で4〜5時間保温した。
Cleavage of DNA Strand by Restriction Enzyme About 10 μg of the obtained chromosomal DNA was placed in an Eppendorf tube, and M buffer (Tris buffer pH 7.5, 10 mM,
MgCl 2 , 10 mM, Dithiothreitol (DTT) 1 mM, NaCl 50 m
M), and the restriction enzyme HindIII (Boehringer)
100 units were added, and the mixture was kept at 37 ° C for 4 to 5 hours.

【0085】 サザン解析による分取分子量の決定と
挿入DNAの調製 完全に制限酵素HindIIIで切断された染色体DNAの1
部を1%アガロースゲル(トリス酢酸緩衝液、EDT
A)にアプライし、100Vで2時間泳動した。アガロー
スゲルを臭化エチジウム溶液に浸し、DNA分子量マー
カーとDNAを染色し、泳動状態を写真等により記録す
る。このアガロースゲルを用いてサザン解析(Molecula
r Cloning, Manniatis et al., Cold Spring Harbor)に
供する。プローブは実施例1のに記載の方法によって
得られた、標識したサッカロマイセス セレビシェ由来
のHO遺伝子断片を使用した。得られたオートラジオグ
ラフから4〜5Kb付近にバンドが観察された。前項で
述べた完全にHindIIIで切断された染色体DNA20μg
を1%低融点アガロースゲルにて電気泳動し、分子量マ
ーカーを指標として約4Kbから約5Kbの分子量に相
当するゲル部分を回収した。低融点アガロースゲルから
DNA断片を、加熱融解とフェノール処理に続くエタノ
ール沈殿によって得た。これらのDNAの一部を再びサ
ザン解析に供し、陽性シグナルを与えることを確認し、
以下の実験に供した。
Determination of preparative molecular weight by Southern analysis and preparation of insert DNA 1 of chromosomal DNA completely digested with restriction enzyme HindIII
1% agarose gel (Tris acetate buffer, EDT
It was applied to A) and electrophoresed at 100 V for 2 hours. The agarose gel is immersed in an ethidium bromide solution, the DNA molecular weight marker and the DNA are stained, and the migration state is recorded by a photograph or the like. Southern analysis using this agarose gel (Molecula
r Cloning, Manniatis et al., Cold Spring Harbor). As the probe, the labeled HO gene fragment derived from Saccharomyces cerevisiae obtained by the method described in Example 1 was used. A band was observed in the vicinity of 4 to 5 Kb from the obtained autoradiograph. 20 μg of chromosomal DNA completely cleaved with HindIII as described in the previous section
Was electrophoresed on a 1% low melting point agarose gel, and a gel portion corresponding to a molecular weight of about 4 Kb to about 5 Kb was recovered using the molecular weight marker as an index. DNA fragments were obtained from a low melting agarose gel by heat melting and phenol treatment followed by ethanol precipitation. A part of these DNAs was again subjected to Southern analysis, and it was confirmed that it gave a positive signal.
The following experiments were carried out.

【0086】 ベクターへの連結 pUC118 をHindIIIで切断し、Bacterial Alkaline P
hosphatase(BAP) 処理した、宝酒造より市販されている
ベクターを使用してライブラリーを作製した。すなわ
ち、このベクターDNA(50ng)と、上述の4〜5Kb
の染色体DNA断片(50ng)とをLigation Kit(宝酒
造)にて連結反応を行った。このLigation Mixの一部を
用い、大腸菌DH5株(東洋紡)を形質転換した。方法
はそれぞれ当該Kitに添付の方法に従った。
Ligation into vector pUC118 was cut with HindIII to give Bacterial Alkaline P
A library was prepared using hosphatase (BAP) treated vector commercially available from Takara Shuzo. That is, this vector DNA (50 ng) and the above-mentioned 4-5 Kb
Ligation Kit (Takara Shuzo) was ligated to the chromosomal DNA fragment (50 ng). Escherichia coli DH5 strain (Toyobo) was transformed with a part of this Ligation Mix. Each method followed the method attached to the said Kit.

【0087】 コロニーハイブリダイゼーションによ
るクローニング 大型シャーレー(90mm)に作製したアンピシリン50μg/
ml含有LB平板培地(バクトトリプトン10g/l,酵母エキ
ス5g/l,塩化ナトリウム5g/l,寒天15g/l)1枚あたりに
約1000個のコロニーを形成させた。この平板培地にニト
ロセルロースフィルターを乗せ、現れた形質転換体をレ
プリカ法にてニトロセルロースフィルターに移した。フ
ィルターは、種々発売されているコロニーハイブリダイ
ゼーションに使用できるものであればいずれのフィルタ
ーでも使用可能である。今回はアマシャム社より市販さ
れているハイボンドN+を使用した。コロニーハイブリ
ダイゼーションの方法は、フィルターに添付された手法
に従い、ハイブリダイゼーションは60℃で行った。フィ
ルターの洗浄もフィルターに添付された手法に従った
が、洗浄工程を1×SSPE,0.1%SDSのステップ
で止め、洗浄温度は65℃で行った。オートラジオグラフ
上のポジティブなシグナルを与える位置にあるマスター
プレート上のコロニーを分離し、当該クローンに含有さ
れるプラスミドをpHO-UV1と命名し、以降の実験に
供した。
Cloning by colony hybridization Ampicillin 50 μg / prepared in a large Petri dish (90 mm)
About 1000 colonies were formed per LB plate medium containing 10 ml of bactotryptone (5 g / l of yeast extract, 5 g / l of sodium chloride, 15 g / l of agar) containing ml. A nitrocellulose filter was placed on this plate medium, and the transformant that appeared was transferred to the nitrocellulose filter by the replica method. As the filter, any filter can be used as long as it can be used for various colony hybridizations on the market. This time, Hibond N +, which is commercially available from Amersham, was used. The colony hybridization was carried out at 60 ° C. according to the method attached to the filter. The washing of the filter also followed the procedure attached to the filter, but the washing process was stopped at the step of 1 × SSPE, 0.1% SDS, and the washing temperature was 65 ° C. A colony on the master plate at a position giving a positive signal on the autoradiograph was separated, and the plasmid contained in the clone was named pHO-UV1 and used for the subsequent experiments.

【0088】b)クローニングされたHO-UV 遺伝子の
塩基配列の決定 pUC118 のHindIII部位にクローニングされた約4.5k
b の挿入断片を低融点アガロースから常法により回収
し、pUC118 のHindIII部位に逆方向に挿入し、pH
O-UV2を作製した。先のpHO-UV1とpHO-UV2を
用いて塩基配列の決定を行った。塩基配列決定は、アプ
ライドバイオシステム社の373A DNAシーケンサーを
使用し、反応はダイ プライマー サイクル シーケン
シング キット及びダイ デオキシ ターミナーター
サイクル シーケンシング キット(アプライド バイ
オ システム社製)を使用した。手順は、付属のプロト
コールに従った。
B) Determination of the nucleotide sequence of the cloned HO-UV gene About 4.5 k cloned into the HindIII site of pUC118
The insert fragment of b was recovered from the low melting point agarose by a conventional method, and was inserted in the HindIII site of pUC118 in the reverse direction, and
O-UV2 was prepared. The base sequence was determined using the above pHO-UV1 and pHO-UV2. Nucleotide sequence determination was performed using Applied Biosystems' 373A DNA sequencer, and the reaction was performed using the Di Primer Cycle Sequencing Kit and Di Deoxy Terminator.
A cycle sequencing kit (manufactured by Applied Biosystems) was used. The procedure followed the attached protocol.

【0089】その結果、本発明HO遺伝子であるHO-U
V 遺伝子は、配列番号5に示す塩基配列を有することが
明らかとなった。また、当該塩基配列から推定される本
発明ホモタリズム遺伝子エンドヌクレアーゼをコードす
る構造遺伝子であると推定される塩基配列部分は、配列
番号5に示す塩基配列のうち、2057番目から3814番目ま
での1758個の配列であった(配列番号6)。かかる塩基
配列から推定される本発明ホモタリズム遺伝子エンドヌ
クレアーゼのアミノ酸配列は配列番号4に示すとおりで
ある。なお、上記の工程に供したpHO-UV1を大腸菌
DH5αに組み込んだ。かかる形質転換体は、EKB1
03と称し、1994年6月15日に、通商産業省工業技術院
生命工学工業技術研究所に、FERM BP−4697
として寄託されている。
As a result, the HO gene of the present invention, HO-U
It was revealed that the V gene has the base sequence shown in SEQ ID NO: 5. In addition, the base sequence portion presumed to be a structural gene encoding the homothalism gene endonuclease of the present invention deduced from the base sequence is 1758 from the 2057th position to the 3814th position in the base sequence shown in SEQ ID NO: 5. (SEQ ID NO: 6). The amino acid sequence of the homotalism gene endonuclease of the present invention deduced from such a nucleotide sequence is as shown in SEQ ID NO: 4. The pHO-UV1 used in the above steps was incorporated into Escherichia coli DH5α. Such a transformant is EKB1
FERM BP-4697 on June 15, 1994, at the Institute of Biotechnology, Institute of Biotechnology, Ministry of International Trade and Industry, on June 15, 1994.
Has been deposited as.

【0090】〔実施例4〕HO-UV 遺伝子破壊ベクター
の構築 遺伝子破壊ベクターの構築図を図5に示す。すなわち、
pHO-UV1をBgl IIで切断し、Klenow酵素で5’の突
出部を埋め、Sal1リンカーを連結し、再環化し、pH
O-UV-12と命名した。
Example 4 Construction of HO-UV Gene Disruption Vector A construction diagram of the gene disruption vector is shown in FIG. That is,
The pHO-UV1 was cleaved with BglII, the 5 ′ overhang was filled in with Klenow enzyme, the Sal1 linker was ligated, and recyclized,
It was named O-UV-12.

【0091】一方、マーカー遺伝子は、中沢ら(J.Ferm
ent.Bioeng.,Vol.76,No.1,p60-63,1993)により報告され
たセルレニン耐性を与えるPDR4遺伝子を使用した。
PDR4遺伝子の塩基配列はHussain ら(Gene,Vol.101,
p149-152,1991)によって決定され既に公知である。本遺
伝子の取得は、中沢らによってセルレニン耐性を発現し
うると報告されている約2kbのKpnI断片をPCR法で
増幅し取得した。得られたPCR断片は、pUC119 の
KpnI部位に挿入し、pYT63と命名した。pUC18の
EcoRI部位とHindIII部位の間に40bpの合成オリゴヌ
クレオチドを連結したpKN1を作製した。pKN1の
KpnI部位に、PDR4を含むpYT63由来の約2Kb
のKpnI断片を挿入し、pKN2と命名した。
On the other hand, the marker gene is Nakazawa et al. (J. Ferm
ent. Bioeng., Vol. 76, No. 1, p60-63, 1993), which used the PDR4 gene conferring cerulenin resistance.
The base sequence of the PDR4 gene is Hussain et al. (Gene, Vol. 101,
p149-152, 1991) and is already known. This gene was obtained by amplifying a KpnI fragment of about 2 kb, which was reported to be able to express cerulenin resistance by Nakazawa et al., By the PCR method. The resulting PCR fragment was inserted into the KpnI site of pUC119 and named pYT63. A 40 bp synthetic oligonucleotide was ligated between the EcoRI and HindIII sites of pUC18 to prepare pKN1. About 2 Kb from pYT63 containing PDR4 at the KpnI site of pKN1
KpnI fragment was inserted and named pKN2.

【0092】得られたプラスミドpKN2のXhoI断片
を、pHO-UV-12のSalI部位に連結し、HO-UV 遺伝
子をマーカー遺伝子で不活化したプラスミドpHO-UV-
31を得た。
The XhoI fragment of the obtained plasmid pKN2 was ligated to the SalI site of pHO-UV-12, and the HO-UV gene was inactivated with a marker gene.
Got 31

【0093】〔実施例5〕ビール酵母からの接合能を保
持した形質転換体の分離 プラスミドpHO-UV-31の10μgをPstIとStuIで切
断し、反応溶液からDNAをエタノール沈殿にて回収
し、沈殿を滅菌水10μgに溶解した。このDNA溶液5
μl を以下の形質転換に使用した。pHOBRGPDBSRの10
μgをSalI分解し、反応溶液からDNAをエタノール
沈殿にて回収し、沈殿を滅菌水10μgに溶解した。この
DNA溶液5μlを以下の形質転換に使用した。酵母 Sa
ccharomyces bayanus(IFO 1127)の形質転換は、エレク
トロポレーション法にて行った。方法は、ベッカー等の
方法(Methods in Enzymology, Vol.194,p182,Academic
Press Inc.)に従ったが、電気パルス後にソルビトール
溶液で回収した酵母懸濁液1mlに0.4mlのYPD液体培
地を添加し、28℃にて4時間振盪培養した。セルレニン
(シグマ社製)を最終濃度5μg/mlと、ブラストサイジ
ンCを最終濃度100μg/ml含有するYPD平板培地に適
当量プレーティングし、28℃にてコロニーが現れるまで
数日間保温した。現れたコロニーを画線培養し、単一ク
ローンを多数分離した。このクローンをYPD平板培地
上で30℃にて培養し、得られた菌体を胞子形成培地(0.
5%酢酸カリウム、2%寒天)に塗布し、20℃で保温し
た。胞子形成を確認し、適当量の酵母細胞を3000rpm、
5分間の遠心分離で集める。5mlの滅菌水に懸濁し、1
mg/mlのザイモリアーゼ水溶液を0.5mlとβ−メルカプト
エタノールを10μl加え、30℃に一晩振盪する。界面活
性剤NP−40の1.5%(W/V)溶液5mlを添加し、15分間氷
冷した後、超音波発生機(トミー精工製、パワーソニッ
ク UR−20P型)にて30秒出力50−75%で胞子を分散
させる。胞子分散液を遠心分離して胞子を沈殿に集め、
5mlの滅菌水に懸濁した。一枚の平板培地に約300〜約4
00コロニー出現するように適当に希釈し、5μg/mlのセ
ルレニンと100μg/mlのブラストサイジンCを含むYP
D平板培地に広げ30℃にて数日保温する。現れたコロニ
ーを釣り上げ、接合型検定酵母との接合能を調べた。
Example 5 Separation of Transformant Retaining Mating Ability from Brewer's Yeast 10 μg of plasmid pHO-UV-31 was cleaved with PstI and StuI, and DNA was recovered from the reaction solution by ethanol precipitation. The precipitate was dissolved in 10 μg of sterilized water. This DNA solution 5
μl was used for the following transformations. pHOBRG PDBSR 10
μg was digested with SalI, DNA was recovered from the reaction solution by ethanol precipitation, and the precipitate was dissolved in 10 μg of sterilized water. 5 μl of this DNA solution was used for the following transformation. Yeast Sa
Transformation of ccharomyces bayanus (IFO 1127) was performed by the electroporation method. The method is Becker's method (Methods in Enzymology, Vol.194, p182, Academic
Press Inc.), but 0.4 ml of YPD liquid medium was added to 1 ml of the yeast suspension recovered with the sorbitol solution after the electric pulse, and the mixture was cultured at 28 ° C. for 4 hours with shaking. An appropriate amount of cerulenin (manufactured by Sigma) was plated on a YPD plate medium containing a final concentration of 5 μg / ml and blasticidin C of a final concentration of 100 μg / ml, and incubated at 28 ° C. for several days until colonies appeared. The colonies that appeared were streaked and a large number of single clones were isolated. This clone was cultured on a YPD plate medium at 30 ° C., and the obtained cells were sporulated medium (0.
It was applied to 5% potassium acetate, 2% agar) and kept at 20 ° C. Confirm sporulation, put an appropriate amount of yeast cells at 3000 rpm,
Collect by centrifugation for 5 minutes. Suspend in 5 ml of sterile water, 1
Add 0.5 ml of mg / ml zymolyase aqueous solution and 10 μl of β-mercaptoethanol, and shake at 30 ° C. overnight. After adding 5 ml of 1.5% (W / V) solution of surfactant NP-40 and cooling with ice for 15 minutes, 30 seconds output with an ultrasonic generator (Tomy Seiko, Powersonic UR-20P type) 50- Disperses spores at 75%. Centrifuge the spore dispersion and collect the spores in the precipitate,
Suspended in 5 ml of sterile water. About 300 to about 4 per plate
YP containing 5μg / ml cerulenin and 100μg / ml blasticidin C diluted appropriately so that 00 colonies appear
Spread on D plate medium and incubate at 30 ℃ for several days. The colonies that appeared were picked up and examined for their mating ability with the mating-type assay yeast.

【0094】すなわち、得られたコロニーから少量の酵
母を採取し、YPD培地上で1白金耳のa型テスターY
PH499(MATa,ura3-52, lys2-801, ade2-101, tr
p1-Δ62, his3-Δ200, leu2-Δ1,CUPr)と混ぜ合わ
せ、30℃で一晩培養した。この混合菌体から一部を採取
し検定培地上〔MgSO4.7H2O, 0.2%.(NH4)2SO4,0.2%. KH2
PO4, 0.3%. CaCl2.2H2O, 0.0025%. Yeast Nitrogen Bas
e W/O A.A.(DIFCO),0.3%. Camino acid,0.5%. Glucose,
4%. CuSO4,1mM. Agar, 2%〕に塗布した。30℃で一晩培
養し、増殖の認められた場合はα型とした。同様にα型
のテスター株YPH500(MATα,接合型以外の遺伝
子マーカーはYPH499と同じ)を用いて同様の試験を
行い、増殖が認められた場合はa型とした。
That is, a small amount of yeast was collected from the obtained colonies, and 1 platinum loop of a-type tester Y was collected on YPD medium.
PH499 (MATa, ura3-52, lys2-801, ade2-101, tr
p1-Δ62, his3-Δ200, leu2-Δ1, CUP r ), and the mixture was incubated at 30 ° C. overnight. The mixed portion was collected from the cells on the assay medium [MgSO 4 .7H 2 O, 0.2% . (NH 4) 2 SO 4, 0.2%. KH 2
PO 4 , 0.3%. CaCl 2 .2H 2 O, 0.0025%. Yeast Nitrogen Bas
e W / O AA (DIFCO), 0.3%. Camino acid, 0.5%. Glucose,
4%. CuSO 4 , 1 mM. Agar, 2%]. It was cultured overnight at 30 ° C., and when growth was observed, it was designated as α type. Similarly, the same test was performed using α-type tester strain YPH500 (MATα, the gene markers other than the zygote type are the same as YPH499), and when proliferation was observed, it was set to a-type.

【0095】さらに、接合型既知の実験室酵母とYPD
E平板培地上で混合培養し、30℃で一晩培養し、翌日顕
鏡し接合子の有無を調べた。これら2つの確認方法によ
ってHO-UV 遺伝子とHO-BR 遺伝子を不活化したSacc
haromyces byanusからはa型及びα型の接合型を有する
酵母株が分離された。
Furthermore, laboratory yeasts of known mating type and YPD
The cells were mixed and cultured on an E plate medium, cultured overnight at 30 ° C., and examined the presence or absence of zygotes by microscopic examination on the next day. Sacc in which the HO-UV and HO-BR genes were inactivated by these two confirmation methods
A yeast strain having a-type and α-type mating type was isolated from haromyces byanus.

【0096】〔実施例6〕HO遺伝子群のサザン解析 HO遺伝子の各種醸造酵母における分布を調べるため、
サザン解析を実施した。供試酵母は、X−2180(実験室
酵母)、TFY069(上面発酵酵母)、KBY003(下面
発酵酵母)、KBY011(下面発酵酵母)、KBY268
(下面発酵酵母)、Saccharomyces byanus(IFO 112
7),Saccharomyces uvarum(IFO 0615) , Pilsen No.1
(IFO 2031)を用いた。
Example 6 Southern Analysis of HO Gene Group In order to investigate the distribution of the HO gene in various brewer's yeasts,
Southern analysis was performed. The test yeasts are X-2180 (laboratory yeast), TFY069 (top-fermenting yeast), KBY003 (bottom-fermenting yeast), KBY011 (bottom-fermenting yeast), KBY268.
(Bottom fermenting yeast), Saccharomyces byanus (IFO 112
7) , Saccharomyces uvarum (IFO 0615), Pilsen No.1
(IFO 2031) was used.

【0097】上記の酵母の一白金耳を5mLのYPD培地
に埴菌し30℃で1〜2日振盪培養し、実施例1のa)
に記載の方法と同様にして染色体DNAを抽出した。5
μgの染色体DNAをEcoRIで完全に切断し、0.8%
のアガロースゲル電気泳動に供した。泳動後、DNAを
変性・中和し、ゲルからメンブランに移しサザン解析
(Molecular Cloning, Manniatis et.al. Cold Spring
Harbor)を行った。プローブは実施例1のa)に方法
を記載した、標識したサッカロマイセス セレビシェ由
来のHO遺伝子断片を使用した。
One platinum loop of the above yeast was cultivated in 5 mL of YPD medium and shake-cultured at 30 ° C. for 1 to 2 days to give a) of Example 1.
Chromosomal DNA was extracted by the same method as described in 1. 5
Completely cut μg of chromosomal DNA with EcoRI to obtain 0.8%
Was subjected to agarose gel electrophoresis. After electrophoresis, the DNA is denatured and neutralized, transferred from the gel to a membrane, and subjected to Southern analysis (Molecular Cloning, Manniatis et.al. Cold Spring.
Harbor). As the probe, a labeled HO gene fragment derived from Saccharomyces cerevisiae whose method was described in Example 1 a) was used.

【0098】結果を図6に示す。上面発酵酵母(TFY
069;レーン2)は、実験室酵母(X−2180;レーン
1)と同じ分子量の位置(約7kbp)にHO遺伝子の相同
遺伝子(HO-SC 遺伝子)を持つが、下面発酵酵母〔K
BY003(レーン3)、KBY011(レーン4)、KBY
268(レーン5)〕はHO-SC 遺伝子とともにもう一種
類分子量の異なる相同遺伝子(HO-BR 遺伝子;約4kb
p )をもっていることが明らかとなった。今回調査した
全ての下面発酵酵母がHO-SC 遺伝子とHO-BR遺伝子
を持っていた。Saccharomyces byanus(レーン6),Sa
ccharomyces uvarum(レーン7), Pilsen No.1(レー
ン8)はさらに分子量の異なるHO相同遺伝子(HO-U
V 遺伝子;約2.5kbpと1.5kbp)を保持していた。
The results are shown in FIG. Top fermenting yeast (TFY
069; lane 2) has a homologous gene (HO-SC gene) of the HO gene at the same molecular weight position (about 7 kbp) as the laboratory yeast (X-2180; lane 1), but the bottom fermentation yeast [K
BY003 (lane 3), KBY011 (lane 4), KBY
268 (lane 5)] is another type of homologous gene (HO-BR gene; about 4 kb with a different molecular weight) together with the HO-SC gene.
It became clear that they had p). All bottom-fermenting yeasts investigated this time had the HO-SC and HO-BR genes. Saccharomyces byanus (lane 6), Sa
ccharomyces uvarum (lane 7) and Pilsen No. 1 (lane 8) are HO homologous genes (HO-U) with different molecular weights.
V gene; about 2.5 kbp and 1.5 kbp) were retained.

【0099】[0099]

【発明の効果】本発明により、既に知られているHO-S
C 遺伝子以外のHO遺伝子の所在とその塩基配列を明ら
かにして、上記HO-SC 遺伝子との組合せにより、また
当該HO-SC 遺伝子以外のHO遺伝子を単独で用いるこ
とにより、酵母のホモタリズムへの移行を十分に阻害す
べき手段が提供される。
According to the present invention, the already known HO-S
The location of the HO gene other than the C gene and its nucleotide sequence were clarified, and the transition to yeast homothalism was achieved by combining the HO gene with the HO-SC gene and by using the HO gene other than the HO-SC gene alone. The means for sufficiently inhibiting the above are provided.

【0100】[0100]

【配列表】[Sequence list]

配列番号:1 配列の長さ:586 配列の型:アミノ酸 トポロジー:不明 配列の種類:ペプチド 配列の特徴 起源 生物名:サッカロマイセス.カールスベルゲンシス(Sac
charomyces carlsbergensis) 株名:KBY003 配列:
SEQ ID NO: 1 Sequence length: 586 Sequence type: Amino acid Topology: Unknown Sequence type: Peptide Sequence characteristics Origin Biological name: Saccharomyces. Karlsbergensis (Sac
charomyces carlsbergensis) Strain name: KBY003 Sequence:

【0101】 [0101]

【0102】 [0102]

【0103】配列番号:2 配列の長さ:3899 配列の型:核酸 鎖の数:二本鎖 トポロジー:不明 配列の種類:Genomic DNA 配列の特徴 起源 生物名:サッカロマイセス.カールスベルゲンシス(Sac
charomyces carlsbergensis) 株名:KBY003 配列:
SEQ ID NO: 2 Sequence length: 3899 Sequence type: Nucleic acid Number of strands: Double strand Topology: Unknown Sequence type: Genomic DNA Sequence features Origin Biological name: Saccharomyces. Karlsbergensis (Sac
charomyces carlsbergensis) Strain name: KBY003 Sequence:

【0104】 [0104]

【0105】 [0105]

【0106】 [0106]

【0107】配列番号:3 配列の長さ:1758 配列の型:核酸 鎖の数:二本鎖 トポロジー:不明 配列の種類:Genomic DNA 配列の特徴 起源 生物名:サッカロマイセス.カールスベルゲンシス(Sac
charomyces carlsbergensis) 株名:KBY003 配列:
SEQ ID NO: 3 Sequence length: 1758 Sequence type: Nucleic acid Number of strands: Double strand Topology: Unknown Sequence type: Genomic DNA Sequence features Origin Biological name: Saccharomyces. Karlsbergensis (Sac
charomyces carlsbergensis) Strain name: KBY003 Sequence:

【0108】 [0108]

【0109】 [0109]

【0110】配列番号:4 配列の長さ:586 配列の型:アミノ酸 トポロジー:不明 配列の種類:ペプチド 配列の特徴 起源: 生物名:サッカロマイセス ウバラム(Saccharomyces
uvarum) 株名:EKB103 配列: Met Leu Ser Glu Asn Thr Thr Ile Leu Met Ala Asn Gly Lys Ile Glu 1 5 10 15 Asp Ile Ala Asn Val Thr Ala Asn Ser Tyr Val Met Cys Glu Asp Gly 20 25 30 Ser Ala Ala Arg Val Ile Ser Val Thr Gln Gly Cys Gln Lys Ile Tyr 35 40 45 Asn Ile Gln Gln Lys Thr Lys His Arg Ala Phe Glu Gly Glu Pro Gly 50 55 60 Arg Leu Asp Pro Arg Arg Arg Thr Ile Tyr Gln Arg Leu Ala Leu Gln 65 70 75 80 Cys Thr Ala Gly His Lys Leu Ser Val Arg Val Pro Thr Lys Pro Leu 85 90 95 Leu Glu Lys Ser Gly Arg Ser Ala Thr Lys Tyr Lys Val Arg Trp Arg 100 105 110 Asn Leu Gln Gln Cys Gln Thr Leu Asp Gly Arg Ile Ile Thr Ile Pro 115 120 125 Lys Asn His His Lys Thr Phe Pro Met Thr Val Glu Gly Glu Phe Ala 130 135 140 Ala Lys Arg Phe Ile Glu Glu Met Glu Arg Leu Lys Gly Glu Tyr Phe 145 150 155 160 Asn Phe Asp Ile Glu Val Arg Asp Leu Asp Tyr Leu Asp Ala Gln Leu 165 170 175 Arg Ile Ser Ser Cys Ile Arg Phe Ser Pro Val Ile Thr Gly Asn Gly 180 185 190 Val Leu Ser Lys Phe Leu Thr Gly Arg Asn Asp Leu Val Thr Pro Ala 195 200 205 Val Lys Ser Met Ala Trp Met Leu Gly Leu Trp Leu Gly Asp Gly Thr 210 215 220 Thr Lys Glu Pro Glu Ile Ser Val Asp Ser Leu Asp Pro Lys Leu Met 225 230 235 240 Glu Ser Leu Arg Lys Gln Ala Lys Ile Trp Gly Leu Tyr Leu Thr Val 245 250 255 Cys Asp Asp His Val Pro Leu Arg Ala Lys His Val Arg Leu His Tyr 260 265 270 Gly Asp Gly Pro Asp Glu Asn Arg Lys Thr Arg Asn Leu Arg Lys Asn 275 280 285 Asn Pro Phe Trp Asn Ala Val Thr Lys Leu Lys Phe Lys Arg Glu Leu 290 295 300 Asp Gly Glu Lys Gln Ile Pro Glu Phe Met Tyr Ser Glu His Val Glu 305 310 315 320 Val Arg Glu Ala Phe Leu Ala Gly Leu Ile Asp Ser Asp Gly Tyr Val 325 330 335 Val Lys Lys Gly Glu Gly Pro Glu Ser Tyr Lys Ile Ala Ile Gln Thr 340 345 350 Val Tyr Ser Ser Ile Met Asp Gly Val Ile His Ile Ser Arg Ser Leu 355 360 365 Gly Met Ser Ala Thr Val Thr Thr Arg Ser Ala Arg Glu Glu Ile Ile 370 375 380 Glu Gly Arg Lys Val Gln Cys Gln Phe Thr Tyr Asp Cys Asn Val Ala 385 390 395 400 Gly Gly Thr Thr Leu Gln Asn Val Leu Ser Tyr Cys Arg Ser Gly His 405 410 415 Lys Thr Arg Glu Ile Pro Pro Ile Val Lys Arg Glu Pro Val Tyr Phe 420 425 430 Gly Phe Thr Asp Asp Phe Gln Gly Glu Ser Thr Val Tyr Gly Leu His 435 440 445 Ile Glu Gly His Lys Asn Phe Leu Leu Gly Asn Lys Ile Glu Val Lys 450 455 460 Ser Cys Gly Gly Tyr Cys Glu Gly Glu Gln Pro Lys Leu Ser Gln Arg 465 470 475 480 Lys Asn Leu Lys His Cys Ile Ala Cys Pro Arg Lys Gly Ile Lys Tyr 485 490 495 Phe Tyr Lys Asp Trp Ser Gly Lys Asn Arg Val Cys Ala Arg Cys Tyr 500 505 510 Gly Arg Tyr Lys Phe Ser Gly His His Cys Ile Asn Cys Lys Tyr Val 515 520 525 Pro Glu Ala Arg Glu Val Lys Lys Ala Lys Asp Lys Gly Glu Lys Leu 530 535 540 Gly Ile Thr Pro Glu Gly Leu Pro Phe Lys Gly Pro Glu Cys Leu Arg 545 550 555 560 Cys Gly Gly Ile Leu Gln Phe Asp Ala Val Arg Gly Pro Asn Lys Ser 565 570 575 Cys Ala Thr Asn Ile Gly Val Arg Ile Cys 586 580 585
SEQ ID NO: 4 Sequence length: 586 Sequence type: Amino acid Topology: Unknown Sequence type: Peptide Sequence characteristics Origin: Organism name: Saccharomyces
uvarum) Strain name: EKB103 Sequence: Met Leu Ser Glu Asn Thr Thr Ile Leu Met Ala Asn Gly Lys Ile Glu 1 5 10 15 Asp Ile Ala Asn Val Thr Ala Asn Ser Tyr Val Met Cys Glu Asp Gly 20 25 30 Ser Ala Ala Arg Val Ile Ser Val Thr Gln Gly Cys Gln Lys Ile Tyr 35 40 45 Asn Ile Gln Gln Lys Thr Lys His Arg Ala Phe Glu Gly Glu Pro Gly 50 55 60 Arg Leu Asp Pro Arg Arg Arg Thr Ile Tyr Gln Arg Leu Ala Leu Gln 65 70 75 80 Cys Thr Ala Gly His Lys Leu Ser Val Arg Val Pro Thr Lys Pro Leu 85 90 95 Leu Glu Lys Ser Gly Arg Ser Ala Thr Lys Tyr Lys Val Arg Trp Arg 100 105 110 Asn Leu Gln Gln Cys Gln Thr Leu Asp Gly Arg Ile Ile Thr Ile Pro 115 120 125 Lys Asn His His Lys Thr Phe Pro Met Thr Val Glu Gly Glu Phe Ala 130 135 140 Ala Lys Arg Phe Ile Glu Glu Met Glu Arg Leu Lys Gly Glu Tyr Phe 145 150 155 160 Asn Phe Asp Ile Glu Val Arg Asp Leu Asp Tyr Leu Asp Ala Gln Leu 165 170 175 Arg Ile Ser Ser Cys Ile Arg Phe Ser Pro Val Ile Thr Gly Asn Gly 180 185 190 Val Leu Ser Lys Phe Leu Thr Gly Arg Asn Asp Leu Val Thr Pro Ala 195 200 205 Val Lys Ser Met Ala Trp Met Leu Gly Leu Trp Leu Gly Asp Gly Thr 210 215 220 Thr Lys Glu Pro Glu Ile Ser Val Asp Ser Leu Asp Pro Lys Leu Met 225 230 235 240 Glu Ser Leu Arg Lys Gln Ala Lys Ile Trp Gly Leu Tyr Leu Thr Val 245 250 255 Cys Asp Asp His Val Pro Leu Arg Ala Lys His Val Arg Leu His Tyr 260 265 270 Gly Asp Gly Pro Asp Glu Asn Arg Lys Thr Arg Asn Leu Arg Lys Asn 275 280 285 Asn Pro Phe Trp Asn Ala Val Thr Lys Leu Lys Phe Lys Arg Glu Leu 290 295 300 Asp Gly Glu Lys Gln Ile Pro Glu Phe Met Tyr Ser Glu His Val Glu 305 310 315 320 Val Arg Glu Ala Phe Leu Ala Gly Leu Ile Asp Ser Asp Gly Tyr Val 325 330 335 Val Lys Lys Gly Glu Gly Pro Glu Ser Tyr Lys Ile Ala Ile Gln Thr 340 345 350 Val Tyr Ser Ser Ile Met Asp Gly Val Ile His Ile Ser Arg Ser Leu 355 360 365 Gly Met Ser Ala Thr Val Thr Thr Arg Ser Ala Arg Glu Glu Ile Ile 370 375 380 Glu Gly Arg Lys Val Gln Cys Gln Phe Thr Tyr Asp Cys Asn Val Ala 385 390 395 400 Gly Gly Thr Thr Leu Gln Asn Val Leu Ser Tyr Cys Arg Ser Gly His 405 410 415 Lys Thr Arg Glu Ile Pro Pro Ile Val Lys Arg Glu Pro Val Tyr Phe 420 425 430 Gly Phe Thr Asp Asp Phe Gln Gly Glu Ser Thr Val Tyr Gly Leu His 435 440 445 Ile Glu Gly His Lys Asn Phe Leu Leu Gly Asn Lys Ile Glu Val Lys 450 455 460 Ser Cys Gly Gly Tyr Cys Glu Gly Glu Gln Pro Lys Leu Ser Gln Arg 465 470 475 480 Lys Asn Leu Lys His Cys Ile Ala Cys Pro Arg Lys Gly Ile Lys Tyr 485 490 495 Phe Tyr Lys Asp Trp Ser Gly Lys Asn Arg Val Cys Ala Arg Cys Tyr 500 505 510 Gly Arg Tyr Lys Phe Ser Gly His His Cys Ile Asn Cys Lys Tyr Val 515 520 525 Pro Glu Ala Arg Glu Val Lys Lys Ala Lys Asp Lys Gly Glu Lys Leu 530 535 540 Gly Ile Thr Pro Glu Gly Leu Pro Phe Lys Gly Pro Glu Cys Leu Arg 545 550 555 560 Cys Gly Gly Ile Leu Gln Phe Asp Ala Val Arg Gly Pro Asn Lys Ser 565 570 575 Cys Ala Thr Asn Ile Gly Val Arg Ile Cys 586 580 585

【0111】配列番号:5 配列の長さ:4442 配列の型:核酸 鎖の数:二本鎖 トポロジー:不明 配列の種類:Genomic DNA 配列の特徴 起源: 生物名:サッカロマイセス ウバラム(Saccharomyces
uvarum) 株名:EKB103 配列: 10 20 30 40 50 60 AAGCTTAGAG TTGCCCGCAG GCTTAACCAG GGCAAGCGAT CGATGCGTAC CAAAAAAAGT 70 80 90 100 110 120 AGTAAGGTGA GAATGATCCT TACCGTTTAA CTTCTACGTG AATCGTGTCT CCGAGCTTAA 130 140 150 160 170 180 AATGGCGTGG CAGTACTAAG TTGTTATTTT TTGAATCAAA AAAAAAAAAA AACGTTACAT 190 200 210 220 230 240 TTTACCGCGT TAAAACCTAC ATCAAAAAAG GGCGGATCAA TACGATGAAA AAAAAGGTGT 250 260 270 280 290 300 GCAAGAAAAA GTAGCATTCC AACGCCGATT GTAGCCTCTA GGATAATAAA GAAACTTGAA 310 320 330 340 350 360 ATCGTACGTA GTATTCGCGT CTTTAAGCGG TTTTGTTTGA TCTTAGTTCT CACAATCCCG 370 380 390 400 410 420 TATTTCTATG GAACTATCAT CCTCAAAGCA GCGACAGATC ATACAATTAC TCTGTGAAGT 430 440 450 460 470 480 GCTACTATCA CCATTCTGTC AGGCCCTCCT TGATTTCTTG GCTCTTGGAT ACACGTATCT 490 500 510 520 530 540 GAATCACTTG TTGGACCTTA GAATTCCACG TGCCGCTGAA CGTAGCAGTC ATCACTGTAC 550 560 570 580 590 600 GGTGCCAACC ACCTGGTGAA AATAATGTTA AAAATCACAT CCACTATTAG TTTTTCCCCT 610 620 630 640 650 660 ACGGACAGTG CCCTGTGCCC TGCGCTGTCC GTGCCTGTGA TGAGATAAAT CAATTTAATG 670 680 690 700 710 720 AAAACCAGCA CACTATAACG CTGGAGCAAT TGTCCAAGCA ACAAGAAAAA AAACCTTGAC 730 740 750 760 770 780 AATAATTAGC TGAAAGGGAT GAAGTAACTG ATTTGTCTTT TCTCTCTGCG GATGATCTGT 790 800 810 820 830 840 GGGAAAATGA TTTGGGCTAA ATCACGTAAA AAGTTTGATT CCGCGGCTAA TATCTCTGAG 850 860 870 880 890 900 GGGGTGTCAA CGAGCTCGTA GAGTCTTCAT TTTGAGGCAA CCAATGTATA ATGTCCAAGG 910 920 930 940 950 960 AGTTGCTCAA AGAAACAGCC GCAGAATGTT AAGAACGAAT CGGTTGGCAT CAGAGTATGC 970 980 990 1000 1010 1020 ACGATTTGTC CTGATCATGG CAATTAAGTA ACTCCTAGAT CGATTTGGCG TCTTGAAATC 1030 1040 1050 1060 1070 1080 ATATTAACGC CAAACGAAAT ATCCCATTAC TTTTCCTATT TGAGATCATC TTAGTTACGG 1090 1100 1110 1120 1130 1140 CTACAGAGAA GAAAAAGGGT CACATGCCAT AATAATACAG ATTACGTTCA CGAAAATTGG 1150 1160 1170 1180 1190 1200 CCCTATGGCA CATATTTTCG ATTCACGAAA ACCCGATGAC TGTATAGACG TGAAATCCAC 1210 1220 1230 1240 1250 1260 GAAAACAAGT CTGATTGCAC ACGTAGGCGA TCCACGAAAA CAGATGCGAC CGTATACCTG 1270 1280 1290 1300 1310 1320 AAGAACTTGT CAGGGTTGAT GCAATTGTAT ACATGAATGC CTCACGAAAC TTGATGTAGC 1330 1340 1350 1360 1370 1380 TGTTCACATG ATTTCCGCGA AGGGTGATTT AGTGGAATAC ACGACTACCA CGAAAACAGA 1390 1400 1410 1420 1430 1440 TGTAATCGCA TACACGAATG CCACAAATGG CGATGTAATA TCACACACGA GTGTCACGAA 1450 1460 1470 1480 1490 1500 ACTGATGTAA ATTCACACAC GAGTGTCACG AAACTGATGT AAATTCATAC ACGAGTTTCA 1510 1520 1530 1540 1550 1560 CGAAATTGAT GTAATCGTAT ACACAAGTGC CACGAAACTG ATGTGATTGT CTGCAGGAGT 1570 1580 1590 1600 1610 1620 ACCACGAAAA ACTGATGTAA TGGACTACAC AATGTGTTGA AAAATGCTTC CGTTATGACA 1630 1640 1650 1660 1670 1680 CACGTCAGTG ATTCACGAAA ACGAAAGCTA TTGTATACAC CAGATATTCA CGAAAATGAT 1690 1700 1710 1720 1730 1740 GCTATTATTT ACATCAACCT GCCGCGAAAA CTGATGTAAT TGTTTACATC AATATCTTCG 1750 1760 1770 1780 1790 1800 CAGAAGAGCA ATCCATTTAC TTCGTAGGAG CTGCCGGTAC TACTGGCAAA TACACTAGCT 1810 1820 1830 1840 1850 1860 TCTGGGCGAA CTACAAGGTG GAAAACCACG AAAAGTTAGA ACTACGTTCA GGCAAAGCAG 1870 1880 1890 1900 1910 1920 TGGAAGAATC CAAGCGTTCT CTTGCTTCCG TCGAAGTTCG TTAAAGTGTT CTAAATGTGC 1930 1940 1950 1960 1970 1980 TGTTAATCAT CGAATATTTA AAGCTCATAG GATCGTAGCC AATTCATACT CTTAGCCCTT 1990 2000 2010 2020 2030 2040 TCTTCTTTCC ATTATAATCA ATTACTCTCA AGCCACATCT ATATAGACAG CAATCACTTC 2050 2060 2070 2080 2090 2100 CATCTAGCCT TTAAACATGC TTTCCGAAAA TACAACTATA TTGATGGCCA ATGGTAAAAT 2110 2120 2130 2140 2150 2160 CGAAGACATC GCTAATGTCA CCGCTAATTC CTACGTTATG TGCGAAGATG GTTCTGCCGC 2170 2180 2190 2200 2210 2220 CCGCGTTATT AGTGTCACAC AAGGCTGCCA AAAAATCTAC AATATTCAGC AAAAAACTAA 2230 2240 2250 2260 2270 2280 GCATAGAGCT TTTGAAGGCG AACCTGGTAG ATTGGACCCT AGACGTAGAA CTATTTACCA 2290 2300 2310 2320 2330 2340 ACGCCTGGCC TTGCAATGTA CTGCAGGTCA TAAACTGTCT GTAAGGGTTC CTACTAAACC 2350 2360 2370 2380 2390 2400 ATTGTTAGAG AAAAGCGGTA GAAGTGCCAC GAAATATAAA GTGAGATGGA GAAACTTACA 2410 2420 2430 2440 2450 2460 ACAATGTCAG ACACTTGACG GAAGAATAAT AACAATTCCA AAAAATCACC ACAAAACGTT 2470 2480 2490 2500 2510 2520 TCCAATGACT GTCGAAGGTG AATTTGCTGC AAAACGTTTC ATAGAAGAAA TGGAGCGTTT 2530 2540 2550 2560 2570 2580 GAAAGGTGAA TACTTTAATT TTGACATCGA AGTCAGAGAT TTGGATTATC TCGACGCTCA 2590 2600 2610 2620 2630 2640 GTTGAGAATT TCTAGCTGTA TAAGATTCAG TCCGGTTATT ACTGGGAACG GTGTTTTATC 2650 2660 2670 2680 2690 2700 TAAATTTCTC ACCGGACGTA ATGACCTAGT GACTCCCGCT GTGAAAAGTA TGGCTTGGAT 2710 2720 2730 2740 2750 2760 GCTTGGTTTA TGGTTAGGTG ACGGTACAAC AAAAGAGCCC GAGATCTCTG TAGATAGTTT 2770 2780 2790 2800 2810 2820 GGACCCTAAA TTAATGGAAA GTCTACGAAA ACAAGCCAAA ATTTGGGGGC TCTATCTTAC 2830 2840 2850 2860 2870 2880 AGTGTGTGAT GACCATGTTC CGCTGCGTGC CAAACATGTG AGGCTACATT ATGGGGATGG 2890 2900 2910 2920 2930 2940 GCCAGATGAA AATAGAAAGA CCAGGAATTT AAGAAAGAAC AATCCATTTT GGAACGCTGT 2950 2960 2970 2980 2990 3000 CACAAAGTTG AAATTCAAAA GGGAACTTGA CGGTGAGAAG CAGATCCCAG AATTCATGTA 3010 3020 3030 3040 3050 3060 TAGCGAGCAC GTAGAGGTCC GTGAAGCATT TTTGGCAGGT TTAATCGATT CAGATGGATA 3070 3080 3090 3100 3110 3120 TGTTGTGAAG AAGGGCGAAG GCCCAGAATC TTACAAAATA GCAATTCAAA CTGTGTATTC 3130 3140 3150 3160 3170 3180 ATCAATTATG GACGGAGTTA TTCATATTTC CAGATCTCTT GGAATGTCCG CTACTGTGAC 3190 3200 3210 3220 3230 3240 CACCAGATCC GCCAGAGAAG AAATTATTGA GGGAAGGAAA GTTCAATGCC AATTCACATA 3250 3260 3270 3280 3290 3300 TGACTGTAAT GTTGCTGGAG GAACAACATT ACAAAACGTT TTATCATACT GTCGAAGCGG 3310 3320 3330 3340 3350 3360 CCATAAAACT AGAGAAATTC CCCCAATTGT GAAAAGAGAA CCAGTGTATT TCGGGTTCAC 3370 3380 3390 3400 3410 3420 GGACGATTTT CAAGGTGAGA GTACAGTATA CGGACTTCAT ATAGAGGGGC ATAAAAATTT 3430 3440 3450 3460 3470 3480 CTTATTAGGC AATAAAATAG AAGTTAAGTC CTGTGGGGGC TATTGCGAAG GAGAACAACC 3490 3500 3510 3520 3530 3540 GAAATTATCC CAGAGGAAAA ACTTGAAGCA CTGTATTGCG TGTCCTAGAA AGGGCATTAA 3550 3560 3570 3580 3590 3600 ATATTTTTAT AAAGATTGGA GCGGTAAAAA CCGAGTGTGT GCAAGATGTT ACGGAAGATA 3610 3620 3630 3640 3650 3660 CAAGTTTAGT GGCCATCACT GTATAAACTG CAAATATGTA CCAGAAGCAC GTGAGGTTAA 3670 3680 3690 3700 3710 3720 AAAAGCGAAA GATAAAGGTG AAAAATTGGG CATAACGCCC GAAGGCCTGC CGTTCAAAGG 3730 3740 3750 3760 3770 3780 ACCAGAATGT TTACGATGTG GGGGGATTTT GCAATTTGAC GCTGTTCGTG GACCCAATAA 3790 3800 3810 3820 3830 3840 GAGTTGTGCG ACAAATATTG GGGTACGGAT TTGTTAAAAT ATGTAAATTA GTTTAAAAAA 3850 3860 3870 3880 3890 3900 AGTAGGTTGT ATGTATTATA TGTAAAAGTA AGTCGTATGT ATTTTATGTA AAAAGTAAGT 3910 3920 3930 3940 3950 3960 TGTATGTGTT ATATGTAATT TTTAATATTT TTTTCTGTCA GAACAGTATT TGCAGGATTT 3970 3980 3990 4000 4010 4020 TCTTTTATTT GAAATGATTA AATTAGAAAA TACATCTACC CACCAATTAC AAAAATTCTA 4030 4040 4050 4060 4070 4080 CTAAAACTGG TAACACGAAA AGTACCAATA CGGTCACTCC ATTGATCGAT ATAATTGAAT 4090 4100 4110 4120 4130 4140 GCAAACAAAA AGTTTTAATT GTGATACTTG TGAATTTTAT TTTATTAAGG ATACAAAGTT 4150 4160 4170 4180 4190 4200 AAGAGAAAAC AAAATTTATA TACAATAAGT AATATTCATA TATATGTGAT GGATGCAATC 4210 4220 4230 4240 4250 4260 TTAACGAGAA GACATGGCCT TGGTGACAAC TCTCTTCAAA CCAACTTCAG CCTTTCTCAA 4270 4280 4290 4300 4310 4320 TTCATCAGTA GATGCGTCTT CGATTTGCAA AGCGGCCATA GCATCAGATA AAGCGGCTTC 4330 4340 4350 4360 4370 4380 GATCTTGGAC TTGGAACCTC TCTTCAATTT AGAAGATAAG ATTGGGTCAG TGACATTTTG 4390 4400 4410 4420 4430 4440 TTCGATGGAA GCAACGTAGG ATTCCAATCT TTGTCTGGCT TCATGCTTCT TGGCGAAAGC TT
SEQ ID NO: 5 Sequence length: 4442 Sequence type: Nucleic acid Number of strands: Double strand Topology: Unknown Sequence type: Genomic DNA Sequence features Origin: Organism name: Saccharomyces saccharomyces
(uvarum) Strain name: EKB103 Sequence: 10 20 30 40 50 60 AAGCTTAGAG TTGCCCGCAG GCTTAACCAG GGCAAGCGAT CGATGCGTAC CAAAAAAAGT 70 80 90 100 110 120 AGTAAGGTGA GAATGATCCT TACCGTTTAA CTTCACTA GAATTCA 130ACT 150AAAATGCAATATAAAAACATTAT 130AGTAAAATGCAATATAAAATGCAATATATAAAATGCAATATATAAAATGCAATAT 130AAAAATGCAATATATAAAATGCAATATATAAAATGCAATATATAAAATGCAATATATATAAAATGCAATATATAAAATTCA TTTACCGCGT TAAAACCTAC ATCAAAAAAG GGCGGATCAA TACGATGAAA AAAAAGGTGT 250 260 270 280 290 300 GCAAGAAAAA GTAGCATTCC AACGCCGATT GTAGCCTCTA GGATAATAAA GAAACTTGAA 310 320 330 340 350 360 ATCGTACGTA GTATTCGCGT CTTTAAGCGG TTTTGTTTGA TCTTAGTTCT CACAATCCCG 370 380 390 400 410 420 TATTTCTATG GAACTATCAT CCTCAAAGCA GCGACAGATC ATACAATTAC TCTGTGAAGT 430 440 450 460 470 480 GCTACTATCA CCATTCTGTC AGGCCCTCCT TGATTTCTTG GCTCTTGGAT ACACGTATCT 490 500 510 520 530 540 GAATCACTTG TTGGACCTTA GAATTCCACG TGCCGCTGAA CGTAGCAGTC ATCACTGTAC 550 560 570 580GGCC 660 CG CG 610 CG 650 CG CG 610 CG CG 650 CG 650 650 CG GTGA TGAGATAAAT CAATTTAATG 670 680 690 700 710 720 AAAACCAGCA CACTATAACG CTGGAGCAAT TGTCCAAGCA ACAAGAAAAA AAACCTTGAC 730 740 750 760 770 780 AATAATTAGC TGAAAGGGAT GAAGTAACTG ATTTGTCTTT TCTCTCTGCG GATGATCTGT 790 800 810 820 830 840 GGGAAAATGA TTTGGGCTAA ATCACGTAAA AAGTTTGATT CCGCGGCTAA TATCTCTGAG 850 860 870 880 890 900 GGGGTGTCAA CGAGCTCGTA GAGTCTTCAT TTTGAGGCAA CCAATGTATA ATGTCCAAGG 910 920 930 940 950 960 AGTTGCTCAA AGAAACAGCC GCAGAATGTT AAGAACGAAT CGGTTGGCAT CAGAGTATGC 970 980 990 1000 1010 1020 ACGATTTGTC CTGATCATGG CAATTAAGTA ACTCCTAGAT CGATTTGGCG TCTTGAAATC 1030 1040 1050 1060 1070 1080 ATATTAACGC CAAACGAAAT ATCCCATTAC TTTTCCTATT TGAGATCATC TTAGTTACGG 1090 1100 1110 1120 1130 1140 CTACAGAGAA GAAAAAGGGT CACATGCCAT AATAATACAG ATTACGTTCA CGAAAATTGG 1150 1160 1170 1180 1190 1200 CCCTATGGCA CATATTTTCG ATTCACGAAA ACCCGATGAC TGTATAGACG TGAAATCCAC 1210 1220 1230 1240 1250 1260 GAAAACAAGT CTGATTGCAC ACGTAGGCGA TCCACGAAAA CAGATGCGAC CGTATACCTG 1270 1280 1290 1300 1310 1320 CAGG TTGAT GCAATTGTAT ACATGAATGC CTCACGAAAC TTGATGTAGC 1330 1340 1350 1360 1370 1380 TGTTCACATG ATTTCCGCGA AGGGTGATTT AGTGGAATAC ACGACTACCA CGAAAACAGA 1390 1400 1410 1420 1430 1440 TGTAATCGCA TACACGAATG CCACAAATGG CGATGTAATA TCACACACGA GTGTCACGAA 1450 1460 1470 1480 1490 1500 ACTGATGTAA ATTCACACAC GAGTGTCACG AAACTGATGT AAATTCATAC ACGAGTTTCA 1510 1520 1530 1540 1550 1560 CGAAATTGAT GTAATCGTAT ACACAAGTGC CACGAAACTG ATGTGATTGT CTGCAGGAGT 1570 1580 1590 1600 1610 1620 ACCACGAAAA ACTGATGTAA TGGACTACAC AATGTGTTGA AAAATGCTTC CGTTATGACA 1630 1640 1650 1660 1670 1680 CACGTCAGTG ATTCACGAAA ACGAAAGCTA TTGTATACAC CAGATATTCA CGAAAATGAT 1690 1700 1710 1720 1730 1740 GCTATTATTT ACATCAACCT GCCGCGAAAA CTGATGTAAT TGTTTACATC AATATCTTCG 1750 1760 1770 1780 1790 1800 CAGAAGAGCA ATCCATTTAC TTCGTAGGAG CTGCCGGTAC TACTGGCAAA TACACTAGCT 1810 1820 1830 1840 1850 1860 TCTGGGCGAA CTACAAGGTG GAAAACCACG AAAAGTTAGA ACTACGTTCA GGCAAAGCAG 1870 1880 1890 1900 1910 1920 TGGAAGAATC CAAGCGTTCT CTTGCTTCCG TCGAAGTTCG TTAAAGTGTT C TAAATGTGC 1930 1940 1950 1960 1970 1980 TGTTAATCAT CGAATATTTA AAGCTCATAG GATCGTAGCC AATTCATACT CTTAGCCCTT 1990 2000 2010 2020 2030 2040 TCTTCTTTCC ATTATAATCA ATTACTCTCA AGCCACATCT ATATAGACAG CAATCACTTC 2050 2060 2070 2080 2090 2100 CATCTAGCCT TTAAACATGC TTTCCGAAAA TACAACTATA TTGATGGCCA ATGGTAAAAT 2110 2120 2130 2140 2150 2160 CGAAGACATC GCTAATGTCA CCGCTAATTC CTACGTTATG TGCGAAGATG GTTCTGCCGC 2170 2180 2190 2200 2210 2220 CCGCGTTATT AGTGTCACAC AAGGCTGCCA AAAAATCTAC AATATTCAGC AAAAAACTAA 2230 2240 2250 2260 2270 2280 GCATAGAGCT TTTGAAGGCG AACCTGGTAG ATTGGACCCT AGACGTAGAA CTATTTACCA 2290 2300 2310 2320 2330 2340 ACGCCTGGCC TTGCAATGTA CTGCAGGTCA TAAACTGTCT GTAAGGGTTC CTACTAAACC 2350 2360 2370 2380 2390 2400 ATTGTTAGAG AAAAGCGGTA GAAGTGCCAC GAAATATAAA GTGAGATGGA GAAACTTACA 2410 2420 2430 2440 2450 2460 ACAATGTCAG ACACTTGACG GAAGAATAAT AACAATTCCA AAAAATCACC ACAAAACGTT 2470 2480 2490 2500 2510 2520 TCCAATGACT GTCGAAGGTG AATTTGCTGC AAAACGTTTC ATAGAAGAAA TGGAGCGTTT 2530 2540 2550 2560 2570 2580 GAAAGGTGAA TACTTTAATT TTGACATCGA AGTCAGAGAT TTGGATTATC TCGACGCTCA 2590 2600 2610 2620 2630 2640 GTTGAGAATT TCTAGCTGTA TAAGATTCAG TCCGGTTATT ACTGGGAACG GTGTTTTATC 2650 2660 2670 2680 2690 2700 TAAATTTCTC ACCGGACGTA ATGACCTAGT GACTCCCGCT GTGAAAAGTA TGGCTTGGAT 2710 2720 2730 2740 2750 2760 GCTTGGTTTA TGGTTAGGTG ACGGTACAAC AAAAGAGCCC GAGATCTCTG TAGATAGTTT 2770 2780 2790 2800 2810 2820 GGACCCTAAA TTAATGGAAA GTCTACGAAA ACAAGCCAAA ATTTGGGGGC TCTATCTTAC 2830 2840 2850 2860 2870 2880 AGTGTGTGAT GACCATGTTC CGCTGCGTGC CAAACATGTG AGGCTACATT ATGGGGATGG 2890 2900 2910 2920 2930 2940 GCCAGATGAA AATAGAAAGA CCAGGAATTT AAGAAAGAAC AATCCATTTT GGAACGCTGT 2950 2960 2970 2980 2990 3000 CACAAAGTTG AAATTCAAAA GGGAACTTGA CGGTGAGAAG CAGATCCCAG AATTCATGTA 3010 3020 3030 3040 3050 3060 TAGCGAGCAC GTAGAGGTCC GTGAAGCATT TTTGGCAGGT TTAATCGATT CAGATGGATA 3070 3080 3090 3100 3110 3120 TGTTGTGAAG AAGGGCGAAG GCCCAGAATC TTACAAAATA GCAATTCAAA CTGTGTATTC 3130 3140 3150 3160 3170 3180 ATCAATTATG GACGGAGTTA TTCATATTTC CAGATCT CTT GGAATGTCCG CTACTGTGAC 3190 3200 3210 3220 3230 3240 CACCAGATCC GCCAGAGAAG AAATTATTGA GGGAAGGAAA GTTCAATGCC AATTCACATA 3250 3260 3270 3280 3290 3300 TGACTGTAAT GTTGCTGGAG GAACAACATT ACAAAACGTT TTATCATACT GTCGAAGCGG 3310 3320 3330 3340 3350 3360 CCATAAAACT AGAGAAATTC CCCCAATTGT GAAAAGAGAA CCAGTGTATT TCGGGTTCAC 3370 3380 3390 3400 3410 3420 GGACGATTTT CAAGGTGAGA GTACAGTATA CGGACTTCAT ATAGAGGGGC ATAAAAATTT 3430 3440 3450 3460 3470 3480 CTTATTAGGC AATAAAATAG AAGTTAAGTC CTGTGGGGGC TATTGCGAAG GAGAACAACC 3490 3500 3510 3520 3530 3540 GAAATTATCC CAGAGGAAAA ACTTGAAGCA CTGTATTGCG TGTCCTAGAA AGGGCATTAA 3550 3560 3570 3580 3590 3600 ATATTTTTAT AAAGATTGGA GCGGTAAAAA CCGAGTGTGT GCAAGATGTT ACGGAAGATA 3610 3620 3630 3640 3650 3660 CAAGTTTAGT GGCCATCACT GTATAAACTG CAAATATGTA CCAGAAGCAC GTGAGGTTAA 3670 3680 3690 3700 3710 3720 AAAAGCGAAA GATAAAGGTG AAAAATTGGG CATAACGCCC GAAGGCCTGC CGTTCAAAGG 3730 3740 3750 3760 3770 3780 ACCAGAATGT TTACGATGTG GGGGGATTTT GCAATTTGAC GCTGTTCGTG GACCCAATAA 3790 3800 3810 3820 3830 3840 GAGTTGTGCG ACAAATATTG GGGTACGGAT TTGTTAAAAT ATGTAAATTA GTTTAAAAAA 3850 3860 3870 3880 3890 3900 AGTAGGTTGT ATGTATTATA TGTAAAAGTA AGTCGTATGT ATTTTATGTA AAAAGTAAGT 3910 3920 3930 3940 3950 3960 TGTATGTGTT ATATGTAATT TTTAATATTT TTTTCTGTCA GAACAGTATT TGCAGGATTT 3970 3980 3990 4000 4010 4020 TCTTTTATTT GAAATGATTA AATTAGAAAA TACATCTACC CACCAATTAC AAAAATTCTA 4030 4040 4050 4060 4070 4080 CTAAAACTGG TAACACGAAA AGTACCAATA CGGTCACTCC ATTGATCGAT ATAATTGAAT 4090 4100 4110 4120 4130 4140 GCAAACAAAA AGTTTTAATT GTGATACTTG TGAATTTTAT TTTATTAAGG ATACAAAGTT 4150 4160 4170 4180 4190 4200 AAGAGAAAAC AAAATTTATA TACAATAAGT AATATTCATA TATATGTGAT GGATGCAATC 4210 4220 4230 4240 4250 4260 TTAACGAGAA GACATGGCCT TGGTGACAAC TCTCTTCAAA CCAACTTCAG CCTTTCTCAA 4270 4280 4290 4300 4310 4320 TTCATCAGTA GATGCGTCTT CGATTTGCAA AGCGGCCATA GCATCAGATA AAGCGGCTTC 4330 4340 4350 4360 4370 4380 GATCTTGGAC TTGGAACCTC TCTTCAATTT AGAAGATAAG ATTGGGTCAG TGACATTTTG 4390 4400 4410 4420 4430 4440 TTCGATGGAA GCAACGTAGG AT TCCAATCT TTGTCTGGCT TCATGCTTCT TGGCGAAAGC TT

【0112】配列番号:6 配列の長さ:1758 配列の型:核酸 鎖の数:二本鎖 トポロジー:不明 配列の種類:Genomic DNA 配列の特徴 起源: 生物名:サッカロマイセス ウバラム(Saccharomyces
uvarum) 株名:EKB103 配列: ATGCTTTCCG AAAATACAAC TATATTGATG GCCAATGGTA AAATCGAAGA CATCGCTAAT 60 GTCACCGCTA ATTCCTACGT TATGTGCGAA GATGGTTCTG CCGCCCGCGT TATTAGTGTC 120 ACACAAGGCT GCCAAAAAAT CTACAATATT CAGCAAAAAA CTAAGCATAG AGCTTTTGAA 180 GGCGAACCTG GTAGATTGGA CCCTAGACGT AGAACTATTT ACCAACGCCT GGCCTTGCAA 240 TGTACTGCAG GTCATAAACT GTCTGTAAGG GTTCCTACTA AACCATTGTT AGAGAAAAGC 300 GGTAGAAGTG CCACGAAATA TAAAGTGAGA TGGAGAAACT TACAACAATG TCAGACACTT 360 GACGGAAGAA TAATAACAAT TCCAAAAAAT CACCACAAAA CGTTTCCAAT GACTGTCGAA 420 GGTGAATTTG CTGCAAAACG TTTCATAGAA GAAATGGAGC GTTTGAAAGG TGAATACTTT 480 AATTTTGACA TCGAAGTCAG AGATTTGGAT TATCTCGACG CTCAGTTGAG AATTTCTAGC 540 TGTATAAGAT TCAGTCCGGT TATTACTGGG AACGGTGTTT TATCTAAATT TCTCACCGGA 600 CGTAATGACC TAGTGACTCC CGCTGTGAAA AGTATGGCTT GGATGCTTGG TTTATGGTTA 660 GGTGACGGTA CAACAAAAGA GCCCGAGATC TCTGTAGATA GTTTGGACCC TAAATTAATG 720 GAAAGTCTAC GAAAACAAGC CAAAATTTGG GGGCTCTATC TTACAGTGTG TGATGACCAT 780 GTTCCGCTGC GTGCCAAACA TGTGAGGCTA CATTATGGGG ATGGGCCAGA TGAAAATAGA 840 AAGACCAGGA ATTTAAGAAA GAACAATCCA TTTTGGAACG CTGTCACAAA GTTGAAATTC 900 AAAAGGGAAC TTGACGGTGA GAAGCAGATC CCAGAATTCA TGTATAGCGA GCACGTAGAG 960 GTCCGTGAAG CATTTTTGGC AGGTTTAATC GATTCAGATG GATATGTTGT GAAGAAGGGC 1020 GAAGGCCCAG AATCTTACAA AATAGCAATT CAAACTGTGT ATTCATCAAT TATGGACGGA 1080 GTTATTCATA TTTCCAGATC TCTTGGAATG TCCGCTACTG TGACCACCAG ATCCGCCAGA 1140 GAAGAAATTA TTGAGGGAAG GAAAGTTCAA TGCCAATTCA CATATGACTG TAATGTTGCT 1200 GGAGGAACAA CATTACAAAA CGTTTTATCA TACTGTCGAA GCGGCCATAA AACTAGAGAA 1260 ATTCCCCCAA TTGTGAAAAG AGAACCAGTG TATTTCGGGT TCACGGACGA TTTTCAAGGT 1320 GAGAGTACAG TATACGGACT TCATATAGAG GGGCATAAAA ATTTCTTATT AGGCAATAAA 1380 ATAGAAGTTA AGTCCTGTGG GGGCTATTGC GAAGGAGAAC AACCGAAATT ATCCCAGAGG 1440 AAAAACTTGA AGCACTGTAT TGCGTGTCCT AGAAAGGGCA TTAAATATTT TTATAAAGAT 1500 TGGAGCGGTA AAAACCGAGT GTGTGCAAGA TGTTACGGAA GATACAAGTT TAGTGGCCAT 1560 CACTGTATAA ACTGCAAATA TGTACCAGAA GCACGTGAGG TTAAAAAAGC GAAAGATAAA 1620 GGTGAAAAAT TGGGCATAAC GCCCGAAGGC CTGCCGTTCA AAGGACCAGA ATGTTTACGA 1680 TGTGGGGGGA TTTTGCAATT TGACGCTGTT CGTGGACCCA ATAAGAGTTG TGCGACAAAT 1740 ATTGGGGTAC GGATTTGT 1758
SEQ ID NO: 6 Sequence length: 1758 Sequence type: Nucleic acid Number of strands: Double strand Topology: Unknown Sequence type: Genomic DNA Sequence features Origin: Organism name: Saccharomyces
uvarum) strain name: EKB103 sequence: ATGCTTTCCG AAAATACAAC TATATTGATG GCCAATGGTA AAATCGAAGA CATCGCTAAT 60 GTCACCGCTA ATTCCTACGT TATGTGCGAA GATGGTTCTG CCGCCCGCGT TATTAGTGTC 120 ACACAAGGCT GCCAAAAAAT CTACAATATT CAGCAAAAAA CTAAGCATAG AGCTTTTGAA 180 GGCGAACCTG GTAGATTGGA CCCTAGACGT AGAACTATTT ACCAACGCCT GGCCTTGCAA 240 TGTACTGCAG GTCATAAACT GTCTGTAAGG GTTCCTACTA AACCATTGTT AGAGAAAAGC 300 GGTAGAAGTG CCACGAAATA TAAAGTGAGA TGGAGAAACT TACAACAATG TCAGACACTT 360 GACGGAAGAA TAATAACAAT TCCAAAAAAT CACCACAAAA CGTTTCCAAT GACTGTCGAA 420 GGTGAATTTG CTGCAAAACG TTTCATAGAA GAAATGGAGC GTTTGAAAGG TGAATACTTT 480 AATTTTGACA TCGAAGTCAG AGATTTGGAT TATCTCGACG CTCAGTTGAG AATTTCTAGC 540 TGTATAAGAT TCAGTCCGGT TATTACTGGG AACGGTGTTT TATCTAAATT TCTCACCGGA 600 CGTAATGACC TAGTGACTCC CGCTGTGAAA AGTATGGCTT GGATGCTTGG TTTATGGTTA 660 GGTGACGGTA CAACAAAAGA GCCCGAGATC TCTGTAGATA GTTTGGACCC TAAATTAATG 720 GAAAGTCTAC GAAAACAAGC CAAAATTTGG GGGCTCTATC TTACAGTGTG TGATGACCAT 780 GTTCCGCTGC GTGCCAAACA TGTGAGGCTA CATTATGGGG A TGGGCCAGA TGAAAATAGA 840 AAGACCAGGA ATTTAAGAAA GAACAATCCA TTTTGGAACG CTGTCACAAA GTTGAAATTC 900 AAAAGGGAAC TTGACGGTGA GAAGCAGATC CCAGAATTCA TGTATAGCGA GCACGTAGAG 960 GTCCGTGAAG CATTTTTGGC AGGTTTAATC GATTCAGATG GATATGTTGT GAAGAAGGGC 1020 GAAGGCCCAG AATCTTACAA AATAGCAATT CAAACTGTGT ATTCATCAAT TATGGACGGA 1080 GTTATTCATA TTTCCAGATC TCTTGGAATG TCCGCTACTG TGACCACCAG ATCCGCCAGA 1140 GAAGAAATTA TTGAGGGAAG GAAAGTTCAA TGCCAATTCA CATATGACTG TAATGTTGCT 1200 GGAGGAACAA CATTACAAAA CGTTTTATCA TACTGTCGAA GCGGCCATAA AACTAGAGAA 1260 ATTCCCCCAA TTGTGAAAAG AGAACCAGTG TATTTCGGGT TCACGGACGA TTTTCAAGGT 1320 GAGAGTACAG TATACGGACT TCATATAGAG GGGCATAAAA ATTTCTTATT AGGCAATAAA 1380 ATAGAAGTTA AGTCCTGTGG GGGCTATTGC GAAGGAGAAC AACCGAAATT ATCCCAGAGG 1440 AAAAACTTGA AGCACTGTAT TGCGTGTCCT AGAAAGGGCA TTAAATATTT TTATAAAGAT 1500 TGGAGCGGTA AAAACCGAGT GTGTGCAAGA TGTTACGGAA GATACAAGTT TAGTGGCCAT 1560 CACTGTATAA ACTGCAAATA TGTACCAGAA GCACGTGAGG TTAAAAAAGC GAAAGATAAA 1620 GGTGAAAAAT TGGGCATAAC GCCCGAAGGC CTGCCGTTCA AAGGACCAGA ATGTTTACGA 1680 TGTGGGGGGA TTTTGCAATT TGACGCTGTT CGTGGACCCA ATAAGAGTTG TGCGACAAAT 1740 ATTGGGGTAC GGATTTGT 1758

【図面の簡単な説明】[Brief description of drawings]

【図1】 プラスミドpUCPGK21及びプラスミドpPGKneo2
の作製工程図。
FIG. 1 Plasmid pUCPGK21 and plasmid pPGKneo2
Manufacturing process drawing of.

【図2】 プラスミドpGPDBSR の作製工程図。FIG. 2 is a process drawing of the plasmid pGPDBSR.

【図3】 プラスミドpHONEOの作製工程図。FIG. 3 is a process drawing of plasmid pHONEO.

【図4】 プラスミドpHOBRBSRの作製工程図。FIG. 4 is a process drawing of plasmid pHOBRBSR.

【図5】 遺伝子破壊ベクターの構築図を示す図。FIG. 5 is a diagram showing a construction diagram of a gene disruption vector.

【図6】 サザン解析の結果を示す図。FIG. 6 is a diagram showing the results of Southern analysis.

───────────────────────────────────────────────────── フロントページの続き (51)Int.Cl.6 識別記号 庁内整理番号 FI 技術表示箇所 (C12N 15/09 ZNA C12R 1:86) (C12N 15/09 ZNA C12R 1:85) (C12N 1/19 C12R 1:86) (C12N 1/19 C12R 1:85) C12R 1:86) (C12N 15/00 ZNA A C12R 1:85) ─────────────────────────────────────────────────── ─── Continuation of the front page (51) Int.Cl. 6 Identification code Internal reference number FI Technical indication (C12N 15/09 ZNA C12R 1:86) (C12N 15/09 ZNA C12R 1:85) (C12N 1 / 19 C12R 1:86) (C12N 1/19 C12R 1:85) C12R 1:86) (C12N 15/00 ZNA A C12R 1:85)

Claims (16)

【特許請求の範囲】[Claims] 【請求項1】 配列番号1に示すアミノ酸配列を有し、
かつ、接合型遺伝子座を切断することができるエンドヌ
クレアーゼをコードする塩基配列を含むことを特徴とす
る酵母のエンドヌクレアーゼ遺伝子。
1. An amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 1,
And a yeast endonuclease gene, which comprises a nucleotide sequence encoding an endonuclease capable of cleaving the mating type locus.
【請求項2】 配列番号4に示すアミノ酸配列を有し、
かつ、接合型遺伝子座を切断することができるエンドヌ
クレアーゼをコードする塩基配列を含むことを特徴とす
る酵母のエンドヌクレアーゼ遺伝子。
2. Having the amino acid sequence shown in SEQ ID NO: 4,
And a yeast endonuclease gene, which comprises a nucleotide sequence encoding an endonuclease capable of cleaving the mating type locus.
【請求項3】 エンドヌクレアーゼをコードする塩基配
列が、配列番号3で表されるものである、請求項1記載
のエンドヌクレアーゼ遺伝子。
3. The endonuclease gene according to claim 1, wherein the nucleotide sequence encoding the endonuclease is represented by SEQ ID NO: 3.
【請求項4】 エンドヌクレアーゼをコードする塩基配
列が、配列番号6で表されるものである、請求項2記載
のエンドヌクレアーゼ遺伝子。
4. The endonuclease gene according to claim 2, wherein the nucleotide sequence encoding the endonuclease is represented by SEQ ID NO: 6.
【請求項5】 請求項1又は3記載のエンドヌクレアー
ゼ遺伝子を含む、酵母のホモタリズム遺伝子。
5. A yeast homothalism gene comprising the endonuclease gene according to claim 1 or 3.
【請求項6】 請求項2又は4記載のエンドヌクレアー
ゼ遺伝子を含む、酵母のホモタリズム遺伝子。
6. A yeast homothalism gene containing the endonuclease gene according to claim 2 or 4.
【請求項7】 ホモタリズム遺伝子が、配列番号2で表
されるものである、請求項5記載のホモタリズム遺伝
子。
7. The homothalism gene according to claim 5, wherein the homothalism gene is represented by SEQ ID NO: 2.
【請求項8】 ホモタリズム遺伝子が、配列番号5で表
されるものである、請求項6記載のホモタリズム遺伝
子。
8. The homothalism gene according to claim 6, wherein the homothalism gene is represented by SEQ ID NO: 5.
【請求項9】 請求項1乃至4のいずれか1項に記載の
エンドヌクレアーゼ遺伝子の少なくとも一部分の発現抑
制により不活化された酵母のホモタリズム遺伝子断片。
9. A yeast homotalism gene fragment inactivated by suppressing the expression of at least a part of the endonuclease gene according to any one of claims 1 to 4.
【請求項10】 発現抑制が、制限酵素による切断、挿
入、欠失、置換若しくは付加によるもの、エンドヌクレ
アーゼ遺伝子のプロモーター若しくはターミネーター領
域に対する制限酵素による切断、挿入、欠失、置換若し
くは付加によるもの、該プロモーター若しくはターミネ
ーター領域に対するマーカー遺伝子の挿入若しくは置換
によるもの、又は該エンドヌクレアーゼ遺伝子のアンチ
センスRNAの導入によるものである、請求項9記載の
ホモタリズム遺伝子断片。
10. Suppression of expression by restriction enzyme cleavage, insertion, deletion, substitution or addition, restriction enzyme digestion, insertion, deletion, substitution or addition to the promoter or terminator region of the endonuclease gene, The homothalism gene fragment according to claim 9, which is obtained by inserting or substituting a marker gene for the promoter or terminator region, or by introducing an antisense RNA of the endonuclease gene.
【請求項11】 請求項1乃至4のいずれか1項に記載の
エンドヌクレアーゼ遺伝子の一部及びマーカー遺伝子が
組み込まれたホモタリズム遺伝子破壊用YIp型プラスミ
ド。
A YIp-type plasmid for disrupting a homotalism gene, which comprises a part of the endonuclease gene according to any one of claims 1 to 4 and a marker gene.
【請求項12】 不活化した請求項1乃至4のいずれか1
項に記載のエンドヌクレアーゼ遺伝子及びマーカー遺伝
子が組み込まれたホモタリズム遺伝子破壊用YIp 型プラ
スミド。
12. The inactivated one of claims 1 to 4.
A YIp type plasmid for disrupting a homotalism gene, which comprises the endonuclease gene and the marker gene according to the above item.
【請求項13】 請求項9又は10記載のホモタリズム遺伝
子断片で形質転換を行った形質転換酵母。
13. A transformed yeast transformed with the homotalism gene fragment according to claim 9.
【請求項14】 請求項11記載のホモタリズム遺伝子破壊
用YIp 型プラスミドで形質転換を行った形質転換酵母。
14. A transformed yeast transformed with the YIp type plasmid for disrupting the homotalism gene according to claim 11.
【請求項15】 請求項12記載のホモタリズム遺伝子破壊
用YIp 型プラスミドで形質転換を行った形質転換酵母。
15. A transformed yeast transformed with the YIp type plasmid for disrupting the homotalism gene according to claim 12.
【請求項16】 請求項13乃至15のいずれか1項に記載の
形質転換酵母を培養して、ヘテロタリズムに基づく接合
型酵母を育種することを特徴とする酵母の育種方法。
16. A method for breeding yeast, which comprises culturing the transformed yeast according to any one of claims 13 to 15 to breed heterozygous mating type yeast.
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Cited By (2)

* Cited by examiner, † Cited by third party
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WO2010106813A1 (en) * 2009-03-19 2010-09-23 キリンホールディングス株式会社 Method for imparting mating ability to yeast
JP2017099338A (en) * 2015-12-02 2017-06-08 株式会社豊田中央研究所 Genome rearrangement method and use thereof

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JP2017099338A (en) * 2015-12-02 2017-06-08 株式会社豊田中央研究所 Genome rearrangement method and use thereof

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