JPH04506401A - Direct soil immunoassay - Google Patents

Direct soil immunoassay

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JPH04506401A
JPH04506401A JP50554490A JP50554490A JPH04506401A JP H04506401 A JPH04506401 A JP H04506401A JP 50554490 A JP50554490 A JP 50554490A JP 50554490 A JP50554490 A JP 50554490A JP H04506401 A JPH04506401 A JP H04506401A
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enzyme
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ミラー,スザンヌ,エム.
ピーターセン,フランク,ピー.
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アグリーダイアグノスティックス アソシエイツ
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Abstract

(57)【要約】本公報は電子出願前の出願データであるため要約のデータは記録されません。 (57) [Summary] This bulletin contains application data before electronic filing, so abstract data is not recorded.

Description

【発明の詳細な説明】 直接的土壌免疫アッセイ 16発明の分野 本発明は土壌中の植物病原体の存在を検出する方法に関する。[Detailed description of the invention] Direct soil immunoassay 16 Fields of invention The present invention relates to a method for detecting the presence of plant pathogens in soil.

さらに詳細には、本発明は関心のある植物病原体の抗原の存在を検出する土壌の 直接的免疫アッセイの方法に関する。More specifically, the present invention provides methods for detecting the presence of antigens of plant pathogens of interest in soil. A method of direct immunoassay.

2、発明の背景 a、植物病害 人類はその根本的な生存のために、はとんど完全に植物に依存している。事実、 世界の食糧供給の大部分は10種の主要穀物、すなわち米、トウモロコシ、ジャ ガイモ、小麦、サツマイモ、カッサバ、大豆、エントウおよびインゲン、サトウ キビ、そして雑穀および穀実用モロコシに由来している。栄養の直接的源泉を提 供することに加えて、植物はまた我々が食べる動物の食物を提供し、さらに多く の繊維、紙、木材および医薬品のちととなる。恐らく最も重要なことは、植物は また我々が呼吸する酸素そのものを提供する。2. Background of the invention a. Plant diseases Humankind is almost completely dependent on plants for its fundamental survival. fact, Most of the world's food supply comes from 10 major grains: rice, corn, and corn. Potatoes, wheat, sweet potatoes, cassava, soybeans, peas and kidney beans, sugar It is derived from millet, as well as millet and grain sorghum. Provides a direct source of nutrition In addition to providing food for the animals we eat, plants also provide food for the animals we eat, and even more. of textiles, paper, wood and pharmaceuticals. Perhaps most importantly, plants It also provides the very oxygen we breathe.

歴史を通じて人は、野性の植物種の選択的育種により、多(の重要な作物を栽培 することを学んでいる。しかしながら、近年の農業における多くの進歩にもかか わらず、人間は世界の作物に災疫をもたらす植物病害の多くを撲滅することがい まだにできていない。人間の歴史は植物病原体が人口に及ぼす破壊的作用の実例 に富んでいる。!9世紀後半のアイルランドのジャガイモ胴葉枯れ病は、かかる 作用の最も劇的で決定的な実例のひとつであるが、今なお局地的に、特定の作物 に病気が蔓延し、作物が襲われて人口に極度の困難または飢謹を生じることがあ る。例えば150億ドル以上に値する合衆国の全農業生産物の15%もが、また 世界では600億ドルが植物病害のために毎年失なわれている。Throughout history, humans cultivated many important crops through selective breeding of wild plant species. learning to do. However, despite many advances in agriculture in recent years, However, humans are unable to eradicate many of the plant diseases that plague the world's crops. It's not done yet. Human history is an example of the devastating effects of plant pathogens on populations. rich in ! In the latter half of the 9th century, Irish potato body blight disease spread. Although this is one of the most dramatic and definitive examples of Diseases can spread throughout the country, attacking crops and causing extreme hardship or famine for the population. Ru. For example, as much as 15% of all agricultural production in the United States, worth more than $15 billion, is also Around the world, $60 billion is lost each year to plant diseases.

b、病原体管理 植物病原体の活動の結果日常的に経験される重大な損失のために、疫病管理の新 しくかつより効果のある方法が常に要求されている。経済的に重要な植物の50 .000以上の病害が現在存在し、それらが、真菌、細菌、ウィルス、マイコプ ラズマ、線虫、およびのにそれ独自の特定な習性および方法を育している。病原 体は風、水、土、植物の部分、またはベクターにより植物から植物へと広がる。b. Pathogen management Due to the significant losses routinely experienced as a result of the activity of plant pathogens, new approaches to late blight management are needed. Newer and more effective methods are always required. 50 economically important plants .. There are over 1,000 diseases currently in existence, including fungi, bacteria, viruses, and mycobacterium. The worm, a nematode, and has developed its own specific habits and methods. Pathogen The body is spread from plant to plant by wind, water, soil, plant parts, or vectors.

はとんどの植物害虫は決して完全には撲滅されないが、病原体が存在するために 害虫が成長する、作物や土壌を注意深くモニターすれば、病害の急激な発生を効 果的にコントロールする第一のステップとなる。病害の外部的徴候を全くあられ さない植物組織が、しばしば少量の病原性生物を宿しており、もし初期に検出さ れればそれらはもっと容易にコントロールできる。同様に、土壌は発芽性および 休眠中の生物両方を少量含有しており、活性化した場合、そこの植物をひど(損 う。ここでもまた土壌中のかかる生物の存在を初期に認識することにより、価値 ある作物における病害の重大な突然発生を防ぐことができる。予防は現存する植 物に化学性農薬塗布をすることにより、耐病性種を用いることにより、または輪 作により、しばしば達成される。Although most plant pests are never completely eradicated, the presence of pathogens Careful monitoring of the crops and soil where pests grow can help prevent disease outbreaks. This is the first step towards effective control. No external signs of disease plant tissues that do not contain pathogenic organisms often harbor small amounts of pathogenic organisms and, if detected initially, They can be more easily controlled. Similarly, soil is germinative and Contains small amounts of dormant organisms that, when activated, can severely (damage) the plants there. cormorant. Again, early recognition of the presence of such organisms in the soil can provide value. Serious outbreaks of diseases in certain crops can be prevented. Prevention is based on existing vegetation. by applying chemical pesticides to crops, by using disease-resistant species, or by This is often accomplished by working.

i、土壌伝播性の病原体および育寄生物植物育害生物の最も害を与えるもののい くつかは、土壌中の生息動物である。植物に有意な災害を生ずるものに、土壌伝 播性真菌、昆虫、線虫および細菌がある。これらのグループは、いつもの植物宿 主がいない場合、それぞれ土壌中で越冬または越夏できるメンバーを有している 。例えば、線虫は、卵または第一段階の幼虫で通常は越冬または越夏する。多く の種の卵は全く悪影響を受けずに数ケ月または数年も土壌中で休眠のままでいる ことができる。成熟線虫は、通常比較的浅い土壌中の植物の根を食べ、根瘤また は根コブ、過度の根の枝分かれ、根先の損傷、および細菌または真菌感染をとも なう場合、根腐病のような徴候を生じる。i. Soil-borne pathogens and parasites The most harmful species of plant-damaging organisms Some are animals that live in the soil. Soil inheritance is one of the causes of significant damage to plants. There are disseminated fungi, insects, nematodes and bacteria. These groups are the usual plant inns. Each has members that can overwinter or summer in the soil in the absence of a master. . For example, nematodes typically overwinter or oversummer as eggs or first stage larvae. many The eggs of some species can remain dormant in the soil for months or years without any adverse effects. be able to. Adult nematodes feed on plant roots, usually in relatively shallow soil, forming root nodules or is associated with root knots, excessive root branching, root tip damage, and bacterial or fungal infections. If it grows, symptoms similar to root rot occur.

土壌中の重要な線虫寄生虫の中には、はとんど全ての栽培されている植物を襲う メロイドシネ(Meloido ne)のような根瘤線虫、ヘテロデラ(Het erodera)およびグロボデラ(Globodera)および他の属のチレ ンクス(nn匹堕1およびブラチレンクス(Praty−Ienchus)のよ うな包のう線虫がある。Some important nematode parasites in the soil attack almost all cultivated plants. Root-knot nematodes such as Meloidone, Heterodera erodera) and Globodera and other genera Like nnchus and Praty-Ienchus. I have a cyst nematode.

同様に多くの昆虫、特に昆虫の幼虫は多数の種々の農作植物に重大な損害を生じ る原因となる。多くの種は幼虫が最終的に襲う植物の基幹部のまわりの土壌中に それらの卵を産みつける。ある種の幼虫はまた土壌中でかなりの期間過ごす。重 要な植物の昆虫ペストの中には、多くの栽培作物を襲うことがわかっているトウ モロコシ根土[ダイアブロチカ種(Diabrotica 5pp) ] )ウ モロコシ、インゲンキャベツ、綿およびタバコに特に被害を与えるネキリムシ[ レビドテラン(le 1dopteran)科ノクチュイダエよび広く種々の野 菜の根を食べる根につくうじ[ブタラン(虹トteran)科アンソマイイダエ (Anthom■封憇)]の種々の属がある1いくつかの細菌種もまた植物病原 体であることが知られている1これらの多くは純粋な土壌生息生物であり、それ らの集団は宿主植物に集結するのであるが、土壌中に放出された場合にのみ徐々 に減少する。もし宿主植物体が毎年毎年同じ土壌で栽培されると土壌中の集団が 純増する場合がある。重要な細菌の病原体には、根こぶ病、小枝こぶ病、および 茎こぶ病の原因となるアグロバクテリウム、立枯れ病、葉枯れ病および軟腐病の 原因となるシュードモナス、ジャガイモ黒星病の原因となるストレプトミセス、 軟腐病の原因となるエルウィニア(Erwinfa)、および細菌性斑紋病およ び腐敗病の原因となるキサントモナス(Xanthomonas)がある。Similarly, many insects, especially insect larvae, cause serious damage to many different agricultural plants. This may cause Many species live in the soil around the plant trunk, where the larvae eventually attack. lay those eggs. Larvae of some species also spend significant periods of time in the soil. heavy Some of the key plant insect pests include cane, which is known to attack many cultivated crops. Sorghum root soil [Diabrotica 5pp]) The beetle beetle is particularly damaging to sorghum, bean cabbage, cotton and tobacco [ Family Lebidopteranidae Noctuidae and a wide variety of other species Maggots that grow on the roots that feed on the roots of rape [Family Anthomaidae] There are various genera of (Anthom) and some bacterial species are also plant pathogens. 1 Many of these are pure soil-dwelling organisms; Their populations converge on host plants, but only gradually when released into the soil. decreases to If the host plant is grown in the same soil year after year, the population in the soil There may be a net increase. Important bacterial pathogens include clubroot, twig clubroot, and Agrobacterium, which causes stem club disease, damping-off disease, leaf blight disease, and soft rot disease. Pseudomonas causes potato scab, Streptomyces causes potato scab, Erwinia (Erwinfa), which causes soft rot, and bacterial spot disease and There is a species called Xanthomonas that causes rot.

これらの病原性種の多くは、病気にかかった植物、有機物残がい、および種また は直接に土壌中でさえ越冬することができる。Many of these pathogenic species are found on diseased plants, organic debris, and seeds. can even overwinter directly in the soil.

特に重要な病原体は土壌伝播性真菌である。作物が栽培されるところではどこで も、多(の種々の属が世界中に見られる。種々の型の病害がこれらの真菌により 生じる。例えば、フィトフトラ(Phytophthora)属の種はタバコ、 大豆およびイチゴのような多くの重要な作物およびアザレア、ロードプントロン およびカメリアのような観賞植物に根肩痛、冠肩痛および茎肩痛を生じる原因と なる。ピチウム(Pythium)属のメンバーは世界の被子植物、野菜および 条植え作物に影響を及ぼす苗木の立枯れ病の原因となる。Pathogens of particular importance are soil-borne fungi. where crops are grown Various genera of fungi are found throughout the world.Different types of diseases are caused by these fungi. arise. For example, species of the genus Phytophthora are tobacco, Many important crops like soybean and strawberry and azalea, rhodopuntron and causes root shoulder pain, crown shoulder pain, and stem shoulder pain in ornamental plants such as camellias. Become. Members of the genus Pythium are the world's angiosperms, vegetables and It causes damping-off of seedlings that affects row-planted crops.

リゾクトニアソラニ(Rhizoctonia 5olani)種は他のどの植 物病原性真菌よりも、広く種々の植物にさらに多くの種々の型の病害の原因とな る。この破壊的病原体により引き起こされる病害の中に特表千4−506401  (4) は種腐敗、立枯れ、根肩痛、および冠肩痛があり、植物成長のほぼ全段階に影響 を及ぼす。フザリウム(Fusarium)およびベルチシリウム(Verti ci 1lic+m)属はほとんど全ての栽培作物に種肩痛、根肩痛、茎肩痛、 裾枯れ病、立枯れ病、および黒穂病、さや肩痛を引き起す多くの種を育している 。スフレロチニア(Sclerotinia)の多くの種が、インゲン、クルジ ファー(crucifers) 、大豆、タバコ、芝生および観賞植物の、水様 (watery)軟腐病や冠および茎肩痛の原因主体となる。チェラビオブシス (Thielaviopsis)は多くの野菜および花に黒板肩痛、立枯れ病を 生じる原因となる。The species Rhizoctonia 5olani is similar to any other plant. They cause more types of diseases on a wider variety of plants than pathogenic fungi. Ru. Among the diseases caused by this destructive pathogen is (4) has seed rot, damping-off, root-shoulder, and crown-shoulder, which affect almost all stages of plant growth. effect. Fusarium and Verticilium The ci1lic+m) genus causes seed shoulder pain, root shoulder pain, stem shoulder pain, We grow many species that cause blight, damping off, and smut, as well as pod shoulder blight. . Many species of Sclerotinia are found on common beans, curds, etc. crucifers, soybeans, tobacco, lawn and ornamental plants, watery (water) Main cause of soft rot and crown and stem shoulder pain. chelaviobsis (Thielaviopsis) causes chalkboard shoulder and damping-off disease on many vegetables and flowers. cause it to occur.

これらの真菌およびそれらのような他の全てとはいわないまでも多くは、それら の天然の宿主なしで長い期間それらが生き残ったり、ときには適当な条件下で再 び感染性になることを可能にする耐久性のあるライフサイクル期を有している。Many if not all of these fungi and others like them They can survive for long periods of time without a natural host and sometimes reproduce under suitable conditions. It has durable life cycle stages that allow it to become infected and infectious.

真菌が越冬するメカニズムの中には、菌核(宿主組織有りまたは無しの菌糸の小 さなかたまり)、卵胞子(水カビにより生成される)、有機物残がい中の厚膜胞 子および菌糸体がある。これらの構造でさらに耐性のあるものが適切な宿主が与 えられるまで土壌中でほとんど無限に、目にみえず発見されないまま存在してい るであろう。わずかな数のこれらの胎芽でさえ、そのような汚染された土壌中に 最終的に植えられた不運な作物には破壊的作用を及ぼすであろう。Among the mechanisms by which fungi overwinter are sclerotia (small hyphae with or without host tissue). clumps), oospores (produced by water mold), chlamydospores in organic debris There are children and mycelium. The more resistant of these structures can be found in suitable hosts. They remain invisible and undiscovered in the soil almost indefinitely until they are harvested. There will be. Even a small number of these embryos are found in such contaminated soil. It will have a destructive effect on the unlucky crop that is eventually planted.

■、病害予防 そのような病原体の活動による実質的な損害を防ぐ多くの方法となりえるものが ある。多くの殺カビ剤、殺菌剤、殺線虫剤が種または植物を処理するのに入手で き、適切な土壌調製および衛生法のような予防的方法もまた知られている。しか しながら、最も効果的な予防は土壌中の任意の潜伏期の病原体を初期に同定する ことにより特定の場所の土壌に汚染の危険性がありうることを認識することに存 在している。しかしながら、新しい植物組織の状況とは異なり、土壌中または腐 敗したまたは乾燥した植物組織中の病原体を発見し同定することは、はるかにと らえどころかない。■ Disease prevention There are many potential ways to prevent substantial damage from the activity of such pathogens. be. Many fungicides, fungicides, and nematicides are available for treating seeds or plants. Preventive methods such as proper soil preparation and sanitation are also known. deer However, the most effective prevention is the early identification of any latent pathogens in the soil. It is important to be aware that there may be a risk of contamination of the soil in a particular location. There is. However, unlike the situation with new plant tissue, Discovering and identifying pathogens in defeated or dried plant tissue is much more difficult. There's nothing wrong with that.

現在用いられている主要な実験法のひとつは希釈ブレーティングである。この方 法は土壌中の細菌を発見するうえで特に一般的である。この方法での問題は、大 部分において同じサンプル中の成育の早い第2のミクロフローラの存在により発 生し、関心のある第一の病原体の認識を妨害する。病原体が休止期で、したがっ てゆっくりと現われてくる場合、これは特に問題である。同様に、胎芽の数が所 定のサンプル中に少ないならば、他の生物の存在下でそれらを発見するのは不可 能ではないにしても難しい。さらに定性的な意味において単純な検出は問題を十 分に表示しない。定量化が、とられるべき処置または予防法の型を明示するのに 常に好ましくかつ不可欠である。One of the main experimental methods currently used is dilution brating. This person The method is particularly popular for finding bacteria in soil. The problem with this method is that caused by the presence of a second fast-growing microflora in the same sample. live and interfere with recognition of the primary pathogen of interest. The pathogen is dormant and therefore This is especially a problem if the symptoms appear slowly. Similarly, the number of embryos If they are small in a given sample, it is impossible to find them in the presence of other organisms. Although it is not Noh, it is difficult. Furthermore, in a qualitative sense, simple detection is sufficient to solve the problem. Do not display in minutes. Quantification is helpful in specifying the type of treatment or prevention that should be taken. Always desirable and essential.

土壌伝播性細菌病原体の単離、同定、および定量的分析は難しく、変化しやすい が、好適な方法が限定された数の例において明らかにされている。しかしながら 、同じ方法を土壌伝播性真菌に応用することはいまだに遅れをとっている。細菌 にきまって用いられるブレーティング・アウト法は数多くの種々の真菌性病原体 に容易に応用できず、さらには非常に時間のかかる工程であり、現われる全ての コロニーを同定する必要がある。Isolation, identification, and quantitative analysis of soil-borne bacterial pathogens is difficult and variable However, preferred methods have been demonstrated in a limited number of examples. however However, the application of the same method to soil-borne fungi still lags behind. bacteria The commonly used brating-out method is used to treat a large number of different fungal pathogens. It is a very time-consuming process that cannot be easily applied to Colonies need to be identified.

免疫アッセイは、それが非常に特異的でありうるだけでなく速くかつ定量的で病 原体検出に多くの期待される利点を提供する。Immunoassays are fast and quantitative, as well as being highly specific. It offers many promising advantages for conformal detection.

しかしながら、この方法は真菌性病原体検出に広く応用されず、そしてさらに土 壌サンプル中で越冬する胎芽を直接検出するためには決して用いられていない。However, this method has not been widely applied to fungal pathogen detection, and even in soil It has never been used to directly detect overwintering embryos in soil samples.

これは主として土壌サンプルを簡ベルを正確に示すことに成功していない。今日 でさえ、病原体真菌の存在を土壌検査する適切で便利な方法は全くなく、より従 来的方法が用い続けられている。This is mainly due to the lack of success in accurately representing soil samples. today There is no adequate and convenient way to test soil for the presence of pathogenic fungi, even in the case of more conventional methods. Traditional methods continue to be used.

例えば、5uttonおよびBarron (Can、 J、 Rot、 50 :1909−1914゜1972)はエンドボーン(Endogone)胞子を 単離するために付着−される。サンプルを分離用漏斗に注ぎ、そこに付着する物 質を紙のディスク上に洗い流し数えるo Furlanら(Trans、 Br 、 Mucol S。For example, 5utton and Barron (Can, J, Rot, 50 :1909-1914゜1972) produced Endogone spores. attached for isolation. Pour the sample into the separation funnel and see what sticks there. Rinse and count the samples on paper discs.Furlan et al. (Trans, Br. , Mucol S.

c、 75:336−338.1981)は内国根胞子の密度勾配抽出法を推せ んしている。その方法において、はじめに土壌サンプルを上に記載されているよ うに胞子が浮揚するように処理し、続いて上溝液を遠心にかける。湿式篩分けも また土壌から非常に多くの胞子を抽出するのに今でも一般に用いられている。こ のプロセスにおいて、土壌サンプルは水と混合し、沈澱の後、だんだんとより小 さなサイズのふるいに注がれる。すなわち、胞子は、よりこまかいサイズのふる いに恐らく保留されるo Abd−ElrazikおよびLorbeer(Ph ytopa−thology 70:892−894.1980)は湿式篩分け とグリセロール中に菌核を浮揚させることを結合し、続いて回収した菌核を数え る方法を開示している。さらに最近では、Ianson and A11enは 湿式篩分は浮揚−付着、および密度勾配遠心の使用を再検討し、これらの方法の あるものは検査される土壌の特別の型によっては他よりよいことに注目した。c, 75:336-338.1981) recommends a density gradient extraction method for internal rhizospores. I'm doing it. In the method, a soil sample is first collected as described above. The sea urchin spores are treated to float, and the supernatant fluid is then centrifuged. Wet sieving also It is also still commonly used to extract large numbers of spores from soil. child In the process, the soil sample is mixed with water and, after settling, becomes smaller and smaller. Pour into a small sieve. That is, the spores are formed into finer-sized sieves. Abd-Elrazik and Lorbeer (Ph.D. ytopa-thology 70:892-894.1980) is wet sieving and flotation of the sclerotia in glycerol, followed by counting the recovered sclerotia. Discloses how to do so. More recently, Ianson and A11en The use of wet sieving, flotation-adhesion, and density gradient centrifugation has been revisited and the use of these methods It was noted that some are better than others depending on the particular type of soil being tested.

上記の全ての方法、すなわち、土壌病原体検出に現在用いられている全ての方法 において、定量化は、その方法により保留された胞子、菌核(または有機残がい 物)の数を、高度に訓練された個人により、顕微鏡で目で検査し、実際に数える ことに依存している。そのような方法は、胎芽の単なる収集が望まれるかまたは 土壌サンプルが関心のある胎芽を含有するのを既に知っているかのような場合に は十分であるが、これらの方法は特別な病原体の存在をはじめて測定する目的ま たは既知の病原体の病気蔓延のレベルを正確に見積りするためには受け入れられ ない。さらに上記の方法により必要とされるプロセシング時間はあまりにも長す ぎ複雑な器具の使用を必要とするので実験室環境外での効率的な大規模な検査に 用いるには実用的でない。All methods mentioned above, i.e. all methods currently used for soil pathogen detection , quantification of spores, sclerotia (or organic debris) retained by the method (objects) visually inspected under a microscope and physically counted by highly trained individuals It depends on that. Such methods may be used to determine whether mere collection of embryos is desired or such as when you already know that the soil sample contains embryos of interest. Although sufficient, these methods are not intended for determining the presence of a particular pathogen for the first time. or is acceptable for accurately estimating the level of disease prevalence for known pathogens. do not have. Furthermore, the processing time required by the above method is too long. It requires the use of complex equipment, making it difficult to conduct efficient large-scale testing outside of the laboratory environment. impractical to use.

すばやくかつ定量的に、土壌中の植物病原体を正確に直接検出する方法の必要が 存在する。このことは、本発明、すなわちわずかに20−25分間の時間で数多 くのサンプルに関して種々の植物病原体による土壌の病気蔓延の正確な評価を提 供することができる方法により提供される。There is a need for a method to accurately and directly detect plant pathogens in soil, quickly and quantitatively. exist. This means that the present invention, i.e., a large number of provides an accurate assessment of soil disease prevalence caused by various plant pathogens on a large number of samples. Provided by a method that can provide.

3、発明の要約 本発明は、病原体構成成分を単離し、もし存在するならば、濃縮単位になるよう に土壌を処理し、液体培地において、任意の病原体構成成分を破壊し、病原体の 抗原をさらすようにして濃縮単位を処理し、病原体の抗原に特異性を有する抗体 を含む培地に接触させて、抗原と抗体との間の反応の存在または非存在を観察す るステップを含んで成る土壌サンプル中の植物病原体の存在または非存在を測定 する方法を提供する。3. Summary of the invention The present invention isolates the pathogen components, if present, so that they become concentrated units. Treat the soil to destroy any pathogen components and remove the pathogen in a liquid medium. The concentration unit is processed in such a way that the antigen is exposed and the antibody has specificity for the antigen of the pathogen. to observe the presence or absence of a reaction between the antigen and antibody. measuring the presence or absence of plant pathogens in a soil sample comprising the steps of: provide a method to do so.

明細書および請求項を通じて、“病原体”という語は、細菌および真菌のような 本来の病原体ならびに線虫または昆虫のような植物有害生物を含む広い意味に理 解されるべきである。“病原体構成成分”とは胎芽(例えば散布され病原体を再 生する生物体の部分)ならびに病原体の同定抗原を担持しているであろう、病原 体を含有する菌糸体または有機残がい物のような病原体の非胎芽的の断片または 部分の両者を意味する。“濃縮“または“濃縮単位に単離″という語は、病原体 構成成分を土壌から効果的に取り出し、免疫学的に検査されるのが可能な、より 小さな単位に単離されることを意味するのに用いられる。Throughout the specification and claims, the term "pathogen" refers to pathogens such as bacteria and fungi. It is understood in a broad sense to include natural pathogens as well as plant pests such as nematodes or insects. should be understood. “Pathogen component” refers to the embryo (for example, parts of living organisms) as well as pathogens that may carry the identifying antigens of the pathogen. non-embryonic fragments of pathogens such as mycelium or organic debris containing the body or It means both parts. The term “enriched” or “isolated into concentrated units” refers to The components can be effectively extracted from the soil and tested immunologically. Used to mean isolated into small units.

本発明の好ましい実施態様において、構成成分は浮揚により濃縮される。これは 、検出される構成成分が浮揚性であることを必要とし、かつ、卵胞子、菌核、厚 膜胞子または菌糸体のような真菌構成成分を検出するのに特にうまく適用される 。特に好ましい実施態様において、病原体構成成分は、浮揚と組合せて構成成分 の粘着力によりをの粘着表面に、又は構成成分を含有する水滴によりその表面に 捕えられる。In a preferred embodiment of the invention, the components are concentrated by flotation. this is , requires that the constituents detected be buoyant, and that oospores, sclerotia, and thick Particularly well applied to detect fungal components such as membrane spores or mycelium . In particularly preferred embodiments, the pathogen component is combined with levitation on the component. to the adhesive surface of the material due to its adhesive strength, or to that surface by water droplets containing the constituent components. Captured.

本発明は非常に応用性があり、ある条件下で、もし病気蔓延が高く陽性であるな らば、はんの20分間で単一のサンプルをプロセスすることができる。病気の蔓 延が低いレベルである場合、検査時間は長くなるかもしれないが、単一のサンプ ルにつき1.5−2時間以上になることはまれである。これはブレーティング・ アウトとの比較であるが、それは通常3−5日必要とし、実験条件下では発芽し ない休眠中の胎芽の検出のような、いくつかの目的には使用できない。本発明の 方法は、例えば密度勾配遠心と異なり任意の複雑な機械または器具の使用を必要 としないために、野外環境での部分的または全面的使用に容易に応用できる。本 発明は、また当方法に用いるために特に応用されるキットを提供し、キットは病 原体構成成分を濃縮する手段、病原体構成成分を破壊する手段、および検出され る病原体の抗原に特異性を育する少なくとも1個の抗体を含んでなる。好ましい 実施態様において、キットは、サンドインチ免疫アッセイを行うために、ひとつ は固定化され、もうひとつは標識化された2個の抗体を含有する。The present invention is highly applicable and under certain conditions, if disease prevalence is high and positive A single sample can be processed in 20 minutes. vine of disease If the spread is at a low level, the inspection time may be longer, but a single sample It is rarely more than 1.5-2 hours per hour. This is brating However, it usually requires 3-5 days and does not germinate under experimental conditions. It cannot be used for some purposes, such as the detection of dormant embryos. of the present invention The method does not require the use of any complex machinery or equipment, unlike e.g. density gradient centrifugation. It is easily adapted for partial or full use in outdoor environments as it does not cause any damage. Book The invention also provides a kit particularly adapted for use in the method, the kit means to concentrate drug components, destroy pathogen components, and detect The antibody comprises at least one antibody that develops specificity for the antigen of the pathogen. preferable In embodiments, the kit includes one kit for performing a sandwich immunoassay. contains two antibodies, one immobilized and the other labeled.

4、発明の詳細な説明 a、病原構成成分の濃縮 この方法は、関連した土壌が土壌構成成分から任意のありうる妨害を除去して適 切に取り出されるならば、土壌から検出される構成成分を濃縮する任意の方法に 利用することができる。湿式篩分けまたは密度勾配遠心のような、希釈−ブレー ティングよりも改善されたものとして元来開発された方法のいくつかは、土壌か ら検査される胞子または他の構成成分を単離する能力において、この方法を行う のに有用な第一のステップを提供する。しかしながら、この方法の便益は、これ らの手段を利用することで完全には達成されない。なぜなら複雑なことおよびお のおのに必要な時間のためである。したがって、それらは病原体構成成分を濃縮 する手段としてたしかに使用されるが、それらが特に好ましいわけではない。好 ましい方法は第一ステップとして浮揚−付着型を使用することであり、以下にそ の詳細を記載する。4. Detailed description of the invention a. Concentration of pathogenic components This method ensures that the soil concerned is suitable by removing any possible disturbances from the soil constituents. Any method of concentrating the constituents found in the soil should be can be used. Dilution-brake methods such as wet sieving or density gradient centrifugation Some of the methods originally developed as improvements over soil This method is carried out in the ability to isolate the spores or other constituents to be examined from provides a useful first step. However, the benefits of this method are This cannot be completely achieved using these methods. Because it's complicated and This is because of the time required for each. Therefore, they concentrate pathogen components Although they are certainly used as a means to do so, they are not particularly preferred. good The preferred method is to use a flotation-deposition method as a first step, which is described below. Describe the details.

i、浮揚および捕そく 好ましい実施態様において、本発明のこの方法は、胎芽または病原体構成成分を 濃縮するために、はぼ同時ステップで浮揚および捕そく方法を利用する。土壌を 所定の場所から収集する。プロセシングを促進するために、土壌を自然乾燥し、 大きなかたまりは乳ばちおよび乳棒で粉さいする。必要なら、土壌をふるい、シ フターまたはフィルターを通過させることによりさらに処理する。i. Levitation and capture In a preferred embodiment, the method of the invention comprises To concentrate, flotation and capture methods are utilized in simultaneous steps. soil Collect from designated locations. Air dry the soil to facilitate processing; Grind any large lumps with a mortar and pestle. If necessary, sieve and sieve the soil. Further processing by passing through a lid or filter.

測定された量の土壌を続いて適当な容器に入れ、それに水を加える。加えられる 水の量は重要ではないが、攪拌ができかつ懸濁物中にあわが形成される程度の量 とする。通常、土壌の2倍量がこの目的のためには充分な水である。土壌および 水を入れた容器にふたをし数秒激しく攪拌する。この攪拌により土壌中の任意の 浮揚性物質は表面に浮遊する。当方法の一実施態様において、浮揚単独でも関心 のある構成成分も効果的に濃縮するのに十分である。The measured amount of soil is then placed in a suitable container and water is added to it. added The amount of water is not critical, but should be sufficient to allow stirring and foam to form in the suspension. shall be. Usually twice the amount of water as soil is sufficient for this purpose. soil and Cover the container with water and stir vigorously for a few seconds. This agitation removes any particles in the soil. Buoyant substances float on surfaces. In one embodiment of the method, flotation alone is also of interest. is sufficient to effectively concentrate certain components.

例えば、それは水の表面から単に取り上げることのできる構成成分を持つような 場合である。そのようなひとつの例が有機残がい物に関連しているカンキツ類感 染性フィトフトラ(匹■吐凹堕])である。しかしながら、方法のもうひとつの 実施態様においては、大部分の場合における病原体構成成分の捕そくは、もうひ とつの方法を必要とする。構成成分は、好ましくは構成成分の付着を達成するこ とができる表面上で捕そくされるか、または構成成分を含有する水滴が表面に付 着するのに適当な表面張力を可能にする。For example, it may have constituents that can simply be taken up from the surface of the water. This is the case. One such example is citrus, which is associated with organic debris. It is a phytophthora. However, another method In embodiments, capture of pathogen components in most cases is accomplished by Requires a special method. The components are preferably Water droplets containing constituents are trapped on surfaces that can be Allows for appropriate surface tension to be applied.

明細書及び請求項で用いられる場合に、“付着面”の語は両方の型の表面を含ん で用いられる。一般的な言い方として、育用な付着面は、なめらかで堅く水を吸 収しない。この目的のために適切な材料の中には、ポリエチレン、ポリプロピレ ン、ポリスチレン、またはガラスがある。付着のために好ましい表面は、ガラス またはポリプロピレンである。攪拌後、続けて容器に、水をふちまで満たし、カ バースリップ、ガラススライドまたは他の付着面を、エアーポケットを避は容器 のふちから液体があふれないようにして、液体表面に直接、接するように置く。As used in the specification and claims, the term "adhesive surface" includes both types of surfaces. used in In general terms, the attachment surface of a plant is smooth, hard, and absorbs water. Not collected. Among the materials suitable for this purpose are polyethylene, polypropylene Polystyrene, polystyrene, or glass. The preferred surface for attachment is glass Or polypropylene. After stirring, fill the container with water to the brim and cover. Avoid air pockets on bar slips, glass slides or other adhesive surfaces in containers. Make sure that the liquid does not overflow from the edges, and place it so that it is in direct contact with the liquid surface.

ふたは短い時間、そのままにする。すなわち、約5分から約30分、その時間中 に水面上の浮揚性物質が付着面に付着する。続いて、ふたをまっすぐ持ち上げ、 付着している水の水滴がしたたり落ちないようにする。たれ下がっている水滴お よび任意の付着性固形粒子を第2の容器に移す。表面を完璧に洗浄する。好まし くはこれをはじめの抽出容器の上部にある水で行う。いくつかの浮揚性の粒子、 特に卵胞子はいくつかの付着面にしっかりと付く。Leave the lid on for a short time. That is, for about 5 minutes to about 30 minutes, during that time buoyant substances on the water surface adhere to the surface. Next, lift the lid straight up and Prevent any water droplets from dripping. Drops of water and any adherent solid particles to a second container. Thoroughly clean surfaces. preferred Do this with water at the top of the first brewing vessel. some buoyant particles, In particular, oospores adhere firmly to several attachment surfaces.

b、構成成分の破壊 病原構成成分を検査に好適なようにするために、それらを完全に溶解する必要は ない。むしろ1個またはそれ以上の抗原が放出され、それら自体が可溶化される ように完全な状態を破壊することが必要なだけである。構成成分の破壊は任意の 既知の方法により達成される。これは、例えば乳ばちおよび乳棒型の粉さい器ま たは他の粉さい器具により機械的になされる。一方、電気ショックを卵胞子のよ うな構成成分を破壊するために集取した液体サンプルに使用できる。他の破壊方 法として可溶化化学処理または酵素的処理を包含する。これらの方法の変形体は 当業者には明らかであろう。b. Destruction of constituent components Complete lysis of pathogenic components is not necessary to make them suitable for testing. do not have. Rather, one or more antigens are released and themselves solubilized. It is only necessary to destroy the complete state. Destruction of components is optional This is achieved by known methods. This is for example a mortar and pestle type flour or mechanically with other sieving equipment. On the other hand, electric shock can be applied to oocytes. It can be used on collected liquid samples to destroy such constituents. Other methods of destruction Methods include solubilization chemical treatments or enzymatic treatments. Variants of these methods are It will be clear to those skilled in the art.

粉さい後、サンプルは続いて免疫アッセイで直接検査用に用いられる。しかしな がら、サンプル中の不溶可成がいの量にもよるが、検査の前にどんな固形物も取 り除くのが好ましい。短い遠心が、そのような残がいおよび検査用に用いられる 上溝物を都合よく取り出すように役立つ。かわるがわるサンプルをろ過し、ろ過 物は免疫アッセイに使用される。After trituration, the sample is subsequently used for direct testing in an immunoassay. However However, depending on the amount of insoluble slag in the sample, any solids should be removed before testing. It is preferable to remove the A short centrifugation is used for such debris and inspection. It is useful for conveniently removing items from the top. Filter and filter samples in turn The product is used in immunoassays.

C9免疫アッセイ 免疫学的検査の方法はよく知られており、当方法は特別に任意の形式のアッセイ にかならずしも限定されるものではない。そのような方法としては固相または液 相の凝集反応、沈降反応、免疫電気泳動、ラジオイムノアッセイ、蛍光体結合免 疫吸着アッセイおよび酵素結合免疫吸着アッセイを包含する。しかしなから、実 行の容易さのために、好ましい形式は固相ELISAである。かかるアッセイに おいて、関心のある病原体の抗原に特異性を有する抗体を当業者が認識している 方法で固形基質上に固定する。検査されるサンプルを抗原−抗体複合体を形成す る結合した抗体と接触させる。複合物は続いて検出できる位に標識されている第 二の病原体特異抗体と接触される。標識抗体は抗原に結合し、抗体−抗原−抗体 複合体が形成され、その存在は検出できる標識の観察により確認される。この一 般的方法に関する変形体は当業者によく知られている。好ましい実施態様におい て、検出できる標識は酵素である。酵素標識物の存在は適切な酵素基質の添加に より示され、それは、加水分解の後、培地中に分析用に検出できる位の変化を生 じる。C9 immunoassay Immunological testing methods are well known and our method is specifically applicable to any format of assay. It is not necessarily limited to. Such methods include solid phase or liquid phase phase agglutination reaction, precipitation reaction, immunoelectrophoresis, radioimmunoassay, fluorophore-conjugated immunological immunosorbent assays and enzyme-linked immunosorbent assays. However, the truth is Due to ease of implementation, the preferred format is solid phase ELISA. For such assays A person skilled in the art will recognize antibodies that have specificity for the antigen of the pathogen of interest. method to immobilize on a solid substrate. The sample to be tested is processed to form antigen-antibody complexes. contact with the bound antibody. The complex is then detected with a detectably labeled compound. contact with two pathogen-specific antibodies. The labeled antibody binds to the antigen, resulting in antibody-antigen-antibody A complex is formed and its presence is confirmed by observation of a detectable label. This one Variations on the general method are familiar to those skilled in the art. Preferred embodiment The detectable label is an enzyme. The presence of the enzyme label is necessary for the addition of the appropriate enzyme substrate. It has been shown that, after hydrolysis, it produces analytically detectable changes in the culture medium. Jiru.

使用される抗体の型は測定される病原体の同定に依存する。現在数種の真菌病原 体に種々の特異性のある数多くの抗体が入手できる。これらのうちには、ピチウ ム(Pythium)または、フィトフトラ(Phytophthora) ( EP Publ、 No、222998) 、スフレロチニア(Sclerot inia) (EP Publ、 No、234501)またはりジフトニア( Rhizoctonia) (E!P Appl、 No、88106775. 5)と反応する抗体がある。5chots、”A Serological A pproach to the Identificationof Pota to Cyst Nematodes、’、 p、11B、 Agricult ural University。The type of antibody used depends on the identity of the pathogen being measured. Currently several fungal pathogens A large number of antibodies are available with different specificities for the body. Among these are Pithi Pythium or Phytophthora ( EP Publ, No, 222998), Sclerotinia inia) (EP Publ, No, 234501) or diphtonia ( Rhizoctonia) (E!P Appl, No, 88106775. There is an antibody that reacts with 5). 5chots, “A Serological A Pproach to the Identification of Pota to Cyst Nematodes,’, p, 11B, Agricult Ural University.

Wageningen、 The Netherlands、 198gは抗− ネマトーダ抗体を記載している。抗体はモノクローナルまたはポリクローナル、 あるいはモノクローナルおよびポリクローナルの組合せである。“レポーター” 抗体の標識には分析上検出できる、例えばラジオアイソトープ、化学ルミネッセ ンス分子、蛍光分子または生物ルミネッセンス分子のような任意の型の分子で理 論的に行うことができる。しかしながら、単純性および費用から特に好ましいの は酵素標識である。種々の酵素がこの目的のために入手できる。例えばアルカリ ホスファターゼ、ベータガラクトシダーゼまたはホースラデッシュペルオキシダ ーゼ。熟練した当業者は認識されたELISA方法中に生じる変形を容易に認識 するであろう。Wageningen, The Netherlands, 198g is anti- Describes nematode antibodies. Antibodies can be monoclonal or polyclonal; Or a combination of monoclonal and polyclonal. “Reporter” Antibody labels can be analytically detectable, such as radioisotopes, chemiluminescence, etc. with any type of molecule, such as fluorescent, fluorescent or bioluminescent molecules. It can be done logically. However, it is particularly preferred due to its simplicity and cost. is an enzyme label. A variety of enzymes are available for this purpose. For example, alkali Phosphatase, beta-galactosidase or horseradish peroxidase -ze. Those skilled in the art will readily recognize variations that occur during recognized ELISA methods. will.

d0診断用キット ひとつの実施態様において、当方法は実験または野外で用いるのに順応できる検 査キットで実施される。検査キットはその基本的な要素として土壌サンプル中の 構成成分の浮揚手段、構成成分を捕そくする手段、構成成分を破壊する手段、お よび関心ある病原体に特異性を有する抗体を含有する。浮揚手段は土壌および水 サンプルを入れるのに好適な任意の型の容器でさらに攪拌することができるもの である。これは、バイアル、ビン、試験管、フラスコまたはその他である。上に 記載されているように、捕そく手段は構成成分またはそれを含有している水滴が 付着する表面を有しているべきである。これは容器の表面を上にぴったりと付け るキャップの形態であり、または単なるガラスのカバースリップまたはスライド である。破壊する手段は乳ばちおよび乳棒のような任意の便利な機械的粉さい器 具または化学的または酵素的可溶化剤である。固相抗体は、例えばガラススライ ド、多ウェル型プレート、試験管、計深棒、流出器具または当業者に知られてい る任意の他の固相上に固定化される。任意の他の盟の検出可能な標識も使用され るが、標識化抗体は溶液中であり、実験室外での観察を容易にするためには酵素 標識が好ましい。酵素標識が使用される場合、キットはまた酵素用の基質も含有 する。好ましくは、キットは可溶化サンプルから不可溶成がいを取り除くろ過を 含有する。d0 diagnostic kit In one embodiment, the method includes a test that is amenable to laboratory or field use. It is carried out with a test kit. The basic element of the test kit is to detect Means for flotation of the constituents, means for capturing the constituents, means for destroying the constituents, and and antibodies with specificity for the pathogen of interest. Flotation means are soil and water Any type of container suitable for holding the sample and capable of further agitation It is. This can be a vial, bottle, test tube, flask or other. above As stated, the capture means may contain components or water droplets containing them. It should have a surface to adhere to. This is done so that the surface of the container is firmly on top. in the form of a cap, or just a glass coverslip or slide. It is. The means of destruction is any convenient mechanical sieve, such as a mortar and pestle. chemical or enzymatic solubilizers. Solid-phase antibodies can be used, for example, on glass slides. a well, a multi-well plate, a test tube, a dipstick, an outflow device or any other device known to those skilled in the art. immobilized on any other solid phase. Any other detectable marker may also be used. However, labeled antibodies are in solution, and enzymes are required to facilitate observation outside the laboratory. Labels are preferred. If an enzyme label is used, the kit also contains a substrate for the enzyme. do. Preferably, the kit includes filtration to remove undissolved particles from the solubilized sample. contains.

当方法および診断キットは、数多くの形態の種々の植物病原体の存在を検出する のに用いられる。検出できる構成成分の型は、線虫の卵または幼虫、昆虫の卵ま たは幼虫、真菌の卵胞子、菌核、〜冬胞子、胞子のう、接合胞子、厚膜胞子、遊 走子、または菌糸体および細菌細胞を包含するが、これらに限定されない。他の 型の生物を検出する応用方法は当業者には明らかであろう。The method and diagnostic kit detect the presence of various plant pathogens in numerous forms. used for. The types of components that can be detected are nematode eggs or larvae, insect eggs or larvae, or larvae, fungal oospores, sclerotia, ~teliospores, sporangia, zygospores, chlamydospores, and fungal oospores. Including, but not limited to, spores, or mycelia and bacterial cells. other Applications for detecting types of organisms will be apparent to those skilled in the art.

次の非制限実施例は本発明の方法の実例となる。The following non-limiting examples are illustrative of the method of the invention.

5、実施例 土壌サンプルを室温で自然乾燥させ、大きな塊を乳鉢と乳棒を使ってすりつぶし た。この土壌を粉末シフターに通して完全に混合した。土壌あたり4つのサブサ ンプル(10g)を秤量して、ねじ込み上部キャップを有する20ccのシンチ レーションバイアルに入れた。5. Examples Let the soil sample air dry at room temperature and grind any large clumps using a mortar and pestle. Ta. The soil was passed through a powder sifter to mix thoroughly. 4 subsample per soil Weigh the sample (10g) into a 20cc cinch with a screw-on top cap. in a ration vial.

B、土壌からフィトフトラ属菌を抽出するための浮揚法それぞれの土壌サンプル は順次以下のように処理した:サブサンプルバイアルのほぼ4分の3のところま で蒸留脱イオン水を満たした。バイアルにキャップをかぶせ、20秒間激しく振 とうした。水をバイアルのふちまで加え、カバーグラスを各バイアルの上部に置 いて、液体と接触させた。カバーグラスの下にエアポケットができないように水 面を十分に高くする一方で、液体が溢れ出ないようにした。30分後、カバーグ ラスを、傾けることなく、まっすぐに持ち上げて一度に一枚ずつ取り外した。垂 れる水滴やカバーグラスに付着している固体粒子を、コンテス・ディスポーザブ ル・ペレット・ペストゥル(Kontes Disposable Pe1le t Pe5−tle)と組合わせて使うように作られた微量遠心チューブに移し た。カバーグラスを各バイアルの上部からの50μmで洗い、微量遠心チューブ に入れた。サブサンプルあたり1つの抽出物を調製し、後でサブサンプルをプー ルした。B. Soil samples for each flotation method for extracting Phytophthora from soil were processed sequentially as follows: approximately three-quarters of the way through the subsample vial. Filled with distilled deionized water. Cap the vial and shake vigorously for 20 seconds. Last night. Add water to the rim of the vials and place a coverslip on top of each vial. and brought into contact with liquid. Water to prevent air pockets from forming under the coverslip. The surface was raised high enough to prevent liquid from spilling out. 30 minutes later, Kabag The lath was removed one at a time by lifting it straight up without tilting it. Tare Contes disposable Kontes Disposable Pe1le Transfer to a microcentrifuge tube designed for use in combination with Pe5-tle). Ta. Wash the coverslips 50 μm from the top of each vial and place in a microcentrifuge tube. I put it in. Prepare one extract per subsample and pool the subsamples later. I did it.

C9イムノアッセイ用の土壌抽出液の調製トールボーイズ・ラボラトリ−・スタ ーラー(Talboys ’Labora−tory 5tirrer) 13 4−2型で駆動させたコンテス・ペレット・ペストゥルを使って、抽出物を25 0Orpmで1分間破砕した。Preparation of soil extract for C9 immunoassay Tallboys Laboratory Sta. -Talboys' Labora-tory 5tirrer 13 Using a Comtesse Pellet Pestur driven in a 4-2 model, the extract was It was crushed for 1 minute at 0 rpm.

300μmの抽出物希釈液を各チューブに加え、短時間のポルテックス混合を行 った。土壌サンプルあたり4つのサブサンプルをプールし、l 0000 r  pmで1分間遠心し、0.08μmフィルターを通して濾過した。濾過抽出液は 清浄な微量遠心チューブに集めた。Add 300 μm extract dilution to each tube and briefly portex mix. It was. Pool 4 subsamples per soil sample, l 0000 r  Centrifuged at pm for 1 minute and filtered through a 0.08 μm filter. The filtered extract is Collected into a clean microcentrifuge tube.

D、フィトフトラ属菌のイムノアッセイアグリーダイアグノスチクス・フィトフ トラ“E”マルチウェルキット(Agri−Diagnostics’ Phy tophthora″E″Multiwell Ki−t)を使って、フィトフ トラ属菌の存在について土壌抽出液を調べた。このキットは、マイクロタイター プレートの表面に固定化した一次抗体として5μg/mlのアフィニティー精製 したヒツジ抗フィトフトラ・メガスペルマ抗体を使用する二抗体ELISAであ った。一連の実験室調製したフィトフトラ・メガスペルマ卵胞子標準をO/mL  50/mL 100/m1および200/mlの濃度で各マイクロタイタープ レートにおいて使用した。D. Immunoassay of Phytophthora sp. Tiger “E” Multiwell Kit (Agri-Diagnostics’ Phy Tophthora "E" Multiwell Kit) Soil extracts were examined for the presence of Tora spp. This kit is a microtiter Affinity purification of 5 μg/ml as primary antibody immobilized on the surface of the plate. This is a two-antibody ELISA using a sheep anti-Phytophthora megasperma antibody. It was. A series of laboratory-prepared Phytophthora megasperma oospore standards in O/mL 50/ml, 100/ml and 200/ml each microtitre It was used in the rate.

100μlの調製した土壌抽出液または標準を2つの抗体感作ウェルと1つの非 感作ウェルのそれぞれにピペットで分注した。このプレートをタイターチクプレ ートシェーカー(Titertek plateshaker )上で室温にて 20分間インキュベートし、6回洗い、その後100μm/ウェルの複合体と共 にさらに20分間インキュベートした。この複合体は西洋ワサビペルオキシダー ゼに結合した7μg/mlの濃度の2種類のモノクローナル抗フィトフトラ・メ ガスペルマ抗体の混合物であった。プレートの洗浄後、100μm/ウェルのA BTS基質を加え、振とうしながら10分間インキュベートした。50μI/ウ エルの1.5%NaFを加えて基質の発色反応を止めた:各つェルの405nm での吸光度をダイナチクミニリーダー(Dynatech MiniReade r ) IIを使って読み取った。各試験および標準において、感作ウェルの平 均吸光度から非感作ウェルの吸光度を差し引いた。フィトフトラの相対レベルは 、土壌抽出物の“補正した”平均吸光度と実験室調製した卵胞子標準の補正した 読み取り値とを比較することにより概算した。Add 100 μl of the prepared soil extract or standard to two antibody-sensitized wells and one non-antibody sensitized well. Pipette into each sensitized well. Tighter this plate on a Titertek plateshaker at room temperature. Incubate for 20 minutes, wash 6 times, then plate with 100 μm/well of complex. The cells were incubated for an additional 20 minutes. This complex is horseradish peroxidase Two monoclonal anti-Phytophthora membranes at a concentration of 7 μg/ml bound to It was a mixture of gasperma antibodies. After washing the plate, 100 μm/well of A BTS substrate was added and incubated for 10 minutes with shaking. 50μI/U The color reaction of the substrate was stopped by adding 1.5% NaF in each well: 405 nm in each well. The absorbance was measured using a Dynatech MiniReader. r) II. For each test and standard, the sensitized well The absorbance of non-sensitized wells was subtracted from the average absorbance. The relative levels of Phytophthora are , the “corrected” average absorbance of soil extracts and the corrected mean absorbance of laboratory-prepared oospore standards. It was estimated by comparing with the reading value.

この方法を使用した種々の試験の結果を表1a−dに示す。これらのデータから 、この方法は少なくとも4種類の異なる作物/病原体系の検出に効果的であるこ とが分かる。The results of various tests using this method are shown in Tables la-d. From these data , this method has been shown to be effective in detecting at least four different crop/pathogen systems. I understand.

(本頁以下余白) 表 1 0標準+915の吸光度 フィトフトラ検出されない0標準+、15→50m1 の吸光度 低レベルのフィトフトラ50m1標準→100m1の吸光度 中レベ ルのフィトフトラ>100+++I標準の吸光度 高レベルのフィトフトラa、 直接土壌イムノアッセイにより試験した大豆土壌抽出物中のフィトフトラ属菌の 検出 A−3、03検出されない A−271,65高 100 0、92 200 1、97 b、直接土壌イムノアッセイにより試験したかんきつ類土壌抽出物中のフィトフ トラ属菌の検出 サンプルII MY吸光度 PmgレベルJB 19−1 .11 検出されな いJB 19−8 .10 // JB14−3.36低 JB14−8.40低 JB8−3.73中 JB13−6.61中 JB13−11.05高 JBBSO−271,63高 卵胞子標準(卵胞子/■l) 9 0、05 5Q 0.47 100 0、96 200 1.91 C,アグリーダイアグノスチクス・リゾクトニア・イムノアッセイにより試験し た大豆土壌抽出物中のりジフトニア属菌の検出結果 サンプルl MW吸光度 結 果 8000 >2.00 陽性 8001 1.38 /1 8002 1、37 N 8003 >2.00 ” 8009 0、28 // 緩衝液 0.03 検出されない d、アグリーダイアグノスチクス・ピチウムCマルチウェルキットにより試験し た大豆土壌抽出物中のピチウム属菌の検出サンプルIt MW吸光度 結 果 A−41,35陽性 A−260,00検出されない A−270,57陽性 に−BUC2−61,77/’ PNO2−60,55// ワトソン 0.23 ” 緩衝液 0.00 検出されない 国際調査報告 PCr/UIS90701615 1X、WXKLm 1smCKED/BlkRCB ?ERX8:5oil/ funq? ins@ct# 1^l―−11町−11t@−^@tha−電か””’1?er/US≦X)1 0161’i(Margins below this page) Table 1 Absorbance of 0 standard + 915 Phytophthora not detected 0 standard +, 15 → 50 m1 Absorbance of low level Phytophthora 50ml standard → absorbance of 100ml medium level Phytophthora >100+++I standard absorbance High level of Phytophthora a, of Phytophthora sp. in soybean soil extracts tested by direct soil immunoassay. detection A-3, 03 not detected A-271, 65 high 100 0, 92 200 1, 97 b. Phytophthalmos in citrus soil extracts tested by direct soil immunoassay Detection of Tora spp. Sample II MY absorbance Pmg level JB 19-1. 11 Not detected IJB 19-8. 10 // JB14-3.36 low JB14-8.40 low JB8-3.73 medium JB13-6.61 JB13-11.05 high JBBSO-271,63 high Oospore standard (oospore/■l) 9 0, 05 5Q 0.47 100 0, 96 200 1.91 C. Tested by Agree Diagnosticus Rhizoctonia Immunoassay Detection results of Diphtonia spp. in soybean soil extract Sample l MW absorbance results 8000>2.00 positive 8001 1.38/1 8002 1, 37 N 8003>2.00” 8009 0, 28 // Buffer 0.03 Not detected d, tested by Agree Diagnosticus pythium C multiwell kit. Detection sample of Pythium genus bacteria in soybean soil extract MW absorbance results A-41,35 positive A-260,00 not detected A-270,57 positive ni-BUC2-61,77/' PNO2-60,55// Watson 0.23” Buffer 0.00 Not detected international search report PCr/UIS90701615 1X, WXKLm 1smCKED/BlkRCB? ERX8:5 oil/ Funq? ins@ct# 1^l--11 town-11t@-^@tha-denka""'1? er/US≦X)1 0161’i

Claims (60)

【特許請求の範囲】[Claims] 1.植物病原体を含む疑いのある土壌サンプル中の該病原体の有無および、存在 するときは、そのレベルを測定する方法であって、 (a)土壌サンプルを、病原体構成成分を濃縮単位として分離すべく処理するこ と; (b)該濃縮単位を、病原体構成成分を破砕し且つ病原体の抗原を露出させるべ く、液体媒質中で処理すること;(c)段階(b)の媒質を、該病原体に特異的 な抗体少なくとも1種と接触させること;および (d)抗原および抗体間の反応の有無を観察すること;から成る方法。1. Presence and presence of plant pathogens in soil samples suspected of containing them If so, how to measure the level, (a) processing soil samples to separate pathogen components as concentrated units; and; (b) the concentration unit is adapted to disrupt pathogen components and expose antigens of the pathogen; (c) treating the medium of step (b) in a liquid medium specific for the pathogen; contacting with at least one type of antibody; and (d) observing the presence or absence of a reaction between the antigen and the antibody; 2.浮揚、遠心、または温式篩分けにより病原体構成成分を濃縮する、請求項1 の方法。2. Claim 1: Concentrating pathogen components by flotation, centrifugation, or hot sieving. the method of. 3.浮揚により該構成成分を濃縮する、請求項2の方法。3. 3. The method of claim 2, wherein said components are concentrated by flotation. 4.付着面での捕獲により該構成成分をさらに濃縮する、請求項3の方法。4. 4. The method of claim 3, wherein said component is further concentrated by capture on a deposition surface. 5.付着面はガラス、ポリエチレン、ポリプロピレン、またはポリスチレンであ る、請求項4の方法。5. The attachment surface may be glass, polyethylene, polypropylene, or polystyrene. 5. The method of claim 4. 6.抗体は検出可能に標識されている、請求項1の方法。6. 2. The method of claim 1, wherein the antibody is detectably labeled. 7.抗体は酵素で標識されている、請求項6の方法。7. 7. The method of claim 6, wherein the antibody is enzyme labeled. 8.抗原を2積類の抗体と接触させ、一方は固定化されており、他方は検出可能 に標識されている、請求項1の方法。8. The antigen is brought into contact with two types of antibodies, one is immobilized and the other is detectable. 2. The method of claim 1, wherein the method is labeled as . 9.検出可能に標識された抗体は酵素で標識されている、請求項8の方法。9. 9. The method of claim 8, wherein the detectably labeled antibody is enzyme labeled. 10.該構成成分を機械的に、化学的に、または酵素により破砕する、請求項1 −9のいずれか1項の方法。10. Claim 1, wherein the constituent components are disrupted mechanically, chemically, or enzymatically. −9. The method according to any one of 9. 11.該病原体は線虫、真菌、細菌または昆虫である、請求項1−9のいずれか 1項の方法。11. Any of claims 1-9, wherein the pathogen is a nematode, a fungus, a bacterium or an insect. Method in section 1. 12.該病原体は真菌である、請求項1−9のいずれか1項の方法。12. 10. The method of any one of claims 1-9, wherein the pathogen is a fungus. 13.真菌はピチウム(Pythium)、リゾクトニア(Rhizocto− nia)、スクレロチニア(Sclerotinia)、フィトフトラ(Phy −toPhthora)、フザリウム(Fusarium)、べルチシリウム( Ver−ticillium)、またはチエラビオプシス(Thielavio psis)属菌である、請求項12の方法。13. Fungi include Pythium and Rhizoctonia. nia), Sclerotinia, Phytophthora (Phytophthora) -toPhthora), Fusarium, Verticillium ( Ver-ticillium, or Thielaviopsis 13. The method according to claim 12, wherein the bacterium belongs to the genus Psis. 14.該構成成分は卵胞子、胞子嚢、厚膜胞子、遊走子、菌核または菌子体であ る、請求項12の方法。14. The constituents are oospores, sporangia, chlamydospores, zoospores, sclerotia or mycelium. 13. The method of claim 12. 15.該病原体は線虫である、請求項1−9のいずれか1項の方法。15. 10. The method of any one of claims 1-9, wherein the pathogen is a nematode. 16.線虫はメロイドジネ(Meloidogyne)、ヘテロデラ(Hete −rodera)、グロボデラ(Globodera)、チレンクス(Tyle nchus)、またはプラチレンクス(Pratylenchus)属である、 請求項15の方法。16. Nematodes include Meloidogyne and Heterodera. -rodera), Globodera, Tylenchus nchus), or of the genus Pratylenchus, 16. The method of claim 15. 17.該病原体は細菌である、請求項1−9のいずれか1項の方法。17. 10. The method of any one of claims 1-9, wherein the pathogen is a bacterium. 18.細菌はエルウイニア(Erwinia)、アグロバクテリウム(Agro −bacterium)、シュードモナス(Pseudomonas)、ストレ プトミセス(Strepto−myces)またはキサントモナス(Xanth o−monas)属である、請求項17の方法。18. Bacteria include Erwinia and Agrobacterium. -bacterium), Pseudomonas, Stre. Ptomyces (Strepto-myces) or Xanthomonas (Xanth 18. The method of claim 17, wherein the plant belongs to the genus O-monas. 19.該病原体は昆虫である、請求項1−9のいずれか1項の方法。19. 10. The method of any one of claims 1-9, wherein the pathogen is an insect. 20.昆虫はコーンルートワーム(corn root worm、Diabr oti−ca種)、ヨトウムシ、ハリガネムシ、またはネクイムシである、請求 項19の方法。20. Insects are corn root worms, diabr. oti-ca species), a fall armyworm, a cutworm, or a hair beetle. The method of Section 19. 21.植物病原体を含む疑いのある土壌サンプル中の該病原体の有無を調べる方 法であって、 (a)土壌サンプルを液体媒質中でかき混ぜて、液面に浮上性病原体構成成分を 浮き上がらせること;(b)該構成成分を濃縮すべく、該構成成分を含むと予想 される液体媒質の部分を分離すること; (c)分離した媒質部分を、そこに含まれる病原体構成成分を破砕し且つ病原体 の抗原を露出させるべく処理すること;(d)段階(c)の処理部分を該病原体 に特異的な抗体と接触させること;および (e)抗原と抗体間の反応の有無を観察すること;から成る方法。21. Those who investigate the presence or absence of plant pathogens in soil samples suspected of containing them. The law is (a) A soil sample is stirred in a liquid medium to deposit floating pathogen components on the surface of the liquid. (b) floating a substance expected to contain said constituent in order to concentrate said constituent; separating the parts of the liquid medium that are (c) The separated medium portion is crushed to remove the pathogen components contained therein, and the pathogen is removed. (d) treating the treated portion of step (c) to expose the antigen of the pathogen; contacting with an antibody specific for; and (e) observing the presence or absence of a reaction between the antigen and the antibody; 22.分離は液面と付着面を接触させることにより達成される、請求項1の方法 。22. 2. The method of claim 1, wherein the separation is achieved by contacting the liquid surface with the adhering surface. . 23.付着面はガラス、ポリエチレン、ポリプロピレン、またはポリスチレンで ある、請求項22の方法。23. The attachment surface can be glass, polyethylene, polypropylene, or polystyrene. 23. The method of claim 22. 24.抗体は検出可能に標識されている、請求項23の方法。24. 24. The method of claim 23, wherein the antibody is detectably labeled. 25.抗体は酵素で標識されている、請求項24の方法。25. 25. The method of claim 24, wherein the antibody is enzyme labeled. 26.段階(d)において、処理部分を2種類の抗体と接触させ、一方は固定化 されており、他方は検出可能に標識されている、請求項23の方法。26. In step (d), the treated part is contacted with two types of antibodies, one of which is immobilized. 24. The method of claim 23, wherein the second one is detectably labeled. 27.標識抗体は酵素で標識されている、請求項26の方法。27. 27. The method of claim 26, wherein the labeled antibody is labeled with an enzyme. 28.該病原体は線虫、真菌、細菌または昆虫である、請求項21−27のいず れか1項の方法。28. Any of claims 21-27, wherein the pathogen is a nematode, a fungus, a bacterium or an insect. Method 1. 29.該病原体は真菌である、請求項21−27のいずれか1項の方法。29. 28. The method of any one of claims 21-27, wherein the pathogen is a fungus. 30.該病原体はピチウム(Pythium)、リゾクトニア(Rhi−zoc tonia)、スクレロチニア(Sclerotinia)、フィトフトラ(P hy−toPhthora)、フザリウム(Fusarium)、ベルチシリウ ム(Verti−cillium)、またはチエラビオプシス(ThieIav iopsis)属菌である、請求項29の方法。30. The pathogens include Pythium, Rhizoctonia tonia), Sclerotinia, Phytophthora (P hy-toPhthora), Fusarium, Verticillium Verti-cillium, or Thielaviopsis 30. The method according to claim 29, wherein the bacterium is of the genus Iopsis. 31.該構成成分は卵胞子、胞子嚢、厚膜胞子、遊走子、菌核または菌子体であ る、請求項29の方法。31. The constituents are oospores, sporangia, chlamydospores, zoospores, sclerotia or mycelium. 30. The method of claim 29. 32.該病原体は線虫である、請求項21−27のいずれか1項の方法。32. 28. The method of any one of claims 21-27, wherein the pathogen is a nematode. 33.線虫はメロイドジネ(Meloidogyne)、ヘテロデラ(Hete −rodera)、グロボデラ(Globodera)、チレンクス(Tyle nchus)、またはプラチレンクス(Pratylenchus)属である、 請求項32の方法。33. Nematodes include Meloidogyne and Heterodera. -rodera), Globodera, Tylenchus nchus), or of the genus Pratylenchus, 33. The method of claim 32. 34.該病原体は細菌である、請求項21−27のいずれか1項の方法。34. 28. The method of any one of claims 21-27, wherein the pathogen is a bacterium. 35.細菌はアグロバクテリウム(Agrobacterium)、シュードモ ナス(Pseudomonas)、ストレプトミセス(Streptomyce s)、エルウイニア(Erwinia)、またはキサントモナス(Xantho monas)属である、請求項34の方法。35. Bacteria are Agrobacterium, Pseudomonas Pseudomonas, Streptomyce s), Erwinia, or Xanthomonas 35. The method of claim 34, wherein the plant belongs to the genus Monas. 36.該病原体は昆虫である、請求項21−27のいずれか1項の方法。36. 28. The method of any one of claims 21-27, wherein the pathogen is an insect. 37.昆虫はコーンルートワーム(corn root worm、Diabr o−tica種)、ヨトウムシ、ハリガネムシ、またはネクイムシである、請求 項36の方法。37. Insects are corn root worms, diabr. o-tica species), a fall armyworm, a cutworm, or a hair beetle. The method of Section 36. 38.土壌中の植物病原体を検出するための診断試験キットであって、 (a)土壌から病原体構成成分を濃縮する手段;(b)病原体構成成分を破砕す る手段;(c)該病原体に対して特異性を有する固定化抗体;および(d)該病 原体に対して特異性を有する標識抗体;を含むキット。38. A diagnostic test kit for detecting plant pathogens in soil, comprising: (a) means of concentrating pathogen components from soil; (b) crushing pathogen components; (c) an immobilized antibody having specificity for the pathogen; and (d) a means for treating the disease. A kit comprising: a labeled antibody having specificity for the drug substance; 39.該病原体を濃縮する手段は、 (i)浮揚手段、および (ii)捕獲手段 を含む、請求項38のキット。39. The means for concentrating the pathogen is (i) flotation means; and (ii) Capture means 39. The kit of claim 38, comprising: 40.捕獲手段は付着面である、請求項39のキット。40. 40. The kit of claim 39, wherein the capture means is an attachment surface. 41.付着面はガラス、ポリエチレン、ポリプロピレン、またはポリスチレンで ある、請求項40のキット。41. The attachment surface can be glass, polyethylene, polypropylene, or polystyrene. 41. The kit of claim 40. 42.標識抗体は酵素で標識されている、請求項38−41のいずれか1項のキ ット。42. 42. The kit of any one of claims 38-41, wherein the labeled antibody is labeled with an enzyme. t. 43.該酵素の基質をさらに含む、請求項42のキット。43. 43. The kit of claim 42, further comprising a substrate for said enzyme. 44.該病原体は線虫、真菌、細菌または昆虫である、請求項38−41のいず れか1項のキット。44. Any of claims 38-41, wherein the pathogen is a nematode, a fungus, a bacterium or an insect. This is the first kit. 45.該病原体は真菌である、請求項38−41のいずれか1項のキット。45. 42. The kit of any one of claims 38-41, wherein the pathogen is a fungus. 46.該病原体はピチウム(Pythium)、リゾクトニア(Rhi−zoc tonia)、スクレロチニア(Sclerotinia)、フィトフトラ(P hy−tophthora)、フザリウム(Fusarium)、ベルチシリウ ム(Vertici−llium)、またはチエラビオプシス(Thielav iopsis)属菌である、請求項45のキット。46. The pathogens include Pythium, Rhizoctonia tonia), Sclerotinia, Phytophthora (P hy-tophthora), Fusarium, verticillium Vertici-llium, or Thielaviopsis 46. The kit of claim 45, wherein the kit is a bacterium of the genus P.iopsis. 47.該病原体は線虫である、請求項38−41のいずれか1項のキット。47. 42. The kit of any one of claims 38-41, wherein the pathogen is a nematode. 48.線虫はメロイドジネ(Meloidogyne)、ヘテロデラ(Hete −rodera)、グロボデラ(Globodera)、チレンクス(TyIe nchus)、またはプラチレンクス(Pratylenchus)属である、 請求項47のキット。48. Nematodes include Meloidogyne and Heterodera. -rodera), Globodera, TyIe nchus), or of the genus Pratylenchus, 48. The kit of claim 47. 49.該病原体は細菌である、請求項38−41のいずれか1項のキット。49. 42. The kit of any one of claims 38-41, wherein the pathogen is a bacterium. 50.細菌はエルウイニア(Erwinia)、アグロバクテリウム(Agro bacterium)、シュードモナス(Pseudomonas)、ストレプ トミセス(Streptomyces)、またはキサントモナス(Xantho mo−nas)属である、請求項49のキット。50. Bacteria include Erwinia and Agrobacterium. bacterium), Pseudomonas, Strep Streptomyces, or Xanthomonas 50. The kit of claim 49, wherein the kit is of the genus Mo-nas. 51.該病原体は昆虫である、請求項38−41のいずれか1項のキット。51. 42. The kit of any one of claims 38-41, wherein the pathogen is an insect. 52.昆虫はコーンルートワーム(corn root worm、Diabr oti−ca種)、ヨトウムシ、ハリガネムシ、またはネクイムシである、請求 項51のキット。52. Insects are corn root worms, diabr. oti-ca species), a fall armyworm, a cutworm, or a hair beetle. Item 51 kit. 53.標識抗体は酵素で標識されている、請求項45のキット。53. 46. The kit of claim 45, wherein the labeled antibody is labeled with an enzyme. 54.該酵素の基質をさらに含む、請求項53のキット。54. 54. The kit of claim 53, further comprising a substrate for said enzyme. 55.標識抗体は酵素で標識されている、請求項47のキット。55. 48. The kit of claim 47, wherein the labeled antibody is labeled with an enzyme. 56.該酵素の基質をさらに含む、請求項55のキット。56. 56. The kit of claim 55, further comprising a substrate for said enzyme. 57.標識抗体は酵素で標識されている、請求項49のキット。57. 50. The kit of claim 49, wherein the labeled antibody is labeled with an enzyme. 58.該酵素の基質をさらに含む、請求項51のキット。58. 52. The kit of claim 51, further comprising a substrate for said enzyme. 59.標識抗体は酵素で標識されている、請求項51のキット。59. 52. The kit of claim 51, wherein the labeled antibody is labeled with an enzyme. 60.該酵素の基質をさらに含む、請求項59のキット。60. 60. The kit of claim 59, further comprising a substrate for said enzyme.
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