JP7444376B2 - がんの予後判定方法 - Google Patents
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Description
乳がんのおよそ70%はERα陽性である。タモキシフェン(tamoxifen:TAM)は、ERα陽性乳がん患者、特に閉経前の患者に対する標準的な治療薬であり(非特許文献1および非特許文献2)、TAM治療によって年間の乳がん死亡率が約30%低下するとの報告がある(非特許文献3および非特許文献4)。しかしながら、TAMで治療した初期の乳がん患者の約25%は、15年以内に再発するとの報告もある(非特許文献5)。そのため、乳がん患者のある割合に対しては、治療方法の見直しが必要と考えられるが、治療方法の見直しが必要な患者をどのように特定していくかが、重要な問題となっている。
まず、発明者らは、SERMの1つであるTAMのERαに対するアンタゴニストとしての機能は、TAM結合型ERαと複合体を形成したKDM4BをSCF-Fbxo22複合体(SCFFbxo22)が選択的に分解することよって誘導されことを明らかにし(図1を参照のこと)、ERα陽性がんにおけるFbxo22の発現量が低いと、SERMによる抗ホルモン療法に抵抗性であることを示した。
さらに、発明者らは、ERα陽性乳がんにおいてFbxo22の発現量が低いと予後不良となることを明らかにし、Fbxo22は、既知の予後判定因子(腫瘍グレード、リンパ節転移、プロゲステロン受容体、Ki67の発現量など)とは独立した、かつ、優れた新規の予後判定因子であることを示した。
本発明は以上の知見に基づいて完成されたものである。
(1)以下の工程(a)および(b)を含むホルモン受容体陽性がんの予後判定方法または予後判定の補助方法。
(a)前記がん組織由来の試料中のFbxo22陽性がん細胞を検出する工程、
(b)試料中に存在するがん細胞に対するFbxo22陽性がん細胞の割合を算出する工程
(2)前記Fbxo22陽性がん細胞の割合が、10%未満である場合に、当該がんは予後不良であると判断することを特徴とする上記(1)に記載の方法。
(3)前記Fbxo22の発現を検出することが、免疫組織化学的染色法であることを特徴とする上記(1)または(2)に記載の方法。
(4)前記Fbxo22陽性がん細胞を、抗Fbxo22抗体による細胞の染色性に基づいて評価することを特徴とする上記(3)に記載の方法。
(5)前記染色性が中度以上である場合に、Fbxo22陽性がん細胞と評価することを特徴とする上記(4)に記載の方法。
(6)前記ホルモン受容体陽性がんが、ERα(estrogen receptor α)陽性がんまたはAR(androgen receptor)陽性がんのいずれかであることを特徴とする上記(1)ないし(5)のいずれかに記載の方法。
(7)前記ERα陽性がんが、ERα陽性乳がんまたはERα陽性子宮内膜がんであることを特徴とする上記(6)に記載の方法。
(8)前記AR陽性がんが、AR陽性前立腺がんであることを特徴とする上記(6)に記載の方法。
(9)上記(1)ないし(5)のいずれかに記載の方法によって得られた結果に基づいて、ホルモン受容体陽性がんの抗ホルモン剤による治療効果を評価する方法または治療効果を補助的に評価する方法。
(10)前記ホルモン受容体陽性がんが、ERα陽性がんまたはAR陽性がんのいずれかであることを特徴とする上記(9)に記載の方法。
(11)前記ERα陽性がんが、ERα陽性乳がんまたはERα陽性子宮内膜がんであることを特徴とする上記(10)に記載の方法。
(12)前記抗ホルモン剤が、SERM(selective estrogen receptor modulator)であることを特徴とする上記(11)に記載の方法。
(13)前記AR陽性がんが、AR陽性前立腺がんであることを特徴とする上記(10)に記載の方法。
(14)前記抗ホルモン剤が、SARM(selective androgen receptor modulator)であることを特徴とする上記(13)に記載の方法。
(15)Fbxo22の発現量を検出するための要素を含んでなる、ホルモン受容体陽性がんの予後を判定するための、または該がんの抗ホルモン剤による治療効果を評価するためのキット。
すなわち、本発明の第1の実施形態は、以下の工程(a)および(b)を含むホルモン受容体陽性がんの予後判定方法または予後判定の補助方法である。
(a)前記がん組織由来の試料中のFbxo22陽性がん細胞を検出する工程、
(b)試料中に存在するがん細胞に対するFbxo22陽性がん細胞の割合を算出する工程
上記判定方法において、工程(b)で算出されたFbxo22陽性細がん胞の割合が、一定割合未満の場合に当該ホルモン受容体陽性がんの予後が不良であると判断する。なお、上記(a)および(b)の工程は、医師以外の技術者によっても実施可能であるため、医師による予後の判定に必要な情報を提供するための、予後判定の補助方法の構成要素でもある。
ここで、「予後」とは、医学分野で通常用いられる意味と同じであって、特に限定はしないが、例えば、予想される医学的な状態(健康状態)に関する見解、病気・創傷の将来的な状態のことである。そして、予後が不良であるとは、例えば、生存率の短縮、再発リスクの増大および/または腫瘍が他の部位に転移している可能性がある場合を指す。
染色なし:核の染色が認められない、あるいは、バックグラウンドと同程度にわずかに核が染色されている細胞。
低度:低倍率では、染色なし、と区別がつかないが、高倍率で淡く核の染色が確認される細胞。
中度:低倍率で核の染色が確認可能で、高倍率で完全に核の染色が確認される細胞。
高度:低倍率で完全に核の染色が確認される細胞。
選んだ100個の細胞に対する核の染色強度が中度以上の細胞を、「Fbxo22陽性細胞」と判定しその割合を算出し、その割合が、検出方法により多少の変動はあるものの、30%未満、20%未満、10%未満、好ましくは5%未満、より好ましくは1%未満の場合に、抗Fbxo22抗体による染色性が「陰性」であると判断する。そして、「陰性」と判断された試料が由来するがんの予後は、不良である可能性が高いと判定することができる。なお、「陰性」と判断する場合の「Fbxo22陽性細胞」の割合は、陰性症例(「陰性」と判断される症例)が全症例中の30%程度となるように設定することが望ましい。
また、採取された試料の染色性の状態をカメラ等で撮影し、染色処理した細胞の画像を取得し、当該画像を電子情報化処理し、解析することも可能である。画像から得られる染色強度を定量し、数値化することで、上記の4段階の染色レベルを評価してもよい。例えば、顕微鏡上で主となるがん細胞の集団を染色した強倍率視野像(200から400倍)を撮影し、撮影した画像内のFbxo22染色の色を、バイオイメージング解析システム等を用いて、赤、緑、青のRGBカラーに分け、色の染色性を各々、色相によって表して、二値化する。撮影した画像上の染色された陽性面積を、陰性抗体(コントロール抗体)によって非特異的に染色された陰性面積を引くことにより求め、陽性面積の割合を「Fbxo22陽性細胞」の割合としてもよい。
その他、免疫組織化学的方法以外にも、試料中の腫瘍細胞に発現するFbxo22のレベルを検出する方法として、定量RT-PCR(real time PCR)法により、試料中のFbxo22 mRNAの発現量を検出してもよい。
以上のようにして取得した検査対象サンプルにおけるFbxo22の陽性細胞の割合に関する情報は、検査対象サンプルが由来するがんの予後の判定材料として使用することができる。
そこで、本発明の第2の実施形態は、本発明の第1の実施形態にかかる予後の判定方法または予後の判定補助方法によって得られた結果に基づいて、ホルモン受容体陽性がんの抗ホルモン剤による治療効果を評価する方法または治療効果を補助的に評価する方法である。
本発明の実施形態で使用される抗ホルモン剤としては、例えば、ホルモン受容体陽性がんがERα陽性乳がん、ERα陽性子宮内膜がんなどのERα陽性がんの場合SERMなどを、AR陽性がんの場合SARMなどを挙げることができる。
第2の実施形態で使用されるSERMとして、例えば、タモキシフェン(tamoxifen)、トレミフェン(toremifene)、ラソフォキシフェン(lasofoxifene)、アルゾキシフェン (arzoxifene)、オスペミフェン(ospemifene)もしくはラロキシフェン(raloxifene)またはこれらの誘導体を挙げることができ、SARMとして、例えば、アンダリン(andarine)もしくはオスタリン(ostarine)またはこれらの誘導体を挙げることができる。
以下に実施例を示してさらに本発明の説明を行うが、本実施例は、あくまでも本発明の実施形態の例示にすぎず、本発明の範囲を限定するものではない。
1-1.抗体およびshRNA
本実施例で使用したshRNAと抗体に関する情報は、各々、表1および表2に示した。
細胞培養と種々の薬剤による処理は、Johmuraら, Molecular Cell 55:73-84 2014に記載される方法に従って行った。
MCF-7細胞、T47D細胞、ZR75-1細胞、U2OS細胞、U2OS-LacO-I-SceI-TetO(Burgessら, Cell reports. 9:1703-17 2014)または293T細胞は、10% fetal bovine serum(FBS)を添加したDMEM (Invitrogen)中で培養した。
エストラジオール(E2)(Sigma-Aldrich)、シクロヘキシミド(Sigma-Aldrich)、4-ヒドロキシタモキシフェン(4-OHT)(Sigma-Aldrich)、フルベストラン(Sigma-Aldrich)、トレミフェン(Sigma-Aldrich)およびMG132 (Sigma-Aldrich)は、各々、10 nM、50 μg/ml、100 nM、10 μg/ml、100 nMおよび100 nMの濃度で使用した。
E2欠乏状態にするには、次のように行った。細胞をPBSで3回洗浄した後、フェノールレッド非添加のDMEM(5% charcoal-stripped FBSを含む)中で72時間培養した。
細胞(5×102)を6-ウェルプレートに播種し、2週間培養した。コロニーは、メタノール/酢酸(1:1)で15分間固定し、0.4% トリパンブルー(Sigma)を含む20 %メタノール/PBS中で15分間染色したのちカウントした。
レンチウイルスベースshRNAコンストラクトおよびTet-on誘導性レンチウイルスコンストラクトは、Johmuraら, Molecular Cell 55:73-84 2014に記載される方法に従って作製した。
レンチウイルスベースshRNAコンストラクトを調製するために、ループ配列(配列番号1:5’-ACGTGTGCTGTCCGT-3’)を有する19-21ベースのshRNAコードフラグメント(表1:Fbxo22(配列番号2)、KDM4B(配列番号3)およびLuciferase(配列番号4))をAgeI/EcoRI で切断したpENTR4-H1に挿入した。次に、H1tetOx1-shRNAをレンチウイルスベクターに挿入するために、得られたpENTR4-H1-shRNAベクターとCS-RfA-ETBsdベクターまたはCS-RfA-ETPuroベクターを混合し、Gateway LR clonase (Invitrogen)を用いて反応させた。
Tet-on誘導レンチウイルスコンストラクトを構築するために、Flag、HA、FLAG-HAまたはEGFPの各配列を含むpENTR-1Aベクター(Invitrogen)をBamHI/ NotIで切断し、ヒト/マウスFbxo22野生型もしくはその各変異体のcDNAまたはヒトKDM4B野生型のcDNAを含むBamHI/ NotIフラグメントをPCRで増幅し、上記BamHI/ NotI切断サイトに挿入した。得られたプラスミドをCS-IV-TRE-RfA-UbC-PuroベクターまたはCS-IV-TRE-RfA-UbC-Hygroベクターと混合し、Gateway LR clonase (Invitrogen)を用いて反応させ、レンチウイルスプラスミドを調製した。
HAでタグ化されたユビキチンコード配列をタンデムに6つ含むpcDNA3-(HA-Ub)x6は、Nishikawaら, The Journal of biological chemistry 279:3916-3924 2004に記載される方法に従って作製した。pcDNA3-St2-KDM4Bは、以下に示すStrep IIエピトープに対応するオリゴヌクレオチドを保持するpcDNA3にサブクローニングされたKDM4B cDNAを用いて調製した:TGGAGCCATCCTCAGTTCGAGAAAGGTGGCGGTTCTGGCGGAGGGTCGGGCGGCTCCGCCTGGAGTCACCCTCAGTTTGAGAAA-3’(配列番号5)
レンチウイルスの調製とその細胞への感染は、Johmuraら, Molecular Cell 55:73-84 2014に記載される方法に従って行った。shRNAまたは各種遺伝子を発現するレンチウイルスは、pCMV-VSV-G-RSV-RevB、pCAG-HIVgpおよびCS-RfA-ETBsd、CS-RfA-ETPuro、CS-IV-TRE-RfA-UbC-Puro、CS-IV-TRE-RfA-UbC-HygroもしくはCSII-CMV-MCSで、リン酸カルシウム共沈殿法により293T細胞にコトランスフェクションして調製した。レンチウイルスを感染させた細胞は、10 μg/ml ブラストサイジン(Invitrogen)および/または2 μg/ml ピューロマイシン(Sigma-Aldrich)で2~3日間処理した。ドキソサイクリン(Sigma-Aldrich)は1 μg/mlとなるように添加し、各shRNAまたは遺伝子の発現誘導を行った。
免疫沈降とイムノブロッティングは、Johmuraら, Molecular Cell 55:73-84 2014に記載される方法に従って行った。細胞は、TBSNバッファー(20 mM Tris-Cl (pH8.0)、150 mM NaCl、0.5% NP-40、5 mM EGTA、1.5 mM EDTAおよび0.5 mM Na3VO4)で溶解した。得られた細胞溶解物を4℃にて、15,000×gで20分間遠心して、抗体による免疫沈降に使用した。
ERαとKDM4Bの免疫沈降に関しては、核抽出物をHirokawaら, Cancer Res. 74:3880-3889 2014に記載される方法に従って調製した。細胞ペレットを5倍容量のbuffer A(10 mM Hepes-KOH pH 7.9、10 mM KCl、1.5 mM MgCl2、0.5 mM DTT、0.5 mM PMSFおよびプロテアーゼインヒビターカクテル(Nakalai Tesque))に懸濁させ、氷上で5分間インキュベートした。その後、細胞を4℃にて、500×gで5分間遠心し、得られた細胞ペレットを2倍容量のbuffer Aに懸濁し、ホモジナイズした。ホモジナイズした細胞懸濁物を4℃にて、4,000×gで5分間遠心し、細胞核を沈殿に回収し、回収した核に等量のbuffer B(20 mM Hepes-KOH pH 7.9、600 mM KCl、1.5 mM MgCl2、0.2 mM EDTA、25% glycerol、0.5 mM DTT、0.5 mM PMSFおよびプロテアーゼインヒビターカクテル) を加えて懸濁し、4℃にて、30分間ローテーターで混合した。核抽出物は、4℃にて、16,000×gで15分間遠心し、上清に回収し、buffer C(20 mM Hepes-KOH pH 7.9、100 mM KCl、0.2 mM EDTA、20 % glycerol、0.5 mM DTTおよび0.5 mM PMSF)に対して透析した。透析後の核抽出物を4℃にて、16,000×gで30分間遠心し、残存していた沈殿物を除去した。
全細胞溶解物については、細胞を直接Laemmli-buffer(2% SDS、10% glycerol、5% 2-mercaptoethanol、0.002% bromophenol blueおよび62.5 mM Tris HCl pH 6.8)で溶解させた。
全細胞溶解物のタンパク質(20~50 μg)は、SDS-PAGEで分離し、PVDF膜(Millipore)にトランスファーし、各種抗体によるイムノブロッティングに使用した。
定量RT-PCRは、Johmuraら, Molecular Cell 55:73-84 2014に記載される方法に従って行った。総RNAをISOGEN II (Wako)を用いて抽出し、これを鋳型として、cDNAをSuperScript II cDNA synthesis kit(Invitrogen)を用いて合成した。PCR増幅は、Power SYBR Green PCR Master Mix(Applied Biosystems)を用いて、96-well optical reaction plate中で行った。各遺伝子の相対的発現比は、GAPDHの発現量に対して正規化した。
ユビキチン化KDM4Bをインビボで検出のために、2×Strep II (WSHPQFEKGGGSGGGSGGSAWSHPQFEK:配列番号8)タグ化KDM4B配列を含むプラスミドで細胞をトランスフェクションし、20 μM MG132で16時間処理し、トランスフェクションから48時間後、細胞を回収した。細胞は、1% SDSを含むbufferで変性条件下にて溶解し、遠心後、上清をNishikawaら, The Journal of biological chemistry 279:3916-3924 2004およびSatoら, The Journal of biological chemistry 279:30919-30922 2004に記載される方法に従って希釈した。10μlの50% StrepTactin resinによるプルダウンは、高塩濃度のbuffer(2M NaCl、50 mM Tris-HCl pH 7.5、0.5% Nonidet P-40、150 mM NaCl、50 mM NaF、1 mM dithiothreitol)を用いて行った。レジンはsample buffer中でボイルし、イムノブロッティングに使用した。
U2OS-LacO-I-SceI-TetO細胞は、environmental chamber(Keyence)を備えたBZ-9000(Keyence)のステージ上で、 glass bottom dish(Iwaki)で培養した。顕微鏡画像は、BZ-9000ソフトウェアで解析した。
ヒトFbxo22をノックアウトするためのsgRNAのオリゴヌクレオチドを調製し、Cas9およびsgRNAを発現するベクターpX330(Dr. Feng Zhangから供与頂いた)のBbsI部位にクローニングした。得られたプラスミド(pX330-hFbxo22-4)を、Lipofectamine 3000 (Invitrogen)を用い、MCF-7細胞またはT47D細胞にトランスフェクションした。48時間インキュベートした後、細胞をクローン化するように植え継いだ。各細胞株の細胞溶解物は、抗Fbxo22抗体を用いたウエスタンブロッティングに使用し、遺伝子が破壊されたかどうかを確認した。ヒトFbxo22のsgRNA配列は5’-CGCCGGAACCAGTCCTACGG-3’(配列番号9)である。
クロマチン免疫沈降は、SimpleChIP Enzymatic Chromatin IP kit(CST)を用いて行った。
4×106細胞を、1% formaldehydeで、室温にて、10分間固定した後、125 mM glycineを添加した。細胞ペレットからクロマチンを調製し、室温にて、15分間、micrococcal nucleaseで処理した。切断したクロマチンと約2μgの各腫抗体とを、4℃で一晩インキュベーションし、その後、20μlの磁気ビーズを添加し、4℃で2時間インキュベーションした。磁気ビーズを洗浄用バッファーで4回洗浄し、ChIP elution bufferでクロマチンを溶出させた後、65℃で4時間Protein Kで処理し、リバースクロスリンクを行った。その後、DNA精製カラムでDNAを抽出した。シークエンシングライブラリーは、1.8ngのDNAで、Ion Xpress Plus Fragment Library kit(Thermo Fisher Scientific)を用いて調製した。シークエンシングは、Ion PI Chip and Ion PI Sequencing 200 kitを使用し、Ion Proton systemで行った(Thermo Fisher Scientific)。シングルエンドリードのベースコールとアライメントは、Torrent SuiteTM Software 5.2.2を用いてデフォルトの設定で行った。リードをTorrent Mapping Alignment Program(TMAP)により対照のヒトゲノムhg19に対してマッピングした。タグディレクトリはアラインしたリードにより、HOMER(http://homer.salk.edu/homer/)で提供される makeTagDirectory version v4.9.1を使用して作製した。 その後、Homer を使用してbasic quality control 解析とsequence bias解析を行った。デフォルトのパラメーター、すなわち、各ピークから10kbの領域の正規化したtag densityと比較して、4倍以上のtag densityおよび0.001以下のfalse discovery rateのパラメーターを使用し、rfindPeaksで、ピークをコールした。濃縮したTFモチーフを見つけるために、50bpの領域サイズおよび1e-50未満のp-値で、findMotifsGenomeを使用し、annotatePeaksで領域をアノテートした。オーバーラップしたERとSRC-3のピークは、ERとSRC-3の濃縮した領域間において、100bp未満の間隔で同定した。濃縮領域のhierarchical cluster解析はCluster 3.0を使用して行った。ヒートマップデータマトリクスは、Homerを使用して作製し、Java TreeViewで可視化した。box-and-whisker plotはExcelにより、各密度のlog2により作成した。
コントロール(野生型)T47D細胞またはFbxo22-KO(ノックアウト) T47D細胞を80~90%コンフルエントになるまで培養した後、トリプシン処理を行い、PBSに懸濁し、Matrigel (CORNING 354230)と1:1となるように混合した。エストロゲンペレット(エストロゲン0.72mg含む60日間長期放出ペレット(Innovative Research of America))をマウスの首筋の皮下に埋め込み、その1日後に3×106細胞を、9週齢のNOD/Scidマウスの乳腺脂肪体皮下に100μlのPBS/Matrigel(1:1)と共にインジェクションした。腫瘍の大きさが約50 mm3になったときに、各群5匹のマウスにタモキシフェンペレット(タモキシフェン5 mg含む60日間長期放出ペレット(Innovative Research of America))を皮下に埋め込む処置を行った。移植した腫瘍の大きさを毎週測定した。6週間後、マウスを安楽死させ、腫瘍を摘出し、大きさを測定した後、ホルマリン固定後パラフィンに包埋し、HE染色スライドを作製した。腫瘍のサイズは次にようにして評価した:V=(長さ×幅×高さ×0.5326)mm3。全てのマウスは特定の病原体フリーの環境で飼育し、東京大学医科学研究所動物実験ガイドラインに従って扱った。
移植した腫瘍組織は、10% ホルマリンで固定し、脱水後、パラフィン中に包埋した。パラフィン切片を脱パラフィン後、再水和させ、抗Ki-67抗体(DAKO)または切断型caspase-3に対する抗体(CST)と共にインキュベーションした。抗原に結合した1次抗体は、HRP標識2次抗体で検出し、DAB(3, 3’-diaminobenzidine tetrahydrochloride)で可視化した。
継続的に治療を行ったT2(直径2~5 cm)ERα陽性/HER-2陰性原発乳がんの163ケースに由来する、ホルマリン固定、パラフィン包埋大針穿刺吸引細胞診パネルおよびその臨床データは、2005年~2009年に聖マリアンナ医科大学病院で外科手術を受けた患者から得た。追跡期間中央値は7.4年であった。本研究は大学の治験審査委員会の承認を得たものである(承認番号:3095)。免疫組織化学的解析は、Nichirei Histofine system(Nichirei Biosiences Inc., Tokyo, Japan)を使用して行った。組織切片を1:200に希釈した1次抗体の抗Fbxo22抗体(GTX117774, GeneTex)とインキュベーションし、HRP-ポリマー標識2次抗体(Histofine Simple Stain MAX PO (multi), Nichirei, Japan)で検出した。発色はDABで行った。100個の細胞のうち、中度または高度にFbxo22染色を示す細胞(Fbxo22陽性細胞)を1つ以上含むがん組織をFbxo22陽性と判定した。Fbxo22陽性は、2名の病理学者による盲検法で評価した。ERα、PR、HER2およびKi-67のステータスは、臨床的検討において用いられる標準的な免疫組織化学的方法およびFISH(fluorescence in situ hybridization)法により決定した。
細胞ベースの実験の統計的解析は、独立変数に対するStudent’s t-testにより行った。P値<0.05を統計的に有意とした。ChIP-seqデータのタグカウントに関する統計的解析は一元配置分散分析(one-way ANOVA)により行った。Fbxo22ステータスと種々の臨床病理学的特徴との関係は、カイ二乗検定、フィッシャーの正確確率検定およびStudent’s t-testで算定した。無再発生存期間(Relapse-Free Survival:RFS)曲線は、Kaplan-Meier法およびlog-rankテストにより作製した。cox比例ハザード回帰モデルは、単変数分析および多変数分析における各変数について、RFSのハザード比(HR)と95%信頼区間(95% CIs)を評価するために使用した。Kaplan-MeierプロットはGraphPad Prism6で作製した。cox比例ハザード回帰モデルはR(version 3.3.2)で解析した。統計的有意は、P<0.05として定義した。
2-1.乳がん
2-1-1.KDM4Bユビキチン化およびその分解のTAMのアゴニスト活性に対する影響
MCF-7細胞におけるE2誘導転写活性が、プロテアソーム依存的分解によって制御されていれば、TAMのアンタゴニスト活性もプロテアソーム依存的タンパク質分解によって制御されている可能性がある。
この点を調べるために、まず、4-ヒドロキシタモキシフェン(4-OHT)のアンタゴニスト活性のキネティクスを測定した。E2欠乏状態にしたMCF-7細胞にE2を添加して刺激し、その6時間後に細胞に4-OHTを添加した。ERαの標的遺伝子であるGREB1およびEBAG1の転写量を経時的に測定したところ、E2添加から4時間後に転写量が最大となり、その後減少して4-OHT添加から6時間後に最小となった(図2A、●)。この結果から、エストロゲンのシグナルは、TAM処理後速やかにアンタゴナイズされることが示された。そこで、プロテアソーム阻害剤であるMG132が、4-OHTによるERα依存的転写のアンタゴナイズ活性に影響を及ぼすかどうか調べた。4-OHT処理後、EBAG9とGREB1の転写量は、MG132非存在下と比較して、MG132存在下において高いレベルで維持された(図2A)。
また、E2を含む培地からE2を除去すると、EBAG9およびGREB1のE2誘導転写活性が消失し(図2C)、MG13を添加すると、このE2誘導転写活性が回復した。そして、E2除去によるERαからのKDM4BとSRC-3の解離が抑制された(図2D、IP:ERのE2+dep+MG)。これらの結果から、ERαと複合体を形成しているKDM4Bのプロテアソームによる分解が、ERαコファクターの動態の引き金になっている可能性を考えた。そこで、細胞内でのKDM4Bの発現をshRNAで阻害したところ、E2存在下においても、SRC-3がERαから解離した(図2E、IP:ERのshKDM4B+E2)。
以上の結果から、ERαと結合しているKDM4Bのプロテアソームによる分解によって、コファクターの動態を引き起こされ、ERα陽性乳がん細胞におけるTAMのアンタゴニスト活性が促進されと考えられる。
次に、ERαと複合体を形成しているKDM4Bを選択的に分解する因子の検索を行った。
Fbxo22がKDM4A機能に何らかの関連性を有するとの報告が有ることから、Fbxo22がKDM4B分解に関与しているかどうか調べた。Fbxo22除去細胞中のKDM4A、4Cおよび4Dの定常レベルは野生型の細胞と同程度であったが、KDM4Bの量は明らかに増加していた(図3A、shFbxo22のKDM4B)。なお、KDM4BのmRNAレベルは変動していなかった。Fbxo22除去細胞中においてKDM4Bタンパク質は、コントロール細胞と比較して、より安定的に存在していた(図3B、○)。
ERαと複合体を形成しているKDM4BをSCFFbxo22がユビキチン化するかどうかを調べるために、まず、ERαとFbxo22間の複合体形成について検討した。FLAG-HAタグを付けたFbxo22(FH-Fbxo22)をMG132存在下でMCF-7細胞にて発現させ、抗FLAG抗体と抗HA抗体で免疫沈降を行うと、抗FLAG/抗HA抗体による免疫沈降物にERαが含まれていたことから、ERαはFbxo22と相互作用していることが分かった(図3C、IP:FLAG/HAのFH-Fbxo22)。そして、MG132非存在下において、Fbxo22が除去されると、ERαとKDM4B間の相互作用が顕著に促進された(図3E、IP:KDM4BのshFbxo22および図3F、IP:ERのshFbxo22)。Fbxo22は3つの異なる機能ドメイン(F-box、FIST-NおよびFIST-C)を有していることから、Fbxo22はERαと多量体を形成していると考えられた。そこで、FIST-NまたはFIST-Cドメインを欠失しているFbxo22変異体を用いて、ERαおよびKDM4Bとの相互作用について検討したところ、 ERαおよびKDM4Bは、各々、FIST-NとFIST-Cドメインに結合することが明らかとなった(図3G)。さらに、MG132存在下において、FLAG-Fbxo22をMCF-7細胞内で発現させた場合、抗FLAG抗体と抗ERα抗体に免疫沈降物にFLAG-Fbxo22、ERαおよびKDM4Bが含まれていたことから、これらの3分子は複合体を形成していることが確認された(図3H)。
ERαと結合するアゴニストまたはアンタゴニストと、Fbxo22との相互作用について次に検討した。MG132存在下において、ERαに結合するFLAG-Fbxo22は、E2の添加量に依存して減少し、KDM4Bとの結合は、影響を受けなかった(図3I)。これに対し、E2およびMG132存在下において、ERαに結合するFLAG-Fbxo22は、4-OHTの添加量に依存して回復(増加)した(図3J)。これらの結果は、Fbxo22がリガンド非結合型ERαまたは4-OHT結合型ERαと優先的に結合し、E2結合型ERαとは結合しないことを示している。
MCF-7細胞中のKDM4Bの量に対する、Fbxo22またはERαの影響を調べるため、Fbxo22および/またはERαをMCF-7細胞内で発現させたところ、Fbxo22またはERαを単独で発現させた場合、KDM4Bの量に影響はなかったが、Fbxo22およびERαを同時に発現させたところ、KDM4Bの量が減少した(図4A)。この結果から、SCFFbxo22はERαと複合体を形成しているKDM4Bを特異的にユビキチン化することが示唆された。
この可能性をさらに調べるために、変性条件下において、インビボユビキチン化アッセイを行った。Fbxo22によるKDM4Bのユビキチン化は、ERαの発現が無い場合は弱かったが、ERαを共発現させるとERαの用量依存的に顕著に増強された(図4B)。これらの結果から、SCFFbxo22は、ERαと複合体を形成しているKDM4Bを優先的にユビキチン化しプロテアソームによる分解を引き起こしていることが示唆された。
Fbxo22がリガンド非結合型ERαまたは4-OHT結合型ERαと優先的に結合するならば、ERαと複合体を形成しているKDM4BのSCFFbxo22によるユビキチン化は、ERαに結合しているリガンドのタイプに依存していると考えられる。ERαと複合体を形成しているKDM4Bのユビキチン化は、E2の添加によって顕著に低下し、4-OHTを添加するとユビキチン化の量が回復した(図4C)。
以上のことから、SCFFbxo22はリガンド非結合型ERαまたは4-OHT結合型ERαと複合体を形成しているKDM4Bを優先的にユビキチン化することが示された。
E2で刺激したコントロールMCF-7細胞を4-OHTで処理すると、EBAG9とGREB1の転写が強く抑制されるが(図5A、●)、4-OHTのこのアンタゴニスト活性は、Fbxo22欠損MCF-7細胞では抑制された(図5A、○)。E2刺激後、コントロールMCF-7細胞およびFbxo22除去MCF-7細胞のいずれにおいても、ERαはKDM4BおよびSRC-3と複合体を形成していた(図5B、IP:E2)。その後、コントロールMCF-7細胞を4-OHTで処理すると、KDM4BとSRC-3はERαから解離し、N-CoRがERαと相互作用した(図5B、IP:E2のshFbxo22)。 これに対して、Fbxo22除去細胞においては、このようなコファクターの動態は認められなかった(図5B、IP:E2のshControl)。また、KDM4Bを除去すると、ERα標的遺伝子の転写誘導の顕著な抑制が、Fbxo22の存在とは無関係に生じた。KDM4Bの除去によっても、E2が誘導するEBAG9とその他のERα標的遺伝子の転写誘導の顕著な抑制が生じたことから、4-OHTのアンタゴニスト活性の制御において、KDM4Bの関与についても確認することにした。
Fbxo22が発現しているU2OS細胞または発現していないU2OS細胞であって、全長の野生型ERαまたはAF1活性を欠損しているΔ44変異型ERαを発現している細胞をE2で刺激し、その後4-OHTで処理した。4-OHTのアンタゴニスト活性は、Fbxo22が発現しておらず野生型ERαを発現しているU2OS細胞であってE2刺激した細胞内では4-OHTのアンタゴニスト活性は抑制されるが(図5C上図、○)、Fbxo22が発現しておらずΔ44 ERαを発現しているU2OS細胞では、4-OHTのアンタゴニスト活性が認められた(図5C下図、○)。この結果は、Fbxo22欠損細胞において、4-OHT存在下におけるERα活性はAF1活性に依存することを示している。ERαのシグナルに対するアンタゴニスト活性におけるFbxo22の役割は、SERD(Selective Estrogen Receptor downregulator:選択的エストロゲン受容体ダウンレギュレーター)ではなく、SERM(Selective Estrogen Receptor modulator:選択的エストロゲン受容体調節因子)特異的であり、Fbxo22の除去することで、トレミフェン(SERM)のアンタゴニスト活性には4-OHTに対する効果と類似の効果を及ぼし(図6A左図および中図)、フルベストラント(SERD)のアンタゴニスト活性には全く効果を示さなかった(図6A右図)。また、トレミフェンで処理した細胞におけるコファクターの動態にはFbxo22が必要であるが(図6B左図、IP:ERのE2+Tor)、フルベストラントで処理した細胞においては不要であった(図6右図、IP:ERのE2+Ful)。従って、これらの結果は、SCFFbxo22によるERα結合KDM4Bの分解は、SERM処理に特異的なコファクター動態に必要であることを示している。
まず、CFP-LacERおよびYFP-SRC-1 foci へのFLAG-KDM4Bの共局在に関し、CFP-LacER、YFP-SRC-1およびFLAG-KDM4Bを発現しているU2OS-LacO-I-SceI TetO細胞を用いて検討を行った。抗FLAG抗体を用いた免疫蛍光解析により、コントロール細胞とFbxo22除去細胞において、E2の存在下ではFLAG-KDM4BもCFP-LacERおよびYFP-SRC-1の fociに共局在した(図5D、shControlとshFbxo22のE2および図5E、shControlとshFbxo22のE2)。これに対して、E2および4-OHT存在下では、コントロール細胞でのFLAG-KDM4BのCFP-LacERおよびYFP-SRC-1との共局在は観察されなかったが(図5D、shControlのE2+4-OHTおよび図5E、shControlのE2+4-OHT)、Fbxo22除去細胞では、FLAG-KDM4BはCFP-LacERおよびYFP-SRC-1と共局在していた(図5D、shFbxo22のE2+4-OHTおよび図5E、shFbxo22のE2+4-OHT)。
以上の結果からも、4-OHTによるE2シグナル伝達アンタゴナイズ作用におけるコファクター動態でのFbxo22の重要な役割が示された。
ChIP-Seq解析を用いて、ERα-SRC-3のゲノムワイドな結合のマッピングを行った。コントロールMCF-7細胞とFbxo22除去MCF-7細胞を用いて解析を行った。細胞を72時間エストロゲン欠乏状態にした後、E2(10 nM)またはE2+4-OHTで2時間刺激した。その結果、E2処理した野生型MCF-7細胞において12,64、Fbxo22除去MCF-7細胞において23,213のERα集積ピークが検出された。また、E2+4-OHT処理したコントロールMCF-7細胞において26,751、Fbxo22除去MCF-7細胞において19,924のERα集積ピークが検出された。これらの結果から、4-OHTはERαと標的領域との相互作用には影響を与えないと考えられる。上記4つのデータセットにおいて、8,528のERα集積ピークが重複していた。E2処理した野生型MCF-7細胞において1,723、Fbxo22除去MCF-7細胞において5,572のSRC-3集積ピークが検出された。これら2つのデータ間で、469のSRC-3集積ピークが共通しており、これらのピークの約90%(410)がERαピークとオーバーラップしていた(図7A)。ERαと相互作用するSRC-3の量を明らかにするために、410のSRC-3オーバーラッピングピークに着目した。box-and-whisker plotの結果、E2+4-OHTで処理したコントロールMCF-7細胞ではERαと相互作用するSRC-3が顕著に減少するのに対し(図7B、shControl+E2+4+OHT)、Fbxo22除去MCF-7細胞では、ERαと相互作用するSRC-3は減少しなかった(図7B、shFbxo22+E2+4+OHT)。ヒートマップにおいては、E2+4-OHTで処理したコントロールMCF-7細胞では、410領域のSRC-3配列のリード密度が、E2のみで処理した場合と比較して、明らかに減少していた(図7C、Control MCF-7、E2+4OHT)。これに対し、Fbxo22除去MCF-7細胞にE2+4-OHTを添加しても、SRC-3配列のリード密度には影響がなかった(図7C、Fbxo22-depleted MCF-7、E2+4OHT)。
これらの結果から、Fbxo22は、タモキシフェンによって誘導されるSRC-3のERα/SRC-3結合ゲノム領域からの解離において、重要かつ普遍的な役割を担っていることが示された。
エストロゲンはMCF-7細胞の増殖に必要である。そこで、Fbxo22が4-OHTによるMCF-7細胞の増殖抑制に必要であるかどうか検討した。コロニー形成アッセイの結果、4-OHT処理により、E2存在下におけるコントロールMCF-7細胞の増殖が完全に抑制されたのに対し、Fbxo22除去MCF-7細胞では、4-OHTに対する増殖抑制効果が低下し(図8A下図、E2+4-OHTのshFbxo22)、Fbxo22を発現させると、増殖抑制効果が回復した(図8A下図、E2+4-OHTのshFbxo22/FLAG-Fbxo22)。同様な結果は、他の2種類の乳がん細胞株(ZR75-1 およびT47D)においても観察された。これら2種類の乳がん細胞株の増殖はエストロゲン刺激に依存していることが知られている。KDM4Bを除去した場合にも、Fbxo22存在とは無関係に、E2によって誘導されるMCF-7細胞の増殖が抑制された(図8B)。
移植から6週間後、マウスを安楽死させ、腫瘍の重量等を測定した。Fbxo22ノックアウトT47D細胞の腫瘍は、野生型T47D細胞の腫瘍よりも明らかに重かった(図8D)。図8Eに代表的な腫瘍の比較例を示す。腫瘍組織に対し、免疫組織化学的解析を行ったところ、Fbxo22をノックアウトしたT47D細胞は、アポトーシスが減少し(図8F上図)、細胞増殖が増大していた(図8F下図)。
以上の結果から、Fbxo22は、インビボおよびインビトロにおいて、ERαと複合体を形成しているKDM4Bの分解を通じて4-OHTのアンタゴニスト活性にとって必須であることが示された。
乳がん細胞におけるTAM感受性決定因子としてのSCFFbxo22の重要な役割は、Fbxo22の発現量が、ERα陽性乳がん患者の予後判定因子として使用できることを示唆している。そこで、Fbxo22の発現量のERα陽性乳がん患者の予後判定因子としての可能性を確認するために、免疫組織化学的手法により、163のERα陽性/HER2陰性乳がん標本についてFbxo22の発現量を解析した。抗Fbxo22抗体を用いて標本を免疫染色すると、正常乳腺由来の組織では細胞核の染色が不均一であった(図9A)。これに対して、腫瘍組織では、細胞核の染色が均一であるケース(図9B左図)と、細胞核がほとんど染色されないケースが観察された(図9B右図)。ここで、がん組織におけるFbxo22の発現量の指標として、抗Fbxo22抗体で核が染色されるFbxo22陽性細胞(中度または高度にFbxo22染色を示す細胞)が1%未満の場合、そのがん組織はFbxo22陰性とした。観察の結果、163の標本のうち49標本(30.1%)をFbxo22陰性と判断した(表3および図10)。Fbxo22陰性は、高Ki-67とPRステータスネガティブと相関していた(表3)。
しかし、Fbxo22ステータスはリンパ節転移および腫瘍グレードとは相関していなかった(表3)。特に注目すべきは、Fbxo22欠損腫瘍は、Fbxo22陽性腫瘍と比べて、無再発生存期間(relapse-free survival:RFS)の短縮と顕著な関連性を有していた(図9C)。このRFSの短縮は、Luminal A型(低Ki-67)乳がん(図9D)、リンバ節転移陰性乳がん(図9E)およびグレード1のERα陽性/HER2陰性乳がん(図10B)においても同様に認められた。さらに、Fbxo22陰性乳がんは、TAM治療を受けた群において、非常に予後が悪かったが(図9F)、TAM治療を受けなかった群ではそこまで悪くはなかった(図10C)。163全群において、高Ki-67群、リンパ節転移群およびグレード2/3群は、予後が悪い傾向にあったが、統計的有意差はなかった(図10D、EおよびF)。
また、多変数生存解析より、Fbxo22の欠損は、他の予後判定因子とは独立に予後を予測することが示された(表4)。これらの臨床データは、低Ki-67、リンパ転移陰性、低グレードまたはタモキシフェン処理とは無関係に、Fbxo22が欠損していると、ERα陽性/HER2陰性乳がんにおける予後が不良となることを示すものである。
子宮内膜がんの発がんにはエストロゲンが関与している。子宮内膜は骨と共に、タモキシフェンがアゴニスト作用を及ぼす臓器としてよく知られており、タモキシフェンにより子宮内膜がんのリスクが上がる。そのため、タモキシフェンのアゴニスト作用が子宮内膜がんのリスク上昇の原因と考えられている。つまり、タモキシフェンを投与した場合に、Fbxo22が陽性の乳がんではアンタゴニストとして働くが、Fbxo22陰性乳がんではアゴニストとして働くとの、前述の乳がんに関する結果から、Fbxo22が陰性である子宮内膜がんにおいて、タモキシフェンなどの抗ホルモン剤の投与により子宮内膜がんが発症し、予後も不良となる可能性が考えられる。
正常子宮内膜では月経周期によってFbxo22の発現が変化し、増殖期は陰性で分泌期には陽性であった(図11AおよびB)。正常子宮内膜はHE染色による形態評価により内膜増殖期(Proliferative phase; P)が8例、分泌期(secretory phase; S)14例(そのうち早期分泌期(early secretory phase; ES)が8例)であった。 増殖期では全例がH-Score 40以下で、平均値は11.9±16.0であった。これに対して分泌期早期では最も高く171.3±40.2、それ以外の分泌期では141.7±34.9であった。増殖の指標であるKi-67は増殖期および分泌早期で高く、分泌中期以降にほぼ消失した(図11AおよびC)。PgRも同様に増殖期および分泌早期で高く、分泌中期以降は低値であった(図11D)。これらの所見から月経周期におけるLHサージと呼ばれる黄体ホルモンの分泌期に一致してFbxo22の発現が誘導されることが示唆された。また、Ki-67とは逆相関する傾向にあり、Fbxo22が低下すると増殖が誘導されることが示唆された。全ての症例でERは強陽性であり、理論的にはFbxo22が発現しないことにより持続したERシグナルが生じることが予想される。
癌化との関連については予想通り、ECではFbxo22が低下しており、H-Scoreで評価するとEH 124.2±69.1、AEH 84.7±51.0、 EC 25.0±35.3と、段階的に低下していた(図12AおよびB)。これらの症例ではFbxo22とKi-67の発現が逆相関する傾向にあり(図12A)、また、EHが混在するAEH症例では、EHではFbxo22陽性、AEHではFbxo22陰性で、Fbxo22陰性の腺管ではKi-67が高いという逆相関する関係が認められた(図13)。
以上より、ERα陽性乳がんモデルでエストロゲンを枯渇してもERシグナルが持続することを考え合わせると、Fbxo22が低下するとプロゲステロンシグナルによる分泌期への導入がスムーズにできず、エストロゲンシグナルによる細胞増殖が過剰に働き、がんを誘発する可能性がある。臨床応用として、EH症例において、AEH、ECへの進行を予測しうる予見因子となる可能性がある。
Claims (11)
- 以下の工程(a)および(b)を含む、ERα(estrogen receptor α)陽性乳がんの予後判定に必要な情報を収集する方法。
(a)前記がん組織由来の試料中のFbxo22陽性がん細胞を検出する工程、
(b)試料中に存在するがん細胞に対するFbxo22陽性がん細胞の割合を算出する工程 - 前記Fbxo22の発現を検出することが、免疫組織化学的染色法であることを特徴とする請求項1に記載の方法。
- 前記Fbxo22陽性がん細胞を、抗Fbxo22抗体による細胞の染色性に基づいて評価することを特徴とする請求項2に記載の方法。
- 前記染色性が中度以上である場合に、Fbxo22陽性がん細胞と評価することを特徴とする請求項3に記載の方法。
- 以下の工程(a)および(b)を含む、ERα陽性がんのSERM(selective estrogen receptor modulator)による治療効果の評価に必要な情報を収集する方法。
(a)前記がん組織由来の試料中のFbxo22陽性がん細胞を検出する工程、
(b)試料中に存在するがん細胞に対するFbxo22陽性がん細胞の割合を算出する工程 - 前記ERα陽性がんが、乳がんまたは子宮内膜がんのいずれかであることを特徴とする請求項5に記載の方法。
- Fbxo22の発現量を検出するための要素を含んでなる、ERα陽性乳がんの予後を判定するためのキット。
- Fbxo22の発現量を検出するための要素を含んでなる、ERα陽性がんのSERMよる治療効果を評価するためのキット。
- 子宮内膜が、異型を伴う過形成(AEH)、前がん病変である過形成(EH)または子宮内膜がん(Endometrial Cancer)のいずれの状態であるかを推定するために必要な情報を収集する方法であって、子宮内膜組織由来の試料中のFbxo22の発現量を評価することを含む、前記方法。
- 前記Fbxo22の発現を検出することが、免疫組織化学的染色法であることを特徴とする請求項9に記載の方法。
- 子宮内膜が、異型を伴う過形成(AEH)、前がん病変である過形成(EH)または子宮内膜がん(Endometrial Cancer)のいずれの状態であるかを推定するためのキットであって、Fbxo22の発現量を検出するための要素を含んでなるキット。
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